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lowQualScore                  :        .  .  ..  . . . . ........   .. ... . .  . .... .. ...... .. .. .  . ...    . .. ..  . ... . . ....... ..  .  .. ...... .. .. ... .. .   . ...  ..  .... ...  ... . .. .  .. . .. .. . .  ... . ......     . . . .  .  . ..... .. . .. .   .....  . ... . . . .   .  ................................   ....  ..  . .  ...  ..   ... .  .. .  ...   .......... . ....  . . .   .. .  . . . .. . ....  .  .    . ...  ..... . .   .  ..   ..     .   
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Reference ( gi|12 )           : AGGGTTT-AA-AC--TT-A-A-C-T--------TAA--A---T-T-TC-C----A--G------G-GG--C-CA-C---GTGG-G--C--TC-C---T-G-A-----T-A--TG-TC--A------T--T--T---C--T-GGG-A---GC--CC----A---CA---A-T--A-AA--A-C--A--T-G-CT---A-G----C-CCACA-T-C-T-AA-TG-A-----A--A-C--A-TTT-----AA-T---A-C-A-A-GTA-AT-------A--A---------------------ATA----TC--TA-A-AT---TA--TGA---G-AC--A-TG---TAT--A-------T-G-T-AAA-T-G-AAT--C-GC-A-T-T-GA-G-A--GC-AA-AAAG-T---CC---A-A-C-ACT-CT--ACA--TTTTG-TAT
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Reference ( family-18 )       :                                                                                                                  AGGGTTT-AA-AC--TT-A-A-C-T--------TAA--A---T-T-T-C-C----AG-G------AGC-C-A-C---GTGG-G--C--TC-C---T-G-A-----T-A--TG-TC--A------T--T--T---C--T-GGG-A---GC--CC----A---CA---AT--A-AA--A-C--A--T-G-CT---A-G----C-CCACA-T-C-T-AA-TG-A-----A--A-C--A-TTT-----AA-T---A-C-A-A-GTA-AT-------A--A---------------------AT-A----T-C--TA-A-AT---TAT--GA---GA-C--AT-G---TAT--A-------T----G-T-GA--A-T-G-AA-T--C-GC-A-T-T--A-A-G-G--GC-AA-AAAGT----CC--T---A--C-ACT-C-T--ACA--TTTTG-TAT
gi|1                          :                                                                                                                   GAGTTTGAA-ACGGTA-A-A-C-T--------TAA--A---TCT-T-T-C----AG-G------ATC-C-GTC---GTAG-GGACGGTC-C---T-G-A-----TTA--TGATC--AGATATGT--T--G---C--G-GGG-A---GC--CC----AA--CA---AT--A-AA--G-C--A--T-G-CTA--A-G----CTCCACA-T-C-G-AA--G-ATAGACA--A-C--A-TGTGTAAGAA-T---A-C-A-ATGTG-AT-------ACCACACGTTTAAACTGAAGCAAACAT-A----T-CTGTA-A-ATTG-TAT--GAATGAA-C--AT-------T--A-------T----A-T-GG--A-T-GAAA-T--CGGC-ATT-T--G-A-G-G--GC-AA-AAAGT----CCTTT---A--C-ACT-T-T--ACA--
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gi|15                         :                                                                                                                   GGGTTT-AA-AC--TT-A-A-C-T--------TAA--A---T-T-T-C-C----AG-G------AGC-C-A-C---GTGG-G--C--TC-C---T-G-A-----T-A--TG-TC--A------T--T--T---C--T-GG--A---GC--CC----A---CA---AT--A-AA--A-C--A--T-G-CT---A-G----C-CCACA-T-C-T-AA-TG-A-----A--A-C--A-TTT-----AA-T---A-C-A-A-GTA-AT-------A--A---------------------AT-A----T-C--TA-A-AT---TAT--GA---GA-C--AT-G---TAT--A-------T----G-T-GA--T-T-G-AA-T--C-GC-A-TAT--G-A-G-G--AC-AA-AAAGT----CC--C---T--C-ACT-C-T--ACA---TTTG-TAg
gi|16                         :                                                                                                                       TT-AA-AC--TT-A-A-C-T--------TAA--AC--T-T-T-C-C----AG-G------AGC-C-A-C---GGTG-G--C---C-C---T-G-A-----T----TG-TC--AT-----T--T--T---C--T-AAG-A---GC--CC--------CA---ATA-A-AA--A-C--A--T-G-CT---A-G----C-CCACA-T-G-T-AA-TG-A-----A--A-C--A-TTT-----AC-T---AGC-A-A-GTA-AT----------A---------------------AT-A----T-C---A-A-AT---TAT--GA---GA-C--AT-G---TAT--A-------T----G---GA--A-T-G-AA-TG-C-GC-A-T-T--A-A---G--AC-AA-AAAGT----CC------A--C-ACT-C-T--ACA--GTTTGATAT
gi|17                         :                                                                                                                    GGTTT-AA-AC--TT-A-A-C-T--------AAA--A---T-T-C-C-C----AG-G------AGC-C-A-C---GTGG-G--C--TC-C---T-G-A-----T-A--TGTTC--A------T--T--T---C--T-GGG-A---G---CC----A---C----AT--A-AA--A-C-----T-G-CT---A-G-------CACA-T-C-T-GA-T--------A--A-C--A-TTT-----AA-T---A-C---A-GTA-AT-------A--G---------------------AT-A----T-C--TA-A-TTA--TAT--GA---GA-C--AT-G---TAT----------C----G-TGGA--A-T-G--A-T--C-GC-A-T-T--A-C-G-G--GC--A-AAAGT----CC--C---A--C--CT-C-T--ACA--TTTTG-TATg
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    T--AA---GA-C--AT-G---TAT--A-------T------T-AA--A-T-G-AA-T--C-GC-A-T-T--A-A-G-G--GC-AA-AAAG-----CC--T---A--C-ACT-A-A--ACA--TTTTG-
gi|19                         : agccacacagggtccaatatcttttctactgctcgtccaatactatgtaaacttgcagataatcctaagggtggtcgactactaacaccgacacaattagcatgcccgaaacgcGGGTTT-AA-AC--TT-A-A-C-T---------AA--A---T-T-T-C-C----AG-G------GGC-C-A-C---GTGG-G--C--TC-C---T-G-A-----T-AT-TG-TC--A------T--T--T---C--T------------------------A---TT--G-AA--A-C--A--T-----------------------T-C---AA-T-----------A-C--A--GT-----AA-T------------------------A--A---------------------AT-A----T-C--TA-A-AT---TAT--GA---GA-C--AT-T---TAC--A-------T----GTT-GA--A-T-G-AG-T--C-GC-A-T-T--A-A-G-G--GC-AA-AAAGT----TC--T---AACC-ACT-C-T--ACA--TTTTG-atg
gi|2                          :                                                                                                                   GGGTTT-AA-AC--TT-A---C-T--------TAA--AC--T-T-T-C-C----AG-TT-----AGC-C-A-C---GTGG-G--C--TC-C---T-G-A-----TTA--TG-TC--ACTTCGCT--T--T---C--T-GGGGA---GC--TCCCTCA---CATTTAT--A-AA--AGC--A--TTG-CTTTTA-GGCACC-CTACA-T-CAT-AA-TT-A-----A--A-C--A-TTT-----AAAT---A-CCA-A-GTA-AT-------A--T---------------------AT-AC---T-C--TA-A-ATGG-TAT--GA---GA-C--AT-G---T-T--A-------T----G-C-GA--A---G-AA-T--C-GC-A-T-T--A-A-G-G---C-AA-AAAGT----CC--T---A--C-ACT-C-T--ACATGTTTTG-tta
gi|20                         :                                                                                                                  AGGGTTT-AA-AC--TT-A-A-C-T--------TAA--A---T-T-T-C-C----AG-G------AGC-C-A-C---GTGG-G--C--TC-C---T-G-A-----T-A--TG-TC--A------C--T--T---C--T-GGG-A---GC--CC----A---CA---AT--A-AA--A-C--A--T-G-CT---A-G----C-CC-------------------------A-C--A-TTT-----AA-T---A-C-A-A-GTA-AT-------A--A---------------------AC-T----T-C--CA-A-AT---TAT--GA---GA-C--AT-G---TAT--A-------T----G-T-GA--A-T-
gi|21                         :                                                                                                                    GGTTT-AA-AC--GT-A--------------TAG--A---A-T-T-C-T----ACCGTTTATTAGC-CCA-T---GTGG-G--C--TC-C---T-G-G-------A--TT-TT--G------TTGT--T---C--T-GAA-A---GC--CC----A---C----CT--A-AA-------A--T-G--T---A-G----C-CCAC----C-T-AC-TC-A-----A--A--------T-----AA-T---G-T-G-A-ATA-AC-------A--C---------------------AT-A----
gi|22                         :                                                                                                               gtaAGGGTTT-CA-AC--TT-A-A-C-T--------TAA--A---T-T-T-C-C----AG-G------AGC-C-A-T---TTGG-G--C--TC-C---T-G-A-----T-A--TG-TC--A------T--T--T---C--T-GGG-A---GC--CC----A---CA---AT--A-AA--A-C--A--T-G-AT---A-G----C-CCACA-T-C-T-AA-TG-A-----A--A-C--A-TTT-----GA-T---A-C-A-A-GTA-AT-------
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   AT--GA---GA-C--AT-G---TAC--AATTGGCAT----G-T-GA--A-T-G-AA-T--C-AC-A-T-T--A-A-GTG--GCAAA-AAAGT----CC--TTAAA--C-TCT-C-T--ACA--ATTTG-TAT
gi|24                         :                                                                                                                  AGAGTTT-AA-A----T-A-A-C-TATGAACTTTAATAA---T-T-T-C-C----AG-G------AGCGC-A-C---GTGGCG--C--TCTC---TCG-A-------AGTTG-TC--A------T--T--T---C--T-GGG-g
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          -A-AT---TAT--GA---GA-C--AT-G---TAT--A-------T----G-T-GA--T-T-G-AA-T--C-GC-A---T--G-A-G-G--AC-AA-AAAGT----CC--T---C--A-ACT-C-T--ATA--TTTTG-TAT
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           t--A-------T----G-T-AA--A-T-G-GG-T--C-GC-T-T-T--A-G-G-G--GT-GA-AAAAT----CC--C---A--C-ACT-C-T--ATT--TTTTG-TATg
gi|28                         :                                                                                                                  AGGGTTT-AA-AC--TG-A-A-T-T--------AAA--A---T-T-T-G-C----AG-A------AGC-C-A-T---GTTG-G--C--TC-C---T-G-A-----T-A--gc
gi|3                          :                                                                                                                   GGGTTT-AACGC--TTTA-A-C-T--------TAA--T---T-T-T-CAC----AG-G------AGA-C-A-CACAGTGG-G--CC-TC-C---T-G-A-----T-A--TG-TCCGA------T--TTCT---C--T-GGG-A---GCA-CC----A----A---AT--A-AA--A-TCAA--T-G-CTA--A-G----TGCCAT--T-C-T-AA-TG-A-----A--A-CTTA-TTA-----AA-T---T-C-A-C-GAA-AC-------C--G---------------------ATAA----TAC--TA-A-AT---TA---GA---GA-C--AT-T---TA---A-------T----G-T-TACTA-T-T-AATT--T-GC-A-TAT--A-A-C-G--GG-GA-ATTGTATTGTT--T---G--C-TCT-CTT--ACA--TTTT--TATag
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gi|4                          :                                                                                                                   GGGTTT-AA-ACC-TT-A-A------------TAA--A---T-T-T-T-CCCCTAG-G------AGC-C-A-C---GTGG-G--G--TC-C---T-G-A-----T-A--TG-TC--A------TCCT--T---CTTT-GGG-A---GCCACC----ACACCA---ATAAA-AA--A-C--A--T-GCCT---A-G----CACCACA-T-C-T-AA-TG-A-----A--A-C--A-TTT-----TA-T---A-C-ATA-GTATAT-------A--A---------------------AT-A----T-C--TT-A-AT---TAT--GA---GA-CATAT-G---TATTCA-------T----G-T-GA--A-A-T-AA-T--C-GC-A-T-T--AGA-G-G--GC-AA-AAAGT----CC--C---A--C-ACTGC-T--ACA--TTTTG-TAT
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gi|6                          :                                                                                                                  AGGGTTT-AATAC--TT-A-A-C-T--------TAA--A---T-T-TTC-C----AG-G-------GC-C-A-C---GTGGCG--C--TT-CCACT-G-A-----TTA--TG-TC---------T--T--T---C--C-TGG-A---GCG-CC----A---CA---AT--A-AATGA-C--A--T-G-CT---A-G----C-CCACA-TTC-T-AAATG-A-----A--AGC--A-TAT-----AA-T---A-C-A-A-GTA-AT-------A--A---------------------AT-A----T-C--TA-AGAT---TAT--AA---GAAC--ATTG---TAT--A-------TTCCTG-T-GA----T-G-AA-T--C-GC-A-T-T--A-A-G-G--GC-AA-AAAGT----CC--T---A----ACT-C-TGAACA--TTTTG-TAT
gi|7                          :                                                                                                                      TTT-AA-AC--TT-A-A-C-T--------TAA--------T-T-C-C----AG-G------AGC-C-A-C---GTGG----C--TC-C---T-G-A-----T-A--TG-TC--A------T--T--T---C--T-G-------AC--CC----A---CA---AT--AGAA--A-C--AGTT-G-CT---AGG----C-CCACA-T-C-T-AA-TG-A-----A--A-CA-A-TAT-----GA-T---A-C-A-A-GTATATTTTTAAAA--A---------------------AT-T----C-C--TA-A-AT---TAT--AA---GA-C--AT-GAT-CAT--A-------TA---G-TGGA--A-TGG-AA-T--C-GCGA-T-T--A-AGG-G--GC-AA-AAAGTTTC-CT--T---A--C-ACT-A-GA-ACA--TTTTG-TAg
gi|8                          :                                                                                                                  tGGGTTT-AA-AC--TT-A-C-T-C--------TAAG-A---T-TAT-C-T----CA-T------AGC-CGA-C---GT-G-G--C--T--C---T-GCAC----T-A--TG-TC--A------C--T---------C-GGG-ATGCAC--CT----A---CA---AT----AA--A-C--A----G-C----A-G------CCAGA-T-C-T-AA-TG-A-----ACGA-CA-A-TTT-----AA-T---A-CAA-A-GT--AT-------AT-A---------------------AT-A----T-C--TA-A-ATTAATAT--GA---GA-C--AT-GT--TAA--A-------T----G-T-GA--A-T-G-CA-CTGC-GC-A-T-TTGA-A-T-T--GC-AATAAAGT----CC--T---A--CTACA-T-A--ACA--TTTTG-TATat
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Reference ( family-18 )       :                                                                                                                  AGGGTTT-AA-AC--TT-A-A-C-T--------TAA--A---T-T-T-C-C----AG-G------AGC-C-A-C---GTGG-G--C--TC-C---T-G-A-----T-A--TG-TC--A------T--T--T---C--T-GGG-A---GC--CC----A---CA---AT--A-AA--A-C--A--T-G-CT---A-G----C-CCACA-T-C-T-AA-TG-A-----A--A-C--A-TTT-----AA-T---A-C-A-A-GTA-AT-------A--A---------------------AT-A----T-C--TA-A-AT---TAT--GA---GA-C--AT-G---TAT--A-------T----G-T-GA--A-T-G-AA-T--C-GC-A-T-T--A-A-G-G--GC-AA-AAAGT----CC--T---A--C-ACT-C-T--ACA--TTTTG-TAT
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gi|17                         :                                                                                                                    GGTTT-AA-AC--TT-A-A-C-T--------AAA--A---T-T-C-C-C----AG-G------AGC-C-A-C---GTGG-G--C--TC-C---T-G-A-----T-A--TGTTC--A------T--T--T---C--T-GGG-A---G---CC----A---C----AT--A-AA--A-C-----T-G-CT---A-G-------CACA-T-C-T-GA-T--------A--A-C--A-TTT-----AA-T---A-C---A-GTA-AT-------A--G---------------------AT-A----T-C--TA-A-TTA--TAT--GA---GA-C--AT-G---TAT----------C----G-TGGA--A-T-G--A-T--C-GC-A-T-T--A-C-G-G--GC--A-AAAGT----CC--C---A--C--CT-C-T--ACA--TTTTG-TATg
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    T--AA---GA-C--AT-G---TAT--A-------T------T-AA--A-T-G-AA-T--C-GC-A-T-T--A-A-G-G--GC-AA-AAAG-----CC--T---A--C-ACT-A-A--ACA--TTTTG-
gi|19                         : agccacacagggtccaatatcttttctactgctcgtccaatactatgtaaacttgcagataatcctaagggtggtcgactactaacaccgacacaattagcatgcccgaaacgcGGGTTT-AA-AC--TT-A-A-C-T---------AA--A---T-T-T-C-C----AG-G------GGC-C-A-C---GTGG-G--C--TC-C---T-G-A-----T-AT-TG-TC--A------T--T--T---C--T------------------------A---TT--G-AA--A-C--A--T-----------------------T-C---AA-T-----------A-C--A--GT-----AA-T------------------------A--A---------------------AT-A----T-C--TA-A-AT---TAT--GA---GA-C--AT-T---TAC--A-------T----GTT-GA--A-T-G-AG-T--C-GC-A-T-T--A-A-G-G--GC-AA-AAAGT----TC--T---AACC-ACT-C-T--ACA--TTTTG-atg
gi|2                          :                                                                                                                   GGGTTT-AA-AC--TT-A---C-T--------TAA--AC--T-T-T-C-C----AG-TT-----AGC-C-A-C---GTGG-G--C--TC-C---T-G-A-----TTA--TG-TC--ACTTCGCT--T--T---C--T-GGGGA---GC--TCCCTCA---CATTTAT--A-AA--AGC--A--TTG-CTTTTA-GGCACC-CTACA-T-CAT-AA-TT-A-----A--A-C--A-TTT-----AAAT---A-CCA-A-GTA-AT-------A--T---------------------AT-AC---T-C--TA-A-ATGG-TAT--GA---GA-C--AT-G---T-T--A-------T----G-C-GA--A---G-AA-T--C-GC-A-T-T--A-A-G-G---C-AA-AAAGT----CC--T---A--C-ACT-C-T--ACATGTTTTG-tta
gi|20                         :                                                                                                                  AGGGTTT-AA-AC--TT-A-A-C-T--------TAA--A---T-T-T-C-C----AG-G------AGC-C-A-C---GTGG-G--C--TC-C---T-G-A-----T-A--TG-TC--A------C--T--T---C--T-GGG-A---GC--CC----A---CA---AT--A-AA--A-C--A--T-G-CT---A-G----C-CC-------------------------A-C--A-TTT-----AA-T---A-C-A-A-GTA-AT-------A--A---------------------AC-T----T-C--CA-A-AT---TAT--GA---GA-C--AT-G---TAT--A-------T----G-T-GA--A-T-
gi|21                         :                                                                                                                    GGTTT-AA-AC--GT-A--------------TAG--A---A-T-T-C-T----ACCGTTTATTAGC-CCA-T---GTGG-G--C--TC-C---T-G-G-------A--TT-TT--G------TTGT--T---C--T-GAA-A---GC--CC----A---C----CT--A-AA-------A--T-G--T---A-G----C-CCAC----C-T-AC-TC-A-----A--A--------T-----AA-T---G-T-G-A-ATA-AC-------A--C---------------------AT-A----
gi|22                         :                                                                                                               gtaAGGGTTT-CA-AC--TT-A-A-C-T--------TAA--A---T-T-T-C-C----AG-G------AGC-C-A-T---TTGG-G--C--TC-C---T-G-A-----T-A--TG-TC--A------T--T--T---C--T-GGG-A---GC--CC----A---CA---AT--A-AA--A-C--A--T-G-AT---A-G----C-CCACA-T-C-T-AA-TG-A-----A--A-C--A-TTT-----GA-T---A-C-A-A-GTA-AT-------
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   AT--GA---GA-C--AT-G---TAC--AATTGGCAT----G-T-GA--A-T-G-AA-T--C-AC-A-T-T--A-A-GTG--GCAAA-AAAGT----CC--TTAAA--C-TCT-C-T--ACA--ATTTG-TAT
gi|24                         :                                                                                                                  AGAGTTT-AA-A----T-A-A-C-TATGAACTTTAATAA---T-T-T-C-C----AG-G------AGCGC-A-C---GTGGCG--C--TCTC---TCG-A-------AGTTG-TC--A------T--T--T---C--T-GGG-g
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          -A-AT---TAT--GA---GA-C--AT-G---TAT--A-------T----G-T-GA--T-T-G-AA-T--C-GC-A---T--G-A-G-G--AC-AA-AAAGT----CC--T---C--A-ACT-C-T--ATA--TTTTG-TAT
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           t--A-------T----G-T-AA--A-T-G-GG-T--C-GC-T-T-T--A-G-G-G--GT-GA-AAAAT----CC--C---A--C-ACT-C-T--ATT--TTTTG-TATg
gi|28                         :                                                                                                                  AGGGTTT-AA-AC--TG-A-A-T-T--------AAA--A---T-T-T-G-C----AG-A------AGC-C-A-T---GTTG-G--C--TC-C---T-G-A-----T-A--gc
gi|3                          :                                                                                                                   GGGTTT-AACGC--TTTA-A-C-T--------TAA--T---T-T-T-CAC----AG-G------AGA-C-A-CACAGTGG-G--CC-TC-C---T-G-A-----T-A--TG-TCCGA------T--TTCT---C--T-GGG-A---GCA-CC----A----A---AT--A-AA--A-TCAA--T-G-CTA--A-G----TGCCAT--T-C-T-AA-TG-A-----A--A-CTTA-TTA-----AA-T---T-C-A-C-GAA-AC-------C--G---------------------ATAA----TAC--TA-A-AT---TA---GA---GA-C--AT-T---TA---A-------T----G-T-TACTA-T-T-AATT--T-GC-A-TAT--A-A-C-G--GG-GA-ATTGTATTGTT--T---G--C-TCT-CTT--ACA--TTTT--TATag
gi|30                         :                                                                                                                           A-AC--TT-A-A-C-T--------AAA--A---T-T---C-C----AG-G------AGC-C-A-C---GTGG-G--C---C-C---T-G-AT----T-A--TG-Tgc
gi|4                          :                                                                                                                   GGGTTT-AA-ACC-TT-A-A------------TAA--A---T-T-T-T-CCCCTAG-G------AGC-C-A-C---GTGG-G--G--TC-C---T-G-A-----T-A--TG-TC--A------TCCT--T---CTTT-GGG-A---GCCACC----ACACCA---ATAAA-AA--A-C--A--T-GCCT---A-G----CACCACA-T-C-T-AA-TG-A-----A--A-C--A-TTT-----TA-T---A-C-ATA-GTATAT-------A--A---------------------AT-A----T-C--TT-A-AT---TAT--GA---GA-CATAT-G---TATTCA-------T----G-T-GA--A-A-T-AA-T--C-GC-A-T-T--AGA-G-G--GC-AA-AAAGT----CC--C---A--C-ACTGC-T--ACA--TTTTG-TAT
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gi|6                          :                                                                                                                  AGGGTTT-AATAC--TT-A-A-C-T--------TAA--A---T-T-TTC-C----AG-G-------GC-C-A-C---GTGGCG--C--TT-CCACT-G-A-----TTA--TG-TC---------T--T--T---C--C-TGG-A---GCG-CC----A---CA---AT--A-AATGA-C--A--T-G-CT---A-G----C-CCACA-TTC-T-AAATG-A-----A--AGC--A-TAT-----AA-T---A-C-A-A-GTA-AT-------A--A---------------------AT-A----T-C--TA-AGAT---TAT--AA---GAAC--ATTG---TAT--A-------TTCCTG-T-GA----T-G-AA-T--C-GC-A-T-T--A-A-G-G--GC-AA-AAAGT----CC--T---A----ACT-C-TGAACA--TTTTG-TAT
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gi|8                          :                                                                                                                  tGGGTTT-AA-AC--TT-A-C-T-C--------TAAG-A---T-TAT-C-T----CA-T------AGC-CGA-C---GT-G-G--C--T--C---T-GCAC----T-A--TG-TC--A------C--T---------C-GGG-ATGCAC--CT----A---CA---AT----AA--A-C--A----G-C----A-G------CCAGA-T-C-T-AA-TG-A-----ACGA-CA-A-TTT-----AA-T---A-CAA-A-GT--AT-------AT-A---------------------AT-A----T-C--TA-A-ATTAATAT--GA---GA-C--AT-GT--TAA--A-------T----G-T-GA--A-T-G-CA-CTGC-GC-A-T-TTGA-A-T-T--GC-AATAAAGT----CC--T---A--CTACA-T-A--ACA--TTTTG-TATat
gi|9                          :                                                                                                                    GGTTT-AA-AC--TT-ATA-CCT--------TAA--AAGTT-C-T-C-C----AG-G------A-C-C-A-C---GTGG-GA-C--TC-C---T-G-GAAAATT-A--TG-TC--A------C--T--TATTC--TCGGG-A---GC--CC----A---CA---AT--A-AA--A-C--A--T-G-CTTA-A-GA---C-CCACA-TAG-T-AA-TG-A-----A--A-C--A-TTT-----AA-TGGAG-C-A-ATGTACAT-------A--A---------------------CT-ACTAGT-C--TAGA-AT---TAT--GA---GA-C--AT-GTTATAC--A-------T----G-T-GA--ATT-G-AA-T--C-GC-A-T-T--A-A-G-GTTGC-AA-TAAGT----g


blockSeqs                     :                                                                                                                         .  C  C   C T A C ATGAACTT   TA AGT . A T A CCCT  C TTTATT   G C . ACA    C A  C   T CAC C C AAAATT  GT  T  CG CTTCGC TG TC ATT TT C   G TGC  CA  CCTC CAC  TTT  AA G  TG G CA GT T C  TTT G GCACC      C T A C  A  C .     CG G TT C   .      A GGA G C T T   T  TTTTAAAAA                         A CTAG A .   G G  TAA   TC  .    A AT  T TTA   AATTGGCA   TCCT T G  CT T A .  T TG .  G . A TG G G T TT  A  T     ATTG  TTAA   AC T   G T GA   TG     A
blockSeqs                     :                                                                                                                         .  T  .   T . . . .          G  AA  . . . . .     . T        . G . C      C .  .   G .   . . GT      T   .  .  GT     CC .  .   .  .   . .    A   .    A    .    A  .  .  . .  .  . .  TA  . TG         . A . .  .  . .     .  . A  .   .      . .   . A . .   T  ATA                               . C    . .   . .  GG    .   .    . .   . AT    ACACT      A    . G  .  . G .  . G  .  . . A .  . . . .   .  .     TTC   GT     .  .   . . A    CT     .
blockSeqs                     :                                                                                                                         .  .  .   . . . . .          .  C   . . . . .     . .        . . . .      . .  .   . .   . . TT      A   .  .  T      .  .  .   .  .   . .    G   .    .    .    T  .  .  . .  .  . .  A   . CA         . . . .  .  . .     .  . A  .   .      . .   . . . .   C  AA                                . .    . .   . .  A     .   .    . .   . T     ACA        .    . .  .  . . .  . .  .  . . . .  . . . .   .  .     .     T      .  .   . . .    .      .
blockSeqs                     :                                                                                                                         .  .  .   . . . . .          .  C   . . . . .     . .        . . . .      . .  .   . .   . . TT      .   .  .  .      .  .  .   .  .   . .    .   .    .    .    .  .  .  . .  .  . .  C   . AC         . . . .  .  . .     .  . .  .   .      . .   . . . .   .  AA                                . .    . .   . .  .     .   .    . .   . .     ACA        .    . .  .  . . .  . .  .  . . . .  . . . .   .  .     .     T      .  .   . . .    .      .
blockSeqs                     :                                                                                                                         .  .  .   . . . . .          .  .   . . . . .     . .        . . . .      . .  .   . .   . . TT      .   .  .  .      .  .  .   .  .   . .    .   .    .    .    .  .  .  . .  .  . .  .   . C          . . . .  .  . .     .  . .  .   .      . .   . . . .   .  AA                                . .    . .   . .  .     .   .    . .   . .     ACA        .    . .  .  . . .  . .  .  . . . .  . . . .   .  .     .     A      .  .   . . .    .      .
blockSeqs                     :                                                                                                                         .  .  .   . . . . .          .  .   . . . . .     . .        . . . .      . .  .   . .   . . CT      .   .  .  .      .  .  .   .  .   . .    .   .    .    .    .  .  .  . .  .  . .  .   . C          . . . .  .  . .     .  . .  .   .      . .   . . . .   .  AA                                . .    . .   . .  .     .   .    . .   . .     TCA        .    . .  .  . . .  . .  .  . . . .  . . . .   .  .     .     T      .  .   . . .    .      .
blockSeqs                     :                                                                                                                         .  .  .   . . . . .          .  .   . . . . .     . .        . . . .      . .  .   . .   . . T       .   .  .  .      .  .  .   .  .   . .    .   .    .    .    .  .  .  . .  .  . .  .   . C          . . . .  .  . .     .  . .  .   .      . .   . . . .   .  AA                                . .    . .   . .  .     .   .    . .   . .     A          .    . .  .  . . .  . .  .  . . . .  . . . .   .  .     .     T      .  .   . . .    .      .
blockSeqs                     :                                                                                                                         .  .  .   . . . . .          .  .   . . . . .     . .        . . . .      . .  .   . .   . . T       .   .  .  .      .  .  .   .  .   . .    .   .    .    .    .  .  .  . .  .  . .  .   . C          . . . .  .  . .     .  . .  .   .      . .   . . . .   .  AA                                . .    . .   . .  .     .   .    . .   . .     A          .    . .  .  . . .  . .  .  . . . .  . . . .   .  .     .     C      .  .   . . .    .      .
blockSeqs                     :                                                                                                                         .  .  .   . . . . .          .  .   . . . . .     . .        . . . .      . .  .   . .   . . T       .   .  .  .      .  .  .   .  .   . .    .   .    .    .    .  .  .  . .  .  . .  .   . C          . . . .  .  . .     .  . .  .   .      . .   . . . .   .  AG                                . .    . .   . .  .     .   .    . .   . .     A          .    . .  .  . . .  . .  .  . . . .  . . . .   .  .     .     C      .  .   . . .    .      .
blockSeqs                     :                                                                                                                         .  .  .   . . . . .          .  .   . . . . .     . .        . . . .      . .  .   . .   . . T       .   .  .  .      .  .  .   .  .   . .    .   .    .    .    .  .  .  . .  .  . .  .   . C          . . . .  .  . .     .  . .  .   .      . .   . . . .   .  AA                                . .    . .   . .  .     .   .    . .   . .     A          .    . .  .  . . .  . .  .  . . . .  . . . .   .  .     .     T      .  .   . . .    .      .
blockSeqs                     :                                                                                                                         .  .  .   . . . . .          .  .   . . . . .     . .        . . . .      . .  .   . .   . . T       .   .  .  .      .  .  .   .  .   . .    .   .    .    .    .  .  .  . .  .  . .  .   . C          . . . .  .  . .     .  . .  .   .      . .   . . . .   .  AT                                . .    . .   . .  .     .   .    . .   . .     A          .    . .  .  . . .  . .  .  . . . .  . . . .   .  .     .     T      .  .   . . .    .      .
blockSeqs                     :                                                                                                                         .  .  .   . . . . .          .  .   . . . . .     . .        . . . .      . .  .   . .   . . T       .   .  .  .      .  .  .   .  .   . .    .   .    .    .    .  .  .  . .  .  . .  .   . C          . . . .  .  . .     .  . .  .   .      . .   . . . .   .  AA                                . .    . .   . .  .     .   .    . .   . .     A          .    . .  .  . . .  . .  .  . . . .  . . . .   .  .     .     T      .  .   . . .    .      .
blockSeqs                     :                                                                                                                         .  .  .   . . . . .          .  .   . . . . .     . .        . . . .      . .  .   . .   . . T       .   .  .  .      .  .  .   .  .   . .    .   .    .    .    .  .  .  . .  .  . .  .   . C          . . . .  .  . .     .  . .  .   .      . .   . . . .   .  AC                                . .    . .   . .  .     .   .    . .   . .     A          .    . .  .  . . .  . .  .  . . . .  . . . .   .  .     .     T      .  .   . . .    .      .
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blockSeqs                     :                                                                                                                         .  .  .   . . . . .          .  .   . . . . .     . .        . . . .      . .  .   . .   . . T       .   .  .  .      .  .  .   .  .   . .    .   .    .    .    .  .  .  . .  .  . .  .   . .          . . . .  .  . .     .  . .  .   .      . .   . . . .   .  AA                                . .    . .   . .  .     .   .    . .   . .     A          .    . .  .  . . .  . .  .  . . . .  . . . .   .  .     .     C      .  .   . . .    .      .
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