lowQualScore : 111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 1111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 22222 111 1 222222222222222222222222222 11 2222222 111 11 1 1111 5555 3 222222 1 666666666666666666 1 11 1 777777777777777 33 1 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 11 4 444444 1 1 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 33 1 66666666666 333 0000000000000000000000000000 1 55555555555 222 33333333 11111111 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 1 11111111 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 111 222222222222 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444
lowQualScore : 4 99 9 88888 777 2 000000000000000000000000000 66 1 2222222 8 444 11 0 8 8 8 7777 0 3 6 3333 6 0 4 222222 4 3 1 333333333333333333 0 6 3 44 7 3 0 111111111111111 00 8 4 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11 0 3 777777 4 5 6 6 9 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 7 6 66 3 0 11111111111 000 7777777777777777777777777777 1 66666666666 111 0 22222222 8 33333333 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 22 1 7 1 4 3 3 777 33 444444 2 44 11111111 2 0 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 999 3 1 777777777777 99999 3 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 22 3 1 4 6 0 6 1
lowQualScore : . .. . ..... ... . ........................... .. . ....... . ... .. . . . . .... . . . .... . . . ...... . . . .................. . . . .. . . . ............... .. . . ............................................................................................ .. . . ...... . . . . . ................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... . . .. . . ........... ... ............................ . ........... ... . ........ . ........ .................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. .. . . . . . . ... .. ...... . .. ........ . . ...................................................................................................................................................................................................................................................................... ... . . ............ ..... . ................................................................................. .. . . . . . . .
lowQualScore : 0 00 7 33333 000 3 333333333333333333333333333 33 0 0000000 0 000 00 4 0 0 0 2222 2 2 5 5555 0 0 5 333333 0 3 0 888888888888888888 1 7 3 33 5 3 8 444444444444444 22 2 5 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 33 0 7 333333 7 0 0 3 0 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 0 0 77 3 8 33333333333 555 0000000000000000000000000000 6 22222222222 222 8 88888888 0 33333333 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 22 5 7 0 8 2 2 888 00 888888 3 66 33333333 7 8 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 222 3 4 111111111111 11111 6 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 66 5 7 7 7 4 8 9
consensus : GAACACNTAATGTCGGGGACACAT--TGTTTTTGCTCCGTTTC---TT-TTATTA---TTTC-TCTTC--CTTTAGTGATGAACTTGTCCG-CG--CGA--TTTNAT-GAA-AGTG-CTTC---AACAGATCCAATTCAAACTTC---TGTGGGCTGATAGGGGGTCCT-GANGA-GGGGTGGCTGCCCAA-CAAG-TAAAAAATCAA-GGTTGTCGGATTTCA-ACCAAATTTTCAATTTTTAGG--GTAATTCGATGAC-CCCGAGTTCATTGCTCC-GCAT-CACAAAAAAATTTTTTAGCCCGNCCATTTTTTTT-CAAAATGGCC-G---CATACA--GGAAAT--GT-TT--AAATGC-NTAAAATCTCTACATCA-TTTGGGTTNTGT----GGTCANTCGAGGGTACACAATTCATATCTAGC--A--AT-TGTN-TTTCTATATCTAAT-TATCAAA---T------NTG-----C--T--AAG-ATGGCCGTC--------ATTTC----A-------------AAA----ATCAAA-TT--------GT----CGGATTCCA-ACCA---AA-T-T------ANTT-A-TTT-TAGGGTT-A-ATTCAGGAT----C-C-AAGTCCAT-TCT-G------TATT-----T-------TTC-------TCTG-GT--C-C--A-TTTCTGACATAGGGGA-GGTGTT--GGN----G-------A---CATTTGTGTTGGCATCCCAGCACAGT-TATAGCTTGTTTTTC---CTCCGCCGTTTCCCCGTGCCTGAAACTGCCCGACATTNTCCGNAA-ACCT--T-GATGAAAGTCTTAGATATTCTA---G---G-ATATGATAG--GCCAATGTATGTAGATG-T-GCAGA---AA---TG--TT------------------GGGG------------TT-GGG--TACATTTTCGGGGGA----TCGAATGGGGGTGGGGTTTAACATAGAACCCTATGGGAA-AAATNAATTCCAAAATTCAACAGAT------GTAACTTGATAAAATATG------ANAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTTGACC-T-----TGA------ACAT-A-AAA-C-TGGTATAACTTTAGAAC--------CAG-AAC-TGNTTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACCGGTATCCAGTANNNNNNNNNGTCCTTGACCTCTG--ACCT-T-GAACAT-A-A-AA-C-TG-GTA------TAACTTTAGAACCGGAAT--------TGA-TAGAGA------CA--------TCANATAGGA--TGA-TANA-----AACTAG-TATCAA--GGTCAAGTGACTCC-------TTTACCTTNCTTACAAAGTAGTATCTCCN--GTGA-CC-------T-TGACC-TTGG-A-AN----------AAAATAGGTAT-TATTT---AAC-CAGG-ACTGACCANCGNNNCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACCGGTATCCAGTATCCTTGACCTCT-G-ACCTT-GAACAT-AAAANT-GG-TATAACTTTAG-----A-AC-----TTGGNCTGGATTCNAAAACGTTGGGTCTTCAAAAATGATAATAGGAGATATCAATTTGNCGANCGNCNNCAGTGNCCTTGACCTTTG--ACCT-T-GANCATGAAAACTNGT-ATAACTTTAGAAC
Reference ( gi|1 ) : GAACACATTGTGTCAGGGACACAT--TGTTTTGGCTCCATTTCGTATTATTATTAGTATTTTTTTTTC-TCTTTGGTGATAAATTCACTTG-CA--TGA--TTTTAT-GAA-AGTG-CTTC---AACAGATCCAATTCAAACTTTAA-TGTGAGCTG-TAGGGAGCCAT-GAAGA-GGGATGACTGCCCAA-CAAG-TAGAAAATCAA-GGCTGTCACACTTCA-ACCAAATTTT--ATTGCTGGG--G-AATTTGATGACTCCTGAGTCCATT--TCCAGCAG-GA-AAAAAAATTGT---G-CCATCCA-----TTT-CAAAACGGCC-T---TATACA--AAAAAT--GT-TT--AAGTGTTTTAAAATTTCTACATCATTTTGGGTTCTGG----AGTCAATTGAGGCTACGCATTTCATGTCTAGC--A--ATCTGTT-TTTCT---TCTA---T-TCAAA---T------CTG-----C--T--AAA-ATGGCTGCC--------ATTTC----A-------------AAA----ATCAA------------GT----CGGATTTCA-ACAA---AA-T-T------ATTT---TTTCTAGGGTT-A-ATTCAGGAT----C-C-AAGTCCATATCTGG------TATT-----T-------TTA-------TTTG-GT--C-C--A-TTTCTGACATAAGGGA-GGTG----GGT----G-------A---CATTTTTGTTGGCATCTCA--ACAGT-TATAGCTTGTTTTTCATATTC-----TTTTTTCAAGCCTAAAAC-AACAGGCATTCTCTGAAA-ACCT--T-GATGAAAGTATTAGATATTC-A---A---T-ATATGATAT--GCCAATGTATCTAGTTGAT-GCAGA---AA---TG--TT------------------AGGG------------TT-GGA--TACATTTTGAGGGGA----TCAAATGGGGTTGGGGCCGAACGTAGAAC-----------AGATTAATTACAAAATTTAGTAGAT------ATAACTTGACAAAATATG------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCTAACC-A-----TGA------ACAT-A-AAA-C-TGGTATAACTTTAAAACT---ACTGCAG-GAC-TANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCCTTGACCTCTG--ACCT-T-GAACAT-A-A-AA-C-TG-GTA------TAACTTTATAACTGGAAT--------TGA-TAGAGA------TA--------TCAAATTGGA--TGA-TACA-----AACTAG-TATCAA--GGTTGAATGACTCC-------TTTACCTTTCTTATTAAGTAGTATCTGCA--GTGA-CC-------T-TGACC-TTG----AT----------AAAACAGATAT-TAT-----AAC-CAAG-ACTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTTGACCTCT-T-ACCTT-GAACAC-AACACT-GA-TATAACTTTAG-----A-AC-----TTGGTCTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCTTGACCTTTG--ACCT-T-GATCATGAAAACTTGT-ATAACTTTAGAAC
gi|9 : GAACACGTAGTGTTGGGGACA--T--TGTTTTG----C-TTTC------TTCTCAA-ATTT---------CTTTAGTGAGAAATTTGTCCG-CA--CGA--TTTTAT-GAATAAT--CTTC---AACAGATTCAATTCAAACTT----CGTGGGTTGACAGGGGGTCCTGGGAGA-GGGGTG
gi|20 : ttatgtccccAACACCTAATGTCGGGGACATAG--TGTTTTTGCTCCATTTCTTCTTATCATTA----TTCATCTTC-GTTT--GTGCTGAACTTGTCTG-CG--CGATTTTTTATGGAA-AGTGCCTTCCCAGAAAAATCCAATTCAAACTT----TGTGGGTGA-TAAGGCGATCT-GAGGA-GNNNNNNNNNNNNNN-NNNN-NNNNNNNTCActatcaactttcggaattttcaaagtggccgccgattcaagatccatcataaaaaaaacccgaaaaaactgagccgccattttcaaaatggccgccataaacgaaaatgtatcaaagtactaaaatctctacatcatttaggttttgtggtcagttgagggtacacaattcatatctagcgtaagtatttctttatatcaaatgtttgaatgtttaaagatggttgtcatttcaaaatggctgccacaaaatgaagtttgtcgaatttcaaccaaatttagtttttaggttgaatgcagtatcataagtttatt
gi|5 : aatatacaattactatatattatgtccaccATTATGTCTCGAACACATATTGTTTTTGTTCCGTTTC---TTCTTATT----TTTCTTCTTCTTCTTTAGTAATGA----ACTTGTCACCCGA--TTTGAT-GAA-AGTG-CTT----AACAG
gi|6 : G-CG--CGA--TTT-AT-GAA-CGTG-CTTC---AACAGATCTAATCTAAA-TTCAATTGTGGACTGATAGGGGGTCAT--ACGACGGGGTG------CAATCAAGTTTCAAAAT----GGCTG--ACAATTCA-Atttgtggactgatagggataattaggagtgcacaaaacattgaaaatggccgccaattcaaaatggccaccaaaaaaaggctaaaattaaaggttgttggattttaaccaaatttttctagggtaatttgatgacccggagtcatttccgcatgcaaaatatttttaagcccgccatttttatatggccgccacagcggaaatccttttaaatgcttaaaaatatattatttgagttatggtgcaagtccaacgagggttcacagttcatttctagctaagttattctttccatatccaatttcaaaatgtatgcaagatggccatcatttcaaaaggctgtcaaaatattccgtttgtcggatttcaaccaaatttagtttatagagtgaattcacccattccaaatcttatttcttgacattaaaatatgtttaaacccaatttatgacaaaggggaggtgttgcggggacag
gi|29 : acttgtcc-CG--TGC--TTTGAT-AAA-AGTG-CCTT---TATAGATCAAATTC-AATTTT---TGTAGGCTGATAGAGAGatttgcggacaaaaaaggtaaaaaaaaaaatacgttgtcggatttcaaccatttcttttctagggtaatttgatgatctcgagttcatttccagcaattaaaacaaattgagtcggcattttgaaaatggccgccatatacagaattgtatcaaaatgataagctttctacatcatttgggatctgtgtcatttgagggtatacaattgatatctatcaatagtattactttatatcaaatttcccactgtttcaagatggccgactttacaaaattgctgcaaaaaataaagtttaacggatttcagccttcagtttttaggttgcatttaggattcgaagtctatttttgtactcgatatgtctctgtgtcaccatttaagataggggggggggcgttcgggtacatttttgttggcaccccaacacatttaaaacttgt
gi|9 : ttctccttcttcagtaagacatgtgtccaATGGCTGCC--A-CAA-------AATGAA-GTTTGTCGAATTTCA-ACCAAATTTA--GTTTTTAGGTTG-AATaacaaactactttcaaaatgccccccaccccgcccccaattcaaaatgtcaaaaatgtcaacaattaaggttg
gi|6 : ttatgtccccgaacacgtagtgttggggacattgttttgctttcttctcaaatttctttagtgagaaatttgtccgcacgattttatgaataatcttcaacagattcaattcaaacttcgtgggttgacagggggtcctgggagaggggtgctatcaactttcggaattttcaaagtggccgccgattcaagatccatcataaaaaaaacccgaaaaaactgagccgccattttcaaaatggccgccataaacgaaaatgtatcaaagtactaaaatctctacatcatttaggttttgtggtcagttgagggtacacaattcatatctagcgtaagtatttctttatatcaaatgtttgaatgtttaaagatggttgtcatttcaaaAAAAAAT--A-CGTTGTCGGATTTCA-ACCA--TTTC--TTTTCTAGG--GTAATTTGATGA-TCTCGAGTTCATT--TCCAGCAATTA-AAACAAATTGA---G-TCGGCAT-----TTT-GAAAATGGCC-GCCATATAC---AGAATT--GT-ATCAAAATG--ATAAGCTTTCTACATCA-TTTGGGATCTGT-----GTCATTTGAGGGTATACAATTGATATCTATC--A--ATA-GTA-TTACT---T-TA---TATCAAA---TTTCCCACTG-----T--TTCAAG-ATGGCCGACTTTACAAAATTGCTGCAA-------------AAA----ATAAA------------GTTTAACGGATTTCA-GC------C-T-TC-----AGTT---TTT---AGGTT-GCATTTAGGAT----T-CGAAGTCTAT-TTTTG------TACTCGATAT-------GTC-------TCTGTGTCAC-C--A-TT--TAAGATAGGGGG-GG-G----GGC----GTTCGGGTA---CATTTTTGTTGGCACCCCAACACATT-TAAAACTTGTgcagtatcataagtttatt
gi|27 : acttgtccgcgcgatttatgaacgtgcttcaacagatctaatctaaattcaattgtggactgatagggggtcatacgacggggtgcaatcaagtttcaaaatggctgacaattcaaatttgcggacaaaaaaggtaaaaaAAAAAATCAA-AGTTGTCGGATTCCACACCAAATTTTCAATT-TTTAT--T-AATTCGATGAC-CCCAAGTTCATTGCTTC-GCAT-CACAAAAACATTTTTTAGCCCGCCCATTTTTTTT-CAAAATGG
gi|26 : tgaaaatgcaaatattacccgaaggcaacttaaactatgtaaaaaAAAAAATCAA-AGTTGTCGGATTCCACACCAAATTTTCAATT-TTTAT--T-AATTCGATGAC-CCCAAGTTCATTGCTTC-GCAT-CACAAAAACATTTTTTAGCCCGCCCATTTTTTTT-CAAAATGG
gi|5 : tgaaaatgcaaatattacccgaaggcaacttaaactatgtaaaaaAAAATTAAAGGTTGTTGGATTTTA-ACCAAATTTT---T--CTAGG--GTAATTTGATGAC-CCGGAGT-CATT--TCC-GCAT-GC-AAAATATTTTTAA-G-CCCGCCA-----TTT-TTATATGGCC-G---C-CACAGCGGAAATCCTT-TT--AAATGCTTAAAAA----TATATTA-TTTGAGTTATGGTGCAAGTCCAACGAGGGTTCACAGTTCATTTCTAGCT-A--AGTTATTCTTTCCATATCCAAT-T-TCAAAATGT------ATG-----C-----AAG-ATGGCCATC--------ATTTC----A-------------AAAGGCTGTCAAAATATTCCGTTTGT----CGGATTTCA-ACCA---AA-T-T-------TAG---TTTATAGAGTG-A-ATTCA--------C-C-CATTCCAAATCT--------TATT-----TCTTGACATTAAAATATGTTTA-AA--C-CCAA-TTTATGACAAAGGGGA-GGTGTTGCGGG----G-------A---CA
gi|9 : attatgtctcgaacacatattgtttttgttccgtttcttcttatttttcttcttcttctttagtaatgaacttgtcacccgatttgatgaaagtgcttaacagtttgtggactgatagggataattaggagtgcacaaaacattgaaaatggccgccaattcaaaatggccaccaaaaaaaggctAAAAAACTGA---G-CCG-CCA-----TTTTCAAAATGGCCGC---CATAAAC-GAAAAT--GTATC--AAA-GTACTAAAATCTCTACATCA-TTTAGGTTTTGT----GGTCAGTTGAGGGTACACAATTCATATCTAGCGTA--A---GTA-TTTCT---T-TA---TATCAAATG-T------TTGAATGTT--T--AAAGATGGTTGTC--------ATTTC----AAAATGGCTGCCACAAA----ATGAAGTTT--------GT----CGAATTTCA-ACCA---AATT-T------AGTT---TT--TAGGTTG-A-ATGCAGTAT----CAT-AAGTTTATg
gi|19 : ttatgtccccgaacacgtagtgttggggacattgttttgctttcttctcaaatttctttagtgagaaatttgtccgcacgattttatgaataatcttcaacagattcaattcaaacttcgtgggttgacagggggtcctgggagaggggtgctatcaactttcggaattttcaaagtggccgccgattcaagatccatcataaaaaaaacccgTCTGGC--ATAAT-TATT-TCTTTATATCTAATTT-CCGAA---T-------TG-----CATC--AAG-ATGGTTGTC--------ATTTC----A-------------AAA---------------------------TGGCTGCCA-AAAATGCAG-T-TTGTTAGACTTTAGTTTGTAGTTTA-A-ATTTAGGAT----C-CAAAGTCCAT----------------------------------------------------------CCGACAT-AGGGA-AATA----GATGTTCG-------AGGTCATTTGTGTTGACATTCCA--ACAGGATATAACTTG-TTATCATACTt
gi|21 : --T--AAA-ATGCCTGCC--------A----------------------AAA----AT----------------------AGATTTCA-ACCA---AA-TGT------AGTT---TT---AAGGTTGA-ATTCGTGAT----C-CCAAGTCTACTTCTGGACTCGATATA-----T-------TTC-------TCTG--T--CAC--AGTTTCTGACAT--GGGACGGTGTTC-GGA----A-------A---CTTTTGTGTTGGCATCCCAGCACAGT-TATAGCTTGTagtattttacaaaataaatttcact
gi|27 : caatctctgaatgcttgagatgttcgccaatt----A-------------AAA----ATCAAAGTT--------GT----CGGATTCCACACCA---AA-T-T-------TTCAA-TTTTTA---TT-A-ATTC--GATGACCC-C-AAGTTCAT
gi|26 : tgaaaatgcaaatattacccgaaggcaacttaaactatgtaaaaaa----A-------------AAA----ATCAAAGTT--------GT----CGGATTCCACACCA---AA-T-T-------TTCAA-TTTTTA---TT-A-ATTC--GATGACCC-C-AAGTTCATtgcttcgcatcacaaaaacattttttagcccgcccattttttttcaaaatgg
gi|33 : tgaaaatgcaaatattacccgaaggcaacttaaactatgtaaaaaaGCTTCTTCTTC---TTCCGCCGTTTTCCCATGTCTAAAAC----------TGTCCGACA-CTGT--T-GATGAAAGTCTTAGATATTC-tgcttcgcatcacaaaaacattttttagcccgcccattttttttcaaaatgg
gi|16 : gtctcccaaacgaagtttggagacttattgagtttgctcagttcttgcaattcttccTTTTTCCGCCTC-----TTTCTT-GTGCCTGAAACTGCCCGACATTATT-------CCC--C-GATGAAAGTCTTAGATATTCTA---G---G-AGATGATAG--GCCAATGTATGTAG-AGGT-ACAGA---AA---TG--TT---------------------T------------TT-G--------TTTTCA---GA----TTGAAGGGGGTTAGGGtagg
gi|31 : aacgaagtttggagtcttattgtatttgctcgattcttattcttaccgtTTCTATGCAACATGT--G-GAAGAAAGTCTTAGATATTA-T---A---TGATATGATATAGGCTAATGTATGTA---GATCGCAGA---AA---TG--TT----------------------------------TT-GGG-------TTTCA---GA----TTGAA-GAGGTTGGGGtacattcgggggggggggggtgtttaacataaaactctatggggaaaattatttaaatcttgataaatatgatagtgtcatag
gi|15 : tttgtcgtgcttaaaactgtcttgataaaaaaagttTTTCTGTAA-CCCT--TTGAGGAAAGTATTAAGTATCC-ATGGATTTT-ATA-GATAG--GCCAA-GTATCTTGTTG-T-GCAGA---AAGGTTGAATT------------------GGGGTGTACATTTGTATT-GAATGTACATTTGGA-GGGA----TCAAATGGGAGTGGGGTTTAACATAAAGCTCGTTGGGAA-AAATAAATTCCAAAATTCAtattgg
gi|4 : tgaagtttggagacttattgtatttttttgcttggtgcttattcttctttttgtgtgtgtgtgtgctggA-ACCTGGT-GATGGAAGTCTTAGATATTCTA---G---G-ATATGATAG--ACCAATGTCTGTAGATG-T-GCAAA---CA---TG--TTTTTGTTATCAGATTGAAGGGGG------------TTAGGG--TACATTCTTGGGGGA----TCAAATGGGGGTGTGGTTTAACATAGAACCCTATTGGAAAAAATTAATTCCAAAATTCAACAGATAATATGATAACTTGAT-AAATATG------ATAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNCCTTTGAACTTGAACATCA-AAA-C-TGGTATAACTCTAGAAacgaaaagcataatagtttccttaatagatgtg
gi|37 : ctccttA-ACCTGTT-GATTAAAGTCTTAGATATTCTA---G---G-ATATGATAagagagtagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgaccttggaaaagaaaataggtattacttcagaaccaggtatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttcacctttgaccttgagcataaatactggtataattctagaaagaaacatgctagattctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgacctctgaccttggaaaagaaaataggtattacttcagaaccaggtatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgaacataaaaactggtataactaattaacagag
gi|3 : gcttcttcttctcccgtcgctttctcatgctaaaactttctccttacttT--T-GATGAAAGTCTTAGATATTCTA---G---G-ATATGATAG--GCCAATGTATGAAGATG-T-GCAAA---CA---TG--TTTTTGTTTTCAGATCGAAAGGGG------------TT-GGGG-TACATTCTGGGAGGA----TTAAATGGGGGTGGGGTTTAACATAAAACCCTATGGGGA-AAA--AAT--CCAAATTCAACAGAT------GTAAATTGA-AAATTATGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTTGACC-AT----TGA------CCATAA-AAA-C-TGGTATAACTCTAGAAg
gi|24 : tgCAGATTGAA---TG-----------------------GAG------------TT-GGGG-TACATTTGGGGGGGGGGGGTCAAATGAGGAAGGAGTTTAACATAGAACTCCAGGG----GGATAATTTCCAAAATTAAACAGAT------TTAACTTGAC-AAATATG------agagagttgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgatcttggaaaagaaaataggtactacttcagaaccaggtacgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgacttttgactttgaatataaaacctggtataactctagaaagagacttccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgatcttggaaaagaaaataggtactacttcagaaccaggtacgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctttgaccttgaacataaaaactggtataactttagaaagagacttgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgacttctgaccttggaaaagaa
gi|2 : ttAAA-----------AAATTAATTCCAAAATTCAACAGAT------GTGACTTAATAAA-TATG------AGAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----------CC-T-----TGA------ACTT-A-AAAAC-TGGCATAACTTTAGAA--------AGAG-AAT-TGATTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTTGACCTTTG--ACCT-TGGAAAAG-A-A-AA-T-TT-ATA------TTACTTCAGAACCAGGTT--------TGN-NNNNNN------NN--------NNNNNNNNNN--NNN-NNNN-----NNNNNN-NNNNNN--NNNNNNNNNNNNNN-------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCGTGA-CC-------T-TGACCTTTG----ACCTTGAACATAAAAACTGGTAT-CATTTAG-AAA-GAGA-ATTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTTGACCTCT-G-ACCTT-GGAAAA-GACAATCGG-TATTACTTCAG-----A-Aatagattcctggggtcttcggaaatgaaaatacaaggcccacgaactacctagt
gi|3 : gcttaacatagaactcgatgggtTTTGACC-T-----TGA------ACAT-A-AAAAC-TGGTATAACTTTAGAA----------AGAGACTTGCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTTGACTTCTG--ACCT-T-GGAacaagtctcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncccactttgatcttgaacatttaaagttgtaatacttaagaaccaatactaatctttagatgtgatagaagaatgtgaactacaaaatagtatatcctgtgaccttgacctttgaccttgattaatataacttgtataattttaggactgggactgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatttactgaagtgaacagactgaggattttttctgaaatttttcaaaatcttggcaatttagatttttcaatgaac
gi|12 : tgttgatgaaagtcttagatattctaggatatgataggccaatgtatgaagatgtgcaaacatgtttttgttttcagatcgaaaggggttggggtacattctgggaggattaaatgggggtggggtttaacataaaaccctatggggaaaaaatccaaattcaacagatgtaaattgaaaattatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctttgaccattgaccataaaaactggtataactctagaaagagagttgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgatcttggaaaagaaaataggtactacttcagaaccaggtacgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgacttttgactttgaatataaaacctggtataactctagaaagagacttccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgatcttggaaaagaaaataggtactacttcagaaccaggtacgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncTTTAACC-A-----TCA------ACAT-A-AAA-C-TCGTATAACTTTAGAACT---aaagaa
gi|12 : ccttgacctctgacctctgaacatgaaattggtatattttcaaaaccagacctgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacttgacccctgaccctagaacataatattggtattatataagaaccgggtcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttcacaTCTGACCTC-----TGA------ACAT-G-AAA-T-TGGTATATTTTCAAAAC--------CAG-ACC-TGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNA--CTTGACCCCTG--ACCC-TAGAACAT-A-A-TA-T-TG-GTA------T---TATATAAggaattgacagagacatgggatcttcagaataatatgacgtcacaaattcggggagtcgggaacgat
gi|7 : ccttgaccTTTGACC-T-----TGA------TCAT-AGAAA-G-TTGTATAACTTAAGAAC--------CAG-TAC-TANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACCGGTATCCAGTA----------TCCTTGACCTTTG--ACCT-T-GAgaaccgggtcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttcacatttaaccatcaacataaaactcgtataactttagaactggaattgacagagacatgggatcttcagaataatatgacgtcacaaattcggggagtcgggaacgat
gi|8 : cttgatatttgaccttgaacattaaaatcatataactgtagaacaggaattggnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaggatccccaatgatTGACC-T-----TGA------ACAT-A-AAAAC-TGGTATAACTttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaacttaaaattggcatttaagcatggattatttgtaagggaggtatacagtagtatgaggaaaaagcccactttgtacagccagtgctt
gi|14 : cttgaccttggaaaagaaaatgggtactgcttcagaaccaggtacgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnact-----TGA------TCCT-A-AAA-C-TCGCATGACTTTAGAACTGGAATTGNNN-NNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNG-CCTTGACCTCT---------------T-A-A-G----TT-GTA------TAACCTTAGAACTGAAAT--------aaagagagttgataaaaacgttgggtcttcaaaaatgataataggagatatcaatttgtcaagtgacttcagtgaccttgacctctgaccttggaaaagaaaatatgttgaaccaggtacgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtttttggaaggaaacaggattatttttgggaattttcaaaaatctttacgattcagaatttttaaatgtacttgaaatgggcatggcatgaattgtgtgcaagggtggaatacagttgtatta
gi|10 : ctttgacttc-----TGA------CCAT-A-AAA-AGTTGTATAACTTTAAAAC--------CAG-AAC-Tnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgacctcttaccttagatcataaaactcgcataaccttagaaatt
gi|23 : ctTCCTTGATATTTG--ACCT-T-GAACAT-T-A-AA-A-TC-ATA------TAACTGTAGAACAGGAAT--------TGgaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttaaaaaaggaaacaaattaccaaggtatttcgtttgtgaaaattttcaaaatcaaggtctttgtgaactagacttttaaacaaaattggcacggattttgtgcaagggagtgattactgcagggaaaaatagttgtgcattatgtattcagaaaaaaacaacacttttatttatatacaaccagtgcttcgtctgagaaacttaattagcagattataatcataattgtcttgttttttttctacactcttttcaattttattgtcagtt
gi|3 : tgacccgtaacttttgaacataagatcagtatatgaaccagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCCTTGACTTTTG--ACTT-T-GAATAT-A-A-AACC-TG-GTA------TAACT------CTAGAA--------------AGAGACTTCCNNN--------NNNNNNNNNN--NNN-NNNN-----NNNNNN-NNNNNN--NNNNNNNNNNNNNN-------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNN-CC-------T-TGATC-TTGGAAAAG----------AAAATAGGTAC-TACTTCAGAAC-CAGGTAC-GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTTGA---------CCTT-GAACATAAAAACT-GG-TATAACTTTAG-----A-A
gi|12 : tgttgatgaaagtcttagatattctaggatatgataggccaatgtatgaagatgtgcaaacatgtttttgttttcagatcgaaaggggttggggtacattctgggaggattaaatgggggtggggtttaacataaaaccctatggggaaaaaatccaaattcaacagatgtaaattgaaaattatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctttgaccattgaccataaaaactggtataactctagaaagagagttgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgatcttggaaaagaaaataggtactacttcagaaccaggtacgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCCTTCACATTTA--ACCA-T-CAACAT-A-A-AA-C-TC-GTA------TAACTTTAGAACTGGAAT--------TGA-CAGAGA------CA--------Tagagacttgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgacttctgaccttggaaaagaa
gi|12 : ccttgacctctgacctctgaacatgaaattggtatattttcaaaaccagacctgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacttgacccctgaccctagaacataatattggtattatataagaaccgggtcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCCTTGACCTCTG--ACCTCT-GAACAT-G-A-AA-T-TG-GTA------TATTTTCAAAACCAGACC--------TGN-NNNNNN------NN--------NNNNNNNNNN--NNN-NNNN-----NNNNNN-NNNNNN--NNNNNNNNNNNNNN-------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAC---TTGACCC-------C-TGACC-CTAGAACAT----------AATATTGGTAT-TAT-----A---TAAG-A------ACCGGGTCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTTCACATTT-A-ACCAT-CAACAT-AAAACT-CG-TATAACTTTAG-----A-AC-----Tgggatcttcagaataatatgacgtcacaaattcggggagtcgggaacgat
gi|14 : CCTTGACCTCTT--ACCT-TAGATCAT-A-A-AA-C-TC-GCA------TAACCTTAGAAggaattgacagagacatgggatcttcagaataatatgacgtcacaaattcggggagtcgggaacgat
gi|34 : ctttgacttctgatcctaaaactcgcatgactttagaactggaattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngccttgacctcttaagttgtataaccttagaactgaaatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCCTTGACTTTTG--ACCC-T-GATCCT-A-A-AAGC-TT-GCA------Tatt
gi|8 : tgactcctgggacatttacctttgaccttgatcttaacaacgaatattactttgaatggtgtgagcttcaaactgttatctccagtgaCCTTGACCTCTG--ACCT-TGGAAAAG-A-A-AA-
gi|17 : cttgaccttggaaaagaaaatgggtactgcttcagaaccaggtacgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacttgaccttgaacataaaaactggtataactaaagagagttgataaaaacgttgggtcttcaaaaatgataataggagatatcaatttgtcaagtgacttcagtgaCTTTGACTTCTG--ATCC-T--------A-A-AA-C-TC-GCA------TGACTTTAGAACTGGtatgttgaaccaggtacgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtttttggaaggaaacaggattatttttgggaattttcaaaaatctttacgattcagaatttttaaatgtacttgaaatgggcatggcatgaattgtgtgcaagggtggaatacagttgtatta
gi|22 : ttttgtattcagattgcaaggggggaggggggggggtacggtacattggggtgatgaaaggggaagttaacatagaaaactattgagggaataattctaaaattcaacataacttcacaatatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaCCTTTACCTTTG--ACCT-T-GATTAT-A-ATAA-C-TA-G
gi|11 : caagaatgtgacttacaaagtagtttatcctgtgaCCTTGACCTTTA--ACCT-T-GGTTAT-A-ATAA-C-TA-ATA------TATCTATATGA-TATAATATA-----TAA-TA-ATA------TA--------TCTAATgactannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtttactgaaggaaacaagaggatttttttttctggaaactttcaaaatctt
gi|7 : ataaagaatgtaacctacaaagtagtgtatcctatgaCTTGATATTTG--ACCT-T-GAACAT-T-A-AA-A-TC-ATA------TAACTGTAGAACAGGAAT--------TG-------------------------------GNN--NNN-NNNN-----NNNNNN-NNNNNN--NNNNNNNNNNNNNN-------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGGATCCCCA--ATGA-TT-------T-TGACC-TTGATC-AT----------AGAA-AGTTG--TAT-----AACTTAAG-A---ACCAGTACTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACCGGTATCCAGTATCCTTGACCTTT-G-ACCTT-GAatatctctataactatagaaatgggattatctgaaatgatgaaaggagcttgagacctacatgtactaactaatatttgtatgagaccagatttaatgatggagtcggaattttctggacaatttgcaaaatctgcaatttagcatttttaaattaacttaaaatctggcattggaggaatacagtagtattgagaaaaagcctactttttacagccagtatttcgtttgggaggttttgtaatcagcagattataatcatatattacat
gi|28 : CTTGACTTCTG--ACCT-T-TAACAT-GTA-AA-C-TG-GTA------TCATTTTAAAAGTGGGAT--------TAA-TAttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaacttaaaattggcatttaagcatggattatttgtaagggaggtatacagtagtatgaggaaaaagcccactttgtacagccagtgctt
gi|44 : CTTGACCTCTGTGACCT-T-TAGGAT-A-A-AA-A-TGAGTG------TAACTTTAGAAGAGGAAC--------TTA-TAGAAA------Tacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntactttgacttagacctctgaccagggaacatagaattgcattacttcagccacat
gi|51 : CTTGACCTCTG--ACCA-T-GAA-AT-G--------TG-ATA------TAACTTTGGAACTGGGAC--------TGA-tc
gi|47 : CTTGACTTCTG--ACCT-TGGAAAAG-A-A-AG-T-TG-GTA------TTGCTCCAGAAC
gi|49 : agTGGTCT-TG--ACCT-T-GATTAT-G-A-AA-TATA-TTA------TAATTTTAGAACTGGAAC--------TGcaggtct
gi|4 : CCTTTG--AACT-T-GAACATCA-A-AA-C-TG-GTA------TAACTCTAGAA--AGA-----------GAGTAG-NN------NN--------NNNNNNNNNN--NNN-NNNN-----NNNNNN-NNNNNN--NNNNNNNNNNNNNN-------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNN-CC-------T-TGACC-TTGGAAAAG----------AAAATAGGTAT-TACTTCAGAAC-CAGG-TATGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTTCACCTTT-G-ACCTT-GAGCATAAATACT-GG-TATAATTCTAGAAAGAA-AC-----ATG--CTAGATTCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTTGACCTCTG--ACCT-T-GGAAAAGAAAATAGGT-ATTACTTCAGAAC
gi|48 : ctccttaacctggtgatggaagtcttagatattctaggatatgatagaccaatgtctgtagatgtgcaaacatgtttttgttatcagattgaagggggttagggtacattcttgggggatcaaatgggggtgtggtttaacatagaaccctattggaaaaaattaattccaaaattcaacagataatatgataacttgataaatatgatagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTTG--ACCT-T-GAACAT-ATA-AT-C-TG-GTATACATGTAACTTTAAAAAGAGAAT--------TGcaggtatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgaacataaaaactggtataactaattaacagag
gi|45 : TG--ACAT-T-GAACATTA-A-AA-G-TG-GTA------AAACTTTAGAAACAGGGT--------TAA-TAGAGA------CA--------T
gi|8 : ctTG--ACCT-T-GAACATAA-A-AA-C-TG-GTA------TAAC----TAAAGAGAGT--------TGA-TAAAAA------CGTTGGGTCTTCAAA---AA--TGA-TA-A-----TAGGAGATATCAATTTGTCAAGTGACTTC-----------------------AGTG--ACCT------TGA-CC-------TCTGACC-TTG----GA----------AAAGAAAATATGTTG-----AAC-CAGG-gggacctt
gi|10 : cttgaccttggaaaagaaaatgggtactgcttcagaaccaggtacgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnactCT-T-GACCAT-A-A-AA-AGTT-GTA------TAACTTTAAAACCAGAAC--------TGA-tacgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtttttggaaggaaacaggattatttttgggaattttcaaaaatctttacgattcagaatttttaaatgtacttgaaatgggcatggcatgaattgtgtgcaagggtggaatacagttgtatta
gi|32 : -A-A-AA-T-TG-GTA------TCATTTTAAAACTGGAATAAAATTATTGA-TAAAGA------TAATG-----TGATATAAGAACTGAGTAGAGGATTAACTAG-TGTCAA--GGTCAATTGACTCCTGGGACATTTACCTT------------------------TGA-CC-------T-TGATC-TTA----AC------------AACGAATAT-TAannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttaaaaaaggaaacaaattaccaaggtatttcgtttgtgaaaattttcaaaatcaaggtctttgtgaactagacttttaaacaaaattggcacggattttgtgcaagggagtgattactgcagggaaaaatagttgtgcattatgtattcagaaaaaaacaacacttttatttatatacaaccagtgcttcgtctgagaaacttaattagcagattataatcataattgtcttgttttttttctacactcttttcaattttattgtcagtt
gi|40 : ataA------TAAATTTAGAAAGAGAAT--------TGA-TAGAGA------CT--------TCAGAAAGGG--TAA-CATG-----ACCT-G-TA--AA--GGTCCAGTGACTCC-------
gi|22 : CTTACAAAGTAGTTTATCCT--GTGA-CCTTTACCTT-TGACC-TTG----AT------------------TAT-AAT-----AAC-TAGG-ACTagtgacttt
gi|11 : caagaatgtgaAAGTAGTGTATCCT--ATGA-CC-------T-TGACC-TTannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtttactgaaggaaacaagaggatttttttttctggaaactttcaaaatctt
gi|34 : ataaagaatgtaacctacaTATCTCCA--GTGA-CC-------T-TGACT-TTtaaccttggttataataactaatatatctatatgatataatatataataatatatctaatatatctctataactatagaaatgggattatctgaaatgatgaaaggagcttgagacctacatgtactaactaatatttgtatgagaccagatttaatgatggagtcggaattttctggacaatttgcaaaatctgcaatttagcatttttaaattaacttaaaatctggcattggaggaatacagtagtattgagaaaaagcctactttttacagccagtatttcgtttgggaggttttgtaatcagcagattataatcatatattacat
gi|23 : tgactcctgggacatttacctttgaccttgatcttaacaacgaatattactttgaatggtgtgagcttcaaactgtCCTTGATATTT-G-ACCTT-GAACAT-TAAAAT-CA-TATAACTGTAG-----A-AC-----tgaccctgatcctaaaagcttgcat
gi|14 : tgacccgtaacttttgaacataagatcagtatatgaaccagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntCCTTGACCTCT-T-AAGTT-G----------------TATAACCTTAG-----A-AC-----T-GAAATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNC-CTTGACCTCTT--ACCT-TAGATCAT-AAAACTCGC-ATAACCTTAGAAaggaattg
gi|12 : ctttgacttctgatcctaaaactcgcatgactttagaactggaattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngCTTGACCCCT-G-ACCCTAGAACAT-AATATT-GG-TATTATATAAG-----A-AC-----CGGGTCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTTCACATTTA--ACCA-T-CAACAT-AAAACTCGT-ATAACTTTAGAACatt
gi|7 : ccttgacctctgacctctgaacatgaaattggtatattttcaaaaccagacctgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaCTTGATATTT-G-ACCTT-GAACAT-TAAAAT-CA-TATAACTGTAG-----A-ACAGGAATTGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGGATCCCCAA---------TGAT-TTTG--ACCT-T-GATCATAGAAAGTTGT-ATAACTTAAGAACtggaattgacagagacatgggatcttcagaataatatgacgtcacaaattcggggagtcgggaacgat
gi|44 : CTTGACCTCTGTGACCTT-TAGGAT-AAAAAT-GAGTGTAACTTTAG-----A-Acagtactannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaccggtatccagtatccttgacctttgaccttgattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaacttaaaattggcatttaagcatggattatttgtaagggaggtatacagtagtatgaggaaaaagcccactttgtacagccagtgctt
gi|51 : CTTGACCTCT-G-ACCAT-GAA-----ATG-T-GA-TATAACTTTGG-----A-AC-----TGGGACTGgaggaacttatagaaattc
gi|8 : CT-TGACCTT-GAACATAAAAACT-GG-TATAACTAAAG-----AGAG-----TTGAT--------AAAAACGTTGGGTCTTCAAAAATGATAATAGGAGATATCAATTTGTCAAGTGACTTCAGTGACCTTGACCTCTG--ACCT-T-GGAAAAGAAAATATGT-a
gi|2 : cttgaccttggaaaagaaaatgggtactgcttcagaaccaggtacgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaCTTGACCTTTG--ACCT-T-GATTAATATAACTTGT-ATAATTTTAGGACtgaaccaggtacgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtttttggaaggaaacaggattatttttgggaattttcaaaaatctttacgattcagaatttttaaatgtacttgaaatgggcatggcatgaattgtgtgcaagggtggaatacagttgtatta
gi|28 : gcttaacatagaactcgatgggtaaaaaattaattccaaaattcaacagatgtgacttaataaatatgagagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgaacttaaaaactggcataactttagaaagagaattgattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgacctttgaccttggaaaagaaaatttatattacttcagaaccaggtttgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccgtgaccttgacctttgaccttgaacataaaaactggtatcatttagaaagagaattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgacctctgaccttggaaaagacaatcggtattacttcagaaacaagtctcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncccactttgatcttgaacatttaaagttgtaatacttaagaaccaatactaatctttagatgtgatagaagaatgtgaactacaaaatagtatatcctgtgacCTTGACTTCTG--ACCT-T-TAACATGTAAACTGGT-ATCATTTTAAAAtgggactgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatttactgaagtgaacagactgaggattttttctgaaatttttcaaaatcttggcaatttagatttttcaatgaac
gi|23 : CTTGATATTTG--ACCT-T-GAACATTAAAA-TCAT-ATAACTGTAGAACgtgggattaataacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntactttgacttagacctctgaccagggaacatagaattgcattacttcagccacat
gi|44 : tgacccgtaacttttgaacataagatcagtatatgaaccagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcCTTGACCTCTGTGACCT-T-TAGGATAAAAATGAGT-GTAACTTTAGAAaggaattg
gi|34 : CTTGACTTTTG--ACCC-T-GATCCTAAAAGCTTGC-ATgaggaacttatagaaattc
gi|22 : tgactcctgggacatttacctttgaccttgatcttaacaacgaatattactttgaatggtgtgagcttcaaactgttatctccagtgacCTTTACCTTTG--ACCT-T-GATTATAATAACT
gi|11 : caagaatgtgacttacaaagtagtttatcctgtgacCTTGACCTTTA--ACCT-T-GGTTATAATAACTAAT-ATATCTATAaggactannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtttactgaaggaaacaagaggatttttttttctggaaactttcaaaatctt
gi|47 : ataaagaatgtaacctacaaagtagtgtatcctatgacCTTGACTTCTG--ACCT-T-GGAAAAGAAAGTTGGT-ATTGCTCCAGAACtgatataatatataataatatatctaatatatctctataactatagaaatgggattatctgaaatgatgaaaggagcttgagacctacatgtactaactaatatttgtatgagaccagatttaatgatggagtcggaattttctggacaatttgcaaaatctgcaatttagcatttttaaattaacttaaaatctggcattggaggaatacagtagtattgagaaaaagcctactttttacagccagtatttcgtttgggaggttttgtaatcagcagattataatcatatattacat
gi|32 : agTTTACCTTTG--ACCT-T-GATCTTAACAACcaggtct
gi|34 : ataaaaattggtatcattttaaaactggaataaaattattgataaagataatgtgatataagaactgagtagaggattaactagtgtcaaggtcaattgactcctgggacaTTTACCTTTG--ACCT-T-GATCTTAACAACGAAT-ATTACTTT-GAAgaatatta
gi|3 : tgactcctgggacaCTTTG--ACCT-T-GAACATAAAAACTGGT-ATAACTTTAGAAtggtgtgagcttcaaactgttatctccagtgaccttgacttttgaccctgatcctaaaagcttgcat
gi|17 : tgttgatgaaagtcttagatattctaggatatgataggccaatgtatgaagatgtgcaaacatgtttttgttttcagatcgaaaggggttggggtacattctgggaggattaaatgggggtggggtttaacataaaaccctatggggaaaaaatccaaattcaacagatgtaaattgaaaattatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctttgaccattgaccataaaaactggtataactctagaaagagagttgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgatcttggaaaagaaaataggtactacttcagaaccaggtacgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgacttttgactttgaatataaaacctggtataactctagaaagagacttccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgatcttggaaaagaaaataggtactacttcagaaccaggtacgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCTTTG--ACTTCT-GATCCT-AAAACTCGC-ATGACTTTAGAACagagacttgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgacttctgaccttggaaaagaa
gi|51 : ttttgtattcagattgcaaggggggaggggggggggtacggtacattggggtgatgaaaggggaagttaacatagaaaactattgagggaataattctaaaattcaacataacttcacaatatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaTTG--ACCTCT-GACCATGAAATGTGAT-ATAACTTTGGAACtgg
gi|45 : cTTG--ACAT-T-GAACATTAAAAGTGGT-AAAACTTTAGAAtgggactga
gi|8 : cTTG--ACCT-T-GAACATAAAAACTGGT-ATAACTacagggttaatagagacatgggacctt
gi|49 : cttgaccttggaaaagaaaatgggtactgcttcagaaccaggtacgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacTTG--ACCT-T-GATTATGAAATATATT-ATAATTTTAGAACaaagagagttgataaaaacgttgggtcttcaaaaatgataataggagatatcaatttgtcaagtgacttcagtgaccttgacctctgaccttggaaaagaaaatatgttgaaccaggtacgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtttttggaaggaaacaggattatttttgggaattttcaaaaatctttacgattcagaatttttaaatgtacttgaaatgggcatggcatgaattgtgtgcaagggtggaatacagttgtatta
gi|13 : tggtcCCT-T-GAACATGAAAAC-TGTAATAAATTTAGAAtggaactg
gi|10 : CT-T-GACCATAAAAAGTTGT-ATAACTTTAAAACaagagaaatggatggacgaacattgggtcttcaaaaggattaatcagaaacctgtaaccttgtatcaaggattcagtgactccagtgacttgacttggaagaaaattggtttacggatccataaccattatgtcttgtagagacatgggctcatcaaaaattgataagggcttttctggactaactaactaggaatccccacttttgacctatgaatcatagaaagttgtaataccatttaagaaacagatgtgatatgaagaatggacctacgacgtagtatatcctgt
12 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|18 ): ATTACGTGTATCAGACGGATTATTATGGGTCTGGAAATTTTCAAAATCTTATTACGTTAGAATTTTCGGTTAATGAACCGGGGCATGTGCATGGGACTACTTGCACGGGAGGAATACAGTTTGTATTAAGAAAAAGCTTTTACTTTGTACAACCACGTACTTCGTTTGCGGAGACTTTTATATCGGTCAGATGGAATATTATATCTCTACATCTGGTTTTAACATGCTAAGGAATT
Unaligned ( gi|25 ): ATTAATCATGGTCTTTGTGCTCTAGATGTATTTTAAATGATTTATGAATGGCATGGATTTTGTGAGAGGGAGGAAAATAGTACTCAAAAAAGTCCACTATTATACAAATAGTATTTCGATTGGGAGACTTTATAATTGGTAAATTATAATAATATCTTATATGACTTC
Unaligned ( gi|30 ): TTTTCAAATGAAGTTTGGAGACATTGCTTTTGCTCGGTTCTTTTCGCTTCTCGTTCATTATCGTCTGCTTCTTTCTTGTGCCTAAAAATCTCCATAGCTTGTTGATGAAAGTATTTATTTAGAGATTTCAGATTGAAGGGGTTAGGGTGCATT
Unaligned ( gi|35 ): CCGCCTCTTTCTTGTGCCTAGAATTTCTCTATAACCTGATAATGCCAAAGTGTGTAGATGTGCAGAAGTTTTTTTGTTTGTTTTTAGATTGAAGGGGGTTGGGGTACATTTTTAG
Unaligned ( gi|36 ): GGATTTTGTGCAAGGGGTTATTAATATGGGGAAAATAGCAGCATCAGAAAAGCTCAACTTTTATACAGCAGATTTATTTGGCGAAGACTTTATAACGCAGATTATCATC
Unaligned ( gi|38 ): AAAGGGAGTTGACCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Unaligned ( gi|39 ): TCTCCAAAACAAAGTTTGGAGAGTGACTAATTCATAGTGTTTTTGCTCTGTTCATGTAATTCTTCCACTCCTCCTTGTTCC
Unaligned ( gi|41 ): ATAGAGACATAAAAATTTTAGATGAGATTAAAAAAAATGTGACCTACAACGTAGTATATCCAGTGACCTTTAT
Unaligned ( gi|42 ): TAAGTCTCCCAAACGAAGTCTGGGGACTTATTGCGTTTGCTCAGTTATAATTCATCATATTCTTCTTCCGCC
Unaligned ( gi|43 ): TCTTCGTAACGAATTTTGGAGACTTATTGTGTTTGCTCAGTTCTTTTAAATCGTCTGGCTCTTCCTCTTCCG
Unaligned ( gi|46 ): AAAATCAAGGCTTGTGTGATCTAGACTTTTAAATAAAGTTAAAATTGGCACGGA
Unaligned ( gi|50 ): CTCCTTAACCTGGTGATGGAAGTCTTAGAATATTTTAGGATATGATAGA
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 11111 111 66666666666666 111 11 1111 2222 33333333333333333333 1 222 22 1 333333333333 1 2222 333333333333 111111111 1 222 1 1 2222 22222222222 11 2222222222222222222 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 11 1111 222 22 1 11 555555555555555555555555555555555555555 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999 1 2222222 22 11111 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 1 111111 111111 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 444444444444444444444444444444444444 11111111111 222222222222222222 111 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555
lowQualScore : 1 0 44444 9 2 4 777 11111111111111 33 444 99 3 5 6 1 99 7 6 6 6 2222 1 3 5 7777 1 77777 555 8 0 77777777777777777777 0 7 1 3 3 99 6 000 2 6 6 11 3 99999 3 777777777777 1 2 4 4444 222222222222 777777777 0 777 77 0 1 0 0000 1 2 1 1 55555555555 1 11 0 55 8888888888888888888 0 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 8 11 8 66 4444 222 0 77 1 8 2 0 2 33 55 6 2 3 2 111111111111111111111111111111111111111 4 4 777 4 66 4 1 5 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999 4 4 9999 55 4 1 7 1 5 888 2 1 0 1111111 33 44444 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 3 7 3 2 0 3 7 000000 222222 4 1 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 6 33 2 222 5 2 2 777 2 33 999 99999999 33 3 000000000000000000000000000000000000 222 22 1 666 33333333333 111 33 555 0 66 3 3 3 333333333333333333 111 55 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 1 22 8 33 6 777 77 0 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 3 4 3 3 2 44 1 0
lowQualScore : . . ..... . . . ... .............. .. ... .. . . . . .. . . . . .... . . . .... . ..... ... . . .................... . . . . . .. . ... . . . .. . ..... . ............ . . . .... ............ ......... . ... .. . . . .... . . . . ........... . .. . .. ................... . ....................................................................................................................................................... . .. . .. .... ... . .. . . . . . .. .. . . . . ....................................... . . ... . .. . . . ........................................................ . . .... .. . . . . . ... . . . ....... .. ..... ........................................................................................... . . . . . . . ...... ...... . . .............................................................................. . .. . ... . . . ... . .. ... ........ .. . .................................... ... .. . ... ........... ... .. ... . .. . . . .................. ... .. .................................................................................... . .. . .. . ... .. . ........................................................................................... . . . . . .. . .
lowQualScore : 0 2 22222 2 5 2 555 00000000000000 22 000 00 8 6 7 0 22 5 7 7 7 7777 0 2 2 2222 0 77777 000 0 8 77777777777777777777 7 8 7 3 2 77 7 777 2 7 7 77 3 77777 3 888888888888 0 5 0 5555 000000000000 000000000 0 222 55 0 0 0 0000 0 0 2 2 66666666666 0 00 8 22 4444444444444444444 3 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 0 00 0 44 8888 000 8 00 0 0 5 5 5 00 00 0 0 2 8 333333333333333333333333333333333333333 4 4 888 4 11 4 7 7 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999 4 4 4444 33 7 9 4 9 0 444 5 4 7 7777777 44 33333 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 6 3 6 5 9 6 3 555555 333333 0 0 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 3 99 7 888 0 5 5 888 5 44 999 77777777 99 3 444444444444444444444444444444444444 999 66 6 000 11111111111 222 44 888 8 22 3 1 3 444444444444444444 333 55 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 7 11 6 99 6 222 22 8 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 8 5 6 6 3 44 0 8
consensus : GAACACGTAGTGTCGGGGACACAT--TGTTTTTGCTCCGTTTC---TTC---TTATTA----TTCCTC---TTCT-CTTTAGTGATGA-ACTTGTCCGCGCGA--TTTTAT-GAA-AGTG-CTTC---AACAGATCCAATTCAAACTTT---TGTGGGCTGATAGGGAGTCNTGANGA-GGGGTGGCCGCCCAA-CAA--GT---AAAAAATCAAGGTTGTCGGATTTCA-ACCAAATTTTCAATTTT-TAGGGTAATTCGATGAC-C-CCGAGTTCATTG-TCC-GCA-TCACAAAAANATTTT--------T-AGCCCGCCCATTTTTTTTCAAAATGGCCGCC--ATACA--GAAAAT--GT-TT--AAA-TG-CTTAAAATTTCTACATCA-TTTGGGTTCT-GTG---GTCAATTGAGGGTACACAATTCATATCTAGC--A--AT-TA-TTTT--TTTATATCNAATTTTCGAA---TGTGC--C-AAGATGGCCGTCATTTCAAAA-----GT--------CAAAA-A------TTGTCGGATTTCAACCAAA-T-T-AGTT-------TTTTAG-----GGTN--AATTCAGGATC-C-AAGTCT-A-T-TCT-G-------TATT-----TTTC----------TCTG-GT-A--C-C--A-TTTCTGACATA---GGGGA---GGTGTTC-GGGGA-CATTTNTGTTGGCATCCCAACACAGTTATAGCTTGTTCTTCTTCCGCCGCTTTCTCGTGCCTAAAACTGTCC-GACA-------TTNTCC--G-A---A-ACCT--T-GATGAAAGTCTTAGA-TATTCTAGGAT---AT-G--ATAG-GCCAATGTATGTAGATG-TGCAGAAATGTT------------------GGGGTT-GGG---TACATTT---------------TNGG-GG-GA----TCGAATGGGGGTGGGGTTTAACATAGAACTCTA-TGGG--GAAAATTAATTCCAAAATTCAACAGAT------GTAACTTGACAAAAT-----ATG------ATAG-----------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTNCTTTGACC-T-TG-ANCAT-A-AAAC-TGGTA------TAACTTTAGAAC-----NAGA-ACTGATTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGTAGTGTATCCTAT--CCTTGACCTTTG--ACC-T-T-GAACAT-A-A-AA-C-TG-GTATAACTTTAG--AACC-GGAAT--------TG--ATAGA-GACN---TC------ANATNGGG--TGA-TACG-----AACTAGTATCAAGGTCGANTGACTCC-------TTT-ACCTTNCTTA-CAAAG---TAGTATCTCCNGTGA-CC-TTGACC-TTG-----G--AA---NA--AAATA--G--GTATTAC-TT---AACCAGG-ACTGA-CANCGNGNCANGATTCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACCGGTATCCNGTGNCCTTGACCTCTGACCTT-GA--ACAT-A-AAAC-TGGTATAACTTTAGA-----ACTN--G--------GANTGGATACAAANACGTNGGGTCTTCAGAAATGATAATAGGAGA-TGTNAACTTGNCAAG----TGACTCCNGTGACCTTGACCTTTGACC-TT-GATCATGAAAACTNGTATAACTTTAGAAC
Reference ( family-2 ) : GAACACNTAATGTCGGGGACACAT--TGTTTTTGCTCCGTTTC---TT----TTATTA----TTTCTC---TTC--CTTTAGTGATGA-ACTTGTCCGCGCGA--TTTNAT-GAA-AGTG-CTTC---AACAGATCCAATTCAAACTTC---TGTGGGCTGATAGGGGGTCCTGANGA-GGGGTGGCTGCCCAA-CAA--GT---AAAAAATCAAGGTTGTCGGATTTCA-ACCAAATTTTCAATTTT-TAGGGTAATTCGATGAC-C-CCGAGTTCATTGCTCC-GCA-TCACAAAAAAATTTT--------TTAGCCCGNCCATTTTTTTTCAAAATGGCCGC---ATACA--GGAAAT--GT-TT--AAA-TG-CNTAAAATCTCTACATCA-TTTGGGTTNT-GTG---GTCANTCGAGGGTACACAATTCATATCTAGC--A--AT-TG-TNTT--TCTATATCTAATTATCAAA---TNTGC--T-AAGATGGCCGTCATTTCAAAA-----AT--------CAAA---------TTGTCGGATTCCAACCAAA-T-T-ANTT------ATTTTAG-----GGTT--AATTCAGGATC-C-AAGTCC-A-T-TCT-G-------TATT-----TTTC----------TCTG-GT----C-C--A-TTTCTGACATA---GGGGA---GGTGTT--GGNGA-CATTTGTGTTGGCATCCCAGCACAGTTATAGCTTGTTTTTCCTCCGCCGTTTCCCCGTGCCTGAAACTGCCC-GACA-------TTNTCC--GNA---A-ACCT--T-GATGAAAGTCTTAGA-TATTCTAGGAT---AT-G--ATAG-GCCAATGTATGTAGATG-TGCAGAAATGTT------------------GGGGTT-GGG---TACATTT---------------TCGG-GG-GA----TCGAATGGGGGTGGGGTTTAACATAGAACCCTA-TGGG--AAAAATNAATTCCAAAATTCAACAGAT------GTAACTTGATAAAAT-----ATG------ANAG-----------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTTGACC-T-TG-AACAT-A-AAAC-TGGTA------TAACTTTAGAAC-----CAGA-ACTGNTTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACCGGTATCCAGTANNNNNNNNNGT--CCTTGACCTCTG--ACC-T-T-GAACAT-A-A-AA-C-TG-GTATAACTTTAG--AACC-GGAAT--------TG--ATAGA-GACA---TC------ANATAGGA--TGA-TANA-----AACTAGTATCAAGGTCAAGTGACTCC-------TTT-ACCTTNCTTA-CAAAG---TAGTATCTCCNGTGA-CC-TTGACC-TTG-----G--AA---NA--AAATA--G--GTATTAT-TT---AACCAGG-ACTGACCANCGNNNCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACCGGTATCCAGTATCCTTGACCTCTGACCTT-GA--ACAT-A-AAAN-TGGTATAACTTTAGA-----ACTT--G--------GNCTGGATTCNAAAACGTTGGGTCTTCAAAAATGATAATAGGAGA-TATCAATTTGNCGAN----CGNCNNCAGTGNCCTTGACCTTTGACC-TT-GANCATGAAAACTNGTATAACTTTAGAAC
gi|1 : GAACACATTGTGTCAGGGACACAT--TGTTTTGGCTCCATTTCGTATTA---TTATTAGTATTTTTTT---TTCT-CTTTGGTGATAA-ATTCACTTGCATGA--TTTTAT-GAA-AGTG-CTTC---AACAGATCCAATTCAAACTTTAA-TGTGAGCTG-TAGGGAGCCATGAAGA-GGGATGACTGCCCAA-CAA--GT---AGAAAATCAAGGCTGTCACACTTCA-ACCAAATTTT--ATTGC-TGGGG-AATTTGATGACTC-CTGAGTCCATT--TCCAGCA-GGA-AAAAAAATTGT-----------G-CCATCCA-----TTTCAAAACGGCCTT---ATACA--AAAAAT--GT-TT--AAG-TGTTTTAAAATTTCTACATCATTTTGGGTTCT-GGA---GTCAATTGAGGCTACGCATTTCATGTCTAGC--A--ATCTG-TTTT--TCT---TCT-AT--TCAAA---TCTGC--T-AAAATGGCTGCCATTTCAAAA-----AT--------CAA------------GTCGGATTTCAACAAAA-T-T-ATTT------TTTCTAG-----GGTT--AATTCAGGATC-C-AAGTCC-A-TATCTGG-------TATT-----TTTA----------TTTG-GT----C-C--A-TTTCTGACATA---AGGGA---GGTG----GGTGA-CATTTTTGTTGGCATCTCA--ACAGTTATAGCTTGTTTTTCATATTC--TTTTTTCAAGCCTAAAAC-AACA-GGCA-------TTCTCT--GAA---A-ACCT--T-GATGAAAGTATTAGA-TATTC-AATAT---AT-G--ATAT-GCCAATGTATCTAGTTGATGCAGAAATGTT------------------AGGGTT-GGA---TACATTT---------------TGAG-GG-GA----TCAAATGGGGTTGGGGCCGAACGTAGAAC-------------AGATTAATTACAAAATTTAGTAGAT------ATAACTTGACAAAAT-----ATG------NNNN-----------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCTAACC-A-TG-AACAT-A-AAAC-TGGTA------TAACTTTAAAACTACTGCAGG-ACTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNT--CCTTGACCTCTG--ACC-T-T-GAACAT-A-A-AA-C-TG-GTATAACTTTAT--AACT-GGAAT--------TG--ATAGA-GATA---TC------AAATTGGA--TGA-TACA-----AACTAGTATCAAGGTTGAATGACTCC-------TTT-ACCTTTCTTA-TTAAG---TAGTATCTGCAGTGA-CC-TTGACC-TTG---------A---TA--AAACA--G--ATATTA---T---AACCAAG-ACTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTTGACCTCTTACCTT-GA--ACAC-A-ACAC-TGATATAACTTTAGA-----ACTT--G--------GTCTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNN----NNNNNNNNNNNNTCTTGACCTTTGACC-TT-GATCATGAAAACTTGTATAACTTTAGAAC
gi|10 : C-T-TG-ACCAT-A-AAAAGTTGTA------TAACTTTAAAAC-----CAGA-ACTG
gi|11 : CCTA-CAAAG---TAGTGTATCCTATGA-CC-TTGACC-TTaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttaaaaaaggaaacaaattaccaaggtatttcgtttgtgaaaattttcaaaatcaaggtctttgtgaactagacttttaaacaaaattggcacggattttgtgcaagggagtgattactgcagggaaaaatagttgtgcattatgtattcagaaaaaaacaacacttttatttatatacaaccagtgcttcgtctgagaaacttaattagcagattataatcataattgtcttgttttttttctacactcttttcaattttattgtcagtt
gi|11 : ataaagaatgtaaAGTAGTGTATCCTATGACCTTGACCTTTA--ACC-T-T-GGTTAT-A-ATAA-C-TA-ATATATCTATAtaaccttggttataataactaatatatctatatgatataatatataataatatatctaatatatctctataactatagaaatgggattatctgaaatgatgaaaggagcttgagacctacatgtactaactaatatttgtatgagaccagatttaatgatggagtcggaattttctggacaatttgcaaaatctgcaatttagcatttttaaattaacttaaaatctggcattggaggaatacagtagtattgagaaaaagcctactttttacagccagtatttcgtttgggaggttttgtaatcagcagattataatcatatattacat
gi|11 : ataaagaatgtaacctacaaTGACCTTGACCTTTAACC-TT-GGTTATAATAACTAATATATCTATAtgatataatatataataatatatctaatatatctctataactatagaaatgggattatctgaaatgatgaaaggagcttgagacctacatgtactaactaatatttgtatgagaccagatttaatgatggagtcggaattttctggacaatttgcaaaatctgcaatttagcatttttaaattaacttaaaatctggcattggaggaatacagtagtattgagaaaaagcctactttttacagccagtatttcgtttgggaggttttgtaatcagcagattataatcatatattacat
gi|12 : ataaagaatgtaacctacaaagtagtgtatccta--CCTTGACCTCTG--ACC-TCT-GAACAT-G-A-AA-T-TG-GTATATTTTCAA--AACC-AGACC--------TG--NNNNN-NNNN---NN------NNNNNNNN--NNN-NNNN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-------NNN-NNNNNNNNNN-NNNNN---NNNNNNNNACT-TGACCC-CTGACC-CTA-----G--AA---CA--TAATATTG--GTATTAT-AT---AA----G-A------ACCGGGTCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTTCACATTTAACCAT-CA--ACAT-A-AAAC-TCGTATAACTTTAGA-----AC-T--G--------GAATTGA--CAGAGACATGGGATCTTCAGA----ATAATATGAtgatataatatataataatatatctaatatatctctataactatagaaatgggattatctgaaatgatgaaaggagcttgagacctacatgtactaactaatatttgtatgagaccagatttaatgatggagtcggaattttctggacaatttgcaaaatctgcaatttagcatttttaaattaacttaaaatctggcattggaggaatacagtagtattgagaaaaagcctactttttacagccagtatttcgtttgggaggttttgtaatcagcagattataatcatatattacat
gi|13 : CC-T-T-GAACATGA-A-AA-C-TG-TAATAAATTTAGAAAAGA-GAAAT--------GG--ATGGACGA-------------ACATTGGG--T-C-TTCA-----AA--AGGATTAA--TCA---GAAACC-------TGTAACCTTG--TATCAAGGATTCAGTGACTCCAGTGA--C-TTGA-C-TTG-----G--AA---GA--AAATT--G--GT-TTAcgtcacaaattcggggagtcgggaacgat
gi|14 : CTTTGACT-TCTG-ATCCT-A-AAAC-TCGCA------TGACTTTAGAAC-----TGGA-ATTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNGCCTTG--ACC-T------CTT-A-A-G----TT-GTATAACCTTAG--AACT-GAAAT--------cggatccataaccattatgtcttgtagagacatgggctcatcaaaaattgataagggcttttctggactaactaactaggaatccccacttttgacctatgaatcatagaaagttgtaataccatttaagaaacagatgtgatatgaagaatggacctacgacgtagtatatcctgt
gi|14 : CCTTGACCTCT--------------T-A-A--G-TTGTATAACCTTAGA-----ACT---G--------AAATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNN----NNNNNNNNNNN-CCTTGACCTCTTACC-TTAGATCAT-AAAACTCGCATAACCTTAGAAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgacctcttaccttagatcataaaactcgcataaccttagaaatt
gi|15 : ctttgacttctgatcctaaaactcgcatgactttagaactggaattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngTTTCT--GTA---A-CCCT--TTGAGGAAAGTATTAAG-TATCCATGGATTTTATAG--ATAG-GCCAA-GTATCTTGTTG-TGCAGAAAGGTT------------------GAA-TT-GGGGTGTACATTTGTATTGAATGTACATTTGGAGG-GA----TCAAATGGGAGTGGGGTTTAACATAAAGCTCGT-TGGG--AAAAATAAATTCCAAAATTCAACatt
gi|16 : tgaagtttggagacttattgtatttttttgcttggtgcttattcttctttttgtgtgtgtgtgtgctggGTTTTT--TCCGCCTCTTTCTTGTGCCTGAAACTGCCC-GACA-------TTATTC------------CC--C-GATGAAAGTCTTAGA-TATTCTAGGAG---AT-G--ATAG-GCCAATGTATGTAGAGG-TACAGAAATGTTTTTGTTTTCAGATTGAAGGGGGTTAGGG---TACA--T---------------TCGG-GG-G-----------GGGGGGGGTGTTTAACATAAAACTCTA-TGGG--GAAAATTATTT---AAAT-------------------CTTGAT-AAAT-----ATG------ATAG-----------gaaaagcataatagtttccttaatagatgtg
gi|17 : aacgaagtttggagtcttattgtatttgctcgattcttattcttacc------------------GGGGTA-CGG---TACATT------------------GG-GGTGA----T-GAAAGGGGAAG----TTAACATAGAAAACTA-TTGA--GGGAAT-AATTCTAAAATTCAACA----------TAACTTCACAATATGNNNNNNN------NNNN-----------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTACTTTGACT-TCTG-ATCCT-A-AAAC-TCGCA------TGACTTTAGAAC-----tgtcatag
gi|19 : ttttgtattcagattgcaaggggggaggggggTCTGGC--ATAAT-TA-TTTC--TTTATATCTAATTTCCGAA---T-TGCATC-AAGATGGTTGTCATTTCAAAA--------------------------------TGGCTGCCAA--AAA-TGC-AGTTTGTTAGACTTTAGTTTGTAGTTTAAATTTAGGATC-C-AAA------------------------------------------------GT----C-C--A-T--CCGACATA---GGGAAATAGATGTT--CGAGGTCATTTGTGTTGACATTCCAACA-GGATATAACTTGTTtgg
gi|2 : GCTTAACATAGAACTCGA-TGGGTAAAAAATTAATTCCAAAATTCAACAGAT------GTGACTTAAT-AAAT-----ATG------AGAG----------------------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCC-T-TG-AACTTAA-AAAC-TGGCA------TAACTTTAGAAA-----GAGA-ATTGATTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--CCTTGACCTTTG--ACC-T-TGGAAAAG-A-A-AA-T-TT-ATATTACTTCAG--AACC-AGGTT--------TGNNNNNNN-NNNN---NN------NNNNNNNN--NNN-NNNN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-------NNN-NNNNNNNNNN-NNNNN---NNNNNNNNNCCGTGA-CC-TTGACCTTTGACCTTG--AACATAA--AAACT--G--GTATCAT-TTAG-AAAGAGA-ATTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTTGACCTCTGACCTTGGA--AAAG-A-CAAT-CGGTATTACTTCAGA-----Aatcatactagtattttacaaaataaatttcact
gi|2 : CTTTGATCTT-GA--ACAT-TTAAAG-TTGTAATACTTAAGA-----ACC-----------------AATACTAA---------TCTTTAGA--TG-TGATAGAAGAATGTGAACT--ACAAAATAGTATATCCTGTGACCTTGACCTTTGACC-TT-GATTAATATAACTTGTATAATTTTAGGACacaagtctcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncccactttgatcttgaacatttaaagttgtaatacttaagaaccaatactaatctttagatgtgatagaagaatgtgaactacaaaatagtatatcctgtgaccttgacctttgaccttgattaatataacttgtataattttaggactgggactgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatttactgaagtgaacagactgaggattttttctgaaatttttcaaaatcttggcaatttagatttttcaatgaac
gi|2 : gcttaacatagaactcgatgggtaaaaaattaattccaaaattcaacagatgtgacttaataaatatgagagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgaacttaaaaactggcataactttagaaagagaattgattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgacctttgaccttggaaaagaaaatttatattacttcagaaccaggtttgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccgtgaccttgacctttgaccttgaacataaaaactggtatcatttagaaagagaattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgacctctgaccttggaaaagacaatcggtattacttcagaaacaagtctcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncccaTATCCTGTGACCTTGACCTTTGACCTT-GATTA-AT-A-TAAC-TTGTATAATTTTAGG-----ACTG--G--------GACTGtgggactgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatttactgaagtgaacagactgaggattttttctgaaatttttcaaaatcttggcaatttagatttttcaatgaac
gi|20 : gcttaacatagaactcgatgggtaaaaaattaattccaaaattcaacagatgtgacttaataaatatgagagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgaacttaaaaactggcataactttagaaagagaattgattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgacctttgaccttggaaaagaaaatttatattacttcagaaccaggtttgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccgtgaccttgacctttgaccttgaacataaaaactggtatcatttagaaagagaattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgacctctgaccttggaaaagacaatcggtattacttcagaaacaagtctcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncccactttgatcttgaacatttaaagttgtaatacttaagaaccaatactaatctttagatgtgatagaagaatgtgaactacaaaatagtaAACACCTAATGTCGGGGACATAG--TGTTTTTGCTCCATTTC---TTCTTATCATTA----TTCATC---TTC--GTTT-GTGCTGA-ACTTGTCTGCGCGATTTTTTATGGAA-AGTGCCTTCCCAGAAAAATCCAATTCAAACTT----TGTGGG-TGATAAGGCGATCTGAGGA-GNNNNNNNNNNNNNN-NNN--NN---NNNNNNTCAtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatttactgaagtgaacagactgaggattttttctgaaatttttcaaaatcttggcaatttagatttttcaatgaac
gi|21 : aatatacaattactatatattatgtccaccTGC--TTGAGATGTTCGCCAATTTAAAATGCCTGC--------CAAA-----------AATAGATTTCAACCAAA-TGT-AGTT---------TTAA-----GGTTG-AATTCGTGATC-CCAAGTCT-ACT-TCT-GGACTCGATATA-----TTTC----------TCTG--T----CAC--AGTTTCTGACAT-----GGGAC--GGTGTTC-GGAAA-CTTTTGTGTTGGCATCCCAGCACAGTTATAGCTTGT
gi|22 : caatctctgaaCTTA-CAAAG---TAGTTTATCCTGTGA-CC-TTTACC-TTT-----G--AC---C------TT--G----ATTATAAT---AACTAGG-ACT
gi|23 : caagaatgtga-T-TG-AACAT-A-AGAT-CAGTA------TA----T-GAAC-----CAGN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----T--CCTTGATATTTG--ACC-T-T-GAACAT-T-A-AA-A-TC-ATATAACTGTAG--AACA-GGAAT--------TG--annnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtttactgaaggaaacaagaggatttttttttctggaaactttcaaaatctt
gi|24 : tgacccgtaacttT------------------GGAGTT-GGGG--TACATTT---------------GGGG-GG-GGGGGGTCAAATGAGGAAGGAGTTTAACATAGAACTCCA-GGGG--GATAAT---TTCCAAAATTAAACAGAT------TTAACTTGAC-AAAT-----ATG------ATAG-----------
gi|26 : ttcagattgaa---AAAAAATCAAAGTTGTCGGATTCCACACCAAATTTTCAATTTT-TAT--TAATTCGATGAC-C-CCAAGTTCATTGCTTC-GCA-TCACAAAAACATTTT--------TTAGCCCGCCCATTTTTTTTCAAAATGGattcctggggtcttcggaaatgaaaatacaaggcccacgaactacctagt
gi|27 : tgaaaatgcaaatattacccgaaggcaacttaaactatgtaaaaa---AAAAAATCAAAGTTGTCGGATTCCACACCAAATTTTCAATTTT-TAT--TAATTCGATGAC-C-CCAAGTTCATTGCTTC-GCA-TCACAAAAACATTTT--------TTAGCCCGCCCATTTTTTTTCAAAATGG
gi|28 : tgaaaatgcaaatattacccgaaggcaacttaaactatgtaaaaaCTTGACTTCTG--ACC-T-T-TAACAT-GTA-AA-C-TG-GTATCATTTTAA--AAGT-GGGAT--------TA--ATA
gi|28 : CTTGACTTCTGACCTT-TA--ACAT-GTAAAC-TGGTATCATTTTAAA-----AGTG--G--------GATT-AAT---AACANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNN----NNNNTACTTTGACTTAGACCTCTGACCAGG-GAACATAGAA--TTGCATTACTTCAGacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntactttgacttagacctctgaccagggaacatagaattgcattacttcagccacat
gi|29 : TTCTC---CTT--CTTCAGTAA-GACATGTGTCCACGTGC--TTTGAT-AAA-AGTG-CCTT---TATAGATCAAATTC-AATTTT---TGTAGGCTGATAGAGAGccacat
gi|3 : T--T-GATGAAAGTCTTAGA-TATTCTAGGAT---AT-G--ATAG-GCCAATGTATGAAGATG-TGCAAACATGTTTTTGTTTTCAGATCGAAAGGGGTT-GGGG--TACATTC---------------TGGG-AG-GA----TTAAATGGGGGTGGGGTTTAACATAAAACCCTA-TGGG--GAAAA--AATCC--AAATTCAACAGAT------GTAAATTGA-AAATT-----ATGNNNNNNNNNN-----------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTTGACCAT-TG-ACCATAA-AAAC-TGGTA------TAACTCTAGAAA-----GAGA-GTTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--CCTTGATCT-TG----------GAAAAG-A-A-AA-T-AG-GTACTACTTCAG--AACC-AGaacaaactactttcaaaatgccccccaccccgcccccaattcaaaatgtcaaaaatgtcaacaattaaggttg
gi|3 : tgCTTTG--ACCAT-T-GACCAT-A-A-AAAC-TG-GTATAACTCTAG--AAAG-AGAGT--------TG--NNNNN-NNNN---NN------NNNNNNNN--NNN-NNNN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-------NNN-NNNNNNNNNN-NNNNN---NNNNNNNNNN------CC-TTGATC-TTG-----G--AA---AAGAAAATA--G--GTACTAC-TTCAGAACCAGGTAC-GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTTGACTTTTGACTTT-GA--ATAT-A-AAACCTGGTATAACTCTAGAAAGAGACTTCCN--------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNN----NNNNNNNNNNNNNNNNNNCC-TTGATC-TT-GGAAAAGAAAATAGGTACTACTTCAGAACgtacgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgacttttgactttgaatataaaacctggtataactctagaaagagacttccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgatcttggaaaagaaaataggtactacttcagaaccaggtacgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctttgaccttgaacataaaaactggtataactttagaaagagacttgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgacttctgaccttggaaaagaa
gi|3 : tgttgatgaaagtcttagatattctaggatatgataggccaatgtatgaagatgtgcaaacatgtttttgttttcagatcgaaaggggttggggtacattctgggaggattaaatgggggtggggtttaacataaaaccctatggggaaaaaatccaaattcaacagatgtaaattgaaaattatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCCTTGATC-T-TGGAAAAG-A-AAAT-AGGTA------CTACTTCAGAAC-----CAGGTAC-GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--CCTTGACTTTTG--ACT-T-T-GAATAT-A-A-AA-CCTG-GTATAACTCTAG--AA----------------------AGA-GACT---TCCNNNNNNNNNNNNN--NNN-NNNN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-------NNN-NNNNNNNNNN-NNNNN---NNNNNNNNNNNNNNN-CC-TTGATC-TTG-----GAAAA---GA--AAATA--G--GTACTAC-TTCAGAACCAGG---T-----ACGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTTGACCTT-GA--ACATAA-AAAC-TGGTATAACTTTAGAAAGAGACTT--GCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNN----NNNNNNNNNNNNCCTTGACTTCTGACC-TT-G-----GAAAAcaggtacgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctttgaccttgaacataaaaactggtataactttagaaagagacttgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgacttctgaccttggaaaagaa
gi|31 : tgttgatgaaagtcttagatattctaggatatgataggccaatgtatgaagatgtgcaaacatgtttttgttttcagatcgaaaggggttggggtacattctgggaggattaaatgggggtggggtttaacataaaaccctatggggaaaaaatccaaattcaacagatgtaaattgaaaattatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctttgaccattgaccataaaaactggtataactctagaaagagagttgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCGTGCTTAAAACTGTCTTGATAAAAAAAGTTTTCTATGCA---ACATGT--G-GAAGAAAGTCTTAGA-TATTATATGAT---AT-GATATAG-GCTAATGTATGTAGAT--CGCAGAAATGTT----------------------TT-GGG--------TT---------------TC----A-GA----TTGAA-GAGGTTGGGGTgaa
gi|32 : tttgt-A-A-AA-T-TG-GTATCATTTTAA--AACT-GGAATAAAATTATTG--ATAAA-GATAATGTG------ATATAAGAACTGAGTAGAGGATTAACTAGTGTCAAGGTCAATTGACTCCTGGGACATTT-ACCTTattgg
gi|33 : ataGCTTCTTCTTCTTCCGCCGTTTTCCCATGTCTAAAACTGTCC-GACA-------CTG----------------T--T-GATGAAAGTCTTAGA-TATTCTAGGtgaccttgatcttaacaacgaatatta
gi|34 : gtctcccaaacgaagtttggagacttattgagtttgctcagttcttgcaattcttccGACTCCTGGGACATTTACCTTTGACC-TT-GATCTTAACAACGAATATTACTTT-GAA
gi|34 : tCTT--CAAAC---TGTTATCTCCAGTGA-CC-TTGACT-TTT-----G--Atggtgtgagcttcaaactgttatctccagtgaccttgacttttgaccctgatcctaaaagcttgcat
gi|34 : tgactcctgggacatttacctttgaccttgatcttaacaacgaatattactttgaatggtgtgagCTCCAGTGACCTTGACTTTTGACC-CT-GATCCTAAAAGCTTGCATccctgatcctaaaagcttgcat
gi|35 : tgactcctgggacatttacctttgaccttgatcttaacaacgaatattactttgaatggtgtgagcttcaaactgttatTCTATAAC---CT-G--ATAATGCCAAAGTGTGTAGATG-TGCAGAAGTTTT------------------TTTGTT-TG--------TTT---------------TT----A-GA----TTGAAGGGGGTTGGGGT---ACAT
gi|37 : ccgcctctttcttgtgcctagaatttcGCTTCTTCTTCTCCCGTCGCTTTCTCATGC-TAAAACT----------------TTCTCC--TTACTTA-ACCTGTT-GATTAAAGTCTTAGA-TATTCTAGGAT---AT-G--ATAG-ttttag
gi|4 : ---A-ACCTGGT-GATGGAAGTCTTAGA-TATTCTAGGAT---AT-G--ATAG-ACCAATGTCTGTAGATG-TGCAAACATGTTTTTGTTATCAGATTGAAGGGGGTTAGGG---TACATTC---------------TTGG-GG-GA----TCAAATGGGGGTGTGGTTTAACATAGAACCCTATTGGA--AAAAATTAATTCCAAAATTCAACAGATAATATGATAACTTGAT-AAAT-----ATG------ATAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTTTGAAC-T-TG-AACATCA-AAAC-TGGTA------TAACTCTAGAAA-----GAGA-GTAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--CCTTGACCT-TG----------GAAAAG-A-A-AA-T-AG-GTATTACTTCAG--AACCAGGTAT--------GN--NNNNN-NNNN---NN------NNNNNNNN--NNN-NNNN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-------NNN-NNNNNNNNNN-NNNNN---NNNNNNNNNCCTTCA-CCTTTGACC-TT------G--AG---CAT-AAATACTG--GTATAAT-T------CTAGA-AA-GA--AACATGCTA-GATTCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTTGACCTCTGACCTTGGA--AAAG-A-AAAT-AGGTATTACTTCAGA-----ACCA--G--------GTATGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNN----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCC-TT-GAACATAAAAACTGGTATAACT
gi|40 : ctccttATAAATTTAG--AAAG-AGAAT--------TG--ATAGA-GACT---TC------AGAAAGGG--TAA-CATG-----ACCT-GTA--AAGGTCCAGTGACTCC-------aattaacagag
gi|41 : CCTA-CAACG---TAGTATATCCAGTGA-CC-TTagtgacttt
gi|44 : atagagacataaaaattttagatgagattaaaaaaaatgtgaCTTGACCTCTGTGACC-T-T-TAGGAT-A-A-AA-A-TGAGTGTAACTTTAG--AAGA-GGAAC--------TT--ATAGA-AAtat
gi|45 : TG--ACA-T-T-GAACATTA-A-AA-G-TG-GTAAAACTTTAG--AAAC-AGGGT--------TA--ATAGA-GACA---Tttc
gi|47 : ctCTTGACTTCTGACCTTGGA--AAAG-A-AAGT-TGGTATTGCTCCAGA-----ACCA--G--------GTCTgggacctt
gi|48 : agTTTGACC-T-TG-AACAT-ATAATC-TGGTATACATGTAACTTTAAAAA-----GAGA-ATTG
gi|49 : TTGACC-T-TG-ATTAT-G-AAATATATTA------TAATTTTAGAAC-----TGGA-ACTG
gi|5 : tggtcATGTCTCGAACACATATTGTTTTTGTTCCGTTTC---TTC---TTATTT----TTCTTC---TTCTTCTTTAGTAATGA-ACTTGT-CACCCGA--TTTGAT-GAA-AGTG-CTT----AACAG--------------TT---TGTGGACTGATAGGGA----TAATTA-GGAGTG
gi|5 : attTGGCCACCAAA-AAAAGGC---TAAAATTAAAGGTTGTTGGATTTTA-ACCAAATT-----TTTC-TAGGGTAATTTGATGAC-C-CGGAG-TCATT--TCC-GCA-T-GC-AAAATATTTT--------TAAGCCCG-CCATTTTT-----ATATGGCCGC----CACAGCGGAAATCCTT-TT--AAA-TG-CTTAAAA---ATATATTA-TTTGAGTTATGGTGCAAGTCCAACGAGGGTTCACAGTTCATTTCTAGCTAA--GT-TATTCTT--TCCATATCCAATT-TCAAAATGTATGC----AAGATGGCCATCATTTCAAAAGGCT-GT--------CAAAATATTCCGTTTGTCGGATTTCAACCAAATT-T-AGT--------TTATAG-----AGTG--AATTCA----C-C-CATTCCAA-A-TCT---------TATT-----TCTTGACATTAAAATATG-TTTAAAC-CCAA-TTTATGACAAA---GGGGA---GGTGTTGCGGGGA-CAcacaaaacattgaaaatggccgccaattcaaaatggccaccaaaaaaaggctaaaattaaaggttgttggattttaaccaaatttttctagggtaatttgatgacccggagtcatttccgcatgcaaaatatttttaagcccgccatttttatatggccgccacagcggaaatccttttaaatgcttaaaaatatattatttgagttatggtgcaagtccaacgagggttcacagttcatttctagctaagttattctttccatatccaatttcaaaatgtatgcaagatggccatcatttcaaaaggctgtcaaaatattccgtttgtcggatttcaaccaaatttagtttatagagtgaattcacccattccaaatcttatttcttgacattaaaatatgtttaaacccaatttatgacaaaggggaggtgttgcggggacag
gi|50 : attatgtctcgaacacatattgtttttgttccgtttcttcttatttttcttcttcttctttagtaatgaacttgtcacccgatttgatgaaagtgcttaacagtttgtggactgatagggataattaggagtgcacaaaacattgaaaatggccgccaattcaaaa---A-ACCTGGT-GATGGAAGTCTTAGAATATTTTAGGAT---AT-G--ATAG-g
gi|51 : ctccttCTTGACCTCTGACCAT-GA--A-AT------G-TGATATAACTTTGGA-----ACTG--G--------GACTGa
gi|6 : -ACTTGTCCGCGCGA--TTT-AT-GAA-CGTG-CTTC---AACAGATCTAATCTAAA-TTCAATTGTGGACTGATAGGGGGTCAT-ACGACGGGGTG------CAATCAA--GTTTCAAAAa
gi|6 : ---AAAAAAT--ACGTTGTCGGATTTCA-ACCA---TTTC--TTTTCTAGGGTAATTTGATGAT-C-TCGAGTTCATT--TCCAGCAATTA-AAACAAATTG-----------AGTCGG--CATTTTG----AAAATGGCCGCCATATACA--G-AATT--GT-ATCAAAA-TG--ATAAGCTTTCTACATCA-TTTGGGATCT-GTG----TCATTTGAGGGTATACAATTGATATCTATC--A--AT-AG-TATTACTTTATATCAAATTTCCCAC---TGTTT--C-AAGATGGCCGACTTTACAAAA-----TTGCTG----CAAAAAATAAAGTTTAACGGATTTCAGCC----T-TCAGT--------TTTTAG-----GTTG--CATTTAGGATT-CGAAGTCT-ATT-TTT-G-------TACTCGATATGTC----------TCTGTGTCA--C-C--A-TT--TAAGATAGGGGGGGG---GGCGTTC-GGGTA-CATTTTTGTTGGCACCCCAACACATTTAAAACTTGTtggctgacaattcaaatttgcggacaaaaaaggtaaaaaaaaaaatacgttgtcggatttcaaccatttcttttctagggtaatttgatgatctcgagttcatttccagcaattaaaacaaattgagtcggcattttgaaaatggccgccatatacagaattgtatcaaaatgataagctttctacatcatttgggatctgtgtcatttgagggtatacaattgatatctatcaatagtattactttatatcaaatttcccactgtttcaagatggccgactttacaaaattgctgcaaaaaataaagtttaacggatttcagccttcagtttttaggttgcatttaggattcgaagtctatttttgtactcgatatgtctctgtgtcaccatttaagataggggggggggcgttcgggtacatttttgttggcaccccaacacatttaaaacttgt
gi|7 : acttgtccgcgcgatttatgaacgtgcttcaacagatctaatctaaattcaattgtggactgatagggggtcatacgacggggtgcaatcaagtttcaaaatggctgacaattcaaatttgcggacaaaaaaggtaaaaaCTTGATATTTG--ACC-T-T-GAACAT-T-A-AA-A-TC-ATATAACTGTAG--AACA-GGAAT--------TG----------------------------GNN--NNN-NNNN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-------NNN-NNNNNNNNNN-NNNNN---NAGGATCCCCAATGA-TT-TTGACC-TTG-----AT-CA---TA--GAA-A--GTTGTATAAC-TT---AA----G-A---ACCAGTACTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACCGGTATCCAGTATCCTTGACCTTTGACCTT-GA--
gi|8 : C-TTGACC-TTG-----G--AA---AAGAAAATG--G--GTACTGC-TT------CAGA-ACCAGGTA-CGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACTTGACCTT-GA--ACAT-A-AAAACTGGTATAACTAAAGA--------------------GAGTTGAT--AAAAACGTTGGGTCTTCAAAAATGATAATAGGAGA-TATCAATTTGTCAAG----TGACTTCAGTGACCTTGACCTCTGACC-TT-GGAAAAGAAAAttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaacttaaaattggcatttaagcatggattatttgtaagggaggtatacagtagtatgaggaaaaagcccactttgtacagccagtgctt
gi|9 : GAACACGTAGTGTTGGGGACA--T--TGTTTT-GCT----TTC---TT-----------------CTCAAATTT--CTTTAGTGAGAA-ATTTGTCCGCACGA--TTTTAT-GAATAAT--CTTC---AACAGATTCAATTCAAACTTC----GTGGGTTGACAGGGGGTCCTG-GGA-GAGG-GG-TGCT-------------------ATCAA--CTTTCGGA-----------ATTTTCAA------AG----------TGGC-CGCCGA-TTCAA-GATCC---A-TCATAAAAAAAACCCGAAAAAACTGAGCC--GCCATTTT----CAAAATGGCCGCC--ATAAAC-GAAAAT--GTATC--AAAGTA-C-TAAAATCTCTACATCA-TTTAGGTTTT-GTG---GTCAGTTGAGGGTACACAATTCATATCTAGCGTA--AG-TA-TTTC--TTTATATCAAATGTTTGAA---TGTTT--A-AAGATGGTTGTCATTTC-AAA-----ATGGCTGCCACAAAATGAAGT--TTGTCGAATTTCAACCAAATT-T-AGT--------TTTTAG-----GTTG--AATGCAGTATCAT-AAGTTT-A-T-Ttatgttgaaccaggtacgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtttttggaaggaaacaggattatttttgggaattttcaaaaatctttacgattcagaatttttaaatgtacttgaaatgggcatggcatgaattgtgtgcaagggtggaatacagttgtatta
9 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|18 ): ATTACGTGTATCAGACGGATTATTATGGGTCTGGAAATTTTCAAAATCTTATTACGTTAGAATTTTCGGTTAATGAACCGGGGCATGTGCATGGGACTACTTGCACGGGAGGAATACAGTTTGTATTAAGAAAAAGCTTTTACTTTGTACAACCACGTACTTCGTTTGCGGAGACTTTTATATCGGTCAGATGGAATATTATATCTCTACATCTGGTTTTAACATGCTAAGGAATT
Unaligned ( gi|25 ): ATTAATCATGGTCTTTGTGCTCTAGATGTATTTTAAATGATTTATGAATGGCATGGATTTTGTGAGAGGGAGGAAAATAGTACTCAAAAAAGTCCACTATTATACAAATAGTATTTCGATTGGGAGACTTTATAATTGGTAAATTATAATAATATCTTATATGACTTC
Unaligned ( gi|30 ): TTTTCAAATGAAGTTTGGAGACATTGCTTTTGCTCGGTTCTTTTCGCTTCTCGTTCATTATCGTCTGCTTCTTTCTTGTGCCTAAAAATCTCCATAGCTTGTTGATGAAAGTATTTATTTAGAGATTTCAGATTGAAGGGGTTAGGGTGCATT
Unaligned ( gi|36 ): GGATTTTGTGCAAGGGGTTATTAATATGGGGAAAATAGCAGCATCAGAAAAGCTCAACTTTTATACAGCAGATTTATTTGGCGAAGACTTTATAACGCAGATTATCATC
Unaligned ( gi|38 ): AAAGGGAGTTGACCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Unaligned ( gi|39 ): TCTCCAAAACAAAGTTTGGAGAGTGACTAATTCATAGTGTTTTTGCTCTGTTCATGTAATTCTTCCACTCCTCCTTGTTCC
Unaligned ( gi|42 ): TAAGTCTCCCAAACGAAGTCTGGGGACTTATTGCGTTTGCTCAGTTATAATTCATCATATTCTTCTTCCGCC
Unaligned ( gi|43 ): TCTTCGTAACGAATTTTGGAGACTTATTGTGTTTGCTCAGTTCTTTTAAATCGTCTGGCTCTTCCTCTTCCG
Unaligned ( gi|46 ): AAAATCAAGGCTTGTGTGATCTAGACTTTTAAATAAAGTTAAAATTGGCACGGA
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111 111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 111 22222222222 11 1111 1111111 222222222 333333333333 5555555555555555555555 111 11111 1 2222 11 33 1 33333333333333 1 2222 1111 2222222222 1 1111 1 2222222 333333333 222222222 22222222222222222222222222222222222222 1111 1 111 2 222222222222222222222222222222222222222222 11111 111 111 6666666666666666666666666666666666666 111111111 8888888888888888888888888888888888888 1111 2222222 22 11111 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 1 1 1111111 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 111111111 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 1 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333
lowQualScore : 3 3 3 3 4 777 88888888888 22 888 3 5 6 3 99 7 6 6 6 2222 1 3 4444444 1 666666666 000000000000 1 8 0 9999999999999999999999 000 44444 1 99 6 3333 6 00 2 6 6 1 11 3 99 3 1 99999999999999 1 2 0 0000 2 3333 7777777777 0 6666 44 0 0 1111111 1 1 1 222222222 88 1 1 1 666666666 0 55555555555555555555555555555555555555 4444 6 6 5 777 6 1 99 6 0 6 333333333333333333333333333333333333333333 5 0 66666 444 0 8 1 7 2 777 5 1 8888888888888888888888888888888888888 4 55 4 4 2 111111111 4 55 4 0 77 888 66 8888888888888888888888888888888888888 0000 444 9999 55 4 1 4 1 777 66 33 1 0 1111111 33 44444 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 1 3 6 3 1 0 3 3 0 999999 1111111 1 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 0 33 777 2 2 99 2 88 777 111111111 0 0 0 00 1 555555 11 1 1 1 0 0 1 0 77 55 3 3 6 3 3 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 0 3 3 66 2 33 1 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 0 55555 555 1 3 3 3 3 6 0 1 3 66
lowQualScore : . . . . . ... ........... .. ... . . . . .. . . . . .... . . ....... . ......... ............ . . . ...................... ... ..... . .. . .... . .. . . . . .. . .. . . .............. . . . .... . .... .......... . .... .. . . ....... . . . ......... .. . . . ......... . ...................................... .... . . . ... . . .. . . . .......................................... . . ..... ... . . . . . ... . . ..................................... . .. . . . ......... . .. . . .. ... .. ..................................... .... ... .... .. . . . . ... .. .. . . ....... .. ..... ......................................................................................... . . . . . . . . . ...... ....... . .................................................................................. . .. ... . . .. . .. ... ......... . . . .. . ...... .. . . . . . . . .. .. . . . . . ......................................................................................................................................... . . . .. . .. . .............................................................................................. . ..... ... . . . . . . . . . ..
lowQualScore : 7 2 2 2 2 555 00000000000 88 888 8 6 7 7 22 2 7 7 7 7777 0 2 2222222 0 777777777 222222222222 0 0 4 2222222222222222222222 000 33333 0 44 0 0000 7 33 2 7 7 7 00 3 88 7 0 88888888888888 0 5 8 8888 5 8888 0000000000 0 8888 00 0 2 0000000 2 2 2 888888888 88 0 5 0 888888888 3 55555555555555555555555555555555555555 5555 7 7 5 777 7 0 22 7 0 7 888888888888888888888888888888888888888888 0 8 00000 000 8 0 0 0 5 555 0 0 6666666666666666666666666666666666666 0 55 0 0 3 999999999 0 55 0 4 55 888 99 8888888888888888888888888888888888888 1111 999 4444 33 7 9 1 9 000 99 55 4 7 7777777 00 33333 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 0 3 7 3 0 0 3 3 0 666666 8888888 0 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 1 77 111 7 7 00 7 55 333 333333333 4 4 5 88 4 999999 77 0 0 0 6 5 5 5 33 00 3 3 7 6 6 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 6 3 5 88 9 33 9 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 3 99999 000 0 1 1 1 1 8 7 0 6 11
consensus : GAACACGTAGTGTCGGGGACACATTGTTTTTGCTCCGTTTC---TTCTT---ATTA----TTCTTCTTCT-CTTTAGTGATGA-ACTTGTCCGCGCGA--TTTTAT-GAA-AGTG-CTTC---AACAGATCCAATTCAAACTT--T--TGTGGGCTGATAG---------GGAGT--------CAT-GAAGA-GGGGTGGCCGCC----CAA---------CAAGT---AAA-----AAATCAA-GGTTGTCGGATTTCACACCAAATTTTC--AATTTT-TAGGGTAATTCGATGAC-C-CCGAGTTCATTG-TCC-GCATCACAAAAACATTT---------T-TA-GCCCGCCCATTTTTTTTCAAAATGGCCGCCATANA-GAAAAT-G--T-TT--AAA-TG-CTTAAAATTTCTACATCA-TTTGGGTTCTG-TG---GTCAATTGAGGGTACACAATTCATATCTAGC--A--AT--TATTTCTTT-ATATCNAATTTCCGAATG--TGT--CAAGATGGCCGTCATTTCAAAATG-CTG----C----CA-AAA-A---AG--TT------GTCGGATTTCAACCAAA-T-T-AGTTTTN-TAGGTTGAATTCA--GGATC-C-AAGTC-TA-T-TCTT-G-------TATT--A--TNTNTCTG-GT-ACC--ATTTCTGACATAGGGG---A-GG---TGTT-CGGGGACATTTNTGTTGGCATCCCAACACAGTTATAGCTTGTTCTTC---TTCCGCCNCTTTCTCGTGCCTAAAACTGTCC-GACA-------TTNTCT--G--AACC--TG-TG-ATG--AAAGTCT-TAGA-TATTCTAGGA-----T---AT-G--ATAG-GCCAATGTATGTAGATG-TGCAGAAA---TG--TT------------------GGGGT------------T-GG--G-TACATTTTNGGGGGA----TCGAATGGGGGTGGGGTTTAACATAGAACTCTA-T-GGG--GAAAATTAATTCCAAAATTCAACAGAT------GTAACTTGACAAAAT-----ATG------ATAG-----------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTNCTTTGACC-T-TG-AACAT-A-AAA-C-TGGTA------TAACTTTAGAAN-----NAGAATTGNTTGACNCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGTAGTGTATCCTAT--CCTTGACCTTTG--ACCT-T-GAACAT-AA-AA-NTG-GTATAACTTTAGAACC-GGAATTG--ATAGAGACNTCAGANNGGGTGACACGANCTAGTATCAAGGTCNAGTGACTCCTTTACCTTTCCTACNAAGTAGTATNTCCCNTGA--C-C-T-TGACC-T-TG-----G-A-A---NA--AAACA--G--GTATNACTT---AACC--AG-G-ACTG-A---ANCNNGNCANGATTCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACCGGTATCCNGTGNCCTTGACCTCTGACCTT-GAACAT--A-AAA-CTGGTATAACTTTAGAAC-CGGG------ANTGGAT-----ACAAAGACATTGGGTCTTCAGAAATGAT-AATAGGGGA--TGTNAACT--TGN--C-AA----G-------TGA-C---T---CCTGTGACCTTGACCTTTGACC-T-T-G-ATCATAAAAACTNGT-ATA--ACTTTAGAAC
Reference ( family-2 ) : GAACACGTAGTGTCGGGGACACATTGTTTTTGCTCCGTTTC---TTCTT---ATTA----TTCCTCTTCT-CTTTAGTGATGA-ACTTGTCCGCGCGA--TTTTAT-GAA-AGTG-CTTC---AACAGATCCAATTCAAACTT--T--TGTGGGCTGATAG---------GGAGT--------CNT-GANGA-GGGGTGGCCGCC----CAA---------CAAGT---AAA-----AAATCAA-GGTTGTCGGATTTCA-ACCAAATTTTC--AATTTT-TAGGGTAATTCGATGAC-C-CCGAGTTCATTG-TCC-GCATCACAAAAANATTT---------T-TA-GCCCGCCCATTTTTTTTCAAAATGGCCGCCATACA-GAAAAT-G--T-TT--AAA-TG-CTTAAAATTTCTACATCA-TTTGGGTTCTG-TG---GTCAATTGAGGGTACACAATTCATATCTAGC--A--AT--TATTTTTTT-ATATCNAATTTTCGAATG--TGC--CAAGATGGCCGTCATTTCAAAA-----G----T----CA-AAA-A-------TT------GTCGGATTTCAACCAAA-T-T-AGTTTTT-TAGGGTNAATTCA--GGATC-C-AAGTC-TA-T-TCT--G-------TATT-----TTTCTCTG-GT-ACC--ATTTCTGACATAGGGG---A-GG---TGTT-CGGGGACATTTNTGTTGGCATCCCAACACAGTTATAGCTTGTTCTTC---TTCCGCCGCTTTCTCGTGCCTAAAACTGTCC-GACA-------TTNTCC--G-AAACC--T--TG-ATG--AAAGTCT-TAGA-TATTCTAGGA-----T---AT-G--ATAG-GCCAATGTATGTAGATG-TGCAGAAA---TG--TT------------------GGGGT------------T-GG--G-TACATTTTNGGGGGA----TCGAATGGGGGTGGGGTTTAACATAGAACTCTA-T-GGG--GAAAATTAATTCCAAAATTCAACAGAT------GTAACTTGACAAAAT-----ATG------ATAG-----------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTNCTTTGACC-T-TG-ANCAT-A-AAA-C-TGGTA------TAACTTTAGAAC-----NAGAACTGATTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGTAGTGTATCCTAT--CCTTGACCTTTG--ACCT-T-GAACAT-AA-AA-CTG-GTATAACTTTAGAACC-GGAATTG--ATAGAGACNTCANATNGGGTGATACGAACTAGTATCAAGGTCGANTGACTCCTTTACCTTNCTTACAAAGTAGTATCTCCNGTGA--C-C-T-TGACC-T-TG-----G-A-A---NA--AAATA--G--GTATTACTT---AACC--AG-G-ACTG-AC--ANCGNGNCANGATTCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACCGGTATCCNGTGNCCTTGACCTCTGACCTT-GAACAT--A-AAA-CTGGTATAACTTTAGAAC-TNGG------ANTGGAT-----ACAAANACGTNGGGTCTTCAGAAATGAT-AATAGGAGA--TGTNAACT--TGN--C-AA----G-------TGA-C---T---CCNGTGACCTTGACCTTTGACC-T-T-G-ATCATGAAAACTNGT-ATA--ACTTTAGAAC
gi|1 : GAACACATTGTGTCAGGGACACATTGTTTTGGCTCCATTTCGTATTATT---ATTAGTATTTTTTTTTCT-CTTTGGTGATAA-ATTCACTTGCATGA--TTTTAT-GAA-AGTG-CTTC---AACAGATCCAATTCAAACTT--TAATGTGAGCTG-TAG---------GGAGC--------CAT-GAAGA-GGGATGACTGCC----CAA---------CAAGT---AGA-----AAATCAA-GGCTGTCACACTTCA-ACCAAATTTT----ATTGC-TGGGG-AATTTGATGACTC-CTGAGTCCATT--TCCAGCAGGA-AAAAAAATTG---------T----G-CCATCCA-----TTTCAAAACGGCC-TTATACA-AAAAAT-G--T-TT--AAG-TGTTTTAAAATTTCTACATCATTTTGGGTTCTG-GA---GTCAATTGAGGCTACGCATTTCATGTCTAGC--A--ATC-TGTTTTTCT----TCTA---TTCAAATC--TGC--TAAAATGGCTGCCATTTCAAAA-----A----T----CA-A-------------------GTCGGATTTCAACAAAA-T-T-ATTTTTTCTAGGGTTAATTCA--GGATC-C-AAGTC-CA-TATCTG-G-------TATT-----TTTATTTG-GT--CC--ATTTCTGACATAAGGG---A-GG---TG----GGTGACATTTTTGTTGGCATCTCA--ACAGTTATAGCTTGTTTTTCATATTC-----TTTTTTCAAGCCTAAAAC-AACA-GGCA-------TTCTCT--GAAAACC--T--TG-ATG--AAAGTAT-TAGA-TATTC-AATA-----T---AT-G--ATAT-GCCAATGTATCTAGTTGATGCAGAAA---TG--TT------------------AGGGT------------T-GG--A-TACATTTTGAGGGGA----TCAAATGGGGTTGGGGCCGAACGTAGAAC--------------AGATTAATTACAAAATTTAGTAGAT------ATAACTTGACAAAAT-----ATG------NNNN-----------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCTAACC-A-TG-AACAT-A-AAA-C-TGGTA------TAACTTTAAAACTACTGCAGGACTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNT--CCTTGACCTCTG--ACCT-T-GAACAT-AA-AA-CTG-GTATAACTTTATAACT-GGAATTG--ATAGAGATATCAAATTGGATGATACAAACTAGTATCAAGGTTGAATGACTCCTTTACCTTTCTTATTAAGTAGTATCTGCAGTGA--C-C-T-TGACC-T-TG---------A---TA--AAACA--G--ATATTA--T---AACC--AA-G-ACTGNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTTGACCTCTTACCTT-GAACAC--A-ACA-CTGATATAACTTTAGAAC-TTGG------TCTGNNN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNN--NNNNNNNN--NNN--N-NN----N-------NNN-N---N---NNNNNNNTCTTGACCTTTGACC-T-T-G-ATCATGAAAACTTGT-ATA--ACTTTAGAAC
gi|10 : C-T-TG-ACCAT-A-AAA-AGTTGTA------TAACTTTAAAAC-----CAGAACTGA
gi|11 : ATAAAGAA--TGT-AACC--TAC--A-AA----G-------TAG-TGTAT---CCTATGACCTTGACCTTTAACC-T-T-G-GTTATAATAACTAAT-ATA--TCTATAannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttaaaaaaggaaacaaattaccaaggtatttcgtttgtgaaaattttcaaaatcaaggtctttgtgaactagacttttaaacaaaattggcacggattttgtgcaagggagtgattactgcagggaaaaatagttgtgcattatgtattcagaaaaaaacaacacttttatttatatacaaccagtgcttcgtctgagaaacttaattagcagattataatcataattgtcttgttttttttctacactcttttcaattttattgtcagtt
gi|11 : CCTACAAAGTAGTGTATCCTATGA--C-C-T-TGACC-T-Ttgatataatatataataatatatctaatatatctctataactatagaaatgggattatctgaaatgatgaaaggagcttgagacctacatgtactaactaatatttgtatgagaccagatttaatgatggagtcggaattttctggacaatttgcaaaatctgcaatttagcatttttaaattaacttaaaatctggcattggaggaatacagtagtattgagaaaaagcctactttttacagccagtatttcgtttgggaggttttgtaatcagcagattataatcatatattacat
gi|11 : ataaagaatgtaaAGTAGTGTATCCTATGACCTTGACCTTTA--ACCT-T-GGTTAT-AATAA-CTA-ATATATCTATAtaaccttggttataataactaatatatctatatgatataatatataataatatatctaatatatctctataactatagaaatgggattatctgaaatgatgaaaggagcttgagacctacatgtactaactaatatttgtatgagaccagatttaatgatggagtcggaattttctggacaatttgcaaaatctgcaatttagcatttttaaattaacttaaaatctggcattggaggaatacagtagtattgagaaaaagcctactttttacagccagtatttcgtttgggaggttttgtaatcagcagattataatcatatattacat
gi|12 : ataaagaatgtaacctacaa--CCTTGACCTCTG--ACCTCT-GAACAT-GA-AA-TTG-GTATATTTTCAAAACC-AGACCTG--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACT-TGA--C-C-CCTGACC-C-TA-----G-A-A---CA--TAATATTG--GTATTATAT---AA------------G-A---ACCGGGTCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTTCACATTTAACCAT-CAACAT--A-AAA-CTCGTATAACTTTAGAAC-TGGA------ATTG--------ACAGAGACATGGGATCTTCAGA----AT-AATATGAtgatataatatataataatatatctaatatatctctataactatagaaatgggattatctgaaatgatgaaaggagcttgagacctacatgtactaactaatatttgtatgagaccagatttaatgatggagtcggaattttctggacaatttgcaaaatctgcaatttagcatttttaaattaacttaaaatctggcattggaggaatacagtagtattgagaaaaagcctactttttacagccagtatttcgtttgggaggttttgtaatcagcagattataatcatatattacat
gi|13 : CCTT-GAACATG-A-AAA-CTGTAATAAATTTAGAAAAGAGA------AATGGAT-----GGACGAACATTGGGTCTTCA-AAAGGATTAATCAGAAACCTGTAACCT--TGTATC-AA----GGATTCAGTGA-C---T---CCAGTGA-CTTGACTTcgtcacaaattcggggagtcgggaacgat
gi|13 : AGAGACATGGGCTCATCAAAAAT--T-GATAAGGGC--TTTT--CT--GGA--CTAA----C-------TAA-C---T-----AGGAATCCCCACTTTTGACC-TAT-GAATCATAGAAAGTTGTAATACCATTTAAGAAggaagaaaattggtttacggatccataaccattatgtcttgtagagacatgggctcatcaaaaattgataagggcttttctggactaactaactaggaatccccacttttgacctatgaatcatagaaagttgtaataccatttaagaaacagatgtgatatgaagaatggacctacgacgtagtatatcctgt
gi|14 : ccttgaacatgaaaactgtaataaatttagaaaagagaaatggatggacgaacattgggtcttcaaaaggattaatcagaaacctgtaaccttgtatcaaggattcagtgactccagtgacttgacttggaagaaaattggtttacggatccataaccattatgtcttgtCTTTGACT-TCTG-ATCCT-A-AAA-C-TCGCA------TGACTTTAGAAC-----TGGAATTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNGCCTTG--ACCT------CTT-AA-G---TT-GTATAACCTTAGAACT-GAAATacagatgtgatatgaagaatggacctacgacgtagtatatcctgt
gi|14 : CTTTG--ACTTCT-GATCCT-AA-AA-CTC-GCATGACTTTAGAACT-GGAATTG--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGC-C-T-TGACC-TCT---------------------TA--A--GTTGTA--T---AACCTTAG-A-ACTG-A---AATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCT-TGACCT------CTTACCTTAGATCAT--A-AAA-CTCGCATAACCTTAGAAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgacctcttaccttagatcataaaactcgcataaccttagaaatt
gi|14 : CCTTGACCTCT------------T--A-AG---TTGTATAACCTTAGAAC-T-GA------AATNNNN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNN--NNNNNNNN--NNN--N-NN----N-------NNN-N---N---NNNNNN-CCTTGACCTCTTACC-T-TAG-ATCAT-AAAACTCGC-ATA--ACCTTAGAAatt
gi|15 : ctttgacttctgatcctaaaactcgcatgactttagaactggaattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngTTTCT--G-TAACCCTT--TG-AGG--AAAGTAT-TAAG-TATCCATGGA-----TTTTATAG--ATAG-GCCAA-GTATCTTGTTG-TGCAGAAAGGTTGAATT------------------GGGGTGTACATTTGTATT-GAATG-TACATTT-GGAGGGA----TCAAATGGGAGTGGGGTTTAACATAAAGCTCGT-T-GGG--AAAAATAAATTCCAAAATTCAACatt
gi|16 : tgaagtttggagacttattgtatttttttgcttggtgcttattcttctttttgtgtgtgtgtgtgctggTTT---TTCCGCCTCTTTCTTGTGCCTGAAACTGCCC-GACA-------TTATTC--------C--C--CG-ATG--AAAGTCT-TAGA-TATTCTAGGA-----G---AT-G--ATAG-GCCAATGTATGTAGAGG-TACAGAAA---TG--TTTTTGTTTTCAGATTGAAGGGGGT------------TAGG--G-TACA--TTCGGGGG-----------GGGGGGGGTGTTTAACATAAAACTCTA-T-GGG--GAAAATTATTT---AAAT-------------------CTTGAT-AAAT-----ATG------ATAG-----------gaaaagcataatagtttccttaatagatgtg
gi|17 : aacgaagtttggagtcttattgtatttgctcgattcttattcttaccgt------------------GGGGT------------A-CG--G-TACATT--GGGGTGA----T-GAAAGGGGAAG----TTAACATAGAAAACTA-TTGAG--GGAA--TAATTCTAAAATTCAACA----------TAACTTCACAATATGNNNNNNN------NNNN-----------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTACTTTGACT-TCTG-ATCCT-A-AAA-C-TCGCA------TGACTTTAGAAC-----TGGtgtcatag
gi|19 : ttttgtattcagattgcaaggggggaggggggTCTGGC--ATAAT--TATTTCTTT-ATATCTAATTTCCGAAT---TGCATCAAGATGGTTGTCATTTCAAAATGGCTG----C----CA-AAA-ATGCAGT-TT------GTTAGACT----------T-T-AG-TTTG-TAGTTTAAATTTA--GGATC-CAAAGTC-CA---------------------------------------------TCCGACATAGGGAAATA-GA---TGTT-CGAGGTCATTTGTGTTGACATTCCAACA-GGATATAACTTGTT
gi|2 : GCTTAACATAGAACTCGA-T-GGGTAAAAAATTAATTCCAAAATTCAACAGAT------GTGACTTAAT-AAAT-----ATG------AGAG----------------------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCC-T-TG-AACTTAA-AAA-C-TGGCA------TAACTTTAGAAA-----GAGAATTGATTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--CCTTGACCTTTG--ACCT-TGGAAAAG-AA-AA-TTT-ATATTACTTCAGAACC-AGGTTTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCGTGA--C-C-T-TGACCTT-TGACCTTG-A-ACATAA--AAACT--G--GTATCATTTAG-AAAG--AG-A-ATTGNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTTGACCTCTGACCTTGGAAAAG--A-CAA-TCGGTATTACTTCAGAAatcatactagtattttacaaaataaatttcact
gi|2 : CTTTGATCTT-GAACATTTA-AAG-TTGTAATA-CTTAAGAAC-CA-------------AT-----ACTAA---------TCTTTAGA--TG-T-GATAGAAGAA-TGTGAACT----A--C-AAAATAG-------TAT-A---T---CCTGTGACCTTGACCTTTGACC-T-T-G-ATTAATATAACTTGT-ATA--ATTTTAGGACacaagtctcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncccactttgatcttgaacatttaaagttgtaatacttaagaaccaatactaatctttagatgtgatagaagaatgtgaactacaaaatagtatatcctgtgaccttgacctttgaccttgattaatataacttgtataattttaggactgggactgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatttactgaagtgaacagactgaggattttttctgaaatttttcaaaatcttggcaatttagatttttcaatgaac
gi|20 : gcttaacatagaactcgatgggtaaaaaattaattccaaaattcaacagatgtgacttaataaatatgagagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgaacttaaaaactggcataactttagaaagagaattgattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgacctttgaccttggaaaagaaaatttatattacttcagaaccaggtttgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccgtgaccttgacctttgaccttgaacataaaaactggtatcatttagaaagagaattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgacctctgaccttggaaaagacaatcggtattacttcagaaacaagtctcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncccaAACACCTAATGTCGGGGACATAGTGTTTTTGCTCCATTTC---TTCTTATCATTA----TTCATCTTCG-TTT--GTGCTGA-ACTTGTCTGCGCGATTTTTTATGGAA-AGTGCCTTCCCAGAAAAATCCAATTCAAAC-T--T--TGTGGG-TGATAA---------GGCGA--------TCT-GAGGA-GNNNNNNNNNNN----NNN---------NNNNN---NNN-----NNNTCAtgggactgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatttactgaagtgaacagactgaggattttttctgaaatttttcaaaatcttggcaatttagatttttcaatgaac
gi|21 : aatatacaattactatatattatgtccaccAATCTCTGAATGCTTG-----AGATGTTCGCCAATTTAAAATGCCTG----C----CA-AAA-A-------T----------AGATTTCAACCAAA-TGT-AGTTTTA--AGGTTGAATTCG--TGATC-CCAAGTC-TACT-TCT--GGACTCGATATA-----TTTCTCTG-TC-ACA--GTTTCTGACAT--GGG---ACGG---TGTT-CGGAAACTTTTGTGTTGGCATCCCAGCACAGTTATAGCTTGT
gi|22 : cA--TGTGA-CT--TAC--A-AA----G-------TAG-T---TTATCCTGTGACCTTTACCTTTGACC-T-T-G-ATTATAATAACTAG
gi|23 : caagaT--CCTTGATATTTG--ACCT-T-GAACAT-TA-AA-ATC-ATATAACTGTAGAACA-GGAATTG--gactannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtttactgaaggaaacaagaggatttttttttctggaaactttcaaaatctt
gi|24 : tgacccgtaacttttgaacataagatcagtatatgaaccagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnT------------------GGAGT------------T-GG--GGTACATTTGGGGGGGGGGGGTCAAATGAGGAAGGAGTTTAACATAGAACTCCA-G-GGG--GATAAT---TTCCAAAATTAAACAGAT------TTAACTTGAC-AAAT-----ATG------ATAG-----------
gi|26 : ttcagattgaa---AAA-----AAATCAA-AGTTGTCGGATTCCACACCAAATTTTC--AATTTT-TAT--TAATTCGATGAC-C-CCAAGTTCATTGCTTC-GCATCACAAAAACATTT---------TTTA-GCCCGCCCATTTTTTTTCAAAATGGattcctggggtcttcggaaatgaaaatacaaggcccacgaactacctagt
gi|27 : tgaaaatgcaaatattacccgaaggcaacttaaactatgtaaaaa---AAA-----AAATCAA-AGTTGTCGGATTCCACACCAAATTTTC--AATTTT-TAT--TAATTCGATGAC-C-CCAAGTTCATTGCTTC-GCATCACAAAAACATTT---------TTTA-GCCCGCCCATTTTTTTTCAAAATGG
gi|28 : tgaaaatgcaaatattacccgaaggcaacttaaactatgtaaaaaCTTGACTTCTGACCTT-TAACAT--GTAAA-CTGGTATCATTTTAAAAG-TGGG------ATT-AAT--------AACANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNN--NNNNNNNN--NNN--N-NN----N-------NNN-N---T---ACTTTGACTTAGACCTCTGACCAG-G-G-AACATAGAA--TTGC-ATT--ACTTCAG
gi|29 : TTCTCCT-T-CTTCAGTAA-GACATGTGTCCACGTGC--TTTGAT-AAA-AGTG-CCTT---TATAGATCAAATTC-AATTT--T--TGTAGGCTGATAG---------AGAGccacat
gi|3 : --T--TG-ATG--AAAGTCT-TAGA-TATTCTAGGA-----T---AT-G--ATAG-GCCAATGTATGAAGATG-TGCAAACA---TG--TTTTTGTTTTCAGATCGAAAGGGGT------------T-GG--GGTACATTCTGGGAGGA----TTAAATGGGGGTGGGGTTTAACATAAAACCCTA-T-GGG--GAAAA--AATCC--AAATTCAACAGAT------GTAAATTGA-AAATT-----ATGNNNNNNNNNN-----------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTTGACCAT-TG-ACCATAA-AAA-C-TGGTA------TAACTCTAGAAA-----GAGAGTTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--CCTTGATC-TTG---------GAAAAG-AA-AA-TAG-GTACTACTTCAGAACCAGGTACGN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTTGA--CTT-T-TGACT-T-TG-----A-ATA---TA--AAACCT-G--GTATAACTC---TAGA--AA-G-A--G-AC--TTCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCT-TGATCTTGGAAAAG--A-AAA-TAGGTACTACTTCAGAAC-CAGGTACGNNNNNNNNN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNN--NNNNNNNN--NNN--N-NN----N-------NNN-N---N---NNNNNNNNNNNNNNCTTTGACC-T-T-G-AACATAAAAACTGGT-ATA--ACTTTAGAAaacaaactactttcaaaatgccccccaccccgcccccaattcaaaatgtcaaaaatgtcaacaattaaggttg
gi|3 : tgTTTGACT-T-TG-AATAT-A-AAA-CCTGGTA------TAACTCTAGAAA-----GAG-ACT------TCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNCCTTG--ATCT-TGGAAAAG-AA-AA-TAG-GTACTACTTCAGAACC-A-----G--GTACGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--C-T-T-TGACC-T-TG-----A-ACA---TA--AAA-ACTG--GTATAACTTTAGAA----AGAG-ACTT-GCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTTGACTTCTGACCTT-GGAagagacttgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgacttctgaccttggaaaagaa
gi|3 : tgttgatgaaagtcttagatattctaggatatgataggccaatgtatgaagatgtgcaaacatgtttttgttttcagatcgaaaggggttggggtacattctgggaggattaaatgggggtggggtttaacataaaaccctatggggaaaaaatccaaattcaacagatgtaaattgaaaattatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctttgaccattgaccataaaaactggtataactctagaaagagagttgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgatcttggaaaagaaaataggtactacttcagaaccaggtacgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgactCCTTGATC-T-TGGAAAAG-A-AAA-T-AGGTA------CTACTTCAGAAC-----CA-----GGT--ACGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNCTTTG--ACCT-T-GAACAT-AA-AAACTG-GTATAACTTTAGAAAG-AGACTTGC-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTTGA--C-T-TCTGACC-T-TG-----G-A-A---AA--GAAaaagaa
gi|3 : tgttgatgaaagtcttagatattctaggatatgataggccaatgtatgaagatgtgcaaacatgtttttgttttcagatcgaaaggggttggggtacattctgggaggattaaatgggggtggggtttaacataaaaccctatggggaaaaaatccaaattcaacagatgtaaattgaaaattatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctttgaccattgaccataaaaactggtataactctagaaagagagttgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgatcttggaaaagaaaataggtactacttcagaaccaggtacgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgacttttgactttgaatataaaacctggtataactctagaaagagacttccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCTTTGACC-T-TG-AACAT-A-AAAAC-TGGTA------TAACTTTAGAAA-----GAGACTTGCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--CCTTGACTTCTG--ACCT-T-GGA
gi|31 : tgttgatgaaagtcttagatattctaggatatgataggccaatgtatgaagatgtgcaaacatgtttttgttttcagatcgaaaggggttggggtacattctgggaggattaaatgggggtggggtttaacataaaaccctatggggaaaaaatccaaattcaacagatgtaaattgaaaattatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctttgaccattgaccataaaaactggtataactctagaaagagagttgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgatcttggaaaagaaaataggtactacttcagaaccaggtacgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgacttttgactttgaatataaaacctggtataactctagaaagagacttccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgatcttggaaaagaaaataggtactacttcagaaccaggtacgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTTGTCGTGCTTAAAACTGTCTTGATAAAAAAAGTTTTCTATG-CAACA--TG-TGGAAG--AAAGTCT-TAGA-TATTATATGA-----T---AT-GATATAG-GCTAATGTATGTAGAT--CGCAGAAA---TG--TT----------------------T------------T-GG--G------TTTC---AGA----TTGAA-GAGGTTGGGGTaaagaa
gi|32 : --A-AAA-TTGGTATCATTTTAAAAC-TGGA------ATAAAATTATTGATAAAGATAATGTGATATAAGAACTGA---GTAGAGGA--T--TAACTAGTGT--C-AA----GGTCAAT-TGA-C---T---CCTGGGACATTTACCTTTGACC-T-T-G-ATCTTAACAACGAAT-ATattgg
gi|33 : ataGCTTCTTCTTC---TTCCGCCGTTTTCCCATGTCTAAAACTGTCC-GACA-------CTG--------------T--TG-ATG--AAAGTCT-TAGA-TATTCTAGGta
gi|34 : gtctcccaaacgaagtttggagacttattgagtttgctcagttcttgcaattcttcc-------TGA-C---T---CCTGGGACATTTACCTTTGACC-T-T-G-ATCTTAACAACGAAT-ATT--ACTTT-GAA
gi|34 : GG--TGTGAGCT--T----C-AAACT-G-------TTATC---T---CCAGTGACCTTGACTTTTGACC-C-T-G-ATCCTAAAAGCTTGC-ATtggtgtgagcttcaaactgttatctccagtgaccttgacttttgaccctgatcctaaaagcttgcat
gi|35 : tgactcctgggacatttacctttgaccttgatcttaacaacgaatattactttgaatCCGCCTCTTTCTTGTGCCTAGAAT-----------------TTCTCT--A-TAACC--TGATA-ATGCCAAAGTGTGTAGA-TGTGC-AGAAGTTTTT---TT-G--TT--------TGTTTTTAGAT--TGAAG------------------------------GGGGT------------TGGG--G-TACATTTTTAG
gi|35 : TCTATAA-----C---CT-G--ATAATGCCAAAGTGTGTAGATG-TGCAGAAG---TT--TT------------------TTTGT------------T-TG--------TTTTT---AGA----TTGAAGGGGGTTGGGGT---ACAT
gi|37 : ccgcctctttcttgtgcctagaatttcGCTTCTTCTTC---TCCCGTCGCTTTCTCATG-CTAAAACTTTCT---CC-------TTACTT-----AACCTGT--TG-ATT--AAAGTCT-TAGA-TATTCTAGGA-----T---AT-G--ATAG-ttttag
gi|4 : AACC--TGGTG-ATG--GAAGTCT-TAGA-TATTCTAGGA-----T---AT-G--ATAG-ACCAATGTCTGTAGATG-TGCAAACA---TG--TTTTTGTTATCAGATTGAAGGGGGT------------TAGG--G-TACATTCTTGGGGGA----TCAAATGGGGGTGTGGTTTAACATAGAACCCTATT-GGA--AAAAATTAATTCCAAAATTCAACAGATAATATGATAACTTGAT-AAAT-----ATG------ATAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTTTGAAC-T-TG-AACATCA-AAA-C-TGGTA------TAACTCTAGAAA-----GAGAGTAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--CCTTGACC-TTG---------GAAAAG-AA-AA-TAG-GTATTACTTCAGAACCAGGTATGN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTTCA--C-CTT-TGACC-T-T------G-A-G---CAT-AAATACTG--GTATAATT------CT--AG-A-AA-G-A---AACATGCTA-GATTCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTTGACCTCTGACCTTGGAAAAG--A-AAA-TAGGTATTACTTCAGAAC-CAGG------TATGNNN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNN--NNNNNNNN--NNN--N-NN----N-------NNN-N---N---NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCC-T-T-G-AACATAAAAACTGGT-ATA--ACT
gi|4 : ctccttCCT-T-GAACAT-AA-AAACTG-GTATAACT-----------AATTA--ACAGAGaattaacagag
gi|40 : ctccttaacctggtgatggaagtcttagatattctaggatatgatagaccaatgtctgtagatgtgcaaacatgtttttgttatcagattgaagggggttagggtacattcttgggggatcaaatgggggtgtggtttaacatagaaccctattggaaaaaattaattccaaaattcaacagataatatgataacttgataaatatgatagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncctttgaacttgaacatcaaaactggtataactctagaaagagagtagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgaccttggaaaagaaaataggtattacttcagaaccaggtatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttcacctttgaccttgagcataaatactggtataattctagaaagaaacatgctagattctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgacctctgaccttggaaaagaaaataggtattacttcagaaccaggtatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnATAAATTTAGAAAG-AGAATTG--ATAGAGACTTCAGAAAGGGTAACATGACCT-GTA--AAGGTCCAGTGACTCC
gi|41 : CCTACAACGTAGTATATCCAGTGA--C-C-T-Tagtgacttt
gi|44 : atagagacataaaaattttagatgagattaaaaaaaatgtgaCTTGACCTCTGTGACCT-T-TAGGAT-AA-AA-ATGAGTGTAACTTTAGAAGA-GGAACTT--ATAGAAAtat
gi|45 : TTG--ACAT-T-GAACATTAA-AA-GTG-GTAAAACTTTAGAAAC-AGGGTTA--ATAGAGACATttc
gi|47 : cCTTGACTTCTGACCTTGGAAAAG--A-AAG-TTGGTATTGCTCCAGAAC-CAGG------gggacctt
gi|48 : agTTTGACC-T-TG-AACAT-ATAAT-C-TGGTATACATGTAACTTTAAAAA-----GAGAATTGtct
gi|49 : TTGACC-T-TG-ATTAT-G-AAA-TATATTA------TAATTTTAGAAC-----TGGAACTG
gi|5 : tggtcGTCTCGAACACATATTGTTTTTGTTCCGTTTC---TTCTT---ATTT----TTCTTCTTCTTCTTTAGTAATGA-ACTTGTC-ACCCGA--TTTGAT-GAA-AGTG-CTT----AACAG--------------T--T--TGTGGACTGATAGGGATAATTAGGAGTGCACAAAACATTGAAAA-----TGGCCGCCAATTCAAAATGGCCACCAAAA---AAAGGCTAAAATTAAAGGTTGTTGGATTTTA-ACCAAATTTT-------TC-TAGGGTAATTTGATGAC-C-CGGAGT-CATT--TCC-GCAT-GCAAAA-TATTT---------T-TAAGCCCGCC-ATTTTTAT-----ATGGCCGCCACAGC-GGAAAT-CCTT-TT--AAA-TG-CTTAAAA---ATATATTA-TTTGAGTTATGGTGCAAGTCCAACGAGGGTTCACAGTTCATTTCTAGCTAA--GT--TATTCTTTCCATATCCAATTTCAAAATG--TATG-CAAGATGGCCATCATTTCAAAA-----GGCTGT----CA-AAATA-------TTCCGTTTGTCGGATTTCAACCAAATT-T-AG-TTTA-TAGAGTGAATTCACCCATTC-C-AAATCTTATT-TCTTGA-------CATTAAAA-TATGTTTA-A--ACCCAATTTATGACAAAGGGG---A-GG---TGTTGCGGGGACA
gi|50 : attatAACC--TGGTG-ATG--GAAGTCT-TAGAATATTTTAGGA-----T---AT-G--ATAG-g
gi|51 : ctccttCTTGACCTCTGACCAT-GAA-AT--G------TGATATAACTTTGGAAC-TGGG------ACTGa
gi|6 : -ACTTGTCCGCGCGA--TTT-AT-GAA-CGTG-CTTC---AACAGATCTAATCTAAATTCAAT--TGTGGACTGATAG---------GGGGT--------CAT--ACGACGGGGTG----------CAAT--------CAAGTTTCAAA-----Aa
gi|6 : ---AAA-----AAAT--A-CGTTGTCGGATTTCA-ACCA---TTTC----TTTTCTAGGGTAATTTGATGAT-C-TCGAGTTCATT--TCCAGCA--ATTAAAACAAAT---------T-GA-GTCGGC--ATTTTG----AAAATGGCCGCCATATA-CAGAATTG--T-ATCAAAA-TG-AT-AAGCTTTCTACATCA-TTTGGGATCTG-TG----TCATTTGAGGGTATACAATTGATATCTATC--A--ATAGTATTACTTT-ATATCAAATTTCCCACTG--TTT--CAAGATGGCCGACTTTACAAAA-----T----TGCTGCA-AAA-AATAAAGTTT------AACGGATTTCAGCC----T-TCAGTTTTT--AGGTTGCATTTA--GGATT-CGAAGTC-TA-T-TTTT-G-------TACTCGATATGTCTCTGTGTCACC--ATTT--AAGATAGGGG---G-GGGGGCGTT-CGGGTACATTTTTGTTGGCACCCCAACACATTTAAAACTTGTtggctgacaattcaaatttgcggacaaaaaaggtaaaaaaaaaaatacgttgtcggatttcaaccatttcttttctagggtaatttgatgatctcgagttcatttccagcaattaaaacaaattgagtcggcattttgaaaatggccgccatatacagaattgtatcaaaatgataagctttctacatcatttgggatctgtgtcatttgagggtatacaattgatatctatcaatagtattactttatatcaaatttcccactgtttcaagatggccgactttacaaaattgctgcaaaaaataaagtttaacggatttcagccttcagtttttaggttgcatttaggattcgaagtctatttttgtactcgatatgtctctgtgtcaccatttaagataggggggggggcgttcgggtacatttttgttggcaccccaacacatttaaaacttgt
gi|7 : acttgtccgcgcgatttatgaacgtgcttcaacagatctaatctaaattcaattgtggactgatagggggtcatacgacggggtgcaatcaagtttcaaaatggctgacaattcaaatttgcggacaaaaaaggtaaaaaCTTGATATTTG--ACCT-T-GAACAT-TA-AA-ATC-ATATAACTGTAGAACA-GGAATTG------------------GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGGATCCCCAATGA--T-T-T-TGACC-T-TG-----ATC-A---TA--GAA-A--GTTGTATAACTTAAGAACC--AG-T-ACT------------ANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACCGGTATCCAGTATCCTTGACCTTTGACCTT-GA
gi|8 : -C-T-TGACC-T-TG-----G-A-A---AAGAAAATG--G--GTACTGCTTCAGAACC--AG-GTAC--------GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACTT--GACCTT-GAACAT--A-AAAACTGGTATAACTAAAGA------G------AGTTGAT-----A--AAAACGTTGGGTCTTCAAAAATGAT-AATAGGAGA--TATCAATT--TGT--C-AA----G-------TGA-C---T---TCAGTGACCTTGACCTCTGACC-T-T-G------GAAAAttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaacttaaaattggcatttaagcatggattatttgtaagggaggtatacagtagtatgaggaaaaagcccactttgtacagccagtgctt
gi|9 : GAACACGTAGTGTTGGGG--ACATTG-TTTTGC----TTTC---TTCTC---A-AA----TT-------T-CTTTAGTGAGAA-ATTTGTCCGCACGA--TTTTAT-GAATAAT--CTTC---AACAGATTCAATTCAAAC-T--T--CGTGGGTTGACAG---------GGGGT--------CCTGGGAGA-GGGGTGgaaaatatgttgaaccaggtacgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtttttggaaggaaacaggattatttttgggaattttcaaaaatctttacgattcagaatttttaaatgtacttgaaatgggcatggcatgaattgtgtgcaagggtggaatacagttgtatta
gi|9 : ttatgtccccAACTTTCGGAATTTT-CAAAGT--------GGC-CGCCGA-TTCAAGA-TCC---ATCATAAAAAAAACCCGAAAAAACT-GA-GCC-GCC-ATTTT----CAAAATGGCCGCCATAAACGAAAAT-G--TATC--AAAGTA-CT-AAAATCTCTACATCA-TTTAGGTTTTG-TG---GTCAGTTGAGGGTACACAATTCATATCTAGCGTA--AG--TATTTCTTT-ATATCAAATGTTTGAATG--TTT--AAAGATGGTTGTCATTTCAAAATGGCTG----C----CACAAA-ATGAAGT-TT------GTCGAATTTCAACCAAATT-T-AG-TTTT-TAGGTTGAATGCA--GTATCAT-AAGTT-TA-T-Tctatcaactttcggaattttcaaagtggccgccgattcaagatccatcataaaaaaaacccgaaaaaactgagccgccattttcaaaatggccgccataaacgaaaatgtatcaaagtactaaaatctctacatcatttaggttttgtggtcagttgagggtacacaattcatatctagcgtaagtatttctttatatcaaatgtttgaatgtttaaagatggttgtcatttcaaaatggctgccacaaaatgaagtttgtcgaatttcaaccaaatttagtttttaggttgaatgcagtatcataagtttatt
9 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|18 ): ATTACGTGTATCAGACGGATTATTATGGGTCTGGAAATTTTCAAAATCTTATTACGTTAGAATTTTCGGTTAATGAACCGGGGCATGTGCATGGGACTACTTGCACGGGAGGAATACAGTTTGTATTAAGAAAAAGCTTTTACTTTGTACAACCACGTACTTCGTTTGCGGAGACTTTTATATCGGTCAGATGGAATATTATATCTCTACATCTGGTTTTAACATGCTAAGGAATT
Unaligned ( gi|25 ): ATTAATCATGGTCTTTGTGCTCTAGATGTATTTTAAATGATTTATGAATGGCATGGATTTTGTGAGAGGGAGGAAAATAGTACTCAAAAAAGTCCACTATTATACAAATAGTATTTCGATTGGGAGACTTTATAATTGGTAAATTATAATAATATCTTATATGACTTC
Unaligned ( gi|30 ): TTTTCAAATGAAGTTTGGAGACATTGCTTTTGCTCGGTTCTTTTCGCTTCTCGTTCATTATCGTCTGCTTCTTTCTTGTGCCTAAAAATCTCCATAGCTTGTTGATGAAAGTATTTATTTAGAGATTTCAGATTGAAGGGGTTAGGGTGCATT
Unaligned ( gi|36 ): GGATTTTGTGCAAGGGGTTATTAATATGGGGAAAATAGCAGCATCAGAAAAGCTCAACTTTTATACAGCAGATTTATTTGGCGAAGACTTTATAACGCAGATTATCATC
Unaligned ( gi|38 ): AAAGGGAGTTGACCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Unaligned ( gi|39 ): TCTCCAAAACAAAGTTTGGAGAGTGACTAATTCATAGTGTTTTTGCTCTGTTCATGTAATTCTTCCACTCCTCCTTGTTCC
Unaligned ( gi|42 ): TAAGTCTCCCAAACGAAGTCTGGGGACTTATTGCGTTTGCTCAGTTATAATTCATCATATTCTTCTTCCGCC
Unaligned ( gi|43 ): TCTTCGTAACGAATTTTGGAGACTTATTGTGTTTGCTCAGTTCTTTTAAATCGTCTGGCTCTTCCTCTTCCG
Unaligned ( gi|46 ): AAAATCAAGGCTTGTGTGATCTAGACTTTTAAATAAAGTTAAAATTGGCACGGA
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 111 1111111 1111 1111111 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 111 11111 2 222 1111 33 1 11 1 1111 11 1 22222222 1 1111 1 333333 333333333 111 1 222 88888888888888888888888888888888888888888 1111 1 222 1 8888888888888888888888888888888888888888 22222 111 11 111 555555555555555555555555555 1 111111111 8888888888888888888888888888888888888 1111 2222222 22 11111 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 1 1 111111 1111111 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 1 3333333333333333333333 222222222222222222222222222222222
lowQualScore : 3 3 3 3 4 777 9999999 8 1 8 888 5 6 3 99 7 6 6 6 2222 1 3 4444444 1 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 000 44444 1 99 0 0 111 8 0000 8 3 66 6 55 3 0 6 999 3 3 2222 2 1 00 0 00000000 0 6666 44 0 0 111111 1 1 1 222222222 6 111 1 1 6 2 5 2 444 5 5 99999999999999999999999999999999999999999 9999 5 88888 2 1 888 000 5 1 5 66 5555555555555555555555555555555555555555 33333 8 6 1 3 6 3 000 11 8 444 1 3 777777777777777777777777777 4 8 3 55 99999 3 3 2 111111111 4 55 4 0 77 888 66 8888888888888888888888888888888888888 0000 444 9999 55 4 1 4 1 777 66 33 1 0 1111111 33 44444 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 1 5 5 5 0 5 444444 4444444 2 1 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 3 555 5 2 0 444 88888 0 8 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 1 0 1 0 77 55 3 3 3 4 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 1 1 0 6 33 7 44 2 33 2 0 1 2222222222222222222222 3 0 1 44 5555 0 44 2 444444444444444444444444444444444 3 555 555 1 3 3 3 77 3 0 1 1 4 4 66 5
lowQualScore : . . . . . ... ....... . . . ... . . . .. . . . . .... . . ....... . ........................................................... ... ..... . .. . . ... . .... . . .. . .. . . . ... . . .... . . .. . ........ . .... .. . . ...... . . . ......... . ... . . . . . . ... . . ......................................... .... . ..... . . ... ... . . . .. ........................................ ..... . . . . . . ... .. . ... . . ........................... . . . .. ..... . . . ......... . .. . . .. ... .. ..................................... .... ... .... .. . . . . ... .. .. . . ....... .. ..... ......................................................................................... . . . . . . ...... ....... . . ........................................................................... . ... . . . ... ..... . . ................................................................. . . . . .. .. . . . . .................................................................................................................................. . . . . .. . .. . .. . . . ...................... . . . .. .... . .. . ................................. . ... ... . . . . .. . . . . . . .. .
lowQualScore : 7 2 2 2 2 555 0000000 2 0 0 666 6 7 7 22 2 7 7 7 7777 0 2 2222222 0 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 000 33333 0 44 0 8 000 0 8888 0 8 00 0 66 2 8 0 444 2 2 4444 5 0 22 0 88888888 0 8888 00 0 2 000000 2 2 2 888888888 0 888 0 5 7 4 7 7 333 7 7 11111111111111111111111111111111111111111 0000 7 33333 1 3 666 999 7 4 7 22 4444444444444444444444444444444444444444 00000 0 7 0 2 8 8 000 00 0 000 0 3 222222222222222222222222222 0 2 6 00 11111 6 6 6 999999999 0 55 0 4 55 888 99 8888888888888888888888888888888888888 1111 999 4444 33 7 9 1 9 000 99 55 4 7 7777777 00 33333 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 0 0 0 0 0 0 444444 5555555 1 0 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 2 444 3 7 1 444 00000 7 0 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 0 4 0 5 88 55 6 6 6 0 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 0 0 6 0 77 3 22 9 99 9 5 2 9999999999999999999999 5 8 2 66 4444 3 66 2 888888888888888888888888888888888 1 444 444 2 1 3 3 99 6 3 5 0 0 0 99 0
consensus : GAACACGTAGTGTCGGGGACACATTGTTTTTGCTCCGTTTC---TTCTTATTA----TTCTTCTTC-T-CTTTAGTGATGA-ACTTGTCCGCGCGA--TTTTAT-GAA-AGTG-CTTC---AACAGATCCAATTCAAACTT--T--TGTGGGCTGATAGGG---------AG-T--------CAT-GAAGA-GGGGTGGCCGCC----CAA---------CAAGT---AAA-----AAATCAA-GGTTGTCGGATTTCACACCAAATTTTCAATTTT-TAGGGTAATTCGATGAC-CCCGAGTTCATTGCTCCAGCATCACAAAAACATTTTTTA-GCCCGCCCATTTTTTTTCAAAATGGCCGCCATANA-GAAAA-TG--T-TT--AAA-TG-CTTAAAATTTCTACATCA-TTTGGGTTCTG-TG---GTCAATTGAGGGTACACAATTCATATCTAGC--A--AT--TATTTCTTT--ATATCNAATTTCCGAA-TGTNT-CAAGATGGCCGNCATTTCAAAA-T-GC-TGCCA-AA---A---A---A----G-----------------TT-GT--CGGATTTCAACCAAA-T-T-A-GTTTTNTAGGTTGAATTCA--GGATC-C-AAGTC-CA-T-TCTNGA-----TAT----T---ATNTNTCTG-GT-ACC--ATTTCTGACATA---GGGGA-GGTGTT-CGGGGACATTTNTGTTGGCATCCCAGCACAGTTATAGCTT---GTTC--T-TC---TTCCGCCTCTTTCTCGTGCCTAAAACTGTCC-GACA-------TTNTCTN---AACC-TG-TG-ATG--AAAGT-----CT-TAGA-TATTCTAGGA-----T---AT-G--ATAG-GCCAATGTATGTAGATG-TGCAGAAA---TG--TT------------------GGGGT------------T-GG--G-TACATTTTNGGGGGA----TCGAATGGGGGTGGGGTTTAACATAGAACTCTA-T-GGG--GAAAATTAATTCCAAAATTCAACAGAT------GTAACTTGACAAAAT-----ATG------ATAG-----------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTNCTTTGACC-T-TGAACAT-AAAA-C-TGGTATA------ACTTTAGAA-----AGAGANTTGCTTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCCTTGACCTTTG--ACCT-T-GAACAT-A-AAAN-TG-GTATAACTTTAGAACC-GGAACTG--ATAGAGACNTCAGATNGGGTGATACGANCTAGNATCAAGGTCNAGTGACTCCTTTACCTTTCCTACNAAGTAGTATNTCCCGTGA--C-C-T-TGACC-TTG-----G---------A-A---TA--AA-ACN--G--GTATAACT-T---AACCAG-G-ACT---G--AANCNNGNCATGATTCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACCGGTATCCNGTGNCCTTGACCTCTGACCTTGGA--ACAT-A-AAA-CTGGTATNACTTTAGAACCGGG------AC-TGGAT-----ACGAAGACATTGGGTCNTCAGAAATGA-TAATAAGGGA--TGTNAACT--TG--TC-A-------A---G------TGA-C---T---CCTGTGACCTTG-ACCTTTGACC-T-TG--AT-CATAAAAACTNGT-A-TA--A-CTTTAGAAC
Reference ( family-2 ) : GAACACGTAGTGTCGGGGACACATTGTTTTTGCTCCGTTTC---TTCTTATTA----TTCTTCTTC-T-CTTTAGTGATGA-ACTTGTCCGCGCGA--TTTTAT-GAA-AGTG-CTTC---AACAGATCCAATTCAAACTT--T--TGTGGGCTGATAGGG---------AG-T--------CAT-GAAGA-GGGGTGGCCGCC----CAA---------CAAGT---AAA-----AAATCAA-GGTTGTCGGATTTCACACCAAATTTTCAATTTT-TAGGGTAATTCGATGAC-CCCGAGTTCATTG-TCC-GCATCACAAAAACA-TTTTTA-GCCCGCCCATTTTTTTTCAAAATGGCCGCCATANA-GAAAA-TG--T-TT--AAA-TG-CTTAAAATTTCTACATCA-TTTGGGTTCTG-TG---GTCAATTGAGGGTACACAATTCATATCTAGC--A--AT--TATTTCTTT--ATATCNAATTTCCGAA-TGTGT-CAAGATGGCCGTCATTTCAAAA-T-GC-TGCCA-AA---A---A---A----G-----------------TT-GT--CGGATTTCAACCAAA-T-T-A-GTTTTNTAGGTTGAATTCA--GGATC-C-AAGTC-TA-T-TCTTG------TAT----T---ATNTNTCTG-GT-ACC--ATTTCTGACATA---GGGGA-GGTGTT-CGGGGACATTTNTGTTGGCATCCCAACACAGTTATAGCTT---GTTC--T-TC---TTCCGCCNCTTTCTCGTGCCTAAAACTGTCC-GACA-------TTNTCTG---AACC-TG-TG-ATG--AAAGT-----CT-TAGA-TATTCTAGGA-----T---AT-G--ATAG-GCCAATGTATGTAGATG-TGCAGAAA---TG--TT------------------GGGGT------------T-GG--G-TACATTTTNGGGGGA----TCGAATGGGGGTGGGGTTTAACATAGAACTCTA-T-GGG--GAAAATTAATTCCAAAATTCAACAGAT------GTAACTTGACAAAAT-----ATG------ATAG-----------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTNCTTTGACC-T-TGAACAT-AAAA-C-TGGTATA------ACTTTAGAA-----NNAGAATTGNTTGACNCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGTAGTGTATCCTATCCTTGACCTTTG--ACCT-T-GAACAT-A-AAAN-TG-GTATAACTTTAGAACC-GGAATTG--ATAGAGACNTCAGANNGGGTGACACGANCTAGTATCAAGGTCNAGTGACTCCTTTACCTTTCCTACNAAGTAGTATNTCCCNTGA--C-C-T-TGACC-TTG-----G---------A-A---NA--AA-ACA--G--GTATNACT-T---AACCAG-G-ACT---G--AANCNNGNCANGATTCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACCGGTATCCNGTGNCCTTGACCTCTGACCTT-GA--ACAT-A-AAA-CTGGTATAACTTTAGAACCGGG------AN-TGGAT-----ACAAAGACATTGGGTCTTCAGAAATGA-TAATAGGGGA--TGTNAACT--TG--NC-A-------A---G------TGA-C---T---CCTGTGACCTTG-ACCTTTGACC-T-TG--AT-CATAAAAACTNGT-A-TA--A-CTTTAGAAC
gi|1 : GAACACATTGTGTCAGGGACACATTGTTTTGGCTCCATTTCGTATTATTATTAGTATTTTTTTTTC-T-CTTTGGTGATAA-ATTCACTTGCATGA--TTTTAT-GAA-AGTG-CTTC---AACAGATCCAATTCAAACTT--TAATGTGAGCTG-TAGGG---------AG-C--------CAT-GAAGA-GGGATGACTGCC----CAA---------CAAGT---AGA-----AAATCAA-GGCTGTCACACTTCA-ACCAAATTTT--ATTGC-TGGGG-AATTTGATGACTCCTGAGTCCATT--TCCAGCAGGA-AAAAAAA-TTGT---G-CCATCCA-----TTTCAAAACGGCC-TTATACA-AAAAA-TG--T-TT--AAG-TGTTTTAAAATTTCTACATCATTTTGGGTTCTG-GA---GTCAATTGAGGCTACGCATTTCATGTCTAGC--A--ATC-TGTTTTTCT-----TCTA---TTCAAA-TCTGC-TAAAATGGCTGCCATTTCAAAA-------ATCA-A--------------------------------------GT--CGGATTTCAACAAAA-T-T-ATTTTTTCTAGGGTTAATTCA--GGATC-C-AAGTC-CA-TATCTGG------TAT----T----TTTATTTG-GT--CC--ATTTCTGACATA---AGGGA-GGTG----GGTGACATTTTTGTTGGCATCTCA--ACAGTTATAGCTT---GTTT--T-TCATATTC-----TTTTTTCAAGCCTAAAAC-AACA-GGCA-------TTCTCTGAA-AACC-T--TG-ATG--AAAGT-----AT-TAGA-TATTC-AATA-----T---AT-G--ATAT-GCCAATGTATCTAGTTGATGCAGAAA---TG--TT------------------AGGGT------------T-GG--A-TACATTTTGAGGGGA----TCAAATGGGGTTGGGGCCGAACGTAGAAC--------------AGATTAATTACAAAATTTAGTAGAT------ATAACTTGACAAAAT-----ATG------NNNN-----------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCTAACC-A-TGAACAT-AAAA-C-TGGTATA------ACTTTAAAACTACTGCAGGACTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCCTTGACCTCTG--ACCT-T-GAACAT-A-AAAC-TG-GTATAACTTTATAACT-GGAATTG--ATAGAGATATCAAATTGGATGATACAAACTAGTATCAAGGTTGAATGACTCCTTTACCTTTCTTATTAAGTAGTATCTGCAGTGA--C-C-T-TGACC-TTG-----------------A---TA--AA-ACA--G--ATATTA---T---AACCAA-G-ACT---GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTTGACCTCTTACCTT-GA--ACAC-A-ACA-CTGATATAACTTTAGAACTTGG------TC-TGNNN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNN--NNNNNNNN--NN--NN-N-------N---N------NNN-N---N---NNNNNNNTCTTG-ACCTTTGACC-T-TG--AT-CATGAAAACTTGT-A-TA--A-CTTTAGAAC
gi|10 : CT-T-GACCAT-A-AAAAGTT-GTATAACTTTAAAACC-AGAACTG--A
gi|11 : ATAAAGAA--TGT-AACC--TA--CA-A-------A---G------TAG-TGTAT---CCTATGACCTTG-ACCTTTAACC-T-TG--GT-TATAATAACTAAT-A-TA--T-CTATAannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttaaaaaaggaaacaaattaccaaggtatttcgtttgtgaaaattttcaaaatcaaggtctttgtgaactagacttttaaacaaaattggcacggattttgtgcaagggagtgattactgcagggaaaaatagttgtgcattatgtattcagaaaaaaacaacacttttatttatatacaaccagtgcttcgtctgagaaacttaattagcagattataatcataattgtcttgttttttttctacactcttttcaattttattgtcagtt
gi|12 : CCTTGACCTCTG--ACCTCT-GAACAT-G-AAAT-TG-GTATATTTTCAAAACC-AGACCTG--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAC-TTGA--C-C-CCTGACC-CTA-----G---------A-A---CA--TA-ATATTG--GTATTATA-T---AA-------------G--AACCGGGTCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTTCACATTTAACCAT-CA--ACAT-A-AAA-CTCGTATAACTTTAGAACTGGA------AT-TG--------ACAGAGACATGGGATCTTCAG-AATAA-TAtgatataatatataataatatatctaatatatctctataactatagaaatgggattatctgaaatgatgaaaggagcttgagacctacatgtactaactaatatttgtatgagaccagatttaatgatggagtcggaattttctggacaatttgcaaaatctgcaatttagcatttttaaattaacttaaaatctggcattggaggaatacagtagtattgagaaaaagcctactttttacagccagtatttcgtttgggaggttttgtaatcagcagattataatcatatattacat
gi|13 : CCTT-GA--ACATGA-AAA-CTGTAATAAATTTAGAAAAGAG------AAATGGATGG---ACGAA--CATTGGGTCTTCA-AAAGGATTAATCAGAAACCTGTAACCT--TGTATC-AAGGATTCA---G------TGA-C---T---CCAGTGA-CTTG-ACTTtgacgtcacaaattcggggagtcgggaacgat
gi|13 : AGAGACATGGGCTCATCAAAAAT---TGATAAGGGC--TTTT--CT--GG--ACTA-------A---C------TAA-C---T---A--GGAATCCCC-ACTTTTGACC-TATGA-AT-CATAGAAAGTTGTAA-TACCA-TTTAAGAAggaagaaaattggtttacggatccataaccattatgtcttgtagagacatgggctcatcaaaaattgataagggcttttctggactaactaactaggaatccccacttttgacctatgaatcatagaaagttgtaataccatttaagaaacagatgtgatatgaagaatggacctacgacgtagtatatcctgt
gi|14 : ccttgaacatgaaaactgtaataaatttagaaaagagaaatggatggacgaacattgggtcttcaaaaggattaatcagaaacctgtaaccttgtatcaaggattcagtgactccagtgacttgacttggaagaaaattggtttacggatccataaccattatgtcttgtCTTTG--ACTTCT-GATCCT-A-AAAC-TC-GCATGACTTTAGAACT-GGAATTG--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGC-C-T-TGACC-TCT-----T---------A-A---------------GTTGTATAACC-T------TAG-A-ACT---G--AA-------ATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTTGACCTCTTACCTTAGA--TCAT-A-AAA-CTCGCATAACCTTAGAAacagatgtgatatgaagaatggacctacgacgtagtatatcctgt
gi|15 : TTTCTGT--AACCCTT-TG-AGG--AAAGT-----AT-TAAG-TATCCATGGA-----TTTTATAG--ATAG-GCCAA-GTATCTTGTTG-TGCAGAAAGGTTGAATT------------------GGGGTGTACATTTGTATT-GAATG-TACATTT-GGAGGGA----TCAAATGGGAGTGGGGTTTAACATAAAGCTCGT-T-GGG--AAAAATAAATTCCAAAATTCAACatt
gi|16 : tgaagtttggagacttattgtatttttttgcttggtgcttattcttctttttgtgtgtgtgtgtgctgg--T-TT---TTCCGCCTCTTTCTTGTGCCTGAAACTGCCC-GACA-------TTATTC------CC-CG----ATG--AAAGT-----CT-TAGA-TATTCTAGGA-----G---AT-G--ATAG-GCCAATGTATGTAGAGG-TACAGAAA---TG--TTTTTGTTTTCAGATTGAAGGGGGT------------TAGG--G-TACA--TTCGGGGG-----------GGGGGGGGTGTTTAACATAAAACTCTA-T-GGG--GAAAATTATTT---AAAT-------------------CTTGAT-AAAT-----ATG------ATAG-----------gaaaagcataatagtttccttaatagatgtg
gi|17 : aacgaagtttggagtcttattgtatttgctcgattcttattcttaccgt------------------GGGGT------------A-CG--G-TACATT--GGGGTGA----T-GAAAGGGGAAG----TTAACATAGAAAACTA-TTGAG--GGAA--TAATTCTAAAATTCAACA----------TAACTTCACAATATGNNNNNNN------NNNN-----------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTACTTTGACT-TCTGATCCT-AAAA-C-TCGCATG------ACTTTAGAA-----CTGGtgtcatag
gi|19 : ttttgtattcagattgcaaggggggaggggggTCTGGC--ATAAT--TATTTCTTT--ATATCTAATTTCCGAATTGCAT-CAAGATGGTTGTCATTTCAAAA-TGGC-TGCCA-AA---A---ATGCA----GT----------------TT-GT--TAGACT----------T-T-A-G-TTTGTAGTTTAAATTTA--GGATC-CAAAGTC-CA-T-CC--G-----------------ACATA---G-G-------------GAAATA---------GATGTT-CGAGGTCATTTGTGTTGACATTCCAACA-GGATATAACTT---GTT
gi|2 : GCTTAACATAGAACTCGA-T-GGGTAAAAAATTAATTCCAAAATTCAACAGAT------GTGACTTAAT-AAAT-----ATG------AGAG----------------------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCC-T-TGAACTTAAAAA-C-TGGCATA------ACTTTAGAA-----AGAGAATTGATTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTTGACCTTTG--ACCT-TGGAAAAG-A-AAAT-TT-ATATTACTTCAGAACC-AGGTTTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCGTGA--C-C-T-TGACCTTTGACCTTG---------A-ACATAA--AA-ACT--G--GTATCATT-TAG-AAAGAG-A-ATT---GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTTGACCTCTGACCTTGGA--AAAG-A-CAA-TCGGTATTACTTCAGAAACAAG------TC-TCNNN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNN--NNNNNNNN--NN--NN-N-------N---N------NNC-C---C---ACTTTGATCTTGAACATTTAAAG-T-TGTAATACTTAAGAACCAAT-ACTA--ATCTTTAGAatcatactagtattttacaaaataaatttcact
gi|2 : CTTTG--ATCT-T-GAACAT-TTAAAG-TT-GTAATACTTAAGAACC-AATACTA--AT-----CTTTAGAT---GTGATA-GA---AGAAT---------GTGA-------AC------TACAAAATAGTATATCCTGTGA--C-C-T-TGACC-TTT-----GACCTTGATTA-A---TA--TA-ACT--T--GTATAATT-T------TAG-G-ACT---G--tgtgatagaagaatgtgaactacaaaatagtatatcctgtgaccttgacctttgaccttgattaatataacttgtataattttaggactgggactgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatttactgaagtgaacagactgaggattttttctgaaatttttcaaaatcttggcaatttagatttttcaatgaac
gi|2 : gcttaacatagaactcgatgggtaaaaaattaattccaaaattcaacagatgtgacttaataaatatgagagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgaacttaaaaactggcataactttagaaagagaattgattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgacctttgaccttggaaaagaaaatttatattacttcagaaccaggtttgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccgtgaccttgacctttgaccttgaacataaaaactggtatcatttagaaagagaattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgacctctgaccttggaaaagacaatcggtattacttcagaaacaagtctcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncccaTATCCTGTGACCTTGACCTTTGACCTT-GATTA-AT-A-TAA-CTTGTATAATTTTAGGACTGGG------AC-TGggactgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatttactgaagtgaacagactgaggattttttctgaaatttttcaaaatcttggcaatttagatttttcaatgaac
gi|20 : gcttaacatagaactcgatgggtaaaaaattaattccaaaattcaacagatgtgacttaataaatatgagagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgaacttaaaaactggcataactttagaaagagaattgattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgacctttgaccttggaaaagaaaatttatattacttcagaaccaggtttgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccgtgaccttgacctttgaccttgaacataaaaactggtatcatttagaaagagaattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgacctctgaccttggaaaagacaatcggtattacttcagaaacaagtctcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncccactttgatcttgaacatttaaagttgtaatacttaagaaccaatactaatctttagatgtgatagaagaatgtgaactacaaaatagtaAACACCTAATGTCGGGGACATAGTGTTTTTGCTCCATTTC---TTCTTATCA----TTATTCATCTT-CGTTTGTGCTGA-ACTTGTCTGCGCGATTTTTTATGGAA-AGTGCCTTCCCAGAAAAATCCAATTCAAAC-T--T--TGTGGG-TGATAAGG---------CGAT--------C-T-GAGGA-GNNNNNNNNNNN----NNN---------NNNNN---NNN-----NNNTCAtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatttactgaagtgaacagactgaggattttttctgaaatttttcaaaatcttggcaatttagatttttcaatgaac
gi|21 : aatatacaattactatatattatgtccaccAATCTCTGAA-TGC-T-TGAGATGTTCGCCAATTTAAAA-T-GCCTGCCA-AA---A---A---------------------------------TAGATTTCAACCAAA-TGT-A-GTTTTA-AGGTTGAATTCG--TGATC-CCAAGTC-TACT-TCTGGACTCGATAT--------ATTTCTCTG-TC-ACA--GTTTCTGACAT-----GGGACGGTGTT-CGGAAACTTTTGTGTTGGCATCCCAGCACAGTTATAGCTT---GT
gi|22 : cGAA--TGTGA-CT--TA--CA-A-------A---G------TAG-T---TTATCCTGTGACCTTT-ACCTTTGACC-T-TG--AT-TATAATAACTAG
gi|23 : caaTCCTTGATATTTG--ACCT-T-GAACAT-T-AAAA-TC-ATATAACTGTAGAACA-GGAATTG--gactannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtttactgaaggaaacaagaggatttttttttctggaaactttcaaaatctt
gi|24 : tgacccgtaacttttgaacataagatcagtatatgaaccagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnT------------------GGAGT------------T-GG--GGTACATTTGGGGGGGGGGGGTCAAATGAGGAAGGAGTTTAACATAGAACTCCA-G-GGG--GATAAT---TTCCAAAATTAAACAGAT------TTAACTTGAC-AAAT-----ATG------ATAG-----------
gi|26 : ttcagattgaa---AAA-----AAATCAA-AGTTGTCGGATTCCACACCAAATTTTCAATTTT-TA--TTAATTCGATGAC-CCCAAGTTCATTGCTTC-GCATCACAAAAACATTTTTTA-GCCCGCCCATTTTTTTTCAAAATGGattcctggggtcttcggaaatgaaaatacaaggcccacgaactacctagt
gi|27 : tgaaaatgcaaatattacccgaaggcaacttaaactatgtaaaaa---AAA-----AAATCAA-AGTTGTCGGATTCCACACCAAATTTTCAATTTT-TA--TTAATTCGATGAC-CCCAAGTTCATTGCTTC-GCATCACAAAAACATTTTTTA-GCCCGCCCATTTTTTTTCAAAATGG
gi|28 : tgaaaatgcaaatattacccgaaggcaacttaaactatgtaaaaaCTTGACTTCTGACCTT-TA--ACAT-GTAAA-CTGGTATCATTTTAAAAGTGGG------AT-T-AAT--------AACANNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNN--NNNNNNNN--NN--NN-N-------N---N------NNN-N---T---ACTTTGACTTAG-ACCTCTGACCAG-GG--AA-CATAGAA--TTGC-A-TT--A-CTTCAG
gi|29 : ----TTCTCCTTC-T---TCAGTAA-GACATGTGTCCACGTGC--TTTGAT-AAA-AGTG-CCTT---TATAGATCAAATTC-AATTT--T--TGTAGGCTGATAGAG---------AG-ccacat
gi|3 : -TG-ATG--AAAGT-----CT-TAGA-TATTCTAGGA-----T---AT-G--ATAG-GCCAATGTATGAAGATG-TGCAAACA---TG--TTTTTGTTTTCAGATCGAAAGGGGT------------T-GG--GGTACATTCTGGGAGGA----TTAAATGGGGGTGGGGTTTAACATAAAACCCTA-T-GGG--GAAAA--AATCC--AAATTCAACAGAT------GTAAATTGA-AAATT-----ATGNNNNNNNNNN-----------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTTGACCAT-TGACCATAAAAA-C-TGGTATA------ACTCTAGAA-----AGAGAGTTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTTGATC-TTG---------GAAAAG-A-AAAT-AG-GTACTACTTCAGAACCAGGTACGN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTTGA--CTT-T-TGACT-TTG-----A---------ATA---TA--AA-ACCT-G--GTATAACTCT---AGAAAGAG-ACT--------TCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCT-TGATCTTGGA--AAAG-A-AAA-TAGGTACTACTTCAGAACCAGGTACGNNNN-NNNNN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNN--NNNNNNNN--NN--NN-N-------N---N------NNN-N---N---NNNNNNNNNNNN-NNCTTTGACC-T-TG--AA-CATAAAAACTGGT-A-TA--A-CTTTAGAAaacaaactactttcaaaatgccccccaccccgcccccaattcaaaatgtcaaaaatgtcaacaattaaggttg
gi|3 : tgtTTTGACT-T-TGAATAT-AAAA-CCTGGTATA------ACTCTAGAA-----AGAGACTTCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTTGATC-TTG---------GAAAAG-A-AAAT-AG-GTACTACTTCAGAACCAGGTACGN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTTGA--C-C-T-TGAAC-------------------A-T---AA--AA-ACT--G--GTATAACT-TTAGAA--AGAG-ACTTGCN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTTGACTTCTGACCTT-GG--Aagagacttgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgacttctgaccttggaaaagaa
gi|3 : tgttgatgaaagtcttagatattctaggatatgataggccaatgtatgaagatgtgcaaacatgtttttgttttcagatcgaaaggggttggggtacattctgggaggattaaatgggggtggggtttaacataaaaccctatggggaaaaaatccaaattcaacagatgtaaattgaaaattatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctttgaccattgaccataaaaactggtataactctagaaagagagttgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgatcttggaaaagaaaataggtactacttcagaaccaggtacgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgactCTTTGACC-T-TGAACAT-AAAAAC-TGGTATA------ACTTTAGAA-----AGAGACTTGCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTTGACTTCTG--ACCT-T-GGAaaagaa
gi|30 : tgttgatgaaagtcttagatattctaggatatgataggccaatgtatgaagatgtgcaaacatgtttttgttttcagatcgaaaggggttggggtacattctgggaggattaaatgggggtggggtttaacataaaaccctatggggaaaaaatccaaattcaacagatgtaaattgaaaattatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctttgaccattgaccataaaaactggtataactctagaaagagagttgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgatcttggaaaagaaaataggtactacttcagaaccaggtacgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgacttttgactttgaatataaaacctggtataactctagaaagagacttccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgatcttggaaaagaaaataggtactacttcagaaccaggtacgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGTT-TGGAGACATTGCTTTTG----CTCGGTTC--TTTTCGCTTCTCGTTCATTATC---GTCTGCTTCTTTCTTGTGCCTAAAAATCTC----CA-------T---------AGCT-TGTTG-ATG--AAAGTATTTATT-TAGA-GATTTCAGaaagaa
gi|31 : ttttcaaatgaaTTTGTCGTGCTTAAAACTGTCTTGATAAAAAAAGTTTTCTATGCAACA-TG-TGGAAG--AAAGT-----CT-TAGA-TATTATATGA-----T---AT-GATATAG-GCTAATGTATGTAGAT--CGCAGAAA---TG--TT----------------------T------------T-GG--G------TTTC---AGA----TTGAA-GAGGTTGGGGTattgaaggggttagggtgcatt
gi|32 : -A-AAA-TTGGTATCATTTTAAAACTGGA------AT-AAAATTATTGATAAAGATAATGTGATATAAGAACTGA---GTAGAGGA--T--TAACTAGTG--TC-A-------A---GGTCAATTGA-C---T---CCTGGGACATTT-ACCTTTGACC-T-TG--AT-CTTAACAACGAAT-A-Tattgg
gi|33 : ataGCTT---CTTC--T-TC---TTCCGCCGTTTTCCCATGTCTAAAACTGTCC-GACA-------CTGT--------------TG-ATG--AAAGT-----CT-TAGA-TATTCTAGGta
gi|34 : gtctcccaaacgaagtttggagacttattgagtttgctcagttcttgcaattcttcc------TGA-C---T---CCTGGGACATTT-ACCTTTGACC-T-TG--AT-CTTAACAACGAAT-A-TT--A-CTTT-GAA
gi|34 : GG--TGTGAGCT--T----C-A-------AACTG------TTATC---T---CCAGTGACCTTG-ACTTTTGACC-C-TG--AT-CCTAAAAGCTTGC-A-Ttggtgtgagcttcaaactgttatctccagtgaccttgacttttgaccctgatcctaaaagcttgcat
gi|35 : tgactcctgggacatttacctttgaccttgatcttaacaacgaatattactttgaatCCGCCTCTTTCTTGTGCCTAGAAT-----------------TTCTCTAT--AACC-TGATA-ATGCCAAAGT-----GTGTAGA-TGTGC-AGAAGTTTTT---TT-G--TT--------TGTTTTTAGAT--TGAAG------------------------------GGGGT------------TGGG--G-TACATTTTTAG
gi|35 : TCTATAA-----C---CT-G--ATAATGCCAAAGTGTGTAGATG-TGCAGAAG---TT--TT------------------TTTGT------------T-TG--------TTTTT---AGA----TTGAAGGGGGTTGGGGT---ACAT
gi|37 : ccgcctctttcttgtgcctagaatttcGCTT---CTTC--T-TC---TCCCGTCGCTTTCTCATG-CTAAAACTTTCT---CC-------TTA-CTT---AACC-TGTTG-ATT--AAAGT-----CT-TAGA-TATTCTAGGA-----T---AT-G--ATAG-ttttag
gi|4 : CTT---AACC-TGGTG-ATG--GAAGT-----CT-TAGA-TATTCTAGGA-----T---AT-G--ATAG-ACCAATGTCTGTAGATG-TGCAAACA---TG--TTTTTGTTATCAGATTGAAGGGGGT------------TAGG--G-TACATTCTTGGGGGA----TCAAATGGGGGTGTGGTTTAACATAGAACCCTATT-GGA--AAAAATTAATTCCAAAATTCAACAGATAATATGATAACTTGAT-AAAT-----ATG------ATAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTTTGAAC-T-TGAACATCAAAA-C-TGGTATA------ACTCTAGAA-----AGAGAGTAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTTGACC-TTG---------GAAAAG-A-AAAT-AG-GTATTACTTCAGAACCAGGTATGN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTTCA--C-CTT-TGACC-TTGA----G---------C-A---TA--AATACT--G--GTATAATT-------CTAG-A-AA----G--AAACATGCTA-GATTCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTTGACCTCTGACCTTGGA--AAAG-A-AAA-TAGGTATTACTTCAGAACCAGG------TA-TGNNN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNN--NNNNNNNN--NN--NN-N-------N---N------NNN-N---N---NNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNCC-T-TG--AA-CATAAAAACTGGT-A-TA--A-CT
gi|40 : ctcATAAATTTAGAAAG-AGAATTG--ATAGAGACTTCAGAAAGGGTAACATGACCT-GTA--AAGGTCCAGTGACTCCaattaacagag
gi|41 : CCTACAACGTAGTATATCCAGTGA--C-C-T-Tagtgacttt
gi|44 : atagagacataaaaattttagatgagattaaaaaaaatgtgaCTTGACCTCTGTGACCT-T-TAGGAT-A-AAAA-TGAGTGTAACTTTAGAAGA-GGAACTT--ATAGAAAtat
gi|45 : TTG--ACAT-T-GAACATTA-AAAG-TG-GTAAAACTTTAGAAAC-AGGGTTA--ATAGAGACATttc
gi|47 : cCTTGACTTCTGACCTTGGA--AAAG-A-AAG-TTGGTATTGCTCCAGAACCAGG------gggacctt
gi|48 : agTTTGACC-T-TGAACAT-ATAATC-TGGTATACATGTAACTTTAAAA-----AGAGAATTGtct
gi|49 : TTG--ACCT-T-GATTAT-G-AAATATA-TTATAATTTTAGAACT-GGAACTG--
gi|5 : tggtcGTCTCGAACACATATTGTTTTTGTTCCGTTTC---TTCTTATTT----TTCTTCTTC-TTCTTTAGTAATGA-ACTTGTC-ACCCGA--TTTGAT-GAA-AGTG-CTT----AACAG--------------T--T--TGTGGACTGATAGGGATAATTAGGAG-TGCACAAAACATTGAAAA-----TGGCCGCCAATTCAAAATGGCCACCAAAA---AAAGGCTAAAATTAAAGGTTGTTGGATTTTA-ACCAAATTTT-----TC-TAGGGTAATTTGATGAC-CCGGAGT-CATT--TCC-GCAT-GCAAAA-TA-TTTTTAAGCCCGCC-ATTTTTAT-----ATGGCCGCCACAGC-GGAAA-TCCTT-TT--AAA-TG-CTTAAAA---ATATATTA-TTTGAGTTATGGTGCAAGTCCAACGAGGGTTCACAGTTCATTTCTAGCTAA--GT--TATT-CTTTCCATATCCAATTTCAAAA-TGTATGCAAGATGGCCATCATTTCAAAA-G-GC-TGTCA-AA---A---T---ATTCCG-----------------TTTGT--CGGATTTCAACCAAATT-T-A-G-TTTATAGAGTGAATTCACCCATTC-C-AAATCTTATT-TCTTGA-----CAT----TAAAATATGTTTA-A--ACCCAATTTATGACAAA---GGGGA-GGTGTTGCGGGGACA
gi|50 : attatCTT---AACC-TGGTG-ATG--GAAGT-----CT-TAGAATATTTTAGGA-----T---AT-G--ATAG-g
gi|51 : ctcCTTGACCTCTGACCAT-GA--A-AT-G------TGATATAACTTTGGAACTGGG------AC-TGa
gi|6 : -ACTTGTCCGCGCGA--TTT-AT-GAA-CGTG-CTTC---AACAGATCTAATCTAAATTCAAT--TGTGGACTGATAGGG---------GG-T--------CAT--ACGACGGGGTG----------CAAT--------CAAGTTTCAAA-----Aa
gi|6 : GTTT-CAAAATGGCTGACAATTCAAAT-TTGC-GGACA-AA---A---A---A----GGTAAAAAAAAAAATACGTT-GT--CGGATTTCAACC--A-T-T-T-CTTTTCTAGGGTAATTTGA--TGATCTC-GAGTT-CA-T-Ttggctgacaattcaaatttgcggacaaaaaaggtaaaaaaaaaaatacgttgtcggatttcaaccatttcttttctagggtaatttgatgatctcgagttcatttccagcaattaaaacaaattgagtcggcattttgaaaatggccgccatatacagaattgtatcaaaatgataagctttctacatcatttgggatctgtgtcatttgagggtatacaattgatatctatcaatagtattactttatatcaaatttcccactgtttcaagatggccgactttacaaaattgctgcaaaaaataaagtttaacggatttcagccttcagtttttaggttgcatttaggattcgaagtctatttttgtactcgatatgtctctgtgtcaccatttaagataggggggggggcgttcgggtacatttttgttggcaccccaacacatttaaaacttgt
gi|6 : acttgtccgcgcgatttatgaacgtgcttcaacagatctaatctaaattcaattgtggactgatagggggtcatacgacggggtgcaatcaa---AAA-----AAAT--A-CGTTGTCGGATTTCA-ACCA---TTTC--TTTTCTAGGGTAATTTGATGAT-CTCGAGTTCATT--TCCAGCA--ATTAAAACA-AATTGA-GTCGG--CA----TTTTGAAAATGGCCGCCATATA-CAGAATTG--T-ATCAAAA-TG-A-TAAGCTTTCTACATCA-TTTGGGATCTG-T----GTCATTTGAGGGTATACAATTGATATCTATC--A--ATAGTATTACTTT--ATATCAAATTTCCCAC-TGTTT-CAAGATGGCCGACTTTACAAAATT-GC-TGCAA-AAAATA---A---A----G-----------------TT--TAACGGATTTCAGCC----T-TCA-GTTTT-TAGGTTGCATTTA--GGATT-CGAAGTC-TA-T-TTTTG------TACTCGAT---ATGTCTCTGTGTCACC--ATT--TAAGATAGGGGGGGG-GGCGTT-CGGGTACATTTTTGTTGGCACCCCAACACATTTAAAACTT---GTtccagcaattaaaacaaattgagtcggcattttgaaaatggccgccatatacagaattgtatcaaaatgataagctttctacatcatttgggatctgtgtcatttgagggtatacaattgatatctatcaatagtattactttatatcaaatttcccactgtttcaagatggccgactttacaaaattgctgcaaaaaataaagtttaacggatttcagccttcagtttttaggttgcatttaggattcgaagtctatttttgtactcgatatgtctctgtgtcaccatttaagataggggggggggcgttcgggtacatttttgttggcaccccaacacatttaaaacttgt
gi|7 : acttgtccgcgcgatttatgaacgtgcttcaacagatctaatctaaattcaattgtggactgatagggggtcatacgacggggtgcaatcaagtttcaaaatggctgacaattcaaatttgcggacaaaaaaggtaaaaaCTTGATATTTG--ACCT-T-GAACAT-T-AAAA-TC-ATATAACTGTAGAACA-GGAATTG------------------GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGGATCCCCAATGA--T-T-T-TGACC-TTG-----AT--------C-A---TA--GA-A-A--GTTGTATAACT-TAAGAACCAG-T-ACT-------------ANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACCGGTATCCAGTATCCTTGACCTTTGACCTT-GA--
gi|8 : -C-T-TGACC-TTG-----G---------A-A---AAGAAA-ATG--G--GTACTGCT-TCAGAACCAG-GTAC---------GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACTT--GACCTT-GA--ACAT-A-AAAACTGGTATAACT---AAA--GAG------AG-TTGAT-----A--AAAACGTTGGGTCTTCAAAAATGA-TAATAGGAGA--TATCAATT--TG--TC-A-------A---G------TGA-C---T---TCAGTGACCTTG-ACCTCTGACC-T-TG--ttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaacttaaaattggcatttaagcatggattatttgtaagggaggtatacagtagtatgaggaaaaagcccactttgtacagccagtgctt
gi|8 : TTCAGTGACCTTGACCTCTGACCTTGGA--AAAG-A-AAA-----TATG--TT--GAACCAGG------gaaaagaaaatatgttgaaccaggtacgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtttttggaaggaaacaggattatttttgggaattttcaaaaatctttacgattcagaatttttaaatgtacttgaaatgggcatggcatgaattgtgtgcaagggtggaatacagttgtatta
gi|9 : cttgaccttggaaaagaaaatgggtactgcttcagaaccaggtacgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacttgaccttgaacataaaaactggtataactaaagagagttgataaaaacgttgggtcttcaaaaatgataataggagatatcaatttgtcaagtgacGAACACGTAGTGTTGGGG--ACATTG-TTTTGC----TTTC---TTCTCA-AA----TT--------T-CTTTAGTGAGAA-ATTTGTCCGCACGA--TTTTAT-GAATAAT--CTTC---AACAGATTCAATTCAAAC-T--T--CGTGGGTTGACAGGG---------GG-T--------CCTGGGAGA-GGGGTGtacgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtttttggaaggaaacaggattatttttgggaattttcaaaaatctttacgattcagaatttttaaatgtacttgaaatgggcatggcatgaattgtgtgcaagggtggaatacagttgtatta
gi|9 : ttatgtccccTTTTCAAAATGGCCGCCATAAACGAAAA-TG--TATC--AAAGTA-CT-AAAATCTCTACATCA-TTTAGGTTTTG-TG---GTCAGTTGAGGGTACACAATTCATATCTAGCGTA--AG--TATTTCTTT--ATATCAAATGTTTGAA-TGTTT-AAAGATGGTTGTCATTTCAAAA-TGGC-TGCCACAA---AATGA---A----GT----------------TT-GT--CGAATTTCAACCAAATT-T-A-GTTTT-TAGGTTGAATGCA--GTATCAT-AAGTT-TA-T-Tctatcaactttcggaattttcaaagtggccgccgattcaagatccatcataaaaaaaacccgaaaaaactgagccgccattttcaaaatggccgccataaacgaaaatgtatcaaagtactaaaatctctacatcatttaggttttgtggtcagttgagggtacacaattcatatctagcgtaagtatttctttatatcaaatgtttgaatgtttaaagatggttgtcatttcaaaatggctgccacaaaatgaagtttgtcgaatttcaaccaaatttagtttttaggttgaatgcagtatcataagtttatt
8 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|18 ): ATTACGTGTATCAGACGGATTATTATGGGTCTGGAAATTTTCAAAATCTTATTACGTTAGAATTTTCGGTTAATGAACCGGGGCATGTGCATGGGACTACTTGCACGGGAGGAATACAGTTTGTATTAAGAAAAAGCTTTTACTTTGTACAACCACGTACTTCGTTTGCGGAGACTTTTATATCGGTCAGATGGAATATTATATCTCTACATCTGGTTTTAACATGCTAAGGAATT
Unaligned ( gi|25 ): ATTAATCATGGTCTTTGTGCTCTAGATGTATTTTAAATGATTTATGAATGGCATGGATTTTGTGAGAGGGAGGAAAATAGTACTCAAAAAAGTCCACTATTATACAAATAGTATTTCGATTGGGAGACTTTATAATTGGTAAATTATAATAATATCTTATATGACTTC
Unaligned ( gi|36 ): GGATTTTGTGCAAGGGGTTATTAATATGGGGAAAATAGCAGCATCAGAAAAGCTCAACTTTTATACAGCAGATTTATTTGGCGAAGACTTTATAACGCAGATTATCATC
Unaligned ( gi|38 ): AAAGGGAGTTGACCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Unaligned ( gi|39 ): TCTCCAAAACAAAGTTTGGAGAGTGACTAATTCATAGTGTTTTTGCTCTGTTCATGTAATTCTTCCACTCCTCCTTGTTCC
Unaligned ( gi|42 ): TAAGTCTCCCAAACGAAGTCTGGGGACTTATTGCGTTTGCTCAGTTATAATTCATCATATTCTTCTTCCGCC
Unaligned ( gi|43 ): TCTTCGTAACGAATTTTGGAGACTTATTGTGTTTGCTCAGTTCTTTTAAATCGTCTGGCTCTTCCTCTTCCG
Unaligned ( gi|46 ): AAAATCAAGGCTTGTGTGATCTAGACTTTTAAATAAAGTTAAAATTGGCACGGA
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 111 1111111 1111 1111111 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 111 11111 22222 2 2222 11 22 1 11 222222222222222 11 1 22222222 1 1111 1 333333 333333333 111 222 88888888888888888888888888888888888888888 1111 1 222 777777777777777777777777777777777777777777777 22222 111 11 111 555555555555555555555555555555555555 111111111 11 111 999999999999999999 33333333333333 1111111 2222222 22 11111 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 1 111111 11111 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 55555555555555555555555555 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 44444444444444444444444 222222222222222222222222222
lowQualScore : 3 3 3 3 4 777 9999999 8 1 8 888 5 6 3 99 7 6 6 6 2222 1 3 4444444 1 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 000 44444 11111 0 3333 6 00 2 6 6 1 11 5 44 5 555555555555555 1 2 1 6 77777 3 2 1 00 0 00000000 0 6666 44 0 0 111111 1 1 1 222222222 6 111 1 1 6 1 88 1 444 5 5 99999999999999999999999999999999999999999 9999 5 88888 2 1 888 000 5 5 5 000000000000000000000000000000000000000000000 77777 8 6 1 3 6 3 000 11 8 444 1 3 222222222222222222222222222222222222 3 55 99999 3 3 3 222222222 4 66 0 00 1 000 77 888888888888888888 00000000000000 66 8 22 1111111 3 00 4 1 777 66 33 1 0 1111111 33 44444 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 1 5 5 5 5 5 5 444444 66 0 22222 1 1 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 3 555 5 2 2 666 66 33 0 55 0 33 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 1 0 1 44 55 3 3 3 22222222222222222222222222 3 3 3 1 0 2 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 1 33 0 2 8888 1 8888 44 1 444 0 1 77777777777777777777777 3 0 1 44 5555 44 2 333333333333333333333333333 3 555 555 1 3 3 3 77 3 0 1 1 4 4 66 5
lowQualScore : . . . . . ... ....... . . . ... . . . .. . . . . .... . . ....... . ........................................................... ... ..... ..... . .... . .. . . . . .. . .. . ............... . . . . ..... . . . .. . ........ . .... .. . . ...... . . . ......... . ... . . . . .. . ... . . ......................................... .... . ..... . . ... ... . . . ............................................. ..... . . . . . . ... .. . ... . . .................................... . .. ..... . . . ......... . .. . .. . ... .. .................. .............. .. . .. ....... . .. . . ... .. .. . . ....... .. ..... ......................................................................................... . . . . . . . ...... .. . ..... . . ........................................................................... . ... . . . ... .. .. . .. . .. ............................................................. . . . .. .. . . . .......................... . . . . . . ...................................................................................... . .. . . .... . .... .. . ... . . ....................... . . . .. .... .. . ........................... . ... ... . . . . .. . . . . . . .. .
lowQualScore : 7 2 2 2 2 555 0000000 2 0 0 666 6 7 7 22 2 7 7 7 7777 0 2 2222222 0 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 000 33333 66666 0 0000 7 33 2 7 7 7 77 5 00 2 222222222222222 0 5 0 7 55555 2 5 0 22 0 88888888 0 8888 00 0 2 000000 2 2 2 888888888 0 888 0 5 7 0 77 0 333 7 7 11111111111111111111111111111111111111111 0000 7 33333 1 3 666 999 7 7 7 000000000000000000000000000000000000000000000 88888 0 7 0 2 4 8 000 00 0 000 0 0 333333333333333333333333333333333333 6 00 11111 6 6 6 666666666 4 11 7 00 3 000 99 333333333333333333 00000000000000 11 9 88 1111111 4 88 1 9 000 99 55 4 7 7777777 00 33333 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 0 0 0 0 0 0 0 444444 99 2 55555 0 6 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 2 444 3 7 7 888 33 77 1 22 2 44 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 0 4 0 33 00 3 3 3 55555555555555555555555555 6 6 6 0 3 6 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 0 99 9 6 4444 9 1111 11 0 777 9 1 99999999999999999999999 5 8 0 66 4444 66 2 777777777777777777777777777 1 444 444 2 1 3 3 99 6 3 5 0 0 0 99 0
consensus : GAACACGTAGTGTCGGGGACACATTGTTTTTGCTCCGTTTC---TTCTTATTA----TTCTTCTTC-T-CTTTAGTGATGA-ACTTGTCCGCGCGA--TTTTAT-GAA-AGTG-CTTC---AACAGATCCAATTCAAACTT--T--TGTGGGCTGATAGGG---------AG-T--------CAT-GAAGA-GGGGTGGCCGCC----CAA---------CAAGT---AAA-----AAATCAA-A---GTTGTCGGATTTCACACCAAATTTTC--AATTTT-TAGGGTAATTCGATGAC-C-CCGAGTTCATTG-TCCAGCAT-ACAAAAAC--------ATTNTT-AGCCCGCCCATTTTTTTTCAAAATGGCCGCCATANA-GAAAA-TG--T-TT--AAA-TG-CTTAAAATTTCTACATCA-TTTGGGTTCTG-TG---GTCAATTGAGGGTACACAATTCATATCTAGC--A--AT--TATTTCTTT--ATATCNAATTTCCGAA-TGTTT-CAAGATGGCCGNCATTTCAAAA-T-GC-TGCCA-AA---A---A---A----G-----------------TT-GT--CGGATTTCAACCAAA-T-T-A-GTTTTNTAGGTTGAATTCA--GGATC-C-AAGTC-CA-T-T------CTCGATAT----T---ATNTNTCTG-GT-ACC--ATTTCTGACATA---GGGGA-GGTGTT-CGGGGACATTTNTGTTGGCATCCCAGCACAGTTATAGCTT---GTTC--T-TC---TTCCGCCTCTTTCTCGTGCCTAAAACTGTCC-GACA-------TTNTCT--N---AACCTG-TG-ATG--AAAGT-----CT-TAGA-TATTCTAGGA-----T---AT-G--ATAGGCCAATGTATGTAGATG-TGCAGAAA---TG--TT------------------GGGGT------------T-GG--G-TACATTTTGGGGGGA----TCGAATGGGGGTGGGGTTTAACATAGAACTCTA-T-GGG--GAAAATTAATTCCAAAATTCAACAGAT------GTAACTTGACAAAAT-----ATG------ATAG-----------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTNCTTTGACC-T-TGAACAT-A-AAA-C-TGGTA------TAACT--TTAGAA-----AGAGAATTGNTTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCCTTGACCTTTG--ACCT-T-GAACAT-A-AAAN-TG-GTATAACTTTAGAACC-GGAACTG--ATAGAGACNTCAGATNGGGTGATACGANCTAGNATCAAGGTCNAGTGACTCCTTTACCTTTCCTACNAAGTAGTATNTCCCGTGA--C-C-T-TGACCTTG-G---------A--------A--T-A-AA-A-CTGGTATAACT-T---AACCAG-G-ACT---G--AANCNNGNCATGATTCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACCGGTATCCAGTGACCTTGACCTCTGACCTTGG--AACAT-A-AAA-CTGGTATNAC---TTTAGAACCGGG-A---C-------TGGAT--AC-AAGACATTGGGTCNTCAGAAATGAT-AATAAGGGA--TGTNAACT--TGT--C-AA---G-------TGA-C---T---CCTGTGACCTTG-ACCTTTGACC-T-TG--AT-CATAAAAACTNGT-A-TA--A-CTTTAGAAC
Reference ( family-2 ) : GAACACGTAGTGTCGGGGACACATTGTTTTTGCTCCGTTTC---TTCTTATTA----TTCTTCTTC-T-CTTTAGTGATGA-ACTTGTCCGCGCGA--TTTTAT-GAA-AGTG-CTTC---AACAGATCCAATTCAAACTT--T--TGTGGGCTGATAGGG---------AG-T--------CAT-GAAGA-GGGGTGGCCGCC----CAA---------CAAGT---AAA-----AAATCAA-G---GTTGTCGGATTTCACACCAAATTTTC--AATTTT-TAGGGTAATTCGATGAC-C-CCGAGTTCATTGCTCCAGCATCACAAAAAC--------ATTTTTTAGCCCGCCCATTTTTTTTCAAAATGGCCGCCATANA-GAAAA-TG--T-TT--AAA-TG-CTTAAAATTTCTACATCA-TTTGGGTTCTG-TG---GTCAATTGAGGGTACACAATTCATATCTAGC--A--AT--TATTTCTTT--ATATCNAATTTCCGAA-TGTNT-CAAGATGGCCGNCATTTCAAAA-T-GC-TGCCA-AA---A---A---A----G-----------------TT-GT--CGGATTTCAACCAAA-T-T-A-GTTTTNTAGGTTGAATTCA--GGATC-C-AAGTC-CA-T-T------CTNGATAT----T---ATNTNTCTG-GT-ACC--ATTTCTGACATA---GGGGA-GGTGTT-CGGGGACATTTNTGTTGGCATCCCAGCACAGTTATAGCTT---GTTC--T-TC---TTCCGCCTCTTTCTCGTGCCTAAAACTGTCC-GACA-------TTNTCT--N---AACCTG-TG-ATG--AAAGT-----CT-TAGA-TATTCTAGGA-----T---AT-G--ATAGGCCAATGTATGTAGATG-TGCAGAAA---TG--TT------------------GGGGT------------T-GG--G-TACATTTTNGGGGGA----TCGAATGGGGGTGGGGTTTAACATAGAACTCTA-T-GGG--GAAAATTAATTCCAAAATTCAACAGAT------GTAACTTGACAAAAT-----ATG------ATAG-----------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTNCTTTGACC-T-TGAACAT-A-AAA-C-TGGTA------TAACT--TTAGAA-----AGAGANTTGCTTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCCTTGACCTTTG--ACCT-T-GAACAT-A-AAAN-TG-GTATAACTTTAGAACC-GGAACTG--ATAGAGACNTCAGATNGGGTGATACGANCTAGNATCAAGGTCNAGTGACTCCTTTACCTTTCCTACNAAGTAGTATNTCCCGTGA--C-C-T-TGACCTTG-G---------A--------A--T-A-AA-A-CNGGTATAACT-T---AACCAG-G-ACT---G--AANCNNGNCATGATTCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACCGGTATCCNGTGNCCTTGACCTCTGACCTTGG--AACAT-A-AAA-CTGGTATNAC---TTTAGAACCGGG-A---C-------TGGAT--ACGAAGACATTGGGTCNTCAGAAATGAT-AATAAGGGA--TGTNAACT--TGT--C-AA---G-------TGA-C---T---CCTGTGACCTTG-ACCTTTGACC-T-TG--AT-CATAAAAACTNGT-A-TA--A-CTTTAGAAC
gi|1 : GAACACATTGTGTCAGGGACACATTGTTTTGGCTCCATTTCGTATTATTATTAGTATTTTTTTTTC-T-CTTTGGTGATAA-ATTCACTTGCATGA--TTTTAT-GAA-AGTG-CTTC---AACAGATCCAATTCAAACTT--TAATGTGAGCTG-TAGGG---------AG-C--------CAT-GAAGA-GGGATGACTGCC----CAA---------CAAGT---AGA-----AAATCAA-G---GCTGTCACACTTCA-ACCAAATTTT----ATTGC-TGGGG-AATTTGATGACTC-CTGAGTCCATT--TCCAGCAGGA-AAAAAA--------ATTGT---G-CCATCCA-----TTTCAAAACGGCC-TTATACA-AAAAA-TG--T-TT--AAG-TGTTTTAAAATTTCTACATCATTTTGGGTTCTG-GA---GTCAATTGAGGCTACGCATTTCATGTCTAGC--A--ATC-TGTTTTTCT-----TCTA---TTCAAA-TCTGC-TAAAATGGCTGCCATTTCAAAA-------ATCA-A--------------------------------------GT--CGGATTTCAACAAAA-T-T-ATTTTTTCTAGGGTTAATTCA--GGATC-C-AAGTC-CA-TAT------CTGG-TAT----T----TTTATTTG-GT--CC--ATTTCTGACATA---AGGGA-GGTG----GGTGACATTTTTGTTGGCATCTCA--ACAGTTATAGCTT---GTTT--T-TCATATTC-----TTTTTTCAAGCCTAAAAC-AACA-GGCA-------TTCTCTGAA---AACCT--TG-ATG--AAAGT-----AT-TAGA-TATTC-AATA-----T---AT-G--ATATGCCAATGTATCTAGTTGATGCAGAAA---TG--TT------------------AGGGT------------T-GG--A-TACATTTTGAGGGGA----TCAAATGGGGTTGGGGCCGAACGTAGAAC--------------AGATTAATTACAAAATTTAGTAGAT------ATAACTTGACAAAAT-----ATG------NNNN-----------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCTAACC-A-TGAACAT-A-AAA-C-TGGTA------TAACT--TTAAAACTACTGCAGGACTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCCTTGACCTCTG--ACCT-T-GAACAT-A-AAAC-TG-GTATAACTTTATAACT-GGAATTG--ATAGAGATATCAAATTGGATGATACAAACTAGTATCAAGGTTGAATGACTCCTTTACCTTTCTTATTAAGTAGTATCTGCAGTGA--C-C-T-TGACCTTG--------------------A--T-A-AA-A-CAGATATTA---T---AACCAA-G-ACT---GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTTGACCTCTTACCTT-G--AACAC-A-ACA-CTGATATAAC---TTTAGAACTTGG-T---C-------TGNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNN--NNNNNNNN--NNN--N-NN---N-------NNN-N---N---NNNNNNNTCTTG-ACCTTTGACC-T-TG--AT-CATGAAAACTTGT-A-TA--A-CTTTAGAAC
gi|10 : CT-T-GACCAT-A-AAAAGTT-GTATAACTTTAAAACC-AGAACTG--A
gi|11 : ATAAAGAA--TGT-AACC--TAC--A-AA---G-------TAG-TGTAT---CCTATGACCTTG-ACCTTTAACC-T-TG--GT-TATAATAACTAAT-A-TA--T-CTATAannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttaaaaaaggaaacaaattaccaaggtatttcgtttgtgaaaattttcaaaatcaaggtctttgtgaactagacttttaaacaaaattggcacggattttgtgcaagggagtgattactgcagggaaaaatagttgtgcattatgtattcagaaaaaaacaacacttttatttatatacaaccagtgcttcgtctgagaaacttaattagcagattataatcataattgtcttgttttttttctacactcttttcaattttattgtcagtt
gi|12 : CCTTGACCTCTG--ACCTCT-GAACAT-G-AAAT-TG-GTATATTTTCAAAACC-AGACCTG--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACT-TGA--C-C-CCTGACCCTA-G---------A--------ACAT-A-AT-A-TTGGTATTATA-T---AA-------------G--AACCGGGTCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTTCACATTTAACCATC---AACAT-A-AAA-CTCGTATAAC---TTTAGAACTGGA-A---T-------TG-----ACAGAGACATGGGATCTTCAG-AATAAT-Atgatataatatataataatatatctaatatatctctataactatagaaatgggattatctgaaatgatgaaaggagcttgagacctacatgtactaactaatatttgtatgagaccagatttaatgatggagtcggaattttctggacaatttgcaaaatctgcaatttagcatttttaaattaacttaaaatctggcattggaggaatacagtagtattgagaaaaagcctactttttacagccagtatttcgtttgggaggttttgtaatcagcagattataatcatatattacat
gi|13 : CCTTG---AACATGA-AAA-CTGTAATAAA---TTTAGAAAAGAG-A---AA------TGGATGGACGAA--CATTGGGTCTTCA-AAAGGATTAATCAGAAACCTGTAACCT--TGTATC-AA---GGATTCAGTGA-C---T---CCAGTGA-CTTG-ACTTtgacgtcacaaattcggggagtcgggaacgat
gi|13 : TCCAGTGAC-TTGAC--------TTGG--AAGA----AAA-TTGGT-TTACGGATCCATAACCATT-ATGTC-------TTG-T--A--GAGACATGGGCTCATCAAAAAT--T-GATAAGGGC--TTTT--CT--GGA--CTAA---C-------TAA-C---T---A--GGAATCCCC-ACTTTTGACC-TATGA-AT-CATAGAAAGTTGTAA-TACCA-TTTAAGAAggaagaaaattggtttacggatccataaccattatgtcttgtagagacatgggctcatcaaaaattgataagggcttttctggactaactaactaggaatccccacttttgacctatgaatcatagaaagttgtaataccatttaagaaacagatgtgatatgaagaatggacctacgacgtagtatatcctgt
gi|14 : ccttgaacatgaaaactgtaataaatttagaaaagagaaatggatggacgaacattgggtcttcaaaaggattaatcagaaacctgtaaccttgtatcaaggattcagtgacCTTTG--ACTTCT-GATCCT-A-AAAC-TC-GCATGACTTTAGAACT-GGAATTG--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGC-C-T-TGACCTC------------------------T-T-AA-G-TTG-TATAACC-T------TAG-A-ACT---G--AA-------ATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTTGACCTCTTACCTTAG--ATCAT-A-AAA-CTCGCATAAC---CTTAGAAacagatgtgatatgaagaatggacctacgacgtagtatatcctgt
gi|15 : -------TTCTGT--A---ACCCTT-TG-AGG--AAAGT-----AT-TAAG-TATCCATGGA-----TTTTATAG--ATAGGCCAA-GTATCTTGTTG-TGCAGAAAGGTTGAATT------------------GGGGTGTACATTTGTATT-GAATG-TACATTT-GGAGGGA----TCAAATGGGAGTGGGGTTTAACATAAAGCTCGT-T-GGG--AAAAATAAATTCCAAAATTCAACatt
gi|16 : tgaagtttggagacttattgtatttttttgcttggtgcttattcttctttttgtgtgtgtgtgtgctggt--T-TT---TTCCGCCTCTTTCTTGTGCCTGAAACTGCCC-GACA-------TTATTC--C-----CC----G-ATG--AAAGT-----CT-TAGA-TATTCTAGGA-----G---AT-G--ATAGGCCAATGTATGTAGAGG-TACAGAAA---TG--TTTTTGTTTTCAGATTGAAGGGGGT------------TAGG--G-TACA--TTCGGGGG-----------GGGGGGGGTGTTTAACATAAAACTCTA-T-GGG--GAAAATTATTT---AAAT-------------------CTTGAT-AAAT-----ATG------ATAG-----------gaaaagcataatagtttccttaatagatgtg
gi|17 : aacgaagtttggagtcttattgtatttgctcgattcttattcttaccgt------------------GGGGT------------A-CG--G-TACATT--GGGGTGA----T-GAAAGGGGAAG----TTAACATAGAAAACTA-TTGAG--GGAA--TAATTCTAAAATTCAACA----------TAACTTCACAATATGNNNNNNN------NNNN-----------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTACTTTGACT-TCTGATCCT-A-AAA-C-TCGCA------TGACT--TTAGAA-----tgtcatag
gi|19 : ttttgtattcagattgcaaggggggaggggggTCTGGC--ATAAT--TATTTCTTT--ATATCTAATTTCCGAATTGCAT-CAAGATGGTTGTCATTTCAAAA-TGGC-TGCCA-AA---A---ATGCA----GT----------------TT-GT--TAGACT----------T-T-A-G-TTTGTAGTTTAAATTTA--GGATC-CAAAGTC-CA-T-C------C--GACA-----T---A-------G-G-------------GAAAT--------A-GATGTT-CGAGGTCATTTGTGTTGACATTCCAACA-GGATATAACTT---GTTctgg
gi|2 : GCTTAACATAGAACTCGA-T-GGGTAAAAAATTAATTCCAAAATTCAACAGAT------GTGACTTAAT-AAAT-----ATG------AGAG----------------------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCC-T-TGAACTTAA-AAA-C-TGGCA------TAACT--TTAGAA-----AGAGAATTGATTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTTGACCTTTG--ACCT-TGGAAAAG-A-AAAT-TT-ATATTACTTCAGAACC-AGGTTTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCGTGA--C-C-T-TGACCTTT-G---------ACCTTGAACA--TAA-AA-A-CTGGTATCATT-TAG-AAAGAG-A-ATT---GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTTGACCTCTGACCTTGG--AAAAG-A-CAA-TCGGTATTAC---TTCAGAAACAAG-T---C-------TCNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNN--NNNNNNNN--NNN--N-NN---N-------NNC-C---C---ACTTTGATCTTGAACATTTAAAG-T-TGTAATACTTAAGAACCAAT-ACTA--ATCTTTAGAatcatactagtattttacaaaataaatttcact
gi|2 : CTTTG--ATCT-T-GAACAT-TTAAAG-TT-GTAATACTTAAGAACC-AATACTA--AT-----CTTTAGAT---GTGATA-GA---AGAAT---------GTGA-------AC------TACAAAATAGTATATCCTGTGA--C-C-T-TGACCTTT-GACCTTGATTA--------A--T-A-TA-A-CTTGTATAATT-T------TAG-G-ACT---G--tgtgatagaagaatgtgaactacaaaatagtatatcctgtgaccttgacctttgaccttgattaatataacttgtataattttaggactgggactgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatttactgaagtgaacagactgaggattttttctgaaatttttcaaaatcttggcaatttagatttttcaatgaac
gi|2 : gcttaacatagaactcgatgggtaaaaaattaattccaaaattcaacagatgtgacttaataaatatgagagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgaacttaaaaactggcataactttagaaagagaattgattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgacctttgaccttggaaaagaaaatttatattacttcagaaccaggtttgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccgtgaccttgacctttgaccttgaacataaaaactggtatcatttagaaagagaattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgacctctgaccttggaaaagacaatcggtattacttcagaaacaagtctcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncccaTATCCTGTGACCTTGACCTTTGACCTTGATTAATAT----AA-CTTGTATAAT---TTTAGGACTGGG-A---C-------TGggactgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatttactgaagtgaacagactgaggattttttctgaaatttttcaaaatcttggcaatttagatttttcaatgaac
gi|20 : gcttaacatagaactcgatgggtaaaaaattaattccaaaattcaacagatgtgacttaataaatatgagagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgaacttaaaaactggcataactttagaaagagaattgattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgacctttgaccttggaaaagaaaatttatattacttcagaaccaggtttgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccgtgaccttgacctttgaccttgaacataaaaactggtatcatttagaaagagaattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgacctctgaccttggaaaagacaatcggtattacttcagaaacaagtctcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncccactttgatcttgaacatttaaagttgtaatacttaagaaccaatactaatctttagatgtgatagaagaatgtgaactacaaaatagtaAACACCTAATGTCGGGGACATAGTGTTTTTGCTCCATTTC---TTCTTATCA----TTATTCATCTT-CGTTTGTGCTGA-ACTTGTCTGCGCGATTTTTTATGGAA-AGTGCCTTCCCAGAAAAATCCAATTCAAAC-T--T--TGTGGG-TGATAAGG---------CGAT--------C-T-GAGGA-GNNNNNNNNNNN----NNN---------NNNNN---NNN-----NNNTCAtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatttactgaagtgaacagactgaggattttttctgaaatttttcaaaatcttggcaatttagatttttcaatgaac
gi|21 : aatatacaattactatatattatgtccaccAATCTCTGAA-TGCTT--GAGATGTTCGCCAATTTAAAA-T-GCCTGCCA-AA---A---A---------------------------------TAGATTTCAACCAAA-TGT-A-GTTTTA-AGGTTGAATTCG--TGATC-CCAAGTC-TA-C-TTCTGGACTCGATAT--------ATTTCTCTG-TC-ACA--GTTTCTGACAT-----GGGACGGTGTT-CGGAAACTTTTGTGTTGGCATCCCAGCACAGTTATAGCTT---GT
gi|22 : cAAGAA--TGTGA-CT--TAC--A-AA---G-------TAG-T---TTATCCTGTGACCTTT-ACCTTTGACC-T-TG--AT-TATAATAACTAG
gi|23 : cCCCGTAA--C-T-T-T-----TG-A---------AC-------A--T-A-AG-A-TCAGTATA--T-G---AACCAG-N-NNN---N--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNT--CCTTGATATTTGACCTT-G--AACAT-T-AAA-ATCATATAAC---TGTAGAACAGGA-A---T-------TGgactannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtttactgaaggaaacaagaggatttttttttctggaaactttcaaaatctt
gi|23 : tgaTCCTTGATATTTG--ACCT-T-GAACAT-T-AAAA-TC-ATATAACTGTAGAACA-GGAATTG--
gi|24 : tgacccgtaacttttgaacataagatcagtatatgaaccagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnT------------------GGAGT------------T-GG--GGTACATTTGGGGGGGGGGGGTCAAATGAGGAAGGAGTTTAACATAGAACTCCA-G-GGG--GATAAT---TTCCAAAATTAAACAGAT------TTAACTTGAC-AAAT-----ATG------ATAG-----------
gi|26 : ttcagattgaa---AAA-----AAATCAA-A---GTTGTCGGATTCCACACCAAATTTTC--AATTTT-TAT--TAATTCGATGAC-C-CCAAGTTCATTGCTTC-GCATCACAAAAAC--------ATTTTTTAGCCCGCCCATTTTTTTTCAAAATGGattcctggggtcttcggaaatgaaaatacaaggcccacgaactacctagt
gi|27 : tgaaaatgcaaatattacccgaaggcaacttaaactatgtaaaaa---AAA-----AAATCAA-A---GTTGTCGGATTCCACACCAAATTTTC--AATTTT-TAT--TAATTCGATGAC-C-CCAAGTTCATTGCTTC-GCATCACAAAAAC--------ATTTTTTAGCCCGCCCATTTTTTTTCAAAATGG
gi|28 : tgaaaatgcaaatattacccgaaggcaacttaaactatgtaaaaaCTTGACTTCTGACCTTT---AACAT-GTAAA-CTGGTATCAT---TTTAAAAGTGGG-A---T-------T-AAT-----AACANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNN--NNNNNNNN--NNN--N-NN---N-------NNN-N---T---ACTTTGACTTAG-ACCTCTGACCAG-GG--AA-CATAGAA--TTGC-A-TT--A-CTTCAG
gi|29 : ----TTCTCCTTC-T---TCAGTAA-GACATGTGTCCACGTGC--TTTGAT-AAA-AGTG-CCTT---TATAGATCAAATTC-AATTT--T--TGTAGGCTGATAGAG---------AG-ccacat
gi|3 : -TG-ATG--AAAGT-----CT-TAGA-TATTCTAGGA-----T---AT-G--ATAGGCCAATGTATGAAGATG-TGCAAACA---TG--TTTTTGTTTTCAGATCGAAAGGGGT------------T-GG--GGTACATTCTGGGAGGA----TTAAATGGGGGTGGGGTTTAACATAAAACCCTA-T-GGG--GAAAA--AATCC--AAATTCAACAGAT------GTAAATTGA-AAATT-----ATGNNNNNNNNNN-----------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTTGACCAT-TGACCATAA-AAA-C-TGGTA------TAACT--CTAGAA-----AGAGAGTTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTTGATC-TTG---------GAAAAG-A-AAAT-AG-GTACTACTTCAGAACCAGGTACGN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTTGA--CTT-T-TGACTTTG-A---------AT-------A--T-A-AA-ACCTGGTATAACTCT---AGAAAGAG-ACT--------TCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCT-TGATCTTGG--AAAAG-A-AAA-TAGGTACTAC---TTCAGAACCAGGTA---CGNNNN--NNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNN--NNNNNNNN--NNN--N-NN---N-------NNN-N---N---NNNNNNNNNNNN-NNCTTTGACC-T-TG--AA-CATAAAAACTGGT-A-TA--A-CTTTAGAAaacaaactactttcaaaatgccccccaccccgcccccaattcaaaatgtcaaaaatgtcaacaattaaggttg
gi|3 : tgtTTTGACT-T-TGAATAT-A-AAA-CCTGGTA------TAACT--CTAGAA-----AGAGACTTCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTTGATC-TTG---------GAAAAG-A-AAAT-AG-GTACTACTTCAGAACC-A-----G--GTACGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--C-T-T-TGACCTTG-A---------AC-------A--TAA-AA-A-CTGGTATAACT-TTAGAA--AGAG-ACTTGCN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTTGACTTCTGACCTTGG--AAagagacttgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgacttctgaccttggaaaagaa
gi|30 : tgttgatgaaagtcttagatattctaggatatgataggccaatgtatgaagatgtgcaaacatgtttttgttttcagatcgaaaggggttggggtacattctgggaggattaaatgggggtggggtttaacataaaaccctatggggaaaaaatccaaattcaacagatgtaaattgaaaattatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctttgaccattgaccataaaaactggtataactctagaaagagagttgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgatcttggaaaagaaaataggtactacttcagaaccaggtacgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgactGTT-TGGAGACATTGCTTTTG----CTCGGTTC--TTTTCGCTTCTCGTTCATTATC---GTCTGCTTCTTTCTTGTGCCTAAAAATCTC----CA-------T-----------AGCTTGTTG-ATG--AAAGTATTTATT-TAGA-GATTTCAGaagaa
gi|31 : ttttcaaatgaaTTTGTCGTGCTTAAAACTGTCTTGATAAAAAAAGTTTTCT--ATGCAACATG-TGGAAG--AAAGT-----CT-TAGA-TATTATATGA-----T---AT-GATATAGGCTAATGTATGTAGAT--CGCAGAAA---TG--TT----------------------T------------T-GG--G------TTTC---AGA----TTGAA-GAGGTTGGGGTattgaaggggttagggtgcatt
gi|32 : -A-AAA-TTGGTATCAT---TTTAAAACTGGA-A---TAAAATTATTGAT--A--AAGATAATGTGATATAAGAACTGA---GTAGAGGA--T--TAACTAGTGT--C-AA---GGTCAAT-TGA-C---T---CCTGGGACATTT-ACCTTTGACC-T-TG--AT-CTTAACAACGAAT-A-Tattgg
gi|33 : ataGCTT---CTTC--T-TC---TTCCGCCGTTTTCCCATGTCTAAAACTGTCC-GACA-------CTGT---------------TG-ATG--AAAGT-----CT-TAGA-TATTCTAGGta
gi|34 : gtctcccaaacgaagtttggagacttattgagtttgctcagttcttgcaattcttcc-------TGA-C---T---CCTGGGACATTT-ACCTTTGACC-T-TG--AT-CTTAACAACGAAT-A-TT--A-CTTT-GAA
gi|34 : GG--TGTGAGCT--T----C-AAACTG-------TTATC---T---CCAGTGACCTTG-ACTTTTGACC-C-TG--AT-CCTAAAAGCTTGC-A-Ttggtgtgagcttcaaactgttatctccagtgaccttgacttttgaccctgatcctaaaagcttgcat
gi|35 : tgactcctgggacatttacctttgaccttgatcttaacaacgaatattactttgaatCCGCCTCTTTCTTGTGCCTAGAAT-----------------TTCTCTA-T---AACCTGATA-ATGCCAAAGT-----GTGTAGA-TGTGC-AGAAGTTTTT---TT-G--TT-------TGTTTTTAGAT--TGAAG------------------------------GGGGT------------TGGG--G-TACATTTTTAG
gi|37 : GCTT---CTTC--T-TC---TCCCGTCGCTTTCTCATG-CTAAAACTTTCT---CC-------TTA-CT--T---AACCTGTTG-ATT--AAAGT-----CT-TAGA-TATTCTAGGA-----T---AT-G--ATAG
gi|4 : CT--T---AACCTGGTG-ATG--GAAGT-----CT-TAGA-TATTCTAGGA-----T---AT-G--ATAGACCAATGTCTGTAGATG-TGCAAACA---TG--TTTTTGTTATCAGATTGAAGGGGGT------------TAGG--G-TACATTCTTGGGGGA----TCAAATGGGGGTGTGGTTTAACATAGAACCCTATT-GGA--AAAAATTAATTCCAAAATTCAACAGATAATATGATAACTTGAT-AAAT-----ATG------ATAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTTTGAAC-T-TGAACATCA-AAA-C-TGGTA------TAACT--CTAGAA-----AGAGAGTAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTTGACC-TTG---------GAAAAG-A-AAAT-AG-GTATTACTTCAGAACCAGGTATGN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTTCA--C-CTT-TGACCTTGAG---------C--------A--T-A-AATA-CTGGTATAATT-------CTAG-A-AA----G--AAACATGCTA-GATTCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTTGACCTCTGACCTTGG--AAAAG-A-AAA-TAGGTATTAC---TTCAGAACCAGG-T---A-------TGNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNN--NNNNNNNN--NNN--N-NN---N-------NNN-N---N---NNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNCC-T-TG--AA-CATAAAAACTGGT-A-TA--A-CT
gi|4 : ctcCC-T-TGAACAT-A-AAAAC-TGGTA------TAACTAATTA-AC-----AGAGaattaacagag
gi|40 : ctccttaacctggtgatggaagtcttagatattctaggatatgatagaccaatgtctgtagatgtgcaaacatgtttttgttatcagattgaagggggttagggtacattcttgggggatcaaatgggggtgtggtttaacatagaaccctattggaaaaaattaattccaaaattcaacagataatatgataacttgataaatatgatagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncctttgaacttgaacatcaaaactggtataactctagaaagagagtagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgaccttggaaaagaaaataggtattacttcagaaccaggtatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttcacctttgaccttgagcataaatactggtataattctagaaagaaacatgctagattctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgacctctgaccttggaaaagaaaataggtattacttcagaaccaggtatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnATAAATTTAGAAAG-AGAATTG--ATAGAGACTTCAGAAAGGGTAACATGACCT-GTA--AAGGTCCAGTGACTCC
gi|41 : CCTACAACGTAGTATATCCAGTGA--C-C-T-Tagtgacttt
gi|44 : atagagacataaaaattttagatgagattaaaaaaaatgtgaCTTGACCTCTGTGACCT-T-TAGGAT-A-AAAA-TGAGTGTAACTTTAGAAGA-GGAACTT--ATAGAAAtat
gi|45 : TTG--ACAT-T-GAACATTA-AAAG-TG-GTAAAACTTTAGAAAC-AGGGTTA--ATAGAGACATttc
gi|47 : cCTTGACTTCTGACCTTGG--AAAAG-A-AAG-TTGGTATTGC---TCCAGAACCAGG-T---C-------Tgggacctt
gi|48 : agTTTGACC-T-TGAACAT-ATAAT-C-TGGTATACATGTAACT--TTAAAA-----AGAGAATTG
gi|49 : TTG--ACCT-T-GATTAT-G-AAATATA-TTATAATTTTAGAACT-GGAACTG--
gi|5 : tggtcGTCTCGAACACATATTGTTTTTGTTCCGTTTC---TTCTTATTT----TTCTTCTTC-TTCTTTAGTAATGA-ACTTGTC-ACCCGA--TTTGAT-GAA-AGTG-CTT----AACAG--------------T--T--TGTGGACTGATAGGGATAATTAGGAG-TGCACAAAACATTGAAAA-----TGGCCGCCAATTCAAAATGGCCACCAAAA---AAAGGCTAAAATTAAAG---GTTGTTGGATTTTA-ACCAAATTTT-------TC-TAGGGTAATTTGATGAC-C-CGGAGT-CATT--TCC-GCAT-GCAAAA-T--------ATTTTTAAGCCCGCC-ATTTTTAT-----ATGGCCGCCACAGC-GGAAA-TCCTT-TT--AAA-TG-CTTAAAA---ATATATTA-TTTGAGTTATGGTGCAAGTCCAACGAGGGTTCACAGTTCATTTCTAGCTAA--GT--TATT-CTTTCCATATCCAATTTCAAAA-TGTATGCAAGATGGCCATCATTTCAAAA-G-GC-TGTCA-AA---A---T---ATTCCG-----------------TTTGT--CGGATTTCAACCAAATT-T-A-G-TTTATAGAGTGAATTCACCCATTC-C-AAATCTTATT-T------CTTGACAT----TAAAATATGTTTA-A--ACCCAATTTATGACAAA---GGGGA-GGTGTTGCGGGGACA
gi|50 : attatCT--T---AACCTGGTG-ATG--GAAGT-----CT-TAGAATATTTTAGGA-----T---AT-G--ATAGg
gi|51 : ctcCTTGACCTCTG--ACCA-T-GAA-AT------G-TG-ATATAACTTTGGAACT-GGGACTG--Aa
gi|6 : -ACTTGTCCGCGCGA--TTT-AT-GAA-CGTG-CTTC---AACAGATCTAATCTAAATTCAAT--TGTGGACTGATAGGG---------GG-T--------CAT--ACGACGGGGTG----------CAAT--------CAAGTTTCAAA-----A
gi|6 : GTTT-CAAAATGGCTGACAATTCAAAT-TTGC-GGACA-AA---A---A---A----GGTAAAAAAAAAAATACGTT-GT--CGGATTTCAACC--A-T-T-T-CTTTTCTAGGGTAATTTGA--TGATCTC-GAGTT-CA-T-T------tggctgacaattcaaatttgcggacaaaaaaggtaaaaaaaaaaatacgttgtcggatttcaaccatttcttttctagggtaatttgatgatctcgagttcatttccagcaattaaaacaaattgagtcggcattttgaaaatggccgccatatacagaattgtatcaaaatgataagctttctacatcatttgggatctgtgtcatttgagggtatacaattgatatctatcaatagtattactttatatcaaatttcccactgtttcaagatggccgactttacaaaattgctgcaaaaaataaagtttaacggatttcagccttcagtttttaggttgcatttaggattcgaagtctatttttgtactcgatatgtctctgtgtcaccatttaagataggggggggggcgttcgggtacatttttgttggcaccccaacacatttaaaacttgt
gi|6 : acttgtccgcgcgatttatgaacgtgcttcaacagatctaatctaaattcaattgtggactgatagggggtcatacgacggggtgcaatcaaAA---------AAGGT---AAA-----AAAAAAA-ATACGTTGTCGGATTTCA-ACCA---TTTC----TTTTCTAGGGTAATTTGATGAT-C-TCGAGTTCATT--TCCAGCA--ATTAAAAC--------A-AATTGAGTCGG--CA----TTTTGAAAATGGCCGCCATATA-CAGAATTG--T-ATCAAAA-TG-A-TAAGCTTTCTACATCA-TTTGGGATCTG-T----GTCATTTGAGGGTATACAATTGATATCTATC--A--ATAGTATTACTTT--ATATCAAATTTCCCAC-TGTTT-CAAGATGGCCGACTTTACAAAATT-GC-TGCAA-AAAATA---A---A----G-----------------TT--TAACGGATTTCAGCC----T-TCA-GTTTT-TAGGTTGCATTTA--GGATT-CGAAGTC-TA-T-T------TTTG-TACTCGAT---ATGTCTCTGTGTCACC--ATT--TAAGATAGGGGGGGG-GGCGTT-CGGGTACATTTTTGTTGGCACCCCAACACATTTAAAACTT---GTtccagcaattaaaacaaattgagtcggcattttgaaaatggccgccatatacagaattgtatcaaaatgataagctttctacatcatttgggatctgtgtcatttgagggtatacaattgatatctatcaatagtattactttatatcaaatttcccactgtttcaagatggccgactttacaaaattgctgcaaaaaataaagtttaacggatttcagccttcagtttttaggttgcatttaggattcgaagtctatttttgtactcgatatgtctctgtgtcaccatttaagataggggggggggcgttcgggtacatttttgttggcaccccaacacatttaaaacttgt
gi|7 : acttgtccgcgcgatttatgaacgtgcttcaacagatctaatctaaattcaattgtggactgatagggggtcatacgacggggtgcaatcaagtttcaaaatggctgacaattcaaatttgcggacaaCTTGATATTTG--ACCT-T-GAACAT-T-AAAA-TC-ATATAACTGTAGAACA-GGAATTG------------------GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGGATCCCCAATGA--T-T-T-TGACCTTG-AT--------C--------A--T-AGAA-A-GTTGTATAACT-TAAGAACCAG-T-ACT-------------ANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACCGGTATCCAGTATCCTTGACCTTTGACCTTG
gi|8 : -C-T-TGACCTTG-G---------A--------AAAG-A-AA-A-TGGGTACTGCT-TCAGAACCAG-GTAC---------GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACTT--GACCTTG---AACAT-A-AAAACTGGTATAAC---T---AAA--GAG-A---G-------TTGAT--A--AAAACGTTGGGTCTTCAAAAATGAT-AATAGGAGA--TATCAATT--TGT--C-AA---G-------TGA-C---T---TCAGTGACCTTG-ACCTCTGACC-T-TG--attnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaacttaaaattggcatttaagcatggattatttgtaagggaggtatacagtagtatgaggaaaaagcccactttgtacagccagtgctt
gi|8 : TTCAGTGACCTTGACCTCTGACCTTGG--AAAAG-A-AAA-----TATG-----TT--GAACCAGG-gaaaagaaaatatgttgaaccaggtacgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtttttggaaggaaacaggattatttttgggaattttcaaaaatctttacgattcagaatttttaaatgtacttgaaatgggcatggcatgaattgtgtgcaagggtggaatacagttgtatta
gi|9 : cttgaccttggaaaagaaaatgggtactgcttcagaaccaggtacgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacttgaccttgaacataaaaactggtataactaaagagagttgataaaaacgttgggtcttcaaaaatgataataggagatatcaatttgtcaagtgacGAACACGTAGTGTTGGGG--ACATTG-TTTTGC----TTTC---TTCTCA-AA----TT--------T-CTTTAGTGAGAA-ATTTGTCCGCACGA--TTTTAT-GAATAAT--CTTC---AACAGATTCAATTCAAAC-T--T--CGTGGGTTGACAGGG---------GG-T--------CCTGGGAGA-GGGGTGtacgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtttttggaaggaaacaggattatttttgggaattttcaaaaatctttacgattcagaatttttaaatgtacttgaaatgggcatggcatgaattgtgtgcaagggtggaatacagttgtatta
gi|9 : ttatgtccccAACTTTCGGAATTTT-CAAAGT--------GGC-CGCCGA-TTCAA-GATCCATCATAAAAAAAACCCGAAAAAACTG---AGCC-GCC-ATTTT----CAAAATGGCCGCCATAAACGAAAA-TG--TATC--AAAGTA-CT-AAAATCTCTACATCA-TTTAGGTTTTG-TG---GTCAGTTGAGGGTACACAATTCATATCTAGCGTA--AG--TATTTCTTT--ATATCAAATGTTTGAA-TGTTT-AAAGATGGTTGTCATTTCAAAA-TGGC-TGCCACAA---AATGA---A----GT----------------TT-GT--CGAATTTCAACCAAATT-T-A-GTTTT-TAGGTTGAATGCA--GTATCAT-AAGTT-TA-T-T------ctatcaactttcggaattttcaaagtggccgccgattcaagatccatcataaaaaaaacccgaaaaaactgagccgccattttcaaaatggccgccataaacgaaaatgtatcaaagtactaaaatctctacatcatttaggttttgtggtcagttgagggtacacaattcatatctagcgtaagtatttctttatatcaaatgtttgaatgtttaaagatggttgtcatttcaaaatggctgccacaaaatgaagtttgtcgaatttcaaccaaatttagtttttaggttgaatgcagtatcataagtttatt
8 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|18 ): ATTACGTGTATCAGACGGATTATTATGGGTCTGGAAATTTTCAAAATCTTATTACGTTAGAATTTTCGGTTAATGAACCGGGGCATGTGCATGGGACTACTTGCACGGGAGGAATACAGTTTGTATTAAGAAAAAGCTTTTACTTTGTACAACCACGTACTTCGTTTGCGGAGACTTTTATATCGGTCAGATGGAATATTATATCTCTACATCTGGTTTTAACATGCTAAGGAATT
Unaligned ( gi|25 ): ATTAATCATGGTCTTTGTGCTCTAGATGTATTTTAAATGATTTATGAATGGCATGGATTTTGTGAGAGGGAGGAAAATAGTACTCAAAAAAGTCCACTATTATACAAATAGTATTTCGATTGGGAGACTTTATAATTGGTAAATTATAATAATATCTTATATGACTTC
Unaligned ( gi|36 ): GGATTTTGTGCAAGGGGTTATTAATATGGGGAAAATAGCAGCATCAGAAAAGCTCAACTTTTATACAGCAGATTTATTTGGCGAAGACTTTATAACGCAGATTATCATC
Unaligned ( gi|38 ): AAAGGGAGTTGACCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Unaligned ( gi|39 ): TCTCCAAAACAAAGTTTGGAGAGTGACTAATTCATAGTGTTTTTGCTCTGTTCATGTAATTCTTCCACTCCTCCTTGTTCC
Unaligned ( gi|42 ): TAAGTCTCCCAAACGAAGTCTGGGGACTTATTGCGTTTGCTCAGTTATAATTCATCATATTCTTCTTCCGCC
Unaligned ( gi|43 ): TCTTCGTAACGAATTTTGGAGACTTATTGTGTTTGCTCAGTTCTTTTAAATCGTCTGGCTCTTCCTCTTCCG
Unaligned ( gi|46 ): AAAATCAAGGCTTGTGTGATCTAGACTTTTAAATAAAGTTAAAATTGGCACGGA
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 111 1111111 1111 1111111 11 8888888888888888888888888888888888888888 111 22222222222222 11111 2 2222 11 1 333333333333 11111111 1 2222 11 2222222222 1 1111 1 2222222 3333333333 11 222 88888888888888888888888888888888888888888 1111 1 222 6666666666666666666666666666666666666666666 22222 111 11 111 555555555555555555555555555555555555 111111111 11 111 999999999999999999 33333333333333 11 1111111 2222222 22 11111 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 1 1 111111 11111 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 55555555555555555555555555 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 1111 44444444444444444444444 222222222222222222222222222
lowQualScore : 3 3 3 3 4 777 9999999 8 1 8 888 5 6 3 99 7 6 6 6 2222 1 3 4444444 1 6 5 33 1 8 2222222222222222222222222222222222222222 000 77777777777777 5 22222 0 3333 6 00 2 6 6 1 7 7 999999999999 1 55555555 1 2 0 0000 2 1 00 7777777777 0 6666 44 0 0 1111111 1 1 1 8888888888 6 8 11 0 1 44 6 6666 1 444 5 5 99999999999999999999999999999999999999999 9999 5 88888 2 1 888 000 5 5 7777777777777777777777777777777777777777777 77777 8 6 1 3 6 3 000 11 8 444 1 3 222222222222222222222222222222222222 3 55 99999 3 3 3 222222222 4 66 0 00 1 000 77 888888888888888888 00000000000000 66 8 33 4444444 3 0 2 4 1 777 66 33 1 0 1111111 33 44444 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 1 5 5 5 0 5 444444 66 0 22222 1 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 3 555 5 2 2 666 66 33 0 55 0 33 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 1 0 1 44 55 3 3 3 22222222222222222222222222 3 3 3 0 2 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 0 44 1 0000 0 4444 33 1 0 1 11111111111111111111111 1 55 66 0 55 1 4 3 111111111111111111111111111 3 6666666 3 3 3 3 55 4 1 2 1 4 5
lowQualScore : . . . . . ... ....... . . . ... . . . .. . . . . .... . . ....... . . . .. . . ........................................ ... .............. . ..... . .... . .. . . . . . . ............ . ........ . . . .... . . .. .......... . .... .. . . ....... . . . .......... . . .. . . .. . .... . ... . . ......................................... .... . ..... . . ... ... . . ........................................... ..... . . . . . . ... .. . ... . . .................................... . .. ..... . . . ......... . .. . .. . ... .. .................. .............. .. . .. ....... . . . . . ... .. .. . . ....... .. ..... ......................................................................................... . . . . . . ...... .. . ..... . ........................................................................... . ... . . . ... .. .. . .. . .. ............................................................. . . . .. .. . . . .......................... . . . . . ...................................................................................... . .. . .... . .... .. . . . ....................... . .. .. . .. . . . ........................... . ....... . . . . .. . . . . . .
lowQualScore : 7 2 2 2 2 555 0000000 2 0 0 666 6 7 7 22 2 7 7 7 7777 0 2 2222222 0 7 6 00 8 0 1111111111111111111111111111111111111111 000 44444444444444 7 55555 0 0000 7 33 2 7 7 7 7 2 222222222222 0 55555555 0 5 8 8888 5 0 22 0000000000 0 8888 00 0 2 0000000 2 2 2 8888888888 0 0 00 8 0 77 7 1111 0 333 7 7 11111111111111111111111111111111111111111 0000 7 33333 1 3 666 999 7 7 4444444444444444444444444444444444444444444 88888 0 7 0 2 4 8 000 00 0 000 0 0 333333333333333333333333333333333333 6 00 11111 6 6 6 666666666 4 11 7 00 3 000 99 333333333333333333 00000000000000 11 9 00 2222222 4 2 5 1 9 000 99 55 4 7 7777777 00 33333 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 0 0 0 0 0 0 444444 99 2 55555 0 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 2 444 3 7 7 888 33 77 1 22 2 44 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 0 4 0 33 00 3 3 3 55555555555555555555555555 6 6 6 3 6 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 7 77 7 4444 8 5555 99 0 5 9 22222222222222222222222 0 44 44 3 00 0 5 5 999999999999999999999999999 3 4444444 3 3 3 6 00 0 2 5 0 4 7
consensus : GAACACGTAGTGTCGGGGACACATTGTTTTTGCTCCGTTTC---TTCTTATTA----TTCTTCTTC-T-CTTTAGTGATGA-ACTTGTCCGCGCGA--TTTTAT-GAA-AGTG-CTTC---AACAGATCCAATTCAAACTT--T--TGTGGGCTGATAGGGAG-TCAT-GAGGA-GGG---------------GTGGCCGCC----CAA---------CAAGT---AAA-----A--------AA-TCAAA---G-TTGTCGGATTTCACACCAAATTTTC--AATTTT-TAGGGTAATTCGATGAC-C-CCGAGTTCATTGTCCAGCAT-A---------CAAAAACA-TTTTTA-GCCCGCCCATTTTTTTTCAAAATGGCCGCCATANA-GAAAAT-G--T-TT--AAA-TG-CTTAAAATTTCTACATCA-TTTGGGTTCTG-TG---GTCAATTGAGGGTACACAATTCATATCTAGC--A--AT---TATTTCTT-T--ATATCAAATTTCCGAA-TGC-TTCAAGATGGCCGNCATTTCAAAA-T-GC-TGCCA-AA---A---A---A----G-----------------TT-GT--CGGATTTCAACCAAA-T-T-A-GTTTTNTAGGTTGAATTCA--GGATC-C-AAGTC-CA-T-T------CTCGACATT---ATNTNTCTG-GT-ACC--ATTTCTGACATA---GGGGA-GGTGTT-CGGGGACATTTNTGTTGGCATCCCAGCACAGTTATAGCTT---GTTC--T-TC---TTCCGCCTCTTTCTCGTGCCTAAAACTGTCC-GACA-------TTNTCT--N---AACCTG-TG-ATG--AAAGT-----CT-TAGA-TATTCTAGGA-----T---AT-G--ATAGGCCAATGTATGTAGATG-TGCAGAAA---TG--TT------------------GGGGT------------T-GG--G-TACATTCTGGGGGGA----TCGAATGGGGGTGGGGTTTAACATAGAACTCTA-T-GGG--GAAAATTAATTCCAAAATTCAACAGAT------GTAACTTGACAAAAT-----ATG------ATAG-----------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTNCTTTGACC-T-TGAACAT-AAAA-C-TGGTATA------ACT--TTAGAA-----AGAGAATTGNTTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCCTTGACCTTTG--ACCT-T-GAACAT-A-AAAN-TG-GTATAACTTTAGAACC-GGAACTG--ATAGAGACNTCAGATNGGGTGATACGANCTAGNATCAAGGTCNAGTGACTCCTTTACCTTTCCTACNAAGTAGTATNTCCCGTGA--C-C-T-TGACCTTG-G---------A--------A--T-A-AA-A-CTGGTATAACT-T---AACCAG-G-ACT---G--AANCNNGNCATGATTCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACCGGTATCCNGTGNCCTTGACCTCTGACCTTGG--AACAT-A-AAA-CTGGTATNACTTTAGAACCGGG-AC-------TGGAT--ACA-AGACATTGGGTCTTCAGAAATGA-TAATAAAGGA--TGTNAACT--TG--TCA-------A---G------TGA-C---T---C-CTGTGAC-CTTG-ACCTTTGACC-TTG--AT-CATAANAACTNGTA-TAA-CTTTAGAAC
Reference ( family-2 ) : GAACACGTAGTGTCGGGGACACATTGTTTTTGCTCCGTTTC---TTCTTATTA----TTCTTCTTC-T-CTTTAGTGATGA-ACTTGTCCGCGCGA--TTTTAT-GAA-AGTG-CTTC---AACAGATCCAATTCAAACTT--T--TGTGGGCTGATAGGGAG-TCAT-GAAGA-GGG---------------GTGGCCGCC----CAA---------CAAGT---AAA-----A--------AA-TCAAA---G-TTGTCGGATTTCACACCAAATTTTC--AATTTT-TAGGGTAATTCGATGAC-C-CCGAGTTCATTGTCCAGCAT-A---------CAAAAACA-TTNTTA-GCCCGCCCATTTTTTTTCAAAATGGCCGCCATANA-GAAAAT-G--T-TT--AAA-TG-CTTAAAATTTCTACATCA-TTTGGGTTCTG-TG---GTCAATTGAGGGTACACAATTCATATCTAGC--A--AT---TATTTCTT-T--ATATCNAATTTCCGAA-TGT-TTCAAGATGGCCGNCATTTCAAAA-T-GC-TGCCA-AA---A---A---A----G-----------------TT-GT--CGGATTTCAACCAAA-T-T-A-GTTTTNTAGGTTGAATTCA--GGATC-C-AAGTC-CA-T-T------CTCGATATT---ATNTNTCTG-GT-ACC--ATTTCTGACATA---GGGGA-GGTGTT-CGGGGACATTTNTGTTGGCATCCCAGCACAGTTATAGCTT---GTTC--T-TC---TTCCGCCTCTTTCTCGTGCCTAAAACTGTCC-GACA-------TTNTCT--N---AACCTG-TG-ATG--AAAGT-----CT-TAGA-TATTCTAGGA-----T---AT-G--ATAGGCCAATGTATGTAGATG-TGCAGAAA---TG--TT------------------GGGGT------------T-GG--G-TACATTTTGGGGGGA----TCGAATGGGGGTGGGGTTTAACATAGAACTCTA-T-GGG--GAAAATTAATTCCAAAATTCAACAGAT------GTAACTTGACAAAAT-----ATG------ATAG-----------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTNCTTTGACC-T-TGAACAT-AAAA-C-TGGTATA------ACT--TTAGAA-----AGAGAATTGNTTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCCTTGACCTTTG--ACCT-T-GAACAT-A-AAAN-TG-GTATAACTTTAGAACC-GGAACTG--ATAGAGACNTCAGATNGGGTGATACGANCTAGNATCAAGGTCNAGTGACTCCTTTACCTTTCCTACNAAGTAGTATNTCCCGTGA--C-C-T-TGACCTTG-G---------A--------A--T-A-AA-A-CTGGTATAACT-T---AACCAG-G-ACT---G--AANCNNGNCATGATTCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACCGGTATCCAGTGACCTTGACCTCTGACCTTGG--AACAT-A-AAA-CTGGTATNACTTTAGAACCGGG-AC-------TGGAT--ACA-AGACATTGGGTCNTCAGAAATGA-TAATAAGGGA--TGTNAACT--TG--TCA-------A---G------TGA-C---T---C-CTGTGAC-CTTG-ACCTTTGACC-TTG--AT-CATAAAAACTNGTA-TAA-CTTTAGAAC
gi|1 : GAACACATTGTGTCAGGGACACATTGTTTTGGCTCCATTTCGTATTATTATTAGTATTTTTTTTTC-T-CTTTGGTGATAA-ATTCACTTGCATGA--TTTTAT-GAA-AGTG-CTTC---AACAGATCCAATTCAAACTT--TAATGTGAGCTG-TAGGGAG-CCAT-GAAGA-GGG---------------ATGACTGCC----CAA---------CAAGT---AGA-----A--------AA-TCAAG---G-CTGTCACACTTCA-ACCAAATTTT----ATTGC-TGGGG-AATTTGATGACTC-CTGAGTCCATT-TCCAGCAG-G---------AAAAAAAA-TTGT---G-CCATCCA-----TTTCAAAACGGCC-TTATACA-AAAAAT-G--T-TT--AAG-TGTTTTAAAATTTCTACATCATTTTGGGTTCTG-GA---GTCAATTGAGGCTACGCATTTCATGTCTAGC--A--ATCTGTTTTTCTTCT--AT-TCAAATC-------TGC-T--AAAATGGCTGCCATTTCAAAA-------ATCA-A--------------------------------------GT--CGGATTTCAACAAAA-T-T-ATTTTTTCTAGGGTTAATTCA--GGATC-C-AAGTC-CA-TAT------CT-GGTATT----TTTATTTG-GT--CC--ATTTCTGACATA---AGGGA-GGTG----GGTGACATTTTTGTTGGCATCTCA--ACAGTTATAGCTT---GTTT--T-TCATATTC-----TTTTTTCAAGCCTAAAAC-AACA-GGCA-------TTCTCTGAA---AACCT--TG-ATG--AAAGT-----AT-TAGA-TATTC-AATA-----T---AT-G--ATATGCCAATGTATCTAGTTGATGCAGAAA---TG--TT------------------AGGGT------------T-GG--A-TACATTTTGAGGGGA----TCAAATGGGGTTGGGGCCGAACGTAGAAC--------------AGATTAATTACAAAATTTAGTAGAT------ATAACTTGACAAAAT-----ATG------NNNN-----------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCTAACC-A-TGAACAT-AAAA-C-TGGTATA------ACT--TTAAAACTACTGCAGGACTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCCTTGACCTCTG--ACCT-T-GAACAT-A-AAAC-TG-GTATAACTTTATAACT-GGAATTG--ATAGAGATATCAAATTGGATGATACAAACTAGTATCAAGGTTGAATGACTCCTTTACCTTTCTTATTAAGTAGTATCTGCAGTGA--C-C-T-TGACCTTG--------------------A--T-A-AA-A-CAGATATTA---T---AACCAA-G-ACT---GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTTGACCTCTTACCTT-G--AACAC-A-ACA-CTGATATAACTTTAGAACTTGG-TC-------TGNNN--NNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNN--NNNNNNNN--NN--NNN-------N---N------NNN-N---N---N-NNNNNNNTCTTG-ACCTTTGACC-TTG--AT-CATGAAAACTTGTA-TAA-CTTTAGAAC
gi|10 : CT-T-GACCAT-A-AAAAGTT-GTATAACTTTAAAACC-AGAACTG--A
gi|11 : ATAAAGAA--TGT-AACC--TA--CAA-------A---G------TAG-TGTAT---C-CTATGAC-CTTG-ACCTTTAACC-TTG--GT-TATAATAACTAATA-TAT-CTATAannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttaaaaaaggaaacaaattaccaaggtatttcgtttgtgaaaattttcaaaatcaaggtctttgtgaactagacttttaaacaaaattggcacggattttgtgcaagggagtgattactgcagggaaaaatagttgtgcattatgtattcagaaaaaaacaacacttttatttatatacaaccagtgcttcgtctgagaaacttaattagcagattataatcataattgtcttgttttttttctacactcttttcaattttattgtcagtt
gi|12 : CCTTGACCTCTG--ACCTCT-GAACAT-G-AAAT-TG-GTATATTTTCAAAACC-AGACCTG--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACT-TGA--C-C-CCTGACCCTA-G---------A--------ACAT-A-AT-A-TTGGTATTATA-T---AA-------------G--AACCGGGTCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTTCACATTTAACCATC---AACAT-A-AAA-CTCGTATAACTTTAGAACTGGA-AT-------TG-----ACAGAGACATGGGATCTTCAG-AATAA-TAtgatataatatataataatatatctaatatatctctataactatagaaatgggattatctgaaatgatgaaaggagcttgagacctacatgtactaactaatatttgtatgagaccagatttaatgatggagtcggaattttctggacaatttgcaaaatctgcaatttagcatttttaaattaacttaaaatctggcattggaggaatacagtagtattgagaaaaagcctactttttacagccagtatttcgtttgggaggttttgtaatcagcagattataatcatatattacat
gi|13 : CCTTG---AACATGA-AAA-CTGTAATAAATTTAGAAAAGAG-AAA------TGGATGGACG-A-ACATTGGGTCTTCA-AAAGGATTAATCAGAAACCTGTAACCT--TGTATCAAGGATTCA---G------TGA-C---T---C-CAGTGA--CTTG-ACTTtgacgtcacaaattcggggagtcgggaacgat
gi|14 : CTTTG--ACTTCT-GATCCT-A-AAAC-TC-GCATGACTTTAGAACT-GGAATTG--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGC-C-T-TGACCTC------------------------T-T-AA-G-TTG-TATAACC-T------TAG-A-ACT---G--AA-------ATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTTGACCTCTTACCTTAG--ATCAT-A-AAA-CTCGCATAACCTTAGAAggaagaaaattggtttacggatccataaccattatgtcttgtagagacatgggctcatcaaaaattgataagggcttttctggactaactaactaggaatccccacttttgacctatgaatcatagaaagttgtaataccatttaagaaacagatgtgatatgaagaatggacctacgacgtagtatatcctgt
gi|15 : -------TTCTGT--A---ACCCTT-TG-AGG--AAAGT-----AT-TAAG-TATCCATGGA-----TTTTATAG--ATAGGCCAA-GTATCTTGTTG-TGCAGAAAGGTTGAATT------------------GGGGTGTACATTTGTATT-GAATG-TACATTT-GGAGGGA----TCAAATGGGAGTGGGGTTTAACATAAAGCTCGT-T-GGG--AAAAATAAATTCCAAAATTCAACatt
gi|16 : tgaagtttggagacttattgtatttttttgcttggtgcttattcttctttttgtgtgtgtgtgtgctggt--T-TT---TTCCGCCTCTTTCTTGTGCCTGAAACTGCCC-GACA-------TTATTC--C-----CC----G-ATG--AAAGT-----CT-TAGA-TATTCTAGGA-----G---AT-G--ATAGGCCAATGTATGTAGAGG-TACAGAAA---TG--TTTTTGTTTTCAGATTGAAGGGGGT------------TAGG--G-TACATTCGGGGGGGG----------GGGGGT---GTTTAACATAAAACTCTA-T-GGG--GAAAATTATTT---AAAT-------------------CTTGAT-AAAT-----ATG------ATAG-----------gaaaagcataatagtttccttaatagatgtg
gi|17 : aacgaagtttggagtcttattgtatttgctcgattcttattcttaccgt------------------GGGGT------------A-CG--G-TACATT--GGGGTGA----T-GAAAGGGGAAG----TTAACATAGAAAACTA-TTGAG--GGAA--TAATTCTAAAATTCAACA----------TAACTTCACAATATGNNNNNNN------NNNN-----------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTACTTTGACT-TCTGATCCT-AAAA-C-TCGCATG------ACT--TTAGAA-----tgtcatag
gi|19 : ttttgtattcagattgcaaggggggaggggggTCTGGC--ATAAT---TATTTCTT-T--ATATCTAATTTCCGAATTGC-ATCAAGATGGTTGTCATTTCAAAA-TGGC-TGCCA-AA---A---ATGCA----GT----------------TT-GT--TAGACT----------T-T-A-G-TTTGTAGTTTAAATTTA--GGATC-CAAAGTC-CA-T---------CCGACA-T---A-------G-G-------------GAAAT--------A-GATGTT-CGAGGTCATTTGTGTTGACATTCCAACA-GGATATAACTT---GTTctgg
gi|2 : GCTTAACATAGAACTCGA-T-GGGTAAAAAATTAATTCCAAAATTCAACAGAT------GTGACTTAAT-AAAT-----ATG------AGAG----------------------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCC-T-TGAACTTAAAAA-C-TGGCATA------ACT--TTAGAA-----AGAGAATTGATTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTTGACCTTTG--ACCT-TGGAAAAG-A-AAAT-TT-ATATTACTTCAGAACC-AGGTTTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCGTGA--C-C-T-TGACCTTT-G---------ACCTTGAACA--TAA-AA-A-CTGGTATCATT-TAG-AAAGAG-A-ATT---GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTTGACCTCTGACCTTGG--AAAAG-A-CAA-TCGGTATTACTTCAGAAACAAG-TC-------TCNNN--NNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNN--NNNNNNNN--NN--NNN-------N---N------NNN-C---C---CACTTTGAT-CTTGAACATTTAAAG-TTGTAATACTTAAGAACCAATACTAATCTTTAGAatcatactagtattttacaaaataaatttcact
gi|2 : CTTTG--ATCT-T-GAACAT-TTAAAG-TT-GTAATACTTAAGAACC-AATACTA--AT-----CTTTAGAT---GTGATA-GA---AGAAT---------GTGA-------AC------TACAAAATAGTATATCCTGTGA--C-C-T-TGACCTTT-GACCTTGATTA--------A--T-A-TA-A-CTTGTATAATT-T------TAG-G-ACT---G--tgtgatagaagaatgtgaactacaaaatagtatatcctgtgaccttgacctttgaccttgattaatataacttgtataattttaggactgggactgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatttactgaagtgaacagactgaggattttttctgaaatttttcaaaatcttggcaatttagatttttcaatgaac
gi|2 : gcttaacatagaactcgatgggtaaaaaattaattccaaaattcaacagatgtgacttaataaatatgagagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgaacttaaaaactggcataactttagaaagagaattgattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgacctttgaccttggaaaagaaaatttatattacttcagaaccaggtttgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccgtgaccttgacctttgaccttgaacataaaaactggtatcatttagaaagagaattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgacctctgaccttggaaaagacaatcggtattacttcagaaacaagtctcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncccaTATCCTGTGACCTTGACCTTTGACCTTGATTAATAT----AA-CTTGTATAATTTTAGGACTGGG-AC-------TGggactgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatttactgaagtgaacagactgaggattttttctgaaatttttcaaaatcttggcaatttagatttttcaatgaac
gi|20 : gcttaacatagaactcgatgggtaaaaaattaattccaaaattcaacagatgtgacttaataaatatgagagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgaacttaaaaactggcataactttagaaagagaattgattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgacctttgaccttggaaaagaaaatttatattacttcagaaccaggtttgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccgtgaccttgacctttgaccttgaacataaaaactggtatcatttagaaagagaattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgacctctgaccttggaaaagacaatcggtattacttcagaaacaagtctcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncccactttgatcttgaacatttaaagttgtaatacttaagaaccaatactaatctttagatgtgatagaagaatgtgaactacaaaatagtaAACACCTAATGTCGGGGACATAGTGTTTTTGCTCCATTTC---TTCTTATCA----TTATTCATCTT-CGTTTGTGCTGA-ACTTGTCTGCGCGATTTTTTATGGAA-AGTGCCTTCCCAGAAAAATCCAATTCAAAC-T--T--TGTGGG-TGATAAGGCGATC-T-GAGGA-GNN---------------NNNNNNNNN----NNN---------NNNNN---NNN-----N--------NN-TCAtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatttactgaagtgaacagactgaggattttttctgaaatttttcaaaatcttggcaatttagatttttcaatgaac
gi|21 : aatatacaattactatatattatgtccaccAATCTCTGAA-TGC-TT-GAGATGTTCGCCAATTTAAAA-T-GCCTGCCA-AA---A---A---------------------------------TAGATTTCAACCAAA-TGT-A-GTTTTA-AGGTTGAATTCG--TGATC-CCAAGTC-TA-C-TTCTGGACTCGATAT----ATTTCTCTG-TC-ACA--GTTTCTGACAT-----GGGACGGTGTT-CGGAAACTTTTGTGTTGGCATCCCAGCACAGTTATAGCTT---GT
gi|22 : cAAGAA--TGTGA-CT--TA--CAA-------A---G------TAG-T---TTATC-CTGTGAC-CTTT-ACCTTTGACC-TTG--AT-TATAATAACTAG
gi|23 : cCCCGTAA--C-T-T-T-----TG-A---------AC-------A--T-A-AG-A-TCAGTATA--T-G---AACCAG-N-NNN---N--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNT--CCTTGATATTTGACCTT-G--AACAT-T-AAA-ATCATATAACTGTAGAACAGGA-AT-------TGgactannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtttactgaaggaaacaagaggatttttttttctggaaactttcaaaatctt
gi|23 : tgaTCCTTGATATTTG--ACCT-T-GAACAT-T-AAAA-TC-ATATAACTGTAGAACA-GGAATTG--
gi|24 : tgacccgtaacttttgaacataagatcagtatatgaaccagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnT------------------GGAGT------------T-GG--GGTACATTTGGGGGGGGGGGGTCAAATGAGGAAGGAGTTTAACATAGAACTCCA-G-GGG--GATAAT---TTCCAAAATTAAACAGAT------TTAACTTGAC-AAAT-----ATG------ATAG-----------
gi|26 : ttcagattgaa---AAA-----A--------AA-TCAAA---G-TTGTCGGATTCCACACCAAATTTTC--AATTTT-TA--TTAATTCGATGAC-C-CCAAGTTCATTGCTTCGCATCA---------CAAAAACATTTTTTA-GCCCGCCCATTTTTTTTCAAAATGGattcctggggtcttcggaaatgaaaatacaaggcccacgaactacctagt
gi|27 : tgaaaatgcaaatattacccgaaggcaacttaaactatgtaaaaa---AAA-----A--------AA-TCAAA---G-TTGTCGGATTCCACACCAAATTTTC--AATTTT-TA--TTAATTCGATGAC-C-CCAAGTTCATTGCTTCGCATCA---------CAAAAACATTTTTTA-GCCCGCCCATTTTTTTTCAAAATGG
gi|28 : tgaaaatgcaaatattacccgaaggcaacttaaactatgtaaaaaCTTGACTTCTGACCTTT---AACAT-GTAAA-CTGGTATCATTTTAAAAGTGGG-AT-------TA-----ATA-ACANNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNN--NNNNNNNN--NN--NNN-------N---N------NNN-N---T---A-CTTTGAC-TTAG-ACCTCTGACCAGGG--AA-CATAGAA--TTGCA-TTA-CTTCAG
gi|29 : ----TTCTCCTTC-T---TCAGTAA-GACATGTGTCCACGTGC--TTTGAT-AAA-AGTG-CCTT---TATAGATCAAATTC-AATTT--T--TGTAGGCTGATAGAGAG-ccacat
gi|3 : -TG-ATG--AAAGT-----CT-TAGA-TATTCTAGGA-----T---AT-G--ATAGGCCAATGTATGAAGATG-TGCAAACA---TG--TTTTTGTTTTCAGATCGAAAGGGGT------------T-GG--GGTACATTCTGGGAGGA----TTAAATGGGGGTGGGGTTTAACATAAAACCCTA-T-GGG--GAAAA--AATCC--AAATTCAACAGAT------GTAAATTGA-AAATT-----ATGNNNNNNNNNN-----------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTTGACCAT-TGACCATAAAAA-C-TGGTATA------ACT--CTAGAA-----AGAGAGTTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTTGATC-TTG---------GAAAAG-A-AAAT-AG-GTACTACTTCAGAACCAGGTACGN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTTGA--CTT-T-TGACTTTG-A---------AT-------A--T-A-AA-ACCTGGTATAACTCT---AGAAAGAG-ACT--------TCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCT-TGATCTTGG--AAAAG-A-AAA-TAGGTACTACTTCAGAACCAGGTACGNNNNN-NNNNN--NNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNN--NNNNNNNN--NN--NNN-------N---N------NNN-N---N---N-NNNNNNN-NNNN-NNCTTTGACC-TTG--AA-CATAAAAACTGGTA-TAA-CTTTAGAAaacaaactactttcaaaatgccccccaccccgcccccaattcaaaatgtcaaaaatgtcaacaattaaggttg
gi|3 : tgtTTTGACT-T-TGAATAT-AAAA-CCTGGTATA------ACT--CTAGAA-----AGAGACTTCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTTGATC-TTG---------GAAAAG-A-AAAT-AG-GTACTACTTCAGAACC-A-----G--GTACGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--C-T-T-TGACCTTG-A---------AC-------A--TAA-AA-A-CTGGTATAACT-TTAGAA--AGAG-ACTTGCN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTTGACTTCTGACCTTGG--AAagagacttgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgacttctgaccttggaaaagaa
gi|30 : tgttgatgaaagtcttagatattctaggatatgataggccaatgtatgaagatgtgcaaacatgtttttgttttcagatcgaaaggggttggggtacattctgggaggattaaatgggggtggggtttaacataaaaccctatggggaaaaaatccaaattcaacagatgtaaattgaaaattatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctttgaccattgaccataaaaactggtataactctagaaagagagttgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgatcttggaaaagaaaataggtactacttcagaaccaggtacgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgactGTT-TGGAGACATTGCTTTTG----CTCGGTTC--TTTTCGCTTCTCGTTCATTATC---GTCTGCTTCTTTCTTGTGCCTAAAAATCTC----CA-------T-----------AGCTTGTTG-ATG--AAAGTATTTATT-TAGA-GATTTCAGaagaa
gi|31 : ttttcaaatgaaTTTGTCGTGCTTAAAACTGTCTTGATAAAAAAAGTTTTCT--ATGCAACATG-TGGAAG--AAAGT-----CT-TAGA-TATTATATGA-----T---AT-GATATAGGCTAATGTATGTAGAT--CGCAGAAA---TG--TT----------------------T------------T-GG--G-T---TTC-----AGA----TTGAA-GAGGTTGGGGTattgaaggggttagggtgcatt
gi|32 : -A-AAA-TTGGTATCATTTTAAAACTGGA-ATAAAATTATTGAT--A-A-AGATAATGTGATATAAGAACTGA---GTAGAGGA--T--TAACTAGTG--TCA-------A---GGTCAATTGA-C---T---C-CTGGGAC-ATTT-ACCTTTGACC-TTG--AT-CTTAACAACGAATA-Tattgg
gi|33 : ataGCTT---CTTC--T-TC---TTCCGCCGTTTTCCCATGTCTAAAACTGTCC-GACA-------CTGT---------------TG-ATG--AAAGT-----CT-TAGA-TATTCTAGGta
gi|34 : gtctcccaaacgaagtttggagacttattgagtttgctcagttcttgcaattcttcc------TGA-C---T---C-CTGGGAC-ATTT-ACCTTTGACC-TTG--AT-CTTAACAACGAATA-TTA-CTTT-GAA
gi|34 : GG--TGTGAGCT--T----CA-------AACTG------TTATC---T---C-CAGTGAC-CTTG-ACTTTTGACC-CTG--AT-CCTAAAAGCTTGCA-Ttggtgtgagcttcaaactgttatctccagtgaccttgacttttgaccctgatcctaaaagcttgcat
gi|35 : tgactcctgggacatttacctttgaccttgatcttaacaacgaatattactttgaatCCGCCTCTTTCTTGTGCCTAGAAT-----------------TTCTCTA-T---AACCTGATA-ATGCCAAAGT-----GTGTAGA-TGTGC-AGAAGTTTTT---TT-G--TT-------TGTTTTTAGAT--TGAAG------------------------------GGGGT------------TGGG--G-TACATTTT
gi|37 : GCTT---CTTC--T-TC---TCCCGTCGCTTTCTCATG-CTAAAACTTTCT---CC-------TTA-CT--T---AACCTGTTG-ATT--AAAGT-----CT-TAGA-TATTCTAGGA-----T---AT-G--ATAGtag
gi|4 : CT--T---AACCTGGTG-ATG--GAAGT-----CT-TAGA-TATTCTAGGA-----T---AT-G--ATAGACCAATGTCTGTAGATG-TGCAAACA---TG--TTTTTGTTATCAGATTGAAGGGGGT------------TAGG--G-TACATTCTTGGGGGA----TCAAATGGGGGTGTGGTTTAACATAGAACCCTATT-GGA--AAAAATTAATTCCAAAATTCAACAGATAATATGATAACTTGAT-AAAT-----ATG------ATAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTTTGAAC-T-TGAACATCAAAA-C-TGGTATA------ACT--CTAGAA-----AGAGAGTAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTTGACC-TTG---------GAAAAG-A-AAAT-AG-GTATTACTTCAGAACCAGGTATGN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTTCA--C-CTT-TGACCTTGAG---------C--------A--T-A-AATA-CTGGTATAATT-------CTAG-A-AA----G--AAACATGCTA-GATTCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTTGACCTCTGACCTTGG--AAAAG-A-AAA-TAGGTATTACTTCAGAACCAGGTAT-------GNNNN--NNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNN--NNNNNNNN--NN--NNN-------N---N------NNN-N---N---N-NNNNNNN-NNNN-NNNNNNNNCC-TTG--AA-CATAAAAACTGGTA-TAA-CT
gi|4 : ctcCC-T-TGAACAT-AAAAAC-TGGTATA------ACTAATTA-AC-----AGAGaattaacagag
gi|40 : ctccttaacctggtgatggaagtcttagatattctaggatatgatagaccaatgtctgtagatgtgcaaacatgtttttgttatcagattgaagggggttagggtacattcttgggggatcaaatgggggtgtggtttaacatagaaccctattggaaaaaattaattccaaaattcaacagataatatgataacttgataaatatgatagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncctttgaacttgaacatcaaaactggtataactctagaaagagagtagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgaccttggaaaagaaaataggtattacttcagaaccaggtatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttcacctttgaccttgagcataaatactggtataattctagaaagaaacatgctagattctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgacctctgaccttggaaaagaaaataggtattacttcagaaccaggtatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnATAAATTTAGAAAG-AGAATTG--ATAGAGACTTCAGAAAGGGTAACATGACCT-GTA--AAGGTCCAGTGACTCC
gi|41 : CCTACAACGTAGTATATCCAGTGA--C-C-T-Tagtgacttt
gi|44 : atagagacataaaaattttagatgagattaaaaaaaatgtgaCTTGACCTCTGTGACCT-T-TAGGAT-A-AAAA-TGAGTGTAACTTTAGAAGA-GGAACTT--ATAGAAAtat
gi|45 : TTG--ACAT-T-GAACATTA-AAAG-TG-GTAAAACTTTAGAAAC-AGGGTTA--ATAGAGACATttc
gi|47 : cCTTGACTTCTGACCTTGG--AAAAG-A-AAG-TTGGTATTGCTCCAGAACCAGG-TC-------Tgggacctt
gi|48 : agTTTGACC-T-TGAACAT-ATAATC-TGGTATACATGTAACT--TTAAAA-----AGAGAATTG
gi|49 : TTG--ACCT-T-GATTAT-G-AAATATA-TTATAATTTTAGAACT-GGAACTG--
gi|5 : tggtcGTCTCGAACACATATTGTTTTTGTTCCGTTTC---TTCTTATTT----TTCTTCTTC-TTCTTTAGTAATGA-ACTTGTC-ACCCGA--TTTGAT-GAA-AGTG-CTT----AACAG--------------T--T--TGTGGACTGATAGGGA--TAAT-TAGGA-GTGCACAAAACATTGAAAATGGCCGCCAATTCAAAATGGCCACCAAAA---AAAGGCTAA--------AA-TTAAA---GGTTGTTGGATTTTA-ACCAAATTTT-------TC-TAGGGTAATTTGATGAC-C-CGGAGT-CATT-TCC-GCAT-G---------CAAAA-TA-TTTTTAAGCCCGCC-ATTTTTAT-----ATGGCCGCCACAGC-GGAAAT-CCTT-TT--AAA-TG-CTTAAAA---ATATATTA-TTTGAGTTATGGTGCAAGTCCAACGAGGGTTCACAGTTCATTTCTAGCTAA--GT---TATT-CTT-TCCATATCCAATTTCAAAA-TGTATGCAAGATGGCCATCATTTCAAAA-G-GC-TGTCA-AA---A---T---ATTCCG-----------------TTTGT--CGGATTTCAACCAAATT-T-A-G-TTTATAGAGTGAATTCACCCATTC-C-AAATCTTATT-T------CTTGACATTAAAATATGTTTA-A--ACCCAATTTATGACAAA---GGGGA-GGTGTTGCGGGGACA
gi|50 : attatCT--T---AACCTGGTG-ATG--GAAGT-----CT-TAGAATATTTTAGGA-----T---AT-G--ATAGg
gi|51 : ctcCTTGACCTCTG--ACCA-T-GAA-AT------G-TG-ATATAACTTTGGAACT-GGGACTG--Aa
gi|6 : -ACTTGTCCGCGCGA--TTT-AT-GAA-CGTG-CTTC---AACAGATCTAATCTAAATTCAAT--TGTGGACTGATAGGGGG-TCAT--ACGACGGG---------------GTG----------CAAT--------CAAGTTTCAAA-----ATGGCTGACAATTCAAA---T-TTG-CGGA
gi|6 : GT-TTCAAAATGGCTGACAATTCAAAT-TTGC-GGACA-AA---A---A---A----GGTAAAAAAAAAAATACGTT-GT--CGGATTTCAACC--A-T-T-T-CTTTTCTAGGGTAATTTGA--TGATCTC-GAGTT-CA-T-T------caaaaaaggtaaaaaaaaaaatacgttgtcggatttcaaccatttcttttctagggtaatttgatgatctcgagttcatttccagcaattaaaacaaattgagtcggcattttgaaaatggccgccatatacagaattgtatcaaaatgataagctttctacatcatttgggatctgtgtcatttgagggtatacaattgatatctatcaatagtattactttatatcaaatttcccactgtttcaagatggccgactttacaaaattgctgcaaaaaataaagtttaacggatttcagccttcagtttttaggttgcatttaggattcgaagtctatttttgtactcgatatgtctctgtgtcaccatttaagataggggggggggcgttcgggtacatttttgttggcaccccaacacatttaaaacttgt
gi|6 : acttgtccgcgcgatttatgaacgtgcttcaacagatctaatctaaattcaattgtggactgatagggggtcatacgacggggtgcaatcaaAA---------AAGGT---AAA-----A--------AA-AAAAATACG-TTGTCGGATTTCA-ACCA---TTTC----TTTTCTAGGGTAATTTGATGAT-C-TCGAGTTCATT-TCCAGCA--A---------TTAAAACA-AATTGA-GTCGGC--ATTTTG----AAAATGGCCGCCATATA-CAGAATTG--T-ATCAAAA-TG-AT-AAGCTTTCTACATCA-TTTGGGATCTG-TG----TCATTTGAGGGTATACAATTGATATCTATC--A--ATAG-TATTACTT-T--ATATCAAATTTCCCAC-TGT-TTCAAGATGGCCGACTTTACAAAATT-GC-TGCAA-AAAATA---A---A----G-----------------TT--TAACGGATTTCAGCC----T-TCA-GTTTT-TAGGTTGCATTTA--GGATT-CGAAGTC-TA-T-TTTTGTACTCGA---T---ATGTCTCTGTGTCACC--ATT--TAAGATAGGGGGGGG-GGCGTT-CGGGTACATTTTTGTTGGCACCCCAACACATTTAAAACTT---GTtccagcaattaaaacaaattgagtcggcattttgaaaatggccgccatatacagaattgtatcaaaatgataagctttctacatcatttgggatctgtgtcatttgagggtatacaattgatatctatcaatagtattactttatatcaaatttcccactgtttcaagatggccgactttacaaaattgctgcaaaaaataaagtttaacggatttcagccttcagtttttaggttgcatttaggattcgaagtctatttttgtactcgatatgtctctgtgtcaccatttaagataggggggggggcgttcgggtacatttttgttggcaccccaacacatttaaaacttgt
gi|7 : acttgtccgcgcgatttatgaacgtgcttcaacagatctaatctaaattcaattgtggactgatagggggtcatacgacggggtgcaatcaagtttcaaaatggctgacaattcaaatttgcggacaaCTTGATATTTG--ACCT-T-GAACAT-T-AAAA-TC-ATATAACTGTAGAACA-GGAATTG------------------GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGGATCCCCAATGA--T-T-T-TGACCTTG-AT--------C--------A--T-AGAA-A-GTTGTATAACT-TAAGAACCAG-T-ACT-------------ANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACCGGTATCCAGTATCCTTGACCTTTGACCTTG
gi|8 : -C-T-TGACCTTG-G---------A--------AAAG-A-AA-A-TGGGTACTGCT-TCAGAACCAG-GTAC---------GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACTT--GACCTTG---AACAT-A-AAAACTGGTATAACT---AAA--GAG-AG-------TTGAT--A-A-AAACGTTGGGTCTTCAAAAATGA-TAATAGGAGA--TATCAATT--TG--TCA-------A---G------TGA-C---T---T-CAGTGAC-CTTG-ACCTCTGACC-TTG--attnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaacttaaaattggcatttaagcatggattatttgtaagggaggtatacagtagtatgaggaaaaagcccactttgtacagccagtgctt
gi|8 : TTCAGTGACCTTGACCTCTGACCTTGG--AAAAG-A-AAA-----TATG--TT--GAACCAGG-gaaaagaaaatatgttgaaccaggtacgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtttttggaaggaaacaggattatttttgggaattttcaaaaatctttacgattcagaatttttaaatgtacttgaaatgggcatggcatgaattgtgtgcaagggtggaatacagttgtatta
gi|9 : cttgaccttggaaaagaaaatgggtactgcttcagaaccaggtacgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacttgaccttgaacataaaaactggtataactaaagagagttgataaaaacgttgggtcttcaaaaatgataataggagatatcaatttgtcaagtgacGAACACGTAGTGTTGGGG--ACATTG-TTTTGC----TTTC---TTCTCA-AA----TT--------T-CTTTAGTGAGAA-ATTTGTCCGCACGA--TTTTAT-GAATAAT--CTTC---AACAGATTCAATTCAAAC-T--T--CGTGGGTTGACAGGGGG-TCCTGGGAGA-GGG---------------GTGtacgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtttttggaaggaaacaggattatttttgggaattttcaaaaatctttacgattcagaatttttaaatgtacttgaaatgggcatggcatgaattgtgtgcaagggtggaatacagttgtatta
gi|9 : ttatgtccccAACTTTCGGAATTTT-CAAAGT--------GGC-CGCCGA-TTCAAGATCCATCAT-AAAAAAAACCCGAAAAAA-CTG--A-GCC-GCC-ATTTT----CAAAATGGCCGCCATAAACGAAAAT-G--TATC--AAAGTA-CT-AAAATCTCTACATCA-TTTAGGTTTTG-TG---GTCAGTTGAGGGTACACAATTCATATCTAGCGTA--AG---TATTTCTT-T--ATATCAAATGTTTGAA-TGT-TTAAAGATGGTTGTCATTTCAAAA-TGGC-TGCCACAA---AATGA---A----GT----------------TT-GT--CGAATTTCAACCAAATT-T-A-GTTTT-TAGGTTGAATGCA--GTATCAT-AAGTT-TA-T-T------ctatcaactttcggaattttcaaagtggccgccgattcaagatccatcataaaaaaaacccgaaaaaactgagccgccattttcaaaatggccgccataaacgaaaatgtatcaaagtactaaaatctctacatcatttaggttttgtggtcagttgagggtacacaattcatatctagcgtaagtatttctttatatcaaatgtttgaatgtttaaagatggttgtcatttcaaaatggctgccacaaaatgaagtttgtcgaatttcaaccaaatttagtttttaggttgaatgcagtatcataagtttatt
8 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|18 ): ATTACGTGTATCAGACGGATTATTATGGGTCTGGAAATTTTCAAAATCTTATTACGTTAGAATTTTCGGTTAATGAACCGGGGCATGTGCATGGGACTACTTGCACGGGAGGAATACAGTTTGTATTAAGAAAAAGCTTTTACTTTGTACAACCACGTACTTCGTTTGCGGAGACTTTTATATCGGTCAGATGGAATATTATATCTCTACATCTGGTTTTAACATGCTAAGGAATT
Unaligned ( gi|25 ): ATTAATCATGGTCTTTGTGCTCTAGATGTATTTTAAATGATTTATGAATGGCATGGATTTTGTGAGAGGGAGGAAAATAGTACTCAAAAAAGTCCACTATTATACAAATAGTATTTCGATTGGGAGACTTTATAATTGGTAAATTATAATAATATCTTATATGACTTC
Unaligned ( gi|36 ): GGATTTTGTGCAAGGGGTTATTAATATGGGGAAAATAGCAGCATCAGAAAAGCTCAACTTTTATACAGCAGATTTATTTGGCGAAGACTTTATAACGCAGATTATCATC
Unaligned ( gi|38 ): AAAGGGAGTTGACCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Unaligned ( gi|39 ): TCTCCAAAACAAAGTTTGGAGAGTGACTAATTCATAGTGTTTTTGCTCTGTTCATGTAATTCTTCCACTCCTCCTTGTTCC
Unaligned ( gi|42 ): TAAGTCTCCCAAACGAAGTCTGGGGACTTATTGCGTTTGCTCAGTTATAATTCATCATATTCTTCTTCCGCC
Unaligned ( gi|43 ): TCTTCGTAACGAATTTTGGAGACTTATTGTGTTTGCTCAGTTCTTTTAAATCGTCTGGCTCTTCCTCTTCCG
Unaligned ( gi|46 ): AAAATCAAGGCTTGTGTGATCTAGACTTTTAAATAAAGTTAAAATTGGCACGGA
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 111 1111111 1111 1111111 8888888888888888888888888888888888888888 111 22222222222222 11111 2 2222 11 1 11 333333333333 1 2222 11 2222222222 1 1111 1 2222222 3333333333 11 22 9999999999999999999999999999999999999 1111 1 222 66666666666666666666666666666666666666666666 11 11 111 111 11 111 555555555555555555555555555555555555 111111111 11 111 999999999999999999 33333333333333 11 1111111 2222222 22 11111 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 1 1 111111 11111 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 55555555555555555555555555 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 1111 44444444444444444444444 222222222222222222222222222
lowQualScore : 3 3 3 3 4 777 9999999 8 1 8 888 5 6 3 99 7 6 6 6 2222 1 3 4444444 1 6 5 8 2222222222222222222222222222222222222222 000 77777777777777 5 22222 0 3333 6 00 2 6 6 1 7 7 66 1 5 000000000000 888 1 2 0 0000 2 1 00 7777777777 0 6666 44 0 0 1111111 1 1 1 8888888888 6 8 11 0 1 44 6 6666 1 44 5 5 4444444444444444444444444444444444444 9999 5 88888 2 1 888 000 5 55555555555555555555555555555555555555555555 00 33 8 444 6 1 3 6 3 000 11 8 444 1 3 222222222222222222222222222222222222 3 55 99999 3 3 3 222222222 4 66 0 00 1 000 77 888888888888888888 00000000000000 66 8 00 4444444 3 0 2 4 1 777 66 33 1 0 1111111 33 44444 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 1 5 5 5 0 5 444444 66 0 22222 1 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 3 555 5 2 2 666 66 33 0 55 0 33 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 1 0 1 44 55 3 3 3 22222222222222222222222222 3 3 3 0 2 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 1 55 1 0000 0 4444 33 1 0 1 11111111111111111111111 55 66 0 55 1 4 3 111111111111111111111111111 3 6666666 3 3 3 3 55 4 1 1 1 4 5
lowQualScore : . . . . . ... ....... . . . ... . . . .. . . . . .... . . ....... . . . . ........................................ ... .............. . ..... . .... . .. . . . . . . .. . . ............ ... . . . .... . . .. .......... . .... .. . . ....... . . . .......... . . .. . . .. . .... . .. . . ..................................... .... . ..... . . ... ... . ............................................ .. .. . ... . . . . . ... .. . ... . . .................................... . .. ..... . . . ......... . .. . .. . ... .. .................. .............. .. . .. ....... . . . . . ... .. .. . . ....... .. ..... ......................................................................................... . . . . . . ...... .. . ..... . ........................................................................... . ... . . . ... .. .. . .. . .. ............................................................. . . . .. .. . . . .......................... . . . . . ...................................................................................... . .. . .... . .... .. . . . ....................... .. .. . .. . . . ........................... . ....... . . . . .. . . . . . .
lowQualScore : 7 2 2 2 2 555 0000000 2 0 0 666 6 7 7 22 2 7 7 7 7777 0 2 2222222 0 7 6 0 1111111111111111111111111111111111111111 000 44444444444444 7 55555 0 0000 7 33 2 7 7 7 7 2 55 0 2 777777777777 888 0 5 8 8888 5 0 22 0000000000 0 8888 00 0 2 0000000 2 2 2 8888888888 0 0 00 8 0 77 7 1111 0 33 7 7 7777777777777777777777777777777777777 0000 7 33333 1 3 666 999 7 00000000000000000000000000000000000000000000 66 88 0 000 7 0 2 4 8 000 00 0 000 0 0 333333333333333333333333333333333333 6 00 11111 6 6 6 666666666 4 11 7 00 3 000 99 333333333333333333 00000000000000 11 9 99 2222222 4 2 5 1 9 000 99 55 4 7 7777777 00 33333 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 0 0 0 0 0 0 444444 99 2 55555 0 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 2 444 3 7 7 888 33 77 1 22 2 44 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 0 4 0 33 00 3 3 3 55555555555555555555555555 6 6 6 3 6 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 0 00 7 4444 8 5555 99 0 5 9 22222222222222222222222 44 44 2 00 0 5 5 999999999999999999999999999 3 4444444 3 3 3 6 00 0 2 0 0 4 7
consensus : GAACACGTAGTGTCGGGGACACATTGTTTTTGCTCCGTTTC---TTCTTATTA----TTCTTCTTC-T-CTTTAGTGATGA-ACTTGTCCGCGCGA--TTTTAT-GAA-AGTG-CTTC---AACAGATCCAATTCAAACTT--T--TGTGGGCTGATAGGGAG-TCATGAG-GAGGG---------------GTGGCCGCC----CAA---------CAAGT---AAA-----A--------AA-TCAAA---G-TTGTCGGATTTCACACCAAATTTTC--AATTTT-TAGGGTAATTCGATGAC-C-CCGAGTTCATTGTCCAGCAT-ACAAAAACA-TTT--------TTA-GCCCGCCCATTTTTTTTCAAAATGGCCGCCATANA-GAAAAT-G--T-TT--AAA-TG-CTTAAAATTTCTACATCA-TTTGGGTTCTG-TG---GTCAATTGAGGGTACACAATTCATATCTAGC--A--AT---TATTTCTT-T--ATATCAAATTTCCGAA-TGC-TTCAAGATGGCCGNCATTTCAAAAT-GC-TGCCA-AAA---A---A----G-----------------TT-GT--CGGATTTCAACCAAA-T-T-A-GTTTTNTAGGTTGAATTCA--GGATC-C-AAGTC-CA-T-T------CTCGAC---AT-T---ATNTNTCTG-GT-ACC--ATTTCTGACATAGGGGA-GG---TGTT-CGGGGACATTTNTGTTGGCATCCCAGCACAGTTATAGCTT---GTTC--T-TC---TTCCGCCTCTTTCTCGTGCCTAAAACTGTCC-GACA-------TTNTCT--N---AACCTG-TG-ATG--AAAGT-----CT-TAGA-TATTCTAGGA-----T---AT-G--ATAGGCCAATGTATGTAGATG-TGCAGAAA---TG--TT------------------GGGGT------------T-GG--G-TACATTCTGGGGGGA----TCGAATGGGGGTGGGGTTTAACATAGAACTCTA-T-GGG--GAAAATTAATTCCAAAATTCAACAGAT------GTAACTTGACAAAAT-----ATG------ATAG-----------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTNCTTTGACC-T-TGAACAT-AAAA-C-TGGTATA------ACT--TTAGAA-----AGAGAATTGNTTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCCTTGACCTTTG--ACCT-T-GAACAT-A-AAAN-TG-GTATAACTTTAGAACC-GGAACTG--ATAGAGACNTCAGATNGGGTGATACGANCTAGNATCAAGGTCNAGTGACTCCTTTACCTTTCCTACNAAGTAGTATNTCCCGTGA--C-C-T-TGACCTTG-G---------A--------A--T-A-AA-A-CTGGTATAACT-T---AACCAG-G-ACT---G--AANCNNGNCATGATTCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACCGGTATCCNGTGNCCTTGACCTCTGACCTTGG--AACAT-A-AAA-CTGGTATNACTTTAGAACCGGG-AC-------TGGAT--ACA-AGACATTGGGTCTTCAGAAATGA-TAATAAAGGA--TGTNAACT--TG--TCA-------A---G------TGA-C---T---C-CTGTGAC-CTTG-ACCTTTGACC-TTG--AT-CATAANAACTNGTA-TAA-CTTTAGAAC
Reference ( family-2 ) : GAACACGTAGTGTCGGGGACACATTGTTTTTGCTCCGTTTC---TTCTTATTA----TTCTTCTTC-T-CTTTAGTGATGA-ACTTGTCCGCGCGA--TTTTAT-GAA-AGTG-CTTC---AACAGATCCAATTCAAACTT--T--TGTGGGCTGATAGGGAG-TCATGAG-GAGGG---------------GTGGCCGCC----CAA---------CAAGT---AAA-----A--------AA-TCAAA---G-TTGTCGGATTTCACACCAAATTTTC--AATTTT-TAGGGTAATTCGATGAC-C-CCGAGTTCATTGTCCAGCAT-ACAAAAACA-TTT--------TTA-GCCCGCCCATTTTTTTTCAAAATGGCCGCCATANA-GAAAAT-G--T-TT--AAA-TG-CTTAAAATTTCTACATCA-TTTGGGTTCTG-TG---GTCAATTGAGGGTACACAATTCATATCTAGC--A--AT---TATTTCTT-T--ATATCAAATTTCCGAA-TGC-TTCAAGATGGCCGNCATTTCAAAAT-GC-TGCCA-AAA---A---A----G-----------------TT-GT--CGGATTTCAACCAAA-T-T-A-GTTTTNTAGGTTGAATTCA--GGATC-C-AAGTC-CA-T-T------CTCGAC---AT-T---ATNTNTCTG-GT-ACC--ATTTCTGACATAGGGGA-GG---TGTT-CGGGGACATTTNTGTTGGCATCCCAGCACAGTTATAGCTT---GTTC--T-TC---TTCCGCCTCTTTCTCGTGCCTAAAACTGTCC-GACA-------TTNTCT--N---AACCTG-TG-ATG--AAAGT-----CT-TAGA-TATTCTAGGA-----T---AT-G--ATAGGCCAATGTATGTAGATG-TGCAGAAA---TG--TT------------------GGGGT------------T-GG--G-TACATTCTGGGGGGA----TCGAATGGGGGTGGGGTTTAACATAGAACTCTA-T-GGG--GAAAATTAATTCCAAAATTCAACAGAT------GTAACTTGACAAAAT-----ATG------ATAG-----------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTNCTTTGACC-T-TGAACAT-AAAA-C-TGGTATA------ACT--TTAGAA-----AGAGAATTGNTTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCCTTGACCTTTG--ACCT-T-GAACAT-A-AAAN-TG-GTATAACTTTAGAACC-GGAACTG--ATAGAGACNTCAGATNGGGTGATACGANCTAGNATCAAGGTCNAGTGACTCCTTTACCTTTCCTACNAAGTAGTATNTCCCGTGA--C-C-T-TGACCTTG-G---------A--------A--T-A-AA-A-CTGGTATAACT-T---AACCAG-G-ACT---G--AANCNNGNCATGATTCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACCGGTATCCNGTGNCCTTGACCTCTGACCTTGG--AACAT-A-AAA-CTGGTATNACTTTAGAACCGGG-AC-------TGGAT--ACA-AGACATTGGGTCTTCAGAAATGA-TAATAAAGGA--TGTNAACT--TG--TCA-------A---G------TGA-C---T---C-CTGTGAC-CTTG-ACCTTTGACC-TTG--AT-CATAANAACTNGTA-TAA-CTTTAGAAC
gi|1 : GAACACATTGTGTCAGGGACACATTGTTTTGGCTCCATTTCGTATTATTATTAGTATTTTTTTTTC-T-CTTTGGTGATAA-ATTCACTTGCATGA--TTTTAT-GAA-AGTG-CTTC---AACAGATCCAATTCAAACTT--TAATGTGAGCTG-TAGGGAG-CCATGAA-GAGGG---------------ATGACTGCC----CAA---------CAAGT---AGA-----A--------AA-TCAAG---G-CTGTCACACTTCA-ACCAAATTTT----ATTGC-TGGGG-AATTTGATGACTC-CTGAGTCCATT-TCCAGCAG-GAAAAAAAA-TTG--------T---G-CCATCCA-----TTTCAAAACGGCC-TTATACA-AAAAAT-G--T-TT--AAG-TGTTTTAAAATTTCTACATCATTTTGGGTTCTG-GA---GTCAATTGAGGCTACGCATTTCATGTCTAGC--A--ATCTGTTTTTCTTCT--AT-TCAAATC-------TGC-T--AAAATGGCTGCCATTTCAAAA------ATCA-A-----------------------------------GT--CGGATTTCAACAAAA-T-T-ATTTTTTCTAGGGTTAATTCA--GGATC-C-AAGTC-CA-TAT------CT-GGT---AT-T----TTTATTTG-GT--CC--ATTTCTGACATAAGGGA-GG---TG----GGTGACATTTTTGTTGGCATCTCA--ACAGTTATAGCTT---GTTT--T-TCATATTC-----TTTTTTCAAGCCTAAAAC-AACA-GGCA-------TTCTCTGAA---AACCT--TG-ATG--AAAGT-----AT-TAGA-TATTC-AATA-----T---AT-G--ATATGCCAATGTATCTAGTTGATGCAGAAA---TG--TT------------------AGGGT------------T-GG--A-TACATTTTGAGGGGA----TCAAATGGGGTTGGGGCCGAACGTAGAAC--------------AGATTAATTACAAAATTTAGTAGAT------ATAACTTGACAAAAT-----ATG------NNNN-----------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCTAACC-A-TGAACAT-AAAA-C-TGGTATA------ACT--TTAAAACTACTGCAGGACTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCCTTGACCTCTG--ACCT-T-GAACAT-A-AAAC-TG-GTATAACTTTATAACT-GGAATTG--ATAGAGATATCAAATTGGATGATACAAACTAGTATCAAGGTTGAATGACTCCTTTACCTTTCTTATTAAGTAGTATCTGCAGTGA--C-C-T-TGACCTTG--------------------A--T-A-AA-A-CAGATATTA---T---AACCAA-G-ACT---GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTTGACCTCTTACCTT-G--AACAC-A-ACA-CTGATATAACTTTAGAACTTGG-TC-------TGNNN--NNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNN--NNNNNNNN--NN--NNN-------N---N------NNN-N---N---N-NNNNNNNTCTTG-ACCTTTGACC-TTG--AT-CATGAAAACTTGTA-TAA-CTTTAGAAC
gi|10 : CT-T-GACCAT-A-AAAAGTT-GTATAACTTTAAAACC-AGAACTG--A
gi|11 : ATAAAGAA--TGT-AACC--TA--CAA-------A---G------TAG-TGTAT---C-CTATGAC-CTTG-ACCTTTAACC-TTG--GT-TATAATAACTAATA-TAT-CTATAannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttaaaaaaggaaacaaattaccaaggtatttcgtttgtgaaaattttcaaaatcaaggtctttgtgaactagacttttaaacaaaattggcacggattttgtgcaagggagtgattactgcagggaaaaatagttgtgcattatgtattcagaaaaaaacaacacttttatttatatacaaccagtgcttcgtctgagaaacttaattagcagattataatcataattgtcttgttttttttctacactcttttcaattttattgtcagtt
gi|12 : CCTTGACCTCTG--ACCTCT-GAACAT-G-AAAT-TG-GTATATTTTCAAAACC-AGACCTG--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACT-TGA--C-C-CCTGACCCTA-G---------A--------ACAT-A-AT-A-TTGGTATTATA-T---AA-------------G--AACCGGGTCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTTCACATTTAACCATC---AACAT-A-AAA-CTCGTATAACTTTAGAACTGGA-AT-------TG-----ACAGAGACATGGGATCTTCAG-AATAA-TAtgatataatatataataatatatctaatatatctctataactatagaaatgggattatctgaaatgatgaaaggagcttgagacctacatgtactaactaatatttgtatgagaccagatttaatgatggagtcggaattttctggacaatttgcaaaatctgcaatttagcatttttaaattaacttaaaatctggcattggaggaatacagtagtattgagaaaaagcctactttttacagccagtatttcgtttgggaggttttgtaatcagcagattataatcatatattacat
gi|13 : CCTTG---AACATGA-AAA-CTGTAATAAATTTAGAAAAGAG-AAA------TGGATGGACG-A-ACATTGGGTCTTCA-AAAGGATTAATCAGAAACCTGTAACCT--TGTATCAAGGATTCA---G------TGA-C---T---C-CAGTGA--CTTG-ACTTtgacgtcacaaattcggggagtcgggaacgat
gi|14 : CTTTG--ACTTCT-GATCCT-A-AAAC-TC-GCATGACTTTAGAACT-GGAATTG--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGC-C-T-TGACCTC------------------------T-T-AA-G-TTG-TATAACC-T------TAG-A-ACT---G--AA-------ATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTTGACCTCTTACCTTAG--ATCAT-A-AAA-CTCGCATAACCTTAGAAggaagaaaattggtttacggatccataaccattatgtcttgtagagacatgggctcatcaaaaattgataagggcttttctggactaactaactaggaatccccacttttgacctatgaatcatagaaagttgtaataccatttaagaaacagatgtgatatgaagaatggacctacgacgtagtatatcctgt
gi|15 : -------TTCTGT--A---ACCCTT-TG-AGG--AAAGT-----AT-TAAG-TATCCATGGA-----TTTTATAG--ATAGGCCAA-GTATCTTGTTG-TGCAGAAAGGTTGAATT------------------GGGGTGTACATTTGTATT-GAATG-TACATT-TGGAGGGA----TCAAATGGGAGTGGGGTTTAACATAAAGCTCGT-T-GGG--AAAAATAAATTCCAAAATTCAACatt
gi|16 : tgaagtttggagacttattgtatttttttgcttggtgcttattcttctttttgtgtgtgtgtgtgctggt--T-TT---TTCCGCCTCTTTCTTGTGCCTGAAACTGCCC-GACA-------TTATTC--C-----CC----G-ATG--AAAGT-----CT-TAGA-TATTCTAGGA-----G---AT-G--ATAGGCCAATGTATGTAGAGG-TACAGAAA---TG--TTTTTGTTTTCAGATTGAAGGGGGT------------TAGG--G-TACATTCGGGGGGGG----------GGGGGT---GTTTAACATAAAACTCTA-T-GGG--GAAAATTATTT---AAAT-------------------CTTGAT-AAAT-----ATG------ATAG-----------gaaaagcataatagtttccttaatagatgtg
gi|17 : aacgaagtttggagtcttattgtatttgctcgattcttattcttaccgt------------------GGGGT------------A-CG--G-TACATT--GGGGTGA----T-GAAAGGGGAAG----TTAACATAGAAAACTA-TTGAG--GGAA--TAATTCTAAAATTCAACA----------TAACTTCACAATATGNNNNNNN------NNNN-----------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTACTTTGACT-TCTGATCCT-AAAA-C-TCGCATG------ACT--TTAGAA-----tgtcatag
gi|19 : ttttgtattcagattgcaaggggggaggggggTCTGGC--ATAAT---TATTTCTT-T--ATATCTAATTTCCGAATTGC-ATCAAGATGGTTGTCATTTCAAAATGGC-TGCCA-AAA---ATGCA----GT----------------TT-GT--TAGACT----------T-T-A-G-TTTGTAGTTTAAATTTA--GGATC-CAAAGTC-CA-T---------CCGAC---A--T---A-------G-G-------------GAAAT-----A-GA---TGTT-CGAGGTCATTTGTGTTGACATTCCAACA-GGATATAACTT---GTTctgg
gi|2 : GCTTAACATAGAACTCGA-T-GGGTAAAAAATTAATTCCAAAATTCAACAGAT------GTGACTTAAT-AAAT-----ATG------AGAG----------------------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCC-T-TGAACTTAAAAA-C-TGGCATA------ACT--TTAGAA-----AGAGAATTGATTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTTGACCTTTG--ACCT-TGGAAAAG-A-AAAT-TT-ATATTACTTCAGAACC-AGGTTTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCGTGA--C-C-T-TGACCTTT-G---------ACCTTGAACA--TAA-AA-A-CTGGTATCATT-TAG-AAAGAG-A-ATT---GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTTGACCTCTGACCTTGG--AAAAG-A-CAA-TCGGTATTACTTCAGAAACAAG-TC-------TCNNN--NNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNN--NNNNNNNN--NN--NNN-------N---N------NNN-C---C---CACTTTGAT-CTTGAACATTTAAAG-TTGTAATACTTAAGAACCAATACTAATCTTTAGAatcatactagtattttacaaaataaatttcact
gi|2 : CTTTG--ATCT-T-GAACAT-TTAAAG-TT-GTAATACTTAAGAACC-AATACTA--AT-----CTTTAGAT---GTGATA-GA---AGAAT---------GTGA-------AC------TACAAAATAGTATATCCTGTGA--C-C-T-TGACCTTT-GACCTTGATTA--------A--T-A-TA-A-CTTGTATAATT-T------TAG-G-ACT---G--tgtgatagaagaatgtgaactacaaaatagtatatcctgtgaccttgacctttgaccttgattaatataacttgtataattttaggactgggactgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatttactgaagtgaacagactgaggattttttctgaaatttttcaaaatcttggcaatttagatttttcaatgaac
gi|2 : gcttaacatagaactcgatgggtaaaaaattaattccaaaattcaacagatgtgacttaataaatatgagagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgaacttaaaaactggcataactttagaaagagaattgattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgacctttgaccttggaaaagaaaatttatattacttcagaaccaggtttgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccgtgaccttgacctttgaccttgaacataaaaactggtatcatttagaaagagaattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgacctctgaccttggaaaagacaatcggtattacttcagaaacaagtctcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncccaTATCCTGTGACCTTGACCTTTGACCTTGATTAATAT----AA-CTTGTATAATTTTAGGACTGGG-AC-------TGggactgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatttactgaagtgaacagactgaggattttttctgaaatttttcaaaatcttggcaatttagatttttcaatgaac
gi|20 : gcttaacatagaactcgatgggtaaaaaattaattccaaaattcaacagatgtgacttaataaatatgagagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgaacttaaaaactggcataactttagaaagagaattgattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgacctttgaccttggaaaagaaaatttatattacttcagaaccaggtttgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccgtgaccttgacctttgaccttgaacataaaaactggtatcatttagaaagagaattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgacctctgaccttggaaaagacaatcggtattacttcagaaacaagtctcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncccactttgatcttgaacatttaaagttgtaatacttaagaaccaatactaatctttagatgtgatagaagaatgtgaactacaaaatagtaAACACCTAATGTCGGGGACATAGTGTTTTTGCTCCATTTC---TTCTTATCA----TTATTCATCTT-CGTTTGTGCTGA-ACTTGTCTGCGCGATTTTTTATGGAA-AGTGCCTTCCCAGAAAAATCCAATTCAAAC-T--T--TGTGGG-TGATAAGGCGATC-TGAG-GAGNN---------------NNNNNNNNN----NNN---------NNNNN---NNN-----N--------NN-TCAtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatttactgaagtgaacagactgaggattttttctgaaatttttcaaaatcttggcaatttagatttttcaatgaac
gi|21 : aatatacaattactatatattatgtccaccAATCTCTGAA-TGC-TT-GAGATGTTCGCCAATTTAAAAT-GCCTGCCA-AAA---A---------------------------------TAGATTTCAACCAAA-TGT-A-GTTTTA-AGGTTGAATTCG--TGATC-CCAAGTC-TACT-T------CTGGACTCGATAT---ATTTCTCTG-TC-ACA--GTTTCTGACAT--GGGACGG---TGTT-CGGAAACTTTTGTGTTGGCATCCCAGCACAGTTATAGCTT---GT
gi|22 : cAAGAA--TGTGA-CT--TA--CAA-------A---G------TAG-T---TTATC-CTGTGAC-CTTT-ACCTTTGACC-TTG--AT-TATAATAACTAG
gi|23 : cCCCGTAA--C-T-T-T-----TG-A---------AC-------A--T-A-AG-A-TCAGTATA--T-G---AACCAG-N-NNN---N--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNT--CCTTGATATTTGACCTT-G--AACAT-T-AAA-ATCATATAACTGTAGAACAGGA-AT-------TGgactannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtttactgaaggaaacaagaggatttttttttctggaaactttcaaaatctt
gi|23 : tgaTCCTTGATATTTG--ACCT-T-GAACAT-T-AAAA-TC-ATATAACTGTAGAACA-GGAATTG--
gi|24 : tgacccgtaacttttgaacataagatcagtatatgaaccagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnT------------------GGAGT------------T-GG--GGTACATTTGGGGGGGGGGGGTCAAATGAGGAAGGAGTTTAACATAGAACTCCA-G-GGG--GATAAT---TTCCAAAATTAAACAGAT------TTAACTTGAC-AAAT-----ATG------ATAG-----------
gi|26 : ttcagattgaa---AAA-----A--------AA-TCAAA---G-TTGTCGGATTCCACACCAAATTTTC--AATTTT-TA--TTAATTCGATGAC-C-CCAAGTTCATTGCTTCGCATCACAAAAACATTTT--------TTA-GCCCGCCCATTTTTTTTCAAAATGGattcctggggtcttcggaaatgaaaatacaaggcccacgaactacctagt
gi|27 : tgaaaatgcaaatattacccgaaggcaacttaaactatgtaaaaa---AAA-----A--------AA-TCAAA---G-TTGTCGGATTCCACACCAAATTTTC--AATTTT-TA--TTAATTCGATGAC-C-CCAAGTTCATTGCTTCGCATCACAAAAACATTTT--------TTA-GCCCGCCCATTTTTTTTCAAAATGG
gi|28 : tgaaaatgcaaatattacccgaaggcaacttaaactatgtaaaaaCTTGACTTCTGACCTTT---AACAT-GTAAA-CTGGTATCATTTTAAAAGTGGG-AT-------TA-----ATA-ACANNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNN--NNNNNNNN--NN--NNN-------N---N------NNN-N---T---A-CTTTGAC-TTAG-ACCTCTGACCAGGG--AA-CATAGAA--TTGCA-TTA-CTTCAG
gi|29 : ----TTCTCCTTC-T---TCAGTAA-GACATGTGTCCACGTGC--TTTGAT-AAA-AGTG-CCTT---TATAGATCAAATTC-AATTT--T--TGTAGGCTGATAGAGAG-ccacat
gi|3 : -TG-ATG--AAAGT-----CT-TAGA-TATTCTAGGA-----T---AT-G--ATAGGCCAATGTATGAAGATG-TGCAAACA---TG--TTTTTGTTTTCAGATCGAAAGGGGT------------T-GG--GGTACATTCTGGGAGGA----TTAAATGGGGGTGGGGTTTAACATAAAACCCTA-T-GGG--GAAAA--AATCC--AAATTCAACAGAT------GTAAATTGA-AAATT-----ATGNNNNNNNNNN-----------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTTGACCAT-TGACCATAAAAA-C-TGGTATA------ACT--CTAGAA-----AGAGAGTTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTTGATC-TTG---------GAAAAG-A-AAAT-AG-GTACTACTTCAGAACCAGGTACGN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTTGA--CTT-T-TGACTTTG-A---------AT-------A--T-A-AA-ACCTGGTATAACTCT---AGAAAGAG-ACT--------TCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCT-TGATCTTGG--AAAAG-A-AAA-TAGGTACTACTTCAGAACCAGGTACGNNNNN-NNNNN--NNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNN--NNNNNNNN--NN--NNN-------N---N------NNN-N---N---N-NNNNNNN-NNNN-NNCTTTGACC-TTG--AA-CATAAAAACTGGTA-TAA-CTTTAGAAaacaaactactttcaaaatgccccccaccccgcccccaattcaaaatgtcaaaaatgtcaacaattaaggttg
gi|3 : tgtTTTGACT-T-TGAATAT-AAAA-CCTGGTATA------ACT--CTAGAA-----AGAGACTTCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTTGATC-TTG---------GAAAAG-A-AAAT-AG-GTACTACTTCAGAACC-A-----G--GTACGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--C-T-T-TGACCTTG-A---------AC-------A--TAA-AA-A-CTGGTATAACT-TTAGAA--AGAG-ACTTGCN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTTGACTTCTGACCTTGG--AAagagacttgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgacttctgaccttggaaaagaa
gi|30 : tgttgatgaaagtcttagatattctaggatatgataggccaatgtatgaagatgtgcaaacatgtttttgttttcagatcgaaaggggttggggtacattctgggaggattaaatgggggtggggtttaacataaaaccctatggggaaaaaatccaaattcaacagatgtaaattgaaaattatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctttgaccattgaccataaaaactggtataactctagaaagagagttgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgatcttggaaaagaaaataggtactacttcagaaccaggtacgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgactGTT-TGGAGACATTGCTTTTG----CTCGGTTC--TTTTCGCTTCTCGTTCATTATC---GTCTGCTTCTTTCTTGTGCCTAAAAATCTC----CA-------T-----------AGCTTGTTG-ATG--AAAGTATTTATT-TAGA-GATTTCAGaagaa
gi|31 : ttttcaaatgaaTTTGTCGTGCTTAAAACTGTCTTGATAAAAAAAGTTTTCT--ATGCAACATG-TGGAAG--AAAGT-----CT-TAGA-TATTATATGA-----T---AT-GATATAGGCTAATGTATGTAGAT--CGCAGAAA---TG--TT----------------------T------------T-GG--G-T---TTC-----AGA----TTGAA-GAGGTTGGGGTattgaaggggttagggtgcatt
gi|32 : -A-AAA-TTGGTATCATTTTAAAACTGGA-ATAAAATTATTGAT--A-A-AGATAATGTGATATAAGAACTGA---GTAGAGGA--T--TAACTAGTG--TCA-------A---GGTCAATTGA-C---T---C-CTGGGAC-ATTT-ACCTTTGACC-TTG--AT-CTTAACAACGAATA-Tattgg
gi|33 : ataGCTT---CTTC--T-TC---TTCCGCCGTTTTCCCATGTCTAAAACTGTCC-GACA-------CTGT---------------TG-ATG--AAAGT-----CT-TAGA-TATTCTAGGta
gi|34 : gtctcccaaacgaagtttggagacttattgagtttgctcagttcttgcaattcttcc------TGA-C---T---C-CTGGGAC-ATTT-ACCTTTGACC-TTG--AT-CTTAACAACGAATA-TTA-CTTT-GAA
gi|34 : TGAATGG--TGTGAGCT--T----CA-------AACTG------TTATC---T---C-CAGTGAC-CTTG-ACTTTTGACC-CTG--AT-CCTAAAAGCTTGCA-Ttggtgtgagcttcaaactgttatctccagtgaccttgacttttgaccctgatcctaaaagcttgcat
gi|35 : tgactcctgggacatttacctttgaccttgatcttaacaacgaatattacttCCGCCTCTTTCTTGTGCCTAGAAT-----------------TTCTCTA-T---AACCTGATA-ATGCCAAAGT-----GTGTAGA-TGTGC-AGAAGTTTTT---TT-G--TT-------TGTTTTTAGAT--TGAAG------------------------------GGGGT------------TGGG--G-TACATTTT
gi|37 : GCTT---CTTC--T-TC---TCCCGTCGCTTTCTCATG-CTAAAACTTTCT---CC-------TTA-CT--T---AACCTGTTG-ATT--AAAGT-----CT-TAGA-TATTCTAGGA-----T---AT-G--ATAGtag
gi|4 : CT--T---AACCTGGTG-ATG--GAAGT-----CT-TAGA-TATTCTAGGA-----T---AT-G--ATAGACCAATGTCTGTAGATG-TGCAAACA---TG--TTTTTGTTATCAGATTGAAGGGGGT------------TAGG--G-TACATTCTTGGGGGA----TCAAATGGGGGTGTGGTTTAACATAGAACCCTATT-GGA--AAAAATTAATTCCAAAATTCAACAGATAATATGATAACTTGAT-AAAT-----ATG------ATAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTTTGAAC-T-TGAACATCAAAA-C-TGGTATA------ACT--CTAGAA-----AGAGAGTAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTTGACC-TTG---------GAAAAG-A-AAAT-AG-GTATTACTTCAGAACCAGGTATGN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTTCA--C-CTT-TGACCTTGAG---------C--------A--T-A-AATA-CTGGTATAATT-------CTAG-A-AA----G--AAACATGCTA-GATTCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTTGACCTCTGACCTTGG--AAAAG-A-AAA-TAGGTATTACTTCAGAACCAGGTAT-------GNNNN--NNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNN--NNNNNNNN--NN--NNN-------N---N------NNN-N---N---N-NNNNNNN-NNNN-NNNNNNNNCC-TTG--AA-CATAAAAACTGGTA-TAA-CT
gi|4 : ctcCC-T-TGAACAT-AAAAAC-TGGTATA------ACTAATTA-AC-----AGAGaattaacagag
gi|40 : ctccttaacctggtgatggaagtcttagatattctaggatatgatagaccaatgtctgtagatgtgcaaacatgtttttgttatcagattgaagggggttagggtacattcttgggggatcaaatgggggtgtggtttaacatagaaccctattggaaaaaattaattccaaaattcaacagataatatgataacttgataaatatgatagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncctttgaacttgaacatcaaaactggtataactctagaaagagagtagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgaccttggaaaagaaaataggtattacttcagaaccaggtatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttcacctttgaccttgagcataaatactggtataattctagaaagaaacatgctagattctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgacctctgaccttggaaaagaaaataggtattacttcagaaccaggtatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnATAAATTTAGAAAG-AGAATTG--ATAGAGACTTCAGAAAGGGTAACATGACCT-GTA--AAGGTCCAGTGACTCC
gi|41 : CCTACAACGTAGTATATCCAGTGA--C-C-T-Tagtgacttt
gi|44 : atagagacataaaaattttagatgagattaaaaaaaatgtgaCTTGACCTCTGTGACCT-T-TAGGAT-A-AAAA-TGAGTGTAACTTTAGAAGA-GGAACTT--ATAGAAAtat
gi|45 : TTG--ACAT-T-GAACATTA-AAAG-TG-GTAAAACTTTAGAAAC-AGGGTTA--ATAGAGACATttc
gi|47 : cCTTGACTTCTGACCTTGG--AAAAG-A-AAG-TTGGTATTGCTCCAGAACCAGG-TC-------Tgggacctt
gi|48 : agTTTGACC-T-TGAACAT-ATAATC-TGGTATACATGTAACT--TTAAAA-----AGAGAATTG
gi|49 : TTG--ACCT-T-GATTAT-G-AAATATA-TTATAATTTTAGAACT-GGAACTG--
gi|5 : tggtcGTCTCGAACACATATTGTTTTTGTTCCGTTTC---TTCTTATTT----TTCTTCTTC-TTCTTTAGTAATGA-ACTTGTC-ACCCGA--TTTGAT-GAA-AGTG-CTT----AACAG--------------T--T--TGTGGACTGATAGGGA--TAATTAG-GAGTGCACAAAACATTGAAAATGGCCGCCAATTCAAAATGGCCACCAAAA---AAAGGCTAA--------AA-TTAAA---GGTTGTTGGATTTTA-ACCAAATTTT-------TC-TAGGGTAATTTGATGAC-C-CGGAGT-CATT-TCC-GCAT-GCAAAA-TA-TTT--------TTAAGCCCGCC-ATTTTTAT-----ATGGCCGCCACAGC-GGAAAT-CCTT-TT--AAA-TG-CTTAAAA---ATATATTA-TTTGAGTTATGGTGCAAGTCCAACGAGGGTTCACAGTTCATTTCTAGCTAA--GT---TATT-CTT-TCCATATCCAATTTCAAAA-TGTATGCAAGATGGCCATCATTTCAAAAG-GC-TGTCA-AAA---T---ATTCCG-----------------TTTGT--CGGATTTCAACCAAATT-T-A-G-TTTATAGAGTGAATTCACCCATTC-C-AAATCTTATT-T------CTTGAC---AT-TAAAATATGTTTA-A--ACCCAATTTATGACAAAGGGGA-GG---TGTTGCGGGGACA
gi|50 : attatCT--T---AACCTGGTG-ATG--GAAGT-----CT-TAGAATATTTTAGGA-----T---AT-G--ATAGg
gi|51 : ctcCTTGACCTCTG--ACCA-T-GAA-AT------G-TG-ATATAACTTTGGAACT-GGGACTG--Aa
gi|6 : -ACTTGTCCGCGCGA--TTT-AT-GAA-CGTG-CTTC---AACAGATCTAATCTAAATTCAAT--TGTGGACTGATAGGGGG-TCATACG-ACGGG---------------GTG----------CAAT--------CAAGTTTCAAA-----ATGGCTGACAATTCAAA---T-TTG-CGGA
gi|6 : GT-TTCAAAATGGCTGACAATTCAAATTTGC-GGACA-AAA---A---A----GGTAAAAAAAAAAATACGTT-GT--CGGATTTCAACC--A-T-T-T-CTTTTCTAGGGTAATTTGA--TGATCTC-GAGTT-CA-T-T------TCCAGCA--AT-T---Acaaaaaaggtaaaaaaaaaaatacgttgtcggatttcaaccatttcttttctagggtaatttgatgatctcgagttcatttccagcaattaaaacaaattgagtcggcattttgaaaatggccgccatatacagaattgtatcaaaatgataagctttctacatcatttgggatctgtgtcatttgagggtatacaattgatatctatcaatagtattactttatatcaaatttcccactgtttcaagatggccgactttacaaaattgctgcaaaaaataaagtttaacggatttcagccttcagtttttaggttgcatttaggattcgaagtctatttttgtactcgatatgtctctgtgtcaccatttaagataggggggggggcgttcgggtacatttttgttggcaccccaacacatttaaaacttgt
gi|6 : acttgtccgcgcgatttatgaacgtgcttcaacagatctaatctaaattcaattgtggactgatagggggtcatacgacggggtgcaatcaaAA---------AAGGT---AAA-----A--------AA-AAAAATACG-TTGTCGGATTTCA-ACCA---TTTC----TTTTCTAGGGTAATTTGATGAT-C-TCGAGTTCATT-TCCAGCA--ATTAAAACA-AAT--------TGA-GTCGGC--ATTTTG----AAAATGGCCGCCATATA-CAGAATTG--T-ATCAAAA-TG-AT-AAGCTTTCTACATCA-TTTGGGATCTG-TG----TCATTTGAGGGTATACAATTGATATCTATC--A--ATAG-TATTACTT-T--ATATCAAATTTCCCAC-TGT-TTCAAGATGGCCGACTTTACAAAATTGC-TGCAA-AAA---ATAAA----G-----------------TT--TAACGGATTTCAGCC----T-TCA-GTTTT-TAGGTTGCATTTA--GGATT-CGAAGTC-TA-T-TTTTGTACTCGA-------T---ATGTCTCTGTGTCACC--ATTT--AAGATAGGGGG-GGGGGCGTT-CGGGTACATTTTTGTTGGCACCCCAACACATTTAAAACTT---GTaaacaaattgagtcggcattttgaaaatggccgccatatacagaattgtatcaaaatgataagctttctacatcatttgggatctgtgtcatttgagggtatacaattgatatctatcaatagtattactttatatcaaatttcccactgtttcaagatggccgactttacaaaattgctgcaaaaaataaagtttaacggatttcagccttcagtttttaggttgcatttaggattcgaagtctatttttgtactcgatatgtctctgtgtcaccatttaagataggggggggggcgttcgggtacatttttgttggcaccccaacacatttaaaacttgt
gi|7 : acttgtccgcgcgatttatgaacgtgcttcaacagatctaatctaaattcaattgtggactgatagggggtcatacgacggggtgcaatcaagtttcaaaatggctgacaattcaaatttgcggacaaCTTGATATTTG--ACCT-T-GAACAT-T-AAAA-TC-ATATAACTGTAGAACA-GGAATTG------------------GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGGATCCCCAATGA--T-T-T-TGACCTTG-AT--------C--------A--T-AGAA-A-GTTGTATAACT-TAAGAACCAG-T-ACT-------------ANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACCGGTATCCAGTATCCTTGACCTTTGACCTTG
gi|8 : -C-T-TGACCTTG-G---------A--------AAAG-A-AA-A-TGGGTACTGCT-TCAGAACCAG-GTAC---------GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACTT--GACCTTG---AACAT-A-AAAACTGGTATAACT---AAA--GAG-AG-------TTGAT--A-A-AAACGTTGGGTCTTCAAAAATGA-TAATAGGAGA--TATCAATT--TG--TCA-------A---G------TGA-C---T---T-CAGTGAC-CTTG-ACCTCTGACC-TTG--attnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaacttaaaattggcatttaagcatggattatttgtaagggaggtatacagtagtatgaggaaaaagcccactttgtacagccagtgctt
gi|8 : TTCAGTGACCTTGACCTCTGACCTTGG--AAAAG-A-AAA-----TATG--TT--GAACCAGG-gaaaagaaaatatgttgaaccaggtacgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtttttggaaggaaacaggattatttttgggaattttcaaaaatctttacgattcagaatttttaaatgtacttgaaatgggcatggcatgaattgtgtgcaagggtggaatacagttgtatta
gi|9 : cttgaccttggaaaagaaaatgggtactgcttcagaaccaggtacgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacttgaccttgaacataaaaactggtataactaaagagagttgataaaaacgttgggtcttcaaaaatgataataggagatatcaatttgtcaagtgacGAACACGTAGTGTTGGGG--ACATTG-TTTTGC----TTTC---TTCTCA-AA----TT--------T-CTTTAGTGAGAA-ATTTGTCCGCACGA--TTTTAT-GAATAAT--CTTC---AACAGATTCAATTCAAAC-T--T--CGTGGGTTGACAGGGGG-TCCTGGGAGAGGG---------------GTGtacgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtttttggaaggaaacaggattatttttgggaattttcaaaaatctttacgattcagaatttttaaatgtacttgaaatgggcatggcatgaattgtgtgcaagggtggaatacagttgtatta
gi|9 : ttatgtccccAACTTTCGGAATTTT-CAAAGT--------GGC-CGCCGA-TTCAAGATCCATCAT-AAAAAAA-A-CCCGAAAAAACTGA-GCC-GCC-ATTTT----CAAAATGGCCGCCATAAACGAAAAT-G--TATC--AAAGTA-CT-AAAATCTCTACATCA-TTTAGGTTTTG-TG---GTCAGTTGAGGGTACACAATTCATATCTAGCGTA--AG---TATTTCTT-T--ATATCAAATGTTTGAA-TGT-TTAAAGATGGTTGTCATTTCAAAATGGC-TGCCACAAAATGA---A----GT----------------TT-GT--CGAATTTCAACCAAATT-T-A-GTTTT-TAGGTTGAATGCA--GTATCAT-AAGTT-TA-T-T------ctatcaactttcggaattttcaaagtggccgccgattcaagatccatcataaaaaaaacccgaaaaaactgagccgccattttcaaaatggccgccataaacgaaaatgtatcaaagtactaaaatctctacatcatttaggttttgtggtcagttgagggtacacaattcatatctagcgtaagtatttctttatatcaaatgtttgaatgtttaaagatggttgtcatttcaaaatggctgccacaaaatgaagtttgtcgaatttcaaccaaatttagtttttaggttgaatgcagtatcataagtttatt
8 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|18 ): ATTACGTGTATCAGACGGATTATTATGGGTCTGGAAATTTTCAAAATCTTATTACGTTAGAATTTTCGGTTAATGAACCGGGGCATGTGCATGGGACTACTTGCACGGGAGGAATACAGTTTGTATTAAGAAAAAGCTTTTACTTTGTACAACCACGTACTTCGTTTGCGGAGACTTTTATATCGGTCAGATGGAATATTATATCTCTACATCTGGTTTTAACATGCTAAGGAATT
Unaligned ( gi|25 ): ATTAATCATGGTCTTTGTGCTCTAGATGTATTTTAAATGATTTATGAATGGCATGGATTTTGTGAGAGGGAGGAAAATAGTACTCAAAAAAGTCCACTATTATACAAATAGTATTTCGATTGGGAGACTTTATAATTGGTAAATTATAATAATATCTTATATGACTTC
Unaligned ( gi|36 ): GGATTTTGTGCAAGGGGTTATTAATATGGGGAAAATAGCAGCATCAGAAAAGCTCAACTTTTATACAGCAGATTTATTTGGCGAAGACTTTATAACGCAGATTATCATC
Unaligned ( gi|38 ): AAAGGGAGTTGACCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Unaligned ( gi|39 ): TCTCCAAAACAAAGTTTGGAGAGTGACTAATTCATAGTGTTTTTGCTCTGTTCATGTAATTCTTCCACTCCTCCTTGTTCC
Unaligned ( gi|42 ): TAAGTCTCCCAAACGAAGTCTGGGGACTTATTGCGTTTGCTCAGTTATAATTCATCATATTCTTCTTCCGCC
Unaligned ( gi|43 ): TCTTCGTAACGAATTTTGGAGACTTATTGTGTTTGCTCAGTTCTTTTAAATCGTCTGGCTCTTCCTCTTCCG
Unaligned ( gi|46 ): AAAATCAAGGCTTGTGTGATCTAGACTTTTAAATAAAGTTAAAATTGGCACGGA
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 111 1111111 1111 1111111 8888888888888888888888888888888888888888 111 22222222222222 11111 2 2222 11 1 11 333333333333 1 2222 11 2222222222 1 1111 1 2222222 3333333333 11 22 9999999999999999999999999999999999999 1111 1 222 66666666666666666666666666666666666666666666 11 11 111 111 11 111 555555555555555555555555555555555555 111111111 11 111 999999999999999999 33333333333333 11 1111111 2222222 22 11111 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 1 1 111111 11111 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 55555555555555555555555555 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 1111 44444444444444444444444 222222222222222222222222222
lowQualScore : 3 3 3 3 4 777 9999999 8 1 8 888 5 6 3 99 7 6 6 6 2222 1 3 4444444 1 6 5 8 2222222222222222222222222222222222222222 000 77777777777777 5 22222 0 3333 6 00 2 6 6 1 7 7 66 1 5 000000000000 888 1 2 0 0000 2 1 00 7777777777 0 6666 44 0 0 1111111 1 1 1 8888888888 6 8 11 0 1 44 6 6666 1 44 5 5 4444444444444444444444444444444444444 9999 5 88888 2 1 888 000 5 55555555555555555555555555555555555555555555 00 33 8 444 6 1 3 6 3 000 11 8 444 1 3 222222222222222222222222222222222222 3 55 99999 3 3 3 222222222 4 66 0 00 1 000 77 888888888888888888 00000000000000 66 8 00 4444444 3 0 2 4 1 777 66 33 1 0 1111111 33 44444 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 1 5 5 5 0 5 444444 66 0 22222 1 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 3 555 5 2 2 666 66 33 0 55 0 33 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 1 0 1 44 55 3 3 3 22222222222222222222222222 3 3 3 0 2 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 1 55 1 0000 0 4444 33 1 0 1 11111111111111111111111 55 66 0 55 1 4 3 111111111111111111111111111 3 6666666 3 3 3 3 55 4 1 1 1 4 5
lowQualScore : . . . . . ... ....... . . . ... . . . .. . . . . .... . . ....... . . . . ........................................ ... .............. . ..... . .... . .. . . . . . . .. . . ............ ... . . . .... . . .. .......... . .... .. . . ....... . . . .......... . . .. . . .. . .... . .. . . ..................................... .... . ..... . . ... ... . ............................................ .. .. . ... . . . . . ... .. . ... . . .................................... . .. ..... . . . ......... . .. . .. . ... .. .................. .............. .. . .. ....... . . . . . ... .. .. . . ....... .. ..... ......................................................................................... . . . . . . ...... .. . ..... . ........................................................................... . ... . . . ... .. .. . .. . .. ............................................................. . . . .. .. . . . .......................... . . . . . ...................................................................................... . .. . .... . .... .. . . . ....................... .. .. . .. . . . ........................... . ....... . . . . .. . . . . . .
lowQualScore : 7 2 2 2 2 555 0000000 2 0 0 666 6 7 7 22 2 7 7 7 7777 0 2 2222222 0 7 6 0 1111111111111111111111111111111111111111 000 44444444444444 7 55555 0 0000 7 33 2 7 7 7 7 2 55 0 2 777777777777 888 0 5 8 8888 5 0 22 0000000000 0 8888 00 0 2 0000000 2 2 2 8888888888 0 0 00 8 0 77 7 1111 0 33 7 7 7777777777777777777777777777777777777 0000 7 33333 1 3 666 999 7 00000000000000000000000000000000000000000000 66 88 0 000 7 0 2 4 8 000 00 0 000 0 0 333333333333333333333333333333333333 6 00 11111 6 6 6 666666666 4 11 7 00 3 000 99 333333333333333333 00000000000000 11 9 99 2222222 4 2 5 1 9 000 99 55 4 7 7777777 00 33333 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 0 0 0 0 0 0 444444 99 2 55555 0 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 2 444 3 7 7 888 33 77 1 22 2 44 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 0 4 0 33 00 3 3 3 55555555555555555555555555 6 6 6 3 6 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 0 00 7 4444 8 5555 99 0 5 9 22222222222222222222222 44 44 2 00 0 5 5 999999999999999999999999999 3 4444444 3 3 3 6 00 0 2 0 0 4 7
consensus : GAACACGTAGTGTCGGGGACACATTGTTTTTGCTCCGTTTC---TTCTTATTA----TTCTTCTTC-T-CTTTAGTGATGA-ACTTGTCCGCGCGA--TTTTAT-GAA-AGTG-CTTC---AACAGATCCAATTCAAACTT--T--TGTGGGCTGATAGGGAG-TCATGAG-GAGGG---------------GTGGCCGCC----CAA---------CAAGT---AAA-----A--------AA-TCAAA---G-TTGTCGGATTTCACACCAAATTTTC--AATTTT-TAGGGTAATTCGATGAC-C-CCGAGTTCATTGTCCAGCAT-ACAAAAACA-TTT--------TTA-GCCCGCCCATTTTTTTTCAAAATGGCCGCCATANA-GAAAAT-G--T-TT--AAA-TG-CTTAAAATTTCTACATCA-TTTGGGTTCTG-TG---GTCAATTGAGGGTACACAATTCATATCTAGC--A--AT---TATTTCTT-T--ATATCAAATTTCCGAA-TGC-TTCAAGATGGCCGNCATTTCAAAAT-GC-TGCCA-AAA---A---A----G-----------------TT-GT--CGGATTTCAACCAAA-T-T-A-GTTTTNTAGGTTGAATTCA--GGATC-C-AAGTC-CA-T-T------CTCGAC---AT-T---ATNTNTCTG-GT-ACC--ATTTCTGACATAGGGGA-GG---TGTT-CGGGGACATTTNTGTTGGCATCCCAGCACAGTTATAGCTT---GTTC--T-TC---TTCCGCCTCTTTCTCGTGCCTAAAACTGTCC-GACA-------TTNTCT--N---AACCTG-TG-ATG--AAAGT-----CT-TAGA-TATTCTAGGA-----T---AT-G--ATAGGCCAATGTATGTAGATG-TGCAGAAA---TG--TT------------------GGGGT------------T-GG--G-TACATTCTGGGGGGA----TCGAATGGGGGTGGGGTTTAACATAGAACTCTA-T-GGG--GAAAATTAATTCCAAAATTCAACAGAT------GTAACTTGACAAAAT-----ATG------ATAG-----------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTNCTTTGACC-T-TGAACAT-AAAA-C-TGGTATA------ACT--TTAGAA-----AGAGAATTGNTTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCCTTGACCTTTG--ACCT-T-GAACAT-A-AAAN-TG-GTATAACTTTAGAACC-GGAACTG--ATAGAGACNTCAGATNGGGTGATACGANCTAGNATCAAGGTCNAGTGACTCCTTTACCTTTCCTACNAAGTAGTATNTCCCGTGA--C-C-T-TGACCTTG-G---------A--------A--T-A-AA-A-CTGGTATAACT-T---AACCAG-G-ACT---G--AANCNNGNCATGATTCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACCGGTATCCNGTGNCCTTGACCTCTGACCTTGG--AACAT-A-AAA-CTGGTATNACTTTAGAACCGGG-AC-------TGGAT--ACA-AGACATTGGGTCTTCAGAAATGA-TAATAAAGGA--TGTNAACT--TG--TCA-------A---G------TGA-C---T---C-CTGTGAC-CTTG-ACCTTTGACC-TTG--AT-CATAANAACTNGTA-TAA-CTTTAGAAC
Reference ( family-2 ) : GAACACGTAGTGTCGGGGACACATTGTTTTTGCTCCGTTTC---TTCTTATTA----TTCTTCTTC-T-CTTTAGTGATGA-ACTTGTCCGCGCGA--TTTTAT-GAA-AGTG-CTTC---AACAGATCCAATTCAAACTT--T--TGTGGGCTGATAGGGAG-TCATGAG-GAGGG---------------GTGGCCGCC----CAA---------CAAGT---AAA-----A--------AA-TCAAA---G-TTGTCGGATTTCACACCAAATTTTC--AATTTT-TAGGGTAATTCGATGAC-C-CCGAGTTCATTGTCCAGCAT-ACAAAAACA-TTT--------TTA-GCCCGCCCATTTTTTTTCAAAATGGCCGCCATANA-GAAAAT-G--T-TT--AAA-TG-CTTAAAATTTCTACATCA-TTTGGGTTCTG-TG---GTCAATTGAGGGTACACAATTCATATCTAGC--A--AT---TATTTCTT-T--ATATCAAATTTCCGAA-TGC-TTCAAGATGGCCGNCATTTCAAAAT-GC-TGCCA-AAA---A---A----G-----------------TT-GT--CGGATTTCAACCAAA-T-T-A-GTTTTNTAGGTTGAATTCA--GGATC-C-AAGTC-CA-T-T------CTCGAC---AT-T---ATNTNTCTG-GT-ACC--ATTTCTGACATAGGGGA-GG---TGTT-CGGGGACATTTNTGTTGGCATCCCAGCACAGTTATAGCTT---GTTC--T-TC---TTCCGCCTCTTTCTCGTGCCTAAAACTGTCC-GACA-------TTNTCT--N---AACCTG-TG-ATG--AAAGT-----CT-TAGA-TATTCTAGGA-----T---AT-G--ATAGGCCAATGTATGTAGATG-TGCAGAAA---TG--TT------------------GGGGT------------T-GG--G-TACATTCTGGGGGGA----TCGAATGGGGGTGGGGTTTAACATAGAACTCTA-T-GGG--GAAAATTAATTCCAAAATTCAACAGAT------GTAACTTGACAAAAT-----ATG------ATAG-----------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTNCTTTGACC-T-TGAACAT-AAAA-C-TGGTATA------ACT--TTAGAA-----AGAGAATTGNTTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCCTTGACCTTTG--ACCT-T-GAACAT-A-AAAN-TG-GTATAACTTTAGAACC-GGAACTG--ATAGAGACNTCAGATNGGGTGATACGANCTAGNATCAAGGTCNAGTGACTCCTTTACCTTTCCTACNAAGTAGTATNTCCCGTGA--C-C-T-TGACCTTG-G---------A--------A--T-A-AA-A-CTGGTATAACT-T---AACCAG-G-ACT---G--AANCNNGNCATGATTCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACCGGTATCCNGTGNCCTTGACCTCTGACCTTGG--AACAT-A-AAA-CTGGTATNACTTTAGAACCGGG-AC-------TGGAT--ACA-AGACATTGGGTCTTCAGAAATGA-TAATAAAGGA--TGTNAACT--TG--TCA-------A---G------TGA-C---T---C-CTGTGAC-CTTG-ACCTTTGACC-TTG--AT-CATAANAACTNGTA-TAA-CTTTAGAAC
gi|1 : GAACACATTGTGTCAGGGACACATTGTTTTGGCTCCATTTCGTATTATTATTAGTATTTTTTTTTC-T-CTTTGGTGATAA-ATTCACTTGCATGA--TTTTAT-GAA-AGTG-CTTC---AACAGATCCAATTCAAACTT--TAATGTGAGCTG-TAGGGAG-CCATGAA-GAGGG---------------ATGACTGCC----CAA---------CAAGT---AGA-----A--------AA-TCAAG---G-CTGTCACACTTCA-ACCAAATTTT----ATTGC-TGGGG-AATTTGATGACTC-CTGAGTCCATT-TCCAGCAG-GAAAAAAAA-TTG--------T---G-CCATCCA-----TTTCAAAACGGCC-TTATACA-AAAAAT-G--T-TT--AAG-TGTTTTAAAATTTCTACATCATTTTGGGTTCTG-GA---GTCAATTGAGGCTACGCATTTCATGTCTAGC--A--ATCTGTTTTTCTTCT--AT-TCAAATC-------TGC-T--AAAATGGCTGCCATTTCAAAA------ATCA-A-----------------------------------GT--CGGATTTCAACAAAA-T-T-ATTTTTTCTAGGGTTAATTCA--GGATC-C-AAGTC-CA-TAT------CT-GGT---AT-T----TTTATTTG-GT--CC--ATTTCTGACATAAGGGA-GG---TG----GGTGACATTTTTGTTGGCATCTCA--ACAGTTATAGCTT---GTTT--T-TCATATTC-----TTTTTTCAAGCCTAAAAC-AACA-GGCA-------TTCTCTGAA---AACCT--TG-ATG--AAAGT-----AT-TAGA-TATTC-AATA-----T---AT-G--ATATGCCAATGTATCTAGTTGATGCAGAAA---TG--TT------------------AGGGT------------T-GG--A-TACATTTTGAGGGGA----TCAAATGGGGTTGGGGCCGAACGTAGAAC--------------AGATTAATTACAAAATTTAGTAGAT------ATAACTTGACAAAAT-----ATG------NNNN-----------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCTAACC-A-TGAACAT-AAAA-C-TGGTATA------ACT--TTAAAACTACTGCAGGACTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCCTTGACCTCTG--ACCT-T-GAACAT-A-AAAC-TG-GTATAACTTTATAACT-GGAATTG--ATAGAGATATCAAATTGGATGATACAAACTAGTATCAAGGTTGAATGACTCCTTTACCTTTCTTATTAAGTAGTATCTGCAGTGA--C-C-T-TGACCTTG--------------------A--T-A-AA-A-CAGATATTA---T---AACCAA-G-ACT---GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTTGACCTCTTACCTT-G--AACAC-A-ACA-CTGATATAACTTTAGAACTTGG-TC-------TGNNN--NNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNN--NNNNNNNN--NN--NNN-------N---N------NNN-N---N---N-NNNNNNNTCTTG-ACCTTTGACC-TTG--AT-CATGAAAACTTGTA-TAA-CTTTAGAAC
gi|10 : CT-T-GACCAT-A-AAAAGTT-GTATAACTTTAAAACC-AGAACTG--A
gi|11 : ATAAAGAA--TGT-AACC--TA--CAA-------A---G------TAG-TGTAT---C-CTATGAC-CTTG-ACCTTTAACC-TTG--GT-TATAATAACTAATA-TAT-CTATAannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttaaaaaaggaaacaaattaccaaggtatttcgtttgtgaaaattttcaaaatcaaggtctttgtgaactagacttttaaacaaaattggcacggattttgtgcaagggagtgattactgcagggaaaaatagttgtgcattatgtattcagaaaaaaacaacacttttatttatatacaaccagtgcttcgtctgagaaacttaattagcagattataatcataattgtcttgttttttttctacactcttttcaattttattgtcagtt
gi|12 : CCTTGACCTCTG--ACCTCT-GAACAT-G-AAAT-TG-GTATATTTTCAAAACC-AGACCTG--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACT-TGA--C-C-CCTGACCCTA-G---------A--------ACAT-A-AT-A-TTGGTATTATA-T---AA-------------G--AACCGGGTCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTTCACATTTAACCATC---AACAT-A-AAA-CTCGTATAACTTTAGAACTGGA-AT-------TG-----ACAGAGACATGGGATCTTCAG-AATAA-TAtgatataatatataataatatatctaatatatctctataactatagaaatgggattatctgaaatgatgaaaggagcttgagacctacatgtactaactaatatttgtatgagaccagatttaatgatggagtcggaattttctggacaatttgcaaaatctgcaatttagcatttttaaattaacttaaaatctggcattggaggaatacagtagtattgagaaaaagcctactttttacagccagtatttcgtttgggaggttttgtaatcagcagattataatcatatattacat
gi|13 : CCTTG---AACATGA-AAA-CTGTAATAAATTTAGAAAAGAG-AAA------TGGATGGACG-A-ACATTGGGTCTTCA-AAAGGATTAATCAGAAACCTGTAACCT--TGTATCAAGGATTCA---G------TGA-C---T---C-CAGTGA--CTTG-ACTTtgacgtcacaaattcggggagtcgggaacgat
gi|14 : CTTTG--ACTTCT-GATCCT-A-AAAC-TC-GCATGACTTTAGAACT-GGAATTG--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGC-C-T-TGACCTC------------------------T-T-AA-G-TTG-TATAACC-T------TAG-A-ACT---G--AA-------ATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTTGACCTCTTACCTTAG--ATCAT-A-AAA-CTCGCATAACCTTAGAAggaagaaaattggtttacggatccataaccattatgtcttgtagagacatgggctcatcaaaaattgataagggcttttctggactaactaactaggaatccccacttttgacctatgaatcatagaaagttgtaataccatttaagaaacagatgtgatatgaagaatggacctacgacgtagtatatcctgt
gi|15 : -------TTCTGT--A---ACCCTT-TG-AGG--AAAGT-----AT-TAAG-TATCCATGGA-----TTTTATAG--ATAGGCCAA-GTATCTTGTTG-TGCAGAAAGGTTGAATT------------------GGGGTGTACATTTGTATT-GAATG-TACATT-TGGAGGGA----TCAAATGGGAGTGGGGTTTAACATAAAGCTCGT-T-GGG--AAAAATAAATTCCAAAATTCAACatt
gi|16 : tgaagtttggagacttattgtatttttttgcttggtgcttattcttctttttgtgtgtgtgtgtgctggt--T-TT---TTCCGCCTCTTTCTTGTGCCTGAAACTGCCC-GACA-------TTATTC--C-----CC----G-ATG--AAAGT-----CT-TAGA-TATTCTAGGA-----G---AT-G--ATAGGCCAATGTATGTAGAGG-TACAGAAA---TG--TTTTTGTTTTCAGATTGAAGGGGGT------------TAGG--G-TACATTCGGGGGGGG----------GGGGGT---GTTTAACATAAAACTCTA-T-GGG--GAAAATTATTT---AAAT-------------------CTTGAT-AAAT-----ATG------ATAG-----------gaaaagcataatagtttccttaatagatgtg
gi|17 : aacgaagtttggagtcttattgtatttgctcgattcttattcttaccgt------------------GGGGT------------A-CG--G-TACATT--GGGGTGA----T-GAAAGGGGAAG----TTAACATAGAAAACTA-TTGAG--GGAA--TAATTCTAAAATTCAACA----------TAACTTCACAATATGNNNNNNN------NNNN-----------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTACTTTGACT-TCTGATCCT-AAAA-C-TCGCATG------ACT--TTAGAA-----tgtcatag
gi|19 : ttttgtattcagattgcaaggggggaggggggTCTGGC--ATAAT---TATTTCTT-T--ATATCTAATTTCCGAATTGC-ATCAAGATGGTTGTCATTTCAAAATGGC-TGCCA-AAA---ATGCA----GT----------------TT-GT--TAGACT----------T-T-A-G-TTTGTAGTTTAAATTTA--GGATC-CAAAGTC-CA-T---------CCGAC---A--T---A-------G-G-------------GAAAT-----A-GA---TGTT-CGAGGTCATTTGTGTTGACATTCCAACA-GGATATAACTT---GTTctgg
gi|2 : GCTTAACATAGAACTCGA-T-GGGTAAAAAATTAATTCCAAAATTCAACAGAT------GTGACTTAAT-AAAT-----ATG------AGAG----------------------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCC-T-TGAACTTAAAAA-C-TGGCATA------ACT--TTAGAA-----AGAGAATTGATTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTTGACCTTTG--ACCT-TGGAAAAG-A-AAAT-TT-ATATTACTTCAGAACC-AGGTTTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCGTGA--C-C-T-TGACCTTT-G---------ACCTTGAACA--TAA-AA-A-CTGGTATCATT-TAG-AAAGAG-A-ATT---GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTTGACCTCTGACCTTGG--AAAAG-A-CAA-TCGGTATTACTTCAGAAACAAG-TC-------TCNNN--NNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNN--NNNNNNNN--NN--NNN-------N---N------NNN-C---C---CACTTTGAT-CTTGAACATTTAAAG-TTGTAATACTTAAGAACCAATACTAATCTTTAGAatcatactagtattttacaaaataaatttcact
gi|2 : CTTTG--ATCT-T-GAACAT-TTAAAG-TT-GTAATACTTAAGAACC-AATACTA--AT-----CTTTAGAT---GTGATA-GA---AGAAT---------GTGA-------AC------TACAAAATAGTATATCCTGTGA--C-C-T-TGACCTTT-GACCTTGATTA--------A--T-A-TA-A-CTTGTATAATT-T------TAG-G-ACT---G--tgtgatagaagaatgtgaactacaaaatagtatatcctgtgaccttgacctttgaccttgattaatataacttgtataattttaggactgggactgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatttactgaagtgaacagactgaggattttttctgaaatttttcaaaatcttggcaatttagatttttcaatgaac
gi|2 : gcttaacatagaactcgatgggtaaaaaattaattccaaaattcaacagatgtgacttaataaatatgagagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgaacttaaaaactggcataactttagaaagagaattgattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgacctttgaccttggaaaagaaaatttatattacttcagaaccaggtttgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccgtgaccttgacctttgaccttgaacataaaaactggtatcatttagaaagagaattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgacctctgaccttggaaaagacaatcggtattacttcagaaacaagtctcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncccaTATCCTGTGACCTTGACCTTTGACCTTGATTAATAT----AA-CTTGTATAATTTTAGGACTGGG-AC-------TGggactgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatttactgaagtgaacagactgaggattttttctgaaatttttcaaaatcttggcaatttagatttttcaatgaac
gi|20 : gcttaacatagaactcgatgggtaaaaaattaattccaaaattcaacagatgtgacttaataaatatgagagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgaacttaaaaactggcataactttagaaagagaattgattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgacctttgaccttggaaaagaaaatttatattacttcagaaccaggtttgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccgtgaccttgacctttgaccttgaacataaaaactggtatcatttagaaagagaattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgacctctgaccttggaaaagacaatcggtattacttcagaaacaagtctcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncccactttgatcttgaacatttaaagttgtaatacttaagaaccaatactaatctttagatgtgatagaagaatgtgaactacaaaatagtaAACACCTAATGTCGGGGACATAGTGTTTTTGCTCCATTTC---TTCTTATCA----TTATTCATCTT-CGTTTGTGCTGA-ACTTGTCTGCGCGATTTTTTATGGAA-AGTGCCTTCCCAGAAAAATCCAATTCAAAC-T--T--TGTGGG-TGATAAGGCGATC-TGAG-GAGNN---------------NNNNNNNNN----NNN---------NNNNN---NNN-----N--------NN-TCAtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatttactgaagtgaacagactgaggattttttctgaaatttttcaaaatcttggcaatttagatttttcaatgaac
gi|21 : aatatacaattactatatattatgtccaccAATCTCTGAA-TGC-TT-GAGATGTTCGCCAATTTAAAAT-GCCTGCCA-AAA---A---------------------------------TAGATTTCAACCAAA-TGT-A-GTTTTA-AGGTTGAATTCG--TGATC-CCAAGTC-TACT-T------CTGGACTCGATAT---ATTTCTCTG-TC-ACA--GTTTCTGACAT--GGGACGG---TGTT-CGGAAACTTTTGTGTTGGCATCCCAGCACAGTTATAGCTT---GT
gi|22 : cAAGAA--TGTGA-CT--TA--CAA-------A---G------TAG-T---TTATC-CTGTGAC-CTTT-ACCTTTGACC-TTG--AT-TATAATAACTAG
gi|23 : cCCCGTAA--C-T-T-T-----TG-A---------AC-------A--T-A-AG-A-TCAGTATA--T-G---AACCAG-N-NNN---N--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNT--CCTTGATATTTGACCTT-G--AACAT-T-AAA-ATCATATAACTGTAGAACAGGA-AT-------TGgactannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtttactgaaggaaacaagaggatttttttttctggaaactttcaaaatctt
gi|23 : tgaTCCTTGATATTTG--ACCT-T-GAACAT-T-AAAA-TC-ATATAACTGTAGAACA-GGAATTG--
gi|24 : tgacccgtaacttttgaacataagatcagtatatgaaccagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnT------------------GGAGT------------T-GG--GGTACATTTGGGGGGGGGGGGTCAAATGAGGAAGGAGTTTAACATAGAACTCCA-G-GGG--GATAAT---TTCCAAAATTAAACAGAT------TTAACTTGAC-AAAT-----ATG------ATAG-----------
gi|26 : ttcagattgaa---AAA-----A--------AA-TCAAA---G-TTGTCGGATTCCACACCAAATTTTC--AATTTT-TA--TTAATTCGATGAC-C-CCAAGTTCATTGCTTCGCATCACAAAAACATTTT--------TTA-GCCCGCCCATTTTTTTTCAAAATGGattcctggggtcttcggaaatgaaaatacaaggcccacgaactacctagt
gi|27 : tgaaaatgcaaatattacccgaaggcaacttaaactatgtaaaaa---AAA-----A--------AA-TCAAA---G-TTGTCGGATTCCACACCAAATTTTC--AATTTT-TA--TTAATTCGATGAC-C-CCAAGTTCATTGCTTCGCATCACAAAAACATTTT--------TTA-GCCCGCCCATTTTTTTTCAAAATGG
gi|28 : tgaaaatgcaaatattacccgaaggcaacttaaactatgtaaaaaCTTGACTTCTGACCTTT---AACAT-GTAAA-CTGGTATCATTTTAAAAGTGGG-AT-------TA-----ATA-ACANNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNN--NNNNNNNN--NN--NNN-------N---N------NNN-N---T---A-CTTTGAC-TTAG-ACCTCTGACCAGGG--AA-CATAGAA--TTGCA-TTA-CTTCAG
gi|29 : ----TTCTCCTTC-T---TCAGTAA-GACATGTGTCCACGTGC--TTTGAT-AAA-AGTG-CCTT---TATAGATCAAATTC-AATTT--T--TGTAGGCTGATAGAGAG-ccacat
gi|3 : -TG-ATG--AAAGT-----CT-TAGA-TATTCTAGGA-----T---AT-G--ATAGGCCAATGTATGAAGATG-TGCAAACA---TG--TTTTTGTTTTCAGATCGAAAGGGGT------------T-GG--GGTACATTCTGGGAGGA----TTAAATGGGGGTGGGGTTTAACATAAAACCCTA-T-GGG--GAAAA--AATCC--AAATTCAACAGAT------GTAAATTGA-AAATT-----ATGNNNNNNNNNN-----------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTTGACCAT-TGACCATAAAAA-C-TGGTATA------ACT--CTAGAA-----AGAGAGTTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTTGATC-TTG---------GAAAAG-A-AAAT-AG-GTACTACTTCAGAACCAGGTACGN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTTGA--CTT-T-TGACTTTG-A---------AT-------A--T-A-AA-ACCTGGTATAACTCT---AGAAAGAG-ACT--------TCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCT-TGATCTTGG--AAAAG-A-AAA-TAGGTACTACTTCAGAACCAGGTACGNNNNN-NNNNN--NNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNN--NNNNNNNN--NN--NNN-------N---N------NNN-N---N---N-NNNNNNN-NNNN-NNCTTTGACC-TTG--AA-CATAAAAACTGGTA-TAA-CTTTAGAAaacaaactactttcaaaatgccccccaccccgcccccaattcaaaatgtcaaaaatgtcaacaattaaggttg
gi|3 : tgtTTTGACT-T-TGAATAT-AAAA-CCTGGTATA------ACT--CTAGAA-----AGAGACTTCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTTGATC-TTG---------GAAAAG-A-AAAT-AG-GTACTACTTCAGAACC-A-----G--GTACGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--C-T-T-TGACCTTG-A---------AC-------A--TAA-AA-A-CTGGTATAACT-TTAGAA--AGAG-ACTTGCN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTTGACTTCTGACCTTGG--AAagagacttgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgacttctgaccttggaaaagaa
gi|30 : tgttgatgaaagtcttagatattctaggatatgataggccaatgtatgaagatgtgcaaacatgtttttgttttcagatcgaaaggggttggggtacattctgggaggattaaatgggggtggggtttaacataaaaccctatggggaaaaaatccaaattcaacagatgtaaattgaaaattatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctttgaccattgaccataaaaactggtataactctagaaagagagttgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgatcttggaaaagaaaataggtactacttcagaaccaggtacgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgactGTT-TGGAGACATTGCTTTTG----CTCGGTTC--TTTTCGCTTCTCGTTCATTATC---GTCTGCTTCTTTCTTGTGCCTAAAAATCTC----CA-------T-----------AGCTTGTTG-ATG--AAAGTATTTATT-TAGA-GATTTCAGaagaa
gi|31 : ttttcaaatgaaTTTGTCGTGCTTAAAACTGTCTTGATAAAAAAAGTTTTCT--ATGCAACATG-TGGAAG--AAAGT-----CT-TAGA-TATTATATGA-----T---AT-GATATAGGCTAATGTATGTAGAT--CGCAGAAA---TG--TT----------------------T------------T-GG--G-T---TTC-----AGA----TTGAA-GAGGTTGGGGTattgaaggggttagggtgcatt
gi|32 : -A-AAA-TTGGTATCATTTTAAAACTGGA-ATAAAATTATTGAT--A-A-AGATAATGTGATATAAGAACTGA---GTAGAGGA--T--TAACTAGTG--TCA-------A---GGTCAATTGA-C---T---C-CTGGGAC-ATTT-ACCTTTGACC-TTG--AT-CTTAACAACGAATA-Tattgg
gi|33 : ataGCTT---CTTC--T-TC---TTCCGCCGTTTTCCCATGTCTAAAACTGTCC-GACA-------CTGT---------------TG-ATG--AAAGT-----CT-TAGA-TATTCTAGGta
gi|34 : gtctcccaaacgaagtttggagacttattgagtttgctcagttcttgcaattcttcc------TGA-C---T---C-CTGGGAC-ATTT-ACCTTTGACC-TTG--AT-CTTAACAACGAATA-TTA-CTTT-GAA
gi|34 : TGAATGG--TGTGAGCT--T----CA-------AACTG------TTATC---T---C-CAGTGAC-CTTG-ACTTTTGACC-CTG--AT-CCTAAAAGCTTGCA-Ttggtgtgagcttcaaactgttatctccagtgaccttgacttttgaccctgatcctaaaagcttgcat
gi|35 : tgactcctgggacatttacctttgaccttgatcttaacaacgaatattacttCCGCCTCTTTCTTGTGCCTAGAAT-----------------TTCTCTA-T---AACCTGATA-ATGCCAAAGT-----GTGTAGA-TGTGC-AGAAGTTTTT---TT-G--TT-------TGTTTTTAGAT--TGAAG------------------------------GGGGT------------TGGG--G-TACATTTT
gi|37 : GCTT---CTTC--T-TC---TCCCGTCGCTTTCTCATG-CTAAAACTTTCT---CC-------TTA-CT--T---AACCTGTTG-ATT--AAAGT-----CT-TAGA-TATTCTAGGA-----T---AT-G--ATAGtag
gi|4 : CT--T---AACCTGGTG-ATG--GAAGT-----CT-TAGA-TATTCTAGGA-----T---AT-G--ATAGACCAATGTCTGTAGATG-TGCAAACA---TG--TTTTTGTTATCAGATTGAAGGGGGT------------TAGG--G-TACATTCTTGGGGGA----TCAAATGGGGGTGTGGTTTAACATAGAACCCTATT-GGA--AAAAATTAATTCCAAAATTCAACAGATAATATGATAACTTGAT-AAAT-----ATG------ATAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTTTGAAC-T-TGAACATCAAAA-C-TGGTATA------ACT--CTAGAA-----AGAGAGTAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTTGACC-TTG---------GAAAAG-A-AAAT-AG-GTATTACTTCAGAACCAGGTATGN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTTCA--C-CTT-TGACCTTGAG---------C--------A--T-A-AATA-CTGGTATAATT-------CTAG-A-AA----G--AAACATGCTA-GATTCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTTGACCTCTGACCTTGG--AAAAG-A-AAA-TAGGTATTACTTCAGAACCAGGTAT-------GNNNN--NNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNN--NNNNNNNN--NN--NNN-------N---N------NNN-N---N---N-NNNNNNN-NNNN-NNNNNNNNCC-TTG--AA-CATAAAAACTGGTA-TAA-CT
gi|4 : ctcCC-T-TGAACAT-AAAAAC-TGGTATA------ACTAATTA-AC-----AGAGaattaacagag
gi|40 : ctccttaacctggtgatggaagtcttagatattctaggatatgatagaccaatgtctgtagatgtgcaaacatgtttttgttatcagattgaagggggttagggtacattcttgggggatcaaatgggggtgtggtttaacatagaaccctattggaaaaaattaattccaaaattcaacagataatatgataacttgataaatatgatagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncctttgaacttgaacatcaaaactggtataactctagaaagagagtagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgaccttggaaaagaaaataggtattacttcagaaccaggtatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttcacctttgaccttgagcataaatactggtataattctagaaagaaacatgctagattctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgacctctgaccttggaaaagaaaataggtattacttcagaaccaggtatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnATAAATTTAGAAAG-AGAATTG--ATAGAGACTTCAGAAAGGGTAACATGACCT-GTA--AAGGTCCAGTGACTCC
gi|41 : CCTACAACGTAGTATATCCAGTGA--C-C-T-Tagtgacttt
gi|44 : atagagacataaaaattttagatgagattaaaaaaaatgtgaCTTGACCTCTGTGACCT-T-TAGGAT-A-AAAA-TGAGTGTAACTTTAGAAGA-GGAACTT--ATAGAAAtat
gi|45 : TTG--ACAT-T-GAACATTA-AAAG-TG-GTAAAACTTTAGAAAC-AGGGTTA--ATAGAGACATttc
gi|47 : cCTTGACTTCTGACCTTGG--AAAAG-A-AAG-TTGGTATTGCTCCAGAACCAGG-TC-------Tgggacctt
gi|48 : agTTTGACC-T-TGAACAT-ATAATC-TGGTATACATGTAACT--TTAAAA-----AGAGAATTG
gi|49 : TTG--ACCT-T-GATTAT-G-AAATATA-TTATAATTTTAGAACT-GGAACTG--
gi|5 : tggtcGTCTCGAACACATATTGTTTTTGTTCCGTTTC---TTCTTATTT----TTCTTCTTC-TTCTTTAGTAATGA-ACTTGTC-ACCCGA--TTTGAT-GAA-AGTG-CTT----AACAG--------------T--T--TGTGGACTGATAGGGA--TAATTAG-GAGTGCACAAAACATTGAAAATGGCCGCCAATTCAAAATGGCCACCAAAA---AAAGGCTAA--------AA-TTAAA---GGTTGTTGGATTTTA-ACCAAATTTT-------TC-TAGGGTAATTTGATGAC-C-CGGAGT-CATT-TCC-GCAT-GCAAAA-TA-TTT--------TTAAGCCCGCC-ATTTTTAT-----ATGGCCGCCACAGC-GGAAAT-CCTT-TT--AAA-TG-CTTAAAA---ATATATTA-TTTGAGTTATGGTGCAAGTCCAACGAGGGTTCACAGTTCATTTCTAGCTAA--GT---TATT-CTT-TCCATATCCAATTTCAAAA-TGTATGCAAGATGGCCATCATTTCAAAAG-GC-TGTCA-AAA---T---ATTCCG-----------------TTTGT--CGGATTTCAACCAAATT-T-A-G-TTTATAGAGTGAATTCACCCATTC-C-AAATCTTATT-T------CTTGAC---AT-TAAAATATGTTTA-A--ACCCAATTTATGACAAAGGGGA-GG---TGTTGCGGGGACA
gi|50 : attatCT--T---AACCTGGTG-ATG--GAAGT-----CT-TAGAATATTTTAGGA-----T---AT-G--ATAGg
gi|51 : ctcCTTGACCTCTG--ACCA-T-GAA-AT------G-TG-ATATAACTTTGGAACT-GGGACTG--Aa
gi|6 : -ACTTGTCCGCGCGA--TTT-AT-GAA-CGTG-CTTC---AACAGATCTAATCTAAATTCAAT--TGTGGACTGATAGGGGG-TCATACG-ACGGG---------------GTG----------CAAT--------CAAGTTTCAAA-----ATGGCTGACAATTCAAA---T-TTG-CGGA
gi|6 : GT-TTCAAAATGGCTGACAATTCAAATTTGC-GGACA-AAA---A---A----GGTAAAAAAAAAAATACGTT-GT--CGGATTTCAACC--A-T-T-T-CTTTTCTAGGGTAATTTGA--TGATCTC-GAGTT-CA-T-T------TCCAGCA--AT-T---Acaaaaaaggtaaaaaaaaaaatacgttgtcggatttcaaccatttcttttctagggtaatttgatgatctcgagttcatttccagcaattaaaacaaattgagtcggcattttgaaaatggccgccatatacagaattgtatcaaaatgataagctttctacatcatttgggatctgtgtcatttgagggtatacaattgatatctatcaatagtattactttatatcaaatttcccactgtttcaagatggccgactttacaaaattgctgcaaaaaataaagtttaacggatttcagccttcagtttttaggttgcatttaggattcgaagtctatttttgtactcgatatgtctctgtgtcaccatttaagataggggggggggcgttcgggtacatttttgttggcaccccaacacatttaaaacttgt
gi|6 : acttgtccgcgcgatttatgaacgtgcttcaacagatctaatctaaattcaattgtggactgatagggggtcatacgacggggtgcaatcaaAA---------AAGGT---AAA-----A--------AA-AAAAATACG-TTGTCGGATTTCA-ACCA---TTTC----TTTTCTAGGGTAATTTGATGAT-C-TCGAGTTCATT-TCCAGCA--ATTAAAACA-AAT--------TGA-GTCGGC--ATTTTG----AAAATGGCCGCCATATA-CAGAATTG--T-ATCAAAA-TG-AT-AAGCTTTCTACATCA-TTTGGGATCTG-TG----TCATTTGAGGGTATACAATTGATATCTATC--A--ATAG-TATTACTT-T--ATATCAAATTTCCCAC-TGT-TTCAAGATGGCCGACTTTACAAAATTGC-TGCAA-AAA---ATAAA----G-----------------TT--TAACGGATTTCAGCC----T-TCA-GTTTT-TAGGTTGCATTTA--GGATT-CGAAGTC-TA-T-TTTTGTACTCGA-------T---ATGTCTCTGTGTCACC--ATTT--AAGATAGGGGG-GGGGGCGTT-CGGGTACATTTTTGTTGGCACCCCAACACATTTAAAACTT---GTaaacaaattgagtcggcattttgaaaatggccgccatatacagaattgtatcaaaatgataagctttctacatcatttgggatctgtgtcatttgagggtatacaattgatatctatcaatagtattactttatatcaaatttcccactgtttcaagatggccgactttacaaaattgctgcaaaaaataaagtttaacggatttcagccttcagtttttaggttgcatttaggattcgaagtctatttttgtactcgatatgtctctgtgtcaccatttaagataggggggggggcgttcgggtacatttttgttggcaccccaacacatttaaaacttgt
gi|7 : acttgtccgcgcgatttatgaacgtgcttcaacagatctaatctaaattcaattgtggactgatagggggtcatacgacggggtgcaatcaagtttcaaaatggctgacaattcaaatttgcggacaaCTTGATATTTG--ACCT-T-GAACAT-T-AAAA-TC-ATATAACTGTAGAACA-GGAATTG------------------GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGGATCCCCAATGA--T-T-T-TGACCTTG-AT--------C--------A--T-AGAA-A-GTTGTATAACT-TAAGAACCAG-T-ACT-------------ANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACCGGTATCCAGTATCCTTGACCTTTGACCTTG
gi|8 : -C-T-TGACCTTG-G---------A--------AAAG-A-AA-A-TGGGTACTGCT-TCAGAACCAG-GTAC---------GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACTT--GACCTTG---AACAT-A-AAAACTGGTATAACT---AAA--GAG-AG-------TTGAT--A-A-AAACGTTGGGTCTTCAAAAATGA-TAATAGGAGA--TATCAATT--TG--TCA-------A---G------TGA-C---T---T-CAGTGAC-CTTG-ACCTCTGACC-TTG--attnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaacttaaaattggcatttaagcatggattatttgtaagggaggtatacagtagtatgaggaaaaagcccactttgtacagccagtgctt
gi|8 : TTCAGTGACCTTGACCTCTGACCTTGG--AAAAG-A-AAA-----TATG--TT--GAACCAGG-gaaaagaaaatatgttgaaccaggtacgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtttttggaaggaaacaggattatttttgggaattttcaaaaatctttacgattcagaatttttaaatgtacttgaaatgggcatggcatgaattgtgtgcaagggtggaatacagttgtatta
gi|9 : cttgaccttggaaaagaaaatgggtactgcttcagaaccaggtacgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacttgaccttgaacataaaaactggtataactaaagagagttgataaaaacgttgggtcttcaaaaatgataataggagatatcaatttgtcaagtgacGAACACGTAGTGTTGGGG--ACATTG-TTTTGC----TTTC---TTCTCA-AA----TT--------T-CTTTAGTGAGAA-ATTTGTCCGCACGA--TTTTAT-GAATAAT--CTTC---AACAGATTCAATTCAAAC-T--T--CGTGGGTTGACAGGGGG-TCCTGGGAGAGGG---------------GTGtacgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtttttggaaggaaacaggattatttttgggaattttcaaaaatctttacgattcagaatttttaaatgtacttgaaatgggcatggcatgaattgtgtgcaagggtggaatacagttgtatta
gi|9 : ttatgtccccAACTTTCGGAATTTT-CAAAGT--------GGC-CGCCGA-TTCAAGATCCATCAT-AAAAAAA-A-CCCGAAAAAACTGA-GCC-GCC-ATTTT----CAAAATGGCCGCCATAAACGAAAAT-G--TATC--AAAGTA-CT-AAAATCTCTACATCA-TTTAGGTTTTG-TG---GTCAGTTGAGGGTACACAATTCATATCTAGCGTA--AG---TATTTCTT-T--ATATCAAATGTTTGAA-TGT-TTAAAGATGGTTGTCATTTCAAAATGGC-TGCCACAAAATGA---A----GT----------------TT-GT--CGAATTTCAACCAAATT-T-A-GTTTT-TAGGTTGAATGCA--GTATCAT-AAGTT-TA-T-T------ctatcaactttcggaattttcaaagtggccgccgattcaagatccatcataaaaaaaacccgaaaaaactgagccgccattttcaaaatggccgccataaacgaaaatgtatcaaagtactaaaatctctacatcatttaggttttgtggtcagttgagggtacacaattcatatctagcgtaagtatttctttatatcaaatgtttgaatgtttaaagatggttgtcatttcaaaatggctgccacaaaatgaagtttgtcgaatttcaaccaaatttagtttttaggttgaatgcagtatcataagtttatt
blockSeqs : C A T T A . TCA A A T TCT T C T TT T G T C CCCA C A TCAAT C A A A CACAAAACATTGAAAATGGCCGCCAATTCAAAATGGCCAC TTC ATGGCTGAC T TACG C CGGA C GG C . G T G C TC C C CCCGAAAAAAC TAA C C C TTTT G G CG TGTATCA G CTT TT . GTGCAAG A G T ATAAT T . CC T CG T ATGC T TG C C AAGGTAAAAAAAAAAATACGTTGT AAAT G CAGT G T CCC CA T CTTCTGGACTCGATATATTTCTCTGTCACA CT AG C GGG G G A A G CTC AT A . C T TGTCTTGATAAAAAAAGTTTTCTATGCAACATG G CC ATTTA G A A GTTTTT A AT G A GGT AA TTTGTTTTCAGATTGAAG GTACATTTGTATT AT G CG GGGGTCA T G T G TT TA TA C AATATGA CA GNNNN ATAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN A A C A A C CATGTA AA . A NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN T TGA C G C TT AG GA CA NN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN N N NN NG T T C TGACCTTGAACATA G T C T TTAGAAAGAGACTTGCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN N NN T GATT TGA AC A T TACGNNNNNNNNNNNNNNN NN TT CC G A A TGTATCAAGGATTCAG T GTAT A . A A TA A A T A C T
blockSeqs : G A T T G . TTT C T . CG T . C . G . . . T A A TTT C . A . NNNNNNNNNNNN . GGCTAA . GG C CA . GG C . . T G C TC C C TTTT TA C C C TTTT G T G CCTTTT . AT TC . TGG T A A TAAGT A . . C TG . ATC C TT . . TATTCCGTTTGT AAAT . AGT A T G CC . TTTCTTGACATTAAAATATGTTTAAACCCA AT AG . . . G G G A . . . . T T TTTCTCCTTACTTAACCTGT . . . . . T TTTT . . G A . . TTTGTTTTCAGATCGAAA TA . G TG TCA A G T T TT . TT T G T . NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN N . . A T . . . . N NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN T A C . C TA TA T CA . NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN N N CG . . . . TGACCTTGATTAAT . . . C TAGAAAGAGAATTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN N NN C AG TGT C A A ATAAAATTATTGATAAAG NN T . G N C AGTGTCAAGGTCAAT . TTAT . . . . . . T G A . .
blockSeqs : . . . . . AA C T . CT G . C . G . . . C T A TT C . C . GTGCAAT . N . G . CA . AA T . . T A A T C T TTTT TA C C . TAT G A C GTATC . CT . . TG G A A AATAG T . . A AA . TTC T TT . . ATGCAGTTTGT AAA . TCT A G T TC . TTTTTGTACTCGATATGTCTCTGTGTCACC . . . . . C G G A . . . . C G TGCCCGACATTATTCCCC . . . . . T G . . G C . . TTTGTTATCAGATTGAAG TG . . CT TTA T G A T T . TT C T T . NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN N . . C . . . . . C NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN T A . . C A T G C . NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN N N TG . . . . AGAACAT . . . T GAACCAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN N NN C GG TA C A C AAATGGATGGACGA NN N . N G N TCAAACTG . T . . . . . . A T A . .
blockSeqs : . . . . . . C . T . . . C C . TT T . . . . A . G . C . . T . . T . A T T C TTT GA T G . G GTAAG . . . A CC . TTC A TG . . ATAAAGTTTAA A . AGT C G T CG . TCCGACATAGG . . . . . T . A . . . . . C T TTCTCTATAACCTGA . . . . . C T . . G A . . . TA . . TT TTG T G T G T . TT C G C . AGAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN C . . . . . . . . N NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN T A . . A G C C C . NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN A A CG . . . . GAACATA . . . T TCAGAACCAGGTACGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN T GA T GG TA C T T TATGNNNNNNNNN GA N . G N N TACAAAG . C . . . . . . A A T . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . TT . . . A . T . . . . . . . . . . A . AAT GA C . . . TG . TTA A T . . ATGAAGTTTGT . . AG . T G AT . . . C G TCTCCATAGCTTGT . . . . . T T . . . C . . . A . . CT TCA T T T C T . T C . A . . . . . . . . . T A . . C A T T T . ACGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN N N CT . . . . GGAAAAG . . . C CTAGAAAGAGACTTCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN N NN T GG GA T A A TCTCNNNNNNNN NN N . N N N NNNNNNN . T . . . . . . A A G . .
blockSeqs : . A . TT T G . . A . . AG . T G C . . TGTCCGACACTGT . . . . . T T . . . . . . . T . . T TG . . C T G . T . . T . . . . . . . . . T A . . C A G T C . NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN N N NN . . . . GAACAT . . . C CTAGAAAGAAACATGCTAGATTCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN N NN C GG TT C A T AGTTGATAAAA AA N . N T A TACAAAG . N . . . . . . T C A . .
blockSeqs : . . . . . T T . . . T . . C . . . C T T . . . . . . . . . . . T A . . A T A C C . GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN N N CT . . . . GAATAT . . . T TAAGAACCAGTACTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN N NN C GG GA A C C ATTGACAGAG G T . G G G NNNNNNN . T . . . . . . T C A .
blockSeqs : . . . . . T T . . . T . . . T A . . A A T G A . CTTTAGATGTGATAGAAGAATGTGAAC A A AG . . . . GAGCAT . . . C TAAGAACCGGGTCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN N AT C GG GA C T T ATTAATAAC A . . N N N NNNNNNN . T . . . . . . C A T .
blockSeqs : . . . . . T . A . . A A T G C . N C AA . . . . GATCAT . . . C TTAGAACTGAAATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN A NN C C GA T C C . A C A NNNNNNN . T . . . . . . A A G
blockSeqs : . . . . . . . A . . G A T G G . T . . . . T . . . . N GA T G TA T T C . . . . TGTCAAG . N . . . . .
blockSeqs : . . . . C A A G A . . . . A . C G GA T T C . T . . .
blockSeqs : . . . T G G A C . . T T T A .
blockSeqs : . . . C T G G T . . G . G
blockSeqs : . . . . A C T .
blockSeqs : A .
blockSeqCons : TT***** CA** TTCT******** NA* TT** ANAAN***** CG TTC* TN ATGNAGTTTGT************************** AAA* AGT** CN* TTTCTGGACTCGATATNTTTCTNTGTCACA************** *** TNCTCTATAACCTGT********************* G* T** T* ***** GAACAT******************** GG** AATTGATAGAG************
originalCons : GAACACGTAGTGTCGGGGACACATTGTTTTTGCTCCGTTTC---TTCTTATTA----TTCTTCTTC-T-CTTTAGTGATGA-ACTTGTCCGCGCGA--TTTTAT-GAA-AGTG-CTTC---AACAGATCCAATTCAAACTT--T--TGTGGGCTGATAGGGAG-TCATGAG-GAGGG---------------GTGGCCGCC----CAA---------CAAGT---AAA-----A--------AA-TCAAA---G-TTGTCGGATTTCACACCAAATTTTC--AATTTT-TAGGGTAATTCGATGAC-C-CCGAGTTCATTGTCCAGCAT-ACAAAAACA-TTT--------TTA-GCCCGCCCATTTTTTTTCAAAATGGCCGCCATANA-GAAAAT-G--T-TT--AAA-TG-CTTAAAATTTCTACATCA-TTTGGGTTCTG-TG---GTCAATTGAGGGTACACAATTCATATCTAGC--A--AT---TATTTCTT-T--ATATCAAATTTCCGAA-TGC-TTCAAGATGGCCGNCATTTCAAAAT-GC-TGCCA-AAA---A---A----G-----------------TT-GT--CGGATTTCAACCAAA-T-T-A-GTTTTNTAGGTTGAATTCA--GGATC-C-AAGTC-CA-T-T------CTCGAC---AT-T---ATNTNTCTG-GT-ACC--ATTTCTGACATAGGGGA-GG---TGTT-CGGGGACATTTNTGTTGGCATCCCAGCACAGTTATAGCTT---GTTC--T-TC---TTCCGCCTCTTTCTCGTGCCTAAAACTGTCC-GACA-------TTNTCT--N---AACCTG-TG-ATG--AAAGT-----CT-TAGA-TATTCTAGGA-----T---AT-G--ATAGGCCAATGTATGTAGATG-TGCAGAAA---TG--TT------------------GGGGT------------T-GG--G-TACATTCTGGGGGGA----TCGAATGGGGGTGGGGTTTAACATAGAACTCTA-T-GGG--GAAAATTAATTCCAAAATTCAACAGAT------GTAACTTGACAAAAT-----ATG------ATAG-----------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTNCTTTGACC-T-TGAACAT-AAAA-C-TGGTATA------ACT--TTAGAA-----AGAGAATTGNTTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCCTTGACCTTTG--ACCT-T-GAACAT-A-AAAN-TG-GTATAACTTTAGAACC-GGAACTG--ATAGAGACNTCAGATNGGGTGATACGANCTAGNATCAAGGTCNAGTGACTCCTTTACCTTTCCTACNAAGTAGTATNTCCCGTGA--C-C-T-TGACCTTG-G---------A--------A--T-A-AA-A-CTGGTATAACT-T---AACCAG-G-ACT---G--AANCNNGNCATGATTCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACCGGTATCCNGTGNCCTTGACCTCTGACCTTGG--AACAT-A-AAA-CTGGTATNACTTTAGAACCGGG-AC-------TGGAT--ACA-AGACATTGGGTCTTCAGAAATGA-TAATAAAGGA--TGTNAACT--TG--TCA-------A---G------TGA-C---T---C-CTGTGAC-CTTG-ACCTTTGACC-TTG--AT-CATAANAACTNGTA-TAA-CTTTAGAAC
finalCons : GAACACGTAGTGTCGGGGACACATTGTTTTTGCTCCGTTTC---TTCTTATTA----TTCTTCTTC-T-CTTTAGTGATGA-ACTTGTCCGCGCGA--TTTTAT-GAA-AGTG-CTTC---AACAGATCCAATTCAAACTT-----TGTGGGCTGATAGGGAG-TCATGAG-GAGGG---------------GTGGCCGCC----CAA---------CAAGT---AAA-----A--------AA-TCAAA---G-TTGTCGGATTTCACACCAAATTTTCA--ATTTT-TAGGGTAATTCGATGAC-C-CCGAGTTCATTGTCCAGCAT-ACAAAAACATTCT--------TNA-GCCCGCCCATTTTTT--CAAAATGGCCGCCATANA-GAAAAT-G--T-TT--AAA-TG-CTTAAAATTTCTACATCA-TTTGGGTTCTG-TG---GTCAATTGAGGGTACACAATTCATATCTAGCANAAN-----TATTTCTT-T--ATATCAAATTTCCGAA-TGCTTC-AAGATGGCCGNCATTTCAAAATNGC-TGCCA-AAAATGNAGTTTGT--------------------------CGGATTTCAACCAAA-T-TAGT--TTTNTAGGTTGAATTCA--GGATCCN-AAGTC-CATTTCTGGACTCGATATNTTTCTNTGTCACA--------------ATTTCTGACATAGGGGA-GG---TGTT-CGGGGACATTTNTGTTGGCATCCCAGCACAGTTATAGCTT---GTTC--T-TC---TTCCGCCTCTTTCTCGTGCCTAAAACTNCTCTATAACCTGT---------------------TG-ATG--AAAGT-----CT-TAGA-TATTCTAGGA-----T---AT-G--ATAGGCCAATGTATGTAGATG-TGCAGAAA---TG--TT------------------GGGGT------------T-GG--G-TACATTCTGGGGGGA----TCGAATGGGGGTGGGGTTTAACATAGAACTCTAT--GGG--GAAAATTAATTCCAAAATTCAACAGAT------GTAACTTGAT-AAAT-----ATG------ATAG-----------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTNCTTTGACC-T-TGAACAT-AAAA-C-TGGTATA------ACT--TTAGAA-----AGAGAATTGNTTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCCTTGACCTTTG--ACCT-T-GAACAT-A-AAAN-TG-GTATAACTTTAGAACC-GGAACTG--ATAGAGACNTCAGATNGGGTGATACGANCTAGNATCAAGGTCNAGTGACTCCTTTACCTTTCCTACNAAGTAGTATNTCCCGTGA--C-C-T-TGACCTTGAACAT--------------------A-AA-A-CTGGTATAACT-T---AACCAG-G-ACT---G--AANCNNGNCATGATTCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACCGGTATCCNGTGNCCTTGACCTCTGACCTTGG--AACAT-A-AAA-CTGGTATNACTTTAGAACCGGGAATTGATAGAG------------ACATTGGGTCTTCAGAAATGA-TAATAAAGGA--TGTNAACT--TG--TCA-------A---G------TGA-C---T---C-CTGTGAC-CTTG-ACCTTTGACC-TTG--AT-CATAANAACTNGTA-TAA-CTTTAGAAC
8 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|18 ): ATTACGTGTATCAGACGGATTATTATGGGTCTGGAAATTTTCAAAATCTTATTACGTTAGAATTTTCGGTTAATGAACCGGGGCATGTGCATGGGACTACTTGCACGGGAGGAATACAGTTTGTATTAAGAAAAAGCTTTTACTTTGTACAACCACGTACTTCGTTTGCGGAGACTTTTATATCGGTCAGATGGAATATTATATCTCTACATCTGGTTTTAACATGCTAAGGAATT
Unaligned ( gi|25 ): ATTAATCATGGTCTTTGTGCTCTAGATGTATTTTAAATGATTTATGAATGGCATGGATTTTGTGAGAGGGAGGAAAATAGTACTCAAAAAAGTCCACTATTATACAAATAGTATTTCGATTGGGAGACTTTATAATTGGTAAATTATAATAATATCTTATATGACTTC
Unaligned ( gi|36 ): GGATTTTGTGCAAGGGGTTATTAATATGGGGAAAATAGCAGCATCAGAAAAGCTCAACTTTTATACAGCAGATTTATTTGGCGAAGACTTTATAACGCAGATTATCATC
Unaligned ( gi|38 ): AAAGGGAGTTGACCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Unaligned ( gi|39 ): TCTCCAAAACAAAGTTTGGAGAGTGACTAATTCATAGTGTTTTTGCTCTGTTCATGTAATTCTTCCACTCCTCCTTGTTCC
Unaligned ( gi|42 ): TAAGTCTCCCAAACGAAGTCTGGGGACTTATTGCGTTTGCTCAGTTATAATTCATCATATTCTTCTTCCGCC
Unaligned ( gi|43 ): TCTTCGTAACGAATTTTGGAGACTTATTGTGTTTGCTCAGTTCTTTTAAATCGTCTGGCTCTTCCTCTTCCG
Unaligned ( gi|46 ): AAAATCAAGGCTTGTGTGATCTAGACTTTTAAATAAAGTTAAAATTGGCACGGA
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 111 1111111 1111 1111111 8888888888888888888888888888888888888888 111 22222222222222 11111 2 2222 11 1 11 222222222 2222 11 11 2222222222 1 1111 1 2222222 11 11 444444444444444444 1111 1 1 1 1 1111 111 111 11 111 22222222222 1111111111 111111111 11 111 999999999999999999 33333333333333 11 1111111 2222222 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 1 1 111111 11111 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 1111111 11111111 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 333333333333333333333 222222222222222222222222222222222
lowQualScore : 3 3 3 3 4 777 9999999 8 1 8 888 5 6 3 99 7 6 6 6 2222 1 4444444 1 6 5 8 2222222222222222222222222222222222222222 000 77777777777777 5 22222 0 3333 6 00 2 6 6 1 7 7 66 1 5 999999999 3 1 2 0000 44 2 1 00 7777777777 0 6666 44 0 0 1111111 1 1 1 8 1 11 6 8 11 0 1 44 5 6666 1 88 5 5 333333333333333333 9999 5 88888 2 1 66 6 5 3 0 00 1 0 0 1 0 5 9 0 4444 444 6 1 3 6 3 000 11 8 444 1 3 22222222222 5555555555 2 7777 55 99999 3 3 3 222222222 4 66 0 00 1 000 77 888888888888888888 00000000000000 66 8 00 4444444 3 0 2 4 1 777 66 33 1 0 1111111 66 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 1 5 5 5 0 5 444444 66 0 22222 1 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 2 444 5 2 3 666 66 33 0 55 0 33 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 1 0 1 44 55 3 4444444 3 3 3 33333333 7 3 3 3 0 2 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 2 3 9 0 77 3 3 1 555 888 999999999999999999999 2 555 0 1 44 5555 44 2 444444444444444444444444444444444 3 555 777777 1 3 3 3 77 3 0 1 1 4 4 66 5
lowQualScore : . . . . . ... ....... . . . ... . . . .. . . . . .... . ....... . . . . ........................................ ... .............. . ..... . .... . .. . . . . . . .. . . ......... . . . .... .. . . .. .......... . .... .. . . ....... . . . . . .. . . .. . . .. . .... . .. . . .................. .... . ..... . . .. . . . . .. . . . . . . . . .... ... . . . . . ... .. . ... . . ........... .......... . .... .. ..... . . . ......... . .. . .. . ... .. .................. .............. .. . .. ....... . . . . . ... .. .. . . ....... .. .......................................................................................... . . . . . . ...... .. . ..... . ........................................................................... . ... . . . ... .. .. . .. . .. ............................................................. . . . .. .. . ....... . . . ........ . . . . . . ..................................................................................................... . . . . .. . . . ... ... ..................... . ... . . .. .... .. . ................................. . ... ...... . . . . .. . . . . . . .. .
lowQualScore : 7 2 2 2 2 555 0000000 2 0 0 666 6 7 7 22 2 7 7 7 7777 0 3333333 0 7 6 0 1111111111111111111111111111111111111111 000 44444444444444 7 55555 0 0000 7 33 2 7 7 7 7 2 55 0 2 777777777 3 0 5 2222 55 5 0 22 0000000000 0 8888 00 0 2 0000000 2 2 2 8 0 00 0 0 00 8 0 77 7 1111 0 00 7 7 999999999999999999 0000 7 33333 1 3 44 6 7 2 0 55 0 8 2 0 0 5 2 8 8888 000 7 0 2 4 8 000 00 0 000 0 0 77777777777 1111111111 3 7777 00 11111 6 6 6 666666666 4 11 7 00 3 000 99 333333333333333333 00000000000000 11 9 99 2222222 4 2 5 1 9 000 99 55 4 7 7777777 99 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 0 0 0 0 0 0 444444 99 2 55555 0 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 3 555 0 5 5 888 00 77 1 22 2 44 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 0 4 0 33 00 3 2222222 3 6 6 22222222 3 6 6 6 3 6 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 6 3 2 4 44 1 1 0 444 333 111111111111111111111 6 666 8 2 66 4444 66 2 555555555555555555555555555555555 1 444 222222 2 1 3 3 99 6 3 0 0 0 0 99 0
consensus : GAACACGTAGTGTCGGGGACACATTGTTTTTGCTCCGTTTC---TTCTTATTA----TTCTTCTTC-T-CTTTAGTGATGA-ACTTGTCCGCGCGA--TTTTAT-GAA-AGTG-CTTC---AACAGATCCAATTCAAACT---T---TGTGGGCTGATAGGGAG-TCATGAG-GAGGG---------------GTGGCCGCC----CAA---------CAAGT---AAA-----A--------AA-TCAAA---G-TTGTCGGATTTCACACCAAATTTTC--AATTTT-TAGGGTAATTCGATGAC-C-CCGAGTTCATTGTCCAGCAT-ACAAAAACATTN-------TTNAGCCCGCCCA--TTTTTTCAAAATGGCCGCCATANA-GAAAAT-G--T-TT--AAA-TG-CTTAAAATTTCTACATCA-TTTGGGTTCTG-TG---GTCAATTGAGGGTACACAATTCATATCTAGCANAANTA--TTTCTT-T--ATATCAAATTTCCGAAT-GC-TTCAAGATGGCCGNCATTTCAAAATGGCTGCCA-AAA-ATGN----------AGT---TTGTCGGATTTCAACCAAA-T-T-A-GTTTTNTAGGTTGAATTCA-GGATCCCAAGTC-CATTTCTGGAC-TCGATATATTTCTNT-GTCACAATTTCTGACATA---GGGG---AGGTGTT-CGGGGACATTTNTGTTGGCATCCCAGCACAGTTATAGCTT---GTTC--T-TC---TTCCGCCTCTTTCTCGTGCCTAAAAC--------TT-CTC--T-A--T--AACCTGTT----GATG--AAAGT-----CT-TAG-ATATTCTAGGA-----T---AT-G--ATAGGCCAATGTATGTAGATG-TGCAGAAA---TG--TT------------------GGGGT------------T-GG--G-TACATTCTGGGGGGA----TCGAATGGGGGTGGGGTTTAACATAGAACTCTA-T-GGG--GAAAATTAATTCCAAAATTCAACAGAT------GTAACTTGAC-AAATATG-------ATAG-----------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTNCTTTGACC-T-TGAACAT-AAAA-C-TGGTATA------ACT--TTAGAA-----AGAGAATTGNTTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCCTTGACCTTTG--ACCT-T-GAACAT-A-AAAN-TG-GTATAACTTTAGAACC-GGAACTG--ATAGAGACNTCAGATNGGGTGATACGANCTAGNATCAAGGTCNAGTGACTCCTTTACCTTTCCTACNAAGTAGTATNTCCCGTGA--C-C-------T-TGACCTT-G-AAC--------AT-A-AA-A-CTGGTATAACT-T---AACCAG-G-ACT---G--AANCNNGNCATGATTCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACCGGTATCCAGTGNCCTTGACCTCTGACCTTGGAACAT-A-AAA-CTGGTATNAC---TTTAGAACCGGG--------A-------A-T--TGATAGA--GACATTGGGTCNTCAGAAATGA-TAATAAGGGA--TGTNAACT--TG--TC-A-------A---G------TGA-C---T---C--CTGTGACCTTG-ACCTTTGACC-T-TG--AT-CATAAAAACTNGT-A-TA--A-CTTTAGAAC
Reference ( family-2 ) : GAACACGTAGTGTCGGGGACACATTGTTTTTGCTCCGTTTC---TTCTTATTA----TTCTTCTTC-T-CTTTAGTGATGA-ACTTGTCCGCGCGA--TTTTAT-GAA-AGTG-CTTC---AACAGATCCAATTCAAACT---T---TGTGGGCTGATAGGGAG-TCATGAG-GAGGG---------------GTGGCCGCC----CAA---------CAAGT---AAA-----A--------AA-TCAAA---G-TTGTCGGATTTCACACCAAATTTTC--AATTTT-TAGGGTAATTCGATGAC-C-CCGAGTTCATTGTCCAGCAT-ACAAAAACATTC-------TTNAGCCCGCCCA--TTTTTTCAAAATGGCCGCCATANA-GAAAAT-G--T-TT--AAA-TG-CTTAAAATTTCTACATCA-TTTGGGTTCTG-TG---GTCAATTGAGGGTACACAATTCATATCTAGCANAANTA--TTTCTT-T--ATATCAAATTTCCGAAT-GC-TTCAAGATGGCCGNCATTTCAAAATNGCTGCCA-AAA-ATGN----------AGT---TTGTCGGATTTCAACCAAA-T-T-A-GTTTTNTAGGTTGAATTCA-GGATCCNAAGTC-CATTTCTGGAC-TCGATATNTTTCTNT-GTCACAATTTCTGACATA---GGGG---AGGTGTT-CGGGGACATTTNTGTTGGCATCCCAGCACAGTTATAGCTT---GTTC--T-TC---TTCCGCCTCTTTCTCGTGCCTAAAAC--------TN-CTC--T-A--T--AACCTGTT----GATG--AAAGT-----CT-TAG-ATATTCTAGGA-----T---AT-G--ATAGGCCAATGTATGTAGATG-TGCAGAAA---TG--TT------------------GGGGT------------T-GG--G-TACATTCTGGGGGGA----TCGAATGGGGGTGGGGTTTAACATAGAACTCTA-T-GGG--GAAAATTAATTCCAAAATTCAACAGAT------GTAACTTGAT-AAATATG-------ATAG-----------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTNCTTTGACC-T-TGAACAT-AAAA-C-TGGTATA------ACT--TTAGAA-----AGAGAATTGNTTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCCTTGACCTTTG--ACCT-T-GAACAT-A-AAAN-TG-GTATAACTTTAGAACC-GGAACTG--ATAGAGACNTCAGATNGGGTGATACGANCTAGNATCAAGGTCNAGTGACTCCTTTACCTTTCCTACNAAGTAGTATNTCCCGTGA--C-C-------T-TGACCTT-G-AAC--------AT-A-AA-A-CTGGTATAACT-T---AACCAG-G-ACT---G--AANCNNGNCATGATTCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACCGGTATCCNGTGNCCTTGACCTCTGACCTTGGAACAT-A-AAA-CTGGTATNAC---TTTAGAACCGGG--------A-------A-T--TGATAGA--GACATTGGGTCTTCAGAAATGA-TAATAAAGGA--TGTNAACT--TG--TC-A-------A---G------TGA-C---T---C--CTGTGACCTTG-ACCTTTGACC-T-TG--AT-CATAANAACTNGT-A-TA--A-CTTTAGAAC
gi|1 : GAACACATTGTGTCAGGGACACATTGTTTTGGCTCCATTTCGTATTATTATTAGTATTTTTTTTTC-T-CTTTGGTGATAA-ATTCACTTGCATGA--TTTTAT-GAA-AGTG-CTTC---AACAGATCCAATTCAAACT---TTAATGTGAGCTG-TAGGGAG-CCATGAA-GAGGG---------------ATGACTGCC----CAA---------CAAGT---AGA-----A--------AA-TCAAG---G-CTGTCACACTTCA-ACCAAATTTT----ATTGC-TGGGG-AATTTGATGACTC-CTGAGTCCATT-TCCAGCAG-GAAAAAAAATTG-------T---G-CCATCCA-----TTTCAAAACGGCC-TTATACA-AAAAAT-G--T-TT--AAG-TGTTTTAAAATTTCTACATCATTTTGGGTTCTG-GA---GTCAATTGAGGCTACGCATTTCATGTCTAGCA-ATCTGTTTTTCTTCT--AT-TCAAATC------T-GC-T--AAAATGGCTGCCATTTCAAAA-----ATCA-A-------------------------GTCGGATTTCAACAAAA-T-T-ATTTTTTCTAGGGTTAATTCA-GGATCC-AAGTC-CATATCTGG-------TATTTTTATTTGGTC-C-ATTTCTGACATA---AGGG---AGGTG----GGTGACATTTTTGTTGGCATCTCA--ACAGTTATAGCTT---GTTT--T-TCATATTC-----TTTTTTCAAGCCTAAAACAACAGGCATT-CTC--TGA--A--AACC--TT----GATG--AAAGT-----AT-TAG-ATATTC-AATA-----T---AT-G--ATATGCCAATGTATCTAGTTGATGCAGAAA---TG--TT------------------AGGGT------------T-GG--A-TACATTTTGAGGGGA----TCAAATGGGGTTGGGGCCGAACGTAGAAC--------------AGATTAATTACAAAATTTAGTAGAT------ATAACTTGACAAAATATG-------NNNN-----------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCTAACC-A-TGAACAT-AAAA-C-TGGTATA------ACT--TTAAAACTACTGCAGGACTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCCTTGACCTCTG--ACCT-T-GAACAT-A-AAAC-TG-GTATAACTTTATAACT-GGAATTG--ATAGAGATATCAAATTGGATGATACAAACTAGTATCAAGGTTGAATGACTCCTTTACCTTTCTTATTAAGTAGTATCTGCAGTGA--C-C-------T-TGACCTT-G------------AT-A-AA-A-CAGATATTA---T---AACCAA-G-ACT---GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTTGACCTCTTACCTT-GAACAC-A-ACA-CTGATATAAC---TTTAGAACTTGG--------T-------C-TGNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNN--NNNNNNNN--NN--NN-N-------N---N------NNN-N---N---N--NNNNNNTCTTG-ACCTTTGACC-T-TG--AT-CATGAAAACTTGT-A-TA--A-CTTTAGAAC
gi|10 : CT-T-GACCAT-A-AAAAGTT-GTATAACTTTAAAACC-AGAACTG--A
gi|11 : ATAAAGAA--TGT-AACC--TA--CA-A-------A---G------TAG-TGTAT---C--CTATGACCTTG-ACCTTTAACC-T-TG--GT-TATAATAACTAAT-A-TA--T-CTATAannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttaaaaaaggaaacaaattaccaaggtatttcgtttgtgaaaattttcaaaatcaaggtctttgtgaactagacttttaaacaaaattggcacggattttgtgcaagggagtgattactgcagggaaaaatagttgtgcattatgtattcagaaaaaaacaacacttttatttatatacaaccagtgcttcgtctgagaaacttaattagcagattataatcataattgtcttgttttttttctacactcttttcaattttattgtcagtt
gi|12 : CCTTGACCTCTG--ACCTCT-GAACAT-G-AAAT-TG-GTATATTTTCAAAACC-AGACCTG--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACT-TGA--C-C-------CCTGACCCTAG-AAC--------AT-A-AT-A-TTGGTATTATA-T---AA-------------G--AACCGGGTCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTTCACATTTAACCATC-AACAT-A-AAA-CTCGTATAAC---TTTAGAACT-GG--------A-------A-T--TGACAGA--GACATGGGATCTTCAG-AATAA-TAtgatataatatataataatatatctaatatatctctataactatagaaatgggattatctgaaatgatgaaaggagcttgagacctacatgtactaactaatatttgtatgagaccagatttaatgatggagtcggaattttctggacaatttgcaaaatctgcaatttagcatttttaaattaacttaaaatctggcattggaggaatacagtagtattgagaaaaagcctactttttacagccagtatttcgtttgggaggttttgtaatcagcagattataatcatatattacat
gi|13 : CCTTG-AACATGA-AAA-CTGTAATAAA---TTTAGAAAAGAG--------A-------AAT--GGATGGACGAACATTGGGTCTTCA-AAAGGATTAATCAGAAACCTGTAACCT--TGTATC-AAGGATTCA---G------TGA-C---T---C--CAGTGA-CTTG-ACTTtgacgtcacaaattcggggagtcgggaacgat
gi|13 : TCCAGTGAC-TTGAC--------TTGGAAGA----AAA-TTGGT-TTACGGATCCATAACCATT--------ATGT----C-T--TG-TAGA--GACATGGGCTCATCAAAAAT---TGATAAGGGC--TTTT--CT--GG--ACTA-------A---C------TAA-C---T---A----GGAATCCCC-ACTTTTGACC-TATGA-AT-CATAGAAAGTTGTAA-TACCA-TTTAAGAAggaagaaaattggtttacggatccataaccattatgtcttgtagagacatgggctcatcaaaaattgataagggcttttctggactaactaactaggaatccccacttttgacctatgaatcatagaaagttgtaataccatttaagaaacagatgtgatatgaagaatggacctacgacgtagtatatcctgt
gi|14 : ccttgaacatgaaaactgtaataaatttagaaaagagaaatggatggacgaacattgggtcttcaaaaggattaatcagaaacctgtaaccttgtatcaaggattcagtgacCTTTG--ACTTCT-GATCCT-A-AAAC-TC-GCATGACTTTAGAACT-GGAATTG--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGC-C-------T-TGACCT------C--------TT-A-AG----TTGTATAACC-T------TAG-A-ACT---G--AA-------ATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTTGACCTCTTACCTTAGATCAT-A-AAA-CTCGCATAAC---CTTAGAAacagatgtgatatgaagaatggacctacgacgtagtatatcctgt
gi|15 : TC--T-G--T--AACCCTTT----GAGG--AAAGT-----AT-TAA-GTATCCATGGA-----TTTTATAG--ATAGGCCAA-GTATCTTGTTG-TGCAGAAAGGTTGAATT------------------GGGGTGTACATTTGTATT-GAATG-TACATT-TGGAGGGA----TCAAATGGGAGTGGGGTTTAACATAAAGCTCGT-T-GGG--AAAAATAAATTCCAAAATTCAACatt
gi|16 : tgaagtttggagacttattgtatttttttgcttggtgcttattcttctttttgtgtgtgtgtgtgctggtt--T-TT---TTCCGCCTCTTTCTTGTGCCTGAAAC--------TG-CCC--G-A--C--A--TTATTCCCCGATG--AAAGT-----CT-TAG-ATATTCTAGGA-----G---AT-G--ATAGGCCAATGTATGTAGAGG-TACAGAAA---TG--TTTTTGTTTTCAGATTGAAGGGGGT------------TAGG--G-TACATTCGGGGGGGG----------GGGGGT---GTTTAACATAAAACTCTA-T-GGG--GAAAATTATTT---AAAT-------------------CTTGAT-AAATATG-------ATAG-----------gaaaagcataatagtttccttaatagatgtg
gi|17 : aacgaagtttggagtcttattgtatttgctcgattcttattcttaccgt------------------GGGGT------------A-CG--G-TACATT--GGGGTGA----T-GAAAGGGGAAG----TTAACATAGAAAACTA-TTGAG--GGAA--TAATTCTAAAATTCAACA----------TAACTTCAC--AATATGNNNNNNNNNNN-----------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTACTTTGACT-TCTGATCCT-AAAA-C-TCGCATG------ACT--TTAGAA-----tgtcatag
gi|19 : ttttgtattcagattgcaaggggggaggggggTCTGGCATAATTA--TTTCTT-T--ATATCTAATTTCCGAATTGC-ATCAAGATGGTTGTCATTTCAAAATGGCTGCCA-AAA-ATGC----------AGT---TTGTTAGACT----------T-T-A-G-TTTGTAGTTTAAATTTA-GGATCCAAAGTC-CATctgg
gi|19 : TCCGACATA---GGGAAATAGATGTT-CGAGGTCATTTGTGTTGACATTCCAACA-GGATATAACTT---GTTccgacatagggaaatagatgttcgaggtcatttgtgttgacattccaacaggatataacttgttatcatactagtattttacaaaataaatttcact
gi|2 : tctggcataattatttctttatatctaatttccgaattgcatcaagatggttgtcatttcaaaatggctgccaaaaatgcagtttgttagactttagtttgtagtttaaatttaggatccaaagtccaGCTTAACATAGAACTCGA-T-GGGTAAAAAATTAATTCCAAAATTCAACAGAT------GTGACTTAAT-AAATATG-------AGAG----------------------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCC-T-TGAACTTAAAAA-C-TGGCATA------ACT--TTAGAA-----AGAGAATTGATTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTTGACCTTTG--ACCT-TGGAAAAG-A-AAAT-TT-ATATTACTTCAGAACC-AGGTTTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCGTGA--C-CTTGACCTT-TGACCTT-G-AAC--------ATAA-AA-A-CTGGTATCATT-TAG-AAAGAG-A-ATT---GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTTGACCTCTGACCTTGGAAAAG-A-CAA-TCGGTATTAC---TTCAGAAACAAG--------T-------C-T--CNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNN--NNNNNNNN--NN--NN-N-------N---N------NNN-N---C---CCACTTTGATCTTGAACATTTAAAG-T-TGTAATACTTAAGAACCAAT-ACTA--ATCTTTAGAatcatactagtattttacaaaataaatttcact
gi|2 : CTTTG--ATCT-T-GAACAT-TTAAAG-TT-GTAATACTTAAGAACC-AATACTA--AT-----CTTTAGAT---GTGATA-GA---AGAAT---------GTGA-------AC------TACAAAATAGTATATCCTGTGA--C-C-------T-TGACCTT-T-GACCTTGATTAAT-A-TA-A-CTTGTATAATT-T------TAG-G-ACT---G--tgtgatagaagaatgtgaactacaaaatagtatatcctgtgaccttgacctttgaccttgattaatataacttgtataattttaggactgggactgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatttactgaagtgaacagactgaggattttttctgaaatttttcaaaatcttggcaatttagatttttcaatgaac
gi|20 : gcttaacatagaactcgatgggtaaaaaattaattccaaaattcaacagatgtgacttaataaatatgagagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgaacttaaaaactggcataactttagaaagagaattgattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgacctttgaccttggaaaagaaaatttatattacttcagaaccaggtttgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccgtgaccttgacctttgaccttgaacataaaaactggtatcatttagaaagagaattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgacctctgaccttggaaaagacaatcggtattacttcagaaacaagtctcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncccaAACACCTAATGTCGGGGACATAGTGTTTTTGCTCCATTTC---TTCTTATCA----TTATTCATCTT-CGTTTGTGCTGA-ACTTGTCTGCGCGATTTTTTATGGAA-AGTGCCTTCCCAGAAAAATCCAATTCAAACT---T---TGTGGG-TGATAAGGCGATC-TGAG-GAGNN---------------NNNNNNNNN----NNN---------NNNNN---NNN-----N--------NN-TCAggactgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatttactgaagtgaacagactgaggattttttctgaaatttttcaaaatcttggcaatttagatttttcaatgaac
gi|21 : aatatacaattactatatattatgtccaccAATCTCTGAAT-GC-TT-GAGATGTTCGCCAATTTAAAATGCCTGCCA-AAA-ATA-----------------------GATTTCAACCAAA-TGT-A-GTTTTA-AGGTTGAATTCG-TGATCCCAAGTC-TACTTCTGGAC-TCGATATATTTCTCT-GTCACAGTTTCTGACAT----GGGA---CGGTGTT-CGGAAACTTTTGTGTTGGCATCCCAGCACAGTTATAGCTT---GT
gi|22 : cAAGAA--TGTGA-CT--TA--CA-A-------A---G------TAG-T---TTATC--CTGTGACCTTT-ACCTTTGACC-T-TG--AT-TATAATAACTAG
gi|23 : cCCCGTAA--C-T-------T-T-----T-G-AAC--------AT-A-AG-A-TCAGTATA--T-G---AACCAG-N-NNN---N--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNT--CCTTGATATTTGACCTTG-AACAT-T-AAA-ATCATATAAC---TGTAGAA-CAGG--------A-------A-T--TGgactannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtttactgaaggaaacaagaggatttttttttctggaaactttcaaaatctt
gi|23 : tgaTCCTTGATATTTG--ACCT-T-GAACAT-T-AAAA-TC-ATATAACTGTAGAACA-GGAATTG--
gi|24 : tgacccgtaacttttgaacataagatcagtatatgaaccagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnT------------------GGAGT------------T-GG--GGTACATTTGGGGGGGGGGGGTCAAATGAGGAAGGAGTTTAACATAGAACTCCA-G-GGG--GATAAT---TTCCAAAATTAAACAGAT------TTAACTTGAC-AAATATG-------ATAG-----------
gi|26 : ttcagattgaa---AAA-----A--------AA-TCAAA---G-TTGTCGGATTCCACACCAAATTTTC--AATTTT-TA--TTAATTCGATGAC-C-CCAAGTTCATTGCTTCGCATCACAAAAACATTT-------TTTAGCCCGCCCATTTTTTTTCAAAATGGattcctggggtcttcggaaatgaaaatacaaggcccacgaactacctagt
gi|27 : tgaaaatgcaaatattacccgaaggcaacttaaactatgtaaaaa---AAA-----A--------AA-TCAAA---G-TTGTCGGATTCCACACCAAATTTTC--AATTTT-TA--TTAATTCGATGAC-C-CCAAGTTCATTGCTTCGCATCACAAAAACATTT-------TTTAGCCCGCCCATTTTTTTTCAAAATGG
gi|28 : tgaaaatgcaaatattacccgaaggcaacttaaactatgtaaaaaCTTGACTTCTGACCTTT-AACAT-GTAAA-CTGGTATCAT---TTTAAAAGTGGG----------------A-T--TAATA-A--CANNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNN--NNNNNNNN--NN--NN-N-------N---N------NNN-N---T---A--CTTTGACTTAG-ACCTCTGACCAG-GG--AA-CATAGAA--TTGC-A-TT--A-CTTCAG
gi|29 : ----TTCTCCTTC-T---TCAGTAA-GACATGTGTCCACGTGC--TTTGAT-AAA-AGTG-CCTT---TATAGATCAAATTCAATTT---T---TGTAGGCTGATAGAGAG-ccacat
gi|3 : TGTT----GATG--AAAGT-----CT-TAG-ATATTCTAGGA-----T---AT-G--ATAGGCCAATGTATGAAGATG-TGCAAACA---TG--TTTTTGTTTTCAGATCGAAAGGGGT------------T-GG--GGTACATTCTGGGAGGA----TTAAATGGGGGTGGGGTTTAACATAAAACCCTA-T-GGG--GAAAA--AATCC--AAATTCAACAGAT------GTAAATTGAA-AATTATGNNNNNN-NNNN-----------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTTGACCAT-TGACCATAAAAA-C-TGGTATA------ACT--CTAGAA-----AGAGAGTTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTTGATC-TTG---------GAAAAG-A-AAAT-AG-GTACTACTTCAGAACCAGGTACGN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTTGA--CTT-------T-TGACTTT-G-AAT--------AT-A-AA-ACCTGGTATAACTCT---AGAAAGAG-ACT--------TCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCT-TGATCTTGGAAAAG-A-AAA-TAGGTACTAC---TTCAGAACCAGGTACGNNNNN-------N-N--NNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNN--NNNNNNNN--NN--NN-N-------N---N------NNN-N---N---N--NNNNNNNNNNN-NNCTTTGACC-T-TG--AA-CATAAAAACTGGT-A-TA--A-CTTTAGAAaacaaactactttcaaaatgccccccaccccgcccccaattcaaaatgtcaaaaatgtcaacaattaaggttg
gi|3 : TTTGACT-T-TGAATAT-AAAA-CCTGGTATA------ACT--CTAGAA-----AGAGACTTCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTTGATC-TTG---------GAAAAG-A-AAAT-AG-GTACTACTTCAGAACC-A-----G--GTACGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--C-T-------T-TGACCTT-G-AAC--------ATAA-AA-A-CTGGTATAACT-TTAGAA--AGAG-ACTTGCN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTTGACTTCTGACCTTGGAAagagacttgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgacttctgaccttggaaaagaa
gi|30 : tgttgatgaaagtcttagatattctaggatatgataggccaatgtatgaagatgtgcaaacatgtttttgttttcagatcgaaaggggttggggtacattctgggaggattaaatgggggtggggtttaacataaaaccctatggggaaaaaatccaaattcaacagatgtaaattgaaaattatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctttgaccattgaccataaaaactggtataactctagaaagagagttgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgatcttggaaaagaaaataggtactacttcagaaccaggtacgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgactGTT-TGGAGACATTGCTTTTG----CTCGGTTC--TTTTCGCTTCTCGTTCATTATC---GTCTGCTTCTTTCTTGTGCCTAAAAA--------T--CTC--C-A--T--AGCTTGTT----GATG--AAAGTATTTATT-TAG-AGATTTCAGaagaa
gi|31 : ttttcaaatgaaAAAAG--------TT-TTC--T-A--TGCAACATGTG----GAAG--AAAGT-----CT-TAG-ATATTATATGA-----T---AT-GATATAGGCTAATGTATGTAGAT--CGCAGAAA---TG--TT----------------------T------------T-GG--G-T---TTC-----AGA----TTGAA-GAGGTTGGGGTattgaaggggttagggtgcatt
gi|32 : tttgtcgtgcttaaaactgtcttgataaa-A-AAA-TTGGTATCAT---TTTAAAACTGGA--------ATAAAATTA-T--TGATAAA--GATAATGTGATATAAGAACTGA---GTAGAGGA--T--TAACTAGTG--TC-A-------A---GGTCAATTGA-C---T---C--CTGGGACATTT-ACCTTTGACC-T-TG--AT-CTTAACAACGAAT-A-Tattgg
gi|33 : ataGCTT---CTTC--T-TC---TTCCGCCGTTTTCCCATGTCTAAAAC--------TG-TCC--G-A--C--A--CTGTT----GATG--AAAGT-----CT-TAG-ATATTCTAGGta
gi|34 : gtctcccaaacgaagtttggagacttattgagtttgctcagttcttgcaattcttcc------TGA-C---T---C--CTGGGACATTT-ACCTTTGACC-T-TG--AT-CTTAACAACGAAT-A-TT--A-CTTT-GAA
gi|34 : TGAATGG--TGTGAGCT--T----C-A-------AACTG------TTATC---T---C--CAGTGACCTTG-ACTTTTGACC-C-TG--AT-CCTAAAAGCTTGC-A-Ttggtgtgagcttcaaactgttatctccagtgaccttgacttttgaccctgatcctaaaagcttgcat
gi|35 : tgactcctgggacatttacctttgaccttgatcttaacaacgaatattacttCCGCCTCTTTCTTGTGCCTAGAAT--------TT-CTC--T-A--T--AACCTGAT----AATGCCAAAGT-----GTGTAG-ATGTGC-AGAAGTTTTT---TT-G--TT-------TGTTTTTAGAT--TGAAG------------------------------GGGGT------------TGGG--G-TACATTTT
gi|37 : GCTT---CTTC--T-TC---TCCCGTCGCTTTCTCATGC-TAAAAC--------TTTCTCCTT-ACTT--AACCTGTT----GATT--AAAGT-----CT-TAG-ATATTCTAGGA-----T---AT-G--ATAGtag
gi|4 : -CTC--C-T--T--AACCTGGT----GATG--GAAGT-----CT-TAG-ATATTCTAGGA-----T---AT-G--ATAGACCAATGTCTGTAGATG-TGCAAACA---TG--TTTTTGTTATCAGATTGAAGGGGGT------------TAGG--G-TACATTCTTGGGGGA----TCAAATGGGGGTGTGGTTTAACATAGAACCCTATT-GGA--AAAAATTAATTCCAAAATTCAACAGATAATATGATAACTTGAT-AAATATG-------ATAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTTTGAAC-T-TGAACATCAAAA-C-TGGTATA------ACT--CTAGAA-----AGAGAGTAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTTGACC-TTG---------GAAAAG-A-AAAT-AG-GTATTACTTCAGAACCAGGTATGN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTTCA--C-CT------T-TGACCTT-G-AGC--------AT-A-AATA-CTGGTATAATT-------CTAG-A-AA----G--AAACATGCTA-GATTCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTTGACCTCTGACCTTGGAAAAG-A-AAA-TAGGTATTAC---TTCAGAACCAGG--------T-------A-TGNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNN--NNNNNNNN--NN--NN-N-------N---N------NNN-N---N---N--NNNNNNNNNNN-NNNNNNNNCC-T-TG--AA-CATAAAAACTGGT-A-TA--A-CT
gi|4 : CC-T-TGAACAT-AAAAAC-TGGTATA------ACTAATTA-AC-----AGAGaattaacagag
gi|40 : ctccttaacctggtgatggaagtcttagatattctaggatatgatagaccaatgtctgtagatgtgcaaacatgtttttgttatcagattgaagggggttagggtacattcttgggggatcaaatgggggtgtggtttaacatagaaccctattggaaaaaattaattccaaaattcaacagataatatgataacttgataaatatgatagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncctttgaacttgaacatcaaaactggtataactctagaaagagagtagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgaccttggaaaagaaaataggtattacttcagaaccaggtatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttcacctttgaccttgagcataaatactggtataattctagaaagaaacatgctagattctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttgacctctgaccttggaaaagaaaataggtattacttcagaaccaggtatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnATAAATTTAGAAAG-AGAATTG--ATAGAGACTTCAGAAAGGGTAACATGACCT-GTA--AAGGTCCAGTGACTCC
gi|41 : CCTACAACGTAGTATATCCAGTGA--C-C-------T-Tagtgacttt
gi|44 : atagagacataaaaattttagatgagattaaaaaaaatgtgaCTTGACCTCTGTGACCT-T-TAGGAT-A-AAAA-TGAGTGTAACTTTAGAAGA-GGAACTT--ATAGAAAtat
gi|45 : TTG--ACAT-T-GAACATTA-AAAG-TG-GTAAAACTTTAGAAAC-AGGGTTA--ATAGAGACATttc
gi|47 : cCTTGACTTCTGACCTTGGAAAAG-A-AAG-TTGGTATTGC---TCCAGAACCAGG--------gggacctt
gi|48 : agTTTGACC-T-TGAACAT-ATAATC-TGGTATACATGTAACT--TTAAAA-----AGAGAATTGtct
gi|49 : TTG--ACCT-T-GATTAT-G-AAATATA-TTATAATTTTAGAACT-GGAACTG--
gi|5 : tggtcGTCTCGAACACATATTGTTTTTGTTCCGTTTC---TTCTTATTT----TTCTTCTTC-TTCTTTAGTAATGA-ACTTGTC-ACCCGA--TTTGAT-GAA-AGTG-CTT----AACAG-------------T---T---TGTGGACTGATAGGGA--TAATTAG-GAGTGCACAAAACATTGAAAATGGCCGCCAATTCAAAATGGCCACCAAAA---AAAGGCTAA--------AA-TTAAA---GGTTGTTGGATTTTA-ACCAAATTTT-------TC-TAGGGTAATTTGATGAC-C-CGGAGT-CATT-TCC-GCAT-GCAAAA-TATTT-------TTAAGCCCGCC-A--TTTTT---ATATGGCCGCCACAGC-GGAAAT-CCTT-TT--AAA-TG-CTTAAAA---ATATATTA-TTTGAGTTATGGTGCAAGTCCAACGAGGGTTCACAGTTCATTTCTAGCTAAGTTA--TT-CTT-TCCATATCCAATTTCAAAAT-GTATGCAAGATGGCCATCATTTCAAAA-GGCTGTCA-AAATATTC----------CGT---TTGTCGGATTTCAACCAAATT-T-A-G-TTTATAGAGTGAATTCACCCATTCCAAATCTTATTTCTTGACATTAAAATATGTTTAA-ACC-CAATTTATGACAAA---GGGG---AGGTGTTGCGGGGACA
gi|50 : attat-CTC--C-T--T--AACCTGGT----GATG--GAAGT-----CT-TAGAATATTTTAGGA-----T---AT-G--ATAGg
gi|51 : CTTGACCTCTG--ACCA-T-GAA-AT------G-TG-ATATAACTTTGGAACT-GGGACTG--Aa
gi|6 : -ACTTGTCCGCGCGA--TTT-AT-GAA-CGTG-CTTC---AACAGATCTAATCTAAATTCAAT---TGTGGACTGATAGGGGG-TCATACG-ACGGG---------------GTG----------CAAT--------CAAGTTTCAAA-----ATGGCTGACAATTCAAA---T-TTG-CGGA
gi|6 : -GT-TTCAAAATGGCTGACAATTCAAATTTGCGGACA-AAA-AAGGTAAAAAAAAAAATACGTTGTCGGATTTCAACC--A-T-T-T-CTTTTCTAGGGTAATTTGA-TGATCTCGAGTT-CATTTCcaaaaaaggtaaaaaaaaaaatacgttgtcggatttcaaccatttcttttctagggtaatttgatgatctcgagttcatttccagcaattaaaacaaattgagtcggcattttgaaaatggccgccatatacagaattgtatcaaaatgataagctttctacatcatttgggatctgtgtcatttgagggtatacaattgatatctatcaatagtattactttatatcaaatttcccactgtttcaagatggccgactttacaaaattgctgcaaaaaataaagtttaacggatttcagccttcagtttttaggttgcatttaggattcgaagtctatttttgtactcgatatgtctctgtgtcaccatttaagataggggggggggcgttcgggtacatttttgttggcaccccaacacatttaaaacttgt
gi|6 : acttgtccgcgcgatttatgaacgtgcttcaacagatctaatctaaattcaattgtggactgatagggggtcatacgacggggtgcaatcaaAA---------AAGGT---AAA-----A--------AA-AAAAATACG-TTGTCGGATTTCA-ACCA---TTTC----TTTTCTAGGGTAATTTGATGAT-C-TCGAGTTCATT-TCCAGCA--ATTAAAACAA-A-------TTGAGTCGGC--A--TTTTG--AAAATGGCCGCCATATA-CAGAATTG--T-ATCAAAA-TG-AT-AAGCTTTCTACATCA-TTTGGGATCTG-TG----TCATTTGAGGGTATACAATTGATATCTATCAATAGTA--TTACTT-T--ATATCAAATTTCCCACT-GT-TTCAAGATGGCCGACTTTACAAAATTGCTGCAA-AAA-ATAA----------AGT---TTAACGGATTTCAGCC----T-TCA-GTTTT-TAGGTTGCATTTA-GGATTCGAAGTC-TATTTTTGTAC-TCGATATGTCTCTGT-GTCACCATT--TAAGATAGGGGGGG---GGGCGTT-CGGGTACATTTTTGTTGGCACCCCAACACATTTAAAACTT---GTcagcaattaaaacaaattgagtcggcattttgaaaatggccgccatatacagaattgtatcaaaatgataagctttctacatcatttgggatctgtgtcatttgagggtatacaattgatatctatcaatagtattactttatatcaaatttcccactgtttcaagatggccgactttacaaaattgctgcaaaaaataaagtttaacggatttcagccttcagtttttaggttgcatttaggattcgaagtctatttttgtactcgatatgtctctgtgtcaccatttaagataggggggggggcgttcgggtacatttttgttggcaccccaacacatttaaaacttgt
gi|7 : acttgtccgcgcgatttatgaacgtgcttcaacagatctaatctaaattcaattgtggactgatagggggtcatacgacggggtgcaatcaagtttcaaaatggctgacaattcaaatttgcggacaaCTTGATATTTG--ACCT-T-GAACAT-T-AAAA-TC-ATATAACTGTAGAACA-GGAATTG------------------GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGGATCCCCAATGA--T-T-------T-TGACCTT-G-ATC--------AT-AGAA-A-GTTGTATAACT-TAAGAACCAG-T-ACT-------------ANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACCGGTATCCAGTATCCTTGACCTTTGACCTTG
gi|8 : -C-------T-TGACCTT-GGAAA--------AG-A-AA-A-TGGGTACTGCT-TCAGAACCAG-GTAC---------GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACTT--GACCTTG-AACAT-A-AAAACTGGTATAAC---T---AAA--GAG--------A-------G-T--TGATAAA--AACGTTGGGTCTTCAAAAATGA-TAATAGGAGA--TATCAATT--TG--TC-A-------A---G------TGA-C---T---T--CAGTGACCTTG-ACCTCTGACC-T-TG--attnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaacttaaaattggcatttaagcatggattatttgtaagggaggtatacagtagtatgaggaaaaagcccactttgtacagccagtgctt
gi|8 : CCTTGACCTCTG--ACCT-T-GGAAAA-G-AAAA-Tgaaaagaaaatatgttgaaccaggtacgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtttttggaaggaaacaggattatttttgggaattttcaaaaatctttacgattcagaatttttaaatgtacttgaaatgggcatggcatgaattgtgtgcaagggtggaatacagttgtatta
gi|9 : cttgaccttggaaaagaaaatgggtactgcttcagaaccaggtacgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacttgaccttgaacataaaaactggtataactaaagagagttgataaaaacgttgggtcttcaaaaatgataataggagatatcaatttgtcaagtgacttcagtgaGAACACGTAGTGTTGGGG--ACATTG-TTTTGC----TTTC---TTCTCA-AA----TT--------T-CTTTAGTGAGAA-ATTTGTCCGCACGA--TTTTAT-GAATAAT--CTTC---AACAGATTCAATTCAAACT---T---CGTGGGTTGACAGGGGG-TCCTGGGAGAGGG---------------GTGatgttgaaccaggtacgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtttttggaaggaaacaggattatttttgggaattttcaaaaatctttacgattcagaatttttaaatgtacttgaaatgggcatggcatgaattgtgtgcaagggtggaatacagttgtatta
gi|9 : ttatgtccccAACTTTCGGAATTTT-CAAAGT--------GGC-CGCCGA-TTCAAGATCCATCAT-AAAAAAA-ACCCGAAAAAACTGAGCC-GCC-A--TTTT--CAAAATGGCCGCCATAAACGAAAAT-G--TATC--AAAGTA-CT-AAAATCTCTACATCA-TTTAGGTTTTG-TG---GTCAGTTGAGGGTACACAATTCATATCTAGCGTAAGTA--TTTCTT-T--ATATCAAATGTTTGAAT-GT-TTAAAGATGGTTGTCATTTCAAAATGGCTGCCACAAA-ATGA----------AGT---TTGTCGAATTTCAACCAAATT-T-A-GTTTT-TAGGTTGAATGCA-GTATCATAAGTT-TATTctatcaactttcggaattttcaaagtggccgccgattcaagatccatcataaaaaaaacccgaaaaaactgagccgccattttcaaaatggccgccataaacgaaaatgtatcaaagtactaaaatctctacatcatttaggttttgtggtcagttgagggtacacaattcatatctagcgtaagtatttctttatatcaaatgtttgaatgtttaaagatggttgtcatttcaaaatggctgccacaaaatgaagtttgtcgaatttcaaccaaatttagtttttaggttgaatgcagtatcataagtttatt
8 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|18 ): ATTACGTGTATCAGACGGATTATTATGGGTCTGGAAATTTTCAAAATCTTATTACGTTAGAATTTTCGGTTAATGAACCGGGGCATGTGCATGGGACTACTTGCACGGGAGGAATACAGTTTGTATTAAGAAAAAGCTTTTACTTTGTACAACCACGTACTTCGTTTGCGGAGACTTTTATATCGGTCAGATGGAATATTATATCTCTACATCTGGTTTTAACATGCTAAGGAATT
Unaligned ( gi|25 ): ATTAATCATGGTCTTTGTGCTCTAGATGTATTTTAAATGATTTATGAATGGCATGGATTTTGTGAGAGGGAGGAAAATAGTACTCAAAAAAGTCCACTATTATACAAATAGTATTTCGATTGGGAGACTTTATAATTGGTAAATTATAATAATATCTTATATGACTTC
Unaligned ( gi|36 ): GGATTTTGTGCAAGGGGTTATTAATATGGGGAAAATAGCAGCATCAGAAAAGCTCAACTTTTATACAGCAGATTTATTTGGCGAAGACTTTATAACGCAGATTATCATC
Unaligned ( gi|38 ): AAAGGGAGTTGACCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Unaligned ( gi|39 ): TCTCCAAAACAAAGTTTGGAGAGTGACTAATTCATAGTGTTTTTGCTCTGTTCATGTAATTCTTCCACTCCTCCTTGTTCC
Unaligned ( gi|42 ): TAAGTCTCCCAAACGAAGTCTGGGGACTTATTGCGTTTGCTCAGTTATAATTCATCATATTCTTCTTCCGCC
Unaligned ( gi|43 ): TCTTCGTAACGAATTTTGGAGACTTATTGTGTTTGCTCAGTTCTTTTAAATCGTCTGGCTCTTCCTCTTCCG
Unaligned ( gi|46 ): AAAATCAAGGCTTGTGTGATCTAGACTTTTAAATAAAGTTAAAATTGGCACGGA