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Reference ( gi|13 )           :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             AAATTTAC--ATG--G-CC-GCAAGCC--AT--TA-AT-A-T--G----T--C------T--A-T-TTTTGGCC--GTA-A---A-A---------C-----ATC---ACA-AAGATTGCTTTG-ATTTT------A-GCA-GAC-AC---C--ATG----AACATT-GGCAA-T--------------T-ACG---CT----T-TT---GAGACT--GCT----TCT-G-TT-------CAC--AA---A---TGA-ATCCAAG-TT---TT-GTGT-G---C-A-T--T-T--TCA--TCAT--A-AT-C-C---T------CAG-CGT--G-T------------GT--G-GCGC-TA-G-AA--AA---GTGA-A-C--G----A--T----A--T-CA-GGA-ATG--TT-G--C---ATT-G--C-TGA-G--C-AT-A-A--TCGCTTT---GATG---GATCG-------T-CT-A--TC-A-TTG-TTTGTG-ACG-G--T--G--TG-TTT--C-GATGG--CTTT-G-CAG-TG--AAA--AG-TGCACCAA--T--TGTTGGC--TTGT-GGGCATGAATATTT
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gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            cAAATTTGC--ATG--C-CC-ACAAGCC--AA--CA-AT-G-G--G----T--C------C--A-G-TTTTCACC--GTA-A---A-AAC-------T-----ATCGAAACA-AAac
gi|11                         :                                                          caaatttacatgtcagccagccatgaatatgtctatgttttgacgtaggacatcacaagcttgctttgattttagcagacaccatgagcattggcaattacgcttttgagactaattctgttcacaaatgaatccacgttttgtctggattttcatcatcatcttcagcctgtgttgcgctagaaaatgaacgatatcaggaatgttgcattgctgagcataatcgttttggtggagggtctatcattgtttgtgacggAAACTTAC--ATG--T-CC-GCCAGCA--AT--GA-AT-A-T--G----C--C------T--A-T-GTTCGACC--GTA-A---G-A---------C-----ATC---AAA-AAGCTTGCTTTG-ATTTT------A-GCA-GAC-AC---C--ATG----AACATT-GGCAA-T--------------T-ACG---CT----T-TA---GAGACT--GCT----TCT-A-TT-------CAC--AA---A---TGA-ATCAAAG-TT---TT-GTGT-G---G-A-T--G-T--TTA--TCAT--A-AT-C-G---T------TAG-CGT--G-T------------GT--G-GCAC-TT-G-AA--AA---ATGA-A-C--G----A--T----A--T-CA-GGA-ATT--TT-G--C---GAT-G--C-TGT-G--C-AT-A-A--TCGCTTT---GGTG---GA--G-------T-CT-A--TC-A-TTG-TTTATG-ACG-G--T--G--TG-TTT--C-AATAG--TTTT-A-CGG-CG--AAA--AC-TTGACCAA--A--TGATGGC--TTGT-GGGCATGCAAATTTac
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            cAAATTTGC--ATG--C-CC-ACAAGCC--AT--CA-TT-T-G--G----T--C------A--A-G-TTTTCGCC--GTA-A---A-A---------C-----ac
gi|15                         :                                              caaacttacatgtccgccagcaatgaatatgcctatgttcgaccgtaagacatcaaaaagcttgctttgattttagcagacaccatgaacattggcaattacgctttagagactgcttctattcacaaatgaatcaaagttttgtgtggatgtttatcataatcgttagcgtgtgtggcacttgaaaaatgaacgatatcaggaattttgcgatgctgtgcataatcgctttggtggagtctatcattgtttatgacggtgtgtttcaataAAAATTGC--ATA--C-CC-ACAAGCC--AA--CA-AT-T-G--G----T--C------C--A-C-TTTTCACT--GTA-A---A-GC--------C-----ATC---ac
gi|6                          :                                                           aatgtacatatccacaagccatggacatgtctatgtttgacatcataaagcttgctttgattttagcagacaccatgaacatttgcaattacacctttgagactgattttgctcagaaatgaatccaagttttgtgtggattttcataatgatcgccagcatgtgtggtggaagaaaatgaacgatatcagtaatattgcattgctgagcataatcgctttggttgacggcctatcattgtttgcgacggtgtgtttcAAATTTAC--ATG--T-CC-GTTAGCC--AT--GA-AT-A-T--GACTATAGC------T--A-T-GTGTGACC--GTA-A---G-A---------C-----ATC---ACA-AAGCTTGTTTTG-ATTTT------A-GCA-CAC-AC---T--ATG----AACATT-GGCAA-T--------------T-ACG---AT----T-TT---GAGACT--GAT----TCT-G-TT-------CAC--AA---A---TGA-ATCCACG-TT---AT-GTGT-G---G-A-T--T-T--TTA--TCAT--A-AT-C-G---T------CAG-CGT--G-T------------GT--A-GCGC-TA-G-AA--AA---ATGA-A-G--G----A--T----A--T-CA-GGA-ATG--TT-A--C---ATT-G--C-TGA-G--C-AT-A-A--TCGCTTT---GGTG---GAGGG-------T-CT-A--TC-A-T---TTTGTG-ACG-G--T--G--TT-TTT--C-GATAG--TTTT-A-CGG-CG--AAATCAG--G-ACCCA--T--TATGGGC--TTGT-GGGCAAGCAAATTTac
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            cAAATTTGC--TTG--C-CC-ACAAGCC--CA--TA-AT-G-G--G----T--C------CTGA-T-TTC--GCC--GTA-A---A-A---------CT----ATC---GAA-AAac
gi|14                         :                                                 caaatttacatgtccgttagccatgaatatgactatagctatgtgtgaccgtaagacatcacaaagcttgttttgattttagcacacactatgaacattggcaattacgattttgagactgattctgttcacaaatgaatccacgttatgtgtggatttttatcataatcgtcagcgtgtgtagcgctagaaaaatgaaggatatcaggaatgttacattgctgagcataatcgctttggtggagggtctatcattttgtgacggtgtAAATGTAC--ACG--T-TT-GCAAGCC--AT--TA-AC-A-T--G----C--T------T--A-T-GTTTGACC--GTA-A---G-A---------C-----ATC---GCA-ATGCCTGCTTTA-ATTCT------A-GCA-GAC-AC---C--ATGCATGGACATT-GGCAA-T--------------T--------------------GAGACT--GAT----TCT-G-TT-------CAC--AA---A---TGA-ATCCAAG-TT---T--ATGA-A---A-A-C--T-T--TCA--TCAT--G-AT-C-G---T------CAG-CGC--G-A------------AT--G-GCGC-CA-G-AA--AA---ATGA-A-C--G----A--T----A--T-CA-GAA-ATG--TT-T--T---ATT-G--C-TGA-G--C-AC-A-A--TCGCTCT---GGTG---AAGTG-------T-CT-A--TC-A-TTA-TTTGTG-ATG-G--T--A--TG-TTT--C-GATGG--CTTT-A-CGG-TT--AAA--AG-TGGACCAA--T--TGTAAGC--TTGT-GGGCATGac
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             AACTTTGC--ATG--C-CC-ACAAGC----T--TA-CA-A-TTGG----T--C------C--A-C-TTTTAACC--GTA-A---A-GC--------C-----ATC---caaagttac
gi|5                          :                                                      aaatgtacacgtttgcaagccattaacatgcttatgtttgaccgtaagacatcgcaatgcctgctttaattctagcagacaccatgcatggacattggcaattgagactgattctgttcacaaatgaatccaagtttatgaaaactttcatcatgatcgtcagcgcgaatggcgccagaaaaatgaacgatatcagaaatgttttattgctgagcacaatcgctctggtgaagtgtctatcattatttgtgatggtatgtttcAAATT-AC--ATG--T-CA-GCA-GCC--AT---G-GT-A-T-------T--C------T--A-T-GTTTGACC--GTA-A---GGA---------C-----A-C---ACA-AAGCTTGCTTTG-ATTTT------AAGCA-GAC-AC---C--ATG----AGCATT-GGCAA-T--------------T-ACGTCGCT----T-TT---GAGACT--GAT----TCT-GGTT-------CACGAAA---A---TGA-ATCCACG-TT---TTTGTCT-G-----G-T--T-T--TCA--TCATC-A-AT-C-T---T------CAG-CAT--G-T------------GT--TTGCGC-TAAG-GA--AA---ATGA-AAC--G----A--T----AGTC-CA-GGA-ATG--TTTG--C---ATT-GGCC-TGA-G----AT-A-A--TCGCTTTTT-GTTG---GATGG-------T-CT-A--TC-A-TTGGTTTGTG-ACGTG--T--G--TG-TTTTTC-GATAG--TTTT-A-CGG-TG--AAA--AC-TGGACCAA--T--TGTTGGC--TTGT-GGGCATGCAAATTTac
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           tcAAATTTGC--ATG--C-CC-ACAAGCC--AA--CA-AT-T-G--G----T--C------C--A-G-TTTTCACC--GTA-A---A-A---------CT----ATC---GAA-AA
gi|16                         :                                   tcaaattacatgtcagcagccatggtattctatgtttgaccgtaaggacacacaaagcttgctttgattttaagcagacaccatgagcattggcaattacgtcgcttttgagactgattctggttcacgaaaatgaatccacgtttttgtctggttttcatcatcaatcttcagcatgtgtttgcgctaaggaaaatgaaacgatagtccaggaatgtttgcattggcctgagataatcgctttttgttggatggtctatcattggtttgtgacgtgtgtgtAAATTTGC--ATG--C-CC-ACAAGAC--AA--CA-AT-T-G--G----T--C------G------TTTTCACC--GTA-A---A-A---------
gi|18                         :                                                    aacatgtcagccagccagaatatgtctatgtttgaccgtacggacatcacaaagctggctttttattttagcagacaccatgagcatttggcaatttacgcttttgagacttgattctgttcacaaatgaatccacgttttgtctggatttttcaatcactcagcgctaagaaaatgaacgatatcatgaatgttgcattgcttgagcataatcgctttggtgagggtctgatcattgttttgtgacggtttgtgtttcgatagtAAGTCTAC--ATT--G-TCAGCA-GCC--AC--GA-TT-G-C--T----T--T------T--A-T-GTTTGATC---TA-ACG-ACA---------C-----ATC---CAA-AAGCTTGCGT-G-ATTT-------A-GCAAGAC-ACA--C--ATG----A-CATT-GGCAT-T--------------T-ACG---CT----T-TT---GAAACT--GCT----TCTTG-TT-------CAC--AA---A---T---ATCAAAG-TT---TT-GTGT-G---A-AAT--TAT--TCA--TCAT--A-AT-A-CGGAT------CAG-AGT--GAT------------GA--G------TA-G-AA--------TGA-A-C--G----A--T----A--T-CA-GGA-ATG--TT-G--C---ATTTG--C-TGA-G--C-ATCA-A--TTGCTT----GGTG---GAGGG-------T-CT-A--TC-AATTG-TTTGTG-ACG-G--T--G--TG-TTT--TAGATAG--TTTT-G-CGG-CG--AAA--AC-TGAAAC----T--TGTAGGC--TTac
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             AAAATTAC--ATG----TC-GCTAGCA--AT--GA-TTCA-TTGG----C--C------T--A-T-GTTTGACC---TA-A---G-A---------C-----ATC---ACC-AAGCTTGCTTTG-ATTTT------A-GCA-GAC-AC---C--ATGT---AAC-TT-GGCAACT--------------T-ACG---CT----T-TT---GAGATT--GCTTTTGTCT-G-TT-------CGC---A---A---TG--ATCCAAG-TT---TT-GTGTGG---A-A-T--T-T--TTA--TCAT--A-AA-T-G---T------CAG-CAA--G-T------------GT--G-ACAC-TA-A-AACCCA---TTAA-A-C--AGTTTA--T----A--T-CAGGGA-ATG--TT-G--G---GGT-G--C-TGG-G--CAAT-ACA--TCGCTTT---GGTG---GA-GG-------G-AT-A--TCAA-TTG-TTTG-G-ACG-G--T--G--TG-TTT--CAAATAGTACTTTAA-CGGCCG--AAA--AATTGGATCAACTT--TG-TGGC--TTGT-GG
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            cAAAATTAC--ATG----TC-GCTAGCA--AT--GA-TTCA-TTGG----C--C------T--A-T-GTTTGACC---TA-A---G-A---------C-----ATC---ACC-AAGCTTGCTTTG-ATTTT------A-GCA-GAC-AC---C--ATGT---AAC-TT-GGCAACT--------------T-ACG---CT----T-TT---GAGATT--GCTTTTGTCT-G-TT-------CGC---A---A---TG--ATCCAAG-TT---TT-GTGTGG---A-A-T--T-T--TTA--TCAT--A-AA-T-G---T------CAG-CAA--G-T------------GT--G-ACAC-TA-A-AACCCA---TTAA-A-C--AGTTTA--T----A--T-CAGGGA-ATG--TT-G--G---GGT-G--C-TGG-G--CAAT-ACA--TCGCTTT---GGTG---GA-GG-------G-AT-A--TCAA-TTG-TTTG-G-ACG-G--T--G--TG-TTT--CAAATAGTACTTTAA-CGGCCG--AAA--AATTGGATCAACTT--TG-TGGC--TTGT-GGcagtgccaaatttacc
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            cAAATTTAC---TA--GTCC-GCCAGCC--AT--GA-AT-A-T--G----T--C------T--A-T-GTTTGACC--GTA-G---G-A---------C-----ATC---ACA-AATCTTGCTTTG-ATTTT------A-GCA-GAC-GC---C--ATG----AACACT-GGCAA-T--------------T-ACG---CT----T-TT---GAGACcagtgccaaatttacc
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           tcAAGTTTACCAATG--T-CA-GCA-GCCCTAT--GA-ATTA-T--G----T--CGCTCTAT--A-T-GTTTGACCTGGTA-G---G-ATCGATTTCGC-----CTC---ATATAGGCTTGCTTT---TTTTCTCTACG-CCA-GAC-GC---CGAATC----AAGGTT-GGCAA-TGCAGCAATTGGCATT-ACT---CTATTTT-TT---GAGACT--ACGGA--TCT-G-TT-------CAC--AA---AAATTGA-ATCCACG-TTCTATT-GTCT-G---GGA-T--T-T--TCAAATCAT--C-AT-C-T---T------CAG-CGT--G-T------------GT--A-GCGC-TA-GTAG--AAATTGTGA-A-C--G----AGTT----C--T-CG-GGATATGTTTT-GCTC---ATT-G--C-TGA-AGTC-AT-A-ACTCCGCTTG---AGTGCGCGGT-G-------T-CT-ATGTC-A-TGA-GTTGTGTACG-GA-T--G--T--TTC--C-GATAG--TTTT-ATCGG-TGATAAA--AC-TG-GCCAA--TTGTGTTGACTTTTGT-GGGCA
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            aAAATTTAC--ATG--T-TC-GCAAGCC--AG--GA-AT-A-T--G----T--C------G--A-T-GTTTGACT--GTgcaagcatttac
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AATGTAC--ATA--T-CC-ACAAGCC--AT--GG-AC-A-T--G----T--C------T--A-T-GTTTG---------------A---------C-----ATC---ATA-AAGCTTGCTTTG-ATTTT------A-GCA-GAC-AC---C--ATG----AACATT-TGCAA-T--------------T-ACA---CC----T-TT---GAGACT--GAT----TTT-G-CT-------CAG--AA---A---TGA-ATCCAAG-TT---TT-GTGT-G---G-A-T--T-T--TCA--TAAT--G-AT-C-G---C------CAG-CAT--G-T------------GT--G-GTGG-AA-G-AA--AA----TGA-A-C--G----A--T----A--T-CA-GTA-ATA--TT-G--C---ATT-G--C-TGA-G--C-AT-A-A--TCGCTTT---GGTT---GACGG-------C-CT-A--TC-A-TTG-TTTGCG-ACG-G--T--G--TG-TTT--C-GATGG--CTTT-A-CAG-TG--AAA--AG-TGGACCAA--T--TGTTGGC--TTGT-GGGTATGCA-ATTT
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AATTTAC--ATA--T-CC-GCAAGCC--AA--AA-AT-A-T--G----T--C------T--A-T-GTTTGACC--ATA-A---A-A---------T-----ATC---GCA-ATGCTTGTTTTG-ATTTT------A-GCA-GAC-AC---C--ATT----AACATT-GGCAA-T--------------T-ACA---CC----TACT---GAGACT--GAT----TCT-G-TT-------CAC--AA---A---TGA-ATCCAAG-TT---TT-GTGT-G---G-A-C--A-T--TCA--TCAT--G-AT-C-G---T------CAG-CGT--G-T------------GT--G-ACGC-CA-G-AA--AA---ATGA-A-C--G----A--T----A--T-CA-AGA-CTG--TT-G--C---ATC-G--T-TGA-G--C-AT-G-A--TCGCTTT---GGTG---GAAGG-------T-CT-A--TC-A------TTGTG-ATG-G--TACG--TG-TAT--C-GATGG--CTTT-A-CGG-TC--AAA--AG-TGGACCAA--T--tac
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AATCTAC--ATG--T-CC-GCCAGCC--AC--GA-AT-A-T--G----T--T------T--A-T-GTTTGgggcaatcaaatttac
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ATTTAC--CAG--T-CT-GCCAGCC--AT--GAGAT---T--G----T--C------T--A-T-GTTTGACC--GTA-GG--A-A---------C-----ATC---ACA-AAGCTTGCTTTG-ATTTTT-----A-GCA-GAC-AC---C--ATG----AACATT-GGCAA-T--------------T-ATG---C-------TT---GAGACT--GCT----TCTCG-TT-------CAC--AA---A---TGA-ATCCAGGTTT---TT-TTCT-G---G-A-T--T-T--TCA--TC------AT-C-T---T------CAG-CGT--G-TG-----------GT--G-GCGC-T--G-AA--AA---TTAA-A-CT-G------------A--T-CA-GAA-ATG--TT-G--C---ATT-G--C-TGA-G--C-AT---A--TC-TTTT---GGTG---GTGGG-------T-CT-A--TC-A-TTGTTTTGTG-ACG-G--T--G--GT-TTT--C-GATAG--TTTT-A-C-G-TG--TTA--AA-CGGACCAA--T--TGTTGGCT-TTGTGGGGCATAAatca
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tcacTTAC--ATGTCG-CCCGC---CC--ATGACA-AT-AAT--G----T--C------T--AATGTTTTGACC--ACG-ACCCA-A---------CCTAGGATC---A-A-AAGCTTGATT-G-AATTG------A-GCA-GCCCACTCGC--AC-----AGCATT-G-CAC-T--------------T-ACG---CT----T-TTTTCGAACCTCGATT----TCT-G-TT-------CAC--AACCCA---TGACACTCCCT-TC---TT-GTCT-GG--C-A-C--T-C--TAG--TAAT--ACATAT-T---T------CAG-CGTAAG-TCACAAATCCATGGT--T-GCGCATACG-CA--AAC--ATAG-A-C--G----A--T----A--TGCA-G-A-ATG--TT-G--CCCAATT-GGAC-TGAAG--C-AT-A-A--TCGATTT----ACA---G-TCGGAAGAGGTACT-AC-TC-A-TAG-TTGATG-ACG-G--T--GACTGGTTT--C-GATG---TTTT-A-CAGGTG--ACA--AT-TGGAC-AA--T--TGTTGGC--TTGT-GGGCtgcaaatttac
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TTGC--A-G--C-CC-ACAAGCC--AA--CA-AT---T--G----T--C------C--A-A-TTGTCACCT-GTA-A---A-A---------C-----ATC---tgcaa
gi|16                         : ttacatgtcgcccgcccatgacaataatgtctaatgttttgaccacgacccaacctaggatcaaaagcttgattgaattgagcagcccactcgcacagcattgcacttacgcttttttcgaacctcgatttctgttcacaacccatgacactcccttcttgtctggcactctagtaatacatatttcagcgtaagtcacaaatccatggttgcgcatacgcaaacatagacgatatgcagaatgttgcccaattggactgaagcataatcgatttacagtcggaagaggtactactcatagttgatgacggtgactggtttcAC--ATG--T-CA-GCCAGCC--AG---A-AT-A-T--G----T--C------T--A-T-GTTTGACC--GTACG---G-A---------C-----ATC---ACA-AAGCTGGCTTTTTATTTT------A-GCA-GAC-AC---C--ATG----AGCATTTGGCAA-T--------------TTACG---CT----T-TT---GAGACTT-GAT----TCT-G-TT-------CAC--AA---A---TGA-ATCCACG-TT---TT-GTCT-G---G-A-T--T-T--T----TCA-----AT-CAC---T------CAG-CG---------------------------C-TA-A-GA--AA---ATGA-A-C--G----A--T----A--T-CA-TGA-ATG--TT-G--C---ATT-G--CTTGA-G--C-AT-A-A--TCGCTTT---GGT----GAGGG-------T-CTGA--TC-A-TTGTTTTGTG-ACG-GTTT--G--TG-TTT--C-GATAGT-TTTT-A-CGG-TG--AAA--A--CG-ACCAA--T--TGTTGTC--TTGT-GGGCATGCAAATTT
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            aC-AC---C--GAC----AACATTAGGCAA-TACTAA---------C-ACA---TT----T-TT---GAGACA--GCT----TCTTG-ATAAAACAACA---AA---A---TGA-ATCCAAG-TT---TT-CTGT-GCCCC-A-TCAC-TGATCA--TCATCAA-AT-C-C---TTCGAGACAGCCGT--GAT------------GTAAG-GCGC-TA-G-AT--AA---ATGATA-CGAG----A--TAATAA--T-CA-GGA-ac
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              -AC---C--ATG----ATCATG-GGCAG-T--------------T-ACG---AT----T-TT---GAGACT--GCT----TCT-G-TT-------CAC--AA---A---taattctaaataatctatatcgactgagtaacaatactagtaaaaattcgctttggttggacggaggatctaagtatttccagtagttgaggtacggtgatagattatcgatagcttttgcgacggtcataagaacttgaagtaaccaaggtgattggct
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ----TCT-G-TT-------CAC--AA---A---TGA-ATCCAAG-TT---TT-TTGT-T---G-A-C--T-T--TCA--TCAT--G-AT-C-A---T------CAT-CGT--G-T------------GA--G-GCGC-CA-G-AA--AA---AAGA-C-C--A----A--T----A--T-CA-GGA-CTG--TT-G--C---ATT-G--C-TGA-G--
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               CT-G-TT-------CAC--AA---A---TGA-ATCCAAG-TT---TT-GTGT-G---
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    -CAT--G-T------------AT--G-GCGC-CA-G-AA--AA---ATAA-A-C--G----A--T----A--T-CG-GGA-ATG--TT-G--C---AAT-G--C-TGA-G--C-AT-A-A--
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       -TTG-TTTGTG-ACG-G--T--G--TG-TTT--T-GATAG--TTTT-G-CGG-CG--AAA--AC-TGGACCAA--T--TGTAGGC--TTGT-GGGCATG
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              --AAA--AC-TGGACCAA--T--TGTTGGC--TTGT-GGGcaaat
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ACCAA--T--TGTTGGC--TTGT-GGGCGTGGAAATTTt

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lowQualScore                  :             ..  . .... .  .    ..    ..  . . .. .... .. ......  .     .    ...  . ... . ......... ..... ..     .            .     ...... .   .   .  ... ..   ....      .     . .............. .   ...  .... .  ...      .. . ....   . .  .......   ..  ... ...   .     . .  ...  .     ............ .  .    ..    .....  . ... ......   .   .. . ............  .. .    .  . .  ..  .....   . . .. .... .. .... .. .  .  ......... .   ..  . .. ...   . .. .   . .. . .......... . . ....       ... ..  ..... .   . .  .  . .......  . .   .      ..   . .. .. .. .. .  . .. .     . ..   . . . .  .........        .....     .. ..       ..    .    ... .  .   ..    
lowQualScore                  :             88  0 2222 7  0    88    88  0 0 55 2222 88 888888  0     0    666  2 111 2 111111111 66666 11     2            2     666666 2   2   0  555 88   2222      0     0 88888888888888 0   555  2222 0  555      00 1 2222   7 9  2222222   66  333 333   0     2 0  555  0     222222222222 1  1    99    00000  1 222 111111   0   88 0 222222222222  88 0    0  0 0  55  66666   0 0 88 5555 88 2222 88 0  0  000000000 0   55  0 88 555   0 55 0   0 88 2 2222222222 1 2 4444       999 11  66666 2   2 2  2  2 5555555  4 1   3      00   1 00 99 00 99 1  1 99 3     3 88   2 1 1 1  888888888        88888     99 66       55    1    999 4  4   11    
consensus                     :     AAATTTAC--AT-G---TCCGCNAGCC--ATGA--AT-A-T--G----T--C------TA-TGTTT-GACC--GTA-A---G-A---------C-----A--TCACA-AAGCTTGCTTTG-ATTTT------A-GCA-GAC-AC---C--ATG----AACATT-GGCAA-T--------------T-ACG---CT----T-TT---GAGACT--GCT----TCT-G-TT-------CAC--AA---A---TGA-ATCCAAG-TT---TT-GTGTG----------G-A-TT-TTCA--TCAT-A---AT-CG--T------CAG-CGT--G-T------------GT--G-GCGC-TA-G-AA--AA-A---TGA-A-C--G----A--T----A--T-CA-GG---------A-ATG--TT-G--C---ATT-G--C-TGA-G--C-A----------T-A-A----TCGCTTT---G--GT-----G-GAG-G-GT-CT-A-------TC-A-TTG-TTTGTG--ACG-G--T--G--T--G-TT-T--C-GATAG-T--TTT-A-C-G-GC--G------AAAACTGG-----ACCAA--T--TGTTGGC--TTGT-GGGC---A-TG-CAA--ATTT
Reference ( family-2570 )     :     AAATTTAC--AT-G---CCCGCAAGCC--ATGA--AT-A-T--G----T--C------TA-TGTTT-GACC--GTA-A---G-A---------C-----A--TCACA-AAGCTTGCTTTG-ATTTT------A-GCA-GAC-AC---C--ATG----AACATT-GGCAA-T--------------T-ACG---CT----T-TT---GAGACT--GCT----TCT-G-TT-------CAC--AA---A---TGA-ATCCAAG-TT---TT-GTGTG----------G-A-TT-TTCA--TCAT-A---AT-CG--T------CAG-CGT--G-T------------GT--G-GCGC-TA-G-AA--AA-A---TGA-A-C--G----A--T----A--T-CA-GG---------A-ATG--TT-G--C---ATT-G--C-TGA-G--C-A----------T-A-A----TCGCTTT---G--GT-----G-GAG-G-GT-CT-A-------TC-A-TTG-TTTGTG--ACG-G--T--G--T--G-TT-T--C-GATAG-T--TTT-A-C-G-GC--G------AAAACTGG-----ACCAA--T--TGTTGGC--TTGT-GGGC---A-TG-CAA--ATTT
gi|1                          :     AAGTTTACCAAT-G---TCAGCA-GCCCTATGA--ATTA-T--G----T--CGCTCTATA-TGTTT-GACCTGGTA-G---G-ATCGATTTCGC-----C--TCATATAGGCTTGCTTT---TTTTCTCTACG-CCA-GAC-GC---CGAATC----AAGGTT-GGCAA-TGCAGCAATTGGCATT-ACT---CTATTTT-TT---GAGACT--ACGGA--TCT-G-TT-------CAC--AA---AAATTGA-ATCCACG-TTCTATT-GTCTG----------GGA-TT-TTCAAATCAT-C---AT-CT--T------CAG-CGT--G-T------------GT--A-GCGC-TA-GTAG--AA-ATTGTGA-A-C--G----AGTT----C--T-CG-GG---------ATATGTTTT-GCTC---ATT-G--C-TGA-AGTC-A----------T-A-ACT--CCGCTTG---A--GT-----GCGCG-GTGT-CT-ATG-----TC-A-TGA-GTTGTGT-ACG-GA-T--G--T----TT-C--C-GATAG-T--TTT-ATC-G-GT--GAT----AAAACTGG------CCAA--TTGTGTTGACTTTTGT-GGGC---A--G-CAAGCATTT
gi|10                         :    aAAATTTAC--AT-G---TCAGCCAGCC--ATGA--AT-A-T--G----T--C------TA-TGTTTTGAC---GTA-G---G-A---------C-----A--TCACA-A-GCTTGCTTTG-ATTTT------A-GCA-GAC-AC---C--ATG----AGCATT-GGCAA-T--------------T-ACG---CT----T-TT---GAGACT--AAT----TCT-G-TT-------CAC--AA---A---TGA-ATCCACG-TT---TT-GTCTG----------G-A-TT-TTCA--TCAT-C---AT-CT--T------CAG-CCT--G-T------------GT--T-GCGC-TA-G--A--AA-A---TGA-A-C--G----A--T----A--T-CA-GG---------A-ATG--TT-G--C---ATT-G--C-TGA-G--C-A----------T-A-A----TCGTTTT---G--GT-----G-GAG-G-GT-CT-A-------TC-A-TTG-TTTGTG--ACG-G--T--T--T--G-TT-T--C-GATAGTT--TTT-A-C-G-GT--G------AAAACTGG-----ACCCA--T--TGTTGGC--TTGT-GGGC---A-TG-CAA--ATTTac
gi|11                         :    cAAACTTAC--AT-G---TCCGCCAGCA--ATGA--AT-A-T--G----C--C------TA-TGTTC-GACC--GTA-A---G-A---------C-----A--TCAAA-AAGCTTGCTTTG-ATTTT------A-GCA-GAC-AC---C--ATG----AACATT-GGCAA-T--------------T-ACG---CT----T-TA---GAGACT--GCT----TCT-A-TT-------CAC--AA---A---TGA-ATCAAAG-TT---TT-GTGTG----------G-A-TG-TTTA--TCAT-A---AT-CG--T------TAG-CGT--G-T------------GT--G-GCAC-TT-G-AA--AA-A---TGA-A-C--G----A--T----A--T-CA-GG---------A-ATT--TT-G--C---GAT-G--C-TGT-G--C-A----------T-A-A----TCGCTTT---G--GT-----G-GA----GT-CT-A-------TC-A-TTG-TTTATG--ACG-G--T--G--T--G-TT-T--C-AATAG-T--TTT-A-C-G-GC--G------AAAACTTG-----ACCAA--A--TGATGGC--TTGT-GGGC---A-TG-CAA--ATTTac
gi|12                         :                                                                                                                                                cC-AC---C--GAC----AACATTAGGCAA-TACTAA---------C-ACA---TT----T-TT---GAGACA--GCT----TCTTG-ATAAAACAACA---AA---A---TGA-ATCCAAG-TT---TT-CTGTGCCCCATCACTG-A-TC-ATCA--TCA--A---AT-CC--TTCGAGACAGCCGT--GAT------------GTAAG-GCGC-TA-G-AT--AA-A---TGATA-CGAG----A--TAATAA--T-CA-GGATAATTCTAA-ATAATCT-A--T---ATC-GA-C-TGA-G--T-AACAATACTAGT-A-AAAATTCGCTTT---G--GTTGGACG-GAG-G-AT-CT-AAGTATTTCC-A-GTA-GTTGAGGTACG-G--T--GA-TAGA-TTAT--C-GATAGCT--TTT-G-C-G-AC--GGTCATAAGAACTTGAAGTAACCAAGGT--GATTGGC--Tac
gi|13                         :     AAATTTAC--AT-G---GCCGCAAGCC--ATTA--AT-A-T--G----T--C------TA-TTTTT-GGCC--GTA-A---A-A---------C-----A--TCACA-AAGATTGCTTTG-ATTTT------A-GCA-GAC-AC---C--ATG----AACATT-GGCAA-T--------------T-ACG---CT----T-TT---GAGACT--GCT----TCT-G-TT-------CAC--AA---A---TGA-ATCCAAG-TT---TT-GTGTG----------C-A-TT-TTCA--TCAT-A---AT-CC--T------CAG-CGT--G-T------------GT--G-GCGC-TA-G-AA--AA-G---TGA-A-C--G----A--T----A--T-CA-GG---------A-ATG--TT-G--C---ATT-G--C-TGA-G--C-A----------T-A-A----TCGCTTT---G--AT-----G-GAT-C-GT-CT-A-------TC-A-TTG-TTTGTG--ACG-G--T--G--T--G-TT-T--C-GATGG-C--TTT-G-C-A-GT--G------AAAAGTGC-----ACCAA--T--TGTTGGC--TTGT-GGGC---A-TG-AAT--ATTT
gi|14                         :     AAATGTAC--AC-G---TTTGCAAGCC--ATTA--AC-A-T--G----C--T------TA-TGTTT-GACC--GTA-A---G-A---------C-----A--TCGCA-ATGCCTGCTTTA-ATTCT------A-GCA-GAC-AC---C--ATGCATGGACATT-GGCAA-T--------------T--------------------GAGACT--GAT----TCT-G-TT-------CAC--AA---A---TGA-ATCCAAG-TT---T--ATGAA----------A-A-CT-TTCA--TCAT-G---AT-CG--T------CAG-CGC--G-A------------AT--G-GCGC-CA-G-AA--AA-A---TGA-A-C--G----A--T----A--T-CA-GA---------A-ATG--TT-T--T---ATT-G--C-TGA-G--C-A----------C-A-A----TCGCTCT---G--GT-----G-AAG-T-GT-CT-A-------TC-A-TTA-TTTGTG--ATG-G--T--A--T--G-TT-T--C-GATGG-C--TTT-A-C-G-GT--T------AAAAGTGG-----ACCAA--T--TGTAAGC--TTGT-GGGC---A-TG-CAA--AGTT
gi|15                         :      AATGTAC--AT-A---TCCACAAGCC--ATGG--AC-A-T--G----T--C------TA-TGTTT-GAC-----------------------------A--TCATA-AAGCTTGCTTTG-ATTTT------A-GCA-GAC-AC---C--ATG----AACATT-TGCAA-T--------------T-ACA---CC----T-TT---GAGACT--GAT----TTT-G-CT-------CAG--AA---A---TGA-ATCCAAG-TT---TT-GTGTG----------G-A-TT-TTCA--TAAT-G---AT-CG--C------CAG-CAT--G-T------------GT--G-GTGG-AA-G-AA--AA-----TGA-A-C--G----A--T----A--T-CA-GT---------A-ATA--TT-G--C---ATT-G--C-TGA-G--C-A----------T-A-A----TCGCTTT---G--GT-----T-GAC-G-GC-CT-A-------TC-A-TTG-TTTGCG--ACG-G--T--G--T--G-TT-T--C-GATGG-C--TTT-A-C-A-GT--G------AAAAGTGG-----ACCAA--T--TGTTGGC--TTGT-GGGT---A-TG-CAA--TTTTac
gi|16                         :           AC--AT-G---TCAGCCAGCC--A-GA--AT-A-T--G----T--C------TA-TGTTT-GACC--GTACG---G-A---------C-----A--TCACA-AAGCTGGCTTTTTATTTT------A-GCA-GAC-AC---C--ATG----AGCATTTGGCAA-T--------------TTACG---CT----T-TT---GAGACTT-GAT----TCT-G-TT-------CAC--AA---A---TGA-ATCCACG-TT---TT-GTCTG----------G-A-TT-TT----TCA------AT-CAC-T------CAG-CG---------------------------C-TA-A-GA--AA-A---TGA-A-C--G----A--T----A--T-CA-TG---------A-ATG--TT-G--C---ATT-G--CTTGA-G--C-A----------T-A-A----TCGCTTT---G--GT-------GAG-G-GT-CTGA-------TC-A-TTGTTTTGTG--ACG-GTTT--G--T--G-TT-T--C-GATAGTT--TTT-A-C-G-GT--G------AAAAC--G-----ACCAA--T--TGTTGTC--TTGT-GGGC---A-TG-CAA--ATTTac
gi|17                         :     aAATTTAC--AT-A---TCCGCAAGCC--AAAA--AT-A-T--G----T--C------TA-TGTTT-GACC--ATA-A---A-A---------T-----A--TCGCA-ATGCTTGTTTTG-ATTTT------A-GCA-GAC-AC---C--ATT----AACATT-GGCAA-T--------------T-ACA---CC----TACT---GAGACT--GAT----TCT-G-TT-------CAC--AA---A---TGA-ATCCAAG-TT---TT-GTGTG----------G-A-CA-TTCA--TCAT-G---AT-CG--T------CAG-CGT--G-T------------GT--G-ACGC-CA-G-AA--AA-A---TGA-A-C--G----A--T----A--T-CA-AG---------A-CTG--TT-G--C---ATC-G--T-TGA-G--C-A----------T-G-A----TCGCTTT---G--GT-----G-GAA-G-GT-CT-A-------TC-A------TTGTG--ATG-G--TACG--T--G-TA-T--C-GATGG-C--TTT-A-C-G-GT--C------AAAAGTGG-----ACCAA-----------------T-GGGC---A-AT-CAA--ATTTac
gi|18                         :     AAGTCTAC--ATTG---TCAGCA-GCC--ACGA--TT-G-C--T----T--T------TA-TGTTT-GATC---TA-AC--G-A---------C-----ACATCCAA-AAGCTTGCGT-G-ATTT-------A-GCAAGAC-ACA--C--ATG----A-CATT-GGCAT-T--------------T-ACG---CT----T-TT---GAAACT--GCT----TCTTG-TT-------CAC--AA---A---T---ATCAAAG-TT---TT-GTGTG----------A-AATTATTCA--TCAT-A---ATACGGAT------CAG-AGT--G--------------AT--G-------A-G-TA--GA-A---TGA-A-C--G----A--T----A--T-CA-GG---------A-ATG--TT-G--C---ATTTG--C-TGA-G--C-A----------TCA-A----TTGCTT----G--GT-----G-GAG-G-GT-CT-A-------TC-AATTG-TTTGTG--ACG-G--T--G--T--G-TT-T--TAGATAG-T--TTT-G-C-G-GC--G------AAAACTGA-----AAC----T--TGTAGGC--TTac
gi|19                         :     AAATTTAC--TA-G---TCCGCCAGCC--ATGA--AT-A-T--G----T--C------TA-TGTTT-GACC--GTA-G---G-A---------C-----A--TCACA-AATCTTGCTTTG-ATTTT------A-GCA-GAC-GC---C--ATG----AACACT-GGCAA-T--------------T-ACG---CT----T-TT---GAGAC
gi|2                          :       tcTTAC--AT-GTCGCCCGC---CC--ATGACAAT-AAT--G----T--C------TAATGTTTTGACC--ACG-ACCCA-A---------CCTAGGA--TCA-A-AAGCTTGATT-G-AATTG------A-GCA-GCCCACTCGC--AC-----AGCATT-G-CAC-T--------------T-ACG---CT----T-TTTTCGAACCTCGATT----TCT-G-TT-------CAC--AACCCA---TGACACTCCCT-TC---TT-GTCTG----------GCA-CT-CTAG--TAAT-ACATAT-T---T------CAG-CGTAAG-TCACAAATCCATGGT--T-GCGCATACG-CA--AACA---TAG-A-C--G----A--T----A--TGCA-G----------A-ATG--TT-G--CCCAATT-GGAC-TGAAG--C-A----------T-A-A----TCGATTT---ACAGTCG---G-AAGAG-GTACT-AC------TC-A-TAG-TTGATG--ACG-G--T--GACT--GGTT-T--C-GAT-G-T--TTT-A-CAG-GT--G------ACAATTGG-----AC-AA--T--TGTTGGC--TTGT-GGGC-----TG-CAA--
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                              ----TCT-G-TT-------CAC--AA---A---TGA-ATCCAAG-TT---TT-TTGTT----------G-A-CT-TTCA--TCAT-G---AT-CA--T------CAT-CGT--G-T------------GA--G-GCGC-CA-G-AA--AA-A---AGA-C-C--A----A--T----A--T-CA-GG---------A-CTG--TT-G--C---ATT-G--C-TGA-G--
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       -TTG-TTTGTG--ACG-G--T--G--T--G-TT-T--T-GATAG-T--TTT-G-C-G-GC--G------AAAACTGG-----ACCAA--T--TGTAGGC--TTGT-GGGC---A-TG-CAA--AT
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         -CAT--G-T------------AT--G-GCGC-CA-G-AA--AA-A---TAA-A-C--G----A--T----A--T-CG-GG---------A-ATG--TT-G--C---AAT-G--C-TGA-G--C-A----------T-A-A----
gi|23                         :                                                                                                                                                  -AC---C--ATG----ATCATG-GGCAG-T--------------T-ACG---AT----T-TT---GAGACT--GCT----TCT-G-TT-------CAC--AA---A---
gi|24                         :     AAATTTAC--AT-G---TTCGCAAGCC--AGGA--AT-A-T--G----T--C------GA-TGTTT-GACT--GT
gi|25                         :      AATCTAC--AT-G---TCCGCCAGCC--ACGA--AT-A-T--G----T--T------TA-TGTTT-GATC--
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GG-----ACCAA--T--TGTTGGC--TTGT-GGGC---G-TG-GAA--ATTTa
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                   CT-G-TT-------CAC--AA---A---TGA-ATCCAAG-TT---TT-GTGTG----------ac
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ------AAAACTGG-----ACCAA--T--TGTTGGC--TTGT-GGG
gi|3                          :     AAAATTAC--AT-G---TC-GCTAGCA--ATGA--TTCA-TTGG----C--C------TA-TGTTT-GACC---TA-A---G-A---------C-----A--TCACC-AAGCTTGCTTTG-ATTTT------A-GCA-GAC-AC---C--ATGT---AAC-TT-GGCAACT--------------T-ACG---CT----T-TT---GAGATT--GCTTTTGTCT-G-TT-------CGC---A---A---TG--ATCCAAG-TT---TT-GTGTG----------GAA-TT-TTTA--TCAT-A---AA-TG--T------CAG-CAA--G-T------------GT--G-ACAC-TA-A-AACCCA-T---TAA-A-C--AGTTTA--T----A--T-CAGGG---------A-ATG--TT-G--G---GGT-G--C-TGG-G--CAA----------T-ACA----TCGCTTT---G--GT-----G-GAG-G-G--AT-A-------TCAA-TTG-TTTG-G--ACG-G--T--G--T--G-TT-T--CAAATAG-TACTTTAA-C-G-GCCGA------AAAATTGG-----ATCAACTT--TG-TGGC--TTGT--GGC---AGTGCCAA--ATTTt
gi|4                          :    cAAAATTAC--AT-G---TC-GCTAGCA--ATGA--TTCA-TTGG----C--C------TA-TGTTT-GACC---TA-A---G-A---------C-----A--TCACC-AAGCTTGCTTTG-ATTTT------A-GCA-GAC-AC---C--ATGT---AAC-TT-GGCAACT--------------T-ACG---CT----T-TT---GAGATT--GCTTTTGTCT-G-TT-------CGC---A---A---TG--ATCCAAG-TT---TT-GTGTG----------GAA-TT-TTTA--TCAT-A---AA-TG--T------CAG-CAA--G-T------------GT--G-ACAC-TA-A-AACCCA-T---TAA-A-C--AGTTTA--T----A--T-CAGGG---------A-ATG--TT-G--G---GGT-G--C-TGG-G--CAA----------T-ACA----TCGCTTT---G--GT-----G-GAG-G-G--AT-A-------TCAA-TTG-TTTG-G--ACG-G--T--G--T--G-TT-T--CAAATAG-TACTTTAA-C-G-GCCGA------AAAATTGG-----ATCAACTT--TG-TGGC--TTGT--GGC---AGTGCCAA--ATTTacc
gi|5                          :    cAAATT-AC--AT-G---TCAGCA-GCC--ATGG---T-A-T-------T--C------TA-TGTTT-GACC--GTA-A---GGA---------C-----A---CACA-AAGCTTGCTTTG-ATTTT------AAGCA-GAC-AC---C--ATG----AGCATT-GGCAA-T--------------T-ACGTCGCT----T-TT---GAGACT--GAT----TCT-GGTT-------CACGAAA---A---TGA-ATCCACG-TT---TTTGTCTG----------G---TT-TTCA--TCATCA---AT-CT--T------CAG-CAT--G-T------------GT--TTGCGC-TAAG-GA--AA-A---TGA-AAC--G----A--T----AGTC-CA-GG---------A-ATG--TTTG--C---ATT-GGCC-TGA-G----A----------T-A-A----TCGCTTTTT-G--TT-----G-GAT-G-GT-CT-A-------TC-A-TTGGTTTGTG--ACGTG--T--G--T--G-TT-TTTC-GATAG-T--TTT-A-C-G-GT--G------AAAACTGG-----ACCAA--T--TGTTGGC--TTGT-GGGC---A-TG-CAA--ATTTacc
gi|6                          :   tcAAATTTAC--AT-G---TCCGTTAGCC--ATGA--AT-A-T--GACTATAGC------TA-TGTGT-GACC--GTA-A---G-A---------C-----A--TCACA-AAGCTTGTTTTG-ATTTT------A-GCA-CAC-AC---T--ATG----AACATT-GGCAA-T--------------T-ACG---AT----T-TT---GAGACT--GAT----TCT-G-TT-------CAC--AA---A---TGA-ATCCACG-TT---AT-GTGTG----------G-A-TT-TTTA--TCAT-A---AT-CG--T------CAG-CGT--G-T------------GT--A-GCGC-TA-G-AA--AA-A---TGA-A-G--G----A--T----A--T-CA-GG---------A-ATG--TT-A--C---ATT-G--C-TGA-G--C-A----------T-A-A----TCGCTTT---G--GT-----G-GAG-G-GT-CT-A-------TC-A-T---TTTGTG--ACG-G--T--G--T--T-TT-T--C-GATAG-T--TTT-A-C-G-GC--G------AAATCAGG-----ACCCA--T--TATGGGC--TTGT-GGGC---A-AG-CAA--ATTT
gi|7                          :    cAAATTTAC--AT-G---TCTGCCAGTC--ATGA--AT-A-T--G----T--C------TA-TGTTT-GACC--GTA-A---G-A---------C-----A--TCACA-AAGCTTGCTTTG-ATATT------A-GCA-GAC-AC---C--ATG----AACATT-GGCAA-T--------------T-GCG---CT----T-CT---GAGACT--GCT----TCT-G-TT-------CAC--AA---A---TGA-ATCCTTG-CT---TT-GTGTG----------G-A-TT-TTCT--TCAT-A---AT-CG--T------CAG-CGT--G-T------------GT--G-GCGC-TA-G-AA--AA-A---TGA-A-C--G----A--T----A--T-CA-GG---------A-ATG--TT-A--C---ATT-G--C-TGA-G--C-A----------T-A-A----TTGCTTTGGAG--GG-----G-GGG-G-GT-CT-A-------TC-A-TTG-TTTGTT--ACG-G--T--T--T--G-TT-T--C-GATAG-T--TTT-A-C-G-GC--G------AAAACTGC-----ACCAA--C--TGTCGGC--TTGT-GGGC---A-TG-CAA--ATTTac
gi|8                          :      cATTTAC--CA-G---TCTGCCAGCC--ATGAG-AT---T--G----T--C------TA-TGTTT-GACC--GTA-G---G-AA--------C-----A--TCACA-AAGCTTGCTTTG-ATTTTT-----A-GCA-GAC-AC---C--ATG----AACATT-GGCAA-T--------------T-ATG---C-------TT---GAGACT--GCT----TCTCG-TT-------CAC--AA---A---TGA-ATCCAGGTTT---TT-TTCTG----------G-A-TT-TTCA--TC-------AT-CT--T------CAG-CGT--G-TG-----------GT--G-GCGC-T--G-AA--AA-T---TAA-A-CT-G------------A--T-CA-GA---------A-ATG--TT-G--C---ATT-G--C-TGA-G--C-A----------T---A----TC-TTTT---G--GT-----G-GTG-G-GT-CT-A-------TC-A-TTGTTTTGTG--ACG-G--T--G--G--T-TT-T--C-GATAG-T--TTT-A-C-GTGT--T------AAA--CGG-----ACCAA--T--TGTTGGCT-TTGTGGGGCATAA-TG-CAA--ATTTac
gi|9                          : tcacAAATTTAC--TT-G---TCCGCCAGCC--ATGA--AT-A-T--G----T--C------TA-TGTTT-GACC--GTA-A---G-A---------C-----A--TCACA-AAAATTCTTTTG-ATTTT------A-GCA-GAC-AC---C--ATG----AACATT-AGCAA-T--------------T-ACG---CT----T-TT---GAGAAT--GCT----TCT-G-TT-------CAC--AA---A---TGA-ATCCAAG-TT---TT-GTGTG----------G-A-TT-TTCA--TCAT-A---AT-CG--T------CGT-CGT--A-T------------GG--G-GCGC-TA-G-AA--AA-A---TGA-A-C--G----A--T----A--T-CA-GG---------A-ATG--TT-G--C---ATT-G--C-TGT-G--C-A----------T-A-A----TCGCTTT---G--GT-----G-GAG-G-GT-CT-A-------TT-A-TTG-TTTGTG--ACG-G--T--G--T--T-TC-T--C-GATAG-T--TAT-G-C-G-GC--A------AAAACTGG-----ACCAA--T--TGCTGGC--TTGT-GAGC---A-TG-CGA--ATTTac

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lowQualScore                  :             ..  .   .  .    ..    ..  . . .. .... .. ......  .     .    ...  . ... . ......... ..... ..     .            .     ...... .   .   .  ... ..   ....      .     . .............. .   ...  .... .  ...      .. . ....   . .  .......   ..  ... ...   .     . .  ...  .     ............ .  .    ..    .....  . ... ......   .   .. . ............  .. .    .  . .  ..  .....   . . .. .... .. .... .. .  .  ......... .   ..  . .. ...   . .. .   . .. . .......... . . ....       ... ..  ..... .   . .  .  . .......  . .   .      ..   . .. .. .. .. .  . .. .     . ..   . . . .  .........        .....     .. ..       ..    .    ... .  .   ..    
lowQualScore                  :             88  0   2  8    88    88  0 0 55 2222 88 888888  0     0    666  2 111 2 111111111 66666 11     2            2     666666 2   2   0  555 88   2222      0     0 88888888888888 0   555  2222 0  555      00 1 2222   7 9  2222222   66  333 333   0     2 0  555  0     222222222222 1  1    99    00000  1 222 111111   0   88 0 222222222222  88 0    0  0 0  55  66666   0 0 88 5555 88 2222 88 0  0  000000000 0   55  0 88 555   0 55 0   0 88 2 2222222222 1 2 4444       999 11  66666 2   2 2  2  2 5555555  4 1   3      00   1 00 99 00 99 1  1 99 3     3 88   2 1 1 1  888888888        88888     99 66       55    1    999 4  4   11    
consensus                     :     AAATTTAC--AT-GTCCGCCAGCC--ATGA--AT-A-T--G----T--C------TA-TGTTT-GACC--GTA-A---G-A---------C-----A--TCACA-AAGCTTGCTTTG-ATTTT------A-GCA-GAC-AC---C--ATG----AACATT-GGCAA-T--------------T-ACG---CT----T-TT---GAGACT--GCT----TCT-G-TT-------CAC--AA---A---TGA-ATCCAAG-TT---TT-GTGTG----------G-A-TT-TTCA--TCAT-A---AT-CG--T------CAG-CGT--G-T------------GT--G-GCGC-TA-G-AA--AA-A---TGA-A-C--G----A--T----A--T-CA-GG---------A-ATG--TT-G--C---ATT-G--C-TGA-G--C-A----------T-A-A----TCGCTTT---G--GT-----G-GAG-G-GT-CT-A-------TC-A-TTG-TTTGTG--ACG-G--T--G--T--G-TT-T--C-GATAG-T--TTT-A-C-G-GC--G------AAAACTGG-----ACCAA--T--TGTTGGC--TTGT-GGGC---A-TG-CAA--ATTT
Reference ( family-2570 )     :     AAATTTAC--AT-GTCCGCNAGCC--ATGA--AT-A-T--G----T--C------TA-TGTTT-GACC--GTA-A---G-A---------C-----A--TCACA-AAGCTTGCTTTG-ATTTT------A-GCA-GAC-AC---C--ATG----AACATT-GGCAA-T--------------T-ACG---CT----T-TT---GAGACT--GCT----TCT-G-TT-------CAC--AA---A---TGA-ATCCAAG-TT---TT-GTGTG----------G-A-TT-TTCA--TCAT-A---AT-CG--T------CAG-CGT--G-T------------GT--G-GCGC-TA-G-AA--AA-A---TGA-A-C--G----A--T----A--T-CA-GG---------A-ATG--TT-G--C---ATT-G--C-TGA-G--C-A----------T-A-A----TCGCTTT---G--GT-----G-GAG-G-GT-CT-A-------TC-A-TTG-TTTGTG--ACG-G--T--G--T--G-TT-T--C-GATAG-T--TTT-A-C-G-GC--G------AAAACTGG-----ACCAA--T--TGTTGGC--TTGT-GGGC---A-TG-CAA--ATTT
gi|1                          :     AAGTTTACCAAT-GTCAGC-AGCCCTATGA--ATTA-T--G----T--CGCTCTATA-TGTTT-GACCTGGTA-G---G-ATCGATTTCGC-----C--TCATATAGGCTTGCTTT---TTTTCTCTACG-CCA-GAC-GC---CGAATC----AAGGTT-GGCAA-TGCAGCAATTGGCATT-ACT---CTATTTT-TT---GAGACT--ACGGA--TCT-G-TT-------CAC--AA---AAATTGA-ATCCACG-TTCTATT-GTCTG----------GGA-TT-TTCAAATCAT-C---AT-CT--T------CAG-CGT--G-T------------GT--A-GCGC-TA-GTAG--AA-ATTGTGA-A-C--G----AGTT----C--T-CG-GG---------ATATGTTTT-GCTC---ATT-G--C-TGA-AGTC-A----------T-A-ACT--CCGCTTG---A--GT-----GCGCG-GTGT-CT-ATG-----TC-A-TGA-GTTGTGT-ACG-GA-T--G--T----TT-C--C-GATAG-T--TTT-ATC-G-GT--GAT----AAAACTGG------CCAA--TTGTGTTGACTTTTGT-GGGC---A--G-CAAGCATTT
gi|10                         :    aAAATTTAC--AT-GTCAGCCAGCC--ATGA--AT-A-T--G----T--C------TA-TGTTTTGAC---GTA-G---G-A---------C-----A--TCACA-A-GCTTGCTTTG-ATTTT------A-GCA-GAC-AC---C--ATG----AGCATT-GGCAA-T--------------T-ACG---CT----T-TT---GAGACT--AAT----TCT-G-TT-------CAC--AA---A---TGA-ATCCACG-TT---TT-GTCTG----------G-A-TT-TTCA--TCAT-C---AT-CT--T------CAG-CCT--G-T------------GT--T-GCGC-TA-G--A--AA-A---TGA-A-C--G----A--T----A--T-CA-GG---------A-ATG--TT-G--C---ATT-G--C-TGA-G--C-A----------T-A-A----TCGTTTT---G--GT-----G-GAG-G-GT-CT-A-------TC-A-TTG-TTTGTG--ACG-G--T--T--T--G-TT-T--C-GATAGTT--TTT-A-C-G-GT--G------AAAACTGG-----ACCCA--T--TGTTGGC--TTGT-GGGC---A-TG-CAA--ATTTac
gi|11                         :    cAAACTTAC--AT-GTCCGCCAGCA--ATGA--AT-A-T--G----C--C------TA-TGTTC-GACC--GTA-A---G-A---------C-----A--TCAAA-AAGCTTGCTTTG-ATTTT------A-GCA-GAC-AC---C--ATG----AACATT-GGCAA-T--------------T-ACG---CT----T-TA---GAGACT--GCT----TCT-A-TT-------CAC--AA---A---TGA-ATCAAAG-TT---TT-GTGTG----------G-A-TG-TTTA--TCAT-A---AT-CG--T------TAG-CGT--G-T------------GT--G-GCAC-TT-G-AA--AA-A---TGA-A-C--G----A--T----A--T-CA-GG---------A-ATT--TT-G--C---GAT-G--C-TGT-G--C-A----------T-A-A----TCGCTTT---G--GT-----G-GA----GT-CT-A-------TC-A-TTG-TTTATG--ACG-G--T--G--T--G-TT-T--C-AATAG-T--TTT-A-C-G-GC--G------AAAACTTG-----ACCAA--A--TGATGGC--TTGT-GGGC---A-TG-CAA--ATTTac
gi|12                         :                                                                                                                                             cC-AC---C--GAC----AACATTAGGCAA-TACTAA---------C-ACA---TT----T-TT---GAGACA--GCT----TCTTG-ATAAAACAACA---AA---A---TGA-ATCCAAG-TT---TT-CTGTGCCCCATCACTG-A-TC-ATCA--TCA--A---AT-CC--TTCGAGACAGCCGT--GAT------------GTAAG-GCGC-TA-G-AT--AA-A---TGATA-CGAG----A--TAATAA--T-CA-GGATAATTCTAA-ATAATCT-A--T---ATC-GA-C-TGA-G--T-AACAATACTAGT-A-AAAATTCGCTTT---G--GTTGGACG-GAG-G-AT-CT-AAGTATTTCC-A-GTA-GTTGAGGTACG-G--T--GA-TAGA-TTAT--C-GATAGCT--TTT-G-C-G-AC--GGTCATAAGAACTTGAAGTAACCAAGGT--GATTGGC--Tac
gi|13                         :     AAATTTAC--AT-GGCCGCAAGCC--ATTA--AT-A-T--G----T--C------TA-TTTTT-GGCC--GTA-A---A-A---------C-----A--TCACA-AAGATTGCTTTG-ATTTT------A-GCA-GAC-AC---C--ATG----AACATT-GGCAA-T--------------T-ACG---CT----T-TT---GAGACT--GCT----TCT-G-TT-------CAC--AA---A---TGA-ATCCAAG-TT---TT-GTGTG----------C-A-TT-TTCA--TCAT-A---AT-CC--T------CAG-CGT--G-T------------GT--G-GCGC-TA-G-AA--AA-G---TGA-A-C--G----A--T----A--T-CA-GG---------A-ATG--TT-G--C---ATT-G--C-TGA-G--C-A----------T-A-A----TCGCTTT---G--AT-----G-GAT-C-GT-CT-A-------TC-A-TTG-TTTGTG--ACG-G--T--G--T--G-TT-T--C-GATGG-C--TTT-G-C-A-GT--G------AAAAGTGC-----ACCAA--T--TGTTGGC--TTGT-GGGC---A-TG-AAT--ATTT
gi|14                         :     AAATGTAC--AC-GTTTGCAAGCC--ATTA--AC-A-T--G----C--T------TA-TGTTT-GACC--GTA-A---G-A---------C-----A--TCGCA-ATGCCTGCTTTA-ATTCT------A-GCA-GAC-AC---C--ATGCATGGACATT-GGCAA-T--------------T--------------------GAGACT--GAT----TCT-G-TT-------CAC--AA---A---TGA-ATCCAAG-TT---T--ATGAA----------A-A-CT-TTCA--TCAT-G---AT-CG--T------CAG-CGC--G-A------------AT--G-GCGC-CA-G-AA--AA-A---TGA-A-C--G----A--T----A--T-CA-GA---------A-ATG--TT-T--T---ATT-G--C-TGA-G--C-A----------C-A-A----TCGCTCT---G--GT-----G-AAG-T-GT-CT-A-------TC-A-TTA-TTTGTG--ATG-G--T--A--T--G-TT-T--C-GATGG-C--TTT-A-C-G-GT--T------AAAAGTGG-----ACCAA--T--TGTAAGC--TTGT-GGGC---A-TG-CAA--AGTT
gi|15                         :      AATGTAC--AT-ATCCACAAGCC--ATGG--AC-A-T--G----T--C------TA-TGTTT-GAC-----------------------------A--TCATA-AAGCTTGCTTTG-ATTTT------A-GCA-GAC-AC---C--ATG----AACATT-TGCAA-T--------------T-ACA---CC----T-TT---GAGACT--GAT----TTT-G-CT-------CAG--AA---A---TGA-ATCCAAG-TT---TT-GTGTG----------G-A-TT-TTCA--TAAT-G---AT-CG--C------CAG-CAT--G-T------------GT--G-GTGG-AA-G-AA--AA-----TGA-A-C--G----A--T----A--T-CA-GT---------A-ATA--TT-G--C---ATT-G--C-TGA-G--C-A----------T-A-A----TCGCTTT---G--GT-----T-GAC-G-GC-CT-A-------TC-A-TTG-TTTGCG--ACG-G--T--G--T--G-TT-T--C-GATGG-C--TTT-A-C-A-GT--G------AAAAGTGG-----ACCAA--T--TGTTGGC--TTGT-GGGT---A-TG-CAA--TTTTac
gi|16                         :           AC--AT-GTCAGCCAGCC--A-GA--AT-A-T--G----T--C------TA-TGTTT-GACC--GTACG---G-A---------C-----A--TCACA-AAGCTGGCTTTTTATTTT------A-GCA-GAC-AC---C--ATG----AGCATTTGGCAA-T--------------TTACG---CT----T-TT---GAGACTT-GAT----TCT-G-TT-------CAC--AA---A---TGA-ATCCACG-TT---TT-GTCTG----------G-A-TT-TT----TCA------AT-CAC-T------CAG-CG---------------------------C-TA-A-GA--AA-A---TGA-A-C--G----A--T----A--T-CA-TG---------A-ATG--TT-G--C---ATT-G--CTTGA-G--C-A----------T-A-A----TCGCTTT---G--GT-------GAG-G-GT-CTGA-------TC-A-TTGTTTTGTG--ACG-GTTT--G--T--G-TT-T--C-GATAGTT--TTT-A-C-G-GT--G------AAAAC--G-----ACCAA--T--TGTTGTC--TTGT-GGGC---A-TG-CAA--ATTTac
gi|17                         :     aAATTTAC--AT-ATCCGCAAGCC--AAAA--AT-A-T--G----T--C------TA-TGTTT-GACC--ATA-A---A-A---------T-----A--TCGCA-ATGCTTGTTTTG-ATTTT------A-GCA-GAC-AC---C--ATT----AACATT-GGCAA-T--------------T-ACA---CC----TACT---GAGACT--GAT----TCT-G-TT-------CAC--AA---A---TGA-ATCCAAG-TT---TT-GTGTG----------G-A-CA-TTCA--TCAT-G---AT-CG--T------CAG-CGT--G-T------------GT--G-ACGC-CA-G-AA--AA-A---TGA-A-C--G----A--T----A--T-CA-AG---------A-CTG--TT-G--C---ATC-G--T-TGA-G--C-A----------T-G-A----TCGCTTT---G--GT-----G-GAA-G-GT-CT-A-------TC-A------TTGTG--ATG-G--TACG--T--G-TA-T--C-GATGG-C--TTT-A-C-G-GT--C------AAAAGTGG-----ACCAA-----------------T-GGGC---A-AT-CAA--ATTTac
gi|18                         :     AAGTCTAC--ATTGTCAGC-AGCC--ACGA--TT-G-C--T----T--T------TA-TGTTT-GATC---TA-AC--G-A---------C-----ACATCCAA-AAGCTTGCGT-G-ATTT-------A-GCAAGAC-ACA--C--ATG----A-CATT-GGCAT-T--------------T-ACG---CT----T-TT---GAAACT--GCT----TCTTG-TT-------CAC--AA---A---T---ATCAAAG-TT---TT-GTGTG----------A-AATTATTCA--TCAT-A---ATACGGAT------CAG-AGT--G--------------AT--G-------A-G-TA--GA-A---TGA-A-C--G----A--T----A--T-CA-GG---------A-ATG--TT-G--C---ATTTG--C-TGA-G--C-A----------TCA-A----TTGCTT----G--GT-----G-GAG-G-GT-CT-A-------TC-AATTG-TTTGTG--ACG-G--T--G--T--G-TT-T--TAGATAG-T--TTT-G-C-G-GC--G------AAAACTGA-----AAC----T--TGTAGGC--TTac
gi|19                         :     AAATTTAC--TA-GTCCGCCAGCC--ATGA--AT-A-T--G----T--C------TA-TGTTT-GACC--GTA-G---G-A---------C-----A--TCACA-AATCTTGCTTTG-ATTTT------A-GCA-GAC-GC---C--ATG----AACACT-GGCAA-T--------------T-ACG---CT----T-TT---GAGAC
gi|2                          :       tcTTAC--AT-GTC-GCCCGCCC-ATGACAAT-AAT--G----T--C------TAATGTTTTGACC--ACG-ACCCA-A---------CCTAGGA--TCA-A-AAGCTTGATT-G-AATTG------A-GCA-GCCCACTCGC--AC-----AGCATT-G-CAC-T--------------T-ACG---CT----T-TTTTCGAACCTCGATT----TCT-G-TT-------CAC--AACCCA---TGACACTCCCT-TC---TT-GTCTG----------GCA-CT-CTAG--TAAT-ACATAT-T---T------CAG-CGTAAG-TCACAAATCCATGGT--T-GCGCATACG-CA--AACA---TAG-A-C--G----A--T----A--TGCA-G----------A-ATG--TT-G--CCCAATT-GGAC-TGAAG--C-A----------T-A-A----TCGATTT---ACAGTCG---G-AAGAG-GTACT-AC------TC-A-TAG-TTGATG--ACG-G--T--GACT--GGTT-T--C-GAT-G-T--TTT-A-CAG-GT--G------ACAATTGG-----AC-AA--T--TGTTGGC--TTGT-GGGC-----TG-CAA--
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                           ----TCT-G-TT-------CAC--AA---A---TGA-ATCCAAG-TT---TT-TTGTT----------G-A-CT-TTCA--TCAT-G---AT-CA--T------CAT-CGT--G-T------------GA--G-GCGC-CA-G-AA--AA-A---AGA-C-C--A----A--T----A--T-CA-GG---------A-CTG--TT-G--C---ATT-G--C-TGA-G--
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    -TTG-TTTGTG--ACG-G--T--G--T--G-TT-T--T-GATAG-T--TTT-G-C-G-GC--G------AAAACTGG-----ACCAA--T--TGTAGGC--TTGT-GGGC---A-TG-CAA--AT
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      -CAT--G-T------------AT--G-GCGC-CA-G-AA--AA-A---TAA-A-C--G----A--T----A--T-CG-GG---------A-ATG--TT-G--C---AAT-G--C-TGA-G--C-A----------T-A-A----
gi|23                         :                                                                                                                                               -AC---C--ATG----ATCATG-GGCAG-T--------------T-ACG---AT----T-TT---GAGACT--GCT----TCT-G-TT-------CAC--AA---A---
gi|24                         :     AAATTTAC--AT-GTTCGCAAGCC--AGGA--AT-A-T--G----T--C------GA-TGTTT-GACT--GT
gi|25                         :      AATCTAC--AT-GTCCGCCAGCC--ACGA--AT-A-T--G----T--T------TA-TGTTT-GATC--
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               GG-----ACCAA--T--TGTTGGC--TTGT-GGGC---G-TG-GAA--ATTTa
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                CT-G-TT-------CAC--AA---A---TGA-ATCCAAG-TT---TT-GTGTG----------ac
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ------AAAACTGG-----ACCAA--T--TGTTGGC--TTGT-GGG
gi|3                          :     AAAATTAC--AT-GTC-GCTAGCA--ATGA--TTCA-TTGG----C--C------TA-TGTTT-GACC---TA-A---G-A---------C-----A--TCACC-AAGCTTGCTTTG-ATTTT------A-GCA-GAC-AC---C--ATGT---AAC-TT-GGCAACT--------------T-ACG---CT----T-TT---GAGATT--GCTTTTGTCT-G-TT-------CGC---A---A---TG--ATCCAAG-TT---TT-GTGTG----------GAA-TT-TTTA--TCAT-A---AA-TG--T------CAG-CAA--G-T------------GT--G-ACAC-TA-A-AACCCA-T---TAA-A-C--AGTTTA--T----A--T-CAGGG---------A-ATG--TT-G--G---GGT-G--C-TGG-G--CAA----------T-ACA----TCGCTTT---G--GT-----G-GAG-G-G--AT-A-------TCAA-TTG-TTTG-G--ACG-G--T--G--T--G-TT-T--CAAATAG-TACTTTAA-C-G-GCCGA------AAAATTGG-----ATCAACTT--TG-TGGC--TTGT--GGC---AGTGCCAA--ATTTt
gi|4                          :    cAAAATTAC--AT-GTC-GCTAGCA--ATGA--TTCA-TTGG----C--C------TA-TGTTT-GACC---TA-A---G-A---------C-----A--TCACC-AAGCTTGCTTTG-ATTTT------A-GCA-GAC-AC---C--ATGT---AAC-TT-GGCAACT--------------T-ACG---CT----T-TT---GAGATT--GCTTTTGTCT-G-TT-------CGC---A---A---TG--ATCCAAG-TT---TT-GTGTG----------GAA-TT-TTTA--TCAT-A---AA-TG--T------CAG-CAA--G-T------------GT--G-ACAC-TA-A-AACCCA-T---TAA-A-C--AGTTTA--T----A--T-CAGGG---------A-ATG--TT-G--G---GGT-G--C-TGG-G--CAA----------T-ACA----TCGCTTT---G--GT-----G-GAG-G-G--AT-A-------TCAA-TTG-TTTG-G--ACG-G--T--G--T--G-TT-T--CAAATAG-TACTTTAA-C-G-GCCGA------AAAATTGG-----ATCAACTT--TG-TGGC--TTGT--GGC---AGTGCCAA--ATTTacc
gi|5                          :    cAAATT-AC--AT-GTCAGC-AGCC--ATGG---T-A-T-------T--C------TA-TGTTT-GACC--GTA-A---GGA---------C-----A---CACA-AAGCTTGCTTTG-ATTTT------AAGCA-GAC-AC---C--ATG----AGCATT-GGCAA-T--------------T-ACGTCGCT----T-TT---GAGACT--GAT----TCT-GGTT-------CACGAAA---A---TGA-ATCCACG-TT---TTTGTCTG----------G---TT-TTCA--TCATCA---AT-CT--T------CAG-CAT--G-T------------GT--TTGCGC-TAAG-GA--AA-A---TGA-AAC--G----A--T----AGTC-CA-GG---------A-ATG--TTTG--C---ATT-GGCC-TGA-G----A----------T-A-A----TCGCTTTTT-G--TT-----G-GAT-G-GT-CT-A-------TC-A-TTGGTTTGTG--ACGTG--T--G--T--G-TT-TTTC-GATAG-T--TTT-A-C-G-GT--G------AAAACTGG-----ACCAA--T--TGTTGGC--TTGT-GGGC---A-TG-CAA--ATTTacc
gi|6                          :   tcAAATTTAC--AT-GTCCGTTAGCC--ATGA--AT-A-T--GACTATAGC------TA-TGTGT-GACC--GTA-A---G-A---------C-----A--TCACA-AAGCTTGTTTTG-ATTTT------A-GCA-CAC-AC---T--ATG----AACATT-GGCAA-T--------------T-ACG---AT----T-TT---GAGACT--GAT----TCT-G-TT-------CAC--AA---A---TGA-ATCCACG-TT---AT-GTGTG----------G-A-TT-TTTA--TCAT-A---AT-CG--T------CAG-CGT--G-T------------GT--A-GCGC-TA-G-AA--AA-A---TGA-A-G--G----A--T----A--T-CA-GG---------A-ATG--TT-A--C---ATT-G--C-TGA-G--C-A----------T-A-A----TCGCTTT---G--GT-----G-GAG-G-GT-CT-A-------TC-A-T---TTTGTG--ACG-G--T--G--T--T-TT-T--C-GATAG-T--TTT-A-C-G-GC--G------AAATCAGG-----ACCCA--T--TATGGGC--TTGT-GGGC---A-AG-CAA--ATTT
gi|7                          :    cAAATTTAC--AT-GTCTGCCAGTC--ATGA--AT-A-T--G----T--C------TA-TGTTT-GACC--GTA-A---G-A---------C-----A--TCACA-AAGCTTGCTTTG-ATATT------A-GCA-GAC-AC---C--ATG----AACATT-GGCAA-T--------------T-GCG---CT----T-CT---GAGACT--GCT----TCT-G-TT-------CAC--AA---A---TGA-ATCCTTG-CT---TT-GTGTG----------G-A-TT-TTCT--TCAT-A---AT-CG--T------CAG-CGT--G-T------------GT--G-GCGC-TA-G-AA--AA-A---TGA-A-C--G----A--T----A--T-CA-GG---------A-ATG--TT-A--C---ATT-G--C-TGA-G--C-A----------T-A-A----TTGCTTTGGAG--GG-----G-GGG-G-GT-CT-A-------TC-A-TTG-TTTGTT--ACG-G--T--T--T--G-TT-T--C-GATAG-T--TTT-A-C-G-GC--G------AAAACTGC-----ACCAA--C--TGTCGGC--TTGT-GGGC---A-TG-CAA--ATTTac
gi|8                          :      cATTTAC--CA-GTCTGCCAGCC--ATGAG-AT---T--G----T--C------TA-TGTTT-GACC--GTA-G---G-AA--------C-----A--TCACA-AAGCTTGCTTTG-ATTTTT-----A-GCA-GAC-AC---C--ATG----AACATT-GGCAA-T--------------T-ATG---C-------TT---GAGACT--GCT----TCTCG-TT-------CAC--AA---A---TGA-ATCCAGGTTT---TT-TTCTG----------G-A-TT-TTCA--TC-------AT-CT--T------CAG-CGT--G-TG-----------GT--G-GCGC-T--G-AA--AA-T---TAA-A-CT-G------------A--T-CA-GA---------A-ATG--TT-G--C---ATT-G--C-TGA-G--C-A----------T---A----TC-TTTT---G--GT-----G-GTG-G-GT-CT-A-------TC-A-TTGTTTTGTG--ACG-G--T--G--G--T-TT-T--C-GATAG-T--TTT-A-C-GTGT--T------AAA--CGG-----ACCAA--T--TGTTGGCT-TTGTGGGGCATAA-TG-CAA--ATTTac
gi|9                          : tcacAAATTTAC--TT-GTCCGCCAGCC--ATGA--AT-A-T--G----T--C------TA-TGTTT-GACC--GTA-A---G-A---------C-----A--TCACA-AAAATTCTTTTG-ATTTT------A-GCA-GAC-AC---C--ATG----AACATT-AGCAA-T--------------T-ACG---CT----T-TT---GAGAAT--GCT----TCT-G-TT-------CAC--AA---A---TGA-ATCCAAG-TT---TT-GTGTG----------G-A-TT-TTCA--TCAT-A---AT-CG--T------CGT-CGT--A-T------------GG--G-GCGC-TA-G-AA--AA-A---TGA-A-C--G----A--T----A--T-CA-GG---------A-ATG--TT-G--C---ATT-G--C-TGT-G--C-A----------T-A-A----TCGCTTT---G--GT-----G-GAG-G-GT-CT-A-------TT-A-TTG-TTTGTG--ACG-G--T--G--T--T-TC-T--C-GATAG-T--TAT-G-C-G-GC--A------AAAACTGG-----ACCAA--T--TGCTGGC--TTGT-GAGC---A-TG-CGA--ATTTac