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gi|7                          :                              TGGTTCATAACTACACCCGCCCCCTGTTT-ATTTACAACTCTATCAATA---GAGAAAA--ACCACATTTTTAAA----ATTATTTTTC----ATTTAT---TCACTTACTTCAAGTTTTCCCAATAT---------CTCTTTCTTTCTCATTACTCTTTAATCTCTCATTTTCGTTT-TTGTTA---CATAAA
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gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ga---------CCAA-AA-CAATGA--TG-ATGTAATT--TGCAG----TGTAAATACGTTTGCACA-TTAAT-------------T-AGTGCTAGTTT-CA-TTCATTC--CGTTTATT----T------GT-TTTGC---------TG--ACTTGA--AT---AAA---C--G--T-T-------T-CTGTCCCGAAGAAGgaataattcttctgtttcaacttgcatc
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gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ttgataacgtctgcT-AGTAA--GTCG-TACTTTGTTCTACA--TCTT----C-------T-TTTATCTTTAAATATCCTATCCTAT-G-----AG---T--CGGT-TTT---CTG-TTGTTCTGAAGAAGG--TACAGG-TCGTCACGAc
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ttcTAGTTT-TA-AGTACTT--TA--TGTTAGGCTA-----TT-TTTGT---------TC--ATTTTTTTGA---AAA---CGTT--T-TTT---CAT-GAAACCTGAGGAATT--GACGGG-TTG------TCCC-ACAAA-------T-GTGA-CGATTT--GCATT-GTTCATGTCGaaa
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    atttctagtttattcAGTTT-TA-TC-ATTC--TG--TAT------AT----AT-TTAAG---------CC--ATCTTAT-GT-----A---C--C--A-TTT---CGT-TTGTCCTGATGAAG
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gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      gGG-TCGTC-T----CC-AAAAA-------C--TGG-CAGTCT--GT-TT-GTTGGTGCCGTCGATCATTTTAGT
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ATT-GTTCGTGTCGTTGGTCATTTTAGTGCTtc
4 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|14 ): ACGCTTGTAGTTAGTGCTGGCGTTTTTGTGTATTTTTAGCCATTTTATGAAAACCTTTTCGTGTGTTTCGACAATCCAGTTGATCGTGTCGTTGGTAATTTTAGTGCGATTTATAATCGTTTGT
Unaligned ( gi|15 ): TTGAACGAATATGATGTGCACCAATTCGCTCTAATCCAAAAACAATGAATATGATTTACGTTTGTAAATTTAGAGTAGATTTAGTACTTAGTCTAACTTTTTGTACATCTTTTACTATCTTAT
Unaligned ( gi|17 ): GTTCACAACCTCGTTTTTTGTGTCTTGTTTATTTTAGTGCTCTTTATCATTTTTCTGCTTGGACTTGTATCTACTAAGTAGATTCGACACCTTTTAAAGGTATCGATGTTGTT
Unaligned ( gi|25 ): TTTTGTTATTGTTACAGCACAATTACAACAGAACATCACCGGGTACGAGTTGCCTTTGCACTGA






Alignments
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gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          acgcttgtagttagtgctggcgtttttgtgtatttttagccattttatgaaaaccttttcgtgtgtTTGAACGAATATGATGTGCACCAATTCGCT-C-------T-AA-T---C-----------------CA-AA-AA-CAATGAATATG--ATTT-------------ACGTTTGTAAATTTA-----GA-G-TAGATTT-AGTACTTAGTCT-AACTT-TTT-----GTA--CATC------------T-TTT--ACT--A-TCTTATgatttataatcgtttgt
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      -TTA---CGT-TTGT----CACGAAGA---AG--G--GGCAGG-GTG-----TCCCGCAAATTTGG---AAA-TC-TA------------GTTCGTTTA--ATTTGTTACTTTAGTGTT
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TT-CTT-----TTA--TCTT----TA-----AA-T----ATCCTA-TCCTATG--AGT--CGGT-TTT---CTG-TTGT----TCTGAAGA---AG--G--TACAGG-TCG-----TCACGAAAAgtgactgtattcaatattttagggtatgtatgtaa
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ttctagtaagtcgtactttgttctacatcA-----GT-T-TAGTCGT-GGTAT-TAGTTTGCATT------------A--TATT----TC-----GA-TTT--CTTC---TCT-ATGTAAA--------TAT---CGTGTCGT----CCTGAAGA---AG--G--GACGTG-TCATCC--
gi|2                          :                                                  ttgataacgtctgcACAATTCAATAAATAATGGTGACCATTAACGCTTTCCTATCTAATATTCCTATTCGTTTATT-ATCTATCATTTA--TCAA-TTTGT--AAAATAAAAATCAATTCATTCCTTCTAA-----------------ATTTTTATTTATTCTTAGAGCACAGTAACGAGAGAATGTCACCGGTTG---TGATTTGATTTTAGCACTGATGAACATAATTAGTTTAAAC--------CCTGATATG-----TGCCCTTTAAG-TC---CATCATTACTACTCCACGCA--TTG---------------TGGGTCAGTCCATTGGGCGAAGAGAATGTGTCCTAACTCGCTCCCCCA--GA-AA-A---CTT--TGTTT--AGCCATCC-AA-AATCAACAAACATGTAATTTGCAGTGTA--AATACGTCTGTAGTTTTA-----GT-----GC--T-AGTG---GGCCT-TTTTT-GT--------A--TAT-------------C-TTT--AGCC-A-TCTTATGTAAAC--C--CATTT---CGT-TTGT----CCCGGGGA---AG--G--GTCAAGCTCG-----TCCCGAAAATTTGA---TGATCT--------A-GGT--GTTCGTc
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                C-A-TCTTTTGTAAAA--C--T-TTTTTTCGT-TTGT----CCTGACGA---AG--G--AAAAGG-T-G-CC--CCCCAAAtagcaatttttgtaaatttagtgcattatatataattatatgcatgcaaagttctaactatcagtgtcg
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      tagggccaactttttcctccaggtattacccgtttgtaggAC--C--T-TTT---CGT-TTGT----CTCAAGGA---AG--A--GACGAC-TGG--C--TCTCTAAA--TTG------ATCT--------A-ATG--GTTCTTGTC---TTGGTCTTATCGGTACTTT
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      -TTT---CAT-TTAA----CCCGATGA---AG--G--GATGAG-TTGTC----CCTGGAA--CTGA-------TG-TA-----A-ATTTCGTTTGTGTT--GTTGGTCATATCAGTGCTa
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         T---CTT-TTGT----CCCGAAGA---AG--G--GA-----TTGTCCG-TCCCGGAAAATTGA---CA--TT-CA-----A-ATT--GCTCGGGTC--GTAAGTCAATTTAGTGCT
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                aGGACAAGCCTTTCGGACAAATAGGATGTGTCCTAATTCGC
gi|25                         :                                                                                                                                                                            gcctgtaaactcgagattattttacgagTTTTGTT-ATTGTTACAGCACAATTACAACAGAACATCACCGGGTA---CGAGTTGCCTTT-GCACTGgccatt
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ---------------CA--TCG---------------TGGATCACTGAAATGGACGAGTAGA--GTGTCCTAATTTGCC-CCCTA--a
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gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               GA---AG--G--GACAAG-TCG-----TCCCGAATTTTTGA---CGACCT--------A-ATT--GTTCGTGTtc
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         g-ATT--GTTCGTGTC--GTTGGTCATTTTAGTGCT
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gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         CCATTGAACGAGTAGGGCCTTTCATAATTTGCC-CCTCAAGCA-AA-T---GTT--TGATT--AGCTAGCG-TA-AA-CAATAAGCATGTAATTTGCAGCGTA--TACTCGAT-GTAGATTTA-----GTGT-TATC--------C-T--TTT-TGTAC-AT--------G--TAT------------AT-GTT----TC-A-TGT-ATGTAAAA--T--T-TTT---CAG-TGGT----TCTGAGGA---AG--G--GACAG----GTCT--TCCCAAAAACT------CACCTTATACATGTA-ATT--GTT--TGTCATGTTTGTCATTTCAGTCCTTTtggtcatttcataattactctcctcgttgtggatcaaatactcatagtagaaatgaa
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1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          acgcttgtagttagtgctggcgtttttgtgtatttttagccattttatgaaaaccttttcgtgtgtTTGAACGAATATGATGTGCACCAATTCGCTC--------T-AA-T---C-----------------CA-AAAA-CAATGAA----TATG--ATT-------------TACGTTTGTAAATTTA-----GA-G-TAGATTT-AGTACTTAGTCT-AA-CTT-TTT-----GTA--CAT-------------CTTTTA-CT------A-TCTTAT---gatttataatcgtttgt
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                -TTA---CGT-TTGT----CACGAAGAAGG--GGCAGG-GTG-----TCCCGCAAATTTGG-AAATC--TA--------------GTTCGTTTA--A-----TTTGTTACTTTAGTGTT
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       T-AGTA---AGTCG-TACTTT-GTT-----CTA--CATC----T------TCTTTTATCTTTAAATA-TCCTATCCTATGAGT--CGGT-TTT---CTG-TTGT----TCTGAAGAAGG--TACAGG-TCG-----TCACGAAAAgtgactgtattcaatattttagggtatgtatgtaa
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ttcA-----GT-T-TAGTCGT-GGTAT-TAGTTTGCA-TT------------A--TATT----T------CGATTTCTTC--------TCT-AT---GTAAA--------TAT---CGTGTCGT----CCTGAAGAAGG--GACGTG-TCATCC--
gi|2                          :                                                  ttgataacgtctgcACAATTCAATAAATAATGGTGACCATTAACGCTTTCCTATCTAATATTCCTATTCGTTTATT-ATCTATCATTTA--TCAA-TTTGTAAAATAAAAATCAATTCATTCCTTCTAA--------------------ATTTTTATTTATTCTTAGAGCACAGTAACGAGAGAATGTCACCGGTTG---TGATTTGATTTTAG-CACTGATGAACATAATTAGTTTAAAC--------CCTGATATGTGCCCTTT---AAG-TC---CATCA--TTACTACTCCACGCATTG---------------TGGGTCAGTCCATTGGGCGAAGAGAATGTGTCCTAACTCGCTCCCCCA--GA-AA-A---CTT--TGTTT--AGCCATCC-AAAATCAACAAA----CATGTAATTTGCAGTGTA--AATACGTCTGTAGTTTTA-----GT-----GC--T-AGTG---GGCCT-TT-TTT-GT--------A--TAT--------------CTTTAGCC------A-TCTTAT---GTAAAC--C--CATTT---CGT-TTGT----CCCGGGGAAGG--GTCAAGCTCG-----TCCCGAAAATTTGA-TGATCT----------A-GGT--GTTCGT-TA--GCAATTTTTGTAAATTTAGTGCATTc
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       T-AGGGC-CAACTT-T---TT-CCT-----CCAGGTATTACC-C------GTTTGTAGGC------A-TCTTTT---GTAAAA--C--T-TTTTTTCGT-TTGT----CCTGACGAAGG--AAAAGG-T-G-CC--CCCCAAAatatataattatatgcatgcaaagttctaactatcagtgtcg
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        AC--C--T-TTT---CGT-TTGT----CTCAAGGAAGA--GACGAC-TGG--C--TCTCTAAA--TTG----ATCT----------A-ATG--GTTCTTGTC--------TTGGTCTTATCGGTACTTT
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                -TTT---CAT-TTAA----CCCGATGAAGG--GATGAG-TTGTC----CCTGGAA--CTGA-TG-----TA-------A-ATTTCGTTTGTGTT--G-----TTGGTCATATCAGTGCTa
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   T---CTT-TTGT----CCCGAAGAAGG--GA-----TTGTCCG-TCCCGGAAAATTGA-CATTC---A-------A-ATT--GCTCGGGTC--G-----TAAGTCAATTTAGTGCT
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           aA--TG---------------G---------------CGGACAAGCCTTTCGGACAAATAGGATGTGTCCTAATTCGC
gi|25                         :                                                                                                                                                                             gcctgtaaactcgagattattttacgagTTTTGTT-ATTGTTACAGCACAATTACAACAGAACATCACCGGGTA---CGAGTTGCCTTT-G-CACTGt
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           CA--TC---------------G---------------TGGATCACTGAAATGGACGAGTAGA--GTGTCCTAATTTGCCCCCT-A--a
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  cgGG-TCGTC---TCC--AAAAACTGG-CAGTCTGT-----------TT--GTTGGTGCC--G-----TCGATCATTTTAGTgaaa
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         GAAGG--GACAAG-TCG-----TCCCGAATTTTTGA-CGACCT----------A-ATT--GTTCGTGTtc
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              g-ATT--GTTCGTGTC--G-----TTGGTCATTTTAGTGCT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                        -CATTGTTTACCATAATGAGTT--AATTCGCCCTACTTCAGATAAA----TTTTAAAAATC---TATCA--TC---------------ACTACTTCATGCACTATGGGTCATTCTATTGGACGTGTAGGGCGTGTCCTAGTTCGCT--------------T---GAT--TGA------CAAGCC---AA-CAATCAAGTAGCGTATAATTCCCAGTCTT--AATATATTTATAGTCTTAGTGATGT-T-T--CTGTGAGTG---------TA-TTT-G--------CA--TATC----T------A--TTTACCC------A-CCTGAT---ATAAAC--C--T-TTC---CCA-TTAC----TTTGAAAAAAAATGATAGG-TCG-----TCCCGAAAAATAAG-CAATCT----------A-ATT--GTTCGTGTC--A-----TTGGTGATTTTaataat
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         CCATTGAACGAGTAGGGCCTTTCATAATTTGCCCCTC-AAGCA-AA-T---GTT--TGATT--AGCTAGCG-TAAA-CAATAAG----CATGTAATTTGCAGCGTA--TACTCGAT-GTAGATTTA-----GTGT-TATC--------C-T--TTT-TG-T---A--------CA--TGTA----T------ATGTTT---C------A-TGT-AT---GTAAAA--T--T-TTT---CAG-TGGT----TCTGAGGAAGG--GACAG----GTCT--TCCCAAAAACTC-----ACCT-TATACATGTA-ATT--GTT--TGTCATG-----TTTGTCATTTCAGTCCTTTtggtcatttcataattactctcctcgttgtggatcaaatactcatagtagaaatgaa
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          cGTATCCGATTTCGCTTC---G--TT-AA-TTAGCAT--TGGAT--AGCGAGCC-AAAA-TAATAAA----CAACTAATTCAGAATGTATAAATA--TTTGTAGATGTA-----CT-T-TAGTTGT-AATGC-CAGTTG-TA-TTT-ATT-----TCA--TACT----TATCTAGATCTTTATCT------A-TATTAT---GTAAAC--C--T-TTC---CAT-CTGC----CTTGACGAACG--AACGGG-TCGTCC--T---GAAAAGTTGA-CAATCT----------A-GTT--GTTCGTGTC--G-----TTGGTCATTTTAGTGCTTTgggtgatttttatgtttgaacctgcattcactttgcagatccaacacttttaggcatatagtgctgttgg
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1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          acgcttgtagttagtgctggcgtttttgtgtatttttagccattttatgaaaaccttttcgtgtgtTTGAACGAATATGATGTGCACCAATTCGCTC--------T-AA-T---C-----------------CA-AAAA-CAATGAA----TATG--ATT-------------TACGTTTGTAAATTTA-----GA-G-TAGATTT-AGTACTTAGTCT-AA-CTT-TTT-----GTA--CAT-------------CTTTTA-CT------A-TCTTAT---gatttataatcgtttgt
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                -TTA---CGT-TTGT----CACGAAGA---AG--G--GGCAGG-GTG-----TCCCGCAAATTTGG---AAATC--TA--------------GTTCGTTTA--A-----TTTGTTACTTTAGTGTT
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       T-AGTA---AGTCG-TACTTT-GTT-----CTA--CATC----T------TCTTTTATCTTTAAATA-TCCTATCCTATGAGT--CGGT-TTT---CTG-TTGT----TCTGAAGA---AG--G--TACAGG-TCG-----TCACGAAAAgtgactgtattcaatattttagggtatgtatgtaa
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ttcA-----GT-T-TAGTCGT-GGTAT-TAGTTTGCA-TT------------A--TATT----T------CGATTTCTTC--------TCT-AT---GTAAA--------TAT---CGTGTCGT----CCTGAAGA---AG--G--GACGTG-TCATCC--
gi|2                          :                                                  ttgataacgtctgcACAATTCAATAAATAATGGTGACCATTAACGCTTTCCTATCTAATATTCCTATTCGTTTATT-ATCTATCATTTA--TCAA-TTTGTAAAATAAAAATCAATTCATTCCTTCTAA--------------------ATTTTTATTTATTCTTAGAGCACAGTAACGAGAGAATGTCACCGGTTG---TGATTTGATTTTAG-CACTGATGAACATAATTAGTTTAAAC--------CCTGATATGTGCCCTTT---AAG-TC---CATCA--TTACTACTCCACGCATTG---------------TGGGTCAGTCCATTGGGCGAAGAGAATGTGTCCTAACTCGCTCCCCCA--GA-AA-A---CTT--TGTTT--AGCCATCC-AAAATCAACAAA----CATGTAATTTGCAGTGTA--AATACGTCTGTAGTTTTA-----GT-----GC--T-AGTG---GGCCT-TT-TTT-GT--------A--TAT--------------CTTTAGCC------A-TCTTAT---GTAAAC--C--CATTT---CGT-TTGT----CCCGGGGA---AG--G--GTCAAGCTCG-----TCCCGAAAATTTGA---TGATCT----------A-GGT--GTTCGT-TA--GCAATTTTTGTAAATTTAGTGCATTc
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       T-AGGGC-CAACTT-T---TT-CCT-----CCAGGTATTACC-C------GTTTGTAGGC------A-TCTTTT---GTAAAA--C--T-TTTTTTCGT-TTGT----CCTGACGA---AG--G--AAAAGG-T-G-CC--CCCCAAAatatataattatatgcatgcaaagttctaactatcagtgtcg
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        AC--C--T-TTT---CGT-TTGT----CTCAAGGA---AG--A--GACGAC-TGGCTC--TCT---AAATT-------GATCT----------A-ATG--GTTCTTGTC--------TTGGTCTTATCGGTACTTT
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                -TTT---CAT-TTAA----CCCGATGA---AG--G--GATGAG-TTGTC----CCTGGAA--CTGA---TG-----TA-------A-ATTTCGTTTGTGTT--G-----TTGGTCATATCAGTGCTa
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   T---CTT-TTGT----CCCGAAGA---AG--G--GA-----TTGTCCG-TCCCGGAAAATTGA---C-AT-T-CA-------A-ATT--GCTCGGGTC--G-----TAAGTCAATTTAGTGCT
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           aA--TG---------------G---------------CGGACAAGCCTTTCGGACAAATAGGATGTGTCCTAATTCGC
gi|25                         :                                                                                                                                                                             gcctgtaaactcgagattattttacgagTTTTGTT-ATTGTTACAGCACAATTACAACAGAACATCACCGGGTA---CGAGTTGCCTTT-G-CACTGt
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           CA--TC---------------G---------------TGGATCACTGAAATGGACGAGTAGA--GTGTCCTAATTTGCCCCCT-A--a
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       cgGG-TCGTC---TCC--AAAAACTGG---CAGTCTGT-----------TT--GTTGGTGCC--G-----TCGATCATTTTAGTgaaa
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         GA---AG--G--GACAAG-TCGTCC-----CGAATTTTTGA---CGACCT----------A-ATT--GTTCGTGTtc
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     g-ATT--GTTCGTGTC--G-----TTGGTCATTTTAGTGCT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                        -CATTGTTTACCATAATGAGTT--AATTCGCCCTACTTCAGATAAA----TTTTAAAAATC---TATCA--TC---------------ACTACTTCATGCACTATGGGTCATTCTATTGGACGTGTAGGGCGTGTCCTAGTTCGCT--------------T---GAT--TGA------CAAGCC---AA-CAATCAAGTAGCGTATAATTCCCAGTCTT--AATATATTTATAGTCTTAGTGATGT-T-T--CTGTGAGTG---------TA-TTT-G--------CA--TATC----T------A--TTTACCC------A-CCTGAT---ATAAAC--C--T-TTC---CCA-TTAC----TTTGAAAA---AA--AATGATAGG-TCG-----TCCCGAAAAATAAG---CAATCT----------A-ATT--GTTCGTGTC--A-----TTGGTGATTTTaataat
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         CCATTGAACGAGTAGGGCCTTTCATAATTTGCCCCTC-AAGCA-AA-T---GTT--TGATT--AGCTAGCG-TAAA-CAATAAG----CATGTAATTTGCAGCGTA--TACTCGAT-GTAGATTTA-----GTGT-TATC--------C-T--TTT-TG-T---A--------CA--TGTA----T------ATGTTT---C------A-TGT-AT---GTAAAA--T--T-TTT---CAG-TGGT----TCTGAGGA---AG--G--GACAG----GTCT--TCCCAAAAACTC-------ACCT-TATACATGTA-ATT--GTT--TGTCATG-----TTTGTCATTTCAGTCCTTTtggtcatttcataattactctcctcgttgtggatcaaatactcatagtagaaatgaa
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1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          acgcttgtagttagtgctggcgtttttgtgtatttttagccattttatgaaaaccttttcgtgtgtTTGAACGAATATGATGTGCACCAATTCGCTC--------T-AA-T---C-----------------CA-AAAA-CAATGAA----TATG--ATT-------------TACGTTTGTAAATTTA-----GA-G-TAGATTT-AGTACTTAGTCT-AA-CTT-TTT-----GTA--CAT-------------CTTTTA-CT------A-TCTTAT---gatttataatcgtttgt
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                -TTA---CGT-TTGT----CACGAAGA---AG--G--GGCAGG-GTG-----TCCCGCAAATTTGG---AAATC--TA--------------GTTCGTTTA--A-----TTTGTTACTTTAGTGTT
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       T-AGTA---AGTCG-TACTTT-GTT-----CTA--CATC----T------TCTTTTATCTTTAAATA-TCCTATCCTATGAGT--CGGT-TTT---CTG-TTGT----TCTGAAGA---AG--G--TACAGG-TCG-----TCACGAAAAgtgactgtattcaatattttagggtatgtatgtaa
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ttcA-----GT-T-TAGTCGT-GGTAT-TAGTTTGCA-TT------------A--TATT----T------CGATTTCTTC--------TCT-AT---GTAAA--------TAT---CGTGTCGT----CCTGAAGA---AG--G--GACGTG-TCATCC--
gi|2                          :                                                  ttgataacgtctgcACAATTCAATAAATAATGGTGACCATTAACGCTTTCCTATCTAATATTCCTATTCGTTTATT-ATCTATCATTTA--TCAA-TTTGTAAAATAAAAATCAATTCATTCCTTCTAA--------------------ATTTTTATTTATTCTTAGAGCACAGTAACGAGAGAATGTCACCGGTTG---TGATTTGATTTTAG-CACTGATGAACATAATTAGTTTAAAC--------CCTGATATGTGCCCTTT---AAG-TC---CATCA--TTACTACTCCACGCATTG---------------TGGGTCAGTCCATTGGGCGAAGAGAATGTGTCCTAACTCGCTCCCCCA--GA-AA-A---CTT--TGTTT--AGCCATCC-AAAATCAACAAA----CATGTAATTTGCAGTGTA--AATACGTCTGTAGTTTTA-----GT-----GC--T-AGTG---GGCCT-TT-TTT-GT--------A--TAT--------------CTTTAGCC------A-TCTTAT---GTAAAC--C--CATTT---CGT-TTGT----CCCGGGGA---AG--G--GTCAAGCTCG-----TCCCGAAAATTTGA---TGATCT----------A-GGT--GTTCGT-TA--GCAATTTTTGTAAATTTAGTGCATTc
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       T-AGGGC-CAACTT-T---TT-CCT-----CCAGGTATTACC-C------GTTTGTAGGC------A-TCTTTT---GTAAAA--C--T-TTTTTTCGT-TTGT----CCTGACGA---AG--G--AAAAGG-T-G-CC--CCCCAAAatatataattatatgcatgcaaagttctaactatcagtgtcg
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        AC--C--T-TTT---CGT-TTGT----CTCAAGGA---AG--A--GACGAC-TGGCTC--TCT---AAATT-------GATCT----------A-ATG--GTTCTTGTC--------TTGGTCTTATCGGTACTTT
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                -TTT---CAT-TTAA----CCCGATGA---AG--G--GATGAG-TTGTC----CCTGGAA--CTGA---TG-----TA-------A-ATTTCGTTTGTGTT--G-----TTGGTCATATCAGTGCTa
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   T---CTT-TTGT----CCCGAAGA---AG--G--GA-----TTGTCCG-TCCCGGAAAATTGA---C-AT-T-CA-------A-ATT--GCTCGGGTC--G-----TAAGTCAATTTAGTGCT
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           aA--TG---------------G---------------CGGACAAGCCTTTCGGACAAATAGGATGTGTCCTAATTCGC
gi|25                         :                                                                                                                                                                             gcctgtaaactcgagattattttacgagTTTTGTT-ATTGTTACAGCACAATTACAACAGAACATCACCGGGTA---CGAGTTGCCTTT-G-CACTGt
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           CA--TC---------------G---------------TGGATCACTGAAATGGACGAGTAGA--GTGTCCTAATTTGCCCCCT-A--a
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       cgGG-TCGTC---TCC--AAAAACTGG---CAGTCTGT-----------TT--GTTGGTGCC--G-----TCGATCATTTTAGTgaaa
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         GA---AG--G--GACAAG-TCGTCC-----CGAATTTTTGA---CGACCT----------A-ATT--GTTCGTGTtc
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     g-ATT--GTTCGTGTC--G-----TTGGTCATTTTAGTGCT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                        -CATTGTTTACCATAATGAGTT--AATTCGCCCTACTTCAGATAAA----TTTTAAAAATC---TATCA--TC---------------ACTACTTCATGCACTATGGGTCATTCTATTGGACGTGTAGGGCGTGTCCTAGTTCGCT--------------T---GAT--TGA------CAAGCC---AA-CAATCAAGTAGCGTATAATTCCCAGTCTT--AATATATTTATAGTCTTAGTGATGT-T-T--CTGTGAGTG---------TA-TTT-G--------CA--TATC----T------A--TTTACCC------A-CCTGAT---ATAAAC--C--T-TTC---CCA-TTAC----TTTGAAAA---AA--AATGATAGG-TCG-----TCCCGAAAAATAAG---CAATCT----------A-ATT--GTTCGTGTC--A-----TTGGTGATTTTaataat
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         CCATTGAACGAGTAGGGCCTTTCATAATTTGCCCCTC-AAGCA-AA-T---GTT--TGATT--AGCTAGCG-TAAA-CAATAAG----CATGTAATTTGCAGCGTA--TACTCGAT-GTAGATTTA-----GTGT-TATC--------C-T--TTT-TG-T---A--------CA--TGTA----T------ATGTTT---C------A-TGT-AT---GTAAAA--T--T-TTT---CAG-TGGT----TCTGAGGA---AG--G--GACAG----GTCT--TCCCAAAAACTC-------ACCT-TATACATGTA-ATT--GTT--TGTCATG-----TTTGTCATTTCAGTCCTTTtggtcatttcataattactctcctcgttgtggatcaaatactcatagtagaaatgaa
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          cGTATCCGATTTCGCTTC---G--TT-AA-TTAGCAT--TGGAT--AGCGAGCC-AAAA-TAATAAA----CAACTAATTCAGAATGTATAAATA--TTTGTAGATGTA-----CT-T-TAGTTGT-AATGC-CAGTTG-TA-TTT-ATT-----TCA--TACT----TATCTAGATCTTTATCT------A-TATTAT---GTAAAC--C--T-TTC---CAT-CTGC----CTTGACGA---AC--G--AACGGG-TCGTCC--T---GAAAAGTTGA---CAATCT----------A-GTT--GTTCGTGTC--G-----TTGGTCATTTTAGTGCTTTgggtgatttttatgtttgaacctgcattcactttgcagatccaacacttttaggcatatagtgctgttgg
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     gaAATCAA-----ATGTGATTAACAGTGGA--AATAGGTTTGTAAAGTTA-----GT-T-CAGTTAT-AGTGC-TAGTTT-TA-TTT-ATT-----CCA--TATT----T------ATTTTTATTC------A-TCTTAT---GTAAAT--C--T-TTT---CGT-TTGT----CCTGAAGA---AG--G--GACGGG-TCG-----TCCCAAAAATTTGA---C-ACCT-TT-------A-ATT--GTTCGTGTC--A-----TTTGACATTATGGTGCTTTgaataattcttctgtttcaacttgcatc
gi|7                          :                             aTGGTTCATAACTACACCCGCCCCCTGTTT-ATTTACAACTCTATCAATA---GAGAAAA--ACCACATT----TTTAAAATTATTTTTCATTTATT-------CACTTACTTCAAGTTTTCCCAATA----T---CTCTTTCTTTCTCATTACTCTTT---AATCTCTCATTTTCGTTT-TTGTTA---CATA--AACAA-Agtataattcttctgttggactttgcttacgttttgatgatccggcactgataggtatcgggtgtttatgcttatagcat
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tttatgattagatcaagttgcgtAATAGT-CGTGTTGTTATCCGACCCGT-A--CT-AAAG---CAT--T-AATTTAGTAAACCCAAAA-CAATGAT----GATGTAATTTGCAGTGTA--AATACGTTTGCACA-TTA-----AT---------T-AGTGC-TAGTTT-CA-TTC-ATT-----CCGTTTATT----T-------GTTTTGCTG------A--CTTGA---ATAAAC--G--T-T-------T-CTGT----CCCGAAGA---AG--at
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tttctgaaatgaAGTTT-TA-TC--ATT-----CTG--TATA----T------A-TTTAAGCC------A-TCTTAT---GTA--C--C--A-TTT---CGT-TTGT----CCTGATGA---AG-------CAGG-------------AACAATTAGA---CAATCTATA-------A-A-T--G-TAATG-C--T-----TTCATAATTTT-GTGCTT


blockSeqs                     :                                         TA     G C        .                   ATG T     TT        CC   C A     C      G      ATCTA       ACT    G      A    AAAATCAA              TTACTCTTTAATCT               TA      GAG    GT     G GAATG    C     .              AG                      TA   TCGCCCTA          GCCCTTTAAGTCCATCATTACTACTCCACGCATTG                                                 G                  CTAGTTAACATCATGAAT           A A    AA   T       GTAGC        TG       TA    T        GT   GTGAT  TTAGTTGT       CTT     G AC  TCATTTTCGTCTA     TTATCTAGAT         T  TTAAAT T      CCT      GA GG A   TTT   G    GAAA     N  TCC  TTG        C   TCCGT              ACCTTATACATGT       .   TC         GCAATT  
blockSeqs                     :                                                                               .   A     .         .    T A     A      A      .           A      .      C    T                     .                            A       CAG    AT     C GAACA    C     .              G                       .    .                 ATTTTAAAAATCTATCATCACTACTTCATGCACTA                                                 A                  TCAAGCAAATGTTTGATT           G C    CA   .       C            TG       .     C        AT   .      GTAGATTT       TC      G A   TCCTCCAGG         TAGGCTAT           T  .      .      .        .  .  .   .     .    .        G  .    AAT        .   CTCT               GTGCGATTTAT         .   .          ATG     
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                T       .      .      .                                                                                                                                                                  A                  GTACTAAAGCATTAATTT           G A    A    .       T            CC       .     C        TT   .      TTAGTCGT       CT      . A   CATTCCGTT         TACCCGT            T  .      .      .        .  .  .   .     .    .        G  .    N          .   TCTT               CCAATTCTA           .   .          G       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         A                  CCCAGAAAACTTTGTTT            G T    A    .       C            TG       .     C        TC   .      TTAGTTGT       TT      . A   TACTTTA           TATTA              G  .      .      .        .  .  .   .     .    .        C  .    T          .   TCCT               CAATCTATA           .   .          G       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         G                  GTTAATTAGCATTGGAT            G G    T    .       C            CA       .     T        AT   .      TCAGTTAT       CC      . A   TTTTGTA           GTAT               T  .      .      .        .  .  .   .     .    .        A  .    C          .   TCC                CAGTCTGT            .   .          G       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         G                  TGATTGA                      . A    A    .       C            AA       .     C        AT   .      TTCTGTG        CT      . T   TGTTCTA           CTTC               T  .      .      .        .  .  .   .     .    .        A  .    G          .   TCT                CGATTTG             .   .          A       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         .                  TAATC                        . .    .    .       G            TG       .     G        AG   .      GTTATC         CC      . A   TATTTCA           TTCG               G  .      .      .        .  .  .   .     .    .        A  .    G          .   CCC                AAATCTA             .   .          G       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         .                                                                   .            .        .     C        T    .      GCTG           CT      . G   TATTCCA           ATAT               G  .      .      .        .  .  .   .     .    .        G  .    G          .   TCT                CACCTTT             .   .          G       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         .        A    .      TTA            CT      . A   ATTCTG            TTAT               C  .      .      .        .  .  .   .     .    .        C  .    G          .   TCC                CAATCC              .   .          G       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         .        .    .      GCT            C       . A   TGTA              CTA                T  .      .      .        .  .  .   .     .    .        G  .    G          .   TC                 TGATCT              .   .          G       
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blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           .               .                                                                 


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1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|17 ): GTTCACAACCTCGTTTTTTGTGTCTTGTTTATTTTAGTGCTCTTTATCATTTTTCTGCTTGGACTTGTATCTACTAAGTAGATTCGACACCTTTTAAAGGTATCGATGTTGTT






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gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          acgcttgtagttagtgctggcgtttttgtgtatttttagccattttatgaaaaccttttcgtgtgtTTGAACGAATATGATGTGCACCAATTCGCTC------T---AA-T-----------------------CCA----AAAA-CAATGAA----TATG--ATT-------------TACGTTTGTAAATTTA-----GA-G-TAGATTT-AGTACTTAGTCT-AA-CTT-TT-----TGTA--CAT-------------CTTTTA-CT------A-TCTTAT---gatttataatcgtttgt
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      -TTA---CGT-TTGT----CACGAAGAAGG--GGCAGG---G-TG---TCCCGCAAATTTG------GAAA--TC--TA--------GTTCGTTTA--A-----TTTGTTACTTTAGTGTT
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             T-AGTA---AGTCG-TACTTT-GT-----TCTA--CATC----T------TCTTTTATCTTTAAATA-TCCTATCCTATGAGT--CGGT-TTT---CTG-TTGT----TCTGAAGAAGG--TACAGG-TCG------TCACGAAAAgtgactgtattcaatattttagggtatgtatgtaa
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ttcA-----GT-T-TAGTCGT-GGTAT-TAGTTTGCA-TT------------A--TATT----T------CGATTTCTTC--------TCT-AT---GTAAA--------TAT---CGTGTCGT----CCTGAAGAAGG--GACGTG-TCA-TC---CC
gi|2                          :                                                  ttgataacgtctgcACAATTCAATAAATAATGGTGACCATTAACGCTTTCCTATCTAATATTCCTATTCGTTTATT-ATCTATCATTTA--TCAA-TTTGTAAAATAAAAATCAATTCATTCCTTCTAA--------------------ATTTTTATTTATTCTTAGAGCACAGTAACGAGAGAATGTCACCGGTTG---TGATTTGATTTTAG-CACTGATGAACATAATTAGTTTAAAC--------CCTGATATGTGCCCTTT---AAG-TC---CATCA--TTACTACTCCACGCATTG---------------TGGGTCAGTCCATTGGGCGAAGAGAATGTGTCCTAACTCGCTCC----CCCAGAA---AACT-----T--TG-T-TT-AGCCATCC-AAAATCAACAAA----CATGTAATTTGCAGTGTA--AATACGTCTGTAGTTTTA-----GT-----GC--T-AGTG---GGCCT-TT-TTT-GT--------A--TAT--------------CTTTAGCC------A-TCTTAT---GTAAAC--C--CATTT---CGT-TTGT----CCCGGGGAAGG--GTCAAGCTCG------TCCCGAAAATTTG------ATGA--TC--TA--G---GTGTTCGT-TA--GCAATTTTTGTAAATTTAGTGCATT
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             T-AGGGC-CAACTT-T---TT-CC-----TCCAGGTATTACC-C------GTTTGTAGGC------A-TCTTTT---GTAAAA--C--T-TTTTTTCGT-TTGT----CCTGACGAAGG--AAAAGG-T-G-CC---CCCCAAAatatataattatatgcatgcaaagttctaactatcagtgtcg
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AC--C--T-TTT---CGT-TTGT----CTCAAGGAAGA--GACGAC-TGGCTC---TCT---AAATT----------GA--TC--TA--A---TGGTTCTTGTC--------TTGGTCTTATCGGTACTTT
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      -TTT---CAT-TTAA----CCCGATGAAGG--GATGAG-TTG-TC----CCTGGAACT-----------GA--TG--TA--AATTTCGTTTGTGTT--G-----TTGGTCATATCAGTGCTa
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         T---CTT-TTGT----CCCGAAGAAGG--GA-----TTG-TCCG-TCCCGGAAAATTG------ACAT--TC--AA--A---TTGCTCGGGTC--G-----TAAGTCAATTTAGTGCT
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           aA--TG---------------G---------------CGGACAAGCCTTTCGGACAAATAGGATGTGTCCTAATTCGCCTC----GT---AA-
gi|25                         :                                                                                                                                                                                    gcctgtaaactcgagattattTTTTGTT-ATTGTTACAGCACAATTACAACAGAACATCACCGGGTA---CGAGTTGCCTTT-G-CACTGt
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           CA--TC---------------G---------------TGGATCACTGAAATGGACGAGTAGA--GTGTCCTAATTTGCCCC----CT---Aa
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        cgGG-TCG-TC---TCC--AAAAACTG------GCAG--TC--TG--T---TTGTTGGTGCC--G-----TCGATCATTTTAGTgaaa
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               GAAGG--GACAAG-TCG-TC-----CCGAATTTTTG------ACGA--CC--TA--A---TTGTTCGTGTtc
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    g--A---TTGTTCGTGTC--G-----TTGGTCATTTTAGTGCT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                        -CATTGTTTACCATAATGAGTT--AATTCGCCCTACTTCAGATAAA----TTTTAAAAATC---TATCA--TC---------------ACTACTTCATGCACTATGGGTCATTCTATTGGACGTGTAGGGCGTGTCCTAGTTCGCTT----------------G-A-----T--TG-A------CAAGCC---AA-CAATCAAGTAGCGTATAATTCCCAGTCTT--AATATATTTATAGTCTTAGTGATGT-T-T--CTGTGAGTG---------TA-TTT-G--------CA--TATC----T------A--TTTACCC------A-CCTGAT---ATAAAC--C--T-TTC---CCA-TTAC----TTTGAAAAAAAATGATAGG-TCG------TCCCGAAAAATAA------GCAA--TC--TA--A---TTGTTCGTGTC--A-----TTGGTGATTTTaataat
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         CCATTGAACGAGTAGGGCCTTTCATAATTTGC-CC----CT---CA---AGCAAATGTT--TG-A-TT-AGCTAGCG-TAAA-CAATAAG----CATGTAATTTGCAGCGTA--TACTCGAT-GTAGATTTA-----GTGT-TATC--------C-T--TTT-TG-T---A--------CA--TGTA----T------ATGTTT---C------A-TGT-AT---GTAAAA--T--T-TTT---CAG-TGGT----TCTGAGGAAGG--GACAGG-TC---T---TCCCAAAAACTCACCTTATAC-A--TG--TA--A---TTGTT--TGTCATG-----TTTGTCATTTCAGTCCTTTtggtcatttcataattactctcctcgttgtggatcaaatactcatagtagaaatgaa
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          cGTATCCGATTTCGCTTCG---TT---AA-TTAGCA-----T--TGGA-T--AGCGAGCC-AAAA-TAATAAA----CAACTAATTCAGAATGTATAAATA--TTTGTAGATGTA-----CT-T-TAGTTGT-AATGC-CAGTTG-TA-TTT-AT-----TTCA--TACT----TATCTAGATCTTTATCT------A-TATTAT---GTAAAC--C--T-TTC---CAT-CTGC----CTTGACGAACG--AACGGG-TCG------TCCTGAAAAGTTG------ACAA--TC--TA--G---TTGTTCGTGTC--G-----TTGGTCATTTTAGTGCTTTgggtgatttttatgtttgaacctgcattcactttgcagatccaacacttttaggcatatagtgctgttgg
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           gaAATCAA-----ATGTGATTAACAGTGGA--AATAGGTTTGTAAAGTTA-----GT-T-CAGTTAT-AGTGC-TAGTTT-TA-TTT-AT-----TCCA--TATT----T------ATTTTTATTC------A-TCTTAT---GTAAAT--C--T-TTT---CGT-TTGT----CCTGAAGAAGG--GACGGG-TCG------TCCCAAAAATTTG------AC-A--CCTTTA--A---TTGTTCGTGTC--A-----TTTGACATTATGGTGCTTTgaataattcttctgtttcaacttgcatc
gi|7                          :                             aTGGTTCATAACTACACCCGCCCCCTGTTT-ATTTACAACTCTATCAATA---GAGAAAA--ACCACATT----TTTAAAATTATTTTTCATTTATT-------CACTTACTTCAAGTTTTCCCAATA----T---CTCTTTCTTTCTCATTACTCTTT---AATCTCTCATTTTCGTTT-TTGTTA---CATA--AACAA-Agtataattcttctgttggactttgcttacgttttgatgatccggcactgataggtatcgggtgtttatgcttatagcat
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tttatgattagatcaagttgcgtAATAGT-CGTGTTGTTATCCGACCCGTA-CT---AA---AGCA-----T--TA-A-TTTAGTAAACCCAAAA-CAATGAT----GATGTAATTTGCAGTGTA--AATACGTTTGCACA-TTA-----AT---------T-AGTGC-TAGTTT-CA-TTC-AT-----TCCGTTTATT----T-------GTTTTGCTG------A--CTTGA---ATAAAC--G--T-T-------T-CTGT----CCCGAAGAAGat
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tttctgaaatgaAGTTT-TA-TC--AT-----TCTG--TATA----T------A-TTTAAGCC------A-TCTTAT---GTA--C--C--A-TTT---CGT-TTGT----CCTGATGAAG-----CAGG--------------AACAATTAG------ACAA--TCTATA--A---ATG-TAATG-C--T-----TTCATAATTTT-GTGCTT
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|17 ): GTTCACAACCTCGTTTTTTGTGTCTTGTTTATTTTAGTGCTCTTTATCATTTTTCTGCTTGGACTTGTATCTACTAAGTAGATTCGACACCTTTTAAAGGTATCGATGTTGTT