lowQualScore : 1 2222 22 1 1 555555555555555555555555555555 111111111111 111 111 11111 2222222 5555555555555555555555555555555555555 1 33 3 77777 2222222222222222 3333333333333333333333333333333333 444 222222222222222222222 2 5555555555555 1 222222222222 1 111111 1 22 111111 1 33 2222222222222 222222222 1 1 11111 33 11 1111 11111
lowQualScore : 7 8888 777 55 2 777 4 9999 2 4 4 0 4 3 555 0 555555555555555555555555555555 4 55 666666666666 4 222 4 000 3 22222 3 44 7777 4 555 2222222 3 8888888888888888888888888888888888888 0 44 55 3 3 666 7777 6 3 7777 3 3 44444 77 4444444444444444 3 3 0000000000000000000000000000000000 3 111 999 888888888888888888888 777 4 4 777 0 8888 4 6 4444444444444 4 6666 2 0 4 333333333333 4 6 777777 1 3 33 5 777777 5 0 55 88 4 4 4 4 11 4 555 4 8 8 4 4 4 4 3 3 3 3 3 1111111111111 3 0 44 3 888888888 3 3 6 44 77 44 6 3 8 33333 33 00 3 3 1111 3 3 3 3 88888 6 6
lowQualScore : . .... ... .. . ... . .... . . . . . . ... . .............................. . .. ............ . ... . ... . ..... . .. .... . ... ....... . ..................................... . .. .. . . ... .... . . .... . . ..... .. ................ . . .................................. . ... ... ..................... ... . . ... . .... . . ............. . .... . . . ............ . . ...... . . .. . ...... . . .. .. . . . . .. . ... . . . . . . . . . . . . ............. . . .. . ......... . . . .. .. .. . . . ..... .. .. . . .... . . . . ..... . .
lowQualScore : 0 4444 888 66 4 888 4 7777 3 4 4 8 4 3 888 3 111111111111111111111111111111 0 55 555555555555 4 222 0 333 6 77777 3 66 1111 6 888 5555555 3 4444444444444444444444444444444444444 0 66 00 6 6 444 7777 4 6 7777 6 6 11111 33 1111111111111111 6 6 3333333333333333333333333333333333 6 444 666 555555555555555555555 000 0 0 000 8 5555 0 9 0000000000000 4 8888 8 8 4 444444444444 4 8 888888 9 2 55 0 999999 0 0 11 66 4 4 4 4 88 0 333 4 9 9 0 0 0 0 6 6 6 6 6 1111111111111 3 4 66 3 444444444 3 8 7 66 99 66 7 6 2 33333 11 88 3 3 4444 3 3 3 3 11111 7 7
consensus : ATATTTTTTTTCACCCTATAT---TT-ATTAAC---ATTT-ATG---ATAAATA-A-ATATATTTA-TA-T---AATGATTA-----N--TA--GAA----CA---N---TT-A--TAA------A-----AA-TT---CAGTAC-CC--TT-AA-----TA-AA--TC----ACTTG---TTTG----G--TT-TT---------T-----AAA-C--AC-T--T-ATA-TT-GCATG-TTCACTG-CAAGTT--AT-GAT-A---G----AATAAACA-ACTGT----G-GACT-GT-----TAAT-AAAAAT-C--AT----------ATA-ATT-TG-------------AT-------------TACA--TACCCCTA-AATT-ATC--CCTA----GAC------CTATGCTAC---CCTT-T-CATC---TTCA----GTTA-TA-CAAATTA---ATTAA--TA-TC-CTTATAGAAACAAATTTGTT-TTT----TG---TT-AT-GTATAT----A-GAAATCTTAATT-TG-GATA-----ATTTGG-AGT-TT-A-ATTAA-CTA-C-T-TCTGATAGACC-T-TG-T-T-TG-TGAA-C-T-TTTT-GAAT-GCATCA-AA-CA-T-T-A------G------A-CTTGCTA--AA-CTCTT--AA-AA--TATG-AGGTTCTGGTT--TT--AAA--A-TGT-ATTATTTTTCA--G--GT--ACATA-TGCATTG-T-GA-C--TA-GTAATTTGG-C-AA-AATG-T---GGC-AAA-AATACA
Reference ( gi|6 ) : ATTTTTTTTTTCACCCTATAT---T--ATCAAC---ATTT-ATG---ATAAATA-A-ATATATCTA-TA-T---AGTGATTC-----T--TA--GAA----CA---A---TT-A--TAA------A-----AA-TT---CAGTAC-CC--TT-AA-----TA-AA--TC----ACTTG---TTTG----G--TT-TT---------T-----AAA-T--AC-T--A-ATA-T--GCATG-TTCACT--CAAGTT--AT-GAT-A---G----AA-AAACA-ACTGT----G-GACT-GTAACTGTAAT-AAAAAT-C--AT----------ATA-ATT-TG-------------AT-------------TACT--TACCCCTA-AA---ATC--CCTA----GAC------CTATGCTAC---CCTT-T-CATC---TTCA----GTTA-TAGCAAATTA---ATTAAAGTA-TC-CTTATAGAAAAAAATTTGTT-TTT----TG---TC-AT-GTAAAT----A-GAAAGCTTAATT-TG-GATA-----ATTTGG-AGT-TT-A-ATTAA-CTA-C-T-TCTGATAGACCGT-TG-T-T-TG-TGAA-C-T-TTTT-GAAT-GCATCA-AA-CA-T-T-A------G------A-CTTGCTA--AA-CTCTT--GA-A---TATG-AGGTTCTGG-T--TT--AAA--A-TGT-ATTA-TTTTCA--G--GTA-ACATG-TGCATTG-T-GA-T--TA-GTAATTTGG-C-AA-AATG-T---GGC-AAA-AATACA
gi|3 : ATATTTTTTTCCAC--TATAT---TCTATTAAC---ATTTTATG---ATTAATA-A-A-ATCTTTA-TA-T---A-TGATCA-----A--TA---AG----CACCTG---TT-A--TAA------A-----AAATT---TAGTAC-CC--TTTAA-----TA-AA--TC----ACTTG---TTTG----G--TT-TT---------TTTTTTAAC-TTTA--T--A-AT--T--GCATG-TTCACCTGCAAGTT--AT-GAT-AAGAG----AT-AAACA-ACTGT----G-GACTCGT-----TAATTAAAAATTC--ATGCAG------ATA-CTTCTG-------------AT-------------TACC--TACCCTTATAAGTTATC--CCTA----GAC-------TATGCTAC---C-TT-T-CATCCGCTTCA----GTTA---ACAAATTATTAATCAAAGTA-TTGCTTATAGAACAAA-TTTGTT-TTT-----G---TT-AT-GTATAT----AAGAAAGCTTAATT-GG-GATAC----ATTTGG-AGT-T--A-ATTAA-CTA-C-T-TCTGATAGACC-T-TG-T-T-GG-TGAA-C-T-TTTT-GAAT-GCATCA-AA-CA-T-T-A------G------A-CTTGCTA--AA-CTCTT--AA-AA--TATG-AGGTTCTGG-T--TTT-AAA--A-TGT-ATTATTTTTCA--G--GT--ACATA-TGCATTG-T-GA-T--TA-GTAATTTGG-C-AA-AATG-T---GGC-AAA-AATAC
gi|19 : tATATTATTTTTTACC-TATAT---TT-ATCAAC---ATT--ATG---ATTAATA-A-ATATATTTA-TA-T---GATAA---------------GAA----CA---T---TTTA--TAA------AT----AA-TT---CAGTAC-CC--TT-AA-----TA-AA--TC----ACTT
gi|23 : tATATTGTTTTTCA-CCTATAT---TC-ATTAAC---ATTT-AT-------AATA-A-ATATATTTA-TA-A---AATGATTTAAAAAT--AA--GAA----CA---T---TT-A--TAA------A-----tt
gi|5 : tTTTTTTTCACC-TATAT---TT-ATTAAC---ATTT-ATG---ATAAATA-AGATATATTTA-T--T---AATGATAT-----A--TA---AA----CA---ACATTT-A--TAA------A-----AA-TT---CAGTAC-CC--TT-AAC----TT-AA--TCACGTACTTG---TTGG----GT-TT-TT---------T-----AAA-C--ACTT--T-ATA-TTGGCATGTTTTACTG-CACGTT--ATCAAT-A---G----AATAAACACACTGT----G-GACT-GT---TTTAAT-AAAAAT-C--AT----------ATA---T-TG-------------AT-------------TA-----ATACCTA-AATT-AT---CCTA----G--------CTATG-TAC---CCTTAT-CATC---T--A----GTAA-TA-CAAATTA---ATTAA--T--TC-CTTATAG-AACAAATTTGTT-TTT----TGGGTTT-AT-GTATAT----A-GAAATCTTAA-T-TG-GATATAATTATTTGGAAGTATT-A----AA-CTA-CTT-TCTGATAGACC-T-TG-T-TCTG-TGAA-C-T-TTTT-GAAT-GCATCA-AACCA-T-T-A------G------A-CTTGCTA--AA-CTCTTAAAA-A---TATG-AGGTTCTAG-TTGTT--AAA--A-TGTAATTA-TTTTTC--A--GT--ACGTA-TGCATTG-T-GA-C--TT-GTAA-TTGG-C-AA-AATG-TG--GGC-AAA-AATA
gi|4 : taTTTTTTTC---CTAATT---T--ATTAAC---ATTT-ATGATTATATATA-A-ATATAT-TA-TA-T---AATGAT
gi|9 : aTTTTTTTCACC-TATAT---TTTATTCAC---ATTT-ATA---ATTAATG-A-AT-TATGTA-T--T---A-TGATTTAA---TAATAATGAA----CA---T---TT-A--GAA------A-----AA-TT---CAGTAC-CC--TT-AA-----TA-GA--TC----ACTTG---TTTG----G--TT-TT---------T-----TAA-C--AC-TT-C-AT--T--GTATG-TTCATTG-CTAGTT--AT-GGT-A---G----AATAAACA-ACTGT----G-GACT-TT-----TAAT-AAAA-T-C--AT----------ATA-ATT-TG-------------ATAATTTGGAGCAATTACA--TACCACTA-AATT-ATC--CCCA----GAC------CT------C---CCTT-T-CATC---T-CA----ATTA-TA-CAAACCA----TGCAATTACTC-CTTATAGAACAAG-TTTGTT-TTCGTTATG---TT-AC-GTATAT----A-GACATCTTAATT--G-GATA-----ATTTGG-AGT-TG-ATTTTAA-CTA-C-T-T-TGATAGACCTT-Taaattctgatattttggcaactttcagccattcacggctggcataatgattaatagaacatttataaaaattcagtacctaataaatcagttgggtttttttaaacactttatattgcatgttcactgcaagtactgatagaataaacaatgtgtgattgttaattaaaaaaattataatttgaaaatacccttaaattatgcttagactatgcttccctttcatcttcttatacaatttaattatctttattaacacagtttttgttatgtatatgaaatcttaattggatatttggagtttaattaaatacttctgacatacctgttgtgaacttttttaatgcatcaacattagactgcaactcttaatatatagtttctggttttaaaatgattatttcaggacatatgcattgtggactagcaatttggccaataatttggaaaaatca
gi|12 : taTTTTTTTC-TCCTATAT---T--ATTAAC---ATTT-ATG---ATATATA-A-ATATATTTATTA-T---AATGAT
gi|17 : ctataTTTTTCA---TATATATTT--ATTCAC---ATTT-ATA---ATACATG-A-ATG-ATTAA-TA-TGAAAGT----------T--TA--TAA----GA---A---TT-ACATAAGTTGATA-----AT-TT---CAGTAC-CC--AT-AA-----TA-AA--TC----ACTTA---TTTGTT--G--TT-TT---------atattgattgattttggcaacttttcagccattcacggcggcataatgattaataagaacatttataaaaattcagtaccctaataaatcagttgggtttttttaaaacactttatattgcatgtttcactgcaagttacatgatagaataaacaactgtggattgtaattaaaaaaattataatttgattacataccc
gi|1 : ata---T--ATCTACTAGATTT-A-----ATAAATATA-ATATATTAA-TAAT---AATGATTA-----A--TAA-GAAGCCTCT---A---TT-A--TAA------ACGAAAAA-TCATGCAGTACGCCAACT-AAAAATATACAA--TC----A-TTG---TTTG----G--TT-TTCTCTTTCTTT-----AAGGC--AC-T--TTATA-TTGGCATG-TTCACT--GCAGTT--AT-GATCA---G----AATCAACA-ACTGT----G-G-CT-GT--TTATAAA-ACAAAT-CCAATCCCCTCTCCTATG-ACT-T--------------ATCCA----------TAGCGATACCCATC-CA---ATTATCCTACGACGACTACCAACTAGGCTACGAACTTC-TGCATA---TTCA----GTTAATACAAAATTA----TT----CC-TT-CTTATTTATGAACATTCGTT-TTT----GT---TCTAT-GTACATTACGA-ACAGGCTTAATTCTGCGATA-----ATTTGG-AGTATT-A-ATTAAGCTAGC-T-TCTGATAGAA-AT-TGAT-T-TGCTGAAGC-TCTTTT-GAATCGCATCA-AG-CAATAT-A------G------AACTTGCTATAAA-CTCTT--AA-AA--TATGCAGGTTCTGGTT--TT--AAA--A-TGT-ATT--TTTCTATCGCCGT--ACAT--TGCATTG-T-GAGC--TG-AAAATTGGG-CAAA-AATGATGGGGGC-AAACAATACct
gi|4 : attatttttgccgctataacttttataataaccaA-T---AATGATTA-----A--TA--GAA----CA---T---TT-A--TAA------A-----AA-TT---CAGTAC-C----T-AA-----TA-AA--TC----A---G---TTGG----GTTTT-TT---------T-----AAA-C--ACTT--T-ATATT--GCATG-TTCACTG-CAAGTA--CT-GAT-A---G----AATAAACA-A-TGT----GTGATT-GTTAAT-TAA--AAAAAT-----T----------ATA-ATT-TG-------------A---------------AAA--TACCCTTA-AATT-ATG--CTTA----GA-------CTATGCTTC---CCTT-T-CATC---TTC------TTA-TA-CAATTTA---AT-----TA-TC-TTTATTAACACAG------T-TTT----TG---TT-AT-GTATAT------GAAATCTTAA-T-TG-GAT------ATTTGG-AGT-TT-A-ATTAA-ATA-C-T-TCTGACATACC---TG---T-TG-TGAA-C-T-TTTT-TAAT-GCATC--AA-CA-T-T-A------G------A-C-TGC----AA-CTCTT--AATA---TAT--AGTTTCTGGTT--TT--AAA--A-TG--ATTA--TTTCA--G--G---ACATA-TGCATTG-TGGA-C--TA-GCAATTTGGCC-AATAATT-T---GG--AAA-AAT
gi|12 : atttttttcctaatttattaacatttatgattatatataaatatattatataatgataaattctgatattttggcaactttcagccattcacggctggcA-T---AATGATTA-----A--TAA-GAA----CA---T---TT-A--TAA------A-----AA-TT---CAGTAC-CC---T-AA-----TA-AA--TC----A---G---TTGG----G--TT-TT---------TTTA--AAA-C--ACTT--T-ATATT--GCATGTTTCACTG-CAAGTTACAT-GAT-A---G----AATAAACA-ACTGT----G-GATT-GTAAT--TAA--AAAAAT-----T----------ATA-ATT-TG-------------AT-------------TACA--TACCCca
gi|2 : ctatatttttttctcctatattattaacatttatgatatataaatatatttattataatgatatattgattgattttggcaacttttcagccattcacggcggcA-T---AATGAT-A-----T--AA--GAA-----A---A---TT-A--AAA------A-----TA-TTT--CAGTAC-C-------A-----TA-AACATC----AATTGGGATTTC-------TT-TT---------T-----AAA-T--CC-T--A-TT--T--GCATGGTTCACTG-CAATTA--AT-GAT-A---G----AATAAAC--------------ACT-GTGATTGTTAC-ACACAT-CGAGT----------ACACATT-GA-------------AT-------------TACTA-TA-CCTTA-AA---GT-----TA----GAG------A-GTGAT------TGT-T-CATA---TTCATCTCGTTA-TAACACATTA---ATTA
gi|24 : tatttttttcctatatttatttaacatataggataataaataaatatattatatagatgattaatatatgatgatttggcaactttcagcatttcggtcggcTAC-CC--TT-AA-----TA-AA--TC----ACTTG---TTTGTTTAT--TT-TT---------T-----AAA-C--ACTT--T-ATATT--GCATG-TTCACT--gtgattattgaaggcacatattagagctcgttgagctgataaaatatcagagttatggagaagaggataataatattatctcacactagagagttactctactcgcacattatcttgtttggtgaatctaatcgaatgaatcaaacatttaaatgctaaaccttaaaagatatgaggttcggtttaaaatgtattatttcagtgtacatagcattgttgactagcaatttgcaaaatgtgagaatcacaagt
gi|7 : T-AA-----TA-AA--TC----ACTTG---TTTG----GGTTTGTT---------T-----AAAAC--AC-T--TTATA-TT-GCATG-TTCACTG-CAAGTT--AT-GAT-A---GCTAGAATAAACA-ACTGT----G-GACT-GT-----TAAT-AAAAAT-C--AT----------ATA-ATT-TG-------------AT-------------TACA--TACCCCTA-AATT-ATC--CCTA----GAC------TT-TGCTAC---CCTT-T-CATC---TTCA----GTTA-TACCAA-TCA---ATTA---TT-TC-CTTATAAGAACAAATTTGTTACTT----TG---T--GTAGTATAT----AAGAAA--TCAATT--G-GATT-----AATTGG-AGT-TTTA-ATCA--CTA-C-TGTCTGATAGAC--T-TG-T-T-TG--GAA-C-T-TTTTTGAAT-GCATCACAA-CA-T-T-A------G------A-CTTGCTA--AA-CTCTTA-AA-A---TATG-A-GTTCTGGTT--TT--AAAATA-TGT-ATTA-TATTCA-----GT--ACATA-TGCATTA-T-GA-C--TA-GTATTTTGA-C-AA-AATGTT---GGC-AAA-AATACAnnnnnnnaac
gi|16 : -AA--TC----ACCTG---TTTG----T--TT-TT---------T-----AA--C--AC-T--T--TA-TT-GCATA-TTCATTG-CCAGTT--AT-GGT-A---G----AATCAACA-ACTGT----G-GACT-GT-----TAAT-AAAAAA-C--AT----------ATA-ATT-TGACAATTTGGAGCAAT-------------TACA--TACCCCTA-GA---
gi|21 : TG---TTGG----G--TT-TT---------TTT---AAA-C--AC-TTTG-ATA-TT-GCATG-TTTACTG-CAAGTT--AT-AAT-A---G----AATAAACA-ACTGTCACTG-GACT-GT-----TAAT-AAAAAT-C--AT----------ATA-ATT-TG-------------At
gi|8 : -ATA-TT-GCATG-TTCACTG-CAA-TT--AT-AAT-A---G----AATAAACA-ACTGT----G-GACT-GT-----TTAT-AAAAAT-C--AT----------ATA-AGT-TG-------------AT-------------TACA--TACCCCTA-AATT-ATC--CCTA----GAC-------TATGCTAC---CCTT-T-CATC---TTCA----GTTA-TA-CAAATTAT--ATTA---T--TC-CTTATAGAACAAA-TTTGTT-TTT-----G---TT-AT-GTATAT----A-GAAATCTAAATT--G-GATA-----ATTTGG-AGT-TT-A-ATTAA-CTA-C-T-TCTGATAGACC-T-TG-T-T-TG-TGAA-C-T-TTTT-GAAT-GCATCA-GA-CA-T-T-A------G------A-CTTGC-A--AA-CTCTTA-AA-A---TATG-A-GTTCTGGTT--TT--AAA--A-TGT-ATTATTTTTCA--G--GT--ACGTA-TGCATTG-T-GA-C--TA-GTAATTTGG-C-AA-AATG-T---GGCAAAA-AATACA
gi|22 : tttcacct-------------AT-------------TACA--TACCCCTA-GATT-ATC--CTTA----GAC------TT------C---CCGT-T-CATC---TTCA----GTTA-TA-CAAACTA---ATTACTG-A-TC-CTTATAG-AACAAATTTG-T-TTT----TG---TT-AT-c
gi|25 : ca-------------AT-------------TACA--TACCCTTA-AATT-ATC--CCTA--------------TAGACTTC---CTTT-T-CATC---TTCA----GTTA-TA
gi|10 : tgtgca-TC-CTTATGAGAACAAATTTGCT-TTT-----G---TT-TT-GTATAT----A-GAAATCTTAATT--G-GATA-----ATTTTG-AGT-TT-A-TTTAA-CTA-C-T-TCTGc
gi|14 : acaaagtactagtaattacTTAA-CTA-C-T-TCTGACATACC-T-TG-T-T-TG-TGAA-CTT-TTTT-GAAT-GCATCA-AA-CA-T-T-A------G------A-CTTGCTA--AA-CTCTT--AAGA---TATG-A-GTTCTGGTT--TT--AAA--A-TGttttggtgttcactctagagcatggtagagtaaacaatgcatgtttttcataaactcaataaacgtgtgtattgtgaactttttgaatgcatcaaacatcaatgcaggccttgctaaaactattaagatataaggctgtggtttaaaatttaatatttttcaagtacgtatgcattgtgactagtaatttggcaaaata
gi|10 : ATAAAC-GTGTG-TAT-TG-TGAA-C-T-TTTT-GAAT-GCATCA-AA-CA-T-C-AATGCAGG------C-CTTGCTA--AAACTATT--AAGA---TATA-AGGCTGTGG-T--TT--AAA--A-TTT-AATATTTTTCA--A--GT--ACGTA-TGCATTG-T-GA-C--TA-GTAATTTGG-C-AA-AATatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccagacatggcattagagcaaactaattcaaaaataa
gi|2 : acaaagtactagtaattactccttatgagaacaaatttgcttttgttttgtatatagaaatcttaattggataattttgagtttatttaactacttctgttttggtgttcactctagagcatggtagagtaaacaatgcatgtttttcataaactcaT-TG-T-T-TGGTGAATC-T-AATC-GAAT-GAATCA-AA-CA-T-TTA------A------A---TGCTA--AA-C-CTT--AA-AAGATATG-AGGTTC-GG-T--TT--AAA--A-TGT-ATTA--TTTCA--GT-GT--ACATA--GCATTGTT-GA-C--TA-GCAATTT-G-C-AA-AATG-T---Ga
gi|11 : tatttttttcctatatttatttaacatataggataataaataaatatattatatagatgattaatatatgatgatttggcaactttcagcatttcggtcggcataatgatataagaaaattaaaaatatttcagtaccataaacatcaattgggatttctttttaaatcctatttgcatggttcactgcaattaatgatagaataaacactgtgattgttacacacatcgagtacacattgaattactataccttaaagttagagagtgattgttcatattcatctcgttataacacattaattagtgattattgaaggcacatattagagctcgttgagctgataaaatatcagagttatggagaagaggataataatattatctcacactagagagttactctactcgcacattatc-T-TTTT-TAAT-GCATCA-AT-CA-T-T-A------GTGCAGAA-CTTCCTA--AC-CAATT--AA-AA--TATA-AGGCTCTGA-A--TT--AAA--AATGC-ATTG-TTTTTA--A--GTA--CATA-TGTATTG-T-GA-C--TA-GTAATTTGG-C-AA-GAagaatcacaagt
gi|18 : attgaataactgatagcaaaacaatccctttcattgcttattagaaatatcaactacatctgagaaaactaatttgtctttttaacatttcatttgatgtccactgtagagtatggtagaataaacagctagataatttttcccataaactagacaaacttaaaaatata-AA-CA-T-T-A------GTGCAGGA-CTT--CA--AA-CACTA--AA-A---TAAA-AG--TCTGG-T--TTTGAAA--A-TGT-ATTATTTTTCA--A--GT--ACATGTTGAGTAG-T-GA-C--T--GTAATTTGG-T-AA-AATcata
gi|13 : ------A-CTTGCTA--AA-CTTTT--AA-AA--TATG-AAGTTCTGG-T--TT--AAA--AATGT-ATTATTTTTTA--A--GT--ACATA-TGCATTG-T-GA-C--TA-GCAATTTAG-C-AA-AATaac
gi|15 : cctttttatatataaggaaaaactttttctgtctccttataataaacatggaaatcataagaagtaacaaaggaggtgccaaatctgctaccaagggtatatgtatatcaagcatactacctgaaagacactgctgtgtaaagaggtccagtgcagaA--G--GTACACATA-TGCATTG-C-AG-TACTAAGTAATTTGG-C-AA-Aaaa
1 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|20 ): ATTGGTTGTTTTTACACTTCTTTTTGATGTTCACTGTAGAGCATGGTAGAATAAACAACTGGAAAATGTTTTTCATTAACTCAACAAGAGAAATTGCTCTGCT
Alignments
lowQualScore : 1 1111111111111111 1111111111 111111111111 111 11111 1111111 111111111111111111 111 111 1111 2222222222 222222222222222222222222222 11111111111 111 3333333 11111 1 1 11111 1111111111111 11111
lowQualScore : 3 0 5 444 3 3 99999999 0 3 3 3 2 2 2 2 6666666666666666 3 0000000000 3 44 3 222222222222 3 3 000 3 3 44 3 00000 2 33 6666 444 8888888 2 33 444444444444444444 5 5 666 2 55 2 5 2 2 33 2 2 2 5555 2 2 6666 3 3 44 77777 555 555 0000 1111111111 3 3 555 777777777777777777777777777 6 77 7777 88888888888 0 4 666 3 3 3 666 3 3 3 7777 000 5555555 3 55 9 4 4 44444 777 4 55 3 777 2 99 4 55555 4 555 4 4 4 4 4 4 3 3 4 4 4 8 8 3 3 3 3 3 3 3 3 3 8888888888888 3 44 3 3 44 3 2 3 55 44 3 7 3 999 3 44 3 3 3 44 3 3 3 3 3 44444 5 5
lowQualScore : . . . ... . . ........ . . . . . . . . ................ . .......... . .. . ............ . . ... . . .. . ..... . .. .... ... ....... . .. .................. . . ... . .. . . . . .. . . . .... . . .... . . .. ..... ... ... .... .......... . . ... ........................... . .. .... ........... . . ... . . . ... . . . .... ... ....... . .. . . . ..... ... . .. . ... . .. . ..... . ... . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ............. . .. . . .. . . . .. .. . . . ... . .. . . . .. . . . . . ..... . .
lowQualScore : 8 7 0 111 6 6 44444444 3 6 6 6 9 9 9 9 7777777777777777 6 5555555555 3 66 3 222222222222 6 6 000 3 3 66 1 88888 9 99 1111 444 1111111 5 44 999999999999999999 0 0 111 5 99 5 0 5 5 44 7 7 7 7777 7 7 5555 1 1 22 77777 000 888 8888 7777777777 3 3 000 444444444444444444444444444 2 99 7777 77777777777 5 5 444 6 6 6 444 6 6 6 7777 000 4444444 6 00 8 7 0 22222 000 0 55 3 888 8 00 4 66666 4 333 4 0 0 0 0 0 6 6 0 0 0 0 0 6 6 6 6 3 3 3 3 3 6666666666666 1 22 1 1 22 1 8 1 66 22 3 3 3 999 1 22 1 1 1 22 1 1 1 1 1 88888 7 7
consensus : ATATTTTTTTTCACCCTATATT-T-ATT-AACATTT-A---TG---ATAAATA-A-ATATATTTA-T-A-T-A-ATGAT-T----AAT-A-----G-AA----CAT---TT-A--T-AA------A-----AA-T-T---CAG-TAC-CC--TT-AA-----TA-AA--TC----ACTTG---TTTG----G--TT-T--T---------T---A----AA-CAC-TT--ATA-TT--G-CATG-TT-CAC-TGCAAGTTA--T-GAT-A-G----A-ATAAACA-ACTG----TG-GACT-G--T-----TAAT---AAAA---AT-C--AT----------ATA-ATT-TG---A-------------T-------------TAC-ATACCCCTA--AATTATCCCTA----GAC------CTA-TGCTAC---CCT-T-T-CATC---TTCAGTTA-T-A-CAAAT----TA---ATTAN--T-A-TC-CTTAT--AGGAACAAATTTGTT-TTT----TG---T-T--ATGTATAT-AGAAAT---CTTAATT-TG-GATA-----ATTTGG-AG-T-TTA-ATT-AA-CTA-C-T-TCTGATAGACC-T-TG-T-T-TG-TGAA-C-T-TTT-TGAAT-GCATCA-AA-CA-T-T-A------G------A-CTTGCTA--AA-CTCTT-AAAA--TATG-AGGTTCTGGTT-TT-AAA--ATGT-ATTATTTT-TCAG--GT-ACA--TA-TGCATTG-T-G--A-CTA-GTAATTTGG-C-AA-AATG-T---GGC-AAA-AATACA
Reference ( family-2386 ) : ATATTTTTTTTCACCCTATATT-T-ATT-AACATTT-A---TG---ATAAATA-A-ATATATTTA-T-A-T-A-ATGAT-T----ANT-A-----G-AA----CAN---TT-A--T-AA------A-----AA-T-T---CAG-TAC-CC--TT-AA-----TA-AA--TC----ACTTG---TTTG----G--TT-T--T---------T---A----AA-CAC-TT--ATA-TT--G-CATG-TT-CAC-TGCAAGTTA--T-GAT-A-G----A-ATAAACA-ACTG----TG-GACT-G--T-----TAAT---AAAA---AT-C--AT----------ATA-ATT-TG---A-------------T-------------TAC-ATACCCCTA--AATTATCCCTA----GAC------CTA-TGCTAC---CCT-T-T-CATC---TTCAGTTA-T-A-CAAAT----TA---ATTAA--T-A-TC-CTTAT--AGAAACAAATTTGTT-TTT----TG---T-T--ATGTATAT-AGAAAT---CTTAATT-TG-GATA-----ATTTGG-AG-T-TTA-ATT-AA-CTA-C-T-TCTGATAGACC-T-TG-T-T-TG-TGAA-C-T-TTT-TGAAT-GCATCA-AA-CA-T-T-A------G------A-CTTGCTA--AA-CTCTT-AAAA--TATG-AGGTTCTGGTT-TT-AAA--ATGT-ATTATTTT-TCAG--GT-ACA--TA-TGCATTG-T-G--A-CTA-GTAATTTGG-C-AA-AATG-T---GGC-AAA-AATACA
gi|1 : CCATATC-T-ACT-AG-ATTT-A--------ATAAATATA-ATATATTAA-T-AAT-A-ATGAT-T----AAT-AA----G-AAGCCTCTA---TT-A--T-AA------ACGAAAAA-T-CATGCAG-TACGCCAACT-AAAAATATACAA--TC----A-TTG---TTTG----G--TT-T--TCTCTTTCTTT---A----AGGCAC-TTT-ATA-TT--GGCATG-TT-CAC-TGCA-GTTA--T-GATCA-G----A-ATCAACA-ACTG----TG-G-CT-G--T-----TTAT---AAAACAAAT-CCAATCCCCTCTCCTATG-ACT-TATCCA-------------T-------------AGCGATACCCATCC-AATTATCC-TACGACGACTACCAACTA-GGCTACGAACTT-C-TGCATA---TTCAGTTAAT-A-CAAA----------ATTAT--T-CCTT-CTTATTTATGAACA--TTCGTT-TTT-----G---T-TCTATGTACATTACGAACAGGCTTAATTCTGCGATA-----ATTTGG-AG-TATTA-ATT-AAGCTAGC-T-TCTGATAGAAA-T-TGAT-T-TGCTGAAGC-TCTTT-TGAATCGCATCA-AG-CAATAT-A------G------AACTTGCTATAAA-CTCTT-AAAA--TATGCAGGTTCTGGTT-TT-AAA--ATGT-ATTTTTCTATC-GCCGT-ACA--T--TGCATTG-T-G--AGCTG-AAAATTGGG-CAAA-AATGATGGGGGC-AAACAATAC
gi|10 : attatttttgccgctataacttttataataa----TA---ATTAC--T----C-CTTAT--GAGAACAAATTTGCT-TTT-----G---T-T--TTGTATAT-AGAAAT---CTTAATT--G-GATA-----ATTTTG-AG-T-TTA-TTT-AA-CTA-C-T-TCTG
gi|10 : acaaagtactag---TTTGA---G--TT-TATT---------T---A----AC-TAC-TT--CTG-TTTTG--GTG-TT-CAC-TCTAGAGCA--T-GGT-A-G----A-GTAAACA-Attttggtgttcactctagagcatggtagagtaaacaatgcatgtttttcataaactcaataaacgtgtgtattgtgaactttttgaatgcatcaaacatcaatgcaggccttgctaaaactattaagatataaggctgtggtttaaaatttaatatttttcaagtacgtatgcattgtgactagtaatttggcaaaata
gi|10 : acaaagtactagtaattactccttatgagaacaaatttgcttttgttttgtatatagaaatcttaattggataatATAAACG-TGTG-TAT-TG-TGAA-C-T-TTT-TGAAT-GCATCA-AA-CA-T-C-AATGCAGG------C-CTTGCTA--AAACTATT-AAGA--TATA-AGGCTGTGGTT-T--AAA--ATTT-AATATTTT-TCAA--GT-ACG--TA-TGCATTG-T-G--A-CTA-GTAATTTGG-C-AA-AATtgcatgtttttcataaactcaataaacgtgtgtattgtgaactttttgaatgcatcaaacatcaatgcaggccttgctaaaactattaagatataaggctgtggtttaaaatttaatatttttcaagtacgtatgcattgtgactagtaatttggcaaaata
gi|11 : acaaagtactagtaattactccttatgagaacaaatttgcttttgttttgtatatagaaatcttaattggataattttgagtttatttaactacttctgttttggtgttcactctagagcatggtagagtaaacaatgcatgtttttcataaactca---TT-A--TTAG------A-----AA-TAT---CAACTAC-AT--CT-GA-----GA-AA--------ACTAA---TTTG----T--CT-T--T---------T---T----AA-CAT-TTC-AT--TT--G--ATG-TC-CAC-TGTAGAGTA--T-GGT-A-G----A-ATAAACA-GCTa
gi|11 : attgaataactgatagcaaaacaatccctttcattgc-T-TTT-TTAAT-GCATCA-AT-CA-T-T-A------GTGCAGAA-CTTCCTA--AC-CAATT-AAAA--TATA-AGGCTCTGAAT-TA-AAA--ATGC-ATTGTTTT-T-AA--GT-ACA--TA-TGTATTG-T-G--A-CTA-GTAATTTGG-C-AA-GAagataatttttcccataaactagacaaacttaaaaatatattttttaatgcatcaatcattagtgcagaacttcctaaccaattaaaatataaggctctgaattaaaaatgcattgtttttaagtacatatgtattgtgactagtaatttggcaagacata
gi|12 : attgaataactgatagcaaaacaatccctttcattgcttattagaaatatcaactacatctgagaaaactaatttgtctttttaacatttcatttgatgtccactgtagagtatggtagaataaacagctagataatttttcccataaactagacaaacttaaaaatataATATTTTTTTCT--CCTATATT---ATT-AACATTT-A---TG---ATATATA-A-ATATATTTATT-A-T-A-ATGATAT----ATT-cata
gi|12 : ct-A-T-A-ATGAT-T----AAT-AA----G-AA----CAT---TT-A--T-AA------A-----AA-T-T---CAG-TAC-CC--T--AA-----TA-AA--TC----AGTTG------G----G--TT-T--T---------TTTAA----AA-CAC-TTT-ATA-TT--G-CATG-TTTCAC-TGCAAGTTACAT-GAT-A-G----A-ATAAACA-ACTG----TG-GATT-G--------TAATTAAAAAA---AT-----T----------ATA-ATT-TG---A-------------T-------------TAC-ATACCCgattgattttggcaacttttcagccattcacggcggcataatgattaataagaacatttataaaaattcagtaccctaataaatcagttgggtttttttaaaacactttatattgcatgtttcactgcaagttacatgatagaataaacaactgtggattgtaattaaaaaaattataatttgattacataccc
gi|13 : ctatatttttttctcctatattattaacatttatgatatataaatatatttattataatgatatattgattgattttggcaacttttcagccattcacggcggc------A-CTTGCTA--AA-CTTTT-AAAA--TATG-AAGTTCTGGTT-TA-AAA--ATGT-ATTATTTT-TTAA--GT-ACA--TA-TGCATTG-T-G--A-CTA-GCAATTTAG-C-AA-AAT
gi|14 : cctttttatatataaggaaaaactttttctgtctccttataataaacatggaaatcataagaagtaacaaaggaggtgccaaatctgctaccaagggtatatgtatatcaagcatactacctgaaagacactgctgtgtaaagaggtccagtgcagaTT-AA-CTA-C-T-TCTGACATACC-T-TG-T-T-TG-TGAA-C-T-TTTTTGAAT-GCATCA-AA-CA-T-T-A------G------A-CTTGCTA--AA-CTCTT-AAGA--TATG-A-GTTCTGGTT-TT-AAA--ATGaaa
gi|15 : AG--GT-ACACATA-TGCATTG-C-AGTA-CTAAGTAATTTGG-C-AA-Aatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccagacatggcattagagcaaactaattcaaaaataa
gi|16 : cttttaatatataagagcaaaccttttttctgtttcatattaataaaaacacgcaaagttcatgttaatacagaagtaacaaagga-AA--TC----ACCTG---TTTG----T--TT-T--T---------T---A----A--CAC-TT---TA-TT--G-CATA-TT-CAT-TGCCAGTTA--T-GGT-A-G----A-ATCAACA-ACTG----TG-GACT-G--T-----TAAT---AAAA---AA-C--AT----------ATA-ATT-TG---ACAATTTGGAGCAAT-------------TAC-ATACCCCTA--GATttatatata
gi|17 : TTTTTCATA-TATATT-T-ATT-CACATTT-A---TA---ATACATG-A-ATG-ATTAA-T-A-TGA-AAGTT-T----ATA-A-----G-AA----------TT-ACAT-AAGTTGATA-----AT-T-T---CAG-TAC-CC--AT-AA-----TA-AA--TC----ACTTA---TTTGTT--G--TT-T--T---------
gi|18 : ata-AA-CA-T-T-A------GTGCAGGA-CTT--CA--AA-CACT--AAAA--TAAA-AG--TCTGGTT-TTGAAA--ATGT-ATTATTTT-TCAA--GT-ACA--TGTTGAGTAG-T-G--A-CT--GTAATTTGG-T-AA-AATct
gi|19 : ATATTATTTTTTACC-TATATT-T-ATC-AACATT--A---TG---ATTAATA-A-ATATATTTA-T-A-T-G-ATAA-----------------G-AA----CAT---TTTA--T-AA------AT----AA-T-T---CAG-TAC-CC--TT-AA-----TA-AA--TC----ACTTaac
gi|2 : tTATTTTTTT----CCTATATT-T-ATTTAACATAT-AGGATA---ATAAATA-A-ATATA-TTA-T-A-T-AGATGAT-T----AAT-A-----tt
gi|2 : -A-T-A-ATGAT------ATA-A-----G-AA-----AA---TT-A--A-AA------A-----TA-T-TT--CAG-TAC-C-------A-----TA-AACATC----AATTGGGATTTC-------TT-T--T---------T---A----AA-T-C-CT--AT--TT--G-CATGGTT-CAC-TGCAATTAA--T-GAT-A-G----A-ATAAAC--ACTG----T--GATT-G--T-----T-AC---ACAC---AT-CGAGT----------ACACATT-GA---A-------------T-------------TACTATACCTTAA--AGTTA----GA----GAG------TGATTGTT-----CATAT-T-CATC---TC--GTTA-TAA-CACAT----TA---ATTAG--TGA-TT-ATTGA--AGGCACATATTtatgatgatttggcaactttcagcatttcggtcggcataatgatataagaaaattaaaaatatttcagtaccataaacatcaattgggatttctttttaaatcctatttgcatggttcactgcaattaatgatagaataaacactgtgattgttacacacatcgagtacacattgaattactataccttaaagttagagagtgattgttcatattcatctcgttataacacattaattagtgattattgaaggcacatattagagctcgttgagctgataaaatatcagagttatggagaagaggataataatattatctcacactagagagttactctactcgcacattatcttgtttggtgaatctaatcgaatgaatcaaacatttaaatgctaaaccttaaaagatatgaggttcggtttaaaatgtattatttcagtgtacatagcattgttgactagcaatttgcaaaatgtgagaatcacaagt
gi|2 : tatttttttcctatatttatttaacatataggataataaataaatatattatatagatgattaatatatgatgatttggcaactttcagcatttcggtcggcATC-T-TG-T-T-TGGTGAATC-T-AAT-CGAAT-GAATCA-AA-CA-T-TTA------A------A---TGCTA--AA-C-CTT-AAAAGATATG-AGGTTC-GGTT-T--AAA--ATGT-ATTA--TT-TCAGT-GT-ACA--TA--GCATTGTT-G--A-CTA-GCAATTT-G-C-AA-AATG-T---Gagagctcgttgagctgataaaatatcagagttatggagaagaggataataatattatctcacactagagagttactctactcgcacattatcttgtttggtgaatctaatcgaatgaatcaaacatttaaatgctaaaccttaaaagatatgaggttcggtttaaaatgtattatttcagtgtacatagcattgttgactagcaatttgcaaaatgtgagaatcacaagt
gi|20 : tatttttttcctatatttatttaacatataggataataaataaatatattatatagatgattaatatatgatgatttggcaactttcagcatttcggtcggcataatgatataagaaaattaaaaatatttcagtaccataaacatcaattgggatttctttttaaatcctatttgcatggttcactgcaattaatgatagaataaacactgtgattgttacacacatcgagtacacattgaattactataccttaaagttagagagtgattgttcatattcatctcgttataacacattaattagtgattattgaaggcacatattagagctcgttgagctgataaaatatcagagttatggagaagaggataataatattatctcacactagagagttactctactcgcacattTTG---GTTG-------TT-T--T---------T---A-------CAC-TT--CTT-TT--T-GATG-TT-CAC-TGTAGAGCA--T-GGT-A-G----A-ATAAACA-ACTG----GA-AAAT-G--T-----Tagaatcacaagt
gi|21 : aTG---TTGG----G--TT-T--T---------TTT-A----AA-CAC-TTTGATA-TT--G-CATG-TT-TAC-TGCAAGTTA--T-AAT-A-G----A-ATAAACA-ACTGTCACTG-GACT-G--T-----TAAT---AAAA---AT-C--AT----------ATA-ATT-TG---A-------------tttcattaactcaacaagagaaattgctctgct
gi|22 : ---A-------------T-------------TAC-ATACCCCTA--GATTATCCTTA----GAC------TT-------C---CCG-T-T-CATC---TTCAGTTA-T-A-CAAAC----TA---ATTAC--TGA-TC-CTTAT--AG-AACAAATTTG-T-TTT----TG---T-T--AT
gi|23 : caATATTGTTTTTCACC-TATATT-C-ATT-AACATTT-A---T-------AATA-A-ATATATTTA-T-A-A-A-ATGAT-TTAAAAATAA-----G-AA----CAT---TT-A--T-AA------A-----
gi|24 : t-TAC-CC--TT-AA-----TA-AA--TC----ACTTG---TTTGTTTAT--TT-T--T---------T---A----AA-CACTTT--ATA-TT--G-CATG-TT-CAC-TNNNNNNNA--
gi|25 : ---A-------------T-------------TAC-ATACCCTTA--AATTATCCCTA--------------TA-GACTTC---CTT-T-T-CATC---TTCAGTTA-T-A-Cac
gi|3 : tgtgcaATATTTTTTTCCAC--TATATTCT-ATT-AACATTTTA---TG---ATTAATA-A-A-ATCTTTA-T-A-T-A--TGAT-C----AAT-A-------AG----CACCTGTT-A--T-AA------A-----AAAT-T---TAG-TAC-CC--TTTAA-----TA-AA--TC----ACTTG---TTTG----G--TT-T--T---------T---TTTTTAA-C-T-TT--ATAATT--G-CATG-TT-CACCTGCAAGTTA--T-GAT-AAG----AGATAAACA-ACTG----TG-GACTCG--T-----TAATT--AAAA---ATTC--ATGCAG------ATA-CTTCTG---A-------------T-------------TAC-CTACCCTTATAAGTTATCCCTA----GAC-------TA-TGCTAC---C-T-T-T-CATCCGCTTCAGTTA---A-CAAAT----TATTAATCAAAGT-A-TTGCTTAT--AGAA-CAAATTTG-T-TTT----TG---T-T--ATGTATATAAGAAAG---CTTAATT-GG-GATAC----ATTTGG-AG---TTA-ATT-AA-CTA-C-T-TCTGATAGACC-T-TG-T-T-GG-TGAA-C-T-TTT-TGAAT-GCATCA-AA-CA-T-T-A------G------A-CTTGCTA--AA-CTCTT-AAAA--TATG-AGGTTCTGGTT-TT-AAA--ATGT-ATTATTTT-TCAG--GT-ACA--TA-TGCATTG-T-G--A-TTA-GTAATTTGG-C-AA-AATG-T---GGC-AAA-AATAC
gi|4 : tATTTTTTT----CCTA-ATT-T-ATT-AACATTT-A---TGATTATATATA-A-ATATA-TTA-T-A-T-A-ATGAT-
gi|4 : -A-T-A-ATGAT-T----AAT-A-----G-AA----CAT---TT-A--T-AA------A-----AA-T-T---CAG-TAC-C----T-AA-----TA-AA--TC----AGTTG------G----G--TT-T--T---------TTT-A----AA-CAC-TTT-ATA-TT--G-CATG-TT-CAC-TGCAAGTAC--T-GAT-A-G----A-ATAAACA-A-TG----TGTGATT-G--T-----TAATTAAAAAA---AT-----T----------ATA-ATT-TG---A----------------------------AA-ATACCCTTA--AATTATGCTTA----GA-------CTA-TGCTTC---CCT-T-T-CATC---TTC--TTA-T-A-CAATT----TA---AT-----T-A-TC-TTTAT--TAACACAG------T-TTT----TG---T-T--ATGTATAT--GAAAT---CTTAA-T-TG-GAT------ATTTGG-AG-T-TTA-ATT-AA-ATA-C-T-TCTGACATACC---TG---T-TG-TGAA-C-T-TTT-TTAAT-GCATC--AA-CA-T-T-A------G------A-C-TGC----AA-CTCTT-AATA--TAT--AGTTTCTGGTT-TT-AAA--ATG--ATTA--TT-TCAG--G--ACA--TA-TGCATTG-TGG--A-CTA-GCAATTTGGCC-AATAATT-T---GG--AAA-AATaaattctgatattttggcaactttcagccattcacggctggcataatgattaatagaacatttataaaaattcagtacctaataaatcagttgggtttttttaaacactttatattgcatgttcactgcaagtactgatagaataaacaatgtgtgattgttaattaaaaaaattataatttgaaaatacccttaaattatgcttagactatgcttccctttcatcttcttatacaatttaattatctttattaacacagtttttgttatgtatatgaaatcttaattggatatttggagtttaattaaatacttctgacatacctgttgtgaacttttttaatgcatcaacattagactgcaactcttaatatatagtttctggttttaaaatgattatttcaggacatatgcattgtggactagcaatttggccaataatttggaaaaatca
gi|5 : atttttttcctaatttattaacatttatgattatatataaatatattatataatgataaattctgatattttggcaactttcagccattcacggctggcTTTTTTTCACC-TATATT-T-ATT-AACATTT-A---TG---ATAAATA-AGATATATTTA-T---T-A-ATGATAT----ATA-A-----ACAA----CAT---TT-A--T-AA------A-----AA-T-T---CAG-TAC-CC--TT-AAC----TT-AA--TCACGTACTTG---TTGG----GT-TT-T--T---------T---A----AA-CACTTT--ATA-TTG-G-CATGTTT-TAC-TGCACGTTA--TCAAT-A-G----A-ATAAACACACTG----TG-GACT-GTTT-----TAAT---AAAA---AT-C--AT----------ATA---T-TG---A-------------T-------------TA--ATA--CCTA--AATTAT-CCTA----G--------CTA-TG-TAC---CCT-TAT-CATC---T--AGTAA-T-A-CAAAT----TA---ATTAA--T---TC-CTTAT--AG-AACAAATTTGTT-TTT----TGGGTT-T--ATGTATAT-AGAAAT---CTTAA-T-TG-GATATAATTATTTGGAAG-T-----ATTAAA-CTA-CTT-TCTGATAGACC-T-TG-T-TCTG-TGAA-C-T-TTT-TGAAT-GCATCA-AACCA-T-T-A------G------A-CTTGCTA--AA-CTCTTAAAAA--TATG-AGGTTCTAGTTGTT-AAA--ATGTAATTATTTT-TCA---GT-ACG--TA-TGCATTG-T-G--A-CTT-GTAA-TTGG-C-AA-AATG-TG--GGC-AAA-AATAca
gi|6 : taATTTTTTTTTTCACCCTATA-T-T-ATC-AACATTT-A---TG---ATAAATA-A-ATATATCTA-T-A-T-A-GTGAT-T----CTT-A-----G-AA----CAA---TT-A--T-AA------A-----AA-T-T---CAG-TAC-CC--TT-AA-----TA-AA--TC----ACTTG---TTTG----G--TT-T--T---------T---A----AA-TAC-TA--ATA--T--G-CATG-TT-CAC-T-CAAGTTA--T-GAT-A-G----A-A-AAACA-ACTG----TG-GACT-G--TAACTGTAAT---AAAA---AT-C--AT----------ATA-ATT-TG---A-------------T-------------TAC-TTACCCCTA--AA--ATCCCTA----GAC------CTA-TGCTAC---CCT-T-T-CATC---TTCAGTTA-T-AGCAAAT----TA---ATTAAAGT-A-TC-CTTAT--AGAAAAAAATTTGTT-TTT----TG---T-C--ATGTAAAT-AGAAAG---CTTAATT-TG-GATA-----ATTTGG-AG-T-TTA-ATT-AA-CTA-C-T-TCTGATAGACCGT-TG-T-T-TG-TGAA-C-T-TTT-TGAAT-GCATCA-AA-CA-T-T-A------G------A-CTTGCTA--AA-CTCTT--GAA--TATG-AGGTTCTGG-T-TT-AAA--ATGT-ATTA-TTT-TCAG--GTAACA--TG-TGCATTG-T-G--A-TTA-GTAATTTGG-C-AA-AATG-T---GGC-AAA-AATACA
gi|7 : T-AA-----TA-AA--TC----ACTTG---TTTG----GGTTTGT--T---------T---A----AAACAC-TTT-ATA-TT--G-CATG-TT-CAC-TGCAAGTTA--T-GAT-A-GCTAGA-ATAAACA-ACTG----TG-GACT-G--T-----TAAT---AAAA---AT-C--AT----------ATA-ATT-TG---A-------------T-------------TAC-ATACCCCTA--AATTATCCCTA----GAC------TT--TGCTAC---CCT-T-T-CATC---TTCAGTTA-T-A-CCAAT----CA---ATT-A--T-T-TC-CTTAT--AAGAACAAATTTGTTACTT----TG---TGT--A-GTATATAAGAAAT---C--AA-T-TG-GATT-----AATTGG-AGTT-TTA-ATC--A-CTA-C-TGTCTGATAGA-C-T-TG-T-T-TG--GAA-CTT-TTT-TGAAT-GCATCACAA-CA-T-T-A------G------A-CTTGCTA--AA-CTCTT-AAAA--TATG-A-GTTCTGGTT-TT-AAAATATGT-ATTA-TAT-TCA---GT-ACA--TA-TGCATTA-T-G--A-CTA-GTATTTTGA-C-AA-AATGTT---GGC-AAA-AATACA
gi|8 : -CAC-CT--ATA-TT--G-CATG-TT-CAC-TGCAA-TTA--T-AAT-A-G----A-ATAAACA-ACTG----TG-GACT-G--T-----TTAT---AAAA---AT-C--AT----------ATA-AGT-TG---A-------------T-------------TAC-ATACCCCTA--AATTATCCCTA----GAC-------TA-TGCTAC---CCT-T-T-CATC---TTCAGTTA-T-A-CAAAT----TAT--ATTA---T---TC-CTTAT--AGAA-CAAATTTGTT-TTT-----G---T-T--ATGTATAT-AGAAAT---CTAAATT--G-GATA-----ATTTGG-AG-T-TTA-ATT-AA-CTA-C-T-TCTGATAGACC-T-TG-T-T-TG-TGAA-C-T-TTT-TGAAT-GCATCA-GA-CA-T-T-A------G------A-CTTGC-A--AA-CTCTT-AAAA--TATG-A-GTTCTGGTT-TT-AAA--ATGT-ATTATTTT-TCAG--GT-ACG--TA-TGCATTG-T-G--A-CTA-GTAATTTGG-C-AA-AATG-T---GGCAAAA-AATACA
gi|9 : tttTTTTTTTCACC-TATATT-TTATT-CACATTT-A---TA---ATTAATG-A-AT-TATGTA-TTA-T-G-AT--T-T----AAT-AATAATG-AA----CAT---TT-A--G-AA------A-----AA-T-T---CAG-TAC-CC--TT-AA-----TA-GA--TC----ACTTG---TTTG----G--TT-T--T---------T---T----AA-CAC-TT---CA-TT--G-TATG-TT-CAT-TGCTAGTTA--T-GGT-A-G----A-ATAAACA-ACTG----TG-GACT-T--T-----TAAT---AAAA----T-C--AT----------ATA-ATT-TG---A-------------TAATTTGGAGCAATTAC-ATACCACTA--AATTATCCCCA----GAC------CT-------C---CCT-T-T-CATC----TCAATTA-T-A-CAAACCATGCA---ATTA-----C-TC-CTTAT--AG-AACAAGTTTGTT-TTCGTTATG---T-T--ACGTATAT-AGACAT---CTTAA-T-TG-GATA-----ATTTGG-AG-T-TGATTTT-AA-CTA-C-T-T-TGATAGACC-T-Tc
Alignments
lowQualScore : 1 111111111111111111 11111111 111 11111 1111111 111111111111111111 111 111 1111 2222222222 222222222222222222222222222 11111111111 111 2222222 11111 11111 1 1 11111 1111111111111 11111
lowQualScore : 3 0 5 444 3 3 99999999 0 3 3 3 2 2 2 888888888888888888 3 3 3 3 55555555 999999 3 3 000 666 3 3 44 3 00000 2 33 6666 444 8888888 2 33 444444444444444444 5 5 666 2 55 2 5 2 2 33 2 2 2 5555 2 2 6666 3 3 44 77777 555 555 0000 1111111111 3 3 555 777777777777777777777777777 6 77 7777 88888888888 0 4 666 3 3 3 666 3 3 3 7777 000 55 6666666 3 55555 7 4 44444 777 4 55 3 777 2 99 4 55555 4 555 4 4 4 4 4 4 3 3 4 4 4 8 8 3 3 3 3 3 3 3 3 3 8888888888888 3 44 3 3 44 3 2 3 55 44 3 7 3 999 3 44 3 3 3 44 3 3 3 3 3 44444 5 5
lowQualScore : . . . ... . . ........ . . . . . . . .................. . . . . ........ ...... . . ... ... . . .. . ..... . .. .... ... ....... . .. .................. . . ... . .. . . . . .. . . . .... . . .... . . .. ..... ... ... .... .......... . . ... ........................... . .. .... ........... . . ... . . . ... . . . .... ... .. ....... . ..... . . ..... ... . .. . ... . .. . ..... . ... . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ............. . .. . . .. . . . .. .. . . . ... . .. . . . .. . . . . . ..... . .
lowQualScore : 8 7 0 111 6 6 44444444 3 6 6 6 9 9 9 777777777777777777 6 3 3 3 44444444 666666 3 6 000 444 3 3 66 1 88888 9 99 1111 444 1111111 5 44 999999999999999999 0 0 111 5 99 5 0 5 5 44 7 7 7 7777 7 7 5555 1 1 22 77777 000 888 8888 7777777777 3 3 000 444444444444444444444444444 2 99 7777 77777777777 5 5 444 6 6 6 444 6 6 6 7777 000 00 8888888 6 77777 2 0 22222 000 0 55 3 888 8 00 4 66666 4 333 4 0 0 0 0 0 6 6 0 0 0 0 0 6 6 6 6 3 3 3 3 3 6666666666666 1 22 1 1 22 1 8 1 66 22 3 3 3 999 1 22 1 1 1 22 1 1 1 1 1 88888 7 7
consensus : ATATTTTTTTTCACCCTATATT-T-ATT-AACATTT-A---TG---ATAAATA-A-ATATATTTA-T-A-TA-ATGAT---T----AAT-A-----GAA-CAT-T-T-AT--------AA------A-AA-T---T---CAG-TAC-CC--TT-AA-----TA-AA--TC----ACTTG---TTTG----G--TT-T--T---------T---A----AA-CAC-TT--ATA-TT--G-CATG-TT-CAC-TGCAAGTTA--T-GAT-A-G----A-ATAAACA-ACTG----TG-GACT-G--T-----TAAT---AAAA---AT-C--AT----------ATA-ATT-TG---A-------------T-------------TAC-ATACCCCTA--AATTATCCCTA----GAC------CTA-TGCTAC---CCT-T-T-CATC---TTCAGTTA-T-A-CAAAT----TA---ATT--AN--T-A-TC-CTTAT--AGGAACAAATTTGTT-TTT----TG---T-T--ATGTATAT-AGAAAT---CTTAATT-TG-GATA-----ATTTGG-AG-T-TTA-ATT-AA-CTA-C-T-TCTGATAGACC-T-TG-T-T-TG-TGAA-C-T-TTT-TGAAT-GCATCA-AA-CA-T-T-A------G------A-CTTGCTA--AA-CTCTT-AAAA--TATG-AGGTTCTGGTT-TT-AAA--ATGT-ATTATTTT-TCAG--GT-ACA--TA-TGCATTG-T-G--A-CTA-GTAATTTGG-C-AA-AATG-T---GGC-AAA-AATACA
Reference ( family-2386 ) : ATATTTTTTTTCACCCTATATT-T-ATT-AACATTT-A---TG---ATAAATA-A-ATATATTTA-T-A-TA-ATGAT---T----AAT-A-----GAA-CAT-T-T-AT--------AA------A-AA-T---T---CAG-TAC-CC--TT-AA-----TA-AA--TC----ACTTG---TTTG----G--TT-T--T---------T---A----AA-CAC-TT--ATA-TT--G-CATG-TT-CAC-TGCAAGTTA--T-GAT-A-G----A-ATAAACA-ACTG----TG-GACT-G--T-----TAAT---AAAA---AT-C--AT----------ATA-ATT-TG---A-------------T-------------TAC-ATACCCCTA--AATTATCCCTA----GAC------CTA-TGCTAC---CCT-T-T-CATC---TTCAGTTA-T-A-CAAAT----TA---ATT--AN--T-A-TC-CTTAT--AGGAACAAATTTGTT-TTT----TG---T-T--ATGTATAT-AGAAAT---CTTAATT-TG-GATA-----ATTTGG-AG-T-TTA-ATT-AA-CTA-C-T-TCTGATAGACC-T-TG-T-T-TG-TGAA-C-T-TTT-TGAAT-GCATCA-AA-CA-T-T-A------G------A-CTTGCTA--AA-CTCTT-AAAA--TATG-AGGTTCTGGTT-TT-AAA--ATGT-ATTATTTT-TCAG--GT-ACA--TA-TGCATTG-T-G--A-CTA-GTAATTTGG-C-AA-AATG-T---GGC-AAA-AATACA
gi|1 : CCATATC-T-ACT-AG-ATTT-A--------ATAAATATA-ATATATTAA-T-AATA-ATGAT---T----AAT-AA----GAAGCCT-C-T-ATTATAAACGAA------A-AA-T---CATGCAG-TACGCCAACT-AAAAATATACAA--TC----A-TTG---TTTG----G--TT-T--TCTCTTTCTTT---A----AGGCAC-TTT-ATA-TT--GGCATG-TT-CAC-TGCA-GTTA--T-GATCA-G----A-ATCAACA-ACTG----TG-G-CT-G--T-----TTAT---AAAACAAAT-CCAATCCCCTCTCCTATG-ACT-TATCCA-------------T-------------AGCGATACCCATCC-AATTATCC-TACGACGACTACCAACTA-GGCTACGAACTT-C-TGCATA---TTCAGTTAAT-A-CAAA----------ATT--AT--T-CCTT-CTTATTTATGAACA--TTCGTT-TTT-----G---T-TCTATGTACATTACGAACAGGCTTAATTCTGCGATA-----ATTTGG-AG-TATTA-ATT-AAGCTAGC-T-TCTGATAGAAA-T-TGAT-T-TGCTGAAGC-TCTTT-TGAATCGCATCA-AG-CAATAT-A------G------AACTTGCTATAAA-CTCTT-AAAA--TATGCAGGTTCTGGTT-TT-AAA--ATGT-ATTTTTCTATC-GCCGT-ACA--T--TGCATTG-T-G--AGCTG-AAAATTGGG-CAAA-AATGATGGGGGC-AAACAATAC
gi|10 : attatttttgccgctataacttttataataa----TA---ATT--AC--T----C-CTTAT--GAGAACAAATTTGCT-TTT-----G---T-T--TTGTATAT-AGAAAT---CTTAATT--G-GATA-----ATTTTG-AG-T-TTA-TTT-AA-CTA-C-T-TCTG
gi|10 : acaaagtactag---TTTGA---G--TT-TATT---------T---A----AC-TAC-TT--CTG-TTTTG--GTG-TT-CAC-TCTAGAGCA--T-GGT-A-G----A-GTAAACA-Attttggtgttcactctagagcatggtagagtaaacaatgcatgtttttcataaactcaataaacgtgtgtattgtgaactttttgaatgcatcaaacatcaatgcaggccttgctaaaactattaagatataaggctgtggtttaaaatttaatatttttcaagtacgtatgcattgtgactagtaatttggcaaaata
gi|10 : acaaagtactagtaattactccttatgagaacaaatttgcttttgttttgtatatagaaatcttaattggataatATAAACG-TGTG-TAT-TG-TGAA-C-T-TTT-TGAAT-GCATCA-AA-CA-T-C-AATGCAGG------C-CTTGCTA--AAACTATT-AAGA--TATA-AGGCTGTGGTT-T--AAA--ATTT-AATATTTT-TCAA--GT-ACG--TA-TGCATTG-T-G--A-CTA-GTAATTTGG-C-AA-AATtgcatgtttttcataaactcaataaacgtgtgtattgtgaactttttgaatgcatcaaacatcaatgcaggccttgctaaaactattaagatataaggctgtggtttaaaatttaatatttttcaagtacgtatgcattgtgactagtaatttggcaaaata
gi|11 : acaaagtactagtaattactccttatgagaacaaatttgcttttgttttgtatatagaaatcttaattggataattttgagtttatttaactacttctgttttggtgttcactctagagcatggtagagtaaacaatgcatgtttttcataaactca-T-T-ATT-------AG------A-AA-TA--T---CAACTAC-AT--CT-GA-----GA-AA--------ACTAA---TTTG----T--CT-T--T---------T---T----AA-CAT-TTC-AT--TT--G--ATG-TC-CAC-TGTAGAGTA--T-GGT-A-G----A-ATAAACA-GCTa
gi|11 : attgaataactgatagcaaaacaatccctttcattgc-T-TTT-TTAAT-GCATCA-AT-CA-T-T-A------GTGCAGAA-CTTCCTA--AC-CAATT-AAAA--TATA-AGGCTCTGAAT-TA-AAA--ATGC-ATTGTTTT-T-AA--GT-ACA--TA-TGTATTG-T-G--A-CTA-GTAATTTGG-C-AA-GAagataatttttcccataaactagacaaacttaaaaatatattttttaatgcatcaatcattagtgcagaacttcctaaccaattaaaatataaggctctgaattaaaaatgcattgtttttaagtacatatgtattgtgactagtaatttggcaagacata
gi|12 : attgaataactgatagcaaaacaatccctttcattgcttattagaaatatcaactacatctgagaaaactaatttgtctttttaacatttcatttgatgtccactgtagagtatggtagaataaacagctagataatttttcccataaactagacaaacttaaaaatataATATTTTTTTCT--CCTATATT---ATT-AACATTT-A---TG---ATATATA-A-ATATATTTATT-A-TA-ATGAT---cata
gi|12 : ct-A-TA-ATGAT---T----AAT-AA----GAA-CAT-T-T-AT--------AA------A-AA-T---T---CAG-TAC-CC--T--AA-----TA-AA--TC----AGTTG------G----G--TT-T--T---------TTTAA----AA-CAC-TTT-ATA-TT--G-CATG-TTTCAC-TGCAAGTTACAT-GAT-A-G----A-ATAAACA-ACTG----TG-GATT-G--------TAATTAAAAAA---AT-----T----------ATA-ATT-TG---A-------------T-------------TAC-ATACCCatattgattgattttggcaacttttcagccattcacggcggcataatgattaataagaacatttataaaaattcagtaccctaataaatcagttgggtttttttaaaacactttatattgcatgtttcactgcaagttacatgatagaataaacaactgtggattgtaattaaaaaaattataatttgattacataccc
gi|13 : ctatatttttttctcctatattattaacatttatgatatataaatatatttattataatgatatattgattgattttggcaacttttcagccattcacggcggc------A-CTTGCTA--AA-CTTTT-AAAA--TATG-AAGTTCTGGTT-TA-AAA--ATGT-ATTATTTT-TTAA--GT-ACA--TA-TGCATTG-T-G--A-CTA-GCAATTTAG-C-AA-AAT
gi|14 : cctttttatatataaggaaaaactttttctgtctccttataataaacatggaaatcataagaagtaacaaaggaggtgccaaatctgctaccaagggtatatgtatatcaagcatactacctgaaagacactgctgtgtaaagaggtccagtgcagaTT-AA-CTA-C-T-TCTGACATACC-T-TG-T-T-TG-TGAA-C-T-TTTTTGAAT-GCATCA-AA-CA-T-T-A------G------A-CTTGCTA--AA-CTCTT-AAGA--TATG-A-GTTCTGGTT-TT-AAA--ATGaaa
gi|15 : AG--GT-ACACATA-TGCATTG-C-AGTA-CTAAGTAATTTGG-C-AA-Aatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccagacatggcattagagcaaactaattcaaaaataa
gi|16 : cttttaatatataagagcaaaccttttttctgtttcatattaataaaaacacgcaaagttcatgttaatacagaagtaacaaagga-AA--TC----ACCTG---TTTG----T--TT-T--T---------T---A----A--CAC-TT---TA-TT--G-CATA-TT-CAT-TGCCAGTTA--T-GGT-A-G----A-ATCAACA-ACTG----TG-GACT-G--T-----TAAT---AAAA---AA-C--AT----------ATA-ATT-TG---ACAATTTGGAGCAAT-------------TAC-ATACCCCTA--GATttatatata
gi|17 : TTTTTCATA-TATATT-T-ATT-CACATTT-A---TA---ATACATG-A-ATG-ATTAA-T-A-TG-AAAGT---T----TAT-A-----AGA--AT-TAC-AT--------AAGTTGATA-AT-T---T---CAG-TAC-CC--AT-AA-----TA-AA--TC----ACTTA---TTTGTT--G--TT-T--T---------
gi|18 : ata-AA-CA-T-T-A------GTGCAGGA-CTT--CA--AA-CACT--AAAA--TAAA-AG--TCTGGTT-TTGAAA--ATGT-ATTATTTT-TCAA--GT-ACA--TGTTGAGTAG-T-G--A-CT--GTAATTTGG-T-AA-AATct
gi|19 : ATATTATTTTTTACC-TATATT-T-ATC-AACATT--A---TG---ATTAATA-A-ATATATTTA-T-A-TG-ATAA-------------------GAA-CAT-T-TTAT--------AA------ATAA-T---T---CAG-TAC-CC--TT-AA-----TA-AA--TC----ACTTaac
gi|2 : tTATTTTTTT----CCTATATT-T-ATTTAACATAT-AGGATA---ATAAATA-A-ATATA-TTA-T-A-TAGATGAT---T----AAT-A-----tt
gi|2 : -A-TA-ATGATA--T----AA--------GAA-AAT-T-------------AA------A-AA-TATTT---CAG-TAC-C-------A-----TA-AACATC----AATTGGGATTTC-------TT-T--T---------T---A----AA-T-C-CT--AT--TT--G-CATGGTT-CAC-TGCAATTAA--T-GAT-A-G----A-ATAAAC--ACTG----T--GATT-G--T-----T-AC---ACAC---AT-CGAGT----------ACACATT-GA---A-------------T-------------TACTATACCTTAA--AGTTA----GA----GAG------TGATTGTT-----CATAT-T-CATC---TC--GTTA-TAA-CACAT----TA---ATT--AG--TGA-TT-ATTGA--AGGCACATATTtatgatgatttggcaactttcagcatttcggtcggcataatgatataagaaaattaaaaatatttcagtaccataaacatcaattgggatttctttttaaatcctatttgcatggttcactgcaattaatgatagaataaacactgtgattgttacacacatcgagtacacattgaattactataccttaaagttagagagtgattgttcatattcatctcgttataacacattaattagtgattattgaaggcacatattagagctcgttgagctgataaaatatcagagttatggagaagaggataataatattatctcacactagagagttactctactcgcacattatcttgtttggtgaatctaatcgaatgaatcaaacatttaaatgctaaaccttaaaagatatgaggttcggtttaaaatgtattatttcagtgtacatagcattgttgactagcaatttgcaaaatgtgagaatcacaagt
gi|2 : tatttttttcctatatttatttaacatataggataataaataaatatattatatagatgattaatatatgatgatttggcaactttcagcatttcggtcggcATC-T-TG-T-T-TGGTGAATC-T-AAT-CGAAT-GAATCA-AA-CA-T-TTA------A------A---TGCTA--AA-C-CTT-AAAAGATATG-AGGTTC-GGTT-T--AAA--ATGT-ATTA--TT-TCAGT-GT-ACA--TA--GCATTGTT-G--A-CTA-GCAATTT-G-C-AA-AATG-T---Gagagctcgttgagctgataaaatatcagagttatggagaagaggataataatattatctcacactagagagttactctactcgcacattatcttgtttggtgaatctaatcgaatgaatcaaacatttaaatgctaaaccttaaaagatatgaggttcggtttaaaatgtattatttcagtgtacatagcattgttgactagcaatttgcaaaatgtgagaatcacaagt
gi|20 : tatttttttcctatatttatttaacatataggataataaataaatatattatatagatgattaatatatgatgatttggcaactttcagcatttcggtcggcataatgatataagaaaattaaaaatatttcagtaccataaacatcaattgggatttctttttaaatcctatttgcatggttcactgcaattaatgatagaataaacactgtgattgttacacacatcgagtacacattgaattactataccttaaagttagagagtgattgttcatattcatctcgttataacacattaattagtgattattgaaggcacatattagagctcgttgagctgataaaatatcagagttatggagaagaggataataatattatctcacactagagagttactctactcgcacattTTG---GTTG-------TT-T--T---------T---A-------CAC-TT--CTT-TT--T-GATG-TT-CAC-TGTAGAGCA--T-GGT-A-G----A-ATAAACA-ACTG----GA-AAAT-G--T-----Tagaatcacaagt
gi|21 : aTG---TTGG----G--TT-T--T---------TTT-A----AA-CAC-TTTGATA-TT--G-CATG-TT-TAC-TGCAAGTTA--T-AAT-A-G----A-ATAAACA-ACTGTCACTG-GACT-G--T-----TAAT---AAAA---AT-C--AT----------ATA-ATT-TG---A-------------tttcattaactcaacaagagaaattgctctgct
gi|22 : ---A-------------T-------------TAC-ATACCCCTA--GATTATCCTTA----GAC------TT-------C---CCG-T-T-CATC---TTCAGTTA-T-A-CAAAC----TA---ATT--AC--TGA-TC-CTTAT--A-GAACAAATTTG-T-TTT----TG---T-T--AT
gi|23 : caATATTGTTTTTCACC-TATATT-C-ATT-AACATTT-A---T-------AATA-A-ATATATTTA-T-A-AA-ATGAT---TTAAAAATAA-----GAA-CAT-T-T-AT--------AA------A-
gi|24 : t-TAC-CC--TT-AA-----TA-AA--TC----ACTTG---TTTGTTTAT--TT-T--T---------T---A----AA-CACTTT--ATA-TT--G-CATG-TT-CAC-TNNNNNNNA--
gi|25 : ---A-------------T-------------TAC-ATACCCTTA--AATTATCCCTA--------------TA-GACTTC---CTT-T-T-CATC---TTCAGTTA-T-A-Cac
gi|3 : tgtgcaATATTTTTTTCCAC--TATATTCT-ATT-AACATTTTA---TG---ATTAATA-A-A-ATCTTTA-T-A-TA--TGAT---C----AAT-AA----GCA-CCTGT-T-AT--------AA------A-AAAT---T---TAG-TAC-CC--TTTAA-----TA-AA--TC----ACTTG---TTTG----G--TT-T--T---------T---TTTTTAA-C-T-TT--ATAATT--G-CATG-TT-CACCTGCAAGTTA--T-GAT-AAG----AGATAAACA-ACTG----TG-GACTCG--T-----TAATT--AAAA---ATTC--ATGCAG------ATA-CTTCTG---A-------------T-------------TAC-CTACCCTTATAAGTTATCCCTA----GAC-------TA-TGCTAC---C-T-T-T-CATCCGCTTCAGTTA---A-CAAAT----TATTAATC--AAAGT-A-TTGCTTAT--AG-AACAAATTTG-T-TTT----TG---T-T--ATGTATATAAGAAAG---CTTAATT-GG-GATAC----ATTTGG-AG---TTA-ATT-AA-CTA-C-T-TCTGATAGACC-T-TG-T-T-GG-TGAA-C-T-TTT-TGAAT-GCATCA-AA-CA-T-T-A------G------A-CTTGCTA--AA-CTCTT-AAAA--TATG-AGGTTCTGGTT-TT-AAA--ATGT-ATTATTTT-TCAG--GT-ACA--TA-TGCATTG-T-G--A-TTA-GTAATTTGG-C-AA-AATG-T---GGC-AAA-AATAC
gi|4 : tATTTTTTT----CCTA-ATT-T-ATT-AACATTT-A---TGATTATATATA-A-ATATA-TTA-T-A-TA-ATGAT---A----AAT-
gi|4 : -A-TA-ATGAT---T----AAT-A-----GAA-CAT-T-T-AT--------AA------A-AA-T---T---CAG-TAC-C----T-AA-----TA-AA--TC----AGTTG------G----G--TT-T--T---------TTT-A----AA-CAC-TTT-ATA-TT--G-CATG-TT-CAC-TGCAAGTAC--T-GAT-A-G----A-ATAAACA-A-TG----TGTGATT-G--T-----TAATTAAAAAA---AT-----T----------ATA-ATT-TG---A----------------------------AA-ATACCCTTA--AATTATGCTTA----GA-------CTA-TGCTTC---CCT-T-T-CATC---TTC--TTA-T-A-CAATT----TA---AT-------T-A-TC-TTTAT----TAACACA---G-T-TTT----TG---T-T--ATGTATAT--GAAAT---CTTAA-T-TG-GAT------ATTTGG-AG-T-TTA-ATT-AA-ATA-C-T-TCTGACATACC---TG---T-TG-TGAA-C-T-TTT-TTAAT-GCATC--AA-CA-T-T-A------G------A-C-TGC----AA-CTCTT-AATA--TAT--AGTTTCTGGTT-TT-AAA--ATG--ATTA--TT-TCAG--G--ACA--TA-TGCATTG-TGG--A-CTA-GCAATTTGGCC-AATAATT-T---GG--AAA-AATtctgatattttggcaactttcagccattcacggctggcataatgattaatagaacatttataaaaattcagtacctaataaatcagttgggtttttttaaacactttatattgcatgttcactgcaagtactgatagaataaacaatgtgtgattgttaattaaaaaaattataatttgaaaatacccttaaattatgcttagactatgcttccctttcatcttcttatacaatttaattatctttattaacacagtttttgttatgtatatgaaatcttaattggatatttggagtttaattaaatacttctgacatacctgttgtgaacttttttaatgcatcaacattagactgcaactcttaatatatagtttctggttttaaaatgattatttcaggacatatgcattgtggactagcaatttggccaataatttggaaaaatca
gi|5 : atttttttcctaatttattaacatttatgattatatataaatatattatataatgataaattctgatattttggcaactttcagccattcacggctggcTTTTTTTCACC-TATATT-T-ATT-AACATTT-A---TG---ATAAATA-AGATATATTTA-T---TA-ATGATATAT----AA--A-----CAA-CAT-T-T-AT--------AA------A-AA-T---T---CAG-TAC-CC--TT-AAC----TT-AA--TCACGTACTTG---TTGG----GT-TT-T--T---------T---A----AA-CACTTT--ATA-TTG-G-CATGTTT-TAC-TGCACGTTA--TCAAT-A-G----A-ATAAACACACTG----TG-GACT-GTTT-----TAAT---AAAA---AT-C--AT----------ATA---T-TG---A-------------T-------------TA--ATA--CCTA--AATTAT-CCTA----G--------CTA-TG-TAC---CCT-TAT-CATC---T--AGTAA-T-A-CAAAT----TA---ATT--AA--T---TC-CTTAT--A-GAACAAATTTGTT-TTT----TGGGTT-T--ATGTATAT-AGAAAT---CTTAA-T-TG-GATATAATTATTTGGAAG-T-----ATTAAA-CTA-CTT-TCTGATAGACC-T-TG-T-TCTG-TGAA-C-T-TTT-TGAAT-GCATCA-AACCA-T-T-A------G------A-CTTGCTA--AA-CTCTTAAAAA--TATG-AGGTTCTAGTTGTT-AAA--ATGTAATTATTTT-TCA---GT-ACG--TA-TGCATTG-T-G--A-CTT-GTAA-TTGG-C-AA-AATG-TG--GGC-AAA-AATAca
gi|6 : taATTTTTTTTTTCACCCTATA-T-T-ATC-AACATTT-A---TG---ATAAATA-A-ATATATCTA-T-A-TA-GTGAT---T----CTT-A-----GAA-CAA-T-T-AT--------AA------A-AA-T---T---CAG-TAC-CC--TT-AA-----TA-AA--TC----ACTTG---TTTG----G--TT-T--T---------T---A----AA-TAC-TA--ATA--T--G-CATG-TT-CAC-T-CAAGTTA--T-GAT-A-G----A-A-AAACA-ACTG----TG-GACT-G--TAACTGTAAT---AAAA---AT-C--AT----------ATA-ATT-TG---A-------------T-------------TAC-TTACCCCTA--AA--ATCCCTA----GAC------CTA-TGCTAC---CCT-T-T-CATC---TTCAGTTA-T-AGCAAAT----TA---ATTAAAG--T-A-TC-CTTAT--AGAAAAAAATTTGTT-TTT----TG---T-C--ATGTAAAT-AGAAAG---CTTAATT-TG-GATA-----ATTTGG-AG-T-TTA-ATT-AA-CTA-C-T-TCTGATAGACCGT-TG-T-T-TG-TGAA-C-T-TTT-TGAAT-GCATCA-AA-CA-T-T-A------G------A-CTTGCTA--AA-CTCTT--GAA--TATG-AGGTTCTGG-T-TT-AAA--ATGT-ATTA-TTT-TCAG--GTAACA--TG-TGCATTG-T-G--A-TTA-GTAATTTGG-C-AA-AATG-T---GGC-AAA-AATACA
gi|7 : T-AA-----TA-AA--TC----ACTTG---TTTG----GGTTTGT--T---------T---A----AAACAC-TTT-ATA-TT--G-CATG-TT-CAC-TGCAAGTTA--T-GAT-A-GCTAGA-ATAAACA-ACTG----TG-GACT-G--T-----TAAT---AAAA---AT-C--AT----------ATA-ATT-TG---A-------------T-------------TAC-ATACCCCTA--AATTATCCCTA----GAC------TT--TGCTAC---CCT-T-T-CATC---TTCAGTTA-T-A-CCAAT----CA---ATT--AT--T---TC-CTTAT--AAGAACAAATTTGTTACTT----TG---TGT--A-GTATATAAGAAAT---C--AA-T-TG-GATT-----AATTGG-AGTT-TTA-ATC--A-CTA-C-TGTCTGATAGA-C-T-TG-T-T-TG--GAA-CTT-TTT-TGAAT-GCATCACAA-CA-T-T-A------G------A-CTTGCTA--AA-CTCTT-AAAA--TATG-A-GTTCTGGTT-TT-AAAATATGT-ATTA-TAT-TCA---GT-ACA--TA-TGCATTA-T-G--A-CTA-GTATTTTGA-C-AA-AATGTT---GGC-AAA-AATACA
gi|8 : -CAC-CT--ATA-TT--G-CATG-TT-CAC-TGCAA-TTA--T-AAT-A-G----A-ATAAACA-ACTG----TG-GACT-G--T-----TTAT---AAAA---AT-C--AT----------ATA-AGT-TG---A-------------T-------------TAC-ATACCCCTA--AATTATCCCTA----GAC-------TA-TGCTAC---CCT-T-T-CATC---TTCAGTTA-T-A-CAAAT----TAT--ATT--AT--T----C-CTTAT--AG-AACAAATTTGTT-TTT-----G---T-T--ATGTATAT-AGAAAT---CTAAATT--G-GATA-----ATTTGG-AG-T-TTA-ATT-AA-CTA-C-T-TCTGATAGACC-T-TG-T-T-TG-TGAA-C-T-TTT-TGAAT-GCATCA-GA-CA-T-T-A------G------A-CTTGC-A--AA-CTCTT-AAAA--TATG-A-GTTCTGGTT-TT-AAA--ATGT-ATTATTTT-TCAG--GT-ACG--TA-TGCATTG-T-G--A-CTA-GTAATTTGG-C-AA-AATG-T---GGCAAAA-AATACA
gi|9 : tttTTTTTTTCACC-TATATT-TTATT-CACATTT-A---TA---ATTAATG-A-AT-TATGTA-TTA-TG-AT--T---T----AAT-AATAATGAA-CAT-T-T-AG--------AA------A-AA-T---T---CAG-TAC-CC--TT-AA-----TA-GA--TC----ACTTG---TTTG----G--TT-T--T---------T---T----AA-CAC-TT---CA-TT--G-TATG-TT-CAT-TGCTAGTTA--T-GGT-A-G----A-ATAAACA-ACTG----TG-GACT-T--T-----TAAT---AAAA----T-C--AT----------ATA-ATT-TG---A-------------TAATTTGGAGCAATTAC-ATACCACTA--AATTATCCCCA----GAC------CT-------C---CCT-T-T-CATC----TCAATTA-T-A-CAAACCATGCA---ATT--AC------TC-CTTAT--A-GAACAAGTTTGTT-TTCGTTATG---T-T--ACGTATAT-AGACAT---CTTAA-T-TG-GATA-----ATTTGG-AG-T-TGATTTT-AA-CTA-C-T-T-TGATAGACC-T-Tc
Alignments
lowQualScore : 1 111111111111111111 11111111 111 11111 1111111 111111111111111111 111 111 1111 2222222222 222222222222222222222222222 11111111111 111 2222222 11111 11111 1 1 11111 1111111111111 11111
lowQualScore : 3 0 5 444 3 3 99999999 0 3 3 3 2 2 2 888888888888888888 3 3 3 3 55555555 999999 3 3 000 666 3 3 44 3 00000 2 33 6666 444 8888888 2 33 444444444444444444 5 5 666 2 55 2 5 2 2 33 2 2 2 5555 2 2 6666 3 3 44 77777 555 555 0000 1111111111 3 3 555 777777777777777777777777777 6 77 7777 88888888888 0 4 666 3 3 3 666 3 3 3 7777 000 55 6666666 3 55555 7 4 44444 777 4 55 3 777 2 99 4 55555 4 555 4 4 4 4 4 4 3 3 4 4 4 8 8 3 3 3 3 3 3 3 3 3 8888888888888 3 44 3 3 44 3 2 3 55 44 3 7 3 999 3 44 3 3 3 44 3 3 3 3 3 44444 5 5
lowQualScore : . . . ... . . ........ . . . . . . . .................. . . . . ........ ...... . . ... ... . . .. . ..... . .. .... ... ....... . .. .................. . . ... . .. . . . . .. . . . .... . . .... . . .. ..... ... ... .... .......... . . ... ........................... . .. .... ........... . . ... . . . ... . . . .... ... .. ....... . ..... . . ..... ... . .. . ... . .. . ..... . ... . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ............. . .. . . .. . . . .. .. . . . ... . .. . . . .. . . . . . ..... . .
lowQualScore : 8 7 0 111 6 6 44444444 3 6 6 6 9 9 9 777777777777777777 6 3 3 3 44444444 666666 3 6 000 444 3 3 66 1 88888 9 99 1111 444 1111111 5 44 999999999999999999 0 0 111 5 99 5 0 5 5 44 7 7 7 7777 7 7 5555 1 1 22 77777 000 888 8888 7777777777 3 3 000 444444444444444444444444444 2 99 7777 77777777777 5 5 444 6 6 6 444 6 6 6 7777 000 00 8888888 6 77777 2 0 22222 000 0 55 3 888 8 00 4 66666 4 333 4 0 0 0 0 0 6 6 0 0 0 0 0 6 6 6 6 3 3 3 3 3 6666666666666 1 22 1 1 22 1 8 1 66 22 3 3 3 999 1 22 1 1 1 22 1 1 1 1 1 88888 7 7
consensus : ATATTTTTTTTCACCCTATATT-T-ATT-AACATTT-A---TG---ATAAATA-A-ATATATTTA-T-A-TA-ATGAT---T----AAT-A-----GAA-CAT-T-T-AT--------AA------A-AA-T---T---CAG-TAC-CC--TT-AA-----TA-AA--TC----ACTTG---TTTG----G--TT-T--T---------T---A----AA-CAC-TT--ATA-TT--G-CATG-TT-CAC-TGCAAGTTA--T-GAT-A-G----A-ATAAACA-ACTG----TG-GACT-G--T-----TAAT---AAAA---AT-C--AT----------ATA-ATT-TG---A-------------T-------------TAC-ATACCCCTA--AATTATCCCTA----GAC------CTA-TGCTAC---CCT-T-T-CATC---TTCAGTTA-T-A-CAAAT----TA---ATT--AN--T-A-TC-CTTAT--AGGAACAAATTTGTT-TTT----TG---T-T--ATGTATAT-AGAAAT---CTTAATT-TG-GATA-----ATTTGG-AG-T-TTA-ATT-AA-CTA-C-T-TCTGATAGACC-T-TG-T-T-TG-TGAA-C-T-TTT-TGAAT-GCATCA-AA-CA-T-T-A------G------A-CTTGCTA--AA-CTCTT-AAAA--TATG-AGGTTCTGGTT-TT-AAA--ATGT-ATTATTTT-TCAG--GT-ACA--TA-TGCATTG-T-G--A-CTA-GTAATTTGG-C-AA-AATG-T---GGC-AAA-AATACA
Reference ( family-2386 ) : ATATTTTTTTTCACCCTATATT-T-ATT-AACATTT-A---TG---ATAAATA-A-ATATATTTA-T-A-TA-ATGAT---T----AAT-A-----GAA-CAT-T-T-AT--------AA------A-AA-T---T---CAG-TAC-CC--TT-AA-----TA-AA--TC----ACTTG---TTTG----G--TT-T--T---------T---A----AA-CAC-TT--ATA-TT--G-CATG-TT-CAC-TGCAAGTTA--T-GAT-A-G----A-ATAAACA-ACTG----TG-GACT-G--T-----TAAT---AAAA---AT-C--AT----------ATA-ATT-TG---A-------------T-------------TAC-ATACCCCTA--AATTATCCCTA----GAC------CTA-TGCTAC---CCT-T-T-CATC---TTCAGTTA-T-A-CAAAT----TA---ATT--AN--T-A-TC-CTTAT--AGGAACAAATTTGTT-TTT----TG---T-T--ATGTATAT-AGAAAT---CTTAATT-TG-GATA-----ATTTGG-AG-T-TTA-ATT-AA-CTA-C-T-TCTGATAGACC-T-TG-T-T-TG-TGAA-C-T-TTT-TGAAT-GCATCA-AA-CA-T-T-A------G------A-CTTGCTA--AA-CTCTT-AAAA--TATG-AGGTTCTGGTT-TT-AAA--ATGT-ATTATTTT-TCAG--GT-ACA--TA-TGCATTG-T-G--A-CTA-GTAATTTGG-C-AA-AATG-T---GGC-AAA-AATACA
gi|1 : CCATATC-T-ACT-AG-ATTT-A--------ATAAATATA-ATATATTAA-T-AATA-ATGAT---T----AAT-AA----GAAGCCT-C-T-ATTATAAACGAA------A-AA-T---CATGCAG-TACGCCAACT-AAAAATATACAA--TC----A-TTG---TTTG----G--TT-T--TCTCTTTCTTT---A----AGGCAC-TTT-ATA-TT--GGCATG-TT-CAC-TGCA-GTTA--T-GATCA-G----A-ATCAACA-ACTG----TG-G-CT-G--T-----TTAT---AAAACAAAT-CCAATCCCCTCTCCTATG-ACT-TATCCA-------------T-------------AGCGATACCCATCC-AATTATCC-TACGACGACTACCAACTA-GGCTACGAACTT-C-TGCATA---TTCAGTTAAT-A-CAAA----------ATT--AT--T-CCTT-CTTATTTATGAACA--TTCGTT-TTT-----G---T-TCTATGTACATTACGAACAGGCTTAATTCTGCGATA-----ATTTGG-AG-TATTA-ATT-AAGCTAGC-T-TCTGATAGAAA-T-TGAT-T-TGCTGAAGC-TCTTT-TGAATCGCATCA-AG-CAATAT-A------G------AACTTGCTATAAA-CTCTT-AAAA--TATGCAGGTTCTGGTT-TT-AAA--ATGT-ATTTTTCTATC-GCCGT-ACA--T--TGCATTG-T-G--AGCTG-AAAATTGGG-CAAA-AATGATGGGGGC-AAACAATAC
gi|10 : attatttttgccgctataacttttataataa----TA---ATT--AC--T----C-CTTAT--GAGAACAAATTTGCT-TTT-----G---T-T--TTGTATAT-AGAAAT---CTTAATT--G-GATA-----ATTTTG-AG-T-TTA-TTT-AA-CTA-C-T-TCTG
gi|10 : acaaagtactag---TTTGA---G--TT-TATT---------T---A----AC-TAC-TT--CTG-TTTTG--GTG-TT-CAC-TCTAGAGCA--T-GGT-A-G----A-GTAAACA-Attttggtgttcactctagagcatggtagagtaaacaatgcatgtttttcataaactcaataaacgtgtgtattgtgaactttttgaatgcatcaaacatcaatgcaggccttgctaaaactattaagatataaggctgtggtttaaaatttaatatttttcaagtacgtatgcattgtgactagtaatttggcaaaata
gi|10 : acaaagtactagtaattactccttatgagaacaaatttgcttttgttttgtatatagaaatcttaattggataatATAAACG-TGTG-TAT-TG-TGAA-C-T-TTT-TGAAT-GCATCA-AA-CA-T-C-AATGCAGG------C-CTTGCTA--AAACTATT-AAGA--TATA-AGGCTGTGGTT-T--AAA--ATTT-AATATTTT-TCAA--GT-ACG--TA-TGCATTG-T-G--A-CTA-GTAATTTGG-C-AA-AATtgcatgtttttcataaactcaataaacgtgtgtattgtgaactttttgaatgcatcaaacatcaatgcaggccttgctaaaactattaagatataaggctgtggtttaaaatttaatatttttcaagtacgtatgcattgtgactagtaatttggcaaaata
gi|11 : acaaagtactagtaattactccttatgagaacaaatttgcttttgttttgtatatagaaatcttaattggataattttgagtttatttaactacttctgttttggtgttcactctagagcatggtagagtaaacaatgcatgtttttcataaactca-T-T-ATT-------AG------A-AA-TA--T---CAACTAC-AT--CT-GA-----GA-AA--------ACTAA---TTTG----T--CT-T--T---------T---T----AA-CAT-TTC-AT--TT--G--ATG-TC-CAC-TGTAGAGTA--T-GGT-A-G----A-ATAAACA-GCTa
gi|11 : attgaataactgatagcaaaacaatccctttcattgc-T-TTT-TTAAT-GCATCA-AT-CA-T-T-A------GTGCAGAA-CTTCCTA--AC-CAATT-AAAA--TATA-AGGCTCTGAAT-TA-AAA--ATGC-ATTGTTTT-T-AA--GT-ACA--TA-TGTATTG-T-G--A-CTA-GTAATTTGG-C-AA-GAagataatttttcccataaactagacaaacttaaaaatatattttttaatgcatcaatcattagtgcagaacttcctaaccaattaaaatataaggctctgaattaaaaatgcattgtttttaagtacatatgtattgtgactagtaatttggcaagacata
gi|12 : attgaataactgatagcaaaacaatccctttcattgcttattagaaatatcaactacatctgagaaaactaatttgtctttttaacatttcatttgatgtccactgtagagtatggtagaataaacagctagataatttttcccataaactagacaaacttaaaaatataATATTTTTTTCT--CCTATATT---ATT-AACATTT-A---TG---ATATATA-A-ATATATTTATT-A-TA-ATGAT---cata
gi|12 : ct-A-TA-ATGAT---T----AAT-AA----GAA-CAT-T-T-AT--------AA------A-AA-T---T---CAG-TAC-CC--T--AA-----TA-AA--TC----AGTTG------G----G--TT-T--T---------TTTAA----AA-CAC-TTT-ATA-TT--G-CATG-TTTCAC-TGCAAGTTACAT-GAT-A-G----A-ATAAACA-ACTG----TG-GATT-G--------TAATTAAAAAA---AT-----T----------ATA-ATT-TG---A-------------T-------------TAC-ATACCCatattgattgattttggcaacttttcagccattcacggcggcataatgattaataagaacatttataaaaattcagtaccctaataaatcagttgggtttttttaaaacactttatattgcatgtttcactgcaagttacatgatagaataaacaactgtggattgtaattaaaaaaattataatttgattacataccc
gi|13 : ctatatttttttctcctatattattaacatttatgatatataaatatatttattataatgatatattgattgattttggcaacttttcagccattcacggcggc------A-CTTGCTA--AA-CTTTT-AAAA--TATG-AAGTTCTGGTT-TA-AAA--ATGT-ATTATTTT-TTAA--GT-ACA--TA-TGCATTG-T-G--A-CTA-GCAATTTAG-C-AA-AAT
gi|14 : cctttttatatataaggaaaaactttttctgtctccttataataaacatggaaatcataagaagtaacaaaggaggtgccaaatctgctaccaagggtatatgtatatcaagcatactacctgaaagacactgctgtgtaaagaggtccagtgcagaTT-AA-CTA-C-T-TCTGACATACC-T-TG-T-T-TG-TGAA-C-T-TTTTTGAAT-GCATCA-AA-CA-T-T-A------G------A-CTTGCTA--AA-CTCTT-AAGA--TATG-A-GTTCTGGTT-TT-AAA--ATGaaa
gi|15 : AG--GT-ACACATA-TGCATTG-C-AGTA-CTAAGTAATTTGG-C-AA-Aatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccagacatggcattagagcaaactaattcaaaaataa
gi|16 : cttttaatatataagagcaaaccttttttctgtttcatattaataaaaacacgcaaagttcatgttaatacagaagtaacaaagga-AA--TC----ACCTG---TTTG----T--TT-T--T---------T---A----A--CAC-TT---TA-TT--G-CATA-TT-CAT-TGCCAGTTA--T-GGT-A-G----A-ATCAACA-ACTG----TG-GACT-G--T-----TAAT---AAAA---AA-C--AT----------ATA-ATT-TG---ACAATTTGGAGCAAT-------------TAC-ATACCCCTA--GATttatatata
gi|17 : TTTTTCATA-TATATT-T-ATT-CACATTT-A---TA---ATACATG-A-ATG-ATTAA-T-A-TG-AAAGT---T----TAT-A-----AGA--AT-TAC-AT--------AAGTTGATA-AT-T---T---CAG-TAC-CC--AT-AA-----TA-AA--TC----ACTTA---TTTGTT--G--TT-T--T---------
gi|18 : ata-AA-CA-T-T-A------GTGCAGGA-CTT--CA--AA-CACT--AAAA--TAAA-AG--TCTGGTT-TTGAAA--ATGT-ATTATTTT-TCAA--GT-ACA--TGTTGAGTAG-T-G--A-CT--GTAATTTGG-T-AA-AATct
gi|19 : ATATTATTTTTTACC-TATATT-T-ATC-AACATT--A---TG---ATTAATA-A-ATATATTTA-T-A-TG-ATAA-------------------GAA-CAT-T-TTAT--------AA------ATAA-T---T---CAG-TAC-CC--TT-AA-----TA-AA--TC----ACTTaac
gi|2 : tTATTTTTTT----CCTATATT-T-ATTTAACATAT-AGGATA---ATAAATA-A-ATATA-TTA-T-A-TAGATGAT---T----AAT-A-----tt
gi|2 : -A-TA-ATGATA--T----AA--------GAA-AAT-T-------------AA------A-AA-TATTT---CAG-TAC-C-------A-----TA-AACATC----AATTGGGATTTC-------TT-T--T---------T---A----AA-T-C-CT--AT--TT--G-CATGGTT-CAC-TGCAATTAA--T-GAT-A-G----A-ATAAAC--ACTG----T--GATT-G--T-----T-AC---ACAC---AT-CGAGT----------ACACATT-GA---A-------------T-------------TACTATACCTTAA--AGTTA----GA----GAG------TGATTGTT-----CATAT-T-CATC---TC--GTTA-TAA-CACAT----TA---ATT--AG--TGA-TT-ATTGA--AGGCACATATTtatgatgatttggcaactttcagcatttcggtcggcataatgatataagaaaattaaaaatatttcagtaccataaacatcaattgggatttctttttaaatcctatttgcatggttcactgcaattaatgatagaataaacactgtgattgttacacacatcgagtacacattgaattactataccttaaagttagagagtgattgttcatattcatctcgttataacacattaattagtgattattgaaggcacatattagagctcgttgagctgataaaatatcagagttatggagaagaggataataatattatctcacactagagagttactctactcgcacattatcttgtttggtgaatctaatcgaatgaatcaaacatttaaatgctaaaccttaaaagatatgaggttcggtttaaaatgtattatttcagtgtacatagcattgttgactagcaatttgcaaaatgtgagaatcacaagt
gi|2 : tatttttttcctatatttatttaacatataggataataaataaatatattatatagatgattaatatatgatgatttggcaactttcagcatttcggtcggcATC-T-TG-T-T-TGGTGAATC-T-AAT-CGAAT-GAATCA-AA-CA-T-TTA------A------A---TGCTA--AA-C-CTT-AAAAGATATG-AGGTTC-GGTT-T--AAA--ATGT-ATTA--TT-TCAGT-GT-ACA--TA--GCATTGTT-G--A-CTA-GCAATTT-G-C-AA-AATG-T---Gagagctcgttgagctgataaaatatcagagttatggagaagaggataataatattatctcacactagagagttactctactcgcacattatcttgtttggtgaatctaatcgaatgaatcaaacatttaaatgctaaaccttaaaagatatgaggttcggtttaaaatgtattatttcagtgtacatagcattgttgactagcaatttgcaaaatgtgagaatcacaagt
gi|20 : tatttttttcctatatttatttaacatataggataataaataaatatattatatagatgattaatatatgatgatttggcaactttcagcatttcggtcggcataatgatataagaaaattaaaaatatttcagtaccataaacatcaattgggatttctttttaaatcctatttgcatggttcactgcaattaatgatagaataaacactgtgattgttacacacatcgagtacacattgaattactataccttaaagttagagagtgattgttcatattcatctcgttataacacattaattagtgattattgaaggcacatattagagctcgttgagctgataaaatatcagagttatggagaagaggataataatattatctcacactagagagttactctactcgcacattTTG---GTTG-------TT-T--T---------T---A-------CAC-TT--CTT-TT--T-GATG-TT-CAC-TGTAGAGCA--T-GGT-A-G----A-ATAAACA-ACTG----GA-AAAT-G--T-----Tagaatcacaagt
gi|21 : aTG---TTGG----G--TT-T--T---------TTT-A----AA-CAC-TTTGATA-TT--G-CATG-TT-TAC-TGCAAGTTA--T-AAT-A-G----A-ATAAACA-ACTGTCACTG-GACT-G--T-----TAAT---AAAA---AT-C--AT----------ATA-ATT-TG---A-------------tttcattaactcaacaagagaaattgctctgct
gi|22 : ---A-------------T-------------TAC-ATACCCCTA--GATTATCCTTA----GAC------TT-------C---CCG-T-T-CATC---TTCAGTTA-T-A-CAAAC----TA---ATT--AC--TGA-TC-CTTAT--A-GAACAAATTTG-T-TTT----TG---T-T--AT
gi|23 : caATATTGTTTTTCACC-TATATT-C-ATT-AACATTT-A---T-------AATA-A-ATATATTTA-T-A-AA-ATGAT---TTAAAAATAA-----GAA-CAT-T-T-AT--------AA------A-
gi|24 : t-TAC-CC--TT-AA-----TA-AA--TC----ACTTG---TTTGTTTAT--TT-T--T---------T---A----AA-CACTTT--ATA-TT--G-CATG-TT-CAC-TNNNNNNNA--
gi|25 : ---A-------------T-------------TAC-ATACCCTTA--AATTATCCCTA--------------TA-GACTTC---CTT-T-T-CATC---TTCAGTTA-T-A-Cac
gi|3 : tgtgcaATATTTTTTTCCAC--TATATTCT-ATT-AACATTTTA---TG---ATTAATA-A-A-ATCTTTA-T-A-TA--TGAT---C----AAT-AA----GCA-CCTGT-T-AT--------AA------A-AAAT---T---TAG-TAC-CC--TTTAA-----TA-AA--TC----ACTTG---TTTG----G--TT-T--T---------T---TTTTTAA-C-T-TT--ATAATT--G-CATG-TT-CACCTGCAAGTTA--T-GAT-AAG----AGATAAACA-ACTG----TG-GACTCG--T-----TAATT--AAAA---ATTC--ATGCAG------ATA-CTTCTG---A-------------T-------------TAC-CTACCCTTATAAGTTATCCCTA----GAC-------TA-TGCTAC---C-T-T-T-CATCCGCTTCAGTTA---A-CAAAT----TATTAATC--AAAGT-A-TTGCTTAT--AG-AACAAATTTG-T-TTT----TG---T-T--ATGTATATAAGAAAG---CTTAATT-GG-GATAC----ATTTGG-AG---TTA-ATT-AA-CTA-C-T-TCTGATAGACC-T-TG-T-T-GG-TGAA-C-T-TTT-TGAAT-GCATCA-AA-CA-T-T-A------G------A-CTTGCTA--AA-CTCTT-AAAA--TATG-AGGTTCTGGTT-TT-AAA--ATGT-ATTATTTT-TCAG--GT-ACA--TA-TGCATTG-T-G--A-TTA-GTAATTTGG-C-AA-AATG-T---GGC-AAA-AATAC
gi|4 : tATTTTTTT----CCTA-ATT-T-ATT-AACATTT-A---TGATTATATATA-A-ATATA-TTA-T-A-TA-ATGAT---A----AAT-
gi|4 : -A-TA-ATGAT---T----AAT-A-----GAA-CAT-T-T-AT--------AA------A-AA-T---T---CAG-TAC-C----T-AA-----TA-AA--TC----AGTTG------G----G--TT-T--T---------TTT-A----AA-CAC-TTT-ATA-TT--G-CATG-TT-CAC-TGCAAGTAC--T-GAT-A-G----A-ATAAACA-A-TG----TGTGATT-G--T-----TAATTAAAAAA---AT-----T----------ATA-ATT-TG---A----------------------------AA-ATACCCTTA--AATTATGCTTA----GA-------CTA-TGCTTC---CCT-T-T-CATC---TTC--TTA-T-A-CAATT----TA---AT-------T-A-TC-TTTAT----TAACACA---G-T-TTT----TG---T-T--ATGTATAT--GAAAT---CTTAA-T-TG-GAT------ATTTGG-AG-T-TTA-ATT-AA-ATA-C-T-TCTGACATACC---TG---T-TG-TGAA-C-T-TTT-TTAAT-GCATC--AA-CA-T-T-A------G------A-C-TGC----AA-CTCTT-AATA--TAT--AGTTTCTGGTT-TT-AAA--ATG--ATTA--TT-TCAG--G--ACA--TA-TGCATTG-TGG--A-CTA-GCAATTTGGCC-AATAATT-T---GG--AAA-AATtctgatattttggcaactttcagccattcacggctggcataatgattaatagaacatttataaaaattcagtacctaataaatcagttgggtttttttaaacactttatattgcatgttcactgcaagtactgatagaataaacaatgtgtgattgttaattaaaaaaattataatttgaaaatacccttaaattatgcttagactatgcttccctttcatcttcttatacaatttaattatctttattaacacagtttttgttatgtatatgaaatcttaattggatatttggagtttaattaaatacttctgacatacctgttgtgaacttttttaatgcatcaacattagactgcaactcttaatatatagtttctggttttaaaatgattatttcaggacatatgcattgtggactagcaatttggccaataatttggaaaaatca
gi|5 : atttttttcctaatttattaacatttatgattatatataaatatattatataatgataaattctgatattttggcaactttcagccattcacggctggcTTTTTTTCACC-TATATT-T-ATT-AACATTT-A---TG---ATAAATA-AGATATATTTA-T---TA-ATGATATAT----AA--A-----CAA-CAT-T-T-AT--------AA------A-AA-T---T---CAG-TAC-CC--TT-AAC----TT-AA--TCACGTACTTG---TTGG----GT-TT-T--T---------T---A----AA-CACTTT--ATA-TTG-G-CATGTTT-TAC-TGCACGTTA--TCAAT-A-G----A-ATAAACACACTG----TG-GACT-GTTT-----TAAT---AAAA---AT-C--AT----------ATA---T-TG---A-------------T-------------TA--ATA--CCTA--AATTAT-CCTA----G--------CTA-TG-TAC---CCT-TAT-CATC---T--AGTAA-T-A-CAAAT----TA---ATT--AA--T---TC-CTTAT--A-GAACAAATTTGTT-TTT----TGGGTT-T--ATGTATAT-AGAAAT---CTTAA-T-TG-GATATAATTATTTGGAAG-T-----ATTAAA-CTA-CTT-TCTGATAGACC-T-TG-T-TCTG-TGAA-C-T-TTT-TGAAT-GCATCA-AACCA-T-T-A------G------A-CTTGCTA--AA-CTCTTAAAAA--TATG-AGGTTCTAGTTGTT-AAA--ATGTAATTATTTT-TCA---GT-ACG--TA-TGCATTG-T-G--A-CTT-GTAA-TTGG-C-AA-AATG-TG--GGC-AAA-AATAca
gi|6 : taATTTTTTTTTTCACCCTATA-T-T-ATC-AACATTT-A---TG---ATAAATA-A-ATATATCTA-T-A-TA-GTGAT---T----CTT-A-----GAA-CAA-T-T-AT--------AA------A-AA-T---T---CAG-TAC-CC--TT-AA-----TA-AA--TC----ACTTG---TTTG----G--TT-T--T---------T---A----AA-TAC-TA--ATA--T--G-CATG-TT-CAC-T-CAAGTTA--T-GAT-A-G----A-A-AAACA-ACTG----TG-GACT-G--TAACTGTAAT---AAAA---AT-C--AT----------ATA-ATT-TG---A-------------T-------------TAC-TTACCCCTA--AA--ATCCCTA----GAC------CTA-TGCTAC---CCT-T-T-CATC---TTCAGTTA-T-AGCAAAT----TA---ATTAAAG--T-A-TC-CTTAT--AGAAAAAAATTTGTT-TTT----TG---T-C--ATGTAAAT-AGAAAG---CTTAATT-TG-GATA-----ATTTGG-AG-T-TTA-ATT-AA-CTA-C-T-TCTGATAGACCGT-TG-T-T-TG-TGAA-C-T-TTT-TGAAT-GCATCA-AA-CA-T-T-A------G------A-CTTGCTA--AA-CTCTT--GAA--TATG-AGGTTCTGG-T-TT-AAA--ATGT-ATTA-TTT-TCAG--GTAACA--TG-TGCATTG-T-G--A-TTA-GTAATTTGG-C-AA-AATG-T---GGC-AAA-AATACA
gi|7 : T-AA-----TA-AA--TC----ACTTG---TTTG----GGTTTGT--T---------T---A----AAACAC-TTT-ATA-TT--G-CATG-TT-CAC-TGCAAGTTA--T-GAT-A-GCTAGA-ATAAACA-ACTG----TG-GACT-G--T-----TAAT---AAAA---AT-C--AT----------ATA-ATT-TG---A-------------T-------------TAC-ATACCCCTA--AATTATCCCTA----GAC------TT--TGCTAC---CCT-T-T-CATC---TTCAGTTA-T-A-CCAAT----CA---ATT--AT--T---TC-CTTAT--AAGAACAAATTTGTTACTT----TG---TGT--A-GTATATAAGAAAT---C--AA-T-TG-GATT-----AATTGG-AGTT-TTA-ATC--A-CTA-C-TGTCTGATAGA-C-T-TG-T-T-TG--GAA-CTT-TTT-TGAAT-GCATCACAA-CA-T-T-A------G------A-CTTGCTA--AA-CTCTT-AAAA--TATG-A-GTTCTGGTT-TT-AAAATATGT-ATTA-TAT-TCA---GT-ACA--TA-TGCATTA-T-G--A-CTA-GTATTTTGA-C-AA-AATGTT---GGC-AAA-AATACA
gi|8 : -CAC-CT--ATA-TT--G-CATG-TT-CAC-TGCAA-TTA--T-AAT-A-G----A-ATAAACA-ACTG----TG-GACT-G--T-----TTAT---AAAA---AT-C--AT----------ATA-AGT-TG---A-------------T-------------TAC-ATACCCCTA--AATTATCCCTA----GAC-------TA-TGCTAC---CCT-T-T-CATC---TTCAGTTA-T-A-CAAAT----TAT--ATT--AT--T----C-CTTAT--AG-AACAAATTTGTT-TTT-----G---T-T--ATGTATAT-AGAAAT---CTAAATT--G-GATA-----ATTTGG-AG-T-TTA-ATT-AA-CTA-C-T-TCTGATAGACC-T-TG-T-T-TG-TGAA-C-T-TTT-TGAAT-GCATCA-GA-CA-T-T-A------G------A-CTTGC-A--AA-CTCTT-AAAA--TATG-A-GTTCTGGTT-TT-AAA--ATGT-ATTATTTT-TCAG--GT-ACG--TA-TGCATTG-T-G--A-CTA-GTAATTTGG-C-AA-AATG-T---GGCAAAA-AATACA
gi|9 : tttTTTTTTTCACC-TATATT-TTATT-CACATTT-A---TA---ATTAATG-A-AT-TATGTA-TTA-TG-AT--T---T----AAT-AATAATGAA-CAT-T-T-AG--------AA------A-AA-T---T---CAG-TAC-CC--TT-AA-----TA-GA--TC----ACTTG---TTTG----G--TT-T--T---------T---T----AA-CAC-TT---CA-TT--G-TATG-TT-CAT-TGCTAGTTA--T-GGT-A-G----A-ATAAACA-ACTG----TG-GACT-T--T-----TAAT---AAAA----T-C--AT----------ATA-ATT-TG---A-------------TAATTTGGAGCAATTAC-ATACCACTA--AATTATCCCCA----GAC------CT-------C---CCT-T-T-CATC----TCAATTA-T-A-CAAACCATGCA---ATT--AC------TC-CTTAT--A-GAACAAGTTTGTT-TTCGTTATG---T-T--ACGTATAT-AGACAT---CTTAA-T-TG-GATA-----ATTTGG-AG-T-TGATTTT-AA-CTA-C-T-T-TGATAGACC-T-Tc
blockSeqs : T C CT T T GGATA . G T T . G TTAAAAATAA . G A T T GTTGAT T A ATT . C . . T C . CA ACGT GGA TTTAT G AT TTTTTT A T TGA A TT . G T C CA C . A CTAG G C TCAC T C TT AACTG TAA . CGA GCAG C C . CAATTTGGAGCAAT T TA . GTGAT T . A A . CGC . A G CATG TTA AA AAGTA G GAG C A GTTAT GGT G . A . T G . TAATT A TT T A . . T G G G . A C G T T . T . C C . . T ATGCAGG . . A A GA . G G TG AT A T . GT A CA T T G GT . A C . T TG A .
blockSeqs : T C TT . . TGATT . . . . . . TAATAATAAT . . . . . . . . A . . . . . . . . . . TTG . . TTTAA . T CA . G . T . . . . . . . . . . . . . . TAA . TC . . . . TAATTTGGAGCAAT . . . CCTA A . . . . . . . . . T . GTGA . AGG T . T . . . A . T T . C . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GTGCAGA . . . . . . G . A . . T . A . . . . . . . . . . . TT . .
blockSeqs : T C T . . TG . . . . . . ATATAAA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GGT . . TTTA . . TA . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . C . . . . T . . . CTT T . . . . . . . . . . . CTGA . AGA T . T . . . . . T T . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GTGCAGG . . . . . . A . A . . T . A . . . . . . . . . . . T . .
blockSeqs : C C T . . TA . . . . . . TAATAA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AG . . TTTA . . TA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . T . . . CTA A . . . . . . . . . . . GTA . AAG T . T . . . . . T T . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . G . T . . T . A . . . . . . . . . . . T . .
blockSeqs : T . T . . TG . . . . . . CAATAA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GT . . TA . . TA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . T . . . CTA A . . . . . . . . . . . CT . AG T . T . . . . . . T . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . G . T . . T . G . . . . . . . . . . . T . .
blockSeqs : T . C . . TG . . . . . . TTATA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . TT . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . T . . . CTA A . . . . . . . . . . . TA . AG T . T . . . . . . T . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . G . T . . T . A . . . . . . . . . . . T . .
blockSeqs : T . T . . TG . . . . . . TAATA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . TA . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . T . . . CTT A . . . . . . . . . . . AT . AG . . T . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . G . T . . T . G . . . . . . . . . . . T
blockSeqs : . . T . . TG . . . . . . TAATA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . TA . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . T . . . CTA . . . . . . . . . . . . TT . AG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . G . T . . . . G . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . T . . TA . . . . . . TCTTA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . TA . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . T . . . CCT . . . . . . . . . . . . TT . AG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . G . T . . . . G . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . T . . . . . . ATAA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . TA . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . TA . . . . . . . . . . . . C . T . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . T . . . . G . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . TA . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . G . . TA . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . G . . TA . . A . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . TT . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqCons : TG****** TAATAA************ ******** *** ** ***** TA**************** A** *** C*** ********** *** ** **** CTN******** *** NT***** AG*** T**** ** *** T* T** ** G** T****
originalCons : ATATTTTTTTTCACCCTATATT-T-ATT-AACATTT-A---TG---ATAAATA-A-ATATATTTA-T-A-TA-ATGAT---T----AAT-A-----GAA-CAT-T-T-AT--------AA------A-AA-T---T---CAG-TAC-CC--TT-AA-----TA-AA--TC----ACTTG---TTTG----G--TT-T--T---------T---A----AA-CAC-TT--ATA-TT--G-CATG-TT-CAC-TGCAAGTTA--T-GAT-A-G----A-ATAAACA-ACTG----TG-GACT-G--T-----TAAT---AAAA---AT-C--AT----------ATA-ATT-TG---A-------------T-------------TAC-ATACCCCTA--AATTATCCCTA----GAC------CTA-TGCTAC---CCT-T-T-CATC---TTCAGTTA-T-A-CAAAT----TA---ATT--AN--T-A-TC-CTTAT--AGGAACAAATTTGTT-TTT----TG---T-T--ATGTATAT-AGAAAT---CTTAATT-TG-GATA-----ATTTGG-AG-T-TTA-ATT-AA-CTA-C-T-TCTGATAGACC-T-TG-T-T-TG-TGAA-C-T-TTT-TGAAT-GCATCA-AA-CA-T-T-A------G------A-CTTGCTA--AA-CTCTT-AAAA--TATG-AGGTTCTGGTT-TT-AAA--ATGT-ATTATTTT-TCAG--GT-ACA--TA-TGCATTG-T-G--A-CTA-GTAATTTGG-C-AA-AATG-T---GGC-AAA-AATACA
finalCons : ATATTTTTTTTCACCCTATATT-T-ATT-AACATTT-ATG------ATAAATA-A-ATATATTTA-T-A-TA-ATGATTAATAA------------GAA-CAT-T-T-AT--------AA------A-AA-T---T---CAG-TAC-CC--TT-AA-----TA-AA--TC----ACTTG---TTTG----G--TT-T--TTA----------------AA-CAC-TTA--TA-TT--G-CATG-TT-CAC-TGCAAGTTA--T-GAT-A-G----A-ATAAACA-ACTG----TG-GACT-G--T-----TAAT---AAAA---ATC---AT----------ATA-ATT-TG---A-------------T-------------TAC-ATACCCCTA--AATTATCCCTA----GACTN--------TGCTAC---CCT-T-T-CATC---TTCAGTTA-T-A-CAAAT----TA---ATT--ANT-----TC-CTTATAG---AACAAATTTGTT-TTTT----G---T-T--ATGTATAT-AGAAAT---CTTAATTT-G-GATA-----ATTTGG-AGT--TTA-ATT-AA-CTA-C-T-TCTGATAGACC-T-TG-T-T-TG-TGAA-C-T-TTT-TGAAT-GCATCA-AA-CA-T-T-A------G------A-CTTGCTA--AA-CTCTT-AAAA--TATG-AGGTTCTGGTT-TT-AAA--ATGT-ATTATTTT-TCAG--GT-ACA--TA-TGCATTG-T-G--A-CTA-GTAATTTGG-C-AA-AATGT----GGC-AAA-AATACA
Alignments
lowQualScore : 1 11111111 111 11111 1111111 111111111111111111 111 111 1111 2222222222 222222222222222222222222222 11111111111 1111 1111 222222222 1 1 1 11111 1111111111111 11111
lowQualScore : 3 0 5 888 3 3 99999999 0 3 3 3 2 2 2 888888 7777 3 3 3 3 3 55555555 999999 3 3 000 666 3 3 44 3 00000 2 33 5555 444 5555555 2 33 777777777777777777 5 2 888 2 33 5 2 2 2 2 33 2 2 2 5555 2 2 6666 3 3 77777 44 555 555 0000 1111111111 3 3 555 777777777777777777777777777 6 77 77777777777 55 3 1111 0 6 666 3 3 3 666 1 3 3 3 7777 333333333 777 88 4 2 4 99999 777 4 55 3 777 1 0 99 4 55555 4 555 4 4 4 4 4 4 3 3 4 4 4 8 8 3 3 3 3 3 3 3 3 3 8888888888888 3 44 3 3 44 3 2 3 55 44 3 7 3 999 3 44 3 3 3 44 3 3 3 3 3 44444 5 5
lowQualScore : . . . ... . . ........ . . . . . . . ...... .... . . . . . ........ ...... . . ... ... . . .. . ..... . .. .... ... ....... . .. .................. . . ... . .. . . . . . .. . . . .... . . .... . . ..... .. ... ... .... .......... . . ... ........................... . .. ........... .. . .... . . ... . . . ... . . . . .... ......... ... .. . . . ..... ... . .. . ... . . .. . ..... . ... . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ............. . .. . . .. . . . .. .. . . . ... . .. . . . .. . . . . . ..... . .
lowQualScore : 8 7 0 555 6 6 44444444 3 6 6 6 9 9 9 888888 7777 6 6 3 3 3 44444444 666666 3 6 000 444 3 3 66 1 88888 9 99 7777 444 6666666 5 44 555555555555555555 0 5 666 5 44 0 5 5 5 5 44 7 7 7 7777 7 7 5555 1 1 77777 22 000 888 8888 7777777777 3 3 000 444444444444444444444444444 2 99 99999999999 00 6 5555 5 6 444 6 6 6 444 3 6 6 6 7777 444444444 000 88 0 1 0 33333 000 0 55 3 888 9 2 00 4 66666 4 333 4 0 0 0 0 0 6 6 0 0 0 0 0 6 6 6 6 3 3 3 3 3 6666666666666 1 22 1 1 22 1 8 1 66 22 3 3 3 999 1 22 1 1 1 22 1 1 1 1 1 88888 7 7
consensus : ATATTTTTTTTCACCCTATATT-T-ATT-AACATTT-A---TG---ATAAATA-A-ATATATTTA-T-A-TA-ATGATT----AATAA----G-AA-CAT-T-T-AT--------AA------A-AA-T---T---CAG-TAC-CC--TT-AA-----TA-AA--TCAC----TTG---TTTG----G--TT-T--T---------T---A----AA-CAC-TTT-ATA-TT--G-CATG-TT-C-AC-TGCAAGTTA--T-GAT-A-G----A-ATAAACA-ACTG----TG-GACT-GT-----T--AAT---AAAA---AT-C--AT----------ATA-ATT-TG---A-------------T-------------TAC-ATACCCCTA--AATTATCC--------C--TA--GAC-T--ATGCTAC---CCT-T-T-CATC---TTCAGTTA-T-A-CAAATTA----ATTAN----T--TCCT---TAT-AGAACAAA-TTTGTT-TTT----TG---T-T--ATGTATAT-AGAAAT---CTTAATT-TG-GATA-----ATTTGG-AG-T-TTA-ATT-AA-CTA-C-T-TCTGATAGACC-T-TG-T-T-TG-TGAA-C-T-TTT-TGAAT-GCATCA-AA-CA-T-T-A------G------A-CTTGCTA--AA-CTCTT-AAAA--TATG-AGGTTCTGGTT-TT-AAA--ATGT-ATTATTTT-TCAG--GT-ACA--TA-TGCATTG-T-G--A-CTA-GTAATTTGG-C-AA-AATG-T---GGC-AAA-AATACA
Reference ( family-2386 ) : ATATTTTTTTTCACCCTATATT-T-ATT-AACATTT-A---TG---ATAAATA-A-ATATATTTA-T-A-TA-ATGATT----AATAA----G-AA-CAT-T-T-AT--------AA------A-AA-T---T---CAG-TAC-CC--TT-AA-----TA-AA--TCAC----TTG---TTTG----G--TT-T--T---------T---A----AA-CAC-TT--ATA-TT--G-CATG-TT-C-AC-TGCAAGTTA--T-GAT-A-G----A-ATAAACA-ACTG----TG-GACT-GT-----T--AAT---AAAA---AT-C--AT----------ATA-ATT-TG---A-------------T-------------TAC-ATACCCCTA--AATTATCC--------C--TA--GAC-T--NTGCTAC---CCT-T-T-CATC---TTCAGTTA-T-A-CAAATTA----ATTAN----T--TCCT---TAT-AGAACAAA-TTTGTT-TTT----TG---T-T--ATGTATAT-AGAAAT---CTTAATT-TG-GATA-----ATTTGG-AG-T-TTA-ATT-AA-CTA-C-T-TCTGATAGACC-T-TG-T-T-TG-TGAA-C-T-TTT-TGAAT-GCATCA-AA-CA-T-T-A------G------A-CTTGCTA--AA-CTCTT-AAAA--TATG-AGGTTCTGGTT-TT-AAA--ATGT-ATTATTTT-TCAG--GT-ACA--TA-TGCATTG-T-G--A-CTA-GTAATTTGG-C-AA-AATG-T---GGC-AAA-AATACA
gi|1 : CCATATC-T-ACT-AG-ATTT-A--------ATAAATATA-ATATATTAA-T-AATA-ATGATT----AATAA----G-AAGCCT-C-T-ATTATAAACGAA------A-AA-T---CATGCAG-TACGCCAACT-AAAAATATACAA--TCA-----TTG---TTTG----G--TT-T--TCTCTTTCTTT---A----AGGCAC-TTT-ATA-TT--GGCATG-TT-C-AC-TGCA-GTTA--T-GATCA-G----A-ATCAACA-ACTG----TG-G-CT-GT-----T--TAT---AAAACAAAT-CCAATCCCCTCTCCTATG-ACT-TATCCA-------------T-------------AGCGATACCCATCC-AATTATCCTACGACGAC--TACCAAC-T--AGGCTACGAACTT-C-TGCATA---TTCAGTTAAT-A-CAAAATT----ATTCC----T--TCTTATTTAT--GAACA---TTCGTT-TTT-----G---T-TCTATGTACATTACGAACAGGCTTAATTCTGCGATA-----ATTTGG-AG-TATTA-ATT-AAGCTAGC-T-TCTGATAGAAA-T-TGAT-T-TGCTGAAGC-TCTTT-TGAATCGCATCA-AG-CAATAT-A------G------AACTTGCTATAAA-CTCTT-AAAA--TATGCAGGTTCTGGTT-TT-AAA--ATGT-ATTTTTCTATC-GCCGT-ACA--T--TGCATTG-T-G--AGCTG-AAAATTGGG-CAAA-AATGATGGGGGC-AAACAATAC
gi|10 : attatttttgccgctataacttttataataaTA----ATTAC----T---CCT---TATGAGAACAAA-TTTGCT-TTT-----G---T-T--TTGTATAT-AGAAAT---CTTAATT--G-GATA-----ATTTTG-AG-T-TTA-TTT-AA-CTA-C-T-TCTG
gi|10 : acaaagtactag---TTTGA---G--TT-TATT---------T---A----AC-TAC-TT--CTG-TTTTG--GTG-TT-C-AC-TCTAGAGCA--T-GGT-A-G----A-GTAAACA-Attttggtgttcactctagagcatggtagagtaaacaatgcatgtttttcataaactcaataaacgtgtgtattgtgaactttttgaatgcatcaaacatcaatgcaggccttgctaaaactattaagatataaggctgtggtttaaaatttaatatttttcaagtacgtatgcattgtgactagtaatttggcaaaata
gi|10 : acaaagtactagtaattactccttatgagaacaaatttgcttttgttttgtatatagaaatcttaattggataatATAAACG-TGTG-TAT-TG-TGAA-C-T-TTT-TGAAT-GCATCA-AA-CA-T-C-AATGCAGG------C-CTTGCTA--AAACTATT-AAGA--TATA-AGGCTGTGGTT-T--AAA--ATTT-AATATTTT-TCAA--GT-ACG--TA-TGCATTG-T-G--A-CTA-GTAATTTGG-C-AA-AATtgcatgtttttcataaactcaataaacgtgtgtattgtgaactttttgaatgcatcaaacatcaatgcaggccttgctaaaactattaagatataaggctgtggtttaaaatttaatatttttcaagtacgtatgcattgtgactagtaatttggcaaaata
gi|11 : acaaagtactagtaattactccttatgagaacaaatttgcttttgttttgtatatagaaatcttaattggataattttgagtttatttaactacttctgttttggtgttcactctagagcatggtagagtaaacaatgcatgtttttcataaactca-T-T-ATT-------AG------A-AA-TA--T---CAACTAC-AT--CT-GA-----GA-AA----AC----TAA---TTTG----T--CT-T--T---------T---T----AA-CAT-TTC-AT--TT--G--ATG-TC-C-AC-TGTAGAGTA--T-GGT-A-G----A-ATAAACA-GCTa
gi|11 : attgaataactgatagcaaaacaatccctttcattgc-T-TTT-TTAAT-GCATCA-AT-CA-T-T-A------GTGCAGAA-CTTCCTA--AC-CAATT-AAAA--TATA-AGGCTCTGAAT-TA-AAA--ATGC-ATTGTTTT-T-AA--GT-ACA--TA-TGTATTG-T-G--A-CTA-GTAATTTGG-C-AA-GAagataatttttcccataaactagacaaacttaaaaatatattttttaatgcatcaatcattagtgcagaacttcctaaccaattaaaatataaggctctgaattaaaaatgcattgtttttaagtacatatgtattgtgactagtaatttggcaagacata
gi|12 : attgaataactgatagcaaaacaatccctttcattgcttattagaaatatcaactacatctgagaaaactaatttgtctttttaacatttcatttgatgtccactgtagagtatggtagaataaacagctagataatttttcccataaactagacaaacttaaaaatataATATTTTTTTCT--CCTATATT---ATT-AACATTT-A---TG---ATATATA-A-ATATATTTATT-A-TA-ATGATcata
gi|12 : ct-A-TA-ATGATT----AATAA----G-AA-CAT-T-T-AT--------AA------A-AA-T---T---CAG-TAC-CC--T--AA-----TA-AA--TCAG----TTG------G----G--TT-T--T---------TTTAA----AA-CAC-TTT-ATA-TT--G-CATG-TTTC-AC-TGCAAGTTACAT-GAT-A-G----A-ATAAACA-ACTG----TG-GATT-G------T--AATTAAAAAA---AT-----T----------ATA-ATT-TG---A-------------T-------------TAC-ATACCCatattgattgattttggcaacttttcagccattcacggcggcataatgattaataagaacatttataaaaattcagtaccctaataaatcagttgggtttttttaaaacactttatattgcatgtttcactgcaagttacatgatagaataaacaactgtggattgtaattaaaaaaattataatttgattacataccc
gi|13 : ctatatttttttctcctatattattaacatttatgatatataaatatatttattataatgatatattgattgattttggcaacttttcagccattcacggcggc------A-CTTGCTA--AA-CTTTT-AAAA--TATG-AAGTTCTGGTT-TA-AAA--ATGT-ATTATTTT-TTAA--GT-ACA--TA-TGCATTG-T-G--A-CTA-GCAATTTAG-C-AA-AAT
gi|14 : cctttttatatataaggaaaaactttttctgtctccttataataaacatggaaatcataagaagtaacaaaggaggtgccaaatctgctaccaagggtatatgtatatcaagcatactacctgaaagacactgctgtgtaaagaggtccagtgcagaTT-AA-CTA-C-T-TCTGACATACC-T-TG-T-T-TG-TGAA-C-T-TTTTTGAAT-GCATCA-AA-CA-T-T-A------G------A-CTTGCTA--AA-CTCTT-AAGA--TATG-A-GTTCTGGTT-TT-AAA--ATGaaa
gi|15 : AG--GT-ACACATA-TGCATTG-C-AGTA-CTAAGTAATTTGG-C-AA-Aatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccagacatggcattagagcaaactaattcaaaaataa
gi|16 : cttttaatatataagagcaaaccttttttctgtttcatattaataaaaacacgcaaagttcatgttaatacagaagtaacaaagga-AA--TCAC----CTG---TTTG----T--TT-T--T---------T---A----A--CAC-TT---TA-TT--G-CATA-TT-C-AT-TGCCAGTTA--T-GGT-A-G----A-ATCAACA-ACTG----TG-GACT-GT-----T--AAT---AAAA---AA-C--AT----------ATA-ATT-TG---ACAATTTGGAGCAAT-------------TAC-ATACCCCTA--GATttatatata
gi|17 : TTTTTCATA-TATATT-T-ATT-CACATTT-A---TA---ATACATG-A-ATG-ATTAA-T-A-TG-AAAGTT----TATAA----G-AA---T-TAC-AT--------AAGTTGATA-AT-T---T---CAG-TAC-CC--AT-AA-----TA-AA--TCAC----TTA---TTTGTT--G--TT-T--T---------
gi|18 : ata-AA-CA-T-T-A------GTGCAGGA-CTT--CA--AA-CACT--AAAA--TAAA-AG--TCTGGTT-TTGAAA--ATGT-ATTATTTT-TCAA--GT-ACA--TGTTGAGTAG-T-G--A-CT--GTAATTTGG-T-AA-AATct
gi|19 : ATATTATTTTTTACC-TATATT-T-ATC-AACATT--A---TG---ATTAATA-A-ATATATTTA-T-A-TG-AT-----------AA----G-AA-CAT-T-TTAT--------AA------ATAA-T---T---CAG-TAC-CC--TT-AA-----TA-AA--TCAC----TTaac
gi|2 : tTATTTTTTT----CCTATATT-T-ATTTAACATAT-AGGATA---ATAAATA-A-ATATA-TTA-T-A-TAGATGATT----AATAtt
gi|2 : -A-TA-ATGAT------ATAA----G-AA-AAT-T-------------AA------A-AA-TATTT---CAG-TAC-C-------A-----TA-AACATCAA----TTGGGATTTC-------TT-T--T---------T---A----AA-T-C-CT--AT--TT--G-CATGGTT-C-AC-TGCAATTAA--T-GAT-A-G----A-ATAAAC--ACTG----T--GATT-GT-----T---AC---ACAC---AT-CGAGT----------ACACATT-GA---A-------------T-------------TACTATACCTTAA--AGTTA--------------GA--GAG-TGATTGTT-----CATAT-T-CATC---TC--GTTA-TAA-CACATTA----ATTAG----T--tatgatgatttggcaactttcagcatttcggtcggcataatgatataagaaaattaaaaatatttcagtaccataaacatcaattgggatttctttttaaatcctatttgcatggttcactgcaattaatgatagaataaacactgtgattgttacacacatcgagtacacattgaattactataccttaaagttagagagtgattgttcatattcatctcgttataacacattaattagtgattattgaaggcacatattagagctcgttgagctgataaaatatcagagttatggagaagaggataataatattatctcacactagagagttactctactcgcacattatcttgtttggtgaatctaatcgaatgaatcaaacatttaaatgctaaaccttaaaagatatgaggttcggtttaaaatgtattatttcagtgtacatagcattgttgactagcaatttgcaaaatgtgagaatcacaagt
gi|2 : tatttttttcctatatttatttaacatataggataataaataaatatattatatagatgattaatatatgatgatttggcaactttcagcatttcggtcggcATC-T-TG-T-T-TGGTGAATC-T-AAT-CGAAT-GAATCA-AA-CA-T-TTA------A------A---TGCTA--AA-C-CTT-AAAAGATATG-AGGTTC-GGTT-T--AAA--ATGT-ATTA--TT-TCAGT-GT-ACA--TA--GCATTGTT-G--A-CTA-GCAATTT-G-C-AA-AATG-T---Ggattattgaaggcacatattagagctcgttgagctgataaaatatcagagttatggagaagaggataataatattatctcacactagagagttactctactcgcacattatcttgtttggtgaatctaatcgaatgaatcaaacatttaaatgctaaaccttaaaagatatgaggttcggtttaaaatgtattatttcagtgtacatagcattgttgactagcaatttgcaaaatgtgagaatcacaagt
gi|20 : tatttttttcctatatttatttaacatataggataataaataaatatattatatagatgattaatatatgatgatttggcaactttcagcatttcggtcggcataatgatataagaaaattaaaaatatttcagtaccataaacatcaattgggatttctttttaaatcctatttgcatggttcactgcaattaatgatagaataaacactgtgattgttacacacatcgagtacacattgaattactataccttaaagttagagagtgattgttcatattcatctcgttataacacattaattagtgattattgaaggcacatattagagctcgttgagctgataaaatatcagagttatggagaagaggataataatattatctcacactagagagttactctactcgcacatt----TTG---GTTG-------TT-T--T---------T---A-------CAC-TT--CTT-TT--T-GATG-TT-C-AC-TGTAGAGCA--T-GGT-A-G----A-ATAAACA-ACTG----GA-AAAT-GT-----T--agaatcacaagt
gi|21 : aTG---TTGG----G--TT-T--T---------TTT-A----AA-CAC-TTTGATA-TT--G-CATG-TT-T-AC-TGCAAGTTA--T-AAT-A-G----A-ATAAACA-ACTGTCACTG-GACT-GT-----T--AAT---AAAA---AT-C--AT----------ATA-ATT-TG---A-------------tttcattaactcaacaagagaaattgctctgct
gi|22 : ---A-------------T-------------TAC-ATACCCCTA--GATTATCC--------T--TA--GAC-T--T-----C---CCG-T-T-CATC---TTCAGTTA-T-A-CAAACTA----ATTAC----TGATCCT---TAT-AGAACAAA-TTTG-T-TTT----TG---T-T--AT
gi|23 : caATATTGTTTTTCACC-TATATT-C-ATT-AACATTT-A---T-------AATA-A-ATATATTTA-T-A-AA-ATGATTTAAAAATAA----G-AA-CAT-T-T-AT--------AA------A-
gi|24 : t-TAC-CC--TT-AA-----TA-AA--TCAC----TTG---TTTGTTTAT--TT-T--T---------T---A----AA-CACTTT--ATA-TT--G-CATG-TT-C-AC-TNNNNNNNA--
gi|25 : ---A-------------T-------------TAC-ATACCCTTA--AATTATCC--------CTATA--GAC-T--T-----C---CTT-T-T-CATC---TTCAGTTA-T-A-Cac
gi|3 : tgtgcaATATTTTTTTCCAC--TATATTCT-ATT-AACATTTTA---TG---ATTAATA-A-A-ATCTTTA-T-A-TA--TGATC----AATAA----G-CA-CCTGT-T-AT--------AA------A-AAAT---T---TAG-TAC-CC--TTTAA-----TA-AA--TCAC----TTG---TTTG----G--TT-T--T---------T---TTTTTAA-C-T-TT--ATAATT--G-CATG-TT-C-ACCTGCAAGTTA--T-GAT-AAG----AGATAAACA-ACTG----TG-GACTCGT-----T--AATT--AAAA---ATTC--ATGCAG------ATA-CTTCTG---A-------------T-------------TAC-CTACCCTTATAAGTTATCC--------C--TA--GAC-T--ATGCTAC---C-T-T-T-CATCCGCTTCAGTTA---A-CAAATTATTA-ATCAAAGTAT--TGCT---TAT-AGAACAAA-TTTG-T-TTT----TG---T-T--ATGTATATAAGAAAG---CTTAATT-GG-GATAC----ATTTGG-AG---TTA-ATT-AA-CTA-C-T-TCTGATAGACC-T-TG-T-T-GG-TGAA-C-T-TTT-TGAAT-GCATCA-AA-CA-T-T-A------G------A-CTTGCTA--AA-CTCTT-AAAA--TATG-AGGTTCTGGTT-TT-AAA--ATGT-ATTATTTT-TCAG--GT-ACA--TA-TGCATTG-T-G--A-TTA-GTAATTTGG-C-AA-AATG-T---GGC-AAA-AATAC
gi|4 : tATTTTTTT----CCTA-ATT-T-ATT-AACATTT-A---TGATTATATATA-A-ATATA-TTA-T-A-TA-ATGATA----AAT
gi|4 : -A-TA-ATGATT----AATA-----G-AA-CAT-T-T-AT--------AA------A-AA-T---T---CAG-TAC-C----T-AA-----TA-AA--TCAG----TTG------G----G--TT-T--T---------TTT-A----AA-CAC-TTT-ATA-TT--G-CATG-TT-C-AC-TGCAAGTAC--T-GAT-A-G----A-ATAAACA-A-TG----TGTGATT-GT-----T--AATTAAAAAA---AT-----T----------ATA-ATT-TG---A----------------------------AA-ATACCCTTA--AATTATGC--------T--TA--GAC-T--ATGCTTC---CCT-T-T-CATC---TTC--TTA-T-A-CAATTTA----ATTA--------TCTT---TAT--TAACACA----G-T-TTT----TG---T-T--ATGTATAT--GAAAT---CTTAA-T-TG-GAT------ATTTGG-AG-T-TTA-ATT-AA-ATA-C-T-TCTGACATACC---TG---T-TG-TGAA-C-T-TTT-TTAAT-GCATC--AA-CA-T-T-A------G------A-C-TGC----AA-CTCTT-AATA--TAT--AGTTTCTGGTT-TT-AAA--ATG--ATTA--TT-TCAG--G--ACA--TA-TGCATTG-TGG--A-CTA-GCAATTTGGCC-AATAATT-T---GG--AAA-AATtctgatattttggcaactttcagccattcacggctggcataatgattaatagaacatttataaaaattcagtacctaataaatcagttgggtttttttaaacactttatattgcatgttcactgcaagtactgatagaataaacaatgtgtgattgttaattaaaaaaattataatttgaaaatacccttaaattatgcttagactatgcttccctttcatcttcttatacaatttaattatctttattaacacagtttttgttatgtatatgaaatcttaattggatatttggagtttaattaaatacttctgacatacctgttgtgaacttttttaatgcatcaacattagactgcaactcttaatatatagtttctggttttaaaatgattatttcaggacatatgcattgtggactagcaatttggccaataatttggaaaaatca
gi|5 : atttttttcctaatttattaacatttatgattatatataaatatattatataatgataaattctgatattttggcaactttcagccattcacggctggcTTTTTTTCACC-TATATT-T-ATT-AACATTT-A---TG---ATAAATA-AGATATATTTA-T---TA-ATGATA----TATAA----ACAA-CAT-T-T-AT--------AA------A-AA-T---T---CAG-TAC-CC--TT-AAC----TT-AA--TCACGTACTTG---TTGG----G--TT-T--T---------TT--A----AA-CAC-TTT-ATA-TT--GGCATG-TT-TTAC-TGCACGTTA--TCAAT-A-G----A-ATAAACACACTG----TG-GACT-GT-----TTTAAT---AAAA---AT-C--AT----------ATA---T-TG---A-------------T-------------TA--ATACC--TA--AATTATCC-----------TA--G-C-T--ATG-TAC---CCT-TAT-CATC---T--AGTAA-T-A-CAAATTA----ATTAA----T--TCCT---TAT-AGAACAAA-TTTGTT-TTT----TGGGTT-T--ATGTATAT-AGAAAT---CTTAA-T-TG-GATATAATTATTTGGAAG-T-----ATTAAA-CTA-CTT-TCTGATAGACC-T-TG-T-TCTG-TGAA-C-T-TTT-TGAAT-GCATCA-AACCA-T-T-A------G------A-CTTGCTA--AA-CTCTTAAAAA--TATG-AGGTTCTAGTTGTT-AAA--ATGTAATTATTTT-TCA---GT-ACG--TA-TGCATTG-T-G--A-CTT-GTAA-TTGG-C-AA-AATG-TG--GGC-AAA-AATAca
gi|6 : taATTTTTTTTTTCACCCTATATT---ATC-AACATTT-A---TG---ATAAATA-A-ATATATCTA-T-A-TA-GTGATT----CTTA-----G-AA-CAA-T-T-AT--------AA------A-AA-T---T---CAG-TAC-CC--TT-AA-----TA-AA--TCAC----TTG---TTTG----G--TT-T--T---------T---A----AA-TAC-TA--ATA-T---G-CATG-TT-C-AC-T-CAAGTTA--T-GAT-A-G----A-A-AAACA-ACTG----TG-GACT-GTAACTGT--AAT---AAAA---AT-C--AT----------ATA-ATT-TG---A-------------T-------------TAC-TTACCCCTA--AA--ATCC--------C--TA--GACCT--ATGCTAC---CCT-T-T-CATC---TTCAGTTA-T-AGCAAATTA----ATTAAAG--TA-TCCT---TAT-AGAAAAAAATTTGTT-TTT----TG---T-C--ATGTAAAT-AGAAAG---CTTAATT-TG-GATA-----ATTTGG-AG-T-TTA-ATT-AA-CTA-C-T-TCTGATAGACCGT-TG-T-T-TG-TGAA-C-T-TTT-TGAAT-GCATCA-AA-CA-T-T-A------G------A-CTTGCTA--AA-CTCTT--GAA--TATG-AGGTTCTGG-T-TT-AAA--ATGT-ATTA-TTT-TCAG--GTAACA--TG-TGCATTG-T-G--A-TTA-GTAATTTGG-C-AA-AATG-T---GGC-AAA-AATACA
gi|7 : T-AA-----TA-AA--TCAC----TTG---TTTG----GGTTTGT--T---------T---A----AAACAC-TTT-ATA-TT--G-CATG-TT-C-AC-TGCAAGTTA--T-GAT-A-GCTAGA-ATAAACA-ACTG----TG-GACT-GT-----T--AAT---AAAA---AT-C--AT----------ATA-ATT-TG---A-------------T-------------TAC-ATACCCCTA--AATTATCC--------C--TA--GAC-T--TTGCTAC---CCT-T-T-CATC---TTCAGTTA-T-A-CCAATCA----ATTAT----T--TCCT---TATAAGAACAAA-TTTGTTACTT----TG---TGT--A-GTATATAAGAAAT---C--AA-T-TG-GATT-----AATTGG-AGTT-TTA-ATC--A-CTA-C-TGTCTGATAGA-C-T-TG-T-T-TG--GAA-CTT-TTT-TGAAT-GCATCACAA-CA-T-T-A------G------A-CTTGCTA--AA-CTCTT-AAAA--TATG-A-GTTCTGGTT-TT-AAAATATGT-ATTA-TAT-TCA---GT-ACA--TA-TGCATTA-T-G--A-CTA-GTATTTTGA-C-AA-AATGTT---GGC-AAA-AATACA
gi|8 : -CAC-CT--ATA-TT--G-CATG-TT-C-AC-TGCAA-TTA--T-AAT-A-G----A-ATAAACA-ACTG----TG-GACT-GT-----T--TAT---AAAA---AT-C--AT----------ATA-AGT-TG---A-------------T-------------TAC-ATACCCCTA--AATTATCC--------C--TA--GAC-T--ATGCTAC---CCT-T-T-CATC---TTCAGTTA-T-A-CAAATTAT---ATTA-----T--TCCT---TAT-AGAACAAA-TTTG-T-TTT----TG---T-T--ATGTATAT-AGAAAT---C-TAAAT-TG-GATA-----ATTTGG-AG-T-TTA-ATT-AA-CTA-C-T-TCTGATAGACC-T-TG-T-T-TG-TGAA-C-T-TTT-TGAAT-GCATCA-GA-CA-T-T-A------G------A-CTTGC-A--AA-CTCTT-AAAA--TATG-A-GTTCTGGTT-TT-AAA--ATGT-ATTATTTT-TCAG--GT-ACG--TA-TGCATTG-T-G--A-CTA-GTAATTTGG-C-AA-AATG-T---GGCAAAA-AATACA
gi|9 : tttTTTTTTTCACC-TATATT-TTATT-CACATTT-A---TA---ATTAATG-A-AT-TATGTA-TTA-TG-AT--TT----AATAATAATG-AA-CAT-T-T-AG--------AA------A-AA-T---T---CAG-TAC-CC--TT-AA-----TA-GA--TCAC----TTG---TTTG----G--TT-T--T---------T---T----AA-CAC-TT---CA-TT--G-TATG-TT-C-AT-TGCTAGTTA--T-GGT-A-G----A-ATAAACA-ACTG----TG-GACT-TT-----T--AAT---AAAA----T-C--AT----------ATA-ATT-TG---A-------------TAATTTGGAGCAATTAC-ATACCACTA--AATTATCC--------C--CA--GAC-------CT-C---CCT-T-T-CATC---T-CAATTA-T-A-CAAACCATGCAATTAC----T---CCT---TAT-AGAACAAG-TTTGTT-TTCGTTATG---T-T--ACGTATAT-AGACAT---CTTAATT--G-GATA-----ATTTGG-AG-T-TGATTTT-AA-CTA-C-T-T-TGATAGACC-T-Tc