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Reference ( gi|10 )           :                                     TTAATT---G--AATTTG-TCATTT-TTTGACTGT-TT-C-C--TGGGAGGTTTTTG-GT--A-T--TT--AC-GTT---C--A-AG-GTG--TAAC-AGTTT---GA--CTG-T-T--A--CC-TT-TCCGGA----T-AA----------AG----AACT-G--TTACA----T----GCGC----A-A-CG-T-----AA--A-TG-CGCA-AAA--AATAT-CCCAT--TG-T--G----AC-G--C-TG-C-AAC--A-CG-TAATT--TG-AC-GT--AACT---A-AAA-T-G-TT--T--AA-G--C---A---A------AGTA--------AA-C--A-C--G---ATGT-CAA--C---G-A-T-T--TG--AAC-T-A-CT-CTG--TATTT--A-----T--ATAA----T------A-----T--T-A---T--TGTT-TG-----AA-A-TA----ATT---A-----AA-G-GA--TT--A--A-TGGTTCA------TAAT-----T-T-AG----------T-CT---A------A-T-TAG-T-----ATT---T-AG--TCT--------T-TT--------AT-GA-ATA-T------A---T-TTT--ATAG-AAAATATGC-ATTTGACT-TGTT---AATA-AA-TAAT
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gi|12                         :                      tattacctaattgtatTAATT---GT-AATTTG-GCATTT-TT-GATTGT-TT-C-C--TGGGTGGTTTT-G-GT--T-T--TT--AC-GTT---C--A-AG-GTG--TAAC-AGTTT---CA--CTG-T-T--A--CC-TT-TCCGGA----T-AA----------AG----AACT-G--TTACA----T----GCGC----A-A-CG-T-----AA--A-TG-CGC--AAA--ACCAT-CCCAT--TG-T--G----AC-G--CAAG-A-AAC--G-CG-TAATT--TG-AC-GT--AAGTA--A-AAA-T-G-TT--T--AA-AACC---A---A------AGTA--------AA-A--A-C--G---ATGT-CAA--C---G-A-A-T--TG--AAT-T-A-CT-CTG--TTTAT--G-----T--TTAATT--T------T-----T--T-A---T--TG-T-TG-----AA-A-TA----ATT---A-----AA-G-TA--TT--A--A-TGGTTCA------TAAT-----T-T-AG----------T-CT---A------A-T-CAG-T-----ATT---T-AG--TCT--------T-TT--------AT-AG-ATA-T----------T-TTA--ATAG-AAAATATGC-ATTTtttgaatatctttcacacatagtgctctatattgatggacatatttgac
gi|2                          :                           taattgtctataAATT---GTAAATTTG--CATTT-TTTGACTGT-TTTC-C--TTGGAGGTTTTGT-GT--A-T--TT--AC-GTTA--CCAA-AG-GTG--TAAC-AGTTT---GAC-CTG-TCT--AAGCCATTATCCAGA----T-AA----------AG----AACT-GGATTA-A----TGTAAGCGC----A-A-CG-TTA---AA--A-TG-CGC--AAA--AATAT-CCCAT--TG-TCGG----AC-G--CAAG-C-AACT-C-CG-TAATT--TG-AT-GTCAAATT---A-AAA-T-A-TT--T--AACA--CAG-A---A------AGTA--------AT-CGGA-TTAG---ATGT-TAA--C---GTT-T-T--TG--AAC-T-A-CTCCTG--TATTT------------TGG----TTTTTTCT-----T--T-A---T--TG-T-TG-----AA-A-TA----ATT---------AC-G-CA--TT--A--A-TGGTT-----------T-----C-C-A--------------T---A------A-T-TAGAT-----A------------CT--------T-TTA-------AT-GA-ATA-T----------T-TTT--ATAG-AAAATATGC-ATTTGACT-TTTTATCAATA-AA-
gi|23                         :                      cctaaattgtctatttaAATT---GG-AATTTG-CTATTT-TG-GACTGT-TT-C-T--TGGGA-GTTTTTA-GT--ATT--TT--AC-GAT---C--taaggtaat
gi|11                         :                        acctaattgtccattaATT---GT-AATTTG-GCATAT-TT-GACTGC-TT-C-C--TGGGAGGTTTT-G-GT--T-T--TT--AC-GTT---C--A-AG-GTG--TAAC-AGTT-----------------A--CC-TT-TCCGGA----T-AA----------AG----AACT-G--ATACA----T----GCGC----A-A-CG-T-----AA--A-TG-CGC--AAA--AATAT-CCCAT--TG-T--G----ACAG--A-GG-C-AAC--A-CG-TAATT----------------------AA-T-G-TT--T--AA-C--C---A---A------AGTA--------AA-C--A-C--G---AAGT-CAA--C---A-A-T-T--TG--AAC-T-A-CT-CTG--TATTT--G-----T--TTGG----T--------------------------TT-TA-----CA-T-TA----ATT---A-----AA-G-GA--TT--A--A-TGGTTCA------TAAT-----T-T-AA----------T-CT---T------T-A-TAG-T-----ATT---T-AG--TCT--------T-TT--------AT-CA-ATA-T----------T-TTT--ATAG-AAA--------------C-TGTT---GATG-AA-TAAT
gi|4                          :               acgtattagtcatactaaattattacctaattgtctTTTG-GCAATT-TTTGACTGT-TT-C----TGGAAGGTTTT-G-GT--A-T--TA--AC--CT---C--A-GG-CTG--TAAC-GTTTC---GA--CTG-T-T--A--CC-TT-TCCGGA----C-AA----------GG----A--T-G--TTACGAG--T----GCG-----A-A-CG-T-----AA--AGTGGCGCC-AAA--A-TA--CCCTT--AG-T--G----AC-G--CAGG-C-AAC--A-CG-TA-TT--TG-AC-GC--AA-T---A-AAA-T-G-TT--C--AA-G--A---A---A------CGTA--------A--C--A-C------AT-T-CAC--CCCAG-A-TAT--TG--AACCT-A-CT-CTAA-TATTT--AATTGTTGAATAA----T------AAAGGAT--T-A---T--GGTT-C---------A-TA----ATT---AGACTTAA-A-GA--TT--A--T-CGGTTCA------TAAT-----T-T-AGACTTAG----T-CT---A------A-T-TAG-T-----ATT-----AG--TCT--------T-TT--------AT-GA-ATA-T------T---T-TTT--ATAG--AAATA-GC-ATTTGACTGTGTtaggtaat
gi|26                         :                       tttattacctcaattccttattttatattgtaagctTTTATTTTACTGT-TT-T-C--TGGGAG-TTTTTG-GA--A-T--TT--AT-GTT---C--A-AG-GTG--TAAT-AGgtgtaa
gi|15                         :                                                                TTGGCTGC-GT-CACAATGGGATATTTTTGCGC--A-T--TT--AC-GTTGCGC--A-----TG--TAAC-AGTT--------CT--T-T--A--------TCGGGAAAGGT-AAC---------AGTCA-AACT-G--TTACACCT-T----G-------A-A-CA-T-----AA--A-TA-T-CA-AAA--
gi|12                         :                               attgtctatttaattgtaatttgtcatttttgactgtttcctgggagg--TGGGATGGTTTTGCGC--A-T--TT--AC-GTTGCGC--A-----TG--TAAC-AGTT--------CT--T-T--A--------TCCGGAAAGGT-AAC---------AGTGA-AACT-G--TTACACCT-T----G-------A-A-CG-T-----AA--A-AA-C-CA-AAA--cacgtaatttgacgtaactaaaatgtttaaccaaagtaaacacgatgtcaacttttattgtggttctaattaatatttagtcttttatgaattttttttatagaaaatatgcattgacgttttataaataattagtaataa
gi|14                         :                             taattgtctatataattgtaatttggcatttttgattgtttcctgggtgg--TGGGATATTTTTGTGC--A-T--TT--AC-GTTGCGC--A-----TG--TAAC-AGTT--------CT-----------T-TT-TCTGGAAAGGT-AAC---------AGTCA-AACT-G--TTACACTT-T----G-------A-A-CT-T-----AA--A-TA-CCCG-AAttgtgacgcaagaaacgcgtaatttgacgtaagtaaaaatgtttaaaaccaaagtaaaaacgatgtcaacgaattgaattactctgtttatgtttaattttttattgttgaaataattaaagtattaatggttcataatttagtctaatcagtatttagtcttttatagatattttaatagaaaatatgcattt
gi|8                          :                              taattgtctatttaattgtaatttggcattttgactgttttccgggagg--TGGGATCTTTTTG-TG--C-T--TT--AC-GTTGCGC--A-----TG--TAACCAGTT--------------------CT-TT-TCTGGAAAGGT-AAC---------AGTCA-AACT-G--TTACAC---T----TTGA----A-A-CT-T-----AA--A-Tttgtgacgcaggcaacatgtaatttgacgtaactaaaatgtttaaccaaagtaaacatgatgtcaacgattagaactactctgtatttgtttaatttttataatattgttgaaataattaaaggattaatggttcataatttagttttttatgaaatatttttttttagcaaaatcatttgacttg
gi|11                         :                        aattgtctattaatttctgtaatttggcattttgactgtctttcggaggttcggg--TGGGATATTTTTGCGC--A-T--TT--AC-GTTGCGC--A-----TG--TATC-AGTT--------CT--T-T--A--------TCCGGA------AA----------GGT---AACT-G--TTACACCT-T----G-------A-A-CG-T-----AA--A-AA-C-CA-AAA--ttatgtgacgcaggcaacatgtaatttgacgtaactaaaattgtttaaccaagtaaacaatgatgtcaacgattagaactatctagttatttgtttaatttttatatattgttggaataattaaaggattaattggttcataattatagatatttagttttttttatgaatatttttatagaaaatatgcatttgacttgtttataaataattggtaata
gi|2                          :       acgtattagtcatactaaattattacctaattgtctattgtaatttggcatatttgactgcttcctgggagg--TGGGATATTTTTGCGC--A-T--TTTAAC-GTT-----------GCGC-TTAC-A--TT---AATCCAG-T-T-----CT-TTATCTGGA----T-AATGGCTTAGACAGGTCAAACT-G--TTACACCTTT----G-GT----A-A-CG-T-----AA--A-TA-CACA-AAA--ttgtgacagaggcaacacgtaattaatgtttaaccaaagtaaacacgaagtcaacaatttgaactactctgtatttgtttggttttacattaattaaaggattaatggttcataatttaatctttatagtatttagtcttttatcaatatttttatagaaactgttgatgaataattaggtaat
gi|9                          :                          cctaaattgtctatttaaattgtaaatttgcattttttgactgttttccttggaggGGGATATTTTTG-GCGCA-T--TT--AC-GTT-----------GCGCTTTAC-AGTCT-----------T-T--A--------TCCGGAGTGGT-AACAGTC-----AA----AACT-G--TTACA----C----CTG-----A-A-CG-T-----AA--A-TA-CGCA-AAA--ttgtcggacgcaagcaactccgtaatttgatgtcaaattaaaatatttaacacagaaagtaatcggattagatgttaacgtttttgaactactcctgtattttggttttttctttattgttgaaataattacgcattaatggtttccataattagatacttttaatgaatatttttatagaaaatatgcatttgactttttatcaataaattaaggtaat
gi|5                          :                                acctaattgtcatatattaattgtaatttggcatttttgactgttttcctgggaggTTTTTG-CG--A-T--TT--AC-ATT---G--C-AC-ATG--TGAC-AGTT--------CT--T-T--A--------TCCGGAAAG-T-AAC---------AGTCA-AACT-A--TTACA----C----TTG-----A-A-CG-T-----AA--A-TA-C-C--AAA--AACAT-CCCAtgtgacgaggcaacaacgtaatttgaagtaactaaaaatgtcttaaagcaaagtaaaacacatgtcaaacgatttgaactactctgtatttatctaatacttattgttgaattaattaaaggattaatggttcataatttagtcctaattagtattagtcttttatagaatatatatttgatagaaaatatgcaatttgacttgctttata
gi|1                          :                                     taccaattgtatctattttaatttgtcaatttgctcatttttgactgtttccTTTTGCGC--ACT--TT--AC-GTT---T--G-CGCATG--TAAC-AGTT--------------------CC-TTGTCCGGAAAGGT-AATCAGTCTC--AA----AACT-G--TTACACCT-T----GAGC----A------T-----AAAGA-TA-C-CA-AAA--Aataacccattttgacgcaggcaaacacgtaattttacggcaactaaaatcgttttaagcaaagtaaacacggatgtcaacgattttgaactactctagataatttattgttgaatataattaaaggaatctacatggttcataattagacttagttaattagtatttagtcttttatgatatatttttatagaaaaatgcatttgacttgtttaaatacaataattaggtaaa
gi|19                         :                                                                                                                            ttatatgttccatacgttattaattataaattgttattaattgtatggcattttttgactgtttcctggaagACT-G--TTACA----T----GCGC----A-A-CG-T-----AA--A-TG-CGC--AAA--AATAT-CCCAT--TG-T--G----AC-G--CAGG-C-AAC--A-CG-TAATT--TG-AC-GT--AAGT---A-AAA-T-G-TT--T--AA-C--C---A---A------AGTA--------AA-C--A-C--G---ATGT-CAA--C---G-A-T-T--TG--AAC-T-A-CT-CTG--TATTT--A-----T--CTAA----T------AT----T--T-A---T--TG-T-TG-----AA-A-TA----ATT---A-----AA-G-GA--TT--A--A-TGGTTCA------TAAT-----T-T-AG----------T-CT---A------A-G-TAG-T-----Atatacacccatcgtgcgagacgaacacaaccgcataaataataaccgcaaacagaaagtaaaaagcaaacacgatgtcaacgatttgaaacttctaatattattgtaaaaaattaaaggatttatggttcattaatttagacttaaaggatttaaggttcattaattttagacttagtctaattagtatttagtcttttatgaatattttttatagaaaatatgcatttgacttgtttgtaaattaattttaggccaat
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gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                              G-TAATTC-TG-AC-GT--AAGT---A-A---T-G-TT--T--AA-AA-C---C---A------AGTA--------AA-C--A-C--G---ATGT-CAA--CTG-G-A-T-T--TG--AAT-T-A-CT-CTG--TTTGT--G-----T--TTAA----T------T-----T--T-A---TAATCTC-TG-----GA-CTTA----ATTAACA-----AA-GTGA--TT--ACTATTGGTTTATG----TAATG----T-T-AG----------A-TC---A------A-TATGA-T-----A-----T-AG--TTA--------T-TC--------A---A-ATA-G------C---T-TTT--GT------ATATG--ATACAATT-TTTT---AATG-AA-
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                      aactatgccatattggtgagtctcaagaaacagaatcgcca-TAATT--TG-AT-GT--AATT---A-AAA-T-A-TT--T--AA-C--A---A---A------AGTA--------AA-CGGA-TTAG---ATGT-TAA--C---G-T-T-T--TG--AAC-T-A-CT-CTG--TATTT--G-----T--TTTT----T------C-----T--TTA---T--TGTT--G-----AA-A-TA----ATT---A-----AC-G-CA--TT--A--A-TGGTTCA------TAAT-----T-T-AG------------------------------A-T-----A------------CT--------T-TT--------AT-GA-ATA-T------T---T-TTT--ATAG-AAAATATGC-ATTTGACT-TGTT---TATC-AA-TAATgata
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             -T-G-TT--T--AA-C--C---A---A------AGTA--------AA-C--A-C--G---ATGT-CAA--C---G-A-A-T--TG--AAtaggtaata
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gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          -T-T--TG--AAC-T-A-CT-CTG--TATTT--G-----T--TTAA----T------T-----T--T-A---T--TGTT--G-----AA-A-TACTTAATT---A-----AA-G-GA--TT--A--A-TGGTTCA------TAAA-----T-T-AG----------T-CTTTGA------A---TAC-T-----ATT---T-AG--TCT--------T-TT--------AT-AA-ATA-T------T---T-TTT--ATAG-
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  A-A-TA----ATT---A-----AA-G-GA--TT--A--A-TGGTTCA------TAAT-----T-T-CG----------T-TT------------T-TAG-C-----ATT---T-AG--CCT--------T-TT--------AT-GA-ATA-T----------T-TTT--ATAG-AAAATATGC-ATTTGACT-TGTT---TATA-AA-
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     -TA----ATT---A-----AA-G-GA--TT--A--A-TGGTTCA------TACT-----T-T-AG----------T-CT---A------A-T-TAG-T-----ATT---TAAG--TCT--------T-
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ----------T-CT---A------A-T-TAA-T-----ATT---T-AG--TCT--------T-TT--------AT-GA-ATT-T------T---T-TTT--ATAG-AAAATATGC-A-TTGACG-TTTT----ATA-AA-TAATat
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Unaligned ( gi|25 ): ATTTTACATTATTACCTAATTGTCTATTTAAAATTGTAATTTGGCATTATTTGA

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Reference ( family-1829 )     :                                          TTA-ATT---GT-AA---TTTGG-CATTT-TTTGACTGT-TT-CCTGGGAGGTTTTTGGTA-T--TTA-C-GTT--CA-A-GGTGTAACAGTTT---GAC-TG-T-T--A--CC-TT-TCCGGATAAA-GAACT-G--TT--AC--ATG----CGC----A-A-CG-T-----AAA-T-GCGCA-AAA--AATAT-CCCAT--TG-T----GAC-GCAGGC-AA-C--A-CG-TAATT--TG-A-C-GT--AANT-A-AAA---T-G-TTT--AA------N-CA---A------AGTA--------AA-C--A-C--G---ATG-TCAA--C---GA-T-TT--GA--A-CT-A-CTC-TG--TA-TTT--G-TTT-AA--T--NT------T--A---T--TGTT-TG-AA-A----TA------ATT---AAA-G-GA--TT--A--A-TGGTTCA------TAAT-----T----------------------T-AG----------T-C----T---A------A--T-TAG-T-----AT-----T----T-AG--TCT--------T-T---T--------A-T-G-A-A-TA--T---T--TT-T---AT---AG-AAAATATGC-ATTTGACT-TG-TTT--ATA-AA-TAAT
gi|1                          :                                          TTA-ATT---GT-A------TGG-CATTT-TTTGACTGT-TT-CCTGGAAG-TTTTTGGTA-TCTTTA-T-GCT--CA-A-GGTGTAACAGTTTTGAGAC-TGAT-T--A--CC-TT-TCCGGACAAG-GAACT-G--TT--AC--ATG----CGCA---A-A-CG-T-----AAAGT-GCGCA-AAA--TATACACCCAT--CG-TGCGAGAC-GAACAC-AACC--G-CA-TAAATAATA-ACC-GC--AAAC-A-GAA---A-G---T--AA---------A---A------AGCA--------AA-C--A-C--G---ATG-TCAA--C---GA-T-TT--GA--A----A-CT----------------TCT-AA--T--AT------T--A---T--TGT-----AA-A----AA------ATT---AAA-G-GA--TT--T--A-TGGTTCAT-----TAAT-----T----------------------T-AGACTTAAAGGAT-T----T---AAGGTTCA--T-TAA-TTTTAGAC-----T----T-AG--TCTAATTAGTAT-T---TAGTCTTTTA-T-G-A-A-TAT-T---T--TT-T---AT---AG-AAAATATGC-ATTTGACT-TG-TTT--GTA-AATTAAT
gi|10                         :      ttatatgttccatacgttattaattataaattgttaTTA-ATT---G--AA---TTTGT-CATTT-TTTGACTGT-TT-CCTGGGAGGTTTTTGGTA-T--TTA-C-GTT--CA-A-GGTGTAACAGTTT---GAC-TG-T-T--A--CC-TT-TCCGGATAAA-GAACT-G--TT--AC--ATG----CGC----A-A-CG-T-----AAA-T-GCGCA-AAA--AATAT-CCCAT--TG-T----GAC-GC-TGC-AA-C--A-CG-TAATT--TG-A-C-GT--AACT-A-AAA---T-G-TTT--AA------G-CA---A------AGTA--------AA-C--A-C--G---ATG-TCAA--C---GA-T-TT--GA--A-CT-A-CTC-TG--TA-TTT--A-TAT-AA--T--AT------T--A---T--TGTT-TG-AA-A----TA------ATT---AAA-G-GA--TT--A--A-TGGTTCA------TAAT-----T----------------------T-AG----------T-C----T---A------A--T-TAG-T-----AT-----T----T-AG--TCT--------T-T---T--------A-T-G-A-A-TA--TA--T--TT-T---AT---AG-AAAATATGC-ATTTGACT-TG-TTA--ATA-AA-TAATtttaggccaat
gi|11                         :                                             -ATT---GT-AA---TTTGG-CATAT-TT-GACTGC-TT-CCTGGGAGGTTTT-GGTT-T--TTA-C-GTT--CA-A-GGTGTAACAGTT----------------A--CC-TT-TCCGGATAAA-GAACT-G--AT--AC--ATG----CGC----A-A-CG-T-----AAA-T-GCGCA-AAA--A-TAT-CCCAT--TG-T----GAC-AGAGGC-AA-C--A-CG-TAATT---------------------AA---T-G-TTT--AA------C-CA---A------AGTA--------AA-C--A-C--G---AAG-TCAA--C---AA-T-TT--GA--A-CT-A-CTC-TG--TA-TTT--G-TTT-GG--T--TT------T--A---C-----------A-T----TA------ATT---AAA-G-GA--TT--A--A-TGGTTCA------TAAT-----T----------------------T-AA----------T-C----T---T------T--A-TAG-T-----AT-----T----T-AG--TCT--------T-T---T--------A-T-C-A-A-TA--T---T--TT-T---AT---AG-AAA
gi|12                         :       acgtattagtcatactaaattattacctaattgtctTA-ATT---GT-AA---TTTGG-CATTT-TT-GATTGT-TT-CCTGGGTGGTTTT-GGTT-T--TTA-C-GTT--CA-A-GGTGTAACAGTTT---CAC-TG-T-T--A--CC-TT-TCCGGATAAA-GAACT-G--TT--AC--ATG----CGC----A-A-CG-T-----AAA-T-GCGC--AAA--ACCAT-CCCAT--TG-T----GAC-GCAAGA-AA-C--G-CG-TAATT--TG-A-C-GT--AAGTAA-AAA---T-G-TTTAAAA------C-CA---A------AGTA--------AA-A--A-C--G---ATG-TCAA--C---GA-A-TT--GA--A-TT-A-CTC-TG--TT-TAT--G-TTT-AATTT--TT------T--A---T--TG-T-TG-AA-A----TA------ATT---AAA-G-TA--TT--A--A-TGGTTCA------TAAT-----T----------------------T-AG----------T-C----T---A------A--T-CAG-T-----AT-----T----T-AG--TCT--------T-T---T--------A-T-A-G-A-TA--T---T--TT-A---AT---AG-AAAATATGC-ATTTctgttgatgaataattaggtaat
gi|13                         :                              taattgtctataTTA-ATT---GT-AA---TATGG-GGCTT-TT-GACTGT-GT-CCTCGGAGGTTAT-GG-A-T--TTA-C-GTT--CA-A-GGTGTAACA--TT---GAC-TG-T-A--A--CC-TT-TCCGGATAAA-GA-CT-G--TT--AC--ATG----C--------A-CG-T-----AA--T-GCGCA-AAA--C-TAT-CCCAT--TG-T----GAC-GCAAGA-AA-C--G-CG-TAATT--TGAA-C-GT--ACC------------G-GTA--GA------C-AA---A------AGTA--------AA----A----G---ATG-TCAA--C---GA---TT--GATGA-TT-A-CTC-TG--TATTTT--GTTTT-AA--T--TT------T--A---T--TATTGTG-AA-A----TA------ATT---AAA-G-GA--TC--T--A-TGGTT-A------TAAT-----T----------------------TAAG----------T-C----T---A------AT-T-TAG-T-----AT-----TAAA-T-AG--TCT--------T-TG--T--------A-T-----A-TA--T---T--TT-A---AT---AG-AAAATATGC-ATTTGACT-T--CTT--ATA-CA-
gi|14                         :                                       ataTTA-ATT---GT-AA---TTTGG-CATTT-T--GACTGT-TT-TCCGGGAGGTTCG-GGTA-T--TTA-A-GTT--CA-A-AGTGTAACAGTTT---GAC-TG-T-T--A--CC-TT-TCCAGAAAAA-GAACT-G--TT--AC--ATG----CGC----A-A-CG-T-----AAA-T-GCACA-AAA---ATAT-CCCAT--TG-T----GAC-GCAGGC-AA-C--A-TG-TAATT--TG-A-C-GT--AACT-A-AAA---T-G-TTT--AA------C-CA---A------AGTA--------AA-C--A-T--G---ATG-TCAA--C---GA-T-TA--GA--A-CT-A-CTC-TG--TA-TTT--G-TTT-AA--T--TTTTATAAT--A---T--TG-T-TG-AA-A----TA------ATT---AAA-G-GA--TT--A--A-TGGTTCA------TA-----------------------------------------------------------------------------AT-----T----T-AG--TTT--------T-T---T--------A-T-GAA-A-TATTT---T--TT-T---TT---AGCAAAAT---C-ATTTGACT-TG-
gi|15                         :                               taattgtctatTTA-ATT---GT-AA---TTTGT-CATTT-TT-GACTGT-TT-CCTGGGAGGTTTT-GATA-T--TTA-T-GTT--CA-A-GGTGTAACAGTTT---GAC-TG-T-T--A--CC-TT-TCCCGATAAA-GAACT-G--TT--AC--ATG----CGC----A-A-CG-T-----AAA-T-GCGC--AAA--AATAT-CCCAT--TG-T----GAC-GCAGCC-AA-C--A-CG-TAATT--TG-A-C-GT--AACT-A-AAA---T-G-TTT--AA------C-CA---A------AGTA--------AA-C--A-C--G---ATG-TCAA--C------T-TT---------T-A-TTG-TG--GT-TCT--A-ATT-AA--T--AT------T--
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      attgtctat----------T-C----T---A------A--T-TAA-T-----AT-----T----T-AG--TCT--------T-T---T--------A-T-G-A-ATTT--T---T--TT-T---AT---AG-AAAATATGC-A-TTGACG-T--TTT--ATA-AA-TAATtagtcttttatgaattttttttatagaaaatatgcattgacgttttataaataattagtaataa
gi|16                         :                                                   attgtctatttaattgtaatttgtcatttttgactgtttcctgggaggttttgatatttatgttcaaggtgtaacagtttgactgttacctttcccgataaagaactgttacatgcgcaacgtaaatgcgcaaaaatatcccattgtgacgcagccaacacgtaatttgacgtaactaaaatgtttaaccaaagtaaacacgatgtcaacttttattgtggtG-TAATTC-TG-A-C-GT--AAGT-A-A-----T-G-TTT--AA------AACC---A------AGTA--------AA-C--A-C--G---ATG-TCAA--CTG-GA-T-TT--GA--A-TT-A-CTC-TG--TT-TGT--G-TTT-AA--T--TT------T--A---TAATCTC-TG-GA-CT---TA------ATTAACAAA-GTGA--TT--ACTATTGGTTTATG----TAATG----T----------------------T-AGA---------T-CAATAT---G------A--TATAGTT-----AT-----TCAAAT-AG--CTT--------T-TGTAT--------A-T-G-ATA-CAATT---T--TT-T---AA---TG-AAGATAtagtaataa
gi|17                         : aactatgccatattggtgagtctcaagaaacagaatcgccaTTA-ATT---GT-AA---TTTGT-TATTT-TT--GCTGT-TT-TCTCGGAG-TTTTTGGT-------------------------------TTT---GAC-TG-T-T--A--CC-TT-TTCAGATAAA-GAATT-G--TT--AC--ATG----CAC----A-A-TA-TAATTAAAA-T-GTGC--AAA--AGTAT-CCCAC--TG-T----GAC-GCAGGT-GA-C--A-TG-TAATT--TG-A-T-GT--GACT-A-AA---------TT--AA------T-TA---A------AACA--------AA-
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                  tattacctaattgtat-TAATT--TG-A-T-GT--AATT-A-AAA---T-A-TTT--AA------C-AA---A------AGTA--------AA-CGGA-TTAG---ATG-TTAA--C---GT-T-TT--GA--A-CT-A-CTC-TG--TA-TTT--G-TTT-TT--T--CT------TT-A---T--TGTT--G-AA-A----TA------ATT---AAC-G-CA--TT--A--A-TGGTTCA------TAAT-----T----------------------T-AG-----------------------------------A-T-----A------------------CT--------T-T---T--------A-T-G-A-A-TA--T---T--TTTT---AT---AG-AAAATATGC-ATTTGACT-TG-TTT--ATC-AA-TAATtttgaatatctttcacacatagtgctctatattgatggacatatttgac
gi|19                         :                                                                                                                                                                             ACT-G--TT--AC--ATG----CGC----A-A-CG-T-----AAA-T-GCGCA-AAA---ATAT-CCCAT--TG-T----GAC-GCAGGC-AA-C--A-CG-TAATT--TG-A-C-GT--AAGT-A-AAA---T-G-TTT--AA------C-CA---A------AGTA--------AA-C--A-C--G---ATG-TCAA--C---GA-T-TT--GA--A-CT-A-CTC-TG--TA-TTT--A-TCT-AA--TA-TT------T--A---T--TG-T-TG-AA-A----TA------ATT---AAA-G-GA--TT--A--A-TGGTTCA------TAAT-----T----------------------T-AG----------T-C----T---A------A--G-TAG-T-----Ataggtaata
gi|2                          :                                            A-ATT---GT-AA---ATTTG-CATTT-TTTGACTGT-TTTCCTTGGAGGTTTTGTGTA-T--TTA-C-GTTACCA-AAGGTGTAACAGTTT---GACCTG-TCT--AAGCCATTATCCAGATAAA-GAACT-GGATT--A---ATGTAAGCGC----A-A-CG-TTA---AAA-T-GCGCA-AAA--A-TAT-CCCAT--TG-TCG--GAC-GCAAGC-AA-CT-C-CG-TAATT--TG-A-T-GTCAAATT-A-AAA---T-A-TTT--AA------CACAGA-A------AGTA--------AT-CGGA-TTAG---ATG-TTAA--C---GT-T-TTT-GA--A-CT-A-CTCCTG--TA-TTTTGG-TTT-TT--T--CT------TT-A---T--TGTT--G-AA-A----TA------ATT---AC--G-CA--TT--A--A-TGGTT-----------T-----C----------------------C-A------------------T---A------A--T-TAGAT-----A------------------CT--------T-T---T--------AAT-G-A-A-TA--T---T--TT-T---AT---AG-AAAATATGC-ATTTGACT-T--TTT--ATC-AA-TAA
gi|20                         :                                                                                                                                                                             cctaaattgtctatttaG----CGC----AGA-TGAT-----TAA-T-GCGCA-AAA--AATAT-CCCAT--TG-T----GAC-GCAGG--AA-CA-A-CA-TAATTC-TG-A-C-GT--TAGT-AGAAA---T-G--TT--AA------C-CAGACG------AGTA--------AA-C--AGCA-A---ATG-TC-A--C---GAGT-TT--GA--A-GTCA-TCT-TC--TA-TTG--T-TTT-AA--TTCTT------T--A---T--TG-T-TG-AA-attaaggtaat
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            -T-TT--GA--A-CT-A-CTC-TG--TA-TTT--G-TTT-AA--T--TT------T--A---T--TG-T-TG-AA-ATACTTA------ATT---AAA-G-GA--TT--A--A-TGGTTCA------TAAA-----T----------------------T-AG----------T-C----TTTGA------A----TAC-T-----AT-----T----T-AG--TCT--------T-T---T--------A-T-A-A-A-TAT-T---T--TT-T---AT---AG-
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      A-A----TA------ATT---AAA-G-GA--TT--A--A-TGGTTCA------TAAT-----T----------------------T-CG----------T-T----T-------------T-TAG-C-----AT-----T----T-AG--CCT--------T-T---T--------A-T-G-A-A-TA--T---T--TT-T---AT---AG-AAAATATGC-ATTTGACT-TG-TTT--ATA-AA-
gi|23                         :                                            A-ATT---GG-AA---TTTGC-TATTT-TG-GACTGT-TT-CTTGGGA-GTTTTTAGTATT--TTA-C-GAT--C
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            acctaattgtccatta-----T----T-AG--TCT--------T-T---T--------A-T-C-A-A-TA--T---T--TT-T---AT---AG-AAAACATGC-ATTTG--C-TG-TTT--ATA-AA-TAAT
gi|25                         :                                          taA-ATT---GT-AA---TTTGG-CATTA-TTTGAtaggg
gi|26                         :                                     attttacattattacctaattgtctatttaaTTTATTTTACTGT-TT-TCTGGGAG-TTTTTGGAA-T--TTA-T-GTT--CA-A-GGTGTAATAG
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ----TA------ATT---AAA-G-GA--TT--A--A-TGGTTCA------TACT-----T----------------------T-AG----------T-C----T---A------A--T-TAG-T-----AT-----T----TAAG--TCT--------T-
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gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TT--AA------C-CA---A------AGTA--------AA-C--A-C--G---ATG-TTAA--C---GA-T-T
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Reference ( family-1829 )     :                                          TTA-ATT---GT-AA---TTTGG-CATTT-TTTGACTGT-TT-CCTGGGAGGTTTTTGGTA-T--TTA-C-GTT--CA-A-GGTGTAACAGTTT---GAC-TG-T-T--A--CC-TT-TCCGGATAAA-GAACT-G--TT--AC--ATG----CGC----A-A-CG-T--AA-----A-T-GCGCA-AAA--AATAT-CCCAT--TG-T--G----AC-GCAGGC-AAC--A-CG-TAATT--TG-AC-GT--AACT-A-AAA---T-G-TTT--AA------C-CA---A------AGTA--------AA-C--A-C--G---ATG-TCAA--C---------GA-T-TT--GA--A-CT-A-CTC-TG--TA-TT--T--G-T------TT---AA--T---TT------T-AT--TGTT--TG-AA---A----TA------ATT---AAA-G-GA--TT--A--A-TGGTTCA------T-AAT-----T----------------------T-------AG-T-C----T---AA--T-TAG-T---AT-----T----T-AG--TCTT-T---TA-T-G-A-ATA--T---T--TT-T---AT---AG-AAAATATGC-ATTTGACT-TG-TTT--ATA-AA-TAAT
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gi|12                         :       acgtattagtcatactaaattattacctaattgtctTA-ATT---GT-AA---TTTGG-CATTT-TT-GATTGT-TT-CCTGGGTGGTTTT-GGTT-T--TTA-C-GTT--CA-A-GGTGTAACAGTTT---CAC-TG-T-T--A--CC-TT-TCCGGATAAA-GAACT-G--TT--AC--ATG----CGC----A-A-CG-T--AA-----A-T-GCGC--AAA--ACCAT-CCCAT--TG-T--G----AC-GCAAGA-AAC--G-CG-TAATT--TG-AC-GT--AAGTAA-AAA---T-G-TTTAAAA------C-CA---A------AGTA--------AA-A--A-C--G---ATG-TCAA--C---------GA-A-TT--GA--A-TT-A-CTC-TG--TT-TA--T--G-T------TT---AATTT---TT------T-AT--TG-T--TG-AA---A----TA------ATT---AAA-G-TA--TT--A--A-TGGTTCA------T-AAT-----T----------------------T-------AG-T-C----T---AA--T-CAG-T---AT-----T----T-AG--TCTT-T---TA-T-A-G-ATA--T---T--TT-A---AT---AG-AAAATATGC-ATTTctgttgatgaataattaggtaat
gi|13                         :                              taattgtctataTTA-ATT---GT-AA---TATGG-GGCTT-TT-GACTGT-GT-CCTCGGAGGTTAT-GG-A-T--TTA-C-GTT--CA-A-GGTGTAACA--TT---GAC-TG-T-A--A--CC-TT-TCCGGATAAA-GA-CT-G--TT--AC--ATG----C--------A-CG-T--AA-------T-GCGCA-AAA--C-TAT-CCCAT--TG-T--G----AC-GCAAGA-AAC--G-CG-TAATT--TGAAC-GT--ACC------------G-GTA--GA------C-AA---A------AGTA--------AA----A----G---ATG-TCAA--C---------GA---TT--GATGA-TT-A-CTC-TG--TATTT--T--GTT------TT---AA--T---TT------T-AT--TATTG-TG-AA---A----TA------ATT---AAA-G-GA--TC--T--A-TGGTT-A------T-AAT-----T----------------------TA------AG-T-C----T---AAT-T-TAG-T---AT-----TAAA-T-AG--TCTT-TG--TA-T-----ATA--T---T--TT-A---AT---AG-AAAATATGC-ATTTGACT-T--CTT--ATA-CA-
gi|14                         :                                       ataTTA-ATT---GT-AA---TTTGG-CATTT-T--GACTGT-TT-TCCGGGAGGTTCG-GGTA-T--TTA-A-GTT--CA-A-AGTGTAACAGTTT---GAC-TG-T-T--A--CC-TT-TCCAGAAAAA-GAACT-G--TT--AC--ATG----CGC----A-A-CG-T--AA-----A-T-GCACA-AAA---ATAT-CCCAT--TG-T--G----AC-GCAGGC-AAC--A-TG-TAATT--TG-AC-GT--AACT-A-AAA---T-G-TTT--AA------C-CA---A------AGTA--------AA-C--A-T--G---ATG-TCAA--C---------GA-T-TA--GA--A-CT-A-CTC-TG--TA-TT--T--G-T------TT---AA--T---TTTTATAAT-AT--TG-T--TG-AA---A----TA------ATT---AAA-G-GA--TT--A--A-TGGTTCA------T-A------------------------------------------------------------------AT-----T----T-AG--TTTT-T---TA-T-GAA-ATATTT---T--TT-T---TT---AGCAAAAT---C-ATTTGACT-TG-
gi|15                         :                               taattgtctatTTA-ATT---GT-AA---TTTGT-CATTT-TT-GACTGT-TT-CCTGGGAGGTTTT-GATA-T--TTA-T-GTT--CA-A-GGTGTAACAGTTT---GAC-TG-T-T--A--CC-TT-TCCCGATAAA-GAACT-G--TT--AC--ATG----CGC----A-A-CG-T--AA-----A-T-GCGC--AAA--AATAT-CCCAT--TG-T--G----AC-GCAGCC-AAC--A-CG-TAATT--TG-AC-GT--AACT-A-AAA---T-G-TTT--AA------C-CA---A------AGTA--------AA-C--A-C--G---ATG-TCAA--CTTTTATTGTGG-T-TC--TA--A-TT-A-ATA-TT--TA-GT--C--T-T------TTATGAA--T---TT------T--T--TTTA--TA-GA---A-----A------AT-----AT-G-CA--TT--G--A-CGTTTTA------T-AA-------------------------------------A---------T---AA--T-TAG-T---A
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                           attgtctatG-TAATTC-TG-AC-GT--AAGT-A-A-----T-G-TTT--AAAA----C-CA---A-------GTA--------AA-C--A-C--G---ATG-TCAA--CTG-------GA-T-TT--GA--A-TT-A-CTC-TG--TT-TG--T--G-T------TT---AA--T---TT------T-ATAATCTC--TG-GA---CT---TA------ATTAACAAA-GTGA--TT--ACTATTGGTTTATG----T-AATG----T----------------------T-------AGAT-CAATAT---GA--TATAGTT---AT-----TCAAAT-AG--CTTT-TGTATA-T-G-ATACAATT---T--TT-T---AA---TG-AAGATAataa
gi|17                         : aactatgccatattggtgagtctcaagaaacagaatcgccaTTA-ATT---GT-AA---TTTGT-TATTT-TT--GCTGT-TT-TCTCGGAG-TTTTTGGT-------------------------------TTT---GAC-TG-T-T--A--CC-TT-TTCAGATAAA-GAATT-G--TT--AC--ATG----CAC----A-A-TA-T--AATTAAAA-T-GTGCA-AAA--G-TAT-CCCAC--TG-T--G----AC-GCAGGT-GAC--A-TG-TAATT--TG-AT-GT--GACT-A-AA---------TT--AA------T-TA---A------AACA--------AA-
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                     tattacctaattgtat-TAATT--TG-AT-GT--AATT-A-AAA---T-A-TTT--AA------C-AA---A------AGTA--------AA-CGGA-TTAG---ATG-TTAA--C---------GT-T-TT--GA--A-CT-A-CTC-TG--TA-TT--T--G-T------TT---TT--TC--TT------T-AT--TGTT---G-AA---A----TA------ATT---AAC-G-CA--TT--A--A-TGGTTCA------T-AAT-----T----------------------T-------AG--------------------A-T---A------------------CTT-T---TA-T-G-A-ATA--T---T--TTTT---AT---AG-AAAATATGC-ATTTGACT-TG-TTT--ATC-AA-TAATtttgaatatctttcacacatagtgctctatattgatggacatatttgac
gi|19                         :                                                                                                                                                                             ACT-G--TT--AC--ATG----CGC----A-A-CG-T--AA-----A-T-GCGCA-AAA---ATAT-CCCAT--TG-T--G----AC-GCAGGC-AAC--A-CG-TAATT--TG-AC-GT--AAGT-A-AAA---T-G-TTT--AA------C-CA---A------AGTA--------AA-C--A-C--G---ATG-TCAA--C---------GA-T-TT--GA--A-CT-A-CTC-TG--TA-TT--T--A-T------CT---AA--TA--TT------T-AT--TG-T--TG-AA---A----TA------ATT---AAA-G-GA--TT--A--A-TGGTTCA------T-AAT-----T----------------------T-------AG-T-C----T---AA--G-TAG-T---Ataggtaata
gi|2                          :                                            A-ATT---GT-AA---ATTTG-CATTT-TTTGACTGT-TTTCCTTGGAGGTTTTGTGTA-T--TTA-C-GTTACCA-AAGGTGTAACAGTTT---GACCTG-TCT--AAGCCATTATCCAGATAAA-GAACT-GGATT--A---ATGTAAGCGC----A-A-CG-TTAAA-----A-T-GCGCA-AAA--A-TAT-CCCAT--TG-TCGG----AC-GCAAGC-AACT-C-CG-TAATT--TG-AT-GTCAAATT-A-AAA---T-A-TTT--AA------CACAGA-A------AGTA--------AT-CGGA-TTAG---ATG-TTAA--C---------GT-T-TTT-GA--A-CT-A-CTCCTG--TA-TT--TTGG-T------TT---TT--TC--TT------T-AT--TGTT---G-AA---A----TA------ATT---AC--G-CA--TT--A--A-TGGTT------------T-----C----------------------C-------A---------T---AA--T-TAGAT---A------------------CTT-T---TAAT-G-A-ATA--T---T--TT-T---AT---AG-AAAATATGC-ATTTGACT-T--TTT--ATC-AA-TAA
gi|20                         :                                                                                                                                                                             cctaaattgtctatttaG----CGC----AGA-TGAT--TA-----A-T-GCGCA-AAA--AATAT-CCCAT--TG-T--G----AC-GCAGG--AACA-A-CA-TAATTC-TG-AC-GT--TAGT-AGAAA---T-G--TT--AA------C-CAGACG------AGTA--------AA-C--AGCA-A---ATG-TC-A--C---------GAGT-TT--GA--A-GTCA-TCT-TC--TA-TT--G--T-T------TT---AA--TTC-TT------T-AT--TG-T--TG-AA---attaaggtaat
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    -T-TT--GA--A-CT-A-CTC-TG--TA-TT--T--G-T------TT---AA--T---TT------T-AT--TG-T--TG-AA---ATACTTA------ATT---AAA-G-GA--TT--A--A-TGGTTCA------T-AAA-----T----------------------T-------AG-T-C----TTTGAA----TAC-T---AT-----T----T-AG--TCTT-T---TA-T-A-A-ATAT-T---T--TT-T---AT---AG-
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      A---A----TA------ATT---AAA-G-GA--TT--A--A-TGGTTCA------T-AAT-----T----------------------T-------CG-T-T----T-------T-TAG-C---AT-----T----T-AG--CCTT-T---TA-T-G-A-ATA--T---T--TT-T---AT---AG-AAAATATGC-ATTTGACT-TG-TTT--ATA-AA-
gi|23                         :                                            A-ATT---GG-AA---TTTGC-TATTT-TG-GACTGT-TT-CTTGGGA-GTTTTTAGTATT--TTA-C-GAT--C
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    acctaattgtccatta-----T----T-AG--TCTT-T---TA-T-C-A-ATA--T---T--TT-T---AT---AG-AAAACATGC-ATTTG--C-TG-TTT--ATA-AA-TAAT
gi|25                         :                                          taA-ATT---GT-AA---TTTGG-CATTA-TTTGAtaggg
gi|26                         :                                     attttacattattacctaattgtctatttaaTTTATTTTACTGT-TT-TCTGGGAG-TTTTTGGAA-T--TTA-T-GTT--CA-A-GGTGTAATAG
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ----TA------ATT---AAA-G-GA--TT--A--A-TGGTTCA------T-ACT-----T----------------------T-------AG-T-C----T---AA--T-TAG-T---AT-----T----TAAG--TCTT-
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gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TT--AA------C-CA---A------AGTA--------AA-C--A-C--G---ATG-TTAA--C---------GA-T-T
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