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lowQualScore                  :                 4         4   4      2  2  2  1 4444   11  2    888888  1  7   4444444444  55555555  444444444444  99 2    666666666   99 1 88 5 777 88 88 2222 0  0     00000 88 888888 0  555 9999999999 0  9 55555555 333333333333333333 333 9  00000000  555555   2222 7 666666 444 6  1  000000    777  444444  5    5 555555 1  000000  3333    4444   888888888888 6  666 88 888 2 2 6  777777777   7777    5  55  00 5 5 33 8  3     77 1111111 2 2 00 2  2 8  2 444  2  111 99   2 66  2 333  2   3    00000  77 2  333 6    77 666666   00 00  77 2  5 2     2  2 88  2 88 2       4 4 1 2  2 5 444 2  2   222 444  2         
consensus                     :            TTATA-ACCCACCTT-ACT-TGATTC-CA-GG-CA-G----CTC--TA-TTTTT---A-TA-TT-GCA--T---A-A-TG--------TG------------TTG-T-TGGG-G--A----TCA--G-A--TGG---C--A--T----A-AT-CACAC-----C--T------A-TG---T-G--A-T---A-CA-T------G-T--A---------G-----A---T-AT-----G--TT------CTT-A--T-A------T---T-TT-GG------TTTT---TC------GA-GCCC-A------T-CT------GA--T-CCCC----GCA-----------TG-TT---T--T---C-T-G-TT-A-------TAT----AACT-TC--GT--C-A-T-TT-AC-ATAAT--A-------A-A-T--G-AC-A-TT-T---TT-TC---A--ATT-C-ACA-T---CG-CTGTCCTG-----TT--T-TC---A-CTGC--C-T----TTA--T--CA--A-GT-A-ACAAG-CA-A--AG-G--C-TACCTGG-C-ACGTTC-A-T---A-TT-AAC---T---AT-GGAACATAA
Reference ( gi|8 )            :            TTATA-ACCCACCTT-ACT-TGATTC-CA-GG-CA-G----CTC--TA-TTTTT---A-TA-TT-GCA--T---A-A-TG--------TG------------TTG-T-TGGG-G--A----TCA--G-A--TGG---C--A--T----A-AT-CACAC-----C--T------A-TG---T-G--A-T---A-CA-T------G-T--A---------G-----A---T-AT-----G--TT------CTT-A--T-A------T---T-TT-GG------TTTT---TC------GA-GCCC-A------T-CT------GA--T-CCCC----GCA-----------TG-TT---T--T---C-T-G-TT-A-------TAT----AACT-TC--GT--C-A-T-CT-AC-ATAAT--A-------A-A-T--G-AC-A-TT-T---TT-TC---A--ATT-C-TCA-T---TG-CTGCCCTG-----TT--T-TC---A-CTGC--C-T----TTA--T--CA--A-GT-A-ACAAG-CA-A--AG-G--C-TACCTGG-C-ACGTTC-A-T---A-TT-AAC---T---AT-GGAACATAA
gi|12                         :            TCATA-ATCCACCTT-ACT-TGATTC-CA-GG-CA-G----CTC--TA-TTTT------------------------------------G------------TTG-T-TAGA-G--A----TCA--G-A--TG----C--A--T----A-AT-CACAC-----C--T------A-TG---T----A-T---A-CA-T--------T------------G-----A---T-AT-----G--TT------CTT-A--T-A------T---T-TT-GG------TTTT----C------GA-GCCC-A------T-CT------GA--T-CCCC----GCA-----------TG-TT---T--T---C-T-G-TT-A-------TAT----AACT-TC---T--C-A-T-TT-AC-GTAAT--A-------A-A-T--G-AC-A--T-T---TT-TC---A--AAT-C-ACA-T---TG-CGTTCCTG-----TT--T-C-------------------------------A-GT-A-ACAAGCCA-A--AG-G--C-TACCTGG-C-ATGTTC-A-T---A-TT-AACTAAT---AT-GGAACATAA
gi|6                          :            aTATA-ACC-ACCTT-ACT-TGATTC-CA-G--CA-G----CTC--TA-TTTTT---T-TAATT-GCA--T---A-AGTG--------TG------------TTG-T-TGGG----A----TCA--G-A--TGG---C--A--T----A-AT-CACAC-----C--T------A-TG---T-G--A-T---A-CA-T------G-TT-A---------G-----A---T-AT-----G--TT------CTT-A--T-A------T---T-TT-GG------TTTT---TC------GA-GCCC-A------T-CT------GA--T-CCCC----GCA------------G-TT---T--T---CTT-G-TT-A-------TAT----AACT-TC--GT--C-A-T-TTAAC-ATAAT--A-------A-A-T--G-AC-ATTT-T---TT-TC---A--ATT-C-ACA-T---TG-CTGTCCTG-----TT--T-T----A-C-GC--C------TTA--T--CA--A-GT-A---AAG-CA-A--AG-G--C-TACCTGGCC-ACGGTC-A-T---A-TT-AAC---T---AT-GGAACATAA
gi|5                          :      atttgtaTATT-AACCACCTT-ACT-TGATTC-CA-G--CA-G----CTC--TA-TTTTT---T-TAATT-GCA--T---A-AGTG--------TG------------TTG-T-TGGG----A----TCA--G-A--TGG---C--A--T----A-AT-CACAC-----C--T------A-TG---T-G--A-T---A-CA-T------G-TGTA---------G-----A---T-AT-----G--TT------CTT-A--T-A------T---T-TT-GG------TTTT---TC------GA-GCCC-A------T-CT------GA--T-CCCC----GCA------------G-TT---T--T---CTT-G-TT-A-------TAT----AACT-TC--GT--C-A-T-TTAAC-ATAAT--A-------A-A-T--G-AC-ATTT-T---TT-TC---A--ATT-C-ACA-T---TG-CTGTCCTG-----TT--T-T----A-C-GC--C------TTA--T--CA--A-GT-A---AAG-CA-A--AG-G--C-TACCTGGCC-ACGGTC-A-T---A-TT-AAC---T---AT-GGAACATAAa
gi|7                          :        atttgTATA-ACCCACCTTTGCT-TGATTC-CA-GG-CA-G----CTC--TA-TTTT----A-TA-TTTGCA--T---A-A-TG--------TG------------TTG-T-TGGG----A----TCA--A-G--T-----C--A--T----A-AT-CACAC-----C--T------A-TG---A-G----T---A-CA-T------G-T--A---------A-----G---T-AT--------TT------CTC----T-A------T---TCTT-GG------TTTT---TC------GA-GCCC-A------T-CT------GA----CCCC----GCA-----------TG-GT---T--T---C-T-T-TA-A-------TAA----AACT-TC--GT--C-A-T-TT-AC-ATAAT--A-------A-A-T--G-AC-ATTT-T---TT-TC---A--ATT-CAACA-T---TG-CTGTCCTG-----TT--T-TC---A-CTG---C-T----TTA--T--CA--A-GT-A-AAAGA-CA-A--AA-GGTC-TACCTGG-C-ACGTTCTATT---A-TT-AAC---C---AT-GGAACATAat
gi|3                          :         tttgTATA-ACAC-CTTT-ACT-TGATTCTCA-GG-CAAG----CTC--TA-TTTT----A-TA-TT-GCA--A---ATA-TG--------TG------------TTG-T-TGGG-G--A----TCACTG-A--TGG---C--A--T----A-AT-CACAC-----C--T------A-TG---T-G--AAT---AACA-TT-----G-T--AA--------G-----A---T-ATAAAATG--TT------CTTCA--T-A------T---T-TG-GC------TTTT---TC------G--GACG-A------T-CT------GA--T-CCCC----CGA-----------TG-TT---T--T---C-T-G-TT-A-------TAT----AACT-TCC-GT--CCA-T-TT-AC-ATAAT--A-------A-A-TT-G-AC-A-TT-T---TT-TTTCAA--ATT-T-ATA-T---TG-CTGTCTCG-----AT--T-TC---AACCGC--CCT----TTA-----CA--A-GT-A-ACAAG-CA-A--AG-G--C-TACCTGG-C-A-GTTC-A-T---ATTT-AAC---T---AT-GGAACATAA
gi|10                         :          ttgTATA-ACCCACCTA-ACT-TGATTC-CA-GG-CA-G----CTC--TA-ATTTG---A-TA-TT-GCA--T---A-A-TG--------TA------------TTG-T-TGGG-G--A----TCA--G-A--TTG---C--ATGT----G-AT-AA------------------A-TG---TAG--A-G---A-GA-T------G-T--A---------G-----A---A-AG-----G--TT------CTT-A--C-A------T---T-TT-GC------TTTT---TC------GA-GCCA-A------T-TT------TA----------------------------------T--T---C-T-G-TT-A-------TAT----AACT-TC--TT--C-A-T-TT-AC-CCAAT--A-------A-A-T--A-AC-A-TT-T---TT-TT---AATATT-C-ACA-T---CG-TTGTCCTG-----TT--T-TC---A-CTGC--C-T----TTG--T--CA--A-GT-A-ACAAT-CA-A--AG-G--C-TACTTGA-C-AAGATC-A-T---A-TT-AAC---T---AC-GGAAa
gi|11                         :      ttatctgTATA----CACCTT-ACT-TGATTC--A-GG-CA-G----ATC--TA-TTTT-------A-TT-GCA------A-A-TG--------TG------------TT--T-TGGG-G--A----TCA--G-A--TGG------A--T----A-AT-CACAC-----C--T------A-TG---T-G--A-T---A-TA--------A-T--A---------GTAAGAA---T-AT-----A--TT------CTT-T--T-A------T---T-TTTGG------TTTT---CA------GA-GCCC-A------TTCT------GA--T-CC------GCA-----------TT-TT---T--T---C-T-G-TT---------TAT----AACT-TA--GT--C-T-T-TA-AC-ATAAT--A-------T---T--G-ATTA-TT-T---TT-TC---A--ATT-C-ACA-T---TG--TG-TCTG------T--T-TC---A-ATG----------TTA--T---A--A-GT-A---AAG-CA-A--AGAG--C-TA-CTGG----TGCTC-A-T---A--T-AAC---T----T-GGAACAT
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gi|2                          :      atcttgaTATA-ACC-ACCTT--CT-TGATTC-CA-GG-CA-G----CTC--TA-TCTCTTACA-TA-TTTGCA--TTGAA-G-TG--------TGCCCCATATAGTTTTG-T-TAGG-GCGA----TCA--GGA--TGG---C-----T----A-AT-CACAC-----C--T------AATG---T-G--A-T---A-CA-T------GTT--A---------GGA---A---T-AC-----T--TTGGGTGGTTT-A--T-AATGAATT---T-TT-GGAATAAATTTT---TTAATACAGA-GCCC-AT-----T-CTATCTTAGA--T-TTCCACGGGCA-----------TG-TCTG-T--T---C-TCGTTT-A-------TAT----AACTATC--GTCAC-A-T-TT-ACAATAAT--A-------ATT-T--G-AC-A-TC-T---CT---------ATT-G-TCA-T---T
gi|42                         :      tattttgTATA-ACCCATCTT-ACT-TGATTC-CA-GG-CA-G----CTC--TA-TTatctcacattgctcgtggcctcgcattttatc
gi|39                         :     attatttgTATA-ACCCACCTT-ACT-TGATTC-CA-GGCCA-G----ATCGGTA-CTGTT---T-TA-TT-
gi|26                         :    cattatttgTAAA-ACTCACCTT-ATT-TAATTG-CA-AA-CA-G----CTC--TA-TTTCA---A-TA-TT-AGA--T---A-T-TT--------TA------------TT--T-T----------------------------C--A--T----A-GT-CATACATGTAC--C------A-TGAAAT-G----T---A-CA-TTTGTTCG-T--A---------G-----A---TGAT-----G--TT------CTA-AGTC-A------T---T-CT-GG------t
gi|47                         : cgcaattatttgTATA-ACCCACCTT-AC-----TTC-CA-GG-CA-G----caacc
gi|9                          :     tgaattatttgA-ACCCACCTT-ACT-TGATTC-CA-GG-CA-G----CTC--TA-TTTTT---A-TA-TT-GCA--T---A-A-TG--------TG------------TTG-T-TGGG-G--A----TCA--G-A--TGG---C--A--T----A-AT-CAAAC-----C--T------A-TG---T-G--AAT---A-CA-T------G-T--A---------G-----A---T-AT-----G--TT------CTT-A--T-A------T---T-TTTGG------TTTT---TC------GA-GCCC-A------T-CT------GA--T-CCCC----GCA-----------TG-TT---T--T---C-T-G-TT-T-------AAT----AACT-TC--GT--C-A-T-TT-AC-ATAAT--A-------A-A-T--G-AC-A-TT-T---TT-TC---A--ATT-C-ACA-T---TG-CTGTCCTG-----TT--T-TC---A-CTGC--CTT----TTA--T--CA--A-GT-A-ACAAG-CA-A--AG-G--C-TACC-GT-C-ACGTTC-A-T---A-TT-AAC---C---AT-GGAACATAA
gi|4                          :               aA-ACCCACCTT-ACT-TGATTC-CACGG-CA-G----CTC--TA-TTTTT---AATA-TT-GCA--T---A---CA--------TG------------TTG-T-GGAGAG--A----TCA--G-AAATGG---C--A--T----A-AT-CACAC-----CC-T------A-AG---TTG--A-TTAAA-CA-T------G-T--A---------G-----A---T-AT-----G--TT------CTA-AC-T-A------T---T-GT-G-------TTTT---TC------GA-GCCCCA------T-C-------GA--T-CCCC----GAA-----------TGGTT---T--T---C-T-G-TTCA-------TATTAAAAACT---------C-A-T-TA-AC-ATAAT--A-------A-A-T----AC-A-TA-T---TT-TC---A--TAT-C-ACA-TC--TG-C-GTCCTG-----TT--T--C---A-CTGC--C-T----TTA--T--CA--A-GT---ACAAG-CACA--AG-G--C-TACCTGG-C-ACTTCC-A-TA--A-TT-AAA---C---AT-GGAACATAA
gi|16                         :                A-ATCCACCTT-ATT-TGATTG-CA-GA-CA-G----CT--------------A-TA-T----G--T---A-A----------------------------------A-G--A----CCA--A-A--CTG---C--A--T----T-AT-CATAC-----C--T------A-TG---T-G--A-------------------T--A---------G-----A---T-AT-----G--TT------CTT-G--T-G----------C-GG-GG------TTTT---TC---------GCCC-GAGTTATT-CT------GA--C-CCC
gi|18                         :         ttgtaaaA-ACCCATCTT-ATA-TGATTG-CA-GA-CA-G----CTC--TA-TTTCA---A-TA-TT-TCA--T---T-A-TG--------CA------------CTT-T-AAGA-T--G----TAA--G-T--TTG---C--A--T----A-TC-CACAC-----C--TATAAACA-TG---T-A--A-T---A-CAGT------G-T--A---------C-----A---T-AT-----G--CT------GTT-G--CAA------T---T-TT-CC------CCTT--------------ACTC-AT-----T-TT------GA--C-TACC----ACT-----------AG-CT---T-------------------------------ATT-TC--GT--C-A-C--------------------------T--G-AT-T-TTTT---TT-TC---A--ATT-C-ATA-T---CA-ATGTCCTG-----TA--T-GT---A-CTGC--C-T----Tactaggtaaatcaatgtcctgcttttactgcttttatcaagtaacaaacaaacactatttggcaacatccatattatgtaacgaacataa
gi|13                         :                                      -CA-GG-CA-GATGTTTCAATA-TTTTA---A-TA-TT-T----T---T-A-CG--------TG------------ATT-TATGGA-G-------TCA--A-A--TTA---C--A--T----A-AT-CATAC-----C--T------A-T-----------------CA-G------G-C----------------------T-AT-----G--TG------ATA-A----A------T---T-TC------------T---TC------CA-GTT--A------TACT------GA----CTCC----ACT-----------AG-TT---TAGT---T-T-C-TT-G-------TAT----GACT-TC--TT--C-A-T-TT-TC-AAAAT--ACGTGTACA-C-T--G-AC-A-TT-TGTTTT-CC---A--CTT-C-ACA-T---CC-ATGTCC-G-----TT--T-T----A-CTG----------------------A-GT-G-ACAAA-CA-A--AG-G--CTTACTTGG-C-AAGATT-A-T---A-CC-AAG---T---AA-AGAACAc
gi|15                         :                                               -G----CTC--TAATTTTT---A-TA-TT-GCA--T---A-A-TG--------TA------------TTG-T-TGGG-G--A----TCA--G-A--TGG---C--A--T----ATAT-CCAAC-----C--T------A-TG---T-GTGA-T---A-CA-T------G-T--A---------G-----A---T-AT-----G--TT------CTT-A--T-A------T---T-TT-GG------TTTA---TC------GA-G-CC-A------T-CT------GA--T--CCC----GCA-----------TG-TT---T--T---C-T-G-TT-A-------T-----------------------------T-ATAA---------------------C-A-TT-T---TT-TC---A--ATT-C-ACA-T---TG-CTGTCCTG-----TT--T-TC---A-CTGC--C-T----TTAT-T--CA--A-GT-A-AC-AG-CA-A--AG-G--C-TACCTGG-C-ATGTTC-A-T---A-TT-AAC---T---AT-GGAACATAAaa
gi|14                         :                                                                                           G--------TG------------TTCCT-TGGG-G--A----T-A--G-A--TG----C--A--T----A-ATTCACAT-----C--T------A--G---T-G--A-T---A-CA-T------G-T--A---------A-----A---T-------------------CTT-C--T-G------TA--T-TT-GG------TTCT---CA------GA-GCCC-A------T-CT------GA--T-CCCC----GCAAT---------TG-TT---T--T---C-T-G-TT-A-------TAT----AACT-CC--GT--C-A-T-TG-AC-ATAATCAA-------A-A-T--GCAC-A-TT-T---TT-TC---A--TGG-C-ACAGT---TG-CTG-TCTG-----TT--T-TC---ACCTGC---------TTAATT--CA--A-GTAA-ACAAG-CA-A--AG-G--C-TACCTGT-C--CGTTC-A-T---A-TTAAAC---TTTAAT-GGAAa
gi|20                         :                                                                                                     G------------TT--T-TAGG-G--A----TCA--G-A--TTG---G--A--T----A-AT-CGTAC---------------A-TG---T------T---G-C-----------T--A---------G-----G---C-AT---------T------CTT-A--C-------------------------------------------GCCC-A--------CT------G---------------------------TG-TTAGGT--T-------G-TT-AA------TAT----AACT-AC--AT--C-A-T-TT-TC-AAATT--A-------A-A-A--G-TC-A-AT-T---TT-TC---A--GTT-C-ATA-T---TA-AAGTAATG-----GT--A-T----A-CTGC--C-T----TAA--T--CA--A-GC-A-ACAAA-CA-A--AG-GC-C-TACTTGG-C-Aacaa
gi|9                          :                                                                                                                         GGG-G--A----TCA--G-A--TGGGCTCGAA--A----A-AC-CAAAA-----A--T------A-TA---A-G--A-----A-CA-T------A-T--C---------T-----A---C-AT-----G--TA------TTC-A--C-A------TAGGT-TT-GA------TTAT--------------GCC--A------T-CT------GA--T-CCCC----agaacaggtataaaagtaaata
gi|17                         :                                                                                             aaacccaccttacttgattccaggcagctctatttttatattgcataatgtgttgtt--A--T----A-AT-CTCAC-----C--T------A-TG---T-G--A-T---A-CA-T------G-T--A---------G-----A---T-AT-----G--TT------CTT-A--T-A------T---T-TT-GG------TTTT---TC------GA-GCCC-A------T-CT------GA--T-CCCC----GCA-----------TG-TT---T--T---C-T-G-TT-A-------TAT----AACT-TC--GT--C-A-T-TT-AC-ATAAT--A-------A-A-T--G-AC-A-TT-T---TT-TC---A--ATT-C-ACA-T---TG-CTGTCCTG-----TT--T-TC---A-CTGC--C-T----TTA--T--CA--A-GT-A-ACAAG-CA-A--AG-G--C-TACCTGG-C-ACGTTC-A-T---A-TT-AAC---T---AT-GGAACATAAgcatgttttctgtttaataacttcgtcatttacataataaatgacattttttcaattcacattgctgtcctgttttcactgccttttatcaagtaacaagcaaaggctaccgtcacgttcatattaaccatggaacataa
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                              A-T------G-T--A---------G-----A---T-AT-----A--TT------ATT-A--T-A------T---T-TT-GG------TTTT---TC------GA-GCCC-A------T-CT------GA--T-CCCC----GTA-----------TG-TT---T--T---C-T-G-TT-A-------TAT----AACT-TC--GG--C-A-T-TT-AC-ATAAT--A-------A-A-T--G-AC-A-TT-T---TT-TC---A--ATT-C-ACA-T---TG-CTGTCCTG-----TT--T-TC---A-CTGC--C-T----TTG--T--CA--A-GT-A-ACAAG-CA-A--AG-G--C-TACCTGG-C-ACGTTC-A-T---A-TT-AAC---T---AT-GGAACATAAa
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                 aattTT-A--T-A------T---T-TT-GG------TTTTATACG------GA-GCCC-A------T-CTT-----GA--TACCCC----GCA-----------GG-TT---T--TGTTC-TCG-TT---------TATTTT-AACT-TC--GT--C-A-TTCT-AC-ATAAT--A-------A-AAT--G-AC-A-TT-T---TT-TT---C--ATT-C---A-A---TG-CTTGCCTG-----TT--T--C---A-CTGC--C-T----TTA--TTTCA--ATGT-A-A-AAA-CA-AGAAG-G--C-TACCTGG-C-ACGTTC-A-TTAAA-TA-AAC---T---AT-G--ACATAAa
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                            -A------T---T-TT-GG------TTTT---TC------GA-GCCA-A------T-CT------GA--T-CCTC----TCA-----------TG-TT---TATT---C-T-G-AT-A-------TAT----AACT-TC--GT--C-A-T-TT-AC-ACTAT--A-------A-A-T--G-AC-A-AT-T---TT-TC---A--ATT-C-ACA-T---CG-CTGTCCTG-----TT--T-TC---A-CTGC--C-T----TTA--T--CA--A-GT-A-ACAAG-CA-A--AG-G--C-TACTTAG-C-ACGAAC-A-T---A-TT-AAC---T---AC-GAAACATAA
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                            -A------T---T-TT-GG------ATTT---CC------GA-GCCA-A------T-CT-------------------------------------------------------------------AT----AACT-TC--GT--C-A-T-TT-AT-ACAAT--A-------A-A-T--G-AC-A-AT-T---TT--C---A--ATT-C-ATA-T---CG-CTGTCCTG-----TT--TCTC---A-CTGC--C-T----T-A--T--CA--A-GA-ATACAAG-CA-A--AG--------------C-A---TC-A-T---A-TT-AAC---T---AC-GGAACATAAa
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                              ------T---T-TT-GG------TTTT---TC------GA-GCCC-A------T-CT------GA--T-CCCC----GCA-----------TG-TT---T--T---C-T-G-TT-A-------TAT----AACT-TC--GT--C-A-T-TT-AC-ATAAT--A-------A-A-T--G-AC-A-TT-T---TT-TC---A--ATT-C-ACA-T---TG-CTGTCCTG-----TT--T-TC---A-CTGC--C-T----TTA--T--CG--A-GT-A-ACAAG-CA-A--AG-G--C-TACCTGG-C-ACGTTC-A-T---A-TT-AAC---T---AT-GGAACATAA
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                           T-GG------TTTT---TC------GA-GCCC-A------T-CT------GA--T-CCCC----GCA-----------TG-TT---T--T---C-T-G-TT-A-------TAT----AACT-TC--GT--C-A-T-TT-AC-ATAAT--A-------A-A-T--G-AC-A-TT-T---TT-TC---A--ATT-C-ACA-T---TG-CTGTCCTG-----TT--T-TC---A-CTGC--C-T----TTA--T--CA--A-GT-A-ACAAG-CA-A--AG-G--C-TACCTGG-C-ACGTTC-A-T---A-TT-AAC---T---AT-GGAACATAAa
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TT---TC------GA-GAAA-A------T-CT------AA--T-CCCG----GCA-----------AG-TT---TATT---C-T-G-TT-ACAATGTATAT----AACT-TC--GT--C-A-T-TT-AC-ACAAT--A-------A-A-T--G-AC-A-AT-T---TT-TC---A--ATT-C-ACA-T---CG-CTGTCCTGCTATATT--T-TC---A-ATGC--C-T----TTA--T--CA--A-GT-A-ACAAG-TA-A--AG-G--C-TACTTGG-C-AAGATC-A-T---A-TT-AAC---T---AC-GGAACATAA
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            CA-----------AG-TT---TAGT---T-T-G-TT-A-------AAT----AAGT-TT--GT--G-A-T-TT-TC-AAAAT--A-------A-C-TCGG-G------------T-TC---A--AT-----------------GTCCTA-----TT--T-TC---A-ATGC--C-T----TTA--C--CA--T-GT-A-ACAAG-TA-AT-AA-C--T-TACTTGG-C-TAGATA-T-T---A-TC-AAC---T---AT-AGAACAa
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 a-------TAT----AACT-TC--GT--C-A-T-TT-AA-ACAAT--A-------A-A-T--G-AC-A-AT-T---TT-TC---A--ATT-C-ATA-T---CG-CTGTCCTG-----TT--T-TC---A-CTGC--C-T----TTA--T--CA--A-GT-A-ACAAG-CA-A--AG-A------------------TC-A-T---A-TT-AAC---T---AC-GGAACATAAaa
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tattttggatttccaagccaatcT----AATT-TCTAGT--C-A-T-CT-AT-TTAAC--A-------A-A-T--G-AC-A----T---TT-TC---AG-A------CA-TGCATG-ACGTTTTA-----TTTGT-TC---ACCTG---C-T----GTA--TC-CA--A-AA-A-ACAAG-TT-T--CG-G--C-TCCTTGA-C-AAGTAC-------------AC---T---AC-GGAACATAA
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consensus                     :           TTATA-ACCCACCTT-ACT-TGATTC-CA-GG-CA-G----CTC--TA-TTTT-T---A-TA-TT-GCA--T---A-A-TG--------TG------------TTG-T-TGGG-G--A----TCA--G-A--TGGCA--T----A-AT-CACAC-----C--T------A-TG---T-G--A-T---A-CA-T------G-T--A---------G-----A---T-AT-----G--TT------CTT-A--T-A------T-T-TT-GG------TTTT---TC------GA-GCCC-A------T-CT------GA--T-CCCC----GCA-----------TG-TT---T--T---C-T-G-TT-A-------TAT----AACT-TC--GT--C-ATT-T-AC-ATAAT--A-------A------A-T--G-AC-A-TT-T---TT----TC---A--AT-T-C-ACA-TC-G-C----TGTCCTG-----TT--T-TC---A-CTGC--C----TTTA--T--CA--A-GT-A-ACAAG-CA-A--AG-G--C-TACCTGG-C-ACGTTC-A-T---A-TT-AAC---T---AT-GGAACATAA
Reference ( family-1655 )     :           TTATA-ACCCACCTT-ACT-TGATTC-CA-GG-CA-G----CTC--TA-TTTT-T---A-TA-TT-GCA--T---A-A-TG--------TG------------TTG-T-TGGG-G--A----TCA--G-A--TGGCA--T----A-AT-CACAC-----C--T------A-TG---T-G--A-T---A-CA-T------G-T--A---------G-----A---T-AT-----G--TT------CTT-A--T-A------T-T-TT-GG------TTTT---TC------GA-GCCC-A------T-CT------GA--T-CCCC----GCA-----------TG-TT---T--T---C-T-G-TT-A-------TAT----AACT-TC--GT--C-ATT-T-AC-ATAAT--A-------A------A-T--G-AC-A-TT-T---TT----TC---A--AT-T-C-ACA-TC-G-C----TGTCCTG-----TT--T-TC---A-CTGC--C----TTTA--T--CA--A-GT-A-ACAAG-CA-A--AG-G--C-TACCTGG-C-ACGTTC-A-T---A-TT-AAC---T---AT-GGAACATAA
gi|1                          :            TATATACCCCCATT-ACTATGATTC-CA-GG-AA-AGC--CTC--TA-TTTT-T---A-TAATT-GCAAAT---A-A-TGCTGAACTATG------------TT----TGGG-G--ACGAATCA--G-ACTTGGCA--CCTCCA-AT-CACAT-----CGCT------A-TG---T-G--A-T---T-CA-T------GAT--AATTGTGAGGG-----AGTTT-AT-----GCTTT------CTTTA--T--------T-T-TT-GC------TTTT---TC------GAAGCCC-A------T-CT------GACTT-CCCC----ATATTGCTGATTACTG-TTC--T--T---C-T-G-TT-T-------TAC-----ACT-TC--GT--C-ATT-CAAC-ATGAT--A-------A------T-T--G-AC-A-TT-T---TTG---TC---A--AT-T-C-A-A-TT-G-C----GTTCCTG-----TT--A-TTATAA-TTACCTC----TTTA--T--AC--A-GT-A-AACAG-CA-A--AG-G--C-TACCTGT-CAACGTTC-ATT---A-TT-AAC---CA--ATAGGAACATAA
gi|10                         :     atcttgaTATA-ACCCACCTA-ACT-TGATTC-CA-GG-CA-G----CTC--TA-ATTT-G---A-TA-TT-GCA--T---A-A-TG--------TA------------TTG-T-TGGG-G--A----TCA--G-A--TTGCATGT----G-AT-AA------------------A-TG---TAG--A-G---A-GA-T------G-T--A---------G-----A---A-AG-----G--TT------CTT-A--C-A------T-T-TT-GC------TTTT---TC------GA-GCCA-A------T-TT------TA----------------------------------T--T---C-T-G-TT-A-------TAT----AACT-TC--TT--C-ATT-T-AC-CCAAT--A-------A------A-T--A-AC-A-TT-T---TT----TT---AATAT-T-C-ACA-TC-G-T----TGTCCTG-----TT--T-TC---A-CTGC--C----TTTG--T--CA--A-GT-A-ACAAT-CA-A--AG-G--C-TACTTGA-C-AAGATC-A-T---A-TT-AAC---T---AC-GGAA
gi|11                         :     ttatctgTATA----CACCTT-ACT-TGATTC--A-GG-CA-G----ATC--TA-TTTT--------A-TT-GCA------A-A-TG--------TG------------TT--T-TGGG-G--A----TCA--G-A--TGG-A--T----A-AT-CACAC-----C--T------A-TG---T-G--A-T---A-TA--------A-T--A---------GTAAGAA---T-AT-----A--TT------CTT-T--T-A------T-T-TTTGG------TTTT---CA------GA-GCCC-A------TTCT------GA--T-CC------GCA-----------TT-TT---T--T---C-T-G-TT---------TAT----AACT-TA--GT--C-TTT-A-AC-ATAAT--A-------T--------T--G-ATTA-TT-T---TT----TC---A--AT-T-C-ACA-TT-G------TGT-CTG------T--T-TC---A-ATG---------TTA--T---A--A-GT-A---AAG-CA-A--AGAG--C-TA-CTGG----TGCTC-A-T---A--T-AAC---T----T-GGAACAT
gi|12                         :        tggTCATA-ATCCACCTT-ACT-TGATTC-CA-GG-CA-G----CTC--TA-TTTT-------------------------------------G------------TTG-T-TAGA-G--A----TCA--G-A--TG-CA--T----A-AT-CACAC-----C--T------A-TG---T----A-T---A-CA-T--------T------------G-----A---T-AT-----G--TT------CTT-A--T-A------T-T-TT-GG------TTTT----C------GA-GCCC-A------T-CT------GA--T-CCCC----GCA-----------TG-TT---T--T---C-T-G-TT-A-------TAT----AACT-TC---T--C-ATT-T-AC-GTAAT--A-------A------A-T--G-AC-A--T-T---TT----TC---A--AA-T-C-ACA-TT-G-C----GTTCCTG-----TT--T-C------------------------------A-GT-A-ACAAGCCA-A--AG-G--C-TACCTGG-C-ATGTTC-A-T---A-TT-AACTAAT---AT-GGAACATAA
gi|13                         :                                    a-CA-GG-CA-GATGTTTCAATA-TTTT-A---A-TA-TT-T----T---T-A-CG--------TG------------ATT-TATGGA-G-------TCA--A-A--TTACA--T----A-AT-CATAC-----C--T------A-T-----------------CA-G------G-C----------------------T-AT-----G--TG------ATA-A----A------T-T-TC------------T---TC------CA-GTT--A------TACT------GA----CTCC----ACT-----------AG-TT---TAGT---T-T-C-TT-G-------TAT----GACT-TC--TT--C-ATT-T-TC-AAAAT--ACGTGTACA------C-T--G-AC-A-TT-TGTTTT----CC---A--CT-T-C-ACA-TC-C-A----TGTCC-G-----TT--T-T----A-CTG---------------------A-GT-G-ACAAA-CA-A--AG-G--CTTACTTGG-C-AAGATT-A-T---A-CC-AAG---T---AA-AGAACA
gi|14                         :                                                                                           G--------TG------------TTCCT-TGGG-G--A----T-A--G-A--TG-CA--T----A-ATTCACAT-----C--T------A--G---T-G--A-T---A-CA-T------G-T--A---------A-----A---T-------------------CTT-C--T-G------TAT-TT-GG------TTCT---CA------GA-GCCC-A------T-CT------GA--T-CCCC----GCAAT---------TG-TT---T--T---C-T-G-TT-A-------TAT----AACT-CC--GT--C-ATT-G-AC-ATAATCAA-------A------A-T--GCAC-A-TT-T---TT----TC---A--TG-G-C-ACAGTT-G-C----TGT-CTG-----TT--T-TC---ACCTGC--------TTAATT--CA--A-GTAA-ACAAG-CA-A--AG-G--C-TACCTGT-C--CGTTC-A-T---A-TTAAAC---TTTAAT-GGAAaa
gi|15                         :                                              -G----CTC--TAATTTT-T---A-TA-TT-GCA--T---A-A-TG--------TA------------TTG-T-TGGG-G--A----TCA--G-A--TGGCA--T----ATAT-CCAAC-----C--T------A-TG---T-GTGA-T---A-CA-T------G-T--A---------G-----A---T-AT-----G--TT------CTT-A--T-A------T-T-TT-GG------TTTA---TC------GA-G-CC-A------T-CT------GA--T--CCC----GCA-----------TG-TT---T--T---C-T-G-TT-A-------T-T--------------------------------------------------A-T--A-AC-A-TT-T---TT----TC---A--AT-T-C-ACA-TT-G-C----TGTCCTG-----TT--T-TC---A-CTGC--C----TTTAT-T--CA--A-GT-A-AC-AG-CA-A--AG-G--C-TACCTGG-C-ATGTTC-A-T---A-TT-AAC---T---AT-GGAACATAAacaa
gi|16                         :               A-ATCCACCTT-ATT-TGATTG-CA-GA-CA-G----CT---------------A-TA-T----G--T---A-A----------------------------------A-G--A----CCA--A-A--CTGCA--T----T-AT-CATAC-----C--T------A-TG---T-G--A-------------------T--A---------G-----A---T-AT-----G--TT------CTT-G--T-G--------C-GG-GG------TTTT---TC---------GCCC-GAGTTATT-CT------GA--C-CCCa
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ttgtaaaA-TC-A-A----TGTCCTG-----CT--T-TT---A-CTGC--T----TTTA--T--CA--A-GT-A-ACAAA-CA-A--AC-A--C-TATTTGG-CAACATCC-A-T---A-TT-ATG---T---AA-CGAACATAAactaggtaaatcaatgtcctgcttttactgcttttatcaagtaacaaacaaacactatttggcaacatccatattatgtaacgaacataa
gi|17                         :                  ttgtaaaaatccaccttatttgattgcagacagctatatgtaaagaccaaactgcattatcatacctatgtgatagatatgttcttgtgcggggtttttcgcccgagttattctgaccccactaggtaaA--T----A-AT-CTCAC-----C--T------A-TG---T-G--A-T---A-CA-T------G-T--A---------G-----A---T-AT-----G--TT------CTT-A--T-A------T-T-TT-GG------TTTT---TC------GA-GCCC-A------T-CT------GA--T-CCCC----GCA-----------TG-TT---T--T---C-T-G-TT-A-------TAT----AACT-TC--GT--C-ATT-T-AC-ATAAT--A-------A------A-T--G-AC-A-TT-T---TT----TC---A--AT-T-C-ACA-TT-G-C----TGTCCTG-----TT--T-TC---A-CTGC--C----TTTA--T--CA--A-GT-A-ACAAG-CA-A--AG-G--C-TACCTGG-C-ACGTTC-A-T---A-TT-AAC---T---AT-GGAACATAA
gi|18                         :               A-ACCCATCTT-ATA-TGATTG-CA-GA-CA-G----CTC--TA-TTTC-A---A-TA-TT-TCA--T---T-A-TG--------CA------------CTT-T-AAGA-T--G----TAA--G-T--TTGCA--T----A-TC-CACAC-----C--TATAAACA-TG---T-A--A-T---A-CAGT------G-T--A---------C-----A---T-AT-----G--CT------GTT-G--CAA------T-T-TT-CC------CCTT--------------ACTC-AT-----T-TT------GA--C-TACC----ACT-----------AG-CT---T-------------------------------ATT-TC--GT--C-AC-------------------------------T--G-AT-T-TTTT---TT----TC---A--AT-T-C-ATA-TC-A-A----TGTCCTG-----TA--T-GT---A-CTGC--C----TTa
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                         A-T------G-T--A---------G-----A---T-AT-----A--TT------ATT-A--T-A------T-T-TT-GG------TTTT---TC------GA-GCCC-A------T-CT------GA--T-CCCC----GTA-----------TG-TT---T--T---C-T-G-TT-A-------TAT----AACT-TC--GG--C-ATT-T-AC-ATAAT--A-------A------A-T--G-AC-A-TT-T---TT----TC---A--AT-T-C-ACA-TT-G-C----TGTCCTG-----TT--T-TC---A-CTGC--C----TTTG--T--CA--A-GT-A-ACAAG-CA-A--AG-G--C-TACCTGG-C-ACGTTC-A-T---A-TT-AAC---T---AT-GGAACATAAc
gi|2                          :        aattTATA-ACC-ACCTT--CT-TGATTC-CA-GG-CA-G----CTC--TA-TCTC-TTACA-TA-TTTGCA--TTGAA-G-TG--------TGCCCCATATAGTTTTG-T-TAGG-GCGA----TCA--GGA--TGGC---T----A-AT-CACAC-----C--T------AATG---T-G--A-T---A-CA-T------GTT--A---------GGA---A---T-AC-----T--TTGGGTGGTTT-A--T-AATGAATT-T-TT-GGAATAAATTTT---TTAATACAGA-GCCC-AT-----T-CTATCTTAGA--T-TTCCACGGGCA-----------TG-TCTG-T--T---C-TCGTTT-A-------TAT----AACTATC--GTCAC-ATT-T-ACAATAAT--A-------AT-----T-T--G-AC-A-TC-T---CTATTGTC---ATTATCT-C-ACA-TT-G-C----Ta
gi|20                         :                                                                                              tattttgG------------TT--T-TAGG-G--A----TCA--G-A--TTGGA--T----A-AT-CGTAC---------------A-TG---T------T---G-C-----------T--A---------G-----G---C-AT---------T------CTT-A--C-----------------------------------------GCCC-A--------CT------G---------------------------TG-TTAGGT--T-------G-TT-AA------TAT----AACT-AC--AT--C-ATT-T-TC-AAATT--A-------A------A-A--G-TC-A-AT-T---TT----TC---A--GT-T-C-ATA-TT-A-A----AGTAATG-----GT--A-T----A-CTGC--C----TTAA--T--CA--A-GC-A-ACAAA-CA-A--AG-GC-C-TACTTGG-C-Acgtggcctcgcattttatc
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                TT-A--T-A------T-T-TT-GG------TTTTATACG------GA-GCCC-A------T-CTT-----GA--TACCCC----GCA-----------GG-TT---T--TGTTC-TCG-TT---------TATTTT-AACT-TC--GT--C-ATTCT-AC-ATAAT--A-------A------AAT--G-AC-A-TT-T---TT----TT---C--AT-T-C-A-A-T--G-C----TTGCCTG-----TT--T--C---A-CTGC--C----TTTA--TTTCA--ATGT-A-A-AAA-CA-AGAAG-G--C-TACCTGG-C-ACGTTC-A-TTAAA-TA-AAC---T---AT-G--ACATAAagaacaggtataaaagtaaata
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                TT---TC------GA-GAAA-A------T-CT------AA--T-CCCG----GCA-----------AG-TT---TATT---C-T-G-TT-ACAATGTATAT----AACT-TC--GT--C-ATT-T-AC-ACAAT--A-------A------A-T--G-AC-A-AT-T---TT----TC---A--AT-T-C-ACA-TC-G-C----TGTCCTGCTATATT--T-TC---A-ATGC--C----TTTA--T--CA--A-GT-A-ACAAG-TA-A--AG-G--C-TACTTGG-C-AAGATC-A-T---A-TT-AAC---T---AC-GGAACATAA
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                       -A------T-T-TT-GG------TTTT---TC------GA-GCCA-A------T-CT------GA--T-CCTC----TCA-----------TG-TT---TATT---C-T-G-AT-A-------TAT----AACT-TC--GT--C-ATT-T-AC-ACTAT--A-------A------A-T--G-AC-A-AT-T---TT----TC---A--AT-T-C-ACA-TC-G-C----TGTCCTG-----TT--T-TC---A-CTGC--C----TTTA--T--CA--A-GT-A-ACAAG-CA-A--AG-G--C-TACTTAG-C-ACGAAC-A-T---A-TT-AAC---T---AC-GAAACATAAa
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                         ------T-T-TT-GG------TTTT---TC------GA-GCCC-A------T-CT------GA--T-CCCC----GCA-----------TG-TT---T--T---C-T-G-TT-A-------TAT----AACT-TC--GT--C-ATT-T-AC-ATAAT--A-------A------A-T--G-AC-A-TT-T---TT----TC---A--AT-T-C-ACA-TT-G-C----TGTCCTG-----TT--T-TC---A-CTGC--C----TTTA--T--CG--A-GT-A-ACAAG-CA-A--AG-G--C-TACCTGG-C-ACGTTC-A-T---A-TT-AAC---T---AT-GGAACATAAa
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                    T-GG------TTTT---TC------GA-GCCC-A------T-CT------GA--T-CCCC----GCA-----------TG-TT---T--T---C-T-G-TT-A-------TAT----AACT-TC--GT--C-ATT-T-AC-ATAAT--A-------A------A-T--G-AC-A-TT-T---TT----TC---A--AT-T-C-ACA-TT-G-C----TGTCCTG-----TT--T-TC---A-CTGC--C----TTTA--T--CA--A-GT-A-ACAAG-CA-A--AG-G--C-TACCTGG-C-ACGTTC-A-T---A-TT-AAC---T---AT-GGAACATAAa
gi|26                         :            TAAA-ACTCACCTT-ATT-TAATTG-CA-AA-CA-G----CTC--TA-TTTC-A---A-TA-TT-AGA--T---A-T-TT--------TA------------TT--T-T-------------------------CA--T----A-GT-CATACATGTAC--C------A-TGAAAT-G----T---A-CA-TTTGTTCG-T--A---------G-----A---TGAT-----G--TT------CTA-AGTC-A------T-T-CT-GG------
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               cgcaattatttg-------TAT----AACT-TC--GT--C-ATT-T-AA-ACAAT--A-------A------A-T--G-AC-A-AT-T---TT----TC---A--AT-T-C-ATA-TC-G-C----TGTCCTG-----TT--T-TC---A-CTGC--C----TTTA--T--CA--A-GT-A-ACAAG-CA-A--AG-A------------------TC-A-T---A-TT-AAC---T---AC-GGAACATAAcaacc
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                tattttggatttccaagccaatc-A------T-T-TT-GG------ATTT---CC------GA-GCCA-A------T-CT-------------------------------------------------------------------AT----AACT-TC--GT--C-ATT-T-AT-ACAAT--A-------A------A-T--G-AC-A-AT-T---TT-----C---A--AT-T-C-ATA-TC-G-C----TGTCCTG-----TT--TCTC---A-CTGC--C----TT-A--T--CA--A-GA-ATACAAG-CA-A--AG--------------C-A---TC-A-T---A-TT-AAC---T---AC-GGAACATAA
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     CA-----------AG-TT---TAGT---T-T-G-TT-A-------AAT----AAGT-TT--GT--G-ATT-T-TC-AAAAT--A-------A------C-TCGG-G------------T----TC---A--AT--------------------GTCCTA-----TT--T-TC---A-ATGC--C----TTTA--C--CA--T-GT-A-ACAAG-TA-AT-AA-C--T-TACTTGG-C-TAGATA-T-T---A-TC-AAC---T---AT-AGAACA
gi|3                          :           aTATA-ACAC-CTTT-ACT-TGATTCTCA-GG-CAAG----CTC--TA-TTTT-----A-TA-TT-GCA--A---ATA-TG--------TG------------TTG-T-TGGG-G--A----TCACTG-A--TGGCA--T----A-AT-CACAC-----C--T------A-TG---T-G--AAT---AACA-TT-----G-T--AA--------G-----A---T-ATAAAATG--TT------CTTCA--T-A------T-T-TG-GC------TTTT---TC------G--GACG-A------T-CT------GA--T-CCCC----CGA-----------TG-TT---T--T---C-T-G-TT-A-------TAT----AACT-TCC-GT--CCATT-T-AC-ATAAT--A-------A------A-TT-G-AC-A-TT-T---TT----TTTCAA--AT-T-T-ATA-TT-G-C----TGTCTCG-----AT--T-TC---AACCGC--CC---TTTA-----CA--A-GT-A-ACAAG-CA-A--AG-G--C-TACCTGG-C-A-GTTC-A-T---ATTT-AAC---T---AT-GGAACATAAaa
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ttgAT----AACT-T----------TT-T-AA-GCAAT--A-------ACACGCTA-T--G-AG-A-TC------------C---A--AT-TTC-ACA-TT-GGC----TGTCCTG-----TT--T-TC---A-CTGC--C----TTTA--T--CACCA-GTAA-ACAAG-CA-A--AA-G--C-TACCT-G-C-ACG-TC-A-T---A-TT-AAC---T---AT--GAACATAAa
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    T----AATT-TCTAGT--C-ATC-T-AT-TTAAC--A-------A------A-T--G-AC-A----T---TT----TC---A--G------ACA-T--G-CATGACGTTTTA-----TTTGT-TC---ACCTG---C----TGTA--TC-CA--A-AA-A-ACAAG-TT-T--CG-G--C-TCCTTGA-C-AAGTAC-------------AC---T---AC-GGAACATAAa
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tt-ACAAT--A-------A------A-T--G-AC-A-TT-T---TT----TC---A--AT-T-C-ACA-TC-G-T----TGTACTG-----TT--T-TC---A-CTGC--CTACTTTTA--T--CA--A-AT-A-ACTAG-CA-A--AG-G--C-TACTTGG-C-AAGGTC-A-T---A-TT-AAC---T---AC-GGCACATAAa
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             -AC-ACAAT--A-------A------A-T--G-CC---TT-T---TT----TC---A--AT-C-C-ACA-TC-G-C----TGTCCTG-----TT--T-TC---A-CCGC--C----TTTA--T--CA--A-CT-A-GCAAG-CA-A--AG-G--C-TACTTGG-C-AAGATC-A-T---A-TT-AAC---T---AA-GGAACATAA
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    AT--A-------A------T-T--G-AT-A-TT-TC--TT----TC---A--AT-C-C-ACA-CC-A-A----TTTTTTC-----AT--T-TT---A-CTAC--C----GTTA--T--CA--A-GT-A-ACAGG-TA-A--AG-A------------------TC-A-T---A-TT-AAT---T---AA-GAATCACAAa
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           -T-AC-AAACT--A-------A------A-T--G-AC-G-TT------------C---A--AT--------------------GTCCTG-----TT--T-TTT--G-CAAC--C----TTTA--T--CA--A-GT-----------------------TATTTGC-C-AAGATC-A-T---A-GT-AAT---C---AA-GGAACATA
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ttaTAAT--A-------A------A-T--G-AC-A-TT-T---TT----TC---A--AT-T-C-ACA-TT-G-C----TGTCCTG-----TT--T-TC---A-CTGC--C----TTTA--T--CA--A-GT-A-ACGAG-CA-A--AG-G--C-TACCTGG-C-ACG
gi|39                         :            TATA-ACCCACCTT-ACT-TGATTC-CA-GGCCA-G----ATCGGTA-CTGT-T---T-TA-TT-
gi|4                          :      cattatttgA-ACCCACCTT-ACT-TGATTC-CACGG-CA-G----CTC--TA-TTTT-T---AATA-TT-GCA--T---A---CA--------TG------------TTG-T-GGAGAG--A----TCA--G-AAATGGCA--T----A-AT-CACAC-----CC-T------A-AG---TTG--A-TTAAA-CA-T------G-T--A---------G-----A---T-AT-----G--TT------CTA-AC-T-A------T-T-GT-G-------TTTT---TC------GA-GCCCCA------T-C-------GA--T-CCCC----GAA-----------TGGTT---T--T---C-T-G-TTCA-------TATTAAAAACT---------C-ATT-A-AC-ATAAT--A-------A------A-T----AC-A-TA-T---TT----TC---A--TA-T-C-ACA-TCTG-C-----GTCCTG-----TT--T--C---A-CTGC--C----TTTA--T--CA--A-GT---ACAAG-CACA--AG-G--C-TACCTGG-C-ACTTCC-A-TA--A-TT-AAA---C---AT-GGAACATAAt
gi|42                         :            TATA-ACCCATCTT-ACT-TGATTC-CA-GG-CA-G----CTC--TA-TT
gi|43                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 attatttgG-CA-A--AG-G--C-TACCTGG-C-ACGTTC-A-T---A-TT-AAT---T---AT-GGAACATAA
gi|45                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         G-CA-A--AG-A--C-T----GG-C-ACGTTC-A-T---A-TT-AAC---T---AT-GGAACTTAAat
gi|47                         :            TATA-ACCCACCTT-AC-----TTC-CA-GG-CA-G----
gi|5                          : tgaattatttgTATT-AACCACCTT-ACT-TGATTC-CA-G--CA-G----CTC--TA-TTTT-T---T-TAATT-GCA--T---A-AGTG--------TG------------TTG-T-TGGG----A----TCA--G-A--TGGCA--T----A-AT-CACAC-----C--T------A-TG---T-G--A-T---A-CA-T------G-TGTA---------G-----A---T-AT-----G--TT------CTT-A--T-A------T-T-TT-GG------TTTT---TC------GA-GCCC-A------T-CT------GA--T-CCCC----GCA------------G-TT---T--T---CTT-G-TT-A-------TAT----AACT-TC--GT--C-ATT-TAAC-ATAAT--A-------A------A-T--G-AC-ATTT-T---TT----TC---A--AT-T-C-ACA-TT-G-C----TGTCCTG-----TT--T-T----A-C-GC--C-----TTA--T--CA--A-GT-A---AAG-CA-A--AG-G--C-TACCTGGCC-ACGGTC-A-T---A-TT-AAC---T---AT-GGAACATAA
gi|6                          :       atttgTATA-ACC-ACCTT-ACT-TGATTC-CA-G--CA-G----CTC--TA-TTTT-T---T-TAATT-GCA--T---A-AGTG--------TG------------TTG-T-TGGG----A----TCA--G-A--TGGCA--T----A-AT-CACAC-----C--T------A-TG---T-G--A-T---A-CA-T------G-TT-A---------G-----A---T-AT-----G--TT------CTT-A--T-A------T-T-TT-GG------TTTT---TC------GA-GCCC-A------T-CT------GA--T-CCCC----GCA------------G-TT---T--T---CTT-G-TT-A-------TAT----AACT-TC--GT--C-ATT-TAAC-ATAAT--A-------A------A-T--G-AC-ATTT-T---TT----TC---A--AT-T-C-ACA-TT-G-C----TGTCCTG-----TT--T-T----A-C-GC--C-----TTA--T--CA--A-GT-A---AAG-CA-A--AG-G--C-TACCTGGCC-ACGGTC-A-T---A-TT-AAC---T---AT-GGAACATAAat
gi|7                          :     atttgtaTATA-ACCCACCTTTGCT-TGATTC-CA-GG-CA-G----CTC--TA-TTTTAT---A-T--TT-GCA--T---A-A-TG--------TG------------TTG-T-TGGG----A----TCA--A-G--T--CA--T----A-AT-CACAC-----C--T------A-TG---A-G----T---A-CA-T------G-T--A---------A-----G---T-AT--------TT------CTC----T-A------T-TCTT-GG------TTTT---TC------GA-GCCC-A------T-CT------GA----CCCC----GCA-----------TG-GT---T--T---C-T-T-TA-A-------TAA----AACT-TC--GT--C-ATT-T-AC-ATAAT--A-------A------A-T--G-AC-ATTT-T---TT----TC---A--AT-T-CAACA-TT-G-C----TGTCCTG-----TT--T-TC---A-CTG---C----TTTA--T--CA--A-GT-A-AAAGA-CA-A--AA-GGTC-TACCTGG-C-ACGTTCTATT---A-TT-AAC---C---AT-GGAACATAa
gi|8                          :       tttgTTATA-ACCCACCTT-ACT-TGATTC-CA-GG-CA-G----CTC--TA-TTTT-T---A-TA-TT-GCA--T---A-A-TG--------TG------------TTG-T-TGGG-G--A----TCA--G-A--TGGCA--T----A-AT-CACAC-----C--T------A-TG---T-G--A-T---A-CA-T------G-T--A---------G-----A---T-AT-----G--TT------CTT-A--T-A------T-T-TT-GG------TTTT---TC------GA-GCCC-A------T-CT------GA--T-CCCC----GCA-----------TG-TT---T--T---C-T-G-TT-A-------TAT----AACT-TC--GT--C-ATC-T-AC-ATAAT--A-------A------A-T--G-AC-A-TT-T---TT----TC---A--AT-T-C-TCA-TT-G-C----TGCCCTG-----TT--T-TC---A-CTGC--C----TTTA--T--CA--A-GT-A-ACAAG-CA-A--AG-G--C-TACCTGG-C-ACGTTC-A-T---A-TT-AAC---T---AT-GGAACATAA
gi|9                          :               A-ACCCACCTT-ACT-TGATTC-CA-GG-CA-G----CTC--TA-TTTT-T---A-TA-TT-GCA--T---A-A-TG--------TG------------TTG-T-TGGG-G--A----TCA--G-A--TGGCA--T----A-AT-CAAAC-----C--T------A-TG---T-G--AAT---A-CA-T------G-T--A---------G-----A---T-AT-----G--TT------CTT-A--T-A------T-T-TTTGG------TTTT---TC------GA-GCCC-A------T-CT------GA--T-CCCC----GCA-----------TG-TT---T--T---C-T-G-TT-T-------AAT----AACT-TC--GT--C-ATT-T-AC-ATAAT--A-------A------A-T--G-AC-A-TT-T---TT----TC---A--AT-T-C-ACA-TT-G-C----TGTCCTG-----TT--T-TC---A-CTGC--CT---TTTA--T--CA--A-GT-A-ACAAG-CA-A--AG-G--C-TACC-GT-C-ACGTTC-A-T---A-TT-AAC---C---AT-GGAACATAA