lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 111111 333333333 22222222222222222222 111111 111 3333333 1 444444444444444444444 11 11111111 55555555555555555 1111 222222 1111111 3333333333333333333333333 11111111111111 111 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 11111 111 111 111111111 1 111 4444444444444444 11 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 111111111111 11 111 11111111 11111111111 111 11111 11111 3333333 11111111 8888888888888888888888888888888888888 2222222222222222222222 11 33333333 44 11111 1111 3333333333 1111111 2222 11 11111 333 11111 1 4444444444 111111 2222 111 444 2 11 1111 4444 22222 444444444444444
lowQualScore : 3 3 3 3 3 3 2 66 2 2 111111 2 555 2 999999999 2 2 2 2 11111111111111111111 5 222222 33 2 000 7777 2 33 5 4444444 8 4 888 2 8888 555 2 999999999999999999999 888888 55 5 77 3 11 555 999 11111111 44 4 5 33 33333333333333333 2 8888 999999 2 2222 2 2 2 111111 5 2 777 2222222 2 1111111111111111111111111 66666 66666666666666 222 5555 66666 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 33 2 44444 2 66 000 77 88 2 44 333 222222222 6666 6 888 999 3 44 1 3 3 3 555 555 5 555 3 2 99 3 222 0000000000000000 3 11 3 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 3 3 7 777777777777 777 55 3 3 22 000 7777 666 33333333 4 88888 4 55 55 99 4 5 4 33333333333 4 4 111 4 4 11111 66666 0000000 66 88888888 5 7777777777777777777777777777777777777 33 5 5555555555555555555555 5 3 666666 3 3 3 00 99999999 3 44 999999 3 3 3 44 6 5 44 3 3 11111 3 44 3 1111 6 55 55 4444444444 55 1111111 6 3 44 3 3 888 1 3333 3 77 3 6 44 4 00 2 3 3 3 3 555 2 2 33333 222 55 2 33 2 5 33 5 2 33 2 2 5 22222 2 3 2 33 2 9999999 3333333333 444 222222 2 0000 66 3 44 888 3 3 333 6 4 2 00 66 4 4 88888 666 1111 777 4 4 0000 4 66666 55 5 777 777777777777777 0 1 4
lowQualScore : . . . . . . . .. . . ...... . ... . ......... . . . . .................... . ...... .. . ... .... . .. . ....... . . ... . .... ... . ..................... ...... .. . .. . .. ... ... ........ .. . . .. ................. . .... ...... . .... . . . ...... . . ... ....... . ......................... ..... .............. ... .... ..... ........................................................................................................... .. . ..... . .. ... .. .. . .. ... ......... .... . ... ... . .. . . . . ... ... . ... . . .. . ... ................ . .. . ............................................................................................................................................................................................... . . . ............ ... .. . . .. ... .... ... ........ . ..... . .. .. .. . . . ........... . . ... . . ..... ..... ....... .. ........ . ..................................... .. . ...................... . . ...... . . . .. ........ . .. ...... . . . .. . . .. . . ..... . .. . .... . .. .. .......... .. ....... . . .. . . ... . .... . .. . . .. . .. . . . . . ... . . ..... ... .. . .. . . .. . . .. . . . ..... . . . .. . ....... .......... ... ...... . .... .. . .. ... . . ... . . . .. .. . . ..... ... .... ... . . .... . ..... .. . ... ............... . . .
lowQualScore : 1 1 1 1 1 1 9 88 9 9 111111 9 000 7 111111111 5 5 5 4 22222222222222222222 0 666666 44 5 000 9999 9 99 7 5555555 6 3 666 9 9999 000 9 111111111111111111111 222222 44 7 33 1 55 444 666 22222222 22 8 7 99 11111111111111111 9 9999 444444 9 9999 9 9 9 888888 7 9 999 1111111 9 4444444444444444444444444 77777 11111111111111 777 7777 77777 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 77 7 55555 7 33 000 33 44 7 33 666 888888888 5555 2 555 666 1 22 4 1 1 1 444 444 0 444 1 4 55 3 000 7777777777777777 3 22 6 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 6 6 3 333333333333 111 00 3 6 33 000 0000 444 77777777 5 11111 0 55 55 55 0 4 0 33333333333 4 4 888 4 4 11111 55555 6666666 99 11111111 0 3333333333333333333333333333333333333 88 9 3333333333333333333333 0 6 555555 1 8 1 44 33333333 3 66 666666 3 3 3 66 7 1 66 3 3 00000 3 66 3 7777 7 00 00 1111111111 00 8888888 3 6 22 1 1 555 4 8888 1 33 1 2 22 3 22 2 1 1 1 1 444 9 9 88888 999 88 9 99 9 7 99 7 9 99 9 9 7 99999 9 4 9 99 9 3333333 5555555555 777 999999 7 6666 55 0 44 888 3 3 888 7 4 2 66 11 4 4 77777 666 8888 000 4 4 6666 0 22222 55 0 000 111111111111111 8 6 0
consensus : TGAAAAAAAGT-GT-A-G-C-C-ACTTTT-TG--TG-CAAAT-G------ATG-TT---TTG-CGTAA-C----AGCGAAATAT-CTTTC-GC-ACAG-AGAT----CG----------C---G-TTA----C-CT--TTTTCA-CTCG---AAATGACC-T--TTT-A--A-C--CA---ATG-TT-T-G-CAT-ATC----AT---A-A--------A------------ATA------AG-TAA-C--ACT-G--CTGA---T---TA--------AGA--TTTATA-T--GATTGA-TTC-AA-------GAA-AG----TT----C-TT-G----TCC-A-GT-CA--N---AT-T-TTC---CT-------CT-C------TC-A----------T----TTTCT-----TATT--NA--T------CATN--A----CAAAA-----A-----------------------GAT--------A---T-----A--------------AA-----------T---------------G------------------T--CAT-G----TC-TAA--TA---TCTA--TTC-A-A-GGTAA---TT------A--TT----T-ATG---TTTTC--G-AC--TCT-A-TCGT-CAT---TAA---CCTTTG---TTA-ATTAAT-GGT-GTG-A-TCT-C---A---G-G--T-A-AA--TC-ATT-C------TA----GC-TGG--G---T--AG-T--TT-----GACCAT----ATA-A-CA----------------T------TATTGC--AT-A-TGCT-C-AAGCA-AAACATTATTA----TA-AC----TGT-------------AT--GT-CAT-------------ACAT-T-------------A-CT-GGTTT-T--------CCT-TAT-TTT--TAAAAA-G-TGA--GCAA---C--GAGT---GAT----C-T-AGTAATNT---CATA-CTAA--A--ATGGGAAAA--T-AAAGTCAAG-G----NA-----CATTCT-TAA-CTTG--AT-TA-CG-----CTG----CTAAG-------GA--ATTTATTTT--------GT-TGTAC-------TATC-GTCAA-----TT----------CTCGAGATTTTCCGTTGCCG-T-ATGAACTT-----GCA-TCCTTGTCA-GA---T--TGATCG-TTAGGGGNA-GAGTTT--ATCA-----TTTC-CACAT--GAACTA------A-TA-CATCTT-CAA--G-CTCAAATCCGTT-G-AAT---TNAC-TTTC--AT-CATA----AT-CAAAA--TA--TTC-G--CG---AAA--AA-------ACGAAAGTCTTTTCTCCTC-GTTATCGAA--A-ACT-T---CGACAGG--CG-C--CG-CC-A--TGTTTTGTGNA-CA-C-AT-TACATTGCA---CCA-A-TCAAA---TTAAAGC--TTTTTTA-AAACT-TG--GAAATC-C-CC--AG-AT-AC--GAAAATA-A-ACT-G-----AA-ATGGCGA-TTGT--CAC-G-------ATTAAC-----A--TTTTTT---TTTAA----ATT-CGC-GATATTAGGC-ATNGC-GTGAT--T-TCA-ATACAC--TG-AAAAATTGG-CTTT--C--GCC-A-A---T-TGC-G-AATTT-C--TG---TAGC-CATT-TTTT-G-AGATTCTT-TCGC-C---A--ATGG---CG-----AAAATGGCG-AACGGC-AGCGTGG
Reference ( gi|5 ) : TGAAAAAAAGT-GT-A-G-C-C-ACTTTT-TG--TG-CAAAT-G------ATG-TT---TTG-CGTAA-T----AGCGAAATAT-CTTTC-GC-ACAG-AGAT----CA----------C---G-TTA----T-CT--TTTTCA-CTTG---AAATGACC-T--TTT-A--A-C--GG---ATG-TT-T-A-CAT-ATC----AT---A-A--------A------------ATA------AG-CAA-C--ACT-G--CTGA---T---TA--------AGA--TTCATA-T--GAT--A-TTTGAA-------GAA-AG----TT----C-TT-G----TCC-A-GT-CA--A---AT-T-TTC---CT-------CT-C------TC-A----------T----TTTCT-----TATT--TA--T------CATC--A----CAAAA-----A-----------------------GAT--------A---T-----A--------------AA-----------T---------------G------------------T--CAT-G----CC-TAA--TA---TCTA--TTT-A-A-GGTAA---TT------A--TT----T-ATG---TTTTG--G-AC--TTT-A-TCGT-CAT---TAA---CCGTTG---TTA-ATTAAA-GGT-GTG-G-TCT-G---A---GTG--T-A-AA--TC-ATT-T------TA----G--TGA--G---T--AG-T--TT-----GACCAT----ATATA-CA-------------T--T------TATTGC--AT-A-TACT-C-AAGCA-AAACATTATTA----TA-AC----TGG-------------A---GT-CAT-------------ACA----------------A-CT-GGTTT-T--------CTT-TGT-TTT--TAAAAA-G-TGA--GCAA---C--AGGT---GAT----C-T-AGTAATAT---CATA-CTAA--A--ATGGGAAAA--T-AAATTCAAG-G----AA-----CATTCT-TAA-CTTC--AT-TA-CG-----CTA----CTAAG-------GA--ATTTATTTT--------GT-TGT---------TATC-GTCAA-----TTT--------CCTCGAGATTTTCCATTGCCG-TGATGAACTT-----GCA-TCCTTATCA-GA---T--TGATCG-TTAGGGACA-GAGTTT--ATCA-----T--C-CACAT--GAACTA------A-TA-CATCTT-CAA--G-CTCAAATC--TT-G-AAT---CAAC-TTTC--AT-CATA----AT-CAAAA--TA--TTC-G--CG---AAA--AA-------ACGAAAATCTTTTCTCCTC-GTTATCGAA--A-ACT-T---CGACA-G--CG-C--CG-CC-A--TGTTTTGTGTA-CA-C-AT-TACATTGCA---CCA-A-TCAAA---TGAAAG---TTTTTTA-AAACT-TG--GAAATC-C-CC--AG-AT-AC--GAAAATA-A-ACT-G-----AA-ATGGAGA-TTGT--CAC-G-------ATTAAC-----ATTTTTTTT---TTTTA----ATT-CGC-AATATTAGGC-ATTGT-GTGAA--T-TCA-ATACA---TG-AAAAATTGG-C-TT--C--GCC-A-A---T-TGC-A-AATTT-C--TG---TAGC-CATT-TTTTGA-AGATTCTT-TCGC-A---A--ATGG---CGAA---AAAATGGCGAAACGGC-AGCGTGG
gi|6 : TGAAAAAAAGTCGT-A-G-C-C-ACTTTT--G--TA-CAAAT-G------ATG-TT---TTG-CGTAA-------GCGAAATAT-CTTTC-GC-AAAG-AGAT----TG----------C---G-TTA----C-CT--TTTCTA-CTCA---AAATGACC-A--TTA-T--A-C--CA---ATG-TTCT-G-CAT-ATC----AT---A-A--------AT-----------ATA------AG-TAA-C--ACT-G--CTTG---T---TA--------AGA--TTTATAAT--GATTGA-TTC--A-------GAA-AGG---TC----C-TT-G----TCC-A-GTTCA--T---ATAT-TTC---CT-------CT-C------TC-AATCA------T----TTTCT-----TATT--AA--T------CATT--A----CAAAA-----A-----------------------TAA--------A---T-----A--------------AA-----------TAAACACAAGAAAAATG------------------T--CAT-G----TC-TAAAAGA---TCTAGGTTC-A-A-GGTGA---TT------A--TT----TTATG---TTTTC--G-AC--TCT-A-TCGT-CTT---TAA---CCTTTG---TTA-ATTAAT-GGT-GTG-A-TCT-C---A---G-G--T-A-AAA-TC-ATT-C------TA----GC-TGG--G---TGTAG-T--TT-----GACCA--------------------------------------------------------AAGCA-AAACATTATTA----TA-AC----TAT-------------ATATAT-TAG-------------ACATTTG------------A-CT-GGTTT-T--------TCT-TAA-TTT--TAAAAA-G-TAA--GTAA---C--GAGT---GAA----C-TTAGTAATTT---CATA-CTAA--A--ATGGGAAAA--T-TAAGTCGAG-G----TA-----CATTCT-TAA-TTTG--AT-TA-CG-----CTG----CTAAGCCTAAG-GG--CTTTATTTT--------GT-TGTACAG-----TATC-TTCAA-----TT----------CTCGAG------TATTTCCG-T--------T-----GTA-TCCTTGTCA-GA---C--TGATCG-TTTGGTGTA-GAGTTT--ATCA-----TTTC-CATAT--GAACTA------A-TA-CATCTT-CAA--G-CTCCAATCCGTT-A-AAT---TTAC-TTTC--AT-CATA----AT-CAAAA--TA--TTC-G--GT---AAA--AA-------ACGAAAGTCTTTTCTCCAC-GTTATCGAA--A-ACT-C---TGACA-GT-CG-C--CG-CC-A--TGTTTT-TAAA-CA-C-AT-TACATTGCA---CCA-A-TCAAA---TTAAAG---CTTTTTGTAAACT-TG--GAAATC-C-CC--AG-AT-AC--GAAAATA-A-ACT-G-----AA-ATGGCGA-TTGT--CGC-G-------ATTAAC-----A---ATTTT---TTTAA----ATT-CGC-G--ATTAGGC-TTAGC-GTGAT--T-TCA-ATACAC--TG-AAAAATTG
gi|7 : cagggctcacactgggtTGAAAAAAAGT-GT-A-G-C-C-ACTTTT-TG--T---AGAT-G------ATG-TAAAATTG-TGT---C----AGCAAAATAT-CTTTC-GT-ACAG-AGAC----CG----------C---G-TTA----CATT--TTTTCAACTTG---AAATGACT-G--TTA-A--A-C--A----ATG-TT-TTA-CAT-ATC----AT---A-A--------ATA----------ATA------AG-TAA-C--TCT-G--CAGA---T---TA--------AGA--TTTATA-T--GATTGA-TT--AA-------GAA-AG----TTAATTC-TT-G----TCC-A-GT-CA--A---AT-T-T-C---CT-------CT-C------TC-A----------G---------------------A--G------GATA--A----CAAAA-----A-----------------------GAT--------A---C-----ACTAAACACAGAGA-AA-----------T---------------G------------------T--TAT------TA-TAA--TA---TCTA--TTC-A-A-GGTAA---TTT-----A--CT----T-ATG---TTTTT----AC--TTC-AATCAC-CAT---TAA---AC-TTG---ATA-ATTAAA-GGT-ATG-GATCT-C---A---AAGA-T-AGAA--TA-ATC-T------AA----GC-TGC--A---T--AG-TATTT-----G--CAT----ATA-A-AA-------------C--T------CATT----------ACT-C-AAGCATAAACATTATTA----TA-AC----TGG-------------A---GAACAT-------------TCG----------------ATCT-GGTTT-C--------CAT-TAT-TTT--TAAAAAAG-AGA--GCAAT--C--AACC---GAT----C-T-AGTA---T---CATA-C-AA--A--ATGGGAAAA----AAAGTCAAGAG----AA-----CATTCT-TAA-CTTG--AT-TA-CG-----CTC----CTAAG-------GA--ATTAATTTT--------GTATGTAC-------TAT-----AA-----TT----------CTCGAGAATTTAC----CCG-TTGTGA--------------CCTTGTCA-GA---T--TGATCAATTAGGGGCAAGAGTTTTAATCA-----T--TTCACAT--GATATA------A-TC-C-TCTT-CAACCG-CTCAATCC--TT-G-AAT---TA-C-TTTCCAAT-CATATGAAATTCAAAA--TAAATTC-G--GGC--AAA--AA-------ACGAAAGTCTTTTCT--TC-GTTAGCGAA--A-ACT-T---CAACA-G---G-CAACG-CC-A--TGTTT-GTGTA-CA-C-AT-TATACTGCA---CCA-A-TCAAA---TTCAAGC--TTTTTTA-AAACC-TG--GAAATC-C-CC--AG-AT-AC--GAAAATA-A-ACT-G-----AA-ATGCCGA-GTGT--TAC-G-------ATTAAC------CTTTTTTT---TTTAA----ATT-CGC-GAT-TT-GGC-ATT
gi|10 : cagggctcacactgggtTGAAAAAAAGT-GT-A-G-C-C-ACTTTA-TG--TG-CAAAT-G------ATG-TT---TTG-AGTAA-------GCGAAATAT-CTTTC-AC-ACAG-AGAT----CG----------C---G-TTG----C-CT--TTTTCA-CTCA---AAATGACC-A--TTT-A--A-C--CA---ATG-TTCT-G-CAT-ATC----AT---A-AAT------A------------ATA------AG-TAA-C--ACT-G--CTGA---T---TA--------AGA--TTTATA-T--GATTGA-TT--AA-------GAA-AG----TC----C-TT-G----TCC-A-AT-CA--T---ATAT-TTC---CT-------CT-CTCGA--TC-A----------T----TTTCT-----TATT--AA--T------CATT--A----CAAAA-----A-----------------------AATAAACAAACA---TGAGAAA--------------AA-----------T---------------G------------------T--CAT-G----TC-TAA--TA---TCTA--TTC-A-A-GGTAA---TT------AT-TT----T-ATG---TTTTC--G-AC--TCT-A-TCGT-CAT---TAA---CCTTTG---TTA-ATTAAT-GGT-GTG-A-TCT-C---A---G-G--TAA-AA--TC-ATT-C------TA----GC-TGGGTG---T--AG-T--TT-----GACCA------------------------------------TATTGC--AT-A-TGCT-G-AAGCA-AAACATTATTA----TA-AC----TAT-------------ATATAT-TAG-------------ATATTTG------------A-CT-GGTTT-T--------TCT-TAA-TTT--TAAAAA-G-TAA--GTAA---C--GAGT---GAA----CTT-AGTAATTT---CATA-CTAA--A--ATGGGAAAA--T-AAAGTCAAA-A----TA-----CATTCT-TAA-CTTG--AT-TA-CG-----
gi|16 : cagggctcacactgggtTGAAAAAAAGT-GT-A-G-C-C-ATTTTT-TG--TG-CAAAT-G------ATG-TT---TTG-CGT---T----AGCGAAATAT-CTTTC-GCCACAG-ATAT----CA----------C---G-TTA----T-CT--TTTTCA-CTT----AAATTACC-T--TTT-A--A-C--CA---ATGTTT-T-A-CAT-ATC----AT---G-A--------A------------ATA------AG-CAA-C--ACT-G--CTGA---T---TA--------AGA--TTCATA-T--GAT--A-TTTGAA-------G-A-AG----TT----C-TT------TCC-A-AT-CA--A---AT-T-TT----CT-------CT-C------TC-A----------T----TTTCT-----TATT--TA--T------CATC--A----CAAAA-----A-----------------------GAT--------A---T-----A--------------AA-----------T---------------G------------------T--CAT-G----CC-TAA--TA---TCTA--TTT-A-A--GTAA---TT------A--TT----T-ATG---TTTTG--G-AC--TCT-A-TCGT-CAT---TAA---CCGTTG---TTA-ATGAAA-GGT-GTG-G-TCT-C---A---G-G--T-A-AA--
gi|15 : cagggctcacactgggttgaaaaaaagTGAAAAAAAGT-GT-AAG-C-C-ACTTTTTTG--TG-CAAAT-GA-----ATGTTT---TTG-CGTA-------AGCGAAATAG-CTTTC-GG-ACAG-AGAT-----G----------T---GTTTA----C-CT--TTTTCA-C-TGCAAAAATGACCAT--TTT-A--A-C--CACC-ATG-TTCT-G-CAT-AT-----AT---A-ATAAAAT--A------------ATA------AG-TAA-CA-ACTGG--CTGA---T---TA--------AGA--TTTTTA-T--GATTGA-TTC-----------AG-AG----TC----T-TT-GC---CCC-A-GT-CAT-A---AT-A-TTCT--CT-------CT-CGA----TC-A----------T----TTTTT-----T-TA--TAATT------CATT--A----CAAAA-----AT----------------------AAA--------A---T-----A--------------AACCCGAGAAAACT---------------GT-----------------T--CAT-G----TC-TAA--TAATCTTTA--TTC-A-A-GGTAA---TT------ATTTT----T-ATG---TTTTC--G-AC--TCTAA-TCGT-CGT---TAC---ACTTTG---TTA-ATC-AT-GGT-GTGAA-TCT-C---A---G-G--TAA-AA--TCAATT-C------TA----G--att
gi|20 : ggctcaactgggtTGAAAAAAAGT-GT-A-A-C-C-ACTTTT-TG--TG-CAAAT-G------ATG-TT---TTG--------------------A------C-GC-ATAG-AGAT----CG----------C---G-TTA----C-CT--TTTTCA-CTTG---AAATGACC-T--TTT-A--A-C--CA---ATGTTT-T-A-CAT-ATC----AT---A-A--------ATAATAAGTACATGTA------AG-CAA-T--ACT-G--CTGA---T---TA--------AGA--TTTTTA-T--GATTGA-TTC--A-------GAA-AG----TT----C-TT-G----TCC-A-GT-CA--T---A--T-TTC---CT-------CT-C------TG-A----------T----TTTCT-----TATT--AA--T------CAT------------A-----A-----------------------GAT--------AAACT-----A--------------AA-----------ct
gi|8 : ctcacactgggtTAAAAAAAAGT-GTGA-G-C-C-ACTTTA-TG--TG-CAAAT-G------ATG-TT---T-G-AGTAA-------ACGAAATAT-CTTTC-AC-ACAG-A-AT----CAGTGTTTGCTTT---G-TTG----T-TTGTTTTTCA-CTTGGCAAAATGACCAT--GTTGA--A-T--AGTCCATG-TTCT-G-CATTATCG---AT---A-GG-------A------------ATATTGATTAG-TAA-C--ACT-GTGCTGA---T---TA--------AGA--TTTATATT--GGT--A-TTAGGAATTAGACGAG-AG----TCA---T-TT-GGT--TCC-A-AT-CATGAT--AT-T-TGC---CC-------CTAC------TC-GGATGTCAGTTT----TTTCT-----TATTAGTA--TGGATTGCATTGAA----CAAAA-----A-----------------------AATAAACCAACA---TGAGGAA--------------AA-----------T---------------G------------------T--CAT-GTGATTA-TAA--TG----CTA--TTC-A-A--GTAAT--TT------A--TTTTTAT-ATGGTTTTTCGGCG-AC--TCT-A--CGT-CA----TAA---CCTTTG---TTA-ATTAAT-GGT-GTG-A-TCT-C---ACAGGTA----A-AA--TC-ATTCC------TATGCTG--GGT--G---T--AG-T--TTAGA--AACCAT----A----------------------------------GC--AT-A-TGCTGA-AAGC--AAACATTATTA----TA-ATA---TAT-------------AT--GT-CATAACAA--------ACA----------------A--T-GATTT-T--------Cca
gi|24 : agggctccactgtggtggtttgggggttgTGGAAAAAAGT-GT-A-G-C-C-ACTTTT-TG--TG-CAAAT-G------ATG-TC---TTG-CAT---C----AGCAAAATAT-CTTTC-GC-ACAG-AGAT----CA----------C---G-TTA----T-CT--TTTT-A-CTTG---AAATGACC-T--TTT-A--A-C--CA---ATG-TT-TCA-CAT-ATC----AT---G-ATTAATATTA------------ATA------AG-TAA-agtgtgtattcta
gi|23 : ctcacactgggtTAAAAGAAAGT-GT-A-G-C-C-ACTTTT-TGAGTG--AAAT-AGCCTATATG-TT---CTC-CGTCA-CCGTGAGCGAAACAT-CTTTT-GC-TCAA-AGAA----TG----------G---G-TTA----C-CT--TTCTCA-TTTG---AAATGACC-T--TTT-A--A-C--CA---ATG-TT-T-A-CAT-GT-----AT---A-T--------A------------AC-------AG-TAA-C--A-T-C--CTGA---T---TA--------AGA--gc
gi|11 : taggtAAAAAAAGT-GT-A-G-C-C-ACTTTT-TGA-GG-CAAAT-G------ATG-TT---TTG-CGTAA-------GCGAACTAT-CTTTC-GC-ACAG-AAAT----GC----------G---G-TTG----C-CT--TTTTCA-CTTA---AAATGACC-T--TTT-A--A-CCTGA---ATG-TT-T-TTCAT-ATC----AT---A-A--------AT-----------ATA------AG-TAA-C--ACT-G--CTGA---T---TA--------AGG--TT-ATA-T--GAT--G-ATTCAA-------TAA--G----TT----C-TT-G----TCC-A-GT-CA--T---AT-T-TTT---GC-------TT-C------TC-A---------------TTTCT-----TATTA-AA--T------CATC--A----CAAAAGATTTA-----------------------GAT--------AAC-T-----AAACAAGAGAG----AA-----------T---------------G------------------T--CAT-G-----------------TCTA--TTC-A-A-GGT-A---TT------A--TT----T-ATG---TTTTG--G-AC--TCT-A-TCGT-CAT---TAA---CCTTTG---TTATATCAAA-GGGAGTG-A-TCT-C---A---G-G--TAA-AA--TC-ATT-C------TA----GTTTGG--GTAAT--AG-T--TT-----CGC---------ACG-CA-----------------------TATTGC--AT-A-TACT-C-AAGCA-AAACATTTTTA----TA-ACTGCATGG-------------G---GA-CAT-------------TCG----------------A-CT-GGTTTGT--------CTT-TAT-TTT--AAAAAA-G-TGA--GCAA---C--ATGT---GAT----C-----TAATAT---CA
gi|2 : cagggctcacactgggttgaAAAAAAGT-GT-A-G-CAC-ACTTTT-TG--TG-CAAATTG------ATG-TT---TTG-CGTAACT----AGCGAA-TAT-CTTTC-GC-ACAG-AGATT---CA----------C---G-TTA----T-CT--TTT-CA-CT-G---AAATGACC-TGTTTT-A--AAC--GA---ATG-TT-T-T-CAT-ATC----AT---A-A--------A------------ATA------AGTCAAGC--ACT-G--CTGA---TGATTATTTGTGTTAGA--TTCATA-T--GAT--A-TTTGAA-------GAA-AG----TT------TG-G----TCC---GT-CA--A---AT-T-TTC---CT-------CT-C------TCAA----------T----TCTCT-----TATT--TAT-T------CACA--A----CAAAA-----A-----------------------GAT--------A---T-----A--------------AA-----------T---------------G------------------T--CAT-G----CC-TAA--TA----CTA--TTA-ACA-GGTAA---TT------A--TT----T-ATG---TTTTG--G-AC--TTT-A-TCGT--AT---TAA---CCGTTG---TTA-ATT-AA-GGT-GT--G-TCT-G---A---GTG--T-A-AA--TC-ATT-T------TA----GT-TGA--G---T--AGTT--TT-----GA-CAT----ATATA-CA----------------T------TATTGC--AT-A-TACT-C-AAGC--AAACATTATTA----TA-AT----GGG-------------A---GT-CAT-------------ACA----------------A-CT-GGTTT-T--------C-T-TGT-TTTTATAAAAA-G-TGAG-GCAA---C--AGGT---GAT----C-T-AG-AATAT---CATA-CTAA--A--A--GGGAAA--T-AAATTCAAA-G----AA-----CATTCT-TAA-CTTC--AT-TA-CG-----CTA----CTAAG-------GA--ATTTTATTT--------GT-TG----------TATC-GTCAA-----T-----------CTCGAGATTTTCCATTGCCGTTGATGAACCT-----GTGCTCCTTATCA-GA---T--TGATCG-TTAGGGAAG-GAGTTT---TCAT----T--C-CACAT--GAACTA------ATTA-CATCTT-CAA--G-CTC-AATC--TT-GAAAT---CAAC-TTTC--AT-CATA----ATCCAAAA--TA--TTC----CGGTCGAA--AA-------ACG-AAATCTTTTCTCCTC-GTTATCGGA--A-ACTAT---CGACA-C--AG-CT-CG-CCGA--TGTTTTGTGTA-CA-CGAT-AATGTAGCA---CCA-A-TCAAA---TGAA-----TTTTTTA-AAACT-TG--G-GATCGCGCC--AG-AG-A---GAGAATA-A-AGC-G-----AA-AAGGAGAGTTGTCCCACGG-------AT--AC-----ATTTTTTTT---TTTT-----ATT-CGCGAATATTAGGCTATTGT-G---A--T-TCA-ATACAAC-TGAAAAAATTGG-C--T--C--G-C-A-A-----TGC-ACAATTT-A--CGTTTTAGCTCATT-TTTTG--AGATTCTTGTCGC-C---ACCAT-G---CG-A---AAAATGGCG-AACGGC-AGCGTGG
gi|30 : gaatAAAAAAGT-GT-A-GAC-C-ACTTTT-TG--TG-CAAAT-G------ATG-TT---TTGCCGTAA-T-----GCGAAA-ATCCTTTC-GC-ACAG-AGAT----CA----------
gi|23 : gctcacactgggttgAGAAAG--GT-A-A-C-CCATTCTT-TG--AG-CAAAA-G------ATG-TT---TCG-Cg
gi|16 : taggttaaaagaaagtgtagccactttttgagtgaaatagcctatatgttctccgtcaccgtgaTC-TG--TGGCGAAA-G------ATA-TT---TCG-C-TAA-C-----GCAAAACAT-CATTT-GC-ACAA-AAA------A----------T---GGCTACAC-T-TT--TTTTCA-CTTcatttgaaatgaccttttaaccaatgtttacatgtatataacagtaacatcctgattaaga
gi|3 : cagggctcacactgggttgaaaaaG-CGTAA------GGCGAAATAT-CTTTTAGC-ACAGGAGATT---CG----------CT--G-TTA----C-TT--TTTCCA-CTCA---AAATGACC-A--TTT-A--ACC--AT---GTG-TT-T-A-CAT-ATCAGTAAC---A-A--------A------------ATA------AG-TAA-C--ACT-GACCTGA---T---TA--------AGACGTACATA-TACGATGAA-TC---A-------GAA-AG----TC----C-CT-GTGCTTCC-ATGT-CT--T---AT-TATTTATACT-------CT-CGTCGGATC-A----------T----TTTCTAAAAGTATA--TA--A------AAAA--A----CAAAA-----AAAGAAAGAAAAAACCAAAACCGAGA---------A---C-----A--------------AA-----------T---------------G------------------T--CATAG----TCGTAA--TA---TCTAAGTTC-A-A---TAA---CTGCTTAGA--TT----T-ATG---TTTTC--G-ACAGTCT-A-TCGTACAT---GTA---CC-TTA---TGA-ATTCAATAGT-GTG-A-TCT-C---A---AGC--T-A-AAAGTC-ATT-TC-----TA----GC-TGGT-G---T--AG-T--TA-----AACCATAGACATATAGCAAAGACGTCTATGGT--TTAACCATATTGCG-ATAA-TGCT-C-AAGCA-AAAC---ATTA----TA-AC----TGT-------------ATT-AT-TATTA-----------ACATTTTCCAC--------G-CT-GGCTT-T--------TCT-TAA-TTT--TAAAAA-G-TAAGTGTAA---C--GAGT---GAA----CTT-AGTAATTT---CATA-CTAA--A--ATGGGAAAA--T-AAAGTCAAG-G----TA-----CATT-----A-CGCT--GC-TA-AG-----C------CTAAG-------GA--CATTATTTT--------GT-TG----------TATC-TTCAA-----TT----------CTCGAGAATTTCCG---------------TT-----GTA-TCCTTGTCA-GA---C--TGATCG-TTTGGGGTA-GAGTTT--ATCATT---T--C-CATAT--GAACTT------A-TA-TATCTT-CAA--G-CTCCAATCCGTT-A-AAT---TTAC-TTTC--AT-CATT----AT-CGAAA--TA--TTC-A--GT---AAA--AA-------ACGAAAGTCTTTTCTCTAC-GTTATCGAA--A-ACT-C---CGACAGG--TG-C--CG-CC-A--TGTTTT-TGAA-CA-C-AT-TACATTGCA---CCA-A-TCAAA---TTAAAGC--TTTTTTT-AAACT-TG--GAAATC-C-CC--AG-AT-AC--GAAAATA-A-ACT-G-----AA-ATGGCGA-TTGT--CGG-T-------GTTAAC-----A----ATTT---TTTTA----ATT-CGC-G--ATTAGGC-TTGGC-GTGAT--T-TCA-ATACAC--TG-AAtatcacgttatctttttcacttaaattaccttttaaccaatgttttacatatcatgaaataagcaacactgctgattaagattcatatgatatttgaagaagttctttccaatcaaattttctctctcattttcttatttatcatcacaaaaagatataaatgtcatgcctaatatctatttaagtaattatttatgttttggactctatcgtcattaaccgttgttaatgaaaggtgtggtctcaggtaaaatt
gi|38 : cagggctcacgctgggttgaaaaaaaggtgcaaaatgactgcgctaaatagCGAAATAC-TTTTC-GC-ACAG-AGAT----CG----------C---G-TTA----C-CT--TTTTCA-
gi|1 : T-CTTTC--C-AAAG-AGATTCTGCA----------T---G-T-A----C-CT--TTTTCA-CTCA---AAATGACA-T--TT--A--A-C--C----ATG-TTCT-G-CAT-ATC----ATTATA-ATT------AT-----------ATA------AG-TAAGC--ACT-GG-CTGAGATT---TA--------AGA--TTT-TA-T--GATTGA-TTC--A-------GAATAG----TT----CCTT-G----TCC-A-GT-CA--GTATAT-T-TTC---CT-------CT-CCTCGA-TC-A----------T----TTTCT-----TATT--TAA-T------CATT--A----CAAAA-----A------------------------AT--------AAA-T-----A--------------AA-----------T---------------GAAACACGCAGAAAAATGAT--CAT-G----TC-TAA--TA---TCTA--TTC-A-AAGGTAAA--TT------AATTT----T-ATG---TTTTC--GTAC--CTA-T-TCGT-CTT---TAA---CCTTTA---TTA-ATTAAT-GGT-GTG-A-TCT-GCCAG---GTAATT-A-AA--TC-ATT-CCTA---TG----C--TGG--G---TTTAG-T--TTA----GACCAT----AT--------------------------------TGC--ATCA-TGCT-AGAAGCA-AAAAATTATTA----TAGAC----TAT-------------ATA-GT--AT-------------ACATGTAAATAGACATTTGA-CTTGGTTT-T--------GTC-TCTATTT--TAAAAA-A-AGA--GTAA---C---GATTGAGAC----T-T-AGTAATTT---CATA-CTAAGAA--ATGGGAAAAGAT-AAAGTCAAG-G----TA-----CAT-CT-TAAGCTTGGAAT-TA-CG-----CTG----CTAAGCCCTAAGGA--CTTTATTTT--------GT-TGTATTGCCCAGTATCTATCAA-----TT---------CCGAGAAATTTTCCGTTGT---------ATTT----------TCTTGTCAAGAGCCC--TGATCG-TTGGGTAGA--AGTTTG-ATCAGATTTT--C-CATATTGAAACTA------A-TAACATCTTTCAA--GGCTCCAATCCGTT-A-AATTTTCCTT-TTTC--AT-CATATT--AT-CAAAAAATA--TTC-G---G---TAA--AA-------CGGAAAGTCTTT-CTCCAC-GT-AT--GA--A-ACT-CG--CGACATG--CGTC--CG-CC-A--TGTTTTATAAAACAGC-ATGTACATTGCAGACCCA-AATCAAA---TTAGCT---TTTTTTT-AAACT-TG--GAA-TC-CGCC--AG-AT-AC--GAAAATATA-ACT-GA----AA-ATGGCGA-TTGT--CAC-G-------ATTAATCAAGAA-----TTT---GTAAA----ATT-CGC-G--ATTAGGC--TAGTCGTGAGTTT-TCA-ATACATCTTG-AAAAATTGG-T-TTTCC--GCC-A-AATTT-TGT-G-AATTT-TGGTG---TAGC-CAGT-TTTTGATATTTTCTT-TCGC-ATCGA--ATGGGATTGAAAGGAAAATGGCG-AACGAC-AGCGTG
gi|21 : AA-AGAT----CA----------CTTCG-TTACTCCT-CC--TTTTCA-CTTG---AAATGACC-T--TTC-ATTA-C---A---ATGTTT-T-A-CAT-A------AT---ATA--------C------------TTA------AG-TAA-CTAACT-G--CTGA---TGC-TA--------AGA--TTTATA-T--GATTGA-TT--AA-------GAA-AG----TT----A-TT-C----TTC-T-TG-CA--G---CT-C-TCT---CT-------CT--------TC-AT---------T----TTTCT-----TAAG--TAT-T------CAACA-A----CAAAA-----ACGTGTACACTATAAAACAC----GAG--------A---G-----A--------------AA-----------T---------------G------------------TTGCCT-G----TC-TAA--TAC--TATA--TTC-A-A-GGTAA---TT------A--Tagcc
gi|4 : TA-T--GATT-ACTTTGAA-------AAA-AAAAAATT----C-TTTG----TCCCA-GT-CC--AT--AT-A-TTC---CTTTGTATTCC-C------TCGA----------TCAGATTTTT-----TCTA--TA--A------CATT--AAAACCAAAA-----ATAACCAC----------------GAA--------A---G-----A--------------AA-----------TTG-------------A------------------C--CAT-GG---TC-TAAA-TAA--TCTA--TTCCA-A-GGTAAAAATT------A--TT----A-ATGA--TTTTC--G-AA--TTT-A-TCGT-CATGCTTAAGCCCCCTTGATCTTA-ATTGAT-GGT-GTG-AATCT-C---A---GGG--T-A-AAA-TC-ATT-TCTAAGCTG----G--TTA------T--AG-T--TTTTGTTGTTTGT----G-ACA-CA-------------TAAT------TA--GCCAAT-AATAAC-T-AAGCA-AAA-ATTATGAGCTTTT-ACA---TGGTTGAAGAATATTTA---GA-CAT-------------TCG----------------A-CT-GGTTT-TTCTATTTTCTTATGT-TTT--TAAAAA-GGTAAA-GTAAATACGAAGGT---AATAACTT-T-AG--ATTTTTCCATAACTAA--ATAATGGGAAAA--TTAAGTGCAGG-GGTAGAAGTCCCTATTGTGTAA-CTTG--ATGTATCGGCCCTCTAAGGCCTAAG-------GACCACCTATTTTTTAGTTTGGT-TATGTGA-----TATC-TTCAAAGGTATTTGAAAGTCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNGATTTTCCGTCGTA-TCCTTGTCA-GA---T--TGATCG-TTTGGGGTA-GAGTTT--ATCA-----TTTC-CATAT--GAACTA------A-TA-CATCTT-CAA--G-CTCCAATTCATT-A-AAT---TTAC-TTTC--AT-CATA----AT-CAAAA--TA--TTC-G--GC---AAA--AC-------ATGAAAGTCTTTTCTCCTC-GTCATCGAA--A-ACT-C---CGAGAGG--CG-C--CA-CC-A--TATTTT-TGAA-CA-C-AT-TACATTGCA---CCA-A-TCAAA---TTAAAGC--TTTTTTT-AAACT-TG--AAAATC-C-CC--AG-AT-AC--GAAAATA-A-ACT-G-----AA-ATGGCAA-TTGT--CGC-G-------ATTAAC-----A----CTTT---TTTAA----ATT-CGC-A--ACTAGGC-TTAGC-GTGAT--T-TCA-ATGCAC--TG-AAAAATTGG-C-TTC-C--GCC-A-A---TGTGT-G-AATTT-C--TG---TAGC-CATT-TTTT---AAATTCTT-TCAC-C---A--ATGG---CG---------------AACGGC-AGCGTG
gi|27 : attTA-T--GATTGA-TTCT---------GAA-AA----TT----C-TT-G----TCC-A-GT-CA--T---AT-T-TCC---TTT------CT-CGA----TC-A----------T----TTTCT-----TACT--AA--T------CAAA--A----TAAAC-----AC----------------------GAA--------A---G-----A--------------AA-----------T---------------G------------------C--CAT-G----TC-TAA--TA---TCTA--TTC-A-A-GGTAagccc
gi|26 : ----------T----TTTCT-----TATC--AA--T------CATC--A----CAAAA-----A-----------------------GAT--------A---T-----ACTAAACATGAGAGAAA-----------T---------------G------------------T--CAT-G----TC-TAA--TA---TCTA--TTC-A-T-TGTAA---TT------A--TT----T-ATG---CTTTG--G-AC--TCT-A-TCGT-CAT---TAA---CCTTTG---TTA-
gi|25 : --------------AA-----------T---------------G------------------T--CAT-G----TC-TAA--TA---TCTA--TTC-A-A-GGTAAA--TT------A--TT----TTATG---TTTTC--A-AC--TCT-A-TCGT-TGT---TAA---CCTTTG---TTA-ATCAAT-GGT-GTG-A-TCTCG---G---GTA----A-AA--TC-ATT-C------TA----GC-TGG--G---T--
gi|28 : ------TATTGC--AT-A-TACT-C-A-GCA-AAACATT-TTA----------------------------------------------------ATA----------------A-CT-GGTTTGT--------CTG-TGT-TTT---AAAAA-G-TGA--GCCA---C--AAGT---GGT------------------------CTAA--A--ATGGGAAAA--T-AAAGTCAAG-G----CA-----CATTgtagt
gi|32 : aCT-G-AAGCA-AAACATTATTA----TA-AC----TAT-------------A---ATACATGTATATATATTAGACATTTG------------A-CT-GGTTT-T--------TCA-TAA-TTT--TAAAAA-
gi|9 : -TTT--TAAAAA-G-TGA--GCAA---C--AAGC---GAT----C-T-ATAAATAT---CATA-CTAA--A--ATGGGAAAA--T-AAATTCAAG-G----AA-----CATTCT-TAA-CTTC--AT-TA-CG-----CTT----CTAAG-------GA--ATTTATTTT--------GT-T----------------GTCAA-----TT----------CTCGAGATTTTCCGTTGCCG-TGATGAACTT-----GCA-TCCTTATCA-GA---T--TGATCG-TTAGGGACA-GAGTTT--ATCATT---T--C-CACAT--GAACTA------A-TA-CATCTT-CAA--G-CTCAAATCG-TT-G-AAT---CAAC-TTTC--AT-CATA----AT-CAAAA--TA--TTCGG--CG----AA--AT-------ACGAAAGTCTTTTCTCCTC-GTTATCGAA--A-ACT-T---C-ACAGG--CG-C--CG-CC-A--TG--TTGTGTA-CA-C-AT-TACATTGCA---CCA-A-TCAAA---TTAAAGC--TTTTTTA-AAACT-TG--GAAATC-C-CC--AG-AT-AC--GAAAATA-A-ACT-G-----AA-AT-GCGA-TTGT--CAC-G-------ATTAAC-----A---TTTTT---TTTAA----ATT-CGC-AATATTAGGC-ATTGT-GTGAT--T-TCA-ATACAC--TG-AAAAATTGG-CTTT--C--GCC-A-A---T-CGC-A-AATTT-C--TG---TAGC-CATT-TTT--G-AGATTCTT-TCGC-----C--AT-G---CG-----AAAATGGCGAA--TGC-AGCGTG
gi|12 : AAAA-G-TGA--GCAA---C--AAGT---GAT----C-T-AGTAATAC---CATG-CTAA--A--ATGGGAAAAA-T-AAATTCAAG-G----AA-----CATTCT-TAA-CTTC--AT-TA-CG-----CTG----CTAAG-------GA--ATTTATTTT--------GT-TGT----------------CAA-----TT----------CTCGAGATTTTCCGTTGCCG-TGATGAACTT-----GCA-TCCTTATCA-GA---T--TGATCG-TTAGGGACA-GAGTTT--ATCA-----TTTC-CACAT--GAACTA------A-TA-CATCTT-CAA--G-CTCAAATCCGTT-G-AAT---CAAC-TTTC--AT-CATA----AT-CAAAA--TA--TTCGG--CG----AA--AA-------ACGAAAGTCTTTTCTCCTC-GTTATCGAA--A-ACT-T---CGACAGG--CG-C--CG-CC-A--TG-TTTGTGTA-CA-C-AT-TACATTGCA---CCA-A-TCAAA---TTAAAGC--TTTTTTA-AAACT-TG--GAAATC-C-CC--AG-AT-AC--GAAAATA-A-ACT-G-----AA-ATGGCGA-TTGT--CAC-G-------ATTAAC-----A---TTTTT---TTTAA----ATT-CGC-AATATTAGGT-ATTGT-GTGAagccc
gi|13 : TC-GTCAA-----TT----------CTCGAG--TTTGCGTTGC-----ATGAACTT-----GC----CTT-TC--GA---T---GATCG-TTAGG-AGA-GAGTTT--AT-A-----T--T-C---T--GAACTA------A-TA-CATCTT-CAA--G--TCAA-TCCGTT-G-AAT---CAAAGTTTC--ATTCATA----AT-CAAAA--TC--TTC-GGCCG---AAAGAAA-------ACGAG--TCTTTTCTC-TC-GTTA-CGAA--A--CT-T---CGACA-GG-CG-C--CG-CC-A--TGT-----GTA-CA-C-AT-TACATCGC-----CA-A-TCAAA-----AAAGC--TTTTTTA-AAACT-TG--GAAATC-T-CCCAAG-A--AC----ACATA-A-ACT-GA----AA-ATGG-CA-TTGT--CAC-G-------ATTAAC-----A----TTTT---TTTTAAAACATT-CGC--ATAT--AGC-A-TGT-GTGAT--TATCACACACAC--TG-AAAAATTGG-CTTT--C--GCC-A-A---T-TGC-A-AAATT----TG---TAGC-CATTATATTG--AGATTCTT-TCGC-C---A--ATGG---TGCA---GAAATGGCGAA--TGC-AGCGTGt
gi|34 : GAGATTTTCCGTTGC-----ATGAACTT-----GCA-TCGTTGTCA-GA---TAATGATCG-TTAGGGGCA-GAGTTT--ATCagcc
gi|17 : -----GCA-TCCTTGTCA-GA---T--TGATCG-TAAGGGATA-CAGTTT--AT-A-----TTTC-CACAT--GAACTG--------TA-TTTCTT-CAA--G-CTCAAATCCGTT-G-AAT---TTAC-TTTC--AT-CATA----AT-CAAAT--TA--TTTGG--CG----AA--AA-------ACGAAAGTCTTTTCTGCTC-GTTATCGAA--A-ACT-T---TGGCAGG--CG-C--CG-CC-A--TG-TTTGTGTA-CA-C-AT-TACATTGCA---CCA-A-TCAAA---TTTAAGCTTTTTTTTT-AAACT-TG--GAAATC-C-CC--AG-AT-AC--GAATATA-A-ACT-G-----AA-ATGGCGA-TCGT--CAC-G-------ATTAAC-----ATTTTTTTTAAA----A----ATT-CGC-G--ATTAGGC-ATTGC-GTGA
gi|29 : CG-TTAAGGGTA-GAGTTT--ATCA-----TTTC-CATAT--AAACTATACTATA-TA-CATCTT-CAA--G-CTCCAATCCATTAA-AAT---TTAC-TTTC--AT-CATA----AT-CAAt
gi|14 : -TTAGGGGAA-GAGGTTG-ATCA-----TTTC-CACA---GTAC--------A-TA-TATCTT-CAA--GACTCAAATCCGTT-G-AAT---TCAC-TTT---AT-CGTA----AT-CAAAA--TA--T-C-GT-CG---AAA--AATCATTCTACCAA--TCTTT-CTCCTTTGTTATCGAATCA-TCT-TTTGCAAGA-G--CA-C--CGGCC-AGTTGATGTACGCA-CA-C-TT-TACATTGCA---CCA-A-TCAA------AAAG---CTTTT---AAACTCTGATGAAAT--C-CC--AGTAT-GC--GAAAATA-ATTCTCG-----AATATCGA----TGT--CAT-GACTCGTCATTAAC-----AACTTCACA---TTTAA----ATT-C-C--GTATTA-GC-ACAGG-CTGAAATT-TCA-ATACAC--TGAAAAAATTGG-CTTT--C--GCCAA-A---T-TGTGG-AATTT-C--TG---TAGC-CATT-TT---G-AGATTCTT-TCGC-C---A--ATGG---CG------AAATCGTG-AAC-GC-AGCGTt
gi|19 : tcCGAA--ACACT-C---C-ACA-GGGCG-C--CG-CCCA--TGTTTT-TAAA-CA-C-AT-TACAT-GCA---CCACA-TCAGAGATTAAAAGGGGCTTTT---AAACT-TG--GAAATC-C-C---AG-ATGACTGAAAAATA-A-ACT-GCACAAAA-ATGACGA-TGG-----C-G-------ATTAAC-----AATTTTTTT---AT-------ATT-CG---AGATTAGGC-TTAGC-GTGAT--T-TCA-ATACAC--TG-AAAAATTa
gi|18 : aaaaatctgaaagtcttttctccaggggcggggggggggggtgggatgGAA--A-ACT-T---CAACA-GG-CG-C--CG-CC-A--TGTTT-GTGTA-CA-C-AT-TACATTGCA---CCA-A-TCAGA---TTAAAGC--TTTTTTA-AAACT-TG--GAAATC-C-CC--AG-AT-AC--GAAAATA-A-ACT-G-----AA-ATGACAA-TTGT--CAT-G-------ATTAA----------------------A----A-T-CGC-A--ATTAGG--ATTGT-GTGAT--T-TCA-ATACAC--TG-AAAAATTAG-CTTT--C--GCC-A-A---T-TGT-A-AATTT-C--TG---TAGC-CATT-TTTT---AGATTCTT-TCGC-C---A--ATGG---CG---------------AACGGC-AGCGTG
gi|22 : tA-A-TCAAA---TTAAAGC--TTTTTTA-AAACT-TG--GAAATC-A-CC--AGAAT-AC--GAAAATA-A-ACTGG-----AA-ATGGCGA-TTGT--CAC---------ATTAAC--------TTTTTT---TTTAA----ATTCCGC-AATATCAGGCGATTG--GTTGA--T-TCA-ATACAC--TG-AAAAATTGGAC-TT--TCGGCC-AGA---T-TGC-A-AATTCAC--TG---TAGC-CATT-TTT--G-AGATTC-T-TCGC-----A--ATGG---CG-----AAAAT-GCGTAACGGCAAGCGTGagccc
gi|31 : TTTCT---TTTAA----ATT-CGC-AAT--TAGGC-ACAGT-GTGAT--T-TTA-ATACAC--TA-AAAAATTTG-CTTT--C--GCC-A-A---T-TGT-G-AATTT-T--AG---TAagccc
gi|35 : aacaa--TG---TAGC-CATT-TTT--G-AGATTCTT-TCGC-C---A--AT---------------ATGGC-AAACGGC-AGCGTGt
gi|37 : TTCTT-TCGCCA---A--ATGG---CG-----AAAATGGCG-AACAGC-AGCGCGagcc
4 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|33 ): TCTGTACATAGAAAATATAGGCCTTATAGAGACTATTCTCAGGGCTCACGCTGGGTTGAAAAAAA
Unaligned ( gi|36 ): AATTTCCTGCTTTGTAGTTGCAGGGCTCACACTGGGTTGAAAAAAA
Unaligned ( gi|39 ): AGGGCTCACTCTGGGTTGAAAAAAAGTGTA
Unaligned ( gi|40 ): TGCTAAGCCTAAGGACTTTATTTTGTTGTA
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 111111 33333333 11111111111111 1111111 11111 33333333333 1111111111 11 11111111 222222222 1111 1111 111111111 33333333333333333333333 11111 1111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 111 111111 1111 1 111111111 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 1 111111111 88888888888888888888888888888888888888888888888888 111111111 1111 11 111111 1111111 1111111 444444444444444444 444444444444 2222222222 1111111 11111 222222 1111 333333333333333333333333
lowQualScore : 3 3 3 3 3 3 77 3 111111 3 555 2 44444444 2 2 2 2 55555555555555 2 2 7777 33 2 2222222 7777 444 33 66 66 2 99999 2 8888 444 55555555555 5555 777777 5555555555 2 66 2 00 555 888 00000000 3 555 2 33 2 55555 333333333 8888 2 2 2222 222 2 2 0000 5 2 444 333333333 2 77777777777777777777777 11111 44 2222222222 444 5555 66666 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 33 99999999 2 2 7777 55 999 66 2 2 2 222 000000 77 4444 66 0 777 33 2 2 2 555 555 0 2 555 2 6 2 3 6 88 44 3 6 3 8 3 6666 77 3 6 3 3 3 6 3 888888888 55 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 88 0 1 888 3 333333333 3 66666666666666666666666666666666666666666666666666 3 3 55 1 444444444 2 3 44 3 3 44 3 555 3 44 1111 6 3 3 3 666 3 00 77 3 3 3 1 99999 4 4 55 111111 6666666 3333333 0 777 55 4 000000000000000000 55 555 55 111111111111 333 3 555 44 3 0 66 2 99 555 44 888888 3 3 3 44 6 7 0 3 3 4 888 44 3 88 555 3 44 44 8888888888 44 0000000 3 33 2 2 2 1 2 66 2 2 5 33 6 8 1 2 2 2 2 555 2 2 33 5555 33 55 2 33 2 5 33 5 2 33 2 2 2 22222 2 33 2 8888888 333333 33 22 33 2 9999 66 3 33 77 3 3 3 44 3 3 4 0 4 4 4 4 777 4 777 9999 666 4 8 4 4 55 3 55 999999999999999999999999 7 5 3
lowQualScore : . . . . . . .. . ...... . ... . ........ . . . . .............. . . .... .. . ....... .... ... .. .. .. . ..... . .... ... ........... .... ...... .......... . .. . .. ... ... ........ . ... . .. . ..... ......... .... . . .... ... . . .... . . ... ......... . ....................... ..... .. .......... ... .... ..... .......................................................................................................................... .. ........ . . .... .. ... .. . . . ... ...... .. .... .. . ... .. . . . ... ... . . ... . . . . . .. .. . . . . . .... .. . . . . . . . ......... .. .......................................................... .. . . ... . ......... . .................................................. . . .. . ......... . . .. . . .. . ... . .. .... . . . . ... . .. .. . . . . ..... . . .. ...... ....... ....... . ... .. . .................. .. ... .. ............ ... . ... .. . . .. . .. ... .. ...... . . . .. . . . . . . ... .. . .. ... . .. .. .......... .. ....... . .. . . . . . .. . . . .. . . . . . . . ... . . .. .... .. .. . .. . . .. . . .. . . . ..... . .. . ....... ...... .. .. .. . .... .. . .. .. . . . .. . . . . . . . . ... . ... .... ... . . . . .. . .. ........................ . . .
lowQualScore : 1 1 1 1 1 1 33 1 999999 1 444 9 22222222 5 5 5 4 66666666666666 5 5 8888 44 5 7777777 9999 777 77 33 33 7 11111 7 3333 777 44444444444 7777 777777 3333333333 7 88 9 77 000 999 44444444 1 444 7 77 7 99999 000000000 3333 7 7 0000 999 7 7 3333 3 7 777 333333333 7 55555555555555555555555 66666 44 9999999999 444 3333 22222 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 44 11111111 5 5 8888 99 444 99 5 5 5 777 333333 33 6666 88 1 999 99 9 9 9 000 000 7 9 000 9 2 6 1 2 55 22 1 2 1 5 1 5555 33 3 7 3 3 3 7 3 999999999 55 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 66 9 0 444 3 333333333 3 33333333333333333333333333333333333333333333333333 6 6 00 2 555555555 6 3 22 1 3 66 3 888 3 66 7777 7 3 3 5 444 6 00 99 3 3 3 0 11111 0 0 55 555555 2222222 0000000 6 000 55 0 111111111111111111 55 333 00 777777777777 999 3 888 66 1 1 66 9 66 444 22 888888 1 1 1 22 2 8 2 1 1 0 555 22 1 55 444 1 66 66 0000000000 66 8888888 3 99 9 9 9 2 9 88 9 9 7 99 9 4 0 9 9 9 9 000 7 7 77 7777 77 55 7 77 7 3 77 3 7 77 7 7 7 00000 7 77 7 7777777 111111 44 99 44 5 6666 11 6 55 33 1 1 1 22 1 3 0 8 0 0 0 0 000 0 666 7777 444 0 1 0 0 00 6 00 999999999999999999999999 3 1 6
consensus : TGAAAAAAAGT-GT-A-G-C-CACTTTT-TG--TGCAAAT-G------ATG-TT---TTG-CGTAAC----AGCGAAATAT-CTTTC-GC-ACAG-AGAT-C-------GC---G-T-TAC----CT--TTTTCA-CT-C-G---AAATGACC-T--TT---TA--ACC--A--ATG-TT-T-G-CAT-ATC----AT---AA--------A--A----TA------AGT----------AA-C--ACT-G--CTGA---T---TA--------AGAT-T---TATA-T--G-ATTG---ATTC-----AA-GAAAGTT----C-TT-G----TCC-A-GT-C-AT---AT-T-TTC---CT---------CT-C------TC----A----------TTTTCT-----TATT-NA-T--------CATN--A----CAAAA-----A-------------------GATA----------------------T-------------A--------------AA-----------T---------------G------------------T--C--------AT-G-TC----TAA--TA---TCTA--TTC-A-A-GGTAA---TT------A--TTT----ATG--TTTTCG---AC--TCT-AT-CGT-CA---TTAA---CCTT-TG---TTA-ATT-AATGGTGT-G-ATCT--C--A-G-G-TAA-A----A--TC-A-TT-C-T-A-G-CTGG--G---T--AG--TT-----------T---GAC------CATATA--CA--------------TTA------TTGC--AT-ATACT-C-AAGCA-AAACATTAT---------TATA-AC--TG-----T-----A-T-GT---CAT--------AC-ATTCG-------ACT-GGTTT-T--CCT---------TANTTTT-A--AAAA-GT-GA--G-CA---A-CGA--GTGA----TC-T-AGTAATNT---CAT-ACTAA--AATGGGAAAA--TAAAGT-C-AAG-GNACA-----TTCTTAA-C-TTG--ATTACG------CTN------CTAAG-------GAATTT---ATT--TTGT-TGTA---T-------ATC-GTCAATT--CTCGAGA--TTTT--CCGTTGCCGT--ATGAACTTGCA-TCCTTGTCA-GA---T--TGATC-GTTAGGGG-NAGA-GTTT--ATCA---TTTCCACAT--GAACTA------A-TA-CATCTT-CAA--G-CTCAAATCCGTT-G-AATTNAC---TTTC--AT-CATA--A---T-CAAAA--T--ATTC-G--CG---AAA--AA-------ACGAAAGTCTTTTCTCCTC-GTTATCGAA--A-ACT-T-CGACA-GG--CG-CCG-CC-A--TGTTTTGTGTA-CA-C-AT-TACATTGCA---CCA-A-TC--AAATTAAA----GC--TTTTTTA-AAACT-TG--GAAATC-C-CC--AG-AT-AC--GAAAATA-AA-CT-G-----AAATGGCGA-TTGT--CAC-GA-------TTAAC--A---TTTTT--TT-TAA--ATT-CGCG-ATATTAGGC-ATNG-CGTGA--TT-TCA-ATAC-A--CTG-AAAA-ATTGG-CTTT-C-GCC-A-A---T-TGC-G-AATTT-C--TG---TAGC-CATT-TTTTG-AGA--TTCTT-TCGC--C-A--A-TG--G--------CG--AAAATGGCG-AACGGC-AGCGTGG
Reference ( family-1600 ) : TGAAAAAAAGT-GT-A-G-C-CACTTTT-TG--TGCAAAT-G------ATG-TT---TTG-CGTAAC----AGCGAAATAT-CTTTC-GC-ACAG-AGAT-C-------GC---G-T-TAC----CT--TTTTCA-CT-C-G---AAATGACC-T--TT---TA--ACC--A--ATG-TT-T-G-CAT-ATC----AT---AA--------A--A----TA------AGT----------AA-C--ACT-G--CTGA---T---TA--------AGAT-T---TATA-T--G-ATTG---ATTC-----AA-GAAAGTT----C-TT-G----TCC-A-GT-C-AN---AT-T-TTC---CT---------CT-C------TC----A----------TTTTCT-----TATT-NA-T--------CATN--A----CAAAA-----A-------------------GATA----------------------T-------------A--------------AA-----------T---------------G------------------T--C--------AT-G-TC----TAA--TA---TCTA--TTC-A-A-GGTAA---TT------A--TTT----ATG--TTTTCG---AC--TCT-AT-CGT-CA---TTAA---CCTT-TG---TTA-ATT-AATGGTGT-G-ATCT--C--A-G-G-T-A-A----A--TC-A-TT-C-T-A-G-CTGG--G---T--AG--TT-----------T---GAC------CATATA-ACA--------------TTA------TTGC--AT-ATGCT-C-AAGCA-AAACATTAT---------TATA-AC--TG-----T-----A-T-GT---CAT--------AC-ATT---------ACT-GGTTT-T--CCT---------TATTTTT-A--AAAA-GT-GA--G-CA---A-CGA--GTGA----TC-T-AGTAATNT---CAT-ACTAA--AATGGGAAAA--TAAAGT-C-AAG-GNACA-----TTCTTAA-C-TTG--ATTACG------CTG------CTAAG-------GAATTT---ATT--TTGT-TGTAC--T-------ATC-GTCAATT--CTCGAGA--TTTT--CCGTTGCCGT--ATGAACTTGCA-TCCTTGTCA-GA---T--TGATC-GTTAGGGG-NAGA-GTTT--ATCA---TTTCCACAT--GAACTA------A-TA-CATCTT-CAA--G-CTCAAATCCGTT-G-AATTNAC---TTTC--AT-CATA--A---T-CAAAA--T--ATTC-G--CG---AAA--AA-------ACGAAAGTCTTTTCTCCTC-GTTATCGAA--A-ACT-T-CGACA-GG--CG-CCG-CC-A--TGTTTTGTGNA-CA-C-AT-TACATTGCA---CCA-A-TC--AAATTAAA----GC--TTTTTTA-AAACT-TG--GAAATC-C-CC--AG-AT-AC--GAAAATA-AA-CT-G-----AAATGGCGA-TTGT--CAC-GA-------TTAAC--A--TTTTTT--TT-TAA--ATT-CGCG-ATATTAGGC-ATNG-CGTGA--TT-TCA-ATAC-A--CTG-AAAA-ATTGG-CTTT-C-GCC-A-A---T-TGC-G-AATTT-C--TG---TAGC-CATT-TTTTG-AGA--TTCTT-TCGC--C-A--A-TG--G--------CG--AAAATGGCG-AACGGC-AGCGTGG
gi|1 : T-CTTTC--C-AAAG-AGAT-TCT-----GC---A-TGTAC----CT--TTTTCA-CT-C-A---AAATGACA-T--TT----A--ACC--A---TG-TTCT-G-CAT-ATC----ATTATAATT------AT-A----TA------AGT----------AAGC--ACT-GG-CTGAGATT---TA--------AGAT-T---T-TA-T--G-ATTG---ATTC-----AG-AATAGTT----CCTT-G----TCC-A-GT-C-AGTATAT-T-TTC---CT---------CT-CCTCGA-TC----A----------TTTTCT-----TATT-TAAT--------CATT--A----CAAAA-----A--------------------ATAAA--------------------T-------------A--------------AA-----------T---------------GAAACACGCAGAAAAATGAT--C--------AT-G-TC----TAA--TA---TCTA--TTC-A-AAGGTAAA--TT------AATTTT----ATG--TTTTCGT--AC---CT-ATTCGT-CT---TTAA---CCTT-TA---TTA-ATT-AATGGTGT-G-ATCTGCC--A-G-G-T-A-ATTAAA--TC-A-TT-CCT-ATG-CTGG--G---TTTAG--TT-----------TA--GAC------CATAT-----------------------------TGC--ATCATGCT-AGAAGCA-AAAAATTAT---------TATAGAC--TA-----T-----A-TAGTATACATGTAAATAGAC-ATTTG-------ACTTGGTTT-TGTCTC---------TATTTTA-A--AAAA-A--GA--G-TA---A-CGA--TTGAGA--CT-T-AGTAATTT---CAT-ACTAAGAAATGGGAAAAGATAAAGT-C-AAG-GTACA-----T-CTTAAGC-TTGGAATTACG------CTG------CTAAGCCCTAAGGACTTT---ATT--TTGT-TGTAT--TGCCCAGTATCTATCAATT--C-CGAGAAATTTT--CCGTTG---T--AT-----T----TTCTTGTCAAGAGCCC--TGATC-GTT--GGG-TAGAAGTTTG-ATCAGATTTTCCATATTGAAACTA------A-TAACATCTTTCAA--GGCTCCAATCCGTT-A-AATTTTCCTTTTTC--AT-CATATTA---T-CAAAAAAT--ATTC-G---G---TAA--AA-------CGGAAAGTCTTT-CTCCAC-GT-AT--GA--A-ACT-CGCGACA-TG--CGTCCG-CC-A--TGTTTTATAAAACAGC-ATGTACATTGCAGACCCA-AATC--AAATTA------GC--TTTTTTTTAAACT-TG--GAA-TC-CGCC--AG-AT-AC--GAAAATATAA-CT-GA----AAATGGCGA-TTGT--CAC-GA-------TTAATCAA--GAATTT--GT-AAA--ATT-CGCG---ATTAGGC--TAGTCGTGAGTTT-TCA-ATAC-ATCTTG-AAAA-ATTGG-TTTTCC-GCC-A-AATTT-TGT-G-AATTT-TGGTG---TAGC-CAGT-TTTTG-ATATTTTCTT-TCGCATCGA--A-TG--GGATTGAAAGG--AAAATGGCG-AACGAC-AGCGTG
gi|10 : TGAAAAAAAGT-GT-A-G-C-CACTTTA-TG--TGCAAAT-G------ATG-TT---TTG-AGTAA------GCGAAATAT-CTTTC-AC-ACAG-AGAT-C-------GC---G-T-TGC----CT--TTTTCA-CT-C-A---AAATGACC-A--TT---TA--ACC--A--ATG-TTCT-G-CAT-ATC----AT---AA--------ATAA----TA------AGT----------AA-C--ACT-G--CTGA---T---TA--------AGAT-T---TATA-T--G-ATTG---ATT------AA-GAAAGTC----C-TT-G----TCC-A-AT-C-AT---ATAT-TTC---CT---------CT-C------TCGATCA----------TTTTCT-----TATT-AA-T--------CATT--A----CAAAA-----A-------------------AATAAACAAACA--------------TGAGAA--------A--------------AA-----------T---------------G------------------T--C--------AT-G-TC----TAA--TA---TCTA--TTC-A-A-GGTAA---TT------A--TTTT---ATG--TTTTCG---AC--TCT-AT-CGT-CA---TTAA---CCTT-TG---TTA-ATT-AATGGTGT-G-ATCT--C--A-G-G-TAA-A----A--TC-A-TT-C-T-A-G-CTGGGTG---T--AG--TT-----------T---GAC------CA-----------------------TA------TTGC--AT-ATGCT-G-AAGCA-AAACATTAT---------TATA-ACTATA-----T-----A-T-AT---TAG--------AT-ATTTG-------ACT-GGTTT-T--TCT---------TAATTTT-A--AAAA-GT-AA--G-TA---A-CGA--GTGA----ACTT-AGTAATTT---CAT-ACTAA--AATGGGAAAA--TAAAGT-C-AAA-ATACA-----TTCTTAA-C-TTG--ATTACG------agcc
gi|11 : cagggctcacactgggtAAAAAAAGT-GT-A-G-C-CACTTTT-TGA-GGCAAAT-G------ATG-TT---TTG-CGTAA------GCGAACTAT-CTTTC-GC-ACAG-AAATGC-------G----G-T-TGC----CT--TTTTCA-CT-T-A---AAATGACC-T--TT---TA--ACCTGA--ATG-TT-T-TTCAT-ATC----AT---AA--------AT-A----TA------AGT----------AA-C--ACT-G--CTGA---T---TA--------AGGT-T----ATA-T--G-AT-G---ATTC-----AA-TAA-GTT----C-TT-G----TCC-A-GT-C-AT---AT-T-TTT---GC---------TT-C------TC----A-----------TTTCT-----TATTAAA-T--------CATC--A----CAAAAGATTTA-------------------GATAAC--------------------T-------------A--------------AA-------------------------------------------------CAAGAGAGAAT-G-TC------A--TG---TCTA--TTC-A-A-GGT-A---TT------A--TTT----ATG--TTTTGG---AC--TCT-AT-CGT-CA---TTAA---CCTT-TG---TTATATCAAAGGGAGT-G-ATCT--C--A-G-G-TAA-A----A--TC-A-TT-C-T-A-GTTTGG--GTAAT--AG--TT-----------T------------CGCAC--GCA---------------TA------TTGC--AT-ATACT-C-AAGCA-AAACATTTT---------TATA-AC--TG-----C-----A-T-G----GGG--------AC-ATTCG-------ACT-GGTTTGT--CTT---------TATTTTA-A--AAAA-GT-GA--G-CA---A-CAT--GTGA----TC-T-AATA
gi|12 : cagggctcacactgggttga--AAAA-GT-GA--G-CA---A-CAA--GTGA----TC-T-AGTAATAC---CAT-GCTAA--AATGGGAAAAA-TAAATT-C-AAG-GAACA-----TTCTTAA-C-TTC--ATTACG------CTG------CTAAG-------GAATTT---ATT--TTGT-TGT------------------CAATT--CTCGAGA--TTTT--CCGTTGCCGTG-ATGAACTTGCA-TCCTTATCA-GA---T--TGATC-GTTAGGGA-CAGA-GTTT--ATCA---TTTCCACAT--GAACTA------A-TA-CATCTT-CAA--G-CTCAAATCCGTT-G-AATCAAC---TTTC--AT-CATA--A---T-CAAAA--T--ATTCGG--CG----AA--AA-------ACGAAAGTCTTTTCTCCTC-GTTATCGAA--A-ACT-T-CGACA-GG--CG-CCG-CC-A--TG-TTTGTGTA-CA-C-AT-TACATTGCA---CCA-A-TC--AAATTAAA----GC--TTTTTTA-AAACT-TG--GAAATC-C-CC--AG-AT-AC--GAAAATA-AA-CT-G-----AAATGGCGA-TTGT--CAC-GA-------TTAAC--A---TTTTT--TT-TAA--ATT-CGCA-ATATTAGGT-ATTG-TGTGA--Ttca
gi|13 : TC-GTCAATT--CTCGAG----TTT--GCGTTGC-----ATGAACTTGC----CTT-TC--GA---T---GATC-GTTAGGAG--AGA-GTTT--AT-A---TTC-----T--GAACTA------A-TA-CATCTT-CAA--G--TCAA-TCCGTT-G-AATCAAAG--TTTC--ATTCATA--A---T-CAAAA--T--CTTC-GGCCG---AAAGAAA-------ACGA--GTCTTTTCTC-TC-GTTA-CGAA--A--CT-T-CGACA-GG--CG-CCG-CC-A--TGT-----GTA-CA-C-AT-TACATCGC-----CA-A-TC--AAA--AAA----GC--TTTTTTA-AAACT-TG--GAAATC-T-CCCAAG-A--AC----ACATA-AA-CT-GA----AAATGGC-A-TTGT--CAC-GA-------TTAAC--A--TTTTTT--TT-AAAACATT-CGC--ATAT--AGC-AT-G-TGTGA--TTATCACACAC-A--CTG-AAAA-ATTGG-CTTT-C-GCC-A-A---T-TGC-A-AAATT----TG---TAGC-CATTATATTG-AGA--TTCTT-TCGC--C-A--A-TGGTG--------CA--GAAATGGCG-AAT-GC-AGCGTG
gi|14 : TTAGGGG-AAGA-GGTTG-ATCA---TTTCCACA---GTAC--------A-TA-TATCTT-CAA--GACTCAAATCCGTT-G-AATTCAC---TTT---AT-CGTA--A---T-CAAAA--T--AT-C-GT-CG---AAA--AATCATTCTACCAA--TCTTT-CTCCTTTGTTATCGAATCA-TCT-T-TTGCA-AGAGCA-CCGGCC-AGTTGATGTACGCA-CA-C-TT-TACATTGCA---CCA-A-TC--AAA---AA----GC--TTTT----AAACTCTGATGAAATC-C-C---AGTAT-GC--GAAAATA-ATTCT-C-----GAATATCGA-T-GT--CAT-GACTCGTCATTAAC--A--ACTTCACATT-TAA--ATT-C-CG--TATTAG-C-ACAG-GCTGAAATT-TCA-ATAC-A--CTG-AAAAAATTGG-CTTT-C-GCCAA-A---T-TGTGG-AATTT-C--TG---TAGC-CA---TTTTG-AGA--TTCTT-TCGC--C-A--A-TG--G--------CG---AAATCGTG-AAC-GC-AGCGTagcc
gi|15 : tcTGAAAAAAAGT-GT-AAG-C-CACTTTTTTG--TGCAAAT-GA-----ATGTTT---TTG-CGTA------AGCGAAATAG-CTTTC-GG-ACAG-AGAT---------GT---GTT-TAC----CT--TTTTCA-CTGCAA---AAATGACCAT--TT---TA--ACC--ACCATG-TTCT-G-CAT-AT-----AT---AATAAAAT--A--A----TA------AGT----------AA-CA-ACTGG--CTGA---T---TA--------AGAT-T---TTTA-T--G-ATTG---ATTC---------AGAGTC----T-TT-GC---CCC-A-GT-C-AT---AA-T-ATT---CT---------CT-C------TC----GATCAT-----TTTTTT-----TATA-AT-T--------CATT--A----CAAAA-----AT------------------AAAA----------------------T-------------A--------------AACCCGAGAAAACT---------------GT-----------------T--C--------AT-G-TC----TAA--TAATCTTTA--TTC-A-A-GGTAA---TT------ATTTTT----ATG--TTTTCG---AC--TCTAAT-CGT-CG---TTAC---ACTT-TG---TTA-ATC--ATGGTGT-GAATCT--C--A-G-G-TAA-A----A--TCAA-TT-C-T-A-G-CTa
gi|16 : ggctcaactgggtTGAAAAAAAGT-GT-A-G-C-CATTTTT-TG--TGCAAAT-G------ATG-TT---TTG-CGT--T----AGCGAAATAT-CTTTC-GCCACAG-ATAT-C-------AC---G-T-TAT----CT--TTTTCA-CT-T-----AAATTACC-T--TT---TA--ACC--A--ATG-TT-TTA-CAT-ATC----AT---GA--------A--A----TA------AGC----------AA-C--ACT-G--CTGA---T---TA--------AGAT-T---CATA-T--G-AT-----ATTT-----GA-AGAAGTT----C-TT------TCC-A-AT-C-AA---AT-T-TTC----T---------CT-C------TC----A----------TTTTCT-----TATT-TA-T--------CATC--A----CAAAA-----A-------------------GATA----------------------T-------------A--------------AA-----------T---------------G------------------T--C--------AT-G-CC----TAA--TA---TCTA--TTT-A-A--GTAA---TT------A--TTT----ATG--TTTTGG---AC--TCT-AT-CGT-CA---TTAA---CCGT-TG---TTA-ATG-AAAGGTGT-G-GTCT--C--A-G-G-T-A-A----A--
gi|17 : cagggctcacactgggttgaaaaaaagGCA-TCCTTGTCA-GA---T--TGATC-GTAAGGGA-TACA-GTTT--AT-A---TTTCCACAT--GAACTG--------TA-TTTCTT-CAA--G-CTCAAATCCGTT-G-AATTTAC---TTTC--AT-CATA--A---T-CAAAT--T--ATTTGG--CG----AA--AA-------ACGAAAGTCTTTTCTGCTC-GTTATCGAA--A-ACT-T-TGGCA-GG--CG-CCG-CC-A--TG-TTTGTGTA-CA-C-AT-TACATTGCA---CCA-A-TC--AAATTTAA----GCTTTTTTTTT-AAACT-TG--GAAATC-C-CC--AG-AT-AC--GAATATA-AA-CT-G-----AAATGGCGA-TCGT--CAC-GA-------TTAAC--A--TTTTTT--TTAAAA--ATT-CGCG---ATTAGGC-ATTG-CGTGA--Tatt
gi|18 : GAA--A-ACT-T-CAACA-GG--CG-CCG-CC-A--TGTTT-GTGTA-CA-C-AT-TACATTGCA---CCA-A-TC--AGATTAAA----GC--TTTTTTA-AAACT-TG--GAAATC-C-CC--AG-AT-AC--GAAAATA-AA-CT-G-----AAATGACAA-TTGT--CAT-GA-------TTAA------------------AA----T-CGCA---ATTAGG--ATTG-TGTGA--TT-TCA-ATAC-A--CTG-AAAA-ATTAG-CTTT-C-GCC-A-A---T-TGT-A-AATTT-C--TG---TAGC-CATT-TTTT--AGA--TTCTT-TCGC--C-------------------------AATGGCG-AACGGC-AGCGTG
gi|19 : tCGAA--ACACT-C-C-ACA-GGG-CG-CCG-CCCA--TGTTTT-TAAA-CA-C-AT-TACA-TGCA---CCACA-TCAGAGATTAAAAGGGGC--TTTT----AAACT-TG--GAAAT--C-CC--AG-ATGACTGAAAAATA-AA-CT-GCACAAAAATGACGA-TGG-----C-GA-------TTAAC--A---ATTTT--TT-TAT--ATT-CGAG---ATTAGGC-TTAG-CGTGA--TT-TCA-ATAC-A--CTG-AAAA-ATTagccc
gi|2 : aaaaatctgaaagtcttttctccaggggcggggggggggggtgggatgAAAAAAGT-GT-A-G-CACACTTTT-TG--TGCAAATTG------ATG-TT---TTG-CGTAACT---AGCGAA-TAT-CTTTC-GC-ACAG-AGATTC-------AC---G-T-TAT----CT--TTT-CA-CT---G---AAATGACC-TGTTT---TA--AACG-A--ATG-TT-T-T-CAT-ATC----AT---AA--------A--A----TA------AGTCA--------AG-C--ACT-G--CTGA---TGATTATTTGTGTTAGAT-T---CATA-T--G-AT-----ATTTG----AA-GAAAGTT------TG-G----TCC---GT-C-AA---AT-T-TTC---CT---------CT-C------TC----AA---------TTCTCT-----TATT-TA-TT-------CACA--A----CAAAA-----A-------------------GATA----------------------T-------------A--------------AA-----------T---------------G------------------T--C--------AT-G-CC----TAA--TA----CTA--TTA-ACA-GGTAA---TT------A--TTT----ATG--TTTTGG---AC--TTT-AT-CGT--A---TTAA---CCGT-TG---TTA-ATT-AA-GGTGT-G--TCT--G--A-GTG-T-A-A----A--TC-A-TT-T-T-A-G-TTGA--G---T--AG--TT-----------TT--GAC-------ATATATACA--------------TTA------TTGC--AT-ATACT-C-AAGCA-AA-CATTAT---------TATA-AT--GG-----G-----A---GT---CAT--------AC-A-----------ACT-GGTTT-T--C-T---------TGTTTTT-ATAAAAA-GT-GA--GGCA---A-CAG--GTGA----TC-T-AG-AATAT---CAT-ACTAA--AA--GGGAAA--TAAATT-C-AAA-GAACA-----TTCTTAA-C-TTC--ATTACG------CTA------CTAAG-------GAATTT---TAT--TTGT-TG-----T-------ATC-GTCAA-T--CTCGAGA--TTTT--CCATTGCCGTTGATGAACCTGTGCTCCTTATCA-GA---T--TGATC-GTTAGGGA-AGGA-GTTT---TCA----TTCCACAT--GAACTA------ATTA-CATCTT-CAA--G-CTC-AATC--TT-GAAATCAAC---TTTC--AT-CATA--A---TCCAAAA--T--ATTC----CGGTCGAA--AA-------ACGAAA-TCTTTTCTCCTC-GTTATCGGA--A-ACTAT-CGACACAG--C--TCG-CCGA--TGTTTTGTGTA-CA-CGAT-AATGTAGCA---CCA-A-TC--AAATGAA---------TTTTTTA-AAACT-TG--G-GATCGCGCC--AG-AG-A---GAGAATA-AA-GC-G-----AAAAGGAGAGTTGTCCCACGGA-------T--AC--AT-TTTTTT--TT-TTT--ATT-CGCGAATATTAGGC--TAT-TGTGA---T-TCA-ATACAA--CTGAAAAA-ATTGG-C--T-C-G-C-A-A-----TGC-ACAATTT-A--CGTTTTAGCTCATT-TTTTG-AGA--TTCTTGTCGC--C-ACCA-T---G--------CGA-AAAATGGCG-AACGGC-AGCGTGG
gi|20 : gaatTGAAAAAAAGT-GT-A-A-C-CACTTTT-TG--TGCAAAT-G------ATG-TT---TTG-------------------A------C-GC-ATAG-AGAT-C-------GC---G-T-TAC----CT--TTTTCA-CT-T-G---AAATGACC-T--TT---TA--ACC--A--ATGTTT-T-A-CAT-ATC----AT---AAAT------A--A----TA------AGTACATGTAAGCAA-T--ACT-G--CTGA---T---TA--------AGAT-T---TTTA-T--G-ATTG---ATTC------A-GAAAGTT----C-TT-G----TCC-A-GT-C-AT---A--T-TTC---CT---------CT-C------TG----A----------TTTTCT-----TATT-AA-T--------CATA--A----GATAA-----A-------------------
gi|21 : ctcacactgggtAA-AGAT-C-------ACTTCG-T-TACTCCTCC--TTTTCA-CT-T-G---AAATGACC-T--TT---CATTA-C--A--ATG-TT-T-----T-A-C----AT---AA--------T--ATACTTA------AGT----------AA-CTAACT-G--CTGA---TGC-TA--------AGAT-T---TATA-T--G-ATTG---ATT------AA-GAAAGTT----A-TT-C----TTC----T-T-GC---AG-C-TCT---CT---------CT-CT-----TC----AT---------TTTTCTTAAG-TATT-CA-----------ACA--A----CAAAA-----ACGTGTACACTATAAAACACGAGA----------------------G-------------A--------------AA-----------T---------------G------------------TTGC--------CT-G-TC----TAA--TAC--TATA--TTC-A-A-GGTAA---TT------A--Tctaaaca
gi|22 : A-A-TC--AAATTAAA----GC--TTTTTTA-AAACT-TG--GAAATC-A-CC--AGAAT-AC--GAAAATA-AA-CTGG-----AAATGGCGA-TTGT--CAC--A-------TTAAC-----TTTTTT--TT-TAA--ATTCCGCA-ATATCAGGCGATTG-GTTGA---T-TCA-ATAC-A--CTG-AAAA-ATTGGACTTT-CGGCC-AGA---T-TGC-A-AATTCAC--TG---TAGC-CA-T-TTTTG-AGA--TTC-T-TCG---C-A--A-TG--G--------CG--AAAAT-GCGTAACGGCAAGCGTG
gi|23 : TAAAAGAAAGT-GT-A-G-C-CACTTTT-TGAGTG-AAAT-AGCCTATATG-TT---CTC-CGTCACCGTGAGCGAAACAT-CTTTT-GC-TCAA-AGAA-T-------GG---G-T-TAC----CT--TTCTCA-TT-T-G---AAATGACC-T--TT---TA--ACC--A--ATG-TT-T-A-CAT-GT-----AT---AT--------A--A----C-------AGT----------AA-C--A-T-C--CTGA---T---TA--------AGAagccc
gi|24 : taggtTGGAAAAAAGT-GT-A-G-C-CACTTTT-TG--TGCAAAT-G------ATG-TC---TTG-CAT--C----AGCAAAATAT-CTTTC-GC-ACAG-AGAT-C-------AC---G-T-TAT----CT--TTTT-A-CT-T-G---AAATGACC-T--TT---TA--ACC--A--ATG-TT-TCA-CAT-ATC----AT---GATTAATATTA--A----TA------AGT----------AA-
gi|25 : ctcacactgggt--------------AA-----------T---------------G------------------T--C--------AT-G-TC----TAA--TA---TCTA--TTC-A-A-GGTAAA--TT------A--TTTT---ATG--TTTTCA---AC--TCT-AT-CGT-TG---TTAA---CCTT-TG---TTA-ATC-AATGGTGT-G-ATCT--C--G-G-G-TAA-A----A--TC-A-TT-C-T-A-G-CTGG--G---T--gc
gi|26 : ----------TTTTCT-----TATC-AA-T--------CATC--A----CAAAA-----A-------------------GATA----------------------T-------------ACTAAACATGAGAGAAA-----------T---------------G------------------T--C--------AT-G-TC----TAA--TA---TCTA--TTC-A-T-TGTAA---TT------A--TTT----ATG--CTTTGG---AC--TCT-AT-CGT-CA---TTAA---CCTT-TG---TTA-gtagt
gi|27 : TA-T--G-ATTG---ATTC-----T--GAAAATT----C-TT-G----TCC-A-GT-C-AT---AT-T-TCC---TTT--------CT-CGA----TC----A----------TTTTCT-----TACT-AA-T--------CAAA--A----TAAAC-----AC------------------GAAA----------------------G-------------A--------------AA-----------T---------------G------------------C--C--------AT-G-TC----TAA--TA---TCTA--TTC-A-A-GGTA
gi|28 : TA------TTGC--AT-ATACT-C-A-GCA-AAACATT-T---------TA------------------------------AT--------A--------------ACT-GGTTT-G--TCT---------GTGTTTT-A--AAAA-GT-GA--G-CC---A-CAA--GTGG----TC-T-A------------------A--AATGGGAAAA--TAAAGT-C-AAG-GCACA-----TT
gi|29 : aC-GTTAAGGG-TAGA-GTTT--ATCA---TTTCCATAT--AAACTATACTATA-TA-CATCTT-CAA--G-CTCCAATCCATTAA-AATTTAC---TTTC--AT-CATA--A---T-CAA
gi|3 : G-CGTAA-----GGCGAAATAT-CTTTTAGC-ACAGGAGATTC-------GCT--G-T-TAC----TT--TTTCCA-CT-C-A---AAATGACC-A--TT---TA--ACC--AT-GTG-TT-T-A-CAT-ATCAGTAAC---AA--------A--A----TA------AGT----------AA-C--ACT-GACCTGA---T---TA--------AGACGTACATATA-C--G-A-TG---AATC------A-GAAAGTC----C-CT-GTGCTTCC-ATGT-C-TT---AT-TATTTATACT---------CT-CGTCGGATC----A----------TTTTCTAAAAGTATA-TA-A--------AAAA--A----CAAAA-----A-------------------AAGAAAGAAAAAACCAAAACCGAGAAC-------------A--------------AA-----------T---------------G------------------T--C--------ATAG-TCG---TAA--TA---TCTAAGTTC-A-A---TAA---CTGCTTAGA--TTT----ATG--TTTTCG---ACAGTCT-AT-CGTACA---TGTA---CCTTATG-----A-ATTCAATAGTGT-G-ATCT--C--A-A-GCT-A-A----AAGTC-ATTT-C-T-A-G-CTGGT-G---T--AG--TT-----------A---AACCATAGACATATA-GCAAAGACGTCTATGGTTTAACCATATTGCG-ATAATGCT-C-AAGCA-AAAC---AT---------TATA-AC--TG-----T-----ATT-AT---TATTA------AC-ATTTTCCAC---GCT-GGCTT-T--TCT---------TAATTTT-A--AAAA-GT-AAGTG-TA---A-CGA--GTGA----ACTT-AGTAATTT---CAT-ACTAA--AATGGGAAAA--TAAAGT-C-AAG-GTACA-----TT----A-CGCTG---CTAAG------C--------CTAAG-------GACATT---ATT--TTGT-TG-----T-------ATC-TTCAATT--CTCGAGA--ATTT--CCG---------------TTGTA-TCCTTGTCA-GA---C--TGATC-GTTTGGGG-TAGA-GTTT--ATCA---TTTCCATAT--GAACTT------A-TA-TATCTT-CAA--G-CTCCAATCCGTT-A-AATTTAC---TTTC--AT-CATT--A---T-CGAAA--T--ATTC-A--GT---AAA--AA-------ACGAAAGTCTTTTCTCTAC-GTTATCGAA--A-ACT-C-CGACA-GG--TG-CCG-CC-A--TGTTTT-TGAA-CA-C-AT-TACATTGCA---CCA-A-TC--AAATTAAA----GC--TTTTTTT-AAACT-TG--GAAATC-C-CC--AG-AT-AC--GAAAATA-AA-CT-G-----AAATGGCGA-TTGT--CGG-TG-------TTAAC--A--ATTTTT--TT---A--ATT-CGCG---ATTAGGC-TTGG-CGTGA--TT-TCA-ATAC-A--CTG-AAt
gi|30 : cagggctcacgctgggttgaaaaaaaggtgcaaaatgactgcgctaaatagAAAAAAGT-GT-A-GAC-CACTTTT-TG--TGCAAAT-G------ATG-TT---TTGCCGTAAT-----GCGAAA-ATCCTTTC-GC-ACAG-AGAT-C-------
gi|31 : gctcacactgggttgAAC--A--ATTTCT--TT-TAA--ATT-CGCA-AT--TAGGC-ACAG-TGTGA--TT-TTA-ATAC-A--CTA-AAAA-ATTTG-CTTT-C-GCC-A-A---T-TGT-G-AATTT-T--AG---TAag
gi|32 : CT-G-AAGCA-AAACATTAT---------TATA-AC--TA-----TAATACA-T-GTA--TAT--------AT-ATTAGACATTTGACT-GGTTT-T--TCA---------TAATTTT-A--AAAA-t
gi|34 : GAGA--TTTT--CCGTTGC-----ATGAACTTGCA-TCGTTGTCA-GA---TAATGATC-GTTAGGGG-CAGA-GTTT--ATC
gi|35 : --TG---TAGC-CATT-TT-TG-AGA--TTCTT-TCGC--C-A--A-T-------------------ATGGCA-AACGGC-AGCGTG
gi|37 : --TTCTT-TCGC--C-A--AATG--G--------CG--AAAATGGCG-AACAGC-AGCGCGagcc
gi|38 : CGAAATAC-TTTTC-GC-ACAG-AGAT-C-------GC---G-T-TAC----CT--TTTTCA-agccc
gi|4 : TA-T--G-ATTA---CTTTGAAAAAA-AAAAATT----C-TTTG----TCCCA-GT-CCAT---AT-A-TTC---CTTTGTATTCCCT-CGA----TC----AGAT-------TTTTTC-----TAT---A-A--------CATT--AAAACCAAAA-----ATAACCAC------------GAAA----------------------G-------------A--------------AA-----------TTG-------------A------------------C--C--------AT-GGTC----TAAA-TAA--TCTA--TTCCA-A-GGTAAAAATT------A--TTA----ATGA-TTTTCG---AA--TTT-AT-CGT-CATGCTTAAGCCCCCT-TGATCTTA-ATT-GATGGTGT-GAATCT--C--AGG-G-TAA-A----A--TC-ATTT-C-TAA-G-CTGGTTA---T--AG--TTTTTGTTGTTTGT---GA-------CACATA---A--------------TTA--------GCCAATAATAAC-T-AAGCA-AAA-ATTATGAGCTTTTACATG-GT--TGAAGAAT-----A-T--T---TAG--------AC-ATTCG-------ACT-GGTTT-T--TCTATTTTCTTATGTTTTT-A--AAAAGGTAAA--G-TAAATA-CGAAGGTAATAACTT-T-AG--ATTTTTCCATAACTAAATAATGGGAAAA--TTAAGTGC-AGG-G
gi|4 : att--TAAGGC-CTAAG-GACCACCTATTTTTTAG-T-TTG--GTTATGTGATATCTT------CAAAG-------GTATTTGAAAGTCANNNN-NNNNN--N-------NNN-NNNNNNN--NNNNNGA--TTTT--CCGT---CGT------------A-TCCTTGTCA-GA---T--TGATC-GTTTGGGG-TAGA-GTTT--ATCA---TTTCCATAT--GAACTA------A-TA-CATCTT-CAA--G-CTCCAATTCATT-A-AATTTAC---TTTC--AT-CATA--A---T-CAAAA--T--ATTC-G--GC---AAA--AC-------ATGAAAGTCTTTTCTCCTC-GTCATCGAA--A-ACT-C-CGAGA-GG--CG-CCA-CC-A--TATTTT-TGAA-CA-C-AT-TACATTGCA---CCA-A-TC--AAATTAAA----GC--TTTTTTT-AAACT-TG--AAAATC-C-CC--AG-AT-AC--GAAAATA-AA-CT-G-----AAATGGCAA-TTGT--CGC-GA-------TTAAC--A----CTTT--TT-TAA--ATT-CGCA---ACTAGGC-TTAG-CGTGA--TT-TCA-ATGC-A--CTG-AAAA-ATTGG-CTTC-C-GCC-A-A---TGTGT-G-AATTT-C--TG---TAGC-CATT-TTTT--AAA--TTCTT-TCAC--C-------------------------AATGGCG-AACGGC-AGCGTGgtagaagtccctattgtgtaacttgatgtatcggccctctaaggcctaaggaccacctattttttagtttggttatgtgatatcttcaaaggtatttgaaagtcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngattttccgtcgtatccttgtcagattgatcgtttggggtagagtttatcatttccatatgaactaatacatcttcaagctccaattcattaaatttactttcatcataatcaaaatattcggcaaaacatgaaagtcttttctcctcgtcatcgaaaactccgagaggcgccaccatatttttgaacacattacattgcaccaatcaaattaaagctttttttaaacttgaaaatccccagatacgaaaataaactgaaatggcaattgtcgcgattaacacttttttaaattcgcaactaggcttagcgtgatttcaatgcactgaaaaattggcttccgccaatgtgtgaatttctgtagccattttttaaattctttcaccaatggcgaacggcagcgtgagccc
gi|40 : atttatgattactttgaaaaaaaaaaattctttgtcccagtccatatattcctttgtattccctcgatcagattttttctataacattaaaaccaaaaataaccacgaaagaaattgaccatggtctaaataatctattccaaggtaaaaattattaatgattttcgaatttatcgtcatgcttaagcccccttgatcttaattgatggtgtgaatctcagggtaaaatcatttctaagctggttatagtttttgttgtttgtgacacataattagccaataataactaagcaaaaattatgagcttttacatggttgaagaatatttagacattcgactggtttttctattttcttatgtttttaaaaaggtaaagtaaatacgaaggtaataactttagatttttccataactaaataatgggaaaattaagtgcaggggtagaagtccctattgtgtaacttgatgtatcggccctc------CTAAG-------GACTTT---ATT--TTGT-TGTAagccc
gi|5 : tgctaagcTGAAAAAAAGT-GT-A-G-C-CACTTTT-TG--TGCAAAT-G------ATG-TT---TTG-CGTAAT----AGCGAAATAT-CTTTC-GC-ACAG-AGAT-C-------AC---G-T-TAT----CT--TTTTCA-CT-T-G---AAATGACC-T--TT---TA--ACG--G--ATG-TT-T-A-CAT-ATC----AT---AA--------A--A----TA------AGC----------AA-C--ACT-G--CTGA---T---TA--------AGAT-T---CATA-T--G-AT-----ATTTG----AA-GAAAGTT----C-TT-G----TCC-A-GT-C-AA---AT-T-TTC---CT---------CT-C------TC----A----------TTTTCT-----TATT-TA-T--------CATC--A----CAAAA-----A-------------------GATA----------------------T-------------A--------------AA-----------T---------------G------------------T--C--------AT-G-CC----TAA--TA---TCTA--TTT-A-A-GGTAA---TT------A--TTT----ATG--TTTTGG---AC--TTT-AT-CGT-CA---TTAA---CCGT-TG---TTA-ATT-AAAGGTGT-G-GTCT--G--A-GTG-T-A-A----A--TC-A-TT-T-T-A-G--TGA--G---T--AG--TT-----------T---GAC------CATATATACAT-------------TTA------TTGC--AT-ATACT-C-AAGCA-AAACATTAT---------TATA-AC--TG-----G-----A---GT---CAT--------AC-A-----------ACT-GGTTT-T--CTT---------TGTTTTT-A--AAAA-GT-GA--G-CA---A-CAG--GTGA----TC-T-AGTAATAT---CAT-ACTAA--AATGGGAAAA--TAAATT-C-AAG-GAACA-----TTCTTAA-C-TTC--ATTACG------CTA------CTAAG-------GAATTT---ATT--TTGT-TGT----T-------ATC-GTCAATTTCCTCGAGA--TTTT--CCATTGCCGTG-ATGAACTTGCA-TCCTTATCA-GA---T--TGATC-GTTAGGGA-CAGA-GTTT--ATCA-----TCCACAT--GAACTA------A-TA-CATCTT-CAA--G-CTCAAATC--TT-G-AATCAAC---TTTC--AT-CATA--A---T-CAAAA--T--ATTC-G--CG---AAA--AA-------ACGAAAATCTTTTCTCCTC-GTTATCGAA--A-ACT-T-CGACA--G--CG-CCG-CC-A--TGTTTTGTGTA-CA-C-AT-TACATTGCA---CCA-A-TC--AAATGAAA----G---TTTTTTA-AAACT-TG--GAAATC-C-CC--AG-AT-AC--GAAAATA-AA-CT-G-----AAATGGAGA-TTGT--CAC-GA-------TTAAC--ATTTTTTTT--TT-TTA--ATT-CGCA-ATATTAGGC-ATTG-TGTGA--AT-TCA-ATAC-A---TG-AAAA-ATTGG-C-TT-C-GCC-A-A---T-TGC-A-AATTT-C--TG---TAGC-CATT-TTTTGAAGA--TTCTT-TCGC--A-A--A-TG--G--------CGAAAAAATGGCGAAACGGC-AGCGTGG
gi|6 : TGAAAAAAAGTCGT-A-G-C-CACTTTT--G--TACAAAT-G------ATG-TT---TTG-CGTAA------GCGAAATAT-CTTTC-GC-AAAG-AGAT-T-------GC---G-T-TAC----CT--TTTCTA-CT-C-A---AAATGACC-A--TT---AT--ACC--A--ATG-TTCT-G-CAT-ATC----AT---AA--------AT-A----TA------AGT----------AA-C--ACT-G--CTTG---T---TA--------AGAT-T---TATAAT--G-ATTG---ATTC-----AG-AAAGGTC----C-TT-G----TCC-A-GTTC-AT---ATAT-TTC---CT---------CT-C------TC----AATCA------TTTTCT-----TATT-AA-T--------CATT--A----CAAAA-----A-------------------TAAA----------------------T-------------A--------------AA-----------TAAACACAAGAAAAATG------------------T--C--------AT-G-TC----TAAAAGA---TCTAGGTTC-A-A-GGTGA---TT------A--TTTT---ATG--TTTTCG---AC--TCT-AT-CGT-CT---TTAA---CCTT-TG---TTA-ATT-AATGGTGT-G-ATCT--C--A-G-G-T-A-A----AA-TC-A-TT-C-T-A-G-CTGG--G---TGTAG--TT-----------T---GAC------CA------------------------------------------------AAGCA-AAACATTAT---------TATA-AC--TA-----T-----A-T-ATAT-TAG--------AC-ATTTG-------ACT-GGTTT-T--TCT---------TAATTTT-A--AAAA-GT-AA--G-TA---A-CGA--GTGA----AC-TTAGTAATTT---CAT-ACTAA--AATGGGAAAA--TTAAGT-C-GAG-GTACA-----TTCTTAA-T-TTG--ATTACG------CTGCTAAGCCTAAG-------GGCTTT---ATT--TTGT-TGTACAGT-------ATC-TTCAATT--CTCGAGT--ATTT--CCG---------------TTGTA-TCCTTGTCA-GA---C--TGATC-GTTTGGTG-TAGA-GTTT--ATCA---TTTCCATAT--GAACTA------A-TA-CATCTT-CAA--G-CTCCAATCCGTT-A-AATTTAC---TTTC--AT-CATA--A---T-CAAAA--T--ATTC-G--GT---AAA--AA-------ACGAAAGTCTTTTCTCCAC-GTTATCGAA--A-ACT-C-TGACA-GT--CG-CCG-CC-A--TGTTTT-TAAA-CA-C-AT-TACATTGCA---CCA-A-TC--AAATTAAA----GC--TTTTTGT-AAACT-TG--GAAATC-C-CC--AG-AT-AC--GAAAATA-AA-CT-G-----AAATGGCGA-TTGT--CGC-GA-------TTAAC--A---ATTTT--TT-TAA--ATT-CGCG---ATTAGGC-TTAG-CGTGA--TT-TCA-ATAC-A--CTG-AAAA-ATTG
gi|7 : cagggctcacactgggtTGAAAAAAAGT-GT-A-G-C-CACTTTT-TG--T--AGAT-G------ATG-TAAAATTG-TGT--C----AGCAAAATAT-CTTTC-GT-ACAG-AGAC-C-------GC---G-T-TACA---TT--TTTTCAACT-T-G---AAATGAC--T--GT---TA--AAC--A--ATG-TT-TTA-CAT-ATC----AT---AA--------ATAA----TA------AGT----------AA-C--TCT-G--CAGA---T---TA--------AGAT-T---TATA-T--G-ATTG---ATT------AA-GAAAGTTAATTC-TT-G----TCC-A-GT-C-AA---AT-T-T-C---CT---------CT-C------TC----A--------------------------GA-G--------GATA--A----CAAAA-----A-------------------GATA----------------------CACTAAACACAGAGA--------------AA-----------T---------------G------------------T--T--------AT---TA----TAA--TA---TCTA--TTC-A-A-GGTAAT--TT------A--CTT----ATG--TTTTTA---CT--TCA-AT-CAC-CA---TTAA---AC-T-TG---ATA-ATT-AAAGGTATGG-ATCT--CAAA-G-A-T-AGA----A--TA-A-TC-T-A-A-G-CTGC--A---T--AGTATT-----------T---G--------CATATA-AAA--------------CT----------C--AT--TACT-C-AAGCATAAACATTAT---------TATA-AC--TG-----G-----A-G-AA---CAT--------TCGAT-----------CT-GGTTT-C--CAT---------TATTTTTAA--AAAA-GA-GA--G-CA---ATCAA--CCGA----TC-T-AGTA---T---CAT-AC-AA--AATGGGAAAA---AAAGT-C-AAGAGAACA-----TTCTTAA-C-TTG--ATTACG------CTC------CTAAG-------GAATTA---ATT--TTGTATGTAC--T-------AT-----AATT--CTCGAGA--ATTTACCCGTTG-------TGA---------CCTTGTCA-GA---T--TGATCAATTAGGGGCAAGA-GTTTTAATCA---TTT-CACAT--GATATA------A-T--CCTCTT-CAACCG-CTC-AATCC-TT-G-AATT-AC---TTTCCAAT-CATATGAAATT-CAAAA--TAAATTC-G--GGC--AAA--AA-------ACGAAAGTCTTTTCT--TC-GTTAGCGAA--A-ACT-T-CAACA-GG--CA-ACG-CC-A--TG-TTTGTGTA-CA-C-AT-TATACTGCA---CCA-A-TC--AAATTCAA----GC--TTTTTTA-AAACC-TG--GAAATC-C-CC--AG-AT-AC--GAAAATA-AA-CT-G-----AAATGCCGA-GTGT--TAC-GA-------TTAAC--CT-TTTTTT--TT-TAA--ATT-CGCG-AT-TT-GGC-AT
gi|8 : cagggctcacactgggtTAAAAAAAAGT-GTGA-G-C-CACTTTA-TG--TGCAAAT-G------ATG-TT---T-G-AGTAA------ACGAAATAT-CTTTC-AC-ACAG-A-AT-CAGTGTTTGCTTTG-T-TGT----TTGTTTTTCA-CT-T-GGCAAAATGACCATG-TTGAATA--GTC--C--ATG-TTCT-G-CATTATCG---AT---AGG-------A--A----TATTGATTAGT----------AA-C--ACT-GTGCTGA---T---TA--------AGAT-T---TATA-TTGGTATTAGGAATTA-----GACGAGAGTCA---T-TT-GGT--TCC-A-AT-C-ATGATAT-T-TGC---CC---------CTAC------TC----GGATGTCAGTTTTTTCT-----TATT-AG-TATGGATTGCATTGAA----CAAAA-----A-------------------AATAAACCAACA--------------TGAGGA--------A--------------AA-----------T---------------G------------------T--C--------AT-G-TGATTATAA--TG----CTA--TTC-A-A-G-TAA---TTT-----A--TTTTTATATGGTTTTTCGGCGAC--TCT-A--CGT-CA---T-AA---CCTT-TG---TTA-ATT-AATGGTGT-G-ATCTCAC--A-G-G-TAA-A----A--TC-A-TTCC-T-ATG-CTGGGTG---T--AG--TT-----------TAGAAAC------CATA-------------------------------GC--AT-ATGCTGA-AAGC--AAACATTAT---------TATA-ATA-TA-----T-----A-T-GT---CAT--------At
gi|9 : agggctccactgtggtggtttgggggttgTTTT-A--AAAA-GT-GA--G-CA---A-CAA--GCGA----TC-T-ATAAATAT---CAT-ACTAA--AATGGGAAAA--TAAATT-C-AAG-GAACA-----TTCTTAA-C-TTC--ATTACG------CTT------CTAAG-------GAATTT---ATT--TTGT-T------------------GTCAATT--CTCGAGA--TTTT--CCGTTGCCGTG-ATGAACTTGCA-TCCTTATCA-GA---T--TGATC-GTTAGGGA-CAGA-GTTT--ATCA---TTTCCACAT--GAACTA------A-TA-CATCTT-CAA--G-CTCAAAT-CGTT-G-AATCAAC---TTTC--AT-CATA--A---T-CAAAA--T--ATTCGG--CG----AA--AT-------ACGAAAGTCTTTTCTCCTC-GTTATCGAA--A-ACT-T-C-ACA-GG--CG-CCG-CC-A--TG--TTGTGTA-CA-C-AT-TACATTGCA---CCA-A-TC--AAATTAAA----GC--TTTTTTA-AAACT-TG--GAAATC-C-CC--AG-AT-AC--GAAAATA-AA-CT-G-----AAAT-GCGA-TTGT--CAC-GA-------TTAAC--A---TTTTT--TT-TAA--ATT-CGCA-ATATTAGGC-ATTG-TGTGA--TT-TCA-ATAC-A--CTG-AAAA-ATTGG-CTTT-C-GCC-A-A---T-CGC-A-AATTT-C--TG---TAGC-CA-T-TTTTG-AGA--TTCTT-TCGC--C----A-T---G--------CG--AAAATGGCG-AAT-GC-AGCGTGacaaacaatgattttcagtgtgtattcta
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|33 ): TCTGTACATAGAAAATATAGGCCTTATAGAGACTATTCTCAGGGCTCACGCTGGGTTGAAAAAAA
Unaligned ( gi|36 ): AATTTCCTGCTTTGTAGTTGCAGGGCTCACACTGGGTTGAAAAAAA
Unaligned ( gi|39 ): AGGGCTCACTCTGGGTTGAAAAAAAGTGTA
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 111111 33333333 11111111111111 1111111 11111 33333333333 1111111111 11 11111111 222222222 1111 111111111 33333333333333333333333 11111 1111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 111 111111 1111 1 1 222222 8888888888888888888888888888888888888888888888888888 111111111 111111111 666666666666666666666666666666666666666666 11111111 111111111 2222222222222222 444444444444444 3333333333333 2222222222 1111111 11111 1111 11111 333333333333333333333333
lowQualScore : 3 3 3 3 3 3 77 3 111111 3 555 2 44444444 2 2 2 2 55555555555555 2 2 7777 33 2 2222222 7777 444 33 66 66 2 99999 2 8888 444 55555555555 5555 777777 5555555555 2 66 2 00 555 888 00000000 3 555 2 33 2 55555 333333333 8888 2 2 2222 222 2 2 8888888 5 2 444 333333333 2 77777777777777777777777 11111 44 2222222222 444 5555 66666 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 33 99999999 2 2 7777 55 999 66 2 2 2 222 000000 77 4444 66 0 777 33 2 2 2 555 555 0 2 555 2 6 2 3 333 88 44 6 6 555 3 3 3 0 0 3 222222 55 55 4444444444444444444444444444444444444444444444444444 55 444 444444444 88 3 333333333 3 666666666666666666666666666666666666666666 22222222 3 3 3 3 444444444 1 3 44 3 77 3 999 44 44 7777 6 3 3 3 666 3 55 55 55 3 3 3 3 99999999999 88888 3 3 3 55 3 3 9999999999999999 0 777 777 4 444444444444444 55 55 0 55 8888888888888 333 3 555 44 3 0 66 2 99 555 44 888888 3 3 3 77 3 7 11 3 3 4 888 44 3 88 555 3 44 44 3333333333 44 0000000 3 33 2 2 2 1 2 66 2 2 5 33 3 8 2 1 2 2 2 33 33 2 33 5555 66 2 2 33 2 5 33 2 2 2 33 2 2 44444 2 33 2 8888888 2 7777 33 444 33 444 2 55555 66 3 33 77 3 3 3 44 3 3 4 0 4 4 4 4 777 4 777 9999 666 4 8 4 4 55 3 55 999999999999999999999999 7 5 3
lowQualScore : . . . . . . .. . ...... . ... . ........ . . . . .............. . . .... .. . ....... .... ... .. .. .. . ..... . .... ... ........... .... ...... .......... . .. . .. ... ... ........ . ... . .. . ..... ......... .... . . .... ... . . ....... . . ... ......... . ....................... ..... .. .......... ... .... ..... .......................................................................................................................... .. ........ . . .... .. ... .. . . . ... ...... .. .... .. . ... .. . . . ... ... . . ... . . . . ... .. .. . . ... . . . . . . ...... .. .. .................................................... .. ... ......... .. . ......... . .......................................... ........ . . . . ......... . . .. . .. . ... .. .. .... . . . . ... . .. .. .. . . . . ........... ..... . . . .. . . ................ . ... ... . ............... .. .. . .. ............. ... . ... .. . . .. . .. ... .. ...... . . . .. . . .. . . . ... .. . .. ... . .. .. .......... .. ....... . .. . . . . . .. . . . .. . . . . . . . .. .. . .. .... .. . . .. . . .. . . . .. . . ..... . .. . ....... . .... .. ... .. ... . ..... .. . .. .. . . . .. . . . . . . . . ... . ... .... ... . . . . .. . .. ........................ . . .
lowQualScore : 1 1 1 1 1 1 33 1 999999 1 444 9 22222222 5 5 5 4 66666666666666 5 5 8888 44 5 7777777 9999 777 77 33 33 7 11111 7 3333 777 44444444444 7777 777777 3333333333 7 88 9 77 000 999 44444444 1 444 7 77 7 99999 000000000 3333 7 7 0000 999 7 7 3333333 3 7 777 333333333 7 55555555555555555555555 66666 44 9999999999 444 3333 22222 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 44 11111111 5 5 8888 99 444 99 5 5 5 777 333333 33 6666 88 1 999 99 9 9 9 000 000 7 9 000 9 2 6 1 222 55 22 2 2 444 1 3 3 0 0 3 999999 00 55 2222222222222222222222222222222222222222222222222222 00 999 555555555 44 3 333333333 3 111111111111111111111111111111111111111111 44444444 3 3 3 3 555555555 0 3 22 3 99 3 222 66 66 1111 7 3 3 5 444 6 00 00 00 3 3 3 3 44444444444 33333 6 6 6 00 6 6 8888888888888888 6 000 000 0 444444444444444 55 00 3 00 5555555555555 999 3 888 66 1 1 66 9 66 444 22 888888 1 1 1 33 1 8 77 1 1 0 555 22 1 55 444 1 22 66 9999999999 66 8888888 3 99 9 9 9 2 9 88 9 9 7 99 4 4 9 4 9 9 9 99 77 7 77 7777 33 9 7 77 7 3 77 7 7 7 77 7 7 77777 7 77 7 7777777 5 4444 44 444 44 444 5 22222 11 6 55 33 1 1 1 22 1 3 0 8 0 0 0 0 000 0 666 7777 444 0 1 0 0 00 6 00 999999999999999999999999 3 1 6
consensus : TGAAAAAAAGT-GT-A-G-C-CACTTTT-TG--TGCAAAT-G------ATG-TT---TTG-CGTAAC----AGCGAAATAT-CTTTC-GC-ACAG-AGAT-C-------GC---G-T-TAC----CT--TTTTCA-CT-C-G---AAATGACC-T--TT---TA--ACC--A--ATG-TT-T-G-CAT-ATC----AT---AA--------A--A----TA------AGT----------AA-C--ACT-G--CTGA---T---TA--------AGAT-T---TATA-T--G-ATTG---ATTC-----AA-GAAAGTT----C-TT-G----TCC-A-GT-C-A---T---AT-T-TTC---CT---------CT-C------TC----A----------TTTTCT-----TATT-NA-T--------CATN--A----CAAAA-----A-------------------GATA----------------------T-------------A--------------AA-----------T---------------G------------------T--C--------AT-G-TC----TAA--TA---TCTA--TTC-A-A-GGTAA---TT------A--TTT----ATG--TTTTCG---AC--TCT-AT-CGT-CAT---TAA---CCTT-TG---TTA-ATT-AATGGTGT-G-A-TCT--C--AG-G-TA---AAA-TC-A-TT-CTA-G-CTGG--G---T--AG--TTT-----------GAC-CATATA-A---T--------------TATTG------C--AT-A-T---------ACT-CAAGCA-AAACATTAT---------TATA-AC--TG-----TA-------------T-GT---CAT--------ACATT-----CGA-C-TGGTTT-T-TCT---------TANTTTT-A--AAAAG-TGA--G-CAA---CGA--GT--GAT----C-T-AGTAATNT---CATA-CTA--AA--ATGGGAAA--A-TAAAGT-C-AAG-GN----A-----CA-----TTCT-TAA-C-TTG--AT-TA-CG------CT-------NCTAAGGAATTT---ATT---TTGT-TGTA--------TATC-GTCAATT--CTCGAG--ATTTT--CCGTTGCCGT--ATGAACTTGCA-TCCTTGTC-AGA---T--TGATC-GTTAGGGG-NAG-AGTTT--ATCA---TTTCCACAT--GAACTA------A-T-ACATC-TTCAA--G-CTCAAATCCGTT-G-AATTNAC---TTTC--AT-CATA--A---T-C--AAAAT--ATTC-G--CG---AAA--AA-------ACGAAAGTCTTTTCTCCTC-GTTATCGAA--A-ACT-T-CGACA-GG--CG-CCG-CC-A--TGTTTTGT-GTACA-C-AT-TACATTGC--ACC--A-ATCAAA--TTAAA----GC--TTTTTTAAAACT-TG--GAAATC-C-CC--AG-A-T-AC--GAAAATA-AA-CTG-----AAATGGCGA-TTGT--CAC-GA-------TTAA-CA---TT--TTT---TTT--AA---ATT-CGCG-ATATTAGGC-ATNG-CGTGA--TT-TCA-ATAC-A--CTG-AAAA-ATTGG-CTTT-C-GCC-A-A---T-TGC-G-AATTT-C--TG---TAGC-CATT-TTTTG-AGA--TTCTT-TCGC--C-A--A-TG--G--------CG--AAAATGGCG-AACGGC-AGCGTGG
Reference ( family-1600 ) : TGAAAAAAAGT-GT-A-G-C-CACTTTT-TG--TGCAAAT-G------ATG-TT---TTG-CGTAAC----AGCGAAATAT-CTTTC-GC-ACAG-AGAT-C-------GC---G-T-TAC----CT--TTTTCA-CT-C-G---AAATGACC-T--TT---TA--ACC--A--ATG-TT-T-G-CAT-ATC----AT---AA--------A--A----TA------AGT----------AA-C--ACT-G--CTGA---T---TA--------AGAT-T---TATA-T--G-ATTG---ATTC-----AA-GAAAGTT----C-TT-G----TCC-A-GT-C-A---T---AT-T-TTC---CT---------CT-C------TC----A----------TTTTCT-----TATT-NA-T--------CATN--A----CAAAA-----A-------------------GATA----------------------T-------------A--------------AA-----------T---------------G------------------T--C--------AT-G-TC----TAA--TA---TCTA--TTC-A-A-GGTAA---TT------A--TTT----ATG--TTTTCG---AC--TCT-AT-CGT-CAT---TAA---CCTT-TG---TTA-ATT-AATGGTGT-G-A-TCT--C--AG-G-TA---AAA-TC-A-TT-CTA-G-CTGG--G---T--AG--TTT-----------GAC-CATATACA---T--------------TATTG------C--AT-A-T---------ACT-CAAGCA-AAACATTAT---------TATA-AC--TG-----TA-------------T-GT---CAT--------ACATT-----CGA-C-TGGTTT-T-CCT---------TANTTTT-A--AAAAG-TGA--G-CAA---CGA--GT--GAT----C-T-AGTAATNT---CATA-CTA--AA--ATGGGAAA--A-TAAAGT-C-AAG-GN----A-----CA-----TTCT-TAA-C-TTG--AT-TA-CG------CT-------NCTAAGGAATTT---ATT---TTGT-TGTA--------TATC-GTCAATT--CTCGAG--ATTTT--CCGTTGCCGT--ATGAACTTGCA-TCCTTGTC-AGA---T--TGATC-GTTAGGGG-NAG-AGTTT--ATCA---TTTCCACAT--GAACTA------A-T-ACATC-TTCAA--G-CTCAAATCCGTT-G-AATTNAC---TTTC--AT-CATA--A---T-C--AAAAT--ATTC-G--CG---AAA--AA-------ACGAAAGTCTTTTCTCCTC-GTTATCGAA--A-ACT-T-CGACA-GG--CG-CCG-CC-A--TGTTTTGT-GTACA-C-AT-TACATTGC--ACC--A-ATCAAA--TTAAA----GC--TTTTTTAAAACT-TG--GAAATC-C-CC--AG-A-T-AC--GAAAATA-AA-CTG-----AAATGGCGA-TTGT--CAC-GA-------TTAA-CA---TT--TTT---TTT--AA---ATT-CGCG-ATATTAGGC-ATNG-CGTGA--TT-TCA-ATAC-A--CTG-AAAA-ATTGG-CTTT-C-GCC-A-A---T-TGC-G-AATTT-C--TG---TAGC-CATT-TTTTG-AGA--TTCTT-TCGC--C-A--A-TG--G--------CG--AAAATGGCG-AACGGC-AGCGTGG
gi|1 : T-CTTTC--C-AAAG-AGAT-TCT-----GC---A-TGTAC----CT--TTTTCA-CT-C-A---AAATGACA-T--TT----A--ACC--A---TG-TTCT-G-CAT-ATC----ATTATAATT------AT-A----TA------AGT----------AAGC--ACT-GG-CTGAGATT---TA--------AGAT-T---T-TA-T--G-ATTG---ATTC-----AG-AATAGTT----CCTT-G----TCC-A-GT-C-AGTAT---AT-T-TTC---CT---------CT-CCTCGA-TC----A----------TTTTCT-----TATT-TAAT--------CATT--A----CAAAA-----A--------------------ATAAA--------------------T-------------A--------------AA-----------T---------------GAAACACGCAGAAAAATGAT--C--------AT-G-TC----TAA--TA---TCTA--TTC-A-AAGGTAAA--TT------AATTTT----ATG--TTTTCGT--AC---CT-ATTCGT-CTT---TAA---CCTT-TA---TTA-ATT-AATGGTGT-G-A-TCTGCC--AG-G-TAATTAAA-TC-A-TTCCTATG-CTGG--GTT-T--AG--TTTA----------GAC-CA------------------------TATTG------C--ATCA-T---------GCTAGAAGCA-AAAAATTAT---------TATAGAC--TA-----TA-------------TAGTATACATGTAAATAGACATT-----TGA-CTTGGTTT-TGTCT---------CTATTTT-A--AAAAA-AGA--G-TAA---CGA--TTGAGAC----T-T-AGTAATTT---CATA-CTAAGAA--ATGGGAAAAGA-TAAAGT-C-AAG-GT----A-----CA------TCT-TAAGC-TTGGAAT-TA-CG------CTGCTAAGCCCTAAGGACTTT---ATT---TTGT-TGTATTGCCCAGTATCTATCAATT--C-CGAGAAATTTT--CCGTT---GT--AT----T-----TTCTTGTCAAGAGCCC--TGATC-GTT--GGG-TAGAAGTTTG-ATCAGATTTTCCATATTGAAACTA------A-TAACATCTTTCAAG-G-CTCCAATCCGTT-A-AATTTTCCTTTTTC--AT-CATATTA---T-CAAAAAAT--ATTC-G---G---TAA--AA-------CGGAAAGTC-TTTCTCCAC-G-TAT--GA--A-ACT-CGCGACA-TG--CGTCCG-CC-A--TGTTTTATAAAACAGC-ATGTACATTGCAGACCCAA-ATCAAA--TT--A----GCT-TTTTTTTAAACT-TG--G-AATC-CGCC--AG-A-T-AC--GAAAATATAA-CTGA----AAATGGCGA-TTGT--CAC-GA-------TTAATCA---AGAATTT---GTA--AA---ATT-CGCG---ATTAGGC--TAGTCGTGAGTTT-TCA-ATAC-ATCTTG-AAAA-ATTGG-TTTTCC-GCC-A-AATTT-TGT-G-AATTT-TGGTG---TAGC-CAGT-TTTTG-ATATTTTCTT-TCGCATCGA--A-TG--GGATTGAAAGG--AAAATGGCG-AACGAC-AGCGTG
gi|10 : TGAAAAAAAGT-GT-A-G-C-CACTTTA-TG--TGCAAAT-G------ATG-TT---TTG-AGTAA------GCGAAATAT-CTTTC-AC-ACAG-AGAT-C-------GC---G-T-TGC----CT--TTTTCA-CT-C-A---AAATGACC-A--TT---TA--ACC--A--ATG-TTCT-G-CAT-ATC----AT---AA--------ATAA----TA------AGT----------AA-C--ACT-G--CTGA---T---TA--------AGAT-T---TATA-T--G-ATTG---ATT------AA-GAAAGTC----C-TT-G----TCC-A-AT-C-A---T---ATAT-TTC---CT---------CT-C------TCGATCA----------TTTTCT-----TATT-AA-T--------CATT--A----CAAAA-----A-------------------AATAAACAAACA--------------TGAGAA--------A--------------AA-----------T---------------G------------------T--C--------AT-G-TC----TAA--TA---TCTA--TTC-A-A-GGTAA---TT------A--TTTT---ATG--TTTTCG---AC--TCT-AT-CGT-CAT---TAA---CCTT-TG---TTA-ATT-AATGGTGT-G-A-TCT--C--AG-G-TA---AAA-TC-A-TT-CTA-G-CTGGGTG---T--AG--TTT-----------GAC-CA------------------------TATTG------C--AT-A-T---------GCT-GAAGCA-AAACATTAT---------TATA-ACTATA-----TA-------------T-AT---TAG--------ATATT-----TGA-C-TGGTTT-T-TCT---------TAATTTT-A--AAAAG-TAA--G-TAA---CGA--GT--GAA----CTT-AGTAATTT---CATA-CTA--AA--ATGGGAAA--A-TAAAGT-C-AAA-AT----A-----CA-----TTCT-TAA-C-TTG--AT-TA-CG------agcc
gi|11 : cagggctcacactgggtAAAAAAAGT-GT-A-G-C-CACTTTT-TGA-GGCAAAT-G------ATG-TT---TTG-CGTAA------GCGAACTAT-CTTTC-GC-ACAG-AAATGC-------G----G-T-TGC----CT--TTTTCA-CT-T-A---AAATGACC-T--TT---TA--ACCTGA--ATG-TT-T-TTCAT-ATC----AT---AA--------AT-A----TA------AGT----------AA-C--ACT-G--CTGA---T---TA--------AGGT-T----ATA-T--G-AT-G---ATTC-----AA-TAA-GTT----C-TT-G----TCC-A-GT-C-A---T---AT-T-TTT---GC---------TT-C------TC----A-----------TTTCT-----TATTAAA-T--------CATC--A----CAAAAGATTTA-------------------GATAAC--------------------T-------------A--------------AA-------------------------------------------------CAAGAGAGAAT-G-TC------A--TG---TCTA--TTC-A-A-GGT-A---TT------A--TTT----ATG--TTTTGG---AC--TCT-AT-CGT-CAT---TAA---CCTT-TG---TTATATCAAAGGGAGT-G-A-TCT--C--AG-G-TA---AAA-TC-A-TT-CTA-GTTTGG--GTAAT--AG--TTT---------------CGCACGCA------------------TATTG------C--AT-A-T---------ACT-CAAGCA-AAACATTTT---------TATA-AC--TG-----CA-------------T-G----GGG--------ACATT-----CGA-C-TGGTTTGT-CTT---------TATTTTA-A--AAAAG-TGA--G-CAA---CAT--GT--GAT----C-T-AATA
gi|12 : cagggctcacactgggttga--AAAAG-TGA--G-CAA---CAA--GT--GAT----C-T-AGTAATAC---CATG-CTA--AA--ATGGGAAA--AATAAATT-C-AAG-GA----A-----CA-----TTCT-TAA-C-TTC--AT-TA-CG------CT-------GCTAAGGAATTT---ATT---TTGT-TGT----------------CAATT--CTCGAG--ATTTT--CCGTTGCCGTG-ATGAACTTGCA-TCCTTATC-AGA---T--TGATC-GTTAGGGA-CAG-AGTTT--ATCA---TTTCCACAT--GAACTA------A-T-ACATC-TTCAA--G-CTCAAATCCGTT-G-AATCAAC---TTTC--AT-CATA--A---T-C--AAAAT--ATTCGG--CG----AA--AA-------ACGAAAGTCTTTTCTCCTC-GTTATCGAA--A-ACT-T-CGACA-GG--CG-CCG-CC-A--TG-TTTGT-GTACA-C-AT-TACATTGC--ACC--A-ATCAAA--TTAAA----GC--TTTTTTAAAACT-TG--GAAATC-C-CC--AG-A-T-AC--GAAAATA-AA-CTG-----AAATGGCGA-TTGT--CAC-GA-------TTAA-CA---TT--TTT---TTT--AA---ATT-CGCA-ATATTAGGT-ATTG-TGTGA--Ttca
gi|13 : TC-GTCAATT--CTCGAG----TTT--GCGTTGC-----ATGAACTTGC----CTT-TC--GA---T---GATC-GTTAGGAG--AG-AGTTT--AT-A---TTC-----T--GAACTA------A-T-ACATC-TTCAA--G--TCAA-TCCGTT-G-AATCAAAG--TTTC--ATTCATA--A---T-C--AAAAT--CTTC-GGCCG---AAAGAAA-------ACGA--GTCTTTTCTC-TC-GTTA-CGAA--A--CT-T-CGACA-GG--CG-CCG-CC-A--TGT------GTACA-C-AT-TACATCGC----C--A-ATCAAA----AAA----GC--TTTTTTAAAACT-TG--GAAATC-T-CCCAAG-A---AC----ACATA-AA-CTGA----AAATGGC-A-TTGT--CAC-GA-------TTAA-CA---TT--TTT---TTT--AAAACATT-CGC--ATAT--AGC-AT-G-TGTGA--TTATCACACAC-A--CTG-AAAA-ATTGG-CTTT-C-GCC-A-A---T-TGC-A-AAATT----TG---TAGC-CATTATATTG-AGA--TTCTT-TCGC--C-A--A-TGGTG--------CA--GAAATGGCG-AAT-GC-AGCGTG
gi|14 : TTAGGGG-AAG-AGGTTG-ATCA---TTTCCACA---GTAC--------A-T-ATATC-TTCAA--GACTCAAATCCGTT-G-AATTCAC---TTT---AT-CGTA--A---T-C--AAAAT--AT-C-GT-CG---AAA--AATCATTCTACCAA--TCTTT-CTCCTTTGTTATCGAATCA-TCT-T-TTGCA-AGAGCA-CCGGCC-AGTTGATGTAC-GCACA-C-TT-TACATTGC--ACC--A-ATCAAA-----AA----GC--TTTT---AAACTCTGATGAAATC-C-C---AGTA-T-GC--GAAAATA-ATTCTC-----GAATATCGA-T-GT--CAT-GACTCGTCATTAA-CA---AC--TTCACATTT--AA---ATT-C-CG--TATTAG-C-ACAG-GCTGAAATT-TCA-ATAC-A--CTG-AAAAAATTGG-CTTT-C-GCCAA-A---T-TGTGG-AATTT-C--TG---TAGC-CA---TTTTG-AGA--TTCTT-TCGC--C-A--A-TG--G--------CG---AAATCGTG-AAC-GC-AGCGTagcc
gi|15 : tcTGAAAAAAAGT-GT-AAG-C-CACTTTTTTG--TGCAAAT-GA-----ATGTTT---TTG-CGTA------AGCGAAATAG-CTTTC-GG-ACAG-AGAT---------GT---GTT-TAC----CT--TTTTCA-CTGCAA---AAATGACCAT--TT---TA--ACC--ACCATG-TTCT-G-CAT-AT-----AT---AATAAAAT--A--A----TA------AGT----------AA-CA-ACTGG--CTGA---T---TA--------AGAT-T---TTTA-T--G-ATTG---ATTC---------AGAGTC----T-TT-GC---CCC-A-GT-C-A---T---AA-T-ATT---CT---------CT-C------TC----GATCAT-----TTTTTT-----TATA-AT-T--------CATT--A----CAAAA-----AT------------------AAAA----------------------T-------------A--------------AACCCGAGAAAACT---------------GT-----------------T--C--------AT-G-TC----TAA--TAATCTTTA--TTC-A-A-GGTAA---TT------ATTTTT----ATG--TTTTCG---AC--TCTAAT-CGT-CGT---TAC---ACTT-TG---TTA-ATC--ATGGTGT-GAA-TCT--C--AG-G-TA---AAA-TCAA-TT-CTA-G-CTa
gi|16 : ggctcaactgggtTGAAAAAAAGT-GT-A-G-C-CATTTTT-TG--TGCAAAT-G------ATG-TT---TTG-CGT--T----AGCGAAATAT-CTTTC-GCCACAG-ATAT-C-------AC---G-T-TAT----CT--TTTTCA-CT-T-----AAATTACC-T--TT---TA--ACC--A--ATG-TT-TTA-CAT-ATC----AT---GA--------A--A----TA------AGC----------AA-C--ACT-G--CTGA---T---TA--------AGAT-T---CATA-T--G-AT-----ATTT-----GA-AGAAGTT----C-TT------TCC-A-AT-C-A---A---AT-T-TTC----T---------CT-C------TC----A----------TTTTCT-----TATT-TA-T--------CATC--A----CAAAA-----A-------------------GATA----------------------T-------------A--------------AA-----------T---------------G------------------T--C--------AT-G-CC----TAA--TA---TCTA--TTT-A-A-G-TAA---TT------A--TTT----ATG--TTTTGG---AC--TCT-AT-CGT-CAT---TAA---CCGT-TG---TTA-ATG-AAAGGTGT-G-G-TCT--C--AG-G-TA---AAA-T
gi|17 : cagggctcacactgggttgaaaaaaagGCA-TCCTTGTC-AGA---T--TGATC-GTAAGGGA-TAC-AGTTT--AT-A---TTTCCACAT--GAACTG--------T-ATTTC-TTCAA--G-CTCAAATCCGTT-G-AATTTAC---TTTC--AT-CATA--A---T-C--AAATT--ATTTGG--CG----AA--AA-------ACGAAAGTCTTTTCTGCTC-GTTATCGAA--A-ACT-T-TGGCA-GG--CG-CCG-CC-A--TG-TTTGT-GTACA-C-AT-TACATTGC--ACC--A-ATCAAA--TTTAA----GCTTTTTTTTTAAACT-TG--GAAATC-C-CC--AG-A-T-AC--GAATATA-AA-CTG-----AAATGGCGA-TCGT--CAC-GA-------TTAA-CA---TT--TTT---TTTAAAA---ATT-CGCG---ATTAGGC-ATTG-CGTGA--Tt
gi|18 : GAA--A-ACT-T-CAACA-GG--CG-CCG-CC-A--TGTTT-GT-GTACA-C-AT-TACATTGC--ACC--A-ATCAGA--TTAAA----GC--TTTTTTAAAACT-TG--GAAATC-C-CC--AG-A-T-AC--GAAAATA-AA-CTG-----AAATGACAA-TTGT--CAT-GA-------TTAA---------------------AA-----T-CGCA---ATTAGG--ATTG-TGTGA--TT-TCA-ATAC-A--CTG-AAAA-ATTAG-CTTT-C-GCC-A-A---T-TGT-A-AATTT-C--TG---TAGC-CATT-TTTT--AGA--TTCTT-TCGC--C-------------------------AATGGCG-AACGGC-AGCGTG
gi|19 : tCGAA--ACACT-C-C-ACA-GGG-CG-CCG-CCCA--TGTTTT-T-AAACA-C-AT-TACAT-GC--ACC--ACATCAGAGATTAAAAGGGGC--TTTT---AAACT-TG--GAAATC-C-C---AG-A-TGACTGAAAAATA-AA-CTGCACAAAAATGACGA-TGG-----C-GA-------TTAA-CA---AT--TTT---TTT--AT---ATT-CGAG-AT--TAGGC-TTAG-CGTGA--TT-TCA-ATAC-A--CTG-AAAA-ATTagccc
gi|2 : aaaaatctgaaagtcttttctccaggggcggggggggggggtgggatgAAAAAAGT-GT-A-G-CACACTTTT-TG--TGCAAATTG------ATG-TT---TTG-CGTAACT---AGCGAA-TAT-CTTTC-GC-ACAG-AGATTC-------AC---G-T-TAT----CT--TTT-CA-CT---G---AAATGACC-TGTTT---TA--AACG-A--ATG-TT-T-T-CAT-ATC----AT---AA--------A--A----TA------AGTCA--------AG-C--ACT-G--CTGA---TGATTATTTGTGTTAGAT-T---CATA-T--G-AT-----ATTTG----AA-GAAAGTT------TG-G----TCC---GT-C-A---A---AT-T-TTC---CT---------CT-C------TC----AA---------TTCTCT-----TATT-TA-TT-------CACA--A----CAAAA-----A-------------------GATA----------------------T-------------A--------------AA-----------T---------------G------------------T--C--------AT-G-CC----TAA--TA----CTA--TTA-ACA-GGTAA---TT------A--TTT----ATG--TTTTGG---AC--TTT-AT-CGT--AT---TAA---CCGT-TG---TTA-ATT-AA-GGTGT-G---TCT--G--AGTG-TA---AA--TC-A-TT-TTA-G-TTGA--G---T--AG--TTTT----------GACATATATACA---T--------------TATTG------C--AT-A-T---------ACT-CAAGCA-AA-CATTAT---------TATA-AT--GG-----GA---------------GT---CAT--------ACA---------A-C-TGGTTT-T-C-T---------TGTTTTT-ATAAAAAG-TGA--GGCAA---CAG--GT--GAT----C-T-AG-AATAT---CATA-CTA--AA--A--GGGAA--A-TAAATT-C-AAA-GA----A-----CA-----TTCT-TAA-C-TTC--AT-TA-CG------CT-------ACTAAGGAATTT---TAT---TTGT-TGTA--------T--C-GTCAAT---CTCGAG--ATTTT--CCATTGCCGTTGATGAACCTGTGCTCCTTATC-AGA---T--TGATC-GTTAGGGA-AGG-AGTTT---TCA----TTCCACAT--GAACTA------ATT-ACATC-TTCAA--G-CTC-AATC--TT-GAAATCAAC---TTTC--AT-CATA--A---TCC--AAAAT--ATTC----CGGTCGAA--AA-------ACGAAA-TCTTTTCTCCTC-GTTATCGGA--A-ACTAT-CGACACAG--C--TCG-CCGA--TGTTTTGT-GTACA-CGAT-AATGTAGC--ACC--A-ATCAAA--TGAA---------TTTTTTAAAACT-TG--G-GATCGCGCC--AG-A-G-A---GAGAATA-AA-GCG-----AAAAGGAGAGTTGTCCCACGGA-------T--A-CATT-TT--TTT---TTT--TT---ATT-CGCGAATATTAGGC--TAT-TGTGA---T-TCA-ATACAA--CTGAAAAA-ATTGG-C--T-C-G-C-A-A-----TGC-ACAATTT-A--CGTTTTAGCTCATT-TTTTG-AGA--TTCTTGTCGC--C-ACCA-T---G--------CGA-AAAATGGCG-AACGGC-AGCGTGG
gi|20 : gaatTGAAAAAAAGT-GT-A-A-C-CACTTTT-TG--TGCAAAT-G------ATG-TT---TTG-------------------A------C-GC-ATAG-AGAT-C-------GC---G-T-TAC----CT--TTTTCA-CT-T-G---AAATGACC-T--TT---TA--ACC--A--ATGTTT-T-A-CAT-ATC----AT---AAAT------A--A----TA------AGTACATGTAAGCAA-T--ACT-G--CTGA---T---TA--------AGAT-T---TTTA-T--G-ATTG---ATTC------A-GAAAGTT----C-TT-G----TCC-A-GT-C-A---T---A--T-TTC---CT---------CT-C------TG----A----------TTTTCT-----TATT-AA-T--------CATA--A----GATAA-----A-------------------
gi|21 : ctcacactgggtAA-AGAT-C-------ACTTCG-T-TACTCCTCC--TTTTCA-CT-T-G---AAATGACC-T--TT---CATTA-C--A--ATG-TT-T-----T-A-C----AT---AA--------T--ATACTTA------AGT----------AA-CTAACT-G--CTGA---TGC-TA--------AGAT-T---TATA-T--G-ATTG---ATT------AA-GAAAGTT----A-TT-C----TTC----T-T-G---C---AG-C-TCT---CT---------CT-CT-----TC----AT---------TTTTCTTAAG-TATT-CA-----------ACA--A----CAAAA-----ACGTGTACACTATAAAACACGAGA----------------------G-------------A--------------AA-----------T---------------G------------------TTGC--------CT-G-TC----TAA--TAC--TATA--TTC-A-A-GGTAA---TT------A--Tctaaaca
gi|22 : --A-ATCAAA--TTAAA----GC--TTTTTTAAAACT-TG--GAAATC-A-CC--AG-AAT-AC--GAAAATA-AA-CTGG----AAATGGCGA-TTGT--CAC--A-------TTAA-CT---TT--TTT---TTT--AA---ATTCCGCA-ATATCAGGCGATTG-GTTGA---T-TCA-ATAC-A--CTG-AAAA-ATTGGACTTT-CGGCC-AGA---T-TGC-A-AATTCAC--TG---TAGC-CA-T-TTTTG-AGA--TTC-T-TCG---C-A--A-TG--G--------CG--AAAAT-GCGTAACGGCAAGCGTG
gi|23 : TAAAAGAAAGT-GT-A-G-C-CACTTTT-TGAGTG-AAAT-AGCCTATATG-TT---CTC-CGTCACCGTGAGCGAAACAT-CTTTT-GC-TCAA-AGAA-T-------GG---G-T-TAC----CT--TTCTCA-TT-T-G---AAATGACC-T--TT---TA--ACC--A--ATG-TT-T-A-CAT-GT-----AT---AT--------A--A----C-------AGT----------AA-C--A-T-C--CTGA---T---TA--------AGAagccc
gi|24 : taggtTGGAAAAAAGT-GT-A-G-C-CACTTTT-TG--TGCAAAT-G------ATG-TC---TTG-CAT--C----AGCAAAATAT-CTTTC-GC-ACAG-AGAT-C-------AC---G-T-TAT----CT--TTTT-A-CT-T-G---AAATGACC-T--TT---TA--ACC--A--ATG-TT-TCA-CAT-ATC----AT---GATTAATATTA--A----TA------AGT----------AA-
gi|25 : ctcacactgggt--------------AA-----------T---------------G------------------T--C--------AT-G-TC----TAA--TA---TCTA--TTC-A-A-GGTAAA--TT------A--TTTT---ATG--TTTTCA---AC--TCT-AT-CGT-TGT---TAA---CCTT-TG---TTA-ATC-AATGGTGT-G-A-TCT--C--GG-G-TA---AAA-TC-A-TT-CTA-G-CTGG--G---T--gc
gi|26 : ----------TTTTCT-----TATC-AA-T--------CATC--A----CAAAA-----A-------------------GATA----------------------T-------------ACTAAACATGAGAGAAA-----------T---------------G------------------T--C--------AT-G-TC----TAA--TA---TCTA--TTC-A-T-TGTAA---TT------A--TTT----ATG--CTTTGG---AC--TCT-AT-CGT-CAT---TAA---CCTT-TG---TTA-gtagt
gi|27 : TA-T--G-ATTG---ATTC-----T--GAAAATT----C-TT-G----TCC-A-GT-C-A---T---AT-T-TCC---TTT--------CT-CGA----TC----A----------TTTTCT-----TACT-AA-T--------CAAA--A----TAAAC-----AC------------------GAAA----------------------G-------------A--------------AA-----------T---------------G------------------C--C--------AT-G-TC----TAA--TA---TCTA--TTC-A-A-GGTA
gi|28 : --------------TATTG------C--AT-A-T---------ACT-CA-GCA-AAACATT-T---------TA-------------------------------------AT--------A-----------A-C-TGGTTT-G-TCT---------GTGTTTT-A--AAAAG-TGA--G-CCA---CAA--GT--GGT----C-T-A--------------------AA--ATGGGAAA--A-TAAAGT-C-AAG-GC----A-----CA-----TT
gi|29 : aC-GTTAAGGG-TAG-AGTTT--ATCA---TTTCCATAT--AAACTATACTATA-T-ACATC-TTCAA--G-CTCCAATCCATTAA-AATTTAC---TTTC--AT-CATA--A---T-C--AA
gi|3 : G-CGTAA-----GGCGAAATAT-CTTTTAGC-ACAGGAGATTC-------GCT--G-T-TAC----TT--TTTCCA-CT-C-A---AAATGACC-A--TT---TA--ACC--AT-GTG-TT-T-A-CAT-ATCAGTAAC---AA--------A--A----TA------AGT----------AA-C--ACT-GACCTGA---T---TA--------AGACGTACATATA-C--G-A-TG---AATC------A-GAAAGTC----C-CT-GTGCTTCC-ATGT-C-T---T---AT-TATTTATACT---------CT-CGTCGGATC----A----------TTTTCTAAAAGTATA-TA-A--------AAAA--A----CAAAA-----A-------------------AAGAAAGAAAAAACCAAAACCGAGAAC-------------A--------------AA-----------T---------------G------------------T--C--------ATAG-TCG---TAA--TA---TCTAAGTTC-A-A---TAA---CTGCTTAGA--TTT----ATG--TTTTCG---ACAGTCT-AT-CGTACAT---GTA---CCTTATG-----A-ATTCAATAGTGT-G-A-TCT--C--AA-GCTA---AAAGTC-ATTT-CTA-G-CTGGT-G---T--AG--TTA-----------AAC-CATAGACA---TATAGCAAAGACGTCTATGGTTTAACC--AT-A-TTGCGATAATGCT-CAAGCA-AAAC---AT---------TATA-AC--TG-----TAT------------T-AT---TATTA------ACATTTTCCACG--C-TGGCTT-T-TCT---------TAATTTT-A--AAAAG-TAAGTG-TAA---CGA--GT--GAA----CTT-AGTAATTT---CATA-CTA--AA--ATGGGAAA--A-TAAAGT-C-AAG-GT----A-----CA-----TT-----A-CGCTG---C-TA-AG------C---------CTAAGGACATT---ATT---TTGT-TG----------TATC-TTCAATT--CTCGAG--AATTT--CCG---------------TTGTA-TCCTTGTC-AGA---C--TGATC-GTTTGGGG-TAG-AGTTT--ATCA---TTTCCATAT--GAACTT------A-T-ATATC-TTCAA--G-CTCCAATCCGTT-A-AATTTAC---TTTC--AT-CATT--A---T-C--GAAAT--ATTC-A--GT---AAA--AA-------ACGAAAGTCTTTTCTCTAC-GTTATCGAA--A-ACT-C-CGACA-GG--TG-CCG-CC-A--TGTTTT-T-GAACA-C-AT-TACATTGC--ACC--A-ATCAAA--TTAAA----GC--TTTTTTTAAACT-TG--GAAATC-C-CC--AG-A-T-AC--GAAAATA-AA-CTG-----AAATGGCGA-TTGT--CGG-TG-------TTAA-CA---AT--TTT---TTT---A---ATT-CGCG---ATTAGGC-TTGG-CGTGA--TT-TCA-ATAC-A--CTG-AAt
gi|30 : cagggctcacgctgggttgaaaaaaaggtgcaaaatgactgcgctaaatagAAAAAAGT-GT-A-GAC-CACTTTT-TG--TGCAAAT-G------ATG-TT---TTGCCGTAAT-----GCGAAA-ATCCTTTC-GC-ACAG-AGAT-C-------
gi|31 : gctcacactgggttgAA-CAA--TT--TCT---TTT--AA---ATT-CGCA-AT--TAGGC-ACAG-TGTGA--TT-TTA-ATAC-A--CTA-AAAA-ATTTG-CTTT-C-GCC-A-A---T-TGT-G-AATTT-T--AG---TAag
gi|32 : CT-GAAGCA-AAACATTAT---------TATA-AC--TA-----TAATACATGTATATAT-AT---TAG--------ACATT-----TGA-C-TGGTTT-T-TCA---------TAATTTT-A--AAAAt
gi|34 : GAG--ATTTT--CCGTTGC-----ATGAACTTGCA-TCGTTGTC-AGA---TAATGATC-GTTAGGGG-CAG-AGTTT--ATC
gi|35 : --TG---TAGC-CATT-TT-TG-AGA--TTCTT-TCGC--C-A--A-T-------------------ATGGCA-AACGGC-AGCGTG
gi|37 : --TTCTT-TCGC--C-A--AATG--G--------CG--AAAATGGCG-AACAGC-AGCGCGagcc
gi|38 : CGAAATAC-TTTTC-GC-ACAG-AGAT-C-------GC---G-T-TAC----CT--TTTTCA-agccc
gi|4 : TA-T--G-ATTA---CTTTGAAAAAA-AAAAATT----C-TTTG----TCCCA-GT-CCA---T---AT-A-TTC---CTTTGTATTCCCT-CGA----TC----AGAT-------TTTTTC-----TAT---A-A--------CATT--AAAACCAAAA-----ATAACCAC------------GAAA----------------------G-------------A--------------AA-----------TTG-------------A------------------C--C--------AT-GGTC----TAAA-TAA--TCTA--TTCCA-A-GGTAAAAATT------A--TTA----ATGA-TTTTCG---AA--TTT-AT-CGT-CATGCTTAAGCCCCCT-TGATCTTA-ATT-GATGGTGT-G-AATCT--C--AG-GGTA---AAA-TC-A-TTTCTAAG-CTGGTTA---T--AG--TTTTTGTTGTTTGTGAC--ACATA-A---T--------------TA--G------CCAAT-AAT---------AAC-TAAGCA-AAA-ATTATGAGCTTTTACATG-GT--TGAAGAATA-------------T--T---TAG--------ACATT-----CGA-C-TGGTTT-T-TCTATTTTCTTATGTTTTT-A--AAAAGGTAAA-G-TAAATACGAAGGT--AATAACTT-T-AG--ATTTTTCCATAACTA--AATAATGGGAAA--A-TTAAGTGC-AGG-GGTAGAAGTCCCTA-----TTGTGTAA-C-TTG--ATGTATCGGC----CC-------TCTAAGG
gi|4 : att-TAAGGC-CTAAG-GA----C-----CACCTATTTTT-TAG-T-TTG--GT-TA-TGTGATATCT-------TCAAAGGTATTTGAAAGTCANNNNN-NNNN--------NNNN-NNNNNNN--NNNNNG--ATTTT--CCGT---CGT------------A-TCCTTGTC-AGA---T--TGATC-GTTTGGGG-TAG-AGTTT--ATCA---TTTCCATAT--GAACTA------A-T-ACATC-TTCAA--G-CTCCAATTCATT-A-AATTTAC---TTTC--AT-CATA--A---T-C--AAAAT--ATTC-G--GC---AAA--AC-------ATGAAAGTCTTTTCTCCTC-GTCATCGAA--A-ACT-C-CGAGA-GG--CG-CCA-CC-A--TATTTT-T-GAACA-C-AT-TACATTGC--ACC--A-ATCAAA--TTAAA----GC--TTTTTTTAAACT-TG--AAAATC-C-CC--AG-A-T-AC--GAAAATA-AA-CTG-----AAATGGCAA-TTGT--CGC-GA-------TTAA-CA----C--TTT---TTT--AA---ATT-CGCA---ACTAGGC-TTAG-CGTGA--TT-TCA-ATGC-A--CTG-AAAA-ATTGG-CTTC-C-GCC-A-A---TGTGT-G-AATTT-C--TG---TAGC-CATT-TTTT--AAA--TTCTT-TCAC--C-------------------------AATGGCG-AACGGC-AGCGTGcctaaggaccacctattttttagtttggttatgtgatatcttcaaaggtatttgaaagtcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngattttccgtcgtatccttgtcagattgatcgtttggggtagagtttatcatttccatatgaactaatacatcttcaagctccaattcattaaatttactttcatcataatcaaaatattcggcaaaacatgaaagtcttttctcctcgtcatcgaaaactccgagaggcgccaccatatttttgaacacattacattgcaccaatcaaattaaagctttttttaaacttgaaaatccccagatacgaaaataaactgaaatggcaattgtcgcgattaacacttttttaaattcgcaactaggcttagcgtgatttcaatgcactgaaaaattggcttccgccaatgtgtgaatttctgtagccattttttaaattctttcaccaatggcgaacggcagcgtgagccc
gi|40 : atttatgattactttgaaaaaaaaaaattctttgtcccagtccatatattcctttgtattccctcgatcagattttttctataacattaaaaccaaaaataaccacgaaagaaattgaccatggtctaaataatctattccaaggtaaaaattattaatgattttcgaatttatcgtcatgcttaagcccccttgatcttaattgatggtgtgaatctcagggtaaaatcatttctaagctggttatagtttttgttgtttgtgacacataattagccaataataactaagcaaaaattatgagcttttacatggttgaagaatatttagacattcgactggtttttctattttcttatgtttttaaaaaggtaaagtaaatacgaaggtaataactttagatttttccataactaaataatgggaaaattaagtgcaggggtagaagtccctattgtgtaacttgatgtatcggccctcCTAAGGACTTT---ATT---TTGT-TGTA--------agccc
gi|5 : tgctaagcTGAAAAAAAGT-GT-A-G-C-CACTTTT-TG--TGCAAAT-G------ATG-TT---TTG-CGTAAT----AGCGAAATAT-CTTTC-GC-ACAG-AGAT-C-------AC---G-T-TAT----CT--TTTTCA-CT-T-G---AAATGACC-T--TT---TA--ACG--G--ATG-TT-T-A-CAT-ATC----AT---AA--------A--A----TA------AGC----------AA-C--ACT-G--CTGA---T---TA--------AGAT-T---CATA-T--G-AT-----ATTTG----AA-GAAAGTT----C-TT-G----TCC-A-GT-C-A---A---AT-T-TTC---CT---------CT-C------TC----A----------TTTTCT-----TATT-TA-T--------CATC--A----CAAAA-----A-------------------GATA----------------------T-------------A--------------AA-----------T---------------G------------------T--C--------AT-G-CC----TAA--TA---TCTA--TTT-A-A-GGTAA---TT------A--TTT----ATG--TTTTGG---AC--TTT-AT-CGT-CAT---TAA---CCGT-TG---TTA-ATT-AAAGGTGT-G-G-TCT--G--AGTG-T----AAA-TC-A-TT-TTA-G--TGA--G---T--AG--TTT-----------GAC-CATATATACATT--------------TATTG------C--AT-A-T---------ACT-CAAGCA-AAACATTAT---------TATA-AC--TG-----GA---------------GT---CAT--------ACA---------A-C-TGGTTT-T-CTT---------TGTTTTT-A--AAAAG-TGA--G-CAA---CAG--GT--GAT----C-T-AGTAATAT---CATA-CTA--AA--ATGGGAAA--A-TAAATT-C-AAG-GA----A-----CA-----TTCT-TAA-C-TTC--AT-TA-CG------CT-------ACTAAGGAATTT---ATT---TTGT-TGT---------TATC-GTCAATTTCCTCGAG--ATTTT--CCATTGCCGTG-ATGAACTTGCA-TCCTTATC-AGA---T--TGATC-GTTAGGGA-CAG-AGTTT--ATCA-----TCCACAT--GAACTA------A-T-ACATC-TTCAA--G-CTCAAATC--TT-G-AATCAAC---TTTC--AT-CATA--A---T-C--AAAAT--ATTC-G--CG---AAA--AA-------ACGAAAATCTTTTCTCCTC-GTTATCGAA--A-ACT-T-CGACA--G--CG-CCG-CC-A--TGTTTTGT-GTACA-C-AT-TACATTGC--ACC--A-ATCAAA--TGAAA----G---TTTTTTAAAACT-TG--GAAATC-C-CC--AG-A-T-AC--GAAAATA-AA-CTG-----AAATGGAGA-TTGT--CAC-GA-------TTAA-CATTTTT--TTT---TTT--TA---ATT-CGCA-ATATTAGGC-ATTG-TGTGA--AT-TCA-ATAC-A---TG-AAAA-ATTGG-C-TT-C-GCC-A-A---T-TGC-A-AATTT-C--TG---TAGC-CATT-TTTTGAAGA--TTCTT-TCGC--A-A--A-TG--G--------CGAAAAAATGGCGAAACGGC-AGCGTGG
gi|6 : TGAAAAAAAGTCGT-A-G-C-CACTTTT--G--TACAAAT-G------ATG-TT---TTG-CGTAA------GCGAAATAT-CTTTC-GC-AAAG-AGAT-T-------GC---G-T-TAC----CT--TTTCTA-CT-C-A---AAATGACC-A--TT---AT--ACC--A--ATG-TTCT-G-CAT-ATC----AT---AA--------AT-A----TA------AGT----------AA-C--ACT-G--CTTG---T---TA--------AGAT-T---TATAAT--G-ATTG---ATTC-----AG-AAAGGTC----C-TT-G----TCC-A-GTTC-A---T---ATAT-TTC---CT---------CT-C------TC----AATCA------TTTTCT-----TATT-AA-T--------CATT--A----CAAAA-----A-------------------TAAA----------------------T-------------A--------------AA-----------TAAACACAAGAAAAATG------------------T--C--------AT-G-TC----TAAAAGA---TCTAGGTTC-A-A-GGTGA---TT------A--TTTT---ATG--TTTTCG---AC--TCT-AT-CGT-CTT---TAA---CCTT-TG---TTA-ATT-AATGGTGT-G-A-TCT--C--AG-G-TA---AAA-TC-A-TT-CTA-G-CTGG--G---TGTAG--TTT-----------GAC-CA----------------------------------------------------------AAGCA-AAACATTAT---------TATA-AC--TA-----TA-------------T-ATAT-TAG--------ACATT-----TGA-C-TGGTTT-T-TCT---------TAATTTT-A--AAAAG-TAA--G-TAA---CGA--GT--GAA----C-TTAGTAATTT---CATA-CTA--AA--ATGGGAAA--A-TTAAGT-C-GAG-GT----A-----CA-----TTCT-TAA-T-TTG--AT-TA-CG------CTGCTAAG-CCTAAGGGCTTT---ATT---TTGT-TGTACAG-----TATC-TTCAATT--CTCGAG--TATTT--CCG---------------TTGTA-TCCTTGTC-AGA---C--TGATC-GTTTGGTG-TAG-AGTTT--ATCA---TTTCCATAT--GAACTA------A-T-ACATC-TTCAA--G-CTCCAATCCGTT-A-AATTTAC---TTTC--AT-CATA--A---T-C--AAAAT--ATTC-G--GT---AAA--AA-------ACGAAAGTCTTTTCTCCAC-GTTATCGAA--A-ACT-C-TGACA-GT--CG-CCG-CC-A--TGTTTT-T-AAACA-C-AT-TACATTGC--ACC--A-ATCAAA--TTAAA----GC--TTTTTGTAAACT-TG--GAAATC-C-CC--AG-A-T-AC--GAAAATA-AA-CTG-----AAATGGCGA-TTGT--CGC-GA-------TTAA-CA---AT--TTT---TTT--AA---ATT-CGCG---ATTAGGC-TTAG-CGTGA--TT-TCA-ATAC-A--CTG-AAAA-ATTG
gi|7 : cagggctcacactgggtTGAAAAAAAGT-GT-A-G-C-CACTTTT-TG--T--AGAT-G------ATG-TAAAATTG-TGT--C----AGCAAAATAT-CTTTC-GT-ACAG-AGAC-C-------GC---G-T-TACA---TT--TTTTCAACT-T-G---AAATGAC--T--GT---TA--AAC--A--ATG-TT-TTA-CAT-ATC----AT---AA--------ATAA----TA------AGT----------AA-C--TCT-G--CAGA---T---TA--------AGAT-T---TATA-T--G-ATTG---ATT------AA-GAAAGTTAATTC-TT-G----TCC-A-GT-C-A---A---AT-T-T-C---CT---------CT-C------TC----A--------------------------GA-G--------GATA--A----CAAAA-----A-------------------GATA----------------------CACTAAACACAGAGA--------------AA-----------T---------------G------------------T--T--------AT---TA----TAA--TA---TCTA--TTC-A-A-GGTAAT--TT------A--CTT----ATG--TTTTTA---CT--TCA-AT-CAC-CAT---TAA---AC-T-TG---ATA-ATT-AAAGGTATGG-A-TCT--CAAAG-A-TA---GAA-TA-A-TC-TAA-G-CTGC--A---T--AGTATTT-----------G---CATATAAA-------------------ACT-------C--AT---T---------ACT-CAAGCATAAACATTAT---------TATA-AC--TG-----GA-------------G-A---------------ACATT-----CGATC-TGGTTT-C-CAT---------TATTTTTAA--AAAAG-AGA--G-CAAT--CAA--CC--GAT----C-T-AGTA---T---CATA-C-A--AA--ATGGGAAA--A--AAAGT-C-AAGAGA----A-----CA-----TTCT-TAA-C-TTG--AT-TA-CG------CT-------CCTAAGGAATTA---ATT---TTGTATGTAC-------TAT-----AATT--CTCGAG--AATTTACCCGTTG-------TGA---------CCTTGTC-AGA---T--TGATCAATTAGGGGCAAG-AGTTTTAATCA---TTT-CACAT--GATATA------A-T--CCTC-TTCAACCG-CTC-AATCC-TT-G-AATT-AC---TTTCCAAT-CATATGAAATT-C--AAAATAAATTC-G--GGC--AAA--AA-------ACGAAAGTCTTTTCT--TC-GTTAGCGAA--A-ACT-T-CAACA-GG--CA-ACG-CC-A--TG-TTTGT-GTACA-C-AT-TATACTGC--ACC--A-ATCAAA--TTCAA----GC--TTTTTTAAAACC-TG--GAAATC-C-CC--AG-A-T-AC--GAAAATA-AA-CTG-----AAATGCCGA-GTGT--TAC-GA-------TTAA-CCTT-TT--TTT---TTT--AA---ATT-CGCG-AT-TT-GGC-AT
gi|8 : cagggctcacactgggtTAAAAAAAAGT-GTGA-G-C-CACTTTA-TG--TGCAAAT-G------ATG-TT---T-G-AGTAA------ACGAAATAT-CTTTC-AC-ACAG-A-AT-CAGTGTTTGCTTTG-T-TGT----TTGTTTTTCA-CT-T-GGCAAAATGACCATG-TTGAATA--GTC--C--ATG-TTCT-G-CATTATCG---AT---AGG-------A--A----TATTGATTAGT----------AA-C--ACT-GTGCTGA---T---TA--------AGAT-T---TATA-TTGGTATTAGGAATTA-----GACGAGAGTCA---T-TT-GGT--TCC-A-AT-C-A---TGATAT-T-TGC---CC---------CTAC------TC----GGATGTCAGTTTTTTCT-----TATT-AG-TATGGATTGCATTGAA----CAAAA-----A-------------------AATAAACCAACA--------------TGAGGA--------A--------------AA-----------T---------------G------------------T--C--------AT-G-TGATTATAA--TG----CTA--TTC-A-A-G-TAA---TTT-----A--TTTTTATATGGTTTTTCGGCGAC--TCT-A--CGT-CAT----AA---CCTT-TG---TTA-ATT-AATGGTGT-G-A-TCTCAC--AG-G-TA---AAA-TC-A-TTCCTATG-CTGGGTG---T--AG--TTTAGA--------AAC-CATA--------------------------G------C--AT-A-T---------GCTGAAAGC--AAACATTAT---------TATA-ATA-TA-----TA-------------T-GT---CATA-------ACAAA-----CAA---TGATTT-T-Ct
gi|9 : agggctccactgtggtggtttgggggttgTTTT-A--AAAAG-TGA--G-CAA---CAA--GC--GAT----C-T-ATAAATAT---CATA-CTA--AA--ATGGGAAA--A-TAAATT-C-AAG-GA----A-----CA-----TTCT-TAA-C-TTC--AT-TA-CG------CT-------TCTAAGGAATTT---ATT---TTGT-TGT----------------CAATT--CTCGAG--ATTTT--CCGTTGCCGTG-ATGAACTTGCA-TCCTTATC-AGA---T--TGATC-GTTAGGGA-CAG-AGTTT--ATCA---TTTCCACAT--GAACTA------A-T-ACATC-TTCAA--G-CTCAAATC-GTT-G-AATCAAC---TTTC--AT-CATA--A---T-C--AAAAT--ATTC-GG-CG---AAA--TA--------CGAAAGTCTTTTCTCCTC-GTTATCGAA--A-ACT-T-C-ACA-GG--CG-CCG-CC-A--TGTT--GT-GTACA-C-AT-TACATTGC--ACC--A-ATCAAA--TTAAA----GC--TTTTTTAAAACT-TG--GAAATC-C-CC--AG-A-T-AC--GAAAATA-AA-CTG-----AAATG-CGA-TTGT--CAC-GA-------TTAA-CA---TT--TTT---TTT--AA---ATT-CGCA-ATATTAGGC-ATTG-TGTGA--TT-TCA-ATAC-A--CTG-AAAA-ATTGG-CTTT-C-GCC-A-A---T-CGC-A-AATTT-C--TG---TAGC-CA-T-TTTTG-AGA--TTCTT-TCGC--C----A-T---G--------CG--AAAATGGCG-AAT-GC-AGCGTGagtgtgtattcta
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|33 ): TCTGTACATAGAAAATATAGGCCTTATAGAGACTATTCTCAGGGCTCACGCTGGGTTGAAAAAAA
Unaligned ( gi|36 ): AATTTCCTGCTTTGTAGTTGCAGGGCTCACACTGGGTTGAAAAAAA
Unaligned ( gi|39 ): AGGGCTCACTCTGGGTTGAAAAAAAGTGTA
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 111111 33333333 11111111111111 1111111 11111 33333333333 1111111111 11 11111111 222222222 1111 111111111 33333333333333333333333 11111 1111111111 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 111 111111 1111 222222 5555555555555555555555555555555555 111111111 555555555555555555555555555555555555555555 111111 111111111 11111111 2222222222222222 4444444444444444 3333333333333 1111 2222222222 1111111 11111 1111 11111 333333333333333333333333
lowQualScore : 3 3 3 3 3 3 77 3 111111 3 555 2 44444444 2 2 2 2 55555555555555 2 2 7777 33 2 2222222 7777 444 33 66 66 2 99999 2 8888 444 55555555555 5555 777777 5555555555 2 66 2 00 555 888 00000000 3 555 2 33 2 55555 333333333 8888 2 2 2222 222 2 2 8888888 5 2 444 333333333 2 77777777777777777777777 11111 44 2222222222 444 5555 66666 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 33 99999999 2 2 7777 55 999 66 2 2 2 000 333333 77 4444 66 0 777 33 2 2 2 555 555 2 555 2 6 2 9 88 77 6 3 555 3 3 6 6 3 6 3 222222 44 3 55 9999999999999999999999999999999999 77 777 2 88 3 3 3 666666666 3 999999999999999999999999999999999999999999 2 111111 3 3 3 3 444444444 1 44 6 3 3 44 555 3 44 44 7777 3 6 3 3 666 3 55 55 55 3 3 3 3 3 1 22222222 88888 3 3 3 55 3 3 9999999999999999 0 777 777 4 0000000000000000 55 55 0 55 8888888888888 333 3 555 44 2 0 3 2 2 99 555 44 888888 3 3 3 77 3 4 11 3 3 4 888 44 3 0000 6 44 44 3333333333 44 0000000 3 33 2 2 2 1 2 66 2 2 5 33 99 2 1 2 2 2 33 33 2 33 5555 66 2 2 33 2 5 33 2 2 2 33 2 2 44444 2 33 2 8888888 2 7777 33 444 33 444 2 55555 66 3 33 77 3 3 3 44 3 3 4 0 4 4 4 4 777 4 777 9999 666 4 8 4 4 55 3 55 999999999999999999999999 7 5 3
lowQualScore : . . . . . . .. . ...... . ... . ........ . . . . .............. . . .... .. . ....... .... ... .. .. .. . ..... . .... ... ........... .... ...... .......... . .. . .. ... ... ........ . ... . .. . ..... ......... .... . . .... ... . . ....... . . ... ......... . ....................... ..... .. .......... ... .... ..... .................................................................................................................. .. ........ . . .... .. ... .. . . . ... ...... .. .... .. . ... .. . . . ... ... . ... . . . . .. .. . . ... . . . . . . . ...... .. . .. .................................. .. ... . .. . . . ......... . .......................................... . ...... . . . . ......... . .. . . . .. ... . .. .. .... . . . . ... . .. .. .. . . . . . . ........ ..... . . . .. . . ................ . ... ... . ................ .. .. . .. ............. ... . ... .. . . . . . .. ... .. ...... . . . .. . . .. . . . ... .. . .... . .. .. .......... .. ....... . .. . . . . . .. . . . .. .. . . . . . .. .. . .. .... .. . . .. . . .. . . . .. . . ..... . .. . ....... . .... .. ... .. ... . ..... .. . .. .. . . . .. . . . . . . . . ... . ... .... ... . . . . .. . .. ........................ . . .
lowQualScore : 1 1 1 1 1 1 33 1 999999 1 444 9 22222222 5 5 5 4 66666666666666 5 5 8888 44 5 7777777 9999 777 77 33 33 7 11111 7 3333 777 44444444444 7777 777777 3333333333 7 88 9 77 000 999 44444444 1 444 7 77 7 99999 000000000 3333 7 7 0000 999 7 7 3333333 3 7 777 333333333 7 55555555555555555555555 66666 44 9999999999 444 3333 22222 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 44 11111111 5 5 8888 99 444 99 5 5 5 000 000000 33 6666 88 1 999 99 9 9 9 000 000 9 000 9 2 6 2 55 33 2 1 444 1 3 7 7 3 7 3 000000 66 6 00 0000000000000000000000000000000000 99 111 1 99 1 1 1 555555555 1 222222222222222222222222222222222222222222 1 777777 6 6 6 6 555555555 0 66 2 3 3 66 888 3 66 66 1111 3 7 3 5 444 6 00 00 00 3 3 3 3 3 0 11111111 33333 6 6 6 00 6 6 8888888888888888 6 000 000 0 8888888888888888 55 00 3 00 5555555555555 999 3 888 66 9 1 8 9 9 66 444 22 888888 1 1 1 33 1 0 77 1 1 0 555 22 1 8888 2 22 66 9999999999 66 8888888 3 99 9 9 9 2 9 88 9 9 7 99 88 9 4 9 9 9 99 77 7 77 7777 33 9 7 77 7 3 77 7 7 7 77 7 7 77777 7 77 7 7777777 5 4444 44 444 44 444 5 22222 11 6 55 33 1 1 1 22 1 3 0 8 0 0 0 0 000 0 666 7777 444 0 1 0 0 00 6 00 999999999999999999999999 3 1 6
consensus : TGAAAAAAAGT-GT-A-G-C-CACTTTT-TG--TGCAAAT-G------ATG-TT---TTG-CGTAAC----AGCGAAATAT-CTTTC-GC-ACAG-AGAT-C-------GC---G-T-TAC----CT--TTTTCA-CT-C-G---AAATGACC-T--TT---TA--ACC--A--ATG-TT-T-G-CAT-ATC----AT---AA--------A--A----TA------AGT----------AA-C--ACT-G--CTGA---T---TA--------AGAT-T---TATA-T--G-ATTG---ATTC-----AA-GAAAGTT----C-TT-G----TCC-A-GT-C-A---T---AT-T-TTC---CT---------CT-C------TC----A----------TTTTCT-----TATT-NA-T--------CATN--A----CAAAA-----A-------------------GATA----------------------T-----A--------------AA-----------T---------------G------------------T--C--------AT-G-TC----TAA--TA---TCTA--TTC-A-A-GGTAA---TT------A--TTT----ATG--TTTTCG---AC--TCT-AT-CGT-CA---TTAA---CCTT-TG---TTA-ATT-AATGGTGTG-ATCT--CA--G-G-TA---AAA-TC-A-TT-CT-A-G-CTGG--G---T--AG-T--T-----------T---GAC-CATATA------TATTGC--AT-A-TACT-CAAGCA-AA-ACAT-TAT---------TATA-AC--TG-----TA-------------T-GT---CAT--------ACATT-----CGA-C-TGGTTTT-TC-T---------TANTTT--TAAAAA-GT-GA-GC--A---A-CGA--GT--GA----TC-T-AGTAATNT---CAT-ACTA--A--AATGGGAAA--A-TAAAGT-C-A-AG-GNA--------CA-----TTCT-TAA-C-TTG--AT-TA-CG------CT-------NCTAAGGAATTT---ATT---TTGT-TGTA--------TATC-GTCAATT--CTCGAG--ATTTT--CCGTTGCCGT--ATGAACTTGCA-TCCTTGTC-AGA---T--TGATCG-TTAGGGGCA-G-AGTTT--ATCA---TTTCCACAT--GAACTA------A-T-ACATC-TTCAA--G-CTCAAATCCGTT-G-AATTNAC---TTTC--AT-CATA----AT-C--AAAATA--TTC-G--CG---AAA--AA-------ACGAAAGTCTTTTCTCCTC-GTTATCGAA--A-ACT-T-CGACA-GG--CG-CCG-CC-A--TGTTTTGT-GTACA-C-AT-TACATTGC--ACC--A-ATCAAA--TTAAA----GC--TTTTTTAAAACT-TG--GAAATC-C-CC--AG-A-T-AC--GAAAATA-AA-CTG-----AAATGGCGA-TTGT--CAC-GA-------TTAA-CA---TT--TTT---TTT--AA---ATT-CGCG-ATATTAGGC-ATNG-CGTGA--TT-TCA-ATAC-A--CTG-AAAA-ATTGG-CTTT-C-GCC-A-A---T-TGC-G-AATTT-C--TG---TAGC-CATT-TTTTG-AGA--TTCTT-TCGC--C-A--A-TG--G--------CG--AAAATGGCG-AACGGC-AGCGTGG
Reference ( family-1600 ) : TGAAAAAAAGT-GT-A-G-C-CACTTTT-TG--TGCAAAT-G------ATG-TT---TTG-CGTAAC----AGCGAAATAT-CTTTC-GC-ACAG-AGAT-C-------GC---G-T-TAC----CT--TTTTCA-CT-C-G---AAATGACC-T--TT---TA--ACC--A--ATG-TT-T-G-CAT-ATC----AT---AA--------A--A----TA------AGT----------AA-C--ACT-G--CTGA---T---TA--------AGAT-T---TATA-T--G-ATTG---ATTC-----AA-GAAAGTT----C-TT-G----TCC-A-GT-C-A---T---AT-T-TTC---CT---------CT-C------TC----A----------TTTTCT-----TATT-NA-T--------CATN--A----CAAAA-----A-------------------GATA----------------------T-----A--------------AA-----------T---------------G------------------T--C--------AT-G-TC----TAA--TA---TCTA--TTC-A-A-GGTAA---TT------A--TTT----ATG--TTTTCG---AC--TCT-AT-CGT-CA---TTAA---CCTT-TG---TTA-ATT-AATGGTGTG-ATCT--CA--G-G-TA---AAA-TC-A-TT-CT-A-G-CTGG--G---T--AG-T--T-----------T---GAC-CATATA-A---TTATTGC--AT-A-TACT-CAAGCA-AA-ACAT-TAT---------TATA-AC--TG-----TA-------------T-GT---CAT--------ACATT-----CGA-C-TGGTTTT-TC-T---------TANTTT--TAAAAA-GT-GA-GC--A---A-CGA--GT--GA----TC-T-AGTAATNT---CAT-ACTA--A--AATGGGAAA--A-TAAAGT-C-A-AG-GNA--------CA-----TTCT-TAA-C-TTG--AT-TA-CG------CT-------NCTAAGGAATTT---ATT---TTGT-TGTA--------TATC-GTCAATT--CTCGAG--ATTTT--CCGTTGCCGT--ATGAACTTGCA-TCCTTGTC-AGA---T--TGATCG-TTAGGGGNA-G-AGTTT--ATCA---TTTCCACAT--GAACTA------A-T-ACATC-TTCAA--G-CTCAAATCCGTT-G-AATTNAC---TTTC--AT-CATA----AT-C--AAAATA--TTC-G--CG---AAA--AA-------ACGAAAGTCTTTTCTCCTC-GTTATCGAA--A-ACT-T-CGACA-GG--CG-CCG-CC-A--TGTTTTGT-GTACA-C-AT-TACATTGC--ACC--A-ATCAAA--TTAAA----GC--TTTTTTAAAACT-TG--GAAATC-C-CC--AG-A-T-AC--GAAAATA-AA-CTG-----AAATGGCGA-TTGT--CAC-GA-------TTAA-CA---TT--TTT---TTT--AA---ATT-CGCG-ATATTAGGC-ATNG-CGTGA--TT-TCA-ATAC-A--CTG-AAAA-ATTGG-CTTT-C-GCC-A-A---T-TGC-G-AATTT-C--TG---TAGC-CATT-TTTTG-AGA--TTCTT-TCGC--C-A--A-TG--G--------CG--AAAATGGCG-AACGGC-AGCGTGG
gi|1 : T-CTTTC--C-AAAG-AGAT-TCT-----GC---A-TGTAC----CT--TTTTCA-CT-C-A---AAATGACA-T--TT----A--ACC--A---TG-TTCT-G-CAT-ATC----ATTATAATT------AT-A----TA------AGT----------AAGC--ACT-GG-CTGAGATT---TA--------AGAT-T---T-TA-T--G-ATTG---ATTC-----AG-AATAGTT----CCTT-G----TCC-A-GT-C-AGTAT---AT-T-TTC---CT---------CT-CCTCGA-TC----A----------TTTTCT-----TATT-TAAT--------CATT--A----CAAAA-----A--------------------ATAAA--------------------T-----A--------------AA-----------T---------------GAAACACGCAGAAAAATGAT--C--------AT-G-TC----TAA--TA---TCTA--TTC-A-AAGGTAAA--TT------AATTTT----ATG--TTTTCGT--AC---CT-ATTCGT-CT---TTAA---CCTT-TA---TTA-ATT-AATGGTGTG-ATCTGCCA--G-G-TAATTAAA-TC-A-TTCCT-ATG-CTGG--GTT-T--AG-T--T-----------TA--GAC-CA----------TATTGC--ATCA-TGCTAGAAGCA-AA-AAAT-TAT---------TATAGAC--TA-----TA-------------TAGTATACATGTAAATAGACATT-----TGA-CTTGGTTTTGTC-T---------CTATTT--TAAAAA-AA-GA-GT--A---A-CGA--TTGAGA----CT-T-AGTAATTT---CAT-ACTAAGA--AATGGGAAAAGA-TAAAGT-C-A-AG-GTA--------CA------TCT-TAAGC-TTGGAAT-TA-CG------CTGCTAAGCCCTAAGGACTTT---ATT---TTGT-TGTATTGCCCAGTATCTATCAATT--C-CGAGAAATTTT--CCGTT---GT--AT----T-----TTCTTGTCAAGAGCCC--TGATCG-TT--GGGTA-GAAGTTTG-ATCAGATTTTCCATATTGAAACTA------A-TAACATCTTTCAAG-G-CTCCAATCCGTT-A-AATTTTCCTTTTTC--AT-CATATT--AT-CAAAAAATA--TTC-G---G---TAA--AA-------CGGAAAGTC-TTTCTCCAC-G-TAT--GA--A-ACT-CGCGACA-TG--CGTCCG-CC-A--TGTTTTATAAAACAGC-ATGTACATTGCAGACCCAA-ATCAAA--TT--A----GCT-TTTTTTTAAACT-TG--G-AATC-CGCC--AG-A-T-AC--GAAAATATAA-CTGA----AAATGGCGA-TTGT--CAC-GA-------TTAATCA---AGAATTT---GTA--AA---ATT-CGCG---ATTAGGC--TAGTCGTGAGTTT-TCA-ATAC-ATCTTG-AAAA-ATTGG-TTTTCC-GCC-A-AATTT-TGT-G-AATTT-TGGTG---TAGC-CAGT-TTTTG-ATATTTTCTT-TCGCATCGA--A-TG--GGATTGAAAGG--AAAATGGCG-AACGAC-AGCGTG
gi|10 : TGAAAAAAAGT-GT-A-G-C-CACTTTA-TG--TGCAAAT-G------ATG-TT---TTG-AGTAA------GCGAAATAT-CTTTC-AC-ACAG-AGAT-C-------GC---G-T-TGC----CT--TTTTCA-CT-C-A---AAATGACC-A--TT---TA--ACC--A--ATG-TTCT-G-CAT-ATC----AT---AA--------ATAA----TA------AGT----------AA-C--ACT-G--CTGA---T---TA--------AGAT-T---TATA-T--G-ATTG---ATT------AA-GAAAGTC----C-TT-G----TCC-A-AT-C-A---T---ATAT-TTC---CT---------CT-C------TCGATCA----------TTTTCT-----TATT-AA-T--------CATT--A----CAAAA-----A-------------------AATAAACAAACA--------------TGAGAAA--------------AA-----------T---------------G------------------T--C--------AT-G-TC----TAA--TA---TCTA--TTC-A-A-GGTAA---TT------A--TTTT---ATG--TTTTCG---AC--TCT-AT-CGT-CA---TTAA---CCTT-TG---TTA-ATT-AATGGTGTG-ATCT--CA--G-G-TA---AAA-TC-A-TT-CT-A-G-CTGGGTG---T--AG-T--T-----------T---GAC-CA----------TATTGC--AT-A-TGCT-GAAGCA-AA-ACAT-TAT---------TATA-ACTATA-----TA-------------T-AT---TAG--------ATATT-----TGA-C-TGGTTTT-TC-T---------TAATTT--TAAAAA-GT-AA-GT--A---A-CGA--GT--GA----ACTT-AGTAATTT---CAT-ACTA--A--AATGGGAAA--A-TAAAGT-C-A-AA-ATA--------CA-----TTCT-TAA-C-TTG--AT-TA-CG------agcc
gi|11 : cagggctcacactgggtAAAAAAAGT-GT-A-G-C-CACTTTT-TGA-GGCAAAT-G------ATG-TT---TTG-CGTAA------GCGAACTAT-CTTTC-GC-ACAG-AAATGC-------G----G-T-TGC----CT--TTTTCA-CT-T-A---AAATGACC-T--TT---TA--ACCTGA--ATG-TT-T-TTCAT-ATC----AT---AA--------AT-A----TA------AGT----------AA-C--ACT-G--CTGA---T---TA--------AGGT-T----ATA-T--G-AT-G---ATTC-----AA-TAA-GTT----C-TT-G----TCC-A-GT-C-A---T---AT-T-TTT---GC---------TT-C------TC----A-----------TTTCT-----TATTAAA-T--------CATC--A----CAAAAGATTTA-------------------GATAAC--------------------T-----A--------------AA-------------------------------------------------CAAGAGAGAAT-G-TC------A--TG---TCTA--TTC-A-A-GGT-A---TT------A--TTT----ATG--TTTTGG---AC--TCT-AT-CGT-CA---TTAA---CCTT-TG---TTATATCAAAGGGAGTG-ATCT--CA--G-G-TA---AAA-TC-A-TT-CT-A-GTTTGG--GTAAT--AG-T--T-----------T-----CGCACGCA------TATTGC--AT-A-TACT-CAAGCA-AA-ACAT-TTT---------TATA-AC--TG-----CA-------------T-G----GGG--------ACATT-----CGA-C-TGGTTTG-TCTT---------TATTTT--AAAAAA-GT-GA-GC--A---A-CAT--GT--GA----TC-T-AATA
gi|12 : cagggctcacactgggttgaAAAA-GT-GA-GC--A---A-CAA--GT--GA----TC-T-AGTAATAC---CAT-GCTA--A--AATGGGAAA--AATAAATT-C-A-AG-GAA--------CA-----TTCT-TAA-C-TTC--AT-TA-CG------CT-------GCTAAGGAATTT---ATT---TTGT-TGT----------------CAATT--CTCGAG--ATTTT--CCGTTGCCGTG-ATGAACTTGCA-TCCTTATC-AGA---T--TGATCG-TTAGGGACA-G-AGTTT--ATCA---TTTCCACAT--GAACTA------A-T-ACATC-TTCAA--G-CTCAAATCCGTT-G-AATCAAC---TTTC--AT-CATA----AT-C--AAAATA--TTCGG--CG----AA--AA-------ACGAAAGTCTTTTCTCCTC-GTTATCGAA--A-ACT-T-CGACA-GG--CG-CCG-CC-A--TG-TTTGT-GTACA-C-AT-TACATTGC--ACC--A-ATCAAA--TTAAA----GC--TTTTTTAAAACT-TG--GAAATC-C-CC--AG-A-T-AC--GAAAATA-AA-CTG-----AAATGGCGA-TTGT--CAC-GA-------TTAA-CA---TT--TTT---TTT--AA---ATT-CGCA-ATATTAGGT-ATTG-TGTGA--Ttca
gi|13 : TC-GTCAATT--CTCGAG----TTT--GCGTTGC-----ATGAACTTGC----CTT-TC--GA---T---GATCG-TTAGGAG-A-G-AGTTT--AT-A---TTC-----T--GAACTA------A-T-ACATC-TTCAA--G--TCAA-TCCGTT-G-AATCAAAG--TTTC--ATTCATA----AT-C--AAAATC--TTC-GGCCG---AAAGAAA-------ACGA--GTCTTTTCTC-TC-GTTA-CGAA--A--CT-T-CGACA-GG--CG-CCG-CC-A--TGT------GTACA-C-AT-TACATCGC----C--A-ATCAAA----AAA----GC--TTTTTTAAAACT-TG--GAAATC-T-CCCAAG-A---AC----ACATA-AA-CTGA----AAATGGC-A-TTGT--CAC-GA-------TTAA-CA---TT--TTT---TTT--AAAACATT-CGC--ATAT--AGC-AT-G-TGTGA--TTATCACACAC-A--CTG-AAAA-ATTGG-CTTT-C-GCC-A-A---T-TGC-A-AAATT----TG---TAGC-CATTATATTG-AGA--TTCTT-TCGC--C-A--A-TGGTG--------CA--GAAATGGCG-AAT-GC-AGCGTG
gi|14 : -TTAGGGGAA-G-AGGTTG-ATCA---TTTCCACA---GTAC--------A-T-ATATC-TTCAA--GACTCAAATCCGTT-G-AATTCAC---TTT---AT-CGTA----AT-C--AAAATA--T-C-GT-CG---AAA--AATCATTCTACCAA--TCTTT-CTCCTTTGTTATCGAATCA-TCT-T-TTGCA-AGAGCA-CCGGCC-AGTTGATGTAC-GCACA-C-TT-TACATTGC--ACC--A-ATCAAA-----AA----GC--TTTT---AAACTCTGATGAAATC-C-C---AGTA-T-GC--GAAAATA-ATTCTC-----GAATATCGA-T-GT--CAT-GACTCGTCATTAA-CA---AC--TTCACATTT--AA---ATT-C-CG--TATTAG-C-ACAG-GCTGAAATT-TCA-ATAC-A--CTG-AAAAAATTGG-CTTT-C-GCCAA-A---T-TGTGG-AATTT-C--TG---TAGC-CA---TTTTG-AGA--TTCTT-TCGC--C-A--A-TG--G--------CG---AAATCGTG-AAC-GC-AGCGTagcc
gi|15 : tcTGAAAAAAAGT-GT-AAG-C-CACTTTTTTG--TGCAAAT-GA-----ATGTTT---TTG-CGTA------AGCGAAATAG-CTTTC-GG-ACAG-AGAT---------GT---GTT-TAC----CT--TTTTCA-CTGCAA---AAATGACCAT--TT---TA--ACC--ACCATG-TTCT-G-CAT-AT-----AT---AATAAAAT--A--A----TA------AGT----------AA-CA-ACTGG--CTGA---T---TA--------AGAT-T---TTTA-T--G-ATTG---ATTC---------AGAGTC----T-TT-GC---CCC-A-GT-C-A---T---AA-T-ATT---CT---------CT-C------TC----GATCAT-----TTTTTT-----TATA-AT-T--------CATT--A----CAAAA-----AT------------------AAAA----------------------T-----A--------------AACCCGAGAAAACT---------------GT-----------------T--C--------AT-G-TC----TAA--TAATCTTTA--TTC-A-A-GGTAA---TT------ATTTTT----ATG--TTTTCG---AC--TCTAAT-CGT-CG---TTAC---ACTT-TG---TTA-ATC--ATGGTGTGAATCT--CA--G-G-TA---AAA-TCAA-TT-CT-A-G-CTa
gi|16 : ggctcaactgggtTGAAAAAAAGT-GT-A-G-C-CATTTTT-TG--TGCAAAT-G------ATG-TT---TTG-CGT--T----AGCGAAATAT-CTTTC-GCCACAG-ATAT-C-------AC---G-T-TAT----CT--TTTTCA-CT-T-----AAATTACC-T--TT---TA--ACC--A--ATG-TT-TTA-CAT-ATC----AT---GA--------A--A----TA------AGC----------AA-C--ACT-G--CTGA---T---TA--------AGAT-T---CATA-T--G-AT-----ATTT-----GA-AGAAGTT----C-TT------TCC-A-AT-C-A---A---AT-T-TTC----T---------CT-C------TC----A----------TTTTCT-----TATT-TA-T--------CATC--A----CAAAA-----A-------------------GATA----------------------T-----A--------------AA-----------T---------------G------------------T--C--------AT-G-CC----TAA--TA---TCTA--TTT-A-A--GTAA---TT------A--TTT----ATG--TTTTGG---AC--TCT-AT-CGT-CA---TTAA---CCGT-TG---TTA-ATG-AAAGGTGTG-GTCT--CA--G-G-TA---AAA-T
gi|17 : cagggctcacactgggttgaaaaaaagGCA-TCCTTGTC-AGA---T--TGATCG-TAAGGGATA-C-AGTTT--AT-A---TTTCCACAT--GAACTG--------T-ATTTC-TTCAA--G-CTCAAATCCGTT-G-AATTTAC---TTTC--AT-CATA----AT-C--AAATTA--TTTGG--CG----AA--AA-------ACGAAAGTCTTTTCTGCTC-GTTATCGAA--A-ACT-T-TGGCA-GG--CG-CCG-CC-A--TG-TTTGT-GTACA-C-AT-TACATTGC--ACC--A-ATCAAA--TTTAA----GCTTTTTTTTTAAACT-TG--GAAATC-C-CC--AG-A-T-AC--GAATATA-AA-CTG-----AAATGGCGA-TCGT--CAC-GA-------TTAA-CA---TT--TTT---TTTAAAA---ATT-CGCG---ATTAGGC-ATTG-CGTGA--Tt
gi|18 : GAA--A-ACT-T-CAACA-GG--CG-CCG-CC-A--TGTTT-GT-GTACA-C-AT-TACATTGC--ACC--A-ATCAGA--TTAAA----GC--TTTTTTAAAACT-TG--GAAATC-C-CC--AG-A-T-AC--GAAAATA-AA-CTG-----AAATGACAA-TTGT--CAT-GA-------TTAA---------------------AA-----T-CGCA---ATTAGG--ATTG-TGTGA--TT-TCA-ATAC-A--CTG-AAAA-ATTAG-CTTT-C-GCC-A-A---T-TGT-A-AATTT-C--TG---TAGC-CATT-TTTT--AGA--TTCTT-TCGC--C-------------------------AATGGCG-AACGGC-AGCGTG
gi|19 : tCGAA--ACACT-C-C-ACA-GGG-CG-CCG-CCCA--TGTTTT-T-AAACA-C-AT-TACAT-GC--ACC--ACATCAGAGATTAAAAGGGGC--TTTT---AAACT-TG--GAAATC-C-C---AG-A-TGACTGAAAAATA-AA-CTGCACAAAAATGACGA-TGG-----C-GA-------TTAA-CA---AT--TTT---TTT--AT---ATT-CGAG-AT--TAGGC-TTAG-CGTGA--TT-TCA-ATAC-A--CTG-AAAA-ATTagccc
gi|2 : aaaaatctgaaagtcttttctccaggggcggggggggggggtgggatgAAAAAAGT-GT-A-G-CACACTTTT-TG--TGCAAATTG------ATG-TT---TTG-CGTAACT---AGCGAA-TAT-CTTTC-GC-ACAG-AGATTC-------AC---G-T-TAT----CT--TTT-CA-CT---G---AAATGACC-TGTTT---TA--AACG-A--ATG-TT-T-T-CAT-ATC----AT---AA--------A--A----TA------AGTCA--------AG-C--ACT-G--CTGA---TGATTATTTGTGTTAGAT-T---CATA-T--G-AT-----ATTTG----AA-GAAAGTT------TG-G----TCC---GT-C-A---A---AT-T-TTC---CT---------CT-C------TC----AA---------TTCTCT-----TATT-TA-TT-------CACA--A----CAAAA-----A-------------------GATA----------------------T-----A--------------AA-----------T---------------G------------------T--C--------AT-G-CC----TAA--TA----CTA--TTA-ACA-GGTAA---TT------A--TTT----ATG--TTTTGG---AC--TTT-AT-CGT--A---TTAA---CCGT-TG---TTA-ATT-AA-GGTGTG--TCT--GA--GTG-T----AAA-TC-A-TT-TT-A-G-TTGA--G---T--AGTT--T-----------T---GACATATATACA---TTATTGC--AT-A-TACT-CAAGC--AA-ACAT-TAT---------TATA-AT--GG-----GA---------------GT---CAT--------ACA---------A-C-TGG-TTT-TC-T---------TGTTTTTATAAAAA-GT-GAGGC--A---A-CAG--GT--GA----TC-T-AG-AATAT---CAT-ACTA--A--AA--GGGAA--A-TAAATT-C-A-AA-GAA--------CA-----TTCT-TAA-C-TTC--AT-TA-CG------CT-------ACTAAGGAATTT---TAT---TTGT-TG----------TATC-GTCAA-T--CTCGAG--ATTTT--CCATTGCCGTTGATGAACCTGTGCTCCTTATC-AGA---T--TGATCG-TTAGGGAAG-G-AGTTT---TCA----TTCCACAT--GAACTA------ATT-ACATC-TTCAA--G-CTC-AATC--TT-GAAATCAAC---TTTC--AT-CATA----ATCC--AAAATA--TTC----CGGTCGAA--AA-------ACGAAA-TCTTTTCTCCTC-GTTATCGGA--A-ACTAT-CGACACAG--C--TCG-CCGA--TGTTTTGT-GTACA-CGAT-AATGTAGC--ACC--A-ATCAAA--TGAA---------TTTTTTAAAACT-TG--G-GATCGCGCC--AG-A-G-A---GAGAATA-AA-GCG-----AAAAGGAGAGTTGTCCCACGGA-------T--A-CATT-TT--TTT---TTT--TT---ATT-CGCGAATATTAGGC--TAT-TGTGA---T-TCA-ATACAA--CTGAAAAA-ATTGG-C--T-C-G-C-A-A-----TGC-ACAATTT-A--CGTTTTAGCTCATT-TTTTG-AGA--TTCTTGTCGC--C-ACCA-T---G--------CGA-AAAATGGCG-AACGGC-AGCGTGG
gi|20 : gaatTGAAAAAAAGT-GT-A-A-C-CACTTTT-TG--TGCAAAT-G------ATG-TT---TTG-------------------A------C-GC-ATAG-AGAT-C-------GC---G-T-TAC----CT--TTTTCA-CT-T-G---AAATGACC-T--TT---TA--ACC--A--ATGTTT-T-A-CAT-ATC----AT---AAAT------A--A----TA------AGTACATGTAAGCAA-T--ACT-G--CTGA---T---TA--------AGAT-T---TTTA-T--G-ATTG---ATTC------A-GAAAGTT----C-TT-G----TCC-A-GT-C-A---T---A--T-TTC---CT---------CT-C------TG----A----------TTTTCT-----TATT-AA-T--------CATA--A----GATAA-----A-------------------
gi|21 : ctcacactgggtAA-AGAT-C-------ACTTCG-T-TACTCCTCC--TTTTCA-CT-T-G---AAATGACC-T--TT---CATTA-C--A--ATG-TT-T-----T-A-C----AT---AA--------T--ATACTTA------AGT----------AA-CTAACT-G--CTGA---TGC-TA--------AGAT-T---TATA-T--G-ATTG---ATT------AA-GAAAGTT----A-TT-C----TTC----T-T-G---C---AG-C-TCT---CT---------CT-CT-----TC----AT---------TTTTCTTAAG-TATT-CA-----------ACA--A----CAAAA-----ACGTGTACACTATAAAACACGAGA----------------------G-----A--------------AA-----------T---------------G------------------TTGC--------CT-G-TC----TAA--TAC--TATA--TTC-A-A-GGTAA---TT------A--Tctaaaca
gi|22 : --A-ATCAAA--TTAAA----GC--TTTTTTAAAACT-TG--GAAATC-A-CC--AG-AAT-AC--GAAAATA-AA-CTGG----AAATGGCGA-TTGT--CAC--A-------TTAA-CT---TT--TTT---TTT--AA---ATTCCGCA-ATATCAGGCGATTG-GTTGA---T-TCA-ATAC-A--CTG-AAAA-ATTGGACTTT-CGGCC-AGA---T-TGC-A-AATTCAC--TG---TAGC-CA-T-TTTTG-AGA--TTC-T-TCG---C-A--A-TG--G--------CG--AAAAT-GCGTAACGGCAAGCGTG
gi|23 : TAAAAGAAAGT-GT-A-G-C-CACTTTT-TGAGTG-AAAT-AGCCTATATG-TT---CTC-CGTCACCGTGAGCGAAACAT-CTTTT-GC-TCAA-AGAA-T-------GG---G-T-TAC----CT--TTCTCA-TT-T-G---AAATGACC-T--TT---TA--ACC--A--ATG-TT-T-A-CAT-GT-----AT---AT--------A--A----C-------AGT----------AA-C--A-T-C--CTGA---T---TA--------AGAagccc
gi|24 : taggtTGGAAAAAAGT-GT-A-G-C-CACTTTT-TG--TGCAAAT-G------ATG-TC---TTG-CAT--C----AGCAAAATAT-CTTTC-GC-ACAG-AGAT-C-------AC---G-T-TAT----CT--TTTT-A-CT-T-G---AAATGACC-T--TT---TA--ACC--A--ATG-TT-TCA-CAT-ATC----AT---GATTAATATTA--A----TA------AGT----------AA-
gi|25 : ctcacactgggt--------------AA-----------T---------------G------------------T--C--------AT-G-TC----TAA--TA---TCTA--TTC-A-A-GGTAAA--TT------A--TTTT---ATG--TTTTCA---AC--TCT-AT-CGT-TG---TTAA---CCTT-TG---TTA-ATC-AATGGTGTG-ATCT--CG--G-G-TA---AAA-TC-A-TT-CT-A-G-CTGG--G---T--gc
gi|26 : ----------TTTTCT-----TATC-AA-T--------CATC--A----CAAAA-----A-------------------GATA----------------------T-----ACTAAACATGAGAGAAA-----------T---------------G------------------T--C--------AT-G-TC----TAA--TA---TCTA--TTC-A-T-TGTAA---TT------A--TTT----ATG--CTTTGG---AC--TCT-AT-CGT-CA---TTAA---CCTT-TG---TTA-gtagt
gi|27 : TA-T--G-ATTG---ATTC-----T--GAAAATT----C-TT-G----TCC-A-GT-C-A---T---AT-T-TCC---TTT--------CT-CGA----TC----A----------TTTTCT-----TACT-AA-T--------CAAA--A----TAAAC-----AC------------------GAAA----------------------G-----A--------------AA-----------T---------------G------------------C--C--------AT-G-TC----TAA--TA---TCTA--TTC-A-A-GGTA
gi|28 : TATTGC--AT-A-TACT-CA-GCA-AA-ACAT-T-T---------TA-------------------------------------AT--------A-----------A-C-TGGTTTG-TC-T---------GTGTTT--TAAAAA-GT-GA-GC--C---A-CAA--GT--GG----TC-T-A--------------------A--AATGGGAAA--A-TAAAGT-C-A-AG-GCA--------CA-----TT
gi|29 : aCG-TTAAGGGTA-G-AGTTT--ATCA---TTTCCATAT--AAACTATACTATA-T-ACATC-TTCAA--G-CTCCAATCCATTAA-AATTTAC---TTTC--AT-CATA----AT-C--AA
gi|3 : G-CGTAA-----GGCGAAATAT-CTTTTAGC-ACAGGAGATTC-------GCT--G-T-TAC----TT--TTTCCA-CT-C-A---AAATGACC-A--TT---TA--ACC--AT-GTG-TT-T-A-CAT-ATCAGTAAC---AA--------A--A----TA------AGT----------AA-C--ACT-GACCTGA---T---TA--------AGACGTACATATA-C--G-A-TG---AATC------A-GAAAGTC----C-CT-GTGCTTCC-ATGT-C-T---T---AT-TATTTATACT---------CT-CGTCGGATC----A----------TTTTCTAAAAGTATA-TA-A--------AAAA--A----CAAAA-----A-------------------AAGAAAGAAAAAACCAAAACCGAGAAC-----A--------------AA-----------T---------------G------------------T--C--------ATAG-TCG---TAA--TA---TCTAAGTTC-A-A---TAA---CTGCTTAGA--TTT----ATG--TTTTCG---ACAGTCT-AT-CGTACA---TGTA---CCTTATG-----A-ATTCAATAGTGTG-ATCT--CA--A-GCTA---AAAGTC-ATTT-CT-A-G-CTGGT-G---T--AG-T--T-----------A---AAC-CATAGA-----------C--AT-A-T------AGCA-AAGACGTCTATGG-------TTTA-AC--CA-----TA-------------T-t
gi|3 : cagggctcacgctgggttgaaaaaaaggtgcaaaatgactgcgctaaatag---T--GG-T--T-----------T---AAC-CATAT----------TGCG-AT-AATGCT-CAAGCA-AA-ACAT-TAT------------A-AC--TG-----TA-------------TTAT---TATTA------ACATTTTCCACG--C-TGGCTTT-TC-T---------TAATTT--TAAAAA-GT-AA-GTGTA---A-CGA--GT--GA----AC-TTAGTAATTT---CAT-ACTA--A--AATGGGAAA--A-TAAAGT-C-A-AG-GTA--------CA-----TT-----A-CGCTG---C-TA-AG------C---------CTAAGGACATT---ATT---TTGT-TG----------TATC-TTCAATT--CTCGAG--AATTT--CCG---------------TTGTA-TCCTTGTC-AGA---C--TGATCG-TTTGGGGTA-G-AGTTT--ATCA---TTTCCATAT--GAACTT------A-T-ATATC-TTCAA--G-CTCCAATCCGTT-A-AATTTAC---TTTC--AT-CATT----AT-C--GAAATA--TTC-A--GT---AAA--AA-------ACGAAAGTCTTTTCTCTAC-GTTATCGAA--A-ACT-C-CGACA-GG--TG-CCG-CC-A--TGTTTT-T-GAACA-C-AT-TACATTGC--ACC--A-ATCAAA--TTAAA----GC--TTTTTTTAAACT-TG--GAAATC-C-CC--AG-A-T-AC--GAAAATA-AA-CTG-----AAATGGCGA-TTGT--CGG-TG-------TTAA-CA---AT--TTT---TTT---A---ATT-CGCG---ATTAGGC-TTGG-CGTGA--TT-TCA-ATAC-A--CTG-AAtgcgataatgctcaagcaaaacattataactgtattattattaacattttccacgctggcttttcttaattttaaaaagtaagtgtaacgagtgaacttagtaatttcatactaaaatgggaaaataaagtcaaggtacattacgctgctaagcctaaggacattattttgttgtatcttcaattctcgagaatttccgttgtatccttgtcagactgatcgtttggggtagagtttatcatttccatatgaacttatatatcttcaagctccaatccgttaaatttactttcatcattatcgaaatattcagtaaaaaacgaaagtcttttctctacgttatcgaaaactccgacaggtgccgccatgtttttgaacacattacattgcaccaatcaaattaaagctttttttaaacttggaaatccccagatacgaaaataaactgaaatggcgattgtcggtgttaacaatttttttaattcgcgattaggcttggcgtgatttcaatacactgaa
gi|30 : cagggctcacgctgggttgaaaaaaaggtgcaaaatgactgcgctaaataggcgtaaggcgaaatatcttttagcacaggagattcgctgttactttttccactcaaaatgaccatttaaccatgtgtttacatatcagtaacaaaataagtaacactgacctgattaagacgtacatatacgatgaatcagaaagtccctgtgcttccatgtcttattatttatactctcgtcggatcattttctaaaagtatataaaaaaacaaaaaaagaaagaaaaaaccaaaaccgagaacaaatgtcatagtcgtaatatctaagttcaataactgcttagatttatgttttcgacagtctatcgtacatgtaccttatgaattcaatagtgtgatctcaagctaaaagtcatttctagctggtgtagttaaaccatagacatatagcaaagacgtctaAAAAAAGT-GT-A-GAC-CACTTTT-TG--TGCAAAT-G------ATG-TT---TTGCCGTAAT-----GCGAAA-ATCCTTTC-GC-ACAG-AGAT-C-------
gi|31 : gctcacactgggttgAA-CAA--TT--TCT---TTT--AA---ATT-CGCA-AT--TAGGC-ACAG-TGTGA--TT-TTA-ATAC-A--CTA-AAAA-ATTTG-CTTT-C-GCC-A-A---T-TGT-G-AATTT-T--AG---TAag
gi|32 : CT-GAAGCA-AA-ACAT-TAT---------TATA-AC--TA-----TAATACATGTATATAT-AT---TAG--------ACATT-----TGA-C-TGGTTTT-TC-A---------TAATTT--TAAAAA-t
gi|34 : GAG--ATTTT--CCGTTGC-----ATGAACTTGCA-TCGTTGTC-AGA---TAATGATCG-TTAGGGGCA-G-AGTTT--ATC
gi|35 : --TG---TAGC-CATT-TT-TG-AGA--TTCTT-TCGC--C-A--A-T-------------------ATGGCA-AACGGC-AGCGTG
gi|37 : --TTCTT-TCGC--C-A--AATG--G--------CG--AAAATGGCG-AACAGC-AGCGCGagcc
gi|38 : CGAAATAC-TTTTC-GC-ACAG-AGAT-C-------GC---G-T-TAC----CT--TTTTCA-agccc
gi|4 : TA-T--G-ATTA---CTTTGAAAAAA-AAAAATT----C-TTTG----TCCCA-GT-CCA---T---AT-A-TTC---CTTTGTATTCCCT-CGA----TC----AGAT-------TTTTTC-----TAT---A-A--------CATT--AAAACCAAAA-----ATAACCAC------------GAAA----------------------G-----A--------------AA-----------TTG-------------A------------------C--C--------AT-GGTC----TAAA-TAA--TCTA--TTCCA-A-GGTAAAAATT------A--TTA----ATGA-TTTTCG---AA--TTT-AT-CGT-CATGCTTAAGCCCCCT-TGATCTTA-ATT-GATGGTGTGAATCT--CAG-G-G-TA---AAA-TC-ATTT-CTAA-G-CTGGTTA---T--AG-T--TTTTGTTGTTTGT---GA--CACATA-A---TTA--GCCAATAA-TAAC-TAAGCA-AA-A-AT-TATGAGCTTTTACATG-GT--TGAAGAATA-------------T--T---TAG--------ACATT-----CGA-C-TGGTTTT-TC-TATTTTCTTATGTTTT--TAAAAAGGTAAA-GT--AAATA-CGAAGGT--AATAACTT-T-AG--ATTTTTCCATAACTA--AATAATGGGAAA--A-TTAAGTGC-AGGG-GTAGAAGTCCCTA-----TTGTGTAA-C-TTG--ATGTATCGGC----CC-------TCTAAGG
gi|4 : att-TAAGGC-CTA-AG-GAC--------CACCTATTTTT-TAG-T-TTG--GT-TA-TGTGATATCT-------TCAAAGGTATTTGAAAGTCANNNNN-NNNN--------NNNN-NNNNNNN--NNNNNG--ATTTT--CCGT---CGT------------A-TCCTTGTC-AGA---T--TGATCG-TTTGGGGTA-G-AGTTT--ATCA---TTTCCATAT--GAACTA------A-T-ACATC-TTCAA--G-CTCCAATTCATT-A-AATTTAC---TTTC--AT-CATA----AT-C--AAAATA--TTC-G--GC---AAA--AC-------ATGAAAGTCTTTTCTCCTC-GTCATCGAA--A-ACT-C-CGAGA-GG--CG-CCA-CC-A--TATTTT-T-GAACA-C-AT-TACATTGC--ACC--A-ATCAAA--TTAAA----GC--TTTTTTTAAACT-TG--AAAATC-C-CC--AG-A-T-AC--GAAAATA-AA-CTG-----AAATGGCAA-TTGT--CGC-GA-------TTAA-CA----C--TTT---TTT--AA---ATT-CGCA---ACTAGGC-TTAG-CGTGA--TT-TCA-ATGC-A--CTG-AAAA-ATTGG-CTTC-C-GCC-A-A---TGTGT-G-AATTT-C--TG---TAGC-CATT-TTTT--AAA--TTCTT-TCAC--C-------------------------AATGGCG-AACGGC-AGCGTGcctaaggaccacctattttttagtttggttatgtgatatcttcaaaggtatttgaaagtcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngattttccgtcgtatccttgtcagattgatcgtttggggtagagtttatcatttccatatgaactaatacatcttcaagctccaattcattaaatttactttcatcataatcaaaatattcggcaaaacatgaaagtcttttctcctcgtcatcgaaaactccgagaggcgccaccatatttttgaacacattacattgcaccaatcaaattaaagctttttttaaacttgaaaatccccagatacgaaaataaactgaaatggcaattgtcgcgattaacacttttttaaattcgcaactaggcttagcgtgatttcaatgcactgaaaaattggcttccgccaatgtgtgaatttctgtagccattttttaaattctttcaccaatggcgaacggcagcgtgagccc
gi|40 : atttatgattactttgaaaaaaaaaaattctttgtcccagtccatatattcctttgtattccctcgatcagattttttctataacattaaaaccaaaaataaccacgaaagaaattgaccatggtctaaataatctattccaaggtaaaaattattaatgattttcgaatttatcgtcatgcttaagcccccttgatcttaattgatggtgtgaatctcagggtaaaatcatttctaagctggttatagtttttgttgtttgtgacacataattagccaataataactaagcaaaaattatgagcttttacatggttgaagaatatttagacattcgactggtttttctattttcttatgtttttaaaaaggtaaagtaaatacgaaggtaataactttagatttttccataactaaataatgggaaaattaagtgcaggggtagaagtccctattgtgtaacttgatgtatcggccctcCTAAGGACTTT---ATT---TTGT-TGTA--------agccc
gi|5 : tgctaagcTGAAAAAAAGT-GT-A-G-C-CACTTTT-TG--TGCAAAT-G------ATG-TT---TTG-CGTAAT----AGCGAAATAT-CTTTC-GC-ACAG-AGAT-C-------AC---G-T-TAT----CT--TTTTCA-CT-T-G---AAATGACC-T--TT---TA--ACG--G--ATG-TT-T-A-CAT-ATC----AT---AA--------A--A----TA------AGC----------AA-C--ACT-G--CTGA---T---TA--------AGAT-T---CATA-T--G-AT-----ATTTG----AA-GAAAGTT----C-TT-G----TCC-A-GT-C-A---A---AT-T-TTC---CT---------CT-C------TC----A----------TTTTCT-----TATT-TA-T--------CATC--A----CAAAA-----A-------------------GATA----------------------T-----A--------------AA-----------T---------------G------------------T--C--------AT-G-CC----TAA--TA---TCTA--TTT-A-A-GGTAA---TT------A--TTT----ATG--TTTTGG---AC--TTT-AT-CGT-CA---TTAA---CCGT-TG---TTA-ATT-AAAGGTGTG-GTCT--GA--GTG-T----AAA-TC-A-TT-TT-A-G--TGA--G---T--AG-T--T-----------T---GAC-CATATATACATTTATTGC--AT-A-TACT-CAAGCA-AA-ACAT-TAT---------TATA-AC--TG-----GA---------------GT---CAT--------ACA---------A-C-TGGTTTT-CT-T---------TGTTTT--TAAAAA-GT-GA-GC--A---A-CAG--GT--GA----TC-T-AGTAATAT---CAT-ACTA--A--AATGGGAAA--A-TAAATT-C-A-AG-GAA--------CA-----TTCT-TAA-C-TTC--AT-TA-CG------CT-------ACTAAGGAATTT---ATT---TTGT-TGT---------TATC-GTCAATTTCCTCGAG--ATTTT--CCATTGCCGTG-ATGAACTTGCA-TCCTTATC-AGA---T--TGATCG-TTAGGGACA-G-AGTTT--ATCA-----TCCACAT--GAACTA------A-T-ACATC-TTCAA--G-CTCAAATC--TT-G-AATCAAC---TTTC--AT-CATA----AT-C--AAAATA--TTC-G--CG---AAA--AA-------ACGAAAATCTTTTCTCCTC-GTTATCGAA--A-ACT-T-CGACA--G--CG-CCG-CC-A--TGTTTTGT-GTACA-C-AT-TACATTGC--ACC--A-ATCAAA--TGAAA----G---TTTTTTAAAACT-TG--GAAATC-C-CC--AG-A-T-AC--GAAAATA-AA-CTG-----AAATGGAGA-TTGT--CAC-GA-------TTAA-CATTTTT--TTT---TTT--TA---ATT-CGCA-ATATTAGGC-ATTG-TGTGA--AT-TCA-ATAC-A---TG-AAAA-ATTGG-C-TT-C-GCC-A-A---T-TGC-A-AATTT-C--TG---TAGC-CATT-TTTTGAAGA--TTCTT-TCGC--A-A--A-TG--G--------CGAAAAAATGGCGAAACGGC-AGCGTGG
gi|6 : TGAAAAAAAGTCGT-A-G-C-CACTTTT--G--TACAAAT-G------ATG-TT---TTG-CGTAA------GCGAAATAT-CTTTC-GC-AAAG-AGAT-T-------GC---G-T-TAC----CT--TTTCTA-CT-C-A---AAATGACC-A--TT---AT--ACC--A--ATG-TTCT-G-CAT-ATC----AT---AA--------AT-A----TA------AGT----------AA-C--ACT-G--CTTG---T---TA--------AGAT-T---TATAAT--G-ATTG---ATTC-----AG-AAAGGTC----C-TT-G----TCC-A-GTTC-A---T---ATAT-TTC---CT---------CT-C------TC----AATCA------TTTTCT-----TATT-AA-T--------CATT--A----CAAAA-----A-------------------TAAA----------------------T-----A--------------AA-----------TAAACACAAGAAAAATG------------------T--C--------AT-G-TC----TAAAAGA---TCTAGGTTC-A-A-GGTGA---TT------A--TTTT---ATG--TTTTCG---AC--TCT-AT-CGT-CT---TTAA---CCTT-TG---TTA-ATT-AATGGTGTG-ATCT--CA--G-G-TA---AAA-TC-A-TT-CT-A-G-CTGG--G---TGTAG-T--T-----------T---GAC-CA-----------------------------AAGCA-AA-ACAT-TAT---------TATA-AC--TA-----TA-------------T-ATAT-TAG--------ACATT-----TGA-C-TGGTTTT-TC-T---------TAATTT--TAAAAA-GT-AA-GT--A---A-CGA--GT--GA----AC-TTAGTAATTT---CAT-ACTA--A--AATGGGAAA--A-TTAAGT-C-G-AG-GTA--------CA-----TTCT-TAA-T-TTG--AT-TA-CG------CTGCTAAG-CCTAAGGGCTTT---ATT---TTGT-TGTACAG-----TATC-TTCAATT--CTCGAG--TATTT--CCG---------------TTGTA-TCCTTGTC-AGA---C--TGATCG-TTTGGTGTA-G-AGTTT--ATCA---TTTCCATAT--GAACTA------A-T-ACATC-TTCAA--G-CTCCAATCCGTT-A-AATTTAC---TTTC--AT-CATA----AT-C--AAAATA--TTC-G--GT---AAA--AA-------ACGAAAGTCTTTTCTCCAC-GTTATCGAA--A-ACT-C-TGACA-GT--CG-CCG-CC-A--TGTTTT-T-AAACA-C-AT-TACATTGC--ACC--A-ATCAAA--TTAAA----GC--TTTTTGTAAACT-TG--GAAATC-C-CC--AG-A-T-AC--GAAAATA-AA-CTG-----AAATGGCGA-TTGT--CGC-GA-------TTAA-CA---AT--TTT---TTT--AA---ATT-CGCG---ATTAGGC-TTAG-CGTGA--TT-TCA-ATAC-A--CTG-AAAA-ATTG
gi|7 : cagggctcacactgggtTGAAAAAAAGT-GT-A-G-C-CACTTTT-TG--T--AGAT-G------ATG-TAAAATTG-TGT--C----AGCAAAATAT-CTTTC-GT-ACAG-AGAC-C-------GC---G-T-TACA---TT--TTTTCAACT-T-G---AAATGAC--T--GT---TA--AAC--A--ATG-TT-TTA-CAT-ATC----AT---AA--------ATAA----TA------AGT----------AA-C--TCT-G--CAGA---T---TA--------AGAT-T---TATA-T--G-ATTG---ATT------AA-GAAAGTTAATTC-TT-G----TCC-A-GT-C-A---A---AT-T-T-C---CT---------CT-C------TC----A--------------------------GA-G--------GATA--A----CAAAA-----A-------------------GATA----------------------C-----ACTAAACACAGAGA-AA-----------T---------------G------------------T--T--------AT---TA----TAA--TA---TCTA--TTC-A-A-GGTAA---TTT-----A--CTT----ATG--TTTTTA---CT--TCA-AT-CAC-CA---TTAA---ACTT--G---ATA-ATT-AAAGGTATGGATCT--CAAAG-A-TA---GAA-TA-A-TC-TA-A-G-CTGC--A---T--AG-TATT-----------T---G---CATATA-A---A-ACT-C--AT---TACT-CAAGCATAA-ACAT-TAT---------TATA-AC--TG-----GA-------------G-A---------------ACATT-----CGATC-TGGTTTC-CA-T---------TATTTT--TAAAAAAGA-GA-GC--A---ATCAA--CC--GA----TC-T-AGTA---T---CAT-AC-A--A--AATGGGAAA--A--AAAGT-C-A-AGAGAA--------CA-----TTCT-TAA-C-TTG--AT-TA-CG------CT-------CCTAAGGAATTA---ATT---TTGTATGTAC-------TAT-----AATT--CTCGAG--AATTTACCCGTTG-------TGA---------CCTTGTC-AGA---T--TGATCAATTAGGGGCAAG-AGTTTTAATCA---TTTC-ACAT--GATATA------A-T-CC-TC-TTCAACCG-CTCAA-TCC-TT-G-AATT-AC---TTTCCAAT-CATATGAAATTC--AAAATAAATTC-G--GGC--AAA--AA-------ACGAAAGTCTTTTCT--TC-GTTAGCGAA--A-ACT-T-CAACA-GG--CA-ACG-CC-A--TGTTT-GT-GTACA-C-AT-TATACTGC--ACC--A-ATCAAA--TTCAA----GC--TTTTTTAAAACC-TG--GAAATC-C-CC--AG-A-T-AC--GAAAATA-AA-CTG-----AAATGCCGA-GTGT--TAC-GA-------TTAA-CCTT-TT--TTT---TTT--AA---ATT-CGCG-AT-TT-GGC-AT
gi|8 : cagggctcacactgggtTAAAAAAAAGT-GTGA-G-C-CACTTTA-TG--TGCAAAT-G------ATG-TT---T-G-AGTAA------ACGAAATAT-CTTTC-AC-ACAG-A-AT-CAGTGTTTGCTTTG-T-TGT----TTGTTTTTCA-CT-T-GGCAAAATGACCATG-TTGAATA--GTC--C--ATG-TTCT-G-CATTATCG---AT---AGG-------A--A----TATTGATTAGT----------AA-C--ACT-GTGCTGA---T---TA--------AGAT-T---TATA-TTGGTATTAGGAATTA-----GACGAGAGTCA---T-TT-GGT--TCC-A-AT-C-A---TGATAT-T-TGC---CC---------CTAC------TC----GGATGTCAGTTTTTTCT-----TATT-AG-TATGGATTGCATTGAA----CAAAA-----A-------------------AATAAACCAACA--------------TGAGGAA--------------AA-----------T---------------G------------------T--C--------AT-G-TGATTATAA--TG----CTA--TTC-A-A-G-TAA---TTT-----A--TTTTTATATGGTTTTTCGGCGAC--TCT-A--CGT-CA---T-AA---CCTT-TG---TTA-ATT-AATGGTGTG-ATCTCACA--G-G-TA---AAA-TC-A-TTCCT-ATG-CTGGGTG---T--AG-T--T-----------TAGAAAC-CATA------------GC--AT-A-TGCTGAAAGC--AA-ACAT-TAT---------TATA-ATA-TA-----TA-------------T-GT---CAT--------At
gi|9 : agggctccactgtggtggtttgggggttgTTT--TAAAAA-GT-GA-GC--A---A-CAA--GC--GA----TC-T-ATAAATAT---CAT-ACTA--A--AATGGGAAA--A-TAAATT-C-A-AG-GAA--------CA-----TTCT-TAA-C-TTC--AT-TA-CG------CT-------TCTAAGGAATTT---ATT---TTGT-TGT----------------CAATT--CTCGAG--ATTTT--CCGTTGCCGTG-ATGAACTTGCA-TCCTTATC-AGA---T--TGATCG-TTAGGGACA-G-AGTTT--ATCA---TTTCCACAT--GAACTA------A-T-ACATC-TTCAA--G-CTCAAATC-GTT-G-AATCAAC---TTTC--AT-CATA----AT-C--AAAATA--TTC-GG-CG---AAA--TA--------CGAAAGTCTTTTCTCCTC-GTTATCGAA--A-ACT-T-C-ACA-GG--CG-CCG-CC-A--TGTT--GT-GTACA-C-AT-TACATTGC--ACC--A-ATCAAA--TTAAA----GC--TTTTTTAAAACT-TG--GAAATC-C-CC--AG-A-T-AC--GAAAATA-AA-CTG-----AAATG-CGA-TTGT--CAC-GA-------TTAA-CA---TT--TTT---TTT--AA---ATT-CGCA-ATATTAGGC-ATTG-TGTGA--TT-TCA-ATAC-A--CTG-AAAA-ATTGG-CTTT-C-GCC-A-A---T-CGC-A-AATTT-C--TG---TAGC-CA-T-TTTTG-AGA--TTCTT-TCGC--C----A-T---G--------CG--AAAATGGCG-AAT-GC-AGCGTGacaaacaatgattttcagtgtgtattcta
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|33 ): TCTGTACATAGAAAATATAGGCCTTATAGAGACTATTCTCAGGGCTCACGCTGGGTTGAAAAAAA
Unaligned ( gi|36 ): AATTTCCTGCTTTGTAGTTGCAGGGCTCACACTGGGTTGAAAAAAA
Unaligned ( gi|39 ): AGGGCTCACTCTGGGTTGAAAAAAAGTGTA
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 111111 33333333 11111111111111 1111111 11111 33333333333 1111111111 11 11111111 222222222 1111 111111111 33333333333333333333333 11111 1111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 111 111111 1111 222222 444444444444444444444444444444444444 111111111 555555555555555555555555555555555555555555 111111 111111111 11111111 2222222222222222 4444444444444444 3333333333333 2222222222 1111111 11111 1111 11111 333333333333333333333333
lowQualScore : 3 3 3 3 3 3 77 3 111111 3 555 2 44444444 2 2 2 2 55555555555555 2 2 7777 33 2 2222222 7777 444 33 66 66 2 99999 2 8888 444 55555555555 5555 777777 5555555555 2 66 2 00 555 888 00000000 3 555 2 33 2 55555 333333333 8888 2 2 2222 222 2 2 8888888 5 2 444 333333333 2 77777777777777777777777 11111 44 2222222222 444 5555 66666 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 33 99999999 2 2 7777 55 999 66 2 2 2 222 000000 77 4444 66 0 777 33 2 2 2 555 555 0 2 555 2 6 2 3 6 88 44 3 6 3 555 3 3 6 6 3 6 3 222222 44 88 333333333333333333333333333333333333 77 777 2 88 3 3 3 666666666 3 999999999999999999999999999999999999999999 2 111111 3 3 3 3 444444444 1 44 3 3 3 3 44 555 3 44 44 7777 3 6 3 3 666 3 55 55 55 3 3 3 3 3 1 22222222 88888 3 3 3 55 3 3 9999999999999999 0 777 777 4 0000000000000000 55 55 0 55 8888888888888 333 3 555 44 3 0 66 2 99 555 44 888888 3 3 3 77 3 7 11 3 3 4 888 44 3 88 555 3 44 44 3333333333 44 0000000 3 33 2 2 2 1 2 66 2 2 5 33 3 8 2 1 2 2 2 33 33 2 33 5555 66 2 2 33 2 5 33 2 2 2 33 2 2 44444 2 33 2 8888888 2 7777 33 444 33 444 2 55555 66 3 33 77 3 3 3 44 3 3 4 0 4 4 4 4 777 4 777 9999 666 4 8 4 4 55 3 55 999999999999999999999999 7 5 3
lowQualScore : . . . . . . .. . ...... . ... . ........ . . . . .............. . . .... .. . ....... .... ... .. .. .. . ..... . .... ... ........... .... ...... .......... . .. . .. ... ... ........ . ... . .. . ..... ......... .... . . .... ... . . ....... . . ... ......... . ....................... ..... .. .......... ... .... ..... .......................................................................................................................... .. ........ . . .... .. ... .. . . . ... ...... .. .... .. . ... .. . . . ... ... . . ... . . . . . .. .. . . . ... . . . . . . . ...... .. .. .................................... .. ... . .. . . . ......... . .......................................... . ...... . . . . ......... . .. . . . . .. ... . .. .. .... . . . . ... . .. .. .. . . . . . . ........ ..... . . . .. . . ................ . ... ... . ................ .. .. . .. ............. ... . ... .. . . .. . .. ... .. ...... . . . .. . . .. . . . ... .. . .. ... . .. .. .......... .. ....... . .. . . . . . .. . . . .. . . . . . . . .. .. . .. .... .. . . .. . . .. . . . .. . . ..... . .. . ....... . .... .. ... .. ... . ..... .. . .. .. . . . .. . . . . . . . . ... . ... .... ... . . . . .. . .. ........................ . . .
lowQualScore : 1 1 1 1 1 1 33 1 999999 1 444 9 22222222 5 5 5 4 66666666666666 5 5 8888 44 5 7777777 9999 777 77 33 33 7 11111 7 3333 777 44444444444 7777 777777 3333333333 7 88 9 77 000 999 44444444 1 444 7 77 7 99999 000000000 3333 7 7 0000 999 7 7 3333333 3 7 777 333333333 7 55555555555555555555555 66666 44 9999999999 444 3333 22222 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 44 11111111 5 5 8888 99 444 99 5 5 5 777 333333 33 6666 88 1 999 99 9 9 9 000 000 7 9 000 9 2 6 1 2 55 22 1 2 1 444 1 3 7 7 3 7 3 000000 66 66 222222222222222222222222222222222222 99 111 1 99 1 1 1 555555555 1 222222222222222222222222222222222222222222 1 777777 6 6 6 6 555555555 0 66 3 1 3 3 66 888 3 66 66 1111 3 7 3 5 444 6 00 00 00 3 3 3 3 3 0 11111111 33333 6 6 6 00 6 6 8888888888888888 6 000 000 0 8888888888888888 55 00 3 00 5555555555555 999 3 888 66 1 1 99 9 66 444 22 888888 1 1 1 33 1 8 77 1 1 0 555 22 1 55 444 1 22 66 9999999999 66 8888888 3 99 9 9 9 2 9 88 9 9 7 99 4 4 9 4 9 9 9 99 77 7 77 7777 33 9 7 77 7 3 77 7 7 7 77 7 7 77777 7 77 7 7777777 5 4444 44 444 44 444 5 22222 11 6 55 33 1 1 1 22 1 3 0 8 0 0 0 0 000 0 666 7777 444 0 1 0 0 00 6 00 999999999999999999999999 3 1 6
consensus : TGAAAAAAAGT-GT-A-G-C-CACTTTT-TG--TGCAAAT-G------ATG-TT---TTG-CGTAAC----AGCGAAATAT-CTTTC-GC-ACAG-AGAT-C-------GC---G-T-TAC----CT--TTTTCA-CT-C-G---AAATGACC-T--TT---TA--ACC--A--ATG-TT-T-G-CAT-ATC----AT---AA--------A--A----TA------AGT----------AA-C--ACT-G--CTGA---T---TA--------AGAT-T---TATA-T--G-ATTG---ATTC-----AA-GAAAGTT----C-TT-G----TCC-A-GT-C-A---T---AT-T-TTC---CT---------CT-C------TC----A----------TTTTCT-----TATT-NA-T--------CATN--A----CAAAA-----A-------------------GATA----------------------T-------------A--------------AA-----------T---------------G------------------T--C--------AT-G-TC----TAA--TA---TCTA--TTC-A-A-GGTAA---TT------A--TTT----ATG--TTTTCG---AC--TCT-AT-CGT-CA---TTAA---CCTT-TG---TTA-ATT-AATGGTGT-G-ATCT--C--A-G-G-TA---AAA-TC-A-TT-CT-A-G-CTGG--G---T--AG--TT-----------T---GAC-CATATA------TATT-GC--AT-A-TACT-CAAGCA-AA-ACAT-TAT---------TATA-AC--TG-----TA-------------T-GT---CAT--------ACATT-----CGA-C-TGGTTTT-TC-T---------TANTTT--T-AAAAA-GT-GA-GC--A---A-CGA--GT--GA----TC-T-AGTAATNT---CAT-ACTA--A--AATGGGAAA--A-TAAAGT-C-A-AG-GNA--------CA-----TTCT-TAA-C-TTG--AT-TA-CG------CT-------NCTAAGGAATTT---ATT---TTGT-TGTA--------TATC-GTCAATT--CTCGAG--ATTTT--CCGTTGCCGT--ATGAACTTGCA-TCCTTGTC-AGA---T--TGATC-GTTAGGGGC-AG-AGTTT--ATCA---TTTCCACAT--GAACTA------A-T-ACATC-TTCAA--G-CTCAAATCCGTT-G-AATTNAC---TTTC--AT-CATA--A---T-C--AAAAT--ATTC-G--CG---AAA--AA-------ACGAAAGTCTTTTCTCCTC-GTTATCGAA--A-ACT-T-CGACA-GG--CG-CCG-CC-A--TGTTTTGT-GTACA-C-AT-TACATTGC--ACC--A-ATCAAA--TTAAA----GC--TTTTTTAAAACT-TG--GAAATC-C-CC--AG-A-T-AC--GAAAATA-AA-CTG-----AAATGGCGA-TTGT--CAC-GA-------TTAA-CA---TT--TTT---TTT--AA---ATT-CGCG-ATATTAGGC-ATNG-CGTGA--TT-TCA-ATAC-A--CTG-AAAA-ATTGG-CTTT-C-GCC-A-A---T-TGC-G-AATTT-C--TG---TAGC-CATT-TTTTG-AGA--TTCTT-TCGC--C-A--A-TG--G--------CG--AAAATGGCG-AACGGC-AGCGTGG
Reference ( family-1600 ) : TGAAAAAAAGT-GT-A-G-C-CACTTTT-TG--TGCAAAT-G------ATG-TT---TTG-CGTAAC----AGCGAAATAT-CTTTC-GC-ACAG-AGAT-C-------GC---G-T-TAC----CT--TTTTCA-CT-C-G---AAATGACC-T--TT---TA--ACC--A--ATG-TT-T-G-CAT-ATC----AT---AA--------A--A----TA------AGT----------AA-C--ACT-G--CTGA---T---TA--------AGAT-T---TATA-T--G-ATTG---ATTC-----AA-GAAAGTT----C-TT-G----TCC-A-GT-C-A---T---AT-T-TTC---CT---------CT-C------TC----A----------TTTTCT-----TATT-NA-T--------CATN--A----CAAAA-----A-------------------GATA----------------------T-------------A--------------AA-----------T---------------G------------------T--C--------AT-G-TC----TAA--TA---TCTA--TTC-A-A-GGTAA---TT------A--TTT----ATG--TTTTCG---AC--TCT-AT-CGT-CA---TTAA---CCTT-TG---TTA-ATT-AATGGTGT-G-ATCT--C--A-G-G-TA---AAA-TC-A-TT-CT-A-G-CTGG--G---T--AG--TT-----------T---GAC-CATATA------TATT-GC--AT-A-TACT-CAAGCA-AA-ACAT-TAT---------TATA-AC--TG-----TA-------------T-GT---CAT--------ACATT-----CGA-C-TGGTTTT-TC-T---------TANTTT--T-AAAAA-GT-GA-GC--A---A-CGA--GT--GA----TC-T-AGTAATNT---CAT-ACTA--A--AATGGGAAA--A-TAAAGT-C-A-AG-GNA--------CA-----TTCT-TAA-C-TTG--AT-TA-CG------CT-------NCTAAGGAATTT---ATT---TTGT-TGTA--------TATC-GTCAATT--CTCGAG--ATTTT--CCGTTGCCGT--ATGAACTTGCA-TCCTTGTC-AGA---T--TGATC-GTTAGGGGC-AG-AGTTT--ATCA---TTTCCACAT--GAACTA------A-T-ACATC-TTCAA--G-CTCAAATCCGTT-G-AATTNAC---TTTC--AT-CATA--A---T-C--AAAAT--ATTC-G--CG---AAA--AA-------ACGAAAGTCTTTTCTCCTC-GTTATCGAA--A-ACT-T-CGACA-GG--CG-CCG-CC-A--TGTTTTGT-GTACA-C-AT-TACATTGC--ACC--A-ATCAAA--TTAAA----GC--TTTTTTAAAACT-TG--GAAATC-C-CC--AG-A-T-AC--GAAAATA-AA-CTG-----AAATGGCGA-TTGT--CAC-GA-------TTAA-CA---TT--TTT---TTT--AA---ATT-CGCG-ATATTAGGC-ATNG-CGTGA--TT-TCA-ATAC-A--CTG-AAAA-ATTGG-CTTT-C-GCC-A-A---T-TGC-G-AATTT-C--TG---TAGC-CATT-TTTTG-AGA--TTCTT-TCGC--C-A--A-TG--G--------CG--AAAATGGCG-AACGGC-AGCGTGG
gi|1 : T-CTTTC--C-AAAG-AGAT-TCT-----GC---A-TGTAC----CT--TTTTCA-CT-C-A---AAATGACA-T--TT----A--ACC--A---TG-TTCT-G-CAT-ATC----ATTATAATT------AT-A----TA------AGT----------AAGC--ACT-GG-CTGAGATT---TA--------AGAT-T---T-TA-T--G-ATTG---ATTC-----AG-AATAGTT----CCTT-G----TCC-A-GT-C-AGTAT---AT-T-TTC---CT---------CT-CCTCGA-TC----A----------TTTTCT-----TATT-TAAT--------CATT--A----CAAAA-----A--------------------ATAAA--------------------T-------------A--------------AA-----------T---------------GAAACACGCAGAAAAATGAT--C--------AT-G-TC----TAA--TA---TCTA--TTC-A-AAGGTAAA--TT------AATTTT----ATG--TTTTCGT--AC---CT-ATTCGT-CT---TTAA---CCTT-TA---TTA-ATT-AATGGTGT-G-ATCTGCC--A-G-G-TAATTAAA-TC-A-TTCCT-ATG-CTGG--GTT-T--AG--TT-----------TA--GAC-C----A------TATT-GC--ATCA-TGCTAGAAGCA-AA-AAAT-TAT---------TATAGAC--TA-----TA-------------TAGTATACATGTAAATAGACATT-----TGA-CTTGGTTTTGTC-T---------CTATTT--T-AAAAA-AA-GA-GT--A---A-CGA--TTGAGA----CT-T-AGTAATTT---CAT-ACTAAGA--AATGGGAAAAGA-TAAAGT-C-A-AG-GTA--------CA------TCT-TAAGC-TTGGAAT-TA-CG------CTGCTAAGCCCTAAGGACTTT---ATT---TTGT-TGTATTGCCCAGTATCTATCAATT--C-CGAGAAATTTT--CCGTT---GT--AT----T-----TTCTTGTCAAGAGCCC--TGATC-GTT--GGGT-AGAAGTTTG-ATCAGATTTTCCATATTGAAACTA------A-TAACATCTTTCAAG-G-CTCCAATCCGTT-A-AATTTTCCTTTTTC--AT-CATATTA---T-CAAAAAAT--ATTC-G---G---TAA--AA-------CGGAAAGTC-TTTCTCCAC-G-TAT--GA--A-ACT-CGCGACA-TG--CGTCCG-CC-A--TGTTTTATAAAACAGC-ATGTACATTGCAGACCCAA-ATCAAA--TT--A----GCT-TTTTTTTAAACT-TG--G-AATC-CGCC--AG-A-T-AC--GAAAATATAA-CTGA----AAATGGCGA-TTGT--CAC-GA-------TTAATCA---AGAATTT---GTA--AA---ATT-CGCG---ATTAGGC--TAGTCGTGAGTTT-TCA-ATAC-ATCTTG-AAAA-ATTGG-TTTTCC-GCC-A-AATTT-TGT-G-AATTT-TGGTG---TAGC-CAGT-TTTTG-ATATTTTCTT-TCGCATCGA--A-TG--GGATTGAAAGG--AAAATGGCG-AACGAC-AGCGTG
gi|10 : TGAAAAAAAGT-GT-A-G-C-CACTTTA-TG--TGCAAAT-G------ATG-TT---TTG-AGTAA------GCGAAATAT-CTTTC-AC-ACAG-AGAT-C-------GC---G-T-TGC----CT--TTTTCA-CT-C-A---AAATGACC-A--TT---TA--ACC--A--ATG-TTCT-G-CAT-ATC----AT---AA--------ATAA----TA------AGT----------AA-C--ACT-G--CTGA---T---TA--------AGAT-T---TATA-T--G-ATTG---ATT------AA-GAAAGTC----C-TT-G----TCC-A-AT-C-A---T---ATAT-TTC---CT---------CT-C------TCGATCA----------TTTTCT-----TATT-AA-T--------CATT--A----CAAAA-----A-------------------AATAAACAAACA--------------TGAGAA--------A--------------AA-----------T---------------G------------------T--C--------AT-G-TC----TAA--TA---TCTA--TTC-A-A-GGTAA---TT------A--TTTT---ATG--TTTTCG---AC--TCT-AT-CGT-CA---TTAA---CCTT-TG---TTA-ATT-AATGGTGT-G-ATCT--C--A-G-G-TA---AAA-TC-A-TT-CT-A-G-CTGGGTG---T--AG--TT-----------T---GAC-C----A------TATT-GC--AT-A-TGCT-GAAGCA-AA-ACAT-TAT---------TATA-ACTATA-----TA-------------T-AT---TAG--------ATATT-----TGA-C-TGGTTTT-TC-T---------TAATTT--T-AAAAA-GT-AA-GT--A---A-CGA--GT--GA----ACTT-AGTAATTT---CAT-ACTA--A--AATGGGAAA--A-TAAAGT-C-A-AA-ATA--------CA-----TTCT-TAA-C-TTG--AT-TA-CG------agcc
gi|11 : cagggctcacactgggtAAAAAAAGT-GT-A-G-C-CACTTTT-TGA-GGCAAAT-G------ATG-TT---TTG-CGTAA------GCGAACTAT-CTTTC-GC-ACAG-AAATGC-------G----G-T-TGC----CT--TTTTCA-CT-T-A---AAATGACC-T--TT---TA--ACCTGA--ATG-TT-T-TTCAT-ATC----AT---AA--------AT-A----TA------AGT----------AA-C--ACT-G--CTGA---T---TA--------AGGT-T----ATA-T--G-AT-G---ATTC-----AA-TAA-GTT----C-TT-G----TCC-A-GT-C-A---T---AT-T-TTT---GC---------TT-C------TC----A-----------TTTCT-----TATTAAA-T--------CATC--A----CAAAAGATTTA-------------------GATAAC--------------------T-------------A--------------AA-------------------------------------------------CAAGAGAGAAT-G-TC------A--TG---TCTA--TTC-A-A-GGT-A---TT------A--TTT----ATG--TTTTGG---AC--TCT-AT-CGT-CA---TTAA---CCTT-TG---TTATATCAAAGGGAGT-G-ATCT--C--A-G-G-TA---AAA-TC-A-TT-CT-A-GTTTGG--GTAAT--AG--TT-----------T-----CGCACGCA------TATT-GC--AT-A-TACT-CAAGCA-AA-ACAT-TTT---------TATA-AC--TG-----CA-------------T-G----GGG--------ACATT-----CGA-C-TGGTTTG-TCTT---------TATTTT--A-AAAAA-GT-GA-GC--A---A-CAT--GT--GA----TC-T-AATA
gi|12 : cagggctcacactgggttgaAAAA-GT-GA-GC--A---A-CAA--GT--GA----TC-T-AGTAATAC---CAT-GCTA--A--AATGGGAAA--AATAAATT-C-A-AG-GAA--------CA-----TTCT-TAA-C-TTC--AT-TA-CG------CT-------GCTAAGGAATTT---ATT---TTGT-TGT----------------CAATT--CTCGAG--ATTTT--CCGTTGCCGTG-ATGAACTTGCA-TCCTTATC-AGA---T--TGATC-GTTAGGGAC-AG-AGTTT--ATCA---TTTCCACAT--GAACTA------A-T-ACATC-TTCAA--G-CTCAAATCCGTT-G-AATCAAC---TTTC--AT-CATA--A---T-C--AAAAT--ATTCGG--CG----AA--AA-------ACGAAAGTCTTTTCTCCTC-GTTATCGAA--A-ACT-T-CGACA-GG--CG-CCG-CC-A--TG-TTTGT-GTACA-C-AT-TACATTGC--ACC--A-ATCAAA--TTAAA----GC--TTTTTTAAAACT-TG--GAAATC-C-CC--AG-A-T-AC--GAAAATA-AA-CTG-----AAATGGCGA-TTGT--CAC-GA-------TTAA-CA---TT--TTT---TTT--AA---ATT-CGCA-ATATTAGGT-ATTG-TGTGA--Ttca
gi|13 : TC-GTCAATT--CTCGAG----TTT--GCGTTGC-----ATGAACTTGC----CTT-TC--GA---T---GATC-GTTAGGAG--AG-AGTTT--AT-A---TTC-----T--GAACTA------A-T-ACATC-TTCAA--G--TCAA-TCCGTT-G-AATCAAAG--TTTC--ATTCATA--A---T-C--AAAAT--CTTC-GGCCG---AAAGAAA-------ACGA--GTCTTTTCTC-TC-GTTA-CGAA--A--CT-T-CGACA-GG--CG-CCG-CC-A--TGT------GTACA-C-AT-TACATCGC----C--A-ATCAAA----AAA----GC--TTTTTTAAAACT-TG--GAAATC-T-CCCAAG-A---AC----ACATA-AA-CTGA----AAATGGC-A-TTGT--CAC-GA-------TTAA-CA---TT--TTT---TTT--AAAACATT-CGC--ATAT--AGC-AT-G-TGTGA--TTATCACACAC-A--CTG-AAAA-ATTGG-CTTT-C-GCC-A-A---T-TGC-A-AAATT----TG---TAGC-CATTATATTG-AGA--TTCTT-TCGC--C-A--A-TGGTG--------CA--GAAATGGCG-AAT-GC-AGCGTG
gi|14 : TTAGGGGA-AG-AGGTTG-ATCA---TTTCCACA---GTAC--------A-T-ATATC-TTCAA--GACTCAAATCCGTT-G-AATTCAC---TTT---AT-CGTA--A---T-C--AAAAT--AT-C-GT-CG---AAA--AATCATTCTACCAA--TCTTT-CTCCTTTGTTATCGAATCA-TCT-T-TTGCA-AGAGCA-CCGGCC-AGTTGATGTAC-GCACA-C-TT-TACATTGC--ACC--A-ATCAAA-----AA----GC--TTTT---AAACTCTGATGAAATC-C-C---AGTA-T-GC--GAAAATA-ATTCTC-----GAATATCGA-T-GT--CAT-GACTCGTCATTAA-CA---AC--TTCACATTT--AA---ATT-C-CG--TATTAG-C-ACAG-GCTGAAATT-TCA-ATAC-A--CTG-AAAAAATTGG-CTTT-C-GCCAA-A---T-TGTGG-AATTT-C--TG---TAGC-CA---TTTTG-AGA--TTCTT-TCGC--C-A--A-TG--G--------CG---AAATCGTG-AAC-GC-AGCGTagcc
gi|15 : tcTGAAAAAAAGT-GT-AAG-C-CACTTTTTTG--TGCAAAT-GA-----ATGTTT---TTG-CGTA------AGCGAAATAG-CTTTC-GG-ACAG-AGAT---------GT---GTT-TAC----CT--TTTTCA-CTGCAA---AAATGACCAT--TT---TA--ACC--ACCATG-TTCT-G-CAT-AT-----AT---AATAAAAT--A--A----TA------AGT----------AA-CA-ACTGG--CTGA---T---TA--------AGAT-T---TTTA-T--G-ATTG---ATTC---------AGAGTC----T-TT-GC---CCC-A-GT-C-A---T---AA-T-ATT---CT---------CT-C------TC----GATCAT-----TTTTTT-----TATA-AT-T--------CATT--A----CAAAA-----AT------------------AAAA----------------------T-------------A--------------AACCCGAGAAAACT---------------GT-----------------T--C--------AT-G-TC----TAA--TAATCTTTA--TTC-A-A-GGTAA---TT------ATTTTT----ATG--TTTTCG---AC--TCTAAT-CGT-CG---TTAC---ACTT-TG---TTA-ATC--ATGGTGT-GAATCT--C--A-G-G-TA---AAA-TCAA-TT-CT-A-G-CTa
gi|16 : ggctcaactgggtTGAAAAAAAGT-GT-A-G-C-CATTTTT-TG--TGCAAAT-G------ATG-TT---TTG-CGT--T----AGCGAAATAT-CTTTC-GCCACAG-ATAT-C-------AC---G-T-TAT----CT--TTTTCA-CT-T-----AAATTACC-T--TT---TA--ACC--A--ATG-TT-TTA-CAT-ATC----AT---GA--------A--A----TA------AGC----------AA-C--ACT-G--CTGA---T---TA--------AGAT-T---CATA-T--G-AT-----ATTT-----GA-AGAAGTT----C-TT------TCC-A-AT-C-A---A---AT-T-TTC----T---------CT-C------TC----A----------TTTTCT-----TATT-TA-T--------CATC--A----CAAAA-----A-------------------GATA----------------------T-------------A--------------AA-----------T---------------G------------------T--C--------AT-G-CC----TAA--TA---TCTA--TTT-A-A--GTAA---TT------A--TTT----ATG--TTTTGG---AC--TCT-AT-CGT-CA---TTAA---CCGT-TG---TTA-ATG-AAAGGTGT-G-GTCT--C--A-G-G-TA---AAA-T
gi|17 : cagggctcacactgggttgaaaaaaagGCA-TCCTTGTC-AGA---T--TGATC-GTAAGGGAT-AC-AGTTT--AT-A---TTTCCACAT--GAACTG--------T-ATTTC-TTCAA--G-CTCAAATCCGTT-G-AATTTAC---TTTC--AT-CATA--A---T-C--AAATT--ATTTGG--CG----AA--AA-------ACGAAAGTCTTTTCTGCTC-GTTATCGAA--A-ACT-T-TGGCA-GG--CG-CCG-CC-A--TG-TTTGT-GTACA-C-AT-TACATTGC--ACC--A-ATCAAA--TTTAA----GCTTTTTTTTTAAACT-TG--GAAATC-C-CC--AG-A-T-AC--GAATATA-AA-CTG-----AAATGGCGA-TCGT--CAC-GA-------TTAA-CA---TT--TTT---TTTAAAA---ATT-CGCG---ATTAGGC-ATTG-CGTGA--Tt
gi|18 : GAA--A-ACT-T-CAACA-GG--CG-CCG-CC-A--TGTTT-GT-GTACA-C-AT-TACATTGC--ACC--A-ATCAGA--TTAAA----GC--TTTTTTAAAACT-TG--GAAATC-C-CC--AG-A-T-AC--GAAAATA-AA-CTG-----AAATGACAA-TTGT--CAT-GA-------TTAA---------------------AA-----T-CGCA---ATTAGG--ATTG-TGTGA--TT-TCA-ATAC-A--CTG-AAAA-ATTAG-CTTT-C-GCC-A-A---T-TGT-A-AATTT-C--TG---TAGC-CATT-TTTT--AGA--TTCTT-TCGC--C-------------------------AATGGCG-AACGGC-AGCGTG
gi|19 : tCGAA--ACACT-C-C-ACA-GGG-CG-CCG-CCCA--TGTTTT-T-AAACA-C-AT-TACAT-GC--ACC--ACATCAGAGATTAAAAGGGGC--TTTT---AAACT-TG--GAAATC-C-C---AG-A-TGACTGAAAAATA-AA-CTGCACAAAAATGACGA-TGG-----C-GA-------TTAA-CA---AT--TTT---TTT--AT---ATT-CGAG-AT--TAGGC-TTAG-CGTGA--TT-TCA-ATAC-A--CTG-AAAA-ATTagccc
gi|2 : aaaaatctgaaagtcttttctccaggggcggggggggggggtgggatgAAAAAAGT-GT-A-G-CACACTTTT-TG--TGCAAATTG------ATG-TT---TTG-CGTAACT---AGCGAA-TAT-CTTTC-GC-ACAG-AGATTC-------AC---G-T-TAT----CT--TTT-CA-CT---G---AAATGACC-TGTTT---TA--AACG-A--ATG-TT-T-T-CAT-ATC----AT---AA--------A--A----TA------AGTCA--------AG-C--ACT-G--CTGA---TGATTATTTGTGTTAGAT-T---CATA-T--G-AT-----ATTTG----AA-GAAAGTT------TG-G----TCC---GT-C-A---A---AT-T-TTC---CT---------CT-C------TC----AA---------TTCTCT-----TATT-TA-TT-------CACA--A----CAAAA-----A-------------------GATA----------------------T-------------A--------------AA-----------T---------------G------------------T--C--------AT-G-CC----TAA--TA----CTA--TTA-ACA-GGTAA---TT------A--TTT----ATG--TTTTGG---AC--TTT-AT-CGT--A---TTAA---CCGT-TG---TTA-ATT-AA-GGTGT-G--TCT--G--A-GTG-T----AAA-TC-A-TT-TT-A-G-TTGA--G---T--AGT-TT-----------T---GACATATATACAT---TATT-GC--AT-A-TACT-CAAGC--AA-ACAT-TAT---------TATA-AT--GG-----GA---------------GT---CAT--------ACA---------A-C-TGG-TTT-TC-T---------TGTTTTTAT-AAAAA-GT-GAGGC--A---A-CAG--GT--GA----TC-T-AG-AATAT---CAT-ACTA--A--AA--GGGAA--A-TAAATT-C-A-AA-GAA--------CA-----TTCT-TAA-C-TTC--AT-TA-CG------CT-------ACTAAGGAATTT---TAT---TTGT-TG----------TATC-GTCAA-T--CTCGAG--ATTTT--CCATTGCCGTTGATGAACCTGTGCTCCTTATC-AGA---T--TGATC-GTTAGGGAA-GG-AGTTT---TCA----TTCCACAT--GAACTA------ATT-ACATC-TTCAA--G-CTC-AATC--TT-GAAATCAAC---TTTC--AT-CATA--A---TCC--AAAAT--ATTC----CGGTCGAA--AA-------ACGAAA-TCTTTTCTCCTC-GTTATCGGA--A-ACTAT-CGACACAG--C--TCG-CCGA--TGTTTTGT-GTACA-CGAT-AATGTAGC--ACC--A-ATCAAA--TGAA---------TTTTTTAAAACT-TG--G-GATCGCGCC--AG-A-G-A---GAGAATA-AA-GCG-----AAAAGGAGAGTTGTCCCACGGA-------T--A-CATT-TT--TTT---TTT--TT---ATT-CGCGAATATTAGGC--TAT-TGTGA---T-TCA-ATACAA--CTGAAAAA-ATTGG-C--T-C-G-C-A-A-----TGC-ACAATTT-A--CGTTTTAGCTCATT-TTTTG-AGA--TTCTTGTCGC--C-ACCA-T---G--------CGA-AAAATGGCG-AACGGC-AGCGTGG
gi|20 : gaatTGAAAAAAAGT-GT-A-A-C-CACTTTT-TG--TGCAAAT-G------ATG-TT---TTG-------------------A------C-GC-ATAG-AGAT-C-------GC---G-T-TAC----CT--TTTTCA-CT-T-G---AAATGACC-T--TT---TA--ACC--A--ATGTTT-T-A-CAT-ATC----AT---AAAT------A--A----TA------AGTACATGTAAGCAA-T--ACT-G--CTGA---T---TA--------AGAT-T---TTTA-T--G-ATTG---ATTC------A-GAAAGTT----C-TT-G----TCC-A-GT-C-A---T---A--T-TTC---CT---------CT-C------TG----A----------TTTTCT-----TATT-AA-T--------CATA--A----GATAA-----A-------------------
gi|21 : ctcacactgggtAA-AGAT-C-------ACTTCG-T-TACTCCTCC--TTTTCA-CT-T-G---AAATGACC-T--TT---CATTA-C--A--ATG-TT-T-----T-A-C----AT---AA--------T--ATACTTA------AGT----------AA-CTAACT-G--CTGA---TGC-TA--------AGAT-T---TATA-T--G-ATTG---ATT------AA-GAAAGTT----A-TT-C----TTC----T-T-G---C---AG-C-TCT---CT---------CT-CT-----TC----AT---------TTTTCTTAAG-TATT-CA-----------ACA--A----CAAAA-----ACGTGTACACTATAAAACACGAGA----------------------G-------------A--------------AA-----------T---------------G------------------TTGC--------CT-G-TC----TAA--TAC--TATA--TTC-A-A-GGTAA---TT------A--Tctaaaca
gi|22 : --A-ATCAAA--TTAAA----GC--TTTTTTAAAACT-TG--GAAATC-A-CC--AG-AAT-AC--GAAAATA-AA-CTGG----AAATGGCGA-TTGT--CAC--A-------TTAA-CT---TT--TTT---TTT--AA---ATTCCGCA-ATATCAGGCGATTG-GTTGA---T-TCA-ATAC-A--CTG-AAAA-ATTGGACTTT-CGGCC-AGA---T-TGC-A-AATTCAC--TG---TAGC-CA-T-TTTTG-AGA--TTC-T-TCG---C-A--A-TG--G--------CG--AAAAT-GCGTAACGGCAAGCGTG
gi|23 : TAAAAGAAAGT-GT-A-G-C-CACTTTT-TGAGTG-AAAT-AGCCTATATG-TT---CTC-CGTCACCGTGAGCGAAACAT-CTTTT-GC-TCAA-AGAA-T-------GG---G-T-TAC----CT--TTCTCA-TT-T-G---AAATGACC-T--TT---TA--ACC--A--ATG-TT-T-A-CAT-GT-----AT---AT--------A--A----C-------AGT----------AA-C--A-T-C--CTGA---T---TA--------AGAagccc
gi|24 : taggtTGGAAAAAAGT-GT-A-G-C-CACTTTT-TG--TGCAAAT-G------ATG-TC---TTG-CAT--C----AGCAAAATAT-CTTTC-GC-ACAG-AGAT-C-------AC---G-T-TAT----CT--TTTT-A-CT-T-G---AAATGACC-T--TT---TA--ACC--A--ATG-TT-TCA-CAT-ATC----AT---GATTAATATTA--A----TA------AGT----------AA-
gi|25 : ctcacactgggt--------------AA-----------T---------------G------------------T--C--------AT-G-TC----TAA--TA---TCTA--TTC-A-A-GGTAAA--TT------A--TTTT---ATG--TTTTCA---AC--TCT-AT-CGT-TG---TTAA---CCTT-TG---TTA-ATC-AATGGTGT-G-ATCT--C--G-G-G-TA---AAA-TC-A-TT-CT-A-G-CTGG--G---T--gc
gi|26 : ----------TTTTCT-----TATC-AA-T--------CATC--A----CAAAA-----A-------------------GATA----------------------T-------------ACTAAACATGAGAGAAA-----------T---------------G------------------T--C--------AT-G-TC----TAA--TA---TCTA--TTC-A-T-TGTAA---TT------A--TTT----ATG--CTTTGG---AC--TCT-AT-CGT-CA---TTAA---CCTT-TG---TTA-gtagt
gi|27 : TA-T--G-ATTG---ATTC-----T--GAAAATT----C-TT-G----TCC-A-GT-C-A---T---AT-T-TCC---TTT--------CT-CGA----TC----A----------TTTTCT-----TACT-AA-T--------CAAA--A----TAAAC-----AC------------------GAAA----------------------G-------------A--------------AA-----------T---------------G------------------C--C--------AT-G-TC----TAA--TA---TCTA--TTC-A-A-GGTA
gi|28 : A------TATT-GC--AT-A-TACT-CA-GCA-AA-ACAT-T-T---------TA-------------------------------------AT--------A-----------A-C-TGGTTTG-TC-T---------GTGTTT--T-AAAAA-GT-GA-GC--C---A-CAA--GT--GG----TC-T-A--------------------A--AATGGGAAA--A-TAAAGT-C-A-AG-GCA--------CA-----TT
gi|29 : C-GTTAAGGGT-AG-AGTTT--ATCA---TTTCCATAT--AAACTATACTATA-T-ACATC-TTCAA--G-CTCCAATCCATTAA-AATTTAC---TTTC--AT-CATA--A---T-C--AA
gi|3 : G-CGTAA-----GGCGAAATAT-CTTTTAGC-ACAGGAGATTC-------GCT--G-T-TAC----TT--TTTCCA-CT-C-A---AAATGACC-A--TT---TA--ACC--AT-GTG-TT-T-A-CAT-ATCAGTAAC---AA--------A--A----TA------AGT----------AA-C--ACT-GACCTGA---T---TA--------AGACGTACATATA-C--G-A-TG---AATC------A-GAAAGTC----C-CT-GTGCTTCC-ATGT-C-T---T---AT-TATTTATACT---------CT-CGTCGGATC----A----------TTTTCTAAAAGTATA-TA-A--------AAAA--A----CAAAA-----A-------------------AAGAAAGAAAAAACCAAAACCGAGAAC-------------A--------------AA-----------T---------------G------------------T--C--------ATAG-TCG---TAA--TA---TCTAAGTTC-A-A---TAA---CTGCTTAGA--TTT----ATG--TTTTCG---ACAGTCT-AT-CGTACA---TGTA---CCTTATG-----A-ATTCAATAGTGT-G-ATCT--C--A-A-GCTA---AAAGTC-ATTT-CT-A-G-CTGGT-G---T--AG--TT-----------A---AAC-CATAGA------------C--AT-A-T------AGCA-AAGACGTCTATGG-------TTTA-AC--CA-----TA-------------T-t
gi|3 : cagggctcacgctgggttgaaaaaaaggtgcaaaatgactgcgctaaatag---T--GG--TT-----------T---AAC-CATAT----------T-GCG-AT-AATGCT-CAAGCA-AA-ACAT-TAT------------A-AC--TG-----TA-------------TTAT---TATTA------ACATTTTCCACG--C-TGGCTTT-TC-T---------TAATTT--T-AAAAA-GT-AA-GTGTA---A-CGA--GT--GA----AC-TTAGTAATTT---CAT-ACTA--A--AATGGGAAA--A-TAAAGT-C-A-AG-GTA--------CA-----TT-----A-CGCTG---C-TA-AG------C---------CTAAGGACATT---ATT---TTGT-TG----------TATC-TTCAATT--CTCGAG--AATTT--CCG---------------TTGTA-TCCTTGTC-AGA---C--TGATC-GTTTGGGGT-AG-AGTTT--ATCA---TTTCCATAT--GAACTT------A-T-ATATC-TTCAA--G-CTCCAATCCGTT-A-AATTTAC---TTTC--AT-CATT--A---T-C--GAAAT--ATTC-A--GT---AAA--AA-------ACGAAAGTCTTTTCTCTAC-GTTATCGAA--A-ACT-C-CGACA-GG--TG-CCG-CC-A--TGTTTT-T-GAACA-C-AT-TACATTGC--ACC--A-ATCAAA--TTAAA----GC--TTTTTTTAAACT-TG--GAAATC-C-CC--AG-A-T-AC--GAAAATA-AA-CTG-----AAATGGCGA-TTGT--CGG-TG-------TTAA-CA---AT--TTT---TTT---A---ATT-CGCG---ATTAGGC-TTGG-CGTGA--TT-TCA-ATAC-A--CTG-AAtgcgataatgctcaagcaaaacattataactgtattattattaacattttccacgctggcttttcttaattttaaaaagtaagtgtaacgagtgaacttagtaatttcatactaaaatgggaaaataaagtcaaggtacattacgctgctaagcctaaggacattattttgttgtatcttcaattctcgagaatttccgttgtatccttgtcagactgatcgtttggggtagagtttatcatttccatatgaacttatatatcttcaagctccaatccgttaaatttactttcatcattatcgaaatattcagtaaaaaacgaaagtcttttctctacgttatcgaaaactccgacaggtgccgccatgtttttgaacacattacattgcaccaatcaaattaaagctttttttaaacttggaaatccccagatacgaaaataaactgaaatggcgattgtcggtgttaacaatttttttaattcgcgattaggcttggcgtgatttcaatacactgaa
gi|30 : cagggctcacgctgggttgaaaaaaaggtgcaaaatgactgcgctaaataggcgtaaggcgaaatatcttttagcacaggagattcgctgttactttttccactcaaaatgaccatttaaccatgtgtttacatatcagtaacaaaataagtaacactgacctgattaagacgtacatatacgatgaatcagaaagtccctgtgcttccatgtcttattatttatactctcgtcggatcattttctaaaagtatataaaaaaacaaaaaaagaaagaaaaaaccaaaaccgagaacaaatgtcatagtcgtaatatctaagttcaataactgcttagatttatgttttcgacagtctatcgtacatgtaccttatgaattcaatagtgtgatctcaagctaaaagtcatttctagctggtgtagttaaaccatagacatatagcaaagacgtctaAAAAAAGT-GT-A-GAC-CACTTTT-TG--TGCAAAT-G------ATG-TT---TTGCCGTAAT-----GCGAAA-ATCCTTTC-GC-ACAG-AGAT-C-------
gi|31 : gctcacactgggttgAA-CAA--TT--TCT---TTT--AA---ATT-CGCA-AT--TAGGC-ACAG-TGTGA--TT-TTA-ATAC-A--CTA-AAAA-ATTTG-CTTT-C-GCC-A-A---T-TGT-G-AATTT-T--AG---TAag
gi|32 : CT-GAAGCA-AA-ACAT-TAT---------TATA-AC--TA-----TAATACATGTATATAT-AT---TAG--------ACATT-----TGA-C-TGGTTTT-TC-A---------TAATTT--T-AAAAA-t
gi|34 : GAG--ATTTT--CCGTTGC-----ATGAACTTGCA-TCGTTGTC-AGA---TAATGATC-GTTAGGGGC-AG-AGTTT--ATC
gi|35 : --TG---TAGC-CATT-TT-TG-AGA--TTCTT-TCGC--C-A--A-T-------------------ATGGCA-AACGGC-AGCGTG
gi|37 : --TTCTT-TCGC--C-A--AATG--G--------CG--AAAATGGCG-AACAGC-AGCGCGagcc
gi|38 : CGAAATAC-TTTTC-GC-ACAG-AGAT-C-------GC---G-T-TAC----CT--TTTTCA-agccc
gi|4 : TA-T--G-ATTA---CTTTGAAAAAA-AAAAATT----C-TTTG----TCCCA-GT-CCA---T---AT-A-TTC---CTTTGTATTCCCT-CGA----TC----AGAT-------TTTTTC-----TAT---A-A--------CATT--AAAACCAAAA-----ATAACCAC------------GAAA----------------------G-------------A--------------AA-----------TTG-------------A------------------C--C--------AT-GGTC----TAAA-TAA--TCTA--TTCCA-A-GGTAAAAATT------A--TTA----ATGA-TTTTCG---AA--TTT-AT-CGT-CATGCTTAAGCCCCCT-TGATCTTA-ATT-GATGGTGT-GAATCT--C--AGG-G-TA---AAA-TC-ATTT-CTAA-G-CTGGTTA---T--AG--TTTTTGTTGTTTGT---GA--CACATA-------ATTAGCCAATAA-TAAC-TAAGCA-AA-A-AT-TATGAGCTTTTACATG-GT--TGAAGAATA-------------T--T---TAG--------ACATT-----CGA-C-TGGTTTT-TC-TATTTTCTTATGTTTT--T-AAAAAGGTAAA-GT--AAATA-CGAAGGT--AATAACTT-T-AG--ATTTTTCCATAACTA--AATAATGGGAAA--A-TTAAGTGC-AGGG-GTAGAAGTCCCTA-----TTGTGTAA-C-TTG--ATGTATCGGC----CC-------TCTAAGG
gi|4 : att-TAAGGC-CTA-AG-GAC--------CACCTATTTTT-TAG-T-TTG--GT-TA-TGTGATATCT-------TCAAAGGTATTTGAAAGTCANNNNN-NNNN--------NNNN-NNNNNNN--NNNNNG--ATTTT--CCGT---CGT------------A-TCCTTGTC-AGA---T--TGATC-GTTTGGGGT-AG-AGTTT--ATCA---TTTCCATAT--GAACTA------A-T-ACATC-TTCAA--G-CTCCAATTCATT-A-AATTTAC---TTTC--AT-CATA--A---T-C--AAAAT--ATTC-G--GC---AAA--AC-------ATGAAAGTCTTTTCTCCTC-GTCATCGAA--A-ACT-C-CGAGA-GG--CG-CCA-CC-A--TATTTT-T-GAACA-C-AT-TACATTGC--ACC--A-ATCAAA--TTAAA----GC--TTTTTTTAAACT-TG--AAAATC-C-CC--AG-A-T-AC--GAAAATA-AA-CTG-----AAATGGCAA-TTGT--CGC-GA-------TTAA-CA----C--TTT---TTT--AA---ATT-CGCA---ACTAGGC-TTAG-CGTGA--TT-TCA-ATGC-A--CTG-AAAA-ATTGG-CTTC-C-GCC-A-A---TGTGT-G-AATTT-C--TG---TAGC-CATT-TTTT--AAA--TTCTT-TCAC--C-------------------------AATGGCG-AACGGC-AGCGTGcctaaggaccacctattttttagtttggttatgtgatatcttcaaaggtatttgaaagtcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngattttccgtcgtatccttgtcagattgatcgtttggggtagagtttatcatttccatatgaactaatacatcttcaagctccaattcattaaatttactttcatcataatcaaaatattcggcaaaacatgaaagtcttttctcctcgtcatcgaaaactccgagaggcgccaccatatttttgaacacattacattgcaccaatcaaattaaagctttttttaaacttgaaaatccccagatacgaaaataaactgaaatggcaattgtcgcgattaacacttttttaaattcgcaactaggcttagcgtgatttcaatgcactgaaaaattggcttccgccaatgtgtgaatttctgtagccattttttaaattctttcaccaatggcgaacggcagcgtgagccc
gi|40 : atttatgattactttgaaaaaaaaaaattctttgtcccagtccatatattcctttgtattccctcgatcagattttttctataacattaaaaccaaaaataaccacgaaagaaattgaccatggtctaaataatctattccaaggtaaaaattattaatgattttcgaatttatcgtcatgcttaagcccccttgatcttaattgatggtgtgaatctcagggtaaaatcatttctaagctggttatagtttttgttgtttgtgacacataattagccaataataactaagcaaaaattatgagcttttacatggttgaagaatatttagacattcgactggtttttctattttcttatgtttttaaaaaggtaaagtaaatacgaaggtaataactttagatttttccataactaaataatgggaaaattaagtgcaggggtagaagtccctattgtgtaacttgatgtatcggccctcCTAAGGACTTT---ATT---TTGT-TGTA--------agccc
gi|5 : tgctaagcTGAAAAAAAGT-GT-A-G-C-CACTTTT-TG--TGCAAAT-G------ATG-TT---TTG-CGTAAT----AGCGAAATAT-CTTTC-GC-ACAG-AGAT-C-------AC---G-T-TAT----CT--TTTTCA-CT-T-G---AAATGACC-T--TT---TA--ACG--G--ATG-TT-T-A-CAT-ATC----AT---AA--------A--A----TA------AGC----------AA-C--ACT-G--CTGA---T---TA--------AGAT-T---CATA-T--G-AT-----ATTTG----AA-GAAAGTT----C-TT-G----TCC-A-GT-C-A---A---AT-T-TTC---CT---------CT-C------TC----A----------TTTTCT-----TATT-TA-T--------CATC--A----CAAAA-----A-------------------GATA----------------------T-------------A--------------AA-----------T---------------G------------------T--C--------AT-G-CC----TAA--TA---TCTA--TTT-A-A-GGTAA---TT------A--TTT----ATG--TTTTGG---AC--TTT-AT-CGT-CA---TTAA---CCGT-TG---TTA-ATT-AAAGGTGT-G-GTCT--G--A-GTG-T----AAA-TC-A-TT-TT-A-G--TGA--G---T--AG--TT-----------T---GAC-CATATATACATTTATT-GC--AT-A-TACT-CAAGCA-AA-ACAT-TAT---------TATA-AC--TG-----GA---------------GT---CAT--------ACA---------A-C-TGGTTTT-CT-T---------TGTTTT--T-AAAAA-GT-GA-GC--A---A-CAG--GT--GA----TC-T-AGTAATAT---CAT-ACTA--A--AATGGGAAA--A-TAAATT-C-A-AG-GAA--------CA-----TTCT-TAA-C-TTC--AT-TA-CG------CT-------ACTAAGGAATTT---ATT---TTGT-TGT---------TATC-GTCAATTTCCTCGAG--ATTTT--CCATTGCCGTG-ATGAACTTGCA-TCCTTATC-AGA---T--TGATC-GTTAGGGAC-AG-AGTTT--ATCA-----TCCACAT--GAACTA------A-T-ACATC-TTCAA--G-CTCAAATC--TT-G-AATCAAC---TTTC--AT-CATA--A---T-C--AAAAT--ATTC-G--CG---AAA--AA-------ACGAAAATCTTTTCTCCTC-GTTATCGAA--A-ACT-T-CGACA--G--CG-CCG-CC-A--TGTTTTGT-GTACA-C-AT-TACATTGC--ACC--A-ATCAAA--TGAAA----G---TTTTTTAAAACT-TG--GAAATC-C-CC--AG-A-T-AC--GAAAATA-AA-CTG-----AAATGGAGA-TTGT--CAC-GA-------TTAA-CATTTTT--TTT---TTT--TA---ATT-CGCA-ATATTAGGC-ATTG-TGTGA--AT-TCA-ATAC-A---TG-AAAA-ATTGG-C-TT-C-GCC-A-A---T-TGC-A-AATTT-C--TG---TAGC-CATT-TTTTGAAGA--TTCTT-TCGC--A-A--A-TG--G--------CGAAAAAATGGCGAAACGGC-AGCGTGG
gi|6 : TGAAAAAAAGTCGT-A-G-C-CACTTTT--G--TACAAAT-G------ATG-TT---TTG-CGTAA------GCGAAATAT-CTTTC-GC-AAAG-AGAT-T-------GC---G-T-TAC----CT--TTTCTA-CT-C-A---AAATGACC-A--TT---AT--ACC--A--ATG-TTCT-G-CAT-ATC----AT---AA--------AT-A----TA------AGT----------AA-C--ACT-G--CTTG---T---TA--------AGAT-T---TATAAT--G-ATTG---ATTC-----AG-AAAGGTC----C-TT-G----TCC-A-GTTC-A---T---ATAT-TTC---CT---------CT-C------TC----AATCA------TTTTCT-----TATT-AA-T--------CATT--A----CAAAA-----A-------------------TAAA----------------------T-------------A--------------AA-----------TAAACACAAGAAAAATG------------------T--C--------AT-G-TC----TAAAAGA---TCTAGGTTC-A-A-GGTGA---TT------A--TTTT---ATG--TTTTCG---AC--TCT-AT-CGT-CT---TTAA---CCTT-TG---TTA-ATT-AATGGTGT-G-ATCT--C--A-G-G-TA---AAA-TC-A-TT-CT-A-G-CTGG--G---TGTAG--TT-----------T---GAC-CA------------------------------AAGCA-AA-ACAT-TAT---------TATA-AC--TA-----TA-------------T-ATAT-TAG--------ACATT-----TGA-C-TGGTTTT-TC-T---------TAATTT--T-AAAAA-GT-AA-GT--A---A-CGA--GT--GA----AC-TTAGTAATTT---CAT-ACTA--A--AATGGGAAA--A-TTAAGT-C-G-AG-GTA--------CA-----TTCT-TAA-T-TTG--AT-TA-CG------CTGCTAAG-CCTAAGGGCTTT---ATT---TTGT-TGTACAG-----TATC-TTCAATT--CTCGAG--TATTT--CCG---------------TTGTA-TCCTTGTC-AGA---C--TGATC-GTTTGGTGT-AG-AGTTT--ATCA---TTTCCATAT--GAACTA------A-T-ACATC-TTCAA--G-CTCCAATCCGTT-A-AATTTAC---TTTC--AT-CATA--A---T-C--AAAAT--ATTC-G--GT---AAA--AA-------ACGAAAGTCTTTTCTCCAC-GTTATCGAA--A-ACT-C-TGACA-GT--CG-CCG-CC-A--TGTTTT-T-AAACA-C-AT-TACATTGC--ACC--A-ATCAAA--TTAAA----GC--TTTTTGTAAACT-TG--GAAATC-C-CC--AG-A-T-AC--GAAAATA-AA-CTG-----AAATGGCGA-TTGT--CGC-GA-------TTAA-CA---AT--TTT---TTT--AA---ATT-CGCG---ATTAGGC-TTAG-CGTGA--TT-TCA-ATAC-A--CTG-AAAA-ATTG
gi|7 : cagggctcacactgggtTGAAAAAAAGT-GT-A-G-C-CACTTTT-TG--T--AGAT-G------ATG-TAAAATTG-TGT--C----AGCAAAATAT-CTTTC-GT-ACAG-AGAC-C-------GC---G-T-TACA---TT--TTTTCAACT-T-G---AAATGAC--T--GT---TA--AAC--A--ATG-TT-TTA-CAT-ATC----AT---AA--------ATAA----TA------AGT----------AA-C--TCT-G--CAGA---T---TA--------AGAT-T---TATA-T--G-ATTG---ATT------AA-GAAAGTTAATTC-TT-G----TCC-A-GT-C-A---A---AT-T-T-C---CT---------CT-C------TC----A--------------------------GA-G--------GATA--A----CAAAA-----A-------------------GATA----------------------CACTAAACACAGAGA--------------AA-----------T---------------G------------------T--T--------AT---TA----TAA--TA---TCTA--TTC-A-A-GGTAAT--TT------A--CTT----ATG--TTTTTA---CT--TCA-AT-CAC-CA---TTAA---AC-T-TG---ATA-ATT-AAAGGTATGG-ATCT--CAAA-G-A-TA---GAA-TA-A-TC-TA-A-G-CTGC--A---T--AGTATT-----------T---G---CATATA------AAAC-TC--AT---TACT-CAAGCATAA-ACAT-TAT---------TATA-AC--TG-----GA-------------G-A---------------ACATT-----CGATC-TGGTTTC-CA-T---------TATTTT--TAAAAAA-GA-GA-GC--A---ATCAA--CC--GA----TC-T-AGTA---T---CAT-AC-A--A--AATGGGAAA--A--AAAGT-C-A-AGAGAA--------CA-----TTCT-TAA-C-TTG--AT-TA-CG------CT-------CCTAAGGAATTA---ATT---TTGTATGTAC-------TAT-----AATT--CTCGAG--AATTTACCCGTTG-------TGA---------CCTTGTC-AGA---T--TGATCAATTAGGGGCAAG-AGTTTTAATCA---TTT-CACAT--GATATA------A-T--CCTC-TTCAACCG-CTC-AATCC-TT-G-AATT-AC---TTTCCAAT-CATATGAAATT-C--AAAATAAATTC-G--GGC--AAA--AA-------ACGAAAGTCTTTTCT--TC-GTTAGCGAA--A-ACT-T-CAACA-GG--CA-ACG-CC-A--TG-TTTGT-GTACA-C-AT-TATACTGC--ACC--A-ATCAAA--TTCAA----GC--TTTTTTAAAACC-TG--GAAATC-C-CC--AG-A-T-AC--GAAAATA-AA-CTG-----AAATGCCGA-GTGT--TAC-GA-------TTAA-CCTT-TT--TTT---TTT--AA---ATT-CGCG-AT-TT-GGC-AT
gi|8 : cagggctcacactgggtTAAAAAAAAGT-GTGA-G-C-CACTTTA-TG--TGCAAAT-G------ATG-TT---T-G-AGTAA------ACGAAATAT-CTTTC-AC-ACAG-A-AT-CAGTGTTTGCTTTG-T-TGT----TTGTTTTTCA-CT-T-GGCAAAATGACCATG-TTGAATA--GTC--C--ATG-TTCT-G-CATTATCG---AT---AGG-------A--A----TATTGATTAGT----------AA-C--ACT-GTGCTGA---T---TA--------AGAT-T---TATA-TTGGTATTAGGAATTA-----GACGAGAGTCA---T-TT-GGT--TCC-A-AT-C-A---TGATAT-T-TGC---CC---------CTAC------TC----GGATGTCAGTTTTTTCT-----TATT-AG-TATGGATTGCATTGAA----CAAAA-----A-------------------AATAAACCAACA--------------TGAGGA--------A--------------AA-----------T---------------G------------------T--C--------AT-G-TGATTATAA--TG----CTA--TTC-A-A-G-TAA---TTT-----A--TTTTTATATGGTTTTTCGGCGAC--TCT-A--CGT-CA---T-AA---CCTT-TG---TTA-ATT-AATGGTGT-G-ATCTCAC--A-G-G-TA---AAA-TC-A-TTCCT-ATG-CTGGGTG---T--AG--TT-----------TAGAAAC-CATA-------------GC--AT-A-TGCTGAAAGC--AA-ACAT-TAT---------TATA-ATA-TA-----TA-------------T-GT---CAT--------At
gi|9 : agggctccactgtggtggtttgggggttgTTT--T-AAAAA-GT-GA-GC--A---A-CAA--GC--GA----TC-T-ATAAATAT---CAT-ACTA--A--AATGGGAAA--A-TAAATT-C-A-AG-GAA--------CA-----TTCT-TAA-C-TTC--AT-TA-CG------CT-------TCTAAGGAATTT---ATT---TTGT-TGT----------------CAATT--CTCGAG--ATTTT--CCGTTGCCGTG-ATGAACTTGCA-TCCTTATC-AGA---T--TGATC-GTTAGGGAC-AG-AGTTT--ATCA---TTTCCACAT--GAACTA------A-T-ACATC-TTCAA--G-CTCAAATC-GTT-G-AATCAAC---TTTC--AT-CATA--A---T-C--AAAAT--ATTC-GG-CG---AAA--TA--------CGAAAGTCTTTTCTCCTC-GTTATCGAA--A-ACT-T-C-ACA-GG--CG-CCG-CC-A--TGTT--GT-GTACA-C-AT-TACATTGC--ACC--A-ATCAAA--TTAAA----GC--TTTTTTAAAACT-TG--GAAATC-C-CC--AG-A-T-AC--GAAAATA-AA-CTG-----AAATG-CGA-TTGT--CAC-GA-------TTAA-CA---TT--TTT---TTT--AA---ATT-CGCA-ATATTAGGC-ATTG-TGTGA--TT-TCA-ATAC-A--CTG-AAAA-ATTGG-CTTT-C-GCC-A-A---T-CGC-A-AATTT-C--TG---TAGC-CA-T-TTTTG-AGA--TTCTT-TCGC--C----A-T---G--------CG--AAAATGGCG-AAT-GC-AGCGTGacaaacaatgattttcagtgtgtattcta
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|33 ): TCTGTACATAGAAAATATAGGCCTTATAGAGACTATTCTCAGGGCTCACGCTGGGTTGAAAAAAA
Unaligned ( gi|36 ): AATTTCCTGCTTTGTAGTTGCAGGGCTCACACTGGGTTGAAAAAAA
Unaligned ( gi|39 ): AGGGCTCACTCTGGGTTGAAAAAAAGTGTA
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 111111 33333333 11111111111111 1111111 11111 33333333333 1111111111 11 11111111 222222222 1111 111111111 33333333333333333333333 11111 1111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 111 111111 1111 222222 444444444444444444444444444444444444 111111111 555555555555555555555555555555555555555555 111111 111111111 11111111 2222222222222222 4444444444444444 3333333333333 2222222222 1111111 11111 1111 11111 333333333333333333333333
lowQualScore : 3 3 3 3 3 3 77 3 111111 3 555 2 44444444 2 2 2 2 55555555555555 2 2 7777 33 2 2222222 7777 444 33 66 66 2 99999 2 8888 444 55555555555 5555 777777 5555555555 2 66 2 00 555 888 00000000 3 555 2 33 2 55555 333333333 8888 2 2 2222 222 2 2 8888888 5 2 444 333333333 2 77777777777777777777777 11111 44 2222222222 444 5555 66666 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 33 99999999 2 2 7777 55 999 66 2 2 2 222 000000 77 4444 66 0 777 33 2 2 2 555 555 0 2 555 2 6 2 3 6 88 44 3 6 3 555 3 3 6 6 3 6 3 222222 44 88 333333333333333333333333333333333333 77 777 2 88 3 3 3 666666666 3 999999999999999999999999999999999999999999 2 111111 3 3 3 3 444444444 1 44 3 3 3 3 44 555 3 44 44 7777 3 6 3 3 666 3 55 55 55 3 3 3 3 3 1 22222222 88888 3 3 3 55 3 3 9999999999999999 0 777 777 4 0000000000000000 55 55 0 55 8888888888888 333 3 555 44 3 0 66 2 99 555 44 888888 3 3 3 77 3 7 11 3 3 4 888 44 3 88 555 3 44 44 3333333333 44 0000000 3 33 2 2 2 1 2 66 2 2 5 33 3 8 2 1 2 2 2 33 33 2 33 5555 66 2 2 33 2 5 33 2 2 2 33 2 2 44444 2 33 2 8888888 2 7777 33 444 33 444 2 55555 66 3 33 77 3 3 3 44 3 3 4 0 4 4 4 4 777 4 777 9999 666 4 8 4 4 55 3 55 999999999999999999999999 7 5 3
lowQualScore : . . . . . . .. . ...... . ... . ........ . . . . .............. . . .... .. . ....... .... ... .. .. .. . ..... . .... ... ........... .... ...... .......... . .. . .. ... ... ........ . ... . .. . ..... ......... .... . . .... ... . . ....... . . ... ......... . ....................... ..... .. .......... ... .... ..... .......................................................................................................................... .. ........ . . .... .. ... .. . . . ... ...... .. .... .. . ... .. . . . ... ... . . ... . . . . . .. .. . . . ... . . . . . . . ...... .. .. .................................... .. ... . .. . . . ......... . .......................................... . ...... . . . . ......... . .. . . . . .. ... . .. .. .... . . . . ... . .. .. .. . . . . . . ........ ..... . . . .. . . ................ . ... ... . ................ .. .. . .. ............. ... . ... .. . . .. . .. ... .. ...... . . . .. . . .. . . . ... .. . .. ... . .. .. .......... .. ....... . .. . . . . . .. . . . .. . . . . . . . .. .. . .. .... .. . . .. . . .. . . . .. . . ..... . .. . ....... . .... .. ... .. ... . ..... .. . .. .. . . . .. . . . . . . . . ... . ... .... ... . . . . .. . .. ........................ . . .
lowQualScore : 1 1 1 1 1 1 33 1 999999 1 444 9 22222222 5 5 5 4 66666666666666 5 5 8888 44 5 7777777 9999 777 77 33 33 7 11111 7 3333 777 44444444444 7777 777777 3333333333 7 88 9 77 000 999 44444444 1 444 7 77 7 99999 000000000 3333 7 7 0000 999 7 7 3333333 3 7 777 333333333 7 55555555555555555555555 66666 44 9999999999 444 3333 22222 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 44 11111111 5 5 8888 99 444 99 5 5 5 777 333333 33 6666 88 1 999 99 9 9 9 000 000 7 9 000 9 2 6 1 2 55 22 1 2 1 444 1 3 7 7 3 7 3 000000 66 66 222222222222222222222222222222222222 99 111 1 99 1 1 1 555555555 1 222222222222222222222222222222222222222222 1 777777 6 6 6 6 555555555 0 66 3 1 3 3 66 888 3 66 66 1111 3 7 3 5 444 6 00 00 00 3 3 3 3 3 0 11111111 33333 6 6 6 00 6 6 8888888888888888 6 000 000 0 8888888888888888 55 00 3 00 5555555555555 999 3 888 66 1 1 99 9 66 444 22 888888 1 1 1 33 1 8 77 1 1 0 555 22 1 55 444 1 22 66 9999999999 66 8888888 3 99 9 9 9 2 9 88 9 9 7 99 4 4 9 4 9 9 9 99 77 7 77 7777 33 9 7 77 7 3 77 7 7 7 77 7 7 77777 7 77 7 7777777 5 4444 44 444 44 444 5 22222 11 6 55 33 1 1 1 22 1 3 0 8 0 0 0 0 000 0 666 7777 444 0 1 0 0 00 6 00 999999999999999999999999 3 1 6
consensus : TGAAAAAAAGT-GT-A-G-C-CACTTTT-TG--TGCAAAT-G------ATG-TT---TTG-CGTAAC----AGCGAAATAT-CTTTC-GC-ACAG-AGAT-C-------GC---G-T-TAC----CT--TTTTCA-CT-C-G---AAATGACC-T--TT---TA--ACC--A--ATG-TT-T-G-CAT-ATC----AT---AA--------A--A----TA------AGT----------AA-C--ACT-G--CTGA---T---TA--------AGAT-T---TATA-T--G-ATTG---ATTC-----AA-GAAAGTT----C-TT-G----TCC-A-GT-C-A---T---AT-T-TTC---CT---------CT-C------TC----A----------TTTTCT-----TATT-NA-T--------CATN--A----CAAAA-----A-------------------GATA----------------------T-------------A--------------AA-----------T---------------G------------------T--C--------AT-G-TC----TAA--TA---TCTA--TTC-A-A-GGTAA---TT------A--TTT----ATG--TTTTCG---AC--TCT-AT-CGT-CA---TTAA---CCTT-TG---TTA-ATT-AATGGTGT-G-ATCT--C--A-G-G-TA---AAA-TC-A-TT-CT-A-G-CTGG--G---T--AG--TT-----------T---GAC-CATATA------TATT-GC--AT-A-TACT-CAAGCA-AA-ACAT-TAT---------TATA-AC--TG-----TA-------------T-GT---CAT--------ACATT-----CGA-C-TGGTTTT-TC-T---------TANTTT--T-AAAAA-GT-GA-GC--A---A-CGA--GT--GA----TC-T-AGTAATNT---CAT-ACTA--A--AATGGGAAA--A-TAAAGT-C-A-AG-GNA--------CA-----TTCT-TAA-C-TTG--AT-TA-CG------CT-------NCTAAGGAATTT---ATT---TTGT-TGTA--------TATC-GTCAATT--CTCGAG--ATTTT--CCGTTGCCGT--ATGAACTTGCA-TCCTTGTC-AGA---T--TGATC-GTTAGGGGC-AG-AGTTT--ATCA---TTTCCACAT--GAACTA------A-T-ACATC-TTCAA--G-CTCAAATCCGTT-G-AATTNAC---TTTC--AT-CATA--A---T-C--AAAAT--ATTC-G--CG---AAA--AA-------ACGAAAGTCTTTTCTCCTC-GTTATCGAA--A-ACT-T-CGACA-GG--CG-CCG-CC-A--TGTTTTGT-GTACA-C-AT-TACATTGC--ACC--A-ATCAAA--TTAAA----GC--TTTTTTAAAACT-TG--GAAATC-C-CC--AG-A-T-AC--GAAAATA-AA-CTG-----AAATGGCGA-TTGT--CAC-GA-------TTAA-CA---TT--TTT---TTT--AA---ATT-CGCG-ATATTAGGC-ATNG-CGTGA--TT-TCA-ATAC-A--CTG-AAAA-ATTGG-CTTT-C-GCC-A-A---T-TGC-G-AATTT-C--TG---TAGC-CATT-TTTTG-AGA--TTCTT-TCGC--C-A--A-TG--G--------CG--AAAATGGCG-AACGGC-AGCGTGG
Reference ( family-1600 ) : TGAAAAAAAGT-GT-A-G-C-CACTTTT-TG--TGCAAAT-G------ATG-TT---TTG-CGTAAC----AGCGAAATAT-CTTTC-GC-ACAG-AGAT-C-------GC---G-T-TAC----CT--TTTTCA-CT-C-G---AAATGACC-T--TT---TA--ACC--A--ATG-TT-T-G-CAT-ATC----AT---AA--------A--A----TA------AGT----------AA-C--ACT-G--CTGA---T---TA--------AGAT-T---TATA-T--G-ATTG---ATTC-----AA-GAAAGTT----C-TT-G----TCC-A-GT-C-A---T---AT-T-TTC---CT---------CT-C------TC----A----------TTTTCT-----TATT-NA-T--------CATN--A----CAAAA-----A-------------------GATA----------------------T-------------A--------------AA-----------T---------------G------------------T--C--------AT-G-TC----TAA--TA---TCTA--TTC-A-A-GGTAA---TT------A--TTT----ATG--TTTTCG---AC--TCT-AT-CGT-CA---TTAA---CCTT-TG---TTA-ATT-AATGGTGT-G-ATCT--C--A-G-G-TA---AAA-TC-A-TT-CT-A-G-CTGG--G---T--AG--TT-----------T---GAC-CATATA------TATT-GC--AT-A-TACT-CAAGCA-AA-ACAT-TAT---------TATA-AC--TG-----TA-------------T-GT---CAT--------ACATT-----CGA-C-TGGTTTT-TC-T---------TANTTT--T-AAAAA-GT-GA-GC--A---A-CGA--GT--GA----TC-T-AGTAATNT---CAT-ACTA--A--AATGGGAAA--A-TAAAGT-C-A-AG-GNA--------CA-----TTCT-TAA-C-TTG--AT-TA-CG------CT-------NCTAAGGAATTT---ATT---TTGT-TGTA--------TATC-GTCAATT--CTCGAG--ATTTT--CCGTTGCCGT--ATGAACTTGCA-TCCTTGTC-AGA---T--TGATC-GTTAGGGGC-AG-AGTTT--ATCA---TTTCCACAT--GAACTA------A-T-ACATC-TTCAA--G-CTCAAATCCGTT-G-AATTNAC---TTTC--AT-CATA--A---T-C--AAAAT--ATTC-G--CG---AAA--AA-------ACGAAAGTCTTTTCTCCTC-GTTATCGAA--A-ACT-T-CGACA-GG--CG-CCG-CC-A--TGTTTTGT-GTACA-C-AT-TACATTGC--ACC--A-ATCAAA--TTAAA----GC--TTTTTTAAAACT-TG--GAAATC-C-CC--AG-A-T-AC--GAAAATA-AA-CTG-----AAATGGCGA-TTGT--CAC-GA-------TTAA-CA---TT--TTT---TTT--AA---ATT-CGCG-ATATTAGGC-ATNG-CGTGA--TT-TCA-ATAC-A--CTG-AAAA-ATTGG-CTTT-C-GCC-A-A---T-TGC-G-AATTT-C--TG---TAGC-CATT-TTTTG-AGA--TTCTT-TCGC--C-A--A-TG--G--------CG--AAAATGGCG-AACGGC-AGCGTGG
gi|1 : T-CTTTC--C-AAAG-AGAT-TCT-----GC---A-TGTAC----CT--TTTTCA-CT-C-A---AAATGACA-T--TT----A--ACC--A---TG-TTCT-G-CAT-ATC----ATTATAATT------AT-A----TA------AGT----------AAGC--ACT-GG-CTGAGATT---TA--------AGAT-T---T-TA-T--G-ATTG---ATTC-----AG-AATAGTT----CCTT-G----TCC-A-GT-C-AGTAT---AT-T-TTC---CT---------CT-CCTCGA-TC----A----------TTTTCT-----TATT-TAAT--------CATT--A----CAAAA-----A--------------------ATAAA--------------------T-------------A--------------AA-----------T---------------GAAACACGCAGAAAAATGAT--C--------AT-G-TC----TAA--TA---TCTA--TTC-A-AAGGTAAA--TT------AATTTT----ATG--TTTTCGT--AC---CT-ATTCGT-CT---TTAA---CCTT-TA---TTA-ATT-AATGGTGT-G-ATCTGCC--A-G-G-TAATTAAA-TC-A-TTCCT-ATG-CTGG--GTT-T--AG--TT-----------TA--GAC-C----A------TATT-GC--ATCA-TGCTAGAAGCA-AA-AAAT-TAT---------TATAGAC--TA-----TA-------------TAGTATACATGTAAATAGACATT-----TGA-CTTGGTTTTGTC-T---------CTATTT--T-AAAAA-AA-GA-GT--A---A-CGA--TTGAGA----CT-T-AGTAATTT---CAT-ACTAAGA--AATGGGAAAAGA-TAAAGT-C-A-AG-GTA--------CA------TCT-TAAGC-TTGGAAT-TA-CG------CTGCTAAGCCCTAAGGACTTT---ATT---TTGT-TGTATTGCCCAGTATCTATCAATT--C-CGAGAAATTTT--CCGTT---GT--AT----T-----TTCTTGTCAAGAGCCC--TGATC-GTT--GGGT-AGAAGTTTG-ATCAGATTTTCCATATTGAAACTA------A-TAACATCTTTCAAG-G-CTCCAATCCGTT-A-AATTTTCCTTTTTC--AT-CATATTA---T-CAAAAAAT--ATTC-G---G---TAA--AA-------CGGAAAGTC-TTTCTCCAC-G-TAT--GA--A-ACT-CGCGACA-TG--CGTCCG-CC-A--TGTTTTATAAAACAGC-ATGTACATTGCAGACCCAA-ATCAAA--TT--A----GCT-TTTTTTTAAACT-TG--G-AATC-CGCC--AG-A-T-AC--GAAAATATAA-CTGA----AAATGGCGA-TTGT--CAC-GA-------TTAATCA---AGAATTT---GTA--AA---ATT-CGCG---ATTAGGC--TAGTCGTGAGTTT-TCA-ATAC-ATCTTG-AAAA-ATTGG-TTTTCC-GCC-A-AATTT-TGT-G-AATTT-TGGTG---TAGC-CAGT-TTTTG-ATATTTTCTT-TCGCATCGA--A-TG--GGATTGAAAGG--AAAATGGCG-AACGAC-AGCGTG
gi|10 : TGAAAAAAAGT-GT-A-G-C-CACTTTA-TG--TGCAAAT-G------ATG-TT---TTG-AGTAA------GCGAAATAT-CTTTC-AC-ACAG-AGAT-C-------GC---G-T-TGC----CT--TTTTCA-CT-C-A---AAATGACC-A--TT---TA--ACC--A--ATG-TTCT-G-CAT-ATC----AT---AA--------ATAA----TA------AGT----------AA-C--ACT-G--CTGA---T---TA--------AGAT-T---TATA-T--G-ATTG---ATT------AA-GAAAGTC----C-TT-G----TCC-A-AT-C-A---T---ATAT-TTC---CT---------CT-C------TCGATCA----------TTTTCT-----TATT-AA-T--------CATT--A----CAAAA-----A-------------------AATAAACAAACA--------------TGAGAA--------A--------------AA-----------T---------------G------------------T--C--------AT-G-TC----TAA--TA---TCTA--TTC-A-A-GGTAA---TT------A--TTTT---ATG--TTTTCG---AC--TCT-AT-CGT-CA---TTAA---CCTT-TG---TTA-ATT-AATGGTGT-G-ATCT--C--A-G-G-TA---AAA-TC-A-TT-CT-A-G-CTGGGTG---T--AG--TT-----------T---GAC-C----A------TATT-GC--AT-A-TGCT-GAAGCA-AA-ACAT-TAT---------TATA-ACTATA-----TA-------------T-AT---TAG--------ATATT-----TGA-C-TGGTTTT-TC-T---------TAATTT--T-AAAAA-GT-AA-GT--A---A-CGA--GT--GA----ACTT-AGTAATTT---CAT-ACTA--A--AATGGGAAA--A-TAAAGT-C-A-AA-ATA--------CA-----TTCT-TAA-C-TTG--AT-TA-CG------agcc
gi|11 : cagggctcacactgggtAAAAAAAGT-GT-A-G-C-CACTTTT-TGA-GGCAAAT-G------ATG-TT---TTG-CGTAA------GCGAACTAT-CTTTC-GC-ACAG-AAATGC-------G----G-T-TGC----CT--TTTTCA-CT-T-A---AAATGACC-T--TT---TA--ACCTGA--ATG-TT-T-TTCAT-ATC----AT---AA--------AT-A----TA------AGT----------AA-C--ACT-G--CTGA---T---TA--------AGGT-T----ATA-T--G-AT-G---ATTC-----AA-TAA-GTT----C-TT-G----TCC-A-GT-C-A---T---AT-T-TTT---GC---------TT-C------TC----A-----------TTTCT-----TATTAAA-T--------CATC--A----CAAAAGATTTA-------------------GATAAC--------------------T-------------A--------------AA-------------------------------------------------CAAGAGAGAAT-G-TC------A--TG---TCTA--TTC-A-A-GGT-A---TT------A--TTT----ATG--TTTTGG---AC--TCT-AT-CGT-CA---TTAA---CCTT-TG---TTATATCAAAGGGAGT-G-ATCT--C--A-G-G-TA---AAA-TC-A-TT-CT-A-GTTTGG--GTAAT--AG--TT-----------T-----CGCACGCA------TATT-GC--AT-A-TACT-CAAGCA-AA-ACAT-TTT---------TATA-AC--TG-----CA-------------T-G----GGG--------ACATT-----CGA-C-TGGTTTG-TCTT---------TATTTT--A-AAAAA-GT-GA-GC--A---A-CAT--GT--GA----TC-T-AATA
gi|12 : cagggctcacactgggttgaAAAA-GT-GA-GC--A---A-CAA--GT--GA----TC-T-AGTAATAC---CAT-GCTA--A--AATGGGAAA--AATAAATT-C-A-AG-GAA--------CA-----TTCT-TAA-C-TTC--AT-TA-CG------CT-------GCTAAGGAATTT---ATT---TTGT-TGT----------------CAATT--CTCGAG--ATTTT--CCGTTGCCGTG-ATGAACTTGCA-TCCTTATC-AGA---T--TGATC-GTTAGGGAC-AG-AGTTT--ATCA---TTTCCACAT--GAACTA------A-T-ACATC-TTCAA--G-CTCAAATCCGTT-G-AATCAAC---TTTC--AT-CATA--A---T-C--AAAAT--ATTCGG--CG----AA--AA-------ACGAAAGTCTTTTCTCCTC-GTTATCGAA--A-ACT-T-CGACA-GG--CG-CCG-CC-A--TG-TTTGT-GTACA-C-AT-TACATTGC--ACC--A-ATCAAA--TTAAA----GC--TTTTTTAAAACT-TG--GAAATC-C-CC--AG-A-T-AC--GAAAATA-AA-CTG-----AAATGGCGA-TTGT--CAC-GA-------TTAA-CA---TT--TTT---TTT--AA---ATT-CGCA-ATATTAGGT-ATTG-TGTGA--Ttca
gi|13 : TC-GTCAATT--CTCGAG----TTT--GCGTTGC-----ATGAACTTGC----CTT-TC--GA---T---GATC-GTTAGGAG--AG-AGTTT--AT-A---TTC-----T--GAACTA------A-T-ACATC-TTCAA--G--TCAA-TCCGTT-G-AATCAAAG--TTTC--ATTCATA--A---T-C--AAAAT--CTTC-GGCCG---AAAGAAA-------ACGA--GTCTTTTCTC-TC-GTTA-CGAA--A--CT-T-CGACA-GG--CG-CCG-CC-A--TGT------GTACA-C-AT-TACATCGC----C--A-ATCAAA----AAA----GC--TTTTTTAAAACT-TG--GAAATC-T-CCCAAG-A---AC----ACATA-AA-CTGA----AAATGGC-A-TTGT--CAC-GA-------TTAA-CA---TT--TTT---TTT--AAAACATT-CGC--ATAT--AGC-AT-G-TGTGA--TTATCACACAC-A--CTG-AAAA-ATTGG-CTTT-C-GCC-A-A---T-TGC-A-AAATT----TG---TAGC-CATTATATTG-AGA--TTCTT-TCGC--C-A--A-TGGTG--------CA--GAAATGGCG-AAT-GC-AGCGTG
gi|14 : TTAGGGGA-AG-AGGTTG-ATCA---TTTCCACA---GTAC--------A-T-ATATC-TTCAA--GACTCAAATCCGTT-G-AATTCAC---TTT---AT-CGTA--A---T-C--AAAAT--AT-C-GT-CG---AAA--AATCATTCTACCAA--TCTTT-CTCCTTTGTTATCGAATCA-TCT-T-TTGCA-AGAGCA-CCGGCC-AGTTGATGTAC-GCACA-C-TT-TACATTGC--ACC--A-ATCAAA-----AA----GC--TTTT---AAACTCTGATGAAATC-C-C---AGTA-T-GC--GAAAATA-ATTCTC-----GAATATCGA-T-GT--CAT-GACTCGTCATTAA-CA---AC--TTCACATTT--AA---ATT-C-CG--TATTAG-C-ACAG-GCTGAAATT-TCA-ATAC-A--CTG-AAAAAATTGG-CTTT-C-GCCAA-A---T-TGTGG-AATTT-C--TG---TAGC-CA---TTTTG-AGA--TTCTT-TCGC--C-A--A-TG--G--------CG---AAATCGTG-AAC-GC-AGCGTagcc
gi|15 : tcTGAAAAAAAGT-GT-AAG-C-CACTTTTTTG--TGCAAAT-GA-----ATGTTT---TTG-CGTA------AGCGAAATAG-CTTTC-GG-ACAG-AGAT---------GT---GTT-TAC----CT--TTTTCA-CTGCAA---AAATGACCAT--TT---TA--ACC--ACCATG-TTCT-G-CAT-AT-----AT---AATAAAAT--A--A----TA------AGT----------AA-CA-ACTGG--CTGA---T---TA--------AGAT-T---TTTA-T--G-ATTG---ATTC---------AGAGTC----T-TT-GC---CCC-A-GT-C-A---T---AA-T-ATT---CT---------CT-C------TC----GATCAT-----TTTTTT-----TATA-AT-T--------CATT--A----CAAAA-----AT------------------AAAA----------------------T-------------A--------------AACCCGAGAAAACT---------------GT-----------------T--C--------AT-G-TC----TAA--TAATCTTTA--TTC-A-A-GGTAA---TT------ATTTTT----ATG--TTTTCG---AC--TCTAAT-CGT-CG---TTAC---ACTT-TG---TTA-ATC--ATGGTGT-GAATCT--C--A-G-G-TA---AAA-TCAA-TT-CT-A-G-CTa
gi|16 : ggctcaactgggtTGAAAAAAAGT-GT-A-G-C-CATTTTT-TG--TGCAAAT-G------ATG-TT---TTG-CGT--T----AGCGAAATAT-CTTTC-GCCACAG-ATAT-C-------AC---G-T-TAT----CT--TTTTCA-CT-T-----AAATTACC-T--TT---TA--ACC--A--ATG-TT-TTA-CAT-ATC----AT---GA--------A--A----TA------AGC----------AA-C--ACT-G--CTGA---T---TA--------AGAT-T---CATA-T--G-AT-----ATTT-----GA-AGAAGTT----C-TT------TCC-A-AT-C-A---A---AT-T-TTC----T---------CT-C------TC----A----------TTTTCT-----TATT-TA-T--------CATC--A----CAAAA-----A-------------------GATA----------------------T-------------A--------------AA-----------T---------------G------------------T--C--------AT-G-CC----TAA--TA---TCTA--TTT-A-A--GTAA---TT------A--TTT----ATG--TTTTGG---AC--TCT-AT-CGT-CA---TTAA---CCGT-TG---TTA-ATG-AAAGGTGT-G-GTCT--C--A-G-G-TA---AAA-T
gi|17 : cagggctcacactgggttgaaaaaaagGCA-TCCTTGTC-AGA---T--TGATC-GTAAGGGAT-AC-AGTTT--AT-A---TTTCCACAT--GAACTG--------T-ATTTC-TTCAA--G-CTCAAATCCGTT-G-AATTTAC---TTTC--AT-CATA--A---T-C--AAATT--ATTTGG--CG----AA--AA-------ACGAAAGTCTTTTCTGCTC-GTTATCGAA--A-ACT-T-TGGCA-GG--CG-CCG-CC-A--TG-TTTGT-GTACA-C-AT-TACATTGC--ACC--A-ATCAAA--TTTAA----GCTTTTTTTTTAAACT-TG--GAAATC-C-CC--AG-A-T-AC--GAATATA-AA-CTG-----AAATGGCGA-TCGT--CAC-GA-------TTAA-CA---TT--TTT---TTTAAAA---ATT-CGCG---ATTAGGC-ATTG-CGTGA--Tt
gi|18 : GAA--A-ACT-T-CAACA-GG--CG-CCG-CC-A--TGTTT-GT-GTACA-C-AT-TACATTGC--ACC--A-ATCAGA--TTAAA----GC--TTTTTTAAAACT-TG--GAAATC-C-CC--AG-A-T-AC--GAAAATA-AA-CTG-----AAATGACAA-TTGT--CAT-GA-------TTAA---------------------AA-----T-CGCA---ATTAGG--ATTG-TGTGA--TT-TCA-ATAC-A--CTG-AAAA-ATTAG-CTTT-C-GCC-A-A---T-TGT-A-AATTT-C--TG---TAGC-CATT-TTTT--AGA--TTCTT-TCGC--C-------------------------AATGGCG-AACGGC-AGCGTG
gi|19 : tCGAA--ACACT-C-C-ACA-GGG-CG-CCG-CCCA--TGTTTT-T-AAACA-C-AT-TACAT-GC--ACC--ACATCAGAGATTAAAAGGGGC--TTTT---AAACT-TG--GAAATC-C-C---AG-A-TGACTGAAAAATA-AA-CTGCACAAAAATGACGA-TGG-----C-GA-------TTAA-CA---AT--TTT---TTT--AT---ATT-CGAG-AT--TAGGC-TTAG-CGTGA--TT-TCA-ATAC-A--CTG-AAAA-ATTagccc
gi|2 : aaaaatctgaaagtcttttctccaggggcggggggggggggtgggatgAAAAAAGT-GT-A-G-CACACTTTT-TG--TGCAAATTG------ATG-TT---TTG-CGTAACT---AGCGAA-TAT-CTTTC-GC-ACAG-AGATTC-------AC---G-T-TAT----CT--TTT-CA-CT---G---AAATGACC-TGTTT---TA--AACG-A--ATG-TT-T-T-CAT-ATC----AT---AA--------A--A----TA------AGTCA--------AG-C--ACT-G--CTGA---TGATTATTTGTGTTAGAT-T---CATA-T--G-AT-----ATTTG----AA-GAAAGTT------TG-G----TCC---GT-C-A---A---AT-T-TTC---CT---------CT-C------TC----AA---------TTCTCT-----TATT-TA-TT-------CACA--A----CAAAA-----A-------------------GATA----------------------T-------------A--------------AA-----------T---------------G------------------T--C--------AT-G-CC----TAA--TA----CTA--TTA-ACA-GGTAA---TT------A--TTT----ATG--TTTTGG---AC--TTT-AT-CGT--A---TTAA---CCGT-TG---TTA-ATT-AA-GGTGT-G--TCT--G--A-GTG-T----AAA-TC-A-TT-TT-A-G-TTGA--G---T--AGT-TT-----------T---GACATATATACAT---TATT-GC--AT-A-TACT-CAAGC--AA-ACAT-TAT---------TATA-AT--GG-----GA---------------GT---CAT--------ACA---------A-C-TGG-TTT-TC-T---------TGTTTTTAT-AAAAA-GT-GAGGC--A---A-CAG--GT--GA----TC-T-AG-AATAT---CAT-ACTA--A--AA--GGGAA--A-TAAATT-C-A-AA-GAA--------CA-----TTCT-TAA-C-TTC--AT-TA-CG------CT-------ACTAAGGAATTT---TAT---TTGT-TG----------TATC-GTCAA-T--CTCGAG--ATTTT--CCATTGCCGTTGATGAACCTGTGCTCCTTATC-AGA---T--TGATC-GTTAGGGAA-GG-AGTTT---TCA----TTCCACAT--GAACTA------ATT-ACATC-TTCAA--G-CTC-AATC--TT-GAAATCAAC---TTTC--AT-CATA--A---TCC--AAAAT--ATTC----CGGTCGAA--AA-------ACGAAA-TCTTTTCTCCTC-GTTATCGGA--A-ACTAT-CGACACAG--C--TCG-CCGA--TGTTTTGT-GTACA-CGAT-AATGTAGC--ACC--A-ATCAAA--TGAA---------TTTTTTAAAACT-TG--G-GATCGCGCC--AG-A-G-A---GAGAATA-AA-GCG-----AAAAGGAGAGTTGTCCCACGGA-------T--A-CATT-TT--TTT---TTT--TT---ATT-CGCGAATATTAGGC--TAT-TGTGA---T-TCA-ATACAA--CTGAAAAA-ATTGG-C--T-C-G-C-A-A-----TGC-ACAATTT-A--CGTTTTAGCTCATT-TTTTG-AGA--TTCTTGTCGC--C-ACCA-T---G--------CGA-AAAATGGCG-AACGGC-AGCGTGG
gi|20 : gaatTGAAAAAAAGT-GT-A-A-C-CACTTTT-TG--TGCAAAT-G------ATG-TT---TTG-------------------A------C-GC-ATAG-AGAT-C-------GC---G-T-TAC----CT--TTTTCA-CT-T-G---AAATGACC-T--TT---TA--ACC--A--ATGTTT-T-A-CAT-ATC----AT---AAAT------A--A----TA------AGTACATGTAAGCAA-T--ACT-G--CTGA---T---TA--------AGAT-T---TTTA-T--G-ATTG---ATTC------A-GAAAGTT----C-TT-G----TCC-A-GT-C-A---T---A--T-TTC---CT---------CT-C------TG----A----------TTTTCT-----TATT-AA-T--------CATA--A----GATAA-----A-------------------
gi|21 : ctcacactgggtAA-AGAT-C-------ACTTCG-T-TACTCCTCC--TTTTCA-CT-T-G---AAATGACC-T--TT---CATTA-C--A--ATG-TT-T-----T-A-C----AT---AA--------T--ATACTTA------AGT----------AA-CTAACT-G--CTGA---TGC-TA--------AGAT-T---TATA-T--G-ATTG---ATT------AA-GAAAGTT----A-TT-C----TTC----T-T-G---C---AG-C-TCT---CT---------CT-CT-----TC----AT---------TTTTCTTAAG-TATT-CA-----------ACA--A----CAAAA-----ACGTGTACACTATAAAACACGAGA----------------------G-------------A--------------AA-----------T---------------G------------------TTGC--------CT-G-TC----TAA--TAC--TATA--TTC-A-A-GGTAA---TT------A--Tctaaaca
gi|22 : --A-ATCAAA--TTAAA----GC--TTTTTTAAAACT-TG--GAAATC-A-CC--AG-AAT-AC--GAAAATA-AA-CTGG----AAATGGCGA-TTGT--CAC--A-------TTAA-CT---TT--TTT---TTT--AA---ATTCCGCA-ATATCAGGCGATTG-GTTGA---T-TCA-ATAC-A--CTG-AAAA-ATTGGACTTT-CGGCC-AGA---T-TGC-A-AATTCAC--TG---TAGC-CA-T-TTTTG-AGA--TTC-T-TCG---C-A--A-TG--G--------CG--AAAAT-GCGTAACGGCAAGCGTG
gi|23 : TAAAAGAAAGT-GT-A-G-C-CACTTTT-TGAGTG-AAAT-AGCCTATATG-TT---CTC-CGTCACCGTGAGCGAAACAT-CTTTT-GC-TCAA-AGAA-T-------GG---G-T-TAC----CT--TTCTCA-TT-T-G---AAATGACC-T--TT---TA--ACC--A--ATG-TT-T-A-CAT-GT-----AT---AT--------A--A----C-------AGT----------AA-C--A-T-C--CTGA---T---TA--------AGAagccc
gi|24 : taggtTGGAAAAAAGT-GT-A-G-C-CACTTTT-TG--TGCAAAT-G------ATG-TC---TTG-CAT--C----AGCAAAATAT-CTTTC-GC-ACAG-AGAT-C-------AC---G-T-TAT----CT--TTTT-A-CT-T-G---AAATGACC-T--TT---TA--ACC--A--ATG-TT-TCA-CAT-ATC----AT---GATTAATATTA--A----TA------AGT----------AA-
gi|25 : ctcacactgggt--------------AA-----------T---------------G------------------T--C--------AT-G-TC----TAA--TA---TCTA--TTC-A-A-GGTAAA--TT------A--TTTT---ATG--TTTTCA---AC--TCT-AT-CGT-TG---TTAA---CCTT-TG---TTA-ATC-AATGGTGT-G-ATCT--C--G-G-G-TA---AAA-TC-A-TT-CT-A-G-CTGG--G---T--gc
gi|26 : ----------TTTTCT-----TATC-AA-T--------CATC--A----CAAAA-----A-------------------GATA----------------------T-------------ACTAAACATGAGAGAAA-----------T---------------G------------------T--C--------AT-G-TC----TAA--TA---TCTA--TTC-A-T-TGTAA---TT------A--TTT----ATG--CTTTGG---AC--TCT-AT-CGT-CA---TTAA---CCTT-TG---TTA-gtagt
gi|27 : TA-T--G-ATTG---ATTC-----T--GAAAATT----C-TT-G----TCC-A-GT-C-A---T---AT-T-TCC---TTT--------CT-CGA----TC----A----------TTTTCT-----TACT-AA-T--------CAAA--A----TAAAC-----AC------------------GAAA----------------------G-------------A--------------AA-----------T---------------G------------------C--C--------AT-G-TC----TAA--TA---TCTA--TTC-A-A-GGTA
gi|28 : A------TATT-GC--AT-A-TACT-CA-GCA-AA-ACAT-T-T---------TA-------------------------------------AT--------A-----------A-C-TGGTTTG-TC-T---------GTGTTT--T-AAAAA-GT-GA-GC--C---A-CAA--GT--GG----TC-T-A--------------------A--AATGGGAAA--A-TAAAGT-C-A-AG-GCA--------CA-----TT
gi|29 : C-GTTAAGGGT-AG-AGTTT--ATCA---TTTCCATAT--AAACTATACTATA-T-ACATC-TTCAA--G-CTCCAATCCATTAA-AATTTAC---TTTC--AT-CATA--A---T-C--AA
gi|3 : G-CGTAA-----GGCGAAATAT-CTTTTAGC-ACAGGAGATTC-------GCT--G-T-TAC----TT--TTTCCA-CT-C-A---AAATGACC-A--TT---TA--ACC--AT-GTG-TT-T-A-CAT-ATCAGTAAC---AA--------A--A----TA------AGT----------AA-C--ACT-GACCTGA---T---TA--------AGACGTACATATA-C--G-A-TG---AATC------A-GAAAGTC----C-CT-GTGCTTCC-ATGT-C-T---T---AT-TATTTATACT---------CT-CGTCGGATC----A----------TTTTCTAAAAGTATA-TA-A--------AAAA--A----CAAAA-----A-------------------AAGAAAGAAAAAACCAAAACCGAGAAC-------------A--------------AA-----------T---------------G------------------T--C--------ATAG-TCG---TAA--TA---TCTAAGTTC-A-A---TAA---CTGCTTAGA--TTT----ATG--TTTTCG---ACAGTCT-AT-CGTACA---TGTA---CCTTATG-----A-ATTCAATAGTGT-G-ATCT--C--A-A-GCTA---AAAGTC-ATTT-CT-A-G-CTGGT-G---T--AG--TT-----------A---AAC-CATAGA------------C--AT-A-T------AGCA-AAGACGTCTATGG-------TTTA-AC--CA-----TA-------------T-t
gi|3 : cagggctcacgctgggttgaaaaaaaggtgcaaaatgactgcgctaaatag---T--GG--TT-----------T---AAC-CATAT----------T-GCG-AT-AATGCT-CAAGCA-AA-ACAT-TAT------------A-AC--TG-----TA-------------TTAT---TATTA------ACATTTTCCACG--C-TGGCTTT-TC-T---------TAATTT--T-AAAAA-GT-AA-GTGTA---A-CGA--GT--GA----AC-TTAGTAATTT---CAT-ACTA--A--AATGGGAAA--A-TAAAGT-C-A-AG-GTA--------CA-----TT-----A-CGCTG---C-TA-AG------C---------CTAAGGACATT---ATT---TTGT-TG----------TATC-TTCAATT--CTCGAG--AATTT--CCG---------------TTGTA-TCCTTGTC-AGA---C--TGATC-GTTTGGGGT-AG-AGTTT--ATCA---TTTCCATAT--GAACTT------A-T-ATATC-TTCAA--G-CTCCAATCCGTT-A-AATTTAC---TTTC--AT-CATT--A---T-C--GAAAT--ATTC-A--GT---AAA--AA-------ACGAAAGTCTTTTCTCTAC-GTTATCGAA--A-ACT-C-CGACA-GG--TG-CCG-CC-A--TGTTTT-T-GAACA-C-AT-TACATTGC--ACC--A-ATCAAA--TTAAA----GC--TTTTTTTAAACT-TG--GAAATC-C-CC--AG-A-T-AC--GAAAATA-AA-CTG-----AAATGGCGA-TTGT--CGG-TG-------TTAA-CA---AT--TTT---TTT---A---ATT-CGCG---ATTAGGC-TTGG-CGTGA--TT-TCA-ATAC-A--CTG-AAtgcgataatgctcaagcaaaacattataactgtattattattaacattttccacgctggcttttcttaattttaaaaagtaagtgtaacgagtgaacttagtaatttcatactaaaatgggaaaataaagtcaaggtacattacgctgctaagcctaaggacattattttgttgtatcttcaattctcgagaatttccgttgtatccttgtcagactgatcgtttggggtagagtttatcatttccatatgaacttatatatcttcaagctccaatccgttaaatttactttcatcattatcgaaatattcagtaaaaaacgaaagtcttttctctacgttatcgaaaactccgacaggtgccgccatgtttttgaacacattacattgcaccaatcaaattaaagctttttttaaacttggaaatccccagatacgaaaataaactgaaatggcgattgtcggtgttaacaatttttttaattcgcgattaggcttggcgtgatttcaatacactgaa
gi|30 : cagggctcacgctgggttgaaaaaaaggtgcaaaatgactgcgctaaataggcgtaaggcgaaatatcttttagcacaggagattcgctgttactttttccactcaaaatgaccatttaaccatgtgtttacatatcagtaacaaaataagtaacactgacctgattaagacgtacatatacgatgaatcagaaagtccctgtgcttccatgtcttattatttatactctcgtcggatcattttctaaaagtatataaaaaaacaaaaaaagaaagaaaaaaccaaaaccgagaacaaatgtcatagtcgtaatatctaagttcaataactgcttagatttatgttttcgacagtctatcgtacatgtaccttatgaattcaatagtgtgatctcaagctaaaagtcatttctagctggtgtagttaaaccatagacatatagcaaagacgtctaAAAAAAGT-GT-A-GAC-CACTTTT-TG--TGCAAAT-G------ATG-TT---TTGCCGTAAT-----GCGAAA-ATCCTTTC-GC-ACAG-AGAT-C-------
gi|31 : gctcacactgggttgAA-CAA--TT--TCT---TTT--AA---ATT-CGCA-AT--TAGGC-ACAG-TGTGA--TT-TTA-ATAC-A--CTA-AAAA-ATTTG-CTTT-C-GCC-A-A---T-TGT-G-AATTT-T--AG---TAag
gi|32 : CT-GAAGCA-AA-ACAT-TAT---------TATA-AC--TA-----TAATACATGTATATAT-AT---TAG--------ACATT-----TGA-C-TGGTTTT-TC-A---------TAATTT--T-AAAAA-t
gi|34 : GAG--ATTTT--CCGTTGC-----ATGAACTTGCA-TCGTTGTC-AGA---TAATGATC-GTTAGGGGC-AG-AGTTT--ATC
gi|35 : --TG---TAGC-CATT-TT-TG-AGA--TTCTT-TCGC--C-A--A-T-------------------ATGGCA-AACGGC-AGCGTG
gi|37 : --TTCTT-TCGC--C-A--AATG--G--------CG--AAAATGGCG-AACAGC-AGCGCGagcc
gi|38 : CGAAATAC-TTTTC-GC-ACAG-AGAT-C-------GC---G-T-TAC----CT--TTTTCA-agccc
gi|4 : TA-T--G-ATTA---CTTTGAAAAAA-AAAAATT----C-TTTG----TCCCA-GT-CCA---T---AT-A-TTC---CTTTGTATTCCCT-CGA----TC----AGAT-------TTTTTC-----TAT---A-A--------CATT--AAAACCAAAA-----ATAACCAC------------GAAA----------------------G-------------A--------------AA-----------TTG-------------A------------------C--C--------AT-GGTC----TAAA-TAA--TCTA--TTCCA-A-GGTAAAAATT------A--TTA----ATGA-TTTTCG---AA--TTT-AT-CGT-CATGCTTAAGCCCCCT-TGATCTTA-ATT-GATGGTGT-GAATCT--C--AGG-G-TA---AAA-TC-ATTT-CTAA-G-CTGGTTA---T--AG--TTTTTGTTGTTTGT---GA--CACATA-------ATTAGCCAATAA-TAAC-TAAGCA-AA-A-AT-TATGAGCTTTTACATG-GT--TGAAGAATA-------------T--T---TAG--------ACATT-----CGA-C-TGGTTTT-TC-TATTTTCTTATGTTTT--T-AAAAAGGTAAA-GT--AAATA-CGAAGGT--AATAACTT-T-AG--ATTTTTCCATAACTA--AATAATGGGAAA--A-TTAAGTGC-AGGG-GTAGAAGTCCCTA-----TTGTGTAA-C-TTG--ATGTATCGGC----CC-------TCTAAGG
gi|4 : att-TAAGGC-CTA-AG-GAC--------CACCTATTTTT-TAG-T-TTG--GT-TA-TGTGATATCT-------TCAAAGGTATTTGAAAGTCANNNNN-NNNN--------NNNN-NNNNNNN--NNNNNG--ATTTT--CCGT---CGT------------A-TCCTTGTC-AGA---T--TGATC-GTTTGGGGT-AG-AGTTT--ATCA---TTTCCATAT--GAACTA------A-T-ACATC-TTCAA--G-CTCCAATTCATT-A-AATTTAC---TTTC--AT-CATA--A---T-C--AAAAT--ATTC-G--GC---AAA--AC-------ATGAAAGTCTTTTCTCCTC-GTCATCGAA--A-ACT-C-CGAGA-GG--CG-CCA-CC-A--TATTTT-T-GAACA-C-AT-TACATTGC--ACC--A-ATCAAA--TTAAA----GC--TTTTTTTAAACT-TG--AAAATC-C-CC--AG-A-T-AC--GAAAATA-AA-CTG-----AAATGGCAA-TTGT--CGC-GA-------TTAA-CA----C--TTT---TTT--AA---ATT-CGCA---ACTAGGC-TTAG-CGTGA--TT-TCA-ATGC-A--CTG-AAAA-ATTGG-CTTC-C-GCC-A-A---TGTGT-G-AATTT-C--TG---TAGC-CATT-TTTT--AAA--TTCTT-TCAC--C-------------------------AATGGCG-AACGGC-AGCGTGcctaaggaccacctattttttagtttggttatgtgatatcttcaaaggtatttgaaagtcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngattttccgtcgtatccttgtcagattgatcgtttggggtagagtttatcatttccatatgaactaatacatcttcaagctccaattcattaaatttactttcatcataatcaaaatattcggcaaaacatgaaagtcttttctcctcgtcatcgaaaactccgagaggcgccaccatatttttgaacacattacattgcaccaatcaaattaaagctttttttaaacttgaaaatccccagatacgaaaataaactgaaatggcaattgtcgcgattaacacttttttaaattcgcaactaggcttagcgtgatttcaatgcactgaaaaattggcttccgccaatgtgtgaatttctgtagccattttttaaattctttcaccaatggcgaacggcagcgtgagccc
gi|40 : atttatgattactttgaaaaaaaaaaattctttgtcccagtccatatattcctttgtattccctcgatcagattttttctataacattaaaaccaaaaataaccacgaaagaaattgaccatggtctaaataatctattccaaggtaaaaattattaatgattttcgaatttatcgtcatgcttaagcccccttgatcttaattgatggtgtgaatctcagggtaaaatcatttctaagctggttatagtttttgttgtttgtgacacataattagccaataataactaagcaaaaattatgagcttttacatggttgaagaatatttagacattcgactggtttttctattttcttatgtttttaaaaaggtaaagtaaatacgaaggtaataactttagatttttccataactaaataatgggaaaattaagtgcaggggtagaagtccctattgtgtaacttgatgtatcggccctcCTAAGGACTTT---ATT---TTGT-TGTA--------agccc
gi|5 : tgctaagcTGAAAAAAAGT-GT-A-G-C-CACTTTT-TG--TGCAAAT-G------ATG-TT---TTG-CGTAAT----AGCGAAATAT-CTTTC-GC-ACAG-AGAT-C-------AC---G-T-TAT----CT--TTTTCA-CT-T-G---AAATGACC-T--TT---TA--ACG--G--ATG-TT-T-A-CAT-ATC----AT---AA--------A--A----TA------AGC----------AA-C--ACT-G--CTGA---T---TA--------AGAT-T---CATA-T--G-AT-----ATTTG----AA-GAAAGTT----C-TT-G----TCC-A-GT-C-A---A---AT-T-TTC---CT---------CT-C------TC----A----------TTTTCT-----TATT-TA-T--------CATC--A----CAAAA-----A-------------------GATA----------------------T-------------A--------------AA-----------T---------------G------------------T--C--------AT-G-CC----TAA--TA---TCTA--TTT-A-A-GGTAA---TT------A--TTT----ATG--TTTTGG---AC--TTT-AT-CGT-CA---TTAA---CCGT-TG---TTA-ATT-AAAGGTGT-G-GTCT--G--A-GTG-T----AAA-TC-A-TT-TT-A-G--TGA--G---T--AG--TT-----------T---GAC-CATATATACATTTATT-GC--AT-A-TACT-CAAGCA-AA-ACAT-TAT---------TATA-AC--TG-----GA---------------GT---CAT--------ACA---------A-C-TGGTTTT-CT-T---------TGTTTT--T-AAAAA-GT-GA-GC--A---A-CAG--GT--GA----TC-T-AGTAATAT---CAT-ACTA--A--AATGGGAAA--A-TAAATT-C-A-AG-GAA--------CA-----TTCT-TAA-C-TTC--AT-TA-CG------CT-------ACTAAGGAATTT---ATT---TTGT-TGT---------TATC-GTCAATTTCCTCGAG--ATTTT--CCATTGCCGTG-ATGAACTTGCA-TCCTTATC-AGA---T--TGATC-GTTAGGGAC-AG-AGTTT--ATCA-----TCCACAT--GAACTA------A-T-ACATC-TTCAA--G-CTCAAATC--TT-G-AATCAAC---TTTC--AT-CATA--A---T-C--AAAAT--ATTC-G--CG---AAA--AA-------ACGAAAATCTTTTCTCCTC-GTTATCGAA--A-ACT-T-CGACA--G--CG-CCG-CC-A--TGTTTTGT-GTACA-C-AT-TACATTGC--ACC--A-ATCAAA--TGAAA----G---TTTTTTAAAACT-TG--GAAATC-C-CC--AG-A-T-AC--GAAAATA-AA-CTG-----AAATGGAGA-TTGT--CAC-GA-------TTAA-CATTTTT--TTT---TTT--TA---ATT-CGCA-ATATTAGGC-ATTG-TGTGA--AT-TCA-ATAC-A---TG-AAAA-ATTGG-C-TT-C-GCC-A-A---T-TGC-A-AATTT-C--TG---TAGC-CATT-TTTTGAAGA--TTCTT-TCGC--A-A--A-TG--G--------CGAAAAAATGGCGAAACGGC-AGCGTGG
gi|6 : TGAAAAAAAGTCGT-A-G-C-CACTTTT--G--TACAAAT-G------ATG-TT---TTG-CGTAA------GCGAAATAT-CTTTC-GC-AAAG-AGAT-T-------GC---G-T-TAC----CT--TTTCTA-CT-C-A---AAATGACC-A--TT---AT--ACC--A--ATG-TTCT-G-CAT-ATC----AT---AA--------AT-A----TA------AGT----------AA-C--ACT-G--CTTG---T---TA--------AGAT-T---TATAAT--G-ATTG---ATTC-----AG-AAAGGTC----C-TT-G----TCC-A-GTTC-A---T---ATAT-TTC---CT---------CT-C------TC----AATCA------TTTTCT-----TATT-AA-T--------CATT--A----CAAAA-----A-------------------TAAA----------------------T-------------A--------------AA-----------TAAACACAAGAAAAATG------------------T--C--------AT-G-TC----TAAAAGA---TCTAGGTTC-A-A-GGTGA---TT------A--TTTT---ATG--TTTTCG---AC--TCT-AT-CGT-CT---TTAA---CCTT-TG---TTA-ATT-AATGGTGT-G-ATCT--C--A-G-G-TA---AAA-TC-A-TT-CT-A-G-CTGG--G---TGTAG--TT-----------T---GAC-CA------------------------------AAGCA-AA-ACAT-TAT---------TATA-AC--TA-----TA-------------T-ATAT-TAG--------ACATT-----TGA-C-TGGTTTT-TC-T---------TAATTT--T-AAAAA-GT-AA-GT--A---A-CGA--GT--GA----AC-TTAGTAATTT---CAT-ACTA--A--AATGGGAAA--A-TTAAGT-C-G-AG-GTA--------CA-----TTCT-TAA-T-TTG--AT-TA-CG------CTGCTAAG-CCTAAGGGCTTT---ATT---TTGT-TGTACAG-----TATC-TTCAATT--CTCGAG--TATTT--CCG---------------TTGTA-TCCTTGTC-AGA---C--TGATC-GTTTGGTGT-AG-AGTTT--ATCA---TTTCCATAT--GAACTA------A-T-ACATC-TTCAA--G-CTCCAATCCGTT-A-AATTTAC---TTTC--AT-CATA--A---T-C--AAAAT--ATTC-G--GT---AAA--AA-------ACGAAAGTCTTTTCTCCAC-GTTATCGAA--A-ACT-C-TGACA-GT--CG-CCG-CC-A--TGTTTT-T-AAACA-C-AT-TACATTGC--ACC--A-ATCAAA--TTAAA----GC--TTTTTGTAAACT-TG--GAAATC-C-CC--AG-A-T-AC--GAAAATA-AA-CTG-----AAATGGCGA-TTGT--CGC-GA-------TTAA-CA---AT--TTT---TTT--AA---ATT-CGCG---ATTAGGC-TTAG-CGTGA--TT-TCA-ATAC-A--CTG-AAAA-ATTG
gi|7 : cagggctcacactgggtTGAAAAAAAGT-GT-A-G-C-CACTTTT-TG--T--AGAT-G------ATG-TAAAATTG-TGT--C----AGCAAAATAT-CTTTC-GT-ACAG-AGAC-C-------GC---G-T-TACA---TT--TTTTCAACT-T-G---AAATGAC--T--GT---TA--AAC--A--ATG-TT-TTA-CAT-ATC----AT---AA--------ATAA----TA------AGT----------AA-C--TCT-G--CAGA---T---TA--------AGAT-T---TATA-T--G-ATTG---ATT------AA-GAAAGTTAATTC-TT-G----TCC-A-GT-C-A---A---AT-T-T-C---CT---------CT-C------TC----A--------------------------GA-G--------GATA--A----CAAAA-----A-------------------GATA----------------------CACTAAACACAGAGA--------------AA-----------T---------------G------------------T--T--------AT---TA----TAA--TA---TCTA--TTC-A-A-GGTAAT--TT------A--CTT----ATG--TTTTTA---CT--TCA-AT-CAC-CA---TTAA---AC-T-TG---ATA-ATT-AAAGGTATGG-ATCT--CAAA-G-A-TA---GAA-TA-A-TC-TA-A-G-CTGC--A---T--AGTATT-----------T---G---CATATA------AAAC-TC--AT---TACT-CAAGCATAA-ACAT-TAT---------TATA-AC--TG-----GA-------------G-A---------------ACATT-----CGATC-TGGTTTC-CA-T---------TATTTT--TAAAAAA-GA-GA-GC--A---ATCAA--CC--GA----TC-T-AGTA---T---CAT-AC-A--A--AATGGGAAA--A--AAAGT-C-A-AGAGAA--------CA-----TTCT-TAA-C-TTG--AT-TA-CG------CT-------CCTAAGGAATTA---ATT---TTGTATGTAC-------TAT-----AATT--CTCGAG--AATTTACCCGTTG-------TGA---------CCTTGTC-AGA---T--TGATCAATTAGGGGCAAG-AGTTTTAATCA---TTT-CACAT--GATATA------A-T--CCTC-TTCAACCG-CTC-AATCC-TT-G-AATT-AC---TTTCCAAT-CATATGAAATT-C--AAAATAAATTC-G--GGC--AAA--AA-------ACGAAAGTCTTTTCT--TC-GTTAGCGAA--A-ACT-T-CAACA-GG--CA-ACG-CC-A--TG-TTTGT-GTACA-C-AT-TATACTGC--ACC--A-ATCAAA--TTCAA----GC--TTTTTTAAAACC-TG--GAAATC-C-CC--AG-A-T-AC--GAAAATA-AA-CTG-----AAATGCCGA-GTGT--TAC-GA-------TTAA-CCTT-TT--TTT---TTT--AA---ATT-CGCG-AT-TT-GGC-AT
gi|8 : cagggctcacactgggtTAAAAAAAAGT-GTGA-G-C-CACTTTA-TG--TGCAAAT-G------ATG-TT---T-G-AGTAA------ACGAAATAT-CTTTC-AC-ACAG-A-AT-CAGTGTTTGCTTTG-T-TGT----TTGTTTTTCA-CT-T-GGCAAAATGACCATG-TTGAATA--GTC--C--ATG-TTCT-G-CATTATCG---AT---AGG-------A--A----TATTGATTAGT----------AA-C--ACT-GTGCTGA---T---TA--------AGAT-T---TATA-TTGGTATTAGGAATTA-----GACGAGAGTCA---T-TT-GGT--TCC-A-AT-C-A---TGATAT-T-TGC---CC---------CTAC------TC----GGATGTCAGTTTTTTCT-----TATT-AG-TATGGATTGCATTGAA----CAAAA-----A-------------------AATAAACCAACA--------------TGAGGA--------A--------------AA-----------T---------------G------------------T--C--------AT-G-TGATTATAA--TG----CTA--TTC-A-A-G-TAA---TTT-----A--TTTTTATATGGTTTTTCGGCGAC--TCT-A--CGT-CA---T-AA---CCTT-TG---TTA-ATT-AATGGTGT-G-ATCTCAC--A-G-G-TA---AAA-TC-A-TTCCT-ATG-CTGGGTG---T--AG--TT-----------TAGAAAC-CATA-------------GC--AT-A-TGCTGAAAGC--AA-ACAT-TAT---------TATA-ATA-TA-----TA-------------T-GT---CAT--------At
gi|9 : agggctccactgtggtggtttgggggttgTTT--T-AAAAA-GT-GA-GC--A---A-CAA--GC--GA----TC-T-ATAAATAT---CAT-ACTA--A--AATGGGAAA--A-TAAATT-C-A-AG-GAA--------CA-----TTCT-TAA-C-TTC--AT-TA-CG------CT-------TCTAAGGAATTT---ATT---TTGT-TGT----------------CAATT--CTCGAG--ATTTT--CCGTTGCCGTG-ATGAACTTGCA-TCCTTATC-AGA---T--TGATC-GTTAGGGAC-AG-AGTTT--ATCA---TTTCCACAT--GAACTA------A-T-ACATC-TTCAA--G-CTCAAATC-GTT-G-AATCAAC---TTTC--AT-CATA--A---T-C--AAAAT--ATTC-GG-CG---AAA--TA--------CGAAAGTCTTTTCTCCTC-GTTATCGAA--A-ACT-T-C-ACA-GG--CG-CCG-CC-A--TGTT--GT-GTACA-C-AT-TACATTGC--ACC--A-ATCAAA--TTAAA----GC--TTTTTTAAAACT-TG--GAAATC-C-CC--AG-A-T-AC--GAAAATA-AA-CTG-----AAATG-CGA-TTGT--CAC-GA-------TTAA-CA---TT--TTT---TTT--AA---ATT-CGCA-ATATTAGGC-ATTG-TGTGA--TT-TCA-ATAC-A--CTG-AAAA-ATTGG-CTTT-C-GCC-A-A---T-CGC-A-AATTT-C--TG---TAGC-CA-T-TTTTG-AGA--TTCTT-TCGC--C----A-T---G--------CG--AAAATGGCG-AAT-GC-AGCGTGacaaacaatgattttcagtgtgtattcta
blockSeqs : C G A A A T AG T GCCTAT T AAA C CACCGTGA C A C G CAGTGTTTGCTTT T . TCCT GT A TGGCA TGT GAA TT TG CC T CTG T AGTA . TTAATATTA TACT TTGATT ACATGTAAGC . TA G AC . GAT TTTGTGTT G ACA A TG T TAGGA TGAAAAAA AATT . T TGCT AT T C TGAT A A ATA TTGTATTCC A TCGGATGTCAGTT AAAAG AA TATGGATTG TGA AAAC GATTT AAGAAAGAAAAAACCAAAACCGAGAACAAATG TG AAGAGAGA A G ATTA AA ATC AG C C . AAA GCTTAG TT TTAT GT GCG AG A . A TGC GCC A ATC T A T G A CA AA G T C . G A T C A T T GTAA GT TA TTTGTTGTTTGTGACACATAATTA CA AA G GA T G C GAGCTTTTA . TATAATACATGTATATATATTAG T TTCCAC T . . T ATTTTCTTA A TA A G A G GT AAT T AG . TAAC T T T T TTC A . AT . A G T G A T GAAGTCCC CCTAT G . G . G T TGATATCTT GAA CAN A TACAGTATCT TC . AC GCCGTTGATGAAC TGC . . AA A CA . TA . . TACTAT T . . CC A A CG A A A G CA T TG AAT C . AA GGCCGA GA TCATTCT T TC C A . G C AG . G C GT T G . T . G . . . C GA AGGG TT A C AT G G CA T A G TG . T CACAA G CC G CTCGTCA . TTTT . ACA AA AAC C GAATA GA T T AA A C A . A A A . G A G . G GG AC TTT T T A A . G . AATGGTGCAG T G A
blockSeqs : . . . . . . A . A . . . AACTA . . . . CACTTC . . A . . GCAA ATG . . G T . TTT . G . TAAAATA . . CA . A . TG . GC . . . . . . TG TGAA A . . GT CA . . T A . . T . GTCGGATCA TAAG A TT T . . CGTGTACACTATAAAACACGAGAGAAATG . . . . G A C GG . . . A T . T A . . . . . . . . . . C G . A . . . T . . . . T . . . . GTG . T TGACCATATATACATTTATT G AA A G . . . GG . TGAAGAATATTTAG T T . . . . . T . . . . . . . . . . . . T T A . . . . . . . . . . A . . . . . . . . CTGCTAAGC . . . NNNNNNN . . . GCCGTGATGAAC CA . . . . C . G . . . . . . . . A CG . . A . . . . . . . . CGGTCG . . . . . . . G . G . . G . A A . T . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . A . . . . . TTT . . . . . AATA A A T . . . . . . . . . . . . . . AC C . . T . . . . . ACCATGCGAA A G .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . AATA . . . . TCGCT . . . . . CA AT . . . . . CTG . . . ATA . . . . . . . . . . . . . . . TG TGAA . . . C A . . T . . . . . TCGATCAT . A T C . . TAAATAAATAAACACAAGAAAAATG . . . . . . A . . . . T . . T . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . TTA . . TGACATATATACATTATT . A A C . . . . . TGTATTATTATTA T C . . . . . T . . . . . . . . . . . . . T A . . . . . . . . . . A . . . . . . . . GCCCT . . . TTATCG . . . GCCGTGATGAAC CA . . . . A . . . . . . . . . . A CG . . C . . . . . . . . GTCGA . . . . . . . T . . . . . . T G . C . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . G . . . . . TTT . . . . . AATA A T G . . . . . . . . . . . . . . A C . . T . . . . . AATGGCGAAA . G .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . AAG . . . . TCAC . . . . . TA A . . . . . TTA . . . ATA . . . . . . . . . . . . . . . TG AGAC . . . . A . . T . . . . . GATCAGAT . T T T . . GATATACTAAACATGAGAGAAATG . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . GTG . . TCGCACGCATATT . A A C . . . . . TATATATATTAG T T . . . . . G . . . . . . . . . . . . . T T . . . . . . . . . . C . . . . . . . . CTG . . . TACTAT . . . GCCGTGATGAAC TA . . . . T . . . . . . . . . . A CG . . T . . . . . . . . GGGCA . . . . . . . G . . . . . . T G . T . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . AT . . . . . AATA A T C . . . . . . . . . . . . . . A A . . T . . . . . AAATGGCGA . G .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . AAT . . . . CGC . . . . . TG T . . . . . TCA . . . ATA . . . . . . . . . . . . . . . TG CAA . . . . A . . A . . . . . TCGATCA . T T C . . AATAAACAAACATGAGAAAAATG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . TG . . TGCATATAAAAC . A G C . . . . . TATATATATTAG T C . . . . . A . . . . . . . . . . . . . T T . . . . . . . . . . T . . . . . . . . CTA . . . TATCG . . . GCATGAAC CA . . . . A . . . . . . . . . . C CA . . A . . . . . . . . GGCGA . . . . . . . A . . . . . . T G . T . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . AATA A A T . . . . . . . . . . . . . . A T . . T . . . . . AATGGCGA . A .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . AA . . . . GCG . . . . . TG T . . . . . CTG . . . AT . . . . . . . . . . . . . . . TG TGA . . . . A . . A . . . . . TCAATCA . A T A . . TAAAATAAACCCGAGAAAACTGT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . G . . TAGAAACCATA . A A C . . . . . ATATATGTCAT T T . . . . . A . . . . . . . . . . . . . T A . . . . . . . . . . T . . . . . . . . CTA . . . TATCT . . . GCATGAAC CA . . . . T . . . . . . . . . . C CG . . T . . . . . . . . GGCG . . . . . . . G . . . . . . T G . A . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . ATA A A C . . . . . . . . . . . . . . G C . . T . . . . . AATGGCG . G .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . AA . . . . CAC . . . . . TG T . . . . . TTA . . . AT . . . . . . . . . . . . . . . TG CAG . . . . A . . T . . . . . TTCAT . C T A . . GATACACTAAACACAGAGAAATG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . G . . TGACCATATT . A A G . . . . . TGCATGGGG T C . . . . . T . . . . . . . . . . . . . T T . . . . . . . . . . A . . . . . . . . CTC . . . T . . . GTGA TA . . . . T . . . . . . . . . . C CA . . T . . . . . . . . GGCG . . . . . . . G . . . . . . T G . T . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . GTA T T T . . . . . . . . . . . . . . G C . . . . . . . . ATGCGA . G .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . TA . . . . CGC . . . . . TG T . . . . . CTG . . . GA . . . . . . . . . . . . . . . TA AA . . . . A . . C . . . . . GATCA . A T A . . AATAAACCAACATGAGGAAAATG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . G . . AAACCATAGA . A A T . . . . . GGGAGTCAT . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . A A . . . . . . . . . . A . . . . . . . . CTT . . . T . . . CGT CA . . . . C . . . . . . . . . . A CG . . T . . . . . . . . AGTA . . . . . . . G . . . . . . T G . A . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . GAT T G G . . . . . . . . . . . . . . A C . . . . . . . . AAT . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . CA . . . . TGG . . . . . CA T . . . . . TT . . . A . . . . . . . . . . . . . . . TG CA . . . . A . . T . . . . . TCAA . A T C . . TAACCACGAAAGAAATTGA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . G . . TAACCATATT . A G C . . . . . TGGAGTCAT . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . C . . . . . . . C . . . . T . . . . . . . . . . C C . . A . . . . . . . . GGCA . . . . . . . G . . . . . . T . . A . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . AAT A A C . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . AA . . . . CAC . . . . . TG T . . . . . TA . . . A . . . . . . . . . . . . . . . TG AA . . . . A . . T . . . . . TCA . T A A . . CGAAAGAAATG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . A . . TGACCA . . . C . . . . . TGGAGA . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . A . . . . C . . . . . . . . . . A G . . T . . . . . . . . GCGA . . . . . . . G . . . . . . T . . T . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . GAT T A T . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . CA . . . . CGC . . . . . CA A . . . . . TA . . . T . . . . . . . . . . . . . . . G CT . . . . A . . T . . . . . TCA . T A A . . GATAACTAAA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . GGTA . . . . . . . A . . . . . . . . . A . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . GA A T C . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . AA . . . . CAC . . . . . TG T . . . . . TA . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . CA . . . . A . . A . . . . . TGA . A T T . . GATATAAATG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . AA T A T . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . TGC . . . . . T A . . . . . TA . . . A . . . . . . . . . . . . . . AA . . . . . . . T . . . . . TCA . G T C . . GATATAAATG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . GA A T C .
blockSeqs : . . . . CGC . . . . . G T . . . . . T . . . A . . . . . . . . C . . . . . . . A . . . . . TCA . A G T . . GATATAAATG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AA A . T .
blockSeqs : . . . . GT . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GA .
blockSeqs : .
blockSeqCons : CGC*********** *** ATA******** ** *** CAA****** T****** TCGATCA**************** T********* *** ** *** ** *** G***** TGACCATATT************************** A** C* TGTATATGTCAG****************************** ** ** ** ** CTN************* TATCT*********** ** GCCGTATGAAC** CA* *** ** *** ** ** *** ** ** GGCG****** ** ** ** ***** ** A* C* ** ** *** C*** ** ** AATGGCGA****************
originalCons : TGAAAAAAAGT-GT-A-G-C-CACTTTT-TG--TGCAAAT-G------ATG-TT---TTG-CGTAAC----AGCGAAATAT-CTTTC-GC-ACAG-AGAT-C-------GC---G-T-TAC----CT--TTTTCA-CT-C-G---AAATGACC-T--TT---TA--ACC--A--ATG-TT-T-G-CAT-ATC----AT---AA--------A--A----TA------AGT----------AA-C--ACT-G--CTGA---T---TA--------AGAT-T---TATA-T--G-ATTG---ATTC-----AA-GAAAGTT----C-TT-G----TCC-A-GT-C-A---T---AT-T-TTC---CT---------CT-C------TC----A----------TTTTCT-----TATT-NA-T--------CATN--A----CAAAA-----A-------------------GATA----------------------T-------------A--------------AA-----------T---------------G------------------T--C--------AT-G-TC----TAA--TA---TCTA--TTC-A-A-GGTAA---TT------A--TTT----ATG--TTTTCG---AC--TCT-AT-CGT-CA---TTAA---CCTT-TG---TTA-ATT-AATGGTGT-G-ATCT--C--A-G-G-TA---AAA-TC-A-TT-CT-A-G-CTGG--G---T--AG--TT-----------T---GAC-CATATA------TATT-GC--AT-A-TACT-CAAGCA-AA-ACAT-TAT---------TATA-AC--TG-----TA-------------T-GT---CAT--------ACATT-----CGA-C-TGGTTTT-TC-T---------TANTTT--T-AAAAA-GT-GA-GC--A---A-CGA--GT--GA----TC-T-AGTAATNT---CAT-ACTA--A--AATGGGAAA--A-TAAAGT-C-A-AG-GNA--------CA-----TTCT-TAA-C-TTG--AT-TA-CG------CT-------NCTAAGGAATTT---ATT---TTGT-TGTA--------TATC-GTCAATT--CTCGAG--ATTTT--CCGTTGCCGT--ATGAACTTGCA-TCCTTGTC-AGA---T--TGATC-GTTAGGGGC-AG-AGTTT--ATCA---TTTCCACAT--GAACTA------A-T-ACATC-TTCAA--G-CTCAAATCCGTT-G-AATTNAC---TTTC--AT-CATA--A---T-C--AAAAT--ATTC-G--CG---AAA--AA-------ACGAAAGTCTTTTCTCCTC-GTTATCGAA--A-ACT-T-CGACA-GG--CG-CCG-CC-A--TGTTTTGT-GTACA-C-AT-TACATTGC--ACC--A-ATCAAA--TTAAA----GC--TTTTTTAAAACT-TG--GAAATC-C-CC--AG-A-T-AC--GAAAATA-AA-CTG-----AAATGGCGA-TTGT--CAC-GA-------TTAA-CA---TT--TTT---TTT--AA---ATT-CGCG-ATATTAGGC-ATNG-CGTGA--TT-TCA-ATAC-A--CTG-AAAA-ATTGG-CTTT-C-GCC-A-A---T-TGC-G-AATTT-C--TG---TAGC-CATT-TTTTG-AGA--TTCTT-TCGC--C-A--A-TG--G--------CG--AAAATGGCG-AACGGC-AGCGTGG
finalCons : TGAAAAAAAGT-GT-A-G-C-CACTTTT-TG--TGCAAAT-G------ATG-TT---TTG-CGTAAC----AGCGAAATAT-CTTTC-GC-ACAG-AGATCGC-----------G-T-TAC----CT--TTTTCA-CT-C-G---AAATGACC-T--TT---TA--ACC--A--ATG-TT-T-G-CAT-ATC----AT---AAATA--------A----TA------AGT----------AA-C--ACT-G--CTGA---T---TA--------AGAT-T---TATA-T--G-ATTG---ATTCAA------GAAAGTT----C-TT-G----TCC-A-GT-C-AT------AT-T-TTC---CT---------CT-CTCGATCA----------------TTTTCT-----TATT-NAT---------CATN--A----CAAAA-----A-------------------GATA----------------------T-------------A--------------AA-----------T---------------G------------------T--C--------AT-G-TC----TAA--TA---TCTA--TTC-A-A-GGTAA---TT------A--TTT----ATG--TTTTCG---AC--TCT-AT-CGT-CA---TTAA---CCTT-TG---TTA-ATT-AATGGTGT-G-ATCT--C--A-G-G-TA---AAA-TC-A-TT-CT-A-G-CTGGG-----T--AG--TTTGACCATATT--------------------------GC--ATA--TACTC-AAGCA-AA-ACAT-TAT---------TATA-ACTGTATATGTCAG------------------------------ACATT-----CGA-C-TGGTTTT-TC-T---------TANTTT--T-AAAAA-GT-GA-GC--A---A-CGA--GT--GA----TC-T-AGTAATNT---CAT-ACTA--A--AATGGGAAA--A-TAAAGT-C-A-AG-GNA--------CA-----TTCT-TAA-C-TTG--AT-TA-CGCTN-------------CTAAGGAATTT---ATT---TTGT-TGTATCT-----------TCAATT--CTCGAG--ATTTT--CCGTTGCCGTATGAAC--TTGCA-TCCTTGTC-AGA---T--TGATC-GTTAGGGGC-AG-AGTTT--ATCA---TTTCCACAT--GAACTA------A-T-ACATC-TTCAA--G-CTCAAATCCGTT-G-AATTNAC---TTTC--AT-CATA--A---T-C--AAAAT--ATTCGGCG------AA--AA-------ACGAAAGTCTTTTCTCCTC-GTTATCGAA--A-ACT-T-CGACA-GG--CG-CCG-CC-A--TGTTTTGT-GTACA-C-AT-TACATTGC--ACC--A-ATCAAA--TTAAA----GC--TTTTTTAAAACT-TG--GAAATC-C-CC--AG-A-T-AC--GAAAATA-AA-CTG-----AAATGGCGA-TTGT--CAC-GA-------TTAA-CA---TT--TTT---TTT--AA---ATT-CGCG-ATATTAGGCA-TNGC-GTGA--TT-TCA-ATAC-A--CTG-AAAA-ATTGG-CTTT-C-GCC-A-A---T-TGC-G-AATTTC---TG---TAGC-CATT-TTTTG-AGA--TTCTT-TCGC--CAATGGCGA----------------AAATGGCG-AACGGC-AGCGTGG
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|33 ): TCTGTACATAGAAAATATAGGCCTTATAGAGACTATTCTCAGGGCTCACGCTGGGTTGAAAAAAA
Unaligned ( gi|36 ): AATTTCCTGCTTTGTAGTTGCAGGGCTCACACTGGGTTGAAAAAAA
Unaligned ( gi|39 ): AGGGCTCACTCTGGGTTGAAAAAAAGTGTA
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 111111 33333333 11111111111111 1111111 1111 11111111111111111111 1111111111 11 11111111 222222222 1111 111111111111 11111 1111111111 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 111 111111 1111 111111111 222222222222222222222222222222222222222222222222 4444444444444444444444444444444 111111 111111111 1111 11 11111111 111111111111111 1111111 11111111 11111 222222222222222 444444444444 1111 11111 1111 11111 333333333333333333333333
lowQualScore : 3 3 3 3 3 3 77 3 111111 3 555 2 44444444 2 2 2 2 55555555555555 2 2 7777 33 2 2222222 7777 444 33 66 66 5 6666 2 2 2 99999999999999999999 2 5555555555 2 66 2 00 555 888 00000000 3 555 2 33 2 0 444 333333333 8888 2 2 2222 222 2 2 8888888 66 2 444 8888888 2 5 888888888888 11111 44 2222222222 444 5555 2 66666 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 33 99999999 2 2 7777 55 999 66 2 2 2 000 333333 77 4444 66 0 777 33 2 2 2 555 555 2 555 2 6 2 9 88 77 6 3 555 3 3 6 3 3 3 6 3 777777777 3 55 888888888888888888888888888888888888888888888888 3 77 777 2 888 3 3 3 44 77777 6 888888 6666666666666666666666666666666 2 111111 3 3 3 3 444444444 1 44 6 3 3 44 555 3 44 1111 6 3 3 3 666 3 00 77 3 3 3 3 1 22222222 88888 3 3 3 55 3 3 666666666666666 1111111 0 44444444 4 00000 4 555555555555555 55 555 55 111111111111 333 3 555 44 2 0 4 2 2 99 555 44 888888 3 3 3 44 6 4 11 3 3 4 888 44 3 0000 6 44 44 3 66666 555 3 7777 44 3 33 2 2 2 1 2 66 2 2 5 33 99 1 2 2 2 2 555 2 2 33 5555 33 55 2 33 2 5 33 2 2 2 33 2 2 44444 2 33 2 8888888 2 7777 33 444 33 444 2 55555 66 3 33 77 3 3 3 44 3 3 4 0 4 4 4 4 777 4 777 9999 666 4 8 4 4 55 3 55 999999999999999999999999 7 5 3
lowQualScore : . . . . . . .. . ...... . ... . ........ . . . . .............. . . .... .. . ....... .... ... .. .. .. . .... . . . .................... . .......... . .. . .. ... ... ........ . ... . .. . . ... ......... .... . . .... ... . . ....... .. . ... ....... . . ............ ..... .. .......... ... .... . ..... .................................................................................................................. .. ........ . . .... .. ... .. . . . ... ...... .. .... .. . ... .. . . . ... ... . ... . . . . .. .. . . ... . . . . . . . . ......... . .. ................................................ . .. ... . ... . . . .. ..... . ...... ............................... . ...... . . . . ......... . .. . . . .. ... . .. .... . . . . ... . .. .. . . . . . ........ ..... . . . .. . . ............... ....... . ........ . ..... . ............... .. ... .. ............ ... . ... .. . . . . . .. ... .. ...... . . . .. . . .. . . . ... .. . .... . .. .. . ..... ... . .... .. . .. . . . . . .. . . . .. .. . . . . . ... . . .. .... .. .. . .. . . .. . . . .. . . ..... . .. . ....... . .... .. ... .. ... . ..... .. . .. .. . . . .. . . . . . . . . ... . ... .... ... . . . . .. . .. ........................ . . .
lowQualScore : 1 1 1 1 1 1 33 1 999999 1 444 9 22222222 5 5 5 4 66666666666666 5 5 8888 44 5 7777777 9999 777 77 33 33 3 5555 7 7 7 22222222222222222222 7 3333333333 7 88 9 77 000 999 44444444 1 444 7 77 7 8 777 000000000 3333 7 7 0000 999 7 7 3333333 22 7 777 7777777 7 3 555555555555 66666 44 9999999999 444 3333 5 22222 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 44 11111111 5 5 8888 99 444 99 5 5 5 000 000000 33 6666 88 1 999 99 9 9 9 000 000 9 000 9 2 6 2 55 33 2 1 444 1 3 7 3 3 3 7 3 111111111 6 00 333333333333333333333333333333333333333333333333 3 99 111 1 999 1 1 1 22 77777 2 888888 3333333333333333333333333333333 1 777777 6 6 6 6 555555555 0 66 2 3 3 66 888 3 66 7777 7 3 3 5 444 6 00 99 3 3 3 3 0 11111111 33333 6 6 6 00 6 6 888888888888888 8888888 6 55555555 0 00000 0 111111111111111 55 333 00 777777777777 999 3 888 66 9 1 0 9 9 66 444 22 888888 1 1 1 22 2 0 77 1 1 0 555 22 1 8888 2 66 66 3 88888 888 3 1111 66 3 99 9 9 9 2 9 88 9 9 7 99 88 4 9 9 9 9 000 7 7 77 7777 77 55 7 77 7 3 77 7 7 7 77 7 7 77777 7 77 7 7777777 5 4444 44 444 44 444 5 22222 11 6 55 33 1 1 1 22 1 3 0 8 0 0 0 0 000 0 666 7777 444 0 1 0 0 00 6 00 999999999999999999999999 3 1 6
consensus : TGAAAAAAAGT-GT-A-G-C-CACTTTT-TG--TGCAAAT-G------ATG-TT---TTG-CGTAAC----AGCGAAATAT-CTTTC-GC-ACAG-AGAT-C-------GC---G-T-TAC----CT--TTTTCA-CT-C-G---AAATGACC-T--TT---TA--ACC--A--ATG-TT-T-GCAT-ATC-A-T----A--A--A----TA---A-TAAGT----------AA-C--ACT-G--CTGA---T---TA--------AGAT-T---TATA-T--G-ATTG---ATTC-----AA-GAAAGTT----C-TT-G----TCC-A-GT-C-A---T---AT-T-TTC---CT-------CT-C-TC-GA---TCA---TTTTCT-----TATT-NA-T--------CATN--A----CAAA-A-----A-------------------GATA----------------------T-----A--------------AA-----------T---------------G------------------T--C--------AT-G-TC----TAA--TA---TCTA--TTC-A-A-GGTAA---TT------A--TTT----ATG--TTTTCG---AC--TCT-AT-CGT-CA---TTAA---CCTT-TG---TTA-ATT-AATGGTGTG-ATCT--CA--G-G-TAA---AA-TC-A-TT-C-T-A-G-CTGG--G---T--AG-T--T-----------T---GAC-------CA----------T-AT-----T-G-C--AT-A-TACT-C-AAGCA-AA-ACAT-TAT--TA-----TA-ACTGT------A-----------TA-------TGT---TA--GACATT-----CGA-CT-GGTTTT-TC-T---------TANTTT--TAAAAA-GT-GA-GC--A---A-CGA--GTGA----TC-T-AGTAATNT---CAT-ACTAA--AATGGGAAAA--TAAAGT-C-A-AG-GNA--------CA-----TTCT-TAA-C-TTG--AT-TA-CG------CT------NCTAAG-------GAATTT--------ATTTTGT-T-----G-TAT----------CT-TCAATT--CTCGAGA--TTTT--CCGTTGCCGT--ATGAACTTGCA-TCCTTGTCA-GA---T--TGATCG-TTAGGGGCA-GA-GTTT--ATCA---TTTCCACAT--GAACTA------A-TA-CATCTT-CAA--G-CTCAAATCCGTT-G-AATTNAC---TTTC--AT-CATA----AT-CAAAA--TA--TT-CGG-C-G-AAA---AACG-A----A--AGTCTTTTCTCCTC-GTTATCGAA--A-ACT-T-CGACA-GG--CG-CCG-CC-A--TGTTTTGTGTA-CA-C-AT-TACATTGCA---CCA-A-TCAAA--TTAAA----GC--TTTTTTA-AAACT-TG--GAAATC-C-CC--AG-A-T-AC--GAAAATA-AA-CTG-----AAATGGCGA-TTGT--CAC-GA-------TTAA-CA---TT--TTT---TTT--AA---ATT-CGCG-ATATTAGGC-ATNG-CGTGA--TT-TCA-ATAC-A--CTG-AAAA-ATTGG-CTTT-C-GCC-A-A---T-TGC-G-AATTT-C--TG---TAGC-CATT-TTTTG-AGA--TTCTT-TCGC--C-A--A-TG--G--------CG--AAAATGGCG-AACGGC-AGCGTGG
Reference ( family-1600 ) : TGAAAAAAAGT-GT-A-G-C-CACTTTT-TG--TGCAAAT-G------ATG-TT---TTG-CGTAAC----AGCGAAATAT-CTTTC-GC-ACAG-AGAT-C-------GC---G-T-TAC----CT--TTTTCA-CT-C-G---AAATGACC-T--TT---TA--ACC--A--ATG-TT-T-GCAT-ATC-A-T----A--A--A----TA---A-TAAGT----------AA-C--ACT-G--CTGA---T---TA--------AGAT-T---TATA-T--G-ATTG---ATTC-----AA-GAAAGTT----C-TT-G----TCC-A-GT-C-A---T---AT-T-TTC---CT-------CT-C-TC-GA---TCA---TTTTCT-----TATT-NA-T--------CATN--A----CAAA-A-----A-------------------GATA----------------------T-----A--------------AA-----------T---------------G------------------T--C--------AT-G-TC----TAA--TA---TCTA--TTC-A-A-GGTAA---TT------A--TTT----ATG--TTTTCG---AC--TCT-AT-CGT-CA---TTAA---CCTT-TG---TTA-ATT-AATGGTGTG-ATCT--CA--G-G-TAA---AA-TC-A-TT-C-T-A-G-CTGG--G---T--AG-T--T-----------T---GAC-------CA----------T-AT-----T-G-C--AT-A-TACT-C-AAGCA-AA-ACAT-TAT--TA-----TA-ACTGT------A-----------TA-------TGT---CA--GACATT-----CGA-CT-GGTTTT-TC-T---------TANTTT--TAAAAA-GT-GA-GC--A---A-CGA--GTGA----TC-T-AGTAATNT---CAT-ACTAA--AATGGGAAAA--TAAAGT-C-A-AG-GNA--------CA-----TTCT-TAA-C-TTG--AT-TA-CG------CT------NCTAAG-------GAATTT--------ATTTTGT-T-----G-TAT----------CT-TCAATT--CTCGAGA--TTTT--CCGTTGCCGT--ATGAACTTGCA-TCCTTGTCA-GA---T--TGATCG-TTAGGGGCA-GA-GTTT--ATCA---TTTCCACAT--GAACTA------A-TA-CATCTT-CAA--G-CTCAAATCCGTT-G-AATTNAC---TTTC--AT-CATA----AT-CAAAA--TA--TT-CGG-C-G-AAA---AACG-A----A--AGTCTTTTCTCCTC-GTTATCGAA--A-ACT-T-CGACA-GG--CG-CCG-CC-A--TGTTTTGTGTA-CA-C-AT-TACATTGCA---CCA-A-TCAAA--TTAAA----GC--TTTTTTA-AAACT-TG--GAAATC-C-CC--AG-A-T-AC--GAAAATA-AA-CTG-----AAATGGCGA-TTGT--CAC-GA-------TTAA-CA---TT--TTT---TTT--AA---ATT-CGCG-ATATTAGGC-ATNG-CGTGA--TT-TCA-ATAC-A--CTG-AAAA-ATTGG-CTTT-C-GCC-A-A---T-TGC-G-AATTT-C--TG---TAGC-CATT-TTTTG-AGA--TTCTT-TCGC--C-A--A-TG--G--------CG--AAAATGGCG-AACGGC-AGCGTGG
gi|1 : T-CTTTC--C-AAAG-AGAT-TCT-----GC---A-TGTAC----CT--TTTTCA-CT-C-A---AAATGACA-T--TT----A--ACC--A---TG-TTCT-GCAT-ATC-A-TTAT-A--A--T----TAT--A-TAAGT----------AAGC--ACT-GG-CTGAGATT---TA--------AGAT-T---T-TA-T--G-ATTG---ATTC-----AG-AATAGTT----CCTT-G----TCC-A-GT-C-AGTAT---AT-T-TTC---CT-------CT-CCTC-GA---TCA---TTTTCT-----TATT-TAAT--------CATT--A----CAAA-A-----A--------------------ATAAA--------------------T-----A--------------AA-----------T---------------GAAACACGCAGAAAAATGAT--C--------AT-G-TC----TAA--TA---TCTA--TTC-A-AAGGTAAA--TT------AATTTT----ATG--TTTTCGT--AC---CT-ATTCGT-CT---TTAA---CCTT-TA---TTA-ATT-AATGGTGTG-ATCTGCCA--G-G-TAATTAAA-TC-A-TT-CCT-ATG-CTGG--G---TTTAG-T--T-----------TA--GAC-------CA----------T-AT-----T-G-C--ATCA-TGCT-AGAAGCA-AA-AAAT-TAT--TA-----TAGACTAT------A-----------TAGTATACATGTAAATA--GACATT-----TGA-CTTGGTTTTGTC-T---------CTATTT--TAAAAA-AA-GA-GT--A---A-CGA--TTGAGA--CT-T-AGTAATTT---CAT-ACTAAGAAATGGGAAAAGATAAAGT-C-A-AG-GTA--------CA-----T-CT-TAAGC-TTGGAAT-TA-CG------CT------GCTAAGCCCTAAGGACTTT--------ATTTTGT-T-----G-TATTGCCCAGTATCTATCAATT--C-CGAGAAATTTT--CCGTTG---T--AT-----T----TTCTTGTCAAGAGCCC--TGATCG-TT--GGGTA-GAAGTTTG-ATCAGATTTTCCATATTGAAACTA------A-TAACATCTTTCAA--GGCTCCAATCCGTT-A-AATTTTCCTTTTTC--AT-CATATT--AT-CAAAAAATA--TT-CGG-T----AA---AACGGA----A--AGTCTTT-CTCCAC-GT-AT--GA--A-ACT-CGCGACA-TG--CGTCCG-CC-A--TGTTTTATAAAACAGC-ATGTACATTGCAGACCCA-AATCAAA--TTA------GC--TTTTTTTTAAACT-TG--GAA-TC-CGCC--AG-A-T-AC--GAAAATATAA-CTGA----AAATGGCGA-TTGT--CAC-GA-------TTAATCA---AGAATTT---GTA--AA---ATT-CGCG---ATTAGGC--TAGTCGTGAGTTT-TCA-ATAC-ATCTTG-AAAA-ATTGG-TTTTCC-GCC-A-AATTT-TGT-G-AATTT-TGGTG---TAGC-CAGT-TTTTG-ATATTTTCTT-TCGCATCGA--A-TG--GGATTGAAAGG--AAAATGGCG-AACGAC-AGCGTG
gi|10 : TGAAAAAAAGT-GT-A-G-C-CACTTTA-TG--TGCAAAT-G------ATG-TT---TTG-AGTAA------GCGAAATAT-CTTTC-AC-ACAG-AGAT-C-------GC---G-T-TGC----CT--TTTTCA-CT-C-A---AAATGACC-A--TT---TA--ACC--A--ATG-TTCT-GCAT-ATC-A-T----A--A--A----TA---A-TAAGT----------AA-C--ACT-G--CTGA---T---TA--------AGAT-T---TATA-T--G-ATTG---ATT------AA-GAAAGTC----C-TT-G----TCC-A-AT-C-A---T---ATAT-TTC---CT-------CT-C-TC-GA---TCA---TTTTCT-----TATT-AA-T--------CATT--A----CAAA-A-----A-------------------AATAAACAAACA--------------TGAGAAA--------------AA-----------T---------------G------------------T--C--------AT-G-TC----TAA--TA---TCTA--TTC-A-A-GGTAA---TT------A--TTTT---ATG--TTTTCG---AC--TCT-AT-CGT-CA---TTAA---CCTT-TG---TTA-ATT-AATGGTGTG-ATCT--CA--G-G-TAA---AA-TC-A-TT-C-T-A-G-CTGG--G---TGTAG-T--T-----------T---GAC-------CA----------T-AT-----T-G-C--AT-A-TGCT-G-AAGCA-AA-ACAT-TAT--TA-----TA-ACTAT------A-----------TA-------TAT---TA--GATATT-----TGA-CT-GGTTTT-TC-T---------TAATTT--TAAAAA-GT-AA-GT--A---A-CGA--GTGA----ACTT-AGTAATTT---CAT-ACTAA--AATGGGAAAA--TAAAGT-C-A-AA-ATA--------CA-----TTCT-TAA-C-TTG--AT-TA-CG------agcc
gi|11 : cagggctcacactgggtAAAAAAAGT-GT-A-G-C-CACTTTT-TGA-GGCAAAT-G------ATG-TT---TTG-CGTAA------GCGAACTAT-CTTTC-GC-ACAG-AAATGC-------G----G-T-TGC----CT--TTTTCA-CT-T-A---AAATGACC-T--TT---TA--ACCTGA--ATGTTT-T-TCAT-ATC-A-T----A--A--A----T----A-TAAGT----------AA-C--ACT-G--CTGA---T---TA--------AGG--T---TATA-T--G-A-TG---ATTC-----AA-T-AAGTT----C-TT-G----TCC-A-GT-C-A---T---AT-T-TTT---GC-------TT-C-TC-A-----------TTTCT-----TATTAAA-T--------CATC--A----CAAA-AGATTTA-------------------GATAAC--------------------T-----A--------------AA-------------------------------------------------CAAGAGAGAAT-G-TC------A--TG---TCTA--TTC-A-A-GGT-A---TT------A--TTT----ATG--TTTTGG---AC--TCT-AT-CGT-CA---TTAA---CCTT-TG---TTATATCAAAGGGAGTG-ATCT--CA--G-G-TAA---AA-TC-A-TT-C-T-A-GTTTGG--GTAAT--AG-T--T-----------T---CGCACG----CA----------T-AT-----T-G-C--AT-A-TACT-C-AAGCA-AA-ACAT-TTT--TA-----TA-ACTGC------A-----------TG-------GG--------GACATT-----CGA-CT-GGTTTG-TCTT---------TATTTT--AAAAAA-GT-GA-GC--A---A-CAT--GTGA----TC-T-AATA
gi|12 : cagggctcacactgggttgaAAAA-GT-GA-GC--A---A-CAA--GTGA----TC-T-AGTAATAC---CAT-GCTAA--AATGGGAAAAA-TAAATT-C-A-AG-GAA--------CA-----TTCT-TAA-C-TTC--AT-TA-CG------CT------GCTAAG-------GAATTT--------ATTTTGT-T-----G-T----------------CAATT--CTCGAGA--TTTT--CCGTTGCCGTG-ATGAACTTGCA-TCCTTATCA-GA---T--TGATCG-TTAGGGACA-GA-GTTT--ATCA---TTTCCACAT--GAACTA------A-TA-CATCTT-CAA--G-CTCAAATCCGTT-G-AATCAAC---TTTC--AT-CATA----AT-CAAAA--TA--TT-CGG-C-G-AAA---AACG-A----A--AGTCTTTTCTCCTC-GTTATCGAA--A-ACT-T-CGACA-GG--CG-CCG-CC-A--TG-TTTGTGTA-CA-C-AT-TACATTGCA---CCA-A-TCAAA--TTAAA----GC--TTTTTTA-AAACT-TG--GAAATC-C-CC--AG-A-T-AC--GAAAATA-AA-CTG-----AAATGGCGA-TTGT--CAC-GA-------TTAA-CA---TT--TTT---TTT--AA---ATT-CGCA-ATATTAGGT-ATTG-TGTGA--Ttca
gi|13 : T----------CG-TCAATT--CTCGAG----TTT--GCGTTGC-----ATGAACTTGC----CTT-TC--GA---T---GATCG-TTAGGAG-A-GA-GTTT--AT-A---TTC-----T--GAACTA------A-TA-CATCTT-CAA--G--TCAA-TCCGTT-G-AATCAAAG--TTTC--ATTCATA----AT-CAAAA--TC--TT-CGG-CCG-AAAGAAAACG-A--------GTCTTTTCTC-TC-GTTA-CGAA--A--CT-T-CGACA-GG--CG-CCG-CC-A--TGT-----GTA-CA-C-AT-TACATCGC-----CA-A-TCAAA----AAA----GC--TTTTTTA-AAACT-TG--GAAATC-T-CCCAAG-A---AC----ACATA-AA-CTGA----AAATGGC-A-TTGT--CAC-GA-------TTAA-CA---TT--TTT---TTT--AAAACATT-CGC--ATAT--AGC-AT-G-TGTGA--TTATCACACAC-A--CTG-AAAA-ATTGG-CTTT-C-GCC-A-A---T-TGC-A-AAATT----TG---TAGC-CATTATATTG-AGA--TTCTT-TCGC--C-A--A-TGGTG--------CA--GAAATGGCG-AAT-GC-AGCGTG
gi|14 : -TTAGGGGAA-GA-GGTTG-ATCA---TTTCCACA---GTAC--------A-TA-TATCTT-CAA--GACTCAAATCCGTT-G-AATTCAC---TTT---AT-CGTA----AT-CAAAA--TA--T--CGT-C-G-AAA---AATC-ATTCTACCAATCTTT-CTCCTTTGTTATCGAATCA-TCT-T-TTGCA-AGAGCA-CCGGCC-AGTTGATGTACGCA-CA-C-TT-TACATTGCA---CCA-A-TCAAA-----AA----GC--TTTT----AAACTCTGATGAAATC-C-C---AGTA-T-GC--GAAAATA-ATTCTC-----GAATATCGA-T-GT--CAT-GACTCGTCATTAA-CA---AC--TTCACATTT--AA---ATT-C-CG--TATTAG-C-ACAG-GCTGAAATT-TCA-ATAC-A--CTG-AAAAAATTGG-CTTT-C-GCCAA-A---T-TGTGG-AATTT-C--TG---TAGC-CA---TTTTG-AGA--TTCTT-TCGC--C-A--A-TG--G--------CG---AAATCGTG-AAC-GC-AGCGTagcc
gi|15 : tcTGAAAAAAAGT-GT-AAG-C-CACTTTTTTG--TGCAAAT-GA-----ATGTTT---TTG-CGTA------AGCGAAATAG-CTTTC-GG-ACAG-AGAT---------GT---GTT-TAC----CT--TTTTCA-CTGCAA---AAATGACCAT--TT---TA--ACC--ACCATG-TTCT-GCAT-AT--A-TAATAA--A--A----TA---A-TAAGT----------AA-CA-ACTGG--CTGA---T---TA--------AGAT-T---TTTA-T--G-ATTG---ATTC---------AGAGTC----T-TT-GC---CCC-A-GT-C-A---T---AA-T-ATT---CT-------CT-C-TC-GA---TCAT--TTTTTT-----TATA-AT-T--------CATT--A----CAAA-A-----AT------------------AAAA----------------------T-----A--------------AACCCGAGAAAACT---------------GT-----------------T--C--------AT-G-TC----TAA--TAATCTTTA--TTC-A-A-GGTAA---TT------ATTTTT----ATG--TTTTCG---AC--TCTAAT-CGT-CG---TTAC---ACTT-TG---TTA-ATC--ATGGTGTGAATCT--CA--G-G-TAA---AA-TCAA-TT-C-T-A-G-CTa
gi|16 : ggctcaactgggtTGAAAAAAAGT-GT-A-G-C-CATTTTT-TG--TGCAAAT-G------ATG-TT---TTG-CGT--T----AGCGAAATAT-CTTTC-GCCACAG-ATAT-C-------AC---G-T-TAT----CT--TTTTCA-CT-T-----AAATTACC-T--TT---TA--ACC--A--ATG-TT-TTACAT-ATC-A-T----G--A--A---------A-TAAGC----------AA-C--ACT-G--CTGA---T---TA--------AGAT-T---CATA-T--G-AT-----ATTT-----GA-AGAAGTT----C-TT------TCC-A-AT-C-A---A---AT-T-TTC-------------T-C-TC------TCA---TTTTCT-----TATT-TA-T--------CATC--A----CAAA-A-----A-------------------GATA----------------------T-----A--------------AA-----------T---------------G------------------T--C--------AT-G-CC----TAA--TA---TCTA--TTT-A-A-G-TAA---TT------A--TTT----ATG--TTTTGG---AC--TCT-AT-CGT-CA---TTAA---CCGT-TG---TTA-ATG-AAAGGTGTG-GTCT--CA--G-G-TAA---AA-T
gi|17 : cagggctcacactgggttgaaaaaaagGCA-TCCTTGTCA-GA---T--TGATCG-TAAGGGATA-CA-GTTT--AT-A---TTTCCACAT--GAACTG--------TA-TTTCTT-CAA--G-CTCAAATCCGTT-G-AATTTAC---TTTC--AT-CATA----AT-CAAAT--TA--TT-TGG-C-G-AAA---AACG-A----A--AGTCTTTTCTGCTC-GTTATCGAA--A-ACT-T-TGGCA-GG--CG-CCG-CC-A--TG-TTTGTGTA-CA-C-AT-TACATTGCA---CCA-A-TCAAA--TTTAA----GCTTTTTTTTT-AAACT-TG--GAAATC-C-CC--AG-A-T-AC--GAATATA-AA-CTG-----AAATGGCGA-TCGT--CAC-GA-------TTAA-CA---TT--TTT---TTTAAAA---ATT-CGCG---ATTAGGC-ATTG-CGTGA--Tt
gi|18 : GAA--A-ACT-T-CAACA-GG--CG-CCG-CC-A--TGTTT-GTGTA-CA-C-AT-TACATTGCA---CCA-A-TCAGA--TTAAA----GC--TTTTTTA-AAACT-TG--GAAATC-C-CC--AG-A-T-AC--GAAAATA-AA-CTG-----AAATGACAA-TTGT--CAT-GA-------TTAA---------------------AA-----T-CGCA---ATTAGG--ATTG-TGTGA--TT-TCA-ATAC-A--CTG-AAAA-ATTAG-CTTT-C-GCC-A-A---T-TGT-A-AATTT-C--TG---TAGC-CATT-TTTT--AGA--TTCTT-TCGC--C-------------------------AATGGCG-AACGGC-AGCGTG
gi|19 : tCGAA--ACACT-C-C-ACA-GGG-CG-CCG-CCCA--TGTTTT-TAAA-CA-C-AT-TACAT-GCA---CCACA-TCAGAGATTAAAAGGGGC--TTTT----AAACT-TG--GAAATC-C-C---AG-A-TGACTGAAAAATA-AA-CTGCACAAAAATGACGA-TGG-----C-GA-------TTAA-CA---AT--TTT---TTT--AT---ATT-CGAG-AT--TAGGC-TTAG-CGTGA--TT-TCA-ATAC-A--CTG-AAAA-ATTagccc
gi|2 : aaaaatctgaaagtcttttctccaggggcggggggggggggtgggatgAAAAAAGT-GT-A-G-CACACTTTT-TG--TGCAAATTG------ATG-TT---TTG-CGTAACT---AGCGAA-TAT-CTTTC-GC-ACAG-AGATTC-------AC---G-T-TAT----CT--TTT-CA-CT---G---AAATGACC-TGTTT---TA--AACG-A--ATG-TT-T-TCAT-ATC-A-T----A--A--A---------A-TAAGTCA--------AG-C--ACT-G--CTGA---TGATTATTTGTGTTAGAT-T---CATA-T--G-AT-----ATTTG----AA-GAAAGTT------TG-G----TCC---GT-C-A---A---AT-T-TTC---CT-------CT-C-TC-AA---T------TCTCT-----TATT-TA-TT-------CACA--A----CAAA-A-----A-------------------GATA----------------------T-----A--------------AA-----------T---------------G------------------T--C--------AT-G-CC----TAA--TA----CTA--TTA-ACA-GGTAA---TT------A--TTT----ATG--TTTTGG---AC--TTT-AT-CGT--A---TTAA---CCGT-TG---TTA-ATT-AA-GGTGTG--TCT--GA--GTG-T-A---AA-TC-A-TT-T-T-A-G-TTGA--G---T--AGTT--T-----------T---GACATATATACAT---------T-AT-----T-G-C--AT-A-TACT-C-AAGC--AA-ACAT-TAT--TA-----TA-ATGGG------A---------------------GT---CA--TACA---------A-CT-GG-TTT-TC-T---------TGTTTTTATAAAAA-GT-GAGGC--A---A-CAG--GTGA----TC-T-AG-AATAT---CAT-ACTAA--AA--GGGAAA--TAAATT-C-A-AA-GAA--------CA-----TTCT-TAA-C-TTC--AT-TA-CG------CT------ACTAAG-------GAATTT--------TATTTGT-T-----G-TAT----------CG-TCAA-T--CTCGAGA--TTTT--CCATTGCCGTTGATGAACCTGTGCTCCTTATCA-GA---T--TGATCG-TTAGGGAAG-GA-GTTT---TCA----TTCCACAT--GAACTA------ATTA-CATCTT-CAA--G-CTC-AATC--TT-GAAATCAAC---TTTC--AT-CATA----ATCCAAAA--TA--TTCCGGTC-G-AAA---AACG-A----A--A-TCTTTTCTCCTC-GTTATCGGA--A-ACTAT-CGACACAG--C--TCG-CCGA--TGTTTTGTGTA-CA-CGAT-AATGTAGCA---CCA-A-TCAAA--TGAA---------TTTTTTA-AAACT-TG--G-GATCGCGCC--AG-A-G-A---GAGAATA-AA-GCG-----AAAAGGAGAGTTGTCCCACGGA-------T--A-CATT-TT--TTT---TTT--TT---ATT-CGCGAATATTAGGC--TAT-TGTGA---T-TCA-ATACAA--CTGAAAAA-ATTGG-C--T-C-G-C-A-A-----TGC-ACAATTT-A--CGTTTTAGCTCATT-TTTTG-AGA--TTCTTGTCGC--C-ACCA-T---G--------CGA-AAAATGGCG-AACGGC-AGCGTGG
gi|20 : gaatTGAAAAAAAGT-GT-A-A-C-CACTTTT-TG--TGCAAAT-G------ATG-TT---TTG-------------------A------C-GC-ATAG-AGAT-C-------GC---G-T-TAC----CT--TTTTCA-CT-T-G---AAATGACC-T--TT---TA--ACC--A--ATGTTT-T-ACAT-ATC-A-T----A--A--A----TA---A-TAAGTACATGTAAGCAA-T--ACT-G--CTGA---T---TA--------AGAT-T---TTTA-T--G-ATTG---ATTC------A-GAAAGTT----C-TT-G----TCC-A-GT-C-A---T---A--T-TTC---CT-------CT-C-T--G------A---TTTTCT-----TATT-AA-T--------CATA--A----GATA-A-----A-------------------
gi|21 : ctcacactgggtAA-AGAT-C-------ACTTCG-T-TACTCCTCC--TTTTCA-CT-T-G---AAATGACC-T--TT---CATTA-C--A--ATG-TT-T----T-A-C-A-T----A--AT-A----TA---CTTAAGT----------AA-CTAACT-G--CTGA---TGC-TA--------AGAT-T---TATA-T--G-ATTG---ATT------AA-GAAAGTT----A-TT-C----TTC----T-T-G---C---AG-C-TCT---CT-------CT-C-T-------TCAT--TTTTCTTAAG-TATT-CA-----------ACA--A----CAAA-A-----ACGTGTACACTATAAAACACGAGA----------------------G-----A--------------AA-----------T---------------G------------------TTGC--------CT-G-TC----TAA--TAC--TATA--TTC-A-A-GGTAA---TT------A--Tctaaaca
gi|22 : A-A-TCAAA--TTAAA----GC--TTTTTTA-AAACT-TG--GAAATC-A-CC--AG-AAT-AC--GAAAATA-AA-CTGG----AAATGGCGA-TTGT--CAC--A-------TTAA-CT---TT--TTT---TTT--AA---ATTCCGCA-ATATCAGGCGATTG-GTTGA---T-TCA-ATAC-A--CTG-AAAA-ATTGGACTTT-CGGCC-AGA---T-TGC-A-AATTCAC--TG---TAGC-CA-T-TTTTG-AGA--TTC-T-TCG---C-A--A-TG--G--------CG--AAAAT-GCGTAACGGCAAGCGTG
gi|23 : TAAAAGAAAGT-GT-A-G-C-CACTTTT-TGAGTG-AAAT-AGCCTATATG-TT---CTC-CGTCACCGTGAGCGAAACAT-CTTTT-GC-TCAA-AGAA-T-------GG---G-T-TAC----CT--TTCTCA-TT-T-G---AAATGACC-T--TT---TA--ACC--A--ATG-TT-T-ACAT-GT--A-T----------A----TA---A-C-AGT----------AA-C--A-T-C--CTGA---T---TA--------AGAagccc
gi|24 : taggtTGGAAAAAAGT-GT-A-G-C-CACTTTT-TG--TGCAAAT-G------ATG-TC---TTG-CAT--C----AGCAAAATAT-CTTTC-GC-ACAG-AGAT-C-------AC---G-T-TAT----CT--TTTT-A-CT-T-G---AAATGACC-T--TT---TA--ACC--A--ATG-TT-TCACAT-ATC-A-T----G--ATTAATATTA---A-TAAGT----------AA-
gi|25 : ctcacactgggt--------------AA-----------T---------------G------------------T--C--------AT-G-TC----TAA--TA---TCTA--TTC-A-A-GGTAAA--TT------A--TTTT---ATG--TTTTCA---AC--TCT-AT-CGT-TG---TTAA---CCTT-TG---TTA-ATC-AATGGTGTG-ATCT--CG--G-G-TAA---AA-TC-A-TT-C-T-A-G-CTGG--G---T--gc
gi|26 : ---TTTTCT-----TATC-AA-T--------CATC--A----CAAA-A-----A-------------------GATA----------------------T-----ACTAAACATGAGAGAAA-----------T---------------G------------------T--C--------AT-G-TC----TAA--TA---TCTA--TTC-A-T-TGTAA---TT------A--TTT----ATG--CTTTGG---AC--TCT-AT-CGT-CA---TTAA---CCTT-TG---TTA-gtagt
gi|27 : TA-T--G-ATTG---ATTC-----T--GAAAATT----C-TT-G----TCC-A-GT-C-A---T---A--T-TTC---CT-------TT-C-TC-GA---TCA---TTTTCT-----TACT-AA-T--------CAAA--A----TAAACA-----C-------------------GAAA----------------------G-----A--------------AA-----------T---------------G------------------C--C--------AT-G-TC----TAA--TA---TCTA--TTC-A-A-GGTA
gi|28 : A----------T-AT-----T-G-C--AT-A-TACT-C-A-GCA-AA-ACAT-T-T--TA-------------------A-----------TA------------------------------A-CT-GGTTTG-TC-T---------GTGTTT--TAAAAA-GT-GA-GC--C---A-CAA--GTGG----TC-T-A------------------A--AATGGGAAAA--TAAAGT-C-A-AG-GCA--------CA-----TT
gi|29 : CG-TTAAGGGTA-GA-GTTT--ATCA---TTTCCATAT--AAACTATACTATA-TA-CATCTT-CAA--G-CTCCAATCCATTAA-AATTTAC---TTTC--AT-CATA----AT-CAA
gi|3 : G-CGTAA-----GGCGAAATAT-CTTTTAGC-ACAGGAGATTC-------GCT--G-T-TAC----TT--TTTCCA-CT-C-A---AAATGACC-A--TT---TA--ACC--AT-GTG-TT-T-ACAT-ATC-AGT----A--AC-A----AA---A-TAAGT----------AA-C--ACT-GACCTGA---T---TA--------AGACGTACATATA-C--G-A-TG---AATC------A-GAAAGTC----C-CT-GTGCTTCC-ATGT-C-T---T---AT-TATTTATACT-------CT-CGTCGGA---TCA---TTTTCTAAAAGTATA-TA-A--------AAAA--A----CAAA-A-----A-------------------AAGAAAGAAAAAACCAAAACCGAGAAC-----A--------------AA-----------T---------------G------------------T--C--------ATAG-TCG---TAA--TA---TCTAAGTTC-A-A---TAA---CTGCTTAGA--TTT----ATG--TTTTCG---ACAGTCT-AT-CGTACA---TGTA---CCTTATG-----A-ATTCAATAGTGTG-ATCT--CA--A-GCTAA---AAGTC-ATTT-C-T-A-G-CTGGT-G---T--AG-T--T-----------A---AAC-------CA----------T-A--------GAC--AT-A-T-------AGCA-AAGACGTCTATGGTT-----TA-ACCAT------A-----------Tt
gi|3 : cagggctcacgctgggttgaaaaaaaggtgcaaaatgactgcgctaaatag---T--GG-T--T-----------T---AAC-------CA----------T-AT-----T-G-CG-AT-AATGCT-C-AAGCA-AA-ACAT-TAT----------A-ACTGT------A-----------T--------TAT---TATTAACATTTTCCACG--CT-GGCTTT-TC-T---------TAATTT--TAAAAA-GT-AA-GTGTA---A-CGA--GTGA----AC-TTAGTAATTT---CAT-ACTAA--AATGGGAAAA--TAAAGT-C-A-AG-GTA--------CA-----TT-----A-CGCTG---C-TA-AG------C--------CTAAG-------GACATT--------ATTTTGT-T-----G-TAT----------CT-TCAATT--CTCGAGA--ATTT--CCG---------------TTGTA-TCCTTGTCA-GA---C--TGATCG-TTTGGGGTA-GA-GTTT--ATCA---TTTCCATAT--GAACTT------A-TA-TATCTT-CAA--G-CTCCAATCCGTT-A-AATTTAC---TTTC--AT-CATT----AT-CGAAA--TA--TT-CAG-T-A-AAA---AACG-A----A--AGTCTTTTCTCTAC-GTTATCGAA--A-ACT-C-CGACA-GG--TG-CCG-CC-A--TGTTTT-TGAA-CA-C-AT-TACATTGCA---CCA-A-TCAAA--TTAAA----GC--TTTTTTT-AAACT-TG--GAAATC-C-CC--AG-A-T-AC--GAAAATA-AA-CTG-----AAATGGCGA-TTGT--CGG-TG-------TTAA-CA---AT--TTT---TTT---A---ATT-CGCG---ATTAGGC-TTGG-CGTGA--TT-TCA-ATAC-A--CTG-AAtgcgataatgctcaagcaaaacattataactgtattattattaacattttccacgctggcttttcttaattttaaaaagtaagtgtaacgagtgaacttagtaatttcatactaaaatgggaaaataaagtcaaggtacattacgctgctaagcctaaggacattattttgttgtatcttcaattctcgagaatttccgttgtatccttgtcagactgatcgtttggggtagagtttatcatttccatatgaacttatatatcttcaagctccaatccgttaaatttactttcatcattatcgaaatattcagtaaaaaacgaaagtcttttctctacgttatcgaaaactccgacaggtgccgccatgtttttgaacacattacattgcaccaatcaaattaaagctttttttaaacttggaaatccccagatacgaaaataaactgaaatggcgattgtcggtgttaacaatttttttaattcgcgattaggcttggcgtgatttcaatacactgaa
gi|30 : cagggctcacgctgggttgaaaaaaaggtgcaaaatgactgcgctaaataggcgtaaggcgaaatatcttttagcacaggagattcgctgttactttttccactcaaaatgaccatttaaccatgtgtttacatatcagtaacaaaataagtaacactgacctgattaagacgtacatatacgatgaatcagaaagtccctgtgcttccatgtcttattatttatactctcgtcggatcattttctaaaagtatataaaaaaacaaaaaaagaaagaaaaaaccaaaaccgagaacaaatgtcatagtcgtaatatctaagttcaataactgcttagatttatgttttcgacagtctatcgtacatgtaccttatgaattcaatagtgtgatctcaagctaaaagtcatttctagctggtgtagttaaaccatagacatatagcaaagacgtctaAAAAAAGT-GT-A-GAC-CACTTTT-TG--TGCAAAT-G------ATG-TT---TTGCCGTAAT-----GCGAAA-ATCCTTTC-GC-ACAG-AGAT-C-------
gi|31 : gctcacactgggttgAA-CAA--TT--TCT---TTT--AA---ATT-CGCA-AT--TAGGC-ACAG-TGTGA--TT-TTA-ATAC-A--CTA-AAAA-ATTTG-CTTT-C-GCC-A-A---T-TGT-G-AATTT-T--AG---TAag
gi|32 : CT-G-AAGCA-AA-ACAT-TAT--TA-----TA-ACTAT------AATACATGTATATA-------TAT---TA--GACATT-----TGA-CT-GGTTTT-TC-A---------TAATTT--TAAAAA-t
gi|34 : GAGA--TTTT--CCGTTGC-----ATGAACTTGCA-TCGTTGTCA-GA---TAATGATCG-TTAGGGGCA-GA-GTTT--ATC
gi|35 : --TG---TAGC-CATT-TT-TG-AGA--TTCTT-TCGC--C-A--A-T-------------------ATGGCA-AACGGC-AGCGTG
gi|37 : --TTCTT-TCGC--C-A--AATG--G--------CG--AAAATGGCG-AACAGC-AGCGCGagcc
gi|38 : CGAAATAC-TTTTC-GC-ACAG-AGAT-C-------GC---G-T-TAC----CT--TTTTCA-agccc
gi|4 : TA-T--G-ATTA---CTTTGAAAAAA-AAAAATT----C-TTTG----TCCCA-GT-CCA---T---AT-A-TTC---CTTTGTATTCC-C-TC-GA---TCAGATTTTTTC-----TAT---A-A--------CATT--AAAACCAAA-A-----ATAACCAC------------GAAA----------------------G-----A--------------AA-----------TTG-------------A------------------C--C--------AT-GGTC----TAAA-TAA--TCTA--TTCCA-A-GGTAAAAATT------A--TTA----ATGA-TTTTCG---AA--TTT-AT-CGT-CATGCTTAAGCCCCCT-TGATCTTA-ATT-GATGGTGTGAATCT--CAG-G-G-TAA---AA-TC-ATTT-C-TAA-G-CTGGTTA---T--AG-T--TTTTGTTGTTTGT---GACA------CA----------TAAT-----TAG-CCAATAA-TAAC-T-AAGCA-AA-A-AT-TAT--GAGCTTTTACATGGTTGAAGAA-----------TA-------T-T---TA--GACATT-----CGA-CT-GGTTTT-TC-TATTTTCTTATGTTTT--TAAAAAGGTAAA-GT--AAATA-CGAAGGTAATAACTT-T-AG--ATTTTTCCATAACTAAATAATGGGAAAA--TTAAGTGC-AGGG-GTAGAAGTCCCTA-----TTGTGTAA-C-TTG--ATGTATCGGC----CC------TCTAAG-------G
gi|4 : att--TAAGGC-CTA-AG-GAC--------CACCTATTTTT-TAG-T-TTG--GT-TA-TGTGATATCT------TCAAAG-------GTATTTGAAAGTCANNNNNNN-N-----N-NNN----------NN-NNNNNN--NNNNNGA--TTTT--CCGT---CGT------------A-TCCTTGTCA-GA---T--TGATCG-TTTGGGGTA-GA-GTTT--ATCA---TTTCCATAT--GAACTA------A-TA-CATCTT-CAA--G-CTCCAATTCATT-A-AATTTAC---TTTC--AT-CATA----AT-CAAAA--TA--TT-CGG-C-A-AAA---CATG-A----A--AGTCTTTTCTCCTC-GTCATCGAA--A-ACT-C-CGAGA-GG--CG-CCA-CC-A--TATTTT-TGAA-CA-C-AT-TACATTGCA---CCA-A-TCAAA--TTAAA----GC--TTTTTTT-AAACT-TG--AAAATC-C-CC--AG-A-T-AC--GAAAATA-AA-CTG-----AAATGGCAA-TTGT--CGC-GA-------TTAA-CA----C--TTT---TTT--AA---ATT-CGCA---ACTAGGC-TTAG-CGTGA--TT-TCA-ATGC-A--CTG-AAAA-ATTGG-CTTC-C-GCC-A-A---TGTGT-G-AATTT-C--TG---TAGC-CATT-TTTT--AAA--TTCTT-TCAC--C-------------------------AATGGCG-AACGGC-AGCGTGcctaaggaccacctattttttagtttggttatgtgatatcttcaaaggtatttgaaagtcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngattttccgtcgtatccttgtcagattgatcgtttggggtagagtttatcatttccatatgaactaatacatcttcaagctccaattcattaaatttactttcatcataatcaaaatattcggcaaaacatgaaagtcttttctcctcgtcatcgaaaactccgagaggcgccaccatatttttgaacacattacattgcaccaatcaaattaaagctttttttaaacttgaaaatccccagatacgaaaataaactgaaatggcaattgtcgcgattaacacttttttaaattcgcaactaggcttagcgtgatttcaatgcactgaaaaattggcttccgccaatgtgtgaatttctgtagccattttttaaattctttcaccaatggcgaacggcagcgtgagccc
gi|40 : atttatgattactttgaaaaaaaaaaattctttgtcccagtccatatattcctttgtattccctcgatcagattttttctataacattaaaaccaaaaataaccacgaaagaaattgaccatggtctaaataatctattccaaggtaaaaattattaatgattttcgaatttatcgtcatgcttaagcccccttgatcttaattgatggtgtgaatctcagggtaaaatcatttctaagctggttatagtttttgttgtttgtgacacataattagccaataataactaagcaaaaattatgagcttttacatggttgaagaatatttagacattcgactggtttttctattttcttatgtttttaaaaaggtaaagtaaatacgaaggtaataactttagatttttccataactaaataatgggaaaattaagtgcaggggtagaagtccctattgtgtaacttgatgtatcggccctcCTAAG-------GACTTT--------ATTTTGT-T-----G-TAagccc
gi|5 : tgctaagcTGAAAAAAAGT-GT-A-G-C-CACTTTT-TG--TGCAAAT-G------ATG-TT---TTG-CGTAAT----AGCGAAATAT-CTTTC-GC-ACAG-AGAT-C-------AC---G-T-TAT----CT--TTTTCA-CT-T-G---AAATGACC-T--TT---TA--ACG--G--ATG-TT-T-ACAT-ATC-A-T----A--A--------A---A-TAAGC----------AA-C--ACT-G--CTGA---T---TA--------AGAT-T---CATA-T--G-AT-----ATTTG----AA-GAAAGTT----C-TT-G----TCC-A-GT-C-A---A---AT-T-TTC---CT-------CT-C---------TCA---TTTTCT-----TATT-TA-T--------CATC--A----CAAA-A-----A-------------------GATA----------------------T-----A--------------AA-----------T---------------G------------------T--C--------AT-G-CC----TAA--TA---TCTA--TTT-A-A-GGTAA---TT------A--TTT----ATG--TTTTGG---AC--TTT-AT-CGT-CA---TTAA---CCGT-TG---TTA-ATT-AAAGGTGTG-GTCT--GA--GTG-T-A---AA-TC-A-TT-T-T-A-G--TGA--G---T--AG-T--T-----------T---GAC-------CATATATACATTT-AT-----T-G-C--AT-A-TACT-C-AAGCA-AA-ACAT-TAT--TA-----TA-ACTGG------A---------------------GT---CA--TACA---------A-CT-GGTTTT-CT-T---------TGTTTT--TAAAAA-GT-GA-GC--A---A-CAG--GTGA----TC-T-AGTAATAT---CAT-ACTAA--AATGGGAAAA--TAAATT-C-A-AG-GAA--------CA-----TTCT-TAA-C-TTC--AT-TA-CG------CT------ACTAAG-------GAATTT--------ATTTTGT-T-----GTTAT----------CG-TCAATTTCCTCGAGA--TTTT--CCATTGCCGTG-ATGAACTTGCA-TCCTTATCA-GA---T--TGATCG-TTAGGGACA-GA-GTTT--ATCA-----TCCACAT--GAACTA------A-TA-CATCTT-CAA--G-CTCAAATC--TT-G-AATCAAC---TTTC--AT-CATA----AT-CAAAA--TA--TT-C-G-C-GAAAA---AACG-A----A--AATCTTTTCTCCTC-GTTATCGAA--A-ACT-T-CGACA--G--CG-CCG-CC-A--TGTTTTGTGTA-CA-C-AT-TACATTGCA---CCA-A-TCAAA--TGAAA----G---TTTTTTA-AAACT-TG--GAAATC-C-CC--AG-A-T-AC--GAAAATA-AA-CTG-----AAATGGAGA-TTGT--CAC-GA-------TTAA-CATTTTT--TTT---TTT--TA---ATT-CGCA-ATATTAGGC-ATTG-TGTGA--AT-TCA-ATAC-A---TG-AAAA-ATTGG-C-TT-C-GCC-A-A---T-TGC-A-AATTT-C--TG---TAGC-CATT-TTTTGAAGA--TTCTT-TCGC--A-A--A-TG--G--------CGAAAAAATGGCGAAACGGC-AGCGTGG
gi|6 : TGAAAAAAAGTCGT-A-G-C-CACTTTT--G--TACAAAT-G------ATG-TT---TTG-CGTAA------GCGAAATAT-CTTTC-GC-AAAG-AGAT-T-------GC---G-T-TAC----CT--TTTCTA-CT-C-A---AAATGACC-A--TT---AT--ACC--A--ATG-TTCT-GCAT-ATC-A-T----A--A--A----TA-----TAAGT----------AA-C--ACT-G--CTTG---T---TA--------AGAT-T---TATAAT--G-ATTG---ATTC-----AG-AAAGGTC----C-TT-G----TCC-A-GTTC-A---T---ATAT-TTC---CT-------CT-C-TC-AA---TCA---TTTTCT-----TATT-AA-T--------CATT--A----CAAA-A-----A-------------------TAAA----------------------T-----A--------------AA-----------TAAACACAAGAAAAATG------------------T--C--------AT-G-TC----TAAAAGA---TCTAGGTTC-A-A-GGTGA---TT------A--TTTT---ATG--TTTTCG---AC--TCT-AT-CGT-CT---TTAA---CCTT-TG---TTA-ATT-AATGGTGTG-ATCT--CA--G-G-TAA---AA-TC-A-TT-C-T-A-G-CTGG--G---TGTAG-T--T-----------T---GAC-------CA--------------------------------------AAGCA-AA-ACAT-TAT--TA-----TA-ACTAT------A-----------TA-------TAT---TA--GACATT-----TGA-CT-GGTTTT-TC-T---------TAATTT--TAAAAA-GT-AA-GT--A---A-CGA--GTGA----ACTT-AGTAATTT---CAT-ACTAA--AATGGGAAAA--TTAAGT-C-G-AG-GTA--------CA-----TTCT-TAA-T-TTG--AT-TA-CG------CTGCTAAGCCTAAG-------GGCTTT--------ATTTTGT-TGTACAG-TAT----------CT-TCAATT--CTCGAGT--ATTT--CCG---------------TTGTA-TCCTTGTCA-GA---C--TGATCG-TTTGGTGTA-GA-GTTT--ATCA---TTTCCATAT--GAACTA------A-TA-CATCTT-CAA--G-CTCCAATCCGTT-A-AATTTAC---TTTC--AT-CATA----AT-CAAAA--TA--TT-CGG-T-A-AAA---AACG-A----A--AGTCTTTTCTCCAC-GTTATCGAA--A-ACT-C-TGACA-GT--CG-CCG-CC-A--TGTTTT-TAAA-CA-C-AT-TACATTGCA---CCA-A-TCAAA--TTAAA----GC--TTTTTGT-AAACT-TG--GAAATC-C-CC--AG-A-T-AC--GAAAATA-AA-CTG-----AAATGGCGA-TTGT--CGC-GA-------TTAA-CA---AT--TTT---TTT--AA---ATT-CGCG---ATTAGGC-TTAG-CGTGA--TT-TCA-ATAC-A--CTG-AAAA-ATTG
gi|7 : cagggctcacactgggtTGAAAAAAAGT-GT-A-G-C-CACTTTT-TG--T--AGAT-G------ATG-TAAAATTG-TGT--C----AGCAAAATAT-CTTTC-GT-ACAG-AGAC-C-------GC---G-T-TACA---TT--TTTTCAACT-T-G---AAATGAC--T--GT---TA--AAC--A--ATG-TT-TTACAT-ATC-A-T----A--A--A----TA---A-TAAGT----------AA-C--TCT-G--CAGA---T---TA--------AGAT-T---TATA-T--G-ATTG---ATT------AA-GAAAGTTAATTC-TT-G----TCC-A-GT-C-A---A---AT-T-T-C---CT-------CT-C-TC-A--------------------------GA-G--------GATA--A----CAAA-A-----A-------------------GATA----------------------C-----ACTAAACACAGAGA-AA-----------T---------------G------------------T--T--------AT---TA----TAA--TA---TCTA--TTC-A-A-GGTAA---TTT-----A--CTT----ATG--TTTTTA---CT--TCA-AT-CAC-CA---TTAA---ACTT--G---ATA-ATT-AAAGGTATGGATCT--CAAAG-A-TAG---AA-TA-A-TC-T-A-A-G-CTGC--A---T--AG-TATT-----------T---G---------CA----------T-ATAAAACT---C--AT---TACT-C-AAGCATAA-ACAT-TAT--TA-----TA-ACTGG------A-----------GA------------------ACATT-----CGATCT-GGTTTC-CA-T---------TATTTT--TAAAAAAGA-GA-GC--A---ATCAA--CCGA----TC-T-AGTA---T---CAT-AC-AA--AATGGGAAAA---AAAGT-C-A-AGAGAA--------CA-----TTCT-TAA-C-TTG--AT-TA-CG------CT------CCTAAG-------GAATTA--------ATTTTGTAT-----G-TA-----------CT-ATAATT--CTCGAGA--ATTTACCCGTTG-------TGA---------CCTTGTCA-GA---T--TGATCAATTAGGGGCAAGA-GTTTTAATCA---TTTC-ACAT--GATATA------A-TC-C-TCTT-CAACCG-CTCAA-TCC-TT-G-AATT-AC---TTTCCAAT-CATATGAAATTCAAAA--TAAATT-CGGGC-A-AAA---AACG-A----A--AGTCTTTTCT--TC-GTTAGCGAA--A-ACT-T-CAACA-GG--CA-ACG-CC-A--TGTTT-GTGTA-CA-C-AT-TATACTGCA---CCA-A-TCAAA--TTCAA----GC--TTTTTTA-AAACC-TG--GAAATC-C-CC--AG-A-T-AC--GAAAATA-AA-CTG-----AAATGCCGA-GTGT--TAC-GA-------TTAA-CCTT-TT--TTT---TTT--AA---ATT-CGCG-AT-TT-GGC-AT
gi|8 : cagggctcacactgggtTAAAAAAAAGT-GTGA-G-C-CACTTTA-TG--TGCAAAT-G------ATG-TT---T-G-AGTAA------ACGAAATAT-CTTTC-AC-ACAG-A-AT-CAGTGTTTGCTTTG-T-TGT----TTGTTTTTCA-CT-T-GGCAAAATGACCATG-TTGAATA--GTC--C--ATG-TTCT-GCATTATCGA-T----AGGA--A----TATTGA-TTAGT----------AA-C--ACT-GTGCTGA---T---TA--------AGAT-T---TATA-TTGGTATTAGGAATTA-----GACGAGAGTCA---T-TT-GGT--TCC-A-AT-C-A---TGATAT-T-TGC---CC-------CTAC-TC-GGATGTCAGTTTTTTCT-----TATT-AG-TATGGATTGCATTGAA----CAAA-A-----A-------------------AATAAACCAACA--------------TGAGGAA--------------AA-----------T---------------G------------------T--C--------AT-G-TGATTATAA--TG----CTA--TTC-A-A-G-TAA---TTT-----A--TTTTTATATGGTTTTTCGGCGAC--TCT-A--CGT-CA---T-AA---CCTT-TG---TTA-ATT-AATGGTGTG-ATCTCACA--G-G-TAA---AA-TC-A-TTCC-T-ATG-CTGGGTG---T--AG-T--T-----------TAGAAAC-------CA----------T-A--------G-C--AT-A-TGCTGA-AAGC--AA-ACAT-TAT--TA-----TA-A-TAT------A-----------TA-------TGT---CA--t
gi|9 : agggctccactgtggtggtttgggggttgTTT--TAAAAA-GT-GA-GC--A---A-CAA--GCGA----TC-T-ATAAATAT---CAT-ACTAA--AATGGGAAAA--TAAATT-C-A-AG-GAA--------CA-----TTCT-TAA-C-TTC--AT-TA-CG------CT------TCTAAG-------GAATTT--------ATTTTGT-T-----G-T----------------CAATT--CTCGAGA--TTTT--CCGTTGCCGTG-ATGAACTTGCA-TCCTTATCA-GA---T--TGATCG-TTAGGGACA-GA-GTTT--ATCA---TTTCCACAT--GAACTA------A-TA-CATCTT-CAA--G-CTCAAATC-GTT-G-AATCAAC---TTTC--AT-CATA----AT-CAAAA--TA--TT-CGG-C-G-AAA---TACG-A----A--AGTCTTTTCTCCTC-GTTATCGAA--A-ACT-T-C-ACA-GG--CG-CCG-CC-A--TGTT--GTGTA-CA-C-AT-TACATTGCA---CCA-A-TCAAA--TTAAA----GC--TTTTTTA-AAACT-TG--GAAATC-C-CC--AG-A-T-AC--GAAAATA-AA-CTG-----AAATG-CGA-TTGT--CAC-GA-------TTAA-CA---TT--TTT---TTT--AA---ATT-CGCA-ATATTAGGC-ATTG-TGTGA--TT-TCA-ATAC-A--CTG-AAAA-ATTGG-CTTT-C-GCC-A-A---T-CGC-A-AATTT-C--TG---TAGC-CA-T-TTTTG-AGA--TTCTT-TCGC--C----A-T---G--------CG--AAAATGGCG-AAT-GC-AGCGTGtaacaaacaatgattttcagtgtgtattcta
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|33 ): TCTGTACATAGAAAATATAGGCCTTATAGAGACTATTCTCAGGGCTCACGCTGGGTTGAAAAAAA
Unaligned ( gi|36 ): AATTTCCTGCTTTGTAGTTGCAGGGCTCACACTGGGTTGAAAAAAA
Unaligned ( gi|39 ): AGGGCTCACTCTGGGTTGAAAAAAAGTGTA