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gi|2 : tatcgcatatggtagctgtctaaatatatgcaaatttataacaagggtatcataaccaattccggaaaaacgtatgcggccgagcaaaacaaccccgagactaaaattttaattaccccctttgcaaaattcatatgtttagaccggtgagaaggataaaatttgtctcacgttaaatacagctttataaataattaatatttttagtgcttaatttgttttgcattctgctaattataagacatccattacaccattttacttttcgattgtgtcacgaatggcccaatttattcggattgaagactgatattaaaaaaaaaattctatgaacccccctaagtgacattttcgagctaaacagtGTGTCATGCCTCTAGTCGGAAAGCGAACGTGAGCTtagatccatcccacacctgtcagacgtcggaacctcgcagcagggggaccaacatggagttctacgcataacaatcctggaaacatttcagggtaagggttatttgttccgcctaggcgtttctgatcaattttaccactatctatttcccacactttttatgacgcgaatagtgcctgcgccagctcagtttacttagcatattagggctccatggtgctatgtgaaatatgccaccttccctttatgcaccatatgttgctttttccatgggattattacgtacaccatgagagagcattgctactaaggcaacatattcctcttccccctgcatcgatatcgttgttttcccattggctaccacgtacacattagcgcatctaattaacgcaatcccctctcctccctggaatgtttctgttgcttttattcattgggtacacacagtagatcattctattaacgcaaacc
gi|2 : aatattgcaatatggtagcctaatgtctcatatagtgcgaatttatagcagggttgaaaatactatacaaattaatccgaaaaattgttatgcggccttgagtgcaaaccaagcccgatactaaaattggtaaattaaccgccctccccgcatttggtcccgccttttatgcaaattttgttagaatcggtgaagaggataattcgtctccgtaaatacatcttttagtaaattaatgaatttgtttagtgctaatttgtttgcattctgctatttatatagacatccatttaacaacgtattatgttcttattgtgtcctcgatggcctcaaatttattctggattgaagcggataaaaaaaaaaaatctgcttagtggacctaaccacgtgacattttaagcttaaagttgggtctcctggaccgctcttcttctgtttaatataaactaacctatttcccggtattttatatctcttaatcttttttgtttttgtgtgctacccgagaccggaaccgagacctgacttttagacacacccGCAAGACTGCCCCAACCTGAAC-----CACACGG-T--A-CACGTGGTGAC-CCG-------CGGT----GGTCACTCCTG-CAAC---------CCGCGGTG-GT--Cnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngcaagactgccccaacctgaaccacacggtacacgtggtgacccgcggtggtcactcctgcaacccgcggtggtcccttctgagcaaagggagatagtccatcccacagccgtcaacatcggaaccttgcagacagggggaccaacaaatggagtctacgcatacaaccacggagcaaattcgggtagggtttattttgttcccctagtcgtttctagtcaattttacacgattaattccccacaatttttatgacgaatagtgcctgctcagctagtttacttacgcataattatataggctccatgttggctatgtgcaaatttggcaccttctctttttacactattatgttgctattcccatggggtatttattgcgtacacaagagcatgctgctaagcaaatattccctcttcccccttgcatgatgctgttgcttttcccatcgggtaccacgtatacattagcgcatactacttagagcaaaaaaaaataccctctcctccctggcatgtttctgttgcttttctcattaggtaaacacgtagatcattctattaagcaaact
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gi|4 : tatcgcatatggtagctgtctaaatatatgcaaatttataacaagggtatcataaccaattccggaaaaacgtatgcggccgagcaaaacaaccccgagactaaaattttaattaccccctttgcaaaattcatatgtttagaccggtgagaaggataaaatttgtctcacgttaaatacagctttataaataattaatatttttagtgcttaatttgttttgcattctgctaattataagacatccattacaccattttacttttcgattgtgtcacgaatggcccaatttattcggattgaagactgatattaaaaaaaaaattctatgaacccccctaagtgacattttcgagctaaacagtTCGAA-TATGGTAGC-TA--GTCT-AATA-----TA-TGC-AAATTTAT-A-CAAGTGT-----AT-C-TA-A-CAA--T--TCCGG--AAAT--GT-T--GCGGCC--AAG--CAAACCAACCCCGGATACTAGAAT-T--TCCACCA--------------------TC------TT-CCTTTT---CAAA--TC-TATGTTTAGATCGGTAA-G--ACGTGATAAAAT-TCGTC-TCCGT--AA-T--ATACTTTA--TA---AATTAA---AATT-TATAGTGC-TAATTGA-ATTGCATTCGGC----TATT-T-AGACATTCAT-TT-AC-A-CGTTTTA-ATTCTT-ATTGTGTCC--CG-ATGGCT-AAAATTT--ATTC-GGATTGAAG-CGGAT-----AGAAAATTT--TTGCTATGGACCTAACAA--CGTGACAT-TTCTAGT-----TAAAGTTTGGTCTCGGCGCG-CTCTT-CTTTAATAT--CACTATACCTATTCCGGTATTTTTA-TATCTCTT-A--ATTTTTG-TTTTTGT-TGCTACTGA-GTGGCATGCCTA-AGTC-GAAAGCGAA-GTGAGC-AGAC-AGCCCAAC-C-G-AACCCCAGCGGCCACACGTGGTCACCGC-AGGCCGA----CAGCAA-----A-CCCGC-GTGCGTC--AC--ATCTGAGC-AACGGTAGACTAAG-TCCATCCCACAGGCCGTCCA-ACATCGGAACC-TCACA-------------AA--CACATGGAGT-CTAACGCATG-CAAATCACGG-----A-TTT----T---GTT--TTTTGTT-CC-CC-AGTACGTTT-CTAGTCAATTTT-ATCAACGATTAATTTC-CCAGATTAATTTTCCAACATT-TTTTATGA-G--AGTAGT-GCCTGC-CCAGCTGAGTTTACCTATGGCATTAT-ATTA---GGGCTCCCATATTAGCTACGAGCAAATTTGGCAACCTTC-C----T-TGCACT-TTATTGTT-GCTTTTTCCCTTGGGTA----T--TGCGTA-CT-C-ATGTAG--AGCAATT-CTACTAAGGC-AA-AAAAAAAGT--CCTCTCGCTGCCCTTGC-T-GATT-CTGTTGCTTTTCTCATTGGGTACA--ACATACATAc
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blockSeqs : . . . . . . . . . ATCA . . T . T . . . . ATCAA TCGTCACT . . . . A . . CGT . T . . ACAG . . T T . . . T T A T . AC C . . A . . A . . . A G . A C . . . TCTGTTTAATATAAA ATA ATTTCC AT C . A T . . AA . . A TGC . . . G G G GCAGGCCGACAGCAAA G . . . . G TAGA A . T A . A . . . . . . . . . . . . . C . CACT . C . . . G . . . AG TT . . C . . . . TAA . . . T T A . . CT . A . C CTT . A C G . A . . AC AAAAAAA T A C . A CA . . . . C C . . T A G A C C T G T . C TG A C CA . . G . . . . . . . . . A G . T C T C C G G AG . . A . . . A . C T . . . C CC .
blockSeqs : . . . . . . . . . ATC . . T . T . . . . TTTA TC . . . . A . . TGA . T . . ATA . . T A . . . . T A . . A A . . . . . . . . . . T . . C . . . TTAATACCA AA TATT TT C . A . . . A . . T TG . . . G G C GTAGGCGACAACAA T . . . . T TAA A . A G . A . . . . . . . . . . . . . . . CAA . T . . . . . . . AG T . . C . . . . AT . . . T T . . . C . A . T CGC . T G G . . GA . T A A . C . . . . . C T . C C A C GA . . T . . . . . . . . . . A . G . T . . A G A . . A . . . A . C T . . . T G .
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blockSeqs : . . . . . . . . . ATC . . T . T . . . . TTT TT . . . . A . . AG . G . . . . G G C GAC G . . . . G TAG A . A A . . . . . . . . . . . . . . . . . CA . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . T . . . . . . G .
blockSeqs : . . . . . . . . AT . . T . C . . . . TTT TC . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . T A . A G . . . . . . . . . . . . . . . . .
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Reference ( family-2518 ) : ATCGCA-TATGGTAGC-TA--GTCT-AATA-----TA-TGC-GAATTTAT-A-CAAGGGT-----AT-C-TA-A-CAA--T--TCCGG--AAAN--GT-T--GCGGCC--GAG--CAAACCAACCCCGGATACTAGAATT----------------T-C-----ATT--ATC------TC-CCTTTT---CAAA--TC-TATGTTTAGATCGGTGA-G--ACGNGATAAAAT-TCGTCT-C-CGT--AA-TACA-CTTT--A--TA---AATTAAT--ATTT-TTTAGTGC-TAATTTG-TTTGCATTCTGC---TTATT-T-AGACATCCAT-TT-AC-A-CGTTTTA-NTTCTT-ATTGTGT-C--CG-ATGGCC-CAAATTT--ATTC-GGATTGAAG-CGGAT--A--AAAAAAAAAANTTG----GGATCTCGCGA--CG---CAT-TTCT--T-----TAA----TA--C------CG-CTATCCTT--A--T-T---C-GGTAT--TTNTTC----------A-TATCTCTTAA--ATTTTTGTTTTTTGT-TGCTACTGA-GTGTCATGC--CT-AGTC-GAAAGCGAA-GTGAGCTAGAC-TGCCC-AAC-CTG-AACCCCA-CGG-CACACGTGGT--CACCGTAGG-CGA-CA-----GC-AACCCGCGGTG-GTCACTTCTGAGC-AACGGGAGAT--AG-TCCATCCCAC-GGCCGT-CA-ACGTCGGAACC-TCGCAGAC-AGGGGGACCAA--CACATGGAGT-CT-ACGCATG-C-AACCACGGAGCAAA-TTC-GGGTAGGGTTTATTTTGTT-CC-CCTAGT-CGTTT-CTAGTCAATTTT-AC--ACGATTAATTTC-CC--------------ACANTT--TTTATGACG--AATAGT-GCCTGC-CCAGCT-AGTTTACTTA-GGC---AT-ATTA---GGGCTTCCATGTTGGCTATGTGCAAATTTGGC-ACCTTC-CCT-TT-TGCACTATTA-TGTT-GCTTTTCCCATGGGGTA-TTATTACGTA-CA-C-ATG-TAGA-GC-ATT-CTAC-TAA-G-C-AA-ATA-----TTCCCTCTCTCCCCCCTTGCAT-GATN-CTGTTGCTTTTCCCATTGNGTACC--ACGTACACATTAGCGCATTCTAACTTAGAGCAAAAAAAAATCCCCTCTCCTCCCTGGNATGTTTNTGTTGCTTTT-CTCATTGGGTACACGCACACGTAGATCATTCTATTAA-GCAAACTTGGGGGTTGCTGCTCGTTAGTGATCCA--ATCAG-TTCTTAGTCGGCTACCACTCTGA-CA-CATTGACTTGCAAAGTAATNTGGTTACTCTGCCAAAATG-CCCCTACANAA-T-TGTGTC-AATCCATAGGTGGACTGACGCATTTCTTATTTATGTCAATTCTACACC-AACAG-CACACCCACACACAACTCAGC-AT-CTATT--ATTTAA-ATAC-TTGCAC---ATATTCGCCTAGGATCTATCA-AAT---CCAAGGAG-GGG--TTAA-TTATG-TGA-GCAGNTTCGGCTGAGAATGGGGCACAACCCTTCTCGAGACTGGGGTTTAGT-G----CAGTGAAC-TTTGTCGTT-GGTTATGGT-ATATGACCACCACCCCTGGTAATAGGCCAAGTAC-CAATCCCCTTCATAAACTTGTG--C-TTCGATTAT--AATTACAA-G--AGTGCATGCAACA-GGGCGTAATGTAG
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gi|10 : atcgcatatggtagctagtctaatactatatatgcgatttatagcaagggtatctaaacaattctggaataattgcggcgagcaaaccaaccccggatactagaattttatttatctccctttagaaatctatgtttaatccgctgagacagaataaaatctcgtcttccgtaatatttgattaacttaatattttttagtgctattttgtttgcattttgcttatttagactccatattacacgttttatttcttattgtgtccgatggcccaaaattgcattcggattgaagcggataaaaaaaaaaaaatttgggatctcgggacgcatcttctttaatatactttccttaattccggtatttattatatctcttaaatttttgttttttgttgctactggtgtgtcatgcctaagtgagaagcgaagtgagctagacttgcccaactggactgaacacgtggtcccacaatagcaccagaaaaCTC-AAC-CTG-AACCCCA-CGG-CACACGTGGT--CACCGTAGG-CGA-CA-----AC-AACCCGCGGTG-GTCACATCTGAGC-AACGGGAGAT--AA-TCCATCCCAC-AGCAGT-CA-TAATCGGAACC-TCGCAGAC-AGGGGGACCAA--CACATGGAGT-CT-ACGCATG-C-AACCACGGAGCAAA-TTC-GGGTAGGGTTTTTTTTGTT-CC-CCTATT-CGTTT-TTAGTCAATTTT-AC--ACGATTAATTTC-CC--------------AC
gi|11 : ATCGCA-TTTGGCAGC-TA--GTCT-AATA-----TA-TGC-GAATGTAT-A-CAAGTGT-----AT-C-TA-A-CAA--T--TCCGG--AAAT--GT-A--GTTGCC--GAG--CAAACCAACCCCGGATACTAGAATT----------------T-T-----GTT--ATC------TC-CCTTTT---AAAA--TC-TATGTTTAGATCGGTGA-G--ACATGATACAAT-TCATCT-C-CGT--AA-TATA-CTTT--A--TA---AATTAAT--ATTT-
gi|12 : tTCATAAACT--TG--C-TTCGA-TAT--AA-TACAACC--AGTGCGAGCAACA-GG
gi|13 : ATCAAA-TATGGTAGC-TA--GTCT-AATA-----TA-TGC-GAATTTAT-A-CAAGTGT-----AT-C-TA-A-CAA--T--TCTGG--AAAT--GT-T--GCAGCC--GGG--CAAACCAACCCCGGATTCTAAAAGT----------------T-T-----ATT--ATC------TT-CCTTTT---CAAA--TT-TATCTTTAGATCGGTGA-G--ACGTGATAAAAT-tatagtaggtatgcgcaccagcggcctgagagcatgcaatggcatacgtgcgctcatcgacatgtcgtggacgaccaaaaccaactaaccactaaatatatactgtgatcgctggcaacgccctaggcaatagtgtgtgtcg
gi|14 : tTTTAT-A-CAAGGGT-----AT----------------TCCGG--AAAG--TT-T--GAGACC--AAG--CAAACGAA-CTCGTATATTACAATA----------------T-CAA---ATT--ATCGTCACTTC-CTCTTT---CAAA--TC-TATATTTAG-TCGGTAA-GCCATGAAATAA
gi|15 : cgtatGGTAG--TA--GTCT-AATA-----TA-TGCCGAATTTAT-A-CAAGGGT----------TA-A-CAA--C--TTCGG----AT--TT-T--GCGG-C--GAG--C-AACCAACCCCGG-T-CTAGAAT--------------------------TT--ATT------TC-CC-TTT---AGAA--TC-TG-GTTTAtc
gi|16 : TGACCACCACCCCTGATAATAGGCCAAGCGC-GAACACTCTTCATAAACTTGTA--C-TTCGATTAT--GATTGCAA-G--AGTGCATGCAACA-GGGCGTAATGTAcaatgc
gi|17 : CGTA-CA-C-ATG-TAGA-GC-ATT-CTAC-TAA-G-C--A-ATA-----TTCC--CTCTTCCCCCTTGCA---------------TTTCCCATTGTGTACC--ACGTACACACTAGCGCATTa
gi|18 : -CACACGCACACACAACTCAGC-A----GTT--ATTTGA-ATAC-TTACAC---ATATTCGCCTAGGATCTAT
gi|2 : ATTGCAATATGGTAGCCTAATGTCT-CATA-----TAGTGC-GAATTTAT-A-GCAGGGTTGAAAATAC-TATA-CAAATTAATCCGA--AAAATTGT-TATGCGGCCTTGAGTGCAAACCAAGCCCG-ATACTAAAATTGGTAAATTAACCGCCCT-CCCCGCATTTGGTC------CCGCCTTTTATGCAAA--TT-T-TGTTAGAATCGGTGAAG--A--GGATAA--T-TCGTCT-C-CGT--AAATACATCTTTTAG--TA---AATTAATGAATTTGTTTAGTGC-TAATTTG-TTTGCATTCTGCTATTTATA-T-AGACATCCAT-TTAACAA-CGTATTATGTTCTT-ATTGTGT-CCTCG-ATGGCCTCAAATTT--ATTCTGGATTGAAG-CGGAT--A--AAAAAAAAAAAT
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