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Reference ( gi|1 ) : AACACAGA-AAGTGCAGATACTAGTACATGTAGTTCATTTAGTGATATAGCTTATGTTGTATGTTAATGTACCAATATGCGAAC-TCTA---ATGTTACTCCG-ATC------ACAGGT-A-------TC--T-G--AATTTT--AAT--CAATAA--A-----G------AG------AT---A---TTA----ATAGG------G--GAA--A---A--------AA---------T-A-------A------T---A----------T--------------C--T------A--T------A----TAA-TAT-----AAATACA-CC--A-G-G-TGT-GCAACGA-CAT------TCTGA--------------------C-------------CCCTTC---C--------TCG-ATTCGG---A--CCCGATTTT--------A--------T---TATCAA----A-T---TTGCC-GAAAC--AAA---CCT------T-TT--CA-C-CGG--CA-CG-----------G-TTAA---C-------CTCA-ATAATGA---TT--CTC-C-T-TCCC-A-TC--C-G---TC-GCTTC-AGAA----G----T---C--TA--A---AGAT-CA-C----TCG--T--AT----TAA--T----C-C--A---------------AC-AA-C----G---G--A-C---ATA-TTTT-------TA-----C-G-ATA--TTT----TG---TA-CATTCCTTCCA-A-G-G-C----C-TG--ACTTC------C---------ATT-ACA-TGA-----C--G-T-----C---ACG-AA--ATC---------------------TG---G--------A---T-C--TACCA----GG-----A----C------------T-----CA--AAT-TTA-C-AAA--TA-----AAATC----AAAG----T--------A-CTCTA-A--TTA--C-AC-A----TCA----C-ATTA-T--GA---T--AAAA--AAAA--------A-AAATA-AAA---AAAT-TG-----------T-A-----TAT------GT-A-G-A-TT-GTTTTGTT-T-T-GATTC----TGAA-TAAATG---AATTCTTTAAA-T-C-------GA---------CAACATCTTAT--C------A--CT--ACT-------T-------A-T-GCAG-----T----TTTCGTG-A--CGTC-ATG---T-A-ATG------G----AA--GT--C----A-GGC-C-T-TGGAAGGAATG-TA---CA----AAA--TAT-C-G-----TA-------AAAA-TAT---G--TC---C---------------G-T-T-GT--T--GGA--T---T----ATT--A---C------GA------G-T-G-AC-T-T----T---A--G---A----C----TTCT-GAAGC-A-AC--G--GA-TGAGA-A-G-GAG--AA---TCATTAT-CGA-------GG--T-----------TAA-CCG-TG--CCG-G-TG--AA-A------AGG---TTTGTTTC-GGCAA---A-T----TTGATA---A--------T--------AAAATCGGG--T---CCGAAT-CG-----A--------GG--AGGG---G-----------G---------------TC-AGA------ATG-TAATTGC-ACA-C-C--TGG-TG----TAT-TT-----ATA--T--T--------A----T--A--------GA-----------T--A------T---------T-A-----------------------T--T---TT---TTCC-----CCCTATTGA--T----------A---T-----AT--A-----------TT-TATTG--ATT--AAAATT--CA--GA-------T-ACCTGTGCTCCGATCCAATTCAATTCCAT--TTTAATTTTAT----TCTTCAAATCAA
gi|18 : AACTCAAATAATTGAAGATAGTAATACATGTAATTCATTT
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gi|41 : aaatatacagaacgaggtcttcatgG-ATC------ATAGGT-A-------TC--A-A--AATTTG--AAT--CAGTAA--A-----T------AG------AT---A---TAA----ATAGA------AATAAG--A---G--------AA---------C-A-------ATT----T---A----------T--------------C--T------A--T------A----ATA-TAT-----AAATAtttaatcaataaatagatataataccatttacatagatattattttttcctattaatatctatttattgataaaaattcagatac
gi|6 : gactcctttcgcttcattggatat-ACC------ACAG-T-A-------TC--T-G--AATTTTTAGATTGCAATAG--A-----ATATTGTAG------AT---A---TTA----ATAGG------T--GAA--A---A--------AGAACAACATTT-A-------A------T---G----------TAAGTACACTTAATAC--T------G--T------A----TAA-TATGTCTAAAACAAA-CCGAG-G-G-CGG-GCAATGA-AATAAAATACGTGACCT-----------------C-------------CCCCTCCTAC--------TCG-GATCGG---A--CCTGATCTT--------A--------TTTATACGAA----A-T---TTGCCAAAAAT--AAACACCCT------T-TT--CT-C-CCG--CAGCG-----------G--TAA---G-------CTCA-AT-ATGAATTTT--TTC-CAT-TCTA-A-TC--C-ATGTTC-GCTTC-AGAA----G----T---TAATAAGA---AGGT-CA-CT---TTG--T--AA----TAATTT----C-C--A---------------AC-AAGC----GCGCA--A-C---ATACTTTT-------TA-----C-G-ATGACTTC----TG---TA-CATTCCTTCAT-A-GCG-G----C-TG--ACACC------A---------ATT-ACA-TGA-----C----T-----C---AAA-AA--A-C---------------------TG---g
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gi|10 : tatcaagtgctatgcctgataagtctctagatctctgatctatagcacaggtatctgaattttaatcaataaatagatattgataggaaaaaataatatctatgtaatataaatacaccaggtgtgcaacgacatgctgaccccctcctttattcaggcccgattttattattaaatttgccggaacaaaccttttcactagcacggttaagctaaaaaatgattttcattctcatccatcacttaagaagtctaaagtcactcgtaataatccaacaacggacatacttttacgatattttgtacattccttccaaggcctgacttccattatgtgacatcacgaaatttggttctaccagagttatactcaaatttacaaataaatcaaagtactaagtaactctaattacatatcatattacgatgagaaaaaataaagaaattgtatatgtggattgtttgttttgattctgaatgaataaataaatacattaaatcgactacatcttatcatgacttaccaggtatgtAACGA---TT--CTC-C-T-TCTT-A-TC--T-G---TT-GCTTC-AGAA----G----T---C--TA--A---AG-T-AA-C----TCG--T--AA----TTA--T----T-C--A---------------AC-AA-C----A---G--A-C---ATA-CTGT-------TA-----C-G-ACA--TTT----TG---TC-CATTCCCTCGA-A-G-G-C----C-TG--ACTGC------C---------ACG-ACG-TGA-----C--G-T-----C---GCG-AA--ATC---------------------TG---G--------GT--T-C--CACCA-----G-----A----T------------TAATAACATTAAT-TAA-C-AAA--T------AAATC----AATG----TA-------A-CACTA-A--ATA--CAAT-A----TGA----T-ATTG-C--AA---T--------GAGA--------A-AAATA-TAG---AAAT-TG-----------C-A-----TGT------GT-G-T-A-TT-G-TTTGTT-T-TGGATTC--------------A---AATTCATTAAA-T-C-------AA---------CTAAAT----------------------CT-------T-------A-T-GCAG-----A----TTTCGTG-A--CGTC-ACG---TCA-GTGT-----G--------GT--C----A-GGC-C-T-TCAAGGGAATG-TT---CA----AAA--T
gi|9 : gaA---TT--CTC-C-T-TCCC-A-TA--C-G---CT-ACTTC-AGAA----A----T---C--TA--T---AG-T-CC-C----TTG--C--AA----CAA--T----C-C--G---------------AA-AA-T----G---G--A-C---ATA-ATTT-------TA-----A-G-TCA--TTT----TA---AA-CATTCCCTTAA-A-G-G-C----C-TG--ACCAC------C---------ATG-TCG-TGA-----C--G-T-----C---ACG-AA--AT----------------------TA---C--------A---T-C--T-CCA----CG-----A----CAAATAATGTGGTT-----CA--AAT-TTG-C-AAA--T------AAATG----TACG----TA-------A-CACTA-A--ATA--C-AA-G----TAA--------TA-T--GA---T----GA--GGAA--------A-AGATA-AAG---GAAT-TG-----------T-A-----TTT------AT-ATT-A-TT-GTTTTGTT-C-T-GTTTC----TGAATTAGGTGACCAACTCTATAAA-TGCAGATTTGGA---------TTCCCTTCTATAAC------A--GT--ATT-------TGGTGCGGA-T-GCAG-----TATGATTTCGTG-A--CGTC-Attagc
gi|7 : ac----TCG--T--AA----TA---T----C-C--A---------------GCCAA-C----G---G--AAC---ATA-CTTTCTAGTTCTA-----CAG-ATA--TTT----TG---AA-CATTCAAACAA-A-G-G-T----C-TG--ACTGC------C---------ATG-ACG-TGA-----A--G-T-----C---ACG-AA--A----------------------------G--------A---T-T--TA--------------A-----------------T-----CA--AATATTA-CTAAA--TA-----AA-TC----ACAGGGAAT--------A-CT--A-A--TTATCC-GCGA----TGA----G-AGGA-A--AG---G--AAAA--AAAAGAAGGAAGA-AAAAA-AGA---AAAT-TGATATCCGCGGTT-ACCGTTTAT------GC-A-TTA-TT-GTTT-GTT-T-T-GATTC----TCAA-TCAATA---AATTCATTAAAAT-C-------GA---------CTA-ATCTTATG-C------AGTTT--GTT-------T-------GGT-GCGGAGATGTGA--TTTCATG-A--CGTC-ACG---T-C-TTG------G----CG--GT--C----A-GGT-T-C-TCGTGGGAATA-TGTTTCA----AAA--TAT-C-G-----TA-------AAAT-TAT---GG-TC---C---------------G-T-T-GG--T--GGG--T---T----ATC--A---C------GA------G-T-G-A--T-T----T---A--G---A----------TCT-GAAGC-G-AC--GA-GATTGAGA-A-G-GAA--AA---TCATTTC-TGA-------GC--T-----------CAACCCGTTG--CCA-A-TG--AATA------AGG---TTTGTTGT-GGCGA---ATT----TTGCTG---A--------TTA------AAAATT-TG--T---CCAA---CG-----A--------GG--AGGG---G-----------cta
gi|14 : aA--T----C-C--AGT-------------AC-AA-C----A---G--AAC---ATA-CTTT--------A-----C-G-ACA--TTA----TT---TC-CATTCCCTCGA-A-G-G-C----C-TGGAACTTTGACACGT---------ATT--CG-TGA-----C--G-T-----C---GCT-AAAGATC---------------------TGCGTG--------AGTTT-C--CA-CA----GA-----A----T------------T-----TA--ATT-CCA-T-AAA--AA-----AAA
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gi|20 : gaaacgattctccttcttatctgttgcttcagaagtctaaagtaactcgtaattattcaacaacagacatactgttacgacattttgtccattccctcgaaggcctgactgccacgacgtgacgtcgcgaaatctgggttccaccagattaataacattaattaacaaataaatcaatgtaacactaaatacaatatgatattgcaatgagaaaaatatagaaattgcatgtgtgtattgtttgttttggattcaaattcattaaatcaactaaatcttCCCTCAA-A-G-G-T----C-TG--TCCAC------C---------ATT-CCA-TGA-----C--G-T-----C---ACA-AA--ATCACATCTCCGCACCAAATAATCTG---G--------T---T-C--TGCCA----GATT---A----A------------T-----CA--AAT-TTA-C-ATA---A-----AAATC----GAGG----T--------A------------A--C-AC-------------T-ATTG-C--GA---T--GAGA--AAAA--------A----TA-AAG---AAAT-TG-----------T-A-----TAT------G--A-GTA-TT-A-TTTGTT-ttagc
gi|5 : TTA------C---------ATG-ACA-TGA-----C--GGT-----CCCTACG-AA--ATCC--------------------TG---A--------A---TTC--TACCA----GA-----G----TA-----------T-----CA--AAT-TTAAC-AAA--TA-----AA-TC----AAAGG---T--------A-ACCTA-A--ATA--C-AT-AA---TCAAAACT-ATTT-T--GC---G--TGAA--AGAA--------A-AAATACAAG---AAAT-TG-----------TTA-----TATT-----GTTG-G-A-TTTGGTTTGTT-T-T-GATTC----TGAA-TAAATA---AATTCTTTAAA-T-C-------GA---------CTACATCTTAT--C------A--ACGAACT-------TG------A-T-GCAG-----T----TTTCGTG-ACCCGTCAATG---T-A-A-----------------------------GC-C-TGTGGAAGGAATG-TC---AA----AAA--TAT-T-G-----TA-------AAAA-TAA---GT-TC---C---------------G-T-T-GC--TTAGGA--T---T----ATTAAA---C------GA------G-T-G-AC-T-T----T---A--G---A----C----TTCT-GAAGC-G-AC--G--GA-TGAGA-A-G-GAAGCAA---TCATTAG-CG--------GGTTT-----------TAA-CCG-TG--CCG-G-TGGAAA-A------AGGT--TTTGTTTC-GGCAAATTA-T----TTGATG---A--------T--------AAAATCGGG--TCC-CCGAAT-CA-----A--------GG--A-GG---G-----------G---------------TC-AGA------ATG-TCATTGC-ACA-CAC--TGG-TG----TAT-TT-----ATAT-T--T--------A----TA-A--------GA-----------T---------T---------T-T-----------------------T--T---TT---TT---------CTATTAA--T----------ATCTT-----AT--------------TT-TATTG--AAT--AAA--T--TA--GAT------T-ACCTGTcagtaaactgacaaaatcttatacagtctataaacattatttggtgcggagatgtgatttcgag
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gi|24 : -----C---ACG-AA--ATC---------------------TG---G--------T---T-C--TACCA----GAGT---A----C------------T-----CA--AGT-TTA-C-AAA--T------AATTC----AAGG----TA-------A-CTCTA-A--TTA--C-AT-A----TCA----T-ATTA-C--GA---T----GA--GAAA--------A-AAATA-AAG---AAAT-TG-----------T-T-----TAT------GT-G-G-A-TT-G-TTTGTT-----------------------TG---AATTCATTAAA-T-C-------GA---------C-TCGTCTTAT--C------A--CG--ACT-------T-------G-T-GCAG-----T----TTTCGTG-A--CGTC-ATG---T-A-ATG------G----ggaacacctgtagatgttctagacgttgtatgacatcagttgaccatgtatttgttggtatggttg
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gi|6 : ag-CTCTATA--TTA--C-AT-A----TCA----TTATTA-CTCGAGTGC--AGAA--GAAA--------ATAACTA-AAG---AAAT-TG-----------T-T-----TAT------GT-G-G-AATT-GTT--GTTATAT-GATTCC---TGAA-TAAATA---AATTCATTAA--T-C-------GA---------CTATCTCTTATT-C------A--AC--ACT-------T-------G-TTGCAG-----T----TTTT-TG-A---GTC-ATG---T-A-ATT------G----GT--GT--C----A-GCCGC-T-ATGAAGGAATG-TA---CA----GAAGTCAT-C-G-----TA-------AAAAGTAT---G--TTGCGC---------------GCT-T-GT--T--GGAAAT---T----ATT--A---C------AAA-----G-T-G-AC-C-T----TCTTATTA---A----C----TTCT-GAAGCGA-ACATG--GA-TTAGA-ATG-GAA--AAAATTCAT-AT-TGA-------GC--T-----------TA--CCGCTG--CGG-G-AG--AA-A------AGGGTGTTTATTTTTGGCAA---A-T----TTCGTATAAA--------T--------AAGATCAGG--T---CCGATC-CGAGT--A--------GG--AGGGGGAG-----------G---------------TC-ACGTATTTTATT-TCATTGC-CCG-C-CCTCGG-TT----TGT-TTTAGACATA--T--T--------A----T--A--------CAG----------T--A------T---------T-AAGTGTACTTACATTAAATGTTGTT--C---TT---TTTC-----ACCTATTAA--T----------A---TCTACAAT--A-----------TTCTATTGCAATCTAAAAATT--CA--GA-------T-A-CTGTG
gi|46 : -ATTG-C--GA---T--GAGA--AAAA--------A----TA-AAG---AAAT-TC-----------T-A-----TAT------GC-G-T-A-TT-ATTT-GTT-T-T-GATTC----TGAA-TCAATA---AATTCAGTAAA-C-T-------GA---------CAAAATCTTAT--gta
gi|36 : ct-GATTC----TGAA-TAAATA---AATTCTTTAAA-T-C-------GAGTTAATCGACTACATCTTAT--C------A--CC--ACT-------T-------G-A-GCAG-----T----TTTTGTG-A--CGTC-ATG---T-A-ATG------G----TG--GT--G----A-GGC-C-T-TGGAAGGAATG-TA---CA----AAA--TAT-C-G-----TA-------a
gi|13 : -TAAATA---AGTTCTATAAT-T-T-------G-------------CAT--TAT--A------A--AT--A---------------------GCAA-----T----TTCC-CG-A--TGTC-ACAGCAT-A-ACA------GTCAGAGTTGT--C----A-GAC-C-C-TCAAGAGAAT-------------AAA---AT-T-G-----TT-------AAAT-TAT---C--TT---C---------------A-T-T-AT--C--ACA--T---T----GT--------------GA------G-G-G-AT-----------------------------------AATC-A-AT----------AGA-A-G-GAA--AA---TCATTTC-TGA-------GC--T-----------TTA-CCA-TG--TTG-G-AG--AA-T------AGG---TTAGCCTC-ACTAT---A-TGC--TT--TA---A--------T--------AAAGTAATG--C---CTGAAT-T----------------A--AGGG---G-----------G---------------TG-AAA------ATG-TTGTTGT-ACA-C-A--TGG-TT----TAC-TT-----TTAG-G--T--------A----T--A--------GA---------------------------------G-----------------------T--T---TT---TTCC-----AT---TTTA--T----------A---T-----CT--A-----------TT-CATTG--ATC-----ATT--CG--GG-----------CTGTG
gi|14 : --ACT-------C-------A-C-GCAGAT---C----TTTAGCG-A--CGTC-ACG-----A-ATACGTGTCA----AA--GTTCC----A-GGC-C-T-TCGAGGGAATG-GA---AA----TAA--TGT-C-G-----T--------AAAG-TAT---GT-TC---T---------------G-T-T-GTACT--GGA--TATAT----ATT--A---
gi|21 : cgc-------A-T-GTGG-----T----TT-CATG-A--CGTC-ACG---A-C-ATG------G----TG--GT--C----A-GGC-C-T-TCGACAGAATG-TT---CA----AAA--TAT-T-G-----TA-------AAAG-TGT---G--TC---T---------------G-T-T-TT--C--AGA--T---T----GTT--G---C------GA------T-G-G-AC-T-T----T---A--G---A----T----TTCT-TAAGC-A-TC--A--TA-TG----A-G-TAT--AA---TCATTTC-TGA-------GC--T-----------TAA-CTG-TG--CCG-G-AG--AA-T------AGG---TTTATTTC-GTCAC---C-T----TTAATA---A--------G--------AAAATCGGttccacagaatttaattccataaaaaaaaataccattaacaaagaattcaaggtaacatactacaactacgtaatgaatattgactatatgtgctttttgaattgaaagattatcttagataattgataattgtgtgtattgtttgtttttggttcaatacattaaatatgcaaatcaaatc
gi|4 : ggtCAG-----T----TTTCGTG-A--CGTC-ATctccgcaccaaataat
gi|10 : CAG-----A----TTTCGCG-A--CGTC-ACG---T-C-GTG------G----CA--GT--C----A-GGC-C-T-TCGAGGGAATG-GA---CA----AAA--TGT-C-G-----TA-------ACAG-TAT---G--TC---T---------------G-T-T-GT--T--GAA--T---A----ATT--A---C------GA------G-T-T-AC-T-T----T---A--G---A----C----TTCT-GAAGC-A-AC--A--GA-TAAGA-A-G-GAG--AA---TCGTTgttctaccagagtactcaaatttacaaataaatcgaggtaactctaattacatatcatattacgattaggaaaaacaaagaaattgtatatgtggattgtttgttttgattctgaataaataaattctttaaatcgactacattttatcacgacatgtgcagttttcgtgacgtcatgtaatggtggtcagggccttggaaggaatgtacaaaatatccgtaaaaatatgtttccgttgtggattactacgagtgactttagactcttaaagccacggattgagaaggaaaatcattattgagcttaactgtgccgcgttgaaaaggtttgttcggtaaattttgatgttaaaatcggtcagaatcgaggaggggatcagaatgttcgttgcacacctggtttattatattatatagatattagttttcctataatatctatttattgattaaaattcagataacctgtggttcaaggaacacctgtagatgttctagacgttgtatgacatcagttgaccatgtatttgttggtatggttg
gi|8 : gaCAGA----T----TTTCGTG-A--CGTC-GCG---T-C-ATG------G----CG--AT--G----A-AGC-C-T-TCGAGGAAATG-TC---CA----CAA--CAT-C-A-----TT-------AAAG-TAT---G--CC---T---------------A-T-T-GT--T--GGA--T---A----AT--------------GA------G-T-G-AA-TAT----T---A------A----C----TTCT-GAAGC-G-AC--G--GA-TTAAA-A-G-GAA--AG---TTATTTC-TGA-------GC--C-----------AAG-CAG-TG--CTG-C-TG--AA-A------AGT---TTTGTTTT-GGCAA---A-T----TTGATA---A--------T--------CAAATCAGA--C---TCAACT-CT-----A--------GG--ACGG---G-----------A---------------TC-GGG------GTG-TCATTGC-ACA-A-C--TGA-TG----TAT-AT-----GTA--TTGT--------A----T--A--------GA-----------T--A------CATCTGTGTAT-A-----------------------T--T---TT---TATA-----GACTAGT-A--T----------A---T-----CT--A-----------AT-TATTA--ATT--AAAAAT--CA--GA-------T-ggttccaccagattaataacattaattaacaaataaatcaatgtaacactaaatacaatatgatattgcaatgagaaaaatatagaaattgcatgtgtgtattgtttgttttggattcaaattcattaaatcaactaaatcttatgcagatttcgtgacgtcacgtcagtgtggtcaggccttcaagggaatgttcaaaatttagc
gi|2 : G-----T----TTTCGTG-A--ATTC-AC----T-ACAGG------G----TG--AT--C----A-GGC-C-T-TCGAGGGAATG-TT---CA----AAA--TAT-C-G-----TA-------AAAG-TAC---G--AC---T---------------G-T-T-TT--C--AGA--T---A----TTT--G---C------GA------G-G-G-AC-T-T-----------G--------------TCC-----C-A---------------------GAG--AA---TCAT-ATGTGA-------GC--T-----------TAA-CTG-TG--CTG-G-GG--AA-T------AGG---TTTGTTTC-GACGA---C-T----TTAATA---A--------G--------AAAATCGGA--C---CCGAAT-CG-----A--------GGAAAGGG---GTGGGGTGGGGTG---------------TC-CAA------ATG-TCGTTGC-TCA-C-C--GGG-TC----TAT-TC-----ATATTT--T--------A----T--A--------GA-----------TTGA------G---------T-T-----------------------T--T---TTAACTTTT-----TTCTAGTTA--T----------A---T-----CG--A-----------TT-TATTG--ATgttcgttctatcattgccacgaaaatctggttcgttctatcagattaatcaaatttacaaataaattaaggtaacactcattacatataatattgcgatgaggaaaacatcgttatttattcgtatggtttgttttcattctgaataattcaatttattaaatcgatta
gi|37 : aagtG-----T----ATTTGTG-A--CATC-ACG---A-C-ATG------G----TG--TT--C----A-TGT-C-T-TAGTGAGAATG-TA---CA----AAA--TTT-C-acatttccgcaccaaatatagttctaccttgttggttaatcaaatttacaaataaatgaaggtaacactagttgcatacatgtaacaatacgatgagagaaaaaaataaagaaattgtatatacatatgtacgtattgtttgttttgactttgaatcaataaattgactaaatttaaattcctttctggaatattatttggtgcggagatgtgatttcgtgacgtcacgacatggtggtcaggccttcgaagggatattcaaaatatcgtaaaaatatgtctacattcatcagattgttacgagggacttaatttagatttgaagcaacagatgagaaggagaatcattccggagcttaaccatgccggagaataggtttgtttcggcaactaaaaatgataagaaaatcggacccgaattgaagaaaggggggggggggggtatggaatttctgaatttcgttacacacctggtctatatatcatagaa
gi|3 : ----TTTCGTG-A--TGTC-ACA---T-A-ATG------G----AA--GT--C----A-GGC-C-T-TGGAAGGAATG-TA---CA----AAA--TAT-C-G-----TA-------AAAG-TAT---G--TC---C---------------G-T-T-GT--T--GGA--T---T----ATT--A---C------GA------G-T-G-AC-T-T----T---A--G---A----C----TTCT-TAAGT-G-AT--G--GA-TGAGA-A-T-GAA--AA---TCATTTT-TTA-------GC--T-----------TAA-CCG-TG--CTA-G-TG--AA-A------AGG---TTTGTTCC-GGCAA---A-T----TTAATA---A--------T--------AAAATCGGG--C---CTGAAT-AA-----A--------GG--AGGG---G-----------G---------------TC-AGC------ATG-TCGTTGC-ACA-C-C--TGG-TG----TAT-TT-----ATA--T--TAC------A----T--A--------GA-----------T--A------T---------T-A-----------------------T--T---TT---TT--------CCTATCAA--T----------A---T-----CT--A-----------TT-TATTG--ATT--AAAATT--CA--GA-------T-ACCTGTGCTacacctccgcaccaattagcccgcttctgccacattgaggaaatttggaaataaatt
gi|7 : tatcaagtgctatgcctgataagtctctagatctctgatctat----TTTCGTG-A--CTTC-ACG---T-C-ATG------G----CA--GT--C----A-GAC-C-T-TTGTTTGAATG-TT---CA----AAA--TAT-CTG-----TAGAACTAGAAAG-TAT---GT-TC---C---------------G-T-TGGC--T--GGA------T----ATT--A---C------GA------tttggttctaccagagttatactcaaatttacaaataaatcaaagtactaagtaactctaattacatatcatattacgatgagaaaaaataaagaaattgtatatgtggattgtttgttttgattctgaatgaataaataaatacattaaatcgactacatcttatcatgacttaccaggtatgtagttttcgtgatgtcaagtaatggtagtcagtgaggccttggaaggaatgtacaaaatatcataaaagtatgtccgttgttggattattacgagtgaaattagacttctgaagcacagatgagaaggaaaatcattattgaggtta
gi|11 : a----TTTCGTGGA--CGTC-ACG---A-C-ATG------G----TG--AC--C----A-GGC-C-T-TCGAGGAAATG-T----CA----AAA--TAT-C-G-----TA-------AAAG-TGT---G--TT---G---------------G-T-T--T--C--AGA--T---T----GTT--G---C-------A------G-TGG-ACTT-T----T---T--G---A----T----TTCT-GAAGG-AGACA-G--GA-TAAAACA-GTGAG--AA---GCAT--T-TGA-------GGC-T-----------TAA--CG-TGGCCCG-GATG--AA-T------AGGTT-TTTGTTTC--GCAA---A-T---------------------------------AAGCGGA--C---CCGGAT-CG-----A--------GG--A-TG---G-----------G---------------TC-TAC------ATG-TCGTTGC-ACA-T-C--TGG-T-----TAT-AT------TA--T--T--------A----T--A--------GA-----------T--AAATTG-T---------T-G-----------------------T--T---TT---TTTT-----C---ATTTA--A----------A---T------T--A-----------TT-T-CTG--ATT--CAAATT--TT--GA-------T-ACCTATGgatttaatcaaatattactaaataaatcacagggaatactaattatccgcgatgagaggaaaggaaaaaaaagaaggaagaaaaaaagaaaattgatatccgcggttaccgtttatgcattattgtttgttttgattctcaatcaataaattcattaaaatcgactaatcttatgcagtttgtttggtgcggagatgtgatttcatgacgtcacgtcttggcggtcaggttctcgtgggaatatgtttcaaaatatcgtaaaattatggtccgttggtgggttatcacgagtgatttagatctgaagcgacgagattgagaaggaaaatcatttctgagctcaacccgttgccaatgaataaggtttgttgtggcgaattttgctgattaaaaatttgtccaacgaggagggg
gi|9 : at----TTTCGTG-A--CGTC-ACG---A-C-ATG------G----TG--GT--C----A-GGC-C-T-TTAAGGGAATG-TT---TA----AAA--TGA-C-T-----TA-------AAAT-TAT---G--TC---C---------------A-T-T-TT--C--GGA--T---T----GTT--G---C------AA------G-G-G-AC-T-A----T---A--G---A----T----TTCT-GAAGT-A-GC--G--TA-TGGGA-A-G-GAG--AA---Ttcacatctctgcgtcagaaataatctctacccagaattaa
gi|20 : ac----TTTTGTG-A--CGTC-ATG---G-A-ATG------G----TG--GA--C----A-GAC-C-T-TTGAGGGttacatctccacgacaaataatgtggttcaaatttgcaaataaatgtacgtaacactaaatacaagtaatatgatgaggaaaagataaaggaattgtatttatattattgttttgttctgtttctgaattaggtgaccaactctataaatgcagatttggattcccttctataacagtatttggtgcggatgcagtatgatttcgtgacgtcacta
gi|15 : TTCGTG-A--CGTC-ACG---T-------------------------T----A-GGC-C-T-ACGAAGGAATA-TA---CA----AAA--TAT-C-G-----TA-------AAAG-TGT---G--TC---CGTTGTAATAGATTTAG-T-T-GT--T--GAA--T---T----ATT--A---C------GA------G-T-G-AC-T-T----T---A--A---ATAGTC----CTCT-GAAGC-G-GC--G--GA-TGAGA-A-G-GA---AA---TCATTTT-TGAGCTTAACGG--TTAACCTGCATGTAA-CCG-TG--CCG-G-TG--AA-A------AGG---TTTGCTTC-GGCAA---A-T----TTGATT---A--------T--------TATA--------------AAT-CG-----A--------GG--AGGG---G-----------A---------------TC-AGA------GTG-TCGTTGC-ACA-C-C--TGtcacatctccgcaccaaataatctggttctgccagattaatcaaatttacataaaaatcgaggtaacactattgcgatgagaaaaaataaagaaattgtatatgagtattatttgttcagtaaactgacaaaatcttatacagtctataaacattatttggtgcggagatgtgatttcgag
gi|22 : tgG-A--TGTC-ACG---A-C-ATG------G----TT--GT--C----G-GGC-C-T-TCGAGGTAATG-TT---CA----AAA--TAT-A-G-----TA-------AAAG-TAT---G--TC---T---------------G-T-T-TT--C--AAA--T---T----GTT--G---C------GA------G-G-G-TT-T-T----T---A--G---A----T----TTCT-GAAGC-A-AC--A--TA-TGA-A-A-G-AAG--AA---T---------A-------GG--T--------------------------------------------------TTGTTTC-GGCGA---C-T----T---TA---A--------C--------AAGA-------------GAAT-CG-----A--------TG--AGGG---G-----------A---------------CC----------ATG-CCGTTGC-A-A-C-CT-TGG-TT----TAT-ta
gi|12 : ct---T-A-ATG------G----TG--GT--C----AAGGC-CGT-T---AGGAATGGTA---TATGATAAA--TATGC-G-----TGTTAAAAGAAAA-TATTTTG--TC---C---------------T-TCT-GT--T--GTG--T---TTGTGATT--A---C------ACCCCCCCG-T-G-AA-T-T----T---A--G---A----C----CCC----AG--A-TC--G--GA----GA-A-C-G-G--AA---TCATATT-TGA-------C---T-----------TAA-CCG-TA--CCC-G-TG--AA-A------AGGA--TTTGTTT--GGCAA---A-T----TTGATA---A--------TTTGATAT-AAGTTCAAGAATGCGCCGAATTCA-----A--------GG--AGTG---G-----------G---------------TC-AGA------ATG-TCGTTTA-GAA-C-C--TGGCTG----TAT-TT-----ATA--TTAT--------A----T--A--------GA-----------T--A------C---------CGA-----------------------T--T---TT---TT--------CATATTAA--T----------A---T------T--A--------------TATGG--ATT--AAA--T--CATCGA-------T-ACCTGTGtc
gi|23 : aatTG------G----TG--GT--C----A-GGC-C-T-TGGTGGGAAAG-TT---CA----AAA--TAT-C-G-----TT-------AACG-CAA---G--TC---C---------------G-T-T-GT--C--GAA--T---T----TTT--T---C------GA------G-G-G-AG-T-T----T---T--A---A----C----TTTT-GAAGC-G-AT--G--GG-TGAGA-A-G-TAA--AA---TCATTTC-TGA-------AC--T-----------TAA-CTG-TG--TCG-G-AG--AA-T------ATG---TTTGTTTT-GGTAC---A-T----TGAATT---A--------T--------AAAATCGGA--C---TCGAAT-CG-----A--------G
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gi|40 : -T-T----C---A--G---A----C----TTCA-GAAGC-G-AC--G--GA-TGGAA-A-G-AAA--AA---TCATTTC-TGA-------GT--T-----------TAA-CCA-TG--CTA---TA--AA-AT-----ATG---TTTGTTTC-TGCGA---C-T----TTGAT
gi|17 : cgggttgttgaatcttg----TTCT-GAAGC-G-AC--G--GA-TGAGA-A-G-GAA--AA---TCATTAT-CTA-------GC--T-----------TAA-CCG-TG--TCG-G-TG--AA-A------AGG---TTTGTATT-GGCAA---C-T----TTGATA---A--------T--------AAAATCGGG--T---CCGAAT-CG--------------GG--AGGT---G-----------G---------------TC-AGA------A-G-T-CTTGC-ACA---C--TGGTTGTATTTAT-TT-----ATA--T--T--------A----T--A--------GC-----------T--G------T-----------------------------------T--T---TT---TTCC---------ATTAA--T----------A---T-----CT--A-----------TT-TATTG--AAT---AAATT--CA--GA-------T--CCTGT
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gi|54 : aaatatacagaacgaggtcttcatggacacaggtatctgaattttaatcaataaatagatctgaattttaatcaataaatagatatataccCTATTAA--T----------A---T-----CT--A-----------TT-TATTG--ATT--AAAATT--CA--GA-------T-ACCTG
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2 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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Reference ( family-2509 ) : AACTCAAATAATTGAAGATAGTAATACATGTAATTCATTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAANATCTA-CATGT-A----CTTCG-ATCACAGGTA-------TC--T-G--AATTTTAATCAATAAA-----------TAG-ATA--TTAATAGG------GGA-A--A---A--------AAT-A---------A------T---A----------TC--T------AT------A----TAA-TAT-AAATACA-CCA-GG-TGT-G-CAACGACATTCTGAC-----------CCCCT--CC--------TCG-ATTCGG-G----CCCGATTTT--------A--------TTATCAA--AT-TTGCCGAAACAAA--CCT------TTTCA-CCGG--CACGGTT------------------AAGC-T---CAGAAATGATTTTC-C-T-TCTCATC--C-GTCGC-TTC-AGAA----G----T---CTA--A-A-G-T-C-A-C------TC------G---TAAT----A---ATCC-G--ACA-A---C---------------GGA-C---ATA----CTTT-------T---A-----C-G-ATA-TTT----TGNA-CATTCCCTCGAAGGCC-TG--AC-----CGC-CATNAC---------GTGACG-T-C---ACG-AA--A---------------------TC-TG---G--------A-----------T-C--T----AC--C-----A-G----A---------------T-A------CT--CA--AAT-TTA-C-AAA--TA-----AAA------------------TCA-------A-GGTAAC--NCT--A-ATTAC-ATA-TC--A----T-AT-----T--AC--GA-T-AGA--------GAA---AAAAATA-A----AGA-A------------ATTG-T-A--TAT-GC--------GG-------------A-TT-GTT--TTGTT-T-T-GATTC----TGAAT---------AA----A-TAAATTC--AT-TAAA-TC---------GACTACAT--CTTA-T--C------A--NN--ACT-------TG-------TGCAG-----T----TTTCGTGACGTCACGT-AATG-GCG-----GT--C----A-GGC-CT-TCGAGGGAATG---TNCAAAA--TAT-CGT-AAAAGTAT-G--TC--CG---TT-G--T--CGG--AT---TATT--AC-GAGTGAC---TT----TA--GACTTCTGAAGCG---ACG-GA-TGAGAA-GGAA--AA---TCATT-TCTGAG-CTTAA-CCG-TGCCG-G-TG--AA-AAG---G-TTTG-TTTCGGCAA---A-T----TTGAT---AAT--AAAATCGGG--CCCGAATCG-----AGGAGGG---GG---------------TCAGA------ATG-TCGTTGCACAC-C--TGG-TG----TATTT-----ATA-T--TA--T-A-GA-TA--T-TA------------------------TTTTTT-C--CCCTATTAAT----------ATC-TA------TTTATTG--ATT--AAAATTCAGA-------T-ACCTGTGGTCCGATCCAATNNAA-GCCATAACTT-ATTTTGTGCGCGCTTCAAATGAA
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gi|12 : -ATCACAGGTA-------TCGAT-G--A--TTTAATCCATA-------------TA--ATA--TTAATATG--------A-A--A---A--------AATCG---------G------T---A----------TC--T------AT------A----TAA-TAT-AAATACAGCCA-GG-TTC-T-AAACGACATTCTGAC-----------CCACT--CC--------TTGAATTCGGCGCATTCTTGAACTTATATCAA-A--------TTATCAA--AT-TTGCC-AAACAAAT-CCT------TTTCA-CGGG--TACGGTT------------------AAG--T---CAAATATGA--TTC-CGT-TCTC---------CGA--TC-TGGG----G----T---CTA--A-A-T-T-C-A-CGGGGGGGT------G---TAATCACAA---ACAC-A--ACAGA---A---------------GGA-CAAAATATTTTCTTT-------TAACA-----C-GCATA-TTTATCATATACCATTCC--TAACGGCCTTG--AC-----CAC-CATTAacatctctgcgtcagaaataatctctacccagaattaa
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gi|14 : cgc---TAAT----ATATATCC-AGTACA-A---C---------------AGAAC---ATA----CTTT-----------A-----C-G-ACA-TTA----TTTC-CATTCCCTCGAAGGCC-TGGAACTTTGACACGTATT-C---------GTGACG-T-C---GCT-AAAGA---------------------TC-TGCGTG--------AGTT--------T-C--C----A---C-----A-G----A-----------------A------TT--TA--ATT-CCA-T-AAA--AA-----AAAATACCATTAACAAAGAATTCA-------A-GGTAACATACTACA-ACTAC-GTA-ATGAA----T-AT-----TG-AC--TA-T-ATGTGCTTTTTGAATTGAAAGATT-ATCTTAGATA------------ATTGAT-AATTGT-GT--------GT-------------A-TT-GTT--TGTTT-T-T-GGTTC------AAT---------AC----ATTAAAT----ATGCAAA-TC---------AAtccataaaaaaaaataccattaacaaagaattcaaggtaacatactacaactacgtaatgaatattgactatatgtgctttttgaattgaaagattatcttagataattgataattgtgtgtattgtttgtttttggttcaatacattaaatatgcaaatcaaatc
gi|15 : cgcCA-GG-TGT-G-CAACGACACTCTGAT-----------CCCCT--CC--------TCG-ATT--------------TATA--------A--------TAATCAA--AT-TTGCCGAAGCAAA--CCT------TTTCA-CCGG--CACGGTTACATGCAGGTTAACCGTTAAGC-T---CAAAAATGATTT-C-C-T-TCTCATC--C-GCCGC-TTC-AGAG----GACTAT---TTA--A-A-G-T-C-A-C------TC------G---TAAT----A---ATTC-A--ACA-A---CTAAATCTATTACAACGGA-C---ACA----CTTT-------T---A-----C-G-ATA-TTT----TGTA-TATTCCTTCGTAGGCC------------------TAAC---------GTGACG-T-C---ACG-AA--atc
gi|16 : tgCAGTAAA-----------TAG-ATA--TAAATAGAATAAATGAA-A--A---A--------AAT-AT--------A------T---A----------TA--T------AT------AAATGTAA-TAT-AAATATA-CCA-GG-TGC-G-CAACGACATTTTGAT-----------CCCCT--CC--------TCG-ATTCGG-G----CCTGATTGT--------A--------TTATCAA--AT-TTGCCGAAACAAA--CCTCGATCATTTCA-CTGG------------------------------------CAGAAATGATTTTC-C-T-ACTCATC--C-GTCAC-TCT-AGAAGCCGG----C---CTATTT-A-G-T-C-A-C------TCGTAGATG---TAAT----A---ATCC-A--ACA-A---T---------------GGA-C---ta
gi|17 : TTCTGAAGCG---ACG-GA-TGAGAA-GGAA--AA---TCATTATCT-AG-CTTAA-CCG-TGTCG-G-TG--AA-AAG---G-TTTG-TATTGGCAA---C-T----TTGAT---AAT--AAAATCGGG--TCCGAATCG------GGAGGT---GG---------------TCAGA------A-G-TC-TTGCACA--C--TGGTTGTATTTATTT-----ATA-T--TA--T-A-GC-TG--T---------------------------TTTTTT-C--C---ATTAAT----------ATC-TA------TTTATTG--AAT---AAATTCAGA-------T--CCTGT
gi|18 : taaagacgactttgacctattgtggaAGGTC-------TC--T-G--AATTTTAATC----AA-----------TAG-ATA--TTAATA-G------GAA-A--A---A--------AAT-----------A------T---A----------TC--T------AT------A----TAA-TAT-AAGT
gi|18 : G-TG----TATTT-----ATA-T--TATTT-A-GA-TA--T-AA------------------------TTTTTT-----CCTATTAAT----------ATC-TA------TTTATTG--ATT--AAAATTCAAATAGGGCCT-ACCTGTGATTGAAT-CAATGAAA-GCCATAACTT-ATTTTGTGCGCGCTTCAAATGAAgtatttatattatttagatataattttttcctattaatatctatttattgattaaaattcaaatagggcctacctgtgattgaatcaatgaaagccataacttattttgtgcgcgcttcaaatgaattacatgtattactatcttcaattatttgagtt
gi|18 : aggtctctgaattttaatcaatagatattaataggaaaaaaatatatctatataatataaAACTCAAATAATTGAAGATAG---------TAATACATGTAATTCATTTGAAGCGCGCACAAAATAAGTTATGGCTTT------------CAT-T-G----ATTCA-ATCACAGGTAGGCCCTATT--T-G--AATTTTAATCAATAAA-----------TAG-ATA--TTAATA--------GGA-A--A---A--------AAT-T---------A------T---A----------TC--T------AA------A----TAA-TAT-AAATACA-Cttacatgtattactatcttcaattatttgagtt
gi|19 : aggtctctgaattttaatcaatagatattaataggaaaaaaatatatctatataatataaAAAGTCTATCATAT-G----ATTCATATCACAGGTA-------TC--T-G--AATTTTAATCAATAGA-----------TGG-ATA--T--ATAAA------AAA-A--A---T--------AAT-A---------A------T---AAAAATCTG--TC--T------AT------A----TGA-TAT-AAATACA-CCA-GG-TGT-G-CAACGACATTCTCAC-----------CCCCT--CCCCCCCTTCTCG-ATTTGG-A----TTTGATTTT--------A--------TTATCGA--AT-TTGCAAAAACAAA--CCT------ACACA-CCGG--CACGGTT------------------AAGC-T---
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gi|15 : cgcCA-GG-TGT-G-CAACGACACTCTGAT-----------CCCCT--CC--------TCG-ATT--------------TATA--------A--------TAATCAA--AT-TTGCCGAAGCAAA--CCT------TTTCA-CCGG--CACGGTTACATGCAGGTTAACCGTTAAGC-T---CAAA-AATGATTT-C-C-T-TCTCATC--C-GCCGC-TTC-AGAG----GACTAT---TTA--A-A-G-T-C-A-C------TC------G---TAAT----A---ATTC-A--ACA-A---CTAAATCTATTACAACGGA-C---ACA----CTTT-------T---A-----C-G-ATA-TTT----TGTA-TATTCCTTCGTAGGCC--------------TA-A--C---------GTGACG-T-C---ACG-AA--atc
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gi|18 : aggtctctgaattttaatcaatagatattaataggaaaaaaatatatctatataatataaAACTCAAATAATTGAAGATAGTAATACATGTAATTCATTT---------GAAGCGCGCACAAAATAAGTTATGGCTTT------------CAT-T-GATTCA----ATCACAGGTAGGCCCTATT--T-G--AATTTTAATCAATAAA-----------TAG-ATA--TTAATA--------GGA-A--A---A--------AAT-T---------A------T---A----------TC--T------AA------A----TAA-TAT-AAATACA-Cttacatgtattactatcttcaattatttgagtt
gi|19 : aggtctctgaattttaatcaatagatattaataggaaaaaaatatatctatataatataaAAAGTCTATCATAT-GATTCAT---ATCACAGGTA-------TC--T-G--AATTTTAATCAATAGA-----------TGG-ATA--T--ATAAA------AAA-A--A---T--------AAT-A---------A------T---AAAAATCTG--TC--T------AT------A----TGA-TAT-AAATACA-CCA-GG-TGT-G-CAACGACATTCTCAC-----------CCCCT--CCCCCCCTTCTCG-ATTTGG-A----TTTGATTTT--------A--------TTATCGA--AT-TTGCAAAAACAAA--CCT------ACACA-CCGG--CACGGTT------------------AAGC-T---
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Reference ( family-2509 ) : AACNCAGATAANTGNAGATANTAGTACATGTAGTTCATTTAGTGATATAGNNNNNNNCGCANGNTAANNTACCGNTNTG-GAACGTCTA-CATGT-GNTCCAT---ATCACAGGTA-------TC--T-G--AATTTTAATCAATAAA-----------TAG-ATA--TTAATAGG------GGA-AA---A--------AAT-A---------A------T---A----------TC--TAT------A----TAA-TATAAATACA-CCA-GG-TGT-G-CAACGACATTCTGAC-----------CCCCT--CC--------TCG-ATTCGG-G----CCCGATTTT--------A--------TTATCAA--AT-TTGCCGAAACAAA--CCT------TTTCA-CCGG--CACGGTT------------------AAGC-T---CAGAAATGATTTTC-C-T-TCTCATC--C-GTCGC-TTC-AGAA----G----T---CTA--A-A-G-T-C-A-C------TC------G---TAAT----A---ATCC-G--ACA-A---C---------------GGA-C---ATA----CTTT-------T---A-----C-G-ATA-TTT----TGNA-CATTCCCTCGAAGGCC-TG--AC--CGCCATG-A--C---------GTGACG-T-C---ACG-AA--A---------------------TC-TG---G--------A-----------T-C--T----AC--C-----A-G----A---------------T-A------CT--CA--AAT-TTA-C-AAA--TA-----AAA------------------TCA-------A-GGTAAC--ACT--A-ATTAC-------ATA-T----CA----T-AT-----T--GC--GA-T--G-AGA---------A---AAAAATA-A----AGA-A------------ATTG-T-A--TAT-GC--------GG-------------A-TT-GTT--TTGTT-T-T-GATTC----TGAAT---------AA----A-TAAATTC--AT-TAAA-TC---------GACTACAT--CTTA-T--C------A--NN--ACT-------TG-------TGCAG-----T----TTTCGTGACGTCACGT-AA-TG-GTG-----GT--C----A-GGC-CT-TNGAAGGAATGTA---CAAAA--TAT-CGT-AAAAGTATG-T-TCCG---TT-GT--T--GG--AT---TATT--AC-GAGTGAC---TT----TA--GACTTCTGAAGCG---ACG-GA-TGAGAA-GGAA--AA---TCATTATCGAG-CTTAA-CCG-TGCCG-G-TG--AA-AAG---G-TTTG-TTTCGGCAA---A-T----TTGAT---GAT--AAAATCGGG--CCCGAATCG-----AGGAGGG---GG---------------TCAGA------ATG-TCGTTGCACAC-C--TGG-TG----TATTT-----ATA-T--TAT--A----GA-TA--T-----TA------------------------TT---TTTT--C-C------CTA---TTNATATC-TA------TTTATTG--ATT--AAAATTCAGA-------T-ACCTGTGGTCCGATCCAAT-NAAG--CCATAACTTAATTTTGTGCGCNCTTCAAATNAA
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gi|14 : taaataagttctataatttgcattataaatagcaATTAAAT--TCTG-T--G------G--AA--ACT-------CA-------CGCAGAT---C----TTTAGCGACGTCACG--AA-TACGTGTCAAAGTTCC----A-GGC-CT-TCGAGGGAATGGA---AATAA--TGT-CGT--AAAGTATG-T-TCTG---TT-GTACT--GG--ATATATATT--A
gi|14 : cgc---TAAT----ATATATCC-AGTACA-A---C---------------AGAAC---ATA----CTTT-----------A-----C-G-ACA-TTA----TTTC-CATTCCCTCGAAGGCC-TGGAACTTTGACACGTATTC---------GTGACG-T-C---GCT-AAAGA---------------------TC-TGCGTG--------AGTT--------T-C--C----A---C-----A-G----A-----------------A------TT--TA--ATT-CCA-T-AAA--AA-----AAAATACCATTAACAAAGAATTCA-------A-GGTAACATACTACA-ACTACGTAATGAATA-TTGACTA----T-ATG----T--GC--TT-T--T-TGA---------ATTGAAAGATT-ATCTTAGATA------------ATTGAT-AATTGT-GT--------GT-------------A-TT-GTT--TGTTT-T-T-GGTTC------AAT---------AC----ATTAAAT----ATGCAAA-TC---------AAtccataaaaaaaaataccattaacaaagaattcaaggtaacatactacaactacgtaatgaatattgactatatgtgctttttgaattgaaagattatcttagataattgataattgtgtgtattgtttgtttttggttcaatacattaaatatgcaaatcaaatc
gi|15 : cgcCA-GG-TGT-G-CAACGACACTCTGAT-----------CCCCT--CC--------TCG-ATT--------------TATA--------A--------TAATCAA--AT-TTGCCGAAGCAAA--CCT------TTTCA-CCGG--CACGGTTACATGCAGGTTAACCGTTAAGC-T---CAAAAATGATTT-C-C-T-TCTCATC--C-GCCGC-TTC-AGAG----GACTAT---TTA--A-A-G-T-C-A-C------TC------G---TAAT----A---ATTC-A--ACA-A---CTAAATCTATTACAACGGA-C---ACA----CTTT-------T---A-----C-G-ATA-TTT----TGTA-TATTCCTTCGTAGGCC--------------TA-A--C---------GTGACG-T-C---ACG-AA--atc
gi|16 : tgCAGTAAA-----------TAG-ATA--TAAATAGAATAAATGAA-AA---A--------AAT-AT--------A------T---A----------TA--TAT------AAATGTAA-TATAAATATA-CCA-GG-TGC-G-CAACGACATTTTGAT-----------CCCCT--CC--------TCG-ATTCGG-G----CCTGATTGT--------A--------TTATCAA--AT-TTGCCGAAACAAA--CCTCGATCATTTCA-CTGG------------------------------------CAGAAATGATTTTC-C-T-ACTCATC--C-GTCAC-TCT-AGAAGCCGG----C---CTATTT-A-G-T-C-A-C------TCGTAGATG---TAAT----A---ATCC-A--ACA-A---T---------------GGA-C---ta
gi|17 : TTCTGAAGCG---ACG-GA-TGAGAA-GGAA--AA---TCATTATCTAG-CTTAA-CCG-TGTCG-G-TG--AA-AAG---G-TTTG-TATTGGCAA---C-T----TTGAT---AAT--AAAATCGGG--TCCGAATCG------GGAGGT---GG---------------TCAGA------A-G-TC-TTGCACA--C--TGGTTGTATTTATTT-----ATA-T--TAT--A----GC-TG--T-------------------------------TT---TTTT--C-C--------A---TTAATATC-TA------TTTATTG--AAT---AAATTCAGA-------T--CCTGT
gi|18 : taaagacgactttgacctattgtggaAGGTC-------TC--T-G--AATTTTAATC----AA-----------TAG-ATA--TTAATA-G------GAA-AA---A--------AAT-----------A------T---A----------TC--TAT------A----TAA-TATAAGT
gi|18 : G-TG----TATTT-----ATA-T--TATTTA----GA-TA--T-----AA------------------------TT---TTTT--C-C-------TA---TTAATATC-TA------TTTATTG--ATT--AAAATTCAAATAGGGCCT-ACCTGTGATTGAAT-CAATGAAAG--CCATAACTT-ATTTTGTGCGCGCTTCAAATGAAgtatttatattatttagatataattttttcctattaatatctatttattgattaaaattcaaatagggcctacctgtgattgaatcaatgaaagccataacttattttgtgcgcgcttcaaatgaattacatgtattactatcttcaattatttgagtt
gi|18 : aggtctctgaattttaatcaatagatattaataggaaaaaaatatatctatataatataaAACTCAAATAATTGAAGATAGTAATACATGTAATTCATTT---------GAAGCGCGCACAAAATAAGTTATGGCTTT------------CAT-T-GATTCA----ATCACAGGTAGGCCCTATT--T-G--AATTTTAATCAATAAA-----------TAG-ATA--TTAATA--------GGA-AA---A--------AAT-T---------A------T---A----------TC--TAA------A----TAA-TATAAATACA-Cttacatgtattactatcttcaattatttgagtt
gi|19 : aggtctctgaattttaatcaatagatattaataggaaaaaaatatatctatataatataaGGTTTA-AAA-GTCTATCATAT-GATTCAT---ATCACAGGTA-------TC--T-G--AATTTTAATCAATAGA-----------TGG-ATA--T--ATAAA------AAA-AA---T--------AAT-A---------A------T---AAAAATCTG--TC--TAT------A----TGA-TATAAATACA-CCA-GG-TGT-G-CAACGACATTCTCAC-----------CCCCT--CCCCCCCTTCTCG-ATTTGG-A----TTTGATTTT--------A--------TTATCGA--AT-TTGCAAAAACAAA--CCT------ACACA-CCGG--CACGGTT------------------AAGC-T---
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gi|8 : aA-------TC--T-G--ATTTTTAATTAATAAT-----------TAG-ATA--T-ACTAGT------CTATAA---A--------AAT-ATACACAGATG------T---A----------TC--TAT------A----CAA-TACATATACA-TCA-GT-TGT-G-CAATGACACCCCGAT-----------CCCGT--CC--------TAG-AGTTGA-G----TCTGATTTG--------A--------TTATCAA--AT-TTGCCAAAACAAA--ACT------TTTCA-GCAG--CACTGCT------------------TGGC-T---CAGAAATAACTTTC-C-T-TTTAATC--C-GTCGC-TTC-AGAA----G----T----TA--ATA-T-T-C-A-C------TC------------AT----T---ATCC-A--ACA-A---T---------------AGG-C---ATA----CTTT-------A---A-----T-G-ATG-TTG----TGGA-CATTTCCTCGAAGGCT-TC--AT--CGCCATG-A--C---------GCGACG-T-C---ACGAAA--A---------------------TC-TG---GTTCGTTCTA-----------T-CATT----GC--C-----ACG----AAAATCTGGTTCGTTCT-A-------T--CA--GAT-TAATC-AAATTTACAAATAAA------------------TTA-------A-GGTAAC--ACT--C-ATTAC-------ATA-T----AA----T-AT-----T--GC--GA-T--G-AGG---------A---AAACAT-----------C------------GTTA-T-T--TAT-TC--------GT-------------A--T-GGT--TTGTT-T-T-CATTC----TGAAT---------AA----T-TCAATTT--AT-TAAA-TC---------GATTA
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gi|15 : cgcCA-GG-TGT-G-CAACGACACTCTGAT-----------CCCCT--CC--------TCG-ATT--------------TATA--------A--------TAATCAA--AT-TTGCCGAAGCAAA--CCT------TTTCA-CCGG--CACGGTTACATGCAGGTTAACCGTTAAGC-T---CAAAAATGATTT-C-C-T-TCTCATC--C-GCCGC-TTC-AGAG----GACTAT---TTA--A-A-G-T-C-A-C------TC------G---TAAT----A---ATTC-A--ACA-A---CTAAATCTATTACAACGGA-C---ACA----CTTT-------T---A-----C-G-ATA-TTT----TGTA-TATTCCTTCGTAGG---------CC-TA--A--------------CGTGACG-T-C---ACG-AA--atc
gi|16 : tgCAGTAAA-----------TAG-ATA--TAAATAGAATAAATGAA-AA---A--------AAT-AT--------A------T---A----------TA--TAT------AAATGTAA-TATAAATATA-CCA-GG-TGC-G-CAACGACATTTTGAT-----------CCCCT--CC--------TCG-ATTCGG-G----CCTGATTGT--------A--------TTATCAA--AT-TTGCCGAAACAAA--CCTCGATCATTTCA-CTGG------------------------------------CAGAAATGATTTTC-C-T-ACTCATC--C-GTCAC-TCT-AGAAGCCGG----C---CTATTT-A-G-T-C-A-C------TCGTAGATG---TAAT----A---ATCC-A--ACA-A---T---------------GGA-C---ta
gi|17 : TTCTGAAGCG---ACG-GA-TGAGAA-GGAA--AA---TCATTATCTAG-CTTAA-CCG-TGTCG-G-TG--AA-AAG---G-TTTG-TATTGGCAA---C-T----TTGAT---AAT--AAAATCGGG--TCCGAATCG------GGAGGT---GG---------------TCAGA------A-G-TC-TTGCACA--C--TGGTTGTATTTATTT-----ATA-T--TAT--A----GC-TG--T-------------------------------TT---TTTT--C-C--------A---TTAATATC-TA------TTTATTG--AAT---AAATTCAGA-------T--CCTGT
gi|18 : taaagacgactttgacctattgtggaAGGTC-------TC--T-G--AATTTTAATC----AA-----------TAG-ATA--TTAATA-G------GAA-AA---A--------AAT-----------A------T---A----------TC--TAT------A----TAA-TATAAGT
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gi|18 : aggtctctgaattttaatcaatagatattaataggaaaaaaatatatctatataatataaAACTCAAATAATTGAAGATAGTAATACATGTAATTCATTT---------GAAGCGCGCACAAAATAAGTTATGGCTTT---------------CAT-T-GATTCA----ATCACAGGTAGGCCCTATT--T-G--AATTTTAATCAATAAA-----------TAG-ATA--TTAATA--------GGA-AA---A--------AAT-T---------A------T---A----------TC--TAA------A----TAA-TATAAATACA-Cttacatgtattactatcttcaattatttgagtt
gi|19 : aggtctctgaattttaatcaatagatattaataggaaaaaaatatatctatataatataaGGTTTA-AAA-G---TCTATCATAT-GATTCAT---ATCACAGGTA-------TC--T-G--AATTTTAATCAATAGA-----------TGG-ATA--T--ATAAA------AAA-AA---T--------AAT-A---------A------T---AAAAATCTG--TC--TAT------A----TGA-TATAAATACA-CCA-GG-TGT-G-CAACGACATTCTCAC-----------CCCCT--CCCCCCCTTCTCG-ATTTGG-A----TTTGATTTT--------A--------TTATCGA--AT-TTGCAAAAACAAA--CCT------ACACA-CCGG--CACGGTT------------------AAGC-T---
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gi|15 : cgcCA-GG-TGT-G-CAACGACACTCTGAT-----------CCCCT--CC--------TCG-ATT--------------TATA--------A--------TAATCAA--AT-TTGCCGAAGCAAA--CCT------TTTCA-CCGG--CACGGTTACATGCAGGTTAACCGTTAAGC-T---CAAAAATGATTT-C-C-T-TCTCATC--C-GCCGC-TTC-AGAG----GACTAT---TTA--A-A-G-T-C-A-C------TC------G---TAAT----A---ATTC-A--ACA-A---CTAAATCTATTACAACGGA-C---ACA----CTTT-------T---A-----C-G-ATA-TTT----TGTA-TATTCCTTCGTAGG---------CC-TA--A--------------CGTGACG-T-C---ACG-AA--atc
gi|16 : tgCAGTAAA-----------TAG-ATA--TAAATAGAATAAATGAA-AA---A--------AAT-AT--------A------T---A----------TA--TAT------AAATGTAA-TATAAATATA-CCA-GG-TGC-G-CAACGACATTTTGAT-----------CCCCT--CC--------TCG-ATTCGG-G----CCTGATTGT--------A--------TTATCAA--AT-TTGCCGAAACAAA--CCTCGATCATTTCA-CTGG------------------------------------CAGAAATGATTTTC-C-T-ACTCATC--C-GTCAC-TCT-AGAAGCCGG----C---CTATTT-A-G-T-C-A-C------TCGTAGATG---TAAT----A---ATCC-A--ACA-A---T---------------GGA-C---ta
gi|17 : TTCTGAAGCG---ACG-GA-TGAGAA-GGAA--AA---TCATTATCTAG-CTTAA-CCG-TGTCG-G-TG--AA-AAG---G-TTTG-TATTGGCAA---C-T----TTGAT---AAT--AAAATCGGG--TCCGAATCG------GGAGGT---GG---------------TCAGA------A-G-TC-TTGCACA--C--TGGTTGTATTTATTT-----ATA-T--TAT--A----GC-TG--T-------------------------------TT---TTTT--C-C--------A---TTAATATC-TA------TTTATTG--AAT---AAATTCAGA-------T--CCTGT
gi|18 : taaagacgactttgacctattgtggaAGGTC-------TC--T-G--AATTTTAATC----AA-----------TAG-ATA--TTAATA-G------GAA-AA---A--------AAT-----------A------T---A----------TC--TAT------A----TAA-TATAAGT
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gi|18 : aggtctctgaattttaatcaatagatattaataggaaaaaaatatatctatataatataaAACTCAAATAATTGAAGATAGTAATACATGTAATTCATTT---------GAAGCGCGCACAAAATAAGTTATGGCTTT---------------CAT-T-GATTCA----ATCACAGGTAGGCCCTATT--T-G--AATTTTAATCAATAAA-----------TAG-ATA--TTAATA--------GGA-AA---A--------AAT-T---------A------T---A----------TC--TAA------A----TAA-TATAAATACA-Cttacatgtattactatcttcaattatttgagtt
gi|19 : aggtctctgaattttaatcaatagatattaataggaaaaaaatatatctatataatataaGGTTTA-AAA-G---TCTATCATAT-GATTCAT---ATCACAGGTA-------TC--T-G--AATTTTAATCAATAGA-----------TGG-ATA--T--ATAAA------AAA-AA---T--------AAT-A---------A------T---AAAAATCTG--TC--TAT------A----TGA-TATAAATACA-CCA-GG-TGT-G-CAACGACATTCTCAC-----------CCCCT--CCCCCCCTTCTCG-ATTTGG-A----TTTGATTTT--------A--------TTATCGA--AT-TTGCAAAAACAAA--CCT------ACACA-CCGG--CACGGTT------------------AAGC-T---
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gi|9 : ATTCTC-C-T-TCCCATA--C-GCTAC-TTC-AGAA----A----T---CTA--T-A-G-T-C-C-C------TT------G---CAAC----A---ATCC-G--AAA-A---T---------------GGA-C---ATA----ATTT-------T---A-----A-G-TCA-TTT----TAAA-CATTCCCTTAAAGG---------CC-TG--AC--CACCATG---TCGTGACG-T-C---ACG-AA--A---------------------T--TA---C--------A-----------T-C--TCC--ACGAC-----A-A----A---------------T-AATGTGGTT--CA--AAT-TTG-C-AAA--T------AAA------------------TGT-------A-CGTAAC--ACT--A-AATAC-------AAG-T----AA----T-AT------------GA-T--G-AGG---------A---AAAGATA-A----AGG-A------------ATTG-T-ATTTAT-AT---------T-------------A-TT-GTT--TTGTT-C-T-GTTTC----TGAATTAGGTGACCAACTCTA-TAAATGCAGAT-T----TG---------GATTCCCT--TCTA-TAAC------A--GT--ATT-------TGGTGCGGATGCAG-----TATGATTTCGTGACGTCAC
blockSeqs : T T T A G . AAGCGCG A A GT C T AGAACGAGG AT A . A T TTGA GGCCCTA GA T TT ATGAGGAGGGT C GA GAATAAATGA T GTT TACAATAT AATAAAGATTCTGC TA TGGATC AATG T G A A C G ACCCCACCCCA TT CCCCCTTC A C CATT ATTATCAAA GC A AA CGATCAT T GC ACATGCAGGTTAACCGTT C CCC A G G CT T C T GACTA TCC TT T A . C CA GGGGGG GTAGATG CACAA AGT G GCC TAAATCTATTACAAC A AAA TTTT CTAGTTCT ATGCC A C G ATCA T C TCTGACAAC T GA TTTG TATT G C CCT A AG TCTGGTTCGTTCTATCATTGCCACGAAAATCTGGTTCGTTCTA AA TT A A T TTTACAAAT AATACCATTAACAAAGAAT AAGTACT A ATA AC T GTAATGA A TGACTA T AACAA TT TC G . C AGGAAAGGAAA C TCTT T GAAAAAAAGAAA A T AT T CGGTTACCGTTTATGC A T T GT T A A G TGAA TAGGTGACCAACTCT T AG G A GAGTTAATC A TC T AACAGTATTTGGTGCGGA AGATGTGA C T C TCAAA TC AGTG G G G C GTTT GT C A G TC CGC C TAC TA AA ATA AA A CCTT AATT TT GAAC A T T GC AAT C T C C C T GA T GGT T T CTAAAA ATA TA G TC AAGAA GGA GGGGGGTATGGAATT TATTTT T G A CT T TATT T TAGAC T TA TT TCCA G AA TAAGTGTACTTACATTAAATGTTGTT CTC TCTTTCTAC AAA A T CAATAT CA TAA TAGGGCC A A C GA . AA . GCGCG G
blockSeqs : G T AGAACA T G . A T T . C . . . . . TGAA . . . ATACACAGATGTA . . CC . . . . . . . . . . . . AAATACCAT T . T AT C . . . . . . . . . . . GCCGG . T . . . . AC . GTTT ATAT AG . . . A . . TAAC . . . . . T . . . . TG A . . . . . ACACATTTCCGCACCAAATATAGTTCTACCTTGTTGGTTAA . . . T . AA A C . A . . A . CAAAAC . G . . . . . AATTG . CTAA . . A . TT . CATATGTACGT . . T . G . . . C AC . . . . . A . . CTGGAATATTATTTGG AGATGTGA . . . . . . . . . C T . . . A TT . . T . . . . . C . . G . T . . . G . . T . . . . . . . ATTAT . . G . AGT . . . . G . . . . T T . AT . . . . ATATCTA . CACC AAA A . T . A T . A . G .
blockSeqs : T C AAAAG A G . A T T . . . . . . . ATGG . . . AATAAAAATCTG . . A . . . . . . . . . . . . ATATCAAA . . . A . . . . . . . . . . . . G . . . . . . A . G T A . . . . . . T . . . . . T . . . . CA T . . . . . TCACATCTCCGCACCAAATAATCTGGTTCTGCCAGATTAA . . . . . TA A . . A . . . . GA . . . . . . . AGAA . . . . . . . . TTGG . . T . T . . . . CA . . . . . A . . CATGACTTACCAGGTA TATGA . . . . . . . . . C A . . . G T . . T . . . . . A . . A . . . . . T . . . . . . . . . . ATT . . G . . . . . . A . . . . T . . . . . . . ATA . GAT . C . . . A . . T
blockSeqs : . . G . T C T . . . . . . . AAAA . . . AAAAATCTTA . . . . . . . . . . . . . . . A . . . T . . . . . . . . . . . . A . . . . . . A . G A G . . . . . . T . . . . . T . . . . CA C . . . . . TTACATCTCCACGACAAATAATGTGGT . . . . . TA T . . A . . . . CA . . . . . . . AGA . . . . . . . . TGT . . T . T . . . . AA . . . . . C . . GCAGTTTGTTTGG ATC . . . . . . . . . G T . . . A T . . C . . . . . C . . C . . . . . T . . . . . . . . . . ATT . . A . . . . . . A . . . . T . . . . . . . CTA . GAT . C . . . A . .
blockSeqs : . . C C T . . . . . . . GAAA . . . AACAATTTA . . . . . . . . . . . . . . . A . . . A . . . . . . . . . . . . G . . . . . . C . G A A . . . . . . A . . . . . A . . . . TG T . . . . . TCTGCGTGAGTTTCCACAGAAT . . . . . TA A . . T . . . . CA . . . . . . . AA . . . . . . . . TGT . . G . T . . . . AA . . . . . C . . CAACGAACTTGA A . . . . . . . . . G A . . . A T . . T . . . . . C . . G . . . . . C . . . . . . . . . . CT . . T . . . . . . . . . . . T . . . . . . . AA . TTC . T . . . A . .
blockSeqs : . . T . . . . . . . . GAGA . . . AACTCAA . . . . . . . . . . . . . . . A . . . T . . . . . . . . . . . . A . . . . . . A . G A G . . . . . . T . . . . . A . . . . CA C . . . . . TTTGGTTCTACCAGAGTTATAC . . . . . TA A . . T . . . . CA . . . . . . . AA . . . . . . . . AGT . . T . T . . . . AA . . . . . C . . CAACACTTGT T . . . . . . . . . G A . . . G G . . G . . . . . . . . G . . . . . T . . . . . . . . . . AT . . . . . . . . T . . . . . . . TA . TTC . C . . . A . .
blockSeqs : . . . . . . . . . GGGG . . . CGGTA . . . . . . . . . . . . . . . A . . . A . . . . . . . . . . . . A . . . . . . A . G A A . . . . . . T . . . . . A . . . . CA T . . . . . TCTGGGTTCCACCAGATTAA . . . . . TA A . . A . . . . CA . . . . . . . GA . . . . . . . . TGG . . T . T . . . . AA . . . . . C . . GGAAACTCA T . . . . . . . . . G A . . . T . . . . . . . . . . . . . . T . . . T . . . . . . . TG . CC . A . . . C . .
blockSeqs : . . . . . . . GGGG . . . ATATA . . . . . . . . . . . . . . . C . . . A . . . . . . . . . . . . G . . . . . . C . G T A . . . . . . T . . . . . A . . . . CA T . . . . . TCCTGAATTCTACCAGAGTA . . . . . T . . . T . . . . CA . . . . . . . AA . . . . . . . . TGG . . G . T . . . . CA . . . . . C . . CACGACTTG T . . . . . . . . . T C . . . . . . . . . . . . . T . CC . T . . . A . .
blockSeqs : . . . . . . . GTCT . . . AATTA . . . . . . . . . . . . . . . C . . . A . . . . . . . . . . . . G . . . . . . C . G A G . . . . . . T . . . . . A . . . . AA A . . . . . TCTGGTTCTACCAGAGTAC . . . . . A . . . A . . . . CA . . . . . . . AA . . . . . . . . CGG . . T . T . . . . AA . . . . . A . . CACCACTTG T . . . . . . . . . C A . . . . . . . . . . . . CC . A . . . C . .
blockSeqs : . . . . . . . GGA . . . GATAA . . . . . . . . . . . . . . . G . . . A . . . . . . . . . . . . G . . . . . . C . G A G . . . . . . A . . . . . T . . . . CA T . . . . . ACTGGTTCTACCAGAGTAC . . . . . T . . . A . . . . AA . . . . . . . GA . . . . . . . . TGG . . . . T . . . . AA . . . . . C . . CACGACATG T . . . . . . . . . . . . . C . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . GGA . . . TATA . . . . . . . . . . . . . . . A . . . A . . . . . . . . . . . . G . . . . . . C . G A G . . . . . . T . . . . . T . . . . TT A . . . . . GATTTAA . . . . . T . . . A . . . . AA . . . . . . . GA . . . . . . . . CGT . . . . . . . . . CA . . . . . T . . . T . A . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . GGA . . . AATA . . . . . . . . . . . . . . . A . . . T . . . . . . . . . . . . G . . . . . . A . G G G . . . . . . T . . . . . C . . . . CA A . . . . . . . . . . T . . . . . . . . C . . . . . . . A . . . . . . . . TGG . . . . . . . . . AA . . . . . C . .
blockSeqs : . . . . . . . GGG . . . AATA . . . . . . . . . . . . . . . A . . . T . . . . . . . . . . . . A . . . . . . A . G A C . . . . . . T . . . . . A . . . . TG A . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . CGT . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . TG . . . AATA . . . . . . . . . . . . . . . A . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . A A . . . . . . A . . . . . G . . . . CG T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TT . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . GG . . . AATA . . . . . . . . . . . . . . . A . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T A . . . . . . T . . . . . A . . . . CA . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . GG . . . GATA . . . . . . . . . . . . . . . A . . . T . . . . . A A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . GG . . . AATA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . GG . . . AATA . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . GA . . . AATA . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . GG . . . AATA . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . GG . . . AATA . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . GG . . . AATA . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . ATA . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . ATA . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . ATA . . . .
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blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqCons : AGAAG***** T*** GG******** ** T** ATAT****** CNC*********
originalCons : AACNCAGATAANTGNAGATANTAGTACATGTAGTTCATTTAGTGATATAGNNNNNNNCGCANGNTAANNTACCGNTTTA-GAACG---TCTA-CATGT-GNTCCAT---ATCACAGGTA-------TC--T-G--AATTTTAATCAATAAA-----------TAG-ATA--TTAATAGG------GGA-AA---A--------AAT-A---------A------T---A----------TC--TAT------A----TAA-TATAAATACA-CCA-GG-TGT-G-CAACGACATTCTGAC-----------CCCCT--CC--------TCG-ATTCGG-G----CCCGATTTT--------A--------TTATCAA--AT-TTGCCGAAACAAA--CCT------TTTCA-CCGG--CACGGTT------------------AAGC-T---CAGAAATGATTTTC-C-T-TCTCATC--C-GTCGC-TTC-AGAA----G----T---CTA--A-A-G-T-C-A-C------TC------G---TAAT----A---ATCC-G--ACA-A---C---------------GGA-C---ATA----CTTT-------T---A-----C-G-ATA-TTT----TGNA-CATTCCCTCGAAGG---------CC-TG--AC--CGCCATG---NCGTGACG-T-C---ACG-AA--A---------------------TC-TG---G--------A-----------T-C--T----AC--C-----A-G----A---------------T-A------CT--CA--AAT-TTA-C-AAA--TA-----AAA------------------TCA-------A-GGTAAC--ACT--A-ATTAC-------ATA-T----CA----T-AT-----T--GC--GA-T--G-AGA---------A---AAAAATA-A----AGA-A------------ATTG-T-A--TAT-GC--------GG-------------A-TT-GTT--TTGTT-T-T-GATTC----TGAAT---------AA----A-TAAATTC--AT-TAAA-TC---------GACTACAT--CTTA-T--C------A--NN--ACT-------TG-------TGCAG-----T----TTTCGTGACGTCACGT-AA-TG-GTG-----GT--C----A-GGC-CT-TNGAAGGAATGTA---CAAAA--TAT-CGT-AAAAGTATG-T-TCCG---TT-GT--T--GG--AT---TATT--AC-GAGTGAC---TT----TA--GACTTCTGAAGCG---ACG-GA-TGAGAA-GGAA--AA---TCATTATCGAG-CTTAA-CCG-TGCCG-G-TG--AA-AAG---G-TTTG-TTTCGGCAA---A-T----TTGAT---GAT--AAAATCGGG--CCCGAATCG-----AGGAGGG---GG---------------TCAGA------ATG-TCGTTGCACAC-C--TGG-TG----TATTT-----ATA-T--TAT--A----GA-TA--T-----TA------------------------TT---TTTT--C-C------CTA---TTNATATC-TA------TTTATTG--ATT--AAAATTCAGA-------T-ACCTGTGGTCCGATCCAAT-NAAG--CCATAACTTAATTTTGTGCGCNCTTCAAATNAA
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|50 ): TCTGAATCTAATTATATTCAGCCAATGAAAATGTGTGTTTATGGAGTAATGCAGTAACAACAAAAATCCA
Unaligned ( gi|57 ): ATCTGCTATGTGACCCTCTCTGTTAGGTACTGCA
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Reference ( family-2509 ) : AACNCAGATAANTGNAGATANTAGTACATGTAGTTCATTTAGTGATATAGNNNNNNNCGCANGNTAANNTACCGNTTTA-GAA-GTCTA-CATGT-GNTCCAT---ATCACAGGTA-------TC--T-G--AATTTTAATCAATAAA-----------TAG-ATA--T--TAAT--AG--G--A--------A---AA---A--AT-----A-------A-----T---A----------TC--T------AT------A----TAA-TAT-AAATACA-CCA-GG-TGT-G-CAACGACATTCTGAC-----------CCCCT--CC--------TCG-ATTCGG-G----CCCGATTTT-------A--------TTATCAA--AT-TTGCCGAAACAAA--CCT------TTTCA-CCGG--CACGGTT------------------AAGC-T---CAGA-AATGATTTTC-C-T-TCTCATC--C-GTCGC-TTC-AGAA----G----T---CTA--A-A-G-T-C-A-C------TC------G---TAAT----A---ATCC-G--ACA-A---C---------------GGA-C---ATA----CTTT-------T---A-----C-G-ATA-TTT----TGNA-CATTCCCTCGAAGG---------CC-TG--AC--CGCCATG---NCGTGACG-T-C---ACG-AA--A---------------------TC-TG---G--------A-----------T-C--T----AC--C-----A-G----A---------------T-A------CT--CA--AAT-TTA-C-AAA--TA-----AAA------------------TCA-------A-GGTAAC--ACT--A-ATTAC-------ATA-T----CA----T-AT-----T--GC--GA-T--G-AGA---------A---AAAAATA-A----AGA-A------------ATTG-T-A--TAT-GC--------GG-------------A-TT-GTT--TTGTT-T-T-GATTC----TGAAT---------AA----A-TAAATTC--AT-TAAA-TC---------GACTACAT--CTTA-T--C------A--NN--ACT-------TG-------TGCAG-----T----TTTCGTGACGTCACGT-AA-TG-GTG-----GT--C----A-GGC-CT-TNGAAGGAATGTA---CAAAA--TAT-CGT-AAAAGTATG-T-TCCG---TT-GT--T--GG--AT---TATT--AC-GAGTGAC---TT----TA--GACTTCTGAAGCG---ACG-GA-TGAGAA-GGAA--AA---TCATTATCGAG-CTTAA-CCG-TGCCG-G-TG--AA-AAG---G-TTTG-TTTCGGCAAA-T------ATTTG-AT-GAT--AAAATCGGG--CCCGAATCG-----AGGAGGG---GG---------------TCAGA------ATG-TCGTTGCACAC-C--TGGTGTATTT-----ATA-T--TATAGA-TA------T-----TA------------------------TT---TTTT--C-NCTA---TTNATATC-TA------TTTATTG--ATT--AAAATTCAGA-T-ACCTGTGGTCCGATCCAATNAAG--CCATAACTTAATTTTGTGCGCNCTTCAAATNAA
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gi|14 : taaataagttctataatttgcattataaatagcaATTAAAT--TCTG-T--G------G--AA--ACT-------CA-------CGCAGAT---C----TTTAGCGACGTCACG--AA-TACGTGTCAAAGTTCC----A-GGC-CT-TCGAGGGAATGGA---AATAA--TGT-CGT--AAAGTATG-T-TCTG---TT-GTACT--GG--ATATATATT--A
gi|14 : cgc---TAAT----ATATATCC-AGTACA-A---C---------------AGAAC---ATA----CTTT-----------A-----C-G-ACA-TTA----TTTC-CATTCCCTCGAAGG---------CC-TGGAACTTTGACACGTATTCGTGACG-T-C---GCT-AAAGA---------------------TC-TGCGTG--------AGTT--------T-C--C----A---C-----A-G----A-----------------A------TT--TA--ATT-CCA-T-AAA--AA-----AAAATACCATTAACAAAGAATTCA-------A-GGTAACATACTACA-ACTACGTAATGAATA-TTGACTA----T-ATG----T--GC--TT-T--T-TGA---------ATTGAAAGATT-ATCTTAGATA------------ATTGAT-AATTGT-GT--------GT-------------A-TT-GTT--TGTTT-T-T-GGTTC------AAT---------AC----ATTAAAT----ATGCAAA-TC---------AAtccataaaaaaaaataccattaacaaagaattcaaggtaacatactacaactacgtaatgaatattgactatatgtgctttttgaattgaaagattatcttagataattgataattgtgtgtattgtttgtttttggttcaatacattaaatatgcaaatcaaatc
gi|15 : cgcCA-GG-TGT-G-CAACGACACTCTGAT-----------CCCCT--CC--------TCG-ATT--------------TATA-------A--------TAATCAA--AT-TTGCCGAAGCAAA--CCT------TTTCA-CCGG--CACGGTTACATGCAGGTTAACCGTTAAGC-T---CAAA-AATGATTT-C-C-T-TCTCATC--C-GCCGC-TTC-AGAG----GACTAT---TTA--A-A-G-T-C-A-C------TC------G---TAAT----A---ATTC-A--ACA-A---CTAAATCTATTACAACGGA-C---ACA----CTTT-------T---A-----C-G-ATA-TTT----TGTA-TATTCCTTCGTAGG---------CC-TA--A--------------CGTGACG-T-C---ACG-AA--atc
gi|16 : tgCAGTAAA-----------TAG-ATA--T--AAAT--AG--A--ATAAATGAAA---AA---A--AT-----AT------A-----T---A----------TA--T------AT------AAATGTAA-TAT-AAATATA-CCA-GG-TGC-G-CAACGACATTTTGAT-----------CCCCT--CC--------TCG-ATTCGG-G----CCTGATTGT-------A--------TTATCAA--AT-TTGCCGAAACAAA--CCTCGATCATTTCA-CTGG------------------------------------CAGA-AATGATTTTC-C-T-ACTCATC--C-GTCAC-TCT-AGAAGCCGG----C---CTATTT-A-G-T-C-A-C------TCGTAGATG---TAAT----A---ATCC-A--ACA-A---T---------------GGA-C---ta
gi|17 : ACAGG-A-------TC--T-G--AATTT-ATTCAATAAA-----------TAG-ATA--T--TAAT--GG--A--A--------A---AA---A--AC-----AGCT----A-----T---A---------------------AT------A----TAA--AT-AAATACAACCA-G--TGT-G-CAA-GAC-TTCTGAC-----------CACCT--CC---------CG-ATTCGG-A----CCCGATTTT-------A--------TTATCAA--AG-TTGCCAATACAAA--CCT------TTTCA-CCGA--CACGGTT------------------AAGC-T----AGATAATGATTTTC-C-T-TCTCATC--C-GTCGC-TTC-AGAA----
gi|18 : taaagacgactttgacctattgtggaAGGTC-------TC--T-G--AATTTTAATCAATA---------------G-ATA--T--TAAT--AG--G--A--------A---AA---A--AA-----T-------A-----T---A----------TC--T------AT------A----TAA-TAT-AAGT
gi|18 : AACTCAAATAATTGAAGATAGTAATACATGTAATTCATTT---------GAAGCGCGCACAAAATAAGTTATGGCTTT------------CAT-T-GATTCA----ATCACAGGTAGGCCCTATT--T-G--AATTTTAATCAATAAA-----------TAG-ATA--T--TAAT--AG--G--A--------A---AA---A--AT-----T-------A-----T---A----------TC--T------AA------A----TAA-TAT-AAATACA-Cgtatttatattatttagatataattttttcctattaatatctatttattgattaaaattcaaatagggcctacctgtgattgaatcaatgaaagccataacttattttgtgcgcgcttcaaatgaattacatgtattactatcttcaattatttgagtt
gi|19 : aggtctctgaattttaatcaatagatattaataggaaaaaaatatatctatataatataaGGTTTA-AAA-GTCTATCATAT-GATTCAT---ATCACAGGTA-------TC--T-G--AATTTTAATCAATAGA-----------TGG-ATA--T----AT--AA--A--A--------A---AA---ATAAT-----A-------A-----T---AAAAATCTG--TC--T------AT------A----TGA-TAT-AAATACA-CCA-GG-TGT-G-CAACGACATTCTCAC-----------CCCCT--CCCCCCCTTCTCG-ATTTGG-A----TTTGATTTT-------A--------TTATCGA--AT-TTGCAAAAACAAA--CCT------ACACA-CCGG--CACGGTT------------------AAGC-T---
gi|2 : aATCAATAAA-----------TCG-ATA--T--AACT--AG--A--A--------A---AA---A--GTTAAAAA-------A-----CTCAA----------TC--T------AT------A----AAA-TAT-GAATAGA-CCC-GG-TGA-G-CAACGACATTTGGACACCCCACCCCACCCCTTTCC--------TCG-ATTCGG-G----TCCGATTTT-------C--------TTATTAA--AG-TCGTCGAAACAAA--CCT------ATTCC-CCAG--CACAGTT------------------AAGC-T---CACA-TATGATTCTC-----------------------TG-GGA--------------C----A-A-G-T-C-C-C------TC------G---CAAA----T---ATCT-G--AAA-A---C---------------AGT-C---GTA----CTTT-------T---A-----C-G-ATA-TTT----TGAA-CATTCCCTCGAAGG---------CC-TG--AT--CACCCTG---TAGTGAAT-T-C---ACG-AA--AACACATT--------------TC-CG---C--------ACCAAATATAGTT-C--T----AC--CTTGTTG-G----T---------------T-A------AT--CA--AAT-TTA-C-AAA--TA-----AA-------------------TGA-------A-GGTAAC--ACT--A-GTTGC-------ATA------CA----T-GTAACAAT--AC--GA-T--G-AGAGA-------A---AAAAATA-A----AGA-A------------ATTG-T-A--TAT-ACATATGTACGT-------------A-TT-GTT--T-GTT-T-T-GACTT----TGAAT---------CA----A-TAAATTG--AC-TAAA-TT------------TAAATTCCTT--T--CTGGAATA--TT--ATT-------TGG------TGCGGAGATGTGA--TTTCGTGACGTCACGA-CA-TG-GTG-----GT--C----A-GGC-CT-TCGAAGGGATATT---CAAAA--TAT-CGT-AAAAATATG-TCTACA---TTCAT--C--AG--AT---TGTT--AC-GAGGGAC---TTAATTTA--GATTT--GAAGCA---ACA-GA-TGAGAA-GGAG--AA---TCATTCCGGAG-CTTAA-CCA-TGCCG-G-AG--AA-TAG---G-TTTG-TTTCGGCAAC-TAA----AAATG-AT-AAG--AAAATCGGA--CCCGAATTGAAGAAAGGGGGG---GGGGGGGGTATGGAATTTCTGA------ATT-TCGTTACACAC-C--TGGTCTA--T-----ATA-T--CATAGA-tgaggt
gi|20 : aagtCCCTCAAAGG---------TC-TG--TC--CACCATT---CCATGACG-T-C---ACA-AA--ATCACATCTCCGCACCAAATAATC-TG---G--------T-----------T-C--T----GC--C-----A-G----A---------------TTA------AT--CA--AAT-TTA-C-ATA---A-----AAA------------------TCG-------A-GGTAAC--ACT--A-------------------------------T-----T--GC--GA-T--G-AGA---------A---AA-AATA-A----AGA-A------------ATTG-T-A--TAT-GA--------GT-------------A-TT-A-T--TTGTT-a
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