lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111                                      11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111                                                                                                                                                                222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222                                                                                                                                                                                                     22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      66666666666666666666666666666      22                                         4444444444444             111             22222  111      666666   111                             2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222       222222    11111                           1                                        11111      4444444       333333333333                             33333333333333333           1  2222               3333333                             333333333333333333333333333              1111      222222        22222222    00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000   11111                           1  44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444      22222          11             444444444444444          1111111           1111   333333333                   11       4444444444444444444444               000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000        6666666666666666666666666666666666                  11      2222222222          555555555555555555555555       2222222222                       1111111                         111111111    22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222        11          11111                                   11111111111111     11111111               9999999                                      1111     1           11      1    3        1111  999999999999999999999999999999999999999               55555555               3333333333333333               1111111111                  666666666666666666666666           111111111111111                 11    2222222222222222222            22222222222222222                                                                                                              
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      555  1 1 22  1  77777777777777777777777777777    3 22  33  1    22 1 22 1  1 22  1 22  1  3   2222222222222 77      333 000    4444     99999  222  2   000000 2 111 2 55 2  2 22   666666   333 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999   3   777777    00000   4       7 55 7 3 88  3  0      9   3   1     9999  3  3  3 3  6  77777      0000000 3  3  222222222222 9    3     3      44 7 3  3 55555555555555555  3 3    1 0  5555 44 44  3   44 2222222  6666        6   44     22  222222222222222222222222222  2 2       2 2222 2    222222     3  33333333    44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444   11111      5     888  66        0  11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111      55555          11   8  99 8   111111111111111   88  1  8888888     5 77  1111   111111111      888 5  5     44 4  55 6666666666666666666666 4        4    777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777        3333333333333333333333333333333333    4   8    55   33 5    2222222222          333333333333333333333333    8  7777777777 3      22   22   4    6666666    4  4 4   4 777    66 777777777    55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 4   9  00 66       55555 4 4 66     4    6   1  4 66   7   88888888888888     66666666      777      9999999     4      777   4         2  33     0000     0  0      5 66      5    6        2222  888888888888888888888888888888888888888               11111111       5 5  4  0000000000000000  2  2  6666 2 9999999999   2 333 333  1   000000000000000000000000  1  5     666666666666666 1     333 44 1  88  1 6666666666666666666         55 44444444444444444 333  22     77 1  1 22 1 1  1  99999  22  1 1 1 3   3333 1   1 1  1 777777   1  3 55 22 1 77  555            
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ...  . . ..  .  .............................    . ..  ..  .    .. . .. .  . ..  . ..  .  .   ............. ..      ... ...    ....     .....  ...  .   ...... . ... . .. .  . ..   ......   ... .....................................................................................................................................................................................   .   ......    .....   .       . .. . . ..  .  .      .   .   .     ....  .  .  . .  .  .....      ....... .  .  ............ .    .     .      .. . .  . .................  . .    . .  .... .. ..  .   .. .......  ....        .   ..     ..  ...........................  . .       . .... .    ......     .  ........    .......................................................................   .....      .     ...  ..        .  ................................................................................................................................      .....          ..   .  .. .   ...............   ..  .  .......     . ..  ....   .........      ... .  .     .. .  .. ...................... .        .    ......................................................................................................        ..................................    .   .    ..   .. .    ..........          ........................    .  .......... .      ..   ..   .    .......    .  . .   . ...    .. .........    ......................................................................................................................................... .   .  .. ..       ..... . . ..     .    .   .  . ..   .   ..............     ........      ...      .......     .      ...   .         .  ..     ....     .  .      . ..      .    .        ....  .......................................               ........       . .  .  ................  .  .  .... . ..........   . ... ...  .   ........................  .  .     ............... .     ... .. .  ..  . ...................         .. ................. ...  ..     .. .  . .. . .  .  .....  ..  . . . .   .... .   . .  . ......   .  . .. .. . ..  ...            
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      222  9 9 66  9  00000000000000000000000000000    2 88  44  6    22 6 22 6  7 33  8 55  9  6   5555555555555 99      555 555    2222     66666  222  0   888888 0 888 1 00 1  5 99   111111   777 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999   6   000000    00000   0       3 00 3 6 66  6  9      2   3   8     2222  3  3  3 3  7  55555      8888888 3  3  999999999999 2    1     3      66 3 6  3 11111111111111111  3 3    3 0  0000 66 66  3   22 5555555  5555        2   22     22  111111111111111111111111111  9 9       9 9999 9    000000     3  88888888    44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444   11111      0     888  99        0  66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666      00000          00   0  44 0   111111111111111   33  7  6666666     7 99  6666   888888888      888 0  0     33 0  55 4444444444444444444444 0        0    111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111        0000000000000000000000000000000000    0   0    55   88 0    8888888888          888888888888888888888888    0  4444444444 2      33   44   6    7777777    4  4 4   4 888    11 888888888    33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 4   8  66 11       66666 4 4 11     4    7   0  4 11   0   44444444444444     11111111      888      7777777     4      888   4         0  22     6666     0  9      0 99      0    9        1111  999999999999999999999999999999999999999               55555555       0 0  0  1111111111111111  7  4  9999 1 0000000000   0 333 333  9   000000000000000000000000  9  5     888888888888888 8     222 33 8  44  7 7777777777777777777         99 88888888888888888 000  33     00 4  4 00 4 4  5  88888  11  5 5 5 1   3333 6   8 8  8 000000   8  6 00 66 9 11  222            
consensus                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           CTTGGTGTAAA---AT-G-C--TG-ACT--------TCTGGA-G-CCC-TC---CAATTTGG--ACG-TC-CAAA--G-T--G-GA-G--AG-A--GG-GT-GGAG-C-C--TC----T--TGTCAT---A-A-GAGA----TTGTCA-N--GG---TG-GAG--C--AT-T---G-G--A-GTTA--ATT------TCA---A---A----A-------------CN---------T-------------AA-TT------------TA----C--------------------------T--------------------------CT-G---T----C-------CT------------CAG-TGTTCG-------------TGG-CTAT-C---AACA-----TAA-AGTTATC-A--A-A-C--AA-AA-CAAGTCCTTT-GAAGCTCCCTAT-AT-AA-AC-T-AA-TT-----CCCCAAAC-----C-CC-AT--------G---C-ATAA-TCTGA-AAAGGG--C-A-GA-A--GGC------------CA-G-CACCAT-AAA---C--C--TG-TTA--C--T-T--CA----AACAAAAA-CAA--AACACACTA-------AAA------TTA---A--T-CA-C-CATTTCA-C----A-ATAA----TTAATTG-AT---TG---AAAG-A----A-G-A-T-----AAAGNTTTATT--------ACA-TT---AAACC--AATT--TCA-CTT-TG-AAAA-----ATATTT-CTGCT---GA--TCGCAGTT-TGC-AA------GA--------A----------GAC------GTGT-------TT-G-T-----ATT--T-AA--TAC---TGAT------C----TAT-ATCGTGTCGTCGAAAG--------------TCCTAT-----TACAGTCAAA--GGT-AA-TT-TTG----A--T-T--AT-AAA-TGATGG-------AGGGA-G--AA-T--GAANTT-TA-T-GTCAAC---A-AG-GTGAT-CA-GC--TA--T-------A--C--AAATCC-AAAACATC-ACAG------AC------TA---TCGTAAA--------TTCA-C-TC----------C-----A--CTCGGCTTTTTACCCC-A-ATTT-------------A---CAGGACAT-------T-----TCA-----T-TG---------TTGT-CAT-GTTT--TAC--A-TATA-----C--CTGGTACATGGAG-----A-----ACTTGTG-GAT-TGGA-TT-CTTTTCTT-TATTTCATAATTGCCATTTATTT-CAT---AAAT-TT-C-ATT-C---ATGC--A---------TATA-------------------T--------------AA---G--------------T--GAG---TTT--TTGTTGT-CATC-CC--NTGTG---------T-TTGATA-------------------------T--G-G-TGCATG--A--TGAAATT-----G-G-G--GGAAA-TCTTGAACATC-A--GCTCAGTAAA-AT--A-----ACACT--------CCTGAC---AGATGC------TGTACT-GAGCAA---TGT-GTCAATTTGTAAATTTTGA----TCTCT-CATCACCAC-A--TTGGACTGGCT-CTGTACTG----CTAT----A---------------------A----------AATTTATTGGACAGCA-ACAGAGAACCAGT-C-TA-CC---T--A-------G-TA-CA-GG----A-A-T----TG--AAA-T---G---AC-AGA-T---GTA--AATAA-G-TT-A--GTGTT-GAAAT-TNA-CTTC--CGA-A-GCTCC---A--C-CCATGA-C-A-TNT-----C-T-----TATGACAAG--A----G--CTC---CA--C---CC--TCTCT--C-CA-C--T-T-TG-GAC----GT--CC-A-A-A-TTG----G-AGG-C-TC-C------AGA-GT-C--A--G-C--AT---TTTACACCAAGC
Reference ( gi|3 )            :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           CTTGGTGTAAA---AT-G-C--TG-ACT---AT---TCTGGA-G-CTCGTC--ACAATTTGG-GACG-TC-CAAA--G-T--G-GA-G--AG-A--GG-GT-GGA--T-C--T-----T--TGTCAT---A-G-GAGA----TTGTC--T--GG---TG-GAGGAC--AT-T---G-G--A-GTTA--ATT------TCA---A---A---TA-------------CA---------T-------------AA-TT------------TA----C--------------------------T--------------------------CT-G---T----C-------CT------------CAG-TGTTC--------------TGG-CTAT-C---AACA-----TAA-AGTTATC-A--A-A-C--AA-AA-CAAGTCATTT-GAAGCTCCCTAT-AT-AA-AC-T-AA-TT-----CCCCAA-------C-CC-AT--------G---C-ATAA-TCTGA-AAAGGG--C-A-GA-A--G-C------------CA-G-CACCAT-AA----C--C--TG-TTA--C--TGT--CA----AACAAAAA-CAA--AACACACTA-------AAA------TTA---A--T-CA-C-CATTTCA-C----A-ATAA----TCAATTG-AT---T----AAAG-A----A-G-A-T-----AAAGGTTTATTA-------ACA--T---AAACT--AATT--TCAGCTT-TG-AAAA-----ATATTT-CTGCT---GA--TCGCAGTT-TG--AA------GA--------A----------GACG-----GTGT-------TT-G-T-----ATT--T-AA--TAC---TGAT------C----TAT-ATC-TGTCGTCGAAA---------------TCCTAT-----TACAGTCAAA--GGT-AA-TT-TTG----A--T-T--AT-AAA-TGATGG-------AGGGA-G--AA-T--GAATTT-TA-A-GTCAAC---A-AG-GTGAT-AA-GC--TA--T-------A--C--AA--TC-AAAACATC-ACAG------AC------T----TTGTAAA--------TTCA-C-TC----------C-----A--CTCAGC--------------TTT-------------A---CAGGACAT-------T-----TC------T-TG---------TTGT-CAT-GTTT--TAC--A-TATA-----C--CTGGTACATGGA------A-----ACTTGTG-GATGTGGA-TT-CTTTTCTTGTATTTCATAATTGTCATTTATTT-AAT---AAAT-TT-C-ATT-C---ATGC--A---------TATA-------------------T--------------AA---G--------------T--GAG---TTTA-TTGTTGT-CA---CC--TTGTG---------G-TTGATGTAA------AGG-----------CATTAGTG-TGCGTG--A--TGAAATT-----G-G-G--GGAAA-TCTTCAACATC-A--GCTTAGTAAA-AT--A-----ACACT--------CCTGAC---AGATGCATAT-GCGTACT-GAGCAA---TGT-GTCAATTTGTAAATTTTGA----TCTCT-CATCACCAC-A--TTGGACGGGCTGCTGTACTG----CTAT----A---------------------A----------AATTTATTGGACAGCA-ATAGAGAACCAGT-C-TA-CC---T--A-------G-TA-CA-GG----A-A-T----TG--AAA-T---G---AC-AGA-T---ATA--AATAA-G-TT-A--GTGTT-GAAAT-TCA-TTTC--TGA-A-GCTCC---A--C-CCATGA-C-A-TAT-----C-T-----TATGACAAG--A----G--CTC---C---C---CC--TCTCT--C-CA-C--T-T-TG-GAG----GT--CC-A-A-A-TTG----G-AGG-C-TC-C------AGA-GT-C--A--G-C--AT---TTTACACCAAGC
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           CTTGGTGTAAA---AT---C--TG--CT---TTGA-TCTGGA-G-CC--TC---CAATTTGG--ACC-TC-CAAA--G-T--G--A-G--AG-A--GG-GT-GGAG-T-C--TC----T--TGTCAT---AAG-GAGA----T-GTC--T--GGGC-TG-GAT--CT-AT-T---G-G--A-GTTG--ATT------TCA---A---A----A-------------CA---------T-------------AA-TTT-----------TA----CTCTGTCATTTAATTTCTAATATCCTGT--------------------------CTCG---T----C-------CT------------CAG--GTTC--------------GTG-CTATAC---AACA-----TAA-A-TTATC-A--AGA-C--AA-AA-CA-GTCATTT-GAA-----------------C-T-AA-TT-----TCCCAAAC-----C-CC-AT--------G---CCATAA-TCTGA-AAAGGG--CCA-GA-AAGG-C------------CACG-CACCAT-AAA---C--C--TG-T-A--C--T-T--CA----AACAAAAAACAA--AACAC-CTA-------AAA------TTA---A--A-CA-C-CATTCTA-C----G--TGAGATGTGACTAG-ATGTGT----AAAG-AGTGAA-G-AGC-----GAATGCTTATGT-------ACA--A---AAAACGGAAT----CA--TTGCG-AAGAGATGGATGTGTGCGGCT---GA--TTGCA-TG-TGC-AA------GA--------ATAAAAGCGTGGGCC-----GTGT-------T--G-TGAGTGATG--TGAA--TGCGTGTGA-------C----TAT-ATA-TGT-GTCGAA----------------TCCTAT-----TACAGTCAAAACGTT-AA-AT-TTG----AAGTGT--ATGAAA-TGATTG-------AGGGA-T--AA----AAAT------A-TTCCACTGAG-AG-GTGATCAG-GC--TT--T-------A--C--AAA-CC-AAAACGTC-ACAGGGTGGTAC------TA---GCGTA----------TTCAGC-TTGGTGTGTGAGC-----T--CCCAAA--------------TTT-------------A---CAG-ACAT-------T-----TC------TGTG---------TTGT-CATTGTTT--TAC--AATATA-----C----GGTACGTGGACCAGAGA-----ACG-GTG--AT-TGGA-TTTCTTTTCTT-TATT-CATAATTGTCATTTATTTCAGT---AAAT-TT-C-TTT-C---ATGTTTA---------TATA-------------------T--------------AA---G--------------T--GAG---TTTACTTGTTGT-TAT--CC--CTGTG---------T-TTGATGTTA------AG------------CAT-AGAG-TGCATGGGA--TGAAATT-----G-G-G--GGAAA-TCTTCAACATC-A--GCTCAGT-AA-AT--A-----ACACT--------CCT-AC---AGATGC---T-G---ACT-GAGCAA---TGT-GTCAATTTG-AA--TTTGA----TCTCT-CATCACCAC-A---TGGACTGGCT-CTGTACTG----CTAT----C---------------------A----------AATTTATTGGACAGC--ACA-AGAACCAGT-C-TA-CC---T--AAG-----G-TACCA-GG----A-A------TGATAAA-TACCG---CC-AGA-T---ATGATAATGA------A--GTGTTGGAAAT-TCACTTTC--TGA-A-GCTCC---A--C-CCATGA-CAA-TAT-----C-T-----TATGACAAG--AG---G--CTC---CA--C---CC--TCTCTCCC-CA-C--T-T-TG-GAG----GT--CA-A-A-A-TT-----G-AGG-C-TC-C------AGA-GT-C--A--G-C--AT---TTTACACCAAGC
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           CTTGGTGTAAA---AT-G-C--TG-AC---------TCTGGA-G-C----C--TCAATTT-T-GACC-TC-CAAA--G-TGGG-GA-G--AG-A--GG-GT-GGAG-C-C--TC----T--TGTCAT---A-A-GATA----TTGTCA-TG-GG---TG-GAG--C--TT-C---A-GAAA-GTGA--ATT------TCC---A---A---CA-------------CT---------T-------------CA-TT------------
gi|6                          :                                                       cttggtgtaaaatctgctttgatctggagcctccaatttggacctccaaagtgagagagggtggagtctcttgtcataaggagatgtctgggctggatctattggagttgatttcaaaacataattttactctgtcatttaatttctaatatcctgtctcgtcctcaggttcgtgctatacaacataaattatcaagacaaaacagtcatttgaactaatttcccaaaccccatgccataatctgaaaagggccagaaaggccacgcaccataaacctgtacttcaaacaaaaaacaaaacacctaaaattaaacaccattctacgtgagatgtgactagatgtgtaaagagtgaagagcgaatgcttatgtacaaaaaacggaatcattgcgaagagatggatgtgtgcggctgattgcatgtgcaagaataaaagcgtgggccgtgttgtgagtgatgtgaatgcgtgtgactatatatgtgtcgaatcctattacagtcaaaacgttaaatttgaagtgtatgaaatgattgagggataaaaatattccactgagaggtgatcaggctttacaaaccaaaacgtcacagggtggtactagcgtattcagcttggtgtgtgagctcccaaatttacagacatttctgtgttgtcattgttttacaatatacggtacgtggaccagagaacggtgattggatttcttttctttattcataattgtcatttatttcagtaaatttctttcatgtttatatataagtgagtttacttgttgttatccctgtgtttgatgttaagcatagagtgcatgggatgaaattgggggaaatcttcaacatcagctcagtaaataacactcctacagatgctgactgagcaatgtgtcaatttgaatttgatctctcatcaccacatggactggctctgtactgctatcaaatttattggacagcacaagaaccagtctacctaaggtaccaggaatgataaataccgccagatatgatCTTGGTGTAAA---AT-G-C--TG-G-----AC---TCTGTA-GTCTC------CAATTTGG--ACG-TC-CAA---G-T--G-GA-G--AG-A--GG-GT-GGA--G-CCTT-----T--TGTCAT---A-A-GAGA----TTGTCA-G--GG---TG-GAG--C---T-TCA-G-A--A-GTGA--ATT------TC----A---A---CA-------------CT---------T-------------CA-CT------------TA----T--------------------------T--------------------------AT-A---T----C-------c
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             atttgttggtaggcaaagtacaagtgaatgggtggggcttcttgtcataagattgtcagggtggagccattggagttaatttcaaaacataatttactctgtcaattaatttctgacatcctggctgttcggatcatgtttgtttggctaaacataatagtttcaaaacaaaaacaagtcctttgaagctccctatataaactactttccccaaccccataccataatctgaaaagggcagaaggccagcaccataaatctgttacttcaaacaaaaacaaaacacactaaataatcaccatttcacaaaattaaatgattgaaagaaagataaagctgtatgaaatccaaaacatcacaaatcactccacctcagctttttacccctatatttacagggcattttattattattttgttttcttgtttgccattatttcataattttcattcattcatatataagaatgttataagaagtgagatttttttgtcatcccgtgtgtttgatagtgcatgatgaaattgggggaaatcttgaacaataacactcctgatagatgctgtactgagcaatatgtcaatttgtaaatttagatctctcaccactatacttggactggctctgtactgctatcgctacctcagatttattggacagcacagaaccagtctacctaggtacaggaacttgaaatgtcaCTTGGTGTAAA---AT-G-C--TG-ACT---------CTGGA-G-CC--TC---CAATTTGG--ACG-TC-CAAA--G-T--G-AA-G--AG-A--GG-GT-AGAG-T-C--TC----T--TGTCAT---A-G-GAGA----TTGTC--T--GGG--TG-GAG--CT-AT-T---G-G--A-GTTA--ATT------TCA---A---A----A-------------CA---------T-------------AA-TT------------CA----C--------------------------T--------------------------CT-G---T----C-------CT------------CAG-TGTTCG-------------TGG-CTAT-A---CACA-----TAA-AGTTATC-A--A-A-CCAAA-AA-CAAGTCATTT-GAAGCTCCTTAT-AT-AA-AT-T-AA-TT-----CCCCAA-------CACC-AT--------GC--C-ATAA-TATGA-AAAGGG--C-A-GA-AG-G-C------------CA-G-CACCATGAA----C--C--TG-TTA--C--T-T--CA----AACAAAAA-CAA--AACACACTA-------AAT------TTT---A--T-TG-T-ATTTTTA-C----A-ATc
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          gCTTGGT--AAA---AT-G-C--TG-ACT---------CTGGA-G-CC--TC---CAATTTGG--ATG-CC-CAAA--G-T--G-GAAG--AG-A--GG-GT-GGG--G-C--T-----TCTTGTCAT---T-A-GAGA----TTGTC--T--GG---TG-GAG--CT-AT-T---G-G--A-GT-A--ATTACTCTGTCATTTA---A---TT-------------TC---------T-------------GA-TA------------TC----C--------------------------TGG------------------------CT-G---T----C-------CT------------CAG-TGTTTG-------------TGG-CTA------AACA-----TAA-AGTTATC-A--A-A-C--AA-AAACAAGTCCTTT-GAAGCTCCCAAT-AT-AA-AC-T-AA-TT-----TCCCAAAC-----C-CC-AT--------A---CCATAA-TCTGA-AAAGGG--C-A-GA-A--GGC------------CA-G-CACCATAAA----C--C--TG-TTA--C--T-T--CA----AACAAAAA-CAA--AACACACTG-------AAA------ATA---A--T-CA-C-CATTTCA-C----A-ATAA----TTCATTG-AT---TG---AAAGAA----A-G-A-TAATTAAAAGCTTTATT--------ACATTT---AAAC---AATT--TCA-TTT-TGCAAAA-----ATATTtgtga
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           CTTGGTGTAAA---AT-G-C--TG-AC----AC----CTGGATG-CC--TC--CCAAGTTGG--ACGGTC-CAAAAGG-T--G-GA-G--AG-A--GG-GT-GGGCTT-C--T-----T--TGTCAT---A-A-GAGA----TTGTA--G--GG---TG-GAGC-C--AT-T---G-GG-A-ATTA--ATT------TCA---A---A----A-------------CA---------T-------------AA-TTACTCTCGCCATTTAA---T--------------------------T--------------------------CT-GAC-T----C-------CTGGCTGTATCGATCAG-TGTTTG-------------TGGGCTA------AACA-----TAA-AGTTATC-A--A-A-C--AAGAA-CAAGTCCTTT-GAAGCTCCCTAT-AT-AA-AC-T-AA-TTGTC--CTCCAAAAC----C-CC-AT--------C---C-ATAT-TATCG-AAGGGG--C-ACGA-A--GGC------------CA-GGCACCAT-TATTTTC--G--TG-TTA--C--TTTTTCA----AACTAAAA-CAATAAACACA-TACGAGAGGGAA------GTA---AGATACAGC-CATTTCA-C----ATATGA----AAAATTGTAT---T----AAA
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          gCTTGGTGTAAA---AT-G-C--TG-ACT---------CTGGA-G--TC--C--CCAATTTGG--ACG-TC-GAAA--G-T--G-GA-G--AG-A--AG-GT-GGA--G-CCTT-----T--TGTCATATAA-A-GAGA----TTGTT--CAGGG---TG-GAG--C--TT-C---A-G--A-AGTA--ATT------TCA---A---agctgtatgcaaatccaaaacatcacagatcactccattcagctttttacccctatatttacagggcattttattattattttgttttcttgtttgccattatttcataattttcattcatgcatatataagaatgttatcagaagtgagatttttgttgtcatcccgtgtgtttgatagtgcatgatgaaattgggggaaaatcttcaacaccagctcagtaaataacactcctgacagatgctgtcacgtgaagaactagtgcaaatctcttcacactatacttggactagcctgtactgcttaatctgctaccggatttattggcagcagagaacaccaagttacctaccgtagggtacaggaacattgtgaaatgtgaacagagtataataagtgaagtgtttgaaatatcacctctgaagctctccgacccctgacaaattttcacttatgacaataggctcctacctttctctccctctttggacgtttccacatggagaactccaggtcaggcattttacacca
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         aaacacaaaaggtccttttgaagctccctataataaaactaattggtccccccaaaaccccataccaccccacataattctgagaaaaggcccagaaggccccccaccgccgcagcacctaaatctgtttactttttcaaagcaacaaaaaccaaaacactataaaaaaaaatttatttatcaccatttcacaaaataattttaaatgattgtggaaagaaaagaaagataaagctgcaatcgtaattagcaaattccaaactatcaccagattcacaccatgcagcttatttttacccctatattacaggccattatcattattttttggttctgttgccgattatttctaattttcattcatgcatatataagaatatgtatctcaggtaagttggagattttgttttgtgtattcccgtgtttctgattttagtcgcatgaagtgaaattggcgggaaactttgaacttcaaggctcataaatacactcctgattttagatgccggtacggcaaatatatgtcaatttgtaaattttgaaatatctcttcaccactataatttggactggctctgtactgctacatctgcttacggtgctacctcaaaatttatttgaaagcaccagaaccagtcctactaggtacaagggaaaattgcaaaatgtcagatatgataacgtgaagtgCTTCGTGTAAA---AT-G-C--TG-ACT---------TTGGA-G-CC--TC---CAACTTTG-AACC-TC-AAAA--A-T--G-GA-A--AG-A--GA-GT-GGAA-C-C--TC----T--TGTCAT---A-A-GAGA----TTGTCA-G--GG---TG-GAG--C--TT-T---TTG--A-GATA--ATT------TAA---A---A----A-------------CA---------T-------------AA-TC------------TA----T--------------------------T--------------------------CT-G---T----CAT-----TT------------CAA-T-TTC--------------TGA---AT-CCTAAACA-----TAA-TGTTATCCA--A-A-C--AA-AA-CAAGTCCTTT-GAAGCTCCCTAC-AT-AA-AG-T-CATTT-----CCCCAAAC-----C-CC-AT--------GC--C-ATGA-TCTGA-AAAGGG--C-A-GATG--G-C------------AA-A-CATT-T-AG----CATC--TG-TTA--C--------------AC------------ACACACTA-------A-------------------C--------------------TAA----CTAATTG-AC---------AGA-A----A-G-A-T-----ATA-GCTTATT--------------------CT----TT--TTA-C------AAAA-----ATATTC-TTGCT---GA--TCACAGTT-TGCAAG------GA--------A----------AAC------CTGT-------TTAA-T-----AT---------TAC---TGTA------C----TAT-
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           CTTGGTGT---------------G-ACT---------CTGGA-G-CT--TC---CAAATTAG--AC---C-TAAA--A-T--G-GA-G--AG-A--G-----GGA--C-C--TC----T--TGTC-T---A-A-GAGA----TTGTCAAA--GG---TG-TAG--C---T-TCAAG-A--A-GT----ATT------TCA---A--------G-------------CT---------T-------------AA-CT------------TA----TTGCA----------------------T--------------------------CT-G---T----CAT-----TT------------CAT-TGTCC--------------c
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ttgctttattgttatcatgaattccttatatcttaaaaaacttgtttggattttatttattttattggaaacatgcaattacagaatgcttataaaaaggtgggtttttttgtgccatccctgtgatttgatagtgcatgaatggataggtagggaatcttgaactcaagctcagtaaatattagatacttaaaaatccctgacagatgctgtactggagcaatggagtcagtatgtgaattcgatctctcatcaccacaatgggactggctctgtactgcatcctatataaggacagcaagaaaacattctactatgtacgtatacCTAGGTGTGAA---AC-G-C--TG-ACT---------CTGGA-A-C-CTTC--A--ATTTTG--ACG-TC-CAAA--G-T--G-GA-G--AG-A--GGCGTGGGG--T-C--TC----T--TGTCAT---A-ACGAGA----TTGTC--TG-GG---TG-GAG--CT-AT-T---G-G--AGGTTA--ATT------TCA---G---A---AA-------------Cccttt
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           CTTGGTGTAAA---AT-G-C--TG-AC---------TCTGAA-GTCTC--C--AC--TTT-G-GATG-CC-CAAA--G-T--G-GA-G--AG-A--
gi|39                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ggCTTGGTGTAAA---AT-G-C--TG-A-----------CTGGA-G-CC--TC---CAATTT-G-GACG-TC-CAAA--G-T--G-
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          gCTTGCTGTAAA---AT-G-G--TG-AC---------TCTGGA---CCCTCC--AC--TTTTG-GACC-TC-CAAA----T--G-GA-G--AG-A--GG-GT-G
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           CTTGGTGTAAA---AT-G-C--TG-A-----------------------TC--A-----TGG-AACA--C-CAAA--A-T--C-GT-G--AG-G--GA-GT-GGG--T-C--T-----C--T
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         aaaTTGGTGTAAA---AT-G-CCCTG-ACT---------CTGGA-G-C----C--TCAATTTTG--ACC-TC-CAAA--G-T--G-GA-G--AG-A--GG-GT-GGAG-C-C--TC----T--TGTCAT---A-A-GATA----TTGTCA-TG-GG---TG-GAG--C---T-TCA-G-A--A-ATGA--ATT------TCA---A---cct
gi|5                          : ggtgtaaatatctgcttgaactctggagcctccaatttggacctctcaaagtgagagagggtgggttctcttgtcataaggagattgtctgggtggatctattggagttgatttcaaaacataatttttactctgtcatttaatgttgtctgaatttcctgtctgcgtcacctcaggtttggctataacataagattatcaagacaaaaacaagtcatttatgatactgaattcccaaaatgcgctcccatgggccataatctgaaaagggccagaaaggccagcaccataaaccctgtagtctattcaaacaaaaacaaaactaaattacacattcacgtgaagtgataatttcagagtagcgcaatttttcacaaacggacatgcaaaactgattgatcgtctgatgaacaggtctgctatagaattaacaattatgaaaatcgtggtaagacgttacagtgtatttgagttgttcattgtgaattcctgattagaagctattatatgtgttcgaaagtcctattacagtcaaacgtaaattttgtataattagaacgattgtattttaagcgagggaattgaaataatatgtccacagaggtgatcagcgctttacaaaccaaaacgtccacagtggtactagcgtaatttcatgtcttttgtagccccaacaatttagaacaggacatttctgtgttgttcattgtttggtacatataccggtacgtggacaaaacgtgtttgattggatttcttttctttatttcataattgtatttatttcataaatttcttcatgtatatataagtgagtttactgttgttatcccttgtgtttgatgttaagcatagagtgcatgatgaaattgggggaaatcttcaacatcagctcagtaaataacactcctgacagatgctgtactgagcaatgtgtcaatttgtaaattttgatctctcatcaccacattggactggctctgtactgctatcaaatttattggacagcacagaaccagtctacctaagtacaggaatgataaatagcagatatgatagatgaagtgTTAGCGTAAA---AT-G-C--TG-ACT---------CGGGA-G-CC--TC---CAATTTGG--ACG-GC-CAAA--G-T--G-GA-G--AG-A--GG-GT-GGAG-C-C--TC----T--TGTCAT---A-A-GAGA----TTGTCA-G--GG---TG-GAG--C---T-TCA-G-A--A-GTGA--ATT------TC----A---A---CA-------------CT---------T-------------CA-CT------------TA----CTATA----------------------T--------------------------CT-G---T----CAT-----TT------------CAA-TTTCC--------------TG
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ataccataatctgaaaagggcagaaggtcagcaccataaacctattacaatgtacttcatcaccatttcacaataaattgattgaaagaaagataaagcaatttcatttgcaaaaatatttctgctgatcgcagtttgcaaggaatacgtgtttattatttaatactgtattatcgtgtcgtcgaagattctcttaaagaagtcctatgcagatgcagtcaaaggttaattttgacttataaaataatggaaggagaatgaaatttatatgtcaacaggatgatcagctaacaaatccaaaacatcacagactagcgttgaaatgcactccactcagctttttacccaagatttacaggacatgttattatcattttgttttcttgttttacatatatacctggtacatgaagaacttgtggattggatatcataattgtcacttatttcataaatttcattcatgcatatataagaatgttatcagaagtgagtttttgttgtcatcccctgtgtttgatagtgcatgatgaaattgagggaaaatcttgaacatcagctcagtaaataacactcctgacagatgctgttctgagcaatgtgtcaatttgcaaattgtgatctctcatcaccacattggactggctctgtactgctatctgctacagcacataaccagtctaccttaggtaTGGTGTAAA---AT-GCC--TG-AC----------CTGGA-G-TTCTCC-----ATGTGGAAACG-TC-CAAA--GAG--G-GA-G--AGAA--AG-GTAGGAG-C-C--TA----T--TGTCAT---A-A-GTGAAAATTTGTC--A--GGGGTCG-GAGAGC--TT-C---A-G--A-GGTGATATT------TCA---A---A---CA-------------CT---------T-------------CA-CTTATTA-------TA----C--------------------------T--------------------------CT-G---T----T-------CA------------CA
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   gcttggtgtaaaatgctgacacctggatgcctcccaagttggacggtccaaaaggtggagagagggtgggcttctttgtcataagagattgtagggtggagccattgggaattaatttcaaaacataattactctcgccatttaattctgactcctggctgtatcgatcagtgtttgtgggctaaacataaagttatcaaacaagaacaagtcctttgaagctccctatataaactaattgtcctccaaaaccccatccatattatcgaaggggcacgaaggccaggcaccattattttcgtgttactttttcaaactaaaacaataaacacatacgagagggaagtaagatacagccatttcacatatgaaaaattgtattaaaagctgtatgcaaatccaaaacatcacagatcactccattcagctttttacccctatatttacagggcattttattattattttgttttcttgtttgccattatttcataattttcattcatgcatatataagaatgttatcagaagtgagatttttgttgtcatcccgtgtgtttgatagtgcatgatgaaattgggggaaaatcttcaacaccagctcagtaaataacactcctgacagatgctgtcacgtgaagaactagtgcaaatctcttcacactatacttggactagcctgtactgcttaatctgctaccggatttattggcagcagagaacaccaagttacctaccgtagggtacaggaacattgtgaaaTGGTGTAAACACATTG-C--TGGACT---CT---TGTGAG-C-CTC--C--A-AATTATG-GACG-GC--AAA--G-T--G--A-G--AG-A--GG-GT-GGAG-C-C--TC----T--TGTCAT---A-A-GAGA----TTGTCA-T--GG---TGTGGAGCC--AT-T---
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tggacagcacacgaaccagttctatcctaggtacaggaaattgaaaatgacagaggctaataatctcacgctgGGTGTAAAT--AT---C--TG--CTTGAAC---TCTGGA-G-CC--TC---CAATTTGG--ACC-TCTCAAA--G-T--G--A-G--AG-A--GG-GT-GGG--TTC--TC----T--TGTCAT---AAG-GAGA----TTGTC--T--GG------GTGGATCTAT-T---G-G--A-GTTG--ATT------TCA---AAACA---TAATTTTTACTCTGTCA---------TTTAATGTTGTCTGAA-TT------------TC----C--------------------------TGT------------------------CT-G---CGTCAC-------CT------------CAG--GTT---------------TGG-CTAT-----AACA-----TAA-GATTATC-A--AGA-C--AA-AAACAAGTCATTT--------------AT-GATAC-TGAA-TT-----CCCAAAATGCGCTC-CC-AT--------GGGCC-ATAA-TCTGA-AAAGGG--CCA-GA-AAGG-C------------CA-G-CACCAT-AAAC--C--C--TG-T-AGTC--TATT-CA----AACAAAAA-CAA--AAC----TA-------AA-------TTA--------CA-C--ATT-CA-CGTGAA-GTGA----T-AATT---T---C----AGAG-T----A-GCG-C-----AA---TTTTTCACAAACGGACA--TGCAAAACT--GATTGATCG--TC-TG-ATGA-----ACAGGT-CTGCTATAGAATTAACAATTATG--AA------AATCGTGGTAA----------GACGTTACAGTGTATTTGAGTT-G-TTC---ATTG-T-GAATTCC---TGATTAGAAGC----TATTATA-TGTGTTCGAAAG--------------TCCTAT-----TACAGTCAAA--CGT-AAATT-TTGTATAA--T-T--A--GAA-CGATTGTATTTTAAGCGA-GGGAA-TTGAAATAA-TA-T-GTCCAC---AGAG-GTGAT-CA-GCGCTT--T-------A--C--AAA-CC-AAAACGTCCACAGTGGT--AC------TA---GCGTAAT--------TTCA-TGTC----------TTTTGTAGCCCCAACAA------------TTT-------------AGAACAGGACAT-------T-----TC------TGTG---------TTGTTCATTGTTTGGTAC--A-TATA-----C--C-GGTACGTGGACAA---A-----ACGTGTTTGAT-TGGA-TTTCTTTTCTT-TATTTCATAATTGT-ATTTATTT-CAT---AAAT-TT-C--TT-C---ATGT--A---------TATA-------------------T--------------AA---G--------------T--GAG---TTTA-CTGTTGT-TATC-CC--TTGTG---------T-TTGATGTTA------AG------------CAT-AGAG-TGCATG--A--TGAAATT-----G-G-G--GGAAA-TCTTCAACATC-A--GCTCAGTAAA--T--A-----ACACT--------CCTGAC---AGATGC------TGTACT-GAGCAA---TGT-GTCAATTTGTAAATTTTGA----TCTCT-CATCACCAC-A--TTGGACTGGCT-CTGTACTG----CTAT----C---------------------A----------AATTTATTGGACAGC----ACAGAACCAGT-C-TA-CC---TA-A-------G-TA-CA-GG----A-A------TGATAAA-T---A---GC-AGA-TATGATA--GATGA------A--GTGTT-GAAAT-TCA-TTTC--TGA-A-GCTCC---A--C-CCATGA-CAA-TAT-----C-T-----TATGACAAG--AG---G--CTC---CA--C---CC--TCTCT--C-CA-C--T-T-TG-GAG----GT--CA-A-A-A-TT-----G-AGG-C-TC-C------AGA-GT-C--AGGG-C--AT---TTTACACCAA
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               GTGTAAA---AT-G-C--TG-ACT---CTAGATCTGGA-G-CC--TC---CAATTTGG--ACG-TC-CAAA--G-C--G-GA-G--AG-A--GG-GT-GGA--G-C--T-----TCTTGTCAT---A-A-TAGA----TTGTC--T--GGG--TG-GAG--CT-AT-T---G-G--A-GTTA--ATT------TCA---A---A----A-------------CA---------T-------------AA-TT------------TA----C--------------------------TCTGTGATTTAATTTCTAACATCCTGGCT-G---T----C-------CT------------CAG-TATTTG-------------TGG-CTA------AACA-----TAA-AGTTATCAA--A-A-C--AA-GA-CAAGTCTTCT-GAAGCTCCCTAT-AT-AA-AC-T-AATTT-----CCCCAAAC-----C-CC-AT--------AC--C-ATAA-
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ttGTGTAAA---AT-G----TG-ACT---AT------GGA-G-CC--TCCAATAAT-----GACC-TC-CAAA----T--G-GA-G--AG-----G-GT-GTA--C-C--TCAATCT--TGTCAC---A-A-GAGA----TTGTCA-G--GG---TG-GAG--C--TT-T---G-T--A-GTTA--CTT------TAA---A---ACTTTAAT-----------TATTTTGTCTTT-------------AATTT------------TACATCC--------------------------T--------------------------TT-A---TC---C-------CC------------CAA-TATTTG-------------TGG-CCTT-A---AACA-----TAA-ATTTATC-CTTG-A-CA-AA-AA-CAAGCC-TTT--AAGCTTGC-A--AT-AA----T-AA-TT-----CCCAAA-------C-CG-AT--------A---C-
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tt-CTCTTC--AC--TTTGG--ACG-TC-CAAA--T-T--G-GA-G--cat
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           gcttggtgtaaaatgctgactctggagc-CTCTCC--AC--TTTGG-G-CA-TC-CAAA--G-T--G-GA-G--Aagggtagagtctcttgtcataggagattgtctgggtggagctattggagttaatttcaaaacataattcactctgtcctcagtgttcgtggctatacacataaagttatcaaaccaaaaacaagtcatttgaagctccttatataaattaattccccaacaccatgccataatatgaaaagggcagaaggccagcaccatgaacctgttacttcaaacaaaaacaaaacacactaaattttattgtatttttacaattgtga
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ggcttggtgtaaaatgctgactctgaagCAATTTGG--ACC-TC-CAAA--G-T--G-GA-GAGAG-A--GG-AT-GGAG-C-C--TC----T--TGTCAT---A-A-GAGA----TTGTC--a
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              cat-CAAA--G-T--ACAA-G--TG-AATGG-GT-GGG--G-C--T-----TCTTGTCAT---A----AGA----TTGTCA-G--GG---TG-GAGC-C--AT-T---G-G--A-GTTA--ATT------TCA---A---A----A-------------CA---------T-------------AA-TT------------TA----C--------------------------TCTGTCAATTAATTT------------CT-GACAT----C-------CT------------GGC-TGTTCGGATCATGTTTGTTTGG-CTA------AACA-----TAATAGTT-TC-A--A-AAC--AA-AAACAAGTCCTTT-GAAGCTCCCTAT-AT-AA-AC-T-AC-TTT----CCCCAA-------C-CCCAT--------A---CCATAA-TCTGA-AAAGGG--C-A-GA-A--GGC------------CA-G-CACCATAAA----T--C--TG-TTA--C--T-T--CA----AACAAAAA-CAA--AACACACTA-------AA--------TA---A--T-CA-C-CATTTCA-C----A-A-AA----TTAAATG-AT---TG---AAAGAA----A-G-A-T-----AAAGCTGTATGA-------Ag
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  atttgttggtaggT-GGAG-T-C--TC----T--TGTCAT---A-G-GAGA----TTGTC--T--GGG--TG-GAG--CT-AT-T---G-G--A-GTTA--ATT------CCA---A---A------------------CA---------T-------------AA-TT------------TA----C--------------------------T--------------------------CT-G---T----CATTTAATTT------------CTGATATCC--------------TGG-CTGT-C---CTCAGTGTTTAA-AGTTATC-A--A-A--------A-CAAGTCATTT-GAA---CCC-----------------------------------------C-AT--------GC--C-ATAA-TCTGA-AAAGGG--atccaaaacatcacaaatcactccacctcagctttttacccctatatttacagggcattttattattattttgttttcttgtttgccattatttcataattttcattcattcatatataagaatgttataagaagtgagatttttttgtcatcccgtgtgtttgatagtgcatgatgaaattgggggaaatcttgaacaataacactcctgatagatgctgtactgagcaatatgtcaatttgtaaatttagatctctcaccactatacttggactggctctgtactgctatcgctacctcagatttattggacagcacagaaccagtctacctaggtacaggaacttgaaatgtcagatataataagtgaagtgttgaaattcacttctgaagctccaccctgacaatctcttatgacaaaaggctccaccctctctccacttggacgtccaaattggagactacagagtccagcattttacaccaagc
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 --GG---TG-GAG--C--TTCT---C-A--A-GTGA--ATT------TCA---ACACA---TA-------------GC---------T-------------AA-TT------------CA----A--------------------------T--------------------------CT-G---T----CAT-----TT------------CAA-TTTCC--------------TG---TAT-C---AA
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          gtc-A--A-A-C--AC-AA-AAGGTCCTTTTGAAGCTCCCTATAATAAA-AC-T-AA-TTGGTCCCCCCAAAAC----C-CC-ATACCACCCCA---C-ATAATTCTGAGAAAAGGCCC-A-GA-AG-G-CCCCCCACCGCCGCA-G-CACCTA-AA----T--C--TGTTTA--CTTTTT--CAAAGCAACAAAAACCAA--AACACTATA-------AAAAAAAATTTATTTA--T-CA-C-CATTTCA-CAA--A-ATAATT--TTAAATG-AT---TGTGGAAAG-A----A-A-A-G-----AAAGATcttccccctctataaaactagcagccctagcccctcgctattcttggaattttgttcaaactgactag
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               AAATCCTTT-GAAACTCCATAC-AT-AA-ACAC-AT-TT-----CCTC---------C-CT-AT--------AT--C-ATGA-TCTGA-AAAG-----------------------------------ACC-T-TG----C--CTTTG-TTA--C---GT--CA----AACACAAA-CAA--GA------A-------AAACC----TTA---------A-C-CATTTCA-C----A-ATaaagctgcaatcgtaattagcaaattccaaactatcaccagattcacaccatgcagcttatttttacccctatattacaggccattatcattattttttggttctgttgccgattatttctaattttcattcatgcatatataagaatatgtatctcaggtaagttggagattttgttttgtgtattcccgtgtttctgattttagtcgcatgaagtgaaattggcgggaaactttgaacttcaaggctcataaatacactcctgattttagatgccggtacggcaaatatatgtcaatttgtaaattttgaaatatctcttcaccactataatttggactggctctgtactgctacatctgcttacggtgctacctcaaaatttatttgaaagcaccagaaccagtcctactaggtacaagggaaaattgcaaaatgtcagatatgataacgtgaagtgttgaaattacttctgaagctccaccctgaacaatctctttatatgacaaaaggctccaccttctctccactttcgacgtccaaattggggactccagagtcagcattttacaccaag
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ---C-ATAA-TCTGA-AAAGGG--C-A-GA-A--GGT------------CA-G-CACCAT-AAA---C--C--TA-TTA--C---------------------------AATGTACT------------------TC---A--T-CA-C-CATTTCA-C----A-ATAA-------ATTG-AT---TG---AAAG-A----AAG-A-T-----AAAG----------------------------C--AATT--TCA--TT-TGCAAAA-----ATATTT-CTGCT---GA--TCGCAGTT-TGCAAG------GA--------A----------TACG------TGT-------TT-A-TT----ATT--T-AA--TAC---TG-------------TATTATCGTGTCGTCGAAGATTCTCTTAAAGAAGTCCTATGCAGATGCAGTCAAA--GGTTAA-TT-TTG----AC-T-T--AT-AAAATAATGG-------AAGGA-G--AA-T--GAAATT-TATATGTCAAC---A-GG-ATGAT-CA-GC--TA----------A--C--AAATCC-AAAACATC-ACAG------AC------TAGCGTTG-AAA--------TGCA-C-TC----------C-----A--CTCAGC--------------TTTTTACCCAAGATTTA---CAGGACATGTTATTATCA---TT------T-TG---------TTTT-CTT-GTTT--TAC--A-TATATA---C--CTGGTACATGAAG-----A-----ACTTGTG-GAT-TGGA-------------TA--TCATAATTGTCACTTATTT-CAT---AAAT-TT-C-ATT-C---ATGC--A---------TATA-------------------TAAGAATGTTATCAGAA---G--------------T--GAG---TTT--TTGTTGT-CATC-CC--CTGTG---------T-TTGATA------------------------------G-TGCATG--A--TGAAATT-----GAG-G--GAAAA-TCTTGAACATC-A--GCTCAGT-AA-AT--A-----ACACT--------CCTGAC---AGATGC------TGTTCT-GAGCAA---TGT-GTCAATTTGCAAATTGTGA----TCTCT-CATCACCAC-A--TTGGACTGGCT-CTGTACTG----CT----------------------------------------ATCTGCT--ACAGCACAT----AACCAGT-C-TA-CC---TTAG-------G-TA-CA-GGA---A-A-T----TG--AAA-T---G---AC-AGA-T---AT---AGTAA-G-TGAA--GTGTT-GAAAT-TCA-CTTC--TGA-A-GCTCC---A--C-CC-TGA-CAA-TCT-----C-T-----TATGACAAG--AG---G--CTC---CA--C---CC--TCTCT--C-CA-C--T-T-TG-GCC----GT--CC-A-A-A-TTG----G-AGG-C-TC-C------CGA-GT-C--A--G-C--AT---TTTACGCTAAgcatgtacatgtaattactaaaaaaaaatattactgtatt
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           atacAA-TCTGA-AAAGGG--C-A-GA-A--GGC------------TA-G-CACCAT-AAA---C--C--TG-TTA--C--T-T--CA----AACAAAAA-CAA--AA------------------------TA---A--T-CA-C-CATTTCA-C----A-ATAA----TTAATTG-AT---TG---AAAGAA----A-G-A-T-----AAAGCTTT-TTT-------ACATTT---AGAC---AATT--TCA-CTT-TG--------------TT-CTGCT---GA--TCGCAGTT-TGC-AA------GG--------A----------
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     A-A--G-C------------CC-G-CACCAT-AAA---C--C--TG-TTA--C--T-T--CA----AACAAAAA-CAA--AACACACTA-------AAA------TT----A--T-CA-CTCATTTCA-CA---A-ATAA----TTAATTG-AT---T----AAGA-A----A-G-A-TAA---AAAGACTTAATT-------ACAATT---AAA----AATT--TCA-CTT-TGCAAAA-----ATATTT--TGCT---GA--TCGCAGTTGCA--AG------GA--------A----------GAC------GTGT-------TT-GAT-----ATT--T-AA--TACA--TGTA------C----TAT-ATCATGTCGTCGAAAG--------------TCCTAT-----TACAGTCAAA--GGT-AA-TT-TTG----AT-T-T--ATAAAA-TAATGG-------AGGGA-G--AA-T--AAA-AT-TA-T-GCCAAC---A-AGTGTGAT-CA-GC--T---T-------A--CA-AA--TC-CAAACATC-ACAG------ACTCAGCAT----TTG-AAA--------TTCA-C-TC----------C-----A--CTCGGCTTTTACCCCAAGA-TTT-------------A---CAGGACAT-------TCATTATT------T-TGTTTTTTGT-TTGT-CAT-GTTT--TACATA-TATA-----C--CTGGTACATGGAG-----A-----ACTTGTG-GAT-TGGATTT-CTTTTCTT-TATTTCATAATTttgagacgtg
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TA--C--TTT--CA----AACAAAAA-CAA--AACACACTA-------AAA------TTA---A--A-CA-C-CATTTCA-C----A-ATAC----TTAATTG-AT---T----
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       CAAACCA-------AAA--------A---C--T-CA-C-AATTTCAAC----A-ATAA----TAAATTG-GA---C----AAAG-A------T-A-T-----AC---TTTAT---------ACA--T---TTAC---AGTC--ACGG----TG-CAAA-----ATATTT-CTGCT---GA--TCGCAGTT-TGC-AA------GA--------A----------AGCT-----GCTT-------TA-A-T-----ATTACT--A--CAC---T-AT------CACAATGT-ATC-AGTCATAGAA
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             t--AATT--TCACTTT-TG-CAAA-----ATATTT-CTTGT---GA--TCGCAGTT-TGC-AATTGAGGGA--------A----------GAC------GTGT-------TT-T-T-----ATT--A-AT--TAC---TG-T------A----CAT-ATCATGTCGggatttt
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         aaaaaaaaaaaaCAGTCAAA--GGT-AA-ATATTG----A--T-TGTAT-AAA--GA-GG-------AGGGAAG--AAGT--GAAATC-TA-T-GTCAAC---A-AG-GTGAT-----C--TAGCT-------G--C--AA--TC-CAAACATC-ACAG------Aaaaaattttcaaa
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  attaatacgtacatcgatgtcgttggtaagatttcttataagatctatgcacgaat-AAA-TAAAAG-------AGAAA-G--AA-T--GACCTT-TATATGTCAAC---A-AG-GTGAT-CA-GC--TA--CATATGTAA--C--AAATCC-AAAACACC-ACAG------A
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ATGG-------AGGGA-G--AA-T--AAAATT-TA-T-GCCAAC---A-AG-GTGAT-CA-GC--T---T-------A--C--AAATCC-AAAACATC-ACAG------ACTAGCG-T----TTG-AAA--------TTCA-C-TC----------C-----A--CTCGGCTTTTTACCCCAAGATTT-------------A---CAGGACAT-------T-----TCATTATTT-TGTTTTCTTGTTTGT-CAT-GTTT--TACATA-TATA-----C--CTGGTACATGGAG-----A-----ACTTGTG-GAT-TGGATTT-CTTTTCTT-TATTTCATAATTccagggtgcaaatgcaaatttgaaaatttgacgcctctatatatttaattacgtctgtattgcaatttctgcacttgtcttatctaatacaatatgacagaaaaaataattgatctctgtcggtgttaaaatagatgaaaggggagaactcagttttctgcatgaaactagaatgtggttatcattcactaacgttcacatgttaatgtaaagatttctcactgcagtatgtcaggtatcagctgtatcctgcttaacggacttctaaaaacaatgagcatgacgagttaccaatttttatttcatctcctttgtaattgagagtattctaacattcttttcattttctcacgtcctaatttgatagttcacctcaatgagtctgactagtcagtttgattattcaaagtcataa
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             aTTTATA-T-GTCAAC---A-CG-GTGAT-CA-GC--TAA-T-------A--A--AC--CC-AAAACATC-ACAG------AC--------------TAGAGTTCATCCTTCA-C-TC----------C-----A--CT
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       GAT-AAAGC--TG--T-------A--TGAAA--TCCAAAACATC-ACAA------A----------------------------TCA-C-TC----------C-----AC-CTCAGCTTTTTACCCCTATATTT-------------A---CAGGGCAT-------T-----TTA-----T-TA---------TTAT-TTT-GTTT--Tggt
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 atttgttggtaggcaaagtacaagtgaatgggtggggcttcttgtcataagattgtcagggtggagccattggagttaatttcaaaacataatttactctgtcaattaatttctgacatcctggctgttcggatcatgtttgtttggctaaacataatagtttcaaaacaaaaacaagtcctttgaagctccctatataaactactttccccaaccccataccataatctgaaaagggcagaaggccagcaccataaatctgttacttcaaacaaaaacaaaacacactaaataatcaccatttcacaaaattaaatgattgaaagaaa-AA-GC--TG--T-------ATGC--AAATCC-AAAACATC-ACAG------A----------------------------TCA-C-TC----------C-----A--TTCAGCTTTTTACCCCTATATTT-------------A---CAGGGCAT-------T-----TTA-----T-TA---------TTAT-TTT-GTTT--Tcttgtttgccattatttcataattttcattcattcatatataagaatgttataagaagtgagatttttttgtcatcccgtgtgtttgatagtgcatgatgaaattgggggaaatcttgaacaataacactcctgatagatgctgtactgagcaatatgtcaatttgtaaatttagatctctcaccactatacttggactggctctgtactgctatcgctacctcagatttattggacagcacagaaccagtctacctaggtacaggaacttgaaatgtcagatataataagtgaagtgttgaaattcacttctgaagctccaccctgacaatctcttatgacaaaaggctccaccctctctccacttggacgtccaaattggagactacagagtccagcattttacaccaagc
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     gcttggtgtaaaatgctgacacctggatgcctcccaagttggacggtccaaaaggtggagagagggtgggcttctttgtcataagagattgtagggtggagccattgggaattaatttcaaaacataattactctcgccatttaattctgactcctggctgtatcgatcagtgtttgtgggctaaacataaagttatcaaacaagaacaagtcctttgaagctccctatataaactaattgtcctccaaaaccccatccatattatcgaaggggcacgaaggccaggcaccattattttcgtgttactttttcaaactaaaacaataaacacatacgagagggaagtaagatacagccatttcacatatgaaaaattgtattaaT-------T-----TA------T-TG---------TTAT-CAT-GAAT--TCC--T-TATA-----T--CT--TAAA---A------A-----ACTTGT----T-TGGA-TT-TT----------------------ATTTATTT-TATTGGAAACATG-CAATTACAGAATGC--T---------TATA-------------------A--------------AAAG-G--------------T--GGG---TTTT-TTTGTGC-CAT--CC--CTGTG---------ATTTGATA------------------------------G-TGCATGA-A--TGGA--T-----A-G-GTAGGGAA-TCTTGAAC-TCAA--GCTCAGTAAATATTAG-----ATACTTAAAAATCCCTGAC---AGATGC------TGTACTGGAGCAA---TGGAGTCAGTATGTGAA-TTCGA----TCTCT-CATCACCACAA--TGGGACTGGCT-CTGTACTGCATCCTAT----A---------------------T----------AA------GGACAGCA---AGAAAA-CATT-C-TA-CTATGT--AC------G-TA-TACGG----ACA-A----TG--AAA-T---G---AC-AGA-T---GC---AATAA-G-TT-A--AGCTT-GAAAT---A-CTTCT-TGA-A-GCTAC---A--C-CTTTGA-CAA-TCT-----C-T-----TA-GACAAG--A----G--GT--------C---CC--TCTCT--C-CA-T--T-T-T---AG----GT--CT-A-A-T-TTG----G-AAG-C-TC-C------AGA-GT-C------------------ACACCAAGCcttgtttgccattatttcataattttcattcatgcatatataagaatgttatcagaagtgagatttttgttgtcatcccgtgtgtttgatagtgcatgatgaaattgggggaaaatcttcaacaccagctcagtaaataacactcctgacagatgctgtcacgtgaagaactagtgcaaatctcttcacactatacttggactagcctgtactgcttaatctgctaccggatttattggcagcagagaacaccaagttacctaccgtagggtacaggaacattgtgaaatgtgaacagagtataataagtgaagtgtttgaaatatcacctctgaagctctccgacccctgacaaattttcacttatgacaataggctcctacctttctctccctctttggacgtttccacatggagaactccaggtcaggcattttacacca
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ttgc---------TTGT-CAT-GTTT--TAC--A-CAAAGAATTC--C--ATATATAAA------AGTTAAACTTATG--ATTTGGA-TT-TTTTTCTC-TATTTTAT--------------T-AA----AAA-----C-ATG-C---ATGC--ACAAGAATGCTATA-------------------C--------------AAACTG--------------G--GAG---TTT---TGTTGT-CATC-CC--TTGTGTTTGATGGTG-CTGATGAAATTGAGGAGGGGGGGGGTCTGC-TTGATGGTGC-TG--A--TGAAATTCGGGGG-G-G--GGGGA-TCTTGAACGTC-A--GCTCAGTATA-AT--ACATAGACA-T--------CCTGAC---AGATAC------TGTACT-GAGCAA---T---------TTGTGAATTTTGA----TCTCT-CATCTCCAC-A--TTGGACTGGAT-CTGTcttt
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         gtT-CAT-GTTT--TAC--A-TATA-----TATCTGGTACATGAA------G-----ACCT-----------A-TT-ATTA----ATATTTCATAATGATCATTTATTT-CAT---AAAT-TTTC-ATT-C---ATGC--A---------TATA-------------------T--------------AA---GAATGTTATTAGAAGT--GAGGTGTTTT-TTTTGGT-CA---CCCCTTGTG---------T-TTGATA------------------------------G-TGCATG--A--TGAAATTG----G-G-G--GGAAA-TCTTGAACATC-A--GCTCAGT--T-AT--A-----ACACT--------CCTGAC---ATATGC------TGTACT-GAGCAA---TGT-GTCAATTTG
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 A-TT-ATTATTTTGT-TTTCTTGTTTGCCATT-ATTT-CAT---AATT-TT-C-ATT-C---ATTC--A---------TATA-------------------T--------------AA---GAATGTTATAAGAAGT--GAG---ATT--TTTTTGT-CATC-CC--GTGTG---------T-TTGATA------------------------------G-TGCATG--A--TGAAATT-----G-G-G--GGAAA-TCTTGAACA-----------------AT--A-----ACACT--------CCTGAT---AGATGC------TGTACT-GAGCAA---TAT-GTCAATTTGTAAATTTAGA----TCTCT-CACCACTAT-AC-TTGGACTGGCT-CTGTACTG----CTATCGCTACCTC-----------------A----------GATTTATTGGACAGCA-C---AGAACCAGT-C-TA-CC---T--A-------GGTA-CA-GG----A-ACT----TG--AAA-T---G---TC-AGA-T---ATA--A-TAA-G-TG-AA-GTGTT-GAAAT-TCA-CTTC--TGA-A-GCTCC---A--C-CC-TGA-CAA-TCT-----C-T-----TATGACAAA--AG---G--CTC---CA--C---CC--TCTCT--C-CA-C----T-TG-GAC----GT--CC-A-A-A-TTG----G-AGA-C-TA-C------AGA-GTCC--A--G-C--AT---TTTACACCAAGC
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           atttgttggtaggcaaagtacaagtgaatgggtggggcttcttgtcataagattgtcagggtggagccattggagttaatttcaaaacataatttactctgtcaattaatttctgacatcctggctgttcggatcatgtttgtttggctaaacataatagtttcaaaacaaaaacaagtcctttgaagctccctatataaactactttccccaaccccataccataatctgaaaagggcagaaggccagcaccataaatctgttacttcaaacaaaaacaaaacacactaaataatcaccatttcacaaaattaaatgattgaaagaaagataaagctgtatgaaatccaaaacatcacaaatcactccacctcagctttttacccctatatttacagggcattttA-TT-ATTATTTTGT-TTTCTTGTTTGCCATT-ATTT-CAT---AATT-TT-C-ATT-C---ATGC--A---------TATA-------------------T--------------AA---GAATGTTATCAGAAGT--GAG---ATTT-TTGTTGT-CATC-CC--GTGTG---------T-TTGATA------------------------------G-TGCATG--A--TGAAATT-----G-G-G--GGAAAATCTTCAACACC-A--GCTCAGTAAA--T--A-----ACACT--------CCTGAC---AGATGC-TGTCACGTGAA-GAACTA----GT-G-CAA-------------A----TCTCTTCA-CACTAT-AC-TTGGACTAGC--CTGTACTG----CT-T----A---------------------ATCTGCTACCGGATTTATTGG-CAGCA-G-AGAACACCAAG-T-TA-CC---T--ACCGTAGGG-TA-CA-GG----A-A-CATTGTG--AAA-T---GTGAAC-AGAGT---ATA--A-TAA-G-TG-AA-GTGTTTGAAATATCA-CCTC--TGA-A-GCTCTCCGA--C-CCCTGA-C-A-AATTTTCAC-T-----TATGACAAT--A----GG-CTC---CTACC---TT--TCTCT--C-CCTC--T-T-TG-GAC----GTTTCC-A-C-A-T-G----G-AGAAC-TC-C------AG--GT-C--A--GGC--AT---TTTACACCA
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gcttggtgtaaaatgctgacacctggatgcctcccaagttggacggtccaaaaggtggagagagggtgggcttctttgtcataagagattgtagggtggagccattgggaattaatttcaaaacataattactctcgccatttaattctgactcctggctgtatcgatcagtgtttgtgggctaaacataaagttatcaaacaagaacaagtcctttgaagctccctatataaactaattgtcctccaaaaccccatccatattatcgaaggggcacgaaggccaggcaccattattttcgtgttactttttcaaactaaaacaataaacacatacgagagggaagtaagatacagccatttcacatatgaaaaattgtattaaaagctgtatgcaaatccaaaacatcacagatcactccattcagctttttacccctatatttacagggcattttTTGCCGATTATTT-C-T---AATT-TT-C-ATT-C---ATGC--A---------TATATAAGAATATGTATCTCAGGT--------------AA---G--------------TTGGAGAT-TTTG-TT-TTGTGTATTCCC--GTGTT---------T-CTGAT-T------------------------TTAGT--CGCATG--AAGTGAAATT-----G-GCG--GGAAA-CTTTGAACTTC-AAGGCTCA-TAAA--T--A------CACT--------CCTGATTTTAGATGC---C-G-GTAC---GGCAAATATAT-GTCAATTTGTAAATTTTGAAATATCTCTTCACCACTAT-AATTTGGACTGGCT-CTGTACTG----CTAC----ATCTGCTTACGGTGCTACCTCAA----------AATTTATTTGAAAGCA-CCAGA--ACCAGT-CCTA-CT---A--G-------G-TA-CA-AGGGAAA-A-T----TGCAAAA-T---G---TC-AGA-T---ATG--A-TAACG-TG-AA-GTGTT-GAAAT-T-A-CTTC--TGA-A-GCTCC---A--C-CC-TGAAC-A--AT-----C-TCTTTATATGACAAA--A----GG-CTC---CA--C---CT--TCTCT--C-CA-C--T-T-TC-GAC----GT--CC-A-A-A-TTG----G-GGA-C-TC-C------AGA-GT-C--A--G-C--AT---TTTACACCAAG
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              aaacacaaaaggtccttttgaagctccctataataaaactaattggtccccccaaaaccccataccaccccacataattctgagaaaaggcccagaaggccccccaccgccgcagcacctaaatctgtttactttttcaaagcaacaaaaaccaaaacactataaaaaaaaatttatttatcaccatttcacaaaataattttaaatgattgtggaaagaaaagaaagataaagctgcaatcgtaattagcaaattccaaactatcaccagattcacaccatgcagcttatttttacccctatattacaggccattatcattattttttggttctgTGGACAGCACAC---GAACCAGTTC-TATCC---T--A-------GGTA-CA-GG----A-AAT----TG--AAAAT---G---AC-AGA-G---GCT--AATAA-T-CT-C--ACGCT-GAA-------------TG----GCTCC---A--CACCATGA-C-AATCT-----C-T-----TATGACAAG--AG---G--CTC---CA--C---CC--TCTCT----CA-C--T-T-T--GCC----GT--CC-ATA-ATTTG----G-AGG-C-TCACA-----AGA-GTCC--A--G-CA-ATGTGTTTACACCA
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          -CT---T--G-------A-TA-CA-GG----A-AAT----TG--AAA-T---G---AC-AGA-T----TG--AATTA-G-CT-AT-GTGTT-GAAAT-TCA-CTTG--AGA-A-GCTCC---A--C-CC-TTC-C-C-CCT-----C-TA----TAAAACTAGC-A----G--CCCTAGC---C---CC--TCGCT-----A-T--TCT-TG-GAATTTTGT--TC-A-A-A-CTG----
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        gt-CT---T--G-------A-TA-CA-GG----A-AAT----TG--AAA-T---G---AC-AAA-TC--AAA--AATTG-GATC-A--TTGCT-GAAAT-TAA-CTCC--AGA-A-GCACC---A--C-CCTTGA---G-T--------------------------A----G--CCC---C---A---CC--CCTCT--C-CA-A--T-T-actag
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           t-TA-AA-GG----A-T-G----TA--AAA-T---T---AA-AGA-C---A-A--AATAA---TT-AAAGTTTT--AAAG-TAA-CTAC---AA-A-GCTCC---A--C-CC-TGA-C-AATCT-----C-T-----TGTGACAAG--ATTGAG--GTA---C---A---CC---CTCT--C-CA----T-T-TG-GAG----GT--CA-T-T-A-TTG----G-AGG-C-TC-C------ATA-GT-C--A----C--AT---TTTACAC
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tt-CA-GA----A-A-T----T---AAT-T---G---AC-AGA-----------GTAA-A-TT-AT-GTTTT-GAAAT-TAA-CTCCAATG----GCTCC---A--C-CC-TGA-C-A--AT-----C-T-----TATGACAAGA-A----G--CCC---CA--C---CCATTCACT--TGTA-C--T-T-TG-tcccccaatatttgtggccttaaacataaatttatccttgacaaaaacaagcctttaagcttgcaataataattcccaaaccgataccat
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  atttgttggtagg-CA-GA----A-A-T----T---AAA-T---G---AC-AGA--------------------------GT----AAT-T-A-CTCC--AAT-A-GCTCC---A--C-C-A-GA-C-AATCT-----C-T-----AATGACAAG--AA---G--CCC---CA--C---CC--TCTCTT-C-CA-C--T-T-TG-GGC----AT--CC-A-A-A-TTG----G-AGG-C-TC-C------AGA-GT-C--A--G-C--AT---TTT--ACCAAGacatcctggctgttcggatcatgtttgtttggctaaacataatagtttcaaaacaaaaacaagtcctttgaagctccctatataaactactttccccaaccccataccataatctgaaaagggcagaaggccagcaccataaatctgttacttcaaacaaaaacaaaacacactaaataatcaccatttcacaaaattaaatgattgaaagaaagataaagctgtatgaaatccaaaacatcacaaatcactccacctcagctttttacccctatatttacagggcattttattattattttgttttcttgtttgccattatttcataattttcattcattcatatataagaatgttataagaagtgagatttttttgtcatcccgtgtgtttgatagtgcatgatgaaattgggggaaatcttgaacaataacactcctgatagatgctgtactgagcaatatgtcaatttgtaaatttagatctctcaccactatacttggactggctctgtactgctatcgctacctcagatttattggacagcacagaaccagtctacctaggtacaggaacttgaaatgtcagatataataagtgaagtgttgaaattcacttctgaagctccaccctgacaatctcttatgacaaaaggctccaccctctctccacttggacgtccaaattggagactacagagtccagcattttacaccaagc
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               -CA-GA----A-A-T----TG--AAA-T---G---AC-AGA-----------ATAG-A-TT-AT-GTTTT-TAAAT-T-A-TCTC--AAA-AAGCTCC---A--C-CC-TGA-C-AATCT-----C-T-----TATGACAAG--A----G--GTT---C---C---AC--TCTCTTTC-CA-T--T-T-TT-GAG----GT--TC-A-A-AGTTG----G-AGG-C-TC-C------AAA-GT-C--A--G-C--AT---TTTACACGAAGatatcctggctgtcctcagtgtttgtggctaaacataaagttatcaaacaaaaacaagtcctttgaagctcccaatataaactaatttcccaaaccccataccataatctgaaaagggcagaaggccagcaccataaacctgttacttcaaacaaaaacaaaacacactgaaaataatcaccatttcacaataattcattgattgaaagaaagataattaaaagctttattacatttaaacaatttcattttgcaaaaatatt
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               -CA-GA----A-A-T----T---AAA-T---G---AC-AGA-----------GTAA-A-TT-A---TGTTTGGAAT-TAA-CTCC--AAT-A-GCTCC---A--C-CCA-GA-C-A--AT-----C-TCC---TATGACAAG--A----GA-CTC---C---aatcctaaacataatgttatccaaacaaaacaagtcctttgaagctccctacataaagtcatttccccaaaccccatgccatgatctgaaaagggcagatggcaaacatttagcatctgttacacacacactaactaactaattgacagaaagatatagcttattctttttacaaaaatattcttgctgatcacagtttgcaaggaaaacctgtttaatattactgtactatc
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tA-GA----A-A-T----T---AAA-T---G---AC-AGA-----GTA--AA----A-TT-AT-GTTTT-GAAAT--CA-ACTC--CAATA-GATCC---AG-C-CCA-GA-C-A-TCT-----CCT-----TATGACAAG--A----GA-CTC---CA--C---CC--TCTCT--C--A-C--T-T-TG-GAG----GT--CC-A-A-A-TTG----G-AGG-C-TC-C------AGA--T-CAAA--G-CAGAT---TTTACACCAAGatatcctggctgtcctcagtgtttaaagttatcaaaacaagtcatttgaaccccatgccataatctgaaaaggg
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 A-GA----A-A-T----T---AAA-T---C---AC-AGA-----------GTAA-A-TT-AT-GTTTT-GAAAT-TAA-CTCC--AAT-A-GCTCC---A--C-CCA-GA-C-A--AT-----C-TAT---TATGACAAG--AA---G--CTC---CA--C---CC--TCTCT--C-CG-C--T-T-TG-GAC----GT--CC-A-A-A-TTG----G-AGG-C-TC-CAGATCTAGA-GT-C--A--G-C--AT---TTTACACaatatcctgtctcgtcctcaggttcgtgctatacaacataaattatcaagacaaaacagtcatttgaactaatttcccaaaccccatgccataatctgaaaagggccagaaaggccacgcaccataaacctgtacttcaaacaaaaaacaaaacacctaaaattaaacaccattctacgtgagatgtgactagatgtgtaaagagtgaagagcgaatgcttatgtacaaaaaacggaatcattgcgaagagatggatgtgtgcggctgattgcatgtgcaagaataaaagcgtgggccgtgttgtgagtgatgtgaatgcgtgtgactatatatgtgtcgaatcctattacagtcaaaacgttaaatttgaagtgtatgaaatgattgagggataaaaatattccactgagaggtgatcaggctttacaaaccaaaacgtcacagggtggtactagcgtattcagcttggtgtgtgagctcccaaatttacagacatttctgtgttgtcattgttttacaatatacggtacgtggaccagagaacggtgattggatttcttttctttattcataattgtcatttatttcagtaaatttctttcatgtttatatataagtgagtttacttgttgttatccctgtgtttgatgttaagcatagagtgcatgggatgaaattgggggaaatcttcaacatcagctcagtaaataacactcctacagatgctgactgagcaatgtgtcaatttgaatttgatctctcatcaccacatggactggctctgtactgctatcaaatttattggacagcacaagaaccagtctacctaaggtaccaggaatgataaataccgccagatatgataatgaagtgttggaaattcactttctgaagctccacccatgacaatatcttatgacaagaggctccaccctctctccccactttggaggtcaaaattgaggctccagagtcagcattttacaccaagc
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ttG----A-A-T----T---AAA-T---G---GCGAGA-----GTA--ATTAT-G-TT-------TT-GAAAT-TAA-TTCC--CAATG-GCTCC---A--C-CC-T-A-C-AATCT-----C-T-----TATGACAAAGAA----G--CCC---A---C---CC--TCTCT--C-CA-CCTT-T-TG-GACC---GT--CC-A-A-C-TTG----GGAGG-CATC-C------AGGTGT-C--A--G-C--AT---TTTACACCAAGCaacatcctggctgtcctcagtatttgtggctaaacataaagttatcaaaacaagacaagtcttctgaagctccctatataaactaatttccccaaaccccataccataa
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          -A-T----T---AAA-T---G---AC-AGA-----GTA--AA--A-A-TT-AT-GTTTT-GAAAT--CA-ACTC--CAATA-GATCC---A--C-CCA-GA-C-A--AT-----C-TCCT--TATGACAAG--A----GAACCC---A---C---CC--TCTCT--C--A-C--T-T-TGAGAG----GT--CC-A-A-A-TTG----G-AGG-C-TC-C------AGA-GT-TCAA--G-CAGATA--TTTACACCtgactcctggctgtatcgatcagtgtttgtgggctaaacataaagttatcaaacaagaacaagtcctttgaagctccctatataaactaattgtcctccaaaaccccatccatattatcgaaggggcacgaaggccaggcaccattattttcgtgttactttttcaaactaaaacaataaacacatacgagagggaagtaagatacagccatttcacatatgaaaaattgtattaaaagctgtatgcaaatccaaaacatcacagatcactccattcagctttttacccctatatttacagggcattttattattattttgttttcttgtttgccattatttcataattttcattcatgcatatataagaatgttatcagaagtgagatttttgttgtcatcccgtgtgtttgatagtgcatgatgaaattgggggaaaatcttcaacaccagctcagtaaataacactcctgacagatgctgtcacgtgaagaactagtgcaaatctcttcacactatacttggactagcctgtactgcttaatctgctaccggatttattggcagcagagaacaccaagttacctaccgtagggtacaggaacattgtgaaatgtgaacagagtataataagtgaagtgtttgaaatatcacctctgaagctctccgacccctgacaaattttcacttatgacaataggctcctacctttctctccctctttggacgtttccacatggagaactccaggtcaggcattttacacca
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            -T----TG--AAA-T---G---AC-AGA-T---GTA--CATAA-A-T---------------------------------G-TCC---AATC-CCTTG--C-A-CAC-----T-T-----TAACACAAG--A----G--GTC---C---A---AT--TCTTTT-C-CA-T--T-TTTG-GAG----CT--CC-A-ACA-TTG----G-gttgtctgaatttcctgtctgcgtcacctcaggtttggctataacataagattatcaagacaaaaacaagtcatttatgatactgaattcccaaaatgcgctcccatgggccataatctgaaaagggccagaaaggccagcaccataaaccctgtagtctattcaaacaaaaacaaaactaaattacacattcacgtgaagtgataatttcagagtagcgcaatttttcacaaacggacatgcaaaactgattgatcgtctgatgaacaggtctgctatagaattaacaattatgaaaatcgtggtaagacgttacagtgtatttgagttgttcattgtgaattcctgattagaagctattatatgtgttcgaaagtcctattacagtcaaacgtaaattttgtataattagaacgattgtattttaagcgagggaattgaaataatatgtccacagaggtgatcagcgctttacaaaccaaaacgtccacagtggtactagcgtaatttcatgtcttttgtagccccaacaatttagaacaggacatttctgtgttgttcattgtttggtacatataccggtacgtggacaaaacgtgtttgattggatttcttttctttatttcataattgtatttatttcataaatttcttcatgtatatataagtgagtttactgttgttatcccttgtgtttgatgttaagcatagagtgcatgatgaaattgggggaaatcttcaacatcagctcagtaaataacactcctgacagatgctgtactgagcaatgtgtcaatttgtaaattttgatctctcatcaccacattggactggctctgtactgctatcaaatttattggacagcacagaaccagtctacctaagtacaggaatgataaatagcagatatgatagatgaagtgttgaaattcatttctgaagctccacccatgacaatatcttatgacaagaggctccaccctctctccactttggaggtcaaaattgaggctccagagtcagggcattttacaccaa
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ---G---AC-AGA-----------GTGA-A-TT-AT-GTTTT-GAAAT-TAA-CTCC--AAT-A-GCTCC---A--C-CCA-GA-C-A--AT-----C-TCC---TATGACAAG--A----GA-CTC---TA--C---CC--TCTCT--T-CA-C--T-T-TG-GAC----GT--CC-A-A-A-TTG----G-AGG-C-TC-C------AGA-GT-C--A--G-C--AT---TTTACACCAAGCatggttgtgggaatgtggcttgaatgtaaaattatccaaacaaa
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    T-GAAAT-TAA-CCTC--CAATA-GCTCC---A--C-CCA-GA-C-A--AT-----C-TCGT--TATGACAAG--A----G--ACC---C---CACGCC--TCTCT--C-CA-C--T-T-TG-GAC----GT--CA-A-A-A-TTG----A-AGG-T-TC-C------AGA-GT-C--A--G-C--GT---TTCACACCTAGctcagtgttcgtggctatacacataaagttatcaaaccaaaaacaagtcatttgaagctccttatataaattaattccccaacaccatgccataatatgaaaagggcagaaggccagcaccatgaacctgttacttcaaacaaaaacaaaacacactaaattttattgtatttttacaattgtga
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          CATGA-C-AATCT-----C-T-----TATGACAAG--A----GG-CTC---CATCC---TC--TCTCT--C-CA-C--T-T-TG-GAG----GT--CC-A-A-A-TTG----G-gaaac
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ---C---CC--TCTCT--C-CA----T-T-TG-GAG----GT--CCAA-A-A-GTG----G-AGG-G-TC-C------AGA-GT-C--A--C-C--AT---TTTACAGCAAG
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ca--TCTCT--C-CA-C--T-T-TG-GGC----AT--CC-A-A-A-GTG----G-AGA-C-TT-C------AGA-GT-C--A--G-C--AT---TTTACACCAAGC
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          gTCT--C-CA-C--T-T-TG-GAT----GC--CC-A-A-A-GTG----G-AG
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ggcttggtgtaaaatgctgactctgaagCT--C-CA-A--T-T-TG-GAC----GT--CC-A-A-A-GTGAAGAG-AGG-G-T---------AGA-GT-C--aga
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gcttggtgtaaaatgctgactctggagcCT--C-CA-A--T-T-TG-GAC----GT--CC-A-A-A-GCG----G-AGtcttgtcataggagattgtctgggtggagctattggagttaatttcaaaacataattcactctgtcctcagtgttcgtggctatacacataaagttatcaaaccaaaaacaagtcatttgaagctccttatataaattaattccccaacaccatgccataatatgaaaagggcagaaggccagcaccatgaacctgttacttcaaacaaaaacaaaacacactaaattttattgtatttttacaattgtga
gi|39                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ttgtgtaaaatgctgactctagatctggagc-CA-C--T-T-TG-GAC----GT--CC-A-A-A-TTG----G-AGG-C-TC-C--------A-GT-C--A--G-C--AT---TTTACACCAAGCagagggtggagcttcttgtcataatagattgtctgggtggagctattggagttaatttcaaaacataatttactctgtgatttaatttctaacatcctggctgtcctcagtatttgtggctaaacataaagttatcaaaacaagacaagtcttctgaagctccctatataaactaatttccccaaaccccataccataa
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              G-T-TC-C------ATG-AT-C--A--G-C--AT---TTTACACCAAGC
4 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|29 ): TTGTCAGATTTTACACACAAAGAATTCCAAATATCAAACATATGGTTTGGATTTTTTTTTTCTTTTATTTTATTAAAAGCATGCATGCACAAGAATGTTAT
Unaligned ( gi|31 ): GGTACTGTATGGTGTGAAACTCTTAATATTGATTGAGGCTCTTATTAACACTATGATAGTATCAAGCCTTTTTTTCCATTCCC
Unaligned ( gi|35 ): TGTCATGTTTTACACATAAAGAATTCGATATAATAAATCTGTTTGGGTTTTTTTTTTTTTT
Unaligned ( gi|40 ): CTTCTAAAAACAATGGGCATGATGAGTTTCCTATTTATATTTCACCT






Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              11111111111111111111111111111111111                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                       11         222222         33                                                                                  11           3          1111111111111     2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222       222222                              11                                             111111     11111111      333333333333                  11          111111111111                                   111                             2222222222222222222222222222                        1111111111            11111111   11                             333333333333333              11   11111                           333333333333333333333333         22222222222             4444444444444     111           4444444444444444444      44444444444444444                        222222222222      222222222222222                        11                            222222222                       555555555555555555555555                          111   2222222                          33333333333333333333333333333333333333                       11111111               2222222222                                                                                     111111111     00000000000000000000000000000000000    111  111111111                               77777777777777777777777                                                            11111    11111     11111111               11111                                                                  11                    1111  888888888888888888888888888888888888888               333333                       2222222222          1111   222222  11                  22222222       2222222                     11                1     22                         1                              111111                                                         
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                    4  11   99    777777     4   22  3   3 3    3  55  3    44 3  33 3    44  3 33    3    6666  2       2 5       2 00  3     44 0     3 3  6666666666666     3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333   3   555555    88888   3      6 3 44 6 3 00  3  6      0   3   0     4 2 3   444  3  6  333333     11111111      111111111111     3    3       11 3   6    555555555555 3 3    0   99999  44   6666 2   2 222    6666      2 2  33        2222222222222222222222222222  2 2       2  2 66  6  5555555555    3 3  3  55555555   11 7777 7  3 99999   99999   4 666666666666666   1   4    4 55   11111      5                    777777777777777777777777    5    55555555555  8888888    0000000000000     111   2     5 4444444444444444444      77777777777777777      5  77   5  5  5   888888888888  5   000000000000000 4      44  66   1 77   11      666 3  7      3  3 44 222222222  3   2       3   3    888888888888888888888888     0    4       777  66 333   9999999 66 4   777         4  1  55555555555555555555555555555555555555  3   7    55   66 4   44444444 6666          7777777777    1  888  4    7  99    1  3 2      4    3    0      4 777    4  4 4   4 777    55 666666666     33333333333333333333333333333333333    111  666666666    4 8888 4       8    3      44444444444444444444444  3  1  88 55       99999 3 3 55  8              4 55       22222 55 00000     44444444      777      00000  4 4  4 4      777 55  4         0      3  9999    4 4         4 55           4        0000  222222222222222222222222222222222222222               222222 0 66      4 4  3  666 9999999999 3  3  3  1111 3 333333  33   3 555 555      22222222  44   3333333   3  3     777  3   00        555  3  5   3 44 3 1 555  3 555 1      3 8 3    2   2      33   5  2    000000 33   2 2 2 22     3    3 3     6  77  3  555            
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                    .  ..   ..    ......     .   ..  .   . .    .  ..  .    .. .  .. .    ..  . ..    .    ....  .       . .       . ..  .     .. .     . .  .............     .......................................................................................................................................................................................................   .   ......    .....   .      . . .. . . ..  .  .      .   .   .     . . .   ...  .  .  ......     ........      ............     .    .       .. .   .    ............ . .    .   .....  ..   .... .   . ...    ....      . .  ..        ............................  . .       .  . ..  .  ..........    . .  .  ........   .. .... .  . .....   .....   . ...............   .   .    . ..   .....      .                    ........................    .    ...........  .......    .............     ...   .     . ...................      .................      .  ..   .  .  .   ............  .   ............... .      ..  ..   . ..   ..      ... .  .      .  . .. .........  .   .       .   .    ........................     .    .       ...  .. ...   ....... .. .   ...         .  .  ......................................  .   .    ..   .. .   ........ ....          ..........    .  ...  .    .  ..    .  . .      .    .    .      . ...    .  . .   . ...    .. .........     ...................................    ...  .........    . .... .       .    .      .......................  .  .  .. ..       ..... . . ..  .              . ..       ..... .. .....     ........      ...      .....  . .  . .      ... ..  .         .      .  ....    . .         . ..           .        ....  .......................................               ...... . ..      . .  .  ... .......... .  .  .  .... . ......  ..   . ... ...      ........  ..   .......   .  .     ...  .   ..        ...  .  .   . .. . . ...  . ... .      . . .    .   .      ..   .  .    ...... ..   . . . ..     .    . .     .  ..  .  ...            
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                    0  00   55    666666     0   22  3   3 3    3  88  1    22 1  22 1    22  1 99    6    1111  9       9 7       9 11  1     22 8     1 1  9999999999999     1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111   3   222222    33333   3      7 1 22 2 1 44  1  7      8   1   8     2 6 1   666  1  2  888888     22222222      222222222222     1    1       22 3   2    888888888888 1 1    5   55555  22   1111 9   9 999    1111      9 9  99        0000000000000000000000000000  7 7       7  9 88  2  3333333333    1 1  1  44444444   88 7777 3  6 11111   22222   4 888888888888888   9   4    4 11   11111      0                    666666666666666666666666    0    99999999999  2222222    4444444444444     888   5     7 4444444444444444444      00000000000000000      7  99   7  7  7   444444444444  0   222222222222222 4      66  33   0 99   00      444 6  3      6  6 66 555555555  3   4       3   3    444444444444444444444444     9    0       888  22 999   3333333 11 4   888         0  1  99999999999999999999999999999999999999  6   3    00   11 4   33333333 2222          6666666666    9  444  4    3  33    4  6 1      3    0    8      0 000    0  0 0   0 000    55 000000000     55555555555555555555555555555555555    000  000000000    0 5555 0       8    6      55555555555555555555555  6  3  66 00       11111 6 6 00  0              0 55       22222 55 00000     55555555      000      00000  0 0  0 0      000 55  0         8      7  4444    4 4         4 00           4        6666  000000000000000000000000000000000000000               000000 1 11      4 4  6  444 2222222222 6  6  6  4444 6 000000  88   3 888 888      88888888  66   9999999   3  3     000  3   22        888  3  8   3 66 3 0 888  3 888 4      1 5 1    9   9      77   0  5    111111 77   7 7 7 77     1    1 1     2  33  1  444            
consensus                     :                                                                                                                                                                         CTTGGTGTAAA-AT--GCT--GACT-----TCTGGA-GCC--TC-CAA-T-TTGG-ACG-TC-CAAA--G-TG-GA-GAGA--GG-G--TGGAGCCTC----TT-GTCATAA-G-AGATTGT-CNGGG-TGGAG--CTATTGG-A-GT-------------TAATT------TCAA-----------A-ACA------------------T------AATT------------T-----A-C-T--------------CTG---T--------------------------C----------------------CT------------C-AGT-GT------T-------CG-------------TGG-CTAT-----AACA-----TAA-AGTTAT-C-A--A-A-C--AA-AA-CAAGTCCTTT-GAAGCTCCCTATA-TAA-A-CT-AA-TT-----CCCCAAA-C-----CCCATG---C--------ATAAT-CTGA-AAAGGGC--A-GAA-GGCC------------A-G-CACCATAA-A---CC--TGT----T-ACT-T---CAAA----CAAAAA-C-AA--AACACACTA-------AAA------TTA---A--T-CA-C-CATTTCA-CA-A--TA-AT-------T--AATT-G-AT-TG--------AAAG-A----A-GA-T-----AAA--GCTTTA-T-TA-CA-TTNAACC-AATTTCA-CTTT-G-AAAA-----ATATTT-CTGCTGATCGCAGTTTGCAA------GG---AA-----------GACG-TGTT-----T-G-T-AT-TT-A--ATAC---TG-ATC----TATATCG-TGTCGTCGA-A--------------AG---TCCTAT------TA---------CAGTCA-AA--GGT-AA-TT-TTG----A--T-T--AT-AAA-TGAT----------G-GAGGGA-GAA-TGAAATT-TAT--GTCAAC---A-AG-GTGATC-AG-C--TAT-------AC-AAATCCAAAAC-ATC-ACAG------ACT-AGCGT---AAA---TTCACTCCAC-TCGGCTT---TT-TA---CCC--C-A--A--T-TTA---CAGGACATT-TCATT--------G--------------TT-------------GT-CAT-GTTT--TAC--A-TAT--A-----C--CTGGTACATGGA-----G----AACTTGTG-GAT-TGGA-TT-CTTTTCTT-TATTTCATAATTGTCATTTATTTCA-T---AAAT-TT-C-ATT-C---ATGC--A---------TATAT--------------AA---GAAT-T-------AG-TGAG---TT------T--TTGT-T----G-TCATCCCNTGTG-TTTGATAT---------A-----------GT-GCATG--A--TGAAATT-----G-G-G--GG-AAATCTTGAACATC-A--GCTCAGTAAA-AT--A-----ACACT--------CCTGAC---AGATGC-----TG-T-AC-T-GAGCAA---T--GT-GTCAATTTGTAAATTTTGA----TCTC-T-CATCACCAC-A--TTGGACTGGCT-CTGTACTG----CTA----TA---------------------A----------AATTTATTGGACAGCA-ACAGAGA--ACCAGT-C-TA-CC---T--A-------G-TA-CA-GG----A-A-T----TG--AAA-T---G---ACAGAT---ATA--AA--TAA-GTN-A-GTG-TT-GAAAT-TCAC-TTC-TGAAGCTCC---AC-CC-TGA-CA-A-TCT---CT-T---ATGACAAG-AGG-CTCC-ACC-CTCTCT--CCA-CT-TTGGA----CG--TCC-A-A-A-TTGGAG-GCTC-C-AGAGT-CA--GC-AT---TTTACACCAAGC
Reference ( family-2546 )     :                                                                                                                                                                         CTTGGTGTAAA-AT--GCT--GACT-----TCTGGA-GCCC-TC-CAA-T-TTGG-ACG-TC-CAAA--G-TG-GA-GAGA--GG-G--TGGAGCCTC----TT-GTCATAA-G-AGATTGT-CANGG-TGGAG--C-ATTGG-A-GT-------------TAATT------TCAA-----------A-ACN------------------T------AATT------------T-----A-C-T--------------CTG---T--------------------------C----------------------CT------------C-AGT-GT------T-------CG-------------TGG-CTAT-C---AACA-----TAA-AGTTAT-C-A--A-A-C--AA-AA-CAAGTCCTTT-GAAGCTCCCTATA-TAA-A-CT-AA-TT-----CCCCAAA-C-----CCCATG---C--------ATAAT-CTGA-AAAGGGC--A-GAA-GGCC------------A-G-CACCATAA-A---CC--TGT----T-ACT-T---CAAA----CAAAAA-C-AA--AACACACTA-------AAA------TTA---A--T-CA-C-CATTTCA-CA-A--TA-AT-------T--AATT-G-AT-TG--------AAAG-A----A-GA-T-----AAA--GNTTTA-T-TA-CA-TTAAACC-AATTTCA-CTTT-G-AAAA-----ATATTT-CTGCTGATCGCAGTTTGCAA------G----AA-----------GACG-TGTT-----T-G-T-AT-TT-A--ATAC---TG-ATC----TATATCG-TGTCGTCGA-A--------------AG---TCCTAT------TA---------CAGTCA-AA--GGT-AA-TT-TTG----A--T-T--AT-AAA-TGAT----------G-GAGGGA-GAA-TGAANTT-TAT--GTCAAC---A-AG-GTGATC-AG-C--TAT-------AC-AAATCCAAAAC-ATC-ACAG------ACT-ATCGT---AAA---TTCACTCCAC-TCGGCTT---TT-TA---CCC--C-A--A--T-TTA---CAGGACATT-TCATT--------G--------------TT-------------GT-CAT-GTTT--TAC--A-TAT--A-----C--CTGGTACATGGA-----G----AACTTGTG-GAT-TGGA-TT-CTTTTCTT-TATTTCATAATTGCCATTTATTTCA-T---AAAT-TT-C-ATT-C---ATGC--A---------TATAT--------------AA---G---------------TGAG---TT------T--TTGT-T----G-TCATCCCNTGTG-TTTGATAT---------G-----------GT-GCATG--A--TGAAATT-----G-G-G--GG-AAATCTTGAACATC-A--GCTCAGTAAA-AT--A-----ACACT--------CCTGAC---AGATGC-----TG-T-AC-T-GAGCAA---T--GT-GTCAATTTGTAAATTTTGA----TCTC-T-CATCACCAC-A--TTGGACTGGCT-CTGTACTG----CTA----TA---------------------A----------AATTTATTGGACAGCA-ACAGAGA--ACCAGT-C-TA-CC---T--A-------G-TA-CA-GG----A-A-T----TG--AAA-T---G---ACAGAT---GTA--AA--TAA-GTT-A-GTG-TT-GAAAT-TNAC-TTC-CGAAGCTCC---AC-CCATGA-C--A-TNT---CT-T---ATGACAAG-A-G-CTCC-ACC-CTCTCT--CCA-CT-TTGGA----CG--TCC-A-A-A-TTGGAG-GCTC-C-AGAGT-CA--GC-AT---TTTACACCAAGC
gi|1                          :                                                                                                                                                                            GGTGTAAATATCTGCTT-GAAC-----TCTGGA-GCC--TC-CAA-T-TTGG-ACC-TCTCAAA--G-TG--A-GAGA--GG-G--TGGGTTCTC----TT-GTCATAA-GGAGATTGT-CTGGG-TGGAT--CTATTGG-A-GTTGATTTCAAAACATAATT------TTTACTCTGTCATTTA-ATG------------------TTGTCTGAATT------------T-----C-C-TGT------------CTG---CGTCA----------------------C----------------------CT------------C-AG--GT------T----------------------TGG-CTAT-----AACA-----TAA-GATTAT-C-A--AGA-C--AA-AAACAAGTCATTT-------------A-TGATA-CTGAA-TT-----CCCAAAA-TGCGCTCCCATGGGCC--------ATAAT-CTGA-AAAGGGCC-A-GAAAGGCC------------A-G-CACCATAA-AC--CC--TGTAGTCT-A-T-T---CAAA----CAAAAA-C-AA--A----ACT--------AAA------TTA--------CA---CA-TTCA-C
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ----TATAT-G-TGT--TCGA-A--------------AG---TCCTAT------TA---------CAGTCA-AA--CGT-AAATT-TTGTATAA--T-T--A--GAA-CGATTGTATTTTAAGCGAGGGA--AT-TGAAATAATAT--GTCCAC---AGAG-GTGATC-AG-CGCTTT-------AC-AAA-CCAAAAC-GTCCACAGTGGT--ACT-AGCGT---AAT---TTCAT--------GTCTT---TTGTAGC-CCCAAC-A--A--T-TTAGAACAGGACATT-TCTGT--------G--------------TT-------------GTTCATTGTTTGGTAC--A-TAT--A-----C--C-GGTACGTGGACA---A----AACGTGTTTGAT-TGGA-TTTCTTTTCTT-TATTTCATAATTGT-ATTTATTTCA-T---AAAT-TT-C--TT-C---ATGT--A---------TATAT--------------AA---G---------------TGAG---TT------TA-CTGT-T----G-TTATCCCTTGTG-TTTGATGTTAAGCATAGA-----------GT-GCATG--A--TGAAATT-----G-G-G--GG-AAATCTTCAACATC-A--GCTCAGTAAA--T--A-----ACACT--------CCTGAC---AGATGC-----TG-T-AC-T-GAGCAA---T--GT-GTCAATTTGTAAATTTTGA----TCTC-T-CATCACCAC-A--TTGGACTGGCT-CTGTACTG----CTA----TC---------------------A----------AATTTATTGGACAGC--AC--AGA--ACCAGT-C-TA-CC---TA-A-------G-TA-CA-GG----A-A------TGATAAA-T---A---GCAGATATGATA--GA--TGA-----A-GTG-TT-GAAAT-TCAT-TTC-TGAAGCTCC---AC-CCATGA-CA-A-TAT---CT-T---ATGACAAG-AGG-CTCC-ACC-CTCTCT--CCA-CT-TTGGA----GG--TCA-A-A-A-TT-GAG-GCTC-C-AGAGT-CAGGGC-AT---TTTACACCAAgtgaagtgataatttcagagtagcgcaatttttcacaaacggacatgcaaaactgattgatcgtctgatgaacaggtctgctatagaattaacaattatgaaaatcgtggtaagacgttacagtgtatttgagttgttcattgtgaattcctgattagaagctattatatgtgttcgaaagtcctattacagtcaaacgtaaattttgtataattagaacgattgtattttaagcgagggaattgaaataatatgtccacagaggtgatcagcgctttacaaaccaaaacgtccacagtggtactagcgtaatttcatgtcttttgtagccccaacaatttagaacaggacatttctgtgttgttcattgtttggtacatataccggtacgtggacaaaacgtgtttgattggatttcttttctttatttcataattgtatttatttcataaatttcttcatgtatatataagtgagtttactgttgttatcccttgtgtttgatgttaagcatagagtgcatgatgaaattgggggaaatcttcaacatcagctcagtaaataacactcctgacagatgctgtactgagcaatgtgtcaatttgtaaattttgatctctcatcaccacattggactggctctgtactgctatcaaatttattggacagcacagaaccagtctacctaagtacaggaatgataaatagcagatatgatagatgaagtgttgaaattcatttctgaagctccacccatgacaatatcttatgacaagaggctccaccctctctccactttggaggtcaaaattgaggctccagagtcagggcattttacaccaa
gi|10                         :                                                                                                                                                                                     ggtgtaaatatctgcttgaactctggagcctccaatttggacctctcaaagtgagagagggtgggttctcttgtcataaggagattgtctgggtggatctattggagttgatttcaaaacataatttttactctgtcatttaatgttgtctgaatttcctgtctgcgtcacctcaggtttggctataacataagattatcaagacaaaaacaagtcatttatgatactgaattcccaaaatgcgctcccatgggccataatctgaaaagggccagaaaggccagcaccataaaccctgtagtctattcaaacaaaaacaaaactaaattacacattcacgtgaagtgataatttcagagtagcgcaatttttcacaaacggacatgcaaaactgattgatcgtctgatgaacaggtctgctatagaattaacaattatgaaaatcgtggtaagacgttacagtgtatttgagttgttcattgtgaattcctgattagaagctatA-AGCC------------C-G-CACCATAA-A---CC--TGT----T-ACT-T---CAAA----CAAAAA-C-AA--AACACACTA-------AAA------TTA------T-CA-CTCATTTCA-CA-AA-TA-AT-------T--AATT-G-AT-TA--------AGA--A----A-GA-T-----AAAAAGACTTAAT-TA-CAATTAAA---AATTTCA-CTTT-GCAAAA-----ATATTT--TGCTGATCGCAGTT-GCAA------GG---AA-----------GACG-TGTT-----T-GAT-AT-TT-A--ATACA--TG-TAC----TATATCA-TGTCGTCGA-A--------------AG---TCCTAT------TA---------CAGTCA-AA--GGT-AA-TT-TTG----A--T-TT-AT-AAAATAAT----------G-GAGGGA-GAA-TAAAATT--AT--GCCAAC---A-AGTGTGATC-AG-C--T-T-------AC-AAATCCAAA-C-ATC-ACAG------ACTCAGCATTTGAAA---TTCACTCCAC-TCGGCTT---TT--A---CCC--C-A--AGAT-TTA---CAGGACATT--CATT--------A--------------TTTTGTTTTTTGTTTGT-CAT-GTTT--TAC--A-TATATA-----C--CTGGTACATGGA-----G----AACTTGTG-GAT-TGGATTT-CTTTTCTT-TATTTCATAATT
gi|11                         :                                                                                                                                                                         CTTGGT--AAA-AT--GCT--GACT------CTGGA-GCC--TC-CAA-T-TTGG-ATG-CC-CAAA--G-TG-GAAGAGA--GG-G--TGGGGCTTC----TT-GTCATTA-G-AGATTGT-C-TGG-TGGAG--CTATTGG-A-G--------------TAATTACTCTGTC---------------ATT------------------T------AATT------------T-------C-TGATATCCTGG----CTG---T--------------------------C----------------------CT------------C-AGT-GT------T-------TG-------------TGG-CTA------AACA-----TAA-AGTTAT-C-A--A-A-CA-AA-AA-CAAGTCCTTT-GAAGCTCCCAATA-TAA-A-CT-AA-TT-----TCCCAAA-C-----CCCATAC--C--------ATAAT-CTGA-AAAGGGC--A-GAA-GGCC------------A-G-CACCATAA-A---CC--TGT----T-ACT-T---CAAA----CAAAAA-C-AA--AACACACTG-------AAA------ATA---A--T-CA-C-CATTTCA-CA-A--TA-AT-------T--CATT-G-AT-TG--------AAAGAA----A-GA-TAATTAAAA--GCTTTA-T-TA-CA-TTTAAAC-AATTTCA-TTTT-GCAAAA-----ATATT
gi|12                         :                                                                                                                                                                         CTTCGTGTAAA-AT--GCT--GACT-----T-TGGA-GCC--TC-CAACT-TTGA-ACC-TC-AAAA--A-TG-GA-AAGA--GA-G--TGGAACCTC----TT-GTCATAA-G-AGATTGT-CAGGG-TGGAG--CTTTTTG-A-GA-------------TAATT------TAAA-----------A-ACA------------------T------AATC------------T-----A-T-T--------------CTG---T--------------------------CAT--------------------TT------------C-AAT--T------T-------C--------------TGA---AT-CCTAAACA-----TAA-TGTTATCC-A--A-A-C--AA-AA-CAAGTCCTTT-GAAGCTCCCTACA-TAA-A-GT-CATTT-----CCCCAAA-C-----CCCATGC--C--------ATGAT-CTGA-AAAGGGC--A-GAT-GGCA------------A-A-CATT-TAGCA---TC--TGT----T-AC---------A----C-------------ACACACTA-------A-------------------C------------------TA-AC-------T--AATT-G-AC-AG--------A----A----A-GA-T-----ATA--GC-TTA-T-T----------CT---TTTTA-C------AAAA-----ATATTC-TTGCTGATCACAGTTTGCAAG-----G----AA-----------AACC-TGTT-----TAA-T-AT--------TAC---TG-TAC----TAT
gi|13                         :                                                                                                                                                                         CTTGGTGTAAA-AT--GCT--GACT------CTGGA-GCC--TC-CAA-T-TTGG-ACG-TC-CAAA--G-TG-AA-GAGA--GG-G--TAGAGTCTC----TT-GTCATAG-G-AGATTGT-CTGGG-TGGAG--CTATTGG-A-GT-------------TAATT------TCAA-----------A-ACA------------------T------AATT------------C-----A-C-T--------------CTG---T--------------------------C----------------------CT------------C-AGT-GT------T-------CG-------------TGG-CTAT-A---CACA-----TAA-AGTTAT-C-A--A-A-CCAAA-AA-CAAGTCATTT-GAAGCTCCTTATA-TAA-A-TT-AA-TT-----CCCCAA--C-----ACCATG---CC-------ATAAT-ATGA-AAAGGGC--A-GAA-GGCC------------A-G-CACCATGA-A---CC--TGT----T-ACT-T---CAAA----CAAAAA-C-AA--AACACACTA-------AAT------TTT---A--T-TG-T-ATTTTTA-CA-A--Tc
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           g--------------TT-------------GT-CAT-GTTT--TAC--A-CAA--AGAATTC--C--ATATATAAA-----AGTTAAACTTATG-ATT-TGGA-TT-TTTTTCTC-TATTT-------------TATT--A-A---AAA-----C-ATG-C---ATGC--ACAAGAATGCTATAC--------------AAACTG---------------GGAG---TT------T--T-GT-T----G-TCATCCCTTGTG-TTTG--AT---------G-----------GT-GC-TG--A--TGAAATT-----G-A-G--Gtgtga
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             gtTG-CTTGAT-----------G-----------GT-GC-TG--A--TGAAATTCGGGGG-G-G--GG-GGATCTTGAACGTC-A--GCTCAGTATA-AT--ACATAGACA-T--------CCTGAC---AGATAC-----TG-T-AC-T-GAGCAA---T-----------TTGTGAATTTTGA----TCTC-T-CATCTCCAC-A--TTGGACTGGAT-CTGTagggggggggtctgcttgatggtgctgatgaaattcgggggggggggatcttgaacgtcagctcagtataatacatagacatcctgacagatactgtactgagcaatttgtgaattttgatctctcatctccacattggactggatctgt
gi|15                         : gtttgtcatgttttacacaaagaattccatatataaaagttaaacttatgatttggatttttttctctattttattaaaaacatgcatgcacaagaatgctatacaaactgggagttttgttgtcatcccttgtgtttgatggtgctgatgaaattgaggagggggggggtcGTGTAAA-AT--GCT--GACTCTAGATCTGGA-GCC--TC-CAA-T-TTGG-ACG-TC-CAAA--G-CG-GA-GAGA--GG-G--TGGAGCTTC----TT-GTCATAA-T-AGATTGT-CTGGG-TGGAG--CTATTGG-A-GT-------------TAATT------TCAA-----------A-ACA------------------T------AATT------------T-----A-C-T--------------CTG---TGATTTAATTTCTAACATCCTGGCTGTC----------------------CT------------C-AGT-AT------T-------TG-------------TGG-CTA------AACA-----TAA-AGTTAT-CAA--A-A-C--AA-GA-CAAGTCTTCT-GAAGCTCCCTATA-TAA-A-CT-AATTT-----CCCCAAA-C-----CCCATAC--C--------ATAA
gi|16                         :                                                                                                                                                                           ttGTGTAAA-AT--G-T--GACT------ATGGA-GCC--TC-CAA-T-AATG-ACC-TC-CAAA----TG-GA-GAG----G-G--TGTA-CCTCAATCTT-GTCACAA-G-AGATTGT-CAGGG-TGGAG--C-TTTGT-A-GT-------------TACTT------T-AA-----------A-ACT------------------T------TAAT------------T-----A-T-T--------------TTG---T--------------------------CTTTAATTTTACATCCTTTATCCCC------------C-AAT-AT------T-------TG-------------TGG-CCTT-A---AACA-----TAA-ATTTAT-C-CTTG-A-CA-AA-AA-CAAG-CCTTT--AAGCTTGC-A-A-TAA----T-AA-TT------CCCAAA-C-----C
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ttT-CAT-GTTT--TAC--A-TAT--A-----TATCTGGTACATGAA-----G----ACCT------AT-T--A-TT-AAT-------ATTTCATAATGATCATTTATTTCA-T---AAAT-TTTC-ATT-C---ATGC--A---------TATAT--------------AA---GAATGTTATTAGAAG-TGAGGTGTT------T--TTTT-T----GGTCACCCCTTGTG-TTTGATA----------------------GT-GCATG--A--TGAAATT-----G-G-G--GGGAAATCTTGAACATC-A--GCTCAGTTA---T--A-----ACACT--------CCTGAC---ATATGC-----TG-T-AC-T-GAGCAA---T--GT-GTCAATTTGgataccat
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        AT----------G-GAGGGA-GAA-TAAAATT-TAT--GCCAAC---A-AG-GTGATC-AG-C--T-T-------AC-AAATCCAAAAC-ATC-ACAG------ACT-AGCGTTTGAAA---TTCACTCCAC-TCGGCTT---TT-TA---CCC--C-AAGA--T-TTA---CAGGACATT-TCATT--------ATTTTGTTTTCTTGTTT-------------GT-CAT-GTTT--TACATA-TAT--A-----C--CTGGTACATGGA-----G----AACTTGTG-GAT-TGGATTT-CTTTTCTT-TATTTCATAATT
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     aTGGACAGCACAC---GA--ACCAGTTC-TATCC---T--A-------GGTA-CA-GG----A-AAT----TG--AAAAT---G---ACAGAG---GCT--AA--TAA-TCT-C-ACG-CT-GAA---TG-----------GCTCC---ACACCATGA-CA-A-TCT---CT-T---ATGACAAG-AGG-CTCC-ACC-CTCTCT---CA-CT-TT-GC----CG--TCC-ATA-ATTTGGAG-GCTCACAAGAGTCCA--GCAATGTGTTTACACCA
gi|2                          :                                                                                                                                                                         CTTGGTGTAAA-ATCTGCTTTGA-------TCTGGA-GCC--TC-CAA-T-TTGG-ACC-TC-CAAA--G-TG--A-GAGA--GG-G--TGGAGTCTC----TT-GTCATAA-GGAGAT-GT-CTGGGCTGGAT--CTATTGG-A-GT-------------TGATT------TCAA-----------A-ACATAATTTTACTCTGTCATTT------AATT------------TCTAATA-T-C--------------CTG---T--------------------------CTCGTC-----------------CT------------C-AG--GT------T-------CG-------------TG--CTATAC---AACA-----TAA-A-TTAT-C-A--AGA-C--AA-AA-CA-GTCATTT-GAA-----------------CT-AA-TT-----TCCCAAA-C-----CCCATG---CC-------ATAAT-CTGA-AAAGGGCC-A-GAAAGGCC------------ACG-CACCATAA-A---CC--TGT------ACT-T---CAAA----CAAAAAAC-AA--AACAC-CTA-------AAA------TTA---A--A-CA-C-CATTCTA-CG-T--GAGATG------T--GACTAG-ATGTGT-------AAAG-AGTGAA-GAGC-----GAA--TGCTTA-TGTA-CA-AAAAACGGAAT--CA-TTGC-G-AAGAGATGGATGTGTGCGGCTGATTGCA-TGTGCAA------G----AATAAAAGCGTGGGCCG-TGTTGTGAGT-G---AT-GTGA--ATGCGTGTG-A-C----TATAT-A-TGT-GTCGA-A-------------------TCCTAT------TA---------CAGTCA-AAACGTT-AA-AT-TTG----AAGTGT--ATGAAA-TGAT----------T-GAGGGA-TAA---AAAT---AT---TCCACTGAG-AG-GTGATC-AGGC--TTT-------AC-AAA-CCAAAAC-GTC-ACAGGGTGGTACT-AGCGT---A-----TTCA----GC-TTGGTGT---GT-GAGCTCCC--A-A--A--T-TTA---CAG-ACATT-TCTGT--------G--------------TT-------------GT-CATTGTTT--TAC--AATAT--A-----C----GGTACGTGGACCAGAG----AACG-GTG--AT-TGGA-TTTCTTTTCTT-TATT-CATAATTGTCATTTATTTCAGT---AAAT-TT-C-TTT-C---ATGTTTA---------TATAT--------------AA---G---------------TGAG---TT------TACTTGT-T----G-TTATCCC-TGTG-TTTGATGTTAAGCATAGA-----------GT-GCATGGGA--TGAAATT-----G-G-G--GG-AAATCTTCAACATC-A--GCTCAGTAAA--T--A-----ACACT--------CCT-AC---AGATGC-----TG---AC-T-GAGCAA---T--GT-GTCAATTTG--AATTT-GA----TCTC-T-CATCACCAC-A--T-GGACTGGCT-CTGTACTG----CTA----TC---------------------A----------AATTTATTGGACAGC--ACA-AGA--ACCAGT-C-TA-CC---T--AAG-----G-TACCA-GG----A-A------TGATAAA-TACCG---CCAGAT---ATGATAA--TGA-----A-GTG-TTGGAAAT-TCACTTTC-TGAAGCTCC---AC-CCATGA-CA-A-TAT---CT-T---ATGACAAG-AGG-CTCC-ACC-CTCTCTCCCCA-CT-TTGGA----GG--TCA-A-A-A-TT-GAG-GCTC-C-AGAGT-CA--GC-AT---TTTACACCAAGC
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       AAT-CTGA-AAAGGGC--A-GAA-GGCT------------A-G-CACCATAA-A---CC--TGT----T-ACT-T---CAAA----CAAAAA-C-AA--AA------------------------TA---A--T-CA-C-CATTTCA-CA-A--TA-AT-------T--AATT-G-AT-TG--------AAAGAA----A-GA-T-----AAA--GCTTTT-T-TA-CA-TTTAGAC-AATTTCA-CTTT-G--------------TT-CTGCTGATCGCAGTTTGCAA------GGATTGA-----------GACG-TG
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            CAAACCA-------AAA--------A---C--T-CA-C-AATTTCAACA-A--TA-AT-------A--AATT-G-----G--------ACA--A----A-GA-T-----ATA---CTTTA-T--A-CA-TTTA--C-AGT--CA-CGGT-G-CAAA-----ATATTT-CTGCTGATCGCAGTTTGCAA------G----AA-----------AGC--TGCT-----T-T-A-ATATT-ACTACAC---T--ATCACAATGTATCA--GTCATAGA-A--------------GG---
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                               t--TGGAGTCTC----TT-GTCATAG-G-AGATTGT-CTGGG-TGGAG--CTATTGG-A-GT-------------TAATT------CC-A-----------A-ACA------------------T------AATT------------T-----A-C-T--------------CTG---T--------------------------CA---------------------TT------------T-AAT-TTCTGATAT-------CC-------------TGG-CTGT-C---CTCAGTGTTTAA-AGTTAT----------C--AA-AA-CAAGTCATTT-GAA---CCC----------------------------------------CATGC--C--------ATAAT-CTGA-AAAGGGatttt
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          AAATCCTTT-GAAACTCCATACA-TAA-A-CA-CA-TT-----TCCT----C-----CCTATAT--C--------ATGAT-CTGA-AAAG--------------------------------ACCTT---G---CCTTTGT----T-ACG-T---CAAA----CACAAA-C-AA--GA------A-------AAACC----TTA---------A-C-CATTTCA-CA-A--TGCATGTACATGT--AATT---AC-TA--------AAAA-A----A-AA-T-----A
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      -TT-A--ATAC----G--------TACATCGATGTCGTTGGTA--------------AGATTTCTTATAAGATCTATGCACGAATCAGTCA-AA--GGT-AA-ATATTG----A--T-TGTAT-AAA--GA-----------G-GAGGGAAGAAGTGAAATC-TAT--GTCAAC---A-AG-GTGATCTAG-C--TGC-----------AATCC-AAAC-ATC-ACAG------Attactgtatt
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   a-CT---T--G-------A-TA-CA-GG----A-AAT----TG--AAA-T---G---ACAGAT----TG--AA--TTA-GCT-ATGTG-TT-GAAAT-TCAC-TTG-AGAAGCTCC---AC-CC-TTC-C--C-CCT---CTAT---AAAACTAGCA-G-CCCT-AGC-CCCTCG--CTA-TTCTTGGAATTTTG--TTC-A-A-A-CTG
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    gt-T----TG--AAA-T---G---ACAGAT---GTA--CA--TAA-AT----G------------------TC-CAA---T------C-CCTTG--C--A-CAC---TT-T---AACACAAG-A-G-GTCC-AAT-TCTTTT--CCATTT-TTGGA----GC--TCC-A-ACA-TTGGactag
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                    C-CAA-TGTTGG-AGC-TC-CAAA--AATG-GA-AAAG--AA-T--TGGA-CCTC----TT-GTGTTAA---AG--TGTGCAAGG--G-------ATTGG-A-----------------CATT------T---------------------------------------------ATG------------T-----A-CAT--------------CTG---T--------------------------CAT--------------------TT------------CAAATGGT------TGTGGGAATG-------------TGG-CT-T-G---AATG-----TAA-AATTATCC-A--A-A-C--AA-Aatggttgtgggaatgtggcttgaatgtaaaattatccaaacaaa
gi|27                         :                                                                                                                                                                         CTAGGTGTGAA-AC--GCT--GACT------CTGGA-ACCT-TC--AA-T-TTTG-ACG-TC-CAAA--G-TG-GA-GAGA--GGCG--TGGGGTCTC----TT-GTCATAACG-AGATTGT-CTGGG-TGGAG--CTATTGG-AGGT-------------TAATT------TCAG-----------A-A
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    -AATTTCA-CTTTTG-CAAA-----ATATTT-CTTGTGATCGCAGTTTGCAATTGAGGG----AA-----------GACG-TGTT-----T-T-T-AT-TA-A--TTAC---TG--TA----CATATCA-TGTCGac
gi|3                          :                                                                                                                                                             aaaaaaaaaaaaCTTGGTGTAAA-AT--GCT--GACTAT---TCTGGA-GCTCGTCACAA-T-TTGGGACG-TC-CAAA--G-TG-GA-GAGA--GG-G--TGGA-TCT-----TT-GTCATAG-G-AGATTGT-C-TGG-TGGAGGAC-ATTGG-A-GT-------------TAATT------TCAA-----------ATACA------------------T------AATT------------T-----A-C-T--------------CTG---T--------------------------C----------------------CT------------C-AGT-GT------T-------C--------------TGG-CTAT-C---AACA-----TAA-AGTTAT-C-A--A-A-C--AA-AA-CAAGTCATTT-GAAGCTCCCTATA-TAA-A-CT-AA-TT-----CCCCAA--------CCCATG---C--------ATAAT-CTGA-AAAGGGC--A-GAA-G-CC------------A-G-CACCATAA-----CC--TGT----T-ACTGT---CAAA----CAAAAA-C-AA--AACACACTA-------AAA------TTA---A--T-CA-C-CATTTCA-CA-A--TA-AT-------C--AATT-G-AT-T---------AAAG-A----A-GA-T-----AAA--GGTTTA-T-TAACA-T-AAACT-AATTTCAGCTTT-G-AAAA-----ATATTT-CTGCTGATCGCAGTTTG-AA------G----AA-----------GACGGTGTT-----T-G-T-AT-TT-A--ATAC---TG-ATC----TATATC--TGTCGTCGA-A--------------A----TCCTAT------TA---------CAGTCA-AA--GGT-AA-TT-TTG----A--T-T--AT-AAA-TGAT----------G-GAGGGA-GAA-TGAATTT-TAA--GTCAAC---A-AG-GTGATA-AG-C--TAT-------AC-AA--TCAAAAC-ATC-ACAG------ACT--TTGT---AAA---TTCACTCCAC-TCAGCTT---T------------------------A---CAGGACATT-TC-TT--------G--------------TT-------------GT-CAT-GTTT--TAC--A-TAT--A-----C--CTGGTACATGGA----------AACTTGTG-GATGTGGA-TT-CTTTTCTTGTATTTCATAATTGTCATTTATTTAA-T---AAAT-TT-C-ATT-C---ATGC--A---------TATAT--------------AA---G---------------TGAG---TT------TA-TTGT-T----G-TCA--CCTTGTG-GTTGATGT---------AAAGGCATTAGTGT-GCGTG--A--TGAAATT-----G-G-G--GG-AAATCTTCAACATC-A--GCTTAGTAAA-AT--A-----ACACT--------CCTGAC---AGATGCATATGCG-T-AC-T-GAGCAA---T--GT-GTCAATTTGTAAATTTTGA----TCTC-T-CATCACCAC-A--TTGGACGGGCTGCTGTACTG----CTA----TA---------------------A----------AATTTATTGGACAGCA-ATAGAGA--ACCAGT-C-TA-CC---T--A-------G-TA-CA-GG----A-A-T----TG--AAA-T---G---ACAGAT---ATA--AA--TAA-GTT-A-GTG-TT-GAAAT-TCAT-TTC-TGAAGCTCC---AC-CCATGA-C--A-TAT---CT-T---ATGACAAG-A-G-CTCC--CC-CTCTCT--CCA-CT-TTGGA----GG--TCC-A-A-A-TTGGAG-GCTC-C-AGAGT-CA--GC-AT---TTTACACCAAGCaaaaattttcaaa
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    -CT---T--G-------A-TA-CA-GG----A-AAT----TG--AAA-T---G---ACAAAT---CAA--AAATTGG-ATC-A-TTG-CT-GAAAT-TAAC-TCC-AGAAGCACC---AC-CCTTGA-------GT-------------------A-G-CCCC-ACC-C-CTCT--CCA-AT-T
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       t-TAT--GTCAAC---A-CG-GTGATC-AG-C--TA--------AT-AAACCCAAAAC-ATC-ACAG------ACT-AGAGT---TCATCCTTCACTCCAC-T
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                    C-CAA-T-TTGG-ACC-TC-CAAA--G-TG-GA-GAGA--GA-GGATGGAGCCTC----TT-GTCATAA-G-AGATTGT-CATGtaaaggt
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ----T-ACT-TT--CAAA----CAAAAA-C-AA--AACACACTA-------AAA------TTA---A--A-CA-C-CATTTCA-CA-A--TA-CT-------T--AATT-G-AT-T
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      C-ACC-CTCTCT--CCA--T-TTGGA----GG--TCCAA-A-A-GTGGAG-GGTC-C-AGAGT-CA--CC-AT---TTTACAGCAAG
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           AAG-A-G-ACCC-ACT-CCCTCA--CGA-TT-TTGG--------------------TG-----TTC-C-ATGAT-CA--GC-AT---TTTACACCAAGC
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           aaTCTCT--CCA-CT-TTGGG----CA--TCC-A-A-A-GTGGAG-ACTT-C-AGAGT-CA--GC-AT---TTTACACCAAGCct
gi|39                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    gCA-CT-TTGGA----CG--TCC-A-A-A-TTGGAG-GCTC-C---AGT-CA--GC-AT---TTTACACCAAGC
gi|4                          :                                                                                                                                                                         CTTGGTGTAAA-AT--GCT--GACA-----CCTGGATGCCT-CC-CAA-G-TTGG-ACGGTC-CAAAAGG-TG-GA-GAGA--GG-G--TGG-GCTTC----TTTGTCATAA-G-AGATTGT--AGGG-TGGAG--CCATTGGGA-AT-------------TAATT------TCAA-----------A-ACA------------------T------AATTACTCTCGCCATTT-----AAT-T--------------CTGAC-T--------------------------C----------------------CTGGCTGTATCGATC-AGT-GT------T-------TG-------------TGGGCTA------AACA-----TAA-AGTTAT-C-A--A-A-C--AAGAA-CAAGTCCTTT-GAAGCTCCCTATA-TAA-A-CT-AA-TTGTC--CTCCAAAAC-----CCCATC---C--------ATATT-ATCG-AAGGGGC--ACGAA-GGCC------------A-GGCACCATTA-TTTTCG--TGT----T-ACT-TTTTCAAA----CTAAAA-C-AATAAACACA-TACGAGAGGGAA------GTA---AGATACAGC-CATTTCA-CATA--TG-AA-------A--AATT-GTAT-TA--------AAAG-
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      g--TAT-------GC-AAATCCAAAAC-ATC-ACAG------A------------------TCACTCCAT-TCAGCTT---TT-TA---CCC--CTAT-A--T-TTA---CAGGGCATT-TTATT--------A--------------TT-------------AT-TTT-GTTT--Tctgtatgcaaatccaaaacatcacagatcactccattcagctttttacccctatatttacagggcattttattattattttgttttcttgtttgccattatttcataattttcattcatgcatatataagaatgttatcagaagtgagatttttgttgtcatcccgtgtgtttgatagtgcatgatgaaattgggggaaaatcttcaacaccagctcagtaaataacactcctgacagatgctgtcacgtgaagaactagtgcaaatctcttcacactatacttggactagcctgtactgcttaatctgctaccggatttattggcagcagagaacaccaagttacctaccgtagggtacaggaacattgtgaaatgtgaacagagtataataagtgaagtgtttgaaatatcacctctgaagctctccgacccctgacaaattttcacttatgacaataggctcctacctttctctccctctttggacgtttccacatggagaactccaggtcaggcattttacacca
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           gcttggtgtaaaatgctgacacctggatgcctcccaagttggacggtccaaaaggtggagagagggtgggcttctttgtcataagagattgtagggtggagccattgggaattaatttcaaaacataattactctcgccatttaattctgactcctggctgtatcgatcagtgtttgtgggctaaacataaagttatcaaacaagaacaagtcctttgaagctccctatataaactaattgtcctccaaaaccccatccatattatcgaaggggcacgaaggccaggcaccattattttcgtgttactttttcaaactaaaacaataaacacatacgagagggaagtaagatacagccatttcacatatgaaaaattgtattaaaagctgA-TT-ATTTTGTT-T-TCTTGT--TTGCCATT-ATTTCA-T---AATT-TT-C-ATT-C---ATGC--A---------TATAT--------------AA---GAATGTTATCAGAAG-TGAGA--TT------T--TTGT-T----G-TCATCCCGTGTG-TTTGATA----------------------GT-GCATG--A--TGAAATT-----G-G-G--GGAAAATCTTCAACACC-A--GCTCAGT-AA-AT--A-----ACACT--------CCTGAC---AGATGC-----TG-TCACGT-GAAGAA---CTAGT-G-CAA-------------A----TCTCTT-CA-CACTAT-AC-TTGGACTAGC--CTGTACTG----CT-----TA---------------------ATCTGCTACCGGATTTATTG----GCA-GCAGAGAACACCAAG-T-TA-CC---T--ACCGTAGGG-TA-CA-GG----A-A-CATTGTG--AAA-T---GTGAACAGA----GTAT-AA--TAA-GTGAA-GTGTTT-GAAATATCAC-CTC-TGAAGCTCTCCGAC-CCCTGA-CAAA-TTTTCACT-T---ATGACAAT-AGG-CTCCTACCTTTCTCT--CCCTCT-TTGGA----CGTTTCC-A-C-A--TGGAGAACTC-C-AG-GT-CAG-GC-AT---TTTACACCActtgtttgccattatttcataattttcattcatgcatatataagaatgttatcagaagtgagatttttgttgtcatcccgtgtgtttgatagtgcatgatgaaattgggggaaaatcttcaacaccagctcagtaaataacactcctgacagatgctgtcacgtgaagaactagtgcaaatctcttcacactatacttggactagcctgtactgcttaatctgctaccggatttattggcagcagagaacaccaagttacctaccgtagggtacaggaacattgtgaaatgtgaacagagtataataagtgaagtgtttgaaatatcacctctgaagctctccgacccctgacaaattttcacttatgacaataggctcctacctttctctccctctttggacgtttccacatggagaactccaggtcaggcattttacacca
gi|5                          :                                                                                                                                                                                             gcttggtgtaaaatgctgacacctggatgcctcccaagttggacggtccaaaaggtggagagagggtgggcttctttgtcataagagattgtagggtggagccattgggaattaatttcaaaacataattactctcgccatttaattctgactcctggctgtatcgatcagtgtttgtgggctaaacataaagttatcaaacaagaacaagtcctttgaagctccctatataaactaattgtcctccaaaaccccatccatattatcgaaggggcacgaaggccaggcaccattattttcgtgttactttttcaaactaaaacaataaacacatacgagagggaagtaagatacagccatttcacatatgaaaaattgtattaaaagctgtatgcaaatccaaaacatcacagatcactccattcagctttttacccctatatttacagggcattttatt---C--------ATAAT-CTGA-AAAGGGC--A-GAA-GGTC------------A-G-CACCATAA-A---CC--TAT----T-AC---------------------------AATGTACT------------------TC---A--T-CA-C-CATTTCA-CA-A--TA-A------------ATT-G-AT-TG--------AAAG-A----AAGA-T-----AAA--G--------------------C-AATTTCA--TTT-GCAAAA-----ATATTT-CTGCTGATCGCAGTTTGCAA------GG---AA-----------TACG-TGTT-----T-A-TTAT-TT-A--ATAC---TGTAT-------TATCG-TGTCGTCGA-AGATTCTCTTAAAGAAG---TCCTATGCAGA-TG---------CAGTCA-AA--GGTTAA-TT-TTG----AC-T-T--AT-AAAATAAT----------G-GAAGGA-GAA-TGAAATT-TATATGTCAAC---A-GG-ATGATC-AG-C--TA--------AC-AAATCCAAAAC-ATC-ACAG------ACT-AGCGTTG-AAA---TGCACTCCAC-TCAGCTT---TT-TA---CCC--A-AG-A--T-TTA---CAGGACATG-TTATTATCATTTTG--------------TT-------------TT-CTT-GTTT--TAC--A-TATATA-----C--CTGGTACATGAA-----G----AACTTGTG-GAT-TGGA-------------TA--TCATAATTGTCACTTATTTCA-T---AAAT-TT-C-ATT-C---ATGC--A---------TATATAAGAATGTTATCAGAA---G---------------TGAG---TT------T--TTGT-T----G-TCATCCCCTGTG-TTTGATA----------------------GT-GCATG--A--TGAAATT-----GAG-G--GA-AAATCTTGAACATC-A--GCTCAGT-AA-AT--A-----ACACT--------CCTGAC---AGATGC-----TG-T-TC-T-GAGCAA---T--GT-GTCAATTTGCAAATTGTGA----TCTC-T-CATCACCAC-A--TTGGACTGGCT-CTGTACTG----CT----------------------------------------ATCTGCT--ACAGC--AC--ATA--ACCAGT-C-TA-CC---TTAG-------G-TA-CA-GGA---A-A-T----TG--AAA-T---G---ACAGAT---AT---AG--TAA-GTGAA-GTG-TT-GAAAT-TCAC-TTC-TGAAGCTCC---AC-CC-TGA-CA-A-TCT---CT-T---ATGACAAG-AGG-CTCC-ACC-CTCTCT--CCA-CT-TTGGC----CG--TCC-A-A-A-TTGGAG-GCTC-C-CGAGT-CA--GC-AT---TTTACGCTAA
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                   atac-CAAA--G-TACAA-GTGAATGG-G--TGGGGCTTC----TT-GTCATAA-G-A--TTGT-CAGGG-TGGAG--CCATTGG-A-GT-------------TAATT------TCAA-----------A-ACA------------------T------AATT------------T-----A-C-TCTGTCAATTAATTTCTGACAT--------------------------C----------------------CT------------G-GCT-GT------T-------CGGATCATGTTTGTTTGG-CTA------AACA-----TAATAGTT-T-C-A--A-AAC--AA-AAACAAGTCCTTT-GAAGCTCCCTATA-TAA-A-CT-AC-TT-----TCCCCAA-C-----CCCATA---CC-------ATAAT-CTGA-AAAGGGC--A-GAA-GGCC------------A-G-CACCATAA-A---TC--TGT----T-ACT-T---CAAA----CAAAAA-C-AA--AACACACTA-------AA--------TA---A--T-CA-C-CATTTCA-CA-A---A-AT-------T--AAAT-G-AT-TG--------AAAGAA----A-GA-T-----AAA--GCTGTA-T-
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       atttgttggtagg---A-AG-ATAA---AG-C--TGT-------ATGAAATCCAAAAC-ATC-ACAA------A------------------TCACTCCACCTCAGCTT---TT-TA---CCC--CTAT-A--T-TTA---CAGGGCATT-TTATT--------A--------------TT-------------AT-TTT-GTTT--Tgaaatccaaaacatcacaaatcactccacctcagctttttacccctatatttacagggcattttattattattttgttttcttgtttgccattatttcataattttcattcattcatatataagaatgttataagaagtgagatttttttgtcatcccgtgtgtttgatagtgcatgatgaaattgggggaaatcttgaacaataacactcctgatagatgctgtactgagcaatatgtcaatttgtaaatttagatctctcaccactatacttggactggctctgtactgctatcgctacctcagatttattggacagcacagaaccagtctacctaggtacaggaacttgaaatgtcagatataataagtgaagtgttgaaattcacttctgaagctccaccctgacaatctcttatgacaaaaggctccaccctctctccacttggacgtccaaattggagactacagagtccagcattttacaccaagc
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          atttgttggtaggcaaagtacaagtgaatgggtggggcttcttgtcataagattgtcagggtggagccattggagttaatttcaaaacataatttactctgtcaattaatttctgacatcctggctgttcggatcatgtttgtttggctaaacataatagtttcaaaacaaaaacaagtcctttgaagctccctatataaactactttccccaaccccataccataatctgaaaagggcagaaggccagcaccataaatctgttacttcaaacaaaaacaaaacacactaaataatcaccatttcacaaaattaaatgattgaaagaA-TT-ATTTTGTT-T-TCTTGT--TTGCCATT-ATTTCA-T---AATT-TT-C-ATT-C---ATTC--A---------TATAT--------------AA---GAATGTTATAAGAAG-TGAG---AT------T--TTTT-T----G-TCATCCCGTGTG-TTTGATA----------------------GT-GCATG--A--TGAAATT-----G-G-G--GG-AAATCTTGAACA-----------------AT--A-----ACACT--------CCTGAT---AGATGC-----TG-T-AC-T-GAGCAA---T--AT-GTCAATTTGTAAATTTAGA----TCTC-T-CACCACTAT-AC-TTGGACTGGCT-CTGTACTG----CTATCGCTACCTC-----------------A----------GATTTATTGGACAGC--AC--AGA--ACCAGT-C-TA-CC---T--AG------G-TA-CA-GG----A-ACT----TG--AAA-T---G---TCAGAT---AT---AA--TAA-GTGAA-GTG-TT-GAAAT-TCAC-TTC-TGAAGCTCC---AC-CC-TGA-CA-A-TCT---CT-T---ATGACAAA-AGG-CTCC-ACC-CTCTCT--CCA-C--TTGGA----CG--TCC-A-A-A-TTGGAG-ACTA-C-AGAGTCCA--GC-AT---TTTACACCAAGCcttgtttgccattatttcataattttcattcattcatatataagaatgttataagaagtgagatttttttgtcatcccgtgtgtttgatagtgcatgatgaaattgggggaaatcttgaacaataacactcctgatagatgctgtactgagcaatatgtcaatttgtaaatttagatctctcaccactatacttggactggctctgtactgctatcgctacctcagatttattggacagcacagaaccagtctacctaggtacaggaacttgaaatgtcagatataataagtgaagtgttgaaattcacttctgaagctccaccctgacaatctcttatgacaaaaggctccaccctctctccacttggacgtccaaattggagactacagagtccagcattttacaccaagc
gi|7                          :                                                                                                                                                               atttgttggtaggcaaagtacaagtgaatgggtggggcttcttgtcataagattgtcagggtggagccattggagttaatttcaaaacataatttactctgtcaattaatttctgacatcctggctgttcggatcatgtttgtttggctaaacataatagtttcaaaacaaaaacaagtcctttgaagctccctatataaactactttccccaaccccataccataatctgaaaagggcagaaggccagcaccataaatctgttacttcaaacaaaaacaaaacacactaaataatcaccatttcacaaaattaaatgattgaaagaaagataaagctgtatgaaatccaaaacatcacaaatcactccacctcagctttttacccctatatttacagggcattttatt-A--A-A-C--AC-AA-AAGGTCCTTTTGAAGCTCCCTATAATAA-AACT-AA-TTGGTCCCCCCAAAAC-----CCCATA---CCACCCCACATAATTCTGAGAAAAGGCCCA-GAA-GGCCCCCCACCGCCGCA-G-CACC-TAA-A---TC--TGT----TTACT-TTTTCAAAGCAACAAAAA-CCAA--AACACTATA-------AAAAAAAATTTATTTA--T-CA-C-CATTTCA-CA-AAATA-AT-------TTTAAAT-G-AT-TGTGGAAAGAAAAG-A----AAGA-T-----AAA--GCT
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TCACAA--AAT-AA-TT-TTA----A-------AT-GAT-TG-T----------G-GAAAGA-AAA--GAAAGA-TAA--AGCTGC---A-ATCGTAATT-AG-C---------------AAATTCCAAACTATC-AC----------------C---AGA---TTCACACCAT-GCAGCTTATTTT-TA---CCC--C-T--A--TATTA---CAGGCCATTATCATT--------A--------------TT-------------gcaatcgtaattagcaaattccaaactatcaccagattcacaccatgcagcttatttttacccctatattacaggccattatcattattttttggttctgttgccgattatttctaattttcattcatgcatatataagaatatgtatctcaggtaagttggagattttgttttgtgtattcccgtgtttctgattttagtcgcatgaagtgaaattggcgggaaactttgaacttcaaggctcataaatacactcctgattttagatgccggtacggcaaatatatgtcaatttgtaaattttgaaatatctcttcaccactataatttggactggctctgtactgctacatctgcttacggtgctacctcaaaatttatttgaaagcaccagaaccagtcctactaggtacaagggaaaattgcaaaatgtcagatatgataacgtgaagtgttgaaattacttctgaagctccaccctgaacaatctctttatatgacaaaaggctccaccttctctccactttcgacgtccaaattggggactccagagtcagcattttacaccaag
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             aaacacaaaaggtccttttgaagctccctataataaaactaattggtccccccaaaaccccataccaccccacataattctgagaaaaggcccagaaggccccccaccgccgcagcacctaaatctgtttactttttcaaagcaacaaaaaccaaaacactataaaaaaaaatttatttatcaccattTTGCCGATTATTTC--T---AATT-TT-C-ATT-C---ATGC--A---------TATAT--------------AA---GAATATGTATCTCAGGTAAG---TTGGAGATT--TTGT-TTTGTG-TATTCCCGTGTT-TCTGATTTT--------A-----------GTCGCATG--AAGTGAAATT-----G-GCG--GG-AAACTTTGAACTTC-AAGGCTCA-TAAA--T--A------CACT--------CCTGATTTTAGATGC-----CGGT-AC----GGCAAATAT--AT-GTCAATTTGTAAATTTTGAAATATCTC-TTCACCACTAT-AATTTGGACTGGCT-CTGTACTG----CTA----CATCTGCTTACGGTGCTACCTCAA----------AATTTATTTGAAAGCA-CCAGA----ACCAGT-CCTA-CT---A--G-------G-TA-CA-AGGGAAA-A-T----TGCAAAA-T---G---TCAGAT---ATG--A---TAACGTG-AAGTG-TT-GAAAT-T-AC-TTC-TGAAGCTCC---AC-CC-TGAAC--AATCT---CT-TTATATGACAAA-A-GGCTCC-ACC-TTCTCT--CCA-CT-TTCGA----CG--TCC-A-A-A-TTGGGG-ACTC-C-AGAGT-CA--GC-AT---TTTACACCAAGttttggttctgttgccgattatttctaattttcattcatgcatatataagaatatgtatctcaggtaagttggagattttgttttgtgtattcccgtgtttctgattttagtcgcatgaagtgaaattggcgggaaactttgaacttcaaggctcataaatacactcctgattttagatgccggtacggcaaatatatgtcaatttgtaaattttgaaatatctcttcaccactataatttggactggctctgtactgctacatctgcttacggtgctacctcaaaatttatttgaaagcaccagaaccagtcctactaggtacaagggaaaattgcaaaatgtcagatatgataacgtgaagtgttgaaattacttctgaagctccaccctgaacaatctctttatatgacaaaaggctccaccttctctccactttcgacgtccaaattggggactccagagtcagcattttacaccaag
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 aaacacaaaaggtccttttgaagctccctataataaaactaattggtccccccaaaaccccataccaccccacataattctgagaaaaggcccagaaggccccccaccgccgcagcacctaaatctgtttactttttcaaagcaacaaaaaccaaaacactataaaaaaaaatttatttatcaccatttcacaaaataattttaaatgattgtggaaagaaaagaaagataaagctgcaatcgtaattagcaaattccaaactatcaccagattcacaccatgcagcttatttttacccctatattacaggccattatcattattttttggttctg-AAA-TAAA----------A-GAGAAA-GAA-TGACCTT-TATATGTCAAC---A-AG-GTGATC-AG-C--TACATATGTAAC-AAATCCAAAAC-ACC-ACAG------A
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            T-TTATT--------G--------------TT-------------AT-CAT-GAAT--TCC--T-TAT--A-----T--CT------TAAA-----A----AACTTGT----T-TGGA-TT-TT----------------------ATTTATTTTA-TTGGAAACATG-CAATTACAGAATGC--T---------TATAA--------------AAAG-G---------------TGGG---TT------T--TTTTGT----G-CCATCCC-TGTGATTTGATA----------------------GT-GCATGA-A--TGGA--T-----A-G-GTAGG-GAATCTTGAAC-TCAA--GCTCAGTAAATATTAG-----ATACTTAAAAATCCCTGAC---AGATGC-----TG-T-AC-TGGAGCAA---T--GGAGTCAGTATGTGAA-TTCGA----TCTC-T-CATCACCACAA--TGGGACTGGCT-CTGTACTGCATCCTA----TA---------------------T----------AA------GGACAGCA---AGAAA--A-CATT-C-TA-CTATGT--AC------G-TA-TACGG----ACA-A----TG--AAA-T---G---ACAGAT---GC---AA--TAA-GTT-A-AGC-TT-GAAAT---AC-TTCTTGAAGCTAC---AC-CTTTGA-CA-A-TCT---CT-T---A-GACAAG-A-G-GT----CC-CTCTCT--CCA-TT-TTAG------G--TCT-A-A-T-TTGGAA-GCTC-C-AGAGT-C--------------ACACCAAGCccagggtgcaaatgcaaatttgaaaatttgacgcctctatatatttaattacgtctgtattgcaatttctgcacttgtcttatctaatacaatatgacagaaaaaataattgatctctgtcggtgttaaaatagatgaaaggggagaactcagttttctgcatgaaactagaatgtggttatcattcactaacgttcacatgttaatgtaaagatttctcactgcagtatgtcaggtatcagctgtatcctgcttaacggacttctaaaaacaatgagcatgacgagttaccaatttttatttcatctcctttgtaattgagagtattctaacattcttttcattttctcacgtcctaatttgatagttcacctcaatgagtctgactagtcagtttgattattcaaagtcataa
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|29 ): TTGTCAGATTTTACACACAAAGAATTCCAAATATCAAACATATGGTTTGGATTTTTTTTTTCTTTTATTTTATTAAAAGCATGCATGCACAAGAATGTTAT
Unaligned ( gi|31 ): GGTACTGTATGGTGTGAAACTCTTAATATTGATTGAGGCTCTTATTAACACTATGATAGTATCAAGCCTTTTTTTCCATTCCC
Unaligned ( gi|35 ): TGTCATGTTTTACACATAAAGAATTCGATATAATAAATCTGTTTGGGTTTTTTTTTTTTTT
Unaligned ( gi|40 ): CTTCTAAAAACAATGGGCATGATGAGTTTCCTATTTATATTTCACCT






Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                       11         222222                                                                                                                                       222222222222222222       000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000           22222                                    1                                                                   333333333333                                111111111111                                                                      2222222222222222222222222222                        1111111111                    2222222                   33333333333333333333333333              11   11111                           11111   111        11111    222222222            4444444444444     111           4444444444444444444      44444444444444444              1        222222222222      1      1111111111                 11   11                            222222222                       444444444444444444444444                          111   33333333                          3333333333333333333333333333333333333333                      11111111                 2222222222                 1                                                              1111111    7777777777777777777777777        111  111111111                             6666666666666666666666666                                                           11111    11111     11111111               11111                                                                 11                     88888888888888888888888888888888888888888888               22222222222                  222222222222        1111   222222  11                      1     11111111                                          1                                                                                                                              
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                    4  11   99    777777     4   55  3 3  3 3    3  55  3    4444  44 3    44  3     4  6666    3       6 3        1   3     44       3 3       888888     3   444444444444444444   44  666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666   999 44  77777 77   44   3      6 3 44 6 3 77  3  0      0   3   0     6666  3  3   3  6 555 6666   7777  3 77777     111111111111 9    2     3      44 6 3   6   555555555555  3 3    0   99999  44  3 6666   999999999  6666        5   33        2222222222222222222222222222  2 2       2 33 2 2  6 5555555555     3 3  3 66666   1111111  7   99999    777 88888888888888888888888888   2   3    4 55   11111      5                    22222   777     5  22222 5  222222222  0 5 66    0000000000000     111   2     5 4444444444444444444      77777777777777777      5  77   1    5   888888888888  5   0   4  9999999999      44  44     00   00      555 3  6      3 44 3  222222222  3   2       3  3     555555555555555555555555          4       777  66 222   11111111 66 4  777          4  1  6666666666666666666666666666666666666666   3 3    55   66 4   44444444 6666         66 1111111111    1 4 44  4    0  88    1  3        99999    0    2      4    0  4 0          3333333    9999999999999999999999999 777    111  666666666    4 8888 4       8    3    0000000000000000000000000  3  1  55 88       99999 3 3 55  8               99       22222 55 00000     44444444      777      00000  4 4  4  4     777 55  4         0      7  9999    4 4          99           4         33333333333333333333333333333333333333333333               55555555555      4 4  3  666 555555555555  3  3  1111 3 333333  33   3 555 555     3 3  2 4   99999999   3  3     3    3    3   44 44     44 3  2 3  3 2 6666     3 555            0  2 33  2      33   4  2    999999 33   2 2 2 2      3    3 3     6  77  3  555            
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                    .  ..   ..    ......     .   ..  . .  . .    .  ..  .    ....  .. .    ..  .     .  ....    .       . .        .   .     ..       . .       ......     .   ..................   ..  ................................................................................................................................................   ... ..  ..... ..   ..   .      . . .. . . ..  .  .      .   .   .     ....  .  .   .  . ... ....   ....  . .....     ............ .    .     .      .. . .   .   ............  . .    .   .....  ..  . ....   .........  ....        .   ..        ............................  . .       . .. . .  . ..........     . .  . .....   .......  .   .....    ... ..........................   .   .    . ..   .....      .                    .....   ...     .  ..... .  .........  . . ..    .............     ...   .     . ...................      .................      .  ..   .    .   ............  .   .   .  ..........      ..  ..     ..   ..      ... .  .      . .. .  .........  .   .       .  .     ........................          .       ...  .. ...   ........ .. .  ...          .  .  ........................................   . .    ..   .. .   ........ ....         .. ..........    . . ..  .    .  ..    .  .        .....    .    .      .    .  . .          .......    ......................... ...    ...  .........    . .... .       .    .    .........................  .  .  .. ..       ..... . . ..  .               ..       ..... .. .....     ........      ...      .....  . .  .  .     ... ..  .         .      .  ....    . .          ..           .         ............................................               ...........      . .  .  ... ............  .  .  .... . ......  ..   . ... ...     . .  . .   ........   .  .     .    .    .   .. ..     .. .  . .  . . ....     . ...            .  . ..  .      ..   .  .    ...... ..   . . . .      .    . .     .  ..  .  ...            
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                    0  00   55    666666     0   55  6 6  6 6    6  00  3    7777  33 3    66  3     7  5555    1       2 1        0   1     22       1 1       888888     1   666666666666666666   22  222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222   222 66  99999 99   66   3      7 1 22 2 1 33  1  0      8   1   8     5555  1  1   1  2 444 1111   6666  1 77777     666666666666 2    9     1      22 7 3   2   888888888888  1 1    5   55555  22  1 1111   999999999  1111        7   99        0000000000000000000000000000  7 7       7 77 9 9  2 2222222222     1 1  1 99999   3333333  3   11111    000 77777777777777777777777777   3   6    4 11   11111      0                    55555   555     0  55555 7  999999999  1 0 99    4444444444444     888   5     7 4444444444444444444      00000000000000000      7  99   4    7   444444444444  0   0   4  4444444444      66  88     66   00      888 3  7      3 66 3  555555555  3   4       3  3     888888888888888888888888          0       888  22 222   00000000 11 4  888          0  1  8888888888888888888888888888888888888888   6 6    00   11 4   33333333 2222         11 4444444444    9 4 00  4    9  77    4  6        88888    3    3      0    8  0 9          0000000    2222222222222222222222222 000    000  000000000    0 5555 0       8    6    6666666666666666666666666  6  3  00 66       11111 6 6 00  0               55       22222 55 00000     55555555      000      00000  0 0  0  0     000 55  0         8      4  4444    4 4          44           4         66666666666666666666666666666666666666666666               66666666666      4 4  6  444 777777777777  6  6  4444 6 000000  88   3 888 888     3 3  0 5   88888888   3  3     3    3    3   66 66     66 3  3 1  1 2 5555     1 444            1  7 77  7      44   7  4    999999 44   5 5 5 5      1    1 1     2  33  1  444            
consensus                     :                                                                                                                                                                         CTTGGTGTAAA-AT--GCT--GACT-----TCTGGA-GCC--TC-C-AA-T-TTGG-ACG-TC-CAAA--G-TG-GA-GAGA--GG-GTGGAGCC----TCTT-GTCATAA-G-AGATTGTCTGGG-TGGAG--CTATTGG-A-GTTAATT------TCAAA-ACA------------------TAA--TT------------T-----A-C-T--------------CTG---T--------------------------C----------------------CT------------C-AGT-GT------T-------CG-------------TGG---C--TAT----A--ACA--TAA-AGTTAT-C-A--A-A-C--AA-AA-CAAGTCCTTT-GAAGCTCCCTAT-AT-AA-ACT-AA-T---T---CCCC---AAA-C-----CCCAT--------G---C-ATAA-TCTGA-AAAGGG--C-A-GAA-GGC------------CA-G-CACCATAA-A---CC--TG-T----TAC---T-T---CA----AACAAAAA-CAA--AACACACTA-------AAA------TTA---A--T-CA-C-CATTTCA-C--A-A-TA-A--T-------TAATT-G-AT-T---G-AAAG------AA-GAT-----AAAG---C-----TTT-AT-TA-CA-TTNAACC-AATTTCA-CTTT-G-AAAA-----ATATTT-CTGCTGATCGCAGTTTGCAA-----GGA---AGACG-TG-----T-TT-G-T-----ATTT-A--ATAC---TG-ATC----TATATCG-TGTCGTCGA-A--------------AG---TCCTAT------TA---------CAGTCA-AA--GGT-AATT-TTG----A--T-T--AT-AAA-TGA-TG----------GAGGGA-GAA-TGAAAT-TTAT--GTCAAC---A-AG-GTGATC-A--G-CTAT-------AC-AAATCCAAAAC-AT-CACAG------ACT-AGCGT---AAA---TTCACTCCAC-TCGGCTT---TT-TA---CCC---C-A--A--T-TT---ACAGGACATT-TCATT--------G--------------TT-------------G-TCA-T-GTTT--TAC--A-TAT--A-----C--CTGGTACATGG--A-----G----AACTTG-TGGAT-TGGA-TT-CTTTTCTT-TATTTCAT----AATTGTCATTTATTTCA-TAAATTT-CATTCATGCATA-------TATAAGAATG----T-------A------G---TGAG---TT------T--TTGT-T----G-TCATCCCNTGTG-TTTGATAT---------A-----------GT-GCATG--A--TGAAATT-----G-G-G--GG-AAATCTTGAACATCA--GCTCAGTAAA-AT--A-----ACACT--------CCTGAC---AGATGC-----TG-T-AC-TG-AGCAA---T--GT-GTCAATTTGTAAATTTTGA----TCTC-T-CATCACCACA--TTGGACTGGCT-CTGTACTGC----TAT----A---------------------A----------AATTTATTGGACAGCA-ACAGAGA--ACCAGT-C-TA-CC---T--A-------G-TA-CA-GG----A-A-T----TG--AAA-T---G---ACAGA-T-ATAAATAA-G-T-NA-GTG-TT-GAAAT-TCAC-TTCT-GAA--G--CTCCA--C-CC-T-GA-CAA----TCTCT-T---ATGACAAGAGGCTCC-A--CC-CTCTCT--CCA-CT-TTGGA----CG--TCC-A-A-A-TTGGAG-GCTC-C-AGAGT-CA--GC-AT---TTTACACCAAGC
Reference ( family-2546 )     :                                                                                                                                                                         CTTGGTGTAAA-AT--GCT--GACT-----TCTGGA-GCC--TC-C-AA-T-TTGG-ACG-TC-CAAA--G-TG-GA-GAGA--GG-GTGGAGCC----TCTT-GTCATAA-G-AGATTGTCNGGG-TGGAG--CTATTGG-A-GTTAATT------TCAAA-ACA------------------TAA--TT------------T-----A-C-T--------------CTG---T--------------------------C----------------------CT------------C-AGT-GT------T-------CG-------------TGG---C--TAT----A--ACA--TAA-AGTTAT-C-A--A-A-C--AA-AA-CAAGTCCTTT-GAAGCTCCCTAT-AT-AA-ACT-AA-T---T---CCCC---AAA-C-----CCCAT--------G---C-ATAA-TCTGA-AAAGGG--C-A-GAA-GGC------------CA-G-CACCATAA-A---CC--TG-T----TAC---T-T---CA----AACAAAAA-CAA--AACACACTA-------AAA------TTA---A--T-CA-C-CATTTCA-C--A-A-TA-A--T-------TAATT-G-AT-T---G-AAAG------AA-GAT-----AAAG---C-----TTT-AT-TA-CA-TTNAACC-AATTTCA-CTTT-G-AAAA-----ATATTT-CTGCTGATCGCAGTTTGCAA-----GGA---AGACG-TG-----T-TT-G-T-----ATTT-A--ATAC---TG-ATC----TATATCG-TGTCGTCGA-A--------------AG---TCCTAT------TA---------CAGTCA-AA--GGT-AATT-TTG----A--T-T--AT-AAA-TGA-TG----------GAGGGA-GAA-TGAAAT-TTAT--GTCAAC---A-AG-GTGATC-A--G-CTAT-------AC-AAATCCAAAAC-AT-CACAG------ACT-AGCGT---AAA---TTCACTCCAC-TCGGCTT---TT-TA---CCC---C-A--A--T-TT---ACAGGACATT-TCATT--------G--------------TT-------------G-TCA-T-GTTT--TAC--A-TAT--A-----C--CTGGTACATGG--A-----G----AACTTG-TGGAT-TGGA-TT-CTTTTCTT-TATTTCAT----AATTGTCATTTATTTCA-TAAATTT-CATTCATGCATA-------TATAAGAAT-----T-------A------G---TGAG---TT------T--TTGT-T----G-TCATCCCNTGTG-TTTGATAT---------A-----------GT-GCATG--A--TGAAATT-----G-G-G--GG-AAATCTTGAACATCA--GCTCAGTAAA-AT--A-----ACACT--------CCTGAC---AGATGC-----TG-T-AC-TG-AGCAA---T--GT-GTCAATTTGTAAATTTTGA----TCTC-T-CATCACCACA--TTGGACTGGCT-CTGTACTGC----TAT----A---------------------A----------AATTTATTGGACAGCA-ACAGAGA--ACCAGT-C-TA-CC---T--A-------G-TA-CA-GG----A-A-T----TG--AAA-T---G---ACAGA-T-ATAAATAA-G-T-NA-GTG-TT-GAAAT-TCAC-TTCT-GAA--G--CTCCA--C-CC-T-GA-CAA----TCTCT-T---ATGACAAGAGGCTCC-A--CC-CTCTCT--CCA-CT-TTGGA----CG--TCC-A-A-A-TTGGAG-GCTC-C-AGAGT-CA--GC-AT---TTTACACCAAGC
gi|1                          :                                                                                                                                                                            GGTGTAAATATCTGCTT-GAAC-----TCTGGA-GCC--TC-C-AA-T-TTGG-ACC-TCTCAAA--G-T--GA-GAGA--GG-GTGGGTTC----TCTT-GTCATAAGG-AGATTGTCTGGG-TGGAT--CTATTGG-A-GTTGATT------TCAAA-ACA------------------TAATTTT------------T-----A-C-T--------------CTG---T--------------------------CA---------------------TT------------T-AAT-GT------T-------
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AA--TT------------T-----C-C-TGT------------CTG---CGTCA----------------------C----------------------CT------------C-AG--GT------T----------------------TGG---C--TAT----A--ACA--TAA-GATTAT-C-A--AGA-C--AA-AAACAAGTCATTT--------------AT-GATACTGAA-T---T---CCCA---AAA-TGCGCTCCCAT--------GGGCC-ATAA-TCTGA-AAAGGG--CCA-GAAAGGC------------CA-G-CACCATAA-AC--CC--TG-TAGTCTA----T-T---CA----AACAAAAA-CAA--A----ACT--------AAA------TTA--------CA---CA-TTCA-C--gtctgaatttcctgtctgcgtcacctcaggtttggctataacataagattatcaagacaaaaacaagtcatttatgatactgaattcccaaaatgcgctcccatgggccataatctgaaaagggccagaaaggccagcaccataaaccctgtagtctattcaaacaaaaacaaaactaaattacacattcacgtgaagtgataatttcagagtagcgcaatttttcacaaacggacatgcaaaactgattgatcgtctgatgaacaggtctgctatagaattaacaattatgaaaatcgtggtaagacgttacagtgtatttgagttgttcattgtgaattcctgattagaagctattatatgtgttcgaaagtcctattacagtcaaacgtaaattttgtataattagaacgattgtattttaagcgagggaattgaaataatatgtccacagaggtgatcagcgctttacaaaccaaaacgtccacagtggtactagcgtaatttcatgtcttttgtagccccaacaatttagaacaggacatttctgtgttgttcattgtttggtacatataccggtacgtggacaaaacgtgtttgattggatttcttttctttatttcataattgtatttatttcataaatttcttcatgtatatataagtgagtttactgttgttatcccttgtgtttgatgttaagcatagagtgcatgatgaaattgggggaaatcttcaacatcagctcagtaaataacactcctgacagatgctgtactgagcaatgtgtcaatttgtaaattttgatctctcatcaccacattggactggctctgtactgctatcaaatttattggacagcacagaaccagtctacctaagtacaggaatgataaatagcagatatgatagatgaagtgttgaaattcatttctgaagctccacccatgacaatatcttatgacaagaggctccaccctctctccactttggaggtcaaaattgaggctccagagtcagggcattttacaccaa
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ggtgtaaatatctgcttgaactctggagcctccaatttggacctctcaaagtgagagagggtgggttctcttgtcataaggagattgtctgggtggatctattggagttgatttcaaaacataatttttactctgtcatttaatgttgtctg----TATAT-G-TGT--TCGA-A--------------AG---TCCTAT------TA---------CAGTCA-AA--CGTAAATT-TTGTATAA--T-T--A--GAA-CGATTGTATTTTAAGCGAGGGA--AT-TGAAATAATAT--GTCCAC---AGAG-GTGATC-AGCG-CTTT-------AC-AAA-CCAAAAC-GTCCACAGTGGT--ACT-AGCGT---AAT---TTCA--------TGTCTT---TTGTAG--CCCCAAC-A--A--T-TTAGAACAGGACATT-TCTGT--------G--------------TT-------------GTTCATT-GTTTGGTAC--A-TAT--A-----C--C-GGTACGTGGACA-----A----AACGTGTTTGAT-TGGATTT-CTTTTCTT-TATTTCAT----AATTGT-ATTTATTTCA-TAAATTT-C-TTCATGTATA-------TATA------------------A------G---TGAG---TT------TA-CTGT-T----G-TTATCCCTTGTG-TTTGATGTTAAGCATAGA-----------GT-GCATG--A--TGAAATT-----G-G-G--GG-AAATCTTCAACATCA--GCTCAGT-AA-AT--A-----ACACT--------CCTGAC---AGATGC-----TG-T-AC-TG-AGCAA---T--GT-GTCAATTTGTAAATTTTGA----TCTC-T-CATCACCACA--TTGGACTGGCT-CTGTACTGC----TAT----C---------------------A----------AATTTATTGGACAGC--AC--AGA--ACCAGT-C-TA-CC---TA-A-------G-TA-CA-GG----A-A------TGATAAA-T---A---GCAGA-T-AT-GATAG-A-TGAA-GTG-TT-GAAAT-TCAT-TTCT-GAA--G--CTCCA--C-CCAT-GA-CAA----TATCT-T---ATGACAAGAGGCTCC-A--CC-CTCTCT--CCA-CT-TTGGA----GG--TCA-A-A-A-TT-GAG-GCTC-C-AGAGT-CAGGGC-AT---TTTACACCAAgtgaagtgataatttcagagtagcgcaatttttcacaaacggacatgcaaaactgattgatcgtctgatgaacaggtctgctatagaattaacaattatgaaaatcgtggtaagacgttacagtgtatttgagttgttcattgtgaattcctgattagaagctattatatgtgttcgaaagtcctattacagtcaaacgtaaattttgtataattagaacgattgtattttaagcgagggaattgaaataatatgtccacagaggtgatcagcgctttacaaaccaaaacgtccacagtggtactagcgtaatttcatgtcttttgtagccccaacaatttagaacaggacatttctgtgttgttcattgtttggtacatataccggtacgtggacaaaacgtgtttgattggatttcttttctttatttcataattgtatttatttcataaatttcttcatgtatatataagtgagtttactgttgttatcccttgtgtttgatgttaagcatagagtgcatgatgaaattgggggaaatcttcaacatcagctcagtaaataacactcctgacagatgctgtactgagcaatgtgtcaatttgtaaattttgatctctcatcaccacattggactggctctgtactgctatcaaatttattggacagcacagaaccagtctacctaagtacaggaatgataaatagcagatatgatagatgaagtgttgaaattcatttctgaagctccacccatgacaatatcttatgacaagaggctccaccctctctccactttggaggtcaaaattgaggctccagagtcagggcattttacaccaa
gi|10                         :                                                                                                                                                               ggtgtaaatatctgcttgaactctggagcctccaatttggacctctcaaagtgagagagggtgggttctcttgtcataaggagattgtctgggtggatctattggagttgatttcaaaacataatttttactctgtcatttaatgttgtctgaatttcctgtctgcgtcacctcaggtttggctataacataagattatcaagacaaaaacaagtcatttatgatactgaattcccaaaatgcgctcccatgggccataatctgaaaagggccagaaaggccagcaccataaaccctgtagtctattcaaacaaaaacaaaactaaattacacattcacgtgaagtgataatttcagagtagcgcaatttttcacaaacggacatgcaaaactgattgatcgtctgatgaacaggtctgctatagaattaacaattatgaaaatcgtggtaagacgttacagtgtatttgagttgttcattgtgaattcctgattagaagctatA-AGC------------CC-G-CACCATAA-A---CC--TG-T----TAC---T-T---CA----AACAAAAA-CAA--AACACACTA-------AAA------TTA------T-CA-CTCATTTCA-C--A-AATA-A--T-------TAATT-G-AT-T---A-AGA-------AA-GAT-----AAAAAGAC-----TTA-AT-TA-CAATTAAA---AATTTCA-CTTT-GCAAAA-----ATATTT--TGCTGATCGCAGTT-GCAA-----GGA---AGACG-TG-----T-TT-GAT-----ATTT-A--ATACA--TG-TAC----TATATCA-TGTCGTCGA-A--------------AG---TCCTAT------TA---------CAGTCA-AA--GGT-AATT-TTG----A--T-TT-AT-AAAATAA-TG----------GAGGGA-GAA-TAAAAT-T-AT--GCCAAC---A-AGTGTGATC-A--G-CT-T-------AC-AAATCCAAA-C-AT-CACAG------ACTCAGCATTTGAAA---TTCACTCCAC-TCGGCTT---TT--A---CCC---C-A--AGAT-TT---ACAGGACATT--CATT--------A--------------TTTTGTTTTTTGTTTG-TCA-T-GTTT--TAC--A-TATATA-----C--CTGGTACATGG--A-----G----AACTTG-TGGAT-TGGATTT-CTTTTCTT-TATTTCAT----AATT
gi|11                         :                                                                                                                                                                         CTTGGT--AAA-AT--GCT--GACT------CTGGA-GCC--TC-C-AA-T-TTGG-ATG-CC-CAAA--G-TG-GAAGAGA--GG-GTGGGGCT----TCTT-GTCATTA-G-AGATTGTCTGG--TGGAG--CTATTGG-A-GT-AATTACTCTGTCA----TT------------------TAA--TT------------T-------C-TGATATCCTGG----CTG---T--------------------------C----------------------CT------------C-AGT-GT------T-------TG-------------TGG---C--TA-----A--ACA--TAA-AGTTAT-C-A--A-A-C--AA-AAACAAGTCCTTT-GAAGCTCCCAAT-AT-AA-ACT-AA-T---T---TCCC---AAA-C-----CCCAT--------A---CCATAA-TCTGA-AAAGGG--C-A-GAA-GGC------------CA-G-CACCATAA-A---CC--TG-T----TAC---T-T---CA----AACAAAAA-CAA--AACACACTG-------AAA------ATA---A--T-CA-C-CATTTCA-C--A-A-TA-A--T-------TCATT-G-AT-T---G-AAAGA-----AA-GATAATTAAAAG---C-----TTT-AT-TA-CA-TTTAAAC-AATTTCA-TTTT-GCAAAA-----ATATT
gi|12                         :                                                                                                                                                                         CTTCGTGTAAA-AT--GCT--GACT-----T-TGGA-GCC--TC-C-AACT-TTGA-ACC-TC-AAAA--A-TG-GA-AAGA--GA-GTGGAACC----TCTT-GTCATAA-G-AGATTGTCAGGG-TGGAG--CTTTTTG-A-GATAATT------TAAAA-ACA------------------TAA--TC------------T-----A-T-T--------------CTG---T--------------------------CAT--------------------TT------------C-AAT--T------T-------C--------------TGAATCC--TA-----A--ACA--TAA-TGTTATCC-A--A-A-C--AA-AA-CAAGTCCTTT-GAAGCTCCCTAC-AT-AA-AGT-CATT---T---CCCC---AAA-C-----CCCAT--------GC--C-ATGA-TCTGA-AAAGGG--C-A-GAT-GGC------------AA-A-CATT-TAGCA---TC--TG-T----TAC----------------AC------------ACACACTA-------A-------------------C-------------------TA-A--C-------TAATT-G-AC-A---G-A---------AA-GAT-----ATAG---C------TT-AT-T----------CT---TTTTA-C------AAAA-----ATATTC-TTGCTGATCACAGTTTGCAA-----GGA---AAACC-TG-----T-TTAA-T-----AT-------TAC---TG-TAC----TAT
gi|13                         :                                                                                                                                                                         CTTGGTGTAAA-AT--GCT--GACT------CTGGA-GCC--TC-C-AA-T-TTGG-ACG-TC-CAAA--G-TG-AA-GAGA--GG-GTAGAGTC----TCTT-GTCATAG-G-AGATTGTCTGGG-TGGAG--CTATTGG-A-GTTAATT------TCAAA-ACA------------------TAA--TT------------C-----A-C-T--------------CTG---T--------------------------C----------------------CT------------C-AGT-GT------T-------CG-------------TGG---C--TAT----AC-ACA--TAA-AGTTAT-C-A--A-A-CCAAA-AA-CAAGTCATTT-GAAGCTCCTTAT-AT-AA-ATT-AA-T---T---CCCC----AA-C-----ACCAT--------GC--C-ATAA-TATGA-AAAGGG--C-A-GAA-GGC------------CA-G-CACCATGA-A---CC--TG-T----TAC---T-T---CA----AACAAAAA-CAA--AACACACTA-------AAT------TTT---A--T-TG-T-ATTTTTA-C--A-A-Tc
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  g--------------TT-------------G-TCA-T-GTTT--TAC--A-CAA--AGAATTC--C--ATATATAA--A-----AGTTAAACTTA-TGATT-TGGA-TT-TTTTTCTC-TATTT-----------------TATT--A-AAAA----CATGCATGCACAAGAATGCTATACAAAC-----T-------G------G----GAG---TT------T--T-GT-T----G-TCATCCCTTGTG-TTTG--AT---------G-----------GT-GC-TG--A--TGAAATT-----G-A-G--Gtgtga
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         gtTG-CTTGATG----------------------GT-GC-TG--A--TGAAATTCGGGGG-G-G--GG-GGATCTTGAACGTCA--GCTCAGTATA-AT--ACATAGACA-T--------CCTGAC---AGATAC-----TG-T-AC-TG-AGCAA---T-----------TTGTGAATTTTGA----TCTC-T-CATCTCCACA--TTGGACTGGAT-CTGTagggggggggtctgcttgatggtgctgatgaaattcgggggggggggatcttgaacgtcagctcagtataatacatagacatcctgacagatactgtactgagcaatttgtgaattttgatctctcatctccacattggactggatctgt
gi|15                         : gtttgtcatgttttacacaaagaattccatatataaaagttaaacttatgatttggatttttttctctattttattaaaaacatgcatgcacaagaatgctatacaaactgggagttttgttgtcatcccttgtgtttgatggtgctgatgaaattgaggagggggggggtcGTGTAAA-AT--GCT--GACTCTAGATCTGGA-GCC--TC-C-AA-T-TTGG-ACG-TC-CAAA--G-CG-GA-GAGA--GG-GTGGAGCT----TCTT-GTCATAA-T-AGATTGTCTGGG-TGGAG--CTATTGG-A-GTTAATT------TCAAA-ACA------------------TAA--TT------------T-----A-C-T--------------CTG---TGATTTAATTTCTAACATCCTGGCTGTC----------------------CT------------C-AGT-AT------T-------TG-------------TGG---C--TA-----A--ACA--TAA-AGTTAT-CAA--A-A-C--AA-GA-CAAGTCTTCT-GAAGCTCCCTAT-AT-AA-ACT-AATT---T---CCCC---AAA-C-----CCCAT--------AC--C-ATAA-
gi|16                         :                                                                                                                                                                           ttGTGTAAA-AT--G-T--GACT------ATGGA-GCC--TC-C-AA-T-AATG-ACC-TC-CAAA----TG----GAGA--GG-GTGTA-CCTCAATCTT-GTCACAA-G-AGATTGTCAGGG-TGGAG--CT-TTGT-A-GTTACTT------T-AAA-ACT------------------TTA--AT------------T-----A-T-T--------------TTG---T--------------------------CTTTAATTTTACATCCTTTATCCCC------------C-AAT-AT------T-------TG-------------TGG---CCTTA-----A--ACA--TAA-ATTTAT-C-CTTG-A-CA-AA-AA-CAAG-CCTTT--AAGCTTGC-A--AT-AA---T-AA-T---T----CCC---AAA-C-----C
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tt-TCA-T-GTTT--TAC--A-TAT--A-----TATCTGGTACATGA--A-----G----ACCT------AT-T--A-TT-AAT-------ATTTCAT----AATGATCATTTATTTCA-TAAATTTTCATTCATGCATA-------TATAAGAATGTTATT-------A------GAAGTGAGGTGTT------T--TTTT-T----GGTCACCCCTTGTG-TTTGATA----------------------GT-GCATG--A--TGAAATT-----G-G-G--GGGAAATCTTGAACATCA--GCTCAGTTA---T--A-----ACACT--------CCTGAC---ATATGC-----TG-T-AC-TG-AGCAA---T--GT-GTCAATTTGgataccat
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              A-TG----------GAGGGA-GAA-TAAAAT-TTAT--GCCAAC---A-AG-GTGATC-A--G-CT-T-------AC-AAATCCAAAAC-AT-CACAG------ACT-AGCGTTTGAAA---TTCACTCCAC-TCGGCTT---TT-TA---CCC---C-AAGA--T-TT---ACAGGACATT-TCATT--------ATTTTGTTTTCTTGTTT-------------G-TCA-T-GTTT--TACATA-TAT--A-----C--CTGGTACATGG--A-----G----AACTTG-TGGAT-TGGATTT-CTTTTCTT-TATTTCAT----AATT
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               aTGGACAGCACAC---GA--ACCAGTTC-TATCC---T--A-------GGTA-CA-GG----A-AAT----TG--AAAAT---G---ACAGA-G-GCTAATAA---T-C---------------TCAC-G-CT-GAATGG--CTCCA--CACCAT-GA-CAA----TCTCT-T---ATGACAAGAGGCTCC-A--CC-CTCTCT---CA-CT-TT-GC----CG--TCC-ATA-ATTTGGAG-GCTCACAAGAGTCCA--GCAATGTGTTTACACCA
gi|2                          :                                                                                                                                                                         CTTGGTGTAAA-ATCTGCTTTGA-------TCTGGA-GCC--TC-C-AA-T-TTGG-ACC-TC-CAAA--G-TG--A-GAGA--GG-GTGGAGTC----TCTT-GTCATAA-GGAGAT-GTCTGGGCTGGAT--CTATTGG-A-GTTGATT------TCAAA-ACATAATTTTACTCTGTCATTTAA--TT------------TCTAATA-T-C--------------CTG---T--------------------------CTCGTC-----------------CT------------C-AG--GT------T-------CG-------------TG----C--TAT----ACAACA--TAA-A-TTAT-C-A--AGA-C--AA-AA-CA-GTCATTT-GAA-----------------CT-AA-T---T---TCCC---AAA-C-----CCCAT--------G---CCATAA-TCTGA-AAAGGG--CCA-GAAAGGC------------CACG-CACCATAA-A---CC--TG-T-----AC---T-T---CA----AACAAAAAACAA--AACAC-CTA-------AAA------TTA---A--A-CA-C-CATTCTA-C--G-T-GAGA--TG------TGACTAG-ATGT---GTAAAG------AGTGA------AGAG---CGAATGCTT-ATGTA-CA-AAAAACGGAAT--CA-TTGC-G-AAGAGATGGATGTGTGCGGCTGATTGCA-TGTGCAA-----GAATAAAAGCG-TGGGCCGTGTT-G-TGAGTGATGTGA--ATGCGTGTG-A-C----TATAT-A-TGT-GTCGA-A-------------------TCCTAT------TA---------CAGTCA-AAACGTT-AAAT-TTG----AAGTGT--ATGAAA-TGA-TT----------GAGGGA-TAA---AAAT---AT---TCCACTGAG-AG-GTGATC-A--GGCTTT-------AC-AAA-CCAAAAC-GT-CACAGGGTGGTACT-AGCGT---A-----TTCA----GC-TTGGTGT---GT-GAGCTCCC---A-A--A--T-TT---ACAG-ACATT-TCTGT--------G--------------TT-------------G-TCA-TTGTTT--TAC--AATAT--A-----C----GGTACGTGG--ACCAGAG----AACG-G-TG-AT-TGGA-TTTCTTTTCTT-TATT-CAT----AATTGTCATTTATTTCAGTAAATTT-CTTTCATGTTTA-------TATA----T-----A-------A------G---TGAG---TT------TACTTGT-T----G-TTATCCC-TGTG-TTTGATGTTAAGCATAGA-----------GT-GCATGGGA--TGAAATT-----G-G-G--GG-AAATCTTCAACATCA--GCTCAGTAAA--T--A-----ACACT--------CCT-AC---AGATGC-----TG---AC-TG-AGCAA---T--GT-GTCAATTTG--AATTT-GA----TCTC-T-CATCACCACA--T-GGACTGGCT-CTGTACTGC----TAT----C---------------------A----------AATTTATTGGACAGC--ACA-AGA--ACCAGT-C-TA-CC---T--AAG-----G-TACCA-GG----A-A------TGATAAA-TACCG---CCAGA-T-AT-GATAA-T-G-AA-GTG-TTGGAAAT-TCACTTTCT-GAA--G--CTCCA--C-CCAT-GA-CAA----TATCT-T---ATGACAAGAGGCTCC-A--CC-CTCTCTCCCCA-CT-TTGGA----GG--TCA-A-A-A-TT-GAG-GCTC-C-AGAGT-CA--GC-AT---TTTACACCAAGC
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AA-TCTGA-AAAGGG--C-A-GAA-GGC------------TA-G-CACCATAA-A---CC--TG-T----TAC---T-T---CA----AACAAAAA-CAA--AA------------------------TA---A--T-CA-C-CATTTCA-C--A-A-TA-A--T-------TAATT-G-AT-T---G-AAAGA-----AA-GAT-----AAAG---C-----TTT-TT-TA-CA-TTTAGAC-AATTTCA-CTTT-G--------------TT-CTGCTGATCGCAGTTTGCAA-----GGATTGAGACG-TG-----
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        CAAACCA-------AAA--------A---C--T-CA-C-AATTTCAAC--A-A-TA-A--T-------AAATT-G--------G-ACA-------AA-GAT-----ATA----C-----TTT-AT--A-CA-TTTA--C-AGT--CA-CGGT-G-CAAA-----ATATTT-CTGCTGATCGCAGTTTGCAA-----GAA---AGCTG-CT-----T-TA-A-T-----A-TT-ACTACAC---T--ATCACAATGTATCA--GTCATAGA-A--------------GG---
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                tTGGAGTC----TCTT-GTCATAG-G-AGATTGTCTGGG-TGGAG--CTATTGG-A-GTTAATT------CC-AA-ACA------------------TAA--TT------------T-----A-C-T--------------CTG---T--------------------------CA---------------------TT------------T-AAT-TTCTGATAT-------CC-------------TGG---C--TGTCCTCA--GTGTTTAA-AGTTAT----------C--AA-AA-CAAGTCATTT-GAA---CCC--------------------------------------------CAT--------GC--C-ATAA-TCTGA-AAAGGG--atttt
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AAATCCTTT-GAAACTCCATAC-AT-AA-ACA-CA-T---T---TCCT-------C-----CCTAT--------AT--C-ATGA-TCTGA-AAAG---------------------------------ACCTT---G---CCTTTG-T----TAC---G-T---CA----AACACAAA-CAA--GA------A-------AAACC----TTA---------A-C-CATTTCA-C--A-A-TGCA--TGTACATGTAATT---AC-T---A-AAAA------AA-AAT-----A
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TT-A--ATAC----G--------TACATCGATGTCGTTGGTA--------------AGATTTCTTATAAGATCTATGCACGAATCAGTCA-AA--GGT-AAATATTG----A--T-TGTAT-AAA--GA--G----------GAGGGAAGAAGTGAAAT-CTAT--GTCAAC---A-AG-GTGATCTA--G-CTGC-----------AATCC-AAAC-AT-CACAG------Attactgtatt
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             a-CT---T--G-------A-TA-CA-GG----A-AAT----TG--AAA-T---G---ACAGA-T--TGAATTA-G-C-TATGTG-TT-GAAAT-TCAC-TTGA-GAA--G--CTCCA--C-CC-T-T--CCC----CCTCTAT---AAAACTAGCAGCCCT-A--GC-CCCTCG--CTA-TTCTTGGAATTTTG--TTC-A-A-A-CTG
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              gt-T----TG--AAA-T---G---ACAGA-T-GTACATA-------A-ATG-TC-CAA---TCCC-TT--------G--C-ACA--C-TT-T-AA-C-------------------ACAAGAGG-TCC-A--AT-TCTTTT--CCATTT-TTGGA----GC--TCC-A-ACA-TTGGactag
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                    C-C-AA-TGTTGG-AGC-TC-CAAA--AATG-GA-AAAG--AA-TTGGA-CC----TCTT-GTGTTAA---AGTGTGCAAGGG----------ATTGG-A----CATT------T----------------------------A--TG------------T-----A-CAT--------------CTG---T--------------------------CAT--------------------TT------------CAAATGGT------TGTGGGAATG-------------TGG---C--TTG----A--ATG--TAA-AATTATCC-A--A-A-C--AA-Aatggttgtgggaatgtggcttgaatgtaaaattatccaaacaaa
gi|27                         :                                                                                                                                                                         CTAGGTGTGAA-AC--GCT--GACT------CTGGA-ACC--TT-C-AA-T-TTTG-ACG-TC-CAAA--G-TG-GA-GAGA--GGCGTGGGGTC----TCTT-GTCATAACG-AGATTGTCTGGG-TGGAG--CTATTGG-AGGTTAATT------TCAGA-A
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   -AATTTCA-CTTTTG-CAAA-----ATATTT-CTTGTGATCGCAGTTTGCAATTGAGGGA---AGACG-TG-----T-TT-T-T-----ATTA-A--TTAC---TG--TA----CATATCA-TGTCGac
gi|3                          :                                                                                                                                                             aaaaaaaaaaaaCTTGGTGTAAA-AT--GCT--GACTAT---TCTGGA-GCTCGTCAC-AA-T-TTGGGACG-TC-CAAA--G-TG-GA-GAGA--GG-GTGGA-TC----T-TT-GTCATAG-G-AGATTGTCTGG--TGGAGGAC-ATTGG-A-GTTAATT------TCAAATACA------------------TAA--TT------------T-----A-C-T--------------CTG---T--------------------------C----------------------CT------------C-AGT-GT------T-------C--------------TGG---C--TATC---A--ACA--TAA-AGTTAT-C-A--A-A-C--AA-AA-CAAGTCATTT-GAAGCTCCCTAT-AT-AA-ACT-AA-T---T---CCCC---AA--------CCCAT--------G---C-ATAA-TCTGA-AAAGGG--C-A-GAA-G-C------------CA-G-CACCATAA-----CC--TG-T----TAC---TGT---CA----AACAAAAA-CAA--AACACACTA-------AAA------TTA---A--T-CA-C-CATTTCA-C--A-A-TA-A--T-------CAATT-G-AT-T-----AAAG------AA-GAT-----AAAG---G-----TTT-AT-TAACA-T-AAACT-AATTTCAGCTTT-G-AAAA-----ATATTT-CTGCTGATCGCAGTTTG--A-----AGA---AGACGGTG-----T-TT-G-T-----ATTT-A--ATAC---TG-ATC----TATATC--TGTCGTCGA-A--------------A----TCCTAT------TA---------CAGTCA-AA--GGT-AATT-TTG----A--T-T--AT-AAA-TGA-TG----------GAGGGA-GAA-TGAATT-TTAA--GTCAAC---A-AG-GTGATA-A--G-CTAT-------AC-AA--TCAAAAC-AT-CACAG------ACT--TTGT---AAA---TTCACTCCAC-TCAGCTT---T----------------------------ACAGGACATT-TC-TT--------G--------------TT-------------G-TCA-T-GTTT--TAC--A-TAT--A-----C--CTGGTACATGG--A----------AACTTG-TGGATGTGGA-TT-CTTTTCTTGTATTTCAT----AATTGTCATTTATTTAA-TAAATTT-CATTCATGCATA-------TATAAG---------------------------TGAG---TT------TA-TTGT-T----G-TCA--CCTTGTG-GTTGATGT---------AAAGGCATTAGTGT-GCGTG--A--TGAAATT-----G-G-G--GG-AAATCTTCAACATCA--GCTTAGTAAA-AT--A-----ACACT--------CCTGAC---AGATGCATATGCG-T-AC-TG-AGCAA---T--GT-GTCAATTTGTAAATTTTGA----TCTC-T-CATCACCACA--TTGGACGGGCTGCTGTACTGC----TAT----A---------------------A----------AATTTATTGGACAGCA-ATAGAGA--ACCAGT-C-TA-CC---T--A-------G-TA-CA-GG----A-A-T----TG--AAA-T---G---ACAGA-T-ATAAATAA-G-T-TA-GTG-TT-GAAAT-TCAT-TTCT-GAA--G--CTCCA--C-CCAT-GA-C-A----TATCT-T---ATGACAAGA-GCTCC----CC-CTCTCT--CCA-CT-TTGGA----GG--TCC-A-A-A-TTGGAG-GCTC-C-AGAGT-CA--GC-AT---TTTACACCAAGCaaaaattttcaaa
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              -CT---T--G-------A-TA-CA-GG----A-AAT----TG--AAA-T---G---ACAAA-TCAAAAATTG-GAT-CA-TTG-CT-GAAAT-TAAC-TCCA-GAA--G--CACCA--C-CC-T----------------------TG---AGTAGCCCC-A--CC-C-CTCT--CCA-AT-T
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tTAT--GTCAAC---A-CG-GTGATC-A--G-CTA--------AT-AAACCCAAAAC-AT-CACAG------ACT-AGAGT---TCATCCTTCACTCCAC-T
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        -T-GA-CAA----TCTCT-T---ATGACAAGAGGCTCC-ATCCT-CTCTCT--CCA-CT-TTGGA----GG--TCC-A-A-A-TTGGtaaaggt
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ca----TAC---T-TT--CA----AACAAAAA-CAA--AACACACTA-------AAA------TTA---A--A-CA-C-CATTTCA-C--A-A-TA-C--T-------TAATT-G-AT-T---
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             C-A--CC-CTCTCT--CCA--T-TTGGA----GG--TCCAA-A-A-GTGGAG-GGTC-C-AGAGT-CA--CC-AT---TTTACAGCAAG
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    AAGAGAC-CC-A--CT-CCCTCA--CGA-TT-TTGG--------------------TG-----TTC-C-ATGAT-CA--GC-AT---TTTACACCAAGC
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    aaTCTCT--CCA-CT-TTGGG----CA--TCC-A-A-A-GTGGAG-ACTT-C-AGAGT-CA--GC-AT---TTTACACCAAGCct
gi|39                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             gCA-CT-TTGGA----CG--TCC-A-A-A-TTGGAG-GCTC-C---AGT-CA--GC-AT---TTTACACCAAGC
gi|4                          :                                                                                                                                                                         CTTGGTGTAAA-AT--GCT--GACA-----CCTGGATGCC--TC-CCAA-G-TTGG-ACGGTC-CAAAAGG-TG-GA-GAGA--GG-GTGG-GCT----TCTTTGTCATAA-G-AGATTGT-AGGG-TGGAG--CCATTGGGA-ATTAATT------TCAAA-ACA------------------TAA--TTACTCTCGCCATTT-----AAT-T--------------CTGAC-T--------------------------C----------------------CTGGCTGTATCGATC-AGT-GT------T-------TG-------------TGGG--C--TA-----A--ACA--TAA-AGTTAT-C-A--A-A-C--AAGAA-CAAGTCCTTT-GAAGCTCCCTAT-AT-AA-ACT-AA-T---TGTCCTCC---AAAAC-----CCCAT--------C---C-ATAT-TATCG-AAGGGG--C-ACGAA-GGC------------CA-GGCACCATTA-TTTTCG--TG-T----TAC---T-TTTTCA----AACTAAAA-CAATAAACACA-TACGAGAGGGAA------GTA---AGATACAGC-CATTTCA-C--ATA-TG-A--A-------AAATT-GTAT-T---A-AAAG------
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    gA-TGAAAAATTGT--ATTAA----A-AG-CTG----------TAT-------GC-AAATCCAAAAC-AT-CACAG------A------------------TCACTCCAT-TCAGCTT---TT-TA---CCC---CTAT-A--T-TT---ACAGGGCATT-TTATT--------A--------------TT-------------A-TTT-T-GTTT--Tctgtatgcaaatccaaaacatcacagatcactccattcagctttttacccctatatttacagggcattttattattattttgttttcttgtttgccattatttcataattttcattcatgcatatataagaatgttatcagaagtgagatttttgttgtcatcccgtgtgtttgatagtgcatgatgaaattgggggaaaatcttcaacaccagctcagtaaataacactcctgacagatgctgtcacgtgaagaactagtgcaaatctcttcacactatacttggactagcctgtactgcttaatctgctaccggatttattggcagcagagaacaccaagttacctaccgtagggtacaggaacattgtgaaatgtgaacagagtataataagtgaagtgtttgaaatatcacctctgaagctctccgacccctgacaaattttcacttatgacaataggctcctacctttctctccctctttggacgtttccacatggagaactccaggtcaggcattttacacca
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            gcttggtgtaaaatgctgacacctggatgcctcccaagttggacggtccaaaaggtggagagagggtgggcttctttgtcataagagattgtagggtggagccattgggaattaatttcaaaacataattactctcgccatttaattctgactcctggctgtatcgatcagtgtttgtgggctaaacataaagttatcaaacaagaacaagtcctttgaagctccctatataaactaattgtcctccaaaaccccatccatattatcgaaggggcacgaaggccaggcaccattattttcgtgttactttttcaaactaaaacaataaacacatacgagagggaagtaagatacagccatttcacatA-TT-ATTTTGTT-T-TCTTGT------TTGCCATT-ATTTCA-TAATTTT-CATTCATGCATA-------TATAAGAATG----TTATCAGAA------G---TGAGA--TT------T--TTGT-T----G-TCATCCCGTGTG-TTTG--AT---------A-----------GT-GCATG--A--TGAAATT-----G-G-G--GGAAAATCTTCAACACCA--GCTCAGT-AA-AT--A-----ACACT--------CCTGAC---AGATGC-----TG-TCACGTG-AAGAA---CTAGT-G-CAA-------------A----TCTCTT-CA-CACTATAC-TTGGACTAGC--CTGTACTGC----T-T----A---------------------ATCTGCTACCGGATTTATTG----GCA-GCAGAGAACACCAAG-T-TA-CC---T--ACCGTAGGG-TA-CA-GG----A-A-CATTGTG--AAA-T---GTGAACAGAGT-AT-AATAA-G-TGAA-GTGTTT-GAAATATCAC-CTCT-GAA--GCTCTCCGACC-CC-T-GA-CAAATTTTCACT-T---ATGACAATAGGCTCCTA--CCTTTCTCT--CCCTCT-TTGGA----CGTTTCC-A-C-A--TGGAGAACTC-C-AG-GT-CAG-GC-AT---TTTACACCActtgtttgccattatttcataattttcattcatgcatatataagaatgttatcagaagtgagatttttgttgtcatcccgtgtgtttgatagtgcatgatgaaattgggggaaaatcttcaacaccagctcagtaaataacactcctgacagatgctgtcacgtgaagaactagtgcaaatctcttcacactatacttggactagcctgtactgcttaatctgctaccggatttattggcagcagagaacaccaagttacctaccgtagggtacaggaacattgtgaaatgtgaacagagtataataagtgaagtgtttgaaatatcacctctgaagctctccgacccctgacaaattttcacttatgacaataggctcctacctttctctccctctttggacgtttccacatggagaactccaggtcaggcattttacacca
gi|5                          :                                                                                                                                                                             gcttggtgtaaaatgctgacacctggatgcctcccaagttggacggtccaaaaggtggagagagggtgggcttctttgtcataagagattgtagggtggagccattgggaattaatttcaaaacataattactctcgccatttaattctgactcctggctgtatcgatcagtgtttgtgggctaaacataaagttatcaaacaagaacaagtcctttgaagctccctatataaactaattgtcctccaaaaccccatccatattatcgaaggggcacgaaggccaggcaccattattttcgtgttactttttcaaactaaaacaataaacacatacgagagggaagtaagatacagccatttcacatatgaaaaattgtattaaaagctgtatgcaaatccaaaacatcacagatcactccattcagctttttacccctatatttacagggcattttatt---C-ATAA-TCTGA-AAAGGG--C-A-GAA-GGT------------CA-G-CACCATAA-A---CC--TA-T----TAC-----------------------------AATGTACT------------------TC---A--T-CA-C-CATTTCA-C--A-A-TA-A------------ATT-G-AT-T---G-AAAG------AAAGAT-----AAAG---C--------------------------AATTTCA--TTT-GCAAAA-----ATATTT-CTGCTGATCGCAGTTTGCAA-----GGA---ATACG-TG-----T-TT-A-TT----ATTT-A--ATAC---TGTAT-------TATCG-TGTCGTCGA-AGATTCTCTTAAAGAAG---TCCTATGCAGA-TG---------CAGTCA-AA--GGTTAATT-TTG----AC-T-T--AT-AAAATAA-TG----------GAAGGA-GAA-TGAAAT-TTATATGTCAAC---A-GG-ATGATC-A--G-CTA--------AC-AAATCCAAAAC-AT-CACAG------ACT-AGCGTTG-AAA---TGCACTCCAC-TCAGCTT---TT-TA---CCC---A-AG-A--T-TT---ACAGGACATG-TTATTATCATTTTG--------------TT-------------T-TCT-T-GTTT--TAC--A-TATATA-----C--CTGGTACATGA--A-----G----AACTTG-TGGAT-TGGA-------------TA--TCAT----AATTGTCACTTATTTCA-TAAATTT-CATTCATGCATA-------TATAAGAATG----TTATCAGAA------G---TGAG---TT------T--TTGT-T----G-TCATCCCCTGTG-TTTG--AT---------A-----------GT-GCATG--A--TGAAATT-----GAG-G--GA-AAATCTTGAACATCA--GCTCAGT-AA-AT--A-----ACACT--------CCTGAC---AGATGC-----TG-T-TC-TG-AGCAA---T--GT-GTCAATTTGCAAATTGTGA----TCTC-T-CATCACCACA--TTGGACTGGCT-CTGTACTGC----T----------------------------------------ATCTGCT--ACAGC--AC--ATA--ACCAGT-C-TA-CC---TTAG-------G-TA-CA-GGA---A-A-T----TG--AAA-T---G---ACAGA-T-AT-AGTAA-G-TGAA-GTG-TT-GAAAT-TCAC-TTCT-GAA--G--CTCCA--C-CC-T-GA-CAA----TCTCT-T---ATGACAAGAGGCTCC-A--CC-CTCTCT--CCA-CT-TTGGC----CG--TCC-A-A-A-TTGGAG-GCTC-C-CGAGT-CA--GC-AT---TTTACGCTAA
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                    atac-CAAA--G-TACAA-GTGAATGG-GTGGGGCT----TCTT-GTCATAA-G-A--TTGTCAGGG-TGGAG--CCATTGG-A-GTTAATT------TCAAA-ACA------------------TAA--TT------------T-----A-C-TCTGTCAATTAATTTCTGACAT--------------------------C----------------------CT------------G-GCT-GT------T-------CGGATCATGTTTGTTTGG---C--TA-----A--ACA--TAATAGTT-T-C-A--A-AAC--AA-AAACAAGTCCTTT-GAAGCTCCCTAT-AT-AA-ACT-AC-T---T---TCCC---CAA-C-----CCCAT--------A---CCATAA-TCTGA-AAAGGG--C-A-GAA-GGC------------CA-G-CACCATAA-A---TC--TG-T----TAC---T-T---CA----AACAAAAA-CAA--AACACACTA-------AA--------TA---A--T-CA-C-CATTTCA-C--A-A--A-A--T-------TAAAT-G-AT-T---G-AAAGA-----AA-GAT-----AAAG---C-----TGT-AT-GA-AA-TCCAA---AACATCA-C
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             atttgttggtagg---A-AG-ATAA---A--G-CTGT-------ATGAAATCCAAAAC-AT-CACAA------A------------------TCACTCCACCTCAGCTT---TT-TA---CCC---CTAT-A--T-TT---ACAGGGCATT-TTATT--------A--------------TT-------------A-TTT-T-GTTT--Taaatcactccacctcagctttttacccctatatttacagggcattttattattattttgttttcttgtttgccattatttcataattttcattcattcatatataagaatgttataagaagtgagatttttttgtcatcccgtgtgtttgatagtgcatgatgaaattgggggaaatcttgaacaataacactcctgatagatgctgtactgagcaatatgtcaatttgtaaatttagatctctcaccactatacttggactggctctgtactgctatcgctacctcagatttattggacagcacagaaccagtctacctaggtacaggaacttgaaatgtcagatataataagtgaagtgttgaaattcacttctgaagctccaccctgacaatctcttatgacaaaaggctccaccctctctccacttggacgtccaaattggagactacagagtccagcattttacaccaagc
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    atttgttggtaggcaaagtacaagtgaatgggtggggcttcttgtcataagattgtcagggtggagccattggagttaatttcaaaacataatttactctgtcaattaatttctgacatcctggctgttcggatcatgtttgtttggctaaacataatagtttcaaaacaaaaacaagtcctttgaagctccctatataaactactttccccaaccccataccataatctgaaaagggcagaaggccagcaccataaatctgttacttcaaacaaaaacaaaacacactaaataatcaccatttcacaaaattaaatgattgaaagaA-TT-ATTTTGTT-T-TCTTGT------TTGCCATT-ATTTCA-TAATTTT-CATTCATTCATA-------TATAAGAATGTTA-T-------AAGAA--G---TGAG---AT------T--TTTT-T----G-TCATCCCGTGTG-TTTGATA----------------------GT-GCATG--A--TGAAATT-----G-G-G--GG-AAATCTTGAACA----------------AT--A-----ACACT--------CCTGAT---AGATGC-----TG-T-AC-TG-AGCAA---T--AT-GTCAATTTGTAAATTTAGA----TCTC-T-CACCACTATAC-TTGGACTGGCT-CTGTACTGC----TATCGCTACCTC-----------------A----------GATTTATTGGACAGCA--CAGA----ACCAGT-C-TA-CC---T--A-------GGTA-CA-GG----A-ACT----TG--AAA-T---G---TCAGA-T-ATAA-TAA-G-T-GAAGTG-TT-GAAAT-TCAC-TTCT-GAA--G--CTCCA--C-CC-T-GA-CAA----TCTCT-T---ATGACAAAAGGCTCC-A--CC-CTCTCT--CCA-C--TTGGA----CG--TCC-A-A-A-TTGGAG-ACTA-C-AGAGTCCA--GC-AT---TTTACACCAAGCcttgtttgccattatttcataattttcattcattcatatataagaatgttataagaagtgagatttttttgtcatcccgtgtgtttgatagtgcatgatgaaattgggggaaatcttgaacaataacactcctgatagatgctgtactgagcaatatgtcaatttgtaaatttagatctctcaccactatacttggactggctctgtactgctatcgctacctcagatttattggacagcacagaaccagtctacctaggtacaggaacttgaaatgtcagatataataagtgaagtgttgaaattcacttctgaagctccaccctgacaatctcttatgacaaaaggctccaccctctctccacttggacgtccaaattggagactacagagtccagcattttacaccaagc
gi|7                          :                                                                                                                                   atttgttggtaggcaaagtacaagtgaatgggtggggcttcttgtcataagattgtcagggtggagccattggagttaatttcaaaacataatttactctgtcaattaatttctgacatcctggctgttcggatcatgtttgtttggctaaacataatagtttcaaaacaaaaacaagtcctttgaagctccctatataaactactttccccaaccccataccataatctgaaaagggcagaaggccagcaccataaatctgttacttcaaacaaaaacaaaacacactaaataatcaccatttcacaaaattaaatgattgaaagaaagataaagctgtatgaaatccaaaacatcacaaatcactccacctcagctttttacccctatatttacagggcattttatt-A--A-A-C--AC-AA-AAGGTCCTTTTGAAGCTCCCTATAATAAA-ACT-AA-TTGGT---CCCCCCAAAA-C-----CCCATACCACCCCA---C-ATAATTCTGAGAAAAGGCCC-A-GAA-GGCCCCCCACCGCCGCA-G-CACC-TAA-A---TC--TGTT----TACTTTT-T---CAAAGCAACAAAAACCAA--AACACTATA-------AAAAAAAATTTATTTA--T-CA-C-CATTTCA-CAAA-A-TA-ATTT-------TAAAT-G-AT-TGTGG-AAAGAAAAGAAA-GAT-----AAAG---C-----TGCAAT-CG-TA-ATTAGCA-AATTCCA-
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TCACAA--AAT-AATT-TTA----A-------AT-GAT-TG--TG----------GAAAGA-AAA--GAAAG-ATAA--AGCTGC---A-ATCGTAATT-A--G-C-------------AAATTCCAAACTAT-CAC----------------C---AGA---TTCACACCAT-GCAGCTTATTTT-TA---CCC---C-T--A--TATT---ACAGGCCATTATCATT--------A--------------TT-------------aactatcaccagattcacaccatgcagcttatttttacccctatattacaggccattatcattattttttggttctgttgccgattatttctaattttcattcatgcatatataagaatatgtatctcaggtaagttggagattttgttttgtgtattcccgtgtttctgattttagtcgcatgaagtgaaattggcgggaaactttgaacttcaaggctcataaatacactcctgattttagatgccggtacggcaaatatatgtcaatttgtaaattttgaaatatctcttcaccactataatttggactggctctgtactgctacatctgcttacggtgctacctcaaaatttatttgaaagcaccagaaccagtcctactaggtacaagggaaaattgcaaaatgtcagatatgataacgtgaagtgttgaaattacttctgaagctccaccctgaacaatctctttatatgacaaaaggctccaccttctctccactttcgacgtccaaattggggactccagagtcagcattttacaccaag
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           aaacacaaaaggtccttttgaagctccctataataaaactaattggtccccccaaaaccccataccaccccacataattctgagaaaaggcccagaaggccccccaccgccgcagcacctaaatctgtttactttttcaaagcaacaaaaaccaaaacactataaaaaaaaatttatttatcaccattTTGCCGATTATTTC--TAATTTT-CATTCATGCATA-------TATAAGAATATG--T-------ATCTCAGG---TAAG---TTGGAGATT--TTGT-TTTGTG-TATTCCCGTGTT-TCTGATTTT--------A-----------GTCGCATG--AAGTGAAATT-----G-GCG--GG-AAACTTTGAACTTCAAGGCTCA-TAAA--T--A------CACT--------CCTGATTTTAGATGC-----CGGT-AC----GGCAAATAT--AT-GTCAATTTGTAAATTTTGAAATATCTC-TTCACCACTATAATTTGGACTGGCT-CTGTACTGC----TAC----ATCTGCTTACGGTGCTACCTCAA----------AATTTATTTGAAAGCA-CCAGA----ACCAGT-CCTA-CT---A--G-------G-TA-CA-AGGGAAA-A-T----TGCAAAA-T---G---TCAGA-T-ATGA-TAACG-T-GAAGTG-TT-GAAAT-T-AC-TTCT-GAA--G--CTCCA--C-CC-T-GAACAA----TCTCT-TTATATGACAAAAGGCTCC-A--CC-TTCTCT--CCA-CT-TTCGA----CG--TCC-A-A-A-TTGGGG-ACTC-C-AGAGT-CA--GC-AT---TTTACACCAAGttttggttctgttgccgattatttctaattttcattcatgcatatataagaatatgtatctcaggtaagttggagattttgttttgtgtattcccgtgtttctgattttagtcgcatgaagtgaaattggcgggaaactttgaacttcaaggctcataaatacactcctgattttagatgccggtacggcaaatatatgtcaatttgtaaattttgaaatatctcttcaccactataatttggactggctctgtactgctacatctgcttacggtgctacctcaaaatttatttgaaagcaccagaaccagtcctactaggtacaagggaaaattgcaaaatgtcagatatgataacgtgaagtgttgaaattacttctgaagctccaccctgaacaatctctttatatgacaaaaggctccaccttctctccactttcgacgtccaaattggggactccagagtcagcattttacaccaag
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       aaacacaaaaggtccttttgaagctccctataataaaactaattggtccccccaaaaccccataccaccccacataattctgagaaaaggcccagaaggccccccaccgccgcagcacctaaatctgtttactttttcaaagcaacaaaaaccaaaacactataaaaaaaaatttatttatcaccatttcacaaaataattttaaatgattgtggaaagaaaagaaagataaagctgcaatcgtaattagcaaattccaaactatcaccagattcacaccatgcagcttatttttacccctatattacaggccattatcattattttttggttctg-AAA-TAA-AA----------GAGAAA-GAA-TGACCT-TTATATGTCAAC---A-AG-GTGATC-A--G-CTACATATGTAAC-AAATCCAAAAC-AC-CACAG------A
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   T-TTATT--------G--------------TT-------------A-TCA-T-GAAT--TCC--T-TAT--A-----T--CT------TAA--A-----A----AACTTG-T---T-TGGA-TT----TTATT-TATTTTATTGGAAA----CATGCAATT-A-CAGA---------ATGC-T--------TATAAAAA--------------G------G---TGGG---TT------T--TTTTGT----G-CCATCCC-TGTGATTTGATA----------------------GT-GCATG--AA-TGGA--T-----A-G-GTAGG-GAATCTTGAAC-TCAA-GCTCAGTAAATATTAG-----ATACTTAAAAATCCCTGAC---AGATGC-----TG-T-AC-TGGAGCAA---T--GGAGTCAGTATGTGAATTC-GA----TCTC-T-CATCACCACAA-TGGGACTGGCT-CTGTACTGCATCCTAT----A---------------------T----------AA------GGACAGCA-A--GAAA--AC-ATT-C-TA-CTATGT--AC------G-TA-TACGG----ACA-A----TG--AAA-T---G---ACAGA-T-GCAA-TAA-G-T-TA-AGC-TT-GAAAT---AC-TTCTTGAA--G--CTACA--C-CT-TTGA-CAA----TCTCT-T---A-GACAAGAGGT-------CC-CTCTCT--CCA-TT-TTAG------G--TCT-A-A-T-TTGGAA-GCTC-C-AGAGT-C--------------ACACCAAGCccagggtgcaaatgcaaatttgaaaatttgacgcctctatatatttaattacgtctgtattgcaatttctgcacttgtcttatctaatacaatatgacagaaaaaataattgatctctgtcggtgttaaaatagatgaaaggggagaactcagttttctgcatgaaactagaatgtggttatcattcactaacgttcacatgttaatgtaaagatttctcactgcagtatgtcaggtatcagctgtatcctgcttaacggacttctaaaaacaatgagcatgacgagttaccaatttttatttcatctcctttgtaattgagagtattctaacattcttttcattttctcacgtcctaatttgatagttcacctcaatgagtctgactagtcagtttgattattcaaagtcataa
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|29 ): TTGTCAGATTTTACACACAAAGAATTCCAAATATCAAACATATGGTTTGGATTTTTTTTTTCTTTTATTTTATTAAAAGCATGCATGCACAAGAATGTTAT
Unaligned ( gi|31 ): GGTACTGTATGGTGTGAAACTCTTAATATTGATTGAGGCTCTTATTAACACTATGATAGTATCAAGCCTTTTTTTCCATTCCC
Unaligned ( gi|35 ): TGTCATGTTTTACACATAAAGAATTCGATATAATAAATCTGTTTGGGTTTTTTTTTTTTTT
Unaligned ( gi|40 ): CTTCTAAAAACAATGGGCATGATGAGTTTCCTATTTATATTTCACCT






Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                       11         222222                                         11                                                                                                  11111111111     2222222222222222222222222    1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111      2222222222222222222222   111     22222                                    1                                                                   333333333333                                111111111111                                                                      2222222222222222222222222222                        1111111111                    2222222                   33333333333333333333333333              11   11111                           11111   111        11111    222222222            4444444444444     111           4444444444444444444      44444444444444444              1        222222222222      1      1111111111                 11   11                            222222222                       444444444444444444444444                          111   33333333                          3333333333333333333333333333333333333333                      11111111                 2222222222                 1                                                                      888888888888888888888888     111  111111111                             6666666666666666666666666                                                           11111    11111     11111111               11111                                                                 11                     88888888888888888888888888888888888888888888               22222222222                  222222222222        1111   222222  11                      1     11111111                                          1                                                                                                                              
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                    4  11   99    777777     4   55  4 4  4     4   4  3    55   00 3    55  3    11  7777    3       3 6        88888   3 88888    44  3   555  3 3       999999    55555555555 3   8888888888888888888888888    7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777      5555555555555555555555   000 55  99999 88   55   3      3 3 44 6 3 77  3  0      0   3   0     6666  3  3   3  6 555 6666   7777  3 77777     111111111111 9    2     3      44 6 3   6   555555555555  3 3    0   99999  44  3 6666   999999999  6666        5   33        2222222222222222222222222222  2 2       2 33 2 2  6 5555555555     3 3  3 66666   1111111  7   99999    777 88888888888888888888888888   2   3    4 55   11111      5                    22222   777     5  22222 5  222222222  0 5 66    0000000000000     111   2     5 4444444444444444444      77777777777777777      5  77   1    5   888888888888  5   0   4  9999999999      44  44     00   00      555 3  6      3 44 3  222222222  3   2       3  3     555555555555555555555555          4       777  66 222   11111111 66 4  777          4  1  6666666666666666666666666666666666666666   3 3    55   66 4   44444444 6666         66 1111111111    1 4 44  4    0  88    1  3        99999    0    2      4    0  4 3       55         999999999999999999999999     111  666666666    4 8888 4       8    3    0000000000000000000000000  3  1  55 88       99999 3 3 55  8               99       22222 55 00000     44444444      777      00000  4 4  4  4     777 55  4         0      7  9999    4 4          99           4         33333333333333333333333333333333333333333333               55555555555      4 4  3  666 555555555555  3  3  1111 3 333333  33   3 555 555     3 3  2 4   99999999   3  3     3    3    3   44 44     44 3  2 3  3 2 6666     3 555            0  2 33  2      33   4  2    999999 33   2 2 2 2      3    3 3     6  77  3  555            
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                    .  ..   ..    ......     .   ..  . .  .     .   .  .    ..   .. .    ..  .    ..  ....    .       . .        .....   . .....    ..  .   ...  . .       ......    ........... .   .........................    ..........................................................................................................      ......................   ... ..  ..... ..   ..   .      . . .. . . ..  .  .      .   .   .     ....  .  .   .  . ... ....   ....  . .....     ............ .    .     .      .. . .   .   ............  . .    .   .....  ..  . ....   .........  ....        .   ..        ............................  . .       . .. . .  . ..........     . .  . .....   .......  .   .....    ... ..........................   .   .    . ..   .....      .                    .....   ...     .  ..... .  .........  . . ..    .............     ...   .     . ...................      .................      .  ..   .    .   ............  .   .   .  ..........      ..  ..     ..   ..      ... .  .      . .. .  .........  .   .       .  .     ........................          .       ...  .. ...   ........ .. .  ...          .  .  ........................................   . .    ..   .. .   ........ ....         .. ..........    . . ..  .    .  ..    .  .        .....    .    .      .    .  . .       ..         ........................     ...  .........    . .... .       .    .    .........................  .  .  .. ..       ..... . . ..  .               ..       ..... .. .....     ........      ...      .....  . .  .  .     ... ..  .         .      .  ....    . .          ..           .         ............................................               ...........      . .  .  ... ............  .  .  .... . ......  ..   . ... ...     . .  . .   ........   .  .     .    .    .   .. ..     .. .  . .  . . ....     . ...            .  . ..  .      ..   .  .    ...... ..   . . . .      .    . .     .  ..  .  ...            
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                    0  00   55    666666     0   55  0 0  0     0   0  6    00   22 6    00  6    88  1111    3       3 7        77777   3 33333    66  3   888  3 3       666666    88888888888 3   3333333333333333333333333    4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444      5555555555555555555555   000 00  11111 66   00   6      6 3 66 7 3 99  3  0      8   1   8     5555  1  1   1  2 444 1111   6666  1 77777     666666666666 2    9     1      22 7 3   2   888888888888  1 1    5   55555  22  1 1111   999999999  1111        7   99        0000000000000000000000000000  7 7       7 77 9 9  2 2222222222     1 1  1 99999   3333333  3   11111    000 77777777777777777777777777   3   6    4 11   11111      0                    55555   555     0  55555 7  999999999  1 0 99    4444444444444     888   5     7 4444444444444444444      00000000000000000      7  99   4    7   444444444444  0   0   4  4444444444      66  88     66   00      888 3  7      3 66 3  555555555  3   4       3  3     888888888888888888888888          0       888  22 222   00000000 11 4  888          0  1  8888888888888888888888888888888888888888   6 6    00   11 4   33333333 2222         11 4444444444    9 4 00  4    9  77    4  6        88888    3    3      0    8  0 3       55         999999999999999999999999     000  000000000    0 5555 0       8    6    6666666666666666666666666  6  3  00 66       11111 6 6 00  0               55       22222 55 00000     55555555      000      00000  0 0  0  0     000 55  0         8      4  4444    4 4          44           4         66666666666666666666666666666666666666666666               66666666666      4 4  6  444 777777777777  6  6  4444 6 000000  88   3 888 888     3 3  0 5   88888888   3  3     3    3    3   66 66     66 3  3 1  1 2 5555     1 444            1  7 77  7      44   7  4    999999 44   5 5 5 5      1    1 1     2  33  1  444            
consensus                     :                                                                                                                                                                         CTTGGTGTAAA-AT--GCT--GACT-----TCTGGA-GCC--TC-C-AA-TTTGG-ACG-TC-CAAA--GTG-GA-GAGA--GG-GTGGAGCC----TCTT-GTCATAA-G-AGATTGTC----TGGG-T-----GGAG--CT-ATT---GG-A-GTTAATT------TCAA-----------A-ACA------------------T------AATT------------T-----A-CT--------------CTG---T--------------------------C----------------------CT------------CAGTGT------TCG-------------TGG---C--TAT----A--ACA--TAA-AGTTAT-C-A--A-A-C--AA-AA-CAAGTCCTTT-GAAGCTCCCTAT-AT-AA-ACT-AA-T---T---CCCC---AAA-C-----CCCAT--------G---C-ATAA-TCTGA-AAAGGG--C-A-GAA-GGC------------CA-G-CACCATAA-A---CC--TG-T----TAC---T-T---CA----AACAAAAA-CAA--AACACACTA-------AAA------TTA---A--T-CA-C-CATTTCA-C--A-A-TA-A--T-------TAATT-G-AT-T---G-AAAG------AA-GAT-----AAAG---C-----TTT-AT-TA-CA-TTNAACC-AATTTCA-CTTT-G-AAAA-----ATATTT-CTGCTGATCGCAGTTTGCAA-----GGA---AGACG-TG-----T-TT-G-T-----ATTT-A--ATAC---TG-ATC----TATATCG-TGTCGTCGA-A--------------AG---TCCTAT------TA---------CAGTCA-AA--GGT-AATT-TTG----A--T-T--AT-AAA-TGA-TG----------GAGGGA-GAA-TGAAAT-TTAT--GTCAAC---A-AG-GTGATC-A--G-CTAT-------AC-AAATCCAAAAC-AT-CACAG------ACT-AGCGT---AAA---TTCACTCCAC-TCGGCTT---TT-TA---CCC---C-A--A--T-TT---ACAGGACATT-TCATT--------G--------------TT-------------G-TCA-T-GTTT--TAC--A-TAT--A-----C--CTGGTACATGG--A-----G----AACTTG-TGGAT-TGGA-TT-CTTTTCTT-TATTTCAT----AATTGTCATTTATTTCA-TAAATTT-CATTCATGC--ATATATAAGAAT--G---TTAT-AGAA------GTGAG---TT------T--TTGT-T----G-TCATCCCNTGTG-TTTGATAT---------A-----------GT-GCATG--A--TGAAATT-----G-G-G--GG-AAATCTTGAACATCA--GCTCAGTAAA-AT--A-----ACACT--------CCTGAC---AGATGC-----TG-T-AC-TG-AGCAA---T--GT-GTCAATTTGTAAATTTTGA----TCTC-T-CATCACCACA--TTGGACTGGCT-CTGTACTGC----TAT----A---------------------A----------AATTTATTGGACAGCA-ACAGAGA--ACCAGT-C-TA-CC---T--A-------G-TA-CA-GG----A-A-T----TG--AAA-T---G---ACAGA-T-ATAAATAA-G-T-NA-GTG-TT-GAAAT-TCAC-TTCT-GAA--G--CTCCA--C-CC-T-GA-CAA----TCTCT-T---ATGACAAGAGGCTCC-A--CC-CTCTCT--CCA-CT-TTGGA----CG--TCC-A-A-A-TTGGAG-GCTC-C-AGAGT-CA--GC-AT---TTTACACCAAGC
Reference ( family-2546 )     :                                                                                                                                                                         CTTGGTGTAAA-AT--GCT--GACT-----TCTGGA-GCC--TC-C-AA-TTTGG-ACG-TC-CAAA--GTG-GA-GAGA--GG-GTGGAGCC----TCTT-GTCATAA-G-AGATTGTC----TGGG-T-----GGAG--CT-ATT---GG-A-GTTAATT------TCAA-----------A-ACA------------------T------AATT------------T-----A-CT--------------CTG---T--------------------------C----------------------CT------------CAGTGT------TCG-------------TGG---C--TAT----A--ACA--TAA-AGTTAT-C-A--A-A-C--AA-AA-CAAGTCCTTT-GAAGCTCCCTAT-AT-AA-ACT-AA-T---T---CCCC---AAA-C-----CCCAT--------G---C-ATAA-TCTGA-AAAGGG--C-A-GAA-GGC------------CA-G-CACCATAA-A---CC--TG-T----TAC---T-T---CA----AACAAAAA-CAA--AACACACTA-------AAA------TTA---A--T-CA-C-CATTTCA-C--A-A-TA-A--T-------TAATT-G-AT-T---G-AAAG------AA-GAT-----AAAG---C-----TTT-AT-TA-CA-TTNAACC-AATTTCA-CTTT-G-AAAA-----ATATTT-CTGCTGATCGCAGTTTGCAA-----GGA---AGACG-TG-----T-TT-G-T-----ATTT-A--ATAC---TG-ATC----TATATCG-TGTCGTCGA-A--------------AG---TCCTAT------TA---------CAGTCA-AA--GGT-AATT-TTG----A--T-T--AT-AAA-TGA-TG----------GAGGGA-GAA-TGAAAT-TTAT--GTCAAC---A-AG-GTGATC-A--G-CTAT-------AC-AAATCCAAAAC-AT-CACAG------ACT-AGCGT---AAA---TTCACTCCAC-TCGGCTT---TT-TA---CCC---C-A--A--T-TT---ACAGGACATT-TCATT--------G--------------TT-------------G-TCA-T-GTTT--TAC--A-TAT--A-----C--CTGGTACATGG--A-----G----AACTTG-TGGAT-TGGA-TT-CTTTTCTT-TATTTCAT----AATTGTCATTTATTTCA-TAAATTT-CATTCATGC--ATATATAAGAAT--G---T-------A------GTGAG---TT------T--TTGT-T----G-TCATCCCNTGTG-TTTGATAT---------A-----------GT-GCATG--A--TGAAATT-----G-G-G--GG-AAATCTTGAACATCA--GCTCAGTAAA-AT--A-----ACACT--------CCTGAC---AGATGC-----TG-T-AC-TG-AGCAA---T--GT-GTCAATTTGTAAATTTTGA----TCTC-T-CATCACCACA--TTGGACTGGCT-CTGTACTGC----TAT----A---------------------A----------AATTTATTGGACAGCA-ACAGAGA--ACCAGT-C-TA-CC---T--A-------G-TA-CA-GG----A-A-T----TG--AAA-T---G---ACAGA-T-ATAAATAA-G-T-NA-GTG-TT-GAAAT-TCAC-TTCT-GAA--G--CTCCA--C-CC-T-GA-CAA----TCTCT-T---ATGACAAGAGGCTCC-A--CC-CTCTCT--CCA-CT-TTGGA----CG--TCC-A-A-A-TTGGAG-GCTC-C-AGAGT-CA--GC-AT---TTTACACCAAGC
gi|1                          :                                                                                                                                                                            GGTGTAAATATCTGCTT-GAAC-----TCTGGA-GCC--TC-C-AA-TTTGG-ACC-TCTCAAA--GTG--A-GAGA--GG-GTGGGTTC----TCTT-GTCATAA-GGAGATTGTCTGGGTGGA-TCTATTGGAG--TTGATTTCAAA-A-CATAATT------TTTACTCTGTCATTTA-ATG------------------TTGTCTGAATT------------T-----C-CTGT------------CTG---CGTCA----------------------C----------------------CT------------CAG-GT------T---------------TGG---C--TAT----A--ACA--TAA-GATTAT-C-A--AGA-C--AA-AAACAAGTCATTT--------------AT-GATACTGAA-T---T---CCCA---AAA-TGCGCTCCCAT--------GGGCC-ATAA-TCTGA-AAAGGG--CCA-GAAAGGC------------CA-G-CACCATAA-AC--CC--TG-TAGTCTA----T-T---CA----AACAAAAA-CAA--A----ACT--------AAA------TTA--------CA---CA-TTCA-C--
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ----TATAT-G-TGT--TCGA-A--------------AG---TCCTAT------TA---------CAGTCA-AA--CGTAAATT-TTGTATAA--T-T--A--GAA-CGATTGTATTTTAAGCGAGGGA--AT-TGAAATAATAT--GTCCAC---AGAG-GTGATC-AGCG-CTTT-------AC-AAA-CCAAAAC-GTCCACAGTGGT--ACT-AGCGT---AAT---TTCA--------TGTCTT---TTGTAG--CCCCAAC-A--A--T-TTAGAACAGGACATT-TCTGT--------G--------------TT-------------GTTCATT-GTTTGGTAC--A-TAT--A-----C--C-GGTACGTGGACA-----A----AACGTGTTTGAT-TGGATTT-CTTTTCTT-TATTTCAT----AATTGT-ATTTATTTCA-TAAATTT-C-TTCATGT--ATATATA-------------------A------GTGAG---TT------TA-CTGT-T----G-TTATCCCTTGTG-TTTGATGTTAAGCATAGA-----------GT-GCATG--A--TGAAATT-----G-G-G--GG-AAATCTTCAACATCA--GCTCAGT-AA-AT--A-----ACACT--------CCTGAC---AGATGC-----TG-T-AC-TG-AGCAA---T--GT-GTCAATTTGTAAATTTTGA----TCTC-T-CATCACCACA--TTGGACTGGCT-CTGTACTGC----TAT----C---------------------A----------AATTTATTGGACAGC--AC--AGA--ACCAGT-C-TA-CC---TA-A-------G-TA-CA-GG----A-A------TGATAAA-T---A---GCAGA-T-AT-GATAG-A-TGAA-GTG-TT-GAAAT-TCAT-TTCT-GAA--G--CTCCA--C-CCAT-GA-CAA----TATCT-T---ATGACAAGAGGCTCC-A--CC-CTCTCT--CCA-CT-TTGGA----GG--TCA-A-A-A-TT-GAG-GCTC-C-AGAGT-CAGGGC-AT---TTTACACCAAgtgaagtgataatttcagagtagcgcaatttttcacaaacggacatgcaaaactgattgatcgtctgatgaacaggtctgctatagaattaacaattatgaaaatcgtggtaagacgttacagtgtatttgagttgttcattgtgaattcctgattagaagctattatatgtgttcgaaagtcctattacagtcaaacgtaaattttgtataattagaacgattgtattttaagcgagggaattgaaataatatgtccacagaggtgatcagcgctttacaaaccaaaacgtccacagtggtactagcgtaatttcatgtcttttgtagccccaacaatttagaacaggacatttctgtgttgttcattgtttggtacatataccggtacgtggacaaaacgtgtttgattggatttcttttctttatttcataattgtatttatttcataaatttcttcatgtatatataagtgagtttactgttgttatcccttgtgtttgatgttaagcatagagtgcatgatgaaattgggggaaatcttcaacatcagctcagtaaataacactcctgacagatgctgtactgagcaatgtgtcaatttgtaaattttgatctctcatcaccacattggactggctctgtactgctatcaaatttattggacagcacagaaccagtctacctaagtacaggaatgataaatagcagatatgatagatgaagtgttgaaattcatttctgaagctccacccatgacaatatcttatgacaagaggctccaccctctctccactttggaggtcaaaattgaggctccagagtcagggcattttacaccaa
gi|10                         :                                                                                                                                                                               ggtgtaaatatctgcttgaactctggagcctccaatttggacctctcaaagtgagagagggtgggttctcttgtcataaggagattgtctgggtggatctattggagttgatttcaaaacataatttttactctgtcatttaatgttgtctgaatttcctgtctgcgtcacctcaggtttggctataacataagattatcaagacaaaaacaagtcatttatgatactgaattcccaaaatgcgctcccatgggccataatctgaaaagggccagaaaggccagcaccataaaccctgtagtctattcaaacaaaaacaaaactaaattacacattcacgtgaagtgataatttcagagtagcgcaatttttcacaaacggacatgcaaaactgattgatcgtctgatgaacaggtctgctatagaattaacaattatgaaaatcgtggtaagacgttacagtgtatttgagttgttcattgtgaattcctgattagaagctatA-AGC------------CC-G-CACCATAA-A---CC--TG-T----TAC---T-T---CA----AACAAAAA-CAA--AACACACTA-------AAA------TTA------T-CA-CTCATTTCA-C--A-AATA-A--T-------TAATT-G-AT-T---A-AGA-------AA-GAT-----AAAAAGAC-----TTA-AT-TA-CAATTAAA---AATTTCA-CTTT-GCAAAA-----ATATTT--TGCTGATCGCAGTT-GCAA-----GGA---AGACG-TG-----T-TT-GAT-----ATTT-A--ATACA--TG-TAC----TATATCA-TGTCGTCGA-A--------------AG---TCCTAT------TA---------CAGTCA-AA--GGT-AATT-TTG----A--T-TT-AT-AAAATAA-TG----------GAGGGA-GAA-TAAAAT-T-AT--GCCAAC---A-AGTGTGATC-A--G-CT-T-------AC-AAATCCAAA-C-AT-CACAG------ACTCAGCATTTGAAA---TTCACTCCAC-TCGGCTT---TT--A---CCC---C-A--AGAT-TT---ACAGGACATT--CATT--------A--------------TTTTGTTTTTTGTTTG-TCA-T-GTTT--TAC--A-TATATA-----C--CTGGTACATGG--A-----G----AACTTG-TGGAT-TGGATTT-CTTTTCTT-TATTTCAT----AATT
gi|11                         :                                                                                                                                                                         CTTGGT--AAA-AT--GCT--GACT------CTGGA-GCC--TC-C-AA-TTTGG-ATG-CC-CAAA--GTG-GAAGAGA--GG-GTGGGGCT----TCTT-GTCATTA-G-AGATTGTC----TGG--T-----GGAG--CT-ATT---GG-A-GT-AATTACTCTGTCA---------------TT------------------T------AATT------------T-------CTGATATCCTGG----CTG---T--------------------------C----------------------CT------------CAGTGT------TTG-------------TGG---C--TA-----A--ACA--TAA-AGTTAT-C-A--A-A-C--AA-AAACAAGTCCTTT-GAAGCTCCCAAT-AT-AA-ACT-AA-T---T---TCCC---AAA-C-----CCCAT--------A---CCATAA-TCTGA-AAAGGG--C-A-GAA-GGC------------CA-G-CACCATAA-A---CC--TG-T----TAC---T-T---CA----AACAAAAA-CAA--AACACACTG-------AAA------ATA---A--T-CA-C-CATTTCA-C--A-A-TA-A--T-------TCATT-G-AT-T---G-AAAGA-----AA-GATAATTAAAAG---C-----TTT-AT-TA-CA-TTTAAAC-AATTTCA-TTTT-GCAAAA-----ATATT
gi|12                         :                                                                                                                                                                         CTTCGTGTAAA-AT--GCT--GACT-----T-TGGA-GCC--TC-C-AACTTTGA-ACC-TC-AAAA--ATG-GA-AAGA--GA-GTGGAACC----TCTT-GTCATAA-G-AGATTGTC----AGGG-T-----GGAG--CT-TTT---TG-A-GATAATT------TAAA-----------A-ACA------------------T------AATC------------T-----A-TT--------------CTG---T--------------------------CAT--------------------TT------------CAAT-T------TC--------------TGAATCC--TA-----A--ACA--TAA-TGTTATCC-A--A-A-C--AA-AA-CAAGTCCTTT-GAAGCTCCCTAC-AT-AA-AGT-CATT---T---CCCC---AAA-C-----CCCAT--------GC--C-ATGA-TCTGA-AAAGGG--C-A-GAT-GGC------------AA-A-CATT-TAGCA---TC--TG-T----TAC----------------AC------------ACACACTA-------A-------------------C-------------------TA-A--C-------TAATT-G-AC-A---G-A---------AA-GAT-----ATAG---C------TT-AT-T----------CT---TTTTA-C------AAAA-----ATATTC-TTGCTGATCACAGTTTGCAA-----GGA---AAACC-TG-----T-TTAA-T-----AT-------TAC---TG-TAC----TAT
gi|13                         :                                                                                                                                                                         CTTGGTGTAAA-AT--GCT--GACT------CTGGA-GCC--TC-C-AA-TTTGG-ACG-TC-CAAA--GTG-AA-GAGA--GG-GTAGAGTC----TCTT-GTCATAG-G-AGATTGTC----TGGG-T-----GGAG--CT-ATT---GG-A-GTTAATT------TCAA-----------A-ACA------------------T------AATT------------C-----A-CT--------------CTG---T--------------------------C----------------------CT------------CAGTGT------TCG-------------TGG---C--TAT----AC-ACA--TAA-AGTTAT-C-A--A-A-CCAAA-AA-CAAGTCATTT-GAAGCTCCTTAT-AT-AA-ATT-AA-T---T---CCCC----AA-C-----ACCAT--------GC--C-ATAA-TATGA-AAAGGG--C-A-GAA-GGC------------CA-G-CACCATGA-A---CC--TG-T----TAC---T-T---CA----AACAAAAA-CAA--AACACACTA-------AAT------TTT---A--T-TG-T-ATTTTTA-C--A-A-Tc
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  g--------------TT-------------G-TCA-T-GTTT--TAC--A-CAA--AGAATTC--C--ATATATAA--A-----AGTTAAACTTA-TGATT-TGGA-TT-TTTTTCTC-TATTT-----------------TATT--A-AAAA--------CATGC--ATGCACAAGAAT--GCTAT-------ACAAACTGGGAG---TT------T--T-GT-T----G-TCATCCCTTGTG-TTTG--AT---------G-----------GT-GC-TG--A--TGAAATT-----G-A-G--Gtgtga
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  gtTG-CTTGATG----------------------GT-GC-TG--A--TGAAATTCGGGGG-G-G--GG-GGATCTTGAACGTCA--GCTCAGTATA-AT--ACATAGACA-T--------CCTGAC---AGATAC-----TG-T-AC-TG-AGCAA---T-----------TTGTGAATTTTGA----TCTC-T-CATCTCCACA--TTGGACTGGAT-CTGTagggggggggtctgcttgatggtgctgatgaaattcgggggggggggatcttgaacgtcagctcagtataatacatagacatcctgacagatactgtactgagcaatttgtgaattttgatctctcatctccacattggactggatctgt
gi|15                         : gtttgtcatgttttacacaaagaattccatatataaaagttaaacttatgatttggatttttttctctattttattaaaaacatgcatgcacaagaatgctatacaaactgggagttttgttgtcatcccttgtgtttgatggtgctgatgaaattgaggagggggggggtcGTGTAAA-AT--GCT--GACTCTAGATCTGGA-GCC--TC-C-AA-TTTGG-ACG-TC-CAAA--GCG-GA-GAGA--GG-GTGGAGCT----TCTT-GTCATAA-T-AGATTGTC----TGGG-T-----GGAG--CT-ATT---GG-A-GTTAATT------TCAA-----------A-ACA------------------T------AATT------------T-----A-CT--------------CTG---TGATTTAATTTCTAACATCCTGGCTGTC----------------------CT------------CAGTAT------TTG-------------TGG---C--TA-----A--ACA--TAA-AGTTAT-CAA--A-A-C--AA-GA-CAAGTCTTCT-GAAGCTCCCTAT-AT-AA-ACT-AATT---T---CCCC---AAA-C-----CCCAT--------AC--C-ATAA-
gi|16                         :                                                                                                                                                                           ttGTGTAAA-AT--G-T--GACT------ATGGA-GCC--TC-C-AA-TAATG-ACC-TC-CAAA---TG----GAGA--GG-GTGTA-CCTCAATCTT-GTCACAA-G-AGATTGTC----AGGG-T-----GGAG--CT--TT---GT-A-GTTACTT------T-AA-----------A-ACT------------------T------TAAT------------T-----A-TT--------------TTG---T--------------------------CTTTAATTTTACATCCTTTATCCCC------------CAATAT------TTG-------------TGG---CCTTA-----A--ACA--TAA-ATTTAT-C-CTTG-A-CA-AA-AA-CAAG-CCTTT--AAGCTTGC-A--AT-AA---T-AA-T---T----CCC---AAA-C-----C
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tt-TCA-T-GTTT--TAC--A-TAT--A-----TATCTGGTACATGA--A-----G----ACCT------AT-T--A-TT-AAT-------ATTTCAT----AATGATCATTTATTTCA-TAAATTTTCATTCATGC--ATATATAAGAAT--G---TTATTAGAA------GTGAGGTGTT------T--TTTT-T----GGTCACCCCTTGTG-TTTGATA----------------------GT-GCATG--A--TGAAATT-----G-G-G--GGGAAATCTTGAACATCA--GCTCAGTTA---T--A-----ACACT--------CCTGAC---ATATGC-----TG-T-AC-TG-AGCAA---T--GT-GTCAATTTGgataccat
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              A-TG----------GAGGGA-GAA-TAAAAT-TTAT--GCCAAC---A-AG-GTGATC-A--G-CT-T-------AC-AAATCCAAAAC-AT-CACAG------ACT-AGCGTTTGAAA---TTCACTCCAC-TCGGCTT---TT-TA---CCC---C-AAGA--T-TT---ACAGGACATT-TCATT--------ATTTTGTTTTCTTGTTT-------------G-TCA-T-GTTT--TACATA-TAT--A-----C--CTGGTACATGG--A-----G----AACTTG-TGGAT-TGGATTT-CTTTTCTT-TATTTCAT----AATT
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        aTGGACAGCACAC---GA--ACCAGTTC-TATCC---T--A-------GGTA-CA-GG----A-AAT----TG--AAAAT---G---ACAGA-G-GCTAATAA---T-C---------------TCAC-G-CT-GAATGG--CTCCA--CACCAT-GA-CAA----TCTCT-T---ATGACAAGAGGCTCC-A--CC-CTCTCT---CA-CT-TT-GC----CG--TCC-ATA-ATTTGGAG-GCTCACAAGAGTCCA--GCAATGTGTTTACACCA
gi|2                          :                                                                                                                                                                         CTTGGTGTAAA-ATCTGCTTTGA-------TCTGGA-GCC--TC-C-AA-TTTGG-ACC-TC-CAAA--GTG--A-GAGA--GG-GTGGAGTC----TCTT-GTCATAA-GGAGAT-GTC----TGGGCT-----GGAT--CT-ATT---GG-A-GTTGATT------TCAA-----------A-ACATAATTTTACTCTGTCATTT------AATT------------TCTAATA-TC--------------CTG---T--------------------------CTCGTC-----------------CT------------CAG-GT------TCG-------------TG----C--TAT----ACAACA--TAA-A-TTAT-C-A--AGA-C--AA-AA-CA-GTCATTT-GAA-----------------CT-AA-T---T---TCCC---AAA-C-----CCCAT--------G---CCATAA-TCTGA-AAAGGG--CCA-GAAAGGC------------CACG-CACCATAA-A---CC--TG-T-----AC---T-T---CA----AACAAAAAACAA--AACAC-CTA-------AAA------TTA---A--A-CA-C-CATTCTA-C--G-T-GAGA--TG------TGACTAG-ATGT---GTAAAG------AGTGA------AGAG---CGAATGCTT-ATGTA-CA-AAAAACGGAAT--CA-TTGC-G-AAGAGATGGATGTGTGCGGCTGATTGCA-TGTGCAA-----GAATAAAAGCG-TGGGCCGTGTT-G-TGAGTGATGTGA--ATGCGTGTG-A-C----TATAT-A-TGT-GTCGA-A-------------------TCCTAT------TA---------CAGTCA-AAACGTT-AAAT-TTG----AAGTGT--ATGAAA-TGA-TT----------GAGGGA-TAA---AAAT---AT---TCCACTGAG-AG-GTGATC-A--GGCTTT-------AC-AAA-CCAAAAC-GT-CACAGGGTGGTACT-AGCGT---A-----TTCA----GC-TTGGTGT---GT-GAGCTCCC---A-A--A--T-TT---ACAG-ACATT-TCTGT--------G--------------TT-------------G-TCA-TTGTTT--TAC--AATAT--A-----C----GGTACGTGG--ACCAGAG----AACG-G-TG-AT-TGGA-TTTCTTTTCTT-TATT-CAT----AATTGTCATTTATTTCAGTAAATTT-CTTTCATGTTTATATATAAG-------------------------TGAG---TT------TACTTGT-T----G-TTATCCC-TGTG-TTTGATGTTAAGCATAGA-----------GT-GCATGGGA--TGAAATT-----G-G-G--GG-AAATCTTCAACATCA--GCTCAGTAAA--T--A-----ACACT--------CCT-AC---AGATGC-----TG---AC-TG-AGCAA---T--GT-GTCAATTTG--AATTT-GA----TCTC-T-CATCACCACA--T-GGACTGGCT-CTGTACTGC----TAT----C---------------------A----------AATTTATTGGACAGC--ACA-AGA--ACCAGT-C-TA-CC---T--AAG-----G-TACCA-GG----A-A------TGATAAA-TACCG---CCAGA-T-AT-GATAA-T-G-AA-GTG-TTGGAAAT-TCACTTTCT-GAA--G--CTCCA--C-CCAT-GA-CAA----TATCT-T---ATGACAAGAGGCTCC-A--CC-CTCTCTCCCCA-CT-TTGGA----GG--TCA-A-A-A-TT-GAG-GCTC-C-AGAGT-CA--GC-AT---TTTACACCAAGC
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AA-TCTGA-AAAGGG--C-A-GAA-GGC------------TA-G-CACCATAA-A---CC--TG-T----TAC---T-T---CA----AACAAAAA-CAA--AA------------------------TA---A--T-CA-C-CATTTCA-C--A-A-TA-A--T-------TAATT-G-AT-T---G-AAAGA-----AA-GAT-----AAAG---C-----TTT-TT-TA-CA-TTTAGAC-AATTTCA-CTTT-G--------------TT-CTGCTGATCGCAGTTTGCAA-----GGATTGAGACG-TG-----
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        CAAACCA-------AAA--------A---C--T-CA-C-AATTTCAAC--A-A-TA-A--T-------AAATT-G--------G-ACA-------AA-GAT-----ATA----C-----TTT-AT--A-CA-TTTA--C-AGT--CA-CGGT-G-CAAA-----ATATTT-CTGCTGATCGCAGTTTGCAA-----GAA---AGCTG-CT-----T-TA-A-T-----A-TT-ACTACAC---T--ATCACAATGTATCA--GTCATAGA-A--------------GG---
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                              tTGGAGTC----TCTT-GTCATAG-G-AGATTGTC----TGGG-T-----GGAG--CT-ATT---GG-A-GTTAATT------CC-A-----------A-ACA------------------T------AATT------------T-----A-CT--------------CTG---T--------------------------CA---------------------TT------------TAATTTCTGATATCC-------------TGG---C--TGTCCTCA--GTGTTTAA-AGTTAT----------C--AA-AA-CAAGTCATTT-GAA---CCC--------------------------------------------CAT--------GC--C-ATAA-TCTGA-AAAGGG--atttt
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AAATCCTTT-GAAACTCCATAC-AT-AA-ACA-CA-T---T---TCCT-------C-----CCTAT--------AT--C-ATGA-TCTGA-AAAG---------------------------------ACCTT---G---CCTTTG-T----TAC---G-T---CA----AACACAAA-CAA--GA------A-------AAACC----TTA---------A-C-CATTTCA-C--A-A-TGCA--TGTACATGTAATT---AC-T---A-AAAA------AA-AAT-----A
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TT-A--ATAC----G--------TACATCGATGTCGTTGGTA--------------AGATTTCTTATAAGATCTATGCACGAATCAGTCA-AA--GGT-AAATATTG----A--T-TGTAT-AAA--GA--G----------GAGGGAAGAAGTGAAAT-CTAT--GTCAAC---A-AG-GTGATCTA--G-CTGC-----------AATCC-AAAC-AT-CACAG------Attactgtatt
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      a-CT---T--G-------A-TA-CA-GG----A-AAT----TG--AAA-T---G---ACAGA-T--TGAATTA-G-C-TATGTG-TT-GAAAT-TCAC-TTGA-GAA--G--CTCCA--C-CC-T-T--CCC----CCTCTAT---AAAACTAGCAGCCCT-A--GC-CCCTCG--CTA-TTCTTGGAATTTTG--TTC-A-A-A-CTG
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       gt-T----TG--AAA-T---G---ACAGA-T-GTACATA-------A-ATG-TC-CAA---TCCC-TT--------G--C-ACA--C-TT-T-AA-C-------------------ACAAGAGG-TCC-A--AT-TCTTTT--CCATTT-TTGGA----GC--TCC-A-ACA-TTGGactag
gi|27                         :                                                                                                                                                                         CTAGGTGTGAA-AC--GCT--GACT------CTGGA-ACC--TT-C-AA-TTTTG-ACG-TC-CAAA--GTG-GA-GAGA--GGCGTGGGGTC----TCTT-GTCATAACG-AGATTGTC----TGGG-T-----GGAG--CT-ATT---GG-AGGTTAATT------TCAG-----------A-Aatggttgtgggaatgtggcttgaatgtaaaattatccaaacaaa
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   -AATTTCA-CTTTTG-CAAA-----ATATTT-CTTGTGATCGCAGTTTGCAATTGAGGGA---AGACG-TG-----T-TT-T-T-----ATTA-A--TTAC---TG--TA----CATATCA-TGTCGac
gi|3                          :                                                                                                                                                             aaaaaaaaaaaaCTTGGTGTAAA-AT--GCT--GACTAT---TCTGGA-GCTCGTCAC-AA-TTTGGGACG-TC-CAAA--GTG-GA-GAGA--GG-GTGGA-TC----T-TT-GTCATAG-G-AGATTGTC----TGG--T-----GGAGGAC--ATT---GG-A-GTTAATT------TCAA-----------ATACA------------------T------AATT------------T-----A-CT--------------CTG---T--------------------------C----------------------CT------------CAGTGT------TC--------------TGG---C--TATC---A--ACA--TAA-AGTTAT-C-A--A-A-C--AA-AA-CAAGTCATTT-GAAGCTCCCTAT-AT-AA-ACT-AA-T---T---CCCC---AA--------CCCAT--------G---C-ATAA-TCTGA-AAAGGG--C-A-GAA-G-C------------CA-G-CACCATAA-----CC--TG-T----TAC---TGT---CA----AACAAAAA-CAA--AACACACTA-------AAA------TTA---A--T-CA-C-CATTTCA-C--A-A-TA-A--T-------CAATT-G-AT-T-----AAAG------AA-GAT-----AAAG---G-----TTT-AT-TAACA-T-AAACT-AATTTCAGCTTT-G-AAAA-----ATATTT-CTGCTGATCGCAGTTTG--A-----AGA---AGACGGTG-----T-TT-G-T-----ATTT-A--ATAC---TG-ATC----TATATC--TGTCGTCGA-A--------------A----TCCTAT------TA---------CAGTCA-AA--GGT-AATT-TTG----A--T-T--AT-AAA-TGA-TG----------GAGGGA-GAA-TGAATT-TTAA--GTCAAC---A-AG-GTGATA-A--G-CTAT-------AC-AA--TCAAAAC-AT-CACAG------ACT--TTGT---AAA---TTCACTCCAC-TCAGCTT---T----------------------------ACAGGACATT-TC-TT--------G--------------TT-------------G-TCA-T-GTTT--TAC--A-TAT--A-----C--CTGGTACATGG--A----------AACTTG-TGGATGTGGA-TT-CTTTTCTTGTATTTCAT----AATTGTCATTTATTTAA-TAAATTT-CATTCATGC--ATATATAAG-------------------------TGAG---TT------TA-TTGT-T----G-TCA--CCTTGTG-GTTGATGT---------AAAGGCATTAGTGT-GCGTG--A--TGAAATT-----G-G-G--GG-AAATCTTCAACATCA--GCTTAGTAAA-AT--A-----ACACT--------CCTGAC---AGATGCATATGCG-T-AC-TG-AGCAA---T--GT-GTCAATTTGTAAATTTTGA----TCTC-T-CATCACCACA--TTGGACGGGCTGCTGTACTGC----TAT----A---------------------A----------AATTTATTGGACAGCA-ATAGAGA--ACCAGT-C-TA-CC---T--A-------G-TA-CA-GG----A-A-T----TG--AAA-T---G---ACAGA-T-ATAAATAA-G-T-TA-GTG-TT-GAAAT-TCAT-TTCT-GAA--G--CTCCA--C-CCAT-GA-C-A----TATCT-T---ATGACAAGA-GCTCC----CC-CTCTCT--CCA-CT-TTGGA----GG--TCC-A-A-A-TTGGAG-GCTC-C-AGAGT-CA--GC-AT---TTTACACCAAGCaaaaattttcaaa
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       -CT---T--G-------A-TA-CA-GG----A-AAT----TG--AAA-T---G---ACAAA-TCAAAAATTG-GAT-CA-TTG-CT-GAAAT-TAAC-TCCA-GAA--G--CACCA--C-CC-T----------------------TG---AGTAGCCCC-A--CC-C-CTCT--CCA-AT-T
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tTAT--GTCAAC---A-CG-GTGATC-A--G-CTA--------AT-AAACCCAAAAC-AT-CACAG------ACT-AGAGT---TCATCCTTCACTCCAC-T
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 -T-GA-CAA----TCTCT-T---ATGACAAGAGGCTCC-ATCCT-CTCTCT--CCA-CT-TTGGA----GG--TCC-A-A-A-TTGGtaaaggt
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ca----TAC---T-TT--CA----AACAAAAA-CAA--AACACACTA-------AAA------TTA---A--A-CA-C-CATTTCA-C--A-A-TA-C--T-------TAATT-G-AT-T---
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      C-A--CC-CTCTCT--CCA--T-TTGGA----GG--TCCAA-A-A-GTGGAG-GGTC-C-AGAGT-CA--CC-AT---TTTACAGCAAG
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             AAGAGAC-CC-A--CT-CCCTCA--CGA-TT-TTGG--------------------TG-----TTC-C-ATGAT-CA--GC-AT---TTTACACCAAGC
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             aaTCTCT--CCA-CT-TTGGG----CA--TCC-A-A-A-GTGGAG-ACTT-C-AGAGT-CA--GC-AT---TTTACACCAAGCct
gi|39                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      gCA-CT-TTGGA----CG--TCC-A-A-A-TTGGAG-GCTC-C---AGT-CA--GC-AT---TTTACACCAAGC
gi|4                          :                                                                                                                                                                         CTTGGTGTAAA-AT--GCT--GACA-----CCTGGATGCC--TC-CCAA-GTTGG-ACGGTC-CAAAAGGTG-GA-GAGA--GG-GTGG-GCT----TCTTTGTCATAA-G-AGATTGTA-----GGG-T-----GGAG--CC-ATT---GGGA-ATTAATT------TCAA-----------A-ACA------------------T------AATTACTCTCGCCATTT-----AATT--------------CTGAC-T--------------------------C----------------------CTGGCTGTATCGATCAGTGT------TTG-------------TGGG--C--TA-----A--ACA--TAA-AGTTAT-C-A--A-A-C--AAGAA-CAAGTCCTTT-GAAGCTCCCTAT-AT-AA-ACT-AA-T---TGTCCTCC---AAAAC-----CCCAT--------C---C-ATAT-TATCG-AAGGGG--C-ACGAA-GGC------------CA-GGCACCATTA-TTTTCG--TG-T----TAC---T-TTTTCA----AACTAAAA-CAATAAACACA-TACGAGAGGGAA------GTA---AGATACAGC-CATTTCA-C--ATA-TG-A--A-------AAATT-GTAT-T---A-AAAG------
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    gA-TGAAAAATTGT--ATTAA----A-AG-CTG----------TAT-------GC-AAATCCAAAAC-AT-CACAG------A------------------TCACTCCAT-TCAGCTT---TT-TA---CCC---CTAT-A--T-TT---ACAGGGCATT-TTATT--------A--------------TT-------------A-TTT-T-GTTT--Tctgtatgcaaatccaaaacatcacagatcactccattcagctttttacccctatatttacagggcattttattattattttgttttcttgtttgccattatttcataattttcattcatgcatatataagaatgttatcagaagtgagatttttgttgtcatcccgtgtgtttgatagtgcatgatgaaattgggggaaaatcttcaacaccagctcagtaaataacactcctgacagatgctgtcacgtgaagaactagtgcaaatctcttcacactatacttggactagcctgtactgcttaatctgctaccggatttattggcagcagagaacaccaagttacctaccgtagggtacaggaacattgtgaaatgtgaacagagtataataagtgaagtgtttgaaatatcacctctgaagctctccgacccctgacaaattttcacttatgacaataggctcctacctttctctccctctttggacgtttccacatggagaactccaggtcaggcattttacacca
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            gcttggtgtaaaatgctgacacctggatgcctcccaagttggacggtccaaaaggtggagagagggtgggcttctttgtcataagagattgtagggtggagccattgggaattaatttcaaaacataattactctcgccatttaattctgactcctggctgtatcgatcagtgtttgtgggctaaacataaagttatcaaacaagaacaagtcctttgaagctccctatataaactaattgtcctccaaaaccccatccatattatcgaaggggcacgaaggccaggcaccattattttcgtgttactttttcaaactaaaacaataaacacatacgagagggaagtaagatacagccatttcacatA-TT-ATTTTGTT-T-TCTTGT------TTGCCATT-ATTTCA-TAATTTT-CATTCATGC--ATATATAAGAAT--G---TTATCAGAA------GTGAGA--TT------T--TTGT-T----G-TCATCCCGTGTG-TTTG--AT---------A-----------GT-GCATG--A--TGAAATT-----G-G-G--GGAAAATCTTCAACACCA--GCTCAGT-AA-AT--A-----ACACT--------CCTGAC---AGATGC-----TG-TCACGTG-AAGAA---CTAGT-G-CAA-------------A----TCTCTT-CA-CACTATAC-TTGGACTAGC--CTGTACTGC----T-T----A---------------------ATCTGCTACCGGATTTATTG----GCA-GCAGAGAACACCAAG-T-TA-CC---T--ACCGTAGGG-TA-CA-GG----A-A-CATTGTG--AAA-T---GTGAACAGAGT-AT-AATAA-G-TGAA-GTGTTT-GAAATATCAC-CTCT-GAA--GCTCTCCGACC-CC-T-GA-CAAATTTTCACT-T---ATGACAATAGGCTCCTA--CCTTTCTCT--CCCTCT-TTGGA----CGTTTCC-A-C-A--TGGAGAACTC-C-AG-GT-CAG-GC-AT---TTTACACCActtgtttgccattatttcataattttcattcatgcatatataagaatgttatcagaagtgagatttttgttgtcatcccgtgtgtttgatagtgcatgatgaaattgggggaaaatcttcaacaccagctcagtaaataacactcctgacagatgctgtcacgtgaagaactagtgcaaatctcttcacactatacttggactagcctgtactgcttaatctgctaccggatttattggcagcagagaacaccaagttacctaccgtagggtacaggaacattgtgaaatgtgaacagagtataataagtgaagtgtttgaaatatcacctctgaagctctccgacccctgacaaattttcacttatgacaataggctcctacctttctctccctctttggacgtttccacatggagaactccaggtcaggcattttacacca
gi|5                          :                                                                                                                                                                                             gcttggtgtaaaatgctgacacctggatgcctcccaagttggacggtccaaaaggtggagagagggtgggcttctttgtcataagagattgtagggtggagccattgggaattaatttcaaaacataattactctcgccatttaattctgactcctggctgtatcgatcagtgtttgtgggctaaacataaagttatcaaacaagaacaagtcctttgaagctccctatataaactaattgtcctccaaaaccccatccatattatcgaaggggcacgaaggccaggcaccattattttcgtgttactttttcaaactaaaacaataaacacatacgagagggaagtaagatacagccatttcacatatgaaaaattgtattaaaagctgtatgcaaatccaaaacatcacagatcactccattcagctttttacccctatatttacagggcattttatt---C-ATAA-TCTGA-AAAGGG--C-A-GAA-GGT------------CA-G-CACCATAA-A---CC--TA-T----TAC-----------------------------AATGTACT------------------TC---A--T-CA-C-CATTTCA-C--A-A-TA-A------------ATT-G-AT-T---G-AAAG------AAAGAT-----AAAG---C--------------------------AATTTCA--TTT-GCAAAA-----ATATTT-CTGCTGATCGCAGTTTGCAA-----GGA---ATACG-TG-----T-TT-A-TT----ATTT-A--ATAC---TGTAT-------TATCG-TGTCGTCGA-AGATTCTCTTAAAGAAG---TCCTATGCAGA-TG---------CAGTCA-AA--GGTTAATT-TTG----AC-T-T--AT-AAAATAA-TG----------GAAGGA-GAA-TGAAAT-TTATATGTCAAC---A-GG-ATGATC-A--G-CTA--------AC-AAATCCAAAAC-AT-CACAG------ACT-AGCGTTG-AAA---TGCACTCCAC-TCAGCTT---TT-TA---CCC---A-AG-A--T-TT---ACAGGACATG-TTATTATCATTTTG--------------TT-------------T-TCT-T-GTTT--TAC--A-TATATA-----C--CTGGTACATGA--A-----G----AACTTG-TGGAT-TGGA-------------TA--TCAT----AATTGTCACTTATTTCA-TAAATTT-CATTCATGC--ATATATAAGAAT--G---TTATCAGAA------GTGAG---TT------T--TTGT-T----G-TCATCCCCTGTG-TTTG--AT---------A-----------GT-GCATG--A--TGAAATT-----GAG-G--GA-AAATCTTGAACATCA--GCTCAGT-AA-AT--A-----ACACT--------CCTGAC---AGATGC-----TG-T-TC-TG-AGCAA---T--GT-GTCAATTTGCAAATTGTGA----TCTC-T-CATCACCACA--TTGGACTGGCT-CTGTACTGC----T----------------------------------------ATCTGCT--ACAGC--AC--ATA--ACCAGT-C-TA-CC---TTAG-------G-TA-CA-GGA---A-A-T----TG--AAA-T---G---ACAGA-T-AT-AGTAA-G-TGAA-GTG-TT-GAAAT-TCAC-TTCT-GAA--G--CTCCA--C-CC-T-GA-CAA----TCTCT-T---ATGACAAGAGGCTCC-A--CC-CTCTCT--CCA-CT-TTGGC----CG--TCC-A-A-A-TTGGAG-GCTC-C-CGAGT-CA--GC-AT---TTTACGCTAA
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                   atac-CAAA--GTACAA-GTGAATGG-GTGGGGCT----TCTT-GTCATAA-G-A--TTGTC----AGGG-T-----GGAG--CC-ATT---GG-A-GTTAATT------TCAA-----------A-ACA------------------T------AATT------------T-----A-CTCTGTCAATTAATTTCTGACAT--------------------------C----------------------CT------------GGCTGT------TCGGATCATGTTTGTTTGG---C--TA-----A--ACA--TAATAGTT-T-C-A--A-AAC--AA-AAACAAGTCCTTT-GAAGCTCCCTAT-AT-AA-ACT-AC-T---T---TCCC---CAA-C-----CCCAT--------A---CCATAA-TCTGA-AAAGGG--C-A-GAA-GGC------------CA-G-CACCATAA-A---TC--TG-T----TAC---T-T---CA----AACAAAAA-CAA--AACACACTA-------AA--------TA---A--T-CA-C-CATTTCA-C--A-A--A-A--T-------TAAAT-G-AT-T---G-AAAGA-----AA-GAT-----AAAG---C-----TGT-AT-GA-AA-TCCAA---AACATCA-C
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             atttgttggtagg---A-AG-ATAA---A--G-CTGT-------ATGAAATCCAAAAC-AT-CACAA------A------------------TCACTCCACCTCAGCTT---TT-TA---CCC---CTAT-A--T-TT---ACAGGGCATT-TTATT--------A--------------TT-------------A-TTT-T-GTTT--Taaatcactccacctcagctttttacccctatatttacagggcattttattattattttgttttcttgtttgccattatttcataattttcattcattcatatataagaatgttataagaagtgagatttttttgtcatcccgtgtgtttgatagtgcatgatgaaattgggggaaatcttgaacaataacactcctgatagatgctgtactgagcaatatgtcaatttgtaaatttagatctctcaccactatacttggactggctctgtactgctatcgctacctcagatttattggacagcacagaaccagtctacctaggtacaggaacttgaaatgtcagatataataagtgaagtgttgaaattcacttctgaagctccaccctgacaatctcttatgacaaaaggctccaccctctctccacttggacgtccaaattggagactacagagtccagcattttacaccaagc
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    atttgttggtaggcaaagtacaagtgaatgggtggggcttcttgtcataagattgtcagggtggagccattggagttaatttcaaaacataatttactctgtcaattaatttctgacatcctggctgttcggatcatgtttgtttggctaaacataatagtttcaaaacaaaaacaagtcctttgaagctccctatataaactactttccccaaccccataccataatctgaaaagggcagaaggccagcaccataaatctgttacttcaaacaaaaacaaaacacactaaataatcaccatttcacaaaattaaatgattgaaagaA-TT-ATTTTGTT-T-TCTTGT------TTGCCATT-ATTTCA-TAATTTT-CATTCATTC--ATATATAAGAAT--G---TTATAAGAA------GTGAG---AT------T--TTTT-T----G-TCATCCCGTGTG-TTTGATA----------------------GT-GCATG--A--TGAAATT-----G-G-G--GG-AAATCTTGAACA----------------AT--A-----ACACT--------CCTGAT---AGATGC-----TG-T-AC-TG-AGCAA---T--AT-GTCAATTTGTAAATTTAGA----TCTC-T-CACCACTATAC-TTGGACTGGCT-CTGTACTGC----TATCGCTACCTC-----------------A----------GATTTATTGGACAGCA--CAGA----ACCAGT-C-TA-CC---T--A-------GGTA-CA-GG----A-ACT----TG--AAA-T---G---TCAGA-T-ATAA-TAA-G-T-GAAGTG-TT-GAAAT-TCAC-TTCT-GAA--G--CTCCA--C-CC-T-GA-CAA----TCTCT-T---ATGACAAAAGGCTCC-A--CC-CTCTCT--CCA-C--TTGGA----CG--TCC-A-A-A-TTGGAG-ACTA-C-AGAGTCCA--GC-AT---TTTACACCAAGCcttgtttgccattatttcataattttcattcattcatatataagaatgttataagaagtgagatttttttgtcatcccgtgtgtttgatagtgcatgatgaaattgggggaaatcttgaacaataacactcctgatagatgctgtactgagcaatatgtcaatttgtaaatttagatctctcaccactatacttggactggctctgtactgctatcgctacctcagatttattggacagcacagaaccagtctacctaggtacaggaacttgaaatgtcagatataataagtgaagtgttgaaattcacttctgaagctccaccctgacaatctcttatgacaaaaggctccaccctctctccacttggacgtccaaattggagactacagagtccagcattttacaccaagc
gi|7                          :                                                                                                                                                   atttgttggtaggcaaagtacaagtgaatgggtggggcttcttgtcataagattgtcagggtggagccattggagttaatttcaaaacataatttactctgtcaattaatttctgacatcctggctgttcggatcatgtttgtttggctaaacataatagtttcaaaacaaaaacaagtcctttgaagctccctatataaactactttccccaaccccataccataatctgaaaagggcagaaggccagcaccataaatctgttacttcaaacaaaaacaaaacacactaaataatcaccatttcacaaaattaaatgattgaaagaaagataaagctgtatgaaatccaaaacatcacaaatcactccacctcagctttttacccctatatttacagggcattttatt-A--A-A-C--AC-AA-AAGGTCCTTTTGAAGCTCCCTATAATAAA-ACT-AA-TTGGT---CCCCCCAAAA-C-----CCCATACCACCCCA---C-ATAATTCTGAGAAAAGGCCC-A-GAA-GGCCCCCCACCGCCGCA-G-CACC-TAA-A---TC--TGTT----TACTTTT-T---CAAAGCAACAAAAACCAA--AACACTATA-------AAAAAAAATTTATTTA--T-CA-C-CATTTCA-CAAA-A-TA-ATTT-------TAAAT-G-AT-TGTGG-AAAGAAAAGAAA-GAT-----AAAG---C-----TGCAAT-CG-TA-ATTAGCA-AATTCCA-
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TCACAA--AAT-AATT-TTA----A-------AT-GAT-TG--TG----------GAAAGA-AAA--GAAAG-ATAA--AGCTGC---A-ATCGTAATT-A--G-C-------------AAATTCCAAACTAT-CAC----------------C---AGA---TTCACACCAT-GCAGCTTATTTT-TA---CCC---C-T--A--TATT---ACAGGCCATTATCATT--------A--------------TT-------------aactatcaccagattcacaccatgcagcttatttttacccctatattacaggccattatcattattttttggttctgttgccgattatttctaattttcattcatgcatatataagaatatgtatctcaggtaagttggagattttgttttgtgtattcccgtgtttctgattttagtcgcatgaagtgaaattggcgggaaactttgaacttcaaggctcataaatacactcctgattttagatgccggtacggcaaatatatgtcaatttgtaaattttgaaatatctcttcaccactataatttggactggctctgtactgctacatctgcttacggtgctacctcaaaatttatttgaaagcaccagaaccagtcctactaggtacaagggaaaattgcaaaatgtcagatatgataacgtgaagtgttgaaattacttctgaagctccaccctgaacaatctctttatatgacaaaaggctccaccttctctccactttcgacgtccaaattggggactccagagtcagcattttacaccaag
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           aaacacaaaaggtccttttgaagctccctataataaaactaattggtccccccaaaaccccataccaccccacataattctgagaaaaggcccagaaggccccccaccgccgcagcacctaaatctgtttactttttcaaagcaacaaaaaccaaaacactataaaaaaaaatttatttatcaccattTTGCCGATTATTTC--TAATTTT-CATTCATGC--ATATATAAGAATATG---T-------ATCTCAGGTAAG---TTGGAGATT--TTGT-TTTGTG-TATTCCCGTGTT-TCTGATTTT--------A-----------GTCGCATG--AAGTGAAATT-----G-GCG--GG-AAACTTTGAACTTCAAGGCTCA-TAAA--T--A------CACT--------CCTGATTTTAGATGC-----CGGT-AC----GGCAAATAT--AT-GTCAATTTGTAAATTTTGAAATATCTC-TTCACCACTATAATTTGGACTGGCT-CTGTACTGC----TAC----ATCTGCTTACGGTGCTACCTCAA----------AATTTATTTGAAAGCA-CCAGA----ACCAGT-CCTA-CT---A--G-------G-TA-CA-AGGGAAA-A-T----TGCAAAA-T---G---TCAGA-T-ATGA-TAACG-T-GAAGTG-TT-GAAAT-T-AC-TTCT-GAA--G--CTCCA--C-CC-T-GAACAA----TCTCT-TTATATGACAAAAGGCTCC-A--CC-TTCTCT--CCA-CT-TTCGA----CG--TCC-A-A-A-TTGGGG-ACTC-C-AGAGT-CA--GC-AT---TTTACACCAAGttttggttctgttgccgattatttctaattttcattcatgcatatataagaatatgtatctcaggtaagttggagattttgttttgtgtattcccgtgtttctgattttagtcgcatgaagtgaaattggcgggaaactttgaacttcaaggctcataaatacactcctgattttagatgccggtacggcaaatatatgtcaatttgtaaattttgaaatatctcttcaccactataatttggactggctctgtactgctacatctgcttacggtgctacctcaaaatttatttgaaagcaccagaaccagtcctactaggtacaagggaaaattgcaaaatgtcagatatgataacgtgaagtgttgaaattacttctgaagctccaccctgaacaatctctttatatgacaaaaggctccaccttctctccactttcgacgtccaaattggggactccagagtcagcattttacaccaag
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       aaacacaaaaggtccttttgaagctccctataataaaactaattggtccccccaaaaccccataccaccccacataattctgagaaaaggcccagaaggccccccaccgccgcagcacctaaatctgtttactttttcaaagcaacaaaaaccaaaacactataaaaaaaaatttatttatcaccatttcacaaaataattttaaatgattgtggaaagaaaagaaagataaagctgcaatcgtaattagcaaattccaaactatcaccagattcacaccatgcagcttatttttacccctatattacaggccattatcattattttttggttctg-AAA-TAA-AA----------GAGAAA-GAA-TGACCT-TTATATGTCAAC---A-AG-GTGATC-A--G-CTACATATGTAAC-AAATCCAAAAC-AC-CACAG------A
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   T-TTATT--------G--------------TT-------------A-TCA-T-GAAT--TCC--T-TAT--A-----T--CT------TAA--A-----A----AACTTG-T---T-TGGA-TT----TTATT-TATTTTATTGGAAA----CATGCAATT-A-CAGA---------ATGC---T-TATAAAAA---------------G------GTGGG---TT------T--TTTTGT----G-CCATCCC-TGTGATTTGATA----------------------GT-GCATG--AA-TGGA--T-----A-G-GTAGG-GAATCTTGAAC-TCAA-GCTCAGTAAATATTAG-----ATACTTAAAAATCCCTGAC---AGATGC-----TG-T-AC-TGGAGCAA---T--GGAGTCAGTATGTGAATTC-GA----TCTC-T-CATCACCACAA-TGGGACTGGCT-CTGTACTGCATCCTAT----A---------------------T----------AA------GGACAGCA-A--GAAA--AC-ATT-C-TA-CTATGT--AC------G-TA-TACGG----ACA-A----TG--AAA-T---G---ACAGA-T-GCAA-TAA-G-T-TA-AGC-TT-GAAAT---AC-TTCTTGAA--G--CTACA--C-CT-TTGA-CAA----TCTCT-T---A-GACAAGAGGT-------CC-CTCTCT--CCA-TT-TTAG------G--TCT-A-A-T-TTGGAA-GCTC-C-AGAGT-C--------------ACACCAAGCccagggtgcaaatgcaaatttgaaaatttgacgcctctatatatttaattacgtctgtattgcaatttctgcacttgtcttatctaatacaatatgacagaaaaaataattgatctctgtcggtgttaaaatagatgaaaggggagaactcagttttctgcatgaaactagaatgtggttatcattcactaacgttcacatgttaatgtaaagatttctcactgcagtatgtcaggtatcagctgtatcctgcttaacggacttctaaaaacaatgagcatgacgagttaccaatttttatttcatctcctttgtaattgagagtattctaacattcttttcattttctcacgtcctaatttgatagttcacctcaatgagtctgactagtcagtttgattattcaaagtcataa
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|29 ): TTGTCAGATTTTACACACAAAGAATTCCAAATATCAAACATATGGTTTGGATTTTTTTTTTCTTTTATTTTATTAAAAGCATGCATGCACAAGAATGTTAT
Unaligned ( gi|31 ): GGTACTGTATGGTGTGAAACTCTTAATATTGATTGAGGCTCTTATTAACACTATGATAGTATCAAGCCTTTTTTTCCATTCCC
Unaligned ( gi|35 ): TGTCATGTTTTACACATAAAGAATTCGATATAATAAATCTGTTTGGGTTTTTTTTTTTTTT
Unaligned ( gi|40 ): CTTCTAAAAACAATGGGCATGATGAGTTTCCTATTTATATTTCACCT






Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                       11         222222                                         11                                                                                                  11111111111     2222222222222222222222222    1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111      2222222222222222222222   111     22222                                    1                                                                   333333333333                                111111111111                                                                      2222222222222222222222222222                        1111111111                    2222222                   33333333333333333333333333              11   11111                           11111   111        11111    222222222            4444444444444     111           4444444444444444444      44444444444444444                        222222222222      222222222222222                   111   11                            222222222                       444444444444444444444444                          111   2222222                          33333333333333333333333333333333333333                          2222222                2222222222                    11                                                                       3333333333333       111   11                                6666666666666666666666                                                              11    11111     11111111               11111                                                                 11                     1111   8888888888888888888888888888888888888               22222222222                  222222222222               222222  11                      1     11111111                                          1                                                                                                                              
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                    4  11   99    777777     4   55  4 4  4     4   4  3    55   00 3    55  3    11  7777    3       3 6        88888   3 88888    44  3   555  3 3       999999    55555555555 3   8888888888888888888888888    7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777      5555555555555555555555   000 55  99999 88   55   3      3 3 44 6 3 77  3  0      0   3   0     6666  3  3   3  6 555 6666   7777  3 77777     111111111111 9    2     3      44 6 3   6   555555555555  3 3    0   99999  44  3 6666   999999999  6666        5   33        2222222222222222222222222222  2 2       2 33 2 2  6 5555555555     3 3  3 66666   1111111  7   99999    777 88888888888888888888888888   2   3    4 55   11111      5                    22222   777     5  22222 5  222222222  0 5 66    0000000000000     111   2     5 4444444444444444444      77777777777777777      5  77   5  5  5   888888888888  5   000000000000000 4      44  44     000   00      555 3  6      3  3 44 222222222  3   2       3   3    555555555555555555555555     0    4       777  66 333   9999999 66 4   777         4  1  22222222222222222222222222222222222222  3   6    44   55 4   55 8888888 6666    4      6666666666    0   55  4    6  11    4  3 1   2  7   333       4  3    4  444              3  2   666   3333333333333  55   111   33    4 8888 4       8    3       6666666666666666666666  3  1  55 88       99999  3 55  8   4            99       0  77 55 00000     44444444      777      00000  4 4  4  4     777 55  4         0      7  9999    4 4          99           4         0000   6666666666666666666666666666666666666  0            55555555555      4 4  3  666 555555555555  3  3  7777 3 666666  33   3 555 555     3 3  2 4   99999999   3  3     3    3    3   44 44     44 3  2 3  3 2 6666     3 555            0  2 33  2      33   4  2    999999 33   2 2 2 2      3    3 3     6  77  3  555            
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                    .  ..   ..    ......     .   ..  . .  .     .   .  .    ..   .. .    ..  .    ..  ....    .       . .        .....   . .....    ..  .   ...  . .       ......    ........... .   .........................    ..........................................................................................................      ......................   ... ..  ..... ..   ..   .      . . .. . . ..  .  .      .   .   .     ....  .  .   .  . ... ....   ....  . .....     ............ .    .     .      .. . .   .   ............  . .    .   .....  ..  . ....   .........  ....        .   ..        ............................  . .       . .. . .  . ..........     . .  . .....   .......  .   .....    ... ..........................   .   .    . ..   .....      .                    .....   ...     .  ..... .  .........  . . ..    .............     ...   .     . ...................      .................      .  ..   .  .  .   ............  .   ............... .      ..  ..     ...   ..      ... .  .      .  . .. .........  .   .       .   .    ........................     .    .       ...  .. ...   ....... .. .   ...         .  .  ......................................  .   .    ..   .. .   .. ....... ....    .      ..........    .   ..  .    .  ..    .  . .   .  .   ...       .  .    .  ...              .  .   ...   .............  ..   ...   ..    . .... .       .    .       ......................  .  .  .. ..       .....  . ..  .   .            ..       .  .. .. .....     ........      ...      .....  . .  .  .     ... ..  .         .      .  ....    . .          ..           .         ....   .....................................  .            ...........      . .  .  ... ............  .  .  .... . ......  ..   . ... ...     . .  . .   ........   .  .     .    .    .   .. ..     .. .  . .  . . ....     . ...            .  . ..  .      ..   .  .    ...... ..   . . . .      .    . .     .  ..  .  ...            
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                    0  00   55    666666     0   55  0 0  0     0   0  6    00   22 6    00  6    88  1111    3       3 7        77777   3 33333    66  3   888  3 3       666666    88888888888 3   3333333333333333333333333    4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444      5555555555555555555555   000 00  11111 66   00   6      6 3 66 7 3 99  3  0      8   1   8     5555  1  1   1  2 444 1111   6666  1 77777     666666666666 2    9     1      22 7 3   2   888888888888  1 1    5   55555  22  1 1111   999999999  1111        7   99        0000000000000000000000000000  7 7       7 77 9 9  2 2222222222     1 1  1 99999   3333333  3   11111    000 77777777777777777777777777   3   6    4 11   11111      0                    55555   555     0  55555 7  999999999  1 0 99    4444444444444     888   5     7 4444444444444444444      00000000000000000      7  99   7  7  7   444444444444  0   222222222222222 4      66  88     222   00      888 3  7      3  3 66 555555555  3   4       3   3    888888888888888888888888     9    0       888  22 999   3333333 11 4   888         0  1  44444444444444444444444444444444444444  3   7    66   55 0   55 5555555 3333    0      3333333333    8   66  0    7  88    6  3 2   3  2   555       4  6    4  888              6  1   222   2222222222222  55   000   55    0 5555 0       8    6       5555555555555555555555  6  3  00 66       11111  6 00  0   0            55       9  00 55 00000     55555555      000      00000  0 0  0  0     000 55  0         8      4  4444    4 4          44           4         6666   0000000000000000000000000000000000000  1            66666666666      4 4  6  444 777777777777  6  6  7777 6 333333  88   3 888 888     3 3  0 5   88888888   3  3     3    3    3   66 66     66 3  3 1  1 2 5555     1 444            1  7 77  7      44   7  4    999999 44   5 5 5 5      1    1 1     2  33  1  444            
consensus                     :                                                                                                                                                                         CTTGGTGTAAA-AT--GCT--GACT-----TCTGGA-GCC--TC-C-AA-TTTGG-ACG-TC-CAAA--GTG-GA-GAGA--GG-GTGGAGCC----TCTT-GTCATAA-G-AGATTGTC----TGGG-T-----GGAG--CT-ATT---GG-A-GTTAATT------TCAA-----------A-ACA------------------T------AATT------------T-----A-CT--------------CTG---T--------------------------C----------------------CT------------CAGTGT------TCG-------------TGG---C--TAT----A--ACA--TAA-AGTTAT-C-A--A-A-C--AA-AA-CAAGTCCTTT-GAAGCTCCCTAT-AT-AA-ACT-AA-T---T---CCCC---AAA-C-----CCCAT--------G---C-ATAA-TCTGA-AAAGGG--C-A-GAA-GGC------------CA-G-CACCATAA-A---CC--TG-T----TAC---T-T---CA----AACAAAAA-CAA--AACACACTA-------AAA------TTA---A--T-CA-C-CATTTCA-C--A-A-TA-A--T-------TAATT-G-AT-T---G-AAAG------AA-GAT-----AAAG---C-----TTT-AT-TA-CA-TTNAACC-AATTTCA-CTTT-G-AAAA-----ATATTT-CTGCTGATCGCAGTTTGCAA-----GGA---AGACG-TG-----T-TT-G-T-----ATTT-A--ATAC---TG-ATC----TATATCG-TGTCGTCGA-A--------------AG---TCCTAT------TA---------CAGTCA-AA--GGT-AA-TT-TTG----A--T-T--AT-AAA-TGAT----------G-GAGGGA-GAA-TGAAAT-T-TAT--GTCAAC---A-AG-GTGATC-AG-C--TAT-------AC-AAATCCAAAAC-ATC-ACAG------ACT-AGCGT---AAA---TTCACTCCAC-TCGGCTT---TT-TA---CCC--C-A--A--T-TTA---CAGGACATT-TCATT--------G--------------TT-------------GT-CAT-GTTT--TAC--A-TAT--A-------C--CTGGTA-CATGGA-----G----AACTTGTG-GAT-TGGA-TT-CTTTTCTT-TATTTCATAATTGTCATTTATTTCA-TAAATTT-CATTCATGCATATATA-AGAATG-T-TAT---A-G--AA---GT--GAG---TTT--TTGT-T----G-TCATCCCNTGTG-TTTGATAT---------A-----------GT-GCATG--A--TGAAATT-----GG-G--GG-AAA-TCTTGAACATCA--GCTCAGTAAA-AT--A-----ACACT--------CCTGAC---AGATGC-----TG-T-AC-TG-AGCAA---T--GT-GTCAATTTGTAAATTTTGA----TCTC-T-CATCACCACA--TTGGACTGGCT-CTGTACTGC----TAT----A---------------------A----------AATTTATTGGACAGCA-ACAGAGA--ACCAGT-C-TA-CC---T--A-------G-TA-CA-GG----A-A-T----TG--AAA-T---G---ACAGA-T-ATAAATAA-G-T-NA-GTG-TT-GAAAT-TCAC-TTCT-GAA--G--CTCCA--C-CC-T-GA-CAA----TCTCT-T---ATGACAAGAGGCTCC-A--CC-CTCTCT--CCA-CT-TTGGA----CG--TCC-A-A-A-TTGGAG-GCTC-C-AGAGT-CA--GC-AT---TTTACACCAAGC
Reference ( family-2546 )     :                                                                                                                                                                         CTTGGTGTAAA-AT--GCT--GACT-----TCTGGA-GCC--TC-C-AA-TTTGG-ACG-TC-CAAA--GTG-GA-GAGA--GG-GTGGAGCC----TCTT-GTCATAA-G-AGATTGTC----TGGG-T-----GGAG--CT-ATT---GG-A-GTTAATT------TCAA-----------A-ACA------------------T------AATT------------T-----A-CT--------------CTG---T--------------------------C----------------------CT------------CAGTGT------TCG-------------TGG---C--TAT----A--ACA--TAA-AGTTAT-C-A--A-A-C--AA-AA-CAAGTCCTTT-GAAGCTCCCTAT-AT-AA-ACT-AA-T---T---CCCC---AAA-C-----CCCAT--------G---C-ATAA-TCTGA-AAAGGG--C-A-GAA-GGC------------CA-G-CACCATAA-A---CC--TG-T----TAC---T-T---CA----AACAAAAA-CAA--AACACACTA-------AAA------TTA---A--T-CA-C-CATTTCA-C--A-A-TA-A--T-------TAATT-G-AT-T---G-AAAG------AA-GAT-----AAAG---C-----TTT-AT-TA-CA-TTNAACC-AATTTCA-CTTT-G-AAAA-----ATATTT-CTGCTGATCGCAGTTTGCAA-----GGA---AGACG-TG-----T-TT-G-T-----ATTT-A--ATAC---TG-ATC----TATATCG-TGTCGTCGA-A--------------AG---TCCTAT------TA---------CAGTCA-AA--GGT-AA-TT-TTG----A--T-T--AT-AAA-TGAT----------G-GAGGGA-GAA-TGAAAT-T-TAT--GTCAAC---A-AG-GTGATC-AG-C--TAT-------AC-AAATCCAAAAC-ATC-ACAG------ACT-AGCGT---AAA---TTCACTCCAC-TCGGCTT---TT-TA---CCC--C-A--A--T-TTA---CAGGACATT-TCATT--------G--------------TT-------------GT-CAT-GTTT--TAC--A-TAT--A-------C--CTGGTA-CATGGA-----G----AACTTGTG-GAT-TGGA-TT-CTTTTCTT-TATTTCATAATTGTCATTTATTTCA-TAAATTT-CATTCATGCATATATA-AGAATG-T-TAT---A-G--AA---GT--GAG---TTT--TTGT-T----G-TCATCCCNTGTG-TTTGATAT---------A-----------GT-GCATG--A--TGAAATT-----GG-G--GG-AAA-TCTTGAACATCA--GCTCAGTAAA-AT--A-----ACACT--------CCTGAC---AGATGC-----TG-T-AC-TG-AGCAA---T--GT-GTCAATTTGTAAATTTTGA----TCTC-T-CATCACCACA--TTGGACTGGCT-CTGTACTGC----TAT----A---------------------A----------AATTTATTGGACAGCA-ACAGAGA--ACCAGT-C-TA-CC---T--A-------G-TA-CA-GG----A-A-T----TG--AAA-T---G---ACAGA-T-ATAAATAA-G-T-NA-GTG-TT-GAAAT-TCAC-TTCT-GAA--G--CTCCA--C-CC-T-GA-CAA----TCTCT-T---ATGACAAGAGGCTCC-A--CC-CTCTCT--CCA-CT-TTGGA----CG--TCC-A-A-A-TTGGAG-GCTC-C-AGAGT-CA--GC-AT---TTTACACCAAGC
gi|1                          :                                                                                                                                                                            GGTGTAAATATCTGCTT-GAAC-----TCTGGA-GCC--TC-C-AA-TTTGG-ACC-TCTCAAA--GTG--A-GAGA--GG-GTGGGTTC----TCTT-GTCATAA-GGAGATTGTCTGGGTGGA-TCTATTGGAG--TTGATTTCAAA-A-CATAATT------TTTACTCTGTCATTTA-ATG------------------TTGTCTGAATT------------T-----C-CTGT------------CTG---CGTCA----------------------C----------------------CT------------CAG-GT------T---------------TGG---C--TAT----A--ACA--TAA-GATTAT-C-A--AGA-C--AA-AAACAAGTCATTT--------------AT-GATACTGAA-T---T---CCCA---AAA-TGCGCTCCCAT--------GGGCC-ATAA-TCTGA-AAAGGG--CCA-GAAAGGC------------CA-G-CACCATAA-AC--CC--TG-TAGTCTA----T-T---CA----AACAAAAA-CAA--A----ACT--------AAA------TTA--------CA---CA-TTCA-C--
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ----TATAT-G-TGT--TCGA-A--------------AG---TCCTAT------TA---------CAGTCA-AA--CGT-AAATT-TTGTATAA--T-T--A--GAA-CGATTGTATTTTAAGCGAGGGA--AT-TGAAAT-AATAT--GTCCAC---AGAG-GTGATC-AG-CGCTTT-------AC-AAA-CCAAAAC-GTCCACAGTGGT--ACT-AGCGT---AAT---TTCAT--------GTCTT---TTGTAGC-CCCAAC-A--A--T-TTAGAACAGGACATT-TCTGT--------G--------------TT-------------GTTCATTGTTTGGTAC--A-TAT--A-------C--C-GGTA-CGTGGACA---A----AACGTGTTTGAT-TGGA-TTTCTTTTCTT-TATTTCATAATTGT-ATTTATTTCA-TAAATTT-C-TTCATGTATATATA-AG------------------------T--GAG---TTTA-CTGT-T----G-TTATCCCTTGTG-TTTGATGTTAAGCATAGA-----------GT-GCATG--A--TGAAATT-----GG-G--GG-AAA-TCTTCAACATCA--GCTCAGTAAA--T--A-----ACACT--------CCTGAC---AGATGC-----TG-T-AC-TG-AGCAA---T--GT-GTCAATTTGTAAATTTTGA----TCTC-T-CATCACCACA--TTGGACTGGCT-CTGTACTGC----TAT----C---------------------A----------AATTTATTGGACAGC--AC--AGA--ACCAGT-C-TA-CC---TA-A-------G-TA-CA-GG----A-A------TGATAAA-T---A---GCAGA-T-AT-GATAG-A-TGAA-GTG-TT-GAAAT-TCAT-TTCT-GAA--G--CTCCA--C-CCAT-GA-CAA----TATCT-T---ATGACAAGAGGCTCC-A--CC-CTCTCT--CCA-CT-TTGGA----GG--TCA-A-A-A-TT-GAG-GCTC-C-AGAGT-CAGGGC-AT---TTTACACCAAgtgaagtgataatttcagagtagcgcaatttttcacaaacggacatgcaaaactgattgatcgtctgatgaacaggtctgctatagaattaacaattatgaaaatcgtggtaagacgttacagtgtatttgagttgttcattgtgaattcctgattagaagctattatatgtgttcgaaagtcctattacagtcaaacgtaaattttgtataattagaacgattgtattttaagcgagggaattgaaataatatgtccacagaggtgatcagcgctttacaaaccaaaacgtccacagtggtactagcgtaatttcatgtcttttgtagccccaacaatttagaacaggacatttctgtgttgttcattgtttggtacatataccggtacgtggacaaaacgtgtttgattggatttcttttctttatttcataattgtatttatttcataaatttcttcatgtatatataagtgagtttactgttgttatcccttgtgtttgatgttaagcatagagtgcatgatgaaattgggggaaatcttcaacatcagctcagtaaataacactcctgacagatgctgtactgagcaatgtgtcaatttgtaaattttgatctctcatcaccacattggactggctctgtactgctatcaaatttattggacagcacagaaccagtctacctaagtacaggaatgataaatagcagatatgatagatgaagtgttgaaattcatttctgaagctccacccatgacaatatcttatgacaagaggctccaccctctctccactttggaggtcaaaattgaggctccagagtcagggcattttacaccaa
gi|10                         :                                                                                                                                                                               ggtgtaaatatctgcttgaactctggagcctccaatttggacctctcaaagtgagagagggtgggttctcttgtcataaggagattgtctgggtggatctattggagttgatttcaaaacataatttttactctgtcatttaatgttgtctgaatttcctgtctgcgtcacctcaggtttggctataacataagattatcaagacaaaaacaagtcatttatgatactgaattcccaaaatgcgctcccatgggccataatctgaaaagggccagaaaggccagcaccataaaccctgtagtctattcaaacaaaaacaaaactaaattacacattcacgtgaagtgataatttcagagtagcgcaatttttcacaaacggacatgcaaaactgattgatcgtctgatgaacaggtctgctatagaattaacaattatgaaaatcgtggtaagacgttacagtgtatttgagttgttcattgtgaattcctgattagaagctatA-AGC------------CC-G-CACCATAA-A---CC--TG-T----TAC---T-T---CA----AACAAAAA-CAA--AACACACTA-------AAA------TTA------T-CA-CTCATTTCA-C--A-AATA-A--T-------TAATT-G-AT-T---A-AGA-------AA-GAT-----AAAAAGAC-----TTA-AT-TA-CAATTAAA---AATTTCA-CTTT-GCAAAA-----ATATTT--TGCTGATCGCAGTT-GCAA-----GGA---AGACG-TG-----T-TT-GAT-----ATTT-A--ATACA--TG-TAC----TATATCA-TGTCGTCGA-A--------------AG---TCCTAT------TA---------CAGTCA-AA--GGT-AA-TT-TTG----A--T-TT-AT-AAAATAAT----------G-GAGGGA-GAA-TAAAAT-T--AT--GCCAAC---A-AGTGTGATC-AG-C--T-T-------AC-AAATCCAAA-C-ATC-ACAG------ACTCAGCATTTGAAA---TTCACTCCAC-TCGGCTT---TT--A---CCC--C-A--AGAT-TTA---CAGGACATT--CATT--------A--------------TTTTGTTTTTTGTTTGT-CAT-GTTT--TAC--A-TATATA-------C--CTGGTA-CATGGA-----G----AACTTGTG-GAT-TGGATTT-CTTTTCTT-TATTTCATAATT
gi|11                         :                                                                                                                                                                         CTTGGT--AAA-AT--GCT--GACT------CTGGA-GCC--TC-C-AA-TTTGG-ATG-CC-CAAA--GTG-GAAGAGA--GG-GTGGGGCT----TCTT-GTCATTA-G-AGATTGTC----TGG--T-----GGAG--CT-ATT---GG-A-GT-AATTACTCTGTCA---------------TT------------------T------AATT------------T-------CTGATATCCTGG----CTG---T--------------------------C----------------------CT------------CAGTGT------TTG-------------TGG---C--TA-----A--ACA--TAA-AGTTAT-C-A--A-A-C--AA-AAACAAGTCCTTT-GAAGCTCCCAAT-AT-AA-ACT-AA-T---T---TCCC---AAA-C-----CCCAT--------A---CCATAA-TCTGA-AAAGGG--C-A-GAA-GGC------------CA-G-CACCATAA-A---CC--TG-T----TAC---T-T---CA----AACAAAAA-CAA--AACACACTG-------AAA------ATA---A--T-CA-C-CATTTCA-C--A-A-TA-A--T-------TCATT-G-AT-T---G-AAAGA-----AA-GATAATTAAAAG---C-----TTT-AT-TA-CA-TTTAAAC-AATTTCA-TTTT-GCAAAA-----ATATT
gi|12                         :                                                                                                                                                                         CTTCGTGTAAA-AT--GCT--GACT-----T-TGGA-GCC--TC-C-AACTTTGA-ACC-TC-AAAA--ATG-GA-AAGA--GA-GTGGAACC----TCTT-GTCATAA-G-AGATTGTC----AGGG-T-----GGAG--CT-TTT---TG-A-GATAATT------TAAA-----------A-ACA------------------T------AATC------------T-----A-TT--------------CTG---T--------------------------CAT--------------------TT------------CAAT-T------TC--------------TGAATCC--TA-----A--ACA--TAA-TGTTATCC-A--A-A-C--AA-AA-CAAGTCCTTT-GAAGCTCCCTAC-AT-AA-AGT-CATT---T---CCCC---AAA-C-----CCCAT--------GC--C-ATGA-TCTGA-AAAGGG--C-A-GAT-GGC------------AA-A-CATT-TAGCA---TC--TG-T----TAC----------------AC------------ACACACTA-------A-------------------C-------------------TA-A--C-------TAATT-G-AC-A---G-A---------AA-GAT-----ATAG---C------TT-AT-T----------CT---TTTTA-C------AAAA-----ATATTC-TTGCTGATCACAGTTTGCAA-----GGA---AAACC-TG-----T-TTAA-T-----AT-------TAC---TG-TAC----TAT
gi|13                         :                                                                                                                                                                         CTTGGTGTAAA-AT--GCT--GACT------CTGGA-GCC--TC-C-AA-TTTGG-ACG-TC-CAAA--GTG-AA-GAGA--GG-GTAGAGTC----TCTT-GTCATAG-G-AGATTGTC----TGGG-T-----GGAG--CT-ATT---GG-A-GTTAATT------TCAA-----------A-ACA------------------T------AATT------------C-----A-CT--------------CTG---T--------------------------C----------------------CT------------CAGTGT------TCG-------------TGG---C--TAT----AC-ACA--TAA-AGTTAT-C-A--A-A-CCAAA-AA-CAAGTCATTT-GAAGCTCCTTAT-AT-AA-ATT-AA-T---T---CCCC----AA-C-----ACCAT--------GC--C-ATAA-TATGA-AAAGGG--C-A-GAA-GGC------------CA-G-CACCATGA-A---CC--TG-T----TAC---T-T---CA----AACAAAAA-CAA--AACACACTA-------AAT------TTT---A--T-TG-T-ATTTTTA-C--A-A-Tc
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   g--------------TT-------------GT-CAT-GTTT--TAC--A-CAA--AGAATT--C--C--ATA-TATAAA-----AGTTAAACTTATG-ATT-TGGA-TT-TTTTTCTC-TATTT-------------TATT--A-AAAA--------CATGCATGCACA-AGAATG-C-TAT---A-C--AAACTGG--GAG---TTT--T-GT-T----G-TCATCCCTTGTG-TTTG--AT---------G-----------GT-GC-TG--A--TGAAATT-----GA-G--Gtgtga
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         gtTG-CTTGATG----------------------GT-GC-TG--A--TGAAATTCGGGGGG-G--GG-GGA-TCTTGAACGTCA--GCTCAGTATA-AT--ACATAGACA-T--------CCTGAC---AGATAC-----TG-T-AC-TG-AGCAA---T-----------TTGTGAATTTTGA----TCTC-T-CATCTCCACA--TTGGACTGGAT-CTGTagggggggggtctgcttgatggtgctgatgaaattcgggggggggggatcttgaacgtcagctcagtataatacatagacatcctgacagatactgtactgagcaatttgtgaattttgatctctcatctccacattggactggatctgt
gi|15                         : gtttgtcatgttttacacaaagaattccatatataaaagttaaacttatgatttggatttttttctctattttattaaaaacatgcatgcacaagaatgctatacaaactgggagttttgttgtcatcccttgtgtttgatggtgctgatgaaattgaggagggggggggtcGTGTAAA-AT--GCT--GACTCTAGATCTGGA-GCC--TC-C-AA-TTTGG-ACG-TC-CAAA--GCG-GA-GAGA--GG-GTGGAGCT----TCTT-GTCATAA-T-AGATTGTC----TGGG-T-----GGAG--CT-ATT---GG-A-GTTAATT------TCAA-----------A-ACA------------------T------AATT------------T-----A-CT--------------CTG---TGATTTAATTTCTAACATCCTGGCTGTC----------------------CT------------CAGTAT------TTG-------------TGG---C--TA-----A--ACA--TAA-AGTTAT-CAA--A-A-C--AA-GA-CAAGTCTTCT-GAAGCTCCCTAT-AT-AA-ACT-AATT---T---CCCC---AAA-C-----CCCAT--------AC--C-ATAA-
gi|16                         :                                                                                                                                                                           ttGTGTAAA-AT--G-T--GACT------ATGGA-GCC--TC-C-AA-TAATG-ACC-TC-CAAA---TG----GAGA--GG-GTGTA-CCTCAATCTT-GTCACAA-G-AGATTGTC----AGGG-T-----GGAG--CT--TT---GT-A-GTTACTT------T-AA-----------A-ACT------------------T------TAAT------------T-----A-TT--------------TTG---T--------------------------CTTTAATTTTACATCCTTTATCCCC------------CAATAT------TTG-------------TGG---CCTTA-----A--ACA--TAA-ATTTAT-C-CTTG-A-CA-AA-AA-CAAG-CCTTT--AAGCTTGC-A--AT-AA---T-AA-T---T----CCC---AAA-C-----C
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ttT-CAT-GTTT--TAC--A-TAT--A-------TATCTGGTA-CATGAA-----G----ACCT------AT-T--A-TT-AAT-------ATTTCATAATGATCATTTATTTCA-TAAATTTTCATTCATGCATATATA-AGAATG-T-TATT--A-G--AA---GT--GAGGTGTTT--TTTT-T----GGTCACCCCTTGTG-TTTGATA----------------------GT-GCATG--A--TGAAATT-----GG-G--GGGAAA-TCTTGAACATCA--GCTCAGTTA---T--A-----ACACT--------CCTGAC---ATATGC-----TG-T-AC-TG-AGCAA---T--GT-GTCAATTTGgataccat
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               AT----------G-GAGGGA-GAA-TAAAAT-T-TAT--GCCAAC---A-AG-GTGATC-AG-C--T-T-------AC-AAATCCAAAAC-ATC-ACAG------ACT-AGCGTTTGAAA---TTCACTCCAC-TCGGCTT---TT-TA---CCC--C-AAGA--T-TTA---CAGGACATT-TCATT--------ATTTTGTTTTCTTGTTT-------------GT-CAT-GTTT--TACATA-TAT--A-------C--CTGGTA-CATGGA-----G----AACTTGTG-GAT-TGGATTT-CTTTTCTT-TATTTCATAATT
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               aTGGACAGCACAC---GA--ACCAGTTC-TATCC---T--A-------GGTA-CA-GG----A-AAT----TG--AAAAT---G---ACAGA-G-GCTAATAA---T-C---------------TCAC-G-CT-GAATGG--CTCCA--CACCAT-GA-CAA----TCTCT-T---ATGACAAGAGGCTCC-A--CC-CTCTCT---CA-CT-TT-GC----CG--TCC-ATA-ATTTGGAG-GCTCACAAGAGTCCA--GCAATGTGTTTACACCA
gi|2                          :                                                                                                                                                                         CTTGGTGTAAA-ATCTGCTTTGA-------TCTGGA-GCC--TC-C-AA-TTTGG-ACC-TC-CAAA--GTG--A-GAGA--GG-GTGGAGTC----TCTT-GTCATAA-GGAGAT-GTC----TGGGCT-----GGAT--CT-ATT---GG-A-GTTGATT------TCAA-----------A-ACATAATTTTACTCTGTCATTT------AATT------------TCTAATA-TC--------------CTG---T--------------------------CTCGTC-----------------CT------------CAG-GT------TCG-------------TG----C--TAT----ACAACA--TAA-A-TTAT-C-A--AGA-C--AA-AA-CA-GTCATTT-GAA-----------------CT-AA-T---T---TCCC---AAA-C-----CCCAT--------G---CCATAA-TCTGA-AAAGGG--CCA-GAAAGGC------------CACG-CACCATAA-A---CC--TG-T-----AC---T-T---CA----AACAAAAAACAA--AACAC-CTA-------AAA------TTA---A--A-CA-C-CATTCTA-C--G-T-GAGA--TG------TGACTAG-ATGT---GTAAAG------AGTGA------AGAG---CGAATGCTT-ATGTA-CA-AAAAACGGAAT--CA-TTGC-G-AAGAGATGGATGTGTGCGGCTGATTGCA-TGTGCAA-----GAATAAAAGCG-TGGGCCGTGTT-G-TGAGTGATGTGA--ATGCGTGTG-A-C----TATAT-A-TGT-GTCGA-A-------------------TCCTAT------TA---------CAGTCA-AAACGTT-AA-AT-TTG----AAGTGT--ATGAAA-TGAT----------T-GAGGGA-TAA---AAAT----AT---TCCACTGAG-AG-GTGATC-AGGC--TTT-------AC-AAA-CCAAAAC-GTC-ACAGGGTGGTACT-AGCGT---A-----TTCA----GC-TTGGTGT---GT-GAGCTCCC--A-A--A--T-TTA---CAG-ACATT-TCTGT--------G--------------TT-------------GT-CATTGTTT--TAC--AATAT--A-------C----GGTA-CGTGGACCAGAG----AACG-GTG--AT-TGGA-TTTCTTTTCTT-TATT-CATAATTGTCATTTATTTCAGTAAATTT-CTTTCATGTTTATATA------------T---A-----A---GT--GAG---TTTACTTGT-T----G-TTATCCC-TGTG-TTTGATGTTAAGCATAGA-----------GT-GCATGGGA--TGAAATT-----GG-G--GG-AAA-TCTTCAACATCA--GCTCAGTAAA--T--A-----ACACT--------CCT-AC---AGATGC-----TG---AC-TG-AGCAA---T--GT-GTCAATTTG--AATTT-GA----TCTC-T-CATCACCACA--T-GGACTGGCT-CTGTACTGC----TAT----C---------------------A----------AATTTATTGGACAGC--ACA-AGA--ACCAGT-C-TA-CC---T--AAG-----G-TACCA-GG----A-A------TGATAAA-TACCG---CCAGA-T-AT-GATAA-T-G-AA-GTG-TTGGAAAT-TCACTTTCT-GAA--G--CTCCA--C-CCAT-GA-CAA----TATCT-T---ATGACAAGAGGCTCC-A--CC-CTCTCTCCCCA-CT-TTGGA----GG--TCA-A-A-A-TT-GAG-GCTC-C-AGAGT-CA--GC-AT---TTTACACCAAGC
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AA-TCTGA-AAAGGG--C-A-GAA-GGC------------TA-G-CACCATAA-A---CC--TG-T----TAC---T-T---CA----AACAAAAA-CAA--AA------------------------TA---A--T-CA-C-CATTTCA-C--A-A-TA-A--T-------TAATT-G-AT-T---G-AAAGA-----AA-GAT-----AAAG---C-----TTT-TT-TA-CA-TTTAGAC-AATTTCA-CTTT-G--------------TT-CTGCTGATCGCAGTTTGCAA-----GGATTGAGACG-TG-----
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        CAAACCA-------AAA--------A---C--T-CA-C-AATTTCAAC--A-A-TA-A--T-------AAATT-G--------G-ACA-------AA-GAT-----ATA----C-----TTT-AT--A-CA-TTTA--C-AGT--CA-CGGT-G-CAAA-----ATATTT-CTGCTGATCGCAGTTTGCAA-----GAA---AGCTG-CT-----T-TA-A-T-----A-TT-ACTACAC---T--ATCACAATGTATCA--GTCATAGA-A--------------GG---
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                              tTGGAGTC----TCTT-GTCATAG-G-AGATTGTC----TGGG-T-----GGAG--CT-ATT---GG-A-GTTAATT------CC-A-----------A-ACA------------------T------AATT------------T-----A-CT--------------CTG---T--------------------------CA---------------------TT------------TAATTTCTGATATCC-------------TGG---C--TGTCCTCA--GTGTTTAA-AGTTAT----------C--AA-AA-CAAGTCATTT-GAA---CCC--------------------------------------------CAT--------GC--C-ATAA-TCTGA-AAAGGG--atttt
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AAATCCTTT-GAAACTCCATAC-AT-AA-ACA-CA-T---T---TCCT-------C-----CCTAT--------AT--C-ATGA-TCTGA-AAAG---------------------------------ACCTT---G---CCTTTG-T----TAC---G-T---CA----AACACAAA-CAA--GA------A-------AAACC----TTA---------A-C-CATTTCA-C--A-A-TGCA--TGTACATGTAATT---AC-T---A-AAAA------AA-AAT-----A
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TT-A--ATAC----G--------TACATCGATGTCGTTGGTA--------------AGATTTCTTATAAGATCTATGCACGAATCAGTCA-AA--GGT-AA-ATATTG----A--T-TGTAT-AAA--GA-----------G-GAGGGAAGAAGTGAAAT-C-TAT--GTCAAC---A-AG-GTGATCTAG-C--TGC-----------AATCC-AAAC-ATC-ACAG------Attactgtatt
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             a-CT---T--G-------A-TA-CA-GG----A-AAT----TG--AAA-T---G---ACAGA-T--TGAATTA-G-C-TATGTG-TT-GAAAT-TCAC-TTGA-GAA--G--CTCCA--C-CC-T-T--CCC----CCTCTAT---AAAACTAGCAGCCCT-A--GC-CCCTCG--CTA-TTCTTGGAATTTTG--TTC-A-A-A-CTG
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              gt-T----TG--AAA-T---G---ACAGA-T-GTACATA-------A-ATG-TC-CAA---TCCC-TT--------G--C-ACA--C-TT-T-AA-C-------------------ACAAGAGG-TCC-A--AT-TCTTTT--CCATTT-TTGGA----GC--TCC-A-ACA-TTGGactag
gi|27                         :                                                                                                                                                                         CTAGGTGTGAA-AC--GCT--GACT------CTGGA-ACC--TT-C-AA-TTTTG-ACG-TC-CAAA--GTG-GA-GAGA--GGCGTGGGGTC----TCTT-GTCATAACG-AGATTGTC----TGGG-T-----GGAG--CT-ATT---GG-AGGTTAATT------TCAG-----------A-Aatggttgtgggaatgtggcttgaatgtaaaattatccaaacaaa
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   -AATTTCA-CTTTTG-CAAA-----ATATTT-CTTGTGATCGCAGTTTGCAATTGAGGGA---AGACG-TG-----T-TT-T-T-----ATTA-A--TTAC---TG--TA----CATATCA-TGTCGac
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        aaaaaaaaaaaa--------------TT-------------GT-CAG-ATTT--TAC--A-CAC--AAAGAATTC--CAAATATCA--------------AACATATG-GTT-TGGA-TT-TTTTT-TT-TCTTTTAT--------TTTATT--A-AAAG--------CATGCATGCACA-AGAATG-T-TAT---aaaaattttcaaa
gi|3                          :                                                                                                                                                                         CTTGGTGTAAA-AT--GCT--GACTAT---TCTGGA-GCTCGTCAC-AA-TTTGGGACG-TC-CAAA--GTG-GA-GAGA--GG-GTGGA-TC----T-TT-GTCATAG-G-AGATTGTC----TGG--T-----GGAGGAC--ATT---GG-A-GTTAATT------TCAA-----------ATACA------------------T------AATT------------T-----A-CT--------------CTG---T--------------------------C----------------------CT------------CAGTGT------TC--------------TGG---C--TATC---A--ACA--TAA-AGTTAT-C-A--A-A-C--AA-AA-CAAGTCATTT-GAAGCTCCCTAT-AT-AA-ACT-AA-T---T---CCCC---AA--------CCCAT--------G---C-ATAA-TCTGA-AAAGGG--C-A-GAA-G-C------------CA-G-CACCATAA-----CC--TG-T----TAC---TGT---CA----AACAAAAA-CAA--AACACACTA-------AAA------TTA---A--T-CA-C-CATTTCA-C--A-A-TA-A--T-------CAATT-G-AT-T-----AAAG------AA-GAT-----AAAG---G-----TTT-AT-TAACA-T-AAACT-AATTTCAGCTTT-G-AAAA-----ATATTT-CTGCTGATCGCAGTTTG--A-----AGA---AGACGGTG-----T-TT-G-T-----ATTT-A--ATAC---TG-ATC----TATATC--TGTCGTCGA-A--------------A----TCCTAT------TA---------CAGTCA-AA--GGT-AA-TT-TTG----A--T-T--AT-AAA-TGAT----------G-GAGGGA-GAA-TGAATT-T-TAA--GTCAAC---A-AG-GTGATA-AG-C--TAT-------AC-AA--TCAAAAC-ATC-ACAG------ACT--TTGT---AAA---TTCACTCCAC-TCAGCTT---T------------------------A---CAGGACATT-TC-TT--------G--------------TT-------------GT-CAT-GTTT--TAC--A-TAT--A-------C--CTGGTA-CATGGA----------AACTTGTG-GATGTGGA-TT-CTTTTCTTGTATTTCATAATTGTCATTTATTTAA-TAAATTT-CATTCATGCATATATA-AG------------------------T--GAG---TTTA-TTGT-T----G-TCA--CCTTGTG-GTTGATGT---------AAAGGCATTAGTGT-GCGTG--A--TGAAATT-----GG-G--GG-AAA-TCTTCAACATCA--GCTTAGTAAA-AT--A-----ACACT--------CCTGAC---AGATGCATATGCG-T-AC-TG-AGCAA---T--GT-GTCAATTTGTAAATTTTGA----TCTC-T-CATCACCACA--TTGGACGGGCTGCTGTACTGC----TAT----A---------------------A----------AATTTATTGGACAGCA-ATAGAGA--ACCAGT-C-TA-CC---T--A-------G-TA-CA-GG----A-A-T----TG--AAA-T---G---ACAGA-T-ATAAATAA-G-T-TA-GTG-TT-GAAAT-TCAT-TTCT-GAA--G--CTCCA--C-CCAT-GA-C-A----TATCT-T---ATGACAAGA-GCTCC----CC-CTCTCT--CCA-CT-TTGGA----GG--TCC-A-A-A-TTGGAG-GCTC-C-AGAGT-CA--GC-AT---TTTACACCAAGC
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              -CT---T--G-------A-TA-CA-GG----A-AAT----TG--AAA-T---G---ACAAA-TCAAAAATTG-GAT-CA-TTG-CT-GAAAT-TAAC-TCCA-GAA--G--CACCA--C-CC-T----------------------TG---AGTAGCCCC-A--CC-C-CTCT--CCA-AT-T
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               t-TAT--GTCAAC---A-CG-GTGATC-AG-C--TA--------AT-AAACCCAAAAC-ATC-ACAG------ACT-AGAGT---TCATCCTTCACTCCAC-T
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        -T-GA-CAA----TCTCT-T---ATGACAAGAGGCTCC-ATCCT-CTCTCT--CCA-CT-TTGGA----GG--TCC-A-A-A-TTGGtaaaggt
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ca----TAC---T-TT--CA----AACAAAAA-CAA--AACACACTA-------AAA------TTA---A--A-CA-C-CATTTCA-C--A-A-TA-C--T-------TAATT-G-AT-T---
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             C-A--CC-CTCTCT--CCA--T-TTGGA----GG--TCCAA-A-A-GTGGAG-GGTC-C-AGAGT-CA--CC-AT---TTTACAGCAAG
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    AAGAGAC-CC-A--CT-CCCTCA--CGA-TT-TTGG--------------------TG-----TTC-C-ATGAT-CA--GC-AT---TTTACACCAAGC
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    aaTCTCT--CCA-CT-TTGGG----CA--TCC-A-A-A-GTGGAG-ACTT-C-AGAGT-CA--GC-AT---TTTACACCAAGCct
gi|39                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             gCA-CT-TTGGA----CG--TCC-A-A-A-TTGGAG-GCTC-C---AGT-CA--GC-AT---TTTACACCAAGC
gi|4                          :                                                                                                                                                                         CTTGGTGTAAA-AT--GCT--GACA-----CCTGGATGCC--TC-CCAA-GTTGG-ACGGTC-CAAAAGGTG-GA-GAGA--GG-GTGG-GCT----TCTTTGTCATAA-G-AGATTGTA-----GGG-T-----GGAG--CC-ATT---GGGA-ATTAATT------TCAA-----------A-ACA------------------T------AATTACTCTCGCCATTT-----AATT--------------CTGAC-T--------------------------C----------------------CTGGCTGTATCGATCAGTGT------TTG-------------TGGG--C--TA-----A--ACA--TAA-AGTTAT-C-A--A-A-C--AAGAA-CAAGTCCTTT-GAAGCTCCCTAT-AT-AA-ACT-AA-T---TGTCCTCC---AAAAC-----CCCAT--------C---C-ATAT-TATCG-AAGGGG--C-ACGAA-GGC------------CA-GGCACCATTA-TTTTCG--TG-T----TAC---T-TTTTCA----AACTAAAA-CAATAAACACA-TACGAGAGGGAA------GTA---AGATACAGC-CATTTCA-C--ATA-TG-A--A-------AAATT-GTAT-T---A-AAAG------
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     gA-TGAAAAAT-TGT--ATTAA----A-AG-CTG----------TAT-------GC-AAATCCAAAAC-ATC-ACAG------A------------------TCACTCCAT-TCAGCTT---TT-TA---CCC--CTAT-A--T-TTA---CAGGGCATT-TTATT--------A--------------TT-------------AT-TTT-GTTT--Tctgtatgcaaatccaaaacatcacagatcactccattcagctttttacccctatatttacagggcattttattattattttgttttcttgtttgccattatttcataattttcattcatgcatatataagaatgttatcagaagtgagatttttgttgtcatcccgtgtgtttgatagtgcatgatgaaattgggggaaaatcttcaacaccagctcagtaaataacactcctgacagatgctgtcacgtgaagaactagtgcaaatctcttcacactatacttggactagcctgtactgcttaatctgctaccggatttattggcagcagagaacaccaagttacctaccgtagggtacaggaacattgtgaaatgtgaacagagtataataagtgaagtgtttgaaatatcacctctgaagctctccgacccctgacaaattttcacttatgacaataggctcctacctttctctccctctttggacgtttccacatggagaactccaggtcaggcattttacacca
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             gcttggtgtaaaatgctgacacctggatgcctcccaagttggacggtccaaaaggtggagagagggtgggcttctttgtcataagagattgtagggtggagccattgggaattaatttcaaaacataattactctcgccatttaattctgactcctggctgtatcgatcagtgtttgtgggctaaacataaagttatcaaacaagaacaagtcctttgaagctccctatataaactaattgtcctccaaaaccccatccatattatcgaaggggcacgaaggccaggcaccattattttcgtgttactttttcaaactaaaacaataaacacatacgagagggaagtaagatacagccatttcacatA-TT-ATTTTGTT-T-TCTTGT--TTGCCATT-ATTTCA-TAATTTT-CATTCATGCATATATA-AGAATG-T-TATC--A-G--AA---GT--GAGA--TTT--TTGT-T----G-TCATCCCGTGTG-TTTG--AT---------A-----------GT-GCATG--A--TGAAATT-----GG-G--GGAAAA-TCTTCAACACCA--GCTCAGT-AA-AT--A-----ACACT--------CCTGAC---AGATGC-----TG-TCACGTG-AAGAA---CTAGT-G-CAA-------------A----TCTCTT-CA-CACTATAC-TTGGACTAGC--CTGTACTGC----T-T----A---------------------ATCTGCTACCGGATTTATTG----GCA-GCAGAGAACACCAAG-T-TA-CC---T--ACCGTAGGG-TA-CA-GG----A-A-CATTGTG--AAA-T---GTGAACAGAGT-AT-AATAA-G-TGAA-GTGTTT-GAAATATCAC-CTCT-GAA--GCTCTCCGACC-CC-T-GA-CAAATTTTCACT-T---ATGACAATAGGCTCCTA--CCTTTCTCT--CCCTCT-TTGGA----CGTTTCC-A-C-A--TGGAGAACTC-C-AG-GT-CAG-GC-AT---TTTACACCActtgtttgccattatttcataattttcattcatgcatatataagaatgttatcagaagtgagatttttgttgtcatcccgtgtgtttgatagtgcatgatgaaattgggggaaaatcttcaacaccagctcagtaaataacactcctgacagatgctgtcacgtgaagaactagtgcaaatctcttcacactatacttggactagcctgtactgcttaatctgctaccggatttattggcagcagagaacaccaagttacctaccgtagggtacaggaacattgtgaaatgtgaacagagtataataagtgaagtgtttgaaatatcacctctgaagctctccgacccctgacaaattttcacttatgacaataggctcctacctttctctccctctttggacgtttccacatggagaactccaggtcaggcattttacacca
gi|5                          :                                                                                                                                                                                             gcttggtgtaaaatgctgacacctggatgcctcccaagttggacggtccaaaaggtggagagagggtgggcttctttgtcataagagattgtagggtggagccattgggaattaatttcaaaacataattactctcgccatttaattctgactcctggctgtatcgatcagtgtttgtgggctaaacataaagttatcaaacaagaacaagtcctttgaagctccctatataaactaattgtcctccaaaaccccatccatattatcgaaggggcacgaaggccaggcaccattattttcgtgttactttttcaaactaaaacaataaacacatacgagagggaagtaagatacagccatttcacatatgaaaaattgtattaaaagctgtatgcaaatccaaaacatcacagatcactccattcagctttttacccctatatttacagggcattttatt---C-ATAA-TCTGA-AAAGGG--C-A-GAA-GGT------------CA-G-CACCATAA-A---CC--TA-T----TAC-----------------------------AATGTACT------------------TC---A--T-CA-C-CATTTCA-C--A-A-TA-A------------ATT-G-AT-T---G-AAAG------AAAGAT-----AAAG---C--------------------------AATTTCA--TTT-GCAAAA-----ATATTT-CTGCTGATCGCAGTTTGCAA-----GGA---ATACG-TG-----T-TT-A-TT----ATTT-A--ATAC---TGTAT-------TATCG-TGTCGTCGA-AGATTCTCTTAAAGAAG---TCCTATGCAGA-TG---------CAGTCA-AA--GGTTAA-TT-TTG----AC-T-T--AT-AAAATAAT----------G-GAAGGA-GAA-TGAAAT-T-TATATGTCAAC---A-GG-ATGATC-AG-C--TA--------AC-AAATCCAAAAC-ATC-ACAG------ACT-AGCGTTG-AAA---TGCACTCCAC-TCAGCTT---TT-TA---CCC--A-AG-A--T-TTA---CAGGACATG-TTATTATCATTTTG--------------TT-------------TT-CTT-GTTT--TAC--A-TAT--ATA-----C--CTGGTA-CATGAA-----G----AACTTGTG-GAT-TGGA-T------------AT--CATAATTGTCACTTATTTCA-TAAATTT-CATTCATGCATATATA-AGAATG-T-TATC--A-G--AA---GT--GAG---TTT--TTGT-T----G-TCATCCCCTGTG-TTTGATA----------------------GT-GCATG--A--TGAAATT-----GA-G--GG-AAAATCTTGAACATCA--GCTCAGTAAA--T--A-----ACACT--------CCTGAC---AGATGC-----TG-T-TC-TG-AGCAA---T--GT-GTCAATTTGCAAATTGTGA----TCTC-T-CATCACCACA--TTGGACTGGCT-CTGTACTGC----TAT----------------------------------------CTGCT--ACAGCA--CATA----ACCAGT-C-TA-CC---TTAG-------G-TA-CA-GG----A-AAT----TG--AAA-T---G---ACAGA-T-AT-AGTAA-G-TGAA-GTG-TT-GAAAT-TCAC-TTCT-GAA--G--CTCCA--C-CC-T-GA-CAA----TCTCT-T---ATGACAAGAGGCTCC-A--CC-CTCTCT--CCA-CT-TTGGC----CG--TCC-A-A-A-TTGGAG-GCTC-C-CGAGT-CA--GC-AT---TTTACGCTAA
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                   atac-CAAA--GTACAA-GTGAATGG-GTGGGGCT----TCTT-GTCATAA-G-A--TTGTC----AGGG-T-----GGAG--CC-ATT---GG-A-GTTAATT------TCAA-----------A-ACA------------------T------AATT------------T-----A-CTCTGTCAATTAATTTCTGACAT--------------------------C----------------------CT------------GGCTGT------TCGGATCATGTTTGTTTGG---C--TA-----A--ACA--TAATAGTT-T-C-A--A-AAC--AA-AAACAAGTCCTTT-GAAGCTCCCTAT-AT-AA-ACT-AC-T---T---TCCC---CAA-C-----CCCAT--------A---CCATAA-TCTGA-AAAGGG--C-A-GAA-GGC------------CA-G-CACCATAA-A---TC--TG-T----TAC---T-T---CA----AACAAAAA-CAA--AACACACTA-------AA--------TA---A--T-CA-C-CATTTCA-C--A-A--A-A--T-------TAAAT-G-AT-T---G-AAAGA-----AA-GAT-----AAAG---C-----TGT-AT-GA-AA-TCCAA---AACATCA-C
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               atttgttggtagg---A-AG-ATAA---AG-C--TGT-------ATGAAATCCAAAAC-ATC-ACAA------A------------------TCACTCCACCTCAGCTT---TT-TA---CCC--CTAT-A--T-TTA---CAGGGCATT-TTATT--------A--------------TT-------------AT-TTT-GTTT--Taaatcactccacctcagctttttacccctatatttacagggcattttattattattttgttttcttgtttgccattatttcataattttcattcattcatatataagaatgttataagaagtgagatttttttgtcatcccgtgtgtttgatagtgcatgatgaaattgggggaaatcttgaacaataacactcctgatagatgctgtactgagcaatatgtcaatttgtaaatttagatctctcaccactatacttggactggctctgtactgctatcgctacctcagatttattggacagcacagaaccagtctacctaggtacaggaacttgaaatgtcagatataataagtgaagtgttgaaattcacttctgaagctccaccctgacaatctcttatgacaaaaggctccaccctctctccacttggacgtccaaattggagactacagagtccagcattttacaccaagc
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     atttgttggtaggcaaagtacaagtgaatgggtggggcttcttgtcataagattgtcagggtggagccattggagttaatttcaaaacataatttactctgtcaattaatttctgacatcctggctgttcggatcatgtttgtttggctaaacataatagtttcaaaacaaaaacaagtcctttgaagctccctatataaactactttccccaaccccataccataatctgaaaagggcagaaggccagcaccataaatctgttacttcaaacaaaaacaaaacacactaaataatcaccatttcacaaaattaaatgattgaaagaA-TT-ATTTTGTT-T-TCTTGT--TTGCCATT-ATTTCA-TAATTTT-CATTCATTCATATATA-AGAATG-T-TAT---AAG--AA---GT--GAG---ATT--TTTT-T----G-TCATCCCGTGTG-TTTGATA----------------------GT-GCATG--A--TGAAATT-----GG-G--GG-AAA-TCTTGAACA----------------AT--A-----ACACT--------CCTGAT---AGATGC-----TG-T-AC-TG-AGCAA---T--AT-GTCAATTTGTAAATTTAGA----TCTC-T-CACCACTATAC-TTGGACTGGCT-CTGTACTGC----TATCGCTACCTC-----------------A----------GATTTATTGGACAGCA--CAGA----ACCAGT-C-TA-CC---T--A-------GGTA-CA-GG----A-ACT----TG--AAA-T---G---TCAGA-T-ATAA-TAA-G-T-GAAGTG-TT-GAAAT-TCAC-TTCT-GAA--G--CTCCA--C-CC-T-GA-CAA----TCTCT-T---ATGACAAAAGGCTCC-A--CC-CTCTCT--CCA-C--TTGGA----CG--TCC-A-A-A-TTGGAG-ACTA-C-AGAGTCCA--GC-AT---TTTACACCAAGCcttgtttgccattatttcataattttcattcattcatatataagaatgttataagaagtgagatttttttgtcatcccgtgtgtttgatagtgcatgatgaaattgggggaaatcttgaacaataacactcctgatagatgctgtactgagcaatatgtcaatttgtaaatttagatctctcaccactatacttggactggctctgtactgctatcgctacctcagatttattggacagcacagaaccagtctacctaggtacaggaacttgaaatgtcagatataataagtgaagtgttgaaattcacttctgaagctccaccctgacaatctcttatgacaaaaggctccaccctctctccacttggacgtccaaattggagactacagagtccagcattttacaccaagc
gi|7                          :                                                                                                                                                   atttgttggtaggcaaagtacaagtgaatgggtggggcttcttgtcataagattgtcagggtggagccattggagttaatttcaaaacataatttactctgtcaattaatttctgacatcctggctgttcggatcatgtttgtttggctaaacataatagtttcaaaacaaaaacaagtcctttgaagctccctatataaactactttccccaaccccataccataatctgaaaagggcagaaggccagcaccataaatctgttacttcaaacaaaaacaaaacacactaaataatcaccatttcacaaaattaaatgattgaaagaaagataaagctgtatgaaatccaaaacatcacaaatcactccacctcagctttttacccctatatttacagggcattttatt-A--A-A-C--AC-AA-AAGGTCCTTTTGAAGCTCCCTATAATAAA-ACT-AA-TTGGT---CCCCCCAAAA-C-----CCCATACCACCCCA---C-ATAATTCTGAGAAAAGGCCC-A-GAA-GGCCCCCCACCGCCGCA-G-CACC-TAA-A---TC--TGTT----TACTTTT-T---CAAAGCAACAAAAACCAA--AACACTATA-------AAAAAAAATTTATTTA--T-CA-C-CATTTCA-CAAA-A-TA-ATTT-------TAAAT-G-AT-TGTGG-AAAGAAAAGAAA-GAT-----AAAG---C-----TGCAAT-CG-TA-ATTAGCA-AATTCCA-
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TCACAA--AAT-AA-TT-TTA----A-------AT-GAT-TG-T----------G-GAAAGA-AAA--GAAAG-A-TAA--AGCTGC---A-ATCGTAATT-AG-C---------------AAATTCCAAACTATC-AC----------------C---AGA---TTCACACCAT-GCAGCTTATTTT-TA---CCC--C-T--A--TATTA---CAGGCCATTATCATT--------A--------------TT-------------aactatcaccagattcacaccatgcagcttatttttacccctatattacaggccattatcattattttttggttctgttgccgattatttctaattttcattcatgcatatataagaatatgtatctcaggtaagttggagattttgttttgtgtattcccgtgtttctgattttagtcgcatgaagtgaaattggcgggaaactttgaacttcaaggctcataaatacactcctgattttagatgccggtacggcaaatatatgtcaatttgtaaattttgaaatatctcttcaccactataatttggactggctctgtactgctacatctgcttacggtgctacctcaaaatttatttgaaagcaccagaaccagtcctactaggtacaagggaaaattgcaaaatgtcagatatgataacgtgaagtgttgaaattacttctgaagctccaccctgaacaatctctttatatgacaaaaggctccaccttctctccactttcgacgtccaaattggggactccagagtcagcattttacaccaag
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        aaacacaaaaggtccttttgaagctccctataataaaactaattggtccccccaaaaccccataccaccccacataattctgagaaaaggcccagaaggccccccaccgccgcagcacctaaatctgtttactttttcaaagcaacaaaaaccaaaacactataaaaaaaaatttatttatcaccattTTGCCGATTATTTC--TAATTTT-CATTCATGCATATATA-AGAATA-TGTATCTCA-GGTAA---GTTGGAG---ATT--TTGT-TTTGTG-TATTCCCGTGTT-TCTGATTTT--------A-----------GTCGCATG--AAGTGAAATT-----GGCG--GG-AAA-CTTTGAACTTCAAGGCTCA-TAAA--T--A------CACT--------CCTGATTTTAGATGC-----CGGT-AC----GGCAAATAT--AT-GTCAATTTGTAAATTTTGAAATATCTC-TTCACCACTATAATTTGGACTGGCT-CTGTACTGC----TAC----ATCTGCTTACGGTGCTACCTCAA----------AATTTATTTGAAAGCA-CCAGA----ACCAGT-CCTA-CT---A--G-------G-TA-CA-AGGGAAA-A-T----TGCAAAA-T---G---TCAGA-T-ATGA-TAACG-T-GAAGTG-TT-GAAAT-T-AC-TTCT-GAA--G--CTCCA--C-CC-T-GAACAA----TCTCT-TTATATGACAAAAGGCTCC-A--CC-TTCTCT--CCA-CT-TTCGA----CG--TCC-A-A-A-TTGGGG-ACTC-C-AGAGT-CA--GC-AT---TTTACACCAAGttttggttctgttgccgattatttctaattttcattcatgcatatataagaatatgtatctcaggtaagttggagattttgttttgtgtattcccgtgtttctgattttagtcgcatgaagtgaaattggcgggaaactttgaacttcaaggctcataaatacactcctgattttagatgccggtacggcaaatatatgtcaatttgtaaattttgaaatatctcttcaccactataatttggactggctctgtactgctacatctgcttacggtgctacctcaaaatttatttgaaagcaccagaaccagtcctactaggtacaagggaaaattgcaaaatgtcagatatgataacgtgaagtgttgaaattacttctgaagctccaccctgaacaatctctttatatgacaaaaggctccaccttctctccactttcgacgtccaaattggggactccagagtcagcattttacaccaag
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        aaacacaaaaggtccttttgaagctccctataataaaactaattggtccccccaaaaccccataccaccccacataattctgagaaaaggcccagaaggccccccaccgccgcagcacctaaatctgtttactttttcaaagcaacaaaaaccaaaacactataaaaaaaaatttatttatcaccatttcacaaaataattttaaatgattgtggaaagaaaagaaagataaagctgcaatcgtaattagcaaattccaaactatcaccagattcacaccatgcagcttatttttacccctatattacaggccattatcattattttttggttctg-AAA-TAAA----------A-GAGAAA-GAA-TGACCT-T-TATATGTCAAC---A-AG-GTGATC-AG-C--TACATATGTAAC-AAATCCAAAAC-ACC-ACAG------A
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    T-TTATT--------G--------------TT-------------AT-CAT-GAAT--TCC--T-TAT--A-------T--CT-------TAAA-----A----AACTTGT----T-TGGA-TT--------T-TATTT----ATT-----TTATT--G-GAAA--------CATGCA-AT-TACAGAATGCT-TAT---A-A--AAAG-GT--GGG---TTT--TTTTGT----G-CCATCCC-TGTGATTTGATA----------------------GT-GCATG--AA-TGGA--T-----AG-GTAGG-GAA-TCTTGAAC-TCAA-GCTCAGTAAATATTAG-----ATACTTAAAAATCCCTGAC---AGATGC-----TG-T-AC-TGGAGCAA---T--GGAGTCAGTATGTGAATTC-GA----TCTC-T-CATCACCACAA-TGGGACTGGCT-CTGTACTGCATCCTAT----A---------------------T----------AA------GGACAGCA-A--GAAA--AC-ATT-C-TA-CTATGT--AC------G-TA-TACGG----ACA-A----TG--AAA-T---G---ACAGA-T-GCAA-TAA-G-T-TA-AGC-TT-GAAAT---AC-TTCTTGAA--G--CTACA--C-CT-TTGA-CAA----TCTCT-T---A-GACAAGAGGT-------CC-CTCTCT--CCA-TT-TTAG------G--TCT-A-A-T-TTGGAA-GCTC-C-AGAGT-C--------------ACACCAAGCccagggtgcaaatgcaaatttgaaaatttgacgcctctatatatttaattacgtctgtattgcaatttctgcacttgtcttatctaatacaatatgacagaaaaaataattgatctctgtcggtgttaaaatagatgaaaggggagaactcagttttctgcatgaaactagaatgtggttatcattcactaacgttcacatgttaatgtaaagatttctcactgcagtatgtcaggtatcagctgtatcctgcttaacggacttctaaaaacaatgagcatgacgagttaccaatttttatttcatctcctttgtaattgagagtattctaacattcttttcattttctcacgtcctaatttgatagttcacctcaatgagtctgactagtcagtttgattattcaaagtcataa
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|31 ): GGTACTGTATGGTGTGAAACTCTTAATATTGATTGAGGCTCTTATTAACACTATGATAGTATCAAGCCTTTTTTTCCATTCCC
Unaligned ( gi|35 ): TGTCATGTTTTACACATAAAGAATTCGATATAATAAATCTGTTTGGGTTTTTTTTTTTTTT
Unaligned ( gi|40 ): CTTCTAAAAACAATGGGCATGATGAGTTTCCTATTTATATTTCACCT






Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                       11         222222                                         11                                                                                                  11111111111     2222222222222222222222222    1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111      2222222222222222222222   111     22222                                    1                                                                   333333333333                                111111111111                                                                      2222222222222222222222222222                        1111111111                    2222222                   33333333333333333333333333              11   11111                           11111   111        11111    222222222            4444444444444     111           4444444444444444444      44444444444444444                        222222222222      222222222222222                   111   11                            222222222                       444444444444444444444444                          111   2222222                          33333333333333333333333333333333333333                          2222222                2222222222                    11                                                                       3333333333333       111   11                                6666666666666666666666                                                              11    11111     11111111               11111                                                                 11                     1111   8888888888888888888888888888888888888               22222222222                  222222222222               222222  11                      1     11111111                                          1                                                                                                                              
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                    4  11   99    777777     4   55  4 4  4     4   4  3    55   00 3    55  3    11  7777    3       3 6        88888   3 88888    44  3   555  3 3       999999    55555555555 3   8888888888888888888888888    7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777      5555555555555555555555   000 55  99999 88   55   3      3 3 44 6 3 77  3  0      0   3   0     6666  3  3   3  6 555 6666   7777  3 77777     111111111111 9    2     3      44 6 3   6   555555555555  3 3    0   99999  44  3 6666   999999999  6666        5   33        2222222222222222222222222222  2 2       2 33 2 2  6 5555555555     3 3  3 66666   1111111  7   99999    777 88888888888888888888888888   2   3    4 55   11111      5                    22222   777     5  22222 5  222222222  0 5 66    0000000000000     111   2     5 4444444444444444444      77777777777777777      5  77   5  5  5   888888888888  5   000000000000000 4      44  44     000   00      555 3  6      3  3 44 222222222  3   2       3   3    555555555555555555555555     0    4       777  66 333   9999999 66 4   777         4  1  22222222222222222222222222222222222222  3   6    44   55 4   55 8888888 6666    4      6666666666    0   55  4    6  11    4  3 1   2  7   333       4  3    4  444              3  2   666   3333333333333  55   111   33    4 8888 4       8    3       6666666666666666666666  3  1  55 88       99999  3 55  8   4            99       0  77 55 00000     44444444      777      00000  4 4  4  4     777 55  4         0      7  9999    4 4          99           4         0000   6666666666666666666666666666666666666  0            55555555555      4 4  3  666 555555555555  3  3  7777 3 666666  33   3 555 555     3 3  2 4   99999999   3  3     3    3    3   44 44     44 3  2 3  3 2 6666     3 555            0  2 33  2      33   4  2    999999 33   2 2 2 2      3    3 3     6  77  3  555            
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                    .  ..   ..    ......     .   ..  . .  .     .   .  .    ..   .. .    ..  .    ..  ....    .       . .        .....   . .....    ..  .   ...  . .       ......    ........... .   .........................    ..........................................................................................................      ......................   ... ..  ..... ..   ..   .      . . .. . . ..  .  .      .   .   .     ....  .  .   .  . ... ....   ....  . .....     ............ .    .     .      .. . .   .   ............  . .    .   .....  ..  . ....   .........  ....        .   ..        ............................  . .       . .. . .  . ..........     . .  . .....   .......  .   .....    ... ..........................   .   .    . ..   .....      .                    .....   ...     .  ..... .  .........  . . ..    .............     ...   .     . ...................      .................      .  ..   .  .  .   ............  .   ............... .      ..  ..     ...   ..      ... .  .      .  . .. .........  .   .       .   .    ........................     .    .       ...  .. ...   ....... .. .   ...         .  .  ......................................  .   .    ..   .. .   .. ....... ....    .      ..........    .   ..  .    .  ..    .  . .   .  .   ...       .  .    .  ...              .  .   ...   .............  ..   ...   ..    . .... .       .    .       ......................  .  .  .. ..       .....  . ..  .   .            ..       .  .. .. .....     ........      ...      .....  . .  .  .     ... ..  .         .      .  ....    . .          ..           .         ....   .....................................  .            ...........      . .  .  ... ............  .  .  .... . ......  ..   . ... ...     . .  . .   ........   .  .     .    .    .   .. ..     .. .  . .  . . ....     . ...            .  . ..  .      ..   .  .    ...... ..   . . . .      .    . .     .  ..  .  ...            
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                    0  00   55    666666     0   55  0 0  0     0   0  6    00   22 6    00  6    88  1111    3       3 7        77777   3 33333    66  3   888  3 3       666666    88888888888 3   3333333333333333333333333    4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444      5555555555555555555555   000 00  11111 66   00   6      6 3 66 7 3 99  3  0      8   1   8     5555  1  1   1  2 444 1111   6666  1 77777     666666666666 2    9     1      22 7 3   2   888888888888  1 1    5   55555  22  1 1111   999999999  1111        7   99        0000000000000000000000000000  7 7       7 77 9 9  2 2222222222     1 1  1 99999   3333333  3   11111    000 77777777777777777777777777   3   6    4 11   11111      0                    55555   555     0  55555 7  999999999  1 0 99    4444444444444     888   5     7 4444444444444444444      00000000000000000      7  99   7  7  7   444444444444  0   222222222222222 4      66  88     222   00      888 3  7      3  3 66 555555555  3   4       3   3    888888888888888888888888     9    0       888  22 999   3333333 11 4   888         0  1  44444444444444444444444444444444444444  3   7    66   55 0   55 5555555 3333    0      3333333333    8   66  0    7  88    6  3 2   3  2   555       4  6    4  888              6  1   222   2222222222222  55   000   55    0 5555 0       8    6       5555555555555555555555  6  3  00 66       11111  6 00  0   0            55       9  00 55 00000     55555555      000      00000  0 0  0  0     000 55  0         8      4  4444    4 4          44           4         6666   0000000000000000000000000000000000000  1            66666666666      4 4  6  444 777777777777  6  6  7777 6 333333  88   3 888 888     3 3  0 5   88888888   3  3     3    3    3   66 66     66 3  3 1  1 2 5555     1 444            1  7 77  7      44   7  4    999999 44   5 5 5 5      1    1 1     2  33  1  444            
consensus                     :                                                                                                                                                                         CTTGGTGTAAA-AT--GCT--GACT-----TCTGGA-GCC--TC-C-AA-TTTGG-ACG-TC-CAAA--GTG-GA-GAGA--GG-GTGGAGCC----TCTT-GTCATAA-G-AGATTGTC----TGGG-T-----GGAG--CT-ATT---GG-A-GTTAATT------TCAA-----------A-ACA------------------T------AATT------------T-----A-CT--------------CTG---T--------------------------C----------------------CT------------CAGTGT------TCG-------------TGG---C--TAT----A--ACA--TAA-AGTTAT-C-A--A-A-C--AA-AA-CAAGTCCTTT-GAAGCTCCCTAT-AT-AA-ACT-AA-T---T---CCCC---AAA-C-----CCCAT--------G---C-ATAA-TCTGA-AAAGGG--C-A-GAA-GGC------------CA-G-CACCATAA-A---CC--TG-T----TAC---T-T---CA----AACAAAAA-CAA--AACACACTA-------AAA------TTA---A--T-CA-C-CATTTCA-C--A-A-TA-A--T-------TAATT-G-AT-T---G-AAAG------AA-GAT-----AAAG---C-----TTT-AT-TA-CA-TTNAACC-AATTTCA-CTTT-G-AAAA-----ATATTT-CTGCTGATCGCAGTTTGCAA-----GGA---AGACG-TG-----T-TT-G-T-----ATTT-A--ATAC---TG-ATC----TATATCG-TGTCGTCGA-A--------------AG---TCCTAT------TA---------CAGTCA-AA--GGT-AA-TT-TTG----A--T-T--AT-AAA-TGAT----------G-GAGGGA-GAA-TGAAAT-T-TAT--GTCAAC---A-AG-GTGATC-AG-C--TAT-------AC-AAATCCAAAAC-ATC-ACAG------ACT-AGCGT---AAA---TTCACTCCAC-TCGGCTT---TT-TA---CCC--C-A--A--T-TTA---CAGGACATT-TCATT--------G--------------TT-------------GT-CAT-GTTT--TAC--A-TAT--A-------C--CTGGTA-CATGGA-----G----AACTTGTG-GAT-TGGA-TT-CTTTTCTT-TATTTCATAATTGTCATTTATTTCA-TAAATTT-CATTCATGCATATATA-AGAATG-T-TAT---A-G--AA---GT--GAG---TTT--TTGT-T----G-TCATCCCNTGTG-TTTGATAT---------A-----------GT-GCATG--A--TGAAATT-----GG-G--GG-AAA-TCTTGAACATCA--GCTCAGTAAA-AT--A-----ACACT--------CCTGAC---AGATGC-----TG-T-AC-TG-AGCAA---T--GT-GTCAATTTGTAAATTTTGA----TCTC-T-CATCACCACA--TTGGACTGGCT-CTGTACTGC----TAT----A---------------------A----------AATTTATTGGACAGCA-ACAGAGA--ACCAGT-C-TA-CC---T--A-------G-TA-CA-GG----A-A-T----TG--AAA-T---G---ACAGA-T-ATAAATAA-G-T-NA-GTG-TT-GAAAT-TCAC-TTCT-GAA--G--CTCCA--C-CC-T-GA-CAA----TCTCT-T---ATGACAAGAGGCTCC-A--CC-CTCTCT--CCA-CT-TTGGA----CG--TCC-A-A-A-TTGGAG-GCTC-C-AGAGT-CA--GC-AT---TTTACACCAAGC
Reference ( family-2546 )     :                                                                                                                                                                         CTTGGTGTAAA-AT--GCT--GACT-----TCTGGA-GCC--TC-C-AA-TTTGG-ACG-TC-CAAA--GTG-GA-GAGA--GG-GTGGAGCC----TCTT-GTCATAA-G-AGATTGTC----TGGG-T-----GGAG--CT-ATT---GG-A-GTTAATT------TCAA-----------A-ACA------------------T------AATT------------T-----A-CT--------------CTG---T--------------------------C----------------------CT------------CAGTGT------TCG-------------TGG---C--TAT----A--ACA--TAA-AGTTAT-C-A--A-A-C--AA-AA-CAAGTCCTTT-GAAGCTCCCTAT-AT-AA-ACT-AA-T---T---CCCC---AAA-C-----CCCAT--------G---C-ATAA-TCTGA-AAAGGG--C-A-GAA-GGC------------CA-G-CACCATAA-A---CC--TG-T----TAC---T-T---CA----AACAAAAA-CAA--AACACACTA-------AAA------TTA---A--T-CA-C-CATTTCA-C--A-A-TA-A--T-------TAATT-G-AT-T---G-AAAG------AA-GAT-----AAAG---C-----TTT-AT-TA-CA-TTNAACC-AATTTCA-CTTT-G-AAAA-----ATATTT-CTGCTGATCGCAGTTTGCAA-----GGA---AGACG-TG-----T-TT-G-T-----ATTT-A--ATAC---TG-ATC----TATATCG-TGTCGTCGA-A--------------AG---TCCTAT------TA---------CAGTCA-AA--GGT-AA-TT-TTG----A--T-T--AT-AAA-TGAT----------G-GAGGGA-GAA-TGAAAT-T-TAT--GTCAAC---A-AG-GTGATC-AG-C--TAT-------AC-AAATCCAAAAC-ATC-ACAG------ACT-AGCGT---AAA---TTCACTCCAC-TCGGCTT---TT-TA---CCC--C-A--A--T-TTA---CAGGACATT-TCATT--------G--------------TT-------------GT-CAT-GTTT--TAC--A-TAT--A-------C--CTGGTA-CATGGA-----G----AACTTGTG-GAT-TGGA-TT-CTTTTCTT-TATTTCATAATTGTCATTTATTTCA-TAAATTT-CATTCATGCATATATA-AGAATG-T-TAT---A-G--AA---GT--GAG---TTT--TTGT-T----G-TCATCCCNTGTG-TTTGATAT---------A-----------GT-GCATG--A--TGAAATT-----GG-G--GG-AAA-TCTTGAACATCA--GCTCAGTAAA-AT--A-----ACACT--------CCTGAC---AGATGC-----TG-T-AC-TG-AGCAA---T--GT-GTCAATTTGTAAATTTTGA----TCTC-T-CATCACCACA--TTGGACTGGCT-CTGTACTGC----TAT----A---------------------A----------AATTTATTGGACAGCA-ACAGAGA--ACCAGT-C-TA-CC---T--A-------G-TA-CA-GG----A-A-T----TG--AAA-T---G---ACAGA-T-ATAAATAA-G-T-NA-GTG-TT-GAAAT-TCAC-TTCT-GAA--G--CTCCA--C-CC-T-GA-CAA----TCTCT-T---ATGACAAGAGGCTCC-A--CC-CTCTCT--CCA-CT-TTGGA----CG--TCC-A-A-A-TTGGAG-GCTC-C-AGAGT-CA--GC-AT---TTTACACCAAGC
gi|1                          :                                                                                                                                                                            GGTGTAAATATCTGCTT-GAAC-----TCTGGA-GCC--TC-C-AA-TTTGG-ACC-TCTCAAA--GTG--A-GAGA--GG-GTGGGTTC----TCTT-GTCATAA-GGAGATTGTCTGGGTGGA-TCTATTGGAG--TTGATTTCAAA-A-CATAATT------TTTACTCTGTCATTTA-ATG------------------TTGTCTGAATT------------T-----C-CTGT------------CTG---CGTCA----------------------C----------------------CT------------CAG-GT------T---------------TGG---C--TAT----A--ACA--TAA-GATTAT-C-A--AGA-C--AA-AAACAAGTCATTT--------------AT-GATACTGAA-T---T---CCCA---AAA-TGCGCTCCCAT--------GGGCC-ATAA-TCTGA-AAAGGG--CCA-GAAAGGC------------CA-G-CACCATAA-AC--CC--TG-TAGTCTA----T-T---CA----AACAAAAA-CAA--A----ACT--------AAA------TTA--------CA---CA-TTCA-C--
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ----TATAT-G-TGT--TCGA-A--------------AG---TCCTAT------TA---------CAGTCA-AA--CGT-AAATT-TTGTATAA--T-T--A--GAA-CGATTGTATTTTAAGCGAGGGA--AT-TGAAAT-AATAT--GTCCAC---AGAG-GTGATC-AG-CGCTTT-------AC-AAA-CCAAAAC-GTCCACAGTGGT--ACT-AGCGT---AAT---TTCAT--------GTCTT---TTGTAGC-CCCAAC-A--A--T-TTAGAACAGGACATT-TCTGT--------G--------------TT-------------GTTCATTGTTTGGTAC--A-TAT--A-------C--C-GGTA-CGTGGACA---A----AACGTGTTTGAT-TGGA-TTTCTTTTCTT-TATTTCATAATTGT-ATTTATTTCA-TAAATTT-C-TTCATGTATATATA-AG------------------------T--GAG---TTTA-CTGT-T----G-TTATCCCTTGTG-TTTGATGTTAAGCATAGA-----------GT-GCATG--A--TGAAATT-----GG-G--GG-AAA-TCTTCAACATCA--GCTCAGTAAA--T--A-----ACACT--------CCTGAC---AGATGC-----TG-T-AC-TG-AGCAA---T--GT-GTCAATTTGTAAATTTTGA----TCTC-T-CATCACCACA--TTGGACTGGCT-CTGTACTGC----TAT----C---------------------A----------AATTTATTGGACAGC--AC--AGA--ACCAGT-C-TA-CC---TA-A-------G-TA-CA-GG----A-A------TGATAAA-T---A---GCAGA-T-AT-GATAG-A-TGAA-GTG-TT-GAAAT-TCAT-TTCT-GAA--G--CTCCA--C-CCAT-GA-CAA----TATCT-T---ATGACAAGAGGCTCC-A--CC-CTCTCT--CCA-CT-TTGGA----GG--TCA-A-A-A-TT-GAG-GCTC-C-AGAGT-CAGGGC-AT---TTTACACCAAgtgaagtgataatttcagagtagcgcaatttttcacaaacggacatgcaaaactgattgatcgtctgatgaacaggtctgctatagaattaacaattatgaaaatcgtggtaagacgttacagtgtatttgagttgttcattgtgaattcctgattagaagctattatatgtgttcgaaagtcctattacagtcaaacgtaaattttgtataattagaacgattgtattttaagcgagggaattgaaataatatgtccacagaggtgatcagcgctttacaaaccaaaacgtccacagtggtactagcgtaatttcatgtcttttgtagccccaacaatttagaacaggacatttctgtgttgttcattgtttggtacatataccggtacgtggacaaaacgtgtttgattggatttcttttctttatttcataattgtatttatttcataaatttcttcatgtatatataagtgagtttactgttgttatcccttgtgtttgatgttaagcatagagtgcatgatgaaattgggggaaatcttcaacatcagctcagtaaataacactcctgacagatgctgtactgagcaatgtgtcaatttgtaaattttgatctctcatcaccacattggactggctctgtactgctatcaaatttattggacagcacagaaccagtctacctaagtacaggaatgataaatagcagatatgatagatgaagtgttgaaattcatttctgaagctccacccatgacaatatcttatgacaagaggctccaccctctctccactttggaggtcaaaattgaggctccagagtcagggcattttacaccaa
gi|10                         :                                                                                                                                                                               ggtgtaaatatctgcttgaactctggagcctccaatttggacctctcaaagtgagagagggtgggttctcttgtcataaggagattgtctgggtggatctattggagttgatttcaaaacataatttttactctgtcatttaatgttgtctgaatttcctgtctgcgtcacctcaggtttggctataacataagattatcaagacaaaaacaagtcatttatgatactgaattcccaaaatgcgctcccatgggccataatctgaaaagggccagaaaggccagcaccataaaccctgtagtctattcaaacaaaaacaaaactaaattacacattcacgtgaagtgataatttcagagtagcgcaatttttcacaaacggacatgcaaaactgattgatcgtctgatgaacaggtctgctatagaattaacaattatgaaaatcgtggtaagacgttacagtgtatttgagttgttcattgtgaattcctgattagaagctatA-AGC------------CC-G-CACCATAA-A---CC--TG-T----TAC---T-T---CA----AACAAAAA-CAA--AACACACTA-------AAA------TTA------T-CA-CTCATTTCA-C--A-AATA-A--T-------TAATT-G-AT-T---A-AGA-------AA-GAT-----AAAAAGAC-----TTA-AT-TA-CAATTAAA---AATTTCA-CTTT-GCAAAA-----ATATTT--TGCTGATCGCAGTT-GCAA-----GGA---AGACG-TG-----T-TT-GAT-----ATTT-A--ATACA--TG-TAC----TATATCA-TGTCGTCGA-A--------------AG---TCCTAT------TA---------CAGTCA-AA--GGT-AA-TT-TTG----A--T-TT-AT-AAAATAAT----------G-GAGGGA-GAA-TAAAAT-T--AT--GCCAAC---A-AGTGTGATC-AG-C--T-T-------AC-AAATCCAAA-C-ATC-ACAG------ACTCAGCATTTGAAA---TTCACTCCAC-TCGGCTT---TT--A---CCC--C-A--AGAT-TTA---CAGGACATT--CATT--------A--------------TTTTGTTTTTTGTTTGT-CAT-GTTT--TAC--A-TATATA-------C--CTGGTA-CATGGA-----G----AACTTGTG-GAT-TGGATTT-CTTTTCTT-TATTTCATAATT
gi|11                         :                                                                                                                                                                         CTTGGT--AAA-AT--GCT--GACT------CTGGA-GCC--TC-C-AA-TTTGG-ATG-CC-CAAA--GTG-GAAGAGA--GG-GTGGGGCT----TCTT-GTCATTA-G-AGATTGTC----TGG--T-----GGAG--CT-ATT---GG-A-GT-AATTACTCTGTCA---------------TT------------------T------AATT------------T-------CTGATATCCTGG----CTG---T--------------------------C----------------------CT------------CAGTGT------TTG-------------TGG---C--TA-----A--ACA--TAA-AGTTAT-C-A--A-A-C--AA-AAACAAGTCCTTT-GAAGCTCCCAAT-AT-AA-ACT-AA-T---T---TCCC---AAA-C-----CCCAT--------A---CCATAA-TCTGA-AAAGGG--C-A-GAA-GGC------------CA-G-CACCATAA-A---CC--TG-T----TAC---T-T---CA----AACAAAAA-CAA--AACACACTG-------AAA------ATA---A--T-CA-C-CATTTCA-C--A-A-TA-A--T-------TCATT-G-AT-T---G-AAAGA-----AA-GATAATTAAAAG---C-----TTT-AT-TA-CA-TTTAAAC-AATTTCA-TTTT-GCAAAA-----ATATT
gi|12                         :                                                                                                                                                                         CTTCGTGTAAA-AT--GCT--GACT-----T-TGGA-GCC--TC-C-AACTTTGA-ACC-TC-AAAA--ATG-GA-AAGA--GA-GTGGAACC----TCTT-GTCATAA-G-AGATTGTC----AGGG-T-----GGAG--CT-TTT---TG-A-GATAATT------TAAA-----------A-ACA------------------T------AATC------------T-----A-TT--------------CTG---T--------------------------CAT--------------------TT------------CAAT-T------TC--------------TGAATCC--TA-----A--ACA--TAA-TGTTATCC-A--A-A-C--AA-AA-CAAGTCCTTT-GAAGCTCCCTAC-AT-AA-AGT-CATT---T---CCCC---AAA-C-----CCCAT--------GC--C-ATGA-TCTGA-AAAGGG--C-A-GAT-GGC------------AA-A-CATT-TAGCA---TC--TG-T----TAC----------------AC------------ACACACTA-------A-------------------C-------------------TA-A--C-------TAATT-G-AC-A---G-A---------AA-GAT-----ATAG---C------TT-AT-T----------CT---TTTTA-C------AAAA-----ATATTC-TTGCTGATCACAGTTTGCAA-----GGA---AAACC-TG-----T-TTAA-T-----AT-------TAC---TG-TAC----TAT
gi|13                         :                                                                                                                                                                         CTTGGTGTAAA-AT--GCT--GACT------CTGGA-GCC--TC-C-AA-TTTGG-ACG-TC-CAAA--GTG-AA-GAGA--GG-GTAGAGTC----TCTT-GTCATAG-G-AGATTGTC----TGGG-T-----GGAG--CT-ATT---GG-A-GTTAATT------TCAA-----------A-ACA------------------T------AATT------------C-----A-CT--------------CTG---T--------------------------C----------------------CT------------CAGTGT------TCG-------------TGG---C--TAT----AC-ACA--TAA-AGTTAT-C-A--A-A-CCAAA-AA-CAAGTCATTT-GAAGCTCCTTAT-AT-AA-ATT-AA-T---T---CCCC----AA-C-----ACCAT--------GC--C-ATAA-TATGA-AAAGGG--C-A-GAA-GGC------------CA-G-CACCATGA-A---CC--TG-T----TAC---T-T---CA----AACAAAAA-CAA--AACACACTA-------AAT------TTT---A--T-TG-T-ATTTTTA-C--A-A-Tc
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   g--------------TT-------------GT-CAT-GTTT--TAC--A-CAA--AGAATT--C--C--ATA-TATAAA-----AGTTAAACTTATG-ATT-TGGA-TT-TTTTTCTC-TATTT-------------TATT--A-AAAA--------CATGCATGCACA-AGAATG-C-TAT---A-C--AAACTGG--GAG---TTT--T-GT-T----G-TCATCCCTTGTG-TTTG--AT---------G-----------GT-GC-TG--A--TGAAATT-----GA-G--Gtgtga
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         gtTG-CTTGATG----------------------GT-GC-TG--A--TGAAATTCGGGGGG-G--GG-GGA-TCTTGAACGTCA--GCTCAGTATA-AT--ACATAGACA-T--------CCTGAC---AGATAC-----TG-T-AC-TG-AGCAA---T-----------TTGTGAATTTTGA----TCTC-T-CATCTCCACA--TTGGACTGGAT-CTGTagggggggggtctgcttgatggtgctgatgaaattcgggggggggggatcttgaacgtcagctcagtataatacatagacatcctgacagatactgtactgagcaatttgtgaattttgatctctcatctccacattggactggatctgt
gi|15                         : gtttgtcatgttttacacaaagaattccatatataaaagttaaacttatgatttggatttttttctctattttattaaaaacatgcatgcacaagaatgctatacaaactgggagttttgttgtcatcccttgtgtttgatggtgctgatgaaattgaggagggggggggtcGTGTAAA-AT--GCT--GACTCTAGATCTGGA-GCC--TC-C-AA-TTTGG-ACG-TC-CAAA--GCG-GA-GAGA--GG-GTGGAGCT----TCTT-GTCATAA-T-AGATTGTC----TGGG-T-----GGAG--CT-ATT---GG-A-GTTAATT------TCAA-----------A-ACA------------------T------AATT------------T-----A-CT--------------CTG---TGATTTAATTTCTAACATCCTGGCTGTC----------------------CT------------CAGTAT------TTG-------------TGG---C--TA-----A--ACA--TAA-AGTTAT-CAA--A-A-C--AA-GA-CAAGTCTTCT-GAAGCTCCCTAT-AT-AA-ACT-AATT---T---CCCC---AAA-C-----CCCAT--------AC--C-ATAA-
gi|16                         :                                                                                                                                                                           ttGTGTAAA-AT--G-T--GACT------ATGGA-GCC--TC-C-AA-TAATG-ACC-TC-CAAA---TG----GAGA--GG-GTGTA-CCTCAATCTT-GTCACAA-G-AGATTGTC----AGGG-T-----GGAG--CT--TT---GT-A-GTTACTT------T-AA-----------A-ACT------------------T------TAAT------------T-----A-TT--------------TTG---T--------------------------CTTTAATTTTACATCCTTTATCCCC------------CAATAT------TTG-------------TGG---CCTTA-----A--ACA--TAA-ATTTAT-C-CTTG-A-CA-AA-AA-CAAG-CCTTT--AAGCTTGC-A--AT-AA---T-AA-T---T----CCC---AAA-C-----C
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ttT-CAT-GTTT--TAC--A-TAT--A-------TATCTGGTA-CATGAA-----G----ACCT------AT-T--A-TT-AAT-------ATTTCATAATGATCATTTATTTCA-TAAATTTTCATTCATGCATATATA-AGAATG-T-TATT--A-G--AA---GT--GAGGTGTTT--TTTT-T----GGTCACCCCTTGTG-TTTGATA----------------------GT-GCATG--A--TGAAATT-----GG-G--GGGAAA-TCTTGAACATCA--GCTCAGTTA---T--A-----ACACT--------CCTGAC---ATATGC-----TG-T-AC-TG-AGCAA---T--GT-GTCAATTTGgataccat
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               AT----------G-GAGGGA-GAA-TAAAAT-T-TAT--GCCAAC---A-AG-GTGATC-AG-C--T-T-------AC-AAATCCAAAAC-ATC-ACAG------ACT-AGCGTTTGAAA---TTCACTCCAC-TCGGCTT---TT-TA---CCC--C-AAGA--T-TTA---CAGGACATT-TCATT--------ATTTTGTTTTCTTGTTT-------------GT-CAT-GTTT--TACATA-TAT--A-------C--CTGGTA-CATGGA-----G----AACTTGTG-GAT-TGGATTT-CTTTTCTT-TATTTCATAATT
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               aTGGACAGCACAC---GA--ACCAGTTC-TATCC---T--A-------GGTA-CA-GG----A-AAT----TG--AAAAT---G---ACAGA-G-GCTAATAA---T-C---------------TCAC-G-CT-GAATGG--CTCCA--CACCAT-GA-CAA----TCTCT-T---ATGACAAGAGGCTCC-A--CC-CTCTCT---CA-CT-TT-GC----CG--TCC-ATA-ATTTGGAG-GCTCACAAGAGTCCA--GCAATGTGTTTACACCA
gi|2                          :                                                                                                                                                                         CTTGGTGTAAA-ATCTGCTTTGA-------TCTGGA-GCC--TC-C-AA-TTTGG-ACC-TC-CAAA--GTG--A-GAGA--GG-GTGGAGTC----TCTT-GTCATAA-GGAGAT-GTC----TGGGCT-----GGAT--CT-ATT---GG-A-GTTGATT------TCAA-----------A-ACATAATTTTACTCTGTCATTT------AATT------------TCTAATA-TC--------------CTG---T--------------------------CTCGTC-----------------CT------------CAG-GT------TCG-------------TG----C--TAT----ACAACA--TAA-A-TTAT-C-A--AGA-C--AA-AA-CA-GTCATTT-GAA-----------------CT-AA-T---T---TCCC---AAA-C-----CCCAT--------G---CCATAA-TCTGA-AAAGGG--CCA-GAAAGGC------------CACG-CACCATAA-A---CC--TG-T-----AC---T-T---CA----AACAAAAAACAA--AACAC-CTA-------AAA------TTA---A--A-CA-C-CATTCTA-C--G-T-GAGA--TG------TGACTAG-ATGT---GTAAAG------AGTGA------AGAG---CGAATGCTT-ATGTA-CA-AAAAACGGAAT--CA-TTGC-G-AAGAGATGGATGTGTGCGGCTGATTGCA-TGTGCAA-----GAATAAAAGCG-TGGGCCGTGTT-G-TGAGTGATGTGA--ATGCGTGTG-A-C----TATAT-A-TGT-GTCGA-A-------------------TCCTAT------TA---------CAGTCA-AAACGTT-AA-AT-TTG----AAGTGT--ATGAAA-TGAT----------T-GAGGGA-TAA---AAAT----AT---TCCACTGAG-AG-GTGATC-AGGC--TTT-------AC-AAA-CCAAAAC-GTC-ACAGGGTGGTACT-AGCGT---A-----TTCA----GC-TTGGTGT---GT-GAGCTCCC--A-A--A--T-TTA---CAG-ACATT-TCTGT--------G--------------TT-------------GT-CATTGTTT--TAC--AATAT--A-------C----GGTA-CGTGGACCAGAG----AACG-GTG--AT-TGGA-TTTCTTTTCTT-TATT-CATAATTGTCATTTATTTCAGTAAATTT-CTTTCATGTTTATATA------------T---A-----A---GT--GAG---TTTACTTGT-T----G-TTATCCC-TGTG-TTTGATGTTAAGCATAGA-----------GT-GCATGGGA--TGAAATT-----GG-G--GG-AAA-TCTTCAACATCA--GCTCAGTAAA--T--A-----ACACT--------CCT-AC---AGATGC-----TG---AC-TG-AGCAA---T--GT-GTCAATTTG--AATTT-GA----TCTC-T-CATCACCACA--T-GGACTGGCT-CTGTACTGC----TAT----C---------------------A----------AATTTATTGGACAGC--ACA-AGA--ACCAGT-C-TA-CC---T--AAG-----G-TACCA-GG----A-A------TGATAAA-TACCG---CCAGA-T-AT-GATAA-T-G-AA-GTG-TTGGAAAT-TCACTTTCT-GAA--G--CTCCA--C-CCAT-GA-CAA----TATCT-T---ATGACAAGAGGCTCC-A--CC-CTCTCTCCCCA-CT-TTGGA----GG--TCA-A-A-A-TT-GAG-GCTC-C-AGAGT-CA--GC-AT---TTTACACCAAGC
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AA-TCTGA-AAAGGG--C-A-GAA-GGC------------TA-G-CACCATAA-A---CC--TG-T----TAC---T-T---CA----AACAAAAA-CAA--AA------------------------TA---A--T-CA-C-CATTTCA-C--A-A-TA-A--T-------TAATT-G-AT-T---G-AAAGA-----AA-GAT-----AAAG---C-----TTT-TT-TA-CA-TTTAGAC-AATTTCA-CTTT-G--------------TT-CTGCTGATCGCAGTTTGCAA-----GGATTGAGACG-TG-----
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        CAAACCA-------AAA--------A---C--T-CA-C-AATTTCAAC--A-A-TA-A--T-------AAATT-G--------G-ACA-------AA-GAT-----ATA----C-----TTT-AT--A-CA-TTTA--C-AGT--CA-CGGT-G-CAAA-----ATATTT-CTGCTGATCGCAGTTTGCAA-----GAA---AGCTG-CT-----T-TA-A-T-----A-TT-ACTACAC---T--ATCACAATGTATCA--GTCATAGA-A--------------GG---
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                              tTGGAGTC----TCTT-GTCATAG-G-AGATTGTC----TGGG-T-----GGAG--CT-ATT---GG-A-GTTAATT------CC-A-----------A-ACA------------------T------AATT------------T-----A-CT--------------CTG---T--------------------------CA---------------------TT------------TAATTTCTGATATCC-------------TGG---C--TGTCCTCA--GTGTTTAA-AGTTAT----------C--AA-AA-CAAGTCATTT-GAA---CCC--------------------------------------------CAT--------GC--C-ATAA-TCTGA-AAAGGG--atttt
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AAATCCTTT-GAAACTCCATAC-AT-AA-ACA-CA-T---T---TCCT-------C-----CCTAT--------AT--C-ATGA-TCTGA-AAAG---------------------------------ACCTT---G---CCTTTG-T----TAC---G-T---CA----AACACAAA-CAA--GA------A-------AAACC----TTA---------A-C-CATTTCA-C--A-A-TGCA--TGTACATGTAATT---AC-T---A-AAAA------AA-AAT-----A
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TT-A--ATAC----G--------TACATCGATGTCGTTGGTA--------------AGATTTCTTATAAGATCTATGCACGAATCAGTCA-AA--GGT-AA-ATATTG----A--T-TGTAT-AAA--GA-----------G-GAGGGAAGAAGTGAAAT-C-TAT--GTCAAC---A-AG-GTGATCTAG-C--TGC-----------AATCC-AAAC-ATC-ACAG------Attactgtatt
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             a-CT---T--G-------A-TA-CA-GG----A-AAT----TG--AAA-T---G---ACAGA-T--TGAATTA-G-C-TATGTG-TT-GAAAT-TCAC-TTGA-GAA--G--CTCCA--C-CC-T-T--CCC----CCTCTAT---AAAACTAGCAGCCCT-A--GC-CCCTCG--CTA-TTCTTGGAATTTTG--TTC-A-A-A-CTG
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              gt-T----TG--AAA-T---G---ACAGA-T-GTACATA-------A-ATG-TC-CAA---TCCC-TT--------G--C-ACA--C-TT-T-AA-C-------------------ACAAGAGG-TCC-A--AT-TCTTTT--CCATTT-TTGGA----GC--TCC-A-ACA-TTGGactag
gi|27                         :                                                                                                                                                                         CTAGGTGTGAA-AC--GCT--GACT------CTGGA-ACC--TT-C-AA-TTTTG-ACG-TC-CAAA--GTG-GA-GAGA--GGCGTGGGGTC----TCTT-GTCATAACG-AGATTGTC----TGGG-T-----GGAG--CT-ATT---GG-AGGTTAATT------TCAG-----------A-Aatggttgtgggaatgtggcttgaatgtaaaattatccaaacaaa
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   -AATTTCA-CTTTTG-CAAA-----ATATTT-CTTGTGATCGCAGTTTGCAATTGAGGGA---AGACG-TG-----T-TT-T-T-----ATTA-A--TTAC---TG--TA----CATATCA-TGTCGac
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        aaaaaaaaaaaa--------------TT-------------GT-CAG-ATTT--TAC--A-CAC--AAAGAATTC--CAAATATCA--------------AACATATG-GTT-TGGA-TT-TTTTT-TT-TCTTTTAT--------TTTATT--A-AAAG--------CATGCATGCACA-AGAATG-T-TAT---aaaaattttcaaa
gi|3                          :                                                                                                                                                                         CTTGGTGTAAA-AT--GCT--GACTAT---TCTGGA-GCTCGTCAC-AA-TTTGGGACG-TC-CAAA--GTG-GA-GAGA--GG-GTGGA-TC----T-TT-GTCATAG-G-AGATTGTC----TGG--T-----GGAGGAC--ATT---GG-A-GTTAATT------TCAA-----------ATACA------------------T------AATT------------T-----A-CT--------------CTG---T--------------------------C----------------------CT------------CAGTGT------TC--------------TGG---C--TATC---A--ACA--TAA-AGTTAT-C-A--A-A-C--AA-AA-CAAGTCATTT-GAAGCTCCCTAT-AT-AA-ACT-AA-T---T---CCCC---AA--------CCCAT--------G---C-ATAA-TCTGA-AAAGGG--C-A-GAA-G-C------------CA-G-CACCATAA-----CC--TG-T----TAC---TGT---CA----AACAAAAA-CAA--AACACACTA-------AAA------TTA---A--T-CA-C-CATTTCA-C--A-A-TA-A--T-------CAATT-G-AT-T-----AAAG------AA-GAT-----AAAG---G-----TTT-AT-TAACA-T-AAACT-AATTTCAGCTTT-G-AAAA-----ATATTT-CTGCTGATCGCAGTTTG--A-----AGA---AGACGGTG-----T-TT-G-T-----ATTT-A--ATAC---TG-ATC----TATATC--TGTCGTCGA-A--------------A----TCCTAT------TA---------CAGTCA-AA--GGT-AA-TT-TTG----A--T-T--AT-AAA-TGAT----------G-GAGGGA-GAA-TGAATT-T-TAA--GTCAAC---A-AG-GTGATA-AG-C--TAT-------AC-AA--TCAAAAC-ATC-ACAG------ACT--TTGT---AAA---TTCACTCCAC-TCAGCTT---T------------------------A---CAGGACATT-TC-TT--------G--------------TT-------------GT-CAT-GTTT--TAC--A-TAT--A-------C--CTGGTA-CATGGA----------AACTTGTG-GATGTGGA-TT-CTTTTCTTGTATTTCATAATTGTCATTTATTTAA-TAAATTT-CATTCATGCATATATA-AG------------------------T--GAG---TTTA-TTGT-T----G-TCA--CCTTGTG-GTTGATGT---------AAAGGCATTAGTGT-GCGTG--A--TGAAATT-----GG-G--GG-AAA-TCTTCAACATCA--GCTTAGTAAA-AT--A-----ACACT--------CCTGAC---AGATGCATATGCG-T-AC-TG-AGCAA---T--GT-GTCAATTTGTAAATTTTGA----TCTC-T-CATCACCACA--TTGGACGGGCTGCTGTACTGC----TAT----A---------------------A----------AATTTATTGGACAGCA-ATAGAGA--ACCAGT-C-TA-CC---T--A-------G-TA-CA-GG----A-A-T----TG--AAA-T---G---ACAGA-T-ATAAATAA-G-T-TA-GTG-TT-GAAAT-TCAT-TTCT-GAA--G--CTCCA--C-CCAT-GA-C-A----TATCT-T---ATGACAAGA-GCTCC----CC-CTCTCT--CCA-CT-TTGGA----GG--TCC-A-A-A-TTGGAG-GCTC-C-AGAGT-CA--GC-AT---TTTACACCAAGC
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              -CT---T--G-------A-TA-CA-GG----A-AAT----TG--AAA-T---G---ACAAA-TCAAAAATTG-GAT-CA-TTG-CT-GAAAT-TAAC-TCCA-GAA--G--CACCA--C-CC-T----------------------TG---AGTAGCCCC-A--CC-C-CTCT--CCA-AT-T
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               t-TAT--GTCAAC---A-CG-GTGATC-AG-C--TA--------AT-AAACCCAAAAC-ATC-ACAG------ACT-AGAGT---TCATCCTTCACTCCAC-T
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        -T-GA-CAA----TCTCT-T---ATGACAAGAGGCTCC-ATCCT-CTCTCT--CCA-CT-TTGGA----GG--TCC-A-A-A-TTGGtaaaggt
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ca----TAC---T-TT--CA----AACAAAAA-CAA--AACACACTA-------AAA------TTA---A--A-CA-C-CATTTCA-C--A-A-TA-C--T-------TAATT-G-AT-T---
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             C-A--CC-CTCTCT--CCA--T-TTGGA----GG--TCCAA-A-A-GTGGAG-GGTC-C-AGAGT-CA--CC-AT---TTTACAGCAAG
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    AAGAGAC-CC-A--CT-CCCTCA--CGA-TT-TTGG--------------------TG-----TTC-C-ATGAT-CA--GC-AT---TTTACACCAAGC
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    aaTCTCT--CCA-CT-TTGGG----CA--TCC-A-A-A-GTGGAG-ACTT-C-AGAGT-CA--GC-AT---TTTACACCAAGCct
gi|39                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             gCA-CT-TTGGA----CG--TCC-A-A-A-TTGGAG-GCTC-C---AGT-CA--GC-AT---TTTACACCAAGC
gi|4                          :                                                                                                                                                                         CTTGGTGTAAA-AT--GCT--GACA-----CCTGGATGCC--TC-CCAA-GTTGG-ACGGTC-CAAAAGGTG-GA-GAGA--GG-GTGG-GCT----TCTTTGTCATAA-G-AGATTGTA-----GGG-T-----GGAG--CC-ATT---GGGA-ATTAATT------TCAA-----------A-ACA------------------T------AATTACTCTCGCCATTT-----AATT--------------CTGAC-T--------------------------C----------------------CTGGCTGTATCGATCAGTGT------TTG-------------TGGG--C--TA-----A--ACA--TAA-AGTTAT-C-A--A-A-C--AAGAA-CAAGTCCTTT-GAAGCTCCCTAT-AT-AA-ACT-AA-T---TGTCCTCC---AAAAC-----CCCAT--------C---C-ATAT-TATCG-AAGGGG--C-ACGAA-GGC------------CA-GGCACCATTA-TTTTCG--TG-T----TAC---T-TTTTCA----AACTAAAA-CAATAAACACA-TACGAGAGGGAA------GTA---AGATACAGC-CATTTCA-C--ATA-TG-A--A-------AAATT-GTAT-T---A-AAAG------
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     gA-TGAAAAAT-TGT--ATTAA----A-AG-CTG----------TAT-------GC-AAATCCAAAAC-ATC-ACAG------A------------------TCACTCCAT-TCAGCTT---TT-TA---CCC--CTAT-A--T-TTA---CAGGGCATT-TTATT--------A--------------TT-------------AT-TTT-GTTT--Tctgtatgcaaatccaaaacatcacagatcactccattcagctttttacccctatatttacagggcattttattattattttgttttcttgtttgccattatttcataattttcattcatgcatatataagaatgttatcagaagtgagatttttgttgtcatcccgtgtgtttgatagtgcatgatgaaattgggggaaaatcttcaacaccagctcagtaaataacactcctgacagatgctgtcacgtgaagaactagtgcaaatctcttcacactatacttggactagcctgtactgcttaatctgctaccggatttattggcagcagagaacaccaagttacctaccgtagggtacaggaacattgtgaaatgtgaacagagtataataagtgaagtgtttgaaatatcacctctgaagctctccgacccctgacaaattttcacttatgacaataggctcctacctttctctccctctttggacgtttccacatggagaactccaggtcaggcattttacacca
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             gcttggtgtaaaatgctgacacctggatgcctcccaagttggacggtccaaaaggtggagagagggtgggcttctttgtcataagagattgtagggtggagccattgggaattaatttcaaaacataattactctcgccatttaattctgactcctggctgtatcgatcagtgtttgtgggctaaacataaagttatcaaacaagaacaagtcctttgaagctccctatataaactaattgtcctccaaaaccccatccatattatcgaaggggcacgaaggccaggcaccattattttcgtgttactttttcaaactaaaacaataaacacatacgagagggaagtaagatacagccatttcacatA-TT-ATTTTGTT-T-TCTTGT--TTGCCATT-ATTTCA-TAATTTT-CATTCATGCATATATA-AGAATG-T-TATC--A-G--AA---GT--GAGA--TTT--TTGT-T----G-TCATCCCGTGTG-TTTG--AT---------A-----------GT-GCATG--A--TGAAATT-----GG-G--GGAAAA-TCTTCAACACCA--GCTCAGT-AA-AT--A-----ACACT--------CCTGAC---AGATGC-----TG-TCACGTG-AAGAA---CTAGT-G-CAA-------------A----TCTCTT-CA-CACTATAC-TTGGACTAGC--CTGTACTGC----T-T----A---------------------ATCTGCTACCGGATTTATTG----GCA-GCAGAGAACACCAAG-T-TA-CC---T--ACCGTAGGG-TA-CA-GG----A-A-CATTGTG--AAA-T---GTGAACAGAGT-AT-AATAA-G-TGAA-GTGTTT-GAAATATCAC-CTCT-GAA--GCTCTCCGACC-CC-T-GA-CAAATTTTCACT-T---ATGACAATAGGCTCCTA--CCTTTCTCT--CCCTCT-TTGGA----CGTTTCC-A-C-A--TGGAGAACTC-C-AG-GT-CAG-GC-AT---TTTACACCActtgtttgccattatttcataattttcattcatgcatatataagaatgttatcagaagtgagatttttgttgtcatcccgtgtgtttgatagtgcatgatgaaattgggggaaaatcttcaacaccagctcagtaaataacactcctgacagatgctgtcacgtgaagaactagtgcaaatctcttcacactatacttggactagcctgtactgcttaatctgctaccggatttattggcagcagagaacaccaagttacctaccgtagggtacaggaacattgtgaaatgtgaacagagtataataagtgaagtgtttgaaatatcacctctgaagctctccgacccctgacaaattttcacttatgacaataggctcctacctttctctccctctttggacgtttccacatggagaactccaggtcaggcattttacacca
gi|5                          :                                                                                                                                                                                             gcttggtgtaaaatgctgacacctggatgcctcccaagttggacggtccaaaaggtggagagagggtgggcttctttgtcataagagattgtagggtggagccattgggaattaatttcaaaacataattactctcgccatttaattctgactcctggctgtatcgatcagtgtttgtgggctaaacataaagttatcaaacaagaacaagtcctttgaagctccctatataaactaattgtcctccaaaaccccatccatattatcgaaggggcacgaaggccaggcaccattattttcgtgttactttttcaaactaaaacaataaacacatacgagagggaagtaagatacagccatttcacatatgaaaaattgtattaaaagctgtatgcaaatccaaaacatcacagatcactccattcagctttttacccctatatttacagggcattttatt---C-ATAA-TCTGA-AAAGGG--C-A-GAA-GGT------------CA-G-CACCATAA-A---CC--TA-T----TAC-----------------------------AATGTACT------------------TC---A--T-CA-C-CATTTCA-C--A-A-TA-A------------ATT-G-AT-T---G-AAAG------AAAGAT-----AAAG---C--------------------------AATTTCA--TTT-GCAAAA-----ATATTT-CTGCTGATCGCAGTTTGCAA-----GGA---ATACG-TG-----T-TT-A-TT----ATTT-A--ATAC---TGTAT-------TATCG-TGTCGTCGA-AGATTCTCTTAAAGAAG---TCCTATGCAGA-TG---------CAGTCA-AA--GGTTAA-TT-TTG----AC-T-T--AT-AAAATAAT----------G-GAAGGA-GAA-TGAAAT-T-TATATGTCAAC---A-GG-ATGATC-AG-C--TA--------AC-AAATCCAAAAC-ATC-ACAG------ACT-AGCGTTG-AAA---TGCACTCCAC-TCAGCTT---TT-TA---CCC--A-AG-A--T-TTA---CAGGACATG-TTATTATCATTTTG--------------TT-------------TT-CTT-GTTT--TAC--A-TAT--ATA-----C--CTGGTA-CATGAA-----G----AACTTGTG-GAT-TGGA-T------------AT--CATAATTGTCACTTATTTCA-TAAATTT-CATTCATGCATATATA-AGAATG-T-TATC--A-G--AA---GT--GAG---TTT--TTGT-T----G-TCATCCCCTGTG-TTTGATA----------------------GT-GCATG--A--TGAAATT-----GA-G--GG-AAAATCTTGAACATCA--GCTCAGTAAA--T--A-----ACACT--------CCTGAC---AGATGC-----TG-T-TC-TG-AGCAA---T--GT-GTCAATTTGCAAATTGTGA----TCTC-T-CATCACCACA--TTGGACTGGCT-CTGTACTGC----TAT----------------------------------------CTGCT--ACAGCA--CATA----ACCAGT-C-TA-CC---TTAG-------G-TA-CA-GG----A-AAT----TG--AAA-T---G---ACAGA-T-AT-AGTAA-G-TGAA-GTG-TT-GAAAT-TCAC-TTCT-GAA--G--CTCCA--C-CC-T-GA-CAA----TCTCT-T---ATGACAAGAGGCTCC-A--CC-CTCTCT--CCA-CT-TTGGC----CG--TCC-A-A-A-TTGGAG-GCTC-C-CGAGT-CA--GC-AT---TTTACGCTAA
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                   atac-CAAA--GTACAA-GTGAATGG-GTGGGGCT----TCTT-GTCATAA-G-A--TTGTC----AGGG-T-----GGAG--CC-ATT---GG-A-GTTAATT------TCAA-----------A-ACA------------------T------AATT------------T-----A-CTCTGTCAATTAATTTCTGACAT--------------------------C----------------------CT------------GGCTGT------TCGGATCATGTTTGTTTGG---C--TA-----A--ACA--TAATAGTT-T-C-A--A-AAC--AA-AAACAAGTCCTTT-GAAGCTCCCTAT-AT-AA-ACT-AC-T---T---TCCC---CAA-C-----CCCAT--------A---CCATAA-TCTGA-AAAGGG--C-A-GAA-GGC------------CA-G-CACCATAA-A---TC--TG-T----TAC---T-T---CA----AACAAAAA-CAA--AACACACTA-------AA--------TA---A--T-CA-C-CATTTCA-C--A-A--A-A--T-------TAAAT-G-AT-T---G-AAAGA-----AA-GAT-----AAAG---C-----TGT-AT-GA-AA-TCCAA---AACATCA-C
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               atttgttggtagg---A-AG-ATAA---AG-C--TGT-------ATGAAATCCAAAAC-ATC-ACAA------A------------------TCACTCCACCTCAGCTT---TT-TA---CCC--CTAT-A--T-TTA---CAGGGCATT-TTATT--------A--------------TT-------------AT-TTT-GTTT--Taaatcactccacctcagctttttacccctatatttacagggcattttattattattttgttttcttgtttgccattatttcataattttcattcattcatatataagaatgttataagaagtgagatttttttgtcatcccgtgtgtttgatagtgcatgatgaaattgggggaaatcttgaacaataacactcctgatagatgctgtactgagcaatatgtcaatttgtaaatttagatctctcaccactatacttggactggctctgtactgctatcgctacctcagatttattggacagcacagaaccagtctacctaggtacaggaacttgaaatgtcagatataataagtgaagtgttgaaattcacttctgaagctccaccctgacaatctcttatgacaaaaggctccaccctctctccacttggacgtccaaattggagactacagagtccagcattttacaccaagc
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     atttgttggtaggcaaagtacaagtgaatgggtggggcttcttgtcataagattgtcagggtggagccattggagttaatttcaaaacataatttactctgtcaattaatttctgacatcctggctgttcggatcatgtttgtttggctaaacataatagtttcaaaacaaaaacaagtcctttgaagctccctatataaactactttccccaaccccataccataatctgaaaagggcagaaggccagcaccataaatctgttacttcaaacaaaaacaaaacacactaaataatcaccatttcacaaaattaaatgattgaaagaA-TT-ATTTTGTT-T-TCTTGT--TTGCCATT-ATTTCA-TAATTTT-CATTCATTCATATATA-AGAATG-T-TAT---AAG--AA---GT--GAG---ATT--TTTT-T----G-TCATCCCGTGTG-TTTGATA----------------------GT-GCATG--A--TGAAATT-----GG-G--GG-AAA-TCTTGAACA----------------AT--A-----ACACT--------CCTGAT---AGATGC-----TG-T-AC-TG-AGCAA---T--AT-GTCAATTTGTAAATTTAGA----TCTC-T-CACCACTATAC-TTGGACTGGCT-CTGTACTGC----TATCGCTACCTC-----------------A----------GATTTATTGGACAGCA--CAGA----ACCAGT-C-TA-CC---T--A-------GGTA-CA-GG----A-ACT----TG--AAA-T---G---TCAGA-T-ATAA-TAA-G-T-GAAGTG-TT-GAAAT-TCAC-TTCT-GAA--G--CTCCA--C-CC-T-GA-CAA----TCTCT-T---ATGACAAAAGGCTCC-A--CC-CTCTCT--CCA-C--TTGGA----CG--TCC-A-A-A-TTGGAG-ACTA-C-AGAGTCCA--GC-AT---TTTACACCAAGCcttgtttgccattatttcataattttcattcattcatatataagaatgttataagaagtgagatttttttgtcatcccgtgtgtttgatagtgcatgatgaaattgggggaaatcttgaacaataacactcctgatagatgctgtactgagcaatatgtcaatttgtaaatttagatctctcaccactatacttggactggctctgtactgctatcgctacctcagatttattggacagcacagaaccagtctacctaggtacaggaacttgaaatgtcagatataataagtgaagtgttgaaattcacttctgaagctccaccctgacaatctcttatgacaaaaggctccaccctctctccacttggacgtccaaattggagactacagagtccagcattttacaccaagc
gi|7                          :                                                                                                                                                   atttgttggtaggcaaagtacaagtgaatgggtggggcttcttgtcataagattgtcagggtggagccattggagttaatttcaaaacataatttactctgtcaattaatttctgacatcctggctgttcggatcatgtttgtttggctaaacataatagtttcaaaacaaaaacaagtcctttgaagctccctatataaactactttccccaaccccataccataatctgaaaagggcagaaggccagcaccataaatctgttacttcaaacaaaaacaaaacacactaaataatcaccatttcacaaaattaaatgattgaaagaaagataaagctgtatgaaatccaaaacatcacaaatcactccacctcagctttttacccctatatttacagggcattttatt-A--A-A-C--AC-AA-AAGGTCCTTTTGAAGCTCCCTATAATAAA-ACT-AA-TTGGT---CCCCCCAAAA-C-----CCCATACCACCCCA---C-ATAATTCTGAGAAAAGGCCC-A-GAA-GGCCCCCCACCGCCGCA-G-CACC-TAA-A---TC--TGTT----TACTTTT-T---CAAAGCAACAAAAACCAA--AACACTATA-------AAAAAAAATTTATTTA--T-CA-C-CATTTCA-CAAA-A-TA-ATTT-------TAAAT-G-AT-TGTGG-AAAGAAAAGAAA-GAT-----AAAG---C-----TGCAAT-CG-TA-ATTAGCA-AATTCCA-
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TCACAA--AAT-AA-TT-TTA----A-------AT-GAT-TG-T----------G-GAAAGA-AAA--GAAAG-A-TAA--AGCTGC---A-ATCGTAATT-AG-C---------------AAATTCCAAACTATC-AC----------------C---AGA---TTCACACCAT-GCAGCTTATTTT-TA---CCC--C-T--A--TATTA---CAGGCCATTATCATT--------A--------------TT-------------aactatcaccagattcacaccatgcagcttatttttacccctatattacaggccattatcattattttttggttctgttgccgattatttctaattttcattcatgcatatataagaatatgtatctcaggtaagttggagattttgttttgtgtattcccgtgtttctgattttagtcgcatgaagtgaaattggcgggaaactttgaacttcaaggctcataaatacactcctgattttagatgccggtacggcaaatatatgtcaatttgtaaattttgaaatatctcttcaccactataatttggactggctctgtactgctacatctgcttacggtgctacctcaaaatttatttgaaagcaccagaaccagtcctactaggtacaagggaaaattgcaaaatgtcagatatgataacgtgaagtgttgaaattacttctgaagctccaccctgaacaatctctttatatgacaaaaggctccaccttctctccactttcgacgtccaaattggggactccagagtcagcattttacaccaag
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        aaacacaaaaggtccttttgaagctccctataataaaactaattggtccccccaaaaccccataccaccccacataattctgagaaaaggcccagaaggccccccaccgccgcagcacctaaatctgtttactttttcaaagcaacaaaaaccaaaacactataaaaaaaaatttatttatcaccattTTGCCGATTATTTC--TAATTTT-CATTCATGCATATATA-AGAATA-TGTATCTCA-GGTAA---GTTGGAG---ATT--TTGT-TTTGTG-TATTCCCGTGTT-TCTGATTTT--------A-----------GTCGCATG--AAGTGAAATT-----GGCG--GG-AAA-CTTTGAACTTCAAGGCTCA-TAAA--T--A------CACT--------CCTGATTTTAGATGC-----CGGT-AC----GGCAAATAT--AT-GTCAATTTGTAAATTTTGAAATATCTC-TTCACCACTATAATTTGGACTGGCT-CTGTACTGC----TAC----ATCTGCTTACGGTGCTACCTCAA----------AATTTATTTGAAAGCA-CCAGA----ACCAGT-CCTA-CT---A--G-------G-TA-CA-AGGGAAA-A-T----TGCAAAA-T---G---TCAGA-T-ATGA-TAACG-T-GAAGTG-TT-GAAAT-T-AC-TTCT-GAA--G--CTCCA--C-CC-T-GAACAA----TCTCT-TTATATGACAAAAGGCTCC-A--CC-TTCTCT--CCA-CT-TTCGA----CG--TCC-A-A-A-TTGGGG-ACTC-C-AGAGT-CA--GC-AT---TTTACACCAAGttttggttctgttgccgattatttctaattttcattcatgcatatataagaatatgtatctcaggtaagttggagattttgttttgtgtattcccgtgtttctgattttagtcgcatgaagtgaaattggcgggaaactttgaacttcaaggctcataaatacactcctgattttagatgccggtacggcaaatatatgtcaatttgtaaattttgaaatatctcttcaccactataatttggactggctctgtactgctacatctgcttacggtgctacctcaaaatttatttgaaagcaccagaaccagtcctactaggtacaagggaaaattgcaaaatgtcagatatgataacgtgaagtgttgaaattacttctgaagctccaccctgaacaatctctttatatgacaaaaggctccaccttctctccactttcgacgtccaaattggggactccagagtcagcattttacaccaag
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        aaacacaaaaggtccttttgaagctccctataataaaactaattggtccccccaaaaccccataccaccccacataattctgagaaaaggcccagaaggccccccaccgccgcagcacctaaatctgtttactttttcaaagcaacaaaaaccaaaacactataaaaaaaaatttatttatcaccatttcacaaaataattttaaatgattgtggaaagaaaagaaagataaagctgcaatcgtaattagcaaattccaaactatcaccagattcacaccatgcagcttatttttacccctatattacaggccattatcattattttttggttctg-AAA-TAAA----------A-GAGAAA-GAA-TGACCT-T-TATATGTCAAC---A-AG-GTGATC-AG-C--TACATATGTAAC-AAATCCAAAAC-ACC-ACAG------A
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    T-TTATT--------G--------------TT-------------AT-CAT-GAAT--TCC--T-TAT--A-------T--CT-------TAAA-----A----AACTTGT----T-TGGA-TT--------T-TATTT----ATT-----TTATT--G-GAAA--------CATGCA-AT-TACAGAATGCT-TAT---A-A--AAAG-GT--GGG---TTT--TTTTGT----G-CCATCCC-TGTGATTTGATA----------------------GT-GCATG--AA-TGGA--T-----AG-GTAGG-GAA-TCTTGAAC-TCAA-GCTCAGTAAATATTAG-----ATACTTAAAAATCCCTGAC---AGATGC-----TG-T-AC-TGGAGCAA---T--GGAGTCAGTATGTGAATTC-GA----TCTC-T-CATCACCACAA-TGGGACTGGCT-CTGTACTGCATCCTAT----A---------------------T----------AA------GGACAGCA-A--GAAA--AC-ATT-C-TA-CTATGT--AC------G-TA-TACGG----ACA-A----TG--AAA-T---G---ACAGA-T-GCAA-TAA-G-T-TA-AGC-TT-GAAAT---AC-TTCTTGAA--G--CTACA--C-CT-TTGA-CAA----TCTCT-T---A-GACAAGAGGT-------CC-CTCTCT--CCA-TT-TTAG------G--TCT-A-A-T-TTGGAA-GCTC-C-AGAGT-C--------------ACACCAAGCccagggtgcaaatgcaaatttgaaaatttgacgcctctatatatttaattacgtctgtattgcaatttctgcacttgtcttatctaatacaatatgacagaaaaaataattgatctctgtcggtgttaaaatagatgaaaggggagaactcagttttctgcatgaaactagaatgtggttatcattcactaacgttcacatgttaatgtaaagatttctcactgcagtatgtcaggtatcagctgtatcctgcttaacggacttctaaaaacaatgagcatgacgagttaccaatttttatttcatctcctttgtaattgagagtattctaacattcttttcattttctcacgtcctaatttgatagttcacctcaatgagtctgactagtcagtttgattattcaaagtcataa


blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                    .  CT   TT    CTAGAT     T   CG  A C  C     G   G  .    AG   CA A    AT  C    GG  TCAA    T       C G        T       C .        GA  .   .    G G       ACTCTG    .           T   TAATTTTACTCTGTCATTT          ACTCTCGCCATTTAATTCTGACTCCTGGCTGTATCGAT                                                                          TCGGATCATGTTTGTT         ATC CT  TCCTC CA   TT   T      C A TT G A CA  G  A          T         TATA  A  .   .  T TGG GTCC   CCAA  A .         ACCACCCCA    C    T     G      CC C C   A   CCCCCACCGCCG  C G        TTTT   TT  T .      TTTTT      AAGC        A   TA        ACGAGAGGGAAGTAAGATA           G T       A AA T .  G TGTACATG       A T  G GTGG    GAAAAGA  T   AATTA    .   GAATGCTTATGTACAAAAAACGG      T   G    T CA   GATGG      G                    TTGAG   TAA     G  GGCCG G  GTGAGTG      G CT    TATCACAA          CGA   C     T GATTCTCTTAAAGAAG         AAGATCTATGCACGAAT      C  AC   T  .  A   AAGTGT        G   ATAAT           .      AG  GT     AT    AT      TGA .  T      T  G .  ACATATGTA  G   T       T   .    ACTCAGCATTTGAAA                   C       ATT  T  GCT   CAAG    GA A   .           A  A  ATTTTGTTTTCTTGTTT                       .   T    .    AT A   AT AAGAATT ATCT    T      CCAGAG            G   G    T  TC    C  G A   C  A   ATC       T  G    T  TCA              C  A   TG    CTCAGGTAA      TG   GTG   AC    G TTGT G       T    A       TAAAGGCATTAGT           C  A  GG AG       CGGGG  C TA  G   A            AG          TA TA CATAG     TAAAAATC      TTT      ATATG  G C  G  G     ATA TA  A                T  AATA    T T          AT           G         ATCC   ATCTGCTTACGGTGCTACCTCAA                             AGCAGAGAAC       T C  T  ATG ACCGTAGGG     C  C  GGAA C CATTG   AT   A ACC TGA     G C  T A   CGTGAA     T  G     A    T    T   TG CT     AC A  A T  A A ATTT     A TAT               T TC  T      CC   T  C    AATTTT TT   A T C T      A    A A     C  G   A  GTG
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                    .  .    .     ATT        .   .   . .  .     .   .  .    .    G  .    .   .    AA  .       .       . .        A       . .        .   .   .    . .       .         .           .   T                            TACTCTGTGATTTAATTTCTAACATCCTGGCTGTCCT                                                                           CTGATATCC                G   .   TC    C    .    .      . . .  . . A   .  A          .         AAT   .  .   .  T .   T      A     . .         GC           C    .     .      .  . .   .   .             . .        CA     .   . .      TTTTT      .           C   .         AAAAAAAAATTTATTTAT            . .       . .  . .  C TTT            . .  . GT      GA       A   .        .   TGCAATCGTAATTAGCA            T   .    . CA   .          .                    .       TTG     .  .     .  AAT          . .     GTGTGAC           CA    C     . AGATT                    GCAGATG                .  .    .  .  .   ATTGT         .   ATAAT           .      G   T      T     AT      .   .  C      .  . .  TT         .   T       .   .    GGTGGTACTAGCGTA                   .       .    G  .     CTAT    .  .   .           .  A  ATTTTGTTTTTTGTTT                        .   .    .    .  .   .  GAATT   CT      .      AGTTA             A   .    T  C     C  . A   C  A   GTC       T  .    T  CT               .  A   CT    ACAAACT        .    A     A     . .    .       T    .       TTAAGCATAGA             .  A  .  A        .      . .   A   .            A           A  .  .         .             .        .      . .  .  .     .   .   .                T  .       . .          C            .         .      AATCTGCTACCG                                        AATAGAGA         . .  .  .   AAGG          .  .  .    . AT      CA   . .   .       . .  G A   GCTAT      .  .     .    .    .   .  .      .  .  A .  . A .        . .                 . .   .      .    T  .    CC     .    . . . .      .    . .     C  .   .  .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                    .  .    .     T          .   .   . .  .     .   .  .    .    G  .    .   .    AG  .       .       . .        T       . .        .   .   .    . .       .         .           .   T                            TATTTTGTCTTTAATTTTACATCCTTTATCCCC                                                                               TTG                      .   .   T     .    .    .      . . .  . . .   .  .          .         TAC   .  .   .  . .   C      A     . .         GC           C    .     .      .  . .   .   .             . .        A      .   . .      TGT        .           .   .         GAAAATAAT                     . .       . .  . .  . TG             . .  . G       GA       .   .        .   TTTATTACATTTAAAC             T   .    . A    .          .                    .       .       .  .     .  ATT          . .     TGTAC             CA    C     . AG                       TA                     .  .    .  .  .   ATTT          .   TGAT            .      G   T      T     .       .   .  .      .  . .  GC         .   T       .   .    ACTAGCGTTTGAAA                    .       .    T  .     CTAT    .  .   .           .  T  ATCATTTTGTT                             .   .    .    .  .   .  TA      CT      .      G                 G   .    .  T     C  . A   C  A   GTC       T  .    T  CA               .  A   C     AAAAAG         .    .     .     . .    .       T    .       TTA                     .  G  .  .        .      . .   .   .            .           A  .  .         .             .        .      . .  .  .     .   .   .                T  .       . .          C            .         .      CGCTACCTCA                                          ACACGA           . .  .  .   TAGG          .  .  .    . AT      .    . .   .       . .  A A   GATCA      .  .     .    .    .   .  .      .  .  A .  . C .        . .                 . .   .      .    .  .    AG     .    . . . .      .    . .     .  .   .  .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                    .  .    .     T          .   .   . .  .     .   .  .    .    A  .    .   .    AG  .       .       . .        T       . .        .   .   .    . .       .         .           .   T                            TACTCTGTCAATTAATTTCTGACATCCT                                                                                    TCG                      .   .   T     .    .    .      . . .  . . .   .  .          .         TAT   .  .   .  . .   C      A     . .         AC           .    .     .      .  . .   .   .             . .        A      .   . .      TTT        .           .   .         AAATTTTAT                     . .       . .  . .  . T              . .  . G       GA       .   .        .   TTTTTTACATTTAGAC             T   .    . A    .          .                    .       .       .  .     .  AT           . .     TGATC             CA    C     . GG                       TA                     .  .    .  .  .   ACTT          .   TGAT            .      T   T      C     .       .   .  .      .  . .  AT         .   C       .   .    ACTAGAGTTCATCC                    .       .    T  .     AAG     .  .   .           .  A  GTT                                     .   .    .    .  .   .  .       CA      .      G                 G   .    .  A     C  . A   C  A   GCC       T  .    T  CA               .  A   T     TAGAA          .    .     .     . .    .       G    .       TG                      .  A  .  .        .      . .   .   .            .           A  .  .         .             .        .      . .  .  .     .   .   .                A  .       . .          A            .         .      CA                                                  ACAAGA           . .  .  .   AGG           .  .  .    . AT      .    . .   .       . .  A A   GTGAA      .  .     .    .    .   .  .      .  .  . .  . A .        . .                 . .   .      .    .  .    AG     .    . . . .      .    . .     .  .   .  .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                    .  .    .     C          .   .   . .  .     .   .  .    .    G  .    .   .    AG  .       .       . .        A       . .        .   .   .    . .       .         .           .   T                            TCTAATATCCTGTCTCGTCCT                                                                                           TTG                      .   .   .     .    .    .      . . .  . . .   .  .          .         TAT   .  .   .  . .   C      A     . .         GC           .    .     .      .  . .   .   .             . .        A      .   . .      TT         .           .   .         AAAATTAAA                     . .       . .  . .  . C              . .  . G       G        .   .        .   TTTATTAACATAAACT             T   .    . C    .          .                    .       .       .  .     .  TT           . .     TGTAT             CG    C     . A                        TA                     .  .    .  .  .   ATT           .   TAAA            .      G   T      T     .       .   .  .      .  . .  AT         .   T       .   .    ACTAGCGTTGAAA                     .       .    T  .     CA      .  .   .           .  A  GTT                                     .   .    .    .  .   .  .       CT      .      G                 G   .    .  C     C  . A   T  A   GTC       T  .    T  CA               .  A   T     CAGAA          .    .     .     . .    .       C    .       TA                      .  A  .  .        .      . .   .   .            .           A  .  .         .             .        .      . .  .  .     .   .   .                T  .       . .          .            .         .      AA                                                  ACCAGA           . .  .  .   AGG           .  .  .    . AT      .    . .   .       . .  A A   GTGAA      .  .     .    .    .   .  .      .  .  . .  . A .        . .                 . .   .      .    .  .    AG     .    . . . .      .    . .     .  .   .  .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                    .  .    .     .          .   .   . .  .     .   .  .    .    G  .    .   .    AG  .       .       . .        T       . .        .   .   .    . .       .         .           .   T                            TCTGATATCCTGGCTGTCCT                                                                                            TTG                      .   .   .     .    .    .      . . .  . . .   .  .          .         TAC   .  .   .  . .   T      A     . .         AT           .    .     .      .  . .   .   .             . .        A      .   . .      TT         .           .   .         AAAACCTTA                     . .       . .  . .  . T              . .  . G       A        .   .        .   TGTATGAAATCCAA               T   .    . C    .          .                    .       .       .  .     .  GT           . .     TGTA              A     C     . .                                               .  .    .  .  .   A             .   TGT             .      G   T      T     .       .   .  .      .  . .  GT         .   T       .   .    ACTTTGTAAA                        .       .    T  .     AA      .  .   .           .  A  ATT                                     .   .    .    .  .   .  .       CT      .      G                 G   .    .  T     G  . C   C  A   GCC       T  .    T  CA               .  A   T     CAGAA          .    .     .     . .    .       G    .       .                       .  A  .  .        .      . .   .   .            .           .  .  .         .             .        .      . .  .  .     .   .   .                .  .       . .          .            .         .      AT                                                  AAGAAA           . .  .  .   ACG           .  .  .    . CT      .    . .   .       . .  A A   GTGAA      .  .     .    .    .   .  .      .  .  . .  . A .        . .                 . .   .      .    .  .    AG     .    . . . .      .    . .     .  .   .  .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                    .  .    .     .          .   .   . .  .     .   .  .    .    G  .    .   .    GG  .       .       . .        T       . .        .   .   .    . .       .         .           .   T                            TATTCTGTCATTT                                                                                                   TCG                      .   .   .     .    .    .      . . .  . . .   .  .          .         TAT   .  .   .  . .   T      A     . .         A            .    .     .      .  . .   .   .             . .        A      .   . .      TT         .           .   .         AAAATTAAT                     . .       . .  . .  . T              . .  . A       G        .   .        .   TTTATACATTTAC                A   .    . A    .          .                    .       .       .  .                     . .     G                 C     .                                                                                       .   GA              .      A   T      A     .       .   .  .      .  . .  T          .   T       .   .    CAGA                              .       .    .  .     CT      .  .   .           .  A  ATT                                     .   .    .    .  .   .  .       CT      .      A                 .   .    .  C     G  . A   T  .   GCC       T  .    T  CA               .  A   T     AAGAA          .    .     .     . .    .       G    .       .                       .  A  .  .        .      . .   .   .            .           .  .  .         .             .        .      . .  .  .     .   .   .                .  .       . .          .            .         .      .                                                   ACATA            . .  .  .   GA            .  .  .    . T       .    . .   .       . .  G A   TGAA       .  .     .    .    .   .  .      .  .  . .  . A .        . .                 . .   .      .    .  .    AG     .    . . . .      .    . .     .  .   .  .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                    .  .    .     .          .   .   . .  .     .   .  .    .    G  .    .   .    GG  .       .       . .        T       . .        .   .   .    . .       .         .           .   T                            TACTCTGTCATT                                                                                                    TTG                      .   .   .     .    .    .      . . .  . . .   .  .          .         TAT   .  .   .  . .   C      A     . .         G            .    .     .      .  . .   .   .             . .        G      .   . .      TT         .           .   .         AAAATTAAA                     . .       . .  . .  . T              . .  . A       G        .   .        .   TTATTCT                      T   .    . .    .                                                                                                                                                                                                                    .      G   .      T     .       .   .  .      .  . .  T          .   T       .   .    A                                 .       .    .  .     .       .  .   .           .  A  ATT                                     .   .    .    .  .   .  .       C       .      .                 .   .    .  A     .  . A   C  .   .         .  .    .  .                .  A   T     AA             .    .     .     . .    .       .    .       .                       .  A  .  .        .      . .   .   .            .           .  .  .         .             .        .      . .  .  .     .   .   .                .  .       . .          .            .                                                                    ACAGA            . .  .  .   AG            .  .  .    . T       .    . .   .       . .  A G   GTTA       .  .     .    .    .   .  .      .  .  . .  . A .        . .                 . .   .      .    .  .    GC     .    . . . .      .    . .     .  .   .  .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                    .  .    .     .          .   .   . .  .     .   .  .    .    .  .    .   .    A   .       .       . .        T       . .        .   .   .    . .       .         .           .   T                            CACTCTGTCCT                                                                                                     TC                       .   .   .     .    .    .      . . .  . . .   .  .          .         TAT   .  .   .  . .   T      C     . .         G            .    .     .      .  . .   .   .             . .        A      .   . .      TT         .           .   .         AAAATTAT                      . .       . .  . .  . T              . .  . G       G        .   .        .   .                            .   .                                                                                                                                                                                                                                           .      .     .       .   .  .      .  . .  A          .   T       .   .    A                                 .                                                .  .  GTT                                     .   .    .    .  .   .  .       .       .      .                 .   .    .  A     .  . A   T  .   .         .  .    .  .                .  .   .     .              .    .     .     . .    .       .    .       .                       .  .  .  .        .      . .   .   .            .           .  .  .         .             .        .      . .  .  .     .   .   .                                                                                                                                                .  .   GA            .  .  .    . T       .    . .   .       . .  . .   GTTA       .  .     .    .    .   .  .      .  .  . .  . A .        . .                 . .   .      .    .  .    AC     .    . . . .      .    . .     .  .   .  .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                       .    .    .  .    .   .    A   .       .       . .        A       . .        .   .   .    . .       .         .           .   T                            TACTCTGTCCT                                                                                                     TC                       .   .   .     .    .    .      . . .  . . .   .  .          .         A     .  .   .  . .   C      .     . .         C            .    .     .      .  . .   .   .             . .        A      .   . .      GT         .           .   .         AAAAACT                       . .       . .  . .  . A              . .  . G       .        .   .                                         .   .                                                                                                                                                                                                                                                        .       .   .  .      .  . .  A          .   .       .   .                                                                                                                                     .   .    .                                                                .  .     .  . .   .  .   .         .  .    .  .                .  .   .                                                         .       .                       .  .  .  .        .      . .                                                                                                                                                                                                                                                     .  .   GG            .  .  .    . A       .    . .   .       . .  . .   TC         .  .     .    .    .   .  .      .  .  . .  . . .        . .                 . .   .      .    .  .    AC     .    . . . .      .    . .     .  .   .  .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                  G   .       .       . .        .       . .        .   .   .    . .       .         .           .                                                                                                                                                                                                          . .  . . .   .  .          .         .     .  .   .  . .   .      .     . .         A            .    .     .      .  . .   .   .             . .        A      .   . .      TT         .           .   .         AAATAAT                       . .       . .  . .  . T              . .  . .       .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           .   .  .      .  . .  .          .   .       .   .                                                                                                                                     .   .    .                                                                .  .     .  . .   .  .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             .       .    . .   .       . .  . .   A          .  .     .    .    .   .  .      .  .  . .  . . .        . .                 . .   .      .    .  .    CC     .    . . . .      .    . .     .  .   .  .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       .         .     .  .   .  . .   .      .     . .                      .    .     .      .        .   .             . .        .      .   . .      .          .           .   .         TAAT                          . .       . .  . .  . .              . .  .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 . .  . . .        . .                 . .   .      .    .  .    AC     .    . . . .      .    . .     .  .   .  .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  .                                                               .      .          .           .   .         TCAT                          . .       . .  . .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                . .   .      .    .  .    AC     .    . . . .                                
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AA                            . .       . .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     . .   .      .    .  .    .      .    . . . .                                
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           .    .  .    .      .    . . . .                                
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                .  .                                                       


blockSeqCons                  :                                                                                                                                                                                       **   **    T*****                                         G*                                              T****     *****            ***                      ***********     T************************                                                                                                                    TCG*******************           *****                                                         TAT*                                 *****     GC**********                                                         A****        ****                                        AAAATTAAT*******************                                                      GA*****               *** TTTATTACATTTAAAC**********              A*                                                               GT*******            TGTAC********     CA*                                                                             ATTT********      TGAT***********        G*         T**                              **                                 ACTAGCGTTGAA************                       T* ***                  ***                                                                **                     CT**           G*********        G*          N*                    GCC                  CA*                     T**   CAGAA********             **                                T*********************                                                                                                                                                                                                                                                             ACAAGA*****                  AGG*********               AT****  **                                                                                                                                                                                       **
originalCons                  :                                                                                                                                                                         CTTGGTGTAAA-AT--GCT--GACT-----TCTGGA-GCC--TC-C-AA-TTTGG-ACG-TC-CAAA--GTG-GA-GAGA--GG-GTGGAGCC----TCTT-GTCATAA-G-AGATTGTC----TGGG-T-----GGAG--CT-ATT---GG-A-GTTAATT------TCAA-----------A-ACA------------------T------AATT------------T-----A-CT--------------CTG---T--------------------------C----------------------CT------------CAGTGT------TCG-------------TGG---C--TAT----A--ACA--TAA-AGTTAT-C-A--A-A-C--AA-AA-CAAGTCCTTT-GAAGCTCCCTAT-AT-AA-ACT-AA-T---T---CCCC---AAA-C-----CCCAT--------G---C-ATAA-TCTGA-AAAGGG--C-A-GAA-GGC------------CA-G-CACCATAA-A---CC--TG-T----TAC---T-T---CA----AACAAAAA-CAA--AACACACTA-------AAA------TTA---A--T-CA-C-CATTTCA-C--A-A-TA-A--T-------TAATT-G-AT-T---G-AAAG------AA-GAT-----AAAG---C-----TTT-AT-TA-CA-TTNAACC-AATTTCA-CTTT-G-AAAA-----ATATTT-CTGCTGATCGCAGTTTGCAA-----GGA---AGACG-TG-----T-TT-G-T-----ATTT-A--ATAC---TG-ATC----TATATCG-TGTCGTCGA-A--------------AG---TCCTAT------TA---------CAGTCA-AA--GGT-AA-TT-TTG----A--T-T--AT-AAA-TGAT----------G-GAGGGA-GAA-TGAAAT-T-TAT--GTCAAC---A-AG-GTGATC-AG-C--TAT-------AC-AAATCCAAAAC-ATC-ACAG------ACT-AGCGT---AAA---TTCACTCCAC-TCGGCTT---TT-TA---CCC--C-A--A--T-TTA---CAGGACATT-TCATT--------G--------------TT-------------GT-CAT-GTTT--TAC--A-TAT--A-------C--CTGGTA-CATGGA-----G----AACTTGTG-GAT-TGGA-TT-CTTTTCTT-TATTTCATAATTGTCATTTATTTCA-TAAATTT-CATTCATGCATATATA-AGAATG-T-TAT---A-G--AA---GT--GAG---TTT--TTGT-T----G-TCATCCCNTGTG-TTTGATAT---------A-----------GT-GCATG--A--TGAAATT-----GG-G--GG-AAA-TCTTGAACATCA--GCTCAGTAAA-AT--A-----ACACT--------CCTGAC---AGATGC-----TG-T-AC-TG-AGCAA---T--GT-GTCAATTTGTAAATTTTGA----TCTC-T-CATCACCACA--TTGGACTGGCT-CTGTACTGC----TAT----A---------------------A----------AATTTATTGGACAGCA-ACAGAGA--ACCAGT-C-TA-CC---T--A-------G-TA-CA-GG----A-A-T----TG--AAA-T---G---ACAGA-T-ATAAATAA-G-T-NA-GTG-TT-GAAAT-TCAC-TTCT-GAA--G--CTCCA--C-CC-T-GA-CAA----TCTCT-T---ATGACAAGAGGCTCC-A--CC-CTCTCT--CCA-CT-TTGGA----CG--TCC-A-A-A-TTGGAG-GCTC-C-AGAGT-CA--GC-AT---TTTACACCAAGC
finalCons                     :                                                                                                                                                                         CTTGGTGTAAA-AT--GCT--GACTT-----CTGGA-GCC--TC-C-AA-TTTGG-ACG-TC-CAAA--GTGG-A-GAGA--GG-GTGGAGCC----TCTT-GTCATAA-G-AGATTGTCT----GGG-T-----GGAG--CT-ATT---GG-A-GTTAATT------TCAA-----------A-ACAT------------------------AATT------------T-----A-CT--------------CTG---T--------------------------C----------------------CT------------CAGTGTTCG-------------------TGG---C--TA-----A--ACA--TAA-AGTTAT-C-A--A-A-C--AA-AA-CAAGTCCTTT-GAAGCTCCCTAT-AT-AA-ACT-AA-T---T---CCCC---AAA-C-----CCCATGC----------C-ATAA-TCTGA-AAAGGG--C-A-GAA-GGC------------CA-G-CACCATAAA----CC--TG-T----TAC---T-T---CA----AACAAAAA-CAA--AACACACTAAAATTAAT-------------------CA-C-CATTTCA-C--A-A-TA-A--T-------TAATT-G-AT-T---G-AAAGA-----AA-GAT-----AAAG---CTTTATTACATTTAAAC----------AATTTCA-CTTT-GA-AAA-----ATATTT-CTGCTGATCGCAGTTTGCAA-----GGA---AGACG-TG-----T-TTGT-------ATTT-A--ATACTGTAC--------TATATCA-TGTCGTCGA-A--------------AG---TCCTAT------TA---------CAGTCA-AA--GGT-AA-TT-TTGATTT--------AT-AAATGAT-----------G-GAGGGAG-AA-TGAAATT--TAT--GTCAAC---A-AG-GTGATC-AG-C--TAT-------AC-AAATCCAAAAC-ATC-ACAGACTAGCGTTGAA------------TTCACTCCAC-TCGGCTT---TTT-A---CCC--C-A--A--T-TTA---CAGGACATT-TCATT--------G--------------TT-------------GT-CAT-GTTT--TAC--A-TAT--A-------CCT--GGTA-CATGGAG---------AACTTGTGG-AT-TGGA-TTN-TTTTCTT-TATTTCATAATTGCCATTTATTTCA-TAAATTTCA-TTCATGCATATATA-AGAATGT--TATCAGAA--------GT--GAG---TTT--TTGT-T----G-TCATCCCNTGTG-TTTGATAT---------------------GT-GCATG--A--TGAAATT-----GG-G--GG-AAA-TCTTGAACATCA--GCTCAGTAAA-AT--A-----ACACT--------CCTGAC---AGATGC-----TG-T-AC-TG-AGCAA---T--GT-GTCAATTTGTAAATTTTGA----TCTC-T-CATCACCACA--TTGGACTGGCT-CTGTACTGC----TAT----A---------------------A----------AATTTATTGGACAGCACAAGA-----ACCAGT-C-TA-CC---TAGG---------TA-CA-GG----A-AAT----TG--AAA-T---G---ACAGA-T-ATAAATAA-G-T-NA-GTG-TT-GAAAT-TCAC-TTCT-GAA--G--CTCCA--C-CC-T-GA-CAA----TCTCT-T---ATGACAAGAGGCTCC-A--CC-CTCTCT--CCA-CT-TTGGA----CG--TCC-A-A-A-TTGGAG-GCTC-C-AGAGT-CA--GC-AT---TTTACACCAAGC
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|31 ): GGTACTGTATGGTGTGAAACTCTTAATATTGATTGAGGCTCTTATTAACACTATGATAGTATCAAGCCTTTTTTTCCATTCCC
Unaligned ( gi|35 ): TGTCATGTTTTACACATAAAGAATTCGATATAATAAATCTGTTTGGGTTTTTTTTTTTTTT
Unaligned ( gi|40 ): CTTCTAAAAACAATGGGCATGATGAGTTTCCTATTTATATTTCACCT






Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                       11         222222                                         11                                                                                                  11111111111     2222222222222222222222222    1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111      2222222222222222222222   111     22222                                   1                                                 1111111111111                                               111111111111                                                                      2222222222222222222222222222                                          222222222             11111             222222222222222              11   11111                           11111   111        11111    222222222            1                           4444444444444444444      44444444444444444                         1111111       1    2222222222                   111   11                            222222222                       55555555555555555555555555                          111   2222222                          33333333333333333333333333333333333333                       444444444444444444444444444444444444       1111          1111111111            33333             111111                           22222222           111   11                               777777777777777777777777                                                              11    11111     11111111               11111                                                                 11                     88888888888888888888888888888888888888888888                 111                   111111111111                      11                      1     11111111                                          1                                                                                                                              
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                    4  11   99    777777     4   55  4 4  4     4   4  3    55   00 3    55  3    11  7777    3       3 6        88888   3 88888    44  3   555  3 3       999999    55555555555 3   8888888888888888888888888    7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777      5555555555555555555555   000 55  77777 3   55   3      3 3 44 6 3 77  3  0      0   3   0     6666  3  3   3  6 555 6666   0000000000000     555 9999999     2     3      44 6 3   6   555555555555  3 3    0 1 3 888  44  3 6666   999999999  6666        5   33        2222222222222222222222222222  2 2       2 33 2 2  999999  3  3 3 3  3 333333333     666     44444    777 0 2  888888888888888   1   4    4 55   11111      5                    22222   777    5   22222 5  222222222  0 5 66    0   8  888    888   2     5 4444444444444444444      77777777777777777        99   6  6  6   5 6666666   5   0    7777777777 4      44  44     000   00      555 3  6      3  3 44 222222222  3   2       3   3    77777777777777777777777777         4        777  66 333   9999999 66 4   777         4  1  22222222222222222222222222222222222222  3   6    44 1 5555   666666666666666666666666666666666666       5555 3  6  6  7777777777  0         00000     4  3    333333 2            3      666   00000000  4 4 55   111   33    4 8888 4       8    3      777777777777777777777777  3  1  55 88       99999 3 3 55  8           4   99       5  22 55 00000     44444444      777      00000  4 4  4  4     777 55  4         0      7  9999    4 4          99           4         33333333333333333333333333333333333333333333               4 777   66      4 4  4  000000000000    3  3  666  77777  33   3 555 555     3 3  6 0   99999999   3  3     3    3    3   44 44     44 3  2 3  3 2 6666     3 555            0  2 33  2      33   4  2    999999 33   2 2 2 2      3    3 3     6  77  3  555            
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                    .  ..   ..    ......     .   ..  . .  .     .   .  .    ..   .. .    ..  .    ..  ....    .       . .        .....   . .....    ..  .   ...  . .       ......    ........... .   .........................    ..........................................................................................................      ......................   ... ..  ..... .   ..   .      . . .. . . ..  .  .      .   .   .     ....  .  .   .  . ... ....   .............     ... .......     .     .      .. . .   .   ............  . .    . . . ...  ..  . ....   .........  ....        .   ..        ............................  . .       . .. . .  ......  .  . . .  . .........     ...     .....    ... . .  ...............   .   .    . ..   .....      .                    .....   ...    .   ..... .  .........  . . ..    .   .  ...    ...   .     . ...................      .................        ..   .  .  .   . .......   .   .    .......... .      ..  ..     ...   ..      ... .  .      .  . .. .........  .   .       .   .    ..........................         .        ...  .. ...   ....... .. .   ...         .  .  ......................................  .   .    .. . ....   ....................................       .... .  .  .  ..........  .         .....     .  .    ...... .            .      ...   ........  . . ..   ...   ..    . .... .       .    .      ........................  .  .  .. ..       ..... . . ..  .           .   ..       .  .. .. .....     ........      ...      .....  . .  .  .     ... ..  .         .      .  ....    . .          ..           .         ............................................               . ...   ..      . .  .  ............    .  .  ...  .....  ..   . ... ...     . .  . .   ........   .  .     .    .    .   .. ..     .. .  . .  . . ....     . ...            .  . ..  .      ..   .  .    ...... ..   . . . .      .    . .     .  ..  .  ...            
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                    0  00   55    666666     0   55  0 0  0     0   0  6    00   22 6    00  6    88  1111    3       3 7        77777   3 33333    66  3   888  3 3       666666    88888888888 3   3333333333333333333333333    4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444      5555555555555555555555   000 00  77777 6   00   6      6 3 66 7 3 99  3  0      8   1   8     5555  1  1   1  2 444 1111   5555555555555     555 3333333     9     1      22 7 3   2   888888888888  1 1    5 7 1 555  22  1 1111   999999999  1111        7   99        0000000000000000000000000000  7 7       7 77 9 9  222222  1  1 1 1  1 111111111     444     11111    000 8 0  888888888888888   9   4    4 11   11111      0                    55555   555    0   55555 7  999999999  1 0 99    0   9  000    444   5     7 4444444444444444444      00000000000000000        22   7  7  7   7 0000000   0   0    2222222222 4      66  88     222   00      888 3  7      3  3 66 555555555  3   4       3   3    55555555555555555555555555         0        888  22 999   3333333 11 4   888         0  1  44444444444444444444444444444444444444  3   7    66 2 1111   555555555555555555555555555555555555       2222 3  7  2  2222222222  3         99999     4  6    000000 0            6      222   11111111  0 0 55   000   55    0 5555 0       8    6      888888888888888888888888  6  3  00 66       11111 6 6 00  0           9   55       8  11 55 00000     55555555      000      00000  0 0  0  0     000 55  0         8      4  4444    4 4          44           4         66666666666666666666666666666666666666666666               4 999   11      4 4  4  888888888888    6  6  444  55555  88   3 888 888     3 3  1 4   88888888   3  3     3    3    3   66 66     66 3  3 1  1 2 5555     1 444            1  7 77  7      44   7  4    999999 44   5 5 5 5      1    1 1     2  33  1  444            
consensus                     :                                                                                                                                                                         CTTGGTGTAAA-AT--GCT--GACT-----TCTGGA-GCC--TC-C-AA-TTTGG-ACG-TC-CAAA--GTG-GA-GAGA--GG-GTGGAGCC----TCTT-GTCATAA-G-AGATTGTC----TGGG-T-----GGAG--CT-ATT---GG-A-GTTAATT------TCAA-----------A-ACA------------------T------AATT------------T-----A-CT--------------CTG---T--------------------------C----------------------CT------------CAGTGT------TCG-------------TGG---C--TAT----A-ACA--TAA-AGTTAT-C-A--A-A-C--AA-AA-CAAGTCCTTT-GAAGCTCCCTAT-AT-AA-ACT-AA-T---T---CCCC---AAA-C-----CCCATG--C-------CATAA-TCTGA-AAAGGG--C-A-GAA-GGC------------CA-G-CACCATAA-A---CC--TG-T----TAC---T-T---CA----AACAAAAA-CAA--AACACACTA-------AAA------TTA---A--T-CA-C-CATTTCA-C--A-A-TA-A--T-TA-AT-T-G-AT-TG--------AAAGA---AAGAT-----AAAG---CTTTAT-T-ACATTTAAAC--AATTTCA-CTTT-G-AAAA-----ATATTT-CTGCTGATCGCAGTTTGCAA-----GGA---AGAC-GTG-----T-TT-G-T-----ATTT-A--ATAC-TGT-AC--TATATC-ATGTCGTCGA-A--------------AG---TCCTAT------TA---------CAGTCAAA--GGT-AA-TT-TTG-A--T--T-TAT-AAA-TGAT----------G-GAGGGA-GAA-TGAAAT-T-TAT--GTCAAC---A-AG-GTGATC-AG-C--TAT-------AC-AAATCCAAAAC-ATC-ACAG------ACT-AGCGTT-----A--A-TTCACTCCA-CTCGGCTT---TT-TA---CCC--C-A--A--T-TTA---CAGGACATT-TCATT--------G--------------TT-------------GT-CAT-GTTT--TAC--A-TAT--A-------C--CTGGTA-CATGGA-----G----AACTTGTG-GAT-TG-GA-TTN-TTTTCTT-TATTTCATAATTGTCATTTATTTCA-TAAATTT-CATTCATGCATATATA-AGAATG-T-TAT-C--AG--AA-G-T--GAG---TTT--TTGT-T----G-TCATCCCNTGTG-TTTGAT------------G-----------GT-GCATG--A--TGAAATT-----G-G-G--GG-AAATCTTGAACATCA--GCTCAGTAAA-AT--A-----ACACT--------CCTGAC---AGATGC-----TG-T-AC-TG-AGCAA---T--GT-GTCAATTTGTAAATTTTGA----TCTC-T-CATCACCACA--TTGGACTGGCT-CTGTACTGC----TA----TA---------------------A----------AATTTATTGGACAGC-ACG-AGA--ACCAGT-C-TA-CC---T-A------GGTA-CA-GG---AA-AT--TG--AAA-T---G---ACAGA-T-ATAAATAA-G-T-NA-GTG-TT-GAAAT-TCAC-TTCT-GAA--G--CTCCA--C-CC-T-GA-CAA----TCTCT-T---ATGACAAGAGGCTCC-A--CC-CTCTCT--CCA-CT-TTGGA----CG--TCC-A-A-A-TTGGAG-GCTC-C-AGAGT-CA--GC-AT---TTTACACCAAGC
Reference ( family-2546 )     :                                                                                                                                                                         CTTGGTGTAAA-AT--GCT--GACT-----TCTGGA-GCC--TC-C-AA-TTTGG-ACG-TC-CAAA--GTG-GA-GAGA--GG-GTGGAGCC----TCTT-GTCATAA-G-AGATTGTC----TGGG-T-----GGAG--CT-ATT---GG-A-GTTAATT------TCAA-----------A-ACA------------------T------AATT------------T-----A-CT--------------CTG---T--------------------------C----------------------CT------------CAGTGT------TCG-------------TGG---C--TA-----A-ACA--TAA-AGTTAT-C-A--A-A-C--AA-AA-CAAGTCCTTT-GAAGCTCCCTAT-AT-AA-ACT-AA-T---T---CCCC---AAA-C-----CCCATG--C-------CATAA-TCTGA-AAAGGG--C-A-GAA-GGC------------CA-G-CACCATAA-A---CC--TG-T----TAC---T-T---CA----AACAAAAA-CAA--AACACACTA-------AAA------TTA---A--T-CA-C-CATTTCA-C--A-A-TA-A--T-TA-AT-T-G-AT-TG--------AAAGA---AAGAT-----AAAG---CTTTAT-T-ACATTTAAAC--AATTTCA-CTTT-G-AAAA-----ATATTT-CTGCTGATCGCAGTTTGCAA-----GGA---AGAC-GTG-----T-TT-G-T-----ATTT-A--ATAC-TGT-AC--TATATC-ATGTCGTCGA-A--------------AG---TCCTAT------TA---------CAGTCAAA--GGT-AA-TT-TTG-A--T--T-TAT-AAA-TGAT----------G-GAGGGA-GAA-TGAAAT-T-TAT--GTCAAC---A-AG-GTGATC-AG-C--TAT-------AC-AAATCCAAAAC-ATC-ACAG------ACT-AGCGTT--G--A--A-TTCACTCCA-CTCGGCTT---TT-TA---CCC--C-A--A--T-TTA---CAGGACATT-TCATT--------G--------------TT-------------GT-CAT-GTTT--TAC--A-TAT--A-------C--CTGGTA-CATGGA-----G----AACTTGTG-GAT-TG-GA-TTN-TTTTCTT-TATTTCATAATTGCCATTTATTTCA-TAAATTT-CATTCATGCATATATA-AGAATG-T-TAT-C--AG--AA-G-T--GAG---TTT--TTGT-T----G-TCATCCCNTGTG-TTTGAT------------AT----------GT-GCATG--A--TGAAATT-----G-G-G--GG-AAATCTTGAACATCA--GCTCAGTAAA-AT--A-----ACACT--------CCTGAC---AGATGC-----TG-T-AC-TG-AGCAA---T--GT-GTCAATTTGTAAATTTTGA----TCTC-T-CATCACCACA--TTGGACTGGCT-CTGTACTGC----TA----TA---------------------A----------AATTTATTGGACAGC-ACA-AGA--ACCAGT-C-TA-CC---T-A------GGTA-CA-GG---AA-AT--TG--AAA-T---G---ACAGA-T-ATAAATAA-G-T-NA-GTG-TT-GAAAT-TCAC-TTCT-GAA--G--CTCCA--C-CC-T-GA-CAA----TCTCT-T---ATGACAAGAGGCTCC-A--CC-CTCTCT--CCA-CT-TTGGA----CG--TCC-A-A-A-TTGGAG-GCTC-C-AGAGT-CA--GC-AT---TTTACACCAAGC
gi|1                          :                                                                                                                                                                            GGTGTAAATATCTGCTT-GAAC-----TCTGGA-GCC--TC-C-AA-TTTGG-ACC-TCTCAAA--GTG--A-GAGA--GG-GTGGGTTC----TCTT-GTCATAA-GGAGATTGTCTGGGTGGA-TCTATTGGAG--TTGATTTCAAA-A-CATAATT------TTTACTCTGTCATTTA-ATG------------------TTGTCTGAATT------------T-----C-CTGT------------CTG---CGTCA----------------------C----------------------CT------------CAG-GT------T---------------TGG---C--TAT----A-ACA--TAA-GATTAT-C-A--AGA-C--AA-AAACAAGTCATTT--------------AT-GATACTGAA-T---T---CCCA---AAA-TGCGCTCCCATGGGC-------CATAA-TCTGA-AAAGGG--CCA-GAAAGGC------------CA-G-CACCATAA-AC--CC--TG-TAGTCTA----T-T---CA----AACAAAAA-CAA--A----ACT--------AAA------TTA--------CA---CA-TTCA-C--
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               T-AT--TATAT--GTGT--TCGA-A--------------AG---TCCTAT------TA---------CAGTCAAA--CGT-AAATT-TTGTA--TAAT-TA--GAA-CGATTGTATTTTAAGCGAGGGA--AT-TGAAAT-AATAT--GTCCAC---AGAG-GTGATC-AG-CGCTTT-------AC-AAA-CCAAAAC-GTCCACAGTGGT--ACT-AGCGT------A--A-TTT----CA-T--GTCTT---TTGTAGC-CCCAAC-A--A--T-TTAGAACAGGACATT-TCTGT--------G--------------TT-------------GTTCATTGTTTGGTAC--A-TAT--A-------C--C-GGTA-CGTGGACA---A----AACGTGTTTGAT-TG-GA-TTTCTTTTCTT-TATTTCATAATTGT-ATTTATTTCA-TAAATTT-C-TTCATGTATATATA-AG-----------------------T--GAG---TTTA-CTGT-T----G-TTATCCCTTGTG-TTTGAT------------GTTAAGCATAGAGT-GCATG--A--TGAAATT-----G-G-G--GG-AAATCTTCAACATCA--GCTCAGTAAA--T--A-----ACACT--------CCTGAC---AGATGC-----TG-T-AC-TG-AGCAA---T--GT-GTCAATTTGTAAATTTTGA----TCTC-T-CATCACCACA--TTGGACTGGCT-CTGTACTGC----TA----TC---------------------A----------AATTTATTGGACAGC-AC--AGA--ACCAGT-C-TA-CC---T-A------AGTA-CA-GG---AA-----TGATAAA-T---A---GCAGA-T-AT-GATAG-A-TGAA-GTG-TT-GAAAT-TCAT-TTCT-GAA--G--CTCCA--C-CCAT-GA-CAA----TATCT-T---ATGACAAGAGGCTCC-A--CC-CTCTCT--CCA-CT-TTGGA----GG--TCA-A-A-A-TT-GAG-GCTC-C-AGAGT-CAGGGC-AT---TTTACACCAAgtgaagtgataatttcagagtagcgcaatttttcacaaacggacatgcaaaactgattgatcgtctgatgaacaggtctgctatagaattaacaattatgaaaatcgtggtaagacgttacagtgtatttgagttgttcattgtgaattcctgattagaagctattatatgtgttcgaaagtcctattacagtcaaacgtaaattttgtataattagaacgattgtattttaagcgagggaattgaaataatatgtccacagaggtgatcagcgctttacaaaccaaaacgtccacagtggtactagcgtaatttcatgtcttttgtagccccaacaatttagaacaggacatttctgtgttgttcattgtttggtacatataccggtacgtggacaaaacgtgtttgattggatttcttttctttatttcataattgtatttatttcataaatttcttcatgtatatataagtgagtttactgttgttatcccttgtgtttgatgttaagcatagagtgcatgatgaaattgggggaaatcttcaacatcagctcagtaaataacactcctgacagatgctgtactgagcaatgtgtcaatttgtaaattttgatctctcatcaccacattggactggctctgtactgctatcaaatttattggacagcacagaaccagtctacctaagtacaggaatgataaatagcagatatgatagatgaagtgttgaaattcatttctgaagctccacccatgacaatatcttatgacaagaggctccaccctctctccactttggaggtcaaaattgaggctccagagtcagggcattttacaccaa
gi|10                         :                                                                                                                                                                               ggtgtaaatatctgcttgaactctggagcctccaatttggacctctcaaagtgagagagggtgggttctcttgtcataaggagattgtctgggtggatctattggagttgatttcaaaacataatttttactctgtcatttaatgttgtctgaatttcctgtctgcgtcacctcaggtttggctataacataagattatcaagacaaaaacaagtcatttatgatactgaattcccaaaatgcgctcccatgggccataatctgaaaagggccagaaaggccagcaccataaaccctgtagtctattcaaacaaaaacaaaactaaattacacattcacgtgaagtgataatttcagagtagcgcaatttttcacaaacggacatgcaaaactgattgatcgtctgatgaacaggtctgctatagaattaacaattatgaaaatcgtggtaagacgttacagtgtatttgagttgttcattgtgaattcctgattagaagcA-AGC------------CC-G-CACCATAA-A---CC--TG-T----TAC---T-T---CA----AACAAAAA-CAA--AACACACTA-------AAA------TTA------T-CA-CTCATTTCA-C--A-AATA-A--T-TA-AT-T-G-AT-T----------AAGA---AAGAT-----AAAAAGACTTAAT-T-ACAATTAAA---AATTTCA-CTTT-GCAAAA-----ATATTT--TGCTGATCGCAGTT-GCAA-----GGA---AGAC-GTG-----T-TT-GAT-----ATTT-A--ATACATGT-AC--TATATC-ATGTCGTCGA-A--------------AG---TCCTAT------TA---------CAGTCAAA--GGT-AA-TT-TTG-A--T--T-TAT-AAAATAAT----------G-GAGGGA-GAA-TAAAAT-T--AT--GCCAAC---A-AGTGTGATC-AG-C--T-T-------AC-AAATCCAAA-C-ATC-ACAG------ACTCAGCATTTGA--A--A-TTCACTCCA-CTCGGCTT---TT--A---CCC--C-A--AGAT-TTA---CAGGACATT--CATT--------A--------------TTTTGTTTTTTGTTTGT-CAT-GTTT--TAC--A-TATATA-------C--CTGGTA-CATGGA-----G----AACTTGTG-GAT-TG-GATTTC-TTTTCTT-TATTTCATAATT
gi|11                         :                                                                                                                                                                         CTTGGT--AAA-AT--GCT--GACT------CTGGA-GCC--TC-C-AA-TTTGG-ATG-CC-CAAA--GTG-GAAGAGA--GG-GTGGGGCT----TCTT-GTCATTA-G-AGATTGTC----TGG--T-----GGAG--CT-ATT---GG-A-GT-AATTACTCTGTCA---------------TT------------------T------AATT------------T-------CTGATATCCTGG----CTG---T--------------------------C----------------------CT------------CAGTGT------TTG-------------TGG---C--TA-----A-ACA--TAA-AGTTAT-C-A--A-A-C--AA-AAACAAGTCCTTT-GAAGCTCCCAAT-AT-AA-ACT-AA-T---T---TCCC---AAA-C-----CCCATA--C-------CATAA-TCTGA-AAAGGG--C-A-GAA-GGC------------CA-G-CACCATAA-A---CC--TG-T----TAC---T-T---CA----AACAAAAA-CAA--AACACACTG-------AAA------ATA---A--T-CA-C-CATTTCA-C--A-A-TA-A--T-TC-AT-T-G-AT-TG--------AAAGA---AAGATAATTAAAAG---CTTTAT-T-ACATTTAAAC--AATTTCA-TTTT-GCAAAA-----ATATT
gi|12                         :                                                                                                                                                                         CTTCGTGTAAA-AT--GCT--GACT-----T-TGGA-GCC--TC-C-AACTTTGA-ACC-TC-AAAA--ATG-GA-AAGA--GA-GTGGAACC----TCTT-GTCATAA-G-AGATTGTC----AGGG-T-----GGAG--CT-TTT---TG-A-GATAATT------TAAA-----------A-ACA------------------T------AATC------------T-----A-TT--------------CTG---T--------------------------CAT--------------------TT------------CAAT-T------TC--------------TGAATCC--TA-----A-ACA--TAA-TGTTATCC-A--A-A-C--AA-AA-CAAGTCCTTT-GAAGCTCCCTAC-AT-AA-AGT-CATT---T---CCCC---AAA-C-----CCCATG--C-------CATGA-TCTGA-AAAGGG--C-A-GAT-GGC------------AA-A-CATT-TAGCA---TC--TG-T----TAC----------------AC------------ACACACTA-------A---------------------------------------------C-TA-AC-T-A-AT-TG--------ACAGA---AAGAT-----ATAG---C-TTAT-T----CT---------TTTTA-C------AAAA-----ATATTC-TTGCTGATCACAGTTTGCAA-----GGA---AAAC-CTG-----T-TTAA-T-----AT-------TAC-TGT-AC--TAT
gi|13                         :                                                                                                                                                                         CTTGGTGTAAA-AT--GCT--GACT------CTGGA-GCC--TC-C-AA-TTTGG-ACG-TC-CAAA--GTG-AA-GAGA--GG-GTAGAGTC----TCTT-GTCATAG-G-AGATTGTC----TGGG-T-----GGAG--CT-ATT---GG-A-GTTAATT------TCAA-----------A-ACA------------------T------AATT------------C-----A-CT--------------CTG---T--------------------------C----------------------CT------------CAGTGT------TCG-------------TGG---C--TAT----ACACA--TAA-AGTTAT-C-A--A-A-CCAAA-AA-CAAGTCATTT-GAAGCTCCTTAT-AT-AA-ATT-AA-T---T---CCCC----AA-C-----ACCATG--C-------CATAA-TATGA-AAAGGG--C-A-GAA-GGC------------CA-G-CACCATGA-A---CC--TG-T----TAC---T-T---CA----AACAAAAA-CAA--AACACACTA-------AAT------TTT---A--T-TG-T-ATTTTTA-C--A-A-Tc
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  g--------------TT-------------GT-CAT-GTTT--TAC--A-CAA--AGAATT--C--C--ATA-TATAAA-----AGTTAAACTTATG-ATT-TG-GA-TTT-TTTTCTC-TATTT-------------TATT--A-AAAA--------CATGCATGCACA-AGAATG-C-TATAC--AA--ACTG-G--GAG---TTT--T-GT-T----G-TCATCCCTTGTG-TTTGAT------------G-----------GT-GC-TG--A--TGAAATT-----G-A-G--Gtgtga
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        gtTG-CTTGAT------------G-----------GT-GC-TG--A--TGAAATTCGGGGG-G-G--GG-GGATCTTGAACGTCA--GCTCAGTATA-AT--ACATAGACA-T--------CCTGAC---AGATAC-----TG-T-AC-TG-AGCAA---T-----------TTGTGAATTTTGA----TCTC-T-CATCTCCACA--TTGGACTGGAT-CTGTagggggggggtctgcttgatggtgctgatgaaattcgggggggggggatcttgaacgtcagctcagtataatacatagacatcctgacagatactgtactgagcaatttgtgaattttgatctctcatctccacattggactggatctgt
gi|15                         : gtttgtcatgttttacacaaagaattccatatataaaagttaaacttatgatttggatttttttctctattttattaaaaacatgcatgcacaagaatgctatacaaactgggagttttgttgtcatcccttgtgtttgatggtgctgatgaaattgaggagggggggggtcGTGTAAA-AT--GCT--GACTCTAGATCTGGA-GCC--TC-C-AA-TTTGG-ACG-TC-CAAA--GCG-GA-GAGA--GG-GTGGAGCT----TCTT-GTCATAA-T-AGATTGTC----TGGG-T-----GGAG--CT-ATT---GG-A-GTTAATT------TCAA-----------A-ACA------------------T------AATT------------T-----A-CT--------------CTG---TGATTTAATTTCTAACATCCTGGCTGTC----------------------CT------------CAGTAT------TTG-------------TGG---C--TA-----A-ACA--TAA-AGTTAT-CAA--A-A-C--AA-GA-CAAGTCTTCT-GAAGCTCCCTAT-AT-AA-ACT-AATT---T---CCCC---AAA-C-----CCCATA--C-------CATAA-
gi|16                         :                                                                                                                                                                           ttGTGTAAA-AT--G-T--GACT------ATGGA-GCC--TC-C-AA-TAATG-ACC-TC-CAAA---TG----GAGA--GG-GTGTA-CCTCAATCTT-GTCACAA-G-AGATTGTC----AGGG-T-----GGAG--CT--TT---GT-A-GTTACTT------T-AA-----------A-ACT------------------T------TAAT------------T-----A-TT--------------TTG---T--------------------------CTTTAATTTTACATCCTTTATCCCC------------CAATAT------TTG-------------TGG---CCTTA-----A-ACA--TAA-ATTTAT-C-CTTG-A-CA-AA-AA-CAAG-CCTTT--AAGCTTGC-A--AT-AA---T-AA-T---T----CCC---AAA-------CCGATA--C-------CAT
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ttT-CAT-GTTT--TAC--A-TAT--A-------TATCTGGTA-CATGAA-----G----ACCT------AT-T---A-TTA-AT-------ATTTCATAATGATCATTTATTTCA-TAAATTTTCATTCATGCATATATA-AGAATG-T-TAT-T--AG--AA-G-T--GAGGTGTTT--TTTT-T----GGTCACCCCTTGTG-TTTGAT------------A-----------GT-GCATG--A--TGAAATT-----G-G-G--GGGAAATCTTGAACATCA--GCTCAGTTA---T--A-----ACACT--------CCTGAC---ATATGC-----TG-T-AC-TG-AGCAA---T--GT-GTCAATTTG
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AT----------G-GAGGGA-GAA-TAAAAT-T-TAT--GCCAAC---A-AG-GTGATC-AG-C--T-T-------AC-AAATCCAAAAC-ATC-ACAG------ACT-AGCGTTTGA--A--A-TTCACTCCA-CTCGGCTT---TT-TA---CCC--C-AAGA--T-TTA---CAGGACATT-TCATT--------ATTTTGTTTTCTTGTTT-------------GT-CAT-GTTT--TACATA-TAT--A-------C--CTGGTA-CATGGA-----G----AACTTGTG-GAT-TG-GATTTC-TTTTCTT-TATTTCATAATT
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               aTGGACAGC-ACA-CGA--ACCAGTTC-TATCC---T-A------GGTA-CA-GG---AA-AT--TG--AAAAT---G---ACAGA-G-GCTAATAA---T-C---------------TCAC-G-CT-GAATGG--CTCCA--CACCAT-GA-CAA----TCTCT-T---ATGACAAGAGGCTCC-A--CC-CTCTCT---CA-CT-TT-GC----CG--TCC-ATA-ATTTGGAG-GCTCACAAGAGTCCA--GCAATGTGTTTACACCA
gi|2                          :                                                                                                                                                                         CTTGGTGTAAA-ATCTGCTTTGA-------TCTGGA-GCC--TC-C-AA-TTTGG-ACC-TC-CAAA--GTG--A-GAGA--GG-GTGGAGTC----TCTT-GTCATAA-GGAGAT-GTC----TGGGCT-----GGAT--CT-ATT---GG-A-GTTGATT------TCAA-----------A-ACATAATTTTACTCTGTCATTT------AATT------------TCTAATA-TC--------------CTG---T--------------------------CTCGTC-----------------CT------------CAG-GT------TCG-------------TG----C--TATAC--A-ACA--TAA-A-TTAT-C-A--AGA-C--AA-AA-CA-GTCATTT-GAA-----------------CT-AA-T---T---TCCC---AAA-C-----CCCATG--C-------CATAA-TCTGA-AAAGGG--CCA-GAAAGGC------------CACG-CACCATAA-A---CC--TG-T-----AC---T-T---CA----AACAAAAAACAA--AACAC-CTA-------AAA------TTA---A--A-CA-C-CATTCTA-C--G-T-GAGA--TGTG-AC-TAG-ATGTGT-------AAAGAGTGAAGAGCG---AATG---CTT-ATGT-ACAAA-AAACGGAAT--CA-TTGC-G-AAGAGATGGATGTGTGCGGCTGATTGCA-TGTGCAA-----GAATAAAAGC-GTGGGCCGTGTT-G-TGAGTGATGTGA--ATGCGTGTGAC--TATAT--ATGT-GTCGA-A-------------------TCCTAT------TA---------CAGTCAAAACGTT-AA-AT-TTG-AAGT--G-TATGAAA-TGAT----------T-GAGGGA-TAA---AAAT----AT---TCCACTGAG-AG-GTGATC-AGGC--TTT-------AC-AAA-CCAAAAC-GTC-ACAGGGTGGTACT-AGCGT---------A-TTCA----G-CTTGGTGT---GT-GAGCTCCC--A-A--A--T-TTA---CAG-ACATT-TCTGT--------G--------------TT-------------GT-CATTGTTT--TAC--AATAT--A-------C----GGTA-CGTGGACCAGAG----AACG-GTG--AT-TG-GA-TTTCTTTTCTT-TATT-CATAATTGTCATTTATTTCAGTAAATTT-CTTTCATGTTTATATA------------T--------AA-G-T--GAG---TTTACTTGT-T----G-TTATCCC-TGTG-TTTGAT------------GTTAAGCATAGAGT-GCATGGGA--TGAAATT-----G-G-G--GG-AAATCTTCAACATCA--GCTCAGTAAA--T--A-----ACACT--------CCT-AC---AGATGC-----TG---AC-TG-AGCAA---T--GT-GTCAATTTG--AATTT-GA----TCTC-T-CATCACCACA--T-GGACTGGCT-CTGTACTGC----TA----TC---------------------A----------AATTTATTGGACAGC-ACA-AGA--ACCAGT-C-TA-CC---TAA------GGTACCA-GG---AA-----TGATAAA-TACCG---CCAGA-T-AT-GATAA-T-G-AA-GTG-TTGGAAAT-TCACTTTCT-GAA--G--CTCCA--C-CCAT-GA-CAA----TATCT-T---ATGACAAGAGGCTCC-A--CC-CTCTCTCCCCA-CT-TTGGA----GG--TCA-A-A-A-TT-GAG-GCTC-C-AGAGT-CA--GC-AT---TTTACACCAAGC
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             AA-TCTGA-AAAGGG--C-A-GAA-GGC------------TA-G-CACCATAA-A---CC--TG-T----TAC---T-T---CA----AACAAAAA-CAA--AA------------------------TA---A--T-CA-C-CATTTCA-C--A-A-TA-A--T-TA-AT-T-G-AT-TG--------AAAGA---AAGAT-----AAAG---CTTTTT-T-ACATTTAGAC--AATTTCA-CTTT-G--------------TT-CTGCTGATCGCAGTTTGCAA-----GGATTGAGAC-GTG-----
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     CAAACCA-------AAA--------A---C--T-CA-C-AATTTCAAC--A-A-TA-A--T-AA-AT-T-G-G--------------ACA---AAGAT-----ATA----CTTTAT---ACATTTA--C--AGT--CA-CGGT-G-CAAA-----ATATTT-CTGCTGATCGCAGTTTGCAA-----GAA---AGCT-GCT-----T-TA-A-T-----A-TT-ACTACAC-TATCACAATGTATC-A-GTCATAGA-A--------------GG---
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                              tTGGAGTC----TCTT-GTCATAG-G-AGATTGTC----TGGG-T-----GGAG--CT-ATT---GG-A-GTTAATT------CC-A-----------A-ACA------------------T------AATT------------T-----A-CT--------------CTG---T--------------------------CA---------------------TT------------TAATTTCTGATATCC-------------TGG---C--TGTCCTCA-GTGTTTAA-AGTTAT----------C--AA-AA-CAAGTCATTT-GAA---CCC--------------------------------------------CATG--C-------CATAA-TCTGA-AAAGGG--atttt
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             AAATCCTTT-GAAACTCCATAC-AT-AA-ACA-CA-T---T---TCCT-------C-----CCTATA--T-------CATGA-TCTGA-AAAG---------------------------------ACCTT---G---CCTTTG-T----TAC---G-T---CA----AACACAAA-CAA--GA------A-------AAACC----TTA---------A-C-CATTTCA-C--A-A-TGCA--TGTACATGT-A-AT-TACT------AAAAA---AAAAT-----A
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TT-A--ATAC--GT-AC-----ATCGATGTCGTTGGTA--------------AGATTTCTTATAAGATCTATGCACGAATCAGTCAAA--GGT-AA-ATATTG-A--T--TGTAT-AAA--GA-----------G-GAGGGAAGAAGTGAAAT-C-TAT--GTCAAC---A-AG-GTGATCTAG-C--TGC-----------AATCC-AAAC-ATC-ACAG------Attactgtatt
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              aC---T-T------GATA-CA-GG---AA-AT--TG--AAA-T---G---ACAGA-T--TGAATTA-G-C-TATGTG-TT-GAAAT-TCAC-TTGA-GAA--G--CTCCA--C-CC-T-T--CCC----CCTCTAT---AAAACTAGCAGCCCT-A--GC-CCCTCG--CTA-TTCTTGGAATTTTG--TTC-A-A-A-CTG
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           gtT--TG--AAA-T---G---ACAGA-T-GTACATA-------A-ATG-TC-CAA---TCCC-TT--------G--C-ACA--C-TT-T-AA-C-------------------ACAAGAGG-TCC-A--AT-TCTTTT--CCATTT-TTGGA----GC--TCC-A-ACA-TTGGactag
gi|27                         :                                                                                                                                                                         CTAGGTGTGAA-AC--GCT--GACT------CTGGA-ACC--TT-C-AA-TTTTG-ACG-TC-CAAA--GTG-GA-GAGA--GGCGTGGGGTC----TCTT-GTCATAACG-AGATTGTC----TGGG-T-----GGAG--CT-ATT---GG-AGGTTAATT------TCAG-----------A-Aatggttgtgggaatgtggcttgaatgtaaaattatccaaacaaa
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AAAA--AATTTCA-CTTTTG-CAAA-----ATATTT-CTTGTGATCGCAGTTTGCAATTGAGGGA---AGAC-GTG-----T-TT-T-T-----ATTA-A--TTAC-TGT-AC---ATATC-ATGTCGac
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           aaaaaaaa--------------TT-------------GT-CAG-ATTT--TAC--A-CAC--AAAGAATTC--CAAATATCA--------------AACATATG-GTT-TG-GA-TTT-TTTT-TT-TCTTTTAT--------TTTATT--A-AAAG--------CATGCATGCACA-AGAATG-T-TAT-aaaaattttcaaa
gi|3                          :                                                                                                                                                                         CTTGGTGTAAA-AT--GCT--GACTAT---TCTGGA-GCTCGTCAC-AA-TTTGGGACG-TC-CAAA--GTG-GA-GAGA--GG-GTGGA-TC----T-TT-GTCATAG-G-AGATTGTC----TGG--T-----GGAGGAC--ATT---GG-A-GTTAATT------TCAA-----------ATACA------------------T------AATT------------T-----A-CT--------------CTG---T--------------------------C----------------------CT------------CAGTGT------TC--------------TGG---C--TATC---A-ACA--TAA-AGTTAT-C-A--A-A-C--AA-AA-CAAGTCATTT-GAAGCTCCCTAT-AT-AA-ACT-AA-T---T---CCCC---AA--------CCCATG--C--------ATAA-TCTGA-AAAGGG--C-A-GAA-G-C------------CA-G-CACCAT-A-A---CC--TG-T----TAC---TGT---CA----AACAAAAA-CAA--AACACACTA-------AAA------TTA---A--T-CA-C-CATTTCA-C--A-A-TA-A--T-CA-AT-T-G-AT-T---------AAAG----AAGAT-----AAAG---GTTTAT-TAACA--TAAACT-AATTTCAGCTTT-G-AAAA-----ATATTT-CTGCTGATCGCAGTTTG--A-----AGA---AGACGGTG-----T-TT-G-T-----ATTT-A--ATAC-TGA-TC--TATATC--TGTCGTCGA-A--------------A----TCCTAT------TA---------CAGTCAAA--GGT-AA-TT-TTG-A-----T-TAT-AAA-TGAT----------G-GAGGGA-GAA-TGAATT-T-TAA--GTCAAC---A-AG-GTGATA-AG-C--TAT-------AC-AA--TCAAAAC-ATC-ACAG------ACT-----TT--GTAA--A-TTCACTCCA-CTCAGC--------------------------T-TTA---CAGGACATT-TC-TT--------G--------------TT-------------GT-CAT-GTTT--TAC--A-TAT--A-------C--CTGGTA-CATGGA----------AACTTGTG-GATGTG-GA-TTC-TTTTCTTGTATTTCATAATTGTCATTTATTTAA-TAAATTT-CATTCATGCATATAT----------------------AA-G-T--GAG---TTTA-TTGT-T----G-TCA--CCTTGTG-GTTGATGTAAAGGCATTAGT----------GT-GCGTG--A--TGAAATT-----G-G-G--GG-AAATCTTCAACATCA--GCTTAGTAAA-AT--A-----ACACT--------CCTGAC---AGATGCATATGCG-T-AC-TG-AGCAA---T--GT-GTCAATTTGTAAATTTTGA----TCTC-T-CATCACCACA--TTGGACGGGCTGCTGTACTGC----TA----TA---------------------A----------AATTTATTGGACAGCAATAGAGA--ACCAGT-C-TA-CC---T-A-------GTA-CA-GG----A-AT--TG--AAA-T---G---ACAGA-T-ATAAATAA-G-T-TA-GTG-TT-GAAAT-TCAT-TTCT-GAA--G--CTCCA--C-CCAT-GA-C-A----TATCT-T---ATGACAAGA-GCTCC----CC-CTCTCT--CCA-CT-TTGGA----GG--TCC-A-A-A-TTGGAG-GCTC-C-AGAGT-CA--GC-AT---TTTACACCAAGC
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               C---T-T------GATA-CA-GG---AA-AT--TG--AAA-T---G---ACAAA-TCAAAAATTG-GAT-CA-TTG-CT-GAAAT-TAAC-TCCA-GAA--G--CACCA--C-CC-T----------------------TG---AGTAGCCCC-A--CC-C-CTCT--CCA-AT-T
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            t-TAT--GTCAAC---A-CG-GTGATC-AG-C--TA--------AT-AAACCCAAAAC-ATC-ACAG------ACT-AGAGTT--C--ATCC-TTCACTCCA-CT
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  -T-GA-CAA----TCTCT-T---ATGACAAGAGGCTCC-ATCCT-CTCTCT--CCA-CT-TTGGA----GG--TCC-A-A-A-TTGGtaaaggt
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ca----TAC---T-TT--CA----AACAAAAA-CAA--AACACACTA-------AAA------TTA---A--A-CA-C-CATTTCA-C--A-A-TA-C--T-TA-AT-T-G-AT-T
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       C-A--CC-CTCTCT--CCA--T-TTGGA----GG--TCCAA-A-A-GTGGAG-GGTC-C-AGAGT-CA--CC-AT---TTTACAGCAAG
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AAGAGAC-CC-A--CT-CCCTCA--CGA-TT-TTGG--------------------TG-----TTC-C-ATGAT-CA--GC-AT---TTTACACCAAGC
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              aaTCTCT--CCA-CT-TTGGG----CA--TCC-A-A-A-GTGGAG-ACTT-C-AGAGT-CA--GC-AT---TTTACACCAAGCct
gi|39                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       gCA-CT-TTGGA----CG--TCC-A-A-A-TTGGAG-GCTC-C---AGT-CA--GC-AT---TTTACACCAAGC
gi|4                          :                                                                                                                                                                         CTTGGTGTAAA-AT--GCT--GACA-----CCTGGATGCC--TC-CCAA-GTTGG-ACGGTC-CAAAAGGTG-GA-GAGA--GG-GTGG-GCT----TCTTTGTCATAA-G-AGATTGTA-----GGG-T-----GGAG--CC-ATT---GGGA-ATTAATT------TCAA-----------A-ACA------------------T------AATTACTCTCGCCATTT-----AATT--------------CTGAC-T--------------------------C----------------------CTGGCTGTATCGATCAGTGT------TTG-------------TGGG--C--TA-----A-ACA--TAA-AGTTAT-C-A--A-A-C--AAGAA-CAAGTCCTTT-GAAGCTCCCTAT-AT-AA-ACT-AA-T---TGTCCTCC---AAAAC-----CCCAT---C-------CATAT-TATCG-AAGGGG--C-ACGAA-GGC------------CA-GGCACCATTA-TTTTCG--TG-T----TAC---T-TTTTCA----AACTAAAA-CAATAAACACA-TACGAGAGGGAA------GTA---AGATACAGC-CATTTCA-C--ATA-TG-A--A-AA-AT-T-GTAT-TA--------AAAG
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  gA-TGAAAAAT-TGT--ATTAA----A-AG-CTG----------TAT-------GC-AAATCCAAAAC-ATC-ACAG------A--------------------TCACTCCA-TTCAGCTT---TT-TA---CCC--CTAT-A--T-TTA---CAGGGCATT-TTATT--------A--------------TT-------------AT-TTT-GTTT--T-----------------------------------------------CTTGT----T-TGCCA-TTA-TTT----------CATAATT---------TTCA-T-----T-CAT----GCATATATA-AGAATG-T-TAT-C--AG--AA-G-T--GAGA--TTT--TTGT-T----G-TCATCCCGTGTG-TTTGAT------------A-----------GT-GCATG--A--TGAAATT-----G-G-G--GGAAAATCTTCAACACCA--GCTCAGT-AA-AT--A-----ACACT--------CCTGAC---AGATGC-----TG-TCACGTG-AAGAA---CTAGT-G-CAA-------------A----TCTCTT-CA-CACTATAC-TTGGACTAGC--CTGTACTGC----T-----TA---------------------ATCTGCTACCGGATTTATTGG-CAGC-A-G-AGAACACCAAG-T-TA-CC---T-ACCGTAGGGTA-CA-GG---AACATTGTG--AAA-T---GTGAACAGAGT-AT-AATAA-G-TGAA-GTGTTT-GAAATATCAC-CTCT-GAA--GCTCTCCGACC-CC-T-GA-CAAATTTTCACT-T---ATGACAATAGGCTCCTA--CCTTTCTCT--CCCTCT-TTGGA----CGTTTCC-A-C-A--TGGAGAACTC-C-AG-GT-CAG-GC-AT---TTTACACCActgtatgcaaatccaaaacatcacagatcactccattcagctttttacccctatatttacagggcattttattattattttgttttcttgtttgccattatttcataattttcattcatgcatatataagaatgttatcagaagtgagatttttgttgtcatcccgtgtgtttgatagtgcatgatgaaattgggggaaaatcttcaacaccagctcagtaaataacactcctgacagatgctgtcacgtgaagaactagtgcaaatctcttcacactatacttggactagcctgtactgcttaatctgctaccggatttattggcagcagagaacaccaagttacctaccgtagggtacaggaacattgtgaaatgtgaacagagtataataagtgaagtgtttgaaatatcacctctgaagctctccgacccctgacaaattttcacttatgacaataggctcctacctttctctccctctttggacgtttccacatggagaactccaggtcaggcattttacacca
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                              gcttggtgtaaaatgctgacacctggatgcctcccaagttggacggtccaaaaggtggagagagggtgggcttctttgtcataagagattgtagggtggagccattgggaattaatttcaaaacataattactctcgccatttaattctgactcctggctgtatcgatcagtgtttgtgggctaaacataaagttatcaaacaagaacaagtcctttgaagctccctatataaactaattgtcctccaaaaccccatccatattatcgaaggggcacgaaggccaggcaccattattttcgtgttactttttcaaactaaaacaataaacacatacgagagggaagtaagatacagccatttcacatATA--C-------CATAA-TCTGA-AAAGGG--C-A-GAA-GGT------------CA-G-CACCATAA-A---CC--TA-T----TAC-----------------------------AATGTACT------------------TC---A--T-CA-C-CATTTCA-C--A-A-TA-A-------AT-T-G-AT-TG--------AAAGA---AAGAT-----AAAG---C--------------------AATTTCA--TTT-GCAAAA-----ATATTT-CTGCTGATCGCAGTTTGCAA-----GGA---ATAC-GTG-----T-TT-A-TT----ATTT-A--ATAC-TGT-AT--TAT--C-GTGTCGTCGA-AGATTCTCTTAAAGAAG---TCCTATGCAGA-TG---------CAGTCAAA--GGTTAA-TT-TTG-A--C--T-TAT-AAAATAAT----------G-GAAGGA-GAA-TGAAAT-T-TATATGTCAAC---A-GG-ATGATC-AG-C--TA--------AC-AAATCCAAAAC-ATC-ACAG------ACT-AGCGTT--G--A--AATGCACTCCA-CTCAGCTT---TT-TA---CCC--A-AG-A--T-TTA---CAGGACATG-TTATTATCATTTTG--------------TT-------------TT-CTT-GTTT--TAC--A-TATATA-------C--CTGGTA-CATGAA-----G----AACTTGTG-GAT-TG-GA-------------TA--TCATAATTGTCACTTATTTCA-TAAATTT-CATTCATGCATATATA-AGAATG-T-TAT-C--AG--AA-G-T--GAG---TTT--TTGT-T----G-TCATCCCCTGTG-TTTGAT------------A-----------GT-GCATG--A--TGAAATT-----GAG-G--GA-AAATCTTGAACATCA--GCTCAGT-AA-AT--A-----ACACT--------CCTGAC---AGATGC-----TG-T-TC-TG-AGCAA---T--GT-GTCAATTTGCAAATTGTGA----TCTC-T-CATCACCACA--TTGGACTGGCT-CTGTACTGC----T----------------------------------------ATCTGCT--ACAGC-AC--ATA--ACCAGT-C-TA-CCT--T-A------GGTA-CA-GG---AA-AT--TG--AAA-T---G---ACAGA-T-AT-AGTAA-G-TGAA-GTG-TT-GAAAT-TCAC-TTCT-GAA--G--CTCCA--C-CC-T-GA-CAA----TCTCT-T---ATGACAAGAGGCTCC-A--CC-CTCTCT--CCA-CT-TTGGC----CG--TCC-A-A-A-TTGGAG-GCTC-C-CGAGT-CA--GC-AT---TTTACGCTAA
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                       -CAAA--GTACAA-GTGAATGG-GTGGGGCT----TCTT-GTCATAA-G-A--TTGTC----AGGG-T-----GGAG--CC-ATT---GG-A-GTTAATT------TCAA-----------A-ACA------------------T------AATT------------T-----A-CTCTGTCAATTAATTTCTGACAT--------------------------C----------------------CT------------GGCTGT------TCGGATCATGTTTGTTTGG---C--TA-----A-ACA--TAATAGTT-T-C-A--A-AAC--AA-AAACAAGTCCTTT-GAAGCTCCCTAT-AT-AA-ACT-AC-T---T---TCCC---CAA-C-----CCCATA--C-------CATAA-TCTGA-AAAGGG--C-A-GAA-GGC------------CA-G-CACCATAA-A---TC--TG-T----TAC---T-T---CA----AACAAAAA-CAA--AACACACTA-------AA--------TA---A--T-CA-C-CATTTCA-C--A-A--A-A--T-TA-AA-T-G-AT-TG--------AAAGA---AAGAT-----AAAG---CTGTAT-G-AAATCCAAA
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            atttgttggtagg---A-AG-ATAA---AG-C--TGT-------ATGAAATCCAAAAC-ATC-ACAA------A--------------------TCACTCCACCTCAGCTT---TT-TA---CCC--CTAT-A--T-TTA---CAGGGCATT-TTATT--------A--------------TT-------------AT-TTT-GTTT--T-----------------------------------------------CTTGT----T-TGCCA-TTA-TTT----------CATAATT---------TTCA-T-----T-CATT----CATATATA-AGAATG-T-TAT-A--AG--AA-G-T--GAG---ATT--TTTT-T----G-TCATCCCGTGTG-TTTGAT------------A-----------GT-GCATG--A--TGAAATT-----G-G-G--GG-AAATCTTGAAC---------------A-AT--A-----ACACT--------CCTGAT---AGATGC-----TG-T-AC-TG-AGCAA---T--AT-GTCAATTTGTAAATTTAGA----TCTC-T-CACCACTATAC-TTGGACTGGCT-CTGTACTGC----TATCGCTACCTC-----------------A----------GATTTATTGGACAGC-AC--AGA--ACCAGT-C-TA-CC---T-A------GGTA-CA-GG---AA-CT--TG--AAA-T---G---TCAGA-T-AT-AATAA-G-TGAA-GTG-TT-GAAAT-TCAC-TTCT-GAA--G--CTCCA--C-CC-T-GA-CAA----TCTCT-T---ATGACAAAAGGCTCC-A--CC-CTCTCT--CCA-C--TTGGA----CG--TCC-A-A-A-TTGGAG-ACTA-C-AGAGTCCA--GC-AT---TTTACACCAAGCacatcacaaatcactccacctcagctttttacccctatatttacagggcattttattattattttgttttcttgtttgccattatttcataattttcattcattcatatataagaatgttataagaagtgagatttttttgtcatcccgtgtgtttgatagtgcatgatgaaattgggggaaatcttgaacaataacactcctgatagatgctgtactgagcaatatgtcaatttgtaaatttagatctctcaccactatacttggactggctctgtactgctatcgctacctcagatttattggacagcacagaaccagtctacctaggtacaggaacttgaaatgtcagatataataagtgaagtgttgaaattcacttctgaagctccaccctgacaatctcttatgacaaaaggctccaccctctctccacttggacgtccaaattggagactacagagtccagcattttacaccaagc
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                    atttgttggtaggcaaagtacaagtgaatgggtggggcttcttgtcataagattgtcagggtggagccattggagttaatttcaaaacataatttactctgtcaattaatttctgacatcctggctgttcggatcatgtttgtttggctaaacataatagtttcaaaacaaaaacaagtcctttgaagctccctatataaactactttccccaaccccataccataatctgaaaagggcagaaggccagcaccataaatctgttacttcaaacaaaaacaaaacacactaaataatcaccatttcacaaaattaaatgattgaaaga-A--A-A-C--AC-AA-AAGGTCCTTTTGAAGCTCCCTATAATAAA-ACT-AA-TTGGT---CCCCCCAAAA-C-----CCCATA--CCACCCCACATAATTCTGAGAAAAGGCCC-A-GAA-GGCCCCCCACCGCCGCA-G-CACC-TAA-A---TC--TGTT----TACTTTT-T---CAAAGCAACAAAAACCAA--AACACTATA-------AAAAAAAATTTATTTA--T-CA-C-CATTTCA-CAAA-A-TA-ATTT-TA-AA-T-G-AT-TGTGGAAAGAAAAGA---AAGAT-----AAAG---CT
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TA-A--T--T-T-T-AAA-TGATTGT-------G-GAAAGA-AAA--GAAAG-A-TAA--AGCTGC---A-ATCGTAATT-AG-C---------------AAATTCCAAACTATC-AC----------C-AG------------A-TTCACACCA-TGCAGCTTATTTT-TA---CCC--C-T--A--TATTA---CAGGCCATTATCATT--------A--------------TT-------------gcaatcgtaattagcaaattccaaactatcaccagattcacaccatgcagcttatttttacccctatattacaggccattatcattattttttggttctgttgccgattatttctaattttcattcatgcatatataagaatatgtatctcaggtaagttggagattttgttttgtgtattcccgtgtttctgattttagtcgcatgaagtgaaattggcgggaaactttgaacttcaaggctcataaatacactcctgattttagatgccggtacggcaaatatatgtcaatttgtaaattttgaaatatctcttcaccactataatttggactggctctgtactgctacatctgcttacggtgctacctcaaaatttatttgaaagcaccagaaccagtcctactaggtacaagggaaaattgcaaaatgtcagatatgataacgtgaagtgttgaaattacttctgaagctccaccctgaacaatctctttatatgacaaaaggctccaccttctctccactttcgacgtccaaattggggactccagagtcagcattttacaccaag
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        aaacacaaaaggtccttttgaagctccctataataaaactaattggtccccccaaaaccccataccaccccacataattctgagaaaaggcccagaaggccccccaccgccgcagcacctaaatctgtttactttttcaaagcaacaaaaaccaaaacactataaaaaaaaatttatttatcaccatttcacaaaaA-TTA-TTTT--T-TGGTTC-TG-TTGCCGATTATTTC--TAATTTT-CATTCATGCATATATA-AGAATA-TGTAT-CTCAGGTAA-G-TTGGAG---ATT--TTGT-TTTGTG-TATTCCCGTGTT-TCTGAT------------TTTA--------GTCGCATG--AAGTGAAATT-----G-GCG--GG-AAACTTTGAACTTCAAGGCTCA-TAAA--T--A------CACT--------CCTGATTTTAGATGC-----CGGT-AC----GGCAAATAT--AT-GTCAATTTGTAAATTTTGAAATATCTC-TTCACCACTATAATTTGGACTGGCT-CTGTACTGC----TA----CATCTGCTTACGGTGCTACCTCAA----------AATTTATTTGAAAGC-ACC-AGA--ACCAGT-CCTA-C----T-A------GGTA-CA-AGGGAAA-AT--TGCAAAA-T---G---TCAGA-T-ATGA-TAACG-T-GAAGTG-TT-GAAAT-T-AC-TTCT-GAA--G--CTCCA--C-CC-T-GAACAA----TCTCT-TTATATGACAAAAGGCTCC-A--CC-TTCTCT--CCA-CT-TTCGA----CG--TCC-A-A-A-TTGGGG-ACTC-C-AGAGT-CA--GC-AT---TTTACACCAAGttttggttctgttgccgattatttctaattttcattcatgcatatataagaatatgtatctcaggtaagttggagattttgttttgtgtattcccgtgtttctgattttagtcgcatgaagtgaaattggcgggaaactttgaacttcaaggctcataaatacactcctgattttagatgccggtacggcaaatatatgtcaatttgtaaattttgaaatatctcttcaccactataatttggactggctctgtactgctacatctgcttacggtgctacctcaaaatttatttgaaagcaccagaaccagtcctactaggtacaagggaaaattgcaaaatgtcagatatgataacgtgaagtgttgaaattacttctgaagctccaccctgaacaatctctttatatgacaaaaggctccaccttctctccactttcgacgtccaaattggggactccagagtcagcattttacaccaag
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      aaacacaaaaggtccttttgaagctccctataataaaactaattggtccccccaaaaccccataccaccccacataattctgagaaaaggcccagaaggccccccaccgccgcagcacctaaatctgtttactttttcaaagcaacaaaaaccaaaacactataaaaaaaaatttatttatcaccatttcacaaaataattttaaatgattgtggaaagaaaagaaagataaagctgcaatcgtaattagcaaattccaaactatcaccagattcacaccatgcagcttatttttacccctatattacaggccattatc-AAA-TAAA----------A-GAGAAA-GAA-TGACCT-T-TATATGTCAAC---A-AG-GTGATC-AG-C--TACATATGTAAC-AAATCCAAAAC-ACC-ACAG------A
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   T-TTATT--------G--------------TT-------------AT-CAT-GAAT--TCC--T-TAT--A-------T--CT-------TAAA-----A----AACTTGT----T-TG-GA-TT--------T-TATTT----ATT-----TTATT--G-GAAA--------CATGCA-AT-TACAGAATGCT-TAT-A--AA--AA-GGT--GGG---TTT--TTTTGT----G-CCATCCC-TGTGATTTGAT------------A-----------GT-GCATG--AA-TGGA--T-----A-G-GTAGG-GAATCTTGAAC-TCAA-GCTCAGTAAATATTAG-----ATACTTAAAAATCCCTGAC---AGATGC-----TG-T-AC-TGGAGCAA---T--GGAGTCAGTATGTGAATTC-GA----TCTC-T-CATCACCACAA-TGGGACTGGCT-CTGTACTGCATCCTA----TA---------------------T----------AA------GGACAGC-AAG-AAA--AC-ATT-C-TA-CTATGT-A------CGTA-TACGG---AC-AA--TG--AAA-T---G---ACAGA-T-GCAA-TAA-G-T-TA-AGC-TT-GAAAT---AC-TTCTTGAA--G--CTACA--C-CT-TTGA-CAA----TCTCT-T---A-GACAAGAGGT-------CC-CTCTCT--CCA-TT-TTAG------G--TCT-A-A-T-TTGGAA-GCTC-C-AGAGT-C--------------ACACCAAGCccagggtgcaaatgcaaatttgaaaatttgacgcctctatatatttaattacgtctgtattgcaatttctgcacttgtcttatctaatacaatatgacagaaaaaataattgatctctgtcggtgttaaaatagatgaaaggggagaactcagttttctgcatgaaactagaatgtggttatcattcactaacgttcacatgttaatgtaaagatttctcactgcagtatgtcaggtatcagctgtatcctgcttaacggacttctaaaaacaatgagcatgacgagttaccaatttttatttcatctcctttgtaattgagagtattctaacattcttttcattttctcacgtcctaatttgatagttcacctcaatgagtctgactagtcagtttgattattcaaagtcataa
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|31 ): GGTACTGTATGGTGTGAAACTCTTAATATTGATTGAGGCTCTTATTAACACTATGATAGTATCAAGCCTTTTTTTCCATTCCC
Unaligned ( gi|35 ): TGTCATGTTTTACACATAAAGAATTCGATATAATAAATCTGTTTGGGTTTTTTTTTTTTTT
Unaligned ( gi|40 ): CTTCTAAAAACAATGGGCATGATGAGTTTCCTATTTATATTTCACCT