lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 2222222 777777777777777777777 1111 2222222222222222 111111111111111 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 111 111111111 111111 222222 3333333333333333333333333333333333333 11111111 3333333333333333333333333333 111 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 4444444444444444 1111111 222 11 666666 11 333333333333333 666666666666666 111111 11 444444444444444444444 111 11111 333 111 3333333333333 22222222222222 3333 222 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 11 22222222222 11 666666666666666666 444444444444444444444444 7777777777777777777777777777777777777777777777777777 1111 33333 11111 22222 1 11 111 333 222 55 11 1 33 77777777777777777777777777777777777777777 2222 222 11 2 1 222 1111111 1 11 111 33333 2222222222 7777777777777777 44444444444444444444 11 4444444444 33 22 111 444444444444 2222222 22 3333 44444444 222222222222222222222222222222222222222222 1111 222 111111111111 3
lowQualScore : 8 4 7777777 333333333333333333333 3333 2 3 3 2 2222222222222222 333 444444444444444 1 22 1 44 1 555 22 2 22 22 4 4 2 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 3 3 33 5 99 66 2 222 444444444 555555 33 66666 33 0 777777 5 33 3333333333333333333333333333333333333 5 00000000 333 2 9999999999999999999999999999 44 999 3 3 44 3 444 77 3 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 4 4 4444444444444444 6666666 222 77 2 111111 11 5 777777777777777 66 5 55 444444444444444 66 444444 3 5 5 66 5 333333333333333333333 000 55555 5 3 777 5 000 5 4444444444444 0 11111111111111 0000 777 000 555 8 4 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 8888 66 4 999 00 8 99999999999 5 0 11 222222222222222222 3 5 999999999999999999999999 88888 66 4 7777777777777777777777777777777777777777777777777777 3 1 4 88888 4444 4 4 0 66 33333 5 44444 77 5 44444 6 888 6 7 99 1 55 222 222 000 6 1 55 55 1 8 0 3 3 11 8 22222222222222222222222222222222222222222 4444 1 5 66 888 4 777 6 00 9999 4 3 5 0 1 5 77 77 777 5 8888888 0 66 5 11 777 66 666 44444 777 1111111111 888 0000000000000000 2 11111111111111111111 2 66 66 4 9999999999 4 4 4 66 66 4 44 222 55 111111111111 3 3333333 6 3 33 3 0000 888 00000000 555555555555555555555555555555555555555555 4444 1 1 22 0000 55 22 2 1 333 4444 444 3 1 1 000000000000 5555555 55 2 33 333 6666 5555 44 3
lowQualScore : . . ....... ..................... .... . . . . ................ ... ............... . .. . .. . ... .. . .. .. . . . ................................................................... . . .. . .. .. . ... ......... ...... .. ..... .. . ...... . .. ..................................... . ........ ... . ............................ .. ... . . .. . ... .. . ............................................................................................................................................................................................................................ . . ................ ....... ... .. . ...... .. . ............... .. . .. ............... .. ...... . . . .. . ..................... ... ..... . . ... . ... . ............. . .............. .... ... ... ... . . ................................................................................ .... .. . ... .. . ........... . . .. .................. . . ........................ ..... .. . .................................................... . . . ..... .... . . . .. ..... . ..... .. . ..... . ... . . .. . .. ... ... ... . . .. .. . . . . . .. . ......................................... .... . . .. ... . ... . .. .... . . . . . . .. .. ... . ....... . .. . .. ... .. ... ..... ... .......... ... ................ . .................... . .. .. . .......... . . . .. .. . .. ... .. ............ . ....... . . .. . .... ... ........ .......................................... .... . . .. .... .. .. . . ... .... ... . . . ............ ....... .. . .. ... .... .... .. .
lowQualScore : 9 4 1111111 999999999999999999999 4444 3 6 1 9 1111111111111111 777 000000000000000 7 44 7 11 7 444 44 0 88 88 0 2 1 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 3 1 99 3 00 33 7 333 333333333 222222 77 77777 77 1 888888 3 77 2222222222222222222222222222222222222 7 44444444 999 9 1111111111111111111111111111 22 444 3 3 66 3 777 33 1 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 0 0 4444444444444444 5555555 555 22 2 555555 99 0 999999999999999 99 0 88 888888888888888 99 444444 2 0 0 99 0 222222222222222222222 000 77777 7 6 111 7 000 0 0000000000000 4 88888888888888 8888 222 666 333 9 4 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 8888 11 4 666 66 9 99999999999 0 2 99 888888888888888888 2 0 444444444444444444444444 77777 11 4 3333333333333333333333333333333333333333333333333333 1 1 4 77777 9999 4 4 1 99 11111 0 33333 99 0 88888 7 222 7 3 22 0 88 555 555 000 7 7 00 55 0 0 8 6 8 00 0 22222222222222222222222222222222222222222 0000 0 0 11 999 4 888 0 66 4444 4 1 0 2 8 0 66 88 555 0 5555555 0 99 0 22 999 99 000 55555 111 9999999999 888 5555555555555555 5 22222222222222222222 5 99 77 4 4444444444 4 4 4 11 11 4 00 555 00 111111111111 6 5555555 7 1 11 1 4444 333 44444444 555555555555555555555555555555555555555555 0000 9 9 66 2222 00 99 1 3 777 5555 222 5 7 7 777777777777 7777777 00 2 11 999 9999 6666 22 8
consensus : CAGGGTT-G-GGCGG-TTAAAACC---------GCCCCCGG---TTTA-A-CCAG-CGG-TT-TTAACCG-GTTTATA-A----C-CGC---C----C----C-----G-GT--C-A--A-TAC---T--C-CCA--AAA--T-G-GT-CA--AT--AG--TGGTCA---------A--------AT---A--TGG-TCAATTTGAA-AATTT----AA-AGTG-T--CC-T--T--T-TCC-N-AT---------TTT-----AAA--T-----ACA--TTTCA-T---GC-AAA--AA------------T-A------------A----TA---GA-T--------T-T-AT-AGTCTTTT---CAAA---A-ATC--A-G------CT-TTATTN-AC-A-AA--G-CA-T-G--T-ATTNATT-T-GAT--CA----A-T-TAAT--G-------A-T------A-AT--------A-----------AT--------------CA--TT----TA-----A-TT-ACA-CC----C-A-GTATTTGAACT-T-C---TGAC-C--TTTTCA----AAG-CT-G-CTC---AT--TTCT--A-G-C---TTG---AT-AT----C--CCTA-N-T----A-TAAC-TTTTT----------------AGTT-----A-ATGGGC-CAACT-GTTTCAAT-GC--AATAC--T-GA---T-AGTA----AGCAC--TT-TT-CAGAG----ACAATT-TC-T--GCATG-T--TTAAG-AT-AT-AA-ATA-T-ATT---GGCT-AA---T-GA---CTACTTATG-GTCGACATAT---CT-TCAG---TACT-ATA----C-AT-GT-TACATG-----TA-------GAGGGTTTACAGG--TAN--GC-A-T-AGTTT-G---------AC-------------A------A--------------A------T--------------T-----T--CT-GCT-T-TATACC--TGG-A-C-AAAATA--A-CAGN-TA-GA-TC-A-GCTG--AGCACTGT--GATCTAGTAAA-A---AATAAATA-TAAACTGGGT-T--GA-T----AAA-CA-----TGTTGC-A---AAA--GA-CAGTGCTTC-AAATGG-------AG--C---AAGATATTA--CTTGGG-G-CAGG--TACAATGGACA-AG---T-G-T--AAT-TAACA-TACCCAA--GGT---CC-AG-----G--GATGGCAATTGTGT-TGT-GTTATTG-TTATGA-AAAACA--TCACCCAC--ACTG-ACACA-CCAATG--TGAT-CATTA--GGTACCTTGATGAAT-ACTCTTTCAATTAATGA-CTTGT-------TACGGAAAA-TATAGGG--CTTTCA-GCTTA--TAGGAAAAT-AT-AGAAATAA-ATAG--GGACTTG-GACACC-CTG---CTCTTTG--CTA----GG-AC-AAAAGTT-AAACAG-TTTN-T-GATTTTTACA-GGTGAG-CA--T----TT-CC--C-CAATT-GAA--TA--AAATCTT-ATG----CATTA-T-T----------TAA---TCTCATTT---G--CAT----GTAAGTGT-T---TGTAAGT-------TGCATGTTT--AGAATT-ACAGT---------AT-TT-AT-CATCAT-AAT--GAACT-CTGTTAAC---ATTT--AAAAT-NAACCA-ATAATAT-AGAATAA-TGAC-CATTAAA-TCTTTCAA-TTG---ACCA-CAATCG--CCA---ATTGACCACTA--TT-T-T-----GACCA-GTAGTT---G-AC-------CG----GT-TTT-AA--CCGGTA---TTGACC--A--C-CGG---C----CCG-GT-C-AA-TA------------C-------TAGT--AT-T--GA---CCG----C-T--TTT--TTG-CCAAC
Reference ( gi|5 ) : CAGGGTT-G-G-CGG-T-AAAAC----------GCCCCCG----TTTA-A-CCAG-CGG-TT-TTAACCG-GTTTATA-A----C-CGC---C----C----C-----G-GT--C-A--A-TAC---T--C-CCA--AAA--T-G-GT-CA--A---AG--TGGTCA---------A--------AT---A--TGG-TCAATTTGAA-AATTTTTACAA-AGTG-T--CC-T--T--T-TCC-A-AT---------TTT-----AAA--T-----ACA--TTTCA-TA-TGC-AAA--AA------------T-A------------A----TA---GA-T--------T-T-AT-AGTCTTTG---CAAA---A-ATC--A-T------CT-TTATTA-AC-A-AA--G-CA-T-G--T-ATTTATT-TTGAT--CA---TA-T-TAAT--G-------A-T------A-AT--------A-----------AT--------------CA--TT----TA-----A-T--ACA-CC----C-A-GTATTTGAACT-GAT---TGAC-C--TTTTCA----AAG-CT-G-CTC---GT--TTCT--A-G-C---TTG---AT-TT----C--CCTA-A-T----A-TAAC-TTTTT----------------AGTT-----A-ATGGGC-CAACT-TTTTCAATTGCCGAATAC--T-GA---TAAGTA----AGCAC--TT-TT-CAGA-----ACA--T-T--T--GCATG-T--TTAAG-AT-A--AA-ATA-T-AT----GGCT-AA---T-GA---CTACTCATG-GTCAACATATG--CT-TTAG---TACT-ATA----C-AT-GT-TACATG-----TA-------GAGGTTTTACAGG--TAT--GT-A-T-AGTTT-G---------AC-------------A------A--------------A------T--------------T-----T--C--GCT-T-TATACC--TGG-A-C-AAAATA--A-CAGC-TA-GA-TC-A-GCTG--AGCACTGT--A--CTAGTAAA-A--TAATAAATA-TAAACTGGGTTT--GA-T----AAA-CA-----TGTTGC-A---AAA--GA-CAGTGCCTCTAAATGG-------AG--C---AAGATATTATTTTTGGGTGTCAAGT-TATAATGGACA-AG---T-G-T--AAT-TAACA-TACCCAA--G-----TC-AG-----G--GATGGCAATTGTGTCTGT-GTTATTG-TTATGA-AGAACA--TCACCCAC--ACCG-ACACACCCAATG--GGAT-CATTATCGGTACCTTGATGAAT-ACTCTTTCAATTAATGA-CTTGTTTTTTTCTATGGAAAACCATAGGGAACTTTCAAGTTT---TAGGAAAAT-AT-AGAAATAA-ATAG--GGACTTG-GACACC-CTG---CTTTTTG--CTA----GG-ACGAAAAGTT-AGATAG-TTTA-T-AATTTTTACA-GGTGAG-CA--T----TT-CC--C-CAATT-GAA--TA--AAATC-T-ATGC---CATTA-T-T----------TAA---TCTCA-TT---G--AA-----GTAAGTGTTT---TGGAAGT-------TGCATGTTT--AGAA-T-ACAG----------AT-TT-AT-CATCA--AAT--GAACT-CTGTTAAC---ATTT--AAAAT-TGCCCA-A-AATAT-AGTATAATTGAC-CATTAAA-TCTTTCAA-TT----ACCA-CAATCG--CCG---ATTGACCACTA--TT-T-T-----GACCA-GTAGTT---G-AC-------CG----GT-TTT-AA--CCAGTA---TTGACC--A--C-CGG---C----CGC-GT-C-AA-TA------------C-------TAGT--AT-T--GA---CCG----C-T--TTT--TTGCCCAAC
gi|15 : CAGGGTT-G-GGCGG-TTAAAACC---------GCCCCCGG---TTTA-AACCAG-CGG-TT-TTAACCG-A-TTATA-A----C-CGC---C----CCGGGC-----G-GT--C-A--A-TAC---T--C-CCA--AAT--T-G-A----------------------------------------------------AATTT--A-AATTC------------T--CC-T--T--T-T------------------------AAA--T-----ACA--TTTCA-TGCCGC-AAA--AATAAAGATATAT-T-A------------A----TA---AA-T--------T-T-AT-AGTCTTTT---CAAA---C-ATC--A-A------CT-TTGTT--AC-A-AA--G-CA-T-G--T-A
gi|12 : CAGGGTT-G-G---G-C-AA------------------------TTAA-A-CCAG-CGG-TT-TTAACCG-GTT-ATA-A----C-CGC---C----C----------G-GT--C-A--A-TAC---T--C-CCA--AAG--T-G-GT-CATTAGCTAG--TGGTC-------------------AT---A--------AATT--GA-AATTT----AA-AATG-T--CC-T--T--TCTCC-T-AT---------GTT-------A--T-----ACA--TTTC---A-TGA-AAA--AA------------C-A------------A-------------------------------CTTT---------------------------------TTC-AC-G-AA--G-CC-T-A--T-AATTAT----------A---GA-T-GAAT----------------------T--------A-----------AG--------------TA--TT----TAATT--A-T--ACA-CCCCTGC-ATGTA--TAAACT-T-C---TGAG-C--TTTTCAAATTAAG-CT---CTC---AT--TTGT--A-G-C----TG---AT-AT----T--CCCA--------A-TAAC-TTTTT----------------AG
gi|27 : CAGGGCT-G-GGCGG-TCAAAACTGTCCCAACCGTCCCCGGT--TTTA-A-CCAG-CAG-TT-TTAACCG-G-TTGTA-A----C-CGC---C----CCG--C-----G-GT--G-A--A-CAC---T--C-CCA--AAA--T-G-GT-CA--AT--AG--TGGTC
gi|14 : CAGGGTTGG-G-CGGTT-AAAAC-----------C--------------A-CC---CGG-TT-TTAACC---------------------------------------A-GT--C-A--A-AAT---T--C-CCA--AAA--T-G-GT-C--------------------------A--------AT---AC-CAG-TCAACT--GA-AATT----CAA-AGTG-T--CCTT--T--T-TCC-T-AT---------TTT-----AAA--T-------A--TTTC---A-GGC-AAA--AATAAAGATATATTT-A------------A----CA---GA-T--------T-T-GT-AGTCTT-----CAAA---A-ATC--A-A------TC-TTATC--AC-A-AA--G-CA-T-G--T-GTTTAT
gi|28 : CAGGGTT-G-GGCGG-TTAAAACC---------ACTCCCGGT--TTTA-A-CCAG-CAG-TT-TTAACTG----------------C-C---C----C----C-----A-GT--C-A--A-TGC---T--C-CCA--AAA--T-G-GT-CA--A------------------------------------------------TTGAA-A-----TATAA-AGTG-T--CC-T--T--T-Tagatgaatgcaaagatt
gi|19 : CAGGGTT-G-GGCGG-T-AAAAC---------------CG----TGT----CC---TGG-TT-TTAACCG-A-TTATA-G----TGCGC---C----CG---A-----G-AT--C-A--A-TAA---T--C-GCA--GGA--T-A-GT---------------GTCA---------A--------GT---AC-TGG-T-AATATG-A-AATTT-----A-AGTG-T--CT-T--T--T-TCC----T---------TTT----------T-----ATA--TT----CA-TGC-AAACGAA------------A-A------------G----TA---AG-T--------T-T-CT-At
gi|4 : AGGGTT-G-GGCGG-TTAAAACCC--------GCCTCCG----TTTA---CCAG-CGG-TTGTTAACCG-CTT---A-A----C-CGC---C----C----C-----G-GT--C-A--A-TAC---T--C-CCA--AAA--C-GTGT-CA--AT--AGTTTGGTC----------A--------AT---C--TGG-TCTAATTG-A-AATTT----AA-AGTG-C--TC-C--T--T-TCC-A-AT---------TTT-----AAA--T-----ACATTTTTCA-T--TGCAAAA--AA------------T-A------------A----TAG--GA-T--------T-TCAT-AATCTTTT---CAAA---AGAGT--A-G------C--TTATCA-GC-A-AATGG-CA---G--T-ATTCTTT-TTGATTCCAAATTA-T-TAAT--G-------A-T------A-AT--------A-----------AT--------------CA--TT----TA-----ATT--ACACCC----C-A-GTA-TTGAACT-TTC---TGAC-C--TTTTCA----AAGACT-C-TTC---ATCATTCT--G-G-CGGATTG---A--TC----C--CCTA-ATT----ATTAACTTTTTT----------------AGTT-----A-ATGGGC-AGCCTGTTTTCAAT---CAAATAC--T-GA---TTAGCT----AGCAC-----TT-CAGAGG---ACAATT-C--T--GCATGTT--TTAAG-AT-AT-AA-ATA-TCAT----TGCT-AATTTT-GA---CTACTTATG-G-CAACATAT---CT-TCAT---TACT-ATAC---C-AT-G--TACATG-----TA-------GACGGGTTACAGGACTAT--AT-A-T--GTTT-G---------ACAATGAGAGAAAAAA------A--------------A------T--------------T-----TTCT--GC--T-TATA-C--TGG-A-C-CAAATAT-A-CAGC-TAGGA-TC-A-CTTG--AGCACTGT--GATCTATTA-------AATAAATACTAAACTCGG--T--GA-TA---AAA-CAT----TGTTGCAA---AAA--GA-CAGTGTCTCCAAATGGGAGTGTCGG--CGAGGAGATATTA-CCTTGGGTG-CAGG--TATAATGGACA-AG-----G-T--AAT-TAACA-TACCCAA--GGT---CC-AG-----G--GATGGCAATTGTG--TGT-GTTATTGTTTATGGCAAAACA--TCACCCAT--ACTG-ACACA-CAAATG--TGAT-CATTA--GGTAC--TGATGAAT-AC-CCTTCAA-TAATGA-CTTG--------TA-GGAAAA-TATAGGG-ACTTTaaaacatttt
gi|3 : AGGGTT-G-GGCGG-TTAAAACC---------ACCCCCGGGTTTTTATA-CGAG-CGG-TT-T-AACCG-GTT-ATATA----C-CGT---CT---C----C-----GCGT--C-AC-A-TAC---T--CTCCA--AAA--T-G-GT-CA--A---TG--TGGTCA---------A--------TT---AC-TGG-T-AATTTGAG-AATTT----AATAGTG-TTGCC-TGTTGGT-TCC-G-ATA--------TTT-----TAA--T-----ACA--TTTCA-T---GC-AAA--AA------------T-G------------AGAAGTATT-AA-T--------T-A-AT-AGTTT---------------ATC--A-CTTCAGACT-TTATTA--C-A-AA--G-CA-TTGC-T-ATTCATA---GAT--CC---AA-T-TAAT--GTTTTTAAA-T------A-ATTATACTGAA-----------ATGT------------CA--TT----TATTGTTA-T--AC--CC----C-G-GTAAT--GACT-T-C---TGAC-C--TTTTTA----GAG-C--G-CTC---AT--TTCT--AAG-C---TGG---AC-ATATCAC--CCTA-T-T----T-TAAC-TTTTTTT--------------AGTA-----AGATCGGC--AACT-GTTT-----GC--AATAC--T-GA---ATAGTACTATAGCAC--TT-TTTCAGATGGCCAAA--T-TCTT--GCATG-T--TTA----T-A--GT-ATA---AT----TGC----------A---CTACT-GTG-GTTGACATAT---CT-TTAC---TACT-ATATC--C-AT-GT--ACATG-----TATACTTAAAAGGTT--ACAGG--TGA--GC-A-TTAGTTT-GCAATGAGAGAC-------------A------A--------------AATAA--T--------------T-----T--CT-GCT-T--ATACC--TGG-ACC-AAAATACGA-CA---TACGATTC-A-GCTG--AGCACTGTTGAT-CTAGTA-------AATAAATA-T-AACTGGGTTG--GATT----AAA-CAATTTGTGTTGC-----AAA--GA-C-----------ATAG-------TG--C---A--GTATTA--CTTGGA---CAGGT-TAATAT-GACACAGTGTT-G-T--AAT-T-ACATTACCCTAGGG-----TCTAACCTGTG--GATGGCAG-TGTGTC--T-GTTATTT-GTATGA-AAAACA--T----CAC--ACC--ACACA--CAAT---TGATGCATTA--GACACCTTtgacaccctgctctttgtaggacaaaaattaaatagtttagtaatttttacacgtgaggcattttcacccaatgaataaatcttatgcattatgttaatctcatttgccaatgtaatgcttgtttgcaagtgcctgtcttaagaattatagtattttattcatctttaatcagaactccgtaacattttaaaaataacccaataatatgagaatatgtgattcattaagctttttcaattggcaccacaatcgagccagatattgaccacttatgaccagtattgactggttttaaccattattgacccaaccggcccgtcaattactagtcattgggaccgcttttt
gi|1 : GGGTTCGTG-CGT-T-AAAACC---------GCCCCAGG---TTT----CCAG-CGGCTT-TTAACCG-GTT-ATA-A----CTCGC---C----G----C-----T-GT--C-A--ACTAC---T--C-CAA--AAAAAT-G-GT-CA--AT--AG--CGGTCA---------A---------T---AGCTGG-TCAAGT-GAA-AATTT----AA-AGTG-T--CC-TA-T--T-TCC-A-AT---------TTT-----AAAAAT-----ACA--TT-CA-TG-CTC-AAA--AA------------TTA------------A----TA---GT-T--------T-G-AT-AGTCTTTGGTCCAAA---A-ATCC-A-G------CT-TTATTC-AC-AGAA--G-CAAT-G--TTATTTATT---GAT--TA---CAAT-TAAT--G-------A-T------A-AT--------A-----------AT--------------CA--TT----TA-----A-TTTACA-CC----CCA-GTAT--GAACT-TCT---GGAC-C--CTTTCA----AAG-CTTG-CAC---AT--T-CT--A-GGC---T-----AT-AT----C--CCTA-T-T----A-TAAC-TTTTTT---------------AGTT-----A-ATGGGCACCACC-GTTTCAAT-GCC-AATAC--T-GA---TA-GTA-----GCAT--TT-TT-CAGAG----ACA--CAT--C--G-ATG-T--GAAAG-AT-AT-AA-ATAAT-ATT---GGCT-AA---TTGA---CTAACTATG-GTCAACATACT--CT-TCAG---TACTTATA----CCAT-GT--ACATA-----TA-------GAGGGTT-ACAGG--TAG--AT-AAT-AGTTT-G---------AC-------------A------A--------------A------TGAGAGACAAAATAAT-----T--T--TCTGT-TATACC--TGGGA-C-AAAA-A--A-CAGCGTA-TA-TC-ACACTGGGAGCACTGTG-A--TTAGTAAA-------TAA-TA-TAAA-TGGGT----GA-T----AAA-CA-----TGTTGC-A---AAAAAGA-CAGTGC-TCTAAATGG-------AGG-C---AAAATATTACTTT--GAT-TCAGGTATACGATTCACA-AG---TTG-TTAAAT-TAACA-TACCAAG--G-----CC-AG-----GATGA-GGCAATTGTGTGT-T-GTTATTG-TTATGA-AAAACA--TCACCCAC--ACTGTACACACC-AATGCTGGAT-CATCA--GGTATCCTGTGGAATTACTCTT-CAAT-AATGAACTTGT--------ACGAAAA--TATAGGGA-CTTTCA-GTTTATATAGGAAAAT-ATAAGAAATAATATAG--GGACTT--GACA-C-CTG---CTCTTTG--CTA----GG-AC-AAAAGTTAAAAAAG-TTTA-T-AATTTTTACATTGT-AG-CAATT----TT-CC--C-AAATT-GAA--AA--AAGTCTT-ATG----CATTATT-T----------TAATATTCTCA-TTTGCA--AAT----GTAA-TGTTT---TGTAAGTGA-----TG---GTTT--AGA----ACAGTTA-------AT-TT-AT-CATCATGAAT--GAACT-C-GTTAATACAATTT--AAA---TAACCA-ATAATAT-AGAATAATTGAC-CATATAA-TC-TTCAA-TG----ACCA-C-ATCG--ACAGT-ATTGACCA-TA---G-T-T-----GACCA-GTTATT---GTAC-------CG----GT-CTTGAA--CCAGTA----TGA-C--A--C-TGGGGCC----CG--GTCC-AA-CAC-----------C-------TAGT--AT-T--GA---CAG----CTT--TTT--TTGGCCAACcagtagtatgactgtatggagagactatgggaacgtcgacccgctgactctctttgtctatgcacaaaagtttaaacagtttgttgattttcacatggtgagcatgagtttcccgcattttgaacttatcaaatcttgtaggcattatttaatttcttttcatgtaagtgtactgaagtcaatgtttaaattacagtaaataatacactcaacagtagatgaactgctttaacaaattaaaaataagctcatatatatataataattgaccattaaattcttcaagttgaccactatcgccagttaatgaccgtattgaccatgtggggaccgttttaaccagtatgaccaactgacccggtccaatactagtacattgaccgcttttttgccaacc
gi|12 : TTG-A-CCGGGCGG-TT-ATAACCG-G-TTAAA-A----C-CGC---cc
gi|26 : cagggttgggcaattaaacca-CAG-TT-TTAACCA-GTAT-TG-A----C-CACTTGC----C----C-----T-GT--C-A--A-TAC---T--tactcccaaagtggtcattagctagtggtcataaattgaaatttaaaatgtcctttctcctatgttatacatttcatgaaaaaacaactttttcacgaagcctataattatagatgaattaagtatttaattatacacccctgcatgtataaacttctgagcttttcaaattaagctctcatttgtagctgatattcccaataactttttag
gi|8 : atgaccaataaattttcaatcaactattattggcGG-TT-TTAACCC-GTAT-TG-A----C-CAC---CAGC-C----C-----G-GT--C-A--A-TAC---T--actattgactctagtattgaccacttttttgccaaccctg
gi|21 : agaatagaaggatttgacaccctgctctttgctacctagaacaaaagttaaacagtttttgatttttacagtcagcattttccccactttaagaaaatcttatgcattatttaatttaatttgcatgtaagtgttgtaagtcataaagtgcatgtttagaattacagtatttatcatcataatgaatctttaaaaaataaaccagtaatatagaataatgaccaataaatttcaattgaccattattgaccactattgactGG-TT-TTAACAATATTGACC-A----C-CGG---C----C----C-----G-GT--C-A--A-TAC---T--agt
gi|2 : ttataaacttgccacttcaacatttaaataaccaataacaaactgtaatgaccaatcaattttcaatcaaccagtattgaccactattgacaT-TTAACTG-GTTAATA-AACACCGCGC---C----C----T-----G-GT--C-A--A-TGC--------CAA--AAA--T-G-GT-CAT-A---CG--TG--CA-------------------T---AC-TGG-TACATTTGAA-AGT------AA-AGTG-T--CC-TG-T--T-TCC-A-AT---------GTT-----TAA--T-----ACA--TTGCA-T---GC-AAA--AA------------T-A------------A----TA---GAAT--------T-T-AT-AGTCTCCT---CAAA---A-AAT--A-G------CTCTTACTT-AC-A-----T-CA-T-A--T-ATTAG-----AAT--CA---AT-T-TAA-----------G-T------ACAT--------A-----------ATG-------------CAAATT----TA-----A-TT-ACATCC----C-A-GTAGT-GAACTTGCT---GGAC-C--TTTC------AAG-C--G-CTCTCAGC--TTCT--A-G-C---GTG---AT-------C--CC---A-TGTCTA-TAAC-TTTTT----------------AGTTTGACTA-A-GGGC--AACT-GTTTCAATGGC--AATACA-T-GAGGATAGTTA----GGCACACTTATT-CAGAG----ACA--A-T--TCCGCATG-GGGTTAAG-AT-A--TA-ATA-T-ATTGATGGCTTAA---T-GGAATCTA-TCA-G-GTCAACAGTTGATCTATCAGACTTACC-AGA----C-ATTGT-CAC-----------------GAGGGGTTACAG---TAG--GTTA-TTAGTTT-GCAAATGAAGAC-------------ATAAAATA--------------A------T--------------TA----T--CCTGCT-T-TATACCAGTGG-A-CCAAAATA--AACAGA-TA-GA-TCCA-G-TG--AGCA-TGT--GATCTA-TAAA-A--CAATAG----TAAACTGGGTGTCAGA-T----AAAACA-----TGTTGC-ATCAAAA--GA-CAGTGA-TCTAAATGG-------AA--CC--AAGTTCATATACTTGGG-GTACAGG-TATAATGG-CA-AG---T-G-T--TATATAACA-TTACCAA--G-----TC-AG-----G--AATG-CAATTGT---TGTTGTTAT-G-TTATGA-AAAACAGTCCACCCACCAACTG-ACACAC--AATG--TGAC-CAT-A--GGTACCT-GAT-AAT-ACTCTTCCAAT-AATGA-CTGGTTT--------GGAAAGATATAGGG--CTTTCAAACTTA--TAGGATAATTAT-AGAAATAA--TAG--GGACTTG--ACACCTCTT---CTCTT-G--CTA----TG-ACGAAA-GTT-AAATAG-TTTA-T-AATTTTTTCA-G-TGAG-CA--T----TTTCC--C-CAAT--GAA--TA--AAATC-T-ATG----CATTA---T----------TAA---TCTCACTT---G--CAT----GTAAGTGTTT---T--AAG--------TGCATG-TT--AGAATT-ACAGT---------ATATT-AT-CATCAT-AAT--GAACT-GT-TTAAC---ATTT--AAA---TAACCA-ATAATAT-AGAATAA-TGAC-CATTAAA-TC-TTCAA-TTG---ACCA-CAATCGA-CCAGT-ATTGACCACTG-----T-T-----GACCA-GTAA-C---G-A--------CG----GT-TTT-AA--CCAGTA---TTGACC--A--C-CAC---CTCCACGG-GT-CAAA-TA------------T---------GT--A--T--GACACCCGA---C-----TT--TTG-CCAACagtattgaccaggtttttttttgccaac
gi|2 : tggcattaaaaataccgccaactgagtttagaaaacctatcagataACTG-GTTAA-A-A----C-CGT---CGTTAC----T-----G-GT--C-A--A-CA----------------G--T-G-GT-CA--AT--AC--TGGTCG---------A--------TT---G--TGG-TCAA-TTGAA-GATTT----AA-TG-G-T--CA-T--TA-T-TCT-ATATTATTGGTTATTT-----AAA--TGTTAAACA--GTTCATTA-TG---AT--GA------------T-A------------A----TA---cc
gi|3 : tggcattaaaaataccgccaactgagtttagaaaacctatcagatatttaactggttaataaacaccgcgccctggtcaatgccaaaaatggtcatacgtgcatactggtacatttgaaagtaaagtgtcctgtttccaatgtttaatacattgcatgcaaaaataatagaatttatagtctcctcaaaaaatagctcttacttacatcatatattagaatcaatttaagtacataatgcaaatttaattacatcccagtagtgaacttgctggacctttcaagcgctctcagcttctagcgtgatcccatgtctataactttttagtttgactaagggcaactgtttcaatggcaatacatgaggatagttaggcacacttattcagagacaattccgcatggggttaagatataatatattgatggcttaatggaatctatcaggtcaacagttgatctatcagacttaccagacattgtcacgaggggttacagtaggttattagtttgcaaatgaagacataaaataattatcctgctttataccagtggaccaaaataaacagatagatccagtgagcatgtgatctataaaacaatagtaaactgggtgtcagataaaacatgttgcatcaaaagacagtgatctaaatggaaccaagttcatatacttggggtacaggtataatggcaagtgttatataacattaccaagtcaggaatgcaattgttgttgttatgttatgaaaaacagtccacccaccaactgacacacaatgtgaccataggtacctgataatactcttccaataatgactggtttggaaagatatagggctttcaaacttataggataattatagaaataatagggacttgacacctcttctcttgctatgacgaaagttaaatagtttataattttttcagtgagcattttccccaatgaataaaatctatgcattattaatctcacttgcatgtaagtgttttaagtgcatgttagaattacagtaACTG-GTTAA-A-A----C-GGT---C----C----CCACATG-GT--C-A--A-TAC---G--G-TCATTAAC--T-G-GC-GA--T---AG--TGGTCA---------ACTTGAAGAATTTAA--TGG-TCAATTattgaccaccacctccacgggtcaaatatgtatgacacccgacttttgccaaccc
gi|33 : agggttgggcggttaaaaccacccccgggtttttatacgagcggtttaaccggttatataccgtctccgcgtcacatactctccaaaatggtcaatgtggtcaattactggtaatttgagaatttaatagtgttgcctgttggttccgatattttaatacatttcatgcaaaaatgagaagtattaattaatagtttatcacttcagactttattacaaagcattgctattcatagatccaattaatgtttttaaataattatactgaaatgtcatttattgttataccccggtaatgacttctgacctttttagagcgctcatttctaagctggacatatcaccctattttaactttttttagtaagatcggcaactgtttgcaatactgaatagtactatagcactttttcagatggccaaattcttgcatgtttatagtataattgcactactgtggttgacatatctttactactatatccatgtacatgtatacttaaaaggttacaggtgagcattagtttgcaatgagagacaaaataatttctgcttatacctggaccaaaatacgacatacgattcagctgagcactgttgatctagtaaataaatataactgggttggattaaacaatttgtgttgcaaagacatagtgcagtattacttggacaggttaatatgacacagtgttgtaattacattaccctagggtctaacctgtggatggcagtgtgtctgttatttgtatgaaaaacatcacaccacacacaattgatgcattagacaccttcagtagtatgactgtatggagagactatgggaacgtcgacccgctgactctctttgtctatgcacaaaagtttaaacagtttgttgattttcacatggtgagcatgagtttcccgcattttgaacttatcaaatcttgtaggcattatttaatttcttttcatgtaagtgtactgaagtcaatgtttaaattacagtaaataatacactcaacagtagatgaactgctttaacaaattaaaaataagctcatatatatataatTTATG-A----T-CGC---C----C----C-----G-GT--C-A--A-TAC---T--C-CCA--AAG--T-atgaccaactgacccggtccaatactagtacattgaccgcttttttgccaacc
gi|11 : gttg-A----C-CGC---C----C----------G-GT--C-ACAG-TAC---T--C-CCA--AAA--T-G-GT-CA--ATT-AG--TGATCC---------A--------AT-------GG--------GAA------TTAC----GTG-T--CC-T--T--C-TCCCA-AT---------TTTCTAACAAA--T-----A-A--TTC----A-TGC-AAA--AA------------T-A------------A----TA---GATT--------T-T-AT-AGTCTT-----CAAAGT-A-ATC--A-A------GC-TTATTACACAA-AA--G-CA-T-GGAT-AGTTA---TCGAT--CC---GA-T-TAATACG-------ATT------A-AT--------A-----------A---------------CA--TTATCCTA-----A-A--AAC-CC----C-A-ATGATGAAACT-TTTCTGTGACACCATTTTCA----AAGACT-T-TTG---AA--TTCTTCA-G-C---GTG---AT-AT----CCACCTATACT----A-TAAC-TTacatgt
gi|1 : GC---C----C----C-----A-GTGTC-A----TAC---TGGT-TCA--AGA--CCG-GTACA--ATA-AC--TGGTCA---------A--------CT---A--TGG-TCAAT
gi|4 : gggttcgtgcgttaaaaccgccccaggtttccagcggcttttaaccggttataactcgccgctgtcaactactccaaaaaaatggtcaatagcggtcaatagctggtcaagtgaaaatttaaagtgtcctatttccaattttaaaaatacattcatgctcaaaaattaatagtttgatagtctttggtccaaaaatccagctttattcacagaagcaatgttatttattgattacaattaatgataataatcatttaatttacaccccagtatgaacttctggaccctttcaaagcttgcacattctaggctatatccctattataacttttttagttaatgggcaccaccgtttcaatgccaatactgatagtagcatttttcagagacacatcgatgtgaaagatataaataatattggctaattgactaactatggtcaacatactcttcagtacttataccatgtacatatagagggttacaggtagataatagtttgacaaatgagagacaaaataattttctgttatacctgggacaaaaaacagcgtatatcacactgggagcactgtgattagtaaataatataaatgggtgataaacatgttgcaaaaaagacagtgctctaaatggaggcaaaatattactttgattcaggtatacgattcacaagttgttaaattaacataccaaggccaggatgaggcaattgtgtgttgttattgttatgaaaaacatcacccacactgtacacaccaatgctggatcatcaggtatcctgtggaattactcttcaataatgaacttgtacgaaaatatagggactttcagtttatataggaaaatataagaaataatatagggacttgacacctgctctttgctaggacaaaagttaaaaaagtttataatttttacattgtagcaattttcccaaattgaaaaaagtcttatgcattattttaatattctcatttgcaaatgtaatgttttgtaagtgatggtttagaacagttaatttatcatcatgaatgaactcgttaatacaatttaaataaccaataatatagaataattgaccatataatcttcaatgaccacatcgacagt----C----C-----A-GT--C-A--A-TAC------------------T-G-GT-CAT-A---AG--TGGTCA---------AT-------AT---C--TGGCTCGATTccggtccaacacctagtattgacagctttttttggccaaccc
gi|3 : agggttgggcggttaaaacccgcctccgtttaccagcggttgttaaccgcttaaccgccccggtcaatactcccaaaacgtgtcaatagtttggtcaatctggtctaattgaaatttaaagtgctcctttccaattttaaatacatttttcattgcaaaaaataataggatttcataatcttttcaaaagagtagcttatcagcaaatggcagtattctttttgattccaaattattaatgataataatcatttaattacaccccagtattgaactttctgaccttttcaaagactcttcatcattctggcggattgatcccctaattattaacttttttagttaatgggcagcctgttttcaatcaaatactgattagctagcacttcagaggacaattctgcatgttttaagatataaatatcattgctaattttgactacttatggcaacatatcttcattactataccatgtacatgtagacgggttacaggactatatatgtttgacaatgagagaaaaaaaattttctgcttatactggaccaaatatacagctaggatcacttgagcactgtgatctattaaataaatactaaactcggtgataaaacattgttgcaaaaagacagtgtctccaaatgggagtgtcggcgaggagatattaccttgggtgcaggtataatggacaaggtaattaacatacccaaggtccagggatggcaattgtgtgtgttattgtttatggcaaaacatcacccatactgacacacaaatgtgatcattaggtactgatgaatacccttcaataatgacttgtaggaaaatatagggacttttgacaccctgctctttgtaggacaaaaattaaatagtttagtaatttttacacgtgaggcattttcacccaatgaataaatcttatgcattatgttaatctcatttgccaatgtaatgcttgtttgcaagtgcctgtcttaagaattatagtattttattcatctttaatcagaactccgtaacattttaaaaataacccaataatatgagaatatgtgattcattaagctttttcaattggcaccac----C----T-----G-GT--T-A--A-AACGG-T--C-CCC--ACA--T-G-GT-CA--A---TA--CGGTCATTAACTGGCG--------AT---AG-TGG-TCAACTTGAAGAATTTttttaaccattattgacccaaccggcccgtcaattactagtcattgggaccgcttttt
gi|7 : agggttgggcggttaaaaccacccccgggtttttatacgagcggtttaaccggttatataccgtctccgcgtcacatactctccaaaatggtcaatgtggtcaattactggtaatttgagaatttaatagtgttgcctgttggttccgatattttaatacatttcatgcaaaaatgagaagtattaattaatagtttatcacttcagactttattacaaagcattgctattcatagatccaattaatgtttttaaataattatactgaaatgtcatttattgttataccccggtaatgacttctgacctttttagagcgctcatttctaagctggacatatcaccctattttaactttttttagtaagatcggcaactgtttgcaatactgaatagtactatagcactttttcagatggccaaattcttgcatgtttatagtataattgcactactgtggttgacatatctttactactatatccatgtacatgtatacttaaaaggttacaggtgagcattagtttgcaatgagagacaaaataatttctgcttatacctggaccaaaatacgacatacgattcagctgagcactgttgatctagtaaataaatataactgggttggattaaacaatttgtgttgcaaagacatagtgcagtattacttggacaggttaatatgacacagtgttgtaattacattaccctagggtctaacctgtggatggcagtgtgtctgttatttgtatgaaaaacatcacaccacacacaattgatgcattagacaccttcagtagtatgactgtatggagagactatgggaacgtcgacccgctgactctctttgtctatgcacaaaagtttaaacagtttgttgattttcacatggtgagcatgagtttcccgcattttgaacttatcaaatcttgtaggcattatttaatttcttttcatgtaagtgtactgaagtcaatgtttaaattacagtaaataatacactcaacagtagatgaactgctttaacaaattaaaaataagctcatatatatataataattgaccatt----C----C-----A-GT--CCA--A-AAC---T--C-CCA---------------A--A---AG--TGGTTC---------A--------AT---AC-CGG-TCAATT--GA-AATTATCACTA-ACTGCT--CCTT--T--T-TCC-T-AT---------TTT------TA--T-----ATA--TTTCA-T----CAAAA--AA------------T-A------------A----AACAGGA-T--------T-T-GT--GTCTTT----CAAA---A-ATCAAA-T------CT-TTATC--AC-A-AA--G-CA------T-ATTGGTTATAGAT--GA----A-TGTAAT--G-------A-TAAACAAA-AT--------AAGAAATGAAATAT--------------CA--TT----TA-----A-T-----------------TGTATGAACT---T---CGAC-CT-TTTTCA----AGG-CT-ATCTCT--AT--TTCT--A-G-----TTGCATAT-TT----C--TC-----T----A-TAAC-TTTTTAGTATGTCGTTTTTTGAGTT-----ATATAGGC-GAACT-ATTTTAA-GGC--AATACTTT-GC---T-AGTA----A-CAG--CT-TA-CAGAG----ACAATT-T--T--GCA--------AAGTAT-A--AG-ATA-T-TT----AG---AA---T-Gtatgaccaactgacccggtccaatactagtacattgaccgcttttttgccaacc
gi|8 : cagggttgggagattaaaaccatccctggttttca-----G-GT--C-A--A-TACGGGT--T---A--AAA--CCA-GT-CA--AT--AG--TGGTCA---------A--------TA---A--TGG-TCAATT--GA-AATTTgtacatttttaaaccattcgtaatctgtcacttctgtggtccacaacctatattgctctcagtttacgtattatccgatttgtactgatgtacatggtatatgtgtatacttgataggagttacaggtagcatagttttgtcattatgcaaagacgttttttgctgtatatcttgattggagtaaacgggtaagttgaacactgtgatcgtagtagaataaatataaactgggtgatattaaaacaatgttgttgcaaaagaccagtgcttatggagatcaaaaagattaatttggggacaggtacaatggacatgtgttaataacataccaagggtcctcagggaggcga
gi|21 : agaatagaaggatttgacaccctgctctttgctacctagaacaaaagttaaacagtttttgatttttacagtcagcattttccccactttaagaaaatcttatgcattatttaatttaatttgcatgtaagtgttgtaagtcataaagtgcatgtttagaattacagtatttatcatcataatgaatctttaaaaaataaaccagtaatatagaataatgaccaat-----G-GT--C-A--A-TAT---T--G-TTA--AAA--C-CTGT-CA--AT--AG--TGGTC----------A--------AT---AC-TGG-TTGA-TTGAA-AATTaccagcccggtcaatactagt
gi|6 : ttataaacttgccacttcaacatttaaataaccaataacaaactgtaatgaccaatc-T--CT-T--T--T-CCC-A-AT---------TTT-----AAA--T-----ACA--TTTCA-T---GC-AAA--AA------------T-A------------A----TA---GA-T--------T-T-AT-AGTCTTTTT--CAAA---A-ATC--AAG------CC-TTATTT-AC-A-AA--GGTA-T-G--T-ATT-ATT-T-GAT--CA---AC-T-TAAT--G-------A-T------A-AT--------A-----------AT--------------CA--TT----TA-----A-TT-ACA-CC----CCA-GTAT--GAACT-T-C---TGAC-C--TTTTCA----AAG-CT---CTC---AT--TTCT--A-G-C---T-G---ATATC----C--CCTA-T-T----A-TAAC-TTTT-----------------AATT-----A-ATGGGC--AACT-GTTTCAAT-GC--AATAC--TTGA---TA-GTA-----GCAC--TT-TT-CAGAG----ACAA-T-TCAT--GCATG-T--T-AAG-ATTATTAA-ATA-T-ATT---GGCT-AA---TTGA---CTACTTATGTGTCAACATAT----C-TTAG---TACT-ATA----CCAT-GT--ACATG-----TA-------GAGGGTT-ACAG---TAG--AT-A-T-AGTTT-G---------AC-------------A------ATGAGAGACAAAATAA------T--------------T-----T--CT-GCT-TATGTACC--TGG-A-C-AAAATA--A-CAGC-TA-GA-TC-A-GCTGT-AGCACTGT--GATCTAGTAAA-------TAAATA-TAAACTGGGTGA--TA-T----AAA-CA-----TGTTGC-A---AAA--GA-CAGTG-CTCTAAGTGG-------AG--C---AAGATATTA--CTTGG--GTCATG--TATAA-GGACA-AG---T-GTT--AAT-TAACA-TACCCAA--GGT---CC-AT-----G--GATGGCAATTGTATGTGT-ATT-----TTATGA-A-AACA--TCACCCACA-ACTG-ACACA-CCAATG--TGAT-CATTA--GGTACC-TGAAGAAT-ACTC-TTCAA-TAATGA-CTTG--------TATGGAAAA-TATAG-----------------------AAAT----------AA-ATAG--GGACTT--GACACC-CTG---CTCTTTG--CTA----GG-AC-AAAAGTT-AAATAGTTTTA-T-AATTTTTACA--GTGAG-CAT-T----TT-CC--C-CAATT-GAA--TA--AAATCTT-ATG----CATTA-T-T----------TAA---TCTCATTT---G--CAT----GCAAGTG--T---TGTAAG--------TGCATGTTT--AGAATT-ACAGT---------AT-TT-AT-CAACAT-AAT--GAACT-C-GTTAAC---ATTT--AAAAT-AACCAA-T-AATGT-AGAATAA-TGAC-CATTAAA-TC-TTCAA-TTG---ACCA-CAATCN--NNN---NNNNNNNNNNN--NN-N-N-----NNNNN-NNNNNN---N-NN-------NN----NN-NNN-NN--NNNNNN---NNNNNN--N--C-CGG---C----CCG-GT-C-AA-TA------------C-------TAGT--AT-T--GA---CCG----C----TTT--TTG-CCAACaccggcccggtcaatactagtattgaccaggtttttttttgccaac
gi|32 : gt--CT-T--T--T-TCT-T-AT---------TTT-----A----T-----ACA--TTTCA-T---GC-TAA--AA------------T-ATAGATACATTTGA----TA---GA-T--------T-T-AT-AGTCTTcc
gi|9 : -T--T--T-TCC-T-AT---------TTTT----AAA--T-----ATA--TTTCA-T---GC-AAA--AA------------T-A------------A-----A---GA-TGCATTTAATAT-AT-AGTCTTTT---CAAA---A-AAC--G-A------CT-TTATTA--C-A-AA--G-CA-T-G--T-A-----T-TT-----------------------------A-T------A-G---------------------AT--------------CA--AT----TA-----A-T--G---------------ATTTGAAAT-AAT---TA-------TATGA----AA---T-A--TC---CT--TTTT--A-G-T---ATG---AC---------------G-T----A-T----TTCTTG---------------AGTT-----A-ATGGG--CAACT-GTTTTAA-TGC--AATAC--T-GA---T-AGTATTC-AGCAC--TT-TA-CAGAG----ACAATT-C--T--GCATG-A--TTA------A--AG-ATA---AT--------------T-GA---CTACT-GTG-GCCGACATAT---CT-TCAG---TACT-ATAATACC-AT-G--TACATaattaa
gi|29 : catAA--T-----ACA--TTTCA-T---GC-AAA--AA------------T-A------------A-----A---GA-T--------T-A-ATGAAT----A---CATATATA-CTC--A-G------CT-TTATTA--C-A-AA--G-CA-T-G--T-ATTAATA-TAGAT--CA----A-T-TAAT--G-------A-TTTTA--A-AT--------A-----------AT--------------TA--
gi|10 : -T-G--T-ATTTATA---GAT--CA----A-T-TAAT--G-------A-TTTGA--A-AT--------A-----------ATTATATATGAAATACCA--TT----TA-----A-TT-ATA-CC----CCA-GTAT--AAGCT-T-C---TGAT-C--TTTTCA----AAG-CT---CTC---------------------------AT-AT----C--CC---A-T----A-TAAC-TTTTT----------------AATT-----C-ATAGG--CAACC-GTTTTAA-TGC--AACAC--T-G---------A----AGTAC--TT-TA-CAGA-----GAA--T-TC-T--GCATG-T--TCAAG-AT-A--AATATA-T-TT----GATT-AAT--T-GA---CT--------------ATAT----C-TTAG---TACT-ATAC---C-AT-G--TACATGTATAATA-------GAGG-GTTACAGG--TACTAGC-A-T-AGTTT-G---------AT-------------A------A--------------
gi|7 : T-ATA----T-GT-GTATACTTGA----TA-------GGAGTT--ACAGG--TA---GC-A-T-AGTTTTGTCATTAT--GC-------------A------A--------------AGACGTTT--------------T-----T--T--GCT-G-TATATC--TTG-A-TTGGAGTA--AACGGG-TA-------A-GTTG--AACACTGT--G--ATCGTAGT-A--GAATAAATA-TAAACTGGG--T--GA-TATTAAAA-CAATGT-TGTTGC-A---AAA--GACCAGTGCTT----ATGG-------AGATCA--AAAAGATTA-ATTTGGG-GACAGG--TACAATGGACA-TG---T-G-T--TAA-TAACA-TA-CCAA--GGGTCCTC-AG-----G--GA-GGCGAtgagagacaaaata
gi|13 : cagggttgggagattaaaaccatccctggttttcaccagtccaaaactcccaaaagtggttcaataccggtcaattgaaattatcactaactgctcctttttcctatttttatatatttcatcaaaaaataaaacaggatttgtgtctttcaaaaatcaaatctttatcacaaagcatattggttatagatgaatgtaatgataaacaaaataagaaatgaaatatcatttaattgtatgaacttcgacctttttcaaggctatctctatttctagttgcatatttctctataactttttagtatgtcgttttttgagttatataggcgaactattttaaggcaatactttgctagtaacagcttacagagacaattttgcaaagtataagatatttagaatggtacatttttaaaccattcgtaatctgtcacttctgtggtccacaacctatattgctctcagtttacgtattatccgatttgtactgatgtacatgg-----TA-------GAGGGTT-ACAGG--TA---GC-A-T-AGTTT-G---------AC-------------A------ATGAGAGACACAATGA------T--------------T-----T--CT-GCT-T-C-TACC--TGG-A-C-AGAATA--A-CAG-----GA----A-GCTG--AGCACTGT--GATCTAGCA-------AATAGATA-TAAACTGGG--T--GA-T----AAA-CAATG--TGTTGC-A---GAA--GA-GATTACT------TGG-------GG-----------ATTAT------------AGA-CAAAGTGGGCA-AG---T-GTT--AAT-TAACA-TATACCA--G-----CC-A
gi|1 : atatatacGG--TAT--GT---T-AATTT-A---------AC-------------A------A--------------C------T--------------TGTGAAT--C--G-----TATACC--TGA-ATC-AAAGTA--A-TAtgaaaactgtaaagatcacccaca
gi|24 : gggttcgtgcgttaaaaccgccccaggtttccagcggcttttaaccggttataactcgccgctgtcaactactccaaaaaaatggtcaatagcggtcaatagctggtcaagtgaaaatttaaagtgtcctatttccaattttaaaaatacattcatgctcaaaaattaatagtttgatagtctttggtccaaaaatccagctttattcacagaagcaatgttatttattgattacaattaatgataataatcatttaatttacaccccagtatgaacttctggaccctttcaaagcttgcacattctaggctatatccctattataacttttttagttaatgggcaccaccgtttcaatgccaatactgatagtagcatttttcagagacacatcgatgtgaaagatataaataatattggctaattgactaactatggtcaacatactcttcagtacttataccatgtacatatagagggttacaggtagataatagtttgacaaatgagagacaaaataattttctgttatacctgggacaaaaaacagcgtatatcacactgggagcactgtgattagtaaataatataaatgggtgataaacatgttgcaaaaaagacagtgctctaaatggaggcaaaa------A--------------A------T--------------T-----T--CT-GCT-T--ACGCC--TGG-A-C-AGAAAA--A-CAGG-T--------A-GCCG--AACACTGA--T--CTAGTAAATACCCAATACATA-TACAATG--------------------------TGTTAC-A---AAA--GA-CAGTGCTT----ATGG-------AG--C---AAGAGATTaaggccaggatgaggcaattgtgtgttgttattgttatgaaaaacatcacccacactgtacacaccaatgctggatcatcaggtatcctgtggaattactcttcaataatgaacttgtacgaaaatatagggactttcagtttatataggaaaatataagaaataatatagggacttgacacctgctctttgctaggacaaaagttaaaaaagtttataatttttacattgtagcaattttcccaaattgaaaaaagtcttatgcattattttaatattctcatttgcaaatgtaatgttttgtaagtgatggtttagaacagttaatttatcatcatgaatgaactcgttaatacaatttaaataaccaataatatagaataattgaccatataatcttcaatgaccacatcgacagtattgaccatagttgaccagttattgtaccggtcttgaaccagtatgacactggggcccggtccaacacctagtattgacagctttttttggccaaccc
gi|31 : gacaatgagagacaaaat-----TGTTGC-A---AAA--GA-CAGTGCTT----ATGG-------AT--C---AAAAGATTA--CTTGGG-GACAGG--TACATTTAACA-TG---T-GTT--AAT-TAACA-TACCCA
gi|23 : atgGGACA-AG---T-G-TT-AAT-TAACA-TACCTAA--GGT---TC-AG-----G--GATGGCAATTGTG--TGT-ATTATTG-TTATGA-A-AACA--TTACCCAC--ATTT-GCACA-CCAATG--TGAT-CATTA--GGAACC-CGATGAAT-ACTC-TTCAA-TAATGA-CTTG
gi|4 : T-GT-AGGAAAAT-ATAG--GGACTTTTGACACC-CTG---CTCTTTG---TA----GG-ACAAAAA-TT-AAATAG-TTTAGT-AATTTTTACA-CGTGAGGCA--T----TT-TCACC-CAAT--GAA--TA--AATCT-T-ATGC----ATTA-TGT----------TAA---TCTCA-TTT--GCCAAT----GTAA-TGCTTGTTTGCAAGT--------GCCTGTCTTAAGAA-TTATAGT---------AT-TTTATTCATCTTTAATCAGAACT-CCGT-AAC---ATTTTAAAAAT-AACCCA-ATAATATGAGAATATGTGATTCATTAAGCTTTTTCAA-TTGGC-ACCA-CAATCGAGCCAGATATTGACCACT----T-A-T-----GACCA-GTA-TT---G-AC-------TG----GT-TTT-AA--CCATTA---TTGACCCAA--C-CGG---C----C-C-GT-C-AATTA------------C-------TAGTC-AT-TGGGA---CCG----C-T--TTT--T
gi|16 : agggttgggcggttaaaacccgcctccgtttaccagcggttgttaaccgcttaaccgccccggtcaatactcccaaaacgtgtcaatagtttggtcaatctggtctaattgaaatttaaagtgctcctttccaattttaaatacatttttcattgcaaaaaataataggatttcataatcttttcaaaagagtagcttatcagcaaatggcagtattctttttgattccaaattattaatgataataatcatttaattacaccccagtattgaactttctgaccttttcaaagactcttcatcattctggcggattgatcccctaattattaacttttttagttaatgggcagcctgttttcaatcaaatactgattagctagcacttcagaggacaattctgcatgttttaagatataaatatcattgctaattttgactacttatggcaacatatcttcattactataccatgtacatgtagacgggttacaggactatatatgtttgacaatgagagaaaaaaaattttctgcttatactggaccaaatatacagctaggatcacttgagcactgtgatctattaaataaatactaaactcggtgataaaacattgttgcaaaaagacagtgtctccaaatgggagtgtcggcgaggagatattaccttgggtgcaggtataatggacaaggtaattaacatacccaaggtccagggatggcaattgtgtgtgttattgtttatggcaaaacatcacccatactgacacacaaatgtgatcattaggtactgatgaatacccttcaataatgactAAATAA-ATAG--GGACTTG--ACACC-CTG---CTCGTTGCTCTA----GG-AC-AAAAGTG-A-ACAG-TTTT-T-GATTTTTACA--GTGAA-CAT-T----TT-CC--C-CAATT-TAA--CA--AAATC-TGATG----CATTA-T-TTTAATATTAATAA---TTTCATTT---GT-AT-----ATAAGTG--T---TGTAAG--------TGCATGTTT--AGAA-T----T----------AT-TT-AT-CATCAATAAT--GAACT-CT-TTAA
gi|8 : A-ATAGAAGGATTTG--ACACC-CTG---CTCTTTG--CTACCTAGA-AC-AAAAGTT-AAACAG-TTTT-T-GATTTTTACA-G-TCAG-CA--T----TTTCC--C-CACTT-TAA--GA--AAATC-TTATGC----ATTA-T-T----------TAA---TTTAATTT---G--CAT----GTAAGTG--T---TGTAAGTCATAAAGTGCATGTTT--AGAATT-ACAGT---------AT-TT-AT-CATCAT-AAT--GAA-T-CT-TTAA----------AAAAT-AAACCA-GTAATAT-AGAATAA-TGAC-CAATAAA---TTTCA---------------------------ATTGACCATTA-----T-T-----GACCA-CTA-TT---G-AC-------TG----GT-TTT-AA--CCCGTA---TTGACC--A--C-CAG---C----CCG-GT-C-AA-TA------------C-------TAGT--
gi|35 : agA-ATAG--GGACTTG--ACACC-CTG---CTCTTTG--CTC----GG-ACAAA
gi|3 : -ATGG--GAACGTC-GACCCG-CTGACTCTCTTTGT-CTA----TGCACAAAAGTTT-AAACAG-TTTG-TTGATTTTCACATGGTGAG-CA--TGAGTTT-CC--CGCATTTTGAACTTATCAAATC-T--TGTAGGCATTA-T-T----------TAA---TTTCT-TT---T--CAT----GTAAGTGTAC---T-GAAGT-------CA-ATGTTT--AAAT-T-ACAGTAAATAATACAC-TC-AA-CAGTA--GAT--GAACTGCT-TTAACAA-ATTA--AAAATAAGCTCATA-TATAT-ATAATAATTGAC-CATTAAA-TTCTTCAAGTTG---ACCA-CTATCG--CCA---GTTAATGACCG--TA-T-T-----GACCATGTGG-G---G-AC-------C-----GT-TTT-AA--CCAGTA----TGACCA-A--C-TGA---C----CCG-GTCC-AA-TA------------C-------TAGTACAT-T--GA---CCG----C-T--TTT--TTG-CCAAC
gi|22 : agggttgggcggttaaaaccacccccgggtttttatacgagcggtttaaccggttatataccgtctccgcgtcacatactctccaaaatggtcaatgtggtcaattactggtaatttgagaatttaatagtgttgcctgttggttccgatattttaatacatttcatgcaaaaatgagaagtattaattaatagtttatcacttcagactttattacaaagcattgctattcatagatccaattaatgtttttaaataattatactgaaatgtcatttattgttataccccggtaatgacttctgacctttttagagcgctcatttctaagctggacatatcaccctattttaactttttttagtaagatcggcaactgtttgcaatactgaatagtactatagcactttttcagatggccaaattcttgcatgtttatagtataattgcactactgtggttgacatatctttactactatatccatgtacatgtatacttaaaaggttacaggtgagcattagtttgcaatgagagacaaaataatttctgcttatacctggaccaaaatacgacatacgattcagctgagcactgttgatctagtaaataaatataactgggttggattaaacaatttgtgttgcaaagacatagtgcagtattacttggacaggttaatatgacacagtgttgtaattacattaccctagggtctaacctgtggatggcagtgtgtctgttatttgtatgaaaaacatcacaccacacacaattgatgcattagacaccttcagtagtatgactgtatggagagactAG--GGACTTG--ACACC-CTG---TTCTTTG--CGA----GG-TC-AAAAGTT-AAACAG-TTTT-T---TTTTTACA--GTGAG-CA--T----TT-TC--C-CAA---AAA--CA--AAATCTT-ATG----CATTA-T-T----------TAA---TTTTATTT---G--CACACATGTAAGTG--T---TGTAAG--------TGCATGTTT--AGc
gi|17 : -T-GCAG-----------T-TT-AC-CATAT--AAT--GG-CC-ATTTTAGC---ATTT--GAAAT-AACCCA-T-AATGG-ACTATA--TAAT-GATCGAG-T--TTCAA-TG----ACCA---ATCA--------ATTTTCAAGTA--CT---------GACCA-G-AGT----G-AC-------CG-----T-TTT-AATACCAGTAAT-TTGACC--A--CGCAA---C----CCCAGT-C-AA-TA------------C-------TAGT--ATAT--GA---CCA----G-T--TTT--TTG-CCAAC
gi|18 : act-ACAGT---------AT-TT-AT-CATCAT-AAT--GAACT-C-GTTATC---ATTT--CAA---TAACCA-ATAATAT-AG---------------AAA-TCTT-CAA-TTG---ACCA-CAATCN--NNN---NNNNNNNNNNN--NN-N-N-----NNNNN-NNNNNN---N-NN-------NN----NN-NNN-NN--NNNNNN---NNNNNN--N--C-CGG---C----CCG-GT-C-AA-TA------------C-------TAGT--AT-T--GA---CCG----C-T--TTT--TTG-CCAACcc
gi|21 : TCAAC---ATTT--AAA---TAACCA-ATAACAA-ACTGTAAT-GAC-CAATCAA-T-TTTCAA-TC----AAC--CAGT----------ATTGACCACTA--TT------------------------G-AC-------AG----GT-TTT-AA--C-AATA---TTGACC--A--C-CGG---C----CCG-GT-C-AA-TA------------C-------TAGT--AT-T--GA---CCAGGTTT-T--TTT--TTG-CCAACcct
gi|20 : ttataaacttgccact---ATTT--AAA-C-TAACCA-ATAACAT-AGAATAAT-GAC-CATTAAA-TC-TTCAA-TTG---ACCA-CAATCN--NNN---NNNNNNNNNNN--NN-N-N-----NNNNN-NNNNNN---N-NN-------NN----NN-NNN-NN--NNNNNN---NNNNNN--N--C-CGG---C----CCG-GT-C-AT-TA------------C-------TAGT--AT-T--GA---CCT----T-T--TTT--TTG-CCAAC
gi|1 : tTTT--AAAAT-TG-----G-AA-AT-AG-------GACACTTTAAA-T-TTTCAC-TTG---ACCAGCTATTGA-CCGCT-ATTGACCATTT--TT-T-T-----GG--A-GTAGTT---G-ACAG-----CGGCGAGT-TAT-AA--CCGGTcct
gi|3 : gggttcgtgcgttaaaaccgccccaggtttccagcggcttttaAC-TATTAAA-TTCTCAAA-TT----ACCAGTAATTGA-CCAC--ATTGACC---A--TT-T-T-----GGAGA-GTATGT---G-ACGCGGAGACG----GTATAT-AA--CCGG-----TTAA----A--C-CGC---T----CGT-AT-A-AA-AA------------CCCGGGGGTGGT--TT-T--AA---CCG----C-aatacattcatgctcaaaaattaatagtttgatagtctttggtccaaaaatccagctttattcacagaagcaatgttatttattgattacaattaatgataataatcatttaatttacaccccagtatgaacttctggaccctttcaaagcttgcacattctaggctatatccctattataacttttttagttaatgggcaccaccgtttcaatgccaatactgatagtagcatttttcagagacacatcgatgtgaaagatataaataatattggctaattgactaactatggtcaacatactcttcagtacttataccatgtacatatagagggttacaggtagataatagtttgacaaatgagagacaaaataattttctgttatacctgggacaaaaaacagcgtatatcacactgggagcactgtgattagtaaataatataaatgggtgataaacatgttgcaaaaaagacagtgctctaaatggaggcaaaatattactttgattcaggtatacgattcacaagttgttaaattaacataccaaggccaggatgaggcaattgtgtgttgttattgttatgaaaaacatcacccacactgtacacaccaatgctggatcatcaggtatcctgtggaattactcttcaataatgaacttgtacgaaaatatagggactttcagtttatataggaaaatataagaaataatatagggacttgacacctgctctttgctaggacaaaagttaaaaaagtttataatttttacattgtagcaattttcccaaattgaaaaaagtcttatgcattattttaatattctcatttgcaaatgtaatgttttgtaagtgatggtttagaacagttaatttatcatcatgaatgaactcgttaatacaatttaaataaccaataatatagaataattgaccatataatcttcaatgaccacatcgacagtattgaccatagttgaccagttattgtaccggtcttgaaccagtatgacactggggcccggtccaacacctagtattgacagctttttttggccaaccc
gi|12 : agggttggTTAAA-T--TTCAA-TTTATGACCA-C--TAG--CTA---AT-GACCAC-----T-T-T-----GG-GA-GTA-TT---G-ACCGGG---CG----GT-TAT-AA--CCGGTgttgcctgttggttccgatattttaatacatttcatgcaaaaatgagaagtattaattaatagtttatcacttcagactttattacaaagcattgctattcatagatccaattaatgtttttaaataattatactgaaatgtcatttattgttataccccggtaatgacttctgacctttttagagcgctcatttctaagctggacatatcaccctattttaactttttttagtaagatcggcaactgtttgcaatactgaatagtactatagcactttttcagatggccaaattcttgcatgtttatagtataattgcactactgtggttgacatatctttactactatatccatgtacatgtatacttaaaaggttacaggtgagcattagtttgcaatgagagacaaaataatttctgcttatacctggaccaaaatacgacatacgattcagctgagcactgttgatctagtaaataaatataactgggttggattaaacaatttgtgttgcaaagacatagtgcagtattacttggacaggttaatatgacacagtgttgtaattacattaccctagggtctaacctgtggatggcagtgtgtctgttatttgtatgaaaaacatcacaccacacacaattgatgcattagacaccttcagtagtatgactgtatggagagactatgggaacgtcgacccgctgactctctttgtctatgcacaaaagtttaaacagtttgttgattttcacatggtgagcatgagtttcccgcattttgaacttatcaaatcttgtaggcattatttaatttcttttcatgtaagtgtactgaagtcaatgtttaaattacagtaaataatacactcaacagtagatgaactgctttaacaaattaaaaataagctcatatatatataataattgaccattaaattcttcaagttgaccactatcgccagttaatgaccgtattgaccatgtggggaccgttttaaccagtatgaccaactgacccggtccaatactagtacattgaccgcttttttgccaacc
gi|30 : cagggttgggcaattaaaccagcggttttaAATCG--ACC---ATTAANNNNNN--NN-N-N-----NNNNN-NNNNNN---N-NN-------NN----NN-NNN-NN--NNNNNN---NNNNNN--N--C-CAG---C----CAG-GT-C-AG-TA------------C-------TAGT--AA-T--GA---CCA----C-T--TTT--TTG-CCAACaatgtcctttctcctatgttatacatttcatgaaaaaacaactttttcacgaagcctataattatagatgaattaagtatttaattatacacccctgcatgtataaacttctgagcttttcaaattaagctctcatttgtagctgatattcccaataactttttag
gi|26 : TGACCAATAAATT-T-TCAATCAACTA-TTA-TT---G-GC-------CA----GT-TTT-AA--CCAGTA---TTGACC--A--C-TTG---C----CCT-GT-C-AA-TACTACTATTGACTC-------TAGT--AT-T--GA---CCA----C-T--TTT--TTG-CCAACc
gi|12 : aA--TT-TAT-----GACCA-CTAGCTAATG-AC-------CA----CT-TTG-GG----AGTA---TTG-----A--C-CGG---G----CG--GT-T-AT-AA------------C-------CGGT--TA-A--AA---CCG----C-TGGTTTAATTGCCCAACcctg
gi|25 : caggA--TTAT-T-----GAACA-CTAGT----G-AC-------CG----GT-TTT-AA--CCAGTA---ATGACC--A--C-TGG---C----AGA-AT-C-AA-TA------------C-------TAGT--AT-T--GA---CCA----C-T--TTT--TTG-CCAACtgaaatttaaaatgtcctttctcctatgttatacatttcatgaaaaaacaactttttcacgaagcctataattatagatgaattaagtatttaattatacacccctgcatgtataaacttctgagcttttcaaattaagctctcatttgtagctgatattcccaataactttttag
gi|27 : ataataaagactcaataatgactaataaattttca--TT-T-T-----AACCA-G-------------------CA----GT-TTT-AA--CCGGTT---GTAACC--G--C-C-----C----CGCGGT-G-AA-CA------------C-------Tcct
gi|28 : cagggctgggcggtcaaaactgtcccaaccgtccccggC-------CG----GT-TTT-AA--CCAGCAGTTTTAACT--G--C-C-----C----CCA-GT-C-AA-TG------------C-------Tcccaaaatggtcaatagtggtc
gi|15 : cagggttgggcggttaaaaccactc-------CG----GT-TTT-AA--CCGATT---ATAACC--GCCC-CGG---G----CG--GT-C-AA-TA------------C-------Tcccaaaatggtcaattgaaatataaagtgtccttttt
gi|12 : cagggttgggcggttaaaaccgcccccggtttaaaccag-------CG----GT-TTT-AA--CCGGTT---ATAACC--G--C-------C----CG--GT-C-AA-TA------------C-------Tcccaaattgaaatttaaattctccttttaaatacatttcatgccgcaaaaataaagatatattaataaatttatagtcttttcaaacatcaactttgttacaaagcatgta
gi|6 : cagggttgggcaattaaaccag-GT-C-AA-TA------------C-------TAGT--AT-T--GA---CCG----cccaaagtggtcattagctagtggtcataaattgaaatttaaaatgtcctttctcctatgttatacatttcatgaaaaaacaactttttcacgaagcctataattatagatgaattaagtatttaattatacacccctgcatgtataaacttctgagcttttcaaattaagctctcatttgtagctgatattcccaataactttttag
gi|18 : gttcttttcccaattttaaatacatttcatgcaaaaataatagatttatagtctttttcaaaaatcaagccttatttacaaaggtatgtattatttgatcaacttaatgataataatcatttaattacaccccagtatgaacttctgaccttttcaaagctctcatttctagctgatatcccctattataacttttaattaatgggcaactgtttcaatgcaatacttgatagtagcacttttcagagacaattcatgcatgttaagattattaaatatattggctaattgactacttatgtgtcaacatatcttagtactataccatgtacatgtagagggttacagtagatatagtttgacaatgagagacaaaataatttctgcttatgtacctggacaaaataacagctagatcagctgtagcactgtgatctagtaaataaatataaactgggtgatataaacatgttgcaaaagacagtgctctaagtggagcaagatattacttgggtcatgtataaggacaagtgttaattaacatacccaaggtccatggatggcaattgtatgtgtattttatgaaaacatcacccacaactgacacaccaatgtgatcattaggtacctgaagaatactcttcaataatgacttgtatggaaaatatagaaataaatagggacttgacaccctgctctttgctaggacaaaagttaaatagttttataatttttacagtgagcattttccccaattgaataaaatcttatgcattatttaatctcatttgcatgcaagtgttgtaagtgcatgtttagaattacagtatttatcaacataatgaactcgttaacatttaaaataaccaataatgtagaataatgaccattaaatcttcaattgaccacaatcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccggcc-GT-C-AA-TA------------C-------TAGT--AT-T--GA---CCG----cgctttttgccaaccc
gi|21 : acagtatttatcatcataatgaactcgttatcatttcaataaccaataatatagaaatcttcaattgaccacaatcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccggcc-GT-C-AA-TA------------C-------TAGT--AT-T--GA---CCG----cgcttttttgccaaccct
gi|20 : ttataaacttgccacttcaacatttaaataaccaataacaaactgtaatgaccaatcaattttcaatcaaccagtattgaccactattgacaggttttaacaatattgaccaccggcc-GT-C-AA-TA------------C-------TAGT--AA-T--GA---CCG----caggtttttttttgccaac
2 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|34 ): ATGTAAATTTATATGGAATTCATATAATAATATAGAAATTT
Unaligned ( gi|36 ): AGGGTTGGGCAGTTAAAACCATCCCCGGTTTAT
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 111111111 22222222222 222222222222 11111111 444444444444444444444444444444 11 1111111111 111111 111 3333333333333333333333333333333333333 1111 11 333333 11 1111 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555 111 1 33333 1111 222 1111111 222222222222 1111 4444444444444444 1111111 22 11 11 111 222222222 111111 111 3333333333333333 222222 222 1111111111111 1 111 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 1 11 11111111111 11 3333333 33333333333333333333333333 22222 222222222222222 444444 11111 11111 11 11 11 11 1 2 66666666666666666666666666666666666666666666666666 222 33 2222222 1111111111 1111111 222 33333333 111111 11 222 1111 11 2222222222 44444444444444444444444 111111111111
lowQualScore : 3 0 333333333 3 88888888888 3 3 999999999999 2 44444444 2 66 2 2 33 3 0 888888888888888888888888888888 11 6 2222222222 3 3 33 2 99 33 2 2 2 2 2 333333 33 0 33 111 33 33 3333333333333333333333333333333333333 2 5 444 88888888 2 2 3 66666 5555 3 0000 3 66 3 3 44 3 333 66 2 4 222222 22 3 3 0000 3 44 44 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999 8888 55 4 555 6 44444 99 8 2222 8 8888 4 8 444 4 4 55 55 4 7777777 3 2 7777 3 666666666666 3 1111 0000000000000000 3333333 77 4 0 4 4 00 00 4 666 4 222222222 4 4 8 66 555555 4 7777 1 0 4 4 3 000 7777777777777777 888 33333 5 2 5 66 5 5 5 5 6 888 4 555555 4 000 6666666666666 4 2 777 555 4 4 8 4 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 88 66 4 3 00 8 99999999999 4 00 4 4 1 4444444 1 4 88888888888888888888888888 4 777 55 4 4 66666 000000000000000 9999999 8 66 333333 88888 4 4 4 99999 4 4 44 88888 22222 66 3 5 77 0 1 66 22 77 33 66 66 77 5 0 77 00 6 8 3 6 55555555555555555555555555555555555555555555555555 4 6 6 5 1 4 55 444 4 777 99 8888 4 4 8 4 55 88 00 4 4 4444444 66 4 7 4 888888 66 4 555 9999999999 777 6666666 4 66 111 4 0 88888888 1 66 4 55 4 4 555555 8 4 4 4 55 4 99 666 55 55 222 3 3 4444 3 3 6 3 3 3 33 3 44 77 8888888888 0 66666666666666666666666 2 0 2 33 5 33 33 2 2 33 8888 2 5 2 2 444444444444 66 3 44 555 9999 44 3
lowQualScore : . . ......... . ........... . . ............ . ........ . .. . . .. . . .............................. .. . .......... . . .. . .. .. . . . . . ...... .. . .. ... .. .. ..................................... . . ... ........ . . . ..... .... . .... . .. . . .. . ... .. . . ...... .. . . .... . .. .. ....................................................... .... .. . ... . ..... .. . .... . .... . . ... . . .. .. . ....... . . .... . ............ . .... ................ ....... .. . . . . .. .. . ... . ......... . . . .. ...... . .... . . . . . ... ................ ... ..... . . . .. . . . . . ... . ...... . ... ............. . . ... ... . . . . ........................................................... .. .. . . .. . ........... . .. . . . ....... . . .......................... . ... .. . . ..... ............... ....... . .. ...... ..... . . . ..... . . .. ..... ..... .. . . .. . . .. .. .. .. .. .. .. . . .. .. . . . . .................................................. . . . . . . .. ... . ... .. .... . . . . .. .. .. . . ....... .. . . . ...... .. . ... .......... ... ....... . .. ... . . ........ . .. . .. . . ...... . . . . .. . .. ... .. .. ... . . .... . . . . . . .. . .. .. .......... . ....................... . . . .. . .. .. . . .. .... . . . . ............ .. . .. ... .... .. .
lowQualScore : 3 4 333333333 3 33333333333 6 3 222222222222 9 11111111 9 88 9 9 99 1 4 444444444444444444444444444444 88 5 5555555555 3 1 99 7 00 77 7 7 0 9 9 666666 77 5 77 000 77 77 2222222222222222222222222222222222222 7 3 777 00000000 7 9 4 22222 8888 1 4444 1 11 1 1 22 1 777 88 9 0 888888 55 3 3 4444 3 66 66 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222 5555 55 0 000 0 99999 55 0 5555 0 5555 0 0 666 0 0 55 55 0 2222222 6 3 7777 6 777777777777 6 4444 0000000000000000 7777777 88 4 9 4 4 66 66 4 777 4 444444444 4 4 9 11 000000 4 1111 0 8 4 4 2 111 2222222222222222 888 44444 0 0 0 99 0 0 0 0 5 888 4 111111 4 888 7777777777777 4 8 222 888 4 4 9 4 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 00 11 4 3 66 9 44444444444 4 66 4 4 9 6666666 9 4 88888888888888888888888888 0 000 55 0 0 66666 111111111111111 7777777 9 11 333333 77777 0 0 0 55555 0 0 66 55555 55555 99 2 7 77 7 4 44 99 99 66 44 44 99 7 1 99 77 7 0 7 7 88888888888888888888888888888888888888888888888888 3 7 7 7 4 0 00 000 0 000 55 5555 0 0 9 4 44 99 66 4 4 3333333 11 4 3 4 666666 11 4 333 4444444444 888 2222222 4 11 777 4 8 88888888 1 11 6 55 0 0 555555 0 0 0 0 55 0 77 444 00 00 444 3 3 2222 3 3 7 3 6 3 88 3 66 88 8888888888 3 99999999999999999999999 9 3 9 99 2 99 99 9 9 99 9999 9 7 9 9 666666666666 88 1 22 444 6666 66 3
consensus : CAGGGTTGG-GCGGTTAAAAC---------C-GCCCCCGG---TTT-A-ACCAGCGG-TT-TTAACCGGTT--ATAA----C-CGCC-C----CG--G-TCA--A-TACTC-CCAAAA--TG-GTCA--A--T-A-GT--GGTCAA-TA--T-GGTCAATTTGAAAATTT----A-----A-AGTG-T--CC-T--T--T-T-CCNA-T-TTT-----AAA--TACATTT--CAT---GC--AAA--AA------------T-A------------A----TA---G-A-T---T------T-AT-AGT-CTTT---T-CAAA--A-ATC-A-G--CT-TTATT-CAC-A-AA--G-CA-T-G--T-ATTTAT-T---GAT--C-A-A----T-T--AAT--G-------A-T------AAT--------A-----------AT--------------CATT----TA--ATT-ACA---CCCCAGTAT-T-TGAAC--TT-CTG----ACC-TTTTCA----AA-G-CT---CTC-A-T--TTCT--A-G-C---TTG-ATAT----CC-C---T---AN---TA-TAAC----TTTTT----------------AGTT-----A-ATGGGC--AACTG-TTTCAAT-G-C--AATAC--T-GA---TA-GTA----AG---CACTT-TT-CAGA-GAC--A-ATTTCTGC-ATG-T--TTAAGAT-AT-AAATA-T-ATTG---GCT-AA---T-GA---CTACTTATG-GTCGAC-A--T-A-T-CT-TCAG---TACT-ATA----C-AT-GT-TACATG-----TA------GAGGGTTTACAGG--TA--GGC-A-T-AGTTT-G---------ACAA--------------A------------T------------------TTCTGCTT-TATACC--TGG-AC-AAAATA--A-CAGC-TA-GAT-C-A-GCTG--AGCACTGT-GATC-TAGTAAA-A---AATAAATA-TAAACTGGGT-T--GA--T-A----AA-CA-----TGTTGC-A---AAA--GAC-AGTG-CTC--AAATGG-------AG--C---AAG---A-TATTA-CTT--GGG-G----CAGGT-A--TAATG-GACA-AGT-G-T---AAT-TAACAT-ACCC-AAGGTC--CAG-----G--GATGGCAATTGT-GT-TGTGTTATTG-TTATGA-AAAACA--TCACCCAC--ACCG-ACACACC-AATGT--GAT-CATTA--GGTACCTTGATGAA-TACTCTTTCAA-TAATG-ACTTGTT-------ATGGAAA-AT-ATAGGGA-CTTT---C-A----GC---T--TGTAGGA-AAATAT-AGAAA-TAA-ATAG--GGACTTG-GACACC-CTG---CTCTTTG--CTA----GG-AC-AAAAGTT-AAACAG-TTT-NT-AATTTTTACA--GTG-A-GCAT-T----TTC--CC-CAATT-GAA--TA--AAATCTTAT--GC-ATTA-T-T----------TAA---TCTCATTTG----C--ATGTAA-G--TG-T-TT-GTAAGT-------TGCATGTTT--AGAATTACAGT--A-T-TTA------TCATC-A-T-A-AT--GAACT-CTGTTAAC---A--TTT--AAAATTAACCAATA-ATAT-AGA----ATA-A-T-GA-CCATTAAA-TCTTTCAA-TTG--ACCACAATC--G-CCA---ATTGACCACTA--TTTT-----GACCA-GTAGTTG-ACCGGTTTT-AA--CCAGTA--TTGACC--A-C-C--GGCCC----GGT-C-AA-TA-C------------TAGT--AT-T--GA---CCG----CTTTTTT--G-CCAAC
Reference ( family-2007 ) : CAGGGTTGG-GCGGTTAAAAC---------C-GCCCCCGG---TTT-A-ACCAGCGG-TT-TTAACCGGTT-TATAA----C-CGCC-C----CG--G-TCA--A-TACTC-CCAAAA--TG-GTCA--A--T-A-GT--GGTCAAATA--T-GGTCAATTTGAAAATTT----A-----A-AGTG-T--CC-T--T--T-T-CCNA-T-TTT-----AAA--TACATTT--CAT---GC--AAA--AA------------T-A------------A----TA---G-A-T---T------T-AT-AGT-CTTT---T-CAAA--A-ATC-A-G--CT-TTATT-NAC-A-AA--G-CA-T-G--T-ATTNAT-T-T-GAT--C-A-A----T-T--AAT--G-------A-T------AAT--------A-----------AT--------------CATT----TA--ATT-ACA---CCC-AGTAT-T-TGAAC--TT-CTG----ACC-TTTTCA----AA-G-CT-G-CTC-A-T--TTCT--A-G-C---TTG-ATAT----CC-C---T---AN---TA-TAAC----TTTTT----------------AGTT-----A-ATGGGC-CAACTG-TTTCAAT-G-C--AATAC--T-GA---TA-GTA----AG---CACTT-TT-CAGA-GAC--A-ATTTCTGC-ATG-T--TTAAGAT-AT-AAATA-T-ATTG---GCT-AA---T-GA---CTACTTATG-GTCGAC-A--T-A-T-CT-TCAG---TACT-ATA----C-AT-GT-TACATG-----TA------GAGGGTTTACAGG--TA--NGC-A-T-AGTTT-G---------ACAA--------------A------------T------------------TTCTGCTT-TATACC--TGG-AC-AAAATA--A-CAGN-TA-GAT-C-A-GCTG--AGCACTGT-GATC-TAGTAAA-A---AATAAATA-TAAACTGGGT-T--GA--T-A----AA-CA-----TGTTGC-A---AAA--GAC-AGTG-CTTC-AAATGG-------AG--C---AAG---A-TATTA-CTT--GGG-G----CAGGT-A--CAATG-GACA-AGT-G-T---AAT-TAACAT-ACCC-AAGGTC--CAG-----G--GATGGCAATTGT-GT-TGTGTTATTG-TTATGA-AAAACA--TCACCCAC--ACTG-ACACACC-AATGT--GAT-CATTA--GGTACCTTGATGAA-TACTCTTTCAATTAATG-ACTTGTT-------ACGGAAA-AT-ATAGGG--CTTT---C-A----GC---T--TATAGGA-AAATAT-AGAAA-TAA-ATAG--GGACTTG-GACACC-CTG---CTCTTTG--CTA----GG-AC-AAAAGTT-AAACAG-TTT-NT-GATTTTTACA-GGTG-A-GCA--T----TTC--CC-CAATT-GAA--TA--AAATCTTAT--GC-ATTA-T-T----------TAA---TCTCATTTG----C--ATGTAA-G--TG-T-TT-GTAAGT-------TGCATGTTT--AGAATTACAGT--A-T-TTA------TCATC-A-T-A-AT--GAACT-CTGTTAAC---A--TTT--AAAATNAACCAATA-ATAT-AGA----ATA-A-T-GA-CCATTAAA-TCTTTCAA-TTG--ACCACAATC--G-CCA---ATTGACCACTA--TTTT-----GACCA-GTAGTTG-ACCGGTTTT-AA--CCGGTA--TTGACC--A-C-C--GGCCC----GGT-C-AA-TA-C------------TAGT--AT-T--GA---CCG----CTTTTTT--G-CCAAC
gi|1 : GGGTTCGTGCG-TTAAAAC---------C-GCCCCAGG---TTT----CCAGCGGCTT-TTAACCGGTT--ATAA----CTCGCC-G----CT--G-TCA--ACTACTC-CAAAAAAATG-GTCA--A--T-A-GC--GGTCAA-TAGCT-GGTCAAGT-GAAAATTT----A-----A-AGTG-T--CC-TA-T--T-T-CCAA-T-TTT-----AAAAATACATT---CAT---GCTCAAA--AA------------TTA------------A----TA---G-T-T---T------G-AT-AGT-CTTTGGTC-CAAA--A-ATCCA-G--CT-TTATT-CAC-AGAA--G-CAAT-G--TTATTTAT-T---GATTAC-A-A----T-T--AAT--G-------A-T------AAT--------A-----------AT--------------CATT----TA--ATTTACA---CCCCAGTAT----GAAC--TT-CTGG---ACC-CTTTCA----AA-G-CTTG-CAC-A-T--T-CT--A-GGC---T---ATAT----CC-C---T---AT---TA-TAAC----TTTTTT---------------AGTT-----A-ATGGGCACCACCG-TTTCAAT-G-CC-AATAC--T-GA---TA-GTA-----G---CATTT-TT-CAGA-GAC--ACATC---G--ATG-T--GAAAGAT-AT-AAATAAT-ATTG---GCT-AA---TTGA---CTAACTATG-GTCAAC-A--T-ACT-CT-TCAG---TACTTATA----CCAT-GT--ACATA-----TA------GAGGGTT-ACAGG--TA--GAT-AAT-AGTTT-G---------ACAA--------------A------------TGAGAGACAAAATAATT--TTCTG--T-TATACC--TGGGAC-AAAA-A--A-CAGCGTA-TAT-C-ACACTGGGAGCACTGT-GAT--TAGTAAA-------TAA-TA-TAAA-TGGGT----GA--T-A----AA-CA-----TGTTGC-A---AAAAAGAC-AGTG-CTCT-AAATGG-------AGG-C---AAA---A-TATTA-CTT--TGA-TT---CAGGT-ATACGATT-CACA-AGTTG-TTA-AAT-TAACAT-ACC--AAGG-C--CAG-----GATGA-GGCAATTGT-GT-GTTGTTATTG-TTATGA-AAAACA--TCACCCAC--ACTGTACACACC-AATGCTGGAT-CATCA--GGTATCCTGTGGAATTACTC-TTCAA-TAATGAACTTG-T-------AC-GAAA-AT-ATAGGGA-CTTT---C-A----GT---TTATATAGGA-AAATATAAGAAA-TAATATAG--GGACTT--GACA-C-CTG---CTCTTTG--CTA----GG-AC-AAAAGTTAAAAAAG-TTT-AT-AATTTTTACA--TTGTA-GCAATT----TTC--CC-AAATT-GAA--AA--AAGTCTTAT--GC-ATTATT-T----------TAATATTCTCATTTG----CAAATGTAA----TGTT-TT-GTAAGTGA-----TG---GTTT--AGA---ACAGTTAA-T-TTA------TCATC-A-TGA-AT--GAACT-C-GTTAATACAA--TTT--AAA--TAACCAATA-ATAT-AGA----ATA-ATT-GA-CCATATAA-TC-TTCAA--TG--ACCAC-ATC--G-ACAGT-ATTGACCA-TA---GTT-----GACCA-GTTATTGTACCGGTCTTGAA--CCAGTA---TGA-C--A-C-TGGGGCCC----GGTCC-AA-CACC------------TAGT--AT-T--GA---CAG----CTTTTTTTGG-CCAAC
gi|10 : -T-G--T-ATTTAT-A---GAT--C-A-A----T-T--AAT--G-------A-TTTGA--AAT--------A-----------ATTATATATGAAATACCATT----TA--ATT-ATA---CCCCAGTAT----AAGC--TT-CTG----ATC-TTTTCA----AA-G-CT---CTC-A-T----------------------AT----CC-C--------A---TA-TAAC----TTTTT----------------AATT-----C-ATAGGC--AACCG-TTTTAAT-G-C--AACAC--T-G---------A----AG---TACTT-TA-CAGA-GA---A---TTCTGC-ATG-T--TCAAG---AT-AAATA-T-ATT-------------T-GA---TTAATT-------GACTA--T-A-T-CT-T-AG---TACT-ATAC---C-AT-G--TACATGTATAATA------GAGGG-TTACAGG--TACTAGC-A-T-AGTTT-G---------ATAA--------------cc
gi|11 : A----C-CGCC-C-----G--G-TCACAG-TACTC-CCAAAA--TG-GTCA--A--TTA-GT--GATC------------CAAT--GGGAATT-----------A-CGTG-T--CC-T--T--C-T-CCCAAT-TTTCTAACAAA--TA-ATT---CAT---GC--AAA--AA------------T-A------------A----TA---G-ATT---T------T-AT-AGT-C--T---T-CAAAGTA-ATC-A-A--GC-TTATTACACAA-AA--G-CA-T-GGAT-AGTTA--T-C-GATC-C-G-A----T-T--AATACG-------ATT------AAT--------A-----------A---------------CATTATCCTA--AAA-AC----CCC-AATGA-T-GAAACTTTT-CTGTGACACCATTTTCA----AA-GACT-T-TTG-A-A--TTCTTCA-G-C---GTG-ATAT----CCACCTAT---AC---TA-TAAC----TTtgagagacaaaata
gi|12 : CAGGGTTGG-GCAATTAAA-------------------------------CCAGCGG-TT-TTAACCGGTT--ATAA----C-CGCC-C-----G--G-TCA--A-TACTC-CCAAAG--TG-GTCATTAGCT-A-GT--GGTC--ATA--------AATT--GAAATTT----A-----A-AATG-T--CC-T--T--TCT-CCTA-T-GTT-------A--TACATTT--CAT---GA--AAA--AA------------C-A------------A---------------------------------CTTT----------------------------TT-CAC-G-AA--G-CC-T-A--T-AATTA--T-A-GAT--G-A-A----T-T--AA---G-------------------------------------------------------TATT----TA--ATT-ATACACCCC-TGCATGTATAAAC--TT-CTG----AGC-TTTTCAAATTAA-G-CT---CTC-A-T--TTGT--A-G-C----TG-ATAT----TC-C---C---A-----A-TAAC----TTTTT----------------AG
gi|13 : -----TA------GAGGGTT-ACAGG--TA---GC-A-T-AGTTT-G---------ACAATGAGAGACACAATGA------------T------------------TTCTGCTT-C-TACC--TGG-AC-AGAATA--A-CAG-----GA----A-GCTG--AGCACTGT-GATC-TAGC----A---AATAGATA-TAAACTGGG--T--GA--T-A----AA-CAATG--TGTTGC-A---GAA--G---AG--------------------------------------ATTA-CTT--GGG-GATTATAGAC-A--AAGTG-GGCA-AGT-GTT---AAT-TAACAT-A
gi|14 : atatatacCAGGGTTGG-GCGGTTAAAAC---------C-ACCC-------------------GG-TT-TTAACCAGT------------------------------CA--A-AATTC-CCAAAA--TG-GTCA--A--T-A-------CCA---------GTCAACT--GAAATTC----A-----A-AGTG-T--CCTT--T--T-T-CCTA-T-TTT-----AAA--T--ATTT--CAG---GC--AAA--AATAAAGATATATTT-A------------A----CA---G-A-T---T------T-GT-AGT-C--T---T-CAAA--A-ATC-A-A--TC-TTA-T-CAC-A-AA--G-CA-T-G--T-GTTTAT-taccagccatgaaaactgtaaagatcacccaca
gi|15 : CAGGGTTGG-GCGGTTAAAAC---------C-GCCCCCGG---TTTAA-ACCAGCGG-TT-TTAACCGA-T-TATAA----C-CGCC-CCGGGCG--G-TCA--A-TACTC-CCAAAT--TG-A---------------------------------AATTT--AAATTC-----------------T--CC-T--T--------------TT-----AAA--TACATTT--CATGCCGC--AAA--AATAAAGATATAT-T-A------------A----TA---A-A-T---T------T-AT-AGT-CTTT---T-CAAA--C-ATC-A-A--CT-TTGTT--AC-A-AA--G-CA-T-G--T-Aagatgaatgcaaagatt
gi|16 : AAA-TAA-ATAG--GGACTT--GACACC-CTG---CTCGTTGCTCTA----GG-AC-AAAAG-T-GAACAG-TTT-TT-GATTTTTACA--GTG-A-ACAT-T----TTC--CC-CAATT-TAA--CA--AAATCTGAT--GC-ATTA-T-TTTAATATTAATAA---TTTCATTTG----T--ATATAA-G--TG---TT-GTAAG--------TGCATGTTT--AGAAT-----T--A-T-TTA------TCATCAA-T-A-AT--GAACT-CT-TTAA
gi|17 : TTGCAGT------TTA------CCAT--A-T-A-AT--GG-CC-ATTTTAGC---A--TTT--GAAAT-AACCCATA-ATG---GACTATATA-A-T-GA-TCG---AG-T--TTCAA-T-G--ACCA--ATC------A---ATTTTCAAGTA--CT-------GACCA-G-AGT-G-ACCG-TTTT-AATACCAGTAATTTGACC--A-CGC--AACCCC---AGT-C-AA-TA-C------------TAGT--ATAT--GA---CCA----GTTTTTT--G-CCAAC
gi|18 : acACAGT--A-T-TTA------TCATC-A-T-A-AT--GAACT-C-GTTATC---A--TTT--CAA--TAACCAATA-ATAT-AGA----A-----------------A-TCTT-CAA-TTG--ACCACAATC--N-NNN---NNNNNNNNNNN--NNNN-----NNNNN-NNNNNNN-NNNNNNNNN-NN--NNNNNN--NNNNNN--N-C-C--GGCCC----GGT-C-AA-TA-C------------TAGT--AT-T--GA---CCG----CTTTTTT--G-CCAACcc
gi|19 : CAGGGTTGG-GCGGT-AAAAC---------C-GTGTCC----------------TGG-TT-TTAACCGATT--ATAG----TGCGCC-C----GA--GATCA--A-TAATC-GCA------G-G-----A--T-A-GT--G-TCAAGTAC-T-GGT-AATATGAAA-TTT----A-----A--GTG-T--CT-T--T--T-T-CCT--T-TTT-------A--TA---TT--CAT---GC--AAACGAA------------A-A------------G----TA---A-G-T---T------T-CT-Acct
gi|2 : T-TTAACTGGTT-AATAAACACCGCGCC-C----TG--G-TCA--A-TGC---CAAAAA--TG-GTCA-----T-ACGT--G--CA--TAC-T-GGTACATTTGAAAGT------A-----A-AGTG-T--CC-TG-T--T-T-CCAA-T-GTT-----TAA--TACATTG--CAT---GC--AAA--AA------------T-A------------A----TA---G-AAT---T------T-AT-AGT-CTCC---T-CAAA--A-AAT-A-G--CTCTTACT-TAC-A-----T-CA-T-A--T-ATTAG------AAT--C-A-A----T-TTAAGT--AC------A-T------AATGC------A-----------A----------------ATT----TA--ATT-ACAT--CCC-AGTAG-T--GAAC--TTGCTG----GAC-CTTTCA----AGCG-CT---CTC-AGC--TTCT--A-G-C---GTG-AT-------C-C---C---ATGTCTA-TAAC----TTTTT----------------AGTTTGACTA-A-GGGC--AACTG-TTTCAAT-GGC--AATACA-T-GAGGATA-GTT----AGGCACACTTATT-CAGA-GAC--A-ATTCC-GC-ATG-GGGTTAAGAT-AT-AA-TA-T-ATTGATGGCTTAA---T-GGAATCTA-TCA-G-GTCAAC-AGTTGA-T-CTATCAGACTTACC-AGA----C-ATTGT-CAC----------------GAGGGGTTACAG---TA--GGTTA-TTAGTTT-G----------CAA--------------A------------TGAAGACATAAAATAATTATCCTGCTT-TATACCAGTGG-ACCAAAATA--AACAGA-TA-GAT-CCA-G-TG--AGCA-TGT-GATC-TA-TAAA-AC--AATAG----TAAACTGGGTGTCAGA--T-A----AAACA-----TGTTGC-ATCAAAA--GAC-AGTG-ATCT-AAATGG-------AA--CC--AAGTTCA-TAT-A-CTT--GGG-GTA--CAGGT-A--TAATG-G-CA-AGT-G-T---TATATAACAT-TACC-AAG--T--CAG-----G--AATG-CAATTGTTGT-TGT--TAT-G-TTATGA-AAAACAGTCCACCCACCAACTG-ACACAC--AATGT--GAC-CAT-A--GGTACCT-GAT-AA-TACTCTTCCAAT-AATG-ACTGGTT--------TGGAAAGAT-ATAGGG--CTTT---CAA----AC---T--TATAGGATAATTAT-AGAAA-T-A-ATAG--GGACTT--GACACCTCTT---CTC-TTG--CTA----TG-AC-GAAAGTT-AAATAG-TTT-AT-AATTTTTTCA--GTG-A-GCAT-T----TTC--CC-CAA-T-GAA--TA--AAATC-TAT--GC-ATTA---T----------TAA---TCTCACTTG----C--ATGTAA-G--TG-T-TT--TAAG--------TGCATG-TT--AGAATTACAGT--A-TATTA------TCATC-A-T-A-AT--GAACT-GT-TTAAC---A--TTT--AAA--TAACCAATA-ATAT-AGA----ATA-A-T-GA-CCATTAAA-TC-TTCAA-TTG--ACCACAATC--GACCAGT-ATTGACCACTG----TT-----GACCA-GTAA-CG-A-CGGTTTT-AA--CCAGTA--TTGACC--A-C-C--ACCTCCACGGGT-CAAA-TA-T--------------GT--A--T--GACACCCGA---C--TTTT--G-CCAACaaaacatttt
gi|20 : tggcattaaaaataccgccaactgagtttagaaaacctatcagata---A--TTT--AAACT-AACCAATA-ACAT-AGA----ATA-A-T-GA-CCATTAAA-TCTT-CAA-TTG--ACCACAATC--N-NNN---NNNNNNNNNNN--NNNN-----NNNNN-NNNNNNN-NNNNNNNNN-NN--NNNNNN--NNNNNN--N-C-C--GGCCC----GGT-C-AT-TA-C------------TAGT--AT-T--GA---CCT----TTTTTTT--G-CCAACcc
gi|21 : tTCAAC---A--TTT--AAA--TAACCAATA-ACAA-ACT----GTA-A-T-GA-CCAATCAA-T-TTTCAA-TCA--ACCA-------G-T-----ATTGACCACTA---------------------TTG-ACAGGTTTT-AA---CAATA--TTGACC--A-C-C--GGCCC----GGT-C-AA-TA-C------------TAGT--AT-T--GA---CCAGGTTTTTTTTT--G-CCAACcct
gi|22 : ttataaacttgccactAG--GGACTTG--ACACC-CTG---TTCTTTG--CGA----GG-TC-AAAAGTT-AAACAG-TTT-TT---TTTTTACA--GTG-A-GCA--T----TTT--CC-CAA---AAA--CA--AAATCTTAT--GC-ATTA-T-T----------TAA---TTTTATTTGCACAC--ATGTAA-G--TG---TT-GTAAG--------TGCATGTTT--AG
gi|23 : G-GACA-AGT-G-TT--AAT-TAACAT-ACCT-AAGGTT--CAG-----G--GATGGCAATTGT-G--TGTATTATTG-TTATG--AAAACA--TTACCCAC--ATTT-GCACACC-AATGT--GAT-CATTA--GGAACC-CGATGAA-TACTC-TTCAA-TAATG-ACTTG
gi|24 : A--------------A------------T------------------TTCTGCTT--ACGCC--TGG-AC-AGAAAA--A-CAGG-T--------A-GCCG--AACAC--T-GATC-TAGTAAATACCCAATACATA-TACAATG----------------------------TGTTAC-A---AAA--GAC-AGTG-CTT----ATGG-------AG--C---AAG---A-GATT
gi|25 : gacaatgagagacaaaatATA-ATAA-AGACTCAATA-A-T-GA-CTAATAAA-T-TTTCAA-TT----------------------ATTGAACACTA--------------------GT-G-ACCGGTTTT-AA--CCAGTA--ATGACC--A-C-T--GGCAG----AAT-C-AA-TA-C------------TAGT--AT-T--GA---CCA----CTTTTTT--G-CCAAC
gi|26 : TGACCAATAAATTTTCAATCAACTA-TTA-TTG-GCCAGTTTT-AA--CCAGTA--TTGACC--A-C-T--TGCCC----TGT-C-AA-TA-CTACTATTGACTCTAGT--AT-T--GA---CCA----CTTTTTT--G-CCAACcct
gi|27 : aCAGGGCTGG-GCGGTCAAAACTGTCCCAACC-GTCCCCGG---TTTTA-ACCAGCAG-TT-TTAACCGGTT--GTAA----C-CGCC-C----CGCGG-TGA--A-CACTC-CCAAAA--TG-GTCA--A--T-A-GT--GGTCcctg
gi|28 : CAGGGTTGG-GCGGTTAAAAC---------C-ACTCCCGGT--TTT-A-ACCAGCAG-TT-TTAACTG-------------C---CC-C----CA--G-TCA--A-TGCTC-CCAAAA--TG-GTCA--A--T----T--G---AAATA--------------------T----A-----A-AGTG-T--CC-T--T--T-T-
gi|29 : AA--TACATTT--CAT---GC--AAA--AA------------T-A------------A-----A---G-A-T---T------A-ATGAATACATA---T---AT--A-CTC-A-G--CT-TTATT--AC-A-AA--G-CA-T-G--T-ATTAATAT-A-GAT--C-A-A----T-T--AAT--G-------A-TTTTA--AAT--------A-----------AT--------------TAt
gi|3 : AGGGTTGG-GCGGTTAAAAC---------C-ACCCCCGGGTTTTT-ATACGAGCGG-TT-T-AACCGGTTATATA-----C-CGTCTC----CGC-G-TCAC-A-TACTCTCCAAAA--TG-GTCA--A--T---GT--GGTCAATTAC-T-GGT-AATTTGAGAATTT----A-----ATAGTG-TTGCC-TGTTGGT-T-CCGA-TATTT-----TAA--TACATTT--CAT---GC--AAA--AA------------T-G------------AGAAGTATT-A-A-T---T------A-AT-AGT--TTA---T-CACT-----TC-A-GA-CT-TTATT--AC-A-AA--G-CA-TTGC-T-ATTCAT-A---GAT--CCA-A----T-T--AAT--GTTTTTAAA-T------AATTATACTGAA-----------ATGT------------CATT----TATTGTT-ATA---CCCCGGTAA-T---GAC--TT-CTG----ACC-TTTTTA----GA-G-C--G-CTC-A-T--TTCT--AAG-C---TGG-ACATATCACC-C---T---AT---TT-TAAC----TTTTTTT--------------AGTA-----AGATCGGC--AACTG-TTT-----G-C--AATAC--T-GAA--TA-GTACTATAG---CACTT-TTTCAGATGGCCAA-ATTCTTGC-ATG-T--TTATAGT-AT-AA-------TTG----C----------A---CTACT-GTG-GTTGAC-A--T-A-T-CT-TTAC---TACT-ATATC--C-AT-GT--ACATG-----TATACTTAAAAGGTT-ACAGG--TG--AGC-A-TTAGTTT-GCAATGAGAGACAA--------------AATAA--------T------------------TTCTGCTT--ATACC--TGG-ACCAAAATACGA-CA---TACGATTC-A-GCTG--AGCACTGTTGATC-TAGTAAA-------TAAATA-TAA-CTGGGT-T--GGATT-A----AA-CAATTTGTGTTGC-A---AA---GAC-A------------TAG-------TG--C---AG------TATTA-CTT--GGA------CAGGT----TAATATGACACAGT-G-TTGTAAT-TA-CATTACCCTAGGGTC--TAACCTGTG--GATGGCAGT-GT-GT-C-TGTTATTT-GTATGA-AAAACA--T----CAC--ACC--ACACA-C-AAT-T--GATGCATTA--GACACCTT
gi|3 : -ATGG--GAACGTC-GACCCG-CTGACTCTCTTTGT-CTA----TGCAC-AAAAGTTTAAACAG-TTT-GTTGATTTTCACATGGTG-A-GCA--TGAGTTTC--CCGCATTTTGAACTTATCAAATCTTGTAGGC-ATTA-T-T----------TAA---TTTC-TTTT----C--ATGTAA-G--TG-TACT-G-AAGT-------CA-ATGTTT--A-AATTACAGT--A-A-ATAATACACTCAAC-AGT-AGAT--GAACTGCT-TTAAC---AAATTA--AAAATAAGCTCATATATAT-ATA----ATA-A-TTGA-CCATTAAA-TTCTTCAAGTTG--ACCACTATC--G-CCA---GTTAATGACCG--TATT-----GACCATGTGGG-G-ACCG-TTTT-AA--CCAGTA--T-GACC--AAC-T--GACCC----GGT-CCAA-TA-C------------TAGTACAT-T--GA---CCG----CTTTTTT--G-CCAACcagtagtatgactgtatggagagactatgggaacgtcgacccgctgactctctttgtctatgcacaaaagtttaaacagtttgttgattttcacatggtgagcatgagtttcccgcattttgaacttatcaaatcttgtaggcattatttaatttcttttcatgtaagtgtactgaagtcaatgtttaaattacagtaaataatacactcaacagtagatgaactgctttaacaaattaaaaataagctcatatatatataataattgaccattaaattcttcaagttgaccactatcgccagttaatgaccgtattgaccatgtggggaccgttttaaccagtatgaccaactgacccggtccaatactagtacattgaccgcttttttgccaacc
gi|30 : agggttgggcggttaaaaccacccccgggtttttatacgagcggtttaaccggttatataccgtctccgcgtcacatactctccaaaatggtcaatgtggtcaattactggtaatttgagaatttaatagtgttgcctgttggttccgatattttaatacatttcatgcaaaaatgagaagtattaattaatagtttatcacttcagactttattacaaagcattgctattcatagatccaattaatgtttttaaataattatactgaaatgtcatttattgttataccccggtaatgacttctgacctttttagagcgctcatttctaagctggacatatcaccctattttaactttttttagtaagatcggcaactgtttgcaatactgaatagtactatagcactttttcagatggccaaattcttgcatgtttatagtataattgcactactgtggttgacatatctttactactatatccatgtacatgtatacttaaaaggttacaggtgagcattagtttgcaatgagagacaaaataatttctgcttatacctggaccaaaatacgacatacgattcagctgagcactgttgatctagtaaataaatataactgggttggattaaacaatttgtgttgcaaagacatagtgcagtattacttggacaggttaatatgacacagtgttgtaattacattaccctagggtctaacctgtggatggcagtgtgtctgttatttgtatgaaaaacatcacaccacacacaattgatgcattagacaccttcagtagtatgactgtatggagagactAATC--G-ACC---ATTAANNNNNN--NNNN-----NNNNN-NNNNNNN-NNNNNNNNN-NN--NNNNNN--NNNNNN--N-C-C--AGCCA----GGT-C-AG-TA-C------------TAGT--AA-T--GA---CCA----CTTTTTT--G-CCAACc
gi|31 : -----TGTTGC-A---AAA--GAC-AGTG-CTT----ATGG-------AT--C---AAA---A-GATTA-CTT--GGG-GA---CAGGT-A--CATTT-AACA-TGT-GTT---AAT-TAACAT-ACCC-Ac
gi|32 : atg--CT-T--T--T-T-CTTA-T-TTT-----A----TACATTT--CAT---GC--TAA--AA------------T-ATAGATACATTTGA----TA---G-A-T---T------T-AT-AGT-CTT
gi|33 : T-TATGA----T-CGCC-C----CG--G-TCA--A-TACTC-CCAAAG--Taattaa
gi|35 : gttgA-ATAG--GGACTTG--ACACC-CTG---CTCTTTG--CTC----GG-AC-AAAacatgt
gi|36 : AGGGTTGG-GCAGTTAAAAC---------C-ATCCCCGG---TTT-A-
gi|4 : AGGGTTGG-GCGGTTAAAAC---------CCGCCTCCG----TTT-A--CCAGCGG-TTGTTAACCGCTT----AA----C-CGCC-C----CG--G-TCA--A-TACTC-CCAAAA--CGTGTCA--A--T-A-GTTTGGTCAA-TC--T-GGTCTAATTGAAA-TTT----A-----A-AGTG-C--TC-C--T--T-T-CCAA-T-TTT-----AAA--TACATTTTTCATT--GC--AAA--AAA-----------T-A------------A----TA---GGA-T---T------TCAT-AAT-CTTT---T-CAAA--AGAGT-A-G--CT-T-ATC-AGC-A-AATGG-CA---G--T-ATTCTT-T-TTGATTCC-A-AATTAT-T--AAT--G-------A-T------AAT--------A-----------AT--------------CATT----TA--ATT-ACAC--CCC-AGTA--T-TGAACT-TT-CTG----ACC-TTTTCA----AA-GACT-C-TTC-A-TCATTCT--G-G-CGGATTG-AT-C----CC-C---TA--AT---TATTAACT---TTTTT----------------AGTT-----A-ATGGGC-AGCCTGTTTTCAAT-C-A--AATAC--T-GAT--TA-GCT----AG---CAC---TT-CAGAGGAC--A-A-TTCTGC-ATGTT--TTAAGAT-AT-AAATA-TCATT----GCT-AATTTT-GA---CTACTTATG-G-CAAC-A--T-A-T-CT-TCAT---TACT-ATAC---C-AT-G--TACATG-----TA------GACGGGTTACAGGACTA--TAT-A-T--GTTT-G---------ACAATG------------AGAGAAAAAAAATT------------------TTCTGC-T-TATA-C--TGG-AC-CAAATAT-A-CAGC-TAGGAT-C-A-CTTG--AGCACTGT-GATC-TATT----A---AATAAATACTAAACTCGG--T--GA--TAA----AA-CAT----TGTTGCAA---AAA--GAC-AGTGTCTCC-AAATGGGAGTGTCGG--CGAGGAG---A-TATTACCTT--GGGTG----CAGGT-A--TAATG-GACA-AG--G-T---AAT-TAACAT-ACCC-AAGGTC--CAG-----G--GATGGCAATTGT-G--TGTGTTATTGTTTATGGCAAAACA--TCACCCAT--ACTG-ACACACA-AATGT--GAT-CATTA--GGTAC--TGATGAA-TAC-CCTTCAA-TAATG-ACTTG-T-------A-GGAAA-AT-ATAGGGA-CTTTTGAC-ACCCTGCTCTT--TGTAGGA-CAA------AAATTAA-ATAG--t
gi|4 : C---T--TGTAGGA-AAATAT-AG--------------GGACTTTTGACACC-CTG---CTCTTTG---TA----GG-AC-AAAAATT-AAATAG-TTTAGT-AATTTTTACA-CGTG-AGGCA--T----TTTCACC-CAA-T-GAA--T---AAATCTTAT--GC-ATTA-TGT----------TAA---TCTCATTTG----CCAATGTAATGCTTG-T-TT-GCAAG--------TGCCTGTCTTAAGAATTATAGT--ATT-TTAT-----TCATCTT-T-A-ATCAGAACT-CCG-TAAC---A--TTTTAAAAATAACCCAATA-ATATGAGA----ATATG-T-GATTCATTAAGCTTTTTCAA-TTGGCACCACAATCGAG-CCAGATATTGACCAC----TTAT-----GACCA-GTA-TTG-ACTGGTTTT-AA--CCATTA--TTGACCCAA-C-C--GGCCC-----GT-C-AATTA-C------------TAGTC-AT-TGGGA---CCG----CTTTTTtttagtaatttttacacgtgaggcattttcacccaatgaataaatcttatgcattatgttaatctcatttgccaatgtaatgcttgtttgcaagtgcctgtcttaagaattatagtattttattcatctttaatcagaactccgtaacattttaaaaataacccaataatatgagaatatgtgattcattaagctttttcaattggcaccacaatcgagccagatattgaccacttatgaccagtattgactggttttaaccattattgacccaaccggcccgtcaattactagtcattgggaccgcttttt
gi|5 : agggttgggcggttaaaacccgcctccgtttaccagcggttgttaaccgcttaaccgccccggtcaatactcccaaaacgtgtcaatagtttggtcaatctggtctaattgaaatttaaagtgctcctttccaattttaaatacatttttcattgcaaaaaataataggatttcataatcttttcaaaagagtagcttatcagcaaatggcagtattctttttgattccaaattattaatgataataatcatttaattacaccccagtattgaactttctgaccttttcaaagactcttcatcattctggcggattgatcccctaattattaacttttttagttaatgggcagcctgttttcaatcaaatactgattagctagcacttcagaggacaattctgcatgttttaagatataaatatcattgctaattttgactacttatggcaacatatcttcattactataccatgtacatgtagacgggttacaggactatatatgtttgacaatgagagaaaaaaaattttctgcttatactggaccaaatatacagctaggatcacttgagcactgtgatctattaaataaatactaaactcggtgataaaacattgttgcaaaaagacagtgtctccaaatgggagtgtcggcgaggagatattaccttgggtgcaggtataatggacaaggtaattaacatacccaaggtccagggatggcaattgtgtgtgttattgtttatggcaaaacatcacccatactgacacacaaatgtgatcattaggtactgatgaatacccttcaataatgaCAGGGTTGG--CGGT-AAAAC-----------GCCCCCG----TTT-A-ACCAGCGG-TT-TTAACCGGTT-TATAA----C-CGCC-C----CG--G-TCA--A-TACTC-CCAAAA--TG-GTCA--A----A-GT--GGTCAAATA--T-GGTCAATTTGAAAATTTTTACA-----A-AGTG-T--CC-T--T--T-T-CCAA-T-TTT-----AAA--TACATTT--CATAT-GC--AAA--AA------------T-A------------A----TA---G-A-T---T------T-AT-AGT-CTTT---G-CAAA--A-ATC-A-T--CT-TTATT-AAC-A-AA--G-CA-T-G--T-ATTTAT-T-TTGAT--C-ATA----T-T--AAT--G-------A-T------AAT--------A-----------AT--------------CATT----TA--AT--ACA---CCC-AGTAT-T-TGAAC--TGATTG----ACC-TTTTCA----AA-G-CT-G-CTC-G-T--TTCT--A-G-C---TTG-ATTT----CC-C---T---AA---TA-TAAC----TTTTT----------------AGTT-----A-ATGGGC-CAACTT-TTTCAATTG-CCGAATAC--T-GA---TAAGTA----AG---CACTT-TT-CAGA--AC--A----TTTGC-ATG-T--TTAAGAT-A--AAATA-T-AT-G---GCT-AA---T-GA---CTACTCATG-GTCAAC-A--T-A-TGCT-TTAG---TACT-ATA----C-AT-GT-TACATG-----TA------GAGGTTTTACAGG--TA--TGT-A-T-AGTTT-G---------ACAA--------------A------------T------------------TTC-GCTT-TATACC--TGG-AC-AAAATA--A-CAGC-TA-GAT-C-A-GCTG--AGCACTGT-A--C-TAGTAAA-AT--AATAAATA-TAAACTGGGT-TT-GA--T-A----AA-CA-----TGTTGC-A---AAA--GAC-AGTG-CCTCTAAATGG-------AG--C---AAG---A-TATTA-TTTTTGGGTGT---CAAGTTA--TAATG-GACA-AGT-G-T---AAT-TAACAT-ACCC-AAG--T--CAG-----G--GATGGCAATTGT-GTCTGTGTTATTG-TTATGA-AGAACA--TCACCCAC--ACCG-ACACACCCAATGG--GAT-CATTATCGGTACCTTGATGAA-TACTCTTTCAATTAATG-ACTTGTTTTTTTCTATGGAAA-ACCATAGGGAACTTT---C-A----AG---T--TTTAGGA-AAATAT-AGAAA-TAA-ATAG--GGACTTG-GACACC-CTG---CTTTTTG--CTA----GG-ACGAAAAGTT-AGATAG-TTT-AT-AATTTTTACA-GGTG-A-GCA--T----TTC--CC-CAATT-GAA--TA--AAATCT-AT--GCCATTA-T-T----------TAA---TCTCATT-G----A--A-GTAA-G--TG-T-TTTGGAAGT-------TGCATGTTT--AGAAT-ACAG---A-T-TTA------TCATC-A---A-AT--GAACT-CTGTTAAC---A--TTT--AAAATTGCCCAA-A-ATAT-AGT----ATA-A-TTGA-CCATTAAA-TCTTTCAA-TT---ACCACAATC--G-CCG---ATTGACCACTA--TTTT-----GACCA-GTAGTTG-ACCGGTTTT-AA--CCAGTA--TTGACC--A-C-C--GGCCG----CGT-C-AA-TA-C------------TAGT--AT-T--GA---CCG----CTTTTTT--GCCCAAC
gi|6 : -T--CT-T--T--T-C-CCAA-T-TTT-----AAA--TACATTT--CAT---GC--AAA--AA------------T-A------------A----TA---G-A-T---T------T-AT-AGT-CTTT---TTCAAA--A-ATC-AAG--CC-TTATT-TAC-A-AA--GGTA-T-G--T-ATT-AT-T-T-GAT--C-A-AC---T-T--AAT--G-------A-T------AAT--------A-----------AT--------------CATT----TA--ATT-ACA---CCCCAGTAT----GAAC--TT-CTG----ACC-TTTTCA----AA-G-CT---CTC-A-T--TTCT--A-G-C---T-G-ATAT----CC-CC--T---AT---TA-TAAC----TTTT-----------------AATT-----A-ATGGGC--AACTG-TTTCAAT-G-C--AATAC--TTGA---TA-GTA-----G---CACTT-TT-CAGA-GAC--A-ATTCATGC-ATG-T--T-AAGATTATTAAATA-T-ATTG---GCT-AA---TTGA---CTACTTATGTGTCAAC-A--T-A-T-CT-T-AG---TACT-ATA----CCAT-GT--ACATG-----TA------GAGGGTT-ACAG---TA--GAT-A-T-AGTTT-G---------ACAATGAGAGACAAAATAA------------T------------------TTCTGCTTATGTACC--TGG-AC-AAAATA--A-CAGC-TA-GAT-C-A-GCTGT-AGCACTGT-GATC-TAGTAAA-------TAAATA-TAAACTGGGT----GA--T-ATA--AA-CA-----TGTTGC-A---AAA--GAC-AGTG-CTCT-AAGTGG-------AG--C---AAG---A-TATTA-CTT--GGG-T----CATGT-A--TAA-G-GACA-AGT-GTT---AAT-TAACAT-ACCC-AAGGTC--CAT-----G--GATGGCAATTGT-A--TGTG-TATT--TTATG--AAAACA--TCACCCACA-ACTG-ACACACC-AATGT--GAT-CATTA--GGTACC-TGAAGAA-TACTC-TTCAA-TAATG-ACTTG-T-------ATGGA--------------------------------------------AAATAT-AGAAA-TAA-ATAG--GGACTT--GACACC-CTG---CTCTTTG--CTA----GG-AC-AAAAGTT-AAATAGTTTT-AT-AATTTTTACA--GTG-A-GCAT-T----TTC--CC-CAATT-GAA--TA--AAATCTTAT--GC-ATTA-T-T----------TAA---TCTCATTTG----C--ATGCAA-G--TG---TT-GTAAG--------TGCATGTTT--AGAATTACAGT--A-T-TTA------TCAAC-A-T-A-AT--GAACT-C-GTTAAC---A--TTT--AAAAT-AACCAATA-ATGT-AGA----ATA-A-T-GA-CCATTAAA-TC-TTCAA-TTG--ACCACAATC--N-NNN---NNNNNNNNNNN--NNNN-----NNNNN-NNNNNNN-NNNNNNNNN-NN--NNNNNN--NNNNNN--N-C-C--GGCCC----GGT-C-AA-TA-C------------TAGT--AT-T--GA---CCG----C-TTTTT--G-CCAAC
gi|7 : gtCAGGGTTGG-GAGATTAAAAC---------C-ATCCCTGG---TT----------------TTCACCAGTC-----------------------------CA--A-AACTC-CCAAAA------------------GT--GGTTCAATA--CCGGTCAATT-GAAA--TT----ATCACTA-ACTGCT--CC-T--T--T-TTCCTA-T-TTT-----TA---TATATTT--CAT---CA--AAA--AA------------T-A------------A----AACAGG-A-T---T------T-GT--GT-C-TT---T-CAAA--A-ATC-A-AATCT-TTA-T-CAC-A-AA--G-CA------T-ATTGGT-TATAGAT--G-A-A----TGT--AAT--G-------A-TAAACAAAAT--------AAGAAATGAAATAT--------------CATT----TA--ATT------------GTA----TGAAC--TT-C-G----ACCTTTTTCA----AG-G-CT-ATCTCTA-T--TTCT--A-G-----TTGCATAT----TT-C---T----C---TA-TAAC----TTTTTAGTATGTCGTTTTTTGAGTT-----ATATAGGC-GAACTA-TTTTAAG-G-C--AATACTTT-GC---TA-GTA----A----CAGCT-TA-CAGA-GAC--A-ATTT-TGCAAAG-T--ATAAGAT-AT-cc
gi|7 : T-ATA----T-GT-GTATACTTG------A------TAGGAGTTACAGG--TA---GC-A-T-AGTTTTGTCATTAT--GCAA--------------AGACGT-------T------------------TTTTGCTG-TATATC--TTG-ATTGGAGTA--AACGGG-TA-------A-GTTG--AACACTGT-GATCGTAGTAGA-A-----TAAATA-TAAACTGGGT----GA--T-ATTAAAA-CAATGT-TGTTGC-A---AAA--GACCAGTG-CTT----ATGG-------AGATC---AAA---AAGATTAATTT--GGG-GA---CAGGT-A--CAATG-GACA-TGT-G-T---TAA-TAACAT-ACCA-AGGGTCCTCAG-----G--GA-GGCGAttagaatggtacatttttaaaccattcgtaatctgtcacttctgtggtccacaacctatattgctctcagtttacgtattatccgatttgtactgatgtacatggtatatgtgtatacttgataggagttacaggtagcatagttttgtcattatgcaaagacgttttttgctgtatatcttgattggagtaaacgggtaagttgaacactgtgatcgtagtagaataaatataaactgggtgatattaaaacaatgttgttgcaaaagaccagtgcttatggagatcaaaaagattaatttggggacaggtacaatggacatgtgttaataacataccaagggtcctcagggaggcga
gi|8 : cagggttgggagattaaaaccatccctggttttcaccagtccaaaactcccaaaagtggttcaataccggtcaattgaaattatcactaactgctcctttttcctatttttatatatttcatcaaaaaataaaacaggatttgtgtctttcaaaaatcaaatctttatcacaaagcatattggttatagatgaatgtaatgataaacaaaataagaaatgaaatatcatttaattgtatgaacttcgacctttttcaaggctatctctatttctagttgcatatttctctataactttttagtatgtcgttttttgagttatataggcgaactattttaaggcaatactttgctagtaacagcttacagagacaattttgcaaagtataagatatttagaatggtacatttttaaaccattcgtaatctgtcacttctgtggtccacaacctatattgctctcagtttacgtattatccgatttgtactgatgtacatggA-ATAGAAGGATTTG--ACACC-CTG---CTCTTTG--CTACCTAGA-AC-AAAAGTT-AAACAG-TTT-TT-GATTTTTACA--GTC-A-GCAT-T----TTC--CC-CACTT-TAA--GA--AAATCTTAT--GC-ATTA-T-T----------TAA---TTTAATTTG----C--ATGTAA-G--TG---TT-GTAAGTCATAAAGTGCATGTTT--AGAATTACAGT--A-T-TTA------TCATC-A-T-A-AT--GAA-T-CT-TTAA------------AAAATAAACCAGTA-ATAT-AGA----ATA-A-T-GA-CCAATAAA---TTTCAA-TTG--ACCAT--T-----------ATTGACCACTA---------------------TTG-ACTGGTTTT-AA--CCCGTA--TTGACC--A-C-C--AGCCC----GGT-C-AA-TA-C------------TAGT--
gi|9 : ag-T--T--T-T-CCTA-T-TTTT----AAA--TATATTT--CAT---GC--AAA--AA------------T-A------------A-----A---G-A-TGCATTTAATAT-AT-AGT-CTTT---T-CAAA--A-AAC-G-A--CT-TTATT--AC-A-AA--G-CA-T-G--T-ATTTA--T-A-GAT--C-A-A----T-T--AAT--G-------A-TTTGA--AAT--------A-----------AT--------------TAT
gi|9 : cat-ATAT----CC-T---TTTTAG---TA-TGACGTATTTCTTG---------------AGTT-----A-ATGGGC--AACTG-TTTTAAT-G-C--AATAC--T-GA---TA-GTATTC-AG---CACTT-TA-CAGA-GAC--A-A-TTCTGC-ATG-A--TTAA-------AGATA---AT--------------T-GA---CTAC-TGTG-GCCGAC-A--T-A-T-CT-TCAG---TACT-ATAATACC-AT-G--TACATatgaaatatcctttttagtatgacgtatttcttgagttaatgggcaactgttttaatgcaatactgatagtattcagcactttacagagacaattctgcatgattaaagataattgactactgtggccgacatatcttcagtactataataccatgtacat
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|34 ): ATGTAAATTTATATGGAATTCATATAATAATATAGAAATTT
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 111111111 222222222222 1111111111111 11111 555555555555555555555555555555555555555 1111111111 111111 111 33333333333333333333333333333333333333333333333333 1111 11 111 11 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555 33333 1111 111111 1111111 222222222222 1111 4444444444444444 1111111 11 11 111 222222222 111111 111 3333333333333333 222222 222 1111111111111 1 111111 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 1 11 11111111111 11 3333333 33333333333333333333333333 333333333 222222222222222 444444 11111 11111 11 11 11 22 1 33333333333 333333333333333333 222 11 1111111111 1111111 222 33333333 111111 11 222 1111 11 222222222 44444444444444444444444 111111111111
lowQualScore : 3 0 333333333 3 666666666666 3 3 6666666666666 2 22222 2 66 2 2 33 3 0 444444444444444444444444444444444444444 0 6666666666 3 3 33 2 99 33 2 2 2 2 2 333333 33 0 33 111 33 33 33333333333333333333333333333333333333333333333333 333 2 2 3 66666 5555 3 0000 3 44 3 3 44 3 2 2 99 2 88 222 11 3 3 9999 3 44 44 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999 8888 55 7777 44444 99 8 2222 8 8888 4 8 55 4 4 000000 55 4 7777777 3 2 7777 3 666666666666 3 1111 0000000000000000 3333333 8 66 4 4 0 4 4 00 00 4 666 4 222222222 4 4 8 66 555555 4 7777 1 0 4 4 3 000 7777777777777777 888 33333 5 2 5 66 5 5 5 5 6 888 4 555555 4 000 6666666666666 4 2 777 888888 4 8 4 4 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 88 66 4 3 00 8 99999999999 4 00 4 4 1 4444444 1 4 88888888888888888888888888 4 777 55 4 222222222 000000000000000 9999999 8 66 333333 4 66 4 4 4 99999 4 4 44 88888 22222 66 3 5 77 0 1 66 22 77 33 777 66 77 5 0 77 11 22 5 1 7 5 77 5 77777777777 999999 77 999999999999999999 1 1 888888 0 5 8 55 444 4 777 99 8888 4 4 8 4 55 55 00 4 4 4 4 777 4 4 555 66 66 66 4 555 9999999999 777 6666666 4 66 111 4 0 33333333 1 66 4 55 4 4 111111 4 4 4 8 4 55 4 99 666 55 3 111 3 3 3 4444 3 3 6 3 3 3 33 3 44 77 888888888 0 88888888888888888888888 2 0 2 33 33 33 2 2 33 8888 2 5 2 2 444444444444 66 3 44 555 9999 44 3
lowQualScore : . . ......... . ............ . . ............. . ..... . .. . . .. . . ....................................... . .......... . . .. . .. .. . . . . . ...... .. . .. ... .. .. .................................................. ... . . . ..... .... . .... . .. . . .. . . . .. . .. ... .. . . .... . .. .. ....................................................... .... .. .... ..... .. . .... . .... . . .. . . ...... .. . ....... . . .... . ............ . .... ................ ....... . .. . . . . . .. .. . ... . ......... . . . .. ...... . .... . . . . . ... ................ ... ..... . . . .. . . . . . ... . ...... . ... ............. . . ... ...... . . . . ........................................................... .. .. . . .. . ........... . .. . . . ....... . . .......................... . ... .. . ......... ............... ....... . .. ...... . .. . . . ..... . . .. ..... ..... .. . . .. . . .. .. .. .. ... .. .. . . .. .. .. . . . . .. . ........... ...... .. .................. . . ...... . . . .. ... . ... .. .... . . . . .. .. .. . . . . ... . . ... .. .. .. . ... .......... ... ....... . .. ... . . ........ . .. . .. . . ...... . . . . . .. . .. ... .. . ... . . . .... . . . . . . .. . .. .. ......... . ....................... . . . .. .. .. . . .. .... . . . . ............ .. . .. ... .... .. .
lowQualScore : 3 4 333333333 3 666666666666 6 3 2222222222222 9 99999 9 88 9 9 99 1 4 000000000000000000000000000000000000000 4 6666666666 3 1 99 7 00 77 7 7 0 9 9 666666 77 5 77 000 77 77 77777777777777777777777777777777777777777777777777 000 7 9 4 22222 8888 1 4444 1 88 1 1 22 1 9 9 66 9 55 222 55 1 1 6666 1 66 66 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222 5555 55 8888 99999 55 0 5555 0 5555 0 0 55 0 0 666666 55 0 2222222 6 3 7777 6 777777777777 6 4444 0000000000000000 7777777 9 11 4 4 9 4 4 66 66 4 777 4 444444444 4 4 9 11 000000 4 1111 0 8 4 4 2 111 2222222222222222 888 44444 0 0 0 99 0 0 0 0 5 888 4 111111 4 888 7777777777777 4 8 222 888888 4 9 4 4 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 00 11 4 3 66 9 22222222222 4 66 4 4 9 6666666 9 4 88888888888888888888888888 0 000 55 0 222222222 111111111111111 7777777 9 11 333333 4 11 0 0 0 55555 0 0 66 55555 55555 99 2 7 77 7 4 44 99 99 66 999 44 99 7 1 99 11 33 7 4 6 7 99 7 22222222222 555555 11 111111111111111111 7 6 777777 1 0 0 00 000 0 000 55 5555 0 0 9 4 44 99 66 4 4 4 4 888 4 4 444 11 11 11 4 333 4444444444 888 2222222 4 11 777 4 8 33333333 1 11 6 55 0 0 555555 0 0 0 0 0 55 0 77 444 00 6 444 6 3 3 2222 3 3 7 3 6 3 88 3 66 88 888888888 3 66666666666666666666666 9 3 9 99 99 99 9 9 99 9999 9 7 9 9 666666666666 88 1 22 444 6666 66 3
consensus : CAGGGTTGG-GCGGTTAAAAC---------C-GCCCCCGG---TTT-A-A-CCAGCGG-TT-TTAACCGGTT-A-TA-A----C-CGCC-C----CG-GTCA--A-TACTC-CCAAAA--TG-GTCA--A--T-A-GT--GGT-CAA-T-A--T-GGTCAATTTGAAAATTT----A-----A-AGTG-T--CC-T--T--T-T-CCNA-T-TTT-----AAA--TACATTT--CAT---GC--AAA--AA------------T-A------------A----TA---G-A-T--------T-T-AT-AGT-CTTT---T-CAAA--A-ATC-A-G--CT-TTATT-CAC-A-AA--G-CA-T-G--T-ATT--TATA--GAT--C-A-A----T-T--AAT--G-------A-T------AAT--------A-----------AT--------------CATT----TA--AT--T-ACACCCCAGTAT-T-TGAAC--TT-CTG----ACC-TTTTCA----AA-G-C--T-C-TC-A-T--TTCT--A-G-C---TTG-ATAT----CC-C---T---AN---TA-TAAC----TTTTT----------------AGTT-----A-ATGGGC-A--A-CTG-TTTCAAT-G-C--AATAC--T-GA---TA-GTA----AG---CACTT-TT-CAGA-GAC--A-ATTTCTGC-ATG-T--TTAAGAT-AT-AAATA-T-ATTG---GCT-AA---T-GA---CTACTTATG-GTCGAC-A--T-A-T-CT-TCAG---TACT-ATA----C-AT-GT-TACATG-----TA------GAGGGTTTACAGG--TA--GGC-A-T-A-GTTT-G---------ACAA--------------A------------T------------------TTCTGCTT-TATACC--TGG-AC-AAAATA--A-CAGC-TA-GAT-C-A-GCTG--AGCACTGT-GATC-TAGTAAA-A---AATAAATA-TAAACTGGGT-T--GA--T-A----AA-CA-----TGTTGC-A---AAA--GAC-AGTG-C-T-CTAAATGG-------AG--C---AAG---A-TATTA-CTT--GGG-G----CAGGT-ATA--ATG-GACA-AGT-G-T---AAT-TAACAT-ACCC-AAGGTC--CAG-----G--GATGGCAATTGT-GT-TGTGTTATTG-TTATGA-AAAACA--TCACCCAC--ACCG-ACACACC-AATGT--GAT-CATTA--GGTACC-TGATGAA-TACTC-TTCAAT-A--ATG-ACTTG-T-------ATGGAAA-A--T-ATAGGGA-CTTT---CA----G-C---T--TGTAGGAAAAT-AT-AGAAA-TAA-ATAG--GGACTTG-GACACC-CTG---CTCTTTG--CTA----GG-AC-AAAAGTT-AAACAG-TTTA-T-AATTTTTACA--G-TG-AG-C-AT---TTTC-CC-CAATT-GAA--TA--AAATCTTAT--GC-ATTA-T-T----------TAA---TCTCATTTG----C--ATGTAA-G--TG-T-TT-GTAAGT-------TGCATGTTT--AGAATTACAGT--AT-TT-A------T-CATC-A-T-A-AT--GAACT-CTGTTAAC---A--TTT-AAAATTAACC-AATA-ATAT-AGA----ATA-A-T-GAC-CATTAAA-TCTTTCAA-TTG--ACCACAATCG--CCA---ATTGACCACTA--TTTT-----GACCA-GTAGTTG-ACCGGTTTT-AA--CCAGTA--TTGACC--A-C-C--GGCCC----GGT-C-AA-TA-C------------TAGT--AT-T--GA---CCG----CTTTTTT--G-CCAAC
Reference ( family-2007 ) : CAGGGTTGG-GCGGTTAAAAC---------C-GCCCCCGG---TTT-A-A-CCAGCGG-TT-TTAACCGGTT-A-TA-A----C-CGCC-C----CG-GTCA--A-TACTC-CCAAAA--TG-GTCA--A--T-A-GT--GGT-CAA-T-A--T-GGTCAATTTGAAAATTT----A-----A-AGTG-T--CC-T--T--T-T-CCNA-T-TTT-----AAA--TACATTT--CAT---GC--AAA--AA------------T-A------------A----TA---G-A-T--------T-T-AT-AGT-CTTT---T-CAAA--A-ATC-A-G--CT-TTATT-CAC-A-AA--G-CA-T-G--T-ATT--TATT--GAT--C-A-A----T-T--AAT--G-------A-T------AAT--------A-----------AT--------------CATT----TA--AT--T-ACACCCCAGTAT-T-TGAAC--TT-CTG----ACC-TTTTCA----AA-G-C--T-C-TC-A-T--TTCT--A-G-C---TTG-ATAT----CC-C---T---AN---TA-TAAC----TTTTT----------------AGTT-----A-ATGGGC-A--A-CTG-TTTCAAT-G-C--AATAC--T-GA---TA-GTA----AG---CACTT-TT-CAGA-GAC--A-ATTTCTGC-ATG-T--TTAAGAT-AT-AAATA-T-ATTG---GCT-AA---T-GA---CTACTTATG-GTCGAC-A--T-A-T-CT-TCAG---TACT-ATA----C-AT-GT-TACATG-----TA------GAGGGTTTACAGG--TA--GGC-A-T-A-GTTT-G---------ACAA--------------A------------T------------------TTCTGCTT-TATACC--TGG-AC-AAAATA--A-CAGC-TA-GAT-C-A-GCTG--AGCACTGT-GATC-TAGTAAA-A---AATAAATA-TAAACTGGGT-T--GA--T-A----AA-CA-----TGTTGC-A---AAA--GAC-AGTG-C-T-C-AAATGG-------AG--C---AAG---A-TATTA-CTT--GGG-G----CAGGT-ATA--ATG-GACA-AGT-G-T---AAT-TAACAT-ACCC-AAGGTC--CAG-----G--GATGGCAATTGT-GT-TGTGTTATTG-TTATGA-AAAACA--TCACCCAC--ACCG-ACACACC-AATGT--GAT-CATTA--GGTACCTTGATGAA-TACTCTTTCAAT-A--ATG-ACTTGTT-------ATGGAAA-A--T-ATAGGGA-CTTT---CA----G-C---T--TGTAGGAAAAT-AT-AGAAA-TAA-ATAG--GGACTTG-GACACC-CTG---CTCTTTG--CTA----GG-AC-AAAAGTT-AAACAG-TTTN-T-AATTTTTACA--G-TG-AG-C-AT---TTTC-CC-CAATT-GAA--TA--AAATCTTAT--GC-ATTA-T-T----------TAA---TCTCATTTG----C--ATGTAA-G--TG-T-TT-GTAAGT-------TGCATGTTT--AGAATTACAGT--AT-TT-A------T-CATC-A-T-A-AT--GAACT-CTGTTAAC---A--TTT-AAAATTAACC-AATA-ATAT-AGA----ATA-A-T-GAC-CATTAAA-TCTTTCAA-TTG--ACCACAATCG--CCA---ATTGACCACTA--TTTT-----GACCA-GTAGTTG-ACCGGTTTT-AA--CCAGTA--TTGACC--A-C-C--GGCCC----GGT-C-AA-TA-C------------TAGT--AT-T--GA---CCG----CTTTTTT--G-CCAAC
gi|1 : GGGTTCGTGCG-TTAAAAC---------C-GCCCCAGG---TTT-----CCAGCGGCTT-TTAACCGGTT-A-TA-A----CTCGCC-G----CT-GTCA--ACTACTC-CAAAAAAATG-GTCA--A--T-A-GC--GGT-CAA-T-AGCT-GGTCAAGT-GAAAATTT----A-----A-AGTG-T--CC-TA-T--T-T-CCAA-T-TTT-----AAAAATACATT---CAT---GCTCAAA--AA------------TTA------------A----TA---G-T-T--------T-G-AT-AGT-CTTTGGTC-CAAA--A-ATCCA-G--CT-TTATT-CAC-AGAA--G-CAAT-G--TTATT--TATT--GATTAC-A-A----T-T--AAT--G-------A-T------AAT--------A-----------AT--------------CATT----TA--AT--TTACACCCCAGTAT----GAAC--TT-CTGG---ACC-CTTTCA----AA-G-C--T-T-GC-A-CA-TTCT--A-GGC---T---ATAT----CC-C---T---AT---TA-TAAC----TTTTTT---------------AGTT-----A-ATGGGC-ACCA-CCG-TTTCAAT-G-CC-AATAC--T-GA---TA-GTA-----G---CATTT-TT-CAGA-GAC--ACATC---G--ATG-T--GAAAGAT-AT-AAATAAT-ATTG---GCT-AA---TTGA---CTAACTATG-GTCAAC-A--T-ACT-CT-TCAG---TACTTATA----CCAT-GT--ACATA-----TA------GAGGGTT-ACAGG--TA--GAT-AAT-A-GTTT-G---------ACAA--------------A------------TGAGAGACAAAATAATT--TTCTG--T-TATACC--TGGGAC-AAAA-A--A-CAGCGTA-TAT-C-ACACTGGGAGCACTGT-GAT--TAGTAAA-------TAA-TA-TAAA-TGGGT----GA--T-A----AA-CA-----TGTTGC-A---AAAAAGAC-AGTG-C-T-CTAAATGG-------AGG-C---AAA---A-TATTA-CTT--TGA-TT---CAGGT-ATACGATT-CACA-AGTTG-TTA-AAT-TAACAT-ACC--AAGG-C--CAG-----GATGA-GGCAATTGT-GT-GTTGTTATTG-TTATGA-AAAACA--TCACCCAC--ACTGTACACACC-AATGCTGGAT-CATCA--GGTATCCTGTGGAATTACTC-TTCAAT-A--ATGAACTTG-T-------AC-GAAA-A--T-ATAGGGA-CTTT---CA----G-T---TTATATAGGAAAAT-ATAAGAAA-TAATATAG--GGACTT--GACA-C-CTG---CTCTTTG--CTA----GG-AC-AAAAGTTAAAAAAG-TTTA-T-AATTTTTACA--T-TGTAG-CAAT---TTTC-CC-AAATT-GAA--AA--AAGTCTTAT--GC-ATTATT-T----------TAATATTCTCATTTG----CAAATGTAA----TGTT-TT-GTAAGTGA-----TG---GTTT--AGA---ACAGTTAAT-TT-A------T-CATC-A-TGA-AT--GAACT-C-GTTAATACAA--TTT-AAA--TAACC-AATA-ATAT-AGA----ATA-ATT-GAC-CATATAA-TC-TTCAA--TG--ACCAC-ATCG--ACAGT-ATTGACCA-TA---GTT-----GACCA-GTTATTGTACCGGTCTTGAA--CCAGTA---TGA-C--A-C-TGGGGCCC----GGTCC-AA-CACC------------TAGT--AT-T--GA---CAG----CTTTTTTTGG-CCAAC
gi|10 : -T-G--T-ATT--TATA--GAT--C-A-A----T-T--AAT--G-------A-TTTGA--AAT--------A-----------ATTATATATGAAATACCATT----TA--AT--T-ATACCCCAGTAT----AAGC--TT-CTG----ATC-TTTTCA----AA-G-C--T-C-TC-A-T----------------------AT----CC-C--------A---TA-TAAC----TTTTT----------------AATT-----C-ATAGGC-A--A-CCG-TTTTAAT-G-C--AACAC--T-G---------A----AG---TACTT-TA-CAGA-GA---A---TTCTGC-ATG-T--TCAAG---AT-AAATA-T-ATT-------------T-GA---TTAATT-------GACTA--T-A-T-CT-T-AG---TACT-ATAC---C-AT-G--TACATGTATAATA------GAGGG-TTACAGG--TACTAGC-A-T-A-GTTT-G---------ATAA--------------cc
gi|11 : -A----C-CGCC-C-----G-GTCACAG-TACTC-CCAAAA--TG-GTCA--A--TTA-GT--GAT-C-------------CAAT--GGGAATT-----------A-CGTG-T--CC-T--T--C-T-CCCAAT-TTTCTAACAAA--TA-ATT---CAT---GC--AAA--AA------------T-A------------A----TA---G-ATT--------T-T-AT-AGT-C--T---T-CAAAGTA-ATC-A-A--GC-TTATTACACAA-AA--G-CA-T-GGAT-AGT--TATC--GATC-C-G-A----T-T--AATACG-------ATT------AAT--------A-----------A---------------CATTATCCTA--A-----AAACCCCAATGA-T-GAAACTTTT-CTGTGACACCATTTTCA----AA-GAC--T-T-TTGA-A--TTCTTCA-G-C---GTG-ATAT----CCACCTAT---AC---TA-TAAC----TTtgagagacaaaata
gi|12 : CAGGGTTGG-GCAATTAAA--------------------------------CCAGCGG-TT-TTAACCGGTT-A-TA-A----C-CG-C-C----CG-GTCA--A-TACTC-CCAAAG--TG-GTCATTAGCT-A-GT--GGT-C-A-T-A--------AATT--GAAATTT----A-----A-AATG-T--CC-T--T--TCT-CCTA-T-GTT-------A--TACATTT--CAT---GA--AAA--AA------------C-A------------A---------------------------------CTTT----------------------------TT-CAC-G-AA--G-CC-T-A--T-AAT--TATA--GAT--G-A-A----T-T--AA---G-------------------------------------------------------TATT----TA--ATTAT-ACACCCCTGCATGTATAAAC--TT-CTG----AGC-TTTTCAAATTAA-G-C--T-C-TC-A-T--TTGT--A-G-C----TG-ATAT----TC-C---C---A-----A-TAAC----TTTTT----------------AG
gi|13 : -----TA------GAGGGTT-ACAGG--TA--G-C-A-T-A-GTTT-G---------ACAATGAGAGACACAATGA------------T------------------TTCTGCTT-C-TACC--TGG-AC-AGAATA--A-CAG-----GA----A-GCTG--AGCACTGT-GATC-TAGC----A---AATAGATA-TAAACTGGG--T--GA--T-A----AA-CAATG--TGTTGC-A---GAA--G---AG---------------------------------------ATTA-CTT--GGG-GATTATAGAC-AAA--GTG-GGCA-AGT-GTT---AAT-TAACAT-A
gi|14 : atatatacCAGGGTTGG-GCGGTTAAAAC---------C-ACCC--------------------GG-TT-TTAACCAGT-----------------------------CA--A-AATTC-CCAAAA--TG-GTCA--A--T-A-------C-CA----------GTCAACT--GAAATTC----A-----A-AGTG-T--CCTT--T--T-T-CCTA-T-TTT-----AAA--T--ATTT--CAG---GC--AAA--AATAAAGATATATTT-A------------A----CA---G-A-T--------T-T-GT-AGT-C--T---T-CAAA--A-ATC-A-A--TC-TTA-T-CAC-A-AA--G-CA-T-G--T-GTT--TATA--GAT--G-A-A----T-taccagccatgaaaactgtaaagatcacccaca
gi|15 : CAGGGTTGG-GCGGTTAAAAC---------C-GCCCCCGG---TTT-A-AACCAGCGG-TT-TTAACCGATT-A-TA-A----C-CGCC-CCGGGCG-GTCA--A-TACTC-CCAAAT--TG-A-----------------------------------AATTT--AAATTC-----------------T--CC-T----------------TTT-----AAA--TACATTT--CATGCCGC--AAA--AATAAAGATATAT-T-A------------A----TA---A-A-T--------T-T-AT-AGT-CTTT---T-CAAA--C-ATC-A-A--CT-TTGTT--AC-A-AA--G-CA-T-G--T-Agcaaagatt
gi|16 : AAA-TAA-ATAG--GGACTT--GACACC-CTG---CTCGTTGCTCTA----GG-AC-AAAAG-T-GAACAG-TTTT-T-GATTTTTACA--G-TG-AA-C-AT---TTTC-CC-CAATT-TAA--CA--AAATCTGAT--GC-ATTA-T-TTTAATATTAATAA---TTTCATTTG----T--ATATAA-G--TG---TT-GTAAG--------TGCATGTTT--AGAAT-----T--AT-TT-A------T-CATCAA-T-A-AT--GAACT-CT-TTAA
gi|17 : TTGCAGT-----TT-A------C-CAT--A-T-A-AT--GG-CC-ATTTTAGC---A--TTT-GAAAT-AACC-CATA-ATG---GACTATATA-A-T-GAT-CG---AG-T--TTCAA-T-G--ACCA--ATC-----A---ATTTTCAAGTA--CT-------GACCA-G-AGT-G-ACCG-TTTT-AATACCAGTAATTTGACC--A-CGC--AACCCC---AGT-C-AA-TA-C------------TAGT--ATAT--GA---CCA----GTTTTTT--G-CCAAC
gi|18 : acACAGT--AT-TT-A------T-CATC-A-T-A-AT--GAACT-C-GTTATC---A--TTT-CAA--TAACC-AATA-ATAT-AGA----A-----------------A-TCTT-CAA-TTG--ACCACAATCN--NNN---NNNNNNNNNNN--NNNN-----NNNNN-NNNNNNN-NNNNNNNNN-NN--NNNNNN--NNNNNN--N-C-C--GGCCC----GGT-C-AA-TA-C------------TAGT--AT-T--GA---CCG----CTTTTTT--G-CCAACcc
gi|19 : CAGGGTTGG-GCGGT-AAAAC---------C-GTGTCC-----------------TGG-TT-TTAACCGATT-A-TA-G----TGCGCC-CG---AG-ATCA--A-TAATC-GCA------G-G-----A--T-A-GT---GT-CAAGT-AC-T-GGT-AATATG-AAATTT----------A-AGTG-T--CT-T--T--T-T-CCT--T-TTT-------A--TA---TT--CAT---GC--AAACGAA------------A-A------------G----TA---A-G-T--------T-T-CT-Acct
gi|2 : T-TTAACTGGTT-AATA-AACACCGCGCC-C----TG-GTCA--A-TGC---CAAAAA--TG-GTCA-----T-ACGT--G---CA--T-AC-T-GGTACATTTGAAAGT------A-----A-AGTG-T--CC-TG-T--T-T-CCAA-T-GTT-----TAA--TACATTG--CAT---GC--AAA--AA------------T-A------------A----TA---G-AAT--------T-T-AT-AGT-CTCC---T-CAAA--A-AAT-A-G--CTCTTACT-TAC-A-----T-CA-T-A--T-ATT--AG----AAT--C-A-A----T-TTAAGT--AC------A-T------AATGC------A-----------A----------------ATT----TA--AT--T-ACATCCCAGTAG-T--GAAC--TTGCTG----GAC-CTTTCA----AGCG-C--T-C-TC-AGC--TTCT--A-G-C---GTG-AT-------C-C---C---ATGTCTA-TAAC----TTTTT----------------AGTTTGACTA-A-GGGC-A--A-CTG-TTTCAAT-GGC--AATACA-T-GAGGATA-GTT----AGGCACACTTATT-CAGA-GAC--A-ATTCC-GC-ATG-GGGTTAAGAT-AT-AA-TA-T-ATTGATGGCTTAA---T-GGAATCTA-TCA-G-GTCAAC-AGTTGA-T-CTATCAGACTTACC-AGA----C-ATTGT-CAC----------------GAGGGGTTACAG---TA--GGTTA-TTA-GTTT-G----------CAA--------------A------------TGAAGACATAAAATAATTATCCTGCTT-TATACCAGTGG-ACCAAAATA--AACAGA-TA-GAT-CCA-G-TG--AGCA-TGT-GATC-TA-TAAA-AC--AATAG----TAAACTGGGTGTCAGA--T-A----AAACA-----TGTTGC-ATCAAAA--GAC-AGTG-A-T-CTAAATGG-------AA--CC--AAGTTCA-TAT-A-CTT--GGG-GTA--CAGGT-ATA--ATG-G-CA-AGT-G-T---TATATAACAT-TACC-AAG--T--CAG-----G--AATG-CAATTGTTGT-TGT--TAT-G-TTATGA-AAAACAGTCCACCCACCAACTG-ACACAC--AATGT--GAC-CAT-A--GGTACCT-GAT-AA-TACTCTTCCAAT-A--ATG-ACTGGTT--------TGGAAAGA--T-ATAGGG--CTTT---CA----AAC---T--TATAGGATAATTAT-AGAAA-TAA--TAG--GGACTTG--ACACCTCTT---CTCTT-G--CTA----TG-AC-GAAAGTT-AAATAG-TTTA-T-AATTTTTTCA--G-TG-AG-C-AT---TTTC-CC-CAA-T-GAA--TA--AAATC-TAT--GC-ATTA---T----------TAA---TCTCACTTG----C--ATGTAA-G--TG-T-TT--TAAG--------TGCATG-TT--AGAATTACAGT--ATATT-A------T-CATC-A-T-A-AT--GAACT-GT-TTAAC---A--TTT-AAA--TAACC-AATA-ATAT-AGA----ATA-A-T-GAC-CATTAAA-TC-TTCAA-TTG--ACCACAATCGA-CCAGT-ATTGACCACTG----TT-----GACCA-GTAA-CG-A-CGGTTTT-AA--CCAGTA--TTGACC--A-C-C--ACCTCCACGGGT-CAAA-TA-T--------------GT--A--T--GACACCCGA---C--TTTT--G-CCAACaaaacatttt
gi|20 : tggcattaaaaataccgccaactgagtttagaaaacctatcagata---A--TTT-AAA-CTAACC-AATA-ACAT-AGA----ATA-A-T-GAC-CATTAAA-TCTT-CAA-TTG--ACCACAATCN--NNN---NNNNNNNNNNN--NNNN-----NNNNN-NNNNNNN-NNNNNNNNN-NN--NNNNNN--NNNNNN--N-C-C--GGCCC----GGT-C-AT-TA-C------------TAGT--AT-T--GA---CCT----TTTTTTT--G-CCAACcc
gi|21 : tTCAAC---A--TTT-AAA--TAACC-AATA-ACAA-ACT----GTA-A-T-GAC-CAATCAA-T-TTTCAA-TCA--ACCA-----G--T-----ATTGACCACTA---------------------TTG-ACAGGTTTT-AA---CAATA--TTGACC--A-C-C--GGCCC----GGT-C-AA-TA-C------------TAGT--AT-T--GA---CCAGGTTTTTTTTT--G-CCAACcct
gi|22 : ttataaacttgccactAG--GGACTTG--ACACC-CTG---TTCTTTG--CGA----GG-TC-AAAAGTT-AAACAG-TTTT-T---TTTTTACA--G-TG-AG-C-AT---TTTC-CC-AAA----AA--CA--AAATCTTAT--GC-ATTA-T-T----------TAA---TTTTATTTGCACAC--ATGTAA-G--TG---TT-GTAAG--------TGCATGTTT--AG
gi|23 : G-GACA-AGT-G-TT--AAT-TAACAT-ACCT-AAGGTT--CAG-----G--GATGGCAATTGT-G--TGTATTATTG-TTATG--AAAACA--TTACCCAC--ATTT-GCACACC-AATGT--GAT-CATTA--GGAACC-CGATGAA-TACTC-TTCAAT-A--ATG-ACTTG
gi|24 : A--------------A------------T------------------TTCTGCTT--ACGCC--TGG-AC-AGAAAA--A-CAGG-T--------A-GCCG--AACAC--T-GATC-TAGTAAATACCCAATACATA-TACAATG----------------------------TGTTAC-A---AAA--GAC-AGTG-C-T-T---ATGG-------AG--C---AAG---A-GATT
gi|25 : gacaatgagagacaaaatATA-ATAA-AGACTCAATA-A-T-GAC-TAATAAA-T-TTTCAA-TT---------------------ATTGAACACTA--------------------GT-G-ACCGGTTTT-AA--CCAGTA--ATGACC--A-C-T--GGCAG----AAT-C-AA-TA-C------------TAGT--AT-T--GA---CCA----CTTTTTT--G-CCAAC
gi|26 : TGACCAATAAATTTTCAATCAACTA-TTA-TTG-GCCAGTTTT-AA--CCAGTA--TTGACC--A-C-T--TGCCC----TGT-C-AA-TA-CTACTATTGACTCTAGT--AT-T--GA---CCA----CTTTTTT--G-CCAACcct
gi|27 : aCAGGGCTGG-GCGGTCAAAACTGTCCCAACC-GTCCCCGG---TTTTA-A-CCAGCAG-TT-TTAACCGGTT-G-TA-A----C-CGCC-CCG--CG-GTGA--A-CACTC-CCAAAA--TG-GTCA--A--T-A-GT--GGT-Ccctg
gi|28 : CAGGGTTGG-GCGGTTAAAAC---------C-ACTCCCGGT--TTT-A-A-CCAGCAG-TT-TTAACTG--------------C---CC-C----CA-GTCA--A-TGCTC-CCAAAA--TG-GTCA--A--T----T--G-------------------------AAATAT----A-----A-AGTG-T--CC-T--T--T-T-
gi|29 : AA--TACATTT--CAT---GC--AAA--AA------------T-A------------A-----A---G-A-T--------T-A-ATGAATACATA---T---AT--A-CTC-A-G--CT-TTATT--AC-A-AA--G-CA-T-G--T-ATTAATATA--GAT--C-A-A----T-T--AAT--G-------A-TTTTA--AAT--------A-----------AT--------------TAt
gi|3 : AGGGTTGG-GCGGTTAAAAC---------C-ACCCCCGGGTTTTT-ATA-CGAGCGG-TT-T-AACCGGTT-A-TATA----C-CGTCTC----CGCGTCAC-A-TACTCTCCAAAA--TG-GTCA--A--T---GT--GGT-CAA-TTAC-T-GGT-AATTTGAGAATTT----A-----ATAGTG-TTGCC-TGTTGGT-T-CCGA-TATTT-----TAA--TACATTT--CAT---GC--AAA--AA------------T-G------------AGAAGTATT-A-A-T--------T-A-AT-AGT--TTA---T-CACT-----TC-A-GA-CT-TTATT--AC-A-AA--G-CA-TTGC-T-ATT--CATA--GAT--CCA-A----T-T--AAT--GTTTTTAAA-T------AATTATACTGAA-----------ATGT------------CATT----TATTGT--T-ATACCCCGGTAA-T---GAC--TT-CTG----ACC-TTTTTA----GA-G-C--G-C-TC-A-T--TTCT--AAG-C---TGG-ACATATCACC-C---T---AT---TT-TAAC----TTTTTTT--------------AGTA-----AGATCGGC-A--A-CTG-TTT-----G-C--AATAC--T-GAA--TA-GTACTATAG---CACTT-TTTCAGATGGCCAA-ATTCTTGC-ATG-T--TTATAGT-AT-AA-------TTG----C----------A---CTACT-GTG-GTTGAC-A--T-A-T-CT-TTAC---TACT-ATATC--C-AT-GT--ACATG-----TATACTTAAAAGGTT-ACAGG--TG--AGC-A-TTA-GTTT-GCAATGAGAGACAA--------------AATAA--------T------------------TTCTGCTT--ATACC--TGG-ACCAAAATACGA-CA---TACGATTC-A-GCTG--AGCACTGTTGATC-TAGTAAA-------TAAATA-TAA-CTGGGT-T--GGATT-A----AA-CAATTTGTGTTGC-A---AA---GAC-A-------------TAG-------TG--C---AG------TATTA-CTT--GGA------CAGGT--TA--ATATGACACAGT-G-TTGTAAT-TA-CATTACCCTAGGGTC--TAACCTGTG--GATGGCAGT-GT-GT-C-TGTTATTT-GTATGA-AAAACA--T----CAC--ACC--ACACA-C-AAT-T--GATGCATTA--GACACC---------------TTCAGT-AGTATG-AC-TG-T-------ATGGAGA-GACT-ATGGGAA-C
gi|3 : TAGACA-CCTT---CA----G-----T--AGTATGACTGT-AT-GGAGA-GACTATGG--GAACGTC-GACCCG-CTGACTCTCTTTGT-CTA----TGCAC-AAAAGTTTAAACAG-TTTG-TTGATTTTCACATGG-TG-AG-C-ATGAGTTTC-CCGCATTTTGAACTTATCAAATCTTGTAGGC-ATTA-T-T----------TAA---TTTC-TTTT----C--ATGTAA-G--TG-TACT-G-AAGT-------CA-ATGTTT--A-AATTACAGT--AA-AT-AATACACT-CAAC-AGT-AGAT--GAACTGCT-TTAAC---AAATTA-AAAATAAGCT-CATATATAT-ATA----ATA-A-TTGAC-CATTAAA-TTCTTCAAGTTG--ACCACTATCG--CCA---GTTAATGACCG--TATT-----GACCATGTGGG-G-ACCG-TTTT-AA--CCAGTA--T-GACC--AAC-T--GACCC----GGT-CCAA-TA-C------------TAGTACAT-T--GA---CCG----CTTTTTT--G-CCAACgtcgacccgctgactctctttgtctatgcacaaaagtttaaacagtttgttgattttcacatggtgagcatgagtttcccgcattttgaacttatcaaatcttgtaggcattatttaatttcttttcatgtaagtgtactgaagtcaatgtttaaattacagtaaataatacactcaacagtagatgaactgctttaacaaattaaaaataagctcatatatatataataattgaccattaaattcttcaagttgaccactatcgccagttaatgaccgtattgaccatgtggggaccgttttaaccagtatgaccaactgacccggtccaatactagtacattgaccgcttttttgccaacc
gi|30 : agggttgggcggttaaaaccacccccgggtttttatacgagcggtttaaccggttatataccgtctccgcgtcacatactctccaaaatggtcaatgtggtcaattactggtaatttgagaatttaatagtgttgcctgttggttccgatattttaatacatttcatgcaaaaatgagaagtattaattaatagtttatcacttcagactttattacaaagcattgctattcatagatccaattaatgtttttaaataattatactgaaatgtcatttattgttataccccggtaatgacttctgacctttttagagcgctcatttctaagctggacatatcaccctattttaactttttttagtaagatcggcaactgtttgcaatactgaatagtactatagcactttttcagatggccaaattcttgcatgtttatagtataattgcactactgtggttgacatatctttactactatatccatgtacatgtatacttaaaaggttacaggtgagcattagtttgcaatgagagacaaaataatttctgcttatacctggaccaaaatacgacatacgattcagctgagcactgttgatctagtaaataaatataactgggttggattaaacaatttgtgttgcaaagacatagtgcagtattacttggacaggttaatatgacacagtgttgtaattacattaccctagggtctaacctgtggatggcagtgtgtctgttatttgtatgaaaaacatcacaccacacacaattgatgcatAATCG--ACC---ATTAANNNNNN--NNNN-----NNNNN-NNNNNNN-NNNNNNNNN-NN--NNNNNN--NNNNNN--N-C-C--AGCCA----GGT-C-AG-TA-C------------TAGT--AA-T--GA---CCA----CTTTTTT--G-CCAACc
gi|31 : -----TGTTGC-A---AAA--GAC-AGTG-C-T-T---ATGG-------AT--C---AAA---A-GATTA-CTT--GGG-GA---CAGGT-ACA--TTT-AACA-TGT-GTT---AAT-TAACAT-ACCC-Ac
gi|32 : atg--CT-T--T--T-T-CTTA-T-TTT-----A----TACATTT--CAT---GC--TAA--AA------------T-ATAGATACATTTGA----TA---G-A-T--------T-T-AT-AGT-CTT
gi|33 : GTT-A-TG-A----T-CGCC-C----CG-GTCA--A-TACTC-CCAAAG--Taattaa
gi|35 : gttA-ATAG--GGACTTG--ACACC-CTG---CTCTTTG--CTC----GG-AC-AAAacatgt
gi|36 : AGGGTTGG-GCAGTTAAAAC---------C-ATCCCCGG---TTT-A-
gi|4 : AGGGTTGG-GCGGTTAAAAC---------CCGCCTCCG----TTT-A---CCAGCGG-TTGTTAACCGCTT-A----A----C-CGCC-C----CG-GTCA--A-TACTC-CCAAAA--CGTGTCA--A--T-A-GTTTGGT-CAA-T-C--T-GGTCTAATTGAAA-TTT----A-----A-AGTG-C--TC-C--T--T-T-CCAA-T-TTT-----AAA--TACATTTTTCATT--GC--AAA--AAA-----------T-A------------A----TA---GGA-T--------T-TCAT-AAT-CTTT---T-CAAA--AGAGT-A-G--CT-T-ATC-AGC-A-AATGG-CA---G--T-ATTCTTTTT--GATTCC-A-AATTAT-T--AAT--G-------A-T------AAT--------A-----------AT--------------CATT----TA--AT--T-ACACCCCAGTA--T-TGAACT-TT-CTG----ACC-TTTTCA----AA-GAC--T-CTTC-A-TCATTCT--G-G-CGGATTG-AT-C----CC-C---TA--AT---TATTAACT---TTTTT----------------AGTT-----A-ATGGGC-A--GCCTGTTTTCAAT-C-A--AATAC--T-GAT--TA-GCT----AG---CAC---TT-CAGAGGAC--A-A-TTCTGC-ATGTT--TTAAGAT-AT-AAATA-TCATT----GCT-AATTTT-GA---CTACTTATG-G-CAAC-A--T-A-T-CT-TCAT---TACT-ATAC---C-AT-G--TACATG-----TA------GACGGGTTACAGGACTA----T-A-T-ATGTTT-G---------ACAATG------------AGAGAAAAAAAATT------------------TTCTGC-T-TATA-C--TGG-AC-CAAATAT-A-CAGC-TAGGAT-C-A-CTTG--AGCACTGT-GATC-TATT----A---AATAAATACTAAACTCGG--T--GA--TAA----AA-CAT----TGTTGCAA---AAA--GAC-AGTGTC-TCC-AAATGGGAGTGTCGG--CGAGGAG---A-TATTACCTT--GGGTG----CAGGT-ATA--ATG-GACA-AG--G-T---AAT-TAACAT-ACCC-AAGGTC--CAG-----G--GATGGCAATTGT-G--TGTGTTATTGTTTATGGCAAAACA--TCACCCAT--ACTG-ACACACA-AATGT--GAT-CATTA--GGTAC--TGATGAA-TAC-CCTTCAAT-A--ATG-ACTTG-T-------A-GGAAA-A--T-ATAGGGA-CTTTTGACACCCTG-CTCTT--TGTAGGACAA-------AAATTAA-ATAG--t
gi|4 : -C---T--TGTAGGAAAAT-AT-AG--------------GGACTTTTGACACC-CTG---CTCTTTG---TA----GG-AC-AAAAATT-AAATAG-TTTAGT-AATTTTTACAC-G-TG-AGGC-AT---TTTCACC-CAAT--GAA--TA--AA-TCTTAT--GC-ATTA-TGT----------TAA---TCTCATTTG----CCAATGTAATGCTTG-T-TT-GCAAGT--------GCCTGTCTTAAGAATTATAGT--AT-TTTA------TTCATC-T-TTA-ATCAGAACT-CCGT-AAC---A--TTTTAAAAATAACCCAATA-ATATGAGA----ATATG-T-GATTCATTAAGCTTTTTCAA-TTGGCACCACAATCGAGCCAGATATTGACCACT----TAT-----GACCA-GTA-TTG-ACTGGTTTT-AA--CCATTA--TTGACCCAA-C-C--GGCCC-----GT-C-AATTA-C------------TAGTC-AT-TGGGA---CCG----CTTTTTtttagtaatttttacacgtgaggcattttcacccaatgaataaatcttatgcattatgttaatctcatttgccaatgtaatgcttgtttgcaagtgcctgtcttaagaattatagtattttattcatctttaatcagaactccgtaacattttaaaaataacccaataatatgagaatatgtgattcattaagctttttcaattggcaccacaatcgagccagatattgaccacttatgaccagtattgactggttttaaccattattgacccaaccggcccgtcaattactagtcattgggaccgcttttt
gi|5 : agggttgggcggttaaaacccgcctccgtttaccagcggttgttaaccgcttaaccgccccggtcaatactcccaaaacgtgtcaatagtttggtcaatctggtctaattgaaatttaaagtgctcctttccaattttaaatacatttttcattgcaaaaaataataggatttcataatcttttcaaaagagtagcttatcagcaaatggcagtattctttttgattccaaattattaatgataataatcatttaattacaccccagtattgaactttctgaccttttcaaagactcttcatcattctggcggattgatcccctaattattaacttttttagttaatgggcagcctgttttcaatcaaatactgattagctagcacttcagaggacaattctgcatgttttaagatataaatatcattgctaattttgactacttatggcaacatatcttcattactataccatgtacatgtagacgggttacaggactatatatgtttgacaatgagagaaaaaaaattttctgcttatactggaccaaatatacagctaggatcacttgagcactgtgatctattaaataaatactaaactcggtgataaaacattgttgcaaaaagacagtgtctccaaatgggagtgtcggcgaggagatattaccttgggtgcaggtataatggacaaggtaattaacatacccaaggtccagggatggcaattgtgtgtgttattgtttatggcaaaacatcacccatactgacacacaaatgtgatcattaggtactgatgaatacccttcaataatgaCAGGGTTGG--CGGT-AAAAC-----------GCCCCCG----TTT-A-A-CCAGCGG-TT-TTAACCGGTTTA-TA-A----C-CGCC-C----CG-GTCA--A-TACTC-CCAAAA--TG-GTCA--A----A-GT--GGT-CAAAT-A--T-GGTCAATTTGAAAATTTTTACA-----A-AGTG-T--CC-T--T--T-T-CCAA-T-TTT-----AAA--TACATTT--CATAT-GC--AAA--AA------------T-A------------A----TA---G-A-T--------T-T-AT-AGT-CTTT---G-CAAA--A-ATC-A-T--CT-TTATT-AAC-A-AA--G-CA-T-G--T-ATT--TATTTTGAT--C-ATA----T-T--AAT--G-------A-T------AAT--------A-----------AT--------------CATT----TA--AT----ACACCC-AGTAT-T-TGAAC--TGATTG----ACC-TTTTCA----AA-G-C--TGC-TC-G-T--TTCT--A-G-C---TTG-ATTT----CC-C---T---AA---TA-TAAC----TTTTT----------------AGTT-----A-ATGGGCCA--A-CTT-TTTCAATTG-CCGAATAC--T-GA---TAAGTA----AG---CACTT-TT-CAGA--AC--A----TTTGC-ATG-T--TTAAGAT-A--AAATA-T-AT-G---GCT-AA---T-GA---CTACTCATG-GTCAAC-A--T-A-TGCT-TTAG---TACT-ATA----C-AT-GT-TACATG-----TA------GAGGTTTTACAGG--TA--TGT-A-T-A-GTTT-G---------ACAA--------------A------------T------------------TTC-GCTT-TATACC--TGG-AC-AAAATA--A-CAGC-TA-GAT-C-A-GCTG--AGCACTGT-A--C-TAGTAAA-AT--AATAAATA-TAAACTGGGT-TT-GA--T-A----AA-CA-----TGTTGC-A---AAA--GAC-AGTG-CCT-CTAAATGG-------AG--C---AAG---A-TATTA-TTTTTGGGTGT---CAAGTTATA--ATG-GACA-AGT-G-T---AAT-TAACAT-ACCC-AAG--T--CAG-----G--GATGGCAATTGT-GTCTGTGTTATTG-TTATGA-AGAACA--TCACCCAC--ACCG-ACACACCCAATGG--GAT-CATTATCGGTACCTTGATGAA-TACTCTTTCAATTA--ATG-ACTTGTTTTTTTCTATGGAAA-A--CCATAGGGAACTTT---CA----A-G---T--TTTAGGAAAAT-AT-AGAAA-TAA-ATAG--GGACTTG-GACACC-CTG---CTTTTTG--CTA----GG-ACGAAAAGTT-AGATAG-TTTA-T-AATTTTTACA--GGTG-AG-C-AT---TT-C-CC-CAATT-GAA--TA--AAATCT-AT--GCCATTA-T-T----------TAA---TCTCATT-G----A--A-GTAA-G--TG-T-TTTGGAAGT-------TGCATGTTT--AGAAT-ACAG---AT-TT-A------T-CATC-A---A-AT--GAACT-CTGTTAAC---A--TTT-AAAATTGCCC-AA-A-ATAT-AGT----ATA-A-TTGAC-CATTAAA-TCTTTCAA-TT---ACCACAATCG--CCG---ATTGACCACTA--TTTT-----GACCA-GTAGTTG-ACCGGTTTT-AA--CCAGTA--TTGACC--A-C-C--GGCCG----CGT-C-AA-TA-C------------TAGT--AT-T--GA---CCG----CTTTTTT--GCCCAAC
gi|6 : -T--CT-T--T--T-C-CCAA-T-TTT-----AAA--TACATTT--CAT---GC--AAA--AA------------T-A------------A----TA---G-A-T--------T-T-AT-AGT-CTTT---TTCAAA--A-ATC-AAG--CC-TTATT-TAC-A-AA--GGTA-T-G--T-ATT--ATTT--GAT--C-A-AC---T-T--AAT--G-------A-T------AAT--------A-----------AT--------------CATT----TA--AT--T-ACACCCCAGTAT----GAAC--TT-CTG----ACC-TTTTCA----AA-G-C--T-C-TC-A-T--TTCT--A-G-C---T-G-ATAT----CC-CC--T---AT---TA-TAAC----TTTT-----------------AATT-----A-ATGGGC-A--A-CTG-TTTCAAT-G-C--AATAC--TTGA---TA-GTA-----G---CACTT-TT-CAGA-GAC--A-ATTCATGC-ATG-T--T-AAGATTATTAAATA-T-ATTG---GCT-AA---TTGA---CTACTTATGTGTCAAC-A--T-A-T-CT-T-AG---TACT-ATA----CCAT-GT--ACATG-----TA------GAGGGTT-ACAG---TA--GAT-A-T-A-GTTT-G---------ACAATGAGAGACAAAATAA------------T------------------TTCTGCTTATGTACC--TGG-AC-AAAATA--A-CAGC-TA-GAT-C-A-GCTGT-AGCACTGT-GATC-TAGTAAA-------TAAATA-TAAACTGGGT----GA--T-ATA--AA-CA-----TGTTGC-A---AAA--GAC-AGTG-C-T-CTAAGTGG-------AG--C---AAG---A-TATTA-CTT--GGG-T----CATGT-ATA--A-G-GACA-AGT-GTT---AAT-TAACAT-ACCC-AAGGTC--CAT-----G--GATGGCAATTGT-A--TGTG-TATT--TTATG--AAAACA--TCACCCACA-ACTG-ACACACC-AATGT--GAT-CATTA--GGTACC-TGAAGAA-TACTC-TTCAAT-A--ATG-ACTTG-T-------ATGGAAA-A--T-ATA--------------------------------GAAA------------TAA-ATAG--GGACTT--GACACC-CTG---CTCTTTG--CTA----GG-AC-AAAAGTT-AAATAGTTTTA-T-AATTTTTACA--G-TG-AG-C-AT---TTTC-CC-CAATT-GAA--TA--AAATCTTAT--GC-ATTA-T-T----------TAA---TCTCATTTG----C--ATGCAA-G--TG---TT-GTAAG--------TGCATGTTT--AGAATTACAGT--AT-TT-A------T-CAAC-A-T-A-AT--GAACT-C-GTTAAC---A--TTT-AAAA-TAACC-AATA-ATGT-AGA----ATA-A-T-GAC-CATTAAA-TC-TTCAA-TTG--ACCACAATCN--NNN---NNNNNNNNNNN--NNNN-----NNNNN-NNNNNNN-NNNNNNNNN-NN--NNNNNN--NNNNNN--N-C-C--GGCCC----GGT-C-AA-TA-C------------TAGT--AT-T--GA---CCG----C-TTTTT--G-CCAAC
gi|7 : gtCAGGGTTGG-GAGATTAAAAC---------C-ATCCCTGG---TTT-----------------TCACCAGTC----------------------------CA--A-AACTC-CCAAAA------------------GT--GGTTCAA-T-A--CCGGTCAATT-GAAA--TT----ATCACTA-ACTGCT--CC-T--T--T-TTCCTA-T-TTT-----TA---TATATTT--CAT---CA--AAA--AA------------T-A------------A----AACAGG-A-T--------T-T-GT--GT-C-TT---T-CAAA--A-ATC-A-AATCT-TTA-T-CAC-A-AA--G-CA-T-AT-T-GGT--TATA--GAT--G-A-A----TGT--AAT--G-------A-TAAACAAAAT--------AAGAAATGAAATAT--------------CATT----TA--AT--T---------GTA----TGAAC--TT-C-G----ACCTTTTTCA----AG-G-CTAT-C-TCTA-T--TTCT--A-G-----TTGCATAT----TT-C---T----C---TA-TAAC----TTTTTAGTATGTCGTTTTTTGAGTT-----ATATAGGCGA--A-CTA-TTTTAAG-G-C--AATACTTT-GC---TA-GTA----A----CAGCT-TA-CAGA-GAC--A-ATTT-TGCAAAG-T--ATAAGAT-AT-cc
gi|7 : T-ATA----T-GT-GTATACTTG------A------TAGGAGTTACAGG--TA--G-C-A-T-A-GTTTTGTCATTAT--GCAA--------------AGACGT-------T------------------TTTTGCTG-TATATC--TTG-ATTGGAGTA--AACGGG-TA-------A-GTTG--AACACTGT-GATCGTAGTAGA-A-----TAAATA-TAAACTGGGT----GA--T-ATTAAAA-CAATGT-TGTTGC-A---AAA--GACCAGTG-C-T-T-A--TGG-------AGATC---AAA---AAGATTAATTT--GGG-GA---CAGGT-ACA--ATG-GACA-TGT-G-T---TAA-TAACAT-ACCA-AGGGTCCTCAG-----G--GA-GGCGAttagaatggtacatttttaaaccattcgtaatctgtcacttctgtggtccacaacctatattgctctcagtttacgtattatccgatttgtactgatgtacatggtatatgtgtatacttgataggagttacaggtagcatagttttgtcattatgcaaagacgttttttgctgtatatcttgattggagtaaacgggtaagttgaacactgtgatcgtagtagaataaatataaactgggtgatattaaaacaatgttgttgcaaaagaccagtgcttatggagatcaaaaagattaatttggggacaggtacaatggacatgtgttaataacataccaagggtcctcagggaggcga
gi|8 : cagggttgggagattaaaaccatccctggttttcaccagtccaaaactcccaaaagtggttcaataccggtcaattgaaattatcactaactgctcctttttcctatttttatatatttcatcaaaaaataaaacaggatttgtgtctttcaaaaatcaaatctttatcacaaagcatattggttatagatgaatgtaatgataaacaaaataagaaatgaaatatcatttaattgtatgaacttcgacctttttcaaggctatctctatttctagttgcatatttctctataactttttagtatgtcgttttttgagttatataggcgaactattttaaggcaatactttgctagtaacagcttacagagacaattttgcaaagtataagatatttagaatggtacatttttaaaccattcgtaatctgtcacttctgtggtccacaacctatattgctctcagtttacgtattatccgatttgtactgatgtacatggA-ATAGAAGGATTTG--ACACC-CTG---CTCTTTG--CTACCTAGA-AC-AAAAGTT-AAACAG-TTTT-T-GATTTTTACA--G-TC-AG-C-AT---TTTC-CC-CACTT-TAA--GA--AAATCTTAT--GC-ATTA-T-T----------TAA---TTTAATTTG----C--ATGTAA-G--TG---TT-GTAAGTCATAAAGTGCATGTTT--AGAATTACAGT--AT-TT-A------T-CATC-A-T-A-AT--GAA-T-CT-TTAA-----------AAAATAAACC-AGTA-ATAT-AGA----ATA-A-T-GAC-CAATAAA---TTTCAA-TTG--ACCAT--T----------ATTGACCACTA---------------------TTG-ACTGGTTTT-AA--CCCGTA--TTGACC--A-C-C--AGCCC----GGT-C-AA-TA-C------------TAGT--
gi|9 : ag-T--T--T-T-CCTA-T-TTTT----AAA--TATATTT--CAT---GC--AAA--AA------------T-A------------A-----A---G-A-TGCATTTAATAT-AT-AGT-CTTT---T-CAAA--A-AAC-G-A--CT-TTATT--AC-A-AA--G-CA-T-G--T-ATT--TATA--GAT--C-A-A----T-T--AAT--G-------A-TTTGA--AAT--------A-----------AT--------------TAT
gi|9 : cat-ATAT----CC-T---TTTTAG---TA-TGACGTATTTCTTG---------------AGTT-----A-ATGGGC-A--A-CTG-TTTTAAT-G-C--AATAC--T-GA---TA-GTATTC-AG---CACTT-TA-CAGA-GAC--A-A-TTCTGC-ATG-A--TTAA-------AGATA---AT--------------T-GA---CTAC-TGTG-GCCGAC-A--T-A-T-CT-TCAG---TACT-ATAATACC-AT-G--TACATatgaaatatcctttttagtatgacgtatttcttgagttaatgggcaactgttttaatgcaatactgatagtattcagcactttacagagacaattctgcatgattaaagataattgactactgtggccgacatatcttcagtactataataccatgtacat
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|34 ): ATGTAAATTTATATGGAATTCATATAATAATATAGAAATTT
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 111111111 222222222222 1111111111111 11111 555555555555555555555555555555555555555 1111111111 111111 111 33333333333333333333333333333333333333333333333333 1111 11 11 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555 33333 1 1111 111111 1111111 222222222222 4444444444444444 1111111 11 11 111 222222222 111111 111 333333333333333 222222 222 1111111111111 1 111111 3333333333333333333333333333333333333333333333333333 11 1 11 111111111111 11 4444444 333333333333333333333333 11111111 222222222222222222222 444444 11111 11111 111 11 22222222 33333333333 222 11 1111111111 1111111 222 333333333 111111 11 222 1111 11 222222222 44444444444444444444444 111111111111
lowQualScore : 3 0 333333333 3 666666666666 3 3 6666666666666 2 22222 2 66 2 2 33 3 0 444444444444444444444444444444444444444 0 6666666666 3 3 33 2 99 33 2 2 2 2 2 333333 33 0 33 111 33 33 33333333333333333333333333333333333333333333333333 333 2 2 3 66666 5555 3 0000 3 44 3 3 44 3 2 2 99 2 88 555 3 11 3 3 9999 3 44 44 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999 8888 55 7777 44444 55 2 2222 8 8888 4 8 55 4 4 000000 55 4 7777777 3 2 7777 3 333333333333 3 3 7777 4444444444444444 3333333 8 66 4 55 4 4 00 00 4 222 4 4 222222222 7777 4 4 66 555555 4 88888 0 4 4 3 000 777777777777777 888 33333 5 2 5 66 5 5 5 5 6 888 4 555555 4 000 6666666666666 4 2 777 555555 4 8 4 7777777777777777777777777777777777777777777777777777 4 33 66 4 3 00 8 999999999999 4 00 4 4 5555555 1 4 555555555555555555555555 4 777 99 4 99999999 222222222222222222222 4 4 66 333333 4 66 4 4 4 99999 4 4 44 88888 22222 66 3 5 777 1 0 5 55 77 33 777 66 77 5 0 77 5 666 22 5 5 5 5 77 5 1 44444444 2 999999 0 77 99999999999 1 6 6 1 8 55 444 4 777 99 8888 4 4 8 4 55 55 00 4 4 4 4 777 4 4 99 66 66 4 66 4 4 4 9999999999 777 6666666 4 66 111 4 0 111111111 1 66 4 55 4 4 111111 4 4 4 8 4 55 4 99 666 55 3 111 3 3 3 4444 3 3 6 3 3 3 33 3 44 77 888888888 0 88888888888888888888888 2 0 2 33 33 33 2 2 33 8888 2 5 2 2 444444444444 66 3 44 555 9999 44 3
lowQualScore : . . ......... . ............ . . ............. . ..... . .. . . .. . . ....................................... . .......... . . .. . .. .. . . . . . ...... .. . .. ... .. .. .................................................. ... . . . ..... .... . .... . .. . . .. . . . .. . .. ... . .. . . .... . .. .. ....................................................... .... .. .... ..... .. . .... . .... . . .. . . ...... .. . ....... . . .... . ............ . . .... ................ ....... . .. . .. . . .. .. . ... . . ......... .... . . .. ...... . ..... . . . . ... ............... ... ..... . . . .. . . . . . ... . ...... . ... ............. . . ... ...... . . . .................................................... . .. .. . . .. . ............ . .. . . ....... . . ........................ . ... .. . ........ ..................... . . .. ...... . .. . . . ..... . . .. ..... ..... .. . . ... . . . .. .. .. ... .. .. . . .. . ... .. . . . . .. . . ........ . ...... . .. ........... . . . . . .. ... . ... .. .... . . . . .. .. .. . . . . ... . . .. .. .. . .. . . . .......... ... ....... . .. ... . . ......... . .. . .. . . ...... . . . . . .. . .. ... .. . ... . . . .... . . . . . . .. . .. .. ......... . ....................... . . . .. .. .. . . .. .... . . . . ............ .. . .. ... .... .. .
lowQualScore : 3 4 333333333 3 666666666666 6 3 2222222222222 9 99999 9 88 9 9 99 1 4 000000000000000000000000000000000000000 4 6666666666 3 1 99 7 00 77 7 7 0 9 9 666666 77 5 77 000 77 77 77777777777777777777777777777777777777777777777777 000 7 9 4 22222 8888 1 4444 1 88 1 1 22 1 9 9 66 9 55 111 1 55 1 1 6666 1 66 66 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222 5555 55 8888 99999 55 0 5555 0 5555 0 0 55 0 0 666666 55 0 2222222 6 3 7777 6 111111111111 6 6 7777 0000000000000000 7777777 9 11 4 33 4 4 66 66 4 222 4 4 444444444 7777 4 4 11 000000 4 11111 8 4 4 2 111 222222222222222 888 44444 0 0 0 99 0 0 0 0 5 888 4 111111 4 888 7777777777777 4 8 222 000000 4 9 4 9999999999999999999999999999999999999999999999999999 4 44 11 4 3 66 9 222222222222 4 66 4 4 3333333 9 4 777777777777777777777777 0 000 55 0 11111111 111111111111111111111 4 4 11 333333 4 11 0 0 0 55555 0 0 66 55555 55555 99 2 7 000 4 7 7 99 99 66 999 44 99 7 1 99 7 666 33 7 7 7 7 99 7 4 22222222 5 555555 7 11 55555555555 7 7 7 4 9 55 000 0 000 55 5555 0 0 9 4 88 99 66 4 4 4 4 888 4 4 00 11 11 6 11 4 4 4 4444444444 888 2222222 4 11 777 4 8 444444444 1 11 6 55 0 0 555555 0 0 0 0 0 55 0 77 444 00 6 444 6 3 3 2222 3 3 7 3 6 3 88 3 66 88 888888888 3 66666666666666666666666 9 3 9 99 99 99 9 9 99 9999 9 7 9 9 666666666666 88 1 22 444 6666 66 3
consensus : CAGGGTTGG-GCGGTTAAAAC---------C-GCCCCCGG---TTT-A-A-CCAGCGG-TT-TTAACCGGTT-A-TA-A----C-CGCC-C----CG-GTCA--A-TACTC-CCAAAA--TG-GTCA--A--T-A-GT--GGT-CAA-T-A--T-GGTCAATTTGAAAATTT----A-----A-AGTG-T--CC-T--T--T-T-CCNA-T-TTT-----AAA--TACATTT--CAT---GC--AAA--AA------------T-A------------A----TA---G-A-T--------T-T-AT-AGT-CTTT---T-CAAA--A-ATC-A-G--CT-TTATT-CAC-A-AA--G-CA-T-G--T-ATT--TATA--GA-T--C-A-A----T-T--AAT--G-------A-T------AAT--------A-----------AT--------------CATT----TA--AT--T-ACACCCCAGTAT-T--GAAC--TT-CTG----ACC-TTTTCA----AA-G-C--T-CT-C-A-T--TTCT--A-G-C---TTG-ATAT----CC-C---T---AN---T-AT-AAC----TTTTT----------------AGTT-----A-ATGGGC-A--AC-TGTTT-CAAT-G-C--AATAC--T-GA---T-A-GTA----AG---CACTT-TT-CAGA-G-AC--A-ATTCCTGC-ATGT--TT-AAGAT-AT-AAATA-T-ATTG---GCT-AATT--GA---CTACTTATG-GTCGAC-A--T-A-T-CT-TCAG---TACT-ATA----C-AT-GT-TACATG-----TA------GAGGGTTTACAGG--TA--GGC-A-T-AGTTT-G---------ACAA--------------A-----T------------------TT-CTGCTT-TATACC--TGG-AC-AAAATA--A-CAGC-TA-G-AT-C-A-GCTG--AGCACTGT-GATC-TAGTAAA-A---AATAAATA-TAAACTGGGT-T--GA--TA----AA-CA-----T-GTTGCA---AAA--GAC-AGTG-C-TCTAAATGGA-------G--C-AAG---A-TATTA-C-TT--GGG-G----CAGGT-ATA--ATG-GACA-AGT-G-T---AAT-TAACAT-ACCC-AAGGTC--CAG-----G--GATGGCAATTGT-GT-TGTGTTATTGTT-ATGA-AAAACA--TCACCCAC--ACCG-ACACACC-AATGT--GAT-CATTA--GGTA-CCT-GATGAA-TACTCTT-C-AAT-A--ATG-ACTTGT--------ATGGAAA-A--T-ATAGGGA-CTTTCAG--T--TGTAGGAAAAT-AT-AGAAATAA-ATAG--GGACTTG-GACACC-CTG---CTCTTTG--CTA----GG-AC-AAAAGTT-AAACAG-TTTA-T-AATTTTTACA--G-TG-AG-C-AT---TTTC-CC-CAATT-GAA--TA--AAATCTTAT--GC-ATTA-T-T----------TAA---TCTCATTTG----C--ATGTAA-G--TG-T-TT-GTAAGT-------TGCATGTTT--AGAATTACAGT--AT-TT-A------T-CATC-A-T-A-AT--GAACT-CTGTTAAC---A--TTT-AAAATTAACC-AATA-ATAT-AGA----ATA-A-T-GAC-CATTAAA-TCTTTCAA-TTG--ACCACAATCG--CCA---ATTGACCACTA--TTTT-----GACCA-GTAGTTG-ACCGGTTTT-AA--CCAGTA--TTGACC--A-C-C--GGCCC----GGT-C-AA-TA-C------------TAGT--AT-T--GA---CCG----CTTTTTT--G-CCAAC
Reference ( family-2007 ) : CAGGGTTGG-GCGGTTAAAAC---------C-GCCCCCGG---TTT-A-A-CCAGCGG-TT-TTAACCGGTT-A-TA-A----C-CGCC-C----CG-GTCA--A-TACTC-CCAAAA--TG-GTCA--A--T-A-GT--GGT-CAA-T-A--T-GGTCAATTTGAAAATTT----A-----A-AGTG-T--CC-T--T--T-T-CCNA-T-TTT-----AAA--TACATTT--CAT---GC--AAA--AA------------T-A------------A----TA---G-A-T--------T-T-AT-AGT-CTTT---T-CAAA--A-ATC-A-G--CT-TTATT-CAC-A-AA--G-CA-T-G--T-ATT--TATA--GA-T--C-A-A----T-T--AAT--G-------A-T------AAT--------A-----------AT--------------CATT----TA--AT--T-ACACCCCAGTAT-T-TGAAC--TT-CTG----ACC-TTTTCA----AA-G-C--T-CT-C-A-T--TTCT--A-G-C---TTG-ATAT----CC-C---T---AN---T-AT-AAC----TTTTT----------------AGTT-----A-ATGGGC-A--AC-TGTTT-CAAT-G-C--AATAC--T-GA---T-A-GTA----AG---CACTT-TT-CAGA-G-AC--A-ATTTCTGC-ATGT--TT-AAGAT-AT-AAATA-T-ATTG---GCT-AAT---GA---CTACTTATG-GTCGAC-A--T-A-T-CT-TCAG---TACT-ATA----C-AT-GT-TACATG-----TA------GAGGGTTTACAGG--TA--GGC-A-T-AGTTT-G---------ACAA--------------A-----T------------------TT-CTGCTT-TATACC--TGG-AC-AAAATA--A-CAGC-TA-G-AT-C-A-GCTG--AGCACTGT-GATC-TAGTAAA-A---AATAAATA-TAAACTGGGT-T--GA--TA----AA-CA-----T-GTTGCA---AAA--GAC-AGTG-C-TCTAAATGGA-------G--C-AAG---A-TATTA-C-TT--GGG-G----CAGGT-ATA--ATG-GACA-AGT-G-T---AAT-TAACAT-ACCC-AAGGTC--CAG-----G--GATGGCAATTGT-GT-TGTGTTATTGTT-ATGA-AAAACA--TCACCCAC--ACCG-ACACACC-AATGT--GAT-CATTA--GGTA-CCT-GATGAA-TACTCTT-C-AAT-A--ATG-ACTTGT--------ATGGAAA-A--T-ATAGGGA-CTTTCAG-CT--TGTAGGAAAAT-AT-AGAAATAA-ATAG--GGACTTG-GACACC-CTG---CTCTTTG--CTA----GG-AC-AAAAGTT-AAACAG-TTTA-T-AATTTTTACA--G-TG-AG-C-AT---TTTC-CC-CAATT-GAA--TA--AAATCTTAT--GC-ATTA-T-T----------TAA---TCTCATTTG----C--ATGTAA-G--TG-T-TT-GTAAGT-------TGCATGTTT--AGAATTACAGT--AT-TT-A------T-CATC-A-T-A-AT--GAACT-CTGTTAAC---A--TTT-AAAATTAACC-AATA-ATAT-AGA----ATA-A-T-GAC-CATTAAA-TCTTTCAA-TTG--ACCACAATCG--CCA---ATTGACCACTA--TTTT-----GACCA-GTAGTTG-ACCGGTTTT-AA--CCAGTA--TTGACC--A-C-C--GGCCC----GGT-C-AA-TA-C------------TAGT--AT-T--GA---CCG----CTTTTTT--G-CCAAC
gi|1 : GGGTTCGTGCG-TTAAAAC---------C-GCCCCAGG---TTT-----CCAGCGGCTT-TTAACCGGTT-A-TA-A----CTCGCC-G----CT-GTCA--ACTACTC-CAAAAAAATG-GTCA--A--T-A-GC--GGT-CAA-T-AGCT-GGTCAAGT-GAAAATTT----A-----A-AGTG-T--CC-TA-T--T-T-CCAA-T-TTT-----AAAAATACATT---CAT---GCTCAAA--AA------------TTA------------A----TA---G-T-T--------T-G-AT-AGT-CTTTGGTC-CAAA--A-ATCCA-G--CT-TTATT-CAC-AGAA--G-CAAT-G--TTATT--TATT--GA-TTAC-A-A----T-T--AAT--G-------A-T------AAT--------A-----------AT--------------CATT----TA--AT--TTACACCCCAGTAT----GAAC--TT-CTGG---ACC-CTTTCA----AA-G-C--T-TG-C-A-CA-TTCT--A-GGC---T---ATAT----CC-C---T---AT---T-AT-AAC----TTTTTT---------------AGTT-----A-ATGGGC-ACCAC-CGTTT-CAAT-G-CC-AATAC--T-GA---T-A-GTA-----G---CATTT-TT-CAGA-G-AC--ACATC---G--ATGT--GA-AAGAT-AT-AAATAAT-ATTG---GCT-AATT--GA---CTAACTATG-GTCAAC-A--T-ACT-CT-TCAG---TACTTATA----CCAT-GT--ACATA-----TA------GAGGGTT-ACAGG--TA--GAT-AAT-AGTTT-G---------ACAA--------------A-----TGAGAGACAAAATAATT--TT-CTG--T-TATACC--TGGGAC-AAAA-A--A-CAGCGTA-T-AT-C-ACACTGGGAGCACTGT-GAT--TAGTAAA-------TAA-TA-TAAA-TGGGT----GA--TA----AA-CA-----T-GTTGCA---AAAAAGAC-AGTG-C-TCTAAATGGA-------GG-C-AAA---A-TATTA-C-TT--TGA-TT---CAGGT-ATACGATT-CACA-AGTTG-TTA-AAT-TAACAT-ACC--AAGG-C--CAG-----GATGA-GGCAATTGT-GT-GTTGTTATTGTT-ATGA-AAAACA--TCACCCAC--ACTGTACACACC-AATGCTGGAT-CATCA--GGTATCCT-GTGGAATTACTCTT-C-AAT-A--ATGAACTTGT--------AC-GAAA-A--T-ATAGGGA-CTTTCAG-TTTATATAGGAAAAT-ATAAGAAATAATATAG--GGACTT--GACA-C-CTG---CTCTTTG--CTA----GG-AC-AAAAGTTAAAAAAG-TTTA-T-AATTTTTACA--T-TGTAG-CAAT---TTTC-CC-AAATT-GAA--AA--AAGTCTTAT--GC-ATTATT-T----------TAATATTCTCATTTG----CAAATGTAA----TGTT-TT-GTAAGTGA-----TG---GTTT--AGA---ACAGTTAAT-TT-A------T-CATC-A-TGA-AT--GAACT-C-GTTAATACAA--TTT-AAA--TAACC-AATA-ATAT-AGA----ATA-ATT-GAC-CATATAA-TC-TTCAA--TG--ACCAC-ATCG--ACAGT-ATTGACCA-TA---GTT-----GACCA-GTTATTGTACCGGTCTTGAA--CCAGTA---TGA-C--A-C-TGGGGCCC----GGTCC-AA-CACC------------TAGT--AT-T--GA---CAG----CTTTTTTTGG-CCAAC
gi|10 : -T-G--T-ATT--TATA--GA-T--C-A-A----T-T--AAT--G-------A-TTTGA--AAT--------A-----------ATTATATATGAAATACCATT----TA--AT--T-ATACCCCAGTAT----AAGC--TT-CTG----ATC-TTTTCA----AA-G-C--T-CT-C-A-T----------------------AT----CC-C--------A---T-AT-AAC----TTTTT----------------AATT-----C-ATAGGC-A--AC-CGTTT-TAAT-G-C--AACAC--T-G----------A----AG---TACTT-TA-CAGA-G-A---A---TTCTGC-ATGT--TC-AAG---AT-AAATA-T-ATT----------T---GA---TTAATT-------GACTA--T-A-T-CT-T-AG---TACT-ATAC---C-AT-G--TACATGTATAATA------GAGGG-TTACAGG--TACTAGC-A-T-AGTTT-G---------ATAA--------------cc
gi|11 : -A----C-CGCC-C-----G-GTCACAG-TACTC-CCAAAA--TG-GTCA--A--TTA-GT--GAT-C-------------CAAT--GGGAATT-----------A-CGTG-T--CC-T--T--C-T-CCCAAT-TTTCTAACAAA--TA-ATT---CAT---GC--AAA--AA------------T-A------------A----TA---G-ATT--------T-T-AT-AGT-C--T---T-CAAAGTA-ATC-A-A--GC-TTATTACACAA-AA--G-CA-T-GGAT-AGT--TATC--GA-TC-C-G-A----T-T--AATACG-------ATT------AAT--------A-----------A---------------CATTATCCTA--A-----AAACCCCAATGA-T-GAAACTTTT-CTGTGACACCATTTTCA----AA-GAC--T-TT-TGA-A--TTCTTCA-G-C---GTG-ATAT----CCACCTAT---AC---T-AT-AAC----TTtgagagacaaaata
gi|12 : CAGGGTTGG-GCAATTAAA--------------------------------CCAGCGG-TT-TTAACCGGTT-A-TA-A----C-CG-C-C----CG-GTCA--A-TACTC-CCAAAG--TG-GTCATTAGCT-A-GT--GGT-C-A-T-A--------AATT--GAAATTT----A-----A-AATG-T--CC-T--T--TCT-CCTA-T-GTT-------A--TACATTT--CAT---GA--AAA--AA------------C-A------------A---------------------------------CTTT----------------------------TT-CAC-G-AA--G-CC-T-A--T-AAT--TATA--GA-T--G-A-A----T-T--AA---G-------------------------------------------------------TATT----TA--ATTAT-ACACCCCTGCATGTATAAAC--TT-CTG----AGC-TTTTCAAATTAA-G-C--T-CT-C-A-T--TTGT--A-G-C----TG-ATAT----TC-C---C---A------AT-AAC----TTTTT----------------AG
gi|13 : -----TA------GAGGGTT-ACAGG--TA--G-C-A-T-AGTTT-G---------ACAATGAGAGACACAATGA-----T------------------TT-CTGCTT-C-TACC--TGG-AC-AGAATA--A-CAG-----G-A----A-GCTG--AGCACTGT-GATC-TAGC----A---AATAGATA-TAAACTGGG--T--GA--TA----AA-CAATG--T-GTTGCA---GAA--G---AG------------------------------------ATTA-C-TT--GGG-GATTATAGAC-AAA--GTG-GGCA-AGT-GTT---AAT-TAACAT-A
gi|14 : atatatacCAGGGTTGG-GCGGTTAAAAC---------C-ACCC--------------------GG-TT-TTAACCAGT-----------------------------CA--A-AATTC-CCAAAA--TG-GTCA--A--T-A-------C-CA----------GTCAACT--GAAATTC----A-----A-AGTG-T--CCTT--T--T-T-CCTA-T-TTT-----AAA--T--ATTT--CAG---GC--AAA--AATAAAGATATATTT-A------------A----CA---G-A-T--------T-T-GT-AGT-C--T---T-CAAA--A-ATC-A-A--TC-TTA-T-CAC-A-AA--G-CA-T-G--T-GTT--TATA--GA-T--G-A-A----T-taccagccatgaaaactgtaaagatcacccaca
gi|15 : CAGGGTTGG-GCGGTTAAAAC---------C-GCCCCCGG---TTT-A-AACCAGCGG-TT-TTAACCGATT-A-TA-A----C-CGCC-CCGGGCG-GTCA--A-TACTC-CCAAAT--TG-A-----------------------------------AATTT--AAATTC-----------------T--CC-T----------------TTT-----AAA--TACATTT--CATGCCGC--AAA--AATAAAGATATAT-T-A------------A----TA---A-A-T--------T-T-AT-AGT-CTTT---T-CAAA--C-ATC-A-A--CT-TTGTT--AC-A-AA--G-CA-T-G--T-Agcaaagatt
gi|16 : AAATAA-ATAG--GGACTT--GACACC-CTG---CTCGTTGCTCTA----GG-AC-AAAAG-T-GAACAG-TTTT-T-GATTTTTACA--G-TG-AA-C-AT---TTTC-CC-CAATT-TAA--CA--AAATCTGAT--GC-ATTA-T-TTTAATATTAATAA---TTTCATTTG----T--ATATAA-G--TG---TT-GTAAG--------TGCATGTTT--AGAAT-----T--AT-TT-A------T-CATCAA-T-A-AT--GAACT-CT-TTAA
gi|17 : TTGCAGT-----TT-A------C-CAT--A-T-A-AT--GG-CC-ATTTTAGC---A--TTT-GAAAT-AACC-CATA-ATG---GACTATATA-A-T-GAT-CG---AG-T--TTCAA-T-G--ACCA--ATC-----A---ATTTTCAAGTA--CT-------GACCA-G-AGT-G-ACCG-TTTT-AATACCAGTAATTTGACC--A-CGC--AACCCC---AGT-C-AA-TA-C------------TAGT--ATAT--GA---CCA----GTTTTTT--G-CCAAC
gi|18 : acACAGT--AT-TT-A------T-CATC-A-T-A-AT--GAACT-C-GTTATC---A--TTT-CAA--TAACC-AATA-ATAT-AGA----A-----------------A-TCTT-CAA-TTG--ACCACAATCN--NNN---NNNNNNNNNNN--NNNN-----NNNNN-NNNNNNN-NNNNNNNNN-NN--NNNNNN--NNNNNN--N-C-C--GGCCC----GGT-C-AA-TA-C------------TAGT--AT-T--GA---CCG----CTTTTTT--G-CCAACcc
gi|19 : CAGGGTTGG-GCGGT-AAAAC---------C-GTGTCC-----------------TGG-TT-TTAACCGATT-A-TA-G----TGCGCC-CG---AG-ATCA--A-TAATC-GCA------G-G-----A--T-A-GT---GT-CAAGT-AC-T-GGT-AATATG-AAATTT----------A-AGTG-T--CT-T--T--T-T-CCT--T-TTT-------A--TA---TT--CAT---GC--AAACGAA------------A-A------------G----TA---A-G-T--------T-T-CT-Acct
gi|2 : T-TTAACTGGTT-AATA-AACACCGCGCC-C----TG-GTCA--A-TGC---CAAAAA--TG-GTCA-----T-ACGT--G---CA--T-AC-T-GGTACATTTGAAAGT------A-----A-AGTG-T--CC-TG-T--T-T-CCAA-T-GTT-----TAA--TACATTG--CAT---GC--AAA--AA------------T-A------------A----TA---G-AAT--------T-T-AT-AGT-CTCC---T-CAAA--A-AAT-A-G--CTCTTACT-TAC-A-----T-CA-T-A--T-ATT-----A--GAAT--C-A-A----T-TTAAGT--AC------A-T------AATGC------A-----------A----------------ATT----TA--AT--T-ACATCCCAGTAG-T--GAAC--TTGCTG----GAC-CTTTCA----AGCG-C--T-CT-C-AGC--TTCT--A-G-C---GTG-AT-------C-C---C---ATGTCT-AT-AAC----TTTTT----------------AGTTTGACTA-A-GGGC-A--AC-TGTTT-CAAT-GGC--AATACA-T-GAGGAT-A-GTT----AGGCACACTTATT-CAGA-G-AC--A-ATTCC-GC-ATGGGGTT-AAGAT-AT-AA-TA-T-ATTGATGGCTTAAT---GGAATCTA-TCA-G-GTCAAC-AGTTGA-T-CTATCAGACTTACC-AGA----C-ATTGT-CAC----------------GAGGGGTTACAG---TA--GGTTA-TTAGTTT-G----------CAA--------------A-----TGAAGACATAAAATAATTATC-CTGCTT-TATACCAGTGG-ACCAAAATA--AACAGA-TA-G-AT-CCA-G-TG--AGCA-TGT-GATC-TA-TAAA-AC--AATAG----TAAACTGGGTGTCAGA--TA----AAACA-----T-GTTGCATCAAAA--GAC-AGTG-A-TCTAAATGGA-------A--CCAAGTTCA-TAT-A-C-TT--GGG-GTA--CAGGT-ATA--ATG-G-CA-AGT-G-T---TATATAACAT-TACC-AAG--T--CAG-----G--AATG-CAATTGTTGT-TGT--TAT-GTT-ATGA-AAAACAGTCCACCCACCAACTG-ACACAC--AATGT--GAC-CAT-A--GGTA-CCT-GAT-AA-TACTCTT-CCAAT-A--ATG-ACTGGT--------TTGGAAAGA--T-ATAGGG--CTTTCAAACT--TATAGGATAATTAT-AGAAATAA--TAG--GGACTTG--ACACCTCTT---CTCTT-G--CTA----TG-AC-GAAAGTT-AAATAG-TTTA-T-AATTTTTTCA--G-TG-AG-C-AT---TTTC-CC-CAAT--GAA--TA--AAATCT-AT--GC-ATTA-T-T-----------AA---TCTCACTTG----C--ATGTAA-G--TG-T-TT--TAAGT--------GCATGTT---AGAATTACAGT--ATATT-A------T-CATC-A-T-A-AT--GAACT-GT-TTAAC---A--TTT-AAA--TAACC-AATA-ATAT-AGA----ATA-A-T-GAC-CATTAAA-TC-TTCAA-TTG--ACCACAATCGA-CCAGT-ATTGACCACTG----TT-----GACCA-GTAA-CG-A-CGGTTTT-AA--CCAGTA--TTGACC--A-C-C--ACCTCCACGGGT-CAAA-TA-T--------------GT--A--T--GACACCCGA---C--TTTT--G-CCAACaaaacatttt
gi|20 : tggcattaaaaataccgccaactgagtttagaaaacctatcagata---A--TTT-AAA-CTAACC-AATA-ACAT-AGA----ATA-A-T-GAC-CATTAAA-TCTT-CAA-TTG--ACCACAATCN--NNN---NNNNNNNNNNN--NNNN-----NNNNN-NNNNNNN-NNNNNNNNN-NN--NNNNNN--NNNNNN--N-C-C--GGCCC----GGT-C-AT-TA-C------------TAGT--AT-T--GA---CCT----TTTTTTT--G-CCAACcc
gi|21 : tTCAAC---A--TTT-AAA--TAACC-AATA-ACAA-ACT----GTA-A-T-GAC-CAATCAA-T-TTTCAA-TCA--ACCA-----G--T-----ATTGACCACTA---------------------TTG-ACAGGTTTT-AA---CAATA--TTGACC--A-C-C--GGCCC----GGT-C-AA-TA-C------------TAGT--AT-T--GA---CCAGGTTTTTTTTT--G-CCAACcct
gi|22 : ttataaacttgccactAG--GGACTTG--ACACC-CTG---TTCTTTG--CGA----GG-TC-AAAAGTT-AAACAG-TTTT-T---TTTTTACA--G-TG-AG-C-AT---TTTC-CC-AAA----AA--CA--AAATCTTAT--GC-ATTA-T-T----------TAA---TTTTATTTGCACAC--ATGTAA-G--TG---TT-GTAAG--------TGCATGTTT--AG
gi|23 : G-GACA-AGT-G-TT--AAT-TAACAT-ACCT-AAGGTT--CAG-----G--GATGGCAATTGT-GT--GTATTATTGTT-ATGA-AAA-CA--TTACCCAC--ATTT-GCACACC-AATGT--GAT-CATTA--GGAA-CCC-GATGAA-TACTCTT-C-AAT-A--ATG-ACTTG
gi|24 : A--------------A-----T------------------TT-CTGCTT--ACGCC--TGG-AC-AGAAAA--A-CAGG-T---------A-GCCG--AACAC--T-GATC-TAGTAAATACCCAATACATA-TACAATG---------------------------T-GTTACA---AAA--GAC-AGTG-C-TT---ATGGA-------G--C-AAG---A-GATT
gi|25 : gacaatgagagacaaaatATA-ATAA-AGACTCAATA-A-T-GAC-TAATAAA-T-TTTCAA-TT---------------------ATTGAACACTA--------------------GT-G-ACCGGTTTT-AA--CCAGTA--ATGACC--A-C-T--GGCAG----AAT-C-AA-TA-C------------TAGT--AT-T--GA---CCA----CTTTTTT--G-CCAAC
gi|26 : TGACCAATAAATTTTCAATCAACTA-TTA-TTG-GCCAGTTTT-AA--CCAGTA--TTGACC--A-C-T--TGCCC----TGT-C-AA-TA-CTACTATTGACTCTAGT--AT-T--GA---CCA----CTTTTTT--G-CCAACcct
gi|27 : aCAGGGCTGG-GCGGTCAAAACTGTCCCAACC-GTCCCCGG---TTTTA-A-CCAGCAG-TT-TTAACCGGTT-G-TA-A----C-CGCC-CCG--CG-GTGA--A-CACTC-CCAAAA--TG-GTCA--A--T-A-GT--GGT-Ccctg
gi|28 : CAGGGTTGG-GCGGTTAAAAC---------C-ACTCCCGGT--TTT-A-A-CCAGCAG-TT-TTAACTG--------------C---CC-C----CA-GTCA--A-TGCTC-CCAAAA--TG-GTCA--A--T----T--G-------------------------AAATAT----A-----A-AGTG-T--CC-T--T--T-T-
gi|29 : AA--TACATTT--CAT---GC--AAA--AA------------T-A------------A-----A---G-A-T--------T-A-ATGAATACATA---T---AT--A-CTC-A-G--CT-TTATT--AC-A-AA--G-CA-T-G--T-ATTAATATA--GA-T--C-A-A----T-T--AAT--G-------A-TTTTA--AAT--------A-----------AT--------------TAt
gi|3 : AGGGTTGG-GCGGTTAAAAC---------C-ACCCCCGGGTTTTT-ATA-CGAGCGG-TT-T-AACCGGTT-A-TATA----C-CGTCTC----CGCGTCAC-A-TACTCTCCAAAA--TG-GTCA--A--T---GT--GGT-CAA-TTAC-T-GGT-AATTTGAGAATTT----A-----ATAGTG-TTGCC-TGTTGGT-T-CCGA-TATTT-----TAA--TACATTT--CAT---GC--AAA--AA------------T-G------------AGAAGTATT-A-A-T--------T-A-AT-AGT--TTA---T-CACT-----TC-A-GA-CT-TTATT--AC-A-AA--G-CA-TTGC-T-ATT--CATA--GA-T--CCA-A----T-T--AAT--GTTTTTAAA-T------AATTATACTGAA-----------ATGT------------CATT----TATTGT--T-ATACCCCGGTAA-T---GAC--TT-CTG----ACC-TTTTTA----GA-G-C--G-CT-C-A-T--TTCT--AAG-C---TGG-ACATATCACC-C---T---AT---T-TT-AAC----TTTTTTT--------------AGTA-----AGATCGGC-A--AC-TGTTT------G-C--AATAC--T-GAA--T-A-GTACTATAG---CACTT-TTTCAGATG-GCCAA-ATTCTTGC-ATGT--TT-ATAGT-AT-AA-------TTG----C---------A---CTACT-GTG-GTTGAC-A--T-A-T-CT-TTAC---TACT-ATATC--C-AT-GT--ACATG-----TATACTTAAAAGGTT-ACAGG--TG--AGC-A-TTAGTTT-GCAATGAGAGACAA--------------AATAA-T------------------TT-CTGCTT--ATACC--TGG-ACCAAAATACGA-CA---TACG-ATTC-A-GCTG--AGCACTGTTGATC-TAGTAAA-------TAAATA-TAA-CTGGGT-T--GGATTA----AA-CAATTTGT-GTTGCA---AA---GAC-A------------TAGT-------G--C-AG------TATTA-C-TT--GGA------CAGGT--TA--ATATGACACAGT-G-TTGTAAT-TA-CATTACCCTAGGGTC--TAACCTGTG--GATGGCAGT-GT-GT-C-TGTTATTTGT-ATGA-AAAACA--T----CAC--ACC--ACACA-C-AAT-T--GATGCATTA--GACA-C--------------CTT-C-AGT-AGTATG-AC-TGT--------ATGGAGA-GACT-ATGGGAA-C
gi|3 : TAGACA-CCTTCAG--T--AGTATGACTGT-AT-GGAGAGACTATGG--GAACGTC-GACCCG-CTGACTCTCTTTGT-CTA----TGCAC-AAAAGTTTAAACAG-TTTG-TTGATTTTCACATGG-TG-AG-C-ATGAGTTTC-CCGCATTTTGAACTTATCAAATCTTGTAGGC-ATTA-T-T----------TAA---TTTC-TTTT----C--ATGTAA-G--TG-TACT-G-AAGT-------CA-ATGTTT--A-AATTACAGT--AA-AT-AATACACT-CAAC-AGT-AGAT--GAACTGCT-TTAAC---AAATTA-AAAATAAGCT-CATATATAT-ATA----ATA-A-TTGAC-CATTAAA-TTCTTCAAGTTG--ACCACTATCG--CCA---GTTAATGACCG--TATT-----GACCATGTGGG-G-ACCG-TTTT-AA--CCAGTA--T-GACC--AAC-T--GACCC----GGT-CCAA-TA-C------------TAGTACAT-T--GA---CCG----CTTTTTT--G-CCAACgtcgacccgctgactctctttgtctatgcacaaaagtttaaacagtttgttgattttcacatggtgagcatgagtttcccgcattttgaacttatcaaatcttgtaggcattatttaatttcttttcatgtaagtgtactgaagtcaatgtttaaattacagtaaataatacactcaacagtagatgaactgctttaacaaattaaaaataagctcatatatatataataattgaccattaaattcttcaagttgaccactatcgccagttaatgaccgtattgaccatgtggggaccgttttaaccagtatgaccaactgacccggtccaatactagtacattgaccgcttttttgccaacc
gi|30 : agggttgggcggttaaaaccacccccgggtttttatacgagcggtttaaccggttatataccgtctccgcgtcacatactctccaaaatggtcaatgtggtcaattactggtaatttgagaatttaatagtgttgcctgttggttccgatattttaatacatttcatgcaaaaatgagaagtattaattaatagtttatcacttcagactttattacaaagcattgctattcatagatccaattaatgtttttaaataattatactgaaatgtcatttattgttataccccggtaatgacttctgacctttttagagcgctcatttctaagctggacatatcaccctattttaactttttttagtaagatcggcaactgtttgcaatactgaatagtactatagcactttttcagatggccaaattcttgcatgtttatagtataattgcactactgtggttgacatatctttactactatatccatgtacatgtatacttaaaaggttacaggtgagcattagtttgcaatgagagacaaaataatttctgcttatacctggaccaaaatacgacatacgattcagctgagcactgttgatctagtaaataaatataactgggttggattaaacaatttgtgttgcaaagacatagtgcagtattacttggacaggttaatatgacacagtgttgtaattacattaccctagggtctaacctgtggatggcagtgtgtctgttatttgtatgaaaaacatcacaccacacacaattgatgcatAATCG--ACC---ATTAANNNNNN--NNNN-----NNNNN-NNNNNNN-NNNNNNNNN-NN--NNNNNN--NNNNNN--N-C-C--AGCCA----GGT-C-AG-TA-C------------TAGT--AA-T--GA---CCA----CTTTTTT--G-CCAACc
gi|31 : -----T-GTTGCA---AAA--GAC-AGTG-C-TT---ATGGA-------T--C-AAA---A-GATTA-C-TT--GGG-GA---CAGGT-ACA--TTT-AACA-TGT-GTT---AAT-TAACAT-ACCC-Ac
gi|32 : atg--CT-T--T--T-T-CTTA-T-TTT-----A----TACATTT--CAT---GC--TAA--AA------------T-ATAGATACATTTGA----TA---G-A-T--------T-T-AT-AGT-CTT
gi|33 : GTT-A-TG-A----T-CGCC-C----CG-GTCA--A-TACTC-CCAAAG--Taattaa
gi|35 : gttA-ATAG--GGACTTG--ACACC-CTG---CTCTTTG--CTC----GG-AC-AAAacatgt
gi|36 : AGGGTTGG-GCAGTTAAAAC---------C-ATCCCCGG---TTT-A-
gi|4 : AGGGTTGG-GCGGTTAAAAC---------CCGCCTCCG----TTT-A---CCAGCGG-TTGTTAACCGCTT-A----A----C-CGCC-C----CG-GTCA--A-TACTC-CCAAAA--CGTGTCA--A--T-A-GTTTGGT-CAA-T-C--T-GGTCTAATTGAAA-TTT----A-----A-AGTG-C--TC-C--T--T-T-CCAA-T-TTT-----AAA--TACATTTTTCATT--GC--AAA--AAA-----------T-A------------A----TA---GGA-T--------T-TCAT-AAT-CTTT---T-CAAA--AGAGT-A-G--CT-T-ATC-AGC-A-AATGG-CA---G--T-ATTCTTTTT--GA-TTCC-A-AATTAT-T--AAT--G-------A-T------AAT--------A-----------AT--------------CATT----TA--AT--T-ACACCCCAGTAT-T--GAAC--TTTCTG----ACC-TTTTCA----AA-GAC--T-CTTC-A-TCATTCT--G-G-CGGATTG-AT-C----CC-C---T---AA---TTATTAAC----TTTTTT---------------AGTT-----A-ATGGGC-A--GCCTGTTTTCAAT-C-A--AATAC--T-GA---TTA-GCT----AG---CACTT----CAGA-GGAC--A-ATT-CTGC-ATGT--TTTAAGAT-AT-AAATA-TCATTG----CT-AATTTTGA---CTACTTATG-G-CAAC-A--T-A-T-CT-TCAT---TACT-ATA----CCAT-GT--ACATG-----TA------GACGGGTTACAGGACTA--TAT-A-T--GTTT-G---------ACAATGAGAGAAAAAAA-A-----T------------------TTTCTGCTT--ATAC---TGG-AC-CAAATAT-A-CAGC-TA-GGAT-C-A-CTTG--AGCACTGT-GATC-TATTAAA-------TAAATACTAAACTCGGT----GA--TA----AAACA-----TTGTTGCA---AAAA-GAC-AGTGTC-TCCAAATGGGAGTGTCGG--C-GAGGAGA-TATTA-CCTT--GGGTG----CAGGT-ATA--ATG-GACA-AG--G-T---AAT-TAACAT-ACCC-AAGGTC--CAG-----G--GATGGCAATTGT-GT--GTGTTATTGTTTATGGCAAAACA--TCACCCAT--ACTG-ACACACA-AATGT--GAT-CATTA--GGTA-C-T-GATGAA-TACCCTT-C-----A--AT----------------------A-A--T------GA-CTT----------GTAGGAAAAT-AT-AG-------------GGACTTTTGACACC-CTG---CTCTTTG---TA----GG-AC-AAAAATT-AAATAG-TTTAGT-AATTTTTACAC-G-TG-AGGC-AT---TTTCACC-CAAT--GAA--TA--AA-TCTTAT--GC-ATTA-TGT----------TAA---TCTCATTTG----CCAATGTAATGCTTG-T-TT-GCAAGT--------GCCTGTCTTAAGAATTATAGT--AT-TTTA------TTCATC-T-TTA-ATCAGAACT-CCGT-AAC---A--TTTTAAAAATAACCCAATA-ATATGAGA----ATATG-T-GATTCATTAAGCTTTTTCAA-TTGGCACCACAATCGAGCCAGATATTGACCACT----TAT-----GACCA-GTA-TTG-ACTGGTTTT-AA--CCATTA--TTGACCCAA-C-C--GGCCC-----GT-C-AATTA-C------------TAGTC-AT-TGGGA---CCG----CTTTTTt
gi|5 : CAGGGTTGG--CGGT-AAAAC-----------GCCCCCG----TTT-A-A-CCAGCGG-TT-TTAACCGGTTTA-TA-A----C-CGCC-C----CG-GTCA--A-TACTC-CCAAAA--TG-GTCA--A----A-GT--GGT-CAAAT-A--T-GGTCAATTTGAAAATTTTTACA-----A-AGTG-T--CC-T--T--T-T-CCAA-T-TTT-----AAA--TACATTT--CATAT-GC--AAA--AA------------T-A------------A----TA---G-A-T--------T-T-AT-AGT-CTTT---G-CAAA--A-ATC-A-T--CT-TTATT-AAC-A-AA--G-CA-T-G--T-ATT--TATTTTGA-T--C-ATA----T-T--AAT--G-------A-T------AAT--------A-----------AT--------------CATT----TA--AT----ACACCC-AGTAT-T-TGAAC--TGATTG----ACC-TTTTCA----AA-G-C--TGCT-C-G-T--TTCT--A-G-C---TTG-ATTT----CC-C---T---AA---T-AT-AAC----TTTTT----------------AGTT-----A-ATGGGCCA--AC-TTTTT-CAATTG-CCGAATAC--T-GA---T-AAGTA----AG---CACTT-TT-CAGA---AC--A----TTTGC-ATGT--TT-AAGAT-A--AAATA-T-AT-G---GCT-AAT---GA---CTACTCATG-GTCAAC-A--T-A-TGCT-TTAG---TACT-ATA----C-AT-GT-TACATG-----TA------GAGGTTTTACAGG--TA--TGT-A-T-AGTTT-G---------ACAA--------------A-----T------------------TT-C-GCTT-TATACC--TGG-AC-AAAATA--A-CAGC-TA-G-AT-C-A-GCTG--AGCACTGT-A--C-TAGTAAA-AT--AATAAATA-TAAACTGGGT-TT-GA--TA----AA-CA-----T-GTTGCA---AAA--GAC-AGTG-CCTCTAAATGGA-------G--C-AAG---A-TATTA-T-TTTTGGGTGT---CAAGTTATA--ATG-GACA-AGT-G-T---AAT-TAACAT-ACCC-AAG--T--CAG-----G--GATGGCAATTGT-GTCTGTGTTATTGTT-ATGA-AGAACA--TCACCCAC--ACCG-ACACACCCAATGG--GAT-CATTATCGGTA-CCTTGATGAA-TACTCTTTC-AATTA--ATG-ACTTGTTTTTTTCTATGGAAA-A--CCATAGGGAACTTTCAA-GT--TTTAGGAAAAT-AT-AGAAATAA-ATAG--GGACTTG-GACACC-CTG---CTTTTTG--CTA----GG-ACGAAAAGTT-AGATAG-TTTA-T-AATTTTTACA--GGTG-AG-C-AT---TT-C-CC-CAATT-GAA--TA--AAATCT-AT--GCCATTA-T-T----------TAA---TCTCATT-G----A--A-GTAA-G--TG-T-TTTGGAAGT-------TGCATGTTT--AGAAT-ACAG---AT-TT-A------T-CATC-A---A-AT--GAACT-CTGTTAAC---A--TTT-AAAATTGCCC-AA-A-ATAT-AGT----ATA-A-TTGAC-CATTAAA-TCTTTCAA-TT---ACCACAATCG--CCG---ATTGACCACTA--TTTT-----GACCA-GTAGTTG-ACCGGTTTT-AA--CCAGTA--TTGACC--A-C-C--GGCCG----CGT-C-AA-TA-C------------TAGT--AT-T--GA---CCG----CTTTTTT--GCCCAAC
gi|6 : -T--CT-T--T--T-C-CCAA-T-TTT-----AAA--TACATTT--CAT---GC--AAA--AA------------T-A------------A----TA---G-A-T--------T-T-AT-AGT-CTTT---TTCAAA--A-ATC-AAG--CC-TTATT-TAC-A-AA--GGTA-T-G--T-ATT--ATTT--GA-T--C-A-AC---T-T--AAT--G-------A-T------AAT--------A-----------AT--------------CATT----TA--AT--T-ACACCCCAGTAT----GAAC--TT-CTG----ACC-TTTTCA----AA-G-C--T-CT-C-A-T--TTCT--A-G-C---T-G-ATAT----CC-CC--T---AT---T-AT-AAC----TTTT-----------------AATT-----A-ATGGGC-A--AC-TGTTT-CAAT-G-C--AATAC--TTGA---T-A-GTA-----G---CACTT-TT-CAGA-G-AC--A-ATTCATGC-ATGT--T--AAGATTATTAAATA-T-ATTG---GCT-AATT--GA---CTACTTATGTGTCAAC-A--T-A-T-CT-T-AG---TACT-ATA----CCAT-GT--ACATG-----TA------GAGGGTT-ACAG---TA--GAT-A-T-AGTTT-G---------ACAATGAGAGACAAAATAA-----T------------------TT-CTGCTTATGTACC--TGG-AC-AAAATA--A-CAGC-TA-G-AT-C-A-GCTGT-AGCACTGT-GATC-TAGTAAA-------TAAATA-TAAACTGGGT----GA--TATA--AA-CA-----T-GTTGCA---AAA--GAC-AGTG-C-TCTAAGTGGA-------G--C-AAG---A-TATTA-C-TT--GGG-T----CATGT-ATA--A-G-GACA-AGT-GTT---AAT-TAACAT-ACCC-AAGGTC--CAT-----G--GATGGCAATTGT-A--TGTG-TATT-TT-ATG--AAAACA--TCACCCACA-ACTG-ACACACC-AATGT--GAT-CATTA--GGTA-CCT-GAAGAA-TACTCTT-C-AAT-A--ATG-ACTTGT--------ATGGAAA-A--T-ATA----------------------GAAA-----------TAA-ATAG--GGACTT--GACACC-CTG---CTCTTTG--CTA----GG-AC-AAAAGTT-AAATAGTTTTA-T-AATTTTTACA--G-TG-AG-C-AT---TTTC-CC-CAATT-GAA--TA--AAATCTTAT--GC-ATTA-T-T----------TAA---TCTCATTTG----C--ATGCAA-G--TG---TT-GTAAG--------TGCATGTTT--AGAATTACAGT--AT-TT-A------T-CAAC-A-T-A-AT--GAACT-C-GTTAAC---A--TTT-AAAA-TAACC-AATA-ATGT-AGA----ATA-A-T-GAC-CATTAAA-TC-TTCAA-TTG--ACCACAATCN--NNN---NNNNNNNNNNN--NNNN-----NNNNN-NNNNNNN-NNNNNNNNN-NN--NNNNNN--NNNNNN--N-C-C--GGCCC----GGT-C-AA-TA-C------------TAGT--AT-T--GA---CCG----C-TTTTT--G-CCAAC
gi|7 : gtCAGGGTTGG-GAGATTAAAAC---------C-ATCCCTGG---TTT-----------------TCACCAGTC----------------------------CA--A-AACTC-CCAAAA------------------GT--GGTTCAA-T-A--CCGGTCAATT-GAAA--TT----ATCACTA-ACTGCT--CC-T--T--T-TTCCTA-T-TTT-----TA---TATATTT--CAT---CA--AAA--AA------------T-A------------A----AACAGG-A-T--------T-T-GT--GT-C-TT---T-CAAA--A-ATC-A-AATCT-TTA-T-CAC-A-AA--G-CA-T-AT-T-GGT--TATA--GA-T--G-A-A----TGT--AAT--G-------A-TAAACAAAAT--------AAGAAATGAAATAT--------------CATT----TA--AT--T---------GTA----TGAAC--TT-C-G----ACCTTTTTCA----AG-G-CTAT-CT-CTA-T--TTCT--A-G-----TTGCATAT----TT-C---T----C---T-AT-AAC----TTTTTAGTATGTCGTTTTTTGAGTT-----ATATAGGCGA--AC-TATTT-TAAG-G-C--AATACTTT-GC---T-A-GTA----A----CAGCT-TA-CAGA-G-AC--A-ATTT-TGCAAAGT--AT-AAGAT-AT-cc
gi|7 : T-ATA----T-GT-GTATACTTG------A------TAGGAGTTACAGG--TA--G-C-A-T-AGTTTTGTCATTAT--GCAA--------------AGACGTT------------------TT-TTGCTG-TATATC--TTG-ATTGGAGTA--AACGGG-TA--------A-GTTG--AACACTGT-GATCGTAGTAGA-A-----TAAATA-TAAACTGGGT----GA--TATTAAAA-CAATGT-T-GTTGCA---AAA--GACCAGTG-C-TT---ATGGA-------GATC-AAA---AAGATTAAT-TT--GGG-GA---CAGGT-ACA--ATG-GACA-TGT-G-T---TAA-TAACAT-ACCA-AGGGTCCTCAG-----G--GA-GGCGAttagaatggtacatttttaaaccattcgtaatctgtcacttctgtggtccacaacctatattgctctcagtttacgtattatccgatttgtactgatgtacatggtatatgtgtatacttgataggagttacaggtagcatagttttgtcattatgcaaagacgttttttgctgtatatcttgattggagtaaacgggtaagttgaacactgtgatcgtagtagaataaatataaactgggtgatattaaaacaatgttgttgcaaaagaccagtgcttatggagatcaaaaagattaatttggggacaggtacaatggacatgtgttaataacataccaagggtcctcagggaggcga
gi|8 : cagggttgggagattaaaaccatccctggttttcaccagtccaaaactcccaaaagtggttcaataccggtcaattgaaattatcactaactgctcctttttcctatttttatatatttcatcaaaaaataaaacaggatttgtgtctttcaaaaatcaaatctttatcacaaagcatattggttatagatgaatgtaatgataaacaaaataagaaatgaaatatcatttaattgtatgaacttcgacctttttcaaggctatctctatttctagttgcatatttctctataactttttagtatgtcgttttttgagttatataggcgaactattttaaggcaatactttgctagtaacagcttacagagacaattttgcaaagtataagatatttagaatggtacatttttaaaccattcgtaatctgtcacttctgtggtccacaacctatattgctctcagtttacgtattatccgatttgtactgatgtacatggA-ATAGAAGGATTTG--ACACC-CTG---CTCTTTG--CTACCTAGA-AC-AAAAGTT-AAACAG-TTTT-T-GATTTTTACA--G-TC-AG-C-AT---TTTC-CC-CACTT-TAA--GA--AAATCTTAT--GC-ATTA-T-T----------TAA---TTTAATTTG----C--ATGTAA-G--TG---TT-GTAAGTCATAAAGTGCATGTTT--AGAATTACAGT--AT-TT-A------T-CATC-A-T-A-AT--GAA-T-CT-TTAA-----------AAAATAAACC-AGTA-ATAT-AGA----ATA-A-T-GAC-CAATAAA---TTTCAA-TTG--ACCAT--T----------ATTGACCACTA---------------------TTG-ACTGGTTTT-AA--CCCGTA--TTGACC--A-C-C--AGCCC----GGT-C-AA-TA-C------------TAGT--
gi|9 : ag-T--T--T-T-CCTA-T-TTTT----AAA--TATATTT--CAT---GC--AAA--AA------------T-A------------A-----A---G-A-TGCATTTAATAT-AT-AGT-CTTT---T-CAAA--A-AAC-G-A--CT-TTATT--AC-A-AA--G-CA-T-G--T-ATT--TATA--GA-T--C-A-A----T-T--AAT--G-------A-TTTGA--AAT--------A-----------AT--------------TAT
gi|9 : cat-ATAT----CC-T---TTTTAG---T-AT-GACGTATTTCTTG---------------AGTT-----A-ATGGGC-A--AC-TGTTT-TAAT-G-C--AATAC--T-GA---T-A-GTATTC-AG---CACTT-TA-CAGA-G-AC--A-A-TTCTGC-ATGA--TT-AA-------AGATA---AT-----------T---GA---CTAC-TGTG-GCCGAC-A--T-A-T-CT-TCAG---TACT-ATAATACC-AT-G--TACATatgaaatatcctttttagtatgacgtatttcttgagttaatgggcaactgttttaatgcaatactgatagtattcagcactttacagagacaattctgcatgattaaagataattgactactgtggccgacatatcttcagtactataataccatgtacat
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|34 ): ATGTAAATTTATATGGAATTCATATAATAATATAGAAATTT
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 111111111 222222222222 1111111111111 11111 555555555555555555555555555555555555555 1111111111 111111 111 33333333333333333333333333333333333333333333333333 1111 11 11 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555 222222 1 1111 111111 1111111 222222222222 1111 3333333333333333 1111111 11 11 11111 222222222 22 222222222222 1 222222 222 222222 111111 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 11 111111111111 11 3333333 333333333333333333333333 11111111 222222222222222222 333333 1111 11111 111 11 777777777777777777777777777777777777777777777 222 11 1111111111 1111111 222 33333333 111111 11 222 1111 11 222222222 44444444444444444444444 111111111111
lowQualScore : 3 0 333333333 3 666666666666 3 3 6666666666666 2 22222 2 66 2 2 33 3 0 444444444444444444444444444444444444444 0 6666666666 3 3 33 2 99 33 2 2 2 2 2 333333 33 0 33 111 33 33 33333333333333333333333333333333333333333333333333 333 2 2 3 66666 5555 3 0000 3 44 3 3 44 3 2 2 99 2 88 555 3 11 3 3 9999 3 44 44 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999 8888 55 7777 000000 777 2 2222 8 8888 4 8 55 4 4 000000 99 7777777 3 2 7777 3 333333333333 3 3 2222 8888888888888888 3333333 8 66 4 4 4 4 00 00 4 11111 4 4 222222222 4 4 2 4 4 66 22 4 88888 9999 111111111111 5 777 5 0 66 5 2 3 66 5 5 5 5 6 888 4 555555 4 000 333333 9 7 777 555555 8 4 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 4 88 66 4 4 8 00 8 999999999999 4 00 4 4 1 4444444 1 4 555555555555555555555555 4 777 99 4 99999999 222222222222222222 44 4 4 66 999999 4 66 4 4 777 4 2222 4 4 44 88888 22222 66 3 5 777 1 0 5 55 77 33 777 66 77 5 0 77 5 666 22 5 5 5 5 77 5 1 666666666666666666666666666666666666666666666 6 6 8 55 444 4 777 99 8888 4 4 8 4 55 55 00 4 4 4 4 777 4 4 555 66 66 66 4 555 9999999999 777 6666666 4 66 111 4 0 33333333 1 66 4 55 4 4 111111 4 4 4 8 4 55 4 99 666 55 3 111 3 3 3 4444 3 3 6 3 3 3 33 3 44 77 888888888 0 88888888888888888888888 2 0 2 33 33 33 2 2 33 8888 2 5 2 2 444444444444 66 3 44 555 9999 44 3
lowQualScore : . . ......... . ............ . . ............. . ..... . .. . . .. . . ....................................... . .......... . . .. . .. .. . . . . . ...... .. . .. ... .. .. .................................................. ... . . . ..... .... . .... . .. . . .. . . . .. . .. ... . .. . . .... . .. .. ....................................................... .... .. .... ...... ... . .... . .... . . .. . . ...... .. ....... . . .... . ............ . . .... ................ ....... . .. . . . . .. .. . ..... . . ......... . . . . . .. .. . ..... .... ............ . ... . . .. . . . .. . . . . . ... . ...... . ... ...... . . ... ...... . . ................................................................ . .. .. . . . .. . ............ . .. . . . ....... . . ........................ . ... .. . ........ .................. .. . . .. ...... . .. . . ... . .... . . .. ..... ..... .. . . ... . . . .. .. .. ... .. .. . . .. . ... .. . . . . .. . . ............................................. . . . .. ... . ... .. .... . . . . .. .. .. . . . . ... . . ... .. .. .. . ... .......... ... ....... . .. ... . . ........ . .. . .. . . ...... . . . . . .. . .. ... .. . ... . . . .... . . . . . . .. . .. .. ......... . ....................... . . . .. .. .. . . .. .... . . . . ............ .. . .. ... .... .. .
lowQualScore : 3 4 333333333 3 666666666666 6 3 2222222222222 9 99999 9 88 9 9 99 1 4 000000000000000000000000000000000000000 4 6666666666 3 1 99 7 00 77 7 7 0 9 9 666666 77 5 77 000 77 77 77777777777777777777777777777777777777777777777777 000 7 9 4 22222 8888 1 4444 1 88 1 1 22 1 9 9 66 9 55 111 1 55 1 1 6666 1 66 66 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222 5555 55 8888 222222 000 0 5555 0 5555 0 0 55 0 0 666666 55 2222222 6 3 7777 6 111111111111 6 6 7777 5555555555555555 7777777 9 11 4 4 4 4 66 66 4 33333 4 4 444444444 4 4 3 4 4 11 44 4 11111 8888 888888888888 0 000 0 0 99 0 0 1 99 0 0 0 0 5 888 4 111111 4 888 999999 9 3 222 000000 9 4 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 4 00 11 4 4 9 66 9 222222222222 4 66 4 4 9 6666666 9 4 777777777777777777777777 0 000 55 0 11111111 666666666666666666 66 4 4 11 666666 4 11 0 0 000 0 5555 0 0 66 55555 55555 99 2 7 000 4 7 7 99 99 66 999 44 99 7 1 99 7 666 33 7 7 7 7 99 7 4 222222222222222222222222222222222222222222222 7 7 9 55 000 0 000 55 5555 0 0 9 4 88 99 66 4 4 4 4 888 4 4 444 11 11 11 4 333 4444444444 888 2222222 4 11 777 4 8 33333333 1 11 6 55 0 0 555555 0 0 0 0 0 55 0 77 444 00 6 444 6 3 3 2222 3 3 7 3 6 3 88 3 66 88 888888888 3 66666666666666666666666 9 3 9 99 99 99 9 9 99 9999 9 7 9 9 666666666666 88 1 22 444 6666 66 3
consensus : CAGGGTTGG-GCGGTTAAAAC---------C-GCCCCCGG---TTT-A-A-CCAGCGG-TT-TTAACCGGTT-A-TA-A----C-CGCC-C----CG-GTCA--A-TACTC-CCAAAA--TG-GTCA--A--T-A-GT--GGT-CAA-T-A--T-GGTCAATTTGAAAATTT----A-----A-AGTG-T--CC-T--T--T-T-CCNA-T-TTT-----AAA--TACATTT--CAT---GC--AAA--AA------------T-A------------A----TA---G-A-T--------T-T-AT-AGT-CTTT---T-CAAA--A-ATC-A-G--CT-TTATT-CAC-A-AA--G-CA-T-G--T-ATT--TATA--GA-T--C-A-A----T-T--AAT--G-------A-T------AAT--------A-----------AT--------------CATT----TA--AT--T-ACACCCCAGTAT---T-GAA---CTT-CTG----ACC-TTTTCA----AA-G-C--T-CT-C-A-T--TTCT--AG-C---TTG-ATAT----CC-C---T---AN---T-AT-AAC----TTTTT----------------AGTT-----A-ATGGGC-A--AC-TGTTT-CAAT-G-C--AATAC--T-G-A---T-A-GTA----AG---CAC-TT-TTCAGA-G-AC--AATTCCTGC-ATGT--TT-AAGAT-AT-AAATA-T-A-TTG---GCT-AATT--G-ACTACTTAT--G-GTCGACA--T-A-T-CT-TCAG---TACT-ATA----C-AT-GT-TACATG------TAGAGGGTTTACAGG--TA--GGC-A-T-AGTTT---------G-------ACA----A--------------A-----T------------------TT-CTGCTT-TATACC--TGG-A-C-AAAATA--A-CAGC-TA-G-A-TC-A-GCTG--AGCACTG-TGATC-TAGTAAA-A---AATAAATA-TAAACTGGGT-T--GA--TA----AA-CA-----T-GTTGCA---AAA--GAC-AGTG-C-TCTAAATGGA-------G--C-AAG---A-TATTA-C-TT--GGG-G----CAGGT-ATA--ATG-GACA-AG---T-G-T--AAT-TAACA-TACCC-AAGGTC--CAG-----G--GATGGCAATTGT-GT-TGTGTTATTGTT-ATGA-AAAACA--TCACCCAC--ACCG-ACACACC-AATGT--GAT-CATTA--GGTA-CCT-GATGAA-TACTCTT-C-AAT-A--ATG-ACTTGT--------ATGGAAA-A--T-ATAGGGA-CTTTCA-G--T---TGTAGGAAAAT-AT-AGAAATAA-ATAG--GGACTTG-GACACC-CTG---CTCTTTG--CTA----GG-AC-AAAAGTT-AAACAG-TTTA-T-AATTTTTACA--G-TG-AG-C-AT---TTTC-CC-CAATT-GAA--TA--AAATCTTAT--GC-ATTA-T-T----------TAA---TCTCATTTG----C--ATGTAA-G--TG-T-TT-GTAAGT-------TGCATGTTT--AGAATTACAGT--AT-TT-A------T-CATC-A-T-A-AT--GAACT-CTGTTAAC---A--TTT-AAAATTAACC-AATA-ATAT-AGA----ATA-A-T-GAC-CATTAAA-TCTTTCAA-TTG--ACCACAATCG--CCA---ATTGACCACTA--TTTT-----GACCA-GTAGTTG-ACCGGTTTT-AA--CCAGTA--TTGACC--A-C-C--GGCCC----GGT-C-AA-TA-C------------TAGT--AT-T--GA---CCG----CTTTTTT--G-CCAAC
Reference ( family-2007 ) : CAGGGTTGG-GCGGTTAAAAC---------C-GCCCCCGG---TTT-A-A-CCAGCGG-TT-TTAACCGGTT-A-TA-A----C-CGCC-C----CG-GTCA--A-TACTC-CCAAAA--TG-GTCA--A--T-A-GT--GGT-CAA-T-A--T-GGTCAATTTGAAAATTT----A-----A-AGTG-T--CC-T--T--T-T-CCNA-T-TTT-----AAA--TACATTT--CAT---GC--AAA--AA------------T-A------------A----TA---G-A-T--------T-T-AT-AGT-CTTT---T-CAAA--A-ATC-A-G--CT-TTATT-CAC-A-AA--G-CA-T-G--T-ATT--TATA--GA-T--C-A-A----T-T--AAT--G-------A-T------AAT--------A-----------AT--------------CATT----TA--AT--T-ACACCCCAGTAT---T-GAA---CTT-CTG----ACC-TTTTCA----AA-G-C--T-CT-C-A-T--TTCT--AG-C---TTG-ATAT----CC-C---T---AN---T-AT-AAC----TTTTT----------------AGTT-----A-ATGGGC-A--AC-TGTTT-CAAT-G-C--AATAC--T-G-A---T-A-GTA----AG---CAC-TT-TTCAGA-G-AC--AATTCCTGC-ATGT--TT-AAGAT-AT-AAATA-T-A-TTG---GCT-AATT--G-ACTACTTAT--G-GTCGACA--T-A-T-CT-TCAG---TACT-ATA----C-AT-GT-TACATG------TAGAGGGTTTACAGG--TA--GGC-A-T-AGTTT---------G-------ACA----A--------------A-----T------------------TT-CTGCTT-TATACC--TGG-A-C-AAAATA--A-CAGC-TA-G-A-TC-A-GCTG--AGCACTG-TGATC-TAGTAAA-A---AATAAATA-TAAACTGGGT-T--GA--TA----AA-CA-----T-GTTGCA---AAA--GAC-AGTG-C-TCTAAATGGA-------G--C-AAG---A-TATTA-C-TT--GGG-G----CAGGT-ATA--ATG-GACA-AG---T-G-T--AAT-TAACA-TACCC-AAGGTC--CAG-----G--GATGGCAATTGT-GT-TGTGTTATTGTT-ATGA-AAAACA--TCACCCAC--ACCG-ACACACC-AATGT--GAT-CATTA--GGTA-CCT-GATGAA-TACTCTT-C-AAT-A--ATG-ACTTGT--------ATGGAAA-A--T-ATAGGGA-CTTTCA-G--T---TGTAGGAAAAT-AT-AGAAATAA-ATAG--GGACTTG-GACACC-CTG---CTCTTTG--CTA----GG-AC-AAAAGTT-AAACAG-TTTA-T-AATTTTTACA--G-TG-AG-C-AT---TTTC-CC-CAATT-GAA--TA--AAATCTTAT--GC-ATTA-T-T----------TAA---TCTCATTTG----C--ATGTAA-G--TG-T-TT-GTAAGT-------TGCATGTTT--AGAATTACAGT--AT-TT-A------T-CATC-A-T-A-AT--GAACT-CTGTTAAC---A--TTT-AAAATTAACC-AATA-ATAT-AGA----ATA-A-T-GAC-CATTAAA-TCTTTCAA-TTG--ACCACAATCG--CCA---ATTGACCACTA--TTTT-----GACCA-GTAGTTG-ACCGGTTTT-AA--CCAGTA--TTGACC--A-C-C--GGCCC----GGT-C-AA-TA-C------------TAGT--AT-T--GA---CCG----CTTTTTT--G-CCAAC
gi|1 : GGGTTCGTGCG-TTAAAAC---------C-GCCCCAGG---TTT-----CCAGCGGCTT-TTAACCGGTT-A-TA-A----CTCGCC-G----CT-GTCA--ACTACTC-CAAAAAAATG-GTCA--A--T-A-GC--GGT-CAA-T-AGCT-GGTCAAGT-GAAAATTT----A-----A-AGTG-T--CC-TA-T--T-T-CCAA-T-TTT-----AAAAATACATT---CAT---GCTCAAA--AA------------TTA------------A----TA---G-T-T--------T-G-AT-AGT-CTTTGGTC-CAAA--A-ATCCA-G--CT-TTATT-CAC-AGAA--G-CAAT-G--TTATT--TATT--GA-TTAC-A-A----T-T--AAT--G-------A-T------AAT--------A-----------AT--------------CATT----TA--AT--TTACACCCCAGTAT-----GAA---CTT-CTGG---ACC-CTTTCA----AA-G-C--T-TG-C-A-CA-TTCT--AGGC---T---ATAT----CC-C---T---AT---T-AT-AAC----TTTTTT---------------AGTT-----A-ATGGGC-ACCAC-CGTTT-CAAT-G-CC-AATAC--T-G-A---T-A-GTA-----G---CAT-TT-TTCAGA-G-AC--ACATC--G--ATGT--GA-AAGAT-AT-AAATAAT-A-TTG---GCT-AATT--G-ACTAACTAT--G-GTCAACA--T-ACT-CT-TCAG---TACTTATA----CCAT-GT--ACATA------TAGAGGGTT-ACAGG--TA--GAT-AAT-AGTTT---------G-------ACA----A--------------A-----TGAGAGACAAAATAATT--TT-CTG--T-TATACC--TGGGA-C-AAAA-A--A-CAGCGTA-T-A-TC-ACACTGGGAGCACTG-TGAT--TAGTAAA-------TAA-TA-TAAA-TGGGT----GA--TA----AA-CA-----T-GTTGCA---AAAAAGAC-AGTG-C-TCTAAATGGA-------GG-C-AAA---A-TATTA-C-TT--TGA-TT---CAGGT-ATACGATT-CACA-AG---TTG-TTAAAT-TAACA-TACC--AAGG-C--CAG-----GATGA-GGCAATTGT-GT-GTTGTTATTGTT-ATGA-AAAACA--TCACCCAC--ACTGTACACACC-AATGCTGGAT-CATCA--GGTATCCT-GTGGAATTACTCTT-C-AAT-A--ATGAACTTGT--------AC-GAAA-A--T-ATAGGGA-CTTTCA-G--TTTATATAGGAAAAT-ATAAGAAATAATATAG--GGACTT--GACA-C-CTG---CTCTTTG--CTA----GG-AC-AAAAGTTAAAAAAG-TTTA-T-AATTTTTACA--T-TGTAG-CAAT---TTTC-CC-AAATT-GAA--AA--AAGTCTTAT--GC-ATTATT-T----------TAATATTCTCATTTG----CAAATGTAA----TGTT-TT-GTAAGTGA-----TG---GTTT--AGA---ACAGTTAAT-TT-A------T-CATC-A-TGA-AT--GAACT-C-GTTAATACAA--TTT-AAA--TAACC-AATA-ATAT-AGA----ATA-ATT-GAC-CATATAA-TC-TTCAA--TG--ACCAC-ATCG--ACAGT-ATTGACCA-TA---GTT-----GACCA-GTTATTGTACCGGTCTTGAA--CCAGTA---TGA-C--A-C-TGGGGCCC----GGTCC-AA-CACC------------TAGT--AT-T--GA---CAG----CTTTTTTTGG-CCAAC
gi|10 : -T-G--T-ATT--TATA--GA-T--C-A-A----T-T--AAT--G-------A-TTTGA--AAT--------A-----------ATTATATATGAAATACCATT----TA--AT--T-ATACCCCAGTAT-----AAG---CTT-CTG----ATC-TTTTCA----AA-G-C--T-CT-C-A-T---------------------AT----CC-C--------A---T-AT-AAC----TTTTT----------------AATT-----C-ATAGGC-A--AC-CGTTT-TAAT-G-C--AACAC--T-G-----------A----AG---TAC-TT-TACAGA-G-----AATT-CTGC-ATGT--TC-AAG---AT-AAATA-T-ATTTG---ATT-AATT--G-ACT----------------A--T-A-T-CT-T-AG---TACT-ATAC---C-AT-G--TACATGTATAA-TAGAGGG-TTACAGG--TACTAGC-A-T-AGTTT---------G-------ATA----A--------------cc
gi|11 : -A----C-CGCC-C-----G-GTCACAG-TACTC-CCAAAA--TG-GTCA--A--TTA-GT--GAT-C-------------CAAT--GGGAATT-----------A-CGTG-T--CC-T--T--C-T-CCCAAT-TTTCTAACAAA--TA-ATT---CAT---GC--AAA--AA------------T-A------------A----TA---G-ATT--------T-T-AT-AGT-C--T---T-CAAAGTA-ATC-A-A--GC-TTATTACACAA-AA--G-CA-T-GGAT-AGT--TATC--GA-TC-C-G-A----T-T--AATACG-------ATT------AAT--------A-----------A---------------CATTATCCTA--A-----AAACCCCAATGA---T-GAAACTTTT-CTGTGACACCATTTTCA----AA-GAC--T-TT-TGA-A--TTCTTCAG-C---GTG-ATAT----CCACCTAT---AC---T-AT-AAC----TTtgagagacaaaata
gi|12 : CAGGGTTGG-GCAATTAAA--------------------------------CCAGCGG-TT-TTAACCGGTT-A-TA-A----C-CG-C-C----CG-GTCA--A-TACTC-CCAAAG--TG-GTCATTAGCT-A-GT--GGT-C-A-T-A--------AATT--GAAATTT----A-----A-AATG-T--CC-T--T--TCT-CCTA-T-GTT-------A--TACATTT--CAT---GA--AAA--AA------------C-A------------A---------------------------------CTTT----------------------------TT-CAC-G-AA--G-CC-T-A--T-AAT--TATA--GA-T--G-A-A----T-T--AA---G-------------------------------------------------------TATT----TA--ATTAT-ACACCCCTGCATGTAT-AAA---CTT-CTG----AGC-TTTTCAAATTAA-G-C--T-CT-C-A-T--TTGT--AG-C----TG-ATAT----TC-C---C---A------AT-AAC----TTTTT----------------AG
gi|13 : ------TAGAGGGTT-ACAGG--TA--G-C-A-T-AGTTT---------G-------ACA----ATGAGAGACACAATGA-----T------------------TT-CTGCTT-C-TACC--TGG-A-C-AGAATA--A-CAG-----G-A----A-GCTG--AGCACTG-TGATC-TAGC----A---AATAGATA-TAAACTGGG--T--GA--TA----AA-CAATG--T-GTTGCA---GAA--G---AG------------------------------------ATTA-C-TT--GGG-GATTATAGAC-AAA--GTG-GGCA-AG---T-GTT--AAT-TAACA-TA
gi|14 : atatatacCAGGGTTGG-GCGGTTAAAAC---------C-ACCC--------------------GG-TT-TTAACCAGT-----------------------------CA--A-AATTC-CCAAAA--TG-GTCA--A--T-A-------C-CA----------GTCAACT--GAAATTC----A-----A-AGTG-T--CCTT--T--T-T-CCTA-T-TTT-----AAA--T--ATTT--CAG---GC--AAA--AATAAAGATATATTT-A------------A----CA---G-A-T--------T-T-GT-AGT-C--T---T-CAAA--A-ATC-A-A--TC-TTA-T-CAC-A-AA--G-CA-T-G--T-GTT--TATA--GA-T--G-A-A----T-taccagccatgaaaactgtaaagatcacccaca
gi|15 : CAGGGTTGG-GCGGTTAAAAC---------C-GCCCCCGG---TTT-A-AACCAGCGG-TT-TTAACCGATT-A-TA-A----C-CGCC-CCGGGCG-GTCA--A-TACTC-CCAAAT--TG-A-----------------------------------AATTT--AAATTC-----------------T--CC-T----------------TTT-----AAA--TACATTT--CATGCCGC--AAA--AATAAAGATATAT-T-A------------A----TA---A-A-T--------T-T-AT-AGT-CTTT---T-CAAA--C-ATC-A-A--CT-TTGTT--AC-A-AA--G-CA-T-G--T-Agcaaagatt
gi|16 : AAATAA-ATAG--GGACTT--GACACC-CTG---CTCGTTGCTCTA----GG-AC-AAAAG-T-GAACAG-TTTT-T-GATTTTTACA--G-TG-AA-C-AT---TTTC-CC-CAATT-TAA--CA--AAATCTGAT--GC-ATTA-T-TTTAATATTAATAA---TTTCATTTG----T--ATATAA-G--TG---TT-GTAAG--------TGCATGTTT--AGAAT-----T--AT-TT-A------T-CATCAA-T-A-AT--GAACT-CT-TTAA
gi|17 : TTGCAGT-----TT-A------C-CAT--A-T-A-AT--GG-CC-ATTTTAGC---A--TTT-GAAAT-AACC-CATA-ATG---GACTATATA-A-T-GAT-CG---AG-T--TTCAA-T-G--ACCA--ATC-----A---ATTTTCAAGTA--CT-------GACCA-G-AGT-G-ACCG-TTTT-AATACCAGTAATTTGACC--A-CGC--AACCCC---AGT-C-AA-TA-C------------TAGT--ATAT--GA---CCA----GTTTTTT--G-CCAAC
gi|18 : acACAGT--AT-TT-A------T-CATC-A-T-A-AT--GAACT-C-GTTATC---A--TTT-CAA--TAACC-AATA-ATAT-AGA----A-----------------A-TCTT-CAA-TTG--ACCACAATCN--NNN---NNNNNNNNNNN--NNNN-----NNNNN-NNNNNNN-NNNNNNNNN-NN--NNNNNN--NNNNNN--N-C-C--GGCCC----GGT-C-AA-TA-C------------TAGT--AT-T--GA---CCG----CTTTTTT--G-CCAACcc
gi|19 : CAGGGTTGG-GCGGT-AAAAC---------C-GTGTCC-----------------TGG-TT-TTAACCGATT-A-TA-G----TGCGCC-CG---AG-ATCA--A-TAATC-GCA------G-G-----A--T-A-GT---GT-CAAGT-AC-T-GGT-AATATG-AAATTT----------A-AGTG-T--CT-T--T--T-T-CCT--T-TTT-------A--TA---TT--CAT---GC--AAACGAA------------A-A------------G----TA---A-G-T--------T-T-CT-Acct
gi|2 : T-TTAACTGGTT-AATA-AACACCGCGCC-C----TG-GTCA--A-TGC---CAAAAA--TG-GTCA-----T-ACGT--G---CA--T-AC-T-GGTACATTTGAAAGT------A-----A-AGTG-T--CC-TG-T--T-T-CCAA-T-GTT-----TAA--TACATTG--CAT---GC--AAA--AA------------T-A------------A----TA---G-AAT--------T-T-AT-AGT-CTCC---T-CAAA--A-AAT-A-G--CTCTTACT-TAC-A-----T-CA-T-A--T-ATT-----A--GAAT--C-A-A----T-TTAAGT--AC------A-T------AATGC------A-----------A----------------ATT----TA--AT--T-ACATCCCAGTAG---T-GAA---CTTGCTG----GAC-CTTTCA----AGCG-C--T-CT-C-AGC--TTCT--AG-C---GTG-AT-------C-C---C---ATGTCT-AT-AAC----TTTTT----------------AGTTTGACTA-A-GGGC-A--AC-TGTTT-CAAT-GGC--AATACA-T-G-AGGAT-A-GTT----AGGCACAC-TTATTCAGA-G-AC--AATTCC-GC-ATGGGGTT-AAGAT-AT-AA-TA-T-A-TTGATGGCTTAATG--G-A--ATCTATCAG-GTCAACAGTTGA-T-CTATCAGACTTACC-AGA----C-ATTGT-CAC-----------GAGGGGTTACAG---TA--GGTTA-TTAGTTT---------G--------CA----A--------------A-----TGAAGACATAAAATAATTATC-CTGCTT-TATACCAGTGG-A-CCAAAATA--AACAGA-TA-G-A-TCCA-G-TG--AGCA-TG-TGATC-TA-TAAA-AC--AATAG----TAAACTGGGTGTCAGA--TA----AAACA-----T-GTTGCATCAAAA--GAC-AGTG-A-TCTAAATGGA-------A--CCAAGTTCA-TAT-A-C-TT--GGG-GTA--CAGGT-ATA--ATG-G-CA-AG---T-G-T--TATATAACA-TTACC-AAG--T--CAG-----G--AATG-CAATTGTTGT-TGT--TAT-GTT-ATGA-AAAACAGTCCACCCACCAACTG-ACACAC--AATGT--GAC-CAT-A--GGTA-CCT-GAT-AA-TACTCTT-CCAAT-A--ATG-ACTGGT--------TTGGAAAGA--T-ATAGGG--CTTTCA-AACT---TATAGGATAATTAT-AGAAATAA--TAG--GGACTTG--ACACCTCTT---CTCTT-G--CTA----TG-AC-GAAAGTT-AAATAG-TTTA-T-AATTTTTTCA--G-TG-AG-C-AT---TTTC-CC-CAA-T-GAA--TA--AAATC-TAT--GC-ATTA---T----------TAA---TCTCACTTG----C--ATGTAA-G--TG-T-TT--TAAG--------TGCATG-TT--AGAATTACAGT--ATATT-A------T-CATC-A-T-A-AT--GAACT-GT-TTAAC---A--TTT-AAA--TAACC-AATA-ATAT-AGA----ATA-A-T-GAC-CATTAAA-TC-TTCAA-TTG--ACCACAATCGA-CCAGT-ATTGACCACTG----TT-----GACCA-GTAA-CG-A-CGGTTTT-AA--CCAGTA--TTGACC--A-C-C--ACCTCCACGGGT-CAAA-TA-T--------------GT--A--T--GACACCCGA---C--TTTT--G-CCAACaaaacatttt
gi|20 : tggcattaaaaataccgccaactgagtttagaaaacctatcagata---A--TTT-AAA-CTAACC-AATA-ACAT-AGA----ATA-A-T-GAC-CATTAAA-TCTT-CAA-TTG--ACCACAATCN--NNN---NNNNNNNNNNN--NNNN-----NNNNN-NNNNNNN-NNNNNNNNN-NN--NNNNNN--NNNNNN--N-C-C--GGCCC----GGT-C-AT-TA-C------------TAGT--AT-T--GA---CCT----TTTTTTT--G-CCAACcc
gi|21 : tTCAAC---A--TTT-AAA--TAACC-AATA-ACAA-ACT----GTA-A-T-GAC-CAATCAA-T-TTTCAA-TCA--ACCA-----G--T-----ATTGACCACTA---------------------TTG-ACAGGTTTT-AA---CAATA--TTGACC--A-C-C--GGCCC----GGT-C-AA-TA-C------------TAGT--AT-T--GA---CCAGGTTTTTTTTT--G-CCAACcct
gi|22 : ttataaacttgccactAG--GGACTTG--ACACC-CTG---TTCTTTG--CGA----GG-TC-AAAAGTT-AAACAG-TTTT-T---TTTTTACA--G-TG-AG-C-AT---TTTC-CC-AAA----AA--CA--AAATCTTAT--GC-ATTA-T-T----------TAA---TTTTATTTGCACAC--ATGTAA-G--TG---TT-GTAAG--------TGCATGTTT--AG
gi|23 : G-GACA-AG---T-G-TT-AAT-TAACA-TACCT-AAGGTT--CAG-----G--GATGGCAATTGT-GT--GTATTATTGTT-ATGA-AAA-CA--TTACCCAC--ATTT-GCACACC-AATGT--GAT-CATTA--GGAA-CCC-GATGAA-TACTCTT-C-AAT-A--ATG-ACTTG
gi|24 : ----A--------------A-----T------------------TT-CTGCTT--ACGCC--TGG-A-C-AGAAAA--A-CAGG-T---------A-GCCG--AACAC---TGATC-TAGTAAATACCCAATACATA-TACAATG---------------------------T-GTTACA---AAA--GAC-AGTG-C-TT---ATGGA-------G--C-AAG---A-GATT
gi|25 : gacaatgagagacaaaatATA-ATAA-AGACTCAATA-A-T-GAC-TAATAAA-T-TTTCAA-TT---------------------ATTGAACACTA--------------------GT-G-ACCGGTTTT-AA--CCAGTA--ATGACC--A-C-T--GGCAG----AAT-C-AA-TA-C------------TAGT--AT-T--GA---CCA----CTTTTTT--G-CCAAC
gi|26 : TGACCAATAAATTTTCAATCAACTA-TTA-TTG-GCCAGTTTT-AA--CCAGTA--TTGACC--A-C-T--TGCCC----TGT-C-AA-TA-CTACTATTGACTCTAGT--AT-T--GA---CCA----CTTTTTT--G-CCAACcct
gi|27 : aCAGGGCTGG-GCGGTCAAAACTGTCCCAACC-GTCCCCGG---TTTTA-A-CCAGCAG-TT-TTAACCGGTT-G-TA-A----C-CGCC-CCG--CG-GTGA--A-CACTC-CCAAAA--TG-GTCA--A--T-A-GT--GGT-Ccctg
gi|28 : CAGGGTTGG-GCGGTTAAAAC---------C-ACTCCCGGT--TTT-A-A-CCAGCAG-TT-TTAACTG--------------C---CC-C----CA-GTCA--A-TGCTC-CCAAAA--TG-GTCA--A--T----T--G-------------------------AAATAT----A-----A-AGTG-T--CC-T--T--T-T-
gi|29 : AA--TACATTT--CAT---GC--AAA--AA------------T-A------------A-----A---G-A-T--------T-A-ATGAATACATA---T---AT--A-CTC-A-G--CT-TTATT--AC-A-AA--G-CA-T-G--T-ATTAATATA--GA-T--C-A-A----T-T--AAT--G-------A-TTTTA--AAT--------A-----------AT--------------TAt
gi|3 : AGGGTTGG-GCGGTTAAAAC---------C-ACCCCCGGGTTTTT-ATA-CGAGCGG-TT-T-AACCGGTT-A-TATA----C-CGTCTC----CGCGTCAC-A-TACTCTCCAAAA--TG-GTCA--A--T---GT--GGT-CAA-TTAC-T-GGT-AATTTGAGAATTT----A-----ATAGTG-TTGCC-TGTTGGT-T-CCGA-TATTT-----TAA--TACATTT--CAT---GC--AAA--AA------------T-G------------AGAAGTATT-A-A-T--------T-A-AT-AGT--TTA---T-CACT-----TC-A-GA-CT-TTATT--AC-A-AA--G-CA-TTGC-T-ATT--CATA--GA-T--CCA-A----T-T--AAT--GTTTTTAAA-T------AATTATACTGAA-----------ATGT------------CATT----TATTGT--T-ATACCCCGGTAA---T-GA----CTT-CTG----ACC-TTTTTA----GA-G-C--G-CT-C-A-T--TTCTA-AG-C---TGG-ACATATCACC-C---T---AT---T-TT-AACTT--TTTTT----------------AGTA-----AGATCGGC-A--AC-TGTT-----T-G-C--AATAC--T-GAA---T-A-GTACTATAG---CACTTT-TTCAGATG-GCCAAATTCTTGC-ATGT--TT----AT-----AGTA-------------T-AATT--GCACTAC-TGT--G-GTTGACA--T-A-T-CT-TTAC---TACT-ATATC--C-AT-G--TACATGTATACTTAAAAGG-TTACAGG--TG--AGC-ATT-AGTTTGCAATGAGAG-------ACAAAATA--------------A-----T------------------TT-CTGC-T-TATACC--TGG-ACC-AAAATACGA-CA---TACG-ATTC-A-GCTG--AGCACTGTTGATC-TAGT----A---AATAAATA-T-AACTGGGT-T--GGATTA----AA-CAATTTGT-GTTGC----AAA--GAC-------------ATAGT-------G--C-A-----G-TATTA-C-TT---GG-A----CAGGT--TA--ATATGACACAGTGTT-G-T--AAT-T-ACATTACCCTAGGGTC--TAACCTGTG--GATGGCAG-TGT-GT-C-TGTTATTTGT-ATGA-AAAACA--T----CAC--ACC--ACACA-C-AAT-T--GATGCATTA--GACA-C--------------CTT-C-AGT-AGTATG-AC-TGT--------ATGGAGA-GACT-ATGGGAA-C
gi|3 : TAGACA-CCTTCA-G--T---AGTATGACTGT-AT-GGAGAGACTATGG--GAACGTC-GACCCG-CTGACTCTCTTTGT-CTA----TGCAC-AAAAGTTTAAACAG-TTTG-TTGATTTTCACATGG-TG-AG-C-ATGAGTTTC-CCGCATTTTGAACTTATCAAATCTTGTAGGC-ATTA-T-T----------TAA---TTTC-TTTT----C--ATGTAA-G--TG-TACT-G-AAGT-------CA-ATGTTT--A-AATTACAGT--AA-AT-AATACACT-CAAC-AGT-AGAT--GAACTGCT-TTAAC---AAATTA-AAAATAAGCT-CATATATAT-ATA----ATA-A-TTGAC-CATTAAA-TTCTTCAAGTTG--ACCACTATCG--CCA---GTTAATGACCG--TATT-----GACCATGTGGG-G-ACCG-TTTT-AA--CCAGTA--T-GACC--AAC-T--GACCC----GGT-CCAA-TA-C------------TAGTACAT-T--GA---CCG----CTTTTTT--G-CCAACgtcgacccgctgactctctttgtctatgcacaaaagtttaaacagtttgttgattttcacatggtgagcatgagtttcccgcattttgaacttatcaaatcttgtaggcattatttaatttcttttcatgtaagtgtactgaagtcaatgtttaaattacagtaaataatacactcaacagtagatgaactgctttaacaaattaaaaataagctcatatatatataataattgaccattaaattcttcaagttgaccactatcgccagttaatgaccgtattgaccatgtggggaccgttttaaccagtatgaccaactgacccggtccaatactagtacattgaccgcttttttgccaacc
gi|30 : agggttgggcggttaaaaccacccccgggtttttatacgagcggtttaaccggttatataccgtctccgcgtcacatactctccaaaatggtcaatgtggtcaattactggtaatttgagaatttaatagtgttgcctgttggttccgatattttaatacatttcatgcaaaaatgagaagtattaattaatagtttatcacttcagactttattacaaagcattgctattcatagatccaattaatgtttttaaataattatactgaaatgtcatttattgttataccccggtaatgacttctgacctttttagagcgctcatttctaagctggacatatcaccctattttaactttttttagtaagatcggcaactgtttgcaatactgaatagtactatagcactttttcagatggccaaattcttgcatgtttatagtataattgcactactgtggttgacatatctttactactatatccatgtacatgtatacttaaaaggttacaggtgagcattagtttgcaatgagagacaaaataatttctgcttatacctggaccaaaatacgacatacgattcagctgagcactgttgatctagtaaataaatataactgggttggattaaacaatttgtgttgcaaagacatagtgcagtattacttggacaggttaatatgacacagtgttgtaattacattaccctagggtctaacctgtggatggcagtgtgtctgttatttgtatgaaaaacatcacaccacacacaattgatgcatAATCG--ACC---ATTAANNNNNN--NNNN-----NNNNN-NNNNNNN-NNNNNNNNN-NN--NNNNNN--NNNNNN--N-C-C--AGCCA----GGT-C-AG-TA-C------------TAGT--AA-T--GA---CCA----CTTTTTT--G-CCAACc
gi|31 : -----T-GTTGCA---AAA--GAC-AGTG-C-TT---ATGGA-------T--C-AAA---A-GATTA-C-TT--GGG-GA---CAGGT-ACA--TTT-AACA-TG---T-GTT--AAT-TAACA-TACCC-Ac
gi|32 : atg--CT-T--T--T-T-CTTA-T-TTT-----A----TACATTT--CAT---GC--TAA--AA------------T-ATAGATACATTTGA----TA---G-A-T--------T-T-AT-AGT-CTT
gi|33 : GTT-A-TG-A----T-CGCC-C----CG-GTCA--A-TACTC-CCAAAG--Taattaa
gi|35 : gttA-ATAG--GGACTTG--ACACC-CTG---CTCTTTG--CTC----GG-AC-AAAacatgt
gi|36 : AGGGTTGG-GCAGTTAAAAC---------C-ATCCCCGG---TTT-A-
gi|4 : AGGGTTGG-GCGGTTAAAAC---------CCGCCTCCG----TTT-A---CCAGCGG-TTGTTAACCGCTT-A----A----C-CGCC-C----CG-GTCA--A-TACTC-CCAAAA--CGTGTCA--A--T-A-GTTTGGT-CAA-T-C--T-GGTCTAATTGAAA-TTT----A-----A-AGTG-C--TC-C--T--T-T-CCAA-T-TTT-----AAA--TACATTTTTCATT--GC--AAA--AAA-----------T-A------------A----TA---GGA-T--------T-TCAT-AAT-CTTT---T-CAAA--AGAGT-A-G--CT-T-ATC-AGC-A-AATGG-CA---G--T-ATTCTTTTT--GA-TTCC-A-AATTAT-T--AAT--G-------A-T------AAT--------A-----------AT--------------CATT----TA--AT--T-ACACCCCAGTAT---T-GAA---CTTTCTG----ACC-TTTTCA----AA-GAC--T-CTTC-A-TCATTCT--GG-CGGATTG-AT-C----CC-C---T---AA---TTATTAAC----TTTTTT---------------AGTT-----A-ATGGGC-A--GCCTGTTTTCAAT-C-A--AATAC--T-G-A---TTA-GCT----AG---CAC-TT---CAGA-GGAC--AATTC-TGC-ATGT--TTTAAGAT-AT-AAATA-TCA-TTG----CT-AATTTTG-ACTACTTAT--G-G-CAACA--T-A-T-CT-TCAT---TACT-ATA----CCAT-GT--ACATG------TAGACGGGTTACAGGACTA--TAT-A-T--GTTT---------G-------ACA----ATGAGAGAAAAAAA-A-----T------------------TTTCTGCTT--ATAC---TGG-A-C-CAAATAT-A-CAGC-TA-GGA-TC-A-CTTG--AGCACTG-TGATC-TATTAAA-------TAAATACTAAACTCGGT----GA--TA----AAACA-----TTGTTGCA---AAAA-GAC-AGTGTC-TCCAAATGGGAGTGTCGG--C-GAGGAGA-TATTA-CCTT--GGGTG----CAGGT-ATA--ATG-GACA-AG-----G-T--AAT-TAACA-TACCC-AAGGTC--CAG-----G--GATGGCAATTGT-GT--GTGTTATTGTTTATGGCAAAACA--TCACCCAT--ACTG-ACACACA-AATGT--GAT-CATTA--GGTA-C-T-GATGAA-TACCCTT-C-AAT-A--AT----------------------------------GA-CTT------------GTAGGAAAAT-AT-AG-------------GGACTTTTGACACC-CTG---CTCTTTG---TA----GG-AC-AAAAATT-AAATAG-TTTAGT-AATTTTTACAC-G-TG-AGGC-AT---TTTCACC-CAAT--GAA--TA--AA-TCTTAT--GC-ATTA-TGT----------TAA---TCTCATTTG----CCAATGTAATGCTTG-T-TT-GCAAGT--------GCCTGTCTTAAGAATTATAGT--AT-TTTA------TTCATC-T-TTA-ATCAGAACT-CCGT-AAC---A--TTTTAAAAATAACCCAATA-ATATGAGA----ATATG-T-GATTCATTAAGCTTTTTCAA-TTGGCACCACAATCGAGCCAGATATTGACCACT----TAT-----GACCA-GTA-TTG-ACTGGTTTT-AA--CCATTA--TTGACCCAA-C-C--GGCCC-----GT-C-AATTA-C------------TAGTC-AT-TGGGA---CCG----CTTTTTt
gi|5 : CAGGGTTGG--CGGT-AAAAC-----------GCCCCCG----TTT-A-A-CCAGCGG-TT-TTAACCGGTTTA-TA-A----C-CGCC-C----CG-GTCA--A-TACTC-CCAAAA--TG-GTCA--A----A-GT--GGT-CAAAT-A--T-GGTCAATTTGAAAATTTTTACA-----A-AGTG-T--CC-T--T--T-T-CCAA-T-TTT-----AAA--TACATTT--CATAT-GC--AAA--AA------------T-A------------A----TA---G-A-T--------T-T-AT-AGT-CTTT---G-CAAA--A-ATC-A-T--CT-TTATT-AAC-A-AA--G-CA-T-G--T-ATT--TATTTTGA-T--C-ATA----T-T--AAT--G-------A-T------AAT--------A-----------AT--------------CATT----TA--AT----ACACCC-AGTAT---TTGAA---CTGATTG----ACC-TTTTCA----AA-G-C--TGCT-C-G-T--TTCT--AG-C---TTG-ATTT----CC-C---T---AA---T-AT-AAC----TTTTT----------------AGTT-----A-ATGGGCCA--AC-TTTTT-CAATTG-CCGAATAC--T-G-A---T-AAGTA----AG---CAC-TT-TTCAGA---AC--A-TT--TGC-ATGT--TT-AAGAT-A--AAATA-T-A-T-G---GCT-AAT---G-ACTACTCAT--G-GTCAACA--T-A-TGCT-TTAG---TACT-ATA----C-AT-GT-TACATG------TAGAGGTTTTACAGG--TA--TGT-A-T-AGTTT---------G-------ACA----A--------------A-----T------------------TT-C-GCTT-TATACC--TGG-A-C-AAAATA--A-CAGC-TA-G-A-TC-A-GCTG--AGCACTG-TA--C-TAGTAAA-AT--AATAAATA-TAAACTGGGT-TT-GA--TA----AA-CA-----T-GTTGCA---AAA--GAC-AGTG-CCTCTAAATGGA-------G--C-AAG---A-TATTA-T-TTTTGGGTGT---CAAGTTATA--ATG-GACA-AG---T-G-T--AAT-TAACA-TACCC-AAG--T--CAG-----G--GATGGCAATTGT-GTCTGTGTTATTGTT-ATGA-AGAACA--TCACCCAC--ACCG-ACACACCCAATGG--GAT-CATTATCGGTA-CCTTGATGAA-TACTCTTTC-AATTA--ATG-ACTTGTTTTTTTCTATGGAAA-A--CCATAGGGAACTTTCAAG--T---TTTAGGAAAAT-AT-AGAAATAA-ATAG--GGACTTG-GACACC-CTG---CTTTTTG--CTA----GG-ACGAAAAGTT-AGATAG-TTTA-T-AATTTTTACA--GGTG-AG-C-AT---TT-C-CC-CAATT-GAA--TA--AAATCT-AT--GCCATTA-T-T----------TAA---TCTCATT-G----A--A-GTAA-G--TG-T-TTTGGAAGT-------TGCATGTTT--AGAAT-ACAG---AT-TT-A------T-CATC-A---A-AT--GAACT-CTGTTAAC---A--TTT-AAAATTGCCC-AA-A-ATAT-AGT----ATA-A-TTGAC-CATTAAA-TCTTTCAA-TT---ACCACAATCG--CCG---ATTGACCACTA--TTTT-----GACCA-GTAGTTG-ACCGGTTTT-AA--CCAGTA--TTGACC--A-C-C--GGCCG----CGT-C-AA-TA-C------------TAGT--AT-T--GA---CCG----CTTTTTT--GCCCAAC
gi|6 : -T--CT-T--T--T-C-CCAA-T-TTT-----AAA--TACATTT--CAT---GC--AAA--AA------------T-A------------A----TA---G-A-T--------T-T-AT-AGT-CTTT---TTCAAA--A-ATC-AAG--CC-TTATT-TAC-A-AA--GGTA-T-G--T-ATT--ATTT--GA-T--C-A-AC---T-T--AAT--G-------A-T------AAT--------A-----------AT--------------CATT----TA--AT--T-ACACCCCAGTAT-----GAA---CTT-CTG----ACC-TTTTCA----AA-G-C--T-CT-C-A-T--TTCT--AG-C---T-G-ATAT----CC-CC--T---AT---T-AT-AAC----TTTT-----------------AATT-----A-ATGGGC-A--AC-TGTTT-CAAT-G-C--AATAC--TTG-A---T-A-GTA-----G---CAC-TT-TTCAGA-G-AC--AATTCATGC-ATGT--T--AAGATTATTAAATA-T-A-TTG---GCT-AATT--G-ACTACTTAT--GTGTCAACA--T-A-T-CT-T-AG---TACT-ATA----CCAT-GT--ACATG------TAGAGGGTT-ACAG---TA--GAT-A-T-AGTTT---------G-------ACA----ATGAGAGACAAAATAA-----T------------------TT-CTGCTTATGTACC--TGG-A-C-AAAATA--A-CAGC-TA-G-A-TC-A-GCTGT-AGCACTG-TGATC-TAGTAAA-------TAAATA-TAAACTGGGT----GA--TATA--AA-CA-----T-GTTGCA---AAA--GAC-AGTG-C-TCTAAGTGGA-------G--C-AAG---A-TATTA-C-TT--GGG-T----CATGT-ATA--A-G-GACA-AG---T-GTT--AAT-TAACA-TACCC-AAGGTC--CAT-----G--GATGGCAATTGT-A--TGTG-TATT-TT-ATG--AAAACA--TCACCCACA-ACTG-ACACACC-AATGT--GAT-CATTA--GGTA-CCT-GAAGAA-TACTCTT-C-AAT-A--ATG-ACTTGT--------AT-------------------------------------GGAAAAT-AT-AGAAATAA-ATAG--GGACTT--GACACC-CTG---CTCTTTG--CTA----GG-AC-AAAAGTT-AAATAGTTTTA-T-AATTTTTACA--G-TG-AG-C-AT---TTTC-CC-CAATT-GAA--TA--AAATCTTAT--GC-ATTA-T-T----------TAA---TCTCATTTG----C--ATGCAA-G--TG---TT-GTAAG--------TGCATGTTT--AGAATTACAGT--AT-TT-A------T-CAAC-A-T-A-AT--GAACT-C-GTTAAC---A--TTT-AAAA-TAACC-AATA-ATGT-AGA----ATA-A-T-GAC-CATTAAA-TC-TTCAA-TTG--ACCACAATCN--NNN---NNNNNNNNNNN--NNNN-----NNNNN-NNNNNNN-NNNNNNNNN-NN--NNNNNN--NNNNNN--N-C-C--GGCCC----GGT-C-AA-TA-C------------TAGT--AT-T--GA---CCG----C-TTTTT--G-CCAAC
gi|7 : gtCAGGGTTGG-GAGATTAAAAC---------C-ATCCCTGG---TTT-----------------TCACCAGTC----------------------------CA--A-AACTC-CCAAAA------------------GT--GGTTCAA-T-A--CCGGTCAATT-GAAA--TT----ATCACTA-ACTGCT--CC-T--T--T-TTCCTA-T-TTT-----TA---TATATTT--CAT---CA--AAA--AA------------T-A------------A----AACAGG-A-T--------T-T-GT--GT-C-TT---T-CAAA--A-ATC-A-AATCT-TTA-T-CAC-A-AA--G-CA-T-AT-T-GGT--TATA--GA-T--G-A-A----TGT--AAT--G-------A-TAAACAAAAT--------AAGAAATGAAATAT--------------CATT----TA--AT--T---------GTA----T-GAA---CTT-C-G----ACCTTTTTCA----AG-G-CTAT-CT-CTA-T--TTCT--AG-----TTGCATAT----TT-C---T----C---T-AT-AAC----TTTTTAGTATGTCGTTTTTTGAGTT-----ATATAGGCGA--AC-TATTT-TAAG-G-C--AATACTTT-G-C---T-A-GTA----A----CAG-CT-TACAGA-G-AC--AATT-TTGCAAAGT--AT-AAGAT-AT-cc
gi|7 : T-ATA----T-GT-GTATACTTG-------ATAGGAGTTACAGG--TA--G-C-A-T-AGTTTT--------GTCATTATGCA----A--------------AGACGTT------------------TT-TTGCTG-TATATC--TTG-A-TTGGAGTA--AACGGG-TA--------A-GTTG--AACACTG-TGATCGTAGTAGA-A-----TAAATA-TAAACTGGGT----GA--TATTAAAA-CAATGT-T-GTTGCA---AAA--GACCAGTG-C-TT---ATGGA-------GATC-AAA---AAGATTAAT-TT--GGG-GA---CAGGT-ACA--ATG-GACA-TG---T-G-T--TAA-TAACA-TACCA-AGGGTCCTCAG-----G--GA-GGCGAttagaatggtacatttttaaaccattcgtaatctgtcacttctgtggtccacaacctatattgctctcagtttacgtattatccgatttgtactgatgtacatggtatatgtgtatacttgataggagttacaggtagcatagttttgtcattatgcaaagacgttttttgctgtatatcttgattggagtaaacgggtaagttgaacactgtgatcgtagtagaataaatataaactgggtgatattaaaacaatgttgttgcaaaagaccagtgcttatggagatcaaaaagattaatttggggacaggtacaatggacatgtgttaataacataccaagggtcctcagggaggcga
gi|8 : cagggttgggagattaaaaccatccctggttttcaccagtccaaaactcccaaaagtggttcaataccggtcaattgaaattatcactaactgctcctttttcctatttttatatatttcatcaaaaaataaaacaggatttgtgtctttcaaaaatcaaatctttatcacaaagcatattggttatagatgaatgtaatgataaacaaaataagaaatgaaatatcatttaattgtatgaacttcgacctttttcaaggctatctctatttctagttgcatatttctctataactttttagtatgtcgttttttgagttatataggcgaactattttaaggcaatactttgctagtaacagcttacagagacaattttgcaaagtataagatatttagaatggtacatttttaaaccattcgtaatctgtcacttctgtggtccacaacctatattgctctcagtttacgtattatccgatttgtactgatgtacatggA-ATAGAAGGATTTG--ACACC-CTG---CTCTTTG--CTACCTAGA-AC-AAAAGTT-AAACAG-TTTT-T-GATTTTTACA--G-TC-AG-C-AT---TTTC-CC-CACTT-TAA--GA--AAATCTTAT--GC-ATTA-T-T----------TAA---TTTAATTTG----C--ATGTAA-G--TG---TT-GTAAGTCATAAAGTGCATGTTT--AGAATTACAGT--AT-TT-A------T-CATC-A-T-A-AT--GAA-T-CT-TTAA-----------AAAATAAACC-AGTA-ATAT-AGA----ATA-A-T-GAC-CAATAAA---TTTCAA-TTG--ACCAT--T----------ATTGACCACTA---------------------TTG-ACTGGTTTT-AA--CCCGTA--TTGACC--A-C-C--AGCCC----GGT-C-AA-TA-C------------TAGT--
gi|9 : ag-T--T--T-T-CCTA-T-TTTT----AAA--TATATTT--CAT---GC--AAA--AA------------T-A------------A-----A---G-A-TGCATTTAATAT-AT-AGT-CTTT---T-CAAA--A-AAC-G-A--CT-TTATT--AC-A-AA--G-CA-T-G--T-ATT--TATA--GA-T--C-A-A----T-T--AAT--G-------A-TTTGA--AAT--------A-----------AT--------------TAT
gi|9 : cat-ATAT----CC-T---TTTTAG---T-AT-GACGTATTTCTTG---------------AGTT-----A-ATGGGC-A--AC-TGTTT-TAAT-G-C--AATAC--T-G-A---T-A-GTATTC-AG---CAC-TT-TACAGA-G-AC--AATT-CTGC-ATGA--TT-AA-------AGA---------------T-AATT--G-ACTAC-TGT--G-GCCGACA--T-A-T-CT-TCAG---TACT-ATAATACC-AT-G--TACATatgaaatatcctttttagtatgacgtatttcttgagttaatgggcaactgttttaatgcaatactgatagtattcagcactttacagagacaattctgcatgattaaagataattgactactgtggccgacatatcttcagtactataataccatgtacat
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|34 ): ATGTAAATTTATATGGAATTCATATAATAATATAGAAATTT
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 111111111 222222222222 1111111111111 11111 555555555555555555555555555555555555555 1111111111 111111 111 33333333333333333333333333333333333333333333333333 1111 11 11 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555 222222 1 1111 111111 1111111 222222222222 1111 3333333333333333 1111111 11 11 11111 222222222 22 222222222222 1 222222 222 222222 111111 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 11 111111111111 11 3333333 333333333333333333333333 11111111 222222222222222222 333333 1111 11111 111 11 777777777777777777777777777777777777777777777 222 11 1111111111 1111111 222 33333333 111111 11 222 1111 11 222222222 44444444444444444444444 111111111111
lowQualScore : 3 0 333333333 3 666666666666 3 3 6666666666666 2 22222 2 66 2 2 33 3 0 444444444444444444444444444444444444444 0 6666666666 3 3 33 2 99 33 2 2 2 2 2 333333 33 0 33 111 33 33 33333333333333333333333333333333333333333333333333 333 2 2 3 66666 5555 3 0000 3 44 3 3 44 3 2 2 99 2 88 555 3 11 3 3 9999 3 44 44 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999 8888 55 7777 000000 777 2 2222 8 8888 4 8 55 4 4 000000 99 7777777 3 2 7777 3 333333333333 3 3 2222 8888888888888888 3333333 8 66 4 4 4 4 00 00 4 11111 4 4 222222222 4 4 2 4 4 66 22 4 88888 9999 111111111111 5 777 5 0 66 5 2 3 66 5 5 5 5 6 888 4 555555 4 000 333333 9 7 777 555555 8 4 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 4 88 66 4 4 8 00 8 999999999999 4 00 4 4 1 4444444 1 4 555555555555555555555555 4 777 99 4 99999999 222222222222222222 44 4 4 66 999999 4 66 4 4 777 4 2222 4 4 44 88888 22222 66 3 5 777 1 0 5 55 77 33 777 66 77 5 0 77 5 666 22 5 5 5 5 77 5 1 666666666666666666666666666666666666666666666 6 6 8 55 444 4 777 99 8888 4 4 8 4 55 55 00 4 4 4 4 777 4 4 555 66 66 66 4 555 9999999999 777 6666666 4 66 111 4 0 33333333 1 66 4 55 4 4 111111 4 4 4 8 4 55 4 99 666 55 3 111 3 3 3 4444 3 3 6 3 3 3 33 3 44 77 888888888 0 88888888888888888888888 2 0 2 33 33 33 2 2 33 8888 2 5 2 2 444444444444 66 3 44 555 9999 44 3
lowQualScore : . . ......... . ............ . . ............. . ..... . .. . . .. . . ....................................... . .......... . . .. . .. .. . . . . . ...... .. . .. ... .. .. .................................................. ... . . . ..... .... . .... . .. . . .. . . . .. . .. ... . .. . . .... . .. .. ....................................................... .... .. .... ...... ... . .... . .... . . .. . . ...... .. ....... . . .... . ............ . . .... ................ ....... . .. . . . . .. .. . ..... . . ......... . . . . . .. .. . ..... .... ............ . ... . . .. . . . .. . . . . . ... . ...... . ... ...... . . ... ...... . . ................................................................ . .. .. . . . .. . ............ . .. . . . ....... . . ........................ . ... .. . ........ .................. .. . . .. ...... . .. . . ... . .... . . .. ..... ..... .. . . ... . . . .. .. .. ... .. .. . . .. . ... .. . . . . .. . . ............................................. . . . .. ... . ... .. .... . . . . .. .. .. . . . . ... . . ... .. .. .. . ... .......... ... ....... . .. ... . . ........ . .. . .. . . ...... . . . . . .. . .. ... .. . ... . . . .... . . . . . . .. . .. .. ......... . ....................... . . . .. .. .. . . .. .... . . . . ............ .. . .. ... .... .. .
lowQualScore : 3 4 333333333 3 666666666666 6 3 2222222222222 9 99999 9 88 9 9 99 1 4 000000000000000000000000000000000000000 4 6666666666 3 1 99 7 00 77 7 7 0 9 9 666666 77 5 77 000 77 77 77777777777777777777777777777777777777777777777777 000 7 9 4 22222 8888 1 4444 1 88 1 1 22 1 9 9 66 9 55 111 1 55 1 1 6666 1 66 66 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222 5555 55 8888 222222 000 0 5555 0 5555 0 0 55 0 0 666666 55 2222222 6 3 7777 6 111111111111 6 6 7777 5555555555555555 7777777 9 11 4 4 4 4 66 66 4 33333 4 4 444444444 4 4 3 4 4 11 44 4 11111 8888 888888888888 0 000 0 0 99 0 0 1 99 0 0 0 0 5 888 4 111111 4 888 999999 9 3 222 000000 9 4 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 4 00 11 4 4 9 66 9 222222222222 4 66 4 4 9 6666666 9 4 777777777777777777777777 0 000 55 0 11111111 666666666666666666 66 4 4 11 666666 4 11 0 0 000 0 5555 0 0 66 55555 55555 99 2 7 000 4 7 7 99 99 66 999 44 99 7 1 99 7 666 33 7 7 7 7 99 7 4 222222222222222222222222222222222222222222222 7 7 9 55 000 0 000 55 5555 0 0 9 4 88 99 66 4 4 4 4 888 4 4 444 11 11 11 4 333 4444444444 888 2222222 4 11 777 4 8 33333333 1 11 6 55 0 0 555555 0 0 0 0 0 55 0 77 444 00 6 444 6 3 3 2222 3 3 7 3 6 3 88 3 66 88 888888888 3 66666666666666666666666 9 3 9 99 99 99 9 9 99 9999 9 7 9 9 666666666666 88 1 22 444 6666 66 3
consensus : CAGGGTTGG-GCGGTTAAAAC---------C-GCCCCCGG---TTT-A-A-CCAGCGG-TT-TTAACCGGTT-A-TA-A----C-CGCC-C----CG-GTCA--A-TACTC-CCAAAA--TG-GTCA--A--T-A-GT--GGT-CAA-T-A--T-GGTCAATTTGAAAATTT----A-----A-AGTG-T--CC-T--T--T-T-CCNA-T-TTT-----AAA--TACATTT--CAT---GC--AAA--AA------------T-A------------A----TA---G-A-T--------T-T-AT-AGT-CTTT---T-CAAA--A-ATC-A-G--CT-TTATT-CAC-A-AA--G-CA-T-G--T-ATT--TATA--GA-T--C-A-A----T-T--AAT--G-------A-T------AAT--------A-----------AT--------------CATT----TA--AT--T-ACACCCCAGTAT---T-GAA---CTT-CTG----ACC-TTTTCA----AA-G-C--T-CT-C-A-T--TTCT--AG-C---TTG-ATAT----CC-C---T---AN---T-AT-AAC----TTTTT----------------AGTT-----A-ATGGGC-A--AC-TGTTT-CAAT-G-C--AATAC--T-G-A---T-A-GTA----AG---CAC-TT-TTCAGA-G-AC--AATTCCTGC-ATGT--TT-AAGAT-AT-AAATA-T-A-TTG---GCT-AATT--G-ACTACTTAT--G-GTCGACA--T-A-T-CT-TCAG---TACT-ATA----C-AT-GT-TACATG------TAGAGGGTTTACAGG--TA--GGC-A-T-AGTTT---------G-------ACA----A--------------A-----T------------------TT-CTGCTT-TATACC--TGG-A-C-AAAATA--A-CAGC-TA-G-A-TC-A-GCTG--AGCACTG-TGATC-TAGTAAA-A---AATAAATA-TAAACTGGGT-T--GA--TA----AA-CA-----T-GTTGCA---AAA--GAC-AGTG-C-TCTAAATGGA-------G--C-AAG---A-TATTA-C-TT--GGG-G----CAGGT-ATA--ATG-GACA-AG---T-G-T--AAT-TAACA-TACCC-AAGGTC--CAG-----G--GATGGCAATTGT-GT-TGTGTTATTGTT-ATGA-AAAACA--TCACCCAC--ACCG-ACACACC-AATGT--GAT-CATTA--GGTA-CCT-GATGAA-TACTCTT-C-AAT-A--ATG-ACTTGT--------ATGGAAA-A--T-ATAGGGA-CTTTCA-G--T---TGTAGGAAAAT-AT-AGAAATAA-ATAG--GGACTTG-GACACC-CTG---CTCTTTG--CTA----GG-AC-AAAAGTT-AAACAG-TTTA-T-AATTTTTACA--G-TG-AG-C-AT---TTTC-CC-CAATT-GAA--TA--AAATCTTAT--GC-ATTA-T-T----------TAA---TCTCATTTG----C--ATGTAA-G--TG-T-TT-GTAAGT-------TGCATGTTT--AGAATTACAGT--AT-TT-A------T-CATC-A-T-A-AT--GAACT-CTGTTAAC---A--TTT-AAAATTAACC-AATA-ATAT-AGA----ATA-A-T-GAC-CATTAAA-TCTTTCAA-TTG--ACCACAATCG--CCA---ATTGACCACTA--TTTT-----GACCA-GTAGTTG-ACCGGTTTT-AA--CCAGTA--TTGACC--A-C-C--GGCCC----GGT-C-AA-TA-C------------TAGT--AT-T--GA---CCG----CTTTTTT--G-CCAAC
Reference ( family-2007 ) : CAGGGTTGG-GCGGTTAAAAC---------C-GCCCCCGG---TTT-A-A-CCAGCGG-TT-TTAACCGGTT-A-TA-A----C-CGCC-C----CG-GTCA--A-TACTC-CCAAAA--TG-GTCA--A--T-A-GT--GGT-CAA-T-A--T-GGTCAATTTGAAAATTT----A-----A-AGTG-T--CC-T--T--T-T-CCNA-T-TTT-----AAA--TACATTT--CAT---GC--AAA--AA------------T-A------------A----TA---G-A-T--------T-T-AT-AGT-CTTT---T-CAAA--A-ATC-A-G--CT-TTATT-CAC-A-AA--G-CA-T-G--T-ATT--TATA--GA-T--C-A-A----T-T--AAT--G-------A-T------AAT--------A-----------AT--------------CATT----TA--AT--T-ACACCCCAGTAT---T-GAA---CTT-CTG----ACC-TTTTCA----AA-G-C--T-CT-C-A-T--TTCT--AG-C---TTG-ATAT----CC-C---T---AN---T-AT-AAC----TTTTT----------------AGTT-----A-ATGGGC-A--AC-TGTTT-CAAT-G-C--AATAC--T-G-A---T-A-GTA----AG---CAC-TT-TTCAGA-G-AC--AATTCCTGC-ATGT--TT-AAGAT-AT-AAATA-T-A-TTG---GCT-AATT--G-ACTACTTAT--G-GTCGACA--T-A-T-CT-TCAG---TACT-ATA----C-AT-GT-TACATG------TAGAGGGTTTACAGG--TA--GGC-A-T-AGTTT---------G-------ACA----A--------------A-----T------------------TT-CTGCTT-TATACC--TGG-A-C-AAAATA--A-CAGC-TA-G-A-TC-A-GCTG--AGCACTG-TGATC-TAGTAAA-A---AATAAATA-TAAACTGGGT-T--GA--TA----AA-CA-----T-GTTGCA---AAA--GAC-AGTG-C-TCTAAATGGA-------G--C-AAG---A-TATTA-C-TT--GGG-G----CAGGT-ATA--ATG-GACA-AG---T-G-T--AAT-TAACA-TACCC-AAGGTC--CAG-----G--GATGGCAATTGT-GT-TGTGTTATTGTT-ATGA-AAAACA--TCACCCAC--ACCG-ACACACC-AATGT--GAT-CATTA--GGTA-CCT-GATGAA-TACTCTT-C-AAT-A--ATG-ACTTGT--------ATGGAAA-A--T-ATAGGGA-CTTTCA-G--T---TGTAGGAAAAT-AT-AGAAATAA-ATAG--GGACTTG-GACACC-CTG---CTCTTTG--CTA----GG-AC-AAAAGTT-AAACAG-TTTA-T-AATTTTTACA--G-TG-AG-C-AT---TTTC-CC-CAATT-GAA--TA--AAATCTTAT--GC-ATTA-T-T----------TAA---TCTCATTTG----C--ATGTAA-G--TG-T-TT-GTAAGT-------TGCATGTTT--AGAATTACAGT--AT-TT-A------T-CATC-A-T-A-AT--GAACT-CTGTTAAC---A--TTT-AAAATTAACC-AATA-ATAT-AGA----ATA-A-T-GAC-CATTAAA-TCTTTCAA-TTG--ACCACAATCG--CCA---ATTGACCACTA--TTTT-----GACCA-GTAGTTG-ACCGGTTTT-AA--CCAGTA--TTGACC--A-C-C--GGCCC----GGT-C-AA-TA-C------------TAGT--AT-T--GA---CCG----CTTTTTT--G-CCAAC
gi|1 : GGGTTCGTGCG-TTAAAAC---------C-GCCCCAGG---TTT-----CCAGCGGCTT-TTAACCGGTT-A-TA-A----CTCGCC-G----CT-GTCA--ACTACTC-CAAAAAAATG-GTCA--A--T-A-GC--GGT-CAA-T-AGCT-GGTCAAGT-GAAAATTT----A-----A-AGTG-T--CC-TA-T--T-T-CCAA-T-TTT-----AAAAATACATT---CAT---GCTCAAA--AA------------TTA------------A----TA---G-T-T--------T-G-AT-AGT-CTTTGGTC-CAAA--A-ATCCA-G--CT-TTATT-CAC-AGAA--G-CAAT-G--TTATT--TATT--GA-TTAC-A-A----T-T--AAT--G-------A-T------AAT--------A-----------AT--------------CATT----TA--AT--TTACACCCCAGTAT-----GAA---CTT-CTGG---ACC-CTTTCA----AA-G-C--T-TG-C-A-CA-TTCT--AGGC---T---ATAT----CC-C---T---AT---T-AT-AAC----TTTTTT---------------AGTT-----A-ATGGGC-ACCAC-CGTTT-CAAT-G-CC-AATAC--T-G-A---T-A-GTA-----G---CAT-TT-TTCAGA-G-AC--ACATC--G--ATGT--GA-AAGAT-AT-AAATAAT-A-TTG---GCT-AATT--G-ACTAACTAT--G-GTCAACA--T-ACT-CT-TCAG---TACTTATA----CCAT-GT--ACATA------TAGAGGGTT-ACAGG--TA--GAT-AAT-AGTTT---------G-------ACA----A--------------A-----TGAGAGACAAAATAATT--TT-CTG--T-TATACC--TGGGA-C-AAAA-A--A-CAGCGTA-T-A-TC-ACACTGGGAGCACTG-TGAT--TAGTAAA-------TAA-TA-TAAA-TGGGT----GA--TA----AA-CA-----T-GTTGCA---AAAAAGAC-AGTG-C-TCTAAATGGA-------GG-C-AAA---A-TATTA-C-TT--TGA-TT---CAGGT-ATACGATT-CACA-AG---TTG-TTAAAT-TAACA-TACC--AAGG-C--CAG-----GATGA-GGCAATTGT-GT-GTTGTTATTGTT-ATGA-AAAACA--TCACCCAC--ACTGTACACACC-AATGCTGGAT-CATCA--GGTATCCT-GTGGAATTACTCTT-C-AAT-A--ATGAACTTGT--------AC-GAAA-A--T-ATAGGGA-CTTTCA-G--TTTATATAGGAAAAT-ATAAGAAATAATATAG--GGACTT--GACA-C-CTG---CTCTTTG--CTA----GG-AC-AAAAGTTAAAAAAG-TTTA-T-AATTTTTACA--T-TGTAG-CAAT---TTTC-CC-AAATT-GAA--AA--AAGTCTTAT--GC-ATTATT-T----------TAATATTCTCATTTG----CAAATGTAA----TGTT-TT-GTAAGTGA-----TG---GTTT--AGA---ACAGTTAAT-TT-A------T-CATC-A-TGA-AT--GAACT-C-GTTAATACAA--TTT-AAA--TAACC-AATA-ATAT-AGA----ATA-ATT-GAC-CATATAA-TC-TTCAA--TG--ACCAC-ATCG--ACAGT-ATTGACCA-TA---GTT-----GACCA-GTTATTGTACCGGTCTTGAA--CCAGTA---TGA-C--A-C-TGGGGCCC----GGTCC-AA-CACC------------TAGT--AT-T--GA---CAG----CTTTTTTTGG-CCAAC
gi|10 : -T-G--T-ATT--TATA--GA-T--C-A-A----T-T--AAT--G-------A-TTTGA--AAT--------A-----------ATTATATATGAAATACCATT----TA--AT--T-ATACCCCAGTAT-----AAG---CTT-CTG----ATC-TTTTCA----AA-G-C--T-CT-C-A-T---------------------AT----CC-C--------A---T-AT-AAC----TTTTT----------------AATT-----C-ATAGGC-A--AC-CGTTT-TAAT-G-C--AACAC--T-G-----------A----AG---TAC-TT-TACAGA-G-----AATT-CTGC-ATGT--TC-AAG---AT-AAATA-T-ATTTG---ATT-AATT--G-ACT----------------A--T-A-T-CT-T-AG---TACT-ATAC---C-AT-G--TACATGTATAA-TAGAGGG-TTACAGG--TACTAGC-A-T-AGTTT---------G-------ATA----A--------------cc
gi|11 : -A----C-CGCC-C-----G-GTCACAG-TACTC-CCAAAA--TG-GTCA--A--TTA-GT--GAT-C-------------CAAT--GGGAATT-----------A-CGTG-T--CC-T--T--C-T-CCCAAT-TTTCTAACAAA--TA-ATT---CAT---GC--AAA--AA------------T-A------------A----TA---G-ATT--------T-T-AT-AGT-C--T---T-CAAAGTA-ATC-A-A--GC-TTATTACACAA-AA--G-CA-T-GGAT-AGT--TATC--GA-TC-C-G-A----T-T--AATACG-------ATT------AAT--------A-----------A---------------CATTATCCTA--A-----AAACCCCAATGA---T-GAAACTTTT-CTGTGACACCATTTTCA----AA-GAC--T-TT-TGA-A--TTCTTCAG-C---GTG-ATAT----CCACCTAT---AC---T-AT-AAC----TTtgagagacaaaata
gi|12 : CAGGGTTGG-GCAATTAAA--------------------------------CCAGCGG-TT-TTAACCGGTT-A-TA-A----C-CG-C-C----CG-GTCA--A-TACTC-CCAAAG--TG-GTCATTAGCT-A-GT--GGT-C-A-T-A--------AATT--GAAATTT----A-----A-AATG-T--CC-T--T--TCT-CCTA-T-GTT-------A--TACATTT--CAT---GA--AAA--AA------------C-A------------A---------------------------------CTTT----------------------------TT-CAC-G-AA--G-CC-T-A--T-AAT--TATA--GA-T--G-A-A----T-T--AA---G-------------------------------------------------------TATT----TA--ATTAT-ACACCCCTGCATGTAT-AAA---CTT-CTG----AGC-TTTTCAAATTAA-G-C--T-CT-C-A-T--TTGT--AG-C----TG-ATAT----TC-C---C---A------AT-AAC----TTTTT----------------AG
gi|13 : ------TAGAGGGTT-ACAGG--TA--G-C-A-T-AGTTT---------G-------ACA----ATGAGAGACACAATGA-----T------------------TT-CTGCTT-C-TACC--TGG-A-C-AGAATA--A-CAG-----G-A----A-GCTG--AGCACTG-TGATC-TAGC----A---AATAGATA-TAAACTGGG--T--GA--TA----AA-CAATG--T-GTTGCA---GAA--G---AG------------------------------------ATTA-C-TT--GGG-GATTATAGAC-AAA--GTG-GGCA-AG---T-GTT--AAT-TAACA-TA
gi|14 : atatatacCAGGGTTGG-GCGGTTAAAAC---------C-ACCC--------------------GG-TT-TTAACCAGT-----------------------------CA--A-AATTC-CCAAAA--TG-GTCA--A--T-A-------C-CA----------GTCAACT--GAAATTC----A-----A-AGTG-T--CCTT--T--T-T-CCTA-T-TTT-----AAA--T--ATTT--CAG---GC--AAA--AATAAAGATATATTT-A------------A----CA---G-A-T--------T-T-GT-AGT-C--T---T-CAAA--A-ATC-A-A--TC-TTA-T-CAC-A-AA--G-CA-T-G--T-GTT--TATA--GA-T--G-A-A----T-taccagccatgaaaactgtaaagatcacccaca
gi|15 : CAGGGTTGG-GCGGTTAAAAC---------C-GCCCCCGG---TTT-A-AACCAGCGG-TT-TTAACCGATT-A-TA-A----C-CGCC-CCGGGCG-GTCA--A-TACTC-CCAAAT--TG-A-----------------------------------AATTT--AAATTC-----------------T--CC-T----------------TTT-----AAA--TACATTT--CATGCCGC--AAA--AATAAAGATATAT-T-A------------A----TA---A-A-T--------T-T-AT-AGT-CTTT---T-CAAA--C-ATC-A-A--CT-TTGTT--AC-A-AA--G-CA-T-G--T-Agcaaagatt
gi|16 : AAATAA-ATAG--GGACTT--GACACC-CTG---CTCGTTGCTCTA----GG-AC-AAAAG-T-GAACAG-TTTT-T-GATTTTTACA--G-TG-AA-C-AT---TTTC-CC-CAATT-TAA--CA--AAATCTGAT--GC-ATTA-T-TTTAATATTAATAA---TTTCATTTG----T--ATATAA-G--TG---TT-GTAAG--------TGCATGTTT--AGAAT-----T--AT-TT-A------T-CATCAA-T-A-AT--GAACT-CT-TTAA
gi|17 : TTGCAGT-----TT-A------C-CAT--A-T-A-AT--GG-CC-ATTTTAGC---A--TTT-GAAAT-AACC-CATA-ATG---GACTATATA-A-T-GAT-CG---AG-T--TTCAA-T-G--ACCA--ATC-----A---ATTTTCAAGTA--CT-------GACCA-G-AGT-G-ACCG-TTTT-AATACCAGTAATTTGACC--A-CGC--AACCCC---AGT-C-AA-TA-C------------TAGT--ATAT--GA---CCA----GTTTTTT--G-CCAAC
gi|18 : acACAGT--AT-TT-A------T-CATC-A-T-A-AT--GAACT-C-GTTATC---A--TTT-CAA--TAACC-AATA-ATAT-AGA----A-----------------A-TCTT-CAA-TTG--ACCACAATCN--NNN---NNNNNNNNNNN--NNNN-----NNNNN-NNNNNNN-NNNNNNNNN-NN--NNNNNN--NNNNNN--N-C-C--GGCCC----GGT-C-AA-TA-C------------TAGT--AT-T--GA---CCG----CTTTTTT--G-CCAACcc
gi|19 : CAGGGTTGG-GCGGT-AAAAC---------C-GTGTCC-----------------TGG-TT-TTAACCGATT-A-TA-G----TGCGCC-CG---AG-ATCA--A-TAATC-GCA------G-G-----A--T-A-GT---GT-CAAGT-AC-T-GGT-AATATG-AAATTT----------A-AGTG-T--CT-T--T--T-T-CCT--T-TTT-------A--TA---TT--CAT---GC--AAACGAA------------A-A------------G----TA---A-G-T--------T-T-CT-Acct
gi|2 : T-TTAACTGGTT-AATA-AACACCGCGCC-C----TG-GTCA--A-TGC---CAAAAA--TG-GTCA-----T-ACGT--G---CA--T-AC-T-GGTACATTTGAAAGT------A-----A-AGTG-T--CC-TG-T--T-T-CCAA-T-GTT-----TAA--TACATTG--CAT---GC--AAA--AA------------T-A------------A----TA---G-AAT--------T-T-AT-AGT-CTCC---T-CAAA--A-AAT-A-G--CTCTTACT-TAC-A-----T-CA-T-A--T-ATT-----A--GAAT--C-A-A----T-TTAAGT--AC------A-T------AATGC------A-----------A----------------ATT----TA--AT--T-ACATCCCAGTAG---T-GAA---CTTGCTG----GAC-CTTTCA----AGCG-C--T-CT-C-AGC--TTCT--AG-C---GTG-AT-------C-C---C---ATGTCT-AT-AAC----TTTTT----------------AGTTTGACTA-A-GGGC-A--AC-TGTTT-CAAT-GGC--AATACA-T-G-AGGAT-A-GTT----AGGCACAC-TTATTCAGA-G-AC--AATTCC-GC-ATGGGGTT-AAGAT-AT-AA-TA-T-A-TTGATGGCTTAATG--G-A--ATCTATCAG-GTCAACAGTTGA-T-CTATCAGACTTACC-AGA----C-ATTGT-CAC-----------GAGGGGTTACAG---TA--GGTTA-TTAGTTT---------G--------CA----A--------------A-----TGAAGACATAAAATAATTATC-CTGCTT-TATACCAGTGG-A-CCAAAATA--AACAGA-TA-G-A-TCCA-G-TG--AGCA-TG-TGATC-TA-TAAA-AC--AATAG----TAAACTGGGTGTCAGA--TA----AAACA-----T-GTTGCATCAAAA--GAC-AGTG-A-TCTAAATGGA-------A--CCAAGTTCA-TAT-A-C-TT--GGG-GTA--CAGGT-ATA--ATG-G-CA-AG---T-G-T--TATATAACA-TTACC-AAG--T--CAG-----G--AATG-CAATTGTTGT-TGT--TAT-GTT-ATGA-AAAACAGTCCACCCACCAACTG-ACACAC--AATGT--GAC-CAT-A--GGTA-CCT-GAT-AA-TACTCTT-CCAAT-A--ATG-ACTGGT--------TTGGAAAGA--T-ATAGGG--CTTTCA-AACT---TATAGGATAATTAT-AGAAATAA--TAG--GGACTTG--ACACCTCTT---CTCTT-G--CTA----TG-AC-GAAAGTT-AAATAG-TTTA-T-AATTTTTTCA--G-TG-AG-C-AT---TTTC-CC-CAA-T-GAA--TA--AAATC-TAT--GC-ATTA---T----------TAA---TCTCACTTG----C--ATGTAA-G--TG-T-TT--TAAG--------TGCATG-TT--AGAATTACAGT--ATATT-A------T-CATC-A-T-A-AT--GAACT-GT-TTAAC---A--TTT-AAA--TAACC-AATA-ATAT-AGA----ATA-A-T-GAC-CATTAAA-TC-TTCAA-TTG--ACCACAATCGA-CCAGT-ATTGACCACTG----TT-----GACCA-GTAA-CG-A-CGGTTTT-AA--CCAGTA--TTGACC--A-C-C--ACCTCCACGGGT-CAAA-TA-T--------------GT--A--T--GACACCCGA---C--TTTT--G-CCAACaaaacatttt
gi|20 : tggcattaaaaataccgccaactgagtttagaaaacctatcagata---A--TTT-AAA-CTAACC-AATA-ACAT-AGA----ATA-A-T-GAC-CATTAAA-TCTT-CAA-TTG--ACCACAATCN--NNN---NNNNNNNNNNN--NNNN-----NNNNN-NNNNNNN-NNNNNNNNN-NN--NNNNNN--NNNNNN--N-C-C--GGCCC----GGT-C-AT-TA-C------------TAGT--AT-T--GA---CCT----TTTTTTT--G-CCAACcc
gi|21 : tTCAAC---A--TTT-AAA--TAACC-AATA-ACAA-ACT----GTA-A-T-GAC-CAATCAA-T-TTTCAA-TCA--ACCA-----G--T-----ATTGACCACTA---------------------TTG-ACAGGTTTT-AA---CAATA--TTGACC--A-C-C--GGCCC----GGT-C-AA-TA-C------------TAGT--AT-T--GA---CCAGGTTTTTTTTT--G-CCAACcct
gi|22 : ttataaacttgccactAG--GGACTTG--ACACC-CTG---TTCTTTG--CGA----GG-TC-AAAAGTT-AAACAG-TTTT-T---TTTTTACA--G-TG-AG-C-AT---TTTC-CC-AAA----AA--CA--AAATCTTAT--GC-ATTA-T-T----------TAA---TTTTATTTGCACAC--ATGTAA-G--TG---TT-GTAAG--------TGCATGTTT--AG
gi|23 : G-GACA-AG---T-G-TT-AAT-TAACA-TACCT-AAGGTT--CAG-----G--GATGGCAATTGT-GT--GTATTATTGTT-ATGA-AAA-CA--TTACCCAC--ATTT-GCACACC-AATGT--GAT-CATTA--GGAA-CCC-GATGAA-TACTCTT-C-AAT-A--ATG-ACTTG
gi|24 : ----A--------------A-----T------------------TT-CTGCTT--ACGCC--TGG-A-C-AGAAAA--A-CAGG-T---------A-GCCG--AACAC---TGATC-TAGTAAATACCCAATACATA-TACAATG---------------------------T-GTTACA---AAA--GAC-AGTG-C-TT---ATGGA-------G--C-AAG---A-GATT
gi|25 : gacaatgagagacaaaatATA-ATAA-AGACTCAATA-A-T-GAC-TAATAAA-T-TTTCAA-TT---------------------ATTGAACACTA--------------------GT-G-ACCGGTTTT-AA--CCAGTA--ATGACC--A-C-T--GGCAG----AAT-C-AA-TA-C------------TAGT--AT-T--GA---CCA----CTTTTTT--G-CCAAC
gi|26 : TGACCAATAAATTTTCAATCAACTA-TTA-TTG-GCCAGTTTT-AA--CCAGTA--TTGACC--A-C-T--TGCCC----TGT-C-AA-TA-CTACTATTGACTCTAGT--AT-T--GA---CCA----CTTTTTT--G-CCAACcct
gi|27 : aCAGGGCTGG-GCGGTCAAAACTGTCCCAACC-GTCCCCGG---TTTTA-A-CCAGCAG-TT-TTAACCGGTT-G-TA-A----C-CGCC-CCG--CG-GTGA--A-CACTC-CCAAAA--TG-GTCA--A--T-A-GT--GGT-Ccctg
gi|28 : CAGGGTTGG-GCGGTTAAAAC---------C-ACTCCCGGT--TTT-A-A-CCAGCAG-TT-TTAACTG--------------C---CC-C----CA-GTCA--A-TGCTC-CCAAAA--TG-GTCA--A--T----T--G-------------------------AAATAT----A-----A-AGTG-T--CC-T--T--T-T-
gi|29 : AA--TACATTT--CAT---GC--AAA--AA------------T-A------------A-----A---G-A-T--------T-A-ATGAATACATA---T---AT--A-CTC-A-G--CT-TTATT--AC-A-AA--G-CA-T-G--T-ATTAATATA--GA-T--C-A-A----T-T--AAT--G-------A-TTTTA--AAT--------A-----------AT--------------TAt
gi|3 : AGGGTTGG-GCGGTTAAAAC---------C-ACCCCCGGGTTTTT-ATA-CGAGCGG-TT-T-AACCGGTT-A-TATA----C-CGTCTC----CGCGTCAC-A-TACTCTCCAAAA--TG-GTCA--A--T---GT--GGT-CAA-TTAC-T-GGT-AATTTGAGAATTT----A-----ATAGTG-TTGCC-TGTTGGT-T-CCGA-TATTT-----TAA--TACATTT--CAT---GC--AAA--AA------------T-G------------AGAAGTATT-A-A-T--------T-A-AT-AGT--TTA---T-CACT-----TC-A-GA-CT-TTATT--AC-A-AA--G-CA-TTGC-T-ATT--CATA--GA-T--CCA-A----T-T--AAT--GTTTTTAAA-T------AATTATACTGAA-----------ATGT------------CATT----TATTGT--T-ATACCCCGGTAA---T-GA----CTT-CTG----ACC-TTTTTA----GA-G-C--G-CT-C-A-T--TTCTA-AG-C---TGG-ACATATCACC-C---T---AT---T-TT-AACTT--TTTTT----------------AGTA-----AGATCGGC-A--AC-TGTT-----T-G-C--AATAC--T-GAA---T-A-GTACTATAG---CACTTT-TTCAGATG-GCCAAATTCTTGC-ATGT--TT----AT-----AGTA-------------T-AATT--GCACTAC-TGT--G-GTTGACA--T-A-T-CT-TTAC---TACT-ATATC--C-AT-G--TACATGTATACTTAAAAGG-TTACAGG--TG--AGC-ATT-AGTTTGCAATGAGAG-------ACAAAATA--------------A-----T------------------TT-CTGC-T-TATACC--TGG-ACC-AAAATACGA-CA---TACG-ATTC-A-GCTG--AGCACTGTTGATC-TAGT----A---AATAAATA-T-AACTGGGT-T--GGATTA----AA-CAATTTGT-GTTGC----AAA--GAC-------------ATAGT-------G--C-A-----G-TATTA-C-TT---GG-A----CAGGT--TA--ATATGACACAGTGTT-G-T--AAT-T-ACATTACCCTAGGGTC--TAACCTGTG--GATGGCAG-TGT-GT-C-TGTTATTTGT-ATGA-AAAACA--T----CAC--ACC--ACACA-C-AAT-T--GATGCATTA--GACA-C--------------CTT-C-AGT-AGTATG-AC-TGT--------ATGGAGA-GACT-ATGGGAA-C
gi|3 : TAGACA-CCTTCA-G--T---AGTATGACTGT-AT-GGAGAGACTATGG--GAACGTC-GACCCG-CTGACTCTCTTTGT-CTA----TGCAC-AAAAGTTTAAACAG-TTTG-TTGATTTTCACATGG-TG-AG-C-ATGAGTTTC-CCGCATTTTGAACTTATCAAATCTTGTAGGC-ATTA-T-T----------TAA---TTTC-TTTT----C--ATGTAA-G--TG-TACT-G-AAGT-------CA-ATGTTT--A-AATTACAGT--AA-AT-AATACACT-CAAC-AGT-AGAT--GAACTGCT-TTAAC---AAATTA-AAAATAAGCT-CATATATAT-ATA----ATA-A-TTGAC-CATTAAA-TTCTTCAAGTTG--ACCACTATCG--CCA---GTTAATGACCG--TATT-----GACCATGTGGG-G-ACCG-TTTT-AA--CCAGTA--T-GACC--AAC-T--GACCC----GGT-CCAA-TA-C------------TAGTACAT-T--GA---CCG----CTTTTTT--G-CCAACgtcgacccgctgactctctttgtctatgcacaaaagtttaaacagtttgttgattttcacatggtgagcatgagtttcccgcattttgaacttatcaaatcttgtaggcattatttaatttcttttcatgtaagtgtactgaagtcaatgtttaaattacagtaaataatacactcaacagtagatgaactgctttaacaaattaaaaataagctcatatatatataataattgaccattaaattcttcaagttgaccactatcgccagttaatgaccgtattgaccatgtggggaccgttttaaccagtatgaccaactgacccggtccaatactagtacattgaccgcttttttgccaacc
gi|30 : agggttgggcggttaaaaccacccccgggtttttatacgagcggtttaaccggttatataccgtctccgcgtcacatactctccaaaatggtcaatgtggtcaattactggtaatttgagaatttaatagtgttgcctgttggttccgatattttaatacatttcatgcaaaaatgagaagtattaattaatagtttatcacttcagactttattacaaagcattgctattcatagatccaattaatgtttttaaataattatactgaaatgtcatttattgttataccccggtaatgacttctgacctttttagagcgctcatttctaagctggacatatcaccctattttaactttttttagtaagatcggcaactgtttgcaatactgaatagtactatagcactttttcagatggccaaattcttgcatgtttatagtataattgcactactgtggttgacatatctttactactatatccatgtacatgtatacttaaaaggttacaggtgagcattagtttgcaatgagagacaaaataatttctgcttatacctggaccaaaatacgacatacgattcagctgagcactgttgatctagtaaataaatataactgggttggattaaacaatttgtgttgcaaagacatagtgcagtattacttggacaggttaatatgacacagtgttgtaattacattaccctagggtctaacctgtggatggcagtgtgtctgttatttgtatgaaaaacatcacaccacacacaattgatgcatAATCG--ACC---ATTAANNNNNN--NNNN-----NNNNN-NNNNNNN-NNNNNNNNN-NN--NNNNNN--NNNNNN--N-C-C--AGCCA----GGT-C-AG-TA-C------------TAGT--AA-T--GA---CCA----CTTTTTT--G-CCAACc
gi|31 : -----T-GTTGCA---AAA--GAC-AGTG-C-TT---ATGGA-------T--C-AAA---A-GATTA-C-TT--GGG-GA---CAGGT-ACA--TTT-AACA-TG---T-GTT--AAT-TAACA-TACCC-Ac
gi|32 : atg--CT-T--T--T-T-CTTA-T-TTT-----A----TACATTT--CAT---GC--TAA--AA------------T-ATAGATACATTTGA----TA---G-A-T--------T-T-AT-AGT-CTT
gi|33 : GTT-A-TG-A----T-CGCC-C----CG-GTCA--A-TACTC-CCAAAG--Taattaa
gi|35 : gttA-ATAG--GGACTTG--ACACC-CTG---CTCTTTG--CTC----GG-AC-AAAacatgt
gi|36 : AGGGTTGG-GCAGTTAAAAC---------C-ATCCCCGG---TTT-A-
gi|4 : AGGGTTGG-GCGGTTAAAAC---------CCGCCTCCG----TTT-A---CCAGCGG-TTGTTAACCGCTT-A----A----C-CGCC-C----CG-GTCA--A-TACTC-CCAAAA--CGTGTCA--A--T-A-GTTTGGT-CAA-T-C--T-GGTCTAATTGAAA-TTT----A-----A-AGTG-C--TC-C--T--T-T-CCAA-T-TTT-----AAA--TACATTTTTCATT--GC--AAA--AAA-----------T-A------------A----TA---GGA-T--------T-TCAT-AAT-CTTT---T-CAAA--AGAGT-A-G--CT-T-ATC-AGC-A-AATGG-CA---G--T-ATTCTTTTT--GA-TTCC-A-AATTAT-T--AAT--G-------A-T------AAT--------A-----------AT--------------CATT----TA--AT--T-ACACCCCAGTAT---T-GAA---CTTTCTG----ACC-TTTTCA----AA-GAC--T-CTTC-A-TCATTCT--GG-CGGATTG-AT-C----CC-C---T---AA---TTATTAAC----TTTTTT---------------AGTT-----A-ATGGGC-A--GCCTGTTTTCAAT-C-A--AATAC--T-G-A---TTA-GCT----AG---CAC-TT---CAGA-GGAC--AATTC-TGC-ATGT--TTTAAGAT-AT-AAATA-TCA-TTG----CT-AATTTTG-ACTACTTAT--G-G-CAACA--T-A-T-CT-TCAT---TACT-ATA----CCAT-GT--ACATG------TAGACGGGTTACAGGACTA--TAT-A-T--GTTT---------G-------ACA----ATGAGAGAAAAAAA-A-----T------------------TTTCTGCTT--ATAC---TGG-A-C-CAAATAT-A-CAGC-TA-GGA-TC-A-CTTG--AGCACTG-TGATC-TATTAAA-------TAAATACTAAACTCGGT----GA--TA----AAACA-----TTGTTGCA---AAAA-GAC-AGTGTC-TCCAAATGGGAGTGTCGG--C-GAGGAGA-TATTA-CCTT--GGGTG----CAGGT-ATA--ATG-GACA-AG-----G-T--AAT-TAACA-TACCC-AAGGTC--CAG-----G--GATGGCAATTGT-GT--GTGTTATTGTTTATGGCAAAACA--TCACCCAT--ACTG-ACACACA-AATGT--GAT-CATTA--GGTA-C-T-GATGAA-TACCCTT-C-AAT-A--AT----------------------------------GA-CTT------------GTAGGAAAAT-AT-AG-------------GGACTTTTGACACC-CTG---CTCTTTG---TA----GG-AC-AAAAATT-AAATAG-TTTAGT-AATTTTTACAC-G-TG-AGGC-AT---TTTCACC-CAAT--GAA--TA--AA-TCTTAT--GC-ATTA-TGT----------TAA---TCTCATTTG----CCAATGTAATGCTTG-T-TT-GCAAGT--------GCCTGTCTTAAGAATTATAGT--AT-TTTA------TTCATC-T-TTA-ATCAGAACT-CCGT-AAC---A--TTTTAAAAATAACCCAATA-ATATGAGA----ATATG-T-GATTCATTAAGCTTTTTCAA-TTGGCACCACAATCGAGCCAGATATTGACCACT----TAT-----GACCA-GTA-TTG-ACTGGTTTT-AA--CCATTA--TTGACCCAA-C-C--GGCCC-----GT-C-AATTA-C------------TAGTC-AT-TGGGA---CCG----CTTTTTt
gi|5 : CAGGGTTGG--CGGT-AAAAC-----------GCCCCCG----TTT-A-A-CCAGCGG-TT-TTAACCGGTTTA-TA-A----C-CGCC-C----CG-GTCA--A-TACTC-CCAAAA--TG-GTCA--A----A-GT--GGT-CAAAT-A--T-GGTCAATTTGAAAATTTTTACA-----A-AGTG-T--CC-T--T--T-T-CCAA-T-TTT-----AAA--TACATTT--CATAT-GC--AAA--AA------------T-A------------A----TA---G-A-T--------T-T-AT-AGT-CTTT---G-CAAA--A-ATC-A-T--CT-TTATT-AAC-A-AA--G-CA-T-G--T-ATT--TATTTTGA-T--C-ATA----T-T--AAT--G-------A-T------AAT--------A-----------AT--------------CATT----TA--AT----ACACCC-AGTAT---TTGAA---CTGATTG----ACC-TTTTCA----AA-G-C--TGCT-C-G-T--TTCT--AG-C---TTG-ATTT----CC-C---T---AA---T-AT-AAC----TTTTT----------------AGTT-----A-ATGGGCCA--AC-TTTTT-CAATTG-CCGAATAC--T-G-A---T-AAGTA----AG---CAC-TT-TTCAGA---AC--A-TT--TGC-ATGT--TT-AAGAT-A--AAATA-T-A-T-G---GCT-AAT---G-ACTACTCAT--G-GTCAACA--T-A-TGCT-TTAG---TACT-ATA----C-AT-GT-TACATG------TAGAGGTTTTACAGG--TA--TGT-A-T-AGTTT---------G-------ACA----A--------------A-----T------------------TT-C-GCTT-TATACC--TGG-A-C-AAAATA--A-CAGC-TA-G-A-TC-A-GCTG--AGCACTG-TA--C-TAGTAAA-AT--AATAAATA-TAAACTGGGT-TT-GA--TA----AA-CA-----T-GTTGCA---AAA--GAC-AGTG-CCTCTAAATGGA-------G--C-AAG---A-TATTA-T-TTTTGGGTGT---CAAGTTATA--ATG-GACA-AG---T-G-T--AAT-TAACA-TACCC-AAG--T--CAG-----G--GATGGCAATTGT-GTCTGTGTTATTGTT-ATGA-AGAACA--TCACCCAC--ACCG-ACACACCCAATGG--GAT-CATTATCGGTA-CCTTGATGAA-TACTCTTTC-AATTA--ATG-ACTTGTTTTTTTCTATGGAAA-A--CCATAGGGAACTTTCAAG--T---TTTAGGAAAAT-AT-AGAAATAA-ATAG--GGACTTG-GACACC-CTG---CTTTTTG--CTA----GG-ACGAAAAGTT-AGATAG-TTTA-T-AATTTTTACA--GGTG-AG-C-AT---TT-C-CC-CAATT-GAA--TA--AAATCT-AT--GCCATTA-T-T----------TAA---TCTCATT-G----A--A-GTAA-G--TG-T-TTTGGAAGT-------TGCATGTTT--AGAAT-ACAG---AT-TT-A------T-CATC-A---A-AT--GAACT-CTGTTAAC---A--TTT-AAAATTGCCC-AA-A-ATAT-AGT----ATA-A-TTGAC-CATTAAA-TCTTTCAA-TT---ACCACAATCG--CCG---ATTGACCACTA--TTTT-----GACCA-GTAGTTG-ACCGGTTTT-AA--CCAGTA--TTGACC--A-C-C--GGCCG----CGT-C-AA-TA-C------------TAGT--AT-T--GA---CCG----CTTTTTT--GCCCAAC
gi|6 : -T--CT-T--T--T-C-CCAA-T-TTT-----AAA--TACATTT--CAT---GC--AAA--AA------------T-A------------A----TA---G-A-T--------T-T-AT-AGT-CTTT---TTCAAA--A-ATC-AAG--CC-TTATT-TAC-A-AA--GGTA-T-G--T-ATT--ATTT--GA-T--C-A-AC---T-T--AAT--G-------A-T------AAT--------A-----------AT--------------CATT----TA--AT--T-ACACCCCAGTAT-----GAA---CTT-CTG----ACC-TTTTCA----AA-G-C--T-CT-C-A-T--TTCT--AG-C---T-G-ATAT----CC-CC--T---AT---T-AT-AAC----TTTT-----------------AATT-----A-ATGGGC-A--AC-TGTTT-CAAT-G-C--AATAC--TTG-A---T-A-GTA-----G---CAC-TT-TTCAGA-G-AC--AATTCATGC-ATGT--T--AAGATTATTAAATA-T-A-TTG---GCT-AATT--G-ACTACTTAT--GTGTCAACA--T-A-T-CT-T-AG---TACT-ATA----CCAT-GT--ACATG------TAGAGGGTT-ACAG---TA--GAT-A-T-AGTTT---------G-------ACA----ATGAGAGACAAAATAA-----T------------------TT-CTGCTTATGTACC--TGG-A-C-AAAATA--A-CAGC-TA-G-A-TC-A-GCTGT-AGCACTG-TGATC-TAGTAAA-------TAAATA-TAAACTGGGT----GA--TATA--AA-CA-----T-GTTGCA---AAA--GAC-AGTG-C-TCTAAGTGGA-------G--C-AAG---A-TATTA-C-TT--GGG-T----CATGT-ATA--A-G-GACA-AG---T-GTT--AAT-TAACA-TACCC-AAGGTC--CAT-----G--GATGGCAATTGT-A--TGTG-TATT-TT-ATG--AAAACA--TCACCCACA-ACTG-ACACACC-AATGT--GAT-CATTA--GGTA-CCT-GAAGAA-TACTCTT-C-AAT-A--ATG-ACTTGT--------AT-------------------------------------GGAAAAT-AT-AGAAATAA-ATAG--GGACTT--GACACC-CTG---CTCTTTG--CTA----GG-AC-AAAAGTT-AAATAGTTTTA-T-AATTTTTACA--G-TG-AG-C-AT---TTTC-CC-CAATT-GAA--TA--AAATCTTAT--GC-ATTA-T-T----------TAA---TCTCATTTG----C--ATGCAA-G--TG---TT-GTAAG--------TGCATGTTT--AGAATTACAGT--AT-TT-A------T-CAAC-A-T-A-AT--GAACT-C-GTTAAC---A--TTT-AAAA-TAACC-AATA-ATGT-AGA----ATA-A-T-GAC-CATTAAA-TC-TTCAA-TTG--ACCACAATCN--NNN---NNNNNNNNNNN--NNNN-----NNNNN-NNNNNNN-NNNNNNNNN-NN--NNNNNN--NNNNNN--N-C-C--GGCCC----GGT-C-AA-TA-C------------TAGT--AT-T--GA---CCG----C-TTTTT--G-CCAAC
gi|7 : gtCAGGGTTGG-GAGATTAAAAC---------C-ATCCCTGG---TTT-----------------TCACCAGTC----------------------------CA--A-AACTC-CCAAAA------------------GT--GGTTCAA-T-A--CCGGTCAATT-GAAA--TT----ATCACTA-ACTGCT--CC-T--T--T-TTCCTA-T-TTT-----TA---TATATTT--CAT---CA--AAA--AA------------T-A------------A----AACAGG-A-T--------T-T-GT--GT-C-TT---T-CAAA--A-ATC-A-AATCT-TTA-T-CAC-A-AA--G-CA-T-AT-T-GGT--TATA--GA-T--G-A-A----TGT--AAT--G-------A-TAAACAAAAT--------AAGAAATGAAATAT--------------CATT----TA--AT--T---------GTA----T-GAA---CTT-C-G----ACCTTTTTCA----AG-G-CTAT-CT-CTA-T--TTCT--AG-----TTGCATAT----TT-C---T----C---T-AT-AAC----TTTTTAGTATGTCGTTTTTTGAGTT-----ATATAGGCGA--AC-TATTT-TAAG-G-C--AATACTTT-G-C---T-A-GTA----A----CAG-CT-TACAGA-G-AC--AATT-TTGCAAAGT--AT-AAGAT-AT-cc
gi|7 : T-ATA----T-GT-GTATACTTG-------ATAGGAGTTACAGG--TA--G-C-A-T-AGTTTT--------GTCATTATGCA----A--------------AGACGTT------------------TT-TTGCTG-TATATC--TTG-A-TTGGAGTA--AACGGG-TA--------A-GTTG--AACACTG-TGATCGTAGTAGA-A-----TAAATA-TAAACTGGGT----GA--TATTAAAA-CAATGT-T-GTTGCA---AAA--GACCAGTG-C-TT---ATGGA-------GATC-AAA---AAGATTAAT-TT--GGG-GA---CAGGT-ACA--ATG-GACA-TG---T-G-T--TAA-TAACA-TACCA-AGGGTCCTCAG-----G--GA-GGCGAttagaatggtacatttttaaaccattcgtaatctgtcacttctgtggtccacaacctatattgctctcagtttacgtattatccgatttgtactgatgtacatggtatatgtgtatacttgataggagttacaggtagcatagttttgtcattatgcaaagacgttttttgctgtatatcttgattggagtaaacgggtaagttgaacactgtgatcgtagtagaataaatataaactgggtgatattaaaacaatgttgttgcaaaagaccagtgcttatggagatcaaaaagattaatttggggacaggtacaatggacatgtgttaataacataccaagggtcctcagggaggcga
gi|8 : cagggttgggagattaaaaccatccctggttttcaccagtccaaaactcccaaaagtggttcaataccggtcaattgaaattatcactaactgctcctttttcctatttttatatatttcatcaaaaaataaaacaggatttgtgtctttcaaaaatcaaatctttatcacaaagcatattggttatagatgaatgtaatgataaacaaaataagaaatgaaatatcatttaattgtatgaacttcgacctttttcaaggctatctctatttctagttgcatatttctctataactttttagtatgtcgttttttgagttatataggcgaactattttaaggcaatactttgctagtaacagcttacagagacaattttgcaaagtataagatatttagaatggtacatttttaaaccattcgtaatctgtcacttctgtggtccacaacctatattgctctcagtttacgtattatccgatttgtactgatgtacatggA-ATAGAAGGATTTG--ACACC-CTG---CTCTTTG--CTACCTAGA-AC-AAAAGTT-AAACAG-TTTT-T-GATTTTTACA--G-TC-AG-C-AT---TTTC-CC-CACTT-TAA--GA--AAATCTTAT--GC-ATTA-T-T----------TAA---TTTAATTTG----C--ATGTAA-G--TG---TT-GTAAGTCATAAAGTGCATGTTT--AGAATTACAGT--AT-TT-A------T-CATC-A-T-A-AT--GAA-T-CT-TTAA-----------AAAATAAACC-AGTA-ATAT-AGA----ATA-A-T-GAC-CAATAAA---TTTCAA-TTG--ACCAT--T----------ATTGACCACTA---------------------TTG-ACTGGTTTT-AA--CCCGTA--TTGACC--A-C-C--AGCCC----GGT-C-AA-TA-C------------TAGT--
gi|9 : ag-T--T--T-T-CCTA-T-TTTT----AAA--TATATTT--CAT---GC--AAA--AA------------T-A------------A-----A---G-A-TGCATTTAATAT-AT-AGT-CTTT---T-CAAA--A-AAC-G-A--CT-TTATT--AC-A-AA--G-CA-T-G--T-ATT--TATA--GA-T--C-A-A----T-T--AAT--G-------A-TTTGA--AAT--------A-----------AT--------------TAT
gi|9 : cat-ATAT----CC-T---TTTTAG---T-AT-GACGTATTTCTTG---------------AGTT-----A-ATGGGC-A--AC-TGTTT-TAAT-G-C--AATAC--T-G-A---T-A-GTATTC-AG---CAC-TT-TACAGA-G-AC--AATT-CTGC-ATGA--TT-AA-------AGA---------------T-AATT--G-ACTAC-TGT--G-GCCGACA--T-A-T-CT-TCAG---TACT-ATAATACC-AT-G--TACATatgaaatatcctttttagtatgacgtatttcttgagttaatgggcaactgttttaatgcaatactgatagtattcagcactttacagagacaattctgcatgattaaagataattgactactgtggccgacatatcttcagtactataataccatgtacat
blockSeqs : . TGTCCCAAC C GGTTTTTATA . G AATAAACACCG T CGGGC C CA . T . T ATAGTTTGGTCAATCTGGTCTAATTGA ATCACT T C TG T GT GG C T C A A CTAACA . TT GCC . CG TAAAGATATATTTAACAGAT TC G A T TT GTA . AAT C AC A . TG G . T GA . AA TTT A TC C T ATTA G TA AC ATTTGAAATAATTATATATGAAATAC ATCC TT TAT TGTAT ACT G TGAC A AATT C A TA G T ATCA TC CGGATT C A ATCA A CTATAC T T GTAT AGTATGTCGTTTTTTG TGACTA C . C T T G CG TT T AGGA T A CTATAG T A A T G CA CC A GGTT TATT TATTGATGG T TTT C C CA T T A GT G . G A C ACT . ATACC T TAT TATACT T T GAC CTAGC T T GCAAATGAAGACATAAAATAATTA T AT AG . C C CG A ATAGATCC . T T G A TACCCAA A C TGGATTAAACAATTTG T TCA A C TCTCCAA AGTGTCGGCGAGGAG AG A C TT GATTA T . T C TGT . TT A T CT GTCCT CCTGT . T T CTG T T GC GT CA TG CC . G TC . CTT TG . T C T GT . T TTTTTTCTATGGAAAACCATAGGGAACTTTCAAGTTT T . T AA TTG T ACT CT CCTA C G T T AG TG TG G . G . GAG A G TTT CT TC AG C TG TTAATATTAA . CACAC T CT TA T TCATAAAG C TA T . A T ATACAC T A G T G CA G TT . AA T ATA C T G CTAT T . T T T C CT G GC CA GAGCCAGAT AATTTTCAATCAACTATTATT . . TA AT CA A G . CACG . A T . TACTATTGACTC AC A GG CAC GGTT . C
blockSeqs : . . . GTTTAAA . . ATAGTG . CGC . C . . . . ATGTGGTCAATTACTGGTAATTTGA TTACA . . . . G . . . T . . TA . . AT . . TATAGATACATTTGATAGAT AT . . T T AG . GA . C . . . . . . C . CT A . C . . C . . . TTTTTAAATAATTATACTGAAATGT . . T TTT . T . T . . A . . . GAA A CGT . A . . CATGTC . . TT T AG G . . . . . . A . AA . . AGGCA . . T . . . CT . TTT AT TATTTGA . T . T . . T G . . . . . T . . TCC . TC TATAA G T G GGTT . . GACAATGAGAGACACAATGAT . C . . . T T A TACGATTC . . . . A ACAA A . GATATTAAAACAATGT . . . . CCTCTAA ACCAAGTTC T . . . GTA . . . . . . TT . . C GTT . . T . TG T . A . A TT C . . . . CT TG . . . . . . T TTGGAAAGATATAGGGCTTTCAAACTTA . . . . CG . . T . . . . . T G C . . . . . . . TT . . . . T . . CCA . . T . T C . T . . . . . . . . . . . CG . . . AAT . . . CTCA . . T . T . CT . . CA GACCAGT NNNNNNNNNNNNNNN . . . . . . . . C . C . . . C . . . A . .
blockSeqs : . . . GTTTTAA . . ATATAC . GA . . . . . . AAGTGGTCAAATATGGTCAATTTGA A . . . . . . . . T . . A . . T . . TAAAGATATATTAATAAAT T . . T T A . AG . C . . . . . . T . . C . . . . . . . . ATAAACAAAATAAGAAATGAAATAT . . T AT . A . . . . . . . . AGC . CGT . A . . TTTTAG . . . G AT . . . . . . . . . A . . TTCAG . . T . . . CA . TC AT TCATTG . G . T . . T A . . . . . C . . CC . TT . G T G AGC . . GACAATGAGAGACAAAATAAT . T . . . . . . CTAGGATC . . . . A ATAA A . GTCAGATAAAACA . . . . ATCTAA GATCAAA G . . . TGT . . . . . . TT . . T GTC . . T . TG T . A . . TG C . . . . CC TG . . . . . . T GACTTG . . . . GG . . . . . . . . A A . . . . . . . . TT . . . . T . . T . . T . T C . T . . . . . . . . . . . TG . . . ATT . . . . . . . . A . TC . . CA NNNN NNNNNNNNNNNNNNN . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . GTTTTAA . . TATAAC . C . . . . . . ATAGTGTCAAGTACTGGTAATATG A . . . . . . . . T . . A . . . . . TAAAGATGCATTTAA T . . A T C . A . T . . . . . . . . . A . . . . . . . . ATTTTAAATAAT . . T GT . . . . . . . . . . TAT . CTG . A . . CTAT . . . . C . . . . . . . . . A . . AG . . T . . . C . TT AT TATTGG . T . T . . T A . . . . . T . . CC . T . T T G TAT . . GCAATGAGAGACAAAATAAT . T . . . . . . CTAGATC . . . . A AAA A . TGATAAACAATG . . . . CTCTAA GCAAG T . . . GA . . . . . . TT . . C GTC . . T . G T . A . . CG A . . . . CT AG . . . . . . T AT . . . . G . . . . . . . . T A . . . . . . . . TT . . . . T . . C . . T . T C . T . . . . . . . . . . . T . . . ATA . . . . . . . . A . TT . . CT NNNN TATTGACCATGTGGG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . TTTAA . . ATAAC . T . . . . . . TACGTGCATACTGGTACATTTGA A . . . . . . . . A . . T . . . . . TGAGAAGTATTAAT T . . T T A . A . A . . . . . . . . . A . . . . . . . . ATTTGAAATAAT . . T AT . . . . . . . . . . AT . CTT . T . . TAT . . . . A . . . . . . . . . A . . AG . . T . . . C . TT AT TATGG . T . . . . C A . . . . . C . . CC . T . T T G TGT . . GACAATGAGAGAAAAAAAAT . T . . . . . . CTAGATC . . . . A AAA A . TTGATAAACA . . . . CTT TCAAA G . . . TG . . . . . . T . . C GTC . . T . C . . A . . TG C . . . . T T . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . G A . . . . . . . . TT . . . . T . . C . . . . . C . T . . . . . . . . . . . G . . . AT . . . . . . . . T . CT . . CA GCCA NNNNNNNNNNNNNNN . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . TTTA . . ATAAC . C . . . . . . GTGGTTCAATACCGGTCAATTGA A . . . . . . . . G . . T . . . . . TAAAACAGGAT T . . T T A . A . A . . . . . . . . . A . . . . . . . . CATAATGCAA . . T TT . . . . . . . . . . AT . CT . A . . TAA . . . . A . . . . . . . . . C . . AG . . A . . . T . AT A . . T . . . . . G . . . . . . . . C . T . G T G GAT . . TGTCATTATGCAAAGACGTT . T . . . . . . GTA . . . . A A A . GATATAAACA . . . . CTT GCAAG T . . . GA . . . . . . T . . C T . . T . G . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . A A . . . . . . . . T . . . . T . . A . . . . . C . T . . . . . . . . . . . T . . . CT . . . . . . . . T . C . . CA GACC TTTTGACCAGTAGTT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . GTTT . . GTAAC . C . . . . . . TTAGCTAGTGGTCATAAATTG A . . . . . . . . T . . A . . . . . ATAATAGGAT T . . T T A . G . T . . . . . . . . . A . . . . . . . . ATTAATAA . . T T . . . . . . . . . . AT . CT . A . . TAA . . . . A . . . . . . . . . A . . G . . A . . . C . TT . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . T . . . . GC . . GACAAAT . . . . . . . . GA . . . . . . A . GATAAAACA . . . . CTT GCAAG T . . . A . . . . . . T . . C T . . . . . G . . . . . . . . A G . . . . . . . . T . . . . T . . C . . . . . C . . . . . . . . . . . . . T . . . AT . . . . . . . . T . T . . CA GCCG NNNNNNNNNNNNNNN . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . ATGAT . C . . . . . . ATTAGTGATCCAATGG A . . . . . . . . A . . A . . . . . TAATAGATT A . . T T A . G . C . . . . . . . . . A . . . . . . . . ATAATAAT . . . T . . . . . . . . . . GT . TT . A . . CA . . . . A . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . T . . T . T . . . . GC . . . . . . . . . . GT . . . . . . . . . . . . . . GCA T . . . T . . . . . . T . . A . . G . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . T . . . . . . . . T . T . . T NNNN TATGACCAGTATT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . AAC . C . . . . . . ATACCAGTCAACTG . . . . . . . . . A . . A . . . . . TAATAGAAT A . . T G A . G . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . ATAATAAT . . . T . . . . . . . . . . AT . . . . . . TC . . . . . . . . . . . . . . . T . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . T . . . . . . . . A . C . . . GT TTGACCAGTAAC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . C . C . . . . . . AATTT . . . . . . . . . A . . A . . . . . AAGTAAGT T . . T T A . T . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . ATAATAAT . . . . A . . . . . . T . . . . . . . . . . T . . . A CTGACCAGAGT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . ATTG . . . . . . . . . T . . T . . . . . TAATAGAT T . . . T . . A . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . TAATAGAT T . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . GT . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TAAAGAT T . . . . . . . TT . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . CAA . .
blockSeqCons : GTTTTAA***** ATAAC******** ** ATGTGGTCAAACTGGTAATTTGA**************** ** ** ** TAATAGAT****************************************** T**** ** T*** T***** **** AT**** TAN********* **************** ** ** AG******* TATTGG****** CC**** ** AAA**** TGATAAAACA************** ** CTCAA*** GCAAG************* ** T*** C* GTC** ** CG* TG* ** ATGGCTT************************************** T** *** C****** T** T******* ** *** AT* CA GCCA***** TNTGACCAGTAGT********** ** **
originalCons : CAGGGTTGG-GCGGTTAAAAC---------C-GCCCCCGG---TTT-A-A-CCAGCGG-TT-TTAACCGGTT-A-TA-A----C-CGCC-C----CG-GTCA--A-TACTC-CCAAAA--TG-GTCA--A--T-A-GT--GGT-CAA-T-A--T-GGTCAATTTGAAAATTT----A-----A-AGTG-T--CC-T--T--T-T-CCNA-T-TTT-----AAA--TACATTT--CAT---GC--AAA--AA------------T-A------------A----TA---G-A-T--------T-T-AT-AGT-CTTT---T-CAAA--A-ATC-A-G--CT-TTATT-CAC-A-AA--G-CA-T-G--T-ATT--TATA--GA-T--C-A-A----T-T--AAT--G-------A-T------AAT--------A-----------AT--------------CATT----TA--AT--T-ACACCCCAGTAT---T-GAA---CTT-CTG----ACC-TTTTCA----AA-G-C--T-CT-C-A-T--TTCT--AG-C---TTG-ATAT----CC-C---T---AN---T-AT-AAC----TTTTT----------------AGTT-----A-ATGGGC-A--AC-TGTTT-CAAT-G-C--AATAC--T-G-A---T-A-GTA----AG---CAC-TT-TTCAGA-G-AC--AATTCCTGC-ATGT--TT-AAGAT-AT-AAATA-T-A-TTG---GCT-AATT--G-ACTACTTAT--G-GTCGACA--T-A-T-CT-TCAG---TACT-ATA----C-AT-GT-TACATG------TAGAGGGTTTACAGG--TA--GGC-A-T-AGTTT---------G-------ACA----A--------------A-----T------------------TT-CTGCTT-TATACC--TGG-A-C-AAAATA--A-CAGC-TA-G-A-TC-A-GCTG--AGCACTG-TGATC-TAGTAAA-A---AATAAATA-TAAACTGGGT-T--GA--TA----AA-CA-----T-GTTGCA---AAA--GAC-AGTG-C-TCTAAATGGA-------G--C-AAG---A-TATTA-C-TT--GGG-G----CAGGT-ATA--ATG-GACA-AG---T-G-T--AAT-TAACA-TACCC-AAGGTC--CAG-----G--GATGGCAATTGT-GT-TGTGTTATTGTT-ATGA-AAAACA--TCACCCAC--ACCG-ACACACC-AATGT--GAT-CATTA--GGTA-CCT-GATGAA-TACTCTT-C-AAT-A--ATG-ACTTGT--------ATGGAAA-A--T-ATAGGGA-CTTTCA-G--T---TGTAGGAAAAT-AT-AGAAATAA-ATAG--GGACTTG-GACACC-CTG---CTCTTTG--CTA----GG-AC-AAAAGTT-AAACAG-TTTA-T-AATTTTTACA--G-TG-AG-C-AT---TTTC-CC-CAATT-GAA--TA--AAATCTTAT--GC-ATTA-T-T----------TAA---TCTCATTTG----C--ATGTAA-G--TG-T-TT-GTAAGT-------TGCATGTTT--AGAATTACAGT--AT-TT-A------T-CATC-A-T-A-AT--GAACT-CTGTTAAC---A--TTT-AAAATTAACC-AATA-ATAT-AGA----ATA-A-T-GAC-CATTAAA-TCTTTCAA-TTG--ACCACAATCG--CCA---ATTGACCACTA--TTTT-----GACCA-GTAGTTG-ACCGGTTTT-AA--CCAGTA--TTGACC--A-C-C--GGCCC----GGT-C-AA-TA-C------------TAGT--AT-T--GA---CCG----CTTTTTT--G-CCAAC
finalCons : CAGGGTTGG-GCGGTTAAAAC---------C-GCCCCCGGTTTTAA-----CCAGCGG-TT-TTAACCGGTTATAAC--------CGCC-C----CG-GTCA--A-TACTC-CCAAAA--TG-GTCAATGTGGTCAAACTGGTAATTTGA----------------AAATTT----A-----A-AGTG-T--CC-T--T--T-T-CCNA-T-TTT-----AAA--TACATTT--CAT---GC--AAA--AATAATAGAT------------------------------------------T-T-AT-AGT-CTTTT----CAAA--A-ATC-A-G--CT-TTATT-CAC-A-AA--G-CA-T-G--T-ATT--TATA--GA-T--C-A-A----T-T--AAT--G-------A-T------AAT--------A-----------AT--------------CATT----TA--ATT---ACACCCCAGTAT-----GAA---CTT-CTG----ACC-TTTTCA----AA-G-C--T-CT-CAT----TTCT--AG-C---TTG-ATAT----CC-CTAN---------T-AT-AAC----TTTTT----------------AGTT-----A-ATGGGC-A--AC-TGTTT-CAAT-G-C--AATAC--T-G-A---T-A-GTAAG-------CAC-TT-TTCAGA-G-AC--AATTCCTGC-ATGT--TT-AAGAT-AT-AAATATATTGG------CT-AATT--G-ACTACTTAT--G-GTCGACA--T-A-T-CT-TCAG---TACT-ATACC----AT-GT-TACATG------TAGAGGGTTTACAGG--TA--GGC-A-T-AGTTT---------G-------ACA----A--------------A-----T------------------TT-CTGCTT-TATACC--TGG-A-C-AAAATA--A-CAGC-TA-G-A-TC-A-GCTG--AGCACTG-TGATC-TAGTAAAAAA----TAAATA-TAAACTGGGTTGATAAAACA--------------T-GTTGCA---AAA--GAC-AGTGCTCAA---ATGGAGCAAG-------------A-TATTA-C-TT--GGG-G----CAGGT-ATA--ATG-GACA-AG---T-GT---AAT-TAACA-TACCC-AAGGTC--CAG-----G--GATGGCAATTGT-GTCG-TGTTATTGTT-ATGA-AAAACA--TCACCCAC--ACTG-ACACACC-AATGT--GAT-CATTA--GGTA-CCT-GATGAA-TACTCTT-C-AAT-A--ATG-ACTTGTATGGCTT--------------------------------------TAGGAAAAT-AT-AGAAATAA-ATAG--GGACTTG-GACACC-CTG---CTCTTTG--CTA----GG-AC-AAAAGTT-AAACAG-TTTA-T-AATTTTTACA--G-TG-AG-C-AT---TTTC-CC-CAATT-GAA--TA--AAATCTTAT--GC-ATTAT--T----------TAA---TCTCATTTGC------ATGTAA-G--TGT--TT-GTAAGT-------TGCATGTTT--AGAATTACAGT--AT-TT-A------T-CATC-A-T-A-AT--GAACT-CTGTTAAC---A--TTT-AAAAT-AACC-AATA-ATAT-AGA----ATA-A-T-GAC-CATTAAA-TCTTTCAA-TTG--ACCACAATCGCCA-----ATTGACCACTATNTGACCAGTAGT----------G-ACCGGTTTT-AA--CCAGTA--TTGACC--A-C-C--GGCCC----GGT-C-AA-TA-C------------TAGT--AT-T--GA---CCG----CTTTTTT--G-CCAAC
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|34 ): ATGTAAATTTATATGGAATTCATATAATAATATAGAAATTT
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 111111111 2222222222 1111111111111 11111 5555555555555555555555555555555555555555 1111111111 111111 111 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 1111 11 11 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555 1111 11 1 1111 111111 1111111 222222222222 1111 3333333333333333 1111111 11 11 1111111 222222222 22 222222222222 1 111 11111 11 3333333333333333 111111 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 11 111111111111 11 2222 333333 111 11111 3333333 222222222222222222 11 333333 11 11111 333 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 1111 22 1111 11 11 1111111111 1111111 222 33333333 111111 11 1111 11 33333333333 3333333333333333 1111111111 111111111111
lowQualScore : 3 0 333333333 3 1111111111 3 3 6666666666666 2 22222 2 66 2 2 33 3 7777777777777777777777777777777777777777 2222222222 3 3 33 99 33 2 5 3 2 2 333333 33 2 33 111 33 33 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 333 2 2 88888 5555 3 0000 3 44 3 3 44 3 2 2 99 2 88 44 0 3 11 3 3 9999 3 44 44 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999 3 7777 55 999 3 4444 3 3 22 3 9999999 0 2222 8 8888 4 8 55 4 4 000000 99 7777777 3 2 7777 3 333333333333 3 3 2222 8888888888888888 3333333 4 4 66 4 4 4 4 00 00 4 3333333 222222222 4 4 2 4 4 66 22 4 88888 9999 111111111111 5 66 5 0 66 5 2 3 66 5 5 5 5 6 666 666 11111 99 5555555555555555 9 7 777 555555 8 4 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 4 88 66 4 4 8 00 8 999999999999 4 00 4 4 1 7777 1 4 444444 222 66 88888 4 777 99 4 2222222 222222222222222222 44 00 4 999999 4 66 4 4 777 4 8 33 4 4 44 88888 22222 66 3 5 222 66 5 5 77 77 5 66 5 0 77 5 0 77 5555 22 5 5 5 5 77 5 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 9999 4 55 4 00 4 777 99 2222 4 4 4 4 00 1 55 4 4 4 777 4 4 888 888888 1 66 4 555 9999999999 777 6666666 4 66 666 0 88888888 1 66 55 4 4 555555 8 4 4 4 55 4 99 55 55 888 3 7 3 3 4444 3 9 3 4 3 88 3 444 6 99999999999 555 44 4 1111111111111111 2 2 2222222222 2 33 33 555 66 2 33 2 6666 5 2 2 2 444444444444 66 3 44 555 9999 44 3
lowQualScore : . . ......... . .......... . . ............. . ..... . .. . . .. . ........................................ .......... . . .. .. .. . . . . . ...... .. . .. ... .. .. ......................................................... ... . . ..... .... . .... . .. . . .. . . . .. . .. .. . . .. . . .... . .. .. ....................................................... . .... .. ... . .... . . .. . ....... . .... . .... . . .. . . ...... .. ....... . . .... . ............ . . .... ................ ....... . . .. . . . . .. .. . ....... ......... . . . . . .. .. . ..... .... ............ . .. . . .. . . . .. . . . . . ... ... ..... .. ................ . . ... ...... . . ................................................................ . .. .. . . . .. . ............ . .. . . . .... . . ...... ... .. ..... . ... .. . ....... .................. .. .. . ...... . .. . . ... . . .. . . .. ..... ..... .. . . ... .. . . .. .. . .. . . .. . . .. .... .. . . . . .. . ........................................................................... .... . .. . .. . ... .. .... . . . . .. . .. . . . ... . . ... ...... . .. . ... .......... ... ....... . .. ... . ........ . .. .. . . ...... . . . . .. . .. .. .. ... . . . . .... . . . . . .. . ... . ........... ... .. . ................ . . .......... . .. .. ... .. . .. . .... . . . . ............ .. . .. ... .... .. .
lowQualScore : 3 4 333333333 3 2222222222 6 3 2222222222222 9 99999 9 88 9 9 99 1 1111111111111111111111111111111111111111 5555555555 3 1 99 00 77 7 3 8 9 9 666666 77 1 77 000 77 77 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 000 7 9 11111 8888 1 4444 1 88 1 1 22 1 9 9 66 9 55 22 8 1 55 1 1 6666 1 66 66 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222 6 7777 00 444 6 1111 6 6 33 6 5555555 9 5555 0 5555 0 0 55 0 0 666666 55 2222222 6 3 7777 6 111111111111 6 6 7777 5555555555555555 7777777 4 4 11 4 4 4 4 66 66 4 9999999 444444444 4 4 3 4 4 11 44 4 11111 8888 888888888888 0 99 0 0 99 0 0 1 99 0 0 0 0 5 777 222 11111 00 3333333333333333 9 3 222 000000 9 4 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 4 00 11 4 4 9 66 9 222222222222 4 66 4 4 9 9999 9 4 000000 222 11 55555 0 000 55 0 2222222 666666666666666666 66 66 4 666666 4 11 0 0 000 0 0 55 0 0 66 55555 55555 99 2 7 111 44 7 0 99 99 7 44 7 7 99 7 1 99 7777 33 7 7 7 7 99 7 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 7777 4 55 0 00 0 000 55 5555 0 4 4 4 22 4 00 4 4 4 888 4 4 333 666666 9 11 4 333 4444444444 888 2222222 4 11 111 8 88888888 1 11 55 0 0 555555 0 0 0 0 55 0 77 00 00 666 6 3 3 3 2222 1 2 1 6 1 88 1 444 2 77777777777 444 22 1 9999999999999999 9 4 5555555555 9 99 99 999 88 7 99 9 1111 7 9 9 9 666666666666 88 1 22 444 6666 66 3
consensus : CAGGGTTGG-GCGGTTAAAAC---------C-GCCCCCGG--TTTTA-ACCAGCGG-TT-TTAACCGGTT-A-TA-A----C-CGCC-C----CG-GTCA--A-TACTC-CCAAAA--TG-GTCA-AT-----G---T-GGT-CAA--AC-TGGT--A-ATTTGAAAATTT----A-----A-AGTG-T--CCT--T--T-T-CCNA-T-TTT-----AAA--TACATTT--CAT---GC--AAA--AA-----------T-A------------A------------TA---G-A-T--------T-T-AT-AGT-CTTT---T-CAAA--A-ATC-A-G--CT-TTATT-CAC-A-AA--G-CA-T-G--T-ATT--TA--TAGA-T--C-A-A----T-T--AAT--G-------A-T------AAT--------A-----------AT--------------CAT-T----TA--AT--T-ACACCC----CA-GT-A--T-GA---A---CTT-CTG----ACC-TTTTCA----AA-G-C--T-CT-C-A-T--TTCT--AG-C---TTG-ATAT----CC-C---T---AN---T-AT-AAC----TTTTT----------------AGTT-----A-ATGGG-C-A--AC-TGTTT-CAA-TG-C--AATAC--T-G-A---T-AGTA----AG---CAC-TT-TTCAGA-G-AC--AATTCCTGC-ATGT--TT-AAGAT-AT-AAATA-T-A-TTG---GCT-AATT--G-ACTACTTAT--G-GTCGACA--T-A-T-CT-TCAGTACT---ATA-C-CA-----TGTTACATG------T---------AGAGGGTTTACAGG--TA--GGC-A-T-AGTTT---------G-------ACA----A--------------A-----T------------------TT-CTGCTT-TATACC--TGG-A-C-AAAATA--A-CAGC-TA-G-A-TC-A-GCTG--AGCACTG-TGATC-TAGTAAAA-AATAAATA-TAAACTGGG-T-T--GATA---A--AACA-----T-GTTGCA---AAA--GAC-AGTG-CTCTAAATGGA-------G--C-AAG---A-TATTA--C-TTGGG-G----CAGG-TATA--ATG-GACA-AG---T-G-T--AAT-TAACA-TACCC-AAGGTC--CAG-----G--GATGGCAATTGT-GT--GTGTTATTG-TTATGA-AAAACA--TCACCCAC--A-CCG-ACACA-CCAATGT--GAT-CATTA--GGTA-CC-TGATGAA-TACTC-TTC-AA-TA--ATG-ACT------------TG--------TAT-----------GG--------------CTT----------T---------AGGAAAAT-AT-AGAAATAA-ATAG--GGAC-TTGGACACC-CTG---CTCTTTG--CTA----GGAC-AAAAG-TT-AAACAG-TTTA-TAATTTTTACA--GTG-A-GC-AT---TTTC-CC-CA-ATTGAA--TA--AAATCTTAT--G-CATTA-T-T----------TAA---TCTCATTTG----C--ATGTAA-G--TG-T-TTGTAAGT-------TGCATGTTT--AGAATTACAGT--A-T-TTA------TCATC-A-T-A-AT--GAACT-CTGTTA--AC--ATTT--AAAAT-AA-CCAATA-ATAT-AGA----ATA-A-TGA-CCATTAAA-TCTTTCAA-TTG--ACCACAATC--G-CCA---AT---T--GACCACTA-T-TGACCA-G-TAG-TG-ACCGGTT----------TT-A--ACC--AGTA--TTGACC--AC-C--GG-CCC----GGT-C-AA-TA-C------------TAGT--AT-T--GA---CCG----CTTTTTT--G-CCAAC
Reference ( family-2007 ) : CAGGGTTGG-GCGGTTAAAAC---------C-GCCCCCGG--TTTTA-ACCAGCGG-TT-TTAACCGGTT-A-TA-A----C-CGCC-C----CG-GTCA--A-TACTC-CCAAAA--TG-GTCA-AT-----G---T-GGT-CAA--AC-TGGT--A-ATTTGAAAATTT----A-----A-AGTG-T--CCT--T--T-T-CCNA-T-TTT-----AAA--TACATTT--CAT---GC--AAA--AA-----------T-A------------A------------TA---G-A-T--------T-T-AT-AGT-CTTT---T-CAAA--A-ATC-A-G--CT-TTATT-CAC-A-AA--G-CA-T-G--T-ATT--TA--TAGA-T--C-A-A----T-T--AAT--G-------A-T------AAT--------A-----------AT--------------CAT-T----TA--AT--T-ACACCC----CA-GT-A--T-GA---A---CTT-CTG----ACC-TTTTCA----AA-G-C--T-CT-C-A-T--TTCT--AG-C---TTG-ATAT----CC-C---T---AN---T-AT-AAC----TTTTT----------------AGTT-----A-ATGGG-C-A--AC-TGTTT-CAA-TG-C--AATAC--T-G-A---T-AGTA----AG---CAC-TT-TTCAGA-G-AC--AATTCCTGC-ATGT--TT-AAGAT-AT-AAATA-T-A-TTG---GCT-AATT--G-ACTACTTAT--G-GTCGACA--T-A-T-CT-TCAGTACT---ATA-C-CA-----TGTTACATG------T---------AGAGGGTTTACAGG--TA--GGC-A-T-AGTTT---------G-------ACA----A--------------A-----T------------------TT-CTGCTT-TATACC--TGG-A-C-AAAATA--A-CAGC-TA-G-A-TC-A-GCTG--AGCACTG-TGATC-TAGTAAAA-AATAAATA-TAAACTGGG-T-T--GATA---A--AACA-----T-GTTGCA---AAA--GAC-AGTG-CTC-AAATGGA-------G--C-AAG---A-TATTA--C-TTGGG-G----CAGG-TATA--ATG-GACA-AG---T-G-T--AAT-TAACA-TACCC-AAGGTC--CAG-----G--GATGGCAATTGT-GTC-GTGTTATTG-TTATGA-AAAACA--TCACCCAC--A-CTG-ACACA-CCAATGT--GAT-CATTA--GGTA-CC-TGATGAA-TACTC-TTC-AA-TA--ATG-ACT------------TG--------TAT-----------GG--------------CTT----------T---------AGGAAAAT-AT-AGAAATAA-ATAG--GGAC-TTGGACACC-CTG---CTCTTTG--CTA----GGAC-AAAAG-TT-AAACAG-TTTA-TAATTTTTACA--GTG-A-GC-AT---TTTC-CC-CA-ATTGAA--TA--AAATCTTAT--G-CATTA-T-T----------TAA---TCTCATTTG----C--ATGTAA-G--TG-T-TTGTAAGT-------TGCATGTTT--AGAATTACAGT--A-T-TTA------TCATC-A-T-A-AT--GAACT-CTGTTA--AC--ATTT--AAAAT-AA-CCAATA-ATAT-AGA----ATA-A-TGA-CCATTAAA-TCTTTCAA-TTG--ACCACAATC--G-CCA---AT---T--GACCACTA-TNTGACCA-G-TAG-TG-ACCGGTT----------TT-A--ACC--AGTA--TTGACC--AC-C--GG-CCC----GGT-C-AA-TA-C------------TAGT--AT-T--GA---CCG----CTTTTTT--G-CCAAC
gi|1 : GGGTTCGTGCG-TTAAAAC---------C-GCCCCAGG--TTT----CCAGCGGCTT-TTAACCGGTT-A-TA-A----CTCGCC-G----CT-GTCA--ACTACTC-CAAAAAAATG-GTCA-ATA----G---C-GGT-CAATAGC-TGGT--C-AAGTGAAAATTT----A-----A-AGTG-T--CCTA-T--T-T-CCAA-T-TTT-----AAAAATACATT---CAT---GCTCAAA--AA-----------TTA------------A------------TA---G-T-T--------T-G-AT-AGT-CTTTGGTC-CAAA--A-ATCCA-G--CT-TTATT-CAC-AGAA--G-CAAT-G--TTATT--TA--TTGA-TTAC-A-A----T-T--AAT--G-------A-T------AAT--------A-----------AT--------------CAT-T----TA--AT--TTACACCC----CA-GT-A--T-GA---A---CTT-CTGG---ACC-CTTTCA----AA-G-C--T-TG-C-A-CA-TTCT--AGGC---T---ATAT----CC-C---T---AT---T-AT-AAC----TTTTTT---------------AGTT-----A-ATGGG-C-ACCAC-CGTTT-CAA-TG-CC-AATAC--T-G-A---T-AGTA-----G---CAT-TT-TTCAGA-G-AC--ACATC--G--ATGT--GA-AAGAT-AT-AAATAAT-A-TTG---GCT-AATT--G-ACTAACTAT--G-GTCAACA--T-ACT-CT-TCAGTACTT--ATA-C-CA-----TGT-ACATA------T---------AGAGGGTT-ACAGG--TA--GAT-AAT-AGTTT---------G-------ACA----A--------------A-----TGAGAGACAAAATAATT--TT-CTG--T-TATACC--TGGGA-C-AAAA-A--A-CAGCGTA-T-A-TC-ACACTGGGAGCACTG-TGAT--TAGTAAA----TAA-TA-TAAA-TGGG-T----GATA---A--A-CA-----T-GTTGCA---AAAAAGAC-AGTG-CTCTAAATGGA-------GG-C-AAA---A-TATTA--C-TTTGA-TT---CAGG-TATACGATT-CACA-AG---TTG-TTAAAT-TAACA-TACC--AAGG-C--CAG-----GATGA-GGCAATTGT-GTG-TTGTTATTG-TTATGA-AAAACA--TCACCCAC--A-CTGTACACA-CCAATGCTGGAT-CATCA--GGTATCC-TGTGGAATTACTC-TTC-AA-TA--ATGAACT------------TG--------TACGAAAATATAGGGA--------------CTTTCAGTTTATAT---------AGGAAAAT-ATAAGAAATAATATAG--GGAC-TT-GACA-C-CTG---CTCTTTG--CTA----GGAC-AAAAG-TTAAAAAAG-TTTA-TAATTTTTACA--TTGTA-GCAAT---TTTC-CC-AA-ATTGAA--AA--AAGTCTTAT--G-CATTATT-T----------TAATATTCTCATTTG----CAAATGTAA----TGTT-TTGTAAGTGA-----TG---GTTT--AGA---ACAGTTAA-T-TTA------TCATC-A-TGA-AT--GAACT-C-GTTAATAC--AATT--TAAAT-AA-CCAATA-ATAT-AGA----ATA-ATTGA-CCATATAA-TC-TTCAA--TG--ACCAC-ATC--G-ACAGT-AT---T--GACCA-TA-GTTGACCA-GTTAT-TGTACCGGTC----------TTGA--ACC--AGTA---TGA-C--AC-TGGGG-CCC----GGTCC-AA-CACC------------TAGT--AT-T--GA---CAG----CTTTTTTTGG-CCAAC
gi|10 : -T-G--T-ATT--TA--TAGA-T--C-A-A----T-T--AAT--G-------A-TTTGA--AAT--------A-----------ATTATATATGAAATACCAT-T----TA--AT--T-ATACCC----CA-GT-A--T-AA---G---CTT-CTG----ATC-TTTTCA----AA-G-C--T-CT-C-A-T---------------------AT----CC-C--------A---T-AT-AAC----TTTTT----------------AATT-----C-ATAGG-C-A--AC-CGTTT-TAA-TG-C--AACAC--T-G----------A----AG---TAC-TT-TACAGA-G-----AATT-CTGC-ATGT--TC-AAG---AT-AAATA-T-ATTTG---ATT-AATT--G-ACT----------------A--T-A-T-CT-T-AGTACT---ATA-C-CA-----TG-TACATGTATAA-T---------AGAGGG-TTACAGG--TACTAGC-A-T-AGTTT---------G-------ATA----A--------------cc
gi|11 : -A----C-CGCC-C-----G-GTCACAG-TACTC-CCAAAA--TG-GTCA-ATTA---G---T-GAT-CCA--A--TGGG--A-ATT-------------------A-CGTG-T--CCT--T--C-T-CCCAAT-TTTCTAACAAA--TA-ATT---CAT---GC--AAA--AA-----------T-A------------A------------TA---G-ATT--------T-T-AT-AGT-C--T---T-CAAAGTA-ATC-A-A--GC-TTATTACACAA-AA--G-CA-T-GGAT-AGT--TA--TCGA-TC-C-G-A----T-T--AATACG-------ATT------AAT--------A-----------A---------------CAT-TATCCTA--A-----AAACCC----CA-ATGA--T-GA---AACTTTT-CTGTGACACCATTTTCA----AA-GAC--T-TT-TGA-A--TTCTTCAG-C---GTG-ATAT----CCACCTAT---AC---T-AT-AAC----TTtgagagacaaaata
gi|12 : CAGGGTTGG-GCAATTAAA------------------------------CCAGCGG-TT-TTAACCGGTT-A-TA-A----C-CG-C-C----CG-GTCA--A-TACTC-CCAAAG--TG-GTCA-TTAGCTAG---T-GGT-CA---------T--A-AATTG-AAATTT----A-----A-AATG-T--CCT--T--TCT-CCTA-T-GTT-------A--TACATTT--CAT---GA--AAA--AA-----------C-A------------A-----------------------------------------CTTT----------------------------TT-CAC-G-AA--G-CC-T-A--T-AAT--TA--TAGA-T--G-A-A----T-T--AA---G-------------------------------------------------------TAT-T----TA--ATTAT-ACACCCCTG-CATGT-A--T-AA---A---CTT-CTG----AGC-TTTTCAAATTAA-G-C--T-CT-C-A-T--TTGT--AG-C----TG-ATAT----TC-C---C---A------AT-AAC----TTTTT----------------AG
gi|13 : ------T---------AGAGGGTT-ACAGG--TA--G-C-A-T-AGTTT---------G-------ACA----ATGAGAGACACAATGA-----T------------------TT-CTGCTT-C-TACC--TGG-A-C-AGAATA--A-CAG-----G-A----A-GCTG--AGCACTG-TGATC-TAGC---A-AATAGATA-TAAACTGGG---T--GATA---AACAATG-----T-GTTGCA---GAA--G---AG-----------------------------------ATTA--C-TTGGG-GATTATAGA-CAAA--GTG-GGCA-AG---T-GTT--AAT-TAACA-TA
gi|14 : atatatacCAGGGTTGG-GCGGTTAAAAC---------C-ACCC------------------GG-TT-TTAACCAGT-----------------------------CA--A-AATTC-CCAAAA--TG-GTCA-AT-----A---CCAGT-CAA---C-TG------------AAATTC----A-----A-AGTG-T--CCT--T--T-TTCCTA-T-TTT-----AAA--TA--TTT--CAG---GC--AAA--AA-----------T-A------------AAGATATATTTAACA---G-A-T--------T-T-GT-AGT-CTT------CAAA--A-ATC-A-A--TC-TTAT--CAC-A-AA--G-CA-T-G--T-GTT--TA--TAGA-T--G-A-A----T-taccagccatgaaaactgtaaagatcacccaca
gi|15 : CAGGGTTGG-GCGGTTAAAAC---------C-GCCCCCGG--TTTAA-ACCAGCGG-TT-TTAACCGATT-A-TA-A----C-CGCC-CCGGGCG-GTCA--A-TACTC-CCAAA----------------------------------------------TTG-AAATTT----A-----A-A---------T--T--C-T-CC---T-TTT-----AAA--TACATTT--CATGCCGC--AAA--AATAAAGATATATT-A------------A------------TA---A-A-T--------T-T-AT-AGT-CTTT---T-CAAA--C-ATC-A-A--CT-TTGTT--AC-A-AA--G-CA-T-G--T-Agcaaagatt
gi|16 : AAATAA-ATAG--GGAC-TT-GACACC-CTG---CTCGTTGCTCTA----GGAC-AAAAG--T-GAACAG-TTTT-TGATTTTTACA--GTG-A-AC-AT---TTTC-CC-CA-ATTTAA--CA--AAATCTGAT--G-CATTA-T-TTTAATATTAATAA---TTTCATTTG----T--ATATAA-G--TG---TTGTAAG--------TGCATGTTT--AGAAT-----T--A-T-TTA------TCATCAA-T-A-AT--GAACT-CT-TTA--A
gi|17 : TTGCAGT------TTA------CCAT--A-T-A-AT--GG-CC-ATTTTA--GC--ATTT--GAAAT-AA-CCCATA---AT-GGACTATATA-A-TGA-TCG--AG----TTTCAA--TG--AC--CAAT------CA---AT---T--TTCAAGTA--CTGACCA-G--AG-TG-ACC-GTT----------TT-AATACC--AGTAATTTGACC--ACGC--AACCCC----AGT-C-AA-TA-C------------TAGT--ATAT--GA---CCA----GTTTTTT--G-CCAAC
gi|18 : acACAGT--A-T-TTA------TCATC-A-T-A-AT--GAACT-C-GTTA--TC--ATTT---CAAT-AA-CCAATA-ATAT-AG--------------------AAA-TC-TTCAA-TTG--ACCACAATCNNN-NNN---NN---N--NNNNNNNN-NNNNNNNN-N-NNN-NN-NNNNNNN----------NN-N--NNN--NNNN--NNNNNN--NC-C--GG-CCC----GGT-C-AA-TA-C------------TAGT--AT-T--GA---CCG----CTTTTTT--G-CCAACcc
gi|19 : CAGGGTTGG-GCGGT-AAAAC---------C-GT-----G--TCCT--------GG-TT-TTAACCGATT-A-TA-G----TGCGCC-CG---AG-ATCA--A-TAATC-GCAGGA--TA-GT-----------------GT-CAAGTAC-TGGT--A-ATATG-AAATTT----------A-AGTG-T--CTT--T--T-T-CCT--T-TTT-------A--TA---TT--CAT---GC--AAACGAA-----------A-A------------G------------TA---A-G-T--------T-T-CT-Acct
gi|2 : T-TTAACTGGTT-AATA-AACACCGCGCC-C----TG-GTCA--A-TGC---CAAAAA--TG-GTCATAC-----G---T-G---CAT--AC-TGGT--ACATTTGAAAGT------A-----A-AGTG-T--CCTG-T--T-T-CCAA-T-GTT-----TAA--TACATTG--CAT---GC--AAA--AA-----------T-A------------A------------TA---G-AAT--------T-T-AT-AGT-CTCC---T-CAAA--A-AAT-A-G--CTCTTACT-TAC-A-----T-CA-T-A--T-ATT-------AGAAT--C-A-A----T-TTAAGT--AC------A-T------AATGC------A-----------A----------------AT-T----TA--AT--T-ACATCC----CA-GT-AG-T-GA---A---CTTGCTG----GAC-CTTTCA----AGCG-C--T-CT-C-AGC--TTCT--AG-C---GTG-AT-------C-C---C---ATGTCT-AT-AAC----TTTTT----------------AGTTTGACTA-A-GGG-C-A--AC-TGTTT-CAA-TGGC--AATACA-T-G-AGGAT-AGTT----AGGCACAC-TTATTCAGA-G-AC--AATTCC-GC-ATGGGGTT-AAGAT-AT-AA-TA-T-A-TTGATGGCTTAATG--G-A--ATCTATCAG-GTCAACAGTTGA-T-CTATCAG-ACT----TA-C-CAGACATTGTCAC--------------------GAGGGGTTACAG---TA--GGTTA-TTAGTTT---------G--------CA----A--------------A-----TGAAGACATAAAATAATTATC-CTGCTT-TATACCAGTGG-A-CCAAAATA--AACAGA-TA-G-A-TCCA-G-TG--AGCA-TG-TGATC-TA-TAAAACAATAG----TAAACTGGG-TGTCAGATA---A--AACA-----T-GTTGCATCAAAA--GAC-AGTG-ATCTAAATGGA-------A--CCAAGTTCA-TAT-A--C-TTGGG-GTA--CAGG-TATA--ATG-G-CA-AG---T-G-T--TATATAACA-TTACC-AAG--T--CAG-----G--AATG-CAATTGTTGT---TGTTAT-G-TTATGA-AAAACAGTCCACCCACCAA-CTG-ACACA-C-AATGT--GAC-CAT-A--GGTA-CC-TGAT-AA-TACTC-TTCCAA-TA--ATG-ACTGGTTTGGAAAGATA--------TAG-----------GG--------------CTT----------TCAAACTTATAGGATAATTAT-AGAAATAA--TAG--GGAC-TTG-ACACCTCTT---CTCTT-G--CTA----TGAC-GAAAG-TT-AAATAG-TTTA-TAATTTTTTCA--GTG-A-GC-AT---TTTC-CC-CA-A-TGAA--TA--AAATC-TAT--G-CATTA---T----------TAA---TCTCACTTG----C--ATGTAA-G--TG-T-TT-TAAG--------TGCATG-TT--AGAATTACAGT--A-TATTA------TCATC-A-T-A-AT--GAACT-GT-TTA--AC--ATTT---AAAT-AA-CCAATA-ATAT-AGA----ATA-A-TGA-CCATTAAA-TC-TTCAA-TTG--ACCACAATC--GACCAGT-AT---T--GACCACTG-T-TGACCA-G-TAA-CG-A-CGGTT----------TT-A--ACC--AGTA--TTGACC--AC-C--AC-CTCCACGGGT-CAAA-TA-T--------------GT--A--T--GACACCCGA---C--TTTT--G-CCAACaaaacatttt
gi|20 : tggcattaaaaataccgccaactgagtttagaaaacctatcagata--ATTT--AAACT-AA-CCAATA-ACAT-AGA----ATA-A-TGA-CCATTAAA-TC-TTCAA-TTG--ACCACAATCNNN-NNN---NN---N--NNNNNNNN-NNNNNNNN-N-NNN-NN-NNNNNNN----------NN-N--NNN--NNNN--NNNNNN--NC-C--GG-CCC----GGT-C-AT-TA-C------------TAGT--AT-T--GA---CCT----TTTTTTT--G-CCAACcc
gi|21 : tTCA--AC--ATTT--AAA-T-AA-CCAATA-ACAA-ACT----GTA-A-TGA-CCAATCAA-T-TTTCAA-TCA--ACCA-------G-T-----AT---T--GACCACTA-T--------------TG-ACAGGTT----------TT-A--A-C--AATA--TTGACC--AC-C--GG-CCC----GGT-C-AA-TA-C------------TAGT--AT-T--GA---CCAGGTTTTTTTTT--G-CCAACcct
gi|22 : ttataaacttgccactAG--GGAC-TTG-ACACC-CTG---TTCTTTG--CGA----GGTC-AAAAG-TT-AAACAG-TTTT-T--TTTTTACA--GTG-A-GC-AT---TTTC-CC-AA-A---AA--CA--AAATCTTAT--G-CATTA-T-T----------TAA---TTTTATTTGCACAC--ATGTAA-G--TG---TTGTAAG--------TGCATGTTT--AG
gi|23 : G-GACA-AG---T-G-TT-AAT-TAACA-TACCT-AAGGTT--CAG-----G--GATGGCAATTGT-GT--GTATTATTG-TTATGA-AAA-CA--TTACCCAC--A-TTT-GCACA-CCAATGT--GAT-CATTA--GGAA-CC-CGATGAA-TACTC-TTC-AA-TA--ATG-ACT------------TG--------
gi|24 : ----A--------------A-----T------------------TT-CTGCTT--ACGCC--TGG-A-C-AGAAAA--A-CAGG-T---------A-GCCG--AACAC---TGATC-TAGTAAAT-ACCCAATA-CA---T----------ATA---C--AATG-----T-GTTACA---AAA--GAC-AGTG-CTT---ATGGA-------G--C-AAG---A-GATT
gi|25 : gacaatgagagacaaaatATA-ATAA-AGACTCAATA-A-TGA-CTAATAAA-T-TTTCAA-TT----------------------AT---T--GAACACTA--------------G-TG-ACCGGTT----------TT-A--ACC--AGTA--ATGACC--AC-T--GG-CAG----AAT-C-AA-TA-C------------TAGT--AT-T--GA---CCA----CTTTTTT--G-CCAAC
gi|26 : -A-TGA-CCAATAAA-T-TTTCAA-TCA--ACTATTATT--GGCCA---GT---TTTAACCAGTA-T-TGACCA-C-T---TG-CCCTGTCAATACTACTATT-G--ACTCTAGTA--TTGACC--AC-cct
gi|26 : ACTA-T-TAT-TG-GCCAGTT----------TT-A--ACC--AGTA--TTGACC--AC-T--TG-CCC----TGT-C-AA-TA-CTACTATTGACTCTAGT--AT-T--GA---CCA----CTTTTTT--G-CCAACttttttgccaaccctg
gi|27 : atgaccaataaattttcaatcaCAGGGCTGG-GCGGTCAAAACTGTCCCAACC-GTCCCCGG--TTTTA-ACCAGCAG-TT-TTAACCGGTT-G-TA-A----C-CGCC-CCG--CG-GTGA--A-CACTC-CCAAAA--TG-GTCA-ATA----G---T-GGT-Ccctg
gi|28 : CAGGGTTGG-GCGGTTAAAAC---------C-ACTCCCGG--TTTTA-ACCAGCAG-TT-TTAACTG--------------C---CC-C----CA-GTCA--A-TGCTC-CCAAAA--TG-GTCA-AT---------T-G-------------------------AAATAT----A-----A-AGTG-T--CCT--T--T-T-
gi|29 : AA--TACATTT--CAT---GC--AAA--AA-----------T-A------------A-------------A---G-A-T--------T-A-ATGAATACATA---T---AT--A-CTC-A-G--CT-TTATT--AC-A-AA--G-CA-T-G--T-ATTAATA--TAGA-T--C-A-A----T-T--AAT--G-------A-TTTTA--AAT--------A-----------AT--------------TAt
gi|3 : AGGGTTGG-GCGGTTAAAAC---------C-ACCCCCGGGTTTTTATACGAGCGG-TT-T-AACCGGTT-A-TATA----C-CGTCTC----CGCGTCAC-A-TACTCTCCAAAA--TG-GTCA-AT-----G---T-GGT-CAATTAC-TGGT--A-ATTTGAGAATTT----A-----ATAGTG-TTGCCTGTTGGT-T-CCGA-TATTT-----TAA--TACATTT--CAT---GC--AAA--AA-----------T-G------------AGAAG--------TATT-A-A-T--------T-A-AT-AGT--TTA---T-CACT-----TC-A-GA-CT-TTATT--AC-A-AA--G-CA-TTGC-T-ATT--CA--TAGA-T--CCA-A----T-T--AAT--GTTTTTAAA-T------AATTATACTGAA-----------ATGT------------CAT-T----TATTGT--T-ATACCC----CG-GT-AA-T-GA-------CTT-CTG----ACC-TTTTTA----GA-G-C--G-CT-C-A-T--TTCTA-AG-C---TGG-ACATATCACC-C---T---AT---T-TT-AACTT--TTTTT----------------AGTA-----AGATCGG-C-A--AC-TGTT------TG-C--AATAC--T-GAA---T-AGTACTATAG---CACTTT-TTCAGATG-GCCAAATTCTTGC-ATGT--TT----AT-----AGTA-------------T-AATT--GCACTAC-TGT--G-GTTGACA--T-A-T-CT-TTACTACT---ATATC-CA-----TG-TACATGTATACTT---------AAAAGG-TTACAGG--TG--AGC-ATT-AGTTTGCAATGAGAG-------ACAAAATA--------------A-----T------------------TT-CTGC-T-TATACC--TGG-ACC-AAAATACGA-CA---TACG-ATTC-A-GCTG--AGCACTGTTGATC-TAGT---A-AATAAATA-T-AACTGGG-T-TG-GATT---A--AACAATTTGT-GTTGC----AAA--GAC------------ATAGT-------G--C-A-----G-TATTA--C-TT-GG-A----CAGG-T-TA--ATATGACACAGTGTT-G-T--AAT-T-ACATTACCCTAGGGTC--TAACCTGTG--GATGGCAG-TGT-GTC--TGTTATTT-GTATGA-AAAACA--T----CAC--A-CC--ACACA--CAAT-T--GATGCATTA--GACA-C--------------C-TTC-AG-TAGTATG-AC-------------TG--------TAT-----------GG--------------------------------------AGAGACT-------------ATGG--GAAC-GTCGACCCG-CTGACTCTCTTTGT-CTAT---GCAC-AAAAGTTT-AAACAG-TTTGTTGATTTTCACATGGTG-A-GC-ATGAGTTTC-CCGCATTTTGAACTTATCAAATCTTGTAGG-CATTA-T-T----------TAA---TTTC-TTTT----C--ATGTAA-G--TG-TACTG-AAGT-------CA-ATGTTT--A-AATTACAGT--A-A-ATAATACACTCAAC-AGT-AGAT--GAACTGCT-TTA--ACAAATTA--AAAAT-AAGCTCATATATAT-ATA----ATA-ATTGA-CCATTAAA-TTCTTCAAGTTG--ACCACTATC--G-CCA---GTTAAT--GACCG-TA-T-TGACCATG-TGG-GG-ACC-GTT----------TT-A--ACC--AGTA---TGACCA-AC-T--GA-CCC----GGTCC-AA-TA-C------------TAGTACAT-T--GA---CCG----CTTTTTT--G-CCAAC
gi|30 : C-C--AG-CCA----GGT-C-AG-TA-C------------TAGT--AA-T--GA---CCA----CTTTTTT--G-CCAACc
gi|31 : aatcgaccattaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-----T-GTTGCA---AAA--GAC-AGTG-CTT---ATGGA-------T--C-AAA---A-GATTA--C-TTGGG-GA---CAGG-TACA--TTT-AACA-TG---T-GTT--AAT-TAACA-TACCC-Ac
gi|32 : atg--CTT--T--T-T-CTTA-T-TTT-----A----TACATTT--CAT---GC--TAA--AA-----------T-ATAGATACATTTGA------------TA---G-A-T--------T-T-AT-AGT-CTT
gi|33 : GTT-A-TG-A----T-CGCC-C----CG-GTCA--A-TACTC-CCAAAG--Taattaa
gi|35 : gttA-ATAG--GGAC-TTG-ACACC-CTG---CTCTTTG--CTC----GGAC-AAAacatgt
gi|36 : AGGGTTGG-GCAGTTAAAAC---------C-ATCCCCGG--TTT
gi|4 : AGGGTTGG-GCGGTTAAAAC---------CCGCCTCCG----TTTA--CCAGCGG-TTGTTAACCGCTT-A----A----C-CGCC-C----CG-GTCA--A-TACTC-CCAAAA--CGTGTCA-AT-----AGTTT-GGT-CAA--TC-TGGTCTA-ATT--GAAATTT----A-----A-AGTG-C--TCC--T--T-T-CCAA-T-TTT-----AAA--TACATTTTTCATT--GC--AAA--AAA----------T-A------------A------------TA---GGA-T--------T-TCAT-AAT-CTTT---T-CAAA--AGAGT-A-G--CT-T-ATC-AGC-A-AATGG-CA---G--T-ATTCTTT--TTGA-TTCC-A-AATTAT-T--AAT--G-------A-T------AAT--------A-----------AT--------------CAT-T----TA--AT--T-ACACCC----CA-GT-A--TTGA---A---CTTTCTG----ACC-TTTTCA----AA-GAC--T-CTTC-A-TCATTCT--GG-CGGATTG-AT-C----CC-C---T---AA---TTATTAAC----TTTTTT---------------AGTT-----A-ATGGG-C-A--GCCTGTTTTCAA-TC-A--AATAC--T-G-A---TTAGCT----AG---CAC-TT---CAGA-GGAC--AATTC-TGC-ATGT--TTTAAGAT-AT-AAATA-TCA-TTG----CT-AATTTTG-ACTACTTAT--G-G-CAACA--T-A-T-CT-TCATTACT---ATA-C-CA-----TGT-ACATG------T---------AGACGGGTTACAGGACTA--TAT-A-T--GTTT---------G-------ACA----ATGAGAGAAAAAAA-A-----T------------------TTTCTGCTT--ATAC---TGG-A-C-CAAATAT-A-CAGC-TA-GGA-TC-A-CTTG--AGCACTG-TGATC-TATTAAA----TAAATACTAAACTCGG-T----GATA---A--AACA-----TTGTTGCA---AAAA-GAC-AGTGTCTCCAAATGGGAGTGTCGG--C-GAGGAGA-TATTA--CCTTGGGTG----CAGG-TATA--ATG-GACA-AG-----G-T--AAT-TAACA-TACCC-AAGGTC--CAG-----G--GATGGCAATTGT-GT--GTGTTATTGTTTATGGCAAAACA--TCACCCAT--A-CTG-ACACA-CAAATGT--GAT-CATTA--GGTA--C-TGATGAA-TACCC-TTC-AA-TA--ATG-ACT------------TG---------------------------------------------------T---------AGGAAAAT-------------ATAG--GGACTTTTGACACC-CTG---CTCTTTG---TA----GGAC-AAAAA-TT-AAATAG-TTTAGTAATTTTTACAC-GTG-AGGC-AT---TTTCACC-CA-A-TGAA--T---AAATCTTAT--G-CATTA-TGT----------TAA---TCTCATTTG----CCAATGTAATGCTTG-T-TTGCAAG--------TGCCTGTCTTAAGAATTATAGT--ATT-TTAT-----TCATCTT-T-A-ATCAGAACT-CCG-TA--AC--ATTTTAAAAAT-AACCCAATA-ATATGAGA----ATATG-TGATTCATTAAGCTTTTTCAA-TTGGCACCACAATCGAG-CCAGATAT---T--GACCACT--TATGACCA-G-TAT-TG-ACTGGTT----------TT-A--ACC--ATTA--TTGACCCAAC-C--GG-CCC-----GT-C-AATTA-C------------TAGTC-AT-TGGGA---CCG----CTTTTTat
gi|5 : CAGGGTTGG--CGGT-AAAAC-----------GCCCCCG----TTTA-ACCAGCGG-TT-TTAACCGGTTTA-TA-A----C-CGCC-C----CG-GTCA--A-TACTC-CCAAAA--TG-GTCA-AA-----G---T-GGT-CAA--ATATGGTC-A-ATTTGAAAATTTTTACA-----A-AGTG-T--CCT--T--T-T-CCAA-T-TTT-----AAA--TACATTT--CATAT-GC--AAA--AA-----------T-A------------A------------TA---G-A-T--------T-T-AT-AGT-CTTT---G-CAAA--A-ATC-A-T--CT-TTATT-AAC-A-AA--G-CA-T-G--T-ATT--TATTTTGA-T--C-ATA----T-T--AAT--G-------A-T------AAT--------A-----------AT--------------CAT-T----TA--A---T-ACA-CC----CA-GT-ATTT-GA---A---CTGATTG----ACC-TTTTCA----AA-G-C--TGCT-C-G-T--TTCT--AG-C---TTG-ATTT----CC-C---T---AA---T-AT-AAC----TTTTT----------------AGTT-----A-ATGGGCC-A--AC-TTTTT-CAATTG-CCGAATAC--T-G-A---TAAGTA----AG---CAC-TT-TTCAGA---AC---ATT--TGC-ATGT--TT-AAGAT-A--AAATA-T-A--TG---GCT-AA-T--G-ACTACTCAT--G-GTCAACA--T-A-TGCT-TTAGTACT---ATA---CA-----TGTTACATG------T---------AGAGGTTTTACAGG--TA--TGT-A-T-AGTTT---------G-------ACA----A--------------A-----T------------------TT-C-GCTT-TATACC--TGG-A-C-AAAATA--A-CAGC-TA-G-A-TC-A-GCTG--AGCACTG-TA--C-TAGTAAAATAATAAATA-TAAACTGGGTT-T--GAT----A--AACA-----T-GTTGCA---AAA--GAC-AGTGCCTCTAAATGGA-------G--C-AAG---A-TATTATTT-TTGGGTGT---CAAGTTATA--ATG-GACA-AG---T-G-T--AAT-TAACA-TACCC-AAG--T--CAG-----G--GATGGCAATTGT-GTCTGTGTTATTG-TTATGA-AGAACA--TCACCCAC--A-CCG-ACACACCCAATGG--GAT-CATTATCGGTA-CCTTGATGAA-TACTCTTTC-AATTA--ATG-ACT------------TGTTTTTTTCTAT-----------GGAAAACCATAGGGAACTT----------TCAAGTTTT-AGGAAAAT-AT-AGAAATAA-ATAG--GGAC-TTGGACACC-CTG---CTTTTTG--CTA----GGACGAAAAG-TT-AGATAG-TTTA-TAATTTTTACAG-GTG-A-GC-A----TTTC-CC-CA-ATTGAA--TA--AAATC-TAT--GCCATTA-T-T----------TAA---TCTCA-TTG----A--A-GTAA-G--TGTT-TTGGAAGT-------TGCATGTTT--AGAA-TACAG---A-T-TTA------TCATC-A---A-AT--GAACT-CTGTTA--AC--ATTT--AAAAT-TG-CCCAAA-ATAT-AGT----ATA-ATTGA-CCATTAAA-TCTTTCAA-TT---ACCACAATC--G-CCG---AT---T--GACCACTATTTTGACCA-G-TAGTTG-ACCGGTT----------TT-A--ACC--AGTA--TTGACC--AC-C--GG-CCG----CGT-C-AA-TA-C------------TAGT--AT-T--GA---CCG----CTTTTTT--GCCCAAC
gi|6 : -T--CTT--T--T-C-CCAA-T-TTT-----AAA--TACATTT--CAT---GC--AAA--AA-----------T-A------------A------------TA---G-A-T--------T-T-AT-AGT-CTTT---TTCAAA--A-ATC-AAG--CC-TTATT-TAC-A-AA--GGTA-T-G--T-ATT--AT--TTGA-T--C-A-AC---T-T--AAT--G-------A-T------AAT--------A-----------AT--------------CAT-T----TA--AT--T-ACACCC----CA-GT-A--T-GA---A---CTT-CTG----ACC-TTTTCA----AA-G-C--T-CT-C-A-T--TTCT--AG-C---T-G-ATAT----CC-CC--T---AT---T-AT-AAC----TTTT-----------------AATT-----A-ATGGG-C-A--AC-TGTTT-CAA-TG-C--AATAC--TTG-A---T-AGTA-----G---CAC-TT-TTCAGA-G-AC--AATTCATGC-ATGT--T--AAGATTATTAAATA-T-A-TTG---GCT-AATT--G-ACTACTTAT--GTGTCAACA--T-A-T-CT-T-AGTACT---ATA-C-CA-----TGT-ACATG------T---------AGAGGGTT-ACAG---TA--GAT-A-T-AGTTT---------G-------ACA----ATGAGAGACAAAATAA-----T------------------TT-CTGCTTATGTACC--TGG-A-C-AAAATA--A-CAGC-TA-G-A-TC-A-GCTGT-AGCACTG-TGATC-TAGTAAA----TAAATA-TAAACTGGG-T----GATAT--A--AACA-----T-GTTGCA---AAA--GAC-AGTG-CTCTAAGTGGA-------G--C-AAG---A-TATTA--C-TTGGG-T----CATG-TATA--A-G-GACA-AG---T-G-TT-AAT-TAACA-TACCC-AAGGTC--CAT-----G--GATGGCAATTGT-AT--GTGT-ATT--TTATGA-AAA-CA--TCACCCAC--AACTG-ACACA-CCAATGT--GAT-CATTA--GGTA-CC-TGAAGAA-TACTC-TTC-AA-TA--ATG-ACT------------TG--------TAT-----------GG----------------------------------------AAAAT-AT-AGAAATAA-ATAG--GGAC-TT-GACACC-CTG---CTCTTTG--CTA----GGAC-AAAAG-TT-AAATAGTTTTA-TAATTTTTACA--GTG-A-GC-AT---TTTC-CC-CA-ATTGAA--TA--AAATCTTAT--G-CATTA-T-T----------TAA---TCTCATTTG----C--ATGCAA-G--TG---TTGTAAG--------TGCATGTTT--AGAATTACAGT--A-T-TTA------TCAAC-A-T-A-AT--GAACT-C-GTTA--AC--ATTT--AAAAT-AA-CCAATA-ATGT-AGA----ATA-A-TGA-CCATTAAA-TC-TTCAA-TTG--ACCACAATCNNN-NNN---NN---N--NNNNNNNN-NNNNNNNN-N-NNN-NN-NNNNNNN----------NN-N--NNN--NNNN--NNNNNN--NC-C--GG-CCC----GGT-C-AA-TA-C------------TAGT--AT-T--GA---CCG----C-TTTTT--G-CCAAC
gi|7 : gtCAGGGTTGG-GAGATTAAAAC---------C-ATCCCTGG--TT----------------TTCACCAGTC----------------------------CA--A-AACTC-CCAAAA-----------------G---T-GGTTCAAT-AC-CGGT--C-AATTGAAA--TT----ATCACTA-ACTGCT--CCT--T--T-TTCCTA-T-TTT-----TA---TATATTT--CAT---CA--AAA--AA-----------T-A------------A------------AACAGG-A-T--------T-T-GT--GT-C-TT---T-CAAA--A-ATC-A-AATCT-TTA-T-CAC-A-AA--G-CA-T-AT-T-GGT--TA--TAGA-T--G-A-A----TGT--AAT--G-------A-TAAACAAAAT--------AAGAAATGAAATAT--------------CAT-T----TA--AT--T--------------GT-A--T-GA---A---CTT-C-G----ACCTTTTTCA----AG-G-CTAT-CT-CTA-T--TTCT--AG-----TTGCATAT----TT-C---T----C---T-AT-AAC----TTTTTAGTATGTCGTTTTTTGAGTT-----ATATAGG-CGA--AC-TATTT-TAA-GG-C--AATACTTT-G-C---T-AGTA----A----CAG-CT-TACAGA-G-AC--AATT-TTGCAAAGT--AT-AAGAT-AT-cc
gi|7 : GTACTG--ATG-TACA-----TGGTATATG------TGTATACTTGATAGGAGTTACAGG--TA--G-C-A-T-AGTTTT--------GTCATTATGCA----A--------------AGACGTT------------------TT-TTGCTG-TATATC--TTG-A-TTGGAGTA--AACGGG-TA--------A-GTTG--AACACTG-TGATCGTAGTAGAA---TAAATA-TAAACTGGG-T----GATATTAA--AACAATGT-T-GTTGCA---AAA--GACCAGTG-CTT-A--TGGA-------GATC-AAA---AAGATTAA-T-TTGGG-GA---CAGG-TACA--ATG-GACA-TG---T-G-T--TAA-TAACA-TACCA-AGGGTCCTCAG-----G--GA-GGCGAttagaatggtacatttttaaaccattcgtaatctgtcacttctgtggtccacaacctatattgctctcagtttacgtattatccgatttgtactgatgtacatggtatatgtgtatacttgataggagttacaggtagcatagttttgtcattatgcaaagacgttttttgctgtatatcttgattggagtaaacgggtaagttgaacactgtgatcgtagtagaataaatataaactgggtgatattaaaacaatgttgttgcaaaagaccagtgcttatggagatcaaaaagattaatttggggacaggtacaatggacatgtgttaataacataccaagggtcctcagggaggcga
gi|8 : cagggttgggagattaaaaccatccctggttttcaccagtccaaaactcccaaaagtggttcaataccggtcaattgaaattatcactaactgctcctttttcctatttttatatatttcatcaaaaaataaaacaggatttgtgtctttcaaaaatcaaatctttatcacaaagcatattggttatagatgaatgtaatgataaacaaaataagaaatgaaatatcatttaattgtatgaacttcgacctttttcaaggctatctctatttctagttgcatatttctctataactttttagtatgtcgttttttgagttatataggcgaactattttaaggcaatactttgctagtaacagcttacagagacaattttgcaaagtataagatatttagaatggtacatttttaaaccattcgtaatctgtcacttctgtggtccacaacctatattgctctcagtttacgtattatccgatttA-ATAGAAGGAT-TTG-ACACC-CTG---CTCTTTG--CTACCTAGAAC-AAAAG-TT-AAACAG-TTTT-TGATTTTTACA--GTC-A-GC-AT---TTTC-CC-CA-CTTTAA--GA--AAATCTTAT--G-CATTA-T-T----------TAA---TTTAATTTG----C--ATGTAA-G--TG---TTGTAAGTCATAAAGTGCATGTTT--AGAATTACAGT--A-T-TTA------TCATC-A-T-A-AT--GAA-T-CT-TTA--A---------AAAATAAA-CCAGTA-ATAT-AGA----ATA-A-TGA-CCAATAAA---TTTCAA-TTG--ACCAT--T-----------AT---T--GACCACTA-T--------------TG-ACTGGTT----------TT-A--ACC--CGTA--TTGACC--AC-C--AG-CCC----GGT-C-AA-TA-C------------TAGT--
gi|9 : agT--T--T-T-CCTA-T-TTTT----AAA--TATATTT--CAT---GC--AAA--AA-----------T-A------------A-------------A---G-A-TGCATTTAATAT-AT-AGT-CTTT---T-CAAA--A-AAC-G-A--CT-TTATT--AC-A-AA--G-CA-T-G--T-ATT--TA--TAGA-T--C-A-A----T-T--AAT--G-------A-TTTGA--AAT--------A-----------AT--------------TATAT----GA--A-----ATATCCTTTTTA-GT-A--T-GACGTA---TTT-CT
gi|9 : cat-ATAT----CC-T---TTTTAG---T-AT-GACGTATTTCTTG---------------AGTT-----A-ATGGG-C-A--AC-TGTTT-TAA-TG-C--AATAC--T-G-A---T-AGTATTC-AG---CAC-TT-TACAGA-G-AC--AATT-CTGC-ATGA--TT-AA-------AGA---------------T-AATT--G-ACTAC-TGT--G-GCCGACA--T-A-T-CT-TCAGTACTATAATA-C-CA-----TG-TACATtgagttaatgggcaactgttttaatgcaatactgatagtattcagcactttacagagacaattctgcatgattaaagataattgactactgtggccgacatatcttcagtactataataccatgtacat
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|34 ): ATGTAAATTTATATGGAATTCATATAATAATATAGAAATTT