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Reference ( gi|1 ) : TCATTGCGTTAAAGAT--TCAATATGGTAGGGAATTTAAT--CGC--ACCAGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTCATTCACAGAAA-CGTT--C--A--A---------------CA-------A--C-------AG-CGT-TT--C--GT---------T-T-CG-T-GCAA--A----------C----CG---TT------C-A--------T---GG-----T-C-----C--A--G---C---AGA-A------C---G-T----C-A-T----C-G-TT-CCG-T---G-C--------------------CA--AA---------C----CG----TT-C---A----G---C-GTT--T--T-GC-T----GC-----AA-A----A--C-G---T--T-C------A-----------A-G--C-G---TTC----CGT--------T-T--C--A-----------C----G--A-----AT----CGTT----T------C-GT----------T--------------T----T----C-GT-GCAAA-C--CG----TT-C--A--GCG----GGTT---T------GT-G-CA--A--A-----CC-G--TCTCA-G-------C--G---TTC--CG-T---TC----CG-----A----A--------G---TCG-T--------T-T----C---G-TT-T--T-GT-T--CCG-T-G-C-A-AGTG-G----GG-----------T-A------G--TAGCAC-GCTTGAGGGTC
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gi|16 : atatatcatattccgttaaaaagagtttttgaagaaattaatgtcgccacccgtaaaatgacctgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatgcattcaagaaacgtaaagccgctgttcgtttcggtgcA-CCTT--C--A--A---------------AA-------A--C-----------GT-TT--C--GT---------T---CG-T-ACAA--AA---------C----CG---TT------C-A--------CC--GG-----T-C-----CT-A--G---C---AGG-C------C---T-T----C-A-T----C-G-TT-CCG-T---GAA--------------------TA--AA---------G----CG----TG-T---G----G---C-G-T--T--T-G--T----GC-----AA-aagaatgttcgttttcgtttgccgctgcaatgggtagtaaacacttagtggtc
gi|24 : atgtatcattgcctttactatattttagaatttactcgacaccgtacaaaacgacctgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcattcatgaacgctcaaagcgtttcatattttgtgcaatg-CGTT--C---------------------CA-------A----------AG-TGT-TT--C--GT---------T-T-CG-G-GCAA--A----------T----CA---TT----------------------------------------------T---AAA-G------C---G-T----T---T----C-G-TT-TC--T---T-T--------------------CA--AA---------C----CG----TT-C---A----C---C-GTT--C--C-G--G----GC-----AG-A----C--C-G---T--T-C------------------A-T--C-G---TTC----CGT----------------G-----------C----A--A-----AC----CGTT----A------A-GTG---------T--------------T----T----C-GT-GAAAA-C--CG----TT-C--A----G----GGTT---TCGTTCCGT-G-CA--A--gtggagtagaagcacggcttt
gi|18 : gcgtgcaagccccgcctac-CGTT--CCGG--G---------------CA-------A--T-------AG-CGT-TT--C---T---------T-C-CG-T-TTAA--GGTTTCCG---T----CG---TT------C-A--------A---CG-----T-CACGTTC--G--G---C---AGA-A------CC--G-TT---C-A-T----C-G-TT-CCG-T---G-----------------------A--AA---------C----CG----CT-T---A----G---C-GTT----------C----GT-----AA-A----C--C-G---T--T--------------------A-G--C-G---TTT----CGTGAACG---T-T--C--A----------------G--------------CATT----T------C-G-----------T--------------T----C----C-GT-GCAgtggggtagtagcaccaggggtcataatgataaccata
gi|13 : gataattgcgttaagatattttagaatttaactgacccgtaaattgactgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagcgtttGTT--C--AT-G---------------CA-------G----------AA-CGT-TCAGC--GT---------T-T-CT-T-GCAA--A----------C----CG---TT------T-AC-------C---GT-----T-C-----C--GT-G---CA--AGA-AT-----C---G-T------G-T----C-G-TT-TCA-T---gtggggtagtagcgctgttagg
gi|2 : tatgtctatattattgcgtttgagatattttacaatttaatcgtgtccgtaaaatcgacctgaataatgcaaaagaaactannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnataattcaaagaacgggcagattatcgtgcaaagcgtttactgccaaccgtcagcaGTT--C--AT-G---------------CA-------A--G-------AGACGT-TCAGC--GT---------T-T-CT-T-GCAA--A----------C----CG---TT------T-A-------------------------------------------A-A------C--------------T----C-G-TT-CCG-T---G-C--------------------tacgcggaagtcaggtaataaaacgttttagg
gi|3 : attgcaaggctatgtctatattaggcgtttgagattatttacaatttattcgtgtcctaaaacgacctgaataatgtcaacaagannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnataattcaaagagggcagattaatcgtgcaaagcgtttactgccaaaccgtaca---------------CA-------A----------AG-CGT-TT--C--GTA--------T-T-CG-G-GCAA--A----------G----CGAT-TT------C-G--------T---T------T-C-----C--C--G---TTT-AAA-G------C---G-T----T---C----C-G-TT-CCG-T---T-T--------------------CA--AA---------C----AG----TTTC---A----C---C-GTG--T-----C-C----GC-----AG-A-------C-G---T--T-C------A-------------T--C-G---T-C----CGT----------------A-----------C----------------------------------------------------------------------------T-GCAAA-C--CG----TT-C--A--GC-----GTTC---C------GT-ACCA--A--A-----CC-G--T-TCA-G-------C--GC--TTT--CG-T---T-----CA-----A----A-------------CG-C--------T-TCAG-C---G-TT-T--C-GT-T--CCG-T-G-C-A-AGTG-GGAAAGG-----------T-A------G--TAGCAC-GCTTacgagagaatcgtgtcgtttcaattacgcggaagtcaggtaattaaaacgttttagggtgttttaaaccatgattgtgacgtgaacctttttttt
gi|37 : tgatatcattcgttaaagataattttagaatttatctgacccgtagaaattgactggnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnA-------A--T-------AT-CGT-TT--T--GT---------T-T-CG-T-ACAA--A----------T----CG---TT------C-A--------T---------------------------------------------------------------C-G-TT-CCG-C---G-C--------------------CA--AG---------C-----G----TT-C---A----G---T-GTT--T--C-G--T----GC-----AA-A----C--C-G---T--T-C------A-----------C----C-G---TTC----CG---------T-T--A--A-----------A----G--A-----AT----CGTG----T------C--C----------T--------------T----C----C-GT-GTAAatagg
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gi|12 : atttcatggtattttctgtatcatcgcatttgagatattttttcgaatttaattgtgcccgtaaaatcggcataataatgcagagaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaacatcggg-------AG-CAT-TT--C--GT---------T-T-CG-G-GCAA--A----------C----CG---TT------T---------------------------------------T---AAA-G------C---G-T----T---T----C-G-TT-TCA-T-----T--------------------CA--AA---------C----CG----TT-C---A----C---C-GTT--C--C-G--G----GC-----AG-A----C--C-G---T--T-C------------------A-T--C-G---TTC----CGT----------------G-----------C----A--A-----AC----CG-T----T------C-A--------------------------------------GT-GCAAA-C--CG----TT-C--A---CC----GTTT---T------GT-G-CA--A--A-----AC-A--T-TCA-C-------C--G---TTT--CG-T---TC----------------------------------------------------------------------CG-T-G-C-A-AGTG-G----GG-----------T-A------G--TAGCAC-GCTTTAGGGTCttgaagttggatagtagcacgctttagggtctg
gi|6 : gaatcattgcgttaaagatattttagaatttaatcgcacccgtaaaattgacgtgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaa-------AG-C-T-TT--C--GT---------T-T-CG---GCAA--A----------CGTTTCG---TT------C---------------G-----T-T-----T--A--A-------AG-----------------------------C-G-TT-CCG-T-------------------------------A---------C----CG----TT-C---A--------------------------------------A----A--C-G---T--T-C------C-----------A-C--C-G---TTC----CGG--------G-C--A--A-----------C-------A-----GT----CAT------------C-GT----------C------------------------C-GTCGCAAA-C--CG----TG-C--A--GCG----T-TC---C------GT-A-CA--A--A-----CC-G--T-TCA-G-------C--G---TTT--CG-T---TG----CA-----A----A------------CCG-T--------T-CAG--C---G-TT-T--C-GT-T--CCG-T-G-C-A-AGTG-GT---GG-----------T-A------G--TAGCAC--CTT
gi|24 : gaatcatttgcgttaaagatattttagaattttacgcacccgtttaaaattgacctgaatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaa-------AG-CGT-TT--C--GT---------T-T-CT-T-TCAA--A----------C----CG---TT------C-A--------C---CG-----T-T-----CCGG--G---C---AGA-C------C---GTT----C-A-T----C-G-TT-CCG-T---G----------------------CA--AA---------C----CG----TT-A---A----G---T-GTT--T--C-G--T----GA-----AA-A----C--C-G---T--T-C------A-----------G-G----G---TTT----CGT--------T-C--C--
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gi|35 : atcattgcgttaaagatattttagaatttaatcgcgcacccgtaatataaaaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaaagcgtcttcgttatcggcaaaagcgttttctccgtttaaaagcgtttcgttccgttt-CGT-TT--A--GT---------T-T-CG-T-TCAA--A----------T----CG---TT------C-A--------T---CG-----T-T-----C--AATG---C---AGA-T------C---GTT----C-A-T----C-G-TT-TCG-C---G----------------------CA--AA---------C----CG----TT-C---A----G---C-GTT--T--C-G--T----GC-----AA-A----C--C-A---T--T-C------AG----------A-G--C-G---TTC----CGT--------G-T--G--A----------------G--A-----AT----CGTT----C------C-GTGTAAGAAGCGT--------------T----T----C-GT-GCAGA-cgtgccaagtgggggtgagatttggtagtagcacgctttagggtct
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gi|34 : aaaccattcag--C--GT---------T-T-GG-A-GCAA--A----------G----CG---TT------CCA--------T----------T-C-----A--A--A---C---TG-------------T-T----C-A-C----T-G-TT-CCG-T---G-C---------------------A--GA---------C----CG----TT-C---A----G---C-GTT--T--C-G--T----GC-----AA-A----C--C-G---T--T-C------------------A-C--C-G---TTC----CG--------------C--A-----------CAA--G--A-----AT----CGTT----T------C-A-----------T--------------T----C----C-GT-GCAtccgtggcaagtgggtagtaggca
gi|4 : gccttttgttgaaag--C--GT---------T-T-CA-T-GCAA--T----------C----TG---TT------C-A---------------------C-----C--AT-G---C---AGA-C------C---G-TA---C-A-A----C-G-TT-TCA-T---G-C---------------------A--AA---------T----CAATGATT-C---A----G---C-GTT--T--C-A--T----GC-----AA-ATTTAA--CTG---T--T-C------A-----------C-C--C-G---TTC----CAT--------G----C--A-----------A----G--A-----AT----CATT----T------C-GT----------TTCG-----------T----T----CTGT-GCAAggtggggtaatagcacactttagggtct
gi|23 : ggatatgtatgtatcatggcatttgagatattttagaagttagaaataccgagaaaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcattcaagaagcaagcagcatttcatgcaaacacatttcgtgcaagg--C--AT---------T-T-TG-T-GCAC--A----------C----CA---TG------C-A------------GA-----T-CATT--C--A----------AGA-A------ATGAG-T----A-G-T------G-TT-TCG-T---G-C--------------------AA--AG---------C----AT----TT-C---A----G---C-GTT--C--T-G--T----GC-----AG-A----T--C-A---T--T-C------G-----------A----C-G---TTC----CA---------T-A--C--A-----------A----G--A-----AT----TGTT----T------C-GC----------T--------------T----T------GT-GCgtggggtagtagcacgctttagggtgtg
gi|38 : tttccagattatttctgtattacatttgagatattttatagtttaatcacgcctgtaaagacctgaataatttcaaaacctaagtgtgcaagccgcctac--C--GT---------T-C-CG-T-ACAA--A----------C----CG---TTCGC---C-A--------T----------T-C-----C--GT-G---C---AAA-C------C---ATT----C-G-C----C-G-TT-CCG-T---G----------------------CA--AA---------C----CA----TT-T---A----AAATC-GTT--TCGT-GC-T--------------A----G--T-G---G--T-G------A-----------A-G--T-A---GTA----CGT--------T-T--C--A-----------tattggggtagtagtaccctttagagtctgta
gi|33 : tttagtgttccatgcagacagttccg--C--AT---------T-C-CG-T-GCAA--A----------G----CG---TT------A-AG-------C---GT-----T-C-----C--AT-G---C---ATA-T------CA--G-T----CAA-G----C-A-TT-CTG-T---G----------------------CA--AA---------G----CA----TT-T---A----G---C-ATT--C--CAG-------GC-----AA-G----A--CTA---T--T-T------T-----------A----C-G---TTC----CAT--------G-T-----A-----------A----G--A-----AT----Cgggtctgc
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gi|2 : tatgtctatattattgcgtttgagatattttacaatttaatcgtgtccgtaaaatcgacctgaataatgcaaaagaaactannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnataattcaaagaacgggcagatta-T-CG-T-GCAA--A----------G----CG---TT------T-A--------C---TG-----C-C-----A--A--A---C--------------C---G-TA---C-A--------G-TT--CA-T---G-C--------------------AAG-AG---------A----CG----TT-C---A----G---C-GTT--T--C--T-T----GC-----AA-A----C--C-G---T--T-T------A-----------A-ACTC-G---TTC----CG---------T-G--C--A-----------CGAGAG--A-----AT----CGTG----T------C-GT----------T--------------T----cattacgcggaagtcaggtaataaaacgttttagg
gi|25 : attgcaaggctatgtctatattaggcgtttgagattatttacaatttattcgtgtcctaaaacgacctgaataatgtcaacaagannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnataattcaaagagggcagattaa-CG-T-ACAA--A----------C----CG---TT------C-A--------G---CG-----T-C-----CGTA--C---C---AAA-T------C---GTT----C-AGT----C-GCTT-TCG-A---A-G--------------------CA--AA---------C----CG----TT-C---A----G---CAGTA--T--C-G--T----GC-----AA-C----C--C-G---T--T-C------------------A-G--C-GTTATTC----CGT--------G-T--C--A-----------A----T--A-----AC----CGTT----T------C-caattacgcggaagtcaggtaattaaaacgttttagggtgttttaaaccatgattgtgacgtgaacctttttttt
gi|38 : c--------T---GT-----T-C-----C--AT-G---C---AGA-C------A---G-TT---C-C-G----C-G-TT-CCG-T---A-C---------------------A--AA---------C----CG----TT-C---G----C---C-ATT--C--C-G--T----GC-----AA-A----C--C-A---T--T-C--------------------G--CCG---TTC----CGTGCAAACCAT-T--T--A----------------A--A-----AT----CGTT----T------C-GT----------G--------------C----T----A-GT-Gacgcgggtttccttcaaggattattcgtattctccgtgcaagtgggggcagtgttgatagtagtagcaccatttagt
gi|8 : tttag---AAA-G------C---G-T----C-T-T----C-G-TTATCG-----G-C---------------------A--AA---------------------------A----G---C-GTT--T--T--C-T----CCGTTTAAA-A----G--C-G---T--T-T-----------------------C-G---TTC----CGT--------T-T--A--G-----------C----G---------T----CGTT----C------C-GT----------TCAAACCGTTCACCTT----C----C-GG-GCAGA-C---G----TT-C--A--GCC----GTTC---C------GT-A-CA--A--A-----CC-G--T-TCA-G-------C--G---TTG---G-T---TG----CGTGC--A----A--------A---CCG-T--------CAG----C---G-TT-T--C-GT-T--C-G-T-G-CCA-AGTGGG----GG-----------TGA------GATTTGCAC-GCTTgtgaagtagtacgtttcagggtctgc
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gi|5 : tcattgcgttaaagatattttagaatttaatcgcgcacccgtaatataaaaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnt---AAA-G------C---G-T----C-T-T----C-G-TTATCG-----G-C---------------------A--AA---------------------------A----G---C-GTT--T--T--C-T----CCGTTTAAA-A----G--C-G---T--T-T-----------------------C-G---TTC----CGT--------T-T--A--G-----------C----G---------T----CGTT----C------C-GT----------TCAAACCGTTCACCTT----C----C-GG-GCAGA-C---G----TT-C--A--GCC----GTTC---C------GT-A-CA--A--A-----CC-G--T-TCA-G-------C--G---TTG---G-T---TG----CGTGC--A----A--------A---CCG-T--------CAG----C---G-TT-T--C-GT-T--C-G-T-G-CCA-AGTG-G----GGGTGAGATTTGGT-A------G--TAGCAC-GCTTTAGGGTCt
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gi|46 : attcaaagatcagttgaagcagttgattgattt-T----C-A-T----C-G-TT-CCG-T---G-A--------------------TA--AG---------CGTTTTA----TT-T---G----G---C-GTT--T--C-G--T----GC-----AA-gacgtggttgcacgtttacggttatgtaa
gi|30 : ggccgt-T----C-A-C----C-A-TT-CGG-T---G-C---------------------A--AA---------C-----G----TC-C--------G---C-GTC--T--T-GC-------------AA-A----G--T-G---T--T-T------AGTGTCCAGCAAA-G--C-G---T------AGT--------G-C--C--A-----------T----C--A-----AG----CGTG----T------A-GT----------G--------------T----T----CTGT-GCACA-G--TG----TT----A--GTG----T-TC---C------AT-G-CA--A--A-----GC-G--TTT---A-------T--G---TTC--TG-T----------G-----A----A--------A---GCG-T--------T-A------------------GTAT--CCG-T-G-C-A-gtggggtagaagcatgctttaggatct
gi|4 : gatcat----C-A-G----C-A-TT-TCA-T---G-C---------------------A--AA---------C----------------------A---C-ATT--T--C-G--T----GC-----AA-G----G--C-G---T--TTC------A-----------T-G--C-A---ATC----TGT--------T----C--A-----------C----C--ATGCAGAC----CGTA----CAA----C-GT----------T--------------T---------C-AT-GCAAA-T--CAATGATT-C--A--GCG----T-TT---C------AT-G-CA--A--ATTTAACT-G--T-TCA-C-------CC-G---TTC--CA-T---GC----AA-----G----A--------A---TCA-T--------T-T----C---G-TT-T--C-GT-T--CTG-T-G-C-A-AGTG-G----GG-----------T-A------G--TAGCAC-GCTTTAGGGTgcgtttatgtttctgtc
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gi|17 : attgcgttaaagatattttagaatttaattgacctannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatcattcaagaaacgttcaaatgtt-T----C-G-TT-TCGGT---G-C---------------------A--AA---------C----C-----TT-C---AAAACG---C-GTT--TCTT-CC-T----GC-----AA-A----C--C-GGTCT--T-C------A-----------T-T--C-G---TCCGGCACGT--------CGT--C--A-----------A----G--A-----AT-----GTT-----------C-GT----------T--------------T----T----C-GT-
gi|22 : atatatcatattccgttaaaaagagtttttgaagaaattaatgtcgccacccgtaaaatgacctgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatgcattcaagaaacgtaaagccgctgt-G-TT-TCG-T---G-C------------------------AA---------------------------A----G---C-GTT--T--C-G--T----GC-----AA-A----C--C-G---T--G--------G-----------A-C--C-G---TTC----CG---------T-G--C--A-----------A----G--A-----AT----CTTT----T------C-AT----------T--------------ttgccgctgcaatgggtagtaaacacttagtggtc
gi|24 : tttcaaggttatttctgtatcattgcgtctgagatattttagaatttaatcgaacccgtaaaattgacacgaataatgcctataacaactccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcattcaagaaatgaacagt-CCG-T---T-C--------------------CA--AA---------G----TG----TT-T------------C-GTT--T--C-GG------GC-----AA-A----T--C-A---T--T-T------A-----------AAG--C-G---TTT----CGT--------T-T--C--TTT---------C----A--A-----AC----CGTT----CAC----C-GT----------T--------------C---------C-GG-GCAGA-C--CG----TT-C--A--TCG----T-TC---C------GT-G-CA--A--A-----CC-G--T-TAA-G-------T--G---TTT--CG-T----------G-----A----A--------AA--CCG-T--------T------CAGGG-TT-T--C-GT-T--CCG-T-G-C-A-AGTG-G----GG-----------T-A------G--TAGCAC-
gi|25 : gcgtgcaagccccgccta-CCG-T---A-C---------------------A--AA---------C----CG----TT-C---A----G---C-GTC--CG-T-AC-------C-----AA-A----T--C-G---T--T-C------A-----------G-T--C-G---CT----------------T-T--C--GAAG--------C----A--A-----AC----CGTT----C------A-GCAG--------T--------------A----T----C-GT-GCAAC-C--CG----TT-C--A--GCGTT--ATTC---C------GT-GTCA--ATAA-----CC-G--TTTCACG-------C--GGGTTTC--C--T---TC-----------A----A--------GGA-TTA-T--------T------C---G-TA-T--T--C-T--CCG-T-G-C-A-AGTG-G----GG-----------caggggtcataatgataaccata
gi|23 : G-T---G-C---------------------A--AG---------C----CG----CC-T---A----C---C-ATT--T--T-G--T----GC-----AC-A----C--C-A---T--G-C------A------------------G---ATC----A----------T-T--C--A-----------A----G--A-----AA----TGAG----T------A-GTG---------T--------------T----T----C-GT-GCAAA-G--CA----TTTC--A--GCG----T-TC---T------GT-G-CA--G--A-----TC-A--T-TCG-A-------C--G---TTC--CA-T---AC----AA-----G----A--------A---TTG-T--------T-T----C---G-CT-T--T-GT----------G-C-T-ATTG-G----GG-----------T-A------G--TAGTAC-CCTTTAGAGTCgcagtgttgatagtagtagcaccatttagt
gi|41 : tttccagattatttctgtattacatttgagatattttatagtttaatcacgcctgtaaagacctgaataatttcaaaacctaagt--------------------CA--AA---------C----CG----TT-C---A----G---A-AAG--T--T-GC------AC-----AA-A----ATCC-G---T--T-C------------------A-G--C-G---TTC----CGA--------T-T--C--A-----------A----G--A-----AT----CGTT----T------C-CG----------T--------------T----T----C-GT-G-----C--CG----TG-C--A--Gtgta
gi|16 : cgccg--------------------CA--AA---------G----CG----TT-T---C----A---T-ATT--T--T-G--T----GC-----AATG----A--C-C---T--T-C------A-----------A--------------------------------------------------------A-----AA----CGTT----T------C-GT----------T------------------------C-GT-ACAAAAC--CG----TT-C--A--CCG----GTCC---T------A--G-CA--G--G-----CC-----TTCA-T-------C--G---TTC--CG-TGAAT------A-----A----A--------G----CG-T--------G-TGG--C---G-TT-T------------G-T-G-C-A-AGTG-G----AG-----------T-A------G--AAGCACGGCTTagtggggtaatgtacacgctttaggggtc
gi|60 : atgtatcattgcctttactatattttagaatttactcgacaccgtacaaaacgacctgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcattcatgaacgct--------------------CA--AA---------C----CG----TT-C---A----G---C-CTT--T--C-G--T----GC-----AA-A----C--C-C---T--T-C------A-----------t
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gi|26 : atattttagaatgttaattcgcacacgtaaaattacctggnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattcaattcaaagaaacgtttcaA--AA---------T----CG----TT-C------------T-GTT--T--C-G--T----GC-----AA-A----T--C-G---T--T-T------A-----------AAG--C-G---TTT----CGT--------T-T--C--G-----------T----GCAA-----AG----CGTC----CAG----C-GT----------T--------------C---------C-GG-GCAGA-C--CG----TT-C--A--TCG----T-TC---C------GT-G-CA--A--A-----TC-G--T-TCA-G-------C--G---TTT--CG-T---GC-----A-----A----A--------GCGTTCG-T--------T-T----C---G-TT-T--C-GT-T--CCG-T-G-C-A-AGTG-G----GG-----------T-A------G--TAGCAC-GCTTTAGGGTCat
gi|32 : aacgtttA--AA---------C----CA----TT-C---A----G---C-GTT--C--C-G--T----AC-----AA-A----T--C-G---T--T-C------AG----------A-G--C-GAG-TTC----CGG--------T----A--A-----------C----A--A-----AC----CGTT----CAGCAGAC-GT----------T--------------T---------C-GT-GCAAA-C--CG----TT-C--A--GCG----TTTT---C------GT-G-CA--A--A-----TC-G--TTTCA-G-------C--G---TTC--CG-T---TC-----------A----A--------GA--TCG-T--------T-TC---C---G-TT-T--C-GT-T--CCG-TGG-C-A-AGT--G----GG-----------T-A------G--TAGtg
gi|14 : --AA---------A----CG----TT-C---AAA--G---C-GTT--T--C-G--T----GC-----AA-A----C--A-G---T--T-C------A-----------AAG--C-G---TTT----CGT--------T-T--C--G-----------T----GCAA-----AC----CGTT----CAC----C-GT----------T--------------C----C----C-G--ACAGA-C--CG----TT-C--A--TCG----TTCC---T-------T-G-TA--A--A-----GC-G--TC-CA-C-------C--G---TTC--CG-T---TC----AA-----G----A--------A---TAG-T--------T-T----C---G-TT-T--C-GT-C--CCG-T-G-C-A-AGTG-G----GG-----------T-A------G--TAGCAC-GCTTTATGGTgca
gi|28 : atcattgctttaaagatatttaaaaatttaatcgcacacgtaaaatcgatctgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcattcaag--AA---------T----CG----TT-C---A----G------------------T----GC-----AA-A----T--A-G---T--T-T------A-------------T--C-A---TTA----AAT--------T-T----------------------A--A-----AA----CGTT----C------A-GT----------T--------------T----T----CCGT-GCAAA-C--CG----TT-C--A--GC------GTTACAT------GT-A-TG--A--A-----TC-GATTCGTA-A-------C--G---TT
gi|35 : attcaaagatcagttgaagcagttgattgatttatgtc----CG----TT-T---A----G------TT--T--C-GT-T-----C-----AA-A----T--C-G---T--T-C------A-------------T--C-G---TTC----AAT----------------G-----------C----A--G-----AT----CGTTCA--T------C-GT----------T--------------T---------C-GC-GCAAA-C--CG----TT-C--A--GCG----T-TT---C------GT-G-CA--A--A-----CC-A--T-TCA-GAG-----C--G---TTC--CG-TG--TG----AG-----A----A-----------------------------------------T--C-GT-T--CCG-T-G-T-A-AGaagtgtaaacgacgtggttgcacgtttacggttatgtaa
gi|15 : aaagcgttt---A----G---C-ATT--T--C-GT-TTCGGGC-----AA-A----C--C-G---T--T-T------A-----------AAG--C-G---TTT----CGT--------T-T--C--ATT---------C----A--A-----AC----CGTT----CAC----C-GT----------T--------------C---------C-GG-GCAGA-C--CG----TT-C--A--TCG------TT---C------GT-G-CA--A--A-----CC-G--TTTCA-GTGCAAACC--G---TTCACCG-T---TTGTTGCA-----A----A--------A----CA-T--------T-CAC--C---G-TT-T--C-GT-T--CCG-T-G-C-A-AGTG-G----GG-----------T-A------G--TAGCAC-GCTTTAGGGTCaagcgtttcgtgcagaagc
gi|39 : gaatcattgcgttaaagatattttagaatttaatcgacccgtaaaattgaccgtgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaa---A----G---C-GTT--T--C-A--T----GC-----AA-A----G--C-G---T--T-C------A-----------C----C-G---TTC----CGT--------A----C--A-----------A----G--A-----AT----CGTT----T------C-GTTACG------T--------------T----C----C-GT-GCAA
gi|40 : tcattcaagaaacgggcatcataacgtgcat---A----G---C-GTT--T--C-A--T----GC-----AA-A----G--C-G---T--T-C------A-----------C----C-G---TTC----CGT--------A----C--A-----------A----G--A-----AT----CGTT----T------C-GTTACG------T--------------T----C----C-GT-GCAAgtggggtagtaacacgctttaggttct
gi|27 : tcattcaagaaacgggcatcatacgtgcat---A----G---C-GTT--T--C-GT-T-----C-----AA-A----C--T-G---T--T-T------A-----------C----C-G---CTC----CGT--------G-T----------------------A--G-----AC----CGTT----C------A-GTA---------T--------------T----T----C-GT-GCAAA-C--CG----TT-C--A--CC------ATTG--C------GT-G-CA--G--A-----CT-G--T-TCA-T-------C--G---TTC--C--T---GG----CA-----AGAATA--------G---T-G-T--------T-T----T-----TT-T--C-GT-C--CCG-TAG-C-A-gtggggtagtaacacgcttaggttct
gi|33 : tcattcaaaaaacgggaagcttctcgttcgaaacatttcaaacaa---A----G---C-ATT--C--C-G--T----GC-----AA-A----G--C-G---T--T--------A-----------A-G--C-G---TTC----CAT----------------G-----------C----A--T-----AT----CAGT----CAAG---C-AT----------T--------------C----T------GT-GCAAA-G--CA----TT-T--A--GC------ATT---CCA----G--G-CA--AG-A-----CT-A--TTTTA---------C--G---TTC--CA-TG--TA----AG-----A----A------------TCA-A--------A-C----C-------------------------A-C-A-AGTG-G----TG-----------T-A------A--TAGTGT-GCTTCAGGGTCcgct
gi|34 : catatcagtca----G---C-CTT--T--T-GT-T----G------AA-A----G--C-G---T--T-TGGAGCAA-----------A-G--C-G---TTC----CAT--------T-------------------C----A--A-----AC----TGTT----CA-----C-TG----------T--------------T----C----C-GT-GCAGA-C--CG----TT-C--A--GCG----T-TT---C------GT-G-CA--A--A-----CC-G--T-TCA-C-------C--G---TTC--CG-C---AC----AA-----G----A--------A---TCG-T--------T-T----C---A-TT------------CCG-T-G-C-A-GGTG-G----GG-----------T-A------A--TAGCAC-ACTTTAGGGTCtgt
gi|44 : ----G---C-GTT--T--C-G--T----GT-----AA-A----T--C-G---CA-T-C------C-----------A-C--C-G---TTC----CGT--------G----C--A-----------A----G--A-----AT----CGTT----T------C----------------------------T----T----C-GT-t
gi|49 : gatcattcaggaaatgggcagattgccttgcaatA-A----A--C-T---T--T-C------A-----------AAG--C-G---TTT----CGT--------T-T--C--GTATAAACTGTTC----A--A-----AG----CGTT----T------C-GT----------T--------------T---------C-GT-GCAAA-C--CG----Tt
gi|28 : tcaag--T-C------A-----------A-T--C-G---TTC----AGT----------------G-----------C----A--A-----AT----AGTT----TAT----C-AT----------TAAA-----------T----T----T------AAA-A--CG----TT-C--A--GT-------TT---TCC----GT-G-CA--A--A-----CC-G--T-TCA-G-------C--G---TTA--CA-TG--TA----TG-----A----A------------TCG-A--------T-T----C---G-TA-A--C-GT-T--AAG-T-G-T-A-AACG-A----CG-----------T-G------G--TTGCAC-GTTT
gi|31 : attcaaagatcagttgaagcagttgattgatttatg------A-----------A-G--T-G---TTT----CGT--------G-T----------------------A--A-----AT----CCTT----TA-----C-CA----------T--------------T----C----C-GT-GCAGA-C--TG----TT-C--A--GTG----T-TT---C------GT-G-CA--A--A-----CC-G--T-TCA-T-------C--G---TTC--CG-T---GC----AA-----T----A--------A---TCG-T--------T-T----T---G-TT-T--C-GA-T--CAA-T-G-A-A-AGTG-G----AG-----------A-C------G--TACCAC-TCTTTATGGTCacggttatgtaa
gi|38 : tcattcaagaaacagacaacattccgtgca-----------A-G--T-G---TTC----CAT----------------G-----------C----A--G-----AC----AGTT----C------C-GCG---------T--------------T----C----C-GT-ACAAA-C--CG----TT-C-----GCC----ATTC---C------GT-G-CA--A--A-----CC-A--T-TCG-C-------C--G---TTC--CG-T---GC-----------A----A--------A---CCA-T--------T-T----A---A-AA-T--C-GT-T--TCG-T-G-C-T-AGTG-G----TG-----------A-A------G--TAGTAC-GTTTCAGGGTCtg
gi|20 : ttt-----------A-G--T-G---TTT----CGT----------------G-----------C----A--A-----AG----CGTT----T------T-GTGCAAAACG--T--------------T----T----C-GT-AAAGA-T--CA----AT-C--A--GCG----TTTC---T-------T-G-CA--A--A-----CC----TTTCA-G-------C--G---TTT--CG-T---GC----AA-----G----A--------A---TCG-T--------T-T----A---G-TT-tgc
gi|37 : ttcaaggttatttcttcatcatagcgattaagatattttagaatttaatggcgcccgtacaattgacctgaataatgcagagaaaagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcattcaaggaacgggc--C-G---TTT----TGT--------T-T--CGTA-----------C----A--A-----AT----CGTTCA--T------C-GT----------T--------------C---------C-GC-GCCAA-G--CG----TT-C--A--GTG----T-TT---C------GT-G-CA--A--A-----CC-G--T-TCA-C-------C--G---TTC--CG-T---T------A-----A----A--------GAA-TCG-T--------G-T----C---C-TT------------CCG-T-G-T-A-AGTG-G----GG-----------T-A------G--TAGCAC-GCTTTAGGGTCccatg
gi|49 : ttaatatT--------T-T--C--A-------------------A-----AG----CGTT----T------C-GT----------T--------------T---------C-GT-ATAAA-C--TG----TT-C--AAAGCGTTTCGTTT---C------GT-G-CA--A--A-----CC-G--Ttgt
gi|52 : tcaagaaac--------T-T--C--A-----------C----G--A-----AT----CGTT----T------CGGT----------T--------------T----TGTTCC-GT-GCAA
gi|19 : --------T-T--C--A-----------A----G--A-----AA----CATT----CAAAG--C-GT----------T--------------T---------C-GT-GTAAA-C--CG----TT-C--A--CCA----T-TC---C------AT-G-CA--G--A-----CC-A--T-TCT-T-------C--G---CTT--CG-T---GC-----A-----A----A--------G----CG-T--------T-C----A---G-C-------GC-T--TCA-T-G-C-A-AGTG-G----GG-----------T-A------G--TAGCCT-ACTTAAAGGTCgtggggtagtagcacgcttgagggt
gi|60 : tttcaaggttatttctgtatcattgcgtttaataagatattttagaatttaattgcgcccataaaatcgacctgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatca--A-----------C----A--A-----AC----CGTT----C------A-GCC---------T--------------T----T----C-GT-GCAAA-C--CC----TT-C--A--GCtg
gi|17 : gtT----T------C-GT----------T--------------T----C----G-GT-GCAAA-C--C-----TT-CAAA--ACG----CGTT---TCTTC--CT-G-CA--A--A-----CCGG--TCTT----------C--A---TT---CG-----TC----CGGC---A----C--------G---TCG-TCAAGAATGT-T----C---G-TT-T--TCGT-TTGCCGCT-G-C-A-A-T--G----GG-----------T-A------G--TAA-AC-ACTTAGTGGTC
gi|21 : atatatcatattccgttaaaaagagtttttgaagaaattaatgtcgccacccgtaaaatgacctgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatgcattcaagaaacgtaaagccgctg----------T--------------T----T----C-GT-GCAAA-G--CA----TT----------------TC---T-------C-G-CA--A--A-----CC-G--T-TCA-C-------C--G---TGC--CG-T---GC----AA-----G----A--------A---TCG-T--------T-T----C---G-TT------------CCA-T-T-G-A-AGTT-G----GA-----------T-A------G--TAGCAC-GCTTTAGGGTC
gi|22 : atttcatggtattttctgtatcatcgcatttgagatattttttcgaatttaattgtgcccgtaaaatcggcataataatgcagagaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaacatcgggcagcg----------T--------------T----T----C-GT-GCAAA-G--CG----T-----------------TT---C------GT-G-CA--A--A-----CC-G--T-GGA-C-------C--G---TTC--CG-T---GC----AA-----G----A--------A---TCT-T--------T-T----C---A-TT-tg
gi|13 : tttcaaggttatttctgtatcattgcgtctgagatattttagaatttaatcgaacccgtaaaattgacacgaataatgcctataacaactccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcattcaagaaatgaacagtg--------------T----T----C-AT-GCAGA-A--CG----TT-C--A--GCG----TTTC---T-------T-G-CA--A--A-----CC-G--TTT-A-C-------C--G---TTC--CG-T---GC----AA-----G----A--------A---TCG-T--------G-T----C---G-TT-T--C-AT-T--ACG-C-G-G-A-AGTC-A----GG-----------T-A------A--TAAAAC-GTTTTAGG
gi|2 : tatgtctatattattgcgtttgagatattttacaatttaatcgtgtccgtaaaatcgacctgaataatgcaaaagaaactannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnataattcaaagaacgggcagattatcgtgcaaagcgtttactgccaaccgtcagcag--------------T----T----C-AT-GCAAG-AGACG----TT-C--A--GCG----TTTC---T-------T-G-CA--A--A-----CC-G--TTTAA-A-------CTCG---TTC--CG-T---GCA---CG-----A----GAGAATCGTG---TCG-T--------T-T----C---A---------AT-T--ACG-C-G-G-A-AGTC-A----GG-----------T-A------AT-TAAAAC-GTTTTAGGGT
gi|39 : attgcaaggctatgtctatattaggcgtttgagattatttacaatttattcgtgtcctaaaacgacctgaataatgtcaacaagannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnataattcaaagagggcagattaatcgtgcaaagcgtttactgccaaaccgtacag----C-GT-GCATA-G--CG----TT-----------------T---C------AT-G-CA--A--A-----GC-G--T-TCA-C-------C--G---TTC--CG-T---AC----AA-----G----A--------A---TCG-T--------T-T----C---G-TT-A--C-GT-T--CCG-T-G-C-A-AGTG-G----GG-----------T-A------G--TAACAC-GCTTTAGGTTCgttttaaaccatgattgtgacgtgaacctttttttt
gi|40 : tcattcaagaaacgggcatcataa----C-GT-GCATA-G--CG----TT-----------------T---C------AT-G-CA--A--A-----GC-G--T-TCA-C-------C--G---TTC--CG-T---AC----AA-----G----A--------A---TCG-T--------T-T----C---G-TT-A--C-GT-T--CCG-T-G-C-A-AGTG-G----GG-----------T-A------G--TAACAC-GCTT-AGGTTCt
gi|60 : tcattcaagaaacgggcatcata-GT-ACAAA-C--CG----TT-C--A--GC-----CTTT---C------GT-G-CA--A--A-----CC-C--T-TCA-G-------C--t
gi|41 : -GCAAA-C--CG----TT-C--A--GAA----AG-T---T------GC-A-CA--A--AAT---CC-G--T-TCA-G-------C--G---TTC--CGAT---TC----AA-----G----A--------A---TCG-T--------T-TC---C---G-TT-T--C-GT-G--CCG-T-G-C-AGAGTG-G----GG-----------T-AAT----G--TA-CAC-GCTTTAGGG
gi|48 : cgccT-G-CA--A--A-----CC-G--T-TCA-C-------C--G---CGC--CG-T---TC----CGTGC--A----A--------G---Tgtc
gi|45 : gttcct-G-CA--A--A-----CT-G--T-TAG-G-------C--A---TTC--TG-T---GC----AA-----G----A--------A---TCA-T--------T-T----A---AATTGT--T-GT-T----G-C-A-C-A-AG---G----TG-----------T-A------G--TAGCAC-ACTTCAGGGTCgatgtagcacatgtagtacatttcagggcctg
gi|49 : A--A--A-----CT-T--TCAAA-G-------C--G---TTT--CG-T---TT----CGTAT--A----A--------A---CTG-T--------T-CAAAGC---G-TT-T--C-GT-T--TCG-T-G-C-A-Ac
gi|46 : tcaag-----CC-G--T-TCA-T-------C--G---TTC--CG-T----------G-----ATA--A--------G----CG-T--------T-T----T---A-TT-TGGC-GT-T--TCG-T-G-C-A-AGTG-G----GG-----------T-A------G--AAGCAT-GCTTTAGGATCaccgt
gi|43 : ggTCA-C-------C--A---TTT--CG-T---GC----CA-----A----A--------A---C---T--------T-T----C---G-TC-C--C-GT-T--CCG-T-GCC-A-AGTG-A----TG-----------T-A------G--CAGCAC-TCTTCAAAGTt
gi|10 : atgcttactgtttcatggggaatgtCA-G-------C--G---TTT--CG-T---TC----CGTAGTAA----A--------G---TCG-T--------T-T----
gi|48 : atatttgcgttaaagatattttagaattaaatgcgccacacccgtaagaattacctgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaaaagcgttttcgtcgg--G---TTC--C--T---TG----CA-----A----A------------CCG-T--------T-CAC--C---G-CG-C--C-GT-T--CCG-T-G-C-A-AGTG-A----TG-----------T-AGCACATG--TAGTAC-ATTTCAGGGCCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcgtgcaaccgtcatcgtcgttcgtgcaatgggtagtagcacgctttagg
gi|52 : -T---TCA---CG-----A----A------------TCG-T--------T-T----C---GGTT-T--T-GT-T--CCG-T-G-C-A-AGTG-G----GG-----------T-A------G--TAGCAC-GCTTGAGGGTtg
gi|57 : CA-T--------T-T----C---G-CT-T--T-GT----------G-C-A-TGTG-G----G------------T-A------G--TAGCAC-ACTTTAGGATC
gi|54 : -T----C---G-TT-C----GT-T--CCG-T-G-C-A--GTG-G----G--------------A------G--TAGCAC-GCTTTAGGGTCtat
gi|56 : aagaa----C---G-TT-T--C-GT-T--CCG-T-G-C-A-AGTG-G----GG-----------T-G------A--TAGCAC-GCTATAGGGTCtg
gi|29 : -T--C-GT-T--CCG-T-G-C-A-AGTG-G----GG-----------T-A------G--TAGCAC-GCTTTAGGGtg
gi|10 : cgtttcgttccgtttaaagcgtttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-T--C-GT-T--C-G-T-G-C-A-A-TG-G----G------------T-A------G--TAGCAC-GCTTTAGG
gi|59 : atatttgcgttaaagatattttagaattaaatgcgccacacccgtaagaattacctgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaaaagcgttttcgtcggcagcgtttcgttccgtagtaaagtcgtttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcgtgcaaccgtcatcgT-T--CCG-T-G-C-A-AGTG-G----GG-----------T-A------G--TAGCAC-GCTTTAGGGTC
6 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|36 ): CGTTTCATGCAAATGATCCATTAAAGTGAGCAGCATTTTGCAAAGCATTTATAGACCATGCAAACTTATTTTGTGTTCTGTACAAGAATTTTTGTGAATCATTCCATGCAAGTGGTGTAACACACGTACTTCAAGATCTG
Unaligned ( gi|42 ): TTCAGCATACGTCACACAAACCACTAACCATTCTGAACGAGAATAATTTTGTACCATTCTGTTAGTGGTACAATATAGTATGCTCCAGGGTCT
Unaligned ( gi|47 ): TTGTTCTGCGTGTGAGAATCATTTCGTATCGTTCCATAGCAGTGGTGTAATAGTACGCTTTGGTGCCTGTAA
Unaligned ( gi|50 ): ATTATCAATATTATATCAATATTCTCAATTATTTTAGAATTTAATCGCGCCCGTAAAATCGACCT
Unaligned ( gi|51 ): TTGTTTTATAAACATTTGAACATTTATAGTGGTACTCAGGAAGTTATGCTGTAATAGTA
Unaligned ( gi|61 ): ACATTTAGCTTAGACAGCCAATAATTTATTTGTA
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Reference ( family-1692 ) : TCATT-GCGTT--A-AAGAT---A--T----TT--T-AG-G----AATT-------TAA--T----CGC-ACCCG--TAA------TA--TAAA-----AACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTN---TCATTCA-AGAAACG--TTC--A--ACA----ACA-GCGT-T----T----CGT---------T-TC-GT-GCAAA------C-CG--TTCA-------CCG-T-CCG--G--C-A--GA-NCG--T-C-----AT--CGTTCCGTGCCA-AA---------CCG---TT-CA--GCGTTT-C-G-TGCA--A--ACCGTTC--A-A-G-CG--TT---CCGTTTC--A--C-G--AATCGTT----T------CGT-T---T----TC-GT-GCAAA-C--CG----TT-CA----G-C-G---NT-T-CGTGC-AA-A-----CC-G--T-T--CAG---C-G---TTCCG-T-TC-CG---A---AA----TCG-T--------T--T----C------G-T---------------T--T--C-GT----T--CCG-T-G-CA-AGT-GG-----------G-------------G-T-A------G--TAGCAC-G--CT-T-TAG-GGTC
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gi|13 : tatgtctatattattgcgtttgagatattttacaatttaatcgtgtccgtaaaatcgacctgaataatgcaaaagaaactannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnataattcaaagaacgggcagatta---T----TC-AT-GCAGA-A--CG----TT-CA----G-C-G---TT-T-CTTGC-AA-A-----CC-G--T-T--TAC---C-G---TTCCG-T-GC-AA---G---AA----TCG-T--------G--T----C------G-T---------------T--T--C-AT----T--ACG-C-G-GA-AGT-CA-----------G-------------G-T-A------A--TAAAAC-G--TT-T-TAG-cattacgcggaagtcaggtaataaaacgttttagg
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gi|17 : atgtatcattgcctttactatattttagaatttactcgacaccgtacaaaacgacctgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcattcatgaacgctATT-CCGTT--A-AAAAG---AGTT----TT--TGAA-G----AAAT-------TAA--TGT--CGCCACCCG--TAA------AA--TGA
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gi|17 : atatatcatattccgttaaaaagagtttttgaagaaattaatgtcgccacccgtaaaatgacctgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatgT----T------CGT-T---T----CG-GT-GCAAA-C--C-----TT-CAAAACG-C-GTTTCT-T-CCTGC-AA-A-----CC-G--G-T--CTT---C-A---TT-CG---TC-CGGC-A---CG----TCG-TCAAGAATGT--T----C------GTT---------------T--T--C-GT----TTGCCGCT-G-CA-A-T--G-----------G-------------G-T-A------G--TAA-AC-A--C--T-TAGTGGTCttgccgctgcaatgggtagtaaacacttagtggtc
gi|18 : atatatcatattccgttaaaaagagtttttgaagaaattaatgtcgccacccgtaaaatgacctgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatgcattcaagaaacgtaaagccgctgATT-GCGTT--A-A-GAT---A--T----TT--T-A--G----AATT-------TAA--C----TG--ACCCG--TAA------
gi|18 : gataA-GCG--T-T------T--CGTTCCGGGCAA-TAGCGTTTCTTCCG---TT-TA--AGGTTT-CCG-T----------CGTTC--A-A---CG--TC---ACGTTCG--G--CAG--AACCGTTCA--T------CGT-T---C-----C-GT-G-AAA-C--CG----CT-TA----G-C-G----T-T-CGT---AA-A-----CC-G--T-T---AG---C-G---TTTCG-T-----G---A---A------CG-T--------T--CAG--C------A-T---------------T--T--C-GT----T--CCG-T-G-CA--GT-GG-----------G-------------G-T-A------G--TAG--C-G--CTGT-TAG-attgactgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagcgtttcgttccgggcaatagcgtttcttccgtttaaggtttccgtcgttcaacgtcacgttcggcagaaccgttcatcgttccgtgaaaccgcttagcgttcgtaaaccgttagcgtttcgtgaacgttcagcatttcgttccgtgcagtggggtagtagcgctgttagg
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gi|21 : ttcaaggttatttcttcatcatagcgattaagatattttagaatttaatggcgcccgtacaattgacctgaataatgcagagaaaagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcattcaaggaacgggTCATC-GCATT--T-GAGAT---A--T----TT--T-TTCG----AATT-------TAA--T----TGT-GCCCG--TAAAATCGGCA--TAAT-----AATGCAGAGAAAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNN-NNNNNNN--NNN--A--ACATCGGGCA-GCGT-T----T----CGTGCAAAGCATT-TC-TC-GCAAA------C-CG--TTCA-------CCG-TGCCGT-G--CAA--GA--------------AT--CGTTTCGTTCCA-g
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3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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lowQualScore : 8 55 8 999 00 5555 33 7 8888888 7 4444444 33 5555 333 33 7 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 2 7777 4444 3333333333 2 7 11 33333333 00 6666666666666666666666 77 22222 77 44444 555 4 99 9999999999999999 444 7 444 1 1 22222 1 66 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 2222 1111 0 9999 99 9 777 9999 9 9 9 22 11 44444 22 00 9 22 22 9999 3333 00000 22 9 4444444444 333 9 1111111111111111 777 6 8 11 11 8 8 11 8 5 3 8 7 0000000000000000000000000 8 8 888888 33 9 33 9 9 0
consensus : TCATT-GCGTT--A-AAGAT---A--T----TT--T-AG------AAT-T-------TAA--T----CGC--ACCCGT--A-AA-------A------T-------NA-------A-----AACGCGGANAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTN---TCAT----TCA-AGAAA----CG--TTCA--A-CA----AC----A-GCGT-T----T----CGT----------T-TC-GT-GCAAA------N-CG--TT--CACCG-T-CCG--G--CA--AA-GCGT--T--T--CGTTC----CGTGCCA-A--A---------C------CG---TT-CA--GCGTTT-C-G-T---GC-AA--A----CCGTTC--A-A-G--C--GTTC--CGTTTCG---C--G--AACCGTT----C------CGT--TT---CCGTGCAAA-C--CG----TT-CA----GC--G-T---T---TCG-TG-C-A--A--A-----CC--G--T-T--C--A---NC----G-----TTC--CG-TGCA-A-G---AA--TCG-T--------T--T----C---G-T-T--T--C-GT-T--CCG-T-G-CA-AGT-GG-----------G-------------G-T-A------G--TAGCAC-G--CT-T-TAG-GGTC
Reference ( family-1692 ) : TCATT-GCGTT--A-AAGAT---A--T----TT--T-AG-G----AAT-T-------TAA--T----CGC--ACCCGT--A-AA-------A------T-------AA-------A-----AACNNNNANNANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTN---TCAT----TCA-AGAAA----CG--TTCA--A-CA----AC----A-GCGT-T----T----CGT----------T-TC-GT-GCAAA------C-CG--TT--CACCG-T-CCG--G--CA--AA-NCGT--C--T--CGTTC----CGTGCCA-A--A---------C------CG---TT-CA--GCGTTT-C-G-T---GC-AA--A----CCGTTC--A-A-G--C--GTTC--CGTTTCG---C--G--AACCGTT----C------CGT--TT---CCGTGCAAA-C--CG----TT-CA----GC--G-T---T---TCG-TG-C-A--A--A-----CC--G--T-T--C--A---NC----G-----TTC--CG-TNCA-G-A---AA--TCG-T--------T--T----C---G-T-T--T--C-GT-T--CCG-T-G-CA-AGT-GG-----------G-------------G-T-A------G--TAGCAC-G--CT-T-TAG-GGTC
gi|1 : TCATT-GCGTT--A-AAGATTCAA--T----ATGGT-AG-GG---AAT-T-------TAA--T----CGC--ACCAGT--N-NN-------N------N-------NN-------N-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNC---TCAT----TCACAGAAA----CG--TTCA--A-CA----AC----A-GCGT-T----T----CGT----------T-TC-GT-GCAAA------C-CG--TT--CATGG-T-CCA--G--CA--GA-ACGT--CA-T--CGTTC----CGTGCCA-A--A---------C------CG---TT-CA--GCGTTT-T-GCT---GC-AA--A----ACGTTC--A-A-G--C--GTTC--CGTTTCA---C--G--AATCGTT----T------CGT--TT---TCGTGCAAA-C--CG----TT-CA----GC--G-GG--T---TTG-TG-C-A--A--A-----CC--G--TCT--C--A---GC----G-----TTC--CG-TTCC-G-A---AG--TCG-T--------T--T----C---G-T-T--T--T-GT-T--CCG-T-G-CA-AGT-GG-----------G-------------G-T-A------G--TAGCAC-G--CT-T-GAG-GGTC
gi|10 : TT-GCGTT--A-AAGAT---A--T----TT--T-A--G----AAT-T-------AAA--TGCGCCAC--ACCCGT--A-AG-------AATTACCT-------GA-------N-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNN----NCA-A-AAG----CGTTTTCG--T-CG----GC----A-GCGT-T----T----CGT----------T-CC-GTAGTAAAG-----T-CG--TT--TNNNN-N-NNN--N--NN--NN-NNNN--N--N--NNNNN----NNNNNNN-N--N---------N------NN---NN-NN--NNNNNN-N-N-N---NN-NN--N----NNNNNN--N-N-N--N--NNNN--NNNNNNN---N--N--NNNNNNN----N------NNN--T-----CGTGC-AA-C--CG-----T-CA----TC--G-TCG-T---TCG-TG-C-A--A--
gi|11 : atatATT-GCGTT--A-AAGAT---A--T----TT--T-AG------AAT-T-------TAA--T----TG---ACC--T--A-NN-------N------N-------NN-------N-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTA---TCAT----TCA-AGAAA----CG--TTCA--A---------------ATGT-T----T----CGT----------T-TC-GT-GCAAA------C-CG--TT--T---------------TA--AA-ACGT--T--T--CGTTT----CGTAC-A-A--A---------G------CG---TT-CA--CCGTTC-C-G-G---GC-AG--A----CTGTTC--A-------------------TCG--------------------------------TT---CCCTGCAAA-A--CG----TT-CA----GC--G-T---T---TCG-TG-C-A--A--A-----CC--G--T-T--C--A---CC----G-----TTC--CG-TTCA-G-G---AA--TCGTT--------T--T----T---G-T-T--T--C-GT-T--CCG-T-G-CA-AGT-GG-----------G-------------GTT-A------G--TAGCAC-G--TT-T-TAG-GGTCtgggtagtagcacgctttagg
gi|12 : TCATT-GCGTT--A-AAGAT---A--T----TT--T-AG------AAT-T-------TAA--T----CGC--ACCCGT--A-AA-------A------T-------TG-------A-------CGTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNN----NNN-NNNNN----NN--NNNA--A-------------A-GCAT-T----T----CGT----------T-TC-GG-GCAAA------C-CG--TT--T---------------TA--AA-GCGT--T--T--CGTTT----CAT-TCA-A--A---------C------CG---TT-CA--CCGTTC-C-G-G---GC-AG--A----CCGTTC--A-------------------TCG--------------------------------TT---CCGTGCAAA-C--CG----TT-CA----G-----------------TG-C-A--A--A-----CC--G--T-T--C--A---CC----G-----TTT--TG-TGCA-A-A---A----CA-T--------TCAC----C---G-T-T--T--C-GT-T--CCG-T-G-CA-AGT-GG-----------G-------------G-T-A------G--TAGCAC-G--CT-T-TAG-GGTC
gi|13 : gaaTTATT-GCGTT--T-GAGAT---A--T----TT--T-AC------AAT-T-------TAA--T----CGT--GTCCGT--A-AA-------A------T-------
gi|13 : tatgtctataT-C-G-T---GC-AA--A----GCGTTT--A-------------------CTG---C--C--AACCGTCAG--C------AGT--T-----CATGCAGA-A--CG----TT-CA----GC--G-T---T---TCT-TG-C-A--A--A-----CC--G--T-T--T--A---CC----G-----TTC--CG-TGCA-A-G---AA--TCG-T--------G--T----C---G-T-T--T--C-AT-T--ACG-C-G-GA-AGT-CA-----------G-------------G-T-A------A--TAAAAC-G--TT-T-TAG-cgacctgaataatgcaaaagaaactannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnataattcaaagaacgggcagattatcgtgcaaagcgtttactgccaaccgtcagcagttcatgcagaacgttcagcgtttcttgcaaaccgtttaccgttccgtgcaagaatcgtgtcgtttcattacgcggaagtcaggtaataaaacgttttagg
gi|14 : tatgtctatattattgcgtttgagatattttacaatttaatcgtgtccgtaaaatcgacctgaataatgcaaaagaaactannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnataattcaaagaacgggcagattaTCATT-GCTTT--A-AAGAT---A--T----TT----AA-A----AAT-T-------TAA--T----CGC--ACACGT--A-AA-------A------T-------CG-------ATCTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNN----NNN-NNNAT----CA--TTCA--A-GA----------A-ACGT-T----CAAAGCGT----------T-TC-GT-GCAAA------C-AG--TT------------------CA--AA-GCGT--T--T--CGTTT----CGTGC
gi|14 : a-A--A---------A------CG---TT-CAAAGCGTTT-C-G-T---GC-AA--A----CAGTTC--A-AAG--C--GTTT--CGTTTCG---T--GCAAACCGTT----CAC----CGT--TC---CCG-ACAGA-C--CG----TT-CA----TC--G-T---T---CCT-TG-T-A--A--A-----GC--G--T-C--C--A---CC----G-----TTC--CG-TTCA-A-G---AA--TAG-T--------T--T----C---G-T-T--T--C-GT-C--CCG-T-G-CA-AGT-GG-----------G-------------G-T-A------G--TAGCAC-G--CT-T-TAT-GGTaaaccgttcaccgttcccgacagaccgttcatcgttccttgtaaagcgtccaccgttccgttcaagaatagtttcgtttcgtcccgtgcaagtggggtagtagcacgctttatggt
gi|15 : atcattgctttaaagatatttaaaaatttaatcgcacacgtaaaatcgatctgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcattcaagTCATT-GCGTT--A-AAGAT---A--T----TT--T-AG------AAT-T-------TAA--T----CG---ACCCGT--A----------------------------------A-----AA--TTGACCGTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNN----NNN-NNNNN----NN--NNNN--N-NA----A-----A-GCAT-T----T----CGT----------T-TC-GG-GCAAA------C-CG--TT--TA------------------AA-GCGT--T--T--CGTTT----CAT-TCA-A--A---------C------CG---TT-CA--CCGTTC-C-G-G---GC-AG--A----CCGTTC--A------------------------------------------T------CGT--T-----CGTGCAAA-C--CG----TTTCA----G-----------------TG-C-A--A--A-----CC--G--T-T--C--A---CC----G-----TTT--GT-TGCA-A-A---A----CA-T--------TCAC----C---G-T-T--T--C-GT-T--CCG-T-G-CA-AGT-GG-----------G-------------G-T-A------G--TAGCAC-G--CT-T-TAG-GGTC
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gi|17 : atgtatcattgcctttactatattttagaatttactcgacaccgtacaaaacgacctgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcattcatgaacgctATT-CCGTT--A-AAAAG---AGTT----TT--TGAA-G----AAA-T-------TAA--TGT--CGCC-ACCCGT--A-AA-------A------T-------GACCTGNNNN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NCATGCATTCA-AGAAA----CG--T--A--A--A----GC----C-GCTG-T----T----CGT----------T-TCGGT-GCAAA------C-C---TT--CA---------------A--AACGCGT--T--T--C-TTC----C-TG-CA-A--A---------C------CGGTCTT-CA------TT-C-G-TCCGGC-AC--G----TCG-TC--A-A-GAAT--GTTC--GTTTTCG---
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gi|18 : atatatcatattccgttaaaaagagtttttgaagaaattaatgtcgccacccgtaaaatgacctgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatgcattcaagaaacgtaaagccgATT-GCGTT--A-A-GAT---A--T----TT--T-A--G----AAT-T-------TAA--C----TG---ACCCGT--A-AATTGACTGN------N-------NN-------N-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGCGTT---TCGT----TC-----------CG--GGCA--A-TA------------GCGT-T----T----C-T----------T-CC-GT-TTAAG---------G--TT--T-CCG-T-CGT--T--CA--A---CGT--C--A--CGTT-----CG-GCAG-A--A---------C------CG---TT-CA--TCGTTC-C-G-T---G--AA--A----CCGCTT----A-G--C--G--------TTCG---T--A--AACCGTTA---G------CGT--TT----CGTG-AA-----CG----TT-CA----GC--A-T---T---TCG-T
gi|18 : gataA-GCGT--T--T--CGTTC----CGGGCAA-T--AGCGTTTCTTC------CG---TT-TA--AGGTTT-CCG-T----------------CGTTC--A-A----C--GTCA--CGTTCGG---CA-G--AACCGTT----CAT----CGT--T----CCGTG-AAA-C--CG----CT-TA----GC--G-T---T----CG-T----A--A--A-----CC--G--T-T-----A---GC----G-----TTT--CG-T----G-A---A----CG-T--------T--CAG--C---A-T-T--T--C-GT-T--CCG-T-G-CA--GT-GG-----------G-------------G-T-A------G--TAG--C-G--CTGT-TAG-tccgtgcagtggggtagtagcgctgttagg
gi|19 : gataattgcgttaagatattttagaatttaactgacccgtaaattgactgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTCATT-GCGTTTAATAAGAT---A--T----TT--T-AG-AATTTAAT-TGCGCCCATAAAAT----CG---ACCTGN--N-NN-------N------N-------NN-------N-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATCAT----TCA-AGAAA----CA--TTCA--A-------------A-GCGT-T----T----CGT------------------GTAAA------C-CG--TT--CACCATT-CCAT-G--CA--GA-CCATTCT--T--CGCTT----CGTG-CA-A--A---------G------CG---TT-CA--GCGCTT-C-A-T---GC-AA--
gi|19 : tttcaaggttatttctgtaTTCA---A--G--AAACATT----CAAAG--CGT--TT---C-GTGTAAA-C--CG----TT-CA----CC--A-T---T---CCA-TG-C-A--G--A-----CC--A--T-T--C--T---TC----G-----CTT--CG-TGC----A---AA--GCG-T--------T--C----A---G---------C-GC-T--TCA-T-G-CA-AGT-GG-----------G-------------G-T-A------G--TAGCCT-A--CT-T-AAA-GGTCgtggggtagtagcctacttaaaggtctg
gi|2 : tttcaaggttatttctgtatcattgcgtttaataagatattttagaatttaattgcgcccataaaatcgacctgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcaT-C-G-T---GC-AA--A----GCGTTT--A------------C--TGC-------C--A--AACCGTA----C------AGT--T-----CATGCAAG-AGACG----TT-CA----GC--G-T---T---TCT-TG-C-A--A--A-----CC--G--T-T--T--AAACTC----G-----TTC--CG-TGCACG-AGAGAA--TCG-T--------G--T----C---G-T-T--T--CAAT-T--ACG-C-G-GA-AGT-CA-----------G-------------G-T-A------AT-TAAAAC-G--TT-T-TAG-GGTtg
gi|20 : attgcaaggctatgtctatattaggcgtttgagattatttacaatttattcgtgtcctaaaacgacctgaataatgtcaacaagannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnataattcaaagagggcagattaaTCATA-GCGAT--T-AAGAT---A--T----TT--T-AG------AAT-T-------TAA--T----GGC--GCCCGT--A-CA-------A------TTGACCTGAA-------T-----AATGCAGAGAAAAGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNN----NNN-NNNNNNNATCA--TTCA--AGGA----ACGGGCA-GTGT-T----T--------------------C-GT-GCAAA------G-CG--TT----TTG-T------G--CA--AA-ACGT--T--T--CGT------------A-AAGA---------T------CA---AT-CA--GCGTTT-C-T-T---GC-AA--A----CCTTTC----A-G--C--GTTT--CGT---G---CAAG--AATCGTT----T------AG---TT---CCATGgttttaaaccatgattgtgacgtgaacctttttttt
gi|20 : ttcaaggttatttcttca-CA--GTGTTT-C-G-T---GC-AA--A----------------G--C--GTTT--TGT---G---C--A--AAACGTT----T------CGT-----------AAAGA-T--CA----AT-CA----GC--G-T---T---TCT-TG-C-A--A--A-----CC--T--T-T--C--A---GC----G-----TTT--CG-TGCA-A-G---AA--TCG-T--------T--T----A---G-T-T--C--C-AT-
gi|21 : ttcaaggttatttcttcatcatagcgattaagatattttagaatttaatggcgcccgtacaattgacctgaataatgcagagaaaagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcattcaaggaacgggTCATC-GCATT--T-GAGAT---A--T----TT--T-TTCG----AAT-T-------TAA--T----TGT--GCCCGT--A-AA-------A------TCGGCAT-AA-------T-----AATGCAGAGAAAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNN----NNN-NNNNN----NN--NNNA--A-CATCGGGC----A-GCGT-T----T----CGTGCAAAGCAT-T-TC-TC-GCAAA------C-CG--TT--CACCG-TGCCGT-G--CAAGAA-TCGT--T--T--CGTTC----CATg
gi|21 : atttcatggtattttctgta------CGT--TT---C-GTGCAAA-------------------GC--A-T---T---TCT-CG-C-A--A--A-----CC--G--T-T--C--A---CC----G-----TGC--CG-TGCA-A-G---AA--TCG-T--------T--T----C---G-T-T--C--C-AT-T----G------A-AGT-TG-----------G-------------A-T-A------G--TAGCAC-G--CT-T-TAG-GGTCtgaagttggatagtagcacgctttagggtctg
gi|22 : atttcatggtattttctgtatcatcgcatttgagatattttttcgaatttaattgtgcccgtaaaatcggcataataatgcagagaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaacatcgggcagTCATT-GCGTC--T-GAGAT---A--T----TT--T-AG------AAT-T-------TAA--T----CGA--ACCCGT--A-AA-------A------T-------tg
gi|22 : tttcaaggttatttctgta--G--AACAGT-------------GT--TT---C-GTGCAAA-------------------GC--G-T---T---TCG-TG-C-A--A--A-----CC--G--T-G--G--A---CC----G-----TTC--CG-TGCA-A-G---AA--TCT-T--------T--T----C---A-T-T--tgacacgaataatgcctataacaactccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcattcaagaaatgaacagtgtttcgtgcaaagcgtttcgtgcaaaccgtggaccgttccgtgcaagaatcttttcatt
gi|23 : tttcaaggttatttctgtatcattgcgtctgagatattttagaatttaatcgaacccgtaaaattgacacgaataatgcctataacaactccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcattcaagaaatATT-ACATT--T-GAGAT---A--T----TT--T-AT------AGT-T-------TAA--T----CAC--GCCTGT--A-A--------------------------------A-----GACCTGAATAATTTCAAAACCTAAGTGTGCAAGCCGCCTACCATTTTGTGCACACCATGCAGA---------------TCAT----TCA-AGAAA----TG-----------A----GT----A-G--------------TGT----------T-TC-GT-GCAAA------G-CAT-TT--CAGCGTT-CTGT-G--CA--GA-TCAT--T--CGACGTTC----CATACAAGA--A---------T------TG---TT-T----CGCTT-T-G-T---GC-
gi|23 : tttccagattatttctgtGTGC-A-A--G---------C------CG---CC-TA--CCATTT-T-G-T---GC-AC--A----CCATGC--A---------GATC--A--TTCA---A--G--AAATGAG----T------AGTG-TT---TCGTGCAAA-G--CA----TTTCA----GC--G-T---T---CTG-TG-C-A--G--A-----TC--A--T-T--C--G---AC----G-----TTC--CA-TACA-A-G---AA--TTG-T--------T--T----C---G-C-T--T-----------TG-T-G-CT-ATT-GG-----------G-------------G-T-A------G--TAGTAC-C--CT-T-TAG-AGTCtattggggtagtagtaccctttagagtctgta
gi|24 : tttccagattatttctgtattacatttgagatattttatagtttaatcacgcctgtaaagacctgaataatttcaaaacctaagtCG-TG-C-A--A--G-----CCCCG--C-C--T--A---CC----G-----TTC--C---------A---AA----G-T--------------------G-T-T--T--C-GT-T--TCG-G-G-CA-AAT-tgta
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gi|25 : gcgtgcaagccccgcctaC----CGTAC-A-A--A---------C------CG---TT-CA--GCGTC--C-G-T---ACCAA--A----TCGTTC--A-G-T--C--GCT------TTCGAAGC--A--AACCGTT----C------AGCAGTA---TCGTGCAAC-C--CG----TT-CA----GC--G-T---TATTCCG-TGTC-A--ATAA-----CC--G--T-T--T--C---AC----GCGGGTTTC--C--TTCA-A-G---GA--TTA-T--------T-------C---G-TAT--T--C----T--CCG-T-G-CA-AGT-GG-----------GGGCAGTGTTGATAG-T-A------G--TAGCAC-C--AT-T-TAG-caggggtcataatgataaccata
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3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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lowQualScore : 7 5555 777 77 3333 11 22 00000 5 0000000 11 9999 333 5 11 5 666666 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 7 22222222222 44444444444 7 55 4444444 000 22 0000000000000000000000000 88 33333 00 66 00 9999 99999999999999999999999999 444 66666666 3 00000 000 1 66 77777 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 5555 44 1111 0 0000 00 666 888 9 9 9 9 9 44 9 44444 888 9 22 22 8888 4444 11111 1111 9 9 9 8888 2 22 9 9 000000000 777 7 9 11 22 9 222 9 6 4 9 8 0000000000000000000000000 8 8 888888 33 9 33 9 9 0
consensus : TCATT-GCGTT--A-AAGAT---A--T----TT--T--AG-----AAT-T-------TAA--T----CGC--AC-CCGT--A-AAA------TC-----G-------A-------AACGCGGANAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTN---TCAT----TCA-AGAAA----CG--TTCA--A----CA----A-C-A-GC-GT-T----T----CGT---------T-TC-GT-GCAA-------A-N-CG--TT--CA----CCG-T-C-----CG--GCA--AA-G---CGT--T--T--CGTTC----CGTGCCA--A--A---------C------CG---TT-C--A--GCGTTT-CG-----T---GC-AA--A----CCGTTC--A-A-G--CG--TTC--CGTTTCG---C--G--AAC------CGTT----C------CGT--TT---CCGTGCAAA-C--C--G----TT-CA----GC--G---T---TT-C-G-TG-C-A--A-A-----CCG---T-T--C--A---NC----G-----TTC----CG-T-G-CA----AGAA--TCG-T-T----T----C---G-T-T--T--C-GTT--CCG-T-G-CA-AGT-GG-----------G-------------G-T-A------G--TAGCAC-G--CT-T-TAG-GGTC
Reference ( family-1692 ) : TCATT-GCGTT--A-AAGAT---A--T----TT--T--AG-----AAT-T-------TAA--T----CGC--AC-CCGT--A-AAA------TN-----A-------A-------AACGCGGANAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTN---TCAT----TCA-AGAAA----CG--TTCA--A----CA----A-C-A-GC-GT-T----T----CGT---------T-TC-GT-GCAA-------A-N-CG--TT--CA----CCG-T-C-----CG--GCA--AA-G---CGT--T--T--CGTTC----CGTGCCA--A--A---------C------CG---TT-C--A--GCGTTT-CG-----T---GC-AA--A----CCGTTC--A-A-G--CG--TTC--CGTTTCG---C--G--AAC------CGTT----C------CGT--TT---CCGTGCAAA-C--C--G----TT-CA----GC--G---T---TT-C-G-TG-C-A--A-A-----CCG---T-T--C--A---NC----G-----TTC----CG-T-G-CA----AGAA--TCG-T-T----T----C---G-T-T--T--C-GTT--CCG-T-G-CA-AGT-GG-----------G-------------G-T-A------G--TAGCAC-G--CT-T-TAG-GGTC
gi|1 : TCATT-GCGTT--A-AAGATTCAA--T----ATGGT--AGGG---AAT-T-------TAA--T----CGC--AC-CAGT--N-NNN------NN-----N-------N-------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNC---TCAT----TCACAGAAA----CG--TTCA--A----CA----A-C-A-GC-GT-T----T----CGT---------T-TC-GT-GCAA-------A-C-CG--TT--CA----TGG-T-C-----CA--GCA--GA-A---CGT--CA-T--CGTTC----CGTGCCA--A--A---------C------CG---TT-C--A--GCGTTT-TGC----T---GC-AA--A----ACGTTC--A-A-G--CG--TTC--CGTTTCA---C--G--AAT------CGTT----T------CGT--TT---TCGTGCAAA-C--C--G----TT-CA----GC--G---GG--TT-T-G-TG-C-A--A-A-----CCG---TCT--C--A---GC----G-----TTC----CG-T-T-CC----GAAG--TCG-T-T----T----C---G-T-T--T--T-GTT--CCG-T-G-CA-AGT-GG-----------G-------------G-T-A------G--TAGCAC-G--CT-T-GAG-GGTC
gi|10 : TT-GCGTT--A-AAGAT---A--T----TT--T--AG-----AAT-T-------AAA--TGCGCCAC--AC-CCGT--A-AGAATTACCTG-----A-------N-------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNN----NCA-A-AAG----CGTTTTCG--T----CG----G-C-A-GC-GT-T----T----CGT---------T-CC-GTAGTAA-------AGT-CG--TT--TN----NNN-N-N-----NN--NNN--NN-N---NNN--N--N--NNNNN----NNNNNNN--N--N---------N------NN---NN-N--N--NNNNNN-NN-----N---NN-NN--N----NNNNNN--N-N-N--NN--NNN--NNNNNNN---N--N--NNN------NNNN----N------NNN--T-----CGTGC-AA-C--C--G-----T-CA----TC--G---TCG-TT-C-G-TG-C-A--A-
gi|11 : atatATT-GCGTT--A-AAGAT---A--T----TT--T--AG-----AAT-T-------TAA--T----TG---AC-C--T--A-NNN------NN-----N-------N-------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTA---TCAT----TCA-AGAAA----CG--TTCA--A----------------AT-GT-T----T----CGT---------T-TC-GT-GCAA-------A-C-CG--TT--T----------------------TA--AA-A---CGT--T--T--CGTTT----CGTAC-A--A--A---------G------CG---TT-C--A--CCGTTC-CG-----G---GC-AG--A----CTGTTC--A-------------------TCG--------------------------------------TT---CCCTGCAAA-A--C--G----TT-CA----GC--G---T---TT-C-G-TG-C-A--A-A-----CCG---T-T--C--A---CC----G-----TTC----CG-T-T-CA----GGAA--TCGTT-T----T----T---G-T-T--T--C-GTT--CCG-T-G-CA-AGT-GG-----------G-------------GTT-A------G--TAGCAC-G--TT-T-TAG-GGTCtgggtagtagcacgctttagg
gi|12 : TCATT-GCGTT--A-AAGAT---A--T----TT--T--AG-----AAT-T-------TAA--T----CGC--AC-CCGT--A-AAA------TT-----G-------A---------CGTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNN----NNN-NNNNN----NN--NNNA--A--------------A-GC-AT-T----T----CGT---------T-TC-GG-GCAA-------A-C-CG--TT--T----------------------TA--AA-G---CGT--T--T--CGTTT----CAT-TCA--A--A---------C------CG---TT-C--A--CCGTTC-CG-----G---GC-AG--A----CCGTTC--A-------------------TCG--------------------------------------TT---CCGTGCAAA-C--C--G----TT-CA----G------------------TG-C-A--A-A-----CCG---T-T--C--A---CC----G-----TTT----TG-T-G-CA----AAA----CA-T-TCA--C----C---G-T-T--T--C-GTT--CCG-T-G-CA-AGT-GG-----------G-------------G-T-A------G--TAGCAC-G--CT-T-TAG-GGTC
gi|13 : gaaTTATT-GCGTT--T-GAGAT---A--T----TT--T--AC-----AAT-T-------TAA--T----CGT--GT-CCGT--A-AAA------TC-----G-------A-------
gi|13 : tatgtctataT-CG-----T---GC-AA--A----GCGTTT--A-------------------CTG---C--C--AAC------CGTCAG--C------AGT--T-----CATGCAGA-A--C--G----TT-CA----GC--G---T---TT-C-T-TG-C-A--A-A-----CCG---T-T--T--A---CC----G-----TTC----CG-T-G-CA----AGAA--TCG-T-G----T----C---G-T-T--T--C-ATT--ACG-C-G-GA-AGT-CA-----------G-------------G-T-A------A--TAAAAC-G--TT-T-TAG-cctgaataatgcaaaagaaactannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnataattcaaagaacgggcagattatcgtgcaaagcgtttactgccaaccgtcagcagttcatgcagaacgttcagcgtttcttgcaaaccgtttaccgttccgtgcaagaatcgtgtcgtttcattacgcggaagtcaggtaataaaacgttttagg
gi|14 : tatgtctatattattgcgtttgagatattttacaatttaatcgtgtccgtaaaatcgacctgaataatgcaaaagaaactannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnataattcaaagaacgggcagattaTCATT-GCTTT--A-AAGAT---A--T----TT--A--AA-----AAT-T-------TAA--T----CGC--AC-ACGT--A-AAA------TC-----G-------ATCTGN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNN----NNN-NNNAT----CA--TTCA--A----GA--------A-AC-GT-T----CAAAGCGT---------T-TC-GT-GCAA-------A-C-AG--TT-------------------------CA--AA-G---CGT--T--T--CGTTT----CGTGC
gi|14 : a--A--A---------A------CG---TT-C--AAAGCGTTT-CG-----T---GC-AA--A----CAGTTC--A-AAG--CG--TTT--CGTTTCG---T--GCAAAC------CGTT----CAC----CGT--TC---CCG-ACAGA-C--C--G----TT-CA----TC--G---T---TC-C-T-TG-T-A--A-A-----GCG---T-C--C--A---CC----G-----TTC----CG-T-T-CA----AGAA--TAG-T-T----T----C---G-T-T--T--C-GTC--CCG-T-G-CA-AGT-GG-----------G-------------G-T-A------G--TAGCAC-G--CT-T-TAT-GGTaaaccgttcaccgttcccgacagaccgttcatcgttccttgtaaagcgtccaccgttccgttcaagaatagtttcgtttcgtcccgtgcaagtggggtagtagcacgctttatggt
gi|15 : atcattgctttaaagatatttaaaaatttaatcgcacacgtaaaatcgatctgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcattcaagTCATT-GCGTT--A-AAGAT---A--T----TT--T--AG-----AAT-T-------TAA--T----CG---AC-CCGT--A-AAA------TT-----G-------A-------
gi|15 : gaaA--AA-G---CAT--T--T--CGTTT----CG-GGCA--A--A---------C------CG---TT-TAAA--GCGTTT-CGTTTCAT---TC-AA--A----CCGTTC----A-C--CG--TTC--CG---GG---C--A--GAC------CGTT----CAT----CGT--T-----CGTGCAAA-C--------------------C--G---T---TT-CAG-TG-C-A--A-A-----CCG---T-T--C--A---CC----G-----TTT----GT-T-G-CA----AAA----CA-T-TCA--C----C---G-T-T--T--C-GTT--CCG-T-G-CA-AGT-GG-----------G-------------G-T-A------G--TAGCAC-G--CT-T-TAG-GGTCccgtgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaagcatttcgtttcgggcaaaccgtttaaagcgtttcgtttcattcaaaccgttcaccgttccgggcagaccgttcatcgttcgtgcaaaccgtttcagtgcaaaccgttcaccgtttgttgcaaaacattcaccgtttcgttccgtgcaagtggggtagtagcacgctttagggtc
gi|16 : gaatcattgcgttaaagatattttagaatttaatcgacccgtaaaattgaccgtgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTCATT-GCCTT--T-ACTAT---A--T----TT--T--AG-----AAT-T-------TAC--T----CG---ACACCGT--A-----------C-----A-------A-------AACG
gi|16 : atgtaCA--A--A---------G------CG---TT-T--C--ATATTT-TG-----T---GC-AATGA----CC-TTC--A-A-----------------------------AAA------CGTT----T------CGT--T-----CGTACAAAAC--C--G----TT-CA----CC--G---G---TC-C-T-AG-C-A--G-G-----CC----T-T--C--A---TC----G-----TTC----CG-T-G-AA----TAAA--GCG-T-G----T----G---G---------C-GTT--T-G-T-G-CA-AGT-GG-----------A-------------G-T-A------G--AAGCACGG--CT-T-Tacctgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcattcatgaacgctcaaagcgtttcatattttgtgcaatgaccttcaaaaacgtttcgttcgtacaaaaccgttcaccggtcctagcaggccttcatcgttccgtgaataaagcgtgtggcgtttgtgcaagtggagtagaagcacggcttt
gi|17 : atgtatcattgcctttactatattttagaatttactcgacaccgtacaaaacgacctgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcattcatgaacgctATT-CCGTT--A-AAAAG---AGTT----TT--TGAAG-----AAA-T-------TAA--TGT--CGCC-AC-CCGT--A-AAA------TG-----ACCTGNNNN-------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NCATGCATTCA-AGAAA----CG--T--A--A-----A----G-C-C-GC-TG-T----T----CGT---------T-TCGGT-GCAA-------A-C-C---TT--CA----------------------A--AACG---CGT--T--T--C-TTC----C-TG-CA--A--A---------C------CGGTCTT-C--A------TT-CG-----TCCGGC-AC--G----TCG-TC--A-A-GAATG--TTC--GTTTTCG---
gi|17 : atatatcatC------TGTT----C-------GT--TT---CGGTGCAAA-C--C-------TT-CAAAACGC--G---TTTCTT-C-C-TG-C-A--A-A-----CCGGTCT-T--C--AT--TC----G-----TCCGGCACG-TCGTCA----AGAA--T-G---T----T----C---GTT-T--T--C-GTTTGCCGCT-G-CA-A-T--G-----------G-------------G-T-A------G--TAA-AC-A--C--T-TAGTGGTCtttgccgctgcaatgggtagtaaacacttagtggtc
gi|18 : atatatcatattccgttaaaaagagtttttgaagaaattaatgtcgccacccgtaaaatgacctgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatgcattcaagaaacgtaaagccgATT-GCGTT--A-A-GAT---A--T----TT--T--AG-----AAT-T-------TAA--C----TG---AC-CCGT--A-AAT------TG-----ACTGNNNNN-------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGCGTT---TCGT----TC-----------CG--GGCA--A----TA----------GC-GT-T----T----C-T---------T-CC-GT-TTAAGGTTTCCG-T-CG--TT--CA----ACG-T-CACGTTCG--GCAG-AA-C---CGT--TCAT--CGTTC----CGTG--A--A--A---------C------CG---CT-T--A--GCG-TT-CG-----T------AA--A----CCGTT-----A-G-----------CGTTTCG---T--G--AACGTTCAGCATT----T------CG---TT---CCGTGCA
gi|18 : gataA-G---CGT--T--T--CGTTC----CGGGCAA--T--AGCGTTTCTTC------CG---TT-T--A--AGGTTTCCG-----T----------------CGTTC--A-A----CG--TCA--CGTTCGG---CA-G--AAC------CGTT----CAT----CG---TT---CCGTG-AAA-C--C--G----CT-TA----GC--G-------TT-C-G-T----A--A-A-----CCG---T-T-----A---GC----G-----TTT----CG-T-G--A----A------CG-T-T----CAG--C---A-T-T--T--C-GTT--CCG-T-G-C--AGT-GG-----------G-------------G-T-A------G--TAG--C-G--CTGT-TAG-gtggggtagtagcgctgttagg
gi|19 : gataattgcgttaagatattttagaatttaactgacccgtaaattgactgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTCATT-GCGTTTAATAAGAT---A--T----TT--T--AGAATTTAAT-TGCGCCCATAAAAT----CG---AC-CTGN--N-NNN------NN-----N-------N-------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATCAT----TCA-AGAAA----CA--TTCA--A--------------A-GC-GT-T----T----C----------------GT-GTAA-------A-C-CG--TT--CA----CCATT-C-----CAT-GCA--GA-C---CATTCT--T--CGCTT----CGTG-CA--A--A---------G------CG---TT-C--A--GCGCTT-CA-----T---GC-AA--
gi|19 : tttcaaggttatttctgtaTTCA---A--G--AAA------CATT----CAAAG--CGT--TT---C-GTGTAAA-C--C--G----TT-CA----CC--A---T---TC-C-A-TG-C-A--G-A-----CCA---T-T--C--T---TC----G-----CTT----CG-T-G-CA----A--A--GCG-T-T----C----A---G---------C-GCT--TCA-T-G-CA-AGT-GG-----------G-------------G-T-A------G--TAGCCT-A--CT-T-AAA-GGTCgtggggtagtagcctacttaaaggtctg
gi|2 : tttcaaggttatttctgtatcattgcgtttaataagatattttagaatttaattgcgcccataaaatcgacctgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcaT-CG-----T---GC-AA--A----GCGTTT--A------------C--TGC-------C--A--AAC------CGTA----C------AGT--T-----CATGCAAG-AGAC--G----TT-CA----GC--G---T---TT-C-T-TG-C-A--A-A-----CCG---T-T--T--AAACTC----G-----TTC----CG-T-G-CACGAGAGAA--TCG-T-G----T----C---G-T-T--T--CAATT--ACG-C-G-GA-AGT-CA-----------G-------------G-T-A------AT-TAAAAC-G--TT-T-TAG-GGTtg
gi|20 : attgcaaggctatgtctatattaggcgtttgagattatttacaatttattcgtgtcctaaaacgacctgaataatgtcaacaagannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnataattcaaagagggcagattaaTCATA-GCGAT--T-AAGAT---A--T----TT--T--AG-----AAT-T-------TAA--T----GGC--GC-CCGT--A-CAA------TT-----G-------ACCTGAATAATGCAGAGAAAAGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNN----NNN-NNNNNNNATCA--TTCA--AG---GA----A-CGG-GCAGT------------GT---------T-TC-GT-GCAA-------A-G-CG--TT--------TTG-T-----------GCA--AA-A---CGT--T--T--CGT------------A--AAGA---------T------CA---AT-C--A--GCGTTT-CT-----T---GC-AA--A----CCTTTC----A-G--CG--TTT--CGT---G---CAAG--AAT------CGTT----T------AG---TT---CCATGgttttaaaccatgattgtgacgtgaacctttttttt
gi|21 : ttcaaggttatttcttcaTCATC-GCATT--T-GAGAT---A--T----TT--TTTCG-----AAT-T-------TAA--T----TGT--GC-CCGT--A-AAA------TCGGCATA-------AT------AATGCAGAGAAAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNN----NNN-NNNNN----NN--NNNA--A----CATCGGG-C-A-GC-GT-T----T----CGTGCAAAGCATT-TC-TC-GCAA-------A-C-CG--TT--CA----CCG-TGC-----CGT-GCAAGAA-T---CGT--T--T--CGTTC----CAT
gi|21 : atttcatggtattttctgta------CGT--TT---C-GTGCAAA---------------------GC--A---T---TT-C-T-CG-C-A--A-A-----CCG---T-T--C--A---CC----G-----TGC----CG-T-G-CA----AGAA--TCG-T-T----T----C---G-T-T--C--C-ATT----G------A-AGT-TG-----------G-------------A-T-A------G--TAGCAC-G--CT-T-TAG-GGTCtgaagttggatagtagcacgctttagggtctg
gi|22 : atttcatggtattttctgtatcatcgcatttgagatattttttcgaatttaattgtgcccgtaaaatcggcataataatgcagagaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaacatcgggcagTCATT-GCGTC--T-GAGAT---A--T----TT--T--AG-----AAT-T-------TAA--T----CGA--AC-CCGT--A-AAA------TT-----G-------A-------CACGtg
gi|22 : tttcaaggttatttctgta---TCAT----TCA-AGAAA----TG--------------A----A-C-A-GT-GT-T----T----CGT-----------------GCAA-------A-G-CG--TT--T------CG-T-----------GCA--AA-C---CGT--GGAC--CGTTC----CGTGCaataatgcctataacaactccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcattcaagaaatgaacagtgtttcgtgcaaagcgtttcgtgcaaaccgtggaccgttccgtgcaagaatcttttcatt
gi|22 : tttcaaggttatttctgtatcattgcgtctgagatattttagaatttaatcgaacccgtaaaattgacacgaataatgcctataacaactccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnna--G--AAC------AGT-------------GT--TT---C-GTGCAAA---------------------GC--G---T---TT-C-G-TG-C-A--A-A-----CCG---T-G--G--A---CC----G-----TTC----CG-T-G-CA----AGAA--TCT-T-T----T----C---A-T-T--aagaatcttttcatt
gi|23 : tttcaaggttatttctgtatcattgcgtctgagatattttagaatttaatcgaacccgtaaaattgacacgaataatgcctataacaactccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcattcaagaaatATT-ACATT--T-GAGAT---A--T----TT--T--AT-----AGT-T-------TAA--T----CAC--GC-CTGT--A-A-----------------------A-------GACCTGAATAATTTCAAAACCTAAGTGTGCAAGCCGCCTACCATTTTGTGCACACCATGCAGA---------------TCAT----TCA-AGAAA----TG--------------A----G-T-A-G---------------TGT---------T-TC-GT-GCAA-------A-G-CAT-TT--CA----GCGTT-C-----TGT-GCA--GA-T---CAT--T--CGACGTTC----CATACAAG-A--A---------T------TG---TT-T------CGCTT-TG-----T---GC-
gi|23 : tttccagattatttctgtGTGC-A--A--G---------C------CG---CC-T--A--CCATTT-TG-----T---GC-AC--A----CCATGC--A-------G--ATC--A--TTCA---A--G--AAA------TGAG----T------AGTG-TT---TCGTGCAAA-G--C--A----TTTCA----GC--G---T---TC-T-G-TG-C-A--G-A-----TCA---T-T--C--G---AC----G-----TTC----CA-T-A-CA----AGAA--TTG-T-T----T----C---G-C-T--T----------TG-T-G-CT-ATT-GG-----------G-------------G-T-A------G--TAGTAC-C--CT-T-TAG-AGTCtattggggtagtagtaccctttagagtctgta
gi|24 : tttccagattatttctgtattacatttgagatattttatagtttaatcacgcctgtaaagacctgaataatttcaaaacctaagtCGTGCAAG-C--CCCG----CC-TA----CC--G---T---TC-C--------A--A-A-----GTG---T-T---------TC----G-----TTT----CG-G-G-CA----A--A--TCA-T-T----TAAAGC---G-T-T--T--C-GTT--TCT-T-T-CA-Atgta
gi|24 : gC----CGTTCCA--A--A---------G------TG---TT-T------CGTTT-CG-----G---GC-AA--A----TCATTT--A-AAG--CG--TTT--CGTTTCTTT-C--A--AAC------CGTT----CAC----CGT--T----CCGGGCAGA-C--C--G----TT-CA----TC--G---T---TC-C-G-TG-C-A--A-A-----CCG---T-T--A--A---GT----G-----TTT----CG-T-G-------AAAA--CCG-T-T---------CAGGG-T-T--T--C-GTT--CCG-T-G-CA-AGT-GG-----------G-------------G-T-A------G--TAGCAC-accgttcaccgttccgggcagaccgttcatcgttccgtgcaaaccgttaagtgtttcgtgaaaaccgttcagggtttcgttccgtgcaagtggggtagtagcaccaggggtcataatgataaccata
gi|25 : gcgtgcaagccccgcctaC----CGTAC-A--A--A---------C------CG---TT-C--A--GCGTC--CG-----T---ACCAA--A----TCGTTC--A-G-T--CG--CT------TTCGAAGC--A--AAC------CGTT----C------AGCAGTA---TCGTGCAAC-C--C--G----TT-CA----GC--GTTAT---TC-C-G-TGTC-AATA-A-----CCG---T-T--T--C---AC----GCGGGTTTC----C--T-T-CA----AGGA--TTA---T----T----C---G-TAT--T--C---T--CCG-T-G-CA-AGT-GG-----------GGGCAGTGTTGATAG-T-A------G--TAGCAC-C--AT-T-TAG-caggggtcataatgataaccata
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gi|27 : aacgttt--AA-G---CTT--C--T--CGTTCGAAACATTTCA--A--A---------C------AA---------A--GCGTTT-CG-----T---TC-AA--A----CTGTTT--A-C----CG--CTC--CGT---G---T--A--GAC------CGTT----C------AGTA-TT---TCGTGCAAA-C--C--G----TT-CA----CC--A---T---TG-C-G-TG-C-A--G-A-----CTG---T-T--C--A---TC----G-----TTC----CT-G-G-CA----AGAA--TAG-TGT----T----T---T-T-T--T--C-GTC--CCG-TAG-CA-tg
gi|28 : tcattcaaaaaacgggCGTTC-AG-----T---GC-AA--A----TAGTTT--A---T--CA--TTA--AATTT--------A--AAA------CGTT----C------AGT--TTT--CCGTGCAAA-C--C--G----TT-CA----GC--G---T---TA-C-A-TG-T-ATGA-A-----TCGA--T-T--CGTA---AC----G-----TTA----AG-T-G-TA----Acgct
gi|28 : attcaaagatcagttgaagcagttgattgatttatgtcaatAAA-A--C--G----TT-CA----GT--T---T---TC-C-G-TG-C-A--A-A-----CCG---T-T--C--A---GC----G-----TTA----CA-T-G-TA----TGAA--TCG-A-T----T----C---G-T-A--A--C-GTT--AAG-T-G-TA-AAC-GA-----------C-------------G-T-G------G--TTGCAC-G---T-T-TAC-GGTacgacgtggttgcacgtttacggttatgtaa
gi|29 : attcaaagatcagttgaagcagttgattgatttatgtcaatcgttcagtgcaaatagtttatcattaaattt--T--C-GTT--CCG-T-G-CA-AGT-GG-----------G-------------G-T-A------G--TAGCAC-G--CT-T-TAG-GGtatgtaa
gi|3 : cgtttcgttccgtttaaagcgtttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTCATT--CGTT--A-AAGAT---AA-T----TT--T--AG-----AAT-T-------TA---T----CTG--AC-CCGT--AGAAA------TT-----G-------A---------CTGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNN----NNN-NNNNN----NN--NNNN--N----CA----A---A-GC-GT-T----T----CGTA--------T-TC-GG-GCAA-------A-G-CGATTT--CGTTTCCCG-T-T-----T-----A--AA-G---CGT--T--C--CGTTC----CGTTTCA--A--A---------C------AG---TTTC--A--CCGTGT-C------C---GC-AG--A----C-GTTC--A-------------------TCG---T-------C------CGTA----C-------------------TGCAAA-C--C--G----TT-CA----GC--G---T---TC-C-G-TA-CCA--A-A-----CCG---T-T--C--A---GC----GC----TTT----CG-T-T-CA----AA-----CG-C-T----T----CAGCG-T-T--T--C-GTT--CCG-T-G-CA-AGT-GGGAAA-------G-------------G-T-A------G--TAGCAC-G--CT-TATAG-
gi|30 : tgata-T----C----CGC---------G-TC-TT-GCAA-------A-G-TG--TT--TA----GTG-T-C-----CA--GCA--AA-G---CGT-----------------AGTGCCATCA--A---------G------CG---TG-T--A--GTGTTC-TG-----T---GC-AC--A----GTGTT-----A-G--TG--TTC--CAT---G---C--A--AAG------CGTT----T------ATG--TT---CTGTG-AAA-G--C--G----TT--A----GT--A-------TC-C-G-TG-C-A--G--------CG---T-T--T--A---TG----T-----TTC----TG-T-
gi|31 : gatcattcaccattcggtgcaaacg-C--A--ACATTC-CG-----T---GC-AA--A----------------G--TG--TTT--CGT---G---T--A--AAT------CCTTTA--C------CAT--T----CCGTGCAGA-C--T--G----TT-CA----GT--G---T---TT-C-G-TG-C-A--A-A-----CCG---T-T--C--A---TC----G-----TTC----CG-T-G-CA----ATAA--TCG-T-T----T----T---G-T-T--T--C-GAT--CAA-T-G-AA-AGT-GG-----------A-------------G-A-C------G--TACCAC-T--CT-T-TAT-GGTCc
gi|32 : tcattcaagaaacagaA--A--A---------C------CA---TT-C--A--GCGTTC-CG-----T---AC-AA--A----TCGTTC--AGA-G--CGAGTTC--CGGT-AA---C--A--AAC------CGTT----CAGCAGACGT--TT---C-GTGCAAA-C--C--G----TT-CA----GC--G---T---TTTC-G-TG-C-A--A-A-----TCG---T-TT-C--A---GC----G-----TTC----CG-T-T-CA----AGA---TCG-T-T----T----CC--G-T-T--T--C-GTT--CCG-TGG-CA-AGT--G-----------G-------------G-T-A------G--TAGtg
gi|33 : --A--GCATTC-CG-----T---GC-AA--A----GCGTT---A-A-G--CG--TTC--CAT---G---C--A--TAT------CAGT----CAAG---CA---TT---CTGTGCAAA-G--C--A----TT-TA----GC--A---T---TC-C-A-GG-C-A--AGA-----CTA---T-T--T--T---AC----G-----TTC----CA-T-G-TA----AGAA--TCA-A-A----C----C--------------------------A-CA-AGT-GG-----------T-------------G-T-A------A--TAGTGT-G--CT-T-CAG-GGTCgca
gi|34 : catatcagtca--A--GCGTTT-GG-----A---GC-AA--A----------------G--CG--TTC--CATT------C--A--AAC------TGTT----CA-----CTG--TT---CCGTGCAGA-C--C--G----TT-CA----GC--G---T---TT-C-G-TG-C-A--A-A-----CCG---T-T--C--A---CC----G-----TTC----CG-C-A-CA----AGAA-------------T----C---G-T-T--T--C-ATT--CCG-T-G-CA-GGT-GG-----------G-------------G-T-A------A--TAGCAC-A--CT-T-TAG-GGTCtgt
gi|35 : gccttttgttgaaC-GT-T----T----AGT---------T-TC-GT-TCAA-------A-T-CG--TT--CA----TCG-T-T-----CAATGCA--GA-T---CGT--TCAT--CGTTT----CGCGC-A--A--A---------C------CG---TT-C--A--GCGTTT-CG-----T---GC-AA--A----CCATTC--AGA-G--CG--TTC--CGTGT-G---A--G--AAT------CGTT----C------CGT---------GTA-AGA----------------A----GC--G---T---TT-C-G-TG-C-A--G-A-----t
gi|36 : aaagcgtttCGTTT-CA-----T---GC-AA--ATGATCCATTA--A-A-G--TG--AGCAGCATTTTG---C--A--AAG------CATT-------------T--ATAGACCATGCAAA-C-----------T-TA------------T---TT-T-G-TG--------------------------------------------TTC----TG-T-A-CA----AGAA--T---T-T----T----T---G-T-GAAT--C-ATT--CCA-T-G-CA-AGT-GG-----------T-------------G-T-A------A--CA-CAC-GTACT-T-CAA-GATCagc
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gi|39 : ttt---TCAT----TCA-AGAAA----CG--GGCATCA----TA----A-C-GTGC-AT-A----G----CGT---------T-TC-AT-GCAA-------A-G-CG--TT--CA----CCG-T-T-----CC--GTAC-AA-GAATCGT--T--T--CGTTA----CGTTCCtgc
gi|39 : A----GC--G---T---TT-C-A-TG-C-A--A-A-----GCG---T-T--C--A---CC----G-----TTC----CG-T-A-CA----AGAA--TCG-T-T----T----C---G-T-T--A--C-GTT--CCG-T-G-CA-AGT-GG-----------G-------------G-T-A------G--TAACAC-G--CT-T-TAG-GTTCgtgcaagtggggtagtaacacgctttaggttct
gi|4 : tcattcaagaaacgggcatcataacgtgcatTCATG-GCATT--T-GAGAT---A--T----TT--T--AG-----AAG-T-------TAG--A----AAT--AC-CGAG--A-AAA------CN-----N-------N-------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNN----NNN-NNNAT----CA--TTCA--AGAAGCA----AGC-A-G---------------CAT---------T-TC-AT-GCAA-------ACA-CA--TT--------TCG-T-----------GCA--AG-G---CGT--T--T--Ct
gi|4 : ggatatgtatgta--CATTT----CATGC-A--A--A---------CACATTTCG---TG-C--AAGGCGTTT-CA-----T---GC-AA--T----CTGTTC--A------------C--CAT---G---C--A--GAC------CGTA----CAA----CGT--TT---C-ATGCAAA-T--C--AATGATT-CA----GC--G---T---TT-C-A-TG-C-A--A-ATTTAACTG---T-T--C--A---CCC---G-----TTC----CA-T-G-CA----AGAA--TCA-T-T----T----C---G-T-T--T--C-GTT--CTG-T-G-CA-AGT-GG-----------G-------------G-T-A------G--TAGCAC-G--CT-T-TAG-GGTatgcaatctgttcaccatgcagaccgtacaacgtttcatgcaaatcaatgattcagcgtttcatgcaaatttaactgttcacccgttccatgcaagaatcatttcgtttcgttctgtgcaagtggggtagtagcacgctttagggtgtg
gi|40 : ggatatgtatgtatcatggcatttgagatattttagaagttagaaataccgagaaaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcattcaagaagcaagcag---TCAT----TCA-AGAAA----CG--GGCA--T----CAT---A-C-GTGC-AT-A----G----CGT---------T-TC-AT-GCAA-------A-G-CG--TT--CA----CCG-T-T-----CC--GTAC-AA-GAATCGT--T--T--CGTTA----CGTTCCgtg
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gi|44 : ga----GC--G---T---TT-C-G-TG-T-A--A-A-----TCGCA-T-C--C--A---CC----G-----TTC----CG-T-G-CA----AGAA--TCG-T-T----T----C-------T--T--C-GTT--gtt
gi|45 : gatcattcaggaaatgggcagattgccttgcaatG-C-A--A-A-----CTG---T-T--A--G---GC----A-----TTC----TG-T-G-CA----AGAA--TCA-T-TTAAAT----T---G-T-T-------GTT----G-C-A-CA-A---GG-----------T-------------G-T-A------G--TAGCAC-A--CT-T-CAG-GGTC
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gi|59 : TT--CCG-T-G-CA-AGT-GG-----------G-------------G-T-A------G--TAGCAC-G--CT-T-TAG-GGTCt
gi|6 : TCATTTGCGTT--A-AAGAT---A--T----TT--T--AG-----AAT-T-------TTA-------CGC--AC-CCGTTTA-AAA------TT-----G-------ACCTG---AATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNN----NNN-NNNNN----NN--NNNN--N----NA----A---A-GC--T-T----T----CGT---------T-TC-G--GCAA-------A---CG--TT--------TCG-T-T-----CGT-TTA--AA-G---CGT--T--C--CGTAC----CGT-TCA--A--A----------------CG---TTCC--A--CCGTTC-CG-----G---GC--A--A----CAGTC-----A-T--CG---TC--CG--TCG---C--A--AAC------CGTG----CAG----CG---TT---CCGTACAAA-C--C--G----TT-CA----GC--G---T---TT-C-GTTG-C-A--A-A-----CCG---T-T--C--A---G-----------------------------------------------------C---G-T-T--T--C-GTT--CCG-T-G-CA-AGT-GGT----------G-------------G-T-A------G--TAGCAC----CT-T-tgt
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gi|8 : TCATT-GCGTT--A-AAGAT---A--T----TT--T--AG-----AAT-T-------TAA--T----CGCGCAC-CCGT--A-ATA------TA-----A-------A-------AACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNN----NNN-NNNNN----NN--NNN--------TA----A---A-GC-GTCT----T----CGT---------TATC-G--GCAA-------A-AGCG--TTTTCT----CCG-T-T-----TA----A--AA-G---CGT--T--T--CGTTC----CGT--------------------------------T-T--A--GCGT-----------------------------------------CG--TTC--CGTT------C--A--AAC------CGTT----C------ACC--TT---CCGGGCAGA-C-----G----TT-CA----GCC-G---T---TC-C-G-TA-C-A--A-A-----CCG---T-T--C--A---GCGTTGG-----TTG----CG-T-G-CA------AA--CCG-T-CA---G----C---G-T-T--T--C-GTT---CG-T-GCCA-AGTGGG-----------G-------------G-TGA------GATTTGCAC-G--CT-T-T
gi|9 : AT---A--T----TT--T--AG-----AATGT-------TAA--TT---CGC--AC-ACGT--A-AAA------TT-----A-------
gi|9 : A--A--A---------G------CG---TT-C------CGTTTTCG-----T---GT-AA--A----CCGTTTTAA-A-G--CG--TTT--CGTTTCG---T--GTAAAA------CGTTGCACC------CGT--T----CCGTGCAAA-C--C--G----TT-CA----GC--G---T---TT-C-G-TG-C-A--A-A-----CCG---T-TCAC--A---GC----G-----TTC----CG-T---TA----AGAA--TCT-T-T----T----C---G-T-T--T--C-GTT--CCG-T-G-CA-AGT-GG-----------G-------------GTT-A------G--TAGCAC-G--CT-T-TAT-GGTCcctggnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattcaattcaaagaaacgtttcaaaagcgttccgttttcgtgtaaaccgttttaaagcgtttcgtttcgtgtaaaacgttgcacccgttccgtgcaaaccgttcagcgtttcgtgcaaaccgttcacagcgttccgttaagaatcttttcgtttcgttccgtgcaagtggggttagtagcacgctttatggtcat
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-1692 ) : TCATT-GCGTT--A-AAGAT---A--T----TT--T--AG-----AAT-T-------TAA--T----CGC--AC-CCGT--A-A-A-------AT-------CGA-------AACGCGGANAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTN---TCAT----TCA-AGAAA----CG--TTCA--A----CA----A-C-A-GC-GT-T----T----CGT---------T-TC-GT-GCAA-------A-N-CG--TT--CA----CCG-T-C-----CG--GCA--AA-G---CGT--T--T--CGTTC----CGTGCCA--A--A---------C------CG---TT-CA--GCGTTT-CG-T---GC-AA--A----CCGTTC--A-A-G--CG--TTC--CGTTTCG---C--G--AAC------CGTT----C------CGT--TT---CCGTGCAAA-C--C--G----TT-CA----GC--G---T---TT-CG-TG-C-A--A-A-----CCG---T-T--C--A---NC----G-----TTC----CG-T-G-CA----AGAA--TCG-T-T----T----C---G-T-T--T--C-GTT--CCG-T-G-CA-AGT-GG-----------G-------------G-T-A------G--TAGCAC-G--CT-T-TAG-GGTC
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gi|13 : gaaTTATT-GCGTT--T-GAGAT---A--T----TT--T--AC-----AAT-T-------TAA--T----CGT--GT-CCGT--A-A-A-------AT-------CGA-------
gi|13 : tatgtctataT-CG-T---GC-AA--A----GCGTTT--A-------------------CTG---C--C--AAC------CGTCAG--C------AGT--T-----CATGCAGA-A--C--G----TT-CA----GC--G---T---TT-CT-TG-C-A--A-A-----CCG---T-T--T--A---CC----G-----TTC----CG-T-G-CA----AGAA--TCG-T-G----T----C---G-T-T--T--C-ATT--ACG-C-G-GA-AGT-CA-----------G-------------G-T-A------A--TAAAAC-G--TT-T-TAG-cctgaataatgcaaaagaaactannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnataattcaaagaacgggcagattatcgtgcaaagcgtttactgccaaccgtcagcagttcatgcagaacgttcagcgtttcttgcaaaccgtttaccgttccgtgcaagaatcgtgtcgtttcattacgcggaagtcaggtaataaaacgttttagg
gi|14 : tatgtctatattattgcgtttgagatattttacaatttaatcgtgtccgtaaaatcgacctgaataatgcaaaagaaactannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnataattcaaagaacgggcagattaTCATT-GCTTT--A-AAGAT---A--T----TT--A--AA-----AAT-T-------TAA--T----CGC--AC-ACGT--A-A-A-------AT-------CGATCTGN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNN----NNN-NNNAT----CA--TTCA--A----GA--------A-AC-GT-T----CAAAGCGT---------T-TC-GT-GCAA-------A-C-AG--TT-------------------------CA--AA-G---CGT--T--T--CGTTT----CGTGC
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gi|15 : atcattgctttaaagatatttaaaaatttaatcgcacacgtaaaatcgatctgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcattcaagTCATT-GCGTT--A-AAGAT---A--T----TT--T--AG-----AAT-T-------TAA--T----CG---AC-CCGT--A-A-A-------AT-------TGA-------
gi|15 : gaa-A-GC-AT-T----T----CGT---------T-TC-GG-GCAA-------A-C-CG--TT-------------------------TA--AA-G---CGT--T--T--CGTTT----CAT-TCA--A--A---------C------CG---TT-CA--CCGTTC-CG-G---GC-AG--A----CCGTTC----A-T--CG--TT---CGT---G---C--A--AA---------------C------CGT--TT---CAGTGCAAA-C--C--G----TT-CA----CC--G---T---TT-GT-TG-C-A--A-A-----ACA---T-T--C--A---C-----------------------------------------------------C---G-T-T--T--C-GTT--CCG-T-G-CA-AGT-GG-----------G-------------G-T-A------G--TAGCAC-G--CT-T-TAG-GGTCccgtgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaagcatttcgtttcgggcaaaccgtttaaagcgtttcgtttcattcaaaccgttcaccgttccgggcagaccgttcatcgttcgtgcaaaccgtttcagtgcaaaccgttcaccgtttgttgcaaaacattcaccgtttcgttccgtgcaagtggggtagtagcacgctttagggtc
gi|16 : gaatcattgcgttaaagatattttagaatttaatcgacccgtaaaattgaccgtgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaTCATT-GCCTT--T-ACTAT---A--T----TT--T--AG-----AAT-T-------TAC--T----CG---ACACCGT--ACA-A-------AA-------CGA-------
gi|16 : atgtaCA--A--A---------G------CG---TT-TC--ATATTT-TG-T---GC-AATGA----CC-TTC--A-A-----------------------------AAA------CGTT----T------CGT--T-----CGTACAAAAC--C--G----TT-CA----CC--G---G---TC-CT-AG-C-A--G-G-----CC----T-T--C--A---TC----G-----TTC----CG-T-G-AA----TAAA--GCG-T-G----T----G---G---------C-GTT--T-G-T-G-CA-AGT-GG-----------A-------------G-T-A------G--AAGCACGG--CT-T-Tcctgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcattcatgaacgctcaaagcgtttcatattttgtgcaatgaccttcaaaaacgtttcgttcgtacaaaaccgttcaccggtcctagcaggccttcatcgttccgtgaataaagcgtgtggcgtttgtgcaagtggagtagaagcacggcttt
gi|17 : atgtatcattgcctttactatattttagaatttactcgacaccgtacaaaacgacctgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcattcatgaacgctATT-CCGTT--A-AAAAG---AGTT----TT--TGAAG-----AAA-T-------TAA--TGT--CGCC-AC-CCGT--A-A-A-------ATGACCTGNNNN-------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NCATGCATTCA-AGAAA----CG--T--A--A-----A----G-C-C-GC-TG-T----T----CGT---------T-TCGGT-GCAA-------A-C-C---TT--CA----------------------A--AACG---CGT--T--T--C-TTC----C-TG-CA--A--A---------C------CGGTCTT-CA------TT-CG-TCCGGC-AC--G----TCG-TC--A-A-GAATG--TTC--GTTTTCG---
gi|17 : atatatcatC------TGTT----C-------GT--TT---CGGTGCAAA-C--C-------TT-CAAAACGC--G---TTTCTT-CC-TG-C-A--A-A-----CCGGTCT-T--C--AT--TC----G-----TCCGGCACG-TCGTCA----AGAA--T-G---T----T----C---GTT-T--T--C-GTTTGCCGCT-G-CA-A-T--G-----------G-------------G-T-A------G--TAA-AC-A--C--T-TAGTGGTCtttgccgctgcaatgggtagtaaacacttagtggtc
gi|18 : atatatcatattccgttaaaaagagtttttgaagaaattaatgtcgccacccgtaaaatgacctgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatgcattcaagaaacgtaaagccgATT-GCGTT--A-A-GAT---A--T----TT--T--AG-----AAT-T-------TAA--C----TG---AC-CCGT--A-A-ATTGACTGNN-------NNN-------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGCGTT---TCGT----TC-----------CG--GGCA--A----TA----------GC-GT-T----T----C-T---------T-CC-GT-TTAAGGTTTCCG-T-CG--TT--CA----ACG-T-CACGTTCG--GCAG-AA-C---CGT--TCAT--CGTTC----CGTG--A--A--A---------C------CG---CT-TA--GCG-TT-CG-T------AA--A----CCGTT-----A-G-----------CGTTTCG---T--G--AACGTTCAGCATT----T------CG---TT---CCGTGCA
gi|18 : gataA-G---CGT--T--T--CGTTC----CGGGCAA--T--AGCGTTTCTTC------CG---TT-TA--AGGTTTCCG-T----------------CGTTC--A-A----CG--TCA--CGTTCGG---CA-G--AAC------CGTT----CAT----CG---TT---CCGTG-AAA-C--C--G----CT-TA----GC--G-------TT-CG-T----A--A-A-----CCG---T-T-----A---GC----G-----TTT----CG-T-G--A----A------CG-T-T----CAG--C---A-T-T--T--C-GTT--CCG-T-G-C--AGT-GG-----------G-------------G-T-A------G--TAG--C-G--CTGT-TAG-gtggggtagtagcgctgttagg
gi|19 : gataattgcgttaagatattttagaatttaactgacccgtaaattgactgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTCATT-GCGTTTAATAAGAT---A--T----TT--T--AGAATTTAAT-TGCGCCCATAAAAT----CG---AC-CTGN--N-N-N-------NN-------NNN-------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATCAT----TCA-AGAAA----CA--TTCA--A--------------A-GC-GT-T----T----C----------------GT-GTAA-------A-C-CG--TT--CA----CCATT-C-----CAT-GCA--GA-C---CATTCT--T--CGCTT----CGTG-CA--A--A---------G------CG---TT-CA--GCGCTT-CA-T---GC-AA--
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gi|23 : tttcaaggttatttctgtatcattgcgtctgagatattttagaatttaatcgaacccgtaaaattgacacgaataatgcctataacaactccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcattcaagaaatATT-ACATT--T-GAGAT---A--T----TT--T--AT-----AGT-T-------TAA--T----CAC--GC-CTGT--A-A--------------------A-------GACCTGAATAATTTCAAAACCTAAGTGTGCAAGCCGCCTACCATTTTGTGCACACCATGCAGA---------------TCAT----TCA-AGAAA----TG--------------A----G-T-A-G---------------TGT---------T-TC-GT-GCAA-------A-G-CAT-TT--CA----GCGTT-C-----TGT-GCA--GA-T---CAT--T--CGACGTTC----CATACAAG-A--A---------T------TG---TT-T----CGCTT-TG-T---GC-
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gi|24 : tttccagattatttctgtattacatttgagatattttatagtttaatcacgcctgtaaagacctgaataatttcaaaacctaagtCGTGCAAG-C--CCCG----CC-TA----CC--G---T---TC-C-------A--A-A-----GTG---T-T---------TC----G-----TTT----CG-G-G-CA----A--A--TCA-T-T----TAAAGC---G-T-T--T--C-GTT--TCT-T-T-CA-Atgta
gi|24 : gC----CGTTCCA--A--A---------G------TG---TT-T----CGTTT-CG-G---GC-AA--A----TCATTT--A-AAG--CG--TTT--CGTTTCTTT-C--A--AAC------CGTT----CAC----CGT--T----CCGGGCAGA-C--C--G----TT-CA----TC--G---T---TC-CG-TG-C-A--A-A-----CCG---T-T--A--A---GT----G-----TTT----CG-T-G-------AAAA--CCG-T-T---------CAGGG-T-T--T--C-GTT--CCG-T-G-CA-AGT-GG-----------G-------------G-T-A------G--TAGCAC-accgttcaccgttccgggcagaccgttcatcgttccgtgcaaaccgttaagtgtttcgtgaaaaccgttcagggtttcgttccgtgcaagtggggtagtagcaccaggggtcataatgataaccata
gi|25 : gcgtgcaagccccgcctaC----CGTAC-A--A--A---------C------CG---TT-CA--GCGTC--CG-T---ACCAA--A----TCGTTC--A-G-T--CG--CT------TTCGAAGC--A--AAC------CGTT----C------AGCAGTA---TCGTGCAAC-C--C--G----TT-CA----GC--GTTAT---TC-CG-TGTC-AATA-A-----CCG---T-T--T--C---AC----GCGGGTTTC----C--T-T-CA----AGGA--TTA---T----T----C---G-TAT--T--C---T--CCG-T-G-CA-AGT-GG-----------GGGCAGTGTTGATAG-T-A------G--TAGCAC-C--AT-T-TAG-caggggtcataatgataaccata
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gi|28 : tcattcaaaaaacgggCGTTC-AG-T---GC-AA--A----TAGTTT--A---T--CA--TTA--AATTT--------A--AAA------CGTT----C------AGT--TTT--CCGTGCAAA-C--C--G----TT-CA----GC--G---T---TA-CA-TG-T-ATGA-A-----TCGA--T-T--CGTA---AC----G-----TTA----AG-T-G-TA----Acgct
gi|28 : attcaaagatcagttgaagcagttgattgatttatgtcaatAAA-A--C--G----TT-CA----GT--T---T---TC-CG-TG-C-A--A-A-----CCG---T-T--C--A---GC----G-----TTA----CA-T-G-TA----TGAA--TCG-A-T----T----C---G-T-A--A--C-GTT--AAG-T-G-TA-AAC-GA-----------C-------------G-T-G------G--TTGCAC-G---T-T-TAC-GGTacgacgtggttgcacgtttacggttatgtaa
gi|29 : attcaaagatcagttgaagcagttgattgatttatgtcaatcgttcagtgcaaatagtttatcattaaattt--T--C-GTT--CCG-T-G-CA-AGT-GG-----------G-------------G-T-A------G--TAGCAC-G--CT-T-TAG-GGtatgtaa
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gi|31 : gatcattcaccattcggtgcaaacg-CA--ACATTC-CG-T---GC-AA--A----------------G--TG--TTT--CGT---G---T--A--AAT------CCTTTA--C------CAT--T----CCGTGCAGA-C--T--G----TT-CA----GT--G---T---TT-CG-TG-C-A--A-A-----CCG---T-T--C--A---TC----G-----TTC----CG-T-G-CA----ATAA--TCG-T-T----T----T---G-T-T--T--C-GAT--CAA-T-G-AA-AGT-GG-----------A-------------G-A-C------G--TACCAC-T--CT-T-TAT-GGTCc
gi|32 : tcattcaagaaacagaA--A--A---------C------CA---TT-CA--GCGTTC-CG-T---AC-AA--A----TCGTTC--AGA-G--CGAGTTC--CGGT-AA---C--A--AAC------CGTT----CAGCAGACGT--TT---C-GTGCAAA-C--C--G----TT-CA----GC--G---T---TTTCG-TG-C-A--A-A-----TCG---T-TT-C--A---GC----G-----TTC----CG-T-T-CA----AGA---TCG-T-T----T----CC--G-T-T--T--C-GTT--CCG-TGG-CA-AGT--G-----------G-------------G-T-A------G--TAGtg
gi|33 : A--GCATTC-CG-T---GC-AA--A----GCGTT---A-A-G--CG--TTC--CAT---G---C--A--TAT------CAGT----CAAG---CA---TT---CTGTGCAAA-G--C--A----TT-TA----GC--A---T---TC-CA-GG-C-A--AGA-----CTA---T-T--T--T---AC----G-----TTC----CA-T-G-TA----AGAA--TCA-A-A----C----C--------------------------A-CA-AGT-GG-----------T-------------G-T-A------A--TAGTGT-G--CT-T-CAG-GGTCgca
gi|34 : catatcagtcaA--GCGTTT-GG-A---GC-AA--A----------------G--CG--TTC--CATT------C--A--AAC------TGTT----CA-----CTG--TT---CCGTGCAGA-C--C--G----TT-CA----GC--G---T---TT-CG-TG-C-A--A-A-----CCG---T-T--C--A---CC----G-----TTC----CG-C-A-CA----AGAA-------------T----C---G-T-T--T--C-ATT--CCG-T-G-CA-GGT-GG-----------G-------------G-T-A------A--TAGCAC-A--CT-T-TAG-GGTCtgt
gi|35 : gccttttgttgaaC-GT-T----T----AGT---------T-TC-GT-TCAA-------A-T-CG--TT--CA----TCG-T-T-----CAATGCA--GA-T---CGT--TCAT--CGTTT----CGCGC-A--A--A---------C------CG---TT-CA--GCGTTT-CG-T---GC-AA--A----CCATTC--AGA-G--CG--TTC--CGTGT-G---A--G--AAT------CGTT----C------CGT---------GTA-AGA----------------A----GC--G---T---TT-CG-TG-C-A--G-A-----t
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gi|37 : --CG--TTT--TGTTTCGTA-C--A--AAT------CGTT----CAT----CGT--T----CCGCGCCAA-G--C--G----TT-CA----GT--G---T---TT-CG-TG-C-A--A-A-----CCG---T-T--C--A---CC----G-----TTC----CG-T-T-AA----AGAA--TCG-T---------------G------T--C-CTT--CCG-T-G-TA-AGT-GG-----------G-------------G-T-A------G--TAGCAC-G--CT-T-TAG-GGTCtg
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gi|39 : ttt---TCAT----TCA-AGAAA----CG--GGCATCA----TA----A-C-GTGC-AT-A----G----CGT---------T-TC-AT-GCAA-------A-G-CG--TT--CA----CCG-T-T-----CC--GTAC-AA-GAATCGT--T--T--CGTTA----CGTTCCtgc
gi|39 : A----GC--G---T---TT-CA-TG-C-A--A-A-----GCG---T-T--C--A---CC----G-----TTC----CG-T-A-CA----AGAA--TCG-T-T----T----C---G-T-T--A--C-GTT--CCG-T-G-CA-AGT-GG-----------G-------------G-T-A------G--TAACAC-G--CT-T-TAG-GTTCgtgcaagtggggtagtaacacgctttaggttct
gi|4 : tcattcaagaaacgggcatcataacgtgcatTCATG-GCATT--T-GAGAT---A--T----TT--T--AG-----AAG-T-------TAG--A----AAT--AC-CGAG--A-A-A-------AC-------NNN-------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNN----NNN-NNNAT----CA--TTCA--AGAAGCA----AGC-A-G---------------CAT---------T-TC-AT-GCAA-------ACA-CA--TT--------TCG-T-----------GCA--AG-G---CGT--T--T--Ct
gi|4 : ggatatgtatgta--CATTT----CATGC-A--A--A---------CACATTTCG---TG-CAAGGCGTTT-CA-T---GC-AA--T----CTGTTC--A------------C--CAT---G---C--A--GAC------CGTA----CAA----CGT--TT---C-ATGCAAA-T--C--AATGATT-CA----GC--G---T---TT-CA-TG-C-A--A-ATTTAACTG---T-T--C--A---CCC---G-----TTC----CA-T-G-CA----AGAA--TCA-T-T----T----C---G-T-T--T--C-GTT--CTG-T-G-CA-AGT-GG-----------G-------------G-T-A------G--TAGCAC-G--CT-T-TAG-GGTatgcaatctgttcaccatgcagaccgtacaacgtttcatgcaaatcaatgattcagcgtttcatgcaaatttaactgttcacccgttccatgcaagaatcatttcgtttcgttctgtgcaagtggggtagtagcacgctttagggtgtg
gi|40 : ggatatgtatgtatcatggcatttgagatattttagaagttagaaataccgagaaaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcattcaagaagcaagcag---TCAT----TCA-AGAAA----CG--GGCA--T----CAT---A-C-GTGC-AT-A----G----CGT---------T-TC-AT-GCAA-------A-G-CG--TT--CA----CCG-T-T-----CC--GTAC-AA-GAATCGT--T--T--CGTTA----CGTTCCgtg
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gi|44 : ga----GC--G---T---TT-CG-TG-T-A--A-A-----TCGCA-T-C--C--A---CC----G-----TTC----CG-T-G-CA----AGAA--TCG-T-T----T----C-------T--T--C-GTT--gtt
gi|45 : gatcattcaggaaatgggcagattgccttgcaatG-C-A--A-A-----CTG---T-T--A--G---GC----A-----TTC----TG-T-G-CA----AGAA--TCA-T-TTAAAT----T---G-T-T-------GTT----G-C-A-CA-A---GG-----------T-------------G-T-A------G--TAGCAC-A--CT-T-CAG-GGTC
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gi|47 : gg----G-----TTCTG--CG-T-G-TG----AGAA--TCA-T-T----T----C---G-T-A--T--C-GTT--CCA-TAG-C--AGT-GG-----------T-------------G-T-A------A--TAGTAC-G--CT-T-TGG-t
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gi|52 : attatcaatattatatcaatattctcaat-CA----CGAA--TCG-T-T----T----C---GGT-T--T--T-GTT--CCG-T-G-CA-AGT-GG-----------G-------------G-T-A------G--TAGCAC-G--CT-T-GAG-GGTcct
gi|53 : ttTCATT-GCGTT--A-AAGAT---A--T----TC--T--AG-----AAT-T-------TCA--T----CGC--AC-CCGT--C-A-A-------AT-------CGA-------
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gi|55 : ATT-GCGTT--A-AAGAT---A--T----TT--T--AG-----AAT-T-------TAA--T----CGC--AC-CCGT--A-A-A-------AT-------CGA-------tg
gi|56 : ----C---G-T-T--T--C-GTT--CCG-T-G-CA-AGT-GG-----------G-------------G-T-G------A--TAGCAC-G--CT-A-TAG-GGTC
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gi|58 : ATT-GCGTT--A-AAGAT---A--TCAATTT--T--AG-----AAT-T-------TAA--T----CGC--AC-CAGT--A-tat
gi|59 : TT--CCG-T-G-CA-AGT-GG-----------G-------------G-T-A------G--TAGCAC-G--CT-T-TAG-GGTCt
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gi|8 : TCATT-GCGTT--A-AAGAT---A--T----TT--T--AG-----AAT-T-------TAA--T----CGCGCAC-CCGT--A-A-T-------AT-------AAA-------AACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNN----NNN-NNNNN----NN--NNN--------TA----A---A-GC-GTCT----T----CGT---------TATC-G--GCAA-------A-AGCG--TTTTCT----CCG-T-T-----TA----A--AA-G---CGT--T--T--CGTTC----CGT--------------------------------T-TA--GCGT-------------------------------------CG--TTC--CGTT------C--A--AAC------CGTT----C------ACC--TT---CCGGGCAGA-C-----G----TT-CA----GCC-G---T---TC-CG-TA-C-A--A-A-----CCG---T-T--C--A---GCGTTGG-----TTG----CG-T-G-CA------AA--CCG-T-CA---G----C---G-T-T--T--C-GTT---CG-T-GCCA-AGTGGG-----------G-------------G-TGA------GATTTGCAC-G--CT-T-T
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3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-1692 ) : TCATT-GCGTT--A-AAGAT---A--T----TT--T--AG-----AAT-T-------TAA--T----CGC--AC-CCGT--A-A-A-------AT-------CGA-------AACGCGGANAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTN---TCAT----TCA-AGAAA----CG--TTCA--A----CA----A-C-A-GC-GT-T----T----CGT---------T-TC-GT-GCAA-------A-N-CG--TT--CA----CCG-T-C-----CG--GCA--AA-G---CGT--T--T--CGTTC----CGTGCCA--A--A---------C------CG---TT-CA--GCGTTT-CG-T---GC-AA--A----CCGTTC--A-A-G--CG--TTC--CGTTTCG---C--G--AAC------CGTT----C------CGT--TT---CCGTGCAAA-C--C--G----TT-CA----GC--G---T---TT-CG-TG-C-A--A-A-----CCG---T-T--C--A---NC----G-----TTC----CG-T-G-CA----AGAA--TCG-T-T----T----C---G-T-T--T--C-GTT--CCG-T-G-CA-AGT-GG-----------G-------------G-T-A------G--TAGCAC-G--CT-T-TAG-GGTC
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gi|13 : gaaTTATT-GCGTT--T-GAGAT---A--T----TT--T--AC-----AAT-T-------TAA--T----CGT--GT-CCGT--A-A-A-------AT-------CGA-------
gi|13 : tatgtctataT-CG-T---GC-AA--A----GCGTTT--A-------------------CTG---C--C--AAC------CGTCAG--C------AGT--T-----CATGCAGA-A--C--G----TT-CA----GC--G---T---TT-CT-TG-C-A--A-A-----CCG---T-T--T--A---CC----G-----TTC----CG-T-G-CA----AGAA--TCG-T-G----T----C---G-T-T--T--C-ATT--ACG-C-G-GA-AGT-CA-----------G-------------G-T-A------A--TAAAAC-G--TT-T-TAG-cctgaataatgcaaaagaaactannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnataattcaaagaacgggcagattatcgtgcaaagcgtttactgccaaccgtcagcagttcatgcagaacgttcagcgtttcttgcaaaccgtttaccgttccgtgcaagaatcgtgtcgtttcattacgcggaagtcaggtaataaaacgttttagg
gi|14 : tatgtctatattattgcgtttgagatattttacaatttaatcgtgtccgtaaaatcgacctgaataatgcaaaagaaactannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnataattcaaagaacgggcagattaTCATT-GCTTT--A-AAGAT---A--T----TT--A--AA-----AAT-T-------TAA--T----CGC--AC-ACGT--A-A-A-------AT-------CGATCTGN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNN----NNN-NNNAT----CA--TTCA--A----GA--------A-AC-GT-T----CAAAGCGT---------T-TC-GT-GCAA-------A-C-AG--TT-------------------------CA--AA-G---CGT--T--T--CGTTT----CGTGC
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gi|15 : atcattgctttaaagatatttaaaaatttaatcgcacacgtaaaatcgatctgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcattcaagTCATT-GCGTT--A-AAGAT---A--T----TT--T--AG-----AAT-T-------TAA--T----CG---AC-CCGT--A-A-A-------AT-------TGA-------
gi|15 : gaa-A-GC-AT-T----T----CGT---------T-TC-GG-GCAA-------A-C-CG--TT-------------------------TA--AA-G---CGT--T--T--CGTTT----CAT-TCA--A--A---------C------CG---TT-CA--CCGTTC-CG-G---GC-AG--A----CCGTTC----A-T--CG--TT---CGT---G---C--A--AA---------------C------CGT--TT---CAGTGCAAA-C--C--G----TT-CA----CC--G---T---TT-GT-TG-C-A--A-A-----ACA---T-T--C--A---C-----------------------------------------------------C---G-T-T--T--C-GTT--CCG-T-G-CA-AGT-GG-----------G-------------G-T-A------G--TAGCAC-G--CT-T-TAG-GGTCccgtgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaagcatttcgtttcgggcaaaccgtttaaagcgtttcgtttcattcaaaccgttcaccgttccgggcagaccgttcatcgttcgtgcaaaccgtttcagtgcaaaccgttcaccgtttgttgcaaaacattcaccgtttcgttccgtgcaagtggggtagtagcacgctttagggtc
gi|16 : gaatcattgcgttaaagatattttagaatttaatcgacccgtaaaattgaccgtgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaTCATT-GCCTT--T-ACTAT---A--T----TT--T--AG-----AAT-T-------TAC--T----CG---ACACCGT--ACA-A-------AA-------CGA-------
gi|16 : atgtaCA--A--A---------G------CG---TT-TC--ATATTT-TG-T---GC-AATGA----CC-TTC--A-A-----------------------------AAA------CGTT----T------CGT--T-----CGTACAAAAC--C--G----TT-CA----CC--G---G---TC-CT-AG-C-A--G-G-----CC----T-T--C--A---TC----G-----TTC----CG-T-G-AA----TAAA--GCG-T-G----T----G---G---------C-GTT--T-G-T-G-CA-AGT-GG-----------A-------------G-T-A------G--AAGCACGG--CT-T-Tcctgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcattcatgaacgctcaaagcgtttcatattttgtgcaatgaccttcaaaaacgtttcgttcgtacaaaaccgttcaccggtcctagcaggccttcatcgttccgtgaataaagcgtgtggcgtttgtgcaagtggagtagaagcacggcttt
gi|17 : atgtatcattgcctttactatattttagaatttactcgacaccgtacaaaacgacctgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcattcatgaacgctATT-CCGTT--A-AAAAG---AGTT----TT--TGAAG-----AAA-T-------TAA--TGT--CGCC-AC-CCGT--A-A-A-------ATGACCTGNNNN-------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NCATGCATTCA-AGAAA----CG--T--A--A-----A----G-C-C-GC-TG-T----T----CGT---------T-TCGGT-GCAA-------A-C-C---TT--CA----------------------A--AACG---CGT--T--T--C-TTC----C-TG-CA--A--A---------C------CGGTCTT-CA------TT-CG-TCCGGC-AC--G----TCG-TC--A-A-GAATG--TTC--GTTTTCG---
gi|17 : atatatcatC------TGTT----C-------GT--TT---CGGTGCAAA-C--C-------TT-CAAAACGC--G---TTTCTT-CC-TG-C-A--A-A-----CCGGTCT-T--C--AT--TC----G-----TCCGGCACG-TCGTCA----AGAA--T-G---T----T----C---GTT-T--T--C-GTTTGCCGCT-G-CA-A-T--G-----------G-------------G-T-A------G--TAA-AC-A--C--T-TAGTGGTCtttgccgctgcaatgggtagtaaacacttagtggtc
gi|18 : atatatcatattccgttaaaaagagtttttgaagaaattaatgtcgccacccgtaaaatgacctgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatgcattcaagaaacgtaaagccgATT-GCGTT--A-A-GAT---A--T----TT--T--AG-----AAT-T-------TAA--C----TG---AC-CCGT--A-A-ATTGACTGNN-------NNN-------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGCGTT---TCGT----TC-----------CG--GGCA--A----TA----------GC-GT-T----T----C-T---------T-CC-GT-TTAAGGTTTCCG-T-CG--TT--CA----ACG-T-CACGTTCG--GCAG-AA-C---CGT--TCAT--CGTTC----CGTG--A--A--A---------C------CG---CT-TA--GCG-TT-CG-T------AA--A----CCGTT-----A-G-----------CGTTTCG---T--G--AACGTTCAGCATT----T------CG---TT---CCGTGCA
gi|18 : gataA-G---CGT--T--T--CGTTC----CGGGCAA--T--AGCGTTTCTTC------CG---TT-TA--AGGTTTCCG-T----------------CGTTC--A-A----CG--TCA--CGTTCGG---CA-G--AAC------CGTT----CAT----CG---TT---CCGTG-AAA-C--C--G----CT-TA----GC--G-------TT-CG-T----A--A-A-----CCG---T-T-----A---GC----G-----TTT----CG-T-G--A----A------CG-T-T----CAG--C---A-T-T--T--C-GTT--CCG-T-G-C--AGT-GG-----------G-------------G-T-A------G--TAG--C-G--CTGT-TAG-gtggggtagtagcgctgttagg
gi|19 : gataattgcgttaagatattttagaatttaactgacccgtaaattgactgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTCATT-GCGTTTAATAAGAT---A--T----TT--T--AGAATTTAAT-TGCGCCCATAAAAT----CG---AC-CTGN--N-N-N-------NN-------NNN-------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATCAT----TCA-AGAAA----CA--TTCA--A--------------A-GC-GT-T----T----C----------------GT-GTAA-------A-C-CG--TT--CA----CCATT-C-----CAT-GCA--GA-C---CATTCT--T--CGCTT----CGTG-CA--A--A---------G------CG---TT-CA--GCGCTT-CA-T---GC-AA--
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gi|23 : tttcaaggttatttctgtatcattgcgtctgagatattttagaatttaatcgaacccgtaaaattgacacgaataatgcctataacaactccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcattcaagaaatATT-ACATT--T-GAGAT---A--T----TT--T--AT-----AGT-T-------TAA--T----CAC--GC-CTGT--A-A--------------------A-------GACCTGAATAATTTCAAAACCTAAGTGTGCAAGCCGCCTACCATTTTGTGCACACCATGCAGA---------------TCAT----TCA-AGAAA----TG--------------A----G-T-A-G---------------TGT---------T-TC-GT-GCAA-------A-G-CAT-TT--CA----GCGTT-C-----TGT-GCA--GA-T---CAT--T--CGACGTTC----CATACAAG-A--A---------T------TG---TT-T----CGCTT-TG-T---GC-
gi|23 : tttccagattatttctgtGTGC-A--A--G---------C------CG---CC-TA--CCATTT-TG-T---GC-AC--A----CCATGC--A-------G--ATC--A--TTCA---A--G--AAA------TGAG----T------AGTG-TT---TCGTGCAAA-G--C--A----TTTCA----GC--G---T---TC-TG-TG-C-A--G-A-----TCA---T-T--C--G---AC----G-----TTC----CA-T-A-CA----AGAA--TTG-T-T----T----C---G-C-T--T----------TG-T-G-CT-ATT-GG-----------G-------------G-T-A------G--TAGTAC-C--CT-T-TAG-AGTCtattggggtagtagtaccctttagagtctgta
gi|24 : tttccagattatttctgtattacatttgagatattttatagtttaatcacgcctgtaaagacctgaataatttcaaaacctaagtCGTGCAAG-C--CCCG----CC-TA----CC--G---T---TC-C-------A--A-A-----GTG---T-T---------TC----G-----TTT----CG-G-G-CA----A--A--TCA-T-T----TAAAGC---G-T-T--T--C-GTT--TCT-T-T-CA-Atgta
gi|24 : gC----CGTTCCA--A--A---------G------TG---TT-T----CGTTT-CG-G---GC-AA--A----TCATTT--A-AAG--CG--TTT--CGTTTCTTT-C--A--AAC------CGTT----CAC----CGT--T----CCGGGCAGA-C--C--G----TT-CA----TC--G---T---TC-CG-TG-C-A--A-A-----CCG---T-T--A--A---GT----G-----TTT----CG-T-G-------AAAA--CCG-T-T---------CAGGG-T-T--T--C-GTT--CCG-T-G-CA-AGT-GG-----------G-------------G-T-A------G--TAGCAC-accgttcaccgttccgggcagaccgttcatcgttccgtgcaaaccgttaagtgtttcgtgaaaaccgttcagggtttcgttccgtgcaagtggggtagtagcaccaggggtcataatgataaccata
gi|25 : gcgtgcaagccccgcctaC----CGTAC-A--A--A---------C------CG---TT-CA--GCGTC--CG-T---ACCAA--A----TCGTTC--A-G-T--CG--CT------TTCGAAGC--A--AAC------CGTT----C------AGCAGTA---TCGTGCAAC-C--C--G----TT-CA----GC--GTTAT---TC-CG-TGTC-AATA-A-----CCG---T-T--T--C---AC----GCGGGTTTC----C--T-T-CA----AGGA--TTA---T----T----C---G-TAT--T--C---T--CCG-T-G-CA-AGT-GG-----------GGGCAGTGTTGATAG-T-A------G--TAGCAC-C--AT-T-TAG-caggggtcataatgataaccata
gi|26 : A--A--A---------T------CG---TT-C----TGTTT-CG-T---GC-AA--A----TCGTTT--A-AAG--CG--TTT--CGTTTCG---T--GCAAAG------CGTC----CAG----CGT--T----CCGGGCAGA-C--C--G----TT-CA----TC--G---T---TC-CG-TG-C-A--A-A-----TCG---T-T--C--A---GC----G-----TTT----CG-T-G-CA----AAGCGTTCG-T-T----T----C---G-T-T--T--C-GTT--CCG-T-G-CA-AGT-GG-----------G-------------G-T-A------G--TAGCAC-G--CT-T-TAG-GGTCt
gi|27 : aacgttt--AA-G---CTT--C--T--CGTTCGAAACATTTCA--A--A---------C------AA-------A--GCGTTT-CG-T---TC-AA--A----CTGTTT--A-C----CG--CTC--CGT---G---T--A--GAC------CGTT----C------AGTA-TT---TCGTGCAAA-C--C--G----TT-CA----CC--A---T---TG-CG-TG-C-A--G-A-----CTG---T-T--C--A---TC----G-----TTC----CT-G-G-CA----AGAA--TAG-TGT----T----T---T-T-T--T--C-GTC--CCG-TAG-CA-tg
gi|28 : tcattcaaaaaacgggCGTTC-AG-T---GC-AA--A----TAGTTT--A---T--CA--TTA--AATTT--------A--AAA------CGTT----C------AGT--TTT--CCGTGCAAA-C--C--G----TT-CA----GC--G---T---TA-CA-TG-T-ATGA-A-----TCGA--T-T--CGTA---AC----G-----TTA----AG-T-G-TA----Acgct
gi|28 : attcaaagatcagttgaagcagttgattgatttatgtcaatAAA-A--C--G----TT-CA----GT--T---T---TC-CG-TG-C-A--A-A-----CCG---T-T--C--A---GC----G-----TTA----CA-T-G-TA----TGAA--TCG-A-T----T----C---G-T-A--A--C-GTT--AAG-T-G-TA-AAC-GA-----------C-------------G-T-G------G--TTGCAC-G---T-T-TAC-GGTacgacgtggttgcacgtttacggttatgtaa
gi|29 : attcaaagatcagttgaagcagttgattgatttatgtcaatcgttcagtgcaaatagtttatcattaaattt--T--C-GTT--CCG-T-G-CA-AGT-GG-----------G-------------G-T-A------G--TAGCAC-G--CT-T-TAG-GGtatgtaa
gi|3 : cgtttcgttccgtttaaagcgtttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTCATT--CGTT--A-AAGAT---AA-T----TT--T--AG-----AAT-T-------TA---T----CTG--AC-CCGT--AGA-A-------AT-------TGA---------CTGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNN----NNN-NNNNN----NN--NNNN--N----CA----A---A-GC-GT-T----T----CGTA--------T-TC-GG-GCAA-------A-G-CGATTT--CGTTTCCCG-T-T-----T-----A--AA-G---CGT--T--C--CGTTC----CGTTTCA--A--A---------C------AG---TTTCA--CCGTGT-C--C---GC-AG--A----C-GTTC--A-------------------TCG---T-------C------CGTA----C-------------------TGCAAA-C--C--G----TT-CA----GC--G---T---TC-CG-TA-CCA--A-A-----CCG---T-T--C--A---GC----GC----TTT----CG-T-T-CA----AA-----CG-C-T----T----CAGCG-T-T--T--C-GTT--CCG-T-G-CA-AGT-GGGAAA-------G-------------G-T-A------G--TAGCAC-G--CT-TATAG-
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gi|31 : gatcattcaccattcggtgcaaacg-CA--ACATTC-CG-T---GC-AA--A----------------G--TG--TTT--CGT---G---T--A--AAT------CCTTTA--C------CAT--T----CCGTGCAGA-C--T--G----TT-CA----GT--G---T---TT-CG-TG-C-A--A-A-----CCG---T-T--C--A---TC----G-----TTC----CG-T-G-CA----ATAA--TCG-T-T----T----T---G-T-T--T--C-GAT--CAA-T-G-AA-AGT-GG-----------A-------------G-A-C------G--TACCAC-T--CT-T-TAT-GGTCc
gi|32 : tcattcaagaaacagaA--A--A---------C------CA---TT-CA--GCGTTC-CG-T---AC-AA--A----TCGTTC--AGA-G--CGAGTTC--CGGT-AA---C--A--AAC------CGTT----CAGCAGACGT--TT---C-GTGCAAA-C--C--G----TT-CA----GC--G---T---TTTCG-TG-C-A--A-A-----TCG---T-TT-C--A---GC----G-----TTC----CG-T-T-CA----AGA---TCG-T-T----T----CC--G-T-T--T--C-GTT--CCG-TGG-CA-AGT--G-----------G-------------G-T-A------G--TAGtg
gi|33 : A--GCATTC-CG-T---GC-AA--A----GCGTT---A-A-G--CG--TTC--CAT---G---C--A--TAT------CAGT----CAAG---CA---TT---CTGTGCAAA-G--C--A----TT-TA----GC--A---T---TC-CA-GG-C-A--AGA-----CTA---T-T--T--T---AC----G-----TTC----CA-T-G-TA----AGAA--TCA-A-A----C----C--------------------------A-CA-AGT-GG-----------T-------------G-T-A------A--TAGTGT-G--CT-T-CAG-GGTCgca
gi|34 : catatcagtcaA--GCGTTT-GG-A---GC-AA--A----------------G--CG--TTC--CATT------C--A--AAC------TGTT----CA-----CTG--TT---CCGTGCAGA-C--C--G----TT-CA----GC--G---T---TT-CG-TG-C-A--A-A-----CCG---T-T--C--A---CC----G-----TTC----CG-C-A-CA----AGAA-------------T----C---G-T-T--T--C-ATT--CCG-T-G-CA-GGT-GG-----------G-------------G-T-A------A--TAGCAC-A--CT-T-TAG-GGTCtgt
gi|35 : gccttttgttgaaC-GT-T----T----AGT---------T-TC-GT-TCAA-------A-T-CG--TT--CA----TCG-T-T-----CAATGCA--GA-T---CGT--TCAT--CGTTT----CGCGC-A--A--A---------C------CG---TT-CA--GCGTTT-CG-T---GC-AA--A----CCATTC--AGA-G--CG--TTC--CGTGT-G---A--G--AAT------CGTT----C------CGT---------GTA-AGA----------------A----GC--G---T---TT-CG-TG-C-A--G-A-----t
gi|36 : aaagcgtttCGTTT-CA-T---GC-AA--ATGATCCATTA--A-A-G--TG--AGCAGCATTTTG---C--A--AAG------CATT-------------T--ATAGACCATGCAAA-C-----------T-TA------------T---TT-TG-TG--------------------------------------------TTC----TG-T-A-CA----AGAA--T---T-T----T----T---G-T-GAAT--C-ATT--CCA-T-G-CA-AGT-GG-----------T-------------G-T-A------A--CA-CAC-GTACT-T-CAA-GATCagc
gi|37 : --CG--TTT--TGTTTCGTA-C--A--AAT------CGTT----CAT----CGT--T----CCGCGCCAA-G--C--G----TT-CA----GT--G---T---TT-CG-TG-C-A--A-A-----CCG---T-T--C--A---CC----G-----TTC----CG-T-T-AA----AGAA--TCG-T---------------G------T--C-CTT--CCG-T-G-TA-AGT-GG-----------G-------------G-T-A------G--TAGCAC-G--CT-T-TAG-GGTCtg
gi|38 : ttaatat-A-G--TG--TTC--CAT---G---C--A--GAC------AGTT----C------CGCG-TT---CCGTACAAA-C--C--G----TT-CG----CC--A---T---TC-CG-TG-C-A--A-A-----CCA---T-T--C--G---CC----G-----TTC----CG-T-G-CA------AA--CCA-T-T----T----A---A-A-A--T--C-GTT--TCG-T-G-CT-AGT-GG-----------T-------------G-A-A------G--TAGTAC-G--TT-T-CAG-GGTCtgt
gi|39 : ttt---TCAT----TCA-AGAAA----CG--GGCATCA----TA----A-C-GTGC-AT-A----G----CGT---------T-TC-AT-GCAA-------A-G-CG--TT--CA----CCG-T-T-----CC--GTAC-AA-GAATCGT--T--T--CGTTA----CGTTCCtgc
gi|39 : A----GC--G---T---TT-CA-TG-C-A--A-A-----GCG---T-T--C--A---CC----G-----TTC----CG-T-A-CA----AGAA--TCG-T-T----T----C---G-T-T--A--C-GTT--CCG-T-G-CA-AGT-GG-----------G-------------G-T-A------G--TAACAC-G--CT-T-TAG-GTTCgtgcaagtggggtagtaacacgctttaggttct
gi|4 : tcattcaagaaacgggcatcataacgtgcatTCATG-GCATT--T-GAGAT---A--T----TT--T--AG-----AAG-T-------TAG--A----AAT--AC-CGAG--A-A-A-------AC-------NNN-------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNN----NNN-NNNAT----CA--TTCA--AGAAGCA----AGC-A-G---------------CAT---------T-TC-AT-GCAA-------ACA-CA--TT--------TCG-T-----------GCA--AG-G---CGT--T--T--Ct
gi|4 : ggatatgtatgta--CATTT----CATGC-A--A--A---------CACATTTCG---TG-CAAGGCGTTT-CA-T---GC-AA--T----CTGTTC--A------------C--CAT---G---C--A--GAC------CGTA----CAA----CGT--TT---C-ATGCAAA-T--C--AATGATT-CA----GC--G---T---TT-CA-TG-C-A--A-ATTTAACTG---T-T--C--A---CCC---G-----TTC----CA-T-G-CA----AGAA--TCA-T-T----T----C---G-T-T--T--C-GTT--CTG-T-G-CA-AGT-GG-----------G-------------G-T-A------G--TAGCAC-G--CT-T-TAG-GGTatgcaatctgttcaccatgcagaccgtacaacgtttcatgcaaatcaatgattcagcgtttcatgcaaatttaactgttcacccgttccatgcaagaatcatttcgtttcgttctgtgcaagtggggtagtagcacgctttagggtgtg
gi|40 : ggatatgtatgtatcatggcatttgagatattttagaagttagaaataccgagaaaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcattcaagaagcaagcag---TCAT----TCA-AGAAA----CG--GGCA--T----CAT---A-C-GTGC-AT-A----G----CGT---------T-TC-AT-GCAA-------A-G-CG--TT--CA----CCG-T-T-----CC--GTAC-AA-GAATCGT--T--T--CGTTA----CGTTCCgtg
gi|40 : A----GC--G---T---TT-CA-TG-C-A--A-A-----GCG---T-T--C--A---CC----G-----TTC----CG-T-A-CA----AGAA--TCG-T-T----T----C---G-T-T--A--C-GTT--CCG-T-G-CA-AGT-GG-----------G-------------G-T-A------G--TAACAC-G--C--T-TAG-GTTCgtgcaagtggggtagtaacacgcttaggttct
gi|41 : tcattcaagaaacgggcatcatacgtgcatGCAAA-C--C--G----TT-CA----GAAAG---T---T---G-CA-C-A--A-AAT---CCG---T-T--C--A---GC----G-----TTC----CGAT-T-CA----AGAA--TCG-T-T----T----CC--G-T-T--T--C-GTG--CCG-T-G-CAGAGT-GG-----------G-------------G-T-AAT----G--TA-CAC-G--CT-T-TAG-GGt
gi|43 : cgcc--G---T---TT-CA-TG-G-G--G-A-----ATG---T-T--C--A---CC----A-----TTT----CG-T-G-CC----AAAA--C---T-T----T----C---G-T-C--C--C-GTT--CCG-T-GCCA-AGT-GA-----------T-------------G-T-A------G--CAGCAC-T--CT-T-CAA-AGTgtc
gi|44 : atgcttact---TCAT----TCA-GGAAA----TG--GGCA--G----------A-T-T-GC-CT-TGCAATG---CGT---------T-TC-GT-GTAA-------A-T-CGCATC--CA----CCGTT-C-----CGT-GCAAGAA-T---CGT--T--T--C-TTC----
gi|44 : ga----GC--G---T---TT-CG-TG-T-A--A-A-----TCGCA-T-C--C--A---CC----G-----TTC----CG-T-G-CA----AGAA--TCG-T-T----T----C-------T--T--C-GTT--gtt
gi|45 : gatcattcaggaaatgggcagattgccttgcaatG-C-A--A-A-----CTG---T-T--A--G---GC----A-----TTC----TG-T-G-CA----AGAA--TCA-T-TTAAAT----T---G-T-T-------GTT----G-C-A-CA-A---GG-----------T-------------G-T-A------G--TAGCAC-A--CT-T-CAG-GGTC
gi|46 : -----CCG---T-T--C--A---TC----G-----TTC----CG-T-G-------ATAA--GCG-T-T----T----T---A-T-T--TGGC-GTT--TCG-T-G-CA-AGT-GG-----------G-------------G-T-A------G--AAGCAT-G--CT-T-TAG-GATCc
gi|47 : gg----G-----TTCTG--CG-T-G-TG----AGAA--TCA-T-T----T----C---G-T-A--T--C-GTT--CCA-TAG-C--AGT-GG-----------T-------------G-T-A------A--TAGTAC-G--CT-T-TGG-t
gi|48 : tt----G-----TTC----CT-T-G-CA----A--A--CCG-T-T----CAC--C---G-C-G--C--C-GTT--CCG-T-G-CA-AGT-GA-----------T-------------G-T-AGCACATG--TAGTAC-A--TT-T-CAG-GGCCtgcctgtaa
gi|49 : ----TCA-AGAAA----CT--TTCA--A--------------A-GC-GT-T----T----CGT---------T-TC-GT-ATAA-------A-C-TG--TT-------------------------CA--AA-G---CGT--T--T--CGTTT----CGTG-CA--A--A---------C------CG---Ttg
gi|5 : TCATT-GCGTT--A-AAGAT---A--T----TT--T--AG-----AAT-T-------TAA--T----CGCGCAC-CCGT--A-A-T-------AT-------AAA-------AACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNN----NNN-NNNNN----NN--NNN--------TA----A---A-GC-GTCT----T----CGT---------TATC-G--GCAA-------A-AGCG--TTTTCT----CCG-T-T-----TA----A--AA-G---CGT--T--T--CGTTC----CGT--------------------------------T-TA--GCGT-------------------------------------CG--TTC--CGTT------C--A--AAC------CGTT----C------ACC--TT---CCGGGCAGA-C-----G----TT-CA----GCC-G---T---TC-CG-TA-C-A--A-A-----CCG---T-T--C--A---GCGTTGG-----TTG----CG-T-G-CA------AA--CCG-T-CA---G----C---G-T-T--T--C-GTT---CG-T-GCCA-AGT-GGGGGTGAGATTTG-------------G-T-A------G--TAGCAC-G--CT-T-TAG-GGTC
gi|50 : aT---A--T----TT--T--AG-----AAT-T-------TAA--T----CGC--GC-CCGT--A-A-A-------AT-------CGA-------t
gi|52 : attatcaatattatatcaatattctcaat-CA----CGAA--TCG-T-T----T----C---GGT-T--T--T-GTT--CCG-T-G-CA-AGT-GG-----------G-------------G-T-A------G--TAGCAC-G--CT-T-GAG-GGTcct
gi|53 : ttTCATT-GCGTT--A-AAGAT---A--T----TC--T--AG-----AAT-T-------TCA--T----CGC--AC-CCGT--C-A-A-------AT-------CGA-------
gi|54 : atgtaA----AGAA--TCG-T-T-----------------------C-GTT--CCG-T-G-CA--GT-GG-----------G-----------------A------G--TAGCAC-G--CT-T-TAG-GGTCcct
gi|55 : ATT-GCGTT--A-AAGAT---A--T----TT--T--AG-----AAT-T-------TAA--T----CGC--AC-CCGT--A-A-A-------AT-------CGA-------tg
gi|56 : ----C---G-T-T--T--C-GTT--CCG-T-G-CA-AGT-GG-----------G-------------G-T-G------A--TAGCAC-G--CT-A-TAG-GGTC
gi|57 : ----C---A-T-T--T--C-GCT--TTG-T-G-CA-TGT-GG-----------G---------------T-A------G--TAGCAC-A--CT-T-TAG-GATCtg
gi|58 : ATT-GCGTT--A-AAGAT---A--TCAATTT--T--AG-----AAT-T-------TAA--T----CGC--AC-CAGT--A-tat
gi|59 : TT--CCG-T-G-CA-AGT-GG-----------G-------------G-T-A------G--TAGCAC-G--CT-T-TAG-GGTCt
gi|6 : TCATTTGCGTT--A-AAGAT---A--T----TT--T--AG-----AAT-T-------TTA-------CGC--AC-CCGTTTA-A-A-------AT-------TGACCTG---AATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNN----NNN-NNNNN----NN--NNNN--N----NA----A---A-GC--T-T----T----CGT---------T-TC-G--GCAA-------A---CG--TT--------TCG-T-T-----CGT-TTA--AA-G---CGT--T--C--CGTAC----CGT-TCA--A--A----------------CG---TTCCA--CCGTTC-CG-G---GC--A--A----CAGTC-----A-T--CG---TC--CG--TCG---C--A--AAC------CGTG----CAG----CG---TT---CCGTACAAA-C--C--G----TT-CA----GC--G---T---TT-CGTTG-C-A--A-A-----CCG---T-T--C--A---G-----------------------------------------------------C---G-T-T--T--C-GTT--CCG-T-G-CA-AGT-GGT----------G-------------G-T-A------G--TAGCAC----CT-T-tgt
gi|60 : gaaGTACAAA-C--C--G----TT-CA----GC--C---T---TT-CG-TG-C-A--A-A-----CCC---T-T--C--A---GC----
gi|7 : TCATT-GCGTT--A-AAGAT---A--T----TT--T--AG-----AAT-T-------TAA--T----CGCGCAC-CCGT--A-A-T-------AT-------AAA-------AACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNN----NNN-NNNNN----NN--NNN--------TA----A---A-GC-GTCT----T----CGT---------TATC-G--GCAA-------A-AGCG--TTTTCT----CCG-T-T-----TA----A--AA-G---CGT--T--T--CGTTC----CGT--------------------------------T-TA--GCGT-------------------------------------CG--TTC--CGTT------C--A--AAC------CGTT----C------ACC--TT---CCGGGCAGA-C-----G----TT-CA----GCC-G---T---TC-CG-TA-C-A--A-A-----CCG---T-T--C--A---GCGTTGG-----TTG----CG-T-G-CA------AA--CCG-T-CA---G----C---G-T-T--T--C-GTT---CG-T-GCCA-AGTGGG-----------G-------------G-TGA------GATTTGCAC-G--CT-T-T
gi|8 : TCATT-GCGTT--A-AAGAT---A--T----TT--T--AG-----AAT-T-------TAA--T----CGCGCAC-CCGT--A-A-T-------AT-------AAA-------AACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNN----NNN-NNNNN----NN--NNN--------TA----A---A-GC-GTCT----T----CGT---------TATC-G--GCAA-------A-AGCG--TTTTCT----CCG-T-T-----TA----A--AA-G---CGT--T--T--CGTTC----CGT--------------------------------T-TA--GCGT-------------------------------------CG--TTC--CGTT------C--A--AAC------CGTT----C------ACC--TT---CCGGGCAGA-C-----G----TT-CA----GCC-G---T---TC-CG-TA-C-A--A-A-----CCG---T-T--C--A---GCGTTGG-----TTG----CG-T-G-CA------AA--CCG-T-CA---G----C---G-T-T--T--C-GTT---CG-T-GCCA-AGTGGG-----------G-------------G-TGA------GATTTGCAC-G--CT-T-T
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gi|9 : A--A--A---------G------CG---TT-C----CGTTTTCG-T---GT-AA--A----CCGTTTTAA-A-G--CG--TTT--CGTTTCG---T--GTAAAA------CGTTGCACC------CGT--T----CCGTGCAAA-C--C--G----TT-CA----GC--G---T---TT-CG-TG-C-A--A-A-----CCG---T-TCAC--A---GC----G-----TTC----CG-T---TA----AGAA--TCT-T-T----T----C---G-T-T--T--C-GTT--CCG-T-G-CA-AGT-GG-----------G-------------GTT-A------G--TAGCAC-G--CT-T-TAT-GGTCtacctggnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattcaattcaaagaaacgtttcaaaagcgttccgttttcgtgtaaaccgttttaaagcgtttcgtttcgtgtaaaacgttgcacccgttccgtgcaaaccgttcagcgtttcgtgcaaaccgttcacagcgttccgttaagaatcttttcgtttcgttccgtgcaagtggggttagtagcacgctttatggtcat
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blockSeqs : . T . . . . . . . . . . C . . . . . NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATCATTCAAGAAGCAAGCA . CTT . . . G . AG . CAGCGTTCTGTGCA . . . . . . NNNNNNN . . C . . . . . G TAAAGCGTTTCGTTTCGTGCAAAGCGTCCAGCGTT C . . . . . . . . . . . . C . . . . A . CAC . . . . C . . . G . . . . . .
blockSeqs : . A . . . . . . . . . . C . . . . . CGATCTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATCATTCAAGAA . TT . . . T . C . CATCGTTCAATGCA . . . . . . TCCAAAG . . C . . . . . C AAAGTGAGCAGCATTTTGCAAAGCATTTATAGA A . . . . . . . . . . . . C . . . . G . AG . . . . C . . . G . . . . . .
blockSeqs : . A . . . . . . . . . . T . . . . . TGACCTGAATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAA . TT . . . T . C . CGTTTCCCGTTTA . . . . . . TTCAAAC . . A . . . . . C CAACGTCACGTTCGGCAGAACCGTTCATCGTT C . . . . . . . . . . . . C . . . . G . AG . . . . T . . . G . . . . . .
blockSeqs : . T . . . . . . . . . . C . . . . . NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATCATTCAAGAAACATTCAAA . TT . . . T . C . CACCGTTCCGTAC . . . . . . TTCAAAC . . G . . . . . C CAGTCGCTTTCGAAGCAAACCGTTCAGCAGTA C . . . . . . . . . . . . T . . . . G . AG . . . . C . . . G . . . . . .
blockSeqs : . A . . . . . . . . . . C . . . . . TGACTGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAAA . TT . . . T . C . CACCGTTCCGTAC . . . . . . ACAAAG . . A . . . . . T NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNT C . . . . . . . . . . . . G . . . . G . T . . . . T . . . G . . . . . .
blockSeqs : . A . . . . . . . . . . T . . . . . AAAAACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTAAA . TT . . . C . C . TNNNNNNNNNNN . . . . . . TCAAAC . . G . . . . . C AGCGTTTCGTGAACGTTCAGCATTTCGTT C . . . . . . . . . . . . T . . . . G . T . . . . A . . . A . . . . . .
blockSeqs : . T . . . . . . . . . . A . . . . . AAAAACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTAAA . TT . . . T . T . TAGTGTCCAGCA . . . . . . TCAAAC . . G . . . . . G AAGCGTTCCATGCATATCAGTCAAGCATT C . . . . . . . . . . . . C . . . . A . T . . . . T . . . G . . . . . .
blockSeqs : . T . . . . . . . . . . C . . . . . AAAAACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTAAA . TT . . . G . C . TTCTCCGTTTAA . . . . . . GCAAAC . . C . . . . . C CAGAGCGTTCCGTGTGAGAATCGTTCCGT G . . . . . . . . . . . . C . . . . G . T . . . . C . . . G . . . . . .
blockSeqs : . T . . . . . . . . . . G . . . . . NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATCATTCAAGAAACGTTCAA . TT . . . T . G . TTCTCCGTTTAA . . . . . . GCAAAG . . G . . . . . C CAGCGTTTCGTGCAAGAATCGTTTAGTT C . . . . . . . . . . . . A . . . . A . T . . . . C . . . G . . . . . .
blockSeqs : . T . . . . . . . . . . T . . . . . TGACGTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAA . TT . . . T . C . TTCTCCGTTTAA . . . . . . AAAGAT . . G . . . . . T TACCGCTCCGTGTAGACCGTTCAGTATT C . . . . . . . . . . . . T . . . . G . C . . . . C . . . G . . . . . .
blockSeqs : . A . . . . . . . . . . C . . . . . NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGCGTTTCGTTCCGGGCAATA . TC . . . T . G . TCGTTCGTTTA . . . . . . GCAAGC . . C . . . . . T TATCATTAAATTTAAAACGTTCAGTTTT C . . . . . . . . . . . . G . . . . G . T . . . . C . . . G . . . . . .
blockSeqs : . T . . . . . . . . . . C . . . . . AGACCTGAATAATTTCAAAACCTAAGTGTGCAAGCCGCCTACCATTTTGTGCACACCATGCAGATCATTCAAGAAATGAGTA . TT . . . T . G . TTGTGCA . . . . . . ACAAAC . . G . . . . . T CAGATCATTCAAGAAATGAGTAGTGTT C . . . . . . . . . . . . A . . . . A . T . . . . A . . . G . . . . . .
blockSeqs : . A . . . . . . . . . . C . . . . . . AG . . . T . G . TCGTGCA . . . . . . GCAAAC . . A . . . . . C ATCGTCCGTCGCAAACCGTGCAGCGTT C . . . . . . . . . . . . G . . . . T . T . . . . C . . . G . . . . . .
blockSeqs : . A . . . . . . . . . . C . . . . . . AG . . . T . T . TTA . . . . . . GCAAAC . . G . . . . . T AGTGTTCCATGCAAAGCGTTTATGTT C . . . . . . . . . . . . T . . . . G . T . . . . C . . . G . . . . . .
blockSeqs : . A . . . . . . . . . . C . . . . . . TT . . . T . G . TTA . . . . . . GAAAC . . G . . . . . C GTGTTTCGTGTAAATCCTTTACCATT A . . . . . . . . . . . . A . . . . G . T . . . . C . . . C . . . . . .
blockSeqs : . A . . . . . . . . . . C . . . . . . TT . . . . . G . CAA . . . . . . TCAAA . . G . . . . . G GCGTTCCATTCAAACTGTTCACTGTT C . . . . . . . . . . . . G . . . . G . T . . . . C . . . G . . . . . .
blockSeqs : . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . CA . . . . . . . . . G . . . . . T CACCATGCAGACCGTACAACGTTT G . . . . . . . . . . . . G . . . . G . T . . . . C . . . A . . . . . .
blockSeqs : . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . TA . . . . . . . . . G . . . . . G CGTTCCGTTCAAACCGTTCACCTT C . . . . . . . . . . . . T . . . . G . T . . . . C . . . G . . . . . .
blockSeqs : . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CA . . . . . . . . . C . . . . . C CGTTCCGTTCAAACCGTTCACCTT C . . . . . . . . . . . . T . . . . G . T . . . . C . . . T . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . C CGTTCCGTTCAAACCGTTCACCTT G . . . . . . . . . . . . G . . . . G . T . . . . T . . . G . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . C TACTGCCAACCGTCAGCAGTT C . . . . . . . . . . . . A . . . . G . T . . . . C . . . T . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . C CATCGTTCGTGCAAACCGTTT C . . . . . . . . . . . . C . . . . G . C . . . . C . . . G . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . TACTGCCAAACCGTACAGTT G . . . . . . . . . . . . C . . . . A . T . . . . C . . . T . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . CAAAAACGTTTCGTT C . . . . . . . . . . . . C . . . . G . T . . . . C . . . G . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . CATCGTCCGTAC T . . . . . . . . . . . . C . . . . G . T . . . . C . . . G . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . CATCGTT C . . . . . . . . . . . . C . . . . T . T . . . . T . . . G . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . CATCGTT C . . . . . . . . . . . . C . . . . G . T . . . . C . . . G . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . C . . . . . . . . . . . . G . . . . G . T . . . . C . . . T . . . . . .
blockSeqs : . . . . . C . . . . . . . . . . . . C . . . . G . T . . . . C . . . T . . . . . .
blockSeqs : . . . . C . . . . . . . . . . . . C . . . . G . T . . . . C . . . G . . . . . .
blockSeqs : C . . . . . . . . . . . . G . . . . . . T . . . . C . . . T . . . . . .
blockSeqs : C . . . . . . . . . . . . T . . . . . . T . . . . T . . . T . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . T . . . . C . . . G . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . T . . . . C . . . G . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . T . . . . C . . . G . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqs : .
blockSeqCons : *** ** ***** ** GCAAAC******************** ***
originalCons : TCATT-GCGTT--A-AAGAT---A--T----TT--T--AG-----AAT-T-------TAA--T----CGC--AC-CCGT--A-A-A-------AT-------CGA-------AACGCGGANAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTN---TCAT----TCA-AGAAA----CG--TTCA--A----CA----A-C-A-GC-GT-T----T----CGT---------T-TC-GT-GCAA-------A-N-CG--TT--CA----CCG-T-C-----CG--GCA--AA-G---CGT--T--T--CGTTC----CGTGCCA--A--A---------C------CG---TT-CA--GCGTTT-CG-T---GC-AA--A----CCGTTC--A-A-G--CG--TTC--CGTTTCG---C--G--AAC------CGTT----C------CGT--TT---CCGTGCAAA-C--C--G----TT-CA----GC--G---T---TT-CG-TG-C-A--A-A-----CCG---T-T--C--A---NC----G-----TTC----CG-T-G-CA----AGAA--TCG-T-T----T----C---G-T-T--T--C-GTT--CCG-T-G-CA-AGT-GG-----------G-------------G-T-A------G--TAGCAC-G--CT-T-TAG-GGTC
finalCons : TCATT-GCGTT--A-AAGAT---A--T----TT--T--AG-----AAT-T-------TAA--T----CGC--AC-CCGT--A-A-A-------AT-------CGA-------AACGCGGANAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTN---TCAT----TCA-AGAAA----CG--TTCA--A----CA----A-C-A-GC-GT-T----T----CGT---------T-TC-GT-GCAA-------A-N-CG--TT--CA----CCG-T-C-----CG--GCA--AA-G---CGT--T--T--CGTTC----CGTGCAAAC--------------------CG---TT-CA--GCGTTT-CG-T---GC-AA--A----CCGTTC--A-A-G--CG--TTC--CGTTTCG---C--G--AAC------CGTT----C------CGT--TT---CCGTGCAAA-C--C--G----TT-CA----GC--G---T---TT-CG-TG-C-A--A-A-----CCG---T-T--C--A---NC----G-----TTC----CG-T-G-CA----AGAA--TCG-T-T----T----C---G-T-T--T--C-GTT--CCG-T-G-CA-AGT-GG-----------G-------------G-T-A------G--TAGCAC-G--CT-T-TAG-GGTC
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|42 ): TTCAGCATACGTCACACAAACCACTAACCATTCTGAACGAGAATAATTTTGTACCATTCTGTTAGTGGTACAATATAGTATGCTCCAGGGTCT
Unaligned ( gi|51 ): TTGTTTTATAAACATTTGAACATTTATAGTGGTACTCAGGAAGTTATGCTGTAATAGTA
Unaligned ( gi|61 ): ACATTTAGCTTAGACAGCCAATAATTTATTTGTA
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 111111111 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 666666666666666666666666666 1111111111111111 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555
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lowQualScore : . .... ... .. .... .. .. ..... . ....... ... .. .... ......... . .. . . ....... ........................................................................................................................................ . ........... .......... . . .. ....... ... .. .. ........................... .. . ... .. .. ..... .. .. . .. . ................ ... . ....... . . ... . ..... ..... . ................................................................. .... . .... .... . .... .. ... ... . . . . .. . ..... ... . .. .... .... ..... .... . ... .... . .. . . ....... ... . . .. .. . .. . . . . . ......................... . . ...... .. . .. . . .
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consensus : TCATT-GCGTT--A-AAGAT---A--T----TT--T--AG-----AAT-T-------T---AA--T----CG------C--AC-CCGT--A-A-A-------AT-------CGA-------AACGCGGANAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTN---TCAT----TCA-AGAAA----CG--TTCA--A-CA-AC-A-GC-GT-T----T----CGT----------T-TC-GT-GCAA-------A-N-C--G--TT--CA----CCG-TT-----CG--GC--A--AA-G---CGT--T--T-----CGTT--CCGTG-C-A--A-A---------C------CG---TT-CA------GCGTTT-CG-T---G-CA--A--A----CCG-TTC--A-A-G--CG--TTC--CGTTTC---G--C--G--AAC------CGTT----C------CGT-TT---CCGTGCAAA-C--CG----TT-CA----GC--G---T---TT-CG-TG-C-A--A-A-----CCG---T-T--CA---NC----G-----TTC----CG-T-G-CA----AGAA--TCG-T-T----T--C---G-T-T--T--C-GTT--CCG-T-G-CA-AGT-GG-----------G-------------G-T-A------G--TAGCAC-G--CT-T-TAG-GGTC
Reference ( family-1692 ) : TCATT-GCGTT--A-AAGAT---A--T----TT--T--AG-----AAT-T-------T---AA--T----CG------C--AC-CCGT--A-A-A-------AT-------CGA-------AACGCGGANAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTN---TCAT----TCA-AGAAA----CG--TTCA--A-CA-AC-A-GC-GT-T----T----CGT----------T-TC-GT-GCAA-------A-N-C--G--TT--CA----CCG-TC-----CG--GC--A--AA-G---CGT--T--T-----CGTT--CCGTG-C-A--A-A---------C------CG---TT-CA------GCGTTT-CG-T---G-CA--A--A----CCG-TTC--A-A-G--CG--TTC--CGTTTC---G--C--G--AAC------CGTT----C------CGT-TT---CCGTGCAAA-C--CG----TT-CA----GC--G---T---TT-CG-TG-C-A--A-A-----CCG---T-T--CA---NC----G-----TTC----CG-T-G-CA----AGAA--TCG-T-T----T--C---G-T-T--T--C-GTT--CCG-T-G-CA-AGT-GG-----------G-------------G-T-A------G--TAGCAC-G--CT-T-TAG-GGTC
gi|1 : TCATT-GCGTT--A-AAGATTCAA--T----ATGGT--AGGG---AAT-T-------T---AA--T----CG------C--AC-CAGT--N-N-N-------NN-------NNN-------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNC---TCAT----TCACAGAAA----CG--TTCA--A-CA-AC-A-GC-GT-T----T----CGT----------T-TC-GT-GCAA-------A-C-C--G--TT--CA----TGG-TC-----CA--GC--A--GA-A---CGT--CA-T-----CGTT--CCGTG-CCA--A-A---------C------CG---TT-CA------GCGTTT-TGCT---G-CA--A--A----ACG-TTC--A-A-G--CG--TTC--CGTTTC---A--C--G--AAT------CGTT----T------CGT-TT---TCGTGCAAA-C--CG----TT-CA----GC--G---GG--TT-TG-TG-C-A--A-A-----CCG---TCT--CA---GC----G-----TTC----CG-T-T-CC----GAAG--TCG-T-T----T--C---G-T-T--T--T-GTT--CCG-T-G-CA-AGT-GG-----------G-------------G-T-A------G--TAGCAC-G--CT-T-GAG-GGTC
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gi|11 : atatATT-GCGTT--A-AAGAT---A--T----TT--T--AG-----AAT-T-------T---AA--T----TG---------AC-C--T--A-N-N-------NN-------NNN-------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTA---TCAT----TCA-AGAAA----CG--TTCA--A---------AT-GT-T----T----CGT----------T-TC-GT-GCAA-------A-C-C--G--TT--T---------------------T--A--AA-A---CGT--T--T-----CGTT--TCGTA-C-A--A-A---------G------CG---TT-CA------CCGTTC-CG-G---G-CA--G--A----CTG-TTC--A-------------------TC---G------------------------------------TT---CCCTGCAAA-A--CG----TT-CA----GC--G---T---TT-CG-TG-C-A--A-A-----CCG---T-T--CA---CC----G-----TTC----CG-T-T-CA----GGAA--TCGTT-T----T--T---G-T-T--T--C-GTT--CCG-T-G-CA-AGT-GG-----------G-------------GTT-A------G--TAGCAC-G--TT-T-TAG-GGTCtgggtagtagcacgctttagg
gi|12 : TCATT-GCGTT--A-AAGAT---A--T----TT--T--AG-----AAT-T-------T---AA--T----CG------C--AC-CCGT--A-A-A-------AT-------TGA---------CGTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNN----NNN-NNNNN----NN--NNNA--A-------A-GC-AT-T----T----CGT----------T-TC-GG-GCAA-------A-C-C--G--TT--T---------------------T--A--AA-G---CGT--T--T-----CGTT--TCATT-C-A--A-A---------C------CG---TT-CA------CCGTTC-CG-G---G-CA--G--A----CCG-TTC--A-------------------TC---G------------------------------------TT---CCGTGCAAA-C--CG----TT-CA----G-----------------TG-C-A--A-A-----CCG---T-T--CA---CC----G-----TTT----TG-T-G-CA----AAA----CA-T-TCA--C--C---G-T-T--T--C-GTT--CCG-T-G-CA-AGT-GG-----------G-------------G-T-A------G--TAGCAC-G--CT-T-TAG-GGTC
gi|13 : gaaTTATT-GCGTT--T-GAGAT---A--T----TT--T--AC-----AAT-T-------T---AA--T----CG------T--GT-CCGT--A-A-A-------AT-------CGA-------
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gi|14 : tatgtctatattattgcgtttgagatattttacaatttaatcgtgtccgtaaaatcgacctgaataatgcaaaagaaactannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnataattcaaagaacgggcagattaTCATT-GCTTT--A-AAGAT---A--T----TT--A--AA-----AAT-T-------T---AA--T----CG------C--AC-ACGT--A-A-A-------AT-------CGATCTGN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNN----NNN-NNNAT----CA--TTCA--A-GA----A-AC-GT-T----CAAAGCGT----------T-TC-GT-GCAA-------A-C-A--G--TT------------------------C--A--AA-G---CGT--T--T-----CGTT--TCGTG-C-A--A-A---------C------CG---TT-CA------
gi|14 : a--A-A---------A------CG---TT-CAAA----GCGTTT-CG-T---G-CA--A--A----CAG-TTC--A-AAG--CG--TTT--CGTTTC---G--T--GCAAAC------CGTT----CAC----CGT-TC---CCG-ACAGA-C--CG----TT-CA----TC--G---T---TC-CT-TG-T-A--A-A-----GCG---T-C--CA---CC----G-----TTC----CG-T-T-CA----AGAA--TAG-T-T----T--C---G-T-T--T--C-GTC--CCG-T-G-CA-AGT-GG-----------G-------------G-T-A------G--TAGCAC-G--CT-T-TAT-GGTccgttcccgacagaccgttcatcgttccttgtaaagcgtccaccgttccgttcaagaatagtttcgtttcgtcccgtgcaagtggggtagtagcacgctttatggt
gi|15 : atcattgctttaaagatatttaaaaatttaatcgcacacgtaaaatcgatctgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcattcaagTCATT-GCGTT--A-AAGAT---A--T----TT--T--AG-----AAT-T-------T---AA--T----CG---------AC-CCGT--A-A-A-------AT-------TGA-------
gi|15 : gaa-A-GC-AT-T----T----CGT----------T-TC-GG-GCAA-------A-C-C--G--TT--TA--------------------------AA-G---CGT--T--T-----CGTT--TCATT-C-A--A-A---------C------CG---TT-CA------CCGTTC-CG-G---G-CA--G--A----CCG-TTC----A-T--CG--TT---CGT------G--C--A--AA---------------C------CGT-TT---CAGTGCAAA-C--CG----TT-CA----CC--G---T---TT-GT-TG-C-A--A-A-----ACA---T-T--CA---C---------------------------------------------------C---G-T-T--T--C-GTT--CCG-T-G-CA-AGT-GG-----------G-------------G-T-A------G--TAGCAC-G--CT-T-TAG-GGTCccgtgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaagcatttcgtttcgggcaaaccgtttaaagcgtttcgtttcattcaaaccgttcaccgttccgggcagaccgttcatcgttcgtgcaaaccgtttcagtgcaaaccgttcaccgtttgttgcaaaacattcaccgtttcgttccgtgcaagtggggtagtagcacgctttagggtc
gi|16 : gaatcattgcgttaaagatattttagaatttaatcgacccgtaaaattgaccgtgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaTCATT-GCCTT--T-ACTAT---A--T----TT--T--AG-----AAT-T-------T---AC--T----CG---------ACACCGT--ACA-A-------AA-------CGA-------
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gi|17 : atgtatcattgcctttactatattttagaatttactcgacaccgtacaaaacgacctgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcattcatgaacgctATT-CCGTT--A-AAAAG---AGTT----TT--TGAAG-----AAA-T-------T---AA--TGT--CG------CC-AC-CCGT--A-A-A-------ATGACCTGNNNN-------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NCATGCATTCA-AGAAA----CG--T--A--A--A-GC-C-GC-TG-T----T----CGT----------T-TCGGT-GCAA-------A-C-C-----TT--CA-----------------------A--AACG---CGT--T--T-----C-TT--CC-TG-C-A--A-A---------C------CGGTCTT-CA----------TT-CG-TCCGG-CA--C--G----TCG--TC--A-A-GAATG--TTC--GTTTTC---G--
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gi|18 : atatatcatattccgttaaaaagagtttttgaagaaattaatgtcgccacccgtaaaatgacctgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatgcattcaagaaacgtaaagccgATT-GCGTT--A-A-GAT---A--T----TT--T--AG-----AAT-T-------T---AA--C----TG---------AC-CCGT--A-A-ATTGACTGNN-------NNN-------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGCGTT---TCGT----TC-----------CG--GGCA--A-TA------GC-GT-T----T----C-T----------T-CC-GT-TTAAGGTTTCCG-T-C--G--TT--CA----ACG-TCACGTTCG--GC--AG-AA-C---CGT--TCAT-----CGTT--CCGTG---A--A-A---------C------CG---CT-TA------GCG-TT-CG-T------A--A--A----CCG-TT-----A-G-----------CGTTTC---G--T--G--AACGTTCAGCATT----T------CG--TT---CCGTGCA
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gi|19 : gataattgcgttaagatattttagaatttaactgacccgtaaattgactgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTCATT-GCGTTTAATAAGAT---A--T----TT--T--AGAATTTAAT-TGCGCCCAT---AAAAT----CG---------AC-CTGN--N-N-N-------NN-------NNN-------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATCAT----TCA-AGAAA----CA--TTCA--A-------A-GC-GT-T----T----C-----------------GT-GTAA-------A-C-C--G--TT--CA----CCATTC-----CAT-GC--A--GA-C---CATTCT--T-----CGCT--TCGTG-C-A--A-A---------G------CG---TT-CA------GCGCTT-CA-T---G-CA--A--
gi|19 : tttcaaggttatttctgtaTTC---A--A--G--AAA------CATT----CAAAG--CGT-TT---C-GTGTAAA-C--CG----TT-CA----CC--A---T---TC-CA-TG-C-A--G-A-----CCA---T-T--CT---TC----G-----CTT----CG-T-G-CA----A--A--GCG-T-T----C--A---G---------C-GCT--TCA-T-G-CA-AGT-GG-----------G-------------G-T-A------G--TAGCCT-A--CT-T-AAA-GGTCgtggggtagtagcctacttaaaggtctg
gi|2 : tttcaaggttatttctgtatcattgcgtttaataagatattttagaatttaattgcgcccataaaatcgacctgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcaT-CG-T---G-CA--A--A----GCG-TTT--A------------C--TGC---------C--A--AAC------CGTA----C------AGT-T-----CATGCAAG-AGACG----TT-CA----GC--G---T---TT-CT-TG-C-A--A-A-----CCG---T-T--TAAACTC----G-----TTC----CG-T-G-CACGAGAGAA--TCG-T-G----T--C---G-T-T--T--CAATT--ACG-C-G-GA-AGT-CA-----------G-------------G-T-A------AT-TAAAAC-G--TT-T-TAG-GGTtg
gi|20 : attgcaaggctatgtctatattaggcgtttgagattatttacaatttattcgtgtcctaaaacgacctgaataatgtcaacaagannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnataattcaaagagggcagattaaTCATA-GCGAT--T-AAGAT---A--T----TT--T--AG-----AAT-T-------T---AA--T----GG------C--GC-CCGT--A-C-A-------AT-------TGACCTGAATAATGCAGAGAAAAGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNN----NNN-NNNNNNNATCA--TTCA--AGGA-ACGG-GCAGT------------GT----------T-TC-GT-GCAA-------A-G-C--G--TT--------TTG-T----------GC--A--AA-A---CGT--T--T------------CGTA-A-A--G-A---------T------CA---AT-CA------GCGTTT-CT-T---G-CA--A--A----CCT-TTC----A-G--CG--TTT--CGT------G--CAAG--AAT------CGTT----T------AG--TT---CCATGgttttaaaccatgattgtgacgtgaacctttttttt
gi|21 : ttcaaggttatttcttcaTCATC-GCATT--T-GAGAT---A--T----TT--TTTCG-----AAT-T-------T---AA--T----TG------T--GC-CCGT--A-A-A-------AT-------CGGCATAAT-AATGCAGAGAAAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNN----NNN-NNNNN----NN--NNNA--A-CA-------------------------------------TC-GG-GCA----------G-C--G--TT--T------CG-T----------GC--A--AA-G---CAT--T--T-----C--T--C---G-C-A--A-A---------C------CG---TT-CA------CCGTGC-CG-T---G-CAAGA--A----TCG-TTT---------CG--TTC--CATT
gi|21 : atttcatggtattttctgta------CGT-TT---C-GTGCAAA-------------------GC--A---T---TT-CT-CG-C-A--A-A-----CCG---T-T--CA---CC----G-----TGC----CG-T-G-CA----AGAA--TCG-T-T----T--C---G-T-T--C--C-ATT----G------A-AGT-TG-----------G-------------A-T-A------G--TAGCAC-G--CT-T-TAG-GGTCgaagttggatagtagcacgctttagggtctg
gi|22 : atttcatggtattttctgtatcatcgcatttgagatattttttcgaatttaattgtgcccgtaaaatcggcataataatgcagagaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaacatcgggcagTCATT-GCGTC--T-GAGAT---A--T----TT--T--AG-----AAT-T-------T---AA--T----CG------A--AC-CCGT--A-A-A-------AT-------TGA-------CACGtg
gi|22 : tttcaaggttatttctgta--G--AAC------AGT-------------GT-TT---C-GTGCAAA-------------------GC--G---T---TT-CG-TG-C-A--A-A-----CCG---T-G--GA---CC----G-----TTC----CG-T-G-CA----AGAA--TCT-T-T----T--C---A-T-T--aataatgcctataacaactccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcattcaagaaatgaacagtgtttcgtgcaaagcgtttcgtgcaaaccgtggaccgttccgtgcaagaatcttttcatt
gi|23 : tttcaaggttatttctgtatcattgcgtctgagatattttagaatttaatcgaacccgtaaaattgacacgaataatgcctataacaactccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcattcaagaaatATT-ACATT--T-GAGAT---A--T----TT--T--AT-----AGT-T-------T---AA--T----CA------C--GC-CTGT--A-A--------------------A-------GACCTGAATAATTTCAAAACCTAAGTGTGCAAGCCGCCTACCATTTTGTGCACACCATGCAGA---------------TCAT----TCA-AGAAA----TG-----------A-GT-A-G---------------TGT----------T-TC-GT-GCAA-------A-G-C--AT-TT--CA----GCGTTC-----TGT-GC--A--GA-T---CAT--T--CGA---CGTT--CCATA-C-AAGA-A---------T------TG---TT-T--------CGCTT-TG-T---G-C
gi|23 : tttccagattatttctgtGTG-C-A--A-G---------C------CG---CC-TA------CCATTT-TG-T---G-CA--C--A----CCA-TGC--A-------G--ATC--A--TTC---A--A--G--AAA------TGAG----T------AGTGTT---TCGTGCAAA-G--CA----TTTCA----GC--G---T---TC-TG-TG-C-A--G-A-----TCA---T-T--CG---AC----G-----TTC----CA-T-A-CA----AGAA--TTG-T-T----T--C---G-C-T--T----------TG-T-G-CT-ATT-GG-----------G-------------G-T-A------G--TAGTAC-C--CT-T-TAG-AGTCtattggggtagtagtaccctttagagtctgta
gi|24 : tttccagattatttctgtattacatttgagatattttatagtttaatcacgcctgtaaagacctgaataatttcaaaacctaagtC-GT-GCAA-------G-C-CCCG--CC--TA----CCG-TT-----C----C--A--AA-G---TGT--T--T-----CGTT--TCGGG-C-A--A-A---------T------CA---TT-TA-------------------------------------------A-A-G--CG--TTT--CGTTTC---TTTC--A--AAC------CGTT----CAC----CGT-T----CCGGGCAGA-C--CG----TT-CA----TC--G---T---TC-CG-TG-C-A--A-A-----CCG---T-T--AA---GT----G-----TTT----CG-T-G-------AAAA--CCG-T-T-------CAGGG-T-T--T--C-GTT--CCG-T-G-CA-AGT-GG-----------G-------------G-T-A------G--TAGCAC-tgta
gi|25 : g--CCGTA-C-A--A-A---------C------CG---TT-CA------GCG-TC-CG-T---ACCA--A--A----TCG-TTC--A-G-T--CG--C------TTTCGAAG--C--A--AAC------CGTT----CAG----CAG-TA---TCGTGCAAC-C--CG----TT-CA----GC--GTTAT---TC-CG-TGTC-AATA-A-----CCG---T-T--TC---AC----GCGGGTTTC----C--T-T-CA----AGGA--TTA---T----T--C---G-TAT--T--C---T--CCG-T-G-CA-AGT-GG-----------GGGCAGTGTTGATAG-T-A------G--TAGCAC-C--AT-T-TAG-caggggtcataatgataaccata
gi|26 : CGTT-T-A--A-A---------T------CG---TT-C--------TGTTT-CG-T---G-CA--A--A----TCG-TTT--A-AAG--CG--TTT--CGTTTC---G--T--GCAAAG------CGTC----CAG----CGT-T----CCGGGCAGA-C--CG----TT-CA----TC--G---T---TC-CG-TG-C-A--A-A-----TCG---T-T--CA---GC----G-----TTT----CG-T-G-CA----AAGCGTTCG-T-T----T--C---G-T-T--T--C-GTT--CCG-T-G-CA-AGT-GG-----------G-------------G-T-A------G--TAGCAC-G--CT-T-TAG-GGTCt
gi|27 : aa--AA-G---CTT--C--T-----CGTT--C---G---A--A-A---------C------AT---TT-CAAACAAAGCGTTT-CG-T---T-CA--A--A----CTG-TTT--A-C----CG--CTC--CGT------G--T--A--GAC------CGTT----C------AGTATT---TCGTGCAAA-C--CG----TT-CA----CC--A---T---TG-CG-TG-C-A--G-A-----CTG---T-T--CA---TC----G-----TTC----CT-G-G-CA----AGAA--TAG-TGT----T--T---T-T-T--T--C-GTC--CCG-TAG-CA-tg
gi|28 : tcattcaaaaaacggg----T----CGT----------T-CA-GT-GCAA-------A-T-A--G--TT--TA----TCA-TT-----AA--ATTTA--AA-A---CGT--T--C-----AGTTTTCCGTG-C-A--A-A---------C------CG---TT-CA------GCGTTA-CA-T---G-TATGA--A----TCGATTC--GTA-A--CG--TTcgct
gi|28 : attcaaagatcagttgaagcagttgattgatttatgtcaaAAA-A--CG----TT-CA----GT--T---T---TC-CG-TG-C-A--A-A-----CCG---T-T--CA---GC----G-----TTA----CA-T-G-TA----TGAA--TCG-A-T----T--C---G-T-A--A--C-GTT--AAG-T-G-TA-AAC-GA-----------C-------------G-T-G------G--TTGCAC-G---T-T-TAC-GGTaagtgtaaacgacgtggttgcacgtttacggttatgtaa
gi|29 : attcaaagatcagttgaagcagttgattgatttatgtcaatcgttcagtgcaaatagtttatcattaaattt---CGT--T--T-----CGTT--CCGTT-T-A--A-A---------G------CG---TT------------TNN-NN-N---N-NN--N--N----NNN-NNN--N-N-N--NN--NNN--NNNNNN---N--N--N--NNN------NNNN----N------NNN-NN---NNNNNNNNN-N--NN----NN-NN----NN--N---N---NN-NN-NN-N-N--N-N-----NNN---N-N--NN---NN----N-----NNN----NN-N-N-NN----NNNN--NNN-N-N----N--N---N-N-N--T--C-GTT--CCG-T-G-CA-AGT-GG-----------G-------------G-T-A------G--TAGCAC-G--CT-T-TAG-GGtatgtaa
gi|3 : TCATT--CGTT--A-AAGAT---AA-T----TT--T--AG-----AAT-T-------T---A---T----CT------G--AC-CCGT--AGA-A-------AT-------TG---------ACTGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNN----NNN-NNNNN----NN--NNNN--N-CA-A--A-GC-GT-T----T----CGTA---------T-TC-GG-GCAA-------A-G-C--GATTT--CGTTTCCCG-TT-----T-------A--AA-G---CGT--T--C-----CGTT--CCGTTTC-A--A-A---------C------AG---TTTCA------CCGTGT-C--C---G-CA--G--A----C-G-TTC--A-------------------TC---G--T-------C------CGTA----C------------------TGCAAA-C--CG----TT-CA----GC--G---T---TC-CG-TA-CCA--A-A-----CCG---T-T--CA---GC----GC----TTT----CG-T-T-CA----AA-----CG-C-T----T--CAGCG-T-T--T--C-GTT--CCG-T-G-CA-AGT-GGGAAA-------G-------------G-T-A------G--TAGCAC-G--CT-TATAG-
gi|30 : tgata-T----C----CGC----------G-TC-TT-GCAA-------A-G-T--G--TT--TA----GTG-TC-----CA--GC--A--AA-G---CG------T-----AGTG--CCAT--C-A--A-G----------------CG---TG-TA------GTGTTC-TG-T---G-CA--C--A----GTG-TT-----A-G--TG--TTC--CAT------G--C--A--AAG------CGTT----T------ATG-TT---CTGTG-AAA-G--CG----TT--A----GT--A-------TC-CG-TG-C-A--G--------CG---T-T--TA---TG----T-----TTC----TG-T-
gi|31 : gatcattcaccattcggtgcaaacg-CA------ACATTC-CG-T---G-CA--A--A-----------------G--TG--TTT--CGT------G--T--A--AAT------CCTTTA--C------CAT-T----CCGTGCAGA-C--TG----TT-CA----GT--G---T---TT-CG-TG-C-A--A-A-----CCG---T-T--CA---TC----G-----TTC----CG-T-G-CA----ATAA--TCG-T-T----T--T---G-T-T--T--C-GAT--CAA-T-G-AA-AGT-GG-----------A-------------G-A-C------G--TACCAC-T--CT-T-TAT-GGTCc
gi|32 : tcattcaagaaacaga-A--A-A---------C------CA---TT-CA------GCGTTC-CG-T---A-CA--A--A----TCG-TTC--AGA-G--CGAGTTC--CGGT-A---A--C--A--AAC------CGTT----CAGCAGACGT-TT---C-GTGCAAA-C--CG----TT-CA----GC--G---T---TTTCG-TG-C-A--A-A-----TCG---T-TT-CA---GC----G-----TTC----CG-T-T-CA----AGA---TCG-T-T----T--CC--G-T-T--T--C-GTT--CCG-TGG-CA-AGT--G-----------G-------------G-T-A------G--TAGtg
gi|33 : A------GCATTC-CG-T---G-CA--A--A----GCG-TT---A-A-G--CG--TTC--CAT------G--C--A--TAT------CAGT----CAAG---CA--TT---CTGTGCAAA-G--CA----TT-TA----GC--A---T---TC-CA-GG-C-A--AGA-----CTA---T-T--TT---AC----G-----TTC----CA-T-G-TA----AGAA--TCA-A-A----C--C--------------------------A-CA-AGT-GG-----------T-------------G-T-A------A--TAGTGT-G--CT-T-CAG-GGTCgca
gi|34 : catatcagtcaA------GCGTTT-GG-A---G-CA--A--A-----------------G--CG--TTC--CATT--------C--A--AAC------TGTT----CA-----CTG-TT---CCGTGCAGA-C--CG----TT-CA----GC--G---T---TT-CG-TG-C-A--A-A-----CCG---T-T--CA---CC----G-----TTC----CG-C-A-CA----AGAA-------------T--C---G-T-T--T--C-ATT--CCG-T-G-CA-GGT-GG-----------G-------------G-T-A------A--TAGCAC-A--CT-T-TAG-GGTCtgt
gi|35 : gccttttgttgaaC-GT-T----T----AGT----------T-TC-GT-TCAA-------A-T-C--G--TT--CA----TCG-TT-----CAATGC--A--GA-T---CGT--TCAT-----CGTT--TCGCG-C-A--A-A---------C------CG---TT-CA------GCGTTT-CG-T---G-CA--A--A----CCA-TTC--AGA-G--CG--TTC--CGTGT----G--A--G--AAT------CGTT----C------CGT--------GTA-AGA--------------A----GC--G---T---TT-CG-TG-C-A--G-A-----t
gi|36 : aaagcgtttCGTTT-CA-T---G-CA--A--ATGATCCA-TTA--A-A-G--TG--AGCAGCATTTT---G--C--A--AAG------CATT-------------T-ATAGACCATGCAAA-C---------T-TA------------T---TT-TG-TG------------------------------------------TTC----TG-T-A-CA----AGAA--T---T-T----T--T---G-T-GAAT--C-ATT--CCA-T-G-CA-AGT-GG-----------T-------------G-T-A------A--CA-CAC-GTACT-T-CAA-GATCagc
gi|37 : --CG--TTT--TGTTTC---GTAC--A--AAT------CGTT----CAT----CGT-T----CCGCGCCAA-G--CG----TT-CA----GT--G---T---TT-CG-TG-C-A--A-A-----CCG---T-T--CA---CC----G-----TTC----CG-T-T-AA----AGAA--TCG-T-------------G------T--C-CTT--CCG-T-G-TA-AGT-GG-----------G-------------G-T-A------G--TAGCAC-G--CT-T-TAG-GGTCtg
gi|38 : ttaatat-A-G--TG--TTC--CAT------G--C--A--GAC------AGTT----C------CGCGTT---CCGTACAAA-C--CG----TT-CG----CC--A---T---TC-CG-TG-C-A--A-A-----CCA---T-T--CG---CC----G-----TTC----CG-T-G-CA------AA--CCA-T-T----T--A---A-A-A--T--C-GTT--TCG-T-G-CT-AGT-GG-----------T-------------G-A-A------G--TAGTAC-G--TT-T-CAG-GGTCtgt
gi|39 : ttt---TCAT----TCA-AGAAA----CG--GGCATCA-TA-AC-GTGC-AT-A----G----CGT----------T-TC-AT-GCAA-------A-G-C--G--TT--CA----CCG-TT-----CC--GT--AC-AA-GAATCGT--T--TCGTTACGTT--CCGTG-C-A--A-tgc
gi|39 : A----GC--G---T---TT-CA-TG-C-A--A-A-----GCG---T-T--CA---CC----G-----TTC----CG-T-A-CA----AGAA--TCG-T-T----T--C---G-T-T--A--C-GTT--CCG-T-G-CA-AGT-GG-----------G-------------G-T-A------G--TAACAC-G--CT-T-TAG-GTTCgtggggtagtaacacgctttaggttct
gi|4 : tcattcaagaaacgggcatcataacgtgcatTCATG-GCATT--T-GAGAT---A--T----TT--T--AG-----AAG-T-------TAGAAA--TAC--CGAGAAAAC--NN-NNNN--N-N-N-------NN-------NNN-------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNA---TCAT----TCA-AGAAG----CA-----------A-GC-A-GC-AT-T----T----CATGCAAACACATT-TC-GT-GCAA-------G-G-C--G--TT--t
gi|4 : ggatatgtatgta-----CATT--TCATG-C-A--A-A---------CACATTTCG---TG-CAAG----GCGTTT-CA-T---G-CA--A--T----CTG-TTC--A------------C--CAT------G--C--A--GAC------CGTA----CAA----CGT-TT---C-ATGCAAA-T--CAATGATT-CA----GC--G---T---TT-CA-TG-C-A--A-ATTTAACTG---T-T--CA---CCC---G-----TTC----CA-T-G-CA----AGAA--TCA-T-T----T--C---G-T-T--T--C-GTT--CTG-T-G-CA-AGT-GG-----------G-------------G-T-A------G--TAGCAC-G--CT-T-TAG-GGTtcatgcaatctgttcaccatgcagaccgtacaacgtttcatgcaaatcaatgattcagcgtttcatgcaaatttaactgttcacccgttccatgcaagaatcatttcgtttcgttctgtgcaagtggggtagtagcacgctttagggtgtg
gi|40 : ggatatgtatgtatcatggcatttgagatattttagaagttagaaataccgagaaaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcattcaagaagcaagcag---TCAT----TCA-AGAAA----CG--GGCA--T-CATAC-GTGC-AT-A----G----CGT----------T-TC-AT-GCAA-------A-G-C--G--TT--CA----CCG-TT-----CC--GT--AC-AA-GAATCGT--T--TCGTTACGTT--CCGTG-C-A--A-gtg
gi|40 : A----GC--G---T---TT-CA-TG-C-A--A-A-----GCG---T-T--CA---CC----G-----TTC----CG-T-A-CA----AGAA--TCG-T-T----T--C---G-T-T--A--C-GTT--CCG-T-G-CA-AGT-GG-----------G-------------G-T-A------G--TAACAC-G--C--T-TAG-GTTCgtggggtagtaacacgcttaggttct
gi|41 : tcattcaagaaacgggcatcatacgtgcatGCAAA-C--CG----TT-CA----GAAAG---T---T---G-CA-C-A--A-AAT---CCG---T-T--CA---GC----G-----TTC----CGAT-T-CA----AGAA--TCG-T-T----TC-C---G-T-T--T--C-GTG--CCG-T-G-CAGAGT-GG-----------G-------------G-T-AAT----G--TA-CAC-G--CT-T-TAG-GGt
gi|43 : cgcc--G---T---TT-CA-TG-G-G--G-A-----ATG---T-T--CA---CC----A-----TTT----CG-T-G-CC----AAAA--C---T-T----T--C---G-T-C--C--C-GTT--CCG-T-GCCA-AGT-GA-----------T-------------G-T-A------G--CAGCAC-T--CT-T-CAA-AGTgtc
gi|44 : atgcttact---TCAT----TCA-GGAAA----TG--GGCA--G----AT-T-GC-CT-TGCAATG---CGT----------T-TC-GT-GTAA-------A-T-C--GCATC--CA----CCGTTC-----CGT-GC--AAGAA-T---CGT--T--T-----C-TT--C
gi|44 : ga----GC--G---T---TT-CG-TG-T-A--A-A-----TCGCA-T-C--CA---CC----G-----TTC----CG-T-G-CA----AGAA--TCG-T-T----T--C-------T--T--C-GTT--gtt
gi|45 : gatcattcaggaaatgggcagattgccttgcaatG-C-A--A-A-----CTG---T-T--AG---GC----A-----TTC----TG-T-G-CA----AGAA--TCA-T-TTAAAT--T---G-T-T-------GTT----G-C-A-CA-A---GG-----------T-------------G-T-A------G--TAGCAC-A--CT-T-CAG-GGTC
gi|46 : -----CCG---T-T--CA---TC----G-----TTC----CG-T-G-------ATAA--GCG-T-T----T--T---A-T-T--TGGC-GTT--TCG-T-G-CA-AGT-GG-----------G-------------G-T-A------G--AAGCAT-G--CT-T-TAG-GATCc
gi|47 : gg----G-----TTCTG--CG-T-G-TG----AGAA--TCA-T-T----T--C---G-T-A--T--C-GTT--CCA-TAG-C--AGT-GG-----------T-------------G-T-A------A--TAGTAC-G--CT-T-TGG-t
gi|48 : tt----G-----TTC----CT-T-G-CA----A--A--CCG-T-T----CACC---G-C-G--C--C-GTT--CCG-T-G-CA-AGT-GA-----------T-------------G-T-AGCACATG--TAGTAC-A--TT-T-CAG-GGCCtgcctgtaa
gi|49 : ----TCA-AGAAA----CT--TTCA--A-------A-GC-GT-T----T----CGT----------T-TC-GT-ATAA-------A-C-T--G--TT--CA--------------------------AA-G---CGT--T--T-----CGTT--TCGTG-C-A--A-A---------C------CG---Ttg
gi|5 : TCATT-GCGTT--A-AAGAT---A--T----TT--T--AG-----AAT-T-------T---AA--T----CG------CGCAC-CCGT--A-A-T-------AT-------AAA-------AA--CNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNN----NNN-NNNNN----NN--NNNN--N-TA-A--A-GC-GTCT----T----CGT----------TATC-G--GCAA-------A-AGC--G--TTTTCT----CCG-TT-----TA------A--AA-G---CGT--T--T-----CGTT--CCGT--------------------------------T-TA------GCGT----------------------------------------CG--TTC--CGTT--------C--A--AAC------CGTT----C------ACC-TT---CCGGGCAGA-C---G----TT-CA----GCC-G---T---TC-CG-TA-C-A--A-A-----CCG---T-T--CA---GCGTTGG-----TTG----CG-T-G-CA------AA--CCG-T-CA---G--C---G-T-T--T--C-GTT---CG-T-GCCA-AGT-GGGGGTGAGATTTG-------------G-T-A------G--TAGCAC-G--CT-T-TAG-GGTC
gi|50 : aT---A--T----TT--T--AG-----AAT-T-------T---AA--T----CG------C--GC-CCGT--A-A-A-------AT-------CGA-------t
gi|52 : attatcaatattatatcaatattctcaat-CA----CGAA--TCG-T-T----T--C---GGT-T--T--T-GTT--CCG-T-G-CA-AGT-GG-----------G-------------G-T-A------G--TAGCAC-G--CT-T-GAG-GGTcct
gi|53 : ttTCATT-GCGTT--A-AAGAT---A--T----TC--T--AG-----AAT-T-------T---CA--T----CG------C--AC-CCGT--C-A-A-------AT-------CGA-------
gi|54 : atgtaA----AGAA--TCG-T-T---------------------C-GTT--CCG-T-G-CA--GT-GG-----------G-----------------A------G--TAGCAC-G--CT-T-TAG-GGTCcct
gi|55 : ATT-GCGTT--A-AAGAT---A--T----TT--T--AG-----AAT-T-------T---AA--T----CG------C--AC-CCGT--A-A-A-------AT-------CGA-------tg
gi|56 : --C---G-T-T--T--C-GTT--CCG-T-G-CA-AGT-GG-----------G-------------G-T-G------A--TAGCAC-G--CT-A-TAG-GGTC
gi|57 : --C---A-T-T--T--C-GCT--TTG-T-G-CA-TGT-GG-----------G---------------T-A------G--TAGCAC-A--CT-T-TAG-GATCtg
gi|58 : ATT-GCGTT--A-AAGAT---A--TCAATTT--T--AG-----AAT-T-------T---AA--T----CG------C--AC-CAGT--A-tat
gi|59 : TT--CCG-T-G-CA-AGT-GG-----------G-------------G-T-A------G--TAGCAC-G--CT-T-TAG-GGTCt
gi|6 : TCATTTGCGTT--A-AAGAT---A--T----TT--T--AG-----AAT-T-------T---TA-------CG------C--AC-CCGTTTA-A-A-------AT-------TGACCTG---AATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNN----NNN-NNNNN----NN--NNNN--N-NA-A--A-GC--T-T----T----CGT----------T-TC-G--GCAA-------A---C--G--TT--------TCG-TT-----CGT-TT--A--AA-G---CGT--T--C-----CGTA--CCGTT-C-A--A-A----------------CG---TTCCA------CCGTTC-CG-G---G-C---A--A----CAG-TC-----A-T--CG---TC--CG--TC---G--C--A--AAC------CGTG----CAG----CG--TT---CCGTACAAA-C--CG----TT-CA----GC--G---T---TT-CGTTG-C-A--A-A-----CCG---T-T--CA---G---------------------------------------------------C---G-T-T--T--C-GTT--CCG-T-G-CA-AGT-GGT----------G-------------G-T-A------G--TAGCAC----CT-T-tgt
gi|60 : gaaGTACAAA-C--CG----TT-CA----GC--C---T---TT-CG-TG-C-A--A-A-----CCC---T-T--CA---GC----
gi|7 : TCATT-GCGTT--A-AAGAT---A--T----TT--T--AG-----AAT-T-------T---AA--T----CG------CGCAC-CCGT--A-A-T-------AT-------AAA-------AA--CNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNN----NNN-NNNNN----NN--NNNN--N-TA-A--A-GC-GTCT----T----CGT----------TATC-G--GCAA-------A-AGC--G--TTTTCT----CCG-TT-----TA------A--AA-G---CGT--T--T-----CGTT--CCGT--------------------------------T-TA------GCGT----------------------------------------CG--TTC--CGTT--------C--A--AAC------CGTT----C------ACC-TT---CCGGGCAGA-C---G----TT-CA----GCC-G---T---TC-CG-TA-C-A--A-A-----CCG---T-T--CA---GCGTTGG-----TTG----CG-T-G-CA------AA--CCG-T-CA---G--C---G-T-T--T--C-GTT---CG-T-GCCA-AGTGGG-----------G-------------G-TGA------GATTTGCAC-G--CT-T-T
gi|8 : TCATT-GCGTT--A-AAGAT---A--T----TT--T--AG-----AAT-T-------T---AA--T----CG------CGCAC-CCGT--A-A-T-------AT-------AAA-------AA--CNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNN----NNN-NNNNN----NN--NNNN--N-TA-A--A-GC-GTCT----T----CGT----------TATC-G--GCAA-------A-AGC--G--TTTTCT----CCG-TT-----TA------A--AA-G---CGT--T--T-----CGTT--CCGT--------------------------------T-TA------GCGT----------------------------------------CG--TTC--CGTT--------C--A--AAC------CGTT----C------ACC-TT---CCGGGCAGA-C---G----TT-CA----GCC-G---T---TC-CG-TA-C-A--A-A-----CCG---T-T--CA---GCGTTGG-----TTG----CG-T-G-CA------AA--CCG-T-CA---G--C---G-T-T--T--C-GTT---CG-T-GCCA-AGTGGG-----------G-------------G-TGA------GATTTGCAC-G--CT-T-T
gi|9 : AT---A--T----TT--T--AG-----AATGT-------T---AA--TT---CG------C--AC-ACGT--A-A-A-------AT-------
gi|9 : --AA-A---CGT--T--T-----CA------------A--A-A---------G------CG---TT-C--------CGTTTTCG-T---G-TA--A--A----CCG-TTTTAA-A-G--CG--TTT--CGTTTC---G--T--GTAAAA------CGTTGCACC------CGT-T----CCGTGCAAA-C--CG----TT-CA----GC--G---T---TT-CG-TG-C-A--A-A-----CCG---T-TCACA---GC----G-----TTC----CG-T---TA----AGAA--TCT-T-T----T--C---G-T-T--T--C-GTT--CCG-T-G-CA-AGT-GG-----------G-------------GTT-A------G--TAGCAC-G--CT-T-TAT-GGTCtacctggnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattcaattcaaagaaacgtttcaaaagcgttccgttttcgtgtaaaccgttttaaagcgtttcgtttcgtgtaaaacgttgcacccgttccgtgcaaaccgttcagcgtttcgtgcaaaccgttcacagcgttccgttaagaatcttttcgtttcgttccgtgcaagtggggttagtagcacgctttatggtcat
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|42 ): TTCAGCATACGTCACACAAACCACTAACCATTCTGAACGAGAATAATTTTGTACCATTCTGTTAGTGGTACAATATAGTATGCTCCAGGGTCT
Unaligned ( gi|51 ): TTGTTTTATAAACATTTGAACATTTATAGTGGTACTCAGGAAGTTATGCTGTAATAGTA
Unaligned ( gi|61 ): ACATTTAGCTTAGACAGCCAATAATTTATTTGTA