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lowQualScore                  :              66     9 9 22   8 4 222  8 66 3 11 8 99  8 77 5555555 8 666 777777 00 33333333 00 333 9999999 888 4444444 5 555 8888 5 0  888888  7 222 555555555 4 2222222222222222   7 66 6666 66 7  7 88 2222 7 3 0000 44444444444 22222222 1 444444 3 66 4 000 6 99 22222 99 888 222 99999 6 3333333 44444 33 777 444 44 88 88 33 7 9999999  666 5555 333 333 1 6 77777 8888888888888888888888 5 1 77777777 999 999 444 999 5 0 1 666666 5 44444444444 44444444 0 77 4444 77 1111 9999 2222 22 1111111 5 0 00000 99 1111 222222 888888 9 3333 66666666666666666 5  333333333333333333333333  77 99 1111111111 111111111111   99 222 8 666 22 9 00 8  9 2222222222  55    9 9 333  0  1  0   
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Reference ( gi|20 )           :            AAT-ATTTA-T-T--AAA-T-A---TA-A--C-G--T-A--AA-A--T---C---A-A---G------G--T-----A--A--T---C-------A---T-------T-A---G----T-A-TT------GC-G---G---------A-T----G--G--------ATA-T--T----G--C-GG-C--A----A-G-T----A------G----A--------C-C------G-G--A-A-A-T-T--G-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--G--T-G-------AA---A----A---T---A-A-C-----A-----C---T---T--T-----T-G-T--------T---A---T---T---T-T-T-C------A-C-----------A-C-T----G-T--G-A--A--A----A----A----T--A-------A-C-A-----A--A----T------T------T-T----A---C--T----------C-AA------------------------CG--G--A----------T------------AAA--T---T-T---C--A-A--T-AT-T----------TC--ACTG-C-T--AAA-AA-TGCTAA
gi|21                         :            AAT-ATTTA-T-T--AAA-T-A---TA-A--C-G--T-A--AA-A--T---T---A-A---G------G--T-----A--A--T---C-------A---T-------T-A---G----T-A-TT------GC-G---G---------A-T----G--G--------ATA-T--T----G--C-GG-C--A----A-G-T----A------G----A--------C-C------G-G--A-A-A-T-T--G-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--C---C---A--C--T--G--G-G-------AA---A----A---T---A-A-C-----A-----C---T---T--T-----T-G-T--------T---A---T---T---A-T-T-C------A-C-----------A-C--------T--G-A--C--A----A----A----T--A-------A-C-A-----A--C----T------T------T-T----A---C--G----------C-AA------------------------CG--G--A----------T------------AAA--T---T-T---C--A-A--T-AT-T----------TC--ACTG-C-T--AAA-AA-TG-TAA
gi|7                          :            AAC-ATTTA-T-TTTAAA-T-A---TA----C-GCCT-A--AA-G--T---T---A-A---G------G--T-----TT-A--T---C-------AG--T-------T-A---G----T-A-TT------GC-GACCG---------A-T----AA-G--------ATA-T--T----G--C-GG-C--ACGCAA-G-T----A------G----A--------C-C------GCG--A-A-A-T-T--G-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--GT-T-G-------AA---A----A---T---A-A-C-----A-----C---T---T--T-----T-G-T--------TC--A---T---T---T-T-T-TCAA---A-C-----------A-C-T----GCT--G-A--A--A----A----A----TA-A-------A-C-A-----A--A----T------T------C-T----A---T--T----------C-AA------------------------CGC-G--AAT--------T------------AAA--T---T-T---C--A-A--T-AT-T----------TC--ACTGAC-TGGAAA-AA-TG-TAAta
gi|18                         :            AAC-ATTTA-G-T--TAA-G-A---TA-A--C-G--T-A--AA-G--TTTTC---AGA---G------G--T-----A--A--T---CG------A---T-------T-A---G----T-A-T-------GC-G-------------A-T----A--G--------ATA-A--G----G--C-GG-C--A----A-G-TT---A------G----A--------C--------G-G--A-A-G-T-T--G-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--G--T-G-------GA---A----A---A---G-A-C-----A-----C---T---T--T-----T-A----------T---A---T---T---T-T-T-C------A-C-----------A-C-T----G-T--GAA--A--A----A----A----T--A-------A-C-A-----A--AT---T------T------T-T----A---C--C----------T-AA------------------------CG--G--A----------T-------------AA--T---T-T---C--A-AG-T-AT-T----------TC--ACTG-C-T--TAA-AA-TGttaa
gi|34                         :            AAC-ATTTA-T-T--AAA-T-A---TA-A--C-G--T-A--AA-A--G---T---A-A---G------G--T-----C--A--T---C-------A---T-------T-A---G----T-A-CT------GC-A---G---------A-T----A--G--------AAA-T--T----G--C-GG-C--A----A-G-A----A------G----A--------C-C------G-G--A-C-A-T-T--G-----T--T---A---TGTTACT-T-------T-----C--A---C---A--C--T--G--T-G-------AA---A----A---T---A-A-T-----G-----C---T---T--T-----T-G-T--------T---A-------T---T-T-T-A------A-C-----------A-C--------T--G-A--A--A----A----A----T--A-----------------------------------------T----A---T--T----------C-AA------------------------CG--A--A----------T------------AAT--T---T-T---T--A-A--T-ta
gi|16                         :           gAAC-ATTTA-T-T--AAA-T-A---TA-A--CTG--T-A--AA--------T---A-A---G------G--T-----T--A--T---C-------A---TG------T-A---G----T-A-T----------G---G---------A-T----A-----------ATA-T--T-------C-GG-C--A----AAG-T----A------A----A--------C-C------C-G--A-A-A-T-T---------------A---T-----T-T-------T-----C--T---C---C--C--T--G--TTG-------AA---A----A---T---A-A-C-----A-----C---T---T--T-----T-G----------T---A---T---T---T-T-T-C------ACC-----------A-C-T------T--C-A--A--A----A----ATTACT--A-------A-C-AT----A--A----T------T------T-T----A---T--T----------C-AA------------------------CG--G--A----------T-------------AA--T---T-TCA-C--A-A--T-A--T----------TC--ACTG-C-T--GAACAA-TG-TAA
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gi|11                         :           gAAC-ATTTT-A-T--AAA-T-A---TA-A--G-A--G-A--AA-A--T---T---C-A---G------G--TT----A--G--T---C-------A---T-------T-A---GG---T-A-TT------GC-G---T---------A-G----A--G--------ATA-T--T----G--C-GG-CTAA----A-G-T----A------A----A--------C-C------G-G--AGA-A-T-A--G-----T--T---A---T-----TGT-------T-----C--T---C---AT-C--T--G--T-A-------AG---A----A---T---AGA-C-----A-----C---T---T--T-----T-G-T--------T---A---T---T---T-T-T-C--------C-------------C-T----G-T--G-A--A--A----A----AGT--T--AATT----A-C-A-----A--A----T------T------TCT----AT--T--T----------C-AATT----------------------C---G--A----------T------------AAA--A---T-T---C--A-AT-T-AT-T----------TC--ACTG-C-T--GAaccaa
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gi|2                          :         tagAAC-ATTTA-T-T--AAA-C-T---TA-AGAC-GACT-AGTAA-A--C---CTATA-A---G------G--T-----T--A--T---C-------A---T-------TCA---GA---T-A-TTCA----GC-G---G---------A-T----------------ATA-T--TTA--G--C-AG-C--A----A-G-T----A------ATAACA--------C-C------G-G--ACA-A-CAT--G-----G--T---G---T-----T-TGTATGGGT-----C--T---T---A--C--T--AGCT-G-------AG---ATA--A---TG--A-A-C-----A-----C---T---T--T-----T-G-T--------T-------T---T---T-T-T-C------A-C-----------A-C-T----G-T--A-G--A--A----A----A----T--ATAAAGGCA-C-A-----A--A----TCCA---T------C-T----AATCC--T----------C-AATGGGGATATACAAATTCTATTCAACG--G--A----------T------------ACA--T---T-T---C--A-A--T-AA-T----------TC--ACTG-C-T--GAA-AA-T
gi|1                          :           gAATCATTTA-T-G--AGA-TTA---TA-A--T-G--T-A--AA-A--T---C---A-A---G------G--T-----A--A--T---TCG-----A---TGAAGTGCT-A---T----T-A-TT------GC-G---GCGCTGCTACA-T----A--G--------GCA-T--TATGGG--C-GG-C--ATATGA-G-T----A------C-------------C-C------G-GTTA-G-G-T-T--G-----TGTT---A---T-----T-T-------TGTCCTC--T---T---A--T--T--T--T-GGTTGAATAA---A----G---T---A-A-C-----ATATCTC---T---TCTT-----T-G-T--------TCTAG---T---T---T-T-T-C------T-CG----------A-C-TCGACA-T--G-G--A--A----AGAAAA----T--A-------AAC-A-----C--A----T------G------T-T----G---C--CTAGTTCTCTAC-AA------------------------CG--G--AA---------T------------AAA--T---T-T---C--A-A--T-AT-T----------TC--ACTG-C----GAA-AA-TGataata
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gi|23                         :             AC-ATTTA-T-T--AAA-T-A---TA-A--C----T-A--AA----T---T---A-A---G------G--T-----T--A--T---C-------A---T-------T-A---G----T-AATT------GC-G---G---------A-T----TT-G--------A-A-T--T----G--C-G--T--A----A-G-T----A------G----A--------C-C------G-G--A-A-A-T-T--G-----T--TA--A---T-----T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--G--T-G-------AA---A----T---A---A-A-C-----A-----C-------T--T-----T-G-T--------T---A---T---T---T-T-T-C------A-C-----------A-C-T----G-T--G-A--A--A----A----A----T----------T-C-A-----A--A----T------T------C-TA---A---T--T----------C-AA------------------------CG--G--A----------T-------------AA--T---T-T---C--A-A--T-AT-T----------TC--ACTG-C-T--GAA-AA-TG-TAAca
gi|32                         :             AC-ATTTA-T----AAA-T-A---TA-A--C-G--T-A--AA----T---T---A-A---G------G--T-----T--A--T---C-------A---T-------T-A---G----T-A-T-------GC-G---G---------A-T----A--G--------ATA-T--T----G--C-TG-C--A----A-G------A------G----A--------C-C------G-G--A-A-G-T-T--G-----T--T---A---A-----T-T-------T-----C----------A--C--T--G--T-G-------AA---A----A---T---A-A-C-----A-----C---T---T--T-----T-G----------T---A---T---T---T-T-T-C------A-C-------------C-T----G-T--G-A--A--A----A----A----T--A-------A-C-A-----A--A-----------T------C-T----A---T--T----------C-AA------------------------AG--G-------------T------------AAA--T---T-T---C--A-A--T-A--T----------TC--ACTG-C-T--taa
gi|10                         :             AC-ATTTA-T-TT-AAA-T-A---TA-A--CCG--A-A--GA-A--T---T---A-A---AT-----G--T-----T--A--T---C-------A---TG------T-A---G----T-A-TT------GC-G---G---------A-T----AA-G--------ATA-T--TTTT-G--C-GG-C--A----A-G-T----A------A----A--------C-CC-----G-G--A-A-A-T-T--G-----TA-T---A---T-----T-T-------C-----CG-T---C---A--C--T--G--T-G-------AA---A----A---T---A---C-----AG----C---T---T--T-----T-G-T--------T---A---T---T---T-T-TTC------A-C-----------A-G-T----G-T--G-A--A--A----A----A----T--A-------A-C-A-----A--A----T------T------C-T----A---T--TG---------C-AA------------------------CG--GA-A----------TA-----------AAA--A---T-A---C--A-A--T-AT-T----------TCA-ACTG-C-T--GAA-AA-TG-TAA
gi|13                         :             AC-ATTTA-T-A--AAA-T-A---AA-A--CTG--T-A--AA-A--T---T---A-A---G------GGGT-----T--A--T---CGC-----A---T-------T-A---G----T-A-T-------GC-G---G---------A-T----GT-G--------ATA-T--G----G--C-GG-C--AT---A-G-T----T------A----A--------C-C------G-G--A-A-A-T-T--G-----T--TTG-A---T-----T-T-------T-----C--T-------A--C--T--G--T-G-------AA---A----A---T---A-A-C-----A-----C---T---G--T-----T-GCT--------T---A---T---T---T-T-T-CCA----A-CG----------A-CTT----G-T--G-A--AG-A----A----A----T--A-------A-C-A-----A--G----T------T------C-T----A---T--T----------C-GA------------------------AGTCG--A----------T------------A--------T-T---C--A-A--TCAT-T----------TCAAACTG-C-T--GAA-Ata
gi|25                         :             AC-ATTTA-T-T--GAA-T-A---TA-A--C-G--T-A--GA-A--T---T---A-A---G------G--T-----C--A--T---C-------A---T-------A-A---G----T-C-TT------TT-G---G---------A-T----A--A--------ATA-T--T----G--C-GG-T--A----A-G-T----G------G----A--------C-C------A-G--A-A-C-T-T--G-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--A--T-G-------AA---A----A---T---A-A-C-----A-----C----------T-----T-G-T--------T---A---T---T---T--------------C-----------A-C-C----GCT--G-A--A--A----AT---G----T--A-------A-T-A-----A--A----T----------------------------------------------------------------------G--A----------T------------ACA--T---T-T---C--T-A--C-AT-T----------Ttata
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gi|12                         :                  taa-T-T--AAA---A---TA-A--C-G--T-AG-AA-A--T---T---A-A---GTTATCAA--T-----A--A--T---T-------AACTT-------T-A---G----T-A-TT------GC-G---G---------A-TT---A--G--------ATA-T--T----G--C-GG-C--A----A---T----A------G----A--------C-C------G-G--A-G---T-T--G-----TG-T---A---T-----T-T-------T-----C--T---CCTCA--C--T--G--T-G-------AA---A----A---T---A-A-C-----A-----CTTTT---T--T-----T-G-T--------T---A---T---T---T-TCT-C------A-C-----------A-C-T----G-T--GAA--A--A----A----A----T--A-------T-CAA-----A--A----T------T------C-T----A---T--T----------C-AA------------------------CG--G--A----------T------------AAA--T---G-T---C--A-A--T-AT-TAG--------TC--ACTG-C-T--GAA-AG-T
gi|52                         :                    t-T-T--AAA-T-A---CC-T--C-G--T-G--AA-C--T---G---A-A---G------T--T-----G--A--T---C-----------T-------T-AT--G----T-A-TC------GC-G---G---------A-TTTATG--A--------ATA-T--T----G--C-GG-C--A----A-G-T----A------aat
gi|46                         :                            AA-T-A---TA-A--C-G--T-A--AA-A--T---T---A-A---G------G--T-----G--A--T---C-------A---T-------T-T---G----T-A-TT------GC-G---G---------A-T----A--T--------ATA-C--T----G--C-GG-C--A----A-A-T----A------A----A--------C-C------G-G--A-A-A-T-T--GTTTACT--T---A---T-----T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--G--T-G-------AA---A----A---T---A-A-C-----A-----C---T---T--attccggttgat
gi|46                         :                        acgtAA-T-A---TA-A--C-G--T-A--AA-A--T---T---A-A---G------G--T-----G--A--T---C-------A---T-------T-T---G----T-A-TT------GC-G---G---------A-T----A--T--------ATA-C--T----G--C-GG-C--A----A-A-T----A------A----A--------C-C------G-G--A-A-A-T-T--G-----T-----------------------------------T---T---A--C--T-------------------------------------------------------------------------------T---A---T---T---T-T---C------T-C-----------A-C-T----G-T--G----A--A----A----A----T--A-------A-C-A-----
gi|9                          :                        acgtAA-T-T---TA-A--C-G--T-A--AA-A--T---T---A-A---G------G--T-----G--A--T---C-----------T-------T-----G----T-A-TT------GG-C---G---------A-T----A--TT-------ATA-C--T----G--C-GG-C--A----A-A-T----A------A----A--------C-C------G-G--A-A---T-T--G-----T--TT--A---C-----T-TATT----T-----C--T---C---A--C--T--G--TTG-------AA---A----A---T---A-A-C-----A-----C---T---T--T-----T-A-T--------T---A---T---T---T-T-T-C------A-C-----------A-C-T----G-T--G-A--A--A----A----AT---T--A-------A-C-ACTTTTATTA----T------T------T-TTCACA---C--TGGAAAA----T-AA------------------------CA--A--A----------TTCTATTCAACGGAAAAAT---T-T---C--A-A--T-AT-T----------TC---CTG-C-T--AAA-Actt
gi|28                         :                             A-T-A---TA-T--C-G--T-A--AA-T--T---------A---T------A--T-----T--A--T---C-------A---T-------T-A---G----T-A-TT------GC-G---G---------ACT----A--G--------ATA-T--T----G--C--------------------------------------------C------G-G--A-A-G-T-T--G-----T--T---A---T-----T-T-------T-----T--T---C---AAAC--T--G--T-G-------AA---A----A---T---A-A-C-----AACT--T---T---T--T-----T-G-T--------T---A---T---T---T-T-TTC------A-C-----------A-C-T----G-T--T-A--A--A----A----T----T--A-------A-C-A-----AT-A----T------T------T-T----A---C--T----------C-AA------------------------CG--G--AA---------T------------AAA--T---T-T---T--C-A--T-AT-T----------TC--ACTG-C-T--AAA-AA-tgtata
gi|30                         :                            gA-T-A---TA-A--C-G--T-A--AA-A--C---C---A-AC--G------G--T-----A-----T---C-------A---TG------T-A---G----T-A-TT------GC-G---G---------A-T----A--G---------TA-T--T----G--C-GG-C--A------G-T----A------G----A--------C-C------G-AC-A-A-ACT-T--G-----T--T---A---T-----T-G-------------C--T---C---A--C--T--G--TTG-------AA---A----A---T---A-A-C-----A-------------T--T-----T-G-G--------T---G---T---T---T-T-T-C------A-C-----------AAC-T----G------A--A--A----A----A----T--A-------A-C-A-----A--A----T------T------G-T----A---C--T----------C--A------------------------CG--G--A----------T------------AA-------T-T---CATA-A--T-AT-C---------------CTG-C-T--AAA-Aaatgtaata
gi|27                         :                          catt-T-A---TACA--T-G--T-A--AA-AGAT---G---A-A---T------T--T-----G--A--T---C-------A---T-------G-T---G----T-A-TC------AC-T---G---------A-T----G--A--------ATA-T--T----C--A-GG-C--A----A-T-TCATTA------G----A--------T-C------T-A--T-A-G-T-T--G-----T--T---A---A-----T-TA------C-----C--TACAC---A--C--T--G--C-G-------AA---A----A---T---A-T-C-----A-----G---T---T--T-----T-G-T--------T-------------------T-C------A-C-----------A-G-T----G-T--G-A--A--A----A---------T--G---------T-A-----A--A----T------T------TAT----A---T--T----------C-AA------------------------TG--G--A----------T------------AAA--T---T-A---C--T-G--T-AT-T----------TC--ACTG-T-T--TAA-AA-CGCtaat
gi|39                         :                               g-A---TA-A--C-G--T-A--AA-A--G---G---A-A---G------A--T-----G--A--T---T-----------T-------T-AT--G----C-A-TT------GT-G---G---------AAT----G--A--------ATA-T--T----A--C-GA-C--A----A-G---------------------------------------------G-T-T--G-----T--T---A---TA----T-T-------T-----T--T-------------------------------------------------A-C-----G-----C---T---T--C-----T-GGT--------T---A---C---A---C-A-T-C------A-------------A-C-G----G-T--G-A--A--A----A----A-------A-------A-T-A-----A--A----T------T------T------A---T--T----------C-AG------------------------TT--G--A----------T------------AGA--T---T-T---T--A-G--A-AT-T----------TC--ACTG-T-T--GAA-AA-TGg
gi|59                         :                                  ---TA-A--T-G--T-A--AA-A--T---G---A-C---A------G--T-----G--ACTT---C-------A---T-------------G----T-A-TC------GC-G---A---------A-T----G--A--------ATA-T--T----G--C-GA----G----A-G-T----A------G----
gi|29                         :                                      A-A--C-G--T-A--GA----T---T---A-A---G------G--T-----T--A--T---C-------A---T-------T-A---G----T-A-CT------GC-G---G---------A-T----T--AT-------ATA-T--T----G--C-GG-C--A----A-G-T----A------A----A--------C-C------G-G--A-A---T-T--G-----T--T---A---T-----T-T-------T-----CCCT---C---A--C--T--G--T-G-------AA---A----A---T---A-A-C-----A-----C---T---T--T-------G-T--------T---A---T---T---T-T-T-CC-----A-C-----------C-C-T----G-T--G-A--A--A----A----A----T--A-------AAC-A-----A--A----T------T------C-T----A---T--T----------C-AA------------------------CG--G--A----------T------------AAA--T---T-T---C--A-A--T-AT-T----------TC--ACTG-C-T--GAA-AA-TG-TAAtcacggttg
gi|64                         :                                                                ---A-A---G------G--T-----T--A--T---C-------A---T-------T-A---G----T-A-TT------GC-G---G---------A-T----T--G--------ATA-A--T----G--C-AG-C--A----A-G-T----A------T----A--------C-C------G-G--
gi|42                         :                                                                                t--T-----A--A--T---C-------A---T-------T-A---G----T-A-TC------GT-G---T---------A-T----A--A--------ATA-T--T----T--C-GG-C--A----A-T-T----A------G----T--------CAA------G-G--G-A-A-T-C--G-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--A---C---A--T--T--G--T-G-------AA---A----T---T---T-A-C-----A--------------------------T--------C---A---A---T---T------------------------------T----G-T--G----------------------------------------------------------T------T-T----A--------------------A------------------------CG--G--A----------T------------GAA--T---T-T---C--A-A--T-AT-T----------TC--AATG-C-T--GAA-AA-TGC
gi|22                         :                                                                                                                                        ------GC-A---G---------A-G----A--A--------ATA-T--T----G-----A-C--A----A-G-T----A------T----C--------C-CTTAAATA-G--A-A-G-T-C--G-----T--T---A---T-----T-T-------T--------T---C---A--CAGT--G--T-G-------AA---A----AA--T---A-A-C-----A-----A---A---A--G-----T-G-T--------T---A---T---T---T---T-C------A-C-----------A--------G-T--G-A--GT-A----A----A----T--A-------A-C-A-----A--T----TTCCGG-T------T-T----A---C--TTG--------C-AG------------------------C---A--A----------T------------ATA--T---A-T---C--A-aata
gi|17                         :                                                                                            atttattgaatataacgtaaaattaaggtcatcattagtattgc------GC-A---G---------A-G----A--A--------ATA-T--T----G-----A-C--A----A-G-T----ATCCCTTG----A--------A-T------A-G--A-A-A-G-TCCG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----T--T---C---A--CAGT--G--T-GAA-----AA---A----A---T---A-A-CAA---A-----A---A---G--T-----G-G-T--------T---A-------T---T-T-C-C------A-C-----------A--------G-T--G-G--AGTA----A----A----T--A-----------A-----A--A----T------T------T-tgaaaatgtaataa
gi|38                         :                                                                     catttatgaatataacgtaaaaattaatggtcatcatttagtattgctgataatatattgctgcagtaaaaccgg-G---G---------A-T----A--G--------ATA-T--T----G--C-GG-C--A----A-G-T----A------A----A--------CGC------G-G--A-A-A-T-T--GG----T--T---A---T-----A-T-------T-----C--T---CG--A--C--T--G--T-G-------AAT--A----A---T---A-A-C-----A-----T---C---T--T-----T-G-T--------C---A---T---T---T-TTT-C------A-C-----------A-C-T----G-T--G-A--A--A----A----A----T--A-------A-C-A-----A--A----T------T------C-T----A---T--T----------C-AA------------------------CG--G--A----------T------------AAA--C---T-T---C--A-A--T-AT-T----------TC--ACCG-C-T--GAA-AA-TG-TAAtgaaaatg
gi|43                         :                                                                                                                                                      ---------A-T----G--G--------A-A-T--T----GGAT-AA-C--A----A-G-T----A------GT---C--------C-C------G-G--------T-T--A-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--A---T---A--C--T--G--T-G-------AA---A----A---T---A-A-C-----A------------------------------------------------------------------------------A-C-T----G-T--T----A--A----A----A----T--A-------T-C-AAT---A--A----T------T------T-T----A---T--T----------C-AA------------------------CG--G--A----------T------------AAA--T---T-T---C--ta
gi|28                         :                                                                                                                                                                                 gcTA-T--T----C--C-GT-T--G----A-G-T----A------A----A----------------------A-T-A-T-T--G-----T--T---AA--T-----T-T-------T-----A--A---C---A--G--T--G--T-G-------AA---A----AAA-T---A-A-C-----A-----A---AAAAG--T-----T-G-T--------T---A---T---T---T---T-C------A-C-----------A-G-T----T-T--GAA--A--A----A----A----T--A-------A-C-A-----A--C----T------T------gctctgaaaatgtattagat
gi|31                         :                                                                                                                                gatatatcgtaaattatattatcattagtattgcggactagatattgccggTA-T--T----G--T-G--C--A----A-A-T----T------G----T--------C-C------C------A-G-T-T--G-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--A---C---G--C--T--G--A-A-------AA---A----AA--T---A-A-------A-----C---T---T--G-------G-T--------T---A---C---T---T-----C------A-C-----------A-C-T----G-T--G-A--A--G----G----A----T--A-------C-C-A-----AT-T----T------T------T-T----A---T--TC---------C-AG------------------------TG--G--A----------T------------ACA--T---T-T---C--A-A--T-AT-T----------TTAAACTG-T-T--GAA-AA-Taattttcatatttcactgctaaaaaaatgtaata
gi|69                         :                                                                                                                                                              aacatgaaaattaattatttaaaatgtattttg--C-GG-C--A----A-G-T----A------G----A--------C-C------G-G--A-A-A-T-T--G-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--T---C---A--atgataaa
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gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                      -G--A-A-T-T-T--G-----T--T---A---T-----T-T-------T-----T--T---C---A--CAGT--G--T-GA------AA---A----A---T---A-A-C-----AAAAAG-----------------T-G-T--------T---A---T---T---T------------A-C-----------A--------G-T--A-AG-A--A----A----A----T--A-------A-C-------A--A----T------T------T-
gi|38                         :                                                                                                                                                                           acatttaattaaatataacgtaaaattaaggttatcattagtattgcggatagatattgcggcaagtagaccggg-G--A-A-T-T-T--G-----T--T---A---T-----T-T-------T--------T---C---A--CAGT--G--T-G-------AA---A----AAA-T---G-A-C-----A-----A---A---G--A-----T-G-T--------T---A---T---T---A-T-T-C------A-C-----------A--------G-TC-G-A--G--A----AT---A----T--A-------A-C-C-----A--A----T------T------T-tattcaaaggataattatttcactgctgaaaatgtaaca
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                          ggatagatattgcggcaagtaaacgcgg-G--A-A-T-T-T--G-----T--T---A---T-----T-T-------T-----T--CAAAC---A--G--T--G--T-G-------AA---A----A---CGGAA-A-C-----A-----A---A---A--T-------G-T--------T---A---T---G---T-T-T-C------A-C-----------A--------G-T--G-AG-A--A----A----A----T--A-------A-C-A-----A--tattcaacggataaacttcaatatttcaccgctgaaaatgtaata
gi|10                         :                                                                                                                                                                       tttatctataaatcaagtaaaaattaaagagttatcattagcattgcggatagatatgcggcaggctaaacgcggaaca-G--A-A-T-T-T--G-----T--T---AT--T-----T-T-------T-----C--A---C---A--C--T--G--T-GAA-----AA---A----A---T---A-A-C-----AAAAG-C----------------T-G----------T---A-------T---T-T-T-C------A-C-----------A--------G-T--G-ACGG--A----A----A----T--AT------A-C-A-----A--T----TTCCGGGT------T-T----A---C--T----------T-GC------------------------CG--C--A----------A------------AAA--T---A-T---C--tattcaaaggataactttcagtatttcactgctaaaactgttataaa
gi|9                          :                                                                                                                                                                                              acatttatttaaatataaccgaagaattaaatgttatcatgtagtattgcggataa-G--A-A-T-T-T--G-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C------C---A--G--T--G--T-G-------AA---A----AA--T---A-A-T-----A-----A---A---A--G-----T-G-T--------T---AA--T---T---T-T-T-C------A-C-----------A-G-T----G-T--G-A--A--A----A----A----T--A-------A-T-A-----A--AAG--T------G------T-T----ATT-T--T----------C-AA------------------------CA--G--tattgcaacggaataaaaatacaatatttcaactgctgaaaatgtaata
gi|21                         :                                                                                                                                                                      aatttaacgtaaaattaaggtgatcttgtattggcgatattatactgcggcaaataaaccggaattgtttacttatttctca--A-A-G-T-T--G-----T--T---A---T-----T-T-------G--------T---C---A--G--T--G--T-G-------AAT--A----A---T---A-A-C-----A-----A---A---A--G-----T-G-T--------T---A---T---T---T-T-C-C--------C-----------A-G-T----G----G-G--A--A----A----A----T--A-------A-C-------A--A----T------T------T-tattcaacggaaaaatttcaatatttcctgctaaaatgtata
gi|19                         :                                                                                                                                                                              aatatttattaaatataacgtaaaattaaggtaatcattagtattgcggatggatattgcggcaagtagaccgg--A-A-T-T-T--G-----T--T---A---T-----T-T-------T--------T---C---A--G--T--G--T-GTGA----AA---A----A---T---A-A-C-----A-----A---G---T----------G-T--------T---A---T---T---T---T-C------A-C-----------A--------G-T--G-AG-A--A----A----A----T--A-------A-C-------A--A----T------T------T-ttacgcaacggataaatttcaatatttcactgctaaaaatgtaata
gi|18                         :                                                                                                                                                                                 atttattaaatataacgtaaaatcaaggtaatcattggtattgcggattgatttagcggcaagtagaccgg--A-A-A-T-TT-G-----T--T---A---T-----T-T-------T-----T--T---C---A--CAGT--G--T-G-------AA---A----AATAT---A-A-A-----A-----G---T--------------G-T--------C-------T---T---T-T-C-C------A-C-----------A--------G-T--G-AG-A--A----A----A----T--A-------A-C-A-----A--C----T------T------aatttgactcaacggataaatttcaatatttcactgctaaaaatgtaataa
gi|35                         :                                                                                                                                                                           aacatttagttaagataacgtaaagttttcagaggtaatcgattagtatgcgatagataaggcggcaagttagacgg--A-A-A-G-T--G-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--A---C---A--G--T--G--A-G-------AA---A----A---T---A-A-C-----A-----A---T---T--T-----ttacctaacggataatttcaagtatttcactgcttaaaatgta
gi|30                         :                                                                                                                                                                                     catttattaaataatagtaattaaggttatcattagtatgcggctagatattgcggcaagtagacgg--A-A-T-T-T--G-----T--T---A---T-----T-T-------T--------T---C---AG-T--T--G--T-G-------AA---A------------A-A-C-----A-----C---CA--A--A-----T-G-T--------T---A---T---T---T-T-C-A------A-C-----------A--------G-T--G-A--G--C----A----A----T--A-------A-C-A-----A--G----T------T------T-tttatttttcacgttgttgaaaataaaaaaaaattcactgaataaatttcatgctgaa
gi|40                         :                                                                                                                                                                                      cattatataacgtaaaaccaacggtatcatgtagtattgcggatagtattgcggcagtagaccgac--A-A-A-T-TT-G-----T--T---A---T-----T-T-------T-----T--CAG-C---A--G--T--G--T-G-------AA---A----AAA-T---A-T-C-----A-----A---A---A--G-----T-G-T--------T---A---C---T---T-T-T-C------A-C-----------A--------G-T--G-A--G--A----A----AT---T--A-------A-C-A-----A--------------T------T-T----C---CG-T----------C-AA------------------------Cgtactcacggataattcataatatcctgctaaaataat
gi|43                         :                                                                                                                                                                                               gaacattagttaaataaacgtaaaatcaaaggtatcatgtaggggatatatattgcggca-A-G-T-T--G-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--A---C---A--G--T--A--T-G-------AA---A----A---T---A-A-T-----A-----accaa
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                               gcatggaattggataacaagtagtcccggt-A-T-T--G-----T------A---T-----T-T-------T-----T--A---T---T--C--C--G--T-T-------GC---A----A---T---A-G-A-----A-------------T--T-----T-G-T--------T---A---T---T---T-T-T-C------A-C-----------A-C-T----G-T--G-AA-A--A----A----A----T--A-------A-C-A-----A--A----gttaaaatatcaataattttattcaacggataaatttcgctctgaaaatgtattagat
gi|25                         :                                                                                                                                          acatttatttaaatataaccgaagaattaaatgttatcatgtagtattgcggataagatatttttgcggcaagtaaacccggaaattgtatatttccgtcactgtgaaaatacagct-T-T--A-----T--T---A---C-----A-T-------T-----T--T---C---AG-C--G--G--T-G-------AA---A--------T---A-A-C-----A-----A---G---T----------G-T--------T---A---T---T---T-T---C------A-T-----------A--------G-T--G-AG-A--A----A----A----T--A-------A-C-A-----A--G----T------T------C-T----G---G--T----------C-CA------------------------Catttcaactgctgaaaatgtaata
gi|60                         :                                                                                                                                                                                              cacatttattgaatataacgtagaattaaggtcatcataagtcttttggataaatattgcggtaa-T-T--G-----T--C---A---T-----T-T-------T-----C--A---C---G--T--C--G----G-------AA---A----A---T---A-A-C-----A-----G---G---T----------G-T--------T---A---T---T---T-T---C------T-C-----------A-G-T----G-T----A--A--A----A----A----T--A-------A-C-A-----atgatacatttctacatttttaattaatagtatgcacattataaatgta
gi|45                         :                                                                                                                                                                                                                                                                 -T--G-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--A---C---A--G--T--G--A-G-------AA---A----A---T---A-A-C-----A-----A---T---T--T-----gtatt
gi|60                         :                                                                                                                                                                                       tcattcattagatataacgtaaaattaaggttatcattagtaattgcggattgatattgcggcaagtagaccgg-T--G-----T--T---A---T-----T-T-------T-----T--A---C---A--C--T--G--A-G-------AA---A----A---T---A-A-C-----A-----C----------C-----T-G-T--------T---A---T---T---T-T-C-C------G-------------A-C------G-T--G----A--A----A----A----T--G-------A-C-A-----A--G----T------A------T-T----c
gi|54                         :                                                                                                                                                                                                                                                                               ---A---T-----T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--G--T-G-------AA---A----A---T---A-A-C-----A-----C---T---T--T-----T-T-T--------C---AGGTC---T---T-T-T-C------A-C-----------A-C-T----G-T--G-A--A--A----A----A----
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ---C---A--T--T--G--T-G-------AA---A----A---T---A-A-C-----A-----------------AAAGAT-G-T--------T---A---T---T---T-T-C-C------A-C-----------T-G-T----G-A--G-A--A--A----A----A----T--A-------A-agggtatatacatgta
gi|47                         :                                                                                                                                                                                               aaaatgtattagatacgtatgcaataaaacgtagaaaattagtccggaatctcataacattagtaattcaaaaagcggccgagaatagatattggtggcaagataaggaaagtccatccggaaa--T--G--T-G-------AA---A--------T---A-A-C-----A-----C---C---A--C-----T------------T---A---T---T---T-T-T-CACGTTAA-C-----------A-C-C----A-T--T-G--A--A----T----A----T--A-------A-T----------A----T------C------T-T----A---CGTT----------C-AA------------------------CA--G--A----------T------------ACC--T---T-G---C--A-A--C-AT-T----------TT--ACTG-C-T--GAA-Atatgtaaactagagtgaaaaaataataacaagatttaatttaaacgaatcaaaattttacatatttcactgctgaaaatgtaca
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ---T---T--T-----T-G-A--------T---A---T---T---TTT-T-C------A-C-----------A-G-T----G-T--G-AG-A--A----A----A----T--A-------A-C-A-----A--A----gcgtaataaacaa
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                             tttaaaataacgtagaaattaagttatcaataattaactttagtattgcggattagatattgcggcaatagaccggagttgtgtattttctcctcactgtgaaaataacactttt---T---T--T-----T-C-T--------T---A---T---T---T-T-C-C------A-C-----------A-G-T----G-T--G----A--A----A----A----T--A-------A-C-------A--A----T------T------T-ttctattcaacggataaatgtcaatattagtcactgctgaaagtaat
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                          aacatttattaaatataacgtaaacttattatcatcattagttttgtggatagatattgcgacaagtagaccgg---T--T-----T-G-T--------T---A---T---T---T-T-TTC------A-C-----------A-G-T----G-T--G-A--A--A----A----A----T--A-------A-C-A-----A--A----aatattcaacggataaattttaatatttcactgttcaaaatgtaataa
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                         acatttaattaaatataacgtaaaattaaggttatcattagtattgcggatagatattgcggcaagtagaccgggaaattgttattttcttactgtaaataacactt---T--T-----T-G-T--------TT--A---T---T---T-T-T-C------A-C-----------A-G-G----G-TG-G-A--A--A----A----A----T--A-------A-C-A-----A--A----ttctattcaaaggataattatttcactgctgaaaatgtaaca
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                         aacgtagattaaggttatcattagtactgcggattatatattgcggcaagtaaaccggaattgttattttccctcactgtgaaaataacac---T--T-----T-G-T--------T---A---T---T---T-T-T-C------A-C-----------A---G----G-T--G-A--A--A----A----A----T----------A-C-A-----A--A----ttctattcaacggataaatttcaatatttcactgctgaaaatgtaa
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                acatttataaatataacgtaaattaaggttatcattagtatgcggatagatattgctgcaagagaccggaagttgttaatttcactgtgaaaataacact---T--T-----T-G-T--------T---A---T---T---T-T-T-C------A-C-----------A-G-T----G-T--GAA--A--A----A----A----T--G-------A-C-A-----A--AGATGT------TA-----T-T----A---T--T----------C-Atctattcaaaggtaaatttcaatattcactgct
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ggatagatattgcggcaagtaaacgcggaaattggttatattctcgactg---T--T-----T-G-T--------T---A---T---T---T-T-T-C------A-------------G-T-T----G-T--G-A--A--A----A----A----C--A-------C-C-A-----A--A----T------G------T-T----ATT-T--T----------C-AA------------------------CA--G--ttctattcaacggataaacttcaatatttcaccgctgaaaatgtaata
gi|45                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                     cattatataacgtaaaaccaacggtatcatgtagtattgcggatagtattgcggcagtagaccgacaaacttgttattgctca--T-----T-G-T--------T---A---T---T---T-T---C------T-C-----------A-C-T----G-T--G----A--A----A----A----T--A-------A-C-A-----ttgtactcacggataattcataatatcctgctaaaataat
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                           tcattcattagatataacgtaaaattaaggttatcattagtaattgcggattgatattgcggcaagtagaccggaaa--T-----T-G-T--------T---A---T---T---T-T-T-C------T-C-----------A-C-T----G-T--G-A--A--A-------------------------------------------T------T------C-T----A---T--T----------C-AA------------------------CG--G--A----------T------------AAA--T---T-T---C--A-A--T-AT-T----------TC--ACTG-C-TG-GAA-AA-TG-TAAc
gi|44                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 gaatttattaaattataacgtaaaattaaggttatcattagtatcgcggattgatattgggcaatagaccggaa-----T-G-T--------T---A---T---T---T-T-T-C------A-C-----------A--------G-T--G-AG-A--A----A----A----T--A-------A-C-------A--A----T------T------T-T----tt
gi|50                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    aacaatttattaaatataacgtaaaatcaaggtaatcattagtaattgcggatagatattgcgggcaagtagaccgg-G-T--------C---A---T---G---T-T-T--------A-C-----------A-C-C----A-T--GTC--A--A----A----A----T--T-------A-T-A-----A--A----G------C------TGT----A---C--T----------C-AA------------------------TG--T--A----------T------------AAA--T---T-T---C--A-G--T-AT-T----------TC--ACTG-T-T--TAC-AA-CGCTAct
gi|61                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   -T--------T---A---T---T---T-A-T-T------A-C-----------A-G-T----G-T--G-A--A--A----A----A----T--A-------A-C-A-----A--A----
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      cggaagttgttattttctcactgtgaacact--------T---A---TA--T---T-T-T-C------A-T-----------A-T-T----G-T--G-A--A--A----A----A----T--A-------A-C-A-----A--
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    aaatttattatatatatcgtaaaatgaaggtgatcttatgtattgcggatgaatatcgcggcaagtagtttcgg---A---T---T---T-T-T-C------A-C-----------A-G-T----G-T--G-A--A--A----A----A----T--A-------A-C-A-----A--A----tctatgaaaatatgaatttgatggataaatttcagtattggaatgttcaaaatataataaa
gi|58                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     acatttattaaatataactaaattaaggttatcattagtaattgcggatttgaattgcgtaagtagaccggaaattgttaattttctcactgtgaaataaacac-----------A-C-T----G-T--G-A--A--A----A----A----T--A-------A-C-A-----A--A----T------T------C-T----A---T--T----------C-AA------------------------CG--G--A----------T------------AAA--T---T-T---C--A-A--T-AT-T----------TC--ACTG-C-T--GAA-AA-TG-TAAtcaaattctaattcaacggataatttcaatatttcactgctgaaaatgtaataa
gi|57                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         --A--A----A----A----T--A-------A-----------------T------T------T-A----A---T--T----------C-A-------------------------TG--G--A----------T------------GAG--T---T-T---C--A-G--T-AT-T----------TC--ACTG-A-A--GAA-AA-TG-TAAta
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4 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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Reference ( family-2116 )     :                       AACA-T-T---TA-T---T--AAA-T-A---TA-A--C-G--T-A--AA-A--T---T----A-A---G-G----TN---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-A-TT------GC-G---G---------A--T--A-G-ATA-T---T----G-C-GGC--A----A-G-T----A--G----A--------C-C-G-G--A-A-A-T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--G--T-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-T--T--T-T---G-T--------T---A---T---T---TT-T-C---AC-----------A-C-T----G-T--G-AA-A----A----------A--T----A-------A---C-A--------A--A-T---T--T-T--A---T-------T-C-AA--CG--G------------------------A--T--AAA-T---T-T---C--A-A--T-AT-T----------TC--ACTG-CT--G--A--A-AATG-TAA
gi|1                          :                         CA-T-T---TA-T---G--AGA-TTA---TA-A--T-G--T-A--AA-A--T---C----A-A---G-G----TA---------A--T---TCGA----------TGAAGTGCT-A----T----T-A-TT------GC-G---GCGCTGCTACA--T--A-G-GCA-T---TATGGG-C-GGC--ATATGA-G-T----A--C-------------C-C-G-GTTA-G-G-T-TG-----TGTT---A---T-----T-T-------TGTCCTC--T---T---A--T--T--T--T-GGTTGAATAA---A----G--T--A-A-C-----ATATCTC-T--TCTT-T---G-T--------TCTAG---T---T---TT-T-C---TCG----------A-C-TCGACA-T--G-GA-A----AGAAA------A--T----A-------AACAC-ATGTTGCCTA--G-T---T--C-T--C---T-------A-C-AA--CG--G------------------------AA-T--AAA-T---T-T---C--A-A--T-AT-T----------TC--ACTG-C---G--A--A-AATG-
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gi|13                         :                       tACA-T-T---TA-T---A--AAA-T-A---AA-A--CTG--T-A--AA-A--T---T----A-A---G-GGG--TT---------A--T---CGCA----------T-------T-A----G----T-A-T-------GC-G---G---------A--T--GTG-ATA-T---G----G-C-GGC--AT---A-G-T----T--A----A--------C-C-G-G--A-A-A-T-TG-----T--TTG-A---T-----T-T-------T-----C--T-------A--C--T--G--T-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-T--G--T-T---GCT--------T---A---T---T---TT-T-CCA-ACG----------A-CTT----G-T--G-AAGA----A----------A--T----A-------A---C-A--------A--G-T---T--C-T--A---T-------T-C-GA--AGTCG------------------------A--T--A-------T-T---C--A-A--TCAT-T----------TCAAACTG-CT--G--A--A-At
gi|14                         :                           -T-T---TA-TCTAT--AAA-T-----CA-A----G--T-A--AA-AA-T---T----A-A---A-GAG--TT---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----C-A-TT------GC-G---G---------A--T--A-G-ATA-T--------G-C-GGC--A----G-GCT----A--A----A--------CGC-G-G--A-ACA-T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--G--T-G-------AA---AC---A--T--A-A-C-----A-------T--T--T-T---G-T--------T-------TCCGT---TT-T-C---AC-----------A-C-T----G-TTTG-AA-A----A----------A--T----A-------A---C-A--------A--A-T---T--C-T--A---T-------T-C-AA--AG--G------------------------A--T--AAC-T---T-T---C--A-G--T-AT-T----------TC--ACTG-CT--A--A--A-ACTG-tata
gi|15                         :                                   A-T---T--AAA-TTA---TA-A--C-G--T-A--AA-G--T--------A-A---G-G----TT---------A--T---C--AC---------T-------T-A----G----TCA-TT------GC-G---G---------T--T--A-G-CTAAT---T----G-C-TGT--A----A-G-T----C--A----A--------A-C-GTG--A-A-A-T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------TATT--C--T---C---A--C--T--G--T-T-------GA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-C--T--C-----G-T--------T---A---T---T---TT-G-C---AC-----------A-T-C----G-T--GTGA-A----A----------A--T----A-------G---C-CC-------A--A-T---T--C-T--A---T-------G-C-AA--TG--G------------------------A--T--AAA-T---T-T---CCAA-A--T-AT-T----------TC--ACTG-CT--T--A--A-GAtataaa
gi|16                         :                    taaAACA-T-T---TA-T---T--AAA-T-A---TA-A--CTG--T-A--AA--------T----A-A---G-G----TT---------A--T---C--A----------TG------T-A----G----T-A-T----------G---G---------A--T--A---ATA-T---T------C-GGC--A----AAG-T----A--A----A--------C-C-C-G--A-A-A-T-T-------------A---T-----T-T-------T-----C--T---C---C--C--T--G--TTG-------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-T--T--T-T---G-T------------A---T---T---TT-T-C---ACC----------A-C-T------T--C-AA-A----A----------A--TTACTA-------A---C-AT-------A--A-T---T--T-T--A---T-------T-C-AA--CG--G------------------------A--T---AA-T---T-TCA-C--A-A--T-A--T----------TC--ACTG-CT--G--A--ACAATG-TAAattactaa
gi|17                         :                        gCA-T-T---TA-T------GAA-T-A---TA-A--C-G--T-A--AA-AA-T---T----A-AT--G-G----TC---------A--T---C--A----------T-------TTA----G----T-A-TT------GC-T---G---------A--T--A-ATATA-T---T----G-C-TGC--A------G-T----A--A----AA-------C-C-G-G--A-A-A-T-T------T--T---A---T-----T-T-------A-----C--T---CC--A--C--T--G--T-G-------GA---A----A--T--A-A-CC----A-----C-T--T--T-TT--G-T--------T---A---T---T---TT-TTC---AC-----------A-C-T----G-T--G-AA-A----A----------AA-T----A-------A---C-G--------G--A-C---T--T-TCTA---T-------T-C-AA--GG--G------------------------A--T--ACT-T---G-T---C--A-A--T-AT-T----------TC--TCTG-CT--G--A--A-AATG-taaa
gi|18                         :                       AACA-T-T---TA-G---T--TAA-G-A---TA-A--C-G--T-A--AA-G--T---TTTCAG-A---G-G----TA---------A--T---CG-A----------T-------T-A----G----T-A-T-------GC-G-------------A--T--A-G-ATA-A---G----G-C-GGC--A----A-G-TT---A--G----A--------C---G-G--A-A-G-T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--G--T-G-------GA---A----A--A--G-A-C-----A-----C-T--T--T-T---A----------T---A---T---T---TT-T-C---AC-----------A-C-T----G-T--GAAA-A----A----------A--T----A-------A---C-A--------A--ATT---T--T-T--A---C-------C-T-AA--CG--G------------------------A--T---AA-T---T-T---C--A-AG-T-AT-T----------TC--ACTG-CT--T--A--A-AATG-TA
gi|19                         :                          A-T-T---TA-T---T--AAA-T-A---TA-A--C-G--T-A--AA-A--T---C----A-A---G-G----TA---------A--T---C--A----------T-------T-G----G----T-A-TT------GC-G---G---------A--T--T-G-ATT-T---A----G-C-GGC--A----A-G-T----A--G----A--------C-C-G-G--A-A-A-T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--G--T-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-------T-T---G-T--------T---A---T---T---TT-T-C---AC-----------A-C-A----C-T--G-AA-A----A----------A--T----A-------A---C-A--------A--A-T---TAAT-TTGA---C-------T-C-AA--CG--G------------------------A--T--AAA-T---T-T---C--A-A--T-AT-T----------TC--ACTG-CT--A--A--A-AATG-TAA
gi|2                          :                       AACA-T-T---TA-T---T--AAA-C-T---TA-AGAC-GACT-AGTAA-A--CCTAT----A-A---G-G----TT---------A--T---C--A----------T-------TCA----GA---T-A-TTCA----GC-G---G---------A--T--A-T-ATT-T---A----G-C-AGC--A----A-G-T----A--ATAACA--------C-C-G-G--ACA-A-CATG-----G--T---G---T-----T-TGTATGGGT-----C--T---T---A--C--T--AGCT-G-------AG---ATA--A--TG-A-A-C-----A-----C-T--T--T-T---G-T--------T-------T---T---TT-T-C---AC-----------A-C-T----G-T--A-GA-A----A----------A--T----ATAAAGGCA---C-A--------A--A-TCCAT--C-T--AATCC-------T-C-AA--TG--GGGATATACAAATTCTATTCAACGGA--T--ACA-T---T-T---C--A-A--T-AA-T----------TC--ACTG-CT--G--A--A-AATA-TAAtaa
gi|20                         :                      gAATA-T-T---TA-T---T--AAA-T-A---TA-A--C-G--T-A--AA-A--T---C----A-A---G-G----TA---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-A-TT------GC-G---G---------A--T--G-G-ATA-T---T----G-C-GGC--A----A-G-T----A--G----A--------C-C-G-G--A-A-A-T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--G--T-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-T--T--T-T---G-T--------T---A---T---T---TT-T-C---AC-----------A-C-T----G-T--G-AA-A----A----------A--T----A-------A---C-A--------A--A-T---T--T-T--A---C-------T-C-AA--CG--G------------------------A--T--AAA-T---T-T---C--A-A--T-AT-T----------TC--ACTG-CT--A--A--A-AATGCTAAta
gi|21                         :                       AATA-T-T---TA-T---T--AAA-T-A---TA-A--C-G--T-A--AA-A--T---T----A-A---G-G----TA---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-A-TT------GC-G---G---------A--T--G-G-ATA-T---T----G-C-GGC--A----A-G-T----A--G----A--------C-C-G-G--A-A-A-T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--C---C---A--C--T--G--G-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-T--T--T-T---G-T--------T---A---T---T---AT-T-C---AC-----------A-C--------T--G-AC-A----A----------A--T----A-------A---C-A--------A--C-T---T--T-T--A---C-------G-C-AA--CG--G------------------------A--T--AAA-T---T-T---C--A-A--T-AT-T----------TC--ACTG-CT--A--A--A-AATG-TAA
gi|22                         :                          A-T-T---TA-T---T--GAA-T-A---TA-A--C-G--T-A--AA-A--T---T----A-A---G-G----TC---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-A-TT------GC-T---G---------A--T--A-T-ATA-T---T----G-C-TGC--A----A-G-T----A--A----A--------C-C-G-G--A-A-A-T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------A-----C--T---C---A--C--T--G--T-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-T--T--T-T---G-T--------T---A---T---T---TT-T-C---AC-----------A-C-T----G-T--G-AA-A----A----------A--T----A-------A---C-G--------A--C-T---T--C-T--A---T-------T-T-AA--GG--G------------------------A--T--ACT-T---G-T---C--A-A--T-AT-T----------TC--TCTG-CT--G--A--A-AATG-TAAta
gi|23                         :                        ACA-T-T---TA-T---T--AAA-T-A---TA-A--C----T-A--AA----T---T----A-A---G-G----TT---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-AATT------GC-G---G---------A--T--TTG-A-A-T---T----G-C-G-T--A----A-G-T----A--G----A--------C-C-G-G--A-A-A-T-TG-----T--TA--A---T-----T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--G--T-G-------AA---A----T--A--A-A-C-----A-----C----T--T-T---G-T--------T---A---T---T---TT-T-C---AC-----------A-C-T----G-T--G-AA-A----A----------A--T------------T---C-A--------A--A-T---T--C-TA-A---T-------T-C-AA--CG--G------------------------A--T---AA-T---T-T---C--A-A--T-AT-T----------TC--ACTG-CT--G--A--A-AATG-TAAtaa
gi|24                         :                       AACT-T-T---TACT---T--TAA-T-A----A-A--C-G--A-A--AC-A--T---T----A-A---G-G----TT---------A------C--A----------T-------T-A----G----T-A-TC------G----------------A--T--A-T--TA-T---T----G-C-G-C--AC---A-T-T----C--A----A--------C-C-G----A-A-A-T-TG-----T--T---A---------T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--G--T-C-------AAG--A----A--T--A-A-C-----A-----C-T--T--T-T---G-T--------T---A---T---T---TT-C-C------------------C-T----T-T--C-AA-A----A----------A--T----A-------G---C-A--------AG-A-T---T--C-T--A---T-------T-C-AAT-CG--GTA----------------------A--A--AAA-T---C-T--------A--T-AT-T----------TC--ACTT-CG--G--A--A-AAtaa
gi|25                         :                        ACA-T-T---TA-T---T--GAA-T-A---TA-A--C-G--T-A--GA-A--T---T----A-A---G-G----TC---------A--T---C--A----------T-------A-A----G----T-C-TT------TT-G---G---------A--T--A-A-ATA-T---T----G-C-GGT--A----A-G-T----G--G----A--------C-C-A-G--A-A-C-T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--A--T-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-------T-T---G-T--------T---A---T---T---T---------C-----------A-C-C----GCT--G-AA-A----AT---------G--T----A-------A---T-A--------A--A-T-----------------------------------G------------------------A--T--ACA-T---T-T---C--T-A--C-AT-T----------Tatggtaataaa
gi|26                         :                       cACA-T-T---TAAT---T--AAA-T-A---TA-A--C-G--T-A--AA-A--T---T----A-A---G-G----TT---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-A-TT------GC-G---G---------A--T--A-G-ATA-T---T----G-C-GGC--A----A-G-T----A--G----A--------C-CGG-G--A-A-A-T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--T---T---A--C--T--G--T----------A---A----A--T--A-A-C-----A-----CTT--T--T-T---G-T--------T---A---T---T---TT-T-C---AC-----------A-C-T----G-T--GAAA-A----A----------A--T----A-------A---C-A--------A--A-T---T--C-T--A---T-------T-C-AA--AG--G------------------------A--T---AA-T-----------------T-AT-T----------TC--ACTG-CT--G--A--A-AATG-TAAttaattaatagtatgcacattataaatgta
gi|27                         :                                               -T-A---TACA--T-G--T-A--AA-AGAT---G----A-A---T-T----TG---------A--T---C--A----------T-------G-T----G----T-A-TC------AC-T---G---------A--T--G-A-ATA-T---T----C-A-GGC--A----A-T-TCATTA--G----A--------T-C-T-A--T-A-G-T-TG-----T--T---A---A-----T-TA------C-----C--TACAC---A--C--T--G--C-G-------AA---A----A--T--A-T-C-----A-----G-T--T--T-T---G-T--------T------------------T-C---AC-----------A-G-T----G-T--G-AA-A----A-------------T----G-----------T-A--------A--A-T---T--TAT--A---T-------T-C-AA--TG--G------------------------A--T--AAA-T---T-A---C--T-G--T-AT-T----------TC--ACTG-TT--T--A--A-AACG-ca
gi|28                         :                                             gA-T-A---TA-T--C-G--T-A--AA----T---T----ATA----------TT---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-A-TT------GC-G---G---------AC-T--A-G-ATA-T---T----G-C---------------------------------------C-G-G--A-A-G-T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----T--T---C---AAAC--T--G--T-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----AACT--T-T--T--T-T---G-T--------T---A---T---T---TT-TTC---AC-----------A-C-T----G-T--T-AA-A----A----------T--T----A-------A---C-A--------AT-A-T---T--T-T--A---C-------T-C-AA--CG--G------------------------AA-T--AAA-T---T-T---T--C-A--T-AT-T----------TC--ACTG-CTAAA--A--A-AATG-TAAcg
gi|29                         :                                                      gA-A--C-G--T-A--GA----T---T----A-A---G-G----TT---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-A-CT------GC-G---G---------A--TT-A-T-ATA-T---T----G-C-GGC--A----A-G-T----A--A----A--------C-C-G-G--A-A---T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----CCCT---C---A--C--T--G--T-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-T--T--T-----G-T--------T---A---T---T---TT-T-CC--AC-----------C-C-T----G-T--G-AA-A----A----------A--T----A-------AA--C-A--------A--A-T---T--C-T--A---T-------T-C-AA--CG--G------------------------A--T--AAA-T---T-T---C--A-A--T-AT-T----------TC--ACTG-CT--G--A--A-AATG-TAAta
gi|3                          :                                             AA-T-A---AA-A--C-G--T-AGAAA-A--T---T----A-GTCCG-GAATCTC---------A--TAA-C--A----------T-------T-A----G----T-AATTCAAAAAGC-G---GCCGAGA---A--T--A-G-ATA-T---T----GGT-GGC--A----A-GAT----AAGG----AAAGTCCATC-C-G-G--A-A-A-T-TA-----T--T-------------T-T-------T-----C--T---C---A--C--A--G--T-GG------AA---A----A--T--A-A-C-----AT----C-T--T--T-T---G-T--------T---A-------T---TT-T-C---ACAATGTATGTAAA-C-TAGA-G-T--G-AA-AAAATA----------A--T----A-------A---C-A--------AG-A-T---T--T-A--A---T-------T-TAAA--CG--A------------------------A--TCAAAA-T---T-T---T--ACA--T-AT-T----------TC--ACTG-CT--G--A--A-AATG-TA
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gi|31                         :                                                   cattA-A--C-A--TGA--AA-A--T---T----A-A----------TT---------A--T-----------------T-------T-AAAATG----T-A-TT------TT-G------------------------TA-T---T----G-T-G-C--A----A-A-T----T--G----T--------C-C-C------A-G-T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--A---C---G--C--T--G--A-A-------AA---A----AA-T--A-A-------A-----C-T--T--G-----G-T--------T---A---C---T---T----C---AC-----------A-C-T----G-T--G-AA-G----G----------A--T----A-------C---C-A--------AT-T-T---T--T-T--A---T-------TCC-AG--TG--G------------------------A--T--ACA-T---T-T---C--A-A--T-AT-T----------TTAAACTG-TT--G--A--A-AATA-TGAtaat
gi|32                         :                        ACA-T-T---TA-T------AAA-T-A---TA-A--C-G--T-A--AA----T---T----A-A---G-G----TT---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-A-T-------GC-G---G---------A--T--A-G-ATA-T---T----G-C-TGC--A----A-G------A--G----A--------C-C-G-G--A-A-G-T-TG-----T--T---A---A-----T-T-------T-----C----------A--C--T--G--T-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-T--T--T-T---G----------T---A---T---T---TT-T-C---AC-------------C-T----G-T--G-AA-A----A----------A--T----A-------A---C-A--------A--A-----T--C-T--A---T-------T-C-AA--AG--G---------------------------T--AAA-T---T-T---C--A-A--T-A--T----------TC--ACTG-CT--taaa
gi|33                         :                          A-T-T---TA-T---T--ATA-T-A---TA-T--C-G--T-A--AA-A--T---G----A-A---G-G----TG---------A--T---C-------------T-------T-AT---G----T-A-TT------GC-G---G---------A--T--G-A-ATA-T---C----G-C-GGC--A----A-G-T----A--GT---T--------T-C-G-G--------T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T--------T---C---A--CAAT--A--T-G-------AA---A----A--T--A----------------------------------------T---A---T-------------------------------C-T----A-T--G--A-A----A----------A--T------------A---T-G--------A--A-T---T--T-G--A---T----------------G--G------------------------A--T--AAA-T---T-T---C--A-G--T-AT-T----------GG--AATG-TT--C--A--A-AATA-TAA
gi|34                         :                     aaAACA-T-T---TA-T---T--AAA-T-A---TA-A--C-G--T-A--AA-A--G---T----A-A---G-G----TC---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-A-CT------GC-A---G---------A--T--A-G-AAA-T---T----G-C-GGC--A----A-G-A----A--G----A--------C-C-G-G--A-C-A-T-TG-----T--T---A---TGTTACT-T-------T-----C--A---C---A--C--T--G--T-G-------AA---A----A--T--A-A-T-----G-----C-T--T--T-T---G-T--------T---A-------T---TT-T-A---AC-----------A-C--------T--G-AA-A----A----------A--T----A------------------------------------T--A---T-------T-C-AA--CG--A------------------------A--T--AAT-T---T-T---T--A-A--T-taaa
gi|35                         :                        gCA-T-T---TA-T---T--AAA-T-AA--TA------G--T-A--A-----T---T----A-A---G-G----TT---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-A-T-------GC-G---G---------C--T--A-G-ATA-T---T----G-C-GGC--A----A-G-T----A--G----A--------C---G-G--A-A-A-T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--G--T-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-T--T--T-T-----T--------T---A---T---T---TT-T-C---AC-----------G-T-T----G-T--T-GA-A----A----------A--T----A-------A---A-A--------A--A--------A-A--A---T-------T-C-AC--TG--A------------------------A--T--AAA-T---T-T---C--A--------------------------TG-CT--G--A--A-
gi|36                         :                       AACA-T-T---TA-T---T--AAA-T-A---TA-A--C-G--T-A--AA-C--T---T----A-T---T-A----TC---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-T-TT------GT-G---G---------A--T--A-G-ATA-T---T----G-C-GAC--A----A-G-T----A--G----A--------C-C-G-G--A-A-A-T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--A---C---A--C--T--G--TGG-------AA---A----A--T--A-A-G-----A------------------------------------------------------------------------------------AA-A----A----------A--T----A-------------------------------------------T-------T-C-AA--CG--G------------------------A--T--AAA-T---T-T---T--A-A--T-AT-T----------TC--ACTG-TT--C--A--A-AATG-TAA
gi|37                         :                          A-T-T---TA-T---T--AAA-TTA---TA-A--C-G--T-A--AA-A--T---T----A-A---G-G----TT---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-A-TC------GC-G---G---------A--T--T-G-ATA-T---T----G---GGC--A----A---T----A--G----A--------C-C-G-G----A-A-T-TG-----T--T---AT--T-----T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--G--T-G-------AA---ATTCTA--TTCA-A-CGGATAA-----A-T--T--T-C---A-A--------T---A---T---T---T---------C-----------A-C-T----GCT--G-GA-A----A----------A--T----taa
gi|38                         :                                                                                                                                                                  ga-G---G---------A--T--A-G-ATA-T---T----G-C-GGC--A----A-G-T----A--A----A--------CGC-G-G--A-A-A-T-TGG----T--T---A---T-----A-T-------T-----C--T---CG--A--C--T--G--T-G-------AAT--A----A--T--A-A-C-----A-----T-C--T--T-T---G-T--------C---A---T---T---TTTT-C---AC-----------A-C-T----G-T--G-AA-A----A----------A--T----A-------A---C-A--------A--A-T---T--C-T--A---T-------T-C-AA--CG--G------------------------A--T--AAA-C---T-T---C--A-A--T-AT-T----------TC--ACCG-CT--G--A--A-AATG-TAAgtaatt
gi|39                         :                                                 -A---TA-A--C-G--T-A--AA-A--G---G----A-A---G-A----TG---------A--T---T-------------T-------T-AT---G----C-A-TT------GT-G---G---------AA-T--G-A-ATA-T---T----A-C-GAC--A----A-G------------------------------------G-T-TG-----T--T---A---TA----T-T-------T-----T--T-----------------------------------------------A-C-----G-----C-T--T--C-T---GGT--------T---A---C---A---CA-T-C---A------------A-C-G----G-T--G-AA-A----A----------A-------A-------A---T-A--------A--A-T---T--T----A---T-------T-C-AG--TT--G------------------------A--T--AGA-T---T-T---T--A-G--A-AT-T----------TC--ACTG-TT--G--A--A-AATG-ta
gi|4                          :                               ---TA-T---T--AAAAT-AAATTA-A--C-G--T-A--AA-A--G---T----A-A---G-G----TGTGGAAGTCTA--T---T--A----------TAGGCTA-T-A----G----G-G-CT------G--G---C---------A--TT-A-G-ATA-TGTTT----GGC-GGT--A----A-T-T----A--A----A--------C-C-G----A-A-A-T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--T---TCG-A--A--T--G--T-G-------AA---G----AATT--ATA-C-----A-----C-T--T--TCT---G-TAGTGGCTAT---A---T---TAGGTT-C-A---AC-----------A-C-T----G-T--A-AA-A----ATAAGCAAATGA--T----A-------C---C-A--------A--A-T---T--A-C--A---TAAGTGGAT-C--A--CGTAG------------------------AG-T--AAA-TA--T-TTGCC--A-A--TAAT-T----------TC--CATG-CT--G--A--A-AATG-TAA
gi|40                         :                     taAACA-T-T---AG-T---T--AAA-T-A----A-A--C-G--T-A--AA-A--T---C----A-A---A-G----GT---------A--T---C--A----------T--------------G----T-A---------GG-G---G---------A--T--A-T-ATA-T---T----G-C-GGC--A------G-T----T--G----A--------C---G-G--A-A-A-T-TG-----T--T---A---A-----T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--G--T-G-------AA---A----AG-T--A-A-C-----A-----C-T--T--T-T---G-A--------T---AT--T---T---TT-T-C---AC-----------A-C-T----GCT--G-AA-A----A----------A--T----A-------A---C-A--------A--A-T---T--T-at
gi|41                         :                       gACA-T-T---TA-T---T--AA--T-A---TA-A--C-G--T-A--AA-A--T---T----A-A---G-G----TT---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-A-TC------GC-G---G---------A--T--T-G-ATA-T---T----G-C-GGC--A----A---T----A--G----A--------C-----G--G-A-A-T-TG-----T--T---AT--T-----T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--G--T-G-------AA---A----accaa
gi|41                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  g-A--------A--A-T---T--C-T--A---T-------T-C-AA--CG--G------------------------A--T--AAA-T---T-T---C--A-A--T-A--T----------TC--ACTG-CTG-G--A--A-AATG-TAAttctattcaacggataaatttcaatattcactgctggaaaatgtaata
gi|42                         : gacatttattaatataacgtaaaattaaggttatcattagtatcgcggattgatattgcggcaatagacggaattgttatttttctcactgtg----TA---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-A-TC------GT-G---T---------A--T--A-A-ATA-T---T----T-C-GGC--A----A-T-T----A--G----T--------CAA-G-G--G-A-A-T-CG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--A---C---A--T--T--G--T-G-------AA---A----T--T--T-A-C-----A---------------------T--------C---A---A---T---T-------------------------T----G-T--G------------------------------------------------------------T--T-T--A----------------A--CG--G------------------------A--T--GAA-T---T-T---C--A-A--T-AT-T----------TC--AATG-CT--G--A--A-AATG-CAAta
gi|43                         :                                                                                                                                                                                                                C--A----A-G-T----A--GT---C--------C-C-G-G--------T-TA-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--A---T---A--C--T--G--T-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----A--------------------------------------------------------------------A-C-T----G-T--T-AA-A----A-------------T----A-------T---C-A--------ATAA-T---T--T-T--A---T-------T-C-AA--CG--G------------------------A--T--AA----------------------AT-T----------TC--GCT--CT--G--A--A-AATG-TAta
gi|44                         :       gcatggaattggataaAACAAT-T---TA-T---T--AAA-T-A---TA-A--C-G--T-A--AA-A--T---C----A-A---G-G----TA---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----TAA-TT------GC-G---G---------A--T--A-G-ATA-T---T----G-CGGGC--A----A-G-T----A--G----A--------C-C-G-GA-A-A-A-T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--G--T-GA------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-T--ttagat
gi|45                         :                         CA-T-T---CA-T---T--AGA-T-A---TA-A--C-G--T-A--AA-A--T---T----A-A---G-G----TT---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-AATT------GC-G---G---------A--T--T-G-ATA-T---T----G-C-GGC--A----A-G-T----A--G----A--------C-C-G-G--A-A-A-T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--G--T-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-
gi|46                         :                                            tAA-T-A---TA-A--C-G--T-A--AA-A--T---T----A-A---G-G----TG---------A--T---C--A----------T-------T-T----G----T-A-TT------GC-G---G---------A--T--A-T-ATA-C---T----G-C-GGC--A----A-A-T----A--A----A--------C-C-G-G--A-A-A-T-TGTTTACT--T---A---T-----T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--G--T-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-T--T--
gi|47                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      acgt--T--G--T-G-------AA---A-------T--A-A-C-----A-----C-C--A--C-T--------------T---A---T---T---TT-T-C---ACGTTAAC-----A-C-C----A-T--T-GA-A----T----------A--T----A-------A---T-A-------------T---C--T-T--ACG-T-------T-C-AA--CA--G------------------------A--T--ACC-T---T-G---C--A-A--C-AT-T----------TT--ACTG-CT--G--A--A-AGCG-TAA
gi|49                         :                         CA-TAT---TA-T---T--AA--T-A---TA-A--C-G--T-A--AA-A--A---T----T-A---G-G----TT---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-A-TT------GC-G---G---------A--T----G-AAA-T---T----G-C-GGC--A----A-G-T----A--G----A--------C-C-G-G--A-A-G-T-TG-----T--T---A---------T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--G--T-G-------AA---taaacaa
gi|5                          :                       AAAA-C-T---TA-TC--T--AAA-T-T---TA-AA-C-G--T-A--AA-AA-T---C----A-A---G-G----TA---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-A-TTG-----GC-G---G---------A--T--A-G-ATA-T---T----G---GGC--A----A-G-T----A--GA---A--------C-C-G-G--ACA-A-G-TGTGGA-T--T---AAGTC-----T-T-------T-----C--T---C---A--CGGTGAG--T-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-TTCT--T-T---A-TGAA-----T---A---T---T---TT-T-C---AC-----------GCC-T----G-T--G-AA-A----A----------A--T----T-------A---C-A--------A--AGC---T--T-T--A---C-------T-C-AATTCGA-G------------------------AG-T--AAT-T---TGT---C----A--T-ATGT----------TC--ACGG-CT--T--AATA-AGTG-TAA
gi|50                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tg---G-T--------C---A---T---G---TT-T-----AC-----------A-C-C----A-T--GTCA-A----A----------A--T----T-------A---T-A--------A--A-G---C--TGT--A---C-------T-C-AA--TG--T------------------------A--T--AAA-T---T-T---C--A-G--T-AT-T----------TC--ACTG-TT--T--A--C-AACG-taaa
gi|51                         :                       AACA-C-T---TA-T---T--GAA-T-A---TA-A--C-T--T-A--AA-A--T---T----A-A---G-G----TT---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----C-A-AT------GC-G---G---------A--T--A-G-ATA-T---T----G-C-GGC--A----A-G-T----A--A----A--------C-T-G-cta
gi|52                         :                                 tag-T---T--AAA-T-A---CC-T--C-G--T-G--AA-C--T---G----A-A---G-T----TG---------A--T---C-------------T-------T-AT---G----T-A-TC------GC-G---GATTT-----A--T--G-A-ATA-T---T----G-C-GGC--A----A-G-T----A--
gi|53                         :                        ACA-T-C---TA-T---C--AAA-T-A---TA-A--C-G--T-A--AC-A--T---T----A-A---G--------------------T---C--A----------T-------T-G----G----T-A-TT------GC-G---G---------A--TGAA-T-ATA-T---T----A-C-GGC--A----A-G-T----A--G----A--------C-C-G-G--A-attccggttgat
gi|54                         :                                                                                                                                                                                                                                                                            gg---A---T-----T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--G--T-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-T--T--T-T---T-T--------C---AGGTC---T---TT-T-C---AC-----------A-C-T----G-T--G-AA-A----A----------A--ta
gi|55                         :                             -T---TG-T---T--GAA-T-A---TA-A--C-G--T-A--GA-A--T---T----A-A---G-G----TT---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-A-CT------GC-G---G---------A--T--A-T-ATA-T---T----G-C-GGC--A----A-G-T----A--G----A--------C-C-G-agggtatatacatgta
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3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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consensus                     :                       AACA-T-T---TA-T---T--AAA-T-A---TA-A--C-G--T-A--AA-A--T---T----A-A---G-G----TN---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-A-TT------GC-G---G---------A--T--A-G-ATA-T---T----G-C-GGC--A----A-G-T----A--G----A--------C-C-G-G--A-A-A-T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--G--T-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-T--T--T-T---G-T--------T---A---T---T---TT-T-C---AC-----------A-C-T----G-T--G-AA-A----A----------A--T----A-------A---C-A--------A--A--T---T--CT---A---T-------T-C-AA--CG------------------------G--A--T--AAA-T---T-T--C--A-A--T-A-T-T----------TC--ACTG-CT--G--A--A-AATG-TAA
Reference ( family-2116 )     :                       AACA-T-T---TA-T---T--AAA-T-A---TA-A--C-G--T-A--AA-A--T---T----A-A---G-G----TN---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-A-TT------GC-G---G---------A--T--A-G-ATA-T---T----G-C-GGC--A----A-G-T----A--G----A--------C-C-G-G--A-A-A-T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--G--T-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-T--T--T-T---G-T--------T---A---T---T---TT-T-C---AC-----------A-C-T----G-T--G-AA-A----A----------A--T----A-------A---C-A--------A--A--T---T--CT---A---T-------T-C-AA--CG------------------------G--A--T--AAA-T---T-T--C--A-A--T-A-T-T----------TC--ACTG-CT--G--A--A-AATG-TAA
gi|1                          :                         CA-T-T---TA-T---G--AGA-TTA---TA-A--T-G--T-A--AA-A--T---C----A-A---G-G----TA---------A--T---TCGA----------TGAAGTGCT-A----T----T-A-TT------GC-G---GCGCTGCTACA--T--A-G-GCA-T---TATGGG-C-GGC--ATATGA-G-T----A--C-------------C-C-G-GTTA-G-G-T-TG-----TGTT---A---T-----T-T-------TGTCCTC--T---T---A--T--T--T--T-GGTTGAATAA---A----G--T--A-A-C-----ATATCTC-T--TCTT-T---G-T--------TCTAG---T---T---TT-T-C---TCG----------A-C-TCGACA-T--G-GA-A----AGAAA------A--T----A-------AACAC-ATGTTGCCTA--G--T---T--CT---C---T-------A-C-AA--CG------------------------G--AA-T--AAA-T---T-T--C--A-A--T-A-T-T----------TC--ACTG-C---G--A--A-AATG-
gi|10                         :                  atgaatACA-T-T---TA-T---TT-AAA-T-A---TA-A--CCG--A-A--GA-A--T---T----A-A---ATG----TT---------A--T---C--A----------TG------T-A----G----T-A-TT------GC-G---G---------A--T--AAG-ATA-T---TTTT-G-C-GGC--A----A-G-T----A--A----A--------C-CCG-G--A-A-A-T-TG-----TA-T---A---T-----T-T-------C-----CG-T---C---A--C--T--G--T-G-------AA---A----A--T--A---C-----AG----C-T--T--T-T---G-T--------T---A---T---T---TT-TTC---AC-----------A-G-T----G-T--G-AA-A----A----------A--T----A-------A---C-A--------A--A--T---T--CT---A---T-------TGC-AA--CG------------------------GA-A--TA-AAA-A---T-A--C--A-A--T-A-T-T----------TCA-ACTG-CT--G--A--A-AATG-TAAaat
gi|11                         :                       AACA-T-T---TT-A---T--AAA-T-A---TA-A--G-A--G-A--AA-A--T---T----C-A---G-G----TT---------AG-T---C--A----------T-------T-A----GG---T-A-TT------GC-G---T---------A--G--A-G-ATA-T---T----G-C-GGCTAA----A-G-T----A--A----A--------C-C-G-G--AGA-A-T-AG-----T--T---A---T-----TGT-------T-----C--T---C---AT-C--T--G--T-A-------AG---A----A--T--AGA-C-----A-----C-T--T--T-T---G-T--------T---A---T---T---TT-T-C----C-------------C-T----G-T--G-AA-A----A----------AGTT----AATT----A---C-A--------A--AT-T---T--CT---AT--T-------T-C-AATTC-------------------------G--A--T--AAA-A---T-T--C--A-AT-T-A-T-T----------TC--ACTG-CT--G-----A-CATG-TAAta
gi|12                         :                                   g-T---T--AAA---A---TA-A--C-G--T-AG-AA-A--T---T----A-A---G------TT---------A--T---C--AATAATTAACTT-------T-A----G----T-A-TT------GC-G---G---------A--TT-A-G-ATA-T---T----G-C-GGC--A----A---T----A--G----A--------C-C-G-G--A-G---T-TG-----TG-T---A---T-----T-T-------T-----C--T---CCTCA--C--T--G--T-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-T--T--T-TTTTG-T--------T---A---T---T---TTCT-C---AC-----------A-C-T----G-T--G-AA-A----A----------AA-T----A-------T---C-A--------A--AA-T---T--CT---A---T-------T-C-AA--CG------------------------G--A--T--AAA-T---G-T--C--A-A--T-A-T-TAG--------TC--ACTG-CT--G--A--A-A--G-TAA
gi|13                         :                       tACA-T-T---TA-T---A--AAA-T-A---AA-A--CTG--T-A--AA-A--T---T----A-A---G-GGG--TT---------A--T---CGCA----------T-------T-A----G----T-A-T-------GC-G---G---------A--T--GTG-ATA-T---G----G-C-GGC--AT---A-G-T----T--A----A--------C-C-G-G--A-A-A-T-TG-----T--TTG-A---T-----T-T-------T-----C--T-------A--C--T--G--T-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-T--G--T-T---GCT--------T---A---T---T---TT-T-CCA-ACG----------A-CTT----G-T--G-AAGA----A----------A--T----A-------A---C-A--------A--G--T---T--CT---A---T-------T-C-GA--AGTC----------------------G--A--T--A-------T-T--C--A-A--TCA-T-T----------TCAAACTG-CT--G--A--A-At
gi|14                         :                           -T-T---TA-TCTAT--AAA-T-----CA-A----G--T-A--AA-AA-T---T----A-A---A-GAG--TT---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----C-A-TT------GC-G---G---------A--T--A-G-ATA-T--------G-C-GGC--A----G-GCT----A--A----A--------CGC-G-G--A-ACA-T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--G--T-G-------AA---AC---A--T--A-A-C-----A-------T--T--T-T---G-T--------T-------TCCGT---TT-T-C---AC-----------A-C-T----G-TTTG-AA-A----A----------A--T----A-------A---C-A--------A--A--T---T--CT---A---T-------T-C-AA--AG------------------------G--A--T--AAC-T---T-T--C--A-G--T-A-T-T----------TC--ACTG-CT--A--A--A-ACTG-tata
gi|15                         :                                   A-T---T--AAA-TTA---TA-A--C-G--T-A--AA-G--T--------A-A---G-G----TT---------A--T---C--AC---------T-------T-A----G----TCA-TT------GC-G---G---------T--T--A-G-CTAAT---T----G-C-TGT--A----A-G-T----C--A----A--------A-C-GTG--A-A-A-T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------TATT--C--T---C---A--C--T--G--T-T-------GA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-C--T--C-----G-T--------T---A---T---T---TT-G-C---AC-----------A-T-C----G-T--GTGA-A----A----------A--T----A-------G---C-CC-------A--A--T---T--CT---A---T-------G-C-AA--TG------------------------G--A--T--AAA-T---T-T--CCAA-A--T-A-T-T----------TC--ACTG-CT--T--A--A-GAtataaa
gi|16                         :                    taaAACA-T-T---TA-T---T--AAA-T-A---TA-A--CTG--T-A--AA--------T----A-A---G-G----TT---------A--T---C--A----------TG------T-A----G----T-A-T----------G---G---------A--T--A---ATA-T---T------C-GGC--A----AAG-T----A--A----A--------C-C-C-G--A-A-A-T-T-------------A---T-----T-T-------T-----C--T---C---C--C--T--G--TTG-------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-T--T--T-T---G-T------------A---T---T---TT-T-C---ACC----------A-C-T------T--C-AA-A----A----------A--TTACTA-------A---C-AT-------A--A--T---T--TT---A---T-------T-C-AA--CG------------------------G--A--T---AA-T---T-TCAC--A-A--T-A---T----------TC--ACTG-CT--G--A--ACAATG-TAAattactaa
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gi|18                         :                       AACA-T-T---TA-G---T--TAA-G-A---TA-A--C-G--T-A--AA-G--T---TTTCAG-A---G-G----TA---------A--T---CG-A----------T-------T-A----G----T-A-T-------GC-G-------------A--T--A-G-ATA-A---G----G-C-GGC--A----A-G-TT---A--G----A--------C---G-G--A-A-G-T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--G--T-G-------GA---A----A--A--G-A-C-----A-----C-T--T--T-T---A----------T---A---T---T---TT-T-C---AC-----------A-C-T----G-T--GAAA-A----A----------A--T----A-------A---C-A--------A--AT-T---T--TT---A---C-------C-T-AA--CG------------------------G--A--T---AA-T---T-T--C--A-AG-T-A-T-T----------TC--ACTG-CT--T--A--A-AATG-TA
gi|19                         :                          A-T-T---TA-T---T--AAA-T-A---TA-A--C-G--T-A--AA-A--T---C----A-A---G-G----TA---------A--T---C--A----------T-------T-G----G----T-A-TT------GC-G---G---------A--T--T-G-ATT-T---A----G-C-GGC--A----A-G-T----A--G----A--------C-C-G-G--A-A-A-T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--G--T-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-------T-T---G-T--------T---A---T---T---TT-T-C---AC-----------A-C-A----C-T--G-AA-A----A----------A--T----A-------A---C-A--------A--A--T---TAATTTG-A---C-------T-C-AA--CG------------------------G--A--T--AAA-T---T-T--C--A-A--T-A-T-T----------TC--ACTG-CT--A--A--A-AATG-TAA
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gi|21                         :                       AATA-T-T---TA-T---T--AAA-T-A---TA-A--C-G--T-A--AA-A--T---T----A-A---G-G----TA---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-A-TT------GC-G---G---------A--T--G-G-ATA-T---T----G-C-GGC--A----A-G-T----A--G----A--------C-C-G-G--A-A-A-T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--C---C---A--C--T--G--G-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-T--T--T-T---G-T--------T---A---T---T---AT-T-C---AC-----------A-C--------T--G-AC-A----A----------A--T----A-------A---C-A--------A--C--T---T--TT---A---C-------G-C-AA--CG------------------------G--A--T--AAA-T---T-T--C--A-A--T-A-T-T----------TC--ACTG-CT--A--A--A-AATG-TAA
gi|22                         :                          A-T-T---TA-T---T--GAA-T-A---TA-A--C-G--T-A--AA-A--T---T----A-A---G-G----TC---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-A-TT------GC-T---G---------A--T--A-T-ATA-T---T----G-C-TGC--A----A-G-T----A--A----A--------C-C-G-G--A-A-A-T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------A-----C--T---C---A--C--T--G--T-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-T--T--T-T---G-T--------T---A---T---T---TT-T-C---AC-----------A-C-T----G-T--G-AA-A----A----------A--T----A-------A---C-G--------A--C--T---T--CT---A---T-------T-T-AA--GG------------------------G--A--T--ACT-T---G-T--C--A-A--T-A-T-T----------TC--TCTG-CT--G--A--A-AATG-TAAta
gi|23                         :                        ACA-T-T---TA-T---T--AAA-T-A---TA-A--C----T-A--AA----T---T----A-A---G-G----TT---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-AATT------GC-G---G---------A--T--TTG-A-A-T---T----G-C-G-T--A----A-G-T----A--G----A--------C-C-G-G--A-A-A-T-TG-----T--TA--A---T-----T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--G--T-G-------AA---A----T--A--A-A-C-----A-----C----T--T-T---G-T--------T---A---T---T---TT-T-C---AC-----------A-C-T----G-T--G-AA-A----A----------A--T------------T---C-A--------A--A--T---T--CTA--A---T-------T-C-AA--CG------------------------G--A--T---AA-T---T-T--C--A-A--T-A-T-T----------TC--ACTG-CT--G--A--A-AATG-TAAtaa
gi|24                         :                       AACT-T-T---TACT---T--TAA-T-A----A-A--C-G--A-A--AC-A--T---T----A-A---G-G----TT---------A------C--A----------T-------T-A----G----T-A-TC------G----------------A--T--A-T--TA-T---T----G-C-G-C--AC---A-T-T----C--A----A--------C-C-G----A-A-A-T-TG-----T--T---A---------T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--G--T-C-------AAG--A----A--T--A-A-C-----A-----C-T--T--T-T---G-T--------T---A---T---T---TT-C-C------------------C-T----T-T--C-AA-A----A----------A--T----A-------G---C-A--------AG-A--T---T--CT---A---T-------T-C-AAT-CG------------------------GTAA--A--AAA-T---C-T-------A--T-A-T-T----------TC--ACTT-CG--G--A--A-AAtaa
gi|25                         :                        ACA-T-T---TA-T---T--GAA-T-A---TA-A--C-G--T-A--GA-A--T---T----A-A---G-G----TC---------A--T---C--A----------T-------A-A----G----T-C-TT------TT-G---G---------A--T--A-A-ATA-T---T----G-C-GGT--A----A-G-T----G--G----A--------C-C-A-G--A-A-C-T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--A--T-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-------T-T---G-T--------T---A---T---T---T---------C-----------A-C-C----GCT--G-AA-A----AT---------G--T----A-------A---T-A--------A--A--T---------------------------------------------------------G--A--T--ACA-T---T-T--C--T-A--C-A-T-T----------Tatggtaataaa
gi|26                         :                       cACA-T-T---TAAT---T--AAA-T-A---TA-A--C-G--T-A--AA-A--T---T----A-A---G-G----TT---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-A-TT------GC-G---G---------A--T--A-G-ATA-T---T----G-C-GGC--A----A-G-T----A--G----A--------C-CGG-G--A-A-A-T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--T---T---A--C--T--G--T----------A---A----A--T--A-A-C-----A-----CTT--T--T-T---G-T--------T---A---T---T---TT-T-C---AC-----------A-C-T----G-T--GAAA-A----A----------A--T----A-------A---C-A--------A--A--T---T--CT---A---T-------T-C-AA--AG------------------------G--A--T---AA-T----------------T-A-T-T----------TC--ACTG-CT--G--A--A-AATG-TAAttaattaatagtatgcacattataaatgta
gi|27                         :                                               -T-A---TACA--T-G--T-A--AA-AGAT---G----A-A---T-T----TG---------A--T---C--A----------T-------G-T----G----T-A-TC------AC-T---G---------A--T--G-A-ATA-T---T----C-A-GGC--A----A-T-TCATTA--G----A--------T-C-T-A--T-A-G-T-TG-----T--T---A---A-----T-TA------C-----C--TACAC---A--C--T--G--C-G-------AA---A----A--T--A-T-C-----A-----G-T--T--T-T---G-T--------T------------------T-C---AC-----------A-G-T----G-T--G-AA-A----AT---------G--T----A-------A--------------A--T--T---T--AT---A---T-------T-C-AA--TG------------------------G--A--T--AAA-T---T-A--C--T-G--T-A-T-T----------TC--ACTG-TT--T--A--A-AACG-ca
gi|28                         :                                             gA-T-A---TA-T--C-G--T-A--AA----T---T----ATA----------TT---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-A-TT------GC-G---G---------AC-T--A-G-ATA-T---T----G-C---------------------------------------C-G-G--A-A-G-T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----T--T---C---AAAC--T--G--T-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----AACT--T-T--T--T-T---G-T--------T---A---T---T---TT-TTC---AC-----------A-C-T----G-T--T-AA-A----A----------T--T----A-------A---C-A--------AT-A--T---T--TT---A---C-------T-C-AA--CG------------------------G--AA-T--AAA-T---T-T--T--C-A--T-A-T-T----------TC--ACTG-CTAAA--A--A-AATG-TAAcg
gi|29                         :                                                      gA-A--C-G--T-A--GA----T---T----A-A---G-G----TT---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-A-CT------GC-G---G---------A--TT-A-T-ATA-T---T----G-C-GGC--A----A-G-T----A--A----A--------C-C-G-G--A-A---T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----CCCT---C---A--C--T--G--T-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-T--T--T-----G-T--------T---A---T---T---TT-T-CC--AC-----------C-C-T----G-T--G-AA-A----A----------A--T----A-------AA--C-A--------A--A--T---T--CT---A---T-------T-C-AA--CG------------------------G--A--T--AAA-T---T-T--C--A-A--T-A-T-T----------TC--ACTG-CT--G--A--A-AATG-TAAta
gi|3                          :                                             AA-T-A---AA-A--C-G--T-AGAAA-A--T---T----A-GTCCG-GAATCTC---------A--TAA-C--A----------T-------T-A----G----T-AATTCAAAAAGC-G---GCCGAGA---A--T--A-G-ATA-T---T----GGT-GGC--A----A-GAT----AAGG----AAAGTCCATC-C-G-G--A-A-A-T-TA-----T--T-------------T-T-------T-----C--T---C---A--C--A--G--T-GG------AA---A----A--T--A-A-C-----AT----C-T--T--T-T---G-T--------T---A-------T---TT-T-C---ACAATGTATGTAAA-C-TAGA-G-T--G-AA-AAAATA----------A--T----A-------A---C-A--------AG-A--T---T--TA---A---T-------T-TAAA--CG------------------------A--A--TCAAAA-T---T-T--T--ACA--T-A-T-T----------TC--ACTG-CT--G--A--A-AATG-TA
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gi|31                         :                                                   cattA-A--C-A--TGA--AA-A--T---T----A-A----------TT---------A--T-----------------T-------T-AAAATG----T-A-TT------TT-G------------------------TA-T---T----G-T-G-C--A----A-A-T----T--G----T--------C-C-C------A-G-T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--A---C---G--C--T--G--A-A-------AA---A----AA-T--A-A-------A-----C-T--T--G-----G-T--------T---A---C---T---T----C---AC-----------A-C-T----G-T--G-AA-G----G----------A--T----A-------C---C-A--------AT-T--T---T--TT---A---T-------TCC-AG--TG------------------------G--A--T--ACA-T---T-T--C--A-A--T-A-T-T----------TTAAACTG-TT--G--A--A-AATA-TGAtaat
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gi|33                         :                          A-T-T---TA-T---T--ATA-T-A---TA-T--C-G--T-A--AA-A--T---G----A-A---G-G----TG---------A--T---C-------------T-------T-AT---G----T-A-TT------GC-G---G---------A--T--G-A-ATA-T---C----G-C-GGC--A----A-G-T----A--GT---T--------T-C-G-G--------T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T--------T---C---A--CAAT--A--T-G-------AA---A----A--T--A----------------------------------------T---A---T-------------------------------C-T----A-T--G-AA-A----AT---------A--T----G-------A--------------------------------A---T-------T-T-GA--TG------------------------G--A--T--AAA-T---T-T--C--A-G--T-A-T-T----------GG--AATG-TT--C--A--A-AATA-TAA
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gi|40                         :                     taAACA-T-T---AG-T---T--AAA-T-A----A-A--C-G--T-A--AA-A--T---C----A-A---A-G----GT---------A--T---C--A----------T--------------G----T-A---------GG-G---G---------A--T--A-T-ATA-T---T----G-C-GGC--A------G-T----T--G----A--------C---G-G--A-A-A-T-TG-----T--T---A---A-----T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--G--T-G-------AA---A----AG-T--A-A-C-----A-----C-T--T--T-T---G-A--------T---AT--T---T---TT-T-C---AC-----------A-C-T----GCT--G-AA-A----A----------A--T----A-------A---C-A--------A--A--T---T--at
gi|41                         :                       gACA-T-T---TA-T---T--AA--T-A---TA-A--C-G--T-A--AA-A--T---T----A-A---G-G----TT---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-A-TC------GC-G---G---------A--T--T-G-ATA-T---T----G-C-GGC--A----A---T----A--G----A--------C-----G--G-A-A-T-TG-----T--T---AT--T-----T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--G--T-G-------AA---A----taccaa
gi|41                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  g-A--------A--A--T---T--CT---A---T-------T-C-AA--CG------------------------G--A--T--AAA-T---T-T--C--A-A--T-A---T----------TC--ACTG-CTG-G--A--A-AATG-TAAttctattcaacggataaatttcaatattcactgctggaaaatgtaata
gi|42                         : gacatttattaatataacgtaaaattaaggttatcattagtatcgcggattgatattgcggcaatagacggaattgttatttttctcactgtg----TA---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-A-TC------GT-G---T---------A--T--A-A-ATA-T---T----T-C-GGC--A----A-T-T----A--G----T--------CAA-G-G--G-A-A-T-CG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--A---C---A--T--T--G--T-G-------AA---A----T--T--T-A-C-----A-----T-CAAT--T-T---G-T--------ta
gi|42                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  --T-C---G-T--------T---A---T---T---TT---C---AC-----------A-T-T----G-T--G-AA-A----TTT--------A--C----A-------T---C-A--------A--T--T---T--GT---G---T-------T-T-AA--CG------------------------G--A--T--GAA-T---T-T--C--A-A--T-A-T-T----------TC--AATG-CT--G--A--A-AATG-CAAgtttaacggatgaatttcaatatttcaatgctgaaaatgcaata
gi|43                         :                                                                                                                                                                 taatcattagtatcgtgtataaatatttcggcaattagtcaagggaaC--A----A-G-T----A--GT---C--------C-C-G-G--------T-TA-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--A---T---A--C--T--G--T-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----A--------------------------------------------------------------------A-C-T----G-T--T-AA-A----A-------------T----A-------T---C-A--------ATAA--T---T--TT---A---T-------T-C-AA--CG------------------------G--A--T--AA---------------------A-T-T----------TC--GCT--CT--G--A--A-AATG-TAta
gi|44                         :       gcatggaattggataaAACAAT-T---TA-T---T--AAA-T-A---TA-A--C-G--T-A--AA-A--T---C----A-A---G-G----TA---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----TAA-TT------GC-G---G---------A--T--A-G-ATA-T---T----G-CGGGC--A----A-G-T----A--G----A--------C-C-G-GA-A-A-A-T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--G--T-GA------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-T--ttagat
gi|45                         :                         CA-T-T---CA-T---T--AGA-T-A---TA-A--C-G--T-A--AA-A--T---T----A-A---G-G----TT---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-AATT------GC-G---G---------A--T--T-G-ATA-T---T----G-C-GGC--A----A-G-T----A--G----A--------C-C-G-G--A-A-A-T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--G--T-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-
gi|46                         :                                            tAA-T-A---TA-A--C-G--T-A--AA-A--T---T----A-A---G-G----TG---------A--T---C--A----------T-------T-T----G----T-A-TT------GC-G---G---------A--T--A-T-ATA-C---T----G-C-GGC--A----A-A-T----A--A----A--------C-C-G-G--A-A-A-T-TGTTTACT--T---A---T-----T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--G--T-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-T--T--
gi|47                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      acgt--T--G--T-G-------AA---A-------T--A-A-C-----A-----C-C--A--C-T--------------T---A---T---T---TT-T-C---ACGTTAAC-----A-C-C----A-T--T-GA-A----T----------A--T----A-------A---T-A--------T--C--T---T--AC---G---T-------T-C-AA--CA------------------------G--A--T--ACC-T---T-G--C--A-A--C-A-T-T----------TT--ACTG-CT--G--A--A-AGCG-TAA
gi|49                         :                         CA-TAT---TA-T---T--AA--T-A---TA-A--C-G--T-A--AA-A--A---T----T-A---G-G----TT---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-A-TT------GC-G---G---------A--T----G-AAA-T---T----G-C-GGC--A----A-G-T----A--G----A--------C-C-G-G--A-A-G-T-TG-----T--T---A---------T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--G--T-G-------AA---taaacaa
gi|5                          :                       AAAA-C-T---TA-TC--T--AAA-T-T---TA-AA-C-G--T-A--AA-AA-T---C----A-A---G-G----TA---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-A-TTG-----GC-G---G---------A--T--A-G-ATA-T---T----G---GGC--A----A-G-T----A--GA---A--------C-C-G-G--ACA-A-G-TGTGGA-T--T---AAGTC-----T-T-------T-----C--T---C---A--CGGTGAG--T-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-TTCT--T-T---A-TGAA-----T---A---T---T---TT-T-C---AC-----------GCC-T----G-T--G-AA-A----A----------A--T----T-------A---C-A--------A--AG-C---T--TT---A---C-------T-C-AATTCGA-----------------------G--AG-T--AAT-T---TGT--C----A--T-A-TGT----------TC--ACGG-CT--T--AATA-AGTG-TAA
gi|50                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tg---G-T--------C---A---T---G---TT-T-----AC-----------A-C-C----A-T--GTCA-A----A----------A--T----T-------A---T-A--------A--AG-C---T--GT---A---C-------T-C-AA--TG------------------------T--A--T--AAA-T---T-T--C--A-G--T-A-T-T----------TC--ACTG-TT--T--A--C-AACG-taaa
gi|51                         :                       AACA-C-T---TA-T---T--GAA-T-A---TA-A--C-T--T-A--AA-A--T---T----A-A---G-G----TT---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----C-A-AT------GC-G---G---------A--T--A-G-ATA-T---T----G-C-GGC--A----A-G-T----A--A----A--------C-T-G-cta
gi|52                         :                                 tag-T---T--AAA-T-A---CC-T--C-G--T-G--AA-C--T---G----A-A---G-T----TG---------A--T---C-------------T-------T-AT---G----T-A-TC------GC-G---GATTT-----A--T--G-A-ATA-T---T----G-C-GGC--A----A-G-T----A--
gi|53                         :                        ACA-T-C---TA-T---C--AAA-T-A---TA-A--C-G--T-A--AC-A--T---T----A-A---G--------------------T---C--A----------T-------T-G----G----T-A-TT------GC-G---G---------A--TGAA-T-ATA-T---T----A-C-GGC--A----A-G-T----A--G----A--------C-C-G-G--A-attccggttgat
gi|54                         :                                                                                                                                                                                                                                                                            gg---A---T-----T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--G--T-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-T--T--T-T---T-T--------C---AGGTC---T---TT-T-C---AC-----------A-C-T----G-T--G-AA-A----A----------A--ta
gi|55                         :                             -T---TG-T---T--GAA-T-A---TA-A--C-G--T-A--GA-A--T---T----A-A---G-G----TT---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-A-CT------GC-G---G---------A--T--A-T-ATA-T---T----G-C-GGC--A----A-G-T----A--G----A--------C-C-G-agggtatatacatgta
gi|56                         :                         cA-T-G---TA-T---T--AGA-T-A---TA-T--C-G--T-A--AA-A--T---G----A-A---G-A----TATA-------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-A-AC------GC-G---G---------A--T--A-A-ACA-C---T----G-C-AGC--A----A-G-T----A--G----
gi|57                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            A-A----A----------A--T----A-------A--------------------T---T--TA---A---T-------T-C-A---TG------------------------G--A--T--GAG-T---T-T--C--A-G--T-A-T-T----------TC--ACTG-AA--G--A--A-AATG-TAA
gi|58                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       aactacagc-----------A-C-T----G-T--G-AA-A----A----------A--T----A-------A---C-A--------A--A--T---T--CT---A---T-------T-C-AA--CG------------------------G--A--T--AAA-T---T-T--C--A-A--T-A-T-T----------TC--ACTG-CT--G--A--A-AATG-TAAtaaat
gi|59                         :                                                   ---TA-A--T-G--T-A--AA-A--T---G----A-C---A-G----TG---------ACTT---C--A----------T--------------G----T-A-TC------GC-G---A---------A--T--G-A-ATA-T---T----G-C-GA---G----A-G-T----A--G----ta
gi|6                          :                       AGCA-G-T---TA-T---T--AAA-T-A---TA-AA-C-G--TGA--AA-A--T---C----A-GAG-G-G----TA---------A--TGCAT--A----------T-------T-A----GGGTAT-A-CT------GCTG---G---------ACGT--A-G-ATA-TG--T----G-C-GGC--A----A-G-TTA--G--G----A--------C-C-G-G--G-A-G-T-TG-----T--T---A---T-----T-G-------T-----C--T---TT--A--C--T--G--TCG-------GATACA----A--T--A-AAC-----A-----C-T--T--T-T-----TGAA-----T---A---T---T---TT-T-C---AC-----------A-C-T----G-G--A-AA-A----A----------G--T----A-------A---T-C--------A--A--T---T--GTTACA---T-------C-T-AA--CG------------------------G--A--T--AAAGTTAAT-T--C--A-ATGT-A-T-T----------GT--ACTG-CT--A--A--A-AATG-TAAtcacggttg
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gi|61                         :                                                                                                                                                                                                                                                   -C-G-G--A-A-G-T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--G--T-G-------AA------------------C-----A-----C-T--T--T-T---G-T--------T---A---T---T---TT-T-C---AC-----------A-C-T----G-T--A-AT-A----A----------A--T----A-------A---att
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3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-2116 )     :                       AACA-T-T---TA-T---T--AAA-T-A---TA-A--C-G--T-A--AA-A--T---T----A-A---G-G----TN---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-A-TT------GC-G---G---------A--T--A-G-ATA-T---T----G-C-GGC--A----A-G-T----A--G----A--------C-C-G-G--A-A-A-T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--G--T-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-T--T--T-T---G-T--------T---A---T---T---TT-T-C---AC-----------A-C-T----G-T--G-AA-A----A----------A--T----A-------A---C-A--------A--A--T---T--CT---A---T-------T-C-AA--CG------------------------G--A--T--AAA-T---T-T--C--A-A--T-A-T-T----------TC--ACTG-CT--G--A--A-AATG-TAA
gi|1                          :                         CA-T-T---TA-T---G--AGA-TTA---TA-A--T-G--T-A--AA-A--T---C----A-A---G-G----TA---------A--T---TCGA----------TGAAGTGCT-A----T----T-A-TT------GC-G---GCGCTGCTACA--T--A-G-GCA-T---TATGGG-C-GGC--ATATGA-G-T----A--C-------------C-C-G-GTTA-G-G-T-TG-----TGTT---A---T-----T-T-------TGTCCTC--T---T---A--T--T--T--T-GGTTGAATAA---A----G--T--A-A-C-----ATATCTC-T--TCTT-T---G-T--------TCTAG---T---T---TT-T-C---TCG----------A-C-TCGACA-T--G-GA-A----AGAAA------A--T----A-------AACAC-ATGTTGCCTA--G--T---T--CT---C---T-------A-C-AA--CG------------------------G--AA-T--AAA-T---T-T--C--A-A--T-A-T-T----------TC--ACTG-C---G--A--A-AATG-
gi|10                         :                  atgaatACA-T-T---TA-T---TT-AAA-T-A---TA-A--CCG--A-A--GA-A--T---T----A-A---ATG----TT---------A--T---C--A----------TG------T-A----G----T-A-TT------GC-G---G---------A--T--AAG-ATA-T---TTTT-G-C-GGC--A----A-G-T----A--A----A--------C-CCG-G--A-A-A-T-TG-----TA-T---A---T-----T-T-------C-----CG-T---C---A--C--T--G--T-G-------AA---A----A--T--A---C-----AG----C-T--T--T-T---G-T--------T---A---T---T---TT-TTC---AC-----------A-G-T----G-T--G-AA-A----A----------A--T----A-------A---C-A--------A--A--T---T--CT---A---T-------TGC-AA--CG------------------------GA-A--TA-AAA-A---T-A--C--A-A--T-A-T-T----------TCA-ACTG-CT--G--A--A-AATG-TAAaat
gi|11                         :                       AACA-T-T---TT-A---T--AAA-T-A---TA-A--G-A--G-A--AA-A--T---T----C-A---G-G----TT---------AG-T---C--A----------T-------T-A----GG---T-A-TT------GC-G---T---------A--G--A-G-ATA-T---T----G-C-GGCTAA----A-G-T----A--A----A--------C-C-G-G--AGA-A-T-AG-----T--T---A---T-----TGT-------T-----C--T---C---AT-C--T--G--T-A-------AG---A----A--T--AGA-C-----A-----C-T--T--T-T---G-T--------T---A---T---T---TT-T-C----C-------------C-T----G-T--G-AA-A----A----------AGTT----AATT----A---C-A--------A--AT-T---T--CT---AT--T-------T-C-AATTC-------------------------G--A--T--AAA-A---T-T--C--A-AT-T-A-T-T----------TC--ACTG-CT--G-----A-CATG-TAAta
gi|12                         :                                   g-T---T--AAA---A---TA-A--C-G--T-AG-AA-A--T---T----A-A---G------TT---------A--T---C--AATAATTAACTT-------T-A----G----T-A-TT------GC-G---G---------A--TT-A-G-ATA-T---T----G-C-GGC--A----A---T----A--G----A--------C-C-G-G--A-G---T-TG-----TG-T---A---T-----T-T-------T-----C--T---CCTCA--C--T--G--T-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-T--T--T-TTTTG-T--------T---A---T---T---TTCT-C---AC-----------A-C-T----G-T--G-AA-A----A----------AA-T----A-------T---C-A--------A--AA-T---T--CT---A---T-------T-C-AA--CG------------------------G--A--T--AAA-T---G-T--C--A-A--T-A-T-TAG--------TC--ACTG-CT--G--A--A-A--G-TAA
gi|13                         :                       tACA-T-T---TA-T---A--AAA-T-A---AA-A--CTG--T-A--AA-A--T---T----A-A---G-GGG--TT---------A--T---CGCA----------T-------T-A----G----T-A-T-------GC-G---G---------A--T--GTG-ATA-T---G----G-C-GGC--AT---A-G-T----T--A----A--------C-C-G-G--A-A-A-T-TG-----T--TTG-A---T-----T-T-------T-----C--T-------A--C--T--G--T-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-T--G--T-T---GCT--------T---A---T---T---TT-T-CCA-ACG----------A-CTT----G-T--G-AAGA----A----------A--T----A-------A---C-A--------A--G--T---T--CT---A---T-------T-C-GA--AGTC----------------------G--A--T--A-------T-T--C--A-A--TCA-T-T----------TCAAACTG-CT--G--A--A-At
gi|14                         :                           -T-T---TA-TCTAT--AAA-T-----CA-A----G--T-A--AA-AA-T---T----A-A---A-GAG--TT---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----C-A-TT------GC-G---G---------A--T--A-G-ATA-T--------G-C-GGC--A----G-GCT----A--A----A--------CGC-G-G--A-ACA-T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--G--T-G-------AA---AC---A--T--A-A-C-----A-------T--T--T-T---G-T--------T-------TCCGT---TT-T-C---AC-----------A-C-T----G-TTTG-AA-A----A----------A--T----A-------A---C-A--------A--A--T---T--CT---A---T-------T-C-AA--AG------------------------G--A--T--AAC-T---T-T--C--A-G--T-A-T-T----------TC--ACTG-CT--A--A--A-ACTG-tata
gi|15                         :                                   A-T---T--AAA-TTA---TA-A--C-G--T-A--AA-G--T--------A-A---G-G----TT---------A--T---C--AC---------T-------T-A----G----TCA-TT------GC-G---G---------T--T--A-G-CTAAT---T----G-C-TGT--A----A-G-T----C--A----A--------A-C-GTG--A-A-A-T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------TATT--C--T---C---A--C--T--G--T-T-------GA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-C--T--C-----G-T--------T---A---T---T---TT-G-C---AC-----------A-T-C----G-T--GTGA-A----A----------A--T----A-------G---C-CC-------A--A--T---T--CT---A---T-------G-C-AA--TG------------------------G--A--T--AAA-T---T-T--CCAA-A--T-A-T-T----------TC--ACTG-CT--T--A--A-GAtataaa
gi|16                         :                    taaAACA-T-T---TA-T---T--AAA-T-A---TA-A--CTG--T-A--AA--------T----A-A---G-G----TT---------A--T---C--A----------TG------T-A----G----T-A-T----------G---G---------A--T--A---ATA-T---T------C-GGC--A----AAG-T----A--A----A--------C-C-C-G--A-A-A-T-T-------------A---T-----T-T-------T-----C--T---C---C--C--T--G--TTG-------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-T--T--T-T---G-T------------A---T---T---TT-T-C---ACC----------A-C-T------T--C-AA-A----A----------A--TTACTA-------A---C-AT-------A--A--T---T--TT---A---T-------T-C-AA--CG------------------------G--A--T---AA-T---T-TCAC--A-A--T-A---T----------TC--ACTG-CT--G--A--ACAATG-TAAattactaa
gi|17                         :                        gCA-T-T---TA-T------GAA-T-A---TA-A--C-G--T-A--AA-AA-T---T----A-AT--G-G----TC---------A--T---C--A----------T-------TTA----G----T-A-TT------GC-T---G---------A--T--A-ATATA-T---T----G-C-TGC--A------G-T----A--A----AA-------C-C-G-G--A-A-A-T-T------T--T---A---T-----T-T-------A-----C--T---CC--A--C--T--G--T-G-------GA---A----A--T--A-A-CC----A-----C-T--T--T-TT--G-T--------T---A---T---T---TT-TTC---AC-----------A-C-T----G-T--G-AA-A----A----------AA-T----A-------A---C-G--------G--ACTT---T--CT---A---T-------T-C-AA--GG------------------------G--A--T--ACT-T---G-T--C--A-A--T-A-T-T----------TC--TCTG-CT--G--A--A-AATG-taaa
gi|18                         :                       AACA-T-T---TA-G---T--TAA-G-A---TA-A--C-G--T-A--AA-G--T---TTTCAG-A---G-G----TA---------A--T---CG-A----------T-------T-A----G----T-A-T-------GC-G-------------A--T--A-G-ATA-A---G----G-C-GGC--A----A-G-TT---A--G----A--------C---G-G--A-A-G-T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--G--T-G-------GA---A----A--A--G-A-C-----A-----C-T--T--T-T---A----------T---A---T---T---TT-T-C---AC-----------A-C-T----G-T--GAAA-A----A----------A--T----A-------A---C-A--------A--AT-T---T--TT---A---C-------C-T-AA--CG------------------------G--A--T---AA-T---T-T--C--A-AG-T-A-T-T----------TC--ACTG-CT--T--A--A-AATG-TA
gi|19                         :                          A-T-T---TA-T---T--AAA-T-A---TA-A--C-G--T-A--AA-A--T---C----A-A---G-G----TA---------A--T---C--A----------T-------T-G----G----T-A-TT------GC-G---G---------A--T--T-G-ATT-T---A----G-C-GGC--A----A-G-T----A--G----A--------C-C-G-G--A-A-A-T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--G--T-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-------T-T---G-T--------T---A---T---T---TT-T-C---AC-----------A-C-A----C-T--G-AA-A----A----------A--T----A-------A---C-A--------A--A--T---TAATTTG-A---C-------T-C-AA--CG------------------------G--A--T--AAA-T---T-T--C--A-A--T-A-T-T----------TC--ACTG-CT--A--A--A-AATG-TAA
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gi|21                         :                       AATA-T-T---TA-T---T--AAA-T-A---TA-A--C-G--T-A--AA-A--T---T----A-A---G-G----TA---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-A-TT------GC-G---G---------A--T--G-G-ATA-T---T----G-C-GGC--A----A-G-T----A--G----A--------C-C-G-G--A-A-A-T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--C---C---A--C--T--G--G-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-T--T--T-T---G-T--------T---A---T---T---AT-T-C---AC-----------A-C--------T--G-AC-A----A----------A--T----A-------A---C-A--------A--C--T---T--TT---A---C-------G-C-AA--CG------------------------G--A--T--AAA-T---T-T--C--A-A--T-A-T-T----------TC--ACTG-CT--A--A--A-AATG-TAA
gi|22                         :                          A-T-T---TA-T---T--GAA-T-A---TA-A--C-G--T-A--AA-A--T---T----A-A---G-G----TC---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-A-TT------GC-T---G---------A--T--A-T-ATA-T---T----G-C-TGC--A----A-G-T----A--A----A--------C-C-G-G--A-A-A-T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------A-----C--T---C---A--C--T--G--T-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-T--T--T-T---G-T--------T---A---T---T---TT-T-C---AC-----------A-C-T----G-T--G-AA-A----A----------A--T----A-------A---C-G--------A--C--T---T--CT---A---T-------T-T-AA--GG------------------------G--A--T--ACT-T---G-T--C--A-A--T-A-T-T----------TC--TCTG-CT--G--A--A-AATG-TAAta
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gi|29                         :                                                      gA-A--C-G--T-A--GA----T---T----A-A---G-G----TT---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-A-CT------GC-G---G---------A--TT-A-T-ATA-T---T----G-C-GGC--A----A-G-T----A--A----A--------C-C-G-G--A-A---T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----CCCT---C---A--C--T--G--T-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-T--T--T-----G-T--------T---A---T---T---TT-T-CC--AC-----------C-C-T----G-T--G-AA-A----A----------A--T----A-------AA--C-A--------A--A--T---T--CT---A---T-------T-C-AA--CG------------------------G--A--T--AAA-T---T-T--C--A-A--T-A-T-T----------TC--ACTG-CT--G--A--A-AATG-TAAta
gi|3                          :                                             AA-T-A---AA-A--C-G--T-AGAAA-A--T---T----A-GTCCG-GAATCTC---------A--TAA-C--A----------T-------T-A----G----T-AATTCAAAAAGC-G---GCCGAGA---A--T--A-G-ATA-T---T----GGT-GGC--A----A-GAT----AAGG----AAAGTCCATC-C-G-G--A-A-A-T-TA-----T--T-------------T-T-------T-----C--T---C---A--C--A--G--T-GG------AA---A----A--T--A-A-C-----AT----C-T--T--T-T---G-T--------T---A-------T---TT-T-C---ACAATGTATGTAAA-C-TAGA-G-T--G-AA-AAAATA----------A--T----A-------A---C-A--------AG-A--T---T--TA---A---T-------T-TAAA--CG------------------------A--A--TCAAAA-T---T-T--T--ACA--T-A-T-T----------TC--ACTG-CT--G--A--A-AATG-TA
gi|30                         :                        aaaatgtattagatacgtatgcA-T-A---TA-A--C-G--T-A--AA-A--C---C----A-A---C-G----GT---------A--T---C--A----------TG------T-A----G----T-A-TT------GC-G---G---------A--T--A-G--TA-T---T----G-C-GGC--A------G-T----A--G----A--------C-C-G-AC-A-A-ACT-TG-----T--T---A---T-----T-G-------------C--T---C---A--C--T--G--TTG-------AA---A----A--T--A-A-C-----A----------T--T-T---G-G--------T---G---T---T---TT-T-C---AC-----------AAC-T----G------AA-A----A----------A--T----A-------A---C-A--------A--A--T---T--GT---A---C-------T-C--A--CG------------------------G--A--T--AA------T-T--CATA-A--T-A-T-C---------------CTG-CT--A--A--A-Aca
gi|31                         :                                                   cattA-A--C-A--TGA--AA-A--T---T----A-A----------TT---------A--T-----------------T-------T-AAAATG----T-A-TT------TT-G------------------------TA-T---T----G-T-G-C--A----A-A-T----T--G----T--------C-C-C------A-G-T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--A---C---G--C--T--G--A-A-------AA---A----AA-T--A-A-------A-----C-T--T--G-----G-T--------T---A---C---T---T----C---AC-----------A-C-T----G-T--G-AA-G----G----------A--T----A-------C---C-A--------AT-T--T---T--TT---A---T-------TCC-AG--TG------------------------G--A--T--ACA-T---T-T--C--A-A--T-A-T-T----------TTAAACTG-TT--G--A--A-AATA-TGAtaat
gi|32                         :                        ACA-T-T---TA-T------AAA-T-A---TA-A--C-G--T-A--AA----T---T----A-A---G-G----TT---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-A-T-------GC-G---G---------A--T--A-G-ATA-T---T----G-C-TGC--A----A-G------A--G----A--------C-C-G-G--A-A-G-T-TG-----T--T---A---A-----T-T-------T-----C----------A--C--T--G--T-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-T--T--T-T---G----------T---A---T---T---TT-T-C---AC-------------C-T----G-T--G-AA-A----A----------A--T----A-------A---C-A--------A--A------T--CT---A---T-------T-C-AA--AG------------------------G-----T--AAA-T---T-T--C--A-A--T-A---T----------TC--ACTG-CT--taaa
gi|33                         :                          A-T-T---TA-T---T--ATA-T-A---TA-T--C-G--T-A--AA-A--T---G----A-A---G-G----TG---------A--T---C-------------T-------T-AT---G----T-A-TT------GC-G---G---------A--T--G-A-ATA-T---C----G-C-GGC--A----A-G-T----A--GT---T--------T-C-G-G--------T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T--------T---C---A--CAAT--A--T-G-------AA---A----A--T--A----------------------------------------T---A---T-------------------------------C-T----A-T--G-AA-A----AT---------A--T----G-------A--------------------------------A---T-------T-T-GA--TG------------------------G--A--T--AAA-T---T-T--C--A-G--T-A-T-T----------GG--AATG-TT--C--A--A-AATA-TAA
gi|34                         :                     aaAACA-T-T---TA-T---T--AAA-T-A---TA-A--C-G--T-A--AA-A--G---T----A-A---G-G----TC---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-A-CT------GC-A---G---------A--T--A-G-AAA-T---T----G-C-GGC--A----A-G-A----A--G----A--------C-C-G-G--A-C-A-T-TG-----T--T---A---TGTTACT-T-------T-----C--A---C---A--C--T--G--T-G-------AA---A----A--T--A-A-T-----G-----C-T--T--T-T---G-T--------T---A-------T---TT-T-A---AC-----------A-C--------T--G-AA-A----A----------A--T----A------------------------------------T---A---T-------T-C-AA--CG------------------------A--A--T--AAT-T---T-T--T--A-A--T-taaa
gi|35                         :                        gCA-T-T---TA-T---T--AAA-T-AA--TA------G--T-A--A-----T---T----A-A---G-G----TT---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-A-T-------GC-G---G---------C--T--A-G-ATA-T---T----G-C-GGC--A----A-G-T----A--G----A--------C---G-G--A-A-A-T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--G--T-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-T--T--T-T-----T--------T---A---T---T---TT-T-C---AC-----------G-T-T----G-T--T-GA-A----A----------A--T----A-------A---A-A--------A--A---------AA---A---T-------T-C-AC--TG------------------------A--A--T--AAA-T---T-T--C--A---------------------------TG-CT--G--A--A-
gi|36                         :                       AACA-T-T---TA-T---T--AAA-T-A---TA-A--C-G--T-A--AA-C--T---T----A-T---T-A----TC---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-T-TT------GT-G---G---------A--T--A-G-ATA-T---T----G-C-GAC--A----A-G-T----A--G----A--------C-C-G-G--A-A-A-T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--A---C---A--C--T--G--TGG-------AA---A----A--T--A-A-G-----A------------------------------------------------------------------------------------AA-A----A----------A--T----A--------------------------------------------T-------T-C-AA--CG------------------------G--A--T--AAA-T---T-T--T--A-A--T-A-T-T----------TC--ACTG-TT--C--A--A-AATG-TAA
gi|37                         :                          A-T-T---TA-T---T--AAA-TTA---TA-A--C-G--T-A--AA-A--T---T----A-A---G-G----TT---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-A-TC------GC-G---G---------A--T--T-G-ATA-T---T----G---GGC--A----A---T----A--G----A--------C-C-G-G----A-A-T-TG-----T--T---AT--T-----T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--G--T-G-------AA---ATTCTA--TTCA-A-CGGATAA-----A-T--T--T-C---A-A--------T---A---T---T---T---------C-----------A-C-T----GCT--G-GA-A----A----------A--T----taa
gi|38                         :                                                                                                                                                                  ga-G---G---------A--T--A-G-ATA-T---T----G-C-GGC--A----A-G-T----A--A----A--------CGC-G-G--A-A-A-T-TGG----T--T---A---T-----A-T-------T-----C--T---CG--A--C--T--G--T-G-------AAT--A----A--T--A-A-C-----A-----T-C--T--T-T---G-T--------C---A---T---T---TTTT-C---AC-----------A-C-T----G-T--G-AA-A----A----------A--T----A-------A---C-A--------A--A--T---T--CT---A---T-------T-C-AA--CG------------------------G--A--T--AAA-C---T-T--C--A-A--T-A-T-T----------TC--ACCG-CT--G--A--A-AATG-TAAgtaatt
gi|39                         :                                                 -A---TA-A--C-G--T-A--AA-A--G---G----A-A---G-A----TG---------A--T---T-------------T-------T-AT---G----C-A-TT------GT-G---G---------AA-T--G-A-ATA-T---T----A-C-GAC--A----A-G------------------------------------G-T-TG-----T--T---A---TA----T-T-------T-----T--T-----------------------------------------------A-C-----G-----C-T--T--C-T---GGT--------T---A---C---A---CA-T-C---A------------A-C-G----G-T--G-AA-A----A----------A-------A-------A---T-A--------A--A--T---T---T---A---T-------T-C-AG--TT------------------------G--A--T--AGA-T---T-T--T--A-G--A-A-T-T----------TC--ACTG-TT--G--A--A-AATG-ta
gi|4                          :                               ---TA-T---T--AAAAT-AAATTA-A--C-G--T-A--AA-A--G---T----A-A---G-G----TGTGGAAGTCTA--T---T--A----------TAGGCTA-T-A----G----G-G-CT------G--G---C---------A--TT-A-G-ATA-TGTTT----GGC-GGT--A----A-T-T----A--A----A--------C-C-G----A-A-A-T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--T---TCG-A--A--T--G--T-G-------AA---G----AATT--ATA-C-----A-----C-T--T--TCT---G-TAGTGGCTAT---A---T---TAGGTT-C-A---AC-----------A-C-T----G-T--A-AA-A----ATAAGCAAATGA--T----A-------C---C-A--------A--A--T---T--AC---A---TAAGTGGAT-C-A---CGTA----------------------G--AG-T--AAA-TAT-T-TGCC--A-A--T-AAT-T----------TC--CATG-CT--G--A--A-AATG-TAA
gi|40                         :                     taAACA-T-T---AG-T---T--AAA-T-A----A-A--C-G--T-A--AA-A--T---C----A-A---A-G----GT---------A--T---C--A----------T--------------G----T-A---------GG-G---G---------A--T--A-T-ATA-T---T----G-C-GGC--A------G-T----T--G----A--------C---G-G--A-A-A-T-TG-----T--T---A---A-----T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--G--T-G-------AA---A----AG-T--A-A-C-----A-----C-T--T--T-T---G-A--------T---AT--T---T---TT-T-C---AC-----------A-C-T----GCT--G-AA-A----A----------A--T----A-------A---C-A--------A--A--T---T--at
gi|41                         :                       gACA-T-T---TA-T---T--AA--T-A---TA-A--C-G--T-A--AA-A--T---T----A-A---G-G----TT---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-A-TC------GC-G---G---------A--T--T-G-ATA-T---T----G-C-GGC--A----A---T----A--G----A--------C-----G--G-A-A-T-TG-----T--T---AT--T-----T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--G--T-G-------AA---A----taccaa
gi|41                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  g-A--------A--A--T---T--CT---A---T-------T-C-AA--CG------------------------G--A--T--AAA-T---T-T--C--A-A--T-A---T----------TC--ACTG-CTG-G--A--A-AATG-TAAttctattcaacggataaatttcaatattcactgctggaaaatgtaata
gi|42                         : gacatttattaatataacgtaaaattaaggttatcattagtatcgcggattgatattgcggcaatagacggaattgttatttttctcactgtg----TA---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-A-TC------GT-G---T---------A--T--A-A-ATA-T---T----T-C-GGC--A----A-T-T----A--G----T--------CAA-G-G--G-A-A-T-CG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--A---C---A--T--T--G--T-G-------AA---A----T--T--T-A-C-----A-----T-CAAT--T-T---G-T--------ta
gi|42                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  --T-C---G-T--------T---A---T---T---TT---C---AC-----------A-T-T----G-T--G-AA-A----TTT--------A--C----A-------T---C-A--------A--T--T---T--GT---G---T-------T-T-AA--CG------------------------G--A--T--GAA-T---T-T--C--A-A--T-A-T-T----------TC--AATG-CT--G--A--A-AATG-CAAgtttaacggatgaatttcaatatttcaatgctgaaaatgcaata
gi|43                         :                                                                                                                                                                 taatcattagtatcgtgtataaatatttcggcaattagtcaagggaaC--A----A-G-T----A--GT---C--------C-C-G-G--------T-TA-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--A---T---A--C--T--G--T-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----A--------------------------------------------------------------------A-C-T----G-T--T-AA-A----A-------------T----A-------T---C-A--------ATAA--T---T--TT---A---T-------T-C-AA--CG------------------------G--A--T--AA---------------------A-T-T----------TC--GCT--CT--G--A--A-AATG-TAta
gi|44                         :       gcatggaattggataaAACAAT-T---TA-T---T--AAA-T-A---TA-A--C-G--T-A--AA-A--T---C----A-A---G-G----TA---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----TAA-TT------GC-G---G---------A--T--A-G-ATA-T---T----G-CGGGC--A----A-G-T----A--G----A--------C-C-G-GA-A-A-A-T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--G--T-GA------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-T--ttagat
gi|45                         :                         CA-T-T---CA-T---T--AGA-T-A---TA-A--C-G--T-A--AA-A--T---T----A-A---G-G----TT---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-AATT------GC-G---G---------A--T--T-G-ATA-T---T----G-C-GGC--A----A-G-T----A--G----A--------C-C-G-G--A-A-A-T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--G--T-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-
gi|46                         :                                            tAA-T-A---TA-A--C-G--T-A--AA-A--T---T----A-A---G-G----TG---------A--T---C--A----------T-------T-T----G----T-A-TT------GC-G---G---------A--T--A-T-ATA-C---T----G-C-GGC--A----A-A-T----A--A----A--------C-C-G-G--A-A-A-T-TGTTTACT--T---A---T-----T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--G--T-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-T--T--
gi|47                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      acgt--T--G--T-G-------AA---A-------T--A-A-C-----A-----C-C--A--C-T--------------T---A---T---T---TT-T-C---ACGTTAAC-----A-C-C----A-T--T-GA-A----T----------A--T----A-------A---T-A--------T--C--T---T--AC---G---T-------T-C-AA--CA------------------------G--A--T--ACC-T---T-G--C--A-A--C-A-T-T----------TT--ACTG-CT--G--A--A-AGCG-TAA
gi|49                         :                         CA-TAT---TA-T---T--AA--T-A---TA-A--C-G--T-A--AA-A--A---T----T-A---G-G----TT---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-A-TT------GC-G---G---------A--T----G-AAA-T---T----G-C-GGC--A----A-G-T----A--G----A--------C-C-G-G--A-A-G-T-TG-----T--T---A---------T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--G--T-G-------AA---taaacaa
gi|5                          :                       AAAA-C-T---TA-TC--T--AAA-T-T---TA-AA-C-G--T-A--AA-AA-T---C----A-A---G-G----TA---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-A-TTG-----GC-G---G---------A--T--A-G-ATA-T---T----G---GGC--A----A-G-T----A--GA---A--------C-C-G-G--ACA-A-G-TGTGGA-T--T---AAGTC-----T-T-------T-----C--T---C---A--CGGTGAG--T-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-TTCT--T-T---A-TGAA-----T---A---T---T---TT-T-C---AC-----------GCC-T----G-T--G-AA-A----A----------A--T----T-------A---C-A--------A--AG-C---T--TT---A---C-------T-C-AATTCGA-----------------------G--AG-T--AAT-T---TGT--C----A--T-A-TGT----------TC--ACGG-CT--T--AATA-AGTG-TAA
gi|50                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tg---G-T--------C---A---T---G---TT-T-----AC-----------A-C-C----A-T--GTCA-A----A----------A--T----T-------A---T-A--------A--AG-C---T--GT---A---C-------T-C-AA--TG------------------------T--A--T--AAA-T---T-T--C--A-G--T-A-T-T----------TC--ACTG-TT--T--A--C-AACG-taaa
gi|51                         :                       AACA-C-T---TA-T---T--GAA-T-A---TA-A--C-T--T-A--AA-A--T---T----A-A---G-G----TT---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----C-A-AT------GC-G---G---------A--T--A-G-ATA-T---T----G-C-GGC--A----A-G-T----A--A----A--------C-T-G-cta
gi|52                         :                                 tag-T---T--AAA-T-A---CC-T--C-G--T-G--AA-C--T---G----A-A---G-T----TG---------A--T---C-------------T-------T-AT---G----T-A-TC------GC-G---GATTT-----A--T--G-A-ATA-T---T----G-C-GGC--A----A-G-T----A--
gi|53                         :                        ACA-T-C---TA-T---C--AAA-T-A---TA-A--C-G--T-A--AC-A--T---T----A-A---G--------------------T---C--A----------T-------T-G----G----T-A-TT------GC-G---G---------A--TGAA-T-ATA-T---T----A-C-GGC--A----A-G-T----A--G----A--------C-C-G-G--A-attccggttgat
gi|54                         :                                                                                                                                                                                                                                                                            gg---A---T-----T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--G--T-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-T--T--T-T---T-T--------C---AGGTC---T---TT-T-C---AC-----------A-C-T----G-T--G-AA-A----A----------A--ta
gi|55                         :                             -T---TG-T---T--GAA-T-A---TA-A--C-G--T-A--GA-A--T---T----A-A---G-G----TT---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-A-CT------GC-G---G---------A--T--A-T-ATA-T---T----G-C-GGC--A----A-G-T----A--G----A--------C-C-G-agggtatatacatgta
gi|56                         :                         cA-T-G---TA-T---T--AGA-T-A---TA-T--C-G--T-A--AA-A--T---G----A-A---G-A----TATA-------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-A-AC------GC-G---G---------A--T--A-A-ACA-C---T----G-C-AGC--A----A-G-T----A--G----
gi|57                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            A-A----A----------A--T----A-------A--------------------T---T--TA---A---T-------T-C-A---TG------------------------G--A--T--GAG-T---T-T--C--A-G--T-A-T-T----------TC--ACTG-AA--G--A--A-AATG-TAA
gi|58                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       aactacagc-----------A-C-T----G-T--G-AA-A----A----------A--T----A-------A---C-A--------A--A--T---T--CT---A---T-------T-C-AA--CG------------------------G--A--T--AAA-T---T-T--C--A-A--T-A-T-T----------TC--ACTG-CT--G--A--A-AATG-TAAtaaat
gi|59                         :                                                   ---TA-A--T-G--T-A--AA-A--T---G----A-C---A-G----TG---------ACTT---C--A----------T--------------G----T-A-TC------GC-G---A---------A--T--G-A-ATA-T---T----G-C-GA---G----A-G-T----A--G----ta
gi|6                          :                       AGCA-G-T---TA-T---T--AAA-T-A---TA-AA-C-G--TGA--AA-A--T---C----A-GAG-G-G----TA---------A--TGCAT--A----------T-------T-A----GGGTAT-A-CT------GCTG---G---------ACGT--A-G-ATA-TG--T----G-C-GGC--A----A-G-TTA--G--G----A--------C-C-G-G--G-A-G-T-TG-----T--T---A---T-----T-G-------T-----C--T---TT--A--C--T--G--TCG-------GATACA----A--T--A-AAC-----A-----C-T--T--T-T-----TGAA-----T---A---T---T---TT-T-C---AC-----------A-C-T----G-G--A-AA-A----A----------G--T----A-------A---T-C--------A--A--T---T--GTTACA---T-------C-T-AA--CG------------------------G--A--T--AAAGTTAAT-T--C--A-ATGT-A-T-T----------GT--ACTG-CT--A--A--A-AATG-TAAtcacggttg
gi|60                         :                                                                                                                                                                                                                                                                 a-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----T--A---C---A--C--T--G--A-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-------C-T---G-T--------T---A---T---T---TT-C-C---G------------A-C------G-T--G--A-A----A----------A--T----G-------A---C-A--------A--G--T---t
gi|61                         :                                                                                                                                                                                                                                                   -C-G-G--A-A-G-T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--G--T-G-------AA------------------C-----A-----C-T--T--T-T---G-T--------T---A---T---T---TT-T-C---AC-----------A-C-T----G-T--A-AT-A----A----------A--T----A-------A---att
gi|62                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     --------A--A--T---T--TT---A---T-------T-C-AA--CG------------------------G--A--T--AAA-T---T-T--C--A-A--T-A-T-T----------TC--ACTG-CA--G--A--A-AATG-TAA
gi|64                         :                                                                         ccat---T----A-A---G-G----TT---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-A-TT------GC-G---G---------A--T--T-G-ATA-A---T----G-C-AGC--A----A-G-T----A--T----A--------C-C-G-G--taa
gi|65                         :                        ACA-T-T---TA-T---T--AAA-T-A---TA-A--C-G--T----AA-A--T---T------A---G-G----TT---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-A-TT------GC-G---G---------A--
gi|66                         :                       AACA-T-T---TA-T---T--AAA-T-A---CA-A--A-G--T-A--GA-A--T---T----A-A---G-G----TC---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-
gi|67                         :                      tgACA-T-TCTGTAGT---T--AAG-T-A---TA-A--T-G--T-A--AA-A--T---G----A-A---G-G----TG---------A--T---C--
gi|68                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            at--A--T--AAA-T---T-T--C--A-A--T-A-T-T----------TC--ACTT-CT--A--A--A-AATG-TAA
gi|69                         :                                                                                                                                                                                                           -C-GGC--A----A-G-T----A--G----A--------C-C-G-G--A-A-A-T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--T---C---A--taa
gi|7                          :                       AACA-T-T---TA-T---TTTAAA-T-A---TA----C-GCCT-A--AA-G--T---T----A-A---G-G----TTT--------A--T---C--AG---------T-------T-A----G----T-A-TT------GC-GACCG---------A--T--AAG-ATA-T---T----G-C-GGC--ACGCAA-G-T----A--G----A--------C-C-GCG--A-A-A-T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--GT-T-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-T--T--T-T---G-T--------TC--A---T---T---TT-T-TCAAAC-----------A-C-T----GCT--G-AA-A----A----------A--TA---A-------A---C-A--------A--A--T---T--CT---A---T-------T-C-AA--CGC-----------------------G--AATT--AAA-T---T-T--C--A-A--T-A-T-T----------TC--ACTGACT--GGAA--A-AATG-TAA
gi|8                          :                             -T---CA-T---T--AAT-T-A---TA-A--C-G--T-A--AATA--T---C----A-A---G-G----TA---------A--T---C--AAT--------TA------T-A----G----T-A-TT------GC-G---G---------A--T--A-G-ATA-T---T----G-C-GGCAAA----A-G-T----G--A----T--------C-C-G-GT-ATA-G-T-TG-----T--TTTAA---T-----C-T-------T-----C--T---C---A--CG-T--G--T-G--------A---A----A--T--A-A-C-----A-----C-T--T--TGT---G-A--------T---A---T---T---TT-C-T---AC-----------A-C-T----G-T--G-AA-A----ATAC-------A--T----A-------A---CGA--------A--A--T---T--TT---A---C-------T-C-AA--C-------------------------G--A--T--AGA-T---T-T--C--A-A--T-A-T-TTTCAACTGCCTC--ACTG-CT--A--A--A-AATG-TAAttaa
gi|9                          :                                             AA-T-T---TA-A--C-G--T-A--AA-A--T---T----A-A---G-G----TG---------A--T---C-------------T-------T------G----T-A-TT------GG-C---G---------A--T--A-TTATA-C---T----G-C-GGC--A----A-A-T----A--A----A--------C-C-G-G--A-A---T-TG-----T--TT--A---C-----T-TATT----T-----C--T---C---A--C--T--G--TTG-------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-T--T--T-T---A-T--------T---A---T---T---TT-T-C---AC-----------A-C-T----G-T--G-AA-A----A----------AT-T----A-------A---C----------A--C--T---T--TT---A---T-------T-taa
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                -T-TA-----T--T---A---T-----T-T-------TT----C--A---C---A--C--T--G--T-G-------AA---A----AATT--A-A-C-----A-----C-T--T--T-T---A-T--------T---A---T---T---TT-T-C---AC-----------A-C--------T--G-GA-A----A----------A--T----A-------A---C-A--------A--A--T---T--CT---A---T-------T-C-AA--CG------------------------G--A--A--AAA-T---T-T--C--A-A--T-A-T-T----------TC---CTG-CT-----A--A-AATG-TAatttttcacactggaaaataacaaattctattcaacggaaaaatttcaatatttcctgctaaaatgtata


blockSeqs                     :                           A A CTG  C CTA TT     T AAT    GA C AC G GT    GA CTA TTCA   TCC   AATC GTGGAAGTCT CT GCA GC ATAATTAACT AGGCTA  T AAAT GGTA C A  CAAAAA    ACC CCGAGA    CG GAA  T     GTT TTT  G     TA CGCA   C CATT AG TAAC AAGTCCAT G C T C  G        TTTAC A  TTA AGT GTTAC   GTATGGG ATT   CC ACA CTC AA AA GA GC T G        TAC TTCT AT TC G   GGATA ACT     AA .  C TTT C AGTGGCTA C   GGT CCG AGG  C T CAA  AATGTATGTAA A   AGA  C TT T    AAAT TAAGCAAATG GT TACT TAAAGGC A     C        ACT   CCA AAT TAC ATC AAGTGGA G    TT  GGGATATACAAATTCTATTCAACG TA AT CA     TAA   CA CA   TG       TTCAACTGCC  AA       AA GA AT      C
blockSeqs                     :                           . . .    A C   T      T A      A  T CC G GA    A  .   .      AG    GG   ATA        G  AA  G  AT         G       C T    G    A A  CA        .   ATTT      C  AA   T     G   .    G     AA T      A TA   .  T    A        G G C A  C        TGGA  G  TG  T   A       ATT     T     G  .   CG  T  GG .  T  T A        G   TA   AT G  T   C     G       TC .  G T   G GAA      .   T   .   .    T T CA   GTTAAC      C   .    C .  A    .    TAC        A  A    ATT     .     T        TAA   .   C   TG  T   .       C    TT  TC                       A  A  A      AT    GC AT   T        AG          AA       G  .  .       .
blockSeqs                     :                           . . .    G .   .      . .      A  T .  . G     A  .   .      T     AG   TT         .  .   .  C          G       . T    A    . A  G         .   .         A  TA   .     .   .    .     .  C      . T    .  T    .        A . . T  C        G     .  A   T   .       A       .     .  .   C   .  G  .  .  G .        T   C    A  .  .   .     T       .  .  . .   . GAA      .   .   .   .    . T C    G           .   .    C .  A    .    TT         A  .    .       .     .        AT    .   C   A   .   .       .    T   TA                       .  G  .      .     .  .    G        .           A        .  .  .       .
blockSeqs                     :                           . . .    . .   .      . .      .  . .  . .     A  .   .      .     .    T          .  .   .  G          G       . T    .    . .  .         .   .         .  GT   .     .   .    .     .  .      . .    .  A    .        . . . .  T        .     .  T   .   .       .       .     .  .   G   .  .  .  .  C .        .   .    G  .  .   .     .       .  .  . .   . .        .   .   .   .    . . .    C           .   .    C .  T    .    T          T  .    .       .     .        AA    .   C   .   .   .       .    .   A                        .  G  .      .     .  .    .        .           .        .  .  .       .
blockSeqs                     :                           . . .    . .   .      . .      .  . .  . .     .  .   .      .     .    T          .  .   .  .          A       . .    .    . .  .         .   .         .  TT   .     .   .    .     .  .      . .    .  .    .        . . . .  .        .     .  .   .   .       .       .     .  .   T   .  .  .  .  T .        .   .    .  .  .   .     .       .  .  . .   . .        .   .   .   .    . . .    .           .   .    . .  .    .    T          .  .    .       .     .        AT    .   C   .   .   .       .    .   C                        .  .  .      .     .  .    .        .           .        .  .  .       .
blockSeqs                     :                           . . .    . .   .      . .      .  . .  . .     .  .   .      .     .    T          .  .   .  .          .       . .    .    . .  .         .   .         .  TA   .     .   .    .     .  .      . .    .  .    .        . . . .  .        .     .  .   .   .       .       .     .  .   .   .  .  .  .  . .        .   .    .  .  .   .     .       .  .  . .   . .        .   .   .   .    . . .    .           .   .    . .  .    .    T          .  .    .       .     .        GA    .   C   .   .   .       .    .   .                        .  .  .      .     .  .    .        .           .        .  .  .       .
blockSeqs                     :                           . . .    . .   .      . .      .  . .  . .     .  .   .      .     .    T          .  .   .  .          .       . .    .    . .  .         .   .         .  TA   .     .   .    .     .  .      . .    .  .    .        . . . .  .        .     .  .   .   .       .       .     .  .   .   .  .  .  .  . .        .   .    .  .  .   .     .       .  .  . .   . .        .   .   .   .    . . .    .           .   .    . .  .    .    .          .  .    .       .     .        TA    .   C   .   .   .       .    .   .                        .  .  .      .     .  .    .        .           .        .  .  .       .
blockSeqs                     :                           . . .    . .   .      . .      .  . .  . .     .  .   .      .     .    T          .  .   .  .          .       . .    .    . .  .         .   .         .  AA   .     .   .    .     .  .      . .    .  .    .        . . . .  .        .     .  .   .   .       .       .     .  .   .   .  .  .  .  . .        .   .    .  .  .   .     .       .  .  . .   . .        .   .   .   .    . . .    .           .   .    . .  .    .    .          .  .    .       .     .        GA    .   T   .   .   .       .    .   .                        .  .  .      .     .  .    .        .           .        .  .  .       .
blockSeqs                     :                           . . .    . .   .      . .      .  . .  . .     .  .   .      .     .    T          .  .   .  .          .       . .    .    . .  .         .   .         .  A    .     .   .    .     .  .      . .    .  .    .        . . . .  .        .     .  .   .   .       .       .     .  .   .   .  .  .  .  . .        .   .    .  .  .   .     .       .  .  . .   . .        .   .   .   .    . . .    .           .   .    . .  .    .    .          .  .    .       .     .        TT    .   C   .   .   .       .    .   .                        .  .  .      .     .  .    .        .           .        .  .  .       .
blockSeqs                     :                           . . .    . .   .      . .      .  . .  . .     .  .   .      .     .    T          .  .   .  .          .       . .    .    . .  .         .   .         .  A    .     .   .    .     .  .      . .    .  .    .        . . . .  .        .     .  .   .   .       .       .     .  .   .   .  .  .  .  . .        .   .    .  .  .   .     .       .  .  . .   . .        .   .   .   .    . . .    .           .   .    . .  .    .    .          .  .    .       .     .        AG    .   T   .   .   .       .    .   .                        .  .  .      .     .  .    .        .           .        .  .  .       .
blockSeqs                     :                           . . .    . .   .      . .      .  . .  . .     .  .   .      .     .    C          .  .   .  .          .       . .    .    . .  .         .   .         .  A    .     .   .    .     .  .      . .    .  .    .        . . . .  .        .     .  .   .   .       .       .     .  .   .   .  .  .  .  . .        .   .    .  .  .   .     .       .  .  . .   . .        .   .   .   .    . . .    .           .   .    . .  .    .    .          .  .    .       .     .        AG    .   C   .   .   .       .    .   .                        .  .  .      .     .  .    .        .           .        .  .  .       .
blockSeqs                     :                           . . .    . .   .      . .      .  . .  . .     .  .   .      .     .    A          .  .   .  .          .       . .    .    . .  .         .   .         .  A    .     .   .    .     .  .      . .    .  .    .        . . . .  .        .     .  .   .   .       .       .     .  .   .   .  .  .  .  . .        .   .    .  .  .   .     .       .  .  . .   . .        .   .   .   .    . . .    .           .   .    . .  .    .    .          .  .    .       .     .        A     .   T   .   .   .       .    .   .                        .  .  .      .     .  .    .        .           .        .  .  .       .
blockSeqs                     :                           . . .    . .   .      . .      .  . .  . .     .  .   .      .     .    A          .  .   .  .          .       . .    .    . .  .         .   .         .  A    .     .   .    .     .  .      . .    .  .    .        . . . .  .        .     .  .   .   .       .       .     .  .   .   .  .  .  .  . .        .   .    .  .  .   .     .       .  .  . .   . .        .   .   .   .    . . .    .           .   .    . .  .    .    .          .  .    .       .     .        G     .   T   .   .   .       .    .   .                        .  .  .      .     .  .    .        .           .        .  .  .       .
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blockSeqs                     :                           . . .    . .   .      . .      .  . .  . .     .  .   .      .     .    T          .  .   .  .          .       . .    .    . .  .         .   .         .  A    .     .   .    .     .  .      . .    .  .    .        . . . .  .        .     .  .   .   .       .       .     .  .   .   .  .  .  .  . .        .   .    .  .  .   .     .       .  .  . .   . .        .   .   .   .    . . .    .           .   .    . .  .    .    .          .  .    .       .     .        A     .   C   .   .   .       .    .   .                        .  .  .      .     .  .    .        .           .        .  .  .       .
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blockSeqs                     :                             . .    . .   .      . .      .  . .  . .     .  .   .      .     .    A          .  .   .  .          .       . .    .    . .  .         .   .         .  A    .     .   .    .     .  .      . .    .  .    .        . . . .  .        .     .  .   .   .       .       .     .  .   .   .  .  .  .  . .        .   .    .  .  .   .     .       .  .  . .   . .        .   .   .   .    . . .    .           .   .    . .  .    .    .          .  .    .       .     .        A     .   C   .   .   .       .    .   .                        .  .  .      .     .  .    .        .           .        .  .  .       .
blockSeqs                     :                               .    . .   .      . .      .  . .  . .     .  .   .      .     .    T          .  .   .  .          .       . .    .    . .  .         .   .         .  T    .     .   .    .     .  .      . .    .  .    .        . . . .  .        .     .  .   .   .       .       .     .  .   .   .  .  .  .  . .        .   .    .  .  .   .     .       .  .  . .   . .        .   .   .   .    . . .    .           .   .    . .  .    .    .          .  .    .       .     .        G     .   T   .   .   .       .    .   .                        .  .  .      .     .  .    .        .           .        .  .  .        
blockSeqs                     :                                    . .   .      . .      .  . .  . .     .  .   .      .     .    G          .  .   .  .          .       . .    .    . .  .         .   .         .  A    .     .   .    .     .  .      . .    .  .    .        . . . .  .        .     .  .   .   .       .       .     .  .   .   .  .  .  .  . .        .   .    .  .  .   .     .       .  .  . .   . .        .   .   .   .    . . .    .           .   .    . .  .    .    .          .  .    .       .     .        A     .   T   .   .   .       .    .   .                        .  .  .      .     .  .    .        .           .        .  .  .        
blockSeqs                     :                                    . .   .      . .      .  . .  . .     .  .   .      .     .    T          .  .   .  .          .       . .    .    . .  .         .   .         .  A    .     .   .    .     .  .      . .    .  .    .        . . . .  .        .     .  .   .   .       .       .     .  .   .   .  .  .  .  . .        .   .    .  .  .   .     .       .  .  . .   . .        .   .   .   .    . . .    .           .   .    . .  .    .    .          .  .    .       .     .        A     .   C   .   .   .       .    .   .                        .  .  .      .     .  .    .        .           .        .  .  .        
blockSeqs                     :                                    . .   .      . .      .  . .  . .     .  .   .      .     .    A          .  .   .  .          .       . .    .    . .  .         .   .         .  A    .     .   .    .     .  .      . .    .  .    .        . . . .  .        .     .  .   .   .       .       .     .  .   .   .  .  .  .  . .        .   .    .  .  .   .     .       .  .  . .   . .        .   .   .   .    . . .    .           .   .    . .  .    .    .          .  .    .       .     .        A     .   .   .   .   .       .    .   .                        .  .  .      .     .  .    .        .           .        .  .  .        
blockSeqs                     :                                                 . .      .  . .  . .     .  .   .      .     .    T          .  .   .  .          .       . .    .    . .  .         .   .         .  G    .     .   .    .     .  .      . .    .  .    .        . . . .  .        .     .  .   .   .       .       .     .  .   .   .  .  .  .  . .        .   .    .  .  .   .     .       .  .  . .   . .        .   .   .   .    . . .    .           .   .    . .  .    .    .          .  .    .       .     .        C     .   .   .   .   .       .    .   .                        .  .  .      .     .  .    .        .           .        .  .  .        
blockSeqs                     :                                                 . .      .  . .  . .     .  .   .      .     .    G          .  .   .  .          .       . .    .    . .  .         .   .         .  A    .     .   .    .     .  .      . .    .  .    .        . . . .  .        .     .  .   .   .       .       .     .  .   .   .  .  .  .  . .        .   .    .  .  .   .     .       .  .  . .   . .        .   .   .   .    . . .    .           .   .    . .  .    .    .          .  .    .       .     .        A     .   .   .   .   .       .    .   .                        .  .  .      .     .  .    .        .           .        .              
blockSeqs                     :                                                 . .      .  . .  . .     .  .   .      .     .    T          .  .   .  .          .       . .    .    . .  .         .   .         .  A    .     .   .    .     .  .      . .    .  .    .        . . . .  .        .     .  .   .   .       .       .     .  .   .   .  .  .  .  . .        .   .    .  .  .   .     .       .  .  . .   . .        .   .   .   .    . . .    .           .   .    . .  .    .    .          .  .    .       .     .        .     .   .   .   .   .       .    .   .                        .  .  .      .     .  .    .        .                                   
blockSeqs                     :                                                 . .      .  . .  . .     .  .   .      .     .    G          .  .   .  .          .       . .    .    . .  .         .   .         .  G    .     .   .    .     .  .      . .    .  .    .        . . . .  .        .     .  .   .   .       .       .     .  .   .   .  .  .  .  . .        .   .    .  .  .   .     .       .  .  . .   . .        .   .   .   .    . . .    .           .   .    . .  .    .    .          .  .    .       .     .        .     .   .   .   .   .       .                                 .  .  .      .     .  .    .                                            
blockSeqs                     :                                                 . .      .  . .  . .     .  .   .      .     .    A          .  .   .  .          .       . .    .    . .  .         .   .         .  A    .     .   .    .     .  .      . .    .  .    .        . . . .  .        .     .  .   .   .       .       .     .  .   .   .  .  .  .  . .        .   .    .  .  .   .     .       .  .  . .   . .        .   .   .   .    . . .    .           .   .    . .  .    .    .          .  .    .       .     .        .     .                                                                                                                                 
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3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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consensus                     :                       AACA-T-T---TA-T---T--AAA-T-A---TA-A--C-G--T-A--AA-A--T---T----A-A---G-G----TN---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-A-TT------GC-G---G---------A--T--A-G-ATA-T---T----G-C-GGC--A----A-G-T----A--G----A--------C-C-G-G--A-A-A-T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--G--T-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-T--T--T-T---G-T--------T---A---T---T---TT-T-C---AC-----------A-C-T----G-T--G-AA-A----A----------A--T----A-------A---C-A--------A--A--T---T--CT---A---T-------T-C-AA--CG------------------------G--A--T--AAA-T---T-T--C--A-A--T-A-T-T----------TC--ACTG-CT--G--A--A-AATG-TAA
Reference ( family-2116 )     :                       AACA-T-T---TA-T---T--AAA-T-A---TA-A--C-G--T-A--AA-A--T---T----A-A---G-G----TN---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-A-TT------GC-G---G---------A--T--A-G-ATA-T---T----G-C-GGC--A----A-G-T----A--G----A--------C-C-G-G--A-A-A-T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--G--T-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-T--T--T-T---G-T--------T---A---T---T---TT-T-C---AC-----------A-C-T----G-T--G-AA-A----A----------A--T----A-------A---C-A--------A--A--T---T--CT---A---T-------T-C-AA--CG------------------------G--A--T--AAA-T---T-T--C--A-A--T-A-T-T----------TC--ACTG-CT--G--A--A-AATG-TAA
gi|1                          :                         CA-T-T---TA-T---G--AGA-TTA---TA-A--T-G--T-A--AA-A--T---C----A-A---G-G----TA---------A--T---TCGA----------TGAAGTGCT-A----T----T-A-TT------GC-G---GCGCTGCTACA--T--A-G-GCA-T---TATGGG-C-GGC--ATATGA-G-T----A--C-------------C-C-G-GTTA-G-G-T-TG-----TGTT---A---T-----T-T-------TGTCCTC--T---T---A--T--T--T--T-GGTTGAATAA---A----G--T--A-A-C-----ATATCTC-T--TCTT-T---G-T--------TCTAG---T---T---TT-T-C---TCG----------A-C-TCGACA-T--G-GA-A----AGAAA------A--T----A-------AACAC-ATGTTGCCTA--G--T---T--CT---C---T-------A-C-AA--CG------------------------G--AA-T--AAA-T---T-T--C--A-A--T-A-T-T----------TC--ACTG-C---G--A--A-AATG-
gi|10                         :                  atgaatACA-T-T---TA-T---TT-AAA-T-A---TA-A--CCG--A-A--GA-A--T---T----A-A---ATG----TT---------A--T---C--A----------TG------T-A----G----T-A-TT------GC-G---G---------A--T--AAG-ATA-T---TTTT-G-C-GGC--A----A-G-T----A--A----A--------C-CCG-G--A-A-A-T-TG-----TA-T---A---T-----T-T-------C-----CG-T---C---A--C--T--G--T-G-------AA---A----A--T--A---C-----AG----C-T--T--T-T---G-T--------T---A---T---T---TT-TTC---AC-----------A-G-T----G-T--G-AA-A----A----------A--T----A-------A---C-A--------A--A--T---T--CT---A---T-------TGC-AA--CG------------------------GA-A--TA-AAA-A---T-A--C--A-A--T-A-T-T----------TCA-ACTG-CT--G--A--A-AATG-TAAaat
gi|11                         :                       AACA-T-T---TT-A---T--AAA-T-A---TA-A--G-A--G-A--AA-A--T---T----C-A---G-G----TT---------AG-T---C--A----------T-------T-A----GG---T-A-TT------GC-G---T---------A--G--A-G-ATA-T---T----G-C-GGCTAA----A-G-T----A--A----A--------C-C-G-G--AGA-A-T-AG-----T--T---A---T-----TGT-------T-----C--T---C---AT-C--T--G--T-A-------AG---A----A--T--AGA-C-----A-----C-T--T--T-T---G-T--------T---A---T---T---TT-T-C----C-------------C-T----G-T--G-AA-A----A----------AGTT----AATT----A---C-A--------A--AT-T---T--CT---AT--T-------T-C-AATTC-------------------------G--A--T--AAA-A---T-T--C--A-AT-T-A-T-T----------TC--ACTG-CT--G-----A-CATG-TAAta
gi|12                         :                                   g-T---T--AAA---A---TA-A--C-G--T-AG-AA-A--T---T----A-A---G------TT---------A--T---C--AATAATTAACTT-------T-A----G----T-A-TT------GC-G---G---------A--TT-A-G-ATA-T---T----G-C-GGC--A----A---T----A--G----A--------C-C-G-G--A-G---T-TG-----TG-T---A---T-----T-T-------T-----C--T---CCTCA--C--T--G--T-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-T--T--T-TTTTG-T--------T---A---T---T---TTCT-C---AC-----------A-C-T----G-T--G-AA-A----A----------AA-T----A-------T---C-A--------A--AA-T---T--CT---A---T-------T-C-AA--CG------------------------G--A--T--AAA-T---G-T--C--A-A--T-A-T-TAG--------TC--ACTG-CT--G--A--A-A--G-TAA
gi|13                         :                       tACA-T-T---TA-T---A--AAA-T-A---AA-A--CTG--T-A--AA-A--T---T----A-A---G-GGG--TT---------A--T---CGCA----------T-------T-A----G----T-A-T-------GC-G---G---------A--T--GTG-ATA-T---G----G-C-GGC--AT---A-G-T----T--A----A--------C-C-G-G--A-A-A-T-TG-----T--TTG-A---T-----T-T-------T-----C--T-------A--C--T--G--T-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-T--G--T-T---GCT--------T---A---T---T---TT-T-CCA-ACG----------A-CTT----G-T--G-AAGA----A----------A--T----A-------A---C-A--------A--G--T---T--CT---A---T-------T-C-GA--AGTC----------------------G--A--T--A-------T-T--C--A-A--TCA-T-T----------TCAAACTG-CT--G--A--A-At
gi|14                         :                           -T-T---TA-TCTAT--AAA-T-----CA-A----G--T-A--AA-AA-T---T----A-A---A-GAG--TT---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----C-A-TT------GC-G---G---------A--T--A-G-ATA-T--------G-C-GGC--A----G-GCT----A--A----A--------CGC-G-G--A-ACA-T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--G--T-G-------AA---AC---A--T--A-A-C-----A-------T--T--T-T---G-T--------T-------TCCGT---TT-T-C---AC-----------A-C-T----G-TTTG-AA-A----A----------A--T----A-------A---C-A--------A--A--T---T--CT---A---T-------T-C-AA--AG------------------------G--A--T--AAC-T---T-T--C--A-G--T-A-T-T----------TC--ACTG-CT--A--A--A-ACTG-tata
gi|15                         :                                   A-T---T--AAA-TTA---TA-A--C-G--T-A--AA-G--T--------A-A---G-G----TT---------A--T---C--AC---------T-------T-A----G----TCA-TT------GC-G---G---------T--T--A-G-CTAAT---T----G-C-TGT--A----A-G-T----C--A----A--------A-C-GTG--A-A-A-T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------TATT--C--T---C---A--C--T--G--T-T-------GA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-C--T--C-----G-T--------T---A---T---T---TT-G-C---AC-----------A-T-C----G-T--GTGA-A----A----------A--T----A-------G---C-CC-------A--A--T---T--CT---A---T-------G-C-AA--TG------------------------G--A--T--AAA-T---T-T--CCAA-A--T-A-T-T----------TC--ACTG-CT--T--A--A-GAtataaa
gi|16                         :                    taaAACA-T-T---TA-T---T--AAA-T-A---TA-A--CTG--T-A--AA--------T----A-A---G-G----TT---------A--T---C--A----------TG------T-A----G----T-A-T----------G---G---------A--T--A---ATA-T---T------C-GGC--A----AAG-T----A--A----A--------C-C-C-G--A-A-A-T-T-------------A---T-----T-T-------T-----C--T---C---C--C--T--G--TTG-------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-T--T--T-T---G-T------------A---T---T---TT-T-C---ACC----------A-C-T------T--C-AA-A----A----------A--TTACTA-------A---C-AT-------A--A--T---T--TT---A---T-------T-C-AA--CG------------------------G--A--T---AA-T---T-TCAC--A-A--T-A---T----------TC--ACTG-CT--G--A--ACAATG-TAAattactaa
gi|17                         :                        gCA-T-T---TA-T------GAA-T-A---TA-A--C-G--T-A--AA-AA-T---T----A-AT--G-G----TC---------A--T---C--A----------T-------TTA----G----T-A-TT------GC-T---G---------A--T--A-ATATA-T---T----G-C-TGC--A------G-T----A--A----AA-------C-C-G-G--A-A-A-T-T------T--T---A---T-----T-T-------A-----C--T---CC--A--C--T--G--T-G-------GA---A----A--T--A-A-CC----A-----C-T--T--T-TT--G-T--------T---A---T---T---TT-TTC---AC-----------A-C-T----G-T--G-AA-A----A----------AA-T----A-------A---C-G--------G--ACTT---T--CT---A---T-------T-C-AA--GG------------------------G--A--T--ACT-T---G-T--C--A-A--T-A-T-T----------TC--TCTG-CT--G--A--A-AATG-taaa
gi|18                         :                       AACA-T-T---TA-G---T--TAA-G-A---TA-A--C-G--T-A--AA-G--T---TTTCAG-A---G-G----TA---------A--T---CG-A----------T-------T-A----G----T-A-T-------GC-G-------------A--T--A-G-ATA-A---G----G-C-GGC--A----A-G-TT---A--G----A--------C---G-G--A-A-G-T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--G--T-G-------GA---A----A--A--G-A-C-----A-----C-T--T--T-T---A----------T---A---T---T---TT-T-C---AC-----------A-C-T----G-T--GAAA-A----A----------A--T----A-------A---C-A--------A--AT-T---T--TT---A---C-------C-T-AA--CG------------------------G--A--T---AA-T---T-T--C--A-AG-T-A-T-T----------TC--ACTG-CT--T--A--A-AATG-TA
gi|19                         :                          A-T-T---TA-T---T--AAA-T-A---TA-A--C-G--T-A--AA-A--T---C----A-A---G-G----TA---------A--T---C--A----------T-------T-G----G----T-A-TT------GC-G---G---------A--T--T-G-ATT-T---A----G-C-GGC--A----A-G-T----A--G----A--------C-C-G-G--A-A-A-T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--G--T-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-------T-T---G-T--------T---A---T---T---TT-T-C---AC-----------A-C-A----C-T--G-AA-A----A----------A--T----A-------A---C-A--------A--A--T---TAATTTG-A---C-------T-C-AA--CG------------------------G--A--T--AAA-T---T-T--C--A-A--T-A-T-T----------TC--ACTG-CT--A--A--A-AATG-TAA
gi|2                          :                       AACA-T-T---TA-T---T--AAA-C-T---TA-AGAC-GACT-AGTAA-A--CCTAT----A-A---G-G----TT---------A--T---C--A----------T-------TCA----GA---T-A-TTCA----GC-G---G---------A--T--A-T-ATT-T---A----G-C-AGC--A----A-G-T----A--ATAACA--------C-C-G-G--ACA-A-CATG-----G--T---G---T-----T-TGTATGGGT-----C--T---T---A--C--T--AGCT-G-------AG---ATA--A--TG-A-A-C-----A-----C-T--T--T-T---G-T--------T-------T---T---TT-T-C---AC-----------A-C-T----G-T--A-GA-A----A----------A--T----ATAAAGGCA---C-A--------A--A--TCCAT--CT---AATCC-------T-C-AA--TGGGGATATACAAATTCTATTCAACGG--A--T--ACA-T---T-T--C--A-A--T-A-A-T----------TC--ACTG-CT--G--A--A-AATA-TAAtaa
gi|20                         :                      gAATA-T-T---TA-T---T--AAA-T-A---TA-A--C-G--T-A--AA-A--T---C----A-A---G-G----TA---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-A-TT------GC-G---G---------A--T--G-G-ATA-T---T----G-C-GGC--A----A-G-T----A--G----A--------C-C-G-G--A-A-A-T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--G--T-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-T--T--T-T---G-T--------T---A---T---T---TT-T-C---AC-----------A-C-T----G-T--G-AA-A----A----------A--T----A-------A---C-A--------A--A--T---T--TT---A---C-------T-C-AA--CG------------------------G--A--T--AAA-T---T-T--C--A-A--T-A-T-T----------TC--ACTG-CT--A--A--A-AATGCTAAta
gi|21                         :                       AATA-T-T---TA-T---T--AAA-T-A---TA-A--C-G--T-A--AA-A--T---T----A-A---G-G----TA---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-A-TT------GC-G---G---------A--T--G-G-ATA-T---T----G-C-GGC--A----A-G-T----A--G----A--------C-C-G-G--A-A-A-T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--C---C---A--C--T--G--G-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-T--T--T-T---G-T--------T---A---T---T---AT-T-C---AC-----------A-C--------T--G-AC-A----A----------A--T----A-------A---C-A--------A--C--T---T--TT---A---C-------G-C-AA--CG------------------------G--A--T--AAA-T---T-T--C--A-A--T-A-T-T----------TC--ACTG-CT--A--A--A-AATG-TAA
gi|22                         :                          A-T-T---TA-T---T--GAA-T-A---TA-A--C-G--T-A--AA-A--T---T----A-A---G-G----TC---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-A-TT------GC-T---G---------A--T--A-T-ATA-T---T----G-C-TGC--A----A-G-T----A--A----A--------C-C-G-G--A-A-A-T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------A-----C--T---C---A--C--T--G--T-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-T--T--T-T---G-T--------T---A---T---T---TT-T-C---AC-----------A-C-T----G-T--G-AA-A----A----------A--T----A-------A---C-G--------A--C--T---T--CT---A---T-------T-T-AA--GG------------------------G--A--T--ACT-T---G-T--C--A-A--T-A-T-T----------TC--TCTG-CT--G--A--A-AATG-TAAta
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gi|27                         :                                               -T-A---TACA--T-G--T-A--AA-AGAT---G----A-A---T-T----TG---------A--T---C--A----------T-------G-T----G----T-A-TC------AC-T---G---------A--T--G-A-ATA-T---T----C-A-GGC--A----A-T-TCATTA--G----A--------T-C-T-A--T-A-G-T-TG-----T--T---A---A-----T-TA------C-----C--TACAC---A--C--T--G--C-G-------AA---A----A--T--A-T-C-----A-----G-T--T--T-T---G-T--------T------------------T-C---AC-----------A-G-T----G-T--G-AA-A----AT---------G--T----A-------A--------------A--T--T---T--AT---A---T-------T-C-AA--TG------------------------G--A--T--AAA-T---T-A--C--T-G--T-A-T-T----------TC--ACTG-TT--T--A--A-AACG-ca
gi|28                         :                                             gA-T-A---TA-T--C-G--T-A--AA----T---T----ATA----------TT---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-A-TT------GC-G---G---------AC-T--A-G-ATA-T---T----G-C---------------------------------------C-G-G--A-A-G-T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----T--T---C---AAAC--T--G--T-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----AACT--T-T--T--T-T---G-T--------T---A---T---T---TT-TTC---AC-----------A-C-T----G-T--T-AA-A----A----------T--T----A-------A---C-A--------AT-A--T---T--TT---A---C-------T-C-AA--CG------------------------G--AA-T--AAA-T---T-T--T--C-A--T-A-T-T----------TC--ACTG-CTAAA--A--A-AATG-TAAcg
gi|29                         :                                                      gA-A--C-G--T-A--GA----T---T----A-A---G-G----TT---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-A-CT------GC-G---G---------A--TT-A-T-ATA-T---T----G-C-GGC--A----A-G-T----A--A----A--------C-C-G-G--A-A---T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----CCCT---C---A--C--T--G--T-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-T--T--T-----G-T--------T---A---T---T---TT-T-CC--AC-----------C-C-T----G-T--G-AA-A----A----------A--T----A-------AA--C-A--------A--A--T---T--CT---A---T-------T-C-AA--CG------------------------G--A--T--AAA-T---T-T--C--A-A--T-A-T-T----------TC--ACTG-CT--G--A--A-AATG-TAAta
gi|3                          :                                             AA-T-A---AA-A--C-G--T-AGAAA-A--T---T----A-GTCCG-GAATCTC---------A--TAA-C--A----------T-------T-A----G----T-AATTCAAAAAGC-G---GCCGAGA---A--T--A-G-ATA-T---T----GGT-GGC--A----A-GAT----AAGG----AAAGTCCATC-C-G-G--A-A-A-T-TA-----T--T-------------T-T-------T-----C--T---C---A--C--A--G--T-GG------AA---A----A--T--A-A-C-----AT----C-T--T--T-T---G-T--------T---A-------T---TT-T-C---ACAATGTATGTAAA-C-TAGA-G-T--G-AA-AAAATA----------A--T----A-------A---C-A--------AG-A--T---T--TA---A---T-------T-TAAA--CG------------------------A--A--TCAAAA-T---T-T--T--ACA--T-A-T-T----------TC--ACTG-CT--G--A--A-AATG-TA
gi|30                         :                        aaaatgtattagatacgtatgcA-T-A---TA-A--C-G--T-A--AA-A--C---C----A-A---C-G----GT---------A--T---C--A----------TG------T-A----G----T-A-TT------GC-G---G---------A--T--A-G--TA-T---T----G-C-GGC--A------G-T----A--G----A--------C-C-G-AC-A-A-ACT-TG-----T--T---A---T-----T-G-------------C--T---C---A--C--T--G--TTG-------AA---A----A--T--A-A-C-----A----------T--T-T---G-G--------T---G---T---T---TT-T-C---AC-----------AAC-T----G------AA-A----A----------A--T----A-------A---C-A--------A--A--T---T--GT---A---C-------T-C--A--CG------------------------G--A--T--AA------T-T--CATA-A--T-A-T-C---------------CTG-CT--A--A--A-Aca
gi|31                         :                                                   cattA-A--C-A--TGA--AA-A--T---T----A-A----------TT---------A--T-----------------T-------T-AAAATG----T-A-TT------TT-G------------------------TA-T---T----G-T-G-C--A----A-A-T----T--G----T--------C-C-C------A-G-T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--A---C---G--C--T--G--A-A-------AA---A----AA-T--A-A-------A-----C-T--T--G-----G-T--------T---A---C---T---T----C---AC-----------A-C-T----G-T--G-AA-G----G----------A--T----A-------C---C-A--------AT-T--T---T--TT---A---T-------TCC-AG--TG------------------------G--A--T--ACA-T---T-T--C--A-A--T-A-T-T----------TTAAACTG-TT--G--A--A-AATA-TGAtaat
gi|32                         :                        ACA-T-T---TA-T------AAA-T-A---TA-A--C-G--T-A--AA----T---T----A-A---G-G----TT---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-A-T-------GC-G---G---------A--T--A-G-ATA-T---T----G-C-TGC--A----A-G------A--G----A--------C-C-G-G--A-A-G-T-TG-----T--T---A---A-----T-T-------T-----C----------A--C--T--G--T-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-T--T--T-T---G----------T---A---T---T---TT-T-C---AC-------------C-T----G-T--G-AA-A----A----------A--T----A-------A---C-A--------A--A------T--CT---A---T-------T-C-AA--AG------------------------G-----T--AAA-T---T-T--C--A-A--T-A---T----------TC--ACTG-CT--taaa
gi|33                         :                          A-T-T---TA-T---T--ATA-T-A---TA-T--C-G--T-A--AA-A--T---G----A-A---G-G----TG---------A--T---C-------------T-------T-AT---G----T-A-TT------GC-G---G---------A--T--G-A-ATA-T---C----G-C-GGC--A----A-G-T----A--GT---T--------T-C-G-G--------T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T--------T---C---A--CAAT--A--T-G-------AA---A----A--T--A----------------------------------------T---A---T-------------------------------C-T----A-T--G-AA-A----AT---------A--T----G-------A--------------------------------A---T-------T-T-GA--TG------------------------G--A--T--AAA-T---T-T--C--A-G--T-A-T-T----------GG--AATG-TT--C--A--A-AATA-TAA
gi|34                         :                     aaAACA-T-T---TA-T---T--AAA-T-A---TA-A--C-G--T-A--AA-A--G---T----A-A---G-G----TC---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-A-CT------GC-A---G---------A--T--A-G-AAA-T---T----G-C-GGC--A----A-G-A----A--G----A--------C-C-G-G--A-C-A-T-TG-----T--T---A---TGTTACT-T-------T-----C--A---C---A--C--T--G--T-G-------AA---A----A--T--A-A-T-----G-----C-T--T--T-T---G-T--------T---A-------T---TT-T-A---AC-----------A-C--------T--G-AA-A----A----------A--T----A------------------------------------T---A---T-------T-C-AA--CG------------------------A--A--T--AAT-T---T-T--T--A-A--T-taaa
gi|35                         :                        gCA-T-T---TA-T---T--AAA-T-AA--TA------G--T-A--A-----T---T----A-A---G-G----TT---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-A-T-------GC-G---G---------C--T--A-G-ATA-T---T----G-C-GGC--A----A-G-T----A--G----A--------C---G-G--A-A-A-T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--G--T-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-T--T--T-T-----T--------T---A---T---T---TT-T-C---AC-----------G-T-T----G-T--T-GA-A----A----------A--T----A-------A---A-A--------A--A---------AA---A---T-------T-C-AC--TG------------------------A--A--T--AAA-T---T-T--C--A---------------------------TG-CT--G--A--A-
gi|36                         :                       AACA-T-T---TA-T---T--AAA-T-A---TA-A--C-G--T-A--AA-C--T---T----A-T---T-A----TC---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-T-TT------GT-G---G---------A--T--A-G-ATA-T---T----G-C-GAC--A----A-G-T----A--G----A--------C-C-G-G--A-A-A-T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--A---C---A--C--T--G--TGG-------AA---A----A--T--A-A-G-----A------------------------------------------------------------------------------------AA-A----A----------A--T----A--------------------------------------------T-------T-C-AA--CG------------------------G--A--T--AAA-T---T-T--T--A-A--T-A-T-T----------TC--ACTG-TT--C--A--A-AATG-TAA
gi|37                         :                          A-T-T---TA-T---T--AAA-TTA---TA-A--C-G--T-A--AA-A--T---T----A-A---G-G----TT---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-A-TC------GC-G---G---------A--T--T-G-ATA-T---T----G---GGC--A----A---T----A--G----A--------C-C-G-G----A-A-T-TG-----T--T---AT--T-----T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--G--T-G-------AA---ATTCTA--TTCA-A-CGGATAA-----A-T--T--T-C---A-A--------T---A---T---T---T---------C-----------A-C-T----GCT--G-GA-A----A----------A--T----taa
gi|38                         :                                                                                                                                                                  ga-G---G---------A--T--A-G-ATA-T---T----G-C-GGC--A----A-G-T----A--A----A--------CGC-G-G--A-A-A-T-TGG----T--T---A---T-----A-T-------T-----C--T---CG--A--C--T--G--T-G-------AAT--A----A--T--A-A-C-----A-----T-C--T--T-T---G-T--------C---A---T---T---TTTT-C---AC-----------A-C-T----G-T--G-AA-A----A----------A--T----A-------A---C-A--------A--A--T---T--CT---A---T-------T-C-AA--CG------------------------G--A--T--AAA-C---T-T--C--A-A--T-A-T-T----------TC--ACCG-CT--G--A--A-AATG-TAAgtaatt
gi|39                         :                                                 -A---TA-A--C-G--T-A--AA-A--G---G----A-A---G-A----TG---------A--T---T-------------T-------T-AT---G----C-A-TT------GT-G---G---------AA-T--G-A-ATA-T---T----A-C-GAC--A----A-G------------------------------------G-T-TG-----T--T---A---TA----T-T-------T-----T--T-----------------------------------------------A-C-----G-----C-T--T--C-T---GGT--------T---A---C---A---CA-T-C---A------------A-C-G----G-T--G-AA-A----A----------A-------A-------A---T-A--------A--A--T---T---T---A---T-------T-C-AG--TT------------------------G--A--T--AGA-T---T-T--T--A-G--A-A-T-T----------TC--ACTG-TT--G--A--A-AATG-ta
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gi|41                         :                       gACA-T-T---TA-T---T--AA--T-A---TA-A--C-G--T-A--AA-A--T---T----A-A---G-G----TT---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-A-TC------GC-G---G---------A--T--T-G-ATA-T---T----G-C-GGC--A----A---T----A--G----A--------C-----G--G-A-A-T-TG-----T--T---AT--T-----T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--G--T-G-------AA---A----taccaa
gi|41                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  g-A--------A--A--T---T--CT---A---T-------T-C-AA--CG------------------------G--A--T--AAA-T---T-T--C--A-A--T-A---T----------TC--ACTG-CTG-G--A--A-AATG-TAAttctattcaacggataaatttcaatattcactgctggaaaatgtaata
gi|42                         : gacatttattaatataacgtaaaattaaggttatcattagtatcgcggattgatattgcggcaatagacggaattgttatttttctcactgtg----TA---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-A-TC------GT-G---T---------A--T--A-A-ATA-T---T----T-C-GGC--A----A-T-T----A--G----T--------CAA-G-G--G-A-A-T-CG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--A---C---A--T--T--G--T-G-------AA---A----T--T--T-A-C-----A-----T-CAAT--T-T---G-T--------ta
gi|42                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  --T-C---G-T--------T---A---T---T---TT---C---AC-----------A-T-T----G-T--G-AA-A----TTT--------A--C----A-------T---C-A--------A--T--T---T--GT---G---T-------T-T-AA--CG------------------------G--A--T--GAA-T---T-T--C--A-A--T-A-T-T----------TC--AATG-CT--G--A--A-AATG-CAAgtttaacggatgaatttcaatatttcaatgctgaaaatgcaata
gi|43                         :                                                                                                                                                                 taatcattagtatcgtgtataaatatttcggcaattagtcaagggaaC--A----A-G-T----A--GT---C--------C-C-G-G--------T-TA-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--A---T---A--C--T--G--T-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----A--------------------------------------------------------------------A-C-T----G-T--T-AA-A----A-------------T----A-------T---C-A--------ATAA--T---T--TT---A---T-------T-C-AA--CG------------------------G--A--T--AA---------------------A-T-T----------TC--GCT--CT--G--A--A-AATG-TAta
gi|44                         :       gcatggaattggataaAACAAT-T---TA-T---T--AAA-T-A---TA-A--C-G--T-A--AA-A--T---C----A-A---G-G----TA---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----TAA-TT------GC-G---G---------A--T--A-G-ATA-T---T----G-CGGGC--A----A-G-T----A--G----A--------C-C-G-GA-A-A-A-T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--G--T-GA------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-T--ttagat
gi|45                         :                         CA-T-T---CA-T---T--AGA-T-A---TA-A--C-G--T-A--AA-A--T---T----A-A---G-G----TT---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-AATT------GC-G---G---------A--T--T-G-ATA-T---T----G-C-GGC--A----A-G-T----A--G----A--------C-C-G-G--A-A-A-T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--G--T-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-
gi|46                         :                                            tAA-T-A---TA-A--C-G--T-A--AA-A--T---T----A-A---G-G----TG---------A--T---C--A----------T-------T-T----G----T-A-TT------GC-G---G---------A--T--A-T-ATA-C---T----G-C-GGC--A----A-A-T----A--A----A--------C-C-G-G--A-A-A-T-TGTTTACT--T---A---T-----T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--G--T-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-T--T--
gi|47                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      acgt--T--G--T-G-------AA---A-------T--A-A-C-----A-----C-C--A--C-T--------------T---A---T---T---TT-T-C---ACGTTAAC-----A-C-C----A-T--T-GA-A----T----------A--T----A-------A---T-A--------T--C--T---T--AC---G---T-------T-C-AA--CA------------------------G--A--T--ACC-T---T-G--C--A-A--C-A-T-T----------TT--ACTG-CT--G--A--A-AGCG-TAA
gi|49                         :                         CA-TAT---TA-T---T--AA--T-A---TA-A--C-G--T-A--AA-A--A---T----T-A---G-G----TT---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-A-TT------GC-G---G---------A--T----G-AAA-T---T----G-C-GGC--A----A-G-T----A--G----A--------C-C-G-G--A-A-G-T-TG-----T--T---A---------T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--G--T-G-------AA---taaacaa
gi|5                          :                       AAAA-C-T---TA-TC--T--AAA-T-T---TA-AA-C-G--T-A--AA-AA-T---C----A-A---G-G----TA---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-A-TTG-----GC-G---G---------A--T--A-G-ATA-T---T----G---GGC--A----A-G-T----A--GA---A--------C-C-G-G--ACA-A-G-TGTGGA-T--T---AAGTC-----T-T-------T-----C--T---C---A--CGGTGAG--T-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-TTCT--T-T---A-TGAA-----T---A---T---T---TT-T-C---AC-----------GCC-T----G-T--G-AA-A----A----------A--T----T-------A---C-A--------A--AG-C---T--TT---A---C-------T-C-AATTCGA-----------------------G--AG-T--AAT-T---TGT--C----A--T-A-TGT----------TC--ACGG-CT--T--AATA-AGTG-TAA
gi|50                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tg---G-T--------C---A---T---G---TT-T-----AC-----------A-C-C----A-T--GTCA-A----A----------A--T----T-------A---T-A--------A--AG-C---T--GT---A---C-------T-C-AA--TG------------------------T--A--T--AAA-T---T-T--C--A-G--T-A-T-T----------TC--ACTG-TT--T--A--C-AACG-taaa
gi|51                         :                       AACA-C-T---TA-T---T--GAA-T-A---TA-A--C-T--T-A--AA-A--T---T----A-A---G-G----TT---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----C-A-AT------GC-G---G---------A--T--A-G-ATA-T---T----G-C-GGC--A----A-G-T----A--A----A--------C-T-G-cta
gi|52                         :                                 tag-T---T--AAA-T-A---CC-T--C-G--T-G--AA-C--T---G----A-A---G-T----TG---------A--T---C-------------T-------T-AT---G----T-A-TC------GC-G---GATTT-----A--T--G-A-ATA-T---T----G-C-GGC--A----A-G-T----A--
gi|53                         :                        ACA-T-C---TA-T---C--AAA-T-A---TA-A--C-G--T-A--AC-A--T---T----A-A---G--------------------T---C--A----------T-------T-G----G----T-A-TT------GC-G---G---------A--TGAA-T-ATA-T---T----A-C-GGC--A----A-G-T----A--G----A--------C-C-G-G--A-attccggttgat
gi|54                         :                                                                                                                                                                                                                                                                            gg---A---T-----T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--G--T-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-T--T--T-T---T-T--------C---AGGTC---T---TT-T-C---AC-----------A-C-T----G-T--G-AA-A----A----------A--ta
gi|55                         :                             -T---TG-T---T--GAA-T-A---TA-A--C-G--T-A--GA-A--T---T----A-A---G-G----TT---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-A-CT------GC-G---G---------A--T--A-T-ATA-T---T----G-C-GGC--A----A-G-T----A--G----A--------C-C-G-agggtatatacatgta
gi|56                         :                         cA-T-G---TA-T---T--AGA-T-A---TA-T--C-G--T-A--AA-A--T---G----A-A---G-A----TATA-------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-A-AC------GC-G---G---------A--T--A-A-ACA-C---T----G-C-AGC--A----A-G-T----A--G----
gi|57                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            A-A----A----------A--T----A-------A--------------------T---T--TA---A---T-------T-C-A---TG------------------------G--A--T--GAG-T---T-T--C--A-G--T-A-T-T----------TC--ACTG-AA--G--A--A-AATG-TAA
gi|58                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       aactacagc-----------A-C-T----G-T--G-AA-A----A----------A--T----A-------A---C-A--------A--A--T---T--CT---A---T-------T-C-AA--CG------------------------G--A--T--AAA-T---T-T--C--A-A--T-A-T-T----------TC--ACTG-CT--G--A--A-AATG-TAAtaaat
gi|59                         :                                                   ---TA-A--T-G--T-A--AA-A--T---G----A-C---A-G----TG---------ACTT---C--A----------T--------------G----T-A-TC------GC-G---A---------A--T--G-A-ATA-T---T----G-C-GA---G----A-G-T----A--G----ta
gi|6                          :                       AGCA-G-T---TA-T---T--AAA-T-A---TA-AA-C-G--TGA--AA-A--T---C----A-GAG-G-G----TA---------A--TGCAT--A----------T-------T-A----GGGTAT-A-CT------GCTG---G---------ACGT--A-G-ATA-TG--T----G-C-GGC--A----A-G-TTA--G--G----A--------C-C-G-G--G-A-G-T-TG-----T--T---A---T-----T-G-------T-----C--T---TT--A--C--T--G--TCG-------GATACA----A--T--A-AAC-----A-----C-T--T--T-T-----TGAA-----T---A---T---T---TT-T-C---AC-----------A-C-T----G-G--A-AA-A----A----------G--T----A-------A---T-C--------A--A--T---T--GTTACA---T-------C-T-AA--CG------------------------G--A--T--AAAGTTAAT-T--C--A-ATGT-A-T-T----------GT--ACTG-CT--A--A--A-AATG-TAAtcacggttg
gi|60                         :                                                                                                                                                                                                                                                                 a-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----T--A---C---A--C--T--G--A-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-------C-T---G-T--------T---A---T---T---TT-C-C---G------------A-C------G-T--G--A-A----A----------A--T----G-------A---C-A--------A--G--T---t
gi|61                         :                                                                                                                                                                                                                                                   -C-G-G--A-A-G-T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--G--T-G-------AA------------------C-----A-----C-T--T--T-T---G-T--------T---A---T---T---TT-T-C---AC-----------A-C-T----G-T--A-AT-A----A----------A--T----A-------A---att
gi|62                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     --------A--A--T---T--TT---A---T-------T-C-AA--CG------------------------G--A--T--AAA-T---T-T--C--A-A--T-A-T-T----------TC--ACTG-CA--G--A--A-AATG-TAA
gi|64                         :                                                                         ccat---T----A-A---G-G----TT---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-A-TT------GC-G---G---------A--T--T-G-ATA-A---T----G-C-AGC--A----A-G-T----A--T----A--------C-C-G-G--taa
gi|65                         :                        ACA-T-T---TA-T---T--AAA-T-A---TA-A--C-G--T----AA-A--T---T------A---G-G----TT---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-A-TT------GC-G---G---------A--
gi|66                         :                       AACA-T-T---TA-T---T--AAA-T-A---CA-A--A-G--T-A--GA-A--T---T----A-A---G-G----TC---------A--T---C--A----------T-------T-A----G----T-
gi|67                         :                      tgACA-T-TCTGTAGT---T--AAG-T-A---TA-A--T-G--T-A--AA-A--T---G----A-A---G-G----TG---------A--T---C--
gi|68                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            at--A--T--AAA-T---T-T--C--A-A--T-A-T-T----------TC--ACTT-CT--A--A--A-AATG-TAA
gi|69                         :                                                                                                                                                                                                           -C-GGC--A----A-G-T----A--G----A--------C-C-G-G--A-A-A-T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--T---C---A--taa
gi|7                          :                       AACA-T-T---TA-T---TTTAAA-T-A---TA----C-GCCT-A--AA-G--T---T----A-A---G-G----TTT--------A--T---C--AG---------T-------T-A----G----T-A-TT------GC-GACCG---------A--T--AAG-ATA-T---T----G-C-GGC--ACGCAA-G-T----A--G----A--------C-C-GCG--A-A-A-T-TG-----T--T---A---T-----T-T-------T-----C--T---C---A--C--T--GT-T-G-------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-T--T--T-T---G-T--------TC--A---T---T---TT-T-TCAAAC-----------A-C-T----GCT--G-AA-A----A----------A--TA---A-------A---C-A--------A--A--T---T--CT---A---T-------T-C-AA--CGC-----------------------G--AATT--AAA-T---T-T--C--A-A--T-A-T-T----------TC--ACTGACT--GGAA--A-AATG-TAA
gi|8                          :                             -T---CA-T---T--AAT-T-A---TA-A--C-G--T-A--AATA--T---C----A-A---G-G----TA---------A--T---C--AAT--------TA------T-A----G----T-A-TT------GC-G---G---------A--T--A-G-ATA-T---T----G-C-GGCAAA----A-G-T----G--A----T--------C-C-G-GT-ATA-G-T-TG-----T--TTTAA---T-----C-T-------T-----C--T---C---A--CG-T--G--T-G--------A---A----A--T--A-A-C-----A-----C-T--T--TGT---G-A--------T---A---T---T---TT-C-T---AC-----------A-C-T----G-T--G-AA-A----ATAC-------A--T----A-------A---CGA--------A--A--T---T--TT---A---C-------T-C-AA--C-------------------------G--A--T--AGA-T---T-T--C--A-A--T-A-T-TTTCAACTGCCTC--ACTG-CT--A--A--A-AATG-TAAttaa
gi|9                          :                                             AA-T-T---TA-A--C-G--T-A--AA-A--T---T----A-A---G-G----TG---------A--T---C-------------T-------T------G----T-A-TT------GG-C---G---------A--T--A-TTATA-C---T----G-C-GGC--A----A-A-T----A--A----A--------C-C-G-G--A-A---T-TG-----T--TT--A---C-----T-TATT----T-----C--T---C---A--C--T--G--TTG-------AA---A----A--T--A-A-C-----A-----C-T--T--T-T---A-T--------T---A---T---T---TT-T-C---AC-----------A-C-T----G-T--G-AA-A----A----------AT-T----A-------A---C----------A--C--T---T--TT---A---T-------T-taa
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                -T-TA-----T--T---A---T-----T-T-------TT----C--A---C---A--C--T--G--T-G-------AA---A----AATT--A-A-C-----A-----C-T--T--T-T---A-T--------T---A---T---T---TT-T-C---AC-----------A-C--------T--G-GA-A----A----------A--T----A-------A---C-A--------A--A--T---T--CT---A---T-------T-C-AA--CG------------------------G--A--A--AAA-T---T-T--C--A-A--T-A-T-T----------TC---CTG-CT-----A--A-AATG-TAatttttcacactggaaaataacaaattctattcaacggaaaaatttcaatatttcctgctaaaatgtata
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|48 ): CCGAGCGATCACCTGACACAAACTTCCACTGGCATGGGGTAATTAAATATCACGCAATAACTACAGGTCATATGACAAATACTATCTTTCTGCATTTGGT
Unaligned ( gi|63 ): ATATTATGCATATTCCTTGCACCAGGTTCATTGTAGATAAATTGCTTTTG
Unaligned ( gi|70 ): TGGACTGCGATTATTATAAATCAATGTGCCTT