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Reference ( gi|20 ) : AAT-ATTTA-T-T--AAA-T-A---TA-A--C-G--T-A--AA-A--T---C---A-A---G------G--T-----A--A--T---C-------A---T-------T-A---G----T-A-TT------GC-G---G---------A-T----G--G--------ATA-T--T----G--C-GG-C--A----A-G-T----A------G----A--------C-C------G-G--A-A-A-T-T--G-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--G--T-G-------AA---A----A---T---A-A-C-----A-----C---T---T--T-----T-G-T--------T---A---T---T---T-T-T-C------A-C-----------A-C-T----G-T--G-A--A--A----A----A----T--A-------A-C-A-----A--A----T------T------T-T----A---C--T----------C-AA------------------------CG--G--A----------T------------AAA--T---T-T---C--A-A--T-AT-T----------TC--ACTG-C-T--AAA-AA-TGCTAA
gi|21 : AAT-ATTTA-T-T--AAA-T-A---TA-A--C-G--T-A--AA-A--T---T---A-A---G------G--T-----A--A--T---C-------A---T-------T-A---G----T-A-TT------GC-G---G---------A-T----G--G--------ATA-T--T----G--C-GG-C--A----A-G-T----A------G----A--------C-C------G-G--A-A-A-T-T--G-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--C---C---A--C--T--G--G-G-------AA---A----A---T---A-A-C-----A-----C---T---T--T-----T-G-T--------T---A---T---T---A-T-T-C------A-C-----------A-C--------T--G-A--C--A----A----A----T--A-------A-C-A-----A--C----T------T------T-T----A---C--G----------C-AA------------------------CG--G--A----------T------------AAA--T---T-T---C--A-A--T-AT-T----------TC--ACTG-C-T--AAA-AA-TG-TAA
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gi|66 : atgAAC-ATTTA-T-T--AAA-T-A---CA-A--A-G--T-A--GA-A--T---T---A-A---G------G--T-----C--A--T---C-------A---T-------T-A---G----T-aat
gi|26 : tgAC-ATTTAAT-T--AAA-T-A---TA-A--C-G--T-A--AA-A--T---T---A-A---G------G--T-----T--A--T---C-------A---T-------T-A---G----T-A-TT------GC-G---G---------A-T----A--G--------ATA-T--T----G--C-GG-C--A----A-G-T----A------G----A--------C-CG-----G-G--A-A-A-T-T--G-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--T---T---A--C--T--G--T----------A---A----A---T---A-A-C-----A-----CT--T---T--T-----T-G-T--------T---A---T---T---T-T-T-C------A-C-----------A-C-T----G-T--GAA--A--A----A----A----T--A-------A-C-A-----A--A----T------T------C-T----A---T--T----------C-AA------------------------AG--G--A----------T-------------AA--T-----------------T-AT-T----------TC--ACTG-C-T--GAA-AA-TG-TAA
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gi|41 : cAC-ATTTA-T-T--AA--T-A---TA-A--C-G--T-A--AA-A--T---T---A-A---G------G--T-----T--A--T---C-------A---T-------T-A---G----T-A-TC------GC-G---G---------A-T----T--G--------ATA-T--T----G--C-GG-C--A----A---T----A------G----A--------C----------G--G-A-A-T-T--G-----T--T---AT--T-----T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--G--T-G-------AA---A----
gi|3 : gAT-ACGTA-T-G--CAA-T-A---AA-A--C-G--T-AGAAA-A--T---T---A-GTCCG------G--------A--A--T---CTCATAACA---T-------T-A---G----T-AATTCAAAAAGC-G---GCCGAGA---A-T----A--G--------ATA-T--T----GG-T-GG-C--A----A-GAT----AAG----G----AAAGTCCATC-C------G-G--A-A-A-T-T--A-----T--T-------------T-T-------T-----C--T---C---A--C--A--G--T-GG------AA---A----A---T---A-A-C-----AT----C---T---T--T-----T-G-T--------T---A-------T---T-T-T-C------A-CAATGTATGTAAA-C-TAGA-G-T--G-A--A--AAAATA----A----T--A-------A-C-A-----AG-A----T------T------T-A----A---T--T----------TAAA------------------------CG--A--A----------TCA----------AAA--T---T-T---T--ACA--T-AT-T----------TC--ACTG-C-T--GAA-AA-TGttctattcaacggataaatttcaatattcactgctggaaaatgtaata
gi|53 : aaaatgtattagAC-ATCTA-T-C--AAA-T-A---TA-A--C-G--T-A--AC-A--T---T---A-A---G---------------------T---C-------A---T-------T-G---G----T-A-TT------GC-G---G---------A-T----G--A--------ATA-TATT----A--C-GG-C--A----A-G-T----A------G----A--------C-C------G-G--A-taca
gi|65 : ggAC-ATTTA-T-T--AAA-T-A---TA-A--C-G--T-A--AA-T--T---------A---G------G--T-----T--A--T---C-------A---T-------T-A---G----T-A-TT------GC-G---G---------A-ta
gi|14 : T-ATCTA-T----AAA-T-----CA-A----G--T-A--AA-AATT---A---A-A---GA-----G--T-----T--A--T---C-------A---T-------T-A---G----C-A-TT------GC-G---G---------A-T----A--G--------ATA-T-------G--C-GG-C--A----G-GCT----A------A----A--------CGC------G-G--A-ACA-T-T--G-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--G--T-G-------AA---AC---A---T---A-A-C-----A---------T---T--T-----T-G-T--------T-------TCCGT---T-T-T-C------A-C-----------A-C-T----G-TTTG-A--A--A----A----A----T--A-------A-C-A-----A--A----T------T------C-T----A---T--T----------C-AA------------------------AG--G--A----------T------------AAC--T---T-T---C--A-G--T-AT-T----------TC--ACTG-C-T--AAA-AC-TGTTA
gi|19 : tt-ATTTA-T-T--AAA-T-A---TA-A--C-G--T-A--AA-A--T---C---A-A---G------G--T-----A--A--T---C-------A---T-------T-G---G----T-A-TT------GC-G---G---------A-T----T--G--------ATT-T--A----G--C-GG-C--A----A-G-T----A------G----A--------C-C------G-G--A-A-A-T-T--G-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--G--T-G-------AA---A----A---T---A-A-C-----A-----C----------T-----T-G-T--------T---A---T---T---T-T-T-C------A-C-----------A-C-A----C-T--G-A--A--A----A----A----T--A-------A-C-A-----A--A----T------TAA----T-TTG--A---C--T----------C-AA------------------------CG--G--A----------T------------AAA--T---T-T---C--A-A--T-AT-T----------TC--ACTG-C-T--AAA-AA-TG-TAAtaaa
gi|22 : -ATTTA-T-T--GAA-T-A---TA-A--C-G--T-A--AA-A--T---T---A-A---G------G--T-----C--A--T---C-------A---T-------T-A---G----T-A-TT------GC-T---G---------A-T----A--T--------ATA-T--T----G--C-TG-C--A----A-G-T----A------A----A--------C-C------G-G--A-A-A-T-T--G-----T--T---A---T-----T-T-------A-----C--T---C---A--C--T--G--T-G-------AA---A----A---T---A-A-C-----A-----C---T---T--T-----T-G-T--------T---A---T---T---T-T-T-C------A-C-----------A-C-T----G-T--G-A--A--A----A----A----T--A-------A-C-G-----A--C----T------T------C-T----A---T--T----------T-AA------------------------GG--G--A----------T------------ACT--T---G-T---C--A-A--T-AT-T----------TC--TCTG-C-T--GAA-AA-TG-TAAtaa
gi|35 : -ATTTA-T-T--AAA-T-AA--TA------G--T-A--A-----T---T---A-A---G------G--T-----T--A--T---C-------A---T-------T-A---G----T-A-T-------GC-G---G---------C-T----A--G--------ATA-T--T----G--C-GG-C--A----A-G-T----A------G----A--------C--------G-G--A-A-A-T-T--G-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--G--T-G-------AA---A----A---T---A-A-C-----A-----C---T---T--T-----T---T--------T---A---T---T---T-T-T-C------A-C-----------G-T-T----G-T--T-G--A--A----A----A----TAAA-------A-A-A-----A--A----A------T------T-C----A---C--T---------------------------------------G--A--A----------T------------AAA--T---T-T---C--A-taa
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gi|44 : aaca-ATTTA-T-T--AAA-T-A---TA-A--C-G--T-A--AA-A--T---C---A-A---G------G--T-----A--A--T---C-------A---T-------T-A---G----T-AATT------GC-G---G---------A-T----A--G--------ATA-T--T----G--C-GGGC--A----A-G-T----A------G----A--------C-C------G-------------------------------------------------------------------------------G-------AA---A----A---T------------------------------------T-G-T--------T---A---T---T---T-T---C------T-C-----------A-C-T----G-T--G-A--A--A----A----A----T--A-------A-C-A-----
gi|45 : aaca-ATTCA-T-T--AGA-T-A---TA-A--C-G--T-A--AA-A--T---T---A-A---G------G--T-----T--A--T---C-------A---T-------T-A---G----T-AATT------GC-G---G---------A-T----T--G--------ATA-T--T----G--C-GG-C--A----A-G-T----A------G----A--------C-C------G-G--A-A-A-T-T--G-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--G--T-G-------AA---A----A---T---A-A-C-----A-----C---ct
gi|17 : tc-ATTTA-T----GAA-T-A---TA-A--C-G--T-A--AA-AA-T---T---A-AT--G------G--T-----C--A--T---C-------A---T-------TTA---G----T-A-TT------GC-T---G---------A-T----A--AT-------ATA-T--T----G--C-TG-C--A------G-T----A------A----AA-------C-C------G-G--A-A-A-T-T--------T--T---A---T-----T-T-------A-----C--T---CC--A--C--T--G--T-G-------GA---A----A---T---A-A-CC----A-----C---T---T--T-----TTG-T--------T---A---T---T---T-T-TTC------A-C-----------A-C-T----G-T--G-A--A--A----A----AA---T--A-------A-C-G-----G--A----C------T------T-TCT--A---T--T----------C-AA------------------------GG--G--A----------T------------ACT--T---G-T---C--A-A--T-AT-T----------TC--TCTG-C-T--GAA-AA-TG
gi|37 : c-ATTTA-T-T--AAA-TTA---TA-A--C-G--T-A--AA-A--T---T---A-A---G------G--T-----T--A--T---C-------A---T-------T-A---G----T-A-TC------GC-G---G---------A-T----T--G--------ATA-T--T----G----GG-C--A----A---T----A------G----A--------C-C------G-G----A-A-T-T--G-----T--T---AT--T-----T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--G--T-G-------AA---ATTCTA---TTC-A-A-CGGATAA-----A---T---T--T-----C-A-A--------T---A---T---T---T--------------C-----------A-C-T----GCT--G-G--A--A----A----A----T--
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gi|56 : aa-ATGTA-T-T--AGA-T-A---TA-T--C-G--T-A--AA-A--T---G---A-A---G------A--T-----ATAA--T---C-------A---T-------T-A---G----T-A-AC------GC-G---G---------A-T----A--A--------ACA-C--T----G--C-AG-C--A----A-G-T----A------G----ataataaa
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gi|8 : aactTCA-T-T--AAT-T-A---TA-A--C-G--T-A--AATA--T---C---A-A---G------G--T-----A--A--T---C-------AAT-TA------T-A---G----T-A-TT------GC-G---G---------A-T----A--G--------ATA-T--T----G--C-GG-CAAA----A-G-T----G------A----T--------C-C------G-GT-ATA-G-T-T--G-----T--TTTAA---T-----C-T-------T-----C--T---C---A--CG-T--G--T-G--------A---A----A---T---A-A-C-----A-----C---T---T--TG----T-G-A--------T---A---T---T---T-T-C-T------A-C-----------A-C-T----G-T--G-A--A--A----ATAC-A----T--A-------A-CGA-----A--A----T------T------T-T----A---C--T----------C-AA------------------------C---G--A----------T------------AGA--T---T-T---C--A-A--T-AT-TTTCAACTGCCTC--ACTG-C-T--AAA-AA-TG-TAAtaaa
gi|6 : TTA-T-T--AAA-T-A---TA-AA-C-G--TGA--AA-A--T---C---A-GAG-G------G--T-----A--A--TGCAT-------A---T-------T-A---GGGTAT-A-CT------GCTG---G---------A-C----GTAG--------ATA-TG-T----G--C-GG-C--A----A-G-TTA--G------G----A--------C-C------G-G--G-A-G-T-T--G-----T--T---A---T-----T-G-------T-----C--T---TT--A--C--T--G--TCG-------GATACA----A---T---A-AAC-----A-----C---T---T--T-----T---TGAA-----T---A---T---T---T-T-T-C------A-C-----------A-C-T----G-G--A-A--A--A----A----G----T--A-------A-T-C-----A--A----T------TG-----T-T----A---CA-T----------CTAA------------------------CG--G--A----------T------------AAAG-TTAAT-T---C--A-ATGT-AT-T----------GT--ACTG-C-T--AAA-AA-TG-TAAtaa
gi|55 : aagcagTTG-T-T--GAA-T-A---TA-A--C-G--T-A--GA-A--T---T---A-A---G------G--T-----T--A--T---C-------A---T-------T-A---G----T-A-CT------GC-G---G---------A-T----A--T--------ATA-T--T----G--C-GG-C--A----A-G-T----A------G----A--------C-C------G-t
gi|4 : cTA-T-T--AAAAT-AAATTA-A--C-G--T-A--AA-A--G---T---A-A---G------G--TGTGGAA--G--T---CT------A---T-------T-ATAGGC---T-A-TA------G--G---G---------C-T----G--GCATTAGATATG-T--TTG--G--C-GG-T--A----A-T-T----A------A----A--------C-C------G----A-A-A-T-T--G-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--T---TCG-A--A--T--G--T-G-------AA---G----AAT-T---ATA-C-----A-----C---T---T--TC----T-G-TAGTGGCTAT---A---T---TAGGT-T-C-A------A-C-----------A-C-T----G-T----A--A--A----A----A----T--A-------AGC-A-----A--A----TGA----TACCAAAT-T----A---CA-T----------A-AG------------------------TG--G--ATCACGTAGAGT------------AAA--TA--T-TTGCC--A-A--TAAT-T----------TC--CATG-C-T--GAA-AA-TG-TAA
gi|15 : taA-T-T--AAA-TTA---TA-A--C-G--T-A--AA-G--T-------A-A---G------G--T-----T--A--T---C-------AC--T-------T-A---G----TCA-TT------GC-G---G---------T-T----A--G--------CTAAT--T----G--C-TG-T--A----A-G-T----C------A----A--------A-C------GTG--A-A-A-T-T--G-----T--T---A---T-----T-T-------TATT--C--T---C---A--C--T--G--T-T-------GA---A----A---T---A-A-C-----A-----C---C---T--C-------G-T--------T---A---T---T---T-T-G-C------A-C-----------A-T-C----G-T--GTG--A--A----A----A----T--A-------G-C-CC----A--A----T------T------C-T----A---T--G----------C-AA------------------------TG--G--A----------T------------AAA--T---T-T---CCAA-A--T-AT-T----------TC--ACTG-CTT--AAG-AATTACTAAat
gi|12 : taa-T-T--AAA---A---TA-A--C-G--T-AG-AA-A--T---T---A-A---GTTATCAA--T-----A--A--T---T-------AACTT-------T-A---G----T-A-TT------GC-G---G---------A-TT---A--G--------ATA-T--T----G--C-GG-C--A----A---T----A------G----A--------C-C------G-G--A-G---T-T--G-----TG-T---A---T-----T-T-------T-----C--T---CCTCA--C--T--G--T-G-------AA---A----A---T---A-A-C-----A-----CTTTT---T--T-----T-G-T--------T---A---T---T---T-TCT-C------A-C-----------A-C-T----G-T--GAA--A--A----A----A----T--A-------T-CAA-----A--A----T------T------C-T----A---T--T----------C-AA------------------------CG--G--A----------T------------AAA--T---G-T---C--A-A--T-AT-TAG--------TC--ACTG-C-T--GAA-AG-T
gi|52 : t-T-T--AAA-T-A---CC-T--C-G--T-G--AA-C--T---G---A-A---G------T--T-----G--A--T---C-----------T-------T-AT--G----T-A-TC------GC-G---G---------A-TTTATG--A--------ATA-T--T----G--C-GG-C--A----A-G-T----A------aat
gi|46 : AA-T-A---TA-A--C-G--T-A--AA-A--T---T---A-A---G------G--T-----G--A--T---C-------A---T-------T-T---G----T-A-TT------GC-G---G---------A-T----A--T--------ATA-C--T----G--C-GG-C--A----A-A-T----A------A----A--------C-C------G-G--A-A-A-T-T--GTTTACT--T---A---T-----T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--G--T-G-------AA---A----A---T---A-A-C-----A-----C---T---T--attccggttgat
gi|46 : acgtAA-T-A---TA-A--C-G--T-A--AA-A--T---T---A-A---G------G--T-----G--A--T---C-------A---T-------T-T---G----T-A-TT------GC-G---G---------A-T----A--T--------ATA-C--T----G--C-GG-C--A----A-A-T----A------A----A--------C-C------G-G--A-A-A-T-T--G-----T-----------------------------------T---T---A--C--T-------------------------------------------------------------------------------T---A---T---T---T-T---C------T-C-----------A-C-T----G-T--G----A--A----A----A----T--A-------A-C-A-----
gi|9 : acgtAA-T-T---TA-A--C-G--T-A--AA-A--T---T---A-A---G------G--T-----G--A--T---C-----------T-------T-----G----T-A-TT------GG-C---G---------A-T----A--TT-------ATA-C--T----G--C-GG-C--A----A-A-T----A------A----A--------C-C------G-G--A-A---T-T--G-----T--TT--A---C-----T-TATT----T-----C--T---C---A--C--T--G--TTG-------AA---A----A---T---A-A-C-----A-----C---T---T--T-----T-A-T--------T---A---T---T---T-T-T-C------A-C-----------A-C-T----G-T--G-A--A--A----A----AT---T--A-------A-C-ACTTTTATTA----T------T------T-TTCACA---C--TGGAAAA----T-AA------------------------CA--A--A----------TTCTATTCAACGGAAAAAT---T-T---C--A-A--T-AT-T----------TC---CTG-C-T--AAA-Actt
gi|28 : A-T-A---TA-T--C-G--T-A--AA-T--T---------A---T------A--T-----T--A--T---C-------A---T-------T-A---G----T-A-TT------GC-G---G---------ACT----A--G--------ATA-T--T----G--C--------------------------------------------C------G-G--A-A-G-T-T--G-----T--T---A---T-----T-T-------T-----T--T---C---AAAC--T--G--T-G-------AA---A----A---T---A-A-C-----AACT--T---T---T--T-----T-G-T--------T---A---T---T---T-T-TTC------A-C-----------A-C-T----G-T--T-A--A--A----A----T----T--A-------A-C-A-----AT-A----T------T------T-T----A---C--T----------C-AA------------------------CG--G--AA---------T------------AAA--T---T-T---T--C-A--T-AT-T----------TC--ACTG-C-T--AAA-AA-tgtata
gi|30 : gA-T-A---TA-A--C-G--T-A--AA-A--C---C---A-AC--G------G--T-----A-----T---C-------A---TG------T-A---G----T-A-TT------GC-G---G---------A-T----A--G---------TA-T--T----G--C-GG-C--A------G-T----A------G----A--------C-C------G-AC-A-A-ACT-T--G-----T--T---A---T-----T-G-------------C--T---C---A--C--T--G--TTG-------AA---A----A---T---A-A-C-----A-------------T--T-----T-G-G--------T---G---T---T---T-T-T-C------A-C-----------AAC-T----G------A--A--A----A----A----T--A-------A-C-A-----A--A----T------T------G-T----A---C--T----------C--A------------------------CG--G--A----------T------------AA-------T-T---CATA-A--T-AT-C---------------CTG-C-T--AAA-Aaatgtaata
gi|27 : catt-T-A---TACA--T-G--T-A--AA-AGAT---G---A-A---T------T--T-----G--A--T---C-------A---T-------G-T---G----T-A-TC------AC-T---G---------A-T----G--A--------ATA-T--T----C--A-GG-C--A----A-T-TCATTA------G----A--------T-C------T-A--T-A-G-T-T--G-----T--T---A---A-----T-TA------C-----C--TACAC---A--C--T--G--C-G-------AA---A----A---T---A-T-C-----A-----G---T---T--T-----T-G-T--------T-------------------T-C------A-C-----------A-G-T----G-T--G-A--A--A----A---------T--G---------T-A-----A--A----T------T------TAT----A---T--T----------C-AA------------------------TG--G--A----------T------------AAA--T---T-A---C--T-G--T-AT-T----------TC--ACTG-T-T--TAA-AA-CGCtaat
gi|39 : g-A---TA-A--C-G--T-A--AA-A--G---G---A-A---G------A--T-----G--A--T---T-----------T-------T-AT--G----C-A-TT------GT-G---G---------AAT----G--A--------ATA-T--T----A--C-GA-C--A----A-G---------------------------------------------G-T-T--G-----T--T---A---TA----T-T-------T-----T--T-------------------------------------------------A-C-----G-----C---T---T--C-----T-GGT--------T---A---C---A---C-A-T-C------A-------------A-C-G----G-T--G-A--A--A----A----A-------A-------A-T-A-----A--A----T------T------T------A---T--T----------C-AG------------------------TT--G--A----------T------------AGA--T---T-T---T--A-G--A-AT-T----------TC--ACTG-T-T--GAA-AA-TGg
gi|59 : ---TA-A--T-G--T-A--AA-A--T---G---A-C---A------G--T-----G--ACTT---C-------A---T-------------G----T-A-TC------GC-G---A---------A-T----G--A--------ATA-T--T----G--C-GA----G----A-G-T----A------G----
gi|29 : A-A--C-G--T-A--GA----T---T---A-A---G------G--T-----T--A--T---C-------A---T-------T-A---G----T-A-CT------GC-G---G---------A-T----T--AT-------ATA-T--T----G--C-GG-C--A----A-G-T----A------A----A--------C-C------G-G--A-A---T-T--G-----T--T---A---T-----T-T-------T-----CCCT---C---A--C--T--G--T-G-------AA---A----A---T---A-A-C-----A-----C---T---T--T-------G-T--------T---A---T---T---T-T-T-CC-----A-C-----------C-C-T----G-T--G-A--A--A----A----A----T--A-------AAC-A-----A--A----T------T------C-T----A---T--T----------C-AA------------------------CG--G--A----------T------------AAA--T---T-T---C--A-A--T-AT-T----------TC--ACTG-C-T--GAA-AA-TG-TAAtcacggttg
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Reference ( family-2116 ) : AACA-T-T---TA-T---T--AAA-T-A---TA-A--C-G--T-A--AA-A--T---T----A-A---G-G----TN---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-A-TT------GC-G---G---------A--T--A-G-ATA-T---T----G-C-GGC--A----A-G-T----A--G----A--------C-C-G-G--A-A-A-T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--G--T-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-T--T--T-T---G-T--------T---A---T---T---TT-T-C---AC-----------A-C-T----G-T--G-AA-A----A----------A--T----A-------A---C-A--------A--A-T---T--T-T--A---T-------T-C-AA--CG--G------------------------A--T--AAA-T---T-T---C--A-A--T-AT-T----------TC--ACTG-CT--G--A--A-AATG-TAA
gi|1 : CA-T-T---TA-T---G--AGA-TTA---TA-A--T-G--T-A--AA-A--T---C----A-A---G-G----TA---------A--T---TCGA----------TGAAGTGCT-A----T----T-A-TT------GC-G---GCGCTGCTACA--T--A-G-GCA-T---TATGGG-C-GGC--ATATGA-G-T----A--C-------------C-C-G-GTTA-G-G-T-TG-----TGTT---A---T-----T-T-------TGTCCTC--T---T---A--T--T--T--T-GGTTGAATAA---A----G--T--A-A-C-----ATATCTC-T--TCTT-T---G-T--------TCTAG---T---T---TT-T-C---TCG----------A-C-TCGACA-T--G-GA-A----AGAAA------A--T----A-------AACAC-ATGTTGCCTA--G-T---T--C-T--C---T-------A-C-AA--CG--G------------------------AA-T--AAA-T---T-T---C--A-A--T-AT-T----------TC--ACTG-C---G--A--A-AATG-
gi|10 : atgaatACA-T-T---TA-T---TT-AAA-T-A---TA-A--CCG--A-A--GA-A--T---T----A-A---ATG----TT---------A--T---C--A----------TG------T-A----G----T-A-TT------GC-G---G---------A--T--AAG-ATA-T---TTTT-G-C-GGC--A----A-G-T----A--A----A--------C-CCG-G--A-A-A-T-TG-----TA-T---A---T-----T-T-------C-----CG-T---C---A--C--T--G--T-G-------AA---A----A--T--A---C-----AG----C-T--T--T-T---G-T--------T---A---T---T---TT-TTC---AC-----------A-G-T----G-T--G-AA-A----A----------A--T----A-------A---C-A--------A--A-T---T--C-T--A---T-------TGC-AA--CG--GA-----------------------A--TA-AAA-A---T-A---C--A-A--T-AT-T----------TCA-ACTG-CT--G--A--A-AATG-TAAaat
gi|11 : AACA-T-T---TT-A---T--AAA-T-A---TA-A--G-A--G-A--AA-A--T---T----C-A---G-G----TT---------AG-T---C--A----------T-------T-A----GG---T-A-TT------GC-G---T---------A--G--A-G-ATA-T---T----G-C-GGCTAA----A-G-T----A--A----A--------C-C-G-G--AGA-A-T-AG-----T--T---A---T-----TGT-------T-----C--T---C---AT-C--T--G--T-A-------AG---A----A--T--AGA-C-----A-----C-T--T--T-T---G-T--------T---A---T---T---TT-T-C----C-------------C-T----G-T--G-AA-A----A----------AGTT----AATT----A---C-A--------A--A-T---T--TCT--AT--T-------T-C-AATTC---G------------------------A--T--AAA-A---T-T---C--A-AT-T-AT-T----------TC--ACTG-CT--G-----A-CATG-TAAta
gi|12 : g-T---T--AAA---A---TA-A--C-G--T-AG-AA-A--T---T----A-A---G------TT---------A--T---C--AATAATTAACTT-------T-A----G----T-A-TT------GC-G---G---------A--TT-A-G-ATA-T---T----G-C-GGC--A----A---T----A--G----A--------C-C-G-G--A-G---T-TG-----TG-T---A---T-----T-T-------T-----C--T---CCTCA--C--T--G--T-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-T--T--T-TTTTG-T--------T---A---T---T---TTCT-C---AC-----------A-C-T----G-T--G-AA-A----A----------AA-T----A-------T---C-A--------A--AAT---T--C-T--A---T-------T-C-AA--CG--G------------------------A--T--AAA-T---G-T---C--A-A--T-AT-TAG--------TC--ACTG-CT--G--A--A-A--G-TAA
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gi|14 : -T-T---TA-TCTAT--AAA-T-----CA-A----G--T-A--AA-AA-T---T----A-A---A-GAG--TT---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----C-A-TT------GC-G---G---------A--T--A-G-ATA-T--------G-C-GGC--A----G-GCT----A--A----A--------CGC-G-G--A-ACA-T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--G--T-G-------AA---AC---A--T--A-A-C-----A-------T--T--T-T---G-T--------T-------TCCGT---TT-T-C---AC-----------A-C-T----G-TTTG-AA-A----A----------A--T----A-------A---C-A--------A--A-T---T--C-T--A---T-------T-C-AA--AG--G------------------------A--T--AAC-T---T-T---C--A-G--T-AT-T----------TC--ACTG-CT--A--A--A-ACTG-tata
gi|15 : A-T---T--AAA-TTA---TA-A--C-G--T-A--AA-G--T--------A-A---G-G----TT---------A--T---C--AC---------T-------T-A----G----TCA-TT------GC-G---G---------T--T--A-G-CTAAT---T----G-C-TGT--A----A-G-T----C--A----A--------A-C-GTG--A-A-A-T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------TATT--C--T---C---A--C--T--G--T-T-------GA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-C--T--C-----G-T--------T---A---T---T---TT-G-C---AC-----------A-T-C----G-T--GTGA-A----A----------A--T----A-------G---C-CC-------A--A-T---T--C-T--A---T-------G-C-AA--TG--G------------------------A--T--AAA-T---T-T---CCAA-A--T-AT-T----------TC--ACTG-CT--T--A--A-GAtataaa
gi|16 : taaAACA-T-T---TA-T---T--AAA-T-A---TA-A--CTG--T-A--AA--------T----A-A---G-G----TT---------A--T---C--A----------TG------T-A----G----T-A-T----------G---G---------A--T--A---ATA-T---T------C-GGC--A----AAG-T----A--A----A--------C-C-C-G--A-A-A-T-T-------------A---T-----T-T-------T-----C--T---C---C--C--T--G--TTG-------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-T--T--T-T---G-T------------A---T---T---TT-T-C---ACC----------A-C-T------T--C-AA-A----A----------A--TTACTA-------A---C-AT-------A--A-T---T--T-T--A---T-------T-C-AA--CG--G------------------------A--T---AA-T---T-TCA-C--A-A--T-A--T----------TC--ACTG-CT--G--A--ACAATG-TAAattactaa
gi|17 : gCA-T-T---TA-T------GAA-T-A---TA-A--C-G--T-A--AA-AA-T---T----A-AT--G-G----TC---------A--T---C--A----------T-------TTA----G----T-A-TT------GC-T---G---------A--T--A-ATATA-T---T----G-C-TGC--A------G-T----A--A----AA-------C-C-G-G--A-A-A-T-T------T--T---A---T-----T-T-------A-----C--T---CC--A--C--T--G--T-G-------GA---A----A--T--A-A-CC----A-----C-T--T--T-TT--G-T--------T---A---T---T---TT-TTC---AC-----------A-C-T----G-T--G-AA-A----A----------AA-T----A-------A---C-G--------G--A-C---T--T-TCTA---T-------T-C-AA--GG--G------------------------A--T--ACT-T---G-T---C--A-A--T-AT-T----------TC--TCTG-CT--G--A--A-AATG-taaa
gi|18 : AACA-T-T---TA-G---T--TAA-G-A---TA-A--C-G--T-A--AA-G--T---TTTCAG-A---G-G----TA---------A--T---CG-A----------T-------T-A----G----T-A-T-------GC-G-------------A--T--A-G-ATA-A---G----G-C-GGC--A----A-G-TT---A--G----A--------C---G-G--A-A-G-T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--G--T-G-------GA---A----A--A--G-A-C-----A-----C-T--T--T-T---A----------T---A---T---T---TT-T-C---AC-----------A-C-T----G-T--GAAA-A----A----------A--T----A-------A---C-A--------A--ATT---T--T-T--A---C-------C-T-AA--CG--G------------------------A--T---AA-T---T-T---C--A-AG-T-AT-T----------TC--ACTG-CT--T--A--A-AATG-TA
gi|19 : A-T-T---TA-T---T--AAA-T-A---TA-A--C-G--T-A--AA-A--T---C----A-A---G-G----TA---------A--T---C--A----------T-------T-G----G----T-A-TT------GC-G---G---------A--T--T-G-ATT-T---A----G-C-GGC--A----A-G-T----A--G----A--------C-C-G-G--A-A-A-T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--G--T-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-------T-T---G-T--------T---A---T---T---TT-T-C---AC-----------A-C-A----C-T--G-AA-A----A----------A--T----A-------A---C-A--------A--A-T---TAAT-TTGA---C-------T-C-AA--CG--G------------------------A--T--AAA-T---T-T---C--A-A--T-AT-T----------TC--ACTG-CT--A--A--A-AATG-TAA
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gi|20 : gAATA-T-T---TA-T---T--AAA-T-A---TA-A--C-G--T-A--AA-A--T---C----A-A---G-G----TA---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-A-TT------GC-G---G---------A--T--G-G-ATA-T---T----G-C-GGC--A----A-G-T----A--G----A--------C-C-G-G--A-A-A-T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--G--T-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-T--T--T-T---G-T--------T---A---T---T---TT-T-C---AC-----------A-C-T----G-T--G-AA-A----A----------A--T----A-------A---C-A--------A--A-T---T--T-T--A---C-------T-C-AA--CG--G------------------------A--T--AAA-T---T-T---C--A-A--T-AT-T----------TC--ACTG-CT--A--A--A-AATGCTAAta
gi|21 : AATA-T-T---TA-T---T--AAA-T-A---TA-A--C-G--T-A--AA-A--T---T----A-A---G-G----TA---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-A-TT------GC-G---G---------A--T--G-G-ATA-T---T----G-C-GGC--A----A-G-T----A--G----A--------C-C-G-G--A-A-A-T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--C---C---A--C--T--G--G-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-T--T--T-T---G-T--------T---A---T---T---AT-T-C---AC-----------A-C--------T--G-AC-A----A----------A--T----A-------A---C-A--------A--C-T---T--T-T--A---C-------G-C-AA--CG--G------------------------A--T--AAA-T---T-T---C--A-A--T-AT-T----------TC--ACTG-CT--A--A--A-AATG-TAA
gi|22 : A-T-T---TA-T---T--GAA-T-A---TA-A--C-G--T-A--AA-A--T---T----A-A---G-G----TC---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-A-TT------GC-T---G---------A--T--A-T-ATA-T---T----G-C-TGC--A----A-G-T----A--A----A--------C-C-G-G--A-A-A-T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------A-----C--T---C---A--C--T--G--T-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-T--T--T-T---G-T--------T---A---T---T---TT-T-C---AC-----------A-C-T----G-T--G-AA-A----A----------A--T----A-------A---C-G--------A--C-T---T--C-T--A---T-------T-T-AA--GG--G------------------------A--T--ACT-T---G-T---C--A-A--T-AT-T----------TC--TCTG-CT--G--A--A-AATG-TAAta
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gi|25 : ACA-T-T---TA-T---T--GAA-T-A---TA-A--C-G--T-A--GA-A--T---T----A-A---G-G----TC---------A--T---C--A----------T-------A-A----G----T-C-TT------TT-G---G---------A--T--A-A-ATA-T---T----G-C-GGT--A----A-G-T----G--G----A--------C-C-A-G--A-A-C-T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--A--T-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-------T-T---G-T--------T---A---T---T---T---------C-----------A-C-C----GCT--G-AA-A----AT---------G--T----A-------A---T-A--------A--A-T-----------------------------------G------------------------A--T--ACA-T---T-T---C--T-A--C-AT-T----------Tatggtaataaa
gi|26 : cACA-T-T---TAAT---T--AAA-T-A---TA-A--C-G--T-A--AA-A--T---T----A-A---G-G----TT---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-A-TT------GC-G---G---------A--T--A-G-ATA-T---T----G-C-GGC--A----A-G-T----A--G----A--------C-CGG-G--A-A-A-T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--T---T---A--C--T--G--T----------A---A----A--T--A-A-C-----A-----CTT--T--T-T---G-T--------T---A---T---T---TT-T-C---AC-----------A-C-T----G-T--GAAA-A----A----------A--T----A-------A---C-A--------A--A-T---T--C-T--A---T-------T-C-AA--AG--G------------------------A--T---AA-T-----------------T-AT-T----------TC--ACTG-CT--G--A--A-AATG-TAAttaattaatagtatgcacattataaatgta
gi|27 : -T-A---TACA--T-G--T-A--AA-AGAT---G----A-A---T-T----TG---------A--T---C--A----------T-------G-T----G----T-A-TC------AC-T---G---------A--T--G-A-ATA-T---T----C-A-GGC--A----A-T-TCATTA--G----A--------T-C-T-A--T-A-G-T-TG-----T--T---A---A-----T-TA------C-----C--TACAC---A--C--T--G--C-G-------AA---A----A--T--A-T-C-----A-----G-T--T--T-T---G-T--------T------------------T-C---AC-----------A-G-T----G-T--G-AA-A----A-------------T----G-----------T-A--------A--A-T---T--TAT--A---T-------T-C-AA--TG--G------------------------A--T--AAA-T---T-A---C--T-G--T-AT-T----------TC--ACTG-TT--T--A--A-AACG-ca
gi|28 : gA-T-A---TA-T--C-G--T-A--AA----T---T----ATA----------TT---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-A-TT------GC-G---G---------AC-T--A-G-ATA-T---T----G-C---------------------------------------C-G-G--A-A-G-T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----T--T---C---AAAC--T--G--T-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----AACT--T-T--T--T-T---G-T--------T---A---T---T---TT-TTC---AC-----------A-C-T----G-T--T-AA-A----A----------T--T----A-------A---C-A--------AT-A-T---T--T-T--A---C-------T-C-AA--CG--G------------------------AA-T--AAA-T---T-T---T--C-A--T-AT-T----------TC--ACTG-CTAAA--A--A-AATG-TAAcg
gi|29 : gA-A--C-G--T-A--GA----T---T----A-A---G-G----TT---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-A-CT------GC-G---G---------A--TT-A-T-ATA-T---T----G-C-GGC--A----A-G-T----A--A----A--------C-C-G-G--A-A---T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----CCCT---C---A--C--T--G--T-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-T--T--T-----G-T--------T---A---T---T---TT-T-CC--AC-----------C-C-T----G-T--G-AA-A----A----------A--T----A-------AA--C-A--------A--A-T---T--C-T--A---T-------T-C-AA--CG--G------------------------A--T--AAA-T---T-T---C--A-A--T-AT-T----------TC--ACTG-CT--G--A--A-AATG-TAAta
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gi|30 : aaaatgtattagatacgtatgcA-T-A---TA-A--C-G--T-A--AA-A--C---C----A-A---C-G----GT---------A--T---C--A----------TG------T-A----G----T-A-TT------GC-G---G---------A--T--A-G--TA-T---T----G-C-GGC--A------G-T----A--G----A--------C-C-G-AC-A-A-ACT-TG-----T--T---A---T-----T-G-------------C--T---C---A--C--T--G--TTG-------AA---A----A--T--A-A-C-----A----------T--T-T---G-G--------T---G---T---T---TT-T-C---AC-----------AAC-T----G------AA-A----A----------A--T----A-------A---C-A--------A--A-T---T--G-T--A---C-------T-C--A--CG--G------------------------A--T--AA------T-T---CATA-A--T-AT-C---------------CTG-CT--A--A--A-Aca
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gi|33 : A-T-T---TA-T---T--ATA-T-A---TA-T--C-G--T-A--AA-A--T---G----A-A---G-G----TG---------A--T---C-------------T-------T-AT---G----T-A-TT------GC-G---G---------A--T--G-A-ATA-T---C----G-C-GGC--A----A-G-T----A--GT---T--------T-C-G-G--------T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T--------T---C---A--CAAT--A--T-G-------AA---A----A--T--A----------------------------------------T---A---T-------------------------------C-T----A-T--G--A-A----A----------A--T------------A---T-G--------A--A-T---T--T-G--A---T----------------G--G------------------------A--T--AAA-T---T-T---C--A-G--T-AT-T----------GG--AATG-TT--C--A--A-AATA-TAA
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gi|35 : gCA-T-T---TA-T---T--AAA-T-AA--TA------G--T-A--A-----T---T----A-A---G-G----TT---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-A-T-------GC-G---G---------C--T--A-G-ATA-T---T----G-C-GGC--A----A-G-T----A--G----A--------C---G-G--A-A-A-T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--G--T-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-T--T--T-T-----T--------T---A---T---T---TT-T-C---AC-----------G-T-T----G-T--T-GA-A----A----------A--T----A-------A---A-A--------A--A--------A-A--A---T-------T-C-AC--TG--A------------------------A--T--AAA-T---T-T---C--A--------------------------TG-CT--G--A--A-
gi|36 : AACA-T-T---TA-T---T--AAA-T-A---TA-A--C-G--T-A--AA-C--T---T----A-T---T-A----TC---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-T-TT------GT-G---G---------A--T--A-G-ATA-T---T----G-C-GAC--A----A-G-T----A--G----A--------C-C-G-G--A-A-A-T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--A---C---A--C--T--G--TGG-------AA---A----A--T--A-A-G-----A------------------------------------------------------------------------------------AA-A----A----------A--T----A-------------------------------------------T-------T-C-AA--CG--G------------------------A--T--AAA-T---T-T---T--A-A--T-AT-T----------TC--ACTG-TT--C--A--A-AATG-TAA
gi|37 : A-T-T---TA-T---T--AAA-TTA---TA-A--C-G--T-A--AA-A--T---T----A-A---G-G----TT---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-A-TC------GC-G---G---------A--T--T-G-ATA-T---T----G---GGC--A----A---T----A--G----A--------C-C-G-G----A-A-T-TG-----T--T---AT--T-----T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--G--T-G-------AA---ATTCTA--TTCA-A-CGGATAA-----A-T--T--T-C---A-A--------T---A---T---T---T---------C-----------A-C-T----GCT--G-GA-A----A----------A--T----taa
gi|38 : ga-G---G---------A--T--A-G-ATA-T---T----G-C-GGC--A----A-G-T----A--A----A--------CGC-G-G--A-A-A-T-TGG----T--T---A---T-----A-T-------T-----C--T---CG--A--C--T--G--T-G-------AAT--A----A--T--A-A-C-----A-----T-C--T--T-T---G-T--------C---A---T---T---TTTT-C---AC-----------A-C-T----G-T--G-AA-A----A----------A--T----A-------A---C-A--------A--A-T---T--C-T--A---T-------T-C-AA--CG--G------------------------A--T--AAA-C---T-T---C--A-A--T-AT-T----------TC--ACCG-CT--G--A--A-AATG-TAAgtaatt
gi|39 : -A---TA-A--C-G--T-A--AA-A--G---G----A-A---G-A----TG---------A--T---T-------------T-------T-AT---G----C-A-TT------GT-G---G---------AA-T--G-A-ATA-T---T----A-C-GAC--A----A-G------------------------------------G-T-TG-----T--T---A---TA----T-T-------T-----T--T-----------------------------------------------A-C-----G-----C-T--T--C-T---GGT--------T---A---C---A---CA-T-C---A------------A-C-G----G-T--G-AA-A----A----------A-------A-------A---T-A--------A--A-T---T--T----A---T-------T-C-AG--TT--G------------------------A--T--AGA-T---T-T---T--A-G--A-AT-T----------TC--ACTG-TT--G--A--A-AATG-ta
gi|4 : ---TA-T---T--AAAAT-AAATTA-A--C-G--T-A--AA-A--G---T----A-A---G-G----TGTGGAAGTCTA--T---T--A----------TAGGCTA-T-A----G----G-G-CT------G--G---C---------A--TT-A-G-ATA-TGTTT----GGC-GGT--A----A-T-T----A--A----A--------C-C-G----A-A-A-T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--T---TCG-A--A--T--G--T-G-------AA---G----AATT--ATA-C-----A-----C-T--T--TCT---G-TAGTGGCTAT---A---T---TAGGTT-C-A---AC-----------A-C-T----G-T--A-AA-A----ATAAGCAAATGA--T----A-------C---C-A--------A--A-T---T--A-C--A---TAAGTGGAT-C--A--CGTAG------------------------AG-T--AAA-TA--T-TTGCC--A-A--TAAT-T----------TC--CATG-CT--G--A--A-AATG-TAA
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gi|41 : g-A--------A--A-T---T--C-T--A---T-------T-C-AA--CG--G------------------------A--T--AAA-T---T-T---C--A-A--T-A--T----------TC--ACTG-CTG-G--A--A-AATG-TAAttctattcaacggataaatttcaatattcactgctggaaaatgtaata
gi|42 : gacatttattaatataacgtaaaattaaggttatcattagtatcgcggattgatattgcggcaatagacggaattgttatttttctcactgtg----TA---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-A-TC------GT-G---T---------A--T--A-A-ATA-T---T----T-C-GGC--A----A-T-T----A--G----T--------CAA-G-G--G-A-A-T-CG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--A---C---A--T--T--G--T-G-------AA---A----T--T--T-A-C-----A---------------------T--------C---A---A---T---T-------------------------T----G-T--G------------------------------------------------------------T--T-T--A----------------A--CG--G------------------------A--T--GAA-T---T-T---C--A-A--T-AT-T----------TC--AATG-CT--G--A--A-AATG-CAAta
gi|43 : C--A----A-G-T----A--GT---C--------C-C-G-G--------T-TA-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--A---T---A--C--T--G--T-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----A--------------------------------------------------------------------A-C-T----G-T--T-AA-A----A-------------T----A-------T---C-A--------ATAA-T---T--T-T--A---T-------T-C-AA--CG--G------------------------A--T--AA----------------------AT-T----------TC--GCT--CT--G--A--A-AATG-TAta
gi|44 : gcatggaattggataaAACAAT-T---TA-T---T--AAA-T-A---TA-A--C-G--T-A--AA-A--T---C----A-A---G-G----TA---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----TAA-TT------GC-G---G---------A--T--A-G-ATA-T---T----G-CGGGC--A----A-G-T----A--G----A--------C-C-G-GA-A-A-A-T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--G--T-GA------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-T--ttagat
gi|45 : CA-T-T---CA-T---T--AGA-T-A---TA-A--C-G--T-A--AA-A--T---T----A-A---G-G----TT---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-AATT------GC-G---G---------A--T--T-G-ATA-T---T----G-C-GGC--A----A-G-T----A--G----A--------C-C-G-G--A-A-A-T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--G--T-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-
gi|46 : tAA-T-A---TA-A--C-G--T-A--AA-A--T---T----A-A---G-G----TG---------A--T---C--A----------T-------T-T----G----T-A-TT------GC-G---G---------A--T--A-T-ATA-C---T----G-C-GGC--A----A-A-T----A--A----A--------C-C-G-G--A-A-A-T-TGTTTACT--T---A---T-----T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--G--T-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-T--T--
gi|47 : acgt--T--G--T-G-------AA---A-------T--A-A-C-----A-----C-C--A--C-T--------------T---A---T---T---TT-T-C---ACGTTAAC-----A-C-C----A-T--T-GA-A----T----------A--T----A-------A---T-A-------------T---C--T-T--ACG-T-------T-C-AA--CA--G------------------------A--T--ACC-T---T-G---C--A-A--C-AT-T----------TT--ACTG-CT--G--A--A-AGCG-TAA
gi|49 : CA-TAT---TA-T---T--AA--T-A---TA-A--C-G--T-A--AA-A--A---T----T-A---G-G----TT---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-A-TT------GC-G---G---------A--T----G-AAA-T---T----G-C-GGC--A----A-G-T----A--G----A--------C-C-G-G--A-A-G-T-TG-----T--T---A---------T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--G--T-G-------AA---taaacaa
gi|5 : AAAA-C-T---TA-TC--T--AAA-T-T---TA-AA-C-G--T-A--AA-AA-T---C----A-A---G-G----TA---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-A-TTG-----GC-G---G---------A--T--A-G-ATA-T---T----G---GGC--A----A-G-T----A--GA---A--------C-C-G-G--ACA-A-G-TGTGGA-T--T---AAGTC-----T-T-------T-----C--T---C---A--CGGTGAG--T-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-TTCT--T-T---A-TGAA-----T---A---T---T---TT-T-C---AC-----------GCC-T----G-T--G-AA-A----A----------A--T----T-------A---C-A--------A--AGC---T--T-T--A---C-------T-C-AATTCGA-G------------------------AG-T--AAT-T---TGT---C----A--T-ATGT----------TC--ACGG-CT--T--AATA-AGTG-TAA
gi|50 : tg---G-T--------C---A---T---G---TT-T-----AC-----------A-C-C----A-T--GTCA-A----A----------A--T----T-------A---T-A--------A--A-G---C--TGT--A---C-------T-C-AA--TG--T------------------------A--T--AAA-T---T-T---C--A-G--T-AT-T----------TC--ACTG-TT--T--A--C-AACG-taaa
gi|51 : AACA-C-T---TA-T---T--GAA-T-A---TA-A--C-T--T-A--AA-A--T---T----A-A---G-G----TT---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----C-A-AT------GC-G---G---------A--T--A-G-ATA-T---T----G-C-GGC--A----A-G-T----A--A----A--------C-T-G-cta
gi|52 : tag-T---T--AAA-T-A---CC-T--C-G--T-G--AA-C--T---G----A-A---G-T----TG---------A--T---C-------------T-------T-AT---G----T-A-TC------GC-G---GATTT-----A--T--G-A-ATA-T---T----G-C-GGC--A----A-G-T----A--
gi|53 : ACA-T-C---TA-T---C--AAA-T-A---TA-A--C-G--T-A--AC-A--T---T----A-A---G--------------------T---C--A----------T-------T-G----G----T-A-TT------GC-G---G---------A--TGAA-T-ATA-T---T----A-C-GGC--A----A-G-T----A--G----A--------C-C-G-G--A-attccggttgat
gi|54 : gg---A---T-----T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--G--T-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-T--T--T-T---T-T--------C---AGGTC---T---TT-T-C---AC-----------A-C-T----G-T--G-AA-A----A----------A--ta
gi|55 : -T---TG-T---T--GAA-T-A---TA-A--C-G--T-A--GA-A--T---T----A-A---G-G----TT---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-A-CT------GC-G---G---------A--T--A-T-ATA-T---T----G-C-GGC--A----A-G-T----A--G----A--------C-C-G-agggtatatacatgta
gi|56 : cA-T-G---TA-T---T--AGA-T-A---TA-T--C-G--T-A--AA-A--T---G----A-A---G-A----TATA-------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-A-AC------GC-G---G---------A--T--A-A-ACA-C---T----G-C-AGC--A----A-G-T----A--G----
gi|57 : A-A----A----------A--T----A-------A-------------------T---T--T-A--A---T-------T-C-A---TG--G------------------------A--T--GAG-T---T-T---C--A-G--T-AT-T----------TC--ACTG-AA--G--A--A-AATG-TAA
gi|58 : aactacagc-----------A-C-T----G-T--G-AA-A----A----------A--T----A-------A---C-A--------A--A-T---T--C-T--A---T-------T-C-AA--CG--G------------------------A--T--AAA-T---T-T---C--A-A--T-AT-T----------TC--ACTG-CT--G--A--A-AATG-TAAtaaat
gi|59 : ---TA-A--T-G--T-A--AA-A--T---G----A-C---A-G----TG---------ACTT---C--A----------T--------------G----T-A-TC------GC-G---A---------A--T--G-A-ATA-T---T----G-C-GA---G----A-G-T----A--G----ta
gi|6 : AGCA-G-T---TA-T---T--AAA-T-A---TA-AA-C-G--TGA--AA-A--T---C----A-GAG-G-G----TA---------A--TGCAT--A----------T-------T-A----GGGTAT-A-CT------GCTG---G---------ACGT--A-G-ATA-TG--T----G-C-GGC--A----A-G-TTA--G--G----A--------C-C-G-G--G-A-G-T-TG-----T--T---A---T-----T-G-------T-----C--T---TT--A--C--T--G--TCG-------GATACA----A--T--A-AAC-----A-----C-T--T--T-T-----TGAA-----T---A---T---T---TT-T-C---AC-----------A-C-T----G-G--A-AA-A----A----------G--T----A-------A---T-C--------A--A-T---TG-T-TACA---T-------C-T-AA--CG--G------------------------A--T--AAAGTTAAT-T---C--A-ATGT-AT-T----------GT--ACTG-CT--A--A--A-AATG-TAAtcacggttg
gi|60 : a-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----T--A---C---A--C--T--G--A-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-------C-T---G-T--------T---A---T---T---TT-C-C---G------------A-C------G-T--G--A-A----A----------A--T----G-------A---C-A--------A--G-T---A--T-T--t
gi|61 : -C-G-G--A-A-G-T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--G--T-G-------AA------------------C-----A-----C-T--T--T-T---G-T--------T---A---T---T---TT-T-C---AC-----------A-C-T----G-T--A-AT-A----A----------A--T----A-------A---
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3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|11 : AACA-T-T---TT-A---T--AAA-T-A---TA-A--G-A--G-A--AA-A--T---T----C-A---G-G----TT---------AG-T---C--A----------T-------T-A----GG---T-A-TT------GC-G---T---------A--G--A-G-ATA-T---T----G-C-GGCTAA----A-G-T----A--A----A--------C-C-G-G--AGA-A-T-AG-----T--T---A---T-----TGT-------T-----C--T---C---AT-C--T--G--T-A-------AG---A----A--T--AGA-C-----A-----C-T--T--T-T---G-T--------T---A---T---T---TT-T-C----C-------------C-T----G-T--G-AA-A----A----------AGTT----AATT----A---C-A--------A--AT-T---T--CT---AT--T-------T-C-AATTC-------------------------G--A--T--AAA-A---T-T--C--A-AT-T-A-T-T----------TC--ACTG-CT--G-----A-CATG-TAAta
gi|12 : g-T---T--AAA---A---TA-A--C-G--T-AG-AA-A--T---T----A-A---G------TT---------A--T---C--AATAATTAACTT-------T-A----G----T-A-TT------GC-G---G---------A--TT-A-G-ATA-T---T----G-C-GGC--A----A---T----A--G----A--------C-C-G-G--A-G---T-TG-----TG-T---A---T-----T-T-------T-----C--T---CCTCA--C--T--G--T-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-T--T--T-TTTTG-T--------T---A---T---T---TTCT-C---AC-----------A-C-T----G-T--G-AA-A----A----------AA-T----A-------T---C-A--------A--AA-T---T--CT---A---T-------T-C-AA--CG------------------------G--A--T--AAA-T---G-T--C--A-A--T-A-T-TAG--------TC--ACTG-CT--G--A--A-A--G-TAA
gi|13 : tACA-T-T---TA-T---A--AAA-T-A---AA-A--CTG--T-A--AA-A--T---T----A-A---G-GGG--TT---------A--T---CGCA----------T-------T-A----G----T-A-T-------GC-G---G---------A--T--GTG-ATA-T---G----G-C-GGC--AT---A-G-T----T--A----A--------C-C-G-G--A-A-A-T-TG-----T--TTG-A---T-----T-T-------T-----C--T-------A--C--T--G--T-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-T--G--T-T---GCT--------T---A---T---T---TT-T-CCA-ACG----------A-CTT----G-T--G-AAGA----A----------A--T----A-------A---C-A--------A--G--T---T--CT---A---T-------T-C-GA--AGTC----------------------G--A--T--A-------T-T--C--A-A--TCA-T-T----------TCAAACTG-CT--G--A--A-At
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gi|17 : gCA-T-T---TA-T------GAA-T-A---TA-A--C-G--T-A--AA-AA-T---T----A-AT--G-G----TC---------A--T---C--A----------T-------TTA----G----T-A-TT------GC-T---G---------A--T--A-ATATA-T---T----G-C-TGC--A------G-T----A--A----AA-------C-C-G-G--A-A-A-T-T------T--T---A---T-----T-T-------A-----C--T---CC--A--C--T--G--T-G-------GA---A----A--T--A-A-CC----A-----C-T--T--T-TT--G-T--------T---A---T---T---TT-TTC---AC-----------A-C-T----G-T--G-AA-A----A----------AA-T----A-------A---C-G--------G--ACTT---T--CT---A---T-------T-C-AA--GG------------------------G--A--T--ACT-T---G-T--C--A-A--T-A-T-T----------TC--TCTG-CT--G--A--A-AATG-taaa
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gi|20 : gAATA-T-T---TA-T---T--AAA-T-A---TA-A--C-G--T-A--AA-A--T---C----A-A---G-G----TA---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-A-TT------GC-G---G---------A--T--G-G-ATA-T---T----G-C-GGC--A----A-G-T----A--G----A--------C-C-G-G--A-A-A-T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--G--T-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-T--T--T-T---G-T--------T---A---T---T---TT-T-C---AC-----------A-C-T----G-T--G-AA-A----A----------A--T----A-------A---C-A--------A--A--T---T--TT---A---C-------T-C-AA--CG------------------------G--A--T--AAA-T---T-T--C--A-A--T-A-T-T----------TC--ACTG-CT--A--A--A-AATGCTAAta
gi|21 : AATA-T-T---TA-T---T--AAA-T-A---TA-A--C-G--T-A--AA-A--T---T----A-A---G-G----TA---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-A-TT------GC-G---G---------A--T--G-G-ATA-T---T----G-C-GGC--A----A-G-T----A--G----A--------C-C-G-G--A-A-A-T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--C---C---A--C--T--G--G-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-T--T--T-T---G-T--------T---A---T---T---AT-T-C---AC-----------A-C--------T--G-AC-A----A----------A--T----A-------A---C-A--------A--C--T---T--TT---A---C-------G-C-AA--CG------------------------G--A--T--AAA-T---T-T--C--A-A--T-A-T-T----------TC--ACTG-CT--A--A--A-AATG-TAA
gi|22 : A-T-T---TA-T---T--GAA-T-A---TA-A--C-G--T-A--AA-A--T---T----A-A---G-G----TC---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-A-TT------GC-T---G---------A--T--A-T-ATA-T---T----G-C-TGC--A----A-G-T----A--A----A--------C-C-G-G--A-A-A-T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------A-----C--T---C---A--C--T--G--T-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-T--T--T-T---G-T--------T---A---T---T---TT-T-C---AC-----------A-C-T----G-T--G-AA-A----A----------A--T----A-------A---C-G--------A--C--T---T--CT---A---T-------T-T-AA--GG------------------------G--A--T--ACT-T---G-T--C--A-A--T-A-T-T----------TC--TCTG-CT--G--A--A-AATG-TAAta
gi|23 : ACA-T-T---TA-T---T--AAA-T-A---TA-A--C----T-A--AA----T---T----A-A---G-G----TT---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-AATT------GC-G---G---------A--T--TTG-A-A-T---T----G-C-G-T--A----A-G-T----A--G----A--------C-C-G-G--A-A-A-T-TG-----T--TA--A---T-----T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--G--T-G-------AA---A----T--A--A-A-C-----A-----C----T--T-T---G-T--------T---A---T---T---TT-T-C---AC-----------A-C-T----G-T--G-AA-A----A----------A--T------------T---C-A--------A--A--T---T--CTA--A---T-------T-C-AA--CG------------------------G--A--T---AA-T---T-T--C--A-A--T-A-T-T----------TC--ACTG-CT--G--A--A-AATG-TAAtaa
gi|24 : AACT-T-T---TACT---T--TAA-T-A----A-A--C-G--A-A--AC-A--T---T----A-A---G-G----TT---------A------C--A----------T-------T-A----G----T-A-TC------G----------------A--T--A-T--TA-T---T----G-C-G-C--AC---A-T-T----C--A----A--------C-C-G----A-A-A-T-TG-----T--T---A---------T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--G--T-C-------AAG--A----A--T--A-A-C-----A-----C-T--T--T-T---G-T--------T---A---T---T---TT-C-C------------------C-T----T-T--C-AA-A----A----------A--T----A-------G---C-A--------AG-A--T---T--CT---A---T-------T-C-AAT-CG------------------------GTAA--A--AAA-T---C-T-------A--T-A-T-T----------TC--ACTT-CG--G--A--A-AAtaa
gi|25 : ACA-T-T---TA-T---T--GAA-T-A---TA-A--C-G--T-A--GA-A--T---T----A-A---G-G----TC---------A--T---C--A----------T-------A-A----G----T-C-TT------TT-G---G---------A--T--A-A-ATA-T---T----G-C-GGT--A----A-G-T----G--G----A--------C-C-A-G--A-A-C-T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--A--T-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-------T-T---G-T--------T---A---T---T---T---------C-----------A-C-C----GCT--G-AA-A----AT---------G--T----A-------A---T-A--------A--A--T---------------------------------------------------------G--A--T--ACA-T---T-T--C--T-A--C-A-T-T----------Tatggtaataaa
gi|26 : cACA-T-T---TAAT---T--AAA-T-A---TA-A--C-G--T-A--AA-A--T---T----A-A---G-G----TT---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-A-TT------GC-G---G---------A--T--A-G-ATA-T---T----G-C-GGC--A----A-G-T----A--G----A--------C-CGG-G--A-A-A-T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--T---T---A--C--T--G--T----------A---A----A--T--A-A-C-----A-----CTT--T--T-T---G-T--------T---A---T---T---TT-T-C---AC-----------A-C-T----G-T--GAAA-A----A----------A--T----A-------A---C-A--------A--A--T---T--CT---A---T-------T-C-AA--AG------------------------G--A--T---AA-T----------------T-A-T-T----------TC--ACTG-CT--G--A--A-AATG-TAAttaattaatagtatgcacattataaatgta
gi|27 : -T-A---TACA--T-G--T-A--AA-AGAT---G----A-A---T-T----TG---------A--T---C--A----------T-------G-T----G----T-A-TC------AC-T---G---------A--T--G-A-ATA-T---T----C-A-GGC--A----A-T-TCATTA--G----A--------T-C-T-A--T-A-G-T-TG-----T--T---A---A-----T-TA------C-----C--TACAC---A--C--T--G--C-G-------AA---A----A--T--A-T-C-----A-----G-T--T--T-T---G-T--------T------------------T-C---AC-----------A-G-T----G-T--G-AA-A----AT---------G--T----A-------A--------------A--T--T---T--AT---A---T-------T-C-AA--TG------------------------G--A--T--AAA-T---T-A--C--T-G--T-A-T-T----------TC--ACTG-TT--T--A--A-AACG-ca
gi|28 : gA-T-A---TA-T--C-G--T-A--AA----T---T----ATA----------TT---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-A-TT------GC-G---G---------AC-T--A-G-ATA-T---T----G-C---------------------------------------C-G-G--A-A-G-T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----T--T---C---AAAC--T--G--T-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----AACT--T-T--T--T-T---G-T--------T---A---T---T---TT-TTC---AC-----------A-C-T----G-T--T-AA-A----A----------T--T----A-------A---C-A--------AT-A--T---T--TT---A---C-------T-C-AA--CG------------------------G--AA-T--AAA-T---T-T--T--C-A--T-A-T-T----------TC--ACTG-CTAAA--A--A-AATG-TAAcg
gi|29 : gA-A--C-G--T-A--GA----T---T----A-A---G-G----TT---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-A-CT------GC-G---G---------A--TT-A-T-ATA-T---T----G-C-GGC--A----A-G-T----A--A----A--------C-C-G-G--A-A---T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----CCCT---C---A--C--T--G--T-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-T--T--T-----G-T--------T---A---T---T---TT-T-CC--AC-----------C-C-T----G-T--G-AA-A----A----------A--T----A-------AA--C-A--------A--A--T---T--CT---A---T-------T-C-AA--CG------------------------G--A--T--AAA-T---T-T--C--A-A--T-A-T-T----------TC--ACTG-CT--G--A--A-AATG-TAAta
gi|3 : AA-T-A---AA-A--C-G--T-AGAAA-A--T---T----A-GTCCG-GAATCTC---------A--TAA-C--A----------T-------T-A----G----T-AATTCAAAAAGC-G---GCCGAGA---A--T--A-G-ATA-T---T----GGT-GGC--A----A-GAT----AAGG----AAAGTCCATC-C-G-G--A-A-A-T-TA-----T--T-------------T-T-------T-----C--T---C---A--C--A--G--T-GG------AA---A----A--T--A-A-C-----AT----C-T--T--T-T---G-T--------T---A-------T---TT-T-C---ACAATGTATGTAAA-C-TAGA-G-T--G-AA-AAAATA----------A--T----A-------A---C-A--------AG-A--T---T--TA---A---T-------T-TAAA--CG------------------------A--A--TCAAAA-T---T-T--T--ACA--T-A-T-T----------TC--ACTG-CT--G--A--A-AATG-TA
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gi|31 : cattA-A--C-A--TGA--AA-A--T---T----A-A----------TT---------A--T-----------------T-------T-AAAATG----T-A-TT------TT-G------------------------TA-T---T----G-T-G-C--A----A-A-T----T--G----T--------C-C-C------A-G-T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--A---C---G--C--T--G--A-A-------AA---A----AA-T--A-A-------A-----C-T--T--G-----G-T--------T---A---C---T---T----C---AC-----------A-C-T----G-T--G-AA-G----G----------A--T----A-------C---C-A--------AT-T--T---T--TT---A---T-------TCC-AG--TG------------------------G--A--T--ACA-T---T-T--C--A-A--T-A-T-T----------TTAAACTG-TT--G--A--A-AATA-TGAtaat
gi|32 : ACA-T-T---TA-T------AAA-T-A---TA-A--C-G--T-A--AA----T---T----A-A---G-G----TT---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-A-T-------GC-G---G---------A--T--A-G-ATA-T---T----G-C-TGC--A----A-G------A--G----A--------C-C-G-G--A-A-G-T-TG-----T--T---A---A-----T-T-------T-----C----------A--C--T--G--T-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-T--T--T-T---G----------T---A---T---T---TT-T-C---AC-------------C-T----G-T--G-AA-A----A----------A--T----A-------A---C-A--------A--A------T--CT---A---T-------T-C-AA--AG------------------------G-----T--AAA-T---T-T--C--A-A--T-A---T----------TC--ACTG-CT--taaa
gi|33 : A-T-T---TA-T---T--ATA-T-A---TA-T--C-G--T-A--AA-A--T---G----A-A---G-G----TG---------A--T---C-------------T-------T-AT---G----T-A-TT------GC-G---G---------A--T--G-A-ATA-T---C----G-C-GGC--A----A-G-T----A--GT---T--------T-C-G-G--------T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T--------T---C---A--CAAT--A--T-G-------AA---A----A--T--A----------------------------------------T---A---T-------------------------------C-T----A-T--G-AA-A----AT---------A--T----G-------A--------------------------------A---T-------T-T-GA--TG------------------------G--A--T--AAA-T---T-T--C--A-G--T-A-T-T----------GG--AATG-TT--C--A--A-AATA-TAA
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gi|35 : gCA-T-T---TA-T---T--AAA-T-AA--TA------G--T-A--A-----T---T----A-A---G-G----TT---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-A-T-------GC-G---G---------C--T--A-G-ATA-T---T----G-C-GGC--A----A-G-T----A--G----A--------C---G-G--A-A-A-T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--G--T-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-T--T--T-T-----T--------T---A---T---T---TT-T-C---AC-----------G-T-T----G-T--T-GA-A----A----------A--T----A-------A---A-A--------A--A---------AA---A---T-------T-C-AC--TG------------------------A--A--T--AAA-T---T-T--C--A---------------------------TG-CT--G--A--A-
gi|36 : AACA-T-T---TA-T---T--AAA-T-A---TA-A--C-G--T-A--AA-C--T---T----A-T---T-A----TC---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-T-TT------GT-G---G---------A--T--A-G-ATA-T---T----G-C-GAC--A----A-G-T----A--G----A--------C-C-G-G--A-A-A-T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--A---C---A--C--T--G--TGG-------AA---A----A--T--A-A-G-----A------------------------------------------------------------------------------------AA-A----A----------A--T----A--------------------------------------------T-------T-C-AA--CG------------------------G--A--T--AAA-T---T-T--T--A-A--T-A-T-T----------TC--ACTG-TT--C--A--A-AATG-TAA
gi|37 : A-T-T---TA-T---T--AAA-TTA---TA-A--C-G--T-A--AA-A--T---T----A-A---G-G----TT---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-A-TC------GC-G---G---------A--T--T-G-ATA-T---T----G---GGC--A----A---T----A--G----A--------C-C-G-G----A-A-T-TG-----T--T---AT--T-----T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--G--T-G-------AA---ATTCTA--TTCA-A-CGGATAA-----A-T--T--T-C---A-A--------T---A---T---T---T---------C-----------A-C-T----GCT--G-GA-A----A----------A--T----taa
gi|38 : ga-G---G---------A--T--A-G-ATA-T---T----G-C-GGC--A----A-G-T----A--A----A--------CGC-G-G--A-A-A-T-TGG----T--T---A---T-----A-T-------T-----C--T---CG--A--C--T--G--T-G-------AAT--A----A--T--A-A-C-----A-----T-C--T--T-T---G-T--------C---A---T---T---TTTT-C---AC-----------A-C-T----G-T--G-AA-A----A----------A--T----A-------A---C-A--------A--A--T---T--CT---A---T-------T-C-AA--CG------------------------G--A--T--AAA-C---T-T--C--A-A--T-A-T-T----------TC--ACCG-CT--G--A--A-AATG-TAAgtaatt
gi|39 : -A---TA-A--C-G--T-A--AA-A--G---G----A-A---G-A----TG---------A--T---T-------------T-------T-AT---G----C-A-TT------GT-G---G---------AA-T--G-A-ATA-T---T----A-C-GAC--A----A-G------------------------------------G-T-TG-----T--T---A---TA----T-T-------T-----T--T-----------------------------------------------A-C-----G-----C-T--T--C-T---GGT--------T---A---C---A---CA-T-C---A------------A-C-G----G-T--G-AA-A----A----------A-------A-------A---T-A--------A--A--T---T---T---A---T-------T-C-AG--TT------------------------G--A--T--AGA-T---T-T--T--A-G--A-A-T-T----------TC--ACTG-TT--G--A--A-AATG-ta
gi|4 : ---TA-T---T--AAAAT-AAATTA-A--C-G--T-A--AA-A--G---T----A-A---G-G----TGTGGAAGTCTA--T---T--A----------TAGGCTA-T-A----G----G-G-CT------G--G---C---------A--TT-A-G-ATA-TGTTT----GGC-GGT--A----A-T-T----A--A----A--------C-C-G----A-A-A-T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--T---TCG-A--A--T--G--T-G-------AA---G----AATT--ATA-C-----A-----C-T--T--TCT---G-TAGTGGCTAT---A---T---TAGGTT-C-A---AC-----------A-C-T----G-T--A-AA-A----ATAAGCAAATGA--T----A-------C---C-A--------A--A--T---T--AC---A---TAAGTGGAT-C-A---CGTA----------------------G--AG-T--AAA-TAT-T-TGCC--A-A--T-AAT-T----------TC--CATG-CT--G--A--A-AATG-TAA
gi|40 : taAACA-T-T---AG-T---T--AAA-T-A----A-A--C-G--T-A--AA-A--T---C----A-A---A-G----GT---------A--T---C--A----------T--------------G----T-A---------GG-G---G---------A--T--A-T-ATA-T---T----G-C-GGC--A------G-T----T--G----A--------C---G-G--A-A-A-T-TG-----T--T---A---A-----T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--G--T-G-------AA---A----AG-T--A-A-C-----A-----C-T--T--T-T---G-A--------T---AT--T---T---TT-T-C---AC-----------A-C-T----GCT--G-AA-A----A----------A--T----A-------A---C-A--------A--A--T---T--at
gi|41 : gACA-T-T---TA-T---T--AA--T-A---TA-A--C-G--T-A--AA-A--T---T----A-A---G-G----TT---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-A-TC------GC-G---G---------A--T--T-G-ATA-T---T----G-C-GGC--A----A---T----A--G----A--------C-----G--G-A-A-T-TG-----T--T---AT--T-----T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--G--T-G-------AA---A----taccaa
gi|41 : g-A--------A--A--T---T--CT---A---T-------T-C-AA--CG------------------------G--A--T--AAA-T---T-T--C--A-A--T-A---T----------TC--ACTG-CTG-G--A--A-AATG-TAAttctattcaacggataaatttcaatattcactgctggaaaatgtaata
gi|42 : gacatttattaatataacgtaaaattaaggttatcattagtatcgcggattgatattgcggcaatagacggaattgttatttttctcactgtg----TA---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-A-TC------GT-G---T---------A--T--A-A-ATA-T---T----T-C-GGC--A----A-T-T----A--G----T--------CAA-G-G--G-A-A-T-CG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--A---C---A--T--T--G--T-G-------AA---A----T--T--T-A-C-----A-----T-CAAT--T-T---G-T--------ta
gi|42 : --T-C---G-T--------T---A---T---T---TT---C---AC-----------A-T-T----G-T--G-AA-A----TTT--------A--C----A-------T---C-A--------A--T--T---T--GT---G---T-------T-T-AA--CG------------------------G--A--T--GAA-T---T-T--C--A-A--T-A-T-T----------TC--AATG-CT--G--A--A-AATG-CAAgtttaacggatgaatttcaatatttcaatgctgaaaatgcaata
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gi|44 : gcatggaattggataaAACAAT-T---TA-T---T--AAA-T-A---TA-A--C-G--T-A--AA-A--T---C----A-A---G-G----TA---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----TAA-TT------GC-G---G---------A--T--A-G-ATA-T---T----G-CGGGC--A----A-G-T----A--G----A--------C-C-G-GA-A-A-A-T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--G--T-GA------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-T--ttagat
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gi|46 : tAA-T-A---TA-A--C-G--T-A--AA-A--T---T----A-A---G-G----TG---------A--T---C--A----------T-------T-T----G----T-A-TT------GC-G---G---------A--T--A-T-ATA-C---T----G-C-GGC--A----A-A-T----A--A----A--------C-C-G-G--A-A-A-T-TGTTTACT--T---A---T-----T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--G--T-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-T--T--
gi|47 : acgt--T--G--T-G-------AA---A-------T--A-A-C-----A-----C-C--A--C-T--------------T---A---T---T---TT-T-C---ACGTTAAC-----A-C-C----A-T--T-GA-A----T----------A--T----A-------A---T-A--------T--C--T---T--AC---G---T-------T-C-AA--CA------------------------G--A--T--ACC-T---T-G--C--A-A--C-A-T-T----------TT--ACTG-CT--G--A--A-AGCG-TAA
gi|49 : CA-TAT---TA-T---T--AA--T-A---TA-A--C-G--T-A--AA-A--A---T----T-A---G-G----TT---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-A-TT------GC-G---G---------A--T----G-AAA-T---T----G-C-GGC--A----A-G-T----A--G----A--------C-C-G-G--A-A-G-T-TG-----T--T---A---------T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--G--T-G-------AA---taaacaa
gi|5 : AAAA-C-T---TA-TC--T--AAA-T-T---TA-AA-C-G--T-A--AA-AA-T---C----A-A---G-G----TA---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-A-TTG-----GC-G---G---------A--T--A-G-ATA-T---T----G---GGC--A----A-G-T----A--GA---A--------C-C-G-G--ACA-A-G-TGTGGA-T--T---AAGTC-----T-T-------T-----C--T---C---A--CGGTGAG--T-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-TTCT--T-T---A-TGAA-----T---A---T---T---TT-T-C---AC-----------GCC-T----G-T--G-AA-A----A----------A--T----T-------A---C-A--------A--AG-C---T--TT---A---C-------T-C-AATTCGA-----------------------G--AG-T--AAT-T---TGT--C----A--T-A-TGT----------TC--ACGG-CT--T--AATA-AGTG-TAA
gi|50 : tg---G-T--------C---A---T---G---TT-T-----AC-----------A-C-C----A-T--GTCA-A----A----------A--T----T-------A---T-A--------A--AG-C---T--GT---A---C-------T-C-AA--TG------------------------T--A--T--AAA-T---T-T--C--A-G--T-A-T-T----------TC--ACTG-TT--T--A--C-AACG-taaa
gi|51 : AACA-C-T---TA-T---T--GAA-T-A---TA-A--C-T--T-A--AA-A--T---T----A-A---G-G----TT---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----C-A-AT------GC-G---G---------A--T--A-G-ATA-T---T----G-C-GGC--A----A-G-T----A--A----A--------C-T-G-cta
gi|52 : tag-T---T--AAA-T-A---CC-T--C-G--T-G--AA-C--T---G----A-A---G-T----TG---------A--T---C-------------T-------T-AT---G----T-A-TC------GC-G---GATTT-----A--T--G-A-ATA-T---T----G-C-GGC--A----A-G-T----A--
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gi|54 : gg---A---T-----T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--G--T-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-T--T--T-T---T-T--------C---AGGTC---T---TT-T-C---AC-----------A-C-T----G-T--G-AA-A----A----------A--ta
gi|55 : -T---TG-T---T--GAA-T-A---TA-A--C-G--T-A--GA-A--T---T----A-A---G-G----TT---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-A-CT------GC-G---G---------A--T--A-T-ATA-T---T----G-C-GGC--A----A-G-T----A--G----A--------C-C-G-agggtatatacatgta
gi|56 : cA-T-G---TA-T---T--AGA-T-A---TA-T--C-G--T-A--AA-A--T---G----A-A---G-A----TATA-------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-A-AC------GC-G---G---------A--T--A-A-ACA-C---T----G-C-AGC--A----A-G-T----A--G----
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gi|58 : aactacagc-----------A-C-T----G-T--G-AA-A----A----------A--T----A-------A---C-A--------A--A--T---T--CT---A---T-------T-C-AA--CG------------------------G--A--T--AAA-T---T-T--C--A-A--T-A-T-T----------TC--ACTG-CT--G--A--A-AATG-TAAtaaat
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gi|8 : -T---CA-T---T--AAT-T-A---TA-A--C-G--T-A--AATA--T---C----A-A---G-G----TA---------A--T---C--AAT--------TA------T-A----G----T-A-TT------GC-G---G---------A--T--A-G-ATA-T---T----G-C-GGCAAA----A-G-T----G--A----T--------C-C-G-GT-ATA-G-T-TG-----T--TTTAA---T-----C-T-------T-----C--T---C---A--CG-T--G--T-G--------A---A----A--T--A-A-C-----A-----C-T--T--TGT---G-A--------T---A---T---T---TT-C-T---AC-----------A-C-T----G-T--G-AA-A----ATAC-------A--T----A-------A---CGA--------A--A--T---T--TT---A---C-------T-C-AA--C-------------------------G--A--T--AGA-T---T-T--C--A-A--T-A-T-TTTCAACTGCCTC--ACTG-CT--A--A--A-AATG-TAAttaa
gi|9 : AA-T-T---TA-A--C-G--T-A--AA-A--T---T----A-A---G-G----TG---------A--T---C-------------T-------T------G----T-A-TT------GG-C---G---------A--T--A-TTATA-C---T----G-C-GGC--A----A-A-T----A--A----A--------C-C-G-G--A-A---T-TG-----T--TT--A---C-----T-TATT----T-----C--T---C---A--C--T--G--TTG-------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-T--T--T-T---A-T--------T---A---T---T---TT-T-C---AC-----------A-C-T----G-T--G-AA-A----A----------AT-T----A-------A---C----------A--C--T---T--TT---A---T-------T-taa
gi|9 : -T-TA-----T--T---A---T-----T-T-------TT----C--A---C---A--C--T--G--T-G-------AA---A----AATT--A-A-C-----A-----C-T--T--T-T---A-T--------T---A---T---T---TT-T-C---AC-----------A-C--------T--G-GA-A----A----------A--T----A-------A---C-A--------A--A--T---T--CT---A---T-------T-C-AA--CG------------------------G--A--A--AAA-T---T-T--C--A-A--T-A-T-T----------TC---CTG-CT-----A--A-AATG-TAatttttcacactggaaaataacaaattctattcaacggaaaaatttcaatatttcctgctaaaatgtata
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-2116 ) : AACA-T-T---TA-T---T--AAA-T-A---TA-A--C-G--T-A--AA-A--T---T----A-A---G-G----TN---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-A-TT------GC-G---G---------A--T--A-G-ATA-T---T----G-C-GGC--A----A-G-T----A--G----A--------C-C-G-G--A-A-A-T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--G--T-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-T--T--T-T---G-T--------T---A---T---T---TT-T-C---AC-----------A-C-T----G-T--G-AA-A----A----------A--T----A-------A---C-A--------A--A--T---T--CT---A---T-------T-C-AA--CG------------------------G--A--T--AAA-T---T-T--C--A-A--T-A-T-T----------TC--ACTG-CT--G--A--A-AATG-TAA
gi|1 : CA-T-T---TA-T---G--AGA-TTA---TA-A--T-G--T-A--AA-A--T---C----A-A---G-G----TA---------A--T---TCGA----------TGAAGTGCT-A----T----T-A-TT------GC-G---GCGCTGCTACA--T--A-G-GCA-T---TATGGG-C-GGC--ATATGA-G-T----A--C-------------C-C-G-GTTA-G-G-T-TG-----TGTT---A---T-----T-T-------TGTCCTC--T---T---A--T--T--T--T-GGTTGAATAA---A----G--T--A-A-C-----ATATCTC-T--TCTT-T---G-T--------TCTAG---T---T---TT-T-C---TCG----------A-C-TCGACA-T--G-GA-A----AGAAA------A--T----A-------AACAC-ATGTTGCCTA--G--T---T--CT---C---T-------A-C-AA--CG------------------------G--AA-T--AAA-T---T-T--C--A-A--T-A-T-T----------TC--ACTG-C---G--A--A-AATG-
gi|10 : atgaatACA-T-T---TA-T---TT-AAA-T-A---TA-A--CCG--A-A--GA-A--T---T----A-A---ATG----TT---------A--T---C--A----------TG------T-A----G----T-A-TT------GC-G---G---------A--T--AAG-ATA-T---TTTT-G-C-GGC--A----A-G-T----A--A----A--------C-CCG-G--A-A-A-T-TG-----TA-T---A---T-----T-T-------C-----CG-T---C---A--C--T--G--T-G-------AA---A----A--T--A---C-----AG----C-T--T--T-T---G-T--------T---A---T---T---TT-TTC---AC-----------A-G-T----G-T--G-AA-A----A----------A--T----A-------A---C-A--------A--A--T---T--CT---A---T-------TGC-AA--CG------------------------GA-A--TA-AAA-A---T-A--C--A-A--T-A-T-T----------TCA-ACTG-CT--G--A--A-AATG-TAAaat
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gi|12 : g-T---T--AAA---A---TA-A--C-G--T-AG-AA-A--T---T----A-A---G------TT---------A--T---C--AATAATTAACTT-------T-A----G----T-A-TT------GC-G---G---------A--TT-A-G-ATA-T---T----G-C-GGC--A----A---T----A--G----A--------C-C-G-G--A-G---T-TG-----TG-T---A---T-----T-T-------T-----C--T---CCTCA--C--T--G--T-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-T--T--T-TTTTG-T--------T---A---T---T---TTCT-C---AC-----------A-C-T----G-T--G-AA-A----A----------AA-T----A-------T---C-A--------A--AA-T---T--CT---A---T-------T-C-AA--CG------------------------G--A--T--AAA-T---G-T--C--A-A--T-A-T-TAG--------TC--ACTG-CT--G--A--A-A--G-TAA
gi|13 : tACA-T-T---TA-T---A--AAA-T-A---AA-A--CTG--T-A--AA-A--T---T----A-A---G-GGG--TT---------A--T---CGCA----------T-------T-A----G----T-A-T-------GC-G---G---------A--T--GTG-ATA-T---G----G-C-GGC--AT---A-G-T----T--A----A--------C-C-G-G--A-A-A-T-TG-----T--TTG-A---T-----T-T-------T-----C--T-------A--C--T--G--T-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-T--G--T-T---GCT--------T---A---T---T---TT-T-CCA-ACG----------A-CTT----G-T--G-AAGA----A----------A--T----A-------A---C-A--------A--G--T---T--CT---A---T-------T-C-GA--AGTC----------------------G--A--T--A-------T-T--C--A-A--TCA-T-T----------TCAAACTG-CT--G--A--A-At
gi|14 : -T-T---TA-TCTAT--AAA-T-----CA-A----G--T-A--AA-AA-T---T----A-A---A-GAG--TT---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----C-A-TT------GC-G---G---------A--T--A-G-ATA-T--------G-C-GGC--A----G-GCT----A--A----A--------CGC-G-G--A-ACA-T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--G--T-G-------AA---AC---A--T--A-A-C-----A-------T--T--T-T---G-T--------T-------TCCGT---TT-T-C---AC-----------A-C-T----G-TTTG-AA-A----A----------A--T----A-------A---C-A--------A--A--T---T--CT---A---T-------T-C-AA--AG------------------------G--A--T--AAC-T---T-T--C--A-G--T-A-T-T----------TC--ACTG-CT--A--A--A-ACTG-tata
gi|15 : A-T---T--AAA-TTA---TA-A--C-G--T-A--AA-G--T--------A-A---G-G----TT---------A--T---C--AC---------T-------T-A----G----TCA-TT------GC-G---G---------T--T--A-G-CTAAT---T----G-C-TGT--A----A-G-T----C--A----A--------A-C-GTG--A-A-A-T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------TATT--C--T---C---A--C--T--G--T-T-------GA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-C--T--C-----G-T--------T---A---T---T---TT-G-C---AC-----------A-T-C----G-T--GTGA-A----A----------A--T----A-------G---C-CC-------A--A--T---T--CT---A---T-------G-C-AA--TG------------------------G--A--T--AAA-T---T-T--CCAA-A--T-A-T-T----------TC--ACTG-CT--T--A--A-GAtataaa
gi|16 : taaAACA-T-T---TA-T---T--AAA-T-A---TA-A--CTG--T-A--AA--------T----A-A---G-G----TT---------A--T---C--A----------TG------T-A----G----T-A-T----------G---G---------A--T--A---ATA-T---T------C-GGC--A----AAG-T----A--A----A--------C-C-C-G--A-A-A-T-T-------------A---T-----T-T-------T-----C--T---C---C--C--T--G--TTG-------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-T--T--T-T---G-T------------A---T---T---TT-T-C---ACC----------A-C-T------T--C-AA-A----A----------A--TTACTA-------A---C-AT-------A--A--T---T--TT---A---T-------T-C-AA--CG------------------------G--A--T---AA-T---T-TCAC--A-A--T-A---T----------TC--ACTG-CT--G--A--ACAATG-TAAattactaa
gi|17 : gCA-T-T---TA-T------GAA-T-A---TA-A--C-G--T-A--AA-AA-T---T----A-AT--G-G----TC---------A--T---C--A----------T-------TTA----G----T-A-TT------GC-T---G---------A--T--A-ATATA-T---T----G-C-TGC--A------G-T----A--A----AA-------C-C-G-G--A-A-A-T-T------T--T---A---T-----T-T-------A-----C--T---CC--A--C--T--G--T-G-------GA---A----A--T--A-A-CC----A-----C-T--T--T-TT--G-T--------T---A---T---T---TT-TTC---AC-----------A-C-T----G-T--G-AA-A----A----------AA-T----A-------A---C-G--------G--ACTT---T--CT---A---T-------T-C-AA--GG------------------------G--A--T--ACT-T---G-T--C--A-A--T-A-T-T----------TC--TCTG-CT--G--A--A-AATG-taaa
gi|18 : AACA-T-T---TA-G---T--TAA-G-A---TA-A--C-G--T-A--AA-G--T---TTTCAG-A---G-G----TA---------A--T---CG-A----------T-------T-A----G----T-A-T-------GC-G-------------A--T--A-G-ATA-A---G----G-C-GGC--A----A-G-TT---A--G----A--------C---G-G--A-A-G-T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--G--T-G-------GA---A----A--A--G-A-C-----A-----C-T--T--T-T---A----------T---A---T---T---TT-T-C---AC-----------A-C-T----G-T--GAAA-A----A----------A--T----A-------A---C-A--------A--AT-T---T--TT---A---C-------C-T-AA--CG------------------------G--A--T---AA-T---T-T--C--A-AG-T-A-T-T----------TC--ACTG-CT--T--A--A-AATG-TA
gi|19 : A-T-T---TA-T---T--AAA-T-A---TA-A--C-G--T-A--AA-A--T---C----A-A---G-G----TA---------A--T---C--A----------T-------T-G----G----T-A-TT------GC-G---G---------A--T--T-G-ATT-T---A----G-C-GGC--A----A-G-T----A--G----A--------C-C-G-G--A-A-A-T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--G--T-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-------T-T---G-T--------T---A---T---T---TT-T-C---AC-----------A-C-A----C-T--G-AA-A----A----------A--T----A-------A---C-A--------A--A--T---TAATTTG-A---C-------T-C-AA--CG------------------------G--A--T--AAA-T---T-T--C--A-A--T-A-T-T----------TC--ACTG-CT--A--A--A-AATG-TAA
gi|2 : AACA-T-T---TA-T---T--AAA-C-T---TA-AGAC-GACT-AGTAA-A--CCTAT----A-A---G-G----TT---------A--T---C--A----------T-------TCA----GA---T-A-TTCA----GC-G---G---------A--T--A-T-ATT-T---A----G-C-AGC--A----A-G-T----A--ATAACA--------C-C-G-G--ACA-A-CATG-----G--T---G---T-----T-TGTATGGGT-----C--T---T---A--C--T--AGCT-G-------AG---ATA--A--TG-A-A-C-----A-----C-T--T--T-T---G-T--------T-------T---T---TT-T-C---AC-----------A-C-T----G-T--A-GA-A----A----------A--T----ATAAAGGCA---C-A--------A--A--TCCAT--CT---AATCC-------T-C-AA--TGGGGATATACAAATTCTATTCAACGG--A--T--ACA-T---T-T--C--A-A--T-A-A-T----------TC--ACTG-CT--G--A--A-AATA-TAAtaa
gi|20 : gAATA-T-T---TA-T---T--AAA-T-A---TA-A--C-G--T-A--AA-A--T---C----A-A---G-G----TA---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-A-TT------GC-G---G---------A--T--G-G-ATA-T---T----G-C-GGC--A----A-G-T----A--G----A--------C-C-G-G--A-A-A-T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--G--T-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-T--T--T-T---G-T--------T---A---T---T---TT-T-C---AC-----------A-C-T----G-T--G-AA-A----A----------A--T----A-------A---C-A--------A--A--T---T--TT---A---C-------T-C-AA--CG------------------------G--A--T--AAA-T---T-T--C--A-A--T-A-T-T----------TC--ACTG-CT--A--A--A-AATGCTAAta
gi|21 : AATA-T-T---TA-T---T--AAA-T-A---TA-A--C-G--T-A--AA-A--T---T----A-A---G-G----TA---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-A-TT------GC-G---G---------A--T--G-G-ATA-T---T----G-C-GGC--A----A-G-T----A--G----A--------C-C-G-G--A-A-A-T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--C---C---A--C--T--G--G-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-T--T--T-T---G-T--------T---A---T---T---AT-T-C---AC-----------A-C--------T--G-AC-A----A----------A--T----A-------A---C-A--------A--C--T---T--TT---A---C-------G-C-AA--CG------------------------G--A--T--AAA-T---T-T--C--A-A--T-A-T-T----------TC--ACTG-CT--A--A--A-AATG-TAA
gi|22 : A-T-T---TA-T---T--GAA-T-A---TA-A--C-G--T-A--AA-A--T---T----A-A---G-G----TC---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-A-TT------GC-T---G---------A--T--A-T-ATA-T---T----G-C-TGC--A----A-G-T----A--A----A--------C-C-G-G--A-A-A-T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------A-----C--T---C---A--C--T--G--T-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-T--T--T-T---G-T--------T---A---T---T---TT-T-C---AC-----------A-C-T----G-T--G-AA-A----A----------A--T----A-------A---C-G--------A--C--T---T--CT---A---T-------T-T-AA--GG------------------------G--A--T--ACT-T---G-T--C--A-A--T-A-T-T----------TC--TCTG-CT--G--A--A-AATG-TAAta
gi|23 : ACA-T-T---TA-T---T--AAA-T-A---TA-A--C----T-A--AA----T---T----A-A---G-G----TT---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-AATT------GC-G---G---------A--T--TTG-A-A-T---T----G-C-G-T--A----A-G-T----A--G----A--------C-C-G-G--A-A-A-T-TG-----T--TA--A---T-----T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--G--T-G-------AA---A----T--A--A-A-C-----A-----C----T--T-T---G-T--------T---A---T---T---TT-T-C---AC-----------A-C-T----G-T--G-AA-A----A----------A--T------------T---C-A--------A--A--T---T--CTA--A---T-------T-C-AA--CG------------------------G--A--T---AA-T---T-T--C--A-A--T-A-T-T----------TC--ACTG-CT--G--A--A-AATG-TAAtaa
gi|24 : AACT-T-T---TACT---T--TAA-T-A----A-A--C-G--A-A--AC-A--T---T----A-A---G-G----TT---------A------C--A----------T-------T-A----G----T-A-TC------G----------------A--T--A-T--TA-T---T----G-C-G-C--AC---A-T-T----C--A----A--------C-C-G----A-A-A-T-TG-----T--T---A---------T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--G--T-C-------AAG--A----A--T--A-A-C-----A-----C-T--T--T-T---G-T--------T---A---T---T---TT-C-C------------------C-T----T-T--C-AA-A----A----------A--T----A-------G---C-A--------AG-A--T---T--CT---A---T-------T-C-AAT-CG------------------------GTAA--A--AAA-T---C-T-------A--T-A-T-T----------TC--ACTT-CG--G--A--A-AAtaa
gi|25 : ACA-T-T---TA-T---T--GAA-T-A---TA-A--C-G--T-A--GA-A--T---T----A-A---G-G----TC---------A--T---C--A----------T-------A-A----G----T-C-TT------TT-G---G---------A--T--A-A-ATA-T---T----G-C-GGT--A----A-G-T----G--G----A--------C-C-A-G--A-A-C-T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--A--T-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-------T-T---G-T--------T---A---T---T---T---------C-----------A-C-C----GCT--G-AA-A----AT---------G--T----A-------A---T-A--------A--A--T---------------------------------------------------------G--A--T--ACA-T---T-T--C--T-A--C-A-T-T----------Tatggtaataaa
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gi|27 : -T-A---TACA--T-G--T-A--AA-AGAT---G----A-A---T-T----TG---------A--T---C--A----------T-------G-T----G----T-A-TC------AC-T---G---------A--T--G-A-ATA-T---T----C-A-GGC--A----A-T-TCATTA--G----A--------T-C-T-A--T-A-G-T-TG-----T--T---A---A-----T-TA------C-----C--TACAC---A--C--T--G--C-G-------AA---A----A--T--A-T-C-----A-----G-T--T--T-T---G-T--------T------------------T-C---AC-----------A-G-T----G-T--G-AA-A----AT---------G--T----A-------A--------------A--T--T---T--AT---A---T-------T-C-AA--TG------------------------G--A--T--AAA-T---T-A--C--T-G--T-A-T-T----------TC--ACTG-TT--T--A--A-AACG-ca
gi|28 : gA-T-A---TA-T--C-G--T-A--AA----T---T----ATA----------TT---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-A-TT------GC-G---G---------AC-T--A-G-ATA-T---T----G-C---------------------------------------C-G-G--A-A-G-T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----T--T---C---AAAC--T--G--T-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----AACT--T-T--T--T-T---G-T--------T---A---T---T---TT-TTC---AC-----------A-C-T----G-T--T-AA-A----A----------T--T----A-------A---C-A--------AT-A--T---T--TT---A---C-------T-C-AA--CG------------------------G--AA-T--AAA-T---T-T--T--C-A--T-A-T-T----------TC--ACTG-CTAAA--A--A-AATG-TAAcg
gi|29 : gA-A--C-G--T-A--GA----T---T----A-A---G-G----TT---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-A-CT------GC-G---G---------A--TT-A-T-ATA-T---T----G-C-GGC--A----A-G-T----A--A----A--------C-C-G-G--A-A---T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----CCCT---C---A--C--T--G--T-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-T--T--T-----G-T--------T---A---T---T---TT-T-CC--AC-----------C-C-T----G-T--G-AA-A----A----------A--T----A-------AA--C-A--------A--A--T---T--CT---A---T-------T-C-AA--CG------------------------G--A--T--AAA-T---T-T--C--A-A--T-A-T-T----------TC--ACTG-CT--G--A--A-AATG-TAAta
gi|3 : AA-T-A---AA-A--C-G--T-AGAAA-A--T---T----A-GTCCG-GAATCTC---------A--TAA-C--A----------T-------T-A----G----T-AATTCAAAAAGC-G---GCCGAGA---A--T--A-G-ATA-T---T----GGT-GGC--A----A-GAT----AAGG----AAAGTCCATC-C-G-G--A-A-A-T-TA-----T--T-------------T-T-------T-----C--T---C---A--C--A--G--T-GG------AA---A----A--T--A-A-C-----AT----C-T--T--T-T---G-T--------T---A-------T---TT-T-C---ACAATGTATGTAAA-C-TAGA-G-T--G-AA-AAAATA----------A--T----A-------A---C-A--------AG-A--T---T--TA---A---T-------T-TAAA--CG------------------------A--A--TCAAAA-T---T-T--T--ACA--T-A-T-T----------TC--ACTG-CT--G--A--A-AATG-TA
gi|30 : aaaatgtattagatacgtatgcA-T-A---TA-A--C-G--T-A--AA-A--C---C----A-A---C-G----GT---------A--T---C--A----------TG------T-A----G----T-A-TT------GC-G---G---------A--T--A-G--TA-T---T----G-C-GGC--A------G-T----A--G----A--------C-C-G-AC-A-A-ACT-TG-----T--T---A---T-----T-G-------------C--T---C---A--C--T--G--TTG-------AA---A----A--T--A-A-C-----A----------T--T-T---G-G--------T---G---T---T---TT-T-C---AC-----------AAC-T----G------AA-A----A----------A--T----A-------A---C-A--------A--A--T---T--GT---A---C-------T-C--A--CG------------------------G--A--T--AA------T-T--CATA-A--T-A-T-C---------------CTG-CT--A--A--A-Aca
gi|31 : cattA-A--C-A--TGA--AA-A--T---T----A-A----------TT---------A--T-----------------T-------T-AAAATG----T-A-TT------TT-G------------------------TA-T---T----G-T-G-C--A----A-A-T----T--G----T--------C-C-C------A-G-T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--A---C---G--C--T--G--A-A-------AA---A----AA-T--A-A-------A-----C-T--T--G-----G-T--------T---A---C---T---T----C---AC-----------A-C-T----G-T--G-AA-G----G----------A--T----A-------C---C-A--------AT-T--T---T--TT---A---T-------TCC-AG--TG------------------------G--A--T--ACA-T---T-T--C--A-A--T-A-T-T----------TTAAACTG-TT--G--A--A-AATA-TGAtaat
gi|32 : ACA-T-T---TA-T------AAA-T-A---TA-A--C-G--T-A--AA----T---T----A-A---G-G----TT---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-A-T-------GC-G---G---------A--T--A-G-ATA-T---T----G-C-TGC--A----A-G------A--G----A--------C-C-G-G--A-A-G-T-TG-----T--T---A---A-----T-T-------T-----C----------A--C--T--G--T-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-T--T--T-T---G----------T---A---T---T---TT-T-C---AC-------------C-T----G-T--G-AA-A----A----------A--T----A-------A---C-A--------A--A------T--CT---A---T-------T-C-AA--AG------------------------G-----T--AAA-T---T-T--C--A-A--T-A---T----------TC--ACTG-CT--taaa
gi|33 : A-T-T---TA-T---T--ATA-T-A---TA-T--C-G--T-A--AA-A--T---G----A-A---G-G----TG---------A--T---C-------------T-------T-AT---G----T-A-TT------GC-G---G---------A--T--G-A-ATA-T---C----G-C-GGC--A----A-G-T----A--GT---T--------T-C-G-G--------T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T--------T---C---A--CAAT--A--T-G-------AA---A----A--T--A----------------------------------------T---A---T-------------------------------C-T----A-T--G-AA-A----AT---------A--T----G-------A--------------------------------A---T-------T-T-GA--TG------------------------G--A--T--AAA-T---T-T--C--A-G--T-A-T-T----------GG--AATG-TT--C--A--A-AATA-TAA
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gi|35 : gCA-T-T---TA-T---T--AAA-T-AA--TA------G--T-A--A-----T---T----A-A---G-G----TT---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-A-T-------GC-G---G---------C--T--A-G-ATA-T---T----G-C-GGC--A----A-G-T----A--G----A--------C---G-G--A-A-A-T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--G--T-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-T--T--T-T-----T--------T---A---T---T---TT-T-C---AC-----------G-T-T----G-T--T-GA-A----A----------A--T----A-------A---A-A--------A--A---------AA---A---T-------T-C-AC--TG------------------------A--A--T--AAA-T---T-T--C--A---------------------------TG-CT--G--A--A-
gi|36 : AACA-T-T---TA-T---T--AAA-T-A---TA-A--C-G--T-A--AA-C--T---T----A-T---T-A----TC---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-T-TT------GT-G---G---------A--T--A-G-ATA-T---T----G-C-GAC--A----A-G-T----A--G----A--------C-C-G-G--A-A-A-T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--A---C---A--C--T--G--TGG-------AA---A----A--T--A-A-G-----A------------------------------------------------------------------------------------AA-A----A----------A--T----A--------------------------------------------T-------T-C-AA--CG------------------------G--A--T--AAA-T---T-T--T--A-A--T-A-T-T----------TC--ACTG-TT--C--A--A-AATG-TAA
gi|37 : A-T-T---TA-T---T--AAA-TTA---TA-A--C-G--T-A--AA-A--T---T----A-A---G-G----TT---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-A-TC------GC-G---G---------A--T--T-G-ATA-T---T----G---GGC--A----A---T----A--G----A--------C-C-G-G----A-A-T-TG-----T--T---AT--T-----T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--G--T-G-------AA---ATTCTA--TTCA-A-CGGATAA-----A-T--T--T-C---A-A--------T---A---T---T---T---------C-----------A-C-T----GCT--G-GA-A----A----------A--T----taa
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gi|8 : -T---CA-T---T--AAT-T-A---TA-A--C-G--T-A--AATA--T---C----A-A---G-G----TA---------A--T---C--AAT--------TA------T-A----G----T-A-TT------GC-G---G---------A--T--A-G-ATA-T---T----G-C-GGCAAA----A-G-T----G--A----T--------C-C-G-GT-ATA-G-T-TG-----T--TTTAA---T-----C-T-------T-----C--T---C---A--CG-T--G--T-G--------A---A----A--T--A-A-C-----A-----C-T--T--TGT---G-A--------T---A---T---T---TT-C-T---AC-----------A-C-T----G-T--G-AA-A----ATAC-------A--T----A-------A---CGA--------A--A--T---T--TT---A---C-------T-C-AA--C-------------------------G--A--T--AGA-T---T-T--C--A-A--T-A-T-TTTCAACTGCCTC--ACTG-CT--A--A--A-AATG-TAAttaa
gi|9 : AA-T-T---TA-A--C-G--T-A--AA-A--T---T----A-A---G-G----TG---------A--T---C-------------T-------T------G----T-A-TT------GG-C---G---------A--T--A-TTATA-C---T----G-C-GGC--A----A-A-T----A--A----A--------C-C-G-G--A-A---T-TG-----T--TT--A---C-----T-TATT----T-----C--T---C---A--C--T--G--TTG-------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-T--T--T-T---A-T--------T---A---T---T---TT-T-C---AC-----------A-C-T----G-T--G-AA-A----A----------AT-T----A-------A---C----------A--C--T---T--TT---A---T-------T-taa
gi|9 : -T-TA-----T--T---A---T-----T-T-------TT----C--A---C---A--C--T--G--T-G-------AA---A----AATT--A-A-C-----A-----C-T--T--T-T---A-T--------T---A---T---T---TT-T-C---AC-----------A-C--------T--G-GA-A----A----------A--T----A-------A---C-A--------A--A--T---T--CT---A---T-------T-C-AA--CG------------------------G--A--A--AAA-T---T-T--C--A-A--T-A-T-T----------TC---CTG-CT-----A--A-AATG-TAatttttcacactggaaaataacaaattctattcaacggaaaaatttcaatatttcctgctaaaatgtata
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blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . A . . . . . . . . . TT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . AT . C . . . . . C . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . TA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . GA . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . TA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TA . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GA . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AG . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . T . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . T . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . C . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
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originalCons : AACA-T-T---TA-T---T--AAA-T-A---TA-A--C-G--T-A--AA-A--T---T----A-A---G-G----TN---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-A-TT------GC-G---G---------A--T--A-G-ATA-T---T----G-C-GGC--A----A-G-T----A--G----A--------C-C-G-G--A-A-A-T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--G--T-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-T--T--T-T---G-T--------T---A---T---T---TT-T-C---AC-----------A-C-T----G-T--G-AA-A----A----------A--T----A-------A---C-A--------A--A--T---T--CT---A---T-------T-C-AA--CG------------------------G--A--T--AAA-T---T-T--C--A-A--T-A-T-T----------TC--ACTG-CT--G--A--A-AATG-TAA
finalCons : AACA-T-T---TA-T---T--AAA-T-A---TA-A--C-G--T-A--AA-A--T---T----A-A---G-G----TN---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-A-TT------GC-G---G---------A--T--A-G-ATA-T---T----G-C-GGC--A----A-G-T----A--G----A--------C-C-G-G--A-A-A-T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--G--T-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-T--T--T-T---G-T--------T---A---T---T---TT-T-C---AC-----------A-C-T----G-T--G-AA-A----A----------A--T----A-------A---C-A--------A--A--T---T--CT---A---T-------T-C-AA--CG------------------------G--A--T--AAA-T---T-T--C--A-A--T-A-T-T----------TC--ACTG-CT--G--A--A-AATG-TAA
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|48 ): CCGAGCGATCACCTGACACAAACTTCCACTGGCATGGGGTAATTAAATATCACGCAATAACTACAGGTCATATGACAAATACTATCTTTCTGCATTTGGT
Unaligned ( gi|63 ): ATATTATGCATATTCCTTGCACCAGGTTCATTGTAGATAAATTGCTTTTG
Unaligned ( gi|70 ): TGGACTGCGATTATTATAAATCAATGTGCCTT
Alignments
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lowQualScore : 1 1 111 2 222 22 0 2 222 0 22 2 22 1 22 0 33 111 1111 0 333 0 3333 5555555555 11 222 22 5555555555 7777777 1 3333 3333 1 2 444444 0 111 666666666 22 3333 1 0 222 2222 1 0 22 4444 0 1 3333 11 3333 33333333 2 1 1 33 3 0 0 0 44444 22 333 222 22222 0 4444444 44444 11 111 444 11 22 11 11 3 4444444 222 3333 33 11 1 0 22222 55555 0 22 11 1 222 1 55555555 222 222 111 111 1 2 333 88888888888 1 0 3333 3 11 3 0 1111 0000000000 33 2222 4444444 222 0 44444444 77777 111 333 333 222 2222222 1 0 33 222222222222222222222222 22 44 22 0 222 0 22 22 0 22 0 0 0 5555555555 33 0 22 11 11 0 1
lowQualScore : . . ... . ... .. . . ... . .. . .. . .. . .. ... .... . ... . .... .......... .. ... .. .......... ....... . .... .... . . ...... . ... ......... .. .... . . ... .... . . .. .... . . .... .. .... ........ . . . .. . . . . ..... .. ... ... ..... . ....... ..... .. ... ... .. .. .. .. . ....... ... .... .. .. . . ..... ..... . .. .. . ... . ........ ... ... ... ... . . ... ........... . . .... . .. . . .... .......... .. .... ....... ... . ........ ..... ... ... ... ... ....... . . .. ........................ .. .. .. . ... . .. .. . .. . . . .......... .. . .. .. .. . .
lowQualScore : 1 0 888 8 666 22 8 4 222 8 55 3 11 5 88 8 33 333 6666 7 111 7 5555 9999999999 77 333 77 7777777777 5555555 5 8888 1111 5 3 000000 7 333 777777777 55 9999 5 8 111 9999 5 7 00 5555 7 5 3333 00 8888 66666666 3 5 5 44 2 8 8 8 44444 66 999 999 77777 8 6666666 00000 88 333 777 88 99 11 88 8 0000000 999 5555 88 99 6 8 88888 00000 8 22 11 7 222 6 88888888 333 333 555 555 7 5 444 77777777777 6 8 2222 3 11 3 8 7777 1111111111 55 6666 2222222 333 8 66666666 00000 444 444 555 333 8888888 7 9 33 555555555555555555555555 00 66 00 9 777 9 33 33 9 99 9 9 9 0000000000 33 9 11 22 22 9 0
consensus : AACA-T-T---TA-T---T--AAA-T-A---TA-A--C-G--T-A--AA-A--T---T----A-A---G-G----TN---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-A-TT------GC-G---G---------A--T--A-G-ATA-T---T----G-C-GGC--A----A-G-T----A--G----A--------C-C-G-G--A-A-A-T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--G--T-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-T--T--T-T---G-T--------T---A---T---T---TT-T-C---AC-----------A-C-T----G-T--G-AA-A----A----------A--T----A-------A---C-A--------A--A--T---T--CT---A---T-------T-C-AA--CG------------------------G--A--T--AAA-T---T-T--C--A-A--T-A-T-T----------TC--ACTG-CT--G--A--A-AATG-TAA
Reference ( family-2116 ) : AACA-T-T---TA-T---T--AAA-T-A---TA-A--C-G--T-A--AA-A--T---T----A-A---G-G----TN---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-A-TT------GC-G---G---------A--T--A-G-ATA-T---T----G-C-GGC--A----A-G-T----A--G----A--------C-C-G-G--A-A-A-T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--G--T-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-T--T--T-T---G-T--------T---A---T---T---TT-T-C---AC-----------A-C-T----G-T--G-AA-A----A----------A--T----A-------A---C-A--------A--A--T---T--CT---A---T-------T-C-AA--CG------------------------G--A--T--AAA-T---T-T--C--A-A--T-A-T-T----------TC--ACTG-CT--G--A--A-AATG-TAA
gi|1 : CA-T-T---TA-T---G--AGA-TTA---TA-A--T-G--T-A--AA-A--T---C----A-A---G-G----TA---------A--T---TCGA----------TGAAGTGCT-A----T----T-A-TT------GC-G---GCGCTGCTACA--T--A-G-GCA-T---TATGGG-C-GGC--ATATGA-G-T----A--C-------------C-C-G-GTTA-G-G-T-TG-----TGTT---A---T-----T-T-------TGTCCTC--T---T---A--T--T--T--T-GGTTGAATAA---A----G--T--A-A-C-----ATATCTC-T--TCTT-T---G-T--------TCTAG---T---T---TT-T-C---TCG----------A-C-TCGACA-T--G-GA-A----AGAAA------A--T----A-------AACAC-ATGTTGCCTA--G--T---T--CT---C---T-------A-C-AA--CG------------------------G--AA-T--AAA-T---T-T--C--A-A--T-A-T-T----------TC--ACTG-C---G--A--A-AATG-
gi|10 : atgaatACA-T-T---TA-T---TT-AAA-T-A---TA-A--CCG--A-A--GA-A--T---T----A-A---ATG----TT---------A--T---C--A----------TG------T-A----G----T-A-TT------GC-G---G---------A--T--AAG-ATA-T---TTTT-G-C-GGC--A----A-G-T----A--A----A--------C-CCG-G--A-A-A-T-TG-----TA-T---A---T-----T-T-------C-----CG-T---C---A--C--T--G--T-G-------AA---A----A--T--A---C-----AG----C-T--T--T-T---G-T--------T---A---T---T---TT-TTC---AC-----------A-G-T----G-T--G-AA-A----A----------A--T----A-------A---C-A--------A--A--T---T--CT---A---T-------TGC-AA--CG------------------------GA-A--TA-AAA-A---T-A--C--A-A--T-A-T-T----------TCA-ACTG-CT--G--A--A-AATG-TAAaat
gi|11 : AACA-T-T---TT-A---T--AAA-T-A---TA-A--G-A--G-A--AA-A--T---T----C-A---G-G----TT---------AG-T---C--A----------T-------T-A----GG---T-A-TT------GC-G---T---------A--G--A-G-ATA-T---T----G-C-GGCTAA----A-G-T----A--A----A--------C-C-G-G--AGA-A-T-AG-----T--T---A---T-----TGT-------T-----C--T---C---AT-C--T--G--T-A-------AG---A----A--T--AGA-C-----A-----C-T--T--T-T---G-T--------T---A---T---T---TT-T-C----C-------------C-T----G-T--G-AA-A----A----------AGTT----AATT----A---C-A--------A--AT-T---T--CT---AT--T-------T-C-AATTC-------------------------G--A--T--AAA-A---T-T--C--A-AT-T-A-T-T----------TC--ACTG-CT--G-----A-CATG-TAAta
gi|12 : g-T---T--AAA---A---TA-A--C-G--T-AG-AA-A--T---T----A-A---G------TT---------A--T---C--AATAATTAACTT-------T-A----G----T-A-TT------GC-G---G---------A--TT-A-G-ATA-T---T----G-C-GGC--A----A---T----A--G----A--------C-C-G-G--A-G---T-TG-----TG-T---A---T-----T-T-------T-----C--T---CCTCA--C--T--G--T-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-T--T--T-TTTTG-T--------T---A---T---T---TTCT-C---AC-----------A-C-T----G-T--G-AA-A----A----------AA-T----A-------T---C-A--------A--AA-T---T--CT---A---T-------T-C-AA--CG------------------------G--A--T--AAA-T---G-T--C--A-A--T-A-T-TAG--------TC--ACTG-CT--G--A--A-A--G-TAA
gi|13 : tACA-T-T---TA-T---A--AAA-T-A---AA-A--CTG--T-A--AA-A--T---T----A-A---G-GGG--TT---------A--T---CGCA----------T-------T-A----G----T-A-T-------GC-G---G---------A--T--GTG-ATA-T---G----G-C-GGC--AT---A-G-T----T--A----A--------C-C-G-G--A-A-A-T-TG-----T--TTG-A---T-----T-T-------T-----C--T-------A--C--T--G--T-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-T--G--T-T---GCT--------T---A---T---T---TT-T-CCA-ACG----------A-CTT----G-T--G-AAGA----A----------A--T----A-------A---C-A--------A--G--T---T--CT---A---T-------T-C-GA--AGTC----------------------G--A--T--A-------T-T--C--A-A--TCA-T-T----------TCAAACTG-CT--G--A--A-At
gi|14 : -T-T---TA-TCTAT--AAA-T-----CA-A----G--T-A--AA-AA-T---T----A-A---A-GAG--TT---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----C-A-TT------GC-G---G---------A--T--A-G-ATA-T--------G-C-GGC--A----G-GCT----A--A----A--------CGC-G-G--A-ACA-T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--G--T-G-------AA---AC---A--T--A-A-C-----A-------T--T--T-T---G-T--------T-------TCCGT---TT-T-C---AC-----------A-C-T----G-TTTG-AA-A----A----------A--T----A-------A---C-A--------A--A--T---T--CT---A---T-------T-C-AA--AG------------------------G--A--T--AAC-T---T-T--C--A-G--T-A-T-T----------TC--ACTG-CT--A--A--A-ACTG-tata
gi|15 : A-T---T--AAA-TTA---TA-A--C-G--T-A--AA-G--T--------A-A---G-G----TT---------A--T---C--AC---------T-------T-A----G----TCA-TT------GC-G---G---------T--T--A-G-CTAAT---T----G-C-TGT--A----A-G-T----C--A----A--------A-C-GTG--A-A-A-T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------TATT--C--T---C---A--C--T--G--T-T-------GA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-C--T--C-----G-T--------T---A---T---T---TT-G-C---AC-----------A-T-C----G-T--GTGA-A----A----------A--T----A-------G---C-CC-------A--A--T---T--CT---A---T-------G-C-AA--TG------------------------G--A--T--AAA-T---T-T--CCAA-A--T-A-T-T----------TC--ACTG-CT--T--A--A-GAtataaa
gi|16 : taaAACA-T-T---TA-T---T--AAA-T-A---TA-A--CTG--T-A--AA--------T----A-A---G-G----TT---------A--T---C--A----------TG------T-A----G----T-A-T----------G---G---------A--T--A---ATA-T---T------C-GGC--A----AAG-T----A--A----A--------C-C-C-G--A-A-A-T-T-------------A---T-----T-T-------T-----C--T---C---C--C--T--G--TTG-------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-T--T--T-T---G-T------------A---T---T---TT-T-C---ACC----------A-C-T------T--C-AA-A----A----------A--TTACTA-------A---C-AT-------A--A--T---T--TT---A---T-------T-C-AA--CG------------------------G--A--T---AA-T---T-TCAC--A-A--T-A---T----------TC--ACTG-CT--G--A--ACAATG-TAAattactaa
gi|17 : gCA-T-T---TA-T------GAA-T-A---TA-A--C-G--T-A--AA-AA-T---T----A-AT--G-G----TC---------A--T---C--A----------T-------TTA----G----T-A-TT------GC-T---G---------A--T--A-ATATA-T---T----G-C-TGC--A------G-T----A--A----AA-------C-C-G-G--A-A-A-T-T------T--T---A---T-----T-T-------A-----C--T---CC--A--C--T--G--T-G-------GA---A----A--T--A-A-CC----A-----C-T--T--T-TT--G-T--------T---A---T---T---TT-TTC---AC-----------A-C-T----G-T--G-AA-A----A----------AA-T----A-------A---C-G--------G--ACTT---T--CT---A---T-------T-C-AA--GG------------------------G--A--T--ACT-T---G-T--C--A-A--T-A-T-T----------TC--TCTG-CT--G--A--A-AATG-taaa
gi|18 : AACA-T-T---TA-G---T--TAA-G-A---TA-A--C-G--T-A--AA-G--T---TTTCAG-A---G-G----TA---------A--T---CG-A----------T-------T-A----G----T-A-T-------GC-G-------------A--T--A-G-ATA-A---G----G-C-GGC--A----A-G-TT---A--G----A--------C---G-G--A-A-G-T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--G--T-G-------GA---A----A--A--G-A-C-----A-----C-T--T--T-T---A----------T---A---T---T---TT-T-C---AC-----------A-C-T----G-T--GAAA-A----A----------A--T----A-------A---C-A--------A--AT-T---T--TT---A---C-------C-T-AA--CG------------------------G--A--T---AA-T---T-T--C--A-AG-T-A-T-T----------TC--ACTG-CT--T--A--A-AATG-TA
gi|19 : A-T-T---TA-T---T--AAA-T-A---TA-A--C-G--T-A--AA-A--T---C----A-A---G-G----TA---------A--T---C--A----------T-------T-G----G----T-A-TT------GC-G---G---------A--T--T-G-ATT-T---A----G-C-GGC--A----A-G-T----A--G----A--------C-C-G-G--A-A-A-T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--G--T-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-------T-T---G-T--------T---A---T---T---TT-T-C---AC-----------A-C-A----C-T--G-AA-A----A----------A--T----A-------A---C-A--------A--A--T---TAATTTG-A---C-------T-C-AA--CG------------------------G--A--T--AAA-T---T-T--C--A-A--T-A-T-T----------TC--ACTG-CT--A--A--A-AATG-TAA
gi|2 : AACA-T-T---TA-T---T--AAA-C-T---TA-AGAC-GACT-AGTAA-A--CCTAT----A-A---G-G----TT---------A--T---C--A----------T-------TCA----GA---T-A-TTCA----GC-G---G---------A--T--A-T-ATT-T---A----G-C-AGC--A----A-G-T----A--ATAACA--------C-C-G-G--ACA-A-CATG-----G--T---G---T-----T-TGTATGGGT-----C--T---T---A--C--T--AGCT-G-------AG---ATA--A--TG-A-A-C-----A-----C-T--T--T-T---G-T--------T-------T---T---TT-T-C---AC-----------A-C-T----G-T--A-GA-A----A----------A--T----ATAAAGGCA---C-A--------A--A--TCCAT--CT---AATCC-------T-C-AA--TGGGGATATACAAATTCTATTCAACGG--A--T--ACA-T---T-T--C--A-A--T-A-A-T----------TC--ACTG-CT--G--A--A-AATA-TAAtaa
gi|20 : gAATA-T-T---TA-T---T--AAA-T-A---TA-A--C-G--T-A--AA-A--T---C----A-A---G-G----TA---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-A-TT------GC-G---G---------A--T--G-G-ATA-T---T----G-C-GGC--A----A-G-T----A--G----A--------C-C-G-G--A-A-A-T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--G--T-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-T--T--T-T---G-T--------T---A---T---T---TT-T-C---AC-----------A-C-T----G-T--G-AA-A----A----------A--T----A-------A---C-A--------A--A--T---T--TT---A---C-------T-C-AA--CG------------------------G--A--T--AAA-T---T-T--C--A-A--T-A-T-T----------TC--ACTG-CT--A--A--A-AATGCTAAta
gi|21 : AATA-T-T---TA-T---T--AAA-T-A---TA-A--C-G--T-A--AA-A--T---T----A-A---G-G----TA---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-A-TT------GC-G---G---------A--T--G-G-ATA-T---T----G-C-GGC--A----A-G-T----A--G----A--------C-C-G-G--A-A-A-T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--C---C---A--C--T--G--G-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-T--T--T-T---G-T--------T---A---T---T---AT-T-C---AC-----------A-C--------T--G-AC-A----A----------A--T----A-------A---C-A--------A--C--T---T--TT---A---C-------G-C-AA--CG------------------------G--A--T--AAA-T---T-T--C--A-A--T-A-T-T----------TC--ACTG-CT--A--A--A-AATG-TAA
gi|22 : A-T-T---TA-T---T--GAA-T-A---TA-A--C-G--T-A--AA-A--T---T----A-A---G-G----TC---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-A-TT------GC-T---G---------A--T--A-T-ATA-T---T----G-C-TGC--A----A-G-T----A--A----A--------C-C-G-G--A-A-A-T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------A-----C--T---C---A--C--T--G--T-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-T--T--T-T---G-T--------T---A---T---T---TT-T-C---AC-----------A-C-T----G-T--G-AA-A----A----------A--T----A-------A---C-G--------A--C--T---T--CT---A---T-------T-T-AA--GG------------------------G--A--T--ACT-T---G-T--C--A-A--T-A-T-T----------TC--TCTG-CT--G--A--A-AATG-TAAta
gi|23 : ACA-T-T---TA-T---T--AAA-T-A---TA-A--C----T-A--AA----T---T----A-A---G-G----TT---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-AATT------GC-G---G---------A--T--TTG-A-A-T---T----G-C-G-T--A----A-G-T----A--G----A--------C-C-G-G--A-A-A-T-TG-----T--TA--A---T-----T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--G--T-G-------AA---A----T--A--A-A-C-----A-----C----T--T-T---G-T--------T---A---T---T---TT-T-C---AC-----------A-C-T----G-T--G-AA-A----A----------A--T------------T---C-A--------A--A--T---T--CTA--A---T-------T-C-AA--CG------------------------G--A--T---AA-T---T-T--C--A-A--T-A-T-T----------TC--ACTG-CT--G--A--A-AATG-TAAtaa
gi|24 : AACT-T-T---TACT---T--TAA-T-A----A-A--C-G--A-A--AC-A--T---T----A-A---G-G----TT---------A------C--A----------T-------T-A----G----T-A-TC------G----------------A--T--A-T--TA-T---T----G-C-G-C--AC---A-T-T----C--A----A--------C-C-G----A-A-A-T-TG-----T--T---A---------T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--G--T-C-------AAG--A----A--T--A-A-C-----A-----C-T--T--T-T---G-T--------T---A---T---T---TT-C-C------------------C-T----T-T--C-AA-A----A----------A--T----A-------G---C-A--------AG-A--T---T--CT---A---T-------T-C-AAT-CG------------------------GTAA--A--AAA-T---C-T-------A--T-A-T-T----------TC--ACTT-CG--G--A--A-AAtaa
gi|25 : ACA-T-T---TA-T---T--GAA-T-A---TA-A--C-G--T-A--GA-A--T---T----A-A---G-G----TC---------A--T---C--A----------T-------A-A----G----T-C-TT------TT-G---G---------A--T--A-A-ATA-T---T----G-C-GGT--A----A-G-T----G--G----A--------C-C-A-G--A-A-C-T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--A--T-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-------T-T---G-T--------T---A---T---T---T---------C-----------A-C-C----GCT--G-AA-A----AT---------G--T----A-------A---T-A--------A--A--T---------------------------------------------------------G--A--T--ACA-T---T-T--C--T-A--C-A-T-T----------Tatggtaataaa
gi|26 : cACA-T-T---TAAT---T--AAA-T-A---TA-A--C-G--T-A--AA-A--T---T----A-A---G-G----TT---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-A-TT------GC-G---G---------A--T--A-G-ATA-T---T----G-C-GGC--A----A-G-T----A--G----A--------C-CGG-G--A-A-A-T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--T---T---A--C--T--G--T----------A---A----A--T--A-A-C-----A-----CTT--T--T-T---G-T--------T---A---T---T---TT-T-C---AC-----------A-C-T----G-T--GAAA-A----A----------A--T----A-------A---C-A--------A--A--T---T--CT---A---T-------T-C-AA--AG------------------------G--A--T---AA-T----------------T-A-T-T----------TC--ACTG-CT--G--A--A-AATG-TAAttaattaatagtatgcacattataaatgta
gi|27 : -T-A---TACA--T-G--T-A--AA-AGAT---G----A-A---T-T----TG---------A--T---C--A----------T-------G-T----G----T-A-TC------AC-T---G---------A--T--G-A-ATA-T---T----C-A-GGC--A----A-T-TCATTA--G----A--------T-C-T-A--T-A-G-T-TG-----T--T---A---A-----T-TA------C-----C--TACAC---A--C--T--G--C-G-------AA---A----A--T--A-T-C-----A-----G-T--T--T-T---G-T--------T------------------T-C---AC-----------A-G-T----G-T--G-AA-A----AT---------G--T----A-------A--------------A--T--T---T--AT---A---T-------T-C-AA--TG------------------------G--A--T--AAA-T---T-A--C--T-G--T-A-T-T----------TC--ACTG-TT--T--A--A-AACG-ca
gi|28 : gA-T-A---TA-T--C-G--T-A--AA----T---T----ATA----------TT---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-A-TT------GC-G---G---------AC-T--A-G-ATA-T---T----G-C---------------------------------------C-G-G--A-A-G-T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----T--T---C---AAAC--T--G--T-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----AACT--T-T--T--T-T---G-T--------T---A---T---T---TT-TTC---AC-----------A-C-T----G-T--T-AA-A----A----------T--T----A-------A---C-A--------AT-A--T---T--TT---A---C-------T-C-AA--CG------------------------G--AA-T--AAA-T---T-T--T--C-A--T-A-T-T----------TC--ACTG-CTAAA--A--A-AATG-TAAcg
gi|29 : gA-A--C-G--T-A--GA----T---T----A-A---G-G----TT---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-A-CT------GC-G---G---------A--TT-A-T-ATA-T---T----G-C-GGC--A----A-G-T----A--A----A--------C-C-G-G--A-A---T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----CCCT---C---A--C--T--G--T-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-T--T--T-----G-T--------T---A---T---T---TT-T-CC--AC-----------C-C-T----G-T--G-AA-A----A----------A--T----A-------AA--C-A--------A--A--T---T--CT---A---T-------T-C-AA--CG------------------------G--A--T--AAA-T---T-T--C--A-A--T-A-T-T----------TC--ACTG-CT--G--A--A-AATG-TAAta
gi|3 : AA-T-A---AA-A--C-G--T-AGAAA-A--T---T----A-GTCCG-GAATCTC---------A--TAA-C--A----------T-------T-A----G----T-AATTCAAAAAGC-G---GCCGAGA---A--T--A-G-ATA-T---T----GGT-GGC--A----A-GAT----AAGG----AAAGTCCATC-C-G-G--A-A-A-T-TA-----T--T-------------T-T-------T-----C--T---C---A--C--A--G--T-GG------AA---A----A--T--A-A-C-----AT----C-T--T--T-T---G-T--------T---A-------T---TT-T-C---ACAATGTATGTAAA-C-TAGA-G-T--G-AA-AAAATA----------A--T----A-------A---C-A--------AG-A--T---T--TA---A---T-------T-TAAA--CG------------------------A--A--TCAAAA-T---T-T--T--ACA--T-A-T-T----------TC--ACTG-CT--G--A--A-AATG-TA
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gi|32 : ACA-T-T---TA-T------AAA-T-A---TA-A--C-G--T-A--AA----T---T----A-A---G-G----TT---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-A-T-------GC-G---G---------A--T--A-G-ATA-T---T----G-C-TGC--A----A-G------A--G----A--------C-C-G-G--A-A-G-T-TG-----T--T---A---A-----T-T-------T-----C----------A--C--T--G--T-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-T--T--T-T---G----------T---A---T---T---TT-T-C---AC-------------C-T----G-T--G-AA-A----A----------A--T----A-------A---C-A--------A--A------T--CT---A---T-------T-C-AA--AG------------------------G-----T--AAA-T---T-T--C--A-A--T-A---T----------TC--ACTG-CT--taaa
gi|33 : A-T-T---TA-T---T--ATA-T-A---TA-T--C-G--T-A--AA-A--T---G----A-A---G-G----TG---------A--T---C-------------T-------T-AT---G----T-A-TT------GC-G---G---------A--T--G-A-ATA-T---C----G-C-GGC--A----A-G-T----A--GT---T--------T-C-G-G--------T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T--------T---C---A--CAAT--A--T-G-------AA---A----A--T--A----------------------------------------T---A---T-------------------------------C-T----A-T--G-AA-A----AT---------A--T----G-------A--------------------------------A---T-------T-T-GA--TG------------------------G--A--T--AAA-T---T-T--C--A-G--T-A-T-T----------GG--AATG-TT--C--A--A-AATA-TAA
gi|34 : aaAACA-T-T---TA-T---T--AAA-T-A---TA-A--C-G--T-A--AA-A--G---T----A-A---G-G----TC---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-A-CT------GC-A---G---------A--T--A-G-AAA-T---T----G-C-GGC--A----A-G-A----A--G----A--------C-C-G-G--A-C-A-T-TG-----T--T---A---TGTTACT-T-------T-----C--A---C---A--C--T--G--T-G-------AA---A----A--T--A-A-T-----G-----C-T--T--T-T---G-T--------T---A-------T---TT-T-A---AC-----------A-C--------T--G-AA-A----A----------A--T----A------------------------------------T---A---T-------T-C-AA--CG------------------------A--A--T--AAT-T---T-T--T--A-A--T-taaa
gi|35 : gCA-T-T---TA-T---T--AAA-T-AA--TA------G--T-A--A-----T---T----A-A---G-G----TT---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-A-T-------GC-G---G---------C--T--A-G-ATA-T---T----G-C-GGC--A----A-G-T----A--G----A--------C---G-G--A-A-A-T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--G--T-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-T--T--T-T-----T--------T---A---T---T---TT-T-C---AC-----------G-T-T----G-T--T-GA-A----A----------A--T----A-------A---A-A--------A--A---------AA---A---T-------T-C-AC--TG------------------------A--A--T--AAA-T---T-T--C--A---------------------------TG-CT--G--A--A-
gi|36 : AACA-T-T---TA-T---T--AAA-T-A---TA-A--C-G--T-A--AA-C--T---T----A-T---T-A----TC---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-T-TT------GT-G---G---------A--T--A-G-ATA-T---T----G-C-GAC--A----A-G-T----A--G----A--------C-C-G-G--A-A-A-T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--A---C---A--C--T--G--TGG-------AA---A----A--T--A-A-G-----A------------------------------------------------------------------------------------AA-A----A----------A--T----A--------------------------------------------T-------T-C-AA--CG------------------------G--A--T--AAA-T---T-T--T--A-A--T-A-T-T----------TC--ACTG-TT--C--A--A-AATG-TAA
gi|37 : A-T-T---TA-T---T--AAA-TTA---TA-A--C-G--T-A--AA-A--T---T----A-A---G-G----TT---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-A-TC------GC-G---G---------A--T--T-G-ATA-T---T----G---GGC--A----A---T----A--G----A--------C-C-G-G----A-A-T-TG-----T--T---AT--T-----T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--G--T-G-------AA---ATTCTA--TTCA-A-CGGATAA-----A-T--T--T-C---A-A--------T---A---T---T---T---------C-----------A-C-T----GCT--G-GA-A----A----------A--T----taa
gi|38 : ga-G---G---------A--T--A-G-ATA-T---T----G-C-GGC--A----A-G-T----A--A----A--------CGC-G-G--A-A-A-T-TGG----T--T---A---T-----A-T-------T-----C--T---CG--A--C--T--G--T-G-------AAT--A----A--T--A-A-C-----A-----T-C--T--T-T---G-T--------C---A---T---T---TTTT-C---AC-----------A-C-T----G-T--G-AA-A----A----------A--T----A-------A---C-A--------A--A--T---T--CT---A---T-------T-C-AA--CG------------------------G--A--T--AAA-C---T-T--C--A-A--T-A-T-T----------TC--ACCG-CT--G--A--A-AATG-TAAgtaatt
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gi|40 : taAACA-T-T---AG-T---T--AAA-T-A----A-A--C-G--T-A--AA-A--T---C----A-A---A-G----GT---------A--T---C--A----------T--------------G----T-A---------GG-G---G---------A--T--A-T-ATA-T---T----G-C-GGC--A------G-T----T--G----A--------C---G-G--A-A-A-T-TG-----T--T---A---A-----T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--G--T-G-------AA---A----AG-T--A-A-C-----A-----C-T--T--T-T---G-A--------T---AT--T---T---TT-T-C---AC-----------A-C-T----GCT--G-AA-A----A----------A--T----A-------A---C-A--------A--A--T---T--at
gi|41 : gACA-T-T---TA-T---T--AA--T-A---TA-A--C-G--T-A--AA-A--T---T----A-A---G-G----TT---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-A-TC------GC-G---G---------A--T--T-G-ATA-T---T----G-C-GGC--A----A---T----A--G----A--------C-----G--G-A-A-T-TG-----T--T---AT--T-----T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--G--T-G-------AA---A----taccaa
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gi|42 : gacatttattaatataacgtaaaattaaggttatcattagtatcgcggattgatattgcggcaatagacggaattgttatttttctcactgtg----TA---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-A-TC------GT-G---T---------A--T--A-A-ATA-T---T----T-C-GGC--A----A-T-T----A--G----T--------CAA-G-G--G-A-A-T-CG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--A---C---A--T--T--G--T-G-------AA---A----T--T--T-A-C-----A-----T-CAAT--T-T---G-T--------ta
gi|42 : --T-C---G-T--------T---A---T---T---TT---C---AC-----------A-T-T----G-T--G-AA-A----TTT--------A--C----A-------T---C-A--------A--T--T---T--GT---G---T-------T-T-AA--CG------------------------G--A--T--GAA-T---T-T--C--A-A--T-A-T-T----------TC--AATG-CT--G--A--A-AATG-CAAgtttaacggatgaatttcaatatttcaatgctgaaaatgcaata
gi|43 : taatcattagtatcgtgtataaatatttcggcaattagtcaagggaaC--A----A-G-T----A--GT---C--------C-C-G-G--------T-TA-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--A---T---A--C--T--G--T-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----A--------------------------------------------------------------------A-C-T----G-T--T-AA-A----A-------------T----A-------T---C-A--------ATAA--T---T--TT---A---T-------T-C-AA--CG------------------------G--A--T--AA---------------------A-T-T----------TC--GCT--CT--G--A--A-AATG-TAta
gi|44 : gcatggaattggataaAACAAT-T---TA-T---T--AAA-T-A---TA-A--C-G--T-A--AA-A--T---C----A-A---G-G----TA---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----TAA-TT------GC-G---G---------A--T--A-G-ATA-T---T----G-CGGGC--A----A-G-T----A--G----A--------C-C-G-GA-A-A-A-T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--G--T-GA------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-T--ttagat
gi|45 : CA-T-T---CA-T---T--AGA-T-A---TA-A--C-G--T-A--AA-A--T---T----A-A---G-G----TT---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-AATT------GC-G---G---------A--T--T-G-ATA-T---T----G-C-GGC--A----A-G-T----A--G----A--------C-C-G-G--A-A-A-T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--G--T-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-
gi|46 : tAA-T-A---TA-A--C-G--T-A--AA-A--T---T----A-A---G-G----TG---------A--T---C--A----------T-------T-T----G----T-A-TT------GC-G---G---------A--T--A-T-ATA-C---T----G-C-GGC--A----A-A-T----A--A----A--------C-C-G-G--A-A-A-T-TGTTTACT--T---A---T-----T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--G--T-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-T--T--
gi|47 : acgt--T--G--T-G-------AA---A-------T--A-A-C-----A-----C-C--A--C-T--------------T---A---T---T---TT-T-C---ACGTTAAC-----A-C-C----A-T--T-GA-A----T----------A--T----A-------A---T-A--------T--C--T---T--AC---G---T-------T-C-AA--CA------------------------G--A--T--ACC-T---T-G--C--A-A--C-A-T-T----------TT--ACTG-CT--G--A--A-AGCG-TAA
gi|49 : CA-TAT---TA-T---T--AA--T-A---TA-A--C-G--T-A--AA-A--A---T----T-A---G-G----TT---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-A-TT------GC-G---G---------A--T----G-AAA-T---T----G-C-GGC--A----A-G-T----A--G----A--------C-C-G-G--A-A-G-T-TG-----T--T---A---------T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--G--T-G-------AA---taaacaa
gi|5 : AAAA-C-T---TA-TC--T--AAA-T-T---TA-AA-C-G--T-A--AA-AA-T---C----A-A---G-G----TA---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-A-TTG-----GC-G---G---------A--T--A-G-ATA-T---T----G---GGC--A----A-G-T----A--GA---A--------C-C-G-G--ACA-A-G-TGTGGA-T--T---AAGTC-----T-T-------T-----C--T---C---A--CGGTGAG--T-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-TTCT--T-T---A-TGAA-----T---A---T---T---TT-T-C---AC-----------GCC-T----G-T--G-AA-A----A----------A--T----T-------A---C-A--------A--AG-C---T--TT---A---C-------T-C-AATTCGA-----------------------G--AG-T--AAT-T---TGT--C----A--T-A-TGT----------TC--ACGG-CT--T--AATA-AGTG-TAA
gi|50 : tg---G-T--------C---A---T---G---TT-T-----AC-----------A-C-C----A-T--GTCA-A----A----------A--T----T-------A---T-A--------A--AG-C---T--GT---A---C-------T-C-AA--TG------------------------T--A--T--AAA-T---T-T--C--A-G--T-A-T-T----------TC--ACTG-TT--T--A--C-AACG-taaa
gi|51 : AACA-C-T---TA-T---T--GAA-T-A---TA-A--C-T--T-A--AA-A--T---T----A-A---G-G----TT---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----C-A-AT------GC-G---G---------A--T--A-G-ATA-T---T----G-C-GGC--A----A-G-T----A--A----A--------C-T-G-cta
gi|52 : tag-T---T--AAA-T-A---CC-T--C-G--T-G--AA-C--T---G----A-A---G-T----TG---------A--T---C-------------T-------T-AT---G----T-A-TC------GC-G---GATTT-----A--T--G-A-ATA-T---T----G-C-GGC--A----A-G-T----A--
gi|53 : ACA-T-C---TA-T---C--AAA-T-A---TA-A--C-G--T-A--AC-A--T---T----A-A---G--------------------T---C--A----------T-------T-G----G----T-A-TT------GC-G---G---------A--TGAA-T-ATA-T---T----A-C-GGC--A----A-G-T----A--G----A--------C-C-G-G--A-attccggttgat
gi|54 : gg---A---T-----T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--G--T-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-T--T--T-T---T-T--------C---AGGTC---T---TT-T-C---AC-----------A-C-T----G-T--G-AA-A----A----------A--ta
gi|55 : -T---TG-T---T--GAA-T-A---TA-A--C-G--T-A--GA-A--T---T----A-A---G-G----TT---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-A-CT------GC-G---G---------A--T--A-T-ATA-T---T----G-C-GGC--A----A-G-T----A--G----A--------C-C-G-agggtatatacatgta
gi|56 : cA-T-G---TA-T---T--AGA-T-A---TA-T--C-G--T-A--AA-A--T---G----A-A---G-A----TATA-------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-A-AC------GC-G---G---------A--T--A-A-ACA-C---T----G-C-AGC--A----A-G-T----A--G----
gi|57 : A-A----A----------A--T----A-------A--------------------T---T--TA---A---T-------T-C-A---TG------------------------G--A--T--GAG-T---T-T--C--A-G--T-A-T-T----------TC--ACTG-AA--G--A--A-AATG-TAA
gi|58 : aactacagc-----------A-C-T----G-T--G-AA-A----A----------A--T----A-------A---C-A--------A--A--T---T--CT---A---T-------T-C-AA--CG------------------------G--A--T--AAA-T---T-T--C--A-A--T-A-T-T----------TC--ACTG-CT--G--A--A-AATG-TAAtaaat
gi|59 : ---TA-A--T-G--T-A--AA-A--T---G----A-C---A-G----TG---------ACTT---C--A----------T--------------G----T-A-TC------GC-G---A---------A--T--G-A-ATA-T---T----G-C-GA---G----A-G-T----A--G----ta
gi|6 : AGCA-G-T---TA-T---T--AAA-T-A---TA-AA-C-G--TGA--AA-A--T---C----A-GAG-G-G----TA---------A--TGCAT--A----------T-------T-A----GGGTAT-A-CT------GCTG---G---------ACGT--A-G-ATA-TG--T----G-C-GGC--A----A-G-TTA--G--G----A--------C-C-G-G--G-A-G-T-TG-----T--T---A---T-----T-G-------T-----C--T---TT--A--C--T--G--TCG-------GATACA----A--T--A-AAC-----A-----C-T--T--T-T-----TGAA-----T---A---T---T---TT-T-C---AC-----------A-C-T----G-G--A-AA-A----A----------G--T----A-------A---T-C--------A--A--T---T--GTTACA---T-------C-T-AA--CG------------------------G--A--T--AAAGTTAAT-T--C--A-ATGT-A-T-T----------GT--ACTG-CT--A--A--A-AATG-TAAtcacggttg
gi|60 : a-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----T--A---C---A--C--T--G--A-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-------C-T---G-T--------T---A---T---T---TT-C-C---G------------A-C------G-T--G--A-A----A----------A--T----G-------A---C-A--------A--G--T---t
gi|61 : -C-G-G--A-A-G-T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--G--T-G-------AA------------------C-----A-----C-T--T--T-T---G-T--------T---A---T---T---TT-T-C---AC-----------A-C-T----G-T--A-AT-A----A----------A--T----A-------A---att
gi|62 : --------A--A--T---T--TT---A---T-------T-C-AA--CG------------------------G--A--T--AAA-T---T-T--C--A-A--T-A-T-T----------TC--ACTG-CA--G--A--A-AATG-TAA
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gi|65 : ACA-T-T---TA-T---T--AAA-T-A---TA-A--C-G--T----AA-A--T---T------A---G-G----TT---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-A-TT------GC-G---G---------A--
gi|66 : AACA-T-T---TA-T---T--AAA-T-A---CA-A--A-G--T-A--GA-A--T---T----A-A---G-G----TC---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-
gi|67 : tgACA-T-TCTGTAGT---T--AAG-T-A---TA-A--T-G--T-A--AA-A--T---G----A-A---G-G----TG---------A--T---C--
gi|68 : at--A--T--AAA-T---T-T--C--A-A--T-A-T-T----------TC--ACTT-CT--A--A--A-AATG-TAA
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gi|7 : AACA-T-T---TA-T---TTTAAA-T-A---TA----C-GCCT-A--AA-G--T---T----A-A---G-G----TTT--------A--T---C--AG---------T-------T-A----G----T-A-TT------GC-GACCG---------A--T--AAG-ATA-T---T----G-C-GGC--ACGCAA-G-T----A--G----A--------C-C-GCG--A-A-A-T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--GT-T-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-T--T--T-T---G-T--------TC--A---T---T---TT-T-TCAAAC-----------A-C-T----GCT--G-AA-A----A----------A--TA---A-------A---C-A--------A--A--T---T--CT---A---T-------T-C-AA--CGC-----------------------G--AATT--AAA-T---T-T--C--A-A--T-A-T-T----------TC--ACTGACT--GGAA--A-AATG-TAA
gi|8 : -T---CA-T---T--AAT-T-A---TA-A--C-G--T-A--AATA--T---C----A-A---G-G----TA---------A--T---C--AAT--------TA------T-A----G----T-A-TT------GC-G---G---------A--T--A-G-ATA-T---T----G-C-GGCAAA----A-G-T----G--A----T--------C-C-G-GT-ATA-G-T-TG-----T--TTTAA---T-----C-T-------T-----C--T---C---A--CG-T--G--T-G--------A---A----A--T--A-A-C-----A-----C-T--T--TGT---G-A--------T---A---T---T---TT-C-T---AC-----------A-C-T----G-T--G-AA-A----ATAC-------A--T----A-------A---CGA--------A--A--T---T--TT---A---C-------T-C-AA--C-------------------------G--A--T--AGA-T---T-T--C--A-A--T-A-T-TTTCAACTGCCTC--ACTG-CT--A--A--A-AATG-TAAttaa
gi|9 : AA-T-T---TA-A--C-G--T-A--AA-A--T---T----A-A---G-G----TG---------A--T---C-------------T-------T------G----T-A-TT------GG-C---G---------A--T--A-TTATA-C---T----G-C-GGC--A----A-A-T----A--A----A--------C-C-G-G--A-A---T-TG-----T--TT--A---C-----T-TATT----T-----C--T---C---A--C--T--G--TTG-------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-T--T--T-T---A-T--------T---A---T---T---TT-T-C---AC-----------A-C-T----G-T--G-AA-A----A----------AT-T----A-------A---C----------A--C--T---T--TT---A---T-------T-taa
gi|9 : -T-TA-----T--T---A---T-----T-T-------TT----C--A---C---A--C--T--G--T-G-------AA---A----AATT--A-A-C-----A-----C-T--T--T-T---A-T--------T---A---T---T---TT-T-C---AC-----------A-C--------T--G-GA-A----A----------A--T----A-------A---C-A--------A--A--T---T--CT---A---T-------T-C-AA--CG------------------------G--A--A--AAA-T---T-T--C--A-A--T-A-T-T----------TC---CTG-CT-----A--A-AATG-TAatttttcacactggaaaataacaaattctattcaacggaaaaatttcaatatttcctgctaaaatgtata
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|48 ): CCGAGCGATCACCTGACACAAACTTCCACTGGCATGGGGTAATTAAATATCACGCAATAACTACAGGTCATATGACAAATACTATCTTTCTGCATTTGGT
Unaligned ( gi|63 ): ATATTATGCATATTCCTTGCACCAGGTTCATTGTAGATAAATTGCTTTTG
Unaligned ( gi|70 ): TGGACTGCGATTATTATAAATCAATGTGCCTT