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Reference ( gi|8 )            :                                                                            GTCCTCCAACATT-TACGTTT-T-A--A-T---AACC------AAGTCGCTG--T----TT--AT-TG-TT--AC-ATGC------AAA-TGT--TTT----CAAGCAT--------GTAATT-A-ATGG------AAA-----GTTA------ATAACTTT---TAACAC-TAATT--A---CT--ATAT-TTT----AAAG-TACCTTT-TTACA------ACAACAAAAAAACCAAT--TGATGAAC----ATCGG-ACC-ATACAGC
gi|20                         :                                                                            GTCCCCCAACAAT-TACTCTT-T-AC-A-T---AATT------TTTTCGCTG--T----TT--AC-TG-AT--AC-ATCC------AAA-TGT--TTT----CAAGCAT--------GTAATT-A-AGGGAATTTCAAA-----GTTG------ATAA-TTT---TAACAC-CAATT--A---CT--
gi|17                         :                                                                      gttgtgGTCCCCCAATGTT-TAC-TTC-T-AGAA-T---GATC------TTCTCGCTG--T----TA--CC-TA-TT--AC-ATGC------AAA-TGT--TTT-----AAACAG--------GTAGTT-ATGTGG------GAA-----A-TA------ATAACGAT---CAATAG-TAACC--A---AT--GTGC-TTT----AAga
gi|13                         :                                                                       ttgcgGTTCCCCAA--TT-TA---TT-A-A--A-T---AATC------TTTCCCCTGATT----TT--CT-T--TT--ACGATGC------AAA-TAT--T------CATGCA---------GTAAT--A-A-GG------AAA-----GTCA------TTAACTTT---TATTAC--AAT---A---TT--ATGC-TTT----AAAG-AA--TTT-TTACA------A--------AAAT-AAT--T-ATCA-C----ATCGGAATC-ATATAGCttaatgaacatcggactatacagc
gi|12                         :                                                                      ttattgtTTCCCTAATATTATACATTT-T-A--A-TTTTAATC------TTCTCATTG--T----TTTCAT-T---T--AC-ATGC------AAA-TGT--GTT----CAAGCAT--------GTAATT-A-ATGG-------AA-----GTTA------ATCAGATC---TGA-AC-T--TT--A---CA--AT-----------AAG-------T-TTAT----------ACAAAAAA--CAAT--AGATGGAC----ATCAG-ACCAATACA
gi|4                          :                                                                        aatagtCCCCCAATGTT-TACTTTT-T-A--A-A---TACC-------------TG--TAATCTT--CT-T--TT--AT-ATGC------AAC-TGT--TTT----CAAACAT--------GTAATT-A-AGAG------ACA-----ATTG------ATAACCTT---TAGCAC-TGATT--A---CT--CGGT-TAT----AAAG-TA-ATTT-TTAC----------ACAAAA----TAAT--GTATGAAC----ATCGG-ACC-ATACa
gi|3                          :                   agtcggatttccctaacgtgcacggggctatttatagacatgaatgtatttattgtgacCCGCTAATATT-TACTTTT-TTA--A-TTT-AATC------TTCTCATTG--T----TTTCAT-T---T--AC-ATGC------AAA-TGTGTTTT----CAAGCAT--------GTAATT-A-ATGG------AAA-----GTTA------ATCAATCT-------GC-T--TT--A---CA--ATA---------A---------TT-TTAT----------ACAAAAAA--CAAT--AGATGGAC----ATCAG-ACC-ATACA
gi|6                          :       tggcattcccctcctgtacatggggctattttaagcacttaaagaaagtcaaatgcatttaaatttaataggttcCAATATT-TACATTT-C-A--AAT---AATT------TTGTCACTG--T----TT-----TC-TTGGAC-CTGT------AAA-TGC--TTT----CAAGCAT--------GTATTT-A-AT----------------ATTAGG----ATAACTTT-------AC-TAATTTAG---CT--GTAT-T-------AAG-TAATTCT-GTACATTTTGGAGAA-AAGGGAAATAAT--AGTTGAACATTGATCAG-ACC-ATACAa
gi|21                         :                                                                tgtatacatggatttgcaCGATATT-TACTTTTAT-A--A-T---AATCTTATCAAAATT------T----TC--AT-T---T--AC-ATGC------AAA-TGT--TTT----TAAG-----------GTAA-----------------A-----GTTA------ATAACTTT---TAA
gi|11                         :                                                                        tttttgggttaccaATT-TATTTTT-T-A--AAT---CATC------TTTTCAACG--T----TT--TC-TT-CT--AC-ATGA------AAA-TGT--TTT----CAAACATTCAAACATATAAT--A-AGAG------AAA-----GTAA------ACAATTTT---TAATAC-TAATT--C---AT--CTAC-TTC----AAAGAAATCTTT--------------AACAAGAAA--TAAT--GTTTAAAC----ATCCG-GCC-ATCCAACaaaaaaattaattcatctgatttga
gi|10                         :                                                                                      ATT-TACTTTT-T-A--AAT---GTTC---------TTATTG--T----TT--TC-TT-TT--AC-GTTT------AAT-TAT--TTT----CAAGCAT--------GCGCTT-A-AGGG------AAA-----TTTAATATTGATAACTTTAAAGAAAAC-TAATT--t
gi|16                         :                                                                                                         ttcatagattccgttttTCACCG--T----TT--TTCTT-TT--AC-ACAC------AAA-TGT--TTT----CAAGCAT--------GTAATT-A-AGGA------AAA-----GTTC------ATAACTTT---AAACACTTAACT--G---AT--CTGT-TTT----AAAA-CAATTTTGTTA----------AAAAAAAAAA--------GATGAAC----A-AGG-ACT-ATACAGcagctgctttagaacattttgggggaaaagatcatcagaccatacacc
gi|19                         :                                                                                                          tttttaagcaatcttcTCGCCG--T----TT--AC-TG-TT--AC-ATGTATATGAAAA-CGT--TTT-----AAGCAT--------GTAGTTAA-AGGG------AAA-----GTTA------TAAACTTT---TAAC-----------------------CTC----AAAG-TAATATT-T-------------ACAAAAAAA-TAAT--AGATGAAC----ATCGG-ACC-ATACAGCat
gi|28                         :                                                                                                                       tttTCGCT--------TT--AC-TGATT--AC-ATGC------AA--TGT--TTT----CA-GCAT--------GTAATT-A-A-GG------AAA-----GATAG-----ATAA-------TAACAC-CAATtt
gi|9                          :                                                                                                                aataatctttTCATTG--T----TT--CC-TT-TT--GC-ATGC------AGA-TTT--TTTTTTTCAAGCAT--------GTAATT-A-AGGG------AGA-----GTTA------ATAACTTG----AAC------TT-------T--CTGC-TTT----AAAG-TACTT
gi|7                          :                                                   tcctcgtgcgaatgggataatttatagaatgtataaatttacatgtaaaagggctcccactttaaatcttcTCGCTG--T----TA--CC-TA-TT--ACTATGC------AAAATGT--TTT----AAA--AT--------GTA-TT-A--TGGGGG---AAA-------TA------ATAACTAT-----ACAA-TAGTA--A---CC--A-AT-----------G-TGCTTT---------------------------AAT--TGATAAAC----ATCGG-ACC-ATACAGCataaatgaa
gi|18                         :                                                          ttcataaaccctaacgagcggcaaattatttttgcggttcccaattttacttctagaatatcttcCGCTG--T----TT--AC-TG-TTGTAC-ATGC------AAA-TGT--TTT----CAAGCAT--------ATAATT-A-A-GG------AAA-----GTTA------ATAACTTT---TAACAC-TAAT
gi|1                          :                                                                      gagagcggcgaatgcatttaatgtgctctcctaatgtatttttaaaataatctttcTG--T----TT--CT-TA-----AC-ATGC------AAA-TGT--TTT----CAAGCAT--------A------A-AGGG------AAA-----GTGA------AGAACTGT---CAACTC-TAATT--A---ATTAATCTGCTT----AAAG-AA---TT-TTGT----------ACAGAAAA--TAAT--AGAAAAAC----ATTGG-ACC-ATA
gi|15                         : atcaggatggatttccccatcatacatgtgagcatttatagacacctaattaagacttaaaacgagtcggcaacatatttataggtttcccctgaattattaattactatcaaaaatcttttctcaG--T----TT--TC-TT-TT--AT-TTCC------AGT-TGT--TTT----CACACAT--------ATCATT-A-AAGG------AAA-----GTTA------ATAACTTT---TAACAC-T-ATT--AAAGCT--GCA---TT----AAAG-TAA--TT-ATATAT-----AC----------TTTATTATGATGAAC----ATTGG-ATC-ATACAGCtctac
gi|2                          :                                                                                                       gcagatcttcccaactttttgtaca--T----TT--GT-T--TT--AC-ATGA------AAA-CAT--TT-----AAAGCTT--------GTAATT-A-TTGG------AAA-----ATTG------ATAACTTA---AAACAC-TAGTC-----------TGC-TTT----AAAG-TAATTTT-T-------------ATAAGAAA--TAAT--AGACGATC----ATCTG-ATC-ATGCAGC
gi|22                         :                                                                                                            atctaatagatacccactaataatgatcttttaatt-TT--AC-CTGT------GAA-TAT--TTT----CAAGCAT--------GCAATT-A-AGGG------AAC-----GCTA------ATAATCTT---CAAAAC-TAATTTAG---CT--GCA--TGT----AAGG-AA--TTT-T------------------AGTACTCTT--TGA--AAA----ATCGG-ACC-ACACAGCtttaatttgaatcaacgatatatctatattgaaatatatctaattactatgtcatgatatatattttcttcctttcag
gi|14                         :                                                                                                                                                          ct------AAA-TAT--TTT----CAAGCAT--------GTAGTT-A-A-GG------AAAAGTACGTCA------TTAACGTT---AAAAAC-TAATTCAG---CT--GCAT-TTTTAAAAAAG-TAATTCT-GTA-------------AAATATATCAAC--T------------TTGG-ACC-ATAC
gi|5                          :                                                                                                                                                           ttttaaataatttcactatttgtcttaacgcaaaataatttATT-A-A---------AGA-----GTTA------ATAACTTT---AAGCAT-TAATT--A---AT--CTTC-TTT----AAAG-TAATTTT-GTACA------A----AAA-----TAAT--AGATGAAC----ATCGG-ACC-ATACAGC
gi|24                         :                                                                                                       ctaacagacttaatgtgcggcaaacgtattggataggcttaattttgaaattattttcttgatggttttttttttctttttttctttttacatttaaacgTGG------AAA-----A-----------AACTT--------AC-TAATT--A---AT--CTGC-TTT----AAAG-TAATTTT-T----------ACAAGAAATAAA-------TGATGAAC----ATCAG-ACC-ATACAGCtttaa
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                         gtattaaactacat-----GTCA------ATAACTTCA--TAACAA-TAATC--A---AT--TTCC-TTT----AAAA-TAAGTTT-GTATA------A-AACAAAATA--TAAT--GGCTGAAC----ATTAG-ACC-ATACAt
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                            TTT-TTAC-----------CAAAAA---TAAT--TGATGAAC----ATTGG-ACC-ATACAGCtaaaca
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      taaAAT--TAATGAAC----ATCGG-ACT-ATACAGCt
8 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|25 ): CTTTCAAATGTATTTGTTTTTAGGGAAATTTGATAACTTTTTAAATTCAGCTGCATTAAAATAATTCTTTATACTTTGGAGAAA
Unaligned ( gi|26 ): GCATGGGGCTATTTATAGATACCTACCACTATAACTAGTGGCAAATATACTTATGGTGATATCCCAATGTTTACTTTTTTAA
Unaligned ( gi|27 ): TTTTATATATAAAATTGGATTTTCCCTTGAGCGCGCGGGGATATTTAATTTATTGTGGTCCCCCACTGTTTACTTTT
Unaligned ( gi|29 ): TTAATGCAAGTCACAGAAAATCTAATGCTATGTGGATTCAAGTGTTTTTTTTTTTATAG
Unaligned ( gi|30 ): TGAGTAGATCGAATTCCCTCAACACTACTCGGCTTTTGTACATATCTAACAATT
Unaligned ( gi|31 ): GATTCCATTATGTGCCTGGGGCATAATTCAAACAACCTATAAACTTTAATGATG
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Reference ( family-1607 )     :                                                                                              GTCCC-CCAA--TATT---TACTTTT-T-A-A-------T---AATCTTCTCGC-TG--TTTNC--T--T-T-AC-ATGC-A------AA----------TGT--TTT----CAAGCAT--------GTAATT-A-----AGGG------AAA----GTTA--ATA------ACT-TT---TAAC----AC-TAATT--ACTNTGC-TTT----A--AAGTAATTTT-TTAC----AC-------AA-AA---AA-A-TAAT--NGATGAAC----ATCGG-ACC-ATACAGC
gi|1                          :                                                                                               TCCC-CTGAATTATTAATTACTATC-A-A-A-----------AATCTTTTCTCATG--TTT-C--T--T-A-AC-ATGC-A------AA----------TGT--TTT----CAAGCAT--------A------A-----AGGG------AAA----GTGA--AGA------ACT-GT---CAACTCTAAT-TAATT--AATCTGC--TT----A--AAG-AATTTT-GTAC--------------A-GA---AA-A-TAAT--AGAAAAAC----ATTGG-ACC-ATA
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gi|4                          :                                                                                                CCC-CCAA--TGTT---TACTTTT-T-A-AATACCTGT---AATCTTCT---------------T--T-T-AT-ATGC-A------AC----------TGT--TTT----CAAACAT--------GTAATT-A-----AGAG------ACA----ATTG--ATA------ACC-TT---TAGC----AC-TGATT--ACTCGGT-TAT----A--AAGTAA-TTT-TTAC----AC-----------A---AA-A-TAAT--GTATGAAC----ATCGG-ACC-ATACtttaaaaatga
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gi|6                          : ctaacagacttaatgtgcggcaaacgtattggataggcttaattttgaaattattttcttgatggttttttttttctttttttctttttacatttaaacgCAA--TATT---TACATTT-C-A-AA------T---AATTTTGTCAC-TG--TTTTC--T--T-GGAC-CTGT-A------AA----------TGC--TTT----CAAGCAT--------GTATTT-A-----AT---------------ATTAGGATA------ACT-TT-----------AC-TAATT----TA-GC-TGT----ATTAAGTAATTCT-GTAC----ATTTTGGAGAA-AAGGGAA-A-TAAT--AGTTGAACATTGATCAG-ACC-ATACAtttaa
gi|7                          :                                                                                tgtatacatggatttgcaC-CCAA--T-TT---TACTTCTAG-A-A-------T---A-TCTTCTCGC-TG--TTACC--TA-T-T-ACTATGCAA------AA----------TGT--TTT----AAA--AT--------GT-ATT-ATG---GGGG------AAA------TA--ATA------ACTATA---CAAT----AG-TAACC--AATGTGC-TT-------------------------------------------------TAAT--TGATAAAC----ATCGG-ACC-ATACAGC
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6 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-1607 )     :                                                                                              GTCCC-CCAA--TATT---TACTTTT-T-A-A-------T---AATCTTCTCGC-TG--TTTNC--T--T-T-AC-ATGC-A------AA----------TGT--TTT----CAAGCAT--------GTAATTA-----A-GGG------AAA----GTTA------ATAACT-TT---T-----A--AC----AC-TAATTAATCTG--C-TTT-----AAAGTAATT-------TT-TTAC-----C---------AAA---AAA--TAATNGATG-AAC----ATCGG-ACC-ATACAGC
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gi|10                         :                 atcaggatggatttccccatcatacatgtgagcatttatagacacctaattaagacttaaaacgagtcggcaacatatttataggtt--TATT---TACTTTT-T-A-A------------ATGTTCTTAT-TG--TTTTC--T--T-TTAC-GTTT-A------AT----------TAT--TTT----CAAGCAT--------GCGCTTA-----A-GGG------AAA----TTTAATATTGATAACT-TTAAAG-----A--AA----AC-TAATTCAGCTG--C-TTT-----AGAACA----------TT-TTGG-----G---------GGA---AAA-------GAT----C----ATCAG-ACC-ATACAtctac
gi|11                         :                                                                                           ttcatagattccgtttATT---TATTTTT-T-A-AA------T---CATCTTTTCAA-CG--TTTTC--T--TCT-AC-ATGA-A------AA----------TGT--TTT----CAAACATTCAAACATATAAT-A-----A-GAG------AAA----GTAA------ACAATT-TT---T-----A--AT----AC-TAATTCATCTA--C-TTC-----AAAG-AAAT-------CT-TTAA-----C---------AAG---AAA--TAATGTTTA-AAC----ATCCG-GCC-ATCCAACcc
gi|12                         :                                                                                               TTCC-CTAA--TATTA--TACATTT-T-A-A-------TTTTAATCTTCTCAT-TG--TTTTCA-T--T-T-AC-ATGC-A------AA----------TGT--GTT----CAAGCAT--------GTAATTA-----A-TGG-------AA----GTTA------AT--------------------C----A-------GATCTGAAC-TTT-----ACAATAAGT-------TT-ATA------C---------AAA---AAA--CAATAGATG-GAC----ATCAG-ACCAATACAt
gi|13                         :                                                                                        aatagtGTTCC-CCAA--T--T---TA---TT-A-A-A-------T---AATCTTTCCCC-TGATTTTCT--T--T-T-ACGATGC-A------AA----------TAT--T------CATGCA---------GTAAT-------A-AGG------AAA----GTCA------TTAACT-TT---T-----ATTAC----AA-T-ATTA---TG--C-TTT-----AAAG-AA-T-------TT-TTAC----------------AA---AAA--TAATT-AT--CAC----ATCGGAATC-ATATAGCa
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gi|21                         :                                                                                           gttgtgCC-ACGA--TATT---TACTTTTAT-A-A-------T---AATCTTATCAA-AA--TTTTCA-T--T-T-AC-ATGC-A------AA----------TGT--TT------------------------TTA-----A-GGT------AAA----GTTA------ATAACT-TT---TAAAAAA--AA----AT-TAATTCATCTG--A-TTT-----GActga
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gi|28                         :                                                                                                                         c-A-A-------T---AATCTTTTCGC-T----TTAC--TGAT-T-AC-ATGC-A------A-----------TGT--TTT----CA-GCAT--------GTAATTA-----A--GG------AAA----GATAG-----ATAA--------T-----A--AC----AC-CAATtactttggagaaa
gi|3                          :                                                                                               TCCCGCTAA--TATT---TACTTTT-TTA-A-------TTT-AATCTTCTCAT-TG--TTTTCA-T--T-T-AC-ATGC-A------AA----------TGTGTTTT----CAAGCAT--------GTAATTA-----A-TGG------AAA----GT--------------------------------------TAATCAATCTG--C-TTT-----ACAATAATT-------TT-ATA------C---------AAA---AAA--CAATAGATG-GAC----ATCAG-ACC-ATACA
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gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ---------AAA---AAA---GGTAGATG-AAC----AT-GG-ACC-ATACAGCt
gi|4                          :                                                                                                CCC-CCAA--TGTT---TACTTTT-T-A-AATACCTGT---AATCTTCT---------------T--T-T-AT-ATGC-A------AC----------TGT--TTT----CAAACAT--------GTAATTA-----A-GAG------ACA----ATTG------ATAACC-TT---T-----A--GC----AC-TGATTACTCGG--T-TAT-----AAAGTAA-T-------TT-TTA------C---------ACA---AAA--TAATGTATG-AAC----ATCGG-ACC-ATACtttaaaaatga
gi|5                          :                                                                                                                                                                     agtcggatttccctaacgtgcacggggctatttatagacatgaatgtatttattgtgacATTA-----A-AG---------A----GTTA------ATAACT-TT---A-----A--GC----AT-TAATTAATCTT--C-TTT-----AAAGTAATT-------TT-GTAC----------------AA---AAA--TAATAGATG-AAC----ATCGG-ACC-ATACAGC
gi|6                          : ctaacagacttaatgtgcggcaaacgtattggataggcttaattttgaaattattttcttgatggttttttttttctttttttctttttacatttaaacgCAA--TATT---TACATTT-C-A-AA------T---AATTTTGTCAC-TG--TTTTC--T--T-GGAC-CTGT-A------AA----------TGC--TTT----CAAGCAT--------GTATTTA-----A-TA---------------TTAGG----ATAACT-TT------------------AC-TAATTTAGCTG--T-ATT-----AA-GTAATT-------CT-GTAC-----ATTTTGGAGAAAAGGGAAA--TAATAGTTG-AACATTGATCAG-ACC-ATACAtttaa
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6 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Unaligned ( gi|27 ): TTTTATATATAAAATTGGATTTTCCCTTGAGCGCGCGGGGATATTTAATTTATTGTGGTCCCCCACTGTTTACTTTT
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Reference ( family-1607 )     :                                                                                              GTCCC-CCAA--TATT---TACTTTT-T-A-A-------T---AATCTTCTCGC-TG--TTTNC--T--T-T-AC-ATGC-A------AA----------TGT--TTT----CAAGCAT--------GTAATTA-----A-GGG------AAA----GTTA------ATAACT-TT---T-----A--AC----AC-TAATTAATCTG--C-TTT-----AAAGTAATTTT-TT-----ACA--------A----A-----AAA----TAATNGATG-AAC----ATCGG-ACC-ATACAGC
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gi|10                         :                 atcaggatggatttccccatcatacatgtgagcatttatagacacctaattaagacttaaaacgagtcggcaacatatttataggtt--TATT---TACTTTT-T-A-A------------ATGTTCTTAT-TG--TTTTC--T--T-TTAC-GTTT-A------AT----------TAT--TTT----CAAGCAT--------GCGCTTA-----A-GGG------AAA----TTTAATATTGATAACT-TTAAAG-----A--AA----AC-TAATTCAGCTG--C-TTT-----AGAACA--TTT-TG-----GGG--------G----A-----AAA---------GAT----C----ATCAG-ACC-ATACAtctac
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gi|28                         :                                                                                                                         c-A-A-------T---AATCTTTTCGC-T----TTAC--TGAT-T-AC-ATGC-A------A-----------TGT--TTT----CA-GCAT--------GTAATTA-----A--GG------AAA----GATAG-----ATAA--------T-----A--AC----AC-CAATctttggagaaa
gi|3                          :                                                                                               TCCCGCTAA--TATT---TACTTTT-TTA-A-------TTT-AATCTTCTCAT-TG--TTTTCA-T--T-T-AC-ATGC-A------AA----------TGTGTTTT----CAAGCAT--------GTAATTA-----A-TGG------AAA----GT--------------------------------------TAATCAATCTG--C-TTT-----ACAATAATTTT-AT-----ACA--------A----A-----AAA----CAATAGATG-GAC----ATCAG-ACC-ATACA
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gi|4                          :                                                                                                CCC-CCAA--TGTT---TACTTTT-T-A-AATACCTGT---AATCTTCT---------------T--T-T-AT-ATGC-A------AC----------TGT--TTT----CAAACAT--------GTAATTA-----A-GAG------ACA----ATTG------ATAACC-TT---T-----A--GC----AC-TGATTACTCGG--T-TAT-----AAAGTAA-TTT-TT-----ACA--------C----A-----AAA----TAATGTATG-AAC----ATCGG-ACC-ATACtttaaaaatga
gi|5                          :                                                                                                                                                                     agtcggatttccctaacgtgcacggggctatttatagacatgaatgtatttattgtgacATTA-----A-AG---------A----GTTA------ATAACT-TT---A-----A--GC----AT-TAATTAATCTT--C-TTT-----AAAGTAATTTT-GT-----AC---------A----A-----AAA----TAATAGATG-AAC----ATCGG-ACC-ATACAGC
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6 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-1607 )     :                                                                                              GTCCC-CCAA--TATT---TACTTTT-T-A-A-------T---AATCTTCTCGC-TG--TTTNC--T--T-T-AC-ATGC-A------AA----------TGT--TTT----CAAGCAT--------GTAATTA-----A-GGG------AAA----GTTA------ATAACT-TT---T-----A--AC----AC-TAATTAATCTG--C-TTT-----AAAGTAATTTT-TT-----ACA--------A----A-----AAA----TAATNGATG-AAC----ATCGG-ACC-ATACAGC
gi|1                          :                                                                                               TCCC-CTGAATTATTAATTACTATC-A-A-A-----------AATCTTTTCTCATG--TTT-C--T--T-A-AC-ATGC-A------AA----------TGT--TTT----CAAGCAT--------A-----A-----A-GGG------AAA----GTGA------AGAACT-GT---C-----A--ACTCTAAT-TAATTAATCTG--C-TT------AAAG-AATTTT-GT-----ACA--------G----A-----AAA----TAATAGAAA-AAC----ATTGG-ACC-ATA
gi|10                         :                 atcaggatggatttccccatcatacatgtgagcatttatagacacctaattaagacttaaaacgagtcggcaacatatttataggtt--TATT---TACTTTT-T-A-A------------ATGTTCTTAT-TG--TTTTC--T--T-TTAC-GTTT-A------AT----------TAT--TTT----CAAGCAT--------GCGCTTA-----A-GGG------AAA----TTTAATATTGATAACT-TTAAAG-----A--AA----AC-TAATTCAGCTG--C-TTT-----AGAACA--TTT-TG-----GGG--------G----A-----AAA---------GAT----C----ATCAG-ACC-ATACAtctac
gi|11                         :                                                                                           ttcatagattccgtttATT---TATTTTT-T-A-AA------T---CATCTTTTCAA-CG--TTTTC--T--TCT-AC-ATGA-A------AA----------TGT--TTT----CAAACATTCAAACATATAAT-A-----A-GAG------AAA----GTAA------ACAATT-TT---T-----A--AT----AC-TAATTCATCTA--C-TTC-----AAAGAAATCTT-TA-----ACA--------A----G-----AAA----TAATGTTTA-AAC----ATCCG-GCC-ATCCAACcc
gi|12                         :                                                                                               TTCC-CTAA--TATTA--TACATTT-T-A-A-------TTTTAATCTTCTCAT-TG--TTTTCA-T--T-T-AC-ATGC-A------AA----------TGT--GTT----CAAGCAT--------GTAATTA-----A-TGG-------AA----GTTA------AT--------------------C----A-------GATCTGAAC-TTT-----ACAATAAGTTT-AT-----ACA--------A----A-----AAA----CAATAGATG-GAC----ATCAG-ACCAATACAt
gi|13                         :                                                                                        aatagtGTTCC-CCAA--T--T---TA---TT-A-A-A-------T---AATCTTTCCCC-TGATTTTCT--T--T-T-ACGATGC-A------AA----------TAT--T------CATGCA---------GTAAT-------A-AGG------AAA----GTCA------TTAACT-TT---T-----ATTAC----AA-T-ATTA---TG--C-TTT-----AAAG-AA-TTT-TT-----AC---------A----A-----AAA----TAATT-AT--CAC----ATCGGAATC-ATATAGCa
gi|14                         :                                                                                                             ttattgtTTTT-A-A-A-------T---AATTT---CAC-TA--TTTGT--C--T-T-A--ACGC-A------AAATAATTTAAATAT--TTT----CAAGCAT--------GTAGTTA-----A-GGA------AAAGTACGTCA------TTAACG-TT---A-----A--AA----AC-TAATTCAGCTG--CATTTTTAAAAAAGTAATTCT-GT---------------------A-----AAA----T-AT--ATC-AAC----TTTGG-ACC-ATAC
gi|15                         :                                                                                                                                                      G--TTTTC--T--T-TTAT-TTCC-A------GT----------TGT--TTT----CACACAT--------ATCATTA-----A-AGG------AAA----GTTA------ATAACT-TT---T-----A--AC----AC-TATTAAAGCTG--C-ATT-----AAAGTAATTAT-AT-----ATA--------C----T-----TTA----TTAT-GATG-AAC----ATTGG-ATC-ATACAGC
gi|16                         :                                                                                           gcagatcttcccaactttttgtacaTTTT-T-A-AG------C---AATCTTCTCAC-CG--TTTTTCTT--T-T-AC-ACAC-A------AA----------TGT--TTT----CAAGCAT--------GTAATTA-----A-GGA------AAA----GTTC------ATAACT-TT---A-----A--AC----ACTTAACTGATCTG--T-TTT-----AAAACAATTTTGTT-----AAA--------A----A-----AAA----AAA--GATG-AAC----A-AGG-ACT-ATACAG
gi|17                         :                                                                                              GTCCC-CCAA--TGTT---TACTTCTAG-A-A-------T---GATCTTCTCGC-TG--TTACC--TA-T-T-AC-ATGC-A------AA----------TGT--TTT-----AAACAG--------GTAGTTATG---T-GGG------AAA------TA------ATAACG-AT---C-----A--AT----AG-TAACCAATGTG--C-TTT-----AA----------TT-----A----------------------------------ATG-AAC----ATCGG-ACT-ATACAGCat
gi|18                         :                                                                                          ttgcgTCTC-CTAA--TGT-----A-TTTT-T-A-AAA-----T---AATCTTTCCGC-TG--TTTAC--TGTTGT-AC-ATGC-A------AA----------TGT--TTT----CAAGCAT--------ATAATTA-----A--GG------AAA----GTTA------ATAACT-TT---T-----A--AC----AC-TAAT
gi|19                         :                                                                                                                   gagagcggcgaatgcatttaatgtgcTTTTCGC-CG--TTTAC--TG-T-T-AC-ATGT-ATATGAAAA----------CGT--TTT-----AAGCAT--------GTAGTTA-----AAGGG------AAA----GTTA------TAAACT-TT---T-----A--AC----------------------CTC-----AAAGTAATATT-T------ACA--------A----A-----AAAA---TAATAGATG-AAC----ATCGG-ACC-ATACAGC
gi|2                          :                                                                                                                        -T-A-A-------T---GATCTTTTAAT-T---TTTGT--T--T-T-AC-ATGA-A------AA----------CAT--TT-----AAAGCTT--------GTAATTA-----T-TGG------AAA----ATTG------ATAACT-TA---A-----A--AC----AC-TAGT----CTG--C-TTT-----AAAGTAATTTT-T------ATA--------A----G-----AAA----TAATAGACG-ATC----ATCTG-ATC-ATGCAGCtt
gi|20                         :                                                                          atctaatagatacccactaaGTCCC-CCAA--CAAT---TACTCTT-T-ACA-------T---AATTTTTTCGC-TG--TTTAC--T--GAT-AC-ATCC-A------AA----------TGT--TTT----CAAGCAT--------GTAATTA-----A-GGGAATTTCAAA----GTTG------ATAA-T-TT---T-----A--AC----AC-CAATTAtttaatttgaatcaacgatatatctatattgaaatatatctaattactatgtcatgatatatattttcttcctttcag
gi|21                         :                                                                                           gttgtgCC-ACGA--TATT---TACTTTTAT-A-A-------T---AATCTTATCAA-AA--TTTTCA-T--T-T-AC-ATGC-A------AA----------TGT--TTT------------------------TA-----A-GGT------AAA----GTTA------ATAACT-TT---TAAAAAA--AA----AT-TAATTCATCTG--A-TTT-----GActga
gi|22                         :                                                                                                                                                  tttttgggttaC--T--T-T-AC-CTGT-G------AA----------TAT--TTT----CAAGCAT--------GCAATTA-----A-GGG------AAC----GCTA------ATAATC-TT---C-----A--AA----AC-TAATTTAGCTG--CATGT-----AAGG-AATTTT-------------------------------AG----TACTCTTTGAAAA----ATCGG-ACC-ACACAGC
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                       ----GTCA------ATAACT-TCA--T-----A--AC----AA-TAATCAATTTC--C-TTT-----AAAATAAGTTT-GTATAAAACA--------A----A-----ATA----TAATGGCTG-AAC----ATTAG-ACC-ATACA
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                              A------AAAACT-T-------------------AC-TAATTAATCTG--C-TTT-----AAAGTAATTTT-T------ACA--------A----G-----AAA----TAAATGATG-AAC----ATCAG-ACC-ATACAGCtaaaca
gi|25                         :                                                                                                                                                                                   gtattaaactacattgga--TTT----CAA--AT--------GTATTTGTTTTTA-GGG------AAA----TTTG------ATAACT-TT---T-----T--A---------AATTCAGCTG--C-ATT-----AAAATAATTCT-TT-----ATA--------t
gi|28                         :                                                                                                                         c-A-A-------T---AATCTTTTCGC-T----TTAC--TGAT-T-AC-ATGC-A------A-----------TGT--TTT----CA-GCAT--------GTAATTA-----A--GG------AAA----GATAG-----ATAA--------T-----A--AC----AC-CAATctttggagaaa
gi|3                          :                                                                                               TCCCGCTAA--TATT---TACTTTT-TTA-A-------TTT-AATCTTCTCAT-TG--TTTTCA-T--T-T-AC-ATGC-A------AA----------TGTGTTTT----CAAGCAT--------GTAATTA-----A-TGG------AAA----GT--------------------------------------TAATCAATCTG--C-TTT-----ACAATAATTTT-AT-----ACA--------A----A-----AAA----CAATAGATG-GAC----ATCAG-ACC-ATACA
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                     tggcattcccctcctgtacatggggctattttaagcacttaaagaaagtcaaatgcatttaaatttaataggtTAATTTT-T------ACC--------A----A-----AAA----TAATTGATG-AAC----ATTGG-ACC-ATACAGCa
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               A--------A----A-----AAA-----GGTAGATG-AAC----AT-GG-ACC-ATACAGCt
gi|4                          :                                                                                                CCC-CCAA--TGTT---TACTTTT-T-A-AATACCTGT---AATCTTCT---------------T--T-T-AT-ATGC-A------AC----------TGT--TTT----CAAACAT--------GTAATTA-----A-GAG------ACA----ATTG------ATAACC-TT---T-----A--GC----AC-TGATTACTCGG--T-TAT-----AAAGTAA-TTT-TT-----ACA--------C----A-----AAA----TAATGTATG-AAC----ATCGG-ACC-ATACtttaaaaatga
gi|5                          :                                                                                                                                                                     agtcggatttccctaacgtgcacggggctatttatagacatgaatgtatttattgtgacATTA-----A-AG---------A----GTTA------ATAACT-TT---A-----A--GC----AT-TAATTAATCTT--C-TTT-----AAAGTAATTTT-GT-----AC---------A----A-----AAA----TAATAGATG-AAC----ATCGG-ACC-ATACAGC
gi|6                          : ctaacagacttaatgtgcggcaaacgtattggataggcttaattttgaaattattttcttgatggttttttttttctttttttctttttacatttaaacgCAA--TATT---TACATTT-C-A-AA------T---AATTTTGTCAC-TG--TTTTC--T--T-GGAC-CTGT-A------AA----------TGC--TTT----CAAGCAT--------GTATTTA-----A-T---------------ATTAGG----ATAACT-TT------------------AC-TAATTTAGCTG--T-ATT------AAGTAATTCT-GT-----ACATTTTGGAGA----AAAGGGAAA----TAATAGTTG-AACATTGATCAG-ACC-ATACAtttaa
gi|7                          :                                                                                tgtatacatggatttgcaC-CCAA--T-TT---TACTTCTAG-A-A-------T---A-TCTTCTCGC-TG--TTACC--TA-T-T-ACTATGCAA------AA----------TGT--TTT----AAA--AT--------GT-ATTATG---G-GGG------AAA------TA------ATAACTATA---C-----A--AT----AG-TAACCAATGTG--C-TT------------------------------------------------------TAATTGATA-AAC----ATCGG-ACC-ATACAGC
gi|8                          :                                                       ttcataaaccctaacgagcggcaaattatttttgcggttGTCCT-CCAA--CATT---TACGTTT-T-A-A-------T---AACCAAGTCGC-TG--TTTAT--TG-T-T-AC-ATGC-A------AA----------TGT--TTT----CAAGCAT--------GTAATTA-----A-TGG------AAA----GTTA------ATAACT-TT---T-----A--AC----AC-TAATTACTATA--T-TTT-----AAAGTACCTTT-TT-----ACA--------ACAACA-----AAAAAACCAATTGATG-AAC----ATCGG-ACC-ATACAGC
gi|9                          :                                                                                                                      TT-T-A-A------------ATCTTCTCAT-TG--TTTCC--T--T-TTGC-ATGC-A------GA----------TTT--TTTTTTTCAAGCAT--------GTAATTA-----A-GGG------AGA----GTTA------ATAAC--TT---G-----A--AC----------TT--TCTG--C-TTT-----AAAGTACTT


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blockSeqs                     :                                                                                                   .    .  A  .         AT  . TTTT             T  A .  .    T A  GA G T  T    . .       .            .    .          .              TG    G   .        .       GG          .  AAAG      .  T     C      C     .  A   .        A  G   GTATAAAACAAA                     A       A    .   .        .   .
blockSeqs                     :                                                                                                   .    .  A  .         TT  . AAT              C  A .  .    T A  A  A G  .    . .       .            .    .          .              TG    G   .        .       G           .  AT        .  C     C      G     .  .   .        T  T   TTACAACAACA                      .       T    .   .        .   .
blockSeqs                     :                                                                                                   .    .  G  .         AG  . TTT              T  C .  .    C A  G  . T  .    . .       .            .    .          .              .     T   .        .       .           .  T         .  C     A      A     .  .   .        T  T   GTTAAAAA                         .       A    .   .        .   .
blockSeqs                     :                                                                                                   .    .  G  .         T   . AT               C  A .  .    G .  A  . .  .    . .       .            .    .          .              .     A   .        .       .           .  T         .  A     C      C     .  .   .        T  T   TGGGGGA                          .       A    .   .        .   .
blockSeqs                     :                                                                                                   .    .  A  .         T   . GC               C  A .  .    T .  G  . .  .    . .       .            .    .          .              .     G   .        .       .           .  A         .  C     C      A     .  .   .        C  T   TAACAAG                          .       C    .   .        .   .
blockSeqs                     :                                                                                                   .    .  A  .         T   . AT               T  G .  .    T .  .  . .  .    . .       .            .    .          .              .     A   .        .       .           .  T         .  C     G      G     .  .   .        T  T   ATACAAA                          .       G    .   .        .   .
blockSeqs                     :                                                                                                   .    .  A  .         A   . T                T  G .  .    C .  .  . .  .    . .       .            .    .          .              .     G   .        .       .           .  A         .  T     C      A     .  .   .        T  T   ATATACT                          .       T    .   .        .   .
blockSeqs                     :                                                                                                   .    .  G  .         A   . T                T  G .  .    A .  .  . .  .    . .       .            .    .          .              .     G   .        .       .           .  C         .  C     C      A     .  .   .        T  G   ATACAAA                          .       A    .   .        .   .
blockSeqs                     :                                                                                                   .    .  A  .         T   . T                T  A .  .    A .  .  . .  .    . .       .            .    .          .              .     T   .        .       .           .  T         .  C     C      C     .  .   .        T  T   TTACACA                          .       T    .   .        .   .
blockSeqs                     :                                                                                                        .  A  .         T   . T                A  G .  .    G .  .  . .  .    . .       .            .    .          .              .     G   .        .       .           .  T         .  C     T      T     .  .   .        T  T   TTACAA                           .       A    .   .        .   .
blockSeqs                     :                                                                                                        .  .  .         T   . T                T  A .  .    A .  .  . .  .    . .       .            .    .          .              .     G   .        .       .           .  A         .  C     C      A     .  .   .        T  T   TACAAA                           .       G    .   .        .   .
blockSeqs                     :                                                                                                           .  .         T   . T                C  G .  .    T .  .  . .  .    . .       .            .    .          .              .     G   .        .       .           .  T         .  A     A      A     .  .   .        T  T   TATAAG                           .       A    .   .        .   .
blockSeqs                     :                                                                                                                        T   . T                C  A .  .    A .  .  . .  .    . .       .            .    .          .              .     G   .        .       .           .  C         .  A     C      C     .  .   .        T  T   TACAAG                           .       A    .   .        .   .
blockSeqs                     :                                                                                                                        C   . T                G  A .  .    T .  .  . .  .    . .       .            .    .          .              .     T   .        .       .           .  T         .  C     C      A     .  .   .        T  T   TACCAA                           .       T    .   .        .   .
blockSeqs                     :                                                                                                                        T   . T                C  G .  .    T .  .  . .  .    . .       .            .    .          .              .     G   .        .       .           .  T         .  C     C      A     .  .   .        T  C   GTACAA                           .       T    .   .        .   .
blockSeqs                     :                                                                                                                        T   . .                G  G .  .    C .  .  . .  .    . .       .            .    .          .              .     A   .        .       .           .  T         .  C     T      A     .  .   .        T  T   GTA                              .       .    .   .        .   .
blockSeqs                     :                                                                                                                            . .                C  A .  .    A .  .  . .  .    . .       .            .    .          .              .     T   .        .       .           .  A         .  C     C      T     .  .   .        T  .   TTA                              .       .    .   .        .   .
blockSeqs                     :                                                                                                                                               .  . .  .    C .  .  . .  .    . .       .            .    .          .              .     G   .        .       .           .  C         .  T     G      A     .  .   .        .  .   .                                .       .    .   .        .   .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                       .    . .  .  . .  .    . .       .            .    .          .              .     T   .        .       .           .  T         .  C     C      A     .  .   .        .  .   .                                .       .    .   .        .   .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                              .  .  . .  .    . .       .            .    .          .              .     G   .        .       .           .  G         .  C     .      .     .  .   .        .  .                                    .       .    .   .        .   .
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6 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-1607 )     :                                                                                              GTCCC-CCAA--TATT---TACTTTT-T-A-A-------T---AATCTTCTCGC-TG--TTTNC--T--T-T-AC-ATGC-A------AA----------TGT--TTT----CAAGCAT--------GTAATTA-----A-GGG------AAA----GTTA------ATAACT-TT---T-----A--AC----AC-TAATTAATCTG--C-TTT-----AAAGTAATTTT-TT-----ACA--------A----A-----AAA----TAATNGATG-AAC----ATCGG-ACC-ATACAGC
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gi|10                         :                 atcaggatggatttccccatcatacatgtgagcatttatagacacctaattaagacttaaaacgagtcggcaacatatttataggtt--TATT---TACTTTT-T-A-A------------ATGTTCTTAT-TG--TTTTC--T--T-TTAC-GTTT-A------AT----------TAT--TTT----CAAGCAT--------GCGCTTA-----A-GGG------AAA----TTTAATATTGATAACT-TTAAAG-----A--AA----AC-TAATTCAGCTG--C-TTT-----AGAACA--TTT-TG-----GGG--------G----A-----AAA---------GAT----C----ATCAG-ACC-ATACAtctac
gi|11                         :                                                                                           ttcatagattccgtttATT---TATTTTT-T-A-AA------T---CATCTTTTCAA-CG--TTTTC--T--TCT-AC-ATGA-A------AA----------TGT--TTT----CAAACATTCAAACATATAAT-A-----A-GAG------AAA----GTAA------ACAATT-TT---T-----A--AT----AC-TAATTCATCTA--C-TTC-----AAAGAAATCTT-TA-----ACA--------A----G-----AAA----TAATGTTTA-AAC----ATCCG-GCC-ATCCAACcc
gi|12                         :                                                                                               TTCC-CTAA--TATTA--TACATTT-T-A-A-------TTTTAATCTTCTCAT-TG--TTTTCA-T--T-T-AC-ATGC-A------AA----------TGT--GTT----CAAGCAT--------GTAATTA-----A-TGG-------AA----GTTA------AT--------------------C----A-------GATCTGAAC-TTT-----ACAATAAGTTT-AT-----ACA--------A----A-----AAA----CAATAGATG-GAC----ATCAG-ACCAATACAt
gi|13                         :                                                                                        aatagtGTTCC-CCAA--T--T---TA---TT-A-A-A-------T---AATCTTTCCCC-TGATTTTCT--T--T-T-ACGATGC-A------AA----------TAT--T------CATGCA---------GTAAT-------A-AGG------AAA----GTCA------TTAACT-TT---T-----ATTAC----AA-T-ATTA---TG--C-TTT-----AAAG-AA-TTT-TT-----AC---------A----A-----AAA----TAATT-AT--CAC----ATCGGAATC-ATATAGCa
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gi|20                         :                                                                          atctaatagatacccactaaGTCCC-CCAA--CAAT---TACTCTT-T-ACA-------T---AATTTTTTCGC-TG--TTTAC--T--GAT-AC-ATCC-A------AA----------TGT--TTT----CAAGCAT--------GTAATTA-----A-GGGAATTTCAAA----GTTG------ATAA-T-TT---T-----A--AC----AC-CAATTAtttaatttgaatcaacgatatatctatattgaaatatatctaattactatgtcatgatatatattttcttcctttcag
gi|21                         :                                                                                           gttgtgCC-ACGA--TATT---TACTTTTAT-A-A-------T---AATCTTATCAA-AA--TTTTCA-T--T-T-AC-ATGC-A------AA----------TGT--TTT------------------------TA-----A-GGT------AAA----GTTA------ATAACT-TT---TAAAAAA--AA----AT-TAATTCATCTG--A-TTT-----GActga
gi|22                         :                                                                                                                                                  tttttgggttaC--T--T-T-AC-CTGT-G------AA----------TAT--TTT----CAAGCAT--------GCAATTA-----A-GGG------AAC----GCTA------ATAATC-TT---C-----A--AA----AC-TAATTTAGCTG--CATGT-----AAGG-AATTTT-------------------------------AG----TACTCTTTGAAAA----ATCGG-ACC-ACACAGC
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                       ----GTCA------ATAACT-TCA--T-----A--AC----AA-TAATCAATTTC--C-TTT-----AAAATAAGTTT-GTATAAAACA--------A----A-----ATA----TAATGGCTG-AAC----ATTAG-ACC-ATACA
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                              A------AAAACT-T-------------------AC-TAATTAATCTG--C-TTT-----AAAGTAATTTT-T------ACA--------A----G-----AAA----TAAATGATG-AAC----ATCAG-ACC-ATACAGCtaaaca
gi|25                         :                                                                                                                                                                                   gtattaaactacattgga--TTT----CAA--AT--------GTATTTGTTTTTA-GGG------AAA----TTTG------ATAACT-TT---T-----T--A---------AATTCAGCTG--C-ATT-----AAAATAATTCT-TT-----ATA--------t
gi|28                         :                                                                                                                         c-A-A-------T---AATCTTTTCGC-T----TTAC--TGAT-T-AC-ATGC-A------A-----------TGT--TTT----CA-GCAT--------GTAATTA-----A--GG------AAA----GATAG-----ATAA--------T-----A--AC----AC-CAATctttggagaaa
gi|3                          :                                                                                               TCCCGCTAA--TATT---TACTTTT-TTA-A-------TTT-AATCTTCTCAT-TG--TTTTCA-T--T-T-AC-ATGC-A------AA----------TGTGTTTT----CAAGCAT--------GTAATTA-----A-TGG------AAA----GT--------------------------------------TAATCAATCTG--C-TTT-----ACAATAATTTT-AT-----ACA--------A----A-----AAA----CAATAGATG-GAC----ATCAG-ACC-ATACA
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                     tggcattcccctcctgtacatggggctattttaagcacttaaagaaagtcaaatgcatttaaatttaataggtTAATTTT-T------ACC--------A----A-----AAA----TAATTGATG-AAC----ATTGG-ACC-ATACAGCa
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               A--------A----A-----AAA-----GGTAGATG-AAC----AT-GG-ACC-ATACAGCt
gi|4                          :                                                                                                CCC-CCAA--TGTT---TACTTTT-T-A-AATACCTGT---AATCTTCT---------------T--T-T-AT-ATGC-A------AC----------TGT--TTT----CAAACAT--------GTAATTA-----A-GAG------ACA----ATTG------ATAACC-TT---T-----A--GC----AC-TGATTACTCGG--T-TAT-----AAAGTAA-TTT-TT-----ACA--------C----A-----AAA----TAATGTATG-AAC----ATCGG-ACC-ATACtttaaaaatga
gi|5                          :                                                                                                                                                                     agtcggatttccctaacgtgcacggggctatttatagacatgaatgtatttattgtgacATTA-----A-AG---------A----GTTA------ATAACT-TT---A-----A--GC----AT-TAATTAATCTT--C-TTT-----AAAGTAATTTT-GT-----AC---------A----A-----AAA----TAATAGATG-AAC----ATCGG-ACC-ATACAGC
gi|6                          : ctaacagacttaatgtgcggcaaacgtattggataggcttaattttgaaattattttcttgatggttttttttttctttttttctttttacatttaaacgCAA--TATT---TACATTT-C-A-AA------T---AATTTTGTCAC-TG--TTTTC--T--T-GGAC-CTGT-A------AA----------TGC--TTT----CAAGCAT--------GTATTTA-----A-T---------------ATTAGG----ATAACT-TT------------------AC-TAATTTAGCTG--T-ATT------AAGTAATTCT-GT-----ACATTTTGGAGA----AAAGGGAAA----TAATAGTTG-AACATTGATCAG-ACC-ATACAtttaa
gi|7                          :                                                                                tgtatacatggatttgcaC-CCAA--T-TT---TACTTCTAG-A-A-------T---A-TCTTCTCGC-TG--TTACC--TA-T-T-ACTATGCAA------AA----------TGT--TTT----AAA--AT--------GT-ATTATG---G-GGG------AAA------TA------ATAACTATA---C-----A--AT----AG-TAACCAATGTG--C-TT------------------------------------------------------TAATTGATA-AAC----ATCGG-ACC-ATACAGC
gi|8                          :                                                       ttcataaaccctaacgagcggcaaattatttttgcggttGTCCT-CCAA--CATT---TACGTTT-T-A-A-------T---AACCAAGTCGC-TG--TTTAT--TG-T-T-AC-ATGC-A------AA----------TGT--TTT----CAAGCAT--------GTAATTA-----A-TGG------AAA----GTTA------ATAACT-TT---T-----A--AC----AC-TAATTACTATA--T-TTT-----AAAGTACCTTT-TT-----ACA--------ACAACA-----AAAAAACCAATTGATG-AAC----ATCGG-ACC-ATACAGC
gi|9                          :                                                                                                                      TT-T-A-A------------ATCTTCTCAT-TG--TTTCC--T--T-TTGC-ATGC-A------GA----------TTT--TTTTTTTCAAGCAT--------GTAATTA-----A-GGG------AGA----GTTA------ATAAC--TT---G-----A--AC----------TT--TCTG--C-TTT-----AAAGTACTT
6 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|26 ): GCATGGGGCTATTTATAGATACCTACCACTATAACTAGTGGCAAATATACTTATGGTGATATCCCAATGTTTACTTTTTTAA
Unaligned ( gi|27 ): TTTTATATATAAAATTGGATTTTCCCTTGAGCGCGCGGGGATATTTAATTTATTGTGGTCCCCCACTGTTTACTTTT
Unaligned ( gi|29 ): TTAATGCAAGTCACAGAAAATCTAATGCTATGTGGATTCAAGTGTTTTTTTTTTTATAG
Unaligned ( gi|30 ): TGAGTAGATCGAATTCCCTCAACACTACTCGGCTTTTGTACATATCTAACAATT
Unaligned ( gi|31 ): GATTCCATTATGTGCCTGGGGCATAATTCAAACAACCTATAAACTTTAATGATG
Unaligned ( gi|32 ): GGGCTATTTTTAGCATTAAGAGAAAGTCGAAAAATGCATTTAAA