lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 22 11 1111111 111 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 8 6 1 55 55 2 3 55 3 7 3 55 4 1111111 777 111 5 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 4 0
lowQualScore : . . . .. .. . . .. . . . .. . ....... ... ... . .................................................................................................... . .
lowQualScore : 0 0 4 55 00 8 6 00 6 3 6 00 0 4444444 000 000 7 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 4 1
consensus : AATATG-TTGTCAACTGGATG-GCAC-AAAC--TGGGCATGAAC-A--C-G-T-TT--CAT-CA---T---GAA---TTC---TTGAACAC-GTG---AAT--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGTCGAACATATTACTTGACAAGTGGTGG-CAGAAATATGCCACCAT
Reference ( gi|3 ) : AATATG-TTGTTAACTGGATG-GCA--AAAC--TGGGCATGAAC-A--C-G-T-TT--CAT-CA---T---GAA---TTC---TTGAACAC-GTG---AAT--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGGTGG-CAGAAATATGCCACCAT
gi|1 : AATATG-TT-TCAACTGGATGCACA--AAAT--TGGGCATGAAC-A--C-G-T-TTTTCAT-CA---T---GAATTCTTCANNNNNNNNNN-NNN---NNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGTCGAACATATTACTTGACAAGTGGTTG-CAGAAATATGCCACCAT
gi|12 : gatgatttatgttgactttcagttcgtcctatgtcagctgtcagaaaAATATG-TTGTCAACTGGATG-ACAC-GAAC--TGGGCATGGAC-A--C-G-TATT--CAT-GT---C---GAA---TTT---TTAAGCAC-
gi|7 : aAATATGATTGTCA-CTGGATG-GCAC-AAAC--TGGG-ATGAA-------GTT-TT--CAT-CA-------GAA---TTCT--TTGAACA
gi|10 : AATATG-TTGTCAACTGGATG-GCACGAAACTTTGG---TGAAC-A--CAG-T-Taagagatcatgcaagagannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnng
gi|11 : tgtctttgctcagatgattatgtggaccttttcagttctctatgaatcacttgtcagaaaATATG-TTGTCAAATG-ATG-ACAC-AAAC--TGGGCATGGAC-A--C-A-T-TC--C---CA---TGTGGAA---TAT---TTAAACAC-
gi|2 : tatgttgacttttcacTCAACTGGATGTGCAC-AAAC---GGG-ATGAAC-GATT-T-T-TT--CAT-CA---T---GAA---TTC---TTGAACACAGTG---AA
gi|13 : nnnnnnnnnnnnnnnGATG-GCAC-AAAC--TGGGCATGAACAA--C-G-T-TTTCCATCCA---T---GAA---TAC---Tnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggtgggcagaaaatatgcacca
gi|6 : --AAAC--TGGGCATGAAC-A--C-G-T-TTT-CAT-CA---T---GAA---TTC---TTGAACAC-GTGNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGTGG-CAGAAATATG-CACCga
gi|4 : --AAAT--TGGGTATGAAC-A--C-GTT-TT--CGT-CA---T---GAA---TTC---TTCAA-AC-TTG---AATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGTGG-CAGAAATATGCCATTATt
gi|5 : --AAAC--TGGGCAT-AAC-A--C-G-T-TT--CAT-CA---T---GAA---TTC---TTGAACact
gi|17 : AAC--AGGGCATGGAC-G--C-G-T-TT----T-CACGTT---GAA---TTT---TCAAGCAT-GTcagtgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtggtggcagaaatatgccaccataagattacaaattcaaacagta
gi|5 : gTGGTGG-CAGAAATATGCCACCAT
gi|15 : aaactgggcataacacgtttcatcatgaattcttgaaccagtgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngTGGTGG-CAGAAATATGCCACCATaagattacaaattcaaacagta
gi|18 : TGGTAG-CAGAAATATGCCACCATagattatgttaactctaaacaac
gi|8 : aaaattatctggcaagTGGTGGGCAGAAATATGCCACCATc
gi|14 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngTGGTGG-CAGAAATGTGACACCATaagggtagaagttcaagctatgtca
gi|9 : gtcgacacaattatttgacaagGGTGG-CAGAAATATATTACCATaa
1 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|16 ): ACAAACTGGGCATTGACACGATTGTGTGTGGAATTTTCGAACAAG
Alignments
lowQualScore : 11 111111111 111111 111 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888
lowQualScore : 6 5 6 44 0 3 44 3 00 3 77 3 666666666 3 000000 5 444 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 8 6 0 4
lowQualScore : . . . .. . . .. . .. . .. . ......... . ...... . ... ....................................................................... . . . .
lowQualScore : 7 0 7 22 8 1 22 1 44 1 99 3 333333333 3 555555 0 000 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 0 8 8 0
consensus : AATATG-TTGTCAACTGGATG-GCAC-AAAC--TGGGCATGAAC-A--C-G--T-TT--CAT-CA---T-----GAATTC-TT------GAACAC-GTG---AAT--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGTCGA-ACATATTATTTGACAAGTGGTGG-CAGAAATATGCCACCAT
Reference ( family-2488 ) : AATATG-TTGTCAACTGGATG-GCAC-AAAC--TGGGCATGAAC-A--C-G--T-TT--CAT-CA---T-----GAATTC-TT------GAACAC-GTG---AAT--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGTCGA-ACATATTACTTGACAAGTGGTGG-CAGAAATATGCCACCAT
gi|1 : AATATG-TT-TCAACTGGAT--GCACAAAAT--TGGGCATGAAC-A--C-GTTT-TT--CAT-CA---T-----GAATTC-TTCANNNNNNNNNN-NNN---NNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGTCGA-ACATATTACTTGACAAGTGGTTG-CAGAAATATGCCACCAT
gi|10 : gatgatttatgttgactttcagttcgtcctatgtcagctgtcagaaaAATATG-TTGTCAACTGGATG-GCACGAAACTTTGG---TGAAC-A--CAG--T-T
gi|11 : tgtctttgctcagatgattatgtggaccttttcagttctctatgaatcacttgtcagaaaATATG-TTGTCAAATG-ATG-ACAC-AAAC--TGGGCATGGAC-A--C-A--T-TC--C---CA---TGTG--GAATAT-TT------AAACAC-
gi|12 : tatgttgacttttcacAATATG-TTGTCAACTGGATG-ACAC-GAAC--TGGGCATGGAC-A--C-G--TATT--CAT-GT---C-----GAATTT-TT------AAGCAC-
gi|13 : aGATG-GCAC-AAAC--TGGGCATGAACAA--C-G--T-TTTCCATCCA---T-----GAATAC-T
gi|14 : GTCGACACA-ATTATTTGACAAGTGGTGG-CAGAAATGTGACACCATga
gi|15 : TGGTGG-CAGAAATATGCCACCATaa
gi|16 : AC-AAAC--TGGGCATTGAC-A--C-G---------AT-TG---TGTGTGGAATTT-TC------GAACAagattatgttaactctaaacaac
gi|17 : AAC--AGGGCATGGAC-G--C-G--T-TT----T-CACGTT-----GAATTT-TC------AAGCAT-GTag
gi|18 : gATTATCTGGCAAGTGGTAG-CAGAAATATGCCACCAT
gi|2 : aaaTCAACTGGATGTGCAC-AAAC---GGG-ATGAAC-GATT-T--T-TT--CAT-CA---T-----GAATTC-TT------GAACACAGTG---AAc
gi|3 : nnnnnnnnnnnnnnnAATATG-TTGTTAACTGGATG-GCA--AAAC--TGGGCATGAAC-A--C-G--T-TT--CAT-CA---T-----GAATTC-TT------GAACAC-GTG---AAT--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNTGGTGG-CAGAAATATGCCACCATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggtgggcagaaaatatgcacca
gi|4 : -AAAT--TGGGTATGAAC-A--C-GT-T-TT--CGT-CA---T-----GAATTC-TT------CAA-AC-TTG---AATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNGGTGG-CAGAAATATGCCATTAT
gi|5 : -AAAC--TGGGCAT-AAC-A--C-G--T-TT--CAT-CA---T-----GAATTC-TT------GAACact
gi|5 : GTGGTGG-CAGAAATATGCCACCATcagtgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtggtggcagaaatatgccaccataagattacaaattcaaacagta
gi|6 : aaactgggcataacacgtttcatcatgaattcttgaaccagtgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-AAAC--TGGGCATGAAC-A--C-G--T-TTT-CAT-CA---T-----GAATTC-TT------GAACAC-GTGNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNGGTGG-CAGAAATATG-CACCaagattacaaattcaaacagta
gi|7 : AATATGATTGTCA-CTGGATG-GCAC-AAAC--TGGG-ATGAA-------GT-T-TT--CAT-CA---------GAATTCTTT------GAACAt
gi|8 : GTGGTGGGCAGAAATATGCCACCATaagagatcatgcaagagannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnng
gi|9 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGGTGG-CAGAAATATATTACCATaagggtagaagttcaagctatgtca
Alignments
lowQualScore : 11 111111111 111111 111 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888
lowQualScore : 6 5 6 44 0 3 44 3 00 3 77 3 666666666 3 000000 5 444 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 8 6 4
lowQualScore : . . . .. . . .. . .. . .. . ......... . ...... . ... ....................................................................... . . .
lowQualScore : 7 0 7 22 8 1 22 1 44 1 99 3 333333333 3 555555 0 000 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 0 8 0
consensus : AATATG-TTGTCAACTGGATG-GCAC-AAAC--TGGGCATGAAC-A--C-G--T-TT--CAT-CA---T-----GAATTC-TT------GAACAC-GTG---AAT--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGTCGA-ACATATTATTTGACAAGTGGTGG-CAGAAATATGCCACCAT
Reference ( family-2488 ) : AATATG-TTGTCAACTGGATG-GCAC-AAAC--TGGGCATGAAC-A--C-G--T-TT--CAT-CA---T-----GAATTC-TT------GAACAC-GTG---AAT--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGTCGA-ACATATTATTTGACAAGTGGTGG-CAGAAATATGCCACCAT
gi|1 : AATATG-TT-TCAACTGGAT--GCACAAAAT--TGGGCATGAAC-A--C-GTTT-TT--CAT-CA---T-----GAATTC-TTCANNNNNNNNNN-NNN---NNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGTCGA-ACATATTACTTGACAAGTGGTTG-CAGAAATATGCCACCAT
gi|10 : gatgatttatgttgactttcagttcgtcctatgtcagctgtcagaaaAATATG-TTGTCAACTGGATG-GCACGAAACTTTGG---TGAAC-A--CAG--T-T
gi|11 : tgtctttgctcagatgattatgtggaccttttcagttctctatgaatcacttgtcagaaaATATG-TTGTCAAATG-ATG-ACAC-AAAC--TGGGCATGGAC-A--C-A--T-TC--C---CA---TGTG--GAATAT-TT------AAACAC-
gi|12 : tatgttgacttttcacAATATG-TTGTCAACTGGATG-ACAC-GAAC--TGGGCATGGAC-A--C-G--TATT--CAT-GT---C-----GAATTT-TT------AAGCAC-
gi|13 : aGATG-GCAC-AAAC--TGGGCATGAACAA--C-G--T-TTTCCATCCA---T-----GAATAC-T
gi|14 : GTCGACACA-ATTATTTGACAAGTGGTGG-CAGAAATGTGACACCATga
gi|15 : TGGTGG-CAGAAATATGCCACCATaa
gi|16 : AC-AAAC--TGGGCATTGAC-A--C-G---------AT-TG---TGTGTGGAATTT-TC------GAACAagattatgttaactctaaacaac
gi|17 : AAC--AGGGCATGGAC-G--C-G--T-TT----T-CACGTT-----GAATTT-TC------AAGCAT-GTag
gi|18 : gATTATCTGGCAAGTGGTAG-CAGAAATATGCCACCAT
gi|2 : aaaTCAACTGGATGTGCAC-AAAC---GGG-ATGAAC-GATT-T--T-TT--CAT-CA---T-----GAATTC-TT------GAACACAGTG---AAc
gi|3 : nnnnnnnnnnnnnnnAATATG-TTGTTAACTGGATG-GCA--AAAC--TGGGCATGAAC-A--C-G--T-TT--CAT-CA---T-----GAATTC-TT------GAACAC-GTG---AAT--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNTGGTGG-CAGAAATATGCCACCATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggtgggcagaaaatatgcacca
gi|4 : -AAAT--TGGGTATGAAC-A--C-GT-T-TT--CGT-CA---T-----GAATTC-TT------CAA-AC-TTG---AATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNGGTGG-CAGAAATATGCCATTAT
gi|5 : -AAAC--TGGGCAT-AAC-A--C-G--T-TT--CAT-CA---T-----GAATTC-TT------GAACact
gi|5 : GTGGTGG-CAGAAATATGCCACCATcagtgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtggtggcagaaatatgccaccataagattacaaattcaaacagta
gi|6 : aaactgggcataacacgtttcatcatgaattcttgaaccagtgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-AAAC--TGGGCATGAAC-A--C-G--T-TTT-CAT-CA---T-----GAATTC-TT------GAACAC-GTGNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNGGTGG-CAGAAATATG-CACCaagattacaaattcaaacagta
gi|7 : AATATGATTGTCA-CTGGATG-GCAC-AAAC--TGGG-ATGAA-------GT-T-TT--CAT-CA---------GAATTCTTT------GAACAt
gi|8 : GTGGTGGGCAGAAATATGCCACCATaagagatcatgcaagagannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnng
gi|9 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGGTGG-CAGAAATATATTACCATaagggtagaagttcaagctatgtca
blockSeqs : A T G TT A AT A T A TC C TGTGTG T . A NNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN C N G
blockSeqs : . . . . . . . T . T . TGTG . . . . NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN . N .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . CGTT . . . . NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN . N .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . C . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . T . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . T . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . T . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . T . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . T . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . T . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqCons : ** ******
originalCons : AATATG-TTGTCAACTGGATG-GCAC-AAAC--TGGGCATGAAC-A--C-G--T-TT--CAT-CA---T-----GAATTC-TT------GAACAC-GTG---AAT--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGTCGA-ACATATTATTTGACAAGTGGTGG-CAGAAATATGCCACCAT
finalCons : AATATG-TTGTCAACTGGATG-GCAC-AAAC--TGGGCATGAAC-A--C-G--T-TT--CAT-CA---T-----GAATTC-TT------GAACAC-GTG---AAT--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGTCGA-ACATATTATTTGACAAGTGGTGG-CAGAAATATGCCACCAT
Alignments
lowQualScore : 11 111111111 111111 111 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888
lowQualScore : 6 5 6 44 0 3 44 3 00 3 77 3 666666666 3 000000 5 444 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 8 6 4
lowQualScore : . . . .. . . .. . .. . .. . ......... . ...... . ... ....................................................................... . . .
lowQualScore : 7 0 7 22 8 1 22 1 44 1 99 3 333333333 3 555555 0 000 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 0 8 0
consensus : AATATG-TTGTCAACTGGATG-GCAC-AAAC--TGGGCATGAAC-A--C-G--T-TT--CAT-CA---T-----GAATTC-TT------GAACAC-GTG---AAT--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGTCGA-ACATATTATTTGACAAGTGGTGG-CAGAAATATGCCACCAT
Reference ( family-2488 ) : AATATG-TTGTCAACTGGATG-GCAC-AAAC--TGGGCATGAAC-A--C-G--T-TT--CAT-CA---T-----GAATTC-TT------GAACAC-GTG---AAT--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGTCGA-ACATATTATTTGACAAGTGGTGG-CAGAAATATGCCACCAT
gi|1 : AATATG-TT-TCAACTGGAT--GCACAAAAT--TGGGCATGAAC-A--C-GTTT-TT--CAT-CA---T-----GAATTC-TTCANNNNNNNNNN-NNN---NNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGTCGA-ACATATTACTTGACAAGTGGTTG-CAGAAATATGCCACCAT
gi|10 : gatgatttatgttgactttcagttcgtcctatgtcagctgtcagaaaAATATG-TTGTCAACTGGATG-GCACGAAACTTTGG---TGAAC-A--CAG--T-T
gi|11 : tgtctttgctcagatgattatgtggaccttttcagttctctatgaatcacttgtcagaaaATATG-TTGTCAAATG-ATG-ACAC-AAAC--TGGGCATGGAC-A--C-A--T-TC--C---CA---TGTG--GAATAT-TT------AAACAC-
gi|12 : tatgttgacttttcacAATATG-TTGTCAACTGGATG-ACAC-GAAC--TGGGCATGGAC-A--C-G--TATT--CAT-GT---C-----GAATTT-TT------AAGCAC-
gi|13 : aGATG-GCAC-AAAC--TGGGCATGAACAA--C-G--T-TTTCCATCCA---T-----GAATAC-T
gi|14 : GTCGACACA-ATTATTTGACAAGTGGTGG-CAGAAATGTGACACCATga
gi|15 : TGGTGG-CAGAAATATGCCACCATaa
gi|16 : AC-AAAC--TGGGCATTGAC-A--C-G---------AT-TG---TGTGTGGAATTT-TC------GAACAagattatgttaactctaaacaac
gi|17 : AAC--AGGGCATGGAC-G--C-G--T-TT----T-CACGTT-----GAATTT-TC------AAGCAT-GTag
gi|18 : gATTATCTGGCAAGTGGTAG-CAGAAATATGCCACCAT
gi|2 : aaaTCAACTGGATGTGCAC-AAAC---GGG-ATGAAC-GATT-T--T-TT--CAT-CA---T-----GAATTC-TT------GAACACAGTG---AAc
gi|3 : nnnnnnnnnnnnnnnAATATG-TTGTTAACTGGATG-GCA--AAAC--TGGGCATGAAC-A--C-G--T-TT--CAT-CA---T-----GAATTC-TT------GAACAC-GTG---AAT--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNTGGTGG-CAGAAATATGCCACCATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggtgggcagaaaatatgcacca
gi|4 : -AAAT--TGGGTATGAAC-A--C-GT-T-TT--CGT-CA---T-----GAATTC-TT------CAA-AC-TTG---AATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNGGTGG-CAGAAATATGCCATTAT
gi|5 : -AAAC--TGGGCAT-AAC-A--C-G--T-TT--CAT-CA---T-----GAATTC-TT------GAACact
gi|5 : GTGGTGG-CAGAAATATGCCACCATcagtgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtggtggcagaaatatgccaccataagattacaaattcaaacagta
gi|6 : aaactgggcataacacgtttcatcatgaattcttgaaccagtgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-AAAC--TGGGCATGAAC-A--C-G--T-TTT-CAT-CA---T-----GAATTC-TT------GAACAC-GTGNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNGGTGG-CAGAAATATG-CACCaagattacaaattcaaacagta
gi|7 : AATATGATTGTCA-CTGGATG-GCAC-AAAC--TGGG-ATGAA-------GT-T-TT--CAT-CA---------GAATTCTTT------GAACAt
gi|8 : GTGGTGGGCAGAAATATGCCACCATaagagatcatgcaagagannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnng
gi|9 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGGTGG-CAGAAATATATTACCATaagggtagaagttcaagctatgtca