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consensus                     :  CAATTAA-TGGAA--T--TGAT-----AC------A---CGAC-A---------T--------A---C------AAGG--C-ATT----T-----AT---A-TGAT-A--TT-A--TT-A-T-T-CA--GAG-A-A----ATC-A-T------------------------TT-CA---------------------TTT-----T---TA----T--G------CGT-----G-AAAAC------C-GAA-A-----C--A-CA--C-TCGTT-A-TT-C--T-TTG-TT-TT-GTT---T-G---------C-TTTT--C-TATTTTGGTG-GGA-G--G--G-A-------CT---AAAA-TTA-T-GG-T-GGAT-CTA--A-CA-G------GG--GTGGGG-AT-A-AC--------A----------C----T-------------------T---------------A---------------G-------------C-----TTG----------------AAA-CT-------T---TG-------T--TG------TTG------A-AGGACAAA-------ATAGGTCCAATT---------------ATTT-TCCT----TA-AAG--TTATCGTGAACCGGATA-G-ACTGGAAACTT-TGT-CGTTGAAGGACA--AAT-AGGTCCAATTATTTTTCTA-NACTAG
Reference ( gi|3 )            :  CAATTAA-TGGAA--T--TAAT-----AC------A---C--------------T--------A---C------AAGG--C-ATA----T-----AT---A-TGAT-A--TT-A--TT-A-T-T-CA--CAG-A-A----ATC-A-T------------------------TT-CA---------------------TTT-----T---TA----T--G------CGT-----G-AAAAC------C-GAA-A-----C--A-CG--C-TCGTT-A-TT-C--T-TTG-TT-TT-GTT---T-G---------C-TTTT--C-TATTTTGGTG-GGA-G--G--G-A-------CT---AAAA-TTA-T-GG-T-GGAT-CTA--A-CA-G------GG--TTGGGG-AT-A-AC--------A----------C----T-------------------T---------------A---------------G-------------C-----TTG----------------AAA-CT-------T---TG-------T--TG------TTG------A-AGGACAAA-------ATAGATCCAATT---------------ATTT-TCCT----TA-AAG--TCATCGTGAACCGGATA-G-ACTGGAAACAT-TGT-C-----AGGACA--GAC-GGATCCAATTATTTTTC---GACTAG
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gi|30                         :  CAATTAA-TGGAA--A--TGATTCACGACT-----A---C--------------T--------A---C------AAAA--C-ATT----T-----AT---A-TGAT-A--TT-A--TT-A-T-t
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gi|23                         :    ATTAA-TGGAA--T--TGAT-----AC------A---C--------------G--------A---C---------------TA----T------T---A-TGAT-A--TT-A--TT-----------CAG-AGA----ATT-A-T------------------------TTTCA---------------------TTT-----T---TT----T--G------CGT-----A-AAAAC------C-GAA-A-----C--A-CG--C-TCGTT-A-AT-T--T-TTG-TT-TT-GTT---T-G---------C-TTTT--C-TATTTc
gi|24                         :    ATTAAATGGAA--T--TGAT-----ACGACG--A---C--------------TCATTA---A---C------AAGGACC-TTA----T-----AT---A-TGAT-A--TT-A--TT-AAT-T-CA--GAG-A-A----ATC-A-T------------------------TT-CA---------------------TTT-----T---CAT---T--G------CGT-----G--AAAC------C-GAA-A-----C--A-Cgttgg
gi|1                          :     TTAA-TCGAA--T--TGATT----AC------A---CGATA----------T--------AT--C------AAGC--A-ATA----T-----AT-----TGAT-A--TT-AACTT-A-T---CA--GAG-A-A----TTCCA-T------------------------TT-CA---------------------TTTATGCGT---TAATTTT--GACCAGACGT-----G-AAAACG-----C-GAA-A-----C--A-CA--C-TCGTT-A-TT-C--T-TTG-TT-TT-GTT---T-G---------C--TTT--C-TATTTGGTTG-GGA-G--G--G-A-------CT---AAAACTTA-T-GG-T-GGAT-CAA--A-AA-GAACGACGG--TTGGGG-AT-A-AC--------A----------C----T-------------------TAGAACTCCTATATTAA---------------G-------------C-----TTATCGGACACAT------AGA-CT-------T---TGAAAACCTT--TG------TTGCTATGAA-AGGAC-AA-------ATAGGTCCAATTC--------------A--T-TCCT----TATAAACTTGATCGTGAACCGATTG-A-ACTGGAAACATATGTCC-----AGGACA--GAC-AGATCCAA--ATTTTTC---TACTAG
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gi|16                         :    tTTAA-TGGAA--T--TGAT-----AC------A---CGACTAT--------T--------A---C------GAGG--C-ATT----TTTAAAAT---A-TGAT-A--CT-A--TT-A-T-T-CA--GAG------------A-T------------------------TT------------------------------------------T--G------TGT-----T-A-------------AA-A-----C--A-CA--C-CCGTT-A-TT-C--T-TTG-TT-TT-GTT---T-GCTTTTCAGCC-TTTT--C-TA-TTTGGTG-GGA-G--G--G-A-------CT---AAAC-TTA-T-GA-T-GGAT-CTA--A-CA-G------GA--GTGGGA-AT-A-AC--------A----------aactcctaaatggctatttcggtata
gi|2                          :      TAA-TGGAAACT--TGAT-----AC------A---CGACCGAGTCACTATT--------A---CC-----AAGG--C-ATA----T-----CT---AATGAT-AACTC-A--TTGA-T-T-TC--GAG-A-A----ATC-AGC------------------------TT-CA---------------------TTT-----T---TAG---T--G------CGG-----GCAAAAC------CAGAA-A-----C--AGCA--CCTCGTT-A-TT-G--C-TTG-TTCTT-GTT---T-G---------C-TTTT--T-TATT--GGTGCGGA-GCGG--A-A-------CT---AAAA-TTAAT-GG-T-GGAT-C-A--A-CA-G------GG--T-GGGG-ATAA-ACTCTATGAAA----------C----TCCTATATGCCTTATCTAGAT---------------A---------------GA------------C-----TTT----------------ACA-CTGTTG---T---TG-------T--TGCAAGGCTTG------A-AGGACAAA--------TAGGTCCAATT---------------ATTT-TC-T----TA-AAG--TGATCGTGAACCGGATA-C-ACTAGAAACAT-TGT-C-----AGGACA--GA
gi|19                         :      TAA-TGGAA--T--TGAT-----AC------A---C--------------G--------A---CTATTAAAAGG--C-ATT----T-----AT---A-TGAT-A--TT-A--TT-A-T-T-CA--GAG-A-A----ATC-A-T------------------------TT-CA---------------------TTG-----T---T-----T--G------CCT-----G-AAAAC------C-GAA-A-----C--A-----T-TCGTT-A-TT-C--T-TTC-TT-CT-GTT---T-G---------C-TTTT--C-------GGTG-GGA-G--A--G-ACTACATTCT---AAAA-TTA-T-GG-T-GGAT-CTA--A-CA-G------GG--agtttctactagttatcatgttggatctaagtgaggccgagtgtggatgtaaattagcttgtggacacttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgaa
gi|18                         :      TAA-TGGAA--T--TGAT-----AC------A---CGC------------T--------A---TCTA---AAGA--C-AT-----T-----AT---A-TGATTA--TT-A--TT-A-T-TGCA--GAA-A-A----ATC-A-T------------------------TC-AA---------------------TTT-----T---TA----TATG------CGT-----G-AACAC--------GAA-A-----C--A-CA--C-TCGTTTA-TT-C--T-TT--TT-TT-GTT---T-G---------C-TTTT--T-CATTTGGCTG-GGA-G--G--G---------CT---AAAAATTA-T-GG-T-GGAT-CTA--A-CA-G------GG--GTGgt
gi|7                          :      aAA-TGGAA--T--TGAT-----AC------A---CGACCAT--------T--------A---C------AAGG--C-ATA----T-----AT---A-TGAT-A--TT-A--TT-A-T-T-CA--GAG-A-A----ATC-A-T------------------------TT-CA---------------------TTT-----T---TA----T--G------CGT-----G-AAAAT------C-GAA-A-----C--A-CG--C-TCGTT-A-TT-C--T-TTG-TT-TT-GTT---T-G---------A-TTTT--C-TA-TTTGGT--GGA-G--G--G-A-------CCAAAAAAA-AAA-T-GG-T-GGAT-CTA--A-CA-G------GA--GTGGGG-AT-A-AC--------A----------C----T-------------------T---------------A---------------GAATTCCTATATGAC-----TTG----------------AAA-CT-------T---TG-------T--TG------TTG------A-AGGAC-AT-------ATAGATCCAATT---------------ATTT-TCCT----TA-AAG--TTATCGTGAACCGGATA-G-ACTGGA
gi|20                         :      tgA-TGGAA--T--TGAT-----AC------A---CGACTAT--------T--------A---C------AAGA--C-ATAATTTT-----AT---A-TGAT-A--TT-A--TT-A-T-T-CA--GAG-A-A----ATC-A-T------------------------TT-CA---------------------TTT-----T---T-----T--G------CGA-----T-AAAAT------C-GAA-A-----C--A-CA--C-CCGTT-A-TT-C--T-TTG-TT-TT-GTT---T-G---------C-TTTT--C-TA-TTTGGTG-
gi|11                         :                                          --------------T--------A---C------AAGG--C-ATT----T-----AT---T-TGAT-A--TT-A--TT-A-T-T-CA--GAG-A-T----ATC-A-T------------------------TT-CA---------------------TTT-----TATCTT----T--G------CGT-----T-AAAAC------C-AAA-A-----C--A-CA--C----CT-A--------------T-TT-GTT---T-G---------C-TTTT--C-TA-TTTGGTG-GGA-A--G--G-A-------CT---AAAA-TTA-T-GG-T-GGAT-CTA--A-CA-G------AG--GTGGGG-AT-A-AC--------A----------C----T-------------------T---------------A---------------G---------------------------------------AA-CT-------CCTATA-------T--GG------TTT------ATCGGATAGA-------TTTGA---AACTTTGTTGCTGAGAGACATTT-TCCT----T--AAG--TTATCGTGAACCGAATA-G-ACTGGAAAactacaatataattaatcctaaggaat
gi|17                         :                                                                            tAGA--C-ATT----T-----AT---A-TGAT-A--TT-A--TT-A-T-T-CA--GAG-------------------------------------------------------------------T-----T---TA----T--G------CGT-----G-AAAAC------C-GGA-A-----C--A-CA--C-TCGTT-A-TT-C--T-TTG-TT-TT-GTT---T-G---------C-TTTT--C--A-TTTGGTG-GGA-G--G--G-A-------CT---AAAA-TTA-T-GG-T-GGAT-CTA--A-CA-G------GG--GTGGGG-AT-A-AC--------A----------CATAAT-------------------T---------------A---------------GATCGGATAGA---C-----TTG----------------AAA-CT-------T---TG-------T--TG------TTG------
gi|25                         :                                                                                                                                    AG-A-A----ATT-A-T------------------------TT-CA---------------------TTT-----T---TA----T--G------CGT-----G--AAAC------C-GAA-A-----C--A-CA--C-TC----A-TT-C--T-TTG-TT-TT-G-T---T-G---------C-TTTT--CATA---TGATG-GGA-G--G--G-A-------CT----AAA-TTA-T-GG-T-GGAT-CT
gi|26                         :                                                                                                                                     g-A-A----AT----T------------------------TC-CA---------------------TTT-----T---T-----T--G------CCTTTTAAA-AAAAC---------AA-A-----C--A-C------CGTT-AATT-C--T-TTT-TT-TT-TTTAATT-G---------C-TTTT--C-TATTTTG
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                             ------CGT-----T-AAAAC------C-GAA-A-----C--A-CA--T-CCGTT-G-TT-C--T-TTG-TT-TT-GTT---T-G---------C-TTTT--C-TG-TTTGGCG-GGA-G--G--G-A-------CT---AGAA-TTA-A-GG-T-GGAT-CTA--A-CA-G------------GAGG-AT-A-AT--------A----------T----A-------------------T---------------G---------------G-------------C-----TTtgac
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ---AAAA-TTA-T-GG-T-GGAT-CTA--A-CA-atcggatagactggaaacttttga
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          -------------------T---------------A---------------G-------------C-----TGG----------------AAA-CT-------T---TG-------T--C------------------AGGACAAG-------AAAGGATCAATT---------------ATTT-TTCT----AA-AAacttagaactcctgtatc
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         attttccttaatttcgtaaaccagaG------TTG------A-ATGATAAATGCCTTAATGGGTTTAATT---------------AACT-TCCT----TA-AAG--TGATCGTAAACCGGATA-G-ACTGGAActagttgaggtggatgctaagtgagcccggatgtggatataaattaagct
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ---------------ATTT-TCCT----TA-A----TT-TCGTAAACCAGATA-G--CTGGAAACTT-TGT-C-----AGGACAAGAAA-GGAT-CAATTATTTTTCTAAAACTAG
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ATCGGATA-G-ACTTGAAATCT-TGT-TGTTGAAGGATA--AAC-GGGTCCACTTATTTTTC---ttgaggtggatgctaagtgagcccggatgtggatataaattaagct
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             caattaatggaatttatacccgactattacaaggcatttatatgatattattattcagagaaattatttcattttttgtgttaaaaccgaaatgtatacccgttattctttgttttgtttgctggagggactaaaattatggtggatctaacaggggtgggggtaacacttagaacccctatatatggcttATCGGATA-G-ACTGGAAACTT-Tttaaatttatt
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     cgttaaaaccgaaacacatccgttgttctttgttttgtttgcttttctgtttggcgggagggactagaattaaggtggatctaacaggaggataatatatggcttCGGATA-GCGCTTGAAACTT-TGT-TGTTGAAGGACA--AATTAGGTCCAATTATTTTCCTA-GACTAtga
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     attatggattgtgatacacgactattacaagacatttataatacatttatatttagagtaaatcaatttcatttttatgcgtgaaaaccgaaacgacactcgttatttctttgtttttgttttgctttttcatttgtgggaggctgaacctaaaattatggtggatctaacaggggtggggaataacaacagaactagcttattATATG-ACTTGAAACTT-TGT-TGTTGAAGGACA--TAT-AGATCCAATTATTTTCC---agttattgtaaacgggatagactggaa
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         tgaatggaattgatacacgaccattacaaggcatatatatgatattattattcagagaaatcatttcatttttatgcgtgaaaatcgaaacacgctcgttattctttgttttgtttgattttctatttggtggagggaccaaaaaaaaaatggtggatctaacaggagtggggataacacttagaattcct-----AGGACA--AAT-AGGTCCAATTATTTTttaaagttatcgtgaaccggatagactgga

Unaligned ( gi|28 ): GCAGGTAATGGAATTGATACACGACTATAACAAGACAATAACAAGACGTTTATATTCA

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lowQualScore                  :             .     .. .   . .  .  .   .............. . ..   .. .  .... . ..... . ... .  . . . ..  . ..  . . . . ..   . .  .   . . ........................    .....................   ..... ... ..... .. ......   ..... .     ...... .   . ..... .. ..   .   .  . .  . .. .   .  .  .   ... . ......... .    .. ....  .    .   . .. .. . .......  ...    .   . .  . .    .   .. .  . ......  ..      .  . .  ........ .............................................................................................................................................. ..  ......   ......      ...........     .     .    .    ..  ....     .                         ..     .....      ....  .     .        ....     
lowQualScore                  :             7     44 5   7 7  7  7   33333333333333 7 00   77 6  0000 6 00000 6 444 6  6 6 6 88  6 22  2 8 6 3 44   7 7  7   7 0 777777777777777777777777    222222222222222222222   22222 999 77777 66 666666   00000 6     222222 6   6 00000 44 88   7   7  7 7  7 33 7   7  7  3   999 7 777777777 7    33 8888  7    8   9 66 55 9 8888888  000    6   8 8  8 8    8   55 9  9 888888  88      4  7 4  55555555 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 00  666666   777777      88888888888     5     6    6    00  7777     6                         44     00000      5555  2     0        7777     
consensus                     :      CAATTAA-TGGAA--T-TGA-T-AC-AC-GACT--------A-TT-A-C--AAGG-C-AT----T-T-----A-T---A-TG-A-T-A--TT-A--TT-A-T-T-C--AGA-G-AA-ATC-A-T------------------------TTCA---------------------TTT-----T---TA----T--G------CGT-----G-AAAAC------C-GAA-A-----C--A--CAC-TCG-TT-A-TT-C--T-TTG-TT-TT-GTT---T-G---------C-TTTT--C-TATTTTGGTG-GGA-G--G--G-A-------CT---AAAA-TTA-T-GG-T-GGAT-CTA--A-CA-G------GG--GTGGGG-AT-A-AC--------A----------C----T-------------------T---------------A---------------G-------------C-----T------TG----------------AGA-CT-------T-------TG-------T--TG------TTG------AAGGACAAA-------ATAGGTCCAATT-ATTT-TCCT--TA----AAGTT-ATCGTGAACCGGATAGACTGGAAAC-TTTGTC-----AGGACAG-ACAGATCCAATTATTTTTCT--GACTAG
Reference ( family-170 )      :      CAATTAA-TGGAA--T-TGA-T-AC-AC-GAC---------A-T--A-C--AAGG-C-AT----T-T-----A-T---A-TG-A-T-A--TT-A--TT-A-T-T-C--AGA-G-AA-ATC-A-T------------------------TTCA---------------------TTT-----T---TA----T--G------CGT-----G-AAAAC------C-GAA-A-----C--A--CAC-TCG-TT-A-TT-C--T-TTG-TT-TT-GTT---T-G---------C-TTTT--C-TATTTTGGTG-GGA-G--G--G-A-------CT---AAAA-TTA-T-GG-T-GGAT-CTA--A-CA-G------GG--GTGGGG-AT-A-AC--------A----------C----T-------------------T---------------A---------------G-------------C-----T------TG----------------AAA-CT-------T-------TG-------T--TG------TTG------AAGGACAAA-------ATAGGTCCAATT-ATTT-TCCT--TA----AAGTT-ATCGTGAACCGGATAGACTGGAAAC-TTTGTCGTTGAAGGACAA-ATAGGTCCAATTATTTTTCT-ANACTAG
gi|1                          :         TTAA-TCGAA--T-TGA-TTAC-AC-GAT---------A-T--ATC--AAGC-A-AT----A-T-----A-T-----TG-A-T-A--TT-AACTT-A-T---C--AGA-G-AA-TTCCA-T------------------------TTCA---------------------TTTATGCGT---TAATTTT--GACCAGACGT-----G-AAAACG-----C-GAA-A-----C--A--CAC-TCG-TT-A-TT-C--T-TTG-TT-TT-GTT---T-G---------C--TTT--C-TATTTGGTTG-GGA-G--G--G-A-------CT---AAAACTTA-T-GG-T-GGAT-CAA--A-AA-GAACGACGG--TTGGGG-AT-A-AC--------A----------C----T-------------------TAGAACTCCTATATTAA---------------G-------------C-----T------TATCGGACACAT------AGA-CT-------T-------TGAAAACCTT--TG------TTGCTATGAAAGGAC-AA-------ATAGGTCCAATTCA--T-TCCTTATA----AACTTGATCGTGAACCGATTGAACTGGAAACATATGTC----CAGGACAG-ACAGATCCAA--ATTTTTCT---ACTAG
gi|10                         :      CAATTAA-TGGAA--T-TTA-T-AC-CC-GACT--------A-TT-A-C--AAGG-C-AT----T-T-----A-T---A-TG-A-T-A--TT-A--TT-A-T-T-C--AGA-G-AA-ATT-A-T------------------------TTCA---------------------TTT-----T---T-----T--G------TGT-----T-AAAAC------C-GAA-A-----TGTA--TAC-CCG-TT-A-TT-C--T-TTG-TT-TT-GTT---T-G---------C-T------------------GGA-G--G--G-A-------CT---AAAA-TTA-T-GG-T-GGAT-CTA--A-CA-G------GG--GTGGGG-GT-A-AC--------A----------C----T-------------------T---------------AGAACCCCTATATATGG-------------C-----T------TATCGGAT----------AGA-CTTGAAATCT-------TG-------T--TG------TTG------AAGGAT-AA-------ACGGGTCCACTT-ATTT-TTCT--TA----AATTT-ATttactggtggatctacagtgagggccgggtgtggatgtaaacttagctgttggacactttcaaacttgacaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttg
gi|11                         :                                                -T--A-C--AAGG-C-AT----T-T-----A-T---T-TG-A-T-A--TT-A--TT-A-T-T-C--AGA-G-AT-ATC-A-T------------------------TTCA---------------------TTT-----TATCTT----T--G------CGT-----T-AAAAC------C-AAA-A-----C--A--CAC-----CT-A--------------T-TT-GTT---T-G---------C-TTTT--C-TA-TTTGGTG-GGA-A--G--G-A-------CT---AAAA-TTA-T-GG-T-GGAT-CTA--A-CA-G------AG--GTGGGG-AT-A-AC--------A----------C----T-------------------T---------------A---------------GAA-----------C-----TCCTATATGGTTTATCGGAT-----AGA-TT-------TGAAACTTTG-------T--TG------CTG------AGAGACA-----------------------TTT-TCCT--T-----AAGTT-ATCGTGAACCGAATAGACTGGAAAt
gi|12                         :        tTCAA-TG-AA--T-TGACT-AT------------------T--A-C--AAGA-C-AT----T-T-----A-TT--A-TG-AAT-A--TA-A--TTTA-T-G-C--AGAAG-TA-ATC-A-T------------------------TTCA---------------------TTT-----T---T-----T--G------CGT-----G-AAAGC------C-GAA-A-----C--A--CAC-TCT-TT-A-TT-C--T-TTG-TT-TT-GTT---T-A---------C-TTTT--CATATTTTGGTG-GGA-G--G--G-A-------CT---AAAA-TTA-T-GG-T-GGAT-CTA--A-CA-G------CG--G-GGGG-AT-A-AC--------A----------C----T-------------------T---------------A---------------G-------------
gi|13                         :     tCAATTAA-TAGAA--T-TGA-T-AC-AA-GACT--------A-TT-G-C--AAGG-C-AT----T-T-----A-T---A-TG-A-T-A--TA-A--TT-A-T-G-C--A-A-G-TA-ATC-A-TCTGGATTTTTTTTTTTTTTTGTGTTTTT---------------------TTT-----T---TT----T--G------CGT-----G-AAAAG------C-GGA-ATTTCAC--A--CAC-TCG-TT-A-TC-T--T-TTG-TT-TTTGTT---T-G-----------TTTT--C--ATTT-GATG-GGA-G--G--G-A-------CT---AAAA-TTA-T-GG-T-GGAT-CAAC-A-CA-G------GG--GTGGaactcctaaatggctatttcggtata
gi|14                         :       AATTAA-TGGA---T-TGA-T-AC-ACCGACT--------A-TTAA-C--AAA--C-AT----T-T-----A-T---A-TG-A-T-A--T--A--TT-AAT-T-T--AGA-G-AA-A-A-A-T------------------------TTCA---------------------TTT-----T---TT----T--G------CGT-----G-AAA-C------C-GAA-------C--A--AAC-TCG-TTCA-TT-T--T-TTG-TT-GT--TT---T-G---------C-TTTT--C--ATATTGG---GGA-G--G--C-A-------CT---AAAA-TTT-A-GG-T-GGAT--TA--ATCA-G------GG--GTGGGG-AT-A-AC--------A----------C----
gi|15                         :      CAATTAA---GGA--T-TGA---AC-AT-GACT--------A-TT-A-C--AAGG-C-AT----T-T-----A-TTCTA-TT-A-T-A--T--A--TT-A-TAT-C--AGA-G-AA-ATC-A-T------------------------TTAA---------------------ATC-----T---TT----T--G------GCT-----T-AAAAC------C-GAA-A-----C--G--CAT-TCG-TT-A-TT-C--T-TTG-TT-TT-GTT---T--------------------------TGGTG-GGGTG--G--G-A-------CT------A-TTA-T--G-T-GGAT-CTATTA-CA--------GG--GTGGTC-TT-A-AC--------A----------C----T-------------------T---------------A---------------G-------------
gi|16                         :        gTTAA-TGGAA--T-TGA-T-AC-AC-GACT--------ATT--A-C--GAGG-C-AT----T-TTTAAAA-T---A-TG-A-T-A--CT-A--TT-A-T-T-C--AGA-G--------A-T------------------------TT-----------------------------------------T--G------TGT-----T-A-------------AA-A-----C--A--CAC-CCG-TT-A-TT-C--T-TTG-TT-TT-GTT---T-GCTTTTCAGCC-TTTT--C-TA-TTTGGTG-GGA-G--G--G-A-------CT---AAAC-TTA-T-GA-T-GGAT-CTA--A-CA-G------GA--GTGGGA-AT-A-AC--------A----------
gi|17                         :                                                          AGA-C-AT----T-T-----A-T---A-TG-A-T-A--TT-A--TT-A-T-T-C--AGA-G--------------------------------------------------------------T-----T---TA----T--G------CGT-----G-AAAAC------C-GGA-A-----C--A--CAC-TCG-TT-A-TT-C--T-TTG-TT-TT-GTT---T-G---------C-TTTT--C--A-TTTGGTG-GGA-G--G--G-A-------CT---AAAA-TTA-T-GG-T-GGAT-CTA--A-CA-G------GG--GTGGGG-AT-A-AC--------A----------CATAAT-------------------T---------------A---------------GATCGGATAGA---C-----T------TG----------------AAA-CT-------T-------TG-------T--TG------TTG------
gi|18                         :          TAA-TGGAA--T-TGA-T-AC-AC-GCT---------A-T----CTAAAGA-C-AT----T-------A-T---A-TG-A-TTA--TT-A--TT-A-T-TGC--AGA-A-AA-ATC-A-T------------------------TCAA---------------------TTT-----T---TA----TATG------CGT-----G-AACAC--------GAA-A-----C--A--CAC-TCGTTT-A-TT-C--T-TT--TT-TT-GTT---T-G---------C-TTTT--T-CATTTGGCTG-GGA-G--G--G---------CTA--AAAA-TTA-T-GG-T-GGAT-CTA--A-CA-G------GG--GTG
gi|19                         :         aTAA-TGGAA--T-TGA-T-AC-AC-GACT--------A-TT-A-A--AAGG-C-AT----T-T-----A-T---A-TG-A-T-A--TT-A--TT-A-T-T-C--AGA-G-AA-ATC-A-T------------------------TTCA---------------------TTG-----T---T-----T--G------CCT-----G-AAAAC------C-GAA----------A--CAT-TCG-TT-A-TT-C--T-TTC-TT-CT-GTT---T-G---------C-TTTT--C-------GGTG-GGA-G--A--G-ACTACATTCT---AAAA-TTA-T-GG-T-GGAT-CTA--A-CA-G------GG--GT
gi|2                          :          TAA-TGGAAACT-TGA-T-AC-AC-GACCGAGTCACTA-TT-A-CC-AAGG-C-AT----A-T-----C-T---AATG-A-T-AACTC-A--TTGA-T-T-T--CGA-G-AA-ATC-AGC------------------------TTCA---------------------TTT-----T---TAG---T--G------CGG-----GCAAAAC------CAGAA-A-----C--AG-CACCTCG-TT-A-TT-G--C-TTG-TTCTT-GTT---T-G---------C-TTTT--T-TATT--GGTGCGGA-GCGG--A-A-------CT---AAAA-TTAAT-GG-T-GGAT-C-A--A-CA-G------GG---TGGGG-ATAA-ACTCTATGAAA----------C----TCCTATATGCCTTATCTAGAT---------------A---------------GA------------C-----T------TT----------------ACA-CTGTTG---T-------TG-------T--TGCAAGGCTTG------AAGGACAAA--------TAGGTCCAATT-ATTT-TC-T--TA----AAGTG-ATCGTGAACCGGATACACTAGAAAC-ATTGTC-----AGGACAG-A-AGTTTCTACTAGTTATC
gi|20                         :            A-TGGAA--T-TGA-T-AC-AC-GACT--------A-TT-A-C--AAGA-C-ATAATTT-T-----A-T---A-TG-A-T-A--TT-A--TT-A-T-T-C--AGA-G-AA-ATC-A-T------------------------TTCA---------------------TTT-----T---T-----T--G------CGA-----T-AAAAT------C-GAA-A-----C--A--CAC-CCG-TT-A-TT-C--T-TTG-TT-TT-GTT---T-G---------C-TTTT--C-TA-TTTGGTG-atgttggatctaagtgaggccgagtgtggatgtaaattagcttgtggacacttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgaa
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                         ------CGT-----T-AAAAC------C-GAA-A-----C--A--CAT-CCG-TT-G-TT-C--T-TTG-TT-TT-GTT---T-G---------C-TTTT--C-TG-TTTGGCG-GGA-G--G--G-A-------CT---AGAA-TTA-A-GG-T-GGAT-CTA--A-CA-G------------GAGG-AT-A-AT--------A----------T----A-------------------T---------------G---------------G-------------C-----T------Tactacaatataattaatcctaaggaat
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ATCGGATAGACTGGAAAC-TTTatcggatagactggaaacttttga
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           cgttaaaaccgaaacacatccgttgttctttgttttgtttgcttttctgtttggcgggagggactagaattaaggtggatctaacaggaggataatatatggctt-ATTT-TCCT--TA----A--TT--TCGTAAACCAGATAG-CTGGAAAC-TTTGTC-----AGGACAAGAAAGGATCAATTATTTTTCTAAAACTAGtga
gi|23                         :        ATTAA-TGGAA--T-TGA-T-AC-AC-GAC------------------------T-AT----T-------------A-TG-A-T-A--TT-------A-T-T-C--AGA-G--A-ATT-ATT------------------------TTCA---------------------TTT-----T---TT----T--G------CGT-----A-AAAAC------C-GAA-A-----C--A--CGC-TCG-TT-A-AT-T--T-TTG-TT-TT-GTT---T-G---------C-TTTT--C-TATTTttgaggtggatgctaagtgagcccggatgtggatataaattaagct
gi|24                         :        ATTAAATGGAA--T-TGA-T-ACGAC-GACTC-------A-TTAA-C--AAGGAC-CT----TAT-----A-T---A-TG-A-T-A--TT-A--TT-AAT-T-C--AGA-G-AA-ATC-A-T------------------------TTCA---------------------TTT-----T---CAT---T--G------CGT-----G--AAAC------C-GAA-A-----C--A--Cgttgg
gi|25                         :                                                                                                                   GA-G-AA-ATT-A-T------------------------TTCA---------------------TTT-----T---TA----T--G------CGT-----G--AAAC------C-GAA-A-----C--A--CAC-TC-----A-TT-C--T-TTG-TT-TT-G-T---T-G---------C-TTTT--CATA---TGATG-GGA-G--G--G-A-------CT----AAA-TTA-T-GG-T-GGAT-CT
gi|26                         :                                                                                                                       -AA-AT----T------------------------TCCA---------------------TTT-----T---T-----T--G------CCTTTTAAA-AAAAC---------AA-A-----C--A--C----CG-TT-AATT-C--T-TTT-TT-TT-TTTAATT-G---------C-TTTT--C-TATTTTG
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        G------TTG------AATGATAAATGCCTTAATGGGTTTAATT-AACT-TCCT--TA----AAGTG-ATCGTAAACCGGATAGACTGGAAtgac
gi|28                         :          TAA-TGGAA--T-TGA-T-AC-AC-GACT--------A-TA-A-C--AAGA-C-AA----T-A-----A-C---A-AG-A-C-G--TT-T--AT-A-T-T-C--A
gi|29                         : gcaggCAATTAA-TGAAA--T-TGA-T-AC-AC-GACT--------A-TT-A-C--AAGA-C-AT----T-G-----A-T---A-TG-A-T-A--TT-A--TT-A-T-T-
gi|3                          :      CAATTAA-TGGAA--T-TAA-T-AC-AC---------------T--A-C--AAGG-C-AT----A-T-----A-T---A-TG-A-T-A--TT-A--TT-A-T-T-C--ACA-G-AA-ATC-A-T------------------------TTCA---------------------TTT-----T---TA----T--G------CGT-----G-AAAAC------C-GAA-A-----C--A--CGC-TCG-TT-A-TT-C--T-TTG-TT-TT-GTT---T-G---------C-TTTT--C-TATTTTGGTG-GGA-G--G--G-A-------CT---AAAA-TTA-T-GG-T-GGAT-CTA--A-CA-G------GG--TTGGGG-AT-A-AC--------A----------C----T-------------------T---------------A---------------G-------------C-----T------TG----------------AAA-CT-------T-------TG-------T--TG------TTG------AAGGACAAA-------ATAGATCCAATT-ATTT-TCCT--TA----AAGTC-ATCGTGAACCGGATAGACTGGAAAC-ATTGTC-----AGGACAG-ACGGATCCAATTATTTTTC---GACTAGt
gi|30                         :      CAATTAA-TGGAA--A-TGA-T-TC-AC-GACT--------ACT--A-C--AAAA-C-AT----T-T-----A-T---A-TG-A-T-A--TT-A--TT-A-T-
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ---AAAA-TTA-T-GG-T-GGAT-CTA--A-CA-
gi|4                          :        ATTA--TGGAT--TGTGA-T-AC-AC-GACT--------A-TT-A-C--AAGA-C-AT----T-T-----A-T---A-AT-A-C-A--TT-T--AT-A-T-T-T--AGA-GTAA-ATC-AAT------------------------TTCA---------------------TTT-----T---TA----T--G------CGT-----G-AAAAC------C-GAA-A-----CG-A--CAC-TCG-TT-A-TTTC--T-TTG-TT-TTTGTT---TTG---------C-TTTT--T-CATTT--GTG-GGA-G--GCTG-AAC-----CT---AAAA-TTA-T-GG-T-GGAT-CTA--A-CA-G------GG--GTGGGGAAT-A-AC--------AACAGAACTAGC----T-------------------T---------------ATTCGGATAGC-----G-------------C-----T------TG----------------AAA-CT-------T-------TG-------T--TG------TTG------AAGGACAAA-------TTAGGTCCAATT-ATTT-TCC---TAGACTAAGTT-ATTGTAAACGGGATAGACTGGAAacttagaactcctgtatc
gi|5                          :       AATTAA-TGGGA--TGTGA-T-AT-AC-AACTAG------A-TT-A-C--AAGG-C-ATG---T-T-----AAT---A-TG-A-T-AA-TT-A--TT-A-T-TTC--AGA-G-AA-TTC-A-TG-----------------------TTCGATGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT-----T---TT----TCGG------CGT-----G-AATAC------C-GAA-A-----TA-A--CAC-TCG-TA-T-TT-C--TATTGATT-TC-GTT---T-G---------CGTCTTAGC-TATTTGGTTG-GGA-G--G--GTA-------CT---AAAATTTA-T-GGTT-CGAT-CT---A-CA-G------GG--GTGGGG-AT-ACAC--------A----------CG---T-------------------T---------------A---------------
gi|6                          :        ATTGA-TGGGA--T-TGA-T-AT-AC-GACT--------A-TT-A-C--AAGG-C-AT----T-T-----A-T---G-AA-A-T-A--TT-A--TT-A-T-T-C--CGA-G-AA-ATT-A-T------------------------TTCA---------------------TTT-----T---CT----T--G------CGT-----T-TAAAC------C-AAA-A-----C--ATGTAC-CCA-TT-A-TT-C--T-TTA-TT-TT-GTT---T-G-----------TTTT--T-TCTTTTGGTG-GGA----G--G-A-------C------AA-TTA-TGGG-TAGAAT-CTT--A-----------GG--GT-GGG-AT-A-AC--------A----------T----TATTATTAGGCTTATCGGAAT---------------A---------------G-------------A-----T------TA----------------AAATCT-------T-------TG-------T--TG------T--------GAGGAC-AA-------ACGGGT-CAATT-TTTTCTCCT--TA----AAGTT-ATCGTGGATCGGATAGTCTAGAAAcgaacttcctataagttggcttatatcggctagacttgagaggtcttaggttgtt
gi|7                          :           AA-TGGAA--T-TGA-T-AC-AC-GACC--------A-TT-A-C--AAGG-C-AT----A-T-----A-T---A-TG-A-T-A--TT-A--TT-A-T-T-C--AGA-G-AA-ATC-A-T------------------------TTCA---------------------TTT-----T---TA----T--G------CGT-----G-AAAAT------C-GAA-A-----C--A--CGC-TCG-TT-A-TT-C--T-TTG-TT-TT-GTT---T-G---------A-TTTT--C-TA-TTTGGT--GGA-G--G--G-A-------CCAAAAAAA-AAA-T-GG-T-GGAT-CTA--A-CA-G------GA--GTGGGG-AT-A-AC--------A----------C----T-------------------T---------------A---------------GAATTCCTATATGAC-----T------TG----------------AAA-CT-------T-------TG-------T--TG------TTG------AAGGAC-AT-------ATAGATCCAATT-ATTT-TCCT--TA----AAGTT-ATCGTGAACCGGATAGACTGGA
gi|8                          :      tgATTAA-TGGAA--T--GA-T-AA-AA-AGCTCTT-----A----A-C--AAGG-CCAT----A-C-----A-T---A-TG-A-T-A--TTGA--TT-AAT-T-C--AGA---AA-ATC-A-T------------------------TTCA---------------------TTT-----T---TA----T--G------CGT-----G-AAAAC------T-GAACA-----C--A--CGC-TCG-TT-A-TT-CCTT-TTG-TT-TT-G-T---T-A---------C-CTTT--C--A-TTTGGTG-GGA-G--GA-G-A-------CT---TAGA-TTA-T-GG-T-GGATACTA--A-CACG------GGAAGTGGGC-GTAA-AC--------A----------CT---T-------------------T---------------A---------------A-------------CCTCTAT------TGTATATGCGTATTGGATAGA-CT-------T-------TGAAAAC--T--TG------TTGTTGA--AAGGACAAA-------CTAGGTACAA
gi|9                          :       AGTTAA-TGAAA--T-TG--T-AC-AC-GACT--------A-TT-A-C--AAG----------C-T-----A-T---A-TGGA-T-A--GT-A--TT-A-T-T-CCAGGA-G-AAGATC-T-C------------------------TTTA---------------------TTT-----C---TA----T--G------CGT-----G-AAAACAGAATTC-GAA-A-----C--A--CAT-TCG-TT-A-TT-C--T-TTG-TT-TT-GTT-----G---------C-TTTT--C--ATTT-GGTG-GGA-G--G--G-A-------CT---AAA--TTA-T-GG-T-GGAT-CTA--A-CA-G------GG--GTGGGG-AT-A-AT--------A----------C----T-------------------TAG-------------A---------------G-------------C-----T------C---------------------CT-------A-------TA-------TCATG------TAT------ATGGTT-----------TAGGTCCAAAT-ATTT-TCCT--TA----AAGTT-ATCGTGAACCGGATAGACTGGAAc

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Reference ( family-170 )      :            CAATTAA-TGGAA--T-TGAT-AC-AC-GAC--------T-A--T-TA-C-AAGG-C-AT----T-T-----A-T---A-TG-A-T-A--TT-A--TT-A-T-T-C--AGA-G-AA-ATC-A-T------------------------TTCA---------------------TTT-----T---TA----T--G------CGT-----G-AAAAC------C-GAA-A-----C-A--CAC-TCG-TT-A-TT-C--T-TTG-TT-TT-GTT---T-G---------C-TTTT--C-TATTTTGGTG-GGA--GG--G-A-------CT---AAAA-TT-AT-GG-T-GGAT-CTA--A-CA-G------GG--GTGGGG-AT-A-A----CA----------------C----TT---------------A---------------G-------------C-----T------TG----------------AGA-------CT-------T-----TG-------T--TGTT------------G------AAGGACAAA-------ATAGGTCCAATT-ATTT-TCCT--TA----AAGTT-ATCGTGAACCGGATAGACTGGAAAC-TTTGT-CAGGAC-AGACAGATCCAATTATTTTTCT--GACTAG
gi|1                          :               TTAA-TCGAA--T-TGATTAC-AC-GA---------T-A--T-AT-C-AAGC-A-AT----A-T-----A-T-----TG-A-T-A--TT-AACTT-A-T---C--AGA-G-AA-TTCCA-T------------------------TTCA---------------------TTTATGCGT---TAATTTT--GACCAGACGT-----G-AAAACG-----C-GAA-A-----C-A--CAC-TCG-TT-A-TT-C--T-TTG-TT-TT-GTT---T-G---------C--TTT--C-TATTTGGTTG-GGA--GG--G-A-------CT---AAAACTT-AT-GG-T-GGAT-CAA--A-AA-GAACGACGG--TTGGGG-AT-A-A----CA----------------C----TTAGAACTCCTATATTAA---------------G-------------C-----T------TATCGGACACAT------AGA-------CT-------T-----TGAAAACCTT--TGTT------------GCTATGAAAGGAC-AA-------ATAGGTCCAATTCA--T-TCCTTATA----AACTTGATCGTGAACCGATTGAACTGGAAACATATGTCCAGGAC-AGACAGATCCAA--ATTTTTCT---ACTAG
gi|10                         :            CAATTAA-TGGAA--T-TTAT-AC-CC-GAC--------T-A--T-TA-C-AAGG-C-AT----T-T-----A-T---A-TG-A-T-A--TT-A--TT-A-T-T-C--AGA-G-AA-ATT-A-T------------------------TTCA---------------------TTT-----T---T-----T--G------TGT-----T-AAAAC------C-GAA-ATG---T-A--TAC-CCG-TT-A-TT-C--T-TTG-TT-TT-GTT---T-G---------C-T------------------GGA--GG--G-A-------CT---AAAA-TT-AT-GG-T-GGAT-CTA--A-CA-G------GG--GTGGGG-GT-A-A----CA----------------C----TT---------------AGAACCCCTATATATGG-------------C-----T------TATCGGAT----------AGA-------CTTGAAATCT-----TG-------T--TGTT------------G------AAGGAT-AA-------ACGGGTCCACTT-ATTT-TTCT--TA----AATTT-ATttactggtggatctacagtgagggccgggtgtggatgtaaacttagctgttggacactttcaaacttgacaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttg
gi|11                         :                                                      --T-TA-C-AAGG-C-AT----T-T-----A-T---T-TG-A-T-A--TT-A--TT-A-T-T-C--AGA-G-AT-ATC-A-T------------------------TTCA---------------------TTT-----TATCTT----T--G------CGT-----T-AAAAC------C-AAA-A-----C-A--CAC-----CT-A--------------T-TT-GTT---T-G---------C-TTTT--C-TA-TTTGGTG-GGA--AG--G-A-------CT---AAAA-TT-AT-GG-T-GGAT-CTA--A-CA-G------AG--GTGGGG-AT-A-A----CA----------------C----TT---------------A---------------GAA-----------C-----TCCTATATGGTTTATCGGAT-----AGATTTGAAACT-------T-----TG-------T--TGCT------------G------AGAGAC-----------------------ATTT-TCCT--T-----AAGTT-ATCGTGAACCGAATAGACTGGAAAt
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gi|20                         :                  A-TGGAA--T-TGAT-AC-AC-GAC--------T-A--T-TA-C-AAGA-C-ATAATTT-T-----A-T---A-TG-A-T-A--TT-A--TT-A-T-T-C--AGA-G-AA-ATC-A-T------------------------TTCA---------------------TTT-----T---T-----T--G------CGA-----T-AAAAT------C-GAA-A-----C-A--CAC-CCG-TT-A-TT-C--T-TTG-TT-TT-GTT---T-G---------C-TTTT--C-TA-TTTGGTG-agtttctactagttatcatgttggatctaagtgaggccgagtgtggatgtaaattagcttgtggacacttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgaa
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                               ------CGT-----T-AAAAC------C-GAA-A-----C-A--CAT-CCG-TT-G-TT-C--T-TTG-TT-TT-GTT---T-G---------C-TTTT--C-TG-TTTGGCG-GGA--GG--G-A-------CT---AGAA-TT-AA-GG-T-GGAT-CTA--A-CA-G------------GAGG-AT-A-A----TA----------------T----AT---------------G---------------G-------------C-----T------Tactacaatataattaatcctaaggaat
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ATCGGATAGACTGGAAAC-TTTatcggatagactggaaacttttga
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        cgttaaaaccgaaacacatccgttgttctttgttttgtttgcttttctgtttggcgggagggactagaattaaggtggatctaacaggaggataatatatggctt-ATTT-TCCT--TA----A--TT--TCGTAAACCAGATAG-CTGGAAAC-TTTGT-CAGGACAAGAAAGGATCAATTATTTTTCTAAAACTAGtga
gi|23                         :              ATTAA-TGGAA--T-TGAT-AC-AC-GAC--------T-A--T-----------------------------T---A-TG-A-------T-A--TT-A-T-T-C--AGA-G--A-ATT-ATT------------------------TTCA---------------------TTT-----T---TT----T--G------CGT-----A-AAAAC------C-GAA-A-----C-A--CGC-TCG-TT-A-AT-T--T-TTG-TT-TT-GTT---T-G---------C-TTTT--C-TATTTttgaggtggatgctaagtgagcccggatgtggatataaattaagct
gi|24                         :              ATTAAATGGAA--T-TGAT-ACGAC-GAC--------TCA--T-TAAC-AAGGAC-CT----TAT-----A-T---A-TG-A-T-A--TT-A--TT-AAT-T-C--AGA-G-AA-ATC-A-T------------------------TTCA---------------------TTT-----T---CAT---T--G------CGT-----G--AAAC------C-GAA-A-----C-A--Cgttgg
gi|25                         :                                                                                                                         GA-G-AA-ATT-A-T------------------------TTCA---------------------TTT-----T---TA----T--G------CGT-----G--AAAC------C-GAA-A-----C-A--CAC-TC-----A-TT-C--T-TTG-TT-TT-G-T---T-G---------C-TTTT--CATA---TGATG-GGA--GG--G-A-------CT----AAA-TT-AT-GG-T-GGAT-CT
gi|26                         :                                                                                                                             -AA-AT----T------------------------TCCA---------------------TTT-----T---T-----T--G------CCTTTTAAA-AAAAC---------AA-A-----C-A--C----CG-TT-AATT-C--T-TTT-TT-TT-TTTAATT-G---------C-TTTT--C-TATTTTG
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               GTT------------G------AATGATAAATGCCTTAATGGGTTTAATT-AACT-TCCT--TA----AAGTG-ATCGTAAACCGGATAGACTGGAAtgac
gi|28                         :                TAA-TGGAA--T-TGAT-AC-AC-GAC--------T-A--T-AA-C-AAGA-C-AA----T-A-----A-C---A-AG-A-C-G--TT-T--AT-A-T-T-C--A
gi|29                         :       gcaggCAATTAA-TGAAA--T-TGAT-AC-AC-GAC--------T-A--T-TA-C-AAGA-C-AT----T-G-----A-T---A-TG-A-T-A--TT-A--TT-A-T-T-
gi|3                          :            CAATTAA-TGGAA--T-TAAT-AC-AC-------------------TA-C-AAGG-C-AT----A-T-----A-T---A-TG-A-T-A--TT-A--TT-A-T-T-C--ACA-G-AA-ATC-A-T------------------------TTCA---------------------TTT-----T---TA----T--G------CGT-----G-AAAAC------C-GAA-A-----C-A--CGC-TCG-TT-A-TT-C--T-TTG-TT-TT-GTT---T-G---------C-TTTT--C-TATTTTGGTG-GGA--GG--G-A-------CT---AAAA-TT-AT-GG-T-GGAT-CTA--A-CA-G------GG--TTGGGG-AT-A-A----CA----------------C----TT---------------A---------------G-------------C-----T------TG----------------AAA-------CT-------T-----TG-------T--TGTT------------G------AAGGACAAA-------ATAGATCCAATT-ATTT-TCCT--TA----AAGTC-ATCGTGAACCGGATAGACTGGAAAC-ATTGT-CAGGAC-AGACGGATCCAATTATTTTTC---GACTAGt
gi|30                         :            CAATTAA-TGGAA--A-TGAT-TC-AC-GAC--------T-A--C-TA-C-AAAA-C-AT----T-T-----A-T---A-TG-A-T-A--TT-A--TT-A-T-
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ---AAAA-TT-AT-GG-T-GGAT-CTA--A-CA-
gi|4                          :              ATTA--TGGAT--TGTGAT-AC-AC-GAC--------T-A--T-TA-C-AAGA-C-AT----T-T-----A-T---A-AT-A-C-A--TT-T--AT-A-T-T-T--AGA-GTAA-ATC-AAT------------------------TTCA---------------------TTT-----T---TA----T--G------CGT-----G-AAAAC------C-GAA-A-----CGA--CAC-TCG-TT-A-TTTC--T-TTG-TT-TTTGTT---TTG---------C-TTTT--T-CATTT--GTG-GGA--GGCTG-AAC-----CT---AAAA-TT-AT-GG-T-GGAT-CTA--A-CA-G------GG--GTGGGGAAT-A-A----CAACAGAACTAG------C----TT---------------ATTCGGATAGC-----G-------------C-----T------TG----------------AAA-------CT-------T-----TG-------T--TGTT------------G------AAGGACAAA-------TTAGGTCCAATT-ATTT-TCC---TAGACTAAGTT-ATTGTAAACGGGATAGACTGGAAacttagaactcctgtatc
gi|5                          :             AATTAA-TGGGA--TGTGAT-AT-AC-AAC--------T-AGAT-TA-C-AAGG-C-ATG---T-T-----AAT---A-TG-A-T-AA-TT-A--TT-A-T-TTC--AGA-G-AA-TTC-A-TG-----------------------TTCGATGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT-----T---TT----TCGG------CGT-----G-AATAC------C-GAA-A-----TAA--CAC-TCG-TA-T-TT-C--TATTGATT-TC-GTT---T-G---------CGTCTTAGC-TATTTGGTTG-GGA--GG--GTA-------CT---AAAATTT-AT-GGTT-CGAT-CT---A-CA-G------GG--GTGGGG-AT-ACA----CA----------------CG---TT---------------A---------------
gi|6                          :              ATTGA-TGGGA--T-TGAT-AT-AC-GAC--------T-A--T-TA-C-AAGG-C-AT----T-T-----A-T---G-AA-A-T-A--TT-A--TT-A-T-T-C--CGA-G-AA-ATT-A-T------------------------TTCA---------------------TTT-----T---CT----T--G------CGT-----T-TAAAC------C-AAA-A-----C-ATGTAC-CCA-TT-A-TT-C--T-TTA-TT-TT-GTT---T-G-----------TTTT--T-TCTTTTGGTG-GGA---G--G-A-------C------AA-TT-ATGGG-TAGAAT-CTT--A-----------GG--GT-GGG-AT-A-A----CA----------------TTA--TT---------------ATTAG-----------G-------------C-----T------TATCGGAAT---------AGATTAAAATCT-------T-----TG-------T--TGT--------------------GAGGAC-AA-------ACGGGT-CAATT-TTTTCTCCT--TA----AAGTT-ATCGTGGATCGGATAGTCTAGAAAcgaacttcctataagttggcttatatcggctagacttgagaggtcttaggttgtt
gi|7                          :                 AA-TGGAA--T-TGAT-AC-AC-GAC--------C-A--T-TA-C-AAGG-C-AT----A-T-----A-T---A-TG-A-T-A--TT-A--TT-A-T-T-C--AGA-G-AA-ATC-A-T------------------------TTCA---------------------TTT-----T---TA----T--G------CGT-----G-AAAAT------C-GAA-A-----C-A--CGC-TCG-TT-A-TT-C--T-TTG-TT-TT-GTT---T-G---------A-TTTT--C-TA-TTTGGT--GGA--GG--G-A-------CCAAAAAAA-AA-AT-GG-T-GGAT-CTA--A-CA-G------GA--GTGGGG-AT-A-A----CA----------------C----TT---------------A---------------GAATTCCTATATGAC-----T------TG----------------AAA-------CT-------T-----TG-------T--TGTT------------G------AAGGAC-AT-------ATAGATCCAATT-ATTT-TCCT--TA----AAGTT-ATCGTGAACCGGATAGACTGGA
gi|8                          :            tgATTAA-TGGAA--T--GAT-AA-AA-AGC--------T-C--T-TAAC-AAGG-CCAT----A-C-----A-T---A-TG-A-T-A--TTGA--TT-AAT-T-C--AGA---AA-ATC-A-T------------------------TTCA---------------------TTT-----T---TA----T--G------CGT-----G-AAAAC------T-GAACA-----C-A--CGC-TCG-TT-A-TT-CCTT-TTG-TT-TT-G-T---T-A---------C-CTTT--C--A-TTTGGTG-GGA--GGA-G-A-------CT---TAGA-TT-AT-GG-T-GGATACTA--A-CACG------GGAAGTGGGC-GTAA-A----CA----------------CT---TT---------------A---------------A-------------CCTCTAT------TGTATATGCGTATTGGATAGA-------CT-------T-----TGAAAAC--T--TGTT------------GTTGA--AAGGACAAA-------CTAGGTACAA
gi|9                          :             AGTTAA-TGAAA--T-TG-T-AC-AC-GAC--------T-A--T-TA-C-AAG----------C-T-----A-T---A-TGGA-T-A--GT-A--TT-A-T-T-CCAGGA-G-AAGATC-T-C------------------------TTTA---------------------TTT-----C---TA----T--G------CGT-----G-AAAACAGAATTC-GAA-A-----C-A--CAT-TCG-TT-A-TT-C--T-TTG-TT-TT-GTT-----G---------C-TTTT--C--ATTT-GGTG-GGA--GG--G-A-------CT---AAA--TT-AT-GG-T-GGAT-CTA--A-CA-G------GG--GTGGGG-AT-A-A----TA----------------C----TTAG-------------A---------------G-------------C-----T------C---------------------------CT-------A-----TA-------TCATGTA------------T------ATGGTT-----------TAGGTCCAAAT-ATTT-TCCT--TA----AAGTT-ATCGTGAACCGGATAGACTGGAAc