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lowQualScore : ....... . . ... .... .. .......... ........ . . ................................................... ... ... ... .. .. .. ...... .. ....... . .. . . . .. . . .... . .............................. .... . ........................... .. .. .. . . . . . .. ...... . ..... ........................ ...... . . . .. .. ............... . . .. ... . . . . . ... . . . . . . .. .. . ...... ..... . . . .. .......... ... .......... .. . ..... . ...... . . ... ....... ... . .. .... . ........ ................................................ . .... . ... ..
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Reference ( gi|4 ) : ACAGTAATCACTCC--TTATAACGCCAACATTTGCACTT---CGG-G-GAATTTG-ACATTAT----GATGGAGGT--------GGCATTATATCGGGG-GAGGG-GA--ACATGCGG--GGAG--G---ATGG---------AC----------A--TG---TCATGAG---AAAT---CA--T--AC--ACG----TTATTC---A---TTA-ATTAAC-CAG-G-TAGTTTGATC-AAGTGAATGGCTTCAC---CGAGTGCTA------CA--------A-------------T----T-TG-------------TC------------AAA--AT-A--ATTCAGCAAACAGTGTA-ATGCTTGTAGTCTG-AGTTTAATACGATTTCA---GGGTGTTCGCTACATA----CTCGGATTACAGATAGATTTGAACT------CAATTAATTATAAATTACACAACTTT-TC-ATCTAC--------------TTCCA-A--CTT---TAC-CAGCAGGGCTAGCAA--GGGATGATTGCTTAAGCCTGGT-CACTG-AAAGT--TTCTC--GCTG-TTG--A--TAT--T-GGGTAATTG-GTGATA-A--TTAA--------CGG---GGG----T---A-AA--TATATACG-----GTA--TA--T-G-AC---CAGT-----TTG---TAC-CT--GCA----AA-TA----T--GTTGG-------C-------------G-------------G-----T-AT-GCGGGGGATGGCGTTA-TACA-ACGGGGTTTTATACA--GTAAG
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gi|24 : atacagtaattccccattataacgccaacaT-----TTG---TAC-CTCGGCG----AA-T---------TTGG-------C-------------A-------------T-----T-ATAACGGGGG-TGCCATTA-TAT---CGGGGgagggggacgtgccaggggtgttaagctgtcatgagaaatcaaacatatttcatttactacatgtacatcaagtctttaattaatgctatcagattatcagattataattttgtttaattgacctatgacctatcatagacactacatgtagatccgacaattcctcatcatgccaagcgtagcacttttccaggctaggttgataaagcaaatagcttcacatttggtccaatatttatgtcagaacaactcatcaaatagtgtaacggacgtaaactgcagtaatatgatttcagtgtgttcgcttcactccgatttcagctagatttgaactcaaataatcataaattacataactcatgatctactcacagctttacctgaaggactaacaaaggataattacttaaatctgtacacttaacatttttcgctg
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8 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|21 ): TATAACGGGGTTTTACATGGTAAAGGAAACAGGACTTTCAATTTTTTTGGTGATATATGGGGTGCCGGTGGCATTATAACAGGAGTGGGGGGGGGGGTGTAATTATAGCAGGGGAGCAGCACTGTATATCATTTGCTGTTTGT
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Unaligned ( gi|30 ): GGCACGATAAACGGGACTTTGAAATTTATGGCGATATTCGGGGGTGGCATTATAAGGGAGGGGGTTATACCATGGGATCACTGTATTTCGCTTATTTTATAA
Unaligned ( gi|31 ): GGGGGGGTCCAGCTATAATGAGAAGTCATACATATTTTATTTACAACATCGAGTCTTTAATTAAAACTTTCAAGTTATCGGATAATAATTCCAAT
Unaligned ( gi|33 ): TACAATGAGGTTTTAGATGGTAAGAAAAACGATACTTTGGATTAATTTCTTTGGCGATATGTGGGAATGGCATTATGACGGGAGG
Unaligned ( gi|36 ): ACTCGTCGAAAGCATAAAATTCATGTATATTTCGGCTATATGCATGATATCCCATATGTCAAGGGTCCCTATATATTTGA
Unaligned ( gi|37 ): CATAACAGGGTTTTACATAGTATTAAAGAGAAAACAGGACTTTAAACTTTTTCGGTGATATGA
Unaligned ( gi|38 ): GGTTTTAGATAGTAAGAAAAACGGTACTTTGGATTAATTTCTTTGGCTATATGTGGGA
Alignments
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Reference ( family-2535 ) : ACAGTAATCCCCCGTTATA--ACGCCAACATTTGTACCT---CGG-CGAATTT--GG--CATTA---TAACGGGGGT--------G-GCATTATATCGGGGGAGGGGGA-CGTGC-GGGG---------GG---ATGNACAG-----------CTGTCATGAG---AAATCAT------AC--ATNTTATTC---A---TTA-ATTNACCAGGC-TAGTTTGATC-AAGCGAATAGCTTCAC---TGAGTACTA------C------------A------------NT---------------------T-T-G-------------TC------------AAAAC-A---ATTCACCAAATAGTGTA-ACGCATGTAGTTTGCGGNTAATATGATTTCAGCGTGTTCGCTACA------CT-C-----G-ATTTC-------AG-CTA--GATTTGAACT------CAAATAATTA--TAA----ATTACGTA-ACTT--ATC-ATCTACTCCNAA-CTT---TAC-CTGNAGGGCTAACAACGG--ATAATTGCTTAAGCCTGTT-CACCG-AAAGT-TTCTC-GCTG-T-TGA--TAT--NG-GGT-AATTG-GCGATA-A--TTAG--------C--GG---GGG----TG-AA--T--AT-A--A----C-GGT--ATTTGACCAATT--TG--TAC-C---T-GCA----AA-T-----AC--GTTGG-------C-------------G-------------G-----T-ATGCGGGGGATGGCGTTA-TATA-ACGGGGTTTTATATAGTAAG
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gi|10 : acagtaaccccccgttataaccccagcatttgtacctcggcaatttgacattataaagagggtggcgttataactggggagggaaacgtgcggggtggagatggggtaaatgtacagttgcaagtcttttattaatattattagattattagtctgtttcattatcaccaaacctatttatatttatatatttgaattttatcagacaccgtggattcaacagacgatacacGTCCCA------T------------A------------TT---------------------T-T-G-------------TC------------AAAAC-A---GTTCACCAAA-AATGTA-A-GCATGTAGTTTGCGG-TAATATGGTTTCAA-GTGTTCGCTACA------CT-C-----ACATTTC-------AT-CTA--GATTTGAACT------CAAATGATTA--TCA----ATTGCACA-ACCT--ATC-ATCTACTCCAAA-CTT---TAC-CCGTAGGA-TAAC-AC-G--ATAATTGCTTAAA-CTGTTCCACTGTAAAATGTTGTC-ACTG-T-TTGTTTAT--T--GGT-AATTC-GCGACA-A--CTAATAATATCTC--GG---GGG----TGCAA--T--TTAA--A----C-GGT--Agatag
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gi|12 : T--GG--CATTA---TAACGGGGTT--------ATACATTGTA--AGGAAAGCGGGA-Cgaaagcgggacttcgaattttttttgcaat
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gi|15 : tAATTTGATG-AAGTGAATAGCTTCAC---TGAGTACTA------C------------A------------CT---------------------T-T-G-------------TCCGACTTTTATTCAAAAC-G---ATTCACCAAATAGTGTA-ATGCATGTAGTTTGTGG-TAATATGATTTCAGCaataaattgcggtaatagg
gi|16 : atttatagacatattttcatcagtgacactatggatccaacactttctgaccgtgccaagcgtaacT---TACTCTGCAGGGC-AACAACGGGGATTCTTGCGTAAGAATGTT-CGC-G-AAAG-----------------A--T-T--AG-GGT-AATTG-GCGATA-A--GTAC--------C--GG---GGG-----A-AA--T--AT-A--A----C-GAT--ATTTAACCAATT--TG--TAC-T---C-GCG----AA-T-----AC--GTCGG-------C------------------------------------------GAATGACG-TA--ATA-ACGGGGTTTTAAGTAGT
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gi|2 : gATCAT------A----TTTTATTC---T---TTA-ATTAACCAGG-------------------GTAGCTTCAC---TGAATGCTA------T-------------------------TT---------------------T-T-G-------------TG------------GAAATTATT-ATTCATCAAATATTGTA-AAGCATATAGTTCGCGATTA-TATTATTTTAGCGT-TTCGCTATATATGTACT-CA----G-ATTCC-------AG-CTA--GATTTGAATTTGATTTCAAATCATTA--TAG----ATTACGTA-AATT--ATT-GTATGCTTCTCA-CTT---TTC-CTGCAGGGCTAACAATGG--ATAATTGTATAAGTCTGTT-CACTG-AAAGA-TTCT----TA-T-TGA--AAT--AG-GGT-AATT--GCGATA-A--TAAG--------C--GG---GGG----CG-AT--T--AT-A--A----C-GAT--ATTTTACCTATT--TG--CAC-C---T-GC-----AA-T-----AC--tttattctttaattaaccagggtagcttcactgaatgctatttttgtggaaattattattcatcaaatattgtaaagcatatagttcgcgattatattattttagcgtttcgctatatatgtactcagattccagctagatttgaatttgatttcaaatcattatagattacgtaaattattgtatgcttctcacttttcctgcagggctaacaatggataattgtataagtctgttcactgaaagattcttattgaaatagggtaattgcgataataagcgggggcgattataacgatattttacctatttgcacctgcaatacaggtacgt
gi|20 : gcagtaatccccgttataacacaaaaatttataccacgtggaggttggtattataacgggagtggcactatatcgggggagggggatgagtggtaaatgtacagctatcgtgagaaatcatggatacatattttattatttgattcacaaaggtagtttgattaagcgaatatcttcaccgagtgctccttttgtaaaaataatgattcACTG-GCGATA-A--TTAG--------G--GG---GGG----GG-GGGTT--AT-A--A----C-GGT--AATTGAACAAAC--AG--TAC-AAAAT-GTA----CA-TGTGCTAC--GTTGG-------C-------------A-------------G-----T-ATGCGGGGGATGCCCTAA-TACATACGaggtacgt
gi|21 : aatt-TATA-ACGGGGTTTTACATGGTAAaaatacggcgctttgaattgtgtggatggccattataat
gi|22 : CTTAAGCCTGTT-CACTG-AACGT-TTTTC-ACTG-T-TGA--TAT--AG-GGT-AATTG-GGGATA-A--TTAG--------T--GT---GGG----TG-CA--T--AT-A--A----C-GGT--A-TTGACCAATT--TG--TAC-C---T-ATA----AA-------A---GTTGG-------C-------------G-------------GAACAAC-ATGTGGGGGATGGCGTTA-TAaggaaacaggactttcaatttttttggtgatatatggggtgccggtggcattataacaggagtgggggggggggtgtaattatagcaggggagcagcactgtatatcatttgctgtttgt
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gi|25 : -CTT---TAC-CTGCAGGACAAACAACGG--ATAATTGCTTTAGCCTGTT-CACCA-AGAGT-GTCTC-ACAG-T-TGA--TGT--AG-GAT-AATTG-GCGATA-A--TTAT--------T--GG---GGG----TG-AT--T--AT-A--A----T-GGT--ATTGGACCAATT--gcttctcatcaactgagagccttgca
gi|26 : T---------------------T-T-G-------------TC------------ATAAC-A---ATTCACCGAATAGTGAA-ACTCATGTATATTGCGGCC-ATATGATTGCAGCGTGCGCGCTATC------CG-C-----ATGTGTC-------CT-ATA--TATTTGAACT------
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gi|3 : atCCAGGC-TAGGTTGATA-AAGCAAATAGCTTCACATTTG-GTCCAA------T------------A------------TT---------------------TAT-G-------------TC------------AGAAC-A---ACTCATCAAATAGTGTA-ACGGACGTAAACTGCAG-TAATATGATTTCAGTGTGTTCGCTTCA------CTCC-----G-ATTTC-------AG-CTA--GATTTGAACT------CAAATAATCA--TAA----ATTACATA-ACTC--ATG-ATCTACTCACAG-CTT---TAC-CTGAAGGACTAACAAAGG--ATAATTACTTAAATCTGTA-CACTT-AACAT-TTTTC-GCTG-tactacatgtacatcaagtctttaattaatgctatcagattatcagattataattttgtttaattgacctatgacctatcatagacactacatgtagatccgacaattcctcatcatgccaagcgtagcacttttccaggctaggttgataaagcaaatagcttcacatttggtccaatatttatgtcagaacaactcatcaaatagtgtaacggacgtaaactgcagtaatatgatttcagtgtgttcgcttcactccgatttcagctagatttgaactcaaataatcataaattacataactcatgatctactcacagctttacctgaaggactaacaaaggataattacttaaatctgtacacttaacatttttcgctg
gi|30 : atacagtaattccccattataacgccaacatttgtacctcagcgaatttggcattataacgggggtggcattatatcgggggagggggacgtgccaggggtgttaagctgtcatgagaaatcaaacatatttcatttactacatgtacatcaagtctttaattaatgctatcagattatcagattataattttgtttaattgacctatgacctatcatagacactacatgtagatccgacaattcctcatcatgccaagcgtagcacttttAATTTATGG--CGATA---TT-CGGGGGT--------G-GCATTATA---AGGGAGGGGG
gi|31 : ggcacgataaacgggactttga-GGGG---------GG-----GTCCAG-----------CTATAATGAG---AAGTCAT------AC--ATATTttataccatgggatcactgtatttcgcttattttataa
gi|32 : ----TG-AA--A--AT-A--A----C-GAT--ATTTG-------------TAC-C---T-ACA----AA-T-----AC--GTTGG-------T-------------G-------------G-----T----------ATGGCGT---TATA-AC-GGGTTTTACATAGCAAGttatttacaacatcgagtctttaattaaaactttcaagttatcggataataattccaat
gi|34 : ACATTTGTACCT---CAG-CG-ATTT--GG--CATTA---TTTGGGGGGT--------gaaaacgggacttttaattat
gi|34 : ---ATGTACAG-----------CTGTCATGAT---CAAT-AC------AG--AGTTTATCT---A---CTA-caaatgtacagctgtcatgatcaatacagagtttatctactacatcc
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gi|6 : tacagtaatcccccgttataccgccaacattagtacttgcatggacgaatttggcattataatgggggtcaccgccaggcgttatatcaggggagggaaaacgtgcggggtggtgatggggtaaatgtacagctgtcgtgagaaatcatacatgttttattaaatacgtcaagtcttgaattaatataatcagattatgattcttgttagttgttactaaacctatatataattatatttcatcagaggcaccttggatttaacaggtgaaacactttaccagACAGTAATCCCCTGTTATA--ACGCCAACATTTGTACCT---CGG-TGAATTT--GG--CATTATATTAAATGGGGT--------G-GCATTATTTC-GGGGAGGGGGA-TGTGC-AGAGT--------AA---ATGTACAG-----------CTGTCATGAAAATAAATCAT------ACATATTTTATTC---T---TTA-ATTTACC-GGCGTAGTTTGATC-AAGCGAATA-CTTCAC---TGAGTACTA------C------------AATTGGTCCACTTTT---------------------T-T-G-------------TC------------TAAAC-A---ATT--CCAAACAGTGTACATGCAT-TAGTTTACGGTAAATATGTTTATAGCGTGTTCGC-AC---------------------------------CTA--GATTTGAACT------CAACTAATT---TAA----ATTACGGA-ACAT--ATC-ACCTACTCCAAATTTT---TAC-CTGCAGGGCAAACAACGG--ATAATTGCTTAAGCCTGTT-CACTG-AGAGT-GTCTC-ATTG-T-T
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gi|8 : tATAATTACATAACTTTATTATCTACAGTTCTATT-ATGTACTCCACA-CTT---TAC-CTGACGGACTAACAACAT--GTAATTACCTAAACCTGTT-CCCTG-AAAGT-TTCTC-GCTT-T-TGC--GAT--AG-AAT-GATTG-GTGATA-A--TTAG-----------AG---GGG----TG-AA--T--AT-A--A----C-GGT--AATTGGCTAATT--TG--TAC-C---T-GCA----CA-T-----AC--GTTGGCAGATGAC-------------G-------------G-----T-ATGCGGGGAATGGAGT---TATA-ACGGGGTTTCAca
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5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-2535 ) : ACAGTAATCCCCCGTTATA--ACGCCAACATTTGTACCT---CGG-CGAATTT--GG--CATTA---TAACGGGGGT--------G-GCATTATATCGGGGGAGGGGGA-CGTGC-GGGG---------GG-----------ATG-----------TACAGCTGTCATGAG---AAATCAT------AC--A--TTTTAT-----TC---A---TTA-ATTTAC--CAGGC-TAGTTTGATC-AA-GCGAATAGCTTCAC---TGAGTACTA------C------------A-------------TT---------------------T-T-GTC------------AAAAC-A---ATTCACCAAATAGTGTA-ACGCATGTAGTTTGCGGT-AATATGATTTCAGCGTGTTCGCTACA------CTC-----G-ATTTC-------AG-CTA--GATTTGAACT------CAAATAATTA--TAA----ATTACGTA-ACTT--ATC-ATCTACTCCAAA-CTT---TAC-CTGCAGGGCTAACAACGG--ATAATTGCTTAAGCCTGTT-CACCG-AAAGT-TTCTC-GCTG-T-TGAT---ATA-G-GGT-AATTG-GCGATA-A--TTAG--------C--GG---GGG----TG-AA--T--AT-A--A----C-GGT--ATTTGACCAATT--TG--TAC-C---T-GCA----AA-T-----AC--GTTGG-------C-------------G-------------G-----T-ATGCGGGGGATGGCGTTA-TATA-ACGGGGTTTTACATAGTAAG
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4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-2535 ) : ACAGTAATCCCCCGTTATA--ACGCCAACATTTGTACCT---CGG-CGAATTT--GG--CATTA---TAACGGGGGT--------G-GCATTATATCGGGGGAGGGGGA-CGTGC-GGGG---------GG-----------ATG-----------TACAGCTGTCATGAG---AAATC----ATACATATTTTATTC---AC---TA-ATTTAC--CAGGC-TAGTTTGATC-AA-GCGAATAGCTTCAC---TGAGTACTA------C------------A-------------TT---------------------T-T-GTC------------AAAAC-A---ATTCACCAAATAGTGTA-ACGCATGTAGTTTGCGGT-AATATGATTTCAGCGTGTTCGCTACA------CTC-----G-ATTTC-------AG-CTA--GATTTGAACT------CAAATAATTA--TAA----ATTACGTA-ACTT--ATC-ATCTACTCCAAA-CTT---TAC-CTGCAGGGCTAACAACGG--ATAATTGCTTAAGCCTGTT-CACCG-AAAGT-TTCTC-GCTG-T-TGAT---ATA-G-GGT-AATTG-GCGATA-A--TTAG--------C--GG---GGG----TG-AA--T--AT-A--A----C-GGT--ATTTGACCAATT--TG--TAC-C---T-GCA----AA-T-----AC--GTTGG-------C-------------G-------------G-----T-ATGCGGGGGATGGCGTTA-TATA-ACGGGGTTTTACATAGTAAG
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4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-2535 ) : ACAGTAATCCCCCGTTATA--ACGCCAACATTTGTACCT---CGG-CGAATTT--GG--CATTA---TAACGGGGGT--------G-GCATTATATCGGGGGAGGGGGA-CGTGC-GGGG---------GG-----------ATG-----------TACAGCTGTCATGAG---AAATC----ATACATATTTTATTC---AC---TA-ATTTAC--CAGGC-TAGTTTGATC-AA-GCGAATAGCTTCAC---TGAGTACTA------C------------A-------------TT---------------------T-T-GTC------------AAAAC-A---ATTCACCAAATAGTGTA-ACGCATGTAGTTTGCGGT-AATATGATTTCAGCGTGTTCGCTACA------CTC-----G-ATTTC-------AG-CTA--GATTTGAACT------CAAATAATTA--TAA----ATTACGTA-ACTT--ATC-ATCTACTCCAAA-CTT---TAC-CTGCAGGGCTAACAACGG--ATAATTGCTTAAGCCTGTT-CACCG-AAAGT-TTCTC-GCTG-T-TGAT---ATA-G-GGT-AATTG-GCGATA-A--TTAG--------C--GG---GGG----TG-AA--T--AT-A--A----C-GGT--ATTTGACCAATT--TG--TAC-C---T-GCA----AA-T-----AC--GTTGG-------C-------------G-------------G-----T-ATGCGGGGGATGGCGTTA-TATA-ACGGGGTTTTACATAGTAAG
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gi|5 : tGCTTCAC---TGTGTACTA------T------------A-------------TTACTATATTTGATCCGATATTTT-T-GTC------------GAAAC-G---ATTCATCAAATAGTGTA-ACGCATGAGGATTGCGGT-AATATGATTTCA-CGTG-----------------------G-ATGTC-------CG-CTA--GATTTAAACT------CAAATAATTA--TGA----ATCACATA-ACTC--ATT-ATTTACTCCAAG-CTT---TAC-CTCAAGGGCTAACCATGG--ATAATTGCTTAGACCTGTT-CAAGG-AAAGT-TTCaaatacgtcaagtcttgaattaatataatcagattatgattcttgttagttgttactaaacctatatataattatatttcatcagaggcaccttggatttaacaggtgaaacactttaccaggcttcactgtgtactatattactatatttgatccgatatttttgtcgaaacgattcatcaaatagtgtaacgcatgaggattgcggtaatatgatttcacgtggatgtccgctagatttaaactcaaataattatgaatcacataactcattatttactccaagctttacctcaagggctaaccatggataattgcttagacctgttcaaggaaagtttc
gi|6 : tacagtaatcccccgttataccgccaacattagtacttgcatggacgaatttggcattataatgggggtcaccgccaggcgttatatcaggggagggaaaacgtgcggggtggtgatggggtaaatgtacagctgtcgtgagaaatcatacatgttttattaaatacgtcaagtcttgaattaatataatcagattatgattcttgttagttgttactaaacctatatataattatatttcatcagaggcaccttggatttaacaggtgaaacactttaccagACAGTAATCCCCTGTTATA--ACGCCAACATTTGTACCT---CGG-TGAATTT--GG--CATTATATTAAATGGGGT--------G-GCATTATTTC-GGGGAGGGGGA-TGTGC-AGAGT--------AA-----------ATG-----------TACAGCTGTCATGAAAATAAATC----ATACATATTTTATTC---TT---TA-ATTTAC--C-GGCGTAGTTTGATC-AA-GCGAATA-CTTCAC---TGAGTACTA------C------------AATTGGTCCACTT-TT---------------------T-T-GTC------------TAAAC-A---ATT--CCAAACAGTGTACATGCAT-TAGTTTACGGTAAATATGTTTATAGCGTGTTCGC-AC--------------------------------CTA--GATTTGAACT------CAACTAATT---TAA----ATTACGGA-ACAT--ATC-ACCTACTCCAAATTTT---TAC-CTGCAGGGCAAACAACGG--ATAATTGCTTAAGCCTGTT-CACTG-AGAGT-GTCTC-ATTG-T-T
gi|7 : atACAGTAATCCCCCGTTATA--ACGCCAGCATTTGTACCT---CAG-CATAATT--GGTATATTA---TGAC--GGGT--------T-GCATTATATGGGGGGGGGGGGG----GG-GGGG---------GGTAA--------ATG-----------TACAGCTGTCATGAG---AAAGC----ATGCATATTTTATTCCCTACATTTA-ATTTAC--CAGGC-TAGTTTGATC-AA-GCGAATAGCTGAAC---TGATTACTA------CATTGGTCCCAT-A-------------TT---------------------T-T-GTC-------------AAAC-A---ATTCACTAAAGAGTGTG-AGGCATGTAGTTTGCGGT-AATATAGTTTCAGTGTGTTCGCTATC------CTC-----GAATTTC-------AC-CT-----TTTGATCT------CAAATAATCA--TAA----ATTACATA-ACCT--ATCAATCTACTCCAAA-CTT---TAC-CTGTAAGACAAACAACGA--ATAATTGCATAAACCTGTT-CACTG-
gi|8 : tATAATTACATAACTTTATTATCTACAGTTCTATT-ATGTACTCCACA-CTT---TAC-CTGACGGACTAACAACAT--GTAATTACCTAAACCTGTT-CCCTG-AAAGT-TTCTC-GCTT-T-TGCG---ATA-G-AAT-GATTG-GTGATA-A--TTAG-----------AG---GGG----TG-AA--T--AT-A--A----C-GGT--AATTGGCTAATT--TG--TAC-C---T-GCA----CA-T-----AC--GTTGGCAGATGAC-------------G-------------G-----T-ATGCGGGGAATGGAGT---TATA-ACGGGGTTTCACca
gi|9 : ggATTTCAGTTTGTCCACCATA------TTCATGCAG-ATTTATGAAATAAGACTACAGATTTTAACT------CCGATAATTA--TAA----TTTATGTA-AC----AT--ATCTACTCTATA-CTTTGGTAC-TTGGAAGACTAACTGCGG--ATGTTTGCTTAATCCGGCC-CACTG-AAATT-TTCTT-GCCG-T-TAAT---AT--T-AGT-AATTG-GTGATA-A--TTAG--------CAAGG---GTG----TG-AA--------A--A----CTGAT--AATTGAGCAAAT--CA--TAT-G---T-GTA----AG-T-----AC--ATTGG-------C-------------GGGTGGCA------G-----T-GTTTGGGGAATGGTGGT--TGTA-ATGGGATTTTTTGTAGTAAGgaaaacaggactctgaaattttggggcgatatgcattataacaggggtatgacagggaatcactgtattt
blockSeqs : TA GCA A AT TA TAT CG CACCGCCA T AC GCGGGGTGGTGATGGGGTAAATG AAT ATGG CCCTACATT C AT CG CG T ATT TATTACTATATTTGATCCGATATTT A T CGACTTTTATTC T ATG T C T T T C T ATATGTACTCAG TGAAATAAGA CA TGATTT CA CTTT A C C CT CA T TGG T T T GG C T T G A C G ACGA TT C C C CT ATAATATCTC GCA CCCG C TCT A CG CCTC T TA T T TGAT A AAA A TGTA T GTGCT . CAGATGGTACACGTGGTATGC TA T G
blockSeqs : . . . . . . AA . . C GCGGGGGGATGGGTGGGTAATG . A CTC C . C G . . CTACTGGTCCGATATT . . . . TT T . T A A T T ATTCATGCAG AT . . . . G . C . C . . . C A . . C . . . . . T GT . . . . GCAA . . . TTT . C . . . T T GCTA . . . . . . . CAGATGACGGTATGC AA . G
blockSeqs : . . . . . . CG . . C GGGGGGGGTAAATG . . ATT . . C C . . CAATTGGTCCACTTTT . . . . . T . A T . C T ATACTCGG AG . . . . G . T . C . . . T T . . T . . . . . A G . . . . TC . . . GTT . T . . . T T TG . . . . . . . CGGGTGGCAGTGTTT TA . G
blockSeqs : . . . . . . CG . . T GCTGAAGGGGGG . . CTT . . G T . . CATTGGTCCCATATT . . . . . T . C T . C T ACTCAC CT . . . . A . T . T . . . C T . . T . . . . . A G . . . . GT . . . T . . . . . C T TG . . . . . . . CGGAACAACATGT TA . G
blockSeqs : . . . . . . CG . . C GCGGGGAGGATG . . TAC . . T T . . TTTGGTCAATGTTT . . . . . T . C T . T T CCGCAT AG . . . . A . T . G . . . C A . . C . . . . . A G . . . . CC . . . T . . . . . T A TG . . . . . . . CGGTAATGC T . G
blockSeqs : . . . . . . CG . . T GCAGAGTAAATG . . TAC . . C A . . TATT . . . . . T . T A . G T ACTCCG AG . . . . A . T . C . . . C T . . T . . . . . A G . . . . GC . . . T . . . . . T T AG . . . . . . . CAGTATGC . . A
blockSeqs : . . . . . . TG . . T GTGGTAAATG . . TAC . . C C . . CACT . . . . . C . C A . C T CCTCGA CG . . . . G . A . T . . . A T . . T . . . . . G G . . . . GG . . . A . . . . . A T TG . . . . . . . CGGTATGC . . G
blockSeqs : . . . . . . TG . . C GCCAGGGGTG . . TAC . . . C . . CCTT . . . . . C . C T . C C G AC . . . . A . C . C . . . C T . . G . . . . . A G . . . . GT . . . T . . . . . T T TG . . . . . . . TGGT . . G
blockSeqs : . . . . . . TG . . C TCGGGAAGG . . TAC . . C . . TATT . . . . . T . T T . T . . . . . . . C . T . T . . . A A . . T . . . . . A G . . . . TT . . . T . . . . . T T TG . . . . . . . TGGT . . G
blockSeqs : . . . . . . TG . . C CAAATG . . CAT . . . . CAAT . . . . . C . G A . T . . . . . G . . . . . . . C A . . T . . . . . A T . . . . AC . . . T . . . . . T A CA . . . . . . . C . . .
blockSeqs : . . . . . . AT . . T AAATG . . CTT . TTT . . . . . G . . T . . . . . T T . . T . . . . . . . . . . . C . . . A . . . . . A . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . C . . . AAATG . . ATT . . . . . . . . T . . . . A T . . T . . . . . . . . G . . . T . . . . . A . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . T . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . T . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqCons : GCGGGGGGTAAATG***************************** ACTCGG*********** ** CGGTATGC*************************************** ***
originalCons : ACAGTAATCCCCCGTTATA--ACGCCAACATTTGTACCT---CGG-CGAATTT--GG--CATTA---TAACGGGGGT--------G-GCATTATATCGGGGGAGGGGGA-CGTGC-GGGG---------GG-----------ATG-----------TACAGCTGTCATGAG---AAATC----ATACATATTTTATTC---AC---TA-ATTTAC--CAGGC-TAGTTTGATC-AA-GCGAATAGCTTCAC---TGAGTACTA------C------------A-------------TT---------------------T-T-GTC------------AAAAC-A---ATTCACCAAATAGTGTA-ACGCATGTAGTTTGCGGT-AATATGATTTCAGCGTGTTCGCTACA------CTC-----G-ATTTC-------AG-CTA--GATTTGAACT------CAAATAATTA--TAA----ATTACGTA-ACTT--ATC-ATCTACTCCAAA-CTT---TAC-CTGCAGGGCTAACAACGG--ATAATTGCTTAAGCCTGTT-CACCG-AAAGT-TTCTC-GCTG-T-TGAT---ATA-G-GGT-AATTG-GCGATA-A--TTAG--------C--GG---GGG----TG-AA--T--AT-A--A----C-GGT--ATTTGACCAATT--TG--TAC-C---T-GCA----AA-T-----AC--GTTGG-------C-------------G-------------G-----T-ATGCGGGGGATGGCGTTA-TATA-ACGGGGTTTTACATAGTAAG
finalCons : ACAGTAATCCCCCGTTATA--ACGCCAACATTTGTACCT---CGG-CGAATTT--GG--CATTA---TAACGGGGGT--------G-GCATTATATCGGGGGAGGGGGA-CGTGCGGGGGGTAAATG-----------------------------TACAGCTGTCATGAG---AAATC----ATACATATTTTATTC---AC---TA-ATTTAC--CAGGC-TAGTTTGATC-AA-GCGAATAGCTTCAC---TGAGTACTA------C------------A-------------TT---------------------T-T-GTC------------AAAAC-A---ATTCACCAAATAGTGTA-ACGCATGTAGTTTGCGGT-AATATGATTTCAGCGTGTTCGCTACACTCGG-----------ATTTC-------AG-CTA--GATTTGAACT------CAAATAATTA--TAA----ATTACGTA-ACTT--ATC-ATCTACTCCAAA-CTT---TAC-CTGCAGGGCTAACAACGG--ATAATTGCTTAAGCCTGTT-CACCG-AAAGT-TTCTC-GCTG-T-TGAT---ATA-G-GGT-AATTG-GCGATA-A--TTAG--------C--GG---GGG----TG-AA--T--AT-A--A----C-GGT--ATTTGACCAATT--TG--TAC-C---T-GCA----AA-T-----AC--GTTGGCGGTATGC---------------------------------------GGGGGATGGCGT---TATA-ACGGGGTTTTACATAGTAAG
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|27 ): GGCGGATGACATTAAAACAGGGATCTACATAGAAAGAAAACCGGACTTTGGACTTTTTTTCGCGAAATGCGGTGATGGCAATTTTACGCAGGGCAATATGCTGAGGGATTACTGTA
Unaligned ( gi|33 ): TACAATGAGGTTTTAGATGGTAAGAAAAACGATACTTTGGATTAATTTCTTTGGCGATATGTGGGAATGGCATTATGACGGGAGG
Unaligned ( gi|36 ): ACTCGTCGAAAGCATAAAATTCATGTATATTTCGGCTATATGCATGATATCCCATATGTCAAGGGTCCCTATATATTTGA
Unaligned ( gi|38 ): GGTTTTAGATAGTAAGAAAAACGGTACTTTGGATTAATTTCTTTGGCTATATGTGGGA
Alignments
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lowQualScore : 44 555 3 33 33 444 3 99999999 2 1 00000000000000000000000000000000000000000000000 555 8888 666666666 7 66 88 55 3 555 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444 2 2 444444444444 2 888 2 3 6 1 3 3 3 1 555555555555555555 0 7777777777 55 000000 55 7777 1 3 1 55 66 3 555 2 2 1 33 2 6 2 2 2 2 3 6666 666 3 3 3 44 888888888888 555 5555 2 88888 2 99 5555 2 0 33 3 1 444444 3 555 3 6666 3 77777 44 00000000000000000000000000000000000000000000000 3 44 5
lowQualScore : .. ... . .. .. ... . ........ . . ............................................... ... .... ......... . .. .. .. . ... ........................................................ . . ............ . ... . . . . . . . . .................. . .......... .. ...... .. .... . . . .. .. . ... . . . .. . . . . . . . .... ... . . . .. ............ ... .... . ..... . .. .... . . .. . . ...... . ... . .... . ..... .. ............................................... . .. .
lowQualScore : 66 444 3 99 44 444 4 11111111 5 4 55555555555555555555555555555555555555555555555 444 9999 888888888 3 11 11 66 6 888 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111 7 7 666666666666 9 999 9 1 5 0 1 1 7 2 888888888888888888 6 2222222222 00 555555 00 7777 0 6 9 00 33 1 000 9 4 9 99 7 3 7 7 9 9 1 5555 333 3 1 1 22 222222222222 444 7777 7 77777 7 00 7777 7 3 77 0 6 333333 1 444 1 5555 1 77777 66 99999999999999999999999999999999999999999999999 6 22 2
consensus : ACAGTAATCCCCCGTTATA--ACGCCAACATTTGTACCT---CGG-CGAATTT--GGCAT--TA---TAACGGGGGT--------G-GCATTATATCGGGGGAGGGGGA-CGTGC----GG---------GG---------GG-----T-A---AATGTACAGCTGTCATGAG---AAATC----ATACATATTTTATTC---AC---TA-ATTTAC--CAGGC-TAGTTTGATC-AA-GCGAATAGCTTCAC---TGAGTACTA------C------------A-------------TT---------------------T-T-GTC------------AAAAC-A---ATTCACCAAATAGTGTA-ACGCATGTAGTTTGCG-GT-AATATGATTTCAGCGTGTTCGCTAC--A------CTCG----GATTTC-------AG-CTA--GATTTGAACT------CAAATAATTA--TAA----ATTACGTA-ACTT--ATC-ATCTACTCCAAA-CTT---TAC-CTGCAGGGCTAACAACGG--ATAATTGCTTAAGCCTGTT-CACCG-AAAGT-TTCTC-GCTG-T-TGAT---ATA-G-GGT-AATTG-GCGATA-A--TTAG--------C--GG---GGG----TG-AA--T--AT-A--A----C-GGT--ATTTGACCAATT--TG--TAC-C---T-GCA----AA-T-----AC--GTTGG-------C-------------G-------------G-----TA-TGCGGGGGATGGC-GTTAT--AACGGGGTTTTACATAGTAAG
Reference ( family-2535 ) : ACAGTAATCCCCCGTTATA--ACGCCAACATTTGTACCT---CGG-CGAATTT--GGCAT--TA---TAACGGGGGT--------G-GCATTATATCGGGGGAGGGGGA-CGTGC----GG---------GG---------GG-----T-A---AATGTACAGCTGTCATGAG---AAATC----ATACATATTTTATTC---AC---TA-ATTTAC--CAGGC-TAGTTTGATC-AA-GCGAATAGCTTCAC---TGAGTACTA------C------------A-------------TT---------------------T-T-GTC------------AAAAC-A---ATTCACCAAATAGTGTA-ACGCATGTAGTTTGCG-GT-AATATGATTTCAGCGTGTTCGCTAC--A------CTCG----GATTTC-------AG-CTA--GATTTGAACT------CAAATAATTA--TAA----ATTACGTA-ACTT--ATC-ATCTACTCCAAA-CTT---TAC-CTGCAGGGCTAACAACGG--ATAATTGCTTAAGCCTGTT-CACCG-AAAGT-TTCTC-GCTG-T-TGAT---ATA-G-GGT-AATTG-GCGATA-A--TTAG--------C--GG---GGG----TG-AA--T--AT-A--A----C-GGT--ATTTGACCAATT--TG--TAC-C---T-GCA----AA-T-----AC--GTTGG-------C-------------G-------------G-----TA-TGCGGGGGATGGC-GTTAT--AACGGGGTTTTACATAGTAAG
gi|1 : ACAGTAACCCCCCGTTATA--ACCCCAGCATTTGTACCT---CGG-C-AATTT--GACAT--TA---TAAAGAGGGT--------G-GCGTTATAACTGGGGAGGGAAA-CGTGC----GGGGTGGAGATGG---------GG-----T-A---AATGTACAGTTG
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gi|10 : acagtaaccccccgttataaccccagcatttgtacctcggcaatttgacattataaagagggtggcgttataactggggagggaaacgtgcggggtggagatggggtaaatgtacagttgcaagtcttttattaatattattagattattagtctgtttcattatcaccaaacctatttatatttatatatttgaattttatcagacaccgtggattcaacagacgatacacGTCCCA------T------------A-------------TT---------------------T-T-GTC------------AAAAC-A---GTTCACCAAA-AATGTA-A-GCATGTAGTTTGCG-GT-AATATGGTTTCAA-GTGTTCGCTAC--A------CTCA----CATTTC-------AT-CTA--GATTTGAACT------CAAATGATTA--TCA----ATTGCACA-ACCT--ATC-ATCTACTCCAAA-CTT---TAC-CCGTAGGA-TAAC-AC-G--ATAATTGCTTAAA-CTGTTCCACTGTAAAATGTTGTC-ACTG-T-TTGT---TTATT-GGT-AATTC-GCGACA-A--CTAATAATATCTC--GG---GGG----TGCAA--T--TTAA--A----C-GGT--Agatag
gi|11 : tacaattg-CTA--GATTCAAACT------TAATTAATTA--TAA----ATTACGTA-ACCT--ATC-ACCTACTCCAAA-CTT---TAC-CTGCAGGGCAAACAATGG--ATAATTTCTTAAGCCTGTT-CACCA-AGAGT-GGTTC-ACAG-TGGGATACGATA---GGT-AA-TG-GCAGTA-ACTCTAT--------C--GGGCAGAG----TG-AATCT--AT-AC-ACCTCC-G----ATTTGAACAA-G--TGATTAC-C---GAGTA----GATT-----ACGGGTTGG-------C-------------GCCGAGGCAGTTCAG-----TA----GGGGGATGCT-AGTAT--AAC-GGGTTATATAGAGTAAGatcatgccatgtaactca
gi|12 : acCTCAAAA-CTT---TAC-TTGTAAGGCTAACAACGG--GTGATTGCTT--------------------T-TTCTT-GTTG-T-TGAA---ATA-G-GGT-AATTG-GCGATA-A--TTTG--------T--GG---GGGCCCGTG-AA--T--AT-A--A----C-GGC--ATTTGACCAATT--TG--TAC-C---T-GTA----AA-T-----AC--GTTGG-------CAGATGGTACACGTG-------------G-----TA-TGCGGGGGATGGC-ATTAT--AACGGGGTTATACATTGTAAGgaaaaga
gi|12 : T--GGCAT--TA---TAACGGGGTT--------ATACATTGTA--AGGAAAGCGGGA-Cgaaagcgggacttcgaattttttttgcaat
gi|13 : ctcaaaactttacttgtaaggctaacaacgggtgattgctttttcttgttgttgaaatagggtaattggcgataatttgtgggggcccgtgaatataacggcatttgaccaatttgtacctgtaaatacgttggcagatggtacacgtggtatgcgggggaACAGTAAATTCCCGTTATA--ACGCCAACATTTGTGCCT---CGA-CGA-----------------------GGGGT--------G-GCATTATATCGGAGG----------TG----------------GG---------GG-----T---------TACAGCTCTCATGAG---AAATC----ATACATATTTTATTT---AC---TA-CTTCAttcgaattttttttgcaat
gi|14 : AT--TA---TAAAAGGGGT--------G-TTATTATATCCGTGGATGGG-A-CGTGC----GG---------GG---------GGATGGGT-GGGTAATGTAATGCTCTCATGAC---AAATT----ATACAC-TTTT-TTC---TC---TT-TTTTCC--CAGGC-TAGCTTGATCGAA-GTGAATAGCTTCAC---TGAGTA-TATTTGGTC------------AATGT---------TT---------------------T-T-GTC------------AAAGT-A---ATTCACCAAA------A-A------TAAATTGCG-GT-AATAagtcttcaattaacgcttgtagattatcagattataactccgtttaattgtcaccaaacctagttataacagtgtattattggactttg
gi|15 : tAATTTGATG-AA-GTGAATAGCTTCAC---TGAGTACTA------C------------A-------------CT---------------------T-T-GTCCGACTTTTATTCAAAAC-G---ATTCACCAAATAGTGTA-ATGCATGTAGTTTGTG-GT-AATATGATTTCAGCgg
gi|16 : atttatagacatattttcatcagtgacactatggatccaacactttctgaccgtgccaagcgtaacT---TACTCTGCAGGGC-AACAACGGGGATTCTTGCGTAAGAATGTT-CGC-G-AAAG-----------------AT----TA-G-GGT-AATTG-GCGATA-A--GTAC--------C--GG---GGG-----A-AA--T--AT-A--A----C-GAT--ATTTAACCAATT--TG--TAC-T---C-GCG----AA-T-----AC--GTCGG-------C------------------------------------------GAATGAC-GTAAT--AACGGGGTTTTAAGTAGT
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gi|2 : CAGTAATCCCC-GTTATA--ACACAAAAATTTATACCA---CGT-GGAGGTT--GGTAT--TA---TAACGGGAGT--------G-GCACTATATCGGGGGAGGGGGA-----T----GA---------GT---------GG-----T-A---AATGTACAGCTATCGTGAG---AAATCATGGATACATATTTTATTA---TT---TG-ATTCAC--AAAGG-TAGTTTGATT-AA-GCGAATATCTTCAC---CGAGTGCT-------C------------C-------------TT---------------------T-T-GTA------------AAAAT-AATGATTCATCATATgaaaaataatagataatatag
gi|2 : gTC----AT-CATATTTTATTC---TT---TA-ATTAAC--CAGG--------------------GTAGCTTCAC---TGAATGCTA------T--------------------------TT---------------------T-T-GTG------------GAAATTATT-ATTCATCAAATATTGTA-AAGCATATAGTTCGCG-AT-TATATTATTTTAGCGT-TTCGCTAT--ATATGTACTCA----GATTCC-------AG-CTA--GATTTGAATTTGATTTCAAATCATTA--TAG----ATTACGTA-AATT--ATT-GTATGCTTCTCA-CTT---TTC-CTGCAGGGCTAACAATGG--ATAATTGTATAAGTCTGTT-CACTG-AAAGA-TTCT----TA-T-TGAA---ATA-G-GGT-AATT--GCGATA-A--TAAG--------C--GG---GGG----CG-AT--T--AT-A--A----C-GAT--ATTTTACCTATT--TG--CAC-C---T-GC-----AA-T-----AC--tttattctttaattaaccagggtagcttcactgaatgctatttttgtggaaattattattcatcaaatattgtaaagcatatagttcgcgattatattattttagcgtttcgctatatatgtactcagattccagctagatttgaatttgatttcaaatcattatagattacgtaaattattgtatgcttctcacttttcctgcagggctaacaatggataattgtataagtctgttcactgaaagattcttattgaaatagggtaattgcgataataagcgggggcgattataacgatattttacctatttgcacctgcaatacaggtacgt
gi|20 : gcagtaatccccgttataacacaaaaatttataccacgtggaggttggtattataacgggagtggcactatatcgggggagggggatgagtggtaaatgtacagctatcgtgagaaatcatggatacatattttattatttgattcacaaaggtagtttgattaagcgaatatcttcaccgagtgctccttttgtaaaaataatgatACTG-GCGATA-A--TTAG--------G--GG---GGG----GG-GGGTT--AT-A--A----C-GGT--AATTGAACAAAC--AG--TAC-AAAAT-GTA----CA-TGTGCTAC--GTTGG-------C-------------A-------------G-----TA-TGCGGGGGATGaggtacgt
gi|21 : aattTAT--AACGGGGTTTTACATGGTAAccctaatacatacgaaatacggcgctttgaattgtgtggatggccattataat
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gi|6 : tacagtaatcccccgttataccgccaacattagtacttgcatggacgaatttggcattataatgggggtcaccgccaggcgttatatcaggggagggaaaacgtgcggggtggtgatggggtaaatgtacagctgtcgtgagaaatcatacatgttttattaaatacgtcaagtcttgaattaatataatcagattatgattcttgttagttgttactaaacctatatataattatatttcatcagaggcaccttggatttaacaggtgaaacactttaccagACAGTAATCCCCTGTTATA--ACGCCAACATTTGTACCT---CGG-TGAATTT--GGCAT--TATATTAAATGGGGT--------G-GCATTATTTC-GGGGAGGGGGA-TGTGC---------------AG---------AG-----T-A---AATGTACAGCTGTCATGAAAATAAATC----ATACATATTTTATTC---TT---TA-ATTTAC--C-GGCGTAGTTTGATC-AA-GCGAATA-CTTCAC---TGAGTACTA------C------------AATTGGTCCACTT-TT---------------------T-T-GTC------------TAAAC-A---ATT--CCAAACAGTGTACATGCAT-TAGTTTACG-GTAAATATGTTTATAGCGTGTTCGC-AC---------------------------------CTA--GATTTGAACT------CAACTAATT---TAA----ATTACGGA-ACAT--ATC-ACCTACTCCAAATTTT---TAC-CTGCAGGGCAAACAACGG--ATAATTGCTTAAGCCTGTT-CACTG-AGAGT-GTCTC-ATTG-T-T
gi|7 : atACAGTAATCCCCCGTTATA--ACGCCAGCATTTGTACCT---CAG-CATAATT--GGTATATTA---TGACGGG--T--------T-GCATTATATGGGGGGGGGGGGG-GG-------GG---------GG---------GG-----T-A---AATGTACAGCTGTCATGAG---AAAGC----ATGCATATTTTATTCCCTACATTTA-ATTTAC--CAGGC-TAGTTTGATC-AA-GCGAATAGCTGAAC---TGATTACTA------C------------A-------------TTGGTCCCATATT----------T-T-GTC------------AAA-C-A---ATTCACTAAAGAGTGTG-AGGCATGTAGTTTGCG-GT-AATATAGTTTCAGTGTGTTCGCTAT--C------CTCG----AATTTC-------AC-CT-----TTTGATCT------CAAATAATCA--TAA----ATTACATA-ACCT--ATCAATCTACTCCAAA-CTT---TAC-CTGTAAGACAAACAACGA--ATAATTGCATAAACCTGTT-CACTG-
gi|8 : tATAATTACATAACTTTATTATCTACAGTTCTATT-ATGTACTCCACA-CTT---TAC-CTGACGGACTAACAACAT--GTAATTACCTAAACCTGTT-CCCTG-AAAGT-TTCTC-GCTT-T-TGCG---ATA-G-AAT-GATTG-GTGATA-A--TTAG-----------AG---GGG----TG-AA--T--AT-A--A----C-GGT--AATTGGCTAATT--TG--TAC-C---T-GCA----CA-T-----AC--GTTGGCAGATGAC-------------G-------------G-----TA-TGCGGGGAATGGA-GTTAT--AACGGGGTTTCACca
gi|9 : ggATTTCAGTTTGTCCACCAT--A------TTCATGCAGATTTATGAAATAAGACTACAGATTTTAACT------CCGATAATTA--TAA----TTTATGTA-AC----AT--ATCTACTCTATA-CTTTGGTAC-TTGGAAGACTAACTGCGG--ATGTTTGCTTAATCCGGCC-CACTG-AAATT-TTCTT-GCCG-T-TAAT---AT--T-AGT-AATTG-GTGATA-A--TTAG--------CAAGG---GTG----TG-AA--------A--A----CTGAT--AATTGAGCAAAT--CA--TAT-G---T-GTA----AG-T-----AC--ATTGG-------C-------------GGGTGGCA------G-----TG-TTTGGGGAATGGTGGTTGT--AATGGGATTTTTTGTAGTAAGgaaaacaggactctgaaattttggggcgatatgcattataacaggggtatgacagggaatcactgtattt
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