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9 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|8 : ctgTACTTAT-TGT--TTGC--T---T--AAGT-A-TCT------T-G-A--GA---------A-----C------CCA--ATT-G--GAC-CAG-ATGC-A-AT-AT-T----T-G----GTGT-A---G-T-----------CA-TG---AT--T-----T----TA---GCG-C-----TT-CT-T-CTATGTA--------TGACAA--T----TAATG---G---A-TA-AAT----T-A-A--CAAATGTT-TC---C--ATATTTTAA-C-----AG-A-------ACC---TA--AATTAGG--GC---C----ACT---T---CTG-CAC--T-GC--CAA-AC-----GT-GCTAA-A--ATG---T-G--A-ATCC-CGCT-AAAT---T-A---AACACACTTACA
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|20 : tgtattatcactagaattcaaatacatcagctgcatgtccaccAT------T-T-A--AA---------ATTTGAC------TCA--ATT-G--AAT-ATG-A--C-A-CG-AT-T----T-T-----TGT-T---A-TTCC--------CA-TG----T--A-----T----TA---GCC-T-----TT-GT-T-TTGTGTT--------TAATAG---------A-G---G---A-TA-AA-----C-A----GAAA--TT-TT---CCAAGATTTCAG-T-----GA-A-------GCT--GTT--AATTAGC--CC---C-----CTATATG--CTT-GAC--T-GC--CAA-AG-----GC---TAA-ATAATGAC-T-G--A-GTGC-CGCT-AACA---G-A---AGGACACATACAatttcgga
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gi|30 : catgtacatgcatgtttgataattg-----GT-GCTAA-A--ATTATAT-G--A-ACCT-TACT-AAGA---T-A---AGTACATATACAtt
gi|31 : atttatgtattatagagtagttcagcaccagtgcagagctgctgcacaataggaataatcatgaattgataatggatgattagagaatcttattcatagaattataattta-A---A-T-----------CA-TG---AT--C-----T-----G---GCG-C-----CT-CT-T-CTATGTACATGTATATGATAGGCC----TAATG---G---ACTG-TT-----T-A-A--GAA---TT-TT---C--ATATTTTGG-C-----GC-AGTTGTACATC--GTA--AATTAGC--G----C----ATT---TA--CTT-TAC--C-AT--CAA-AG-----CC-GCTAA-A--ATT---T-G--A-ACCC-CACT-AAAT---T-A---AATACAgttttaaata
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-1583 ) : TACTTAT-TGT--TTAT--T---T--TAGC-G-T---AT------TTA-----A-AATTT-G--C-G-CA--GTC-G--GAG-CTGATGC-A-CT-ATTT-G----GCGT-A---A-T-----------CA-TG---AT--T--T----TA---GCG-C-----TT-CT-T-CTATGTN--------T-GA-CAA--T----TA-ATGG---A-TA-AA-----T-A-A--GAAA--TT-TTC--ATA-TTTTAG-C-----GC-A-------A-CC--ATA--AATTAG--CGCT-C-T---T-G-CTT-CAC--C-GCCAAAG-----GC-GCTAA-A--ATN---T-G--A-ATCC-CGCT-AAAA---T-A---AGTACACGTACA
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3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Unaligned ( gi|40 ): GTATCTGTACTTATTTTGGTGCATTTAAACTGACATAATTAAAGCTGATGTATTATATTTACATTCTCATGATTTAA
Unaligned ( gi|41 ): TATTGTGATTTTACATCTCTCCTGTGTTATGGAAGGAACATGGAGACCATCACA