lowQualScore                  :                                                                                                                    1                1                                         11         1                                            11                                                                                                      111111111                                         1                                                                                                                                          555555555555                        
lowQualScore                  :               1    222          3333 1 2  1   1    2 1  66    2222  11  2  1 3333333 1 11 1 11     1 333333   8    0  0   1    1    2        1 11  2222 1 1 33333 1   1   1   00    1    0 1 1    22   1   1 6  1   55555555 1     22 11    0   1      44444 22  22  1    99999     6666        1 88    22          44 22 9   444444 22    1  777777777   3         9  222   1 4444444  5    44 3 11 1  1 44    33   1  1    5555 2222 1    11    1   1  6666666666666 44  3333  11  11  3 1   44444  555555       1 22          1     333 111111111111  22  99                
lowQualScore                  :               .    ...          .... . .  .   .    . .  ..    ....  ..  .  . ....... . .. . ..     . ......   .    .  .   .    .    .        . ..  .... . . ..... .   .   .   ..    .    . . .    ..   .   . .  .   ........ .     .. ..    .   .      ..... ..  ..  .    .....     ....        . ..    ..          .. .. .   ...... ..    .  .........   .         .  ...   . .......  .    .. . .. .  . ..    ..   .  .    .... .... .    ..    .   .  ............. ..  ....  ..  ..  . .   .....  ......       . ..          .     ... ............  ..  ..                
lowQualScore                  :               9    999          0000 4 3  4   4    7 3  88    6666  77  4  1 8888888 2 66 2 66     1 333333   0    7  9   3    3    7        3 88  7777 3 3 22222 3   3   4   55    5    7 5 4    66   4   4 3  4   22222222 5     00 77    1   5      00000 22  22  7    88888     3333        5 00    00          55 00 7   444444 11    5  444444444   0         0  555   3 3333333  6    88 9 88 3  3 55    11   2  2    3333 7777 2    77    2   2  7777777777777 55  8888  77  77  8 2   44444  888888       3 99          5     000 555555555555  00  22                
consensus                     :            TCT-TATG---TATGATGCAA----A-CATT-ATG-AAAT-T-TAG-ACTG----TA--GG-TA-T-------A-T--G-A--TACAA-A------TGCCTGTTGAACGAA-ATCA-ACAANAATTCTAA-A--TC----A-T-A-----C-TCA-CAT-GTTCGCGTA-TGCACT-G-TGTGC-GCG-AGA-AGGC-ACG--------T-GCATT--GN-AATTCACC-TTTTTT-----C--AT--TA-GATAT----TGATC-GC-TACCATTA-T-GAGAT--TTCAATGACAC-A--TNTTG------G--TACA-TAC--------TAT-AGAAAGCTAGAA---TGT-A-------AGATGAT--TGG--T-TG-T--GCAG--AAG-CA-CATT----G----A-CACC--ACTT-TTT-AA-------------A--TG----GG--GG--AG-G-TTT-----GG------GGAACAT-C-CGTAACGGTCC-CCGTT---ATC-GTAACGG--CCCGTT--ACAATTAGTACTAGTT
Reference ( gi|2 )            :            TCT-TATA---TATGATGCAA----A-CGTT-ATG-AAAT-T-TAT-ACTG----TA--GG-TA-T-------A-T--G-A--TACAA-A------TGCTTGTTTAACGAA-ATCA-ACAATAATTCTAA-A--TC----A-T-A-----C-TCA-CAT-GTTCACGTA-TGCAAT-G-TGTGT-GCG-AGA-AAGC-ACG--------T-GCATT--GA-AATTCACC-TTTTTT-----C--AT--TA-GATAC----TGATC-GC-TACCATTA-T-AAGAT--TTCAATGATAT-A--TGTTG------G--TACA-TAT--------TAT-AGAAAGCTACAA---TAT-A-------AGGTGAT--TCG--T-TG-T--GCAG--AAG-CA-CATT----G----A-CACC--ACTT-TTT-AA-------------A--TG----GG--GG--AG-G-TTT-----GG------GGAACAT-C-TGTAACGGTCC-CCGTT---ATCTGTAACGGTCCCCGTT--ACAATTAGTACTAGTT
gi|5                          :            TCT-TATA---TATGATGCAA----A-CATT-ATG-AAAT-T-TAG-ACTG----TC--GA-TA-T-------A-T--G-A--TACAA-A------TGCCTGTTGAACGAA-ATCA-ACAATAATGATAA-A--TC----A-C-A-----C-TCA-CAT-GTTCGCGTA-TGCACT-G-TGTGT-GCA-AGA-AGGA-ACA--------T-GCCTT--GG-AATTAACC-TTTT-T-----C--AT--TA-GATAT----CGATC-GC-TACCATTA-T-GAGAT--TTGAATGATAC-A--TATTG------G--TATA-TAT--------TAT-AGAAAACTACAA---TAT-A-------AGATGAT--TGG--T-TG-T--ACAG--AAG-CA-CATT----G----A-CACC--ACTT-TTT-AA-------------A--TG----GG--GG--AG-G-TTT-----GG------GGAACAT-C-CGTAACAGTCC-CCGTT---A
gi|4                          :        atccTCT-TATA---TTTGATGCAA----A-CATT-CTG-AAAT-T-TAG-ACTG----TA--GG-TA-A-------A-T--G-A--TACAA-A------TGCCCGTTGATCAAA-ATAA-AAAAAAATTCTAA-A--TC----A-T-A-----C-TAA-CAT-GTTCGCGTA-TGCACT-A-TGTTA-GCG-AGA-AGGC-ACG--------T-GCATT--GG-GATTCACC-TTTTTC-----C--AT--TA-GATAT----TGATC-GC-GAACATTA-T-GAGAT--TTCAATGATAC-A--TGTTGGTACATG--TACA-TAT--------TAT-AGAAAGCTAGAA---TAT-A-------AGATGAT--TGG--T-TA-T--ACAG--AAG-CA-CATT----G----A-CACC--ACTT-TTT-AA-------------A--TG----GG--GG--TG-G-TTT-----GG------GGAACAT-C-CATAACGGTCC-CCGTTACAATTTGTAaaattagtacta
gi|10                         :     ataatcaTCT-TGTG---TATGATGCAA----A-CATT-ATG-AATT-T-TAT---TG----TA--C--CA-T-------A-T--G-A--TACTA-A------TGCCTATTGAACGAC-ATCA-TCAAAAATTCTAA-A--CC----A-T-A-----C-TCA-CAT-ATCCGCGTA-TGCATT-G-CGTGC-GCG-AGA-AAGT-GCG--------T-GCATT--GC-AACTAACC-TTTTAT-----C--ATTCTA-GATAT----TGATC-TA-TACCACAA-T-GAGAT--TTAAATGACAC-A--TTTTA------G--TATG-TACACACTTG-TAC-AGAAAGCTATAAATTTGC-A-------AGGTGAT--TGG--T-TG-T--ACAG--AAG-CA-GATT----G----A-GGCG--GCTT-ATT-AA-------------A--T-----GG--GG--AG-G-TTT-----GG------ctag
gi|3                          :     ataatctTCTGTATA---TATAA-GCAA----AACGTTTATG-AAAT-T-TAG-GATG----TA--GG-TAAT-------A-T--TTA--TACAA-A-------GC--GGTTAACGAA-ATCA-TTAATAATTCTAATA--TC----A-T-A-----TATCA--ATAGTTCGCATA-TGCAAT-G-TGTGTTGCG-AGA-AATC-ACG--------T-GCTCT--GC-A-CTCTCT-CTCTCT-----C--A----A-GATAT----TGATC-GCATACCATTA-T-GAGAT--TCCAATAATAT-A--T-TTG------G--TACA-TAT--------TAT-AGAAAGCTAC-A---TAT---------AGGTGATTATC---T-TT-TCAGCAG--AAG--A-CTTT----C----A-CACCGTATTTATTA-AA-------------A--TGT---GA--GG--AG-T-TTT-----AG------GGAACAT-CTTGTAACTGTCCACCGTT---Aa
gi|22                         :    cacatctcTCT-TATA---TATAATGCAA----A-CGTT-ATG-AAAT-T-TAG-ACTG----TA--GG-TA-T-------A-T--G-A--AACAA-A------TACCTGTTTAATGAA-ATCA-ACAATAATTCTAA-A--TC----A-A-A-----T-TCA-CAT-GTTCGCGTA-TGCAAT-G-TGTGT-GCA-AGA-AAGC------------T----TT--GG-AATTCACC-CTTTTT-----C--AT--AA-GATAT----TGATC-GC-TTCCATTA-T-GAGAT--TTCAATGATAT-A--caagttaatacta
gi|18                         :     acaatccTCT-TATG---TGTGATGCAA----A-CATT-GTA-AAAT-G-TAT-ACTG----TA--GG-CA-T-------A-T--G-A--TACAA-A------TGCCTTTTGAACGAA-ATCA-ACAAAAATTCCAA-A--TC----A-A-A-----C-TCG-CAT-GTC------------T-G-CGTGC-ACG-AGA-AGGC-ATGTACATGTAT-GCATT--GC-GATTCACC-CTTTTT-----C--AT--TA-GATGT----TGCTC-AC-TATCATTA-T-GAGAT--TTCAATGACAC-A--ATTTG------G--TACA-TACTTGTCCTATAT-AGAAAGCTAAAA---TGT-A-------AGATGAT--T
gi|24                         :       aatccTTT-TATG---TTTGATGCAA----A-CATT-ATG-AAAT-T-TAG-ACTG----AA--GG-TA-T-------A-T--C-A--TACTA-A------TGCCTGTTGAATGAA-ATCA-ACAAGAAATCTAA-A--TC----A-T-A-----C-TCG-CAT-GTTAGCATA-TGCACT-G-TGTGC-GCT-AGA-ACGC-ATG--------T-GCATT--GG-AATTAACC-TTTTTT-----C--AT--gg
gi|17                         :    cacaatccTCT-CATG---TATGATGCAA----A-CGTT-ATG-AAAT-G-TAG-CCTG----TA--GG-CA-T-------ATT--G-A---ACGACA------TGCATG
gi|25                         :       aattcTTT-TATG---TTTGATGCAA----A-CATT-ATG-AAAT-T-TAG-ACTG----AA--GGATA-T-------A-T--C-A--TACTA-A------TGCCTGTTGAATGAA-ATCA-ACAAGAAATCTAA-A--TC----A-T-A-----C-TCG-CAT-GTTAGCATA-TGCACT-G-TGTGC-GCT-AGA-ACGC-ATG--------T-GCATT--GG-AATTAACC-TTTTTcgcgtgcattgtaatttaccttttttcattagatattaatctatgccattattaaatttcaatgagacattttggcgcatactacagaaagctagaatgtaagatgaatatttgttcagaagcatattaagtctgctttctaaatgggggggggtgggtggattttgtaacggtcgccgttacaatcgt
gi|29                         :     acaatccTCT-TATG---TATGATGCAA----A-CGTT-ATA-CAAT-T-TAT-ACTG----CA--AG-CA-T-------A-T--G-A--TTCAA-A------TGCCTGTTGAATGAA-ATCA-ACAACAATTCTAA-A--TG----A-T-A-----C-TCG-CAT-TTCCGAGTA-TGCACT-A-TGTAT-TAG-AGA-AGGC-ACG--------C-ACATT--GT-GATTCA
gi|15                         :       aatttTCT-CATG---TAGGATGCAA----A-CACA-ATG-GAATAT-TAT-A-------------------------A-T--G-A---ATAA----------CCTGTT---------------GATAATGCTAA-A--TC----A-T-A-----C-CCG-C---GTT---GTA-TGCA-C-G-CGTGC-GCG-AGATGCGCCACA--------TTGCATT--GGTAATTTACC-TTTTCT--------AT--TA-G-------------------CCATTA------A------AATAAT------TTTTG------G--TACA-TAC--------TGC-AGAAA-TTAGAA---TGT-A-------AGATGACA-TGG--T-TG-T--GCAG--AAG-CA-CATT----G----------------------A-------------A--TG----GG--GG--AG-G-TTT-----TG------GGAACATCC-TGTAACGATCC-CCCTT---
gi|35                         :       aattcTCT-TATA---TATGATGCAA----A-CATT-ATGAAAAT-T-AAG-ACGG----TA--GG-TA-T-------A-T--G-A--TACAG-A---------------AA--AA-AACA-A-AA-AATCCT-A-A--TC----A-T-A-----C-TCA-CGT-ATTCGCGTA-TGCACT-G-TGTGT-ATG-AGA-AGGtcaattagaact
gi|48                         :    cacaatccTCT-TATA---CATAATGCAA----A-CGTT-ATA-AAAG-T-TAG-ACTG----TG--GG-TA-T-------A-T--G-A--TACAA-A------TGCCTGTTTAA
gi|47                         :        atccTCT-TACAATGTATGATGCAA----A-CATT-ATG-AAAT-T-TAG-AATG----AA--GG-TA-TACCGTAAA-T--G-A--TACAA-A------TG
gi|58                         :   ccacaatccTCT-CATG---TATAATGCAA----A-CCAT-ATG-G------TAT----------------CA-T-------A-T--G-A--TACAA-A------TGCCTGTTGAACtccg
gi|19                         :        gatttCT-TATA---TATGATGCAA----A-CATT-ATG-AAAT-T-TAG-ACTA----TATAGG-TA-T-------G-T--G-A--TACAA-A------TGCCCCTTGAACGAA-ATCA-ACAAAAATTCTAA-A--TC----A-T-A-----C-TTA-CGT-GTTCGCGTA-TGCACT-G-TGTGT---G-AGA-AGGC-ACG--------T-GCATT--GG-AATTCACCTTTTTTT-----C--AT--AA-GATAT----TTATC-GC-TACCATTA-T-AAGAT--TTCAATGATAC-A--TGTTG------G--TACA-TAT--------TAC-AGAAAGCT--GA---TAT-A-------AGATGAT--TGG--T-TG-T--GCAG--AAG-
gi|9                          :              T-TATG---TATAATGCAA----A-CATT-GTG-AAAT-T-TAA-ACAG----TA--GG-TA-
gi|50                         :    cacaatcttgT-TATA---TATAATGCAA----A-CGTT-ATG-AAAT-T-TAG-ACTG----TA--GG-TA-T-------A-T--G-A--TACAA-A------TGCCTGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncctgttgaaggaaatcaacaaaaattctaaatcatactcacatgttcgcgtattcattgtgtgcgcgagaaggcacgtgtattgaaattcacctttttctttagattgtgatcactaccattatgatatttcaatgatacatattggtacatctaatagaaagctagaacataagataatttgttgtgcagaagcttattgacaccatttttaaatg
gi|46                         :       caatcctT-TATA---TGTGATGCAA----A-CGTT-ATG-AAAT-T-TAG-ACTGTACATA--GG-TA-T-------A-T--G-A--TACAA-A------TGCCTGTTTAA
gi|6                          : cacaatcatcttag-TGTG---TATGATGCAATATTA-CATT-G-----AT-T-CAT-ACTG----CA--G--TA-T-------A-T--G-A--TTCA--A------TAC---TTTG--GAACATCATACCG-AATGCTAC-A--TTTTTTG-T-AAGTGGC-GAA-AAG-GTGCCC--A-TGCAAT-GATGCGT-GTA-TGA-GTGC-ACG--------T-GCAT---GC-AATTAAC--TTTTAA-----A--AT--TA-GATAT----TAACT-G--TACCTTT--T-GA-AT--TTCAATGACAC-A--ATTTG------GAGTACA-TA----------ATCAAAAAGCTAGAA---TGT-A-------AGAT-AT--AAA--T-AT-T--ACAG--AAG-CA-CATC----G----A--ACC--G-----TT-GG-----------------G----GGTTGG--GGTG-TTT-----GGAGC---GGAACAT-C-CGTAACGGTCC-
gi|51                         :          ctttc-TATG---TGTGATGCAA----A-CATT-AT--AAAT-TGTAT-ACTG----TA--GG-CA-T-------A-T--G-A--TACAA-A------TGCCTGttacaactaaagcta
gi|27                         :          ctcttaaATG---TTTGATGCAA----A-CATT-ATG-AAAT-T-TAG-ACTG----AA--GGATA-T-------A-T--C-A--TACTA-A------TGCCTGTTGAATGAA-ATCA-ACAAGAAATCTAA-A--TC----A-T-A-----C-TCG-CAT-GTTAGCATA-TGCACT-G-TGTGC-GCT-AGA-ACGC-ATG--------T-GCATT--GG-AATTAACC-TTTTTT-----C--AT--
gi|28                         :                 ATG---TATGATGCAA----A-CATT-ATG-AAAA-T-TAG-ACTG----TA--GG-TA-T-------A-T--G-A--TACAA-G------TGGCCGTTGAACAAA-ATCA-ACAAACATTCTGA-A--TC----A-T-A-----C-TCA-CAT-GTTCGCGTA-TCCA
gi|8                          :  caatcctcttatgtacTG---TGTGATGCAA----A-TATT-GTA-AAAT-T-TAT-ACTG----T---GG-CA-T-------A-TCGG-A--TACTA-A------TGCCTGTTGAACGAA-ATCA-GCAAAAACTCCAA-A--TC----A-T-A-----C-CCA-CAT-GTC------------T-G-CGTGC-ACA-AGA-AGGC-ACG--------C-GCATT--GC-GATTCACC-TTCCTT-----C--CT--TA-GATAT----TGATC-AC-TACCATTA-T-GAGAT--TCCAATGACAC-A--ATTTG------G--TACA-TAC--------TA------AGCTAGAG---TGT-A-------AGATGAT--TGG--T-TG-T--GCAG--AAG-CA-CAGT----G----A-CACC--ACTT-TTT-AA-------------A--TG----GG--GG--AG-G-TTT-----GG------GGAACAT-C-CGTAACGGTCC-CCGTT---gccgagccgaatctcaaccgcaattaggca
gi|1                          :                  tcttctATGATGTAA----A-CATT-ATA-GAGT-T-TAT-ACTG----CA--AG-C------------T--A-A--TACAA-A------TGCCTGTTGAATGAA-ATTA-ACAAAAATTCTAA-A--TC----A-TAA-----C-TCATCAT-GCCCTCCTATTGCACC-A-TGTGC-GCA-ATA-AGGC-GTG--------C-GC---------ATTCACG-TTTTTTATTTCC--AT--AA-GATAT----TTATC-AC-TATCATTA-T-GAGAT--TTCAA-GACACAA--TA-TG------G--TACA-TACTA------TAT-AGAAAGCTACAT---TGT-AGATTTGTAGGTGAT--TGG--TATG-TC-GCAGACAAGTCAGCATT----G----AGCGCC--AC-T-TTT-AA-------------AGGTG----GG--GAGCAG-GATCTTAGAGGG------GGGAAA--C-TCCAACGGTCgcaattagtacta
gi|61                         :                   ttcatgaGATGCAA----A-CATT-ATA-AAAT-A-TAT-ACTG----TA--GG-AA-T-------A-T--G-A--TACAA-A------TGCCT-TTTAAagccaccgcgttacaagtgattagttactag
gi|7                          :                            TGCAA----A-CATT-GTG-AAAT-T-TAG-ACTG----TA--GA-TA-T-------A-T--G-A--TACAA-A------TGCCTGTCGAAAGAA-ATCA-ACAAAAATTCTAA-A--TC----A-T-A-----C-TCA-CAT-GTTTGCGCA-TGCATT-G-TGTGC-GCG-AGG-AGGC-ACG--------T-GCAAT--GG-AATTCATC-TTTT-T-----C--AT--TA-GACAT----TGATC-AC-TAACATTA-T-GAGAT--TTCAATGATAT-A--TATTG------G--TACT-TCT--------AAT-AGAAAGCTAGAA---TAT-A-------AGATAAT--TGG--T-TG-T--TCAG--AAG-CA-TATT----G----A-CACC--ACTT-TTT-AA-------------A--TG----GG--GG--AG-G-TTTG----GG------GGAACAT-C-TGTAACGGTCC----------------AC-------GTT--ACAATTAGTACTAGa
gi|13                         :                            TGCAA----A-CATT-ATA-AAAAAT-TAT-ATTG----TA--GG-CA-T-------A-T--A-AAATACAA-A------TGCCTGTTTTT------TCA-GCAACAATTCTAA-A--TC----A-T-A-----C-TCA-CAT-GTCCGCGTA-TGCACT-C-TGGGC-GCG-ATA-AGGC-ACG--------
gi|36                         :                                                  AT-T-TAG-ACTG----TA--GG-TA-T-------A-T--G-A--TACCA-A------TGCCCACTGATCGAA-ATCA-ACAATAATGCTAA-A--TC----A-T-A--------CA-CAT-ATTgaatttcaatgacgcattttggtacattctaaagaaagctagaatattagatgattggttgtgcagaagcacattggtcaacaccactttctagatgggggaatgtttggggaacatctgttacggtccccgttacaataaatactagt
gi|45                         :           nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAT-T-TATTACTG----TA--AG-C------------T--A-A--TACAA-ACGTTCATGCCTGGTGAATGAA--TTA-ACAAAGATTCTAA-AATTC----A-T-A-----C-GCA-CA
gi|34                         :                                                      atacacCTG----TA--GG-TA-T-------A-T--G-A--TACCA-A------TGCCCACTGATCGAA-ATCA-ACAATAATGCTAA-A--TC----A-T-A--------CA-CAT-ATTGAC
gi|52                         :                                                             TG----TG--GG-CG-T-------A-T--G-A--TGCGA-A------TGTCTGCTGAACTAT-ATCA-GCAAAAATGCCGA-A--TC----AAT-A-----C-TCA-CAaccactttttaaatgggggagatttggggaacatccgtaacggaccccgttacaattagtact
gi|59                         :                                                             TG----CA--AA-TA-T-------A-T--G-A--TACAA-A------TGCCTGTTGAAC-AA-ATTA-
gi|14                         :                                                         taatcctcttatgtgtgaA-T-------A-T--G-A--TATAA-A------TGCCTGTTGAACAAA-ATCA-AAAA-AATTCTAA-A--TC----A-T-A-----C-GAA-CAT-GTCCGCGTA-TGCATC-G-TGTGC-ACG-AGA-AGTT-ACG--------A-GAGTT--GC-GATTCA-C-TTTTTT-----C--AT--TA-GATAT----TGATT-AC-TACC------------------ATGACGC-A--TTTTG------A--TACA-TAC--------AAT-AGAAAGCTAGAA---CGT-G-------AGATGAT--TGG--T-TG-T--GCAG--AAG-AA-AATT----G----A-CACC--ACTT-TTT-AA-------------A--TG----GG--GG--AG-G-TTT-----GG------GGAACAA-C-CGTAACGGTCC-CTG----------------------TT--ACAATTAGTACTAG
gi|12                         :                                                                            -T-------A-T--G-A--TGCAA-A------TACCCTTTGAACGGC-ATCA-ACAA--ATTCTTA-A--TC----T-T-A-----C-CCA-TAT-GCGCGTGTA-CGCACT-G-CGTGC-GCG-AGA-TGGG-GCG--------T-ACACT--GC-AATTTAAC-TTTTTT-----C--AT--TACGGTACATATTGATC-TA-TGCCATTT-TTGAGAT--TTCAATTACAC-A--TTTTG------G--TACG-TAC--------AAC-AAAATGCTAGAA---TAT-A-------AGATGAT--TGG--T-TG-T--ATAG--AAG-CA-AACT----G----A-GACC--GCTT-TTT-AA-------------A---G----GG--AG--AA-C-CTT-----GG------GGAACCT-C-CATAACAGTCC-CCGTT---A
gi|30                         :                                                                                             --TACAA-A-------GCCTGTTGCATGAA-ATGA-ACAACCATTTTAA-A--TT----A-T-A-----C-TCC-TAT-ATCCGTGTA-TGCCATTA-TGTGC-ACG-AGA-AGGC-ACG--------C-ACATT--GC-GATTCACT-TTTTTT-----C--AT--TA-AATAT----TGATC-AC-TACCGTTA-T-GAGAT--TTCAATGACAC-A--Tcaa
gi|16                         :                                                                                                             GCTTTTTGAACAAA-ATCA-ACAAAAATTC-GA-A--TC----A-G-A-----C-TGG-AAT-GTT------------T-G-CGTGT-ACG-AGA-ATGT-AAG--------C-GTATT--GC-AAATCACC-TTTTTT-----C--AT--TA-GATTT----TGATC-AC-TATCGTTA-T-GAGAT--TTCAATGACAT-A--ATTTG------G--TACA-TAC--------TAC-AAATA--TAGAT---TGT-A-------AGATGAT--TGG--T-TA-C--GCAG--AAG-CA-CATT----G----A-CATC--ACTT-TTT-AA-------------A--TG----GG--GG--AG-G-TTT-----GG------TTAACAT-C-CGAAACAGTCC-CCGTC---A
gi|9                          :                                                                                                            aaCCTGTTGAAGGAA-ATCA-ACAAAAATTCTAA-A--TC----A-T-A-----C-TCA-CAT-GTTCGCGTA-TTCATT-G-TGTGC-GCG-AGA-AGGC-ACG--------T-GTATT--GA-AATTCACC-TTTTT------C--TT--TA-GATTG----TGATC-AC-TACCATTA-T-GATAT--TTCAATGATAC-A--TATTG------G--TACA-TCT--------AAT-AGAAAGCTAGAA---CAT-A-------AGATAAT--TTG--T-TG-T--GCAG--AAG-CT-TATT----G----A-CACC--A-TT-TTT-AA-------------A--TG----gaagaagtac
gi|65                         :                                cacaatcttgttatgtataatgcaaacattgtgaaatttaaacagtaggtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGAA-ATCA-ACAAAAATTCTGA-A--TC----A-T-A-----C-TCG-TAT-G
gi|39                         :                                                                                                                          A-ATCA-ACAAT---TCCAA----TC----A-T-A-----C-TCA-CAT-AT------------AT-G-CGTGC-ACG-AGA-AGGA-ACG--------C-GCATT--GC-AATTCACT-TTTTTT-----TAAAT--AA-GATAT----TGATC-AC-GACCATTA-T-GAGA
gi|64                         :                                                                                                                                         TCTAA-A--TC----A-T-A-----A-TCA-CAT-GTTCGCGTA-TGCACT-G-TGTGT-GCG-
gi|11                         :                                                                                                                                                                                    A-TGCAAT-G-AGTGC-GTA-TGA-GTGC-ACG--------T-GCA-T--GC-AATT-AC----TTTT-----A--AT--TA-GATAT----TAATC-TG-TACCCTTT-T-GA-AT--TTCAATGACAC-ATTTGGTA------G--TACA-TA---------CAT--CAAAACT--AA---TGT-A-------A--TGAT--TAA----TA-T--ACAG--AAG-CA-
gi|20                         :                                                                             ttcttgtgtaatgcaaatattacattgatcatactgcaggtatatattaaaccatttgaacaatcataccgatgcactacattttttgtaagtggcgaaaaggtgcctccT-G-TATGC-GCG-ATA-AGGC-ACG--------T-GCATT--GG-AATTCACC---TTTT-----C--AT--TA--ATAT----TG-TC-AT-TAGCATTA-T-GAGAT--CTCAATGATAC-A--TATTA------G--TACAGTCT--------T-T-AGGTAGCTAGAA---TAT-C-------A-ATGATTGTGG--T-TG-TG-GCAGC-AAG-CA-TATTC---G----A--ACC--AGTG-TTT-AATGGGGAGGGGAGGG--TG----GG--GG--GG-G-GTT-----GGGGTTGTGGACCAT-C-CGTTAC-GTCC-CCGTtcaaccgtttggttggggttttgagcgaaatccgt
gi|21                         :                                                                                                                                                                               agcgtgcattgtctt-TGTAT-GCGCATA-AGGC-AC---------T-GCATTTTGG-AATTCACC-TTTTTT-----C--AT--TA-CATAT----TGATCCAT-TAGCATTAAT-GAGAT--CTCAATGATAC-A--TATTA------G--TACA-T-C--------TATTAGGTAGCTAGAA---TATCA-------AATTTAT--G-G--T-TG-T--GCAG--AAG-CA-TATTC---G----A--ACC--A-TG-TTT-AA-------------A--TGGGGAGG--GG--AG-G-GTG-----GG------GG
gi|23                         :                                                                                                                                                                                            tcttGTGC-GCG-A-A-AAG---------------GCATT--GG-GATTGACC-TTCTTT-----C--AT--TA-GATAT----TAATC-AC-TAACATTA-T-GGAAT--TTCAATACCAC-A--TATTG------T--TACA-TAC--------TAT-AGAATGCTAGAT---TGT-A-------AGATAAT--TGA--T-TT-T--GCAG--AAG-CA-CATT----G----A-TCGC--ACAT-TTC-AA-------------A--TG----GG--GG--AT-G-TTT-----TC------GAAACAT-T-CGTAACggggttggggttgtggaccatccgttacgtccccc
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                               GC-GCG--------T-GCATT--GT-AATTTACC-TTTTTT-----C--AT--TA-GATAT----TAATC-TA-TGCCATTA-T-TAAAT--TTCAATGAGAC-A--TTTTG------G--CGCA-TAC--------TAC-AGAAAGCTAGAA---TGT-A-------AGATGAA--TAT--T-TG-T--TCAG--AAG-CA-TATT----A----A-GTCT--GCTT-TCT-AA-------------A--TG----GG--GG--GG-G-GTG-----GG------TGGAT-T-T-TGTAACGGTCG-CCGTT---Atacacaagttacaat
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                           aattctctcatgtatgatgcaaacgttatgaaatgtagcctgtaggcatattgaacgacatgcatCATTA-T-GGAAT--TTCAATGATAT----------------------------------TAT-AGAAAGCTACAA---TAT-A-------AGATGAT--TGG--T-TG-T--GCAG--AAG-CA-TAGT----G----A-CACC--ATCA-TTT-AA-------------A--TG----GG--GG--AG-G-TTT-----GG------GGAACAT------------------------TC-GTAACGGTCCCCGTT--ACAATAAGTACTAGTTcaatcgt
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                            CATTA-T-GGAAT--TTCAATGATAT----------------------------------TAT-AGAAAGCTACAA---TAT-A-------AGATGAT--TGG--T-TG-T--GCAG--AAG-CA-TAGT----G----A-CACC--ATCA-TTT-AA-------------A--TG----GG--GG--AG-G-TTT------G------GGAACAT-T-CGTAACGGTCC-CCGTT---A
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                              TTA-T-GAGATATTCCAGTGACAC-A--TTTTG------G--TAGA-TAC--------T----GAAAGCTATAA---T-T-A-----------GAT--GCGGAT-TGAT--GCAG--AAG-CA-TATT----G----A-C-CC---CCT-GTT-AA-------------AT-TG----GG--GG--AT-G-TTT-----GG------GGGG-------GGGGGGGACA-C--------TCCGTAATGGGACCTTTTAAACAATTATTACTAGTcaataaagtactagtt
gi|40                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                              TTA-T-GAGAT--TTCAAAGACAC-A--TTTTG------G--TACA-TAC--------CAT-AGAAAGCTAGAA---TGT-A-------AGATGAA--TGG--T-TG-T--GCAT--AAA-CA-CAT
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                aatgttggtcctttatacaacttAT--TTCAATGATAC-A--TGTTG------A--TACA-TAT--------TAT-AGAAAGCTAGAA---TAT-A-------AGATGAT--TGG--T-TG-T--GCAG--AAG-CA-AATT----G----A-CACC--ACCT-TTT-AA-------------A--TT----GG--GG--GA-G-TTT-----GG------GGAACA----CGTAACGGTCC-CCGTT---Aa
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                cgcatacAT--TTCAATGACGC-A--TTTTG------G--TACA-TTC--------TAA-AGAAAGCTAGAA---TAT-T-------AGATGAT--TGG--T-TG-T--GCAG--AAG-CA-CATT----GGTCAA-CACC--ACTT-TCT-AG-------------A--TG----GG--GG--AATG-TTT-----GG------GGAACAT-C-TGTTACGGTCC-CCGTT---Acgactagtact
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                tgcaaacattataaaaaattatattgtaggcatataaaatacaaatgcctgttttttcagcaacaattctaaatcatactcacatgtccgcgtatgcactctgggcgcgataaggcacggaAT-AGAAAGCAAAAA---TGT-A-------AGCTGAC--TGG--T-TG-T--GCAT--CAG-CA-CATT----C----A-CACT--ACTT-TCT-AT-------------ATCTG----GC--GG---------T-----AG------GGAACAT-C-TGTAACGGT-C-CCGTT---Acaataaatactagt
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               AAGCTACAA---TAT-A-------AGATGAT--TGG--T-TG-T--GCAG--AAG-CA-TAGT----G----A-CACC--ATCA-TTT-AA-------------A--TG----GG--GG--AG-G-TTT------G------GGAACAT-T-CGTAACGGTCC----------------------CCCGTT--ACAATAAGTACTAGTTcaataagcactag
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gi|54                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                G--AGG-CA-CAAT----G----A-CACC--ACTT-TTT-AA-------------A--TG----GA--CT--GC-G-TTT-----GG------TGAGAAT-C-CGTAACGGACC-TCtttggaacattc
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     t-CA-TATT----G----A-CACC--ACTT-TTT-AA-------------A--TG----GG--GG--AG-A-TTT-----GG------GGAACAT-C-CGTAACGGACC-CCGTT---A
gi|62                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ctgtaggtatatgataccaatgcccactgatcgaaatcaacaataatgctaaatcataca-CA-CATT----G----A-CACC--ACTT-TTTTAA-------------A--TA----GG--GG--AG-G-TTT-----GG------GGAACAT-C-TGTAACGGcaattagtact
gi|55                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ATT----G----A-CACC--ACTT-TTT-AA-------------T--TG----GG--AG--AA-G-TTT-----GG------GGAACAT-C-TGCAACGGTCC-TCGTT---A
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Unaligned ( gi|56 ): CAGTATCAGATATGTTTCACTAGATGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTGTGCAGA
Unaligned ( gi|57 ): ACAGGTAGATAACTATGGTTTAACTATAGAAAGTGTAATATAAATATGCCAAACACGAAC
Unaligned ( gi|60 ): CACAGGTAGATAATATGGTTTACTATAGAAAAGTGTAATAAAATATGCCAACACG
Unaligned ( gi|63 ): TAACTTAATTTCAAATAATGGTCAAATCTCCCGTTACATTTAGTCCAAGT

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Reference ( family-2588 )     :                                                                  TCT-TA---TGTATGATGCAA----A-CATT-A---TG-AAAT-T-TAG-ACTG----TA--GG-TA-T-------A-T--G-A--TACAA-A------TGCCTGTTGAACGAAATCA-ACAANAATTCTAA-A--TC----A-TA-----C-TCA-CAT-GTTCGCGTAT-GC-ACTG-TGTGC-GCGAGAAG-GC-ACG--------T-GCATT--GN-AATTCACC-TTTTTT-----C--AT--TA--G---ATATTGATC-GC-TACCATTA-T-GAGAT--TTCAATGACACATNT--TG------G--TACATAC--------T-AT-A--GAAAGCTAGAA---TGTA-------AGATGAT--TGG-T-TG-T---GCAG-A--AG-CA-CATT----G----A-CACC--ACTT-TTT-AA-------------A--------------TG-GG--GG--AG-G--TTT--------GG------G-GAACA-TC-C-GTAACGGTCC-CCGTT---ATC-GTAACGG--CCCGTTACA----ATT-AG-TACTAGTT
gi|1                          :                                                                    T-CA---TGAATGATGTAA----A-CATT-A---TA-GAGT-T-TAT-ACTG----CA--AG-C------------T--A-A--TACAA-A------TGCCTGTTGAATGAAATTA-ACAAAAATTCTAA-A--TC----A-TAA----C-TCATCAT-GCCCTCCTATTGC-ACCA-TGTGC-GCAATAAG-GC-GTG--------C-GCATT---------CACG-TTTTTTATTTCC--AT--AA--G---ATATTTATC-AC-TATCATTA-T-GAGAT--TTCAA-GACACAATA--TG------G--TACATAC--------T-AT-ATAGAAAGCTACAT---TGTAGATTTGTAGGTGAT--TGG-TATG-TC--GCAG-ACAAGTCAGCATT----G----AGCGCC--ACTT-TT--AA-------------AGG------------TG-GG--GAGCAG-GATCTTAGAGG---GG------G-GAAAC-TC-C---AACGGTCA---GCC---ACC-G----------CGTTACAAGTGATT-AGTTACTAG
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gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                          tAT-GC-AATG-AGTGC-GTATGAGT-GC-ACG--------T-GCAT---GC-AATT-AC----TTTT-----A--AT--TA--G---ATATTAATC-TG-TACCCTTT-T-GA-AT--TTCAATGACACATTTGGTA------G--TACATAC----------AT----CAAAACT--AA---TGTA---------ATGAT--TAA---TA-T---ACAG-A--AG-CATCA--------------ACC--G----TTT-GG-------------T--------------TG-GG-------G-T--TTT--------GA------GCGAA-A-TC-C-GTtaccgatgcactacattttttgtaagtggcgaaaaggtgcctccatgcaatgagtgcgtatgagtgcacgtgcatgcaattacttttaattagatattaatctgtacccttttgaatttcaatgacacatttggtagtacatacatcaaaactaatgtaatgattaatatacagaagcatcaaccgtttggttggggttttgagcgaaatccgt
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gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                               aattc-GC-GCG--------T-GCATT--GT-AATTTACC-TTTTTT-----C--AT--TA--G---ATATTAATC-TA-TGCCATTA-T-TAAAT--TTCAATGAGACATTT--TG------G--CGCATAC--------T-AC-A--GAAAGCTAGAA---TGTA-------AGATGAA--TAT-T-TG-T---TCAG-A--AG-CA-TATT----A----A-GTCT--GCTT-TCT-AA-------------A--------------TG-GG--GG--GG-G--GTG--------GG------T-GGAT--TT-T-GTAACGGTCG-CCGTTACAATC-GTcgcgtgcattgtaatttaccttttttcattagatattaatctatgccattattaaatttcaatgagacattttggcgcatactacagaaagctagaatgtaagatgaatatttgttcagaagcatattaagtctgctttctaaatgggggggggtgggtggattttgtaacggtcgccgttacaatcgt
gi|18                         : aattctctcatgtatgatgcaaacgttatgaaatgtagcctgtaggcatattgaacgacatgcatTCT-TA---TGTGTGATGCAA----A-CATT-G---TA-AAAT-G-TAT-ACTG----TA--GG-CA-T-------A-T--G-A--TACAA-A------TGCCTTTTGAACGAAATCA-ACAAAAATTCCAA-A--TC----A-AA-----C-TCG-CAT-GT-------------CTG-CGTGC-ACGAGAAG-GC-ATGTACATGTAT-GCATT--GC-GATTCACC-CTTTTT-----C--AT--TA--G---ATGTTGCTC-AC-TATCATTA-T-GAGAT--TTCAATGACACAATT--TG------G--TACATACTTGTCCTAT-AT-A--GAAAGCTAAAA---TGTA-------AGATGAT--TGG-
gi|19                         :                                                              aatccCT-TA---TATATGATGCAA----A-CATT-A---TG-AAAT-T-TAG-ACTA----TATAGG-TA-T-------G-T--G-A--TACAA-A------TGCCCCTTGAACGAAATCA-ACAAAAATTCTAA-A--TC----A-TA-----C-TTA-CGT-GTTCGCGTAT-GC-ACTG-TGT---GTGAGAAG-GC-ACG--------T-GCATT--GG-AATTCACCTTTTTTT-----C--AT--AA--G---ATATTTATC-GC-TACCATTA-T-AAGAT--TTCAATGATACATGT--TG------G--TACATAT--------T-AC-A--GAAAGCT--GA---TATA-------AGATGAT--TGG-T-TG-T---GCAG-A--AG-
gi|2                          :                                                                  TCT-TA---TATATGATGCAA----A-CGTT-A---TG-AAAT-T-TAT-ACTG----TA--GG-TA-T-------A-T--G-A--TACAA-A------TGCTTGTTTAACGAAATCA-ACAATAATTCTAA-A--TC----A-TA-----C-TCA-CAT-GTTCACGTAT-GC-AATG-TGTGT-GCGAGAAA-GC-ACG--------T-GCATT--GA-AATTCACC-TTTTTT-----C--AT--TA--G---ATACTGATC-GC-TACCATTA-T-AAGAT--TTCAATGATATATGT--TG------G--TACATAT--------T-AT-A--GAAAGCTACAA---TATA-------AGGTGAT--TCG-T-TG-T---GCAG-A--AG-CA-CATT----G----A-CACC--ACTT-TTT-AA-------------A--------------TG-GG--GG--AG-G--TTT--------GG------G-GAACA-TC-T-GTAACGGTCC-CCGTT---ATCTGTAACGGTCCCCGTTACA----ATT-AG-TACTAGTT
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                   TG-TATGC-GCGATAAG-GC-ACG--------T-GCATT--GG-AATTCACC---TTTT-----C--AT--TA------ATATTG-TC-AT-TAGCATTA-T-GAGAT--CTCAATGATACATAT--TA------G--TACAGTC--------T-TT-A--GGTAGCTAGAA---TATC-------A-ATGATTGTGG-T-TG-TG--GCAGCA--AG-CA-TATTC---G----A--ACC--AGTG-TTT-AATGGGGAGGGGAGGG--------------TG-GG--GG--GG-G--GTT--------GGGGTTGTG-GACCA-TC-C-GTTAC-GTCC-CCGT
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                    agcgtgcattgtcttTG-TATGC-GC-ATAAG-GC-AC---------T-GCATTTTGG-AATTCACC-TTTTTT-----C--AT--TA--C---ATATTGATCCAT-TAGCATTAAT-GAGAT--CTCAATGATACATAT--TA------G--TACAT-C--------T-ATTA--GGTAGCTAGAA---TATC-------AAATTTA--TGG-T-TG-T---GCAG-A--AG-CA-TATTC---G----A--ACC--A-TG-TTT-AA-------------ATGGGGAGGGGAGGGTG-GG--GG--GG-G--GTT--------GGGGTTGTG-GACCA-TC-C-GTTAC-GTCC-CC
gi|22                         :                                                              tcttTCT-TA---TATATAATGCAA----A-CGTT-A---TG-AAAT-T-TAG-ACTG----TA--GG-TA-T-------A-T--G-A--AACAA-A------TACCTGTTTAATGAAATCA-ACAATAATTCTAA-A--TC----A-AA-----T-TCA-CAT-GTTCGCGTAT-GC-AATG-TGTGT-GCAAGAAA-GC------------T----TT--GG-AATTCACC-CTTTTT-----C--AT--AA--G---ATATTGATC-GC-TTCCATTA-T-GAGAT--TTCAATGATATAc
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                acaatccGTGC-GCGAAAAG-GC-A---------------TT--GG-GATTGACC-TTCTTT-----C--AT--TA--G---ATATTAATC-AC-TAACATTA-T-GGAAT--TTCAATACCACATAT--TG------T--TACATAC--------T-AT-A--GAATGCTAGAT---TGTA-------AGATAAT--TGA-T-TT-T---GCAG-A--AG-CA-CATT----G----A-TCGC--ACAT-TTC-AA-------------A--------------TG-GG--GG--AT-G--TTT--------TC------G-AAACA-TT-C-GTAAC
gi|24                         :                                                                  TTT-TA---TGTTTGATGCAA----A-CATT-A---TG-AAAT-T-TAG-ACTG----AA--GG-TA-T-------A-T--C-A--TACTA-A------TGCCTGTTGAATGAAATCA-ACAAGAAATCTAA-A--TC----A-TA-----C-TCG-CAT-GTTAGCATAT-GC-ACTG-TGTGC-GCTAGAAC-GC-ATG--------T-GCATT--GG-AATTAACC-TTTTTT-----C--AT--tacacaagttacaat
gi|25                         :                                                          cacaatccTTT-TA---TGTTTGATGCAA----A-CATT-A---TG-AAAT-T-TAG-ACTG----AA--GGATA-T-------A-T--C-A--TACTA-A------TGCCTGTTGAATGAAATCA-ACAAGAAATCTAA-A--TC----A-TA-----C-TCG-CAT-GTTAGCATAT-GC-ACTG-TGTGC-GCTAGAAC-GC-ATG--------T-GCATT--GG-AATTAACC-TTTTT
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             acaatccTTA-T-GAGATATTCCAGTGACACATTT--TG------G--TAGATAC--------T-------GAAAGCTATAA---T-T--------AGATG----CGGAT-TGAT---GCAG-A--AG-CA-TATT----G----A-C-CC---CCT-GTT-AA-------------AT-------------TG-GG--GG--AT-G--TTTGGGGGGGGGG------G-GGACACTC-C-GTAATGGGAC-CT-TT--------TAA-----------ACA----ATT-AT-TACTAGT
gi|27                         :                                                                       A---TGTTTGATGCAA----A-CATT-A---TG-AAAT-T-TAG-ACTG----AA--GGATA-T-------A-T--C-A--TACTA-A------TGCCTGTTGAATGAAATCA-ACAAGAAATCTAA-A--TC----A-TA-----C-TCG-CAT-GTTAGCATAT-GC-ACTG-TGTGC-GCTAGAAC-GC-ATG--------T-GCATT--GG-AATTAACC-TTTTTT-----C--AT--
gi|28                         :                                                                       A---TGTATGATGCAA----A-CATT-A---TG-AAAA-T-TAG-ACTG----TA--GG-TA-T-------A-T--G-A--TACAA-G------TGGCCGTTGAACAAAATCA-ACAAACATTCTGA-A--TC----A-TA-----C-TCA-CAT-GTTCGCGTAT-CC-A
gi|29                         :                                                  caatcctcttatgtacTCT-TA---TGTATGATGCAA----A-CGTT-A---TA-CAAT-T-TAT-ACTG----CA--AG-CA-T-------A-T--G-A--TTCAA-A------TGCCTGTTGAATGAAATCA-ACAACAATTCTAA-A--TG----A-TA-----C-TCG-CAT-TTCCGAGTAT-GC-ACTA-TGTAT-TAGAGAAG-GC-ACG--------C-ACATT--GT-GATTCAgccgagccgaatctcaaccgcaattaggca
gi|3                          :                                                             aatttTCTGTA---TATATAA-GCAA----AACGTTTA---TG-AAAT-T-TAG-GATG----TA--GG-TAAT-------A-T--TTA--TACAA-A-------GCG-GTT-AACGAAATCA-TTAATAATTCTAATA--TC----A-TA-----TATCA--ATAGTTCGCATAT-GC-AATG-TGTGTTGCGAGAAA-TC-ACG--------T-GCTCT--GC-A-CTCTCT-CTCTCT-----C--A----A--G---ATATTGATC-GCATACCATTA-T-GAGAT--TCCAATAATATAT-T--TG------G--TACATAT--------T-AT-A--GAAAGCTA-CA---TAT--------AGGTGAT--TAT-C-TT-TTCAGCAG-A--AG--A-CTTT----C----A-CACCGTATTTATTA-AA-------------A--------------TGTGA--GG--AG-T--TTT--------AG------G-GAACA-TCTT-GTAACTGTCCACCGTT---A
gi|30                         :                                                                                                                                              cacatctc--TACAA-A-------GCCTGTTGCATGAAATGA-ACAACCATTTTAA-A--TT----A-TA-----C-TCC-TAT-ATCCGTGTAT-GCCATTA-TGTGC-ACGAGAAG-GC-ACG--------C-ACATT--GC-GATTCACT-TTTTTT-----C--AT--TA--A---ATATTGATC-AC-TACCGTTA-T-GAGAT--TTCAATGACACATcaagttaatacta
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             AT--TTCAATGATACATGT--TG------A--TACATAT--------T-AT-A--GAAAGCTAGAA---TATA-------AGATGAT--TGG-T-TG-T---GCAG-A--AG-CA-AATT----G----A-CACC--ACCT-TTT-AA-------------A--------------TT-GG--GG--GA-G--TTT--------GG------G-GAACA----C-GTAACGGTCC-CCGTT---A
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           cgcatacCATTA-T-GGAAT--TTCAATGA------------------------TAT--------T-AT-A--GAAAGCTACAA---TATA-------AGATGAT--TGG-T-TG-T---GCAG-A--AG-CA-TAGT----G----A-CACC--ATCA-TTT-AA-------------A--------------TG-GG--GG--AG-G--TTT---------G------G-GAACA-TT-C-GTAACGGTCC-CCGTT---Acgactagtact
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  CATTA-T-GGAAT--TTCAATGA------------------------TAT--------T-AT-A--GAAAGCTACAA---TATA-------AGATGAT--TGG-T-TG-T---GCAG-A--AG-CA-TAGT----G----A-CACC--ATCA-TTT-AA-------------A--------------TG-GG--GG--AG-G--TTT--------GG------G-GAACA-TT-C-GTAACGGTC-----------------------CCCGTTACA----ATA-AG-TACTAGTTcaataaagtactagtt
gi|34                         :                                                                                                                     CTG----TA--GG-TA-T-------A-T--G-A--TACCA-A------TGCCCACTGATCGAAATCA-ACAATAATGCTAA-A--TC----A-TA--------CA-CAT-ATT
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             -CA-TATT----G----A-CACC--ACTT-TTT-AA-------------A--------------TG-GG--GG--AG-A--TTT--------GG------G-GAACA-TC-C-GTAACGG-------------------AC----CCCGTTACA----ATT-AG-TACTgacaccactttttaaatgggggagatttggggaacatccgtaacggaccccgttacaattagtact
gi|35                         :      ctgtaggtatatgataccaatgcccactgatcgaaatcaacaataatgctaaatcatacaTCT-TA---TATATGATGCAA----A-CATT-A---TGAAAAT-T-AAG-ACGG----TA--GG-TA-T-------A-T--G-A--TACA-----------------GAA--AAA--A-ACAAAAAATCCTA-A--TC----A-TA-----C-TCA-CGT-ATTCGCGTAT-GC-ACTG-TGTGT-ATGAGAAG-G
gi|36                         :                                                                                                   cacaatccAT-T-TAG-ACTG----TA--GG-TA-T-------A-T--G-A--TACCA-A------TGCCCACTGATCGAAATCA-ACAATAATGCTAA-A--TC----A-TA--------CA-CAT-ATT
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAAGCTACAA---TATA-------AGATGAT--TGG-T-TG-T---GCAG-A--AG-CA-TAGT----G----A-CACC--ATCA-TTT-AA-------------A--------------TG-GG--GG--AG-G--TTT---------G------G-GAACA-TT-C-GTAACGGTCC----------------------CCCGTTACA----ATA-AG-TACTAGTT
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             -AT-A--GAAAGCAAAAA---TGTA-------AGCTGAC--TGG-T-TG-T---GCAT-C--AG-CA-CATT----C----A-CACT--ACTT-TCT-AT-------------ATC------------TG-GC--GG----------T--------AG------G-GAACA-TC-T-GTAACGGT-C-CCGTT---A
gi|39                         :                                                                                                                                                                                   AATCA-ACAA---TTCCAA----TC----A-TA-----C-TCA-CAT-AT------AT-GC-------GTGC-ACGAGAAG-GA-ACG--------C-GCATT--GC-AATTCACT-TTTTTT-----TAAAT--AA--G---ATATTGATC-AC-GACCATTA-T-GAGAcaataagcactag
gi|4                          :                                                                  TCT-TA---TATTTGATGCAA----A-CATT-C---TG-AAAT-T-TAG-ACTG----TA--GG-TA-A-------A-T--G-A--TACAA-A------TGCCCGTTGATCAAAATAA-AAAAAAATTCTAA-A--TC----A-TA-----C-TAA-CAT-GTTCGCGTAT-GC-ACTA-TGTTA-GCGAGAAG-GC-ACG--------T-GCATT--GG-GATTCACC-TTTTTC-----C--AT--TA--G---ATATTGATC-GC-GAACATTA-T-GAGAT--TTCAATGATACATGT--TGGTACATG--TACATAT--------T-AT-A--GAAAGCTAGAA---TATA-------AGATGAT--TGG-T-TA-T---ACAG-A--AG-CA-CATT----G----A-CACC--ACTT-TTT-AA-------------A--------------TG-GG--GG--TG-G--TTT--------GG------G-GAACA-TC-C-ATAACGGTCC-CCGTT---A
gi|40                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ataatcaTTA-T-GAGAT--TTCAAAGACACATTT--TG------G--TACATAC--------C-AT-A--GAAAGCTAGAA---TGTA-------AGATGAA--TGG-T-TG-T---GCAT-A--AA-CA-CATcaatttgtactag
gi|41                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             aatgttggtcctttatacaacttTA-------AGATGAT--TGG-T-TG-T---GTTG-A--AG-CT-CAAT----G----A-AAC----CTTATTT-AT-------------C--------------TG-GG--TA--AC-G--TTT--------GG------A-GATCA-TC-T-TTAACGACCC-TCCTT---ATa
gi|42                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TGAT--TGG-T-TG-T---GCAG-A--AG-CA-CATTCATTG----A-GACC--GCTT-TTT-AA-------------A--------------TG-GG--GA--AA-G--TTT--------TG------G-AAACA-TC-C-GTAACGGTCaattagaact
gi|43                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     A-------AGATGAT--TGG-T-TG-T---GCTT-C--TG-CA-CATT----G----A-CACC--ACTT------------------------------------G-GG--GG--AG-G--TTT--------GG------G-GAAAA-TC-C-GTAACGGTCC-CCTTT---Atttggaacattc
gi|44                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     A-------AGATGAT--TGG-T-TG-T---GCTT-C--TG-CA-CATT----G----A-CACC--ACT------------------------------------TG-GG--GG--GG-----TT--------GG------G-GAAAA-TC-C-GTAACGGTCC-CCTTT---Acaataagtacta
gi|45                         :                                                                                                          cAT-T-TATTACTG----TA--AG-C------------T--A-A--TACAA-ACGTTCATGCCTGGTGAATGAA-TTA-ACAAAGATTCTAA-AATTC----A-TA-----C-GCA-CAcaataagtacta
gi|46                         :                                                              atacacT-TA---TATGTGATGCAA----A-CGTT-A---TG-AAAT-T-TAG-ACTGTACATA--GG-TA-T-------A-T--G-A--TACAA-A------TGCCTGTTTAA
gi|47                         :                                                    cacaatcatcttagTCT-TACAATGTATGATGCAA----A-CATT-A---TG-AAAT-T-TAG-AATG----AA--GG-TA-TACCGTAAA-T--G-A--TACAA-A------TGTCCG
gi|48                         :                                                         ccacaatccTCT-TA---TACATAATGCAA----A-CGTT-A---TA-AAAG-T-TAG-ACTG----TG--GG-TA-T-------A-T--G-A--TACAA-A------TGCCTGTTTAA
gi|49                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      atcc----A-CAC---ACTT-TTT-AA-------------A--------------TG-GG--GA--AG-G--TTT--------GG------G--AACA-TC-T-GTAACGGTC-----------------------CTCGTTACA----ATTCAG-TACTAGT
gi|5                          :                                                                  TCT-TA---TATATGATGCAA----A-CATT-A---TG-AAAT-T-TAG-ACTG----TC--GA-TA-T-------A-T--G-A--TACAA-A------TGCCTGTTGAACGAAATCA-ACAATAATGATAA-A--TC----A-CA-----C-TCA-CAT-GTTCGCGTAT-GC-ACTG-TGTGT-GCAAGAAG-GA-ACA--------T-GCCTT--GG-AATTAACC-TTTT-T-----C--AT--TA--G---ATATCGATC-GC-TACCATTA-T-GAGAT--TTGAATGATACATAT--TG------G--TATATAT--------T-AT-A--GAAAACTACAA---TATA-------AGATGAT--TGG-T-TG-T---ACAG-A--AG-CA-CATT----G----A-CACC--ACTT-TTT-AA-------------A--------------TG-GG--GG--AG-G--TTT--------GG------G-GAACA-TC-C-GTAACAGTCC-CCGTT---A
gi|50                         :                                                                atccT-TA---TATATAATGCAA----A-CGTT-A---TG-AAAT-T-TAG-ACTG----TA--GG-TA-T-------A-T--G-A--TACAA-A------TGCCTGaaattagtacta
gi|51                         :                                                              caatcct-TA---TGTGTGATGCAA----A-CATT-A---T--AAAT-TGTAT-ACTG----TA--GG-CA-T-------A-T--G-A--TACAA-A------TGCCTG
gi|52                         :                                                                                                               ctcttaaTG----TG--GG-CG-T-------A-T--G-A--TGCGA-A------TGTCTGCTGAACTATATCA-GCAAAAATGCCGA-A--TC----AATA-----C-TCA-CA
gi|53                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       CTT-TTT-AA-------------A--------------AA-AG--TG--GGCG--CTT--------GG------G-AAACT-TA-C-ATAGCAGTCC-CCGTT---A
gi|54                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      G-A--GG-CA-CAAT----G----A-CACC--ACTT-TTT-AA-------------A--------------TG-GA--CT--GC-G--TTT--------GG------T-GAGAA-TC-C-GTAACGGACC-TCcaagttgaactaat
gi|55                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tATT----G----A-CACC--ACTT-TTT-AA-------------T--------------TG-GG--AG--AA-G--TTT--------GG------G-GAACA-TC-T-GCAACGGTCC-TCGTT---A
gi|58                         :                                                                  TCT-CA---TGTATAATGCAA----A-CCAT-A---TG-GTAT-C---------------------A-T-------A-T--G-A--TACAA-A------TGCCTGTTGAACcaat
gi|59                         :                                                             gatttTCT-TA---TGTGTGATGCAA----A---------------------------------------TA-T-------A-T--G-A--TACAA-A------TGCCTGTTGAAC-AAATTA-
gi|6                          :                                                               taatcc-TG---TGTATGATGCAATATTA-CATT-G--------AT-T-CAT-ACTG----CA--G--TA-T-------A-T--G-A--TTCAA--------TACTT-TGGAAC---ATCATACC-GAATGCTAC-A--TTTTTTG-TAAGTGGC-GAA-AAG-GT--GCCCAT-GC-AATGATGCGT-GTATGAGT-GC-ACG--------T-GCAT---GC-AATTAAC--TTTTAA-----A--AT--TA--G---ATATTAACT-G--TACCTTT--T-GA-AT--TTCAATGACACAATT--TG------GAGTACATAA--------T--C-A--AAAAGCTAGAA---TGTA-------AGAT-AT--AAA-T-AT-T---ACAG-A--AG-CA-CATC----G----A--ACC--G-----TT-GG-----------------------------G-GGTTGG--GGTG--TTT--------GGAGC---G-GAACA-TC-C-GTAACGGTCC-
gi|61                         :                                                                           ctttcGATGCAA----A-CATT-A---TA-AAAT-A-TAT-ACTG----TA--GG-AA-T-------A-T--G-A--TACAA-A------TGCCTTTTAAAttacaactaaagcta
gi|62                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             -CA-CATT----G----A-CACC--ACTT-TTTTAA-------------A--------------TA-GG--GG--AG-G--TTT--------GG------G-GAACA-TC-T-GTAACGG
gi|64                         :                                                                                                                                                                                                 TCTAA-A--TC----A-TA-----A-TCA-CAT-GTTCGCGTAT-GC-ACTG-TGTGT-GCG
gi|65                         :                                                                                                                                                                                 GAAATCA-ACAAAAATTCTGA-A--TC----A-TA-----C-TCG-TAT-G
gi|66                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       AACGGTCCCCATTACA----ATT-AG-TACTAGTT
gi|7                          :                                                                                  TGCAA----A-CATT-G---TG-AAAT-T-TAG-ACTG----TA--GA-TA-T-------A-T--G-A--TACAA-A------TGCCTGTCGAAAGAAATCA-ACAAAAATTCTAA-A--TC----A-TA-----C-TCA-CAT-GTTTGCGCAT-GC-ATTG-TGTGC-GCGAGGAG-GC-ACG--------T-GCAAT--GG-AATTCATC--TTTTT-----C--AT--TA--G---ACATTGATC-AC-TAACATTA-T-GAGAT--TTCAATGATATATAT--TG------G--TAC-TTC--------TAAT-A--GAAAGCTAGAA---TATA-------AGATAAT--TGG-T-TG-T---TCAG-A--AG-CA-TATT----G----A-CACC--ACTT-TTT-AA-------------A--------------TG-GG--GG--AG-G--TTTG-------GG------G-GAACA-TC-T-GTAACGGTCC---------A--------------CGTTACA----ATT-AG-TACTAGtcttt
gi|8                          :                                                                        ---TGTGTGATGCAA----A-TATT-G---TA-AAAT-T-TAT-ACTG----T---GG-CA-T-------A-TCGG-A--TACTA-A------TGCCTGTTGAACGAAATCA-GCAAAAACTCCAA-A--TC----A-TA-----C-CCA-CAT-GT-------------CTG-CGTGC-ACAAGAAG-GC-ACG--------C-GCATT--GC-GATTCACC-TTCCTT-----C--CT--TA--G---ATATTGATC-AC-TACCATTA-T-GAGAT--TCCAATGACACAATT--TG------G--TACATAC--------T-A--------AGCTAGAG---TGTA-------AGATGAT--TGG-T-TG-T---GCAG-A--AG-CA-CAGT----G----A-CACC--ACTT-TTT-AA-------------A--------------TG-GG--GG--AG-G--TTT--------GG------G-GAACA-TC-C-GTAACGGTC-----------------------CCCGTTGCA----ATT-AG-TACTA
gi|9                          :                                                              tcttctT-TA---TGTATAATGCAA----A-CATT-G---TG-AAAT-T-TAA-ACAG----TA--GG-TA-
gi|9                          :                                                                                                                                                             cacaatcttgCCTGTTGAAGGAAATCA-ACAAAAATTCTAA-A--TC----A-TA-----C-TCA-CAT-GTTCGCGTAT-TC-ATTG-TGTGC-GCGAGAAG-GC-ACG--------T-GTATT--GA-AATTCACC--TTTTT-----C--TT--TA--G---ATTGTGATC-AC-TACCATTA-T-GATAT--TTCAATGATACATAT--TG------G--TACAT-C--------TAAT-A--GAAAGCTAGAA---CATA-------AGATAAT--TTG-T-TG-T---GCAG-A--AG-CT-TATT----G----A-CACC--A-TT-TTT-AA-------------A--------------TG-nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncctgttgaaggaaatcaacaaaaattctaaatcatactcacatgttcgcgtattcattgtgtgcgcgagaaggcacgtgtattgaaattcacctttttctttagattgtgatcactaccattatgatatttcaatgatacatattggtacatctaatagaaagctagaacataagataatttgttgtgcagaagcttattgacaccatttttaaatg