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Reference ( gi|2 ) : ACTTTTC--GCA-CA-T-A----C-C-CTTT-ATA-ATACAGAG--TT-TT--T-ATTT---TA-A-AA---ACA-T--A--TTTTCCGCTNCATAAC---T--TT-T----C--GCA-CA-T-AC-C-CT-TTA-TAATAC--GG-A---------G---T-TT---T----A-A--T----T---T-----------AA-AA--A---ACA-TAT-T-TT---C---C--G-C-T--G-T--G-T---CTG---A----GG-G-TT---G-------------------G--T---T--A---T-G--T-AGT--T-T--TG-A-TA--C----------------A-A-G-TA-----AA----CCC-G-TAG--ACG-ATAC-G--AAATTGC
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gi|32 : actccgtacatgtgaattaattaaatatatcatatcatcatattttggaagataagt--TT-T----C--GAA--A-T-AC-C-CTGTCA-TA-TAT--GT---------------T-TT---T----T-ACTT----T---T-----------AA-AA--A---ATA--AT-T-TT---CA--C--G-C-TTAG-T--G-T---CTG---AC---AG-G-TC---A-------------------G--T---T------T-G--T-AGT--TAT--TA-A-TA--C------------------A-C-TA-----AA----CCCGG-TAG--ACGAATAC-G--AAtct
gi|14 : caatagcgaaaacaaataT-T----C--GCT-CA---AC-CTCT-TTA-TA---C--GG-A---------A---T-TT---TT---A-A--T----G---T-----------AA-AA--A---A---TAT-G-TT---C---C--G-C-T--G-T--G-T---CTG---T----AG-G-TT---G-------------------A--T---T--A---T-G--C-AG---T-T--TG-A-TA--C----------------A-A-G-TA-----AA----CCC-G-TAG--GCG-AAAT-G--AAATTtt
gi|13 : agatgtacatgtaataatatacttacacatttaggaagaaagT-T----C--GCT-CA---AC-C-TC-TTA-TA---C--GG-A---------A---T-TT---TT---A-A--T----G---T-----------AA-AA--A---A---TAT-G-TT---C---C--G-C-T--G-T--G-T---CTG---T----AG-G-TT---G-------------------A--T---T--A---T-G--C-AG---T-T--TG-A-TA--C----------------A-A-G-TA-----AA----CCC-G-TAG--GCG-AAAT-G--AAATTtct
gi|35 : agatgtacatgtaatatatatacttacacatttaggaagaaag--GCA-CA-T-AC-C-CT-TTA-TA---C--GG-A---------G---T-TT----------A--T----T---T-----------AA-AA--A---AAAATAT-T-TT---C---CCTG-C-T--GGT--G-T---CTG---A----GC-G-TC---G-------------------G--T---A--A---T-G--T-AGT--T-T--TGGA-TA--C----------------A-A-G-TA-----AA----CCC-G-TAG--ACG-AAACAG--AAATTGCtctt
gi|36 : atttaggaaga--GCA-CA-T-AC-C-CT-TTA-TA---C--GG-A---------G---T-TT---T----A-T--T----T---A-----------AA-AA--A---AAA-TAT-T-TT---C---C--G-C-T--G-TG-G-TGCACTGC--A----AG-G-TC---G-------------------G--T---TA-A---T-G--T-AGT--T-T--TG-G-AA--C----------------A-A-G-TA-----AA----CCC-G-TAG--ACG-A-AC-A--AAATTGCt
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gi|52 : aaacattttggaagaacatgcatgctatgtactatgtaatatcttgtTAC--GG-A---------G---T-TT---T----A-C--T---------------------------------A-CAT-T-TT---C---C--G-C-T--A-T--G-T---CTG---C----GG-GTTT---G-------------------GTTT---T--G---T-G--T-AGT--T-T--TT-A-TA--C----------------A-A---TA-----AA----CCG-GATAG--ACG-A-AC-G---AATTGCg
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gi|53 : tatttaggaagaacataacttttcgctcatacccttcctacggagttcttgtttttgtttttgcttttttttttttt--T---T--G---T-G--T-AGT--T-T--TG-A-TA--C----------------A-A-G-TA-----A------CC-GTTAG--ACG-GAAC-G--ACATTGCtc
gi|42 : caacgaaaatatgaaattatggca---T--A---T-G--T-AGT--T-T--TA-A-TA--C----------------A-A-G-TA-----A------CC-G-TAG--ACG-AAAC-G--AAATTGCttt
gi|58 : ttatcctcattacatgcagtggtttattctgaacaaatttctgaacaaataatttgtctgctagtcactaT--T-T--TG-A-TA--C----------------A-A-G-TA-----GA----CCC-G-TAG--ACA-AAAC-G--AAATtt
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5 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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Alignments
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lowQualScore : 0 555 0 555555 2 2 222 77 4 6666 55 1 66666666 33 9 9 5 9 999999 8 8 5555555555555 8 333 333333333333333333333333333333333 999 6 22 777 6 8 11 11 8 8 8 8 111 11 8 6 11 6 77 222 8 6666666 333333 8 55 00000 4444444444444444444444 999 66 11 8 11 6 666 8 66 3 99 0000000000000000 6 99 8 8 66666 7777 3 11 11 8 7 9 22
consensus : ACTTTTCGCNCATGCCCTTTATAATACGGAGTTTTTATTTTAAAAANATATTTTCCGCTACGTA-A-C---T--TT-T----C--GCT-C--------AN-AC-CCT-TTAT-A-TA---C-GG-A---------G---T-TT---T----A-A--T-------T---T-----------A---A-AA--A---AAA-T--A--T-T-T-T-C---C--G-C-T--G-T--GT---CT-G--C----A------G-G--T-----CG-------------------G--T---T--A--T-G--T-AGT--T-T--TG-ATA--C----------------A-A--G-T-A-----AA----CCCG-T--AG--ACG-AA-AC-G--AAATTGC
Reference ( family-2419 ) : ACTTTTCGCNCATACCCTTTATAATACGGAGTTTTTATTTTAAAAAAATATTTTCCGCTACGTA-A-C---T--TT-T----C--GCT-C--------AN-AC-CCT-TTAT-A-TA---C-GG-A---------G---T-TT---T----A-A--T-------T---T-----------A---A-AA--A---ANA-T--A--T-T-T-T-C---C--G-C-T--G-T--GT---CT-G--C----A------G-G--T-----CG-------------------G--T---T--A--T-G--T-AGT--T-T--TG-ATA--C----------------A-A--G-T-A-----AA----CCCG-T--AG--ACG-AA-AC-G--AAATTGC
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gi|18 : atatatacttgtacatttaggaagatACGTA-A-C---G--TT-T----C--GCT-C--------A--AT-CCT--CT-T-A-TA---C-GG-A---------G-T-TT---TT---A-A--T-------T--T-----------A---A-C----G--A-AT---A-T--A--T-G-T-T---C---C--G--C------T--G-T--GT---CT-G--T----A------G-G--C-----CG-------------------A--T---A--A--T-G--T-AAT--T-T--TG-ATA--C----------------A-A--G-T-A-----AA----CCCG-T--AG--GCG-AA-AC-G--AAATTtct
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gi|23 : atatgtacattaatatatatctatacattagatagaaGTA-A-C---T--TT-T----C--GCT-C--------AA-AC-CTC--T--T-A-TA---C-GG-A---------A-T-TT---T------T--T-------T--T-----------ATATA-A----A--A-AA---T-T--A--T-T-C-T---C---C--G--C------T--G-T--GT---CT-G--T----A------G-A--T-----TG-------------------A--TTAAT--A--T-G--C-AG---T-T--TG-ATC--C----------------A-A--G-T-A-----AA----CCTG-T--TG--GCG-AA-AC-G--AAATtct
gi|24 : gttaatatttaggaagaaaACACA-A-T---T--TT-T----T--ACT-CTGCTTGTGAT-AC-CCT--TTAT-A------C-GG-A---------C-T-TTATAT----ATA--T-------A--T-----------A---A-A----A--A-AA---A-A--A--T-C-------C---C--G--T------T--G-T--GT---CT-G--C----A------G-G--T-----CG-------------------G--T---T--A--T-G--T-AG---T-A--TG-ATATTC----------------A-A--G-T-------AA----CTCG-C--AG--ATG-A
gi|25 : acttatacatgtaggaaga--TTGT-A-TA---C-GG-A---------G-C-CT---T----T-ACCT-------T--T-----------A---A-A----A-----------T--A--T-G-------C---C--G--C------T--A-T--GT---CT-G--C----A------G-G--T-----CG-------------------G--T---T--G--T-G--T-ACT--T-T--TG-ATA--C----------------A-A--A-T-A-----AA----TCCG-C--AG--GCG-AA-AC-A--AAAT
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gi|27 : tatttaggaagaacataacttttcgctcatacccttcctacggagttcttgtttttgtttttgctttttttttttttACGTA-T-C---T--TA-T----C--GCT-C--------AA-AC-CTC--TTAT-A------C-GG-A---------A-T-TT---T----T-A--A-------T--A-----------A---A-A----A--A-GA---A-A--A--A-A-T-T---C---C--A--C------T--G-T--GT---CT-G--T----A------A-G--T-----CG-------------------A--T---T--A--T-G--T-AGC--T-T--TG-ATA--C----------------A-A--G-T-ACTT--AA----ACCA-T--AG--GTG-CA-A--G--AAATTtc
gi|28 : catttagtaaaaACATA-A-C---T--TT-T----C--GCA-C---------T-AC-TCT--TTA--A-TAAATC-GG-A---------G-T-TT---T----T-A--T-------T--T-----------T---A-A----A-----------T--A--T-T-T-TTATC---C-----C------T--G-T--GT---CT-G--C----A------G-G--T-----CG-------------------G--T---C--A--T-G--T-AGT--T-T--TGAATA--C----------------A-G--G-T-A-----AA----CCCG-T--AG--ACG-AT-AC-A--AAATTGtct
gi|29 : atttaggaaaaGTATA-C---T--TT-T----C--GCT-C--------AA----CCT--CT-T-A-TA---C-GG-A---------A-T-TT---T----T-T--T-------TA-T-----------A---T-A----A--A-AA---A-T--T--A-T-T-T---C---C--G--C------T--G-T--GT---CT-G--CT---A------G-A--T-----TG-------------------A--TTAAT--A--T-G--C-AG---T-T--TG-ATC--C----------------A-A--G-T-A-----AA----CCtt
gi|3 : tcgtacatgtcatgttaatatttaggaagaaaTA-A-CATTT--TT-T----C--GCT-C--------AA-AA-C----TTAT-A-TA---C-GG-A---------GTT-TT---T----A-A--T-------TAATTAAAAAAAAAAA---A-A----A--A-AA---A-A--A--A-T-T-C---CGAGC--G--C------T--------T---CT-G--TAA--A------G-A--T-----TG-------------------A--T---T--A--TCG--C-AG---T-T--TG-ATA--G----------------A-A--G------------------G-TCAAG--GCG-AA-A--G--AAATT
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gi|31 : cttatacatttaggaacA-A-C---T--TT-T----C--GCAAC--------AT-ACGCCT--TTAT-A------C-GG-A---------G-T-TT---T----TTA--T-------T--T----------------------------------T--T--T-T-T-T---C---C--A--C------T--G-T--GT---CT-G--C----A------G-G--C-----CA-------------------G--T---T--A--T-G--T-AGT--T-T--TG-ATA--C----------------A-A--G-T-A-----AA----CCTG-T--AG--ACG-AT-AC-G--AAATTGC
gi|32 : cttatacgattaggaaaaac--------AT-AC-CCTG-TCAT-A-TA---T-GT-----------T-T-TT---T----A-C--T-------T--T-----------T---A-A----A--A-AA---T-A--A--T-T-T-T---CA--C--G--C------TTAG-T--GT---CT-GA-C----A------G-G--T-----CA-------------------G--T---T-----T-G--T-AGT--TAT--TA-ATA--C----------------A-C----T-A-----AA----CCCGGT--AG--ACG-AATAC-G--AAtt
gi|33 : caatagcgaaaacaaatatttcgaa-A-C---T--TT-T----C--GCA-C--------ATTAC-CCC--TT-T-A-TA---C-GG-A---------G-T-TT---T----A-T--T-------T--TTTT--------A---A-A----A-----------T--A--T-T-T-T---C---C--G--CT-----T--G-T--G----CT-G--C----A------T-G--T-----CG-------------------G--T---A--A--T-G--T-AGT--T-T--TG-ATA--C----------------A-A--G-T-A-----AA----CCTG-T--AG--ACG-AA-AC-G--AAATTGCtt
gi|34 : taggaaaaatattACATA-A-C---T--TT-T----C--GCT-C--------AT-AC-CCT--TAA-----A---C-GG-A---------G-T-TT---T----T-A--T-------T--T-----------A---A-A----A--A-TATATA-T--A--T-T-T-T---T---C--G--C------T--T-T--GT---CT-G--C-----------G-G--T-----CG-------------------G--T---T--A--T-G--T-AGT--A-T--TG-ATA--C----------------A-A--G-T-A-----AA----CCCG-T--AG--ACG-AA-AC-G--AAATTGCt
gi|35 : aga--GCA-C--------AT-AC-CCT--TTAT-A------C-GG-A---------G-T-TT----------A--T-------T--T-----------A---A-A----A--A-AA---AAT--A--T-T-T-T---C---CCTG--C------T--GGT--GT---CT-G-------A------GCG--T-----CG-------------------G--T---A--A--T-G--T-AGT--T-T--TGGATA--C----------------A-A--G-T-A-----AA----CCCG-T--AG--ACG-AA-ACAG--AAATTGCt
gi|36 : atttaggaaga--GCA-C--------AT-AC-CCT--TTAT-A------C-GG-A---------G-T-TT---T----A-T--T-------T--A-----------A---A-A----A--A-AA---A-T--A--T-T-T-T---C---C--G--C------T--G-TG-GTGCACT-G--CA---A------G-G--T-----CG-------------------G--T---TA-A--T-G--T-AGT--T-T--TG-GAA--C----------------A-A--G-T-A-----AA----CCCG-T--AG--ACG--A-AC-A--AAATTGCt
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gi|38 : acatttaggaaaac-C--------AT-AC-CCT--TTAT-A------C-GG-AT--------G-T-TT----------A--T-------T--T-----------T---A-A----A--A-AA---A-T--A--T-T-T-T---CG--C--G--G---------G-T--GT---CT-G--C----A------G-G--T-----CG----------------------T---A--A--T-G--TTAGT--T-TA-TG-GTAA-C----------------A-A--G-T-A-----AA----CCCG-T--AG--ACG-AA-AC-G--AAATTG
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gi|40 : atgtaataatatattatacacatttggaaa--------AT-AC-CCT--TTAT-A--G---C-G--A---------G-T-TT---T----A----T-------T--T-----------A---A-A----A--A-A------T--A--T-T-T-----C---C--A--C------T--G----GT---CT-G--C----A------G-G--T-----CG-------------------G--T---TA-A--T-GATC-AGT--T-TGATGAATA--C----------------A-A--G-TAA-----AA----CCCG-T--AG--A-G-AACAC-GA-AAATTGCtctt
gi|41 : aagcaca-AC-CCT--TTAT-A-T------GG-A---------G-T-TT---C----A------------T--C-----------A---A-C----A--A-AA---A-T--A--T-T-------C---T--G--T------T--G-T--GA---CT-G--C----A------G-G--T-----TG-------------------G--T---T--G--T-G--T-AAT--T-T--TG-ATA--C----------------A-A--G-T-A-----AAAGTTCTCG-T--AG--ATG-AA-AC-A--AAATTACt
gi|42 : aattgcttgtg-AT-CCTCATTAC-A-TG---C-AG-T---------G-G-TT---T----A-T--T-------C--T-----------G---A-A----C--A-AA-------------T-T-T---C---T--GAACAAATAAT--T-T--GT---CT-G--C----T------A-G--T-----CA-------------------C--TA--T--A--T-G--T-AGT--T-T--TA-ATA--C----------------A-A--G-T-A-----A------CCG-T--AG--ACG-AA-AC-G--AAATTGCt
gi|44 : tt--T-----------A---A-G----A--A-AA---T-T--A--G-T-G-T---C---C--G--C------T--G-T--GT---CT-G--C----G------G-G--T-----GT-------------------G--T---T--G--T-G--T-AGT--T-T--TG-ATA--C----------------A-A--G-T-A-----AA----CCCG-T--AG--ACG-AA-AC-G--AAATTGtt
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gi|47 : aaa---------G-T-TT---T----A-A--T-------T--T-----------T---A-A----A--A-AA---A-TGCA--T-T-T-T---C---C--G--C------T--G-T--GT---CA-G--C----A------G-G--T-----CG-------------------G--T---T--A--T-G--T-AGT--T-T--TG-ATA--CATAACATTGTACTTGTA-A--G-T-G-----AA----CCCG-T--AG--ATG-AA-AC-G--AAAt
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gi|49 : tacgtttagagaacta-A-TA---C-GG-A---------G-T-TT---T----A-T--T-------T--T-----------T---A-A----A--A-AA---A-T--A--T-T-T-T---C---C--G--C------T--G-T--GT---CT-A--T----A------G-G--T-----CG-------------------G--T---A--A--T-G--T-AGT--T-T--TG-ATA--C----------------A-A--G-T-A-----AA----CCCG-T--AG--ACG-AA-AC-G--AAATTGC
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gi|56 : taggaagtatataACGCA-A-C---T--TT-T----C--GCT-C--------AA-AC-CTC--T--T-A-TA---C-GG-A---------c
gi|57 : catttagaata----C--GCT-C--------AA-AC-CTC--TTAT-A------C-GG-A---------ATT-TT---T----A-A--T-------G--T-----------A---A-A----A--A-A
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Reference ( family-2419 ) : ACTTTTCGCNCATGCCCTTTATAATACGGAGTTTTTATTTT--AAAAACATATTTTCC--GCTACGTA-A-C---T--TT-T----C--GCT-C--------AN-AC-CCT--TTAT-A-TA---C-GG-A---------G-T-TT---T----A-A--T-------T--T-----------A---A-A----A--A-AA---A-T--A--T-T-T-T---C---C--G--C------T--G-T--GT---CT-G--C----A------G-G--T-----CG-------------------G--T---T--A--T-G--T-AGT--T-T--TG-ATA--C----------------A-A--G-T-A-----AA----CCCG-T--AG--ACG-AA-AC-G--AAATTGC
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Reference ( family-2419 ) : ACTTTTCGCNCATG----CCCTTTATA-ATACGGAGTTTTTATTTTGGAAGAACATATTTT--GCTACGTAA-C---T--TT-T----C--GCT-CAN-AC-CCT--TTA-TA-TA---CGG-A---------G-T-TT---T----A-A--T-------T--T-----------A---A-A----A--A-AA---A-T--A--T-T-T-T---C---C--G--C------T--G-T--GT---CT-G--C----A------G-G--T-----CG-------------------G--T---T--AT-G--T-AGT--T-T--TG-ATA--C----------------A-A--G-T-A-----AA----CCCG-T--AG--ACG-AA-AC-G--AAATTGC
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gi|33 : caatagcgaaaacaaatatttcgaaA-C---T--TT-T----C--GCA-CATTAC-CCC--TT--TA-TA---CGG-A---------G-T-TT---T----A-T--T-------T--TTTT--------A---A-A----A-----------T--A--T-T-T-T---C---C--G--CT-----T--G-T--G----CT-G--C----A------T-G--T-----CG-------------------G--T---A--AT-G--T-AGT--T-T--TG-ATA--C----------------A-A--G-T-A-----AA----CCTG-T--AG--ACG-AA-AC-G--AAATTGCtt
gi|34 : taggaaaaatattACATAA-C---T--TT-T----C--GCT-CAT-AC-CCT--TAA-----A---CGG-A---------G-T-TT---T----T-A--T-------T--T-----------A---A-A----A--A-TATATA-T--A--T-T-T-T---T---C--G--C------T--T-T--GT---CT-G--C-----------G-G--T-----CG-------------------G--T---T--AT-G--T-AGT--A-T--TG-ATA--C----------------A-A--G-T-A-----AA----CCCG-T--AG--ACG-AA-AC-G--AAATTGCt
gi|35 : aga--GCA-CAT-AC-CCT--TTA-TA------CGG-A---------G-T-TT----------A--T-------T--T-----------A---A-A----A--A-AA---AAT--A--T-T-T-T---C---CCTG--C------T--GGT--GT---CT-G-------A------GCG--T-----CG-------------------G--T---A--AT-G--T-AGT--T-T--TGGATA--C----------------A-A--G-T-A-----AA----CCCG-T--AG--ACG-AA-ACAG--AAATTGCt
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gi|37 : ttaggaagAA-A---T--TT-T----C--GCA-CAT-AC-CCT--TTA-TA------CGG-A---------G-T-TT---T----T-A--T-------T--T-----------A---A-A----A-----A---A-T--A--T-T-T-T---C---C--G--C------T--G-T--GT---CT-G--C----A------G-G--T-----CA-------------------G--T---T--TT-G--T-AGT--T-T--TG-ATA--C----------------A-C--G-T-A-----AA----CCCG-T--AG--ACG-AT-AC-G--t
gi|38 : acatttaggaaaac-CAT-AC-CCT--TTA-TA------CGG-AT--------G-T-TT----------A--T-------T--T-----------T---A-A----A--A-AA---A-T--A--T-T-T-T---CG--C--G--G---------G-T--GT---CT-G--C----A------G-G--T-----CG----------------------T---A--AT-G--TTAGT--T-TA-TG-GTAA-C----------------A-A--G-T-A-----AA----CCCG-T--AG--ACG-AA-AC-G--AAATTG
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gi|41 : aagcaca-AC-CCT--TTA-TA-T-----GG-A---------G-T-TT---C----A------------T--C-----------A---A-C----A--A-AA---A-T--A--T-T-------C---T--G--T------T--G-T--GA---CT-G--C----A------G-G--T-----TG-------------------G--T---T--GT-G--T-AAT--T-T--TG-ATA--C----------------A-A--G-T-A-----AAAGTTCTCG-T--AG--ATG-AA-AC-A--AAATTACt
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gi|45 : taataaaaatatcagaaagaaattgagta-CCT--CT--TG-TG---CAG-A---------A-T-TTC--T----A-A--T-------C--------------------A----A--A-AA---A----A--T-T-T-T---C---T--G--C------T--G-T--GT---CT-G--T----ACATTTAG-G--T-----CG-------------------A--T---T--AT-G--T-AGC--T-T--TG-ATA--C----------------A-A--G-T-tt
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gi|47 : aaa---------G-T-TT---T----A-A--T-------T--T-----------T---A-A----A--A-AA---A-TGCA--T-T-T-T---C---C--G--C------T--G-T--GT---CA-G--C----A------G-G--T-----CG-------------------G--T---T--AT-G--T-AGT--T-T--TG-ATA--CATAACATTGTACTTGTA-A--G-T-G-----AA----CCCG-T--AG--ATG-AA-AC-G--AAAt
gi|48 : -AC-TCC--CTA-TA-------GG-AC--------G-T-TT---T----A-A--T-------A--A-----------C---A-A----A--A-AA---A-T--A--T-T-T-C---C---C--G--C------T--G-TTTGTT--CT-GATT----A------G-A--T-----CG-------------------A--T---T--AT-G--T-AGT--T-T--TG-ATA--C----------------A-A--
gi|49 : tacgtttagagaactaA-TA---CGG-A---------G-T-TT---T----A-T--T-------T--T-----------T---A-A----A--A-AA---A-T--A--T-T-T-T---C---C--G--C------T--G-T--GT---CT-A--T----A------G-G--T-----CG-------------------G--T---A--AT-G--T-AGT--T-T--TG-ATA--C----------------A-A--G-T-A-----AA----CCCG-T--AG--ACG-AA-AC-G--AAATTGC
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Reference ( family-2419 ) : ACTTTTCGCACATA----CCCTTTATA-ATACGGAGTTTTTA--TTTA-GGAAGAACATA------G-T----A-CG-TAACT--TT-T----C--GCT-C---AN-AC-CCT--TTAT-A----TA---C-GG-A---------G-T-TT---T----A-A--T-------T--T-----------A---A-A----A---A-AA---A-T--A--T-T-T-T---C---C--G--C------T--G-T--GT---CT-G--C----A------G-G--T-----CG-------------------G--T---T--A--T-G--T-AGT--T-T--TG-ATA--C----------------A-A--G-T-A-----AA----CCCG-T--AG--ACG-AA-AC-G--AAATTGC
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consensus : ACTTTTCGCACATAAGAACCCTTTATACATACA--------TA--TTTA-GGAAGAACA-T--A-------------AGTA---AC---T--TT-T----C--GCT-C--------AN-AC-CCT--TTAT-A----TA---C-G-GA---------G-T-TT---T----A-A--T-------T--T-----------A---A-A----A---A-AA---A-T--A--T-T-T-T---C---C--G--C------T--G-T--GT---CT-G--C----A------G-G--T-----CG-------------------G--T---T--A--T-G--T-AGT--T-T--TG-ATA--C----------------A-A--G-T-A-----AA----CCCG-T--AG--ACG-AA-AC-G--AAATTGC
Reference ( family-2419 ) : ACTTTTCGCACATAAGAACCCTTTATACATACAGA-GCTTTTA--TTTA-GGAAGAACA-T--A--T----------AGTA---AC---T--TT-T----C--GCT-C--------AN-AC-CCT--TTAT-A----TA---C-G-GA---------G-T-TT---T----A-A--T-------T--T-----------A---A-A----A---A-AA---A-T--A--T-T-T-T---C---C--G--C------T--G-T--GT---CT-G--C----A------G-G--T-----CG-------------------G--T---T--A--T-G--T-AGT--T-T--TG-ATA--C----------------A-A--G-T-A-----AA----CCCG-T--AG--ACG-AA-AC-G--AAATTGC
gi|1 : TA--TTTT-GGAAGA----T--A-------------AGTA----C---T--CT-TG---C--GCT-C--------AA-AA-CCT--CTATTA----TA---CCG-GA---------G-T-TT---T-----------------T--T-----------G---A-ATATCA---A-TA---A-T--A--G-T-TGT---T---C--G--C------G--G-C---T---CTCG--T----A------G-AA-T-----TG-------------------A--T---T--AAAT-A--TGAGT--T-T-----ATA--C----------------A-A--G-T-A-----AA----CCAG-T--TG--GCG-AA-AC-G--AAATT
gi|10 : actccgtacatgtgaattaattaaatatatcatatcatcaT-A----TA---C-G-GAAGAACATTAG-T-TT---T----T-A--T-------C--A-----------A---ATA----A---A-AA---A-T--A--A-T-T-T---C---C--G--C------T--G-T--GA---TT-G--C----A------G-G--T-----CG-------------------G--T---T--A--T-G--T-AAT--T-T--TG-ATA--C----------------A-A--G-T-A-----AA----TCCG-T--AG--ACG-AA-AC-G--AATTTGCtct
gi|11 : cgtacacattgattatattaaataatgcagtttctcattggaacacatatactTATACATACA--------CA--TTTA-GGAAGAA--------------------AGTA---AC---T--TT-T----C--GCT-C--------AA-AC-CTC--TTAT-G----TA---C-G-AG---------T-T-TT---T----G-A--T-------A--G-----------G---A-A----A---A-AA---A-T--A--T-T-T-T---C---C--G--CG-----T--G-T--GT---CT-G--T----A------G-A--TATTAACA-------------------G--C---G--A--T-G--T---TA-T-T--TG-ATA-------------------A-A--G-T-A-----AA----CCCA-A--TG--GCG-AC-AC-G--AAATT
gi|12 : agtacattatataTTATACATACTGT-ACTTATACATTTA-GGAAGAAC--------------------GTA---AC---T--TT-T----C--GCC-C--------AA-AC-CTC--TTAT-A---------C-G-GA---------G-T-TT---T----A-A-------------------------A---A-A----A---A-AA---A-T--G--T-T-T-T---C---C--G--C------A--G-T--GT---CT-G--T----A------A-G--T-----CG-------------------A--T---T--A--T-G--T-AAT--T-T--TG-ATA--C----------------ATAT-G-T-A----------------T--AG--GTG-AA-AC-G--AAATT
gi|13 : atgtacaTATACTTACA--------CA--TTTA-GGAAGAA--------------------AG--------------T-T----C--GCT-C--------AA----CCT--CT-T-A----TA---C-G-GA---------ATT-TT---T----A-A--T-------G--T-----------------A----A---A-AA---A-T--A--T-G-T-T---C---C--G--C------T--G-T--GT---CT-G--T----A------G-G--T-----TG-------------------A--T---T--A--T-G--C-AG---T-T--TG-ATA--C----------------A-A--G-T-A-----AA----CCCG-T--AG--GCG-AA-AT-G--AAATTtctt
gi|14 : agatgtacatgtaatataTATACTTACA--------CA--TTTA-GGAAGAA--------------------AG--------------T-T----C--GCT-C--------AA-CC-TCT--T--T-A----TA---C-G-GA---------ATT-TT---T----A-A--T-------G--T-----------------A----A---A-AA---A-T--A--T-G-T-T---C---C--G--C------T--G-T--GT---CT-G--T----A------G-G--T-----TG-------------------A--T---T--A--T-G--C-AG---T-T--TG-ATA--C----------------A-A--G-T-A-----AA----CCCG-T--AG--GCG-AA-AT-G--AAATTtctt
gi|15 : agatgtacatgtaataaTA--TGTA-AAAAGAAC--------------------GTA---AA---T--TT-T----C--GCT-C--------AA-AC-CTC--TTAT-A---------C-G-GA---------G-T-TT---TTAATA-A--TACAC---T--T-----------G---T-A----ATT-A-AA---A-T--A--A-T-C-----C---C--G--C------T--G-T--GT---CT-G--T----A------G-G--T-----CG-------------------A--T---T--A--T-G--T-AGT--T-T--TG-AAC--C----------------A-ATTT-T-A-----A-------------------G-AA-AC-G--AAATTtct
gi|16 : actatatatatttataA--TTTA-GGAAGGA------A--T-----------GTA---AC---T--TT-TAATTC--GCT-C--------AA-AC-CTC--TCAT-A---------C-G-GT---------G-A-TT---C----T-A--T-------T--------------------A----A---A-AA---A-T--A--T-T-T-T---C---C--G--A------T--G-T--GT---CT-G--T----A------G-G--T-----CG-------------------A--T---T--A--T-G--T-AGT--T-T--TG-ATA--T----------------A-A--G-T-A-----CA----CTCG-T--AA--GTG-AA-AC-G--AAATTtcttt
gi|17 : atatatagcataataA--TTTA-GGAAGA----------T----------CGTA---AC---T--TT-T----C--ACT-C--------AA-AC-CTT--TTAT-A----TA---T-G-GA---------A-T-TT---T----T-A--T-------T--C-----------A---A-A----G---A-AA---A-T--G--T-T-T-T---G---T--G---------T--C-T--GA---CT-G--T----A------G-T--T-----CG-------------------A--T---T--A--T-G--A-AG---T-T--TG-ATA--C----------------A-A--G-T-A-----AA----CCCG-T--CG--GCG-AA-AG-G--AAATTtct
gi|18 : atatatacttgtacA--TTTA---AATAAC--------------------GTA---AC---G--TT-T----C--GCT-C--------A--AT-CCT--CT-T-A----TA---C-G-GA---------G-T-TT---TT---A-A--T-------T--T-----------A---A-C----G---A-AT---A-T--A--T-G-T-T---C---C--G--C------T--G-T--GT---CT-G--T----A------G-G--C-----CG-------------------A--T---A--A--T-G--T-AAT--T-T--TG-ATA--C----------------A-A--G-T-A-----AA----CCCG-T--AG--GCG-AA-AC-G--AAATTtct
gi|19 : catatatgcttatac-----------A---A-A----A---A-AA---A-A--A--A-T-T-C---C---C--G--C------T--A-T--GG---CA-G--C----A------A-G--T-----CG-------------------A--T---T--G--T-G--T-AGT--T-T--TG-TTA--C----------------A-A--GTT-AATTTTAA----CCCG-T--AG--ACG-AA-AC-G--AAATtc
gi|2 : atgtttcactctgcttgttatccctttaaaggagtttttaaaaaaaaagaaaaaaaaaaaaACTTTTCGCACATA----CCCTTTATA-ATACAGA-GTTTTTA--TTT---TAAAAACA-T--A--TTTTCCGCTNCA-TA---AC---T--TT-T----C--GCA-C--------AT-AC-CCT--TTAT-AA---TA---C-G-GA---------G-T-TT---T----A-A--T-------T--T-----------A---A-A----A---A-AC---A-T--A--T-T-T-T---C---C--G--C------T--G-T--GT---CT-G--A----G------G-G--T-----TG-------------------G--T---T--A--T-G--T-AGT--T-T--TG-ATA--C----------------A-A--G-T-A-----AA----CCCG-T--AG--ACG-AT-AC-G--AAATTGCa
gi|20 : A--TTTG-GGAAGAACA-T----------------------------------T----T--GCT-C--------AT-AC-CCT--TCAT-A---------C-G-GA---------G-T-TT---T----T-A--T-------T--TCT---------A---A-A----T---A-TATATA-T--A--TGTAT-T---C---T--G--C------T--G-T--GT---CT-C--C----A------C-G--T-----CG-------------------A--T---T--A--T-G--T-AGT--T-A--TG-ATA--C----------------A-G--A-T-A-----AA----CTTG-T--AG--ACG-AA-AC-G--AAATT
gi|21 : atacTA---AC---T--TT-T----C--GCA-C--------AT-AC-CCT--TTAT-AA---TA---C-G--A---------G-T-TT---T----A-A--T-------T--------------A---A-A----A---A-AC---A-T--A--T-T-T-T---C---C--G--C------T--G-T--GT---CT-G--A----A------G-GGTT-----CG-------------------G--T---T--A--T-G--T-AGT--T-T--TG-ATA--C----------------A-A--G-T-A-----AA----CCCG-T--AG--ACG-AT-AA-G--AAATTGtagct
gi|22 : tatacataatgaaaaca----------AGTA---AC---T--GT-C----C----T-C--------AT-AA-CCT--CT-T-A----TA---G-G-GA---------G-T-T--------------T-------T--T-----------A---A-ATAT-A---T-AA---A-T--A--T-T-T-TC--C---C--G--C------T--A-G--GT---CT-G--T----A------G-A--T-----TG-------------------A--T---T--A--T------------------------------------------------C-A-----AA----CCCG-C--TA--TCG-AA-AC-G--AAATTgct
gi|23 : atatgtacattaatatatatctatacattagatagaTA--TTTA-GGAAGAA--------------------AGTA---AC---T--TT-T----C--GCT-C--------AA-AC-CTC--T--T-A----TA---C-G-GA---------A-T-TT---T------T--T-------T--T-----------ATATA-A----A---A-AA---T-T--A--T-T-C-T---C---C--G--C------T--G-T--GT---CT-G--T----A------G-A--T-----TG-------------------A--TTAAT--A--T-G--C-AG---T-T--TG-ATC--C----------------A-A--G-T-A-----AA----CCTG-T--TG--GCG-AA-AC-G--AAATtct
gi|24 : gttaaA--TGTA-GGAAGAACA-C--A--------------------AT---T--TT-T----T--ACT-CTGCTTGTGAT-AC-CCT--TTAT-A---------C-G-GA---------C-T-TTATAT----ATA--T-------A--T-----------A---A-A----A---A-AA---A-A--A--T-C-------C---C--G--T------T--G-T--GT---CT-G--C----A------G-G--T-----CG-------------------G--T---T--A--T-G--T-AG---T-A--TG-ATATTC----------------A-A--G-T-------AA----CTCG-C--AG--ATG-A
gi|25 : acttatacA--TTTT-GGAAGAACA-TGCA--T----------GCTATGTAC---T--AT---------G-T-A--------AT-AT-C----TTGT-A----TA---C-G-GA---------G-C-CT---T----T-ACCT-------T--T-----------A---A-A----A------------T--A--T-G-------C---C--G--C------T--A-T--GT---CT-G--C----A------G-G--T-----CG-------------------G--T---T--G--T-G--T-ACT--T-T--TG-ATA--C----------------A-A--A-T-A-----AA----TCCG-C--AG--GCG-AA-AC-A--AAAT
gi|26 : aaacTA--TTTA-GGAAGAACA-T--A--------------------AC---T--TT-T----C--GCT-C--------AT-AC-CCT--T--C-C----TA---C-G-GA---------G-T-TC---T----T-G--T-------T--T-----------g
gi|26 : -T--A--A-T-T-T---C---C--G--C------T--G-T--GT---TT-A--C----A------G-G--T-----TG-------------------A--T---T--A--T-G--T--------------------------------------A--G-T-A-----AA----TCCG-T--AG--ACG-AC-AC-G--AAGTTttgtttttgcttttttttttttttaatttccgctgtgtttacaggttgattatgtagtaaatccgtagacgacacgaagtttc
gi|27 : tatttaggaagaacataacttttcgctcatacccttcctacggagttcttgtttttgtttttgctttttttttttttA--TTTA-GTAAAAACG-T--A--T------------------C---T--TA-T----C--GCT-C--------AA-AC-CTC--TTAT-A---------C-G-GA---------A-T-TT---T----T-A--A-------T--A-----------A---A-A----A---A-GA---A-A--A--A-A-T-T---C---C--A--C------T--G-T--GT---CT-G--T----A------A-G--T-----CG-------------------A--T---T--A--T-G--T-AGC--T-T--TG-ATA--C----------------A-A--G-T-ACTT--AA----ACCA-T--AG--GTG-CA-A--G--AAATTtc
gi|28 : cA--TTTA-GGAAAAACA-T--A--------------------AC---T--TT-T----C--GCA-C---------T-AC-TCT--TTA--A----TAAATC-G-GA---------G-T-TT---T----T-A--T-------T--T-----------T---A-A----A------------T--A--T-T-T-TTATC---C-----C------T--G-T--GT---CT-G--C----A------G-G--T-----CG-------------------G--T---C--A--T-G--T-AGT--T-T--TGAATA--C----------------A-G--G-T-A-----AA----CCCG-T--AG--ACG-AT-AC-A--AAATTGtct
gi|29 : TA--TTTA-GGAAGAA--------------------AGTAT--AC---T--TT-T----C--GCT-C--------AA----CCT--CT-T-A----TA---C-G-GA---------A-T-TT---T----T-T--T-------TA-T-----------A---T-A----A---A-AA---A-T--T--A-T-T-T---C---C--G--C------T--G-T--GT---CT-G--CT---A------G-A--T-----TG-------------------A--TTAAT--A--T-G--C-AG---T-T--TG-ATC--C----------------A-A--G-T-A-----AA----CCtt
gi|3 : tcgtacatgtcatgttaaTA--TTTA-GGAAAAA------A--T----------AATA---ACATTT--TT-T----C--GCT-C--------AA-AA-C----TTAT-A----TA---C-G-GA---------GTT-TT---T----A-A--T-------TAATTAAAAAAAAAAA---A-A----A---A-AA---A-A--A--A-T-T-C---CGAGC--G--C------T--------T---CT-G--TAA--A------G-A--T-----TG-------------------A--T---T--A--TCG--C-AG---T-T--TG-ATA--G----------------A-A--G------------------G-TCAAG--GCG-AA-A--G--AAATT
gi|30 : atgtatgtaaattatatgcacttacaA--TTTA-GGAA-------------------------CA---AC---T--TT-T----C--GGT-C--------AT-AC-CAT--TTAT-A----T---------------------T-TT---T----G-A--T-------T--T-----------ATTTA-A----A---A-AT---A-T--ACAT-T-T-T---C---C--G--C------T--G-T--GT---CT-G--C----A------G-G--T-----CG-------------------G--T---T--A--C-G--T-GGT--T-T--TG-ATC--C----------------A-A--G-T-A-----AA----GCCG-T--AA--ACT-AA-AC-G--AAATTGtcttt
gi|31 : cttatacTTA-GGAAAAACA-------------------------AC---T--TT-T----C--GCAAC--------AT-ACGCCT--TTAT-A---------C-G-GA---------G-T-TT---T----TTA--T-------T--T-----------------------------------T--T--T-T-T-T---C---C--A--C------T--G-T--GT---CT-G--C----A------G-G--C-----CA-------------------G--T---T--A--T-G--T-AGT--T-T--TG-ATA--C----------------A-A--G-T-A-----AA----CCTG-T--AG--ACG-AT-AC-G--AAATTGC
gi|32 : cttatacga--------AT-AC-CCTG-TCAT-A----TA---T-G-T----------T-T-TT---T----A-C--T-------T--T-----------T---A-A----A---A-AA---T-A--A--T-T-T-T---CA--C--G--C------TTAG-T--GT---CT-GA-C----A------G-G--T-----CA-------------------G--T---T-----T-G--T-AGT--TAT--TA-ATA--C----------------A-C----T-A-----AA----CCCGGT--AG--ACG-AATAC-G--AAtt
gi|33 : caatagcgaaaacaaatatttcgaaTA-GGAAAAATA-T------------------TA----C---T--TT-T----C--GCA-C--------ATTAC-CCC--TT-T-A----TA---C-G-GA---------G-T-TT---T----A-T--T-------T--TTTT--------A---A-A----A------------T--A--T-T-T-T---C---C--G--CT-----T--G-T--G----CT-G--C----A------T-G--T-----CG-------------------G--T---A--A--T-G--T-AGT--T-T--TG-ATA--C----------------A-A--G-T-A-----AA----CCTG-T--AG--ACG-AA-AC-G--AAATTGCtt
gi|34 : AGAACA-T--A--------------------AC---T--TT-T----C--GCT-C--------AT-AC-CCT--TAA--------A---C-G-GA---------G-T-TT---T----T-A--T-------T--T-----------A---A-A----A---A-TATATA-T--A--T-T-T-T---T---C--G--C------T--T-T--GT---CT-G--C-----------G-G--T-----CG-------------------G--T---T--A--T-G--T-AGT--A-T--TG-ATA--C----------------A-A--G-T-A-----AA----CCCG-T--AG--ACG-AA-AC-G--AAATTGCt
gi|35 : A--TTTA-GGAAGAGCA------------------------------------------------C--------AT-AC-CCT--TTAT-A---------C-G-GA---------G-T-TT----------A--T-------T--T-----------A---A-A----A---A-AA---AAT--A--T-T-T-T---C---CCTG--C------T--GGT--GT---CT-G-------A------GCG--T-----CG-------------------G--T---A--A--T-G--T-AGT--T-T--TGGATA--C----------------A-A--G-T-A-----AA----CCCG-T--AG--ACG-AA-ACAG--AAATTGCt
gi|36 : --GCA-C--------AT-AC-CCT--TTAT-A---------C-G-GA---------G-T-TT---T----A-T--T-------T--A-----------A---A-A----A---A-AA---A-T--A--T-T-T-T---C---C--G--C------T--G-TG-GTGCACT-G--CA---A------G-G--T-----CG-------------------G--T---TA-A--T-G--T-AGT--T-T--TG-GAA--C----------------A-A--G-T-A-----AA----CCCG-T--AG--ACG--A-AC-A--AAATTGCt
gi|37 : ttaggaagA--TTTA-GGAA-AACA---------------------A---A----T--TT-T----C--GCA-C--------AT-AC-CCT--TTAT-A---------C-G-GA---------G-T-TT---T----T-A--T-------T--T-----------A---A-A----A------A---A-T--A--T-T-T-T---C---C--G--C------T--G-T--GT---CT-G--C----A------G-G--T-----CA-------------------G--T---T--T--T-G--T-AGT--T-T--TG-ATA--C----------------A-C--G-T-A-----AA----CCCG-T--AG--ACG-AT-AC-G--t
gi|38 : ac-C--------AT-AC-CCT--TTAT-A---------C-G-GAT--------G-T-TT----------A--T-------T--T-----------T---A-A----A---A-AA---A-T--A--T-T-T-T---CG--C--G--G---------G-T--GT---CT-G--C----A------G-G--T-----CG----------------------T---A--A--T-G--TTAGT--T-TA-TG-GTAA-C----------------A-A--G-T-A-----AA----CCCG-T--AG--ACG-AA-AC-G--AAATTG
gi|4 : tttaggaaagcca----------AGTA---AC---T--TT-T----CCCGCT-C--------AA-AC-TCT--T----A----TA---C-G-GA---------G-T-TT---TT---A-A--T-------A--T-----------A---A-A----A---AGAA---A-T--A--G-T-T-T---C---C--G--C------T--G-T--GT---CT-G--T----A------G-A--T-----TGAAGTAATACTAGACACTAAG--T---T--A--T-G--T-AG---T-T--TG-ATA--C----------------A-A--A---A-----AC----CCCG-T--TG--GCGAAA-AC-GGAAAATT
gi|40 : atgtaataatatattatacacatttggaa--------AT-AC-CCT--TTAT-A-----G---C-G--A---------G-T-TT---T----A----T-------T--T-----------A---A-A----A---A-A------T--A--T-T-T-----C---C--A--C------T--G----GT---CT-G--C----A------G-G--T-----CG-------------------G--T---TA-A--T-GATC-AGT--T-TGATGAATA--C----------------A-A--G-TAA-----AA----CCCG-T--AG--A-G-AACAC-GA-AAATTGCtctt
gi|41 : aagcaca-AC-CCT--TTAT-A----T------G-GA---------G-T-TT---C----A------------T--C-----------A---A-C----A---A-AA---A-T--A--T-T-------C---T--G--T------T--G-T--GA---CT-G--C----A------G-G--T-----TG-------------------G--T---T--G--T-G--T-AAT--T-T--TG-ATA--C----------------A-A--G-T-A-----AAAGTTCTCG-T--AG--ATG-AA-AC-A--AAATTACt
gi|42 : aattgcttgtg-AT-CCTCATTAC-A----TG---C-A-GT---------G-G-TT---T----A-T--T-------C--T-----------G---A-A----C---A-AA-------------T-T-T---C---T--GAACAAATAAT--T-T--GT---CT-G--C----T------A-G--T-----CA-------------------C--TA--T--A--T-G--T-AGT--T-T--TA-ATA--C----------------A-A--G-T-A-----A------CCG-T--AG--ACG-AA-AC-G--AAATTGCt
gi|43 : ttA--TTTA-GAAAGAACA-T--AATT----------GTTA---AC---T--CT-G----C--TTT-G--------AT-AC-ACT--T--G-A----TA---C-A-GA---------G-T-TT---T----T-A--T-------T--A-----------A---A-A----AGTCA-GA---A-T--A--A-T-T-tt
gi|44 : ttttaaataccctcgccaattggaacacgtatac--T-----------A---A-G----A---A-AA---T-T--A--G-T-G-T---C---C--G--C------T--G-T--GT---CT-G--C----G------G-G--T-----GT-------------------G--T---T--G--T-G--T-AGT--T-T--TG-ATA--C----------------A-A--G-T-A-----AA----CCCG-T--AG--ACG-AA-AC-G--AAATTGgttc
gi|45 : taataaaaatatcagaaagaaattgagtaA--TTTA-GGAAAAAC--------------------GTA---AC---C--TC-T----T--G---------------------------------TG---C-A-GA---------A-T-TTC--T----A-A--T-------C--------------------A----A---A-AA---A----A--T-T-T-T---C---T--G--C------T--G-T--GT---CT-G--T----ACATTTAG-G--T-----CG-------------------A--T---T--A--T-G--T-AGC--T-T--TG-ATA--C----------------A-A--G-T-tt
gi|46 : acttatac----------AATA---AC---T--TT-T----C--GCT-C--------AT-AC--------A--A----T-------------------G-T-TT---G-----------------T--C-----------A---A-A----A---A-AA---A-T---------------C---C--G--C------T--A-T--GT---CT-G--C----A------G-G--T-----TG-------------------C--C---T--G--T-T--T-AGT--C-T--TG-ATA--C----------------A-A--G-T-A-----AA----CCCG-T--TG--ACG-AA-AC-G--AAATGGC
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gi|48 : -AC-TCC--CTAT-A-----------G-GAC--------G-T-TT---T----A-A--T-------A--A-----------C---A-A----A---A-AA---A-T--A--T-T-T-C---C---C--G--C------T--G-TTTGTT--CT-GATT----A------G-A--T-----CG-------------------A--T---T--A--T-G--T-AGT--T-T--TG-ATA--C----------------A-A--
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consensus : ACTTTTCGCACATAAGAACCCT-T---TATA-C-A---TAC---------A-------CA-T-TTA-GGAAGA----ACAT-------A-----------A--G-TA-AC---TTT-T----C--GCT-C--------AN-AC-CCT--TTAT-A----TA---C-G-GA---------G-TTT---T----A-A--T-------T--T-----------A---A-A----A---A-AA---A-T--A--T-T-T-T---C---C--G--C------T--G-T--GT---CT-G--C----A------G-G--T-----CG-------------------G--T---T--A--T-G--T-AGT--T-T--TG-ATA--C----------------A-A--G-T-A-----AA----CCCG-T--AG--ACG-AA-AC-G--AAATTGC
Reference ( family-2419 ) : ACTTTTCGCACATAAGAACCCT-T---TATA-C-A---TAC---------A-------TA-T-TTA-GGAAGA----ACAT-------A-----------A--G-TA-AC---TTT-T----C--GCT-C--------AN-AC-CCT--TTAT-A----TA---C-G-GA---------G-TTT---T----A-A--T-------T--T-----------A---A-A----A---A-AA---A-T--A--T-T-T-T---C---C--G--C------T--G-T--GT---CT-G--C----A------G-G--T-----CG-------------------G--T---T--A--T-G--T-AGT--T-T--TG-ATA--C----------------A-A--G-T-A-----AA----CCCG-T--AG--ACG-AA-AC-G--AAATTGC
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gi|26 : aa-------TA-T-TTA-GGAAGA----ACAT-------A-----------A--------C---TTT-T----C--GCT-C--------AT-AC-CCT--T--C-C----TA---C-G-GA---------G-TTC---T----T-G--T-------T--T-----------g
gi|26 : -T--A--A-T-T-T---C---C--G--C------T--G-T--GT---TT-A--C----A------G-G--T-----TG-------------------A--T---T--A--T-G--T--------------------------------------A--G-T-A-----AA----TCCG-T--AG--ACG-AC-AC-G--AAGTTttgtttttgcttttttttttttttaatttccgctgtgtttacaggttgattatgtagtaaatccgtagacgacacgaagtttc
gi|27 : tatttaggaagaacataacttttcgctcatacccttcctacggagttcttgtttttgtttttgctttttttttttttA-T-TTA-GTAAAA----AC------------------------G-TA-TC---TTA-T----C--GCT-C--------AA-AC-CTC--TTAT-A---------C-G-GA---------A-TTT---T----T-A--A-------T--A-----------A---A-A----A---A-GA---A-A--A--A-A-T-T---C---C--A--C------T--G-T--GT---CT-G--T----A------A-G--T-----CG-------------------A--T---T--A--T-G--T-AGC--T-T--TG-ATA--C----------------A-A--G-T-ACTT--AA----ACCA-T--AG--GTG-CA-A--G--AAATTtc
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gi|29 : ---------A-------TA-T-TTA-GGAAGA----A----------------------A--G-TATAC---TTT-T----C--GCT-C--------AA----CCT--CT-T-A----TA---C-G-GA---------A-TTT---T----T-T--T-------TA-T-----------A---T-A----A---A-AA---A-T--T--A-T-T-T---C---C--G--C------T--G-T--GT---CT-G--CT---A------G-A--T-----TG-------------------A--TTAAT--A--T-G--C-AG---T-T--TG-ATC--C----------------A-A--G-T-A-----AA----CCtt
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gi|30 : atgtatgtaaatta---TAT---------A-------CA-T-TTA-GGAA----------------------------------CA-AC---TTT-T----C--GGT-C--------AT-AC-CAT--TTAT-A----T---------------------TTT---T----G-A--T-------T--T-----------ATTTA-A----A---A-AT---A-T--ACAT-T-T-T---C---C--G--C------T--G-T--GT---CT-G--C----A------G-G--T-----CG-------------------G--T---T--A--C-G--T-GGT--T-T--TG-ATC--C----------------A-A--G-T-A-----AA----GCCG-T--AA--ACT-AA-AC-G--AAATTGtcttt
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gi|33 : caatagcTA-GGAAAA----ATAT------------------------TA--C---TTT-T----C--GCA-C--------ATTAC-CCC--TT-T-A----TA---C-G-GA---------G-TTT---T----A-T--T-------T--TTTT--------A---A-A----A------------T--A--T-T-T-T---C---C--G--CT-----T--G-T--G----CT-G--C----A------T-G--T-----CG-------------------G--T---A--A--T-G--T-AGT--T-T--TG-ATA--C----------------A-A--G-T-A-----AA----CCTG-T--AG--ACG-AA-AC-G--AAATTGCtt
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gi|37 : ttaggaag---------A-------CA-T-TTA-GGAA-A----ACA--------------------------A-A----TTT-T----C--GCA-C--------AT-AC-CCT--TTAT-A---------C-G-GA---------G-TTT---T----T-A--T-------T--T-----------A---A-A----A------A---A-T--A--T-T-T-T---C---C--G--C------T--G-T--GT---CT-G--C----A------G-G--T-----CA-------------------G--T---T--T--T-G--T-AGT--T-T--TG-ATA--C----------------A-C--G-T-A-----AA----CCCG-T--AG--ACG-AT-AC-G--t
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gi|41 : aagcaca-AC-CCT--TTAT-A----T------G-GA---------G-TTT---C----A------------T--C-----------A---A-C----A---A-AA---A-T--A--T-T-------C---T--G--T------T--G-T--GA---CT-G--C----A------G-G--T-----TG-------------------G--T---T--G--T-G--T-AAT--T-T--TG-ATA--C----------------A-A--G-T-A-----AAAGTTCTCG-T--AG--ATG-AA-AC-A--AAATTACt
gi|42 : aattgcttgtg-AT-CCTCATTAC-A----TG---C-A-GT---------G-GTT---T----A-T--T-------C--T-----------G---A-A----C---A-AA-------------T-T-T---C---T--GAACAAATAAT--T-T--GT---CT-G--C----T------A-G--T-----CA-------------------C--TA--T--A--T-G--T-AGT--T-T--TA-ATA--C----------------A-A--G-T-A-----A------CCG-T--AG--ACG-AA-AC-G--AAATTGCt
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|15 : agatgtacatgtaataa---TATA-T-T---TAT---------AT-A---TGTA-AA--AAGA----AC------------------------G-TA-AA---TTT-T----C--GCT-C--------AA-AC-CTC--TTAT-A---------C-G-GA---------G-TTT---TTAATA-A--TACAC---T--T-----------G---T-A----ATT-A-AA---A-T--A--A-T-C-----C---C--G--C------T--G-T--GT---CT-G--T----A------G-G--T-----CG-------------------A--T---T--A--T-G--T-AGT--T-T--TG-AAC--C----------------A-ATTT-T-A-----A-------------------G-AA-AC-G--AAATTtct
gi|16 : actata---TATAGC-A---TAA---------TA-A---TTTA-GG--AAGG----A-AT----------------------G-TA-AC---TTT-TAATTC--GCT-C--------AA-AC-CTC--TCAT-A---------C-G-GT---------G-ATT---C----T-A--T-------T--------------------A----A---A-AA---A-T--A--T-T-T-T---C---C--G--A------T--G-T--GT---CT-G--T----A------G-G--T-----CG-------------------A--T---T--A--T-G--T-AGT--T-T--TG-ATA--T----------------A-A--G-T-A-----CA----CTCG-T--AA--GTG-AA-AC-G--AAATTtcttt
gi|17 : ata---TATA-C-T---TGT---------AC-A---TTTA-GG--AAGA----TC------------------------G-TA-AC---TTT-T----C--ACT-C--------AA-AC-CTT--TTAT-A----TA---T-G-GA---------A-TTT---T----T-A--T-------T--C-----------A---A-A----G---A-AA---A-T--G--T-T-T-T---G---T--G---------T--C-T--GA---CT-G--T----A------G-T--T-----CG-------------------A--T---T--A--T-G--A-AG---T-T--TG-ATA--C----------------A-A--G-T-A-----AA----CCCG-T--CG--GCG-AA-AG-G--AAATTtct
gi|18 : ata---TATG-C-T---TAT---------AC-A---TTTA-----AATA----AC------------------------G-TA-AC---GTT-T----C--GCT-C--------A--AT-CCT--CT-T-A----TA---C-G-GA---------G-TTT---TT---A-A--T-------T--T-----------A---A-C----G---A-AT---A-T--A--T-G-T-T---C---C--G--C------T--G-T--GT---CT-G--T----A------G-G--C-----CG-------------------A--T---A--A--T-G--T-AAT--T-T--TG-ATA--C----------------A-A--G-T-A-----AA----CCCG-T--AG--GCG-AA-AC-G--AAATTtct
gi|19 : cata-----------A---A-A----A---A-AA---A-A--A--A-T-T-C---C---C--G--C------T--A-T--GG---CA-G--C----A------A-G--T-----CG-------------------A--T---T--G--T-G--T-AGT--T-T--TG-TTA--C----------------A-A--GTT-AATTTTAA----CCCG-T--AG--ACG-AA-AC-G--AAATtc
gi|2 : atgtttcactctgcttgttatccctttaaaggagtttttaaaaaaaaagaaaaaaaaaaaaACTTTTCGCACATA----CCCT-T---TATA---A---TAC---------AG-AGTTTTTA-TTTTAAAA----ACAT-------ATTTTCCGCTNCA----TA-AC---TTT-T----C--GCA-C--------AT-AC-CCT--TTAT-AA---TA---C-G-GA---------G-TTT---T----A-A--T-------T--T-----------A---A-A----A---A-AC---A-T--A--T-T-T-T---C---C--G--C------T--G-T--GT---CT-G--A----G------G-G--T-----TG-------------------G--T---T--A--T-G--T-AGT--T-T--TG-ATA--C----------------A-A--G-T-A-----AA----CCCG-T--AG--ACG-AT-AC-G--AAATTGCa
gi|20 : AT---------AC-A---TTTG-GG--AAGA----ACAT------------------------------------T----T--GCT-C--------AT-AC-CCT--TCAT-A---------C-G-GA---------G-TTT---T----T-A--T-------T--TCT---------A---A-A----T---A-TATATA-T--A--TGTAT-T---C---T--G--C------T--G-T--GT---CT-C--C----A------C-G--T-----CG-------------------A--T---T--A--T-G--T-AGT--T-A--TG-ATA--C----------------A-G--A-T-A-----AA----CTTG-T--AG--ACG-AA-AC-G--AAATT
gi|21 : ---TATA-C-A---TA-------------A---T-----G--AA-A----ACAT-------A-----------A--------C---TTT-T----C--GCA-C--------AT-AC-CCT--TTAT-AA---TA---C-G--A---------G-TTT---T----A-A--T-------T--------------A---A-A----A---A-AC---A-T--A--T-T-T-T---C---C--G--C------T--G-T--GT---CT-G--A----A------G-GGTT-----CG-------------------G--T---T--A--T-G--T-AGT--T-T--TG-ATA--C----------------A-A--G-T-A-----AA----CCCG-T--AG--ACG-AT-AA-G--AAATTGtagct
gi|22 : ---TATA-T-C---TAT---------AC-A---TT--------AGA-----TAG-------A-----------A--G-TA-AC---TGT-C----C----T-C--------AT-AA-CCT--CT-T-A----TA---G-G-GA---------G-TT--------------T-------T--T-----------A---A-ATAT-A---T-AA---A-T--A--T-T-T-TC--C---C--G--C------T--A-G--GT---CT-G--T----A------G-A--T-----TG-------------------A--T---T--A--T------------------------------------------------C-A-----AA----CCCG-C--TA--TCG-AA-AC-G--AAATTgct
gi|23 : atatgtacattaata---------AT-A---TTTA-GG--AAGA----A----------------------A--G-TA-AC---TTT-T----C--GCT-C--------AA-AC-CTC--T--T-A----TA---C-G-GA---------A-TTT---T------T--T-------T--T-----------ATATA-A----A---A-AA---T-T--A--T-T-C-T---C---C--G--C------T--G-T--GT---CT-G--T----A------G-A--T-----TG-------------------A--TTAAT--A--T-G--C-AG---T-T--TG-ATC--C----------------A-A--G-T-A-----AA----CCTG-T--TG--GCG-AA-AC-G--AAATtct
gi|24 : gttaA-C-T---TAT---------AC-A---TGTA-GG--AAGA----ACAC-------A-----------A--------T---TTT-T----T--ACT-CTGCTTGTGAT-AC-CCT--TTAT-A---------C-G-GA---------C-TTTATAT----ATA--T-------A--T-----------A---A-A----A---A-AA---A-A--A--T-C-------C---C--G--T------T--G-T--GT---CT-G--C----A------G-G--T-----CG-------------------G--T---T--A--T-G--T-AG---T-A--TG-ATATTC----------------A-A--G-T-------AA----CTCG-C--AG--ATG-A
gi|25 : ---------AC-A---TTTT-GG--AAGA----ACATGCATGCTA-----------T--G-TA--C---TAT---------G-T-A--------AT-AT-C----TTGT-A----TA---C-G-GA---------G-CCT---T----T-ACCT-------T--T-----------A---A-A----A------------T--A--T-G-------C---C--G--C------T--A-T--GT---CT-G--C----A------G-G--T-----CG-------------------G--T---T--G--T-G--T-ACT--T-T--TG-ATA--C----------------A-A--A-T-A-----AA----TCCG-C--AG--GCG-AA-AC-A--AAAT
gi|26 : aa-A---TTTA-GG--AAGA----ACAT-------A-----------A--------C---TTT-T----C--GCT-C--------AT-AC-CCT--T--C-C----TA---C-G-GA---------G-TTC---T----T-G--T-------T--T-----------g
gi|26 : t-T--A--A-T-T-T---C---C--G--C------T--G-T--GT---TT-A--C----A------G-G--T-----TG-------------------A--T---T--A--T-G--T--------------------------------------A--G-T-A-----AA----TCCG-T--AG--ACG-AC-AC-G--AAGTTttgtttttgcttttttttttttttaatttccgctgtgtttacaggttgattatgtagtaaatccgtagacgacacgaagtttc
gi|27 : tatttaggaagaacataacttttcgctcatacccttcctacggagttcttgtttttgtttttgctttttttttttttC-A---TTTA-GT--AAAA----AC------------------------G-TA-TC---TTA-T----C--GCT-C--------AA-AC-CTC--TTAT-A---------C-G-GA---------A-TTT---T----T-A--A-------T--A-----------A---A-A----A---A-GA---A-A--A--A-A-T-T---C---C--A--C------T--G-T--GT---CT-G--T----A------A-G--T-----CG-------------------A--T---T--A--T-G--T-AGC--T-T--TG-ATA--C----------------A-A--G-T-ACTT--AA----ACCA-T--AG--GTG-CA-A--G--AAATTtc
gi|28 : -A---TTTA-GG--AAAA----ACAT-------A-----------A--------C---TTT-T----C--GCA-C---------T-AC-TCT--TTA--A----TAAATC-G-GA---------G-TTT---T----T-A--T-------T--T-----------T---A-A----A------------T--A--T-T-T-TTATC---C-----C------T--G-T--GT---CT-G--C----A------G-G--T-----CG-------------------G--T---C--A--T-G--T-AGT--T-T--TGAATA--C----------------A-G--G-T-A-----AA----CCCG-T--AG--ACG-AT-AC-A--AAATTGtct
gi|29 : ---------AT-A---TTTA-GG--AAGA----A----------------------A--G-TATAC---TTT-T----C--GCT-C--------AA----CCT--CT-T-A----TA---C-G-GA---------A-TTT---T----T-T--T-------TA-T-----------A---T-A----A---A-AA---A-T--T--A-T-T-T---C---C--G--C------T--G-T--GT---CT-G--CT---A------G-A--T-----TG-------------------A--TTAAT--A--T-G--C-AG---T-T--TG-ATC--C----------------A-A--G-T-A-----AA----CCtt
gi|3 : tcgtacatgtcatgtta---TATG-C-ACT-TAC---------AT-A---TTTA-GG--AAAA----A-AT-------A-----------A----TA-ACATTTTT-T----C--GCT-C--------AA-AA-C----TTAT-A----TA---C-G-GA---------GTTTT---T----A-A--T-------TAATTAAAAAAAAAAA---A-A----A---A-AA---A-A--A--A-T-T-C---CGAGC--G--C------T--------T---CT-G--TAA--A------G-A--T-----TG-------------------A--T---T--A--TCG--C-AG---T-T--TG-ATA--G----------------A-A--G------------------G-TCAAG--GCG-AA-A--G--AAATT
gi|30 : atgtatgtaaatta---TAT---------AC-A---TTTA-GG--AA----------------------------------CA-AC---TTT-T----C--GGT-C--------AT-AC-CAT--TTAT-A----T---------------------TTT---T----G-A--T-------T--T-----------ATTTA-A----A---A-AT---A-T--ACAT-T-T-T---C---C--G--C------T--G-T--GT---CT-G--C----A------G-G--T-----CG-------------------G--T---T--A--C-G--T-GGT--T-T--TG-ATC--C----------------A-A--G-T-A-----AA----GCCG-T--AA--ACT-AA-AC-G--AAATTGtcttt
gi|31 : ct---TAT---------AC-G---ATTA-GG--AAAA----ACA----------------------------AC---TTT-T----C--GCAAC--------AT-ACGCCT--TTAT-A---------C-G-GA---------G-TTT---T----TTA--T-------T--T-----------------------------------T--T--T-T-T-T---C---C--A--C------T--G-T--GT---CT-G--C----A------G-G--C-----CA-------------------G--T---T--A--T-G--T-AGT--T-T--TG-ATA--C----------------A-A--G-T-A-----AA----CCTG-T--AG--ACG-AT-AC-G--AAATTGC
gi|32 : ctGA----AAAC-------A-----------A--A-TA-------TT-T----C--GA--A--------AT-AC-CCTG-TCAT-A----TA---T-G-T----------T-TTT---T----A-C--T-------T--T-----------T---A-A----A---A-AA---T-A--A--T-T-T-T---CA--C--G--C------TTAG-T--GT---CT-GA-C----A------G-G--T-----CA-------------------G--T---T-----T-G--T-AGT--TAT--TA-ATA--C----------------A-C----T-A-----AA----CCCGGT--AG--ACG-AATAC-G--AAtt
gi|33 : caatagcTA-GG--AAAA----ATAT------------------------TA--C---TTT-T----C--GCA-C--------ATTAC-CCC--TT-T-A----TA---C-G-GA---------G-TTT---T----A-T--T-------T--TTTT--------A---A-A----A------------T--A--T-T-T-T---C---C--G--CT-----T--G-T--G----CT-G--C----A------T-G--T-----CG-------------------G--T---A--A--T-G--T-AGT--T-T--TG-ATA--C----------------A-A--G-T-A-----AA----CCTG-T--AG--ACG-AA-AC-G--AAATTGCtt
gi|34 : AGA----ACAT-------A-----------A--------C---TTT-T----C--GCT-C--------AT-AC-CCT--TAA--------A---C-G-GA---------G-TTT---T----T-A--T-------T--T-----------A---A-A----A---A-TATATA-T--A--T-T-T-T---T---C--G--C------T--T-T--GT---CT-G--C-----------G-G--T-----CG-------------------G--T---T--A--T-G--T-AGT--A-T--TG-ATA--C----------------A-A--G-T-A-----AA----CCCG-T--AG--ACG-AA-AC-G--AAATTGCt
gi|35 : -A---TTTA-GG--AAGA----GCA-------------------------------------------------C--------AT-AC-CCT--TTAT-A---------C-G-GA---------G-TTT----------A--T-------T--T-----------A---A-A----A---A-AA---AAT--A--T-T-T-T---C---CCTG--C------T--GGT--GT---CT-G-------A------GCG--T-----CG-------------------G--T---A--A--T-G--T-AGT--T-T--TGGATA--C----------------A-A--G-T-A-----AA----CCCG-T--AG--ACG-AA-ACAG--AAATTGCt
gi|36 : --GCA-C--------AT-AC-CCT--TTAT-A---------C-G-GA---------G-TTT---T----A-T--T-------T--A-----------A---A-A----A---A-AA---A-T--A--T-T-T-T---C---C--G--C------T--G-TG-GTGCACT-G--CA---A------G-G--T-----CG-------------------G--T---TA-A--T-G--T-AGT--T-T--TG-GAA--C----------------A-A--G-T-A-----AA----CCCG-T--AG--ACG--A-AC-A--AAATTGCt
gi|37 : ttaggaag---------AC-A---TTTA-GG--AA-A----ACA--------------------------A-A----TTT-T----C--GCA-C--------AT-AC-CCT--TTAT-A---------C-G-GA---------G-TTT---T----T-A--T-------T--T-----------A---A-A----A------A---A-T--A--T-T-T-T---C---C--G--C------T--G-T--GT---CT-G--C----A------G-G--T-----CA-------------------G--T---T--T--T-G--T-AGT--T-T--TG-ATA--C----------------A-C--G-T-A-----AA----CCCG-T--AG--ACG-AT-AC-G--t
gi|38 : -C--------AT-AC-CCT--TTAT-A---------C-G-GAT--------G-TTT----------A--T-------T--T-----------T---A-A----A---A-AA---A-T--A--T-T-T-T---CG--C--G--G---------G-T--GT---CT-G--C----A------G-G--T-----CG----------------------T---A--A--T-G--TTAGT--T-TA-TG-GTAA-C----------------A-A--G-T-A-----AA----CCCG-T--AG--ACG-AA-AC-G--AAATTG
gi|4 : tttaggaaagcca---TATA-TTA---TAC---------AC-A---TTT--GG--AA-----------------------------A--G-TA-AC---TTT-T----CCCGCT-C--------AA-AC-TCT--T----A----TA---C-G-GA---------G-TTT---TT---A-A--T-------A--T-----------A---A-A----A---AGAA---A-T--A--G-T-T-T---C---C--G--C------T--G-T--GT---CT-G--T----A------G-A--T-----TGAAGTAATACTAGACACTAAG--T---T--A--T-G--T-AG---T-T--TG-ATA--C----------------A-A--A---A-----AC----CCCG-T--TG--GCGAAA-AC-GGAAAATT
gi|40 : atgtaataa--------AT-AC-CCT--TTAT-A-----G---C-G--A---------G-TTT---T----A----T-------T--T-----------A---A-A----A---A-A------T--A--T-T-T-----C---C--A--C------T--G----GT---CT-G--C----A------G-G--T-----CG-------------------G--T---TA-A--T-GATC-AGT--T-TGATGAATA--C----------------A-A--G-TAA-----AA----CCCG-T--AG--A-G-AACAC-GA-AAATTGCtctt
gi|41 : aagcaca-AC-CCT--TTAT-A----T------G-GA---------G-TTT---C----A------------T--C-----------A---A-C----A---A-AA---A-T--A--T-T-------C---T--G--T------T--G-T--GA---CT-G--C----A------G-G--T-----TG-------------------G--T---T--G--T-G--T-AAT--T-T--TG-ATA--C----------------A-A--G-T-A-----AAAGTTCTCG-T--AG--ATG-AA-AC-A--AAATTACt
gi|42 : aattgcttgtg-AT-CCTCATTAC-A----TG---C-A-GT---------G-GTT---T----A-T--T-------C--T-----------G---A-A----C---A-AA-------------T-T-T---C---T--GAACAAATAAT--T-T--GT---CT-G--C----T------A-G--T-----CA-------------------C--TA--T--A--T-G--T-AGT--T-T--TA-ATA--C----------------A-A--G-T-A-----A------CCG-T--AG--ACG-AA-AC-G--AAATTGCt
gi|43 : ttACA-C-G---TAT---------AC-A---TTTA-GA--AAGA----ACAT-------A-----------ATTGTTA-AC---TCT-G----C--TTT-G--------AT-AC-ACT--T--G-A----TA---C-A-GA---------G-TTT---T----T-A--T-------T--A-----------A---A-A----AGTCA-GA---A-T--A--A-T-T-tt
gi|44 : ttttaaataccctcgccaattgga--T-----------A---A-G----A---A-AA---T-T--A--G-T-G-T---C---C--G--C------T--G-T--GT---CT-G--C----G------G-G--T-----GT-------------------G--T---T--G--T-G--T-AGT--T-T--TG-ATA--C----------------A-A--G-T-A-----AA----CCCG-T--AG--ACG-AA-AC-G--AAATTGgttc
gi|45 : taataaaaatatcagaaagaaattgagtaA-C-T---TAT---------AC-A---TTTA-GG--AAAA----AC------------------------G-TA-AC---CTC-T----T--G---------------------------------TG---C-A-GA---------A-TTTC--T----A-A--T-------C--------------------A----A---A-AA---A----A--T-T-T-T---C---T--G--C------T--G-T--GT---CT-G--T----ACATTTAG-G--T-----CG-------------------A--T---T--A--T-G--T-AGC--T-T--TG-ATA--C----------------A-A--G-T-tt
gi|46 : -------A-----------A--A-TA-AC---TTT-T----C--GCT-C--------AT-AC--------A--A----T-------------------G-TTT---G-----------------T--C-----------A---A-A----A---A-AA---A-T---------------C---C--G--C------T--A-T--GT---CT-G--C----A------G-G--T-----TG-------------------C--C---T--G--T-T--T-AGT--C-T--TG-ATA--C----------------A-A--G-T-A-----AA----CCCG-T--TG--ACG-AA-AC-G--AAATGGC
gi|47 : ---------G-TTT---T----A-A--T-------T--T-----------T---A-A----A---A-AA---A-TGCA--T-T-T-T---C---C--G--C------T--G-T--GT---CA-G--C----A------G-G--T-----CG-------------------G--T---T--A--T-G--T-AGT--T-T--TG-ATA--CATAACATTGTACTTGTA-A--G-T-G-----AA----CCCG-T--AG--ATG-AA-AC-G--AAAt
gi|48 : -AC-TCC--CTAT-A-----------G-GAC--------G-TTT---T----A-A--T-------A--A-----------C---A-A----A---A-AA---A-T--A--T-T-T-C---C---C--G--C------T--G-TTTGTT--CT-GATT----A------G-A--T-----CG-------------------A--T---T--A--T-G--T-AGT--T-T--TG-ATA--C----------------A-A--
gi|49 : tacgtttagagaacta-A----TA---C-G-GA---------G-TTT---T----A-T--T-------T--T-----------T---A-A----A---A-AA---A-T--A--T-T-T-T---C---C--G--C------T--G-T--GT---CT-A--T----A------G-G--T-----CG-------------------G--T---A--A--T-G--T-AGT--T-T--TG-ATA--C----------------A-A--G-T-A-----AA----CCCG-T--AG--ACG-AA-AC-G--AAATTGC
gi|5 : TCGTACATAAGAACCCTATATATATA-C-A---TAC---------ACTA---TTTA-GG--AAGACAGTACAC-------A-----------A--C-TG-G----TTG-T----C--GCT-C--------AA-AC-CTC--TC--------TA---C-GTTA---------GTTTT---T----G-A--T-------C--T-----------A---A-A----A---G-AA---A-T--A--T-T-T-T-------C--G--C------T--G-T--GT---CT-G--T----A------G-A--T-----TG-------------------A--T---T--A----A--T-AGCAGT-T--TG-ATA--C----------------A-A--G-T-ACT---AA----CCCGCT--AG---CG-AA-At
gi|50 : cac--G-TA-AC---TTT-T----C--GCT-C--------AA-AC-CTC--TTAT-A---------------------------------------------------------------------A-A----A---G-AG---A-T--A--T-T-T-T---C---C--G--C------T--G-T--GT---CT-T--T----A------G-G--T-----AG-------------------G--T---T--A--T-G--T-AG---T-T--TG-ATA--C----------------A-A--G-T-A-----AA----CCCG-T--AG--ACG-AA-atga
gi|51 : aac-A---TTTA-GG--AAAA----ACAT-------A-----------A--------C---TTT-T----C--GC------------------------AC-A----TA---C-G-GA---------G-TTT---T----T-A--T-------T--T-----------T---T-A----A---A-AT-----T--A--T-G-T-T---C---C--G--C------T--G-T--GG---CT-G--G----A------G-G--T-----CA-------------------G--T---TGAA--T-G--T-
gi|52 : ----TA---C-G-GA---------G-TTT---T----A-C--T--------------------------------------------A-C--A--T-T-T-T---C---C--G--C------T--A-T--GT---CT-G--C----G------G-GT-T-----TG-------------------GTTT---T--G--T-G--T-AGT--T-T--TT-ATA--C----------------A-A----T-A-----AA----CCGGAT--AG--ACG--A-AC-G---AATTGCcttgctgaat
gi|53 : --T---T--G--T-G--T-AGT--T-T--TG-ATA--C----------------A-A--G-T-A-----A------CCGTT--AG--ACG-GA-AC-G--ACATTGCt
gi|54 : caacgaaaatatgaaattatggca---TAT---------AC-A---TTCA-GG--AAGA----ACAT-------A-----------ATTGTTA-AC---TTT---------GCT-TTTG-----AT-A--CAT--TTAT-A----CA---ttt
gi|55 : TA-GG--AAG------TAT-------A----------------TA-AC---TTT-T----C--GCT-C--------AT-GC-CCT--T--T-A----TA---C-G-GA---------G-TTT---T----T-A--T-------T--ga
gi|56 : C-A---TTTA-G---AATA----AC------------------------G-CA-AC---TTT-T----C--GCT-C--------AA-AC-CTC--T--T-A----TA---C-G-GA---------c
gi|57 : ----C--GCT-C--------AA-AC-CTC--T--T-A----TA---C-G-GA---------ATTTT---T----A-A--T-------G--T-----------A---A-A----A---A-A
gi|58 : T--T-T--TG-ATA--C----------------A-A--G-T-A-----GA----CCCG-T--AG--ACA-AA-AC-G--AAAT
gi|59 : --TG-ATA--C----------------A-A--G-T-A-----AA----CCCG-T--AG--GCG-AA-AC-G--
gi|6 : ---TATC-C-A---TAC---------AC-A---TTTA-GG--AAGA---------------A-----------A--G-TA-AC---TTTAT----C--GCT-C--------AA-AC-CTC--TTA--A----TA---C-G-GAG--------G-TCT---T----A---------------T-----------A---ATA----A---A-AA---A-C--A--T-T-T-T---C---C--T--A------T--GTT--GT---CT-GT-T----A------G-A--T-----TT-------------------GAATTAAT--A--T-G--C-AG---T-T--TG-ATA--CA---------------A-A--G-T-A-----AA-----CCG-T--TG--GCG-AA-AC----AAATT
gi|7 : tcgtacatgtacagtaatata-T---TATA-T-ACTTTAC---------AC-A---TTTAAGG--AAGA----A----------------------A--G-TA-AC---TTT-T----C--GCT-C--------AA-AC-CTC--TTAT-A----C----C-G-GA---------G-GTT---T---------T-------T--C-----------A---ATAT---A---A-AA---A-T--A--T-T-T-T---C---C--GC-C------T--G-T--GT---CT-G--T----A------G-G--A-----TG-------------------A--T---T--A--T-G--C-AAC--T-TG-TG-ATA--C----------------ATG--G-T-G-----AA----CCAG-T--AGGCGCG-AA-AC-G--AAATTtctt
gi|8 : tacatgtacatttaa--AAGA----ACGT-------A-----------A--A-T-------TTT-T----C--GCT-C--------AA-AA-CCT--CTTT-A----CA---A-G-GA---------GTTTT---T----A-A--TAATACACT--T-----------G---T-A----ATT-A-AA---A-T--A----A-T-C---C---C--G--C------T--G-TG-GT---CT-G--T----A------G-GA-T-----CG-------------------A--T---T--A--T-G--T-AGT--T-T--TG-Actt
gi|9 : tgtactatatatagtttatgatatgtaccaaACA-C-A---TAT---------AC-A---TTTA-GG--AAGA----ACA--------A-----------------A-AC---TGT-T---------------------A-AC-ACT--TGAT-AAGGCCA-----G-GA---------G-T------------A--T-------T--T-----------A---ATA----A---A-AA---G-T--AG-T-T-TGT---T---C--A--C------T--T-T--GT---CT-G--CTGATA------G-G--------CG-------------------A--C---T--G--C-A--T-AGT--T-T--TG-ATG--T----------------A-A--G-C-A-----AA----GCGG-C--AT--ACG-AA-accaattttaagaaacgaaaatttcttt
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gi|26 : t-T--A--A-T-T-T---C---C--G--C------T--G-T--GT---TT-A--C----A------G-G--T-----TG-------------------A--T---T--A--T-G--T--------------------------------------A--G-T-A-----AA----TCCG-T--AG--ACG-AC-AC-G--AAGTTttgtttttgcttttttttttttttaatttccgctgtgtttacaggttgattatgtagtaaatccgtagacgacacgaagtttc
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gi|35 : -A---TTTA-GG--AAGA----GCA-------------------------------------------------C--------AT-AC-CCT--TTAT-A---------C-G-GA---------G-TTT----------A--T-------T--T-----------A---A-A----A---A-AA---AAT--A--T-T-T-T---C---CCTG--C------T--GGT--GT---CT-G-------A------GCG--T-----CG-------------------G--T---A--A--T-G--T-AGT--T-T--TGGATA--C----------------A-A--G-T-A-----AA----CCCG-T--AG--ACG-AA-ACAG--AAATTGCt
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gi|38 : -C--------AT-AC-CCT--TTAT-A---------C-G-GAT--------G-TTT----------A--T-------T--T-----------T---A-A----A---A-AA---A-T--A--T-T-T-T---CG--C--G--G---------G-T--GT---CT-G--C----A------G-G--T-----CG----------------------T---A--A--T-G--TTAGT--T-TA-TG-GTAA-C----------------A-A--G-T-A-----AA----CCCG-T--AG--ACG-AA-AC-G--AAATTG
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gi|41 : aagcaca-AC-CCT--TTAT-A----T------G-GA---------G-TTT---C----A------------T--C-----------A---A-C----A---A-AA---A-T--A--T-T-------C---T--G--T------T--G-T--GA---CT-G--C----A------G-G--T-----TG-------------------G--T---T--G--T-G--T-AAT--T-T--TG-ATA--C----------------A-A--G-T-A-----AAAGTTCTCG-T--AG--ATG-AA-AC-A--AAATTACt
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gi|51 : aac-A---TTTA-GG--AAAA----ACAT-------A-----------A--------C---TTT-T----C--GC------------------------AC-A----TA---C-G-GA---------G-TTT---T----T-A--T-------T--T-----------T---T-A----A---A-AT-----T--A--T-G-T-T---C---C--G--C------T--G-T--GG---CT-G--G----A------G-G--T-----CA-------------------G--T---TGAA--T-G--T-
gi|52 : ----TA---C-G-GA---------G-TTT---T----A-C--T--------------------------------------------A-C--A--T-T-T-T---C---C--G--C------T--A-T--GT---CT-G--C----G------G-GT-T-----TG-------------------GTTT---T--G--T-G--T-AGT--T-T--TT-ATA--C----------------A-A----T-A-----AA----CCGGAT--AG--ACG--A-AC-G---AATTGCcttgctgaat
gi|53 : --T---T--G--T-G--T-AGT--T-T--TG-ATA--C----------------A-A--G-T-A-----A------CCGTT--AG--ACG-GA-AC-G--ACATTGCt
gi|54 : caacgaaaatatgaaattatggca---TAT---------AC-A---TTCA-GG--AAGA----ACAT-------A-----------ATTGTTA-AC---TTT---------GCT-TTTG-----AT-A--CAT--TTAT-A----CA---ttt
gi|55 : TA-GG--AAG------TAT-------A----------------TA-AC---TTT-T----C--GCT-C--------AT-GC-CCT--T--T-A----TA---C-G-GA---------G-TTT---T----T-A--T-------T--ga
gi|56 : C-A---TTTA-G---AATA----AC------------------------G-CA-AC---TTT-T----C--GCT-C--------AA-AC-CTC--T--T-A----TA---C-G-GA---------c
gi|57 : ----C--GCT-C--------AA-AC-CTC--T--T-A----TA---C-G-GA---------ATTTT---T----A-A--T-------G--T-----------A---A-A----A---A-A
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blockSeqs : . . . ACT C . . . . . CATGCATGCTATGTA . . . TTG A G TA TAAAT T T C TAATAATACACTTG T T TT TAT . G . C A . C G . T G T TAA . T . GTT TAA A . . . TA A G A A T T CTT . C . . C A
blockSeqs : . . . TA C . . . . . CATAATTGTTAA . . . . A . TA ATA C T . AATAATACACTTG T . TT . . . . . G . . T . . G . ATT . A . GAA TAA A . . . T G A . . . . CT . A . . . .
blockSeqs : . . . A C . . . . . CATAATTGTTAA . . . . A . CA ATA G T . GATTTATTT T . . . . . . . . . . . . . . . CT . . . G A . . . . T . . . . . . . . T . . . .
blockSeqs : . . A T . . . . . TAGAAGTAA . . . . A . TA TA . . . ATTTTTTTA . . . . . . . . . . . . . . . . AC . . . G . . . . . T . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . T A . . . . . CACAACTGG . . . . A . TA TA . . . TATTTCTA . . . . . . . . . . . . . . . . CA . . . A . . . . . T . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . T T . . . . . AACAAATA . . . . A . CA TA . . . TTTTATAT . . . . . . . . . . . . . . . . TT . . . A . . . . . T . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . T T . . . . . ATAATAA . . . . A . TA TA . . . TACCTTTA . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . A . . . . . T . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . A C . . . . . TATATAA . . . . T . TA TA . . . TAATGTA . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . A . . . . . T . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . T T . . . . . CGTAAAT . . . . T . TG TA . . . TAATGTA . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . A . . . . . T . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . T T . . . . . ATGTAA . . . . T . TA TA . . . TAATTTA . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . A . . . . . T . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . A T . . . . . AGTATA . . . . T . TA TA . . . ATATATA . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . A . . . . . T . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . A C . . . . . AAGTAA . . . . A . TA TA . . . TTTTATA . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . A . . . . . C . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . C T . . . . . AGTAA . . . . T . TA TA . . . TAATATA . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . G . . . . . T . . . . . . . . . . . . .
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blockSeqs : . A T . . . . . AGTAA . . . . A . TA TG . . . TATTTT . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . G . . . . . T . . . . . . . . . . . . .
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blockSeqs : . . . . . . CATAA . . . . T . TA TA . . . ATTTAA . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . A . . . . . T . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . TATTA . . . . T . TA TA . . . TATTTA . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . A . . . . . T . . . . . . . . . . . . .
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blockSeqs : . . . . . CAAAA . . . . T . T CA . . . TATTTT . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . G . . . . . T . . . . . . . . . . . . .
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blockSeqs : . . . CAT . . . . T . T T . . . ATTTT . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . C . . . . . C . . . . . . . . . . . . .
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blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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Reference ( family-2419 ) : ACTTTTCGCACATAAGAACCCT-T---TATA-C-A---TAC---------AC-A--------TTTA-GGAAG-A-----------AC--GTA---A-C---T--TT-T----C--GCT-C--------AN-AC-CCT--TTAT-A----TA---C-G-GA---------G-TTT---T----A-A--T-------T--T-----------A---A-A----A---A-AA---A-T--A--T-T-T-T---C---C--G--C------T--G-T--GT---CT-G--C----A------G-G--T-----CG-------------------G--T---T--A--T-G--T-AGT--T-T--TG-ATA--C----------------A-A--G-T-A-----AA----CCCG-T--AG--ACG-AA-AC-G--AAATTGC
gi|1 : -T---CATATC-A---T-C---------AT-A--------TTTT-GGAAG-AT----------AA--GTA-----C---T--CT-TG---C--GCT-C--------AA-AA-CCT--CTATTA----TA---CCG-GA---------G-TTT---T-----------------T--T-----------G---A-ATATCA---A-TA---A-T--A--G-T-TGT---T---C--G--C------G--G-C---T---CTCG--T----A------G-AA-T-----TG-------------------A--T---T--AAAT-A--TGAGT--T-T-----ATA--C----------------A-A--G-T-A-----AA----CCAG-T--TG--GCG-AA-AC-G--AAATT
gi|10 : actccgtacatgtgaattaattaaatataT-A----TA---C-G-GAAGAACATTAG-TTT---T----T-A--T-------C--A-----------A---ATA----A---A-AA---A-T--A--A-T-T-T---C---C--G--C------T--G-T--GA---TT-G--C----A------G-G--T-----CG-------------------G--T---T--A--T-G--T-AAT--T-T--TG-ATA--C----------------A-A--G-T-A-----AA----TCCG-T--AG--ACG-AA-AC-G--AATTTGCtct
gi|11 : cgtacacattgattatattaaataatgcagtttctcattggaacacatatact---TATA-C-A---TAC---------AC-A--------TTTA-GGAAG-A-----------AA--GTA---A-C---T--TT-T----C--GCT-C--------AA-AC-CTC--TTAT-G----TA---C-G-AG---------T-TTT---T----G-A--T-------A--G-----------G---A-A----A---A-AA---A-T--A--T-T-T-T---C---C--G--CG-----T--G-T--GT---CT-G--T----A------G-A--TATTAACA-------------------G--C---G--A--T-G--T---TA-T-T--TG-ATA-------------------A-A--G-T-A-----AA----CCCA-A--TG--GCG-AC-AC-G--AAATT
gi|12 : agtacattatata-T---TATA-C-A---TACTGTACTTATAC-A--------TTTA-GGAAG-A-----------AC--GTA---A-C---T--TT-T----C--GCC-C--------AA-AC-CTC--TTAT-A---------C-G-GA---------G-TTT---T----A-A-------------------------A---A-A----A---A-AA---A-T--G--T-T-T-T---C---C--G--C------A--G-T--GT---CT-G--T----A------A-G--T-----CG-------------------A--T---T--A--T-G--T-AAT--T-T--TG-ATA--C----------------ATAT-G-T-A----------------T--AG--GTG-AA-AC-G--AAATT
gi|13 : atgtaca---TATA-C-T---TAC---------AC-A--------TTTA-GGAAG-A-----------AA--GT----------------T----C--GCT-C--------AA----CCT--CT-T-A----TA---C-G-GA---------A-TTT---TT---A-A--T-------G--T-----------A---A-A----A---A-A------T--A--T-G-T-T---C---C--G--C------T--G-T--GT---CT-G--T----A------G-G--T-----TG-------------------A--T---T--A--T-G--C-AG---T-T--TG-ATA--C----------------A-A--G-T-A-----AA----CCCG-T--AG--GCG-AA-AT-G--AAATTtctt
gi|14 : agatgtacatgtaatata---TATA-C-T---TAC---------AC-A--------TTTA-GGAAG-A-----------AA--GT----------------T----C--GCT-C--------AA-CC-TCT--TTAT-A---------C-G-GA---------A-TTT---TT---A-A--T-------G--T-----------A---A-A----A---A-A------T--A--T-G-T-T---C---C--G--C------T--G-T--GT---CT-G--T----A------G-G--T-----TG-------------------A--T---T--A--T-G--C-AG---T-T--TG-ATA--C----------------A-A--G-T-A-----AA----CCCG-T--AG--GCG-AA-AT-G--AAATTtctt
gi|15 : agatgtacatgtaataa---TATA-T-T---TAT---------AT-A--------TGTA-AAAAG-A-----------AC--GTA---A-A---T--TT-T----C--GCT-C--------AA-AC-CTC--TTAT-A---------C-G-GA---------G-TTT---TTAATA-A--TACAC---T--T-----------G---T-A----ATT-A-AA---A-T--A--A-T-C-----C---C--G--C------T--G-T--GT---CT-G--T----A------G-G--T-----CG-------------------A--T---T--A--T-G--T-AGT--T-T--TG-AAC--C----------------A-ATTT-T-A-----A-------------------G-AA-AC-G--AAATTtct
gi|16 : actata---TATAGC-A---TAA---------TA-A--------TTTA-GGAAGGA-----------AT--GTA---A-C---T--TT-TAATTC--GCT-C--------AA-AC-CTC--TCAT-A---------C-G-GT---------G-ATT---C----T-A--T-------T--------------------A----A---A-AA---A-T--A--T-T-T-T---C---C--G--A------T--G-T--GT---CT-G--T----A------G-G--T-----CG-------------------A--T---T--A--T-G--T-AGT--T-T--TG-ATA--T----------------A-A--G-T-A-----CA----CTCG-T--AA--GTG-AA-AC-G--AAATTtcttt
gi|17 : ata---TATA-C-T---TGT---------AC-A--------TTTA-GGAAG-A-----------TC--GTA---A-C---T--TT-T----C--ACT-C--------AA-AC-CTT--TTAT-A----TA---T-G-GA---------A-TTT---T----T-A--T-------T--C-----------A---A-A----G---A-AA---A-T--G--T-T-T-T---G---T--G---------T--C-T--GA---CT-G--T----A------G-T--T-----CG-------------------A--T---T--A--T-G--A-AG---T-T--TG-ATA--C----------------A-A--G-T-A-----AA----CCCG-T--CG--GCG-AA-AG-G--AAATTtct
gi|18 : ata---TATG-C-T---TAT---------AC-A--------TTTA---AAT-A-----------AC--GTA---A-C---G--TT-T----C--GCT-C--------A--AT-CCT--CT-T-A----TA---C-G-GA---------G-TTT---TT---A-A--T-------T--T-----------A---A-C----G---A-AT---A-T--A--T-G-T-T---C---C--G--C------T--G-T--GT---CT-G--T----A------G-G--C-----CG-------------------A--T---A--A--T-G--T-AAT--T-T--TG-ATA--C----------------A-A--G-T-A-----AA----CCCG-T--AG--GCG-AA-AC-G--AAATTtct
gi|19 : cata-----------A---A-A----A---A-AA---A-A--A--A-T-T-C---C---C--G--C------T--A-T--GG---CA-G--C----A------A-G--T-----CG-------------------A--T---T--G--T-G--T-AGT--T-T--TG-TTA--C----------------A-A--GTT-AATTTTAA----CCCG-T--AG--ACG-AA-AC-G--AAATtc
gi|2 : atgtttcactctgcttgttatccctttaaaggagtttttaaaaaaaaagaaaaaaaaaaaaACTTTTCGCACATA----CCCT-T---TATA---A---TAC---------AG-AGTTTTTATTTTA-AAAAC-ATATTTTCCGCTNC--ATA---A-C---T--TT-T----C--GCA-C--------AT-AC-CCT--TTAT-AA---TA---C-G-GA---------G-TTT---T----A-A--T-------T--T-----------A---A-A----A---A-AC---A-T--A--T-T-T-T---C---C--G--C------T--G-T--GT---CT-G--A----G------G-G--T-----TG-------------------G--T---T--A--T-G--T-AGT--T-T--TG-ATA--C----------------A-A--G-T-A-----AA----CCCG-T--AG--ACG-AT-AC-G--AAATTGCa
gi|20 : AT---------AC-A--------TTTG-GGAAG-A-----------AC--AT----------------T----T--GCT-C--------AT-AC-CCT--TCAT-A---------C-G-GA---------G-TTT---T----T-A--T-------T--TCT---------A---A-A----T---A-TATATA-T--A--TGTAT-T---C---T--G--C------T--G-T--GT---CT-C--C----A------C-G--T-----CG-------------------A--T---T--A--T-G--T-AGT--T-A--TG-ATA--C----------------A-G--A-T-A-----AA----CTTG-T--AG--ACG-AA-AC-G--AAATT
gi|21 : ---TATA-C-A---TA-------------A--------T-----GAA--A-----------AC--ATA---A-C---T--TT-T----C--GCA-C--------AT-AC-CCT--TTAT-AA---TA---C-G--A---------G-TTT---T----A-A--T-------T--------------A---A-A----A---A-AC---A-T--A--T-T-T-T---C---C--G--C------T--G-T--GT---CT-G--A----A------G-GGTT-----CG-------------------G--T---T--A--T-G--T-AGT--T-T--TG-ATA--C----------------A-A--G-T-A-----AA----CCCG-T--AG--ACG-AT-AA-G--AAATTGtagct
gi|22 : ---TATA-T-C---TAT---------AC-A--------TT-A-GATAG-A-----------A---GTA---A-C---T--GT-C----C----T-C--------AT-AA-CCT--CT-T-A----TA---G-G-GA---------G-TT--------------T-------T--T-----------A---A-ATAT-A---T-AA---A-T--A--T-T-T-TC--C---C--G--C------T--A-G--GT---CT-G--T----A------G-A--T-----TG-------------------A--T---T--A--T------------------------------------------------C-A-----AA----CCCG-C--TA--TCG-AA-AC-G--AAATTgct
gi|23 : atatgtacattaata---------AT-A--------TTTA-GGAAG-A-----------AA--GTA---A-C---T--TT-T----C--GCT-C--------AA-AC-CTC--T--T-A----TA---C-G-GA---------A-TTT---T------T--T-------T--T-----------ATATA-A----A---A-AA---T-T--A--T-T-C-T---C---C--G--C------T--G-T--GT---CT-G--T----A------G-A--T-----TG-------------------A--TTAAT--A--T-G--C-AG---T-T--TG-ATC--C----------------A-A--G-T-A-----AA----CCTG-T--TG--GCG-AA-AC-G--AAATtct
gi|24 : gttaA-C-T---TAT---------AC-A--------TGTA-GGAAG-A-----------AC--ACA---A-T---T--TT-T----T--ACT-CTGCTTGTGAT-AC-CCT--TTAT-A---------C-G-GA---------C-TTTATAT----ATA--T-------A--T-----------A---A-A----A---A-AA---A-A--A--T-C-------C---C--G--T------T--G-T--GT---CT-G--C----A------G-G--T-----CG-------------------G--T---T--A--T-G--T-AG---T-A--TG-ATATTC----------------A-A--G-T-------AA----CTCG-C--AG--ATG-A
gi|25 : ---------AC-A--------TTTT-GGAAG-A-----------AC--ATGCATG-C---T--AT-G----T--ACT-ATGTA----AT-AT-C----TTGT-A----TA---C-G-GA---------G-CCT---T----T-ACCT-------T--T-----------A---A-A----A------------T--A--T-G-------C---C--G--C------T--A-T--GT---CT-G--C----A------G-G--T-----CG-------------------G--T---T--G--T-G--T-ACT--T-T--TG-ATA--C----------------A-A--A-T-A-----AA----TCCG-C--AG--GCG-AA-AC-A--AAAT
gi|26 : aa-A--------TTTA-GGAAG-A-----------AC--ATA---A-C---T--TT-T----C--GCT-C--------AT-AC-CCT--T--C-C----TA---C-G-GA---------G-TTC---T----T-G--T-------T--T-----------g
gi|26 : t-T--A--A-T-T-T---C---C--G--C------T--G-T--GT---TT-A--C----A------G-G--T-----TG-------------------A--T---T--A--T-G--T--------------------------------------A--G-T-A-----AA----TCCG-T--AG--ACG-AC-AC-G--AAGTTttgtttttgcttttttttttttttaatttccgctgtgtttacaggttgattatgtagtaaatccgtagacgacacgaagtttc
gi|27 : tatttaggaagaacataacttttcgctcatacccttcctacggagttcttgtttttgtttttgctttttttttttttC-A--------TTTA-GTAAA-A-----------AC--GTA---T-C---T--TA-T----C--GCT-C--------AA-AC-CTC--TTAT-A---------C-G-GA---------A-TTT---T----T-A--A-------T--A-----------A---A-A----A---A-GA---A-A--A--A-A-T-T---C---C--A--C------T--G-T--GT---CT-G--T----A------A-G--T-----CG-------------------A--T---T--A--T-G--T-AGC--T-T--TG-ATA--C----------------A-A--G-T-ACTT--AA----ACCA-T--AG--GTG-CA-A--G--AAATTtc
gi|28 : -A--------TTTA-GGAAA-A-----------AC--ATA---A-C---T--TT-T----C--GCA-C---------T-AC-TCT--TTA--A----TAAATC-G-GA---------G-TTT---T----T-A--T-------T--T-----------T---A-A----A------------T--A--T-T-T-TTATC---C-----C------T--G-T--GT---CT-G--C----A------G-G--T-----CG-------------------G--T---C--A--T-G--T-AGT--T-T--TGAATA--C----------------A-G--G-T-A-----AA----CCCG-T--AG--ACG-AT-AC-A--AAATTGtct
gi|29 : ---------AT-A--------TTTA-GGAAG-A-----------AA--GTAT--A-C---T--TT-T----C--GCT-C--------AA----CCT--CT-T-A----TA---C-G-GA---------A-TTT---T----T-T--T-------TA-T-----------A---T-A----A---A-AA---A-T--T--A-T-T-T---C---C--G--C------T--G-T--GT---CT-G--CT---A------G-A--T-----TG-------------------A--TTAAT--A--T-G--C-AG---T-T--TG-ATC--C----------------A-A--G-T-A-----AA----CCtt
gi|3 : tcgtacatgtcatgtta---TATG-C-ACT-TAC---------AT-A--------TTTA-GGAAA-A-----------AATAATA---A-CATTT--TT-T----C--GCT-C--------AA-AA-C----TTAT-A----TA---C-G-GA---------GTTTT---T----A-A--T-------TAATTAAAAAAAAAAA---A-A----A---A-AA---A-A--A--A-T-T-C---CGAGC--G--C------T--------T---CT-G--TAA--A------G-A--T-----TG-------------------A--T---T--A--TCG--C-AG---T-T--TG-ATA--G----------------A-A--G------------------G-TCAAG--GCG-AA-A--G--AAATT
gi|30 : atgtatgtaaatta---TAT---------AC-A--------TTTA-GGAA-------------------CA---A-C---T--TT-T----C--GGT-C--------AT-AC-CAT--TTAT-A----T---------------------TTT---T----G-A--T-------T--T-----------ATTTA-A----A---A-AT---A-T--ACAT-T-T-T---C---C--G--C------T--G-T--GT---CT-G--C----A------G-G--T-----CG-------------------G--T---T--A--C-G--T-GGT--T-T--TG-ATC--C----------------A-A--G-T-A-----AA----GCCG-T--AA--ACT-AA-AC-G--AAATTGtcttt
gi|31 : ct---TAT---------AC-G--------ATTA-GGAAA-A-----------AC----A---A-C---T--TT-T----C--GCAAC--------AT-ACGCCT--TTAT-A---------C-G-GA---------G-TTT---T----TTA--T-------T--T-----------------------------------T--T--T-T-T-T---C---C--A--C------T--G-T--GT---CT-G--C----A------G-G--C-----CA-------------------G--T---T--A--T-G--T-AGT--T-T--TG-ATA--C----------------A-A--G-T-A-----AA----CCTG-T--AG--ACG-AT-AC-G--AAATTGC
gi|32 : ct--------AT-AC-CCTG-TCAT-A----TA---T-G-T----------T-TTT---T----A-C--T-------T--T-----------T---A-A----A---A-AA---T-A--A--T-T-T-T---CA--C--G--C------TTAG-T--GT---CT-GA-C----A------G-G--T-----CA-------------------G--T---T-----T-G--T-AGT--TAT--TA-ATA--C----------------A-C----T-A-----AA----CCCGGT--AG--ACG-AATAC-G--AAtt
gi|33 : caatagcgaaaacaaatatttcgaaTA-GGAAA-A-----------AT--ATT---A-C---T--TT-T----C--GCA-C--------ATTAC-CCC--TT-T-A----TA---C-G-GA---------G-TTT---T----A-T--T-------T--TTTT--------A---A-A----A------------T--A--T-T-T-T---C---C--G--CT-----T--G-T--G----CT-G--C----A------T-G--T-----CG-------------------G--T---A--A--T-G--T-AGT--T-T--TG-ATA--C----------------A-A--G-T-A-----AA----CCTG-T--AG--ACG-AA-AC-G--AAATTGCtt
gi|34 : AG-A-----------AC--ATA---A-C---T--TT-T----C--GCT-C--------AT-AC-CCT--TAA--------A---C-G-GA---------G-TTT---T----T-A--T-------T--T-----------A---A-A----A---A-TATATA-T--A--T-T-T-T---T---C--G--C------T--T-T--GT---CT-G--C-----------G-G--T-----CG-------------------G--T---T--A--T-G--T-AGT--A-T--TG-ATA--C----------------A-A--G-T-A-----AA----CCCG-T--AG--ACG-AA-AC-G--AAATTGCt
gi|35 : -A--------TTTA-GGAAG-A-----------------------------------------GCA-C--------AT-AC-CCT--TTAT-A---------C-G-GA---------G-TTT----------A--T-------T--T-----------A---A-A----A---A-AA---AAT--A--T-T-T-T---C---CCTG--C------T--GGT--GT---CT-G-------A------GCG--T-----CG-------------------G--T---A--A--T-G--T-AGT--T-T--TGGATA--C----------------A-A--G-T-A-----AA----CCCG-T--AG--ACG-AA-ACAG--AAATTGCt
gi|36 : --GCA-C--------AT-AC-CCT--TTAT-A---------C-G-GA---------G-TTT---T----A-T--T-------T--A-----------A---A-A----A---A-AA---A-T--A--T-T-T-T---C---C--G--C------T--G-TG-GTGCACT-G--CA---A------G-G--T-----CG-------------------G--T---TA-A--T-G--T-AGT--T-T--TG-GAA--C----------------A-A--G-T-A-----AA----CCCG-T--AG--ACG--A-AC-A--AAATTGCt
gi|37 : ttaggaag---------AC-A--------TTTA-GGAA--A-----------AC----A---A-A---T--TT-T----C--GCA-C--------AT-AC-CCT--TTAT-A---------C-G-GA---------G-TTT---T----T-A--T-------T--T-----------A---A-A----A------A---A-T--A--T-T-T-T---C---C--G--C------T--G-T--GT---CT-G--C----A------G-G--T-----CA-------------------G--T---T--T--T-G--T-AGT--T-T--TG-ATA--C----------------A-C--G-T-A-----AA----CCCG-T--AG--ACG-AT-AC-G--t
gi|38 : -C--------AT-AC-CCT--TTAT-A---------C-G-GAT--------G-TTT----------A--T-------T--T-----------T---A-A----A---A-AA---A-T--A--T-T-T-T---CG--C--G--G---------G-T--GT---CT-G--C----A------G-G--T-----CG----------------------T---A--A--T-G--TTAGT--T-TA-TG-GTAA-C----------------A-A--G-T-A-----AA----CCCG-T--AG--ACG-AA-AC-G--AAATTG
gi|4 : tttaggaaagcca---TATA-TTA---TAC---------AC-A--------TTTG-GAAAG------------------TA---A-C---T--TT-T----CCCGCT-C--------AA-AC-TCT--T----A----TA---C-G-GA---------G-TTT---TT---A-A--T-------A--T-----------A---A-A----A---AGAA---A-T--A--G-T-T-T---C---C--G--C------T--G-T--GT---CT-G--T----A------G-A--T-----TGAAGTAATACTAGACACTAAG--T---T--A--T-G--T-AG---T-T--TG-ATA--C----------------A-A--A---A-----AC----CCCG-T--TG--GCGAAA-AC-GGAAAATT
gi|40 : atgtaataa--------AT-AC-CCT--TTAT-A-----G---C-G--A---------G-TTT---T----A----T-------T--T-----------A---A-A----A---A-A------T--A--T-T-T-----C---C--A--C------T--G----GT---CT-G--C----A------G-G--T-----CG-------------------G--T---TA-A--T-GATC-AGT--T-TGATGAATA--C----------------A-A--G-TAA-----AA----CCCG-T--AG--A-G-AACAC-GA-AAATTGCtctt
gi|41 : aagcaca-AC-CCT--TTAT-A----T------G-GA---------G-TTT---C----A------------T--C-----------A---A-C----A---A-AA---A-T--A--T-T-------C---T--G--T------T--G-T--GA---CT-G--C----A------G-G--T-----TG-------------------G--T---T--G--T-G--T-AAT--T-T--TG-ATA--C----------------A-A--G-T-A-----AAAGTTCTCG-T--AG--ATG-AA-AC-A--AAATTACt
gi|42 : aattgcttgtg-AT-CCTCATTAC-A----TG---C-A-GT---------G-GTT---T----A-T--T-------C--T-----------G---A-A----C---A-AA-------------T-T-T---C---T--GAACAAATAAT--T-T--GT---CT-G--C----T------A-G--T-----CA-------------------C--TA--T--A--T-G--T-AGT--T-T--TA-ATA--C----------------A-A--G-T-A-----A------CCG-T--AG--ACG-AA-AC-G--AAATTGCt
gi|43 : ttACA-C-G---TAT---------AC-A--------TTTA-GAAAG-A-----------AC--ATA---A-T---T--GT-T----A--ACT-CTGCTTTG-AT-AC-ACT--T--G-A----TA---C-A-GA---------G-TTT---T----T-A--T-------T--A-----------A---A-A----AGTCA-GA---A-T--A--A-T-T-tt
gi|44 : ttttaaataccctcgccaattgga--T-----------A---A-G----A---A-AA---T-T--A--G-T-G-T---C---C--G--C------T--G-T--GT---CT-G--C----G------G-G--T-----GT-------------------G--T---T--G--T-G--T-AGT--T-T--TG-ATA--C----------------A-A--G-T-A-----AA----CCCG-T--AG--ACG-AA-AC-G--AAATTGgttc
gi|45 : taataaaaatatcagaaagaaattgagtaA-C-T---TAT---------AC-A--------TTTA-GGAAA-A-----------AC--GTA---A-C---C--TC-T----T--G---------------------------------TG---C-A-GA---------A-TTTC--T----A-A--T-------C--------------------A----A---A-AA---A----A--T-T-T-T---C---T--G--C------T--G-T--GT---CT-G--T----ACATTTAG-G--T-----CG-------------------A--T---T--A--T-G--T-AGC--T-T--TG-ATA--C----------------A-A--G-T-tt
gi|46 : TA---A-C---T--TT-T----C--GCT-C--------AT-AC--------A--A----T-------------------G-TTT---G-----------------T--C-----------A---A-A----A---A-AA---A-T---------------C---C--G--C------T--A-T--GT---CT-G--C----A------G-G--T-----TG-------------------C--C---T--G--T-T--T-AGT--C-T--TG-ATA--C----------------A-A--G-T-A-----AA----CCCG-T--TG--ACG-AA-AC-G--AAATGGC
gi|47 : aaa---------G-TTT---T----A-A--T-------T--T-----------T---A-A----A---A-AA---A-TGCA--T-T-T-T---C---C--G--C------T--G-T--GT---CA-G--C----A------G-G--T-----CG-------------------G--T---T--A--T-G--T-AGT--T-T--TG-ATA--CATAACATTGTACTTGTA-A--G-T-G-----AA----CCCG-T--AG--ATG-AA-AC-G--AAAt
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gi|53 : --T---T--G--T-G--T-AGT--T-T--TG-ATA--C----------------A-A--G-T-A-----A------CCGTT--AG--ACG-GA-AC-G--ACATTGCt
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gi|6 : ---TATC-C-A---TAC---------AC-A--------TTTA-GGAAG-A-----------AA--GTA---A-C---T--TTAT----C--GCT-C--------AA-AC-CTC--TTA--A----TA---C-G-GAG--------G-TCT---T----A---------------T-----------A---ATA----A---A-AA---A-C--A--T-T-T-T---C---C--T--A------T--GTT--GT---CT-GT-T----A------G-A--T-----TT-------------------GAATTAAT--A--T-G--C-AG---T-T--TG-ATA--CA---------------A-A--G-T-A-----AA-----CCG-T--TG--GCG-AA-AC----AAATT
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