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Reference ( gi|1 ) : TAAGTCGCCCCAAACGGAGTTTTGGCGACTTATTG--------GTTTTTGTACAGTTTTAAAATTCTTCCAACTTT-TGGA--AGATTTTGTCCGCT-CGAT-TACGGAGAATCGCCTCGACCGA--TCG-AGATGAAACTTTCTGAGTGGATAGAGGGTGGC-TCGAAGGGGTGCATTCAACTTTTGAAAT-TAATGG-GTT-C-AGCCC---CGAGGGTGCT-C-TGGGG-GTCACTAAGT--GCAAAA---T--AC-------A---AA-C-TTGACC----A-AAGGGCATCG-TGT-GA-TATA------TCAAATTGAAGGTCT-CCA-CG-AG--TAGAGTTC-A-AT-CT-----GG-GG-TGT----CC----CA-T-G--GTCATTAAG-TGCATAGTGTT-C-AGCCC---CTGGG-GTG-T-T-C-T--A--G-G---TC--ATTAAG-T--GC----------------TAAA-T------A--A-A----------G------------A-------------G-GTA---------------T-CG-TGAG-AC-A------TA-TCAAATT-GAACGTCTC-C-ACG-A----G--TA-AG-GT-TC-------AA--CCTTGG--------T-----GGG-GG---G---G---G----GGGTGT---CATTAA----G-TGC------CAA--AAAATGG----CCGAAATTGATGGGT-----TC-AGCCC---CGGGG-GTG-TT-CTGG-GG-GTCATTA-GGTGC-----A------------A---------A------------A-----A-------A-------T----TG-A---------CC-CAAAG-GTAT-CATGT-G------A-TATA-TCAAATT-GAAGGTCT-C-CACG-AG--TAGAG-ATC-AG--CCT-----AG-GG-TGT-T---CC-----A--AGGTCATTCGG-TG------GACAG-AGTTC-AGCCCCG--GGGGGTG-TTAT--A-G-G-TCATT-A----G-TGCAA---AATTTAAA----A---AAAATTGACT--AAAGGGTATCGTG-T-GA-C-A------T-A-TC-AAATTGAAGGTCTTGACGAG--TAGAGT-TCAGC----CC-G-GGG-GTG-TTACGG-G--GTC--ATTAAG----TG-C-----AATTTG-TTTTT--AGAA-A-TT------GAAC--T---AAGGGTATCGTGTGAC-ATA---G---CAAACTGAAAGTC-TG-GACGAGG--AGAGTTC-AGCCCCCCCGGG---------GGGGG----G---G----GGGGATTTGGGCGACTTGTGTGTTGGCATCCCAACACAATTATCACTAGTTA----TCAATTTGTATTTTATATTTTCTG
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gi|11 : gagtcttagcgacttattgtggattgtgtttttcagttttaaattctttccaactttgtggatgagaattttccgcgacgatatacggacaAAGGTCTT-G-ACG-A----G--TA-GA-GT-TC-------AG--CC-CGG--------C-----CGG-GG---G---T---GTTATGGG-GT---CATTAG----G-TGC-----------AAAATGtctatgtc
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gi|6 : atcttctaactgattgacattggacaagtagagttacgggcccgggggtttcatgagggtcataatttggcaaaatataaatttcaccgcaagtgcatcgatgtgaatatcaaattgaaggtctcgaacgagtagagttcagtctggtgtgtgtctaaggagtcattaattggcagttctgcagcgggatgtatctgccctttaatgcccgccaccgccccagtcG-GTAT-CTTTTTG------A-TATA-TCAAATT-AAAGATCT-T-GACG-AT--T------TC-AGA-CCG-----GG-GG-TGT-T---AC-----G--GGGTTATTAAG-TG------AAgttata
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Reference ( family-1796 ) : TAAGTCGCCCCAAACGGAGTCTTGGCGACTTATTG-T---TTNTGTT---CAGTTTTAAAATTCTTCCAACTTT-TGGATGAGAATTTGTCCGC-ACGAT-TACGGAGAAACGCCTCGACCGAAATCG-AGACGAAACTTTCTGAGTGGATAGAGGGTGGC-TCGAAGGGGTGCATTCAACTTTTGAAAT-TGATGGGTTCAGCCCCGGGGGTGCT-CTGGGG-GTCATTAAGTGCAAAATACA-AA-C-TTGACCGAAGGGCATCGTGTGA-TATATCAAATTGAAGGTCCCCACG-AG--TAGAGTTCAACCT-GGGGTGTCCCGG--GGTCATTAAG-TGCACAGNGTTC-AGCCCCGGGG-GTG-TTCTAG-GTCATTAAG-TGCTAAA-TAAAGA-------------GGTA---------------TCGTGTG-ACATA-TCAAATTGAACGTCTCCACGAGTAGAGT-TCAACC--GGGGGGGGGGGGGGNGTCATTGAG----TG-C-------AA---AAAATG-GCCG---------------------AAATTG----------ATGAGT-----T-CAGCC-CCGG----GGGTGTTAC--G-GGGTCATTAAGT--GC-----AA---AA----AATTG-A---------CCG-AAGG-GTAT-CN-TGTGATATATCAAATT-GAAGGTCTCGAACGAGTAGAGTTC-AG--CCCGG-GGTGT-T---CC--G-----GGGTCATTAAGTG-----GACAGAGTTC-AGCCCCGGGGNGTG--------TTA-----CG----------GG---TCATT-A--G-TGCAAAA-T-TAAAAAAAGNTNACT-AAAGGGTA-TCNTGTTGAC-ATA-TCAAA-TTGAAGGTCTC-------G-A----C--GAGTAGAGTTC-AG--CCCGG----GGGTGTTACG--------GGGTC--ATTAA-GTGCAA---ATTG-----T---T-----AAAAA-TT--G-AACGAA-GGGTA-TCGTG-TG-A-CATA------TC-AAACTGAA-GG-TC-TGGACGAG-GAGAGTTCA-G----C-CCGG---------GGGGG-----GGGT---GGGGATTTGGGCGACTTGTGTGTTGGCATCCCAACACAATTATCACTAGTT-ATC--TT--CATTTTATGTTCTCTTTT
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Reference ( family-1796 ) : TAAGTCGCCCCAAACGGAGTCTTGGCGACTTATTG-T---TTNTGTT---CAGTTTTAAAATTCTTCCAACTTT-TGGATGAGAATTTGTCCGC-ACGAT-TACGGAGAAACGCCTCGACCGAAATCG-AGACGAAACTTTCTGAGTGGATAGAGGGTGGC-TCGAAGGGGTGCATTCAACTTTTGAAAT-TGATGGGTTCAGCCCCGGGGGTGCT-CTGGGG-GTCATTAAGTGCAAAATACA-AA-C-TTGACCGAAGGGCATCGTGTGA-TATATCAAATTGAAGGTCCCCACG-AG--TAGAGTTCAACCT-GGGGTGTCCCGG--GGTCATTAAG-TGCACAGNGTTC-AGCCCCGGGG-GTG-TTCTAG-GTCATTAAG-TGCTAAA-TAAAGA-------------GGTA---------------TCGTGTG-ACATA-TCAAATTGAACGTCTCCACGAGTAGAGT-TCAACC--GGGGGGGGGGGGGGNGTCATTGAG----TG-C-------AA---AAAATG-GCCG---------------------AAATTG----------ATGAGT-----T-CAGCC-CCGG----GGGTGTTAC--G-GGGTCATTAAGT--GC-----AA---AA----AATTG-A---------CCG-AAGG-GTAT-CN-TGTGATATATCAAATT-GAAGGTCTCGAACGAGTAGAGTTC-AG--CCCGG-GGTGT-T---CC--G-----GGGTCATTAAGTG-----GACAGAGTTC-AGCCCCGGGGNGTG--------TTA-----CG----------GG---TCATT-A--G-TGCAAAA-T-TAAAAAAAGNTNACT-AAAGGGTA-TCNTGTTGAC-ATA-TCAAA-TTGAAGGTCTC-------G-A----C--GAGTAGAGTTC-AG--CCCGG----GGGTGTTACG--------GGGTC--ATTAA-GTGCAA-----ANT-T----A-------AAAA-TT--G-AACGAA-GGGTA-TCGTG-TG-A-CATA------TC-AAACTGAA-GG-TC-TGGACGAG-GAGAGTTCA-G----C-CCGG---------GGGGG-----GGGT---GGGGATTTGGGCGACTTGTGTGTTGGCATCCCAACACAATTATCACTAGTT-ATC--TT--CATTTTATGTTCTCTTTT
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1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|10 ): GATTTTGTACATTTTCAGACCAGGAATGTTATTATCAAGTTTATAAACTAAAGCAAGGACAACGAGTGCAAAGCACACATAATCCAGATCGACAAGTGTCGACCCAGGGAAGG