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Reference ( family-1933 ) : NNNNCATTCGGTNAATTTTCAAGCGATTAAAATTGGGTACCTGTAAAGT-GCGAA-ACG---AAA------------TA-----------GAA---A-CGAAA------CGAA---ACGAAA-----TCTA-C-C-G-A--A-AC--GAA---------A-----CGAA--A-T--AC----GA--C-GAA-AC------GAAA-T-C-TACCGAA-ACGAAA------CG---------AAAC-C---T---A------CCG-A-AACG-AAA--CG--AA-A-CCT-ACC-GAAA-C-G-A-A--CG-AAAA-TC--TA---TACCG-AAG-CAAA-A----A-N-AAA-C-AG-AC----------C-A--T-T-G---TAC----AA--CCA-A-AC------T-ATA---T--TT-----------AA-TT---ATA-AT----ATC-AA-T-A-A----ATGA-TAA-T--AT-GG----ACGAG--CA-T----CT-CAGAC----CC--CTGTGA--AA----GGTG------CCACATA-TATA---A-AGATG----A--AAT--CGATT-AG-G-GTC------G-ACTGA-TAC-G-TCCA-T-CA-TT---ACA--ATCAAA--C-ATT------------GTA-G---GA---------A--G---CCG--GCG--TCT-G-GG--AGNAG-AT------A-AA---TACA-G--A---AACAC-G----TGC-AA-ATCATAAA-------AA-----C--------G--------GGGGG--------GG---GGGCAA---AGTAC-AAGGT-AAAA-TCTT-A-A-GTT----AACTT--AGA-TC----ATA------AC-GG---G------G-----GCAAT-GAGTTTCA--GA-AATTTCAGA-TG-GGAGGGG-GT-TGGGTTGGGTT-----GTTACAGGTCGG-ACGTCAGGGA-TAACACGAAACAACGGGAGGTTTCAGT-ATTTCTTGCTCTGAAG-A-CAA--------AT--GTGCATAT-------------------------TGTTTGTTT----TACA-AGA-TANACTAATTAA-TTGGCGCGAAAGTT--TATA-AAT
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gi|11 : cgggtacttaaagtgcgaaacagcaaatacgaaacgaacgaaatctaccggccGTAAAGT-GCGAA-ACG---AAA------------T
gi|11 : ------CGAA---ACGAAA-----TCTA-C-C-G-A---------AA---------A-----CGAA--A-T--AT----GGCCC-GAA-AC------GAAA-T-CTTACCGAA-ACGAAAACCCATCGAAAAACGAAAAAC-C---TATTA------CCG-A-AACGAAAA--TGATAA-A-CCTAACC-GAAACC-A-A-A--CA-AAAA-TG--TA---TACCT-AAG-CAAA-A----ATT-AAACC-AG-AC----------C-A--A-T-AT--TAC----AA--CCA-A-AC------T-ATA---T--TT------------A-TT---ATA-AT----ATC-AA-T-A-A----ATGATTAATT--AT-GG----ACGAG--CA-T----CTAAAGAC----CT--TCTTGATGAA----GGTG------CCActaccgaaaacgaaatatggcccgaaacgaaatcttaccgaaacgaaaacccatcgaaaaacgaaaaacctattaccgaaacgaaaatgataaacctaaccgaaaccaaacaaaaatgtatacctaagcaaaaattaaaccagaccaatattacaaccaaactatatttattataatatcaataaatgattaattatggacgagcatctaaagaccttcttgatgaaggtgcca
gi|12 : gtaaagtgAA---------A-----TAAA--A-A--GC----AA----AAA-AT------GAAA--------CGAA-CTAAAA------TG---------AAAA-C---T---A------CCA-A-ATTG-AAA--CG--AA-A-CCT-ACC-GAAA-C-A-A-AA-CG-AA------------T-TCA-AAT-CAAA-A----C-A-AAA-C-GA-AC----------T-T--T-T-G------------------A-AC------------------------------------------AT----AGC-AA-T-A-A----ATGA-TAA-T--AT-GG----ACGAG--CA-T----TT-CTGGT----CC--TTGTAA--AA----GGTG------C----------A---A-AGGTGCCACA--AAT--CAATA-AG-A-TTC------G-CCT
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gi|14 : GGGTACCTGTAAAGT-GCAAA-ACG---AAA------------TA--------------------GAAA------CGAA---ACGAAA-----TCTA-A-C-G-A--A-AC--GAA---------A-----C-----A-T--A--------------------------------TACCGAA-ACGAAA------CG---------AAAC-C---T---A------CCG-A-AAC-----------------------------C-A-A-A--CA-AAAA-TC--TA---TACCG-AAGAAAAA-A----A-T-AAA-C-AG-AC----------A-A--T-
gi|14 : AT-AAGGT-AAAAATCTT-A-A-GTT----AACTT--AGT-TC----ATATGGGGAAC-GA---G------A-----GCAAT-GAGTTTCA--GA-AATTTCAGA-TG-GGaatcatatcaataaggtaaaaatcttaagttaacttagttcatatggggaacgagagcaatgagtttcagaaatttcagatggg
gi|15 : gggtacctgtaaagtgcaaaacgaaatagaaacgaaacgaaatctaacgaaacgaaacatataccgaaacgaaacgaaacctaccgaaaccaaacaaaaatctataccgaagaaaaaaataaacagacaataatcatatcaGGGTAC-TGTAAAGC-G-GAA-ACG---AAAACGAACAAAATCTA------------AA---C-CGAAA------CGAA---ACGAAAAT---TCTAAC-C-G-A--ACAC--GAA---------AA----CAAA--A-TCCACCAA-AA--C-GAA-AC------GAAA-C-C-CACCGAAGACGAAA------CG---------AAAG-C---TATAA------CC--A-AACGAAAA--CG--AA-A-CCT-ACC-GACA-C-A-A-A--C----AA-TC--TA---TACTGAAAG-C-AA-A----A-T-AAA-C-AG-AC----------C-A--T-T-G---TAC----AA--CCA-A-
gi|16 : taT----TACA-AGAATACACTAATTAAGTTGGCGC-AAAGTTACTATACAAT
gi|17 : tgcatacctctgaattaaTTGGGTACCTTTAAAGT-GCGAA-ACG---AAA------------TC-----------GAA---cattagatagtgttactaaaacgtgcccagaccgggaaaaaaagcggcccatgaaaataaattttaaggattacatgtattattaatcactgaaacccgactagaagaaaacagcaccgacgaaaaattaatgaaaattaaa
gi|18 : tgacatt--C-AAA-AC------GAAA-T-A-TACCGAA-ATAAAA------CG---------AAAT-T---C---A-------------ATG-AAA--CG--AA-A-CCT-ATC-AAAA-CCA-A-A--CA-AAAA-TC--TA---TACAG-AAG-CAAA-ACCAAA-TCAAA-C-AA-AT----------C-A--T-T-G---CAC----AA--CCA-A-GC------T-ATA---T--TC-----------AA-TT---ATA-Annnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncc
gi|2 : gTTCGGTGAATTTTCAAGCGATTAAAATGGGGTACCTGTAAAGT-GCGAA-ACG---AAA------------TA-----------GGA---A-CGAAA------CG---------AA-----TCTA-C-C-G-A--A-AC--GAA---------A-----CGAA--A-T--A--------------------------------TACCGAA-ACGAAA------CG---------AAAC-C---T---A------CCG-A-AACG-A--------------------------------------AAAA-TC--TA---TGCCG-AAG-TAAA-A----A-G-AAA-C-AG-AC----------C-AATT-T-G---TAC----AA--CCA-A-GCTACATGT-ATA---T--AT-----------AA-TT---TAA-AT----ATC-AA-T-A-A----ATGA-TAA-G--AT--G----ACGAG--CA-T----CT-CAGAC----CC--CTGTGA--AA----GGTG------CCAC-----ATA---A-AGATG----A--AAT--CGATT-AG-G-GTT------G-ACTGT-TACGG-TCCA-A-TATTT---ACA--ATCAAA--C-ATT------------GTA-G---GA---------A----------------------------------------A-AA----GCG-G--C---AACACAG----TGC-AA-ATCAT-AA-------AA-----CGGGGGAGGG--------GGGGG--------GG---GGGCAA---AGTACAAAAGTAAAAA-TCTT-A-A-GTT----AACTT--AGA-TC----ATA------ACGGG---G------G-----GCAAT-GAGTTTCA--GA-AATTTCAGA-T------GGG-GTGTGTGTGGGGGT-----GTGACAGGTCGG-ACGTCAGGGA-TAACACGAAACAACGG--ACTTTCAGC-ATTTCTTGCTCTGAAG-A-CAAATGTATATAT--GTGTATAT-------------------------TGTTTGTTT----TACACAGA-TAGACTAATGAA-TTGACGAGAAAGTT--TACA-gt
gi|20 : ttatattt-TT---ATA-TC----ATT-AA-T-G-G----TTGC-TA--C--AA-GG-----CGAT--CA-T----TT-CAGGT----CA--ATGTGA--TA----GGTG------C---------TA---A-AG--G----A--ATC--CAATT-AA-C-ATCATTGCTG-ACTAA-TAA-GACCCA-TTCG-TT---AGA--ATCAAA--C-ATT------------GTA-G---GA---------A--tgtataactaaaagcg
gi|21 : GAAA------CG---------AAAC-C---T---ATA----CAG-A-AACG-AAA--TG--AA-C-CCC-ATC-GAAA-CCA-A-A--TA-AAAA-TG--TA---TACCG-AA----AA-A----A-T-AAA-C-AG-AC----------C-A--T-T-G---TAC----AT--CCT-A-Aaaa
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gi|23 : GATG----A--AAT--CGATT-AG-G-GTT------G-ACTGA-TGG-GATCCA-T-TA-TTT--ACA--ATCAAA--T-ATT------------GTA-G---GA---------A--GAAACCG--GTG--TCT-G-GG--GAAAG--T------A-AAATATACA-G--A---AACAC-G----TGC-AA-ATCATAAA-----------------------G--------GGG
gi|24 : -AAAA-T---TA---TACCG-AAG-CAAA-A----A-T-AAA-C-AG-AC----------C-A--T-T-G---TAC----AA--CCA-A-AC------T-ATA---G--TT-----------GA-AT---AGA-AA----TTC-AT-T-A-A----AGGA-TAAGT--AT-GG----ACGAG--CA-T----CT-AAGAC----CC--CGGTGG--AA----GGTG------C
gi|25 : TT----AATTT--AGA-TC----ATA------AC-GG---G------G-----GCAGT-GAGTTAAA--GA-AATTTCTAA-TG-GGAAGGGAG---GGG--GGGTT-----GTTACATGTCGG-ACGTCAGGCA-TAACACGAAACAACGGGAGaa
gi|26 : GT-AAAA-TTTTTA-A-GTT----AACTT--AGA-TCGTATATA------AT-GG---G------G-----ACA------------------TTTCAGA-TG-G-AGGGA-GT-TGGGTTGGGTTAAATTGTTACAGATGAG-ACGTCAGGGATTAACAC
gi|27 : A--CG--AA-A-TCT-ACC-GAAA-C-G-A--------AAC-CC--TA---TATTG-AAA-CAAA-G----A-G-AAA-C-AGAACACA-------C-A--T-T-G---TAC----AA--CCA-A-AC------T-A
gi|28 : TAAAGT-GCGAA-ACG---AA---------------------------------------------CGAA---AC---A-----TCTA-C-C-G-A--A-------------------------------T--AC----A-----GAA-AC------GAACCT-C-TACTGAA-AACAAA------CG---------AAACTC---C---A------CCG-ACAACG-AAA--CG---A-A-CCC-GTC-GAAA-aaggaataaatggcgagcaactcagtagtac
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gi|30 : gctcgtccataattatcatttattgattttaactaaatatagtttgaaaaacggaa-A-GTT----AACTT--AGA-TC----ATA------AC-GG---GAACGGGG-----ACAAT-GATTTTCA--GA-AATTTTAGA-TG-GGAGGGA-GT-TTGGTT
gi|31 : TGAAG-A-CAA--------ATATGTGCAAAT-------------------------TGTTTGTTT----TACA-AGA-TACACTAATTAA-TTGGCGCAAAAGTT--T
gi|32 : GGGTACCTGTAAAAT-GCGAA-ACG---AAA------------CG-----------CAATCTACCGAAA------TGAA---ACGAAA-----TTTA-C-A-G-A--A-
gi|33 : A------AC-GG---G------A-----GCAAT-GAGTTTCA--GA-AA-TTCAGA-TG-GGAGGGT-GT-TGGGTT
gi|34 : g-T----CT-CAGAC----CG--CTTTGA--AA----GGTG------CCACACA-T--------AGAT-----A--AAT--CGAT
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gi|36 : GGGTACCTGTAAAGT-GCGAA-ACG---AAA------------T
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gi|14 : GGG-TACCTGTAAAGT-GCAAA-ACG---AAA------------TA--------------------GAAA------CGAA---ACGAAA-----TCTA-A-C-G-A--A-AC--GAA---------A-----C-----A-T--A--------------------------------TACCGAA-ACGAAA------CG---------AAAC-C---T---A------CCG-A-AAC-----------------------------C-A-A-A--CA-AAAA-TC--TA---TACCG-AAGAAAAA-A----A-T-AAA-C-AG-AC----------A-A--T-
gi|14 : AT-AAGGT-AAAAATCTT-A-A-GTT----AACTT--AGT-TC----ATATGGGGAAC-GA---G------A-----GCAAT-GAGTTTCA--GA-AATTTCAGA-TG-GGaatcatatcaataaggtaaaaatcttaagttaacttagttcatatggggaacgagagcaatgagtttcagaaatttcagatggg
gi|15 : gggtacctgtaaagtgcaaaacgaaatagaaacgaaacgaaatctaacgaaacgaaacatataccgaaacgaaacgaaacctaccgaaaccaaacaaaaatctataccgaagaaaaaaataaacagacaataatcatatcaGGG-TAC-TGTAAAGC-G-GAA-ACG---AAAACGAACAAAATCTA------------AA---C-CGAAA------CGAA---ACGAAAAT---TCTAAC-C-G-A--ACAC--GAA---------AA----CAAA--A-TCCACCAA-AA--C-GAA-AC------GAAA-C-C-CACCGAAGACGAAA------CG---------AAAG-C---TATAA------CC--A-AACGAAAA--CG--AA-A-CCT-ACC-GACA-C-A-A-A--C----AA-TC--TA---TACTGAAAG-C-AA-A----A-T-AAA-C-AG-AC----------C-A--T-T-G---TAC----AA--CCA-A-
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Reference ( family-1933 ) : NNNNCATTCGGTNAATTTTCAAGCGATTAAAATGGG-TACCTGTAAAGT-GCGAA-ACG---AAA------------TA-----------GAA---A-CGAAA------CGAA---ACGAAA-----TCTA-C-C-G-A--A-AC--GAA---------A-----CGAA--A-T--AC----GA--C-GAA-AC------GAAA-T-C-TACCGAA-ACGAAA------CG---------AAAC-C---T---A------CCG-A-AACG-AAA--CG--AA-A-CCT-ACC-GAAA-C-G-A-A--CG-AAAA-TC--TA---TACCG-AAG-CAAA-A----A-N-AAA-C-AG-AC----------C-A--T-T-G---TAC----AA--CCA-A-AC------T-ATA---T--TT-----------AA-TT---ATA-AT----ATC-AA-T-A-A----ATGA-TAA-T--AT-GG----ACGAG--CA-T----CT-CAGAC----CC--CTGTGA--AA----GGTG------CCACATA-TATA---A-AGATG----A--AAT--CGATT-AG-G-GTC------G-ACTGA--TAC-G-TCCA-TT-----A-TT---ACA-ATC--A-AA--C-ATT------------GT-A-G---GA---------A--G----CCG--GTGTCT-GGG--AGNAG-AT------A-AA---TACA-G--A---AACAC-G----TGC-AA-ATCATAAA-------AA-----C--------G--------GGGGG--------GG---GGGCAA---AGTAC-AAGGT-AAAA-TCTT-A-A-GTT----AACTT--AGA-TC----ATA------AC-GG---G------G-----GCAAT-GAGTTTCA--GA-AATTTCAGA-TG-GGAGGGG-GT-TGGGTTGGGTT-----GTTACAGGTCGG-ACGTCAGGGA-TAACACGAAACAACGGGAGGTTTCAGT-ATTTCTTGCTCTGAAG-A-CAA--------AT--GTGCATAT-------------------------TGTTTGTTT----TACA-AGA-TANACTAATTAA-TTGGCGCGAAAGTT--TATA-AAT
gi|1 : CATTTGGTTAATTTT-----------AATGGG-CACCTGTAAAGC-GCGAA-TCG---AAA------------TA-----------GAA---A-AGAAA------GGAA---ACGAAA-----TCTA-C-C-G-A--A-TC--AAA---------A-----CCAA--A-T--AT----GA--C-GAA-AC------GAAA-T-C-TATCGAA-ACGAAA------CG---------AAAT-C---C---A------CTG-A-AACG-AAA--CG--AA-A-CCT-ACC-GAAA-C-G-A-A--CG-AAAG-TC--TA---TACCG-AAG-CAAA-A----A-G-AAA-C-AG-AC----------C-A--T-T-G---TAC----AA--CCC-A-GC------T-ATA---T--TT-----------AA-TT---GTA-AT----ATC-AA-T-A-A----ATGA-TAA-T--AT-CG----ACAAG--CA-T----CT-CAGAC----TC--CTGTGA--AA----GGTG------CCACATG-TATA---A-AGATG----A--AAT--CGATT-AG-G-GTT------G-ACTGA--TGC-A-TACA-TC-----A-TT----CA-AT---A-AA--C-ATTG-----------GT-A-G---AA---------A--G-----CA--GTTTCT-GAG--CGTAG-AT------A-AA---TGCA-G--A---AACAC-G----TGC-AA-ATCATAAA-------AA-----T--------G--------GGGGG--------GG---GGGCAA---AGTAC-AAAGT-AAAA-TC-T-G-A-GTT----AAC-T--AGA-TC----AAA------AC-GG---G------G-----GCAAT-GAGTTTTA--GACAATTTTCGA-TG-AGAGGGG-CT-TGGGTTGGGTT-----GTTATAGGTCAG-ATGTCAGGGA-TAACACGAAGTAACGGGAGGTTTTAGC-ATTTCTTGCTCTGAAG-A-C----------AT--GTGCATAT-------------------------TTTTTGTTT----TACA-AGA-TAGACTAATGAA-TTGGCGCAAAAGTT--TATA-AAT
gi|10 : ttgaGGG-TACTT--AAAGT-GCGAA-AC-----AG------------CA-----------AAT---A-CGAAA------CGAA----CGAAA-----TCTA-C-C-G-GCCA-AC--GAAGATCTACGAA-----CGAA--AAT--CC----AC--C-GAA-AC------GAAAGT-C-TATC-----CGAAA------TG---------AAAT-C---C---A------CCG-A-A-CG-AAAAACG--AATA-C---ACC-GAAA-C-G-A-A--CG--AAA-CC--TAGATTCCCG-AA--CAAA-A----T-G-AAA-C-CT-AC----------C-G-----------A-----AA--CCA-A-AC------
gi|10 : cA-ACG---AAGATC---------TA-----------CGA---A-CGAAAATCCACCGAA---ACGAAAG----TCTATC-C-G-A--A-AT--GAA---------ATCCACCGAA--------C----GA----AAA-AC------GAA--T-A-CACCGAA-ACGAA-------CG---------AAAC-C---T---AGATTC-CCG-A-A-CA-AAA--TG--AA-A-CCT-ACC-GAAACC-A-A-A--CA-AAAA-----TA---TACCG-AAG-CAAA-A----A-T-AAA-CAAG-AC----------CAA--T-T-G---TAC----AGATCCA-AGAC------TCAT----T--TT-----------GATTT---ATAGGT----ATC-AACT-A-AT---ATGA-TAATT--AT-GGA---ACGAGGCCAGTAATACT---GACCTCGCC--CACTGG--AA----GGTG------CAACAaaaaatataccgaagcaaaaataaacaagaccaattgtacagatccaagactcattttgatttataggtatcaactaatatgataattatggaacgaggccagtaatactgacctcgcccactggaaggtgcaaca
gi|11 : cgggtacttaaagtgcgaaacagcaaatacgaaacgaacgaaatctaccggccGTAAAGT-GCGAA-ACG---AAA------------T
gi|11 : ------CGAA---ACGAAA-----TCTA-C-C-G-A---------AA---------A-----CGAA--A-T--AT----GGCCC-GAA-AC------GAAA-T-CTTACCGAA-ACGAAAACCCATCGAAAAACGAAAAAC-C---TATTA------CCG-A-AACGAAAA--TGATAA-A-CCTAACC-GAAACC-A-A-A--CA-AAAA-TG--TA---TACCT-AAG-CAAA-A----ATT-AAACC-AG-AC----------C-A--A-T-AT--TAC----AA--CCA-A-AC------T-ATA---T--TT------------A-TT---ATA-AT----ATC-AA-T-A-A----ATGATTAATT--AT-GG----ACGAG--CA-T----CTAAAGAC----CT--TCTTGATGAA----GGTG------CCActaccgaaaacgaaatatggcccgaaacgaaatcttaccgaaacgaaaacccatcgaaaaacgaaaaacctattaccgaaacgaaaatgataaacctaaccgaaaccaaacaaaaatgtatacctaagcaaaaattaaaccagaccaatattacaaccaaactatatttattataatatcaataaatgattaattatggacgagcatctaaagaccttcttgatgaaggtgcca
gi|12 : gtaaagtgAA---------A-----TAAA--A-A--GC----AA----AAA-AT------GAAA--------CGAA-CTAAAA------TG---------AAAA-C---T---A------CCA-A-ATTG-AAA--CG--AA-A-CCT-ACC-GAAA-C-A-A-AA-CG-AA------------T-TCA-AAT-CAAA-A----C-A-AAA-C-GA-AC----------T-T--T-T-G------------------A-AC------------------------------------------AT----AGC-AA-T-A-A----ATGA-TAA-T--AT-GG----ACGAG--CA-T----TT-CTGGT----CC--TTGTAA--AA----GGTG------C----------A---A-AGGTGCCACA--AAT--CAATA-AG-A-TTC------G-CCTCCCTTAT-G-ACCA-TTCGGGGA-TT----CA-ATT--GCAA--C-ATC------------ATCA-A---AA---------A--G----C
gi|13 : atgcaaggtactagc----CT-CAGAC----CC--CTGTGA--AA----GGTA------CCACATA-CA--------GATG----A--AAT--CGATT-AG-G-G----------ATTGA--TAC-GGTTCA-TT-----A-T---------------------ATT------------GT-A-G---GA---------A--GAAG-CCG--GTGTTT-GGG--GAAAG--T------A-GAC--TGCA-G--A---AACAC-G----TGC-AA-ATCATAAA-------A------C--------G--------GGGGAT-------GG---GGGCAA---AGCAC-AATCT-AAAAATCTT-A-A-GTT----AACTT--CGA-TC----ATA------CC-GG---G------G-----GCAGC-GAGTTTCA--GA-AATTTCAGA-TG-GGAGGGG-Gaat
gi|14 : GGG-TACCTGTAAAGT-GCAAA-ACG---AAA------------TA--------------------GAAA------CGAA---ACGAAA-----TCTA-A-C-G-A--A-AC--GAA---------A-----C-----A-T--A--------------------------------TACCGAA-ACGAAA------CG---------AAAC-C---T---A------CCG-A-AAC-----------------------------C-A-A-A--CA-AAAA-TC--TA---TACCG-AAGAAAAA-A----A-T-AAA-C-AG-AC----------A-A--T-
gi|14 : AT-AAGGT-AAAAATCTT-A-A-GTT----AACTT--AGT-TC----ATATGGGGAAC-GA---G------A-----GCAAT-GAGTTTCA--GA-AATTTCAGA-TG-GGaatcatatcaataaggtaaaaatcttaagttaacttagttcatatggggaacgagagcaatgagtttcagaaatttcagatggg
gi|15 : gggtacctgtaaagtgcaaaacgaaatagaaacgaaacgaaatctaacgaaacgaaacatataccgaaacgaaacgaaacctaccgaaaccaaacaaaaatctataccgaagaaaaaaataaacagacaataatcatatcaGGG-TAC-TGTAAAGC-G-GAA-ACG---AAAACGAACAAAATCTA------------AA---C-CGAAA------CGAA---ACGAAAAT---TCTAAC-C-G-A--ACAC--GAA---------AA----CAAA--A-TCCACCAA-AA--C-GAA-AC------GAAA-C-C-CACCGAAGACGAAA------CG---------AAAG-C---TATAA------CC--A-AACGAAAA--CG--AA-A-CCT-ACC-GACA-C-A-A-A--C----AA-TC--TA---TACTGAAAG-C-AA-A----A-T-AAA-C-AG-AC----------C-A--T-T-G---TAC----AA--CCA-A-
gi|16 : taT----TACA-AGAATACACTAATTAAGTTGGCGC-AAAGTTACTATACAAT
gi|17 : tgcatacctctgaattaaTGGG-TACCTTTAAAGT-GCGAA-ACG---AAA------------TC-----------GAA---cattagatagtgttactaaaacgtgcccagaccgggaaaaaaagcggcccatgaaaataaattttaaggattacatgtattattaatcactgaaacccgactagaagaaaacagcaccgacgaaaaattaatgaaaattaaa
gi|18 : tgacattt--C-AAA-AC------GAAA-T-A-TACCGAA-ATAAAA------CG---------AAAT-T---C---A-------------ATG-AAA--CG--AA-A-CCT-ATC-AAAA-CCA-A-A--CA-AAAA-TC--TA---TACAG-AAG-CAAA-ACCAAA-TCAAA-C-AA-AT----------C-A--T-T-G---CAC----AA--CCA-A-GC------T-ATA---T--TC-----------AA-TT---ATA-Annnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncc
gi|2 : gTTCGGTGAATTTTCAAGCGATTAAAATGGGGTACCTGTAAAGT-GCGAA-ACG---AAA------------TA-----------GGA---A-CGAAA------CG---------AA-----TCTA-C-C-G-A--A-AC--GAA---------A-----CGAA--A-T--A--------------------------------TACCGAA-ACGAAA------CG---------AAAC-C---T---A------CCG-A-AACG-A--------------------------------------AAAA-TC--TA---TGCCG-AAG-TAAA-A----A-G-AAA-C-AG-AC----------C-AATT-T-G---TAC----AA--CCA-A-GCTACATGT-ATA---T--AT-----------AA-TT---TAA-AT----ATC-AA-T-A-A----ATGA-TAA-G--AT--G----ACGAG--CA-T----CT-CAGAC----CC--CTGTGA--AA----GGTG------CCAC-----ATA---A-AGATG----A--AAT--CGATT-AG-G-GTT------G-ACTGT--TACGG-TCCA-AT-----ATTT---ACA-ATC--A-AA--C-ATT------------GT-A-G---GA---------A--------------------------------------A-AA----GCG-G--C---AACACAG----TGC-AA-ATCAT-AA-------AA-----CGGGGGAGGG--------GGGGG--------GG---GGGCAA---AGTACAAAAGTAAAAA-TCTT-A-A-GTT----AACTT--AGA-TC----ATA------ACGGG---G------G-----GCAAT-GAGTTTCA--GA-AATTTCAGA-T------GGG-GTGTGTGTGGGGGT-----GTGACAGGTCGG-ACGTCAGGGA-TAACACGAAACAACGG--ACTTTCAGC-ATTTCTTGCTCTGAAG-A-CAAATGTATATAT--GTGTATAT-------------------------TGTTTGTTT----TACACAGA-TAGACTAATGAA-TTGACGAGAAAGTT--TACA-gt
gi|20 : ttatattt-TT---ATA-TC----ATT-AA-T-G-G----TTGC-TA--C--AA-GG-----CGAT--CA-T----TT-CAGGT----CA--ATGTGA--TA----GGTG------C---------TA---A-AG--G----A--ATC--CAATT-AA-C-ATCATTGCTG-ACTAA--TAA-GACCCA-TTC----G-TT---AGA-ATC--A-AA--C-ATT------------GT-A-G---GA---------A--tgtataactaaaagcg
gi|21 : GAAA------CG---------AAAC-C---T---ATA----CAG-A-AACG-AAA--TG--AA-C-CCC-ATC-GAAA-CCA-A-A--TA-AAAA-TG--TA---TACCG-AA----AA-A----A-T-AAA-C-AG-AC----------C-A--T-T-G---TAC----AT--CCT-A-Aaaa
gi|22 : C--CTGTGA--AA----GGTG------CCACATA-T--------AGAT-----A--AAT--CTATT-AG-G-GTT------G-ACTGA--TACTG-TCCA-T----------------------------C-ACT------------GT--------A---------A--G----CCG--GTGCCT-GGG--A--AA-AT------AGAA---TAAA-T--A---AACAC-G----TGC-AA-ATCAT-AA-------AA-----C--------G--------GGGGgcacaggagtcggcaattttatcaata
gi|23 : GATG----A--AAT--CGATT-AG-G-GTT------G-ACTGA--TGG-GATCCA-TT-----A-TTT--ACA-ATC--A-AA--T-ATT------------GT-A-G---GA---------A--GAAA-CCG--GTGTCT-GGG--GAAAG--T------A-AAATATACA-G--A---AACAC-G----TGC-AA-ATCATAAA-----------------------G--------GGG
gi|24 : -AAAA-T---TA---TACCG-AAG-CAAA-A----A-T-AAA-C-AG-AC----------C-A--T-T-G---TAC----AA--CCA-A-AC------T-ATA---G--TT-----------GA-AT---AGA-AA----TTC-AT-T-A-A----AGGA-TAAGT--AT-GG----ACGAG--CA-T----CT-AAGAC----CC--CGGTGG--AA----GGTG------C
gi|25 : TT----AATTT--AGA-TC----ATA------AC-GG---G------G-----GCAGT-GAGTTAAA--GA-AATTTCTAA-TG-GGAAGGGAG---GGG--GGGTT-----GTTACATGTCGG-ACGTCAGGCA-TAACACGAAACAACGGGAGaa
gi|26 : GT-AAAA-TTTTTA-A-GTT----AACTT--AGA-TCGTATATA------AT-GG---G------G-----ACA------------------TTTCAGA-TG-G-AGGGA-GT-TGGGTTGGGTTAAATTGTTACAGATGAG-ACGTCAGGGATTAACAC
gi|27 : A--CG--AA-A-TCT-ACC-GAAA-C-G-A--------AAC-CC--TA---TATTG-AAA-CAAA-G----A-G-AAA-C-AGAACACA-------C-A--T-T-G---TAC----AA--CCA-A-AC------T-A
gi|28 : TAAAGT-GCGAA-ACG---AA---------------------------------------------CGAA---AC---A-----TCTA-C-C-G-A--A-------------------------------T--AC----A-----GAA-AC------GAACCT-C-TACTGAA-AACAAA------CG---------AAACTC---C---A------CCG-ACAACG-AAA--CG---A-A-CCC-GTC-GAAA-aaggaataaatggcgagcaactcagtagtac
gi|29 : gtG-TAC-TGTAAAGCAGCCAAGACA---ATG------------CG-----------GAA---A-CGAAA------C-----------------TCTA-G-C-G-------C--GAA---------A-----CGAA--A-TTGCC----GAA-T-GAA-ACC-----GAAA-TTC-TACCGAA-ACCGAA------Cac
gi|29 : A--A-T--GC----G-----GAA-AC------GAAACT-C-TAGCG----CGAAA------CG---------AAA--T---T---G------CCG---AATG-AAAC-CG--AA-ATTCT-ACC-GAAACC-G-A-A--C
gi|3 : gtactgtaaagcagccaagacCA-A-AC------T-ATA---T--TT-----------AG-TT---A-A-A-----ATC-AA-T-A-A----ATGA-TAATT--AT-GG----ACGAG--C
gi|3 : CGAA-ACG---AAA------------TA-----------GAA---A-CAAA----------------GAAA-----TCTA-C-CTG-A--A-AC--GAA---------A-----CGAA--A-TCCACCGAAAA--C-GAACAC------GAAA-C-C-CACCGAA-ACGAAT------AG---------AAAC-CATAT---G------C------ACA-AAA---G--AA-A-CCT-ACC-GA---C-A-A-A--CTCAAAA-TTAGTA---TACCG-AAG-CATG-A----A-A-AAA-A-AG-AC----------C-A--C-T-GGTGTAC----AA--CCA-A-AC------T-ATA---T--TT-----------AG-T----GTA-AA----ATC-AA-TTA-A----AT---TAA-TT-AT-GGCGTGACG-G--CA-T----CT--GGAC----CG--CT-TGA--AT----GGTG------CTACATAGTAT-------GAT-----A--AAT--CGATTTAG-GTGTG------A-ACTGA--TAC-G-GTCA-TT-----A-G----ATC-ATA--A-AA--C-AT-------------GT-ATG---GA---------AAAG----CCG--G-GTCT-GGG--A--AG-AT------A-GA---TATAAG--A---AACAC------TGC-AG-A-CATAAA-------AGGGGGGT--------G--------GGGGGGGGAGGGGGG---GGGCAATTTAGCAC-AAGGT-AAAG-ACCT-ACA-GTT----AACT----GATTT----ATA------AC-GGACTG------GTCCTCGC-AT-AGGTTTCA--GA-AATTT-AGA-TGTTGAGGTG-GT-Taaaaacggaacgaaacgaaatagaaacaaagaaatctacctgaaacgaaacgaaatccaccgaaaacgaacacgaaacccaccgaaacgaatagaaaccatatgcacaaaagaaacctaccgacaaactcaaaattagtataccgaagcatgaaaaaaaagaccactggtgtacaaccaaactatatttagtgtaaaatcaattaaattaattatggcgtgacggcatctggaccgcttgaatggtgctacatagtatgataaatcgatttaggtgtgaactgatacggtcattagatcataaaacatgtatggaaaagccgggtctgggaagatagatataagaaacactgcagacataaaaggggggtgggggggggagggggggggcaatttagcacaaggtaaagacctacagttaactgatttataacggactggtcctcgcataggtttcagaaatttagatgttgaggtggtt
gi|30 : gctcgtccataattatcatttattgattttaactaaatatagtttgaaaaacggaa-A-GTT----AACTT--AGA-TC----ATA------AC-GG---GAACGGGG-----ACAAT-GATTTTCA--GA-AATTTTAGA-TG-GGAGGGA-GT-TTGGTT
gi|31 : TGAAG-A-CAA--------ATATGTGCAAAT-------------------------TGTTTGTTT----TACA-AGA-TACACTAATTAA-TTGGCGCAAAAGTT--T
gi|32 : GGG-TACCTGTAAAAT-GCGAA-ACG---AAA------------CG-----------CAATCTACCGAAA------TGAA---ACGAAA-----TTTA-C-A-G-A--A-
gi|33 : A------AC-GG---G------A-----GCAAT-GAGTTTCA--GA-AA-TTCAGA-TG-GGAGGGT-GT-TGGGTT
gi|34 : g-T----CT-CAGAC----CG--CTTTGA--AA----GGTG------CCACACA-T--------AGAT-----A--AAT--CGAT
gi|35 : A-T----CT-AAGAC----CC--CTGTGA--AA----GGTG------CCACATA-T
gi|36 : GGG-TACCTGTAAAGT-GCGAA-ACG---AAA------------T
gi|4 : ta-GAA-AC------GA-----C-TACCGAA-ACGAAA------CC---------TA-------T---A------CTG-A-AACG-AAA--TG--AA-A-CCT-ACC-GAAA-C-C-ACA--CA-AAAA-TA--TA---TACCG-AAG-CAAA-A----A-ATAAA-C-AG-AC----------C-A--T-T-G---TAC-----A--TCATA-AG------T-ATA---T--TT-----------AA-CT---ACA-AT----ATC-AA-T-A-A----ATGG-TAATT--AT-GG----ACGAG--CATT----CT-CAGAC----CCCGCTGTGA--AA----GGTG------TCA-AT---------A-AGATT----A--AAT--CGATT-AG-G-GTT------G-A-TGAT-TGC-G-TTCT-AT-----A-TT---TAA-ATC--A-AA--C-ATT------------GT-A-GGAAGA---------A--G----CCG--GTGTCG-GGG--A-AAG-CT------AGAG---TAAA-G--G---AATAC-G----TAC-AA-ATCATTAA-------AA-----CGGGGG---G--------GGGGG--------GG---GGGCAG---AGAAC-GGGGG-CAG----TT-G-A-GTTTCAGAAATT--AGA-T
gi|4 : taA------AC-GG---G------G-----GCAGTTGAGTTTCA--GA-AATT--AGA-TG-GA-----------GGTTGGGTT-------TACGGGTCGGGAC-TCAGG-A-TAACACGAAACAACGGGAGGTTTCAGT-ATTTCTTGCTCTGAAG-ACCAAGT------AT--GTGCATAT-------------------------TGTTTGTTT----CACA-AGA-TATAggaggttgggtttacgggtcgggactcaggataacacgaaacaacgggaggtttcagtatttcttgctctgaagaccaagtatgtgcatattgtttgtttcacaagatatagt
gi|5 : tagaaacgactaccgaaacgaaacctatactgaaacgaaatgaaacctaccgaaaccacacaaaaatatataccgaagcaaaaaataaacagaccattgtacatcataagtatatttaactacaatatcaataaatggtaattatggacgagcattctcagaccccgctgtgaaaggtgtcaataagattaaatcgattagggttgatgattgcgttctatatttaaatcaaacattgtaggaagaagccggtgtcggggaaagctagagtaaaggaatacgtacaaatcattaaaacggggggggggggggggcagagA---A-CGA---------GAA---ACGAAGAGTCCTCTA-CAC-G-A--A-ACCTGAA---------AAC---CGAAGAA-C--ACCCC-GA--CTAAA-AC------AAAA-C-C--ACCGAA-ACGAAATA----CG---------AAACAT---T---AATTGACCCG-A-AA---AAT--CG--AA-ATCCT-GTCTGAAA-C-C-A-AATCATAAAA-TC--TA---TACCT-AAG-AAAA-A----A-ATAAA-C-AG-ACAAAAGCTGTGT-A--T-T-G---CACGACAAA--CCA-A-AC------T-ATA---T--TT-----------AG-TTAAAATT-AT----ATCTAT-T-A-A----ATGA--AA-TGCATCTG----ACGAG--CA-T----CT-CAGACA---CC--CTGTGA--AATACTAGTGGTTGTCCCAC-CA-TAT----A-AGATA----A--ACT--GCATTAAG-G-GTT------G-ACGGA--TACGG-TCCA-CT-----A-TTTTGACATATC--A-AAACC-ATTCATTGTAAAAGGGT-A-G---GAGAACATCTTA--C----CTGTAGTGTCTGGGG--AGGAACATAAAGTAA-AA---TAAA-GTAA---AACAC-GTGATTGC-AA-ATCAgt
gi|6 : gacCTGTAA-GT-GCGAA-ACGTAAAAA------------TAAGAACGACAACGAA---A-CGAAATTTA--CGAACGAACGAAA-----TCTA-A-C-G-A--A-AC--AAA----------------GAA--A-CC-AC--------C-GGA-ACACACAAGAAA-C-CATACCGAA-ACGAAA------TG---------AAA--C---T---A------CCGAA-AACC-AAA--CA--AATA-TAT-ACC---AT-CAG-C-A--CA-AAAA-T---------------AA-CACATG----A-A-AAA-C-GA-AC----------C-A--TGTGG---TATA---AA--CCA-A-AT------T-ATATTTT--TT-----------AA--T---ATA-AT-----TC-AA-T-ACA----AT-A-TAA-TC-AT-GGAAATATGAG--CA-T----CT-C-GAC----CG--CTG-GA--AT----GGTG------AGGC-TA--ATA---ATAGATA----A--ATC--CGATT-AGAG-GTT------GAACTGA--TACGG-TCCATTT-----A-TT---AAC-ATC--A-AA--C-ATT------------GT-A-T---GA---------A--ATCCCCCG--AT-TCT-GGA--AGAAG-AT---------A---TATA-G--AC--AACAC-G----TGC--A-ATCATAAA-------Aat
gi|7 : taA-TCTT-A-AAGTT----AACTTGTAGA-TC----ATACGGGA-AC-GG---G------G-----GCAAT-GAGTT-CAAAGA-AATTTCAGAATG-GGAGGGG-TT-T---TTGG-TT-----GTTACGGGTCGG-ACGTCAGGGA-TAACACGATACAACGGGAGGTTTCAGTAATTTCTTGCTCTGAAGAA-CAA--------AT--ATGTATGTATATATATATATGTGTGTGTGTGCATATTGGTTTGTTATACA-AGA-TA-ACTAATTAGTTTGGCGC-AAAGTT--TATA-t
gi|8 : ACCTGTAATGT-GCGAA-ACG---AAA------------TA-----------GAA---A-CGAAA------CG-------GAAT-----TATA-C-C-GTA--A-AC--G-A---------A-----CGGA--------------------------------AAA-T-C-TGC------CGATA------CG---------AAAC-C---T---A-----------------------------------ACC-GATA-C-GCA-A--CG-AAAACTC--TA---TACCG-AAG-CAAA-G----A-G--AA-C-AG-ACGT--------A-A--G-T-G---TAC----AA--CCA-A-AC------T-ATA---TAATTATAATAATATAAA-TT---ATA-ATTAATATC-AA-T-A-AAATTATAA-TAA-TA-AT-TG----A-GAG--CCTT----CT-CGGAC----CA--CTGTGA--AA-----GTG------CCACATA-T---------GGTG----AATAATTACGATT-AG-G-G--------G-ACTGA-----------------------T---ACA-ATCTAA-AG--CTTTT------------GT-A-G---GA---------A--G----AAGC-GTGTAT--GG--AATAG-----------AA---TACA-G--ATTTAACAC-G----TGCAAA-ATCAT-AA-------AA-----C--------G--------GGGGG--------GG---GGGtatagtaagtggatactaaaaacgcggggaaaaaaagaatgaaaaaattttaagaattacatgtattataatcctgaacccggagaaattcaattgaataaaatcaaaaatttggtaagttaaatctataacataaattggttgagcta
gi|9 : taA-TT---ATA-AT----ATC-AA-T-A-A----ATAA-TAA-TT-AT-GG----ACGAG--CA-T----CT-CAGAT----CC--CTGTGA--AA----GGTG------CTACATA-TACATGTA-A-AT-----A--AAT--CGA---------TC------G------------G-TCCA-TT-----ATTT---ACA-ATC--A-AA--C-ATT------------GT-A-GGAAGA---------A--G----CTG--GTGTCT-GGGAAAGTAG-----------AA---TA-A-G--A---AGCAC-G----TGC-AACATCATAAACGGGGGGAA-----C--------GCGGGAGGAGGGAG--------GGGACGGGCAA---AGTACAAAGGT-AAAA-TCTT-A-A--------AGTTT---------------------AC-GG---G------G-----GCAAT-GAG------------TTTCAGA-TG-G--GGGG-GT-TGGG--G---T-----GTTTCAGATCGG-ACTTCAGGGA-TAACACAAAACAACGGGAGACTTCACT-ATTTCTTGCTCTGAAG-A-C----------AT--GTGCATAT-------------------------TGgggggg
blockSeqs : G CAAGCGATTAA G A G TAA ACGAACAAAATCTA TCT C ATCCAC A CGAA AGTCC T A T T CC CA CT GATCTACGAACGAAAATCCACC C ACACAA GTC G ACCCAT AAAAACGAA CATTAATTGAC AC A AAC AT TA A T C CAAATCAT C TAG GAT A A T CCAA TT C A A AAAAGCTGTG A ATT G GTG GACA AT T G TACATG C TTT AA ATAATAATATA T AAA G TAAT T C T C AATT T TGC C CGTG GC G AATA AA CTCG CG TG TACT GTTGTC A ATATACATGTA GCCAC AT TA T A T CATTGCT A CTTATG T CGGGGATTCA CTA C AC T CATTGTAAAAGG C T GAA GAACATCTTAC TA G AGGAACATAAAGTAA ATA C A TA TTT A TGAT A C A CGGGGGGAACGCGGGAGGA GGGAGGGG GAC TTT A A A T C A TCAG GT T GTAT TGGGGA G ACT AACGGGG T T AA . A T G A G G T AAATT G T A A C AAATGTATAT AT ATATATATATATGTGTGTGTGTGCA GTTA C A C G G AC C
blockSeqs : . . . . TAAGAACGACAACG . . TTTA A A AT A . . . . A . AACCGAAGAACACCCCGACT . C TCT . TA . CCTAGATTC AA A CC . AT . . C AAAACG . C . . . . . TC . . . ACA . TG . T A . . . . . . . . . . . . . . . . T . TT . AAAT . T . C A . . . . C ATAGTAT G . . A . . C . TACGG . ATTTTGACAT T . . . . . . GAA AATCCC C . AAAGCTAG C C . . C . . . . A AACGGGGGAGGG T . . A . A . . . . . . . CGGGA . . GTCCTC . T . . . . G . . G T . . . . . . AAGT . . . . . G T A . .
blockSeqs : . . . . ATCTAC . . . A A G . . . . . A . AACAAAATCCACCAAAAC . . CTC . . . CCTATTA A . T . AT . . C CAAACA . G . . . . . AT . . . GT . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TT . A . T . C . . . . . C TAATAAT G . . . . . T . TACGG . ATTTACA C . . . . . . . AGAAG . . GAAAGTA . A . . . . . . . A AGGGGGGTG . . . . . . . . . . . . . . . . G . T . . . . G . . G T . . . . . . AA . . . . . C . . . .
blockSeqs : . . . . CAA . . . A A . . . . . . A . ACGAAATCCACCGAAAAC . . TTC . . . GCTATAA A . T . TA . . . CAAATA . C . . . . . AT . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GT . . . . . C . . . . . C CATATA G . . . . . T . TAAGA . CGTTAGA C . . . . . . . AGAAA . . AAAATAG . C . . . . . . . T AACGGGGGG . . . . . . . . . . . . . . . . A . A . . . . G . . T T . . . . . . AA . . . . . T . . .
blockSeqs : . . . . TCG . . . A A . . . . . . A . ACGAAATTGCCGAAT . . CTC . . . CCATATG A . C . A . . . AAACTC . C . . . . . G . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TT . . . . . C . . . . . C ATACA G . . . . . T . TACTG . ATTTACA C . . . . . . . AAAG . . GAAAGTA . T . . . . . . . A AACG . . . . . . . . . . . . . . . . G . T . . . . G . . G T . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . TAG . . . A A . . . . . . A . ACGAAATATGGCCC . . CCA . . . CCTATA A . C . A . . . CACACA . C . . . . . T . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TT . . . . . A . . . . . T ATAA T . . . . . G . TGGGA . ATTTACA A . . . . . . . AG . . AGAAGAT . A . . . . . . . A AACG . . . . . . . . . . . . . . . G . T . . . . G . . G T . . .
blockSeqs : . . . . CGG . . . A A . . . . . . A . ATCCACCGAACGA . . TA . . . CTCCA A . C . A . . . AGCACA . C . . . . . A . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TT . . . . . C . . . . . C ATAT A . . . . . T . TTGCG . ATTTAA C . . . . . . . AG . . AAAGTAG . A . . . . . . . . ACG . . . . . . . . . . . . G . T . . . . A . . . .
blockSeqs : . . . . TAG . . . A A . . . . . . A . ATAAAAAGCAA . . CC . . . TCCA A . T . A . . . GCAACG . G . . . . . T . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TC . . . . . A . . . . . C ACAT A . . . . . T . TACGG . ATTAAC C . . . . . . . AG . . AAGATA . T . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . A . T . . . . G . . . .
blockSeqs : . . . CGC . . . A . . . . . . . A . GAAACCACC . . TA . . . ACTA A . C . A . . . GAACG . C . . . . . T . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TA . . . . . C . . . . . C ATAT G . . . . . T . TACGG . AGATC C . . . . . . . AG . . AATAG . C . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . TAG . . . . . . . . . . . . . ACGAAATA . . CC . . . CCTA A . C . C . . . AAACA . A . . . . . G . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TT . . . . . C . . . . . C TAA . . . . . . C . TACG . TACA C . . . . . . . AG . . A . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . .
blockSeqs : . . . TA . . . . . . . . . . . . . ACATA . . CC . . . TTCA A . T . A . . . AAACA . C . . . . . T . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . C . . . . . G ATA . . . . . . . . G . AT . . . . . . . . A . . . G . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . ACGGA . . TC . . . CCTA A . C . A . . . AAACA . C . . . . . T . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . C . . . . . C AA . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . TACA . . C . . . CCTA . . C . A . . . AAAC . . . . . . . G . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . C . . . . . T . . .
blockSeqs : . . . . . . . . TTG . . . . A . . . GA . . . . . . . A . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . CTA . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . G . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . TA . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqCons : ACGAAATCCACCAC************************ AAACA****** TT** ATAT********* TACGG*** ATTTACA********* C** ************ AAAGTAG*********** AAGT******
originalCons : NNNNCATTCGGTNAATTTTCAAGCGATTAAAATGGG-TACCTGTAAAGT-GCGAA-ACG---AAA------------TA-----------GAA---A-CGAAA------CGAA---ACGAAA-----TCTA-C-C-G-A--A-AC--GAA---------A-----CGAA--A-T--AC----GA--C-GAA-AC------GAAA-T-C-TACCGAA-ACGAAA------CG---------AAAC-C---T---A------CCG-A-AACG-AAA--CG--AA-A-CCT-ACC-GAAA-C-G-A-A--CG-AAAA-TC--TA---TACCG-AAG-CAAA-A----A-N-AAA-C-AG-AC----------C-A--T-T-G---TAC----AA--CCA-A-AC------T-ATA---T--TT-----------AA-TT---ATA-AT----ATC-AA-T-A-A----ATGA-TAA-T--AT-GG----ACGAG--CA-T----CT-CAGAC----CC--CTGTGA--AA----GGTG------CCACATA-TATA---A-AGATG----A--AAT--CGATT-AG-G-GTC------G-ACTGA--TAC-G-TCCA-TT-----A-TT---ACA-ATC--A-AA--C-ATT------------GT-A-G---GA---------A--G----CCG--GTGTCT-GGG--AGNAG-AT------A-AA---TACA-G--A---AACAC-G----TGC-AA-ATCATAAA-------AA-----C--------G--------GGGGG--------GG---GGGCAA---AGTAC-AAGGT-AAAA-TCTT-A-A-GTT----AACTT--AGA-TC----ATA------AC-GG---G------G-----GCAAT-GAGTTTCA--GA-AATTTCAGA-TG-GGAGGGG-GT-TGGGTTGGGTT-----GTTACAGGTCGG-ACGTCAGGGA-TAACACGAAACAACGGGAGGTTTCAGT-ATTTCTTGCTCTGAAG-A-CAA--------AT--GTGCATAT-------------------------TGTTTGTTT----TACA-AGA-TANACTAATTAA-TTGGCGCGAAAGTT--TATA-AAT
finalCons : NNNNCATTCGGTNAATTTTCAAGCGATTAAAATGGG-TACCTGTAAAGT-GCGAA-ACG---AAA------------TA-----------GAA---A-CGAAA------CGAA---ACGAAA-----TCTA-C-C-G-A--A-AC--GAAACGAAATCCACCAC------------------------GAA-AC------GAAA-T-C-TACCGAA-ACGAAA------CG---------AAAC-C---T---A------CCG-A-AACG-AAA--CG--AA-A-CCT-ACC-GAAA-CAAACA------AAAA-TC--TA---TACCG-AAG-CAAA-A----A-N-AAA-C-AG-AC----------C-A--T-T-G---TAC----AA--CCA-A-AC------T-ATA---T--TT-----------AA-TT---ATA-AT----ATC-AA-T-A-A----ATGA-TAATT--AT-GG----ACGAG--CA-T----CT-CAGAC----CC--CTGTGA--AA----GGTG------CCACATAT---------AGATG----A--AAT--CGATT-AG-G-GTC------G-ACTGATACGG---TCCA-TTATTTACA---------ATC--A-AA--C-ATT------------GT-A-G---GA---------A--G----CCG--GTGTCT-GGGAAAGTAG-----------AA---TACA-G--A---AACAC-G----TGC-AA-ATCATAAA-------AA-----C--------G--------GGGGG--------GG---GGGCAA---AGTAC-AAGGT-AAAA-TCTT-A-A-GTT----AACTT--AGA-TC----ATA------AC-GG---G------G-----GCAAT-GAGTTTCA--GA-AATTTCAGA-TG-GGAGGGG-GT-TGGGTTGGGTT-----GTTACAGGTCGG-ACGTCAGGGA-TAACACGAAACAACGGGAGGTTTCAGT-ATTTCTTGCTCTGAAG-A-CAAGT------AT--GTGCATAT-------------------------TGTTTGTTT----TACA-AGA-TANACTAATTAA-TTGGCGCGAAAGTT--TATA-AAT
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|19 ): GATTGATACGAGGAGTAATGTGACATCATGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGATGGCCATCTAACAATGTCAACTTATACAATAAGCTAATTACCTGACTGTCCTAACATAGTAGCCATGACTTTAGA
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Reference ( family-1933 ) : NNNNCATTCGGTNAATTTTCAAGCGATTAAAATGGG-TACCTGTAAAGT-GCGAA-ACG---AAA------------TA-GAAACGA-AA------CGAAACGAAA-----TCTA-C-C-G-AA-AC--GAAA--CG--AAA-TCC-ACC----A---CGA----A-A--C---GAAA-TC-TACCGA--A-A--CGAAA--C--GAAA-C-C---TA------CCGA-AACGAAA-CGA--AA-CCTA-CC-GAAA--C-AA-A-C-A-AAAATC--TATACCG-AAG-CA---AAA---------A-N-AAA-C-AG-AC----------C--A--T----TG---TAC----AA--CCA-A-AC------T-ATAT--TT---A-----------A-TTATA-AT----ATCAA-T-A-A-A----TGA-TAAT-TATG-G----A----CGAG--CA-T----CT-CAGAC----CC--CTGTGA--AA----GGTG------CCAC-ATA-T----A-GATG----A--AAT--CGATT-A-G-G-GTC------GA-CTGA-TACGGTCCA-TTATTT--ACA-ATCAAA--C-ATT------------GTA-G---GA---------A--G----CCG--GTGTCT-GGG---------AAAG-TAG---A--ATACAG--A---AACAC-G----TGC-AA-ATCATAAA-------AA-----C--------G--------GGGGG--------GG---GGGCAA---AGTAC-AAGGT-AAAA-TCTT-A-A-GTT----AACTT--AGA-TC----ATA------AC-GG---G------G-----GCAAT-GAGTTTCA--GA-AATTTCAGA-TG-GGAGGGG-GT-TGGGTTGGGTT-----GTTACAGGTCGG-ACGTCAGGGA-TAACACGAAACAACGGGAGGTTTCAGT-ATTTCTTGCTCTGAAG-A-CAA------GTATG--TGCATAT-------TG------------------TTTGTTTTACA-AGA-TANACTAATTAA-TTGGCGCGAAAGTT--TATA-AAT
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gi|10 : cC--GAAA--CAGCAAA-TAC-GAA----A---CGA----A----C---GAAA-TC-TACCGGCCA-A--CGAAG--------A-T-C---TA------C--G-AACGAAA-------A-TCCA-CC-GA-------A-A-C-G-AAAGTC--TAT-CCG-AAA-TG---AAA---------tctaccggccaacgaagatctacgaacgaaaatccaccgaaacgaaagtctatccgaaatgaaatccaccgaacgaaaaacgaatacaccgaaacgaacgaaacctagattcccgaacaaaatgaaacctaccgaaaccaaacaaaaatataccgaagcaaaaataaacaagaccaattgtacagatccaagactcattttgatttataggtatcaactaatatgataattatggaacgaggccagtaatactgacctcgcccactggaaggtgcaaca
gi|10 : cgggtacttaaagtgA-ACG---AAGATC---------TA-CGAACGA-AAATCCACCGAAACGAAAG----TCTA-T-C-------C--GAAA--TG--AAA-TCC-ACCGA--A---CGA----A-AAAC---GAA--TA-CACCGA--A-A--CGAA---C--GAAA-C-C---TAGATTC-CCGA-A-CAAAA-TGA--AA-CCTA-CC-GAAA--CCAA-A-C-A-AAAAT----ATACCG-AAG-CA---AAA---------A-T-AAA-CAAG-AC----------CA-A--T----TG---TAC----AGATCCA-AGAC------TCAT-T--TT---G-----------ATTTATAGGT----ATCAACT-A-ATA----TGA-TAAT-TATG-GA---A----CGAGGCCAGTAATACT---GACCTCGCC--CACTGG--AA----GGTG------CAAC-Atccaccgaacgaaaaacgaatacaccgaaacgaacgaaacctagattcccgaacaaaatgaaacctaccgaaaccaaacaaaaatataccgaagcaaaaataaacaagaccaattgtacagatccaagactcattttgatttataggtatcaactaatatgataattatggaacgaggccagtaatactgacctcgcccactggaaggtgcaaca
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