lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 1111111111111 1111111111111111111111111111111111111111111 2222222222222222222222222222222222222222222222222222 1111111111111111
lowQualScore : 333333333333333 11111111111111 1111111 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 0000000000000 1 11 111 111 111 1111 3333333333 111111111 1 22 1 11 333333333333333333 1111 55555555555555555 11 11 333 2 33333333333333333333 4 33 2 1 1111 1 11 4 11 11 11 3333333333 3 33 2 1 1 2222222222222222222222222222222222222222222 2 7777777777777777777777777777777777777777777777777777 0000000000000000 1 333333 88888888888888888888888 1 11 1 1 11 1 1 1 1 1 22 2 1 2 1
lowQualScore : 2 777777777777777 22 33 4 2 333 2 66666666666666 2 2 1111111 22 2 0 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 2 2 444 5 44 33 444 33 0 22 5 2 444 444 666 2 666 444 33 2 2 555 55 2 33 2 7777777777777 2 1 333 2 55 6666 77 3 3 000 3 666 3 888888 3 99 55 000 7777 5555 77 0000000000 2 44 44 555 3 555 111111111 3 3 44 2 3 555 3 555 3 6 0 3 11 777 4 4 4 4 4 4 5 1 5 33 6 888888888888888888 7777 88888888888888888 88 3 444 11 000 4 6 22222222222222222222 0 0 00 2 77 5 3 6 6 7777 6 3 6 8 22 8 8 8 0 11 5 77 11 0 6666666666 8 5 6 55 8 0 0 0 7777777777777777777777777777777777777777777 3 8888888888888888888888888888888888888888888888888888 2 5555555555555555 3 2 0 6 888888 7 7 99999999999999999999999 0 2 44 33 0 0 2 33 8 0 0 8 3 6 3 3 00 6 7 2 2 5 3 0 5
lowQualScore : . ............... .. .. . . ... . .............. . . ....... .. . . ..................................................................................... . . ... . .. .. ... .. . .. . . ... ... ... . ... ... .. . . ... .. . .. . ............. . . ... . .. .... .. . . ... . ... . ...... . .. .. ... .... .... .. .......... . .. .. ... . ... ......... . . .. . . ... . ... . . . . .. ... . . . . . . . . . .. . .................. .... ................. .. . ... .. ... . . .................... . . .. . .. . . . . .... . . . . .. . . . . .. . .. .. . .......... . . . .. . . . . ........................................... . .................................................... . ................ . . . . ...... . . ....................... . . .. .. . . . .. . . . . . . . . .. . . . . . . . .
lowQualScore : 7 666666666666666 99 11 4 2 999 2 11111111111111 2 2 9999999 99 1 2 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 5 5 444 0 99 44 444 44 8 99 0 5 111 111 555 4 555 111 22 4 4 111 99 5 44 5 1111111111111 9 4 999 7 99 1111 55 3 1 888 1 222 1 888888 3 88 55 000 1111 9999 99 8888888888 5 22 22 444 1 444 333333333 1 1 22 1 1 000 1 888 3 7 3 6 55 000 0 4 4 4 4 4 0 4 7 66 7 000000000000000000 0000 88888888888888888 22 0 888 00 000 0 7 11111111111111111111 7 0 77 9 44 7 3 7 7 7777 7 3 7 0 66 0 0 0 0 88 4 00 44 8 6666666666 0 0 0 00 0 0 5 0 0000000000000000000000000000000000000000000 7 8888888888888888888888888888888888888888888888888888 0 2222222222222222 3 2 7 7 333333 0 3 55555555555555555555555 0 5 88 88 0 0 5 88 2 0 0 3 3 7 3 3 77 7 5 5 5 5 0 0 0
consensus : NAATGTTCAC-AAAAGT--AGTAT------ACATATG--CA--CGGTG-TTTG-TA---C-AA--------------C-AA-T-------T--A-GAGCCATC-----------G---T-G---------T-G-G------GTA--------------C--------A--------------GT-A-A-T-T---GGT-AACA-CA--GT---C--CAACA-AT-T-TA---GCA---T---A-G---GTG---A--GAG-G-TAAA--TTT--GCAG-A--A-TG-T--T--------TAT-ACAACA-ATT-AAGAN-AATT----AAGTA-GGATTAG-C-ATA---GG-CTT--CA-AG-----TGC-A-TGC-ACATG-T-A----TTGGT---AAATAGG--A-----CCAA-AATATAC--AGT--TG---TA-A---TA-------TAC-T-AA--TAGTTAGCCAGAAATCC-GA---TG-TCTC---T-A-TTTAGTCCAT-TGT-T---TTT-G-CA-GT-CA-AA-TTTGGCAATC-AG-TTT-T--GTTCAGT-GA---C---TC---------TTTGT----CTAATGT------CG---GGTA--ATTGT-CCCTGTAAGTATGG--ATAC--CCGCATA-TTGTCACAA-CAATG-TCCA---TTTTTGTTGTAG-TGTTC-ACCTACTGGTACAAACA-CA-TTTT-GCTGTTG-AT-GGT-CT-GGCGGTG-T-C-ATT-GATGCGGTTTCTTNATTTT-T-G-GCACGTT-TC-TCCAATGTAACATGATGGAA--CATAACACT-GCAT-TGAATCA-AA-TACACACAATTTTTTAGTTTCACATG-TGAAGT-------------G-------AAT------TCATTT--CCTGAATTTGGAA-TTCGGATATT--GGCA-----T---CACTGGC--------TT-TTGG--G-GAATG-GG--GGCAAAGTTTGCAGCGAG-T-TTTTCT------TTTTTTTTTTTTTACAAGGAAAGGTCCC-TCTTGGCATGCAGGGCGCAAGTTCACTATGTACCAGCATAC------GTTTGATATTAGGAGGTTGCCGGTAAGCAATGACGGGGGGNTTNGGGGANATAGCTCCTTTAGTT-GGTCGTC--CTCGTTGAT-AA-CATTTTGCATTTCCTTGGCAATGCGTTTGATAGGGCCTAATCCT--GGGTGA-TAGG-TTAATACGA-GAGGAATCCTGTCACCTTCC-GTCTCTGC-TGTG-TTGTACTGCAGTAATAGTTACCGTGGTTTNGNCTTAGCCTTATCCATCTGGTTGCTAATTAANCTGGTGGTTAT
Reference ( gi|2 ) : TAATGTTCAC-AAAAGT-TAGTAT------ACATATG--CA--CGATG-TTTG-TA---C-AA--------------C-AA-T-------T--A-GAGCCAT------------G---T-G---------T-A-G------GTA--------------C--------A--------------GT-A-A-T-T---GGT-AACA-CA--GT---C--CAACA-AT-T-TA---GCA---T---A-G---GTG---A--GAG-G-TAAA--TTT--GCAG-A--A-TG-T--TAAAAAAAATAT-AGAACA-ATT-AAGAA-AATT----AAGTA-TGATTAG-C-ATA---GG-CTT--AA-AG-----TGC-A-TGC-ACATG-C-A----TTGGG---AAATAGG--A-----CTAA-AATATAC--AGT--TG---TA-A---TA-------TGC-T-AA--TAGTTAGCCAGAAATCC-AA---TG-TCTC---T-A-TTTAGCCCAT-TG--T---TTT-G-CA-GT-CA-AA-TTTGGCAATC-AG-TTT-T--GTTCAGT-GA---C---TC---------TTTGT----CTAATGT------CG---G-----ATTGT-ACTTGTAAGTATGG--ATA---CCG-ATA-TTGTCAC-A-CAATG-TCCA---TTTGTGTTGTAGCTGTT--ACCTACTGGTA-AAACA-TA-TTTT-GCTGTTG-AT-GGT-TC-GGCGGTG-T-C-ATT-GATGCGGTTTCTTTATTTT-T-G-GCACGTTGTC-TCAAA-GTAACATGATG--A--CATAACACT-GCATCTGGATC--AA-TACACACAATGTTTTTGTTTCACATG-TGAAGT-------------G-------AAT------TCATTTTCTCTG-ATTTGGAATTTCGGATATTTGGGCAAAATCC---CACTGGCCCCAAAAATT-TTGGGGGGGAATG-GG--GGCAGAGTTTGCAGCGAATTCTTTTCTTTC--TTTTTTTTTTTTTTACAAGGAAAGGTCCC-TCTTGGCATGCAGGGTGCAAGTTCACTATGCAGCAGCATAC------GTTTGATATTAGGATGTTGCCGGTAAGCAATGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTCCTTTAGTT-GGTTGTC--CTCGTTGAT-AA-CATTTTGCATTTCCTTGGCAATGCGTTTGATAGGGCCTAATCCT--GGATGA-TAGG-TTATTACAA-GAGGAATCCTGTCACCTTCT-GTCTCTGC-TGTG-TTGTACTGCAGTAATAGTTCCCGTGGTTTGGCCTTAGCTTTATCTATCTGGTTGTTAATTAAAC-GGTGGTTAT
gi|3 : AATGTTCAC-AAAAGG-TA-TATTTAAAAACATATGGCTAATTGATGATTTG-TAATAC-AAACGTATTTGGCATTC-AA-TGTGT---T--A-GTGCCAG------------G---T-G---------T-T-G------TTG--------------A--------G--------------GG-A-A-T-TTATGGT-AACA-CA--GTGTTC--CA-CAGATAT-TA---GCAAAAT---A-GCCAGTG---AAGGAGTG-TAAA--TT---GCGA-A--G-TA-T----------ATATTACAACA-ATA-ACGAA-AATT----AAGTAGCGATTAG-C-ATA---GT-CCTTCAC-AGGTCTATGC-AATGCTACATG-T-A----TTGAGTAAAAATAGGGAA-----GTAACAATATAC--AGT--TG---TA-AGAATA-------TACCT-AA--TAGTTAGCCGAGAATCC-AAAAGTG-TCTTACTT-A-TTTA--TCAT-CG--TCTCTTT-G-CA-GTTCACAA-TTTGGCAATC-AG-TTT-TT-GTTCAGCCGA---T---TCATCTATCTATTTGTAAATCTAATGTTCTAGCCG---T-----ATTGT-CCCTGTA-GTATGG--ATATACCCGCATA-TTGTCAC-AACAAT----------------TGTAG-TGTTC-ACCTACTGGTACAAACA-CA-TTTTTAATGTTG-AT-GGT-CT-GGCGGTG-T-CCATT-GATGCGGCTTCTT-ATTTTCT-G-CCACTTT-TC-TCCAATGTA-CATGATGGAA--CATA-CACT-GCAT-TGAATC--AAATACACACAAT-TTTTAGTTTCACATG-TGAAGTGGCCTTGAATTGAG-------AAT------TCATTT--CCTGAATTTGTAA-TTCGGACATT--GGCA-----T---CACTGGC--------------------AATG-AGTCGGCAAAAATTGCAGCGAG-----------G--GTTTTTTTTTTTTTACAAAGAAAGGTCCC-TCTTGGCATGCAGGGCGCAAGTTCACTATGTACCAGCATAC------GTTTGATATTAGGAGGTTGCCGGTAAGCAATGACGGGAGGTTTAGGGAATAGC--TCCTTTAGTT-GGTCGTC--CTCGTTGAT-AA-CATTTTGCATTTCCTTGGCAATGCGTTTGATAGGGCCTATTCCT--GGGTGA-CAGG-TT
gi|5 : caaatcATGTTCAC-AAAAGT-----AT------ACATATG--CA--CGGTG-TTTG-TA---C-AA--------------C-AA-TTAGAATTT--A-GAGCCATCTAAGGGTTGT-G---T-G---------T-G-GCTTCAAGTG--------------CCACGTGTAG--------------GT-A-A-T-T---GGT-AACA-CA--GT---C--CAACA-AT-T-TA---GCA---T---A-G---GTG---A--GAG-G-TAAA--TTT--GCAG-A--A-TG-T----------ATAT-ACAACA-ATT-AAGAC-AATTTTAAAAGTA-GGATTAG-C-ATA---GG-CTT--CA-A------TGC-A-GGT-ACATA-T-A----TTGGT---AGATAGG--A-----GCAA-ATTATAC--AGT--AG---TA-A---TA-------TAA-T-AA--TAGTTAGCCAGAAATCC-AA---TT-TTTC---T-A-TTTAGTCCAT-TGT-T---TTT-G-CA-GT-AA-AA-TATGGCAATC-AATTTT-T--GTTCAGT-GA---CTCTTC---------TTTGT----CTAATGT------CA---GGTA--ATTAT-CCCTGTAA-TATGG--ATAC--CCGCATA-TTGTCACAA-CAATG-TCCA---CTTTTGTTGTAG-TGTTC-ACCTACTGGTACAAACA-CATTTTT-GCTGTTG-AT-GGT-CT-GGCGGTG-TCC-ATT-GATGCGGTTTCTTATTTTT-T-G-GCACGTT-TC-TCCAATGT-ACATGATGGAA--CAT-ACACT-GCAT-TGAATCA-AA-TACACACAATTTTT
gi|11 : caaatcATGTTCAC-TAGAGT-----AT------ACATATG--CA--CGATG-TTTG-TA---C-AA--------------C-AA-T-------T--A-GAGCCATCTAAGGACT---G---T-GATATGGCTTC-A-A------GTG--------------C--------AATGTGTAG------GT-A-G-T-T---GGT-AACA-----GT---C--CAACA-GT-T-TA---GGA---T---A-G---GTG---A--GAG-A-TAAA--TTT--GCAG-A--A-TG-T--T--------TAT-ACAACA-ATT-AAGAA-AATT----AAGTA-TGATAAG-C-ATA---GG-CTT--CA-AG-----TGC-A-TGC-ACATG-C-A----TTGGT---AAATAGG--A-----GCAA-AA-ATAC--AAT--TG---CA-A---TA-------TAC-T-AA--TAGTTAGCCAGAAATCC-AA---TG-TCTC---T-A-TTTAGTCC
gi|7 : gccattcATGT-CAC-AAAA----AGTAT------ACATATG--CA--CGGTG-TTTG-TA---C-AA--------------C-AA-T-------T--A-GAGCCATCTAAG-------A---T-G---------T-G-G------CTC--------------C--------AAGTGCCATGT----GT-A-AAT-T---GGTTGACA-CA--GT---C--CAACA-AT-T-TA---GCA---T---A-G---GTG---A--GAG-G-TAAA--TTT--GCAG-A--A-TG-T-----------TAT-ACAAC------------AATT----AAGTA-GGATTAGAG-ATA---GG-CTTC-AA-AG-----AGC----GT-ACATG-T-A----TTGGT---AAATAGG--AG----C----AATATAC--AGT--TG---TA-A---TA-------CAC-T-AA--TAGTTAGCCACAAACCCGAA---TG-TCTC---T-A-TTTAGTCCAT-TGT-T---TTT-G-CA-GT-CA-AA--TTGGCAATC-AA-TTT-T--TCTTAG
gi|10 : caaatcATGTTCAT-AAAA----AGTA-------ACATAT---CA---GGTG-TT-G-TA---T-G---------------C-AA-T-------T--A-GAGCCATTAGGGTTGCT--G---T-G---------T-G-GCTTCAAGTG--------------C--------ATGTTAG--------GT-A-A-T-----GGT-AACA-CA--GT---A--CAAAC-AT-T-TA---G-A---TC--A-G---GTG---A--GAG-G-TAAA--TTTTGGCAG-A--A-TG-T--T-------ATAC-ACCAC--ATT-AAGAACAATT----AAGTG--GATTAG-C-ATA---GG-CTTC-AA-AG-----C-C-A-GGT-ACATG-T-A----TTGGT----AATAGA--AG----C----ATTATAC--GGT--AG----A-A---TA-------GAC-T-AAAGTAGT---CCAAAAATCC-AA---TG-TCT----T-ACTTTAGTCCAT-TG--T---TTT-gattatccgtagatttaaagtccaagtag
gi|19 : atctATGTTGAC-AAGAGT-T----T------ACCTATG--CA--CGATG-TTTG-TA---C-AA--------------C-AA-T-------T--A-GAGCCATCTAA--------GGGTT-G---------T---G------GTATTGTCTT-------C--------AAATTCCATGTGTAGGT-A-A-T-T---GGT-AACA-CA--GT---C--CAACA-GT-T-TA---GGA---T---G-A---GTG---A--GAG-G-TACA--TTT--GCAG-A--A-TG-T--T--------TAT-ATAATA-ACT-CCTAA-A--T----AAGTA-Tttgcac
gi|9 : agcaaatcATGTTC-C-TAAAGC-TA---T------A-AT-TG--C---CGGTG-TTTA-TT---T-AA--------------C-AT-G-------T--A-GAGCCATTAAGGGTT----G---T-G---------C-T-T------GTG--------------C--------TTCCTGCCTGT----GT-ATA-A-T---GGT-A-CA-CA--GT---C--CAACC-AT-T-CA---GCA---T---A-GT--GTG---A--G-----TAA----TT--CCAG-A----TGCT--T--------TAT-CCAACC-ATT-AAGAC-AATT----A-GTA--GATTCG-C-CT----GG-CTT--CA-AG-----GG--A--GT-ACATG-T-A----TTGTA---AGGGAGC--A-----CTT----TATAC--ATT--T----TA-A---T--------TAC-T-----TAGTTAGCCA-AAATC--GA---TGCTCTC---T---TTTAGGTCCT-TG--T---TTTTG-CAAGT-CG-A---TTG-CA-TC-AA-TTT-TTTGTTCGGT-GA---C---TC---------TTcgaataaagat
gi|23 : gaagcaacATGCTCAT-AAAAGT---ATA-------ACATATG--CA--CGGTG-TTTG-T----C-AA--------------C-A----------T--AGGAGCCAT------------C---T-A---------T-G-G------GTT--------------C--------T--------------GT-C-A-TAT---GGC-----------T---T--CA--A-AT-T------GCA---T---G-T---GT--------AG-G-TAAAATTTT--GCAA-A--A-AG-C--C---AACAGTTT-AGAATAGGTT-GAGAG-AGTcttgt
gi|27 : ccATGTTCAC-AAACGT-----AT------ACATATG--CA--CGGTG-TTTa
gi|29 : gaagcaaatcATGTTCAC-AAA-----AGTAT------ACATATG--
gi|6 : ctgaagcaaatcTATTAAC-AAAAGT---AT-T------ACATATG--CA--CGATG-CTTGTTA---CAAA--------------CAAA-T-------T--A-G-GTCAT------------
gi|28 : TGTTCAC-AAAAGT-----AT------ACATATG--CA--CGGTG-Tctaagtgttgtatacaacccttagagatgggagcgtctaattgttgtacaaatgtcactgtaggtaattggtaacatagtccaacagtttgcatagtgagaggtaattgcagagaatggtttatacaacaattaagacaattaatagattagcatattaggcttcaagtgcagtgcacatgtattggtaaataggagcaaactagcatacacggagtagtgaaataatagctgaatagttagccaaaatccaagtctctaatttagtccattgtttttgcagtcaaatttggcaat
gi|1 : caaatcGTTCACCAAAAGTGTAGTAT------ACATATG--CA--CGATT-CTTG-TA---C-AC--------------A-AA-T-------T--A-GAG-CAT------------G---T-G---------T-A-G------GTA--------------C--------A--------------GTAA-A-T-T---GGTAAACA-AA--GT---C--CCACA----T-TA---GCA---T---A-G---GTG---A--GAG-G-T--A--TTT--GCAG-A--A-TGTT--TAAAAAAAATAT-AGAA-A-A-T-AAGAA-AATT----AAGTA-TGATTAG-C-ATA---GGCCTT--AA-AA-----TGCAA-TGC-ACATG-CAA----TTGGG---AAATAGGT-A-----CTAA-AATATAT--CGT--TG---TACA---TA-------TGC-T-AA--TAGTTAGCCAGAAATCC-AA---TG-TCT----T-A-TTTAG-CCAT-TG--T---TTT-G-CA-GT-CA-AA-TTTGGCAATCAAG-TTT-T--GTTCAGT-GA---C---TC---------TTTGT----CTAAT-T------CG---G-----ATTGTAACTTGTAAGTATGG--ATA---CCG-ATA-TTGTCAC-A-CAATG-TCCA---TT--TGTTGTAG-TGTT--ACCTACTGGTA-CAAAA-TA-TTTT-GCTGTTG-ATAGGT-TCTGGCGGTG-T-C-ATT-GATGCGGTTTCTTTATTTT-T-G-GCACGTT-TC--CAAA-GT-ACATGATGGAA--CAT-ACACT-GCAT-TGAATCA-AA-TA-ACACAATGTTTTTGTTTCACATG-TGAAGT-------------G-------AAT------TCATTT--CCTGAATTTGGAATTTCGGATATT--GGCA-----T---CA-TGGC-------ATT-T-----GGGAATGTGG--GGCAGAATTTGCAGCGAATTCTTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTACAAGGAAAGGTCCC-TCTTGGCATGCAGGGTGCAAGTTCACTATGCAGCAGCATAC------GTTTGATATTAGGATGTTGCCGGT-AGCAATG----TGGGAGGTTTAGGGATAGTTCCTTTAGTT-GGTT-TC--CTCGTTGAT-AATCATTTTGCATTTCCTTGGCAATGCGTTTGATAGGTGCTAAATCT--GACTGA-TAGGTTTATTACAATGAGGAATCCTGTCA-CTTCT-GTCTCTGCTTGTG--GGTACTGCAGTAATAGTT-CCGTGGTTTTGGCTTAGCTTTATCTATCTGGTTGTTAATTAAACTGGTGGTTAT
gi|14 : GTTCAC-AAGAGT-----AT------ATATATG--CA--CGATG-TTTG-TA---C-AA--------------C-AA-T-------T--A-GAGCCAatattgcactaggacctgtctgtaaggaatgtccaaggctaacgttgctggcctgttgcaaaattaagtcgttctg
gi|22 : agcaaatcaa-AAAA----AGTA-------ACATATG--CA----ATGAGTTC-TA---C-AA--------------C-AA-T-------TGGA-GAGCCATCTTGG-------G---T-G---------T-T-GTG----GTATGGCCTTCAAGTGCC--------ATTTATAG-------GT-A-A-T-T---GGA-AACA-CA--GT---C--CAATG-GT-T-TA---G-A---T---A-G---GTA---A--GAA-G-cctaagggttgtggtattagcttcaagtgccatttaagaaatttaagtgggattagcgtaggcttcaagtgcatgtacatgtattggtaaataggatcaaactatatagttgtaatatacaatgtactaatagttagccggaaatccgaagtctccatttagtccat
gi|8 : aagcgcaatcatttcaccaaaaaaaaaaaAGTATT-----ACATATG--CA--CGATG-CTGG-TA---C-AA--------------C-AATT-------T--A-GAGTCAT------------aag
gi|12 : tattataaAGTAT------ACATATT--CA--CAGTG-TTTG-TA---C-AA--------------C-AA-T-------T--A-GTGTCATCTAAAGGTTGTGG---T-G---------T-G-G------CTT--------------C--------AACTGCCATGTGTAGGT-A-A-T-T---GGT-AACA-CA--GT---C--CAATA-TA-T-TA---GCA---T---A-G---ATG---A--AAG-G-TAAA--TTT--GCAG-A--A-TG-T--T--------TAT-ACAACA-ATT-AAGGC-AATT----AAGTA-AGATTAG-C-ATA---GG-CTT--CA-A------TGC-A-GGT-ACATG-T-A----TTGGT---AAATAGG--A-----GCAA-ATTTAAC--AGT--TG---TA-A---TA-------TAC-T-AA--TAGTTAGCCAGAAATCC-GA---ctaagtgtgtatatcacacccttagatgtctaattgttgtacaaatgtcacgtgtaggtaattggtaacatagtccaacagtttagcataggtgagcggtaattgcagaaatggtttatacacaattaagacaattaagtaggattagcatattaggcttcaagtgcatgcacatgtattggtaaataggagcaaactatacagtagtaatatactaatagttagccagaaatccaatgtctctatttagtccattgtttttgcagtcaaatttggcaatca
gi|18 : aaGTAT------ACATATG--CA--TCATT-GTTG--A---C-AAAC------------C-AA-T-------T--A-GAGCCA
gi|8 : gcaaatccatgtttataggT------ACCTACA--CG--TGACA-TTTG-TA---C-AA--------------C-AA-T-------T--A-GAcctaaggggttggtataggcttcctcagtgtgccacaatgtaaggtaaatggtacagtctatcatgagtaaggtaaaaaatgataacaataatgtcccttaattaacatacgatgagagtaaatttcgcagaatgttttt
gi|8 : tattataaagtattacatatgcacgatgctggtacaacaatttagagtcatctaagtgtgtatatcacacccttagatgTTG-TA---C-AA-----------------A-T--------------GTCAC------------G---T-G---------T-A-G------GTA-------------------------------------------A-T-T---GGT-AACA-TA--GT---C--CAACA-GT-T-TA---GCA---T---A-G---GTG---A--GCG-G-TAA----TT--GCAG-A--AATGGT--T--------TAT-ACA-CA-ATT-AAGAC-AATT----AAGTA-GGATTAG-C-ATATTAGG-CTT--CA-AG-----TGC-A-TGC-ACATG-T-A----TTGGT---AAATAGG--A-----GCAA-ACTATAC--AGT--AG---TA-A---TA-------TAC-T-AA--TAGTTAGCCAGAAATCC-AA---TG-TCTC---T-A-TTTAGTCCAT-TGT-T---TTT-G-CA-GT-CA-AA-TTTGGCAATC-Aattggtaacatagtccaacagtttagcataggtgagcggtaattgcagaaatggtttatacacaattaagacaattaagtaggattagcatattaggcttcaagtgcatgcacatgtattggtaaataggagcaaactatacagtagtaatatactaatagttagccagaaatccaatgtctctatttagtccattgtttttgcagtcaaatttggcaatca
gi|6 : tattataaagtattacatatgcacgatgctggtacaacaatttagagtcatctaagtgtgtatatcacacccttagatgtctaattgTTG-TA---C-AA-----------------A-T--------------GTCAC----------------T-G---------T-A-G------GTA-------------------------------------------A-T-T---GGT-AACA-TA--GT---C--CAACA-GT-T-T----GCA---T---A-G----TG---A--GAG-G-TAA----TT--GCAG-AGAA-TGGT--T--------TAT-ACAACA-ATT-AAGAC-AATT----AA-TA--GATTAG-C-ATATTAGG-CTT--CA-AG-----TGC-AGTGC-ACATG-T-A----TTGGT---AAATAGG--AGCAAACTAG-CATACACGGAGTAGTGAAATA-A---TA--------GC-TGAA--TAGTTAGCCA-AAATCC-AA----G-TCTC---TAA-TTTAGTCCAT-TGT-T---TTT-G-CA-GT-CA-AA-TTTGGCAAT
gi|17 : tattaacaaaagtattacatatgcacgatgcttgttacaaacaaattaggtcatctaagtgttgtatacaacccttagagatgggagcgtctaattg--A-GTGCCCT------------G---TTG---------T-A-G------GTA-------------------------------------------A-T-T---GGT-AACA-CA--GT---CAACAA-A-AT-A-TATAGGCA---TAAGA-G---ATGAGAA--GAG-A-T-AA--TTT--GCAG-A--A-TG-T--T--------TAT-ACAA-A-ATTAAAGAC-AATT----AAGTA-
gi|20 : aagcaatcatgtttcataaaagtatacatatgagaagatagatataatgctataaaattagagcattaagggttgtggtgtggcttcaCAT------------G---T-G---------TTA-G------GTA---------------------------------------T-G-A--------GA-GACA--A--AT---C--CAGAA-ATATATA---GCA---T---G-G---GTG---A--GGG-GGTA----TTT--GCAGGA--A-TG-TCTTAATAAAAG-----------ATT-AACGA-AATT----AAGTA-GGATTAG-CAATA---GG-CTT--AA-gg
gi|18 : tccggtgtttgttaattgatgagcatctaagggatttgatgtgtgtggcttgtaacgtgaCAT------------G---A-G---------T-AAG------GTA--------------A--------A-----------------A-A-A-T---GAT-AACAATAATGT---C--CCTTA-AT-T--A---ACA---T---ACG---ATG---A--GAG---TAAA--TTTC-GCAG-A--A-TG-T--T
gi|30 : gcaaatccatgtttatagggtatacatatgcatcattgttgacaaaccaattagagccacctaaggggttggtataggcttcctcagtgtgccacaatgtaaggtaaatggtacagtctat---GCA---T---A-G---ATG---A--AAG-G-TAAA--TTT--GCAG-A--A-TG-T--Tttt
gi|14 : CA-TTT-AAGAA-ATTT----AAGTG-GGATTAG-C-GTA---GG-CTT--CA-AG-----TGC-A-TGT-ACATG-T-A----TTGGT---AAATAGG--A-----TCAA-ACTATAT--AGT--TG---TA-A---TATACAATGTAC-T-AA--TAGTTAGCCGGAAATCC-GA---AG-TCTC---C-A-TTTAGTCCAT-
gi|4 : agcaaatcaagttcacaagagtatatatatgcacgatgtttgtacaacaattagagccacctaagggttgtggtattagcttcaagtgc-ATA---GG-CTT--CATAG------GC-A-TG--AGATGAT-AAGTCTTCGT---AAATAGG--AG----C--A-AATATAC--AAT--TG---TA-A----A-------TAC-C-AA--TAGTTAGCCAGAAATCC-AA---TG-TCTC---A-ATTTTAGTCCATGTGTTT---TTT-A-CA-GT-CA-AATTTTGGCAATC-AGATTT-T--GTTCCGT-GACTCC---TC---------TTTGT----CTAATGT------CA---AGTAATATTGT-CTCTGTAAATATGG--ATAC--CCGCATACTTGTCACAA-CAATGCTCCATCTTTTGT-TTGTAG-TGTC--------------AAACA-CA-TTTT-GCTGTTGAAT-GGT-CT-GG-GGCG-TCC-ATTGGATGCGGTTTCTTATTTTT-T-G-GTACGTT-TC-TCCAC-GTAAAATGCTG--A---ACAACACT-GCAT-TGAATCA-AA-TACACACAAT-TCTTAGTTTCACATG-TGAAGT-------------GGCCTTGAAATTGAGAATCATTT--CCTA-ATTTGGAA-TTCGGATATT--GGCA-----T---CACTG----------TTGTTGAG------T---G--GGTAAAGTTTACAACGAGGT----------------------TTTTACACGAAAAGGCCCCTTCTTGGCATACAGGGCGC
gi|26 : AA-AACATAC--AGT--TG---TA-T---TA-------TAC-T-GA--TAGTTAGCCAGAAATCC-GA---TG-caatgaacgggagatttagggaaatagctcctttagtttggtcgtcacttctttgatgaacattttgcatttcttggcaatgcgtttgatagggcctaatcctttgggtgaataggttaatacaagaggaatcctgtcacctttttgtctctgctgtgtttgtactgcataatagttaccgtggtttggccttagccttatccatctggttgctaataaccggtgttatctcctagatggctgaatgcaatttggtcaacgtccctgagtgtcgctatcttgagtcgagttctg
gi|21 : gc---TG-TCTC---T-A-TTTAGTCCAT-TG--T---TTT-GGCA-GT-CA-AA-TTTGGCAATC-AG-TTTGT--GTTCAAT-GATTCT---TC---------TTTGT----CTAATGT------CAGGTG-----ATTGT-CTCTGC-AGTATGGAAATC---CCC-ATA-TTGTCACAA-CAGTG-TTCA---CTTTTGTTGTAG-TGTTC-ACCTACTGGTACAAACA-TA-T
gi|25 : TA-TTGTCAC-A------------------TGTTGTAG-TGTTC-ACCTACTGGTACAAATA-CA-TTTTTGCTGTTG-AT-GGT-CT-GGCGGTG-T-C-
gi|16 : AATG-TCCAC--TTTTTGTTGTAG-TGTTCAACCTACTGGTA-AAACAACA-TTTT-GCTGTTT--T-GGTCTT-GGCGGTGCT-C-ATT-GATGCA--TTCTCTATTTT-TTGTGCACAAT-TCGCCAAT-GAAAT-TGATG--AAACATTACACTTGCATGTGAATCGAAA-TACACTTAATTTTTTAGTTTCACATGTTGAAG
gi|24 : ATTTGGG---AATTCGATTACTGGCATCA-------CTGGCGATGAGTG-GG----CAAAGTTTGCAGCGAG--GTTTTCTgtggccttgaattaaaaaattc
gi|15 : tcatgtcctgaTGCAGGACGAAAGTTCACTTTGTACCAGCATACTTGTACGTTTGATATTAGGAGGTTGCCGGTAAGCAATGACGGGAGGTTTAGGG--------------AATT-G-TCGTC--CTCGTTGAT-AA-CATTTTGCATTTCCTTGGCAATGCGTATGATAGGGCCTAATCCT--GGGTGG-TAGG-TTAATACGA-AAGGAATCCTGTCACCTTCC-TTCTCTGC-TATG-TTGTACTGCAGTAAacacagggcgcaagttatatactttatataaggggttgccgtaagtgaatgaggaaaat
gi|4 : CAATGAACGGGAGATTTAGGGAAATAGCTCCTTTAGTTTGGTCGTCACTTCTTTGATGAA-CATTTTGCATTTC-TTGGCAATGCGTTTGATAGGGCCTAATCCTTTGGGTGAATAGG-TTAATACAA-GAGGAATCCTGTCACCTTTTTGTCTCTGC-TGTGTTTGTACTGCA-TAATAGTTACCGTGGTTTGGCCTTAGCCTTATCCATCTGGTTGCTAA-TAACC-GGT-GTTAT
1 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|13 ): CTTACTGGTGACAACACTTTGTGACTATTGATTGGCTCTTTGTGTTCCCGTGTGCCCTATTCTGATATCTTGCCGTTTCTTCATTTTGATTGCTGTTCGTGTCTTCTCCAATGTACGATGATGTGTGTTTGTCTTCATCAAATACCAAGTTTTTTAGTTTCACAAGTGAACTAGGACTTGTACTTTTGGATTCATTCCTTGACTCTGTGGGATTCTGATGTTGAAAGGCTAGTTCGACTGGCATGAGTGCAA
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 222222 11111111111111 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 111111 1111111 1111 1111111 222222222 111 1111 22222222222 1 111111 111 1111 1 11 11 11111 111 11 111 11 1 11111 111 888888888888888888888888888 111111 1 22222 7777777777777777777 11 777777777777777777 1 222222 222 11 11 1 11 1 11 1 1
lowQualScore : 2 2 111111 66666666 22 1 44 1 555 4444 4 333 2 44444444444444 2 2 4444 22 2 6666666 888888888 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 2 2 444 2 2 44 33 444 33 0 2 4 2 333 333 2 2 666 333 22 4 555 777 55 2 33 2 88888888888 33 7777777 2 2 2 4 2 1 5555 2 2 2 2 888 5 66 5 777777 99 666 2 2 8888 2 33 66 9 2 222222 33 33 2 555 2222222 2 2 2 2 1 33 444 2 555 9 3 3 7 55 2 3 4 4 4 7777 5 5 5 4444444 222222222 000 4444 88888888888 6 88 99 777 5 2 5 000000 5 5 5 4 4 1 4 8 5 5 5 5 555 5 5 0000 5 5 0 11 33 44444 33 000 5 33 000 5 1 3 8 6 1 33 5 1 44444 5 6 111 555555555555555555555555555 999999 99 3 99 6 3 99 00000 8888888888888888888 8 11 222222222222222222 0 0 333333 0 0 6 11 1 1 1 999 1 8 11 8 8 11 8 8 4 2 0 2 22 0 33 2 5 1 1 0 0 0 7 1 2 6
lowQualScore : . . ...... ........ .. . .. . ... .... . ... . .............. . . .... .. . ....... ......... .................................................................................................................. . . ... . . .. .. ... .. . . . . ... ... . . ... ... .. . ... ... .. . .. . ........... .. ....... . . . . . . .... . . . . ... . .. . ...... .. ... . . .... . .. .. . . ...... .. .. . ... ....... . . . . . .. ... . ... . . . . .. . . . . . .... . . . ....... ......... ... .... ........... . .. .. ... . . . ...... . . . . . . . . . . . . ... . . .... . . . .. .. ..... .. ... . .. ... . . . . . . .. . . ..... . . ... ........................... ...... .. . .. . . .. ..... ................... . .. .................. . . ...... . . . .. . . . ... . . .. . . .. . . . . . . .. . .. . . . . . . . . . . .
lowQualScore : 5 4 222222 99999999 66 9 55 9 222 0000 0 555 0 55555555555555 0 0 2222 88 0 5555555 000000000 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 5 5 444 5 4 00 22 111 22 2 4 7 4 999 999 2 2 111 999 99 2 888 666 33 2 11 1 00000000000 11 6666666 4 2 2 7 4 9 3333 5 7 7 5 888 0 33 3 555555 99 111 9 9 9999 9 99 88 0 9 555555 99 99 9 000 1111111 9 9 9 9 2 11 777 9 444 2 1 3 3 00 1 6 0 0 0 3333 0 0 7 6666666 999999999 000 2222 00000000000 7 33 22 555 7 0 0 999999 0 0 6 4 4 1 4 9 0 0 0 0 666 0 0 6666 0 0 0 99 66 33333 11 000 7 66 000 7 4 9 4 6 4 66 7 4 33333 7 7 777 222222222222222222222222222 222222 22 2 22 7 3 22 00000 4444444444444444444 0 00 888888888888888888 0 8 000000 8 8 7 22 8 0 0 666 4 0 00 0 0 00 0 0 0 0 0 5 00 0 22 5 3 0 0 7 7 7 3 0 3 7
consensus : NAATGTT-CAC-AAAAGT--AGTATA--------CATATG--C-A--CGGT-G---TT----TG-TA---C-AA--------------C-AA-T----T--A-GA-------GC---------CAT-----------CTAAG-------GT-G---T-G------G-------------------GTG--------------C---------A--------------G-T----------AA-T-T---GG-TAA-CA-CA--GT---C--CAACA-AT-T-TA---GCA---T-A-G---G---TGA--GAG-G---TAAA--TTT--GCAG-A--A-TG-TT--------T--A-------T-ACAACA-ATT-A-AG-ACAATT----AAGTAG-GAT-TAG-C-ATA---GGC-TTC--A-AG-----TGCA-TG-C-AC-ATG-TA----TTG-GTAAA--TAGG--AGCAA-A-----NTATAC--AGTTGT--A-A---TA-------TA-C-T-AATAGTTAG-CCAGAAATCCG-A---TG-TCTC---TA-TTTA-GTCCAT-TG-TTT--TTGC-AGT-CA-AA-TTTGGCAATCA-G--TTT-T-GTTCAGT-GA---C---TC---------TT---TGT----CTAATGTC--GG--GTA--ATTGTC-CCTGTAAGTATGGATA--CCCGCATA-TTGTCACAACAATG-TCCA-T-TTTTG-TTGTAG-TGTTCA-CCTACTGGT-ACAAACA-CA-TTTT-G-CTGTTG-AT-GG---TCT-G-G----CG-GTG-T-C--ATT--GAT-----GCGGTTTCTTNNTTTT---T-G--GCACGT---T-TCTCCAATGTAACATGATGGAACATAACACT-GCAT-TGA-----ATC-AAATACACACAATTTTTTAGTTTCACATG-TGA---AG------------TGGCCTTGA------AAT------TCATTTCCT--GAATT--TGG-AATT-CGGATATT--GGCA-----TCACTGGC---------TTTGGNG---AATG-GG--GGCAAAGTTTGCAGCGAGNTCTTTTCTTTCTTTT--TTTTTTTTTTACAAGGAAAGGTCCC-TCTTGGCATGCAGGGCGCAAGTTCACTATGTACCAGCATAC------GTTTGATATTAGGAGGTTGCCGGTAAGC-AATGACGGGAGGTTTAGGGGAAATAGCTCCTTTAGTT-GGTCGTC--CTCGTTGAT-AA-CATTTTGCATTTCCTTGGCAATGCGTTTGATAGGGCCTAATCCT--GGGTGA-TAGG-TTANTACAA-GAGGAATCCTGTCACCTTCT-GTCTCTGC-TGTG-TTGTACTGCAGTAATAGTT-CCGTGGTTTGGCCTTAGCTTTATCTATCTGGTTGTTAATTAAACCGGTGGTTAT
Reference ( family-1618 ) : NAATGTT-CAC-AAAAGT--AGTATA--------CATATG--C-A--CGGT-G---TT----TG-TA---C-AA--------------C-AA-T----T--A-GA-------GC---------CAT-----------C-----------GT-G---T-G------G-------------------GTA--------------C---------A--------------G-T----------AA-T-T---GG-TAA-CA-CA--GT---C--CAACA-AT-T-TA---GCA---T-A-G---G---TGA--GAG-G---TAAA--TTT--GCAG-A--A-TG-TT--------T--A-------T-ACAACA-ATT-A-AG-ANAATT----AAGTAG-GAT-TAG-C-ATA---GGC-TTC--A-AG-----TGCA-TG-C-AC-ATG-TA----TTG-GTAAA--TAGG--ACCAA-A-----ATATAC--AGTTGT--A-A---TA-------TA-C-T-AATAGTTAG-CCAGAAATCCG-A---TG-TCTC---TA-TTTA-GTCCAT-TG-TTT--TTGC-AGT-CA-AA-TTTGGCAATCA-G--TTT-T-GTTCAGT-GA---C---TC---------TT---TGT----CTAATGTC--GG--GTA--ATTGTC-CCTGTAAGTATGGATA--CCCGCATA-TTGTCACAACAATG-TCCA-T-TTTTG-TTGTAG-TGTTCA-CCTACTGGT-ACAAACA-CA-TTTT-G-CTGTTG-AT-GG---TCT-G-G----CG-GTG-T-C--ATT--GAT-----GCGGTTTCTTNATTTT---T-G--GCACGT---T-TCTCCAATGTAACATGATGGAACATAACACT-GCAT-TGA-----ATC-AAATACACACAATTTTTTAGTTTCACATG-TGA---AG------------TG-------------AAT------TCATTTCCT--GAATT--TGG-AATT-CGGATATT--GGCA-----TCACTGGC--------TTTTGGGG---AATG-GG--GGCAAAGTTTGCAGCGAGTT------TTTCTTTT--TTTTTTTTTTACAAGGAAAGGTCCC-TCTTGGCATGCAGGGCGCAAGTTCACTATGTACCAGCATAC------GTTTGATATTAGGAGGTTGCCGGTAAGC-AATGACGGGGGGNTTNGGGGANATAGCTCCTTTAGTT-GGTCGTC--CTCGTTGAT-AA-CATTTTGCATTTCCTTGGCAATGCGTTTGATAGGGCCTAATCCT--GGGTGA-TAGG-TTAATACGA-GAGGAATCCTGTCACCTTCC-GTCTCTGC-TGTG-TTGTACTGCAGTAATAGTTACCGTGGTTTNGNCTTAGCCTTATCCATCTGGTTGCTAATTAANCTGGTGGTTAT
gi|1 : GTT-CACCAAAAGTGTAGTATA--------CATATG--C-A--CGAT-T---CT----TG-TA---C-AC--------------A-AA-T----T--A-GA-------GC----------AT-----------------------GT-G---T-A------G-------------------GTA--------------C---------A--------------G-T----------AAAT-T---GG-TAAACA-AA--GT---C--CCACA----T-TA---GCA---T-A-G---G---TGA--GAG-G---TA----TTT--GCAG-A--A-TG-TT--------T--AAAAAAAAT-ATAGAA-AAT-A-AG-AAAATT----AAGTAT-GAT-TAG-C-ATA---GGCCTTA--A-AA-----TGCAATG-C-AC-ATG-CAA---TTG-GGAAA--TAGGT-ACTAA-A-----ATATAT--CGTTGT--ACA---TA-------TG-C-T-AATAGTTAG-CCAGAAATCCA-A---TG-TCT----TA-TTTA-G-CCAT-TG-TTT--T-GC-AGT-CA-AA-TTTGGCAATCAAG--TTT-T-GTTCAGT-GA---C---TC---------TT---TGT----CTAAT-TC--GG-------ATTGTAACTTGTAAGTATGGATA--CC-G-ATA-TTGTCACA-CAATG-TCCA-T-TT--G-TTGTAG-TGTT-A-CCTACTGGT-ACAAA-A-TA-TTTT-G-CTGTTG-AT-AGGT-TCT-G-G----CG-GTG-T-C--ATT--GAT-----GCGGTTTCTTTATTTT---T-G--GCACGT---T-TC--CAAAGTA-CATGATGGAACATA-CACT-GCAT-TGA-----ATC-AAATA-ACACAATGTTTTTGTTTCACATG-TGA---AG------------TG-------------AAT------TCATTTCCT--GAATT--TGG-AATTTCGGATATT--GGCA-----TCA-TGGC--------ATTTGGG----AATGTGG--GGCAGAATTTGCAGCGAATTCTTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTACAAGGAAAGGTCCC-TCTTGGCATGCAGGGTGCAAGTTCACTATGCAGCAGCATAC------GTTTGATATTAGGATGTTGCCGGT-AGC-AATG-TGGGAGGTTTAGGG---ATAGTTCCTTTAGTT-GGTT-TC--CTCGTTGAT-AATCATTTTGCATTTCCTTGGCAATGCGTTTGATAGGTGCTAAATCT--GACTGA-TAGGTTTATTACAATGAGGAATCCTGTCA-CTTCT-GTCTCTGCTTGTG--GGTACTGCAGTAATAGTT-CCGTGGTTTTGGCTTAGCTTTATCTATCTGGTTGTTAATTAAACTGGTGGTTAT
gi|10 : ATGTT-CAT-AAAA----AGTA-A--------CATAT---C-A---GGT-G---TT-----G-TA---T-G---------------C-AA-T----T--A-GA-------GC---------CAT-----------TAGGGTTGCT--GT-G---T-G------GCTTCAA-------------GTG--------------C---------ATGTTAG--------G-T----------AA-T-----GG-TAA-CA-CA--GT---A--CAAAC-AT-T-TA---G-A---TCA-G---G---TGA--GAG-G---TAAA--TTTTGGCAG-A--A-TG--T--------T--A-------T-ACACCACATT-A-AGAACAATT----AAGT-G-GAT-TAG-C-ATA---GGC-TTC--A-AA-----GCCA-GG-T-AC-ATG-TA----TTG-GT-AA--TAGA--AGC---A-----TTATAC--GGTAG---A-A---TA-------GA-C-T-AA-AG-TAGTCCAAAAATCCA-A---TG-TCT----TACTTTA-GTCCAT-TGTTTT--TTGC-Aatattgcactaggacctgtctgtaaggaatgtccaaggctaacgttgctggcctgttgcaaaattaagtcgttctg
gi|11 : atctATGTT-CAC-TAGAGT--A---TA--------CATATG--C-A--CGAT-G---TT----TG-TA---C-AA--------------C-AA-T----T--A-GA-------GC---------CAT-----------CTAAGGACT---GT-GATAT-G------GCTTCAA-------------GTG--------------C---------AATGTGTAG------G-T----------AG-T-T---GG-TAA-CA-----GT---C--CAACA-GT-T-TA---GGA---T-A-G---G---TGA--GAG-A---TAAA--TTT--GCAG-A--A-TG-TT--------T--A-------T-ACAACA-ATT-A-AG-AAAATT----AAGTAT-GAT-AAG-C-ATA---GGC-TTC--A-AG-----TGCA-TG-C-AC-ATG-CA----TTG-GTAAA--TAGG--AGCAA-A-----A-ATAC--AATTGC--A-A---TA-------TA-C-T-AATAGTTAG-CCAGAAATCCA-A---TG-TCTC---TA-TTTA-GTCCc
gi|12 : gccattc--AGTATA--------CATATT--C-A--CAGT-G---TT----TG-TA---C-AA--------------C-AA-T----T--A-GT-------GT---------CAT-----------CTAAAGGTTGTGGT-G---T-G------G-------------------CTT--------------C---------AACTGCCATGTGTAGG-T----------AA-T-T---GG-TAA-CA-CA--GT---C--CAATA-TA-T-TA---GCA---T-A-G---A---TGA--AAG-G---TAAA--TTT--GCAG-A--A-TG-TT--------T--A-------T-ACAACA-ATT-A-AG-GCAATT----AAGTAA-GAT-TAG-C-ATA---GGC-TTC--A-A------TGCA-GG-T-AC-ATG-TA----TTG-GTAAA--TAGG--AGCAA-A-----TTTAAC--AGTTGT--A-A---TA-------TA-C-T-AATAGTTAG-CCAGAAATCCG-A---
gi|13 : aa-CTTACTGGTGACAA-CA-CT-TTGT-GACTATTG-ATTGGCTCTTT-GTGTTCCCGTGTG-C-CCTATTCTGATATCTTGCCGTTTCTTCATTTTGATT-GCTGTTCGTGTCT-TCTCCAATGTACGATGATG-----------T-GTGT-TTGTCTTCATC-AAATAC-CA-AGTTTTTTAGTTTCACAAG-TGAACTAGGACTTGTACTTTTG-------------GAT------TCATTCCTT--GACTCTGTGG-GATT-CTGATGTT--G
gi|14 : GTT-CAC-AAGAGT--A---TA--------TATATG--C-A--CGAT-G---TT----TG-TA---C-AA--------------C-AA-T----T--A-GA-------GC---------CAC-----------C-----------aaaggctagttcgactggcatgagtgcaa
gi|14 : agcaaatcaaA--GAGTA---TATA--TAT--GCAC-G--A-TG-TT--------T--G-------T-ACAACA-ATT-AGAG-CCACCT----AAG--G-GTTGTGG-T-ATT---AGC-TTC--A-AG-----TGCtaagggttgtggtattagcttcaagtgccatttaagaaatttaagtgggattagcgtaggcttcaagtgcatgtacatgtattggtaaataggatcaaactatatagttgtaatatacaatgtactaatagttagccggaaatccgaagtctccatttagtccat
gi|14 : agcaaatcaagttcacaCA-TTT-A-AG-AAATTT----AAGTGG-GAT-TAG-C-GTA---GGC-TTC--A-AG-----TGCA-TG-T-AC-ATG-TA----TTG-GTAAA--TAGG--ATCAA-A-----CTATAT--AGTTGT--A-A---TATACAATGTA-C-T-AATAGTTAG-CCGGAAATCCG-A---AG-TCTC---CA-TTTA-GTCCAT-catttaagaaatttaagtgggattagcgtaggcttcaagtgcatgtacatgtattggtaaataggatcaaactatatagttgtaatatacaatgtactaatagttagccggaaatccgaagtctccatttagtccat
gi|15 : agcaaatcaagttcacaagagtatatatatgcacgatgtttgtacaacaattagagccacctaagggttgtggtattagcttcaagtgcTGCAGGACGAAAGTTCACTTTGTACCAGCATACTTGTACGTTTGATATTAGGAGGTTGCCGGTAAGC-AATGACGGGAGGTTTAGGGAA--------------TT-G-TCGTC--CTCGTTGAT-AA-CATTTTGCATTTCCTTGGCAATGCGTATGATAGGGCCTAATCCT--GGGTGG-TAGG-TTAATACGA-AAGGAATCCTGTCACCTTCC-TTCTCTGC-TATG-TTGTACTGCAGTAA
gi|16 : AATG-TCCACT-TTTTG-TTGTAG-TGTTCAACCTACTGGT-A-AAACAACA-TTTT-G-CTGTTT--T-GG---TCTTG-G----CG-GTGCT-C--ATT--GAT-----GCA--TTCTCTATTTT---TTGT-GCACAA---T-TCGCCAATGAAAT-TGATGAAACATTACACTTGCATGTGA-----ATCGAAATACACTTAATTTTTTAGTTTCACATGTTGA---AG------------
gi|17 : ATGTTTCAT-AAAAGT--A---TA--------CATATG--AGA--AGATAG---ATATAATGCTA---T-AA----------------AA-T----T--A-GA-------GCATTAAGGGTTGT-----------G-----------GT-G---T-G------GCTTCAA-------------GTG--------------CCCTGTTGTAG--------------G-T----------AA-T-T---GG-TAA-CA-CA--GT---CAACAA-A-AT-A-TATAGGCA---T-A-A---GAGATGA--GAA-GAGATAA---TTT--GCAG-A--A-TG-TT--------T--A-------T-ACAA-A-ATTAA-AG-ACAATT----AAGTAG-Ggtggccttgaattaaaaaattc
gi|18 : aagcaatcGTATA--------CATATG--C-AT-CATT-G----T----TG--A---C-AAAC------------C-AA-T----T--A-GA-------GC---------CAC-----------CTAAG-------GG-G---T-T------G-------------------GTA--------------T---------A--------------G-
gi|18 : gcaaatccatgtttatagg-TG-TT--------G--A-------C-AAACCA-ATT-AGAG-CCACCT----AAG--G-GGT-TGG-T-ATA---GGC-TTCCTC-AG-----TG---TGCC-ACAATG-TA-----AG-GTAAA--TGGT--ACgcttcctcagtgtgccacaatgtaaggtaaatggtacagtctatcatgagtaaggtaaaaaatgataacaataatgtcccttaattaacatacgatgagagtaaatttcgcagaatgttttt
gi|18 : gcaaatccatgtttatagggtatacatatgcatcatC---------TAT-----------C-----------AT-G---A-GTAA---G-------------------GTA--------------A---------A---------------------------AA-A-T---GA-TAA-CAATAATGT---C--CCTTA-AT-T--A---ACA---T-ACG---A---TGA--GAG-----TAAA--TTTC-GCAG-A--A-TG-TT--------T--agtctatcatgagtaaggtaaaaaatgataacaataatgtcccttaattaacatacgatgagagtaaatttcgcagaatgttttt
gi|19 : gcaaatccatgtttatagggtatacatatgcatcattgttgacaaaccaattagagccacctaaggggttggtataggcttcctcagtgtgccacaatgtaaggtaaatggtacagtATGTT-GAC-AAGAGT----T-TA--------CCTATG--C-A--CGAT-G---TT----TG-TA---C-AA--------------C-AA-T----T--A-GA-------GC---------CAT-----------CTAAGG------GTTG---T-G------GTATTGTCTTCAAATTCCATGTG--------------T---------A--------------GGT----------AA-T-T---GG-TAA-CA-CA--GT---C--CAACA-GT-T-TA---GGA---T-G-A---G---TGA--GAG-G---TACA--TTT--GCAG-A--A-TG-TT--------T--A-------T-ATAATA-ACT-tt
gi|2 : agcaaatcAATGTT-CAC-AAAAGTT-AGTATA--------CATATG--C-A--CGAT-G---TT----TG-TA---C-AA--------------C-AA-T----T--A-GA-------GC---------CAT-----------------------GT-G---T-A------G-------------------GTA--------------C---------A--------------G-T----------AA-T-T---GG-TAA-CA-CA--GT---C--CAACA-AT-T-TA---GCA---T-A-G---G---TGA--GAG-G---TAAA--TTT--GCAG-A--A-TG-TTAAAAAAAAT--A-------T-AGAACA-ATT-A-AG-AAAATT----AAGTAT-GAT-TAG-C-ATA---GGC-TTA--A-AG-----TGCA-TG-C-AC-ATG-CA----TTG-GGAAA--TAGG--ACTAA-A-----ATATAC--AGTTGT--A-A---TA-------TG-C-T-AATAGTTAG-CCAGAAATCCA-A---TG-TCTC---TA-TTTA-GCCCAT-TG-TTT--T-GC-AGT-CA-AA-TTTGGCAATCA-G--TTT-T-GTTCAGT-GA---C---TC---------TT---TGT----CTAATGTC--GG-------ATTGTA-CTTGTAAGTATGGATA--CC-G-ATA-TTGTCACA-CAATG-TCCA-T-TTGTG-TTGTAGCTGTT-A-CCTACTGGT-A-AAACA-TA-TTTT-G-CTGTTG-AT-GG---TTC-G-G----CG-GTG-T-C--ATT--GAT-----GCGGTTTCTTTATTTT---T-G--GCACGT---TGTCTCAAA-GTAACATGATG--ACATAACACT-GCATCTGG-----ATC-AA-TACACACAATGTTTTTGTTTCACATG-TGA---AG------------TG-------------AAT------TCATTTTCTCTGA-TT--TGG-AATTTCGGATATTTGGGCAAAATCCCACTGGCCCCAAAAATTTTGGGGGGGAATG-GG--GGCAGAGTTTGCAGCGAATTCTTTTCTTTCTTTT--TTTTTTTTTTACAAGGAAAGGTCCC-TCTTGGCATGCAGGGTGCAAGTTCACTATGCAGCAGCATAC------GTTTGATATTAGGATGTTGCCGGTAAGC-AATGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTCCTTTAGTT-GGTTGTC--CTCGTTGAT-AA-CATTTTGCATTTCCTTGGCAATGCGTTTGATAGGGCCTAATCCT--GGATGA-TAGG-TTATTACAA-GAGGAATCCTGTCACCTTCT-GTCTCTGC-TGTG-TTGTACTGCAGTAATAGTTCCCGTGGTTTGGCCTTAGCTTTATCTATCTGGTTGTTAATTAAAC-GGTGGTTATcctaaataagtatcgaataaagat
gi|20 : tA-CA--A--AT---C--CAGAA-ATATATA---GCA---T-G-G---G---TGA--GGG-GG--TA----TTT--GCAGGA--A-TG-TC--------TTAA-------T-AAAA-G-ATT-A-AC-GAAATT----AAGTAG-GAT-TAG-CAATA---GGC-TT
gi|21 : tccggtgtttgttaattgatgagcatctaagggatttgatgtgtgtggcttgtaacgtgacatgtgttaggtatgagag---TG-TCTC---TA-TTTA-GTCCAT-TG-TTT--TGGC-AGT-CA-AA-TTTGGCAATCA-G--TTTGT-GTTCAAT-GA---T---TC---------TTCTTTGT----CTAATGTC--AG--GTG--ATTGTC-TCTGCA-GTATGGAAA--TCCCCATA-TTGTCACAACAGTG-TTCA-C-TTTTG-TTGTAG-TGTTCA-CCTACTGGT-ACAAACA-TA-Taa
gi|22 : -AAAAAA--AGTA-A--------CATATG--C-A--ATGA-G---TT----C--TA---C-AA--------------C-AA-T----TGGA-GA-------GC---------CAT-----------CTTGG-------GT-G---TTGT-----G-------------------GTATGGCCTTCAAGTGCC---------ATTTATAG-------G-T----------AA-T-T---GG-AAA-CA-CA--GT---C--CAATG-GT-T-TA---G-A---T-A-G---G---TAA--GAA-G---
gi|23 : aagcgcaatcatttcaccaaaaaaaaaATGCT-CAT-AAAAGT--A-TA-A--------CATATG--C-A--CGGT-G---TT----TG-T----C-AA--------------C-A-------T--AGGA-------GC---------CAT-----------C------------T-A---T-G------G-------------------GTT--------------C---------T--------------G-T----------CA-TAT---GG-C-----------T---T--CA--A-AT-T------GCA---T-G-T---G---T-----AG-G---TAAAATTTT--GCAA-A--A-AG-C-----------------------CAACA-GTT-T-AG-Aaag
gi|24 : cc------TCATGTCCT--GAATT--TGGGAATT-CGATTACT--GGCA-----TCACTGGC------------GATG---AGTG-GG----CAAAGTTTGCAGCGAGGT------TTTCTataggttgagagagta
gi|24 : CAGGGCGCAAGT----TATATAC---------------TTT-ATATAAGG-GGTTGCC-GTAAGTGAATGAacacagggcgcaagttatatactttatataaggggttgccgtaagtgaatgaggaaaat
gi|25 : tcatgtcctgaatttgggaattcgattactggcatcactggcgatgagtgggcaaagtttgcagcgaggttttctacaTA-TTGTCACA-----------------TG-TTGTAG-TGTTCA-CCTACTGGT-ACAAATA-CATTTTT-G-CTGTTG-AT-GG---TCT-G-G----CG-GTG-T-C--ggaaaat
gi|26 : CAA-A-----ACATAC--AGTTGT--A-T---TA-------TA-C-T-GATAGTTAG-CCAGAAATCCG-A---TG-
gi|27 : gATGTT-CAC-AAACGT--A---TA--------CATATG--C-A--CGGT-G---TT----T
gi|28 : gaagcaaatcTGTT-CAC-AAAAGT--A---TA--------CATATG--C-A--CGGT-G---T
gi|29 : caaatcATGTT-CAC-AAA-----AGTATA--------CATATG--
gi|3 : ctgaagcaaatcAATGTT-CAC-AAAAG----GTATATTTAAAAACATATGGCT-AATTGAT-GA--TT----TG-TAATAC-AAACGTATTTGGCATTC-AA-TGTGTT--A-GT-------GC---------CAG-----------------------GT-G---T-T------G-------------------TTG--------------A---------G--------------G-G----------AA-T-TTATGG-TAA-CA-CA--GTGTTC--CA-CAGATAT-TA---GCAAAAT-A-GCCAG---TGAAGGAGTG---TAAA--TT---GCGA-A--G-TA-TA--------T--A-------TTACAACA-ATA-A-CG-AAAATT----AAGTAGCGAT-TAG-C-ATA---GTCCTTC--ACAGGTCTATGCAATG-CTAC-ATG-TA----TTGAGTAAAAATAGGGAAGTAACA-----ATATAC--AGTTGT--A-AGAATA-------TA-CCT-AATAGTTAG-CCGAGAATCCA-AAAGTG-TCTTACTTA-TTTA---TCAT-CG-TCTCTTTGC-AGTTCACAA-TTTGGCAATCA-G--TTT-TTGTTCAGCCGA---T---TCATCTATCTATT---TGTAAATCTAATGTTCTAGCCGTA---TTGTC-CCTGTA-GTATGGATATACCCGCATA-TTGTCACAACAAT----------------TGTAG-TGTTCA-CCTACTGGT-ACAAACA-CA-TTTTTA-ATGTTG-AT-GG---TCT-G-G----CG-GTG-T-CC-ATT--GAT-----GCGGCTTCTTATTTTC---T-G--CCACTT---T-TCTCCAATGTA-CATGATGGAACATA-CACT-GCAT-TGA-----ATC-AAATACACACAATTTTT-AGTTTCACATG-TGA---AG------------TGGCCTTGAATTGAGAAT------TCATTTCCT--GAATT--TGT-AATT-CGGACATT--GGCA-----TCACTGGC-------------------AATG-AGTCGGCAAAAATTGCAGCGAGGG------TTT-------TTTTTTTTTTACAAAGAAAGGTCCC-TCTTGGCATGCAGGGCGCAAGTTCACTATGTACCAGCATAC------GTTTGATATTAGGAGGTTGCCGGTAAGC-AATGACGGGAGGTTTAGGG--AATAGCTCCTTTAGTT-GGTCGTC--CTCGTTGAT-AA-CATTTTGCATTTCCTTGGCAATGCGTTTGATAGGGCCTATTCCT--GGGTGA-CAGG-TT
gi|30 : caaatc---GCA---T-A-G---A---TGA--AAG-G---TAAA--TTT--GCAG-A--A-TG-TT--------
gi|4 : -ATA---GGC-TTC--ATAG------GCA-TG---AG-ATGATAAGTCTTC-GTAAA--TAGG--AGCAA-A------TATAC--AATTGT--A-A----A-------TA-C-C-AATAGTTAG-CCAGAAATCCA-A---TG-TCTC---AATTTTA-GTCCATGTGTTTT--TTAC-AGT-CA-AATTTTGGCAATCA-GA-TTT-T-GTTCCGT-GACTCC---TC---------TT---TGT----CTAATGTC--AA--GTAATATTGTC-TCTGTAAATATGGATA--CCCGCATACTTGTCACAACAATGCTCCA-TCTTTTGTTTGTAG-TGT---------------CAAACA-CA-TTTT-G-CTGTTGAAT-GG---TCT-G-G-----G-GCG-TCC--ATTG-GAT-----GCGGTTTCTTATTTTT---T-G--GTACGT---T-TCTCC-ACGTAAAATGCT-GAAC--AACACT-GCAT-TGA-----ATC-AAATACACACAA-TTCTTAGTTTCACATG-TGA---AG------------TGGCCTTGA------AATTGAGAATCATTTCCT---AATT--TGG-AATT-CGGATATT--GGCA-----TCACTG------------TTGTTG---AGT---G--GGTAAAGTTTACAACGAG----------------------GTTTTTACACGAAAAGGCCCCTTCTTGGCATACAGGGCGC
gi|4 : C-AATGAACGGGAGATTTAGGGAAATAGCTCCTTTAGTTTGGTCGTCACTTCTTTGATGAA-CATTTTGCATTTC-TTGGCAATGCGTTTGATAGGGCCTAATCCTTTGGGTGAATAGG-TTAATACAA-GAGGAATCCTGTCACCTTTTTGTCTCTGC-TGTGTTTGTACTGCA-TAATAGTTACCGTGGTTTGGCCTTAGCCTTATCCATCTGGTTGCTAAT--AACCGGT-GTTATcaatgaacgggagatttagggaaatagctcctttagtttggtcgtcacttctttgatgaacattttgcatttcttggcaatgcgtttgatagggcctaatcctttgggtgaataggttaatacaagaggaatcctgtcacctttttgtctctgctgtgtttgtactgcataatagttaccgtggtttggccttagccttatccatctggttgctaataaccggtgttatctcctagatggctgaatgcaatttggtcaacgtccctgagtgtcgctatcttgagtcgagttctg
gi|5 : ataggcttcataggcatgagatgataagtcttcgtaaataggagcaaatatacaattgtaaataccaatagttagccagaaatccaatgtctcaattttagtccatgtgttttttacagtcaaattttggcaatcagattttgttccgtgactcctctttgtctaatgtcaagtaatattgtctctgtaaatatggatacccgcatacttgtcacaacaatgctccatcttttgtttgtagtgtcaaacacattttgctgttgaatggtctggggcgtccattggatgcggtttcttattttttggtacgtttctccacgtaaaatgctgaacaacactgcattgaatcaaatacacacaattcttagtttcacatgtgaagtggccttgaaattgagaatcatttcctaatttggaattcggatattggcatcactgttgttgagtgggtaaagtttacaacgaggtttttacacgaaaaggccccttcttggcatacagggcgcATGTT-CAC-AAAAGT--A---TA--------CATATG--C-A--CGGT-G---TT----TG-TA---C-AA--------------C-AA-T----T--A-GAATTTAGAGC---------CAT-----------CTAAGGGTTGT-GT-G---T-G------GCTTCAA-------------GTG--------------CCACGTGTA-G--------------G-T----------AA-T-T---GG-TAA-CA-CA--GT---C--CAACA-AT-T-TA---GCA---T-A-G---G---TGA--GAG-G---TAAA--TTT--GCAG-A--A-TG-TA--------T--A-------T-ACAACA-ATT-A-AG-ACAATTTTAAAAGTAG-GAT-TAG-C-ATA---GGC-TTC--A-A------TGCA-GG-T-AC-ATA-TA----TTG-GTAGA--TAGG--AGCAA-A-----TTATAC--AGTAGT--A-A---TA-------TA-A-T-AATAGTTAG-CCAGAAATCCA-A---TT-TTTC---TA-TTTA-GTCCAT-TG-TTT--TTGC-AGT-AA-AA-TATGGCAATCA-AT-TTT-T-GTTCAGT-GA---CTCTTC---------TT---TGT----CTAATGTC--AG--GTA--ATTATC-CCTGTAA-TATGGATA--CCCGCATA-TTGTCACAACAATG-TCCA-C-TTTTG-TTGTAG-TGTTCA-CCTACTGGT-ACAAACA-CATTTTT-G-CTGTTG-AT-GG---TCT-G-G----CG-GTG-TCC--ATT--GAT-----GCGGTTTCTTATTTTT---T-G--GCACGT---T-TCTCCAATGT-ACATGATGGAACAT-ACACT-GCAT-TGA-----ATC-AAATACACACAATTTTTctcctagatggctgaatgcaatttggtcaacgtccctgagtgtcgctatcttgagtcgagttctg
gi|6 : caaatcTATT-AAC-AAAAGT--A-T-TA--------CATATG--C-A--CGAT-G---CT----TGTTA---CAAA--------------CAAA-T----T--A-G--------GT---------CAT-----------CTAA--------GT-GT--T-G------T-------------------ATA--------------C---------A--------------
gi|6 : -A--CAGT-GACATT----TG-TA---C-AA--------------C-AA-T----T--A-GA-------acccttagagatgggagcgtctaattgttgtacaaatgtcactgtaggtaattggtaacatagtccaacagtttgcatagtgagaggtaattgcagagaatggtttatacaacaattaagacaattaatagattagcatattaggcttcaagtgcagtgcacatgtattggtaaataggagcaaactagcatacacggagtagtgaaataatagctgaatagttagccaaaatccaagtctctaatttagtccattgtttttgcagtcaaatttggcaat
gi|6 : tattaacaaaagtattacatatgcacgatgcttgttacaaacaaattaggtcatctaagtgttgtatacaacccttagagatgggagcg--------------G-T----------AA-T-T---GG-TAA-CA-TA--GT---C--CAACA-GT-T-T----GCA---T-A-G-------TGA--GAG-G---TAA----TT--GCAG-AGAA-TGGTT--------T--A-------T-ACAACA-ATT-A-AG-ACAATT----AA-TAG--AT-TAG-C-ATATTAGGC-TTC--A-AG-----TGCAGTG-C-AC-ATG-TA----TTG-GTAAA--TAGG--AGCAA-ACTAGCATACACGGAGTAGTGAA-A---TAA------TAGC-TGAATAGTTAG-CCA-AAATCCA-A----G-TCTC---TAATTTA-GTCCAT-TG-TTT--TTGC-AGT-CA-AA-TTTGGCAATaggtaattggtaacatagtccaacagtttgcatagtgagaggtaattgcagagaatggtttatacaacaattaagacaattaatagattagcatattaggcttcaagtgcagtgcacatgtattggtaaataggagcaaactagcatacacggagtagtgaaataatagctgaatagttagccaaaatccaagtctctaatttagtccattgtttttgcagtcaaatttggcaat
gi|7 : tattaacaaaagtattacatatgcacgatgcttgttacaaacaaattaggtcatctaagtgttgtatacaacccttagagatgggagcgtctaattgttgtacaaatgtcactgtagATGT--CAC-AAAA----AGTATA--------CATATG--C-A--CGGT-G---TT----TG-TA---C-AA--------------C-AA-T----T--A-GA-------GC---------CAT-----------CTAAG-------AT-G---T-G------G-------------------CTC--------------CA--------A--------------G-TGCCATGTGTAAA-T-T---GGTTGA-CA-CA--GT---C--CAACA-AT-T-TA---GCA---T-A-G---G---TGA--GAG-G---TAAA--TTT--GCAG-A--A-TG--T--------T--A-------T-ACAAC-------------AATT----AAGTAG-GAT-TAGAG-ATA---GGC-TTCA-A-AG-----AGC---G-T-AC-ATG-TA----TTG-GTAAA--TAGG--AGC---A-----ATATAC--AGTTGT--A-A---TA-------CA-C-T-AATAGTTAG-CCACAAACCCGAA---TG-TCTC---TA-TTTA-GTCCAT-TG-TTT--TTGC-AGT-CA-AA--TTGGCAATCA-A--TTT-T-TCTTAG
gi|8 : caaatcAAAGT--A-T-TA--------CATATG--C-A--CGAT-G---CT----GG-TA---C-AA--------------C-AATT----T--A-GA-------GT---------CAT-----------CTAA--------GT-G---T-G------gattatccgtagatttaaagtccaagtag
gi|8 : tattatTA--------CCTACA--C-G--TGAC-A---TT----TG-TA---C-AA--------------C-AA-T----T--A-GA------------------CAT-----------CTAAGG------GT-G---T-G------tatatcacacccttagatgtctaattgttgtacaaatgtcacgtgtaggtaattggtaacatagtccaacagtttagcataggtgagcggtaattgcagaaatggtttatacacaattaagacaattaagtaggattagcatattaggcttcaagtgcatgcacatgtattggtaaataggagcaaactatacagtagtaatatactaatagttagccagaaatccaatgtctctatttagtccattgtttttgcagtcaaatttggcaatca
gi|8 : tattataaagtattacatatgcacgatgctggtacaacaatttagagtcatctaagtgtgtatatT----TG-TA---C-AA-----------------A-T------------------GT---------CA------------C-----------GT-G---T-A------G-------------------GTA-----------------------------------------------------A-T-T---GG-TAA-CA-TA--GT---C--CAACA-GT-T-TA---GCA---T-A-G---G---TGA--GCG-G---TAA----TT--GCAG-A--AATGGTT--------T--A-------T-ACA-CA-ATT-A-AG-ACAATT----AAGTAG-GAT-TAG-C-ATATTAGGC-TTC--A-AG-----TGCA-TG-C-AC-ATG-TA----TTG-GTAAA--TAGG--AGCAA-A-----CTATAC--AGTAGT--A-A---TA-------TA-C-T-AATAGTTAG-CCAGAAATCCA-A---TG-TCTC---TA-TTTA-GTCCAT-TG-TTT--TTGC-AGT-CA-AA-TTTGGCAATCA-attggtaacatagtccaacagtttagcataggtgagcggtaattgcagaaatggtttatacacaattaagacaattaagtaggattagcatattaggcttcaagtgcatgcacatgtattggtaaataggagcaaactatacagtagtaatatactaatagttagccagaaatccaatgtctctatttagtccattgtttttgcagtcaaatttggcaatca
gi|9 : tattataaagtattacatatgcacgatgctggtacaacaatttagagtcatctaagtgtgtatatcacacccttagatgtctaattgATGTT-C-C-TAAAGC----TATA---------AT-TG--C----CGGT-G---TT----TA-TT---T-AA--------------C-AT-G----T--A-GA-------GC---------CATTAAGGGTTGTGC-----------TT-G---T-GCTTCCTGCCT----------------GTG--------------T---------A----------------T----------AA-T-----GG-TA--CA-CA--GT---C--CAACC-AT-T-CA---GCA---T-A-GT--G---TGA------G---TAA----TT--CCAG----A-TGCTT--------T--A-------T-CCAACC-ATT-A-AG-ACAATT-----AGTA--GAT-TCG-C-CT----GGC-TTC--A-AG------GGA--G-T-AC-ATG-TA----TT--GTAA----GGG--AGCAC-T-----TTATAC--A-TTTT--A-A---T--------TA-C-T---TAGTTAG-CCA-AAAT-CG-A---TGCTCTC---T--TTTAGGTCC-T-TG-TTT--TTGCAAGT-C--GA-TT--GC-ATCA-ATTTTT-T-GTTCGGT-GA---C---TC---------TT---
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 222222 11111111111111 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 1111111 1111 111 333333333 111 1111 111111111 1 111111 111 1111 11 11111 111 11 111 1 111 1 11111 444444444444444 1 22222 7777777777777777777 11 444444444444444444 1 222222 333 11 11 1 1 1 111 2
lowQualScore : 2 2 111111 66666666 22 1 44 1 555 4444 4 333 2 44444444444444 2 2 4444 22 44 8888888 333 22 3 8888888 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 55555 2 44444 2 666666 2 44 33 444 33 0 2 4 2 333 333 2 2 666 333 22 4 555 777 55 2 33 2 88888888888 33 7777777 2 0 2 2 4 2 2 0 5555 2 2 2 2 888 5 66 5 777777 99 666 2 2 8888 2 33 77 2 4 555 6666 33 2 555 2222222 2 2 2 2 1 33 444 2 555 6 3 3 3 3 55 55 3 4 4 4 7777 5 5 5 000 222222222 000 4444 888888888 99 6 88 99 777 5 2 5 000000 5 5 5 4 4 1 4 8 5 5 5 5 555 5 5 0000 5 5 5 66 77 5 44444 22 000 33 000 5 1 3 8 3 888 5 1 44444 5 7 6 6 6 99 3 222222222222222 99 3 99 6 3 99 00000 5555555555555555555 8 11 555555555555555555 0 0 333333 0 0 6 77 555 1 8 11 8 8 11 8 8 1 0 2 0 0 000 2 6 7 6 6
lowQualScore : . . ...... ........ .. . .. . ... .... . ... . .............. . . .... .. .. ....... ... .. . ....... ................................................................................ ..... . ..... . ...... . .. .. ... .. . . . . ... ... . . ... ... .. . ... ... .. . .. . ........... .. ....... . . . . . . . . .... . . . . ... . .. . ...... .. ... . . .... . .. .. . . ... .... .. . ... ....... . . . . . .. ... . ... . . . . . .. .. . . . . .... . . . ... ......... ... .... ......... .. . .. .. ... . . . ...... . . . . . . . . . . . . ... . . .... . . . .. .. . ..... .. ... .. ... . . . . . ... . . ..... . . . . . .. . ............... .. . .. . . .. ..... ................... . .. .................. . . ...... . . . .. ... . . .. . . .. . . . . . . . ... . . . . .
lowQualScore : 5 4 222222 99999999 66 9 33 8 000 0000 0 555 0 55555555555555 0 0 2222 88 88 5555555 555 88 8 5555555 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 99999 4 88888 4 888888 4 00 22 111 22 2 4 7 4 999 999 2 2 111 999 99 2 888 666 33 2 11 1 00000000000 11 6666666 4 5 2 2 7 4 4 9 3333 5 7 7 5 888 0 33 3 555555 99 111 9 9 9999 9 99 33 9 8 000 1111 99 9 000 1111111 9 9 9 9 2 11 777 9 444 2 1 1 3 6 00 77 6 0 0 0 3333 0 0 7 000 999999999 000 2222 888888888 22 7 33 22 555 7 0 0 999999 0 0 6 4 4 1 4 9 0 0 0 0 666 0 0 6666 0 0 0 99 99 7 33333 00 000 66 000 7 4 9 4 7 444 7 4 33333 7 3 7 7 7 22 3 000000000000000 22 2 22 7 3 22 00000 4444444444444444444 0 00 666666666666666666 0 8 000000 8 8 7 55 666 4 0 00 0 0 00 0 0 0 0 5 0 0 222 5 7 3 7 7
consensus : NAATGTT-CAC-AAAAGT--AGTATA--------CATATG--C-A--CGGT-G---TT----TG-TA---C-AA--------------C-AA-T----T--A--GA-------G---CCA--TCTAA-------GG-----------T------GT--------G------GCTTC-A-------------GTG-C---------A--------G-T-----AA-T-T---GG-TA------A-CA-CA--GT---C--CAACA-AT-T-TA---GCA---T-A-G---G---TGA--GAG-G---TAAA--TTT--GCAG-A--A-TG-TT--------T--A-------T-ACAACA-ATT-A-A-G-ACAATT----AAGTAG-GAT-TAG-C-ATA---GGC-TTC--A-AG-----TGCA-TG-C-AC-ATG-TA----TTG-GTAAA--TAGG--AGCAA-ANTA---TACA----GTTGT--A-A---TA-------TA-C-T-AATAGTTAG-CCAGAAATCCG-A---TG-TCTC---TA-TTT-A-GTCCAT-TG-TTT--TT-GC-AGT-CA-AATTT-GGCAATCA-G--TTT-T-GTTCAGT-GAC---TC---------TT---TGT----CTAATGTC--GG--GTAAT--TGTC-CCTGTAAGTATGGATA--CCCGCATA-TTGTCACAACAATG-TCCA-T-TTTTGTT-GTAG-TGTTCA-CCTACTGGT-ACAAACA-CA-TTTT-G-CTGTTGA-T-GG---TCT-G-G----CG-GTG-T-CC-ATT--G-AT-----GCGGTTTCTTANTTTT---TG--GCACGT---T-TCTCCAATGTAACATGATGGAACATAACACT-GCAT-TGA-----ATC-AAATACACACAATTTTTTAGTTTCACATG-TGAA-GT-GGCCTTGAA-------AT------TCATTTCCT--GAATT--TGG-AATT-CGGATATT--GGCA-----TCACTGGC---------TTTGGTG---AATG-GG--GGCAAAGTTTGCAGCGAGGTCTTTTCTTTCTTTT--TTTTTTTTTTACAAGGAAAGGTCCC-TCTTGGCATGCAGGGCGCAAGTTCACTATGTACCAGCATAC------GTTTGATATTAGGAGGTTGCCGGTAAGC-AATGA-CGGGAGGTTTAGGG-AAATAGCTCCTTTAGTT-GGTCGTC--CTCGTTGAT-AA-CATTTTGCATTTCCTTGGCAATGCGTTTGATAGGGCCTAATCCT--GGGTGA-TAGG-TTANTACAA-GAGGAATCCTGTCACCTTCT-GTCTCTGC-TGTGTT-GTACTGCAGTAATAGTT-CCGTGGTTTGGCCTTAGCTTTATCTATCTGGTTGTTAATTAAACCGGTGGTTAT
Reference ( family-1618 ) : NAATGTT-CAC-AAAAGT--AGTATA--------CATATG--C-A--CGGT-G---TT----TG-TA---C-AA--------------C-AA-T----T--A--GA-------G---CCA--TCTAA-------GG-----------T------GT--------G------G-------------------GTG-C---------A--------G-T-----AA-T-T---GG-TA------A-CA-CA--GT---C--CAACA-AT-T-TA---GCA---T-A-G---G---TGA--GAG-G---TAAA--TTT--GCAG-A--A-TG-TT--------T--A-------T-ACAACA-ATT-A-A-G-ACAATT----AAGTAG-GAT-TAG-C-ATA---GGC-TTC--A-AG-----TGCA-TG-C-AC-ATG-TA----TTG-GTAAA--TAGG--AGCAA-ANTA---TACA----GTTGT--A-A---TA-------TA-C-T-AATAGTTAG-CCAGAAATCCG-A---TG-TCTC---TA-TTT-A-GTCCAT-TG-TTT--TT-GC-AGT-CA-AATTT-GGCAATCA-G--TTT-T-GTTCAGT-GAC---TC---------TT---TGT----CTAATGTC--GG--GTAAT--TGTC-CCTGTAAGTATGGATA--CCCGCATA-TTGTCACAACAATG-TCCA-T-TTTTGTT-GTAG-TGTTCA-CCTACTGGT-ACAAACA-CA-TTTT-G-CTGTTGA-T-GG---TCT-G-G----CG-GTG-T-C--ATT--G-AT-----GCGGTTTCTTNNTTTT---TG--GCACGT---T-TCTCCAATGTAACATGATGGAACATAACACT-GCAT-TGA-----ATC-AAATACACACAATTTTTTAGTTTCACATG-TGAA-GT-GGCCTTGAA-------AT------TCATTTCCT--GAATT--TGG-AATT-CGGATATT--GGCA-----TCACTGGC---------TTTGGNG---AATG-GG--GGCAAAGTTTGCAGCGAGNTCTTTTCTTTCTTTT--TTTTTTTTTTACAAGGAAAGGTCCC-TCTTGGCATGCAGGGCGCAAGTTCACTATGTACCAGCATAC------GTTTGATATTAGGAGGTTGCCGGTAAGC-AATGA-CGGGAGGTTTAGGGGAAATAGCTCCTTTAGTT-GGTCGTC--CTCGTTGAT-AA-CATTTTGCATTTCCTTGGCAATGCGTTTGATAGGGCCTAATCCT--GGGTGA-TAGG-TTANTACAA-GAGGAATCCTGTCACCTTCT-GTCTCTGC-TGTGTT-GTACTGCAGTAATAGTT-CCGTGGTTTGGCCTTAGCTTTATCTATCTGGTTGTTAATTAAACCGGTGGTTAT
gi|1 : GTT-CACCAAAAGTGTAGTATA--------CATATG--C-A--CGAT-T---CT----TG-TA---C-AC--------------A-AA-T----T--A--GA-------G---C-A--T------------G-----------T------GT--------A------G-------------------GTA-C---------A--------G-T-----AAAT-T---GG-TA------AACA-AA--GT---C--CCACA----T-TA---GCA---T-A-G---G---TGA--GAG-G---TA----TTT--GCAG-A--A-TG-TT--------T--AAAAAAAAT-ATAGAA-AAT-A-A-G-AAAATT----AAGTAT-GAT-TAG-C-ATA---GGCCTTA--A-AA-----TGCAATG-C-AC-ATG-CAA---TTG-GGAAA--TAGGT-ACTAA-AATA---TATC----GTTGT--ACA---TA-------TG-C-T-AATAGTTAG-CCAGAAATCCA-A---TG-TCT----TA-TTT-A-G-CCAT-TG-TTT--T--GC-AGT-CA-AATTT-GGCAATCAAG--TTT-T-GTTCAGT-GAC---TC---------TT---TGT----CTAAT-TC--GG-----AT--TGTAACTTGTAAGTATGGATA--CC-G-ATA-TTGTCACA-CAATG-TCCA-T-TT--GTT-GTAG-TGTT-A-CCTACTGGT-ACAAA-A-TA-TTTT-G-CTGTTGA-T-AGGT-TCT-G-G----CG-GTG-T-C--ATT--G-AT-----GCGGTTTCTTTATTTT---TG--GCACGT---T-TC--CAAAGTA-CATGATGGAACATA-CACT-GCAT-TGA-----ATC-AAATA-ACACAATGTTTTTGTTTCACATG-TGAA-GT-G-------A-------AT------TCATTTCCT--GAATT--TGG-AATTTCGGATATT--GGCA-----TCA-TGGCA--------TTTGG-G---AATGTGG--GGCAGAATTTGCAGCGAATTCTTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTACAAGGAAAGGTCCC-TCTTGGCATGCAGGGTGCAAGTTCACTATGCAGCAGCATAC------GTTTGATATTAGGATGTTGCCGGT-AGC-AATG--TGGGAGGTTTAGGG---ATAGTTCCTTTAGTT-GGTT-TC--CTCGTTGAT-AATCATTTTGCATTTCCTTGGCAATGCGTTTGATAGGTGCTAAATCT--GACTGA-TAGGTTTATTACAATGAGGAATCCTGTCA-CTTCT-GTCTCTGCTTGTG-G-GTACTGCAGTAATAGTT-CCGTGGTTTTGGCTTAGCTTTATCTATCTGGTTGTTAATTAAACTGGTGGTTAT
gi|10 : ATGTT-CAT-AAAA----AGTA-A--------CATAT---C-A---GGT-G---TT-----G-TA---T-G---------------C-AA-T----T--A--GA-------G---CCA--T-TAG-------GG-----------TTGCTGTGT--------G------GCTTCAA-------------GTG-C---------ATGTTAG--G-T-----AA-T-----GG-TA------A-CA-CA--GT---A--CAAAC-AT-T-TA---G-A---TCA-G---G---TGA--GAG-G---TAAA--TTTTGGCAG-A--A-TG--T--------T--A-------T-ACACCACATT-A-A-GAACAATT----AAGT-G-GAT-TAG-C-ATA---GGC-TTC--A-AA-----GCCA-GG-T-AC-ATG-TA----TTG-GT-AA--TAGA--AGC---ATTA---TACG----GTAG---A-A---TA-------GA-C-T-AA-AG-TAGTCCAAAAATCCA-A---TG-TCT----TACTTT-A-GTCCAT-TGTTTT--TT-GC-Aatattgcactaggacctgtctgtaaggaatgtccaaggctaacgttgctggcctgttgcaaaattaagtcgttctg
gi|11 : atctATGTT-CAC-TAGAGT--A---TA--------CATATG--C-A--CGAT-G---TT----TG-TA---C-AA--------------C-AA-T----T--A--GA-------G---CCA--TCTAA-------GGACTGTGA----T------AT--------G------GCTTCAA-------------GTG-C---------AATGTGTAGG-T-----AG-T-T---GG-TA------A-CA-----GT---C--CAACA-GT-T-TA---GGA---T-A-G---G---TGA--GAG-A---TAAA--TTT--GCAG-A--A-TG-TT--------T--A-------T-ACAACA-ATT-A-A-G-AAAATT----AAGTAT-GAT-AAG-C-ATA---GGC-TTC--A-AG-----TGCA-TG-C-AC-ATG-CA----TTG-GTAAA--TAGG--AGCAA-AA-A---TACA----ATTGC--A-A---TA-------TA-C-T-AATAGTTAG-CCAGAAATCCA-A---TG-TCTC---TA-TTT-A-GTCCc
gi|12 : gccattc--AGTATA--------CATATT--C-A--CAGT-G---TT----TG-TA---C-AA--------------C-AA-T----T--A--GT-------G---TCA--TCTAAAGGTTGTGG-----------T------GT--------G------GCTTCAACTGCCAT------GTG-T---------A--------GGT-----AA-T-T---GG-TA------A-CA-CA--GT---C--CAATA-TA-T-TA---GCA---T-A-G---A---TGA--AAG-G---TAAA--TTT--GCAG-A--A-TG-TT--------T--A-------T-ACAACA-ATT-A-A-G-GCAATT----AAGTAA-GAT-TAG-C-ATA---GGC-TTC--A-A------TGCA-GG-T-AC-ATG-TA----TTG-GTAAA--TAGG--AGCAA-ATTT---AACA----GTTGT--A-A---TA-------TA-C-T-AATAGTTAG-CCAGAAATCCG-A---
gi|13 : aa-CTTACTGGTGACAA-CA-CT-TTGT-GACTATTGA-TTGGCTCTTT-GTGTTCCCGTGTG-C-CCTATTCTG-ATATCTTGCCGTTTCTTCATTTTGATTGCTGTTCGTGTCT-TCTCCAATGTACGATGATG-----------T-GTGT-TTGTCTTCATC-AAATAC-CA-AGTTTTTTAGTTTCACAAG-TGAA-CTAGGACTTGTACTTTTGGAT------TCATTCCTT--GACTCTGTGG-GATT-CTGATGTT--G
gi|14 : GTT-CAC-AAGAGT--A---TA--------TATATG--C-A--CGAT-G---TT----TG-TA---C-AA--------------C-AA-T----T--A--GA-------G---CCA--CCTAA-------GGGT---------T------GT--------G------G-------------------aaaggctagttcgactggcatgagtgcaa
gi|14 : agcaaatcaaA--GAGTA---TATA--TAT--GCAC-G--A-TG-TT--------T--G-------T-ACAACA-ATT-AGA-G-CCACCT----AAG--G-GTTGTGG-T-ATT---AGC-TTC--A-AG-----TGCtattagcttcaagtgccatttaagaaatttaagtgggattagcgtaggcttcaagtgcatgtacatgtattggtaaataggatcaaactatatagttgtaatatacaatgtactaatagttagccggaaatccgaagtctccatttagtccat
gi|14 : agcaaatcaagttcacaCA-TTT-A-A-G-AAATTT----AAGTGG-GAT-TAG-C-GTA---GGC-TTC--A-AG-----TGCA-TG-T-AC-ATG-TA----TTG-GTAAA--TAGG--ATCAA-ACTA---TATA----GTTGT--A-A---TATACAATGTA-C-T-AATAGTTAG-CCGGAAATCCG-A---AG-TCTC---CA-TTT-A-GTCCAT-catttaagaaatttaagtgggattagcgtaggcttcaagtgcatgtacatgtattggtaaataggatcaaactatatagttgtaatatacaatgtactaatagttagccggaaatccgaagtctccatttagtccat
gi|15 : agcaaatcaagttcacaagagtatatatatgcacgatgtttgtacaacaattagagccacctaagggttgtggtattagcttcaagtgcTGCAGGACGAAAGTTCACTTTGTACCAGCATACTTGTACGTTTGATATTAGGAGGTTGCCGGTAAGC-AATGA-CGGGAGGTTTAGGGAA--------------TT-G-TCGTC--CTCGTTGAT-AA-CATTTTGCATTTCCTTGGCAATGCGTATGATAGGGCCTAATCCT--GGGTGG-TAGG-TTAATACGA-AAGGAATCCTGTCACCTTCC-TTCTCTGC-TATGTT-GTACTGCAGTAA
gi|16 : AATG-TCCACT-TTTTGTT-GTAG-TGTTCAACCTACTGGT-A-AAACAACA-TTTT-G-CTGTTT--T-GG---TCTTG-G----CG-GTGCT-C--ATT--G-AT-----GCATTCTCT-ATTTTT---TGT-GCACAA---T-TCGCCAATGAAAT-TGATGAAACATTACACTTGCATGTGA-----ATCGAAATACACTTAATTTTTTAGTTTCACATGTTGAAGGT-GGCCTTGAA-------
gi|17 : ATGTTTCAT-AAAAGT--A---TA--------CATATG--AGA--AGATAG---ATATAATGCTA---T-AA----------------AA-T----T--A--GA-------G---C-A--T-TAA-------GGGTTGTGG----T------GT--------G------GCTTCAA-------------GTG-CCCTGTTGTAG--------G-T-----AA-T-T---GG-TA------A-CA-CA--GT---CAACAA-A-AT-A-TATAGGCA---T-A-A---GAGATGA--GAA-GAGATAA---TTT--GCAG-A--A-TG-TT--------T--A-------T-ACAA-A-ATTAA-A-G-ACAATT----AAGTAG-Gttaaaaaattc
gi|18 : aagcaatcGTATA--------CATATG--C-AT-CATT-G---TT-----G--A---C-AAAC------------C-AA-T----T--A--GA-------G---CCA--CCTAA-------GG-----------G------GT--------T------G-------------------GTA-T---------A--------G-
gi|18 : gcaaatccatgtttatagg-TG-TT--------G--A-------C-AAACCA-ATT-AGA-G-CCACCT----AAG--G-GGT-TGG-T-ATA---GGC-TTCCTC-AG-----TG---TGCC-ACAATG-TA-----AG-GTAAA--TGGgcttcctcagtgtgccacaatgtaaggtaaatggtacagtctatcatgagtaaggtaaaaaatgataacaataatgtcccttaattaacatacgatgagagtaaatttcgcagaatgttttt
gi|18 : gcaaatccatgtttatagggtatacatatgcatcat-----AA-A-T---GA-TA------A-CAATAATGT---C--CCTTA-AT-T--A---ACA---T-ACG---A---TGA--GAG-----TAAA--TTTC-GCAG-A--A-TG-TT--------T--tacagtctatcatgagtaaggtaaaaaatgataacaataatgtcccttaattaacatacgatgagagtaaatttcgcagaatgttttt
gi|19 : gcaaatccatgtttatagggtatacatatgcatcattgttgacaaaccaattagagccacctaaggggttggtataggcttcctcagtgtgccacaatgtaaggtaaatggtacagtctatcatgagtaaggtaaaATGTT-GAC-AAGAGT----T-TA--------CCTATG--C-A--CGAT-G---TT----TG-TA---C-AA--------------C-AA-T----T--A--GA-------G---CCA--TCTAA-------GGGT---------T------GT--------G------GTATTGTCTTCAAATTCCATGTG-T---------A--------GGT-----AA-T-T---GG-TA------A-CA-CA--GT---C--CAACA-GT-T-TA---GGA---T-G-A---G---TGA--GAG-G---TACA--TTT--GCAG-A--A-TG-TT--------T--A-------T-ATAATA-ACT-tt
gi|2 : agcaaatcAATGTT-CAC-AAAAGTT-AGTATA--------CATATG--C-A--CGAT-G---TT----TG-TA---C-AA--------------C-AA-T----T--A--GA-------G---CCA--T------------G-----------T------GT--------A------G-------------------GTA-C---------A--------G-T-----AA-T-T---GG-TA------A-CA-CA--GT---C--CAACA-AT-T-TA---GCA---T-A-G---G---TGA--GAG-G---TAAA--TTT--GCAG-A--A-TG-TTAAAAAAAAT--A-------T-AGAACA-ATT-A-A-G-AAAATT----AAGTAT-GAT-TAG-C-ATA---GGC-TTA--A-AG-----TGCA-TG-C-AC-ATG-CA----TTG-GGAAA--TAGG--ACTAA-AATA---TACA----GTTGT--A-A---TA-------TG-C-T-AATAGTTAG-CCAGAAATCCA-A---TG-TCTC---TA-TTT-A-GCCCAT-TG-TTT--T--GC-AGT-CA-AATTT-GGCAATCA-G--TTT-T-GTTCAGT-GAC---TC---------TT---TGT----CTAATGTC--GG-----AT--TGTA-CTTGTAAGTATGGATA--CC-G-ATA-TTGTCACA-CAATG-TCCA-T-TTGTGTT-GTAGCTGTT-A-CCTACTGGT-A-AAACA-TA-TTTT-G-CTGTTGA-T-GG---TTC-G-G----CG-GTG-T-C--ATT--G-AT-----GCGGTTTCTTTATTTT---TG--GCACGT---TGTCTCAAA-GTAACATGATG--ACATAACACT-GCATCTGG-----ATC-AA-TACACACAATGTTTTTGTTTCACATG-TGAA-GT-G-------A-------AT------TCATTTTCTCTGA-TT--TGG-AATTTCGGATATTTGGGCAAAATCCCACTGGCCCCAAAAATTTTGGGGGGGAATG-GG--GGCAGAGTTTGCAGCGAATTCTTTTCTTTCTTTT--TTTTTTTTTTACAAGGAAAGGTCCC-TCTTGGCATGCAGGGTGCAAGTTCACTATGCAGCAGCATAC------GTTTGATATTAGGATGTTGCCGGTAAGC-AATGN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTCCTTTAGTT-GGTTGTC--CTCGTTGAT-AA-CATTTTGCATTTCCTTGGCAATGCGTTTGATAGGGCCTAATCCT--GGATGA-TAGG-TTATTACAA-GAGGAATCCTGTCACCTTCT-GTCTCTGC-TGTGTT-GTACTGCAGTAATAGTTCCCGTGGTTTGGCCTTAGCTTTATCTATCTGGTTGTTAATTAAA-CGGTGGTTATcctaaataagtatcgaataaagat
gi|20 : t--CGGT-G---TT----TG-T----------------------T-AA-T----T--GATGA-------G---C-A--TCTAA-------GGGATTTGATGTGT------GT--------G------GCTTGTAAC-----------GTGAC---------AT-------G-T-----GT-T-A---GG-TATGAGAGA-CA--A--AT---C--CAGAA-ATATATA---GCA---T-G-G---G---TGA--GGG-GG--TA----TTT--GCAGGA--A-TG-TC--------TTAA-------T-AAAA-G-ATT-A-ACG-A-AATT----AAGTAG-GAT-TAG-CAATA---GGC-TT
gi|21 : tc---TG-TCTC---TA-TTT-A-GTCCAT-TG-TTT--TG-GC-AGT-CA-AATTT-GGCAATCA-G--TTTGT-GTTCAAT-GAT---TC---------TTCTTTGT----CTAATGTC--AG--GTGAT--TGTC-TCTGCA-GTATGGAAA--TCCCCATA-TTGTCACAACAGTG-TTCA-C-TTTTGTT-GTAG-TGTTCA-CCTACTGGT-ACAAACA-TA-Taa
gi|22 : -AAAAAA--AGTA-A--------CATATG--C-A--ATGA-G---TT----C--TA---C-AA--------------C-AA-T----TGGA--GA-------G---CCA--TCTTG-------GG-----------T------GTTGTGGTATG------GCCTTCAA------------GTG-CCATTTATA-G--------G-T-----AA-T-T---GG-AA------A-CA-CA--GT---C--CAATG-GT-T-TA---G-A---T-A-G---G---TAA--GAA-G---
gi|23 : aagcgcaatcatttcaccaaaaaaaaaATGCT-CAT-AAAAGT--A-TA-A--------CATATG--C-A--CGGT-G---TT----TG-T----C-AA--------------C-A-------T--AG-GA-------G---CCA--TCTA-----------------------------T--------G------G-------------------GTT-C---------T--------G-T-----CA-TAT---GG-C-----------------T---T--CA--A-AT-T------GCA---T-G-T---G---T-----AG-G---TAAAATTTT--GCAA-A--A-AG-C-----------------------CAACA-GTT-T-A-G-Aaag
gi|24 : cc------TCATGTCCT--GAATT--TGGGAATT-CGATTACT--GGCA-----TCACTGGC------------GATG---AGTG-GG----CAAAGTTTGCAGCGAGG--TTTTCTataggttgagagagta
gi|24 : CAGGGCGCAAGT----TATATAC---------------TTT-ATATAAGG-GGTTGCC-GTAAGTGAATGA-acacagggcgcaagttatatactttatataaggggttgccgtaagtgaatgaggaaaat
gi|25 : tcatgtcctgaatttgggaattcgattactggcatcactggcgatgagtgggcaaagtttgcagcgaggttttctacaTA-TTGTCACA-----------------TGTT-GTAG-TGTTCA-CCTACTGGT-ACAAATA-CATTTTT-G-CTGTTGA-T-GG---TCT-G-G----CG-GTG-T-C--ggaaaat
gi|26 : GCAA-AACA---TACA----GTTGT--A-T---TA-------TA-C-T-GATAGTTAG-CCAGAAATCCG-A---TG-
gi|27 : ATGTT-CAC-AAACGT--A---TA--------CATATG--C-A--CGGT-G---TT----T
gi|28 : gaagcaaatcTGTT-CAC-AAAAGT--A---TA--------CATATG--C-A--CGGT-G---T
gi|29 : caaatcATGTT-CAC-AAA-----AGTATA--------CATATG--
gi|3 : ctgaagcaaatcAATGTT-CAC-AAAAG----GTATATTTAAAAACATATGGCT-AATTGAT-GA--TT----TG-TAATAC-AAACGTATTTGGCATTC-AA-TGTGTT--A--GT-------G---CCA--------------GG-----------T------GT--------T------G-------------------TTG-A---------G--------G-G-----AA-T-TTATGG-TA------A-CA-CA--GTGTTC--CA-CAGATAT-TA---GCAAAAT-A-GCCAG---TGAAGGAGTG---TAAA--TT---GCGA-A--G-TA-TA--------T--A-------TTACAACA-ATA-A-C-G-AAAATT----AAGTAGCGAT-TAG-C-ATA---GTCCTTC--ACAGGTCTATGCAATG-CTAC-ATG-TA----TTGAGTAAAAATAGGGAAGTAACAATA---TACA----GTTGT--A-AGAATA-------TA-CCT-AATAGTTAG-CCGAGAATCCA-AAAGTG-TCTTACTTA-TTT-A---TCAT-CG-TCTCTTT-GC-AGTTCACAATTT-GGCAATCA-G--TTT-TTGTTCAGCCGAT---TCATCTATCTATT---TGTAAATCTAATGTTCTAGCCGTA-T--TGTC-CCTGTA-GTATGGATATACCCGCATA-TTGTCACAACAAT---------------T-GTAG-TGTTCA-CCTACTGGT-ACAAACA-CA-TTTTTA-ATGTTGA-T-GG---TCT-G-G----CG-GTG-T-CC-ATT--G-AT-----GCGGCTTCTTATTTTC---TG--CCACTT---T-TCTCCAATGTA-CATGATGGAACATA-CACT-GCAT-TGA-----ATC-AAATACACACAATTTTT-AGTTTCACATG-TGAA-GT-GGCCTTGAATTGAGA-AT------TCATTTCCT--GAATT--TGT-AATT-CGGACATT--GGCA-----TCACTGGC-------------------AATG-AGTCGGCAAAAATTGCAGCGAGG-----------GTTT--TTTTTTTTTTACAAAGAAAGGTCCC-TCTTGGCATGCAGGGCGCAAGTTCACTATGTACCAGCATAC------GTTTGATATTAGGAGGTTGCCGGTAAGC-AATGA-CGGGAGGTTTAGGG--AATAGCTCCTTTAGTT-GGTCGTC--CTCGTTGAT-AA-CATTTTGCATTTCCTTGGCAATGCGTTTGATAGGGCCTATTCCT--GGGTGA-CAGG-TT
gi|30 : caaatc---GCA---T-A-G---A---TGA--AAG-G---TAAA--TTT--GCAG-A--A-TG-TT--------
gi|4 : -ATA---GGC-TTC--ATAG------GCA-TG---AG-ATGATAAGTCTTC-GTAAA--TAGG--AGCAA-A-TA---TACA----ATTGT--A-A----A-------TA-C-C-AATAGTTAG-CCAGAAATCCA-A---TG-TCTC---AA-TTTTA-GTCCATGTG-TTT--TTTAC-AGT-CA-AATTTTGGCAATCA-GA-TTT-T-GTTCCGT-GAC---TCCTC------TT---TGT----CTAATGTC--AA--GTAATATTGTC-TCTGTAAATATGGATA--CCCGCATACTTGTCACAACAATGCTCCA-TCTTTTGTTTGTAG-TGT---------------CAAACA-CA-TTTT-G-CTGTTGAAT-GG---TCT-G-G-----G-GCG-T-CC-ATT--GGAT-----GCGGTTTCTTATTTTT---TG--GTACGT---T-TCTCCA-CGTAAAATGCTG-AACA--ACACT-GCAT-TGA-----ATC-AAATACACACAATTCTT-AGTTTCACATG-TGAA-GT-GGCCTTGAA-------ATTGAGAATCATTTCCT---AATT--TGG-AATT-CGGATATT--GGCA-----TCACTG------------TTGTTG---AGT---G--GGTAAAGTTTACAACGAGG----------------------TTTTTACACGAAAAGGCCCCTTCTTGGCATACAGGGCGC
gi|4 : C-AATGAACGGGAGATTTAGGG-AAATAGCTCCTTTAGTTTGGTCGTCACTTCTTTGATGAA-CATTTTGCATTTC-TTGGCAATGCGTTTGATAGGGCCTAATCCTTTGGGTGAATAGG-TTAATACAA-GAGGAATCCTGTCACCTTTTTGTCTCTGC-TGTGTTTGTACTGCA-TAATAGTTACCGTGGTTTGGCCTTAGCCTTATCCATCTGGTTGCTAAT--AACCGGT-GTTATcaatgaacgggagatttagggaaatagctcctttagtttggtcgtcacttctttgatgaacattttgcatttcttggcaatgcgtttgatagggcctaatcctttgggtgaataggttaatacaagaggaatcctgtcacctttttgtctctgctgtgtttgtactgcataatagttaccgtggtttggccttagccttatccatctggttgctaataaccggtgttatctcctagatggctgaatgcaatttggtcaacgtccctgagtgtcgctatcttgagtcgagttctg
gi|5 : ataggcttcataggcatgagatgataagtcttcgtaaataggagcaaatatacaattgtaaataccaatagttagccagaaatccaatgtctcaattttagtccatgtgttttttacagtcaaattttggcaatcagattttgttccgtgactcctctttgtctaatgtcaagtaatattgtctctgtaaatatggatacccgcatacttgtcacaacaatgctccatcttttgtttgtagtgtcaaacacattttgctgttgaatggtctggggcgtccattggatgcggtttcttattttttggtacgtttctccacgtaaaatgctgaacaacactgcattgaatcaaatacacacaattcttagtttcacatgtgaagtggccttgaaattgagaatcatttcctaatttggaattcggatattggcatcactgttgttgagtgggtaaagtttacaacgaggtttttacacgaaaaggccccttcttggcatacagggcgcATGTT-CAC-AAAAGT--A---TA--------CATATG--C-A--CGGT-G---TT----TG-TA---C-AA--------------C-AA-T----T--A--GAATTTAGAG---CCA--TCTAA-------GGGTTGTG-----T------GT--------G------GCTTCAA-------------GTG-CCACGTGTA-G--------G-T-----AA-T-T---GG-TA------A-CA-CA--GT---C--CAACA-AT-T-TA---GCA---T-A-G---G---TGA--GAG-G---TAAA--TTT--GCAG-A--A-TG-TA--------T--A-------T-ACAACA-ATT-A-A-G-ACAATTTTAAAAGTAG-GAT-TAG-C-ATA---GGC-TTC--A-A------TGCA-GG-T-AC-ATA-TA----TTG-GTAGA--TAGG--AGCAA-ATTA---TACA----GTAGT--A-A---TA-------TA-A-T-AATAGTTAG-CCAGAAATCCA-A---TT-TTTC---TA-TTT-A-GTCCAT-TG-TTT--TT-GC-AGT-AA-AATAT-GGCAATCA-AT-TTT-T-GTTCAGT-GACTCTTC---------TT---TGT----CTAATGTC--AG--GTAAT--TATC-CCTGTAA-TATGGATA--CCCGCATA-TTGTCACAACAATG-TCCA-C-TTTTGTT-GTAG-TGTTCA-CCTACTGGT-ACAAACA-CATTTTT-G-CTGTTGA-T-GG---TCT-G-G----CG-GTG-TCC--ATT--G-AT-----GCGGTTTCTTATTTTT---TG--GCACGT---T-TCTCCAATGT-ACATGATGGAACAT-ACACT-GCAT-TGA-----ATC-AAATACACACAATTTTTctcctagatggctgaatgcaatttggtcaacgtccctgagtgtcgctatcttgagtcgagttctg
gi|6 : caaatcTATT-AAC-AAAAGT--A-T-TA--------CATATG--C-A--CGAT-G---CT----TGTTA---CAAA--------------CAAA-T----T--A--G--------G---TCA--TCTAA--------G-----------T------GT--------
gi|6 : -A--CAGT-GACATT----TG-TA---C-AA--------------C-AA-T----T--A--GAC------GCTCCCATCTCTAA-------GG-----------tgtatacaacccttagagatgggagcgtctaattgttgtacaaatgtcactgtaggtaattggtaacatagtccaacagtttgcatagtgagaggtaattgcagagaatggtttatacaacaattaagacaattaatagattagcatattaggcttcaagtgcagtgcacatgtattggtaaataggagcaaactagcatacacggagtagtgaaataatagctgaatagttagccaaaatccaagtctctaatttagtccattgtttttgcagtcaaatttggcaat
gi|6 : tattaacaaaagtattacatatgcacgatgcttgttacaaacaaattaggtcatctaagtgttgtatacaac--------G-T-----AA-T-T---GG-TA------A-CA-TA--GT---C--CAACA-GT-T-T----GCA---T-A-G-------TGA--GAG-G---TAA----TT--GCAG-AGAA-TGGTT--------T--A-------T-ACAACA-ATT-A-A-G-ACAATT----AA-TAG--AT-TAG-C-ATATTAGGC-TTC--A-AG-----TGCAGTG-C-AC-ATG-TA----TTG-GTAAA--TAGG--AGCAA-ACTAGCATACACGGAGTAGTGAA-A---TAA------TAGC-TGAATAGTTAG-CCA-AAATCCA-A----G-TCTC---TAATTT-A-GTCCAT-TG-TTT--TT-GC-AGT-CA-AATTT-GGCAATaggtaattggtaacatagtccaacagtttgcatagtgagaggtaattgcagagaatggtttatacaacaattaagacaattaatagattagcatattaggcttcaagtgcagtgcacatgtattggtaaataggagcaaactagcatacacggagtagtgaaataatagctgaatagttagccaaaatccaagtctctaatttagtccattgtttttgcagtcaaatttggcaat
gi|7 : tattaacaaaagtattacatatgcacgatgcttgttacaaacaaattaggtcatctaagtgttgtatacaacccttagagatgggagcgtctaattgttgtacaaatgtcactgtagATGT--CAC-AAAA----AGTATA--------CATATG--C-A--CGGT-G---TT----TG-TA---C-AA--------------C-AA-T----T--A--GA-------G---CCA--TCTAA-------GA-----------T------GT--------G------GCTCCAA-------------GTG-C---------C--------A-TGTGTAAA-T-T---GGTTG------A-CA-CA--GT---C--CAACA-AT-T-TA---GCA---T-A-G---G---TGA--GAG-G---TAAA--TTT--GCAG-A--A-TG--T--------T--A-------T-ACA--------------ACAATT----AAGTAG-GAT-TAGAG-ATA---GGC-TTCA-A-AG-----AGC---G-T-AC-ATG-TA----TTG-GTAAA--TAGG--AGCAA---TA---TACA----GTTGT--A-A---TA-------CA-C-T-AATAGTTAG-CCACAAACCCGAA---TG-TCTC---TA-TTT-A-GTCCAT-TG-TTT--TT-GC-AGT-CA-AA-TT-GGCAATCA-A--TTT-T-TCTTAG
gi|8 : caaatcAAAGT--A-T-TA--------CATATG--C-A--CGAT-G---CT----GG-TA---C-AA--------------C-AATT----T--A--GA-------G---TCA--TCTAA--------G-----------T------GT--------G------gattatccgtagatttaaagtccaagtag
gi|8 : tattatTA--------CCTACA--C-G--TGAC-A---TT----TG-TA---C-AA--------------C-AA-T----T--A--GA------------CA--TCTAAG------GG-----------T------GT--------G------tatatcacacccttagatgtctaattgttgtacaaatgtcacgtgtaggtaattggtaacatagtccaacagtttagcataggtgagcggtaattgcagaaatggtttatacacaattaagacaattaagtaggattagcatattaggcttcaagtgcatgcacatgtattggtaaataggagcaaactatacagtagtaatatactaatagttagccagaaatccaatgtctctatttagtccattgtttttgcagtcaaatttggcaatca
gi|8 : tattataaagtattacatatgcacgatgctggtacaacaatttagagtcatctaagtgtgtatat-------------------GTG-T---------A--------GGT-----AA-T-T---GG-TA------A-CA-TA--GT---C--CAACA-GT-T-TA---GCA---T-A-G---G---TGA--GCG-G---TAA----TT--GCAG-A--AATGGTT--------T--A-------T-ACA-CA-ATT-A-A-G-ACAATT----AAGTAG-GAT-TAG-C-ATATTAGGC-TTC--A-AG-----TGCA-TG-C-AC-ATG-TA----TTG-GTAAA--TAGG--AGCAA-ACTA---TACA----GTAGT--A-A---TA-------TA-C-T-AATAGTTAG-CCAGAAATCCA-A---TG-TCTC---TA-TTT-A-GTCCAT-TG-TTT--TT-GC-AGT-CA-AATTT-GGCAATCA-attggtaacatagtccaacagtttagcataggtgagcggtaattgcagaaatggtttatacacaattaagacaattaagtaggattagcatattaggcttcaagtgcatgcacatgtattggtaaataggagcaaactatacagtagtaatatactaatagttagccagaaatccaatgtctctatttagtccattgtttttgcagtcaaatttggcaatca
gi|9 : tattataaagtattacatatgcacgatgctggtacaacaatttagagtcatctaagtgtgtatatcacacccttagatgtctaattgttgtacaaatgtcacATGTT-C-C-TAAAGC----TATA---------AT-TG--C----CGGT-G---TT----TA-TT---T-AA--------------C-AT-G----T--A--GA-------G---CCA--T-TAA-------GGGTTGTGCT---T------GT--------GCTTCCTGCCT----------------GTG-T---------A----------T-----AA-T-----GG-TA--------CA-CA--GT---C--CAACC-AT-T-CA---GCA---T-A-GT--G---TGA------G---TAA----TT--CCAG----A-TGCTT--------T--A-------T-CCAACC-ATT-A-A-G-ACAATT-----AGTA--GAT-TCG-C-CT----GGC-TTC--A-AG------GGA--G-T-AC-ATG-TA----TT--GTAA----GGG--AGCAC-TTTA---TACA-----TTTT--A-A---T--------TA-C-T---TAGTTAG-CCA-AAAT-CG-A---TGCTCTC---T--TTT-AGGTCC-T-TG-TTT--TT-GCAAGT-C--GATT---GC-ATCA-ATTTTT-T-GTTCGGT-GAC---TC---------TT---
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 222222 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 111 1111111 11 1111111 1111 111 333333333 111 1111 111111111 1 111111 111 1111 11 11111 11 111 1 111 1 11111 44444444444444444444444444444 1 22222 7777777777777777777 11 44444444444444444 1 222222 111 11 11 1 1 1 111 2
lowQualScore : 2 2 111111 66666666 22 2 44 1 1 6666 4 2 22 2 777777 22 44 6666666 555555 3 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 666 333 2 666666 2 44 33 333 33 33 4 2 333 333 2 2 6666666 22 4 555 5 55 2 33 2 7 99999999 33 9999999 2 11 2 2 2 2 2 6666 22 3 2 000 5 3 6 0000000 11 44 3 9999 3 44 77 2 4 555 6666 33 2 555 2222222 2 2 2 2 1 33 444 2 555 6 3 3 3 3 55 55 3 4 4 4 7777 5 5 5 000 222222222 000 4444 888888888 99 6 88 99 777 5 2 5 000000 5 5 5 4 4 1 4 8 5 5 5 5 555 5 5 0000 5 00 77 5 44444 5 5 1 77 33 000 5 1 3 66 3 888 5 1 44444 5 6 6 6 00000000000000000000000000000 99 3 99 6 3 99 00000 4444444444444444444 8 11 44444444444444444 0 0 333333 0 0 6 77 333 0 8 8 11 8 8 11 8 8 1 0 2 0 0 000 2 6 7 6 6
lowQualScore : . . ...... ........ .. . .. . . .... . . .. . ...... .. .. ....... ...... . .......................................................................................................... ... ... . ...... . .. .. ... .. .. . . ... ... . . ....... .. . ... . .. . .. . . ........ .. ....... . .. . . . . . .... .. . . ... . . . ....... .. .. . .... . .. .. . . ... .... .. . ... ....... . . . . . .. ... . ... . . . . . .. .. . . . . .... . . . ... ......... ... .... ......... .. . .. .. ... . . . ...... . . . . . . . . . . . . ... . . .... . .. .. . ..... . . . .. .. ... . . . .. . ... . . ..... . . . . ............................. .. . .. . . .. ..... ................... . .. ................. . . ...... . . . .. ... . . . .. . . .. . . . . . . . ... . . . . .
lowQualScore : 5 4 222222 99999999 66 0 55 8 8 0000 0 0 88 0 888888 88 88 5555555 888888 3 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 111 999 2 444444 2 11 11 999 11 22 4 2 777 777 1 1 7777777 99 2 888 4 99 5 44 5 5 11111111 77 3333333 9 99 7 7 9 9 5 1111 99 1 9 000 7 1 2 2222222 44 33 1 6666 1 22 33 9 8 000 1111 99 9 000 1111111 9 9 9 9 2 11 777 9 444 2 1 1 3 6 00 77 6 0 0 0 3333 0 0 7 000 999999999 000 2222 888888888 22 7 33 22 555 7 0 0 999999 0 0 6 4 4 1 4 9 0 0 0 0 666 0 0 6666 0 00 99 7 33333 7 7 0 99 66 000 7 4 9 44 7 444 7 4 33333 7 7 7 7 22222222222222222222222222222 22 2 22 7 3 22 00000 2222222222222222222 0 00 66666666666666666 0 8 000000 8 8 7 55 222 4 0 0 00 0 0 00 0 0 0 0 5 0 0 222 5 7 3 7 7
consensus : NAATGTT-CAC-AAAAGT--AGTATA--------CATATG--C-A--CGGT-G-TT----TG-TAC-AA--C-AA------TT--A--GA-------GC------CATCTAA-------GGG----------T------GT--------G------G------C-T---T-C-AA-------G--TG---C---------A--------G-T------AA---TT---GG-TA------A-CA-CA--GT---C--CAACA-GT-T-TA---GCA---T-A-G---G---TGA--GAG-G---TAAATTT--GCAG-A--A-TG-TT--------T--A-------T-ACAACA-ATT-AA-G-ACAATT----AAGTAG-GATTAG-C-ATA---GGC-TTC-A-AG-----TGCA-TGC-ACATG-TA----TTG-GTAAA--TAGG--AGCAA-ANTA---TACA----GTTGT--A-A---TA-------TA-C-T-AATAGTTAG-CCAGAAATCCG-A---TG-TCTC---TA-TTT-A-GTCCAT-TG-TTT--TT-GC-AGT-CA-AATTT-GGCAATCA-G--TTT-T-GTTCAGT-GAC---TC---------TT---TGT----CTAATGTC--GG--GTAAT--TGTC-CCTGTAAGTATGGATA--CCCGCATA-TTGTCACAACAATG-TCCA-T-TTTTGTT-GTAG-TGTTCA-CCTACTGGT-ACAAAC-ACA-TTTT-G-CTGTTGA-T-GG---TC-TG-G----CG-GTGTCC-ATT--G-AT-----GCGGTTTCT-T-ATTTT--TTG--GCACGT---T-TCTCCAATGTAACATGATGGAACAT-ACAC-TGCAT-TGA-----ATC-AAATACACACAATTTTTTAGTTTCACATG-TGAA-GT-GGCCTTGA------A-------AT------TCATTTCCT--GAATT--TGG-AATT-CGGATATT--GGCA-----TCACTGGC---------TTTGGTG---AATG-GG--GGCAAAGTTTGCAGCGAGGTCTTTTCTTTCTTTT--TTTTTTTTTTACAAGGAAAGGTCCC-TCTTGGCATGCAGGGCGCAAGTTCACTATGTACCAGCATAC------GTTTGATATTAGGAGGTTGCCGGTAAGC-AATGA-CGGGAGGTTTAGGGAAATAGCT-CCTTTAGTT-GGTCGTC--CTCGTTGAT-AA-CATTTTGCATTTCCTTGGCAATGCGTTTGATAGGGCCTAATCCT--GGGTGA-TAGG-TTANTACAA-GAGGAATCCTGTCACCTTCT-GTCTCTGC-TGTGTT-GTACTGCAGTAATAGTT-CCGTGGTTTGGCCTTAGCTTTATCTATCTGGTTGTTAATTAAACCGGTGGTTAT
Reference ( family-1618 ) : NAATGTT-CAC-AAAAGT--AGTATA--------CATATG--C-A--CGGT-G-TT----TG-TAC-AA--C-AA------TT--A--GA-------GC------CATCTAA-------GG-----------T------GT--------G------G------C-T---T-C-A--------G--TG---C---------A--------G-T------AA---TT---GG-TA------A-CA-CA--GT---C--CAACA-AT-T-TA---GCA---T-A-G---G---TGA--GAG-G---TAAATTT--GCAG-A--A-TG-TT--------T--A-------T-ACAACA-ATT-AA-G-ACAATT----AAGTAG-GATTAG-C-ATA---GGC-TTC-A-AG-----TGCA-TGC-ACATG-TA----TTG-GTAAA--TAGG--AGCAA-ANTA---TACA----GTTGT--A-A---TA-------TA-C-T-AATAGTTAG-CCAGAAATCCG-A---TG-TCTC---TA-TTT-A-GTCCAT-TG-TTT--TT-GC-AGT-CA-AATTT-GGCAATCA-G--TTT-T-GTTCAGT-GAC---TC---------TT---TGT----CTAATGTC--GG--GTAAT--TGTC-CCTGTAAGTATGGATA--CCCGCATA-TTGTCACAACAATG-TCCA-T-TTTTGTT-GTAG-TGTTCA-CCTACTGGT-ACAAAC-ACA-TTTT-G-CTGTTGA-T-GG---TC-TG-G----CG-GTGTCC-ATT--G-AT-----GCGGTTTCT-T-ANTTT--TTG--GCACGT---T-TCTCCAATGTAACATGATGGAACATAACAC-TGCAT-TGA-----ATC-AAATACACACAATTTTTTAGTTTCACATG-TGAA-GT-GGCCTTGA------A-------AT------TCATTTCCT--GAATT--TGG-AATT-CGGATATT--GGCA-----TCACTGGC---------TTTGGTG---AATG-GG--GGCAAAGTTTGCAGCGAGGTCTTTTCTTTCTTTT--TTTTTTTTTTACAAGGAAAGGTCCC-TCTTGGCATGCAGGGCGCAAGTTCACTATGTACCAGCATAC------GTTTGATATTAGGAGGTTGCCGGTAAGC-AATGA-CGGGAGGTTTAGGGAAATAGCT-CCTTTAGTT-GGTCGTC--CTCGTTGAT-AA-CATTTTGCATTTCCTTGGCAATGCGTTTGATAGGGCCTAATCCT--GGGTGA-TAGG-TTANTACAA-GAGGAATCCTGTCACCTTCT-GTCTCTGC-TGTGTT-GTACTGCAGTAATAGTT-CCGTGGTTTGGCCTTAGCTTTATCTATCTGGTTGTTAATTAAACCGGTGGTTAT
gi|1 : GTT-CACCAAAAGTGTAGTATA--------CATATG--C-A--CGAT-T-CT----TG-TAC-AC--A-AA------TT--A--GA-------GC-------AT------------G-----------T------GT--------A------G-------------------------G--TA---C---------A--------G-T------AAA--TT---GG-TA------AACA-AA--GT---C--CCACA----T-TA---GCA---T-A-G---G---TGA--GAG-G---TA--TTT--GCAG-A--A-TG-TT--------T--AAAAAAAAT-ATAGAA-AAT-AA-G-AAAATT----AAGTAT-GATTAG-C-ATA---GGCCTTA-A-AA-----TGCAATGC-ACATG-CAA---TTG-GGAAA--TAGGT-ACTAA-AATA---TATC----GTTGT--ACA---TA-------TG-C-T-AATAGTTAG-CCAGAAATCCA-A---TG-TCT----TA-TTT-A-G-CCAT-TG-TTT--T--GC-AGT-CA-AATTT-GGCAATCAAG--TTT-T-GTTCAGT-GAC---TC---------TT---TGT----CTAAT-TC--GG-----AT--TGTAACTTGTAAGTATGGATA--CC-G-ATA-TTGTCACA-CAATG-TCCA-T-TT--GTT-GTAG-TGTT-A-CCTACTGGT-ACAAA--ATA-TTTT-G-CTGTTGA-T-AGGT-TC-TG-G----CG-GTGTC--ATT--G-AT-----GCGGTTTCT-T-TATTT--TTG--GCACGT---T-TC--CAAAGTA-CATGATGGAACATA-CAC-TGCAT-TGA-----ATC-AAATA-ACACAATGTTTTTGTTTCACATG-TGAA-GT-G-------------A-------AT------TCATTTCCT--GAATT--TGG-AATTTCGGATATT--GGCA-----TCA-TGGCA--------TTTGG-G---AATGTGG--GGCAGAATTTGCAGCGAATTCTTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTACAAGGAAAGGTCCC-TCTTGGCATGCAGGGTGCAAGTTCACTATGCAGCAGCATAC------GTTTGATATTAGGATGTTGCCGGT-AGC-AATG--TGGGAGGTTTAGGG--ATAGTT-CCTTTAGTT-GGTT-TC--CTCGTTGAT-AATCATTTTGCATTTCCTTGGCAATGCGTTTGATAGGTGCTAAATCT--GACTGA-TAGGTTTATTACAATGAGGAATCCTGTCA-CTTCT-GTCTCTGCTTGTG-G-GTACTGCAGTAATAGTT-CCGTGGTTTTGGCTTAGCTTTATCTATCTGGTTGTTAATTAAACTGGTGGTTAT
gi|10 : ATGTT-CAT-AAAA----AGTA-A--------CATAT---C-A---GGT-G-TT-----G-TAT-G---C-AA------TT--A--GA-------GC------CAT-TAG-------GG-----------TTGCTGTGT--------G------G------C-T---T-C-AA-------G--TG---C---------ATGTTAG--G-T------AA---T----GG-TA------A-CA-CA--GT---A--CAAAC-AT-T-TA---G-A---TCA-G---G---TGA--GAG-G---TAAATTTTGGCAG-A--A-TG--T--------T--A-------T-ACACCACATT-AA-GAACAATT----AAGT-G-GATTAG-C-ATA---GGC-TTC-A-AA-----GCCA-GGT-ACATG-TA----TTG-GT-AA--TAGA--AGC---ATTA---TACG----GTAG---A-A---TA-------GA-C-T-AA-AG-TAGTCCAAAAATCCA-A---TG-TCT----TACTTT-A-GTCCAT-TGTTTT--TT-GC-Aatattgcactaggacctgtctgtaaggaatgtccaaggctaacgttgctggcctgttgcaaaattaagtcgttctg
gi|11 : atctATGTT-CAC-TAGAGT--A---TA--------CATATG--C-A--CGAT-G-TT----TG-TAC-AA--C-AA------TT--A--GA-------GC------CATCTAA-------GGACTGTGA----T------AT--------G------G------C-T---T-C-AA-------G--TG---C---------AATGTGTAGG-T------AG---TT---GG-TA------A-CA-----GT---C--CAACA-GT-T-TA---GGA---T-A-G---G---TGA--GAG-A---TAAATTT--GCAG-A--A-TG-TT--------T--A-------T-ACAACA-ATT-AA-G-AAAATT----AAGTAT-GATAAG-C-ATA---GGC-TTC-A-AG-----TGCA-TGC-ACATG-CA----TTG-GTAAA--TAGG--AGCAA-AA-A---TACA----ATTGC--A-A---TA-------TA-C-T-AATAGTTAG-CCAGAAATCCA-A---TG-TCTC---TA-TTT-A-GTCCc
gi|12 : gccattc--AGTATA--------CATATT--C-A--CAGT-G-TT----TG-TAC-AA--C-AA------TT--A--GT-------GT------CATCTAAAGGTTGTGG-----------T------GT--------G------G------C-T---T-C-AACTGCCATG--TG---T---------A--------GGT------AA---TT---GG-TA------A-CA-CA--GT---C--CAATA-TA-T-TA---GCA---T-A-G---A---TGA--AAG-G---TAAATTT--GCAG-A--A-TG-TT--------T--A-------T-ACAACA-ATT-AA-G-GCAATT----AAGTAA-GATTAG-C-ATA---GGC-TTC-A-A------TGCA-GGT-ACATG-TA----TTG-GTAAA--TAGG--AGCAA-ATTT---AACA----GTTGT--A-A---TA-------TA-C-T-AATAGTTAG-CCAGAAATCCG-A---
gi|13 : aa-CTTACTGGTGACAA-C-ACT-TTGT-GACTATTGA-TTGGCTCTT-TGTGTTCCCGTGTGCCCTATTCTG-ATATCTTGCCGTTTCT-TCATTTTGATTGCTGTTCGTGTCT-TCTCCAATGTACGATGATG------------TGTGT-TTGTCTTCATC-AAATAC-CA-AGTTTTTTAGTTTCACAAG-TGAA-CTAGGACTTGT------ACTTTTGGAT------TCATTCCTT--GACTCTGTGG-GATT-CTGATGTT--G
gi|14 : GTT-CAC-AAGAGT--A---TA--------TATATG--C-A--CGAT-G-TT----TG-TAC-AA--C-AA------TT--A--GA-------GC------CACCTAA-------GGGT---------T------GT--------GGTATTAG------C-T---T-CAA--------G--TG---C---------aaaggctagttcgactggcatgagtgcaa
gi|14 : agcaaatcaaCA-TTT-AA-G-AAATTT----AAGTGG-GATTAG-C-GTA---GGC-TTC-A-AG-----TGCA-TGT-ACATG-TA----TTG-GTAAA--TAGG--ATCAA-ACTA---TATA----GTTGT--A-A---TATACAATGTA-C-T-AATAGTTAG-CCGGAAATCCG-A---AG-TCTC---CA-TTT-A-GTCCAT-catttaagaaatttaagtgggattagcgtaggcttcaagtgcatgtacatgtattggtaaataggatcaaactatatagttgtaatatacaatgtactaatagttagccggaaatccgaagtctccatttagtccat
gi|15 : agcaaatcaagttcacaagagtatatatatgcacgatgtttgtacaacaattagagccacctaagggttgtggtattagcttcaagtgcTGCAGGACGAAAGTTCACTTTGTACCAGCATACTTGTACGTTTGATATTAGGAGGTTGCCGGTAAGC-AATGA-CGGGAGGTTTAGGGAA--------------TT-G-TCGTC--CTCGTTGAT-AA-CATTTTGCATTTCCTTGGCAATGCGTATGATAGGGCCTAATCCT--GGGTGG-TAGG-TTAATACGA-AAGGAATCCTGTCACCTTCC-TTCTCTGC-TATGTT-GTACTGCAGTAA
gi|16 : AATG-TCCACT-TTTTGTT-GTAG-TGTTCAACCTACTGGT-A-AAACAACA-TTTT-G-CTGTTT--T-GG---TCTTG-G----CG-GTGCTC-ATT--G-AT-----GCA--TTCTCT-ATTTT--TTGT-GCACAA---T-TCGCCAATGAAAT-TGATGAAACATTACACTTGCATGTGA-----ATCGAAATACACTTAATTTTTTAGTTTCACATGTTGAAGGT-GGCCTTGA------A-------
gi|17 : ATGTTTCAT-AAAAGT--A---TA--------CATATG--AGA--AGATAG-ATATAATGCTAT-AA----AA------TT--A--GA-------GC-------AT-TAA-------GGGTTGTGG----T------GT--------G------G------C-T---T-C-AA-------G--TG---CCCTGTTGTAG--------G-T------AA---TT---GG-TA------A-CA-CA--GT---CAACAA-A-AT-A-TATAGGCA---T-A-A---GAGATGA--GAA-GAGATAA-TTT--GCAG-A--A-TG-TT--------T--A-------T-ACAA-A-ATTAAA-G-ACAATT----AAGTAG-Gttaaaaaattc
gi|18 : aagcaatcGTATA--------CATATG--C-AT-CATT-G-TT-----G--AC-AAACC-AA------TT--A--GA-------GC------CACCTAA-------GG-----------G------GTTGGTATA-G------G------C-TTCCT-C-A--------G--TGTGCC---------ACAAT----G-T------AA--------GG-TA------A--A-TG--GT--------ACA-GT-C-TA---TCA---T-G-A---G---T----AAG-G---TAAA
gi|18 : gcaaatccatgtttatagg------AA---AT---GA-TA------A-CAATAATGT---C--CCTTA-AT-T--A---ACA---T-ACG---A---TGA--GAG-----TAAATTTC-GCAG-A--A-TG-TT--------T--aaatgataacaataatgtcccttaattaacatacgatgagagtaaatttcgcagaatgttttt
gi|19 : gcaaatccatgtttatagggtatacatatgcatcattgttgacaaaccaattagagccacctaaggggttggtataggcttcctcagtgtgccacaatgtaaggtaaatggtacagtctatcatgagtaaggtaaaATGTT-GAC-AAGAGT----T-TA--------CCTATG--C-A--CGAT-G-TT----TG-TAC-AA--C-AA------TT--A--GA-------GC------CATCTAA-------GGGT---------T------GT--------G------GTATTGTC-T---T-C-AAATTCCATG--TG---T---------A--------GGT------AA---TT---GG-TA------A-CA-CA--GT---C--CAACA-GT-T-TA---GGA---T-G-A---G---TGA--GAG-G---TACATTT--GCAG-A--A-TG-TT--------T--A-------T-ATAATA-ACT-tt
gi|2 : agcaaatcAATGTT-CAC-AAAAGTT-AGTATA--------CATATG--C-A--CGAT-G-TT----TG-TAC-AA--C-AA------TT--A--GA-------GC------CAT------------G-----------T------GT--------A------G-------------------------G--TA---C---------A--------G-T------AA---TT---GG-TA------A-CA-CA--GT---C--CAACA-AT-T-TA---GCA---T-A-G---G---TGA--GAG-G---TAAATTT--GCAG-A--A-TG-TTAAAAAAAAT--A-------T-AGAACA-ATT-AA-G-AAAATT----AAGTAT-GATTAG-C-ATA---GGC-TTA-A-AG-----TGCA-TGC-ACATG-CA----TTG-GGAAA--TAGG--ACTAA-AATA---TACA----GTTGT--A-A---TA-------TG-C-T-AATAGTTAG-CCAGAAATCCA-A---TG-TCTC---TA-TTT-A-GCCCAT-TG-TTT--T--GC-AGT-CA-AATTT-GGCAATCA-G--TTT-T-GTTCAGT-GAC---TC---------TT---TGT----CTAATGTC--GG-----AT--TGTA-CTTGTAAGTATGGATA--CC-G-ATA-TTGTCACA-CAATG-TCCA-T-TTGTGTT-GTAGCTGTT-A-CCTACTGGT-A-AAAC-ATA-TTTT-G-CTGTTGA-T-GG---TT-CG-G----CG-GTGTC--ATT--G-AT-----GCGGTTTCT-T-TATTT--TTG--GCACGT---TGTCTCAAA-GTAACATGATG--ACATAACAC-TGCATCTGG-----ATC-AA-TACACACAATGTTTTTGTTTCACATG-TGAA-GT-G-------------A-------AT------TCATTTTCTCTGA-TT--TGG-AATTTCGGATATTTGGGCAAAATCCCACTGGCCCCAAAAATTTTGGGGGGGAATG-GG--GGCAGAGTTTGCAGCGAATTCTTTTCTTTCTTTT--TTTTTTTTTTACAAGGAAAGGTCCC-TCTTGGCATGCAGGGTGCAAGTTCACTATGCAGCAGCATAC------GTTTGATATTAGGATGTTGCCGGTAAGC-AATGN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTCCTTTAGTT-GGTTGTC--CTCGTTGAT-AA-CATTTTGCATTTCCTTGGCAATGCGTTTGATAGGGCCTAATCCT--GGATGA-TAGG-TTATTACAA-GAGGAATCCTGTCACCTTCT-GTCTCTGC-TGTGTT-GTACTGCAGTAATAGTTCCCGTGGTTTGGCCTTAGCTTTATCTATCTGGTTGTTAATTAAA-CGGTGGTTATcctaaataagtatcgaataaagat
gi|20 : t--CGGT-G-TT----TG-T-------T-AA------TT--GATGA-------GC-------ATCTAA-------GGGATTTGATGTGT------GT--------G------G------C-T---TGT-AAC------G--TGA--C---------AT-------G-T------GT---TA---GG-TATGAGAGA-CA--A--AT---C--CAGAA-ATATATA---GCA---T-G-G---G---TGA--GGG-GG--TA--TTT--GCAGGA--A-TG-TC--------TTAA-------T-AAAA-G-ATT-AACG-A-AATT----AAGTAG-GATTAG-CAATA---GGC-TT
gi|21 : tc---TG-TCTC---TA-TTT-A-GTCCAT-TG-TTT--TG-GC-AGT-CA-AATTT-GGCAATCA-G--TTTGT-GTTCAAT-GAT---TC---------TTCTTTGT----CTAATGTC--AG--GTGAT--TGTC-TCTGCA-GTATGGAAA--TCCCCATA-TTGTCACAACAGTG-TTCA-C-TTTTGTT-GTAG-TGTTCA-CCTACTGGT-ACAAAC-ATA-Taa
gi|22 : -AAAAAA--AGTA-A--------CATATG--C-A--ATGA-G-TT----C--TAC-AA--C-AA------TTGGA--GA-------GC------CATCTTG-------GG-----------T------GTTGTGGTATG------G------CCT---T-C-AA-------G--TG---CCATTTATA-G--------G-T------AA---TT---GG-AA------A-CA-CA--GT---C--CAATG-GT-T-TA---G-A---T-A-G---G---TAA--GAA-G---
gi|23 : aagcgcaatcatttcaccaaaaaaaaaATGCT-CAT-AAAAGT--A-TA-A--------CATATG--C-A--CGGT-G-TT----TG-T-C-AA--C-A--------T--AG-GA-------GC------CATCTAT-------GGGTTCTGTCA--T------AT--------G------G------C-T---T-C-A--------AATTG---C---------ATGTGTAG-G-T------AAAATTT---TG-CA------A--A-AA--G----C--CAACA-GT-T-TA---GAA---T-A-G---GT--TGA--GAGAG---TAaag
gi|24 : cc------TCATGTCCT--GAATT--TGGGAATT-CGATTACT--GGCA-----TCACTGGC------------GATG---AGTG-GG----CAAAGTTTGCAGCGAGG--TTTTCT
gi|24 : CAGGGCGCAAGT----TATATAC---------------TTT-ATATAAGG-GGTTGCC-GTAAGTGAATGA-acacagggcgcaagttatatactttatataaggggttgccgtaagtgaatgaggaaaat
gi|25 : tcatgtcctgaatttgggaattcgattactggcatcactggcgatgagtgggcaaagtttgcagcgaggttttctacaTA-TTGTCACA-----------------TGTT-GTAG-TGTTCA-CCTACTGGT-ACAAAT-ACATTTTT-G-CTGTTGA-T-GG---TC-TG-G----CG-GTGTCggaaaat
gi|26 : GCAA-AACA---TACA----GTTGT--A-T---TA-------TA-C-T-GATAGTTAG-CCAGAAATCCG-A---TG-
gi|27 : ATGTT-CAC-AAACGT--A---TA--------CATATG--C-A--CGGT-G-TT----T
gi|28 : gaagcaaatcTGTT-CAC-AAAAGT--A---TA--------CATATG--C-A--CGGT-G-T
gi|29 : caaatcATGTT-CAC-AAA-----AGTATA--------CATATG--
gi|3 : ctgaagcaaatcAATGTT-CAC-AAAAG----GTATATTTAAAAACATATGGCT-AATTGAT-GATT----TG-TAA-TA--C-AAACGTATTT--G--G----------------CATTCAA-------TG-----------T------GTT-------A------G------T-G---C-C-A--------GG-TG---T---------T--------G-TTGAGGGAA---TTTATGG-TA------A-CA-CA--GTGTTC--CA-CAGATAT-TA---GCAAAAT-A-GCCAG---TGAAGGAGTG---TAAATT---GCGA-A--G-TA-TA--------T--A-------TTACAACA-ATA-AC-G-AAAATT----AAGTAGCGATTAG-C-ATA---GTCCTTC-ACAGGTCTATGCAATGCTACATG-TA----TTGAGTAAAAATAGGGAAGTAACAATA---TACA----GTTGT--A-AGAATA-------TA-CCT-AATAGTTAG-CCGAGAATCCA-AAAGTG-TCTTACTTA-TTT-A---TCAT-CG-TCTCTTT-GC-AGTTCACAATTT-GGCAATCA-G--TTT-TTGTTCAGCCGAT---TCATCTATCTATT---TGTAAATCTAATGTTCTAGCCGTA-T--TGTC-CCTGTA-GTATGGATATACCCGCATA-TTGTCACAACAAT---------------T-GTAG-TGTTCA-CCTACTGGT-ACAAAC-ACA-TTTTTA-ATGTTGA-T-GG---TC-TG-G----CG-GTGTCC-ATT--G-AT-----GCGGCTTCT-T-ATTTT--CTG--CCACTT---T-TCTCCAATGT-ACATGATGGAACAT-ACAC-TGCAT-TGA-----ATC-AAATACACACAA-TTTTTAGTTTCACATG-TGAA-GT-GGCCTTGAATTGAGA-------AT------TCATTTCCT--GAATT--TGT-AATT-CGGACATT--GGCA-----TCACTGGC-------------------AATG-AGTCGGCAAAAATTGCAGCGAGG-----------GTTT--TTTTTTTTTTACAAAGAAAGGTCCC-TCTTGGCATGCAGGGCGCAAGTTCACTATGTACCAGCATAC------GTTTGATATTAGGAGGTTGCCGGTAAGC-AATGA-CGGGAGGTTTAGGG-AATAGCT-CCTTTAGTT-GGTCGTC--CTCGTTGAT-AA-CATTTTGCATTTCCTTGGCAATGCGTTTGATAGGGCCTATTCCT--GGGTGA-CAGG-TT
gi|30 : caaatc---GCA---T-A-G---A---TGA--AAG-G---TAAATTT--GCAG-A--A-TG-TT--------
gi|4 : -ATA---GGC-TTC-ATAG------GCA-TG--AGATGATAAGTCTTC-GTAAA--TAGG--AGCAA-A-TA---TACA----ATTGT--A-A----A-------TA-C-C-AATAGTTAG-CCAGAAATCCA-A---TG-TCTC---AA-TTTTA-GTCCATGTG-TTT--TTTAC-AGT-CA-AATTTTGGCAATCA-GA-TTT-T-GTTCCGT-GAC---TCCTC------TT---TGT----CTAATGTC--AA--GTAATATTGTC-TCTGTAAATATGGATA--CCCGCATACTTGTCACAACAATGCTCCA-TCTTTTGTTTGTAG-TGT---------------CAAAC-ACA-TTTT-G-CTGTTGAAT-GG---TC-TG-G-----G-GCGTCC-ATT--GGAT-----GCGGTTTCT-T-ATTTT--TTG--GTACGT---T-TCTCCA-CGTAAAATGCTG-AACA--ACAC-TGCAT-TGA-----ATC-AAATACACACAATTCTT-AGTTTCACATG-TGAA-GT-GGCCTTGA------A-------ATTGAGAATCATTTCCT---AATT--TGG-AATT-CGGATATT--GGCA-----TCACTG------------TTGTTG---AGT---G--GGTAAAGTTTACAACGAGG----------------------TTTTTACACGAAAAGGCCCCTTCTTGGCATACAGGGCGC
gi|4 : C-AATGAACGGGAGATTTAGGGAAATAGCT-CCTTTAGTTTGGTCGTCACTTCTTTGATGAA-CATTTTGCATTTC-TTGGCAATGCGTTTGATAGGGCCTAATCCTTTGGGTGAATAGG-TTAATACAA-GAGGAATCCTGTCACCTTTTTGTCTCTGC-TGTGTTTGTACTGCA-TAATAGTTACCGTGGTTTGGCCTTAGCCTTATCCATCTGGTTGCTAAT--AACCGGT-GTTATcaatgaacgggagatttagggaaatagctcctttagtttggtcgtcacttctttgatgaacattttgcatttcttggcaatgcgtttgatagggcctaatcctttgggtgaataggttaatacaagaggaatcctgtcacctttttgtctctgctgtgtttgtactgcataatagttaccgtggtttggccttagccttatccatctggttgctaataaccggtgttatctcctagatggctgaatgcaatttggtcaacgtccctgagtgtcgctatcttgagtcgagttctg
gi|5 : ataggcttcataggcatgagatgataagtcttcgtaaataggagcaaatatacaattgtaaataccaatagttagccagaaatccaatgtctcaattttagtccatgtgttttttacagtcaaattttggcaatcagattttgttccgtgactcctctttgtctaatgtcaagtaatattgtctctgtaaatatggatacccgcatacttgtcacaacaatgctccatcttttgtttgtagtgtcaaacacattttgctgttgaatggtctggggcgtccattggatgcggtttcttattttttggtacgtttctccacgtaaaatgctgaacaacactgcattgaatcaaatacacacaattcttagtttcacatgtgaagtggccttgaaattgagaatcatttcctaatttggaattcggatattggcatcactgttgttgagtgggtaaagtttacaacgaggtttttacacgaaaaggccccttcttggcatacagggcgcATGTT-CAC-AAAAGT--A---TA--------CATATG--C-A--CGGT-G-TT----TG-TAC-AA--C-AA------TT--A--GAATTTAGAGC------CATCTAA-------GGGTTGTG-----T------GT--------G------G------C-T---T-C-AA-------G--TG---CCACGTGTA-G--------G-T------AA---TT---GG-TA------A-CA-CA--GT---C--CAACA-AT-T-TA---GCA---T-A-G---G---TGA--GAG-G---TAAATTT--GCAG-A--A-TG-TA--------T--A-------T-ACAACA-ATT-AA-G-ACAATTTTAAAAGTAG-GATTAG-C-ATA---GGC-TTC-A-A------TGCA-GGT-ACATA-TA----TTG-GTAGA--TAGG--AGCAA-ATTA---TACA----GTAGT--A-A---TA-------TA-A-T-AATAGTTAG-CCAGAAATCCA-A---TT-TTTC---TA-TTT-A-GTCCAT-TG-TTT--TT-GC-AGT-AA-AATAT-GGCAATCA-AT-TTT-T-GTTCAGT-GACTCTTC---------TT---TGT----CTAATGTC--AG--GTAAT--TATC-CCTGTAA-TATGGATA--CCCGCATA-TTGTCACAACAATG-TCCA-C-TTTTGTT-GTAG-TGTTCA-CCTACTGGT-ACAAAC-ACATTTTT-G-CTGTTGA-T-GG---TC-TG-G----CG-GTGTCC-ATT--G-AT-----GCGGTTTCT-T-ATTTT--TTG--GCACGT---T-TCTCCAATGT-ACATGATGGAACAT-ACAC-TGCAT-TGA-----ATC-AAATACACACAATTTTTctcctagatggctgaatgcaatttggtcaacgtccctgagtgtcgctatcttgagtcgagttctg
gi|6 : caaatcTATT-AAC-AAAAGT--A-T-TA--------CATATG--C-A--CGAT-G-CT----TGTTACAAA--CAAA------TT--A--G--------GT------CATCTAA--------G-----------T------GT--------
gi|6 : GT-G-TTG---TA-TAC-AA--C-CC------TT--A--GA-------GATGGGAGCGTCTAATT-----GT-----------T------GT--------ACAA---A------T-G---T-C-A--------C--TG---T---------A--------GGT------AA---TT---GG-TA------A-CA-TA--GT---C--CAACA-GT-T-T----GCA---T-A-G-------TGA--GAG-G---TAA--TT--GCAG-AGAA-TGGTT--------T--A-------T-ACAACA-ATT-AA-G-ACAATT----AA-TAG--ATTAG-C-ATATTAGGC-TTC-A-AG-----TGCAGTGC-ACATG-TA----TTG-GTAAA--TAGG--AGCAA-ACTAGCATACACGGAGTAGTGAA-A---TAA------TAGC-TGAATAGTTAG-CCA-AAATCCA-A----G-TCTC---TAATTT-A-GTCCAT-TG-TTT--TT-GC-AGT-CA-AATTT-GGCAATtgtatacaacccttagagatgggagcgtctaattgttgtacaaatgtcactgtaggtaattggtaacatagtccaacagtttgcatagtgagaggtaattgcagagaatggtttatacaacaattaagacaattaatagattagcatattaggcttcaagtgcagtgcacatgtattggtaaataggagcaaactagcatacacggagtagtgaaataatagctgaatagttagccaaaatccaagtctctaatttagtccattgtttttgcagtcaaatttggcaat
gi|7 : tattaacaaaagtattacatatgcacgatgcttgttacaaacaaattaggtcatctaaATGT--CAC-AAAA----AGTATA--------CATATG--C-A--CGGT-G-TT----TG-TAC-AA--C-AA------TT--A--GA-------GC------CATCTAA-------GA-----------T------GT--------G------G------C-T---C-CAA--------G--TG---C---------C--------A-TGTGTA-AA---TT---GGTTG------A-CA-CA--GT---C--CAACA-AT-T-TA---GCA---T-A-G---G---TGA--GAG-G---TAAATTT--GCAG-A--A-TG--T--------T--A-------T-ACA-------------ACAATT----AAGTAG-GATTAGAG-ATA---GGC-TTCAA-AG-----AGC---GT-ACATG-TA----TTG-GTAAA--TAGG--AGCAA---TA---TACA----GTTGT--A-A---TA-------CA-C-T-AATAGTTAG-CCACAAACCCGAA---TG-TCTC---TA-TTT-A-GTCCAT-TG-TTT--TT-GC-AGT-CA-AA-TT-GGCAATCA-A--TTT-T-TCTTAG
gi|8 : caaatcAAAGT--A-T-TA--------CATATG--C-A--CGAT-G-CT----GG-TAC-AA--C-AAT-----TT--A--GA-------GT------CATCTAA--------G-----------T------GT--------G------gattatccgtagatttaaagtccaagtag
gi|8 : tattatTA--------CCTACA--C-G--TGAC-A-TT----TG-TAC-AA--C-AA------TT--A--GA---------------CATCTAAG------GG-----------T------GT--------G------tatatcacacccttagatgtctaattgttgtacaaatgtcacgtgtaggtaattggtaacatagtccaacagtttagcataggtgagcggtaattgcagaaatggtttatacacaattaagacaattaagtaggattagcatattaggcttcaagtgcatgcacatgtattggtaaataggagcaaactatacagtagtaatatactaatagttagccagaaatccaatgtctctatttagtccattgtttttgcagtcaaatttggcaatca
gi|8 : tattataaagtattacatatgcacgatgctggtacaacaatttagagtcatctaagtgtgtatat---T-C-AC-------G--TG---T---------A--------GGT------AA---TT---GG-TA------A-CA-TA--GT---C--CAACA-GT-T-TA---GCA---T-A-G---G---TGA--GCG-G---TAA--TT--GCAG-A--AATGGTT--------T--A-------T-ACA-CA-ATT-AA-G-ACAATT----AAGTAG-GATTAG-C-ATATTAGGC-TTC-A-AG-----TGCA-TGC-ACATG-TA----TTG-GTAAA--TAGG--AGCAA-ACTA---TACA----GTAGT--A-A---TA-------TA-C-T-AATAGTTAG-CCAGAAATCCA-A---TG-TCTC---TA-TTT-A-GTCCAT-TG-TTT--TT-GC-AGT-CA-AATTT-GGCAATCA-attggtaacatagtccaacagtttagcataggtgagcggtaattgcagaaatggtttatacacaattaagacaattaagtaggattagcatattaggcttcaagtgcatgcacatgtattggtaaataggagcaaactatacagtagtaatatactaatagttagccagaaatccaatgtctctatttagtccattgtttttgcagtcaaatttggcaatca
gi|9 : tattataaagtattacatatgcacgatgctggtacaacaatttagagtcatctaagtgtgtatatcacacccttagatgtctaattgttgtacaaatgATGTT-C-C-TAAAGC----TATA---------AT-TG--C----CGGT-G-TT----TA-TTT-AA--C-AT------GT--A--GA-------GC------CAT-TAA-------GGGT---------T------GT--------GCTTGT-G------C-T---T-C-CTGCCT---G--TG---T---------A----------T------AA---T----GG-TA--------CA-CA--GT---C--CAACC-AT-T-CA---GCA---T-A-GT--G---TGA------G---TAA--TT--CCAG----A-TGCTT--------T--A-------T-CCAACC-ATT-AA-G-ACAATT-----AGTA--GATTCG-C-CT----GGC-TTC-A-AG------GGA--GT-ACATG-TA----TT--GTAA----GGG--AGCAC-TTTA---TACA-----TTTT--A-A---T--------TA-C-T---TAGTTAG-CCA-AAAT-CG-A---TGCTCTC---T--TTT-AGGTCC-T-TG-TTT--TT-GCAAGT-C--GATT---GC-ATCA-ATTTTT-T-GTTCGGT-GAC---TC---------TT---
Alignments
lowQualScore : 222222222222222 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 1111111 111 1111111 1111111 2222 111 333333333 111 1111 22222 1 111111 1 111 1111 11 11111 11 111 1 44444444444444444444444444444 1 22222 7777777777777777777 11 44444444444444444 1 222222 111 11 11 1 1 1 111 2
lowQualScore : 2 2 666666666666666 22 2 44 1 1 6666 4 2 22 2 777777 22 44 6666666 555555 3 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 666 444 2 666666 2 1 444 2 33 55 4 2 333 333 2 2 6666666 22 4 555 5 55 2 33 2 7 99999999 33 2222222 11 2 2 2 2 2 6666 22 3 2 000 2 2 3 6 0000000 3 88 44 3 9999 3 44 77 2 4 555 6666 888 2 2222222 5 2 2 1 33 444 2 555 6 3 3 3 88 55 3 4 4 4 2222 5 5 000 222222222 000 4444 99 0 44444 99 6 1 99 777 5 2 0 5 000000 5 5 5 4 4 1 4 3 5 5 5 555 5 5 0000 5 00 77 5 44444 5 5 77 33 000 5 1 3 66 6 5 5 5 1 5 5 6 6 6 00000000000000000000000000000 99 3 99 6 3 99 00000 4444444444444444444 8 11 44444444444444444 0 0 333333 0 0 6 77 333 0 8 8 11 8 8 11 8 8 1 0 2 0 0 000 2 6 7 6 6
lowQualScore : . . ............... .. . .. . . .... . . .. . ...... .. .. ....... ...... . .......................................................................................................... ... ... . ...... . . ... . .. .. . . ... ... . . ....... .. . ... . .. . .. . . ........ .. ....... .. . . . . . .... .. . . ... . . . . ....... . .. .. . .... . .. .. . . ... .... ... . ....... . . . . .. ... . ... . . . . .. .. . . . . .... . . ... ......... ... .... .. . ..... .. . . .. ... . . . . ...... . . . . . . . . . . . ... . . .... . .. .. . ..... . . .. .. ... . . . .. . . . . . . . . . . ............................. .. . .. . . .. ..... ................... . .. ................. . . ...... . . . .. ... . . . .. . . .. . . . . . . . ... . . . . .
lowQualScore : 5 4 111111111111111 66 0 55 8 8 0000 0 0 88 0 888888 88 88 5555555 888888 3 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 555 111 4 888888 4 6 111 4 22 44 4 2 777 777 1 1 7777777 99 2 888 4 99 5 44 5 5 11111111 77 1111111 99 7 7 9 9 5 1111 99 1 9 000 9 9 1 2 2222222 1 33 33 1 6666 1 22 33 9 8 000 1111 999 9 1111111 7 9 9 2 11 777 9 444 2 1 1 3 66 77 6 0 0 0 3333 0 0 000 999999999 000 2222 22 7 55555 22 7 0 22 555 7 0 1 0 999999 0 0 6 4 4 1 4 3 0 0 0 666 0 0 6666 0 00 99 7 33333 7 7 99 66 000 7 4 9 44 6 7 7 7 4 7 0 7 7 7 22222222222222222222222222222 22 2 22 7 3 22 00000 2222222222222222222 0 00 66666666666666666 0 8 000000 8 8 7 55 222 4 0 0 00 0 0 00 0 0 0 0 5 0 0 222 5 7 3 7 7
consensus : NAATGTT-CAC-AAAAGT--AGTAT--------ACATATG--C-A--CGGT-G-TT----TG-TAC-AA--C-AA------TT--A--GA-------GC------CATCTAAG-----G-------G----------T------G---T-G------G------C-TT-C--AA-------G----TG---C---------A--------G-T------AA---T---TGGT-A------A-CACAG---T-C--CAACAG-T-T-TA---GC---AT-A-G---G---TGA--GAG-G---TAAATTT--GCAG-A--A-TG-TT--------T--A-------TACAACA-ATT-AA-G-ACAATT----AAGTAG-GATTAG-C-ATA---G-GC-TTC-A-AG-----TGC-A-TGC-ACATG-TA----TTG-GT--AAATAGG--AGCAA-ANTA---TACA----GTTGT---A-ATA-------TA-CT-AATAGTTAG-CCAGAAATCCG-A---TG-TCT---CTA-TTT-A-GTCCAT-TG--TTTTT-GC-AG-TCA-AATTT-GGCAATCA-G--TTT-TGTTCAG-TGAC---TC---------TT---TG----TCTAATGT--CGG--GTAAT--TGTC-CCTGTAAGTATGG--ATACCCGCATA-TTGTCACAACAATG-TCCA-T-TTTTGTT-GTAG-TGTTCA-CCTACTGGT-ACAAAC-ACA-TTTTG-CTGTTGA-T-GG---TC-TG-G----CG-GTGTCC-ATT--G-AT-----GCGGTTTCT-T-ATTTT--TTG--GCACGT---T-TCTCCAATGTAACATGATGGAACA-TA-CAC-TGCAT-TGAATC-AAATACACACAATTTTTTAGTTTCACATG-TGAA-GT-GGCCTTGA------A-------AT------TCATTTCCT--GAATT--TGG-AATT-CGGATATT--GGCA-----TCACTGGC---------TTTGGTG---AATG-GG--GGCAAAGTTTGCAGCGAGGTCTTTTCTTTCTTTT--TTTTTTTTTTACAAGGAAAGGTCCC-TCTTGGCATGCAGGGCGCAAGTTCACTATGTACCAGCATAC------GTTTGATATTAGGAGGTTGCCGGTAAGC-AATGA-CGGGAGGTTTAGGGAAATAGCT-CCTTTAGTT-GGTCGTC--CTCGTTGAT-AA-CATTTTGCATTTCCTTGGCAATGCGTTTGATAGGGCCTAATCCT--GGGTGA-TAGG-TTANTACAA-GAGGAATCCTGTCACCTTCT-GTCTCTGC-TGTGTT-GTACTGCAGTAATAGTT-CCGTGGTTTGGCCTTAGCTTTATCTATCTGGTTGTTAATTAAACCGGTGGTTAT
Reference ( family-1618 ) : NAATGTT-CAC-AAAAGT--AGTAT--------ACATATG--C-A--CGGT-G-TT----TG-TAC-AA--C-AA------TT--A--GA-------GC------CATCTAAG-----G-------G----------T------G---T-G------G------C-TT-C--AA-------G----TG---C---------A--------G-T------AA---T---TGGT-A------A-CACAG---T-C--CAACAG-T-T-TA---GC---AT-A-G---G---TGA--GAG-G---TAAATTT--GCAG-A--A-TG-TT--------T--A-------TACAACA-ATT-AA-G-ACAATT----AAGTAG-GATTAG-C-ATA---G-GC-TTC-A-AG-----TGC-A-TGC-ACATG-TA----TTG-GT--AAATAGG--AGCAA-ANTA---TACA----GTTGT---A-ATA-------TA-CT-AATAGTTAG-CCAGAAATCCG-A---TG-TCT---CTA-TTT-A-GTCCAT-TG--TTTTT-GC-AG-TCA-AATTT-GGCAATCA-G--TTT-TGTTCAG-TGAC---TC---------TT---TG----TCTAATGT--CGG--GTAAT--TGTC-CCTGTAAGTATGG--ATACCCGCATA-TTGTCACAACAATG-TCCA-T-TTTTGTT-GTAG-TGTTCA-CCTACTGGT-ACAAAC-ACA-TTTTG-CTGTTGA-T-GG---TC-TG-G----CG-GTGTCC-ATT--G-AT-----GCGGTTTCT-T-ATTTT--TTG--GCACGT---T-TCTCCAATGTAACATGATGGAACA-TA-CAC-TGCAT-TGAATC-AAATACACACAATTTTTTAGTTTCACATG-TGAA-GT-GGCCTTGA------A-------AT------TCATTTCCT--GAATT--TGG-AATT-CGGATATT--GGCA-----TCACTGGC---------TTTGGTG---AATG-GG--GGCAAAGTTTGCAGCGAGGTCTTTTCTTTCTTTT--TTTTTTTTTTACAAGGAAAGGTCCC-TCTTGGCATGCAGGGCGCAAGTTCACTATGTACCAGCATAC------GTTTGATATTAGGAGGTTGCCGGTAAGC-AATGA-CGGGAGGTTTAGGGAAATAGCT-CCTTTAGTT-GGTCGTC--CTCGTTGAT-AA-CATTTTGCATTTCCTTGGCAATGCGTTTGATAGGGCCTAATCCT--GGGTGA-TAGG-TTANTACAA-GAGGAATCCTGTCACCTTCT-GTCTCTGC-TGTGTT-GTACTGCAGTAATAGTT-CCGTGGTTTGGCCTTAGCTTTATCTATCTGGTTGTTAATTAAACCGGTGGTTAT
gi|1 : GTT-CACCAAAAGTGTAGTAT--------ACATATG--C-A--CGAT-T-CT----TG-TAC-AC--A-AA------TT--A--GA-------GC-------AT------------------G----------T------G---T-A------G-----------------------G----TA---C---------A--------G-T------AAA--T---TGGT-A------AACAAAG---T-C--CCACA----T-TA---GC---AT-A-G---G---TGA--GAG-G---TA--TTT--GCAG-A--A-TG-TT--------T--AAAAAAAATATAGAA-AAT-AA-G-AAAATT----AAGTAT-GATTAG-C-ATA---G-GCCTTA-A-AA-----TGC-AATGC-ACATG-CAA---TTG-GG--AAATAGGT-ACTAA-AATA---TATC----GTTGT---ACATA-------TG-CT-AATAGTTAG-CCAGAAATCCA-A---TG-TCT----TA-TTT-A-G-CCAT-TG--TTTT--GC-AG-TCA-AATTT-GGCAATCAAG--TTT-TGTTCAG-TGAC---TC---------TT---TG----TCTAAT-T--CGG-----AT--TGTAACTTGTAAGTATGG--ATACC-G-ATA-TTGTCACA-CAATG-TCCA-T-TT--GTT-GTAG-TGTT-A-CCTACTGGT-ACAAA--ATA-TTTTG-CTGTTGA-T-AGGT-TC-TG-G----CG-GTGTC--ATT--G-AT-----GCGGTTTCT-T-TATTT--TTG--GCACGT---T-TC--CAAAGTA-CATGATGGAACA-TA-CAC-TGCAT-TGAATC-AAATA-ACACAATGTTTTTGTTTCACATG-TGAA-GT-G-------------A-------AT------TCATTTCCT--GAATT--TGG-AATTTCGGATATT--GGCA-----TCA-TGGCA--------TTTGG-G---AATGTGG--GGCAGAATTTGCAGCGAATTCTTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTACAAGGAAAGGTCCC-TCTTGGCATGCAGGGTGCAAGTTCACTATGCAGCAGCATAC------GTTTGATATTAGGATGTTGCCGGT-AGC-AATG--TGGGAGGTTTAGGG--ATAGTT-CCTTTAGTT-GGTT-TC--CTCGTTGAT-AATCATTTTGCATTTCCTTGGCAATGCGTTTGATAGGTGCTAAATCT--GACTGA-TAGGTTTATTACAATGAGGAATCCTGTCA-CTTCT-GTCTCTGCTTGTG-G-GTACTGCAGTAATAGTT-CCGTGGTTTTGGCTTAGCTTTATCTATCTGGTTGTTAATTAAACTGGTGGTTAT
gi|10 : ATGTT-CAT-AAAA----AGTA---------ACATAT---C-A---GGT-G-TT-----G-TAT-G---C-AA------TT--A--GA-------GC------CAT-TAGG-----GTTGCT--G----------T------G---T-G------G------C-TT-C--AA-------G----TG---C---------ATGTTAG--G-T------AA---T----GGT-A------A-CACAG---TAC--AAACA--T-T-TA---G----ATCA-G---G---TGA--GAG-G---TAAATTTTGGCAG-A--A-TG--T--------T--A-------TACACCACATT-AA-GAACAATT----AAGT-G-GATTAG-C-ATA---G-GC-TTC-A-AA-----GCC-A-GGT-ACATG-TA----TTG-GT---AATAGA--AGC---ATTA---TACG----GTAG----A-ATA-------GA-CT-AA-AG-TAGTCCAAAAATCCA-A---TG-TCT----TACTTT-A-GTCCAT-TGT-TTTTT-GC-Aatattgcactaggacctgtctgtaaggaatgtccaaggctaacgttgctggcctgttgcaaaattaagtcgttctg
gi|11 : atctATGTT-CAC-TAGAGT--A---T--------ACATATG--C-A--CGAT-G-TT----TG-TAC-AA--C-AA------TT--A--GA-------GC------CATCTAAG-----GACT----G----------T------GATAT-G------G------C-TT-C--AA-------G----TG---C---------AATGTGTAGG-T------AG---T---TGGT-A------A-CA--G---T-C--CAACAG-T-T-TA---GG---AT-A-G---G---TGA--GAG-A---TAAATTT--GCAG-A--A-TG-TT--------T--A-------TACAACA-ATT-AA-G-AAAATT----AAGTAT-GATAAG-C-ATA---G-GC-TTC-A-AG-----TGC-A-TGC-ACATG-CA----TTG-GT--AAATAGG--AGCAA-AA-A---TACA----ATTGC---A-ATA-------TA-CT-AATAGTTAG-CCAGAAATCCA-A---TG-TCT---CTA-TTT-A-GTCCc
gi|12 : gccattc--AGTAT--------ACATATT--C-A--CAGT-G-TT----TG-TAC-AA--C-AA------TT--A--GT-------GT------CATCTAAA-----G-------G----------TTGTGGTG---T-G------G------C-TT-C--AACTGCCATG----TG---T---------A--------GGT------AA---T---TGGT-A------A-CACAG---T-C--CAATAT-A-T-TA---GC---AT-A-G---A---TGA--AAG-G---TAAATTT--GCAG-A--A-TG-TT--------T--A-------TACAACA-ATT-AA-G-GCAATT----AAGTAA-GATTAG-C-ATA---G-GC-TTC-A-A------TGC-A-GGT-ACATG-TA----TTG-GT--AAATAGG--AGCAA-ATTT---AACA----GTTGT---A-ATA-------TA-CT-AATAGTTAG-CCAGAAATCCG-A---
gi|13 : aa-CTTACTGGTGACAA-C-ACT-TTGTGACTATTGA-TTGGCTCTT-TGTGTTCCCGTGTGCCCTATTCTG-ATATCTTGCCGTTTCT-TCATTTTGATTGCTGTTCGTGTCT-TCTCCAATGTACGATGATG---TG-TG-T-T-TGTCT-TCA-TC-AAATAC-CA-AGTTTTTTAGTTTCACAAG-TGAA-CTAGGACTTGT------ACTTTTGGAT------TCATTCCTT--GACTCTGTGG-GATT-CTGATGTT--G
gi|14 : GTT-CAC-AAGAGT--A---T--------ATATATG--C-A--CGAT-G-TT----TG-TAC-AA--C-AA------TT--A--GA-------GC------CACCTAAG-----G-------GT---------T------G---T-GGTATTAG------C-TT-C--AA-------G----TG---C---------aaaggctagttcgactggcatgagtgcaa
gi|14 : agcaaatcaaCA-TTT-AA-G-AAATTT----AAGTGG-GATTAG-C-GTA---G-GC-TTC-A-AG-----TGC-A-TGT-ACATG-TA----TTG-GT--AAATAGG--ATCAA-ACTA---TATA----GTTGT---A-ATATACAATGTA-CT-AATAGTTAG-CCGGAAATCCG-A---AG-TCT---CCA-TTT-A-GTCCAT-catttaagaaatttaagtgggattagcgtaggcttcaagtgcatgtacatgtattggtaaataggatcaaactatatagttgtaatatacaatgtactaatagttagccggaaatccgaagtctccatttagtccat
gi|15 : agcaaatcaagttcacaagagtatatatatgcacgatgtttgtacaacaattagagccacctaagggttgtggtattagcttcaagtgcTGCAGGACGAAAGTTCACTTTGTACCAGCATACTTGTACGTTTGATATTAGGAGGTTGCCGGTAAGC-AATGA-CGGGAGGTTTAGGGAA--------------TT-G-TCGTC--CTCGTTGAT-AA-CATTTTGCATTTCCTTGGCAATGCGTATGATAGGGCCTAATCCT--GGGTGG-TAGG-TTAATACGA-AAGGAATCCTGTCACCTTCC-TTCTCTGC-TATGTT-GTACTGCAGTAA
gi|16 : AATG-TCCACT-TTTTGTT-GTAG-TGTTCAACCTACTGGT-A-AAACAACA-TTTTG-CTGTTT--T-GG---TCTTG-G----CG-GTGCTC-ATT--G-AT-----GCA--TTCTCT-ATTTT--TTGT-GCACAA---T-TCGCCAATGAAAT-TGATGAAACATTA-CACTTGCATGTGAATCGAAATACACTTAATTTTTTAGTTTCACATGTTGAAGGT-GGCCTTGA------A-------
gi|17 : ATGTTTCAT-AAAAGT--A---T--------ACATATG--AGA--AGATAG-ATATAATGCTAT-AA----AA------TT--A--GA-------GC-------AT-TAAG-----G-------G----------TTGTGGTG---T-G------G------C-TT-C--AA-------G----TG---CCCTGTTGTAG--------G-T------AA---T---TGGT-A------A-CACAG---T-CAACAA-AA-T-A-TATAGGC---AT-A-A---GAGATGA--GAA-GAGATAA-TTT--GCAG-A--A-TG-TT--------T--A-------TACAA-A-ATTAAA-G-ACAATT----AAGTAG-Gttaaaaaattc
gi|18 : aagcaatcGTAT--------ACATATG--C-AT-CATT-G-TT-----G--AC-AAACC-AA------TT--A--GA-------GC------CACCTAAGGGGTTG-------G----------T------A---TAG------G------C-TT-CCTCA-------G----TGTGCC---------ACAAT----G-T------AA--------GGT-A------A--ATGG---T------ACAG-T-C-TA---TC---AT-G-A---G---T----AAG-G---TAAA
gi|18 : gcaaatccatgtttatagg-T-TA---AC---AT-ACG---A---TGA--GAG-----TAAATTTC-GCAG-A--A-TG-TT--------T--aaatgataacaataatgtcccttaattaacatacgatgagagtaaatttcgcagaatgttttt
gi|19 : gcaaatccatgtttatagggtatacatatgcatcattgttgacaaaccaattagagccacctaaggggttggtataggcttcctcagtgtgccacaatgtaaggtaaatggtacagtctatcatgagtaaggtaaaaaatgataacaataatgtcccttaaATGTT-GAC-AAGAGT----T-T--------ACCTATG--C-A--CGAT-G-TT----TG-TAC-AA--C-AA------TT--A--GA-------GC------CATCTAAG-----G-------G----------TT-----G---T-G------GTATTGTC-TT-C--AAATTCCATG----TG---T---------A--------GGT------AA---T---TGGT-A------A-CACAG---T-C--CAACAG-T-T-TA---GG---AT-G-A---G---TGA--GAG-G---TACATTT--GCAG-A--A-TG-TT--------T--A-------TATAATA-ACT-tt
gi|2 : agcaaatcAATGTT-CAC-AAAAGTT-AGTAT--------ACATATG--C-A--CGAT-G-TT----TG-TAC-AA--C-AA------TT--A--GA-------GC------CAT------------------G----------T------G---T-A------G-----------------------G----TA---C---------A--------G-T------AA---T---TGGT-A------A-CACAG---T-C--CAACAA-T-T-TA---GC---AT-A-G---G---TGA--GAG-G---TAAATTT--GCAG-A--A-TG-TTAAAAAAAAT--A-------TAGAACA-ATT-AA-G-AAAATT----AAGTAT-GATTAG-C-ATA---G-GC-TTA-A-AG-----TGC-A-TGC-ACATG-CA----TTG-GG--AAATAGG--ACTAA-AATA---TACA----GTTGT---A-ATA-------TG-CT-AATAGTTAG-CCAGAAATCCA-A---TG-TCT---CTA-TTT-A-GCCCAT-TG--TTTT--GC-AG-TCA-AATTT-GGCAATCA-G--TTT-TGTTCAG-TGAC---TC---------TT---TG----TCTAATGT--CGG-----AT--TGTA-CTTGTAAGTATGG--ATACC-G-ATA-TTGTCACA-CAATG-TCCA-T-TTGTGTT-GTAGCTGTT-A-CCTACTGGT-A-AAAC-ATA-TTTTG-CTGTTGA-T-GG---TT-CG-G----CG-GTGTC--ATT--G-AT-----GCGGTTTCT-T-TATTT--TTG--GCACGT---TGTCTCAAA-GTAACATGATG--ACA-TAACAC-TGCATCTGGATC-AA-TACACACAATGTTTTTGTTTCACATG-TGAA-GT-G-------------A-------AT------TCATTTTCTCTGA-TT--TGG-AATTTCGGATATTTGGGCAAAATCCCACTGGCCCCAAAAATTTTGGGGGGGAATG-GG--GGCAGAGTTTGCAGCGAATTCTTTTCTTTCTTTT--TTTTTTTTTTACAAGGAAAGGTCCC-TCTTGGCATGCAGGGTGCAAGTTCACTATGCAGCAGCATAC------GTTTGATATTAGGATGTTGCCGGTAAGC-AATGN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTCCTTTAGTT-GGTTGTC--CTCGTTGAT-AA-CATTTTGCATTTCCTTGGCAATGCGTTTGATAGGGCCTAATCCT--GGATGA-TAGG-TTATTACAA-GAGGAATCCTGTCACCTTCT-GTCTCTGC-TGTGTT-GTACTGCAGTAATAGTTCCCGTGGTTTGGCCTTAGCTTTATCTATCTGGTTGTTAATTAAA-CGGTGGTTATcctaaataagtatcgaataaagat
gi|20 : t--CGGT-G-TT----TG-T-------T-AA------TT--GATGA-------GC-------ATCTAAG-----G-------GATTTGATGTGT------G---T-G------G------C-TTGT--AAC------G----TGA--C---------AT-------G-T------GT---T---AGGT-ATGAGAGA-CA-AA---T-C--CAGAAA-TATATA---GC---AT-G-G---G---TGA--GGG-GG--TA--TTT--GCAGGA--A-TG-TC--------TTAA-------TAAAA-G-ATT-AACG-A-AATT----AAGTAG-GATTAG-CAATA---G-GC-TT
gi|21 : tc---TG-TCT---CTA-TTT-A-GTCCAT-TG--TTTTG-GC-AG-TCA-AATTT-GGCAATCA-G--TTTGTGTTCAA-TGAT---TC---------TTCTTTG----TCTAATGT--CAG--GTGAT--TGTC-TCTGCA-GTATGG--AAATCCCCATA-TTGTCACAACAGTG-TTCA-C-TTTTGTT-GTAG-TGTTCA-CCTACTGGT-ACAAAC-ATA-Taa
gi|22 : -AAAAAA--AGTA---------ACATATG--C-A--ATGA-G-TT----C--TAC-AA--C-AA------TTGGA--GA-------GC------CATCTTGG-----GTGTTGTGG----------T------A---T-G------G------CCTT-C--AA-------G----TG---CCATTTATA-G--------G-T------AA---T---TGGA-A------A-CACAG---T-C--CAATGG-T-T-TA---G----AT-A-G---G---TAA--GAA-G---
gi|23 : aagcgcaatcatttcaccaaaaaaaaaATGCT-CAT-AAAAGT--A-TA---------ACATATG--C-A--CGGT-G-TT----TG-T-C-AA--C-A--------T--AG-GA-------GC------CATCTATG-----G-------GTTCTGTCA--T------A---T-G------G------C-TT-C--AA-------AT---TG---C---------ATGTGTAG-G-T------AAAATT---TTGC-A------A--AAAG-----C--CAACAG-T-T-TA---GA---AT-A-G---GT--TGA--GAGAG---TAaag
gi|24 : cc------TCATGTCCT--GAATT--TGGGAATT-CGATTACT--GGCA-----TCACTGGC------------GATG---AGTG-GG----CAAAGTTTGCAGCGAGG--TTTTCT
gi|24 : CAGGGCGCAAGT----TATATAC---------------TTT-ATATAAGG-GGTTGCC-GTAAGTGAATGA-acacagggcgcaagttatatactttatataaggggttgccgtaagtgaatgaggaaaat
gi|25 : tcatgtcctgaatttgggaattcgattactggcatcactggcgatgagtgggcaaagtttgcagcgaggttttctacaTA-TTGTCACA-----------------TGTT-GTAG-TGTTCA-CCTACTGGT-ACAAAT-ACATTTTTG-CTGTTGA-T-GG---TC-TG-G----CG-GTGTCggaaaat
gi|26 : GCAA-AACA---TACA----GTTGT---A-TTA-------TA-CT-GATAGTTAG-CCAGAAATCCG-A---TG-
gi|27 : ATGTT-CAC-AAACGT--A---T--------ACATATG--C-A--CGGT-G-TT----T
gi|28 : gaagcaaatcTGTT-CAC-AAAAGT--A---T--------ACATATG--C-A--CGGT-G-T
gi|29 : caaatcATGTT-CAC-AAA-----AGTAT--------ACATATG--
gi|3 : ctgaagcaaatcAATGTT-CAC-AAAAG----GTATATTTAAAAACATATGGCT-AATTGAT-GATT----TG-TAA-TA--C-AAACGTATTT--G--G----------------CATTCAA-------------------------T------G---T-GTTA---G------T-GC-C--AG-------G----TG---T---------T--------G-TTGAGGGAA---TTTATGGT-A------A-CACAGTGTT-C--C-ACAGATAT-TA---GCAAAAT-A-GCCAG---TGAAGGAGTG---TAAA-TT--GCGA-A--G-TA-TA--------T--AT------TACAACA-ATA-AC-G-AAAATT----AAGTAGCGATTAG-C-ATA---GTCC-TTC-ACAGGTCTATGCAA-TGCTACATG-TA----TTGAGTAAAAATAGGGAAGTAACAATA---TACA----GTTGTAAGA-ATA-------TACCT-AATAGTTAG-CCGAGAATCCA-AAAGTG-TCTTACTTA-TTT-A---TCAT-CGTCTCTTT-GC-AGTTCACAATTT-GGCAATCA-GT-TTT-TGTTCAGCCGAT---TCATCTATCTATT---TGTAAATCTAATGTTCTAGCCGT-AT--TGTC-CCTGT-AGTATGGATATACCCGCATA-TTGTCACAACAA---------------TT-GTAG-TGTTCA-CCTACTGGT-ACAAAC-ACATTTTTA-ATGTTGA-T-GG---TC-TG-G----CG-GTGTCC-ATT--G-AT-----GCGGCTTCT-T-ATTTT--CTG--CCACTT---T-TCTCCAATGT-ACATGATGGAACA-TA-CAC-TGCAT-TGAATC-AAATACACACAA-TTTTTAGTTTCACATG-TGAA-GT-GGCCTTGAATTGAGA-------AT------TCATTTCCT--GAATT--TGT-AATT-CGGACATT--GGCA-----TCACTGGC-------------------AATG-AGTCGGCAAAAATTGCAGCGAGG-----------GTTT--TTTTTTTTTTACAAAGAAAGGTCCC-TCTTGGCATGCAGGGCGCAAGTTCACTATGTACCAGCATAC------GTTTGATATTAGGAGGTTGCCGGTAAGC-AATGA-CGGGAGGTTTAGGG-AATAGCT-CCTTTAGTT-GGTCGTC--CTCGTTGAT-AA-CATTTTGCATTTCCTTGGCAATGCGTTTGATAGGGCCTATTCCT--GGGTGA-CAGG-TT
gi|30 : caaatc---GC---AT-A-G---A---TGA--AAG-G---TAAATTT--GCAG-A--A-TG-TT--------
gi|4 : -ATA---G-GC-TTC-ATAG------GC-A-TG--AGATGATAAGTCTTC-GT--AAATAGG--AGCAA-A-TA---TACA----ATTGT---A-A-A-------TA-CC-AATAGTTAG-CCAGAAATCCA-A---TG-TCT---CAA-TTTTA-GTCCATGTG--TTTTTTAC-AG-TCA-AATTTTGGCAATCA-GA-TTT-TGTTCCG-TGAC---TCCTC------TT---TG----TCTAATGT--CAA--GTAATATTGTC-TCTGTAAATATGG--ATACCCGCATACTTGTCACAACAATGCTCCA-TCTTTTGTTTGTAG-TGT---------------CAAAC-ACA-TTTTG-CTGTTGAAT-GG---TC-TG-G-----G-GCGTCC-ATT--GGAT-----GCGGTTTCT-T-ATTTT--TTG--GTACGT---T-TCTCC-ACGTAAAATGCT-GAACA--A-CAC-TGCAT-TGAATC-AAATACACACAA-TTCTTAGTTTCACATG-TGAA-GT-GGCCTTGA------A-------ATTGAGAATCATTTCCT---AATT--TGG-AATT-CGGATATT--GGCA-----TCACTG------------TTGTTG---AGT---G--GGTAAAGTTTACAACGAGG----------------------TTTTTACACGAAAAGGCCCCTTCTTGGCATACAGGGCGC
gi|4 : C-AATGAACGGGAGATTTAGGGAAATAGCT-CCTTTAGTTTGGTCGTCACTTCTTTGATGAA-CATTTTGCATTTC-TTGGCAATGCGTTTGATAGGGCCTAATCCTTTGGGTGAATAGG-TTAATACAA-GAGGAATCCTGTCACCTTTTTGTCTCTGC-TGTGTTTGTACTGCA-TAATAGTTACCGTGGTTTGGCCTTAGCCTTATCCATCTGGTTGCTAAT--AACCGGT-GTTATcaatgaacgggagatttagggaaatagctcctttagtttggtcgtcacttctttgatgaacattttgcatttcttggcaatgcgtttgatagggcctaatcctttgggtgaataggttaatacaagaggaatcctgtcacctttttgtctctgctgtgtttgtactgcataatagttaccgtggtttggccttagccttatccatctggttgctaataaccggtgttatctcctagatggctgaatgcaatttggtcaacgtccctgagtgtcgctatcttgagtcgagttctg
gi|5 : ataggcttcataggcatgagatgataagtcttcgtaaataggagcaaatatacaattgtaaataccaatagttagccagaaatccaatgtctcaattttagtccatgtgttttttacagtcaaattttggcaatcagattttgttccgtgactcctctttgtctaatgtcaagtaatattgtctctgtaaatatggatacccgcatacttgtcacaacaatgctccatcttttgtttgtagtgtcaaacacattttgctgttgaatggtctggggcgtccattggatgcggtttcttattttttggtacgtttctccacgtaaaatgctgaacaacactgcattgaatcaaatacacacaattcttagtttcacatgtgaagtggccttgaaattgagaatcatttcctaatttggaattcggatattggcatcactgttgttgagtgggtaaagtttacaacgaggtttttacacgaaaaggccccttcttggcatacagggcgcATGTT-CAC-AAAAGT--A---T--------ACATATG--C-A--CGGT-G-TT----TG-TAC-AA--C-AA------TT--A--GAATTTAGAGC------CATCTAAG-----G-------G----------TTGTGT-G---T-G------G------C-TT-C--AA-------G----TG---CCACGTGTA-G--------G-T------AA---T---TGGT-A------A-CACAG---T-C--CAACAA-T-T-TA---GC---AT-A-G---G---TGA--GAG-G---TAAATTT--GCAG-A--A-TG-TA--------T--A-------TACAACA-ATT-AA-G-ACAATTTTAAAAGTAG-GATTAG-C-ATA---G-GC-TTC-A-A------TGC-A-GGT-ACATA-TA----TTG-GT--AGATAGG--AGCAA-ATTA---TACA----GTAGT---A-ATA-------TA-AT-AATAGTTAG-CCAGAAATCCA-A---TT-TTT---CTA-TTT-A-GTCCAT-TG--TTTTT-GC-AG-TAA-AATAT-GGCAATCA-AT-TTT-TGTTCAG-TGACTCTTC---------TT---TG----TCTAATGT--CAG--GTAAT--TATC-CCTGTAA-TATGG--ATACCCGCATA-TTGTCACAACAATG-TCCA-C-TTTTGTT-GTAG-TGTTCA-CCTACTGGT-ACAAAC-ACATTTTTG-CTGTTGA-T-GG---TC-TG-G----CG-GTGTCC-ATT--G-AT-----GCGGTTTCT-T-ATTTT--TTG--GCACGT---T-TCTCCAATGT-ACATGATGGAACA-TA-CAC-TGCAT-TGAATC-AAATACACACAATTTTTctcctagatggctgaatgcaatttggtcaacgtccctgagtgtcgctatcttgagtcgagttctg
gi|6 : caaatcTATT-AAC-AAAAGT--A-T-T--------ACATATG--C-A--CGAT-G-CT----TGTTACAAA--CAAA------TT--A--G--------GT------CATCTAAG-----T-------G----------T------
gi|6 : GT-G-TTG---TA-TAC-AA--C-CC------TT--A--GA-------GATGGGAGCGTCTAAT-----T-------G----------T----------T-G---------------TA-C--AA-------A----TGT--C---------ACTGTAG--G-T------AA---T---TGGT-A------A-CATAG---T-C--CAACAG-T-T-T----GC---AT-A-G-------TGA--GAG-G---TAA--TT--GCAG-AGAA-TGGTT--------T--A-------TACAACA-ATT-AA-G-ACAATT----AA-TAG--ATTAG-C-ATATTAG-GC-TTC-A-AG-----TGC-AGTGC-ACATG-TA----TTG-GT--AAATAGG--AGCAA-ACTAGCATACACGGAGTAGTGA-A-ATAA------TAGCTGAATAGTTAG-CCA-AAATCCA-A----G-TCT---CTAATTT-A-GTCCAT-TG--TTTTT-GC-AG-TCA-AATTT-GGCAATtgtatacaacccttagagatgggagcgtctaattgttgtacaaatgtcactgtaggtaattggtaacatagtccaacagtttgcatagtgagaggtaattgcagagaatggtttatacaacaattaagacaattaatagattagcatattaggcttcaagtgcagtgcacatgtattggtaaataggagcaaactagcatacacggagtagtgaaataatagctgaatagttagccaaaatccaagtctctaatttagtccattgtttttgcagtcaaatttggcaat
gi|7 : tattaacaaaagtattacatatgcacgatgcttgttacaaacaaattaggtcatctaaATGT--CAC-AAAA----AGTAT--------ACATATG--C-A--CGGT-G-TT----TG-TAC-AA--C-AA------TT--A--GA-------GC------CATCTAAG-----A------------------T------G---T-G------G------C-TC-C--AA-------G----TG---C---------C--------A-TGTGTA-AA---T---TGGTTG------A-CACAG---T-C--CAACAA-T-T-TA---GC---AT-A-G---G---TGA--GAG-G---TAAATTT--GCAG-A--A-TG--T--------T--A-------TACA-------------ACAATT----AAGTAG-GATTAGAG-ATA---G-GC-TTCAA-AG-----AGC----GT-ACATG-TA----TTG-GT--AAATAGG--AGCAA---TA---TACA----GTTGT---A-ATA-------CA-CT-AATAGTTAG-CCACAAACCCGAA---TG-TCT---CTA-TTT-A-GTCCAT-TG--TTTTT-GC-AG-TCA-AA-TT-GGCAATCA-A--TTT-TTCTTAG-
gi|8 : caaatcAAAGT--A-T-T--------ACATATG--C-A--CGAT-G-CT----GG-TAC-AA--C-AAT-----TT--A--GA-------GT------CATCTAAG-----T-------G----------T------G---T-gattatccgtagatttaaagtccaagtag
gi|8 : tattatT--------ACCTACA--C-G--TGAC-A-TT----TG-TAC-AA--C-AA------TT--A--GA---------------CATCTAAG-----G-------G----------T------G---T-G------atatcacacccttagatgtctaattgttgtacaaatgtcacgtgtaggtaattggtaacatagtccaacagtttagcataggtgagcggtaattgcagaaatggtttatacacaattaagacaattaagtaggattagcatattaggcttcaagtgcatgcacatgtattggtaaataggagcaaactatacagtagtaatatactaatagttagccagaaatccaatgtctctatttagtccattgtttttgcagtcaaatttggcaatca
gi|8 : tattataaagtattacatatgcacgatgctggtacaacaatttagagtcatctaagtgtgtatatT-C--AC-------G----TG---T---------A--------GGT------AA---T---TGGT-A------A-CATAG---T-C--CAACAG-T-T-TA---GC---AT-A-G---G---TGA--GCG-G---TAA--TT--GCAG-A--AATGGTT--------T--A-------TACA-CA-ATT-AA-G-ACAATT----AAGTAG-GATTAG-C-ATATTAG-GC-TTC-A-AG-----TGC-A-TGC-ACATG-TA----TTG-GT--AAATAGG--AGCAA-ACTA---TACA----GTAGT---A-ATA-------TA-CT-AATAGTTAG-CCAGAAATCCA-A---TG-TCT---CTA-TTT-A-GTCCAT-TG--TTTTT-GC-AG-TCA-AATTT-GGCAATCA-attggtaacatagtccaacagtttagcataggtgagcggtaattgcagaaatggtttatacacaattaagacaattaagtaggattagcatattaggcttcaagtgcatgcacatgtattggtaaataggagcaaactatacagtagtaatatactaatagttagccagaaatccaatgtctctatttagtccattgtttttgcagtcaaatttggcaatca
gi|9 : tattataaagtattacatatgcacgatgctggtacaacaatttagagtcatctaagtgtgtatatcacacccttagatgtctaattgttgtacaaatgATGTT-C-C-TAAAGC----TAT--------A-AT-TG--C----CGGT-G-TT----TA-TTT-AA--C-AT------GT--A--GA-------GC------CAT-TAAG-----G-------G----------TT-----G---T-GCTTGT-G------C-TT-C--CT-------GCCTGTG---T---------A----------T------AA---T----GGT-A--------CACAG---T-C--CAACCA-T-T-CA---GC---AT-A-GT--G---TGA--G-------TAA--TT--CCAG-A----TGCTT--------T--A-------TCCAACC-ATT-AA-G-ACAATT-----AGTA--GATTCG-C-CT----G-GC-TTC-A-AG------GG-A--GT-ACATG-TA----TT--GT--AA--GGG--AGCAC-TTTA---TACA-----TTTT---A-AT--------TA-CT---TAGTTAG-CCA-AAAT-CG-A---TGCTCT---CT--TTT-AGGTCC-T-TG--TTTTT-GCAAG-TC--GATT---GC-ATCA-ATTTTT-TGTTCGG-TGAC---TC---------TT---
Alignments
lowQualScore : 222222222222222 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 1111111 111 1111111 1111111 2222 111 333333333 111 1111 22222 1 111111 1 111 1111 11 11111 11 111 1 44444444444444444444444444444 1 22222 7777777777777777777 11 44444444444444444 1 222222 111 11 11 1 1 1 111 2
lowQualScore : 2 2 666666666666666 22 2 44 1 1 6666 4 2 22 2 777777 22 44 6666666 555555 3 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 666 444 2 666666 2 1 444 2 33 55 4 2 333 333 2 2 6666666 22 4 555 5 55 2 33 2 7 99999999 33 2222222 11 2 2 2 2 2 6666 22 3 2 000 2 2 3 6 0000000 3 88 44 3 9999 3 44 77 2 4 555 6666 888 2 2222222 5 2 2 1 33 444 2 555 6 3 3 3 88 55 3 4 4 4 2222 5 5 000 222222222 000 4444 99 0 44444 99 6 1 99 777 5 2 0 5 000000 5 5 5 4 4 1 4 3 5 5 5 555 5 5 0000 5 00 77 5 44444 5 5 77 33 000 5 1 3 66 6 5 5 5 1 5 5 6 6 6 00000000000000000000000000000 99 3 99 6 3 99 00000 4444444444444444444 8 11 44444444444444444 0 0 333333 0 0 6 77 333 0 8 8 11 8 8 11 8 8 1 0 2 0 0 000 2 6 7 6 6
lowQualScore : . . ............... .. . .. . . .... . . .. . ...... .. .. ....... ...... . .......................................................................................................... ... ... . ...... . . ... . .. .. . . ... ... . . ....... .. . ... . .. . .. . . ........ .. ....... .. . . . . . .... .. . . ... . . . . ....... . .. .. . .... . .. .. . . ... .... ... . ....... . . . . .. ... . ... . . . . .. .. . . . . .... . . ... ......... ... .... .. . ..... .. . . .. ... . . . . ...... . . . . . . . . . . . ... . . .... . .. .. . ..... . . .. .. ... . . . .. . . . . . . . . . . ............................. .. . .. . . .. ..... ................... . .. ................. . . ...... . . . .. ... . . . .. . . .. . . . . . . . ... . . . . .
lowQualScore : 5 4 111111111111111 66 0 55 8 8 0000 0 0 88 0 888888 88 88 5555555 888888 3 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 555 111 4 888888 4 6 111 4 22 44 4 2 777 777 1 1 7777777 99 2 888 4 99 5 44 5 5 11111111 77 1111111 99 7 7 9 9 5 1111 99 1 9 000 9 9 1 2 2222222 1 33 33 1 6666 1 22 33 9 8 000 1111 999 9 1111111 7 9 9 2 11 777 9 444 2 1 1 3 66 77 6 0 0 0 3333 0 0 000 999999999 000 2222 22 7 55555 22 7 0 22 555 7 0 1 0 999999 0 0 6 4 4 1 4 3 0 0 0 666 0 0 6666 0 00 99 7 33333 7 7 99 66 000 7 4 9 44 6 7 7 7 4 7 0 7 7 7 22222222222222222222222222222 22 2 22 7 3 22 00000 2222222222222222222 0 00 66666666666666666 0 8 000000 8 8 7 55 222 4 0 0 00 0 0 00 0 0 0 0 5 0 0 222 5 7 3 7 7
consensus : NAATGTT-CAC-AAAAGT--AGTAT--------ACATATG--C-A--CGGT-G-TT----TG-TAC-AA--C-AA------TT--A--GA-------GC------CATCTAAG-----G-------G----------T------G---T-G------G------C-TT-C--AA-------G----TG---C---------A--------G-T------AA---T---TGGT-A------A-CACAG---T-C--CAACAG-T-T-TA---GC---AT-A-G---G---TGA--GAG-G---TAAATTT--GCAG-A--A-TG-TT--------T--A-------TACAACA-ATT-AA-G-ACAATT----AAGTAG-GATTAG-C-ATA---G-GC-TTC-A-AG-----TGC-A-TGC-ACATG-TA----TTG-GT--AAATAGG--AGCAA-ANTA---TACA----GTTGT---A-ATA-------TA-CT-AATAGTTAG-CCAGAAATCCG-A---TG-TCT---CTA-TTT-A-GTCCAT-TG--TTTTT-GC-AG-TCA-AATTT-GGCAATCA-G--TTT-TGTTCAG-TGAC---TC---------TT---TG----TCTAATGT--CGG--GTAAT--TGTC-CCTGTAAGTATGG--ATACCCGCATA-TTGTCACAACAATG-TCCA-T-TTTTGTT-GTAG-TGTTCA-CCTACTGGT-ACAAAC-ACA-TTTTG-CTGTTGA-T-GG---TC-TG-G----CG-GTGTCC-ATT--G-AT-----GCGGTTTCT-T-ATTTT--TTG--GCACGT---T-TCTCCAATGTAACATGATGGAACA-TA-CAC-TGCAT-TGAATC-AAATACACACAATTTTTTAGTTTCACATG-TGAA-GT-GGCCTTGA------A-------AT------TCATTTCCT--GAATT--TGG-AATT-CGGATATT--GGCA-----TCACTGGC---------TTTGGTG---AATG-GG--GGCAAAGTTTGCAGCGAGGTCTTTTCTTTCTTTT--TTTTTTTTTTACAAGGAAAGGTCCC-TCTTGGCATGCAGGGCGCAAGTTCACTATGTACCAGCATAC------GTTTGATATTAGGAGGTTGCCGGTAAGC-AATGA-CGGGAGGTTTAGGGAAATAGCT-CCTTTAGTT-GGTCGTC--CTCGTTGAT-AA-CATTTTGCATTTCCTTGGCAATGCGTTTGATAGGGCCTAATCCT--GGGTGA-TAGG-TTANTACAA-GAGGAATCCTGTCACCTTCT-GTCTCTGC-TGTGTT-GTACTGCAGTAATAGTT-CCGTGGTTTGGCCTTAGCTTTATCTATCTGGTTGTTAATTAAACCGGTGGTTAT
Reference ( family-1618 ) : NAATGTT-CAC-AAAAGT--AGTAT--------ACATATG--C-A--CGGT-G-TT----TG-TAC-AA--C-AA------TT--A--GA-------GC------CATCTAAG-----G-------G----------T------G---T-G------G------C-TT-C--AA-------G----TG---C---------A--------G-T------AA---T---TGGT-A------A-CACAG---T-C--CAACAG-T-T-TA---GC---AT-A-G---G---TGA--GAG-G---TAAATTT--GCAG-A--A-TG-TT--------T--A-------TACAACA-ATT-AA-G-ACAATT----AAGTAG-GATTAG-C-ATA---G-GC-TTC-A-AG-----TGC-A-TGC-ACATG-TA----TTG-GT--AAATAGG--AGCAA-ANTA---TACA----GTTGT---A-ATA-------TA-CT-AATAGTTAG-CCAGAAATCCG-A---TG-TCT---CTA-TTT-A-GTCCAT-TG--TTTTT-GC-AG-TCA-AATTT-GGCAATCA-G--TTT-TGTTCAG-TGAC---TC---------TT---TG----TCTAATGT--CGG--GTAAT--TGTC-CCTGTAAGTATGG--ATACCCGCATA-TTGTCACAACAATG-TCCA-T-TTTTGTT-GTAG-TGTTCA-CCTACTGGT-ACAAAC-ACA-TTTTG-CTGTTGA-T-GG---TC-TG-G----CG-GTGTCC-ATT--G-AT-----GCGGTTTCT-T-ATTTT--TTG--GCACGT---T-TCTCCAATGTAACATGATGGAACA-TA-CAC-TGCAT-TGAATC-AAATACACACAATTTTTTAGTTTCACATG-TGAA-GT-GGCCTTGA------A-------AT------TCATTTCCT--GAATT--TGG-AATT-CGGATATT--GGCA-----TCACTGGC---------TTTGGTG---AATG-GG--GGCAAAGTTTGCAGCGAGGTCTTTTCTTTCTTTT--TTTTTTTTTTACAAGGAAAGGTCCC-TCTTGGCATGCAGGGCGCAAGTTCACTATGTACCAGCATAC------GTTTGATATTAGGAGGTTGCCGGTAAGC-AATGA-CGGGAGGTTTAGGGAAATAGCT-CCTTTAGTT-GGTCGTC--CTCGTTGAT-AA-CATTTTGCATTTCCTTGGCAATGCGTTTGATAGGGCCTAATCCT--GGGTGA-TAGG-TTANTACAA-GAGGAATCCTGTCACCTTCT-GTCTCTGC-TGTGTT-GTACTGCAGTAATAGTT-CCGTGGTTTGGCCTTAGCTTTATCTATCTGGTTGTTAATTAAACCGGTGGTTAT
gi|1 : GTT-CACCAAAAGTGTAGTAT--------ACATATG--C-A--CGAT-T-CT----TG-TAC-AC--A-AA------TT--A--GA-------GC-------AT------------------G----------T------G---T-A------G-----------------------G----TA---C---------A--------G-T------AAA--T---TGGT-A------AACAAAG---T-C--CCACA----T-TA---GC---AT-A-G---G---TGA--GAG-G---TA--TTT--GCAG-A--A-TG-TT--------T--AAAAAAAATATAGAA-AAT-AA-G-AAAATT----AAGTAT-GATTAG-C-ATA---G-GCCTTA-A-AA-----TGC-AATGC-ACATG-CAA---TTG-GG--AAATAGGT-ACTAA-AATA---TATC----GTTGT---ACATA-------TG-CT-AATAGTTAG-CCAGAAATCCA-A---TG-TCT----TA-TTT-A-G-CCAT-TG--TTTT--GC-AG-TCA-AATTT-GGCAATCAAG--TTT-TGTTCAG-TGAC---TC---------TT---TG----TCTAAT-T--CGG-----AT--TGTAACTTGTAAGTATGG--ATACC-G-ATA-TTGTCACA-CAATG-TCCA-T-TT--GTT-GTAG-TGTT-A-CCTACTGGT-ACAAA--ATA-TTTTG-CTGTTGA-T-AGGT-TC-TG-G----CG-GTGTC--ATT--G-AT-----GCGGTTTCT-T-TATTT--TTG--GCACGT---T-TC--CAAAGTA-CATGATGGAACA-TA-CAC-TGCAT-TGAATC-AAATA-ACACAATGTTTTTGTTTCACATG-TGAA-GT-G-------------A-------AT------TCATTTCCT--GAATT--TGG-AATTTCGGATATT--GGCA-----TCA-TGGCA--------TTTGG-G---AATGTGG--GGCAGAATTTGCAGCGAATTCTTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTACAAGGAAAGGTCCC-TCTTGGCATGCAGGGTGCAAGTTCACTATGCAGCAGCATAC------GTTTGATATTAGGATGTTGCCGGT-AGC-AATG--TGGGAGGTTTAGGG--ATAGTT-CCTTTAGTT-GGTT-TC--CTCGTTGAT-AATCATTTTGCATTTCCTTGGCAATGCGTTTGATAGGTGCTAAATCT--GACTGA-TAGGTTTATTACAATGAGGAATCCTGTCA-CTTCT-GTCTCTGCTTGTG-G-GTACTGCAGTAATAGTT-CCGTGGTTTTGGCTTAGCTTTATCTATCTGGTTGTTAATTAAACTGGTGGTTAT
gi|10 : ATGTT-CAT-AAAA----AGTA---------ACATAT---C-A---GGT-G-TT-----G-TAT-G---C-AA------TT--A--GA-------GC------CAT-TAGG-----GTTGCT--G----------T------G---T-G------G------C-TT-C--AA-------G----TG---C---------ATGTTAG--G-T------AA---T----GGT-A------A-CACAG---TAC--AAACA--T-T-TA---G----ATCA-G---G---TGA--GAG-G---TAAATTTTGGCAG-A--A-TG--T--------T--A-------TACACCACATT-AA-GAACAATT----AAGT-G-GATTAG-C-ATA---G-GC-TTC-A-AA-----GCC-A-GGT-ACATG-TA----TTG-GT---AATAGA--AGC---ATTA---TACG----GTAG----A-ATA-------GA-CT-AA-AG-TAGTCCAAAAATCCA-A---TG-TCT----TACTTT-A-GTCCAT-TGT-TTTTT-GC-Aatattgcactaggacctgtctgtaaggaatgtccaaggctaacgttgctggcctgttgcaaaattaagtcgttctg
gi|11 : atctATGTT-CAC-TAGAGT--A---T--------ACATATG--C-A--CGAT-G-TT----TG-TAC-AA--C-AA------TT--A--GA-------GC------CATCTAAG-----GACT----G----------T------GATAT-G------G------C-TT-C--AA-------G----TG---C---------AATGTGTAGG-T------AG---T---TGGT-A------A-CA--G---T-C--CAACAG-T-T-TA---GG---AT-A-G---G---TGA--GAG-A---TAAATTT--GCAG-A--A-TG-TT--------T--A-------TACAACA-ATT-AA-G-AAAATT----AAGTAT-GATAAG-C-ATA---G-GC-TTC-A-AG-----TGC-A-TGC-ACATG-CA----TTG-GT--AAATAGG--AGCAA-AA-A---TACA----ATTGC---A-ATA-------TA-CT-AATAGTTAG-CCAGAAATCCA-A---TG-TCT---CTA-TTT-A-GTCCc
gi|12 : gccattc--AGTAT--------ACATATT--C-A--CAGT-G-TT----TG-TAC-AA--C-AA------TT--A--GT-------GT------CATCTAAA-----G-------G----------TTGTGGTG---T-G------G------C-TT-C--AACTGCCATG----TG---T---------A--------GGT------AA---T---TGGT-A------A-CACAG---T-C--CAATAT-A-T-TA---GC---AT-A-G---A---TGA--AAG-G---TAAATTT--GCAG-A--A-TG-TT--------T--A-------TACAACA-ATT-AA-G-GCAATT----AAGTAA-GATTAG-C-ATA---G-GC-TTC-A-A------TGC-A-GGT-ACATG-TA----TTG-GT--AAATAGG--AGCAA-ATTT---AACA----GTTGT---A-ATA-------TA-CT-AATAGTTAG-CCAGAAATCCG-A---
gi|13 : aa-CTTACTGGTGACAA-C-ACT-TTGTGACTATTGA-TTGGCTCTT-TGTGTTCCCGTGTGCCCTATTCTG-ATATCTTGCCGTTTCT-TCATTTTGATTGCTGTTCGTGTCT-TCTCCAATGTACGATGATG---TG-TG-T-T-TGTCT-TCA-TC-AAATAC-CA-AGTTTTTTAGTTTCACAAG-TGAA-CTAGGACTTGT------ACTTTTGGAT------TCATTCCTT--GACTCTGTGG-GATT-CTGATGTT--G
gi|14 : GTT-CAC-AAGAGT--A---T--------ATATATG--C-A--CGAT-G-TT----TG-TAC-AA--C-AA------TT--A--GA-------GC------CACCTAAG-----G-------GT---------T------G---T-GGTATTAG------C-TT-C--AA-------G----TG---C---------aaaggctagttcgactggcatgagtgcaa
gi|14 : agcaaatcaaCA-TTT-AA-G-AAATTT----AAGTGG-GATTAG-C-GTA---G-GC-TTC-A-AG-----TGC-A-TGT-ACATG-TA----TTG-GT--AAATAGG--ATCAA-ACTA---TATA----GTTGT---A-ATATACAATGTA-CT-AATAGTTAG-CCGGAAATCCG-A---AG-TCT---CCA-TTT-A-GTCCAT-catttaagaaatttaagtgggattagcgtaggcttcaagtgcatgtacatgtattggtaaataggatcaaactatatagttgtaatatacaatgtactaatagttagccggaaatccgaagtctccatttagtccat
gi|15 : agcaaatcaagttcacaagagtatatatatgcacgatgtttgtacaacaattagagccacctaagggttgtggtattagcttcaagtgcTGCAGGACGAAAGTTCACTTTGTACCAGCATACTTGTACGTTTGATATTAGGAGGTTGCCGGTAAGC-AATGA-CGGGAGGTTTAGGGAA--------------TT-G-TCGTC--CTCGTTGAT-AA-CATTTTGCATTTCCTTGGCAATGCGTATGATAGGGCCTAATCCT--GGGTGG-TAGG-TTAATACGA-AAGGAATCCTGTCACCTTCC-TTCTCTGC-TATGTT-GTACTGCAGTAA
gi|16 : AATG-TCCACT-TTTTGTT-GTAG-TGTTCAACCTACTGGT-A-AAACAACA-TTTTG-CTGTTT--T-GG---TCTTG-G----CG-GTGCTC-ATT--G-AT-----GCA--TTCTCT-ATTTT--TTGT-GCACAA---T-TCGCCAATGAAAT-TGATGAAACATTA-CACTTGCATGTGAATCGAAATACACTTAATTTTTTAGTTTCACATGTTGAAGGT-GGCCTTGA------A-------
gi|17 : ATGTTTCAT-AAAAGT--A---T--------ACATATG--AGA--AGATAG-ATATAATGCTAT-AA----AA------TT--A--GA-------GC-------AT-TAAG-----G-------G----------TTGTGGTG---T-G------G------C-TT-C--AA-------G----TG---CCCTGTTGTAG--------G-T------AA---T---TGGT-A------A-CACAG---T-CAACAA-AA-T-A-TATAGGC---AT-A-A---GAGATGA--GAA-GAGATAA-TTT--GCAG-A--A-TG-TT--------T--A-------TACAA-A-ATTAAA-G-ACAATT----AAGTAG-Gttaaaaaattc
gi|18 : aagcaatcGTAT--------ACATATG--C-AT-CATT-G-TT-----G--AC-AAACC-AA------TT--A--GA-------GC------CACCTAAGGGGTTG-------G----------T------A---TAG------G------C-TT-CCTCA-------G----TGTGCC---------ACAAT----G-T------AA--------GGT-A------A--ATGG---T------ACAG-T-C-TA---TC---AT-G-A---G---T----AAG-G---TAAA
gi|18 : gcaaatccatgtttatagg-T-TA---AC---AT-ACG---A---TGA--GAG-----TAAATTTC-GCAG-A--A-TG-TT--------T--aaatgataacaataatgtcccttaattaacatacgatgagagtaaatttcgcagaatgttttt
gi|19 : gcaaatccatgtttatagggtatacatatgcatcattgttgacaaaccaattagagccacctaaggggttggtataggcttcctcagtgtgccacaatgtaaggtaaatggtacagtctatcatgagtaaggtaaaaaatgataacaataatgtcccttaaATGTT-GAC-AAGAGT----T-T--------ACCTATG--C-A--CGAT-G-TT----TG-TAC-AA--C-AA------TT--A--GA-------GC------CATCTAAG-----G-------G----------TT-----G---T-G------GTATTGTC-TT-C--AAATTCCATG----TG---T---------A--------GGT------AA---T---TGGT-A------A-CACAG---T-C--CAACAG-T-T-TA---GG---AT-G-A---G---TGA--GAG-G---TACATTT--GCAG-A--A-TG-TT--------T--A-------TATAATA-ACT-tt
gi|2 : agcaaatcAATGTT-CAC-AAAAGTT-AGTAT--------ACATATG--C-A--CGAT-G-TT----TG-TAC-AA--C-AA------TT--A--GA-------GC------CAT------------------G----------T------G---T-A------G-----------------------G----TA---C---------A--------G-T------AA---T---TGGT-A------A-CACAG---T-C--CAACAA-T-T-TA---GC---AT-A-G---G---TGA--GAG-G---TAAATTT--GCAG-A--A-TG-TTAAAAAAAAT--A-------TAGAACA-ATT-AA-G-AAAATT----AAGTAT-GATTAG-C-ATA---G-GC-TTA-A-AG-----TGC-A-TGC-ACATG-CA----TTG-GG--AAATAGG--ACTAA-AATA---TACA----GTTGT---A-ATA-------TG-CT-AATAGTTAG-CCAGAAATCCA-A---TG-TCT---CTA-TTT-A-GCCCAT-TG--TTTT--GC-AG-TCA-AATTT-GGCAATCA-G--TTT-TGTTCAG-TGAC---TC---------TT---TG----TCTAATGT--CGG-----AT--TGTA-CTTGTAAGTATGG--ATACC-G-ATA-TTGTCACA-CAATG-TCCA-T-TTGTGTT-GTAGCTGTT-A-CCTACTGGT-A-AAAC-ATA-TTTTG-CTGTTGA-T-GG---TT-CG-G----CG-GTGTC--ATT--G-AT-----GCGGTTTCT-T-TATTT--TTG--GCACGT---TGTCTCAAA-GTAACATGATG--ACA-TAACAC-TGCATCTGGATC-AA-TACACACAATGTTTTTGTTTCACATG-TGAA-GT-G-------------A-------AT------TCATTTTCTCTGA-TT--TGG-AATTTCGGATATTTGGGCAAAATCCCACTGGCCCCAAAAATTTTGGGGGGGAATG-GG--GGCAGAGTTTGCAGCGAATTCTTTTCTTTCTTTT--TTTTTTTTTTACAAGGAAAGGTCCC-TCTTGGCATGCAGGGTGCAAGTTCACTATGCAGCAGCATAC------GTTTGATATTAGGATGTTGCCGGTAAGC-AATGN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTCCTTTAGTT-GGTTGTC--CTCGTTGAT-AA-CATTTTGCATTTCCTTGGCAATGCGTTTGATAGGGCCTAATCCT--GGATGA-TAGG-TTATTACAA-GAGGAATCCTGTCACCTTCT-GTCTCTGC-TGTGTT-GTACTGCAGTAATAGTTCCCGTGGTTTGGCCTTAGCTTTATCTATCTGGTTGTTAATTAAA-CGGTGGTTATcctaaataagtatcgaataaagat
gi|20 : t--CGGT-G-TT----TG-T-------T-AA------TT--GATGA-------GC-------ATCTAAG-----G-------GATTTGATGTGT------G---T-G------G------C-TTGT--AAC------G----TGA--C---------AT-------G-T------GT---T---AGGT-ATGAGAGA-CA-AA---T-C--CAGAAA-TATATA---GC---AT-G-G---G---TGA--GGG-GG--TA--TTT--GCAGGA--A-TG-TC--------TTAA-------TAAAA-G-ATT-AACG-A-AATT----AAGTAG-GATTAG-CAATA---G-GC-TT
gi|21 : tc---TG-TCT---CTA-TTT-A-GTCCAT-TG--TTTTG-GC-AG-TCA-AATTT-GGCAATCA-G--TTTGTGTTCAA-TGAT---TC---------TTCTTTG----TCTAATGT--CAG--GTGAT--TGTC-TCTGCA-GTATGG--AAATCCCCATA-TTGTCACAACAGTG-TTCA-C-TTTTGTT-GTAG-TGTTCA-CCTACTGGT-ACAAAC-ATA-Taa
gi|22 : -AAAAAA--AGTA---------ACATATG--C-A--ATGA-G-TT----C--TAC-AA--C-AA------TTGGA--GA-------GC------CATCTTGG-----GTGTTGTGG----------T------A---T-G------G------CCTT-C--AA-------G----TG---CCATTTATA-G--------G-T------AA---T---TGGA-A------A-CACAG---T-C--CAATGG-T-T-TA---G----AT-A-G---G---TAA--GAA-G---
gi|23 : aagcgcaatcatttcaccaaaaaaaaaATGCT-CAT-AAAAGT--A-TA---------ACATATG--C-A--CGGT-G-TT----TG-T-C-AA--C-A--------T--AG-GA-------GC------CATCTATG-----G-------GTTCTGTCA--T------A---T-G------G------C-TT-C--AA-------AT---TG---C---------ATGTGTAG-G-T------AAAATT---TTGC-A------A--AAAG-----C--CAACAG-T-T-TA---GA---AT-A-G---GT--TGA--GAGAG---TAaag
gi|24 : cc------TCATGTCCT--GAATT--TGGGAATT-CGATTACT--GGCA-----TCACTGGC------------GATG---AGTG-GG----CAAAGTTTGCAGCGAGG--TTTTCT
gi|24 : CAGGGCGCAAGT----TATATAC---------------TTT-ATATAAGG-GGTTGCC-GTAAGTGAATGA-acacagggcgcaagttatatactttatataaggggttgccgtaagtgaatgaggaaaat
gi|25 : tcatgtcctgaatttgggaattcgattactggcatcactggcgatgagtgggcaaagtttgcagcgaggttttctacaTA-TTGTCACA-----------------TGTT-GTAG-TGTTCA-CCTACTGGT-ACAAAT-ACATTTTTG-CTGTTGA-T-GG---TC-TG-G----CG-GTGTCggaaaat
gi|26 : GCAA-AACA---TACA----GTTGT---A-TTA-------TA-CT-GATAGTTAG-CCAGAAATCCG-A---TG-
gi|27 : ATGTT-CAC-AAACGT--A---T--------ACATATG--C-A--CGGT-G-TT----T
gi|28 : gaagcaaatcTGTT-CAC-AAAAGT--A---T--------ACATATG--C-A--CGGT-G-T
gi|29 : caaatcATGTT-CAC-AAA-----AGTAT--------ACATATG--
gi|3 : ctgaagcaaatcAATGTT-CAC-AAAAG----GTATATTTAAAAACATATGGCT-AATTGAT-GATT----TG-TAA-TA--C-AAACGTATTT--G--G----------------CATTCAA-------------------------T------G---T-GTTA---G------T-GC-C--AG-------G----TG---T---------T--------G-TTGAGGGAA---TTTATGGT-A------A-CACAGTGTT-C--C-ACAGATAT-TA---GCAAAAT-A-GCCAG---TGAAGGAGTG---TAAA-TT--GCGA-A--G-TA-TA--------T--AT------TACAACA-ATA-AC-G-AAAATT----AAGTAGCGATTAG-C-ATA---GTCC-TTC-ACAGGTCTATGCAA-TGCTACATG-TA----TTGAGTAAAAATAGGGAAGTAACAATA---TACA----GTTGTAAGA-ATA-------TACCT-AATAGTTAG-CCGAGAATCCA-AAAGTG-TCTTACTTA-TTT-A---TCAT-CGTCTCTTT-GC-AGTTCACAATTT-GGCAATCA-GT-TTT-TGTTCAGCCGAT---TCATCTATCTATT---TGTAAATCTAATGTTCTAGCCGT-AT--TGTC-CCTGT-AGTATGGATATACCCGCATA-TTGTCACAACAA---------------TT-GTAG-TGTTCA-CCTACTGGT-ACAAAC-ACATTTTTA-ATGTTGA-T-GG---TC-TG-G----CG-GTGTCC-ATT--G-AT-----GCGGCTTCT-T-ATTTT--CTG--CCACTT---T-TCTCCAATGT-ACATGATGGAACA-TA-CAC-TGCAT-TGAATC-AAATACACACAA-TTTTTAGTTTCACATG-TGAA-GT-GGCCTTGAATTGAGA-------AT------TCATTTCCT--GAATT--TGT-AATT-CGGACATT--GGCA-----TCACTGGC-------------------AATG-AGTCGGCAAAAATTGCAGCGAGG-----------GTTT--TTTTTTTTTTACAAAGAAAGGTCCC-TCTTGGCATGCAGGGCGCAAGTTCACTATGTACCAGCATAC------GTTTGATATTAGGAGGTTGCCGGTAAGC-AATGA-CGGGAGGTTTAGGG-AATAGCT-CCTTTAGTT-GGTCGTC--CTCGTTGAT-AA-CATTTTGCATTTCCTTGGCAATGCGTTTGATAGGGCCTATTCCT--GGGTGA-CAGG-TT
gi|30 : caaatc---GC---AT-A-G---A---TGA--AAG-G---TAAATTT--GCAG-A--A-TG-TT--------
gi|4 : -ATA---G-GC-TTC-ATAG------GC-A-TG--AGATGATAAGTCTTC-GT--AAATAGG--AGCAA-A-TA---TACA----ATTGT---A-A-A-------TA-CC-AATAGTTAG-CCAGAAATCCA-A---TG-TCT---CAA-TTTTA-GTCCATGTG--TTTTTTAC-AG-TCA-AATTTTGGCAATCA-GA-TTT-TGTTCCG-TGAC---TCCTC------TT---TG----TCTAATGT--CAA--GTAATATTGTC-TCTGTAAATATGG--ATACCCGCATACTTGTCACAACAATGCTCCA-TCTTTTGTTTGTAG-TGT---------------CAAAC-ACA-TTTTG-CTGTTGAAT-GG---TC-TG-G-----G-GCGTCC-ATT--GGAT-----GCGGTTTCT-T-ATTTT--TTG--GTACGT---T-TCTCC-ACGTAAAATGCT-GAACA--A-CAC-TGCAT-TGAATC-AAATACACACAA-TTCTTAGTTTCACATG-TGAA-GT-GGCCTTGA------A-------ATTGAGAATCATTTCCT---AATT--TGG-AATT-CGGATATT--GGCA-----TCACTG------------TTGTTG---AGT---G--GGTAAAGTTTACAACGAGG----------------------TTTTTACACGAAAAGGCCCCTTCTTGGCATACAGGGCGC
gi|4 : C-AATGAACGGGAGATTTAGGGAAATAGCT-CCTTTAGTTTGGTCGTCACTTCTTTGATGAA-CATTTTGCATTTC-TTGGCAATGCGTTTGATAGGGCCTAATCCTTTGGGTGAATAGG-TTAATACAA-GAGGAATCCTGTCACCTTTTTGTCTCTGC-TGTGTTTGTACTGCA-TAATAGTTACCGTGGTTTGGCCTTAGCCTTATCCATCTGGTTGCTAAT--AACCGGT-GTTATcaatgaacgggagatttagggaaatagctcctttagtttggtcgtcacttctttgatgaacattttgcatttcttggcaatgcgtttgatagggcctaatcctttgggtgaataggttaatacaagaggaatcctgtcacctttttgtctctgctgtgtttgtactgcataatagttaccgtggtttggccttagccttatccatctggttgctaataaccggtgttatctcctagatggctgaatgcaatttggtcaacgtccctgagtgtcgctatcttgagtcgagttctg
gi|5 : ataggcttcataggcatgagatgataagtcttcgtaaataggagcaaatatacaattgtaaataccaatagttagccagaaatccaatgtctcaattttagtccatgtgttttttacagtcaaattttggcaatcagattttgttccgtgactcctctttgtctaatgtcaagtaatattgtctctgtaaatatggatacccgcatacttgtcacaacaatgctccatcttttgtttgtagtgtcaaacacattttgctgttgaatggtctggggcgtccattggatgcggtttcttattttttggtacgtttctccacgtaaaatgctgaacaacactgcattgaatcaaatacacacaattcttagtttcacatgtgaagtggccttgaaattgagaatcatttcctaatttggaattcggatattggcatcactgttgttgagtgggtaaagtttacaacgaggtttttacacgaaaaggccccttcttggcatacagggcgcATGTT-CAC-AAAAGT--A---T--------ACATATG--C-A--CGGT-G-TT----TG-TAC-AA--C-AA------TT--A--GAATTTAGAGC------CATCTAAG-----G-------G----------TTGTGT-G---T-G------G------C-TT-C--AA-------G----TG---CCACGTGTA-G--------G-T------AA---T---TGGT-A------A-CACAG---T-C--CAACAA-T-T-TA---GC---AT-A-G---G---TGA--GAG-G---TAAATTT--GCAG-A--A-TG-TA--------T--A-------TACAACA-ATT-AA-G-ACAATTTTAAAAGTAG-GATTAG-C-ATA---G-GC-TTC-A-A------TGC-A-GGT-ACATA-TA----TTG-GT--AGATAGG--AGCAA-ATTA---TACA----GTAGT---A-ATA-------TA-AT-AATAGTTAG-CCAGAAATCCA-A---TT-TTT---CTA-TTT-A-GTCCAT-TG--TTTTT-GC-AG-TAA-AATAT-GGCAATCA-AT-TTT-TGTTCAG-TGACTCTTC---------TT---TG----TCTAATGT--CAG--GTAAT--TATC-CCTGTAA-TATGG--ATACCCGCATA-TTGTCACAACAATG-TCCA-C-TTTTGTT-GTAG-TGTTCA-CCTACTGGT-ACAAAC-ACATTTTTG-CTGTTGA-T-GG---TC-TG-G----CG-GTGTCC-ATT--G-AT-----GCGGTTTCT-T-ATTTT--TTG--GCACGT---T-TCTCCAATGT-ACATGATGGAACA-TA-CAC-TGCAT-TGAATC-AAATACACACAATTTTTctcctagatggctgaatgcaatttggtcaacgtccctgagtgtcgctatcttgagtcgagttctg
gi|6 : caaatcTATT-AAC-AAAAGT--A-T-T--------ACATATG--C-A--CGAT-G-CT----TGTTACAAA--CAAA------TT--A--G--------GT------CATCTAAG-----T-------G----------T------
gi|6 : GT-G-TTG---TA-TAC-AA--C-CC------TT--A--GA-------GATGGGAGCGTCTAAT-----T-------G----------T----------T-G---------------TA-C--AA-------A----TGT--C---------ACTGTAG--G-T------AA---T---TGGT-A------A-CATAG---T-C--CAACAG-T-T-T----GC---AT-A-G-------TGA--GAG-G---TAA--TT--GCAG-AGAA-TGGTT--------T--A-------TACAACA-ATT-AA-G-ACAATT----AA-TAG--ATTAG-C-ATATTAG-GC-TTC-A-AG-----TGC-AGTGC-ACATG-TA----TTG-GT--AAATAGG--AGCAA-ACTAGCATACACGGAGTAGTGA-A-ATAA------TAGCTGAATAGTTAG-CCA-AAATCCA-A----G-TCT---CTAATTT-A-GTCCAT-TG--TTTTT-GC-AG-TCA-AATTT-GGCAATtgtatacaacccttagagatgggagcgtctaattgttgtacaaatgtcactgtaggtaattggtaacatagtccaacagtttgcatagtgagaggtaattgcagagaatggtttatacaacaattaagacaattaatagattagcatattaggcttcaagtgcagtgcacatgtattggtaaataggagcaaactagcatacacggagtagtgaaataatagctgaatagttagccaaaatccaagtctctaatttagtccattgtttttgcagtcaaatttggcaat
gi|7 : tattaacaaaagtattacatatgcacgatgcttgttacaaacaaattaggtcatctaaATGT--CAC-AAAA----AGTAT--------ACATATG--C-A--CGGT-G-TT----TG-TAC-AA--C-AA------TT--A--GA-------GC------CATCTAAG-----A------------------T------G---T-G------G------C-TC-C--AA-------G----TG---C---------C--------A-TGTGTA-AA---T---TGGTTG------A-CACAG---T-C--CAACAA-T-T-TA---GC---AT-A-G---G---TGA--GAG-G---TAAATTT--GCAG-A--A-TG--T--------T--A-------TACA-------------ACAATT----AAGTAG-GATTAGAG-ATA---G-GC-TTCAA-AG-----AGC----GT-ACATG-TA----TTG-GT--AAATAGG--AGCAA---TA---TACA----GTTGT---A-ATA-------CA-CT-AATAGTTAG-CCACAAACCCGAA---TG-TCT---CTA-TTT-A-GTCCAT-TG--TTTTT-GC-AG-TCA-AA-TT-GGCAATCA-A--TTT-TTCTTAG-
gi|8 : caaatcAAAGT--A-T-T--------ACATATG--C-A--CGAT-G-CT----GG-TAC-AA--C-AAT-----TT--A--GA-------GT------CATCTAAG-----T-------G----------T------G---T-gattatccgtagatttaaagtccaagtag
gi|8 : tattatT--------ACCTACA--C-G--TGAC-A-TT----TG-TAC-AA--C-AA------TT--A--GA---------------CATCTAAG-----G-------G----------T------G---T-G------atatcacacccttagatgtctaattgttgtacaaatgtcacgtgtaggtaattggtaacatagtccaacagtttagcataggtgagcggtaattgcagaaatggtttatacacaattaagacaattaagtaggattagcatattaggcttcaagtgcatgcacatgtattggtaaataggagcaaactatacagtagtaatatactaatagttagccagaaatccaatgtctctatttagtccattgtttttgcagtcaaatttggcaatca
gi|8 : tattataaagtattacatatgcacgatgctggtacaacaatttagagtcatctaagtgtgtatatT-C--AC-------G----TG---T---------A--------GGT------AA---T---TGGT-A------A-CATAG---T-C--CAACAG-T-T-TA---GC---AT-A-G---G---TGA--GCG-G---TAA--TT--GCAG-A--AATGGTT--------T--A-------TACA-CA-ATT-AA-G-ACAATT----AAGTAG-GATTAG-C-ATATTAG-GC-TTC-A-AG-----TGC-A-TGC-ACATG-TA----TTG-GT--AAATAGG--AGCAA-ACTA---TACA----GTAGT---A-ATA-------TA-CT-AATAGTTAG-CCAGAAATCCA-A---TG-TCT---CTA-TTT-A-GTCCAT-TG--TTTTT-GC-AG-TCA-AATTT-GGCAATCA-attggtaacatagtccaacagtttagcataggtgagcggtaattgcagaaatggtttatacacaattaagacaattaagtaggattagcatattaggcttcaagtgcatgcacatgtattggtaaataggagcaaactatacagtagtaatatactaatagttagccagaaatccaatgtctctatttagtccattgtttttgcagtcaaatttggcaatca
gi|9 : tattataaagtattacatatgcacgatgctggtacaacaatttagagtcatctaagtgtgtatatcacacccttagatgtctaattgttgtacaaatgATGTT-C-C-TAAAGC----TAT--------A-AT-TG--C----CGGT-G-TT----TA-TTT-AA--C-AT------GT--A--GA-------GC------CAT-TAAG-----G-------G----------TT-----G---T-GCTTGT-G------C-TT-C--CT-------GCCTGTG---T---------A----------T------AA---T----GGT-A--------CACAG---T-C--CAACCA-T-T-CA---GC---AT-A-GT--G---TGA--G-------TAA--TT--CCAG-A----TGCTT--------T--A-------TCCAACC-ATT-AA-G-ACAATT-----AGTA--GATTCG-C-CT----G-GC-TTC-A-AG------GG-A--GT-ACATG-TA----TT--GT--AA--GGG--AGCAC-TTTA---TACA-----TTTT---A-AT--------TA-CT---TAGTTAG-CCA-AAAT-CG-A---TGCTCT---CT--TTT-AGGTCC-T-TG--TTTTT-GCAAG-TC--GATT---GC-ATCA-ATTTTT-TGTTCGG-TGAC---TC---------TT---
blockSeqs : T . GTATATTTAAAA GC G AT A A ATAA C A AC A ACGTAT GG AT ATTTAGA TGGGAG C GTGTTGTGGTATGGCCTTCAAGTGCCATTTATAGGT AAT TTA T TGAGAG . C TGT A AA GA A A TAG AAA C C GAGA AG A AGA A TG G GA A G AAAAAAAA TA T CC C A C A C TTAA GC A A TTA T . A C GGTCTAT A GT CT A AGTC A AA GA C T GCA CGGA AAG . TACAATG C G T A GA AAG C TAC C T G G TC TT A T C T ATT G C TCT ATCTATCTA CTT TAAA TC CCGT AT . G AT CCC C A C CTTTT T C C A G C A T A A T CTC T T TTCC T CT CT G ATCTT C C GA CT GTC G T T AC A T A T G G T T G A GACTTGTACTTTTGGAT CT C TG G T TG AAATC CCCAAAAATTTTGGGGGGG . TC TCTTTTCTTTCTTTT T TTGTAC G AA NNN T T AC G . TT A . A . C T . TTT G C T C G
blockSeqs : . . TAGTAT . . T . . G T . . . T . G . . C GGTTCTGTCATATGGCTTCAAATTGCATGTGTAGGT . . . . . C . . . G A . . . . . CCAG . T G A C . . . G . . . AC . . . . A . G . . TTA . . . T AG . G T . . . . . . A . . GA . A G . . G A . . . A . . . T T . . . . GT . . . CTC . . . GTG . . G . CGC . A . TCTTT . . C . . C . T . . . . . . . . C . . . . . . T . . G T AA G . . . C . T . . . GCCTTGAATTGAGAAT . A . . . . . TTGTTG . . GTTT . . . A AAA . . . . . . . . T . C . . TT G A . . .
blockSeqs : . . AGTAT . . . . . . . . . . . . . . . C GGTTGTGGTGTGGCTTCAAGTGCCCTGTTGTAGGT . . . . . C . . . T . . . . . . GT . . . A . . . . C . . . AC . . . . C . T . . . . . . . GT . T C . . . . . . T . . . . . . . . G A . . . . . . . . G . . . . GA . . . . . . . GTA . . G . CGC . A . TTTG . . C . . C . T . . . . . . . . C . . . . . . . . . T T AA G . . . . . T . . . GCCTTGAAATTGAGAA . A . . . . . GATG . . . . . . N AA . . . . . . . . A . C . . TT .
blockSeqs : . . AGTAT . . . . . . . . . . . . . . . C GGGTTGGTATAGGCTTCCTCAGTGTGCCACAATGT . . . . . T . . . A . . . . . . TG . . . A . . . . . . . . AT . . . . A . A . . . . . . . GT . G T . . . . . . C . . . . . . . . G G . . . . . . . . T . . . . AT . . . . . . . GTA . . A . CGC . A . CTTT . . C . . C . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . T C AA G . . . . . T . . . AAT . A . . . . . . . . . . A AA . . . . . . . .
blockSeqs : . . AGTAT . . . . . . . . . . . . . . . C GGTTGTGGTATTGTCTTCAAATTCCATGTGTAGGT . . . . . C . . . G . . . . . . G . . . A . . . . . . . . AC . . . . C . G . . . . . . . GT . T T . . . . . . A . . . . . . . . G G . . . . . . . . T . . . . G . . . . . . . . . . . . G . . . CTTT . . C . . C . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . T T A . . . . . . . . . . . . . . . . . A
blockSeqs : . . AGTA . . . . . . . . . . . . . . . C GACTGTGATATGGCTTCAAGTGCAATGTGTAGGT . . . . . C . . . G . . . . . . G . . . A . . . . . . . . AC . . . . A . G . . . . . . . GT . T C . . . . . . A . . . . . . . . G A . . . . . . . . T . . . . G . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . A . . . . . . .
blockSeqs : . . AGTA . . . . . . . . . . . . . . . C GGTTGTGGTGTGGCTTCAACTGCCATGTGTAGGT . . . . . C . . . A . . . . . . A . . . A . . . . . . . . AC . . . . A . T . . . . . . . GA . T T . . . . . . A . . . . . . . . A G . . . . . . . . T . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . ATA . . . . . . . . . . . . . . . C GGATTTGATGTGTGTGGCTTGTAACGTGACATGT . . . . . A . . . A . . . . . . G . . . A . . . . . . . . AC . . . . C . G . . . . . . . GT . T C . . . . . . T . . . . . . . . G A . . . . . . . . T . . . . . . . . .
blockSeqs : . . ATT . . . . . . . . . . . . . . . T GGTTGTGTGTGGCTTCAAGTGCCACGTGTAGGT . . . . . C . . . G . . . . . . A . . . A . . . . . . . . AC . . . . C . G . . . . . . . T . G T . . . . . . C . . . . . . . . G A . . . . . . . . T . . . .
blockSeqs : . . ATT . . . . . . . . . . . . . . . C GTTGCTGTGTGGCTTCAAGTGCATGTTAGGT . . . . . C . . . G . . . . . . G . . . A . . . . . . . . A . . . . C . G . . . . . . . G . T C . . . . . . C . . . . . . . . C A . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . TAT . . . . . . . . . . . . . . . C GGTTGTGCTTGTGCTTCCTGCCTGTGTAT . . . . . T . . . A . . . . . . G . . . A . . . . . . . . A . . . . C . G . . . . . . . T . . T . . . . . . T . . . . . . . . G A . . . . . . .
blockSeqs : . . AT . . . . . . . . . . . . . . . C TGTGTTAGTGCCAGGTGTTGTTGAGGG . . . . . C . . . G . . . . . . G . . . . . . . . . . . . C . . . . C . G . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . .
blockSeqs : . . AT . . . . . . . . . . . . . . . C TGTTGTACAAATGTCACTGTAGGT . . . . . T . . . A . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . .
blockSeqs : . . AT . . . . . . . . . . . . . . . C ATGTGGCTCCAAGTGCCATGTGTA . . . . . C . . . G . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . TT . . . . . . . . . . . . . . . C GTGTAGGTACAGT . . . . . . . . . A . . . . . . G . . . . . . . . . .
blockSeqs : . AT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . .
blockSeqs : AT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . .
blockSeqs : AT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . .
blockSeqCons : ATAT*********** *** G* ******* T* **** ** T* GT** GTA** CGC CTTT** *** C* AA GCTTGATTGAAT***************** CCGG*************** A* AAA
originalCons : NAATGTT-CAC-AAAAGT--AGTAT--------ACATATG--C-A--CGGT-G-TT----TG-TAC-AA--C-AA------TT--A--GA-------GC------CATCTAAG-----G-------G----------T------G---T-G------G------C-TT-C--AA-------G----TG---C---------A--------G-T------AA---T---TGGT-A------A-CACAG---T-C--CAACAG-T-T-TA---GC---AT-A-G---G---TGA--GAG-G---TAAATTT--GCAG-A--A-TG-TT--------T--A-------TACAACA-ATT-AA-G-ACAATT----AAGTAG-GATTAG-C-ATA---G-GC-TTC-A-AG-----TGC-A-TGC-ACATG-TA----TTG-GT--AAATAGG--AGCAA-ANTA---TACA----GTTGT---A-ATA-------TA-CT-AATAGTTAG-CCAGAAATCCG-A---TG-TCT---CTA-TTT-A-GTCCAT-TG--TTTTT-GC-AG-TCA-AATTT-GGCAATCA-G--TTT-TGTTCAG-TGAC---TC---------TT---TG----TCTAATGT--CGG--GTAAT--TGTC-CCTGTAAGTATGG--ATACCCGCATA-TTGTCACAACAATG-TCCA-T-TTTTGTT-GTAG-TGTTCA-CCTACTGGT-ACAAAC-ACA-TTTTG-CTGTTGA-T-GG---TC-TG-G----CG-GTGTCC-ATT--G-AT-----GCGGTTTCT-T-ATTTT--TTG--GCACGT---T-TCTCCAATGTAACATGATGGAACA-TA-CAC-TGCAT-TGAATC-AAATACACACAATTTTTTAGTTTCACATG-TGAA-GT-GGCCTTGA------A-------AT------TCATTTCCT--GAATT--TGG-AATT-CGGATATT--GGCA-----TCACTGGC---------TTTGGTG---AATG-GG--GGCAAAGTTTGCAGCGAGGTCTTTTCTTTCTTTT--TTTTTTTTTTACAAGGAAAGGTCCC-TCTTGGCATGCAGGGCGCAAGTTCACTATGTACCAGCATAC------GTTTGATATTAGGAGGTTGCCGGTAAGC-AATGA-CGGGAGGTTTAGGGAAATAGCT-CCTTTAGTT-GGTCGTC--CTCGTTGAT-AA-CATTTTGCATTTCCTTGGCAATGCGTTTGATAGGGCCTAATCCT--GGGTGA-TAGG-TTANTACAA-GAGGAATCCTGTCACCTTCT-GTCTCTGC-TGTGTT-GTACTGCAGTAATAGTT-CCGTGGTTTGGCCTTAGCTTTATCTATCTGGTTGTTAATTAAACCGGTGGTTAT
finalCons : NAATGTT-CAC-AAAAGTATAT-----------ACATATG--C-A--CGGT-G-TT----TG-TAC-AA--C-AA------TT--A--GA-------GC------CATCTAAG-----G-------G----------T------G---T-G------G------C-TT-C--AA-------G----TG---C---------A--------G-T------AA---T---TGGT-A------A-CACAG---T-C--CAACAG-T-T-TA---GC---AT-A-G---G---TGA--GAG-G---TAAATTT--GCAG-A--A-TG-TT--------T--A-------TACAACA-ATT-AA-G-ACAATT----AAGTAG-GATTAG-C-ATA---G-GC-TTC-A-AG-----TGC-AT-GC-ACATG-TA----TTG-GT--AAATAGG--AGCAA-ANTA---TACA----GTTGT---A-ATA-------TA-CT-AATAGTTAG-CCAGAAATCCG-A---TG-TCT---CTA-TTT-A-GTCCAT-TG--TTTTT-GC-AG-TCA-AATTT-GGCAATCAGT--TTT-TGTTCAG-TGAC---TC---------TT---TG----TCTAATGT--CGGGTA--AT--TGTC-CCTGTAAGTATGG--ATACCCGCATA-TTGTCACAACAATG-TCCACTTT--TGTT-GTAG-TGTTCA-CCTACTGGT-ACAAAC-ACA-TTTTG-CTGTTGA-T-GG---TC-TG-G----CG-GTGTCC-ATT--G-AT-----GCGGTTTCT-T-ATTTT--TTG--GCACGT---T-TCTCCAATGTAACATGATGGAACA-TA-CAC-TGCAT-TGAATC-AAATACACACAATTTTTTAGTTTCACATG-TGAA-GT-GGCTTGATTGAAT-----------------TCATTTCCT--GAATT--TGG-AATT-CGGATATT--GGCA-----TCACTGGCCCGG---------------AATG-GG--GGCAAAGTTTGCAGCGAGGTCTTTTCTTTCTTTT--TTTTTTTTTTACAAGGAAAGGTCCC-TCTTGGCATGCAGGGCGCAAGTTCACTATGTACCAGCATAC------GTTTGATATTAGGAGGTTGCCGGTAAGC-AATGA-CGGGAGGTTTAGGGAAATAGCT-CCTTTAGTT-GGTCGTC--CTCGTTGAT-AA-CATTTTGCATTTCCTTGGCAATGCGTTTGATAGGGCCTAATCCT--GGGTGA-TAGG-TTANTACAA-GAGGAATCCTGTCACCTTCT-GTCTCTGC-TGTGTT-GTACTGCAGTAATAGTT-CCGTGGTTTGGCCTTAGCTTTATCTATCTGGTTGTTAATTAAACCGGTGGTTAT
Alignments
lowQualScore : 22222222222 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 111 1111111 11 1111111 111 333333333 111 1111 111111111 111 111 1111 11111 11 111 1 7777777777777777777 22222 999999999999999999 11 44444444444444444 1 222222 11111111 11 11 1 1 1 111 2
lowQualScore : 2 2 2 2 22 11111111111 22 2 44 1 1 6666 4 2 22 2 777777 22 44 6666666 555555 3 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 666 444 2 666666 2 1 666 33 55 4 2 333 333 2 2 6666666 22 4 555 5 55 2 33 2 7 99999999 33 9999999 2 11 2 2 2 2 2 6666 22 3 2 000 5 3 6 0000000 11 44 3 9999 3 44 77 2 4 555 6666 33 2 555 2222222 2 2 2 2 1 33 444 2 555 6 3 3 3 3 55 3 3 4 4 4 88 5 000 222222222 000 4444 888888888 99 6 88 000 6 5 5 5 99 5 5 5 5 4 4 1 4 8 5 5 5 5 555 5 5 0000 5 5 77 5 44444 5 5 77 33 000 5 1 3 66 6 999 5 1 5 5 6 6 1111111111111111111 6 99 99 6 6 6 99 00000 000000000000000000 8 11 44444444444444444 0 0 333333 0 0 6 77 44444444 8 11 8 8 11 8 8 1 0 2 0 0 000 2 6 7 6 6
lowQualScore : . . . . .. ........... .. . .. . . .... . . .. . ...... .. .. ....... ...... . .......................................................................................................... ... ... . ...... . . ... .. .. . . ... ... . . ....... .. . ... . .. . .. . . ........ .. ....... . .. . . . . . .... .. . . ... . . . ....... .. .. . .... . .. .. . . ... .... .. . ... ....... . . . . . .. ... . ... . . . . . .. . . . . . .. . ... ......... ... .... ......... .. . .. ... . . . . .. . . . . . . . . . . . . . ... . . .... . . .. . ..... . . .. .. ... . . . .. . ... . . . . . . ................... . .. .. . . . .. ..... .................. . .. ................. . . ...... . . . .. ........ . .. . . .. . . . . . . . ... . . . . .
lowQualScore : 4 2 0 0 88 55555555555 66 0 55 8 8 0000 0 0 88 0 888888 88 88 5555555 888888 3 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 555 111 4 888888 4 6 555 22 44 4 2 777 777 1 1 7777777 99 2 888 4 99 5 44 5 5 11111111 77 3333333 9 99 7 7 9 9 5 1111 99 1 9 000 7 1 2 2222222 44 33 1 6666 1 22 33 9 8 000 1111 99 9 000 1111111 9 9 9 9 2 11 777 9 444 2 1 1 3 6 00 6 6 0 0 0 44 7 000 999999999 000 2222 888888888 22 7 33 222 7 7 0 0 55 0 0 0 6 4 4 1 4 9 0 0 0 0 666 0 0 6666 0 7 99 7 33333 7 7 99 66 000 7 4 9 44 6 444 7 4 7 0 7 7 7777777777777777777 7 22 22 7 7 7 22 00000 444444444444444444 0 00 66666666666666666 0 8 000000 8 8 7 55 44444444 0 00 0 0 00 0 0 0 0 5 0 0 222 5 7 3 7 7
consensus : NAATGTT-CAC-AAAA-G-T--ATA---T------ACATATG--C-A--CGGT-G-TT----TG-TAC-AA--C-AA------TT--A--GA-------GC------CATCTAAG-----G-------G----------T------G---T-G------G------C-TT-C--AA-------G----TG---C---------A--------G-T------AA---TT---GGT-A------A-CACAGT---C--CAACAG-T-T-TA---GCA---T-A-G---G---TGA--GAG-G---TAAATTT--GCAG-A--A-TG-TT--------T--A-------T-ACAACA-ATT-AA-G-ACAATT----AAGTAG-GATTAG-C-ATA---GGC-TTC-A-AG-----TGCA-TGC-ACATG-TA----TTG-GTAAA--TAGG--AGCAA-ANTA---TACA----GTTGT--A-A---TA-------TA-C-T-AATAGTTAG-CCAGAAATCCG-A---TG-TCTC---TA-TTT-A-GTCCAT-TG-TTT--TT-GC-AGT-CA-AATTT-GGCAATCAG-TTTTTGTTCAGT-GAC---TC---------TT---TGT----CTAATGTC--GG--GTAAT--TGTC-CCTGTAAGTATGGATA--CCCGCATA-TTGTCACAACAATG-TCCA-CTTTT-GTT-GTAG-TGTTCA-CCTACTGGT-ACAAAC-ACA-TTTT-G-CTGTTGA-T-GG---TC-TG-G----CG-GTGTCC-ATT--G-AT-----GCGGTTTCT-T-ATTTT--TTG--GCACGT---T-TCTCCAATGTAACATGATGGAACA-T-ACAC-TGCAT-TGAATC-AAATACACACAATTTTTTAGTTTCACATG-TGAA-GT--GG-CTTG--A---TT--GA-ATTCATTT--CCTGAATT--TGG-AA-TT-CGGATATT--GGCA-----TCACTGGCGC---------------GGAATG-GG--GGCAAAGTTTGCAGCGAGGTCTTTTCTTTCTTTT--TTTTTTTTTTACAAGGAAAGGTCCC-TCTTGGCATGCAGGGCGCAAGTTCACTATGTACCAGCATAC------GTTTGATATTAGGAGGTTGCCGGTAAGC-AATGA-CGGGAGGTTTAGGGAAATAGC-TCCTTTAGTT-GGTCGTC--CTCGTTGAT-AA-CATTTTGCATTTCCTTGGCAATGCGTTTGATAGGGCCTAATCCT--GGGTGA-TAGG-TTANTACAA-GAGGAATCCTGTCACCTTCT-GTCTCTGC-TGTGTT-GTACTGCAGTAATAGTT-CCGTGGTTTGGCCTTAGCTTTATCTATCTGGTTGTTAATTAAACCGGTGGTTAT
Reference ( family-1618 ) : NAATGTT-CAC-AAAA-G-T--ATA---T------ACATATG--C-A--CGGT-G-TT----TG-TAC-AA--C-AA------TT--A--GA-------GC------CATCTAAG-----G-------G----------T------G---T-G------G------C-TT-C--AA-------G----TG---C---------A--------G-T------AA---TT---GGT-A------A-CACAGT---C--CAACAG-T-T-TA---GCA---T-A-G---G---TGA--GAG-G---TAAATTT--GCAG-A--A-TG-TT--------T--A-------T-ACAACA-ATT-AA-G-ACAATT----AAGTAG-GATTAG-C-ATA---GGC-TTC-A-AG-----TGCA-TGC-ACATG-TA----TTG-GTAAA--TAGG--AGCAA-ANTA---TACA----GTTGT--A-A---TA-------TA-C-T-AATAGTTAG-CCAGAAATCCG-A---TG-TCTC---TA-TTT-A-GTCCAT-TG-TTT--TT-GC-AGT-CA-AATTT-GGCAATCAG-TTTTTGTTCAGT-GAC---TC---------TT---TGT----CTAATGTC--GG--GTAAT--TGTC-CCTGTAAGTATGGATA--CCCGCATA-TTGTCACAACAATG-TCCA-CTTTT-GTT-GTAG-TGTTCA-CCTACTGGT-ACAAAC-ACA-TTTT-G-CTGTTGA-T-GG---TC-TG-G----CG-GTGTCC-ATT--G-AT-----GCGGTTTCT-T-ATTTT--TTG--GCACGT---T-TCTCCAATGTAACATGATGGAACA-T-ACAC-TGCAT-TGAATC-AAATACACACAATTTTTTAGTTTCACATG-TGAA-GT--GG-CTTG--A---TT--GA-ATTCATTT--CCTGAATT--TGG-AA-TT-CGGATATT--GGCA-----TCACTGGCCC---------------GGAATG-GG--GGCAAAGTTTGCAGCGAGGTCTTTTCTTTCTTTT--TTTTTTTTTTACAAGGAAAGGTCCC-TCTTGGCATGCAGGGCGCAAGTTCACTATGTACCAGCATAC------GTTTGATATTAGGAGGTTGCCGGTAAGC-AATGA-CGGGAGGTTTAGGGAAATAGC-TCCTTTAGTT-GGTCGTC--CTCGTTGAT-AA-CATTTTGCATTTCCTTGGCAATGCGTTTGATAGGGCCTAATCCT--GGGTGA-TAGG-TTANTACAA-GAGGAATCCTGTCACCTTCT-GTCTCTGC-TGTGTT-GTACTGCAGTAATAGTT-CCGTGGTTTGGCCTTAGCTTTATCTATCTGGTTGTTAATTAAACCGGTGGTTAT
gi|1 : GTT-CACCAAAA-G-T--GTAGTAT------ACATATG--C-A--CGAT-T-CT----TG-TAC-AC--A-AA------TT--A--GA-------GC-------AT------------------G----------T------G---T-A------G-----------------------G----TA---C---------A--------G-T------AAA--TT---GGT-A------AACAAAGT---C--CCACA----T-TA---GCA---T-A-G---G---TGA--GAG-G---TA--TTT--GCAG-A--A-TG-TT--------T--AAAAAAAAT-ATAGAA-AAT-AA-G-AAAATT----AAGTAT-GATTAG-C-ATA---GGCCTTA-A-AA-----TGCAATGC-ACATG-CAA---TTG-GGAAA--TAGGT-ACTAA-AATA---TATC----GTTGT--ACA---TA-------TG-C-T-AATAGTTAG-CCAGAAATCCA-A---TG-TCT----TA-TTT-A-G-CCAT-TG-TTT--T--GC-AGT-CA-AATTT-GGCAATCAA-GTTTTGTTCAGT-GAC---TC---------TT---TGT----CTAAT-TC--GG-----AT--TGTAACTTGTAAGTATGGATA--CC-G-ATA-TTGTCACA-CAATG-TCCA---TTT-GTT-GTAG-TGTT-A-CCTACTGGT-ACAAA--ATA-TTTT-G-CTGTTGA-T-AGGT-TC-TG-G----CG-GTGTC--ATT--G-AT-----GCGGTTTCT-T-TATTT--TTG--GCACGT---T-TC--CAAAGTA-CATGATGGAACA-T-ACAC-TGCAT-TGAATC-AAATA-ACACAATGTTTTTGTTTCACATG-TGAA-GT--G-----------------A-ATTCATTT--CCTGAATT--TGG-AA-TTTCGGATATT--GGCA-----TCA-TGGCATTTG------------GGAATGTGG--GGCAGAATTTGCAGCGAATTCTTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTACAAGGAAAGGTCCC-TCTTGGCATGCAGGGTGCAAGTTCACTATGCAGCAGCATAC------GTTTGATATTAGGATGTTGCCGGT-AGC-AATG--TGGGAGGTTTAGGG--ATAGT-TCCTTTAGTT-GGTT-TC--CTCGTTGAT-AATCATTTTGCATTTCCTTGGCAATGCGTTTGATAGGTGCTAAATCT--GACTGA-TAGGTTTATTACAATGAGGAATCCTGTCA-CTTCT-GTCTCTGCTTGTG-G-GTACTGCAGTAATAGTT-CCGTGGTTTTGGCTTAGCTTTATCTATCTGGTTGTTAATTAAACTGGTGGTTAT
gi|10 : ATGTT-CAT-AAAAAG-T--A------------ACATAT---C-A---GGT-G-TT-----G-TAT-G---C-AA------TT--A--GA-------GC------CAT-TAGG-----GTTGCT--G----------T------G---T-G------G------C-TT-C--AA-------G----TG---C---------ATGTTAG--G-T------AA---T----GGT-A------A-CACAGTA--C--AAACA--T-T-TA---G-A---TCA-G---G---TGA--GAG-G---TAAATTTTGGCAG-A--A-TG--T--------T--A-------T-ACACCACATT-AA-GAACAATT----AAGT-G-GATTAG-C-ATA---GGC-TTC-A-AA-----GCCA-GGT-ACATG-TA----TTG-GT-AA--TAGA--AGC---ATTA---TACG----GTAG---A-A---TA-------GA-C-T-AA-AG-TAGTCCAAAAATCCA-A---TG-TCT----TACTTT-A-GTCCAT-TGTTTT--TT-GC-Aatattgcactaggacctgtctgtaaggaatgtccaaggctaacgttgctggcctgttgcaaaattaagtcgttctg
gi|11 : atctATGTT-CAC-TAGA-G-T--ATA-----------CATATG--C-A--CGAT-G-TT----TG-TAC-AA--C-AA------TT--A--GA-------GC------CATCTAAG-----GACT----G----------T------GATAT-G------G------C-TT-C--AA-------G----TG---C---------AATGTGTAGG-T------AG---TT---GGT-A------A-CA--GT---C--CAACAG-T-T-TA---GGA---T-A-G---G---TGA--GAG-A---TAAATTT--GCAG-A--A-TG-TT--------T--A-------T-ACAACA-ATT-AA-G-AAAATT----AAGTAT-GATAAG-C-ATA---GGC-TTC-A-AG-----TGCA-TGC-ACATG-CA----TTG-GTAAA--TAGG--AGCAA-AA-A---TACA----ATTGC--A-A---TA-------TA-C-T-AATAGTTAG-CCAGAAATCCA-A---TG-TCTC---TA-TTT-A-GTCCc
gi|12 : gccattcAAA-G-T--ATA-----------CATATT--C-A--CAGT-G-TT----TG-TAC-AA--C-AA------TT--A--GT-------GT------CATCTAAA-----G-------G----------TTGTGGTG---T-G------G------C-TT-C--AACTGCCATG----TG---T---------A--------GGT------AA---TT---GGT-A------A-CACAGT---C--CAATAT-A-T-TA---GCA---T-A-G---A---TGA--AAG-G---TAAATTT--GCAG-A--A-TG-TT--------T--A-------T-ACAACA-ATT-AA-G-GCAATT----AAGTAA-GATTAG-C-ATA---GGC-TTC-A-A------TGCA-GGT-ACATG-TA----TTG-GTAAA--TAGG--AGCAA-ATTT---AACA----GTTGT--A-A---TA-------TA-C-T-AATAGTTAG-CCAGAAATCCG-A---
gi|13 : -CTTACTGGTGACAA-C-ACT-TTGT-GACTATTGA-TTGGCTCTT-TGTGTTCCCGTGTGCCCTATTCTG-ATATCTTGCCGTTTCT-TCATTTTGATTGCTGTTCGTGTCT-TCTCCAATGTACGATGATG---TG-T-GT-T-TGTCT-TCA-TC-AAATAC-CA-AGTTTTTTAGTTTCACAAG-TGAA-CTAGGA-CTTGT-ACTTTT--GG-ATTCATTC--CTTGACTCTGTGG-GA-TT-CTGATGTT--G
gi|14 : GTT-CAC-AAGA-G-T--ATA---T------A--TATG--C-A--CGAT-G-TT----TG-TAC-AA--C-AA------TT--A--GA-------GC------CACCTAAG-----G-------GT---------T------G---T-GGTATTAG------C-TT-C--AA-------G----TG---C---------aaaggctagttcgactggcatgagtgcaa
gi|14 : agcaaatcaaCA-TTT-AA-G-AAATTT----AAGTGG-GATTAG-C-GTA---GGC-TTC-A-AG-----TGCA-TGT-ACATG-TA----TTG-GTAAA--TAGG--ATCAA-ACTA---TATA----GTTGT--A-A---TATACAATGTA-C-T-AATAGTTAG-CCGGAAATCCG-A---AG-TCTC---CA-TTT-A-GTCCAT-catttaagaaatttaagtgggattagcgtaggcttcaagtgcatgtacatgtattggtaaataggatcaaactatatagttgtaatatacaatgtactaatagttagccggaaatccgaagtctccatttagtccat
gi|15 : agcaaatcaagttcacaagagtatatatatgcacgatgtttgtacaacaattagagccacctaagggttgtggtattagcttcaagtgcTGCAGGACGAAAGTTCACTTTGTACCAGCATACTTGTACGTTTGATATTAGGAGGTTGCCGGTAAGC-AATGA-CGGGAGGTTTAGGGAA--------------TT-G-TCGTC--CTCGTTGAT-AA-CATTTTGCATTTCCTTGGCAATGCGTATGATAGGGCCTAATCCT--GGGTGG-TAGG-TTAATACGA-AAGGAATCCTGTCACCTTCC-TTCTCTGC-TATGTT-GTACTGCAGTAA
gi|16 : AATG-TCCA-CTTTTTGTT-GTAG-TGTTCAACCTACTGGT-A-AAACAACA-TTTT-G-CTGTTT--T-GG---TCTTG-G----CG-GTGCTC-ATT--G-AT-----GCA--TTCTCT-ATTTT--TTGT-GCACAA---T-TCGCCAATGAAAT-TGATGAAACATT-ACACTTGCATGTGAATCGAAATACACTTAATTTTTTAGTTTCACATGTTGAAGGT--GG-CC--------TT--GA-ATT
gi|17 : ATGTTTCAT-AAAA-G-T--ATA-----------CATATG--AGA--AGATAG-ATATAATGCTAT-AA----AA------TT--A--GA-------GC-------AT-TAAG-----G-------G----------TTGTGGTG---T-G------G------C-TT-C--AA-------G----TG---CCCTGTTGTAG--------G-T------AA---TT---GGT-A------A-CACAGT---CAACAA-AA-T-A-TATAGGCA---T-A-A---GAGATGA--GAA-GAGATAA-TTT--GCAG-A--A-TG-TT--------T--A-------T-ACAA-A-ATTAAA-G-ACAATT----AAGTAG-Gaaaaaattc
gi|18 : aagcaatcATGTT-TAT-A----G-G--GTA---T------ACATATG--C-AT-CATT-G-TT-----G--AC-AAACC-AA------TT--A--GA-------GC------CACCTAAGGGGTTG-------G----------T------A---TAG------G------C-TT-CCTCA-------G----TGTGCC---------ACAAT----G-T------AA--------GGT-A------A--ATGGT--------ACAG-T-C-TA---TCA---T-G-A---G---T----AAG-G---TAAA
gi|18 : gcaaatcc-T-TA---ACA---T-ACG---A---TGA--GAG-----TAAATTTC-GCAG-A--A-TG-TT--------T--aaatgataacaataatgtcccttaattaacatacgatgagagtaaatttcgcagaatgttttt
gi|19 : gcaaatccatgtttatagggtatacatatgcatcattgttgacaaaccaattagagccacctaaggggttggtataggcttcctcagtgtgccacaatgtaaggtaaatggtacagtctatcatgagtaaggtaaaaaatgataacaataatgtcccttaaATGTT-GAC-AAGA-G-T---T----T------ACCTATG--C-A--CGAT-G-TT----TG-TAC-AA--C-AA------TT--A--GA-------GC------CATCTAAG-----G-------G----------TT-----G---T-G------GTATTGTC-TT-C--AAATTCCATG----TG---T---------A--------GGT------AA---TT---GGT-A------A-CACAGT---C--CAACAG-T-T-TA---GGA---T-G-A---G---TGA--GAG-G---TACATTT--GCAG-A--A-TG-TT--------T--A-------T-ATAATA-ACT-tt
gi|2 : agcaaatcAATGTT-CAC-AAAA-G-TTAGTA---T------ACATATG--C-A--CGAT-G-TT----TG-TAC-AA--C-AA------TT--A--GA-------GC------CAT------------------G----------T------G---T-A------G-----------------------G----TA---C---------A--------G-T------AA---TT---GGT-A------A-CACAGT---C--CAACAA-T-T-TA---GCA---T-A-G---G---TGA--GAG-G---TAAATTT--GCAG-A--A-TG-TTAAAAAAAAT--A-------T-AGAACA-ATT-AA-G-AAAATT----AAGTAT-GATTAG-C-ATA---GGC-TTA-A-AG-----TGCA-TGC-ACATG-CA----TTG-GGAAA--TAGG--ACTAA-AATA---TACA----GTTGT--A-A---TA-------TG-C-T-AATAGTTAG-CCAGAAATCCA-A---TG-TCTC---TA-TTT-A-GCCCAT-TG--TT--TT-GC-AGT-CA-AATTT-GGCAATCAG--TTTTGTTCAGT-GAC---TC---------TT---TGT----CTAATGTC--GG-----AT--TGTA-CTTGTAAGTATGGATA---CCG-ATA-TTGTCAC-ACAATG-TCCA-TTTGT-GTT-GTAGCTGTT-A-CCTACTGGT-A-AAAC-ATA-TTTT-G-CTGTTGA-T-GG---TT-CG-G----CG-GTGT-C-ATT--G-AT-----GCGGTTTCT-T-TATTT--TTG--GCACGT---TGTCTCAAA-GTAACATGATG--ACA-TAACAC-TGCATCTGGATC--AATACACACAATGTTTTTGTTTCACATG-TGAA-G-----------------T--GA-ATTCATTTTCTCTG-ATT--TGG-AATTT-CGGATATTTGGGCAAAATCCCACTGGCCCCAAAAATTTTGGGGGGGAATG-GG--GGCAGAGTTTGCAGCGAATTCTTTTCTTTCTTTT--TTTTTTTTTTACAAGGAAAGGTCCC-TCTTGGCATGCAGGGTGCAAGTTCACTATGCAGCAGCATAC------GTTTGATATTAGGATGTTGCCGGTAAGC-AATGN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTCCTTTAGTT-GGTTGTC--CTCGTTGAT-AA-CATTTTGCATTTCCTTGGCAATGCGTTTGATAGGGCCTAATCCT--GGATGA-TAGG-TTATTACAA-GAGGAATCCTGTCACCTTCT-GTCTCTGC-TGTGTT-GTACTGCAGTAATAGTTCCCGTGGTTTGGCCTTAGCTTTATCTATCTGGTTGTTAATTAAA-CGGTGGTTATcctaaataagtatcgaataaagat
gi|20 : t--CGGT-G-TT----TG-T-------T-AA------TT--GATGA-------GC-------ATCTAAG-----G-------GATTTGATGTGT------G---T-G------G------C-TTGT--AAC------G----TGA--C---------AT-------G-T------GT---TA---GGT-ATGAGAGA-CA-AAT---C--CAGAAA-TATATA---GCA---T-G-G---G---TGA--GGG-GG--TA--TTT--GCAGGA--A-TG-TC--------TTAA-------T-AAAA-G-ATT-AACG-A-AATT----AAGTAG-GATTAG-CAATA---GGC-TT
gi|21 : tc---TG-TCTC---TA-TTT-A-GTCCAT-TG-TTT--TG-GC-AGT-CA-AATTT-GGCAATCAG-TTTGTGTTCAAT-GAT---TC---------TTCTTTGT----CTAATGTC--AG--GTGAT--TGTC-TCTGCA-GTATGGAAA--TCCCCATA-TTGTCACAACAGTG-TTCA-CTTTT-GTT-GTAG-TGTTCA-CCTACTGGT-ACAAAC-ATA-Taa
gi|22 : -AAAA-G-T--A------------ACATATG--C-A--ATGA-G-TT----C--TAC-AA--C-AA------TTGGA--GA-------GC------CATCTTGG-----GTGTTGTGG----------T------A---T-G------G------CCTT-C--AA-------G----TG---CCATTTATA-G--------G-T------AA---TT---GGA-A------A-CACAGT---C--CAATGG-T-T-TA---G-A---T-A-G---G---TAA--GAA-G---
gi|23 : aagcgcaatcatttcaccaaaaaaaaaaaaATGCT-CAT-AAAA-G-T--ATA----------ACATATG--C-A--CGGT-G-TT----TG-T-C-AA--C-A--------T--AG-GA-------GC------CATCTATG-----G-------GTTCTGTCA--T------A---T-G------G------C-TT-C--AA-------AT---TG---C---------ATGTGTAG-G-T------AAAATTT---TGC-A------A--AAAG----C--CAACAG-T-T-TA---GAA---T-A-G---GT--TGA--GAGAG---TAaag
gi|24 : ccTCATGT--CCTGAATT--TGGGAA-TT-CGATTACT--GGCA-----TCACTGGCGA---------------TGAGTG-GG----CAAAGTTTGCAGCGAGG--TTTTCT
gi|24 : CAGGGCGCAAGT----TATATAC---------------TTT-ATATAAGG-GGTTGCC-GTAAGTGAATGA-acacagggcgcaagttatatactttatataaggggttgccgtaagtgaatgaggaaaat
gi|25 : tcatgtcctgaatttgggaattcgattactggcatcactggcgatgagtgggcaaagtttgcagcgaggttttctacaTA-TTGTCACA----------------T-GTT-GTAG-TGTTCA-CCTACTGGT-ACAAAT-ACATTTTT-G-CTGTTGA-T-GG---TC-TG-G----CG-GTGTCggaaaat
gi|26 : GCAA-AACA---TACA----GTTGT--A-T---TA-------TA-C-T-GATAGTTAG-CCAGAAATCCG-A---TG-
gi|27 : ATGTT-CAC-AAAC-G-T--ATA-----------CATATG--C-A--CGGT-G-TT----T
gi|28 : gaagcaaatcTGTT-CAC-AAAA-G-T--ATA-----------CATATG--C-A--CGGT-G-T
gi|29 : caaatcATGTT-CAC-AAAA-G-----TA---T------ACATATG--
gi|3 : ctgaagcaaatcAATGTT-CAC-AAAA-GGT--ATA---TTTAAAAACATATGGCT-AATTGAT-GATT----TG-TAA-TA--C-AAACGTATTT--G--G----------------CATTCAA-------------------------T------G---T-GTTA---G------T-GC-C--AG-------G----TG---T---------T--------G-TTGAGGGAA---TTTATGGT-A------A-CACAGTGTTC--CA-CAGATAT-TA---GCAAAAT-A-GCCAG---TGAAGGAGTG---TAAATT---GCGA-A--G-TA-TA--------T--A-------TTACAACA-ATA-AC-G-AAAATT----AAGTAGCGATTAG-C-ATA---GTCCTTC-ACAGGTCTATGCAATGCTACATG-TA----TTGAGTAAAAATAGGGAAGTAACAATA---TACA----GTTGT--A-AGAATA-------TA-CCT-AATAGTTAG-CCGAGAATCCA-AAAGTG-TCTTACTTA-TTT-A---TCAT-CG-TCTCTTT-GC-AGTTCACAATTT-GGCAATCAG-TTTTTGTTCAGCCGAT---TCATCTATCTATT---TGTAAATCTAATGTTCTAGCCGTA-T--TGTC-CCTGTA-GTATGGATATACCCGCATA-TTGTCACAACAAT---------------T-GTAG-TGTTCA-CCTACTGGT-ACAAAC-ACA-TTTTTA-ATGTTGA-T-GG---TC-TG-G----CG-GTGTCC-ATT--G-AT-----GCGGCTTCT-T-ATTTT--CTG--CCACTT---T-TCTCCAATGT-ACATGATGGAACA-T-ACAC-TGCAT-TGAATC-AAATACACACAA-TTTTTAGTTTCACATG-TGAA-GT--GGCCTTGA-A---TTGAGA-ATTCATTT--CCTGAATT--TGT-AA-TT-CGGACATT--GGCA-----TCACTGGC-------------------AATG-AGTCGGCAAAAATTGCAGCGAGG-----------GTTT--TTTTTTTTTTACAAAGAAAGGTCCC-TCTTGGCATGCAGGGCGCAAGTTCACTATGTACCAGCATAC------GTTTGATATTAGGAGGTTGCCGGTAAGC-AATGA-CGGGAGGTTTAGGG-AATAGC-TCCTTTAGTT-GGTCGTC--CTCGTTGAT-AA-CATTTTGCATTTCCTTGGCAATGCGTTTGATAGGGCCTATTCCT--GGGTGA-CAGG-TT
gi|30 : caaatc---GCA---T-A-G---A---TGA--AAG-G---TAAATTT--GCAG-A--A-TG-TT--------
gi|4 : -ATA---GGC-TTC-ATAG------GCA-TG--AGATGATAAGTCTTC-GTAAA--TAGG--AGCAA-A-TA---TACA----ATTGT--A-A----A-------TA-C-C-AATAGTTAG-CCAGAAATCCA-A---TG-TCTC---AA-TTTTA-GTCCATGTG-TTT--TTTAC-AGT-CA-AATTTTGGCAATCAG-ATTTTGTTCCGT-GAC---TCCTC------TT---TGT----CTAATGTC--AA--GTAATATTGTC-TCTGTAAATATGGATA--CCCGCATACTTGTCACAACAATGCTCCATCTTTT-GTTTGTAG-TGT---------------CAAAC-ACA-TTTT-G-CTGTTGAAT-GG---TC-TG-G-----G-GCGTCC-ATT--GGAT-----GCGGTTTCT-T-ATTTT--TTG--GTACGT---T-TCTCC-ACGTAAAATGCT-GAACA---ACAC-TGCAT-TGAATC-AAATACACACAA-TTCTTAGTTTCACATG-TGAA-GT--GGCCTTGAAA---TT--GAGAATCATTT--CCT-AATT--TGG-AA-TT-CGGATATT--GGCA-----TCACTGTTGT---------------TGAGT---G--GGTAAAGTTTACAACGAGG----------------------TTTTTACACGAAAAGGCCCCTTCTTGGCATACAGGGCGC
gi|4 : C-AATGAACGGGAGATTTAGGGAAATAGC-TCCTTTAGTTTGGTCGTCACTTCTTTGATGAA-CATTTTGCATTTC-TTGGCAATGCGTTTGATAGGGCCTAATCCTTTGGGTGAATAGG-TTAATACAA-GAGGAATCCTGTCACCTTTTTGTCTCTGC-TGTGTTTGTACTGCA-TAATAGTTACCGTGGTTTGGCCTTAGCCTTATCCATCTGGTTGCTAAT--AACCGGT-GTTATcaatgaacgggagatttagggaaatagctcctttagtttggtcgtcacttctttgatgaacattttgcatttcttggcaatgcgtttgatagggcctaatcctttgggtgaataggttaatacaagaggaatcctgtcacctttttgtctctgctgtgtttgtactgcataatagttaccgtggtttggccttagccttatccatctggttgctaataaccggtgttatctcctagatggctgaatgcaatttggtcaacgtccctgagtgtcgctatcttgagtcgagttctg
gi|5 : ataggcttcataggcatgagatgataagtcttcgtaaataggagcaaatatacaattgtaaataccaatagttagccagaaatccaatgtctcaattttagtccatgtgttttttacagtcaaattttggcaatcagattttgttccgtgactcctctttgtctaatgtcaagtaatattgtctctgtaaatatggatacccgcatacttgtcacaacaatgctccatcttttgtttgtagtgtcaaacacattttgctgttgaatggtctggggcgtccattggatgcggtttcttattttttggtacgtttctccacgtaaaatgctgaacaacactgcattgaatcaaatacacacaattcttagtttcacatgtgaagtggccttgaaattgagaatcatttcctaatttggaattcggatattggcatcactgttgttgagtgggtaaagtttacaacgaggtttttacacgaaaaggccccttcttggcatacagggcgcATGTT-CAC-AAAA-G-T--ATA-----------CATATG--C-A--CGGT-G-TT----TG-TAC-AA--C-AA------TT--A--GAATTTAGAGC------CATCTAAG-----G-------G----------TTGTGT-G---T-G------G------C-TT-C--AA-------G----TG---CCACGTGTA-G--------G-T------AA---TT---GGT-A------A-CACAGT---C--CAACAA-T-T-TA---GCA---T-A-G---G---TGA--GAG-G---TAAATTT--GCAG-A--A-TG-TA--------T--A-------T-ACAACA-ATT-AA-G-ACAATTTTAAAAGTAG-GATTAG-C-ATA---GGC-TTC-A-A------TGCA-GGT-ACATA-TA----TTG-GTAGA--TAGG--AGCAA-ATTA---TACA----GTAGT--A-A---TA-------TA-A-T-AATAGTTAG-CCAGAAATCCA-A---TT-TTTC---TA-TTT-A-GTCCAT-TG-TTT--TT-GC-AGT-AA-AATAT-GGCAATCAA-TTTTTGTTCAGT-GACTCTTC---------TT---TGT----CTAATGTC--AG--GTAAT--TATC-CCTGTAA-TATGGATA--CCCGCATA-TTGTCACAACAATG-TCCA-CTTTT-GTT-GTAG-TGTTCA-CCTACTGGT-ACAAAC-ACATTTTT-G-CTGTTGA-T-GG---TC-TG-G----CG-GTGTCC-ATT--G-AT-----GCGGTTTCT-T-ATTTT--TTG--GCACGT---T-TCTCCAATGT-ACATGATGGAACA-T-ACAC-TGCAT-TGAATC-AAATACACACAATTTTTctcctagatggctgaatgcaatttggtcaacgtccctgagtgtcgctatcttgagtcgagttctg
gi|6 : caaatcTATT-AAC-AAAA-G-T--AT----T------ACATATG--C-A--CGAT-G-CT----TGTTACAAA--CAAA------TT--A--G--------GT------CATCTAAG-----T-------G----------T------
gi|6 : GT-G-TTG---TA-TAC-AA--C-CC------TT--A--GA-------GATGGGAGCGTCTAAT-----T-------G----------T----------T-G---------------TA-C--AA-------A----TGT--C---------ACTGTAG--G-T------AA---TT---GGT-A------A-CATAGT---C--CAACAG-T-T-T----GCA---T-A-G-------TGA--GAG-G---TAA--TT--GCAG-AGAA-TGGTT--------T--A-------T-ACAACA-ATT-AA-G-ACAATT----AA-TAG--ATTAG-C-ATATTAGGC-TTC-A-AG-----TGCAGTGC-ACATG-TA----TTG-GTAAA--TAGG--AGCAA-ACTAGCATACACGGAGTAGTGAA-A---TAA------TAGC-TGAATAGTTAG-CCA-AAATCCA-A----G-TCTC---TAATTT-A-GTCCAT-TG-TTT--TT-GC-AGT-CA-AATTT-GGCAATtgtatacaacccttagagatgggagcgtctaattgttgtacaaatgtcactgtaggtaattggtaacatagtccaacagtttgcatagtgagaggtaattgcagagaatggtttatacaacaattaagacaattaatagattagcatattaggcttcaagtgcagtgcacatgtattggtaaataggagcaaactagcatacacggagtagtgaaataatagctgaatagttagccaaaatccaagtctctaatttagtccattgtttttgcagtcaaatttggcaat
gi|7 : tattaacaaaagtattacatatgcacgatgcttgttacaaacaaattaggtcatctaaATGT--CAC-AAAA-A----GTA---T------ACATATG--C-A--CGGT-G-TT----TG-TAC-AA--C-AA------TT--A--GA-------GC------CATCTAAG-----A------------------T------G---T-G------G------C-TC-C--AA-------G----TG---C---------C--------A-TGTGTA-AA---TT---GGTTG------A-CACAGT---C--CAACAA-T-T-TA---GCA---T-A-G---G---TGA--GAG-G---TAAATTT--GCAG-A--A-TG--T--------T--A-------T-ACA-------------ACAATT----AAGTAG-GATTAGAG-ATA---GGC-TTCAA-AG-----AGC---GT-ACATG-TA----TTG-GTAAA--TAGG--AGCAA---TA---TACA----GTTGT--A-A---TA-------CA-C-T-AATAGTTAG-CCACAAACCCGAA---TG-TCTC---TA-TTT-A-GTCCAT-TG-TTT--TT-GC-AGT-CA-AA-TT-GGCAATCAA-TTTTTCTT
gi|8 : caaatcAAA-G-T--AT----T------ACATATG--C-A--CGAT-G-CT----GG-TAC-AA--C-AAT-----TT--A--GA-------GT------CATCTAAG-----T-------G----------T------G---T-aggattatccgtagatttaaagtccaagtag
gi|8 : tattat---T------ACCTACA--C-G--TGAC-A-TT----TG-TAC-AA--C-AA------TT--A--GA---------------CATCTAAG-----G-------G----------T------G---T-G------atatcacacccttagatgtctaattgttgtacaaatgtcacgtgtaggtaattggtaacatagtccaacagtttagcataggtgagcggtaattgcagaaatggtttatacacaattaagacaattaagtaggattagcatattaggcttcaagtgcatgcacatgtattggtaaataggagcaaactatacagtagtaatatactaatagttagccagaaatccaatgtctctatttagtccattgtttttgcagtcaaatttggcaatca
gi|8 : tattataaagtattacatatgcacgatgctggtacaacaatttagagtcatctaagtgtgtatatT-C--AC-------G----TG---T---------A--------GGT------AA---TT---GGT-A------A-CATAGT---C--CAACAG-T-T-TA---GCA---T-A-G---G---TGA--GCG-G---TAA--TT--GCAG-A--AATGGTT--------T--A-------T-ACA-CA-ATT-AA-G-ACAATT----AAGTAG-GATTAG-C-ATATTAGGC-TTC-A-AG-----TGCA-TGC-ACATG-TA----TTG-GTAAA--TAGG--AGCAA-ACTA---TACA----GTAGT--A-A---TA-------TA-C-T-AATAGTTAG-CCAGAAATCCA-A---TG-TCTC---TA-TTT-A-GTCCAT-TG-TTT--TT-GC-AGT-CA-AATTT-GGCAATCAattggtaacatagtccaacagtttagcataggtgagcggtaattgcagaaatggtttatacacaattaagacaattaagtaggattagcatattaggcttcaagtgcatgcacatgtattggtaaataggagcaaactatacagtagtaatatactaatagttagccagaaatccaatgtctctatttagtccattgtttttgcagtcaaatttggcaatca
gi|9 : tattataaagtattacatatgcacgatgctggtacaacaatttagagtcatctaagtgtgtatatcacacccttagatgtctaattgttgtacaaatgATGTT-CCT-AAAG-C-T--ATA------------AT-TG--C----CGGT-G-TT----TA-TTT-AA--C-AT------GT--A--GA-------GC------CAT-TAAG-----G-------G----------TT-----G---T-GCTTGT-G------C-TT-C--CT-------GCCTGTG---T---------A----------T------AA---T----GGT-A--------CACAGT---C--CAACCA-T-T-CA---GCA---T-A-GT--G---TGA--G-------TAA--TT--CCAG-A----TGCTT--------T--A-------T-CCAACC-ATT-AA-G-ACAATT-----AGTA--GATTCG-C-CT----GGC-TTC-A-AG------GGA--GT-ACATG-TA----TT--GTAA----GGG--AGCAC-TTTA---TACA-----TTTT--A-A---T--------TA-C-T---TAGTTAG-CCA-AAAT-CG-A---TGCTCTC---T--TTT-AGGTCC-T-TG-TTT--TT-GCAAGT-C--GATT---GC-ATCAATTTTTTGTTCGGT-GAC---TC---------TT---