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lowQualScore                  :           .    . ..   .     . ... ...     .     .     ................    ..   .    .  .  .. .. .   ...........  .. .........  . .  ...         ..  ...        . .  . ...     . ... . . . .    ..         .. ..   .....       .....       ...      ...... . . ..  .   .   . .  .  . .... . .... .     . .. . . .  . ....     ...  . ............................ .   . ....  . ....  .   ... .. .    .    .  ................................     ....  .   .......  ......       ....      ...  ....    ...   . ....................       ...................     ....  ....  ..   .       ..........   ......................................  .    .     ..  ...          ..   ....   ..          
lowQualScore                  :           4    0 66   4     9 000 000     3     8     9999999999999999    99   9    9  9  99 99 9   66666666666  22 888888888  6 0  000         55  222        1 0  0 000     6 444 0 6 6 6    77         22 00   11111       22222       444      555555 6 6 00  6   4   6 3  3  6 7777 0 6666 6     0 55 0 0 7  5 5555     888  0 7777777777777777777777777777 4   0 0000  6 0000  4   888 11 0    0    7  99999999999999999999999999999999     6666  1   2222222  444444       5555      888  8888    000   1 33333333333333333333       8888888888888888888     6666  2222  99   0       9999999999   55555555555555555555555555555555555555  7    7     22  777          22   8888   22          
consensus                     :   TGTAACGA-CGAAAA--GTG-ACCCCCG---T---AGAAT-ATTGACCGGGG---G------------TCAT--ATT-TCTA-CG-TA--G--A-AAA-----------AT--G----ACC--CATT-TT---GTTGTAGAA--TAC--TTGGATGANT-TC-G---TAGAA-A---TTA-T-G-TCCT-TGGGGTCATT-AT--TCT-----CCGTGTG-----GGTTGTA---GAAAAA------T-G-A--CC-CCGTAGA-A-TA-CT-G----ACTCTGTA-TTTTT-A--C-A-TACTCT----ATATT---TA-C----T-------GG---TT-TCGG----G-TGT-A-A-ATTATC---TT-CTT---T--A-GGGC-GGATACA---G-GG---T-GGGTG----------GGGGTGGGGG-CA-AATCCC-------AT------TGCTTGGAA-CATGTAT---TTGG-ATTATA--GGAAA---------TA-TGTTGTT-ATATTTTT--CT--------------TCCGT----TT----CA--GCT-CACCCAA-----A----TTA----------------------A-C-------------CT-GTTG-TTGCC--TA---TCGTCTTTAT--GTC----AGT--CTGTTTCTAA
Reference ( gi|1 )            :   TGTAACGA-CGAAGA--GTG-ACCCCTG---T---AGAAT-ATTGACCGGGG---C------------TCAT--ATT-TCTA-CG-TA--G--A-AAA-----------AT--G----ATC--CATT-TT---GTTGTAGAA--TAC--TTGGATGACT-TC-G---TAGAA-A---TCA-T-G-TCCT-CGGGGTCATT-AT--TCT-----CCGTGTG-----GGTTGTA---GAAAAA------T-G-A--CC-CCGCAGA-A-TA-CT-G----ACTCTGCA-TTTTT-A--C-A-TACTCT----ATATT---TA-C----T-------GG---TT-CCAG----G-TGT-A-A-ATTATC---TT-CTT---T--A-GGGC-GGATGCA---G-GG-AATGGGGTG----------AGGGTGGGGG-CA-AATCCC-------AT------TGCTTGGAA-CATGTAT---TTGA-ATTATG--GGAAA---------TA-TGTTATT-ATATTTTC--CT--------------TCCGT----TT----CA--GCT-CACCCAA-----A----TTA----------------------A-C-------------CT-GTTG-TTGCC--TA---TCATCTTTAT--GTC----AGT--CTGTTTCTAA
gi|7                          :   TGTAATGA-CTAAAA--GTG-ACCCCTG---T---AGAAT-ATTGACCGGGA----------------TCAT--AAT-TTTA-CA-TG--G--A-AAA-----------AT-------ACA--CATT-TAAAAGTTTTAAAA--TAC--TTGGATGAGT-TC-A---TAGAA-A---TTA-T-G-TCCT-TGGGATCATT--T--TCT-----CCGTTAG-----GGTTTTA---GAAAAA------T-A-A--ACACCGTAGA-A-TA-CTTGTCTTGCTCTGTA-ATTTC-A--C-T-CAGT-T----ACACT---TA-CCTAAT-------GG--------AGCACTA-TAT-A-G-ATTATC---TT-CCT---T--
gi|19                         :   TGCAACGA-CGAAAA--GTG-ATCCC-A---T---AGAAT-ATTAATCGAAA---C------------T-AT--A-----TA-CA-TA--A--A-A
gi|9                          : cggGTAACGA-CGAAAA--GTG-ACCCCCG---T---ATAAT-ATTGACCGGGG---GG-----------TCAT--ATT-TCTA-CG-TA--G--A-AAA-----------AT--G----ACC--CAGT-TT---GTTGTAGAA--TA--------------TC-G---TAGAA-A---TTA-T-G-TCTA-TGGGGTCATT-AT--TCT-----CCGTGTG-----GGTTGTA---GAAAAA------T-G-A--CC-CCGTAGA-A-TA-CT-G----ACTGTATA-TTTTC-A--C-A-TACTCT----ATATT---TA-G----T-------GG---TT-TCGG----G-TGT-ATT-TTTGTC----T-CTT---T--A-GGGC-GGgcgtacgcgtagtatcacaggttttg
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gi|20                         :    GTAACGA-CGAAAA--GTG-ACCCCCATACT---AAAATAATTGA-CGCGG---C------------Tgta
gi|4                          :     TAACGA-CGAAAA--TTG-ACCCCCG---T---AGAAT-ATTGACCGGGG---G------------TCAA--ATT-TCTA-CG-TA--G--A-AAA-----------AT--G----AAC--CAGT-TT---GTTGCACAA--TAC--CTCGATGACT-TC-G---TACAA-A---TTA-T-G-TCCT-TGGGGTCATT-AT--TCT-----CCGTGTG-----GGTGGTA---GAAAAA------T-G-A--CC-CAGCAGA-A-TA-CT-G----ACT--GTA-TCTTTCA--C-A-TACTCT----ATATT---TA-C----T-------TG---TT-TAGG----G-TGT-A-T-ATT-TC---TC-TTTAATT--A-GGAC-GGATACA---GTGG-A---GGGAG----------GGGG-GGGGG-CA-AG-CCC-------AT------TGC------------AT---TAGA--TTACA--TGAAA---------T----------ATATTTTT--CT--------------TCCGT----TTTGAACA--GCT-CACggggtg
gi|3                          :     TAACTA-TGAAAA--GTG-GCCCCCA---T---AGGAT-GTTGACCGGGG---G------------TCAC--ATT-TCTA-GG-CA--G--A-AGA-----------AT--G----ACA--TATT-TT---GTTGAGAAA--TAG--TTGGATGATT-TC-G---TAGAA-A---TTA-T-G-TCCT-TGGGGTCATT--T--TTT-----CCGTGTA-----GGTTGTA---GAAAGA------T-T-A--TC-CCATAGA-A-TA-CT-G----AATCTAAA-TATCT-ATGC-A-TACTCT----ATATT---TA-C----T-------TA---TT-TTGT----G-TGC-G-A---TGTT---TT-TCC---T--AGGGGC-AGATAGA---G-GG-AGT--------------------TGGAGA-CA-AATCCC-------AT------TGCTTG-------GTAC---TTAG-ATTATA--GGA------------------ATT-ATATTTTA------------------TCCGT----TT----CA--GCT-TAACCTA-----A----CTA----------------------A-
gi|14                         :      AACGATCGGAAAAGGTGGACCGCCG---CGTGAGAAT-ATTGAACGGAG---T------------CCAT--ATG-TC-A-CGTTA--GTAG-AAA-----------ATCGG----A----CA-T-TT---GTTGTAGAA--TATTGTTGGATGAGTGTC-GAGAGAGAA-A---T-A-T-G-GTCT-TG
gi|5                          : atgttgACGA-CGAAAA--GTG-ACCCTCG---T---AGAAT-ATTGAGCGGAG---G------------TAAT--ATT-TCTA-CG-TA--G--A-AAA-----------AT--G----A-C--CATT-TT---GTTGTAGAA--TAC--TTGGAAGAAC-TC-A---TAGAA-A---TTA-T-G-TACT-TAAGGTTGTT-AT--TCT-----CCGTGTG-----GGTTGTA---GAAAAATTACACT-GTA--CC-CCGTAGA-A-TA-CT-G----ACTCTATA--TTTT-A--C-A-TACTCC----ATATT---TA-C----T-------GG---TG-TCGA----G-TGTAA-A-ATTAT----TT-CTT---T--A-AGGC-GGATACC---G-GG----GGGATG------------------------AATCCT-------AT------TGCTTGGAA-CATGTAT---TTAG-ATTATA--GGGAA---------TA-
gi|6                          :                          CCCTG---T---AGAAT-ATTGACCGGAG---G------------TCATCGATT-TCTATCG--A--G--A-AAGGCACGAATAACAT--G----ATCATAACTATT---GTTGTAAGATGTAC--TT-GATGACT-TCGG---TAAGA-ACATTCA-T-GATCCT-C
gi|16                         :                                        AAT-ATTGACCGGGG---G------------TCAT--ATT-TCTA-CG-TATAG--A-AAA-----------AT--GCATGATT--CATT-TT---GTTGTAGAA--TAT--TTGGATGACT-TC-A---TAGTA-A---TTA-T-G-TCCT-TGGGGTCATT-AT--TTT-----CCGTatatgtcaaacaaggttcacttccaaacaaaacttctgtaccgcattctctgcggtagtcattcatcttctccgtatgactgggattgtaagaaaatgacaccgtagaattacctgactctgatttttacatcctcta
gi|12                         :                                          T-AATGAACGCGG---G------------TCAT--TTTCTCTG-CG-TA--G--A-AAA-----------AT--GG---ACT--C--T-TT---GTAGTAGAA--TAC--CTGGTTGGAT-CC-G---TAGAATA---TGT-TGG-TCCT-TGGAATCACT-TT--TCT-----CTTTGTA-----GATTGAAGGGGGGAAA------T-G-ATTCC-TTGTGAA-A-T---C-G----ATTCCGTA-T
gi|9                          :                                               tACTGGG-----------------TCAT--TTT-TCTA-CG-TA--G--A-AAT-----------AT--G----ACC--Cca
gi|12                         :             gtaacgacgaaaagtgacccccgtataatattgaccgggGAG---T------------CCAT--TTT-TCTA-CG-CA--G--AGAAA-----------AT--G----ACC--Cttgttgtagaatatcgtagaaattatgtctatggggtcattattctccgtgtgggttgtagaaaaatgaccccgtagaatactgactgtatattttcacatactctatatttagtggtttcgggtgtatttttgtctctttagggcgg
gi|4                          :                                          ttaatgaacgcGG---T------------TCAT--TTT-TCTA-CG-TA--G--A-AAT-----------TT--G----ACC--Ctttgtagtagaatacctggttggatccgtagaatatgttggtccttggaatcacttttctctttgtagattgaaggggggaaatgattccttgtgaaatcgattccgtatca
gi|9                          :                                                                                                                                         taacgacgaaaattgacccccgtagaatattgaccggA-G---TCAGT-A-TTCTACGGGGTCATT-TT--TCTACAACCCACACG-----G-----A---GAATAA------T-G-A--CC-CCATAGACA-TA----------------A-TTTCT-A--CGA-TATTCT----ACAagtttgttgcacaatacctcgatgacttcgtacaaattatgtccttggggtcattattctccgtgtgggtggtagaaaaatgacccagcagaatactgactgtatctttcacatactctatatttacttgtttagggtgtatatttctctttaattaggacggatacagtggagggaggggggggggcaagcccattgcattagattacatgaaatatatttttcttccgttttgaacagctcac
gi|6                          :                                                                                                                         gtaacgacgaaaagtgacccccgtataatattgaccggggggtcatatttctacgtagaaaaatgacccagtttgtGTCATTCATCTTCT-----CCGTATGACTGGGATTGTA---AGAAAA------T-G-A--CA-CCGTAGA-ATTACCT-G----ACTCTG-A-TTTTT-A--C-A-TCCTCT----Agtatattttcacatactctatatttagtggtttcgggtgtatttttgtctctttagggcgg
gi|2                          :                       ccctgtagaatattgaccggaggtcatcgatttctatcgagaaaggcacgaataacatgatcataactattgttgtaagatgtacttgatgacttcggtaagaacattcatgatcctcatatgtcaaacaaggttcacttccaaacaaaacttctgtaccgcattctctgcggtaTCATC--T--TCT-----CCGTATGACTGGGATTGTA---AGAAAA------T-G-A--CA-CCGTAGA-ATTACCT-G----ACTCTG-A-TTTTT-A--C-A-TCCTCTAATAATGTTCCATC-C----TTCTATGAGGTTTTT-CGAG----GTTAT-A-ATATTATTTTATT-CTT---TTGA-GGGCTTGATGCAATTG-GGCGATAGGGTGT---------GGGGGGGGGG-CATCATCCCTGGCAGTATGTAGAGCGATTGGAA-CATGTATTAATTGGTATTATGGAGGAAACTCATAGTCTG-TGTT-TT-ATATTTTT--CTCCCTAATTTAAACGCCCGTATTGTT----CA--GCT-CACCTAATTTTCAATACTTA----------------------AGC-------------CTGGTTGTTTACCTTTATATTCGTCTTTTTTGGTCA---AGTACTTGTTTCTAA
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Reference ( family-1575 )     :                                                                                                                                                                                TGTAACGA-CGAAAA--GTG-ACCCCCG---T---AGAAT-ATTGAC-CG---GGGG---------------TCAT--ATT-TCTA-CG-TA--G--AAA------AAT--G----AC----CCAT---T-TT---GTTGTAGAA--TAC--TTGGATGANT-TC-G---T-AGAA-ATT-ATG-T----CCTTGGGGTCATT-AT--TCTCCGTGTG-----GGTTGTA---GAAAAA------T-G-A--CCCCGTAGAA-TA-C-TG----ACTCT--GTA-TTTTT-ACA-TACTCT----ATATT---TA-CT-------GG--TTTC-GG------G--TGT-A-A-ATTATC---TT-CTT---T--A-GGGC-GGATACA---G-GG--T----G-GGTG------------GGGGTGGGGGCA-AATCCC-------AT------TGCTTGGAA-CATGTAT---TTGG-ATTAT--AGGAAA---------TA-TGTTGTT-ATATTTTT--CT--------------TCCGT----TT----CA--GCT-CACCCAA-----A----TTA----------------------A-C-------------CT-GTTG-TTGCC--TA---TCGTCTTTAT--GTC----AGT--CTGTTTCTAA
gi|1                          :                                                                                                                                                                                TGTAACGA-CGAAGA--GTG-ACCCCTG---T---AGAAT-ATTGAC-CG---GGGC---------------TCAT--ATT-TCTA-CG-TA--G--AAA------AAT--G----AT----CCAT---T-TT---GTTGTAGAA--TAC--TTGGATGACT-TC-G---T-AGAA-ATC-ATG-T----CCTCGGGGTCATT-AT--TCTCCGTGTG-----GGTTGTA---GAAAAA------T-G-A--CCCCGCAGAA-TA-C-TG----ACTCT--GCA-TTTTT-ACA-TACTCT----ATATT---TA-CT-------GG--TTCC-AG------G--TGT-A-A-ATTATC---TT-CTT---T--A-GGGC-GGATGCA---G-GGAATG---G-GGTG------------AGGGTGGGGGCA-AATCCC-------AT------TGCTTGGAA-CATGTAT---TTGA-ATTAT--GGGAAA---------TA-TGTTATT-ATATTTTC--CT--------------TCCGT----TT----CA--GCT-CACCCAA-----A----TTA----------------------A-C-------------CT-GTTG-TTGCC--TA---TCATCTTTAT--GTC----AGT--CTGTTTCTAA
gi|10                         :                                                                                                                                                                                 GTAACGA-CAAAAAA-GTG-ATCCCTG---T---AGAAT-ATTGAC-TG---GGGGAGCGGAGGGGGGGGGTCAT--ATT-T----------------------------G----AC----CCGT---T-TT---TTTGT------T-C--TTGGACGACT-TC-G---T-AGAC-ACT-ATG-T----CCTTGAGGTCATT--T--TTTCCTTGTG-----GGTTGTA---GAA------------------------AA-TA-C-TG----A--CT--GCATTTTTT-AAA-T-TTAT----TTATT---TA-CT-------AA--TTTT-GG------G--TGC-A-
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             -GG------G--TGC-A-A---TAT-----T-CCT---T--A-GGGC-GGATACA---A-GT--T--------TG-----------------GGGGACA-AATCTC-------AT------TGCCTG-------GTAC---TTAG------------------------A-TATTAAC-ATATTTTT--CT--------------TCCGT----TT----CG--GCT-CACCCAA-----A----TTAACACTTGAGTGGTTTTCTAATTA-C-------------CT-GCTC-TTTCC--TA---TCATCTTTAG--GTC----AGC--CGGTTTCTAAgta
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                      tT-AATGAA-CG---CGGG---------------TCAT--TTTCTCTG-CG-TA--G--AAA------AAT--GG---AC----TC-----T-TT---GTAGTAGAA--TAC--CTGGTTGGAT-CC-G---T-AGAA---T-ATG-TTGGTCCTTGGAATCACT-TT--TCTCTTTGTA-----GATTGAAGGGGGGAAA------T-G-ATTCCTTGTGAAA-T----CG----ATTCC--GTA-T
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      tGTG-----GGTTGTA---GAAATA------TTG-A--CCCCGTAGAA-TC-C-TG----ATT--------TTTCT-ACAATACT-T----ATATT---TAACT-------GG--TTTCCGG------G--TGT-C-A-TTTTTT---TTTCTC---T--A-GGGT-GGATACA---G-GG--------------------------GGGTGGGGG---AATCCC-------AT------TGCTTGGAA-TATGTAT---TTAG-ATTAT--AGGAca
gi|14                         :                                                                                                                                                                                   AACGATCGGAAAAGGTGGACCGCCG---CGTGAGAAT-ATTGAA-CG---GAGT---------------CCAT--ATG-TC-A-CGTTA--GTAGAA------AATCGG----A------CA----T-TT---GTTGTAGAA--TATTGTTGGATGAGTGTC-GAGAG-AGAA-A-T-ATG-G----TCTTG
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          atgttg-AATCTC-------AT------TGCTTGGAA-CATGTAT---TTGA-ATTGT--GGTAAA---------TC-TGTTGTT-ATATTTTC--CT--------------TCCAT----TT----CA--GTT-CACCCAA-----A----TTA----------------------A-C-------------CT-GTTG-TTGCC--TA---TCGTCTTTAT--GTCAGCTAGT--CTGTT
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                     AAT-ATTGAC-CG---GGGG---------------TCAT--ATT-TCTA-CG-TATAG--AAA------AAT--GCATGAT----TCAT---T-TT---GTTGTAGAA--TAT--TTGGATGACT-TC-A---T-AGTA-ATT-ATG-T----CCTTGGGGTCATT-AT--TTTCCGT
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ATTTTTATCT--------------TTTAT----TT----CAAGGCTTCACCAAA-----C----TTA----------------------A-CTAGTTCTTATTGCCT-GTTG-TTGCC--TA---TCATCTTTAT--GTC----AGT--CGGTTTCTAA
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TTTTT--CT--------------TCATT----TT----CA--GCT-CACCCAA-----A----TTA----------------------A-CAGTTCTAATCAG-CT-GCTG-TTGCC--GA---TCATCTTTAC--ATC----AGT--CTGTTTCTAAa
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gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   cggTCATC--T--TCTCCGTATGACTGGGATTGTA---AGAAAA------T-G-A--CACCGTAGAATTACC-TG----ACTCT--G-A-TTTTT-ACA-TCCTCTAATAATGTTCCATC-CTTCTATGAGGTTTTTC-GA------GGTTAT-A-ATATTATTTTATT-CTT---TTGA-GGGCTTGATGCAATTG-GG--CGATAG-GGTGT-----------GGGGGGGGGGCATCATCCCTGGCAGTATGTAGAGCGATTGGAA-CATGTATTAATTGGTATTATGGAGGAAACTCATAGTCTG-TGTT-TT-ATATTTTT--CTCCCTAATTTAAACGCCCGTATTGTT----CA--GCT-CACCTAATTTTCAATACTTA----------------------AGC-------------CTGGTTGTTTACCTTTATATTCGTCTTTTTTGGTCA---AGTACTTGTTTCTAAaaactatatacataaaagcgtacgcgtagtatcacaggttttg
gi|20                         :                                                                                                                                                                             tcatGTAACGA-CGAAAA--GTG-ACCCCCATACT---AAAATAATTGACGCGGCTGGGG---------------Tac
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Reference ( family-1575 )     :                                                                                                                                                                                TGTAACGA-CGAAAA--GTG-ACCCCCG---T---AGAAT-ATTGAC-CG---GGGG---------------TCAT--ATT-TCTA-CG-TA--G--AAA------AAT--G----AC----CCAT---T-TT---GTTGTAGAA--TAC--TTGGATGACT-TC-G---T-AGAA-ATT-ATG-T----CCTTGGGGTCATT-AT--TCTCCGTGTG-----GGTTGTA---GAAAAA------T-G-A--CCCCGTAGAA-TA-C-TG----ACTCT--GTA-TTTTT-ACA-TACTCT----ATATT---TA-CT-------GG--TTTC-GG------G--TGT-A-A-ATTATC---TT-CTT---T--A-GGGC-GGATACA---G-GG--T----G-GGTG------------GGGGTGGGGGCA-AATCCC-------AT------TGCTTGGAA-CATGTAT---TTAG-ATTAT--AGGAAA---------TA-TGTTGTT-ATATTTTT--CT--------------TCCGT----TT----CA--GCT-CACCCAA-----A----TTA----------------------A-C-------------CT-GTTG-TTGCC--TA---TCGTCTTTAT--GTC----AGT--CTGTTTCTAA
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gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   cggTCATC--T--TCTCCGTATGACTGGGATTGTA---AGAAAA------T-G-A--CACCGTAGAATTACC-TG----ACTCT--G-A-TTTTT-ACA-TCCTCTAATAATGTTCCATC-CTTCTATGAGGTTTTTC-GA------GGTTAT-A-ATATTATTTTATT-CTT---TTGA-GGGCTTGATGCAATTG-GG--CGATAG-GGTGT-----------GGGGGGGGGGCATCATCCCTGGCAGTATGTAGAGCGATTGGAA-CATGTATTAATTGGTATTATGGAGGAAACTCATAGTCTG-TGTT-TT-ATATTTTT--CTCCCTAATTTAAACGCCCGTATTGTT----CA--GCT-CACCTAATTTTCAATACTTA----------------------AGC-------------CTGGTTGTTTACCTTTATATTCGTCTTTTTTGGTCA---AGTACTTGTTTCTAAaaactatatacataaaagcgtacgcgtagtatcacaggttttg
gi|20                         :                                                                                                                                                                             tcatGTAACGA-CGAAAA--GTG-ACCCCCATACT---AAAATAATTGACGCGGCTGGGG---------------Tac
gi|3                          :                                                                                                                                                                                  TAACTA-TGAAAA--GTG-GCCCCCA---T---AGGAT-GTTGAC-CG---GGGG---------------TCAC--ATT-TCTA-GG-CA--G--AAG------AAT--G----AC----ATAT---T-TT---GTTGAGAAA--TAG--TTGGATGATT-TC-G---T-AGAA-ATT-ATG-T----CCTTGGGGTCATT--T--TTTCCGTGTA-----GGTTGTA---GAAAGA------T-T-A--TCCCATAGAA-TA-C-TG----AATCTAAATA-TCTAT-GCA-TACTCT----ATATT---TA-CT-------TA--TTTT-GT------G--TGC-G-A---TGTT---TT-TCC---T--AGGGGC-AGATAGA---G-G--------G-AGT-----------------TGGAGACA-AATCCC-------AT------TGCTTG-------GTAC---TTAG-ATTAT--AGGAA------------------TT-ATATTTT----A--------------TCCGT----TT----CA--GCT-TAACCTA-----A----CTA----------------------A-g
gi|4                          :                                                                                                                                                                                  TAACGA-CGAAAA--TTG-ACCCCCG---T---AGAAT-ATTGAC-CG---GGGG---------------TCAA--ATT-TCTA-CG-TA--G--AAA------AAT--G----AA----CCAG---T-TT---GTTGCACAA--TAC--CTCGATGACT-TC-G---T-ACAA-ATT-ATG-T----CCTTGGGGTCATT-AT--TCTCCGTGTG-----GGTGGTA---GAAAAA------T-G-A--CCCAGCAGAA-TA-C-TG----ACT----GTA-TCTTTCACA-TACTCT----ATATT---TA-CT-------TG--TTTA-GG------G--TGT-A-T-ATT-TC---TC-TTTAATT--A-GGAC-GGATACA---GTGG--A----G-GGAG------------GGGG-GGGGGCA-AG-CCC-------AT------TGC------------AT---T-AG-ATTAC--ATGAAA---------TA-T---------ATTTTT--CT--------------TCCGT----TTTGAACA--GCT-CAC
gi|5                          :                                                                                                                                                                                    ACGA-CGAAAA--GTG-ACCCTCG---T---AGAAT-ATTGAG-CG---GAGG---------------TAAT--ATT-TCTA-CG-TA--G--AAA------AAT--G----AC----C-AT---T-TT---GTTGTAGAA--TAC--TTGGAAGAAC-TC-A---T-AGAA-ATT-ATG-T----ACTTAAGGTTGTT-AT--TCTCCGTGTG-----GGTTGTA---GAAAAATTACACT-GTA--CCCCGTAGAA-TA-C-TG----ACTCT--ATA--TTTT-ACA-TACTCC----ATATT---TA-CT-------GG--TGTC-GA------G--TGTAA-A-ATTAT----TT-CTT---T--A-AGGC-GGATACC---G-G-------------G------------GGGATG-------AATCCT-------AT------TGCTTGGAA-CATGTAT---TTAG-ATTAT--AGGGAA---------TA-
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                       CCCTG---T---AGAAT-ATTGAC-CG---GAGG---------------TCATCGATT-TCTATCG--A--G--AAAGGCACGAAT--A----ACATGATCATAACTATT---GTTGTAAGATGTAC--TT-GATGACT-TCGG---TAAGAACATTCATGAT----CCT
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     GTCATTCATCTTCTCCGTATGACTGGGATTGTA---AGAAAA------T-G-A--CACCGTAGAATTACC-TG----ACTCT--G-A-TTTTT-ACA-TCCTCT----Acatatgtcaaacaaggttcacttccaaacaaaacttctgtaccgcattctctgcggtagtcattcatcttctccgtatgactgggattgtaagaaaatgacaccgtagaattacctgactctgatttttacatcctcta
gi|7                          : ccctgtagaatattgaccggaggtcatcgatttctatcgagaaaggcacgaataacatgatcataactattgttgtaagatgtacttgatgacttcggtaagaacattcatgatcctcatatgtcaaacaaggttcacttccaaacaaaacttctgtaccgcattctctgcggtaTGTAATGA-CTAAAA--GTG-ACCCCTG---T---AGAAT-ATTGAC-CG---GGA----------------TCAT--AAT-TTTA-CA-TG--G--AAA------AAT-------AC----ACAT---T-TAAAAGTTTTAAAA--TAC--TTGGATGAGT-TC-A---T-AGAA-ATT-ATG-T----CCTTGGGATCATT--T--TCTCCGTTAG-----GGTTTTA---GAAAAA------TAA-A--CACCGTAGAA-TA-CTTGTCTTGCTCT--GTA-ATTTC-ACT-CAGT-T----ACACT---TACCT-------AA--T----GGAGCACTA--TAT-A-G-ATTATC---TT-CCT---T--
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           T-A-ATATTTTT---TT-CTT---T--G-GGGC-G-ATACA---A-TG--T----GTGGTGTGTGTGTCTGGGGGGGGGGGGGTA-AAGCCC-------AA------TGCTTGGAAGCATGCAT---TTAG-ATTAT--AGGAAA---------TATTGTTGTTAATATTTTA--CT--------------TCCGT----TTTGAACA--GCT-CACCCAA-----A----TTACAGTTCCAATC-----------G-C-------------CT-GTTG-TTGCA--TA---TCATCTTTAT--GTC----AGT--CTGTTTC
gi|9                          :                                                                                                                                                      catatttatttgattgatggaagataaGTAACGA-CGAAAA--GTG-ACCCCCG---T---ATAAT-ATTGAC-CG---GGGGG--------------TCAT--ATT-TCTA-CG-TA--G--AAA------AAT--G----AC----CCAG---T-TT---GTTGTAGAA--TA--------------TC-G---T-AGAA-ATT-ATG-T----CTATGGGGTCATT-AT--TCTCCGTGTG-----GGTTGTA---GAAAAA------T-G-A--CCCCGTAGAA-TA-C-TG----ACTGT--ATA-TTTTC-ACA-TACTCT----ATATT---TA-GT-------GG--TTTC-GG------G--TGT-ATT-TTTGTC----T-CTT---T--A-GGGC-GG


blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                        T      AG   G       TAC GTG     A      G  GCT    AGCGGAGGGGGGGGG    CG   C    T  T  TA TA   GGCACG   AACATGATCATAAC       A  AAA         TG   TG        C G  G AGA A    C   C   A TGGT             CA CT          ACTGG       GGG      TTACACT  T TT          T  C T  TCTT   C AAAT T     C   A    A AATA     CCA  A  TCTATGAGGTT    C  AGCACT GT   A ATA   A TTTA  T   AAT TG G    T       ATGTGTGGTGTGTGTGTCTGGGG             T     C T      TGGCAGT  GTAGAG      GAAGC      TAA    T     GG     ACTCATAGTCTGTGTTTT          TAT  CCCTAATTTAAACG     ATTG  TGAA  AG   T       TTTTCAATAC   ACACTTGAGTGGTTTTCTAATTAC                G    T     TT  TAT  A       TG   AGCT   AC
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                        .      A    .       .   .       .      .  .      G                  .    .    .  .  .  .    .        GCATGATTCAT          .  .           .    .         A .  . .   .    .   .   . .                T  .           ACTGG       .        TT       . .           T  C .  .      C GC   .     .   .    C .        .    C  AA             .  .      .    . ATA   T T     .   .   .  .    .       ATTGGGCGATAGGGTGTG                  G     C .      .        .           GAAT       .      .     .      ATATTGTTGTTA                T    .                  .     TGAA  .    .       A            ACTAGTTCTTATTGC                         .    .     .   .    G       .    A      . 
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blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                        .      .    .       .   .       .      .  .      .                  .    .    .  .  .  .    .        GACATAT              .  .           .    .         C .  . .   .    .   .   . .                A  .           .           .        T        . .           .  . .  .      C GT   .     .   .    C .        .    .  TA             .  .      .    . AT    G C     .   .   .  .    .       AGTTTG                              T     C .      .        .           GAAC       .      .     .      ATATTAAC                    T    .                  .     .     .    .       C            CAGTTCCAATCGC                           .    .     .   .    A       .    .      . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                        .      .    .       .   .       .      .  .      .                  .    .    .  .  .  .    .        GAACCAG              .  .           .    .         T .  . .   .    .   .   . .                A  .           .           .        T        . .           .  . .  .      C AT   .     .   .    C .        .    .  TG             .  .      .    . TA    A C     .   .   .  .    .       GGGAGT                              G     T .      .        .           GAAC       .      .     .      ATAT                        T    .                  .     .     .    .       A            AGC                                     .    .     .   .    G       .    .      . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                        .      .    .       .   .       .      .  .      .                  .    .    .  .  .  .    .        GACCCAG              .  .           .    .         C .  . .   .    .   .   . .                A  .           .           .        T        . .           .  . .  .      C GT   .     .   .    C .        .    .  GG             .  .      .    . AA    A T     .   .   .  .    .       GGGG                                .     . .      .        .           .          .      .     .      TT                          T    .                  .     .     .    .       A            AC                                      .    .     .   .    A       .    .      . 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                        .      .    .       .   .       .      .  .      .                  .    .    .  .  .  .    .        GGACTC               .  .           .    .         A .  . .   .    .   .   . .                .  .           .           .        T        . .           .  . .  .      C AT   .     .   .    C .        .    .  AA             .  .      .    . GA    T C     .   .   .  .    .       GGG                                 .     . .      .        .           .          .      .     .                                  A    .                  .     .     .    .       A                                                                                              
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                        .      .    .       .   .       .      .  .      .                  .    .    .  .  .  .    .        CGGACA               .  .           .    .         C .  . .   .    .   .   . .                .  .           .           .        T        . .           .  . .  .      G G    .     .   .    . .        .    .  GG             .  .      .    . A     G .     .   .   .  .    .                                                   .      .        .           .          .      .     .                                  .    .                  .     .     .    .                                                                                                      
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                        .      .    .       .   .       .      .  .      .                  .    .    .  .  .  .    .        GACCAT               .  .           .    .         G .  . .   .    .   .   . .                .  .           .           .        T        . .           .  . .  .      . G    .     .   .    . .                               .  .      .    . A     . .     .   .   .                                                                                                                                                                                                                                                                                                  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                            .   .       .      .  .      .                  .    .    .  .  .  .    .        ACACAT               .  .           .    .         . .  . .   .    .   .   . .                .  .           .           .        .        . .           .  . .  .      . .    .                                                               .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                        .      .  .      .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             
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gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                      tT-AATGAA-CG---CGGG---------------TCAT--TTTCTCTG-CG-TA--G--AAA------AAT--GG---AC----TC-----T-TT---GTAGTAGAA--TAC--CTGGTTGGAT-CC-G---T-AGAA---T-ATG-TTGGTCCTTGGAATCACT-TT--TCTCTTTGTA-----GATTGAAGGGGGGAAA------T-G-ATTCCTTGTGAAA-T----CG----ATTCC--GTA-T
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      tGTG-----GGTTGTA---GAAATA------TTG-A--CCCCGTAGAA-TC-C-TG----ATT--------TTTCT-ACAATACT-T----ATATT---TAACT-------GG--TTTCCGG------G--TGT-C-A-TTTTTT---TTTCTC---T--A-GGGT-GGATACA--------------------------GG-----------G---------GGGTGGGGG---AATCCC-------AT------TGCTTGGAA-TATGTAT---TTAG-ATTAT--AGGAca
gi|14                         :                                                                                                                                                                                   AACGATCGGAAAAGGTGGACCGCCG---CGTGAGAAT-ATTGAA-CG---GAGT---------------CCAT--ATG-TC-A-CGTTA--GTAGAA------AATCGG----A------CA----T-TT---GTTGTAGAA--TATTGTTGGATGAGTGTC-GAGAG-AGAA-A-T-ATG-G----TCTTG
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          atgttg-AATCTC-------AT------TGCTTGGAA-CATGTAT---TTGA-ATTGT--GGTAAATC---------TGTTGTTA-TATTTTC--CT--------------TCCAT----TT----CA--GTT-CACCCAAATT--AA-----------------------CCT-GTTG-TTGCC--TA---TCGTCTTTAT--GTCAGCTAGT--CTGTT
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                     AAT-ATTGAC-CG---GGGG---------------TCAT--ATT-TCTA-CG-TATAG--AAA------AAT--GCATGAT----TCAT---T-TT---GTTGTAGAA--TAT--TTGGATGACT-TC-A---T-AGTA-ATT-ATG-T----CCTTGGGGTCATT-AT--TTTCCGT
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ATTTTTATCT--------------TTTAT----TT----CAAGGCTTCACCAAACTT--AACTA---G-------TTCTTATTGCCT-GTTG-TTGCC--TA---TCATCTTTAT--GTC----AGT--CGGTTTCTAA
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TTTTT--CT--------------TCATT----TT----CA--GCT-CACCCAAATT--AAC-A---G-------TTCTAATCAGCT-GCTG-TTGCC--GA---TCATCTTTAC--ATC----AGT--CTGTTTCTAAa
gi|19                         :                                                                                                                                                                                TGCAACGA-CGAAAA--GTG-A-TCCCA---T---AGAAT-ATTAAT-CG---a
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   cggTCATC--T--TCTCCGTATGACTGGGATTGTA---AGAAAA------T-G-A--CACCGTAGAATTACC-TG----ACTCT--G-A-TTTTT-ACA-TCCTCTAATAATGTTCCATC-CTTCTATGAGGTTTTTC-GA------GGTTAT-A-ATATTATTTTATT-CTT---TTGA-GGGCTTGATGCAATT----------------G------GGCGATAGGGTGTG---------GGGGGGGGGCATCATCCCTGGCAGTATGTAGAGCGATTGGAA-CATGTATTAATTGGTATTATGGAGGAAACTCATAGTCTGTGTT-TTA-TATTTTT--CTCCCTAATTTAAACGCCCGTATTGTT----CA--GCT-CACCTAATTTTCAAT-A---C-------T--TAA--GCCTGGTTGTTTACCTTTATATTCGTCTTTTTTGGTCA---AGTACTTGTTTCTAAaaactatatacataaaagcgtacgcgtagtatcacaggttttg
gi|20                         :                                                                                                                                                                             tcatGTAACGA-CGAAAA--GTG-ACCCCCATACT---AAAATAATTGACGCGGCTGGGG---------------Tac
gi|3                          :                                                                                                                                                                                  TAACTA-TGAAAA--GTG-GCCCCCA---T---AGGAT-GTTGAC-CG---GGGG---------------TCAC--ATT-TCTA-GG-CA--G--AAG------AAT--G----AC----ATAT---T-TT---GTTGAGAAA--TAG--TTGGATGATT-TC-G---T-AGAA-ATT-ATG-T----CCTTGGGGTCATT--T--TTTCCGTGTA-----GGTTGTA---GAAAGA------T-T-A--TCCCATAGAA-TA-C-TG----AATCTAAATA-TCTAT-GCA-TACTCT----ATATT---TA-CT-------TA--TTTT-GT------G--TGC-G-A---TGTT---TT-TCC---T--AGGGGC-AGATAGA--------------------------GG-----------G---------AGTTGGAGACA-AATCCC-------AT------TGCTTG-------GTAC---TTAG-ATTAT--AGGAA-----------------TTA-TATTTT----A--------------TCCGT----TT----CA--GCT-TAACCTAACT--AAg
gi|4                          :                                                                                                                                                                                  TAACGA-CGAAAA--TTG-ACCCCCG---T---AGAAT-ATTGAC-CG---GGGG---------------TCAA--ATT-TCTA-CG-TA--G--AAA------AAT--G----AA----CCAG---T-TT---GTTGCACAA--TAC--CTCGATGACT-TC-G---T-ACAA-ATT-ATG-T----CCTTGGGGTCATT-AT--TCTCCGTGTG-----GGTGGTA---GAAAAA------T-G-A--CCCAGCAGAA-TA-C-TG----ACT----GTA-TCTTTCACA-TACTCT----ATATT---TA-CT-------TG--TTTA-GG------G--TGT-A-T-ATT-TC---TC-TTTAATT--A-GGAC-GGATACA-------------------GTGGAGGGA-----------G---------GGGGGGGGGCA-AG-CCC-------AT------TGC------------AT---T-AG-ATTAC--ATGAAAT-----------------A-TATTTTT--CT--------------TCCGT----TTTGAACA--GCT-CAC
gi|5                          :                                                                                                                                                                                    ACGA-CGAAAA--GTG-ACCCTCG---T---AGAAT-ATTGAG-CG---GAGG---------------TAAT--ATT-TCTA-CG-TA--G--AAA------AAT--G----AC----C-AT---T-TT---GTTGTAGAA--TAC--TTGGAAGAAC-TC-A---T-AGAA-ATT-ATG-T----ACTTAAGGTTGTT-AT--TCTCCGTGTG-----GGTTGTA---GAAAAATTACACT-GTA--CCCCGTAGAA-TA-C-TG----ACTCT--ATA--TTTT-ACA-TACTCC----ATATT---TA-CT-------GG--TGTC-GA------G--TGTAA-A-ATTAT----TT-CTT---T--A-AGGC-GGATACC-------------------G------GG-----------G---------GGATG-------AATCCT-------AT------TGCTTGGAA-CATGTAT---TTAG-ATTAT--AGGGAAT----------
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                       CCCTG---T---AGAAT-ATTGAC-CG---GAGG---------------TCATCGATT-TCTATCG--A--G--AAAGGCACGAAT--A----ACATGATCATAACTATT---GTTGTAAGATGTAC--TT-GATGACT-TCGG---TAAGAACATTCATGAT----CCTa
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     GTCATTCATCTTCTCCGTATGACTGGGATTGTA---AGAAAA------T-G-A--CACCGTAGAATTACC-TG----ACTCT--G-A-TTTTT-ACA-TCCTCT----Acatatgtcaaacaaggttcacttccaaacaaaacttctgtaccgcattctctgcggtagtcattcatcttctccgtatgactgggattgtaagaaaatgacaccgtagaattacctgactctgatttttacatcctcta
gi|7                          : ccctgtagaatattgaccggaggtcatcgatttctatcgagaaaggcacgaataacatgatcataactattgttgtaagatgtacttgatgacttcggtaagaacattcatgatcctcatatgtcaaacaaggttcacttccaaacaaaacttctgtaccgcattctctgcggtaTGTAATGA-CTAAAA--GTG-ACCCCTG---T---AGAAT-ATTGAC-CG---GGA----------------TCAT--AAT-TTTA-CA-TG--G--AAA------AAT-------AC----ACAT---T-TAAAAGTTTTAAAA--TAC--TTGGATGAGT-TC-A---T-AGAA-ATT-ATG-T----CCTTGGGATCATT--T--TCTCCGTTAG-----GGTTTTA---GAAAAA------TAA-A--CACCGTAGAA-TA-CTTGTCTTGCTCT--GTA-ATTTC-ACT-CAGT-T----ACACT---TACCT-------AA--T----GGAGCACTA--TAT-A-G-ATTATC---TT-CCT---T--
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           T-A-ATATTTTT---TT-CTT---T--G-GGGC-G-ATACAATGTGTGGTGTGTGTGTCTG------GG-----------G---------GGGGGGGGGTA-AAGCCC-------AA------TGCTTGGAAGCATGCAT---TTAG-ATTAT--AGGAAATAT--------TGTTGTTAATATTTTA--CT--------------TCCGT----TTTGAACA--GCT-CACCCAAATT--A-C-A---G-------TTCCAATCGCCT-GTTG-TTGCA--TA---TCATCTTTAT--GTC----AGT--CTGTTTC
gi|9                          :                                                                                                                                                      catatttatttgattgatggaagataaGTAACGA-CGAAAA--GTG-ACCCCCG---T---ATAAT-ATTGAC-CG---GGGGG--------------TCAT--ATT-TCTA-CG-TA--G--AAA------AAT--G----AC----CCAG---T-TT---GTTGTAGAA--TA--------------TC-G---T-AGAA-ATT-ATG-T----CTATGGGGTCATT-AT--TCTCCGTGTG-----GGTTGTA---GAAAAA------T-G-A--CCCCGTAGAA-TA-C-TG----ACTGT--ATA-TTTTC-ACA-TACTCT----ATATT---TA-GT-------GG--TTTC-GG------G--TGT-ATT-TTTGTC----T-CTT---T--A-GGGC-GG