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Reference ( gi|1 )            : ACCCTATGT--TTTTATTATTCCATA-ACAAAGAGGAAAAATTATTT-TCTC-TAATTCCTT-GAGG----TAGTG-ATC--TGAAAGGATTTGGG-ATTGAGACATAAAAATAT-TGGT-TTAGGTAAAGGTAAGAAGTAATTGTTTTAATGACA-GTAATTTT--TCCAA-TGGGG--T---TAAAGATCTTTTTTT--CC-ATTG-TTTAATTATAGATTTTATTCTTTCCCAA-TTTATG-CTCATTTA---AATT-TAATT-TAA-CATCTT-ATCCAATC-TCCACATCAAAATGGATTCCCAACAGAGTAAA--TCTGGTTATACC------CCA--CCTAAGCCTGTAATTTGAAAGCAGAGT--TTCATTTACGT-ACATT-T-TGGAACCTA-GCCATATGACATGAG--TTTTTTCATAATTAATATGAAGCCCAGACAGTTTCTGAAAATTTTTCCAATGTCTTAAAA-GTTCTTC-CA-AAGAGATTCGTTCACT---GCC--ATCAAG-AATAAGTGATGATTCA-CAGCCAGTTGT-AAATCTTTTTTTCAATA-TTATAACCACT-AAT-TGCCCTTGATTATTCTTATTC-CTTCT-AACTATGAATCGCCA--ATATTTCC--GCACAA-ATTAAAAATATA-A-GGTGATA-AAGG------A----CACCCTGTCGTGCAACCTCTCTGA-AT-GT--G-ATTCTATCA--GAGAT--ATTGCC-ACC--TTGGTTTATTACAG--A-ATGTAATGACTGTATTAAAAA--TTGAAAATCCA---TCCT--AATTGAGGGACCAAAAATTGAAAAT--TCTCAGTGCT-TTT-GTATAAA-TGA-CATGACAGTGTATCAAA-TGCTTTTTTCGAAGTCAATAAG--TAGCGAATAATCCAGGTA---T-TTTTC-TTCTTCA-GT----GTCATTGCATTAA-ATCGTTAAATCAGCCTTGTA-TTT-------CAC-----CA--TATATCTCTTGGA-AATG-AAACCTGTTTGATCT-TG---AAT--AATATTTGTCTA---ATATTTTTTTATTCTACT----GGC--AATTACAACCTGATGCAATTTTATACACA-GTATTTAAAAGGGTAATTTGGTCTTCCAAT---TTTTCA-GA--TAA---TGC---TT---GGCTTGTCCACC-TTTT-GGTA-ATAAA--GTAAT-AATACCAATGTCTT-GTG---T----AATAGA-AAGACTTGCTA-TTTTCATAACCATAA--TTAATAGA-TCAAACTACGA------AGATCCCAATA-TGTTTCCAAAACATCT------AAAACAAT-TCAGCAGAAAACCAT-TCAGACCCTTGGGGAATTTATGTTGATTTCATTTTTAAAAAAGAGTATTGGAGGCTTC-CTTAATAGTAAATGTGA-----CCTTCTAATGATTGCC-GATTCTAAATTTTTGAAAGTTTTGGAATATTCTCAT-TGTTAAAAGTTCTAGTCTTGA--AGGT-----TCAGTAATTGTGTTTACACTGCTTTTTTGCGTACAA-CTGT-CA-TAGAATGATT-TTG--TTCTTTCAATATTC-TGATTGTTTATAAATTACGTGTACCATCATTG
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gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            atCATTAA-ATCGT-AAATCAGCCTTGTA-TTTTCCCCAACACATGTACATGTATATCTGTTGGA-AATG-AAACCTA----------G---AAT---ATTTTTGTCTAGTGATATCTTTTtc
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           CTCCCAGT---CTTTAA-GAACTAT---TGCATTTTACCGGTTTGTC-ACC-TCTTAGGTACATTAATCGTAATTCACACCA-TGTCTT--TG---TTGTCGATGGATAAAACTCATTA-ATTTTGTAACCATGCGTTTAATGG---CAACCTCCTACCCCATACACACCAATA-TATTTCCAGAAGACTT------AAAA-AAT-TCTGCAGAAAAACA--TCAGAGCCTT
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         c---TT---GGTTTGTCT-CC-TTTT-GGTA-AGGAT--GTAAT-TACACCC-TGTCTTTGTG---T----GATGGA-TA-ACATGTTA-TTTTTATAGCCATGA--TTAATTGA-CCTTACAACAA------AAGTTCCAATA-TATTTCCAGAATTTTTTTTTAAAAAAAAACCTCGGTAGAAAAA-GTATCTGATCCT--GGAGATTTAT-TTGATTTCAT--------------ATT--ACGCTTCACTTAA-AGTGA-TTTCT-----CCTTCTAA--ATTTTCAGATTC--ACTCTTAGAAGGTTTAGGGATATCACTATATGCTAGA--TTCTTAT-TTAATTAAATCCATATCAGT-ATTTTG--TAAATCATTCTT----GTATAG-GTTT-TAGTAAAAT--TTGTCGGTTTCATTCAAAATTTGTGATTGATCATAACTTATCT-CCCCATCAT
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          AGTAAATGTGATTTCACCCTCTAAAGATT--C-GACTCTA--TTTTAGAAAGTTTTGGGATACTctaactctagtcttgggataatcttagacgtgaaattcctgga
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          atttgatgattcTTTTTTG-GTACAATCTGTTCA-TAGAATGTTT-TTG--TTTCTTCAATATTT-CGATTGCTCATAA--TAC-TGTACCATCATTacatgtacatgataattcattctctaaatcaaaatcagcattgtttaaat
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ttTTTTTG-GTACAAGCTGTTCA-TAGAATGATT-TTG--TTCTT--AATATTT-TGATTGTTCAT-AATTAC-TGTACCAacactctaatctcgaacgttatatttttgtggtgaaatttctagatagcaataagactaagaaacttacaagaaatataatatcttgtaagtttttttagtctaattgcttttatcaaaaacctaaacttatttaaaatttacataatgctttttttttttttttttttttttttttttcttatt
15 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|4 ): CATTCTTGTATAGGTTTTAGTAAAATTTGTCGGTTTCATTCAAAATTTGTGATTGATCATAACTTATCTCCCCATCATCTAACTCTAGTCTTGGGATAATCTTAGACGTGAAATTCCTGGATTCTAATTTACAAAAATAATTTGATGTTTTTCCCCCTCCATCCATCTCGCTCTACTCCTTATATAGTTTCCTTGTAGTTTATGTTTTATGCATTTTTATCTAATTCTTGTTTTTGTGTTATATAGTTCTTCAACATTGTTTTCTGTAACATTTTCCTCATCACTTTTTATTTTTTTAATTGTATTTCTTCCTGTTCTTTTTTGTTGTTGATATATGATGAAAAGGAAATGATTTACTTCTAGTTTCTAATAACAAAGTTTCTAGGAATAACTGGTCATTATTTTCGTCTGAAAATGTGTGTAAATTGTTCATGTTGTAAACAGAAACAGCAAATACATGTAGTTTTTTAACATGTAAAATGATATCTCTAATACTTTCCAAATATTCATCATCACAAAGCAAGGAATTATTAAATTTCCATAATCGTCGACCTCTCTTGAAGTTGTTAAAGACAAAGATATTGCAGAATTATCTGCTCTATAACTGGATTCTATAGAACAAGAATGTAAACTAGGTACAGTAAGAGCCACTCTAAATCTCTAAATCTAATCTACTTTGCTTAAGAGATTTTTTTCTCCATGTATATCTTCGAAAATATTCATGTAACTGTCTAAAGGAGTCAACATTTGTTTCTATCAATTCTAAAATTTTGTTTCTTTTATAGCCTTTGCATTGTTTACACGTTTATAATTATAACAATCCAGATCTGGGTTAAGAACCAAATTAAAATCCCCACACCATGTGACATTACTACACTGCATATTATCAATATGTGTTTGAACATTTTCAAAAAAACTGGGGATTATCGTTATTTGGCCCATATACTTCATGATTCTCTACCATTAATTTGAGTATTAAGTAATTTCCACTTACATCCCCTATTTCTGAAGAACGTTGCAATCAAAATTATTATTAATAAGAATAGCCACTCCTCTTGGATTTGAAGAGTATGAACTAAAATAACATTGATACCCCGTTAGATTTCTAACATAATTTTCCTTATCACTTGTAAAATAAGTGTCTTGTAGA
Unaligned ( gi|5 ): TGCATTTATACAAATTTTCATAAAAGTTTTTTGTTTCAATAAAAATTTCTGACTTATCATATATTTTATCTCCATTACCCATTACCCAATTCCAGTTGAGGTATAATTTACTTGTAAAGTTTCTTGATTCAAGTTTACAAAAATAGTTTGATGGTTTTTCTCCTTCTTCTACCCATTTTGCTCTGCTTCAAATATAGTTTCCTTGTAGTCTATGCTTCTTAATTTTTCTAATTCTTGTTTTTTGTTGTATAGCTCATCTACATTACCTTCAGAAGCATTTTCCTCAATAGCTTTTATTTCTTTCATCAAATCTTGTTCCTCCTTATTTTTCTTCTTCTTGATATAAGAAGAGTAAGAGATGCTCTTATCTCTTATCTCAAAAAGTAAAGTTTCAAGGAACAACTGATCATTTATAGTGAAGAAAATATTTTCATCTGACACCATGTGTAAATTGTCCATGTTGTAAACAGGGACTGGCATACTGTTTTTAACCTTTAAAATTATATCTCTAATGCATTCTAAATTTATCATCATAAAGTAAGGAGTTATTGAATTTCCATAACCAATGTCCTTTCTTAAAATCATTGACGACAAGGATATTGCAGAGTGATCAGATCTGTAACTAGACTCGATTTAACAAGTATCTAAACTAAATAACAAAGATTCAGAAAGTAAAAAGAAATCCAATCGACCTTGTTTCAGTGGATACTTTTTCCTCCAAGAATATCTAAGAAGCTTTCCATGCAGTTGTCTAAAGGGGTCTATATA
Unaligned ( gi|6 ): ATACTGTTTCCTTGGGAATTATTTATACATTTTGTAGTTTATCAATAATCTAGGTCTGGGCTTTAGAACCAAGTTAAAATCACCACACTCAGAAAATCATTGCGATGCATTATCATCAATTATGATATGTTGCTATATTTTGTTTCGAAAGAAAATACAATGGTGTGTCAATTGTTAGCTCCATAGAATAGTGCATTATATACTGACTTCATGAACCTTCTATATAATGCTTTCAGGTAATAAATAATTCCAATCAGGCACGCTTTTTTCCCATAATAACCGCTTAAAAATCAAAATTATTGTTAATTAAGAAATTGCACAACTCCCCTTGAATTAGTAGCATATGAGCTAAAGAAGCACTGGTATCCCCATGAGTTTCTTACCTCATTTTCCCTGTCGTGTGAAAAATGGGTATCTTGCAAACTATAAATATTATGCTCTAAGACTCTTAAGTAGTTAAATACGTCCTTGCGTTTCACAATATCACCTAGACCTTGACAGTTTACCGAAATGATCTTAACCAT
Unaligned ( gi|8 ): GGAAACATTGGTTGATGGTGCAAATATTGGTATGCAGGAATTGGGCATACGGTTTCTTCTACTTCTACAGATTAGTTTTTTAATACTCTAGAATATTTTTCATTCATAGGTTACTTCCATAGACCTCTACAACACCATTTTAAGTTATTTAAATCTATTGACAATGATACTAATTTGATTGGTCTGATCTATAACTAGTTCTATGCTACAGCATTTTCAACCCAACAAAAAGATTTCAAGATATTAAACAAGAAATCTAAACCTACTGTTGTTTCAAGAAGTTTTTTTTTTTTCTCCACGAGTATTCTTATCGGGTATTTTTGTGTAGACTGTTAAAAGGGATATATAGCAATTATTTTCCATAATTTCTAATGGACTTGATTGTTCTTGCTTTGGATTTGATTTTATATACATTTGTGAGTTATAAGTAATCTGAAGTCTG
Unaligned ( gi|12 ): GTCTGATCTATAACTAGGTTCTATGTACACATTTTCAAACCAGACAAAAGAGTTTCAGATATTAAAAAGAAATCTAACCTACTTTGTTTCAAAGGAGTTTTTTTTTTTTTTAACGATTATCTATGGTTATTTTTGTTTAACTGTTTAAACGGGTTTATATAGCCATTATTTTCCATAAATTTTAATACTATTCTTCTTGCCTTGGAATTCTTTATACATTTGTAGTTATAATAATCTAAGTCTG
Unaligned ( gi|13 ): TTCAAAATTATTATTTAAAAAAATGGATACACCTCTTGCATTTATTGTATAGGAATTGAAAAAAACATTTATAGCCCGCACATGGTTTCAATGTATTATGGTTCTAATTCAAGAGTGAAGTGGGTGTCTTGAAAAACATATTATAGAGTAACCTTTTGCTCTGTAAAAATTTAACACATTCTTGGCGTTTTTGAACAATGTAGATAAACCCTGGCAGTTTACTGTAGCCAATTTTTA
Unaligned ( gi|15 ): CTTTAAAATCAAAATTGTTATTAAACGGTATTGCACCCCACCCCCTTGAAATTAAAATGGAATTGGTATCCCCACATTATTAGAAAAGACAATAAATATTAAAATACAGATTTTTTAAGCAATTAAAAAACATGCATCTTTTCGTTTTGCGATATCACCTAGGCTTTAACAATTTACAGGCAATACTTTAATTCCCAT
Unaligned ( gi|16 ): ATTTCTATACAGATTTTCATAAAACTGTTTCATTTCTTCCAGAATATCTGATTGGTTATGGGTCTCTATTCTTTTAATGACCTCATTCAAAATATTTCTTGATTCGAGATGACAGAAATATGTTGTGGATTTCTCCCCTTCTTCAATCCATTTGGCTCT
Unaligned ( gi|17 ): TTGGGTATATATTTATTTGTATAATGGTCTGGTTTCCATATTCAAGATAAGAAGTACTTAGGTTGGTTTCTCCCCTTCATCTGTCCACTTTGCTCTGGACCTTACTATAATTACCATTAATTTGTGATTTCGAAATTTTTCTAATTCCTTCTTTCT
Unaligned ( gi|18 ): AAAAGAACCGATGTCTTTCCAAAAACATTTTAAAAATTCACATGTGAATCTACCAGGACCTGGGGTTTTATCATTTTTCAAGTACCTCTTTCTCCTTCTATACTTTGTGATTCATCAGAAGTAAGTTTAGGAATATCATCATATCTAGATT
Unaligned ( gi|19 ): TTCTATCAATTCTAAAATGTTGTTTCTAGCCTTTGCATTGTTTATATGTTTAAAATTTCTGGATCCAAATTTAAAATATGACATTCAAACTACACTGCATTTTGAACATTTTTTAGGGATTA
Unaligned ( gi|21 ): TACTTCATATCTTTACTATTAATTTTCAGGAATAAGTTATCTCCACTCTACTTCCCCTTATTTCTGAAAACAACTTGCCATTCAAATGATTATTAATAAGATGCCTTTCCTTTGTA
Unaligned ( gi|22 ): AAAAATGGTGTGTTGAAGACAATAAATATTACATGTATAATTAAAATTTTTTAAGCAATTTAAAACATAATTTTATTTTGCAATATTCTAGGCCTTTGACAATTTACTAAA
Unaligned ( gi|23 ): ATTTAAATGGATGAGTATATGAACTAGGAATATTTAACATTCATTTGACACCATTGCAAAGATTTCTAACATAATTTTCTATGATCAGTTGTAAGATTGTGTGTCTTTAGA
Unaligned ( gi|28 ): AATTTCTGGATTCCAAAGCACAAAAGTATTTTGATGGTTTTCCGCCTTCTTCCACCCATTTGGCTCTAC






Alignments
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gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           tCTCCCAGTCT----TTAAGAACTA---TTGCATTTTACCGGTTTGT-CA--CCTCTTAGGTACATTAATCGTAATTCACACCA-TGTCTTTGTTG---TCGATGGATAAAACTCATTAATTTT-GTAACCATGCGTTTAATGGCAA-CCTCCTACCCCATACACACCAATA-TATTTCCAGAAGAC----TTAAAAAA----TTCTGCAGAAAAAC--ATCAGAGCCTTacactctaatctcgaacgttatatttttgtggtgaaatttctagatagcaataagactaagaaacttacaagaaatataatatcttgtaagtttttttagtctaattgcttttatcaaaaacctaaacttatttaaaatttacataatgctttttttttttttttttttttttttttttcttatt
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        cTTTTTG-GTACAAGCTGTTCATAGAATGATTTT-G--TTCTT--AATATTT-TGATTGTTCAT-AA-TTAC-TGTACCA
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tg-AGTAAATGTGATTTCACCCTCTAAAGATTC---GACTCTA--TTTTAGAAAGTTTTGGGATACTACATGTACATGATA-A--TTC--AT-TCT--CTAAATCAAAATCAGC-ATTGTT--TAAATctccatgcactccaatctcggtataattttgattgtgtgaaatttcctagacaattctaacgtatacaaaatgtgttgtggttttctccttctatcaaatcatccttagctctgcatcttacatacataccagtgtagcttatttttttctatattttctaactcttgcttttatattacacagttcaatcaaatcattagcctgtccgcaaacattattttctacctaattaacctattttgcttttagttctctttcttctttttctttctttttattactataattatgttcgataagagattagttttacctcttatttcaaaaagtaatgtttgccaaaaaagttgcacattaactagagaaagagatgtctgcgatcagaaatattgttattgtttgttcaaattgtacacaggggagtacatactgtttctttacttctaaaatagttattttttacattctaaatatttcatcatagaagtaaagagttcatttaaattccatagacctttaccttttttaaagttgttaaaatctatgggtgaaatgatactattgagtgcgtctatcattaactagtttttggttctattagtacacgttttcaaaccgacaaaagagcttcagaattaaaaaaatctaagccgacttgtttcaatggtgtttttctctcatgagatatctcgtgtattttcatgtagctgtctgaaagggtctattatagcaatatttccattaatttataaaacgattcttgctgtttgggttatttattacatttgtagttataataactctaagtctgggtttaaaaccaagtttaaaatcaccacacccaaaacaatatcattgcatgcatatttcattcttatgatttgtatatttcaaaaatatggtggggtcttgttagtccataggatatgcatatttacttaccttcattgaccttcttatacatgctaaataaatcaagtaattcccatcatgtcacccttttccataataggcttaacaatcaaaattattattaataagattgcaaccctgaattagtagcatactgagctgaagaagcactggtccctaaaattttctctacctcgtttcccatatatgtgaaaaggcgagtttaatcttgcaacaatagatgatttattctaaggcccaagtagtgaaatacatccttgcgtttc
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           atttgatgattcATATA-A-GGTGATA-AAGGCATTAAAGTGTCATCCTGTC-TGCAACCTCTCTGA-A----------------TA-----G--------TGCCA--CC-TTGATTTATCAC-T-G-ATGTAATG-TCTGTATTAAAGA--TTG-AAATC
gi|25                         :                                                                                                                                      atGAAGTAAT-GTCTTAATAACT-GTTATCTT--TCCAATTGGAG--T---TAAATGTCTTTT--CC-TCCATTGATTTAGG-GTAGATTTAATT-TTTACTAA--CTTTGGATCA-T-----AATC-TAAT
gi|26                         :                                                                                                                                                                                               TCTTTA--CT-CCCATTG-TTTAATTGTAGATTTGA-TCTTTGTCAA--TTTTGGTTCACACATGTAATT-TAATT-CAA-TACTTT-ATCCAA-A--T-CCACATCAAAATGAA
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         CATTAA-ATCG-TAAATCAGCCTTGTATTTTCCCCAACACATGTACATGTATATCTGTTGGA-AATGAAA-CCTA----------------G----AA-T-ATT-TTTGTCTAGTGATATCTTTT
gi|3                          : ACCCTATGTGGTTTTATTATTCCATACA--AATAGGAATA--TATTT-TCTC-TATTTCCTT-GAAG----TAGTGGATCCCTGAA-GGATTTGG--ATTGACA-ATAAAAATATATGGT-TTAAGTAAAGGTA-GAAGTAA--GTTT-AATAA---GTAGTTTTATCCCAAT-GGGGGGT---TAAAAATCTTTT--CCTCCCATTG-TTTAATTAT-GATTTTAATCTTTGTTAAATTTTTGGTTCA-ATC---AATT-TAATTGTGG-CATTTT---CCAA-A--TTCCACATCAAAATGAATTCCCAA-AGGGTAAAAATCTGGTAG-ATCGCCTCTCTATTCTTAAGCCTGTAATTTGGAAGCATAGTGCTTCA-TTACTTTATATT-TCTTGAACCTATGCCATATGATCTGAGTTTTT---CATA--TAATATGAAGCCCAGACA-TTTCTTGAAACTTTTCCAAT---TTAAAGTGTTC--CACA-GAGAGATTTCTTCACCTGGGCCCAATCAAGAAATAAGTGAGTAA--T--CATCAGCCAATTGTGAGATTTTTTTTTCAATATTTATTAACACTA-AAT-TGC-TTGGATT-TTCTTGTTCATTTCT-AA-TATGGATTGCCA--ATATTTCCCGGCACAACATTAAAAATATATACGGTGATATAGGGT----------CACCCTGTC-TGCACCCTCTTTGACGTAGT--GAAT-T---CTATCAACGAGATACATTGCCAACCCGTTGGTTTACTACACAG-ATGTA-TG-TATG-ATTCAAAA--TTG-AAATCCAATTCCCTT--ATCGGGGAACGCAAAATTGAAAA--AT-TCAGTGTTCTTT-GTATAAA-TGACCATGAAAGTGTATCAAATTGCTTTTT-CGAAGTCAATAAAGTTAGC-AATAATCCAGGTAACTT-CTTTCTTTCTTCAGGTTGGGGTCG-TGCATTAATCTCG-TAA-TCCGC-TTGTATTTTCACAA-------------TATATCTGTTAGATAATGAAAACCTGTTTGGTC-TCCGAGTTA----AA-T-A-T-TT-GCATG---ATAGTTTTTTATTCTTCCTCCGGGCCAAATAACAA-CTGATGCAATTTTATATCCAGGTATTAATAGGAGTAA-TTGGTCT-CCAGTCTATTGTCAGGA--TAAAGTCGTGT------GGCTTGT-CAACCTTTTT-GGT--ATAAA--GTTATG-ATACCA-TATC-T-GT-GAGTT-AACAGA-AAGAC-TGTTATTTTTCATAACAATAA--TTAA-AG--ATTCTA--ACTACAAAAAGCCCAATACTGTTTC
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     CATTCTT----GTATAG-GTTTTAGTAAAATT-TGTC-GGTTTCATTCAAAATTTGTGATTGATCAT-AACTTAT-CTCCCCATCAT
gi|7                          :                 TTATTCCCTACACAAGACGGAT-A--TATTTATCTCCTAATTCCTTTGAGGCTGGTAGTG-ATC--TGAAAG-ATTTGGGGATTGA---ATAAAAA-ATATG-TGTTAG-TAAAG---AGTAGTA-T-GTTTTACTAACATGTAATTTT--TCCAAT-GGGG--TGGTTAAAAATCTTTTTTCT-CCCATTG-TATAAT-ATAGATTTAAT-CTTTGTTA---TTTTGGATCA--------ATTCTAATTGTGGGCATTTTTATCCAA-TCAT-CCA-ATCAAA-TGAATTCCC--CAGAGTAAA---TTGGTAGTACC-------CA--CCAAAGCCTGT---TTGGAAGCATAGT--TTCA-TTACT--ATATTCT-TGGAGCCTA-GCCATATGACATGAGTTTTTTTTCAATATTGATATGAAGCCCAGACA-TTTCT-GAAAATTTTCCAATGTCTTAAAGT-TTC----CACAAGAGATTC--TTACCT--ACC--ATCAAGAA-TAAGTG-----------ATCAGTGAG------ATTTTTTTTTTCAATATT-ATTAACACctaactctagtcttgggataatcttagacgtgaaattcctggattctaatttacaaaaataatttgatgtttttccccctccatccatctcgctctactccttatatagtttccttgtagtttatgttttatgcatttttatctaattcttgtttttgtgttatatagttcttcaacattgttttctgtaacattttcctcatcactttttatttttttaattgtatttcttcctgttcttttttgttgttgatatatgatgaaaaggaaatgatttacttctagtttctaataacaaagtttctaggaataactggtcattattttcgtctgaaaatgtgtgtaaattgttcatgttgtaaacagaaacagcaaatacatgtagttttttaacatgtaaaatgatatctctaatactttccaaatattcatcatcacaaagcaaggaattattaaatttccataatcgtcgacctctcttgaagttgttaaagacaaagatattgcagaattatctgctctataactggattctatagaacaagaatgtaaactaggtacagtaagagccactctaaatctctaaatctaatctactttgcttaagagatttttttctccatgtatatcttcgaaaatattcatgtaactgtctaaaggagtcaacatttgtttctatcaattctaaaattttgtttcttttatagcctttgcattgtttacacgtttataattataacaatccagatctgggttaagaaccaaattaaaatccccacaccatgtgacattactacactgcatattatcaatatgtgtttgaacattttcaaaaaaactggggattatcgttatttggcccatatacttcatgattctctaccattaatttgagtattaagtaatttccacttacatcccctatttctgaagaacgttgcaatcaaaattattattaataagaatagccactcctcttggatttgaagagtatgaactaaaataacattgataccccgttagatttctaacataattttccttatcacttgtaaaataagtgtcttgtaga
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tatatgttT------GGTTTGT-CT--CCTTTT-GGTA-AGGAT--GTAATT-ACACCC-TGTCTTTGT-G---T-GATGGATAACAT--GTTATTTTT-ATAGCCATGA--TTAATTG--A-CCTT--ACAACAAAAGTTCCAATA-TATTTCCAGAATTTTTTTTTAAAAAAAAACCTCGGTAGAAAAA-GTATCTGATCC-TGGAG-ATTTAT-TTGATTTCA--------------TATT--ACGCTTCACTTAA-AGTGA------TTTCTCCTTCTAA--ATTTTCAGATTC--ACTCTTAGAAGGTTTAGGGATATCAC---TATATGCTAGA--TTCTTAT-T-TAATTAAATCCATATCAGT-ATTTTG--TAAATCATTCTT----GTATAG-GTTTTAGTAAAATT-TGTC-GGTTTCATTCAAAATTTGTGATTGATCAT-AACTTAT-CTCCCCATCAT
14 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|5 ): TGCATTTATACAAATTTTCATAAAAGTTTTTTGTTTCAATAAAAATTTCTGACTTATCATATATTTTATCTCCATTACCCATTACCCAATTCCAGTTGAGGTATAATTTACTTGTAAAGTTTCTTGATTCAAGTTTACAAAAATAGTTTGATGGTTTTTCTCCTTCTTCTACCCATTTTGCTCTGCTTCAAATATAGTTTCCTTGTAGTCTATGCTTCTTAATTTTTCTAATTCTTGTTTTTTGTTGTATAGCTCATCTACATTACCTTCAGAAGCATTTTCCTCAATAGCTTTTATTTCTTTCATCAAATCTTGTTCCTCCTTATTTTTCTTCTTCTTGATATAAGAAGAGTAAGAGATGCTCTTATCTCTTATCTCAAAAAGTAAAGTTTCAAGGAACAACTGATCATTTATAGTGAAGAAAATATTTTCATCTGACACCATGTGTAAATTGTCCATGTTGTAAACAGGGACTGGCATACTGTTTTTAACCTTTAAAATTATATCTCTAATGCATTCTAAATTTATCATCATAAAGTAAGGAGTTATTGAATTTCCATAACCAATGTCCTTTCTTAAAATCATTGACGACAAGGATATTGCAGAGTGATCAGATCTGTAACTAGACTCGATTTAACAAGTATCTAAACTAAATAACAAAGATTCAGAAAGTAAAAAGAAATCCAATCGACCTTGTTTCAGTGGATACTTTTTCCTCCAAGAATATCTAAGAAGCTTTCCATGCAGTTGTCTAAAGGGGTCTATATA
Unaligned ( gi|6 ): ATACTGTTTCCTTGGGAATTATTTATACATTTTGTAGTTTATCAATAATCTAGGTCTGGGCTTTAGAACCAAGTTAAAATCACCACACTCAGAAAATCATTGCGATGCATTATCATCAATTATGATATGTTGCTATATTTTGTTTCGAAAGAAAATACAATGGTGTGTCAATTGTTAGCTCCATAGAATAGTGCATTATATACTGACTTCATGAACCTTCTATATAATGCTTTCAGGTAATAAATAATTCCAATCAGGCACGCTTTTTTCCCATAATAACCGCTTAAAAATCAAAATTATTGTTAATTAAGAAATTGCACAACTCCCCTTGAATTAGTAGCATATGAGCTAAAGAAGCACTGGTATCCCCATGAGTTTCTTACCTCATTTTCCCTGTCGTGTGAAAAATGGGTATCTTGCAAACTATAAATATTATGCTCTAAGACTCTTAAGTAGTTAAATACGTCCTTGCGTTTCACAATATCACCTAGACCTTGACAGTTTACCGAAATGATCTTAACCAT
Unaligned ( gi|8 ): GGAAACATTGGTTGATGGTGCAAATATTGGTATGCAGGAATTGGGCATACGGTTTCTTCTACTTCTACAGATTAGTTTTTTAATACTCTAGAATATTTTTCATTCATAGGTTACTTCCATAGACCTCTACAACACCATTTTAAGTTATTTAAATCTATTGACAATGATACTAATTTGATTGGTCTGATCTATAACTAGTTCTATGCTACAGCATTTTCAACCCAACAAAAAGATTTCAAGATATTAAACAAGAAATCTAAACCTACTGTTGTTTCAAGAAGTTTTTTTTTTTTCTCCACGAGTATTCTTATCGGGTATTTTTGTGTAGACTGTTAAAAGGGATATATAGCAATTATTTTCCATAATTTCTAATGGACTTGATTGTTCTTGCTTTGGATTTGATTTTATATACATTTGTGAGTTATAAGTAATCTGAAGTCTG
Unaligned ( gi|12 ): GTCTGATCTATAACTAGGTTCTATGTACACATTTTCAAACCAGACAAAAGAGTTTCAGATATTAAAAAGAAATCTAACCTACTTTGTTTCAAAGGAGTTTTTTTTTTTTTTAACGATTATCTATGGTTATTTTTGTTTAACTGTTTAAACGGGTTTATATAGCCATTATTTTCCATAAATTTTAATACTATTCTTCTTGCCTTGGAATTCTTTATACATTTGTAGTTATAATAATCTAAGTCTG
Unaligned ( gi|13 ): TTCAAAATTATTATTTAAAAAAATGGATACACCTCTTGCATTTATTGTATAGGAATTGAAAAAAACATTTATAGCCCGCACATGGTTTCAATGTATTATGGTTCTAATTCAAGAGTGAAGTGGGTGTCTTGAAAAACATATTATAGAGTAACCTTTTGCTCTGTAAAAATTTAACACATTCTTGGCGTTTTTGAACAATGTAGATAAACCCTGGCAGTTTACTGTAGCCAATTTTTA
Unaligned ( gi|15 ): CTTTAAAATCAAAATTGTTATTAAACGGTATTGCACCCCACCCCCTTGAAATTAAAATGGAATTGGTATCCCCACATTATTAGAAAAGACAATAAATATTAAAATACAGATTTTTTAAGCAATTAAAAAACATGCATCTTTTCGTTTTGCGATATCACCTAGGCTTTAACAATTTACAGGCAATACTTTAATTCCCAT
Unaligned ( gi|16 ): ATTTCTATACAGATTTTCATAAAACTGTTTCATTTCTTCCAGAATATCTGATTGGTTATGGGTCTCTATTCTTTTAATGACCTCATTCAAAATATTTCTTGATTCGAGATGACAGAAATATGTTGTGGATTTCTCCCCTTCTTCAATCCATTTGGCTCT
Unaligned ( gi|17 ): TTGGGTATATATTTATTTGTATAATGGTCTGGTTTCCATATTCAAGATAAGAAGTACTTAGGTTGGTTTCTCCCCTTCATCTGTCCACTTTGCTCTGGACCTTACTATAATTACCATTAATTTGTGATTTCGAAATTTTTCTAATTCCTTCTTTCT
Unaligned ( gi|18 ): AAAAGAACCGATGTCTTTCCAAAAACATTTTAAAAATTCACATGTGAATCTACCAGGACCTGGGGTTTTATCATTTTTCAAGTACCTCTTTCTCCTTCTATACTTTGTGATTCATCAGAAGTAAGTTTAGGAATATCATCATATCTAGATT
Unaligned ( gi|19 ): TTCTATCAATTCTAAAATGTTGTTTCTAGCCTTTGCATTGTTTATATGTTTAAAATTTCTGGATCCAAATTTAAAATATGACATTCAAACTACACTGCATTTTGAACATTTTTTAGGGATTA
Unaligned ( gi|21 ): TACTTCATATCTTTACTATTAATTTTCAGGAATAAGTTATCTCCACTCTACTTCCCCTTATTTCTGAAAACAACTTGCCATTCAAATGATTATTAATAAGATGCCTTTCCTTTGTA
Unaligned ( gi|22 ): AAAAATGGTGTGTTGAAGACAATAAATATTACATGTATAATTAAAATTTTTTAAGCAATTTAAAACATAATTTTATTTTGCAATATTCTAGGCCTTTGACAATTTACTAAA
Unaligned ( gi|23 ): ATTTAAATGGATGAGTATATGAACTAGGAATATTTAACATTCATTTGACACCATTGCAAAGATTTCTAACATAATTTTCTATGATCAGTTGTAAGATTGTGTGTCTTTAGA
Unaligned ( gi|28 ): AATTTCTGGATTCCAAAGCACAAAAGTATTTTGATGGTTTTCCGCCTTCTTCCACCCATTTGGCTCTAC






Alignments
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gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tCTCCCAGTCT-TT---AAGAACT-A--TTGCATTTTACCGGTTTGT-CA--CCTCTTAGGTACATTAATCGTAATTCACACC-ATGTCTTTGTTG-TCGATGGATAAAACTCATTAATTTT-GTAACCATGCGTTTAATGGCAA-CCTCCTACCCCATACACACCAATA-TATTTCCAGAAGACTT-------AAAAAAT-TCTGCAGAAAAAC--ATCAGAGCCTTacactctaatctcgaacgttatatttttgtggtgaaatttctagatagcaataagactaagaaacttacaagaaatataatatcttgtaagtttttttagtctaattgcttttatcaaaaacctaaacttatttaaaatttacataatgctttttttttttttttttttttttttttttcttatt
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 cTTTTTG-GTACAAGCTGTTCATAGAATGATT-TTG--TTCTT--AATATTT-TGATTGTTCATAA-TTAC-TGTACCA
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           tgATTTGATGATTCA-------GTAAATGTGATTTCACCCTCTAAAGATT--CGACTCT-A-TTTTAGAAAGTTTTGGGATACTACATGTACATGATA-A--TTC--A--TTCT--CTAAATCAAA-ATCAGC-ATTGTT--TAAATctccatgcactccaatctcggtataattttgattgtgtgaaatttcctagacaattctaacgtatacaaaatgtgttgtggttttctccttctatcaaatcatccttagctctgcatcttacatacataccagtgtagcttatttttttctatattttctaactcttgcttttatattacacagttcaatcaaatcattagcctgtccgcaaacattattttctacctaattaacctattttgcttttagttctctttcttctttttctttctttttattactataattatgttcgataagagattagttttacctcttatttcaaaaagtaatgtttgccaaaaaagttgcacattaactagagaaagagatgtctgcgatcagaaatattgttattgtttgttcaaattgtacacaggggagtacatactgtttctttacttctaaaatagttattttttacattctaaatatttcatcatagaagtaaagagttcatttaaattccatagacctttaccttttttaaagttgttaaaatctatgggtgaaatgatactattgagtgcgtctatcattaactagtttttggttctattagtacacgttttcaaaccgacaaaagagcttcagaattaaaaaaatctaagccgacttgtttcaatggtgtttttctctcatgagatatctcgtgtattttcatgtagctgtctgaaagggtctattatagcaatatttccattaatttataaaacgattcttgctgtttgggttatttattacatttgtagttataataactctaagtctgggtttaaaaccaagtttaaaatcaccacacccaaaacaatatcattgcatgcatatttcattcttatgatttgtatatttcaaaaatatggtggggtcttgttagtccataggatatgcatatttacttaccttcattgaccttcttatacatgctaaataaatcaagtaattcccatcatgtcacccttttccataataggcttaacaatcaaaattattattaataagattgcaaccctgaattagtagcatactgagctgaagaagcactggtccctaaaattttctctacctcgtttcccatatatgtgaaaaggcgagtttaatcttgcaacaatagatgatttattctaaggcccaagtagtgaaatacatccttgcgtttc
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ATATA-A-GGTGATA-AAGGCATTAAAGTGTCATCCTGTC-TGCAACCTCTCTGA-AT-----------------------AG------TGCC-ACC--TTGATTTATCAC-T-G-ATGTAATG-TCTGTATTAAAGA--TTG-AAATC
gi|25                         :                                                                                                                                       atGAAGTAAT-GTCTTAATAACT-GTTATCT--TTCCAATT--GGAGT---TAAATGTCTTTT--CCTCCATTGATTTAG-GGTAGATTTAATT-TTTACTAA--CTTTGGATCA-T-----AATCTAAT
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                TCTTTA--CTCCCATTG-TTTAATTGTAGATTTGA-TCTTTGTCAA--TTTTGGTTCACACATGTAATTTAATT-CAA-TACTTT-ATCC-AA-A--TCCACATCAAAATGAA
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      CATTAA-ATCG-TAAATCAGCCTTGTATTTTCCCCAACACATGTACATGTATATCTGTTGGA-AATG-AAACCTA-----------G----AA-T---ATT-TTTGTCTAGTGATATCTTTT
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gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TTCTT-GTATAG-GTTTTAGTAAAAT--TTGTCGGTTTCATTCAAAATTTGTGATTGATCATAACTTAT-CTCCCCATCAT
gi|7                          :               caTTATTCCCTACACAAGACGGAT-A---TATTTATCTCCTAATTCCTTTGAGGCTGGTAGTG-ATC--TGAAAG-ATTTGGGGATTGA-AT--AAAAAATATGTG--TTAG-TAAAG---AGTAGTA-T-GTTTTACTAACATGTAATTT--TTCCAA-T--GGGGTGGTTAAAAATCTTTTTTCTCCCATTG-TATAAT-ATAGATTTAAT-CTTTGTTA---TTTTGGATCA-AT------TCTAATTGTGGGCATTTTTATCC-AA-TCATCCA-ATCAAA-TGAATTCCC--CAGAGTAAA---TTGGTAG--TACC---C-A--CCAAAGCCTGT---TTGGAAGCATAGT--TTCA-TTAC-T-ATATTCTTGGAGCCTA-GCCATATGACATGAGTTTTTTTTCAATATTGATATGAAGCCCAGACA-TTTC-TG-AAAATTTTCCAATGTCTTAAAGT-TTC--C-ACAAGAGA-TTC-TT-ACCT--ACC--ATCAAG-AATAAGTG-----------ATCAGTGAG------ATTTTTTTTTTCAATA-TTATTAACACctaactctagtcttgggataatcttagacgtgaaattcctggattctaatttacaaaaataatttgatgtttttccccctccatccatctcgctctactccttatatagtttccttgtagtttatgttttatgcatttttatctaattcttgtttttgtgttatatagttcttcaacattgttttctgtaacattttcctcatcactttttatttttttaattgtatttcttcctgttcttttttgttgttgatatatgatgaaaaggaaatgatttacttctagtttctaataacaaagtttctaggaataactggtcattattttcgtctgaaaatgtgtgtaaattgttcatgttgtaaacagaaacagcaaatacatgtagttttttaacatgtaaaatgatatctctaatactttccaaatattcatcatcacaaagcaaggaattattaaatttccataatcgtcgacctctcttgaagttgttaaagacaaagatattgcagaattatctgctctataactggattctatagaacaagaatgtaaactaggtacagtaagagccactctaaatctctaaatctaatctactttgcttaagagatttttttctccatgtatatcttcgaaaatattcatgtaactgtctaaaggagtcaacatttgtttctatcaattctaaaattttgtttcttttatagcctttgcattgtttacacgtttataattataacaatccagatctgggttaagaaccaaattaaaatccccacaccatgtgacattactacactgcatattatcaatatgtgtttgaacattttcaaaaaaactggggattatcgttatttggcccatatacttcatgattctctaccattaatttgagtattaagtaatttccacttacatcccctatttctgaagaacgttgcaatcaaaattattattaataagaatagccactcctcttggatttgaagagtatgaactaaaataacattgataccccgttagatttctaacataattttccttatcacttgtaaaataagtgtcttgtaga
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tatatgttT------GGTTTGT-CT--CCTTTT-GGTA-AGGAT--GTAATT-ACACC-CTGTCTTTGT-G-T-GATGGATAACAT--GTTATTTTT-ATAGCCATGA--TTAATTG--A-CCT--TACAACAAAAGTTCCAATA-TATTTCCAGAATTTTTTTTTAAAAAAAAACCTCGGTAGAAAAA-GTATCTGATCCT--GGAGATTTAT-TTGATTTCAT--------------ATT--ACGCTTCACTTAA-AGTGA------TTTCTCCTTCTAA-ATTTTCAGATTC--ACTCTTAGAAGGTTTAGGGATATCAC---TATATGCTAGA--TTCTTA--TT-TAATTAAATCC-ATATCAGT-ATTTTG--TAAATCATTCTT----GTATAG-GTTTTAGTAAAAT--TTGTCGGTTTCATTCAAAATTTGTGATTGATCATAACTTAT-CTCCCCATCAT
14 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Unaligned ( gi|6 ): ATACTGTTTCCTTGGGAATTATTTATACATTTTGTAGTTTATCAATAATCTAGGTCTGGGCTTTAGAACCAAGTTAAAATCACCACACTCAGAAAATCATTGCGATGCATTATCATCAATTATGATATGTTGCTATATTTTGTTTCGAAAGAAAATACAATGGTGTGTCAATTGTTAGCTCCATAGAATAGTGCATTATATACTGACTTCATGAACCTTCTATATAATGCTTTCAGGTAATAAATAATTCCAATCAGGCACGCTTTTTTCCCATAATAACCGCTTAAAAATCAAAATTATTGTTAATTAAGAAATTGCACAACTCCCCTTGAATTAGTAGCATATGAGCTAAAGAAGCACTGGTATCCCCATGAGTTTCTTACCTCATTTTCCCTGTCGTGTGAAAAATGGGTATCTTGCAAACTATAAATATTATGCTCTAAGACTCTTAAGTAGTTAAATACGTCCTTGCGTTTCACAATATCACCTAGACCTTGACAGTTTACCGAAATGATCTTAACCAT
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Unaligned ( gi|15 ): CTTTAAAATCAAAATTGTTATTAAACGGTATTGCACCCCACCCCCTTGAAATTAAAATGGAATTGGTATCCCCACATTATTAGAAAAGACAATAAATATTAAAATACAGATTTTTTAAGCAATTAAAAAACATGCATCTTTTCGTTTTGCGATATCACCTAGGCTTTAACAATTTACAGGCAATACTTTAATTCCCAT
Unaligned ( gi|16 ): ATTTCTATACAGATTTTCATAAAACTGTTTCATTTCTTCCAGAATATCTGATTGGTTATGGGTCTCTATTCTTTTAATGACCTCATTCAAAATATTTCTTGATTCGAGATGACAGAAATATGTTGTGGATTTCTCCCCTTCTTCAATCCATTTGGCTCT
Unaligned ( gi|17 ): TTGGGTATATATTTATTTGTATAATGGTCTGGTTTCCATATTCAAGATAAGAAGTACTTAGGTTGGTTTCTCCCCTTCATCTGTCCACTTTGCTCTGGACCTTACTATAATTACCATTAATTTGTGATTTCGAAATTTTTCTAATTCCTTCTTTCT
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Unaligned ( gi|19 ): TTCTATCAATTCTAAAATGTTGTTTCTAGCCTTTGCATTGTTTATATGTTTAAAATTTCTGGATCCAAATTTAAAATATGACATTCAAACTACACTGCATTTTGAACATTTTTTAGGGATTA
Unaligned ( gi|21 ): TACTTCATATCTTTACTATTAATTTTCAGGAATAAGTTATCTCCACTCTACTTCCCCTTATTTCTGAAAACAACTTGCCATTCAAATGATTATTAATAAGATGCCTTTCCTTTGTA
Unaligned ( gi|22 ): AAAAATGGTGTGTTGAAGACAATAAATATTACATGTATAATTAAAATTTTTTAAGCAATTTAAAACATAATTTTATTTTGCAATATTCTAGGCCTTTGACAATTTACTAAA
Unaligned ( gi|23 ): ATTTAAATGGATGAGTATATGAACTAGGAATATTTAACATTCATTTGACACCATTGCAAAGATTTCTAACATAATTTTCTATGATCAGTTGTAAGATTGTGTGTCTTTAGA
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Reference ( family-157 )      : ACCCTATGTGGTTTTATTATTCCATACACAAANAGGAA-A---TATTT-TCTC-TAATTCCTT-GAGG----TAGTG-ATC--TGAAAGGATTTGGG-ATTGA-AA--TAAAAATATGTGGTTTAGGTAAAGGTA-GAAGTAAT-GTTTTAATAACA-GTAATTT--TTCCAA-T--GGGGT---TAAAAATCTTTT--CTCCCATTG-TTTAATTATAGATTTNATTCTTTGTTAA--TTTTGGNTCA-AT-A---AATTTAATTGTGG-CATTTT-ATCC-AAT--TCCACATCAAAATGAATTCCCAACAGAGTAAAAATCTGGTAG--TACC---CCA--CCTAAGCCTGTAATTTGGAAGCATAGT--TTCA-TTAC-TTATATTTCTGGAACCTA-GCCATATGACATGAGTTTTTT--CATAATTAATATGAAGCCCAGACA-TTTC-TG-AAANTTTTCCAATGTCTTAAAGTGTTC--C-CAAAGAGA-TTC-TTCACCT--GCC--ATCAAG-AATAAGTGAG--G--T--CATCAGCNAGTTGT-AGNTTTTTTTTTCAATA-TTATTAACACTA-AGT-TGCCTTTGATTATTCTTATTCNTTCCTAACTATGAATCGCC--AATATTTCC--GCACAA-ATTAAAAATATA-A-GGTGATA-AAGGN----------CACCCTGTC-TGCAACCTCTCTGA-AT-GT--G-AT-T---TTA-----GAGATA-ATTGCC-ACC--TTGGTTTACTAC-C-G-ATGTAATG-T-TGTATTAAAAA--TTG-AAATCC-ATTCCCTTAATCGAGGNAC-C-AAAATTGAAAAC-ATTCAGTGCTCTTTTGTAT-AAACGA-CATGANAGTGTATCAAA-TGC-TTTTTCGAAGTCAATAAA--TAGCGAATAATCCAGGTA----TTTTNT-TTCTTCA-GT----GTCG-TGCATTAA-ATCG-TAAATCAGCCTTGTATTTTCACCA-------------TATATCTGTTGGA-AATG-AAACCTGTTTGATC-T--G----AAT---ATA-TTTGTCTA---ATATTTTTTTATTCTNCCTCCGGGCCAAATNACAACCTGATGCAATTTTATACNCAGGTATTNANAGGGGTAATTTGGTCTCCCAGTCT-TT-TCAGGATAA--TCGCGT------GGCTTGT-CA--CCTTTT-GGTA-ATAAA--GTAATN-ACACC-ATGTCTTTGT-G-T-GATGGATAAGACTCGTTATTTTT-ATAACCATGA--TTAATAG--A-CCT--NACTACAAAAATCCCAATA-TGTTTCCAGAAN-ACTTT-----AAAAAAAT-TCGGCAGAAAAACGTATCAGANCCTTGGGGGATTTATGTTGATTTCATTTTTAAAAAAGAGTATT-GACGCTTCACTTAA-AGTAAATGTG-TTTCACCTTCTA-A-GATT-CC-GATTCT--ATTTTAGA---AAGTTTTGGGATATTAC---TATATGNTAGA--TTCT-A--TT-TGACTAAATC--A-ATCAGT-ATTGTG--TAAATCGTTTTTTTG-GTACAA-CTGTTCGTAGAATGATTGTCGGTTTCNTTCAATATTTGTGATTGNTCATAACTTAC-CGTACCATCATT
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gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   tCTCCCAGTCT-TT--AAGAACTA--TTGCATTTTACCGGTTTGT-CA--CCTCTTAGGTACATTAATCGTAATTCACACC-ATGTCTTTGTTG-TCGATGGATAAAACTCATTAATTTT-GTAACCATGCGTTTAATGGCAA-CCTCCTACCCCATACACACCAATA-TATTTCCAGAAG-ACTT-------AAAAAAT-TCTGCAGAAAAAC--ATCAGAGCCTTacactctaatctcgaacgttatatttttgtggtgaaatttctagatagcaataagactaagaaacttacaagaaatataatatcttgtaagtttttttagtctaattgcttttatcaaaaacctaaacttatttaaaatttacataatgctttttttttttttttttttttttttttttcttatt
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    cCCGATG-TCTTTCCAAAAACATTTT-----AAAAA--T-TCA-CATGTGAATCTACCAGGACCT--GGGGTTTTAT--------CATTTTTCAA-----GTA-------CCTC------------------TTTCTCCTTCTATA-CTTT-GT-GATTC---A--TCAGAAGTAAGTTTAGGAATATCAT---CATAT-CTAGA--TT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             aaaagaaTTTTTG-GTACAAGCTGTTCATAGAATGATT-TTG--TTCTT--AATATTT-TGATTGTTCATAA-TTAC-TGTACCA
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         tgTT-GATGATTCA-------GTAAATGTGATTTCACCCTCTA-AAGATT-C--GACTCT--ATTTTAGA---AAGTTTTGGGATACTACATGTACATGATA-A--TTC--A--TTCT--CTAAATCAAA-ATCAGC-ATTGTT--TAAATctccatgcactccaatctcggtataattttgattgtgtgaaatttcctagacaattctaacgtatacaaaatgtgttgtggttttctccttctatcaaatcatccttagctctgcatcttacatacataccagtgtagcttatttttttctatattttctaactcttgcttttatattacacagttcaatcaaatcattagcctgtccgcaaacattattttctacctaattaacctattttgcttttagttctctttcttctttttctttctttttattactataattatgttcgataagagattagttttacctcttatttcaaaaagtaatgtttgccaaaaaagttgcacattaactagagaaagagatgtctgcgatcagaaatattgttattgtttgttcaaattgtacacaggggagtacatactgtttctttacttctaaaatagttattttttacattctaaatatttcatcatagaagtaaagagttcatttaaattccatagacctttaccttttttaaagttgttaaaatctatgggtgaaatgatactattgagtgcgtctatcattaactagtttttggttctattagtacacgttttcaaaccgacaaaagagcttcagaattaaaaaaatctaagccgacttgtttcaatggtgtttttctctcatgagatatctcgtgtattttcatgtagctgtctgaaagggtctattatagcaatatttccattaatttataaaacgattcttgctgtttgggttatttattacatttgtagttataataactctaagtctgggtttaaaaccaagtttaaaatcaccacacccaaaacaatatcattgcatgcatatttcattcttatgatttgtatatttcaaaaatatggtggggtcttgttagtccataggatatgcatatttacttaccttcattgaccttcttatacatgctaaataaatcaagtaattcccatcatgtcacccttttccataataggcttaacaatcaaaattattattaataagattgcaaccctgaattagtagcatactgagctgaagaagcactggtccctaaaattttctctacctcgtttcccatatatgtgaaaaggcgagtttaatcttgcaacaatagatgatttattctaaggcccaagtagtgaaatacatccttgcgtttc
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  atATATA-A-GGTGATA-AAGGCATTAAAGTGTCATCCTGTC-TGCAACCTCTCTGA-AT-----------------------AG------TGCC-ACC--TTGATTTATCAC-T-G-ATGTAATG-TCTGTATTAAAGA--TTG-AAATC
gi|25                         :                                                                                                                                      at-GAAGTAAT-GTCTTAATAACT-GTTATCT--TTCCAATT--GGAGT---TAAATGTCTTTT--CCTCCATTGATTTAG-GGTAGATTTAATT-TTTACTAA--CTTTGGATC--AT-----AATCTAAT
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                TCTTTA--CTCCCATTG-TTTAATTGTAGATTTGA-TCTTTGTCAA--TTTTGGTTCACAC-ATGTAATTTAATT-CAA-TACTTT-ATCC-AAA--TCCACATCAAAATGAA
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     CATTAA-ATCG-TAAATCAGCCTTGTATTTTCCCCAACACATGTACATGTATATCTGTTGGA-AATG-AAACCTA-----------G----AAT---ATT-TTTGTCTAGTGATATCTTTT
gi|3                          : ACCCTATGTGGTTTTATTATTCCATACA--AATAGGAATA---TATTT-TCTC-TATTTCCTT-GAAG----TAGTGGATCCCTGAA-GGATTTGG--ATTGACAA--TAAAAATATATGGTTTAAGTAAAGGTA-GAAGTAA--G-TTTAATA--A-GTAGTTTTATCCCAA-TGGGGGGT---TAAAAATCTTTTC-CTCCCATTG-TTTAATTAT-GATTTTAATCTTTGTTAAATTTTTGGTTCA-AT-C---AATTTAATTGTGG-CATTT---TCCAAAT--TCCACATCAAAATGAATTCCCAA-AGGGTAAAAATCTGGTAGATCGCCTCTCTATTCTTAAGCCTGTAATTTGGAAGCATAGTGCTTCA-TTACTTTATATTTCTTGAACCTATGCCATATGATCTGAG-TTTTT--CATA--TAATATGAAGCCCAGACA-TTTCTTG-AAACTTTTCCAAT---TTAAAGTGTTC--CACAGAGAGATTTC-TTCACCTGGGCCCAATCAAGAAATAAGTGAGTAA--T--CATCAGCCAATTGTGAGATTTTTTTTTCAATATTTATTAACACTA-AAT-TG-CTTGGATT-TTCTTGTTCATTTCTAA-TATGGATTGCC--AATATTTCCCGGCACAACATTAAAAATATATACGGTGATATAGGGT----------CACCCTGTC-TGCACCCTCTTTGACGTAGT--GAAT-T---CTATCAACGAGATACATTGCCAACCCGTTGGTTTACTACACAG-ATGT-ATG-TATG-ATTCAAAA--TTG-AAATCCAATTCCCTT-ATCGGGGAACGC-AAAATTGAAAA--ATTCAGTGTTC-TTTGTAT-AAATGACCATGAAAGTGTATCAAATTGC-TTTTTCGAAGTCAATAAAGTTAGC-AATAATCCAGGTAACTTCTTTCT-TTCTTCAGGTTGGGGTCG-TGCATTAATCTCG-T-AATCCG-CTTGTATTTTCACAA-------------TATATCTGTTAGATAATGAAAACCTGTTTGGTC-TCCG----AGTTAAATA-TTTGCATG---ATAGTTTTTTATTCTTCCTCCGGGCCAAATAACAA-CTGATGCAATTTTATATCCAGGTATTAATAGGAGTAA-TTGGTCT-CCAGTCTATTGTCAGGATAAAGTCGTGT------GGCTTGT-CAACCTTTTT-GGT--ATAAA--GTTATG-ATACC-ATATCTGTGA-GTT-AACAGA-AAGACT-GTTATTTTTCATAACAATAA--TTAA-AG--ATTCT--AACTACAAAAAGCCCAATACTGTTTC
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TTCTT-GTATAG-GTTTTAGTAAAAT--TTGTCGGTTTCATTCAAAATTTGTGATTGATCATAACTTAT-CTCCCCATCAT
gi|7                          :               caTTATTCCCTACACAAGACGGAT-A---TATTTATCTCCTAATTCCTTTGAGGCTGGTAGTG-ATC--TGAAAG-ATTTGGGGATTGA-AT--AAAAAATATGTG--TTAG-TAAAG--A-GTAGTA-T-GTTTTACTAACATGTAATTT--TTCCAA-T--GGGGTGGTTAAAAATCTTTTTTCTCCCATTG-TATAAT-ATAGATTTAAT-CTTTGTTA---TTTTGGATCA-AT-------TCTAATTGTGGGCATTTTTATCC-AATCATCCA-ATCAAA-TGAATTCCC--CAGAGTAAA---TTGGTAG--TACC---C-A--CCAAAGCCTGT---TTGGAAGCATAGT--TTCA-TTAC-T-ATATTCTTGGAGCCTA-GCCATATGACATGAGTTTTTTTTCAATATTGATATGAAGCCCAGACA-TTTC-TG-AAAATTTTCCAATGTCTTAAAGT-TTC--C-ACAAGAGA-TTC-TT-ACCT--ACC--ATCAAG-AATAAGTG-----------ATCAGTGAG------ATTTTTTTTTTCAATA-TTATTAACACctaactctagtcttgggataatcttagacgtgaaattcctggattctaatttacaaaaataatttgatgtttttccccctccatccatctcgctctactccttatatagtttccttgtagtttatgttttatgcatttttatctaattcttgtttttgtgttatatagttcttcaacattgttttctgtaacattttcctcatcactttttatttttttaattgtatttcttcctgttcttttttgttgttgatatatgatgaaaaggaaatgatttacttctagtttctaataacaaagtttctaggaataactggtcattattttcgtctgaaaatgtgtgtaaattgttcatgttgtaaacagaaacagcaaatacatgtagttttttaacatgtaaaatgatatctctaatactttccaaatattcatcatcacaaagcaaggaattattaaatttccataatcgtcgacctctcttgaagttgttaaagacaaagatattgcagaattatctgctctataactggattctatagaacaagaatgtaaactaggtacagtaagagccactctaaatctctaaatctaatctactttgcttaagagatttttttctccatgtatatcttcgaaaatattcatgtaactgtctaaaggagtcaacatttgtttctatcaattctaaaattttgtttcttttatagcctttgcattgtttacacgtttataattataacaatccagatctgggttaagaaccaaattaaaatccccacaccatgtgacattactacactgcatattatcaatatgtgtttgaacattttcaaaaaaactggggattatcgttatttggcccatatacttcatgattctctaccattaatttgagtattaagtaatttccacttacatcccctatttctgaagaacgttgcaatcaaaattattattaataagaatagccactcctcttggatttgaagagtatgaactaaaataacattgataccccgttagatttctaacataattttccttatcacttgtaaaataagtgtcttgtaga
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tatatgttT------GGTTTGT-CT--CCTTTT-GGTA-AGGAT--GTAATT-ACACC-CTGTCTTTGT-G-T-GATGGATAACAT--GTTATTTTT-ATAGCCATGA--TTAATTG--A-CCT--TACAACAAAAGTTCCAATA-TATTTCCAGAAT-TTTTTTTTAAAAAAAAACCTCGGTAGAAAAA-GTATCTGATCCT--GGAGATTTAT-TTGATTTCAT--------------ATT--ACGCTTCACTTAA-AGTGA------TTTCTCCTTCTA-A-ATTT-TCAGATTCA--CTCTTAGA---AGGTTTAGGGATATCAC---TATATGCTAGA--TTCTTA--TT-TAATTAAATCC-ATATCAGT-ATTTTG--TAAATCATTCTT----GTATAG-GTTTTAGTAAAAT--TTGTCGGTTTCATTCAAAATTTGTGATTGATCATAACTTAT-CTCCCCATCAT
13 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|5 ): TGCATTTATACAAATTTTCATAAAAGTTTTTTGTTTCAATAAAAATTTCTGACTTATCATATATTTTATCTCCATTACCCATTACCCAATTCCAGTTGAGGTATAATTTACTTGTAAAGTTTCTTGATTCAAGTTTACAAAAATAGTTTGATGGTTTTTCTCCTTCTTCTACCCATTTTGCTCTGCTTCAAATATAGTTTCCTTGTAGTCTATGCTTCTTAATTTTTCTAATTCTTGTTTTTTGTTGTATAGCTCATCTACATTACCTTCAGAAGCATTTTCCTCAATAGCTTTTATTTCTTTCATCAAATCTTGTTCCTCCTTATTTTTCTTCTTCTTGATATAAGAAGAGTAAGAGATGCTCTTATCTCTTATCTCAAAAAGTAAAGTTTCAAGGAACAACTGATCATTTATAGTGAAGAAAATATTTTCATCTGACACCATGTGTAAATTGTCCATGTTGTAAACAGGGACTGGCATACTGTTTTTAACCTTTAAAATTATATCTCTAATGCATTCTAAATTTATCATCATAAAGTAAGGAGTTATTGAATTTCCATAACCAATGTCCTTTCTTAAAATCATTGACGACAAGGATATTGCAGAGTGATCAGATCTGTAACTAGACTCGATTTAACAAGTATCTAAACTAAATAACAAAGATTCAGAAAGTAAAAAGAAATCCAATCGACCTTGTTTCAGTGGATACTTTTTCCTCCAAGAATATCTAAGAAGCTTTCCATGCAGTTGTCTAAAGGGGTCTATATA
Unaligned ( gi|6 ): ATACTGTTTCCTTGGGAATTATTTATACATTTTGTAGTTTATCAATAATCTAGGTCTGGGCTTTAGAACCAAGTTAAAATCACCACACTCAGAAAATCATTGCGATGCATTATCATCAATTATGATATGTTGCTATATTTTGTTTCGAAAGAAAATACAATGGTGTGTCAATTGTTAGCTCCATAGAATAGTGCATTATATACTGACTTCATGAACCTTCTATATAATGCTTTCAGGTAATAAATAATTCCAATCAGGCACGCTTTTTTCCCATAATAACCGCTTAAAAATCAAAATTATTGTTAATTAAGAAATTGCACAACTCCCCTTGAATTAGTAGCATATGAGCTAAAGAAGCACTGGTATCCCCATGAGTTTCTTACCTCATTTTCCCTGTCGTGTGAAAAATGGGTATCTTGCAAACTATAAATATTATGCTCTAAGACTCTTAAGTAGTTAAATACGTCCTTGCGTTTCACAATATCACCTAGACCTTGACAGTTTACCGAAATGATCTTAACCAT
Unaligned ( gi|8 ): GGAAACATTGGTTGATGGTGCAAATATTGGTATGCAGGAATTGGGCATACGGTTTCTTCTACTTCTACAGATTAGTTTTTTAATACTCTAGAATATTTTTCATTCATAGGTTACTTCCATAGACCTCTACAACACCATTTTAAGTTATTTAAATCTATTGACAATGATACTAATTTGATTGGTCTGATCTATAACTAGTTCTATGCTACAGCATTTTCAACCCAACAAAAAGATTTCAAGATATTAAACAAGAAATCTAAACCTACTGTTGTTTCAAGAAGTTTTTTTTTTTTCTCCACGAGTATTCTTATCGGGTATTTTTGTGTAGACTGTTAAAAGGGATATATAGCAATTATTTTCCATAATTTCTAATGGACTTGATTGTTCTTGCTTTGGATTTGATTTTATATACATTTGTGAGTTATAAGTAATCTGAAGTCTG
Unaligned ( gi|12 ): GTCTGATCTATAACTAGGTTCTATGTACACATTTTCAAACCAGACAAAAGAGTTTCAGATATTAAAAAGAAATCTAACCTACTTTGTTTCAAAGGAGTTTTTTTTTTTTTTAACGATTATCTATGGTTATTTTTGTTTAACTGTTTAAACGGGTTTATATAGCCATTATTTTCCATAAATTTTAATACTATTCTTCTTGCCTTGGAATTCTTTATACATTTGTAGTTATAATAATCTAAGTCTG
Unaligned ( gi|13 ): TTCAAAATTATTATTTAAAAAAATGGATACACCTCTTGCATTTATTGTATAGGAATTGAAAAAAACATTTATAGCCCGCACATGGTTTCAATGTATTATGGTTCTAATTCAAGAGTGAAGTGGGTGTCTTGAAAAACATATTATAGAGTAACCTTTTGCTCTGTAAAAATTTAACACATTCTTGGCGTTTTTGAACAATGTAGATAAACCCTGGCAGTTTACTGTAGCCAATTTTTA
Unaligned ( gi|15 ): CTTTAAAATCAAAATTGTTATTAAACGGTATTGCACCCCACCCCCTTGAAATTAAAATGGAATTGGTATCCCCACATTATTAGAAAAGACAATAAATATTAAAATACAGATTTTTTAAGCAATTAAAAAACATGCATCTTTTCGTTTTGCGATATCACCTAGGCTTTAACAATTTACAGGCAATACTTTAATTCCCAT
Unaligned ( gi|16 ): ATTTCTATACAGATTTTCATAAAACTGTTTCATTTCTTCCAGAATATCTGATTGGTTATGGGTCTCTATTCTTTTAATGACCTCATTCAAAATATTTCTTGATTCGAGATGACAGAAATATGTTGTGGATTTCTCCCCTTCTTCAATCCATTTGGCTCT
Unaligned ( gi|17 ): TTGGGTATATATTTATTTGTATAATGGTCTGGTTTCCATATTCAAGATAAGAAGTACTTAGGTTGGTTTCTCCCCTTCATCTGTCCACTTTGCTCTGGACCTTACTATAATTACCATTAATTTGTGATTTCGAAATTTTTCTAATTCCTTCTTTCT
Unaligned ( gi|19 ): TTCTATCAATTCTAAAATGTTGTTTCTAGCCTTTGCATTGTTTATATGTTTAAAATTTCTGGATCCAAATTTAAAATATGACATTCAAACTACACTGCATTTTGAACATTTTTTAGGGATTA
Unaligned ( gi|21 ): TACTTCATATCTTTACTATTAATTTTCAGGAATAAGTTATCTCCACTCTACTTCCCCTTATTTCTGAAAACAACTTGCCATTCAAATGATTATTAATAAGATGCCTTTCCTTTGTA
Unaligned ( gi|22 ): AAAAATGGTGTGTTGAAGACAATAAATATTACATGTATAATTAAAATTTTTTAAGCAATTTAAAACATAATTTTATTTTGCAATATTCTAGGCCTTTGACAATTTACTAAA
Unaligned ( gi|23 ): ATTTAAATGGATGAGTATATGAACTAGGAATATTTAACATTCATTTGACACCATTGCAAAGATTTCTAACATAATTTTCTATGATCAGTTGTAAGATTGTGTGTCTTTAGA
Unaligned ( gi|28 ): AATTTCTGGATTCCAAAGCACAAAAGTATTTTGATGGTTTTCCGCCTTCTTCCACCCATTTGGCTCTAC






Alignments
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Reference ( family-157 )      : ACCCTATGTGGTTTTATTATTCCATACACAAANAGGAA-A---TATTT-TCTC-TAATTCCTT-GAGG----TAGTG-ATC--TGAAAGGATTTGGG-ATTGA-AA--TAAAAATATGTGGTTTAGGTAAAGGTA-GAAGTAAT-GTTTTAATAACA-GTAATTT--TTCCAA-T--GGGGT---TAAAAATCTTTT--CTCCCATTG-TTTAATTATAGATTTNATTCTTTGTTAA--TTTTGGNTCA-ATA---AATTTAATTGTGG-CATTTT-ATCCAATC-TCCACATCAAAATGAATTCCCAACAGAGT--AAATCTGGTAG--TACC---CCA--CCTAAGCCTGTAATTTGGAAGCATAGT--TTCA-TTAC-TTATATTTCTGGAACCTA-GCCATATGACATGAGTTTTTT--CATAATTAATATGAAGCCCAGACA-TTTC-TG-AAANTTTTCCAATGTCTTAAAGTGTTC--C-CAAAGAGA-TTC-TTCACCT--GCC--ATCAAG-AATAAGTGAG--G--T--CATCAGCNAGTTGT-AGNTTTTTTTTTCAATA-TTATTAACACTA-AGT-TGCCTTTGATTATTCTTATTCNTTCCTAACTATGAATCGCC--AATATTTCC--GCACAA-ATTAAAAATATA-A-GGTGATA-AAGGN----------CACCCTGTC-TGCAACCTCTCTGA-AT-GT--G-AT-T---TTA-----GAGATA-ATTGCC-ACC--TTGGTTTACTAC-C-G-ATGTAATG-T-TGTATTAAAAA--TTG-AAATCC-ATTCCTTAATCGAGGNAC-C-AAAATTGAAAAC-ATTCAGTGCTCTTTTGTAT-AAACGA-CATGANAGTGTATCAAA-TGC-TTTTTCGAAGTCAATAAA--TAGCGAATAATCCAGGTA----TTTTNT-TTCTTCA-GT----GTCG-TGCATTAA-ATCG-TAAATCAGCCTTGTATTTTCACCA-------------TATATCTGTTGGA-AATG-AAACCTGTTTGATC-T--G----AAT---ATA-TTTGTCTA---ATATTTTTTTATTCTNCCTCCGGGCCAAATNACAACCTGATGCAATTTTATACNCAGGTATTNANAGGGGTAATTTGGTCTCCCAGTCT-TT-TCAGGATAA--TCGCGT------GGCTTGT-CA--CCTTTT-GGTA-ATAAA--GTAATN-ACACC-ATGTCTTTGT-G-T-GATGGATAAGACTCGTTATTTTT-ATAACCATGA--TTAATAG--A-CCT--NACTACAAAAATCCCAATA-TGTTTCCAGAA---N-ATTTTAAAAAAA---TTCGGCAGAAAAACGTATCAGANCCTTGGGG-ATTTAT-TTGATTTCATTTTT-A------AGTATT-GACGCTTCACTTAA-AGTAAATGTG-TTTCNCCTTCTA-A-GNTT-CC-GATTCT--ATTTTAGA---AAGTTTNGGGATATCAC---CATATGCTAGA--TTC-TA--TT-TGACTAAAT-C--A-ATCAGT-ATTGTG--TAAATCGTTTTTTTG-GTACAA-CTGTTCGTAGAATGATTGTCGGTTTCNTTCAATATTTGTGATTGNTCATAACTTAC-CGTACCATCATT
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gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tCTCCCAGTCT-TT--AAGAACTA--TTGCATTTTACCGGTTTGT-CA--CCTCTTAGGTACATTAATCGTAATTCACACC-ATGTCTTTGTTG-TCGATGGATAAAACTCATTAATTTT-GTAACCATGCGTTTAATGGCAA-CCTCCTACCCCATACACACCAATA-TATTTCCAGAA---G-ACTT--AAAAAA---TTCTGCAGAAAAAC--ATCAGAGCCTTacactctaatctcgaacgttatatttttgtggtgaaatttctagatagcaataagactaagaaacttacaagaaatataatatcttgtaagtttttttagtctaattgcttttatcaaaaacctaaacttatttaaaatttacataatgctttttttttttttttttttttttttttttcttatt
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 cCCGATG-TCTTTCCAAAA---ACATTTTAAAAA-----TTCA-CATGTGAATCTACCAGGACCT-GGGG-TTTTAT--------CATTTTTCA------AGTA-------CCTC------------------TTTCTCCTTCTATA-CTTT-GT-GATTC---A--TCAGAAGTAAGTTTAGGAATATCAT---CATAT-CTAGA--TT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            aaaagaaTTTTTG-GTACAAGCTGTTCATAGAATGATT-TTG--TTCTT--AATATTT-TGATTGTTCATAA-TTAC-TGTACCA
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tgTT-GATGATTCA-------GTAAATGTGATTTCACCCTCTA-A-AGAT-TC-GACTCT--ATTTTAGA---AAGTTTTGGGATACTACATGTACATGATA-A--TTC--A--TTCT--CTAAAT-CAAA-ATCAGC-ATTGTT--TAAATctccatgcactccaatctcggtataattttgattgtgtgaaatttcctagacaattctaacgtatacaaaatgtgttgtggttttctccttctatcaaatcatccttagctctgcatcttacatacataccagtgtagcttatttttttctatattttctaactcttgcttttatattacacagttcaatcaaatcattagcctgtccgcaaacattattttctacctaattaacctattttgcttttagttctctttcttctttttctttctttttattactataattatgttcgataagagattagttttacctcttatttcaaaaagtaatgtttgccaaaaaagttgcacattaactagagaaagagatgtctgcgatcagaaatattgttattgtttgttcaaattgtacacaggggagtacatactgtttctttacttctaaaatagttattttttacattctaaatatttcatcatagaagtaaagagttcatttaaattccatagacctttaccttttttaaagttgttaaaatctatgggtgaaatgatactattgagtgcgtctatcattaactagtttttggttctattagtacacgttttcaaaccgacaaaagagcttcagaattaaaaaaatctaagccgacttgtttcaatggtgtttttctctcatgagatatctcgtgtattttcatgtagctgtctgaaagggtctattatagcaatatttccattaatttataaaacgattcttgctgtttgggttatttattacatttgtagttataataactctaagtctgggtttaaaaccaagtttaaaatcaccacacccaaaacaatatcattgcatgcatatttcattcttatgatttgtatatttcaaaaatatggtggggtcttgttagtccataggatatgcatatttacttaccttcattgaccttcttatacatgctaaataaatcaagtaattcccatcatgtcacccttttccataataggcttaacaatcaaaattattattaataagattgcaaccctgaattagtagcatactgagctgaagaagcactggtccctaaaattttctctacctcgtttcccatatatgtgaaaaggcgagtttaatcttgcaacaatagatgatttattctaaggcccaagtagtgaaatacatccttgcgtttc
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                atATATA-A-GGTGATA-AAGGCATTAAAGTGTCATCCTGTC-TGCAACCTCTCTGA-AT-----------------------AG------TGCC-ACC--TTGATTTATCAC-T-G-ATGTAATG-TCTGTATTAAAGA--TTG-AAATC
gi|25                         :                                                                                                                                      at-GAAGTAAT-GTCTTAATAACT-GTTATCT--TTCCAATT--GGAGT---TAAATGTCTTTT--CCTCCATTGATTTAG-GGTAGATTTAATT-TTTACTAA--CTTTGGATC--AT----AATCTAAT
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                TCTTTA--CTCCCATTG-TTTAATTGTAGATTTGA-TCTTTGTCAA--TTTTGGTTCACACATGTAATTTAATT-CAA-TACTTT-ATCCAA-A-TCCACATCAAAATGAA
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  CATTAA-ATCG-TAAATCAGCCTTGTATTTTCCCCAACACATGTACATGTATATCTGTTGGA-AATG-AAACCTA-----------G----AAT---ATT-TTTGTCTAGTGATATCTTTT
gi|3                          : ACCCTATGTGGTTTTATTATTCCATACA--AATAGGAATA---TATTT-TCTC-TATTTCCTT-GAAG----TAGTGGATCCCTGAA-GGATTTGG--ATTGACAA--TAAAAATATATGGTTTAAGTAAAGGTA-GAAGTAA--G-TTTAATA--A-GTAGTTTTATCCCAA-TGGGGGGT---TAAAAATCTTTTC-CTCCCATTG-TTTAATTAT-GATTTTAATCTTTGTTAAATTTTTGGTTCA-ATC---AATTTAATTGTGG-CATTT---TCCAAAT-TCCACATCAAAATGAATTCCCAA-AGGGTAAAAATCTGGTAGATCGCCTCTCTATTCTTAAGCCTGTAATTTGGAAGCATAGTGCTTCA-TTACTTTATATTTCTTGAACCTATGCCATATGATCTGAG-TTTTT--CATA--TAATATGAAGCCCAGACA-TTTCTTG-AAACTTTTCCAAT---TTAAAGTGTTC--CACAGAGAGATTTC-TTCACCTGGGCCCAATCAAGAAATAAGTGAGTAA--T--CATCAGCCAATTGTGAGATTTTTTTTTCAATATTTATTAACACTA-AAT-TG-CTTGGATT-TTCTTGTTCATTTCTAA-TATGGATTGCC--AATATTTCCCGGCACAACATTAAAAATATATACGGTGATATAGGGT----------CACCCTGTC-TGCACCCTCTTTGACGTAGT--GAAT-T---CTATCAACGAGATACATTGCCAACCCGTTGGTTTACTACACAG-ATGT-ATG-TATG-ATTCAAAA--TTG-AAATCCAATTCCCTTATCGGGGAACGC-AAAATTGAAAA--ATTCAGTGTTC-TTTGTAT-AAATGACCATGAAAGTGTATCAAATTGC-TTTTTCGAAGTCAATAAAGTTAGC-AATAATCCAGGTAACTTCTTTCT-TTCTTCAGGTTGGGGTCG-TGCATTAATCTCG-T-AATCCG-CTTGTATTTTCACAA-------------TATATCTGTTAGATAATGAAAACCTGTTTGGTC-TCCG----AGTTAAATA-TTTGCATG---ATAGTTTTTTATTCTTCCTCCGGGCCAAATAACAA-CTGATGCAATTTTATATCCAGGTATTAATAGGAGTAA-TTGGTCT-CCAGTCTATTGTCAGGATAAAGTCGTGT------GGCTTGT-CAACCTTTTT-GGT--ATAAA--GTTATG-ATACC-ATATCTGTGA-GTT-AACAGA-AAGACT-GTTATTTTTCATAACAATAA--TTAA-AG--ATTCT--AACTACAAAAAGCCCAATACTGTTTC
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TTCTT-GTATAG-GTTTTAGTAAAAT--TTGTCGGTTTCATTCAAAATTTGTGATTGATCATAACTTAT-CTCCCCATCAT
gi|7                          :               caTTATTCCCTACACAAGACGGAT-A---TATTTATCTCCTAATTCCTTTGAGGCTGGTAGTG-ATC--TGAAAG-ATTTGGGGATTGA-AT--AAAAAATATGTG--TTAG-TAAAG--A-GTAGTA-T-GTTTTACTAACATGTAATTT--TTCCAA-T--GGGGTGGTTAAAAATCTTTTTTCTCCCATTG-TATAAT-ATAGATTTAAT-CTTTGTTA---TTTTGGATCA-AT------TCTAATTGTGGGCATTTTTATCCAATCATCCA-ATCAAA-TGAATTCCC--CAGAGT--AAAT-TGGTAG--TACC---C-A--CCAAAGCCTGT---TTGGAAGCATAGT--TTCA-TTAC-T-ATATTCTTGGAGCCTA-GCCATATGACATGAGTTTTTTTTCAATATTGATATGAAGCCCAGACA-TTTC-TG-AAAATTTTCCAATGTCTTAAAGT-TTC--C-ACAAGAGA-TTC-TT-ACCT--ACC--ATCAAG-AATAAGTG-----------ATCAGTGAG------ATTTTTTTTTTCAATA-TTATTAACACctaactctagtcttgggataatcttagacgtgaaattcctggattctaatttacaaaaataatttgatgtttttccccctccatccatctcgctctactccttatatagtttccttgtagtttatgttttatgcatttttatctaattcttgtttttgtgttatatagttcttcaacattgttttctgtaacattttcctcatcactttttatttttttaattgtatttcttcctgttcttttttgttgttgatatatgatgaaaaggaaatgatttacttctagtttctaataacaaagtttctaggaataactggtcattattttcgtctgaaaatgtgtgtaaattgttcatgttgtaaacagaaacagcaaatacatgtagttttttaacatgtaaaatgatatctctaatactttccaaatattcatcatcacaaagcaaggaattattaaatttccataatcgtcgacctctcttgaagttgttaaagacaaagatattgcagaattatctgctctataactggattctatagaacaagaatgtaaactaggtacagtaagagccactctaaatctctaaatctaatctactttgcttaagagatttttttctccatgtatatcttcgaaaatattcatgtaactgtctaaaggagtcaacatttgtttctatcaattctaaaattttgtttcttttatagcctttgcattgtttacacgtttataattataacaatccagatctgggttaagaaccaaattaaaatccccacaccatgtgacattactacactgcatattatcaatatgtgtttgaacattttcaaaaaaactggggattatcgttatttggcccatatacttcatgattctctaccattaatttgagtattaagtaatttccacttacatcccctatttctgaagaacgttgcaatcaaaattattattaataagaatagccactcctcttggatttgaagagtatgaactaaaataacattgataccccgttagatttctaacataattttccttatcacttgtaaaataagtgtcttgtaga
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tatatgttT------GGTTTGT-CT--CCTTTT-GGTA-AGGAT--GTAATT-ACACC-CTGTCTTTGT-G-T-GATGGATAACAT--GTTATTTTT-ATAGCCATGA--TTAATTG--A-CCT--TACAACAAAAGTTCCAATA-TATTTCCAGAATTTT-TTTTTAAAAAAAAACCTCGGTAGAAAAA-GTATCTGATCC-TGGAG-ATTTAT-TTGATTTCA---------------TATT--ACGCTTCACTTAA-AGTGA------TTTCTCCTTCTA-A-ATTT-TCAGATTCA--CTCTTAGA---AGGTTTAGGGATATCAC---TATATGCTAGA--TTCTTA--TT-TAATTAAATCC--ATATCAGT-ATTTTG--TAAATCATTCTT----GTATAG-GTTTTAGTAAAAT--TTGTCGGTTTCATTCAAAATTTGTGATTGATCATAACTTAT-CTCCCCATCAT
13 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|5 ): TGCATTTATACAAATTTTCATAAAAGTTTTTTGTTTCAATAAAAATTTCTGACTTATCATATATTTTATCTCCATTACCCATTACCCAATTCCAGTTGAGGTATAATTTACTTGTAAAGTTTCTTGATTCAAGTTTACAAAAATAGTTTGATGGTTTTTCTCCTTCTTCTACCCATTTTGCTCTGCTTCAAATATAGTTTCCTTGTAGTCTATGCTTCTTAATTTTTCTAATTCTTGTTTTTTGTTGTATAGCTCATCTACATTACCTTCAGAAGCATTTTCCTCAATAGCTTTTATTTCTTTCATCAAATCTTGTTCCTCCTTATTTTTCTTCTTCTTGATATAAGAAGAGTAAGAGATGCTCTTATCTCTTATCTCAAAAAGTAAAGTTTCAAGGAACAACTGATCATTTATAGTGAAGAAAATATTTTCATCTGACACCATGTGTAAATTGTCCATGTTGTAAACAGGGACTGGCATACTGTTTTTAACCTTTAAAATTATATCTCTAATGCATTCTAAATTTATCATCATAAAGTAAGGAGTTATTGAATTTCCATAACCAATGTCCTTTCTTAAAATCATTGACGACAAGGATATTGCAGAGTGATCAGATCTGTAACTAGACTCGATTTAACAAGTATCTAAACTAAATAACAAAGATTCAGAAAGTAAAAAGAAATCCAATCGACCTTGTTTCAGTGGATACTTTTTCCTCCAAGAATATCTAAGAAGCTTTCCATGCAGTTGTCTAAAGGGGTCTATATA
Unaligned ( gi|6 ): ATACTGTTTCCTTGGGAATTATTTATACATTTTGTAGTTTATCAATAATCTAGGTCTGGGCTTTAGAACCAAGTTAAAATCACCACACTCAGAAAATCATTGCGATGCATTATCATCAATTATGATATGTTGCTATATTTTGTTTCGAAAGAAAATACAATGGTGTGTCAATTGTTAGCTCCATAGAATAGTGCATTATATACTGACTTCATGAACCTTCTATATAATGCTTTCAGGTAATAAATAATTCCAATCAGGCACGCTTTTTTCCCATAATAACCGCTTAAAAATCAAAATTATTGTTAATTAAGAAATTGCACAACTCCCCTTGAATTAGTAGCATATGAGCTAAAGAAGCACTGGTATCCCCATGAGTTTCTTACCTCATTTTCCCTGTCGTGTGAAAAATGGGTATCTTGCAAACTATAAATATTATGCTCTAAGACTCTTAAGTAGTTAAATACGTCCTTGCGTTTCACAATATCACCTAGACCTTGACAGTTTACCGAAATGATCTTAACCAT
Unaligned ( gi|8 ): GGAAACATTGGTTGATGGTGCAAATATTGGTATGCAGGAATTGGGCATACGGTTTCTTCTACTTCTACAGATTAGTTTTTTAATACTCTAGAATATTTTTCATTCATAGGTTACTTCCATAGACCTCTACAACACCATTTTAAGTTATTTAAATCTATTGACAATGATACTAATTTGATTGGTCTGATCTATAACTAGTTCTATGCTACAGCATTTTCAACCCAACAAAAAGATTTCAAGATATTAAACAAGAAATCTAAACCTACTGTTGTTTCAAGAAGTTTTTTTTTTTTCTCCACGAGTATTCTTATCGGGTATTTTTGTGTAGACTGTTAAAAGGGATATATAGCAATTATTTTCCATAATTTCTAATGGACTTGATTGTTCTTGCTTTGGATTTGATTTTATATACATTTGTGAGTTATAAGTAATCTGAAGTCTG
Unaligned ( gi|12 ): GTCTGATCTATAACTAGGTTCTATGTACACATTTTCAAACCAGACAAAAGAGTTTCAGATATTAAAAAGAAATCTAACCTACTTTGTTTCAAAGGAGTTTTTTTTTTTTTTAACGATTATCTATGGTTATTTTTGTTTAACTGTTTAAACGGGTTTATATAGCCATTATTTTCCATAAATTTTAATACTATTCTTCTTGCCTTGGAATTCTTTATACATTTGTAGTTATAATAATCTAAGTCTG
Unaligned ( gi|13 ): TTCAAAATTATTATTTAAAAAAATGGATACACCTCTTGCATTTATTGTATAGGAATTGAAAAAAACATTTATAGCCCGCACATGGTTTCAATGTATTATGGTTCTAATTCAAGAGTGAAGTGGGTGTCTTGAAAAACATATTATAGAGTAACCTTTTGCTCTGTAAAAATTTAACACATTCTTGGCGTTTTTGAACAATGTAGATAAACCCTGGCAGTTTACTGTAGCCAATTTTTA
Unaligned ( gi|15 ): CTTTAAAATCAAAATTGTTATTAAACGGTATTGCACCCCACCCCCTTGAAATTAAAATGGAATTGGTATCCCCACATTATTAGAAAAGACAATAAATATTAAAATACAGATTTTTTAAGCAATTAAAAAACATGCATCTTTTCGTTTTGCGATATCACCTAGGCTTTAACAATTTACAGGCAATACTTTAATTCCCAT
Unaligned ( gi|16 ): ATTTCTATACAGATTTTCATAAAACTGTTTCATTTCTTCCAGAATATCTGATTGGTTATGGGTCTCTATTCTTTTAATGACCTCATTCAAAATATTTCTTGATTCGAGATGACAGAAATATGTTGTGGATTTCTCCCCTTCTTCAATCCATTTGGCTCT
Unaligned ( gi|17 ): TTGGGTATATATTTATTTGTATAATGGTCTGGTTTCCATATTCAAGATAAGAAGTACTTAGGTTGGTTTCTCCCCTTCATCTGTCCACTTTGCTCTGGACCTTACTATAATTACCATTAATTTGTGATTTCGAAATTTTTCTAATTCCTTCTTTCT
Unaligned ( gi|19 ): TTCTATCAATTCTAAAATGTTGTTTCTAGCCTTTGCATTGTTTATATGTTTAAAATTTCTGGATCCAAATTTAAAATATGACATTCAAACTACACTGCATTTTGAACATTTTTTAGGGATTA
Unaligned ( gi|21 ): TACTTCATATCTTTACTATTAATTTTCAGGAATAAGTTATCTCCACTCTACTTCCCCTTATTTCTGAAAACAACTTGCCATTCAAATGATTATTAATAAGATGCCTTTCCTTTGTA
Unaligned ( gi|22 ): AAAAATGGTGTGTTGAAGACAATAAATATTACATGTATAATTAAAATTTTTTAAGCAATTTAAAACATAATTTTATTTTGCAATATTCTAGGCCTTTGACAATTTACTAAA
Unaligned ( gi|23 ): ATTTAAATGGATGAGTATATGAACTAGGAATATTTAACATTCATTTGACACCATTGCAAAGATTTCTAACATAATTTTCTATGATCAGTTGTAAGATTGTGTGTCTTTAGA
Unaligned ( gi|28 ): AATTTCTGGATTCCAAAGCACAAAAGTATTTTGATGGTTTTCCGCCTTCTTCCACCCATTTGGCTCTAC






Alignments
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Reference ( family-157 )      : ACCCTATGTGGTTTTATTATTCCATACACAAANAGGAA-A---TATTT-TCTC-TAATTCCTT-GAGG----TAGTG-ATC--TGAAAGGATTTGGG-ATTGA-AA--TAAAAATATGTGGTTTAGGTAAAGGTA-GAAGTAAT-GTTTTAATAACA-GTAATTT--TTCCAA-T--GGGGT---TAAAAATCTTTT--CTCCCATTG-TTTAATTATAGATTTNATTCTTTGTTAA--TTTTGGNTCA-ATA---AATTTAATTGTGG-CATTTT-ATCCAATC-TCCACATCAAAATGAATTCCCAACAGAGT--AAATCTGGTAG--TACC---CCA--CCTAAGCCTGTAATTTGGAAGCATAGT--TTCA-TTAC-TTATATTTCTGGAACCTA-GCCATATGACATGAGTTTTTT--CATAATTAATATGAAGCCCAGACA-TTTC-TG-AAANTTTTCCAATGTCTTAAAGTGTTC--C-CAAAGAGA-TTC-TTCACCT--GCC--ATCAAG-AATAAGTGAG--G--T--CATCAGCNAGTTGT-AGNTTTTTTTTTCAATA-TTATTAACACTA-AGT-TGCCTTTGATTATTCTTATTCNTTCCTAACTATGAATCGCC--AATATTTCC--GCACAA-ATTAAAAATATA-A-GGTGATA-AAGGN----------CACCCTGTC-TGCAACCTCTCTGA-AT-GT--G-AT-T---TTA-----GAGATA-ATTGCC-ACC--TTGGTTTACTAC-C-G-ATGTAATG-T-TGTATTAAAAA--TTG-AAATCC-ATTCCCTAATCGAGGNAC-C-AAAATTGAAAAC-ATTCAGTGCTCTTTTGTAT-AAACGA-CATGANAGTGTATCAAA-TGC-TTTTTCGAAGTCAATAAA--TAGCGAATAATCCAGGTA----TTTTNT-TTCTTCA-GT----GTCG-TGCATTAA-ATCG-TAAATCAGCCTTGTATTTTCACCA-------------TATATCTGTTGGA-AATG-AAACCTGTTTGATC-T--G----AAT---ATA-TTTGTCTA---ATATTTTTTTATTCTNCCTCCGGGCCAAATNACAACCTGATGCAATTTTATACNCAGGTATTNANAGGGGTAATTTGGTCTCCCAGTCT-TT-TCAGGATAA--TCGCGT------GGCTTGT-CA--CCTTTT-GGTA-ATAAA--GTAATN-ACACC-ATGTCTTTGT-G-T-GATGGATAAGACTCGTTATTTTT-ATAACCATGA--TTAATAG--A-CCT--NACTACAAAAATCCCAATA-TGTTTCCAGAA---N-ATTTTAAAAAAA---TTCGGCAGAAAAACGTATCAGANCCTTGGGG-ATTTAT-TTGATTTCATTTTT-A------AGTATT-GACGCTTCACTTAA-AGTAAATGTG-TTTCNCCTTCTAA--ANTTT-C-GATTCT--ATTTTAGA---AAGTTTNGGGATATCAC---CATATGCTAGA--TTC-TA--TT-TGACTAAAT-C--A-ATCAGT-ATTGTG--TAAATCGTTTTTTTG-GTACAA-CTGTTCGTAGAATGATTGTCGGTTTCNTTCAATATTTGTGATTGNTCATAACTTAC-CGTACCATCATT
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gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tCTCCCAGTCT-TT--AAGAACTA--TTGCATTTTACCGGTTTGT-CA--CCTCTTAGGTACATTAATCGTAATTCACACC-ATGTCTTTGTTG-TCGATGGATAAAACTCATTAATTTT-GTAACCATGCGTTTAATGGCAA-CCTCCTACCCCATACACACCAATA-TATTTCCAGAA---G-ACTT--AAAAAA---TTCTGCAGAAAAAC--ATCAGAGCCTTacactctaatctcgaacgttatatttttgtggtgaaatttctagatagcaataagactaagaaacttacaagaaatataatatcttgtaagtttttttagtctaattgcttttatcaaaaacctaaacttatttaaaatttacataatgctttttttttttttttttttttttttttttcttatt
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 cCCGATG-TCTTTCCAAAA---ACATTTTAAAAA-----TTCA-CATGTGAATCTACCAGGACCT-GGGG-TTTTAT--------CATTTTTCA------AGTA-------CCTC------------------TTTCTCCTTCTAT--ACTTTGT-GATTC---A--TCAGAAGTAAGTTTAGGAATATCAT---CATAT-CTAGA--TT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            aaaagaaTTTTTG-GTACAAGCTGTTCATAGAATGATT-TTG--TTCTT--AATATTT-TGATTGTTCATAA-TTAC-TGTACCA
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tgTT-GATGATTCA-------GTAAATGTGATTTCACCCTCTAA--AGATT-C-GACTCT--ATTTTAGA---AAGTTTTGGGATACTACATGTACATGATA-A--TTC--A--TTCT--CTAAAT-CAAA-ATCAGC-ATTGTT--TAAATctccatgcactccaatctcggtataattttgattgtgtgaaatttcctagacaattctaacgtatacaaaatgtgttgtggttttctccttctatcaaatcatccttagctctgcatcttacatacataccagtgtagcttatttttttctatattttctaactcttgcttttatattacacagttcaatcaaatcattagcctgtccgcaaacattattttctacctaattaacctattttgcttttagttctctttcttctttttctttctttttattactataattatgttcgataagagattagttttacctcttatttcaaaaagtaatgtttgccaaaaaagttgcacattaactagagaaagagatgtctgcgatcagaaatattgttattgtttgttcaaattgtacacaggggagtacatactgtttctttacttctaaaatagttattttttacattctaaatatttcatcatagaagtaaagagttcatttaaattccatagacctttaccttttttaaagttgttaaaatctatgggtgaaatgatactattgagtgcgtctatcattaactagtttttggttctattagtacacgttttcaaaccgacaaaagagcttcagaattaaaaaaatctaagccgacttgtttcaatggtgtttttctctcatgagatatctcgtgtattttcatgtagctgtctgaaagggtctattatagcaatatttccattaatttataaaacgattcttgctgtttgggttatttattacatttgtagttataataactctaagtctgggtttaaaaccaagtttaaaatcaccacacccaaaacaatatcattgcatgcatatttcattcttatgatttgtatatttcaaaaatatggtggggtcttgttagtccataggatatgcatatttacttaccttcattgaccttcttatacatgctaaataaatcaagtaattcccatcatgtcacccttttccataataggcttaacaatcaaaattattattaataagattgcaaccctgaattagtagcatactgagctgaagaagcactggtccctaaaattttctctacctcgtttcccatatatgtgaaaaggcgagtttaatcttgcaacaatagatgatttattctaaggcccaagtagtgaaatacatccttgcgtttc
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                atATATA-A-GGTGATA-AAGGCATTAAAGTGTCATCCTGTC-TGCAACCTCTCTGA-AT-----------------------AG------TGCC-ACC--TTGATTTATCAC-T-G-ATGTAATG-TCTGTATTAAAGA--TTG-AAATC
gi|25                         :                                                                                                                                      at-GAAGTAAT-GTCTTAATAACT-GTTATCT--TTCCAATT--GGAGT---TAAATGTCTTTT--CCTCCATTGATTTAG-GGTAGATTTAATT-TTTACTAA--CTTTGGATC--AT----AATCTAAT
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                TCTTTA--CTCCCATTG-TTTAATTGTAGATTTGA-TCTTTGTCAA--TTTTGGTTCACACATGTAATTTAATT-CAA-TACTTT-ATCCAA-A-TCCACATCAAAATGAA
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  CATTAA-ATCG-TAAATCAGCCTTGTATTTTCCCCAACACATGTACATGTATATCTGTTGGA-AATG-AAACCTA-----------G----AAT---ATT-TTTGTCTAGTGATATCTTTT
gi|3                          : ACCCTATGTGGTTTTATTATTCCATACA--AATAGGAATA---TATTT-TCTC-TATTTCCTT-GAAG----TAGTGGATCCCTGAA-GGATTTGG--ATTGACAA--TAAAAATATATGGTTTAAGTAAAGGTA-GAAGTAA--G-TTTAATA--A-GTAGTTTTATCCCAA-TGGGGGGT---TAAAAATCTTTTC-CTCCCATTG-TTTAATTAT-GATTTTAATCTTTGTTAAATTTTTGGTTCA-ATC---AATTTAATTGTGG-CATTT---TCCAAAT-TCCACATCAAAATGAATTCCCAA-AGGGTAAAAATCTGGTAGATCGCCTCTCTATTCTTAAGCCTGTAATTTGGAAGCATAGTGCTTCA-TTACTTTATATTTCTTGAACCTATGCCATATGATCTGAG-TTTTT--CATA--TAATATGAAGCCCAGACA-TTTCTTG-AAACTTTTCCAAT---TTAAAGTGTTC--CACAGAGAGATTTC-TTCACCTGGGCCCAATCAAGAAATAAGTGAGTAA--T--CATCAGCCAATTGTGAGATTTTTTTTTCAATATTTATTAACACTA-AAT-TG-CTTGGATT-TTCTTGTTCATTTCTAA-TATGGATTGCC--AATATTTCCCGGCACAACATTAAAAATATATACGGTGATATAGGGT----------CACCCTGTC-TGCACCCTCTTTGACGTAGT--GAAT-T---CTATCAACGAGATACATTGCCAACCCGTTGGTTTACTACACAG-ATGT-ATG-TATG-ATTCAAAA--TTG-AAATCCAATTCCCTTATCGGGGAACGC-AAAATTGAAAA--ATTCAGTGTTC-TTTGTAT-AAATGACCATGAAAGTGTATCAAATTGC-TTTTTCGAAGTCAATAAAGTTAGC-AATAATCCAGGTAACTTCTTTCT-TTCTTCAGGTTGGGGTCG-TGCATTAATCTCG-T-AATCCG-CTTGTATTTTCACAA-------------TATATCTGTTAGATAATGAAAACCTGTTTGGTC-TCCG----AGTTAAATA-TTTGCATG---ATAGTTTTTTATTCTTCCTCCGGGCCAAATAACAA-CTGATGCAATTTTATATCCAGGTATTAATAGGAGTAA-TTGGTCT-CCAGTCTATTGTCAGGATAAAGTCGTGT------GGCTTGT-CAACCTTTTT-GGT--ATAAA--GTTATG-ATACC-ATATCTGTGA-GTT-AACAGA-AAGACT-GTTATTTTTCATAACAATAA--TTAA-AG--ATTCT--AACTACAAAAAGCCCAATACTGTTTC
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TTCTT-GTATAG-GTTTTAGTAAAAT--TTGTCGGTTTCATTCAAAATTTGTGATTGATCATAACTTAT-CTCCCCATCAT
gi|7                          :               caTTATTCCCTACACAAGACGGAT-A---TATTTATCTCCTAATTCCTTTGAGGCTGGTAGTG-ATC--TGAAAG-ATTTGGGGATTGA-AT--AAAAAATATGTG--TTAG-TAAAG--A-GTAGTA-T-GTTTTACTAACATGTAATTT--TTCCAA-T--GGGGTGGTTAAAAATCTTTTTTCTCCCATTG-TATAAT-ATAGATTTAAT-CTTTGTTA---TTTTGGATCA-AT------TCTAATTGTGGGCATTTTTATCCAATCATCCA-ATCAAA-TGAATTCCC--CAGAGT--AAAT-TGGTAG--TACC---C-A--CCAAAGCCTGT---TTGGAAGCATAGT--TTCA-TTAC-T-ATATTCTTGGAGCCTA-GCCATATGACATGAGTTTTTTTTCAATATTGATATGAAGCCCAGACA-TTTC-TG-AAAATTTTCCAATGTCTTAAAGT-TTC--C-ACAAGAGA-TTC-TT-ACCT--ACC--ATCAAG-AATAAGTG-----------ATCAGTGAG------ATTTTTTTTTTCAATA-TTATTAACACctaactctagtcttgggataatcttagacgtgaaattcctggattctaatttacaaaaataatttgatgtttttccccctccatccatctcgctctactccttatatagtttccttgtagtttatgttttatgcatttttatctaattcttgtttttgtgttatatagttcttcaacattgttttctgtaacattttcctcatcactttttatttttttaattgtatttcttcctgttcttttttgttgttgatatatgatgaaaaggaaatgatttacttctagtttctaataacaaagtttctaggaataactggtcattattttcgtctgaaaatgtgtgtaaattgttcatgttgtaaacagaaacagcaaatacatgtagttttttaacatgtaaaatgatatctctaatactttccaaatattcatcatcacaaagcaaggaattattaaatttccataatcgtcgacctctcttgaagttgttaaagacaaagatattgcagaattatctgctctataactggattctatagaacaagaatgtaaactaggtacagtaagagccactctaaatctctaaatctaatctactttgcttaagagatttttttctccatgtatatcttcgaaaatattcatgtaactgtctaaaggagtcaacatttgtttctatcaattctaaaattttgtttcttttatagcctttgcattgtttacacgtttataattataacaatccagatctgggttaagaaccaaattaaaatccccacaccatgtgacattactacactgcatattatcaatatgtgtttgaacattttcaaaaaaactggggattatcgttatttggcccatatacttcatgattctctaccattaatttgagtattaagtaatttccacttacatcccctatttctgaagaacgttgcaatcaaaattattattaataagaatagccactcctcttggatttgaagagtatgaactaaaataacattgataccccgttagatttctaacataattttccttatcacttgtaaaataagtgtcttgtaga
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tatatgttT------GGTTTGT-CT--CCTTTT-GGTA-AGGAT--GTAATT-ACACC-CTGTCTTTGT-G-T-GATGGATAACAT--GTTATTTTT-ATAGCCATGA--TTAATTG--A-CCT--TACAACAAAAGTTCCAATA-TATTTCCAGAATTTT-TTTTTAAAAAAAAACCTCGGTAGAAAAA-GTATCTGATCC-TGGAG-ATTTAT-TTGATTTCA---------------TATT--ACGCTTCACTTAA-AGTGA------TTTCTCCTTCTAA--ATTTT-CAGATTCA--CTCTTAGA---AGGTTTAGGGATATCAC---TATATGCTAGA--TTCTTA--TT-TAATTAAATCC--ATATCAGT-ATTTTG--TAAATCATTCTT----GTATAG-GTTTTAGTAAAAT--TTGTCGGTTTCATTCAAAATTTGTGATTGATCATAACTTAT-CTCCCCATCAT
13 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|5 ): TGCATTTATACAAATTTTCATAAAAGTTTTTTGTTTCAATAAAAATTTCTGACTTATCATATATTTTATCTCCATTACCCATTACCCAATTCCAGTTGAGGTATAATTTACTTGTAAAGTTTCTTGATTCAAGTTTACAAAAATAGTTTGATGGTTTTTCTCCTTCTTCTACCCATTTTGCTCTGCTTCAAATATAGTTTCCTTGTAGTCTATGCTTCTTAATTTTTCTAATTCTTGTTTTTTGTTGTATAGCTCATCTACATTACCTTCAGAAGCATTTTCCTCAATAGCTTTTATTTCTTTCATCAAATCTTGTTCCTCCTTATTTTTCTTCTTCTTGATATAAGAAGAGTAAGAGATGCTCTTATCTCTTATCTCAAAAAGTAAAGTTTCAAGGAACAACTGATCATTTATAGTGAAGAAAATATTTTCATCTGACACCATGTGTAAATTGTCCATGTTGTAAACAGGGACTGGCATACTGTTTTTAACCTTTAAAATTATATCTCTAATGCATTCTAAATTTATCATCATAAAGTAAGGAGTTATTGAATTTCCATAACCAATGTCCTTTCTTAAAATCATTGACGACAAGGATATTGCAGAGTGATCAGATCTGTAACTAGACTCGATTTAACAAGTATCTAAACTAAATAACAAAGATTCAGAAAGTAAAAAGAAATCCAATCGACCTTGTTTCAGTGGATACTTTTTCCTCCAAGAATATCTAAGAAGCTTTCCATGCAGTTGTCTAAAGGGGTCTATATA
Unaligned ( gi|6 ): ATACTGTTTCCTTGGGAATTATTTATACATTTTGTAGTTTATCAATAATCTAGGTCTGGGCTTTAGAACCAAGTTAAAATCACCACACTCAGAAAATCATTGCGATGCATTATCATCAATTATGATATGTTGCTATATTTTGTTTCGAAAGAAAATACAATGGTGTGTCAATTGTTAGCTCCATAGAATAGTGCATTATATACTGACTTCATGAACCTTCTATATAATGCTTTCAGGTAATAAATAATTCCAATCAGGCACGCTTTTTTCCCATAATAACCGCTTAAAAATCAAAATTATTGTTAATTAAGAAATTGCACAACTCCCCTTGAATTAGTAGCATATGAGCTAAAGAAGCACTGGTATCCCCATGAGTTTCTTACCTCATTTTCCCTGTCGTGTGAAAAATGGGTATCTTGCAAACTATAAATATTATGCTCTAAGACTCTTAAGTAGTTAAATACGTCCTTGCGTTTCACAATATCACCTAGACCTTGACAGTTTACCGAAATGATCTTAACCAT
Unaligned ( gi|8 ): GGAAACATTGGTTGATGGTGCAAATATTGGTATGCAGGAATTGGGCATACGGTTTCTTCTACTTCTACAGATTAGTTTTTTAATACTCTAGAATATTTTTCATTCATAGGTTACTTCCATAGACCTCTACAACACCATTTTAAGTTATTTAAATCTATTGACAATGATACTAATTTGATTGGTCTGATCTATAACTAGTTCTATGCTACAGCATTTTCAACCCAACAAAAAGATTTCAAGATATTAAACAAGAAATCTAAACCTACTGTTGTTTCAAGAAGTTTTTTTTTTTTCTCCACGAGTATTCTTATCGGGTATTTTTGTGTAGACTGTTAAAAGGGATATATAGCAATTATTTTCCATAATTTCTAATGGACTTGATTGTTCTTGCTTTGGATTTGATTTTATATACATTTGTGAGTTATAAGTAATCTGAAGTCTG
Unaligned ( gi|12 ): GTCTGATCTATAACTAGGTTCTATGTACACATTTTCAAACCAGACAAAAGAGTTTCAGATATTAAAAAGAAATCTAACCTACTTTGTTTCAAAGGAGTTTTTTTTTTTTTTAACGATTATCTATGGTTATTTTTGTTTAACTGTTTAAACGGGTTTATATAGCCATTATTTTCCATAAATTTTAATACTATTCTTCTTGCCTTGGAATTCTTTATACATTTGTAGTTATAATAATCTAAGTCTG
Unaligned ( gi|13 ): TTCAAAATTATTATTTAAAAAAATGGATACACCTCTTGCATTTATTGTATAGGAATTGAAAAAAACATTTATAGCCCGCACATGGTTTCAATGTATTATGGTTCTAATTCAAGAGTGAAGTGGGTGTCTTGAAAAACATATTATAGAGTAACCTTTTGCTCTGTAAAAATTTAACACATTCTTGGCGTTTTTGAACAATGTAGATAAACCCTGGCAGTTTACTGTAGCCAATTTTTA
Unaligned ( gi|15 ): CTTTAAAATCAAAATTGTTATTAAACGGTATTGCACCCCACCCCCTTGAAATTAAAATGGAATTGGTATCCCCACATTATTAGAAAAGACAATAAATATTAAAATACAGATTTTTTAAGCAATTAAAAAACATGCATCTTTTCGTTTTGCGATATCACCTAGGCTTTAACAATTTACAGGCAATACTTTAATTCCCAT
Unaligned ( gi|16 ): ATTTCTATACAGATTTTCATAAAACTGTTTCATTTCTTCCAGAATATCTGATTGGTTATGGGTCTCTATTCTTTTAATGACCTCATTCAAAATATTTCTTGATTCGAGATGACAGAAATATGTTGTGGATTTCTCCCCTTCTTCAATCCATTTGGCTCT
Unaligned ( gi|17 ): TTGGGTATATATTTATTTGTATAATGGTCTGGTTTCCATATTCAAGATAAGAAGTACTTAGGTTGGTTTCTCCCCTTCATCTGTCCACTTTGCTCTGGACCTTACTATAATTACCATTAATTTGTGATTTCGAAATTTTTCTAATTCCTTCTTTCT
Unaligned ( gi|19 ): TTCTATCAATTCTAAAATGTTGTTTCTAGCCTTTGCATTGTTTATATGTTTAAAATTTCTGGATCCAAATTTAAAATATGACATTCAAACTACACTGCATTTTGAACATTTTTTAGGGATTA
Unaligned ( gi|21 ): TACTTCATATCTTTACTATTAATTTTCAGGAATAAGTTATCTCCACTCTACTTCCCCTTATTTCTGAAAACAACTTGCCATTCAAATGATTATTAATAAGATGCCTTTCCTTTGTA
Unaligned ( gi|22 ): AAAAATGGTGTGTTGAAGACAATAAATATTACATGTATAATTAAAATTTTTTAAGCAATTTAAAACATAATTTTATTTTGCAATATTCTAGGCCTTTGACAATTTACTAAA
Unaligned ( gi|23 ): ATTTAAATGGATGAGTATATGAACTAGGAATATTTAACATTCATTTGACACCATTGCAAAGATTTCTAACATAATTTTCTATGATCAGTTGTAAGATTGTGTGTCTTTAGA
Unaligned ( gi|28 ): AATTTCTGGATTCCAAAGCACAAAAGTATTTTGATGGTTTTCCGCCTTCTTCCACCCATTTGGCTCTAC






Alignments
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Reference ( family-157 )      : ACCCTATGTGGTTTTATTATTCCATACACAAANAGGAA-A---TATTT-TCTC-TAATTCCTT-GAGG----TAGTG-ATC--TGAAAGGATTTGGG-ATTGA-AA--TAAAAATATGTGGTTTAGGTAAAGGTA-GAAGTAAT-GTTTTAATAACA-GTAATTT--TTCCAA-T--GGGGT---TAAAAATCTTTT--CTCCCATTG-TTTAATTATAGATTTNATTCTTTGTTAA--TTTTGGNTCA-ATA---AATTTAATTGTGG-CATTTT-ATCCAATC-TCCACATCAAAATGAATTCCCAACAGAGT--AAATCTGGTAG--TACC---CCA--CCTAAGCCTGTAATTTGGAAGCATAGT--TTCA-TTAC-TTATATTTCTGGAACCTA-GCCATATGACATGAGTTTTTT--CATAATTAATATGAAGCCCAGACA-TTTC-TG-AAANTTTTCCAATGTCTTAAAGTGTTC--C-CAAAGAGA-TTC-TTCACCT--GCC--ATCAAG-AATAAGTGAG--G--T--CATCAGCNAGTTGT-AGNTTTTTTTTTCAATA-TTATTAACACTA-AGT-TGCCTTTGATTATTCTTATTCNTTCCTAACTATGAATCGCC--AATATTTCC--GCACAA-ATTAAAAATATA-A-GGTGATA-AAGGN----------CACCCTGTC-TGCAACCTCTCTGA-AT-GT--G-AT-T---TTA-----GAGATA-ATTGCC-ACC--TTGGTTTACTAC-C-G-ATGTAATG-T-TGTATTAAAAA--TTG-AAATCC-ATTCCCTAATCGAGGNAC-C-AAAATTGAAAAC-ATTCAGTGCTCTTTTGTAT-AAACGA-CATGANAGTGTATCAAA-TGC-TTTTTCGAAGTCAATAAA--TAGCGAATAATCCAGGTA----TTTTNT-TTCTTCA-GT----GTCG-TGCATTAA-ATCG-TAAATCAGCCTTGTATTTTCACCA-------------TATATCTGTTGGA-AATG-AAACCTGTTTGATC-T--G----AAT---ATA-TTTGTCTA---ATATTTTTTTATTCTNCCTCCGGGCCAAATNACAACCTGATGCAATTTTATACNCAGGTATTNANAGGGGTAATTTGGTCTCCCAGTCT-TT-TCAGGATAA--TCGCGT------GGCTTGT-CA--CCTTTT-GGTA-ATAAA--GTAATN-ACACC-ATGTCTTTGT-G-T-GATGGATAAGACTCGTTATTTTT-ATAACCATGA--TTAATAG--A-CCT--NACTACAAAAATCCCAATA-TGTTTCCAGAA---N-ATTTTAAAAAAA---TTCGGCAGAAAAACGTATCAGANCCTTGGGG-ATTTAT-TTGATTTCATTTTT-A------AGTATT-GACGCTTCACTTAA-AGTAAATGTG-TTTCNCCTTCTAA--ATTTT-C-GATTCT--ATTTTAGA---AAGTTTNGGGATATCAC---CATATGCTAGA--TTC-TA--TT-TGACTAAAT-C--A-ATCAGT-ATTGTG--TAAATCGTTTTTTTG-GTACAA-CTGTTCGTAGAATGATTGTCGGTTTCNTTCAATATTTGTGATTGNTCATAACTTAC-CGTACCATCATT
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gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tCTCCCAGTCT-TT--AAGAACTA--TTGCATTTTACCGGTTTGT-CA--CCTCTTAGGTACATTAATCGTAATTCACACC-ATGTCTTTGTTG-TCGATGGATAAAACTCATTAATTTT-GTAACCATGCGTTTAATGGCAA-CCTCCTACCCCATACACACCAATA-TATTTCCAGAA---G-ACTT--AAAAAA---TTCTGCAGAAAAAC--ATCAGAGCCTTacactctaatctcgaacgttatatttttgtggtgaaatttctagatagcaataagactaagaaacttacaagaaatataatatcttgtaagtttttttagtctaattgcttttatcaaaaacctaaacttatttaaaatttacataatgctttttttttttttttttttttttttttttcttatt
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 cCCGATG-TCTTTCCAAAA---ACATTTTAAAAA-----TTCA-CATGTGAATCTACCAGGACCT-GGGG-TTTTAT--------CATTTTTCA------AGTA-------CCTC------------------TTTCTCCTTCTAT--ACTTTGT-GATTC---A--TCAGAAGTAAGTTTAGGAATATCAT---CATAT-CTAGA--TT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            aaaagaaTTTTTG-GTACAAGCTGTTCATAGAATGATT-TTG--TTCTT--AATATTT-TGATTGTTCATAA-TTAC-TGTACCA
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tgTT-GATGATTCA-------GTAAATGTGATTTCACCCTCTAA--AGATT-C-GACTCT--ATTTTAGA---AAGTTTTGGGATACTACATGTACATGATA-A--TTC--A--TTCT--CTAAAT-CAAA-ATCAGC-ATTGTT--TAAATctccatgcactccaatctcggtataattttgattgtgtgaaatttcctagacaattctaacgtatacaaaatgtgttgtggttttctccttctatcaaatcatccttagctctgcatcttacatacataccagtgtagcttatttttttctatattttctaactcttgcttttatattacacagttcaatcaaatcattagcctgtccgcaaacattattttctacctaattaacctattttgcttttagttctctttcttctttttctttctttttattactataattatgttcgataagagattagttttacctcttatttcaaaaagtaatgtttgccaaaaaagttgcacattaactagagaaagagatgtctgcgatcagaaatattgttattgtttgttcaaattgtacacaggggagtacatactgtttctttacttctaaaatagttattttttacattctaaatatttcatcatagaagtaaagagttcatttaaattccatagacctttaccttttttaaagttgttaaaatctatgggtgaaatgatactattgagtgcgtctatcattaactagtttttggttctattagtacacgttttcaaaccgacaaaagagcttcagaattaaaaaaatctaagccgacttgtttcaatggtgtttttctctcatgagatatctcgtgtattttcatgtagctgtctgaaagggtctattatagcaatatttccattaatttataaaacgattcttgctgtttgggttatttattacatttgtagttataataactctaagtctgggtttaaaaccaagtttaaaatcaccacacccaaaacaatatcattgcatgcatatttcattcttatgatttgtatatttcaaaaatatggtggggtcttgttagtccataggatatgcatatttacttaccttcattgaccttcttatacatgctaaataaatcaagtaattcccatcatgtcacccttttccataataggcttaacaatcaaaattattattaataagattgcaaccctgaattagtagcatactgagctgaagaagcactggtccctaaaattttctctacctcgtttcccatatatgtgaaaaggcgagtttaatcttgcaacaatagatgatttattctaaggcccaagtagtgaaatacatccttgcgtttc
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                atATATA-A-GGTGATA-AAGGCATTAAAGTGTCATCCTGTC-TGCAACCTCTCTGA-AT-----------------------AG------TGCC-ACC--TTGATTTATCAC-T-G-ATGTAATG-TCTGTATTAAAGA--TTG-AAATC
gi|25                         :                                                                                                                                      at-GAAGTAAT-GTCTTAATAACT-GTTATCT--TTCCAATT--GGAGT---TAAATGTCTTTT--CCTCCATTGATTTAG-GGTAGATTTAATT-TTTACTAA--CTTTGGATC--AT----AATCTAAT
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                TCTTTA--CTCCCATTG-TTTAATTGTAGATTTGA-TCTTTGTCAA--TTTTGGTTCACACATGTAATTTAATT-CAA-TACTTT-ATCCAA-A-TCCACATCAAAATGAA
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  CATTAA-ATCG-TAAATCAGCCTTGTATTTTCCCCAACACATGTACATGTATATCTGTTGGA-AATG-AAACCTA-----------G----AAT---ATT-TTTGTCTAGTGATATCTTTT
gi|3                          : ACCCTATGTGGTTTTATTATTCCATACA--AATAGGAATA---TATTT-TCTC-TATTTCCTT-GAAG----TAGTGGATCCCTGAA-GGATTTGG--ATTGACAA--TAAAAATATATGGTTTAAGTAAAGGTA-GAAGTAA--G-TTTAATA--A-GTAGTTTTATCCCAA-TGGGGGGT---TAAAAATCTTTTC-CTCCCATTG-TTTAATTAT-GATTTTAATCTTTGTTAAATTTTTGGTTCA-ATC---AATTTAATTGTGG-CATTT---TCCAAAT-TCCACATCAAAATGAATTCCCAA-AGGGTAAAAATCTGGTAGATCGCCTCTCTATTCTTAAGCCTGTAATTTGGAAGCATAGTGCTTCA-TTACTTTATATTTCTTGAACCTATGCCATATGATCTGAG-TTTTT--CATA--TAATATGAAGCCCAGACA-TTTCTTG-AAACTTTTCCAAT---TTAAAGTGTTC--CACAGAGAGATTTC-TTCACCTGGGCCCAATCAAGAAATAAGTGAGTAA--T--CATCAGCCAATTGTGAGATTTTTTTTTCAATATTTATTAACACTA-AAT-TG-CTTGGATT-TTCTTGTTCATTTCTAA-TATGGATTGCC--AATATTTCCCGGCACAACATTAAAAATATATACGGTGATATAGGGT----------CACCCTGTC-TGCACCCTCTTTGACGTAGT--GAAT-T---CTATCAACGAGATACATTGCCAACCCGTTGGTTTACTACACAG-ATGT-ATG-TATG-ATTCAAAA--TTG-AAATCCAATTCCCTTATCGGGGAACGC-AAAATTGAAAA--ATTCAGTGTTC-TTTGTAT-AAATGACCATGAAAGTGTATCAAATTGC-TTTTTCGAAGTCAATAAAGTTAGC-AATAATCCAGGTAACTTCTTTCT-TTCTTCAGGTTGGGGTCG-TGCATTAATCTCG-T-AATCCG-CTTGTATTTTCACAA-------------TATATCTGTTAGATAATGAAAACCTGTTTGGTC-TCCG----AGTTAAATA-TTTGCATG---ATAGTTTTTTATTCTTCCTCCGGGCCAAATAACAA-CTGATGCAATTTTATATCCAGGTATTAATAGGAGTAA-TTGGTCT-CCAGTCTATTGTCAGGATAAAGTCGTGT------GGCTTGT-CAACCTTTTT-GGT--ATAAA--GTTATG-ATACC-ATATCTGTGA-GTT-AACAGA-AAGACT-GTTATTTTTCATAACAATAA--TTAA-AG--ATTCT--AACTACAAAAAGCCCAATACTGTTTC
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TTCTT-GTATAG-GTTTTAGTAAAAT--TTGTCGGTTTCATTCAAAATTTGTGATTGATCATAACTTAT-CTCCCCATCAT
gi|7                          :               caTTATTCCCTACACAAGACGGAT-A---TATTTATCTCCTAATTCCTTTGAGGCTGGTAGTG-ATC--TGAAAG-ATTTGGGGATTGA-AT--AAAAAATATGTG--TTAG-TAAAG--A-GTAGTA-T-GTTTTACTAACATGTAATTT--TTCCAA-T--GGGGTGGTTAAAAATCTTTTTTCTCCCATTG-TATAAT-ATAGATTTAAT-CTTTGTTA---TTTTGGATCA-AT------TCTAATTGTGGGCATTTTTATCCAATCATCCA-ATCAAA-TGAATTCCC--CAGAGT--AAAT-TGGTAG--TACC---C-A--CCAAAGCCTGT---TTGGAAGCATAGT--TTCA-TTAC-T-ATATTCTTGGAGCCTA-GCCATATGACATGAGTTTTTTTTCAATATTGATATGAAGCCCAGACA-TTTC-TG-AAAATTTTCCAATGTCTTAAAGT-TTC--C-ACAAGAGA-TTC-TT-ACCT--ACC--ATCAAG-AATAAGTG-----------ATCAGTGAG------ATTTTTTTTTTCAATA-TTATTAACACctaactctagtcttgggataatcttagacgtgaaattcctggattctaatttacaaaaataatttgatgtttttccccctccatccatctcgctctactccttatatagtttccttgtagtttatgttttatgcatttttatctaattcttgtttttgtgttatatagttcttcaacattgttttctgtaacattttcctcatcactttttatttttttaattgtatttcttcctgttcttttttgttgttgatatatgatgaaaaggaaatgatttacttctagtttctaataacaaagtttctaggaataactggtcattattttcgtctgaaaatgtgtgtaaattgttcatgttgtaaacagaaacagcaaatacatgtagttttttaacatgtaaaatgatatctctaatactttccaaatattcatcatcacaaagcaaggaattattaaatttccataatcgtcgacctctcttgaagttgttaaagacaaagatattgcagaattatctgctctataactggattctatagaacaagaatgtaaactaggtacagtaagagccactctaaatctctaaatctaatctactttgcttaagagatttttttctccatgtatatcttcgaaaatattcatgtaactgtctaaaggagtcaacatttgtttctatcaattctaaaattttgtttcttttatagcctttgcattgtttacacgtttataattataacaatccagatctgggttaagaaccaaattaaaatccccacaccatgtgacattactacactgcatattatcaatatgtgtttgaacattttcaaaaaaactggggattatcgttatttggcccatatacttcatgattctctaccattaatttgagtattaagtaatttccacttacatcccctatttctgaagaacgttgcaatcaaaattattattaataagaatagccactcctcttggatttgaagagtatgaactaaaataacattgataccccgttagatttctaacataattttccttatcacttgtaaaataagtgtcttgtaga
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tatatgttT------GGTTTGT-CT--CCTTTT-GGTA-AGGAT--GTAATT-ACACC-CTGTCTTTGT-G-T-GATGGATAACAT--GTTATTTTT-ATAGCCATGA--TTAATTG--A-CCT--TACAACAAAAGTTCCAATA-TATTTCCAGAATTTT-TTTTTAAAAAAAAACCTCGGTAGAAAAA-GTATCTGATCC-TGGAG-ATTTAT-TTGATTTCA---------------TATT--ACGCTTCACTTAA-AGTGA------TTTCTCCTTCTAA--ATTTT-CAGATTCA--CTCTTAGA---AGGTTTAGGGATATCAC---TATATGCTAGA--TTCTTA--TT-TAATTAAATCC--ATATCAGT-ATTTTG--TAAATCATTCTT----GTATAG-GTTTTAGTAAAAT--TTGTCGGTTTCATTCAAAATTTGTGATTGATCATAACTTAT-CTCCCCATCAT


blockSeqs                     :          GG               C C   T     TA        A    C         T    CTGG     G   CC    A G      GG     CAA           A  G     G     G  .      AT  T       A  T       TA      TGG      GGT    T       TT         A     TT        A TT        AAT      A  ACACATGT         GTGGG     TT      TCA    C      A         AA      AA    C      AT    TCTCTATT           A               GC    .    TTT      C         T               T     TT    A                   .    T  .   C         G        TG   CA          T   .  C C  GG   CA      A        AGGTGT      T    A  T  TG  C              T    T A     TAGTA  C      T A         T  C    C           AG    TTTCCCG  ACAAC            TAC       T    CATTAAAGTGT      G  .  C           C  AGTGAATTCTATCAACGAGATAC            A   CG            ACA .    T   CT   T        GG  G       A  TT      A    T  GC            CA        CTT        A      C     T           T   .                  GTTAGCA             ACTT    A G       G  TGGG   A         T    . A      C      T        ACACATGTACATGT  A   G     T    A       T      TCCGAGTTAAA       T        GTG               T  TCCG   CA   A    .                 C  G     A T        .       C     C A  GT  G     TTGCATTTTACC         .  AC      A   AC  T  TC     TC     .     T    T TC       T     TC         C          GT    TG CAACCTCCT   C       CA      C A         TTTTTT   T     AAAAC   TG        TCTA     G  TT    .      T         TATTACGCTTCACTTAAAGTGAT                           T        .      GT      TATT       AGT      A          ATG   A GA  G .    TTATTTAATTAAATCCAT           .      .             T  .      T             GT  GTCGGT   T     T    G      C      C    .
blockSeqs                     :                           C .   A     A         .    .         .    .        .   .     . .      .      AT            G  .     .     .  .      A   T       A  .       .       TT       .      A       C          .     TT        G AT        A        T  AATC             GTGG      T       AT     C      A         C       .     .      .     CA                 .               .     .    T        T         .               .     .     .                   .    .  .   A         .        T    C           .   .  . C  .    .       .        AGTAAT      T    C  T  .   A              .    T A     AAT    .      . .         A  T    T           .     .        .                A         .    G                G  .  C           .  ATCAAATACTTAAGATAG                 .   .             C   .    A   TC   T        .   G       .  TC      C    A  C             .         TTC        .      .     A           .   .                  AGG                 .       C .       .  .      G         .    . A      C      T        T               A   G     .    .       T      TGGGTCAAT         .        .                                                                                   .     C .  .   G     AGTCGTGT             .  .       .   A   A  .      G      .     T    . TT       T     T          .          .     TT ATTCTA      T       GC      . C         ACAT     T     AA      GG        GTA      A  T     .      .         TTTTTCAAGTACCTCT                                  A        .      CA      ACTC       .        T          .     A GC  G .    ATTCTCTAAATCAAA              .      .             T  .      G             GA  GTCGGT   A     T    G      T      C    .
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13 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-157 )      : ACCCTATGTGGTTTTATTATTCCATACACAAANAGGAA-A---TATTT-TCTC-TAATTCCTT-GAGG----TAGTG-ATC--TGAAAGGATTTGGG-ATTGA-AA--TAAAAATATGTGGTTTAGGTAAAGGTA-GAAGTAAT-GTTTTAATAACA-GTAATTT--TTCCAAT--GGGGT---TAAAAATCTTTT--CTCCCATTG-TTTAATTATAGATTTNAT-CTTTGTTAA--TTTTGGNTCA-----GT--AATTTAATTGTGG-CATTTT-ATCCAATC-TCCACATCAAAATGAATTCCCAACAGAGT--AAATCTGGTAG--TACC---CCA--CCTAAGCCTGTAATTTGGAAGCATAGT--TTCA-TTAC-TTATATTTCTGGAACCTA-GCCATATGACATGAGTTTTTT--CATAATTAATATGAAGCCCAGACA-TTTC-TG-AAANTTTTCCAATGTCTTAAAGTGTTC--C-CAAAGAGA-TTC-TTCACCT--GCC--ATCAAG-AATAAGTGAG--G--T--CATCAGCNAGTTGT-AGNTTTTTTTTTCAATA-TTATTAACACTA-AGT-TGCCTTTGATTATTCTTATTCNTTCCTAACTATGAATCGCC--AATATTTCC--GCACAA-ATTAAAAATATA-A-GGTGATA-AAGGN----------CACCCTGTC-TGCAACCTCTCTGA-AT-GT--G-AT-T---TTA-----GAGATA-ATTGCC-ACC--TTGGTTTACTAC-C-G-ATGTAATG-T-TGTATTAAAAA--TTG-AAATCC-ATTCCCTAATCGAGGNAC-C-AAAATTGAAAAC-ATTCAGTGCTCTTTTGTAT-AAACGA-CATGANAGTGTATCAAA-TGC-TTTTTCGAAGTCAATAAA--TAGCGAATAATCCAGGTA----TTTTNT-TTCTTCA-GT----GTCG-TGCATTAA-ATCG-TAAATCAGCCTTGTATTTTCACCA-------------TATATCTGTTGGA-AATG-AAACCTGTTTGATC-T--G----AAT---ATA-TTTGTCTA---ATATTTTTTTATTCTNCCTCCGGGCCAAATNACAACCTGATGCAATTTTATACNCAGGTATTNANAGGGGTAATTTGGTCTCCCAGTCT-TT-TCAGGATAA--TCGCGT------GGCTTGT-CA--CCTTTT-GGTA-ATAAA--GTAATN-ACACC-ATGTCTTTGT-G-T-GATGGATAAGACTCGTTATTTTT-ATAACCATGA--TTAATAG--A-CCT--NACTACAAAAATCCCAATA-TGTTTCCAGAAN-ATTTT-----AAAAAAAT-TCGGCAGAAAAACGTATCAGANCCTTGGGG-ATTTAT-TTGATTTCATTTTT-A------AGTATT-GACGCTTCACTTAA-AGTAAATGTG-TTTCNCCTTCTAA--ATTTT-C-GATTCT--ATTTTAGA---AAGTTTNGGGATATCAC---CATATGCTAGA--TTC-TA--TT-TGACTAAAT-C--A-ATCAGT-ATTGTG--TAAATCGTTTTTTTG-GTACAA-CTGTTCGTAGAATG-TTTCGGTTTCNTTCAATATTTGTGATTGNTCATAACTTAC-CGTACCATCATT
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gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tCTCCCAGTCT-TT--AAGAACTA--TTGCATTTTACCGGTTTGT-CA--CCTCTTAGGTACATTAATCGTAATTCACACC-ATGTCTTTGTTG-TCGATGGATAAAACTCATTAATTTT-GTAACCATGCGTTTAATGGCAA-CCTCCTACCCCATACACACCAATA-TATTTCCAGAAG-ACTT-------AAAAAAT-TCTGCAGAAAAAC--ATCAGAGCCTTacactctaatctcgaacgttatatttttgtggtgaaatttctagatagcaataagactaagaaacttacaagaaatataatatcttgtaagtttttttagtctaattgcttttatcaaaaacctaaacttatttaaaatttacataatgctttttttttttttttttttttttttttttcttatt
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  cCCGATG-TCTTTCCAAAAACATTTT-----AAAAA--T-TCA-CATGTGAATCTACCAGGACCT-GGGG-TTTTAT--------CATTTTTCA------AGTA-------CCTC------------------TTTCTCCTTCTAT--ACTTTGT-GATTC---A--TCAGAAGTAAGTTTAGGAATATCAT---CATAT-CTAGA--TT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             aaaagaaTTTTTG-GTACAAGCTGTTCATAGAATGATTTTG--TTCTT--AATATTT-TGATTGTTCATAA-TTAC-TGTACCA
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tgTT-GATGATTCA-------GTAAATGTGATTTCACCCTCTAA--AGATT-C-GACTCT--ATTTTAGA---AAGTTTTGGGATACTACATGTACATGATA-A--TTC--A--TTCT--CTAAAT-CAAA-ATCAGC-ATTGTT--TAAATctccatgcactccaatctcggtataattttgattgtgtgaaatttcctagacaattctaacgtatacaaaatgtgttgtggttttctccttctatcaaatcatccttagctctgcatcttacatacataccagtgtagcttatttttttctatattttctaactcttgcttttatattacacagttcaatcaaatcattagcctgtccgcaaacattattttctacctaattaacctattttgcttttagttctctttcttctttttctttctttttattactataattatgttcgataagagattagttttacctcttatttcaaaaagtaatgtttgccaaaaaagttgcacattaactagagaaagagatgtctgcgatcagaaatattgttattgtttgttcaaattgtacacaggggagtacatactgtttctttacttctaaaatagttattttttacattctaaatatttcatcatagaagtaaagagttcatttaaattccatagacctttaccttttttaaagttgttaaaatctatgggtgaaatgatactattgagtgcgtctatcattaactagtttttggttctattagtacacgttttcaaaccgacaaaagagcttcagaattaaaaaaatctaagccgacttgtttcaatggtgtttttctctcatgagatatctcgtgtattttcatgtagctgtctgaaagggtctattatagcaatatttccattaatttataaaacgattcttgctgtttgggttatttattacatttgtagttataataactctaagtctgggtttaaaaccaagtttaaaatcaccacacccaaaacaatatcattgcatgcatatttcattcttatgatttgtatatttcaaaaatatggtggggtcttgttagtccataggatatgcatatttacttaccttcattgaccttcttatacatgctaaataaatcaagtaattcccatcatgtcacccttttccataataggcttaacaatcaaaattattattaataagattgcaaccctgaattagtagcatactgagctgaagaagcactggtccctaaaattttctctacctcgtttcccatatatgtgaaaaggcgagtttaatcttgcaacaatagatgatttattctaaggcccaagtagtgaaatacatccttgcgtttc
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 atATATA-A-GGTGATA-AAGGCATTAAAGTGTCATCCTGTC-TGCAACCTCTCTGA-AT-----------------------AG------TGCC-ACC--TTGATTTATCAC-T-G-ATGTAATG-TCTGTATTAAAGA--TTG-AAATC
gi|25                         :                                                                                                                                      at-GAAGTAAT-GTCTTAATAACT-GTTATCT--TTCCAATT-GGAGT---TAAATGTCTTTT--CCTCCATTGATTTAG-GGTAGATTTAAT-TTTTACTAA--CTTTGGATCA------T--AATCTAAT
gi|26                         :                                                                                                                                                                                               TCTTTA--CTCCCATTG-TTTAATTGTAGATTTGAT-CTTTGTCAA--TTTTGGTTCACACATGT--AATTTAATT-CAA-TACTTT-ATCCAA-A-TCCACATCAAAATGAA
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   CATTAA-ATCG-TAAATCAGCCTTGTATTTTCCCCAACACATGTACATGTATATCTGTTGGA-AATG-AAACCTA-----------G----AAT---ATT-TTTGTCTAGTGATATCTTTT
gi|3                          : ACCCTATGTGGTTTTATTATTCCATACA--AATAGGAATA---TATTT-TCTC-TATTTCCTT-GAAG----TAGTGGATCCCTGAA-GGATTTGG--ATTGACAA--TAAAAATATATGGTTTAAGTAAAGGTA-GAAGTAA--G-TTTAATA--A-GTAGTTTTATCCCAATGGGGGGT---TAAAAATCTTTTC-CTCCCATTG-TTTAATTATGATTTTAAT-CTTTGTTAAATTTTTGGTTCA-----ATC-AATTTAATTGTGG-CATTT---TCCAAAT-TCCACATCAAAATGAATTCCCAA-AGGGTAAAAATCTGGTAGATCGCCTCTCTATTCTTAAGCCTGTAATTTGGAAGCATAGTGCTTCA-TTACTTTATATTTCTTGAACCTATGCCATATGATCTGAG-TTTTT--CATA--TAATATGAAGCCCAGACA-TTTCTTG-AAACTTTTCCAAT---TTAAAGTGTTC--CACAGAGAGATTTC-TTCACCTGGGCCCAATCAAGAAATAAGTGAGTAA--T--CATCAGCCAATTGTGAGATTTTTTTTTCAATATTTATTAACACTA-AAT-TG-CTTGGATT-TTCTTGTTCATTTCTAA-TATGGATTGCC--AATATTTCCCGGCACAACATTAAAAATATATACGGTGATATAGGGT----------CACCCTGTC-TGCACCCTCTTTGACGTAGT--GAAT-T---CTATCAACGAGATACATTGCCAACCCGTTGGTTTACTACACAG-ATGT-ATG-TATG-ATTCAAAA--TTG-AAATCCAATTCCCTTATCGGGGAACGC-AAAATTGAAAA--ATTCAGTGTTC-TTTGTAT-AAATGACCATGAAAGTGTATCAAATTGC-TTTTTCGAAGTCAATAAAGTTAGC-AATAATCCAGGTAACTTCTTTCT-TTCTTCAGGTTGGGGTCG-TGCATTAATCTCG-T-AATCCG-CTTGTATTTTCACAA-------------TATATCTGTTAGATAATGAAAACCTGTTTGGTC-TCCG----AGTTAAATA-TTTGCATG---ATAGTTTTTTATTCTTCCTCCGGGCCAAATAACAA-CTGATGCAATTTTATATCCAGGTATTAATAGGAGTAA-TTGGTCT-CCAGTCTATTGTCAGGATAAAGTCGTGT------GGCTTGT-CAACCTTTTT-GGT--ATAAA--GTTATG-ATACC-ATATCTGTGA-GTT-AACAGA-AAGACT-GTTATTTTTCATAACAATAA--TTAA-AG--ATTCT--AACTACAAAAAGCCCAATACTGTTTC
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TTCTT-GTATAG-GTTTTAGTAAAATT-TGTCGGTTTCATTCAAAATTTGTGATTGATCATAACTTAT-CTCCCCATCAT
gi|7                          :               caTTATTCCCTACACAAGACGGAT-A---TATTTATCTCCTAATTCCTTTGAGGCTGGTAGTG-ATC--TGAAAG-ATTTGGGGATTGA-AT--AAAAAATATGTG--TTAG-TAAAG--A-GTAGTA-T-GTTTTACTAACATGTAATTT--TTCCAAT--GGGGTGGTTAAAAATCTTTTTTCTCCCATTG-TATAAT-ATAGATTTAAT-CTTTGTTA---TTTTGGATCA-----AT----TCTAATTGTGGGCATTTTTATCCAATCATCCA-ATCAAA-TGAATTCCC--CAGAGT--AAAT-TGGTAG--TACC---C-A--CCAAAGCCTGT---TTGGAAGCATAGT--TTCA-TTAC-T-ATATTCTTGGAGCCTA-GCCATATGACATGAGTTTTTTTTCAATATTGATATGAAGCCCAGACA-TTTC-TG-AAAATTTTCCAATGTCTTAAAGT-TTC--C-ACAAGAGA-TTC-TT-ACCT--ACC--ATCAAG-AATAAGTG-----------ATCAGTGAG------ATTTTTTTTTTCAATA-TTATTAACACctaactctagtcttgggataatcttagacgtgaaattcctggattctaatttacaaaaataatttgatgtttttccccctccatccatctcgctctactccttatatagtttccttgtagtttatgttttatgcatttttatctaattcttgtttttgtgttatatagttcttcaacattgttttctgtaacattttcctcatcactttttatttttttaattgtatttcttcctgttcttttttgttgttgatatatgatgaaaaggaaatgatttacttctagtttctaataacaaagtttctaggaataactggtcattattttcgtctgaaaatgtgtgtaaattgttcatgttgtaaacagaaacagcaaatacatgtagttttttaacatgtaaaatgatatctctaatactttccaaatattcatcatcacaaagcaaggaattattaaatttccataatcgtcgacctctcttgaagttgttaaagacaaagatattgcagaattatctgctctataactggattctatagaacaagaatgtaaactaggtacagtaagagccactctaaatctctaaatctaatctactttgcttaagagatttttttctccatgtatatcttcgaaaatattcatgtaactgtctaaaggagtcaacatttgtttctatcaattctaaaattttgtttcttttatagcctttgcattgtttacacgtttataattataacaatccagatctgggttaagaaccaaattaaaatccccacaccatgtgacattactacactgcatattatcaatatgtgtttgaacattttcaaaaaaactggggattatcgttatttggcccatatacttcatgattctctaccattaatttgagtattaagtaatttccacttacatcccctatttctgaagaacgttgcaatcaaaattattattaataagaatagccactcctcttggatttgaagagtatgaactaaaataacattgataccccgttagatttctaacataattttccttatcacttgtaaaataagtgtcttgtaga
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tatatgttT------GGTTTGT-CT--CCTTTT-GGTA-AGGAT--GTAATT-ACACC-CTGTCTTTGT-G-T-GATGGATAACAT--GTTATTTTT-ATAGCCATGA--TTAATTG--A-CCT--TACAACAAAAGTTCCAATA-TATTTCCAGAAT-TTTTTTTTAAAAAAAAACCTCGGTAGAAAAA-GTATCTGATCCT-GGAG-ATTTAT-TTGATTTCAT---------------ATT--ACGCTTCACTTAA-AGTGA------TTTCTCCTTCTAA--ATTTT-CAGATTCA--CTCTTAGA---AGGTTTAGGGATATCAC---TATATGCTAGA--TTCTTA--TT-TAATTAAATCC--ATATCAGT-ATTTTG--TAAATCATTCTT----GTATAG-GTTTTAGTAAAATT-TGTCGGTTTCATTCAAAATTTGTGATTGATCATAACTTAT-CTCCCCATCAT
13 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|5 ): TGCATTTATACAAATTTTCATAAAAGTTTTTTGTTTCAATAAAAATTTCTGACTTATCATATATTTTATCTCCATTACCCATTACCCAATTCCAGTTGAGGTATAATTTACTTGTAAAGTTTCTTGATTCAAGTTTACAAAAATAGTTTGATGGTTTTTCTCCTTCTTCTACCCATTTTGCTCTGCTTCAAATATAGTTTCCTTGTAGTCTATGCTTCTTAATTTTTCTAATTCTTGTTTTTTGTTGTATAGCTCATCTACATTACCTTCAGAAGCATTTTCCTCAATAGCTTTTATTTCTTTCATCAAATCTTGTTCCTCCTTATTTTTCTTCTTCTTGATATAAGAAGAGTAAGAGATGCTCTTATCTCTTATCTCAAAAAGTAAAGTTTCAAGGAACAACTGATCATTTATAGTGAAGAAAATATTTTCATCTGACACCATGTGTAAATTGTCCATGTTGTAAACAGGGACTGGCATACTGTTTTTAACCTTTAAAATTATATCTCTAATGCATTCTAAATTTATCATCATAAAGTAAGGAGTTATTGAATTTCCATAACCAATGTCCTTTCTTAAAATCATTGACGACAAGGATATTGCAGAGTGATCAGATCTGTAACTAGACTCGATTTAACAAGTATCTAAACTAAATAACAAAGATTCAGAAAGTAAAAAGAAATCCAATCGACCTTGTTTCAGTGGATACTTTTTCCTCCAAGAATATCTAAGAAGCTTTCCATGCAGTTGTCTAAAGGGGTCTATATA
Unaligned ( gi|6 ): ATACTGTTTCCTTGGGAATTATTTATACATTTTGTAGTTTATCAATAATCTAGGTCTGGGCTTTAGAACCAAGTTAAAATCACCACACTCAGAAAATCATTGCGATGCATTATCATCAATTATGATATGTTGCTATATTTTGTTTCGAAAGAAAATACAATGGTGTGTCAATTGTTAGCTCCATAGAATAGTGCATTATATACTGACTTCATGAACCTTCTATATAATGCTTTCAGGTAATAAATAATTCCAATCAGGCACGCTTTTTTCCCATAATAACCGCTTAAAAATCAAAATTATTGTTAATTAAGAAATTGCACAACTCCCCTTGAATTAGTAGCATATGAGCTAAAGAAGCACTGGTATCCCCATGAGTTTCTTACCTCATTTTCCCTGTCGTGTGAAAAATGGGTATCTTGCAAACTATAAATATTATGCTCTAAGACTCTTAAGTAGTTAAATACGTCCTTGCGTTTCACAATATCACCTAGACCTTGACAGTTTACCGAAATGATCTTAACCAT
Unaligned ( gi|8 ): GGAAACATTGGTTGATGGTGCAAATATTGGTATGCAGGAATTGGGCATACGGTTTCTTCTACTTCTACAGATTAGTTTTTTAATACTCTAGAATATTTTTCATTCATAGGTTACTTCCATAGACCTCTACAACACCATTTTAAGTTATTTAAATCTATTGACAATGATACTAATTTGATTGGTCTGATCTATAACTAGTTCTATGCTACAGCATTTTCAACCCAACAAAAAGATTTCAAGATATTAAACAAGAAATCTAAACCTACTGTTGTTTCAAGAAGTTTTTTTTTTTTCTCCACGAGTATTCTTATCGGGTATTTTTGTGTAGACTGTTAAAAGGGATATATAGCAATTATTTTCCATAATTTCTAATGGACTTGATTGTTCTTGCTTTGGATTTGATTTTATATACATTTGTGAGTTATAAGTAATCTGAAGTCTG
Unaligned ( gi|12 ): GTCTGATCTATAACTAGGTTCTATGTACACATTTTCAAACCAGACAAAAGAGTTTCAGATATTAAAAAGAAATCTAACCTACTTTGTTTCAAAGGAGTTTTTTTTTTTTTTAACGATTATCTATGGTTATTTTTGTTTAACTGTTTAAACGGGTTTATATAGCCATTATTTTCCATAAATTTTAATACTATTCTTCTTGCCTTGGAATTCTTTATACATTTGTAGTTATAATAATCTAAGTCTG
Unaligned ( gi|13 ): TTCAAAATTATTATTTAAAAAAATGGATACACCTCTTGCATTTATTGTATAGGAATTGAAAAAAACATTTATAGCCCGCACATGGTTTCAATGTATTATGGTTCTAATTCAAGAGTGAAGTGGGTGTCTTGAAAAACATATTATAGAGTAACCTTTTGCTCTGTAAAAATTTAACACATTCTTGGCGTTTTTGAACAATGTAGATAAACCCTGGCAGTTTACTGTAGCCAATTTTTA
Unaligned ( gi|15 ): CTTTAAAATCAAAATTGTTATTAAACGGTATTGCACCCCACCCCCTTGAAATTAAAATGGAATTGGTATCCCCACATTATTAGAAAAGACAATAAATATTAAAATACAGATTTTTTAAGCAATTAAAAAACATGCATCTTTTCGTTTTGCGATATCACCTAGGCTTTAACAATTTACAGGCAATACTTTAATTCCCAT
Unaligned ( gi|16 ): ATTTCTATACAGATTTTCATAAAACTGTTTCATTTCTTCCAGAATATCTGATTGGTTATGGGTCTCTATTCTTTTAATGACCTCATTCAAAATATTTCTTGATTCGAGATGACAGAAATATGTTGTGGATTTCTCCCCTTCTTCAATCCATTTGGCTCT
Unaligned ( gi|17 ): TTGGGTATATATTTATTTGTATAATGGTCTGGTTTCCATATTCAAGATAAGAAGTACTTAGGTTGGTTTCTCCCCTTCATCTGTCCACTTTGCTCTGGACCTTACTATAATTACCATTAATTTGTGATTTCGAAATTTTTCTAATTCCTTCTTTCT
Unaligned ( gi|19 ): TTCTATCAATTCTAAAATGTTGTTTCTAGCCTTTGCATTGTTTATATGTTTAAAATTTCTGGATCCAAATTTAAAATATGACATTCAAACTACACTGCATTTTGAACATTTTTTAGGGATTA
Unaligned ( gi|21 ): TACTTCATATCTTTACTATTAATTTTCAGGAATAAGTTATCTCCACTCTACTTCCCCTTATTTCTGAAAACAACTTGCCATTCAAATGATTATTAATAAGATGCCTTTCCTTTGTA
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Unaligned ( gi|23 ): ATTTAAATGGATGAGTATATGAACTAGGAATATTTAACATTCATTTGACACCATTGCAAAGATTTCTAACATAATTTTCTATGATCAGTTGTAAGATTGTGTGTCTTTAGA
Unaligned ( gi|28 ): AATTTCTGGATTCCAAAGCACAAAAGTATTTTGATGGTTTTCCGCCTTCTTCCACCCATTTGGCTCTAC