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gi|8 : TGTTGCCAGTACTACCGTCAGAG-CGAGCACAACTAC--ACTG----TATA----CATATAAATGCGTGGATC------T-AGG---CT-T---TTTCCCATTGAGGCGGGTTGCACCC-CA---------------------------TCCAATTGAAACTATGAAATA-GAA--TCAAATATTTTAC-AT--GAATGA---C---TAAAAGTGTAT-A-AAGATAGAA-AATT-----A--TATG---TATTTTC
gi|9 : AATATCTTCTATC--GACC-A---C---TGGAAATGCAT-ACAAAAAAGGC-AAAT-----AGCTATT---TATTTTCTATGTCGCACAATGGTG--G-T------G--GATTT-GGA-G------C---CT---C----CACCT------TC-C-CC--CCT------------AT---AAATGTGC----CTTTAACGTAGCCTCTAC--ATGTAgt
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blockSeqs : . . . . ACAATC T CT C . CT T A T AT A CATTTTTTCTTT CA AA AC . . T G AATGCACATC AC A . . . C A A C GGAGGGGGGGGGGGTGTCGGACTCTGGCCCTCATCCATCCTCT .
blockSeqs : . . . . AC A CT T . . G A T AA A TAAATTTGACTG CT AG AA . . T T CATGAACTAT A T . . . C A G G AGGATGAGGGCCTCAGACCCCCACGGTGCCACCCCCTTT .
blockSeqs : . . . . AC T CT A . . T T T AC A CAGTTCGTT CA CA AC . . T A CATGAATGAC A A . . . C G G G GTGGTTTTAAACCCTGCAATGTCCACTCCAATTTCTAT .
blockSeqs : . . . . AT G C A . . G G G A . CAATTTTCC TG AG AA . . A G TATCGACCAC A A . . . T A A A ATAACTCCCTCTCCCCCTCCTTCCGAATTTG .
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originalCons : TATGTTGACGGTGCTACCGTTAGAG-CGAGCGCAGCTAC--A-TG----TATA----C------ATGNGTGGATC------C-GAA---NT-T---TTTCCCAGGGNAGTGGGTTCCATCCACATGC--A--TTT--CC----G----GGGTCCAATCGAAACTNAGGANTA-ACA--TTTANTATTTTACAAC--GA---A---C---TGGAAGTGCAT-A-AAAATAGGC-AAAT-----A--TATT---CATTTTCTA-------CCAGGNTC--G-G------A--GACCC-GG--G------C---CT---C----C-CCT------CC-C-CC--CCT------------AT---ATATGCGC----GCCTAACATAGCCTCTACCAATGTA
finalCons : TATGTTGACGGTGCTACCGTTAGAG-CGAGCGCAGCTAC--A-TG----TATA----C------ATGNGTGGATC------C-GAA---NT-T---TTTCCCAGGGNAGTGGGTTCCATCCACATGCATTTCT---------------GGGTCCAATCGAAACTNAGGANTA-ACA--TTTANTATTTTACAAC--GA---A---C---TGGAAGTGCAT-A-AAAATAGGC-AAAT-----A--TATTC---ATTTTCTA-------CCAGGNTC--G-G------A--GACCC-GG--G------C---CT---C----C-CCT------CC-C-CC--CCT------------AT---ATATGCGC----GCCTAACATAGCCTCTACCAATGTA
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|14 ): AGGGTGATGGGTTTGACACGCACACCCCTTTACTCCCAAAACTGTGGACATGCCATAACGTCTTGTCAGTGGAATCAGAAATA
Unaligned ( gi|16 ): AGAAATATATTTTATGTGCTGATCCAGAGTTGTTTTTTTCCCAAGTGGATTCCATTTCAGGTAATTTCTT
Alignments
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Reference ( family-2195 ) : TATGTTGACGGTGCTACCGTTAGAG-CGAGCGCAGCTAC--A-TG----TATAC------A----TGNGTGGATC------C-GAA---NT-T---TTTCCCAGGGNAGTGGGTTCCATCCACATGC--A--TTT--C--T-----GGGTCCAATCGAAACTNAGGANTA-ACA--TTTANTATTTTACAAC--GA---A---C---TGGAAGTGCAT-A-AAAATAGGC-AAAT-----A--TATT---CATTTTCTA-------CCAGGNTC--G-G------A--GACCC-GG--G------C---CT---C----C-CCT------CC-C-CC--CCT------------AT---ATATGCGC----GCCTAACATAGCCTCTACCAATGTA
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gi|10 : -ACA--TTTAGAATTTTACAACTCGA---A---C----------ACAT----------------C-----A--TATT---GATTTTCTA-------CCATGCTG--G-G------A--GGGGG-GG--GGGGTGTCGGACT---CTGG-C-CCT------CA-T-CCATCCT------------CT---ATATCCGC----GCCTAACAGAGTTTCTATC
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gi|19 : -GAA---AT-T---GTCCCCATGGAAGTAGGTTCCATCC-CATGC--A--
gi|2 : aAT------A----TGTATGAATC------C-AAA---AT-TCT-TTTCCTAGGGTACTGAGTTCCAACC-CATAC--A--TTT--T--TTCTTTGGGTCCTATCAAAATTAGGGACTA-ACA--TTTATCATTTTACAA----A-----------TGGAAGTGCCTCA-AAAAT-TGC-AAA------A--TACT---CATT---------------GGGTC--GTGGTTTT-A--AACCC-TGCAA------T---GT---C----C-ACT------CCAA-TT--TCT------------AT---ATA--CAC----ACCTAACATAGCCTCTACTAATG
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gi|4 : TGTGTTGACAGTGTTATCATTAGAG-CCAACCTAACTAT--A-TG----TATAC------AATCATGGGAAGATC------CTGAA---CT-T---TTCCCCCAGGGAATGCG--------ATATG-------TT--A--A-----AGGTTTTGTCAAAACTAGGGACTG-ACC--TAGAGTATTTTAC-AT--GA---A---CTATTGAAAATGCAT-A-GAAATAGGCAAAATATACGA--TATT---CATTTTTTG-------TCAaaat
gi|5 : gA-ACT--TATACTATTTTA-AAC-----------C---TGGGAATGGAT-A-GAA-TAGGC-AAAT-----A--TATT---TATTTTCTA-------CCCAGATCAAG-GGGGAGTA--GACCCTGG--GTA----C---CC---C----C-CCT------CC-CACT--CCTCCCATGTGCATAAT---ATACGCAT----GCCTGGTGTATCCTCTACCAATGa
gi|6 : cA-ACA--TTTAGTATTTCACTA----A---A--------GGCCGTGCAT-A-AAA-TCGGC-AGAT-----A--TACT---TATTTTCTA-------CCAAGCTC--G-G------AGTGGGTC-GG--A------C---TT---C----C-A--------CC-T-TC--CTT------------A----ATATGTGC----GCCTAACATATCCTCTATCAGTGgaaattatatgtttataaaaatacgagaaaacccccaaaa
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