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Reference ( gi|3 ) : GGGT--CACTTTAT---CGATGG-T-GTC-ATCGATGTCCCCAAAATA-AA-AGAAAAACCTGA-C-CGGAA-A-GGTTAC-TTTGGGGAGT-A--TGACTCC-AAA--A--TCCCT-ATC-GTTTT-CTCAAAAA-TG--GTA-A-AAATT-AGA---C-TTGGCTAAAG--GATACCA-C---T-G-ACAG-CG---G--G-----------G-T-AC-GTTTGTTTA-GTAAAAAGCAT-GACG-AA-TATA-AAAAACAG-A--------GAG---AAGAGAA---TTTGA-GCATT--AAA-------A-TATTTGAC-ATTTTATTTTCT-GA--C---TGG--A---ATT-TT----T--T-A-A-AAATTGG----T-A-TTATCA-----TAA-T-GTGGGCT---C------TGGAT-T--TC-CAA--TGT-GGGCCCGT-AAA---A-GT-T---A----AAAGTTAGG-----GG------C-C-A-CAT--GGCCCC-TA--AA-T-CCC--A-A--TGTTAAGCCC
gi|1 : GGGTAGCACTTTAT---C-ATGGATAGTC--TTGATGTCCCCAAAATATAA-AGAAAAGC-TGATC-CGGAA-CTGGTTAGATTTGGGG-GT-A--TGACTGC-AAG--AATTCTCT-GTC-GTTTTTCTCAAAC--TGT-GTATA-CAATTCAGA---C-TTTGTGAGCGTTGATAGTA-CACGTAG-ACAGACT---G--GAGACTTAATTTG-T-AT-GTTTATTCAAGTAAAAAGTCT-GAAG-AAATATA-AAAAGCAG-GCAGGTGCGGAG---A-GAGAAATGTTAGA-CCATT--AAATCAGACTA-TTTTTGACGATTTT----TCT-GAGAC---TGG--A---ATT-TT----T----A-A-AATTTGG----T-A-T--TCAATAGTTAA-T--TGGGTTCTCC------TGGAT-T--CC-C-A--TGT-GGTGACGTGAAA---A-AT-TCAAA----AAAGTTAGGTTGTAGC------C-C-ACCATG-GGCCCC-TATTAA-T-TCCCAA-A--TGTTA
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gi|15 : tctgactgctatttggtttccccagGGAT-T---C-CAA--TGT-GGGCCCAT-AAA---CTTT-T---A----AAAGTTAAG-----GG------CTT-A-CAT--GGCCAA-TA--AAGT-CCCA-A-A--TGTT-AGCCgtgtttcagacgttattcacaa
gi|2 : T-AAC---A-GT-T---GTG--GAATTTAGG-----GG------C-C-A-TGTGGGGCCCC-TA--Aacaa
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gi|17 : tta---A----AAAGTTAGG-----GG------C-CCA-CAT--GGCCCC-TA--AT-T-TCCCAA-A--TGTTAAac
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gi|17 : tttagtaaaaagcatgacgaaatataaaaacagagagagagaatttgagcattaaaaatatttgacatttattttctgactggaattttttaaaaattggtattatcgtaatgtgggctcctggattccaatgtgggcccgtaaaagttaaaaagAAATTAGG-----GG------C-C-A-TGTG-GGCCCC-TA--Acccaaatgttaaccacaacactgaga
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Alignments
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lowQualScore : .. ... . . . .. .. . .. . . . . ... . . . . .. . ..... . . . ... .. . . ... . .......... . .. ... . ... . . . ..................... . . . . . . . .. . . . ........ ..... ... . .... ... . . . .. ... .. ... .... . .. . .. . . .... . . .. . . . .. ....... . . . ... . . ............ .... ..... ...... . . . . . .. . .
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Reference ( family-2411 ) : GGGT--CACTTTAT---CGATGG-T-GTC--TCGATGTCCCCAAAATA-AA-AGAAA-AGC-TGA-C-CGGAA-A-GGTTAC-TTTGGGGAGT-A--TGACTCC-AAA--A--TCCCT-ATC-GTTTT-CTCAAAA-G-TG--GT-A-AAAATTAGA---C-TTGGCTGA----------A-G--G---ATACCA-C---T-G-AC-GG-CG-G----G-----------G-T-AC-GTTTGTTTA-GTAAAAAGCAT-GACG-AA-TATA-AAAAACAG-A--------GAG---AAGAGAA---TTTGA-GCATTAAA----AATATTC--GAC-A-TTTATTTTCT-GA--C---TGG--A---AT----T-TTT--TA-A-AA-ATTGGT-ATT--ATCG-T--AA-T-GTG-GG--CTCCTGGAT-T---TC-CAAT-G-T---GGGCCCGT-AAA---A-NT-T---A----AAAGTTAGG-----GG------C-C-A-CGT-GGCCCCTA--AA-TTCC-CAAATGTTAAGCC
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Alignments
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