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Reference ( gi|5 )            :  TTAC-TCTT--C--AA-GT-T--AA---C--TC-GT-GTATAGTTT--AGGCGG--TGT-ACTTT---A-A--A---AAG--AAG----A----GAAA-CATGT-CGGAAAA----------TTGACAAAGAAGA-AAC-TTGGG---TT---C-GTGG-C-AA---G-T-ACAA-ATT-AA---G-A--TTT-A-A-A----TA-T----GCA-T--CTAA---GT--AA--TTAA-A------TA-CATA-AT-AC-AA--C--ATG---T----TTTATATC----------CAT-G-T-TGACG-A-T--AT--TC-C-C--GT--------G-A-AAC-ATTAC----------TGG-CACACGACG--TTAC-G-G----TTAAACGTGATCGAAA
gi|4                          :  TTAC-TCTT--C--AA-AT-T--AA---C--TC--T-GTATAGTT---AGGCGG---GT-ACTTT---A-A--ATA-AAG--AAG---------GAAA-CATTT-CGGAAA-----------TTGACAAAGAAGA-AAC-TTGGT---TT---C-CTGG-C-AA---G-TTACAC-ATT-AAA--G-A--TTT-A-A-A----TA-T----GCA-T--TTAA---GT--AAATTTAA-AA-----TA-CAGA-GT-AC-AAACC--ATG---T----TTTATATC----------CAT-GTT-TGAC--A-T--AT--TC-C-C--GT--------G-A-AAC-ATTAC----------TGG-C-CACGACC--GTAC-GAG----TT-AACGTAATCGAA
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gi|9                          :    AC-TCTT--C--AA-GT-T--AA---C--TT-GT-GTATAGTTT--AGGCGG---GT-ACTTT---A-A--ATA-AAG--AAG----A----GAAG-CATGT-CGGAAA-----------TTGACAAAGAAGA-CAC---GAG---T------GTGG-C-AA---G-T-ACAA-ATT-AA---C-A--TTT-A-A-A----TA-T----GTA-T--TTAA---GT--AA--TTAA-A------TA-CATA-GT-----A--C--ATG---T----TTTATATC----------CAT-G-T-TGAC--A-T--AT--TC-C-C--GT--------G-A-AAC-GTTAC----------CGG-CACATGGCG---TAC-GAG----TT-AACATGATCGAAgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcatattttaccttagcagca
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1 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|18 ): TTTGCGGGAAGTATGAATTACGATTTTGATATGTATTTAAATGATTTGA






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Reference ( family-2082 )     :   TTAC-TCTT--C--AA-GT-T--AA---C--TC-GT-GTATAGTTT--AGGCGG-G---T--ACTTT-AAA--TA-AAG---AAG----A----GAAA-CATGT-CGGAAAA----------TTGACAAAGAAGACA-C-NTGGG---T---T---C-GTGG-CAA---G-T-ACAA-ATTAA---GA--TTT-A-A-A--TA-T------GTA-T--TT-A---A--GT--AA--TTAA-A------TA-CATAG-T-AC--AA--C--ATG---T----TTTATATC----------CAT-GT-T-G-A-C--A--T--AT--TC-C-C--GT--------GA-A----AC-ATTAC-TGG-C----------A--CA-CGA-CG-TA-CG--AGTT--AACGTGATCGAAA
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gi|11                         :                                                           ---T--ACTTT-AGA--TA-AAG---AAGCTAGA----GAAA-CATGT-CGG-AAA----------TTGACAAAGAAGACA-C-ATGGGT--T---T---C-GTGG-CAA---G-T-ACAA-ATTAA---GA--TTT-A-A-A--TA-T------GTA-T--TT-A---A--GT--AA--TTAA-A------TA-CATAG---ACA-AA--C--ATG---T----TTTATAAC----------AAT-GT-T-G-A-CATA--T--AT--TC-C-C--GT--------GA-A----AC-ATTAC-TGG-C----------A--CA-CGA-TG-TA-CG--AGTT--AACGTGATCGAA
gi|12                         :    TAC-TCTT--C--AA-AT-T--AA---C--TC--T-GTATAGTT---AGGCGG-G---T--ACTTT-AAA--TA-AAG---AAG---------GAAA-CATTT-CGGAAA-----------TTGACAAAGAAGAAA-C-TTGGT---T---T---C-CTGG-CAA---G-TTACAC-ATTAAA--GA--TTT-A-A-A--TA-T------GCA-T--TT-A---A--GT--AA--TTAA-A------TA-CA
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gi|15                         :           T--C--AA-GC-T--AA---C--TC-GT-ATAGAGTTT--AGGCCA-G---C--ACTTT-AGA--TA-GAG---AAA----A----TAAA-CATGT-CGGAAA
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gi|6                          :    TAC-TCTTTTC--AA-GT-T--AA---C--CG-GT-G-ATAGTTC--AGGCGG-G------ACTTT-AAA--TA-AAG---AAG----A----GAAAACATGT-CTGGAAA----------TTGATAAAGAAAACA-C-GTGGGGT-T---T---C-TTGGTTAA---G-T-ACAA-ATTAA---TA--TTT-C-A-A--TA-T------GTATT--TT-A---A--GT--AA--TT-A-A------TA-CA-AG-T-AC--AG--C--ATG--------TTTATATC----------CAT-GT-T-G-A-CATA--T--AT--TC-C-C--GA--------GC-A----AC-ATTTC-TTG-C----------A--CA-CGA-CG-TA-AA--AG-T--AAC-TGATCGAAA
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gi|8                          :      C-TCTT--C--AA-GT-T--AA---C--TC-GT-GTATAGTTT--AGGCGG-G---T--ATTT---AA--TA-AAG---AAG----A----AAAA-CATGT-TGGAAA-----------TTGACAAAGAAGGCA-C-GTGGG---T---TT--C-GTG--CAA---G-T-A----ATTAA---GA--TTT-A-ATA--T--T------GTA-T--TT-A---A--GT--AAC-TTAA-A------TA-CATAG-T--C--AA--CAAATG--------TTTATAAC----------AAT-GT-T-G---C--A--T--ATA-TC-C-C--GT--------GA-A----AC-ATTAC-TGG-C----------A--CA-CGA-TG-TA-CG--AGTT--AACGTG-TCGAA
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Reference ( family-2082 )     :   TTAC-TCTT--C--AA-GT-T--AA---C--TC-GT-GTATAGTTT--AGGCGG-G---T--ACTTT-AAA--TA-AAG---AAG----A----GAAA-CATGT-CGGAAAA----------TTGACAAAGAAGACA-C-NTGGG---T---T---C-GTGG-CAA---G-T-ACAA-ATTAA---GA--TTT-A-A-A--TA-T------GTA-T--TT-A---A--GT--AA--TTAA-A------TA-CATAG-T-AC--AA--C--ATG---T----TTTATATC----------CAT-GT-T-G-A-C--A--T--AT--TC-C-C--GT--------GA-A----AC-ATTAC-TGG-C----------A--CA-CGA-CG-TA-CG--AGTT--AACGTGATCGAAA
gi|1                          :   TTACGTCTT--CCAAA-GT-T--AGAG-CGGTC-GTTGTAGAGTTTGAAAGCGA-----T--ACTTT-AAA--TAGAAG---AAG----A----GAAC-GATAT-CGAGGAGGTTTCATAGTTTGACAAAGAAGACA-CGTTGGG---TTTCT---C-GTGG-CAACACGTT-ACAA-ATTAAT--GAATTTT-A-A-AATTA-CATCGTGGTA-T--TT-AATCA--GTTAAA--TTAACA------TA-CATAG-T-CCAAAA--C--ATA---T----GTTAT-TCTATAGGACGACAT-GT-T-G-A-C--A--T--ATCGTCGC-C--GT--------GA-ATACTAT-ATCAA--GG-C----------AACCACCGA-TG-TA-CG--A
gi|10                         :  aTTAC-TCTT--C--AA-GT-T--AA---C--TC-GT-GTTTAGTTT--CAGCGG-G---A--ACTTT-AAA--T----------------------------GT-CGGAAA-----------TTGACAAAGAAGACA-C-GTGGG---T---TTCGC-GTGG-TAA---G-T-ACAA-ATTAA---GA--TTT-A-G-A--TA-T------GTA-T--TT-A---A--GC--AA--TTAA-A------TG-CATAG-T-GC--AA--C--ATG---T----TTTATATC----------CAT-GT-T-G-A-C--A--T--AT--CC-C-C---T--------GA-A----AC-ATTAC-TGG-C----------A--CA-CGA-CG-TA-CG--AGAT--AACGTGATCGAAAagt
gi|11                         :                                                           ---T--ACTTT-AGA--TA-AAG---AAGCTAGA----GAAA-CATGT-CGG-AAA----------TTGACAAAGAAGACA-C-ATGGGT--T---T---C-GTGG-CAA---G-T-ACAA-ATTAA---GA--TTT-A-A-A--TA-T------GTA-T--TT-A---A--GT--AA--TTAA-A------TA-CATAG---ACA-AA--C--ATG---T----TTTATAAC----------AAT-GT-T-G-A-CATA--T--AT--TC-C-C--GT--------GA-A----AC-ATTAC-TGG-C----------A--CA-CGA-TG-TA-CG--AGTT--AACGTGATCGAA
gi|12                         :    TAC-TCTT--C--AA-AT-T--AA---C--TC--T-GTATAGTT---AGGCGG-G---T--ACTTT-AAA--TA-AAG---AAG---------GAAA-CATTT-CGGAAA-----------TTGACAAAGAAGAAA-C-TTGGT---T---T---C-CTGG-CAA---G-TTACAC-ATTAAA--GA--TTT-A-A-A--TA-T------GCA-T--TT-A---A--GT--AA--TTAA-A------TA-CA
gi|13                         :                                                                                                                                  AGAGTAGACA-C-CTGGG---T---T---TTGTGG-CAA---G-T-ATGA-ATTAA---GA--TTT-A-G-A--TA-T------GCA-T--TT-A---A--AC--GA--TTTA-A------TA-TATAG-T-AC--AA--C--ATG---T----TCTACATC----------CATCTT-T-G-AGT--A--TGAGT--TA-C-C--GT--------GA-gnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcatattttaccttagcagca
gi|14                         :                                                                                                                                                                 agaatcctggcg-T-ACAACATTAA---AA--TTT-A-A-AA-TA-T------GTA-T--TT-A---A--GT--AA--T-AA-A------TAACATAGAT-AC--AA--C--ATG---C----TTTATATC----------CAT-GT-T-G-A-C--A--T--AT--TC-C-----T--------AA-A----GC-ATTACTTGG-C----------A--CA-CGA-CA-TA-CG--A-TT--AACGTGATCGAAAtcga
gi|15                         :           T--C--AA-GC-T--AA---C--TC-GT-ATAGAGTTT--AGGCCA-G---C--ACTTT-AGA--TA-GAG---AAA----A----TAAA-CATGT-CGGAAA
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gi|17                         :                           A---C--TC-TT-GTATAGTTT--AGGCGG-G---T--ACCAT-AAA--TA-AAG---AGG----A----GACA-CATGT-CGG-AAA----------TTGACAAAGAAGACA-C-GTt
gi|18                         :                                                                                                                                                    ---T---T---T-GCGG-GAA---G-T-ATGA-ATTAC---GA--TTT-T-G-A--TA-T------GTA-T--TT-A---A--AT--GA--TT
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            -A----AC-ATTAC-TTG-C----------A--CA-CGA-CG-TA-CG--AGTT--CAC-TGATCAAAAtga
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gi|21                         :   TTAT-TCTT--C--AA-GT-T--AA---C--TC-GT-GTATAGTTC--AGt
gi|3                          : atTTAC-TCTT--T--AGTGTAT--AAGAAC--TC-GT-GTATGGTTT--AGGCGG-G---CTAACTTT-AAATTTA-AAG----AG----ATCGTAAAA-CATG--CGGAAAA----------TGAATAAAG-AGACA-C-GTAGG---T---T---T-GTGG-CAA---A-T--CAA-ATTAA---GA--TTTGA-A-A--TA-T------GTG-TTATT-A---A--GT--AA--TT-A-A------TA-CTCAG-T-AC--AA--C--ATG---TTTAGTTTATATC----------CAT-GT-T-G-A-C--AAGT--AT--TC-C-CCAGTTAGGCATAGA-A----AC-ATTAC-TGGCC----------A--CA-C-A-CT-TA-CGAAAGTTTAAACG
gi|4                          :   TTAC-TCTT--C--AA-AT-T--AA---C--TC--T-GTATAGTT---AGGCGG-G---T--ACTTT-AAA--TA-AAG---AAG---------GAAA-CATTT-CGGAAA-----------TTGACAAAGAAGAAA-C-TTGGT---T---T---C-CTGG-CAA---G-TTACAC-ATTAAA--GA--TTT-A-A-A--TA-T------GCA-T--TT-A---A--GT--AAATTTAA-AA-----TA-CAGAG-T-AC--AAACC--ATG---T----TTTATATC----------CAT-GT-TTG-A-C--A--T--AT--TC-C-C--GT--------GA-A----AC-ATTAC-TGG-C-------------CA-CGACCG-TA-CG--AGTT--AACGTAATCGAA
gi|5                          :   TTAC-TCTT--C--AA-GT-T--AA---C--TC-GT-GTATAGTTT--AGGCGGTG---T--ACTTT-AAA-----AAG---AAG----A----GAAA-CATGT-CGGAAAA----------TTGACAAAGAAGAAA-C-TTGGG---T---T---C-GTGG-CAA---G-T-ACAA-ATTAA---GA--TTT-A-A-A--TA-T------GCA-T--CT-A---A--GT--AA--TTAA-A------TA-CATAA-T-AC--AA--C--ATG---T----TTTATATC----------CAT-GT-T-G-A-CG-A--T--AT--TC-C-C--GT--------GA-A----AC-ATTAC-TGG-C----------A--CA-CGA-CGTTA-CG---GTTA-AACGTGATCGAAA
gi|6                          :    TAC-TCTTTTC--AA-GT-T--AA---C--CG-GT-G-ATAGTTC--AGGCGG-G------ACTTT-AAA--TA-AAG---AAG----A----GAAAACATGT-CTGGAAA----------TTGATAAAGAAAACA-C-GTGGGGT-T---T---C-TTGGTTAA---G-T-ACAA-ATTAA---TA--TTT-C-A-A--TA-T------GTATT--TT-A---A--GT--AA--TT-A-A------TA-CA-AG-T-AC--AG--C--ATG--------TTTATATC----------CAT-GT-T-G-A-CATA--T--AT--TC-C-C--GA--------GC-A----AC-ATTTC-TTG-C----------A--CA-CGA-CG-TA-AA--AG-T--AAC-TGATCGAAA
gi|7                          :   TTAC-TTTT--C--AA-GT-T--AA---C--TC-GT-G-ATAGTT---AGGCGG-G---T--A-------------AAG---AAC----G----AAAA-CATGTTCCGAAAA----------TTGAAAAAGAAGATAAC-TTGGAGTTT---T---C-GTGG-CAA---G-T-ACAA-ATTAAG--GA--TTT-A-A-A--TA-T------GCA-T--TTAA---A--GT--AA--TTAA-A------TA-CATG----AC--AA--C--ATG--------TTTATATC----------CAT-GT-T-GAA-C--A--T--AT--TC-C-C--GTG-------GA-A----ACGATTAC-TGG-C----------A--CA-CGACCG-TA-CG--AGTT--AACGTGATCAAAA
gi|8                          :      C-TCTT--C--AA-GT-T--AA---C--TC-GT-GTATAGTTT--AGGCGG-G---T--ATTT---AA--TA-AAG---AAG----A----AAAA-CATGT-TGGAAA-----------TTGACAAAGAAGGCA-C-GTGGG---T---TT--C-GTG--CAA---G-T-A----ATTAA---GA--TTT-A-ATA--T--T------GTA-T--TT-A---A--GT--AAC-TTAA-A------TA-CATAG-T--C--AA--CAAATG--------TTTATAAC----------AAT-GT-T-G---C--A--T--ATA-TC-C-C--GT--------GA-A----AC-ATTAC-TGG-C----------A--CA-CGA-TG-TA-CG--AGTT--AACGTG-TCGAA
gi|9                          :  attAC-TCTT--C--AA-GT-T--AA---C--TT-GT-GTATAGTTT--AGGCGG-G---T--ACTTT-AAA--TA-AAG---AAG----A----GAAG-CATGT-CGGAAA-----------TTGACAAAGAAGACA-C---GAG---T---------GTGG-CAA---G-T-ACAA-ATTAA---CA--TTT-A-A-A--TA-T------GTA-T--TT-A---A--GT--AA--TTAA-A------TA-CATAG-T-AC--A-------TG---T----TTTATATC----------CAT-GT-T-G-A-C--A--T--AT--TC-C-C--GT--------GA-A----AC-GTTAC-CGG-C----------A--CA-TGG-CG-TA-CG--AGTT--AACATGATCGAA


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blockSeqs                     :       .    .  .   .  . .   .   .   .  .        T        . A          .   .   .   .     A            .     .      A                         . T     TTTC        .    .   .   . .    .     A    .    . . . .   . .        . .   . .   .   .   C     . .       .     . .  .   .  .    T               .            .  . . . . G  .  .   .   . . .   .         . .     .     .   . .          .   .   .  .  .  .     . 
blockSeqs                     :       .    .  .   .  . .   .   .   .  .        C        . T          .   .   .   .     A            .     .      A                         . C     GTTT        .    .   .   . .    .     G    .    . . . .   . .        . .   . .   .   .   .     . .       .     . .  .   .  .    T               .            .  . . . . .  .  .   .   . . .   .         . .     .     .   . .          .   .   .  .  .  .     . 
blockSeqs                     :       .    .  .   .  . .   .   .   .  .        T        . T          .   .   .   .     T            .     .      A                         . G     TTT         .    .   .   . .    .     .    .    . . . .   . .        . .   . .   .   .   .     . .       .     . .  .   .  .    T               .            .  . . . . .  .  .   .   . . .   .         . .     .     .   . .          .   .   .  .  .  .     . 
blockSeqs                     :       .    .  .   .  . .   .   .   .  .        T        . C          .   .   .   .     A            .     .      A                         . T     TTT         .    .   .   . .    .     .    .    . . . .   . .        . .   . .   .   .   .     . .       .     . .  .   .  .    C               .            .  . . . . .  .  .   .   . . .   .         . .     .     .   . .          .   .   .  .  .  .     . 
blockSeqs                     :       .    .  .   .  . .   .   .   .  .        C        . T          .   .   .   .     A            .     .      A                         . G     TT          .    .   .   . .    .     .    .    . . . .   . .        . .   . .   .   .   .     . .       .     . .  .   .  .    T               .            .  . . . . .  .  .   .   . . .   .         . .     .     .   . .          .   .   .  .  .  .     . 
blockSeqs                     :       .    .  .   .  . .   .   .   .  .        T        . T          .   .   .   .     G            .     .      .                         . T     TT          .    .   .   . .    .     .    .    . . . .   . .        . .   . .   .   .   .     . .       .     . .  .   .  .    T               .            .  . . . . .  .  .   .   . . .   .         . .     .     .   . .          .   .   .  .  .  .     . 
blockSeqs                     :       .    .  .   .  . .   .   .   .  .        T        . T          .   .   .   .     A            .     .      .                         . T     TT          .    .   .   . .    .     .    .    . . . .   . .        . .   . .   .   .   .     . .       .     . .  .   .  .    T               .            .  . . . . .  .  .   .   . . .   .         . .     .     .   . .          .   .   .  .  .  .     . 
blockSeqs                     :       .    .  .   .  . .   .   .   .  .        .        . T          .   .   .   .     A            .     .      .                         . G     TT          .    .   .   . .    .     .    .    . . . .   . .        . .   . .   .   .   .     . .       .     . .  .   .  .    T               .            .  . . . . .  .  .   .   . . .   .         . .     .     .   . .          .   .   .  .  .  .     . 
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blockSeqs                     :            .  .   .  . .   .   .   .  .        .        . T          .   .   .   .     .            .     .      .                         . G     TT          .    .   .   . .    .     .    .    . . . .   . .        . .   . .   .   .   .     . .       .     . .  .   .  .    .               .            .  . . . . .  .  .   .   . . .   .         . .     .     .   . .          .   .   .  .  .  .     . 
blockSeqs                     :                            .   .   .  .        .          .          .   .   .   .     .            .     .                                . .     T           .    .   .   . .    .     .    .    . . . .   . .        . .   . .   .   .   .     . .       .                 .    .               .            .  . . . . .  .  .   .   . . .   .         . .     .     .   . .          .   .   .  .  .  .     . 
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lowQualScore                  :       .    .. ..  .  . ..  ... ..  .  .        ...      . ......     .   ..  .   ...   .........    .     .   .  ...........               . ..    ........... .    .   ... . .    .     ...  ..   . . . ..  . ......   . ..  . ... ..  ..  ..    . ......  .     . .  ..  .. ..   ........        ..........   .  . . . . .. .. ..  ..  . . ..  ........  . ....  .     .   . .......... ..  .   .  .  .  ..    ..             
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Reference ( family-2082 )     :   TTAC-TCTT--C--AA-GT-T--AA---C--TC-GT-GTATAGTTT--AGGCGG-G---T--ACTTT-AAA--TA-AAG---AAG----A----GAAA-CATGT-CGGAAAA----------TTGACAAAGAAGACA-C-NTGGG---T---T---C-GTGG-CAA---G-T-ACAA-ATTAA---GA--TTT-A-A-A--TA-T------GTA-T--TT-A---A--GT--AA--TTAA-A------TA-CATAG-T-AC--AA--C--ATG---T----TTTATATC----------CAT-GT-T-G-A-C--A--T--AT--TC-C-C--GT--------GA-A----AC-ATTAC-TGG-C----------A--CA-CGA-CG-TA-CG--AGTT--AACGTGATCGAAA
gi|1                          :   TTACGTCTT--CCAAA-GT-T--AGAG-CGGTC-GTTGTAGAGTTTGAAAGCGA-----T--ACTTT-AAA--TAGAAG---AAG----A----GAAC-GATAT-CGAGGAGGTTTCATAGTTTGACAAAGAAGACA-CGTTGGG---TTTCT---C-GTGG-CAACACGTT-ACAA-ATTAAT--GAATTTT-A-A-AATTA-CATCGTGGTA-T--TT-AATCA--GTTAAA--TTAACA------TA-CATAG-T-CCAAAA--C--ATA---T----GTTAT-TCTATAGGACGACAT-GT-T-G-A-C--A--T--ATCGTCGC-C--GT--------GA-ATACTAT-ATCAA--GG-C----------AACCACCGA-TG-TA-CG--A
gi|10                         :  aTTAC-TCTT--C--AA-GT-T--AA---C--TC-GT-GTTTAGTTT--CAGCGG-G---A--ACTTT-AAA--T----------------------------GT-CGGAAA-----------TTGACAAAGAAGACA-C-GTGGG---T---TTCGC-GTGG-TAA---G-T-ACAA-ATTAA---GA--TTT-A-G-A--TA-T------GTA-T--TT-A---A--GC--AA--TTAA-A------TG-CATAG-T-GC--AA--C--ATG---T----TTTATATC----------CAT-GT-T-G-A-C--A--T--AT--CC-C-C---T--------GA-A----AC-ATTAC-TGG-C----------A--CA-CGA-CG-TA-CG--AGAT--AACGTGATCGAAAagt
gi|11                         :                                                           ---T--ACTTT-AGA--TA-AAG---AAGCTAGA----GAAA-CATGT-CGG-AAA----------TTGACAAAGAAGACA-C-ATGGGT--T---T---C-GTGG-CAA---G-T-ACAA-ATTAA---GA--TTT-A-A-A--TA-T------GTA-T--TT-A---A--GT--AA--TTAA-A------TA-CATAG---ACA-AA--C--ATG---T----TTTATAAC----------AAT-GT-T-G-A-CATA--T--AT--TC-C-C--GT--------GA-A----AC-ATTAC-TGG-C----------A--CA-CGA-TG-TA-CG--AGTT--AACGTGATCGAA
gi|12                         :    TAC-TCTT--C--AA-AT-T--AA---C--TC--T-GTATAGTT---AGGCGG-G---T--ACTTT-AAA--TA-AAG---AAG---------GAAA-CATTT-CGGAAA-----------TTGACAAAGAAGAAA-C-TTGGT---T---T---C-CTGG-CAA---G-TTACAC-ATTAAA--GA--TTT-A-A-A--TA-T------GCA-T--TT-A---A--GT--AA--TTAA-A------TA-CA
gi|13                         :                                                                                                                                  AGAGTAGACA-C-CTGGG---T---T---TTGTGG-CAA---G-T-ATGA-ATTAA---GA--TTT-A-G-A--TA-T------GCA-T--TT-A---A--AC--GA--TTTA-A------TA-TATAG-T-AC--AA--C--ATG---T----TCTACATC----------CATCTT-T-G-AGT--A--TGAGT--TA-C-C--GT--------GA-gnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcatattttaccttagcagca
gi|14                         :                                                                                                                                                                 agaatcctggcg-T-ACAACATTAA---AA--TTT-A-A-AA-TA-T------GTA-T--TT-A---A--GT--AA--T-AA-A------TAACATAGAT-AC--AA--C--ATG---C----TTTATATC----------CAT-GT-T-G-A-C--A--T--AT--TC-C-----T--------AA-A----GC-ATTACTTGG-C----------A--CA-CGA-CA-TA-CG--A-TT--AACGTGATCGAAAtcga
gi|15                         :           T--C--AA-GC-T--AA---C--TC-GT-ATAGAGTTT--AGGCCA-G---C--ACTTT-AGA--TA-GAG---AAA----A----TAAA-CATGT-CGGAAA
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                 ttcctcaatttcaa--ATG---T----TT-AT-TC----------CAT-GTGT-G-A-C--A--T--AT--CC-CGC--GT--------AA-A----GC-ATTAC-TGG-CACCGAATGGCA--CA-CGA-CG-TA-CG--AGTT--AACGTGATCGGAAtagagagaca
gi|17                         :                           A---C--TC-TT-GTATAGTTT--AGGCGG-G---T--ACCAT-AAA--TA-AAG---AGG----A----GACA-CATGT-CGG-AAA----------TTGACAAAGAAGACA-C-GTt
gi|18                         :                                                                                                                                                    ---T---T---T-GCGG-GAA---G-T-ATGA-ATTAC---GA--TTT-T-G-A--TA-T------GTA-T--TT-A---A--AT--GA--TT
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            -A----AC-ATTAC-TTG-C----------A--CA-CGA-CG-TA-CG--AGTT--CAC-TGATCAAAAtga
gi|2                          :  cTTAC-TCTT--C--AA-AT-TTAAA---C--TCTGT-GTATAGTT---AGGCGG-GATGT--ACTTTTAAA--TA-AAAGTTAAG----T----GAAA-CATTT-CGGAAAA----------TTGACAAAGAAGAAA-C-TTGAG---T---TTC-C-TTGGTCAA---GTT-AC-A-ATTAAGATGA--TTT-ATA-A--TATT------GCA-T--TT-A---ATTGT--AAT-TTAA-AAGAATTTA--GTAG-TAAC--AAACC--ATGGGTT----TTTATATC----------CAT-GT-T-G-A-C--A--T--AT--TC-C-C--GT--------GATA----AC-ATTAC-TGGCC----------A--TA-CGA-CG-TATCGC-AGTT--AACGT-ATCt
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        AC-TGG-C----------A--CA-CGA-CG-TA-CA--AGTT--AACGTGATCGAAAtcgtaaatg
gi|21                         :   TTAT-TCTT--C--AA-GT-T--AA---C--TC-GT-GTATAGTTC--AGt
gi|3                          : atTTAC-TCTT--T--AGTGTAT--AAGAAC--TC-GT-GTATGGTTT--AGGCGG-G---CTAACTTT-AAATTTA-AAG----AG----ATCGTAAAA-CATG--CGGAAAA----------TGAATAAAG-AGACA-C-GTAGG---T---T---T-GTGG-CAA---A-T--CAA-ATTAA---GA--TTTGA-A-A--TA-T------GTG-TTATT-A---A--GT--AA--TT-A-A------TA-CTCAG-T-AC--AA--C--ATG---TTTAGTTTATATC----------CAT-GT-T-G-A-C--AAGT--AT--TC-C-CCAGTTAGGCATAGA-A----AC-ATTAC-TGGCC----------A--CA-C-A-CT-TA-CGAAAGTTTAAACG
gi|4                          :   TTAC-TCTT--C--AA-AT-T--AA---C--TC--T-GTATAGTT---AGGCGG-G---T--ACTTT-AAA--TA-AAG---AAG---------GAAA-CATTT-CGGAAA-----------TTGACAAAGAAGAAA-C-TTGGT---T---T---C-CTGG-CAA---G-TTACAC-ATTAAA--GA--TTT-A-A-A--TA-T------GCA-T--TT-A---A--GT--AAATTTAA-AA-----TA-CAGAG-T-AC--AAACC--ATG---T----TTTATATC----------CAT-GT-TTG-A-C--A--T--AT--TC-C-C--GT--------GA-A----AC-ATTAC-TGG-C-------------CA-CGACCG-TA-CG--AGTT--AACGTAATCGAA
gi|5                          :   TTAC-TCTT--C--AA-GT-T--AA---C--TC-GT-GTATAGTTT--AGGCGGTG---T--ACTTT-AAA-----AAG---AAG----A----GAAA-CATGT-CGGAAAA----------TTGACAAAGAAGAAA-C-TTGGG---T---T---C-GTGG-CAA---G-T-ACAA-ATTAA---GA--TTT-A-A-A--TA-T------GCA-T--CT-A---A--GT--AA--TTAA-A------TA-CATAA-T-AC--AA--C--ATG---T----TTTATATC----------CAT-GT-T-G-A-CG-A--T--AT--TC-C-C--GT--------GA-A----AC-ATTAC-TGG-C----------A--CA-CGA-CGTTA-CG---GTTA-AACGTGATCGAAA
gi|6                          :    TAC-TCTTTTC--AA-GT-T--AA---C--CG-GT-G-ATAGTTC--AGGCGG-G------ACTTT-AAA--TA-AAG---AAG----A----GAAAACATGT-CTGGAAA----------TTGATAAAGAAAACA-C-GTGGGGT-T---T---C-TTGGTTAA---G-T-ACAA-ATTAA---TA--TTT-C-A-A--TA-T------GTATT--TT-A---A--GT--AA--TT-A-A------TA-CA-AG-T-AC--AG--C--ATG--------TTTATATC----------CAT-GT-T-G-A-CATA--T--AT--TC-C-C--GA--------GC-A----AC-ATTTC-TTG-C----------A--CA-CGA-CG-TA-AA--AG-T--AAC-TGATCGAAA
gi|7                          :   TTAC-TTTT--C--AA-GT-T--AA---C--TC-GT-G-ATAGTT---AGGCGG-G---T--A-------------AAG---AAC----G----AAAA-CATGTTCCGAAAA----------TTGAAAAAGAAGATAAC-TTGGAGTTT---T---C-GTGG-CAA---G-T-ACAA-ATTAAG--GA--TTT-A-A-A--TA-T------GCA-T--TTAA---A--GT--AA--TTAA-A------TA-CATG----AC--AA--C--ATG--------TTTATATC----------CAT-GT-T-GAA-C--A--T--AT--TC-C-C--GTG-------GA-A----ACGATTAC-TGG-C----------A--CA-CGACCG-TA-CG--AGTT--AACGTGATCAAAA
gi|8                          :      C-TCTT--C--AA-GT-T--AA---C--TC-GT-GTATAGTTT--AGGCGG-G---T--ATTT---AA--TA-AAG---AAG----A----AAAA-CATGT-TGGAAA-----------TTGACAAAGAAGGCA-C-GTGGG---T---TT--C-GTG--CAA---G-T-A----ATTAA---GA--TTT-A-ATA--T--T------GTA-T--TT-A---A--GT--AAC-TTAA-A------TA-CATAG-T--C--AA--CAAATG--------TTTATAAC----------AAT-GT-T-G---C--A--T--ATA-TC-C-C--GT--------GA-A----AC-ATTAC-TGG-C----------A--CA-CGA-TG-TA-CG--AGTT--AACGTG-TCGAA
gi|9                          :  attAC-TCTT--C--AA-GT-T--AA---C--TT-GT-GTATAGTTT--AGGCGG-G---T--ACTTT-AAA--TA-AAG---AAG----A----GAAG-CATGT-CGGAAA-----------TTGACAAAGAAGACA-C---GAG---T---------GTGG-CAA---G-T-ACAA-ATTAA---CA--TTT-A-A-A--TA-T------GTA-T--TT-A---A--GT--AA--TTAA-A------TA-CATAG-T-AC--A-------TG---T----TTTATATC----------CAT-GT-T-G-A-C--A--T--AT--TC-C-C--GT--------GA-A----AC-GTTAC-CGG-C----------A--CA-TGG-CG-TA-CG--AGTT--AACATGATCGAA