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Reference ( gi|2 ) : CCCGAGA-G----AAGCAA-----ACGTCA--T--AC----GT----A--AGCTGACGT-CATA-CGT-------A-AAC---A--------AT--------GTCTG--T-TAGGTTT-C-ATC-T-TC-C-CAGCTT--------C--AAT-G-AA--ATTAA-C-GA-TC-TTCTA-G--CAAGT-A--AGGG-C--ACG---AC--ATA-AACA----AA-AAAG--TTGACTAAACTATC-AGTGAA-ATG-ATT-A-AG-AGA-----T-TT--------TTT-------A--CA-AGTGA---CTGAA------T---------T---------T-G------TA----AA-TG--CC-GACATT-CA--------CGATT--------------GTT-C----GA-A-GGAA-----------------------A-----------T-------------------------A-----------------G---GC-------T-----T----A------C---C--GTGT-----T-T------T-G-A-A-GCAT--TT---------TA-TGTTG------GGGCG--AGAA-AAA--C-T-----C-AC-GGA----GGTCTCTTTTT--AAA--CA----CTTGAA------AT-TAA-ATGGATGT-A-T--GTTTCA-GCG---GATT-CCTT--AATTTTGGACC--T--TTG--ATTTCTCTGACATTTG----TAACG-TTGCCATCAGTTAACATT--T-C-TTTC-AGAAAT-GACA-GCAA---TG------CA-G-------TAGGTTCAACT-AG-TTTC----------GAG--TTT--TGAA--T-AAAC-T---TG-A-A-TTTCTA-CC-ATG-AA-ACTACAGTATTTCTTT---AAATATAGG--A-T--ACTT-AAT--GC-AGATG-----G----T---AGCTCAC-TT-----T-AATATT-C-ATCTACCA-T-TCTGCAT-AACT-GAATTA-TTG------AACAT-TTAATT-TAC-AAA---AT--------TA---TTTTTC-CT-GA-T----A-AATTG-TTGTTTA----AC--CGAG-------TGTAGACTCCA---TTA----C-AAATCTA-CCATGTACAGGAGCCCCACAGGCACAGTAGCCTTGCTTTGGTTCGGT
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gi|23 : tcCCCGAGA-G----AAACTG-----ACGTCA--A--AC----GT----A--AGCTGACGT-TATA-CGT-------A-AAC---A--------AT--------G--------TA------------T-TC-C-CAGCTC--------C--GGT-G-AA--ATTAA-T-GA-TC-TTCTA-G--CAAGT-A--AGGG-C--AC-------------------------AG--TTAACTAAATTTTT-AGTtcaagaactagtcctatagtgaagggcttatccc
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gi|42 : actttCCGGGA-G----AAGCAA-----ACGTTA--T--AC----GT----A--AGCTGACAT-CATA-CAT-------G-TACGTAA--------AT--------ATCGG--T-TATGTTT-C-ATA-T-TC-C-CAGTTC--------C--CAT-G-A
gi|4 : aaacttCGAGA-G----AAGCAA-----ACGTCA--T--AC----GT----A--AGATGACGT-CATA-CGT-------A-AAC---A--------AT--------GTCGG--T-TAGGTTT-C-ATC-T-TC-C-CAGCTCGATAGCTCC--GAG-G-AA--ATTAA-C-AA-TC-TTCTA-G--CAAGT-A--AGGA-C--ATG---GC--A---AATA----AATAAAG--TTAACGAAATTATC-AGTGAA-ATG-TTT-A-AG-ATA-----C-TT--------ATT-------AA-CG-AGAGG---CTGAAA-----T---------TACG------T-G------TA----AC-TA--CC-GACATT-CA--------CGATTACTAGTAATTGATTGTT-C----GA-A-GGAAGTCTCAAGAACTAGTCT------A-----------T-------------------------A-----------------G---GC-------C-----T----A------C---C--TTGT-----A-T------T-G-A-A-AGAT--TTAA-------TA-TGTTG------GGGCG--AGAA-AAAAAC-T-----A-AA-TGA----GATCTCTTTTA--AAA--CA----CTCGAA------AT-CAA-ATGGACAC-A-T--GTTTCA-GTG----ATT-CCTT--AATTTTGGAC------TAA--ATTTCTCTGACATTTG----TAACG-TAACCAT----TAATATT--T-CCTTTC-AGAAAT-GACA-GCAA-------------------------------CT-AG-TTT---------------------TGAA--T-AAAC-T---TGTA-A-TTTTTA-TC-TTG-AA-ACT------TTTTTTT---AAATCTGTG--A-C--ATTT-ATT--GC-AGATG-----G----T---AGCTCAC-TT-----T-AATTTT-C-ATCTGCCA-T-TCCGCAT-AATT-GAATAA-TTGTTACAAAATAA-TTAAGT-TA---AA---AT--------T-------TCC-CT-GA-T----A-TTTTT-TGGTTTA----AC--CGAA-------TATAGACTCCA---TAC----C-AAATCTA-CCTTGT----------------------AGCCTTGGTTTGATTCGG
gi|3 : GAGA-G----AAGCAAGTT--ACGTCA--T--GT----TTC---G--AGCTGACGT-CATA-CAT-------A-AAC---A--------AT--------GTCGG--G-TAGGTCT-T-ATC-T-TC-C-CAGCTC--------C--GATAG-AA--ATTAA-C-GACTC-TTCTA-G--TAAGT-A--AGGG-C--ACG---GC--A-A-GACA----AA-A--G--TGGA-------ATC-CG-------G-ATT-T-AGCAGA-----T-TTGTA-----TTT-------AG-CA-ACTGAGTACTGGA------CATGTACTGCC---------T-G------TA----AA-TG--CCCGATATT-CA--------CGATT--------------GTTTC----GA-ATGGAA-----------------------G-----------TCTCATAAACAAGTCTATT-------A-----------------G---GC-------C-----TTC--A------C---CT-GTGT-----GAT------T-G-A-A--CAT--TT---------TAATGTTG------TGGCGC-AGAC-AAA--CAT-----A-AC-AGAAGACGG-CTCTCTTT--ATA--CAGCGTCTCGAA------AT-TA---CGGATGT-AAT--GTTTCA-GCT----ATT-C-TT--A--TTTGGACA--T--TTG--ATTTCTCTGACTTTTG----T-ACG-TT--------CTAACA-T--T-C-TTTC-AGAAAT-GACA-GCGATATTA------TA-GATCTAGTTAGGTTCAACT-AG-ATTT----------GAG--TTTTCTGAA--T-AAACTT---TT-A-A-TTTCTA-CCTTTG-AA-ACTAT----TTTTTTTAA-AAATCTAGA--A-T--ACTT-ATT--GC-AGATGCAGC-G----T---AG-TCAC--T-----T-AATATT-T-ATCTA-CA-T-TCTGCAT-AAC--GAATTA-TTG------G------------TAC--AA---AT--------GA---TTTTCT-CT-GA-T----C-AATTG--TGTTTA----AC--CGAG-------TA-AGA--CCA---TTA----C--AATCCACCCATGTA
gi|18 : catAGA-G----AAGCAAGTT--AATTCA--T--A-----GTTT--G--AGCTGAC-T-CATA-CGT-------A-AAC---A--------AT--------GT-TG--T-TAG-TTT-C-ATC-T-TC-C-CAGCTC--------C--GAT-GAAA--ATTAA-T-GA-TC-TTTCT-G--T-AGT-A--AGGG-CCAACG---GC--A-A-GACA----AA-AAAG---TGA---------------AA-ATG-TTT-A-AGAAGA-----T-TT--------TTT-------gcctttgctg
gi|11 : cgcc----AAGCGA-----ACGTCA--T--AATA--GT----A--AGCTGACGT-TATA-CGT-------A-AAC---ATTAAAACAAT--------GTCGG--T-TAGGTTT-C-ATC-T-TC-C-CAGCGC--------C--GAA-G-AA--ATTAA-C-GA-TC-CTCTA-G--CAAGT-A--AGGA-C--ACG---AC--AAA-TACA----AA-AAAG--TTAACTAAATTATC-AATGAA-ATG-TTT-T-AG-ATA-----C-TT--------TTT-------A--CA-AGAGG---CTGAA------T---------TGCA------T-G------TA----AA-TG--CC-GACATT-CACGATTAATCGATT--------------GTT-CTCGAGA-A-GGAA-----------------------G-----------TCTCAAGAACTACAACTA--------A-----------------G---GT-------C-----T----A------C---C--GTGT-----A-T------T-GAA-A-GCAT--TTAATAGCCCCTA-TGTTG------GGGCG--AGAA-AAA--C-T-----A-AC-GGG----TATCTCTTTTA--AAA--CA----CTCGAA------AT-CAA-ATGGATAC-G-T--GTATCA-GTT---GATT-CTTT--AATTGTGGACC------AA--ATTTCTCTGAAATTTG----CAACG-TTACCA----TTAATATT--T-----------AAT-GACA-G-------------------------------CGACT-AG-TTTT----------GAG--TTT--TGAA--T-AAAC-T---Tttttttttctttttttttttttaaaacaaaagaaagaaaaaccccttgggaaaaaaattacctgtaaatgcccgatattccagatcgttcgagaggaaat
gi|1 : ----AAGCAAGTT--ACGTCAA-T--A-----GTTTT-G--AGCTGACGT-CATATCAT-------T-AACT--A--------AT--------GTC-G--T-TAGGTTT-T-ACT-A-TC-C-CAGCTC--------C--GA--G-AATAATTAA-C-GA-TC-TTCTA-G--TAAGTGA--AGGG-C--AGG-------------CA----AA---------GAC-AAACAATT-AG-GAA-ATC-GTTCATAG-CGA-----T-TTGTT-----TTT-------AGGCA-AATGA---CTACA------TG--------T---------T-ACT----TA----AA-TAGCCC-GA-ATTACA--------CGATT--------------GTTTC----GA-A-GGAAGCTC-------------------A-----------T-------------------------A-----------------A---ACAAGTCTAT-----T----AGGGACCC---CTTGTGTGACACT-T------T-G-A-A-TTATGCTT---------TAATGTTAAGCCGTGGACGGCAGAACAAA--CAT-----A-AC-AGAAGACGGCTTCTCTTT--AA---TA----C--GAGCGGTCTATATAATACGGATGT-AAT--GTTTCA-GCG---TATT-CCTT--A-TTTTGGACCATT--TTAGAATTTCTCTGACTTTTG----TAACGTTTGCCA-----TAACATT--T-C-TTTCAAGAAAT-GACA-GCGATATTA------TA-GATCTAGTTAGGTTCAACT-AG-ATTT----------GAAGTTTT--TGAA--T-AAAC-TTTGTA-ACA-TTTCTA-CCTTTG-AA-ACTA---TTTTTTTTTAAAAAATCTAGA--A-T--ACTT-ATT--GCAAGATGCACGCG----T---AGCTCAC--T-----T-AATAT----ATCTA-CA-T-TC-GCAT-AAC--GAATTA-TTG----------------TT-TAC-AAA---AT--------GA---TTTTCCTCT-GA-T----C-AATTG--TGTTTA----A---CGAG-------TA-AGACTCCA---TTA----C-AAATCCACCCATGTA
gi|39 : a----AAGCAA-----A-GTCA--T--A-----GTTT--A--AG-TGACGT-CATA-CGT-------A-AAC---A--------AT--------GTC--------GGTT-------------C-CAGCTC--------C--GAT-G-AA--ATCAA-C-GA-TC-TTCTAGG--CAAGT-A--AGGA-C--ACG---gcctttgcttttggttc
gi|41 : AGCAA-----A--TCA--T--TA----GTTT--A--AGCTGACGT-CATA-CGT-------A-AAC---A--------AT--------GTC--------GGTT-----------C-C-CAGCTC--------C--GAT-G-AA--ATCAA-C-GA-TC-TTCTA-G--CAAGT-A--AGGA-C--AC
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gi|43 : cgaaaacaaatttccgagctgtttgcatACGT-CATG-CGC-------A-----------------T--------GTCGG--A-TATGTTT-TTATC-T-TT-C--AGCTC--------C--GAT-G-AA--ATCAA-C-AA-Taaaaaaaaaaaaaa
gi|36 : cgaaaacaaatttccgagtgtttgcatAGGTTT-C-ATC-T-TC-C-CAGCTC--------C--GAT-G-AA--ATTGA-C-GA-T---------------------GGG-C--ACG---GC--AAA-GACA----AA-GA-------------------AGTGAA-ATG-TTT-A-AG-AGATTTTTT-TT--------TTT-------A--CA-AGAGA---CTGAA------T---------T---------atctt
gi|26 : C-C-CAGCTC--------C--GGT-G-AA--ATTAA-C-GA-TC-TTCTA-G--CAAGT-A--AGGG-C--ACG---GC----A-GACA----AA-AAAG--TAAACTAAATTATC-AGTGAA-ATG-TTT-A-AG-AGA-----------------AAT-------A--CA-AGAGA---CTGAA------T---------TACG------T-G------TA----AA-TG--CC-GACACT-CA--------CGA-T--------------GTT-a
gi|8 : A----AA-AAAG--TTAACTGAATTATC-AGCGAA-ATG-CTG-A-AG-AGA-----CCTT--------TTT-------A--TA-GGAGA---CTAAA------T---------T---------TCG------TA-------TG--CC-GACATT-CA--------CGACT--------------GTT-A----GA-T-GGAA-----------------------G-----------TCTCAAGAACTAGTCTACATCTATAGA-----------------G---GC-------C-----T----A------C---C--GTGT-----T-T------TTA-A-A-GCAT--TT---------TA-TGTAG------GGGCG--AGAA-AAA--C-TAACGTT-AC-GGA----GAACTCTTTTG--AAA--CA----TTTGCA------AT-AAA-ATGTATGC-A-T--GTTTCA-GTG---AATT-CCTT--AATTTTGGACC------TA--ATTTCTCAGACATTAG----TACCG-TT---ATCA-TTAACATTA-C-C-TTTC-GGAAAT-GACA-GCGA---TG------CA-G-------TAA--TTAACTCAG-TTTT----------GAG--TTT--TGAA--T-AAAC-T---TGAA-A-TTTCAA-TC-TTG-A----------ATTTTTTT---TAATCGGTG--A-T--ACTT-ATT--GC-AGATG-----G----T---AGTTCACTTT-----T-AATATG-C-ATCTACCG-T-TCTGCAT-AATT-GGATTG-TTGTTACAAAATAA-ATAAAA-TA--AAG---AT--------AA---ACTT----T-GATT----T-ATTTG-GTGTGTA----AC--CGAATATTAATTATAGACCTCA---TTA----CAAAATCTA-CCTCGTACaa
gi|9 : A----AA-AAAG--TTAACTGAATTATC-AGCGAA-ATG-CTG-A-AG-AGA-----CCTT--------TTT-------A--TA-GGAGA---CTAAA------T---------T---------TCG------TA-------TG--CC-GACATT-CA--------CGACT--------------GTT-A----GA-T-GGAAGTCCAAGAACTAGTCTAATCT--A-----------T-------------------------A-----------------GA--GC-------C-----T----A------C---C--GTGT-----T-T------T-A-A-A-GCATG-TT---------TA-TGTAG------GGCCG--AGAA-AAA--C-TAACGTT-AC-GGA----GAACTCTTTTG--AAAAACA----TTTGCA------AT--AA-ATGTATGC-A-T--GTTTCA-GTG---AATT-CCTT--AATTTTGGACC--T----A--ATTTCTCAGACATTAG----TACC---TGT-ATCA-TTAACATTA-C-C-TTTC-GGAAAT-GACA-GCGA---TG------CA-G-------TAA--TTAACTCAG-TTTT----------GAG--TTT---GAA--T-AAAC-T---TG-A-AATTTCAA-TC-TTG-AA-----------TTTTTT---AA---TCGGTGA-T--ACTT-ATT--GC-AGATG-----G--------AGTTCAC-TT-----TTAATATG-C-ATCTACCG-T-TCTGCAT-AATT-GGATTG-TTGTTACAAAATAA-ATAAAA-TA--AAG---AT--------AA---ACTT----T-GATT----T-ATTTG-GTGTGTA----AC--CGAAATTAAT-TATAGACCTCA---TTA----CAAAATCTA-CCTCGTACccttggtttgattcggt
gi|45 : -----T-TT--------TTT-------A--CA-AGAGA---CTGAC------T---------TACATGTACCT-G------TA----AA-TG--CC-GATATT-CA--------CGccttggtttgattcg
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gi|21 : aaactcccgagagaaactgacgtcaaacgtaagctgacgttatacgtaaacaatgtattcccagctccggtgaaattaatgatcttctagcaagtaagggcacag-AA-TTTT----------TAG--TTT--TGAA--T-AAAC-T---TGTA-A-TTTCTA-CG-ATG-AA-ACTAT----TTTCTTT---AATTTT-GG--A-T--ACTT-ATT--GC-AGATG-----G----T---CGCTCAC-TTTAATAT-AATATT-C-ACCTACCA-T-TCTGCAT-AACTGGAATT--TTG-----------------T-TACAAAA---AT--------GA---TTTCCC-CT-TA-T----ACAATTG-T
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gi|34 : aagttatctgTTT---AAATCTAGG--A-T--ACTT-ATT--GC-AGATGCATGCG----T---AGCTCAT-TT-----T-AATATT-C-ATCTACCA-T-TCTGCAT-AACT-AAATTA-TT-------AATATATTAATtgttgcaaaatata
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2 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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lowQualScore : 2 9999 66666 99 11 99999999999 6 6 4444444 7 77777777 44 5 666 7 7 6 6 88888888 3333 6 33 7 7 7 7 8 55 8 55 8 55 8 0 88 55 11111111111111 7 0 88 0 0 0 0 888888888 666 5555555 55 0 88 0 9 9 000 9 8 1111111111111111 0000 0 88 0 0 55555555555555555555555 77777777 2 7777 2 2 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 77777777777777 99 22222 4 888888 7 4 4 1 4 66 999999999 4 888888 66 22 4 1 4 88888 0000 888888 7 99 5555 333333 7 1 8 1 3 777 777 1 2 1 88 33 11111111 777 3333 7 5 55555 111111 9 9 3 5 9999999999999999999999999999999999999999 1 3 7 77 77 33 7 9 22 1 9 3 7 3 7 2222222222 99999999 4 2 11 2 2 2 2 44444 7777 999 2222222 1 1 1 1 1 2 2 7 00000000000000000 777 999 2 111111 444444444444 1111111111 0 88 0 99 555 0 0 99 6666 99 1 5555555555555555 777 5555 2 4 11 2 00000000000000000000000 22 7 5
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Reference ( family-1868 ) : CCCGAGA-G----AAGCAA-----ACGTCA--T--A-CGT---T---AAGCTGACGT-CATA-CGT-------A-AAC--------AATGTCGG--T-TAGGTTT-C-ATC-T-TC-C-C--------AGCTCCGA--T-G-AA--ATTAA-C-GA-T-CTTCTA-G--CAAGT-A--AGGG-C--A-CGG-CAAAG--ACA--AAAAAGTTAACTAAATTATC-AGTGAA-A--T-G-TTTA-AG-AGA-----C---TT---TTT-------A--CA-A--GAG-ACTG-AA-T---T-A-C-------T-G------TA----AA-TG--CC-GACATT-CA--------C--------------GATT--------GTT-C----GA-A-GGAA--------------G-----------------T-------------------------A-----------------G-------G-----CCT----A---------CC--GTGT-----T-T------T-G-A-A-G-CAT--TT---------TA-TGTTG------GGGCG--AG--AA-AAAC-TAAC-G-----GA----GG------TCTCTTTTNAAA--CA----C------TCGAAA-TTAAACGGATGT-A-T---GTTT---CAG-TGGATT-CCTT--AATTTTGGAC-C---TTG--ATT---TCTCTGACATTTG----TAACG-TTGCCATC--TTAACATT--T-C-TTTC-AGAAAT-GACA-GCGA---T---------GC---------A-G-------T-AGGTTCGACT-AG-TTTTGAG--TTTT--GAA--T-AAAC-TTGTA--A-TTTCTA-CC-T-TG-AA-AC-----T---ATTTTTTT-----N--AATCTGGGA-T--ACTT-A-TTG-C-AGATG-----G----T---AGCTCACTT-----T-AATATT-C-ATCTACCA-T-TCTGCAT-AACT-G-AATTA-TTG------A-A-----AAAT---TA---C-AAA------AT---G--------AT----------TTTCC-C--T-GAT-NAAT---T-G-TT--GTTTA----AC--CG-AG------TGT-------AGACTCCA---TTA----C-AAATCTA-C--C-ATGTAC-------------------TAGC--C-TTGC-TTTGGTTCGGT
gi|1 : ----AAGCAAGTT--ACGTCAA-T--A--GT---TTT-GAGCTGACGT-CATATCAT-------T-AACT-------AATGTCG---T-TAGGTTT-T-ACT-A-TC-C-C--------AGCTCCGA----G-AATAATTAA-C-GA-T-CTTCTA-G--TAAGTGA--AGGG-C--A--GG-CAAAG--ACA--AACAA-------------TT-AG-GAA-A--TCG-TTCATAG-CGA-----T---TTGTTTTT-------AGGCA-A--ATG-ACTA-CA-TGT-T-A-C-------T--------TA----AA-TAGCCC-GA-ATTACA--------C--------------GATT--------GTTTC----GA-A-GGAA--------------G-----------------CTCATAAAC-----------------A-----------------A-------G-----TCT----ATTAGGGACCCCTTGTGTGACACT-T------T-G-A-A-T-TATGCTT---------TAATGTTAAGCCGTGGACGGCAG--AACAAACATAAC-A-----GA----AGACGGCTTCTCTTT---AA--TA----CGAGCGGTCTATA-TAATACGGATGT-AAT---GTTT---CAG-CGTATT-CCTT--A-TTTTGGAC-CATTTTAGAATT---TCTCTGACTTTTG----TAACGTTTGCCA-----TAACATT--T-C-TTTCAAGAAAT-GACA-GCGATATT---------AT---------A-GATCTAGTT-AGGTTCAACT-AG-ATTTGAAGTTTTT--GAA--T-AAACTTTGTAACA-TTTCTA-CCTT-TG-AA-AC-----T---ATTTTTTTTTAAAA--AATCTAGAA-T--ACTT-A-TTG-CAAGATGCACGCG----T---AGCTCAC-T-----T-AATAT----ATCTA-CA-T-TC-GCAT-AAC--G-AATTA-TTG----------------TT---TA---C-AAA------AT---G--------AT----------TTTCCTC--T-GAT-CAAT---T-G--T--GTTTA----A---CG-AG------TA--------AGACTCCA---TTA----C-AAATCCACC--C-ATG----------------------TAGC--CTTTGCTTTTGGTTC
gi|10 : aCCTGAGAAG----AAGTTA------CGTCA--T--A-GTT---T---GAGCTGACAT-CAT--CGT-------A-TA---------AATGTCGGCAT-TAGGTTT----TT-T-TT-C-A--------AGCTCCGGATT-G-AA----TAA-C-GA-T-TTTCTA-AACTAAGT-A---GGG-C----CGG-CAAGA--ACA--AAAAAGTGAA--GGATTA-------AG-A--T-T-CTT-----------------TT---TTT-------ATGCATA--GAG-ACTT-AA-T---T-A-CAGTCC--T-G------TA----AA-TG--CC-GATATT-CC--------A--------------GATT--------GTT-C----GA-A-GGAA--------------G-----------------T---------------------------------------------------------CCTCATAA---------AC--ATGT-----T-T------T-A-A-T-G-CAT--TT---------TA-TGTGG------TGGC---AG--AA-AAACTTAAC-A-----AA----GG------TCTCTTAT-AAA--CA----CG-----TCG-AA-TTAAACGGATGT-A------TTT---CGA-CTAATT-C--G--AGTTTTGAA--A---TTA--ATTGTATTTCT-AC-TTTG----AAAC
gi|10 : ctTTCGACT-AA-TTC-GAG--TTTT--GAAATT-AA---TTGTA----TTTCTA-CT-T-TG-AA-AC-----T---ATTTTTTT-----T--AATCTAAGAAT--ACTA-A-TTGGC-AGATG-----CATTCT---AGCTCACTT-----A-AGTATT---A-CTAC-A-TCTCTGCAT-AACT-ACAATTACTTG---------------------TA---C-AAA------AT---G--------AT----------TTTCC-C--T-T-T-CAAT-----G-TT--GTTTA----AC--AG-AG------TGA-------AGACTCCA---GTA----C-AAATCTA-C--C-ATATGC-------------------TTGC--T-TTGtattttttttaatctaagaatactaattggcagatgcattctagctcacttaagtattactacatctctgcataactacaattacttgtacaaaatgattttccctttcaatgttgtttaacagagtgaagactccagtacaaatctaccatatgcttgctttg
gi|11 : ctcctgagaagaagttacgtcatagtttgagctgacatcatcgtataaatgtcggcattaggttttttttcaagctccggattgaataacgattttctaaactaagtagggccggcaagaacaaaaaagtgaaggattaagattctttttttatgcatagagacttaattacagtcctgtaaatgccgatattccagattgttcgaaggaagtcctcataaacatgttttaatgcattttatgtggtggcagaaaaacttaacaaaggtctcttataaacacgtcgaattaaacggatgtat----AAGCGA-----ACGTCA--T--AATAG---T---AAGCTGACGT-TATA-CGT-------A-AACATTAAAACAATGTCGG--T-TAGGTTT-C-ATC-T-TC-C-C--------AGCGCCGA--A-G-AA--ATTAA-C-GA-T-CCTCTA-G--CAAGT-A--AGGA-C--A-CGA-CAAAT--ACA--AAAAAGTTAACTAAATTATC-AATGAA-A--T-G-TTTT-AG-ATA-----C---TT---TTT-------A--CA-A--GAG-GCTG-AA-T---T-G-CA------T-G------TA----AA-TG--CC-GACATT-CACGATTAATC--------------GATT--------GTT-CTCGAGA-A-GGAA--------------G-----------------TCTCAAGAACTACAACTA--------A-----------------G-------G-----TCT----A---------CC--GTGT-----A-T------T-GAA-A-G-CAT--TTAATAGCCCCTA-TGTTG------GGGCG--AG--AA-AAAC-TAAC-G-----GG----TA------TCTCTTTTAAAA--CA----C------TCGAAA-TCAAATGGATAC-G-T---GTAT---CAG-TTGATT-CTTT--AATTGTGGAC-C----AA--ATT---TCTCTGAAATTTG----CAACG-TTACCA----TTAATATT--T-----------AAT-GACA-G--------------------------------------------CGACT-AG-TTTTGAG--TTTT--GAA--T-AAAC-TT
gi|12 : CCGAGA-A----CAGCAAGTT--ACGTCA--T--A-GTT---T---TAGCTGACGT-CATA-CGT-------A-AAC--------AATGTCGG--T-TGGGTTT-C-ATC-T-TC-C-C--------AGCTCCCA--T-G-AA--ATTAA-C-GA-T-CTTCTA-G--CAAGT-A--AGGG-C--A-CGA-CAAAG--ACA--AAAAAGGGAAAT-AATTA---A--GAA-ATTT-G-TTT-------T-----T---TT---TTT-------A--CA-A--GAG-ACTG-AA-T---T-ACC-------T-G------TA----TA-T------GATATT-CA--------C--------------GATT--------GTT-C----GA-A-GGAA--------------GTCTCATAAAC-------T-------------------------A-----------------GTATATACG-----CCT----A---------CC--GTGT-----T-T------T-GAA-A-G-C----------------A-TGTTG------GGGCG--AG--AA-CAAC-TAAC-G-----GA----GG------TCTCTTTTTGAA--CA----C------TCGAAA-TTAAGCGGACGT-A-T---GTTT---CAG-TGGATT-CCTT--AATTTTGGAC-CAA-TTG--ATT---TCTCTGACATTTGTACATAACG-TTGTCA----TTAATATT--T-CTTTTT-AGAAAT-GACA-GCGA---T---------AT---------A-G-------
gi|13 : tt----AA-TG--CC-GATATT-CAGC------C--------------GATT--------GGT-C----GA-A-GGAAAGTCTCAAGAACTAG-----------------T-------------------------T-----------------G-------G-----CCT----G---------CC--G-AT-----T-TGACCACT-G-AGA-G-TAT--TT---------TA-TGTTG------GGGCG--AG--AA-AA-C-TAAT-C-----GA----GG------TCTATTTTAGAA--AA----CA-----TCGAAAATTAAATGAATATCA-T---GTTT---TAGGTTGATT-TTTTTAAATTTTGGAA-C---GCG-------------GACATTTG----CGACG-TTGCCAT----TGACATT--C-C-T--C-GGAAATTGACAAGCGA---T---------GC---------AAG-------T-A--TTCAACT-GC-TTTTGTG--TTTT--GAAA-T-AAAC-CTGTA--A-ATTCTT-TC-T-TGCAG-GC-----T-----TTTTTT-----T--AATCTAGGA-G--ACTT-A-TTG-C-AGATG-----A----T---AGCTTACTT-----T-AATATT-CAATCTATCA-C-TCTGCAT-AAat
gi|14 : tCCCGAGA-G----AAGCAAGTT--ATGTCA--T--A-GTT---T---GAGATGACGT-CATA-CGT-------A-AAC--------AATGTTGG--T-TAGGTTT-C-AAC-T-TC-C-C--------AGCTCCGA--T-G-AA--ATTAA-C-GA-T-CTGATA-G--CAAGT-A--AGGG-C--A-CGG-CAAAG--ACA--AAAAAGT-----------------GAA-A--T-G-TTTA--G-AGA-----T---TT---TTTTTTTTTTA--CA-A--GAG-ACTG-AA-T---T-A-CC------T-G------TA----AA-TG--CC-AATATT-CA--------C--------------AATT--------GTT-T----GA-A-GGAA--------------G-----------------TCTAT---------------------A-----------------G-------G-----GCT----A---------CT--GTGT-----T-T------T-G-A-AAG-CAT--TT---------TA-TGTTG------GGGCG--AG--AA-AAAC-TAAC-A-----GA----GG------TCTCTTTTTAAA--CA----C------TCGTGA-TTAAACGGATGT-A-T---GTTT---CGG-TGGATT-CCTT--AATTTTGGAC-CA--TTG--ATT---TCTCTGACATt
gi|15 : tCCCGAGA-G----AAGCGA-----ACGTCA--T--C-CGT-------AAGCTGACGT-CATA-CGT-------A-AAC--------AATGTCCG--T-TAGGTTT-C-ATC-T-TC-C-T---------GCTCCGA--C-A-AA--A-TAA-C-GA-T--TTCTA-G--CAAGT-A--AAGA-A--A-CGA-CAAAT--AC---AACAACTT---TAAATTGTT-AATAAA-A--T-G-TTTG-AG-AGA-----CGTTTT---TTT-------A--TA-A--GAG-ACTG-AA-T---T-A-CG------T-G------TA----AA-TG--CC-AACAGT-CA--------C--------------GATT--------GTT-C----GA-A-GGAA--------------G-----------------TTTCAAGAACTAGTCATAGC------A-----------------G-------GCTTTTCCT----A---------TC--GTGC-----T-T------T-GAA-A-A-CAT--TT---------TA-TG-TA------GAGTG--AG--AA-AAAC-TGAC-G-----GA----GA------TCTCTTTTAAAA--C---------------------AAATGGGTTT-A-T---GTCT---TAG-T-GATT-CATT--AGTTT
gi|16 : CCGAGA-GTACTAAGCAA-----ACGTCA--A--A-CAT---C---A-GCTGACGT-CATA-CGT-------A-AAC--------AATGTCTG--T-TAGGTTT-C-ATC-T-TC-C-C--------A-TTCCGA--T-G-AA--ATTAA-C-GA-T-CGTCTA-G--CAAGT-A---GGG-C--A-CGG-CAAAG--ACA--AAAAAGTTAACTAGATTATC-AGTGAA-A--T-GTTTTA-AG-AGA-----C---TT---TTTTATA---A--CA-A--GAA-ACTG-AA-T---T-A-CA------T-G------TA----AA-TG--CC-GATATT-CA--------C--------------GATT--------GTT-T----GA-G-GGAA--------------G-----------------T-------------------------
gi|16 : aaatctA--------------G-----------------T-------------------------A-----------------G---------------T----A---------CC--GCGT-----T-T------T-G-A-A-ATCAT--TT---------TA-ctcataaactatctaggcctataatatgggacacagtagtaccgcgttttgaaatcatttta
gi|17 : aaatctccgagagtactaagcaaacgtcaaacatcagctgacgtcatacgtaaacaatgtctgttaggtttcatcttcccattccgatgaaattaacgatcgtctagcaagtagggcacggcaaagacaaaaaagttaactagattatcagtgaaatgttttaagagacttttttataacaagaaactgaattacatgtaaatgccgatattcacgattgtttgagggaagtctcataaactatctaggcctataatatgggacacCCCGAAATG----AAACAA-----ACGTCA--TCAA-CAT---A---GAGTTGACGT-CATA-CGT-------A-AACAACCACGTAACGTTAG--T-TAGGTTTGC-ATC-T-TCGCGC--------AGCTACGA----G-GA--ATTAAGC-AA-TCCTTCTA-G--CAAGT-A--A-CG-C--A-CAGCCGGCG--GCC--AAA-----AACCAAA-AATCTAGTGAT-A--T-G-TTTA-TG-ACA-----C----T---TTT-------A--CA-A--AAG-GCTG-AA-T---TGA-CG------T-G------TAGCACAA-GG--CC-GACATT-CACGATAATCC--------------GATT--------GTT-C----AA-A-GGAA--------------G-----------------T-------------------------A-----------------
gi|18 : tcAGA-G----AAGCAAGTT--AATTCA--T--A-GTT---T---GAGCTGAC-T-CATA-CGT-------A-AAC--------AATGTTG---T-TAG-TTT-C-ATC-T-TC-C-C--------AGCTCCGA--T-GAAA--ATTAA-T-GA-T-CTTTCT-G--T-AGT-A--AGGG-CCAA-CGG-C-AAG--ACA--AAAAAGTGA----------------AA-A--T-G-TTTA-AGAAGA-----T---TT---TTT-------tcaagaactagtcctatagtgaagggcttatccc
gi|18 : cgcc-AA-T---T-A-CC------T-G------TA----AA-TGC-CC-GATATT-CC--------A--------------GATC--------GTT-C----GAGA-GGAA--------------A-----------------T-------------------------ttttttttctttttttttttttaaaacaaaagaaagaaaaaccccttgggaaaaaaattacctgtaaatgcccgatattccagatcgttcgagaggaaat
gi|19 : cgccagagaagcaagttaattcatagtttgagctgactcatacgtaaacaatgttgttagtttcatcttcccagctccgatgaaaattaatgatctttctgtagtaagggccaacggcaagacaaaaaagtgaaaatgtttaagaagattttttttttttttctttttttttttttaaaacaaaagaaagaaaaaccccttgggaaaaaCCGAAA-G----CAGCAAGTT--ACGTCA--T--A-GTT---T---GAGCTGACGT-TATA-C-T-------ATCAC--------A-TGTTGG--TCTAGGTTT-C-ATCGT-TC-C-C--------AG-TCTGA--T-G-A----TTAA-T-GA-T-CTTCTA-G---AAGT-ACTAGGG-C--AACGG-CAAAG--ACA--AAAAA----------------AGTGAAGA--T-G-TTTA-AG-AGA-----T---TT---TTTTTTTT--A--CA-A--GGG-ACTG-AA-T---T-ACC-------T-G------TA----A
gi|2 : CCCGAGA-G----AAGCAA-----ACGTCA--T--A-CGT-------AAGCTGACGT-CATA-CGT-------A-AAC--------AATGTCTG--T-TAGGTTT-C-ATC-T-TC-C-C--------AGCTTCAA--T-G-AA--ATTAA-C-GA-T-CTTCTA-G--CAAGT-A--AGGG-C--A-CGA-CATAA--ACA--AAAAAGTTGACTAAACTATC-AGTGAA-A--T-G-ATTA-AG-AGA-----T---TT---TTT-------A--CA-A--GTG-ACTG-AA-T---T-----------T-G------TA----AA-TG--CC-GACATT-CA--------C--------------GATT--------GTT-C----GA-A-GGAA--------------A-----------------T-------------------------A-----------------G-------G-----CTT----A---------CC--GTGT-----T-T------T-G-A-A-G-CAT--TT---------TA-TGTTG------GGGCG--AG--AA-AAAC-TCAC-G-----GA----GG------TCTCTTTTTAAA--CA----C------TTGAAA-TTAAATGGATGT-A-T---GTTT---CAG-CGGATT-CCTT--AATTTTGGAC-CT--TTG--ATT---TCTCTGACATTTG----TAACG-TTGCCATCAGTTAACATT--T-C-TTTC-AGAAAT-GACA-GCAA---T---------GC---------A-G-------T-AGGTTCAACT-AG-TTTCGAG--TTTT--GAA--T-AAAC-TTG-A--A-TTTCTA-CC-A-TG-AA-ACTACAGT---ATTTCTTT-----A--AATATAGGA-T--ACTT-A-ATG-C-AGATG-----G----T---AGCTCACTT-----T-AATATT-C-ATCTACCA-T-TCTGCAT-AACT-G-AATTA-TTG------A-ACATTTAATT---TA---C-AAA------AT---T--------AT----------TTTTC-C--T-GAT-AAAT---T-G-TT--GTTTA----AC--CG-AG------TGT-------AGACTCCA---TTA----C-AAATCTA-C--C-ATGTACAGGAGCCCCACAGGCACAGTAGC--C-TTGC-TTTGGTTCGGTcaagctgtaattata
gi|20 : C-T-TG-AA-AC-----T---ATTTGTTT-----T--TATCTGAGA-T--ACTT-A-TTG-C-AGGTG-----G----T---AATTCACTT-----T-AGTATT-C-ATCTGCCA-C-TTTGCGA-AATT-G-ATTTA-TTGTTAC--A-A-----TAATAAATA---T-AAGTGCGTTAT---G--------GT----------TTTCC-C--T-GAT-AATT---T-G-TT--GTTTA----AC--CG-AA------TTT----------TTCCA---TTA----C-AAATCT--T--C-A-GTGT-------------------T-GC--C-TTGC-TTTTATTCG
gi|21 : aa-AA-TTTTTAG--TTTT--GAA--T-AAAC-TTGTA--A-TTTCTA-CG-A-TG-AA-AC-----T---ATTTTCTT-----T--AATTTTGGA-T--ACTT-A-TTG-C-AGATG-----G----T---CGCTCACTTTAATAT-AATATT-C-ACCTACCA-T-TCTGCAT-AACTGG-AATT--TTG-----------------T---TA---CAAAA------AT---G--------AT----------TTCCC-C--T-TATACAAT---T-G-T
gi|22 : ctaCTAGAA-T--ACTT-A-TTG-C-AGATGCACGCG----T---AGCTCACTT-----T-AATATT-T-ATCTAACA-T-TCTGCAT-AACT-G-AATTA-TTG-----------------T---TA---C-AAA------AT---G--------AT----------TTTCC-C--T-GAT-CAAT---T-G-TT--GTTTA----AC--CG-AG------TGA-------AGACTCCA---TTA----C-AAATCCA-C--C-ATG----------------------TAGC--C-TTGC-TTTGGTTCGG
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gi|23 : aaactACT-AAATTTTTAG--TTTT--GAA--T-AAAC-TTGTA--A-TTTCTA-CG-A-TG-AA-AC-----T---tttgaataaacttgtaatttctacgatgaaact
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lowQualScore : 2 9999 66666 99 11 99999999999 6 6 4444444 7 77777777 44 5 666 7 7 6 6 88888888 3333 6 33 7 7 7 7 8 55 8 55 8 55 8 0 88 55 7 11111111111111 7 0 88 0 0 0 0 888888888 666 5555555 55 0 88 0 9 9 111111 9 2222222 000000000 0000 0 88 0 0 55555555555555555555555 77777777 2 7777 2 2 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 77777777777777 99 22222 4 888888 7 4 4 1 4 66 999999999 4 888888 66 22 4 1 4 88888 0000 888888 7 99 5555 333333 7 1 8 1 3 777 777 1 2 1 88 11111111111 777 3333 7 22222 111111 777777 7 9 3 5 9999999999999999999999999999999999999999 1 3 7 77 77 33 7 9 22 1 9 3 7 3 7 00000000000 00000 4 2 11 2 2 2 2 44444 7777 999 4 66666 2 1 1 1 1 1 2 2 3 3333333333 888 0 00000000000000000 2222222222222222222222222222222222222 0 88 0 0 77777 0 99 6666 99 1 7777777 8 777 5555 2 4 11 666666666666666666666666 22 7 4
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Reference ( family-1868 ) : CCCGAGA-G----AAGCAA-----ACGTCA--T--A-CGT---T---AAGCTGACGT-CATA-CGT-------A-AAC--------AATGTCGG--T-TAGGTTT-C-ATC-T-TC-C-C--------AGCTCCGA--T-G-AA--ATTAA-C-GA-T-CTTCTA-G--CAAGT-A--AGGG-C--A-CGG-CAAAG--ACA--AAAAAGTTAACTAAATTATC-AGTGAA-A--T-G-TTTA-AG-AGA-----C---TT---TTT-------A--CA-A--GAG-ACTG-AA-T------T-ACG------TGT---------A----AA-TG--CC-GACATT-CA--------C--------------GATT--------GTT-C----GA-A-GGAA--------------G-----------------T-------------------------A-----------------G-------G-----CCT----A---------CC--GTGT-----T-T------T-G-A-A-G-CAT--TT---------TA-TGTTG------GGGCG--AG--AA-AAAC-TAAC-G-----GA----GG------TCTCTTTTNAAA--CA----C------TCGAAA-TTAAACGGATGT-A-T---GTTT---CAG-TGGATT-CCTT--AATTTTGGAC-C---TTA--ATT---TCTCTGACATTTG----TAACG-TTG----CCAT---TTAACATT--T-C-TTTC-AGAAAT-GACA-GCGA---T---------GC---------A-G-------T-AGGTTCGACT-AG-TTTTGAG--TTTT--GAA--T-AAAC-TTGTA--A-TTTCTA-CC-T-TG-AA-AC-----T---ATTTTTTTT-----AATCTGGGA-T--ACTT-A-TTG-C-AGATG-----G----T---AGCTCAC-TT-----T-AATATT-C-ATCTACCA-T-TCTGCAT-AACT-G-AATTA-TTG----------TTAC---AA-A-----------------AT------------G------------AT----------TTTCC-C--T-GA-T-C---AATTG-TT--GTTTA----AC--CG-AG-------TGTAGACTCCA---TTA----C-AAATCTA-C--CATGTA--------------------TAGC--C-TTGC-TTTGGTTCGGT
gi|1 : ----AAGCAAGTT--ACGTCAA-T--A--GT---TTT-GAGCTGACGT-CATATCAT-------T-AACT-------AATGTCG---T-TAGGTTT-T-ACT-A-TC-C-C--------AGCTCCGA----G-AATAATTAA-C-GA-T-CTTCTA-G--TAAGTGA--AGGG-C--A--GG-CAAAG--ACA--AACAA-------------TT-AG-GAA-A--TCG-TTCATAG-CGA-----T---TTGTTTTT-------AGGCA-A--ATG-ACTA-CA-TGT----T-AC-------T-T---------A----AA-TAGCCC-GA-ATTACA--------C--------------GATT--------GTTTC----GA-A-GGAA--------------G-----------------CTCATAAAC-----------------A-----------------A-------G-----TCT----ATTAGGGACCCCTTGTGTGACACT-T------T-G-A-A-T-TATGCTT---------TAATGTTAAGCCGTGGACGGCAG--AACAAACATAAC-A-----GA----AGACGGCTTCTCTTT---AA--TA----CGAGCGGTCTATA-TAATACGGATGT-AAT---GTTT---CAG-CGTATT-CCTT--A-TTTTGGAC-CATTTTAGAATT---TCTCTGACTTTTG----TAACGTTTG----CCA-----TAACATT--T-C-TTTCAAGAAAT-GACA-GCGATATT---------AT---------A-GATCTAGTT-AGGTTCAACT-AG-ATTTGAAGTTTTT--GAA--T-AAACTTTGTAACA-TTTCTA-CCTT-TG-AA-AC-----T---ATTTTTTTTTAAAAAATCTAGAA-T--ACTT-A-TTG-CAAGATGCACGCG----T---AGCTCAC--T-----T-AATAT----ATCTA-CA-T-TC-GCAT-AAC--G-AATTA-TTGT---------TTAC---AA-A-----------------AT------------G------------AT----------TTTCCTC--T-GA-T-C---AATTG--T--GTTTA----A---CG-AG-------TA-AGACTCCA---TTA----C-AAATCCACC--CATG----------------------TAGC--CTTTGCTTTTGGTTC
gi|10 : aCCTGAGAAG----AAGTTA------CGTCA--T--A-GTT---T---GAGCTGACAT-CAT--CGT-------A-TA---------AATGTCGGCAT-TAGGTTT----TT-T-TT-C-A--------AGCTCCGGATT-G-AA----TAA-C-GA-T-TTTCTA-AACTAAGT-A---GGG-C----CGG-CAAGA--ACA--AAAAAGTGAA--GGATTA-------AG-A--T-T-CTT-----------------TT---TTT-------ATGCATA--GAG-ACTT-AA-T------T-ACAGTCC--TGT---------A----AA-TG--CC-GATATT-CC--------A--------------GATT--------GTT-C----GA-A-GGAA--------------G-----------------T---------------------------------------------------------CCTCATAA---------AC--ATGT-----T-T------T-A-A-T-G-CAT--TT---------TA-TGTGG------TGGC---AG--AA-AAACTTAAC-A-----AA----GG------TCTCTTAT-AAA--CA----CG-----TCG-AA-TTAAACGGATGT-A------TTT---CGA-CTAATT-C--G--AGTTTTGAA--A---TTA--ATTGTATTTCT-AC-TTTG----AAAC
gi|10 : ctTTCGACT-AA-TTC-GAG--TTTT--GAAATT-AA---TTGTA----TTTCTA-CT-T-TG-AA-AC-----T---ATTTTTTTT-----AATCTAAGAAT--ACTA-A-TTGGC-AGATG-----CATTCT---AGCTCAC-TT-----A-AGTATT---A-CTAC-A-TCTCTGCAT-AACT-ACAATTACTTG----------T-AC---AA-A-----------------AT------------G------------AT----------TTTCC-C--T-T--T-C---AAT-G-TT--GTTTA----AC--AG-AG-------TGAAGACTCCA---GTA----C-AAATCTA-C--CATATG--------------------------C-TTGC-TTTGtattttttttaatctaagaatactaattggcagatgcattctagctcacttaagtattactacatctctgcataactacaattacttgtacaaaatgattttccctttcaatgttgtttaacagagtgaagactccagtacaaatctaccatatgcttgctttg
gi|11 : ctcctgagaagaagttacgtcatagtttgagctgacatcatcgtataaatgtcggcattaggttttttttcaagctccggattgaataacgattttctaaactaagtagggccggcaagaacaaaaaagtgaaggattaagattctttttttatgcatagagacttaattacagtcctgtaaatgccgatattccagattgttcgaaggaagtcctcataaacatgttttaatgcattttatgtggtggcagaaaaacttaacaaaggtctcttataaacacgtcgaattaaacggatgtat----AAGCGA-----ACGTCA--T--AATAG---T---AAGCTGACGT-TATA-CGT-------A-AACATTAAAACAATGTCGG--T-TAGGTTT-C-ATC-T-TC-C-C--------AGCGCCGA--A-G-AA--ATTAA-C-GA-T-CCTCTA-G--CAAGT-A--AGGA-C--A-CGA-CAAAT--ACA--AAAAAGTTAACTAAATTATC-AATGAA-A--T-G-TTTT-AG-ATA-----C---TT---TTT-------A--CA-A--GAG-GCTG-AA-T------T-GCA------TGT---------A----AA-TG--CC-GACATT-CACGATTAATC--------------GATT--------GTT-CTCGAGA-A-GGAA--------------G-----------------TCTCAAGAACTACAACTA--------A-----------------G-------G-----TCT----A---------CC--GTGT-----A-T------T-GAA-A-G-CAT--TTAATAGCCCCTA-TGTTG------GGGCG--AG--AA-AAAC-TAAC-G-----GG----TA------TCTCTTTTAAAA--CA----C------TCGAAA-TCAAATGGATAC-G-T---GTAT---CAG-TTGATT-CTTT--AATTGTGGAC-C----AA--ATT---TCTCTGAAATTTG----CAACG-TTA----CCA----TTAATATT--T-----------AAT-GACA-G--------------------------------------------CGACT-AG-TTTTGAG--TTTT--GAA--T-AAAC-TT
gi|12 : CCGAGA-A----CAGCAAGTT--ACGTCA--T--A-GTT---T---TAGCTGACGT-CATA-CGT-------A-AAC--------AATGTCGG--T-TGGGTTT-C-ATC-T-TC-C-C--------AGCTCCCA--T-G-AA--ATTAA-C-GA-T-CTTCTA-G--CAAGT-A--AGGG-C--A-CGA-CAAAG--ACA--AAAAAGGGAAAT-AATTA---A--GAA-ATTT-G-TTT-------T-----T---TT---TTT-------A--CA-A--GAG-ACTG-AA-T------T-ACC------TGT---------A----TA-T------GATATT-CA--------C--------------GATT--------GTT-C----GA-A-GGAA--------------GTCTCATAAAC-------T-------------------------A-----------------GTATATACG-----CCT----A---------CC--GTGT-----T-T------T-GAA-A-G-C----------------A-TGTTG------GGGCG--AG--AA-CAAC-TAAC-G-----GA----GG------TCTCTTTTTGAA--CA----C------TCGAAA-TTAAGCGGACGT-A-T---GTTT---CAG-TGGATT-CCTT--AATTTTGGAC-CAA-TTG--ATT---TCTCTGACATTTGTACATAACG-TTG----TCA----TTAATATT--T-CTTTTT-AGAAAT-GACA-GCGA---T---------AT---------A-G-------
gi|13 : tt----AA-TG--CC-GATATT-CAGC------C--------------GATT--------GGT-C----GA-A-GGAAAGTCTCAAGAACTAG-----------------T-------------------------T-----------------G-------G-----CCT----G---------CC--G-AT-----T-TGACCACT-G-AGA-G-TAT--TT---------TA-TGTTG------GGGCG--AG--AA-AA-C-TAAT-C-----GA----GG------TCTATTTTAGAA--AA----CA-----TCGAAAATTAAATGAATATCA-T---GTTT---TAGGTTGATT-TTTTTAAATTTTGGA-----------A------CGCGGACATTTG----CGACG-TTG----CCAT---T-GACATT--C-C-T--C-GGAAATTGACAAGCGA---T---------GC---------AAG-------T-A--TTCAACT-GC-TTTTGTG--TTTT--GAAA-T-AAAC-CTGTA--A-ATTCTT-TC-T-TGCAG-GC-----T-----TTTTTTT-----AATCTAGGA-G--ACTT-A-TTG-C-AGATG-----A----T---AGCTTAC-TT-----T-AATATT-CAATCTATCA-C-TCTGCAT-AAat
gi|14 : tCCCGAGA-G----AAGCAAGTT--ATGTCA--T--A-GTT---T---GAGATGACGT-CATA-CGT-------A-AAC--------AATGTTGG--T-TAGGTTT-C-AAC-T-TC-C-C--------AGCTCCGA--T-G-AA--ATTAA-C-GA-T-CTGATA-G--CAAGT-A--AGGG-C--A-CGG-CAAAG--ACA--AAAAAGT-----------------GAA-A--T-G-TTTA--G-AGA-----T---TT---TTTTTTTTTTA--CA-A--GAG-ACTG-AA-T------T-ACC------TGT---------A----AA-TG--CC-AATATT-CA--------C--------------AATT--------GTT-T----GA-A-GGAA--------------G-----------------TCTAT---------------------A-----------------G-------G-----GCT----A---------CT--GTGT-----T-T------T-G-A-AAG-CAT--TT---------TA-TGTTG------GGGCG--AG--AA-AAAC-TAAC-A-----GA----GG------TCTCTTTTTAAA--CA----C------TCGTGA-TTAAACGGATGT-A-T---GTTT---CGG-TGGATT-CCTT--AATTTTGGAC-CA--TTG--ATT---TCTCTGACATt
gi|15 : tCCCGAGA-G----AAGCGA-----ACGTCA--T--C-CGT-------AAGCTGACGT-CATA-CGT-------A-AAC--------AATGTCCG--T-TAGGTTT-C-ATC-T-TC-C-T---------GCTCCGA--C-A-AA--AT-AA-C-GA-T--TTCTA-G--CAAGT-A--AAGA-A--A-CGA-CAAAT--ACA--ACAAC-TT---TAAATTGTT-AATAAA-A--T-G-TTTG-AG-AGA-----CGTTTT---TTT-------A--TA-A--GAG-ACTG-AA-T------T-ACG------TGT---------A----AA-TG--CC-AACAGT-CA--------C--------------GATT--------GTT-C----GA-A-GGAA--------------G-----------------TTTCAAGAACTAGTCATAGC------A-----------------G-------GCTTTTCCT----A---------TC--GTGC-----T-T------T-GAA-A-A-CAT--TT---------TA-TG-TA------GAGTG--AG--AA-AAAC-TGAC-G-----GA----GA------TCTCTTTTAAAA--C---------------------AAATGGGTTT-A-T---GTCT---TAG-T-GATT-CATT--AGTTT
gi|16 : CCGAGA-GTACTAAGCAA-----ACGTCA--A--A-CAT---C---A-GCTGACGT-CATA-CGT-------A-AAC--------AATGTCTG--T-TAGGTTT-C-ATC-T-TC-C-C--------A-TTCCGA--T-G-AA--ATTAA-C-GA-T-CGTCTA-G--CAAGT-A---GGG-C--A-CGG-CAAAG--ACA--AAAAAGTTAACTAGATTATC-AGTGAA-A--T-GTTTTA-AG-AGA-----C---TT---TTTTATA---A--CA-A--GAA-ACTG-AA-T------T-ACA------TGT---------A----AA-TG--CC-GATATT-CA--------C--------------GATT--------GTT-T----GA-G-GGAA--------------G-----------------T-------------------------
gi|16 : aaatctA--------------G-----------------T-------------------------A-----------------G---------------T----A---------CC--GCGT-----T-T------T-G-A-A-ATCAT--TT---------TA-ctcataaactatctaggcctataatatgggacacagtagtaccgcgttttgaaatcatttta
gi|17 : aaatctccgagagtactaagcaaacgtcaaacatcagctgacgtcatacgtaaacaatgtctgttaggtttcatcttcccattccgatgaaattaacgatcgtctagcaagtagggcacggcaaagacaaaaaagttaactagattatcagtgaaatgttttaagagacttttttataacaagaaactgaattacatgtaaatgccgatattcacgattgtttgagggaagtctcataaactatctaggcctataatatgggacacCCCGAAATG----AAACAA-----ACGTCA--TCAA-CAT---A---GAGTTGACGT-CATA-CGT-------A-AACAACCACGTAACGTTAG--T-TAGGTTTGC-ATC-T-TCGCGC--------AGCTACGA----G-GA--ATTAAGC-AA-TCCTTCTA-G--CAAGT-A--A-CG-C--A-CAGCCGGCG--GCC--AAA-----AACCAAA-AATCTAGTGAT-A--T-G-TTTA-TG-ACA-----C----T---TTT-------A--CA-A--AAG-GCTG-AA-T------TGACG------TGT---------AGCACAA-GG--CC-GACATT-CACGATAATCC--------------GATT--------GTT-C----AA-A-GGAA--------------G-----------------T-------------------------A-----------------
gi|18 : tcAGA-G----AAGCAAGTT--AATTCA--T--A-GTT---T---GAGCTGAC-T-CATA-CGT-------A-AAC--------AATGTTG---T-TAG-TTT-C-ATC-T-TC-C-C--------AGCTCCGA--T-GAAA--ATTAA-T-GA-T-CTTTCT-G--T-AGT-A--AGGG-CCAA-CGG-C-AAG--ACA--AAAAAGTGA----------------AA-A--T-G-TTTA-AGAAGA-----T---TT---TTT-------tcaagaactagtcctatagtgaagggcttatccc
gi|18 : cgcc-AA-T------T-ACC------TGT---------A----AA-TGC-CC-GATATT-CC--------A--------------GATC--------GTT-C----GAGA-GGAA--------------A-----------------T-------------------------ttttttttctttttttttttttaaaacaaaagaaagaaaaaccccttgggaaaaaaattacctgtaaatgcccgatattccagatcgttcgagaggaaat
gi|19 : cgccagagaagcaagttaattcatagtttgagctgactcatacgtaaacaatgttgttagtttcatcttcccagctccgatgaaaattaatgatctttctgtagtaagggccaacggcaagacaaaaaagtgaaaatgtttaagaagattttttttttttttctttttttttttttaaaacaaaagaaagaaaaaccccttgggaaaaaCCGAAA-G----CAGCAAGTT--ACGTCA--T--A-GTT---T---GAGCTGACGT-TATA-C-T-------ATCAC--------A-TGTTGG--TCTAGGTTT-C-ATCGT-TC-C-C--------AG-TCTGA--T-G-A----TTAA-T-GA-T-CTTCTA-G---AAGT-ACTAGGG-C--AACGG-CAAAG--ACA--AAAAA----------------AGTGAAGA--T-G-TTTA-AG-AGA-----T---TT---TTTTTTTT--A--CA-A--GGG-ACTG-AA-T------T-ACC------TGT---------A----A
gi|2 : CCCGAGA-G----AAGCAA-----ACGTCA--T--A-CGT-------AAGCTGACGT-CATA-CGT-------A-AAC--------AATGTCTG--T-TAGGTTT-C-ATC-T-TC-C-C--------AGCTTCAA--T-G-AA--ATTAA-C-GA-T-CTTCTA-G--CAAGT-A--AGGG-C--A-CGA-CATAA--ACA--AAAAAGTTGACTAAACTATC-AGTGAA-A--T-G-ATTA-AG-AGA-----T---TT---TTT-------A--CA-A--GTG-ACTG-AA-T------T----------TGT---------A----AA-TG--CC-GACATT-CA--------C--------------GATT--------GTT-C----GA-A-GGAA--------------A-----------------T-------------------------A-----------------G-------G-----CTT----A---------CC--GTGT-----T-T------T-G-A-A-G-CAT--TT---------TA-TGTTG------GGGCG--AG--AA-AAAC-TCAC-G-----GA----GG------TCTCTTTTTAAA--CA----C------TTGAAA-TTAAATGGATGT-A-T---GTTT---CAG-CGGATT-CCTT--AATTTTGGAC-CT--TTG--ATT---TCTCTGACATTTG----TAACG-TTG----CCATCAGTTAACATT--T-C-TTTC-AGAAAT-GACA-GCAA---T---------GC---------A-G-------T-AGGTTCAACT-AG-TTTCGAG--TTTT--GAA--T-AAAC-TTG-A--A-TTTCTA-CC-A-TG-AA-ACTACAGT---ATTTCTTTA-----AATATAGGA-T--ACTT-A-ATG-C-AGATG-----G----T---AGCTCAC-TT-----T-AATATT-C-ATCTACCA-T-TCTGCAT-AACT-G-AATTA-TTGAACATTTAATTTAC---AA-A-----------------AT------------T------------AT----------TTTTC-C--T-GA-T-A---AATTG-TT--GTTTA----AC--CG-AG-------TGTAGACTCCA---TTA----C-AAATCTA-C--CATGTACAGGAGCCCCACAGGCACAGTAGC--C-TTGC-TTTGGTTCGGTcaagctgtaattata
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gi|21 : aa-AA-TTTTTAG--TTTT--GAA--T-AAAC-TTGTA--A-TTTCTA-CG-A-TG-AA-AC-----T---ATTTTCTTT-----AATTTTGGA-T--ACTT-A-TTG-C-AGATG-----G----T---CGCTCAC-TTTAATAT-AATATT-C-ACCTACCA-T-TCTGCAT-AACTGG-AATT--TTG----------TTACA--AA-A-----------------AT------------G------------AT----------TTCCC-C--T-TA-TAC---AATTG-T
gi|22 : ctaCTAGAA-T--ACTT-A-TTG-C-AGATGCACGCG----T---AGCTCAC-TT-----T-AATATT-T-ATCTAACA-T-TCTGCAT-AACT-G-AATTA-TTG----------TTAC---AA-A-----------------AT------------G------------AT----------TTTCC-C--T-GA-T-C---AATTG-TT--GTTTA----AC--CG-AG-------TGAAGACTCCA---TTA----C-AAATCCA-C--CATG----------------------TAGC--C-TTGC-TTTGGTTCGG
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gi|23 : aaactACT-AAATTTTTAG--TTTT--GAA--T-AAAC-TTGTA--A-TTTCTA-CG-A-TG-AA-AC-----T---tttgaataaacttgtaatttctacgatgaaact
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Reference ( family-1868 ) : CCCGAGA-G----AAGCAA-----ACGTCA--T--A-CGT---T---AAGCTGACGT-CATA-CGT-------A-AAC--------AATGTCGG--T-TAGGTTT-C-ATC-T-TC-C-C--------AGCTCCGA--T-G-AA--ATTAA-C-GA-T-CTTCTA-G--CAAGT-A--AGGG-C--A-CGG-CAAAG--ACA--AAAAAGTTAACTAAATTATC-AGTGAA-A--T-G-TTTA-AG-AGA-----C---TT---TTT-------A--CA-A--GAG-ACTG-AA-T------T-ACG------TGT---------A----AA-TG--CC-GACATT-CA--------C--------------GATT--------GTT-C----GA-A-GGAA--------------G-----------------T-------------------------A-----------------G-------G-----CCT----A---------CC--GTGT-----T-T------T-G-A-A-G-CAT--TT---------TA-TGTTG------GGGCG--AG--AA-AAAC-TAAC-G-----GA----GG------TCTCTTTTNAAA--CA----C------TCGAAA-TTAAACGGATGT-A-T---GTTT---CAG-TGGATT-CCTT--AATTTTGGAC-C---TTA--ATT---TCTCTGACATTTG----TAACG-TT----ACCA----TTAACATT--T-C-TTTC-AGAAAT-GACA-GCGA---T---------GC---------A-G-------T-AGGTTCGACT-AG-TTTTGAG--TTTT--GAA--T-AAAC-TTGTA--A-TTTCTA-CC-T-TG-AA-AC-----T---ATTTTTTTT-----AATCTGGGA-T--ACTT-A-TTG-C-AGATG-----G----T---AGCTCAC-TT-----T-AATATT-C-ATCTACCA-T-TCTGCAT-AACT-G-AATTA-TTG----------TTAC---AA-A-----------------AT------------G------------AT----------TTTCC-C--T-GA-T-C---AATTG-TT--GTTTA----AC--CG-AG-------TGTAGACTCCA---TTA----C-AAATCTA-C--CATGTA--------------------TAGC--C-TTGC-TTTGGTTCGGT
gi|1 : ----AAGCAAGTT--ACGTCAA-T--A--GT---TTT-GAGCTGACGT-CATATCAT-------T-AACT-------AATGTCG---T-TAGGTTT-T-ACT-A-TC-C-C--------AGCTCCGA----G-AATAATTAA-C-GA-T-CTTCTA-G--TAAGTGA--AGGG-C--A--GG-CAAAG--ACA--AACAA-------------TT-AG-GAA-A--TCG-TTCATAG-CGA-----T---TTGTTTTT-------AGGCA-A--ATG-ACTA-CA-TGT----T-AC-------T-T---------A----AA-TAGCCC-GA-ATTACA--------C--------------GATT--------GTTTC----GA-A-GGAA--------------G-----------------CTCATAAAC-----------------A-----------------A-------G-----TCT----ATTAGGGACCCCTTGTGTGACACT-T------T-G-A-A-T-TATGCTT---------TAATGTTAAGCCGTGGACGGCAG--AACAAACATAAC-A-----GA----AGACGGCTTCTCTTT---AA--TA----CGAGCGGTCTATA-TAATACGGATGT-AAT---GTTT---CAG-CGTATT-CCTT--A-TTTTGGAC-CATTTTAGAATT---TCTCTGACTTTTG----TAACGTTT----GCCA-----TAACATT--T-C-TTTCAAGAAAT-GACA-GCGATATT---------AT---------A-GATCTAGTT-AGGTTCAACT-AG-ATTTGAAGTTTTT--GAA--T-AAACTTTGTAACA-TTTCTA-CCTT-TG-AA-AC-----T---ATTTTTTTTTAAAAAATCTAGAA-T--ACTT-A-TTG-CAAGATGCACGCG----T---AGCTCAC--T-----T-AATAT----ATCTA-CA-T-TC-GCAT-AAC--G-AATTA-TTGT---------TTAC---AA-A-----------------AT------------G------------AT----------TTTCCTC--T-GA-T-C---AATTG--T--GTTTA----A---CG-AG-------TA-AGACTCCA---TTA----C-AAATCCACC--CATG----------------------TAGC--CTTTGCTTTTGGTTC
gi|10 : aCCTGAGAAG----AAGTTA------CGTCA--T--A-GTT---T---GAGCTGACAT-CAT--CGT-------A-TA---------AATGTCGGCAT-TAGGTTT----TT-T-TT-C-A--------AGCTCCGGATT-G-AA----TAA-C-GA-T-TTTCTA-AACTAAGT-A---GGG-C----CGG-CAAGA--ACA--AAAAAGTGAA--GGATTA-------AG-A--T-T-CTT-----------------TT---TTT-------ATGCATA--GAG-ACTT-AA-T------T-ACAGTCC--TGT---------A----AA-TG--CC-GATATT-CC--------A--------------GATT--------GTT-C----GA-A-GGAA--------------G-----------------T---------------------------------------------------------CCTCATAA---------AC--ATGT-----T-T------T-A-A-T-G-CAT--TT---------TA-TGTGG------TGGC---AG--AA-AAACTTAAC-A-----AA----GG------TCTCTTAT-AAA--CA----CG-----TCG-AA-TTAAACGGATGT-A------TTT---CGA-CTAATT-C--G--AGTTTTGAA--A---TTA--ATTGTATTTCT-AC-TTTG----AAAC
gi|10 : ctTTCGACT-AA-TTC-GAG--TTTT--GAAATT-AA---TTGTA----TTTCTA-CT-T-TG-AA-AC-----T---ATTTTTTTT-----AATCTAAGAAT--ACTA-A-TTGGC-AGATG-----CATTCT---AGCTCAC-TT-----A-AGTATT---A-CTAC-A-TCTCTGCAT-AACT-ACAATTACTTG----------T-AC---AA-A-----------------AT------------G------------AT----------TTTCC-C--T-T--T-C---AAT-G-TT--GTTTA----AC--AG-AG-------TGAAGACTCCA---GTA----C-AAATCTA-C--CATATG--------------------------C-TTGC-TTTGtattttttttaatctaagaatactaattggcagatgcattctagctcacttaagtattactacatctctgcataactacaattacttgtacaaaatgattttccctttcaatgttgtttaacagagtgaagactccagtacaaatctaccatatgcttgctttg
gi|11 : ctcctgagaagaagttacgtcatagtttgagctgacatcatcgtataaatgtcggcattaggttttttttcaagctccggattgaataacgattttctaaactaagtagggccggcaagaacaaaaaagtgaaggattaagattctttttttatgcatagagacttaattacagtcctgtaaatgccgatattccagattgttcgaaggaagtcctcataaacatgttttaatgcattttatgtggtggcagaaaaacttaacaaaggtctcttataaacacgtcgaattaaacggatgtat----AAGCGA-----ACGTCA--T--AATAG---T---AAGCTGACGT-TATA-CGT-------A-AACATTAAAACAATGTCGG--T-TAGGTTT-C-ATC-T-TC-C-C--------AGCGCCGA--A-G-AA--ATTAA-C-GA-T-CCTCTA-G--CAAGT-A--AGGA-C--A-CGA-CAAAT--ACA--AAAAAGTTAACTAAATTATC-AATGAA-A--T-G-TTTT-AG-ATA-----C---TT---TTT-------A--CA-A--GAG-GCTG-AA-T------T-GCA------TGT---------A----AA-TG--CC-GACATT-CACGATTAATC--------------GATT--------GTT-CTCGAGA-A-GGAA--------------G-----------------TCTCAAGAACTACAACTA--------A-----------------G-------G-----TCT----A---------CC--GTGT-----A-T------T-GAA-A-G-CAT--TTAATAGCCCCTA-TGTTG------GGGCG--AG--AA-AAAC-TAAC-G-----GG----TA------TCTCTTTTAAAA--CA----C------TCGAAA-TCAAATGGATAC-G-T---GTAT---CAG-TTGATT-CTTT--AATTGTGGAC-C----AA--ATT---TCTCTGAAATTTG----CAACG-TT----ACCA----TTAATATT--T-----------AAT-GACA-G--------------------------------------------CGACT-AG-TTTTGAG--TTTT--GAA--T-AAAC-TT
gi|12 : CCGAGA-A----CAGCAAGTT--ACGTCA--T--A-GTT---T---TAGCTGACGT-CATA-CGT-------A-AAC--------AATGTCGG--T-TGGGTTT-C-ATC-T-TC-C-C--------AGCTCCCA--T-G-AA--ATTAA-C-GA-T-CTTCTA-G--CAAGT-A--AGGG-C--A-CGA-CAAAG--ACA--AAAAAGGGAAAT-AATTA---A--GAA-ATTT-G-TTT-------T-----T---TT---TTT-------A--CA-A--GAG-ACTG-AA-T------T-ACC------TGT---------A----TA-T------GATATT-CA--------C--------------GATT--------GTT-C----GA-A-GGAA--------------GTCTCATAAAC-------T-------------------------A-----------------GTATATACG-----CCT----A---------CC--GTGT-----T-T------T-GAA-A-G-C----------------A-TGTTG------GGGCG--AG--AA-CAAC-TAAC-G-----GA----GG------TCTCTTTTTGAA--CA----C------TCGAAA-TTAAGCGGACGT-A-T---GTTT---CAG-TGGATT-CCTT--AATTTTGGAC-CAA-TTG--ATT---TCTCTGACATTTGTACATAACG-TT----GTCA----TTAATATT--T-CTTTTT-AGAAAT-GACA-GCGA---T---------AT---------A-G-------
gi|13 : tt----AA-TG--CC-GATATT-CAGC------C--------------GATT--------GGT-C----GA-A-GGAAAGTCTCAAGAACTAG-----------------T-------------------------T-----------------G-------G-----CCT----G---------CC--G-AT-----T-TGACCACT-G-AGA-G-TAT--TT---------TA-TGTTG------GGGCG--AG--AA-AA-C-TAAT-C-----GA----GG------TCTATTTTAGAA--AA----CA-----TCGAAAATTAAATGAATATCA-T---GTTT---TAGGTTGATT-TTTTTAAATTTTGGA-----------A------CGCGGACATTTG----CGACG-TT----GCCA----TTGACATT--C-C-T--C-GGAAATTGACAAGCGA---T---------GC---------AAG-------T-A--TTCAACT-GC-TTTTGTG--TTTT--GAAA-T-AAAC-CTGTA--A-ATTCTT-TC-T-TGCAG-GC-----T-----TTTTTTT-----AATCTAGGA-G--ACTT-A-TTG-C-AGATG-----A----T---AGCTTAC-TT-----T-AATATT-CAATCTATCA-C-TCTGCAT-AAat
gi|14 : tCCCGAGA-G----AAGCAAGTT--ATGTCA--T--A-GTT---T---GAGATGACGT-CATA-CGT-------A-AAC--------AATGTTGG--T-TAGGTTT-C-AAC-T-TC-C-C--------AGCTCCGA--T-G-AA--ATTAA-C-GA-T-CTGATA-G--CAAGT-A--AGGG-C--A-CGG-CAAAG--ACA--AAAAAGT-----------------GAA-A--T-G-TTTA--G-AGA-----T---TT---TTTTTTTTTTA--CA-A--GAG-ACTG-AA-T------T-ACC------TGT---------A----AA-TG--CC-AATATT-CA--------C--------------AATT--------GTT-T----GA-A-GGAA--------------G-----------------TCTAT---------------------A-----------------G-------G-----GCT----A---------CT--GTGT-----T-T------T-G-A-AAG-CAT--TT---------TA-TGTTG------GGGCG--AG--AA-AAAC-TAAC-A-----GA----GG------TCTCTTTTTAAA--CA----C------TCGTGA-TTAAACGGATGT-A-T---GTTT---CGG-TGGATT-CCTT--AATTTTGGAC-CA--TTG--ATT---TCTCTGACATt
gi|15 : tCCCGAGA-G----AAGCGA-----ACGTCA--T--C-CGT-------AAGCTGACGT-CATA-CGT-------A-AAC--------AATGTCCG--T-TAGGTTT-C-ATC-T-TC-C-T---------GCTCCGA--C-A-AA--AT-AA-C-GA-T--TTCTA-G--CAAGT-A--AAGA-A--A-CGA-CAAAT--ACA--ACAAC-TT---TAAATTGTT-AATAAA-A--T-G-TTTG-AG-AGA-----CGTTTT---TTT-------A--TA-A--GAG-ACTG-AA-T------T-ACG------TGT---------A----AA-TG--CC-AACAGT-CA--------C--------------GATT--------GTT-C----GA-A-GGAA--------------G-----------------TTTCAAGAACTAGTCATAGC------A-----------------G-------GCTTTTCCT----A---------TC--GTGC-----T-T------T-GAA-A-A-CAT--TT---------TA-TG-TA------GAGTG--AG--AA-AAAC-TGAC-G-----GA----GA------TCTCTTTTAAAA--C---------------------AAATGGGTTT-A-T---GTCT---TAG-T-GATT-CATT--AGTTT
gi|16 : CCGAGA-GTACTAAGCAA-----ACGTCA--A--A-CAT---C---A-GCTGACGT-CATA-CGT-------A-AAC--------AATGTCTG--T-TAGGTTT-C-ATC-T-TC-C-C--------A-TTCCGA--T-G-AA--ATTAA-C-GA-T-CGTCTA-G--CAAGT-A---GGG-C--A-CGG-CAAAG--ACA--AAAAAGTTAACTAGATTATC-AGTGAA-A--T-GTTTTA-AG-AGA-----C---TT---TTTTATA---A--CA-A--GAA-ACTG-AA-T------T-ACA------TGT---------A----AA-TG--CC-GATATT-CA--------C--------------GATT--------GTT-T----GA-G-GGAA--------------G-----------------T-------------------------
gi|16 : aaatctA--------------G-----------------T-------------------------A-----------------G---------------T----A---------CC--GCGT-----T-T------T-G-A-A-ATCAT--TT---------TA-ctcataaactatctaggcctataatatgggacacagtagtaccgcgttttgaaatcatttta
gi|17 : aaatctccgagagtactaagcaaacgtcaaacatcagctgacgtcatacgtaaacaatgtctgttaggtttcatcttcccattccgatgaaattaacgatcgtctagcaagtagggcacggcaaagacaaaaaagttaactagattatcagtgaaatgttttaagagacttttttataacaagaaactgaattacatgtaaatgccgatattcacgattgtttgagggaagtctcataaactatctaggcctataatatgggacacCCCGAAATG----AAACAA-----ACGTCA--TCAA-CAT---A---GAGTTGACGT-CATA-CGT-------A-AACAACCACGTAACGTTAG--T-TAGGTTTGC-ATC-T-TCGCGC--------AGCTACGA----G-GA--ATTAAGC-AA-TCCTTCTA-G--CAAGT-A--A-CG-C--A-CAGCCGGCG--GCC--AAA-----AACCAAA-AATCTAGTGAT-A--T-G-TTTA-TG-ACA-----C----T---TTT-------A--CA-A--AAG-GCTG-AA-T------TGACG------TGT---------AGCACAA-GG--CC-GACATT-CACGATAATCC--------------GATT--------GTT-C----AA-A-GGAA--------------G-----------------T-------------------------A-----------------
gi|18 : tcAGA-G----AAGCAAGTT--AATTCA--T--A-GTT---T---GAGCTGAC-T-CATA-CGT-------A-AAC--------AATGTTG---T-TAG-TTT-C-ATC-T-TC-C-C--------AGCTCCGA--T-GAAA--ATTAA-T-GA-T-CTTTCT-G--T-AGT-A--AGGG-CCAA-CGG-C-AAG--ACA--AAAAAGTGA----------------AA-A--T-G-TTTA-AGAAGA-----T---TT---TTT-------tcaagaactagtcctatagtgaagggcttatccc
gi|18 : cgcc-AA-T------T-ACC------TGT---------A----AA-TGC-CC-GATATT-CC--------A--------------GATC--------GTT-C----GAGA-GGAA--------------A-----------------T-------------------------ttttttttctttttttttttttaaaacaaaagaaagaaaaaccccttgggaaaaaaattacctgtaaatgcccgatattccagatcgttcgagaggaaat
gi|19 : cgccagagaagcaagttaattcatagtttgagctgactcatacgtaaacaatgttgttagtttcatcttcccagctccgatgaaaattaatgatctttctgtagtaagggccaacggcaagacaaaaaagtgaaaatgtttaagaagattttttttttttttctttttttttttttaaaacaaaagaaagaaaaaccccttgggaaaaaCCGAAA-G----CAGCAAGTT--ACGTCA--T--A-GTT---T---GAGCTGACGT-TATA-C-T-------ATCAC--------A-TGTTGG--TCTAGGTTT-C-ATCGT-TC-C-C--------AG-TCTGA--T-G-A----TTAA-T-GA-T-CTTCTA-G---AAGT-ACTAGGG-C--AACGG-CAAAG--ACA--AAAAA----------------AGTGAAGA--T-G-TTTA-AG-AGA-----T---TT---TTTTTTTT--A--CA-A--GGG-ACTG-AA-T------T-ACC------TGT---------A----A
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gi|21 : aa-AA-TTTTTAG--TTTT--GAA--T-AAAC-TTGTA--A-TTTCTA-CG-A-TG-AA-AC-----T---ATTTTCTTT-----AATTTTGGA-T--ACTT-A-TTG-C-AGATG-----G----T---CGCTCAC-TTTAATAT-AATATT-C-ACCTACCA-T-TCTGCAT-AACTGG-AATT--TTG----------TTACA--AA-A-----------------AT------------G------------AT----------TTCCC-C--T-TA-TAC---AATTG-T
gi|22 : ctaCTAGAA-T--ACTT-A-TTG-C-AGATGCACGCG----T---AGCTCAC-TT-----T-AATATT-T-ATCTAACA-T-TCTGCAT-AACT-G-AATTA-TTG----------TTAC---AA-A-----------------AT------------G------------AT----------TTTCC-C--T-GA-T-C---AATTG-TT--GTTTA----AC--CG-AG-------TGAAGACTCCA---TTA----C-AAATCCA-C--CATG----------------------TAGC--C-TTGC-TTTGGTTCGG
gi|23 : CCCGAGA-G----AAACTG-----ACGTCA--A--A-CGT-------AAGCTGACGT-TATA-CGT-------A-AAC--------AATGT-----------------AT----TC-C-C--------AGCTCCGG--T-G-AA--ATTAA-T-GA-T-CTTCTA-G--CAAGT-A--AGGG-C--A-C-------------------AGTTAACTAAATTTTT-AGT
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Reference ( family-1868 ) : CCCGAGA-G----AAGCAA-----ACGTCA--T--A-CGT---T---AAGCTGACGT-CATA-CGT-------A-AAC--------AATGTCGG--T-TAGGTTT-C-ATC-T-TC-C-C--------AGCTCCGA--T-G-AA--ATTAA-C-GA-T-CTTCTA-G--CAAGT-A--AGGG-C--A-CGG-CAAAG--ACA--AAAAAGTTAACTAAATTATC-AGTGAA-A--T-G-TTTA-AG-AGA-----C---TT---TTT-------A--CA-A--GAG-ACTG-AA-T------T-ACG------TGT---------A----AA-TG--CC-GACATT-CA--------C--------------GATT--------GTT-C----GA-A-GGAA--------------G-----------------T-------------------------A-----------------G-------G-----CCT----A---------CC--GTGT-----T-T------T-G-A-A-G-CAT--TT---------TA-TGTTG------GGGCG--AG--AA-AAAC-TAAC-G-----GA----GG------TCTCTTTTNAAA--CA----C------TCGAAA-TTAAACGGATGT-A-T---GTTT---CAG-TGGATT-CCTT--AATTTTGGAC-C---TTA--ATT---TCTCTGACATTTG----TAACG-TT----ACCA----TTAACATT--T-C-TTTC-AGAAAT-GACA-GCGA---T---------GC---------A-G-------T-AGGTTCGACT-AG-TTTTGAG--TTTT--GAA--T-AAAC-TTGTA--A-TTTCTA-CC-T-TG-AA-AC-----T---ATTTTTTTT-----AATCTGGGA-T--ACTT-A-TTG-C-AGATG-----G----T---AGCTCAC-TT-----T-AATATT-C-ATCTACCA-T-TCTGCAT-AACT-G-AATTA-TTG----------TTAC---AA-A-----------------AT------------G------------AT----------TTTCC-C--T-GA-T-C---AATTG-TT--GTTTA----AC--CG-AG-------TGTAGACTCCA---TTA----C-AAATCTA-C--CATGTA--------------------TAGC--C-TTGC-TTTGGTTCGGT
gi|1 : ----AAGCAAGTT--ACGTCAA-T--A--GT---TTT-GAGCTGACGT-CATATCAT-------T-AACT-------AATGTCG---T-TAGGTTT-T-ACT-A-TC-C-C--------AGCTCCGA----G-AATAATTAA-C-GA-T-CTTCTA-G--TAAGTGA--AGGG-C--A--GG-CAAAG--ACA--AACAA-------------TT-AG-GAA-A--TCG-TTCATAG-CGA-----T---TTGTTTTT-------AGGCA-A--ATG-ACTA-CA-TGT----T-AC-------T-T---------A----AA-TAGCCC-GA-ATTACA--------C--------------GATT--------GTTTC----GA-A-GGAA--------------G-----------------CTCATAAAC-----------------A-----------------A-------G-----TCT----ATTAGGGACCCCTTGTGTGACACT-T------T-G-A-A-T-TATGCTT---------TAATGTTAAGCCGTGGACGGCAG--AACAAACATAAC-A-----GA----AGACGGCTTCTCTTT---AA--TA----CGAGCGGTCTATA-TAATACGGATGT-AAT---GTTT---CAG-CGTATT-CCTT--A-TTTTGGAC-CATTTTAGAATT---TCTCTGACTTTTG----TAACGTTT----GCCA-----TAACATT--T-C-TTTCAAGAAAT-GACA-GCGATATT---------AT---------A-GATCTAGTT-AGGTTCAACT-AG-ATTTGAAGTTTTT--GAA--T-AAACTTTGTAACA-TTTCTA-CCTT-TG-AA-AC-----T---ATTTTTTTTTAAAAAATCTAGAA-T--ACTT-A-TTG-CAAGATGCACGCG----T---AGCTCAC--T-----T-AATAT----ATCTA-CA-T-TC-GCAT-AAC--G-AATTA-TTGT---------TTAC---AA-A-----------------AT------------G------------AT----------TTTCCTC--T-GA-T-C---AATTG--T--GTTTA----A---CG-AG-------TA-AGACTCCA---TTA----C-AAATCCACC--CATG----------------------TAGC--CTTTGCTTTTGGTTC
gi|10 : aCCTGAGAAG----AAGTTA------CGTCA--T--A-GTT---T---GAGCTGACAT-CAT--CGT-------A-TA---------AATGTCGGCAT-TAGGTTT----TT-T-TT-C-A--------AGCTCCGGATT-G-AA----TAA-C-GA-T-TTTCTA-AACTAAGT-A---GGG-C----CGG-CAAGA--ACA--AAAAAGTGAA--GGATTA-------AG-A--T-T-CTT-----------------TT---TTT-------ATGCATA--GAG-ACTT-AA-T------T-ACAGTCC--TGT---------A----AA-TG--CC-GATATT-CC--------A--------------GATT--------GTT-C----GA-A-GGAA--------------G-----------------T---------------------------------------------------------CCTCATAA---------AC--ATGT-----T-T------T-A-A-T-G-CAT--TT---------TA-TGTGG------TGGC---AG--AA-AAACTTAAC-A-----AA----GG------TCTCTTAT-AAA--CA----CG-----TCG-AA-TTAAACGGATGT-A------TTT---CGA-CTAATT-C--G--AGTTTTGAA--A---TTA--ATTGTATTTCT-AC-TTTG----AAAC
gi|10 : ctTTCGACT-AA-TTC-GAG--TTTT--GAAATT-AA---TTGTA----TTTCTA-CT-T-TG-AA-AC-----T---ATTTTTTTT-----AATCTAAGAAT--ACTA-A-TTGGC-AGATG-----CATTCT---AGCTCAC-TT-----A-AGTATT---A-CTAC-A-TCTCTGCAT-AACT-ACAATTACTTG----------T-AC---AA-A-----------------AT------------G------------AT----------TTTCC-C--T-T--T-C---AAT-G-TT--GTTTA----AC--AG-AG-------TGAAGACTCCA---GTA----C-AAATCTA-C--CATATG--------------------------C-TTGC-TTTGtattttttttaatctaagaatactaattggcagatgcattctagctcacttaagtattactacatctctgcataactacaattacttgtacaaaatgattttccctttcaatgttgtttaacagagtgaagactccagtacaaatctaccatatgcttgctttg
gi|11 : ctcctgagaagaagttacgtcatagtttgagctgacatcatcgtataaatgtcggcattaggttttttttcaagctccggattgaataacgattttctaaactaagtagggccggcaagaacaaaaaagtgaaggattaagattctttttttatgcatagagacttaattacagtcctgtaaatgccgatattccagattgttcgaaggaagtcctcataaacatgttttaatgcattttatgtggtggcagaaaaacttaacaaaggtctcttataaacacgtcgaattaaacggatgtat----AAGCGA-----ACGTCA--T--AATAG---T---AAGCTGACGT-TATA-CGT-------A-AACATTAAAACAATGTCGG--T-TAGGTTT-C-ATC-T-TC-C-C--------AGCGCCGA--A-G-AA--ATTAA-C-GA-T-CCTCTA-G--CAAGT-A--AGGA-C--A-CGA-CAAAT--ACA--AAAAAGTTAACTAAATTATC-AATGAA-A--T-G-TTTT-AG-ATA-----C---TT---TTT-------A--CA-A--GAG-GCTG-AA-T------T-GCA------TGT---------A----AA-TG--CC-GACATT-CACGATTAATC--------------GATT--------GTT-CTCGAGA-A-GGAA--------------G-----------------TCTCAAGAACTACAACTA--------A-----------------G-------G-----TCT----A---------CC--GTGT-----A-T------T-GAA-A-G-CAT--TTAATAGCCCCTA-TGTTG------GGGCG--AG--AA-AAAC-TAAC-G-----GG----TA------TCTCTTTTAAAA--CA----C------TCGAAA-TCAAATGGATAC-G-T---GTAT---CAG-TTGATT-CTTT--AATTGTGGAC-C----AA--ATT---TCTCTGAAATTTG----CAACG-TT----ACCA----TTAATATT--T-----------AAT-GACA-G--------------------------------------------CGACT-AG-TTTTGAG--TTTT--GAA--T-AAAC-TT
gi|12 : CCGAGA-A----CAGCAAGTT--ACGTCA--T--A-GTT---T---TAGCTGACGT-CATA-CGT-------A-AAC--------AATGTCGG--T-TGGGTTT-C-ATC-T-TC-C-C--------AGCTCCCA--T-G-AA--ATTAA-C-GA-T-CTTCTA-G--CAAGT-A--AGGG-C--A-CGA-CAAAG--ACA--AAAAAGGGAAAT-AATTA---A--GAA-ATTT-G-TTT-------T-----T---TT---TTT-------A--CA-A--GAG-ACTG-AA-T------T-ACC------TGT---------A----TA-T------GATATT-CA--------C--------------GATT--------GTT-C----GA-A-GGAA--------------GTCTCATAAAC-------T-------------------------A-----------------GTATATACG-----CCT----A---------CC--GTGT-----T-T------T-GAA-A-G-C----------------A-TGTTG------GGGCG--AG--AA-CAAC-TAAC-G-----GA----GG------TCTCTTTTTGAA--CA----C------TCGAAA-TTAAGCGGACGT-A-T---GTTT---CAG-TGGATT-CCTT--AATTTTGGAC-CAA-TTG--ATT---TCTCTGACATTTGTACATAACG-TT----GTCA----TTAATATT--T-CTTTTT-AGAAAT-GACA-GCGA---T---------AT---------A-G-------
gi|13 : tt----AA-TG--CC-GATATT-CAGC------C--------------GATT--------GGT-C----GA-A-GGAAAGTCTCAAGAACTAG-----------------T-------------------------T-----------------G-------G-----CCT----G---------CC--G-AT-----T-TGACCACT-G-AGA-G-TAT--TT---------TA-TGTTG------GGGCG--AG--AA-AA-C-TAAT-C-----GA----GG------TCTATTTTAGAA--AA----CA-----TCGAAAATTAAATGAATATCA-T---GTTT---TAGGTTGATT-TTTTTAAATTTTGGA-----------A------CGCGGACATTTG----CGACG-TT----GCCA----TTGACATT--C-C-T--C-GGAAATTGACAAGCGA---T---------GC---------AAG-------T-A--TTCAACT-GC-TTTTGTG--TTTT--GAAA-T-AAAC-CTGTA--A-ATTCTT-TC-T-TGCAG-GC-----T-----TTTTTTT-----AATCTAGGA-G--ACTT-A-TTG-C-AGATG-----A----T---AGCTTAC-TT-----T-AATATT-CAATCTATCA-C-TCTGCAT-AAat
gi|14 : tCCCGAGA-G----AAGCAAGTT--ATGTCA--T--A-GTT---T---GAGATGACGT-CATA-CGT-------A-AAC--------AATGTTGG--T-TAGGTTT-C-AAC-T-TC-C-C--------AGCTCCGA--T-G-AA--ATTAA-C-GA-T-CTGATA-G--CAAGT-A--AGGG-C--A-CGG-CAAAG--ACA--AAAAAGT-----------------GAA-A--T-G-TTTA--G-AGA-----T---TT---TTTTTTTTTTA--CA-A--GAG-ACTG-AA-T------T-ACC------TGT---------A----AA-TG--CC-AATATT-CA--------C--------------AATT--------GTT-T----GA-A-GGAA--------------G-----------------TCTAT---------------------A-----------------G-------G-----GCT----A---------CT--GTGT-----T-T------T-G-A-AAG-CAT--TT---------TA-TGTTG------GGGCG--AG--AA-AAAC-TAAC-A-----GA----GG------TCTCTTTTTAAA--CA----C------TCGTGA-TTAAACGGATGT-A-T---GTTT---CGG-TGGATT-CCTT--AATTTTGGAC-CA--TTG--ATT---TCTCTGACATt
gi|15 : tCCCGAGA-G----AAGCGA-----ACGTCA--T--C-CGT-------AAGCTGACGT-CATA-CGT-------A-AAC--------AATGTCCG--T-TAGGTTT-C-ATC-T-TC-C-T---------GCTCCGA--C-A-AA--AT-AA-C-GA-T--TTCTA-G--CAAGT-A--AAGA-A--A-CGA-CAAAT--ACA--ACAAC-TT---TAAATTGTT-AATAAA-A--T-G-TTTG-AG-AGA-----CGTTTT---TTT-------A--TA-A--GAG-ACTG-AA-T------T-ACG------TGT---------A----AA-TG--CC-AACAGT-CA--------C--------------GATT--------GTT-C----GA-A-GGAA--------------G-----------------TTTCAAGAACTAGTCATAGC------A-----------------G-------GCTTTTCCT----A---------TC--GTGC-----T-T------T-GAA-A-A-CAT--TT---------TA-TG-TA------GAGTG--AG--AA-AAAC-TGAC-G-----GA----GA------TCTCTTTTAAAA--C---------------------AAATGGGTTT-A-T---GTCT---TAG-T-GATT-CATT--AGTTT
gi|16 : CCGAGA-GTACTAAGCAA-----ACGTCA--A--A-CAT---C---A-GCTGACGT-CATA-CGT-------A-AAC--------AATGTCTG--T-TAGGTTT-C-ATC-T-TC-C-C--------A-TTCCGA--T-G-AA--ATTAA-C-GA-T-CGTCTA-G--CAAGT-A---GGG-C--A-CGG-CAAAG--ACA--AAAAAGTTAACTAGATTATC-AGTGAA-A--T-GTTTTA-AG-AGA-----C---TT---TTTTATA---A--CA-A--GAA-ACTG-AA-T------T-ACA------TGT---------A----AA-TG--CC-GATATT-CA--------C--------------GATT--------GTT-T----GA-G-GGAA--------------G-----------------T-------------------------
gi|16 : aaatctA--------------G-----------------T-------------------------A-----------------G---------------T----A---------CC--GCGT-----T-T------T-G-A-A-ATCAT--TT---------TA-ctcataaactatctaggcctataatatgggacacagtagtaccgcgttttgaaatcatttta
gi|17 : aaatctccgagagtactaagcaaacgtcaaacatcagctgacgtcatacgtaaacaatgtctgttaggtttcatcttcccattccgatgaaattaacgatcgtctagcaagtagggcacggcaaagacaaaaaagttaactagattatcagtgaaatgttttaagagacttttttataacaagaaactgaattacatgtaaatgccgatattcacgattgtttgagggaagtctcataaactatctaggcctataatatgggacacCCCGAAATG----AAACAA-----ACGTCA--TCAA-CAT---A---GAGTTGACGT-CATA-CGT-------A-AACAACCACGTAACGTTAG--T-TAGGTTTGC-ATC-T-TCGCGC--------AGCTACGA----G-GA--ATTAAGC-AA-TCCTTCTA-G--CAAGT-A--A-CG-C--A-CAGCCGGCG--GCC--AAA-----AACCAAA-AATCTAGTGAT-A--T-G-TTTA-TG-ACA-----C----T---TTT-------A--CA-A--AAG-GCTG-AA-T------TGACG------TGT---------AGCACAA-GG--CC-GACATT-CACGATAATCC--------------GATT--------GTT-C----AA-A-GGAA--------------G-----------------T-------------------------A-----------------
gi|18 : tcAGA-G----AAGCAAGTT--AATTCA--T--A-GTT---T---GAGCTGAC-T-CATA-CGT-------A-AAC--------AATGTTG---T-TAG-TTT-C-ATC-T-TC-C-C--------AGCTCCGA--T-GAAA--ATTAA-T-GA-T-CTTTCT-G--T-AGT-A--AGGG-CCAA-CGG-C-AAG--ACA--AAAAAGTGA----------------AA-A--T-G-TTTA-AGAAGA-----T---TT---TTT-------tcaagaactagtcctatagtgaagggcttatccc
gi|18 : cgcc-AA-T------T-ACC------TGT---------A----AA-TGC-CC-GATATT-CC--------A--------------GATC--------GTT-C----GAGA-GGAA--------------A-----------------T-------------------------ttttttttctttttttttttttaaaacaaaagaaagaaaaaccccttgggaaaaaaattacctgtaaatgcccgatattccagatcgttcgagaggaaat
gi|19 : cgccagagaagcaagttaattcatagtttgagctgactcatacgtaaacaatgttgttagtttcatcttcccagctccgatgaaaattaatgatctttctgtagtaagggccaacggcaagacaaaaaagtgaaaatgtttaagaagattttttttttttttctttttttttttttaaaacaaaagaaagaaaaaccccttgggaaaaaCCGAAA-G----CAGCAAGTT--ACGTCA--T--A-GTT---T---GAGCTGACGT-TATA-C-T-------ATCAC--------A-TGTTGG--TCTAGGTTT-C-ATCGT-TC-C-C--------AG-TCTGA--T-G-A----TTAA-T-GA-T-CTTCTA-G---AAGT-ACTAGGG-C--AACGG-CAAAG--ACA--AAAAA----------------AGTGAAGA--T-G-TTTA-AG-AGA-----T---TT---TTTTTTTT--A--CA-A--GGG-ACTG-AA-T------T-ACC------TGT---------A----A
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gi|21 : aa-AA-TTTTTAG--TTTT--GAA--T-AAAC-TTGTA--A-TTTCTA-CG-A-TG-AA-AC-----T---ATTTTCTTT-----AATTTTGGA-T--ACTT-A-TTG-C-AGATG-----G----T---CGCTCAC-TTTAATAT-AATATT-C-ACCTACCA-T-TCTGCAT-AACTGG-AATT--TTG----------TTACA--AA-A-----------------AT------------G------------AT----------TTCCC-C--T-TA-TAC---AATTG-T
gi|22 : ctaCTAGAA-T--ACTT-A-TTG-C-AGATGCACGCG----T---AGCTCAC-TT-----T-AATATT-T-ATCTAACA-T-TCTGCAT-AACT-G-AATTA-TTG----------TTAC---AA-A-----------------AT------------G------------AT----------TTTCC-C--T-GA-T-C---AATTG-TT--GTTTA----AC--CG-AG-------TGAAGACTCCA---TTA----C-AAATCCA-C--CATG----------------------TAGC--C-TTGC-TTTGGTTCGG
gi|23 : CCCGAGA-G----AAACTG-----ACGTCA--A--A-CGT-------AAGCTGACGT-TATA-CGT-------A-AAC--------AATGT-----------------AT----TC-C-C--------AGCTCCGG--T-G-AA--ATTAA-T-GA-T-CTTCTA-G--CAAGT-A--AGGG-C--A-C-------------------AGTTAACTAAATTTTT-AGT
gi|23 : aaactACT-AAATTTTTAG--TTTT--GAA--T-AAAC-TTGTA--A-TTTCTA-CG-A-TG-AA-AC-----T---tttgaataaacttgtaatttctacgatgaaact
gi|24 : aaactcccgagagaaactgacgtcaaacgtaagctgacgttatacgtaaacaatgtattcccagctccggtgaaattaatgatcttctagcaagtaagggcacagttaATT-C-ATCTACCA-T-TCTGCAT-AACT-G-AATTAATTG----------TTAC---AA-A-----------------AT------------G------------AT----------TTTCC-C--T-GA-T-C---AATTG-TT--GTTTA----ACCTCG-AG-------TG-AGACTCCA---TTA----C-AAATCTA-C--CATGTA---------------------AGC--C-TTGC-TTTGGTTC
gi|25 : gnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGA-T--ACTT-A-TTG-C-AGATG-----G----T---AGCTTAC-TT-----T-ACTATT-C-ATCTACAATT-TCTGCAT-AATT-G-AATTA-TTG----------TTAC---AA-A-----------------AT------------AAAGTTAAT----AT----------TTACC-C--TGGA-T-T---ATTTG-TT--GTCTA----AC--CG-AATAT----TATATACCCCG---TTA----C-AA
gi|26 : ggtC-C-C--------AGCTCCGG--T-G-AA--ATTAA-C-GA-T-CTTCTA-G--CAAGT-A--AGGG-C--A-CGG-C--AG--ACA--AAAAAGTAAACTAAATTATC-AGTGAA-A--T-G-TTTA-AG-AGA-----A---------AT-------A--CA-A--GAG-ACTG-AA-T------T-ACG------TGT---------A----AA-TG--CC-GACACT-CA--------C--------------GA-T--------GTT-tgtatttttca
gi|27 : ACGT-CATG-CG------------C--------ATCGTCGG--GATATGTTT-TTATC-T-TC------------AGCTCCGA--T-G-AA--ATCAA-C-AA-T-ACTTTG-G---AAG--A--AGGG-C--A-CGG--AAAGATACA--AGAAAaa
gi|28 : cgaaaacaaatttccgagctgtttgcatGA-T--ACTT-A-TTG-C-AGATG-----G----T---AGTTCAC-TT-----C-AATATT-C-ATCTACCA-T-TTTGCAT---------------T-----------TTAC---AA-A-----------------AT------------G------------TT----------TTTCC-C--T-GA-T-C---AATTG-TT--GTTTA----AC--C---G-------TGTAGACTCTA---TGA----C-AAATTTA-C--CATG----------------------TAGC--C-TTGC-TTTaaaaaaaaaaaaaaaaa
gi|29 : TTTAAA--CA----C------TTGAAA-TTAAACGGATGA-A-T---GTTT---CAG-TGGATT-TCTT--AATTTTGGACAA---TTG--ATT---TCTCTGGCATTTG----TAATA-TT----TTCA----TTAACATT--T-T-TTAC-AGAAAT-GA
gi|3 : ctagacccctacGAGA-G----AAGCAAGTT--ACGTCA--T--G-TTT---C---GAGCTGACGT-CATA-CAT-------A-AAC--------AATGTCGG--G-TAGGTCT-T-ATC-T-TC-C-C--------AGCTCCGA--TAG-AA--ATTAA-C-GACT-CTTCTA-G--TAAGT-A--AGGG-C--A-CGG-CAA-G--ACA--AAA--GTGGA-------ATC-CG-GA---------TTTA-GC-AGA-----T---TTGTATTT-------AG-CA-ACTGAGTACTG-GA-CATGTACT-GCC------TGT---------A----AA-TG--CCCGATATT-CA--------C--------------GATT--------GTTTC----GA-ATGGAA--------------G-----------------TCTCATAAACAAGTCTATT-------A-----------------G-------G-----CCTTC--A---------CCT-GTGT-----GAT------T-G-A-A---CAT--TT---------TAATGTTG------TGGCGC-AG--AC-AAACATAAC-A-----GAAGACGG-------CTCTCTTTATA--CAGCGTC------TCGAAA-TTA--CGGATGT-AAT---GTTT---CAG-CT-ATT-C-TT--A--TTTGGACAT---TTG--ATT---TCTCTGACTTTTG----TA-CG-TT------------CTAACATT----C-TTTC-AGAAAT-GACA-GCGA---T---------ATTATAGATCTA-G-------TTAGGTTCAACT-AG-ATTTGAG--TTTTCTGAA--T-AAAC-TTTTA--A-TTTCTA-CCTT-TG-AA-AC-----T---ATTTTTTTTAAA--AATCTAGAA-T--ACTT-A-TTG-C-AGATGCAGC-G----T---AG-TCAC--T-----T-AATATT-T-ATCTA-CA-T-TCTGCAT-AAC--G-AATTA-TTG----------GTAC----A-A-----------------AT------------G------------AT----------TTTCT-C--T-GA-T-C---AATTG--T--GTTTA----AC--CG-AG-------TA-AGA--CCA---TTA----C--AATCCACC--CATG----------------------TAGC--CTTTGC-aa
gi|30 : catTT--AATTTTGGAC-CA--TTG--ATT---TCTCTGACATCTG----TAACG-TT----ATCA----ATAACATT--T-C-TCTC-AGAAAT-GACA-GCGA---TAGAGATCTAGT---------A-GGTTCAACT-AGGTTCAACT-AG-ATTTGAG--TTTT--GAA--T-AAg
gi|31 : TA-TC-TGTG-AA-AT-----TTGTACATTTTTT-----AATCTGTGA-T--ATTTTA-CTG-C-AG-TT-----G----T---AGCTCAC-T--------AATATTTC-ACCTACCA-T-TCTGCGTAAATT-G-AATTATTTG----------TTGC---AA-A-----------------AT------------
gi|32 : aagtTCC-CGGT-GT-T-C---AATTG-TT--GTTTACGTAAC--CG-AG-------AGAAGACTCCA---TTATGTAC-AAATCTA-C--CATGTA----------------------GC--C-TTGC-TTTGGTTCTGTata
gi|33 : acaaacaaacgtaagaggtcagagaa--CA----C------GCAGAA-TTAAGTGGATGT-G-TCAAATTCATGCAG-ATGATT-TCTA--AATTTCAGAC-C---T-A--AGT---TTTCAGACAATTG----CAATG-TA----ACCA----TCAACATCAAT---TTTC-AGAAAT-Gat
gi|34 : TTTA-----AATCTAGGA-T--ACTT-A-TTG-C-AGATGCATGCG----T---AGCTCAT-TT-----T-AATATT-C-ATCTACCA-T-TCTGCAT-AACT-A-AATTA-TT
gi|35 : -T------T-G-A-AAG-CAT--TT---------TA-TGTTG------GGGAG--AG--AA-AAAC-TAAC-G-----GA----GA------TATCTTT-----------------------AAA-TCAAATGGATGT-A-T---GTTT---CAG-TGGATT-GCTT--AATTTTGGAC-C----AA--ATT---TCTCTaatatattaatggccacacatgcaatt
gi|36 : AGGTTT-C-ATC-T-TC-C-C--------AGCTCCGA--T-G-AA--ATTGA-C-GA-T---------------------GGG-C--A-CGG-CAAAG--ACA--AAGA-----------------AGTGAA-A--T-G-TTTA-AG-AGATTTTTT---TT---TTT-------A--CA-A--GAG-ACTG-AA-T------T-A
gi|37 : -TGTTG------GGGCA--AG--AA-AAAC-TAAC-G-----GA----TG------TCTCTTTTCAAA--CA----C------TCG---------C--ATGT-A-T---ATTT---TAG-TGGATT-CTTT--AATCTTGAAT-C----AA--ATT---TTTCTGGTAT
gi|38 : TG----------TTAC---AA-A-----------------AT------------G------------AT----------TTTCC-C--T-TA-T-A---AATTG-AT--GTTTAT---TC--CG-TG-------TGTAGAATCCAATGTTA----C-AAATCTA-C--CATGTA--------------------CAGTAAC-TTGC-TTTGGT
gi|39 : ----AAGCAA-----A-GTCA--T--A-GTT---T---AAG-TGACGT-CATA-CGT-------A-AAC--------AATGTCGG--T-T------------------C-C--------AGCTCCGA--T-G-AA--ATCAA-C-GA-T-CTTCTAGG--CAAGT-A--AGGA-C--A-CG
gi|4 : CGAGA-G----AAGCAA-----ACGTCA--T--A-CGT-------AAGATGACGT-CATA-CGT-------A-AAC--------AATGTCGG--T-TAGGTTT-C-ATC-T-TC-C-CAGCTCGATAGCTCCGA--G-G-AA--ATTAA-C-AA-T-CTTCTA-G--CAAGT-A--AGGA-C--A-TGG-CAAAT--A-A--ATAAAGTTAACGAAATTATC-AGTGAA-A--T-G-TTTA-AG-ATA-----C---TTA--TTA-------A--CG-A--GAG-GCTGAAA-T------T-ACG------TGT---------A----AC-TA--CC-GACATT-CA--------CGATTACTAGTAATTGATT--------GTT-C----GA-A-GGAA--------------GTCTCAAGAACTAGTCTAT-------------------------A-----------------G-------G-----CCT----A---------CC--TTGT-----A-T------T-G-A-A-A-GAT--TTAA-------TA-TGTTG------GGGCG--AGAAAA-AAAC-TAAA-T-----GA----GA------TCTCTTTTAAAA--CA----C------TCGAAA-TCAAATGGACAC-A-T---GTTT---CAG-T-GATT-CCTT--AATTTTGGA--C---TAA--ATT---TCTCTGACATTTG----TAACG-TA----ACCA----TTAATATT--TCC-TTTC-AGAAAT-GACA-G--------------------------------------------CAACT---------AG--TTTT--GAA--T-AAAC-TTGTA--A-TTTTTA-TC-T-TG-AA-AC-----T----TTTTTTTA-----AATCTGTGA-C--ATTT-A-TTG-C-AGATG-----G----T---AGCTCAC-TT-----T-AATTTT-C-ATCTGCCA-T-TCCGCAT-AATT-G-AATAA-TTG----------TTAC---AA-A-----------------AT------------A------------ATTAAGTTAAAATTTCC-C--T-GA-T------ATTT-TTTGGTTTA----AC--CG-AA-------TATAGACTCCA---TAC----C-AAATCTA-C--CTTG----------------------TAGC--C-TTGG-TTTGATTCGG
gi|40 : TA-TTG----------TTAC---AA-A-----------------AT------------AATTGAAGTTAACAT----------TTTCC-C--T-GA-T-CATTAAATG-TT--GTTTA----AC--CG-A-----------AAACTCCA---TAA----C-AAATCCA-C--CTTGTA--------------------
gi|41 : AGCAA-----A--TCA--TT-A-GTT---T---AAGCTGACGT-CATA-CGT-------A-AAC--------AATGTCGG--T-T----------------C-C-C--------AGCTCCGA--T-G-AA--ATCAA-C-GA-T-CTTCTA-G--CAAGT-A--AGGA-C--A-Caggtta
gi|42 : CCGGGA-G----AAGCAA-----ACGTTA--T--A-CGT-------AAGCTGACAT-CATA-CAT-------G-TACGTA-----AATATCGG--T-TATGTTT-C-ATA-T-TC-C-C--------AGTTCCCA--T-G-A
gi|43 : aaacttACGT-CATG-CGC-------A--------------TGTCGG--A-TATGTTT-TTATC-T-TT-C----------AGCTCCGA--T-G-AA--ATCAA-C-AA-T-
gi|44 : cgaaaacaaatttccgagtgtttgcatCCAAGA-G----AAGCAA-----ACGTCA--C--A-CAT-------AAGCTGACAT-CATA-CGT-------A-AAC--------ATTGTCGG--T-TAGGTTT-A-ATC-T-TC-C-C--------AGC-CCAA--T-G-AA--atctt
gi|45 : acttt---TT---TTT-------A--CA-A--GAG-ACTG-AC-T------T-ACATGTACCTGT---------A----AA-TG--CC-GATATT-CA--------C--------------G
gi|46 : tcagctcaaaactattgacgtaacttgctttgtA-A-----------------AT------------G------------ATGT--------TTTCC-C--CAGA-A-T---AAATG-TT--GTTT-----AC--CGAAG-------TGAAG-------------------AATCTA-C--CA-ATG--------------------TAGC--C-TTGC--TTGGTT
gi|47 : CCCGAGG-G----AAGCGA-----ACGTCA--T--A-TTTAAGT---AAGCTGACGT-CATA-CGTTGTCACAA-AAT--------AGTGTC
gi|49 : CCGGAGA-G----GAGCAT-----ACGTCAC-T--A-TGT-------AAGCAGACGT-CATA-Caat
gi|5 : ctCCCGAGA-G----AGGCAA-----ACGTCA--T--A-CAT-------AAGCTGACGT-CATA-CGT-------A-AAC--------AATGTCAG--T-TTGGTTT-C-ATC-T-CC-C-C--------AGATTCGA--G-G-AA--ATTAA-C-GA-T-GATCTA-G--CAAGT-A--AGGA-C--A-CGG-CGAAT--AAA--GAAACCTTAATTGAATTATC-AGTGAA----------TA-AG-ATA-----C---CT---TTT-------A--CA-A--GAG-GCTG-TA-T------T-ACG------TGT---------A----AA-TG--CC-GACATT-CA--------C--------------GATTAATCGATTGTT-T----GA-A-ATAA--------------G-----------------T-------------------------ACCAAAAACTATTCAAAAG-------G-----CCT----A---------CC--GTGT-----A-T------T-G-A-AAG-CAT--TTAA-------TA-TGTTG------GGGCA--AG--AA-AAAC-TAAC-G-----GA----GA------TCTCTTTTAAAA--CA----C------TCGAAA-CCAGATGGATAC-G-T---GTTT---CAG-TGGATT-CCTT--AATTTTGGAC-C----AA--ATG---TCTCAGACATTTG----TCACG-TT----ACCA----TTAATATTA-C-C-TTTC-AAAACT-GACA-G--------------------------------------------CGACT-AG-TTTTGAG--TTTT--GAA--T-ATAC-TTGTA--A-TCTTTA-TC-T-TG-AA-AC---------A--TGTTTT-----GATCTGTGA-T--ACAT-A-TTG-C-AGATG-----G----T---AGCTCAC-TT-----T-AATATT-C-ATCTGCCA-T-TCCGCAT-AATT-G-AATCA-TTG----------TTACAAAAA-A-----------------ATTAAGGTAA----A------------AT----------TGTCC-C--C-GA-T-A---ATTTGTTT--ACTTA----AC--AG-AA-------TATTAACTCCA---TTA----C-AAATCTA----CAT-TG--------------------TAGC--A-TTGG-CTTGATTCG
gi|6 : ctCCCGAGA-G----AAGTGA-----ATGTTAAGT--A-CGT-------AAGTTGACGT-CATA-CGT-------T-AAC--------AATGTCGG--T-TAGGTTT-C-ATC-T-TC-C-C--------TGCTCCGA--A-G-AA--ATTAA-T-GA-T-CCTCTA-G--CAAGT-A--AGGA-A--A-CGG-CAAAC--ATACCAAAAAGTTAACTAAGTTTTT-AGTAAA-A--T-G-TTTA-AA-AGA-----C---AT---TTT-------A--CA-A--GAG-ACGG-AA-T------C-ACT------TGT---------A----AAATG--CT-GGCATC-CA--------C--------------GATT--------GTT-C----GA-A-GGAA--------------G-----------------TTTCAAGAATTTGTCTTATAACAT--A-----------------G-------G-----TCT----A---------TC--GTGT-----T-T------T-GAA-A-G-CA---TT---------TA-TGTAG------GGGCG--AG--AA-AAAC-GAAC-A-----TA----AA------TCTCTATTGAAA--CA----C------TCGAAA-TCAAATAAATGT-G-T---GTCT---CAA-TGGATT-CTTT--AATTCTAGAC-C-----AC-ATT---TGCCTAACATTTA----TAACG-TT----ACCA----TCAACATT--TCC-TTTC-AGAAAC-GACA-ACAG---T---------GC---------A-G-------T-A--TTCAACT-AG-TTTTATA--TT------A--TAAAAC-TT-TA--A-TTTCTA-CC-T-TGAAA-AC-----T---A--TCATTT-----AATATGTGA-T--ACCT-A-TTG-C-AGGTG-----G----T---AGCTCAC-TT-----TAAATATT-C-ATTTACCA-T-TCTGCAT-AAAT---AATTA-AAG----------TT-----AA-A-----------------AT------------A-------------------------TTCT-T--T-GA-T-----AAT---TT--CTTTA----AC--CA-AA-------TATAGACTCCG---GTA----C-AAATCTT-CTTCAGTTG--------------------TAGC--T-TTGC-CTTGATT
gi|7 : aactCTGAGA-G----AAGCAAGGTTAACGGCA--T--A--GT---TTGAGAGCTGACACACATA-CGT-------T-AAC--------AATGTCGG--T--AGGTTT-T-ATT-TATC-C-A--------AGCTCC-A--T-G-AA--ATTAA-CAGA-T-TTTCTA-G--TAAGT-A--AGGGAC--A-CGT-AAAAG--ACA--AAAAAGT---------------GTGAA-A--C-G-TTTA-AG-ATA-----T---TT---TTTTTTAAT-A--CA-A--GAG-ACTG-AAAT------T-ACA------TGTTGCTACCTTA----GA-TG--CC-GATATT-CA--------C--------------GATTT-------GTT-C----GA-A-GGAA--------------GCTCA-------------T-------------------------A-----------------A--------------------A---------CC--ATGT-----T-T------TCA-A-A-G-CA---TT---------TA-TGTTG------GGGCG--AG--AA-AAAC-TAACAG-----AA----GG------TCCTCTTCTAAA--CA----C------TCG-AA-TTAAACGGATGT-ATT---GGTT---C-----GACTACCTT--CAGTTTGAA-------TA--AAT---TGT---AAATTTC----TAACT-TTGAGGACTA----TT----TT--T-T-TTTC-A
gi|7 : ctgGA---T---------GT---------A-T-------T--GGTTCGACT-AC-CTTC-AG--TTT---GAA--T-AAA--TTGTA--AATTTCTAACT-T-TG-AGGAC-----T---ATTTTTTTTTC---AATCTAGAA-TTTACTA-AATTG-C-AGATC-----A----TCTTAGCTCAC-TT-----G-AATATT-C-ATCTACCA-T-TCTGCAT-AACT-A-CATTA-TTG----------TTAC---AA-A-----------------AT------------G------------TT----------TTTCC-C--T-TA-T-C---AATTG-TT--G-TTA----AC--AG-AGT------TGAAGACCTCA-----A----T-AAAACTA-C--CATGT---------------------TAG---C-TTGC--TTGGTatctagaatttactaaattgcagatcatcttagctcacttgaatattcatctaccattctgcataactacattattgttacaaaatgtttttcccttatcaattgttgttaacagagttgaagacctcaataaaactaccatgttagcttgcttggtcg
gi|8 : ctgctgagagaagcaaggttaacggcatagtttgagagctgacacacatacgttaacaatgtcggtaggttttatttatccaagctccatgaaattaacagattttctagtaagtaagggacacgtaaaagacaaaaaagtgtgaaacgtttaagatatttttttttaatacaagagactgaaattacatgttgctaccttagatgccgatattcacgatttgttcgaaggaagctcataaaccatgttttcaaagcatttatgttggggcgagaaaaactaacagaaggtcctcttctaaacactcgaattaaacgA--AAAAAGTTAACTGAATTATC-AGCGAA-A--T-G-CTGA-AG-AGA-----CC--TT---TTT-------A--TA-G--GAG-ACTA-AA-T------T-TCG------T-----------------A-TG--CC-GACATT-CA--------C--------------GACT--------GTT-A----GA-T-GGAA--------------G-----------------TCTCAAGAACTAGTCTACATCTATAGA-----------------G-------G-----CCT----A---------CC--GTGT-----T-T------TTA-A-A-G-CAT--TT---------TA-TGTAG------GGGCG--AG--AA-AAAC-TAAC-GTTACGGA----GA------ACTCTTTTGAAA--CA----T------TTGCAA-TAAAATGTATGC-A-T---GTTT---CAG-TGAATT-CCTT--AATTTTGGAC-C----TA--ATT---TCTCAGACATTAG----TACCG-TT----ATCA----TTAACATTA-C-C-TTTC-GGAAAT-GACA-GCGA---T---------GC---------A-G-------T-AA--TTAACTCAG-TTTTGAG--TTTT--GAA--T-AAAC-TTGAA--A-TTTCAA-TC-T-TG-A-------------ATTTTTTTT-----AATCGGTGA-T--ACTT-A-TTG-C-AGATG-----G----T---AGTTCACTTT-----T-AATATG-C-ATCTACCG-T-TCTGCAT-AATT-G-GATTG-TTG----------TTAC---AA-A-----------------ATAAATAAAATAAAG------------AT----------AAACT-T--T-GATT-T---ATTTG-GT--GTGTA----AC--CG-AATATTAATTATAGACCTCA---TTA----CAAAATCTA-C--CTCGTA--------------------C--C--C-TTGG-TTTGATTCGGTcg
gi|9 : A--AAAAAGTTAACTGAATTATC-AGCGAA-A--T-G-CTGA-AG-AGA-----CC--TT---TTT-------A--TA-G--GAG-ACTA-AA-T------T-TCG------T-----------------A-TG--CC-GACATT-CA--------C--------------GACT--------GTT-A----GA-T-GGAA--------------G-----------------TCCAAGAACTAGTCTAATCTAT----A-----------------GA------G-----CCT----A---------CC--GTGT-----T-T------T-A-A-A-G-CATG-TT---------TA-TGTAG------GGCCG--AG--AA-AAAC-TAAC-GTTACGGA----GA------ACTCTTTTGAAAAACA----T------TTGCAA-T-AAATGTATGC-A-T---GTTT---CAG-TGAATT-CCTT--AATTTTGGAC-C---T-A--ATT---TCTCAGACATTAG----TACCT-GT----ATCA----TTAACATTA-C-C-TTTC-GGAAAT-GACA-GCGA---T---------GC---------A-G-------T-AA--TTAACTCAG-TTTTGAG--TTT---GAA--T-AAAC-TTGAA--A-TTTCAA-TC-T-TG-AA---------------TTTTTT-----AATCGGTGA-T--ACTT-A-TTG-C-AGATG-----G--------AGTTCACTTT-----T-AATATG-C-ATCTACCG-T-TCTGCAT-AATT-G-GATTG-TTG----------TTAC---AA-A-----------------ATAAATAAAATAAAG------------AT----------AAACT-T--T-GATT-T---ATTTG-GT--GTGTA----AC--CG-AAATTAAT-TATAGACCTCA---TTA----CAAAATCTA-C--CTCGTA--------------------C--C--C-TTGG-TTTGATTCG
blockSeqs : T TACT GGTTA AG CA TTTAAGT A . TGTCACA T ATTAAAAC CA C GC G A G G AGCTCGAT ATT A . G A C C G AC . CT A CA A C AT CC TAACTAAATTATC T G TT . T . A TTTTTT GTA TTTTTTT TG T CT T A A ATGTAC G ATGTACC TGCTACCTT GCAC A C C . CGATTACTAGTAATT AATCGATT T TCGA G T GTCTCAAGAACTAGTCTACATCTATAGAGG CATAA T . A GACCAC C A G A T G AATAGCCCC A . C AA . T A TTACG AGAC . A AA GCGT G A A T C A CAA ATG G T A TA CCAATTG GTA TACA . GAGG TCAG TCT . T A C TAGAGATCTAGTAGGTTCAACTAGGT G C A . CT AT A . . A A T G C G TACAGTAT AAA A A TT T A G . CACGC ATTC CTT T TAATA A T A T C A G C C AACATTTAAT AAA T ATAAATATAAGTGCGTT AATTGAAGTTAACAT . GG G T CATT T TG CGTA CT A TATTAAT A ATG TGTA A C TT TACAGGAGCCCCACAGGCACAGTA AA T .
blockSeqs : . . GTT C T GTTTGA . . . . AACCACGT . A TT . . . . . TA . . . . . . . . . . . . . . . . TAACTAGATTATC T . . . . . . CGTT A TTTAAT G . . . . . . . AGTCC . . . . . . CGATTAATC T . . . . GTTTCAAGAACTAGTCATAGCAGGCTTTT TCA . . . . T A . A . . AA . . . . . A . TTACG . . T . . A A . C . T . . . T . . CCATTG . . . . . AAT . . . C TATTATAGATCTAGTTAGGT G C . . . A . . . . . . . A . TTGTAC TC G . . . . . . CATGC . . T . . . . . . . . . A . A . . AAATAAAATAAAGAT . . A T AC . . T . . ATTAAT T . . A . . TGTT . . .
blockSeqs : . . GTT . . ATAGT . . . . GTA . . TT . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . TGACTAAACTATC T . . . . . . CC . TTTTT . . . . . . . . A . . . . . . CGATAATCC . . . . . GTTTCAAGAATTTGTCTTATAACATAGG A . . . . . A . A . . AA . . . . . . . . . . A . . . A . T . . . . . G . . CCTTTG . . . . . TCC . . . C TGCAGTAGGT A . . . . . . . . . . . . . . TAT . G . . . . . . CAGC . . . . . . . . . . . . T . . . . AAATAAAATAAAGAT . . . . C . . . . . TAT T . . . . . TACA . . .
blockSeqs : . . GTT . . GTTT . . . . . . . C . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . TAACTAAATTTTT T . . . . . . CC . TATA . . . . . . . . C . . . . . . GCC . . . . . GTCCAAGAACTAGTCTAATCTATAGAG A . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . T . . . T . T . . . . . T . . CAATTG . . . . . ACC . . . C TGCAAGTAT A . . . . . . . . . . . . . . TAT . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AATTAAGTTAAAA . . . . A . . . . . T A . . . . . TGTA . . .
blockSeqs : . . GTT . . GTTT . . . . . . . C . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . AAACTAAATTATC T . . . . . . C . . . . . . . . . . C . . . . . . A . . . . . GTCTCATAAACAAGTCTATTAGG G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . A . T . . . . . G . . CATTTG . . . . . TCC . . . C TGTATTGGT A . . . . . . . . . . . . . . TAT . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AAAGTTAATAT . . . . A . . . . . . T . . . . . TGTA . . .
blockSeqs : . . GTT . . GTTT . . . . . . . C . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . TAACGAAATTATC T . . . . . . T . . . . . . . . . . G . . . . . . C . . . . . GTCTCAAGAACTACAACTAAGG A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . A . T . . . . . G . . CCATTG . . . . . ACC . . . C TGCAGTAT A . . . . . . . . . . . . . . TAT . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TAAGGTAAAAT . . . . C . . . . . . T . . . . . TGTA . . .
blockSeqs : . . . . . CATC . . . . . . . C . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . TAATTGAATTATC T . . . . . . T . . . . . . . . . . A . . . . . . C . . . . . GTCTCATAAACTAGTATATACG A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . A . T . . . . . G . . ATTA . . . . . ACC . . . C TGCAGTAA A . . . . . . . . . . . . . . TAT . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GATGT . . . . C . . . . . . A . . . . . TAA . . .
blockSeqs : . . . . . CATA . . . . . . . C . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . TAACTAAGTTTTT T . . . . . . C . . . . . . . . . . G . . . . . . C . . . . . GTCTCAAGAACTAGTCTATAGG A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . G . T . . . . . T . . CCAA . . . . . CC . . . C TGCAGTAA G . . . . . . . . . . . . . . TT . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GAT . . . . T . . . . . . T . . . . . TTA . . .
blockSeqs : . . . . . GTTT . . . . . . . C . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . TAACTGAATTATC T . . . . . . C . . . . . . . . . . C . . . . . . C . . . . . GTACCAAAAACTATTCAAAAGG A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . A . T . . . . . T . . CCTA . . . . . TC . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . TA . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TAT . . . . C . . . . . . T . . . . . TAC . . .
blockSeqs : . . . . . GTTT . . . . . . . C . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . TAACTGAATTATC T . . . . . . T . . . . . . . . . . C . . . . . . A . . . . . AGTCTCAAGAACTAGTTGG A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . A . C . . . . . G . . CCAA . . . . . TT . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . AT . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GGT . . . . C . . . . . . A . . . . . TAC . . .
blockSeqs : . . . . . TTTC . . . . . . . C . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . AACCAAAAATCT T . . . . . . T . . . . . . . . . . G . . . . . . C . . . . . GTCTATAGG A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . A . C . . . . . G . . TCAA . . . . . TC . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . T . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GAT . . . . C . . . . . . T . . . . . TG . . .
blockSeqs : . . . . . GTTT . . . . . . . T . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . GAAATAATTA T . . . . . . T . . . . . . . . . . C . . . . . . C . . . . . GCTCATAA A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . A . C . . . . . G . . CTAA . . . . . TT . . A . . . . . . . . . . . . . . A . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GAT . . . . A . . . . . . T . . . . . TA . . .
blockSeqs : . . . . . GTTT . . . . . . . C . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . TTAAATTGTT T . . . . . . A . . . . . . . . . . G . . . . . . C . . . . . ATAGG A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . C . C . . . . . G . . CCAA . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GAT . . . . T . . . . . . A . . . . . TA . . .
blockSeqs : . . . . . CGT . . . . . . . C . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . GAAGGATTA C . . . . . . T . . . . . . . . . . G . . . . . . C . . . . . GTAG A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . C . T . . . . . G . . CCAC . . . . . C . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GTT . . . . A . . . . . . T . . . . . TA . . .
blockSeqs : . . . . . CGT . . . . . . . C . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . GGAATC C . . . . . . C . . . . . . . . . . T . . . . . . C . . . . . GT A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . A . . . . . G . . CCTA . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GAT . . . . C . . . . . . T . . . . . TA . . .
blockSeqs : . . . . . CGT . . . . . . . A . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . GA . . . . . . . C . . . . . . . . . . A . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CCTA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GAT . . . . T . . . . . . . . . . . . TA . . .
blockSeqs : . . . . . CGT . . . . . . . C . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . G . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GTT . . . . T . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . CGT . . . . . . . C . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . G . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . CAT . . . . . . . T . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . TGT . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . CAT . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . CGT . . . . . . . . . . . . . A . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . T . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqCons : ***** ** CGT******** ******** T*** ** TAACTAAATTATC* *** ** ****** G****** ** A************* ** ***** ** ****** ** ****** ****** CCAA******* TCC*** TGCAGTAGT******************************* ** ** ***** ***** **********
originalCons : CCCGAGA-G----AAGCAA-----ACGTCA--T--A-CGT---T---AAGCTGACGT-CATA-CGT-------A-AAC--------AATGTCGG--T-TAGGTTT-C-ATC-T-TC-C-C--------AGCTCCGA--T-G-AA--ATTAA-C-GA-T-CTTCTA-G--CAAGT-A--AGGG-C--A-CGG-CAAAG--ACA--AAAAAGTTAACTAAATTATC-AGTGAA-A--T-G-TTTA-AG-AGA-----C---TT---TTT-------A--CA-A--GAG-ACTG-AA-T------T-ACG------TGT---------A----AA-TG--CC-GACATT-CA--------C--------------GATT--------GTT-C----GA-A-GGAA--------------G-----------------T-------------------------A-----------------G-------G-----CCT----A---------CC--GTGT-----T-T------T-G-A-A-G-CAT--TT---------TA-TGTTG------GGGCG--AG--AA-AAAC-TAAC-G-----GA----GG------TCTCTTTTNAAA--CA----C------TCGAAA-TTAAACGGATGT-A-T---GTTT---CAG-TGGATT-CCTT--AATTTTGGAC-C---TTA--ATT---TCTCTGACATTTG----TAACG-TT----ACCA----TTAACATT--T-C-TTTC-AGAAAT-GACA-GCGA---T---------GC---------A-G-------T-AGGTTCGACT-AG-TTTTGAG--TTTT--GAA--T-AAAC-TTGTA--A-TTTCTA-CC-T-TG-AA-AC-----T---ATTTTTTTT-----AATCTGGGA-T--ACTT-A-TTG-C-AGATG-----G----T---AGCTCAC-TT-----T-AATATT-C-ATCTACCA-T-TCTGCAT-AACT-G-AATTA-TTG----------TTAC---AA-A-----------------AT------------G------------AT----------TTTCC-C--T-GA-T-C---AATTG-TT--GTTTA----AC--CG-AG-------TGTAGACTCCA---TTA----C-AAATCTA-C--CATGTA--------------------TAGC--C-TTGC-TTTGGTTCGGT
finalCons : CCCGAGA-G----AAGCAA-----ACGTCA--T--ACGT--------AAGCTGACGT-CATA-CGT-------A-AAC--------AATGTCGG--T-TAGGTTT-C-ATC-T-TC-C-C--------AGCTCCGAT---G-AA--ATTAA-C-GA-T-CTTCTA-G--CAAGT-A--AGGG-C--A-CGG-CAAAG--ACA--AAAAAGTTAACTAAATTATC-AGTGAA-A--T-G-TTTA-AG-AGA-----C---TT---TTT-------A--CA-A--GAG-ACTG-AA-T------T-ACG------TGT---------A----AA-TG--CC-GACATT-CA--------C--------------GATT--------GTT-C----GA-A-GGAA--------------G-----------------T-------------------------A-----------------G-------G-----CCTA-------------CC--GTGT-----T-T------T-G-A-A-G-CAT--TT---------TA-TGTTG------GGGCG--AG--AA-AAAC-TAAC-G-----GA----GG------TCTCTTTTNAAA--CA----C------TCGAAA-TTAAACGGATGT-A-T---GTTT---CAG-TGGATT-CCTT--AATTTTGGACCAA-------ATT---TCTCTGACATTTG----TAACG-TT----ACCA----TTAACATTTCC---TTTC-AGAAAT-GACA-GCGATGCAGTAGT-------------------------------TCGACT-AG-TTTTGAG--TTTT--GAA--T-AAAC-TTGTA--A-TTTCTA-CC-T-TG-AA-AC-----T---ATTTTTTTT-----AATCTGGGA-T--ACTT-A-TTG-C-AGATG-----G----T---AGCTCAC-TT-----T-AATATT-C-ATCTACCA-T-TCTGCAT-AACT-G-AATTA-TTG----------TTAC---AA-A-----------------AT------------G------------AT----------TTTCC-C--T-GA-T-C---AATTG-TT--GTTTA----AC--CG-AG-------TGTAGACTCCA---TTA----C-AAATCTA-C--CATGTA--------------------TAGC--C-TTGC-TTTGGTTCGGT
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|48 ): GCGTGGACCATCCTTGCATGCATCTCTAGTCAGTTAGTCTAACCACTGCATGA
Alignments
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lowQualScore : 22222 22222222222222 11111111 22222222222222 111111111 2222222 1111111 22222222222222222222222 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 11111111111111 111111111 11111 111111 2222222222222 111 555555555555555555555555555555555555555 11111111111 11111 22222 1111111111 11111111111111111 4444444444444444444444444444444444444 1111111 333333333333333333333333
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lowQualScore : . .... ..... .. .. .............. . . ....... . ........ .. . ... . . . . ........ .... . .. . . . . . .. . .. . .. . . .. .. .............. . . .. . . . . ......... ... ....... .. . .. . . . ...... . ....... ......... .... . .. . . ....................... ........ . .... . . .......................................................................................... .............. .. ..... . ...... . . . . . .. ......... . ...... .. .. . . . ..... .... ...... . .. .... ...... . . . . . ... ... . . . .. ............. ..... .... . . .... ... . . . . ....................................... .. . . .. .. .. . . .. . . . . . . ........... ..... . . .. . . . . ..... .... ... . ..... . . . . . . . . . .......... ... . ................. ..................................... . .. . . ..... . .. .... .. . ....... . ... .... . . .. ........................ .. . .
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consensus : CCCGAGA-G----AAGCAA-----ACGTCA--T--AC----GT----A--AGCTGACGT-CATA-CGT-------A-AAC--------AATGTCGG--T-TAGGTTT-C-ATC-T-TC-C-C--------AGCTCCGA--T-G-AA--ATTAA-C-GA-T-CTTCTA-G--CAAGT-A--AGGG-C--A-CGG-CAAAG--ACA--AAAAAGTTAACTAAATTATC-AGTGAA-A--T-G-TTTA-AG-AGA-----C---TT---TTT-------A--CA-A--GAG-ACTG-AA-T------T-ACG------TGT---------A----AA-TG--CC-GACATT-CA--------C--------------GATT--------GTT-C----GA-A-GGAA--------------G-----------------T-------------------------A-----------------G-------G-----CCT----A---------CC--GTGT-----T-T------T-G-A-A-G-CAT--TT---------TA-TGTTG------GGGCG--AG--AA-AAAC-TAAC-G-----GA----GG------TCTCTTTTNAAA--CA----C------TCGAAA-TTAAACGGATGT-A-T---GTTT---CAG-TGGATT-CCTT--AATTTTGGACC--A------A---ATT-----TCTCTGACATTTG----TAACG-TTACCA----TTAACATTTCCTTT-CAGAAAT-GACA-GCGATG---------C---------A-GT--A-----------GTTCAACT-AG-TTTTGAG--TTTT--GAA--T-AAAC-TTGTA--A-TTTCTA-CC-T-TG-AA-AC-----T---ATTTTTTTT-----AATCTGGGA-T--ACTT-A-TTG-C-AGATG-----G----T---AGCTCAC-TT-----T-AATATT-C-ATCTACCA-T-TCTGCAT-AACT-G-AATTA-TTG----------TTAC---AA-A-----------------AT------------G------------AT----------TTTCC-C--T-GA-T-C---AATTG-TT--GTTTA----AC--CG-AG-------TGTAGACTCCA---TTA----C-AAATCTA-C--CATGTA--------------------TAGC--C-TTGC-TTTGGTTCGGT
Reference ( family-1868 ) : CCCGAGA-G----AAGCAA-----ACGTCA--T--AC----GT----A--AGCTGACGT-CATA-CGT-------A-AAC--------AATGTCGG--T-TAGGTTT-C-ATC-T-TC-C-C--------AGCTCCGA--T-G-AA--ATTAA-C-GA-T-CTTCTA-G--CAAGT-A--AGGG-C--A-CGG-CAAAG--ACA--AAAAAGTTAACTAAATTATC-AGTGAA-A--T-G-TTTA-AG-AGA-----C---TT---TTT-------A--CA-A--GAG-ACTG-AA-T------T-ACG------TGT---------A----AA-TG--CC-GACATT-CA--------C--------------GATT--------GTT-C----GA-A-GGAA--------------G-----------------T-------------------------A-----------------G-------G-----CCT----A---------CC--GTGT-----T-T------T-G-A-A-G-CAT--TT---------TA-TGTTG------GGGCG--AG--AA-AAAC-TAAC-G-----GA----GG------TCTCTTTTNAAA--CA----C------TCGAAA-TTAAACGGATGT-A-T---GTTT---CAG-TGGATT-CCTT--AATTTTGGACC--A------A---ATT-----TCTCTGACATTTG----TAACG-TTACCA----TTAACATTTCCTTT-CAGAAAT-GACA-GCGATG---------C---------A-GT--A-----------GTTCGACT-AG-TTTTGAG--TTTT--GAA--T-AAAC-TTGTA--A-TTTCTA-CC-T-TG-AA-AC-----T---ATTTTTTTT-----AATCTGGGA-T--ACTT-A-TTG-C-AGATG-----G----T---AGCTCAC-TT-----T-AATATT-C-ATCTACCA-T-TCTGCAT-AACT-G-AATTA-TTG----------TTAC---AA-A-----------------AT------------G------------AT----------TTTCC-C--T-GA-T-C---AATTG-TT--GTTTA----AC--CG-AG-------TGTAGACTCCA---TTA----C-AAATCTA-C--CATGTA--------------------TAGC--C-TTGC-TTTGGTTCGGT
gi|1 : ----AAGCAAGTT--ACGTCAA-T--A-----GTTTT-G--AGCTGACGT-CATATCAT-------T-AACT-------AATGTCG---T-TAGGTTT-T-ACT-A-TC-C-C--------AGCTCCGA----G-AATAATTAA-C-GA-T-CTTCTA-G--TAAGTGA--AGGG-C--A--GG-CAAAG--ACA--AACAA-------------TT-AG-GAA-A--TCG-TTCATAG-CGA-----T---TTGTTTTT-------AGGCA-A--ATG-ACTA-CA-TGT----T-AC-------T-T---------A----AA-TAGCCC-GA-ATTACA--------C--------------GATT--------GTTTC----GA-A-GGAA--------------G-----------------CTCATAAAC-----------------A-----------------A-------G-----TCT----ATTAGGGACCCCTTGTGTGACACT-T------T-G-A-A-T-TATGCTT---------TAATGTTAAGCCGTGGACGGCAG--AACAAACATAAC-A-----GA----AGACGGCTTCTCTTT---AA--TA----CGAGCGGTCTATA-TAATACGGATGT-AAT---GTTT---CAG-CGTATT-CCTT--A-TTTTGGACC--ATTTTAGA---ATT-----TCTCTGACTTTTG----TAACGTTTGCCA-----TAACATTTCTTTC-AAGAAAT-GACA-GCGATATTATAGATCT---------A-GTTAG-----------GTTCAACT-AG-ATTTGAAGTTTTT--GAA--T-AAACTTTGTAACA-TTTCTA-CCTT-TG-AA-AC-----T---ATTTTTTTTTAAAAAATCTAGAA-T--ACTT-A-TTG-CAAGATGCACGCG----T---AGCTCAC--T-----T-AATAT----ATCTA-CA-T-TC-GCAT-AAC--G-AATTA-TTGT---------TTAC---AA-A-----------------AT------------G------------AT----------TTTCCTC--T-GA-T-C---AATTG--T--GTTTA----A---CG-AG-------TA-AGACTCCA---TTA----C-AAATCCACC--CATG----------------------TAGC--CTTTGCTTTTGGTTC
gi|10 : aCCTGAGAAG----AAGTTA------CGTCA--T--A-----GTTT--G--AGCTGACAT-CAT--CGT-------A-TA---------AATGTCGGCAT-TAGGTTT----TT-T-TT-C-A--------AGCTCCGGATT-G-AA----TAA-C-GA-T-TTTCTA-AACTAAGT-A---GGG-C----CGG-CAAGA--ACA--AAAAAGTGAA--GGATTA-------AG-A--T-T-CTT-----------------TT---TTT-------ATGCATA--GAG-ACTT-AA-T------T-ACAGTCC--TGT---------A----AA-TG--CC-GATATT-CC--------A--------------GATT--------GTT-C----GA-A-GGAA--------------G-----------------T---------------------------------------------------------CCTCATAA---------AC--ATGT-----T-T------T-A-A-T-G-CAT--TT---------TA-TGTGG------TGGC---AG--AA-AAACTTAAC-A-----AA----GG------TCTCTTAT-AAA--CA----CG-----TCG-AA-TTAAACGGATGT-A------TTT---CGA-CTAATT-C--G--AGTTTTGAAAT--T------A---ATTGTA--TTTCT-AC-TTTG----AAAC
gi|10 : ct-GT--A-----------TTTCGACT-AA-TTC-GAG--TTTT--GAAATT-AA---TTGTA----TTTCTA-CT-T-TG-AA-AC-----T---ATTTTTTTT-----AATCTAAGAAT--ACTA-A-TTGGC-AGATG-----CATTCT---AGCTCAC-TT-----A-AGTATT---A-CTAC-A-TCTCTGCAT-AACT-ACAATTACTTG----------T-AC---AA-A-----------------AT------------G------------AT----------TTTCC-C--T-T--T-C---AAT-G-TT--GTTTA----AC--AG-AG-------TGAAGACTCCA---GTA----C-AAATCTA-C--CATATG--------------------------C-TTGC-TTTGtattttttttaatctaagaatactaattggcagatgcattctagctcacttaagtattactacatctctgcataactacaattacttgtacaaaatgattttccctttcaatgttgtttaacagagtgaagactccagtacaaatctaccatatgcttgctttg
gi|11 : ctcctgagaagaagttacgtcatagtttgagctgacatcatcgtataaatgtcggcattaggttttttttcaagctccggattgaataacgattttctaaactaagtagggccggcaagaacaaaaaagtgaaggattaagattctttttttatgcatagagacttaattacagtcctgtaaatgccgatattccagattgttcgaaggaagtcctcataaacatgttttaatgcattttatgtggtggcagaaaaacttaacaaaggtctcttataaacacgtcgaattaaacggat----AAGCGA-----ACGTCA--T--AATA--GT----A--AGCTGACGT-TATA-CGT-------A-AACATTAAAACAATGTCGG--T-TAGGTTT-C-ATC-T-TC-C-C--------AGCGCCGA--A-G-AA--ATTAA-C-GA-T-CCTCTA-G--CAAGT-A--AGGA-C--A-CGA-CAAAT--ACA--AAAAAGTTAACTAAATTATC-AATGAA-A--T-G-TTTT-AG-ATA-----C---TT---TTT-------A--CA-A--GAG-GCTG-AA-T------T-GCA------TGT---------A----AA-TG--CC-GACATT-CACGATTAATC--------------GATT--------GTT-CTCGAGA-A-GGAA--------------G-----------------TCTCAAGAACTACAACTA--------A-----------------G-------G-----TCT----A---------CC--GTGT-----A-T------T-GAA-A-G-CAT--TTAATAGCCCCTA-TGTTG------GGGCG--AG--AA-AAAC-TAAC-G-----GG----TA------TCTCTTTTAAAA--CA----C------TCGAAA-TCAAATGGATAC-G-T---GTAT---CAG-TTGATT-CTTT--AATTGTGGACC--A------A---ATT-----TCTCTGAAATTTG----CAACG-TTACCA----TTAATATTT----------AAT-GACA-G---------------------------------------------CGACT-AG-TTTTGAG--TTTT--GAA--T-AAAC-TT
gi|12 : CCGAGA-A----CAGCAAGTT--ACGTCA--T--A-----GT----TTTAGCTGACGT-CATA-CGT-------A-AAC--------AATGTCGG--T-TGGGTTT-C-ATC-T-TC-C-C--------AGCTCCCA--T-G-AA--ATTAA-C-GA-T-CTTCTA-G--CAAGT-A--AGGG-C--A-CGA-CAAAG--ACA--AAAAAGGGAAAT-AATTA---A--GAA-ATTT-G-TTT-------T-----T---TT---TTT-------A--CA-A--GAG-ACTG-AA-T------T-ACC------TGT---------A----TA-T------GATATT-CA--------C--------------GATT--------GTT-C----GA-A-GGAA--------------GTCTCATAAAC-------T-------------------------A-----------------GTATATACG-----CCT----A---------CC--GTGT-----T-T------T-GAA-A-G-C----------------A-TGTTG------GGGCG--AG--AA-CAAC-TAAC-G-----GA----GG------TCTCTTTTTGAA--CA----C------TCGAAA-TTAAGCGGACGT-A-T---GTTT---CAG-TGGATT-CCTT--AATTTTGGACC--A------ATTGATT-----TCTCTGACATTTGTACATAACG-TTGTCA----TTAATATTTCTTTT-TAGAAAT-GACA-GCGATA---------T---------A-G
gi|13 : tt----AA-TG--CC-GATATT-CAGC------C--------------GATT--------GGT-C----GA-A-GGAAAGTCTCAAGAACTAG-----------------T-------------------------T-----------------G-------G-----CCT----G---------CC--G-AT-----T-TGACCACT-G-AGA-G-TAT--TT---------TA-TGTTG------GGGCG--AG--AA-AA-C-TAAT-C-----GA----GG------TCTATTTTAGAA--AA----CA-----TCGAAAATTAAATGAATATCA-T---GTTT---TAGGTTGATT-TTTTTAAATTTTGGAAC--G---------------------CGGACATTTG----CGACG-TTGCCA----TTGACATTCC---T-CGGAAATTGACAAGCGATG---------C---------AAGT--A------------TTCAACT-GC-TTTTGTG--TTTT--GAAA-T-AAAC-CTGTA--A-ATTCTT-TC-T-TGCAG-GC-----T-----TTTTTTT-----AATCTAGGA-G--ACTT-A-TTG-C-AGATG-----A----T---AGCTTAC-TT-----T-AATATT-CAATCTATCA-C-TCTGCAT-AAat
gi|14 : tCCCGAGA-G----AAGCAAGTT--ATGTCA--T--A-----GTTT--G--AGATGACGT-CATA-CGT-------A-AAC--------AATGTTGG--T-TAGGTTT-C-AAC-T-TC-C-C--------AGCTCCGA--T-G-AA--ATTAA-C-GA-T-CTGATA-G--CAAGT-A--AGGG-C--A-CGG-CAAAG--ACA--AAAAAGT-----------------GAA-A--T-G-TTTA--G-AGA-----T---TT---TTTTTTTTTTA--CA-A--GAG-ACTG-AA-T------T-ACC------TGT---------A----AA-TG--CC-AATATT-CA--------C--------------AATT--------GTT-T----GA-A-GGAA--------------G-----------------TCTAT---------------------A-----------------G-------G-----GCT----A---------CT--GTGT-----T-T------T-G-A-AAG-CAT--TT---------TA-TGTTG------GGGCG--AG--AA-AAAC-TAAC-A-----GA----GG------TCTCTTTTTAAA--CA----C------TCGTGA-TTAAACGGATGT-A-T---GTTT---CGG-TGGATT-CCTT--AATTTTGGACC--ATT----G---ATT-----TCTCTGACATt
gi|15 : tCCCGAGA-G----AAGCGA-----ACGTCA--T--CC----GT----A--AGCTGACGT-CATA-CGT-------A-AAC--------AATGTCCG--T-TAGGTTT-C-ATC-T-TC-C-T---------GCTCCGA--C-A-AA--A-TAA-C-GA-T--TTCTA-G--CAAGT-A--AAGA-A--A-CGA-CAAAT--AC---AACAACTT---TAAATTGTT-AATAAA-A--T-G-TTTG-AG-AGA-----CGTTTT---TTT-------A--TA-A--GAG-ACTG-AA-T------T-ACG------TGT---------A----AA-TG--CC-AACAGT-CA--------C--------------GATT--------GTT-C----GA-A-GGAA--------------G-----------------TTTCAAGAACTAGTCATAGC------A-----------------G-------GCTTTTCCT----A---------TC--GTGC-----T-T------T-GAA-A-A-CAT--TT---------TA-TG-TA------GAGTG--AG--AA-AAAC-TGAC-G-----GA----GA------TCTCTTTTAAAA--C---------------------AAATGGGTTT-A-T---GTCT---TAG-T-GATT-CATT--AGTTT
gi|16 : CCGAGA-GTACTAAGCAA-----ACGTCA--A--AC----AT----C--AGCTGACGT-CATA-CGT-------A-AAC--------AATGTCTG--T-TAGGTTT-C-ATC-T-TC-C-C--------A-TTCCGA--T-G-AA--ATTAA-C-GA-T-CGTCTA-G--CAAGT----AGGG-C--A-CGG-CAAAG--ACA--AAAAAGTTAACTAGATTATC-AGTGAA-A--T-GTTTTA-AG-AGA-----C---TT---TTTTATA---A--CA-A--GAA-ACTG-AA-T------T-ACA------TGT---------A----AA-TG--CC-GATATT-CA--------C--------------GATT--------GTT-T----GA-G-GGAA--------------G-----------------T-------------------------
gi|16 : aaatctA--------------G-----------------T-------------------------A-----------------G---------------T----A---------CC--GCGT-----T-T------T-G-A-A-ATCAT--TT---------TA-ctcataaactatctaggcctataatatgggacacagtagtaccgcgttttgaaatcatttta
gi|17 : aaatctccgagagtactaagcaaacgtcaaacatcagctgacgtcatacgtaaacaatgtctgttaggtttcatcttcccattccgatgaaattaacgatcgtctagcaagtagggcacggcaaagacaaaaaagttaactagattatcagtgaaatgttttaagagacttttttataacaagaaactgaattacatgtaaatgccgatattcacgattgtttgagggaagtctcataaactatctaggcctataatatgggacacCCCGAAATG----AAACAA-----ACGTCA--TCAAC----AT----AG-AGTTGACGT-CATA-CGT-------A-AACAACCACGTAACGTTAG--T-TAGGTTTGC-ATC-T-TCGCGC--------AGCTACGA----G-GA--ATTAAGC-AA-TCCTTCTA-G--CAAGT-A--A-CG-C--A-CAGCCGGCG--GCC--AAA-----AACCAAA-AATCTAGTGAT-A--T-G-TTTA-TG-ACA-----C----T---TTT-------A--CA-A--AAG-GCTG-AA-T------TGACG------TGT---------AGCACAA-GG--CC-GACATT-CACGATAATCC--------------GATT--------GTT-C----AA-A-GGAA--------------G-----------------T-------------------------A-----------------
gi|18 : tcAGA-G----AAGCAAGTT--AATTCA--T--A-----GTTT--G--AGCTGAC-T-CATA-CGT-------A-AAC--------AATGTTG---T-TAG-TTT-C-ATC-T-TC-C-C--------AGCTCCGA--T-GAAA--ATTAA-T-GA-T-CTTTCT-G--T-AGT-A--AGGG-CCAA-CGG-C-AAG--ACA--AAAAAGTGA----------------AA-A--T-G-TTTA-AGAAGA-----T---TT---TTT-------tcaagaactagtcctatagtgaagggcttatccc
gi|18 : cgcc-AA-T------T-ACC------TGT---------A----AA-TGC-CC-GATATT-CC--------A--------------GATC--------GTT-C----GAGA-GGAA--------------A-----------------T-------------------------ttttttttctttttttttttttaaaacaaaagaaagaaaaaccccttgggaaaaaaattacctgtaaatgcccgatattccagatcgttcgagaggaaat
gi|19 : cgccagagaagcaagttaattcatagtttgagctgactcatacgtaaacaatgttgttagtttcatcttcccagctccgatgaaaattaatgatctttctgtagtaagggccaacggcaagacaaaaaagtgaaaatgtttaagaagattttttttttttttctttttttttttttaaaacaaaagaaagaaaaaccccttgggaaaaaCCGAAA-G----CAGCAAGTT--ACGTCA--T--A-----GTTT--G--AGCTGACGT-TATA-C-T-------ATCAC--------A-TGTTGG--TCTAGGTTT-C-ATCGT-TC-C-C--------AG-TCTGA--T-G-A----TTAA-T-GA-T-CTTCTA-G---AAGT-ACTAGGG-C--AACGG-CAAAG--ACA--AAAAA----------------AGTGAAGA--T-G-TTTA-AG-AGA-----T---TT---TTTTTTTT--A--CA-A--GGG-ACTG-AA-T------T-ACC------TGT---------A----A
gi|2 : CCCGAGA-G----AAGCAA-----ACGTCA--T--AC----GT----A--AGCTGACGT-CATA-CGT-------A-AAC--------AATGTCTG--T-TAGGTTT-C-ATC-T-TC-C-C--------AGCTTCAA--T-G-AA--ATTAA-C-GA-T-CTTCTA-G--CAAGT-A--AGGG-C--A-CGA-CATAA--ACA--AAAAAGTTGACTAAACTATC-AGTGAA-A--T-G-ATTA-AG-AGA-----T---TT---TTT-------A--CA-A--GTG-ACTG-AA-T------T----------TGT---------A----AA-TG--CC-GACATT-CA--------C--------------GATT--------GTT-C----GA-A-GGAA--------------A-----------------T-------------------------A-----------------G-------G-----CTT----A---------CC--GTGT-----T-T------T-G-A-A-G-CAT--TT---------TA-TGTTG------GGGCG--AG--AA-AAAC-TCAC-G-----GA----GG------TCTCTTTTTAAA--CA----C------TTGAAA-TTAAATGGATGT-A-T---GTTT---CAG-CGGATT-CCTT--AATTTTGGACCTTT------G---ATT-----TCTCTGACATTTG----TAACG-TTGCCATCAGTTAACATTT-CTTT-CAGAAAT-GACA-GCAATG---------C---------A-GT--AG----------GTTCAACT-AG-TTTCGAG--TTTT--GAA--T-AAAC-TTG-A--A-TTTCTA-CC-A-TG-AA-ACTACAGT---ATTTCTTTA-----AATATAGGA-T--ACTT-A-ATG-C-AGATG-----G----T---AGCTCAC-TT-----T-AATATT-C-ATCTACCA-T-TCTGCAT-AACT-G-AATTA-TTGAACATTTAATTTAC---AA-A-----------------AT------------T------------AT----------TTTTC-C--T-GA-T-A---AATTG-TT--GTTTA----AC--CG-AG-------TGTAGACTCCA---TTA----C-AAATCTA-C--CATGTACAGGAGCCCCACAGGCACAGTAGC--C-TTGC-TTTGGTTCGGTcaagctgtaattata
gi|20 : C-T-TG-AA-AC-----T---ATTTGTTTT-----TATCTGAGA-T--ACTT-A-TTG-C-AGGTG-----G----T---AATTCAC-TT-----T-AGTATT-C-ATCTGCCA-C-TTTGCGA-AATT-G-ATTTA-TTG----------TTAC---AATAATAAATATAAGTGCGTTAT------------G------------GT----------TTTCC-C--T-GA-T-A---ATTTG-TT--GTTTA----AC--CG-AA-------TTT---TTCCA---TTA----C-AAATCT--T--CA-GTG--------------------TTGC--C-TTGC-TTTTATTCG
gi|21 : aa-AA-TTTTTAG--TTTT--GAA--T-AAAC-TTGTA--A-TTTCTA-CG-A-TG-AA-AC-----T---ATTTTCTTT-----AATTTTGGA-T--ACTT-A-TTG-C-AGATG-----G----T---CGCTCAC-TTTAATAT-AATATT-C-ACCTACCA-T-TCTGCAT-AACTGG-AATT--TTG----------TTACA--AA-A-----------------AT------------G------------AT----------TTCCC-C--T-TA-TAC---AATTG-T
gi|22 : ctaCTAGAA-T--ACTT-A-TTG-C-AGATGCACGCG----T---AGCTCAC-TT-----T-AATATT-T-ATCTAACA-T-TCTGCAT-AACT-G-AATTA-TTG----------TTAC---AA-A-----------------AT------------G------------AT----------TTTCC-C--T-GA-T-C---AATTG-TT--GTTTA----AC--CG-AG-------TGAAGACTCCA---TTA----C-AAATCCA-C--CATG----------------------TAGC--C-TTGC-TTTGGTTCGG
gi|23 : CCCGAGA-G----AAACTG-----ACGTCA--A--AC----GT----A--AGCTGACGT-TATA-CGT-------A-AAC--------AATGT-----------------AT----TC-C-C--------AGCTCCGG--T-G-AA--ATTAA-T-GA-T-CTTCTA-G--CAAGT-A--AGGG-C--A-C-------------------AGTTAACTAAATTTTT-AGT
gi|23 : aaact--A-----------GTT-AACT-AAATTTTTAG--TTTT--GAA--T-AAAC-TTGTA--A-TTTCTA-CG-A-TG-AA-AC-----T---tttgaataaacttgtaatttctacgatgaaact
gi|24 : aaactcccgagagaaactgacgtcaaacgtaagctgacgttatacgtaaacaatgtattcccagctccggtgaaattaatgatcttctagcaagtaagggcacATT-C-ATCTACCA-T-TCTGCAT-AACT-G-AATTAATTG----------TTAC---AA-A-----------------AT------------G------------AT----------TTTCC-C--T-GA-T-C---AATTG-TT--GTTTA----ACCTCG-AG-------TG-AGACTCCA---TTA----C-AAATCTA-C--CATGTA---------------------AGC--C-TTGC-TTTGGTTC
gi|25 : gnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGA-T--ACTT-A-TTG-C-AGATG-----G----T---AGCTTAC-TT-----T-ACTATT-C-ATCTACAATT-TCTGCAT-AATT-G-AATTA-TTG----------TTAC---AA-A-----------------AT------------AAAGTTAAT----AT----------TTACC-C--TGGA-T-T---ATTTG-TT--GTCTA----AC--CG-AATAT----TATATACCCCG---TTA----C-AA
gi|26 : ggtC-C-C--------AGCTCCGG--T-G-AA--ATTAA-C-GA-T-CTTCTA-G--CAAGT-A--AGGG-C--A-CGG-C--AG--ACA--AAAAAGTAAACTAAATTATC-AGTGAA-A--T-G-TTTA-AG-AGA-----A---------AT-------A--CA-A--GAG-ACTG-AA-T------T-ACG------TGT---------A----AA-TG--CC-GACACT-CA--------C--------------GA-T--------GTT-tgtatttttca
gi|27 : ACGT-CATG-CG------------C--------ATCGTCGG--GATATGTTT-TTATC-T-TC------------AGCTCCGA--T-G-AA--ATCAA-C-AA-T-ACTTTG-G---AAG--A--AGGG-C--A-CGG--AAAGATACA--AGAAAaa
gi|28 : cgaaaacaaatttccgagctgtttgcatGA-T--ACTT-A-TTG-C-AGATG-----G----T---AGTTCAC-TT-----C-AATATT-C-ATCTACCA-T-TTTGCAT---------------T-----------TTAC---AA-A-----------------AT------------G------------TT----------TTTCC-C--T-GA-T-C---AATTG-TT--GTTTA----AC--C---G-------TGTAGACTCTA---TGA----C-AAATTTA-C--CATG----------------------TAGC--C-TTGC-TTTaaaaaaaaaaaaaaaaa
gi|29 : TTTAAA--CA----C------TTGAAA-TTAAACGGATGA-A-T---GTTT---CAG-TGGATT-TCTT--AATTTTGGACA--ATT----G---ATT-----TCTCTGGCATTTG----TAATA-TTTTCA----TTAACATTT--TTTACAGAAAT-GA
gi|3 : ctagacccctacGAGA-G----AAGCAAGTT--ACGTCA--T--GT----TTC---G--AGCTGACGT-CATA-CAT-------A-AAC--------AATGTCGG--G-TAGGTCT-T-ATC-T-TC-C-C--------AGCTCCGA--TAG-AA--ATTAA-C-GACT-CTTCTA-G--TAAGT-A--AGGG-C--A-CGG-CAA-G--ACA--AAA--GTGGA-------ATC-CG-GA---------TTTA-GC-AGA-----T---TTGTATTT-------AG-CA-ACTGAGTACTG-GA-CATGTACT-GCC------TGT---------A----AA-TG--CCCGATATT-CA--------C--------------GATT--------GTTTC----GA-ATGGAA--------------G-----------------TCTCATAAACAAGTCTATT-------A-----------------G-------G-----CCTTC--A---------CCT-GTGT-----GAT------T-G-A-A---CAT--TT---------TAATGTTG------TGGCGC-AG--AC-AAACATAAC-A-----GAAGACGG-------CTCTCTTTATA--CAGCGTC------TCGAAA-TTA--CGGATGT-AAT---GTTT---CAG-CT-ATT-C-TT--A--TTTGGAC---ATTT---G---ATT-----TCTCTGACTTTTG----TA-CG-TT--------CTAACATT--CTTT-CAGAAAT-GACA-GCGATA---------TTATAGATCTA-GTTAG-----------GTTCAACT-AG-ATTTGAG--TTTTCTGAA--T-AAAC-TTTTA--A-TTTCTA-CCTT-TG-AA-AC-----T---ATTTTTTTTAAA--AATCTAGAA-T--ACTT-A-TTG-C-AGATGCAGC-G----T---AG-TCAC--T-----T-AATATT-T-ATCTA-CA-T-TCTGCAT-AAC--G-AATTA-TTG----------GTAC----A-A-----------------AT------------G------------AT----------TTTCT-C--T-GA-T-C---AATTG--T--GTTTA----AC--CG-AG-------TA-AGA--CCA---TTA----C--AATCCACC--CATG----------------------TAGC--CTTTGC-aa
gi|30 : catTT--AATTTTGGACC--ATT----G---ATT-----TCTCTGACATCTG----TAACG-TTATCA----ATAACATTT-CTCT-CAGAAAT-GACA-GCGATAGAGATC---T---------A-GT--AGGTTCAACTAGGTTCAACT-AG-ATTTGAG--TTTT--GAA--T-AAg
gi|31 : TA-TC-TGTG-AA-AT-----TTGTACATTTTTT-----AATCTGTGA-T--ATTTTA-CTG-C-AG-TT-----G----T---AGCTCAC-T--------AATATTTC-ACCTACCA-T-TCTGCGTAAATT-G-AATTATTTG----------TTGC---AA-A-----------------AT------------
gi|32 : aagtTCC-CGGT-GT-T-C---AATTG-TT--GTTTACGTAAC--CG-AG-------AGAAGACTCCA---TTATGTAC-AAATCTA-C--CATGTA----------------------GC--C-TTGC-TTTGGTTCTGTata
gi|33 : acaaacaaacgtaagaggtcagagaa--CA----C------GCAGAA-TTAAGTGGATGT-G-TCAAATTCATGCAG-ATGATT-TCTA--AATTTCAGACC--T------A---AGT-----TTTCAGACAATTG----CAATG-TAACCA----TCAACATCAATTTT-CAGAAAT-Gat
gi|34 : TTTA-----AATCTAGGA-T--ACTT-A-TTG-C-AGATGCATGCG----T---AGCTCAT-TT-----T-AATATT-C-ATCTACCA-T-TCTGCAT-AACT-A-AATTA-TT
gi|35 : -T------T-G-A-AAG-CAT--TT---------TA-TGTTG------GGGAG--AG--AA-AAAC-TAAC-G-----GA----GA------TATCTTT-----------------------AAA-TCAAATGGATGT-A-T---GTTT---CAG-TGGATT-GCTT--AATTTTGGACC--A------A---ATT-----TCTCTaatatattaatggccacacatgcaatt
gi|36 : AGGTTT-C-ATC-T-TC-C-C--------AGCTCCGA--T-G-AA--ATTGA-C-GA-T---------------------GGG-C--A-CGG-CAAAG--ACA--AAGA-----------------AGTGAA-A--T-G-TTTA-AG-AGATTTTTT---TT---TTT-------A--CA-A--GAG-ACTG-AA-T------T-A
gi|37 : -TGTTG------GGGCA--AG--AA-AAAC-TAAC-G-----GA----TG------TCTCTTTTCAAA--CA----C------TCG---------C--ATGT-A-T---ATTT---TAG-TGGATT-CTTT--AATCTTGAATC--A------A---ATT-----TTTCTGGTAT
gi|38 : TG----------TTAC---AA-A-----------------AT------------G------------AT----------TTTCC-C--T-TA-T-A---AATTG-AT--GTTTAT---TC--CG-TG-------TGTAGAATCCAATGTTA----C-AAATCTA-C--CATGTA--------------------CAGTAAC-TTGC-TTTGGT
gi|39 : ----AAGCAA-----A-GTCA--T--A-----GTTT--A--AG-TGACGT-CATA-CGT-------A-AAC--------AATGTCGG--T-T------------------C-C--------AGCTCCGA--T-G-AA--ATCAA-C-GA-T-CTTCTAGG--CAAGT-A--AGGA-C--A-CG
gi|4 : CGAGA-G----AAGCAA-----ACGTCA--T--AC----GT----A--AGATGACGT-CATA-CGT-------A-AAC--------AATGTCGG--T-TAGGTTT-C-ATC-T-TC-C-CAGCTCGATAGCTCCGA--G-G-AA--ATTAA-C-AA-T-CTTCTA-G--CAAGT-A--AGGA-C--A-TGG-CAAAT--A-A--ATAAAGTTAACGAAATTATC-AGTGAA-A--T-G-TTTA-AG-ATA-----C---TTA--TTA-------A--CG-A--GAG-GCTGAAA-T------T-ACG------TGT---------A----AC-TA--CC-GACATT-CA--------CGATTACTAGTAATTGATT--------GTT-C----GA-A-GGAA--------------GTCTCAAGAACTAGTCTAT-------------------------A-----------------G-------G-----CCT----A---------CC--TTGT-----A-T------T-G-A-A-A-GAT--TTAA-------TA-TGTTG------GGGCG--AGAAAA-AAAC-TAAA-T-----GA----GA------TCTCTTTTAAAA--CA----C------TCGAAA-TCAAATGGACAC-A-T---GTTT---CAG-T-GATT-CCTT--AATTTTGGACT--A------A---ATT-----TCTCTGACATTTG----TAACG-TAACCA----TTAATATTTCCTTT-CAGAAAT-GACA-G---------------------------------------------CAACT---------AG--TTTT--GAA--T-AAAC-TTGTA--A-TTTTTA-TC-T-TG-AA-AC-----T----TTTTTTTA-----AATCTGTGA-C--ATTT-A-TTG-C-AGATG-----G----T---AGCTCAC-TT-----T-AATTTT-C-ATCTGCCA-T-TCCGCAT-AATT-G-AATAA-TTG----------TTAC---AA-A-----------------AT------------A------------ATTAAGTTAAAATTTCC-C--T-GA-T------ATTT-TTTGGTTTA----AC--CG-AA-------TATAGACTCCA---TAC----C-AAATCTA-C--CTTG----------------------TAGC--C-TTGG-TTTGATTCGG
gi|40 : TA-TTG----------TTAC---AA-A-----------------AT------------AATTGAAGTTAACAT----------TTTCC-C--T-GA-T-CATTAAATG-TT--GTTTA----AC--CG-A-----------AAACTCCA---TAA----C-AAATCCA-C--CTTGTA--------------------
gi|41 : AGCAA-----A--TCA--T--TA----GTTT--A--AGCTGACGT-CATA-CGT-------A-AAC--------AATGTCGG--T-T----------------C-C-C--------AGCTCCGA--T-G-AA--ATCAA-C-GA-T-CTTCTA-G--CAAGT-A--AGGA-C--A-Caggtta
gi|42 : CCGGGA-G----AAGCAA-----ACGTTA--T--AC----GT----A--AGCTGACAT-CATA-CAT-------G-TACGTA-----AATATCGG--T-TATGTTT-C-ATA-T-TC-C-C--------AGTTCCCA--T-G-A
gi|43 : aaacttACGT-CATG-CGC-------A--------------TGTCGG--A-TATGTTT-TTATC-T-TT-C----------AGCTCCGA--T-G-AA--ATCAA-C-AA-T-
gi|44 : cgaaaacaaatttccgagtgtttgcatCCAAGA-G----AAGCAA-----ACGTCA--C--AC----AT----A--AGCTGACAT-CATA-CGT-------A-AAC--------ATTGTCGG--T-TAGGTTT-A-ATC-T-TC-C-C--------AGC-CCAA--T-G-AA--atctt
gi|45 : acttt---TT---TTT-------A--CA-A--GAG-ACTG-AC-T------T-ACATGTACCTGT---------A----AA-TG--CC-GATATT-CA--------C--------------G
gi|46 : tcagctcaaaactattgacgtaacttgctttgtA-A-----------------AT------------G------------ATGT--------TTTCC-C--CAGA-A-T---AAATG-TT--GTTT-----AC--CGAAG-------TGAAG-------------------AATCTA-C--CA-ATG--------------------TAGC--C-TTGC--TTGGTT
gi|47 : CCCGAGG-G----AAGCGA-----ACGTCA--T--ATTTAAGT----A--AGCTGACGT-CATA-CGTTGTCACAA-AAT--------AGTGTC
gi|49 : CCGGAGA-G----GAGCAT-----ACGTCAC-T--AT----GT----A--AGCAGACGT-CATA-Caat
gi|5 : ctCCCGAGA-G----AGGCAA-----ACGTCA--T--AC----AT----A--AGCTGACGT-CATA-CGT-------A-AAC--------AATGTCAG--T-TTGGTTT-C-ATC-T-CC-C-C--------AGATTCGA--G-G-AA--ATTAA-C-GA-T-GATCTA-G--CAAGT-A--AGGA-C--A-CGG-CGAAT--AAA--GAAACCTTAATTGAATTATC-AGTGAA----------TA-AG-ATA-----C---CT---TTT-------A--CA-A--GAG-GCTG-TA-T------T-ACG------TGT---------A----AA-TG--CC-GACATT-CA--------C--------------GATTAATCGATTGTT-T----GA-A-ATAA--------------G-----------------T-------------------------ACCAAAAACTATTCAAAAG-------G-----CCT----A---------CC--GTGT-----A-T------T-G-A-AAG-CAT--TTAA-------TA-TGTTG------GGGCA--AG--AA-AAAC-TAAC-G-----GA----GA------TCTCTTTTAAAA--CA----C------TCGAAA-CCAGATGGATAC-G-T---GTTT---CAG-TGGATT-CCTT--AATTTTGGACC--A------A---ATG-----TCTCAGACATTTG----TCACG-TTACCA----TTAATATTACCTTT-CAAAACT-GACA-G---------------------------------------------CGACT-AG-TTTTGAG--TTTT--GAA--T-ATAC-TTGTA--A-TCTTTA-TC-T-TG-AA-AC---------A--TGTTTT-----GATCTGTGA-T--ACAT-A-TTG-C-AGATG-----G----T---AGCTCAC-TT-----T-AATATT-C-ATCTGCCA-T-TCCGCAT-AATT-G-AATCA-TTG----------TTACAAAAA-A-----------------ATTAAGGTAA----A------------AT----------TGTCC-C--C-GA-T-A---ATTTGTTT--ACTTA----AC--AG-AA-------TATTAACTCCA---TTA----C-AAATCTA----CAT-TG--------------------TAGC--A-TTGG-CTTGATTCG
gi|6 : ctCCCGAGA-G----AAGTGA-----ATGTTAAGT--AC----GT----A--AGTTGACGT-CATA-CGT-------T-AAC--------AATGTCGG--T-TAGGTTT-C-ATC-T-TC-C-C--------TGCTCCGA--A-G-AA--ATTAA-T-GA-T-CCTCTA-G--CAAGT-A--AGGA-A--A-CGG-CAAAC--ATACCAAAAAGTTAACTAAGTTTTT-AGTAAA-A--T-G-TTTA-AA-AGA-----C---AT---TTT-------A--CA-A--GAG-ACGG-AA-T------C-ACT------TGT---------A----AAATG--CT-GGCATC-CA--------C--------------GATT--------GTT-C----GA-A-GGAA--------------G-----------------TTTCAAGAATTTGTCTTATAACAT--A-----------------G-------G-----TCT----A---------TC--GTGT-----T-T------T-GAA-A-G-CA---TT---------TA-TGTAG------GGGCG--AG--AA-AAAC-GAAC-A-----TA----AA------TCTCTATTGAAA--CA----C------TCGAAA-TCAAATAAATGT-G-T---GTCT---CAA-TGGATT-CTTT--AATTCTAGACC--A------C---ATT-----TGCCTAACATTTA----TAACG-TTACCA----TCAACATTTCCTTT-CAGAAAC-GACA-ACAGTG---------C---------A-GT--A------------TTCAACT-AG-TTTTATA--TT------A--TAAAAC-TT-TA--A-TTTCTA-CC-T-TGAAA-AC-----T---A--TCATTT-----AATATGTGA-T--ACCT-A-TTG-C-AGGTG-----G----T---AGCTCAC-TT-----TAAATATT-C-ATTTACCA-T-TCTGCAT-AAAT---AATTA-AAG----------TT-----AA-A-----------------AT------------A-------------------------TTCT-T--T-GA-T-----AAT---TT--CTTTA----AC--CA-AA-------TATAGACTCCG---GTA----C-AAATCTT-CTTCAGTTG--------------------TAGC--T-TTGC-CTTGATT
gi|7 : aactCTGAGA-G----AAGCAAGGTTAACGGCA--T--A-----GTTTGAG--AGCTGACACACATA-CGT-------T-AAC--------AATGTCGG--T--AGGTTT-T-ATT-TATC-C-A--------AGCTCC-A--T-G-AA--ATTAA-CAGA-T-TTTCTA-G--TAAGT-A--AGGGAC--A-CGT-AAAAG--ACA--AAAAAGT---------------GTGAA-A--C-G-TTTA-AG-ATA-----T---TT---TTTTTTAAT-A--CA-A--GAG-ACTG-AAAT------T-ACA------TGTTGCTACCTTA----GA-TG--CC-GATATT-CA--------C--------------GATTT-------GTT-C----GA-A-GGAA--------------GCTCA-------------T-------------------------A-----------------A--------------------A---------CC--ATGT-----T-T------TCA-A-A-G-CA---TT---------TA-TGTTG------GGGCG--AG--AA-AAAC-TAACAG-----AA----GG------TCCTCTTCTAAA--CA----C------TCG-AA-TTAAACGGATGT-ATT---GGTT---C-----GACTACCTT--CAGTTTGAA-T--A------A---ATTGTAAATTTCTAAC-TTTG----
gi|7 : ctgGATG---------T---------A-TT--G-----------GTTCGACT-AC-CTTC-AG--TTT---GAA--T-AAA--TTGTA--AATTTCTAACT-T-TG-AGGAC-----T---ATTTTTTTTTC---AATCTAGAA-TTTACTA-AATTG-C-AGATC-----A----TCTTAGCTCAC-TT-----G-AATATT-C-ATCTACCA-T-TCTGCAT-AACT-A-CATTA-TTG----------TTAC---AA-A-----------------AT------------G------------TT----------TTTCC-C--T-TA-T-C---AATTG-TT--G-TTA----AC--AG-AGT------TGAAGACCTCA-----A----T-AAAACTA-C--CATGT---------------------TAG---C-TTGC--TTGGTaggactatttttttttcaatctagaatttactaaattgcagatcatcttagctcacttgaatattcatctaccattctgcataactacattattgttacaaaatgtttttcccttatcaattgttgttaacagagttgaagacctcaataaaactaccatgttagcttgcttggtcg
gi|8 : ctgctgagagaagcaaggttaacggcatagtttgagagctgacacacatacgttaacaatgtcggtaggttttatttatccaagctccatgaaattaacagattttctagtaagtaagggacacgtaaaagacaaaaaagtgtgaaacgtttaagatatttttttttaatacaagagactgaaattacatgttgctaccttagatgccgatattcacgatttgttcgaaggaagctcataaaccatgttttcaaagcatttatgttggggcgagaaaaactaacagaaggtcctcttctaaacactcgaattaaacgA--AAAAAGTTAACTGAATTATC-AGCGAA-A--T-G-CTGA-AG-AGA-----CC--TT---TTT-------A--TA-G--GAG-ACTA-AA-T------T-TCG------T-----------------A-TG--CC-GACATT-CA--------C--------------GACT--------GTT-A----GA-T-GGAA--------------G-----------------TCTCAAGAACTAGTCTACATCTATAGA-----------------G-------G-----CCT----A---------CC--GTGT-----T-T------TTA-A-A-G-CAT--TT---------TA-TGTAG------GGGCG--AG--AA-AAAC-TAAC-GTTACGGA----GA------ACTCTTTTGAAA--CA----T------TTGCAA-TAAAATGTATGC-A-T---GTTT---CAG-TGAATT-CCTT--AATTTTGGACC--T------A---ATT-----TCTCAGACATTAG----TACCG-TTATCA----TTAACATTACCTTT-CGGAAAT-GACA-GCGATG---------C---------A-GT--A-----------ATT-AACTCAG-TTTTGAG--TTTT--GAA--T-AAAC-TTGAA--A-TTTCAA-TC-T-TG-A-------------ATTTTTTTT-----AATCGGTGA-T--ACTT-A-TTG-C-AGATG-----G----T---AGTTCACTTT-----T-AATATG-C-ATCTACCG-T-TCTGCAT-AATT-G-GATTG-TTG----------TTAC---AA-A-----------------ATAAATAAAATAAAG------------AT----------AAACT-T--T-GATT-T---ATTTG-GT--GTGTA----AC--CG-AATATTAATTATAGACCTCA---TTA----CAAAATCTA-C--CTCGTA--------------------C--C--C-TTGG-TTTGATTCGGTcg
gi|9 : A--AAAAAGTTAACTGAATTATC-AGCGAA-A--T-G-CTGA-AG-AGA-----CC--TT---TTT-------A--TA-G--GAG-ACTA-AA-T------T-TCG------T-----------------A-TG--CC-GACATT-CA--------C--------------GACT--------GTT-A----GA-T-GGAA--------------G-----------------TCCAAGAACTAGTCTAATCTAT----A-----------------GA------G-----CCT----A---------CC--GTGT-----T-T------T-A-A-A-G-CATG-TT---------TA-TGTAG------GGCCG--AG--AA-AAAC-TAAC-GTTACGGA----GA------ACTCTTTTGAAAAACA----T------TTGCAA-T-AAATGTATGC-A-T---GTTT---CAG-TGAATT-CCTT--AATTTTGGACC--T------A---ATT-----TCTCAGACATTAG----TACCT-GTATCA----TTAACATTACCTTT-CGGAAAT-GACA-GCGATG---------C---------A-GT--A-----------ATT-AACTCAG-TTTTGAG---TTT--GAA--T-AAAC-TTGAA--A-TTTCAA-TC-T-TG-AA---------------TTTTTT-----AATCGGTGA-T--ACTT-A-TTG-C-AGATG-----G--------AGTTCACTTT-----T-AATATG-C-ATCTACCG-T-TCTGCAT-AATT-G-GATTG-TTG----------TTAC---AA-A-----------------ATAAATAAAATAAAG------------AT----------AAACT-T--T-GATT-T---ATTTG-GT--GTGTA----AC--CG-AAATTAAT-TATAGACCTCA---TTA----CAAAATCTA-C--CTCGTA--------------------C--C--C-TTGG-TTTGATTCG
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|48 ): GCGTGGACCATCCTTGCATGCATCTCTAGTCAGTTAGTCTAACCACTGCATGA