lowQualScore : 111111111111111111111 1111111 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 888888888 4444 4 1 22 7777777777777 1 000000000000000000000 22 33 555555 1 666666666 2 2 99999999999999999999999999999999 2 22 1 1 1 11 3333333 22 1 4 222222 111111 33333333 33333333333 111 111 33333333 1111 111 1 1 22 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 22222222 1111 22 11111 111 1 111111111111 666666666666666666666666666 222 333333333333333 888888888888888888888888888888888888888888888 22222222 11111 111111 111 1 11 111 1 11111 000000000000000000000000000 111 111 1111 1 11111 33333333 11111 1 555555555555 33333333 555 333333333 11 1 222222 1 99999999999999999999999 1111 1 333 111 1111111 77777777777777777777777777777777777 11 1 111111 6666666666666666666666 11 2222222 88888888888888888888888888888888888 3333333333333333333333333 1111 11111 22
lowQualScore : 5 888888888 2 2 2222 0 7 77 3 0 3333333333333 2 333333333333333333333 6 77 7 7 66 2 4 4 3 4 444444 3 4 2 6 5 000000000 2 55 0 0 77777777777777777777777777777777 4 0 11 7 5 5 6 22 0000000 6 6 6 11 6 5 6 0 2 111111 6 888 666666 8 33333333 5 5 5 2 2 22222222222 000 8 111 99 6 99999999 0 3 2222 000 5 1 77 66 5 999 5 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 6 66666666 5 3 3 5 888 66 888 66 0000 11 3 99999 55 00000 4 1 333 4 55 0 3 3 7777 3 99 000000000000 3 555 555 44 4 4 8 4 4 88 66 1 000000000000000000000000000 4 4 777 444 333333333333333 3 4 4 4 4 333333333333333333333333333333333333333333333 00000000 5 9999 5 77777 666666 111 5 77 5 5 11 5 777777 000 77 5 1 0 77 22222 888 444444444444444444444444444 555 5 888 1 5 333 5 7777 5 66 2 77 44444 7 77777777 5 22222 1 1 5 4 222222222222 5 5 0 88888888 5 66 5 5 8 222 0 5 5 4 4 4 6 99 6 44 99 1 222222222 11 5 555555 7 3 5 7 5 5 55555555555555555555555 3 4444 1 6 8 0 6 0 5 999 000 5 9 8888888 00000000000000000000000000000000000 11 6 8 3 6 999999 8888888888888888888888 8 88 3333333 8 88888888888888888888888888888888888 6 5555555555555555555555555 5 2222 5 5 55555 5 1 3 2 33
lowQualScore : . ......... . . .... . . .. . . ............. . ..................... . .. . . .. . . . . . ...... . . . . . ......... . .. . . ................................ . . .. . . . . .. ....... . . . .. . . . . . ...... . ... ...... . ........ . . . . . ........... ... . ... .. . ........ . . .... ... . . .. .. . ... . ..................................................................... . ........ . . . . ... .. ... .. .... .. . ..... .. ..... . . ... . .. . . . .... . .. ............ . ... ... .. . . . . . .. .. . ........................... . . ... ... ............... . . . . . ............................................. ........ . .... . ..... ...... ... . .. . . .. . ...... ... .. . . . .. ..... ... ........................... ... . ... . . ... . .... . .. . .. ..... . ........ . ..... . . . . ............ . . . ........ . .. . . . ... . . . . . . . .. . .. .. . ......... .. . ...... . . . . . . ....................... . .... . . . . . . . ... ... . . ....... ................................... .. . . . . ...... ...................... . .. ....... . ................................... . ......................... . .... . . ..... . . . . ..
lowQualScore : 0 000000000 5 5 5555 0 0 55 7 7 0000000000000 0 000000000000000000000 0 55 3 3 77 5 0 0 0 0 000000 0 0 5 0 0 000000000 5 55 0 0 00000000000000000000000000000000 0 0 00 0 0 0 0 00 0000000 0 0 0 00 0 0 0 0 8 222222 0 000 444444 9 33333333 0 0 0 2 0 99999999999 000 1 777 22 7 88888888 8 8 1111 000 0 4 55 99 0 555 0 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 7 99999999 7 9 0 0 888 99 000 99 6666 88 9 44444 55 00000 3 1 333 4 55 0 3 3 1111 3 88 555555555555 0 888 888 77 0 0 9 4 4 33 88 9 000000000000000000000000000 4 4 888 666 000000000000000 0 4 4 4 4 111111111111111111111111111111111111111111111 44444444 0 4444 0 55555 444444 000 0 99 7 7 44 0 777777 000 99 7 4 7 99 55555 888 222222222222222222222222222 666 0 888 9 0 888 0 5555 0 99 0 44 33333 3 11111111 0 55555 7 4 3 3 111111111111 7 7 7 44444444 0 99 0 0 8 111 1 0 0 0 0 3 0 44 0 33 22 0 000000000 00 0 000000 3 0 7 0 7 7 66666666666666666666666 3 2222 0 0 0 8 2 9 7 444 000 7 1 6666666 44444444444444444444444444444444444 00 0 0 2 7 222222 4444444444444444444444 0 00 8888888 0 00000000000000000000000000000000000 7 7777777777777777777777777 7 6666 0 0 22222 7 7 5 2 88
consensus : NNNNNNNNNNNNATGAACGCTATGCAAATTAAGTGGACGTACACNTGTANCTTTGTTTNATTGACGTCAAGTCGACTATC-CATTTTATTTAATTTCATTCAATGTGTAGACGTATTTAATTTTATGTTGAATTAAATTTTT----GCGTATTTTCGTGTCTGGAAGAAAAGAACAAAATCNAATCCAANACGAATTCTTTATTTTCAGAAAATCTTTATTTCAGTNTTNGAAACGTGCGTTTCTGTTNTNCGTNGTCCATTTATNGATAANANATTTNGCCAGTACCGTCATCATTGTANTCGNNCCCTGTTCTATTTAGAACGATTGCTGTCAAAACGGGACAATTCATGNTTGGACACTTAACTCGGAACGAGTGCAAGTTTCGGTTTCAGTGTAATTAAGAATGATTACTATCAAAACATTTTAAGACACAAAGCCGGGAAGGTCAAAGTACAG---C---TAACTGCTCGTGCTGTGTCGTGAAGACATACCTCGTATGTGCATAATTTTACGTGTACATTG---T--ACATGATCTACATGTATGAATATAT-T-AT------TGTATTTGTTGGT----T--AAAAAAAC-AT-CGCTTAATATT-ATATTCATGTACGTTTTACA-----------GATCT---ACACATATGCACATAAAGCATCGATAAC---GGGAAA--AGTA-GT-A------TATATAAATA----CAT---GTAAATTGACGTTTACAT-TTAAACT-GGCA--CG-TGCCGTTGT-GGC-AGGTGA----------ACCC-AG--A---C-------T-TCT-T---A-CA------AANT--------------A-ATCCACCCCTAAGCCCCGGGAAATAA-CGCACACAACCAANT-CA---AAA--TCA-C-G--A----CAGGGGTAAAAT-GGCTTCAAT----TCAGTA--CACGATC-----CACGGTCCTAA--TTAACCCTTA-ATT--GCATCACACATGTAACC-CACCCTC-TACT----CG-AAGCGAN-CAACCAC-----G-----CAAGATT---G---AAGAAAGAT-ATCGAGAATTTCAC-TC-TGCTGT-T-GAAGAATA-AATCATCGTATCGGAAAGCATTTATTAT------AG----------------A-TTAAG-AG---AAAA--ATACCTTAA----CGG---G----ACC-T-ACAAAAAGCAT-TGAA-GAA--------G---------T-----GA---------C---------AAT-------AT-TTCATTATATCAAATAT----CGTATA-AAA-----CTA------GCCA-AATTTGTTT--GT-G-CGGCTTTTTTTGC-ATAGGAATT---A--CC-TTCTTCAT-ATTACA--TTTTGTTTCATT-----TTGA---AGGGG----------N------N-A----AAAAC--TTAC-T---TANTC-TACA---T-GAT----TG-T--TGCACGAAATTATGCAGCGCACA-----ATTTCCTTCAACATGT--------TATTAATGTGT-----AAATTAATC-AGTATTGTTCACTTTC-----GA---TC-AAATTA-TCACTGCATGTTA----TATCGT-GTAAA--TGC-AG-CTACTCGTA---TTTTTTTAATAC-GC-AAATTGT-AAAT-GAGCACTTTGATCATATAATATAATA-TCGTTGTGTTACCCTATTTACACACTGTAAAAAGAAGT--GAAAAGTTAATGATCTGATACATTG---------TATAAATATTGATA--ATTGGTTTAGGAAAATTACTCTGTCGAGTTGTTNTTTAAACCCGTACTTC-TTTTCAAGTATTTCCCTA-ATT-TT----A------C-----A-----AAGTCCTNTCGAGTA----ATACTTAATCACGGTGTTACGAATGGCCAG-AGTTANTCTACGTCCTCCTTTAACGGGCTCC-AT-CGAGAG---A-AATNAA-------TGAAGA----TA--------AGA-T-TA-T-CAA----TAG--TATTACCTTA-TTAGGCATACTGCA-CGGTA------CGGTTCG-G--T-CG-----GAA--CGCTTTG-AGGGC-NTGGT------TTGC-A---TA--------------A----------A----CG-TTCT---ATGA--ACGNTAC-GGTT-CGCTTCT-TGCACGGTAC-GG-TTCG-C---TTCT-TGCACGGTACGGTGCGCTTCT
Reference ( gi|1 ) : GATGAACGATTAATGAACTCTATGCAAATTAAGTGGA-------A-GTAGCTTTGTTTGATTGAC----AGTCGACTATTTCATTTTATTTAATTTCAATTAAT--ATAGACGTATTTAATTTCATGTTGAAT--AATTTTTTTTTGTGTATTTTCGTGTCTGGAAGAACAG--CGAAATTAAATCC-CCACGGAT--TTTATTTTCAGAAAATCTTT--TTCAGTGTTAGAAATGTGCGTTTCTGTTATTCGTAGTCTATGTCTCGATAAAATATTTCGTCATTACC--CATCATTGTACTCGCACTT-GTT-TAT--AGAACGATTGCTGCAAAAATA--ACAATTTATAATTAGACAC-TAACTCGACACGTGTGCAAGTTTCGGGTTCAGTGTAATTAAGAATGATTACTATCAAAACATGTTGAGACACAAAGCCGGGAAGGTCGGAGTACAGGTACATGTAACTGCTCATGTTGTGTCGTGGAGAAGTACCCCGTCTGTGCATGA-TTTGCGTGTACATTG---T--ACATGATCTGCATGTATGAATATAT-T-AT------TGTATTTGTTAGT----T--GAAAAAAC-AT-CGCTTAATATT-ATATTCATGTATGTTTTACA-----------GATCT---ACATATATGCACATAAAGCATCGATAAC---AGGAAA--AGTA-GT-A------TATATAAATA----CAT---GTAAATTGACGTGTACAT-TTAAACA-GGCA--CG-TGCCGCTAT-GGC-AGGTGA----------A--------------------T-TCT-T---A-CA------AAGT--------------A-ATCCACCCGTAAGACCCGGAAAATAA-CACACACAACCAAAT-CA---AAA--CCA-C-G--A----CAGGGGTAAAATTGGTTTCAAT----TCAGTA--CACGATC-----CACGTTCCTAA--TTAACCCTTA-ATT--GCATCACACATGTAACC-CACCCTC-TACT----CG-AAGCGAT-CAACCAT-----G-----CAAGATT---G---AAGAAAGAT-ATCGAGAATTCCAC-TC-TGCTGT-T-GAAGAATA-AATCATTGTATCGGAAAGCATTTATTAT------TA----------------A-TTAAG-AG---AAAC--ATACCTTAA----CAA---G----ATC-T-ACAAAAAGCAT-TGAA-GAA--------G---------T-----GA---------C---------AAT-------GT-TTCATTATATCAAATAT----CGTATA-AAA-----CTA------GCCA-AATTTCTTT--GT-G-CGGCTTTTTTTGC-ATAGGAATT---A--CC-TTCTTCAT-ATTACA--TTTTGTTTCATT-----TTGA---AG-------------C------A-A----AAAAC--TTAC-T---TAATC-TACA---T-GAT----TG-T--TGAACGAAATTATGCAGCACACA-----ATTTCTTTCAACATGT--------TATTAATGTGT-----AAATTAATC-AGTATTGTTCACTT-------GA---TC-AAATTA-TTACTGCATGTTA----TATCGT-GTAAA--TGC-AG-CTACTTGTAATTTTTTTTTAATAC-GC-AAATTGT-AAAT-GAGCACTTTGATCATATAATATAACA-CCGTTGTGTTACCCTATTTATACACCGTAAAAAGAAGT--GAAAAGTTAATGATCTGATACATTG---------TATAAATATTGATA--ATTGGTTTCGGAAAATTACTCTGTCGAGTTGTTTTTTAAACCCATACTTC-TTTTCAAGTATATCCCTA-ATT-TT----A------C-----A-----AAGTCCTTTCGAGTA----ATACTTAATCACGGTGTCACAAATGGCCAG-AGTTATTCTACGTCCTCCTTTAACGAGCTTC-AT-C-AGAG---A-AATTAA-------TGATAA----TA--------AGA-T-TAGTTTAA----TAG--TGTTACCTTA-TTAGGCATAATGCA-CGGTA------CGG-----G--T-CG-----GAA--CGCTTTG-AGGGC-GTGGT------TTGC-A---TA--------------A----------A----CG-TTCT---ATGA--ACTTTAC-GATT-CGTTTCT-TGCACGGTAC-GG-TTCG-T---TTCT-TGCACAGTACGGTACGATTCT
gi|18 : ATGAACGCTATGCAAATTAAGTGGACGTACACATGTAGCTTTGTTTCATTGAC----AGTCGACTATT-CATTTTATTTAATTTCATTCAATGTATAGACGTATTTAATTTCATGTTGAATTAAATTTTT----GTGTATTTTCGTGTCTGGAAGAA---------ATCCAA-----CACGAAT--TTTATTTTCAGAAAATCTTTATTTCAGTGTTAGAAATGTGCATTTCTGTT
gi|24 : ATTAAGTGGA-------C-GTACCTTTGTTTGATTGACGTCAAGTCGACTATC-CATTTTATTTAATTTCATTTAAT--GTAGAAGTATTTAATTTTATGCTGAAT----TACATTTTTGTATATTTTCGTG
gi|25 : TAAATGTATTAAATTTTGTGTTGGATTAAATTTT-----GC-TATTTTCATGTCTGGAAGAAAAGAACAAAATTAAATCCAAAACAAATTCTTTA-TTTCAG--AATCTTT--TT
gi|22 : gATGTCCAAAAAATCTTTATTTCAATTTTTGAAACCTGTGTTTCTGTTATGTGTTGTCCATTTATAGATAACAAATTTAGCCAGTACC---------GTAATCGACCCC-ATT-TAT--A-------TAC------AATG--AC----CATATTTAGACACTTAACTCG
gi|13 : AATGTGCGTTTCTGTTTTTCGTAGTCTA-----CGATAAAATATTTCGCCAGTACTGTCATCATTGTACTCGCACTTTGTTCTATTTAGAACGATTGCTGTCAAAACAGGACAATTCATGATTGGACAC-TAACTCGGAACGAGTGCAAGTTTCGGTTTCAGTGTAATTAAGAATGATTACTATCAAAACATTTTAAGACACAAAGCCGGGAAGGTCAAAGTACAG---C---TAACTGCTCGTGCTGTGTCGTGAAGACATACCTCGTATGTGCATAATTTTGTGTG
gi|7 : TACGTATACATTG---A--ACGTGATCTATATGTATGAATATAT-G-AT------TGTATTTGTTCGT-------AAAAAAAA-AT-CGCTTAATATC-ATATTCATGTACGTTTTACA-----------AATTTGAAACAAATCTACACAAAAAGCATCGATAAT---GGGAAA--AGCA-GT-A------TATATAT-TA----CAT---GTAAATTGACGCTTATAT-TTAAACT-GGCA--AG-TGCCGTTGT-GGC-AGGTTA----------A--------------------T-TCTAG---A-CT------AAGTCTTCTTTCAAACCCA-ATCCACCCCTAATCCCCAAAAAATAA-CGCACACAACCACCT-CA---AAA--CCA-C-G--A----CAGGGGTAAAA-TGGCTTCAATATAATCAGTA--CATGATC-----CACGGACC------TAACCCTTA-ATT--GCATTACACATGTAACC-CACCCTC-TACC----CG-AAGCGAT-CAACCAT-----G-----CAAGATT---G---AAGAAAGAT-ATCGAGAATTTCAC-TC-TGCTGT-T-GAAGAATA-AATCATCGTATCGGAAAGCATTTATTATACAATGTACATTATGTACATGTACA-TTAAG-AG---AAAA--ATACCTTAA----CGG---G----ACC-T-ACAAAAAGCAT-TGGA-GAA--------G---------T-----GA---------T---------AAT-------gcaggagagacatattgaaaataaaaataagtaaactgatttaaaaaaaaaagtttcttccttatgcacattgtgcacgtacatgcatttaatattcagatacgtgtacattgtacatgttctacatgtatgaatatattattgtatttgttggtagaaaaaacatcacttaatattatactcatatatgt
gi|17 : taccccgtcagtgcattgttttgtgtggcaggatagacttatgttgaaaataaaaataaatacactgatttttttccttatacacatagtgcatgcacatgcatttaatatacagaTACGTGTACATTG---T--ACATGACCTACATGTATGAATATAT-C-ATAATGATTGTCTTTGTTGGT----T--AAAAAAGC-AT-CGCT-GATATT-ATATTCATGTATGTTTTACA-----------GATCT---ACACATATGCACTTAAAGCATCGATAAC---AGAAAA--AGTA-GTAA------CATATAAATA----CAT---GTAAATTGACGTTTACAT-TTAAACT-GGCA--CG-TGCCGCTGT-GGC-AGGTGA----------ACCCCAGACAATGTC------T-TCT-T---A-CA------AACT--------------A-ACCCACCCCTAAGCCCTGGGAAATAA-CACACACAACCAAAT-CA---AAA--CCA-C-G--A----CAGGGGTAAAA-TGGCTTCAAT----GCAGTA--CACG-----------GTT-CTAA--TTAACCCTTA-ATT--GCACCACACATGcatga
gi|13 : taatatacagaTACGTGTACATTG---T--ACATGTTCTACATGTATGAATATAT-T-AT------TGTATTTGTTGGT----A--GAAAAAAC-AT-CACTTAATATT-ATACTCATATATGT
gi|15 : aatgtgcgtttctgtttttcgtagtctacgataaaatatttcgccagtactgtcatcattgtactcgcactttgttctatttagaacgattgctgtcaaaacaggacaattcatgattggacactaactcggaacgagtgcaagtttcggtttcagtgtaattaagaatgattactatcaaaacattttaagacacaaagccgggaaggtcaaagtacagctaactgctcgtgctgtgtcgtgaagacatacctcgtatgtgcataattttgtgtggcaggagagacatattgaaaataaaaataagtaaactgatttaaaaaaaaaagtttcttccttatgcacattgtgcacgtacatgcatttaatattcagaTACGTGTACATTG---T--ACATGATCTACATGTATGAATATAT-T-AT------TGTCTTTGTTTGT----TAAAAAAAAAC-AT-CG-TTAATATT-ATATTCATGTATTTTTTAAA-----------GATCT---ACACATATGCACA
gi|2 : gaaaataaaaataaatacactgatttaaaaacaattgattttcttccttatacgcattgcgcatgtacatgcatttaatatacagaGTGTTCATTGACTTGAACATGATCTACATGTACGGATATATATGAT------TGTATTTGTTGGTAAAAC--AAAAATAC-AT-CGCTTCATATC-ATATCCATGTATGTTTCACATATTTTAAATAAATCT---ACACATATGCACAAAAAGCATCGATAAC---AGGAAA--AGTA-GT--------T-TATAAGTA----CAT---GTAAAGTGACGCTTATAT-TTAAAC--TGCA--CG-TGCCGTTGT-GGC-AGGTGA----------ACCTAAGCAATGTC-------T-TCT-T---A-CATGTACAAACT--------------A-ATCCACCT-CAAGCCCCGAAAAATAAACGCACACAGCCACCT-CA---AAA--TCA-T-G--A----CAGGGGTAAAATTG-TTTCAAT----TCAGTA--CATGATCTGATCCACGGTCCTAA------CCCTTA-ACT--GCATTACACATGTAACC-CACTCTC-TACT----CG-AAGCGAT-CAACCTC-----G-----CAAGATT---G---AAGA---------------TTCAC-TA-TGCTGT-T-ACAGAATA-AATCATCATATCCGAAAGCATTTATTAT------AG----------------A-TTAAG-AG---AAAA--ATACCTTAA----CAG---G----ATC-T-ACAACAAGCAT-TGAA-GAA--------G---------T-----GA---------TAATCAAGGAAAT-------AT-TTCATTATATCAAATAT----CGTATA-AAA-----CTA------GACA-AATTACTTT--GT-G-CGGC-TTTTTTGC-ACAGGAATT---A--CC-TTCTTCAT-ATTACA--TTTTATTTCATT-----TCGA---AAGGGAAAAACT---C------C-A----AAAAC--TTAC-T---TACTC-TACA---T-GAT----TG-T--TGCACGACATTACGTAGTGCACC-----ATATCCTTCAACATGT--------TATTAATGTGT-----AAAATAATCAAACATTGTTCACTT-------GA---TC-AAATAA-TTACTGCATAT------TATCGT-GTAAA--TGC-AG-CTACTAGTA---TTTTTTTAATA--GCTAAATTGT-AAAT-GAGCACTTTCATCGAATAATATAGTA-TTGTTGTGTTACCCTATTGACACAGTGTAAAAAAAAAGAAGAAAAGTTAATGATCTGATACATTG---------TATAAATATTGACAACATTGGGTTAGGAAAATTACTCTGTCGAGTTGTTGT---AACCAGTATTTCTTTTTCAAATATTTCCCTA-GTT-TT----AACAGCTC-----A-----AAGTCCTTTCGAGTAGTATATACTTAATAATGGTGTTACGAATTCCAAG-AG-TAAACTACGTCCTACTTAAACGGGCTTC-AA-CGAGAG---A-AATAAA-------TGAAGA----TA--------ATA-T-TAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaatggcttcaatacagtacacgatccacggcta
gi|26 : TATACATGTAT-T-AT------TGTATTTCTTGGT----TT-AAAAAAAC-A--CGCTTTATATT-ATAT----GCATGTTTTACA-----------GATCT---ACA--------CATAAAGCATCGATAAC---AGGAAA--AGTA-Gt
gi|10 : AGTATAT-T-AT------TGTATTTGTTGGT----T--AAAAAAACTAT-CGCTTAATATC-ATATTC----------------------------------CATATACGCA--TAAATCATCGATAAC---AGAAAA--AGTA-GT-ACATGTATATATAAATA----CAT---GTAAATTGACGTTTACAT-TTAAACT-GGCA--CG-TGCTGCTGT-GGC-AGGTGA----------ACCCCAGACAATGTC------T-TCT-T---A-CA------AACT--------------A-ATCCACCCCTAAGCCCCGGGAAATAA-CGCACACAACCAAAT-CA---AAA--CCA-C-G--A----CACAGGTCAAAT-GGTTTCAAT----TCAGTA--CACGATT-----CACGTTCCTAA--TTAACCCTTA-ATT--GCATCACACATGTAACC-CACTCTA-TATT----CG-AAGCGAT-CAACCAC-----G-----CAAGATT---G---AAGAAAGAT-ATCGAGAATTCCAC-TC-TGCTGT-T-GAAGA-------------ATCGTAATGCATTTATTAT------AG----------------A-TTAAG-AG---AAAA--ATACCT----------------------T-GCAAAAAGCAT-TGAA-GAA--------GTGATAATCAT-----GA---------C---------AAT-------AT-TTCATTTTATTATACTT----C-TGTA-AAA-----
gi|13 : gggggggggggggggggggggggttagtccagataggacagttctAC-ATGCATTTAATATTCAGATACGTGTACATTGTACAT----------GTTCT---ACATGTATGAATATAatgttt
gi|21 : aatgtgcgtttctgtttttcgtagtctacgataaaatatttcgccagtactgtcatcattgtactcgcactttgttctatttagaacgattgctgtcaaaacaggacaattcatgattggacactaactcggaacgagtgcaagtttcggtttcagtgtaattaagaatgattactatcaaaacattttaagacacaaagccgggaaggtcaaagtacagctaactgctcgtgctgtgtcgtgaagacatacctcgtatgtgcataattttgtgtggcaggagagacatattgaaaataaaaataagtaaactgatttaaaaaaaaaagtttcttccttatgcacattgtgcacgtGATAACTCTGGGAAACAAGTTTGT-AA-----TAAATAAATAGTCACATTGCATATATTGACGTTTACAT-TTAAACCTTGCA--CGTTGCCATTG--GGCAAGGTGA----------A--------------------C-TCttattgtatttgttggtagaaaaaacatcacttaatattatactcatatatgt
gi|4 : agaaaatcatcaaacatcataatgacaatcccatattcggaagaaaaagtcagtccgTA----CAT---GTAAATTGACGTTTACATCTTAAACT-GGCAAGCG-CGCCGTTGTTGGC-AGGTGACCCCAAGACAA--------------------TGTCT-CTAAA-CA------AAGT--------------ATATTC--------------GAAAATAA-CGCACACAACCAACT-CA---AAA--TCAAT-G--A----CAGGGGTAAAAT-GGCTTCAAT----TCAGTAAACACGATC-----CACGTCC-------TAAACCTTA-ATT--GCATCACA------ACC--ACCCTCGTACTAGTACG-AAGCGAAACAACCAC-----G-----CACGATT---G---AAGAAAGAT-GTCGAGAATTTCAC-TC-TGCTGT-TCGAAGAATACAACCATCGTATC--------TTTA-----------G----------------A-TTAAG-A-----AACTAATACCTTAAATAACGG---G----ACC-TTACAAAAAGCATCTGAA-GAA--------G---------T-----GA---------T---------AATCATGACAATATTAATTTTATCAAATAT----CGTATGCAAA-----CTA------GCC--AATTTGTTTTGGTGG-CGGTTTTTTTTGC------AACTGTAA--CCATTCTTCAT-ATTACA---TTTGTTTCATT-----TTGA---AG-------------G------G-G----GGAA----TAC-T---TACGC-TACA---T-AATAA--TG-T--TGCACG-AATTATGCAGTTCATA-----ATCTCCTTCAACATGTTGCATG--TATTAATGTGT-----AAAATAATCAAACATTGTTCACTTTC-----AAAATTC-AAATTACTCAATGCATGTT-------TCGT-GTAAA--TGT-AG-CTACTCG-A----------AATAC-GC-ACATTGT-AAATCGAGC
gi|6 : tnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgA----CAT---G-AAATTGACGGTTACATGTTAAAC--TGCA--CG-CGCGTTTTT-TGC-AGAAGG----------AACCTCTCTAAGACAATGTCCT-TCT-T---AACA------AAGTT-------------A-AT--ATC-GAAAAA---GTGAGATAA-CGCACACAACCACCTTCATATGAA--TCA-T-AGTA----CAGGGGTAAAATCG--CTCAAT-----CAGTA--CAC-ATC-----CACGTTC-TAAACTTAATCCTTGCATT--TCATAACA------ACCTCACCCTC--AC-----CG-AAGCGAAACAACCAT-----G-----CTAGATTTAAGTTTAAGAAAGA--ATCGAGAATTTCACTTC-TGCTGTGT-GTAAAATA-AACCATC-----------CA---------------A----------------A-CTTAG-AGATCAAATA-ATACCTTAA----TAC---GCGGAACCTT-ACAAAAAGCAT-TGAA-GAATG------A---------TAATCAGA---------C---------AAT-------AT-TAATTTATGCAAAAT-T----TGTATA-AGAAAATCTTATCCCGCGCCAGAATTTGTTT--GT-GTCGGC--ATGTTGCAATAA--------A--CC-TTTTCTATCATTACA--TTTTGTTCAATCCATAATTGA---AG-------------G------G-A----AATACAATTAC-C-----GTCTTACAT--T-GAA----TG-TTATGCACGAAATTA
gi|16 : atcaattcagtcattgtttcatcgtttggtcccattaaatattcataaatcgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggtaagccttaACT-GGCA--TG-TGCCACTGT-GGC-AGGTGA----------A--------------------gtccccagtctatgttcacaatccccctcaaactatgtgtctagtccatgtatc
gi|5 : actggcatgtgccactgtggcaggtgaaccccagacaatgttttctcactaacnCCACCTA-AAGCCCCGGGAAATAA-CGCACACAACCAAAT-------GA--TCA-T-G--AAAACCAGGGGTAAAAT-GGCTTCAAT----TCAGTA--CACGATC-----CACGGTCCTAA--TTAACCCTTA-ATT--GCATCACACATGTAACC-CACCCTC-TACT----CG-AAGCGAC----------------------G------G---AAGAAAGAT-ATCGAGAATTCCAC-TC-TGCTAT-T-GAAGAATA-AATCATCGTATCGAAAAGCATTTATTAT------AG----------------A-TTAAG-AG---AAA-----------------AA----------------AAAAAGCAT-TGAA-GAA--------G---------T-----GATAATCATGAC---------AAT-------AT-TTCATCATATCAA-TAT----CGTATA-AAA-----CTA------GCCG-------TTT--GT-G-CGGCTTTTTT-GC-ATAGGAATT---A--CC-CTCTTGGT-ATTACACATGTTGTTTCATT-----TTGA---AGGGGGGAAAA----C------C-A----AAAAC--TTAC-T---TAATC-TACA---T-GAC----TG-T--TGCACGAAATTATGCAGCACACA-----ATTTCCTTCAACATGT--------TATTAATGTGT-----AAATTAATC-AGTATTGTTCACTT-------GG---TC-AAATTA-TTACTGCATGTTACGTGTATCAT-GTAAA--TGC-AG-CTACTCGTA--TTTTTTTTAATAC-GC-AAATTGT-AAAT-GAGCACTTTGATCATATAATATGATA-TCGT--TGTTACCCTATTTACACACTGTAAAAAGAAGT--GAAAAGTTTATGATCTGATACATTGTATCTACATTATAAATATTGATA--ATTGGTTTAAGAAAATTACTCTGTCGAGTTG-TATTTAAACCTGTACTTC-TTTTCAAGTATTTCCCTA-ATT-TT----cccgagacaatgtttcctcacaaactaatgcgtttactgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtaacccaccctctactcgaagcgatcaatcgtggcacgcaatattgaagataattccactgttgttgaagaataaatcatcgtatcggaaagcatttatagcttaagagaaaaataccttaacgagatctacaaaaagcatttaagaagtgataatcatgacaatatttcaccatatcaactatc
gi|9 : aAAT-CA---AAGATTCA-CTG--A----CAGGGGTAAAAT-GGCTTCAAT----TCAGTA--CACGATC-----CACGGTCCTAA-----ACC-TTA-ATTTTGCATCACA-----AACC-CACCCTC-TACT----CGGAAGCGAA-CAAACAC-----G-----CACGATT---G---AAGAAAGATGATCGAGAATTTCAC-TCATGCGGGGT-GGAGAATA-A-CCATCGTAT------------ATTA--------G----------------A-TTAAGGAG---AATA--ATACCTTAAA---TAATGGG----ACC-T-ACAAAAAGCAT-TGAAAGAATGATAATCA---------T-----GA---------C---------AAT-------AT-TTAAATTTATCAAATAT----CGTATA-AAAA----CTA------GCTC-TATATATTT--GC-G-C---TTTATTTGC-AT-----TT---AAACC-TTCTTCATAATTA-A--TTTTGTTTCATT-----TTGA---AG-------------A------AGG----GGAA----TACGT---TACGC-TACA---TGGAA----TGCT--TGCACGAAATCATGCAGT-CACA-----ATCTCCTTCAACATGCTTACAATGTATTAATGTGTTAAAAAAATCAAAC-ATTGTT-TTCACTTTCGAA--AA---TCAAAATTA-TCCATGCATGT------TATCGTGGGAAA--TGT-AG-CTACTCGTAA---------A--AC-GC-ACATT-T-AAAT-GAGC
gi|15 : atcAAAT-GGCTTCAAT----ACAGTA--CACGATC-----CACGg
gi|3 : gaaaataaaaataaatacactgatttaaaaacaattgattttcttccttatacgcattgcgcatgtacatgcatttaatatacagatacgtgtacattgtacatgatctacatgtatgaatatattattgtctttgtttgttaaaaaaaaacatcgttaatattatattcatgtattttttaaagatctacacatatgcacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGGCTTCAAT----TCAGTA--TACGATC-----CACGGTCCTGA--TTAACACTTA-ATT--GCATCACACATGTAACC-CTCCCTT-TACT----CG-AAGCGAT-CAACCAC-----G--------------------AGAA---T-ATCGAGAATTCCAC-TC-TGCTGT-T-GAAGAATA-AATCATAGTATCGGAAAGCATTTATTAT------AA----------------A-TTAAG-AG---AAAA--ATATCTTAA----CGA---C----ATC-T-ACAAAAAGCAT-TGAA-GAA--------G---------T-----GATAATCATGGC---------AAT-------AT-TTCATCATATCAAATAT----CGTATA-AAA-----CTA------ACCA-AATTTGTTT--GT-G-TGG---TTTTTGC-ATAGAAATT---A--CC-TTCTTCAT-ATTAAA--TGTTATTTCATT-----TTGA---AG-------------GGGGAAAA-ATCCCAAAAC--TTAC-T---TAATC-CACA---T-GAT----TG-T--TGCACGAAATTATGCAGCACACA-----ATTTCCTTCAACATAT--------TATTAATGTGT-----AAACTAATC-AGTATTTTTCACTT-------AA---TC-AAATTA-TTACTGCATG----------CGT-GTGAA--TGC-AG-TTACTCGTATTTTTTTTTTAATAC-GC-AAATTGT-AAAC-GAGCACTTTGATCATATAATATAATA-TCGTTGTGTTATCCTATTTACACACTGTAAAAAGAAGT--GAAAAGTTAATGATCTGATACATTG---------TATAAATATTGATA--ATTGGTTTAGGAAAATTACTCTGTCGAGTTGTTTTT-AAACTCGTACTTC-TTTTCAAGTATTTCCCTATCTT-TC----A------C-----ACCTAGAAGTCCTTTCCAGTA----ATACATAATCACCGTGTTACAAATGGCCAG-AGTTATTCTACATCCTCCTTGAACGGGCTTC-AT-CGAGAG---A-AATTAA-------TGAAGA----TA--------GGA-T-TA-----A----TAG--TATTACCTTA-TTAGGCATAGTGCG-CGGTA------CGGTTCG-G--TTCG-----GAA--TGCTTTG-AGGGC-GTGGT------TTGC-A---TA--------------A----------A----CG-TTCT---ATGA--ACT------------------------GTAA-GG-TTCG-T---TGCT-AGCAAGGTACGGTGCGCTTCTgcta
gi|32 : T--GCATCACA------ACC-CACCCTC-TACT----CG-AAGCGTA-CAACCAC-----G-----CACGATT---G---AAGAAAGAtgcgcggtacggttccgcgatatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaacgtttctgaggtgtagtagcacggtttaggatctg
gi|16 : ATGTAACC-CACCCTC-TACT----CG-AAGCGAT-CAATCGT-----GGCACGCAATATT---G---AAGA-------T----AATTCCAC-T---GTTGT-T-GAAGAATA-AATCATCGTATCGGAAAGCATTTAT----------A----------------GCTTAAG-AG---AAAA--ATACCTTAA----CGA---G----ATC-T-ACAAAAAGCAT-TTAA-GAA--------GTGATAATCAT-----GA---------C---------AAT-------AT-TTCACCATATCAACTAT----C
gi|35 : actggcatgtgccactgtggcaggtgaaccccagacaatgttttctcactaacnactggcatgtgccactgtggcaggtgaacccgagacaatgtttcctcacaaactaatgcgtttactgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGTAACC-CACCCTC-TACT----CG-AAGCGAT-CAACCGTGGCGCG-----CAAGATT---G---AA
gi|23 : AACC-CACCCTC-AACT----CG-AAGCGAA-CAATCAC-----G-----CACGATT---G---AAGAAAGAT-ATCGAGAACTTCAC-TC-TGCTG
gi|11 : acTCATTATATCAAATATGTATCGTATA-AAA-----CTA------GCAA-AAATT-TTT--GT-G-CAGCTTTTTT-GC-ATAGGAATT---A------TCTTCAT-ATTACA--TTTTGATTCATT-----TTGA---AGGGGGGGGGGGACTC------C-A----AAAAC--TTAC-T---TAATG-TACA---T-GAT----TG-T--TGCACGAAAGTTTGCAGTACACATCACAATTTCCTTCAACATGT--------TA--------------AACTTAA----GTA-----------------------C-A-------TACTGCATGTTA----T--CGT-GTAAA--TGC-AG-CTACTAGTA---TTTTTTTAATAC-GC-AAAATTT-AGAT-GAGCACTTTGAT-ATATAATATAGTAACTGTTGTGTTACCCTATTTACACAGTGTAAAAAGAAGT--GA-----------TCTGATACACTG---------TATAAATATTGAAA--ATTGGTTTAGGAAAATTACTCTGTCGAATTGT--------------------TTTCAAGTATTTCCCTA-ATT-TTTATAG------CT----A-----AAGTCCTTTCGAGTA----ATACTTAATCATGGTGTTACGAATGGCCAG-AGTTAGTCTACGTCCTCCTTTAACGGGCTTC-AT-TGAAAG---A-AATAAA-------TGAAGA----TA--------AGA-T-TA--TTAG----TAccaccgtatcttagatgaaaagaataataccttaaataacgggacttacaa
gi|5 : T-----TTGACCAAG-------------T------G-A----ACAA----TAC-TGATTAATT-TACACATT-AATAACATG-T--TGAAGGAAATTGTGTGCTGCATA-----ATTTCGTGCAACA-GT--------CA------TGT-----AGATTAA
gi|27 : accacctaaagccccgggaaataacgcacacaaccaaatgatcatgaaaaccaggggtaaaatggcttcaattcagtacacgatccacggtcctaattaacccttaattgcatcacacatgtaacccaccctctactcgaagcgacggaagaaagatatcgagaattccactctgctattgaagaataaatcatcgtatcgaaaagcatttattatagattaagagaaaaaaaaaagcattgaagaagtgataatcatgacaatatttcatcatatcaatatcgtataaaactagccgtttgtgcggcttttttgcataggaattaccctcttggtattacacatgttgtttcattttgaaggggggaaaaccaaaaacttac-----AAATAAATC-A---TTGTTCACTTTCAAAAAAG---TC-AAATTA-TCAATGCATGT------TATCGT-GTAAAACTGTGAGCCTACTCGTAA------------ACGGC-ACATTGTAAAAT-GAttattactgcatgttacgtgtatcatgtaaatgcagctactcgtattttttttaatacgcaaattgtaaatgagcactttgatcatataatatgatatcgttgttaccctatttacacactgtaaaaagaagtgaaaagtttatgatctgatacattgtatctacattataaatattgataattggtttaagaaaattactctgtcgagttgtatttaaacctgtacttcttttcaagtatttccctaatttt
gi|8 : aCATGTTA----T--CGT-GTAAA--TGC-AC-CTACTCGTA---TTTTTTTAATAC-GC-AAACTGT-AAAT-GATCACTTTGATCATATAATATAATA-TCGTTGTGTTACCCTATTTACACATTGTAAA--GAAGT--GAAAAGTTAATGATCTGATACATTG---------TATAAATATTGATA--ATTGGTTTAGGAAAATTACTCTGTCGAGTTG-TGTTTAAACCCGTACCTC-TTTTCAAGTATTTCCCTA-ATT-TTTAGGG------CTG---A-----AAGTCCTATCGAGCA----ATACTTAATCACGGTGTTACAAATGGCCAGAAGTTATTCTACGTCCTCCTTTAACGGGCTTC-AT-CGAGAG---AGAATTAA-------TGAAGA----TA--------AGA-------TTAA----TAG--TATTACCTTA-TTAGGCATACTGCA-CGGTA------CGGTTC--GGTT-CG-----GAA--CGCTTTG-AGGGT--TGGT------TTGC-A---TA--------------A----------A----CG-CTCT---ATGA--ACTagc
gi|29 : AATTGT-AAAT-GAGCACTTTGATAATATAATACAATA-TCGTTGTGTTACCCATTTTACACACCGTAAAAAGAAAT--GAAAAGTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtacatttcttaggtgtagtagcacggtttagggtctg
gi|34 : ATTGT-AAAT-GAGCACTTTGATAATATAATATAATA-TCGGTGTGTTACCCT
gi|19 : GTTGTTTT--AAACCCGTAATTC-CTTTCAAGTATTTCCTTA-ATTCTT----A------TGGGTGA-----AAGTCCTGTTGAGTA----ATACTTAATAATGGTGTTACGAATGACCAA-AGTTAACCTCCGACCTCCTTTAACGGGCTCC-AT-CGAGAG---A-AATAAA-------TGATTA----TA--------ACA-T-TA-T--------TAG--TATTACCTTA-TTAGGTATACTGCA-CGGTA------
gi|30 : TTTAAACCCGTAATTA-TTTTCAAGTATTTCCCTA-ATT-GT----AATGGGTG-----A-----AAGTTCTGTTGAGTA----ATACTTGATTA
gi|12 : ttggCGTACCTCTTTAATGGGCTCCCATGCGAGAG---A-AAT-AA-------TGAGAACATGTA--------AGAAT-TACTACAAATG-TAGATTATTACCTTAGTTAGGCAATCTGCAGCGGTA------CGGTTTGCG--T-CG-----GAAGCCGCTTTG-AGGGG-TTGGT------TTGC-AG--TAATAATTTATTTGAGA----------A----CG-TTATTTAATGA--GGTGTAC-GGTA-CGCTTCT-TGCCAAGAAC-GG-TTCG-C---TTCT-TG
gi|14 : CGTCCTCCTTTAACG-GCTCC-AT---AGAGTAGA-AATTAAAGTATAGTGAAAA----TACATCGTGAAGA-TATACTACAAATGTTGA--TATTAC-TTA-TTAGGCATACTGCC-CGGTAACGGTTCGG-----T--T-CG-----GA----GCTTTG-AGGGCTGTGG-------TTGCGA---TA--------------ATTTATTTGAGA----AGTTTCT---ATGAGGGTGTAACGGATTATGCTTCT-TG-AC-GTAC-GG-TTCG-C---TT-T-TGTACGGTACGTTGC--TTCTttcgtaggttcgctgttcttgcacgtactgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttttgcacggtacagggttgttcgcttcttagtacggtacgtttcgcttcttggtaccggttaaacggttcgttcgtctttgcacgatacggttcggctatcagtttctgaggtgtagtaggcacggttctaggtca
gi|20 : TGCA-CGGTA------CGG-----T--T-CGCTTCTG----CGCGTGGTACGGC-TTCGTGTATTCTTGC-ACGGTA--------------A----------GGTATCG-CTCT---GT----ACGTAAC-GGTTGCG-CTCT-TGTAC-GTACGGG-TTCGTT---TTCT-TGC-CA-CCCGGTACG-TTCtagtgcggtagagtggttgtacgctttcagttggcagtaagttcgcttttggcgctcggtacggatttaggtgttctggcagggtatcgggtcgttctgatgcaagtacggtcgttgttgcggggatacgtgttgttttcttgcacagagtcgagttcggcttctgtagggtttcgtttcttgtgcgatcgtgttatggttgtcggttttcgtttctgcaggtggttagcagg
gi|20 : tacggtcgcttct-TTCT----TGC--ACGGTAC-GGTT-CGCTTCTGCGCGTGGTAC-GGCTTCG-TGTATTCT-TGCACGGTAAGGTAgacgttcgtttctgaggtgtacggtagccacggtttagatc
gi|20 : tacggtcgcTAC-GGT--CGCTTCT-TGCACGGTAC-GG-TTCG-C---TTCTGCGCGTGGTACGGtcgctctgtacgtaacggttgcgctcttgtacgtacgggttcgttttcttgccacccggtacgttcgacgttcgtttctgaggtgtacggtagccacggtttagatc
gi|8 : -TGCACGGTAC-GG-TTCG-G---TTCcttcgtgtattcttgcacggtaaggtatcgctctgtacgtaacggttgcgctcttgtacgtacgggttcgttttcttgccacccggtacgttcgacgttcgtttctgaggtgtacggtagccacggtttagatc
gi|20 : catgttatcgtgtaaatgcacctactcgtatttttttaatacgcaaactgtaaatgatcactttgatcatataatataatatcgttgtgttaccctatttacacattgtaaagaagtgaaaagttaatgatctgatacattgtataaatattgataattggtttaggaaaattactctgtcgagttgtgtttaaacccgtacctcttttcaagtatttccctaatttttagggctgaaagtcctatcgagcaatacttaatcacggtgttacaaatggccagaagttattctacgtcctcctttaacgggcttcatcgagagagaattaatgaagataagattaatagtattaccttattaggcatacTAC-GG-T-CG-C---TTCT-TGCACGGTACGGTTCGCTTCTggaacgctttgagggttggtttgcataaacgctctatgaactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtacatttcttaggtgtagtagcacggtttagggtctg
7 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|28 ): TTAACGATTTTGTCGTTAACATCTACGTTCAATGAAATACTAGCATTGTCATCTAAAATAATCAATTGAGCACTATTATTCTGTATTTAAAA
Unaligned ( gi|31 ): TTGGTTTAAACACGTAAATTATTTTCAAAAGTATGTCCCCTAATTGTAATGGGTGAAAGTTTCTGTTGAGGTAATATT
Unaligned ( gi|33 ): CACGGTATGGTTCGGTACGTTTCTGAGGTGTAGTAGCACTGTTTAGGGTCT
Unaligned ( gi|36 ): ATACACTCATCCATTTGTTTTTACTGAAAAAACCTCA
Unaligned ( gi|37 ): ACGTTTCTGAGGTGTAGTAGCACAGTTTAGGGTCTGT
Unaligned ( gi|38 ): ACACTTCTGAGGTGTAGTAGTACGGTTTAGGGTCTGT
Unaligned ( gi|39 ): CGTTTCTAGGTGTAGTAGCACGGTTTAGGGTCT
Alignments
lowQualScore : 4444444444444 4444 11 11 22222 444444444444 33 2222 111 3333333 1 33333333333333 2 6666666 2222 1 4444444444 111111 111111 1111111 22222222222 111 1111 333333 1111 1 99999999999999999999999999999 111111 111 111 22222222222222222222222 11111111111 777777777777777777777777777777777777777777777 1111111 11111 111111 11 111 1 11111 5555555555555555555555555555555555 1111 22222222 11111 33333333 11111 1 444444444444 33333333 2222222222222 222222222 222 88888888888888888888888 1111 1111111 1111 11111111 444444444444 222 111 111 111111 66666666666666666666666666666666666 1111 333333333333333333333 11111111 11111 1 11 111111 22
lowQualScore : 2 3333333333333 1 4444 44 0 11 6 0 3 44444 88 111111111111 88 00 3 3 7 1 1 2 1 1 1 0 0000 1 1 1 1 222 1 22 1111111 7 3 55555555555555 7 11 0 3 3 4 3 3 0000000 2 2222 0 3333333333 666666 555 444444 5 9999999 5 1 6 77777777777 000 0 1111 77 5 222222 1 0000 888 0 4 55 4 4 4 55 4 88888888888888888888888888888 777 4 222222 1 8 4 6666 555 5 4 1 777 66 666 66 9999 3 7777 55 99999 333 4 55 5 3 3 6666 3 3 77 77777 77777 2 555 555 3 3 3 7 3 3 555 2 2 77777777777777777777777 3 0 66666666666 0 7 4 4 000000000000000000000000000000000000000000000 4 4444444 8888 4 4 11111 444444 11 4 66 666 6 3 5 0 4 555 5 0 66 22222 8888888888888888888888888888888888 5 1 5 5 5 66 5 66 0000 44444444 22222 66 22222222 22222 1 0 3 2 999999999999 5 5 00000000 4 66 4 4 1111111111111 1 4 3 3 2 5 999 666666666 99 000 4 2 4 66 4 4 4 22222222222222222222222 5 1 5 0000 6 1 5 5 5 5 5 6666666 0000 88888888 5 5 999999999999 99 6 5 5 000 6 222 6 000 999999 6 77777777777777777777777777777777777 5 0000 777777777777777777777 1 777 77777777 4 4 55 77 777 4 4 11111 66 5 0 5 11 888 444444 11
lowQualScore : . ............. . .... .. . .. . . . ..... .. ............ .. .. . . . . . . . . . . .... . . . . ... . .. ....... . . .............. . .. . . . . . . ....... . .... . .......... ...... ... ...... . ....... . . . ........... ... . .... .. . ...... . .... ... . . .. . . . .. . ............................. ... . ...... . . . .... ... . . . ... .. ... .. .... . .... .. ..... ... . .. . . . .... . . .. ..... ..... . ... ... . . . . . . ... . . ....................... . . ........... . . . . ............................................. . ....... .... . . ..... ...... .. . .. ... . . . . . ... . . .. ..... .................................. . . . . . .. . .. .... ........ ..... .. ........ ..... . . . . ............ . . ........ . .. . . ............. . . . . . . ... ......... .. ... . . . .. . . . ....................... . . . .... . . . . . . . ....... .... ........ . . ............ .. . . . ... . ... . ... ...... . ................................... . .... ..................... . ... ........ . . .. .. ... . . ..... .. . . . .. ... ...... ..
lowQualScore : 5 0000000000000 0 0000 00 7 00 5 2 2 55555 55 000000000000 33 33 2 2 3 0 0 0 0 0 0 7 3333 0 0 0 0 333 0 00 3333333 3 3 77777777777777 3 77 7 7 0 0 0 0 0000000 5 2222 0 3333333333 222222 999 444444 0 8888888 0 4 2 11111111111 000 7 4444 99 7 555555 7 6666 888 0 0 55 0 0 0 55 0 99999999999999999999999999999 888 4 888888 0 9 4 0000 888 0 4 0 888 11 000 11 4444 6 7777 00 11111 666 0 00 9 1 1 5555 1 1 11 77777 77777 1 444 444 6 6 6 3 6 6 222 0 0 55555555555555555555555 6 5 33333333333 4 3 0 0 000000000000000000000000000000000000000000000 0 4444444 5555 4 4 11111 444444 22 5 99 222 2 2 0 1 5 666 0 0 99 55555 8888888888888888888888888888888888 0 0 0 0 0 99 0 99 6666 99999999 55555 99 55555555 55555 2 0 4 5 111111111111 0 0 11111111 4 11 4 4 3333333333333 1 4 6 6 5 0 333 777777777 22 666 4 9 4 11 4 4 4 99999999999999999999999 0 0 0 6666 7 0 0 0 0 0 9 2222222 6666 11111111 0 0 999999999999 22 7 7 7 888 7 333 7 222 222222 7 33333333333333333333333333333333333 7 1111 888888888888888888888 0 888 44444444 4 4 33 33 888 4 4 88888 99 0 0 0 99 888 444444 77
consensus : NNNNNNNNNNNNATGAACNCTATGCAAATTAAGTGGACGTACA---GTAGCTTTGTTTGATTGAC----AGTCGACTATT-CATTTTATTTAATTTCATTTAATGTGTAGACGTATTTAATTTCATGTTGAATTAAATTTTT----GTGTATTTTCGTGTCTGGAAGAAAAG--CGAAATTAAATCCAACACGAATT--TTATTTTCAGAAAATCTTTATTTCAGTGTTAGAAATGTGCGTTTCTGTTATTCGTAGTCTAT-T-TCGATAAAATATTTCGCCAGTACCGTCATCATTGTACTCGCACTCTGTT-TATTTAGA-ACGATTGCTGC-AAAACA-GACAATTCATAATTAGACACT-AACTCGGNACGNGTGCAAGTTTCGGNTTCAGTGTAATTAAGAATGATTACTATCAAAACATNTTGAGACACAAAGCCGGGAAGGTCGGAGTACAGGTACATGTAACTGCTCGTGCTGTGTCGTGGAGACGTACCCCGTACGTGCAT--G-AT-TT----------TACGTGTACATTG---T--ACATGATCTACATGTATGAATATAT-T-AT------TGTATTTGTTGG-T----T--AAAAAAAC-ATCGCTTAATATTATATTCATGTATGTTTTACA-----------GATCT---ACACATATGCACATAAAGCATCGATAAC---GGGAAA--AGTA-GTA------TATATAAATA----CAT---GTAAATTGACGTTTACAT-TTAAA-CTGGCA--CG-TGCCGCTGT-GGC-AG--GTGAA-CCC-----A------GACAATGTC-T------TCTT---A-CA------AACT-A-ATCCACC-CCTAA-GCCCCGGGAAATAA-CGCACACAACCA-AATCA---AAA--CCA-C-G--A----CAGGGGTAAAAT-GGCTTCAAT----TCAGTA--CACGATC-----CACGGTCCTAA--TTAACCCTTA-ATT--GCATCACACATGTAACC-CACCCTC-TACT----CG-AAGCG-AT-CAAC-----C-----ACGCAAGATT---G---AAGAAAGAT-ATCGAGAATTCCAC-TC-TGCTGT-T-GAAGAATA-AATCATCGTATCGGAAAGCATTTATTATA----G------------------ATTAAG-AGAAAAATACCT----TAA----CGGGACC-TACAAAAAGCAT-TG-AAGAA--------G---------T-----GA---------C---------AAT-AT-------TTCATTATATCAAATAT----CGTAT-A-AAA-----CTA------GCCA-AATTTGTTT--GT-G-CGGCTTTTTTTGC-ATAGGAATT---ACC-TTCTTCAT-ATTACA--TTTTGTTTCATT-----TTGAAGGGG-------GG----------AAAA-------AC--TTAC-TTANTC-TACA-T-GAT--TG-T--TGCACGAAATTATG----CAG----CG--CACA-----ATCTCCTTCAA--CATGT--------TATTAATGTGT-----AAATTAATC-AGTATTGTTCACTTTCG---A-----TC-AAATTA-TTACTGCATGTTA----TATCGT-GTAAA--TGC-AG-CTACTCGTA---TTTTTTT---AATACGC-AAATTGT-AAAT-GAGCACTTTGATCATATAATATAATATC-GTTGTGTTACCCTATTTACACACCGTAAAAAGAAGT--GAAAAGTTAATGATCTGATACATTG---------TATAAATATTGATA--ATTGGTTTAGGAAAATTACTCTGTCGAGTTGTT-TTTAAACCCGT-ACTTC-TTTTC--AAGTAT-TTCCCTA-ATT-TT----AA--G-TC-----A-----AAG-TCCTNTCGA-GTA----ATACTTAATCACGGTGTTACGAATGGCCAG-AGTTANTCTACGTCCTCCTTTAACGGGCTTC-AT-CGAG-AGA-AATNAA-------TGAAGA----TA--------AGA-T-TA--T--CAA----TAG--TATTACCTTA-TTAGGCATACTGCA-CGGT-ACGGTTCG-G-T-CGGAA--CGCTTTG-AGGGC-NTGGT------TTGC-A---TA--------------A----------A----CG-TTCT---ATGAAC---------------------GGT---ACGG-----TT-CGCTTCT-T-G-CAC-GGT---AC-GG-TTCG-C---T--TCT-T-G-CA--CGGT---ACG------GTT-CGCTTCT
Reference ( family-203 ) : NNNNNNNNNNNNATGAACGCTATGCAAATTAAGTGGACGTACACNTGTANCTTTGTTTNATTGACGTCAAGTCGACTATC-CATTTTATTTAATTTCATTCAATGTGTAGACGTATTTAATTTTATGTTGAATTAAATTTTT----GCGTATTTTCGTGTCTGGAAGAAAAGAACAAAATCNAATCCAANACGAATTCTTTATTTTCAGAAAATCTTTATTTCAGTNTTNGAAACGTGCGTTTCTGTTNTNCGTNGTCCATTTATNGATAANANATTTNGCCAGTACCGTCATCATTGTANTCGNNCCCTGTTCTATTTAGA-ACGATTGCTGTCAAAACGGGACAATTCATGNTTGGACACTTAACTCGGAACGAGTGCAAGTTTCGGTTTCAGTGTAATTAAGAATGATTACTATCAAAACATTTTAAGACACAAAGCCGGGAAGGTCAAAGTACAG---C---TAACTGCTCGTGCTGTGTCGTGAAGACATACCTCGTATGTGCAT--A-AT-TT----------TACGTGTACATTG---T--ACATGATCTACATGTATGAATATAT-T-AT------TGTATTTGTTGG-T----T--AAAAAAAC-ATCGCTTAATATTATATTCATGTACGTTTTACA-----------GATCT---ACACATATGCACATAAAGCATCGATAAC---GGGAAA--AGTA-GTA------TATATAAATA----CAT---GTAAATTGACGTTTACAT-TTAAA-CTGGCA--CG-TGCCGTTGT-GGC-AG--GTGAA-CCC-----A------GAC-------T------TCTT---A-CA------AANT-A-ATCCACC-CCTAA-GCCCCGGGAAATAA-CGCACACAACCA-ANTCA---AAA--TCA-C-G--A----CAGGGGTAAAAT-GGCTTCAAT----TCAGTA--CACGATC-----CACGGTCCTAA--TTAACCCTTA-ATT--GCATCACACATGTAACC-CACCCTC-TACT----CG-AAGCG-AN-CAAC-----C-----ACGCAAGATT---G---AAGAAAGAT-ATCGAGAATTTCAC-TC-TGCTGT-T-GAAGAATA-AATCATCGTATCGGAAAGCATTTATTATA----G------------------ATTAAG-AGAAAAATACCT----TAA----CGGGACC-TACAAAAAGCAT-TG-AAGAA--------G---------T-----GA---------C---------AAT-AT-------TTCATTATATCAAATAT----CGTAT-A-AAA-----CTA------GCCA-AATTTGTTT--GT-G-CGGCTTTTTTTGC-ATAGGAATT---ACC-TTCTTCAT-ATTACA--TTTTGTTTCATT-----TTGAAGGGG-------NN----------AAAA-------AC--TTAC-TTANTC-TACA-T-GAT--TG-T--TGCACGAAATTATG----CAG----CG--CACA-----ATTTCCTTCAA--CATGT--------TATTAATGTGT-----AAATTAATC-AGTATTGTTCACTTTCG---A-----TC-AAATTA-TCACTGCATGTTA----TATCGT-GTAAA--TGC-AG-CTACTCGTA---TTTTTTT---AATACGC-AAATTGT-AAAT-GAGCACTTTGATCATATAATATAATATC-GTTGTGTTACCCTATTTACACACTGTAAAAAGAAGT--GAAAAGTTAATGATCTGATACATTG---------TATAAATATTGATA--ATTGGTTTAGGAAAATTACTCTGTCGAGTTGTTNTTTAAACCCGT-ACTTC-TTTTC--AAGTAT-TTCCCTA-ATT-TT----A------C-----A-----AAG-TCCTNTCGA-GTA----ATACTTAATCACGGTGTTACGAATGGCCAG-AGTTANTCTACGTCCTCCTTTAACGGGCTCC-AT-CGAG-AGA-AATNAA-------TGAAGA----TA--------AGA-T-TA--T--CAA----TAG--TATTACCTTA-TTAGGCATACTGCA-CGGT-ACGGTTCG-G-T-CGGAA--CGCTTTG-AGGGC-NTGGT------TTGC-A---TA--------------A----------A----CG-TTCT---ATGAAC---------------------GNT---ACGG-----TT-CGCTTCT-T-G-CAC-GGT---AC-GG-TTCG-C---T--TCT-T-G-CA--CGGT---ACG------GTG-CGCTTCT
gi|1 : ATGAACTCTATGCAAATTAAGTGGA-----A---GTAGCTTTGTTTGATTGAC----AGTCGACTATTTCATTTTATTTAATTTCAATTAATAT--AGACGTATTTAATTTCATGTTGAAT--AATTTTTTTTTGTGTATTTTCGTGTCTGGAAGAACAG--CGAAATTAAATCCC-CACGGATT--TTATTTTCAGAAAATCTTT--TTCAGTGTTAGAAATGTGCGTTTCTGTTATTCGTAGTCTATGTCTCGATAAAATATTTCGTCATTACC--CATCATTGTACTCGCACT-TGTT-TAT--AGA-ACGATTGCTGCAAAAATA--ACAATTTATAATTAGACACT-AACTCGACACGTGTGCAAGTTTCGGGTTCAGTGTAATTAAGAATGATTACTATCAAAACATGTTGAGACACAAAGCCGGGAAGGTCGGAGTACAGGTACATGTAACTGCTCATGTTGTGTCGTGGAGAAGTACCCCGTCTGTGCAT--G-AT-TT-----------GCGTGTACATTG---T--ACATGATCTGCATGTATGAATATAT-T-AT------TGTATTTGTTAG-T----T--GAAAAAAC-ATCGCTTAATATTATATTCATGTATGTTTTACA-----------GATCT---ACATATATGCACATAAAGCATCGATAAC---AGGAAA--AGTA-GTA------TATATAAATA----CAT---GTAAATTGACGTGTACAT-TTAAA-CAGGCA--CG-TGCCGCTAT-GGC-AG--GTGAA--------------------------T------TCTT---A-CA------AAGT-A-ATCCACC-CGTAA-GACCCGGAAAATAA-CACACACAACCA-AATCA---AAA--CCA-C-G--A----CAGGGGTAAAATTGGTTTCAAT----TCAGTA--CACGATC-----CACGTTCCTAA--TTAACCCTTA-ATT--GCATCACACATGTAACC-CACCCTC-TACT----CG-AAGCG-AT-CAAC-----C-----ATGCAAGATT---G---AAGAAAGAT-ATCGAGAATTCCAC-TC-TGCTGT-T-GAAGAATA-AATCATTGTATCGGAAAGCATTTATTATT----A------------------ATTAAG-AGAAACATACCT----TAA----CAAGATC-TACAAAAAGCAT-TG-AAGAA--------G---------T-----GA---------C---------AAT-GT-------TTCATTATATCAAATAT----CGTAT-A-AAA-----CTA------GCCA-AATTTCTTT--GT-G-CGGCTTTTTTTGC-ATAGGAATT---ACC-TTCTTCAT-ATTACA--TTTTGTTTCATT-----TTGAA---G-------CA----------AAAA-------AC--TTAC-TTAATC-TACA-T-GAT--TG-T--TGAACGAAATTATG----CAG----CA--CACA-----ATTTCTTTCAA--CATGT--------TATTAATGTGT-----AAATTAATC-AGTATTGTTCACTT--G---A-----TC-AAATTA-TTACTGCATGTTA----TATCGT-GTAAA--TGC-AG-CTACTTGTAATTTTTTTTT---AATACGC-AAATTGT-AAAT-GAGCACTTTGATCATATAATATAACACC-GTTGTGTTACCCTATTTATACACCGTAAAAAGAAGT--GAAAAGTTAATGATCTGATACATTG---------TATAAATATTGATA--ATTGGTTTCGGAAAATTACTCTGTCGAGTTGTTTTTTAAACCCAT-ACTTC-TTTTC--AAGTAT-ATCCCTA-ATT-TT----A------C-----A-----AAG-TCCTTTCGA-GTA----ATACTTAATCACGGTGTCACAAATGGCCAG-AGTTATTCTACGTCCTCCTTTAACGAGCTTC-AT-C-AG-AGA-AATTAA-------TGATAA----TA--------AGA-T-TAGTT--TAA----TAG--TGTTACCTTA-TTAGGCATAATGCA-CGGT-ACG----G-G-T-CGGAA--CGCTTTG-AGGGC-GTGGT------TTGC-A---TA--------------A----------A----CG-TTCT---ATGAAC---------------------TTT---ACGA-----TT-CGTTTCT-T-G-CAC-GGT---AC-GG-TTCG-T---T--TCT-T-G-CA--CAGT---ACG------GTA-CGATTCT
gi|10 : gatgaacgattaAGTATAT-T-AT------TGTATTTGTTGG-T----T--AAAAAAACTATCGCTTAATATCATATTC------------------------------------CATATACGCATAAATCATCGATAAC---AGAAAA--AGTA-GTACATGTATATATAAATA----CAT---GTAAATTGACGTTTACAT-TTAAA-CTGGCA--CG-TGCTGCTGT-GGC-AG--GTGAA-CCCC----A------GACAATGTC-T------TCTT---A-CA------AACT-A-ATCCACC-CCTAA-GCCCCGGGAAATAA-CGCACACAACCA-AATCA---AAA--CCA-C-G--A----CACAGGTCAAAT-GGTTTCAAT----TCAGTA--CACGATT-----CACGTTCCTAA--TTAACCCTTA-ATT--GCATCACACATGTAACC-CACTCTA-TATT----CG-AAGCG-AT-CAAC-----C-----ACGCAAGATT---G---AAGAAAGAT-ATCGAGAATTCCAC-TC-TGCTGT-T-GAAGAAT--------CGTA-----ATGCATTTATTATA----G------------------ATTAAG-AGAAAAATACCT----TG---------------CAAAAAGCAT-TG-AAGAA--------GTGATAATCAT-----GA---------C---------AAT-AT-------TTCATTTTATTATACTT----C-TGT-A-AAA-----
gi|11 : gggggggggggggggggggggggttagtccagataggacagttctTCATTATATCAAATATGTATCGTAT-A-AAA-----CTA------GCAA-AAATT-TTT--GT-G-CAGCTTTTTT-GC-ATAGGAATT---A----TCTTCAT-ATTACA--TTTTGATTCATT-----TTGAAGGGG-------GGGGGGGACTCCAAAA-------AC--TTAC-TTAATG-TACA-T-GAT--TG-T--TGCACGAAAGTTTG----CAG----TA--CACATCACAATTTCCTTCAA--C-----------------ATGT-T-----AAACT--TA-AGTA-----------------------C-A-------TACTGCATGTTA----T--CGT-GTAAA--TGC-AG-CTACTAGTA---TTTTTTT---AATACGC-AAAATTT-AGAT-GAGCACTTTGAT-ATATAATATAGTAACTGTTGTGTTACCCTATTTACACAGTGTAAAAAGAAG-------------TGATCTGATACACTG---------TATAAATATTGAAA--ATTGGTTTAGGAAAATTACTCTGTCGAATTG---------------------TTTTC--AAGTAT-TTCCCTA-ATT-TTTATAG------CT----A-----AAG-TCCTTTCGA-GTA----ATACTTAATCATGGTGTTACGAATGGCCAG-AGTTAGTCTACGTCCTCCTTTAACGGGCTTC-AT-TGAA-AGA-AATAAA-------TGAAGA----TA--------AGA-T-TA--T--TAG----TAatgttt
gi|12 : CGTACCTCTTTAATGGGCTCCCATGCGAG-AGA-AAT-AA-------TGAGAACATGTA--------AGAAT-TA--CTACAAATG-TAGATTATTACCTTAGTTAGGCAATCTGCAGCGGT-ACGGTTTGCG-T-CGGAAGCCGCTTTG-AGGGG-TTGGT------TTGC-AG--TAATAATTTATTTGAGA----------A----CG-TTATTTAATGAGG---------------------TGT---ACGG-----TA-CGCTTCT-T-G-CCA-AGA---AC-GG-TTCG-C---T--TCT-T-G-TT--C-GT---A-G------GTT-CGCT
gi|12 : TGCAC---------------------GGT---ACAGGGTTGTT-CGCTTCT-TAG-TAC-GGT---AC-GT-TTCG-C---T--TCT-TGG-TAC-CGGTTAAACG------GTT-CGTTgttcttgcacgtactgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttttgcacggtacagggttgttcgcttcttagtacggtacgtttcgcttcttggtaccggttaaacggttcgttcgtctttgcacgatacggttcggctatcagtttctgaggtgtagtaggcacggttctaggtca
gi|12 : cgtacctctttaatgggctcccatgcgagagaaataatgagaacatgtaagaattactacaaatgtagattattaccttagttaggcaatctgcagcggtacggtttgcgtcggaagccgctttgaggggttggtttgcagtaataatttatttgagaacgttatttaatgaggtgtacggtacgcttcttgccaagaacggttcgcttcttgttcgtaggttcgctgttcttgcacgtactgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttttAC---------------------GGT---ACGT-----TT-CGCTTCT-T-GGTACCGGTTAAAC-GG-TTCG-T---TCGTCT-TTG-CA--CGAT---ACG------GTT-CGcgtctttgcacgatacggttcggctatcagtttctgaggtgtagtaggcacggttctaggtca
gi|13 : cgtacctctttaatgggctcccatgcgagagaaataatgagaacatgtaagaattactacaaatgtagattattaccttagttaggcaatctgcagcggtacggtttgcgtcggaagccgctttgaggggttggtttgcagtaataatttatttgagaacgttatttaatgaggtgtacggtacgcttcttgccaagaacggttcgcttcttgttcgtaggttcgctgttcttgcacgtactgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttttgcacggtacagggttgttcgcttcttagtAATGTGCGTTTCTGTTTTTCGTAGTCTA-----CGATAAAATATTTCGCCAGTACTGTCATCATTGTACTCGCACTTTGTTCTATTTAGA-ACGATTGCTGTCAAAACAGGACAATTCATGATTGGACACT-AACTCGGAACGAGTGCAAGTTTCGGTTTCAGTGTAATTAAGAATGATTACTATCAAAACATTTTAAGACACAAAGCCGGGAAGGTCAAAGTACAG---C---TAACTGCTCGTGCTGTGTCGTGAAGACATACCTCGTATGTGCAT--A-AT-TT----------TGTGTGgctatcagtttctgaggtgtagtaggcacggttctaggtca
gi|13 : CGTACATGCATTTA-ATATTCAGA------TACGTGTACATTG---T--ACATGTTCTACATGTATGAATATAT-T-AT------TGTATTTGTTGG-T----A--GAAAAAAC-ATCACTTAATATTATACTCATATATGTgcaggagagacatattgaaaataaaaataagtaaactgatttaaaaaaaaaagtttcttccttatgcacattgtgcacgtacatgcatttaatattcagatacgtgtacattgtacatgttctacatgtatgaatatattattgtatttgttggtagaaaaaacatcacttaatattatactcatatatgt
gi|14 : aatgtgcgtttctgtttttcgtagtctacgataaaatatttcgccagtactgtcatcattgtactcgcactttgttctatttagaacgattgctgtcaaaacaggacaattcatgattggacactaactcggaacgagtgcaagtttcggtttcagtgtaattaagaatgattactatcaaaacattttaagacacaaagccgggaaggtcaaagtacagctaactgctcgtgctgtgtcgtgaagacatacctcgtatgtgcataattttgtgtggcaggagagacatattgaaaataaaaataagtaaactgatttaaaaaaaaaagtttcttccttatgcacattgtgcaCGTCCTCCTTTAACGG-CTCC-AT-AGAGTAGA-AATTAAAGTATAGTGAAAA----TACATCGTGAAGA-TATA--CTACAAATGTTGA--TATTAC-TTA-TTAGGCATACTGCC-CGGTAACGGTTCG-GTT-CGGA----GCTTTG-AGGGCTGTGG-------TTGCGA---TA--------------ATTTATTTGAGA----AGTTTCT---ATGAG----------------------GGTGTAACGGA----TTATGCTTCT-T-G--AC--GT---AC-GG-TTCG-C---T--T-T-T-G-TA--CGGT---ACG------TT---GCTTCT
gi|15 : CGCATGTACAT--GCAT-TTAATATACAGATACGTGTACATTG---T--ACATGATCTACATGTATGAATATAT-T-AT------TGTCTTTGTTTG-T----TAAAAAAAAAC-ATCG-TTAATATTATATTCATGTATTTTTTAAA-----------GATCT---ACACATATGCACAtagtgcggtagagtggttgtacgctttcagttggcagtaagttcgcttttggcgctcggtacggatttaggtgttctggcagggtatcgggtcgttctgatgcaagtacggtcgttgttgcggggatacgtgttgttttcttgcacagagtcgagttcggcttctgtagggtttcgtttcttgtgcgatcgtgttatggttgtcggttttcgtttctgcaggtggttagcagg
gi|15 : gaaaataaaaataaatacactgatttaaaaacaattgattttcttccttatacgcattgAAAT-GGCTTCAAT----ACAGTA--CACGATC-----CACGGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaatggcttcaatacagtacacgatccacggcta
gi|16 : gaaaataaaaataaatacactgatttaaaaacaattgattttcttccttatacgcattgcgcatgtacatgcatttaatatacagatacgtgtacattgtacatgatctacatgtatgaatatattattgtctttgtttgttaaaaaaaaacatcgttaatattatattcatgtattttttaaagatctacacatatgcacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnA-CTGGCA--TG-TGCCACTGT-GGC-AG--GTGAACCCC-----A------GACAATGTT-T------TCTC---A-CT------AACN-A-cta
gi|16 : A-CTGGCA--TG-TGCCACTGT-GGC-AG--GTGAA-CCCG----A------GACAATGTT-T------CCTC---A-CA------AACT-A-ATctggcatgtgccactgtggcaggtgaacccgagacaatgtttcctcacaaactaatgcgtttactgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtaacccaccctctactcgaagcgatcaatcgtggcacgcaatattgaagataattccactgttgttgaagaataaatcatcgtatcggaaagcatttatagcttaagagaaaaataccttaacgagatctacaaaaagcatttaagaagtgataatcatgacaatatttcaccatatcaactatc
gi|16 : actggcatgtgccactgtggcaggtgaaccccagacaatgttttctcactaacnATGTAACC-CACCCTC-TACT----CG-AAGCG-AT-CAAT-----CGTGGCACGCAATATT---G---AAGA-------T----AATTCCAC-T---GTTGT-T-GAAGAATA-AATCATCGTATCGGAAAGCATTTAT---A----G------------------CTTAAG-AGAAAAATACCT----TAA----CGAGATC-TACAAAAAGCAT-TT-AAGAA--------GTGATAATCAT-----GA---------C---------AAT-AT-------TTCACCATATCAACTAT----Cgcgtttactgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtaacccaccctctactcgaagcgatcaatcgtggcacgcaatattgaagataattccactgttgttgaagaataaatcatcgtatcggaaagcatttatagcttaagagaaaaataccttaacgagatctacaaaaagcatttaagaagtgataatcatgacaatatttcaccatatcaactatc
gi|17 : actggcatgtgccactgtggcaggtgaaccccagacaatgttttctcactaacnactggcatgtgccactgtggcaggtgaacccgagacaatgtttcctcacaaactaatgcgtttactgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn----------TACGTGTACATTG---T--ACATGACCTACATGTATGAATATAT-C-ATAATGATTGTCTTTGTTGG-T----T--AAAAAAGC-ATCGCT-GATATTATATTCATGTATGTTTTACA-----------GATCT---ACACATATGCACTTAAAGCATCGATAAC---AGAAAA--AGTA-GTAA-----CATATAAATA----CAT---GTAAATTGACGTTTACAT-TTAAA-CTGGCA--CG-TGCCGCTGT-GGC-AG--GTGAA-CCCC----A------GACAATGTC-T------TCTT---A-CA------AACT-A-ACCCACC-CCTAA-GCCCTGGGAAATAA-CACACACAACCA-AATCA---AAA--CCA-C-G--A----CAGGGGTAAAAT-GGCTTCAAT----GCAGTA--------------CACGGTTCTAA--TTAACCCTTA-ATT--GCACCACACATG
gi|18 : taatatacagaATGAACGCTATGCAAATTAAGTGGACGTACACATGTAGCTTTGTTTCATTGAC----AGTCGACTATT-CATTTTATTTAATTTCATTCAATGTATAGACGTATTTAATTTCATGTTGAATTAAATTTTT----GTGTATTTTCGTGTCTGGAAGAAA--------------TCCAACACGAATT--TTATTTTCAGAAAATCTTTATTTCAGTGTTAGAAATGTGCATTTCTGTT
gi|19 : GTTGTT--TTAAACCCGT-AATTC-CTTTC--AAGTAT-TTCCTTA-ATTCTT----A------TGGGTGA-----AAG-TCCTGTTGA-GTA----ATACTTAATAATGGTGTTACGAATGACCAA-AGTTAACCTCCGACCTCCTTTAACGGGCTCC-AT-CGAG-AGA-AATAAA-------TGATTA----TA--------ACA-T-TA--T---------TAG--TATTACCTTA-TTAGGTATACTGCA-CGGT-A
gi|2 : GTGTTCATTGACTTGAACATGATCTACATGTACGGATATATATGAT------TGTATTTGTTGG-TAAAAC--AAAAATAC-ATCGCTTCATATCATATCCATGTATGTTTCACATATTTTAAATAAATCT---ACACATATGCACAAAAAGCATCGATAAC---AGGAAA--AGTA-GT-------T-TATAAGTA----CAT---GTAAAGTGACGCTTATAT-TTAAA-CTG-CA--CG-TGCCGTTGT-GGC-AG--GTGAA-CCT-----AAGCAATGTC-------T------TCTT---A-CATGTACAAACT-A-ATCCACC-TC-AA-GCCCCGAAAAATAAACGCACACAGCCA-CCTCA---AAA--TCA-T-G--A----CAGGGGTAAAAT-TGTTTCAAT----TCAGTA--CATGATCTGATCCACGGTCCTAA------CCCTTA-ACT--GCATTACACATGTAACC-CACTCTC-TACT----CG-AAGCG-AT-CAAC-----C-----TCGCAAGATT---G---AAGA---------------TTCAC-TA-TGCTGT-T-ACAGAATA-AATCATCATATCCGAAAGCATTTATTATA----G------------------ATTAAG-AGAAAAATACCT----TAA----CAGGATC-TACAACAAGCAT-TG-AAGAA--------G---------T-----GA---------TAATCAAGGAAAT-AT-------TTCATTATATCAAATAT----CGTAT-A-AAA-----CTA------GACA-AATTACTTT--GT-G-CGGC-TTTTTTGC-ACAGGAATT---ACC-TTCTTCAT-ATTACA--TTTTATTTCATT-----TCGAAAGGGAAAAACTCC----------AAAA-------AC--TTAC-TTACTC-TACA-T-GAT--TG-T--TGCACGACATTACG----TAG----TG--CACC-----ATATCCTTCAA--CATGT--------TATTAATGTGT-----AAAATAATCAAACATTGTTCACTT--G---A-----TC-AAATAA-TTACTGCATAT------TATCGT-GTAAA--TGC-AG-CTACTAGTA---TTTTTTT---AATA-GCTAAATTGT-AAAT-GAGCACTTTCATCGAATAATATAGTATT-GTTGTGTTACCCTATTGACACAGTGTAAAAAAAAAGAAGAAAAGTTAATGATCTGATACATTG---------TATAAATATTGACAACATTGGGTTAGGAAAATTACTCTGTCGAGTTGTTGT---AACCAGT-ATTTCTTTTTC--AAATAT-TTCCCTA-GTT-TT----AACAGCTC-----A-----AAG-TCCTTTCGA-GTAGTATATACTTAATAATGGTGTTACGAATTCCAAG-AG-TAAACTACGTCCTACTTAAACGGGCTTC-AA-CGAG-AGA-AATAAA-------TGAAGA----TA--------ATA-T-TA--T--
gi|20 : T---ACGG-----T--CGCTTCT-T-G-CAC-GGT---AC-GG-TTCG-C---T--TCTGC-G-CG--TGGT---ACG------G
gi|20 : -TTCT----TGCAC---------------------GGT---ACGG-----TT-CGCTTCTGC-G-CGT-GGT---AC-GGCTTCG-TGTAT--TCT-T-G-CA--CGGT---AAG------GTATCGCTcttcgtgtattcttgcacggtaaggtatcgctctgtacgtaacggttgcgctcttgtacgtacgggttcgttttcttgccacccggtacgttcgacgttcgtttctgaggtgtacggtagccacggtttagatc
gi|20 : tacggtcgcTGCA-CGGT-ACGGTTCGCT-T-CTG----CGCGTGGTACGGC-TTCGTGTATTCTTGC-ACGGTA--------------A----------GGTATCG-CTCT---GT--AC---------------------GTA---ACGG-----TTGCGC-TCT-T-G-TAC--GT---ACGGG-TTCGTT---T--TCT-T-GCCACCCGGT---ACGTTCGACGTT-CGTTTCTctgtacgtaacggttgcgctcttgtacgtacgggttcgttttcttgccacccggtacgttcgacgttcgtttctgaggtgtacggtagccacggtttagatc
gi|21 : tacggtcgcttctGATAACTCTGGGAAACAAGTTTGTAA-----TAAATAAATAGTCACATTGCATATATTGACGTTTACAT-TTAAACCTTGCA--CGTTGCCATTG--GGCAAG--GTGAA-CTC-----gaggtgtacggtagccacggtttagatc
gi|22 : agaaaatcatcaaacatcataatgacaatcccatattcggaagaaaaagtcagtccgATGTCCAAAAAATCTTTATTTCAATTTTTGAAACCTGTGTTTCTGTTATGTGTTGTCCATTTATAGATAACAAATTTAGCCAGTACCGT---------AATCGACCCC------ATTTATATACAAT--------------GAC----CATATTTAGACACTTAACTCG
gi|23 : AACC-CACCCTC-AACT----CG-AAGCG-AA-CAAT-----C-----ACGCACGATT---G---AAGAAAGAT-ATCGAGAACTTCAC-TC-TGCTG---------------CCACCGTATC--------T------TA----G------------------ATGAAA-AGAATAATACCTTAAATAA----CGGGACT-TACAA
gi|24 : acATTAAGTGGACGTAC--------CTTTGTTTGATTGACGTCAAGTCGACTATC-CATTTTATTTAATTTCATTTAA--TGTAGAAGTATTTAATTTTATGCTGAATTACATTTTT----GTATATTTTCGTG
gi|25 : GTAAATGTATTAAATTTTGTGTTGGATTAAATTTT-----GC-TATTTTCATGTCTGGAAGAAAAGAACAAAATTAAATCCAAAACAAATTCTTTA-TTTCAG--AATCTTT
gi|26 : TATACATGTAT-T-AT------TGTATTTCTTGGTT----T--AAAAAAAC-A-CGCTTTATATTATATGCAT----GTTTTACA-----------GATCT---A--------CACATAAAGCATCGATAAC---AGGAAA--AGTA-Gtt
gi|27 : -----AAATAAATC-A---TTGTTCACTTTCA---AAAAAGTC-AAATTA-TCAATGCATGT------TATCGT-GTAAAACTGTGAGCCTACTCGTA-------------AACG-GC-ACATTGTAAAAT-GA
gi|29 : aAATTGT-AAAT-GAGCACTTTGATAATATAATACAATATC-GTTGTGTTACCCATTTTACACACCGTAAAAAGAAAT--GAAAAGTagc
gi|3 : -GGCTTCAAT----TCAGTA--TACGATC-----CACGGTCCTGA--TTAACACTTA-ATT--GCATCACACATGTAACC-CTCCCTT-TACT----CG-AAGCG-AT-CAAC-----C-----ACG---------------AGAA---T-ATCGAGAATTCCAC-TC-TGCTGT-T-GAAGAATA-AATCATAGTATCGGAAAGCATTTATTATA----A------------------ATTAAG-AGAAAAATATCT----TAA----CGACATC-TACAAAAAGCAT-TG-AAGAA--------G---------T-----GATAATCATGGC---------AAT-AT-------TTCATCATATCAAATAT----CGTAT-A-AAA-----CTA------ACCA-AATTTGTTT--GT-G-TGG---TTTTTGC-ATAGAAATT---ACC-TTCTTCAT-ATTAAA--TGTTATTTCATT-----TTGAAGGGG-------GA----------AAAATCCCAAAAC--TTAC-TTAATC-CACA-T-GAT--TG-T--TGCACGAAATTATG----CAG----CA--CACA-----ATTTCCTTCAA--CATAT--------TATTAATGTGT-----AAACTAATC-AGTATTTTTCACTT--A---A-----TC-AAATTA-TTACTGCATG----------CGT-GTGAA--TGC-AG-TTACTCGTA---TTTTTTTTTTAATACGC-AAATTGT-AAAC-GAGCACTTTGATCATATAATATAATATC-GTTGTGTTATCCTATTTACACACTGTAAAAAGAAGT--GAAAAGTTAATGATCTGATACATTG---------TATAAATATTGATA--ATTGGTTTAGGAAAATTACTCTGTCGAGTTGTT-TTTAAACTCGT-ACTTC-TTTTC--AAGTAT-TTCCCTATCTT-TC----A------C-----ACCTAGAAG-TCCTTTCCA-GTA----ATACATAATCACCGTGTTACAAATGGCCAG-AGTTATTCTACATCCTCCTTGAACGGGCTTC-AT-CGAG-AGA-AATTAA-------TGAAGA----TA--------GGA-T-TA-------A----TAG--TATTACCTTA-TTAGGCATAGTGCG-CGGT-ACGGTTCG-G-TTCGGAA--TGCTTTG-AGGGC-GTGGT------TTGC-A---TA--------------A----------A----CG-TTCT---ATGAACTGTAAGGTTCGTTGCTAGCAAGGT---ACGG-----TG-CGCTTCT-T-G-CGC-GGT---AC-GG-TTC
gi|30 : TTTAAACCCGT-AATTA-TTTTC--AAGTAT-TTCCCTA-ATT-GT----AATGGGTG-----A-----AAG-TTCTGTTGA-GTA----ATACTTGATTAcgcgatatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaacgtttctgaggtgtagtagcacggtttaggatctg
gi|31 : ttggTTTAAACACGTAAATTA-TTTTCAAAAGTATGTCCCCTA-ATT-GT----AATGGGTG-----A-----AAGTTTCTGTTGAGGTA----ATATT
gi|32 : ttggT--GCATCACA------ACC-CACCCTC-TACT----CG-AAGCG-TA-CAAC-----C-----ACGCACGATT---G---AAGAAAGA
gi|34 : ATTGT-AAAT-GAGCACTTTGATAATATAATATAATATC-GGTGTGTTACCCT
gi|35 : GTAACC-CACCCTC-TACT----CG-AAGCG-AT-CAACCGTGGC-----GCGCAAGATT---G---AA
gi|4 : TA----CAT---GTAAATTGACGTTTACATCTTAAA-CTGGCAAGCG-CGCCGTTGTTGGC-AG--GTGAC-CCC-----AA-----GACAA-----TG-----TCTCTAAA-CA------AAGT-ATATTC----------------GAAAATAA-CGCACACAACCA-ACTCA---AAA--TCAAT-G--A----CAGGGGTAAAAT-GGCTTCAAT----TCAGTAAACACGATC-----CACG-TCCTAA-----ACC-TTA-ATT--GCATCACA------ACC--ACCCTCGTACTAGTACG-AAGCG-AAACAAC-----C-----ACGCACGATT---G---AAGAAAGAT-GTCGAGAATTTCAC-TC-TGCTGT-TCGAAGAATACAACCATCGTATC--------TT-----TA----G------------------ATTAAG-AAACTAATACCTTAAATAA----CGGGACCTTACAAAAAGCATCTG-AAGAA--------G---------T-----GA---------T---------AATCATGACAATATTAATTTTATCAAATAT----CGTAT-GCAAA-----CTA------GCC--AATTTGTTTTGGTGG-CGGTTTTTTTTGC------AACTGTAACCATTCTTCAT-ATTACA---TTTGTTTCATT-----TTGAAGGGG-------GG----------AA--------------TAC-TTACGC-TACA-T-AATAATG-T--TGCACG-AATTATG----CAG----TT--CATA-----ATCTCCTTCAA--CATGTTGCATG--TATTAATGTGT-----AAAATAATCAAACATTGTTCACTTTCA---AAAT--TC-AAATTACTCAATGCATGTT-------TCGT-GTAAA--TGT-AG-CTACTCG-A-------------AATACGC-ACATTGT-AAATCGAGC
gi|5 : tnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgACCACCTAAAGCCCCGGGAAATAA-CGCACACAACCA-AAT------GA--TCA-T-G--AAAACCAGGGGTAAAAT-GGCTTCAAT----TCAGTA--CACGATC-----CACGGTCCTAA--TTAACCCTTA-ATT--GCATCACACATGTAACC-CACCCTC-TACT----CG-AAGCG-A------------------CG----------G---AAGAAAGAT-ATCGAGAATTCCAC-TC-TGCTAT-T-GAAGAATA-AATCATCGTATCGAAAAGCATTTATTATA----G------------------ATTAAG-AGAAAAA---------------------------AAAAAGCAT-TG-AAGAA--------G---------T-----GATAATCATGAC---------AAT-AT-------TTCATCATATCAA-TAT----CGTAT-A-AAA-----CTA------GCC-------GTTT--GT-G-CGGCTTTTTT-GC-ATAGGAATT---ACC-CTCTTGGT-ATTACACATGTTGTTTCATT-----TTGAAGGGG-------GG----------AAAACCAAAA-AC--TTAC-TTAATC-TACA-T-GAC--TG-T--TGCACGAAATTATG----CAG----CA--CACA-----ATTTCCTTCAA--CATGT--------TATTAATGTGT-----AAATTAATC-AGTATTGTTCACTT--G---G-----TC-AAATTA-TTACTGCATGTTACGTGTATCAT-GTAAA--TGC-AG-CTACTCGTAT--TTTTTTT---AATACGC-AAATTGT-AAAT-GAGCACTTTGATCATATAATATGATATC-GT--TGTTACCCTATTTACACACTGTAAAAAGAAGT--GAAAAGTTTATGATCTGATACATTGTATCTACATTATAAATATTGATA--ATTGGTTTAAGAAAATTACTCTGTCGAGTTG-TATTTAAACCTGT-ACTTC-TTTTC--AAGTAT-TTCCCTA-ATT-TT----
gi|6 : A----CAT---G-AAATTGACGGTTACATGTTAAA-CTG-CA--CG-CGCGTTTTT-TGC-AGAAG-GAA-CCTCTCTAA------GACAATGTCCT------TCTT---AACA------AAGTTA-AT--ATC-GAAAA-A----GTGAGATAA-CGCACACAACCACCTTCATATGAA--TCA-T-AGTA----CAGGGGTAAAAT-CGC-TCAA-----TCAGTA--CAC-ATC-----CAC-GTTCTAAACTTAATCCTTGCATT--TCATAAC------AACCTCACCCTC--AC-----CG-AAGCGAAA-CAAC-----C-----ATGCTAGATTTAAGTTTAAGAAAGA--ATCGAGAATTTCACTTC-TGCTGTGT-GTAAAATA-AACCATC----C---AAAC-----TTAGA----G------------------ATCA-----AATAATACCT----TAATACGCGGAACCTTACAAAAAGCAT-TG-AAGAATG------A---------TAATCAGA---------C---------AAT-AT-------TAATTTATGCAAAAT-T----TGTAT-A-AGAAAATCTTATCCCGCGCCAGAATTTGTTT--GT-GTCGGC--ATGTTGCAATAA--------ACC-TTTTCTATCATTACA--TTTTGTTCAATCCATAATTGAAGGG--------------------AAAT-------ACAATTAC-C--GTCTTACATT-GAA--TG-TTATGCACGAAATTA-GTCCCCAGTCTATGTTCACA-----ATCCCCCTCAAACTATGT--------
gi|7 : atcaattcagtcattgtttcatcgtttggtcccattaaatattcataaatcgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggtaagcctta----------TACGTATACATTG---A--ACGTGATCTATATGTATGAATATAT-G-AT------TGTATTTGTTCG-T-------AAAAAAAA-ATCGCTTAATATCATATTCATGTACGTTTTACA-----------AATTTGAAACAAATCTACACAAAAAGCATCGATAAT---GGGAAA--AGCA-GTA------TATATAT-TA----CAT---GTAAATTGACGCTTATAT-TTAAA-CTGGCA--AG-TGCCGTTGT-GGC-AG--GTTAA-TTCT----A------GAC-------TAAGTCTTCTT---T-CA------AACCCA-ATCCACC-CCTAA-TCCCCAAAAAATAA-CGCACACAACCA-CCTCA---AAA--CCA-C-G--A----CAGGGGTAAAAT-GGCTTCAATATAATCAGTA--CATGATC-----CACGGACC------TAACCCTTA-ATT--GCATTACACATGTAACC-CACCCTC-TACC----CG-AAGCG-AT-CAAC-----C-----ATGCAAGATT---G---AAGAAAGAT-ATCGAGAATTTCAC-TC-TGCTGT-T-GAAGAATA-AATCATCGTATCGGAAAGCATTTATTATACAATGTACATTATGTACATGTACATTAAG-AGAAAAATACCT----TAA----CGGGACC-TACAAAAAGCAT-TG-GAGAA--------G---------T-----GA---------T---------AAT-gtctagtccatgtatc
gi|8 : taccccgtcagtgcattgttttgtgtggcaggatagacttatgttgaaaataaaaataaatacactgatttttttccttatacacatagtgcatgcacatgcatttaatatacagaCATGTTA----T--CGT-GTAAA--TGC-AC-CTACTCGTA---TTTTTTT---AATACGC-AAACTGT-AAAT-GATCACTTTGATCATATAATATAATATC-GTTGTGTTACCCTATTTACACATTGT--AAAGAAGT--GAAAAGTTAATGATCTGATACATTG---------TATAAATATTGATA--ATTGGTTTAGGAAAATTACTCTGTCGAGTTG-TGTTTAAACCCGT-ACCTC-TTTTC--AAGTAT-TTCCCTA-ATT-TTTAGGG------CTG---A-----AAG-TCCTATCGA-GCA----ATACTTAATCACGGTGTTACAAATGGCCAGAAGTTATTCTACGTCCTCCTTTAACGGGCTTC-AT-CGAG-AGAGAATTAA-------TGAAGA----TA--------AGA-T-T-------AA----TAG--TATTACCTTA-TTAGGCATACTGCA-CGGT-ACGGTTCG-GTT-CGGAA--CGCTTTG-AGGG--TTGGT------TTGC-A---TA--------------A----------A----CG-CTCT---ATGAAC---------------------catga
gi|9 : -AATCA---AAGATTCA-CTG--A----CAGGGGTAAAAT-GGCTTCAAT----TCAGTA--CACGATC-----CACGGTCCTAA-----ACC-TTA-ATTTTGCATCACA-----AACC-CACCCTC-TACT----CGGAAGCG-AA-CAAA-----C-----ACGCACGATT---G---AAGAAAGATGATCGAGAATTTCAC-TCATGCGGGGT-GGAGAATA-A-CCATCGTAT------------ATTA------G------------------ATTAAGGAGAATAATACCT----TAAATAATGGGACC-TACAAAAAGCAT-TGAAAGAATGATAATCA---------T-----GA---------C---------AAT-AT-------TTAAATTTATCAAATAT----CGTATAA-AAA-----CTA------GCTC-TATATATTT--GC-----GCTTTATTTGC-AT-----TTAA-ACC-TTCTTCATAATTA-A--TTTTGTTTCATT-----TTGAAGAAG-------GG----------GAA-------------TACGTTACGC-TACA-TGGAA--TGCT--TGCACGAAATCATG----CAG----T---CACA-----ATCTCCTTCAA--CATGCTTACAATGTATTAATGTGTTAAAAAAATCAAAC-ATTGTT-TTCACTTTCGAAAA-----TCAAAATTA-TCCATGCATGT------TATCGTGGGAAA--TGT-AG-CTACTCGTA-------------AA-ACGC-ACATT-T-AAAT-GAGCtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtacatttcttaggtgtagtagcacggtttagggtctg
6 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|28 ): TTAACGATTTTGTCGTTAACATCTACGTTCAATGAAATACTAGCATTGTCATCTAAAATAATCAATTGAGCACTATTATTCTGTATTTAAAA
Unaligned ( gi|33 ): CACGGTATGGTTCGGTACGTTTCTGAGGTGTAGTAGCACTGTTTAGGGTCT
Unaligned ( gi|36 ): ATACACTCATCCATTTGTTTTTACTGAAAAAACCTCA
Unaligned ( gi|37 ): ACGTTTCTGAGGTGTAGTAGCACAGTTTAGGGTCTGT
Unaligned ( gi|38 ): ACACTTCTGAGGTGTAGTAGTACGGTTTAGGGTCTGT
Unaligned ( gi|39 ): CGTTTCTAGGTGTAGTAGCACGGTTTAGGGTCT
Alignments
lowQualScore : 333333333 2222 1 22 22222 222222 11 444444 1 1 222 33333333333333 1 3333333 2222 1 4444444444 111111 111111 1111111 22222222222 111 1111 333333 1111 1 22222 111111 111 111 22222222222222222222222 2222 777777777777777777777777777777777777777777777 1111111 11111 111111 1 1 11111 5555555555555555555555555 1111 22222222 11111 33333333 11111 1 444444444444 33333333 2222222222 222222222 555555555555555555 1111 1111111 1111 11111111 4444444444444 222 111 111 111111 66666666666666666666666666666666666 1111 11111 1 111111 11 111111
lowQualScore : 1 222222222 8888 3 22 0 3 44444 6 666666 7 88 3 3 7 888888 6 7 2 3 222 66666666666666 7 3 1 1 1 1 2222222 3 2 1111 0 3333333333 666666 555 444444 5 9999999 5 77777777777 000 0 1111 77 5 222222 1 0000 888 0 4 55 4 4 4 55 4 66666 4 4 4 222222 4 4 4 6666 555 5 1 4 777 66 666 66 9999 3 7777 55 99999 333 4 55 5 3 3 6666 3 3 77 77777 77777 2 555 555 3 3 3 7 3 3 555 2 2 77777777777777777777777 3 0 7777 3333 0 3 3 4 4 000000000000000000000000000000000000000000000 3333333 4 8888 4 55555 444444 55 0 4 66 0 77 3 5 0 4 888 66 5 0 66 22222 4 3333333333333333333333333 5 1 5 5 5 66 5 66 0000 44444444 22222 1 66 22222222 22222 1 0 3 2 999999999999 5 5 00000000 4 66 4 4 4444444444 1 4 3 3 2 5 1 999 666666666 99 5 1 4 77 4 66 4 4 4 555555555555555555 5 1 5 0000 6 1 5 5 5 5 5 6666666 0000 88888888 5 5 6666666666666 99 6 5 5 777 222 6 000 999999 6 77777777777777777777777777777777777 5 0000 888 77777 0 666 000000 777 4 4 99999 66 8 4 00 777 222222 4
lowQualScore : . ......... .... . .. . . ..... . ...... . .. . . . ...... . . . . ... .............. . . . . . . ....... . . .... . .......... ...... ... ...... . ....... . ........... ... . .... .. . ...... . .... ... . . .. . . . .. . ..... . . . ...... . . . .... ... . . . ... .. ... .. .... . .... .. ..... ... . .. . . . .... . . .. ..... ..... . ... ... . . . . . . ... . . ....................... . . .... .... . . . . . ............................................. ....... . .... . ..... ...... .. . . .. . .. . . . . ... .. . . .. ..... . ......................... . . . . . .. . .. .... ........ ..... . .. ........ ..... . . . . ............ . . ........ . .. . . .......... . . . . . . . ... ......... .. . . . .. . .. . . . .................. . . . .... . . . . . . . ....... .... ........ . . ............. .. . . . ... ... . ... ...... . ................................... . .... ... ..... . ... ...... ... . . ..... .. . . .. ... ...... .
lowQualScore : 0 000000000 3333 3 00 2 2 55555 5 000000 3 33 2 2 3 000000 7 3 0 3 333 77777777777777 3 3 0 0 0 0 0000000 7 0 8888 0 3333333333 222222 999 444444 0 8888888 0 11111111111 000 7 4444 99 7 555555 7 6666 888 0 0 55 0 0 0 55 0 00000 4 4 4 888888 4 4 4 0000 888 0 7 4 888 11 000 11 4444 6 7777 00 11111 666 0 00 9 1 1 5555 1 1 88 77777 77777 1 444 444 6 6 6 3 6 6 222 0 0 55555555555555555555555 6 5 7777 2222 4 6 6 0 0 000000000000000000000000000000000000000000000 0000000 4 5555 4 66666 444444 11 1 5 99 0 66 2 0 1 5 888 99 0 0 99 55555 5 2222222222222222222222222 0 0 0 0 0 99 0 99 6666 99999999 55555 1 99 55555555 55555 2 0 4 5 111111111111 0 0 11111111 4 11 4 4 3333333333 1 4 6 6 5 0 4 333 777777777 22 7 6 6 33 4 11 4 4 4 222222222222222222 0 0 0 6666 7 0 0 0 0 0 9 2222222 6666 11111111 0 0 6666666666666 22 7 7 7 555 333 7 222 222222 7 33333333333333333333333333333333333 7 1111 888 55555 0 111 999999 888 4 4 33333 11 9 4 66 888 888888 4
consensus : NNNNNNNNNNNNATGAACNCTATGCAAATTAAGTGGACGTACA---GTAGCTTTGTTTGATTGAC----AGTCGACTATT-CATTTTATTTAATTTCATTTAATGTGTAGACGTATTTAATTTCATGTTGAATTAAATTTTT----GTGTATTTTCGTGTCTGGAAGAAAAG--CGAAATTAAATCCAACACGAAT--TTTATTTTCAGAAAATCTTTATTTCAGTGTTAGAAATGTGCGTTTCTGTTATTCGTAGTCTAT--C--TCGATAAAATATTTCGCCAGTACCGTCATCGTTGTACTCGCACTCCGTT-TAT-TAGAACGATTGCTG-CAAAA---GACAATTCATAATTAGACAC-TAACTCGGNACGNGTGCAAGTTTCGGNTTCAGTGTAATTAAGAATGATTACTATCAAAACATNTTGAGACACAAAGCCGGGAAGGTCGGAGTACAGGTACATGTAACTGCTCGTGCTGTGTCGTGGAGACGTACCNCGTACGTGCAT--G-AT-TT----------TACGTGTACATTG---T--ACATGATCTACATGTATGAATATAT-T-AT------TGTATTTGTTGG-T----T--AAAAAAAC-ATCGCTTAATATTATATTCATGTATGTTTTACA-----------GATCT---ACACATATGCACATAAAGCATCGATAAC---GGGAAA--AGTA-GTA------TATATAAATA----CAT---GTAAATTGACGTTTACAT-TTAAA-CTGGCA--CG-TGCCGCTGT-GGC-AG--GTGAA-CCC-----A-GACAATGTC-TTCTTA-CA------AA-CT-A-ATCCACC-CCTAA-GCCCCGGGAAATAA-CGCACACAACCAAAT-CA---AAA--CCA-C-G--A----CAGGGGTAAAAT-GGCTTCAAT----TCAGTA--CACGATC-----CACGGTCCTAA--TTAACCCTTA-ATT--GCATCACACATGTAACC-CACCCTC-TACT----CG-AAGCG-AT-CAAC-----C-----ACGCAAGATT---G---AAGAAAGAT-ATCGAGAATTCCAC-TC-TGCTGT-T-GAAGAATA-AATCATCGTATCGGAAAGCATTTATTATA----G------------------ATTAAG-AGAAAAATACCT----TAA----CGGGACC-T-ACAAAAAGCAT-TGAA-GAA--------G---------T-----GA---------C---------AAT-------AT-TTCATTATATCAAATAT----CGTATA-AAA-----CTA------GCCA-AATTTGTTT--GTG-CGGCTTTTTTTGC-ATAGGAATT---A--CC-TTCTTCAT-ATTACA--TTTTGTTTCATT-----TTGAAGGGGGG----------AAAA-------AC--TTAC-TTANTC-TACA-T-GAT--TG-T--TGCACGAAATTATG----CAG----CG--CACA-----ATCTCCTTCAA--CATGT--------TATTAATGTGT-----AAATTAATC-AGTATTGTTCACTTTCG---A-----TC-AAATTA-TTACTGCATGTTA----TATCGT-GTAAA--TGC-AG-CTACTCGTA---TTTT---TTTAATACGC-AAATTGT-AAAT-GAGCACTTTGATCATATAATATAATATC-GTTGTGTTACCCTATTTACACACCGTAAAAAGAAGT--GAAAAGTTAATGATCTGATACATTG---------TATAAATATTGATA--ATTGGTTTAGGAAAATTACTCTGTCGAGTTG-TTTTTAAACCCGTAC-TTC-TTTTCAA--GTAT-TTCCCTAA-TT-TTA--A---G---TNA-----AAG-TCCTNTCGA-GTA----ATACTTAATCACGGTGTTACGAATGGCCAG-AGTTANTCTACGTCCTCCTTTAACGGGCTTC-AT-CGAG-AGA-AATNAA-------TGAAGA----TA--------AGA-T-TA--T--CAA----TAG--TATTACCTTA-TTAGGCATACTGCA-CGGT-ACGGTTCG-GTTCGGAA--CGCTTTG-AGGGC-NTGGT------TTGC-A---TA--------------A----------A----CG-TTCT---ATGAACGGT---ACGG-----TT-CGCTTCT-T-G-CAC-GGT---AC-GG-TTCG-C---T--TCTT-G-CA--CGGT---ACG------GT-TCGCTTCT
Reference ( family-203 ) : NNNNNNNNNNNNATGAACNCTATGCAAATTAAGTGGACGTACA---GTAGCTTTGTTTGATTGAC----AGTCGACTATT-CATTTTATTTAATTTCATTTAATGTGTAGACGTATTTAATTTCATGTTGAATTAAATTTTT----GTGTATTTTCGTGTCTGGAAGAAAAG--CGAAATTAAATCCAACACGAAT--TTTATTTTCAGAAAATCTTTATTTCAGTGTTAGAAATGTGCGTTTCTGTTATTCGTAGTCTAT--T--TCGATAAAATATTTCGCCAGTACCGTCATCATTGTACTCGCACTCTGTT-TATTTAGAACGATTGCTG-CAAAACA-GACAATTCATAATTAGACAC-TAACTCGGNACGNGTGCAAGTTTCGGNTTCAGTGTAATTAAGAATGATTACTATCAAAACATNTTGAGACACAAAGCCGGGAAGGTCGGAGTACAGGTACATGTAACTGCTCGTGCTGTGTCGTGGAGACGTACCCCGTACGTGCAT--G-AT-TT----------TACGTGTACATTG---T--ACATGATCTACATGTATGAATATAT-T-AT------TGTATTTGTTGG-T----T--AAAAAAAC-ATCGCTTAATATTATATTCATGTATGTTTTACA-----------GATCT---ACACATATGCACATAAAGCATCGATAAC---GGGAAA--AGTA-GTA------TATATAAATA----CAT---GTAAATTGACGTTTACAT-TTAAA-CTGGCA--CG-TGCCGCTGT-GGC-AG--GTGAA-CCC-----A-GACAATGTC-TTCTTA-CA------AA-CT-A-ATCCACC-CCTAA-GCCCCGGGAAATAA-CGCACACAACCAAAT-CA---AAA--CCA-C-G--A----CAGGGGTAAAAT-GGCTTCAAT----TCAGTA--CACGATC-----CACGGTCCTAA--TTAACCCTTA-ATT--GCATCACACATGTAACC-CACCCTC-TACT----CG-AAGCG-AT-CAAC-----C-----ACGCAAGATT---G---AAGAAAGAT-ATCGAGAATTCCAC-TC-TGCTGT-T-GAAGAATA-AATCATCGTATCGGAAAGCATTTATTATA----G------------------ATTAAG-AGAAAAATACCT----TAA----CGGGACC-T-ACAAAAAGCAT-TGAA-GAA--------G---------T-----GA---------C---------AAT-------AT-TTCATTATATCAAATAT----CGTATA-AAA-----CTA------GCCA-AATTTGTTT--GTG-CGGCTTTTTTTGC-ATAGGAATT---A--CC-TTCTTCAT-ATTACA--TTTTGTTTCATT-----TTGAAGGGGGG----------AAAA-------AC--TTAC-TTANTC-TACA-T-GAT--TG-T--TGCACGAAATTATG----CAG----CG--CACA-----ATCTCCTTCAA--CATGT--------TATTAATGTGT-----AAATTAATC-AGTATTGTTCACTTTCG---A-----TC-AAATTA-TTACTGCATGTTA----TATCGT-GTAAA--TGC-AG-CTACTCGTA---TTTT---TTTAATACGC-AAATTGT-AAAT-GAGCACTTTGATCATATAATATAATATC-GTTGTGTTACCCTATTTACACACCGTAAAAAGAAGT--GAAAAGTTAATGATCTGATACATTG---------TATAAATATTGATA--ATTGGTTTAGGAAAATTACTCTGTCGAGTTG-TTTTTAAACCCGTAC-TTC-TTTTCAA--GTAT-TTCCCTAA-TT-TTA--A---G---TCA-----AAG-TCCTNTCGA-GTA----ATACTTAATCACGGTGTTACGAATGGCCAG-AGTTANTCTACGTCCTCCTTTAACGGGCTTC-AT-CGAG-AGA-AATNAA-------TGAAGA----TA--------AGA-T-TA--T--CAA----TAG--TATTACCTTA-TTAGGCATACTGCA-CGGT-ACGGTTCG-G-TCGGAA--CGCTTTG-AGGGC-NTGGT------TTGC-A---TA--------------A----------A----CG-TTCT---ATGAACGGT---ACGG-----TT-CGCTTCT-T-G-CAC-GGT---AC-GG-TTCG-C---T--TCTT-G-CA--CGGT---ACG------GT-TCGCTTCT
gi|1 : ATGAACTCTATGCAAATTAAGTGGA-----A---GTAGCTTTGTTTGATTGAC----AGTCGACTATTTCATTTTATTTAATTTCAATTAATAT--AGACGTATTTAATTTCATGTTGAAT--AATTTTTTTTTGTGTATTTTCGTGTCTGGAAGAACAG--CGAAATTAAATCCC-CACGGAT--TTTATTTTCAGAAAATCTTT--TTCAGTGTTAGAAATGTGCGTTTCTGTTATTCGTAGTCTATGTC--TCGATAAAATATTTCGTCATTACC--CATCATTGTACTCGCACT-TGTT-TAT--AGAACGATTGCTG-CAAAAAT-AACAATTTATAATTAGACAC-TAACTCGACACGTGTGCAAGTTTCGGGTTCAGTGTAATTAAGAATGATTACTATCAAAACATGTTGAGACACAAAGCCGGGAAGGTCGGAGTACAGGTACATGTAACTGCTCATGTTGTGTCGTGGAGAAGTACCCCGTCTGTGCAT--G-AT-TT-----------GCGTGTACATTG---T--ACATGATCTGCATGTATGAATATAT-T-AT------TGTATTTGTTAG-T----T--GAAAAAAC-ATCGCTTAATATTATATTCATGTATGTTTTACA-----------GATCT---ACATATATGCACATAAAGCATCGATAAC---AGGAAA--AGTA-GTA------TATATAAATA----CAT---GTAAATTGACGTGTACAT-TTAAA-CAGGCA--CG-TGCCGCTAT-GGC-AG--GTGAA---------------------TTCTTA-CA------AA-GT-A-ATCCACC-CGTAA-GACCCGGAAAATAA-CACACACAACCAAAT-CA---AAA--CCA-C-G--A----CAGGGGTAAAATTGGTTTCAAT----TCAGTA--CACGATC-----CACGTTCCTAA--TTAACCCTTA-ATT--GCATCACACATGTAACC-CACCCTC-TACT----CG-AAGCG-AT-CAAC-----C-----ATGCAAGATT---G---AAGAAAGAT-ATCGAGAATTCCAC-TC-TGCTGT-T-GAAGAATA-AATCATTGTATCGGAAAGCATTTATTATT----A------------------ATTAAG-AGAAACATACCT----TAA----CAAGATC-T-ACAAAAAGCAT-TGAA-GAA--------G---------T-----GA---------C---------AAT-------GT-TTCATTATATCAAATAT----CGTATA-AAA-----CTA------GCCA-AATTTCTTT--GTG-CGGCTTTTTTTGC-ATAGGAATT---A--CC-TTCTTCAT-ATTACA--TTTTGTTTCATT-----TTGAA---GCA----------AAAA-------AC--TTAC-TTAATC-TACA-T-GAT--TG-T--TGAACGAAATTATG----CAG----CA--CACA-----ATTTCTTTCAA--CATGT--------TATTAATGTGT-----AAATTAATC-AGTATTGTTCACTT--G---A-----TC-AAATTA-TTACTGCATGTTA----TATCGT-GTAAA--TGC-AG-CTACTTGTAATTTTTT---TTTAATACGC-AAATTGT-AAAT-GAGCACTTTGATCATATAATATAACACC-GTTGTGTTACCCTATTTATACACCGTAAAAAGAAGT--GAAAAGTTAATGATCTGATACATTG---------TATAAATATTGATA--ATTGGTTTCGGAAAATTACTCTGTCGAGTTGTTTTTTAAACCCATAC-TTC-TTTTCAA--GTAT-ATCCCTAA-TT-TTA-----------CA-----AAG-TCCTTTCGA-GTA----ATACTTAATCACGGTGTCACAAATGGCCAG-AGTTATTCTACGTCCTCCTTTAACGAGCTTC-AT-C-AG-AGA-AATTAA-------TGATAA----TA--------AGA-T-TAGTT--TAA----TAG--TGTTACCTTA-TTAGGCATAATGCA-CGGT-ACG----G-G-TCGGAA--CGCTTTG-AGGGC-GTGGT------TTGC-A---TA--------------A----------A----CG-TTCT---ATGAACTTT---ACGA-----TT-CGTTTCT-T-G-CAC-GGT---AC-GG-TTCG-T---T--TCTT-G-CA--CAGT---ACG------GT-ACGATTCT
gi|10 : gatgaacgattaAGTATAT-T-AT------TGTATTTGTTGG-T----T--AAAAAAACTATCGCTTAATATCATATTC------------------------------------CATATACGCATAAATCATCGATAAC---AGAAAA--AGTA-GTACATGTATATATAAATA----CAT---GTAAATTGACGTTTACAT-TTAAA-CTGGCA--CG-TGCTGCTGT-GGC-AG--GTGAA-CCCC----A-GACAATGTC-TTCTTA-CA------AA-CT-A-ATCCACC-CCTAA-GCCCCGGGAAATAA-CGCACACAACCAAAT-CA---AAA--CCA-C-G--A----CACAGGTCAAAT-GGTTTCAAT----TCAGTA--CACGATT-----CACGTTCCTAA--TTAACCCTTA-ATT--GCATCACACATGTAACC-CACTCTA-TATT----CG-AAGCG-AT-CAAC-----C-----ACGCAAGATT---G---AAGAAAGAT-ATCGAGAATTCCAC-TC-TGCTGT-T-GAAGAAT--------CGTA-----ATGCATTTATTATA----G------------------ATTAAG-AGAAAAATACCT----TG----------------CAAAAAGCAT-TGAA-GAA--------GTGATAATCAT-----GA---------C---------AAT-------AT-TTCATTTTATTATACTT----C-TGTA-AAA-----
gi|11 : gggggggggggggggggggggggttagtccagataggacagttctTCATTATATCAAATATGTATCGTATA-AAA-----CTA------GCAA-AAATT-TTT--GTG-CAGCTTTTTT-GC-ATAGGAATT---A------TCTTCAT-ATTACA--TTTTGATTCATT-----TTGAAGGGGGGGGGGGACTCCAAAA-------AC--TTAC-TTAATG-TACA-T-GAT--TG-T--TGCACGAAAGTTTG----CAG----TA--CACATCACAATTTCCTTCAA--CA-----------------TGT-T-----AAACT--TA-AGTA-----------------------C-A-------TACTGCATGTTA----T--CGT-GTAAA--TGC-AG-CTACTAGTA---TTTT---TTTAATACGC-AAAATTT-AGAT-GAGCACTTTGAT-ATATAATATAGTAACTGTTGTGTTACCCTATTTACACAGTGTAAAAAGAAG-------------TGATCTGATACACTG---------TATAAATATTGAAA--ATTGGTTTAGGAAAATTACTCTGTCGAATTG---------------------TTTTCAA--GTAT-TTCCCTAATTT-TTAT-A---G---CTA-----AAG-TCCTTTCGA-GTA----ATACTTAATCATGGTGTTACGAATGGCCAG-AGTTAGTCTACGTCCTCCTTTAACGGGCTTC-AT-TGAA-AGA-AATAAA-------TGAAGA----TA--------AGA-T-TA--T--TAG----TAatgttt
gi|12 : CGTACCTCTTTAATGGGCTCCCATGCGAG-AGA-AAT-AA-------TGAGAACATGTA--------AGAAT-TA--CTACAAATG-TAGATTATTACCTTAGTTAGGCAATCTGCAGCGGT-ACGGTTTGCG-TCGGAAGCCGCTTTG-AGGGG-TTGGT------TTGC-AG--TAATAATTTATTTGAGA----------A----CG-TTATTTAATGAGGTGT---ACGG-----TA-CGCTTCT-T-G-CCA-AGA---AC-GG-TTCG-C---T--TCTT-G-TT--C-GT---A-G------GT-TCGCT
gi|12 : TGCACGGT---ACAGGGTTGTT-CGCTTCT-TAG-TAC-GGT---AC-GT-TTCG-C---T--TCTTGG-TAC-CGGTTAAACG------GT-TCGTTgttcttgcacgtactgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttttgcacggtacagggttgttcgcttcttagtacggtacgtttcgcttcttggtaccggttaaacggttcgttcgtctttgcacgatacggttcggctatcagtttctgaggtgtagtaggcacggttctaggtca
gi|12 : cgtacctctttaatgggctcccatgcgagagaaataatgagaacatgtaagaattactacaaatgtagattattaccttagttaggcaatctgcagcggtacggtttgcgtcggaagccgctttgaggggttggtttgcagtaataatttatttgagaacgttatttaatgaggtgtacggtacgcttcttgccaagaacggttcgcttcttgttcgtaggttcgctgttcttgcacgtactgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttttACGGT---ACGT-----TT-CGCTTCT-T-GGTACCGGTTAAAC-GG-TTCG-T---TCGTCTTTG-CA--CGAT---ACG------GT-TCGcgtctttgcacgatacggttcggctatcagtttctgaggtgtagtaggcacggttctaggtca
gi|13 : cgtacctctttaatgggctcccatgcgagagaaataatgagaacatgtaagaattactacaaatgtagattattaccttagttaggcaatctgcagcggtacggtttgcgtcggaagccgctttgaggggttggtttgcagtaataatttatttgagaacgttatttaatgaggtgtacggtacgcttcttgccaagaacggttcgcttcttgttcgtaggttcgctgttcttgcacgtactgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttttgcacggtacagggttgttcgcttcttagtAATGTGCGTTTCTGTTTTTCGTAGTCTA-------CGATAAAATATTTCGCCAGTACTGTCATCATTGTACTCGCACTTTGTTCTATTTAGAACGATTGCTGTCAAAACAGGACAATTCATGATTGGACAC-TAACTCGGAACGAGTGCAAGTTTCGGTTTCAGTGTAATTAAGAATGATTACTATCAAAACATTTTAAGACACAAAGCCGGGAAGGTCAAAGTACAG---C---TAACTGCTCGTGCTGTGTCGTGAAGACATACCTCGTATGTGCAT--A-AT-TT----------TGTGTGgctatcagtttctgaggtgtagtaggcacggttctaggtca
gi|13 : CGTACATGCATTTA-ATATTCAGA------TACGTGTACATTG---T--ACATGTTCTACATGTATGAATATAT-T-AT------TGTATTTGTTGG-T----A--GAAAAAAC-ATCACTTAATATTATACTCATATATGTgcaggagagacatattgaaaataaaaataagtaaactgatttaaaaaaaaaagtttcttccttatgcacattgtgcacgtacatgcatttaatattcagatacgtgtacattgtacatgttctacatgtatgaatatattattgtatttgttggtagaaaaaacatcacttaatattatactcatatatgt
gi|14 : aatgtgcgtttctgtttttcgtagtctacgataaaatatttcgccagtactgtcatcattgtactcgcactttgttctatttagaacgattgctgtcaaaacaggacaattcatgattggacactaactcggaacgagtgcaagtttcggtttcagtgtaattaagaatgattactatcaaaacattttaagacacaaagccgggaaggtcaaagtacagctaactgctcgtgctgtgtcgtgaagacatacctcgtatgtgcataattttgtgtggcaggagagacatattgaaaataaaaataagtaaactgatttaaaaaaaaaagtttcttccttatgcacattgtgcaCGTCCTCCTTTAACGG-CTCC-AT-AGAGTAGA-AATTAAAGTATAGTGAAAA----TACATCGTGAAGA-TATA--CTACAAATGTTGA--TATTAC-TTA-TTAGGCATACTGCC-CGGTAACGGTTCG-GTTCGGA----GCTTTG-AGGGCTGTGG-------TTGCGA---TA--------------ATTTATTTGAGA----AGTTTCT---ATGAG-GGTGTAACGGA----TTATGCTTCT-T-G--AC--GT---AC-GG-TTCG-C---T--T-TT-G-TA--CGGT---ACG---------TTGCTTCT
gi|15 : ACGCATTGCGCATGTACAT--GCAT-TTAATATACAGATACGTGTACATTG---T--ACATGATCTACATGTATGAATATAT-T-AT------TGTCTTTGTTTG-T----TAAAAAAAAAC-ATCG-TTAATATTATATTCATGTATTTTTTAAA-----------GATCT---ACACATATGCACAtagtgcggtagagtggttgtacgctttcagttggcagtaagttcgcttttggcgctcggtacggatttaggtgttctggcagggtatcgggtcgttctgatgcaagtacggtcgttgttgcggggatacgtgttgttttcttgcacagagtcgagttcggcttctgtagggtttcgtttcttgtgcgatcgtgttatggttgtcggttttcgtttctgcaggtggttagcagg
gi|15 : gaaaataaaaataaatacactgatttaaaaacaattgattttcttccttatAAAT-GGCTTCAAT----ACAGTA--CACGATC-----CACGGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaatggcttcaatacagtacacgatccacggcta
gi|16 : gaaaataaaaataaatacactgatttaaaaacaattgattttcttccttatacgcattgcgcatgtacatgcatttaatatacagatacgtgtacattgtacatgatctacatgtatgaatatattattgtctttgtttgttaaaaaaaaacatcgttaatattatattcatgtattttttaaagatctacacatatgcacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnA-CTGGCA--TG-TGCCACTGT-GGC-AG--GTGAACCCC-----A-GACAATGTT-TTCTCA-CT------AA-CN-A-cta
gi|16 : A-CTGGCA--TG-TGCCACTGT-GGC-AG--GTGAA-CCCG----A-GACAATGTT-TCCTCA-CA------AA-CT-A-ATctggcatgtgccactgtggcaggtgaacccgagacaatgtttcctcacaaactaatgcgtttactgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtaacccaccctctactcgaagcgatcaatcgtggcacgcaatattgaagataattccactgttgttgaagaataaatcatcgtatcggaaagcatttatagcttaagagaaaaataccttaacgagatctacaaaaagcatttaagaagtgataatcatgacaatatttcaccatatcaactatc
gi|16 : actggcatgtgccactgtggcaggtgaaccccagacaatgttttctcactaacnATGTAACC-CACCCTC-TACT----CG-AAGCG-AT-CAAT-----CGTGGCACGCAATATT---G---AAGA-------T----AATTCCAC-T---GTTGT-T-GAAGAATA-AATCATCGTATCGGAAAGCATTTAT---A----G------------------CTTAAG-AGAAAAATACCT----TAA----CGAGATC-T-ACAAAAAGCAT-TTAA-GAA--------GTGATAATCAT-----GA---------C---------AAT-------AT-TTCACCATATCAACTAT----Cgcgtttactgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtaacccaccctctactcgaagcgatcaatcgtggcacgcaatattgaagataattccactgttgttgaagaataaatcatcgtatcggaaagcatttatagcttaagagaaaaataccttaacgagatctacaaaaagcatttaagaagtgataatcatgacaatatttcaccatatcaactatc
gi|17 : actggcatgtgccactgtggcaggtgaaccccagacaatgttttctcactaacnactggcatgtgccactgtggcaggtgaacccgagacaatgtttcctcacaaactaatgcgtttactgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn----------TACGTGTACATTG---T--ACATGACCTACATGTATGAATATAT-C-ATAATGATTGTCTTTGTTGG-T----T--AAAAAAGC-ATCGCT-GATATTATATTCATGTATGTTTTACA-----------GATCT---ACACATATGCACTTAAAGCATCGATAAC---AGAAAA--AGTA-GTAA-----CATATAAATA----CAT---GTAAATTGACGTTTACAT-TTAAA-CTGGCA--CG-TGCCGCTGT-GGC-AG--GTGAA-CCCC----A-GACAATGTC-TTCTTA-CA------AA-CT-A-ACCCACC-CCTAA-GCCCTGGGAAATAA-CACACACAACCAAAT-CA---AAA--CCA-C-G--A----CAGGGGTAAAAT-GGCTTCAAT----GCAGTA--------------CACGGTTCTAA--TTAACCCTTA-ATT--GCACCACACATG
gi|18 : taatatacagaATGAACGCTATGCAAATTAAGTGGACGTACACATGTAGCTTTGTTTCATTGAC----AGTCGACTATT-CATTTTATTTAATTTCATTCAATGTATAGACGTATTTAATTTCATGTTGAATTAAATTTTT----GTGTATTTTCGTGTCTGGAAGAAA--------------TCCAACACGAAT--TTTATTTTCAGAAAATCTTTATTTCAGTGTTAGAAATGTGCATTTCTGTT
gi|19 : GTTG-TTTT-AAACCCGTAA-TTC-CTTTCAA--GTAT-TTCCTTAA-TTCTTATGG---G---TGA-----AAG-TCCTGTTGA-GTA----ATACTTAATAATGGTGTTACGAATGACCAA-AGTTAACCTCCGACCTCCTTTAACGGGCTCC-AT-CGAG-AGA-AATAAA-------TGATTA----TA--------ACA-T-TA--T---------TAG--TATTACCTTA-TTAGGTATACTGCA-CGGT-A
gi|2 : GTGTTCATTGACTTGAACATGATCTACATGTACGGATATATATGAT------TGTATTTGTTGG-TAAAAC--AAAAATAC-ATCGCTTCATATCATATCCATGTATGTTTCACATATTTTAAATAAATCT---ACACATATGCACAAAAAGCATCGATAAC---AGGAAA--AGTA-GT-------T-TATAAGTA----CAT---GTAAAGTGACGCTTATAT-TTAAA-CTG-CA--CG-TGCCGTTGT-GGC-AG--GTGAA-CCT-----A-AGCAATGTC-TTCTTA-CATGTACAAA-CT-A-ATCCACC-TC-AA-GCCCCGAAAAATAAACGCACACAGCCACCT-CA---AAA--TCA-T-G--A----CAGGGGTAAAAT-TGTTTCAAT----TCAGTA--CATGATCTGATCCACGGTCCTAA------CCCTTA-ACT--GCATTACACATGTAACC-CACTCTC-TACT----CG-AAGCG-AT-CAAC-----C-----TCGCAAGATT---G---AAGA---------------TTCAC-TA-TGCTGT-T-ACAGAATA-AATCATCATATCCGAAAGCATTTATTATA----G------------------ATTAAG-AGAAAAATACCT----TAA----CAGGATC-T-ACAACAAGCAT-TGAA-GAA--------G---------T-----GA---------TAATCAAGGAAAT-------AT-TTCATTATATCAAATAT----CGTATA-AAA-----CTA------GACA-AATTACTTT--GTG-CGGC-TTTTTTGC-ACAGGAATT---A--CC-TTCTTCAT-ATTACA--TTTTATTTCATT-----TCGAAAGGGAAAAACTCC---AAAA-------AC--TTAC-TTACTC-TACA-T-GAT--TG-T--TGCACGACATTACG----TAG----TG--CACC-----ATATCCTTCAA--CATGT--------TATTAATGTGT-----AAAATAATCAAACATTGTTCACTT--G---A-----TC-AAATAA-TTACTGCATAT------TATCGT-GTAAA--TGC-AG-CTACTAGTA---TTTT---TTTAATA-GCTAAATTGT-AAAT-GAGCACTTTCATCGAATAATATAGTATT-GTTGTGTTACCCTATTGACACAGTGTAAAAAAAAAGAAGAAAAGTTAATGATCTGATACATTG---------TATAAATATTGACAACATTGGGTTAGGAAAATTACTCTGTCGAGTTG-TTGT--AACCAGTAT-TTCTTTTTCAA--ATAT-TTCCCTAG-TT-TTAACA---GC--TCA-----AAG-TCCTTTCGA-GTAGTATATACTTAATAATGGTGTTACGAATTCCAAG-AG-TAAACTACGTCCTACTTAAACGGGCTTC-AA-CGAG-AGA-AATAAA-------TGAAGA----TA--------ATA-T-TA--T--
gi|20 : T---AC-GG-T-CG-C---T--TCTT-G-CA--CGGT---ACG------GT-TCGCTTCT
gi|20 : -TTCT----TGCACGGT---ACGG-----TT-CGCTTCTGC-G-CGT-GGT---AC-GGCTTCG-TGTAT--TCTT-G-CA--CGGT---AAG------GTATCGCTgcgcgtggtacggcttcgtgtattcttgcacggtaaggtatcgctctgtacgtaacggttgcgctcttgtacgtacgggttcgttttcttgccacccggtacgttcgacgttcgtttctgaggtgtacggtagccacggtttagatc
gi|20 : tacggtcgcTGCA-CGGT-ACGGTTCGCT-TCTG----CGCGTGGTACGGC-TTCGTGTATTCTTGC-ACGGTA--------------A----------GGTATCG-CTCT---GT--ACGTA---ACGG-----TTGCGC-TCT-T-G-TAC--GT---ACGGG-TTCGTT---T--TCTT-GCCACCCGGT---ACGTTCGACGT-TCGTTTCTctgtacgtaacggttgcgctcttgtacgtacgggttcgttttcttgccacccggtacgttcgacgttcgtttctgaggtgtacggtagccacggtttagatc
gi|21 : tacggtcgcttctGATAACTCTGGGAAACAAGTTTGTAA-----TAAATAAATAGTCACATTGCATATATTGACGTTTACAT-TTAAACCTTGCA--CGTTGCCATTG--GGCAAG--GTGAA-CTC-----gaggtgtacggtagccacggtttagatc
gi|22 : agaaaatcatcaaacatcataatgacaatcccatattcggaagaaaaagtcagtccgATGTCCAAAAAATCTTTATTTCAATTTTTGAAACCTGTGTTTCTGTTATGTGTTGTCCAT--TTATAGATAACAAATTTAGCCAGTACCGTAATCG----------ACCCCATT-TATAT---ACAAT--------------GAC----CATATTTAGACACTTAACTCG
gi|23 : AACC-CACCCTC-AACT----CG-AAGCG-AA-CAAT-----C-----ACGCACGATT---G---AAGAAAGAT-ATCGAGAACTTCAC-TC-TGCTG---------------CCACCGTATC--------T------TA----G------------------ATGAAA-AGAATAATACCTTAAATAA----CGGGACT-T-ACAA
gi|24 : acATTAAGTGGACGTAC--------CTTTGTTTGATTGACGTCAAGTCGACTATC-CATTTTATTTAATTTCATTTAATGT--AGAAGTATTTAATTTTATGCTGAATTACATTTTT----GTATATTTTCGTG
gi|25 : GTAAATGTATTAAATTTTGTGTTGGATTAAATTTT-----GC-TATTTTCATGTCTGGAAGAAAAGAACAAAATTAAATCCAAAACAAATTCTTTA-TTTCAG--AATCTTT
gi|26 : TATACATGTAT-T-AT------TGTATTTCTTGGTT----T--AAAAAAAC-A-CGCTTTATATTAT----ATGCATGTTTTACA-----------GATCT---A--------CACATAAAGCATCGATAAC---AGGAAA--AGTA-Gtt
gi|27 : -----AAATAAATC-A---TTGTTCACTTTCA---AAAAAGTC-AAATTA-TCAATGCATGT------TATCGT-GTAAAACTGTGAGCCTACTCGTA-------------AACG-GC-ACATTGTAAAAT-GA
gi|29 : aAATTGT-AAAT-GAGCACTTTGATAATATAATACAATATC-GTTGTGTTACCCATTTTACACACCGTAAAAAGAAAT--GAAAAGTagc
gi|3 : -GGCTTCAAT----TCAGTA--TACGATC-----CACGGTCCTGA--TTAACACTTA-ATT--GCATCACACATGTAACC-CTCCCTT-TACT----CG-AAGCG-AT-CAAC-----C-----ACG---------------AGAA---T-ATCGAGAATTCCAC-TC-TGCTGT-T-GAAGAATA-AATCATAGTATCGGAAAGCATTTATTATA----A------------------ATTAAG-AGAAAAATATCT----TAA----CGACATC-T-ACAAAAAGCAT-TGAA-GAA--------G---------T-----GATAATCATGGC---------AAT-------AT-TTCATCATATCAAATAT----CGTATA-AAA-----CTA------ACCA-AATTTGTTT--GTG-TGG---TTTTTGC-ATAGAAATT---A--CC-TTCTTCAT-ATTAAA--TGTTATTTCATT-----TTGAAGGGGGA----------AAAATCCCAAAAC--TTAC-TTAATC-CACA-T-GAT--TG-T--TGCACGAAATTATG----CAG----CA--CACA-----ATTTCCTTCAA--CATAT--------TATTAATGTGT-----AAACTAATC-AGTATTTTTCACTT--A---A-----TC-AAATTA-TTACTGCATG----------CGT-GTGAA--TGC-AG-TTACTCGTA---TTTTTTTTTTAATACGC-AAATTGT-AAAC-GAGCACTTTGATCATATAATATAATATC-GTTGTGTTATCCTATTTACACACTGTAAAAAGAAGT--GAAAAGTTAATGATCTGATACATTG---------TATAAATATTGATA--ATTGGTTTAGGAAAATTACTCTGTCGAGTTG-TTTTTAAACTCGTAC-TTC-TTTTCAA--GTAT-TTCCCTAT-CT-TTC--A--------CACCTAGAAG-TCCTTTCCA-GTA----ATACATAATCACCGTGTTACAAATGGCCAG-AGTTATTCTACATCCTCCTTGAACGGGCTTC-AT-CGAG-AGA-AATTAA-------TGAAGA----TA--------GGA-T-T-------AA----TAG--TATTACCTTA-TTAGGCATAGTGCG-CGGT-ACGGTTCG-GTTCGGAA--TGCTTTG-AGGGC-GTGGT------TTGC-A---TA--------------A----------A----CG-TTCT---ATGAACTGT---AAGG-----TT-CGTTGCT-A-G-CAA-GGT---AC-GG-TGCG-C---T--TCTT-G-CG--CGGT---ACG------GT-TC
gi|30 : TTTAAACCCGTAA-TTA-TTTTCAA--GTAT-TTCCCTAA-TT-GTA--ATGGG---TGA-----AAG-TTCTGTTGA-GTA----ATACTTGATTAcgcgatatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaacgtttctgaggtgtagtagcacggtttaggatctg
gi|31 : ttggTTTAAACACGTAAATTA-TTTTCAAAAGTATGTCCCCTAA-TT-GTA--ATGGG---TGA-----AAGTTTCTGTTGAGGTA----ATATT
gi|32 : ttggT--GCATCACA------ACC-CACCCTC-TACT----CG-AAGCG-TA-CAAC-----C-----ACGCACGATT---G---AAGAAAGA
gi|34 : ATTGT-AAAT-GAGCACTTTGATAATATAATATAATATC-GGTGTGTTACCCT
gi|35 : GTAACC-CACCCTC-TACT----CG-AAGCG-AT-CAACCGTGGC-----GCGCAAGATT---G---AA
gi|4 : TA----CAT---GTAAATTGACGTTTACATCTTAAA-CTGGCAAGCG-CGCCGTTGTTGGC-AG--GTGAC-CCC-----AAGACAATGTC-TCTAAA-CA------AA-GT-ATATTC----------------GAAAATAA-CGCACACAACCAACT-CA---AAA--TCAAT-G--A----CAGGGGTAAAAT-GGCTTCAAT----TCAGTAAACACGATC-----CACG-TCCTAA-----ACC-TTA-ATT--GCATCACA------ACC--ACCCTCGTACTAGTACG-AAGCG-AAACAAC-----C-----ACGCACGATT---G---AAGAAAGAT-GTCGAGAATTTCAC-TC-TGCTGT-TCGAAGAATACAACCATCGTATC------------TT-TA----G------------------ATTAAG-AAACTAATACCT----TAAATAACGGGACC-TTACAAAAAGCATCTGAA-GAA--------G---------T-----GA---------T---------AATCATGACAATATTAATTTTATCAAATAT----CGTATGCAAA-----CTA------GCCA-A-TTTGTTTTGGTGGCGGTTTTTTTTGC-A-----ACTGTAA--CCATTCTTCAT-ATTACA--TTT-GTTTCATT-----TTGAAGGGGGG----------AA--------------TAC-TTACGC-TACA-T-AATAATG-T--TGCACGAA-TTATG----CAG----TT--CATA-----ATCTCCTTCAA--CATGTTGCATG--TATTAATGTGT-----AAAATAATCAAACATTGTTCACTTTCA---AAAT--TC-AAATTACTCAATGCATGTT-------TCGT-GTAAA--TGT-AG-CTACTCG-A-------------AATACGC-ACATTGT-AAATCGAGC
gi|5 : tnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgACCACCTAAAGCCCCGGGAAATAA-CGCACACAACCAAAT-------GA--TCA-T-G--AAAACCAGGGGTAAAAT-GGCTTCAAT----TCAGTA--CACGATC-----CACGGTCCTAA--TTAACCCTTA-ATT--GCATCACACATGTAACC-CACCCTC-TACT----CG-AAGCG-A------------------CG----------G---AAGAAAGAT-ATCGAGAATTCCAC-TC-TGCTAT-T-GAAGAATA-AATCATCGTATCGAAAAGCATTTATTATA----G------------------ATTAAG-AGAAAAA----------------------------AAAAAGCAT-TGAA-GAA--------G---------T-----GATAATCATGAC---------AAT-------AT-TTCATCATATCAA-TAT----CGTATA-AAA-----CTA------GCC-------GTTT--GTG-CGGCTTTTTT-GC-ATAGGAATT---A--CC-CTCTTGGT-ATTACACATGTTGTTTCATT-----TTGAAGGGGGG----------AAAACCAAAA-AC--TTAC-TTAATC-TACA-T-GAC--TG-T--TGCACGAAATTATG----CAG----CA--CACA-----ATTTCCTTCAA--CATGT--------TATTAATGTGT-----AAATTAATC-AGTATTGTTCACTT--G---G-----TC-AAATTA-TTACTGCATGTTACGTGTATCAT-GTAAA--TGC-AG-CTACTCGTAT--TTTT---TTTAATACGC-AAATTGT-AAAT-GAGCACTTTGATCATATAATATGATATC-GT--TGTTACCCTATTTACACACTGTAAAAAGAAGT--GAAAAGTTTATGATCTGATACATTGTATCTACATTATAAATATTGATA--ATTGGTTTAAGAAAATTACTCTGTCGAGTTG-TATTTAAACCTGTAC-TTC-TTTTCAA--GTAT-TTCCCTAA-TT-TT
gi|6 : A----CAT---G-AAATTGACGGTTACATGTTAAA-CTG-CA--CG-CGCGTTTTT-TGC-AGAAG-GAA-CCTCTCTAA-GACAATGTCCTTCTTAACA------AAGTT-A-AT--ATC-GAAAA-A----GTGAGATAA-CGCACACAACCACCTTCATATGAA--TCA-T-AGTA----CAGGGGTAAAAT-CGC-TCAA-----TCAGTA--CAC-ATC-----CAC-GTTCTAAACTTAATCCTTGCATT--TCATAAC------AACCTCACCCTC--AC-----CG-AAGCGAAA-CAAC-----C-----ATGCTAGATTTAAGTTTAAGAAAGA--ATCGAGAATTTCACTTC-TGCTGTGT-GTAAAATA-AACCATC----C---AAAC-----TTAGA----G------------------ATCA-----AATAATACCT----TAATACGCGGAACCTT-ACAAAAAGCAT-TGAA-GAATG------A---------TAATCAGA---------C---------AAT-------AT-TAATTTATGCAAAAT-T----TGTATA-AGAAAATCTTATCCCGCGCCAGAATTTGTTT--GTGTCGGC--ATGTTGCAATAA--------A--CC-TTTTCTATCATTACA--TTTTGTTCAATCCATAATTGAA---GGG----------AAAT-------ACAATTAC-C--GTCTTACATT-GAA--TG-TTATGCACGAAATTA-GTCCCCAGTCTATGTTCACA-----ATCCCCCTCAAACTATGT--------
gi|7 : atcaattcagtcattgtttcatcgtttggtcccattaaatattcataaatcgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggtaagcctta----------TACGTATACATTG---A--ACGTGATCTATATGTATGAATATAT-G-AT------TGTATTTGTTCG-T-------AAAAAAAA-ATCGCTTAATATCATATTCATGTACGTTTTACA-----------AATTTGAAACAAATCTACACAAAAAGCATCGATAAT---GGGAAA--AGCA-GTA------TATATAT-TA----CAT---GTAAATTGACGCTTATAT-TTAAA-CTGGCA--AG-TGCCGTTGT-GGC-AG--GTTAA-TTCT----A-GACTAAGTC-TTCTTT-CA------AA-CCCA-ATCCACC-CCTAA-TCCCCAAAAAATAA-CGCACACAACCACCT-CA---AAA--CCA-C-G--A----CAGGGGTAAAAT-GGCTTCAATATAATCAGTA--CATGATC-----CACGGACC------TAACCCTTA-ATT--GCATTACACATGTAACC-CACCCTC-TACC----CG-AAGCG-AT-CAAC-----C-----ATGCAAGATT---G---AAGAAAGAT-ATCGAGAATTTCAC-TC-TGCTGT-T-GAAGAATA-AATCATCGTATCGGAAAGCATTTATTATACAATGTACATTATGTACATGTACATTAAG-AGAAAAATACCT----TAA----CGGGACC-T-ACAAAAAGCAT-TGGA-GAA--------G---------T-----GA---------T---------AAT-------gtctagtccatgtatc
gi|8 : taccccgtcagtgcattgttttgtgtggcaggatagacttatgttgaaaataaaaataaatacactgatttttttccttatacacatagtgcatgcacatgcatttaatatacagaCATGTTA----T--CGT-GTAAA--TGC-AC-CTACTCGTA---TTTT---TTTAATACGC-AAACTGT-AAAT-GATCACTTTGATCATATAATATAATATC-GTTGTGTTACCCTATTTACACATTGTAAA--GAAGT--GAAAAGTTAATGATCTGATACATTG---------TATAAATATTGATA--ATTGGTTTAGGAAAATTACTCTGTCGAGTTG-TGTTTAAACCCGTAC-CTC-TTTTCAA--GTAT-TTCCCTAA-TT-TTT--A---GGGCTGA-----AAG-TCCTATCGA-GCA----ATACTTAATCACGGTGTTACAAATGGCCAGAAGTTATTCTACGTCCTCCTTTAACGGGCTTC-AT-CGAG-AGAGAATTAA-------TGAAGA----TA--------AGA-T-T-------AA----TAG--TATTACCTTA-TTAGGCATACTGCA-CGGT-ACGGTTCG-GTTCGGAA--CGCTTTG-AGGG--TTGGT------TTGC-A---TA--------------A----------A----CG-CTCT---ATGAACcatga
gi|9 : AAT-CA---AAGATTCA-CTG--A----CAGGGGTAAAAT-GGCTTCAAT----TCAGTA--CACGATC-----CACGGTCCTAA-----ACC-TTA-ATTTTGCATCACA-----AACC-CACCCTC-TACT----CGGAAGCG-AA-CAAA-----C-----ACGCACGATT---G---AAGAAAGATGATCGAGAATTTCAC-TCATGCGGGGT-GGAGAATA-A-CCATCGTAT------------ATTA------G------------------ATTAAGGAGAATAATACCT----TAAATAATGGGACC-T-ACAAAAAGCAT-TGAAAGAATGATAATCA---------T-----GA---------C---------AAT-------AT-TTAAATTTATCAAATAT----CGTATA-AAAA----CTA------GCTC-TATATATTT--GCG-C---TTTATTTGC-AT-----TT---AAACC-TTCTTCATAATTA-A--TTTTGTTTCATT-----TTGAAGAAGGG----------GAA-------------TACGTTACGC-TACA-TGGAA--TGCT--TGCACGAAATCATG----CAG----T---CACA-----ATCTCCTTCAA--CATGCTTACAATGTATTAATGTGTTAAAAAAATCAAAC-ATTGTT-TTCACTTTCGAAAA-----TCAAAATTA-TCCATGCATGT------TATCGTGGGAAA--TGT-AG-CTACTCGTA-------------AA-ACGC-ACATT-T-AAAT-GAGCtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtacatttcttaggtgtagtagcacggtttagggtctg
6 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|28 ): TTAACGATTTTGTCGTTAACATCTACGTTCAATGAAATACTAGCATTGTCATCTAAAATAATCAATTGAGCACTATTATTCTGTATTTAAAA
Unaligned ( gi|33 ): CACGGTATGGTTCGGTACGTTTCTGAGGTGTAGTAGCACTGTTTAGGGTCT
Unaligned ( gi|36 ): ATACACTCATCCATTTGTTTTTACTGAAAAAACCTCA
Unaligned ( gi|37 ): ACGTTTCTGAGGTGTAGTAGCACAGTTTAGGGTCTGT
Unaligned ( gi|38 ): ACACTTCTGAGGTGTAGTAGTACGGTTTAGGGTCTGT
Unaligned ( gi|39 ): CGTTTCTAGGTGTAGTAGCACGGTTTAGGGTCT
Alignments
lowQualScore : 333333333 2222 1 22 22222 222222 11 444444 11 1 333333 44444444444444444 1 3333333 2222 1 4444444444 111111 111111 1111111 22222222222 111 1111 333333 1111 1 22222 111111 111 111 22222222222222222222222 2222 777777777777777777777777777777777777777777777 1111111 11111 111111 1 1 11111 5555555555555555555555555 1111 22222222 11111 33333333 11111 1 444444444444 33333333 2222222222 222222222 55555555555555 1111 1111111 1111 11111111 4444444444444 111 111 111111 66666666666666666666666666666666666 1111 11111 1 111111 11 111111
lowQualScore : 1 222222222 8888 3 22 0 3 44444 6 666666 7 88 3 3 7 777777 6 88 22 3 888888 66666666666666666 7 3 1 1 1 1 2222222 1 2 1111 0 3333333333 666666 555 444444 5 9999999 5 77777777777 000 0 1111 77 5 222222 1 0000 888 0 4 55 4 4 4 55 4 66666 4 4 4 222222 4 4 4 6666 555 5 1 4 777 66 666 66 9999 3 7777 55 99999 333 4 55 5 3 3 6666 3 3 77 77777 77777 2 555 555 3 3 3 7 3 3 555 2 2 77777777777777777777777 3 0 7777 3333 0 3 3 4 4 000000000000000000000000000000000000000000000 3333333 4 8888 4 55555 444444 55 0 4 66 0 77 3 5 0 4 888 66 5 0 66 22222 4 3333333333333333333333333 5 1 5 5 5 66 5 66 0000 44444444 22222 1 66 22222222 22222 1 0 3 2 999999999999 5 5 00000000 4 66 4 4 4444444444 1 4 3 3 2 5 1 999 666666666 99 5 1 4 77 4 66 4 4 4 00000000000000 1 5 1 5 0000 6 1 5 5 5 5 5 6666666 0000 88888888 5 5 6666666666666 99 6 5 5 6 222 6 000 999999 6 77777777777777777777777777777777777 5 0000 888 77777 0 666 000000 777 4 4 99999 66 8 4 00 777 222222 4
lowQualScore : . ......... .... . .. . . ..... . ...... . .. . . . ...... . .. .. . ...... ................. . . . . . . ....... . . .... . .......... ...... ... ...... . ....... . ........... ... . .... .. . ...... . .... ... . . .. . . . .. . ..... . . . ...... . . . .... ... . . . ... .. ... .. .... . .... .. ..... ... . .. . . . .... . . .. ..... ..... . ... ... . . . . . . ... . . ....................... . . .... .... . . . . . ............................................. ....... . .... . ..... ...... .. . . .. . .. . . . . ... .. . . .. ..... . ......................... . . . . . .. . .. .... ........ ..... . .. ........ ..... . . . . ............ . . ........ . .. . . .......... . . . . . . . ... ......... .. . . . .. . .. . . . .............. . . . . .... . . . . . . . ....... .... ........ . . ............. .. . . . . ... . ... ...... . ................................... . .... ... ..... . ... ...... ... . . ..... .. . . .. ... ...... .
lowQualScore : 0 000000000 3333 3 00 2 2 55555 5 000000 3 33 2 2 3 777777 7 00 77 3 777777 00000000000000000 3 3 0 0 0 0 0000000 0 0 8888 0 3333333333 222222 999 444444 0 8888888 0 11111111111 000 7 4444 99 7 555555 7 6666 888 0 0 55 0 0 0 55 0 00000 4 4 4 888888 4 4 4 0000 888 0 7 4 888 11 000 11 4444 6 7777 00 11111 666 0 00 9 1 1 5555 1 1 88 77777 77777 1 444 444 6 6 6 3 6 6 222 0 0 55555555555555555555555 6 5 7777 2222 4 6 6 0 0 000000000000000000000000000000000000000000000 0000000 4 5555 4 66666 444444 11 1 5 99 0 66 2 0 1 5 888 99 0 0 99 55555 5 2222222222222222222222222 0 0 0 0 0 99 0 99 6666 99999999 55555 1 99 55555555 55555 2 0 4 5 111111111111 0 0 11111111 4 11 4 4 3333333333 1 4 6 6 5 0 4 333 777777777 22 7 6 6 33 4 11 4 4 4 33333333333333 0 0 0 0 6666 7 0 0 0 0 0 9 2222222 6666 11111111 0 0 6666666666666 22 7 7 7 7 333 7 222 222222 7 33333333333333333333333333333333333 7 1111 888 55555 0 111 999999 888 4 4 33333 11 9 4 66 888 888888 4
consensus : NNNNNNNNNNNNATGAACNCTATGCAAATTAAGTGGACGTACA---GTAGCTTTGTTTGATTGAC----AGTCGACTATT-CATTTTATTTAATTTCATTTAATGTGTAGACGTATTTAATTTCATGTTGAATTAAATTTTT----GTGTATTTTCGTGTCTGGAAGAAAAG--CGAAATTAAATCCAACACGAAT--TTTATTTTCAGAAAATCTTTATTTCAGTGTTAGAAATGTGCGTTTCTGTTATTCGTAGTCTAT--C--TCGATAAAATATTTCGCCAGTACCGTCATCGTTGTACTCGCACTTCGTT-TAT--AGA-ACGATTGCTG-CAAAA---G--ACAATTCATAATTAGACAC-TAACTCGGNACGNGTGCAAGTTTCGGNTTCAGTGTAATTAAGAATGATTACTATCAAAACATNTTGAGACACAAAGCCGGGAAGGTCGGAGTACAGGTACATGTAACTGCTCGTGCTGTGTCGTGGAGACGTACCNCGTACGTGCAT--G-AT-TT----------TACGTGTACATTG---T--ACATGATCTACATGTATGAATATAT-T-AT------TGTATTTGTTGG-T----T--AAAAAAAC-ATCGCTTAATATTATATTCATGTATGTTTTACA-----------GATCT---ACACATATGCACATAAAGCATCGATAAC---GGGAAA--AGTA-GTA------TATATAAATA----CAT---GTAAATTGACGTTTACAT-TTAAA-CTGGCA--CG-TGCCGCTGT-GGC-AG--GTGAA-CCC-----A-GACAATGTC-TTCTTA-CA------AA-CT-A-ATCCACC-CCTAA-GCCCCGGGAAATAA-CGCACACAACCAAAT-CA---AAA--CCA-C-G--A----CAGGGGTAAAAT-GGCTTCAAT----TCAGTA--CACGATC-----CACGGTCCTAA--TTAACCCTTA-ATT--GCATCACACATGTAACC-CACCCTC-TACT----CG-AAGCG-AT-CAAC-----C-----ACGCAAGATT---G---AAGAAAGAT-ATCGAGAATTCCAC-TC-TGCTGT-T-GAAGAATA-AATCATCGTATCGGAAAGCATTTATTATA----G------------------ATTAAG-AGAAAAATACCT----TAA----CGGGACC-T-ACAAAAAGCAT-TGAA-GAA--------G---------T-----GA---------C---------AAT-------AT-TTCATTATATCAAATAT----CGTATA-AAA-----CTA------GCCA-AATTTGTTT--GTG-CGGCTTTTTTTGC-ATAGGAATT---A--CC-TTCTTCAT-ATTACA--TTTTGTTTCATT-----TTGAAGGGGGG----------AAAA-------AC--TTAC-TTANTC-TACA-T-GAT--TG-T--TGCACGAAATTATG----CAG----CG--CACA-----ATCTCCTTCAA--CATGT--------TATTAATGTGT-----AAATTAATC-AGTATTGTTCACTTTCG---A-----TC-AAATTA-TTACTGCATGTTA----TATCGT-GTAAA--TGC-AG-CTACTCGTA---TTTT---TTTAATACGC-AAATTGT-AAAT-GAGCACTTTGATCATATAATATAATATC-GTTGTGTTACCCTATTTACACACCGTAAAAAGAAGT--GAAAAGTTAATGATCTGATACATTG---------TATAAATATTGATA--ATTGGTTTAGGAAAATTACTCTGTCGAGTTG-TTTTTAAACCCGTAC-TTC-TTTTCAA--GTAT-TTCCCTAA-TT-TT---A--A---G---TGAAAG-TCCTNTCGA-GTA----ATACTTAATCACGGTGTTACGAATGGCCAG-AGTTANTCTACGTCCTCCTTTAACGGGCTTC-AT-CGAG-AGA-AATNAA-------TGAAGA----TA--------AGA-T-TA--T--CAA----TAG--TATTACCTTA-TTAGGCATACTGCA-CGGT-ACGGTTCGGTTCGGAA--CGCTTTG-AGGGC-NTGGT------TTGC-A---TA--------------A----------A----CG-TTCT---ATGAACGGT---ACGG-----TT-CGCTTCT-T-G-CAC-GGT---AC-GG-TTCG-C---T--TCTT-G-CA--CGGT---ACG------GT-TCGCTTCT
Reference ( family-203 ) : NNNNNNNNNNNNATGAACNCTATGCAAATTAAGTGGACGTACA---GTAGCTTTGTTTGATTGAC----AGTCGACTATT-CATTTTATTTAATTTCATTTAATGTGTAGACGTATTTAATTTCATGTTGAATTAAATTTTT----GTGTATTTTCGTGTCTGGAAGAAAAG--CGAAATTAAATCCAACACGAAT--TTTATTTTCAGAAAATCTTTATTTCAGTGTTAGAAATGTGCGTTTCTGTTATTCGTAGTCTAT--C--TCGATAAAATATTTCGCCAGTACCGTCATCGTTGTACTCGCACTCCGTT-TATT-AGA-ACGATTGCTG-CAAAA---G--ACAATTCATAATTAGACAC-TAACTCGGNACGNGTGCAAGTTTCGGNTTCAGTGTAATTAAGAATGATTACTATCAAAACATNTTGAGACACAAAGCCGGGAAGGTCGGAGTACAGGTACATGTAACTGCTCGTGCTGTGTCGTGGAGACGTACCNCGTACGTGCAT--G-AT-TT----------TACGTGTACATTG---T--ACATGATCTACATGTATGAATATAT-T-AT------TGTATTTGTTGG-T----T--AAAAAAAC-ATCGCTTAATATTATATTCATGTATGTTTTACA-----------GATCT---ACACATATGCACATAAAGCATCGATAAC---GGGAAA--AGTA-GTA------TATATAAATA----CAT---GTAAATTGACGTTTACAT-TTAAA-CTGGCA--CG-TGCCGCTGT-GGC-AG--GTGAA-CCC-----A-GACAATGTC-TTCTTA-CA------AA-CT-A-ATCCACC-CCTAA-GCCCCGGGAAATAA-CGCACACAACCAAAT-CA---AAA--CCA-C-G--A----CAGGGGTAAAAT-GGCTTCAAT----TCAGTA--CACGATC-----CACGGTCCTAA--TTAACCCTTA-ATT--GCATCACACATGTAACC-CACCCTC-TACT----CG-AAGCG-AT-CAAC-----C-----ACGCAAGATT---G---AAGAAAGAT-ATCGAGAATTCCAC-TC-TGCTGT-T-GAAGAATA-AATCATCGTATCGGAAAGCATTTATTATA----G------------------ATTAAG-AGAAAAATACCT----TAA----CGGGACC-T-ACAAAAAGCAT-TGAA-GAA--------G---------T-----GA---------C---------AAT-------AT-TTCATTATATCAAATAT----CGTATA-AAA-----CTA------GCCA-AATTTGTTT--GTG-CGGCTTTTTTTGC-ATAGGAATT---A--CC-TTCTTCAT-ATTACA--TTTTGTTTCATT-----TTGAAGGGGGG----------AAAA-------AC--TTAC-TTANTC-TACA-T-GAT--TG-T--TGCACGAAATTATG----CAG----CG--CACA-----ATCTCCTTCAA--CATGT--------TATTAATGTGT-----AAATTAATC-AGTATTGTTCACTTTCG---A-----TC-AAATTA-TTACTGCATGTTA----TATCGT-GTAAA--TGC-AG-CTACTCGTA---TTTT---TTTAATACGC-AAATTGT-AAAT-GAGCACTTTGATCATATAATATAATATC-GTTGTGTTACCCTATTTACACACCGTAAAAAGAAGT--GAAAAGTTAATGATCTGATACATTG---------TATAAATATTGATA--ATTGGTTTAGGAAAATTACTCTGTCGAGTTG-TTTTTAAACCCGTAC-TTC-TTTTCAA--GTAT-TTCCCTAA-TT-TT---A--A---G---TNAAAG-TCCTNTCGA-GTA----ATACTTAATCACGGTGTTACGAATGGCCAG-AGTTANTCTACGTCCTCCTTTAACGGGCTTC-AT-CGAG-AGA-AATNAA-------TGAAGA----TA--------AGA-T-TA--T--CAA----TAG--TATTACCTTA-TTAGGCATACTGCA-CGGT-ACGGTTCGGTTCGGAA--CGCTTTG-AGGGC-NTGGT------TTGC-A---TA--------------A----------A----CG-TTCT---ATGAACGGT---ACGG-----TT-CGCTTCT-T-G-CAC-GGT---AC-GG-TTCG-C---T--TCTT-G-CA--CGGT---ACG------GT-TCGCTTCT
gi|1 : ATGAACTCTATGCAAATTAAGTGGA-----A---GTAGCTTTGTTTGATTGAC----AGTCGACTATTTCATTTTATTTAATTTCAATTAATAT--AGACGTATTTAATTTCATGTTGAAT--AATTTTTTTTTGTGTATTTTCGTGTCTGGAAGAACAG--CGAAATTAAATCCC-CACGGAT--TTTATTTTCAGAAAATCTTT--TTCAGTGTTAGAAATGTGCGTTTCTGTTATTCGTAGTCTATGTC--TCGATAAAATATTTCGTCATTACC--CATCATTGTACTCGCACTT-GTT-TAT--AGA-ACGATTGCTG-CAAAA---ATAACAATTTATAATTAGACAC-TAACTCGACACGTGTGCAAGTTTCGGGTTCAGTGTAATTAAGAATGATTACTATCAAAACATGTTGAGACACAAAGCCGGGAAGGTCGGAGTACAGGTACATGTAACTGCTCATGTTGTGTCGTGGAGAAGTACCCCGTCTGTGCAT--G-AT-TT-----------GCGTGTACATTG---T--ACATGATCTGCATGTATGAATATAT-T-AT------TGTATTTGTTAG-T----T--GAAAAAAC-ATCGCTTAATATTATATTCATGTATGTTTTACA-----------GATCT---ACATATATGCACATAAAGCATCGATAAC---AGGAAA--AGTA-GTA------TATATAAATA----CAT---GTAAATTGACGTGTACAT-TTAAA-CAGGCA--CG-TGCCGCTAT-GGC-AG--GTGAA---------------------TTCTTA-CA------AA-GT-A-ATCCACC-CGTAA-GACCCGGAAAATAA-CACACACAACCAAAT-CA---AAA--CCA-C-G--A----CAGGGGTAAAATTGGTTTCAAT----TCAGTA--CACGATC-----CACGTTCCTAA--TTAACCCTTA-ATT--GCATCACACATGTAACC-CACCCTC-TACT----CG-AAGCG-AT-CAAC-----C-----ATGCAAGATT---G---AAGAAAGAT-ATCGAGAATTCCAC-TC-TGCTGT-T-GAAGAATA-AATCATTGTATCGGAAAGCATTTATTATT----A------------------ATTAAG-AGAAACATACCT----TAA----CAAGATC-T-ACAAAAAGCAT-TGAA-GAA--------G---------T-----GA---------C---------AAT-------GT-TTCATTATATCAAATAT----CGTATA-AAA-----CTA------GCCA-AATTTCTTT--GTG-CGGCTTTTTTTGC-ATAGGAATT---A--CC-TTCTTCAT-ATTACA--TTTTGTTTCATT-----TTGAA---GCA----------AAAA-------AC--TTAC-TTAATC-TACA-T-GAT--TG-T--TGAACGAAATTATG----CAG----CA--CACA-----ATTTCTTTCAA--CATGT--------TATTAATGTGT-----AAATTAATC-AGTATTGTTCACTT--G---A-----TC-AAATTA-TTACTGCATGTTA----TATCGT-GTAAA--TGC-AG-CTACTTGTAATTTTTT---TTTAATACGC-AAATTGT-AAAT-GAGCACTTTGATCATATAATATAACACC-GTTGTGTTACCCTATTTATACACCGTAAAAAGAAGT--GAAAAGTTAATGATCTGATACATTG---------TATAAATATTGATA--ATTGGTTTCGGAAAATTACTCTGTCGAGTTGTTTTTTAAACCCATAC-TTC-TTTTCAA--GTAT-ATCCCTAA-TT-TT---A-----------CAAAG-TCCTTTCGA-GTA----ATACTTAATCACGGTGTCACAAATGGCCAG-AGTTATTCTACGTCCTCCTTTAACGAGCTTC-AT-C-AG-AGA-AATTAA-------TGATAA----TA--------AGA-T-TAGTT--TAA----TAG--TGTTACCTTA-TTAGGCATAATGCA-CGGT-ACGG---G--TCGGAA--CGCTTTG-AGGGC-GTGGT------TTGC-A---TA--------------A----------A----CG-TTCT---ATGAACTTT---ACGA-----TT-CGTTTCT-T-G-CAC-GGT---AC-GG-TTCG-T---T--TCTT-G-CA--CAGT---ACG------GT-ACGATTCT
gi|10 : gatgaacgattaAGTATAT-T-AT------TGTATTTGTTGG-T----T--AAAAAAACTATCGCTTAATATCATATTC------------------------------------CATATACGCATAAATCATCGATAAC---AGAAAA--AGTA-GTACATGTATATATAAATA----CAT---GTAAATTGACGTTTACAT-TTAAA-CTGGCA--CG-TGCTGCTGT-GGC-AG--GTGAA-CCCC----A-GACAATGTC-TTCTTA-CA------AA-CT-A-ATCCACC-CCTAA-GCCCCGGGAAATAA-CGCACACAACCAAAT-CA---AAA--CCA-C-G--A----CACAGGTCAAAT-GGTTTCAAT----TCAGTA--CACGATT-----CACGTTCCTAA--TTAACCCTTA-ATT--GCATCACACATGTAACC-CACTCTA-TATT----CG-AAGCG-AT-CAAC-----C-----ACGCAAGATT---G---AAGAAAGAT-ATCGAGAATTCCAC-TC-TGCTGT-T-GAAGAAT--------CGTA-----ATGCATTTATTATA----G------------------ATTAAG-AGAAAAATACCT----TG----------------CAAAAAGCAT-TGAA-GAA--------GTGATAATCAT-----GA---------C---------AAT-------AT-TTCATTTTATTATACTT----C-TGTA-AAA-----
gi|11 : gggggggggggggggggggggggttagtccagataggacagttctTCATTATATCAAATATGTATCGTATA-AAA-----CTA------GCAA-AAATT-TTT--GTG-CAGCTTTTTT-GC-ATAGGAATT---A------TCTTCAT-ATTACA--TTTTGATTCATT-----TTGAAGGGGGGGGGGGACTCCAAAA-------AC--TTAC-TTAATG-TACA-T-GAT--TG-T--TGCACGAAAGTTTG----CAG----TA--CACATCACAATTTCCTTCAA--CA-----------------TGT-T-----AAACT--TA-AGTA-----------------------C-A-------TACTGCATGTTA----T--CGT-GTAAA--TGC-AG-CTACTAGTA---TTTT---TTTAATACGC-AAAATTT-AGAT-GAGCACTTTGAT-ATATAATATAGTAACTGTTGTGTTACCCTATTTACACAGTGTAAAAAGAAG-------------TGATCTGATACACTG---------TATAAATATTGAAA--ATTGGTTTAGGAAAATTACTCTGTCGAATTG---------------------TTTTCAA--GTAT-TTCCCTAATTT-TT---AT-A---G---CTAAAG-TCCTTTCGA-GTA----ATACTTAATCATGGTGTTACGAATGGCCAG-AGTTAGTCTACGTCCTCCTTTAACGGGCTTC-AT-TGAA-AGA-AATAAA-------TGAAGA----TA--------AGA-T-TA--T--TAG----TAatgttt
gi|12 : CGTACCTCTTTAATGGGCTCCCATGCGAG-AGA-AAT-AA-------TGAGAACATGTA--------AGAAT-TA--CTACAAATG-TAGATTATTACCTTAGTTAGGCAATCTGCAGCGGT-ACGGTTTGCGTCGGAAGCCGCTTTG-AGGGG-TTGGT------TTGC-AG--TAATAATTTATTTGAGA----------A----CG-TTATTTAATGAGGTGT---ACGG-----TA-CGCTTCT-T-G-CCA-AGA---AC-GG-TTCG-C---T--TCTT-G-TT--C-GT---A-G------GT-TCGCT
gi|12 : TGCACGGT---ACAGGGTTGTT-CGCTTCT-TAG-TAC-GGT---AC-GT-TTCG-C---T--TCTTGG-TAC-CGGTTAAACG------GT-TCGTTgttcttgcacgtactgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttttgcacggtacagggttgttcgcttcttagtacggtacgtttcgcttcttggtaccggttaaacggttcgttcgtctttgcacgatacggttcggctatcagtttctgaggtgtagtaggcacggttctaggtca
gi|12 : cgtacctctttaatgggctcccatgcgagagaaataatgagaacatgtaagaattactacaaatgtagattattaccttagttaggcaatctgcagcggtacggtttgcgtcggaagccgctttgaggggttggtttgcagtaataatttatttgagaacgttatttaatgaggtgtacggtacgcttcttgccaagaacggttcgcttcttgttcgtaggttcgctgttcttgcacgtactgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttttACGGT---ACGT-----TT-CGCTTCT-T-GGTACCGGTTAAAC-GG-TTCG-T---TCGTCTTTG-CA--CGAT---ACG------GT-TCGcgtctttgcacgatacggttcggctatcagtttctgaggtgtagtaggcacggttctaggtca
gi|13 : cgtacctctttaatgggctcccatgcgagagaaataatgagaacatgtaagaattactacaaatgtagattattaccttagttaggcaatctgcagcggtacggtttgcgtcggaagccgctttgaggggttggtttgcagtaataatttatttgagaacgttatttaatgaggtgtacggtacgcttcttgccaagaacggttcgcttcttgttcgtaggttcgctgttcttgcacgtactgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttttgcacggtacagggttgttcgcttcttagtAATGTGCGTTTCTGTTTTTCGTAGTCTA-------CGATAAAATATTTCGCCAGTACTGTCATCATTGTACTCGCACTTTGTTCTATTTAGA-ACGATTGCTGTCAAAACAGG--ACAATTCATGATTGGACAC-TAACTCGGAACGAGTGCAAGTTTCGGTTTCAGTGTAATTAAGAATGATTACTATCAAAACATTTTAAGACACAAAGCCGGGAAGGTCAAAGTACAG---C---TAACTGCTCGTGCTGTGTCGTGAAGACATACCTCGTATGTGCAT--A-AT-TT----------TGTGTGgctatcagtttctgaggtgtagtaggcacggttctaggtca
gi|13 : CACGTACATGCATTTA-ATATTCAGA------TACGTGTACATTG---T--ACATGTTCTACATGTATGAATATAT-T-AT------TGTATTTGTTGG-T----A--GAAAAAAC-ATCACTTAATATTATACTCATATATGTgcaggagagacatattgaaaataaaaataagtaaactgatttaaaaaaaaaagtttcttccttatgcacattgtgcacgtacatgcatttaatattcagatacgtgtacattgtacatgttctacatgtatgaatatattattgtatttgttggtagaaaaaacatcacttaatattatactcatatatgt
gi|14 : aatgtgcgtttctgtttttcgtagtctacgataaaatatttcgccagtactgtcatcattgtactcgcactttgttctatttagaacgattgctgtcaaaacaggacaattcatgattggacactaactcggaacgagtgcaagtttcggtttcagtgtaattaagaatgattactatcaaaacattttaagacacaaagccgggaaggtcaaagtacagctaactgctcgtgctgtgtcgtgaagacatacctcgtatgtgcataattttgtgtggcaggagagacatattgaaaataaaaataagtaaactgatttaaaaaaaaaagtttcttccttatgcacattgtgCGTCCTCCTTTAACGG-CTCC-AT-AGAGTAGA-AATTAAAGTATAGTGAAAA----TACATCGTGAAGA-TATA--CTACAAATGTTGA--TATTAC-TTA-TTAGGCATACTGCC-CGGTAACGGTTCGGTTCGGA----GCTTTG-AGGGCTGTGG-------TTGCGA---TA--------------ATTTATTTGAGA----AGTTTCT---ATGAG-GGTGTAACGGA----TTATGCTTCT-T-G--AC--GT---AC-GG-TTCG-C---T--T-TT-G-TA--CGGT---ACG---------TTGCTTCT
gi|15 : ACGCATTGCGCATGTACAT--GCAT-TTAATATACAGATACGTGTACATTG---T--ACATGATCTACATGTATGAATATAT-T-AT------TGTCTTTGTTTG-T----TAAAAAAAAAC-ATCG-TTAATATTATATTCATGTATTTTTTAAA-----------GATCT---ACACATATGCACAtagtgcggtagagtggttgtacgctttcagttggcagtaagttcgcttttggcgctcggtacggatttaggtgttctggcagggtatcgggtcgttctgatgcaagtacggtcgttgttgcggggatacgtgttgttttcttgcacagagtcgagttcggcttctgtagggtttcgtttcttgtgcgatcgtgttatggttgtcggttttcgtttctgcaggtggttagcagg
gi|15 : gaaaataaaaataaatacactgatttaaaaacaattgattttcttccttatAAAT-GGCTTCAAT----ACAGTA--CACGATC-----CACGGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaatggcttcaatacagtacacgatccacggcta
gi|16 : gaaaataaaaataaatacactgatttaaaaacaattgattttcttccttatacgcattgcgcatgtacatgcatttaatatacagatacgtgtacattgtacatgatctacatgtatgaatatattattgtctttgtttgttaaaaaaaaacatcgttaatattatattcatgtattttttaaagatctacacatatgcacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnA-CTGGCA--TG-TGCCACTGT-GGC-AG--GTGAACCCC-----A-GACAATGTT-TTCTCA-CT------AA-CN-A-cta
gi|16 : A-CTGGCA--TG-TGCCACTGT-GGC-AG--GTGAA-CCCG----A-GACAATGTT-TCCTCA-CA------AA-CT-A-ATctggcatgtgccactgtggcaggtgaacccgagacaatgtttcctcacaaactaatgcgtttactgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtaacccaccctctactcgaagcgatcaatcgtggcacgcaatattgaagataattccactgttgttgaagaataaatcatcgtatcggaaagcatttatagcttaagagaaaaataccttaacgagatctacaaaaagcatttaagaagtgataatcatgacaatatttcaccatatcaactatc
gi|16 : actggcatgtgccactgtggcaggtgaaccccagacaatgttttctcactaacnATGTAACC-CACCCTC-TACT----CG-AAGCG-AT-CAAT-----CGTGGCACGCAATATT---G---AAGA-------T----AATTCCAC-T---GTTGT-T-GAAGAATA-AATCATCGTATCGGAAAGCATTTAT---A----G------------------CTTAAG-AGAAAAATACCT----TAA----CGAGATC-T-ACAAAAAGCAT-TTAA-GAA--------GTGATAATCAT-----GA---------C---------AAT-------AT-TTCACCATATCAACTAT----Cgcgtttactgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtaacccaccctctactcgaagcgatcaatcgtggcacgcaatattgaagataattccactgttgttgaagaataaatcatcgtatcggaaagcatttatagcttaagagaaaaataccttaacgagatctacaaaaagcatttaagaagtgataatcatgacaatatttcaccatatcaactatc
gi|17 : actggcatgtgccactgtggcaggtgaaccccagacaatgttttctcactaacnactggcatgtgccactgtggcaggtgaacccgagacaatgtttcctcacaaactaatgcgtttactgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn----------TACGTGTACATTG---T--ACATGACCTACATGTATGAATATAT-C-ATAATGATTGTCTTTGTTGG-T----T--AAAAAAGC-ATCGCT-GATATTATATTCATGTATGTTTTACA-----------GATCT---ACACATATGCACTTAAAGCATCGATAAC---AGAAAA--AGTA-GTAA-----CATATAAATA----CAT---GTAAATTGACGTTTACAT-TTAAA-CTGGCA--CG-TGCCGCTGT-GGC-AG--GTGAA-CCCC----A-GACAATGTC-TTCTTA-CA------AA-CT-A-ACCCACC-CCTAA-GCCCTGGGAAATAA-CACACACAACCAAAT-CA---AAA--CCA-C-G--A----CAGGGGTAAAAT-GGCTTCAAT----GCAGTA--------------CACGGTTCTAA--TTAACCCTTA-ATT--GCACCACACATG
gi|18 : taatatacagaATGAACGCTATGCAAATTAAGTGGACGTACACATGTAGCTTTGTTTCATTGAC----AGTCGACTATT-CATTTTATTTAATTTCATTCAATGTATAGACGTATTTAATTTCATGTTGAATTAAATTTTT----GTGTATTTTCGTGTCTGGAAGAAA--------------TCCAACACGAAT--TTTATTTTCAGAAAATCTTTATTTCAGTGTTAGAAATGTGCATTTCTGTT
gi|19 : GTTG-TTTT-AAACCCGTAA-TTC-CTTTCAA--GTAT-TTCCTTAA-TTCTT---ATGG---G---TGAAAG-TCCTGTTGA-GTA----ATACTTAATAATGGTGTTACGAATGACCAA-AGTTAACCTCCGACCTCCTTTAACGGGCTCC-AT-CGAG-AGA-AATAAA-------TGATTA----TA--------ACA-T-TA--T---------TAG--TATTACCTTA-TTAGGTATACTGCA-CGGT-A
gi|2 : GTGTTCATTGACTTGAACATGATCTACATGTACGGATATATATGAT------TGTATTTGTTGG-TAAAAC--AAAAATAC-ATCGCTTCATATCATATCCATGTATGTTTCACATATTTTAAATAAATCT---ACACATATGCACAAAAAGCATCGATAAC---AGGAAA--AGTA-GT-------T-TATAAGTA----CAT---GTAAAGTGACGCTTATAT-TTAAA-CTG-CA--CG-TGCCGTTGT-GGC-AG--GTGAA-CCT-----A-AGCAATGTC-TTCTTA-CATGTACAAA-CT-A-ATCCACC-TC-AA-GCCCCGAAAAATAAACGCACACAGCCACCT-CA---AAA--TCA-T-G--A----CAGGGGTAAAAT-TGTTTCAAT----TCAGTA--CATGATCTGATCCACGGTCCTAA------CCCTTA-ACT--GCATTACACATGTAACC-CACTCTC-TACT----CG-AAGCG-AT-CAAC-----C-----TCGCAAGATT---G---AAGA---------------TTCAC-TA-TGCTGT-T-ACAGAATA-AATCATCATATCCGAAAGCATTTATTATA----G------------------ATTAAG-AGAAAAATACCT----TAA----CAGGATC-T-ACAACAAGCAT-TGAA-GAA--------G---------T-----GA---------TAATCAAGGAAAT-------AT-TTCATTATATCAAATAT----CGTATA-AAA-----CTA------GACA-AATTACTTT--GTG-CGGC-TTTTTTGC-ACAGGAATT---A--CC-TTCTTCAT-ATTACA--TTTTATTTCATT-----TCGAAAGGGAAAAACTCC---AAAA-------AC--TTAC-TTACTC-TACA-T-GAT--TG-T--TGCACGACATTACG----TAG----TG--CACC-----ATATCCTTCAA--CATGT--------TATTAATGTGT-----AAAATAATCAAACATTGTTCACTT--G---A-----TC-AAATAA-TTACTGCATAT------TATCGT-GTAAA--TGC-AG-CTACTAGTA---TTTT---TTTAATA-GCTAAATTGT-AAAT-GAGCACTTTCATCGAATAATATAGTATT-GTTGTGTTACCCTATTGACACAGTGTAAAAAAAAAGAAGAAAAGTTAATGATCTGATACATTG---------TATAAATATTGACAACATTGGGTTAGGAAAATTACTCTGTCGAGTTG-TTGT--AACCAGTAT-TTCTTTTTCAA--ATAT-TTCCCTAG-TT-TT---AACA---GC--TCAAAG-TCCTTTCGA-GTAGTATATACTTAATAATGGTGTTACGAATTCCAAG-AG-TAAACTACGTCCTACTTAAACGGGCTTC-AA-CGAG-AGA-AATAAA-------TGAAGA----TA--------ATA-T-TA--T--
gi|20 : T---AC-GG-T-CG-C---T--TCTT-G-CA--CGGT---ACG------GT-TCGCTTCT
gi|20 : -TTCT----TGCACGGT---ACGG-----TT-CGCTTCTGC-G-CGT-GGT---AC-GGCTTCG-TGTAT--TCTT-G-CA--CGGT---AAG------GTATCGCTgcgcgtggtacggcttcgtgtattcttgcacggtaaggtatcgctctgtacgtaacggttgcgctcttgtacgtacgggttcgttttcttgccacccggtacgttcgacgttcgtttctgaggtgtacggtagccacggtttagatc
gi|20 : tacggtcgcTGCA-CGGT-ACGGTTCGCTTCTG----CGCGTGGTACGGC-TTCGTGTATTCTTGC-ACGGTA--------------A----------GGTATCG-CTCT---GT--ACGTA---ACGG-----TTGCGC-TCT-T-G-TAC--GT---ACGGG-TTCGTT---T--TCTT-GCCACCCGGT---ACGTTCGACGT-TCGTTTCTctgtacgtaacggttgcgctcttgtacgtacgggttcgttttcttgccacccggtacgttcgacgttcgtttctgaggtgtacggtagccacggtttagatc
gi|21 : tacggtcgcttctGATAACTCTGGGAAACAAGTTTGTAA-----TAAATAAATAGTCACATTGCATATATTGACGTTTACAT-TTAAACCTTGCA--CGTTGCCATTG--GGCAAG--GTGAA-CTC-----gaggtgtacggtagccacggtttagatc
gi|22 : agaaaatcatcaaacatcataatgacaatcccatattcggaagaaaaagtcagtccgATGTCCAAAAAATCTTTATTTCAATTTTTGAAACCTGTGTTTCTGTTATGTGTTGTCCAT--TTATAGATAACAAATTTAGCCAGTACCGTAATCG----------ACCCCATT-TAT----ATACAAT--------------G--AC----CATATTTAGACACTTAACTCG
gi|23 : AACC-CACCCTC-AACT----CG-AAGCG-AA-CAAT-----C-----ACGCACGATT---G---AAGAAAGAT-ATCGAGAACTTCAC-TC-TGCTG---------------CCACCGTATC--------T------TA----G------------------ATGAAA-AGAATAATACCTTAAATAA----CGGGACT-T-ACAA
gi|24 : acATTAAGTGGACGTAC--------CTTTGTTTGATTGACGTCAAGTCGACTATC-CATTTTATTTAATTTCATTTAATGT--AGAAGTATTTAATTTTATGCTGAATTACATTTTT----GTATATTTTCGTG
gi|25 : GTAAATGTATTAAATTTTGTGTTGGATTAAATTTT-----GC-TATTTTCATGTCTGGAAGAAAAGAACAAAATTAAATCCAAAACAAATTCTTTA-TTTCAG--AATCTTT
gi|26 : TATACATGTAT-T-AT------TGTATTTCTTGGTT----T--AAAAAAAC-A-CGCTTTATATTAT----ATGCATGTTTTACA-----------GATCT---A--------CACATAAAGCATCGATAAC---AGGAAA--AGTA-Gtt
gi|27 : -----AAATAAATC-A---TTGTTCACTTTCA---AAAAAGTC-AAATTA-TCAATGCATGT------TATCGT-GTAAAACTGTGAGCCTACTCGTA-------------AACG-GC-ACATTGTAAAAT-GA
gi|29 : aAATTGT-AAAT-GAGCACTTTGATAATATAATACAATATC-GTTGTGTTACCCATTTTACACACCGTAAAAAGAAAT--GAAAAGTagc
gi|3 : -GGCTTCAAT----TCAGTA--TACGATC-----CACGGTCCTGA--TTAACACTTA-ATT--GCATCACACATGTAACC-CTCCCTT-TACT----CG-AAGCG-AT-CAAC-----C-----ACG---------------AGAA---T-ATCGAGAATTCCAC-TC-TGCTGT-T-GAAGAATA-AATCATAGTATCGGAAAGCATTTATTATA----A------------------ATTAAG-AGAAAAATATCT----TAA----CGACATC-T-ACAAAAAGCAT-TGAA-GAA--------G---------T-----GATAATCATGGC---------AAT-------AT-TTCATCATATCAAATAT----CGTATA-AAA-----CTA------ACCA-AATTTGTTT--GTG-TGG---TTTTTGC-ATAGAAATT---A--CC-TTCTTCAT-ATTAAA--TGTTATTTCATT-----TTGAAGGGGGA----------AAAATCCCAAAAC--TTAC-TTAATC-CACA-T-GAT--TG-T--TGCACGAAATTATG----CAG----CA--CACA-----ATTTCCTTCAA--CATAT--------TATTAATGTGT-----AAACTAATC-AGTATTTTTCACTT--A---A-----TC-AAATTA-TTACTGCATG----------CGT-GTGAA--TGC-AG-TTACTCGTA---TTTTTTTTTTAATACGC-AAATTGT-AAAC-GAGCACTTTGATCATATAATATAATATC-GTTGTGTTATCCTATTTACACACTGTAAAAAGAAGT--GAAAAGTTAATGATCTGATACATTG---------TATAAATATTGATA--ATTGGTTTAGGAAAATTACTCTGTCGAGTTG-TTTTTAAACTCGTAC-TTC-TTTTCAA--GTAT-TTCCCTAT-CT-TTCACA--C---C---TAGAAG-TCCTTTCCA-GTA----ATACATAATCACCGTGTTACAAATGGCCAG-AGTTATTCTACATCCTCCTTGAACGGGCTTC-AT-CGAG-AGA-AATTAA-------TGAAGA----TA--------GGA-T-T-------AA----TAG--TATTACCTTA-TTAGGCATAGTGCG-CGGT-ACGGTTCGGTTCGGAA--TGCTTTG-AGGGC-GTGGT------TTGC-A---TA--------------A----------A----CG-TTCT---ATGAACTGT---AAGG-----TT-CGTTGCT-A-G-CAA-GGT---AC-GG-TGCG-C---T--TCTT-G-CG--CGGT---ACG------GT-TC
gi|30 : TTTAAACCCGTAA-TTA-TTTTCAA--GTAT-TTCCCTAA-TT-GT---A--ATGGG---TGAAAG-TTCTGTTGA-GTA----ATACTTGATTAcgcgatatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaacgtttctgaggtgtagtagcacggtttaggatctg
gi|31 : ttggTTTAAACACGTAAATTA-TTTTCAAAAGTATGTCCCCTAA-TT-GT---A--ATGGG---TGAAAGTTTCTGTTGAGGTA----ATATT
gi|32 : ttggT--GCATCACA------ACC-CACCCTC-TACT----CG-AAGCG-TA-CAAC-----C-----ACGCACGATT---G---AAGAAAGA
gi|34 : ATTGT-AAAT-GAGCACTTTGATAATATAATATAATATC-GGTGTGTTACCCT
gi|35 : GTAACC-CACCCTC-TACT----CG-AAGCG-AT-CAACCGTGGC-----GCGCAAGATT---G---AA
gi|4 : TA----CAT---GTAAATTGACGTTTACATCTTAAA-CTGGCAAGCG-CGCCGTTGTTGGC-AG--GTGAC-CCC-----AAGACAATGTC-TCTAAA-CA------AA-GT-ATATTC----------------GAAAATAA-CGCACACAACCAACT-CA---AAA--TCAAT-G--A----CAGGGGTAAAAT-GGCTTCAAT----TCAGTAAACACGATC-----CACG-TCCTAA-----ACC-TTA-ATT--GCATCACA------ACC--ACCCTCGTACTAGTACG-AAGCG-AAACAAC-----C-----ACGCACGATT---G---AAGAAAGAT-GTCGAGAATTTCAC-TC-TGCTGT-TCGAAGAATACAACCATCGTATC------------TT-TA----G------------------ATTAAG-AAACTAATACCT----TAAATAACGGGACC-TTACAAAAAGCATCTGAA-GAA--------G---------T-----GA---------T---------AATCATGACAATATTAATTTTATCAAATAT----CGTATGCAAA-----CTA------GCCA-A-TTTGTTTTGGTGGCGGTTTTTTTTGC-A-----ACTGTAA--CCATTCTTCAT-ATTACA--TTT-GTTTCATT-----TTGAAGGGGGG----------AA--------------TAC-TTACGC-TACA-T-AATAATG-T--TGCACGAA-TTATG----CAG----TT--CATA-----ATCTCCTTCAA--CATGTTGCATG--TATTAATGTGT-----AAAATAATCAAACATTGTTCACTTTCA---AAAT--TC-AAATTACTCAATGCATGTT-------TCGT-GTAAA--TGT-AG-CTACTCG-A-------------AATACGC-ACATTGT-AAATCGAGC
gi|5 : tnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgACCACCTAAAGCCCCGGGAAATAA-CGCACACAACCAAAT-------GA--TCA-T-G--AAAACCAGGGGTAAAAT-GGCTTCAAT----TCAGTA--CACGATC-----CACGGTCCTAA--TTAACCCTTA-ATT--GCATCACACATGTAACC-CACCCTC-TACT----CG-AAGCG-A------------------CG----------G---AAGAAAGAT-ATCGAGAATTCCAC-TC-TGCTAT-T-GAAGAATA-AATCATCGTATCGAAAAGCATTTATTATA----G------------------ATTAAG-AGAAAAA----------------------------AAAAAGCAT-TGAA-GAA--------G---------T-----GATAATCATGAC---------AAT-------AT-TTCATCATATCAA-TAT----CGTATA-AAA-----CTA------GCC-------GTTT--GTG-CGGCTTTTTT-GC-ATAGGAATT---A--CC-CTCTTGGT-ATTACACATGTTGTTTCATT-----TTGAAGGGGGG----------AAAACCAAAA-AC--TTAC-TTAATC-TACA-T-GAC--TG-T--TGCACGAAATTATG----CAG----CA--CACA-----ATTTCCTTCAA--CATGT--------TATTAATGTGT-----AAATTAATC-AGTATTGTTCACTT--G---G-----TC-AAATTA-TTACTGCATGTTACGTGTATCAT-GTAAA--TGC-AG-CTACTCGTAT--TTTT---TTTAATACGC-AAATTGT-AAAT-GAGCACTTTGATCATATAATATGATATC-GT--TGTTACCCTATTTACACACTGTAAAAAGAAGT--GAAAAGTTTATGATCTGATACATTGTATCTACATTATAAATATTGATA--ATTGGTTTAAGAAAATTACTCTGTCGAGTTG-TATTTAAACCTGTAC-TTC-TTTTCAA--GTAT-TTCCCTAA-TT-TT---
gi|6 : A----CAT---G-AAATTGACGGTTACATGTTAAA-CTG-CA--CG-CGCGTTTTT-TGC-AGAAG-GAA-CCTCTCTAA-GACAATGTCCTTCTTAACA------AAGTT-A-AT--ATC-GAAAA-A----GTGAGATAA-CGCACACAACCACCTTCATATGAA--TCA-T-AGTA----CAGGGGTAAAAT-CGC-TCAA-----TCAGTA--CAC-ATC-----CAC-GTTCTAAACTTAATCCTTGCATT--TCATAAC------AACCTCACCCTC--AC-----CG-AAGCGAAA-CAAC-----C-----ATGCTAGATTTAAGTTTAAGAAAGA--ATCGAGAATTTCACTTC-TGCTGTGT-GTAAAATA-AACCATC----C---AAAC-----TTAGA----G------------------ATCA-----AATAATACCT----TAATACGCGGAACCTT-ACAAAAAGCAT-TGAA-GAATG------A---------TAATCAGA---------C---------AAT-------AT-TAATTTATGCAAAAT-T----TGTATA-AGAAAATCTTATCCCGCGCCAGAATTTGTTT--GTGTCGGC--ATGTTGCAATAA--------A--CC-TTTTCTATCATTACA--TTTTGTTCAATCCATAATTGAA---GGG----------AAAT-------ACAATTAC-C--GTCTTACATT-GAA--TG-TTATGCACGAAATTA-GTCCCCAGTCTATGTTCACA-----ATCCCCCTCAAACTATGT--------
gi|7 : atcaattcagtcattgtttcatcgtttggtcccattaaatattcataaatcgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggtaagcctta----------TACGTATACATTG---A--ACGTGATCTATATGTATGAATATAT-G-AT------TGTATTTGTTCG-T-------AAAAAAAA-ATCGCTTAATATCATATTCATGTACGTTTTACA-----------AATTTGAAACAAATCTACACAAAAAGCATCGATAAT---GGGAAA--AGCA-GTA------TATATAT-TA----CAT---GTAAATTGACGCTTATAT-TTAAA-CTGGCA--AG-TGCCGTTGT-GGC-AG--GTTAA-TTCT----A-GACTAAGTC-TTCTTT-CA------AA-CCCA-ATCCACC-CCTAA-TCCCCAAAAAATAA-CGCACACAACCACCT-CA---AAA--CCA-C-G--A----CAGGGGTAAAAT-GGCTTCAATATAATCAGTA--CATGATC-----CACGGACC------TAACCCTTA-ATT--GCATTACACATGTAACC-CACCCTC-TACC----CG-AAGCG-AT-CAAC-----C-----ATGCAAGATT---G---AAGAAAGAT-ATCGAGAATTTCAC-TC-TGCTGT-T-GAAGAATA-AATCATCGTATCGGAAAGCATTTATTATACAATGTACATTATGTACATGTACATTAAG-AGAAAAATACCT----TAA----CGGGACC-T-ACAAAAAGCAT-TGGA-GAA--------G---------T-----GA---------T---------AAT-------gtctagtccatgtatc
gi|8 : taccccgtcagtgcattgttttgtgtggcaggatagacttatgttgaaaataaaaataaatacactgatttttttccttatacacatagtgcatgcacatgcatttaatatacagaCATGTTA----T--CGT-GTAAA--TGC-AC-CTACTCGTA---TTTT---TTTAATACGC-AAACTGT-AAAT-GATCACTTTGATCATATAATATAATATC-GTTGTGTTACCCTATTTACACATTGTAAA--GAAGT--GAAAAGTTAATGATCTGATACATTG---------TATAAATATTGATA--ATTGGTTTAGGAAAATTACTCTGTCGAGTTG-TGTTTAAACCCGTAC-CTC-TTTTCAA--GTAT-TTCCCTAA-TT-TT---T--A---GGGCTGAAAG-TCCTATCGA-GCA----ATACTTAATCACGGTGTTACAAATGGCCAGAAGTTATTCTACGTCCTCCTTTAACGGGCTTC-AT-CGAG-AGAGAATTAA-------TGAAGA----TA--------AGA-T-T-------AA----TAG--TATTACCTTA-TTAGGCATACTGCA-CGGT-ACGGTTCGGTTCGGAA--CGCTTTG-AGGG--TTGGT------TTGC-A---TA--------------A----------A----CG-CTCT---ATGAACcatga
gi|9 : AAT-CA---AAGATTCA-CTG--A----CAGGGGTAAAAT-GGCTTCAAT----TCAGTA--CACGATC-----CACGGTCCTAA-----ACC-TTA-ATTTTGCATCACA-----AACC-CACCCTC-TACT----CGGAAGCG-AA-CAAA-----C-----ACGCACGATT---G---AAGAAAGATGATCGAGAATTTCAC-TCATGCGGGGT-GGAGAATA-A-CCATCGTAT------------ATTA------G------------------ATTAAGGAGAATAATACCT----TAAATAATGGGACC-T-ACAAAAAGCAT-TGAAAGAATGATAATCA---------T-----GA---------C---------AAT-------AT-TTAAATTTATCAAATAT----CGTATA-AAAA----CTA------GCTC-TATATATTT--GCG-C---TTTATTTGC-AT-----TT---AAACC-TTCTTCATAATTA-A--TTTTGTTTCATT-----TTGAAGAAGGG----------GAA-------------TACGTTACGC-TACA-TGGAA--TGCT--TGCACGAAATCATG----CAG----T---CACA-----ATCTCCTTCAA--CATGCTTACAATGTATTAATGTGTTAAAAAAATCAAAC-ATTGTT-TTCACTTTCGAAAA-----TCAAAATTA-TCCATGCATGT------TATCGTGGGAAA--TGT-AG-CTACTCGTA-------------AA-ACGC-ACATT-T-AAAT-GAGCtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtacatttcttaggtgtagtagcacggtttagggtctg
6 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|28 ): TTAACGATTTTGTCGTTAACATCTACGTTCAATGAAATACTAGCATTGTCATCTAAAATAATCAATTGAGCACTATTATTCTGTATTTAAAA
Unaligned ( gi|33 ): CACGGTATGGTTCGGTACGTTTCTGAGGTGTAGTAGCACTGTTTAGGGTCT
Unaligned ( gi|36 ): ATACACTCATCCATTTGTTTTTACTGAAAAAACCTCA
Unaligned ( gi|37 ): ACGTTTCTGAGGTGTAGTAGCACAGTTTAGGGTCTGT
Unaligned ( gi|38 ): ACACTTCTGAGGTGTAGTAGTACGGTTTAGGGTCTGT
Unaligned ( gi|39 ): CGTTTCTAGGTGTAGTAGCACGGTTTAGGGTCT
Alignments
lowQualScore : 333333333 2222 1 22 22222 222222 11 444444 1 1 11 44444444444444444 1 3333333 2222 1 4444444444 111111 111111 1111111 22222222222 111 1111 333333 1111 1 22222 111111 111 111 22222222222222222222222 2222 777777777777777777777777777777777777777777777 1111111 11111 111111 1 1 11111 5555555555555555555555555 1111 22222222 11111 33333333 11111 1 444444444444 33333333 2222222222 222222222 55555555555555 1111 1111111 1111 11111111 4444444444444 111 111 111111 66666666666666666666666666666666666 1111 11111 1 111111 11 111111
lowQualScore : 1 222222222 8888 3 22 0 3 44444 6 666666 7 88 3 3 7 777777 6 88 2 3 88 7 66666666666666666 7 3 1 1 1 1 2222222 1 2 1111 0 3333333333 666666 555 444444 5 9999999 5 77777777777 000 0 1111 77 5 222222 1 0000 888 0 4 55 4 4 4 55 4 66666 4 4 4 222222 4 4 4 6666 555 5 1 4 777 66 666 66 9999 3 7777 55 99999 333 4 55 5 3 3 6666 3 3 77 77777 77777 2 555 555 3 3 3 7 3 3 555 2 2 77777777777777777777777 3 0 7777 3333 0 3 3 4 4 000000000000000000000000000000000000000000000 3333333 4 8888 4 55555 444444 55 0 4 66 0 77 3 5 0 4 888 66 5 0 66 22222 4 3333333333333333333333333 5 1 5 5 5 66 5 66 0000 44444444 22222 1 66 22222222 22222 1 0 3 2 999999999999 5 5 00000000 4 66 4 4 4444444444 1 4 3 3 2 5 1 999 666666666 99 5 1 4 77 4 66 4 4 4 00000000000000 1 5 1 5 0000 6 1 5 5 5 5 5 6666666 0000 88888888 5 5 6666666666666 99 6 5 5 6 222 6 000 999999 6 77777777777777777777777777777777777 5 0000 888 77777 0 666 000000 777 4 4 99999 66 8 4 00 777 222222 4
lowQualScore : . ......... .... . .. . . ..... . ...... . .. . . . ...... . .. . . .. . ................. . . . . . . ....... . . .... . .......... ...... ... ...... . ....... . ........... ... . .... .. . ...... . .... ... . . .. . . . .. . ..... . . . ...... . . . .... ... . . . ... .. ... .. .... . .... .. ..... ... . .. . . . .... . . .. ..... ..... . ... ... . . . . . . ... . . ....................... . . .... .... . . . . . ............................................. ....... . .... . ..... ...... .. . . .. . .. . . . . ... .. . . .. ..... . ......................... . . . . . .. . .. .... ........ ..... . .. ........ ..... . . . . ............ . . ........ . .. . . .......... . . . . . . . ... ......... .. . . . .. . .. . . . .............. . . . . .... . . . . . . . ....... .... ........ . . ............. .. . . . . ... . ... ...... . ................................... . .... ... ..... . ... ...... ... . . ..... .. . . .. ... ...... .
lowQualScore : 0 000000000 3333 3 00 2 2 55555 5 000000 3 33 2 2 3 777777 7 00 0 3 33 3 00000000000000000 3 3 0 0 0 0 0000000 0 0 8888 0 3333333333 222222 999 444444 0 8888888 0 11111111111 000 7 4444 99 7 555555 7 6666 888 0 0 55 0 0 0 55 0 00000 4 4 4 888888 4 4 4 0000 888 0 7 4 888 11 000 11 4444 6 7777 00 11111 666 0 00 9 1 1 5555 1 1 88 77777 77777 1 444 444 6 6 6 3 6 6 222 0 0 55555555555555555555555 6 5 7777 2222 4 6 6 0 0 000000000000000000000000000000000000000000000 0000000 4 5555 4 66666 444444 11 1 5 99 0 66 2 0 1 5 888 99 0 0 99 55555 5 2222222222222222222222222 0 0 0 0 0 99 0 99 6666 99999999 55555 1 99 55555555 55555 2 0 4 5 111111111111 0 0 11111111 4 11 4 4 3333333333 1 4 6 6 5 0 4 333 777777777 22 7 6 6 33 4 11 4 4 4 33333333333333 4 0 0 0 6666 7 0 0 0 0 0 9 2222222 6666 11111111 0 0 6666666666666 22 7 7 7 7 333 7 222 222222 7 33333333333333333333333333333333333 7 1111 888 55555 0 111 999999 888 4 4 33333 11 9 4 66 888 888888 4
consensus : NNNNNNNNNNNNATGAACNCTATGCAAATTAAGTGGACGTACA---GTAGCTTTGTTTGATTGAC----AGTCGACTATT-CATTTTATTTAATTTCATTTAATGTGTAGACGTATTTAATTTCATGTTGAATTAAATTTTT----GTGTATTTTCGTGTCTGGAAGAAAAG--CGAAATTAAATCCAACACGAAT--TTTATTTTCAGAAAATCTTTATTTCAGTGTTAGAAATGTGCGTTTCTGTTATTCGTAGTCTAT--C--TCGATAAAATATTTCGCCAGTACCGTCATCGTTGTACTCGCACTTCGTT-TAT--AGAACGATTGCTG-CAAAA---G--ACAATTCATAATTAGACAC-TAACTCGGNACGNGTGCAAGTTTCGGNTTCAGTGTAATTAAGAATGATTACTATCAAAACATNTTGAGACACAAAGCCGGGAAGGTCGGAGTACAGGTACATGTAACTGCTCGTGCTGTGTCGTGGAGACGTACCNCGTACGTGCAT--G-AT-TT----------TACGTGTACATTG---T--ACATGATCTACATGTATGAATATAT-T-AT------TGTATTTGTTGG-T----T--AAAAAAAC-ATCGCTTAATATTATATTCATGTATGTTTTACA-----------GATCT---ACACATATGCACATAAAGCATCGATAAC---GGGAAA--AGTA-GTA------TATATAAATA----CAT---GTAAATTGACGTTTACAT-TTAAA-CTGGCA--CG-TGCCGCTGT-GGC-AG--GTGAA-CCC-----A-GACAATGTC-TTCTTA-CA------AA-CT-A-ATCCACC-CCTAA-GCCCCGGGAAATAA-CGCACACAACCAAAT-CA---AAA--CCA-C-G--A----CAGGGGTAAAAT-GGCTTCAAT----TCAGTA--CACGATC-----CACGGTCCTAA--TTAACCCTTA-ATT--GCATCACACATGTAACC-CACCCTC-TACT----CG-AAGCG-AT-CAAC-----C-----ACGCAAGATT---G---AAGAAAGAT-ATCGAGAATTCCAC-TC-TGCTGT-T-GAAGAATA-AATCATCGTATCGGAAAGCATTTATTATA----G------------------ATTAAG-AGAAAAATACCT----TAA----CGGGACC-T-ACAAAAAGCAT-TGAA-GAA--------G---------T-----GA---------C---------AAT-------AT-TTCATTATATCAAATAT----CGTATA-AAA-----CTA------GCCA-AATTTGTTT--GTG-CGGCTTTTTTTGC-ATAGGAATT---A--CC-TTCTTCAT-ATTACA--TTTTGTTTCATT-----TTGAAGGGGGG----------AAAA-------AC--TTAC-TTANTC-TACA-T-GAT--TG-T--TGCACGAAATTATG----CAG----CG--CACA-----ATCTCCTTCAA--CATGT--------TATTAATGTGT-----AAATTAATC-AGTATTGTTCACTTTCG---A-----TC-AAATTA-TTACTGCATGTTA----TATCGT-GTAAA--TGC-AG-CTACTCGTA---TTTT---TTTAATACGC-AAATTGT-AAAT-GAGCACTTTGATCATATAATATAATATC-GTTGTGTTACCCTATTTACACACCGTAAAAAGAAGT--GAAAAGTTAATGATCTGATACATTG---------TATAAATATTGATA--ATTGGTTTAGGAAAATTACTCTGTCGAGTTG-TTTTTAAACCCGTAC-TTC-TTTTCAA--GTAT-TTCCCTAA-TT-TT---A--A---G---TGAAAG-TCCTNTCGA-GTA----ATACTTAATCACGGTGTTACGAATGGCCAG-AGTTANTCTACGTCCTCCTTTAACGGGCTTC-AT-CGAG-AGA-AATNAA-------TGAAGA----TA--------AGA-T-TA--T--CAA----TAG--TATTACCTTA-TTAGGCATACTGCA-CGGT-ACGGTTCGGTTCGGAA--CGCTTTG-AGGGC-NTGGT------TTGC-A---TA--------------A----------A----CG-TTCT---ATGAACGGT---ACGG-----TT-CGCTTCT-T-G-CAC-GGT---AC-GG-TTCG-C---T--TCTT-G-CA--CGGT---ACG------GT-TCGCTTCT
Reference ( family-203 ) : NNNNNNNNNNNNATGAACNCTATGCAAATTAAGTGGACGTACA---GTAGCTTTGTTTGATTGAC----AGTCGACTATT-CATTTTATTTAATTTCATTTAATGTGTAGACGTATTTAATTTCATGTTGAATTAAATTTTT----GTGTATTTTCGTGTCTGGAAGAAAAG--CGAAATTAAATCCAACACGAAT--TTTATTTTCAGAAAATCTTTATTTCAGTGTTAGAAATGTGCGTTTCTGTTATTCGTAGTCTAT--C--TCGATAAAATATTTCGCCAGTACCGTCATCGTTGTACTCGCACTTCGTT-TAT--AGAACGATTGCTG-CAAAA---G--ACAATTCATAATTAGACAC-TAACTCGGNACGNGTGCAAGTTTCGGNTTCAGTGTAATTAAGAATGATTACTATCAAAACATNTTGAGACACAAAGCCGGGAAGGTCGGAGTACAGGTACATGTAACTGCTCGTGCTGTGTCGTGGAGACGTACCNCGTACGTGCAT--G-AT-TT----------TACGTGTACATTG---T--ACATGATCTACATGTATGAATATAT-T-AT------TGTATTTGTTGG-T----T--AAAAAAAC-ATCGCTTAATATTATATTCATGTATGTTTTACA-----------GATCT---ACACATATGCACATAAAGCATCGATAAC---GGGAAA--AGTA-GTA------TATATAAATA----CAT---GTAAATTGACGTTTACAT-TTAAA-CTGGCA--CG-TGCCGCTGT-GGC-AG--GTGAA-CCC-----A-GACAATGTC-TTCTTA-CA------AA-CT-A-ATCCACC-CCTAA-GCCCCGGGAAATAA-CGCACACAACCAAAT-CA---AAA--CCA-C-G--A----CAGGGGTAAAAT-GGCTTCAAT----TCAGTA--CACGATC-----CACGGTCCTAA--TTAACCCTTA-ATT--GCATCACACATGTAACC-CACCCTC-TACT----CG-AAGCG-AT-CAAC-----C-----ACGCAAGATT---G---AAGAAAGAT-ATCGAGAATTCCAC-TC-TGCTGT-T-GAAGAATA-AATCATCGTATCGGAAAGCATTTATTATA----G------------------ATTAAG-AGAAAAATACCT----TAA----CGGGACC-T-ACAAAAAGCAT-TGAA-GAA--------G---------T-----GA---------C---------AAT-------AT-TTCATTATATCAAATAT----CGTATA-AAA-----CTA------GCCA-AATTTGTTT--GTG-CGGCTTTTTTTGC-ATAGGAATT---A--CC-TTCTTCAT-ATTACA--TTTTGTTTCATT-----TTGAAGGGGGG----------AAAA-------AC--TTAC-TTANTC-TACA-T-GAT--TG-T--TGCACGAAATTATG----CAG----CG--CACA-----ATCTCCTTCAA--CATGT--------TATTAATGTGT-----AAATTAATC-AGTATTGTTCACTTTCG---A-----TC-AAATTA-TTACTGCATGTTA----TATCGT-GTAAA--TGC-AG-CTACTCGTA---TTTT---TTTAATACGC-AAATTGT-AAAT-GAGCACTTTGATCATATAATATAATATC-GTTGTGTTACCCTATTTACACACCGTAAAAAGAAGT--GAAAAGTTAATGATCTGATACATTG---------TATAAATATTGATA--ATTGGTTTAGGAAAATTACTCTGTCGAGTTG-TTTTTAAACCCGTAC-TTC-TTTTCAA--GTAT-TTCCCTAA-TT-TT---A--A---G---TGAAAG-TCCTNTCGA-GTA----ATACTTAATCACGGTGTTACGAATGGCCAG-AGTTANTCTACGTCCTCCTTTAACGGGCTTC-AT-CGAG-AGA-AATNAA-------TGAAGA----TA--------AGA-T-TA--T--CAA----TAG--TATTACCTTA-TTAGGCATACTGCA-CGGT-ACGGTTCGGTTCGGAA--CGCTTTG-AGGGC-NTGGT------TTGC-A---TA--------------A----------A----CG-TTCT---ATGAACGGT---ACGG-----TT-CGCTTCT-T-G-CAC-GGT---AC-GG-TTCG-C---T--TCTT-G-CA--CGGT---ACG------GT-TCGCTTCT
gi|1 : ATGAACTCTATGCAAATTAAGTGGA-----A---GTAGCTTTGTTTGATTGAC----AGTCGACTATTTCATTTTATTTAATTTCAATTAATAT--AGACGTATTTAATTTCATGTTGAAT--AATTTTTTTTTGTGTATTTTCGTGTCTGGAAGAACAG--CGAAATTAAATCCC-CACGGAT--TTTATTTTCAGAAAATCTTT--TTCAGTGTTAGAAATGTGCGTTTCTGTTATTCGTAGTCTATGTC--TCGATAAAATATTTCGTCATTACC--CATCATTGTACTCGCACTT-GTT-TAT--AGAACGATTGCTG-CAAAA---ATAACAATTTATAATTAGACAC-TAACTCGACACGTGTGCAAGTTTCGGGTTCAGTGTAATTAAGAATGATTACTATCAAAACATGTTGAGACACAAAGCCGGGAAGGTCGGAGTACAGGTACATGTAACTGCTCATGTTGTGTCGTGGAGAAGTACCCCGTCTGTGCAT--G-AT-TT-----------GCGTGTACATTG---T--ACATGATCTGCATGTATGAATATAT-T-AT------TGTATTTGTTAG-T----T--GAAAAAAC-ATCGCTTAATATTATATTCATGTATGTTTTACA-----------GATCT---ACATATATGCACATAAAGCATCGATAAC---AGGAAA--AGTA-GTA------TATATAAATA----CAT---GTAAATTGACGTGTACAT-TTAAA-CAGGCA--CG-TGCCGCTAT-GGC-AG--GTGAA---------------------TTCTTA-CA------AA-GT-A-ATCCACC-CGTAA-GACCCGGAAAATAA-CACACACAACCAAAT-CA---AAA--CCA-C-G--A----CAGGGGTAAAATTGGTTTCAAT----TCAGTA--CACGATC-----CACGTTCCTAA--TTAACCCTTA-ATT--GCATCACACATGTAACC-CACCCTC-TACT----CG-AAGCG-AT-CAAC-----C-----ATGCAAGATT---G---AAGAAAGAT-ATCGAGAATTCCAC-TC-TGCTGT-T-GAAGAATA-AATCATTGTATCGGAAAGCATTTATTATT----A------------------ATTAAG-AGAAACATACCT----TAA----CAAGATC-T-ACAAAAAGCAT-TGAA-GAA--------G---------T-----GA---------C---------AAT-------GT-TTCATTATATCAAATAT----CGTATA-AAA-----CTA------GCCA-AATTTCTTT--GTG-CGGCTTTTTTTGC-ATAGGAATT---A--CC-TTCTTCAT-ATTACA--TTTTGTTTCATT-----TTGAA---GCA----------AAAA-------AC--TTAC-TTAATC-TACA-T-GAT--TG-T--TGAACGAAATTATG----CAG----CA--CACA-----ATTTCTTTCAA--CATGT--------TATTAATGTGT-----AAATTAATC-AGTATTGTTCACTT--G---A-----TC-AAATTA-TTACTGCATGTTA----TATCGT-GTAAA--TGC-AG-CTACTTGTAATTTTTT---TTTAATACGC-AAATTGT-AAAT-GAGCACTTTGATCATATAATATAACACC-GTTGTGTTACCCTATTTATACACCGTAAAAAGAAGT--GAAAAGTTAATGATCTGATACATTG---------TATAAATATTGATA--ATTGGTTTCGGAAAATTACTCTGTCGAGTTGTTTTTTAAACCCATAC-TTC-TTTTCAA--GTAT-ATCCCTAA-TT-TT---A-----------CAAAG-TCCTTTCGA-GTA----ATACTTAATCACGGTGTCACAAATGGCCAG-AGTTATTCTACGTCCTCCTTTAACGAGCTTC-AT-C-AG-AGA-AATTAA-------TGATAA----TA--------AGA-T-TAGTT--TAA----TAG--TGTTACCTTA-TTAGGCATAATGCA-CGGT-ACGG---G--TCGGAA--CGCTTTG-AGGGC-GTGGT------TTGC-A---TA--------------A----------A----CG-TTCT---ATGAACTTT---ACGA-----TT-CGTTTCT-T-G-CAC-GGT---AC-GG-TTCG-T---T--TCTT-G-CA--CAGT---ACG------GT-ACGATTCT
gi|10 : gatgaacgattaAGTATAT-T-AT------TGTATTTGTTGG-T----T--AAAAAAACTATCGCTTAATATCATATTC------------------------------------CATATACGCATAAATCATCGATAAC---AGAAAA--AGTA-GTACATGTATATATAAATA----CAT---GTAAATTGACGTTTACAT-TTAAA-CTGGCA--CG-TGCTGCTGT-GGC-AG--GTGAA-CCCC----A-GACAATGTC-TTCTTA-CA------AA-CT-A-ATCCACC-CCTAA-GCCCCGGGAAATAA-CGCACACAACCAAAT-CA---AAA--CCA-C-G--A----CACAGGTCAAAT-GGTTTCAAT----TCAGTA--CACGATT-----CACGTTCCTAA--TTAACCCTTA-ATT--GCATCACACATGTAACC-CACTCTA-TATT----CG-AAGCG-AT-CAAC-----C-----ACGCAAGATT---G---AAGAAAGAT-ATCGAGAATTCCAC-TC-TGCTGT-T-GAAGAAT--------CGTA-----ATGCATTTATTATA----G------------------ATTAAG-AGAAAAATACCT----TG----------------CAAAAAGCAT-TGAA-GAA--------GTGATAATCAT-----GA---------C---------AAT-------AT-TTCATTTTATTATACTT----C-TGTA-AAA-----
gi|11 : gggggggggggggggggggggggttagtccagataggacagttctTCATTATATCAAATATGTATCGTATA-AAA-----CTA------GCAA-AAATT-TTT--GTG-CAGCTTTTTT-GC-ATAGGAATT---A------TCTTCAT-ATTACA--TTTTGATTCATT-----TTGAAGGGGGGGGGGGACTCCAAAA-------AC--TTAC-TTAATG-TACA-T-GAT--TG-T--TGCACGAAAGTTTG----CAG----TA--CACATCACAATTTCCTTCAA--CA-----------------TGT-T-----AAACT--TA-AGTA-----------------------C-A-------TACTGCATGTTA----T--CGT-GTAAA--TGC-AG-CTACTAGTA---TTTT---TTTAATACGC-AAAATTT-AGAT-GAGCACTTTGAT-ATATAATATAGTAACTGTTGTGTTACCCTATTTACACAGTGTAAAAAGAAG-------------TGATCTGATACACTG---------TATAAATATTGAAA--ATTGGTTTAGGAAAATTACTCTGTCGAATTG---------------------TTTTCAA--GTAT-TTCCCTAATTT-TT---AT-A---G---CTAAAG-TCCTTTCGA-GTA----ATACTTAATCATGGTGTTACGAATGGCCAG-AGTTAGTCTACGTCCTCCTTTAACGGGCTTC-AT-TGAA-AGA-AATAAA-------TGAAGA----TA--------AGA-T-TA--T--TAG----TAatgttt
gi|12 : CGTACCTCTTTAATGGGCTCCCATGCGAG-AGA-AAT-AA-------TGAGAACATGTA--------AGAAT-TA--CTACAAATG-TAGATTATTACCTTAGTTAGGCAATCTGCAGCGGT-ACGGTTTGCGTCGGAAGCCGCTTTG-AGGGG-TTGGT------TTGC-AG--TAATAATTTATTTGAGA----------A----CG-TTATTTAATGAGGTGT---ACGG-----TA-CGCTTCT-T-G-CCA-AGA---AC-GG-TTCG-C---T--TCTT-G-TT--C-GT---A-G------GT-TCGCT
gi|12 : TGCACGGT---ACAGGGTTGTT-CGCTTCT-TAG-TAC-GGT---AC-GT-TTCG-C---T--TCTTGG-TAC-CGGTTAAACG------GT-TCGTTgttcttgcacgtactgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttttgcacggtacagggttgttcgcttcttagtacggtacgtttcgcttcttggtaccggttaaacggttcgttcgtctttgcacgatacggttcggctatcagtttctgaggtgtagtaggcacggttctaggtca
gi|12 : cgtacctctttaatgggctcccatgcgagagaaataatgagaacatgtaagaattactacaaatgtagattattaccttagttaggcaatctgcagcggtacggtttgcgtcggaagccgctttgaggggttggtttgcagtaataatttatttgagaacgttatttaatgaggtgtacggtacgcttcttgccaagaacggttcgcttcttgttcgtaggttcgctgttcttgcacgtactgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttttACGGT---ACGT-----TT-CGCTTCT-T-GGTACCGGTTAAAC-GG-TTCG-T---TCGTCTTTG-CA--CGAT---ACG------GT-TCGcgtctttgcacgatacggttcggctatcagtttctgaggtgtagtaggcacggttctaggtca
gi|13 : cgtacctctttaatgggctcccatgcgagagaaataatgagaacatgtaagaattactacaaatgtagattattaccttagttaggcaatctgcagcggtacggtttgcgtcggaagccgctttgaggggttggtttgcagtaataatttatttgagaacgttatttaatgaggtgtacggtacgcttcttgccaagaacggttcgcttcttgttcgtaggttcgctgttcttgcacgtactgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttttgcacggtacagggttgttcgcttcttagtAATGTGCGTTTCTGTTTTTCGTAGTCTA-------CGATAAAATATTTCGCCAGTACTGTCATCATTGTACTCGCACTTTGTTCTATTTAGAACGATTGCTGTCAAAACAGG--ACAATTCATGATTGGACAC-TAACTCGGAACGAGTGCAAGTTTCGGTTTCAGTGTAATTAAGAATGATTACTATCAAAACATTTTAAGACACAAAGCCGGGAAGGTCAAAGTACAG---C---TAACTGCTCGTGCTGTGTCGTGAAGACATACCTCGTATGTGCAT--A-AT-TT----------TGTGTGgctatcagtttctgaggtgtagtaggcacggttctaggtca
gi|13 : CACGTACATGCATTTA-ATATTCAGA------TACGTGTACATTG---T--ACATGTTCTACATGTATGAATATAT-T-AT------TGTATTTGTTGG-T----A--GAAAAAAC-ATCACTTAATATTATACTCATATATGTgcaggagagacatattgaaaataaaaataagtaaactgatttaaaaaaaaaagtttcttccttatgcacattgtgcacgtacatgcatttaatattcagatacgtgtacattgtacatgttctacatgtatgaatatattattgtatttgttggtagaaaaaacatcacttaatattatactcatatatgt
gi|14 : aatgtgcgtttctgtttttcgtagtctacgataaaatatttcgccagtactgtcatcattgtactcgcactttgttctatttagaacgattgctgtcaaaacaggacaattcatgattggacactaactcggaacgagtgcaagtttcggtttcagtgtaattaagaatgattactatcaaaacattttaagacacaaagccgggaaggtcaaagtacagctaactgctcgtgctgtgtcgtgaagacatacctcgtatgtgcataattttgtgtggcaggagagacatattgaaaataaaaataagtaaactgatttaaaaaaaaaagtttcttccttatgcacattgtgCGTCCTCCTTTAACGG-CTCC-AT-AGAGTAGA-AATTAAAGTATAGTGAAAA----TACATCGTGAAGA-TATA--CTACAAATGTTGA--TATTAC-TTA-TTAGGCATACTGCC-CGGTAACGGTTCGGTTCGGA----GCTTTG-AGGGCTGTGG-------TTGCGA---TA--------------ATTTATTTGAGA----AGTTTCT---ATGAG-GGTGTAACGGA----TTATGCTTCT-T-G--AC--GT---AC-GG-TTCG-C---T--T-TT-G-TA--CGGT---ACG---------TTGCTTCT
gi|15 : ACGCATTGCGCATGTACAT--GCAT-TTAATATACAGATACGTGTACATTG---T--ACATGATCTACATGTATGAATATAT-T-AT------TGTCTTTGTTTG-T----TAAAAAAAAAC-ATCG-TTAATATTATATTCATGTATTTTTTAAA-----------GATCT---ACACATATGCACAtagtgcggtagagtggttgtacgctttcagttggcagtaagttcgcttttggcgctcggtacggatttaggtgttctggcagggtatcgggtcgttctgatgcaagtacggtcgttgttgcggggatacgtgttgttttcttgcacagagtcgagttcggcttctgtagggtttcgtttcttgtgcgatcgtgttatggttgtcggttttcgtttctgcaggtggttagcagg
gi|15 : gaaaataaaaataaatacactgatttaaaaacaattgattttcttccttatAAAT-GGCTTCAAT----ACAGTA--CACGATC-----CACGGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaatggcttcaatacagtacacgatccacggcta
gi|16 : gaaaataaaaataaatacactgatttaaaaacaattgattttcttccttatacgcattgcgcatgtacatgcatttaatatacagatacgtgtacattgtacatgatctacatgtatgaatatattattgtctttgtttgttaaaaaaaaacatcgttaatattatattcatgtattttttaaagatctacacatatgcacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnA-CTGGCA--TG-TGCCACTGT-GGC-AG--GTGAACCCC-----A-GACAATGTT-TTCTCA-CT------AA-CN-A-cta
gi|16 : A-CTGGCA--TG-TGCCACTGT-GGC-AG--GTGAA-CCCG----A-GACAATGTT-TCCTCA-CA------AA-CT-A-ATctggcatgtgccactgtggcaggtgaacccgagacaatgtttcctcacaaactaatgcgtttactgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtaacccaccctctactcgaagcgatcaatcgtggcacgcaatattgaagataattccactgttgttgaagaataaatcatcgtatcggaaagcatttatagcttaagagaaaaataccttaacgagatctacaaaaagcatttaagaagtgataatcatgacaatatttcaccatatcaactatc
gi|16 : actggcatgtgccactgtggcaggtgaaccccagacaatgttttctcactaacnATGTAACC-CACCCTC-TACT----CG-AAGCG-AT-CAAT-----CGTGGCACGCAATATT---G---AAGA-------T----AATTCCAC-T---GTTGT-T-GAAGAATA-AATCATCGTATCGGAAAGCATTTAT---A----G------------------CTTAAG-AGAAAAATACCT----TAA----CGAGATC-T-ACAAAAAGCAT-TTAA-GAA--------GTGATAATCAT-----GA---------C---------AAT-------AT-TTCACCATATCAACTAT----Cgcgtttactgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtaacccaccctctactcgaagcgatcaatcgtggcacgcaatattgaagataattccactgttgttgaagaataaatcatcgtatcggaaagcatttatagcttaagagaaaaataccttaacgagatctacaaaaagcatttaagaagtgataatcatgacaatatttcaccatatcaactatc
gi|17 : actggcatgtgccactgtggcaggtgaaccccagacaatgttttctcactaacnactggcatgtgccactgtggcaggtgaacccgagacaatgtttcctcacaaactaatgcgtttactgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn----------TACGTGTACATTG---T--ACATGACCTACATGTATGAATATAT-C-ATAATGATTGTCTTTGTTGG-T----T--AAAAAAGC-ATCGCT-GATATTATATTCATGTATGTTTTACA-----------GATCT---ACACATATGCACTTAAAGCATCGATAAC---AGAAAA--AGTA-GTAA-----CATATAAATA----CAT---GTAAATTGACGTTTACAT-TTAAA-CTGGCA--CG-TGCCGCTGT-GGC-AG--GTGAA-CCCC----A-GACAATGTC-TTCTTA-CA------AA-CT-A-ACCCACC-CCTAA-GCCCTGGGAAATAA-CACACACAACCAAAT-CA---AAA--CCA-C-G--A----CAGGGGTAAAAT-GGCTTCAAT----GCAGTA--------------CACGGTTCTAA--TTAACCCTTA-ATT--GCACCACACATG
gi|18 : taatatacagaATGAACGCTATGCAAATTAAGTGGACGTACACATGTAGCTTTGTTTCATTGAC----AGTCGACTATT-CATTTTATTTAATTTCATTCAATGTATAGACGTATTTAATTTCATGTTGAATTAAATTTTT----GTGTATTTTCGTGTCTGGAAGAAA--------------TCCAACACGAAT--TTTATTTTCAGAAAATCTTTATTTCAGTGTTAGAAATGTGCATTTCTGTT
gi|19 : GTTG-TTTT-AAACCCGTAA-TTC-CTTTCAA--GTAT-TTCCTTAA-TTCTT---ATGG---G---TGAAAG-TCCTGTTGA-GTA----ATACTTAATAATGGTGTTACGAATGACCAA-AGTTAACCTCCGACCTCCTTTAACGGGCTCC-AT-CGAG-AGA-AATAAA-------TGATTA----TA--------ACA-T-TA--T---------TAG--TATTACCTTA-TTAGGTATACTGCA-CGGT-A
gi|2 : GTGTTCATTGACTTGAACATGATCTACATGTACGGATATATATGAT------TGTATTTGTTGG-TAAAAC--AAAAATAC-ATCGCTTCATATCATATCCATGTATGTTTCACATATTTTAAATAAATCT---ACACATATGCACAAAAAGCATCGATAAC---AGGAAA--AGTA-GT-------T-TATAAGTA----CAT---GTAAAGTGACGCTTATAT-TTAAA-CTG-CA--CG-TGCCGTTGT-GGC-AG--GTGAA-CCT-----A-AGCAATGTC-TTCTTA-CATGTACAAA-CT-A-ATCCACC-TC-AA-GCCCCGAAAAATAAACGCACACAGCCACCT-CA---AAA--TCA-T-G--A----CAGGGGTAAAAT-TGTTTCAAT----TCAGTA--CATGATCTGATCCACGGTCCTAA------CCCTTA-ACT--GCATTACACATGTAACC-CACTCTC-TACT----CG-AAGCG-AT-CAAC-----C-----TCGCAAGATT---G---AAGA---------------TTCAC-TA-TGCTGT-T-ACAGAATA-AATCATCATATCCGAAAGCATTTATTATA----G------------------ATTAAG-AGAAAAATACCT----TAA----CAGGATC-T-ACAACAAGCAT-TGAA-GAA--------G---------T-----GA---------TAATCAAGGAAAT-------AT-TTCATTATATCAAATAT----CGTATA-AAA-----CTA------GACA-AATTACTTT--GTG-CGGC-TTTTTTGC-ACAGGAATT---A--CC-TTCTTCAT-ATTACA--TTTTATTTCATT-----TCGAAAGGGAAAAACTCC---AAAA-------AC--TTAC-TTACTC-TACA-T-GAT--TG-T--TGCACGACATTACG----TAG----TG--CACC-----ATATCCTTCAA--CATGT--------TATTAATGTGT-----AAAATAATCAAACATTGTTCACTT--G---A-----TC-AAATAA-TTACTGCATAT------TATCGT-GTAAA--TGC-AG-CTACTAGTA---TTTT---TTTAATA-GCTAAATTGT-AAAT-GAGCACTTTCATCGAATAATATAGTATT-GTTGTGTTACCCTATTGACACAGTGTAAAAAAAAAGAAGAAAAGTTAATGATCTGATACATTG---------TATAAATATTGACAACATTGGGTTAGGAAAATTACTCTGTCGAGTTG-TTGT--AACCAGTAT-TTCTTTTTCAA--ATAT-TTCCCTAG-TT-TT---AACA---GC--TCAAAG-TCCTTTCGA-GTAGTATATACTTAATAATGGTGTTACGAATTCCAAG-AG-TAAACTACGTCCTACTTAAACGGGCTTC-AA-CGAG-AGA-AATAAA-------TGAAGA----TA--------ATA-T-TA--T--
gi|20 : T---AC-GG-T-CG-C---T--TCTT-G-CA--CGGT---ACG------GT-TCGCTTCT
gi|20 : -TTCT----TGCACGGT---ACGG-----TT-CGCTTCTGC-G-CGT-GGT---AC-GGCTTCG-TGTAT--TCTT-G-CA--CGGT---AAG------GTATCGCTgcgcgtggtacggcttcgtgtattcttgcacggtaaggtatcgctctgtacgtaacggttgcgctcttgtacgtacgggttcgttttcttgccacccggtacgttcgacgttcgtttctgaggtgtacggtagccacggtttagatc
gi|20 : tacggtcgcTGCA-CGGT-ACGGTTCGCTTCTG----CGCGTGGTACGGC-TTCGTGTATTCTTGC-ACGGTA--------------A----------GGTATCG-CTCT---GT--ACGTA---ACGG-----TTGCGC-TCT-T-G-TAC--GT---ACGGG-TTCGTT---T--TCTT-GCCACCCGGT---ACGTTCGACGT-TCGTTTCTctgtacgtaacggttgcgctcttgtacgtacgggttcgttttcttgccacccggtacgttcgacgttcgtttctgaggtgtacggtagccacggtttagatc
gi|21 : tacggtcgcttctGATAACTCTGGGAAACAAGTTTGTAA-----TAAATAAATAGTCACATTGCATATATTGACGTTTACAT-TTAAACCTTGCA--CGTTGCCATTG--GGCAAG--GTGAA-CTC-----gaggtgtacggtagccacggtttagatc
gi|22 : agaaaatcatcaaacatcataatgacaatcccatattcggaagaaaaagtcagtccgATGTCCAAAAAATCTTTATTTCAATTTTTGAAACCTGTGTTTCTGTTATGTGTTGTCCAT--TTATAGATAACAAATTTAGCCAGTACCGTAATCG----------ACCCCATT-TAT--AT-ACAAT--------------G--AC----CATATTTAGACACTTAACTCG
gi|23 : AACC-CACCCTC-AACT----CG-AAGCG-AA-CAAT-----C-----ACGCACGATT---G---AAGAAAGAT-ATCGAGAACTTCAC-TC-TGCTG---------------CCACCGTATC--------T------TA----G------------------ATGAAA-AGAATAATACCTTAAATAA----CGGGACT-T-ACAA
gi|24 : acATTAAGTGGACGTAC--------CTTTGTTTGATTGACGTCAAGTCGACTATC-CATTTTATTTAATTTCATTTAATGT--AGAAGTATTTAATTTTATGCTGAATTACATTTTT----GTATATTTTCGTG
gi|25 : GTAAATGTATTAAATTTTGTGTTGGATTAAATTTT-----GC-TATTTTCATGTCTGGAAGAAAAGAACAAAATTAAATCCAAAACAAATTCTTTA-TTTCAG--AATCTTT
gi|26 : TATACATGTAT-T-AT------TGTATTTCTTGGTT----T--AAAAAAAC-A-CGCTTTATATTAT----ATGCATGTTTTACA-----------GATCT---A--------CACATAAAGCATCGATAAC---AGGAAA--AGTA-Gtt
gi|27 : -----AAATAAATC-A---TTGTTCACTTTCA---AAAAAGTC-AAATTA-TCAATGCATGT------TATCGT-GTAAAACTGTGAGCCTACTCGTA-------------AACG-GC-ACATTGTAAAAT-GA
gi|29 : aAATTGT-AAAT-GAGCACTTTGATAATATAATACAATATC-GTTGTGTTACCCATTTTACACACCGTAAAAAGAAAT--GAAAAGTagc
gi|3 : -GGCTTCAAT----TCAGTA--TACGATC-----CACGGTCCTGA--TTAACACTTA-ATT--GCATCACACATGTAACC-CTCCCTT-TACT----CG-AAGCG-AT-CAAC-----C-----ACG---------------AGAA---T-ATCGAGAATTCCAC-TC-TGCTGT-T-GAAGAATA-AATCATAGTATCGGAAAGCATTTATTATA----A------------------ATTAAG-AGAAAAATATCT----TAA----CGACATC-T-ACAAAAAGCAT-TGAA-GAA--------G---------T-----GATAATCATGGC---------AAT-------AT-TTCATCATATCAAATAT----CGTATA-AAA-----CTA------ACCA-AATTTGTTT--GTG-TGG---TTTTTGC-ATAGAAATT---A--CC-TTCTTCAT-ATTAAA--TGTTATTTCATT-----TTGAAGGGGGA----------AAAATCCCAAAAC--TTAC-TTAATC-CACA-T-GAT--TG-T--TGCACGAAATTATG----CAG----CA--CACA-----ATTTCCTTCAA--CATAT--------TATTAATGTGT-----AAACTAATC-AGTATTTTTCACTT--A---A-----TC-AAATTA-TTACTGCATG----------CGT-GTGAA--TGC-AG-TTACTCGTA---TTTTTTTTTTAATACGC-AAATTGT-AAAC-GAGCACTTTGATCATATAATATAATATC-GTTGTGTTATCCTATTTACACACTGTAAAAAGAAGT--GAAAAGTTAATGATCTGATACATTG---------TATAAATATTGATA--ATTGGTTTAGGAAAATTACTCTGTCGAGTTG-TTTTTAAACTCGTAC-TTC-TTTTCAA--GTAT-TTCCCTAT-CT-TTCACA--C---C---TAGAAG-TCCTTTCCA-GTA----ATACATAATCACCGTGTTACAAATGGCCAG-AGTTATTCTACATCCTCCTTGAACGGGCTTC-AT-CGAG-AGA-AATTAA-------TGAAGA----TA--------GGA-T-T-------AA----TAG--TATTACCTTA-TTAGGCATAGTGCG-CGGT-ACGGTTCGGTTCGGAA--TGCTTTG-AGGGC-GTGGT------TTGC-A---TA--------------A----------A----CG-TTCT---ATGAACTGT---AAGG-----TT-CGTTGCT-A-G-CAA-GGT---AC-GG-TGCG-C---T--TCTT-G-CG--CGGT---ACG------GT-TC
gi|30 : TTTAAACCCGTAA-TTA-TTTTCAA--GTAT-TTCCCTAA-TT-GT---A--ATGGG---TGAAAG-TTCTGTTGA-GTA----ATACTTGATTAcgcgatatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaacgtttctgaggtgtagtagcacggtttaggatctg
gi|31 : ttggTTTAAACACGTAAATTA-TTTTCAAAAGTATGTCCCCTAA-TT-GT---A--ATGGG---TGAAAGTTTCTGTTGAGGTA----ATATT
gi|32 : ttggT--GCATCACA------ACC-CACCCTC-TACT----CG-AAGCG-TA-CAAC-----C-----ACGCACGATT---G---AAGAAAGA
gi|34 : ATTGT-AAAT-GAGCACTTTGATAATATAATATAATATC-GGTGTGTTACCCT
gi|35 : GTAACC-CACCCTC-TACT----CG-AAGCG-AT-CAACCGTGGC-----GCGCAAGATT---G---AA
gi|4 : TA----CAT---GTAAATTGACGTTTACATCTTAAA-CTGGCAAGCG-CGCCGTTGTTGGC-AG--GTGAC-CCC-----AAGACAATGTC-TCTAAA-CA------AA-GT-ATATTC----------------GAAAATAA-CGCACACAACCAACT-CA---AAA--TCAAT-G--A----CAGGGGTAAAAT-GGCTTCAAT----TCAGTAAACACGATC-----CACG-TCCTAA-----ACC-TTA-ATT--GCATCACA------ACC--ACCCTCGTACTAGTACG-AAGCG-AAACAAC-----C-----ACGCACGATT---G---AAGAAAGAT-GTCGAGAATTTCAC-TC-TGCTGT-TCGAAGAATACAACCATCGTATC------------TT-TA----G------------------ATTAAG-AAACTAATACCT----TAAATAACGGGACC-TTACAAAAAGCATCTGAA-GAA--------G---------T-----GA---------T---------AATCATGACAATATTAATTTTATCAAATAT----CGTATGCAAA-----CTA------GCCA-A-TTTGTTTTGGTGGCGGTTTTTTTTGC-A-----ACTGTAA--CCATTCTTCAT-ATTACA--TTT-GTTTCATT-----TTGAAGGGGGG----------AA--------------TAC-TTACGC-TACA-T-AATAATG-T--TGCACGAA-TTATG----CAG----TT--CATA-----ATCTCCTTCAA--CATGTTGCATG--TATTAATGTGT-----AAAATAATCAAACATTGTTCACTTTCA---AAAT--TC-AAATTACTCAATGCATGTT-------TCGT-GTAAA--TGT-AG-CTACTCG-A-------------AATACGC-ACATTGT-AAATCGAGC
gi|5 : tnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgACCACCTAAAGCCCCGGGAAATAA-CGCACACAACCAAAT-------GA--TCA-T-G--AAAACCAGGGGTAAAAT-GGCTTCAAT----TCAGTA--CACGATC-----CACGGTCCTAA--TTAACCCTTA-ATT--GCATCACACATGTAACC-CACCCTC-TACT----CG-AAGCG-A------------------CG----------G---AAGAAAGAT-ATCGAGAATTCCAC-TC-TGCTAT-T-GAAGAATA-AATCATCGTATCGAAAAGCATTTATTATA----G------------------ATTAAG-AGAAAAA----------------------------AAAAAGCAT-TGAA-GAA--------G---------T-----GATAATCATGAC---------AAT-------AT-TTCATCATATCAA-TAT----CGTATA-AAA-----CTA------GCC-------GTTT--GTG-CGGCTTTTTT-GC-ATAGGAATT---A--CC-CTCTTGGT-ATTACACATGTTGTTTCATT-----TTGAAGGGGGG----------AAAACCAAAA-AC--TTAC-TTAATC-TACA-T-GAC--TG-T--TGCACGAAATTATG----CAG----CA--CACA-----ATTTCCTTCAA--CATGT--------TATTAATGTGT-----AAATTAATC-AGTATTGTTCACTT--G---G-----TC-AAATTA-TTACTGCATGTTACGTGTATCAT-GTAAA--TGC-AG-CTACTCGTAT--TTTT---TTTAATACGC-AAATTGT-AAAT-GAGCACTTTGATCATATAATATGATATC-GT--TGTTACCCTATTTACACACTGTAAAAAGAAGT--GAAAAGTTTATGATCTGATACATTGTATCTACATTATAAATATTGATA--ATTGGTTTAAGAAAATTACTCTGTCGAGTTG-TATTTAAACCTGTAC-TTC-TTTTCAA--GTAT-TTCCCTAA-TT-TT---
gi|6 : A----CAT---G-AAATTGACGGTTACATGTTAAA-CTG-CA--CG-CGCGTTTTT-TGC-AGAAG-GAA-CCTCTCTAA-GACAATGTCCTTCTTAACA------AAGTT-A-AT--ATC-GAAAA-A----GTGAGATAA-CGCACACAACCACCTTCATATGAA--TCA-T-AGTA----CAGGGGTAAAAT-CGC-TCAA-----TCAGTA--CAC-ATC-----CAC-GTTCTAAACTTAATCCTTGCATT--TCATAAC------AACCTCACCCTC--AC-----CG-AAGCGAAA-CAAC-----C-----ATGCTAGATTTAAGTTTAAGAAAGA--ATCGAGAATTTCACTTC-TGCTGTGT-GTAAAATA-AACCATC----C---AAAC-----TTAGA----G------------------ATCA-----AATAATACCT----TAATACGCGGAACCTT-ACAAAAAGCAT-TGAA-GAATG------A---------TAATCAGA---------C---------AAT-------AT-TAATTTATGCAAAAT-T----TGTATA-AGAAAATCTTATCCCGCGCCAGAATTTGTTT--GTGTCGGC--ATGTTGCAATAA--------A--CC-TTTTCTATCATTACA--TTTTGTTCAATCCATAATTGAA---GGG----------AAAT-------ACAATTAC-C--GTCTTACATT-GAA--TG-TTATGCACGAAATTA-GTCCCCAGTCTATGTTCACA-----ATCCCCCTCAAACTATGT--------
gi|7 : atcaattcagtcattgtttcatcgtttggtcccattaaatattcataaatcgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggtaagcctta----------TACGTATACATTG---A--ACGTGATCTATATGTATGAATATAT-G-AT------TGTATTTGTTCG-T-------AAAAAAAA-ATCGCTTAATATCATATTCATGTACGTTTTACA-----------AATTTGAAACAAATCTACACAAAAAGCATCGATAAT---GGGAAA--AGCA-GTA------TATATAT-TA----CAT---GTAAATTGACGCTTATAT-TTAAA-CTGGCA--AG-TGCCGTTGT-GGC-AG--GTTAA-TTCT----A-GACTAAGTC-TTCTTT-CA------AA-CCCA-ATCCACC-CCTAA-TCCCCAAAAAATAA-CGCACACAACCACCT-CA---AAA--CCA-C-G--A----CAGGGGTAAAAT-GGCTTCAATATAATCAGTA--CATGATC-----CACGGACC------TAACCCTTA-ATT--GCATTACACATGTAACC-CACCCTC-TACC----CG-AAGCG-AT-CAAC-----C-----ATGCAAGATT---G---AAGAAAGAT-ATCGAGAATTTCAC-TC-TGCTGT-T-GAAGAATA-AATCATCGTATCGGAAAGCATTTATTATACAATGTACATTATGTACATGTACATTAAG-AGAAAAATACCT----TAA----CGGGACC-T-ACAAAAAGCAT-TGGA-GAA--------G---------T-----GA---------T---------AAT-------gtctagtccatgtatc
gi|8 : taccccgtcagtgcattgttttgtgtggcaggatagacttatgttgaaaataaaaataaatacactgatttttttccttatacacatagtgcatgcacatgcatttaatatacagaCATGTTA----T--CGT-GTAAA--TGC-AC-CTACTCGTA---TTTT---TTTAATACGC-AAACTGT-AAAT-GATCACTTTGATCATATAATATAATATC-GTTGTGTTACCCTATTTACACATTGTAAA--GAAGT--GAAAAGTTAATGATCTGATACATTG---------TATAAATATTGATA--ATTGGTTTAGGAAAATTACTCTGTCGAGTTG-TGTTTAAACCCGTAC-CTC-TTTTCAA--GTAT-TTCCCTAA-TT-TT---T--A---GGGCTGAAAG-TCCTATCGA-GCA----ATACTTAATCACGGTGTTACAAATGGCCAGAAGTTATTCTACGTCCTCCTTTAACGGGCTTC-AT-CGAG-AGAGAATTAA-------TGAAGA----TA--------AGA-T-T-------AA----TAG--TATTACCTTA-TTAGGCATACTGCA-CGGT-ACGGTTCGGTTCGGAA--CGCTTTG-AGGG--TTGGT------TTGC-A---TA--------------A----------A----CG-CTCT---ATGAACcatga
gi|9 : AAT-CA---AAGATTCA-CTG--A----CAGGGGTAAAAT-GGCTTCAAT----TCAGTA--CACGATC-----CACGGTCCTAA-----ACC-TTA-ATTTTGCATCACA-----AACC-CACCCTC-TACT----CGGAAGCG-AA-CAAA-----C-----ACGCACGATT---G---AAGAAAGATGATCGAGAATTTCAC-TCATGCGGGGT-GGAGAATA-A-CCATCGTAT------------ATTA------G------------------ATTAAGGAGAATAATACCT----TAAATAATGGGACC-T-ACAAAAAGCAT-TGAAAGAATGATAATCA---------T-----GA---------C---------AAT-------AT-TTAAATTTATCAAATAT----CGTATA-AAAA----CTA------GCTC-TATATATTT--GCG-C---TTTATTTGC-AT-----TT---AAACC-TTCTTCATAATTA-A--TTTTGTTTCATT-----TTGAAGAAGGG----------GAA-------------TACGTTACGC-TACA-TGGAA--TGCT--TGCACGAAATCATG----CAG----T---CACA-----ATCTCCTTCAA--CATGCTTACAATGTATTAATGTGTTAAAAAAATCAAAC-ATTGTT-TTCACTTTCGAAAA-----TCAAAATTA-TCCATGCATGT------TATCGTGGGAAA--TGT-AG-CTACTCGTA-------------AA-ACGC-ACATT-T-AAAT-GAGCtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtacatttcttaggtgtagtagcacggtttagggtctg
6 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|28 ): TTAACGATTTTGTCGTTAACATCTACGTTCAATGAAATACTAGCATTGTCATCTAAAATAATCAATTGAGCACTATTATTCTGTATTTAAAA
Unaligned ( gi|33 ): CACGGTATGGTTCGGTACGTTTCTGAGGTGTAGTAGCACTGTTTAGGGTCT
Unaligned ( gi|36 ): ATACACTCATCCATTTGTTTTTACTGAAAAAACCTCA
Unaligned ( gi|37 ): ACGTTTCTGAGGTGTAGTAGCACAGTTTAGGGTCTGT
Unaligned ( gi|38 ): ACACTTCTGAGGTGTAGTAGTACGGTTTAGGGTCTGT
Unaligned ( gi|39 ): CGTTTCTAGGTGTAGTAGCACGGTTTAGGGTCT
Alignments
lowQualScore : 333333333 2222 1 22 22222 222222 11 444444 1 1 11 44444444444444444 1 3333333 2222 1 4444444444 111111 111111 1111111 22222222222 111 1111 333333 1111 1 22222 111111 111 111 22222222222222222222222 2222 777777777777777777777777777777777777777777777 1111111 11111 111111 1 1 11111 5555555555555555555555555 1111 22222222 11111 33333333 11111 1 444444444444 33333333 2222222222 222222222 55555555555555 1111 1111111 1111 11111111 4444444444444 111 111 111111 66666666666666666666666666666666666 1111 11111 1 111111 11 111111
lowQualScore : 1 222222222 8888 3 22 0 3 44444 6 666666 7 88 3 3 7 777777 6 88 2 3 88 7 66666666666666666 7 3 1 1 1 1 2222222 1 2 1111 0 3333333333 666666 555 444444 5 9999999 5 77777777777 000 0 1111 77 5 222222 1 0000 888 0 4 55 4 4 4 55 4 66666 4 4 4 222222 4 4 4 6666 555 5 1 4 777 66 666 66 9999 3 7777 55 99999 333 4 55 5 3 3 6666 3 3 77 77777 77777 2 555 555 3 3 3 7 3 3 555 2 2 77777777777777777777777 3 0 7777 3333 0 3 3 4 4 000000000000000000000000000000000000000000000 3333333 4 8888 4 55555 444444 55 0 4 66 0 77 3 5 0 4 888 66 5 0 66 22222 4 3333333333333333333333333 5 1 5 5 5 66 5 66 0000 44444444 22222 1 66 22222222 22222 1 0 3 2 999999999999 5 5 00000000 4 66 4 4 4444444444 1 4 3 3 2 5 1 999 666666666 99 5 1 4 77 4 66 4 4 4 00000000000000 1 5 1 5 0000 6 1 5 5 5 5 5 6666666 0000 88888888 5 5 6666666666666 99 6 5 5 6 222 6 000 999999 6 77777777777777777777777777777777777 5 0000 888 77777 0 666 000000 777 4 4 99999 66 8 4 00 777 222222 4
lowQualScore : . ......... .... . .. . . ..... . ...... . .. . . . ...... . .. . . .. . ................. . . . . . . ....... . . .... . .......... ...... ... ...... . ....... . ........... ... . .... .. . ...... . .... ... . . .. . . . .. . ..... . . . ...... . . . .... ... . . . ... .. ... .. .... . .... .. ..... ... . .. . . . .... . . .. ..... ..... . ... ... . . . . . . ... . . ....................... . . .... .... . . . . . ............................................. ....... . .... . ..... ...... .. . . .. . .. . . . . ... .. . . .. ..... . ......................... . . . . . .. . .. .... ........ ..... . .. ........ ..... . . . . ............ . . ........ . .. . . .......... . . . . . . . ... ......... .. . . . .. . .. . . . .............. . . . . .... . . . . . . . ....... .... ........ . . ............. .. . . . . ... . ... ...... . ................................... . .... ... ..... . ... ...... ... . . ..... .. . . .. ... ...... .
lowQualScore : 0 000000000 3333 3 00 2 2 55555 5 000000 3 33 2 2 3 777777 7 00 0 3 33 3 00000000000000000 3 3 0 0 0 0 0000000 0 0 8888 0 3333333333 222222 999 444444 0 8888888 0 11111111111 000 7 4444 99 7 555555 7 6666 888 0 0 55 0 0 0 55 0 00000 4 4 4 888888 4 4 4 0000 888 0 7 4 888 11 000 11 4444 6 7777 00 11111 666 0 00 9 1 1 5555 1 1 88 77777 77777 1 444 444 6 6 6 3 6 6 222 0 0 55555555555555555555555 6 5 7777 2222 4 6 6 0 0 000000000000000000000000000000000000000000000 0000000 4 5555 4 66666 444444 11 1 5 99 0 66 2 0 1 5 888 99 0 0 99 55555 5 2222222222222222222222222 0 0 0 0 0 99 0 99 6666 99999999 55555 1 99 55555555 55555 2 0 4 5 111111111111 0 0 11111111 4 11 4 4 3333333333 1 4 6 6 5 0 4 333 777777777 22 7 6 6 33 4 11 4 4 4 33333333333333 4 0 0 0 6666 7 0 0 0 0 0 9 2222222 6666 11111111 0 0 6666666666666 22 7 7 7 7 333 7 222 222222 7 33333333333333333333333333333333333 7 1111 888 55555 0 111 999999 888 4 4 33333 11 9 4 66 888 888888 4
consensus : NNNNNNNNNNNNATGAACNCTATGCAAATTAAGTGGACGTACA---GTAGCTTTGTTTGATTGAC----AGTCGACTATT-CATTTTATTTAATTTCATTTAATGTGTAGACGTATTTAATTTCATGTTGAATTAAATTTTT----GTGTATTTTCGTGTCTGGAAGAAAAG--CGAAATTAAATCCAACACGAAT--TTTATTTTCAGAAAATCTTTATTTCAGTGTTAGAAATGTGCGTTTCTGTTATTCGTAGTCTAT--C--TCGATAAAATATTTCGCCAGTACCGTCATCGTTGTACTCGCACTTCGTT-TAT--AGAACGATTGCTG-CAAAA---G--ACAATTCATAATTAGACAC-TAACTCGGNACGNGTGCAAGTTTCGGNTTCAGTGTAATTAAGAATGATTACTATCAAAACATNTTGAGACACAAAGCCGGGAAGGTCGGAGTACAGGTACATGTAACTGCTCGTGCTGTGTCGTGGAGACGTACCNCGTACGTGCAT--G-AT-TT----------TACGTGTACATTG---T--ACATGATCTACATGTATGAATATAT-T-AT------TGTATTTGTTGG-T----T--AAAAAAAC-ATCGCTTAATATTATATTCATGTATGTTTTACA-----------GATCT---ACACATATGCACATAAAGCATCGATAAC---GGGAAA--AGTA-GTA------TATATAAATA----CAT---GTAAATTGACGTTTACAT-TTAAA-CTGGCA--CG-TGCCGCTGT-GGC-AG--GTGAA-CCC-----A-GACAATGTC-TTCTTA-CA------AA-CT-A-ATCCACC-CCTAA-GCCCCGGGAAATAA-CGCACACAACCAAAT-CA---AAA--CCA-C-G--A----CAGGGGTAAAAT-GGCTTCAAT----TCAGTA--CACGATC-----CACGGTCCTAA--TTAACCCTTA-ATT--GCATCACACATGTAACC-CACCCTC-TACT----CG-AAGCG-AT-CAAC-----C-----ACGCAAGATT---G---AAGAAAGAT-ATCGAGAATTCCAC-TC-TGCTGT-T-GAAGAATA-AATCATCGTATCGGAAAGCATTTATTATA----G------------------ATTAAG-AGAAAAATACCT----TAA----CGGGACC-T-ACAAAAAGCAT-TGAA-GAA--------G---------T-----GA---------C---------AAT-------AT-TTCATTATATCAAATAT----CGTATA-AAA-----CTA------GCCA-AATTTGTTT--GTG-CGGCTTTTTTTGC-ATAGGAATT---A--CC-TTCTTCAT-ATTACA--TTTTGTTTCATT-----TTGAAGGGGGG----------AAAA-------AC--TTAC-TTANTC-TACA-T-GAT--TG-T--TGCACGAAATTATG----CAG----CG--CACA-----ATCTCCTTCAA--CATGT--------TATTAATGTGT-----AAATTAATC-AGTATTGTTCACTTTCG---A-----TC-AAATTA-TTACTGCATGTTA----TATCGT-GTAAA--TGC-AG-CTACTCGTA---TTTT---TTTAATACGC-AAATTGT-AAAT-GAGCACTTTGATCATATAATATAATATC-GTTGTGTTACCCTATTTACACACCGTAAAAAGAAGT--GAAAAGTTAATGATCTGATACATTG---------TATAAATATTGATA--ATTGGTTTAGGAAAATTACTCTGTCGAGTTG-TTTTTAAACCCGTAC-TTC-TTTTCAA--GTAT-TTCCCTAA-TT-TT---A--A---G---TGAAAG-TCCTNTCGA-GTA----ATACTTAATCACGGTGTTACGAATGGCCAG-AGTTANTCTACGTCCTCCTTTAACGGGCTTC-AT-CGAG-AGA-AATNAA-------TGAAGA----TA--------AGA-T-TA--T--CAA----TAG--TATTACCTTA-TTAGGCATACTGCA-CGGT-ACGGTTCGGTTCGGAA--CGCTTTG-AGGGC-NTGGT------TTGC-A---TA--------------A----------A----CG-TTCT---ATGAACGGT---ACGG-----TT-CGCTTCT-T-G-CAC-GGT---AC-GG-TTCG-C---T--TCTT-G-CA--CGGT---ACG------GT-TCGCTTCT
Reference ( family-203 ) : NNNNNNNNNNNNATGAACNCTATGCAAATTAAGTGGACGTACA---GTAGCTTTGTTTGATTGAC----AGTCGACTATT-CATTTTATTTAATTTCATTTAATGTGTAGACGTATTTAATTTCATGTTGAATTAAATTTTT----GTGTATTTTCGTGTCTGGAAGAAAAG--CGAAATTAAATCCAACACGAAT--TTTATTTTCAGAAAATCTTTATTTCAGTGTTAGAAATGTGCGTTTCTGTTATTCGTAGTCTAT--C--TCGATAAAATATTTCGCCAGTACCGTCATCGTTGTACTCGCACTTCGTT-TAT--AGAACGATTGCTG-CAAAA---G--ACAATTCATAATTAGACAC-TAACTCGGNACGNGTGCAAGTTTCGGNTTCAGTGTAATTAAGAATGATTACTATCAAAACATNTTGAGACACAAAGCCGGGAAGGTCGGAGTACAGGTACATGTAACTGCTCGTGCTGTGTCGTGGAGACGTACCNCGTACGTGCAT--G-AT-TT----------TACGTGTACATTG---T--ACATGATCTACATGTATGAATATAT-T-AT------TGTATTTGTTGG-T----T--AAAAAAAC-ATCGCTTAATATTATATTCATGTATGTTTTACA-----------GATCT---ACACATATGCACATAAAGCATCGATAAC---GGGAAA--AGTA-GTA------TATATAAATA----CAT---GTAAATTGACGTTTACAT-TTAAA-CTGGCA--CG-TGCCGCTGT-GGC-AG--GTGAA-CCC-----A-GACAATGTC-TTCTTA-CA------AA-CT-A-ATCCACC-CCTAA-GCCCCGGGAAATAA-CGCACACAACCAAAT-CA---AAA--CCA-C-G--A----CAGGGGTAAAAT-GGCTTCAAT----TCAGTA--CACGATC-----CACGGTCCTAA--TTAACCCTTA-ATT--GCATCACACATGTAACC-CACCCTC-TACT----CG-AAGCG-AT-CAAC-----C-----ACGCAAGATT---G---AAGAAAGAT-ATCGAGAATTCCAC-TC-TGCTGT-T-GAAGAATA-AATCATCGTATCGGAAAGCATTTATTATA----G------------------ATTAAG-AGAAAAATACCT----TAA----CGGGACC-T-ACAAAAAGCAT-TGAA-GAA--------G---------T-----GA---------C---------AAT-------AT-TTCATTATATCAAATAT----CGTATA-AAA-----CTA------GCCA-AATTTGTTT--GTG-CGGCTTTTTTTGC-ATAGGAATT---A--CC-TTCTTCAT-ATTACA--TTTTGTTTCATT-----TTGAAGGGGGG----------AAAA-------AC--TTAC-TTANTC-TACA-T-GAT--TG-T--TGCACGAAATTATG----CAG----CG--CACA-----ATCTCCTTCAA--CATGT--------TATTAATGTGT-----AAATTAATC-AGTATTGTTCACTTTCG---A-----TC-AAATTA-TTACTGCATGTTA----TATCGT-GTAAA--TGC-AG-CTACTCGTA---TTTT---TTTAATACGC-AAATTGT-AAAT-GAGCACTTTGATCATATAATATAATATC-GTTGTGTTACCCTATTTACACACCGTAAAAAGAAGT--GAAAAGTTAATGATCTGATACATTG---------TATAAATATTGATA--ATTGGTTTAGGAAAATTACTCTGTCGAGTTG-TTTTTAAACCCGTAC-TTC-TTTTCAA--GTAT-TTCCCTAA-TT-TT---A--A---G---TGAAAG-TCCTNTCGA-GTA----ATACTTAATCACGGTGTTACGAATGGCCAG-AGTTANTCTACGTCCTCCTTTAACGGGCTTC-AT-CGAG-AGA-AATNAA-------TGAAGA----TA--------AGA-T-TA--T--CAA----TAG--TATTACCTTA-TTAGGCATACTGCA-CGGT-ACGGTTCGGTTCGGAA--CGCTTTG-AGGGC-NTGGT------TTGC-A---TA--------------A----------A----CG-TTCT---ATGAACGGT---ACGG-----TT-CGCTTCT-T-G-CAC-GGT---AC-GG-TTCG-C---T--TCTT-G-CA--CGGT---ACG------GT-TCGCTTCT
gi|1 : ATGAACTCTATGCAAATTAAGTGGA-----A---GTAGCTTTGTTTGATTGAC----AGTCGACTATTTCATTTTATTTAATTTCAATTAATAT--AGACGTATTTAATTTCATGTTGAAT--AATTTTTTTTTGTGTATTTTCGTGTCTGGAAGAACAG--CGAAATTAAATCCC-CACGGAT--TTTATTTTCAGAAAATCTTT--TTCAGTGTTAGAAATGTGCGTTTCTGTTATTCGTAGTCTATGTC--TCGATAAAATATTTCGTCATTACC--CATCATTGTACTCGCACTT-GTT-TAT--AGAACGATTGCTG-CAAAA---ATAACAATTTATAATTAGACAC-TAACTCGACACGTGTGCAAGTTTCGGGTTCAGTGTAATTAAGAATGATTACTATCAAAACATGTTGAGACACAAAGCCGGGAAGGTCGGAGTACAGGTACATGTAACTGCTCATGTTGTGTCGTGGAGAAGTACCCCGTCTGTGCAT--G-AT-TT-----------GCGTGTACATTG---T--ACATGATCTGCATGTATGAATATAT-T-AT------TGTATTTGTTAG-T----T--GAAAAAAC-ATCGCTTAATATTATATTCATGTATGTTTTACA-----------GATCT---ACATATATGCACATAAAGCATCGATAAC---AGGAAA--AGTA-GTA------TATATAAATA----CAT---GTAAATTGACGTGTACAT-TTAAA-CAGGCA--CG-TGCCGCTAT-GGC-AG--GTGAA---------------------TTCTTA-CA------AA-GT-A-ATCCACC-CGTAA-GACCCGGAAAATAA-CACACACAACCAAAT-CA---AAA--CCA-C-G--A----CAGGGGTAAAATTGGTTTCAAT----TCAGTA--CACGATC-----CACGTTCCTAA--TTAACCCTTA-ATT--GCATCACACATGTAACC-CACCCTC-TACT----CG-AAGCG-AT-CAAC-----C-----ATGCAAGATT---G---AAGAAAGAT-ATCGAGAATTCCAC-TC-TGCTGT-T-GAAGAATA-AATCATTGTATCGGAAAGCATTTATTATT----A------------------ATTAAG-AGAAACATACCT----TAA----CAAGATC-T-ACAAAAAGCAT-TGAA-GAA--------G---------T-----GA---------C---------AAT-------GT-TTCATTATATCAAATAT----CGTATA-AAA-----CTA------GCCA-AATTTCTTT--GTG-CGGCTTTTTTTGC-ATAGGAATT---A--CC-TTCTTCAT-ATTACA--TTTTGTTTCATT-----TTGAA---GCA----------AAAA-------AC--TTAC-TTAATC-TACA-T-GAT--TG-T--TGAACGAAATTATG----CAG----CA--CACA-----ATTTCTTTCAA--CATGT--------TATTAATGTGT-----AAATTAATC-AGTATTGTTCACTT--G---A-----TC-AAATTA-TTACTGCATGTTA----TATCGT-GTAAA--TGC-AG-CTACTTGTAATTTTTT---TTTAATACGC-AAATTGT-AAAT-GAGCACTTTGATCATATAATATAACACC-GTTGTGTTACCCTATTTATACACCGTAAAAAGAAGT--GAAAAGTTAATGATCTGATACATTG---------TATAAATATTGATA--ATTGGTTTCGGAAAATTACTCTGTCGAGTTGTTTTTTAAACCCATAC-TTC-TTTTCAA--GTAT-ATCCCTAA-TT-TT---A-----------CAAAG-TCCTTTCGA-GTA----ATACTTAATCACGGTGTCACAAATGGCCAG-AGTTATTCTACGTCCTCCTTTAACGAGCTTC-AT-C-AG-AGA-AATTAA-------TGATAA----TA--------AGA-T-TAGTT--TAA----TAG--TGTTACCTTA-TTAGGCATAATGCA-CGGT-ACGG---G--TCGGAA--CGCTTTG-AGGGC-GTGGT------TTGC-A---TA--------------A----------A----CG-TTCT---ATGAACTTT---ACGA-----TT-CGTTTCT-T-G-CAC-GGT---AC-GG-TTCG-T---T--TCTT-G-CA--CAGT---ACG------GT-ACGATTCT
gi|10 : gatgaacgattaAGTATAT-T-AT------TGTATTTGTTGG-T----T--AAAAAAACTATCGCTTAATATCATATTC------------------------------------CATATACGCATAAATCATCGATAAC---AGAAAA--AGTA-GTACATGTATATATAAATA----CAT---GTAAATTGACGTTTACAT-TTAAA-CTGGCA--CG-TGCTGCTGT-GGC-AG--GTGAA-CCCC----A-GACAATGTC-TTCTTA-CA------AA-CT-A-ATCCACC-CCTAA-GCCCCGGGAAATAA-CGCACACAACCAAAT-CA---AAA--CCA-C-G--A----CACAGGTCAAAT-GGTTTCAAT----TCAGTA--CACGATT-----CACGTTCCTAA--TTAACCCTTA-ATT--GCATCACACATGTAACC-CACTCTA-TATT----CG-AAGCG-AT-CAAC-----C-----ACGCAAGATT---G---AAGAAAGAT-ATCGAGAATTCCAC-TC-TGCTGT-T-GAAGAAT--------CGTA-----ATGCATTTATTATA----G------------------ATTAAG-AGAAAAATACCT----TG----------------CAAAAAGCAT-TGAA-GAA--------GTGATAATCAT-----GA---------C---------AAT-------AT-TTCATTTTATTATACTT----C-TGTA-AAA-----
gi|11 : gggggggggggggggggggggggttagtccagataggacagttctTCATTATATCAAATATGTATCGTATA-AAA-----CTA------GCAA-AAATT-TTT--GTG-CAGCTTTTTT-GC-ATAGGAATT---A------TCTTCAT-ATTACA--TTTTGATTCATT-----TTGAAGGGGGGGGGGGACTCCAAAA-------AC--TTAC-TTAATG-TACA-T-GAT--TG-T--TGCACGAAAGTTTG----CAG----TA--CACATCACAATTTCCTTCAA--CA-----------------TGT-T-----AAACT--TA-AGTA-----------------------C-A-------TACTGCATGTTA----T--CGT-GTAAA--TGC-AG-CTACTAGTA---TTTT---TTTAATACGC-AAAATTT-AGAT-GAGCACTTTGAT-ATATAATATAGTAACTGTTGTGTTACCCTATTTACACAGTGTAAAAAGAAG-------------TGATCTGATACACTG---------TATAAATATTGAAA--ATTGGTTTAGGAAAATTACTCTGTCGAATTG---------------------TTTTCAA--GTAT-TTCCCTAATTT-TT---AT-A---G---CTAAAG-TCCTTTCGA-GTA----ATACTTAATCATGGTGTTACGAATGGCCAG-AGTTAGTCTACGTCCTCCTTTAACGGGCTTC-AT-TGAA-AGA-AATAAA-------TGAAGA----TA--------AGA-T-TA--T--TAG----TAatgttt
gi|12 : CGTACCTCTTTAATGGGCTCCCATGCGAG-AGA-AAT-AA-------TGAGAACATGTA--------AGAAT-TA--CTACAAATG-TAGATTATTACCTTAGTTAGGCAATCTGCAGCGGT-ACGGTTTGCGTCGGAAGCCGCTTTG-AGGGG-TTGGT------TTGC-AG--TAATAATTTATTTGAGA----------A----CG-TTATTTAATGAGGTGT---ACGG-----TA-CGCTTCT-T-G-CCA-AGA---AC-GG-TTCG-C---T--TCTT-G-TT--C-GT---A-G------GT-TCGCT
gi|12 : TGCACGGT---ACAGGGTTGTT-CGCTTCT-TAG-TAC-GGT---AC-GT-TTCG-C---T--TCTTGG-TAC-CGGTTAAACG------GT-TCGTTgttcttgcacgtactgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttttgcacggtacagggttgttcgcttcttagtacggtacgtttcgcttcttggtaccggttaaacggttcgttcgtctttgcacgatacggttcggctatcagtttctgaggtgtagtaggcacggttctaggtca
gi|12 : cgtacctctttaatgggctcccatgcgagagaaataatgagaacatgtaagaattactacaaatgtagattattaccttagttaggcaatctgcagcggtacggtttgcgtcggaagccgctttgaggggttggtttgcagtaataatttatttgagaacgttatttaatgaggtgtacggtacgcttcttgccaagaacggttcgcttcttgttcgtaggttcgctgttcttgcacgtactgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttttACGGT---ACGT-----TT-CGCTTCT-T-GGTACCGGTTAAAC-GG-TTCG-T---TCGTCTTTG-CA--CGAT---ACG------GT-TCGcgtctttgcacgatacggttcggctatcagtttctgaggtgtagtaggcacggttctaggtca
gi|13 : cgtacctctttaatgggctcccatgcgagagaaataatgagaacatgtaagaattactacaaatgtagattattaccttagttaggcaatctgcagcggtacggtttgcgtcggaagccgctttgaggggttggtttgcagtaataatttatttgagaacgttatttaatgaggtgtacggtacgcttcttgccaagaacggttcgcttcttgttcgtaggttcgctgttcttgcacgtactgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttttgcacggtacagggttgttcgcttcttagtAATGTGCGTTTCTGTTTTTCGTAGTCTA-------CGATAAAATATTTCGCCAGTACTGTCATCATTGTACTCGCACTTTGTTCTATTTAGAACGATTGCTGTCAAAACAGG--ACAATTCATGATTGGACAC-TAACTCGGAACGAGTGCAAGTTTCGGTTTCAGTGTAATTAAGAATGATTACTATCAAAACATTTTAAGACACAAAGCCGGGAAGGTCAAAGTACAG---C---TAACTGCTCGTGCTGTGTCGTGAAGACATACCTCGTATGTGCAT--A-AT-TT----------TGTGTGgctatcagtttctgaggtgtagtaggcacggttctaggtca
gi|13 : CACGTACATGCATTTA-ATATTCAGA------TACGTGTACATTG---T--ACATGTTCTACATGTATGAATATAT-T-AT------TGTATTTGTTGG-T----A--GAAAAAAC-ATCACTTAATATTATACTCATATATGTgcaggagagacatattgaaaataaaaataagtaaactgatttaaaaaaaaaagtttcttccttatgcacattgtgcacgtacatgcatttaatattcagatacgtgtacattgtacatgttctacatgtatgaatatattattgtatttgttggtagaaaaaacatcacttaatattatactcatatatgt
gi|14 : aatgtgcgtttctgtttttcgtagtctacgataaaatatttcgccagtactgtcatcattgtactcgcactttgttctatttagaacgattgctgtcaaaacaggacaattcatgattggacactaactcggaacgagtgcaagtttcggtttcagtgtaattaagaatgattactatcaaaacattttaagacacaaagccgggaaggtcaaagtacagctaactgctcgtgctgtgtcgtgaagacatacctcgtatgtgcataattttgtgtggcaggagagacatattgaaaataaaaataagtaaactgatttaaaaaaaaaagtttcttccttatgcacattgtgCGTCCTCCTTTAACGG-CTCC-AT-AGAGTAGA-AATTAAAGTATAGTGAAAA----TACATCGTGAAGA-TATA--CTACAAATGTTGA--TATTAC-TTA-TTAGGCATACTGCC-CGGTAACGGTTCGGTTCGGA----GCTTTG-AGGGCTGTGG-------TTGCGA---TA--------------ATTTATTTGAGA----AGTTTCT---ATGAG-GGTGTAACGGA----TTATGCTTCT-T-G--AC--GT---AC-GG-TTCG-C---T--T-TT-G-TA--CGGT---ACG---------TTGCTTCT
gi|15 : ACGCATTGCGCATGTACAT--GCAT-TTAATATACAGATACGTGTACATTG---T--ACATGATCTACATGTATGAATATAT-T-AT------TGTCTTTGTTTG-T----TAAAAAAAAAC-ATCG-TTAATATTATATTCATGTATTTTTTAAA-----------GATCT---ACACATATGCACAtagtgcggtagagtggttgtacgctttcagttggcagtaagttcgcttttggcgctcggtacggatttaggtgttctggcagggtatcgggtcgttctgatgcaagtacggtcgttgttgcggggatacgtgttgttttcttgcacagagtcgagttcggcttctgtagggtttcgtttcttgtgcgatcgtgttatggttgtcggttttcgtttctgcaggtggttagcagg
gi|15 : gaaaataaaaataaatacactgatttaaaaacaattgattttcttccttatAAAT-GGCTTCAAT----ACAGTA--CACGATC-----CACGGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaatggcttcaatacagtacacgatccacggcta
gi|16 : gaaaataaaaataaatacactgatttaaaaacaattgattttcttccttatacgcattgcgcatgtacatgcatttaatatacagatacgtgtacattgtacatgatctacatgtatgaatatattattgtctttgtttgttaaaaaaaaacatcgttaatattatattcatgtattttttaaagatctacacatatgcacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnA-CTGGCA--TG-TGCCACTGT-GGC-AG--GTGAACCCC-----A-GACAATGTT-TTCTCA-CT------AA-CN-A-cta
gi|16 : A-CTGGCA--TG-TGCCACTGT-GGC-AG--GTGAA-CCCG----A-GACAATGTT-TCCTCA-CA------AA-CT-A-ATctggcatgtgccactgtggcaggtgaacccgagacaatgtttcctcacaaactaatgcgtttactgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtaacccaccctctactcgaagcgatcaatcgtggcacgcaatattgaagataattccactgttgttgaagaataaatcatcgtatcggaaagcatttatagcttaagagaaaaataccttaacgagatctacaaaaagcatttaagaagtgataatcatgacaatatttcaccatatcaactatc
gi|16 : actggcatgtgccactgtggcaggtgaaccccagacaatgttttctcactaacnATGTAACC-CACCCTC-TACT----CG-AAGCG-AT-CAAT-----CGTGGCACGCAATATT---G---AAGA-------T----AATTCCAC-T---GTTGT-T-GAAGAATA-AATCATCGTATCGGAAAGCATTTAT---A----G------------------CTTAAG-AGAAAAATACCT----TAA----CGAGATC-T-ACAAAAAGCAT-TTAA-GAA--------GTGATAATCAT-----GA---------C---------AAT-------AT-TTCACCATATCAACTAT----Cgcgtttactgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtaacccaccctctactcgaagcgatcaatcgtggcacgcaatattgaagataattccactgttgttgaagaataaatcatcgtatcggaaagcatttatagcttaagagaaaaataccttaacgagatctacaaaaagcatttaagaagtgataatcatgacaatatttcaccatatcaactatc
gi|17 : actggcatgtgccactgtggcaggtgaaccccagacaatgttttctcactaacnactggcatgtgccactgtggcaggtgaacccgagacaatgtttcctcacaaactaatgcgtttactgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn----------TACGTGTACATTG---T--ACATGACCTACATGTATGAATATAT-C-ATAATGATTGTCTTTGTTGG-T----T--AAAAAAGC-ATCGCT-GATATTATATTCATGTATGTTTTACA-----------GATCT---ACACATATGCACTTAAAGCATCGATAAC---AGAAAA--AGTA-GTAA-----CATATAAATA----CAT---GTAAATTGACGTTTACAT-TTAAA-CTGGCA--CG-TGCCGCTGT-GGC-AG--GTGAA-CCCC----A-GACAATGTC-TTCTTA-CA------AA-CT-A-ACCCACC-CCTAA-GCCCTGGGAAATAA-CACACACAACCAAAT-CA---AAA--CCA-C-G--A----CAGGGGTAAAAT-GGCTTCAAT----GCAGTA--------------CACGGTTCTAA--TTAACCCTTA-ATT--GCACCACACATG
gi|18 : taatatacagaATGAACGCTATGCAAATTAAGTGGACGTACACATGTAGCTTTGTTTCATTGAC----AGTCGACTATT-CATTTTATTTAATTTCATTCAATGTATAGACGTATTTAATTTCATGTTGAATTAAATTTTT----GTGTATTTTCGTGTCTGGAAGAAA--------------TCCAACACGAAT--TTTATTTTCAGAAAATCTTTATTTCAGTGTTAGAAATGTGCATTTCTGTT
gi|19 : GTTG-TTTT-AAACCCGTAA-TTC-CTTTCAA--GTAT-TTCCTTAA-TTCTT---ATGG---G---TGAAAG-TCCTGTTGA-GTA----ATACTTAATAATGGTGTTACGAATGACCAA-AGTTAACCTCCGACCTCCTTTAACGGGCTCC-AT-CGAG-AGA-AATAAA-------TGATTA----TA--------ACA-T-TA--T---------TAG--TATTACCTTA-TTAGGTATACTGCA-CGGT-A
gi|2 : GTGTTCATTGACTTGAACATGATCTACATGTACGGATATATATGAT------TGTATTTGTTGG-TAAAAC--AAAAATAC-ATCGCTTCATATCATATCCATGTATGTTTCACATATTTTAAATAAATCT---ACACATATGCACAAAAAGCATCGATAAC---AGGAAA--AGTA-GT-------T-TATAAGTA----CAT---GTAAAGTGACGCTTATAT-TTAAA-CTG-CA--CG-TGCCGTTGT-GGC-AG--GTGAA-CCT-----A-AGCAATGTC-TTCTTA-CATGTACAAA-CT-A-ATCCACC-TC-AA-GCCCCGAAAAATAAACGCACACAGCCACCT-CA---AAA--TCA-T-G--A----CAGGGGTAAAAT-TGTTTCAAT----TCAGTA--CATGATCTGATCCACGGTCCTAA------CCCTTA-ACT--GCATTACACATGTAACC-CACTCTC-TACT----CG-AAGCG-AT-CAAC-----C-----TCGCAAGATT---G---AAGA---------------TTCAC-TA-TGCTGT-T-ACAGAATA-AATCATCATATCCGAAAGCATTTATTATA----G------------------ATTAAG-AGAAAAATACCT----TAA----CAGGATC-T-ACAACAAGCAT-TGAA-GAA--------G---------T-----GA---------TAATCAAGGAAAT-------AT-TTCATTATATCAAATAT----CGTATA-AAA-----CTA------GACA-AATTACTTT--GTG-CGGC-TTTTTTGC-ACAGGAATT---A--CC-TTCTTCAT-ATTACA--TTTTATTTCATT-----TCGAAAGGGAAAAACTCC---AAAA-------AC--TTAC-TTACTC-TACA-T-GAT--TG-T--TGCACGACATTACG----TAG----TG--CACC-----ATATCCTTCAA--CATGT--------TATTAATGTGT-----AAAATAATCAAACATTGTTCACTT--G---A-----TC-AAATAA-TTACTGCATAT------TATCGT-GTAAA--TGC-AG-CTACTAGTA---TTTT---TTTAATA-GCTAAATTGT-AAAT-GAGCACTTTCATCGAATAATATAGTATT-GTTGTGTTACCCTATTGACACAGTGTAAAAAAAAAGAAGAAAAGTTAATGATCTGATACATTG---------TATAAATATTGACAACATTGGGTTAGGAAAATTACTCTGTCGAGTTG-TTGT--AACCAGTAT-TTCTTTTTCAA--ATAT-TTCCCTAG-TT-TT---AACA---GC--TCAAAG-TCCTTTCGA-GTAGTATATACTTAATAATGGTGTTACGAATTCCAAG-AG-TAAACTACGTCCTACTTAAACGGGCTTC-AA-CGAG-AGA-AATAAA-------TGAAGA----TA--------ATA-T-TA--T--
gi|20 : T---AC-GG-T-CG-C---T--TCTT-G-CA--CGGT---ACG------GT-TCGCTTCT
gi|20 : -TTCT----TGCACGGT---ACGG-----TT-CGCTTCTGC-G-CGT-GGT---AC-GGCTTCG-TGTAT--TCTT-G-CA--CGGT---AAG------GTATCGCTgcgcgtggtacggcttcgtgtattcttgcacggtaaggtatcgctctgtacgtaacggttgcgctcttgtacgtacgggttcgttttcttgccacccggtacgttcgacgttcgtttctgaggtgtacggtagccacggtttagatc
gi|20 : tacggtcgcTGCA-CGGT-ACGGTTCGCTTCTG----CGCGTGGTACGGC-TTCGTGTATTCTTGC-ACGGTA--------------A----------GGTATCG-CTCT---GT--ACGTA---ACGG-----TTGCGC-TCT-T-G-TAC--GT---ACGGG-TTCGTT---T--TCTT-GCCACCCGGT---ACGTTCGACGT-TCGTTTCTctgtacgtaacggttgcgctcttgtacgtacgggttcgttttcttgccacccggtacgttcgacgttcgtttctgaggtgtacggtagccacggtttagatc
gi|21 : tacggtcgcttctGATAACTCTGGGAAACAAGTTTGTAA-----TAAATAAATAGTCACATTGCATATATTGACGTTTACAT-TTAAACCTTGCA--CGTTGCCATTG--GGCAAG--GTGAA-CTC-----gaggtgtacggtagccacggtttagatc
gi|22 : agaaaatcatcaaacatcataatgacaatcccatattcggaagaaaaagtcagtccgATGTCCAAAAAATCTTTATTTCAATTTTTGAAACCTGTGTTTCTGTTATGTGTTGTCCAT--TTATAGATAACAAATTTAGCCAGTACCGTAATCG----------ACCCCATT-TAT--AT-ACAAT--------------G--AC----CATATTTAGACACTTAACTCG
gi|23 : AACC-CACCCTC-AACT----CG-AAGCG-AA-CAAT-----C-----ACGCACGATT---G---AAGAAAGAT-ATCGAGAACTTCAC-TC-TGCTG---------------CCACCGTATC--------T------TA----G------------------ATGAAA-AGAATAATACCTTAAATAA----CGGGACT-T-ACAA
gi|24 : acATTAAGTGGACGTAC--------CTTTGTTTGATTGACGTCAAGTCGACTATC-CATTTTATTTAATTTCATTTAATGT--AGAAGTATTTAATTTTATGCTGAATTACATTTTT----GTATATTTTCGTG
gi|25 : GTAAATGTATTAAATTTTGTGTTGGATTAAATTTT-----GC-TATTTTCATGTCTGGAAGAAAAGAACAAAATTAAATCCAAAACAAATTCTTTA-TTTCAG--AATCTTT
gi|26 : TATACATGTAT-T-AT------TGTATTTCTTGGTT----T--AAAAAAAC-A-CGCTTTATATTAT----ATGCATGTTTTACA-----------GATCT---A--------CACATAAAGCATCGATAAC---AGGAAA--AGTA-Gtt
gi|27 : -----AAATAAATC-A---TTGTTCACTTTCA---AAAAAGTC-AAATTA-TCAATGCATGT------TATCGT-GTAAAACTGTGAGCCTACTCGTA-------------AACG-GC-ACATTGTAAAAT-GA
gi|29 : aAATTGT-AAAT-GAGCACTTTGATAATATAATACAATATC-GTTGTGTTACCCATTTTACACACCGTAAAAAGAAAT--GAAAAGTagc
gi|3 : -GGCTTCAAT----TCAGTA--TACGATC-----CACGGTCCTGA--TTAACACTTA-ATT--GCATCACACATGTAACC-CTCCCTT-TACT----CG-AAGCG-AT-CAAC-----C-----ACG---------------AGAA---T-ATCGAGAATTCCAC-TC-TGCTGT-T-GAAGAATA-AATCATAGTATCGGAAAGCATTTATTATA----A------------------ATTAAG-AGAAAAATATCT----TAA----CGACATC-T-ACAAAAAGCAT-TGAA-GAA--------G---------T-----GATAATCATGGC---------AAT-------AT-TTCATCATATCAAATAT----CGTATA-AAA-----CTA------ACCA-AATTTGTTT--GTG-TGG---TTTTTGC-ATAGAAATT---A--CC-TTCTTCAT-ATTAAA--TGTTATTTCATT-----TTGAAGGGGGA----------AAAATCCCAAAAC--TTAC-TTAATC-CACA-T-GAT--TG-T--TGCACGAAATTATG----CAG----CA--CACA-----ATTTCCTTCAA--CATAT--------TATTAATGTGT-----AAACTAATC-AGTATTTTTCACTT--A---A-----TC-AAATTA-TTACTGCATG----------CGT-GTGAA--TGC-AG-TTACTCGTA---TTTTTTTTTTAATACGC-AAATTGT-AAAC-GAGCACTTTGATCATATAATATAATATC-GTTGTGTTATCCTATTTACACACTGTAAAAAGAAGT--GAAAAGTTAATGATCTGATACATTG---------TATAAATATTGATA--ATTGGTTTAGGAAAATTACTCTGTCGAGTTG-TTTTTAAACTCGTAC-TTC-TTTTCAA--GTAT-TTCCCTAT-CT-TTCACA--C---C---TAGAAG-TCCTTTCCA-GTA----ATACATAATCACCGTGTTACAAATGGCCAG-AGTTATTCTACATCCTCCTTGAACGGGCTTC-AT-CGAG-AGA-AATTAA-------TGAAGA----TA--------GGA-T-T-------AA----TAG--TATTACCTTA-TTAGGCATAGTGCG-CGGT-ACGGTTCGGTTCGGAA--TGCTTTG-AGGGC-GTGGT------TTGC-A---TA--------------A----------A----CG-TTCT---ATGAACTGT---AAGG-----TT-CGTTGCT-A-G-CAA-GGT---AC-GG-TGCG-C---T--TCTT-G-CG--CGGT---ACG------GT-TC
gi|30 : TTTAAACCCGTAA-TTA-TTTTCAA--GTAT-TTCCCTAA-TT-GT---A--ATGGG---TGAAAG-TTCTGTTGA-GTA----ATACTTGATTAcgcgatatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaacgtttctgaggtgtagtagcacggtttaggatctg
gi|31 : ttggTTTAAACACGTAAATTA-TTTTCAAAAGTATGTCCCCTAA-TT-GT---A--ATGGG---TGAAAGTTTCTGTTGAGGTA----ATATT
gi|32 : ttggT--GCATCACA------ACC-CACCCTC-TACT----CG-AAGCG-TA-CAAC-----C-----ACGCACGATT---G---AAGAAAGA
gi|34 : ATTGT-AAAT-GAGCACTTTGATAATATAATATAATATC-GGTGTGTTACCCT
gi|35 : GTAACC-CACCCTC-TACT----CG-AAGCG-AT-CAACCGTGGC-----GCGCAAGATT---G---AA
gi|4 : TA----CAT---GTAAATTGACGTTTACATCTTAAA-CTGGCAAGCG-CGCCGTTGTTGGC-AG--GTGAC-CCC-----AAGACAATGTC-TCTAAA-CA------AA-GT-ATATTC----------------GAAAATAA-CGCACACAACCAACT-CA---AAA--TCAAT-G--A----CAGGGGTAAAAT-GGCTTCAAT----TCAGTAAACACGATC-----CACG-TCCTAA-----ACC-TTA-ATT--GCATCACA------ACC--ACCCTCGTACTAGTACG-AAGCG-AAACAAC-----C-----ACGCACGATT---G---AAGAAAGAT-GTCGAGAATTTCAC-TC-TGCTGT-TCGAAGAATACAACCATCGTATC------------TT-TA----G------------------ATTAAG-AAACTAATACCT----TAAATAACGGGACC-TTACAAAAAGCATCTGAA-GAA--------G---------T-----GA---------T---------AATCATGACAATATTAATTTTATCAAATAT----CGTATGCAAA-----CTA------GCCA-A-TTTGTTTTGGTGGCGGTTTTTTTTGC-A-----ACTGTAA--CCATTCTTCAT-ATTACA--TTT-GTTTCATT-----TTGAAGGGGGG----------AA--------------TAC-TTACGC-TACA-T-AATAATG-T--TGCACGAA-TTATG----CAG----TT--CATA-----ATCTCCTTCAA--CATGTTGCATG--TATTAATGTGT-----AAAATAATCAAACATTGTTCACTTTCA---AAAT--TC-AAATTACTCAATGCATGTT-------TCGT-GTAAA--TGT-AG-CTACTCG-A-------------AATACGC-ACATTGT-AAATCGAGC
gi|5 : tnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgACCACCTAAAGCCCCGGGAAATAA-CGCACACAACCAAAT-------GA--TCA-T-G--AAAACCAGGGGTAAAAT-GGCTTCAAT----TCAGTA--CACGATC-----CACGGTCCTAA--TTAACCCTTA-ATT--GCATCACACATGTAACC-CACCCTC-TACT----CG-AAGCG-A------------------CG----------G---AAGAAAGAT-ATCGAGAATTCCAC-TC-TGCTAT-T-GAAGAATA-AATCATCGTATCGAAAAGCATTTATTATA----G------------------ATTAAG-AGAAAAA----------------------------AAAAAGCAT-TGAA-GAA--------G---------T-----GATAATCATGAC---------AAT-------AT-TTCATCATATCAA-TAT----CGTATA-AAA-----CTA------GCC-------GTTT--GTG-CGGCTTTTTT-GC-ATAGGAATT---A--CC-CTCTTGGT-ATTACACATGTTGTTTCATT-----TTGAAGGGGGG----------AAAACCAAAA-AC--TTAC-TTAATC-TACA-T-GAC--TG-T--TGCACGAAATTATG----CAG----CA--CACA-----ATTTCCTTCAA--CATGT--------TATTAATGTGT-----AAATTAATC-AGTATTGTTCACTT--G---G-----TC-AAATTA-TTACTGCATGTTACGTGTATCAT-GTAAA--TGC-AG-CTACTCGTAT--TTTT---TTTAATACGC-AAATTGT-AAAT-GAGCACTTTGATCATATAATATGATATC-GT--TGTTACCCTATTTACACACTGTAAAAAGAAGT--GAAAAGTTTATGATCTGATACATTGTATCTACATTATAAATATTGATA--ATTGGTTTAAGAAAATTACTCTGTCGAGTTG-TATTTAAACCTGTAC-TTC-TTTTCAA--GTAT-TTCCCTAA-TT-TT---
gi|6 : A----CAT---G-AAATTGACGGTTACATGTTAAA-CTG-CA--CG-CGCGTTTTT-TGC-AGAAG-GAA-CCTCTCTAA-GACAATGTCCTTCTTAACA------AAGTT-A-AT--ATC-GAAAA-A----GTGAGATAA-CGCACACAACCACCTTCATATGAA--TCA-T-AGTA----CAGGGGTAAAAT-CGC-TCAA-----TCAGTA--CAC-ATC-----CAC-GTTCTAAACTTAATCCTTGCATT--TCATAAC------AACCTCACCCTC--AC-----CG-AAGCGAAA-CAAC-----C-----ATGCTAGATTTAAGTTTAAGAAAGA--ATCGAGAATTTCACTTC-TGCTGTGT-GTAAAATA-AACCATC----C---AAAC-----TTAGA----G------------------ATCA-----AATAATACCT----TAATACGCGGAACCTT-ACAAAAAGCAT-TGAA-GAATG------A---------TAATCAGA---------C---------AAT-------AT-TAATTTATGCAAAAT-T----TGTATA-AGAAAATCTTATCCCGCGCCAGAATTTGTTT--GTGTCGGC--ATGTTGCAATAA--------A--CC-TTTTCTATCATTACA--TTTTGTTCAATCCATAATTGAA---GGG----------AAAT-------ACAATTAC-C--GTCTTACATT-GAA--TG-TTATGCACGAAATTA-GTCCCCAGTCTATGTTCACA-----ATCCCCCTCAAACTATGT--------
gi|7 : atcaattcagtcattgtttcatcgtttggtcccattaaatattcataaatcgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggtaagcctta----------TACGTATACATTG---A--ACGTGATCTATATGTATGAATATAT-G-AT------TGTATTTGTTCG-T-------AAAAAAAA-ATCGCTTAATATCATATTCATGTACGTTTTACA-----------AATTTGAAACAAATCTACACAAAAAGCATCGATAAT---GGGAAA--AGCA-GTA------TATATAT-TA----CAT---GTAAATTGACGCTTATAT-TTAAA-CTGGCA--AG-TGCCGTTGT-GGC-AG--GTTAA-TTCT----A-GACTAAGTC-TTCTTT-CA------AA-CCCA-ATCCACC-CCTAA-TCCCCAAAAAATAA-CGCACACAACCACCT-CA---AAA--CCA-C-G--A----CAGGGGTAAAAT-GGCTTCAATATAATCAGTA--CATGATC-----CACGGACC------TAACCCTTA-ATT--GCATTACACATGTAACC-CACCCTC-TACC----CG-AAGCG-AT-CAAC-----C-----ATGCAAGATT---G---AAGAAAGAT-ATCGAGAATTTCAC-TC-TGCTGT-T-GAAGAATA-AATCATCGTATCGGAAAGCATTTATTATACAATGTACATTATGTACATGTACATTAAG-AGAAAAATACCT----TAA----CGGGACC-T-ACAAAAAGCAT-TGGA-GAA--------G---------T-----GA---------T---------AAT-------gtctagtccatgtatc
gi|8 : taccccgtcagtgcattgttttgtgtggcaggatagacttatgttgaaaataaaaataaatacactgatttttttccttatacacatagtgcatgcacatgcatttaatatacagaCATGTTA----T--CGT-GTAAA--TGC-AC-CTACTCGTA---TTTT---TTTAATACGC-AAACTGT-AAAT-GATCACTTTGATCATATAATATAATATC-GTTGTGTTACCCTATTTACACATTGTAAA--GAAGT--GAAAAGTTAATGATCTGATACATTG---------TATAAATATTGATA--ATTGGTTTAGGAAAATTACTCTGTCGAGTTG-TGTTTAAACCCGTAC-CTC-TTTTCAA--GTAT-TTCCCTAA-TT-TT---T--A---GGGCTGAAAG-TCCTATCGA-GCA----ATACTTAATCACGGTGTTACAAATGGCCAGAAGTTATTCTACGTCCTCCTTTAACGGGCTTC-AT-CGAG-AGAGAATTAA-------TGAAGA----TA--------AGA-T-T-------AA----TAG--TATTACCTTA-TTAGGCATACTGCA-CGGT-ACGGTTCGGTTCGGAA--CGCTTTG-AGGG--TTGGT------TTGC-A---TA--------------A----------A----CG-CTCT---ATGAACcatga
gi|9 : AAT-CA---AAGATTCA-CTG--A----CAGGGGTAAAAT-GGCTTCAAT----TCAGTA--CACGATC-----CACGGTCCTAA-----ACC-TTA-ATTTTGCATCACA-----AACC-CACCCTC-TACT----CGGAAGCG-AA-CAAA-----C-----ACGCACGATT---G---AAGAAAGATGATCGAGAATTTCAC-TCATGCGGGGT-GGAGAATA-A-CCATCGTAT------------ATTA------G------------------ATTAAGGAGAATAATACCT----TAAATAATGGGACC-T-ACAAAAAGCAT-TGAAAGAATGATAATCA---------T-----GA---------C---------AAT-------AT-TTAAATTTATCAAATAT----CGTATA-AAAA----CTA------GCTC-TATATATTT--GCG-C---TTTATTTGC-AT-----TT---AAACC-TTCTTCATAATTA-A--TTTTGTTTCATT-----TTGAAGAAGGG----------GAA-------------TACGTTACGC-TACA-TGGAA--TGCT--TGCACGAAATCATG----CAG----T---CACA-----ATCTCCTTCAA--CATGCTTACAATGTATTAATGTGTTAAAAAAATCAAAC-ATTGTT-TTCACTTTCGAAAA-----TCAAAATTA-TCCATGCATGT------TATCGTGGGAAA--TGT-AG-CTACTCGTA-------------AA-ACGC-ACATT-T-AAAT-GAGCtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtacatttcttaggtgtagtagcacggtttagggtctg
blockSeqs : G CGTACACAT GTCA . AT T T G AGAACA A TC T A A TTTA G AT T C TT A TGCTGTCAAAACAGG A T A A T T C T T TTA A AATATACAGA ACTTGA ATG AATGAT T AAAAC T TATTTTAAATA GAA TCTG CA T CATGTA A GTCA TGC C C AG T T A AA C CTCTA A C A TGTACA G C T ACCT AGC A A T TAT AT AT GT AAAC . ATAA AA TGATC ACT C TT C T G AGTA G A AA CGTGG GTGGC A TAA TTT G T A G C C GGA A T CAATGTACATTATGTACATGTAC G TAAA ATAA T T C A GTGATAATCATGAC CATGACA A GTAT C AAATC TCCCGC AG C TG G CT T A G GTA AA A C CA CATAA G GGGGGACTCCAAAAAC G A T T G AA C TA TCCC TCTATGTT TCACA T AC TTACAATG TAAAA C A G G TCAAAAAAG A C TACGTGTA G AC G C TTTTTTT C T A C C T T GAA TATCTACAT AC . T T AA T AA G T C AACAGC T T T G GTAT A G C G T G A AGTATAG CATG CATCGTGA A A ACTACAAATGT AT G G A C AGC T CTG GTATTC G GTAATAATTTATTTGAGAA T TTAA GTA GGTTG A TA GTACCG TAA G C TGTA CG G C CC TAA TTCGAC A
blockSeqs : CGTAC . . GT T T A . A . T A A . G G C . . . G . . A C GC . CAGA T T . . TAA . . . A . . A A . . G . . . . . . . C . . . . . . . CCT GC . A . . . CT . . . . . . T . . C . . . . . T . . A . . . . . G . . CGA A T G . . TACG . . . . GTGATAATCATGAC . . . . A . A G . T TT T . G . . . A . . A AAACTCCAAAAAC . C . . . . . . . TA . A . TGCATG . A A A G TCAAAAT . . TAT . . . . TTTTT C . . . A . T T . . . T T A . . . . . CACACC G . G . . . A . . . . T . . . . . ACTACAAATG . . . . G A . GT . . TAATTTATTTGAGA . A . A G GC CCAA . . . TT . T . C . . .
blockSeqs : . T . . . . G T A . . T T . . T . . . A . . A G . . . . . . . . . . G . . . . . . . CCT GC . C . . . C . . . . . . T . . C . . . . . T . . A . . . . . . . . GGA A T G . . ATAA . . . . GTGATAATCAAGGA . . . . . . A G . . CT T . A . . . . . . G AAAATCCCAAAAC . A . . . . . . . TG . T . . . T . G T TCGAAAA . . TAT . . . . TTTT C . . . C . C T . . . T T T . . . . . AATGGG C . T . . . A . . . . A . . . . . ATTAG . . . . C A . CT . . CGGTAAGGTAT . G . . . T TACG . . . C . . . . . . .
blockSeqs : . T T . . A . . . A . . . A . . . . . . . . . . C . . . . . . . GAA GC . C . . . C . . . . . . T . . C . . . . . T . . C . . . . . . . . GAA A T G . . . . . . . GTGATAATCATGGC . . . . . . A G . . C T . G . . . . . . G AAAACCAAAAAC . C . . . . . . . CA . C . . . C . A G GA . . TA . . . . TTTT C . . . A . T T . . . A T C . . . . . AATGGG A . T . . . T . . . . A . . . . . AT . . . . G . . CG . . TAAA . A . . . T CGTG . . . C . . . . . . .
blockSeqs : . A C . . T . . . A . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . CCT TC . A . . . T . . . . . . T . . C . . . . . A . . C . . . . . . . . GGA A T G . . . . . . . GTGATAATCATGAC . . . . . . A G . . C T . . . . . . . . G AAATACAA . A . . . . . . . TT . T . . . A . G G AA . . TA . . . . TTTT C . . . C . T T . . . G T A . . . . . TAGGGC G . G . . . T . . . . T . . . . . AA . . . . G . . T . . TAAA . A . . . T CAAG . . . T . . . . . . .
blockSeqs : T . . T . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TC A . C . . . T . . . . . . . . . C . . . . . T . . A . . . . . . . . . A T A . . . . . . . TGATAATCATGAC . . . . . . C A . . T . . . . . . . . . G GAA . G . . . . . . . CA . C . . . T . T . GG . . TA . . . . . C . . . C . T . . . . C . . . . . ATGGG G . G . . . . . . T . . . . . AA . . . . . . . T TAC . . . C . . . . . . .
blockSeqs : G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . T . . . . . . . . . . . . . . . A . . C . . . . . . . . . . . G . . . . . . . TGATAATCAGAC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AA . C . . . . . . . T . C . . . T . . . . . . T . . . . . . . . . . . . C . . . . . ATAG G . A . . . . . . . . . . . . . . . A AC . . . C . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . A . . . C . . . . . . . . . . . . . . . T . . A . . . . . . . . . . . G . . . . . . . GTGAT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . A . . . . . . . . . . . G . . . . . . . GTGAT . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . T . . C . . . . . . . . . . . G . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . A . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqCons : A***** GA* GTGATAATCATGAC******************************* AAATCCAAAAAC************* TA****** TTTT****** AACGGC******** ATTAG******** A**
originalCons : NNNNNNNNNNNNATGAACNCTATGCAAATTAAGTGGACGTACA---GTAGCTTTGTTTGATTGAC----AGTCGACTATT-CATTTTATTTAATTTCATTTAATGTGTAGACGTATTTAATTTCATGTTGAATTAAATTTTT----GTGTATTTTCGTGTCTGGAAGAAAAG--CGAAATTAAATCCAACACGAAT--TTTATTTTCAGAAAATCTTTATTTCAGTGTTAGAAATGTGCGTTTCTGTTATTCGTAGTCTAT--C--TCGATAAAATATTTCGCCAGTACCGTCATCGTTGTACTCGCACTTCGTT-TAT--AGAACGATTGCTG-CAAAA---G--ACAATTCATAATTAGACAC-TAACTCGGNACGNGTGCAAGTTTCGGNTTCAGTGTAATTAAGAATGATTACTATCAAAACATNTTGAGACACAAAGCCGGGAAGGTCGGAGTACAGGTACATGTAACTGCTCGTGCTGTGTCGTGGAGACGTACCNCGTACGTGCAT--G-AT-TT----------TACGTGTACATTG---T--ACATGATCTACATGTATGAATATAT-T-AT------TGTATTTGTTGG-T----T--AAAAAAAC-ATCGCTTAATATTATATTCATGTATGTTTTACA-----------GATCT---ACACATATGCACATAAAGCATCGATAAC---GGGAAA--AGTA-GTA------TATATAAATA----CAT---GTAAATTGACGTTTACAT-TTAAA-CTGGCA--CG-TGCCGCTGT-GGC-AG--GTGAA-CCC-----A-GACAATGTC-TTCTTA-CA------AA-CT-A-ATCCACC-CCTAA-GCCCCGGGAAATAA-CGCACACAACCAAAT-CA---AAA--CCA-C-G--A----CAGGGGTAAAAT-GGCTTCAAT----TCAGTA--CACGATC-----CACGGTCCTAA--TTAACCCTTA-ATT--GCATCACACATGTAACC-CACCCTC-TACT----CG-AAGCG-AT-CAAC-----C-----ACGCAAGATT---G---AAGAAAGAT-ATCGAGAATTCCAC-TC-TGCTGT-T-GAAGAATA-AATCATCGTATCGGAAAGCATTTATTATA----G------------------ATTAAG-AGAAAAATACCT----TAA----CGGGACC-T-ACAAAAAGCAT-TGAA-GAA--------G---------T-----GA---------C---------AAT-------AT-TTCATTATATCAAATAT----CGTATA-AAA-----CTA------GCCA-AATTTGTTT--GTG-CGGCTTTTTTTGC-ATAGGAATT---A--CC-TTCTTCAT-ATTACA--TTTTGTTTCATT-----TTGAAGGGGGG----------AAAA-------AC--TTAC-TTANTC-TACA-T-GAT--TG-T--TGCACGAAATTATG----CAG----CG--CACA-----ATCTCCTTCAA--CATGT--------TATTAATGTGT-----AAATTAATC-AGTATTGTTCACTTTCG---A-----TC-AAATTA-TTACTGCATGTTA----TATCGT-GTAAA--TGC-AG-CTACTCGTA---TTTT---TTTAATACGC-AAATTGT-AAAT-GAGCACTTTGATCATATAATATAATATC-GTTGTGTTACCCTATTTACACACCGTAAAAAGAAGT--GAAAAGTTAATGATCTGATACATTG---------TATAAATATTGATA--ATTGGTTTAGGAAAATTACTCTGTCGAGTTG-TTTTTAAACCCGTAC-TTC-TTTTCAA--GTAT-TTCCCTAA-TT-TT---A--A---G---TGAAAG-TCCTNTCGA-GTA----ATACTTAATCACGGTGTTACGAATGGCCAG-AGTTANTCTACGTCCTCCTTTAACGGGCTTC-AT-CGAG-AGA-AATNAA-------TGAAGA----TA--------AGA-T-TA--T--CAA----TAG--TATTACCTTA-TTAGGCATACTGCA-CGGT-ACGGTTCGGTTCGGAA--CGCTTTG-AGGGC-NTGGT------TTGC-A---TA--------------A----------A----CG-TTCT---ATGAACGGT---ACGG-----TT-CGCTTCT-T-G-CAC-GGT---AC-GG-TTCG-C---T--TCTT-G-CA--CGGT---ACG------GT-TCGCTTCT
finalCons : NNNNNNNNNNNNATGAACNCTATGCAAATTAAGTGGACGTACA---GTAGCTTTGTTTGATTGAC----AGTCGACTATT-CATTTTATTTAATTTCATTTAATGTGTAGACGTATTTAATTTCATGTTGAATTAAATTTTT----GTGTATTTTCGTGTCTGGAAGAAAAG--CGAAATTAAATCCAACACGAAT--TTTATTTTCAGAAAATCTTTATTTCAGTGTTAGAAATGTGCGTTTCTGTTATTCGTAGTCTAT--C--TCGATAAAATATTTCGCCAGTACCGTCATCGTTGTACTCGCACTTCGTT-TAT--AGAACGATTGCTG-CAAAA---G--ACAATTCATAATTAGACAC-TAACTCGGNACGNGTGCAAGTTTCGGNTTCAGTGTAATTAAGAATGATTACTATCAAAACATNTTGAGACACAAAGCCGGGAAGGTCGGAGTACAGGTACATGTAACTGCTCGTGCTGTGTCGTGGAGACGTACCNCGTACGTGCAT--G-AT-TT----------TACGTGTACATTG---T--ACATGATCTACATGTATGAATATAT-T-AT------TGTATTTGTTGG-T----T--AAAAAAAC-ATCGCTTAATATTATATTCATGTATGTTTTACA-----------GATCT---ACACATATGCACATAAAGCATCGATAAC---GGGAAA--AGTA-GTAA-----TATATAAATA----CAT---GTAAATTGACGTTTACAT-TTAAA-CTGGCA--CG-TGCCGCTGT-GGC-AG--GTGAA-CCC-----A-GACAATGTC-TTCTTA-CA------AA-CT-A-ATCCACC-CCTAA-GCCCCGGGAAATAA-CGCACACAACCAAAT-CA---AAA--CCA-C-G--A----CAGGGGTAAAAT-GGCTTCAAT----TCAGTA--CACGATC-----CACGGTCCTAA--TTAACCCTTA-ATT--GCATCACACATGTAACC-CACCCTC-TACT----CG-AAGCG-AT-CAAC-----C-----ACGCAAGATT---G---AAGAAAGAT-ATCGAGAATTCCAC-TC-TGCTGT-T-GAAGAATA-AATCATCGTATCGA-AAGCATTTATTATA----G------------------ATTAAG-AGAAAAATACCT----TAA----CGGGACC-T-ACAAAAAGCAT-TGAA-GAAGTGATAATCATGAC-------------------------------AAT-------AT-TTCATTATATCAAATAT----CGTATA-AAA-----CTA------GCCA-AATTTGTTT--GTG-CGGCTTTTTTTGC-ATAGGAATT---A--CC-TTCTTCAT-ATTACA--TTTTGTTTCATT-----TTGAAGGGGGGAAATCCAAAAAC-------------TTAC-TTANTC-TACA-T-GAT--TG-T--TGCACGAAATTATG----CAG----CG--CACA-----ATCTCCTTCAA--CATGT--------TATTAATGTGT-----AAATTAATC-AGTATTGTTCACTTTCG---A-----TC-AAATTA-TTACTGCATGTTA------TCGT-GTAAA--TGC-AG-CTACTCGTATTTT------TTTAATACGC-AAATTGT-AAAT-GAGCACTTTGATCATATAATATAATATC-GTTGTGTTACCCTATTTACACACCGTAAAAAGAAGT--GAAAAGTTAATGATCTGATACATTG---------TATAAATATTGATA--ATTGGTTTAGGAAAATTACTCTGTCGAGTTG-TTTTTAAACCCGTAC-TTC-TTTTCAA--GTAT-TTCCCTAA-TT-TTAACGGC--------TGAAAG-TCCTNTCGA-GTA----ATACTTAATCACGGTGTTACGAATGGCCAG-AGTTANTCTACGTCCTCCTTTAACGGGCTTC-AT-CGAG-AGA-AATNAA-------TGAAGA----TA--------AGA-T-TATTAG--------TAG--TATTACCTTA-TTAGGCATACTGCA-CGGT-ACGGTTCGGTTCGGAA--CGCTTTG-AGGGC-NTGGT------TTGC-A---TA--------------A----------A----CG-TTCT---ATGAACGGT---ACGG-----TT-CGCTTCT-T-G-CAC-GGT---AC-GG-TTCG-C---T--TCTT-G-CA--CGGT---ACG------GT-TCGCTTCT
6 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|28 ): TTAACGATTTTGTCGTTAACATCTACGTTCAATGAAATACTAGCATTGTCATCTAAAATAATCAATTGAGCACTATTATTCTGTATTTAAAA
Unaligned ( gi|33 ): CACGGTATGGTTCGGTACGTTTCTGAGGTGTAGTAGCACTGTTTAGGGTCT
Unaligned ( gi|36 ): ATACACTCATCCATTTGTTTTTACTGAAAAAACCTCA
Unaligned ( gi|37 ): ACGTTTCTGAGGTGTAGTAGCACAGTTTAGGGTCTGT
Unaligned ( gi|38 ): ACACTTCTGAGGTGTAGTAGTACGGTTTAGGGTCTGT
Unaligned ( gi|39 ): CGTTTCTAGGTGTAGTAGCACGGTTTAGGGTCT
Alignments
lowQualScore : 333333333 2222 1 22 22222 222222 11 444444 1 1 11 44444444444444444 1 3333333 2222 1 4444444444 111111 111111 1111111 22222222222 111 1111 222222 1111 1 22222 111111 111 11 333333333333333333333333333333333333333333 11111111111 11111 111111 11 111 1 11111 22222222 1111 22222222 11111 33333333 11111 1 444444444444 111111 2222222222 222222222 1111 1111111 1111 11111111 1111 222222 11 111 111 111111 66666666666666666666666666666666666 1111 11111 1 111111 11 111111
lowQualScore : 1 222222222 8888 3 22 0 3 44444 6 666666 7 88 3 3 7 777777 6 88 2 3 88 7 66666666666666666 7 3 1 1 1 1 2222222 1 2 1111 0 3333333333 666666 555 444444 5 9999999 5 77777777777 000 0 1111 77 5 666666 0000 888 0 4 55 4 4 4 55 8 22222 4 4 4 222222 4 4 4 6666 555 5 1 4 777 66 666 66 9999 3 7777 55 99999 3 333 4 55 8 3 3 6666 3 00 77777 77777 2 555 555 3 444 7 3 3 666666666666666666666666666666666666666666 3 0 66666666666 0 3 3 4 0 8888 4 4 11111 444444 11 4 66 666 3 6 5 0 4 555 5 0 66 22222 1 44444444 3 5 1 5 5 5 66 5 66 0000 44444444 22222 1 66 22222222 22222 1 0 3 2 999999999999 5 5 222222 66 4 66 4 4 4444444444 1 4 3 3 2 5 1 999 666666666 99 5 1 4 77 4 66 4 9 33 2 4 5 1 5 0000 6 1 5 5 5 5 5 6666666 0000 88888888 0000 66 999999 55 6 5 5 6 222 6 000 999999 6 77777777777777777777777777777777777 5 0000 888 77777 0 666 000000 777 4 4 99999 66 8 4 00 777 222222 4
lowQualScore : . ......... .... . .. . . ..... . ...... . .. . . . ...... . .. . . .. . ................. . . . . . . ....... . . .... . .......... ...... ... ...... . ....... . ........... ... . .... .. . ...... .... ... . . .. . . . .. . ..... . . . ...... . . . .... ... . . . ... .. ... .. .... . .... .. ..... . ... . .. . . . .... . .. ..... ..... . ... ... . ... . . . .......................................... . . ........... . . . . . .... . . ..... ...... .. . .. ... . . . . . ... . . .. ..... . ........ . . . . . . .. . .. .... ........ ..... . .. ........ ..... . . . . ............ . . ...... .. . .. . . .......... . . . . . . . ... ......... .. . . . .. . .. . . .. . . . . . .... . . . . . . . ....... .... ........ .... .. ...... .. . . . . ... . ... ...... . ................................... . .... ... ..... . ... ...... ... . . ..... .. . . .. ... ...... .
lowQualScore : 0 000000000 3333 3 00 2 2 55555 5 000000 3 33 2 2 3 777777 7 00 0 3 33 3 00000000000000000 3 3 0 0 0 0 0000000 0 0 8888 0 3333333333 222222 999 444444 0 8888888 0 11111111111 000 7 4444 99 7 555555 6666 888 0 0 55 0 0 0 55 0 00000 4 4 4 888888 4 4 4 0000 888 0 7 4 888 11 000 11 4444 6 7777 00 11111 6 666 0 00 2 1 1 5555 1 99 77777 77777 1 444 444 6 111 3 6 6 777777777777777777777777777777777777777777 6 5 33333333333 4 6 6 0 9 5555 4 4 11111 444444 22 5 99 222 4 2 0 1 5 666 0 0 99 55555 4 11111111 1 0 0 0 0 0 99 0 99 6666 99999999 55555 1 99 55555555 55555 2 0 4 5 111111111111 0 0 888888 11 4 11 4 4 3333333333 1 4 6 6 5 0 4 333 777777777 22 7 6 6 33 4 11 4 9 44 5 5 0 0 0 6666 7 0 0 0 0 0 9 2222222 6666 11111111 2222 99 000000 88 7 7 7 7 333 7 222 222222 7 33333333333333333333333333333333333 7 1111 888 55555 0 111 999999 888 4 4 33333 11 9 4 66 888 888888 4
consensus : NNNNNNNNNNNNATGAACNCTATGCAAATTAAGTGGACGTACA---GTAGCTTTGTTTGATTGAC----AGTCGACTATT-CATTTTATTTAATTTCATTTAATGTGTAGACGTATTTAATTTCATGTTGAATTAAATTTTT----GTGTATTTTCGTGTCTGGAAGAAAAG--CGAAATTAAATCCAACACGAAT--TTTATTTTCAGAAAATCTTTATTTCAGTGTTAGAAATGTGCGTTTCTGTTATTCGTAGTCTAT--C--TCGATAAAATATTTCGCCAGTACCGTCATCGTTGTACTCGCACTTCGTT-TAT--AGAACGATTGCTG-CAAAA---G--ACAATTCATAATTAGACAC-TAACTCGGNACGNGTGCAAGTTTCGGNTTCAGTGTAATTAAGAATGATTACTATCAAAACATNTTGAGACACAAAGCCGGGAAGGTCGGAGTACAGGTACATGTAACTGCTCGTGCTGTGTCGTGGAGACGTACCNCGTACGTGCAT--G-AT-TT----------TACGTGTACATTG---T--ACATGATCTACATGTATGAATATAT-T-AT------TGTATTTGTTGG-T----T--AAAAAAAC-ATCGCTTAATATTATATTCATGTATGTTTTACA-----------GATCT---ACACATATGCACATAAAGCATCGATAAC---GGGAAA--AGTA-GTA-----ATATATAAATA----CAT---GTAAATTGACGTTTACAT-TTAAA-CTGGCA--CG-TGCCGCTGT-GGC-AG--GTGAA-CCC-----A-GACAATGTC-TTCTTA-CA------AA-CT-A-ATCCACC-CCTAA-GCCCCGGGAAATAA-CGCACACAACCAAAT-CA---AAA--CCA-C-G--A----CAGGGGTAAAAT-GGCTTCAAT----TCAGTA--CACGATC-----CACGGTCCTAA--TTAACCCTTA-ATT--GCATCACACATGTAACC-CACCCTC-TACT----CG-AAGCGAT-CAAC-----C-----ACGCAAGATT---G---AAGAAAGAT-ATCGAGAATTCCACT-C-TGCTGT-T-GAAGAATA-AATCATCGTATC-G-AAA-GCATTTATTATA----G------------------ATTAAG-AGAAAAATACCT----TAA----CGGGACC-T-ACAAAAAGCAT-TGAAGAAGTGATAATCATGACAATATTTCATTATATCAAATAT----CGTAT-A-AAA-----CTA------GCCA-AATTTGTTT--GT-G-CGGCTTTTTTTGCA-TAGGAATT---ACC-TTCTTCAT-ATTACA--TTTTGTTTCATT-----TTGAAGGGGGGA----AA-TCCAAAAACTTAC-TTANTC-TACA-T-GAT--TG-T--TGCACGAAATTATG----CAG----CG--CACA-----ATCTCCTTCAA--CATGT--------TATTAATGTGT-----AAATTAATC-AGTATTGTTCACTTTCG---A-----TC-AAATTA-TTACTGCATGT------TAT--CGT-GTAAA--TGC-AG-CTACTCGTA---TTTT---TTTAATACGC-AAATTGT-AAAT-GAGCACTTTGATCATATAATATAATATC-GTTGTGTTACCCTATTTACACACCGTAAAAAGAAGT--GAAAAGTTAATGATCTGATACATTG---------TATAAATATTGATA--ATTGGTTTAGGAAAATTACTCTGTCGAGTTG-TTTTTAAACCCGTAC-TTC-TTTTCAA--GTAT-TTCCCTAATTTTNACGGCTGAAAG-TCCTNTCGA-GTA----ATACTTAATCACGGTGTTACGAATGGCCAG-AGTTANTCTACGTCCTCCTTTAACGGGCTTC-AT-CGAG-AGA-AATNAA-------TGAAGA----TA--------AGA-T-TA--TTA-----GTAG--TATTACCTTA-TTAGGCATACTGCA-CGGT-ACGGTTCGGTTCGGAA--CGCTTTG-AGGGC-NTGGT------TTGC-A---TA--------------A----------A----CG-TTCT---ATGAACGGT---ACGG-----TT-CGCTTCT-T-G-CAC-GGT---AC-GG-TTCG-C---T--TCTT-G-CA--CGGT---ACG------GT-TCGCTTCT
Reference ( family-203 ) : NNNNNNNNNNNNATGAACNCTATGCAAATTAAGTGGACGTACA---GTAGCTTTGTTTGATTGAC----AGTCGACTATT-CATTTTATTTAATTTCATTTAATGTGTAGACGTATTTAATTTCATGTTGAATTAAATTTTT----GTGTATTTTCGTGTCTGGAAGAAAAG--CGAAATTAAATCCAACACGAAT--TTTATTTTCAGAAAATCTTTATTTCAGTGTTAGAAATGTGCGTTTCTGTTATTCGTAGTCTAT--C--TCGATAAAATATTTCGCCAGTACCGTCATCGTTGTACTCGCACTTCGTT-TAT--AGAACGATTGCTG-CAAAA---G--ACAATTCATAATTAGACAC-TAACTCGGNACGNGTGCAAGTTTCGGNTTCAGTGTAATTAAGAATGATTACTATCAAAACATNTTGAGACACAAAGCCGGGAAGGTCGGAGTACAGGTACATGTAACTGCTCGTGCTGTGTCGTGGAGACGTACCNCGTACGTGCAT--G-AT-TT----------TACGTGTACATTG---T--ACATGATCTACATGTATGAATATAT-T-AT------TGTATTTGTTGG-T----T--AAAAAAAC-ATCGCTTAATATTATATTCATGTATGTTTTACA-----------GATCT---ACACATATGCACATAAAGCATCGATAAC---GGGAAA--AGTA-GTA-----ATATATAAATA----CAT---GTAAATTGACGTTTACAT-TTAAA-CTGGCA--CG-TGCCGCTGT-GGC-AG--GTGAA-CCC-----A-GACAATGTC-TTCTTA-CA------AA-CT-A-ATCCACC-CCTAA-GCCCCGGGAAATAA-CGCACACAACCAAAT-CA---AAA--CCA-C-G--A----CAGGGGTAAAAT-GGCTTCAAT----TCAGTA--CACGATC-----CACGGTCCTAA--TTAACCCTTA-ATT--GCATCACACATGTAACC-CACCCTC-TACT----CG-AAGCGAT-CAAC-----C-----ACGCAAGATT---G---AAGAAAGAT-ATCGAGAATTCCACT-C-TGCTGT-T-GAAGAATA-AATCATCGTATC-G-AAA-GCATTTATTATA----G------------------ATTAAG-AGAAAAATACCT----TAA----CGGGACC-T-ACAAAAAGCAT-TGAAGAAGTGATAATCATGACAATATTTCATTATATCAAATAT----CGTAT-A-AAA-----CTA------GCCA-AATTTGTTT--GT-G-CGGCTTTTTTTGCA-TAGGAATT---ACC-TTCTTCAT-ATTACA--TTTTGTTTCATT-----TTGAAGGGGGGA----AA-TCCAAAAACTTAC-TTANTC-TACA-T-GAT--TG-T--TGCACGAAATTATG----CAG----CG--CACA-----ATCTCCTTCAA--CATGT--------TATTAATGTGT-----AAATTAATC-AGTATTGTTCACTTTCG---A-----TC-AAATTA-TTACTGCATGT------TAT--CGT-GTAAA--TGC-AG-CTACTCGTA---TTTT---TTTAATACGC-AAATTGT-AAAT-GAGCACTTTGATCATATAATATAATATC-GTTGTGTTACCCTATTTACACACCGTAAAAAGAAGT--GAAAAGTTAATGATCTGATACATTG---------TATAAATATTGATA--ATTGGTTTAGGAAAATTACTCTGTCGAGTTG-TTTTTAAACCCGTAC-TTC-TTTTCAA--GTAT-TTCCCTAATTTTAACGGCTGAAAG-TCCTNTCGA-GTA----ATACTTAATCACGGTGTTACGAATGGCCAG-AGTTANTCTACGTCCTCCTTTAACGGGCTTC-AT-CGAG-AGA-AATNAA-------TGAAGA----TA--------AGA-T-TA--TTA-----GTAG--TATTACCTTA-TTAGGCATACTGCA-CGGT-ACGGTTCGGTTCGGAA--CGCTTTG-AGGGC-NTGGT------TTGC-A---TA--------------A----------A----CG-TTCT---ATGAACGGT---ACGG-----TT-CGCTTCT-T-G-CAC-GGT---AC-GG-TTCG-C---T--TCTT-G-CA--CGGT---ACG------GT-TCGCTTCT
gi|1 : ATGAACTCTATGCAAATTAAGTGGA-----A---GTAGCTTTGTTTGATTGAC----AGTCGACTATTTCATTTTATTTAATTTCAATTAATAT--AGACGTATTTAATTTCATGTTGAAT--AATTTTTTTTTGTGTATTTTCGTGTCTGGAAGAACAG--CGAAATTAAATCCC-CACGGAT--TTTATTTTCAGAAAATCTTT--TTCAGTGTTAGAAATGTGCGTTTCTGTTATTCGTAGTCTATGTC--TCGATAAAATATTTCGTCATTACC--CATCATTGTACTCGCACTT-GTT-TAT--AGAACGATTGCTG-CAAAA---ATAACAATTTATAATTAGACAC-TAACTCGACACGTGTGCAAGTTTCGGGTTCAGTGTAATTAAGAATGATTACTATCAAAACATGTTGAGACACAAAGCCGGGAAGGTCGGAGTACAGGTACATGTAACTGCTCATGTTGTGTCGTGGAGAAGTACCCCGTCTGTGCAT--G-AT-TT-----------GCGTGTACATTG---T--ACATGATCTGCATGTATGAATATAT-T-AT------TGTATTTGTTAG-T----T--GAAAAAAC-ATCGCTTAATATTATATTCATGTATGTTTTACA-----------GATCT---ACATATATGCACATAAAGCATCGATAAC---AGGAAA--AGTA-GTA------TATATAAATA----CAT---GTAAATTGACGTGTACAT-TTAAA-CAGGCA--CG-TGCCGCTAT-GGC-AG--GTGAA---------------------TTCTTA-CA------AA-GT-A-ATCCACC-CGTAA-GACCCGGAAAATAA-CACACACAACCAAAT-CA---AAA--CCA-C-G--A----CAGGGGTAAAATTGGTTTCAAT----TCAGTA--CACGATC-----CACGTTCCTAA--TTAACCCTTA-ATT--GCATCACACATGTAACC-CACCCTC-TACT----CG-AAGCGAT-CAAC-----C-----ATGCAAGATT---G---AAGAAAGAT-ATCGAGAATTCCACT-C-TGCTGT-T-GAAGAATA-AATCATTGTATC-GGAAA-GCATTTATTATT----A------------------ATTAAG-AGAAACATACCT----TAA----CAAGATC-T-ACAAAAAGCAT-TGAAGAAGTGA---------CAATGTTTCATTATATCAAATAT----CGTAT-A-AAA-----CTA------GCCA-AATTTCTTT--GT-G-CGGCTTTTTTTGCA-TAGGAATT---ACC-TTCTTCAT-ATTACA--TTTTGTTTCATT-----TTGAAG--------------CAAAAAACTTAC-TTAATC-TACA-T-GAT--TG-T--TGAACGAAATTATG----CAG----CA--CACA-----ATTTCTTTCAA--CATGT--------TATTAATGTGT-----AAATTAATC-AGTATTGTTCACTT--G---A-----TC-AAATTA-TTACTGCATGT------TATATCGT-GTAAA--TGC-AG-CTACTTGTAATTTTTT---TTTAATACGC-AAATTGT-AAAT-GAGCACTTTGATCATATAATATAACACC-GTTGTGTTACCCTATTTATACACCGTAAAAAGAAGT--GAAAAGTTAATGATCTGATACATTG---------TATAAATATTGATA--ATTGGTTTCGGAAAATTACTCTGTCGAGTTGTTTTTTAAACCCATAC-TTC-TTTTCAA--GTAT-ATCCCTAATTTT-AC-----AAAG-TCCTTTCGA-GTA----ATACTTAATCACGGTGTCACAAATGGCCAG-AGTTATTCTACGTCCTCCTTTAACGAGCTTC-AT-C-AG-AGA-AATTAA-------TGATAA----TA--------AGA-T-TAGTTTA-----ATAG--TGTTACCTTA-TTAGGCATAATGCA-CGGT-ACGG---G--TCGGAA--CGCTTTG-AGGGC-GTGGT------TTGC-A---TA--------------A----------A----CG-TTCT---ATGAACTTT---ACGA-----TT-CGTTTCT-T-G-CAC-GGT---AC-GG-TTCG-T---T--TCTT-G-CA--CAGT---ACG------GT-ACGATTCT
gi|10 : gatgaacgattaAGTATAT-T-AT------TGTATTTGTTGG-T----T--AAAAAAACTATCGCTTAATATCATATTC------------------------------------CATATACGCATAAATCATCGATAAC---AGAAAA--AGTA-GTACATGTATATATAAATA----CAT---GTAAATTGACGTTTACAT-TTAAA-CTGGCA--CG-TGCTGCTGT-GGC-AG--GTGAA-CCCC----A-GACAATGTC-TTCTTA-CA------AA-CT-A-ATCCACC-CCTAA-GCCCCGGGAAATAA-CGCACACAACCAAAT-CA---AAA--CCA-C-G--A----CACAGGTCAAAT-GGTTTCAAT----TCAGTA--CACGATT-----CACGTTCCTAA--TTAACCCTTA-ATT--GCATCACACATGTAACC-CACTCTA-TATT----CG-AAGCGAT-CAAC-----C-----ACGCAAGATT---G---AAGAAAGAT-ATCGAGAATTCCACT-C-TGCTGT-T-GAAGAAT--------CGTA------AT-GCATTTATTATA----G------------------ATTAAG-AGAAAAATACCT----TG----------------CAAAAAGCAT-TGAAGAAGTGATAATCATGACAATATTTCATTTTATTATACTT----C-TGT-A-AAA-----
gi|11 : gggggggggggggggggggggggttagtccagataggacagttctTCATTATATCAAATATGTATCGTAT-A-AAA-----CTA------GCAA-AAATT-TTT--GT-G-CAGCTTTTTT-GCA-TAGGAATT---A----TCTTCAT-ATTACA--TTTTGATTCATT-----TTGAAGGGGGGGGGGGAC-TCCAAAAACTTAC-TTAATG-TACA-T-GAT--TG-T--TGCACGAAAGTTTG----CAG----TA--CACATCACAATTTCCTTCAA--CA-----------------TGT-T-----AAACT--TA-AGTA-----------------------C-A-------TACTGCATGT------TAT--CGT-GTAAA--TGC-AG-CTACTAGTA---TTTT---TTTAATACGC-AAAATTT-AGAT-GAGCACTTTGAT-ATATAATATAGTAACTGTTGTGTTACCCTATTTACACAGTGTAAAAAGAAG-------------TGATCTGATACACTG---------TATAAATATTGAAA--ATTGGTTTAGGAAAATTACTCTGTCGAATTG---------------------TTTTCAA--GTAT-TTCCCTAATTTTTATAGCT-AAAG-TCCTTTCGA-GTA----ATACTTAATCATGGTGTTACGAATGGCCAG-AGTTAGTCTACGTCCTCCTTTAACGGGCTTC-AT-TGAA-AGA-AATAAA-------TGAAGA----TA--------AGA-T-TA--TTA-----GTAatgttt
gi|12 : CGTACCTCTTTAATGGGCTCCCATGCGAG-AGA-AAT-AA-------TGAGAACATGTA--------AGAAT-TA--CTACAAATGTAGATTATTACCTTAGTTAGGCAATCTGCAGCGGT-ACGGTTTGCGTCGGAAGCCGCTTTG-AGGGG-TTGGT------TTGC-AG--TAATAATTTATTTGAGA----------A----CG-TTATTTAATGAGGTGT---ACGG-----TA-CGCTTCT-T-G-CCA-AGA---AC-GG-TTCG-C---T--TCTT-G-TT--C-GT---A-G------GT-TCGCT
gi|12 : TGCACGGT---ACAGGGTTGTT-CGCTTCT-TAG-TAC-GGT---AC-GT-TTCG-C---T--TCTTGG-TAC-CGGTTAAACG------GT-TCGTTgttcttgcacgtactgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttttgcacggtacagggttgttcgcttcttagtacggtacgtttcgcttcttggtaccggttaaacggttcgttcgtctttgcacgatacggttcggctatcagtttctgaggtgtagtaggcacggttctaggtca
gi|12 : cgtacctctttaatgggctcccatgcgagagaaataatgagaacatgtaagaattactacaaatgtagattattaccttagttaggcaatctgcagcggtacggtttgcgtcggaagccgctttgaggggttggtttgcagtaataatttatttgagaacgttatttaatgaggtgtacggtacgcttcttgccaagaacggttcgcttcttgttcgtaggttcgctgttcttgcacgtactgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttttACGGT---ACGT-----TT-CGCTTCT-T-GGTACCGGTTAAAC-GG-TTCG-T---TCGTCTTTG-CA--CGAT---ACG------GT-TCGcgtctttgcacgatacggttcggctatcagtttctgaggtgtagtaggcacggttctaggtca
gi|13 : cgtacctctttaatgggctcccatgcgagagaaataatgagaacatgtaagaattactacaaatgtagattattaccttagttaggcaatctgcagcggtacggtttgcgtcggaagccgctttgaggggttggtttgcagtaataatttatttgagaacgttatttaatgaggtgtacggtacgcttcttgccaagaacggttcgcttcttgttcgtaggttcgctgttcttgcacgtactgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttttgcacggtacagggttgttcgcttcttagtAATGTGCGTTTCTGTTTTTCGTAGTCTA-------CGATAAAATATTTCGCCAGTACTGTCATCATTGTACTCGCACTTTGTTCTATTTAGAACGATTGCTGTCAAAACAGG--ACAATTCATGATTGGACAC-TAACTCGGAACGAGTGCAAGTTTCGGTTTCAGTGTAATTAAGAATGATTACTATCAAAACATTTTAAGACACAAAGCCGGGAAGGTCAAAGTACAG---C---TAACTGCTCGTGCTGTGTCGTGAAGACATACCTCGTATGTGCAT--A-AT-TT----------TGTGTGgctatcagtttctgaggtgtagtaggcacggttctaggtca
gi|13 : CACGTACATGCATTTA-ATATTCAGA------TACGTGTACATTG---T--ACATGTTCTACATGTATGAATATAT-T-AT------TGTATTTGTTGG-T----A--GAAAAAAC-ATCACTTAATATTATACTCATATATGTgcaggagagacatattgaaaataaaaataagtaaactgatttaaaaaaaaaagtttcttccttatgcacattgtgcacgtacatgcatttaatattcagatacgtgtacattgtacatgttctacatgtatgaatatattattgtatttgttggtagaaaaaacatcacttaatattatactcatatatgt
gi|14 : aatgtgcgtttctgtttttcgtagtctacgataaaatatttcgccagtactgtcatcattgtactcgcactttgttctatttagaacgattgctgtcaaaacaggacaattcatgattggacactaactcggaacgagtgcaagtttcggtttcagtgtaattaagaatgattactatcaaaacattttaagacacaaagccgggaaggtcaaagtacagctaactgctcgtgctgtgtcgtgaagacatacctcgtatgtgcataattttgtgtggcaggagagacatattgaaaataaaaataagtaaactgatttaaaaaaaaaagtttcttccttatgcacattgtgCGTCCTCCTTTAACGG-CTCC-AT-AGAGTAGA-AATTAAAGTATAGTGAAAA----TACATCGTGAAGA-TATA--CTACAAATGTTGA-TATTAC-TTA-TTAGGCATACTGCC-CGGTAACGGTTCGGTTCGGA----GCTTTG-AGGGCTGTGG-------TTGCGA---TA--------------ATTTATTTGAGA----AGTTTCT---ATGAG-GGTGTAACGGA----TTATGCTTCT-T-G--AC--GT---AC-GG-TTCG-C---T--T-TT-G-TA--CGGT---ACG---------TTGCTTCT
gi|15 : ACGCATTGCGCATGTACAT--GCAT-TTAATATACAGATACGTGTACATTG---T--ACATGATCTACATGTATGAATATAT-T-AT------TGTCTTTGTTTG-T----TAAAAAAAAAC-ATCG-TTAATATTATATTCATGTATTTTTTAAA-----------GATCT---ACACATATGCACAtagtgcggtagagtggttgtacgctttcagttggcagtaagttcgcttttggcgctcggtacggatttaggtgttctggcagggtatcgggtcgttctgatgcaagtacggtcgttgttgcggggatacgtgttgttttcttgcacagagtcgagttcggcttctgtagggtttcgtttcttgtgcgatcgtgttatggttgtcggttttcgtttctgcaggtggttagcagg
gi|15 : gaaaataaaaataaatacactgatttaaaaacaattgattttcttccttatAAAT-GGCTTCAAT----ACAGTA--CACGATC-----CACGGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaatggcttcaatacagtacacgatccacggcta
gi|16 : gaaaataaaaataaatacactgatttaaaaacaattgattttcttccttatacgcattgcgcatgtacatgcatttaatatacagatacgtgtacattgtacatgatctacatgtatgaatatattattgtctttgtttgttaaaaaaaaacatcgttaatattatattcatgtattttttaaagatctacacatatgcacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnA-CTGGCA--TG-TGCCACTGT-GGC-AG--GTGAACCCC-----A-GACAATGTT-TTCTCA-CT------AA-CN-A-cta
gi|16 : A-CTGGCA--TG-TGCCACTGT-GGC-AG--GTGAA-CCCG----A-GACAATGTT-TCCTCA-CA------AA-CT-A-ATctggcatgtgccactgtggcaggtgaacccgagacaatgtttcctcacaaactaatgcgtttactgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtaacccaccctctactcgaagcgatcaatcgtggcacgcaatattgaagataattccactgttgttgaagaataaatcatcgtatcggaaagcatttatagcttaagagaaaaataccttaacgagatctacaaaaagcatttaagaagtgataatcatgacaatatttcaccatatcaactatc
gi|16 : actggcatgtgccactgtggcaggtgaaccccagacaatgttttctcactaacnATGTAACC-CACCCTC-TACT----CG-AAGCGAT-CAAT-----CGTGGCACGCAATATT---G---AAGA-------T----AATTCCACT----GTTGT-T-GAAGAATA-AATCATCGTATC-GGAAA-GCATTTAT---A----G------------------CTTAAG-AGAAAAATACCT----TAA----CGAGATC-T-ACAAAAAGCAT-TTAAGAAGTGATAATCATGACAATATTTCACCATATCAACTAT----Cgcgtttactgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtaacccaccctctactcgaagcgatcaatcgtggcacgcaatattgaagataattccactgttgttgaagaataaatcatcgtatcggaaagcatttatagcttaagagaaaaataccttaacgagatctacaaaaagcatttaagaagtgataatcatgacaatatttcaccatatcaactatc
gi|17 : actggcatgtgccactgtggcaggtgaaccccagacaatgttttctcactaacnactggcatgtgccactgtggcaggtgaacccgagacaatgtttcctcacaaactaatgcgtttactgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn----------TACGTGTACATTG---T--ACATGACCTACATGTATGAATATAT-C-ATAATGATTGTCTTTGTTGG-T----T--AAAAAAGC-ATCGCT-GATATTATATTCATGTATGTTTTACA-----------GATCT---ACACATATGCACTTAAAGCATCGATAAC---AGAAAA--AGTA-GTA-----ACATATAAATA----CAT---GTAAATTGACGTTTACAT-TTAAA-CTGGCA--CG-TGCCGCTGT-GGC-AG--GTGAACCCC-----A-GACAATGTC-TTCTTA-CA------AA-CT-A-ACCCACC-CCTAA-GCCCTGGGAAATAA-CACACACAACCAAAT-CA---AAA--CCA-C-G--A----CAGGGGTAAAAT-GGCTTCAAT----GCAGTA--------------CACGGTTCTAA--TTAACCCTTA-ATT--GCACCACACATG
gi|18 : taatatacagaATGAACGCTATGCAAATTAAGTGGACGTACACATGTAGCTTTGTTTCATTGAC----AGTCGACTATT-CATTTTATTTAATTTCATTCAATGTATAGACGTATTTAATTTCATGTTGAATTAAATTTTT----GTGTATTTTCGTGTCTGGAAGAAA--------------TCCAACACGAAT--TTTATTTTCAGAAAATCTTTATTTCAGTGTTAGAAATGTGCATTTCTGTT
gi|19 : GTTG-TTTT-AAACCCGTAA-TTC-CTTTCAA--GTAT-TTCCTTAATTCTTATGGGTGAAAG-TCCTGTTGA-GTA----ATACTTAATAATGGTGTTACGAATGACCAA-AGTTAACCTCCGACCTCCTTTAACGGGCTCC-AT-CGAG-AGA-AATAAA-------TGATTA----TA--------ACA-T-TA--T--------TAG--TATTACCTTA-TTAGGTATACTGCA-CGGT-A
gi|2 : GTGTTCATTGACTTGAACATGATCTACATGTACGGATATATATGAT------TGTATTTGTTGG-TAAAAC--AAAAATAC-ATCGCTTCATATCATATCCATGTATGTTTCACATATTTTAAATAAATCT---ACACATATGCACAAAAAGCATCGATAAC---AGGAAA--AGTA-GT-------T-TATAAGTA----CAT---GTAAAGTGACGCTTATAT-TTAAA-CTG-CA--CG-TGCCGTTGT-GGC-AG--GTGAA-CCT-----A-AGCAATGTC-TTCTTA-CATGTACAAA-CT-A-ATCCACC-TC-AA-GCCCCGAAAAATAAACGCACACAGCCACCT-CA---AAA--TCA-T-G--A----CAGGGGTAAAAT-TGTTTCAAT----TCAGTA--CATGATCTGATCCACGGTCCTAA------CCCTTA-ACT--GCATTACACATGTAACC-CACTCTC-TACT----CG-AAGCGAT-CAAC-----C-----TCGCAAGATT---G---AAGA---------------TTCACT-A-TGCTGT-T-ACAGAATA-AATCATCATATCCG-AAA-GCATTTATTATA----G------------------ATTAAG-AGAAAAATACCT----TAA----CAGGATC-T-ACAACAAGCAT-TGAAGAAGTGATAATCAAGGAAATATTTCATTATATCAAATAT----CGTAT-A-AAA-----CTA------GACA-AATTACTTT--GT-G-CGGC-TTTTTTGCA-CAGGAATT---ACC-TTCTTCAT-ATTACA--TTTTATTTCATT-----TCGAAAGGGAAA----AACTCCAAAAACTTAC-TTACTC-TACA-T-GAT--TG-T--TGCACGACATTACG----TAG----TG--CACC-----ATATCCTTCAA--CATGT--------TATTAATGTGT-----AAAATAATCAAACATTGTTCACTT--G---A-----TC-AAATAA-TTACTGCATAT------TAT--CGT-GTAAA--TGC-AG-CTACTAGTA---TTTT---TTTAATA-GCTAAATTGT-AAAT-GAGCACTTTCATCGAATAATATAGTATT-GTTGTGTTACCCTATTGACACAGTGTAAAAAAAAAGAAGAAAAGTTAATGATCTGATACATTG---------TATAAATATTGACAACATTGGGTTAGGAAAATTACTCTGTCGAGTTG-TTGT--AACCAGTAT-TTCTTTTTCAA--ATAT-TTCCCTAGTTTTAACAGCTCAAAG-TCCTTTCGA-GTAGTATATACTTAATAATGGTGTTACGAATTCCAAG-AG-TAAACTACGTCCTACTTAAACGGGCTTC-AA-CGAG-AGA-AATAAA-------TGAAGA----TA--------ATA-T-TA--T
gi|20 : T---AC-GG-T-CG-C---T--TCTT-G-CA--CGGT---ACG------GT-TCGCTTCT
gi|20 : -TTCT----TGCACGGT---ACGG-----TT-CGCTTCTGC-G-CGT-GGT---AC-GGCTTCG-TGTAT--TCTT-G-CA--CGGT---AAG------GTATCGCTgcgcgtggtacggcttcgtgtattcttgcacggtaaggtatcgctctgtacgtaacggttgcgctcttgtacgtacgggttcgttttcttgccacccggtacgttcgacgttcgtttctgaggtgtacggtagccacggtttagatc
gi|20 : tacggtcgcTGCA-CGGT-ACGGTTCGCTTCTG----CGCGTGGTACGGC-TTCGTGTATTCTTGC-ACGGTA--------------A----------GGTATCG-CTCT---GT--ACGTA---ACGG-----TTGCGC-TCT-T-G-TAC--GT---ACGGG-TTCGTT---T--TCTT-GCCACCCGGT---ACGTTCGACGT-TCGTTTCTctgtacgtaacggttgcgctcttgtacgtacgggttcgttttcttgccacccggtacgttcgacgttcgtttctgaggtgtacggtagccacggtttagatc
gi|21 : tacggtcgcttctGATAACTCTGGGAAACAAGTTTGTA-----ATAAATAAATAGTCACATTGCATATATTGACGTTTACAT-TTAAACCTTGCA--CGTTGCCATTG--GGCAAG--GTGAA-CTC-----gaggtgtacggtagccacggtttagatc
gi|22 : agaaaatcatcaaacatcataatgacaatcccatattcggaagaaaaagtcagtccgATGTCCAAAAAATCTTTATTTCAATTTTTGAAACCTGTGTTTCTGTTATGTGTTGTCCAT--TTATAGATAACAAATTTAGCCAGTACCGTAATCG----------ACCCCATT-TAT--AT-ACAAT--------------G--AC----CATATTTAGACACTTAACTCG
gi|23 : AACC-CACCCTC-AACT----CG-AAGCGAA-CAAT-----C-----ACGCACGATT---G---AAGAAAGAT-ATCGAGAACTTCACT-C-TGCTG---------------CCACCGTATC----------T------TA----G------------------ATGAAA-AGAATAATACCTTAAATAA----CGGGACT-T-ACAA
gi|24 : acATTAAGTGGACGTAC--------CTTTGTTTGATTGACGTCAAGTCGACTATC-CATTTTATTTAATTTCATTTAATGT--AGAAGTATTTAATTTTATGCTGAATTACATTTTT----GTATATTTTCGTG
gi|25 : GTAAATGTATTAAATTTTGTGTTGGATTAAATTTT-----GC-TATTTTCATGTCTGGAAGAAAAGAACAAAATTAAATCCAAAACAAATTCTTTA-TTTCAG--AATCTTT
gi|26 : TATACATGTAT-T-AT------TGTATTTCTTGGTT----T--AAAAAAAC-A-CGCTTTATATTAT----ATGCATGTTTTACA-----------GATCT---A--------CACATAAAGCATCGATAAC---AGGAAA--AGTA-Gtt
gi|27 : -----AAATAAATC-A---TTGTTCACTTTCA---AAAAAGTC-AAATTA-TCAATGCATGT------TAT--CGT-GTAAAACTGTGAGCCTACTCGTA-------------AACG-GC-ACATTGTAAAAT-GA
gi|29 : aAATTGT-AAAT-GAGCACTTTGATAATATAATACAATATC-GTTGTGTTACCCATTTTACACACCGTAAAAAGAAAT--GAAAAGTagc
gi|3 : -GGCTTCAAT----TCAGTA--TACGATC-----CACGGTCCTGA--TTAACACTTA-ATT--GCATCACACATGTAACC-CTCCCTT-TACT----CG-AAGCGAT-CAAC-----C-----ACG---------------AGAA---T-ATCGAGAATTCCACT-C-TGCTGT-T-GAAGAATA-AATCATAGTATC-GGAAA-GCATTTATTATA----A------------------ATTAAG-AGAAAAATATCT----TAA----CGACATC-T-ACAAAAAGCAT-TGAAGAAGTGATAATCATGGCAATATTTCATCATATCAAATAT----CGTAT-A-AAA-----CTA------ACCA-AATTTGTTT--GT-G-TGG---TTTTTGCA-TAGAAATT---ACC-TTCTTCAT-ATTAAA--TGTTATTTCATT-----TTGAAGGGGGAA----AAATCCCAAAACTTAC-TTAATC-CACA-T-GAT--TG-T--TGCACGAAATTATG----CAG----CA--CACA-----ATTTCCTTCAA--CATAT--------TATTAATGTGT-----AAACTAATC-AGTATTTTTCACTT--A---A-----TC-AAATTA-TTACTGCATG------------CGT-GTGAA--TGC-AG-TTACTCGTA---TTTTTTTTTTAATACGC-AAATTGT-AAAC-GAGCACTTTGATCATATAATATAATATC-GTTGTGTTATCCTATTTACACACTGTAAAAAGAAGT--GAAAAGTTAATGATCTGATACATTG---------TATAAATATTGATA--ATTGGTTTAGGAAAATTACTCTGTCGAGTTG-TTTTTAAACTCGTAC-TTC-TTTTCAA--GTAT-TTCCCTATCTTTCACACCTAGAAG-TCCTTTCCA-GTA----ATACATAATCACCGTGTTACAAATGGCCAG-AGTTATTCTACATCCTCCTTGAACGGGCTTC-AT-CGAG-AGA-AATTAA-------TGAAGA----TA--------GG-----A--TTA-----ATAG--TATTACCTTA-TTAGGCATAGTGCG-CGGT-ACGGTTCGGTTCGGAA--TGCTTTG-AGGGC-GTGGT------TTGC-A---TA--------------A----------A----CG-TTCT---ATGAACTGT---AAGG-----TT-CGTTGCT-A-G-CAA-GGT---AC-GG-TGCG-C---T--TCTT-G-CG--CGGT---ACG------GT-TC
gi|30 : TTTAAACCCGTAA-TTA-TTTTCAA--GTAT-TTCCCTAATTGTAATGGGTGAAAG-TTCTGTTGA-GTA----ATACTTGATTAcgcgatatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaacgtttctgaggtgtagtagcacggtttaggatctg
gi|31 : ttggTTTAAACACGTAAATTA-TTTTCAAAAGTATGTCCCCTAATTGTAATGGGTGAAAGTTTCTGTTGAGGTA----ATATT
gi|32 : ttggT--GCATCACA------ACC-CACCCTC-TACT----CG-AAGCGTA-CAAC-----C-----ACGCACGATT---G---AAGAAAGA
gi|34 : ATTGT-AAAT-GAGCACTTTGATAATATAATATAATATC-GGTGTGTTACCCT
gi|35 : GTAACC-CACCCTC-TACT----CG-AAGCGAT-CAACCGTGGC-----GCGCAAGATT---G---AA
gi|4 : TA----CAT---GTAAATTGACGTTTACATCTTAAA-CTGGCAAGCG-CGCCGTTGTTGGC-AG--GTGAC-CCC-----AAGACAATGTC-TCTAAA-CA------AA-GT-ATATTC----------------GAAAATAA-CGCACACAACCAACT-CA---AAA--TCAAT-G--A----CAGGGGTAAAAT-GGCTTCAAT----TCAGTAAACACGATC-----CACG-TCCTAA-----ACC-TTA-ATT--GCATCACA------ACC--ACCCTCGTACTAGTACG-AAGCGAAACAAC-----C-----ACGCACGATT---G---AAGAAAGAT-GTCGAGAATTTCACT-C-TGCTGT-TCGAAGAATACAACCATCGTATC----------TT-----TA----G------------------ATTAAG-AAACTAATACCTTAAATAA----CGGGACCTT-ACAAAAAGCATCTGAAGAAGTGATAATCATGACAATA-TTAATTTTATCAAATAT----CGTAT-GCAAA-----CTA------GCC--AATTTGTTTTGGTGG-CGGTTTTTTTTGC------AACTGTAACCATTCTTCAT-ATTACA---TTTGTTTCATT-----TTGAAGGGGGGA----A------------TAC-TTACGC-TACA-T-AATAATG-T--TGCACG-AATTATG----CAG----TT--CATA-----ATCTCCTTCAA--CATGTTGCATG--TATTAATGTGT-----AAAATAATCAAACATTGTTCACTTTCA---AAAT--TC-AAATTACTCAATGCATGT------T-T--CGT-GTAAA--TGT-AG-CTACTCG-A-------------AATACGC-ACATTGT-AAATCGAGC
gi|5 : tnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgACCACCTAAAGCCCCGGGAAATAA-CGCACACAACCAAAT-------GA--TCA-T-G--AAAACCAGGGGTAAAAT-GGCTTCAAT----TCAGTA--CACGATC-----CACGGTCCTAA--TTAACCCTTA-ATT--GCATCACACATGTAACC-CACCCTC-TACT----CG-AAGCGA------------------CG----------G---AAGAAAGAT-ATCGAGAATTCCACT-C-TGCTAT-T-GAAGAATA-AATCATCGTATC-G-AAAAGCATTTATTATA----G------------------ATTAAG-AGAAAAA----------------------------AAAAAGCAT-TGAAGAAGTGATAATCATGACAATATTTCATCATATCAA-TAT----CGTAT-A-AAA-----CTA------GCC-------GTTT--GT-G-CGGCTTTTTT-GCA-TAGGAATT---ACC-CTCTTGGT-ATTACACATGTTGTTTCATT-----TTGAAGGGGGGA----AA-ACCAAAAACTTAC-TTAATC-TACA-T-GAC--TG-T--TGCACGAAATTATG----CAG----CA--CACA-----ATTTCCTTCAA--CATGT--------TATTAATGTGT-----AAATTAATC-AGTATTGTTCACTT--G---G-----TC-AAATTA-TTACTGCATGTTACGTGTAT--CAT-GTAAA--TGC-AG-CTACTCGTAT--TTTT---TTTAATACGC-AAATTGT-AAAT-GAGCACTTTGATCATATAATATGATATC-GT--TGTTACCCTATTTACACACTGTAAAAAGAAGT--GAAAAGTTTATGATCTGATACATTGTATCTACATTATAAATATTGATA--ATTGGTTTAAGAAAATTACTCTGTCGAGTTG-TATTTAAACCTGTAC-TTC-TTTTCAA--GTAT-TTCCCTAATTTT
gi|6 : A----CAT---G-AAATTGACGGTTACATGTTAAA-CTG-CA--CG-CGCGTTTTT-TGC-AGAAG-GAA-CCTCTCTAA-GACAATGTCCTTCTTAACA------AAGTT-A-AT--ATC-GAAAA-A----GTGAGATAA-CGCACACAACCACCTTCATATGAA--TCA-T-AGTA----CAGGGGTAAAAT-CGCT-CAAT-----CAGTA--CAC-ATC-----CACG-TTCTAAACTTAATCCTTGCATT--TCATAACA------ACCTCACCCTC--AC-----CG-AAGCGAAACAAC-----C-----ATGCTAGATTTAAGTTTAAGAAAGA--ATCGAGAATTTCACTTC-TGCTGTGT-GTAAAATA-AACCATC----C-A-AA---C-----TTAGA----G------------------ATCAA-----ATAATACCT----TAATACGCGGAACC-TTACAAAAAGCAT-TGAAGAA-TGATAATCA-GACAATATTAATTTATGCAAAAT-T----TGTAT-A-AGAAAATCTTATCCCGCGCCAGAATTTGTTT--GT-GTCGGCATGTT--GCAATAA--------ACC-TTTTCTATCATTACA--TTTTGTTCAATCCATAATTGAA---GGGA----AA-TACAA----TTAC-C--GTCTTACATT-GAA--TG-TTATGCACGAAATTA-GTCCCCAGTCTATGTTCACA-----ATCCCCCTCAAACTATGT--------
gi|7 : atcaattcagtcattgtttcatcgtttggtcccattaaatattcataaatcgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggtaagcctta----------TACGTATACATTG---A--ACGTGATCTATATGTATGAATATAT-G-AT------TGTATTTGTTCG-T-------AAAAAAAA-ATCGCTTAATATCATATTCATGTACGTTTTACA-----------AATTTGAAACAAATCTACACAAAAAGCATCGATAAT---GGGAAA--AGCA-GTAT----ATATAT---TA----CAT---GTAAATTGACGCTTATAT-TTAAA-CTGGCA--AG-TGCCGTTGT-GGC-AG--GTTAA-TTCT----A-GACTAAGTC-TTCTTT-CA------AA-CCCA-ATCCACC-CCTAA-TCCCCAAAAAATAA-CGCACACAACCACCT-CA---AAA--CCA-C-G--A----CAGGGGTAAAAT-GGCTTCAATATAATCAGTA--CATGATC-----CACGGACC------TAACCCTTA-ATT--GCATTACACATGTAACC-CACCCTC-TACC----CG-AAGCGAT-CAAC-----C-----ATGCAAGATT---G---AAGAAAGAT-ATCGAGAATTTCACT-C-TGCTGT-T-GAAGAATA-AATCATCGTATCGG-AAA-GCATTTATTATACAATGTACATTATGTACATGTACATTAAG-AGAAAAATACCT----TAA----CGGGACC-T-ACAAAAAGCAT-TGGAGAAGTGATAATCATGAgtctagtccatgtatc
gi|8 : taccccgtcagtgcattgttttgtgtggcaggatagacttatgttgaaaataaaaataaatacactgatttttttccttatacacatagtgcatgcacatgcatttaatatacagaCATGT------TAT--CGT-GTAAA--TGC-AC-CTACTCGTA---TTTT---TTTAATACGC-AAACTGT-AAAT-GATCACTTTGATCATATAATATAATATC-GTTGTGTTACCCTATTTACACATTGTAAA--GAAGT--GAAAAGTTAATGATCTGATACATTG---------TATAAATATTGATA--ATTGGTTTAGGAAAATTACTCTGTCGAGTTG-TGTTTAAACCCGTAC-CTC-TTTTCAA--GTAT-TTCCCTAATTTTTAGGGCTGAAAG-TCCTATCGA-GCA----ATACTTAATCACGGTGTTACAAATGGCCAGAAGTTATTCTACGTCCTCCTTTAACGGGCTTC-AT-CGAG-AGAGAATTAA-------TGAAGA----TA--------AG-----A--TTA-----ATAG--TATTACCTTA-TTAGGCATACTGCA-CGGT-ACGGTTCGGTTCGGAA--CGCTTTG-AGGG--TTGGT------TTGC-A---TA--------------A----------A----CG-CTCT---ATGAAC
gi|9 : AAT-CA---AAGATTCA-CTG--A----CAGGGGTAAAAT-GGCTTCAAT----TCAGTA--CACGATC-----CACGGTCCTAA-----ACC-TTA-ATTTTGCATCACA-----AACC-CACCCTC-TACT----CGGAAGCGAA-CAAA-----C-----ACGCACGATT---G---AAGAAAGATGATCGAGAATTTCACT-CATGCGGGGT-GGAGAATA-A-CCATCGTAT--------------ATTA------G------------------ATTAAGGAGAATAATACCT----TAAATAATGGGACC-T-ACAAAAAGCAT-TGAAAGAATGATAATCATGACAATATTTAAATTTATCAAATAT----CGTATAA-AAA-----CTA------GCTC-TATATATTT--GC-----GCTTTATTTGCA-T-----TTAA-ACC-TTCTTCATAATTA-A--TTTTGTTTCATT-----TTGAAGAAGGGG----AA-----------TACGTTACGC-TACA-TGGAA--TGCT--TGCACGAAATCATG----CAG----T---CACA-----ATCTCCTTCAA--CATGCTTACAATGTATTAATGTGTTAAAAAAATCAAAC-ATTGTT-TTCACTTTCGAAAA-----TCAAAATTA-TCCATGCATGT------TAT--CGTGGGAAA--TGT-AG-CTACTCGTA-------------AA-ACGC-ACATT-T-AAAT-GAGCtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtacatttcttaggtgtagtagcacggtttagggtctg
6 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|28 ): TTAACGATTTTGTCGTTAACATCTACGTTCAATGAAATACTAGCATTGTCATCTAAAATAATCAATTGAGCACTATTATTCTGTATTTAAAA
Unaligned ( gi|33 ): CACGGTATGGTTCGGTACGTTTCTGAGGTGTAGTAGCACTGTTTAGGGTCT
Unaligned ( gi|36 ): ATACACTCATCCATTTGTTTTTACTGAAAAAACCTCA
Unaligned ( gi|37 ): ACGTTTCTGAGGTGTAGTAGCACAGTTTAGGGTCTGT
Unaligned ( gi|38 ): ACACTTCTGAGGTGTAGTAGTACGGTTTAGGGTCTGT
Unaligned ( gi|39 ): CGTTTCTAGGTGTAGTAGCACGGTTTAGGGTCT