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Reference ( gi|1 )            :     GTAG--AATATCAA--CATAATTATGTGA-ATATAGCTTAAATAACACTGTGAAAATAGCAAACA-GTGATG-AATCTAGTAACCCC-TATGTGGAATA----CAAAAGTACTGGTAATAATTAATTACAATATGAATTTTTTTTAGCATCCGTTGACCAACAGTGATTT-AGAGAACTGAAATTGTGTATTAACTAGCTCTCTTCAGTGTTTGTATTTTTGCTTT-AAAGATAAATGGTTTGCTTTTGTTTGAAAATAAAAATAGACATTATTAAGGTATCTTCTGATCTATTCAGTGTATTACATGTGTAAAACATGAGGTGAGAGTAAATAAGGATTGAGA-TCAACTTTCAGAAAAAT
gi|10                         :     GTAG--CATATCAA--CA--A--ACGTGA----TAGCTTAAATAACAATGTGAAAATAGTAACC---TAATG-AGTCTAGTGACCCCGTATTAGGAATA----CAAAATTGCAGGTAACAATTAATTACAATA
gi|7                          : gtcaGTAGCAAATATAAA--AA-AA--ACGTGA----TACCTTAAATAACATTAGGAAAATAGCGAACA-GTGATC-AATTTAGTAACCCA-TATAAGGAATA----CAAAATTACCGGTAACAATTAATTACCGT-TGAAT
gi|8                          :  tcaGTAG--CAAATCAAATCAAAAGAACGTGATACGTACCATGAATAACATTGTGAATATAGCGAACACGTTATTCAATTT-GTAATCCC-TATTAAGAATA----CAAATATACAGGTA-CAATTAATTACAACAatacaat
gi|11                         :  tcaGTAG--CAAATCAA--CA--A--ACGTGA----TAACTTACAAAACACTGTG--CATAGCGAACA-GTATTC-AATTTA-TAAACCC-TATAAGGAAAA----TAAATTTACCGGTAACAGTTAATTTCAct
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5 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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Unaligned ( gi|15 ): GTCAGTAGCATATCCAAAAAGCGTGATACCTTAAACAAGCATTCTGAGAGTATT
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Reference ( family-2663 )     :      GTAGCAAATC--AA--CA-AA--A---CGTGA---GTAN--CTTAAATAACACTGTGAAAATAGCGAACA-GTGAT-CAATCTAGTAACCCC-TATTAGGAATAC-AAAATTACCGGTAACAATTAATTACAATATGAATTNTTTTTTGCTTCTGTTAACCGNCAGCGACTTAAGAGCGCTGAAANTCTGCGTTGA----CCCTCTTCAGTGTTTGTATTTTTGCTTTCAAANATAAGTGGCTGGCTTTTGTTTGAAAATAAAAATAGACATTAAAAAGTTATTTTCTT-ATCTATTCAGTG-T-T--------TAAAACGTGAGGTTATCGTAAATAACGATCGAGATCGACTTTCGGAAAA
gi|1                          :      GTAGAATATC--AA--CATAATTA---TGTGA---ATATAGCTTAAATAACACTGTGAAAATAGCAAACA-GTGAT-GAATCTAGTAACCCC-TATGTGGAATAC-AAAAGTACTGGTAATAATTAATTACAATATGAATTTTTTTTAGCATCCGTTGACCAACAGTGATTT-AGAGAACTGAAATTGTGTATTAACTAGCTCTCTTCAGTGTTTGTATTTTTGCTTT-AAAGATAAATGGTTTGCTTTTGTTTGAAAATAAAAATAGACATTATTAAGGTATCTTCTG-ATCTATTCAGTG-TATTACATGTGTAAAACATGAGGTGAGAGTAAATAAGGATTGAGATCAACTTTCAGAAAA
gi|10                         :      GTAGCATATC--AA--CA-AA------CGTGA----TAG--CTTAAATAACAATGTGAAAATAGTAACC---TAAT-GAGTCTAGTGACCCCGTATTAGGAATAC-AAAATTGCAGGTAACAATTAATTACAATAat
gi|11                         :  gtcaGTAGCAAATC--AA--CA-AA------CGTGA----TAA--CTTACAAAACACTGTGCA--TAGCGAACA-GTATT-CAATTTA-TAAACCC-TATAAGGAAAAT-AAATTTACCGGTAACAGTTAATTTCA
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|17 ): TGATTTTAGGCTACGCATCTAAAGTCAAGACATGGAACAT
Unaligned ( gi|18 ): GAAACAAGCATTCTGAGAGTATTGCACA