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Reference ( gi|1 ) : TAAGT-TTCCGGAATA--A-TAATT--TTTGC---TTTGATCT----ACATT--ATG-TTTGATGAAATACTAATACAGA-CA-CA---GT-------------TTGTTC--TTGTT------TTGGGG-TTCT--CT--TTGCGCTGTTTTAAATTA-GTTT-ACC-TAAACA--CAATG--TCCGAAGA-ATGATT--TTATCGG------TGG-A------------T----------G-GTT---T----TTTTTTC-AACC-A-GTGTATGG-GGTAAA--TG-TGTT-AACA--A-TA-A-A------AA-----TATCTTCA----T--A---------------TT--------------------T--------------------CCGAAAC-TC--AA--C----CTCAATATGAAGTGCCACAATACAACCAATCTAAATGATC-AT-TAAGGAATTTGAGG--ATTTT-----T----CATGTCG-CA--CAA-TC---------AGGTTT---T-CAA-C--AGC--T-------------A--------------T-------GGG--GAGA----GG--G--G-G--G-----CGTGG--ATCAA--TC--CCCAG--AGG-CAA-TGAGTTTG-GAGAC---T-C--CGCT-G--T-TA--T-GCC-T-----CCAAT-GT-GC--CC-AT-----A--T--AA-GCCCT--------GATGAGGGC--A---T--G-GG-GT-G-AA--TCC---CC---------T------TGT---------------G-TTAT--AC------TAG--A------TCCTCT--CC--CCCT--TCCCCCTCAG--TA------G--GTTCT-CC---T-AGAA-GAT-CTGC-ATG-TA-AA--T----T----A-T-G---CCTTGC-AATTTGGA--TATA----GTC-AATTCGTG-TA--TGGT-A-TCAT--A-ATTT--C----A-TTATT-GGTA--TAAG---GAATATTCTT---TCTTTGC--TTTAAATA-AT-A---AC--T--A---G------A-TAAT-ATAT--C-----A------AGA-TA-C---A-A-TT---------T-TCC-TTGGCAAGC-T-C--AT-T--CAA-TTCAG-T--A--GATGA-A--TG-AC-TGAT--AAA-A-G-A----AG------CG--A-TATATCAAAA--GA-TATT--G-A-T-AA-AATC-T-CA-TCT-AACCATGCACGT-ATATT------TGTTGT-CT-CA--A----AG--TTTT-CTTACTA--TAATGGTTAG-GGAAT-A-----TA----A--CCACCCCTC--T--AAAAAAA-AA---AGG-GGGGGGGGGGGG---TCCGATG-GAAATTT-GAA-AAT-AAAATCCAGTCCGAA-CACGTAA--GG-GGGAAGTCT-CACT-ATGG-TGGT
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gi|9 : -----TATCT-CA----T--A---------------TT--------------------T--------------------CCGAAAC-TC--AGACC----CTCAATA--------------ACAA---ATCTAACTGG---AT-CAA--AAC--GAG-------T-----T----CTTGTC--CAACCGA-TC---------AGGTTT-----CAA-----GC--TTAAAGAAAAAAAAA--------------G-------GGG--GGGG----GG--G--G-G--GAGGAGCGTGG--ATCAA--TC--TCCAG--ATG-TA--TGAGATTGTGAGAC---T-T--TGCT-G--T-TG--TTGCC-T-----CGAGT-GT-GC--CCCAT-----A--T--AA-GCCCT--------GTTTAGGGC--AAT-T--G-GG-GT-G-AAATTCC---CCCCTAAGTTTT------TGTTTTTTTTTTTATAAAA-TTAT--AA------TGG--A----------CT--CC--CCTT----CCCCTCAG--TA------TATGTTCTTCC---C-AGAA-GAA-CTGC-ATGGTA-AAATT----TGCGCA-T-G---CCTTGCAAATTTGGA--TATC----GTC-AA-TGGTG-TA--TGGTAA-TCAT--ATATTT--T----A-TTATT-GG----TAAG---GAATATTCTT---TCTTTGC--TTTAAATA-AT-T---ACAAT--A---G------A-TGAT-ATCA--A-----A------AGG-TA-A---C-A-TT---------T-TCCTTTGACAAGC-TCC--AT-T--C-A-TTCAG-T-----GATGA-A--TG-AC-TGAT--AAA-tta
gi|15 : ----T--A---------------TT--------------------T--------------------CCGAAAC-CC--AG--C----CTCAATATCAAGTGCCACAATACAACCAATCTAAATGATC-AT-AAAAGAATCTGATG--TTTTT-----T----CATGCCG-TA--CGA-TC---------AGGTTT---------C--AGC--TTAAA---------A--------------A-------GGG--GGGA----GG--G--G-G--------CATGG--ATCAA--TC--CCCAG--AGG-CAA-TGGGTTTG-GACGC---T-T--CGCT-G--T-TA--C-GCC-T-----CCAGT-GT-GC--CC-AT-----A--T--AA-GCCCT--------GGTGAGGGC--AT--T--G-GG-GT-G-AA--TCCCTACC---------T------AGT---------------G-TTATAAAA------TAG--A------CCCCCT--CC--CCCT--T---CATTAGGTTA------A--ATTAT-CC---T-AGAA-GAT--TAC--TG-------------T----A-T-G---CCTTGC-AAATTtc
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lowQualScore : 7 99 7 99 000 99999 66666 7 4 0000000000 0 0 888 888 11111 222 11111 888 0 0 99 99 2 0 0 7 33 99 99 0 9 7 00 8 555555 55555555555555555555555 3 1 1 99 0 99 9 9 88 9 222 444444 77777 77 77 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 3333333 0 22 8 2 4 4 1111 0 3 3 3 1 0000 9999 33 1 5 444444444 33333333333333333333333333333333333 444444 111111111111111111 11 7777 1 88 88 33 11 7 0 2 999 11 2 2 11 2 11 2 2 66666 11 2 4 5 99999999 44 5 11111111 99 222222 222222 99 99 4 4 0000 444 4 3333333333333 55555555555555555 111111111111 22 8888888888888888888888888888 7 22 888888 22 4 111 4 4 4 2 5 7 7 77 333333333 9 000 7 5 9 5555 22 1 22 7 77 3 22 1 8888 1 2 3 77777777777 444 4 22 9 7 777 00 99 444 222222 5 44 7777 44 999999 111 5 5 444 0 4 000000000 7 7 7 7 77 8888 0 7 11111 8 88 9 7 22 1 3 3 1111 666666 66 3 7 3333 3 999 3 7 7 3 999 11 3 1111111111 888888 00 5555555555555 6 22 9999 3 3 77777777777777 0 3 333333333333333333 33 3 66 3 5 3 7 3 6 55 0 4 4 7
consensus : TAAGT-TTCCGGAATA--A-TAATT--TTTGC---TTTGATCT----ACAC---A-TG-TTTGATGAAATA---ATACAG-GCA-CA---GT---TTG-----TT--GTTG-----TTGTT---TT-GGGG-TTTT--CT--TTGCACTGTT-TTAATTTAGTTT-ACC-TAAACA--CAATG--TCCG-AAGACCGATT--TTATCAG------TGGATA-----------GGTT--------TTTTTTTC-AACC-A-GTGCATGG-GGTTAA--TG-TGTT-AACA--A-TA-A-A------AA-----TATTTTCA--T--A---------------TT--------------------T--------------------C-------CGAAACACAA--CCTCAATATGAAGTGCCACAATACAACCAATCTAAATG-ATC-AT-AAAGGAATCTGAGG----TTTT----TTCATGTC--GCGCGA-TC---------AGGTTT----AA-CA-GCTT------AA-------------GG------GG------G-------GA--GGG--GG----G-CGT--GGATC--AATC--CCCAG--AGG-CAA-TGAGTTTG-GAGAC---TC--C-GC-TG--T-T--AT-GCC-T-----CCA--GT-GTGC-CC-AT-----A--T--AA-GCCCT--------GGTG------AGGGC--A---T--G--GG-GTG-AA----TCC---CCTA-G-----T-------GTT-----------------AT--A------G--TAG--A----CCC----CCTCC------CCCT--TCCCCCTCAG--T------AG--GTTCT-CC---T-AGAA-GAT-CTGC-ATG-TA-AA--T----T----AT-G---CCTTGC-AATTT-GG----A--TATCGT-CAATTCGTG-TA--TGGT-ATCAT--A-ATTT----CA-TTANT-GGTA--TAAG---GAATATTCTT---TCTTTGC--TTTAAATA-AT-A---AC--T--A---G------A-TGAT--AT----C--T--A---AA---G-GTA-C---A-A-TT---------T-TCC-TTGACAAGC-T-C--AT-T--CAA-TTCAG-T--A--GATGA--ATG-AC-TGAT--AAA-A-G-A----AG------TG--A-TATATCAAAA--GA-TATT--G-A-T-AA-AATC-T-CA-TCT-AACC-A--CACGTATATT------TGTTG--TA----AG---AG--TT-TT-NTTACTATAATGGTTAG-GGAAT-A-----TA----A--CCACC-CCTC--T-AAAAAAA-AA---AGG-GGGGGGGGGGGT-T--CCGATG-GAAATCT-GAA-AAT-AAAATCCAGTCCG-AGCACGTAA--GG-GGGAAGTCT-CACT-ATGG-TGGT
Reference ( family-232 ) : TAAGT-TTCCGGAATA--A-TAATT--TTTGC---TTTGATCT----ACAC---A-TG-TTTGACGAAATA---ATACAG-GCA-CA---GT---TTG-----TT--GTTG-----TTGTT---TT-GGGG-TTTT--CT--TTGCACTGTT-TTAATTTAGTTT-ACC-TAAACA--CAATG--TCCG-AAGANCGATT--TTATCAG------TGGATA-----------GGTT--------TTTTTTTC-AACC-A-GTGCATGG-GGTTAA--TG-TGTT-AACA--A-TA-A-A------AA-----TATTTTCA--T--A---------------TT--------------------T--------------------C-------CGAAACNCAA--CCTCAATATGAAGTGCCACAATACAACCAATCTAAATG-ATC-AT-AAAGGAATCTGAGG----TTTT----TTCATGTC--GCGCGA-TC---------AGGTTT-T--AA-CA-GCTT------AN-------------GG------GG------G-------GA--GGG--GG----G-CGT--GGATC--AATC--CCCAG--AGG-CAA-TGAGTTTG-GAGAC---TC--C-GC-TG--T-T--AT-GCC-T-----CCA--GT-GTGC-CC-AT-----A--T--AA-GCCCT--------GGTG------AGGGC--A---T--G--GG-GTG-AA----TCC---CCTA-G-----T-------GTT-----------------AT--A------G--TAG--A----CCC----CCTCC------CCCT--TCCCCCTCAG--T------AG--GTTCT-CC---T-AGAA-GAT-CTGC-ATG-TA-AA--T----T----AT-G---CCTTGC-AATTT-GG----A--TATCGT-CAATTCGTG-TA--TGGT-ATCAT--A-ATTT----CA-TTANT-GGTA--TAAG---GAATATTCTT---TCTTTGC--TTTAAATA-AT-A---AC--T--A---G------A-TGAT--AT----C--T--C---AA---G-GTA-C---A-A-TT---------T-TCC-TTGACAAGC-T-C--AT-T--CAA-TTCAG-T--A--GATGA--ATG-AC-TGAT--AAA-A-G-A----AG------TG--A-TATATCAAAA--GA-TATT--G-A-T-AA-AATC-T-CA-TCT-AACC-A--CACGTATATT------TGTTG--TA----AG---AG--TT-TT-NTTACTATAATGGTTAG-GGAAT-A-----TA----A--CCACC-CCTC--T-AAAAAAA-AA---AGG-GGGGGGGGGGGT-T--CCGATG-GAAATCT-GAA-AAT-AAAATCCAGTCCG-AGCACGTAA--GG-GGGAAGTCT-CACT-ATGG-TGGT
gi|1 : TAAGT-TTCCGGAATA--A-TAATT--TTTGC---TTTGATCT----ACATT--A-TG-TTTGATGAAATACTAATACAG-ACA-CA---GT---TTG-----TT--CTTG-----TT------TT-GGGG-TTCT--CT--TTGCGCTGTT-TTAAATTAGTTT-ACC-TAAACA--CAATG--TCCG-AAGAATGATT--TTATCGG------TGGAT------------GGTT--------TTTTTTTC-AACC-A-GTGTATGG-GGTAAA--TG-TGTT-AACA--A-TA-A-A------AA-----TATCTTCA--T--A---------------TT--------------------T--------------------C-------CGAAACTCAA--CCTCAATATGAAGTGCCACAATACAACCAATCTAAATG-ATC-AT-TAAGGAATTTGAGG----ATTT----TTCATGTC--GCACAA-TC---------AGGTTT-TC-AA-CA-GC-T------AT-------------GG------GG------A-------GA--GGG--GG----G-CGT--GGATC--AATC--CCCAG--AGG-CAA-TGAGTTTG-GAGAC---TC--C-GC-TG--T-T--AT-GCC-T-----CCA--AT-GTGC-CC-AT-----A--T--AA-GCCCT--------GATG------AGGGC--A---T--G--GG-GTG-AA----TCC---CCTT-G-----T-------GTT-----------------AT--A------C--TAG--A----TCC----TCTCC------CCCT--TCCCCCTCAG--T------AG--GTTCT-CC---T-AGAA-GAT-CTGC-ATG-TA-AA--T----T----AT-G---CCTTGC-AATTT-GG----A--TATAGT-CAATTCGTG-TA--TGGT-ATCAT--A-ATTT----CA-TTATT-GGTA--TAAG---GAATATTCTT---TCTTTGC--TTTAAATA-AT-A---AC--T--A---G------A-TAAT--AT----A--T--C---AA---G-ATA-C---A-A-TT---------T-TCC-TTGGCAAGC-T-C--AT-T--CAA-TTCAG-T--A--GATGA--ATG-AC-TGAT--AAA-A-G-A----AG------CG--A-TATATCAAAA--GA-TATT--G-A-T-AA-AATC-T-CA-TCT-AACC-ATGCACGTATATT------TGTTGTCTC----AA---AG--TT-TT-CTTACTATAATGGTTAG-GGAAT-A-----TA----A--CCACC-CCTC--T-AAAAAAA-AA---AGG-GGGGGGGGGGGG-T--CCGATG-GAAATTT-GAA-AAT-AAAATCCAGTCCG-AACACGTAA--GG-GGGAAGTCT-CACT-ATGG-TGGT
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gi|12 : agtgcatgaggttaatgtgttaacaatttaaatattttcatagatttacttgcttttttgatatccgaaacacaacctcaatatacaaccaatctaaatgatagaggaacatggtgttttatcatgtcacacgatcagaagAGT-TCCCG-AATA--G-TAATT--TTTGC---ATTGATCT----ACAC------G-TTTGACGAAATA------CAG-GCA-CA---GT---TTG-----TT--GTTG-----TTGTTGTTTT-GGGGGTTTT--CT--TTGCATTGTT-TAAATTTAGTTA-CCC-TAAACA--AAATG--TTTG-AAGGCCGA-T--TTATCAG------TGGATA-----------TG-T--------TGTTTTTC-AACC-A-GTGCATAG-TGTTAA--TG-TATT-AACA--A-TA-T-A------AA-----TATTCTAA--G--A---------------TTTTTACTTGTCTTTTCGAATAT--------------------C-------CGAAACATAA--ACTCAATATAAAGTGTTATAAT-C----------AATG-ATC-GT-AAAGGAATCTAAGG----TTTT----GTTATGTC--GCGCAA-TC---------AGGTTT-TGAAA-CA-GC--------------------------------------------------------------G-TGT--GGATC--AATC--TCCAG--AGG-
gi|13 : -TTCCCGAATA--AGTAATT--TTTGC---ATTGATCT----ACAC------G-TTTGACGA---A---ATACAG-GCA-CA---GTTTGTTG-----TT--GTTG-----TTGTT---TT-GGGG-TTTT--CT--TTGCATTGTT----ATTTAG-TT-ACC-TAAACA--AAATG--TTTG-AAGGCCGA-T--TTATCAG------TGGATA-----------TG-T--------TGTTTTTC-AACC---GTGCATAG-TGTTAA--TG-TATT--ACA--A-TATA-ATATTCTAA-----GATTTTTACTT--GTCT------------TT--------------------T--------------------CAAAATATCGAAACATAA---CTCAATATAAAGTGTTATAAT-C----------AATG-ATC-GT-AAAGGAATCT-AAG----TTTT----GTTATGTC--GCGCAA-TC---------AGGTTT-TGAAA-CA-GC--------------------------------------------------------------G-TGT--GGATC--AATC--TCCAG--AGG-
gi|14 : g---G-ATA-C---A-A-TT---------T-TCC-TT----------C--A------AA-TTCAG-T--A--GTTG----TG-GC-TGAT--AAA-A-G-A----AG------TG--AATATATCAAA---GA-TATTTTG-A-TTAA-AATTGC-CA-TCT-TAAA-A--TAC-CATATT------TGTTG--TA----CGGGAAG--TT-TT-ATTACTA--ATGGTTAG-GGAAT-A-----TA--------CATC-CTTA----AGGAGGG-GG---AAG-GGGGGGGGGGGT-T--CCAATG-GAAATCTGGAA-AATAAAAATCCAATCCG-AGCACGCAA---G-CGGAAGTCT-CACT-ATGATTGGT
gi|15 : --T--A---------------TT--------------------T--------------------C-------CGAAACCCAG--CCTCAATATCAAGTGCCACAATACAACCAATCTAAATG-ATC-AT-AAAAGAATCTGATG----TTTT----TTCATGCC--GTACGA-TC---------AGGTTT-------CA-GCTTAAA---AA-------------GG------GG------G-------GA---GG--GG----G-CAT--GGATC--AATC--CCCAG--AGG-CAA-TGGGTTTG-GACGC---TT--C-GC-TG--T-T--AC-GCC-T-----CCA--GT-GTGC-CC-AT-----A--T--AA-GCCCT--------GGTG------AGGGC--AT--T--G--GG-GTG-AA----TCCCTACCTA-G-----T-------GTT-----------------ATAAA------A--TAG--A----CCC----CCTCC------CCCT--T---CATTAGGTT------AA--ATTAT-CC---T-AGAA-GAT--TAC--TG-------------T----AT-G---CCTTGC-AAATT-taggggggggggtgggagggggagtcttcactatatagccagtcttcgggggggggtacgtggtctcatatgggaag
gi|16 : GTA-TA--TGGT-ATCAT--A-ATTT----CA-TTGCT-GGTA----AT---GAATAATCCT---T----GC--CTTAAATG-AT-A---TC--T--A---A------A-TGAT--ATATATC--T--A---AA---G-ATA-A---A-A-TC---------T-TTC-ACGACAGGC-T-C--AT-T--CAA-TTCAG-T--A--G-TGA--GTG-AC-TG------A-A-G-A----AGTTCATTTG--A-TATATC-AAA--GA-TATT--G-A-T-AA-AATT-G-CA-ACT-AACC-A--CAC--ATATT------CGTTG--TAC---AGGA-AG--TT-TC-ATTAC--TAATGGTTAA-AGGAT-A-----
gi|17 : tgtggattaatcctcaagggaaGT-TTCGGGAATA--A-TTATT--TTTGC---TTTGATCT----TCAT---A-TG-TTTGATGA---A---ACACAG-ACA-CA---GT---TTGGGGGATTTAGTTGTTCATTTATT---T-----A-TTTTAATT--TTGCACTGTG-TTGATTTAGTTT-ACCAAAAACA--CAATG--TCCG-AAAACCgaggggatgcccatatccagtcttcagttgaaaatttagaaataaaa
gi|17 : -AAGACCGATTATTTATCAG------TTGATA-----------GG-----------GTTTTTC-AACA-A-----------GTTAA--AA-TGTT-AACA--A-TA-T-A------GATTTTTTACTTTCC--T--C---------------TTTTGATA--------------T--------------------C-------CGAAGCACAA--C--CAATAtaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaagaccgattatttatcagttgatagggtttttcaacaagttaaaatgttaacaatatagattttttactttcctcttttgatatccgaagcacaaccaata
gi|18 : gtttcgggaataattatttttgctttgatcttcatatgtttgatgaaacacagacacagtttgggggatttagttgttcatttatttattttaattttgcactgtgttgatttagtttaccaaaaacacaatgtccgaaaacctaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaC--GCACGA-TC---------GAATTT-C--AA--G-G---------AA-------------GGAATAGTGG------G-------GAC-GGGAAGGT---G-CGT--GGATC--GATC--CTCAG--AGG-CAA-TGAGTCTG-GAGAT---TC--C-GC-T---------------------CCA--GT-GTGC-CA-AT-----GGCT--AA-ACCCG--------GGGG------GGGGC--A---T--A--GG-GTG-TA----TCC---CCTA-A-----C-------GTT-----------------AT--A------G--TAG--T----CCCATGACCACC------CC----TCCCCCTAAT--T------AG--GTTTC-CC---C-AGAG-GAT-CTGC-ATG-TA-AA--T----T----AT-G---CCTTGC-AAGTT-AA----A--TATCGT-CTATAAGTG-TA--T-----TCGC--A-GTTT----CG-TT
gi|19 : TC--TCCAG--AAG-TAA-TGAGTGTT-TAGAC---GT--T-GC-TG--T-T--AT-ACC-T-----CCA--GT-GTGC-CC-AT-----CGTT--AA-GTCAT--------GGGGGGGGGGAGGGG--G---T--GCGAG-GTG-AA----TCC---CCTA-G-----T-------GTT-----------------AT--A------G--TAG--A----TCC----CCTCC------CCCT------CCTCTG--T------AG--GTTCT-C----T-AAAA-GAT-CTGC-ATG-TA-AA--T----T----AT-A---TCTTGC-AATTT-GA----G--TATCGT-CAATTCATG-TA--TGGT-ctccatattgaattgtcttatctc
gi|19 : TTGC--TTTAAAAA-AT-A---AC--T--A---G------A-TGAT--AT----C--T--A---AA---G-ACA-C---A-A-Tcattgctttaaaaaataactagatgatatctaaagacacaat
gi|2 : tctccagaagtaatgagtgtttagacgttgctgttatacctccagtgtgcccatcgttaagtcatggggggggggagggggtgcgaggtgaatcccctagtgttatagtagatcccctccccctcctctgtaggttctctaaaagatctgcatgtaaattatatcttgcaatttgagtatcgtcaattcatgtatggtcaTAAGTATTCCGGA-TACTA-TAGGTGCTTCGCACGTTTCATCT----ACATTTAG-TGATTTGATAGAAT-----CACAGAGCA-TACGGGT---TTG-----T-----TG-----TTGTT---TT-GGGG-TTCT--TTTATTGCAATGTTGTTAATTAGGTTTAACC-GTAACAGCCAATGGATCCG-AAGAT-GA-G--TTATCAG------TGGATAGTGTTTGGCTTGGTT--------TTTTTTTC-AACCTA-GTGTATGGCGGTAAA--TG-TGTT-AACA--AGTATA-A------GA-----TATCTTCA--TTGA---------------TT--------------------T--------------------
gi|2 : tgggtCTGAGA----TTTTCGGGTTCATGTCG-GCACAG-TCGGATGCAGGAGGTTTGT--TT-CAGGCTT------GT-------------AG------AA------A-------AAAGGGG--GG----G-CGTAGGAATCAAAATCA-CTCAG--ATG-CAA-TGAGTTTG-GAGAC---TC--C-GCAAG--T-TACAT-GCC-T-----ACAGCGT-GCGC-CC-AT-----A--T--AACGCCC---------GGTG------AGGGA--ATC-T--G--GG-TCG-AA----TCCAG-CCTA-AT----T-------GTT-----------------AT--AT-----G--TAG--AGACGCAC----CCTCCGACCGACCTTGGTCAGCCTCAG--TGAATACGG--ATTC--CC---T-AGAA-AAT-CT-C-ATG-TA-AT--TGACGT----AT-G---TGCCAC-GATTT--A----A--TATCGTCCAATCGGTG-TAGTTGGGAATGATCGA-ATTTTGTGTA-TTATTCGG----TAAGCGTGAATATTATC---T-TTTGC--TTTACATA-AT-AACGAC--T--A---ACGAGGTA-TGATTCAC----C--T--CTAAAA---GAGTA-CAGAA-A-TCATGAGGAGGT-CCA-TTGACAAGC-T-C--ATCT--CAACTTGAG-CCGAACGATGA--ATGCGCTTGCT--AAA-AGG-A----AG------TG--A-TATGTTCAAT--GA-TAT-------T-AA-CATC-T-CA-TCT-AACCTG--C-TGTATATT------Tatcctgagattttcgggttcatgtcggcacagtcggatgcaggaggtttgtttcaggcttgtagaaaaaagggggggcgtaggaatcaaaatcactcagatgcaatgagtttggagactccgcaagttacatgcctacagcgtgcgcccatataacgcccggtgagggaatctgggtcgaatccagcctaattgttatatgtagagacgcaccctccgaccgaccttggtcagcctcagtgaatacggattccctagaaaatctcatgtaattgacgtatgtgccacgatttaatatcgtccaatcggtgtagttgggaatgatcgaattttgtgtattattcggtaagcgtgaatattatcttttgctttacataataacgactaacgaggtatgattcacctctaaaagagtacagaaatcatgaggaggtccattgacaagctcatctcaacttgagccgaacgatgaatgcgcttgctaaaaggaagtgatatgttcaatgatattaacatctcatctaacctgctgtatatttac
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Reference ( family-232 ) : TAAGT-TTCCGGAATA--A-TAATT--TTTGC---TTTGATCT----ACAC---A-TG-TTTGATGAAATA---ATACAG-GCA-CA---GTTTG-----T---T--GTTG-----TTGTT---TT-GGGG-TTTT--CT--TTGCACTGTT-TTAATTTAGTTT-ACC-TAAACA--CAATG--TCCG-AAGACCGATT--TTATCAG------TGGATA-----------GGTT--------TTTTTTTC-AACC-A-GTGCATGG-GGTTAA--TG-TGTT-AACA--A-TA-A-A------AA-----TATTTTCA--T--A---------------TT--------------------T--------------------C-------CGAAACACAA--CCTCAATATGAAGTGCCACAATACAACCAATCTAAATG-ATC-AT-AAAGGAATCTGAGG----TTTT----TTCATGTC--G-CGCGA-TC---------AGGTTT---AA--CA-G-CTT------A-A-------------GG------GG------G-------GA-GGG--GG----G-CGTGG--ATCAA--TC--CCCAG--AGG-CAA-TGAGTTTG-GAGAC---TC--C-GC-TG--T-T--AT-GCC-T-----CCA--GT-GTGC-CC-AT-----A--T--AA-GCCCT--------GGTG------AGGGC--A---T--G--GG-GT-G-AA----TCC---CCTA-G-----TG-------TT-----------------AT--A------G--TAG--A----CCC----CCTCC------CCCT--TCCCCCTCAG--T------AG--GTTCT-CC---T-AGAA-GAT-CTGC-ATG-TA-AA--T----T----A-T-G---CCTTGC-AA-TTT-GG----A--TATCGT-CAATTCGTG-TA--TGGT-A-TCAT--A-ATTT----CA-TTANT-GGTA--TAAG---GAATATTCTT---TCTTTGC--TTTAAATA-AT-A---AC--T--A---G------A-TGAT--AT-----C-T---A--AAG-GTA-C---A-A-TT---------T-TCC-TTGACAAGC-T-C--AT-T--CAA-TTCAG-T--A--GATGA-A--TG-AC-TGAT--AAA-A-G-A----AG------TG--A-TATATCAAAA--GA-TATT--G-A-T-AA-AATC-T-CA-TCT-AACC-A--CACGTATATT------TGTTG--TA----AG---AG--TT-TTN-TTACTATAATGGTTAG-GGAAT-A-----TA----A--CCACCCCTC--T-AAAAAAA-AA---AGG-GGGGGGGGGGGT-T--CCGATG-GAAATCT-GAA-AAT-AAAATCCAGTCCG-AGCACGTAA--GG-GGGAAGTCT-CACT-ATGG-TGGT
gi|1 : TAAGT-TTCCGGAATA--A-TAATT--TTTGC---TTTGATCT----ACATT--A-TG-TTTGATGAAATACTAATACAG-ACA-CA---GTTTG-----T---T--CTTG-----TT------TT-GGGG-TTCT--CT--TTGCGCTGTT-TTAAATTAGTTT-ACC-TAAACA--CAATG--TCCG-AAGAATGATT--TTATCGG------TGGAT------------GGTT--------TTTTTTTC-AACC-A-GTGTATGG-GGTAAA--TG-TGTT-AACA--A-TA-A-A------AA-----TATCTTCA--T--A---------------TT--------------------T--------------------C-------CGAAACTCAA--CCTCAATATGAAGTGCCACAATACAACCAATCTAAATG-ATC-AT-TAAGGAATTTGAGG----ATTT----TTCATGTC--G-CACAA-TC---------AGGTTTTC-AA--CA-G-CT-------A-T-------------GG------GG------A-------GA-GGG--GG----G-CGTGG--ATCAA--TC--CCCAG--AGG-CAA-TGAGTTTG-GAGAC---TC--C-GC-TG--T-T--AT-GCC-T-----CCA--AT-GTGC-CC-AT-----A--T--AA-GCCCT--------GATG------AGGGC--A---T--G--GG-GT-G-AA----TCC---CCTT-G-----TG-------TT-----------------AT--A------C--TAG--A----TCC----TCTCC------CCCT--TCCCCCTCAG--T------AG--GTTCT-CC---T-AGAA-GAT-CTGC-ATG-TA-AA--T----T----A-T-G---CCTTGC-AA-TTT-GG----A--TATAGT-CAATTCGTG-TA--TGGT-A-TCAT--A-ATTT----CA-TTATT-GGTA--TAAG---GAATATTCTT---TCTTTGC--TTTAAATA-AT-A---AC--T--A---G------A-TAAT--AT-----A-T---C--AAG-ATA-C---A-A-TT---------T-TCC-TTGGCAAGC-T-C--AT-T--CAA-TTCAG-T--A--GATGA-A--TG-AC-TGAT--AAA-A-G-A----AG------CG--A-TATATCAAAA--GA-TATT--G-A-T-AA-AATC-T-CA-TCT-AACC-ATGCACGTATATT------TGTTGTCTC----AA---AG--TT-TTC-TTACTATAATGGTTAG-GGAAT-A-----TA----A--CCACCCCTC--T-AAAAAAA-AA---AGG-GGGGGGGGGGGG-T--CCGATG-GAAATTT-GAA-AAT-AAAATCCAGTCCG-AACACGTAA--GG-GGGAAGTCT-CACT-ATGG-TGGT
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gi|12 : agtgcatgaggttaatgtgttaacaatttaaatattttcatagatttacttgcttttttgatatccgaaacacaacctcaatatacaaccaatctaaatgatagaggaacatggtgttttatcatgtcacacgatcagaagAGT-TCCCG-AATA--G-TAATT--TTTGC---ATTGATCT----ACAC------G-TTTGACGAAATA------CAG-GCA-CA---GTTTG-----T---T--GTTG-----TTGTTGTTTT-GGGGGTTTT--CT--TTGCATTGTT-TAAATTTAGTTA-CCC-TAAACA--AAATG--TTTG-AAGGCCGA-T--TTATCAG------TGGATA-----------TG-T--------TGTTTTTC-AACC-A-GTGCATAG-TGTTAA--TG-TATT-AACA--A-TA-T-A------AA-----TATTCTAA--G--A---------------TTTTTACTTGTCTTTTCGAATAT--------------------C-------CGAAACATAA--ACTCAATATAAAGTGTTATAAT-C----------AATG-ATC-GT-AAAGGAATCTAAGG----TTTT----GTTATGTC--G-CGCAA-TC---------AGGTTTTGAAA--CA-G-C--------------------------------------------------------------G-TGTGG--ATCAA--TC--TCCAG--AGG-
gi|13 : -TTCCCGAATA--AGTAATT--TTTGC---ATTGATCT----ACAC------G-TTTGACGAAATA------CAG-GCA-CA---GTTTG-----TTGTT--GTTG-----TTGTT---TT-GGGG-TTTT--CT--TTGCATTGTT----ATTTAG-TT-ACC-TAAACA--AAATG--TTTG-AAGGCCGA-T--TTATCAG------TGGATA-----------TG-T--------TGTTTTTC-AACC---GTGCATAG-TGTTAA--TG-TATT--ACA--A-TATA-ATATTCTAA-----GATTTTTACTT--GTCT------------TT--------------------T--------------------CAAAATATCGAAACATAA---CTCAATATAAAGTGTTATAAT-C----------AATG-ATC-GT-AAAGGAATCT-AAG----TTTT----GTTATGTC--G-CGCAA-TC---------AGGTTTTGAAA--CA-G-C--------------------------------------------------------------G-TGTGG--ATCAA--TC--TCCAG--AGG-
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gi|15 : --T--A---------------TT--------------------T--------------------C-------CGAAACCCAG--CCTCAATATCAAGTGCCACAATACAACCAATCTAAATG-ATC-AT-AAAAGAATCTGATG----TTTT----TTCATGCC--G-TACGA-TC---------AGGTTT-------CA-G-CTTAAA---A-A-------------GG------GG------G-------GA--GG--GG----G-CATGG--ATCAA--TC--CCCAG--AGG-CAA-TGGGTTTG-GACGC---TT--C-GC-TG--T-T--AC-GCC-T-----CCA--GT-GTGC-CC-AT-----A--T--AA-GCCCT--------GGTG------AGGGC--AT--T--G--GG-GT-G-AA----TCCCTACCTA-G-----TG-------TT-----------------ATAAA------A--TAG--A----CCC----CCTCC------CCCT--T---CATTAGGTT------AA--ATTAT-CC---T-AGAA-GAT--TAC--TG-------------T----A-T-G---CCTTGC-AA-ATT-taggggggggggtgggagggggagtcttcactatatagccagtcttcgggggggggtacgtggtctcatatgggaag
gi|16 : GTA-TA--TGGT-A-TCAT--A-ATTT----CA-TTGCT-GGTA----AT---GAATAATCCT---T----GC--CTTAAATG-AT-A---TC--T--A---A------A-TGAT--ATATAT-C-T---A--AAG-ATA-A---A-A-TC---------T-TTC-ACGACAGGC-T-C--AT-T--CAA-TTCAG-T--A--G-TGA-G--TG-AC-TG------A-A-G-A----AGTTCATTTG--A-TATATC-AAA--GA-TATT--G-A-T-AA-AATT-G-CA-ACT-AACC-A--CAC--ATATT------CGTTG--TAC---AGGA-AG--TT-TCA-TTAC--TAATGGTTAA-AGGAT-A-----
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gi|17 : -AAGACCGATTATTTATCAG------TTGATA-----------GG-----------GTTTTTC-AACA-A-----------GTTAA--AA-TGTT-AACA--A-TA-T-A------GATTTTTTACTTTCC--T--C---------------TTTTGATA--------------T--------------------C-------CGAAGCACAA--C--CAATAtaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaagaccgattatttatcagttgatagggtttttcaacaagttaaaatgttaacaatatagattttttactttcctcttttgatatccgaagcacaaccaata
gi|18 : gtttcgggaataattatttttgctttgatcttcatatgtttgatgaaacacagacacagtttgggggatttagttgttcatttatttattttaattttgcactgtgttgatttagtttaccaaaaacacaatgtccgaaaacctaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaC--G-CACGA-TC---------GAATTT---CA--AG-G----------A-A-------------GGAATAGTGG------G-------GACGGGAAGGT---G-CGTGG--ATCGA--TC--CTCAG--AGG-CAA-TGAGTCTG-GAGAT---TC--C-GC-T---------------------CCA--GT-GTGC-CA-AT-----GGCT--AA-ACCCG--------GGGG------GGGGC--A---T--A--GG-GT-G-TA----TCC---CCTA-A-----CG-------TT-----------------AT--A------G--TAG--T----CCCATGACCACC------CC----TCCCCCTAAT--T------AG--GTTTC-CC---C-AGAG-GAT-CTGC-ATG-TA-AA--T----T----A-T-G---CCTTGC-AA-GTT-AA----A--TATCGT-CTATAAGTG-TA--T------TCGC--A-GTTT----CG-TT
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gi|2 : TAAGTATTCCGGA-TACTA-TAGGTGCTTCGCACGTTTCATCT----ACATTTAG-TGATTTGATAGAAT-----CACAGAGCA-TACGGGTTTG-----T--------TG-----TTGTT---TT-GGGG-TTCT--TTTATTGCAATGTTGTTAATTAGGTTTAACC-GTAACAGCCAATGGATCCG-AAGA-TGA-G--TTATCAG------TGGATAGTGTTTGGCTTGGTT--------TTTTTTTC-AACCTA-GTGTATGGCGGTAAA--TG-TGTT-AACA--AGTATA-A------GA-----TATCTTCA--TTGA---------------TT--------------------T--------------------
gi|2 : tgggtCTGAGA----TTTTCGGGTTCATGTC--GGCACAG-TCGGATGCAGGAGGTTT---GTTTCA-GGCTT------GTA-------------GA------AA------A-------AA-GGG--GG----GGCGTAGGAATCAAAATCA-CTCAG--ATG-CAA-TGAGTTTG-GAGAC---TC--C-GCAAG--T-TACAT-GCC-T-----ACAGCGT-GCGC-CC-AT-----A--T--AACGCCC---------GGTG------AGGGA--ATC-T--G--GG-TC-G-AA----TCCAG-CCTA-AT----TG-------TT-----------------AT--AT-----G--TAG--AGACGCAC----CCTCCGACCGACCTTGGTCAGCCTCAG--TGAATACGG--ATTC--CC---T-AGAA-AAT-CT-C-ATG-TA-AT--TGACGT----A-T-G---TGCCAC-GA-TTT--A----A--TATCGTCCAATCGGTG-TAGTTGGGAA-TGATCGA-ATTTTGTGTA-TTATTCGG----TAAGCGTGAATATTATC---T-TTTGC--TTTACATA-AT-AACGAC--T--A---ACGAGGTA-TGATTCAC-----C-TCTAA--AAGAGTA-CAGAA-A-TCATGAGGAGGT-CCA-TTGACAAGC-T-C--ATCT--CAACTTGAG-CCGAACGATGA-A--TGCGCTTGCT--AAA-AGG-A----AG------TG--A-TATGTTCAAT--GA-TAT-------T-AA-CATC-T-CA-TCT-AACCTG--C-TGTATATT------Tatcctgagattttcgggttcatgtcggcacagtcggatgcaggaggtttgtttcaggcttgtagaaaaaagggggggcgtaggaatcaaaatcactcagatgcaatgagtttggagactccgcaagttacatgcctacagcgtgcgcccatataacgcccggtgagggaatctgggtcgaatccagcctaattgttatatgtagagacgcaccctccgaccgaccttggtcagcctcagtgaatacggattccctagaaaatctcatgtaattgacgtatgtgccacgatttaatatcgtccaatcggtgtagttgggaatgatcgaattttgtgtattattcggtaagcgtgaatattatcttttgctttacataataacgactaacgaggtatgattcacctctaaaagagtacagaaatcatgaggaggtccattgacaagctcatctcaacttgagccgaacgatgaatgcgcttgctaaaaggaagtgatatgttcaatgatattaacatctcatctaacctgctgtatatttac
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gi|20 : TTGC--TTTAAAAA-AT-A---AC--T--A---G------A-TGAT--AT-----C-T------AAG-ACA-C---A-A-TT---------cattgctttaaaaaataactagatgatatctaagacacaatt
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Reference ( family-232 ) : TAAGT-TTCCGGAATA--A-TAATT--TTTGC---TTTGATCT----ACAC---A-TG-TTTGATGAAATA---ATACAG-GCA-CA---GTTTG-----T---T--GTTG-----TTGTT---TT-GGGG-TTTT--CT--TTGCACTGTT-TTAATTTAGTTT-ACC-TAAACA--CAATG--TCCG-AAGACCGATT--TTATCAG------TGGATA-----------GGTT--------TTTTTTTC-AACC-A-GTGCATGG-GGTTAA--TG-TGTT-AACA--A-TA-A-A------AA-----TATTTTCA--T--A---------------TT--------------------T--------------------C-------CGAAACACAA--CCTCAATATGAAGTGCCACAATACAACCAATCTAAATG-ATC-AT-AAAGGAATCTGAGG----TTTT----TTCATGTC--GCGCGA-TC---------AGGTTT----A---CA-GCTT------A-A-------------GG------GG------G-------GA-GGG--GG----G-CGT--GGATC--AATC--CCCAG--AGG-CAA-TGAGTTTG-GAGAC---TC--C-GC-TG--T-T--AT-GCC-T-----CCA--GT-GTGC-CC-AT-----A--T--AA-GCCCT--------GGTG------AGGGC--A---T--G--GG-GT-G-AA----TCC---CCTA-G-----TG-------TT-----------------AT--A------G--TAG--A----CCC----CCTCC------CCCT--TCCCCCTCAG--T------AG--GTTCT-CC---T-AGAA-GAT-CTGC-ATG-TA-AA--T----T----A-T-G---CCTTGC-AA-TTT-GG----A--TATCGT-CAATTCGTG-TA--TGGT-A-TCAT--A-ATTT----CA-TTANT-GGTA--TAAG---GAATATTCTT---TCTTTGC--TTTAAATA-AT-A---AC--T--A---G------A-TGAT--AT-----C-T---A--AAG-GTA-C---A-A-TT---------T-TCC-TTGACAAGC-T-C--AT-T--CAA-TTCAG-T--A--GATGA-A--TG-AC-TGAT--AAA-A-G-A----AG------TG--A-TATATCAAAA--GA-TATT--G-A-T-AA-AATC-T-CA-TCT-AACC-A--CACGTATATT------TGTTG--TA----AG---AG--TT-TTN-TTACTATAATGGTTAG-GGAAT-A-----TA----A--CCACCCCTC--T-AAAAAAA-AA---AGG-GGGGGGGGGGGT-T--CCGATG-GAAATCT-GAA-AAT-AAAATCCAGTCCG-AGCACGTAA--GG-GGGAAGTCT-CACT-ATGG-TGGT
gi|1 : TAAGT-TTCCGGAATA--A-TAATT--TTTGC---TTTGATCT----ACATT--A-TG-TTTGATGAAATACTAATACAG-ACA-CA---GTTTG-----T---T--CTTG-----TT------TT-GGGG-TTCT--CT--TTGCGCTGTT-TTAAATTAGTTT-ACC-TAAACA--CAATG--TCCG-AAGAATGATT--TTATCGG------TGGAT------------GGTT--------TTTTTTTC-AACC-A-GTGTATGG-GGTAAA--TG-TGTT-AACA--A-TA-A-A------AA-----TATCTTCA--T--A---------------TT--------------------T--------------------C-------CGAAACTCAA--CCTCAATATGAAGTGCCACAATACAACCAATCTAAATG-ATC-AT-TAAGGAATTTGAGG----ATTT----TTCATGTC--GCACAA-TC---------AGGTTTTCA-A---CA-GCT-------A-T-------------GG------GG------A-------GA-GGG--GG----G-CGT--GGATC--AATC--CCCAG--AGG-CAA-TGAGTTTG-GAGAC---TC--C-GC-TG--T-T--AT-GCC-T-----CCA--AT-GTGC-CC-AT-----A--T--AA-GCCCT--------GATG------AGGGC--A---T--G--GG-GT-G-AA----TCC---CCTT-G-----TG-------TT-----------------AT--A------C--TAG--A----TCC----TCTCC------CCCT--TCCCCCTCAG--T------AG--GTTCT-CC---T-AGAA-GAT-CTGC-ATG-TA-AA--T----T----A-T-G---CCTTGC-AA-TTT-GG----A--TATAGT-CAATTCGTG-TA--TGGT-A-TCAT--A-ATTT----CA-TTATT-GGTA--TAAG---GAATATTCTT---TCTTTGC--TTTAAATA-AT-A---AC--T--A---G------A-TAAT--AT-----A-T---C--AAG-ATA-C---A-A-TT---------T-TCC-TTGGCAAGC-T-C--AT-T--CAA-TTCAG-T--A--GATGA-A--TG-AC-TGAT--AAA-A-G-A----AG------CG--A-TATATCAAAA--GA-TATT--G-A-T-AA-AATC-T-CA-TCT-AACC-ATGCACGTATATT------TGTTGTCTC----AA---AG--TT-TTC-TTACTATAATGGTTAG-GGAAT-A-----TA----A--CCACCCCTC--T-AAAAAAA-AA---AGG-GGGGGGGGGGGG-T--CCGATG-GAAATTT-GAA-AAT-AAAATCCAGTCCG-AACACGTAA--GG-GGGAAGTCT-CACT-ATGG-TGGT
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gi|12 : agtgcatgaggttaatgtgttaacaatttaaatattttcatagatttacttgcttttttgatatccgaaacacaacctcaatatacaaccaatctaaatgatagaggaacatggtgttttatcatgtcacacgatcagaagAGT-TCCCG-AATA--G-TAATT--TTTGC---ATTGATCT----ACAC------G-TTTGACGAAATA------CAG-GCA-CA---GTTTG-----T---T--GTTG-----TTGTTGTTTT-GGGGGTTTT--CT--TTGCATTGTT-TAAATTTAGTTA-CCC-TAAACA--AAATG--TTTG-AAGGCCGA-T--TTATCAG------TGGATA-----------TG-T--------TGTTTTTC-AACC-A-GTGCATAG-TGTTAA--TG-TATT-AACA--A-TA-T-A------AA-----TATTCTAA--G--A---------------TTTTTACTTGTCTTTTCGAATAT--------------------C-------CGAAACATAA--ACTCAATATAAAGTGTTATAAT-C----------AATG-ATC-GT-AAAGGAATCTAAGG----TTTT----GTTATGTC--GCGCAA-TC---------AGGTTTTGAAA---CA-GC--------------------------------------------------------------G-TGT--GGATC--AATC--TCCAG--AGG-
gi|13 : -TTCCCGAATA--AGTAATT--TTTGC---ATTGATCT----ACAC------G-TTTGACGAAATA------CAG-GCA-CA---GTTTG-----TTGTT--GTTG-----TTGTT---TT-GGGG-TTTT--CT--TTGCATTGTT----ATTTAG-TT-ACC-TAAACA--AAATG--TTTG-AAGGCCGA-T--TTATCAG------TGGATA-----------TG-T--------TGTTTTTC-AACC---GTGCATAG-TGTTAA--TG-TATT--ACA--A-TATA-ATATTCTAA-----GATTTTTACTT--GTCT------------TT--------------------T--------------------CAAAATATCGAAACATAA---CTCAATATAAAGTGTTATAAT-C----------AATG-ATC-GT-AAAGGAATCT-AAG----TTTT----GTTATGTC--GCGCAA-TC---------AGGTTTTGAAA---CA-GC--------------------------------------------------------------G-TGT--GGATC--AATC--TCCAG--AGG-
gi|14 : gG-ATA-C---A-A-TT---------T-TCC-TT----------C--A------AA-TTCAG-T--A--GTTG-----TG-GC-TGAT--AAA-A-G-A----AG------TG--AATATATCAAA---GA-TATTTTG-A-TTAA-AATTGC-CA-TCT-TAAA-A--TAC-CATATT------TGTTG--TA----CGGGAAG--TT-TTA-TTACTA--ATGGTTAG-GGAAT-A-----TA--------CATCCTTA----AGGAGGG-GG---AAG-GGGGGGGGGGGT-T--CCAATG-GAAATCTGGAA-AATAAAAATCCAATCCG-AGCACGCAA---G-CGGAAGTCT-CACT-ATGATTGGT
gi|15 : --T--A---------------TT--------------------T--------------------C-------CGAAACCCAG--CCTCAATATCAAGTGCCACAATACAACCAATCTAAATG-ATC-AT-AAAAGAATCTGATG----TTTT----TTCATGCC--GTACGA-TC---------AGGTTT--------CA-GCTT------A-AAAA----------GG------GG------G-------GA-GGG--GG------CAT--GGATC--AATC--CCCAG--AGG-CAA-TGGGTTTG-GACGC---TT--C-GC-TG--T-T--AC-GCC-T-----CCA--GT-GTGC-CC-AT-----A--T--AA-GCCCT--------GGTG------AGGGC--AT--T--G--GG-GT-G-AA----TCCCTACCTA-G-----TG-------TT-----------------ATAAA------A--TAG--A----CCC----CCTCC------CCCT--T---CATTAGGTT------AA--ATTAT-CC---T-AGAA-GAT--TAC--TG-------------T----A-T-G---CCTTGC-AA-ATT-taggggggggggtgggagggggagtcttcactatatagccagtcttcgggggggggtacgtggtctcatatgggaag
gi|16 : GTA-TA--TGGT-A-TCAT--A-ATTT----CA-TTGCT-GGTA----AT---GAATAATCCT---T----GC--CTTAAATG-AT-A---TC--T--A---A------A-TGAT--ATATAT-C-T---A--AAG-ATA-A---A-A-TC---------T-TTC-ACGACAGGC-T-C--AT-T--CAA-TTCAG-T--A--G-TGA-G--TG-AC-TG------A-A-G-A----AGTTCATTTG--A-TATATC-AAA--GA-TATT--G-A-T-AA-AATT-G-CA-ACT-AACC-A--CAC--ATATT------CGTTG--TAC---AGGA-AG--TT-TCA-TTAC--TAATGGTTAA-AGGAT-A-----
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gi|17 : -AAGACCGATTATTTATCAG------TTGATA-----------GG-----------GTTTTTC-AACA-A-----------GTTAA--AA-TGTT-AACA--A-TA-T-A------GATTTTTTACTTTCC--T--C---------------TTTTGATA--------------T--------------------C-------CGAAGCACAA--C--CAATAtaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaagaccgattatttatcagttgatagggtttttcaacaagttaaaatgttaacaatatagattttttactttcctcttttgatatccgaagcacaaccaata
gi|18 : gtttcgggaataattatttttgctttgatcttcatatgtttgatgaaacacagacacagtttgggggatttagttgttcatttatttattttaattttgcactgtgttgatttagtttaccaaaaacacaatgtccgaaaacctaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaC--GCACGA-TC---------GAATTT----C---AA-GG--------A-A-------------GGAATAGTGG------G-------GACGGGAAGGT---G-CGT--GGATC--GATC--CTCAG--AGG-CAA-TGAGTCTG-GAGAT---TC--C-GC-T---------------------CCA--GT-GTGC-CA-AT-----GGCT--AA-ACCCG--------GGGG------GGGGC--A---T--A--GG-GT-G-TA----TCC---CCTA-A-----CG-------TT-----------------AT--A------G--TAG--T----CCCATGACCACC------CC----TCCCCCTAAT--T------AG--GTTTC-CC---C-AGAG-GAT-CTGC-ATG-TA-AA--T----T----A-T-G---CCTTGC-AA-GTT-AA----A--TATCGT-CTATAAGTG-TA--T------TCGC--A-GTTT----CG-TT
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gi|2 : TAAGTATTCCGGA-TACTA-TAGGTGCTTCGCACGTTTCATCT----ACATTTAG-TGATTTGATAGAAT-----CACAGAGCA-TACGGGTTTG-----T--------TG-----TTGTT---TT-GGGG-TTCT--TTTATTGCAATGTTGTTAATTAGGTTTAACC-GTAACAGCCAATGGATCCG-AAGA-TGA-G--TTATCAG------TGGATAGTGTTTGGCTTGGTT--------TTTTTTTC-AACCTA-GTGTATGGCGGTAAA--TG-TGTT-AACA--AGTATA-A------GA-----TATCTTCA--TTGA---------------TT--------------------T--------------------
gi|2 : tgggtCTGAGA----TTTTCGGGTTCATGTCG-GCACAG-TCGGATGCAGGAGGTTT----GTTTCAGGCTT------GTA-------------GA------AA------A-------AAGGGG--GG----G-CGTAGGAATCAAAATCA-CTCAG--ATG-CAA-TGAGTTTG-GAGAC---TC--C-GCAAG--T-TACAT-GCC-T-----ACAGCGT-GCGC-CC-AT-----A--T--AACGCCC---------GGTG------AGGGA--ATC-T--G--GG-TC-G-AA----TCCAG-CCTA-AT----TG-------TT-----------------AT--AT-----G--TAG--AGACGCAC----CCTCCGACCGACCTTGGTCAGCCTCAG--TGAATACGG--ATTC--CC---T-AGAA-AAT-CT-C-ATG-TA-AT--TGACGT----A-T-G---TGCCAC-GA-TTT--A----A--TATCGTCCAATCGGTG-TAGTTGGGAA-TGATCGA-ATTTTGTGTA-TTATTCGG----TAAGCGTGAATATTATC---T-TTTGC--TTTACATA-AT-AACGAC--T--A---ACGAGGTA-TGATTCAC-----C-TCTAA--AAGAGTA-CAGAA-A-TCATGAGGAGGT-CCA-TTGACAAGC-T-C--ATCT--CAACTTGAG-CCGAACGATGA-A--TGCGCTTGCT--AAA-AGG-A----AG------TG--A-TATGTTCAAT--GA-TAT-------T-AA-CATC-T-CA-TCT-AACCTG--C-TGTATATT------Tatcctgagattttcgggttcatgtcggcacagtcggatgcaggaggtttgtttcaggcttgtagaaaaaagggggggcgtaggaatcaaaatcactcagatgcaatgagtttggagactccgcaagttacatgcctacagcgtgcgcccatataacgcccggtgagggaatctgggtcgaatccagcctaattgttatatgtagagacgcaccctccgaccgaccttggtcagcctcagtgaatacggattccctagaaaatctcatgtaattgacgtatgtgccacgatttaatatcgtccaatcggtgtagttgggaatgatcgaattttgtgtattattcggtaagcgtgaatattatcttttgctttacataataacgactaacgaggtatgattcacctctaaaagagtacagaaatcatgaggaggtccattgacaagctcatctcaacttgagccgaacgatgaatgcgcttgctaaaaggaagtgatatgttcaatgatattaacatctcatctaacctgctgtatatttac
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Reference ( family-232 ) : TAAGT-TTCCGGAATA--A-TAATT--TTTGC---TTTGATCT----ACAC---A-TG-TTTGATGAAATA---ATACAG-GCA-CA---GTTTG-----T---T--GTTG-----TTGTT---TT-GGGG-TTTT--CT--TTGCACTGTT-TTAATTTAGTTT-ACC-TAAACA--CAATG--TCCG-AAGACCGATT--TTATCAG------TGGATA-----------GGTT--------TTTTTTTC-AACC-A-GTGCATGG-GGTTAA--TG-TGTT-AACA--A-TA-A-A------AA-----TATTTTCA--T--A---------------TT--------------------T--------------------C-------CGAAACACAA--CCTCAATATGAAGTGCCACAATACAACCAATCTAAATG-ATC-AT-AAAGGAATCTGAGG----TTTT----TTCATGTC--G-CGC-----GA-T-C----AGG-------TTT----CA--G-CTT--------A-A-------------GG------GG------G-------GA-GGG--GG----G-CGTGG--ATCAA--TC--CCCAG--AGG-CAA-TGAGTTTG-GAGAC---TC--C-GC-TG--T-T--AT-GCC-T-----CCA--GT-GTGC-CC-AT-----A--T--AA-GCCCT--------GGTG------AGGGC--A---T--G--GG-GT-G-AA----TCC---CCTA-G-----TG-------TT-----------------AT--A------G--TAG--A----CCC----CCTCC------CCCT--TCCCCCTCAG--T------AG--GTTCT-CC---T-AGAA-GAT-CTGC-ATG-TA-AA--T----T----A-T-G---CCTTGC-AA-TTT-GGA--TAT----CGT-CAATTCGTG-TA--TGGT-A-TCAT--A-ATTT----CA-TTANT-GGTA--TAAG---GAATATTCTT---TCTTTGC--TTTAAATA-AT-A---AC--T--A---G------A-TGAT--AT-----C-T---A--AAG-GTA-C---A-A-TT---------T-TCC-TTGACAAGC-T-C--AT-T--CAA-TTCAG-T--A--GATGA-A--TG-AC-TGAT--AAA-A-G-A----AG------TG--A-TATATCAAAA--GA-TATT--G-A-T-AA-AATC-T-CA-TCT-AACC-A--CACGTATATT------TGTTG--TA----AG---AG--TT-TTN-TTACTATAATGGTTAG-GGAAT-A-----TA----A--CCACCCCTC--T-AAAAAAA-AA---AGG-GGGGGGGGGGGT-T--CCGATG-GAAATCT-GAA-AAT-AAAATCCAGTCCG-AGCACGTAA--GG-GGGAAGTCT-CACT-ATGG-TGGT
gi|1 : TAAGT-TTCCGGAATA--A-TAATT--TTTGC---TTTGATCT----ACATT--A-TG-TTTGATGAAATACTAATACAG-ACA-CA---GTTTG-----T---T--CTTG-----TT------TT-GGGG-TTCT--CT--TTGCGCTGTT-TTAAATTAGTTT-ACC-TAAACA--CAATG--TCCG-AAGAATGATT--TTATCGG------TGGAT------------GGTT--------TTTTTTTC-AACC-A-GTGTATGG-GGTAAA--TG-TGTT-AACA--A-TA-A-A------AA-----TATCTTCA--T--A---------------TT--------------------T--------------------C-------CGAAACTCAA--CCTCAATATGAAGTGCCACAATACAACCAATCTAAATG-ATC-AT-TAAGGAATTTGAGG----ATTT----TTCATGTC--G-CAC-----AA-T-C----AGG-------TTTTCAACA--G-CT---------A-T-------------GG------GG------A-------GA-GGG--GG----G-CGTGG--ATCAA--TC--CCCAG--AGG-CAA-TGAGTTTG-GAGAC---TC--C-GC-TG--T-T--AT-GCC-T-----CCA--AT-GTGC-CC-AT-----A--T--AA-GCCCT--------GATG------AGGGC--A---T--G--GG-GT-G-AA----TCC---CCTT-G-----TG-------TT-----------------AT--A------C--TAG--A----TCC----TCTCC------CCCT--TCCCCCTCAG--T------AG--GTTCT-CC---T-AGAA-GAT-CTGC-ATG-TA-AA--T----T----A-T-G---CCTTGC-AA-TTT-GGA--TAT----AGT-CAATTCGTG-TA--TGGT-A-TCAT--A-ATTT----CA-TTATT-GGTA--TAAG---GAATATTCTT---TCTTTGC--TTTAAATA-AT-A---AC--T--A---G------A-TAAT--AT-----A-T---C--AAG-ATA-C---A-A-TT---------T-TCC-TTGGCAAGC-T-C--AT-T--CAA-TTCAG-T--A--GATGA-A--TG-AC-TGAT--AAA-A-G-A----AG------CG--A-TATATCAAAA--GA-TATT--G-A-T-AA-AATC-T-CA-TCT-AACC-ATGCACGTATATT------TGTTGTCTC----AA---AG--TT-TTC-TTACTATAATGGTTAG-GGAAT-A-----TA----A--CCACCCCTC--T-AAAAAAA-AA---AGG-GGGGGGGGGGGG-T--CCGATG-GAAATTT-GAA-AAT-AAAATCCAGTCCG-AACACGTAA--GG-GGGAAGTCT-CACT-ATGG-TGGT
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gi|12 : agtgcatgaggttaatgtgttaacaatttaaatattttcatagatttacttgcttttttgatatccgaaacacaacctcaatatacaaccaatctaaatgatagaggaacatggtgttttatcatgtcacacgatcagaagAGT-TCCCG-AATA--G-TAATT--TTTGC---ATTGATCT----ACAC------G-TTTGACGAAATA------CAG-GCA-CA---GTTTG-----T---T--GTTG-----TTGTTGTTTT-GGGGGTTTT--CT--TTGCATTGTT-TAAATTTAGTTA-CCC-TAAACA--AAATG--TTTG-AAGGCCGA-T--TTATCAG------TGGATA-----------TG-T--------TGTTTTTC-AACC-A-GTGCATAG-TGTTAA--TG-TATT-AACA--A-TA-T-A------AA-----TATTCTAA--G--A---------------TTTTTACTTGTCTTTTCGAATAT--------------------C-------CGAAACATAA--ACTCAATATAAAGTGTTATAAT-C----------AATG-ATC-GT-AAAGGAATCTAAGG----TTTT----GTTATGTC--G-CGC-----AA-T-C----AGG-------TTT----T------------------------------------------------G-------AA-ACA--GC----G-TGTGG--ATCAA--TC--TCCAG--AGG-
gi|13 : -TTCCCGAATA--AGTAATT--TTTGC---ATTGATCT----ACAC------G-TTTGACGAAATA------CAG-GCA-CA---GTTTG-----TTGTT--GTTG-----TTGTT---TT-GGGG-TTTT--CT--TTGCATTGTT----ATTTAG-TT-ACC-TAAACA--AAATG--TTTG-AAGGCCGA-T--TTATCAG------TGGATA-----------TG-T--------TGTTTTTC-AACC---GTGCATAG-TGTTAA--TG-TATT--ACA--A-TATA-ATATTCTAA-----GATTTTTACTT--GTCT------------TT--------------------T--------------------CAAAATATCGAAACATAA---CTCAATATAAAGTGTTATAAT-C----------AATG-ATC-GT-AAAGGAATCT-AAG----TTTT----GTTATGTC--G-CGC-----AA-T-C----AGG-------TTT----T------------------------------------------------G-------AA-ACA--GC----G-TGTGG--ATCAA--TC--TCCAG--AGG-
gi|14 : gG-ATA-C---A-A-TT---------T-TCC-TT----------C--A------AA-TTCAG-T--A--GTTG-----TG-GC-TGAT--AAA-A-G-A----AG------TG--AATATATCAAA---GA-TATTTTG-A-TTAA-AATTGC-CA-TCT-TAAA-A--TAC-CATATT------TGTTG--TA----CGGGAAG--TT-TTA-TTACTA--ATGGTTAG-GGAAT-A-----TA--------CATCCTTA----AGGAGGG-GG---AAG-GGGGGGGGGGGT-T--CCAATG-GAAATCTGGAA-AATAAAAATCCAATCCG-AGCACGCAA---G-CGGAAGTCT-CACT-ATGATTGGT
gi|15 : --T--A---------------TT--------------------T--------------------C-------CGAAACCCAG--CCTCAATATCAAGTGCCACAATACAACCAATCTAAATG-ATC-AT-AAAAGAATCTGATG----TTTT----TTCATGCC--G-TAC-----GA-T-C----AGG-------TTT----CA--G-CTTAAA-----A-A-------------GG------GG------G-------GA--GG--GG----G-CATGG--ATCAA--TC--CCCAG--AGG-CAA-TGGGTTTG-GACGC---TT--C-GC-TG--T-T--AC-GCC-T-----CCA--GT-GTGC-CC-AT-----A--T--AA-GCCCT--------GGTG------AGGGC--AT--T--G--GG-GT-G-AA----TCCCTACCTA-G-----TG-------TT-----------------ATAAA------A--TAG--A----CCC----CCTCC------CCCT--T---CATTAGGTT------AA--ATTAT-CC---T-AGAA-GAT--TAC--TG-------------T----A-T-G---CCTTGC-AA-ATT-taggggggggggtgggagggggagtcttcactatatagccagtcttcgggggggggtacgtggtctcatatgggaag
gi|16 : GTA-TA--TGGT-A-TCAT--A-ATTT----CA-TTGCT-GGTA----AT---GAATAATCCT---T----GC--CTTAAATG-AT-A---TC--T--A---A------A-TGAT--ATATAT-C-T---A--AAG-ATA-A---A-A-TC---------T-TTC-ACGACAGGC-T-C--AT-T--CAA-TTCAG-T--A--G-TGA-G--TG-AC-TG------A-A-G-A----AGTTCATTTG--A-TATATC-AAA--GA-TATT--G-A-T-AA-AATT-G-CA-ACT-AACC-A--CAC--ATATT------CGTTG--TAC---AGGA-AG--TT-TCA-TTAC--TAATGGTTAA-AGGAT-A-----
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gi|17 : -AAGACCGATTATTTATCAG------TTGATA-----------GG-----------GTTTTTC-AACA-A-----------GTTAA--AA-TGTT-AACA--A-TA-T-A------GATTTTTTACTTTCC--T--C---------------TTTTGATA--------------T--------------------C-------CGAAGCACAA--C--CAATAtaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaagaccgattatttatcagttgatagggtttttcaacaagttaaaatgttaacaatatagattttttactttcctcttttgatatccgaagcacaaccaata
gi|18 : gtttcgggaataattatttttgctttgatcttcatatgtttgatgaaacacagacacagtttgggggatttagttgttcatttatttattttaattttgcactgtgttgatttagtttaccaaaaacacaatgtccgaaaacctaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaC--G-CAC-----GA-T-C----GAA-------TTT----CAAGG------------A-A-------------GGAATAGTGG------G-------GACGGGAAGGT---G-CGTGG--ATCGA--TC--CTCAG--AGG-CAA-TGAGTCTG-GAGAT---TC--C-GC-T---------------------CCA--GT-GTGC-CA-AT-----GGCT--AA-ACCCG--------GGGG------GGGGC--A---T--A--GG-GT-G-TA----TCC---CCTA-A-----CG-------TT-----------------AT--A------G--TAG--T----CCCATGACCACC------CC----TCCCCCTAAT--T------AG--GTTTC-CC---C-AGAG-GAT-CTGC-ATG-TA-AA--T----T----A-T-G---CCTTGC-AA-GTT-AAA--TAT----CGT-CTATAAGTG-TA--T------TCGC--A-GTTT----CG-TT
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gi|2 : TAAGTATTCCGGA-TACTA-TAGGTGCTTCGCACGTTTCATCT----ACATTTAG-TGATTTGATAGAAT-----CACAGAGCA-TACGGGTTTG-----T--------TG-----TTGTT---TT-GGGG-TTCT--TTTATTGCAATGTTGTTAATTAGGTTTAACC-GTAACAGCCAATGGATCCG-AAGA-TGA-G--TTATCAG------TGGATAGTGTTTGGCTTGGTT--------TTTTTTTC-AACCTA-GTGTATGGCGGTAAA--TG-TGTT-AACA--AGTATA-A------GA-----TATCTTCA--TTGA---------------TT--------------------T--------------------
gi|2 : tgggtCTGAGA----TTTTCGGGTTCATGTC--GGCACAGTCGGA-TGC----AGGAGGTTTGTTT----CA--GGCTT--------GTA-------------GA------AA------A-------AA-GGG--GG----GGCGTAGGAATCAAAATCA-CTCAG--ATG-CAA-TGAGTTTG-GAGAC---TC--C-GCAAG--T-TACAT-GCC-T-----ACAGCGT-GCGC-CC-AT-----A--T--AACGCCC---------GGTG------AGGGA--ATC-T--G--GG-TC-G-AA----TCCAG-CCTA-AT----TG-------TT-----------------AT--AT-----G--TAG--AGACGCAC----CCTCCGACCGACCTTGGTCAGCCTCAG--TGAATACGG--ATTC--CC---T-AGAA-AAT-CT-C-ATG-TA-AT--TGACGT----A-T-G---TGCCAC-GA-TTT--AA--TAT----CGTCCAATCGGTG-TAGTTGGGAA-TGATCGA-ATTTTGTGTA-TTATTCGG----TAAGCGTGAATATTATC---T-TTTGC--TTTACATA-AT-AACGAC--T--A---ACGAGGTA-TGATTCAC-----C-TCTAA--AAGAGTA-CAGAA-A-TCATGAGGAGGT-CCA-TTGACAAGC-T-C--ATCT--CAACTTGAG-CCGAACGATGA-A--TGCGCTTGCT--AAA-AGG-A----AG------TG--A-TATGTTCAAT--GA-TAT-------T-AA-CATC-T-CA-TCT-AACCTG--C-TGTATATT------Tatcctgagattttcgggttcatgtcggcacagtcggatgcaggaggtttgtttcaggcttgtagaaaaaagggggggcgtaggaatcaaaatcactcagatgcaatgagtttggagactccgcaagttacatgcctacagcgtgcgcccatataacgcccggtgagggaatctgggtcgaatccagcctaattgttatatgtagagacgcaccctccgaccgaccttggtcagcctcagtgaatacggattccctagaaaatctcatgtaattgacgtatgtgccacgatttaatatcgtccaatcggtgtagttgggaatgatcgaattttgtgtattattcggtaagcgtgaatattatcttttgctttacataataacgactaacgaggtatgattcacctctaaaagagtacagaaatcatgaggaggtccattgacaagctcatctcaacttgagccgaacgatgaatgcgcttgctaaaaggaagtgatatgttcaatgatattaacatctcatctaacctgctgtatatttac
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Reference ( family-232 ) : TAAGT-TTCCGGAATA--A-TAATT--TTTGC---TTTGATCT----ACAC---A-TG-TTTGATGAAATA---ATACAG-GCA-CA---GTTTG-----T---T--GTTG-----TTGTT---TT-GGGG-TTTT--CT--TTGCACTGTT-TTAATTTAGTTT-ACC-TAAACA--CAATG--TCCG-AAGACCGATT--TTATCAG------TGGATA-----------GGTT--------TTTTTTTC-AACC-A-GTGCATGG-GGTTAA--TG-TGTT-AACA--A-TA-A-A------AA-----TATTTTCA--T--A---------------TT--------------------T--------------------C-------CGAAACACAA--CCTCAATATGAAGTGCCACAATACAACCAATCTAAATG-ATC-AT-AAAGGAATCTGAGG----TTTT----TTCATGTC--G-CGC-----GA-T-C----AGG-------TTT----CA--G-CTT--------A-A-------------GG------GG------G-------GA-GGG--GG----G-CGTGG--ATCAA--TC--CCCAG--AGG-CAA-TGAGTTTG-GAGAC---TC--C-GC-TG--T-T--AT-GCC-T-----CCA--GT-GTGC-CC-AT-----A--T--AA-GCCCT--------GGTG------AGGGC--A---T--G--GG-GT-G-AA----TCC---CCTA-G-----TG-------TT-----------------AT--A------G--TAG--A----CCC----CCTCC------CCCT--TCCCCCTCAG--T------AG--GTTCT-CC---T-AGAA-GAT-CTGC-ATG-TA-AA--T----T----A-T-G---CCTTGC-AA-TTT-GGA--TAT----CGT-CAATTCGTG-TA--TGGT-A-TCAT--A-ATTT----CA-TTANT-GGTA--TAAG---GAATATTCTT---TCTTTGC--TTTAAATA-AT-A---AC--T--A---G------A-TGAT--AT-----C-T---A--AAG-GTA-C---A-A-TT---------T-TCC-TTGACAAGC-T-C--AT-T--CAA-TTCAG-T--A--GATGA-A--TG-AC-TGAT--AAA-A-G-A----AG------TG--A-TATATCAAAA--GA-TATT--G-A-T-AA-AATC-T-CA-TCT-AACC-A--CACGTATATT------TGTTG--TA----AG---AG--TT-TTN-TTACTATAATGGTTAG-GGAAT-A-----TA----A--CCACCCCTC--T-AAAAAAA-AA---AGG-GGGGGGGGGGGT-T--CCGATG-GAAATCT-GAA-AAT-AAAATCCAGTCCG-AGCACGTAA--GG-GGGAAGTCT-CACT-ATGG-TGGT
gi|1 : TAAGT-TTCCGGAATA--A-TAATT--TTTGC---TTTGATCT----ACATT--A-TG-TTTGATGAAATACTAATACAG-ACA-CA---GTTTG-----T---T--CTTG-----TT------TT-GGGG-TTCT--CT--TTGCGCTGTT-TTAAATTAGTTT-ACC-TAAACA--CAATG--TCCG-AAGAATGATT--TTATCGG------TGGAT------------GGTT--------TTTTTTTC-AACC-A-GTGTATGG-GGTAAA--TG-TGTT-AACA--A-TA-A-A------AA-----TATCTTCA--T--A---------------TT--------------------T--------------------C-------CGAAACTCAA--CCTCAATATGAAGTGCCACAATACAACCAATCTAAATG-ATC-AT-TAAGGAATTTGAGG----ATTT----TTCATGTC--G-CAC-----AA-T-C----AGG-------TTTTCAACA--G-CT---------A-T-------------GG------GG------A-------GA-GGG--GG----G-CGTGG--ATCAA--TC--CCCAG--AGG-CAA-TGAGTTTG-GAGAC---TC--C-GC-TG--T-T--AT-GCC-T-----CCA--AT-GTGC-CC-AT-----A--T--AA-GCCCT--------GATG------AGGGC--A---T--G--GG-GT-G-AA----TCC---CCTT-G-----TG-------TT-----------------AT--A------C--TAG--A----TCC----TCTCC------CCCT--TCCCCCTCAG--T------AG--GTTCT-CC---T-AGAA-GAT-CTGC-ATG-TA-AA--T----T----A-T-G---CCTTGC-AA-TTT-GGA--TAT----AGT-CAATTCGTG-TA--TGGT-A-TCAT--A-ATTT----CA-TTATT-GGTA--TAAG---GAATATTCTT---TCTTTGC--TTTAAATA-AT-A---AC--T--A---G------A-TAAT--AT-----A-T---C--AAG-ATA-C---A-A-TT---------T-TCC-TTGGCAAGC-T-C--AT-T--CAA-TTCAG-T--A--GATGA-A--TG-AC-TGAT--AAA-A-G-A----AG------CG--A-TATATCAAAA--GA-TATT--G-A-T-AA-AATC-T-CA-TCT-AACC-ATGCACGTATATT------TGTTGTCTC----AA---AG--TT-TTC-TTACTATAATGGTTAG-GGAAT-A-----TA----A--CCACCCCTC--T-AAAAAAA-AA---AGG-GGGGGGGGGGGG-T--CCGATG-GAAATTT-GAA-AAT-AAAATCCAGTCCG-AACACGTAA--GG-GGGAAGTCT-CACT-ATGG-TGGT
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gi|12 : agtgcatgaggttaatgtgttaacaatttaaatattttcatagatttacttgcttttttgatatccgaaacacaacctcaatatacaaccaatctaaatgatagaggaacatggtgttttatcatgtcacacgatcagaagAGT-TCCCG-AATA--G-TAATT--TTTGC---ATTGATCT----ACAC------G-TTTGACGAAATA------CAG-GCA-CA---GTTTG-----T---T--GTTG-----TTGTTGTTTT-GGGGGTTTT--CT--TTGCATTGTT-TAAATTTAGTTA-CCC-TAAACA--AAATG--TTTG-AAGGCCGA-T--TTATCAG------TGGATA-----------TG-T--------TGTTTTTC-AACC-A-GTGCATAG-TGTTAA--TG-TATT-AACA--A-TA-T-A------AA-----TATTCTAA--G--A---------------TTTTTACTTGTCTTTTCGAATAT--------------------C-------CGAAACATAA--ACTCAATATAAAGTGTTATAAT-C----------AATG-ATC-GT-AAAGGAATCTAAGG----TTTT----GTTATGTC--G-CGC-----AA-T-C----AGG-------TTT----T------------------------------------------------G-------AA-ACA--GC----G-TGTGG--ATCAA--TC--TCCAG--AGG-
gi|13 : -TTCCCGAATA--AGTAATT--TTTGC---ATTGATCT----ACAC------G-TTTGACGAAATA------CAG-GCA-CA---GTTTG-----TTGTT--GTTG-----TTGTT---TT-GGGG-TTTT--CT--TTGCATTGTT----ATTTAG-TT-ACC-TAAACA--AAATG--TTTG-AAGGCCGA-T--TTATCAG------TGGATA-----------TG-T--------TGTTTTTC-AACC---GTGCATAG-TGTTAA--TG-TATT--ACA--A-TATA-ATATTCTAA-----GATTTTTACTT--GTCT------------TT--------------------T--------------------CAAAATATCGAAACATAA---CTCAATATAAAGTGTTATAAT-C----------AATG-ATC-GT-AAAGGAATCT-AAG----TTTT----GTTATGTC--G-CGC-----AA-T-C----AGG-------TTT----T------------------------------------------------G-------AA-ACA--GC----G-TGTGG--ATCAA--TC--TCCAG--AGG-
gi|14 : gG-ATA-C---A-A-TT---------T-TCC-TT----------C--A------AA-TTCAG-T--A--GTTG-----TG-GC-TGAT--AAA-A-G-A----AG------TG--AATATATCAAA---GA-TATTTTG-A-TTAA-AATTGC-CA-TCT-TAAA-A--TAC-CATATT------TGTTG--TA----CGGGAAG--TT-TTA-TTACTA--ATGGTTAG-GGAAT-A-----TA--------CATCCTTA----AGGAGGG-GG---AAG-GGGGGGGGGGGT-T--CCAATG-GAAATCTGGAA-AATAAAAATCCAATCCG-AGCACGCAA---G-CGGAAGTCT-CACT-ATGATTGGT
gi|15 : --T--A---------------TT--------------------T--------------------C-------CGAAACCCAG--CCTCAATATCAAGTGCCACAATACAACCAATCTAAATG-ATC-AT-AAAAGAATCTGATG----TTTT----TTCATGCC--G-TAC-----GA-T-C----AGG-------TTT----CA--G-CTTAAA-----A-A-------------GG------GG------G-------GA--GG--GG----G-CATGG--ATCAA--TC--CCCAG--AGG-CAA-TGGGTTTG-GACGC---TT--C-GC-TG--T-T--AC-GCC-T-----CCA--GT-GTGC-CC-AT-----A--T--AA-GCCCT--------GGTG------AGGGC--AT--T--G--GG-GT-G-AA----TCCCTACCTA-G-----TG-------TT-----------------ATAAA------A--TAG--A----CCC----CCTCC------CCCT--T---CATTAGGTT------AA--ATTAT-CC---T-AGAA-GAT--TAC--TG-------------T----A-T-G---CCTTGC-AA-ATT-taggggggggggtgggagggggagtcttcactatatagccagtcttcgggggggggtacgtggtctcatatgggaag
gi|16 : GTA-TA--TGGT-A-TCAT--A-ATTT----CA-TTGCT-GGTA----AT---GAATAATCCT---T----GC--CTTAAATG-AT-A---TC--T--A---A------A-TGAT--ATATAT-C-T---A--AAG-ATA-A---A-A-TC---------T-TTC-ACGACAGGC-T-C--AT-T--CAA-TTCAG-T--A--G-TGA-G--TG-AC-TG------A-A-G-A----AGTTCATTTG--A-TATATC-AAA--GA-TATT--G-A-T-AA-AATT-G-CA-ACT-AACC-A--CAC--ATATT------CGTTG--TAC---AGGA-AG--TT-TCA-TTAC--TAATGGTTAA-AGGAT-A-----
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gi|17 : -AAGACCGATTATTTATCAG------TTGATA-----------GG-----------GTTTTTC-AACA-A-----------GTTAA--AA-TGTT-AACA--A-TA-T-A------GATTTTTTACTTTCC--T--C---------------TTTTGATA--------------T--------------------C-------CGAAGCACAA--C--CAATAtaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaagaccgattatttatcagttgatagggtttttcaacaagttaaaatgttaacaatatagattttttactttcctcttttgatatccgaagcacaaccaata
gi|18 : gtttcgggaataattatttttgctttgatcttcatatgtttgatgaaacacagacacagtttgggggatttagttgttcatttatttattttaattttgcactgtgttgatttagtttaccaaaaacacaatgtccgaaaacctaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaC--G-CAC-----GA-T-C----GAA-------TTT----CAAGG------------A-A-------------GGAATAGTGG------G-------GACGGGAAGGT---G-CGTGG--ATCGA--TC--CTCAG--AGG-CAA-TGAGTCTG-GAGAT---TC--C-GC-T---------------------CCA--GT-GTGC-CA-AT-----GGCT--AA-ACCCG--------GGGG------GGGGC--A---T--A--GG-GT-G-TA----TCC---CCTA-A-----CG-------TT-----------------AT--A------G--TAG--T----CCCATGACCACC------CC----TCCCCCTAAT--T------AG--GTTTC-CC---C-AGAG-GAT-CTGC-ATG-TA-AA--T----T----A-T-G---CCTTGC-AA-GTT-AAA--TAT----CGT-CTATAAGTG-TA--T------TCGC--A-GTTT----CG-TT
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gi|2 : TAAGTATTCCGGA-TACTA-TAGGTGCTTCGCACGTTTCATCT----ACATTTAG-TGATTTGATAGAAT-----CACAGAGCA-TACGGGTTTG-----T--------TG-----TTGTT---TT-GGGG-TTCT--TTTATTGCAATGTTGTTAATTAGGTTTAACC-GTAACAGCCAATGGATCCG-AAGA-TGA-G--TTATCAG------TGGATAGTGTTTGGCTTGGTT--------TTTTTTTC-AACCTA-GTGTATGGCGGTAAA--TG-TGTT-AACA--AGTATA-A------GA-----TATCTTCA--TTGA---------------TT--------------------T--------------------
gi|2 : tgggtCTGAGA----TTTTCGGGTTCATGTC--GGCACAGTCGGA-TGC----AGGAGGTTTGTTT----CA--GGCTT--------GTA-------------GA------AA------A-------AA-GGG--GG----GGCGTAGGAATCAAAATCA-CTCAG--ATG-CAA-TGAGTTTG-GAGAC---TC--C-GCAAG--T-TACAT-GCC-T-----ACAGCGT-GCGC-CC-AT-----A--T--AACGCCC---------GGTG------AGGGA--ATC-T--G--GG-TC-G-AA----TCCAG-CCTA-AT----TG-------TT-----------------AT--AT-----G--TAG--AGACGCAC----CCTCCGACCGACCTTGGTCAGCCTCAG--TGAATACGG--ATTC--CC---T-AGAA-AAT-CT-C-ATG-TA-AT--TGACGT----A-T-G---TGCCAC-GA-TTT--AA--TAT----CGTCCAATCGGTG-TAGTTGGGAA-TGATCGA-ATTTTGTGTA-TTATTCGG----TAAGCGTGAATATTATC---T-TTTGC--TTTACATA-AT-AACGAC--T--A---ACGAGGTA-TGATTCAC-----C-TCTAA--AAGAGTA-CAGAA-A-TCATGAGGAGGT-CCA-TTGACAAGC-T-C--ATCT--CAACTTGAG-CCGAACGATGA-A--TGCGCTTGCT--AAA-AGG-A----AG------TG--A-TATGTTCAAT--GA-TAT-------T-AA-CATC-T-CA-TCT-AACCTG--C-TGTATATT------Tatcctgagattttcgggttcatgtcggcacagtcggatgcaggaggtttgtttcaggcttgtagaaaaaagggggggcgtaggaatcaaaatcactcagatgcaatgagtttggagactccgcaagttacatgcctacagcgtgcgcccatataacgcccggtgagggaatctgggtcgaatccagcctaattgttatatgtagagacgcaccctccgaccgaccttggtcagcctcagtgaatacggattccctagaaaatctcatgtaattgacgtatgtgccacgatttaatatcgtccaatcggtgtagttgggaatgatcgaattttgtgtattattcggtaagcgtgaatattatcttttgctttacataataacgactaacgaggtatgattcacctctaaaagagtacagaaatcatgaggaggtccattgacaagctcatctcaacttgagccgaacgatgaatgcgcttgctaaaaggaagtgatatgttcaatgatattaacatctcatctaacctgctgtatatttac
gi|20 : tgggttaagtattccggatactataggtgcttcgcacgtttcatctacatttagtgatttgatagaatcacagagcatacgggtttgttgttgttttggggttcttttattgcaatgttgttaattaggtttaaccgtaacagccaatggatccgaagatgagttatcagtggatagtgtttggcttggtttttttttcaacctagtgtatggcggtaaatgtgttaacaagtataagatatcttcattgatttatcA--TC--TCCAG--AAG-TAA-TGAGTGTT-TAGAC---GT--T-GC-TG--T-T--AT-AAC-T-----CCA--GT-GTGC-CC-AT-----CGTT--AA-GTCATGGGGGGGGGGGG------AGGGG--G---TGCG--AG-GT-G-AA----TCC---CCTA-G-----TG-------TT-----------------AT--A------G--TAG--A-----TC----CCTCC-------------CCTCCTCTG--T------AG--GTTCT--C---T-AAAA-GAT-CTGC-ATG-TA-AA--T----T----A-T-A---TCTTGC-AA--TT-GAG--TAT----CGT-CAATTCATG-TA--TGGT-ac
gi|20 : TTGC--TTTAAAAA-AT-A---AC--T--A---G------A-TGAT--AT-----C-T------AAG-ACA-C---A-A-TT---------cattgctttaaaaaataactagatgatatctaagacacaatt
gi|21 : atctccagaagtaatgagtgtttagacgttgctgttataactccagtgtgcccatcgttaagtcatggggggggggggagggggtgcgaggtgaatcccctagtgttatagtagatccctcccctcctctgtaggttctctaaaagatctgcatgtaaattatatcttgcaattgagtatcgtcaattcatgtatggtcaTT--TTGT-AG------TTGATGT----------GGTT--------TTTCAGGC-AGCT-A-GTGCATGA-AGTTAA--TG-TGTT-AACA--A-TA-T-A------AA-----TATTTTCA--C--A---------------CTTTTGATA-------------T--------------------C-------TGAAGCACGA--CTTCAGTATGAA--GCCAGTCTA-AATTA--CTAAATG-ATCAAA-AAAGGAATCTGAGG-----TAT----ATCATTGC--G-CGC-----GA-T-C----AGT-------TTT----CA--G-CTT--------C-A-------------GG------GG------GTGAGAACGG-GAG--GG----A-TGTGG--ATTAA--TC--CTCAA--GGG-
gi|22 : TC--T-AAGACAC-AATTTAGG-TGGGGGAGGGGT-T--CCGATG-AAAAT-T-GGA-AAT-AGAATCCAATCCG-AGCACGTAA--GG-GGGGAGTTT-CACC-ATGG-TGGT
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gi|24 : --TTAATAG------TGGATATGCT-------GATT--------TTTTTTGT-AACC-A-GTGT-TGG-GGAAAAGTTGGCGTCGAACA--A-TT-A-A------AA-----TATCTT-A--T--A---------------TT--------------------T--------------------C-------CAAAAATGAA--CCTCAAT-TGAAGTGCCGTAATACAACCAATCT-AATG-AT--ATAAAAGGAATCTGA------TTTT----TTCA-GT---G-CAC-----AAGT-C----AGG-------TTT----CA--G-CTT--------A-A-------------
gi|25 : CAACCAATCTAAATG-ATC-AT-AAAGAAATCTGAGG----TTTT----TTCATGCC--G-CAC-----GA-T-C----ATG-------AAT----CA--G-CTA--------A-AAAAAAAAAAGGGTGG------GG------G-------GA-GGG--GG----G-CGTGG--ATCAA--TC--CCCAG--AGG-C-------TTTG-GATGC---TT--C-GC-TG--T-T--AT-GCC-T-----CCA--GT-a
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gi|29 : -TTACTA--ATGATTAG-GGAAT-A-----TAT---AT-CCACCCCTC--TAAAAAAAA-AA---AAG-GAGGAGGGGGGTGT--CCAACG-G---------------AAAATCCAGTCCG-AACACGTTA--GG-GGGAAGTCT-CACT-ATGG-
gi|3 : --------A-A-------------AG------GG------G-------GG-GGG--GA----G-CG--G--ATCAA--TC--CCCAGT-ACG-CAA-TGGGTT-G-CATGC---TT--C--C-TA--C-T--AT-GCCAT-----CCA---T-GTGC-C---T-----A--T--AA--CCCT--------GCGG------AG--C--A---T--T--AG-GTTGCAA----TCC---CCTA-G-----TACGTGTGATT-----------------AA--A------A--TAG--A----CCC----CCTCC------CCCT---------CGA--T------A----TTCT-CCCATT-AATA-AAT-A-GC-ATG-TA-AA--T----A----AAT-A---CCTTGC-AA-AT--GGA--TAT----CGT-AAATTAGTG-TG--TG---A-TCAT--A-ATTT----CA-TTAAT-G-----TAAT---CAATATTCTTATATCTATGC--TT--AATATAT-A---AC--T--AATGG------A-TGAT--AT-----C-T---A--CAT-GTA-C---A-AGTT---------T-TCC-TTGACAAGC-T-C--AT-T--TAGCTTCAG-T--AT-GATGA-ACATG-AC-T-AT--AAA-G-A-ATGTGAG------TA--A-TAT-TCAAAA-----TATT--G-A-T-CA-AAAC-T----TCT-AAC--A--C-TTTATATT------TGTTG--TAG---AG---AA--TT-TTGCTTACTA-AATG-TTAG-GAAAT-A-----TA----AACCTACCTCTT--T-TAAATAA-AAT--AGG-AGGGAGG------T--CCGATG-GAAATTT-GAAGAAT-AAAATCCAGTCC--AACACCTAG--GG-AGGAAATCTCCACT-A
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gi|31 : GT-TTCCGGAATA--A-TAATT--TTTGC---TTTGACCTGTAGACAT---AATG-TTTAATGAAATA------CAG-GTA-CG---GTTT--------------TTG-----TTGTT---TT-GGGG-TTTT--CT--TTGCAATGTT-TTAATTTA
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gi|34 : ATG-ATC-AT-AGAGGAATCTGAGGGTTTTTTT----TCCATATC--G-CAC-----AA-T-C----AGG-------TTA----CA--G-CTTAA------A-A-------------GG------GG------G-------TA-GGG-----------GTGG--ATCAA--TC--CTCAG--AGG-CAA-T
gi|35 : AAACA--CAAT---TCCATGAGAC-GATT--T-ATCA-------TGGATA-----------TGTC--------TCTTTTAC-AACC-ACGTGTATGG---TTAA--TG-TGTT-AACC--A-T
gi|36 : AATA-AT-T---AC--TTTA---G------A-TGAT--AT-----C-T---A--AAG-GTA-C---A-A-TT---------T-TCA-TTGACAAGC-T-C--AT-T--CAA-TTCAG-T--A--GATGA-A--CA-AC-TGAT--AAA-A-G-A----AG------TG--A-TATAtcatctataaatgctct
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gi|38 : A--TG-GGTT-AA------TG-A-A------TA-----TATTTTCA--T--A---------------TT--------------------TTTACTTGTCCTTTTTGTTATC-------CGAAACACAA--CCTGAATATGAAGTGTCACAAT-CAAg
gi|39 : TT--G-AAT-AATAATC-TGCG-TCT-AA---A--CAC-TACATTAGAGAATGTTG--TA----AG---AAGTTT-TTC-TTAC--TAATGGTTAA-GGAAT-A-----tta
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gi|5 : A---ATACAG-GCA-CA---GTTTG-----T---T--GTTG-----TTGTT---TTTGGGG-TTTT--CT--TTGCACTGTT-TTAATTTAGTTT-ACC-TAAACA--CAATG--TCTG-AAGACCGATT--T-ATCAG------TGGATATGTTTTTTT--GGTT--------TTTTTCTCCAACC-A-GTGCATGG-GGTTAA--TG-T--C-AATAT-A-GA-A-ACCTA--AA-----TATTTTCA--T--G---------------TT--------------------TTTACTTGTCTTTTTGGATATC-------CGAAACA-AA--C-TCAATATGAAGTGTTACAAT---------C--AATG-ATC-GT-GAAGGAATCTGAGG----TTTT----ATCATTTC--G-TGT-----GA-T-C----AAG-------TTT----CA--G-CTT--------A-A-------------AA------GG------G-------GA-GGG--GC----G-CGTGG--ATCAA--TC--CC-AG--AGG-CAA-TGAATCTG-GAGAC---TC--C-GC-TG--T-T--AT-GCC-T-----CCA--CT-GTGC-CC-GG-----A------A-G---------------G------GGGG---A---T--G--GG-GT-G-AA----TCC---CCTA-G-----TG-------TT-----------------AT--ACATGTAG--TAG--A----CCC----C-------------T--CCCCCCTCAG--T------AG--GTTCT-CA---T-AGAG-GAT-CTGC-ATG-TA-AA--T----T----A-T-A---TCTTGC-AA-TTT-GGA--TAT----CGT-CAATTCGTG-TA--TGGT-A-TCAT--A-ATTT----CA-TTATT-G
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blockSeqs : . . . . . . TGT . . . G A . . . . . A . . . . TTT . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . CG . A . . . . . . . . . . . AG . CCGCCCCT C G . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . C . . . . . . . . A . TTAG . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . A A . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . T A . CTACG . . GAG . . AA . . . TTAA A . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . GG . . . G T . . . . . A . . . . TTT . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . CA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . GT . G . . . . . . . . . . . AG . CTCCCCTT C C . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . G . . . . . . . . T . TAAG . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . A T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . ACAC . . . . . TA . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . T . . . . . A . . . . TTT . . . . . . . . . . A . . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . TT . G . . . . . . . . . . . AG . CCACCTT C C . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . TAAG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . A A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . CCAG . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . T . . . . . A . . . . TTT . . . . . . A . . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . G . A . . . . . . . . . . . AA . TCCCTCC . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . TTT . . . . . G . . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . T . A . . . . . . . . . . . AG . TTCCCCT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . TTT . . G . . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . T . A . . . . . . . . . . . AG . CCCCCGA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . AA . CCCCTC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . AA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . TT . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-232 ) : TAAGT-TTCCGGAATA--A-TAATT--TTTGC---TTTGATCT----ACAC---A-TG-TTTGATGAAATAC----ACAG-GCA-CA---GTTTG-----T---T--GTTG-----TTGTT---TT-GGGG-TTTT--CT--TTGCACTGTT-TTAATTTAGTTT-ACC-TAAACA--CAATG--TCCG-AAGACCGATT--TTATCAG------TGGATA----------TG--------GTT---TTTTTTTC-AACC-A-GTGCATGG-GGTTAA--TG-TGTT-AACA--A-TA-A-A------AA-----TATTTTCA--T--A---------------TT--------------------T--------------------C-------CGAAACACAA--CCTCAATATGAAGTGCCACAATACAACCAATCTAAATG-ATC-AT-AAAGGAATCTGAGG----TTTT----TTCATGTC--G-CGC-----GA-T-C----AGG-------TTT----CA--G-CTT--------A-A-------------GG------GG------G-------GA-GGG--GG----G-CGTGG--ATCAA--TC--CCCAG--AGG-CAA-TGAGTTTG-GAGAC---TC--C-GC-TG--T-T--AT-GCC-T-----CCA--GT-GTGC-CC-AT-----A--T--AA-GCCCT--------GGTG------AGGGC--A---T--G--GG-GT-G-AA----TCC---CCTA-G-----TG-------TT-----------------A------T--A-G--TAG--A----CCC----CCTCC------CC-C---TCCCCCTCAGT------AG--G-----TTCT-CC---T-AGAA-GAT-CTGC-ATG-TA-AA--T----T----A-T-G---CCTTGC-AA-TTT-GGA--TAT----CGT-CAATTCGTG-TA--TGGT-A-TCAT--A-ATTT----CA-TT-ANT-GG--TAAG---GAATATTCTT---TCTTTGC--TTTAAATA-AT-A---AC--T--A---G------A-TG----AT--AT-----C-T---A--AAG-GTA-C---A-A-TT---------T-TCC-TTGACAAGC-T-C--AT-T--CAA-TTCAG-T--A--GATGA-A--TG-AC-TGAT--AAA-A-G-A----AG------TG--A-TATATCAAAA--GA-TATT--G-A-T-AA-AATC-T-C-A-TCT-AACCACGC---TATATT------TGTTGTA-GGGAAGTT--TTNTTAC--TAATGGTTAG-GGAAT-A-----TA----A--CCACC-CCTC--T-AAAAAAA-AA---AGG-GGGGGGGGGGGT-T--CCGATG-GAAATCT-GAA-AAT-AAAATCCAGTCCG-AGCACGTAA--GG-GGGAAGTCT-CACT-ATGG-TGGT
gi|1 : TAAGT-TTCCGGAATA--A-TAATT--TTTGC---TTTGATCT----ACATT--A-TG-TTTGATGAAATACTAATACAG-ACA-CA---GTTTG-----T---T--CTTG-----TT------TT-GGGG-TTCT--CT--TTGCGCTGTT-TTAAATTAGTTT-ACC-TAAACA--CAATG--TCCG-AAGAATGATT--TTATCGG------TGGAT------------G--------GTT---TTTTTTTC-AACC-A-GTGTATGG-GGTAAA--TG-TGTT-AACA--A-TA-A-A------AA-----TATCTTCA--T--A---------------TT--------------------T--------------------C-------CGAAACTCAA--CCTCAATATGAAGTGCCACAATACAACCAATCTAAATG-ATC-AT-TAAGGAATTTGAGG----ATTT----TTCATGTC--G-CAC-----AA-T-C----AGG-------TTTTCAACA--G-C-T--------A-T-------------GG------GG------A-------GA-GGG--GG----G-CGTGG--ATCAA--TC--CCCAG--AGG-CAA-TGAGTTTG-GAGAC---TC--C-GC-TG--T-T--AT-GCC-T-----CCA--AT-GTGC-CC-AT-----A--T--AA-GCCCT--------GATG------AGGGC--A---T--G--GG-GT-G-AA----TCC---CCTT-G-----TG-------TT-----------------A------T--A-C--TAG--A----TCC----TCTCC------CC-CT--TCCCCCTCAGT------AG--G-----TTCT-CC---T-AGAA-GAT-CTGC-ATG-TA-AA--T----T----A-T-G---CCTTGC-AA-TTT-GGA--TAT----AGT-CAATTCGTG-TA--TGGT-A-TCAT--A-ATTT----CA-TT-ATT-GGTATAAG---GAATATTCTT---TCTTTGC--TTTAAATA-AT-A---AC--T--A---G------A-TA----AT--AT-----A-T---C--AAG-ATA-C---A-A-TT---------T-TCC-TTGGCAAGC-T-C--AT-T--CAA-TTCAG-T--A--GATGA-A--TG-AC-TGAT--AAA-A-G-A----AG------CG--A-TATATCAAAA--GA-TATT--G-A-T-AA-AATC-T-C-A-TCT-AACCATGCACGTATATT------TGTTGTC-TCAAAGTT--TTCTTACTATAATGGTTAG-GGAAT-A-----TA----A--CCACC-CCTC--T-AAAAAAA-AA---AGG-GGGGGGGGGGGG-T--CCGATG-GAAATTT-GAA-AAT-AAAATCCAGTCCG-AACACGTAA--GG-GGGAAGTCT-CACT-ATGG-TGGT
gi|10 : -----T---T--GTTG-----CTGTT---TT-GGGG-TTCT--CT--TTGCACTGAT-TTAATTCAG------------------ATG--TCCG-AAGAACGATT--T-ATCAGCCTGAGTGGATA----------TG---------TTGGGTTTTTTTT-AACC-A-GTGTATGG-GGTAAA--TG-TGCT-AACA--A-TG-A-A------AA-----TATCTTCA--T--A---------------TT--------------------T--------------------C-------CGAAACTCAA--CCTCAATATGAAGTGCCACAATACAACCAATCTAAATT-ATC-AT-AAAAGAATCTGAGGTT--TTTT----TTTATGTC--G-CAC-----GA-T-CCTGAAGG-------TTT----CA--G-CTT--------A-A-------------AA------GG------G-------GA-GGG--GG----G-CCTGG--ATCAA--TC--CCCAG--AGG-CAA-TGAGTTAG-GAGAC---TC--C-GT-TG--T-T--AT-GCC-T-----CCA--GT-GTGC-CC-AT-----A--T--AA-GCCTT--------GGTG------AGGGC--A---TTGG--GG-GT-G-AA----TCC---CCTA-A-----AG-------TT-----------------A------T--A-G--TAG--A-----CC----CCTCA------TC-T---TCCCCCTCAGT------AG--G-----TTCT-CC---T-TGAA-GAT-C
gi|11 : t-A-GTGCATGA-GGTTAA--TG-TGTT-AACA--A-TT-T-A------AA-----TATTTTCA--T--AGATTTACTTGCTTTTTTGATA----------------T--------------------C-------CGAAACACAA--CCTCAAT-------------ATACAACCAATCTAAATG-----AT-AGAGGAACATGGTG----TTTT----ATCATGTC--A-CAC-----GA-T-C----AG
gi|11 : CCAT--AGA-CAA-TGAGTCTG-GAGAC---TC--C-GC-TG--T-T--AT-GTT-T-----CTA--GT-GTGC-CC-AT-----GGCT--AA-GCCCT--------GGTG------GGGAC--A---T--G--GG-GC-A-AA----TGC---CCTA-G-----TG-------TT-----------------A------T--A-G--CAG--A----CCA----CCT---------------TTCCTCTCAGT------AG--G--------------------------CTGC-ATG-CA-AA--T----C----A-T-G---TCTTGC-AA-TTT-GGA--TATATATCGT-CAATTCGTG-TA--TGGT-A-TCGT--A-ATTT----CA-TTTATT-GG--TAAT---GAATATCCTT---ACTTTGT--TCTAAATA-AT-G---AC--T--G---A------A-TG----AT--GT-----C-T---A--AAaagccatagacaatgagtctggagactccgctgttatgtttctagtgtgcccatggctaagccctggtggggacatggggcaaatgccctagtgttatagcagaccacctttcctctcagtaggctgcatgcaaatcatgtcttgcaatttggatatatatcgtcaattcgtgtatggtatcgtaatttcatttattggtaatgaatatccttactttgttctaaataatgactgaatgatgtctaaa
gi|12 : agtgcatgaggttaatgtgttaacaatttaaatattttcatagatttacttgcttttttgatatccgaaacacaacctcaatatacaaccaatctaaatgatagaggaacatggtgttttatcatgtcacacgatcagaagAGT-TCCCG-AATA--G-TAATT--TTTGC---ATTGATCT----ACAC------G-TTTGACGAAATAC----A--G-GCA-CA---GTTTG-----T---T--GTTG-----TTGTTGTTTT-GGGGGTTTT--CT--TTGCATTGTT-TAAATTTAGTTA-CCC-TAAACA--AAATG--TTTG-AAGGCCGA-T--TTATCAG------TGGATA----------TG----------T---TGTTTTTC-AACC-A-GTGCATAG-TGTTAA--TG-TATT-AACA--A-TA-T-A------AA-----TATTCTAA--G--A---------------TTTTTACTTGTCTTTTCGAATAT--------------------C-------CGAAACATAA--ACTCAATATAAAGTGTTATAAT-C----------AATG-ATC-GT-AAAGGAATCTAAGG----TTTT----GTTATGTC--G-CGC-----AA-T-C----AGG-------TTT----T------------------------------------------------G-------AA-ACA--GC----G-TGTGG--ATCAA--TC--TCCAG--AGG-
gi|13 : -TTCCCGAATA--AGTAATT--TTTGC---ATTGATCT----ACAC------G-TTTGACGAAATAC----A--G-GCA-CA---GTTTG-----TTGTT--GTTG-----TTGTT---TT-GGGG-TTTT--CT--TTGCATTGTT----ATTTAG-TT-ACC-TAAACA--AAATG--TTTG-AAGGCCGA-T--TTATCAG------TGGATA----------TG----------T---TGTTTTTC-AACC---GTGCATAG-TGTTAA--TG-TATT--ACA--A-TATA-ATATTCTAA-----GATTTTTACTT--GTCT------------TT--------------------T--------------------CAAAATATCGAAACATAA---CTCAATATAAAGTGTTATAAT-C----------AATG-ATC-GT-AAAGGAATCT-AAG----TTTT----GTTATGTC--G-CGC-----AA-T-C----AGG-------TTT----T------------------------------------------------G-------AA-ACA--GC----G-TGTGG--ATCAA--TC--TCCAG--AGG-
gi|14 : gG-ATA-C---A-A-TT---------T-TCC-TT----------C--A------AA-TTCAG-T--A--GTTG-----TG-GC-TGAT--AAA-A-G-A----AG------TG--AATATATCAAA---GA-TATTTTG-A-TTAA-AATTGC-C-A-TCT-TAAAATAC---CATATT------TGTTGTACGGGAAGTT--TTATTAC--TAATGGTTAG-GGAAT-A-----TA--------CATC-CTTA----AGGAGGG-GG---AAG-GGGGGGGGGGGT-T--CCAATG-GAAATCTGGAA-AATAAAAATCCAATCCG-AGCACGCAA---G-CGGAAGTCT-CACT-ATGATTGGT
gi|15 : --T--A---------------TT--------------------T--------------------C-------CGAAACCCAG--CCTCAATATCAAGTGCCACAATACAACCAATCTAAATG-ATC-AT-AAAAGAATCTGATG----TTTT----TTCATGCC--G-TAC-----GA-T-C----AGG-------TTT----CA--G-CTTAAA-----A-A-------------GG------GG------G-------GA--GG--GG----G-CATGG--ATCAA--TC--CCCAG--AGG-CAA-TGGGTTTG-GACGC---TT--C-GC-TG--T-T--AC-GCC-T-----CCA--GT-GTGC-CC-AT-----A--T--AA-GCCCT--------GGTG------AGGGC--AT--T--G--GG-GT-G-AA----TCCCTACCTA-G-----TG-------TT-----------------A------TAAA-A--TAG--A----CCC----CCTCC------CC-C---T-----TCATT------AG--GTTAAATTAT-CC---T-AGAA-GAT--TAC--TG-------------T----A-T-G---CCTTGC-AA-ATT-taggggggggggtgggagggggagtcttcactatatagccagtcttcgggggggggtacgtggtctcatatgggaag
gi|16 : GTA-TA--TGGT-A-TCAT--A-ATTT----CA-TT-GCT-GG--TAAT---GAATA----A---TCCTTGC--CTTAAATG-AT-A---TC--T--A---A------A-TGATATAT--AT-----C-T---A--AAG-ATA-A---A-A-TC---------T-TTC-ACGACAGGC-T-C--AT-T--CAA-TTCAG-T--A--G-TGA-G--TG-AC-TG------A-A-G-A----AGTTCATTTG--A-TATATC-AAA--GA-TATT--G-A-T-AA-AATT-G-C-A-ACT-AACCACAC----ATATT------CGTTGTACAGGAAGTT--TCATTAC--TAATGGTTAA-AGGAT-A-----
gi|17 : tgtggattaatcctcaagggaaGT-TTCGGGAATA--A-TTATT--TTTGC---TTTGATCT----TCAT---A-TG-TTTGATGAA--AC----ACAG-ACA-CA---GTTTGGGGGAT---TTAGTTGTTCATTTATT---T-----A-TTTTAATT--TTGCACTGTG-TTGATTTAGTTT-ACCAAAAACA--CAATG--TCCG-AAAACCgaggggatgcccatatccagtcttcagttgaaaatttagaaataaaa
gi|17 : -AAGACCGATTATTTATCAG------TTGATA----------GG--------G-------TTTTTC-AACA-A-----------GTTAA--AA-TGTT-AACA--A-TA-T-A------GATTTTTTACTTTCC--T--C---------------TTTTGATA--------------T--------------------C-------CGAAGCACAA--C--CAATAtaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaagaccgattatttatcagttgatagggtttttcaacaagttaaaatgttaacaatatagattttttactttcctcttttgatatccgaagcacaaccaata
gi|18 : gtttcgggaataattatttttgctttgatcttcatatgtttgatgaaacacagacacagtttgggggatttagttgttcatttatttattttaattttgcactgtgttgatttagtttaccaaaaacacaatgtccgaaaacctaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaC--G-CAC-----GA-T-C----GAA-------TTT----CAAGG------------A-A-------------GGAATAGTGG------G-------GACGGGAAGGT---G-CGTGG--ATCGA--TC--CTCAG--AGG-CAA-TGAGTCTG-GAGAT---TC--C-GC-T---------------------CCA--GT-GTGC-CA-AT-----GGCT--AA-ACCCG--------GGGG------GGGGC--A---T--A--GG-GT-G-TA----TCC---CCTA-A-----CG-------TT-----------------A------T--A-G--TAG--T----CCCATGACC-AC------CC-C---TCCCCCTAATT------AG--G-----TTTC-CC---C-AGAG-GAT-CTGC-ATG-TA-AA--T----T----A-T-G---CCTTGC-AA-GTT-AAA--TAT----CGT-CTATAAGTG-TA--T------TCGC--A-GTTT----CG-TT-
gi|19 : --TC--TCCAG--AAG-TAA-TGAGTGTT-TAGAC---GT--T-GC-TG--T-T--AT-ACC-T-----CCA--GT-GTGC-CC-AT-----CGTT--AA-GTCAT--------GGGGGGGGGGAGGGG--G---T--GCGAG-GT-G-AA----TCC---CCTA-G-----TG-------TT-----------------A------T--A-G--TAG--A----TCC----CCTCC------CC-C---TCC---TCTGT------AG--G-----TTCT-C----T-AAAA-GAT-CTGC-ATG-TA-AA--T----T----A-T-A---TCTTGC-AA-TTT-GA------------------------------GT-A-TCGT--C-AATT----CA-T-------G--TATG---G------------TCATTGC--TTTAAAAA-AT-A---AC--T--A---G------A-TG----AT--AT-----C-T---A--AAG-ACA-C---A-A-Tctccatattgaattgtcttatctc
gi|2 : TAAGTATTCCGGA-TACTA-TAGGTGCTTCGCACGTTTCATCT----ACATTTAG-TGATTTGATAGAAT-C----ACAGAGCA-TACGGGTTTG-----T--------TG-----TTGTT---TT-GGGG-TTCT--TTTATTGCAATGTTGTTAATTAGGTTTAACC-GTAACAGCCAATGGATCCG-AAGA-TGA-G--TTATCAG------TGGATAGTGTTTGGCTTG--------GTT---TTTTTTTC-AACCTA-GTGTATGGCGGTAAA--TG-TGTT-AACA--AGTATA-A------GA-----TATCTTCA--TTGA---------------TT--------------------T--------------------
gi|2 : tgggtCTGAGA----TTTTCGGGTTCATGTC--GGCACAGTCGGA-TGC----AGGAGGTTTGTTT----CA--GGCTT--------GTA-------------GA------AA------A-------AA-GGG--GG----GGCGTAGGAATCAAAATCA-CTCAG--ATG-CAA-TGAGTTTG-GAGAC---TC--C-GCAAG--T-TACAT-GCC-T-----ACAGCGT-GCGC-CC-AT-----A--T--AACGCCC---------GGTG------AGGGA--ATC-T--G--GG-TC-G-AA----TCCAG-CCTA-AT----TG-------TT-----------------A------T--ATG--TAG--AGACGCAC----CCTCCGACCGACC-TTGGTCAGCCTCAGTGAATACGG--A-----TTC--CC---T-AGAA-AAT-CT-C-ATG-TA-AT--TGACGT----A-T-G---TGCCAC-GA-TTT--AA--TAT----CGTCCAATCGGTG-TAGTTGGGAA-TGATCGA-ATTTTGTGTA-TT-ATTCGG--TAAGCGTGAATATTATC---T-TTTGC--TTTACATA-AT-AACGAC--T--A---ACGAGGTA-TG----ATTCAC-----C-TCTAA--AAGAGTA-CAGAA-A-TCATGAGGAGGT-CCA-TTGACAAGC-T-C--ATCT--CAACTTGAG-CCGAACGATGA-A--TGCGCTTGCT--AAA-AGG-A----AG------TG--A-TATGTTCAAT--GA-TAT-------T-AA-CATC-T-C-A-TCT-AACC-TGCTG-TATATT------Tatcctgagattttcgggttcatgtcggcacagtcggatgcaggaggtttgtttcaggcttgtagaaaaaagggggggcgtaggaatcaaaatcactcagatgcaatgagtttggagactccgcaagttacatgcctacagcgtgcgcccatataacgcccggtgagggaatctgggtcgaatccagcctaattgttatatgtagagacgcaccctccgaccgaccttggtcagcctcagtgaatacggattccctagaaaatctcatgtaattgacgtatgtgccacgatttaatatcgtccaatcggtgtagttgggaatgatcgaattttgtgtattattcggtaagcgtgaatattatcttttgctttacataataacgactaacgaggtatgattcacctctaaaagagtacagaaatcatgaggaggtccattgacaagctcatctcaacttgagccgaacgatgaatgcgcttgctaaaaggaagtgatatgttcaatgatattaacatctcatctaacctgctgtatatttac
gi|20 : tgggttaagtattccggatactataggtgcttcgcacgtttcatctacatttagtgatttgatagaatcacagagcatacgggtttgttgttgttttggggttcttttattgcaatgttgttaattaggtttaaccgtaacagccaatggatccgaagatgagttatcagtggatagtgtttggcttggtttttttttcaacctagtgtatggcggtaaatgtgttaacaagtataagatatcttcattgatttatcA--TC--TCCAG--AAG-TAA-TGAGTGTT-TAGAC---GT--T-GC-TG--T-T--AT-AAC-T-----CCA--GT-GTGC-CC-AT-----CGTT--AA-GTCATGGGGGGGGGGGG------AGGGG--G---TGCG--AG-GT-G-AA----TCC---CCTA-G-----TG-------TT-----------------A------T--A-G--TAG--A-------------TCC------CT-C---CCCTCCTCTGT------AG--G-----TTCT--C---T-AAAA-GAT-CTGC-ATG-TA-AA--T----T----A-T-A---TCTTGC-AA--TT-GAG--TAT----CGT-CAATTCATG-TA--TGGT-ac
gi|20 : TTGC--TTTAAAAA-AT-A---AC--T--A---G------A-TG----AT--AT-----C-T------AAG-ACA-C---A-A-TT---------cattgctttaaaaaataactagatgatatctaagacacaatt
gi|21 : atctccagaagtaatgagtgtttagacgttgctgttataactccagtgtgcccatcgttaagtcatggggggggggggagggggtgcgaggtgaatcccctagtgttatagtagatccctcccctcctctgtaggttctctaaaagatctgcatgtaaattatatcttgcaattgagtatcgtcaattcatgtatggtcaTT--TTGT-AG------TTGATG----------TG--------GTT---TTTCAGGC-AGCT-A-GTGCATGA-AGTTAA--TG-TGTT-AACA--A-TA-T-A------AA-----TATTTTCA--C--A---------------CTTTTGATA-------------T--------------------C-------TGAAGCACGA--CTTCAGTATGAA--GCCAGTCTA-AATTA--CTAAATG-ATCAAA-AAAGGAATCTGAGG-----TAT----ATCATTGC--G-CGC-----GA-T-C----AGT-------TTT----CA--G-CTT--------C-A-------------GG------GG------GTGAGAACGG-GAG--GG----A-TGTGG--ATTAA--TC--CTCAA--GGG-
gi|22 : TC--T-AAGACAC-AATTTAGG-TGGGGGAGGGGT-T--CCGATG-AAAAT-T-GGA-AAT-AGAATCCAATCCG-AGCACGTAA--GG-GGGGAGTTT-CACC-ATGG-TGGT
gi|23 : -TT---------T-TCC-TTGCCAAGC-A-C--AA-T--CAG-TTCAG-T--A--GTTGA-C--TG-AC-AGAT--AAA---G-A----GG------TG--A-TATATCATA---GA-TATT--G-A-T-AA-AGTC-G-C-G-TCT-AACCACAC----ATATT------TGTTGTATGGGGAGTT--TTGTTAC--TAATGGTTAA-GGAAT-A-----T----------------T------------------AGG-G------GGATT-T--TTGATG-AAAATTT-GAA-AAT-AAAAGCCCGTCCG-AGCACGTttagggggcactatatagccaaacttcctctgggggagtctactatatagcaagtcttctgggggggggggggtctcatatggataagcctcactattaaac
gi|24 : --TTAATAG------TGGATA----------TGCTG-----ATT---TTTTTTGT-AACC-A-GTGT-TGG-GGAAAAGTTGGCGTCGAACA--A-TT-A-A------AA-----TATCTT-A--T--A---------------TT--------------------T--------------------C-------CAAAAATGAA--CCTCAAT-TGAAGTGCCGTAATACAACCAATCT-AATG-AT--ATAAAAGGAATCTGA------TTTT----TTCA-GT---G-CAC-----AAGT-C----AGG-------TTT----CA--G-CTT--------A-A-------------
gi|25 : CAACCAATCTAAATG-ATC-AT-AAAGAAATCTGAGG----TTTT----TTCATGCC--G-CAC-----GA-T-C----ATG-------AAT----CA--G-CTA--------A-AAAAAAAAAAGGGTGG------GG------G-------GA-GGG--GG----G-CGTGG--ATCAA--TC--CCCAG--AGG-C-------TTTG-GATGC---TT--C-GC-TG--T-T--AT-GCC-T-----CCA--GT-a
gi|26 : CCG-AAGAATGATT--T-ATCAG------TGGATA----------TGTTGGCTT-GGT---TTTTTTTC-AACC-A-GTGTATGG-GGTAAA--AG-TGTT-AACA--A-TA-A-A------GA-----TATCTTCA--T--A---------------TT--------------------T--------------------C-------CGAGA
gi|26 : TCCGAGA----TTTTT---TTCATGTC--G-CAC-----GA-T-C----AGG-------tttttttcatgtcgcacgatcagg
gi|27 : ccgaagaatgatttatcagtggatatgttggcttggttttttttcaaccagtgtatggggtaaaagtgttaacaataaagatatcttcatattG-TA--TGGT-A-TCAT--A-ATTT----CA-TT-AAT-GG--TAAT---TAA------------TTTGC--TTTAAATA-TT-A---GCTAT--A---G------A-TG----AT--AT-----C-T---A--AAG-GCA-C---A-G-TT---------T-CCC-TTGATAATC-T-C--AT-T--TAA-TTCAG-T--A--GATGA-A--TG-AC-T
gi|28 : -GCC-T-----CCA--GT-GTGC-CC-AT-----A--T--AA-GCCCT--------GGTG------GGGGC--AT--T--G--GG-GT-G-AA----TCC---CCTA-T-----TG-------TT-----------------A------TAAA-A--TAG--A----CAC----CCTCC------CCTC---CCCCCTTTAGT------AG--G-----TTCT-CC---T-AGAA-GAT-C-----TG-TA-AA--T----
gi|29 : TTAC--TAATGATTAG-GGAAT-A-----TAT---AT-CCACC-CCTC--TAAAAAAAA-AA---AAG-GAGGAGGGGGGTGT--CCAACG-G---------------AAAATCCAGTCCG-AACACGTTA--GG-GGGAAGTCT-CACT-ATGG-
gi|3 : --------A-A-------------AG------GG------G-------GG-GGG--GA----G-CG--G--ATCAA--TC--CCCAGT-ACG-CAA-TGGGTT-G-CATGC---TT--C--C-TA--C-T--AT-GCCAT-----CCA---T-GTGC-C---T-----A--T--AA--CCCT--------GCGG------AG--C--A---T--T--AG-GTTGCAA----TCC---CCTA-G-----TACGTGTGATT-----------------A------A--A-A--TAG--A----CCC----CCTCC------CC-C---TC------GAT------A---------TTCT-CCCATT-AATA-AAT-A-GC-ATG-TA-AA--T----A----AAT-A---CCTTGC-AA-AT--GGA--TAT----CGT-AAATTAGTG-TG--TG---A-TCAT--A-ATTT----CA-TT-AAT-G---TAAT---CAATATTCTTATATCTATGC--TT--AATATAT-A---AC--T--AATGG------A-TG----AT--AT-----C-T---A--CAT-GTA-C---A-AGTT---------T-TCC-TTGACAAGC-T-C--AT-T--TAGCTTCAG-T--AT-GATGA-ACATG-AC-T-AT--AAA-G-A-ATGTGAG------TA--A-TAT-TCAAAA-----TATT--G-A-T-CA-AAAC-T-----TCT-AAC-ACTT---TATATT------TGTTGTA-GAGAATTT--TGCTTAC--TAAATGTTAG-GAAAT-A-----TA----AACCTACCTCTTT--T-AAATAAA-AT---AGG-AGGGAGG------T--CCGATG-GAAATTT-GAAGAAT-AAAATCCAGTCC--AACACCTAG--GG-AGGAAATCTCCACT-A
gi|30 : aaaC-AACC-A-GTGCATGG-GGTTAA--TG-TGTT-AACAGTA-TA-ATA------AA-----TATTTTCA--T--A---------------TTTTACTTGTCTTTTTGGATA-T--------------------C-------CGAAACACAA--ACTCAATATGAAGTGTCACAAT-CAAagtttaggggatcatttccacttatatacgcagcctccggggggggggctatcacttatcgggaagcctcactatataaca
gi|31 : GT-TTCCGGAATA--A-TAATT--TTTGC---TTTGACCTGTAGACAT---AATG-TTTAATGAAATAC----A--G-GTA-CG---GTTT--------------TTG-----TTGTT---TT-GGGG-TTTT--CT--TTGCAATGTT-TTAATTTA
gi|32 : -T--CCGATG-AAAATCT-GAA-AAT-AAAATCCAGTTTG-AACACGTAA--GG-GGGAAGTCT-CACT-ATAG-TGGT
gi|33 : T-A---AC--T--A---G------A-TG----AT--ATTCACTC-T---A--AAG-ATA-C---AGA-TT---------T-TCC-TTGACAAGC-T-C--AT-T--CAA-TTCAG-C--A--GATGA-A--TG-GC-TGCT--AAA-A-G-A----AG------TG--A-TATGTC-AAA--GA-TAtagtggagggggagtctcactatatagccaagcttc
gi|34 : ATG-ATC-AT-AGAGGAATCTGAGGGTTTTTTT----TCCATATC--G-CAC-----AA-T-C----AGG-------TTA----CA--G-CTTAA------A-A-------------GG------GG------G-------TA-GGG-----------GTGG--ATCAA--TC--CTCAG--AGG-CAA-T
gi|35 : AAACA--CAAT---TCCATGAGAC-GATT--T-ATCA-------TGGATA----------TG---------TC---TCTTTTAC-AACC-ACGTGTATGG---TTAA--TG-TGTT-AACC--A-T
gi|36 : AATA-AT-T---AC--TTTA---G------A-TG----AT--AT-----C-T---A--AAG-GTA-C---A-A-TT---------T-TCA-TTGACAAGC-T-C--AT-T--CAA-TTCAG-T--A--GATGA-A--CA-AC-TGAT--AAA-A-G-A----AG------TG--A-TATAtcatctataaatgctct
gi|37 : -------TTT----CA--G-CTTTCACAAGAA-A-------------GG------GG------G-------AA-GGG--GG----GAGGTTG--TTCAA--CCATCCCAAATAGG-CA------------AGGT---TC--C-GT-TG--T-T--AT-CTC-T-----CTA--GT-TTGC-
gi|38 : A--TG-GGTT-AA------TG-A-A------TA-----TATTTTCA--T--A---------------TT--------------------TTTACTTGTCCTTTTTGTTATC-------CGAAACACAA--CCTGAATATGAAGTGTCACAAT-CAAg
gi|39 : TT--G-AAT-AATAATC-TGC-G-TCT-AA--ACAC---TACATTAGAGAATGTTGTA-AGAAGTTT--TTCTTAC--TAATGGTTAA-GGAAT-A-----tta
gi|4 : atataccatGTGT--GTCAA--TC--CCCCA--AGT-CAA-TG-GTCTG-GAGAC---TC--CCGC-TGAAC-T--AT-CCC-TATTACCTT--GT-ATTC-TC-AA-----A--T--CA-ACCTT--------GG---------GGAT--A---T--G--TG-GT-G-AA----TCC---CCAA-G-----TC-------TT-----------------A------T----G--TAA--A-------------TTC------CC-C---TCCCCGTCAGT------A---G-----TTCT-CC---T-AGAA-AAT-C-GC-ATG-T--AA--T----T----T-T-GAGTCTTTGC-AA-TTTGGGA--TAT----CG----GT---TG-TA---AAT-A-TCAT--A-ATTTTC--CATTT-CTT-TG--TAA----GAATATCTTT---TCTTTGCCTTTTAAAT--AT-A---A---T--A---G------A-CT----ATTAAT-----C-A---A--TAGAGTA-C---ACA-CT---------T-TCG-TCCACACAC-T-CCAAT-TTCCAATTTTAGCT--A--GATGA-A--TG-AC-TGATTCAAACA-GAA----AA------TA--A-TATATCATAA---A-TCTT--G-A-T-AA-CAAA-G-C-AGTCT-AAACACAC---GA-ATA------TGTTGTATTGGAAATTTCTTGTTACT-TAGTGTTTAGAAGTAT-ACTAGTTA----A--CCACC-CCTC--T-AAAAA--------------GGGTGGTGGT-TGCCCGATGTTAACTCT-GAACAAT-AAAAT-CAGTCCA-AGCA-ATAA---G-GGGAAGTCT-CACTCATG
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gi|5 : GATGGAATAC----A--G-GCA-CA---GTTTG-----T---T--GTTG-----TTGTT---TTTGGGG-TTTT--CT--TTGCACTGTT-TTAATTTAGTTT-ACC-TAAACA--CAATG--TCTG-AAGACCGATT--T-ATCAG------TGGATA----------TGTTTTTTTGGTT---TTTTTCTCCAACC-A-GTGCATGG-GGTTAA--TG-T--C-AATAT-A-GA-A-ACCTA--AA-----TATTTTCA--T--G---------------TT--------------------TTTACTTGTCTTTTTGGATATC-------CGAAACA-AA--C-TCAATATGAAGTGTTACAAT---------C--AATG-ATC-GT-GAAGGAATCTGAGG----TTTT----ATCATTTC--G-TGT-----GA-T-C----AAG-------TTT----CA--G-CTT--------A-A-------------AA------GG------G-------GA-GGG--GC----G-CGTGG--ATCAA--TC--CC-AG--AGG-CAA-TGAATCTG-GAGAC---TC--C-GC-TG--T-T--AT-GCC-T-----CCA--CT-GTGC-CC-GG-----A------A-G---------------G------GGGG---A---T--G--GG-GT-G-AA----TCC---CCTA-G-----TG-------TT-----------------ATACATGT--A-G--TAG--A-----CC----CCTC---------------CCCCCTCAGT------AG--G-----TTCT-CA---T-AGAG-GAT-CTGC-ATG-TA-AA--T----T----A-T-A---TCTTGC-AA-TTT-GGA--TAT----CGT-CAATTCGTG-TA--TGGT-A-TCAT--A-ATTT----CA-TT-ATT-G
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gi|8 : -CGTAG--AT-AA--TC--CC-AG--AGGACAAATGATCTC---AGAC---TC--C-AC-TG--AAT--AT-GCC-T-----C-A--GT-GTGC-CC-ATTGGCTA--T--AA-GCCCT----------TG------GGGGCC-AGGTT--G--GG-GT-G-A------TC---TGTA-G-----T----------------------------------T--A-G--TAG--A----CCC----TCTCC------TC-T-----------AGT------AG--------TTCT-CC---T-AGAA-ATT-CT-------TG-GA--T----T----A-----------GT-AA-ATT-AGA--TAT-----GT--AAT-CATG-TA--TAGT-A-T-AT--A-ATTT----C--TT-A-T-GG--TAAG---G--TATTCTT---TCTTTGC---TTAAAT--AT-A-------T--A---G------AGTG----AT---T-----C-T---ACCAAG-ATA-C---A-A-TT---------T-TAC-TTGACGA-C-T-C--AT------------------------G-A--TG-ACATGAT--AAA-A-G-A------------TG--A-TTTAC--AAA--GA-TATA--G-ATT-AA-AATT-G-C-A-TCTAAACCA-G----TATATT------TATTG-----------------TAC--TAAT-GTTA--GGAATAA-----TA----A--GCATT-CCTT--T-AA--------------------GGGGGAT-T--CCGATG-GAAATCT-GAA-AAT--AAATCC--TTCGAAGCCGGTAAAGGG-GGGGAGTCC-GACT-AGGG-ta
gi|9 : acaTCTCA--T--A---------------TT--------------------T--------------------C-------CGAAACTCAGACCCTCAATA--------------ACAA---ATCTAACTGGATC-A--AAACGA-------G----TTCT----T----GTCCAA-C-C-----GA-T-C----AGG-------TTT----CAA-G-CTT--------A-AAGAAAAAAAAAGGGG------GG------G-------GG-GGG--GGAGGAG-CGTGG--ATCAA--TC--TCCAG--ATG-TA--TGAGATTGTGAGAC---TT--T-GC-TG--T-T--GTTGCC-T-----CGA--GT-GTGC-CCCAT-----A--T--AA-GCCCT--------GTTT------AGGGC--AAT-T--G--GG-GT-G-AAATTCCCC---CCTA-AGTTTTTG-------TTTTTTTTTTTATAAAATTA------T--A-A--TGG--A----CTC----CC------------C---TTCCCCTCAGT------ATATG-----TTCTTCC---C-AGAA-GAA-CTGC-ATGGTA-AAATT----TGCGCA-T-G---CCTTGC-AAATTT-GGA--TAT----CGT-CAATG-GTG-TA--TGGT-AATCAT--ATATTT----TA-TT-ATT-GG--TAAG---GAATATTCTT---TCTTTGC--TTTAAATA-AT-T---ACAAT--A---G------A-TG----AT--AT-----C-A---A--AAG-GTA-A---C-A-TT---------T-TCCTTTGACAAGC-TCC--AT-T--C-A-TTCAG-T-----GATGA-A--TG-AC-TGAT--AAA-cagtggttaggaggggggggtctcacttatgccaaacttcgtccggggggggggtctcacta
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|47 ): TAAGTGGATTTGCAGTTTTGTCCTCCATATTGATTTTTCTTA
Unaligned ( gi|49 ): TAAGTGTATTCGCAGTTTCGTCCTCCATATTGATTTT