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Reference ( gi|1 ) : AAGATT-ACA-CAAGC-TC-A--C-C--T--C-------GAC--G-G-G----CAA-CA-C-C--TT-T-A--T-A--T-GGCAC-----C-A----T-----TAT-------GT-C---T-A---T----T-----ATGC-T-TTA-TTT--TAA-CCCA---A-GG-A--TTT-CAT--C-----CA-T--TT-ACAACT-TTATCA---T-A-T-TACACA---A--TA-C-T-A---AAAA--AAT-TAT-C--AT-A------A-TG-TAC--A------TCAATATA-AA--A----ATCTATAT-TATA----TAC-TTATAA-ACATAT-AT--TT-ATG-AATTATC-TATTAT-CA-AT-ATAGGA----TATA--A-A-T-ATGAT----TATG---AATA-TAT-T-CATATAA-AAT-C--A-T-ATTAT--TATGAT--A-T----CAT-T--G-A-TAT--T-ATAT-CATA-TGA--AT--ATGA------ATGTAA--TA----T--A-T-ATGTAT-ATAATA--ATAT-ATC----GT-AT--A-A--T--CA-----TATTA--------TA--C-CATA--T---GT--A---A-T-----A----T-A-CC----A---T----TG-TACTG---ATAT---TGT-TA-ATC---AT---CCCAT--ATC-A-A-A-C-A----T-A-T-GTA----AT-----CAT---------C--A-----TAT------T--TGTA--ATA----AT----A--ATAT----ATCG------AT-CA----T--A--------C------ACCA-ATA----A-T--G------TAA--A-TC-AT------A------C-------------------C-A-T-A-TCG-T-AT-----------A----------------T--A--T-----T--GTA-TGAT--A--TCA----A---A-G-----C----A-A-------TA--T-C--G--T----TA-C-CA----T-AT--C-G-----TAT---------CA-----TA--T---C-A-T-AT----A-A-T--------A-T-T-------G------T-A--T---CA-TAC----C--A-TA----------ATCT--T----TGT------C-CA-A-A------A-------AC---AT---CAT---T-C--C--A--T--CG-AC-A-----A-CACC---GC---TCG----T---AT--A------------------A---T---T------G--T-A------T---CA--T-A-----C--C-A-T-A--TC--G----A----A----A--------TC-AT-A----C------C---A---TA--A---C--------A-T----A--TCA-T------A-C---C-A-TA-T---T-G---A---------T-T-----T---CA--T--A---------A----T----A--T-AT-T------GCA--T-C-A----TA-C-GC----A-T-AT-------------C------GT---A--T-A--A----T-A------TC----C-------T-A-C-CA-T------A---A--A--CA-------T---AT-------AA-T--CAT-------CGTATC-A---------TAGAA--ATA----TNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNA-----AT----ATCG-T-ATC----A-----------ACACCA-TAT----------C--G---TA-AT-A-------AT--A---------A-C---T--A------T---C-A----T----------AT----A--A--T---A-TC---G-----T---A-------A------T---C-AT-----A--CC----A---AT--A----T---C-A-T--------A-T-------T-G-----T--T---A--A--T-----ACCA-TA-T-C--G-T---AT--C-A-TA---C-C---A--------AC--------TAT--------T-----GT--A----AT----C-AT-ACC-A--T---A--TCA-----T----AT--C---TA----------------------AT-A-T-T--G-T-ATC---CCACA--C-C--A--T--TA-TC---A---A---TA--ATA----------------------AC-A-ACCT-TAT---T-----CA-T--AC---------T-AA--TAA--C-GT---A---T--C---T--A-C--C-T---TAT---C--A-TA-AT------C--A-----A---T--A-C----C---A-A------AT----C-----AT---A-GT-CCATA-C-------AA---AA----C-G--T-A---T-A-------GT-------AT-A--G--T----A-T-----C-G-------C-A---TC--A-T----AC--CA--TA----A------T--TG--TA-T-T-------A---T-A-T---T----G-TA-------T-CA--------T--A-----CC-----A--TA----T-C-----G-T-------A-----T------A-----A----T-A---T-C--A---------T-----------A------AT----T----A----T---A---C---CA-----T-----A--TC----G-T-A------T-A-AT-----AT-C--A-T-----AT-CT-TACA--A-T--------A----A------T---------ATA---------CCA-T-A--AT---C-TA-T--A-T--ATCA--T---A------T--A--T--AT----G--T---CAT-A-C-AA-------TAT------C-AT-A-G---AT---AAC-AT-C---AT---T-----CA--T-ACC-C----ATAT-TCG--T--AT-A--AT-A----T-CGTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---CCCAT-A----T--T-G-T-AC--T-----CATA----AT-A-T----A-----ATCA-TA----C--A-TA---------------AT-TGT-AT--C-------T--A-------C---CA-T--------A------T-T------GT-AT-TA----AT-A-T--T-G----T-----A--A---C--A-T--ATC----A--------A--CA---T---------C----AT-A--T-C--------------G--TA-T--------A--------A--TA-----------AT---A-T---------A---C-C----AAT--A----TCA-----T-A---TA----A-CA------T-----TG---T-A-TC-A-T-AC----C--A-------TA---A-T----A---T----------A--T-A----A-----T---A-T-C-A--T-A--T---CA----T----AG----C-C-------A-T-AT--T--G-----T---A--T-----------C-----TA----CCA-T-AG-T-CGTAT-----A-------AT-A--T-C------G---GTA--T-------CAC----TA--CC--A--T-A-TC---A----T-A-----T--A--------AT--A--T---A-T-T---G----T--T---CA-TA---T-C--A--G--G---------A----A--CCAT-AT-CG--T-A--TA-----------AT---T--T------CAGT-A----T-CA----TA--T--A----------AT-A-T-C---A-T-----A------T---C-AT------A---------TACCA---CA---A---AT-----C-A------T----ATC---------C-----A-T--AC--C--A---T-A--T-C---GT----A--T-----A-------------GT-----------A-----ATA--A-T-ATCG-CATC-----ATA----------AC-CAT-ATTG-T----A-T---AT-C---T--TG---TA---AC----T-CATA-CNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCG-------A-TCGTA-TA--A-TATTATATC------ATACC--A--GCATC-T-AACTACTCAC-A--AATA-C------AT-TTTAGAA--TCATA-AGACG-CATTCT-TAAT-ATAAGTTCTGGAGATGAAATATGAACAAATCAATGCCTATTTAAACAACAT
gi|6 : AAGATT-ACA-AAAGCGTC-A--C-C--T--C-------GAC--G-G-GG---CAA-AA-CAC--TT-T-A----A--T-GGAAC-----C-AATTAT-----TAT-------AT-T---TTG---T----T-----GTGA-T-TTAATTT--TAA-CCCA---CCGG-A--TTT-CAT--A-----CA-T--T--ACA-CT-TTATCA---T-A-T-TACA-A---A--TA-C-TTA---AAAA--AAT-TAT-C--AT-A------AATG-TAC--A------T-AATATA-CA--------TCNNNNN-NNNN----NNN-NNNNNN-NNNNNN-NN--NN-NNN-NNNNNNN-NNNNNN-NN-NN-NNNNNN----NNNN--N-N-N-NNNNN----NNNN---NNNN-NNN-N-NNNA----AAT-C--AGT-ATTAT---ATGAT--A-T----CAA-T--G-A-TAT--T-ATAT-AATA-TGA---T--ATTA-------TGTA---------T--A-T-AT-TAT-ATAATAT-AAATGATC----GTGAT--A-A--T--CA-----TTATA--------TA--CTCATA--TC--AT--A---T-T-----A----T-AACC----A---TAT--CG-TA-TG---ATAT---TGT--A-ATC---AT---ACCAT--ATC-A-A-AAC-AA---T-A-TTGTA-----T-----CATA--------C--C-----TAT------T--GGTAC-ATA----AT----A--TTAT----GT--------AT-CA----T--A--------C--------CA--TA----ACT--G------TA-----TC-A--------------C-------------------T-A-T-A-TCG-T-AT-----------A----------------T--AAAT-----T--GTAATGAT--A--TCA----A---A----------------------------------------A-C-CA----T-AT--C-G-----TAT----------A-----CA--C---T-A----------------------A-T-C-------G------T-A--T---CA-----------A-TA----------ATCA--T----------------A-T-A------A-------AT---AT---TGT-----------A--T--C--AT-A-----G-CATA---G----TCG----T---AT--A------------------AATAT---T------G--T-A------T---CA----A-----C--C-A-T-A---C--G----G----A-------------TC-AT-A----A------C---A---TA--A---C--------A------A--TCA-T------A-C---C-A-TA-T---TTG---A---------T-T-----C---CA--T--AT--------A----A----A--T-AT-TC-----ACA--TAC-A----TATC-GT----A-T-ATATCTACCATAGATC------AT---A--T-A--A----T-A------TC----G-------T-A-T-CA-T------A---G--A---A-------T---AT----------T--CATA------TGTATT-A----------ATAACCATACTCGTACTCATACCATATGTATAATATTGTAATCAATACGCATATCGTATCATACACATAATCGTTATCTATACCATCATTGTATCAATAATCATATA-----AT----ATCG-T-ATC----A-----------CAACCA-TAT----------C--G---TA--T-A-------AT--A---------A-CAA-T--A------T---C-A----T----------AT----A--A------A-TC---G-----T---A-------G------T---C-ATG----A--CC----A----T--A----T---C-A-T--------A-T-------T-GGGTAAT--T---T--A--T-----ACCA-TA-T-CCGA-T---AT--C-A--A---C-C---A--------A---------TAT--------T-----GT--A----TT----A-AT-ATT-G--TGT-A--TCA-----T----AC--C----G----------------------AT-A-T-C--A-T-ATC---ACATA--C-C--A--T---A-TT---T---A---TC--ATA----------------------CC-A------TAT---------CA-T--A----------T-AA--TAT--C-GT---A---T--CAA-C--A-C--C-A---TAT---C--A-TA--T------A--G-----A---C--A-C----C---A---------T----T-----AT--------CTA-A-T-------AAT--AA----C-G--T-A---T-C-------AT-------AC-C--T--T----A-T-----C-A-------T-A---TCG-A-T----AC--AA---A----A------T--CA---------------------A-T---T-----------------CA--------T--A-----CC-----A--TA----T-C-----G-T-------A-----T------A-----G----T-A--------A---------T-----------AGATCGCAT----C----AA---T---A---C---CA-----T-----A--TT----G-T-A------T-T-AT-----AT-T--G-T-----AT-C
gi|4 : aAAGATT-ACA--AAGCGTC-A--C-C--T--C--------AC--G-G-GGCAACAA-CA-A-C--TT-T-A--A-A--T-GGCACGCGATT-A----T-----TAT-------AT-T---T-C---T----T-----AT---T-TTA-TTT--TAAACCCA---CCGG-A--TTT-CAT--C------A-T--T--ACA-CT-TTATCA---T-A-T-TACACA---A--TA-CTT-A---AAAA--AAT-TAT-C--AT-A------A-TG-TAC--A------T--ATATATTA--C----ATCTATAT-TATA----TA--TTATAA-ACATAT-AT--TA-ATG--ATTATC-TATTAT-AT-AT-ATAGGA----TATA--A-A-T-G---------ATA---AATA-TAT-T-CATATAA-AAT-CAGA-T-ATTAT--ATTGAT--AGT----CATAT--GAA-TAT--T-ATAT-AATA-TG---AT--ATTT------ATGTAA--TA----T--ATT-ATATA--ATAATA--ATAT-GAT----GT-AT--A-A--T--CA-----TTATA--------TAG-C-CATAATC---AT--A---ATT-----A----TAA-CCAT--A---T----CG-TATGA---ATAT---TGT----ATC---AT---ACCAT--ATCAA-A-A-CAA----T-ATT-GTATC--AT-----TAC---------C--A-----TA-------T--TGTA----C----AT----A--ATAT----ATTGTA----AT-CA----T--A--------C-------C---ATA----ACT--G------T----A-TC---------A------C-------------------T-A-T-A-TCG-T-AT-----------A----------------TAAA--T-----T--GTA-TGAT--A--TCA----A---A-------C----C-A-------TG--A-C--G--TA---TA-C-CT----A-AT--C-G-----TAT---------CAG----TA--T---C-AGT-ATA---A-A-T--------A-T-T-------G------T-A--T---CA-TAG----C--A-TA----------------T----CGT-----------A-T------A-------AT---A-----AT---T-G--T--A--T------C-A-----A-AACC-------------------AT--A------------------A---T---C------G--G-A------T---CA--T-A---------------------------------------------------------------C---A---TA--A---C--------A------A--TCA-T------A-C---C-AGTATT---T-G---A-----------T-----T---CA--T--AT--------A----A----A--T-AT-T------GCA----C-A----TA-A-CA----A-T-AT-------------C------GT---A--T-A--A----T-A------T-----C-------T-A-C-CA-T----------A--T--CA-------T---AT-------AA-T--AAT-------CGTATC-A---------TAG-A--ATA----TCATGATGTATAATACCATACTCGTATCATACCATATGGGTATAATATTGTATAATACGCATATCGTATCATACCATATCGTATCATACCATCATTGTTATCATAATCA-T-AT-----A-----------ATATCG-TATCACACCATATC--G---TG-AT-A-------AT--A---------A-CAA-T--A------T---C-A----T----------AT----A--G------A-AC---G-----T---A-------G------T---C-ATG----A--CC--------AT--A----T---C-A-T--------A-TG------T-G--------T---A--A--TTTATCACCA-TA-TCC--G-TAC-AT--C-A-GA---C-C---A--------ATATG-----TATTAATCATAT-----GT--T----AT----C-AT-ACC-A--T---A--TCA-----T----AT--CA--TACCATAATTTATCATAACATATCAT-A-T-A--A-T-ATCGTTCAACA--C-C--A-----TA-TC-------A---TT--ATA----------------------AC-A-CCAT-TAT---C-----TA---------------T-AA--TAA--C-GT---A---T--CA--TAAA-CA-C-T---TAT---C--A-T--AT------C--------A---T--A-C----A---A-A------AT----CA----ATTCAA-GTACCATA-T------------------C-G--T-A---T-A-------GTA------AT-A--G--T----A-T-----C-G-------C-----TCGAA-T----AC--CA--T-----A------T--TG--TAGT-C-------A---T-A-T---T----G-TA-------T-CA--------T--A-----CCAAG--A--TA----T-C-----G-T-------A------------A-----A----T-A---T-C--A---------T-----------A------TT----A----A----T---A---C---CA-----T-----A--TC----G-T-A------T-A-ATG----AT-C--A-aat
gi|5 : tcaAAGATTTAC--CAAGC-TC-A--C-C--T--C-------GAC--G-G-G----CAA-CA-C-CATTTAT-A--T-A--T-GGCAC-----C-AA---T-----TAT--------T-CAGAT-C---T----T-----ATGC-T-TTA-TTTC-TAG-CCCAC--A-GGCA--TTTTCAT--C-----CA-T--TT-ACACTT-TTATCA---T-A----ACACA---A--TA-C-T-A---AAAT--AAT--AT-C--AT-A---------------------------------------------ATGT-TACA----TAA-GTATAA-CCATCTTAT--TT-ATA-TATTATat
gi|27 : AAGATT-ACA--AAGC-TC-A--C-C--T--C-------GAC--G-G-GG---CAA-CA-C-C--TA-T-A--T-A--T-GGCAC-----C-A----T-----TAT--------T-A---T-AT--T----T-----ATGC-T-TTA-TTT--TAA-CCCAC--A-GG-AT-TTT-CAT--C-----CG----TT-AC-ACT-TTATCA---T-A-T-TACACA---A--TA-T-C-A---AAAAC-AAA-TAT-C--AT-A------A-TG-TAC--A------T-AATATA-aataccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaattcgttaatcatattataccatttcgtattatacatatcgtatgatattgtatcataccatatcaaacaattatatgtatcataccatattgtatccattaaatactatcgtaattcataccccactgtatccataacatacgtatataattgtatatcaacatatctataccagtattcgtatctatcatatatatttcataccagtatcgtataatattgtattcataccatatcgtatcataccatcatattgatttcatataatattgcatcataccagtatcgtattaatatcctaccatatcatataatatcgtatcatagaatatatattgtataataccatatcgtatcataacccatattgtattaaattgatatcataccattattatcataccatatcgttatcattaccatattgtatcatatcatataatatcgtatcacaccatatcgtataataaacatagtccataccatatcgctatcatactatattgtataatattgttatcataccaattatcataccatattgtatatccattatcatataatatcgtatcacaccatatcatataataacgtatcataccttcatatcataccaaatcaatatcataccatatcgtatagtatagtatcgcatcataccatcattgtattatgcctattgtattaattcatattataccatatcgttataatatcagtatctacatatcataaaatatcatattaatatgtcatataattaaaagtatcattataacatcatattcattaccattatcgtataatatcatatt
gi|16 : ggaaatcaAAGATT-ACAACCAGT-TCCA--C-C--T-----------ATT-G-G-G----CAA-CA-C-C--TT-TTA--T-A--T-GGTAC-----C-A-----------------------------A---T----T------TGCCT-TTA-ATTGATAG-CCCACACA-GC-A--TTTTCAT--C-----CA-TACTT--CA-CT-TT-TCA---T-A-T--ACACA---A--TA-C-T-A---AAAA--CAT-TAT-C--AT-A------A-TG-TACCAA------T-AATGTA-AC--A----GGCTATAT-TA-G----CACGTTATAATACATCC-AG--TT-ATG--ATTATC-TATTAT--A-GT-ATAGGA----TATG--A-A-TGATGAT-----------AATA-TAT-T-TATA-AA-AAT-C--A-T-ATTA---TGCAAT--A-T----T--------A-TAA--T-ATAT-AATC-T-----T--ATGGCC----GTATAA--T----------T-GCGTAT-ATTATA--Attta
gi|29 : tcaAAGATT-ACA-AAAGC-TC-A--C-C--T--C-------GAC--G-G-G----CAA--A-C-C--TT-T----T-A--T-GGCAC-----C-A----T-----TAT--------------T-AAATT----T-----ATGC---TTA-TTTA-TAG-CCCAT--ATGG-AT-TTT-CAT--TCG---CA-T--CTGACCACT-TTATCA---T-A-T-T----A---A--TA-C-TAA---AAAA--AATATAT-C--AT--------A-TG-TAC--A------a
gi|17 : caAAGATT-ACA--GAGC-TC-A--C-G--T--C-------CAC--G-G-GG---CAA-AA-C-C--TT-T-A--T-A--T-GACAC-----C-A----T-----TAT----------CA--T-A---T----TT----ATGC-T-TTA-TCT--TAG-CCCAC--A-GG-A--TTTTCAT--C-----TG-T--T--ACA-CT-TTATCA---T-A-T-TACACA---A--CATT-T-A---AAAA--AAT-TAG-C--AG-A------A-TG-TAC--A-------AGATAT--AA--T----ATCTATAT-TAGA----T----------------------------GATTATG-TATTGT--A-AT-ACA--A----TAT---A-A-T-AC-AT----CAT----ACTC-TA--T-CATATAT-GAT-T--A-T--TTAA--TATAAT--A-A----TAT-TTCA-A-TAT--T-ATAT-CAT
gi|32 : atcaAAGATT-ACA--GAGC-TC-A--C-C--T--C-------GAC--G-G-G----TAA-CA-C-C-------A--T----T-G----------------T-----TAT-------AT-----------T----T-----ATGC-T-TTA-TTT--TAG-TCCAT--A-GG-AC-TTT-CAT--C-----TG----TT-AT-ATT-TTATCA---T-A-T-TACACA---A--CC-T-T-A---AAAA--A---TAT-C--AC-A------A-TG-TAC--A------T-AATATgaaatt
gi|42 : tcaAAGATT-ACA--AAGC-TC-A--T-C--T--C-------AAC--G-G-GG---CAA-CA-C-C--TT-T-A--T-A--T-GGTAC-----C-A----T-----TAT--------T-A---T-A---T----TC----ATGC-T-TTA-TTT--TAG-ACCAC--A-AG-A--TTT-c
gi|46 : taatcaAAGATT-ACA--AAGC-TC-A--C-C--T--C-------GACG-G-G-G----CAACCA-C-C--TT-T-A--T-AT-T-GGCAC-----C-A----T-----TAT--------------T-ACATT----T-----ATGC---TTA-TTT--TAG-CCCtc
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gi|41 : tatatatataccagtatttgtataaattAC---------C--A-----TAT------C---GTA---TA----AT----A--CCAT----ATCATGTACTAT-CA----T--A--------CCAT---ACCA-A------A-T---------CAC--A-TC-AT------A------C-------------------C-A-T-A-TCG-T-AA-----------A-------------------------------GTA-TAAT--A--TCG----A---A-T-----C----A--------------------------TA-C-CA----T-AT--T-G-----agataaaatccgta
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gi|23 : atgttaccttcgcctatttgtatcaaatcatacaataccatatcatatcatattaataccatatcgtaaagtatcgtattatataataacacattgtttacttcgccaatttatatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtat-ATG----A-T--A------TAAT-A-TT-AT------A------C-------------------G-A-T-A-TGG-T-ATTGATATTTATGA----------------T--A--T-----T--GTA-TGAC--A--TT------------------------A-------TA--T----G--A----TA-C-GA----T-AT--T-A-----TA----------CA-----TA--T---G-G-T-AT----G-A-T--------A-T-T-------T------T-A--T---GA-TAT----T--A-TA----------c
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gi|34 : ccattttatatcaaaccata---TCA----T---AT--A------------------A---TCATT------G--T-A------T---CA--T-A-----C--A-A-T-A--T-------------A----A--------TC-AT-A----T----------A---TG--AT--C--------G-T----G--TCA-T------A-C---C-A-T------------------------------------------------------------------AT-C------GCA--C-C-A----AA-C--C----A-TGAT-------------T------GT---AGTT-C--A------A------TC----A-------T-A-C-CA-T------A---A--GT-CG-------T---AA-------AA-T--AAT-------CGTATC-A---------
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gi|39 : tgtatcttatattcatgatca-------AT-A--A--T----A-T-----C-A-------T-A---TA--A-T----AC--CAA-TA----A------T--A----A-T-C-------A---C-A-T---A----A-AA-------T-AA--------T--A-----CC-----A--CA----T-C-----G-C-------A-----T------A-----A----T-A---C-CTTA---------T-----------A------ATAGCAT----A----T---A---C---CA-----T-----A--TC----A-T-A------T-A-AT-----ATCC--A-T-----AT-a
gi|6 : -A--G--T----A-T-----T-A-------T-A---TG--A-T----AT--CA--------A------T--GA--TA-T-T-------A---T-A-T---A----A-TA-------T-GA--------T--A-----TT-----A--TG----T-------A-T-------A-----T------A-----T----T-A---T----A---------T-----------A------A-----T----A----T---A-------AA-----TG----A--TC----G-TGA------T-A-ATC----AT-T--A-T-----ATACT-C-----A-T--------A----T------C---------ATA---------TTA-T-A--AC---C-------A-T--ATCG--T---A------TG-A--T--ATTGTAA--T---CAT-A-C-CA-------TAT------C-A--A-A---AC---AAT-AT-T---GTA--T-----CA--T-ACC-------TAT-TGG--TACAT-A--AT-A----T-TATGTATCATACCATAACTGTATCACTATATCGTATATAAATTGTAATGATATCAAAACCATATCGTATACACTA------------A----T--C-G-T-A---T-----CA---------A-T----A-----ATCA-TA----T--A-AAT--------------AT-TGT-AT--CA------T--A-------G---CA-T--------AG-----T-C------GT-AT-AA----AT-A-T--T-G----------------------T--ATC----A--------A--C--------------C----AT-A----C--------------G--GA-T--------C--------A--TA-----------AC---A-T---------A---A-C----A----A----TCA-----T-A---CC----A-TA------T-----T--------TG-A-T-TC----C--A-------T----A-T----A-------------------A----A-----T---ATT-C-A--C-A--TA--CA----T----A-----T-C-------G-T-A---T--A-----T---A--T-----------C-----TA----CCA-T-AGAT-CATAT-----A-------AT-A--T-C----------GTA--T-------CA-----TA--GA--A--T-ATTC---A----T-ATGTATT--A--------AT--AACC---A---T---A----C--T---CG-TAC--T-C--A--T-----------------A--CCAT-AT--G--T-A--TA-----------ATA--T--T--------GTAA----T-CA-----A--T--ACGC-------AT-A-T-C---G-T-----A------T---C-AT------A------------CA---CAT--A---AT-----C-GT-----T----ATC---------T-----A-T--AC--C--A---TCA--T-T---GT----A--TC----A-------------AT-----------AATCATATA--A-T-ATCG-TATC-----ACA----------AC-CAT-ATCG-T----A-T---A----------A---TA---ACAATAT-CATA-TAAATCGTAGTCATGACCATATCATATTGGGTAATTTATACCATATCCGATATCAACCAATATTGTATTAATATTGTGTATCATACCGATATCATA-TCACA-TACCA-TATT-TATC------ATACCATA--TCATA-T-AA-TA-TCGT-ATCAACACC------AT-------A--TCATATAGACACCATTATCTAATAATAAaa
gi|25 : aaagattacaaaagcgtcacctcgacggggcaaaacactttaatggaaccaattattatattttgttgtgatttaattttaacccaccggatttcatacattacactttatcatattacaaatacttaaaaaaattatcataaatgtacataatatacatcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaatc-A--A--T----A-T-----G-A-------T-A---TT--A-T----GC--AA--TA-----------T--TA--TA-T-T-------A---T-A-T---T----A-TA-------T-CA--------T--A-----ACGAATAA--TA----T-C-----A-T-------A-----T------A-----A----T-A---A-CA-A---------T-----------A------AT----T----T----T-----------CA-----T-----A--TA----A-A-A------T-A-AT-----AC-C--A-T-----AT-C-----------------------------------------ATA---------TCA-T-A--TT---G-TA-TA-A-C--ATCA--T---A------C-----C--AT----A--T---CGT-A-T-AC-------TAT------C-AT-A-----AT-----T-AT-C---ATA--C-----CA--T-ACT-C----ATAT-CAGATC--AT-A--AT-A----T-cgtatcataccttatcatatcgatacaaaatcaattcataccatatcgtatagtaatagatcgcatcaataccatattgtattatattgtatcaat
gi|54 : -A--A--T----A-T-----C-G-------A-A---TC--A-T----AC--CA--TA-----------T--CA--TA-T-A-------A---T-A-C---A----A-CA---------CA--------T--A------------A--TA----T-C-----G-T-------A-----T------A-------------------------------------------------------------A----T---A---C---CA-----T-----A--TC----G-T-A------T-A-Atc
gi|13 : --G--T----A-T-----A-A-------T-A---TC--A-T----AA--AA--TACCACA------T--CG--TA-T-A-------A---T-A-TACAT----G-TA-------T-CA--------T--A------T-----A--CA----C-T-----G-TA------A-----T------ACC---A----T-A---T-C--G---------T-----------A------------T----AC---T---A---T---CA-----T-----A--TC----G-T-G------T-A-AT-----AT-C--A-T-----AT-CG-TATA--A-T--------A----A------CATAAA----ATA---------CCA-T-ATTGT---C-TA-C----T--ATCA--T---A------T-----C--AA----A--T---TAT-A-C-CA-------TAT------C-AT-
gi|41 : atgttaccttcgcctatttgtatcaaatcatacaataccatatcatatcatattaataccatatcgtaaagtatcgtattatataataacacattgtttacttcgccaatttatatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn--T----A-T-----C-G-------T-A---TA--A-T----AC--CA--TA---------------------T-C-------A---T-G-T---A----C-TA-------T-CA--------T--A-----CC-----A--TA----C-C----------------------------A-----A------A---T-C--A---------C------------------AT----C----A----T---A---C---CA-----T-----A--TC----G-T-A------A-A-GT-----AT-A--A-T-----AT-C----GA--A-T--------------------C---------ATA---------CCA-T-A--c
gi|19 : acca----A-T-----C-A-------T-A---TC----T----AT--CA--TA-----------T--CG--TA-T-T-------AGTAT-A-T---C----A--A-------T-CA--------T--A-----CC-----A--TA----T-T-----GGT-------AA----T------A-----A----A-A---T-C--G---------T-----------C------AT---------A----TG--A---C---CAA----T-----A--TC----G---A------T-A-AT-----AT-G--A-T-----A------ACA--AAT--------A----T------C---------ATA---------CCA-T-A--TG---C-TA-T--A-T--CTTA--TC--A------T--A--T--AT----G--T----AT-A-C-A--------TAT------C-AT-A--------------------------T-----CA--T-ACG-A----AT----CG--T--AT-A--AT-A----T-CATttg
gi|51 : tctggtgataaaaattgtacgaatatgattttatcataccaa-A---TC--A-T----AC--CA--TA---------------------C-C-------A---A-A-T---C----A-TA-------T-CA--------T--A-----CT-----A--TA----T-C-----G-T-------A-----T------A-----A----C-A---T-A--A---------T-----------ATCGC--AG----C----A----T---A---C---CA-----T-----A--TT----G-T-A------T-atctaaccgcatctaactactcaatacatttacgatcacacaagcaatatacta
gi|2 : at---TC--A-T----AC--AA--TA----G------T--CAATTA-T-A-------A---T-A-T---C----A-TA-------T-CA--------T--A-----C------A--TA----T-T-----G-T-------A-----TCTACTCA-----A------A---T-C--A---------T-----------ACGT---AT----T----A----G---A---T---CA-----TTAC--A--TC----A-T-A------T-A-AT-----GT-C--G-T-----AT-CC----------------------------------------ATA---------CCA-C-A--TT---G-TA-T--A-A--TTCG--T---A------T--C--C--AT----G-------A--A-C-CA-------TAC------C-GT-A--------------------------T-----CA--T-ACC------ATAT--CA--T---T-A--ATCA----T---TAGTTCATACCATATTGTGTAATATTCGTATCATGACCTATCTTACTGATATCTGTATCAACCATATCGGTATCCA---CCCAT-A----T--T-G-A-AA--T-----CATA----CC-A-T----A-----ATCA-TA----T--AATT---------------AT-TGT-AT--CATAAT--TGAA-------CG--CA-T--------A------T--------GT-GT-TA-----T-A-A----A----T-----A--A---C--A-T--ATCTT--A--------T--CA---TA--------C----AT-A--T-T--------------G--TA-T--------G--------A--TA-----------TC---A-T---------A---A-A----ATT--A----CCA-----T-A---T---------------------CG---T-A-TC-A-T-AC----C--A-------TA-----T----C---T----------A--T-A----A-----T---A-T-CTG--TGA--T---CA----T----AC----A-A-------A-C-AT--TACG-----C---A--T-----------TA----TA----CCA-T-A--T-CGTAT-----C-------AT-ACAT-CT-----G---ATA--TAATATAATAT----TA--CC--A--T-A-TC---G----T-T-----G--G--------AT--A--T-----------G----TA-T---CA-TA---T-C--A---------------A----A--CCAT-AT-CG--T-A--TA-----------AT---A--C------CCAT-A----TTCA----TG--T--A-----------T-ACT-C---G-T-----A------T---C-AT------A-----------CC--------------T--------------T----ATC---------C-----A-TTGAT--C--AC--T-ACTT-C---TT-------T-----A-------------GG-----------T-----ATA--A-T-ATCA-CATC-----AT-----------AC-CAT-A-TG-T----A-T---A
gi|45 : atcaatg----A------T--TG--TA-T-A-------A---T-A-T---C----G-TA-------T-CG--------T--A-----CC-----A--TA----T-C-----G-C-------A-----T------A-----A----T-A---T-C--A---------T-----------A------TC----T----A----T-------C---AA-----T-----A--TC----A-T-A------A-A-AT-----AT-G--A-A-----AT-C--------A-T--------A----C------C---------ATA---------TCA-T-A---------TA----A-T--ATCA--T---A------atataatatcctaccatattgtatatatcatgatcattaccccatagttgtatccaccatattgtgataaatatatattcagaacccatatacggttgtaatatggttcatattcaacgcgagatcgggggctaaattctactgatccatacccccccctgcccattattcaaaagcctaatgtggatcgtatcgataactcttattatactgaatcatatcagtatagtataaatatggaattccataataccgtaattttgtactacttatcggtcattttcataccatatcgtgaagaaatagcatattaccattcaatcatacaataatataccatatatcaggtatgacatgatcatatcaaaccattcttgtatcaatggagctaagatcggtgtatattatttattgttacctcgataatcaatattcactatcgtgatgcttctgtataatgaatttagttgcatatcgacatattcgaatatacaaataccatatatactccatatccgaagttccttatcataccaattataatcgagttataaaataattatatgaagcggcagcaagtactccactagttgtataattcataatcactttccatatcgtactaatactcatatagtcgattaccatattgttgaataagtatcatacataccttccatatcggaaataataatcatactcagtataatgtcacatcacatatcatattcatcatacccatatc
gi|52 : G--TA-T-C-------A---T-A-C---C----T-TA-------T-CA--------T--A-----CC-----A--TA----T-C-----G-T-------A-----T------C-----A----T-A---T-T--A---------T-----------AT-----AA----T----A----T---AATTC---CA-----T-----A--TC----G-T-A------T-A-AT-----AT-C--
gi|24 : --TA-C-C-------A---T-A-T--------G-TA-------T-CA--------T--A-----CC-----A---A----T-C-----T-T-------A-----T------A-----A------A---T-C--A---------T-------------------T----TC---A----T---A---C---CA-----T-----A--TC------T-A------T-A-AT-----AT-C--G-T-----TT-C--------A-T--------A----C------C---------ATA---------TCT-T-A--A----A-TA-T--G-T--TTCAG-T---A------C--A--T--ATCGT-A--T---CAT-A-C-CA-------TAT------C-AT-A-T---ATTTAAAT-AT-C---ATA--T-----AA--T-A-C-C----ATA--TCG--T--GT-A--AT-A----T-CGTct
gi|37 : atgaat--TA-T-T-------A---T-A-T---C----A-TA-------T-AA--------T--A-----TC-----A--TGTCGCT-C-----G-T-------A-----G------A-----A----T-A---T-C--A---------T------------------AT----A----A----T---A---C---CAATAATT-----A--TT----G-T-A------T-ataataccatattgta
gi|41 : atatgtatatcaatatataatatgatactttatgcaa-------A---T-A-T---C----G-TA-------T-AA--------T--A-----CC-----A--TA----T-C-----A-T-------G-----T------A-----C----T-A---T-C--A---------T------------------AC----C----A----T---A---C---CA-----A-----A--TC----A-C-A------T-C-AT-----AC-C--A-T-----AT-CG-TAAAGTA-T--------A----A------T---------AT-----------CG---A--AT---C-------A-T--ACCA--T---A------T--caaa
gi|33 : acc-------A---T-T-T---T----A-TA-------T-CA--------A--A-----CC-----A--TA----T-C-----G-T-------A-----T------A-----A----T-A---C-C--A---------T-----------C------A-----C----A----T---A---C---CA-----T-----A--TT----G-T-A------T-A-AT-----AT-C--A-T-----A-----AACA--A-T--------A----T------C---------ATA---------CC--------------------A-T--ATCA--T---A------T--A-----AT----G--T---CAT-A-C-AA-------TAT------C-GT-------AT---AAT-AT-T---GTG--T-----CA--T-A-C-C----ATA--TCA--T--AT-C--GT-A----T-Ctg
gi|54 : cc-------A---T-A-T---C----G-AA-------T-CA--------T--A-----CC-----A--TA----T-C-----A-T-------A-----T------A-----A----T-A---C-A--A---------C-----------A------------C----A----T---A--------A-----T-----A--TC----G-T-A------T-A-AT-----AC-C--A-T-----AT-CG-TATA--A-
gi|51 : a-TA-------T-CA--------T--A-----CC-----A--TA----C-C----------------------------A-----A------A---T-C--A---------T-----------A-------T----C----A----T---A---C---TA-----T-----A--TC----G-T-A------T-A-AC-----AT-A--A-T-----AT-C--------G-C--------A----G------C---------ATA---------CCA-T-A--TT---G-TA-T--
gi|47 : a-TA-------T-CA--------T--A-----CC-----A--CA----T-C-----G-T-------A-----T------ATC---ATAATT-A---T-C--A---------T-----------A------ACA---T----A----TCAGA---C---CA-----T-----A--TT----A-T-A------T-A-AT-----AT-C--A-T-----AT-CA-TAC
gi|45 : tgattactaactaaA----T-T-----G-T-------A-----T------A-----A----T-A---T-C--G---------T-----------A-------T----C----G----T---A---C---CA-----T-----A--TC----G-C-A------T-A-AT-----AT-C--A-T-----AT-CT-------A-T--------C----A----------------ATA---------TCA-T-A--AA---A-TA-TG-A-A--ATCA--T---A------C-----C--AT----A--T---CAT-A-T-AA-------TAT------C-AT-A-c
gi|5 : ----T-C-----G-T-------------T------A-----A----T-------C--A---------T-----------A-------T----T----A----T---A---C---CA-----T-----T--TC----G-T-A------T-T-AT-----A--C--A-T-----AT-CG-TATG--A-T--------A----T------T---------GTA---------TCA-T-A-------C-CA-T--A-TCAAACAATT---A------T--A--T--GT----A--T---CAT-A-C-CA-------TATTGTATCC-ATTA-A---AT---ACT-AT-CGTAAT---T-----CA--T-ACC-CCACTGTAT-CC------AT-A--AC-A----TACGTATATAATTGTATATCAACATATCTATACCAGTATTCGTATCTATCATATATATTTCATACCAGTATCGTATA---------AT-A----T--T-G-T-AT--T-----CATA----CC-A-T----ATCGT-ATCA-TACCATC--A-TATTGATTTCATATAATAT-TGC-AT--CA------T--A-------C---CAGT--------A------T-C------GT-AT-TA----AT-A-T--C-C----T-----A--C---C--A-T--ATCATATA--------A--TA---T---------C----GT-A--T-CATAGAATATATATTG--TA-T--------A--------A--TACC---------AT---A-TCGTATCATAA---C-C----CAT--A----TTG-----T-A---TT----A-AA------T-----TGA--T-A-TC-A-T-AC----C--A-------TT---A-TTATCA---T----------A--C-C----A-----T---A-T-C-GT-T-A--T---CA----T----TA----C-C-------A-T-AT--T--G-----T---A--T------------------------CA-T-A--T-CATAT-----A-------AT-A--T-C----------GTA--T-------CAC-----A--CC--A--T-A-TC---G----T-A-----T--A--------ATAAA--C---A-T-A---G----T--C---CA-T------------------------------A--CCAT-AT-CGC-T-A--TC-----------AT---A--C------TA-T-A----T-TG----TA--T--A----------AT-A-T-T---GTT-----A------T---C---------A---------TACC---------A---AT-----T-A------T----------------C-----A-T--AC--C--A---T-A--T-T---GT----A--TATCC-A-------------TT-----------ATCAT-ATA--A-T-ATCG-TATC-----AC-----------AC-CAT-ATCA-T----A-T---A----------A---TA---ACGTA-T-CATA-CCTTCATATCATACCAAATCAATATCATACCATATCGTATAGTATAGTATCGCATCATACCATCATTGTATTATGCCTATTGTATTAA-------T-TCATA-TT--A-TACCATATCGTTATAATATC--A--GTATC-T-ACATA-TCATAA--AATATC------AT-ATTAATATGTCATA-
gi|30 : aagatttaccaagctcacctcgacgggcaacaccatttatatatggcaccaattattcagatcttatgctttatttctagcccacaggcattttcatccatttacacttttatcataacacaatactaaaataatatcataatgttacataagtataaccatcttatttatatattataataccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaat-C-----G-T-------A-----T------A-----A----T-A---T-C--A---------T-----------A----------------------T---A---C---CA-----T-----A--TC----G-T-A------T-A-TC-----AT-T--A-T-----AT-Ctaattaaaagtatcattataacatcatattcattaccattatcgtataatatcatatt
gi|13 : -----G-T-------A-----T------A-----A----T-A---T-C--A---------T-----------A------AA---------A----T---A---C---CA-----C-----A--TC----G-T-A------T-A-AT-----ATAC--A-T-----GT-AT-CATAT-A-C--------A----C------TGTA------ATA---------CCA-T----AT---CGTA-T--ACT--ATCA--T---A------T-----C--GT----G--T---AAT-A-T-CA-------TAT------C-GT-ATA---AT---AAC-AT-A---A----------AA--T-A-C-C----ATAT-T-G--T--CT-A--CT-A----T-CATagcatctaaactactcaaatactcaaaaataatagatcacaagaccattcttaatctaagtttgatgaaattcaacaaagcaataactcaaatatcgcctg
gi|41 : atgttaccttcgcctatttgtatcaaatcatacaataccatatcatatcatattaataccatatcgtaaagtatcgtattatataataacacattgtttacttcgccaatttatatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn---A---C---CA-----T-----A--TC----G-T-A------T-A-AT-----AC-C--A-T-----AT-CA-TGTA--C-T--------A----T------C---------ATA---------CCA-T-A-------C-CA----A----ATCA--C---A------------------------T---CAT-A-C-CA-------TAT------C-GT-A-AAGTAT---AAT-AT-CG--AA---T-----CA--T-A-C-C----ATAT-Tatcaaattataccatatcatc
gi|8 : CA--T-T--------A----A------TC--------ATA---------CCA-T-A---T---CGTA-T--AAT--ATCA--T---A------T--A--T---------------CAT-A-C-AA-------TAT------C-AT-A------T---AAT-AT-CGT-AT---TTC---CAC-T-ATCAC----ATAT--CG--T--------AT-A----TCCATATAATATCATCCCATAGCAAATAATTGCATGTACATACCATATCGTATCATACCAAGATCGTATAATATCGTCA-----CCATCA-------------AC--T-----CAAA----CC-A-C----A-----TTTG-CA----CG-A-TA----------------T-CGT-AT--G-------T--A-------TAGACA-T--------A------T-TT-----GT-AT-TA----AT-A-T--C-G----T-----A---------------TC----A--------A--TA---C---------C----AT-A--T-C--------------A---A-T--------A-----------TA-----------AT---A-T---------T---T-G----AAT--------C------T-A---CG----A-AA------T-----TCCTCT-C-CC-G-T-TC----C--A-------TA---A-T----A---TCCTCGCCATCA--T-A----ACCAGTC---A-T-C-A--T-A--T---CA----TGCAAAA----T-CGGTACTAA-T-AT--C--G-----TG--A--T-----------CA----TA----CCA-T-AT-C-CGTAT-----A-------CT-A--T-C----------GTA--T-------CAA----TA--CC--A--T-A-TCAAAA----A-A-----G--A--------ATA-A--T---A-T-T---G----TA-T---CA-TA---C-------G--C---------A----A--C-----T-CG--T-A--TA-----------AC---TA-T------CA-T-A----T-CA----TA--TC-A----------AT-A-T-C---A-T-----A------T------T------A---------AACCA---C----A---CT-----C-A------T----TCT---------C-----ATT--CC--C--ATTTT-A--T-C---GT----A--T-----C-------------AT-----------A-----AT-----T-ATCC-CATCCCTGTATAATATCAATTCAC-CAT-ATTG-TAATAA-T---AT-CA--T--TAT--TT---AC----TGCATA-Cg
gi|33 : CCAT-A----T--C-G-T-A-----------TA----AT-A-C----C-----ATCA-CA---------------------------------------------T--A-------C---CA-T--------A------T-T------GT-AT--A----AT-A-T--C-A----T-----A--AA--C--AAT--ATC----A-----------TA---C---------C----AT-A--T-C--------------A--TA-T--------A--------A--TG-----------TC---A-T---------A---C------AAT--A----TCG-----T-A---TA----A-TA------T-----TG---T-G-TC-A-T-AC----C--A-------TA---T-C----A---T----------A--T-C----G-----T---A-T-C-cattcatccatg
gi|24 : ccattttatatcaaaCCAT-A----T----G-T-A---T-----CATA----CC-A------------ATCT-TA----T--A--A---------------AT-CAT-TT--CA------T--A-------C---CA-T--------A------T-C-------T-AT--A----AT-A-T--C-G----TTTCATA--C---C--A-T--ATCTTA-A--------A--TA---TGTTTCAGTAC----AT-A--T-C--------------G--TA-T--------C--------A--TACCATATC----AT---A-T---------A---T-TTA--AAT--A----TCA-----T-A---TA--------------------------------A-T-AC----C--A-------TA---T-C----G---T----------G--T-A----A-----T---A-T-C-G--T-A--T---AA----T----A-----C-C-------A-T-AT--T--G-----T---A--
gi|13 : atgaattaCCAC-A----T--C-G-T-A-----------TA----AT-A-T----ACATGTATCA-TA----T--A-CA----------------C-TGT-A---A-------T--A-------C---CA-T--------A------T-C------GT-AT--A----CT-A-T--C-A----T-----A--T---C--G-T--GT-----A--------A--TA---T---------C----AT-A--T-C--------------G--TA-T--------A--------A--TA-----------AC---A-T---------A---A------AAT--A----CCA-----T-A---T--------------------------T-G-TC---T-AC----T--A-------TC---A-T----A---TCAA-------A--T-T----A-----T---A-C-C-A--T-A--T---CA----T----
gi|4 : atgttaccttcgcctatttgtatcaaatcatacaataccatatcatatcatattaataccatatcgtaaagtatcgtattatataataacacattgtttacttcgccaatttatatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtataatatcataaaataAT-A----TGAT-G-T-ATAAT-----CATT----AT-A-T----A-----GCCA-TAAT--C--A-TA---------------AT-TAT-A--------------A-------C---CA-T--------A------T-C------GT-AT-GA----AT-A-T--T-G----T-----ATCATACC--A-T--ATC----A--------A--AA---C---------A----AT-A--T-T--------------G--TA-T--------C--------A--T-------------------T---------A---C-C-----AT--A----TTG-----T-A---CATAATA-TA------T-----TG---TAA-TC-A-T-AC----C--A-------TA---ACT----G---T----------A--TCACT--A-----T---A-T-C-G--T-A--T----A----TA---AA----T-T-------G-T-AT--G--A-----T---A--T-----------CA----AA----CCA-T--G-A-CGTAT-----ACCT----A--A--T-C----------GTA--T-------CAG----TA--TC--A-----------G----T-A-----T--A--------A---A--T---A-T-T---G----TA-T---CA-T---------A--G---------------------CAT-AT-CG--T-A--TA-----------ATAA-T--T--------GT-A----T-CAAAACCA--T--A-------------A-T-C---G-G-----A------T---C-AT------A---------CATAA---C----A---AT-----C-A------T----ACC---------A-----G-T--AT--TTGA---T----T-C---AT----A--T-----A----------------------------------A--A-T-ATTG-CA-C-----ATA----------AC-AAT-ATCG-TATA-A-T---AT-C---TACCA---TA---------T-CATA--TAATAATCGTATCATAGAATATCATGATGTATAATACCATACTCGTATCATACCATATGGGTATAATATTGTATAATACGCATATCGT------A-TCATA-CC--A-TATCGTATC------ATACC--A--TCATc
gi|19 : tcaaagattacaaagcgtcacctcacggggcaacaacaactttaaatggcacgcgattattatatttcttattttattttaaacccaccggatttcatcattacactttatcatattacacaatacttaaaaaaattatcataatgtacatatatattacatctatattatatattataaacatatattaatgattatctattatatatataggatataaatgataaatatattcatataaaatcagatattatattgatagtcatatgaatattatataatatgatatttatgtaatatattatataataata-A----T--T-G-T-AC--G-----AATATG--AT-T-T----T-----ATCA-TA----C--C-AA---------------AT-CAT-AT--C-------T--A-------T---CA-T--------A------T-C------GT-AT-TA----GT-----------------------------A-T--ATC----A------------A---T---------C----AT-A--C-C--------------A--TATT--------G--------G--TA-----------AT---A-----------A----------AATC-G----TCA-----T-A---TG----ACCA-------------A---T-A-TC-G------------A-------TA---A-T----A---TG---------A--T-A----A-----C---A---A-A--T-A--T---CA----T----A-----C-C-------A-T-ATGCT--A-----T---A--T-----------CT----TA----TCA-T-AT-A-TGTAT-----AC------AT-A--T-C----------ATA--T-------CA-----TA--CG--A----A-TC---G----T-A-----T--A--------AT--A----------------------T---CA-TA---T-C--------T---------A----A--CCGC-AT-C--------TA-----------AC---TACT------CAAT-A------CA----TT--T--A----------CG-A-T-C---A-C-----A------CAAGCAAT------A---------TACTA---tgttatcataatcatataatatcgtatcacaccatatcgtgataataacaatatcatatagaacgtagtcatgaccatatcatatgtgtaatttatcaccatatccgtacatcagaccaatatgtattaatcatatgttatcataccatatcatatcataccataatttatcataacatatcatataatatcgttcaacaccatatcattataacaccattatctataataacgtatcataaacacttatcatatcatacaaaatcaattcaagtaccatatcgtatagtaatagtatcgctcgaataccatattgtagtcatattgtatcataccaagatatcgtaaatatcatattaataccatatcgtataatgatcaat
gi|34 : tctggtgataaaa-A----T--T-G-T-A---T-----CATACA--AT-A-T----A-----ATCA-TA----T--A-TG---------------AT-CGT-GT--CA------T--A-------C---CA-T--------A------T-C------GC-AC-CAAACCATGA-T--T-G----T-----A--GTT-C--A----ATC-------------A--TA---C---------C----AT-AAGT-C--------------G--TA-A--------A--------A--TA-----------AT---
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gi|6 : ttataccatttcatataatatcacaccattcgttgattttatatctaagtcattatgattcatttatgccgtatgaatgatatcgtatatgcaattatctattattacatatgtatgatttgttatcattatggttataccttttttattcgttttttctatgtcaatcA-T--------T------T-T------GT-AT-CG----AT-A-T--G-A----T-----A--A---G--G-T--ATG----AT-------A--CG---T---------T----ATTA--T-T--------------A--GA-T--------A--------A--TG-----------GT---G-T---------------C----TAT--A----TGA-----T-A---TG----G-TG------T-----TG----------A-T-AC----G--A-------TA---T-T----A---T----------A--T-G----A-----T---A-T-G-G--T-A--T---GA----T----AA--------------A-T-AT--G--G-----T---A--T------------------------------G-T-GATAT-----G-------AT-A--T-C------G---GTA--TGA-----TAC-----A--CA--A--T-A-TTA--A----T-A-----C--A--------AT--A--T-----T-G---G----T--T---GA-TA---T-C--G--G----------------------AT-AT-GG--T-A--TA-----------AA---T--TACC---CAAT-A----T-GA----TA--T--tccatacattccgtattatgt
gi|25 : aaagattacaaaagcgtcacctcgacggggcaaaacactttaatggaaccaattattatattttgttgtgatttaattttaacccaccggatttcatacattacactttatcatattacaaatacttaaaaaaattatcataaatgtacataatatacatcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaatcagtattatatgatatcaatgatattatataatatgatattatgtatatattatataatataaatgatcgtgataatcattatatactcatatcatattataaccatatcgtatgatattgtaatcataccatatcaaaacaatattgtatcatacctattggtacataatattatgtatcataccataactgtatcactatatcgtatataaattgtaatgatatcaaaaccatatcgtatacactaatcgtatcaataatcatataaatattgtatcatagcatagtcgtataaatattgtatcaaccatacggatcataacataacaatcataccatatttgattccatataaatattcacatacatatcgtatatatctaccatagatcatataatatcgtatcatagaatattcatatgtattaataaccatactcgtactcataccatatgtataatattgtaatcaatacgcatatcgtatcatacacataatcgttatctataccatcattgtatcaataatcatataatatcgtatcacaaccatatcgtataataacaatatcatataaatcgtagtcatgaccA-T--------A------T-T------AT-AT-TA-----T-A-T--T-A----T-----A--T---C--A-T--AAC----G--------A---A---T---------A----AT-A--T-C--------------A--TA-T--------A--------A--TA-----------A----------------------C----AAT--AATTTTCA-----T-A---TA----A-AA------TAATACCA---T-A-TC-A-T-AT----C--A-------TA---T-T----G---T----------A--T-A----A-----C---A-T-C-A--T-A-----------------------C-C-------A-T-AT--C--G-----T---A--TA----------C-----TA----TCA-T-AA-T---TAT-----C-------AT-A--C-C------------A--T--------AC----T----C--A--T-A-TC---A----G-A-----T--C--------ATA-A--T---A-T-T---caattcataccatatcgtatagtaatagatcgcatcaataccatattgtattatattgtatcaat
gi|45 : aatatgatattatgca--------A------T-T------GT-AT--A----AT-A-T--C-G----T-----A--T---C--G-T--ACC----A--------------------------------T-A--T-C--------------G--CA-T--------A--------A--TATC---------AT---A-TCT-------A---T-C----AAT--A----TCA-----T-A---AA----A-TA------T-----GA---A-A-TC-A-T-AC----C--A-------TA---T-C----A---T----------A--T-A----A-----T---A-T-C-A--T-A--c
gi|24 : -T------GA-AT-TA----CC-A-TA-T-G----T-----A--T---C--A-T--ACC----A--------A--TC---T---------T----AT-A----------------------------------A--------A--TC-----------ATTTCA-T---------A---C-C----A-T--A----TC------T-A---TA----A-TA------T-----CG---T-T-TC-A-T-AC----C--A-------TA---T-C----T---T----------A----A----A-----T---A-T---G--T-T--T---CAG---T----A-------C-------A-T-AT--C--G-----T---A--T-----------CA----TA----CCA-T-A--T-CATATATTTAA-------AT-A--T-C----------ATA--T--------AA----TA--CC--A--T-A-TC---G----T-G-----T--A--------AT--A----------------------T---CG-TA---T-A--A--T-----------------A--CCAT-AT-TG--T-A--
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gi|12 : atttattaggggattaaacagtaaatgT-A-T--T-A----T-----G--A---C--AGT--ATC----T--------G---A---T---------A----AT-A--C-C--------------G--TA-T--------C--------G--TA-----------AT---A-T---------A----------AA---------CA-----T-A----A----A-AA------T-----CA---T-A-T--A-T-AC----CGAA-------TACCTA-T----C---T----------AGCT-ACCATA-----T---G-T-T-A--T-A--T---CA----T----GA----T-C-------A-T-TC--C--A-----T---G--T-----------C-----TA----ATA---AG-T-CGTAT-----AAGT----AT-A--T-C------AT--GTACTT-------CAT----AA--TCTGA--T-A-TC---ACT--C-A-----T-----------AC--A--T---A-T-C---G----T-------A-TA---A-C--A--ATCA---------T----A--CCAT-AT-CGA-T-A--TA-----------AT---C--T--------AT------T-CA----T---T--G----------AT-A-T-T---A-T------------C---C-AT------A---------T-------CG---A---AT-----G-A------T----ATCCGTT-----C-----A-T--AC--C------T-A--TCC---GT----ATCT-----AT------------GT------------------TA--A------G-CATC------TA----------TCTCAT-ATCG-T----A-A---CT-C---A--TG---TACGTAT----T-CATA-Ccatctaaat
gi|47 : taatatg----T-----A--A---CTAA-T--ATC----A-----------TA---C---------C----AC-A--T-C--------------G--TA-T--------ATC------A--TA-----------AT----------------------------T--A----TCA-----T-A---------A-CA------T------------A-TC-A-G-AC----C--A-------TA---T-T----A---T----------A--T-A----A-----T---A-T-C-A--T-A--T---CA----T----Actcgtatcatatatattagtataatatactctatagaactattcttgatatatcgggctattgtatataatcattgatta
gi|18 : tgattac--A---T--A-T--ACC----A--------G--TA---T--------------------T-T--------------G--TA-T--------A--------AATTC-----------AT---A-T---------ATTAC-C----AAT--A----TCA-----TTA---TA----A--------------------T-A-TC-AAT-AC----C--A-------TA---A-TCGTTA---T----------A--C-A----A-----T---A-T-C-A----A--T----A----T----AA--------------A-T-AT--A--G-----T------------------------CA----ACA-T-A--T-CATAT-----A-------AT-A--T-G------A---ATA--C-------CATA---TA--CC--A--TTA-TC---AAGATT-ACG---T--A--------AT--AACC---A-A-T---A----T--T---CA-TA---T-C--A--T-----------------A--CCAT-AC-T--------TA-----------AT---T---------AAGT-A----T-CA----------------------GT-A-T-C----------------------C-AT----------------TACCA---TT---A----T-----T-G------T----ATC---------------A-T--AC--C--A---T-A--C-C---TG----A--T-----A-------------AT-----------A-----ATA--G---AGTG-CATC-----ACA----------cc
gi|33 : tatat--A-T--ATC----A--------A---A---C---------C----AT-A--T-C--------------G--TA-T--------A--------A----------------------T---------A---C-C----A---------TCA-------------------------------------------C-A-T-AC----C--A-------TA---T-T----G---T----------A--T-A----A-----T---A-T-C-A--T-A-----------------AA----C-A-------A-T-AT--C--A------------------------------TA----CCA-T-A--T-CATAT-----A-------AT-G--T-C------A-----------------------TA--CA--A--T-A-TC---G----T-A-----T--A------------A--T---A-T-T---G----TG-T---CA-TA---C-C--A--T-----------------A--TCAT-AT-CG--T-A--Ttaagataaaatccgta
gi|41 : ccattttA---C---------C----AT-A--T-C--------------G--TA-T--------A-----------------------------A-T---------A---C-C-----AT--A----TCA-----T-G---T-----A-C------------------T-A-TC-A-T-AC----C--A-------TA---C-C----A--------------A-------------------A-T-C-A--C-A--T---CA----T----A-----C-C-------A-T-AT--C--G-----T---A--------------------------------AA----GTAT-----A-------AT-A--T-C------G---A-A--T-------CA-----TA--CC--A--T-A-Tc
gi|39 : A---T---------A----AT-A--T-C--------------A--TA-T--------A--------A----------------------T---------A---C-C----AAT--A------A-----TAA---TC----A-CA------T-----AA---A-A-TA-A-T-AC----C--A-------CA---T-C----G---C----------A--T-A----A-----T---A-C-C-T--T-A--T---AA----T----AG------C-------A-T-A-------------------------------------TA----CCA-T-A--T-CATAT-----A-------AT-A--T-C------C---ATA--T-------tg
gi|30 : -C--------------G--TA-T--------A--------A--TATC---------AT---A-T---------A---C-C-----AT--A----TCG-----T-A---TA----T-CA------T-----TA---T-A-TC-A-aa
gi|25 : --TA-T--------G--------A--TA-----------TT---A-T---------G---C------AAT--A----TTA-----T-A---TT----A-TA------T-----TA---T-A-TC-A-T-A--------A-------CG---A---------------------A--T-A----A-----T---A-T-C-A--T-A--T---AA----T----AA----C-A-------A-T-A----------------A--T-----------T-----T--------------T-CATAT-----A-------AA-A--T--------------------------AA----TA--CC--A--T-A-TC---A----T-A-----T------------C--A--T---A-T-T---G----TA-T---AA-CA---T-C--A--T-----------------A--CCAT-AT-CG--T-A--TA-----------CT---A--T------CATA-A----T-------TA--T--C----------AT-A-C-C---A-T-----AC-----T---C-AT------A---------T-------CA---G---AT-----C-A------T----Agcatctaaactactcaaatactcaaaaataatagatcacaagaccattcttaatctaagtttgatgaaattcaacaaagcaataactcaaatatcgcctg
gi|8 : aa--TA-----------ATC--A-T---------A---C-C----A-T--A----TCG-----T-A---TA----A-TA------TCA---TA---T-A-TC-A-T-AC----A--A-------TA---T-C----A---T----------A--T-A----A-----T---A-T-C-G--T-A--TTTCCAC---T----AT----CAC-------A-T-AT--C--G-----T---A--T-----------A-----T-----CCA-T-A--------T-----A-------AT-A--T-C------------A--T-------C----------CC--A--T-A-GC---A---------------A--------AT--A------A-T-T---G-----------CA-TG---TAC--A--T-----------------A--CCAT-AT-CG--T-A--TC-----------AT---A--C------CAAG-A----T-CG----TA--T--A----------AT-A-T-C---G-TC----A------C---C-AT------C---------AACT----CA---A---AC-----C-A------C----ATT---------T-----G-C--AC--G--A---T-A--T-C---GT----A--T-----GTATAGACATATTTGT-----------A-----TTA--A-T-ATCG-TATC-----AAT----------AC-CAT-ATatattc
gi|51 : cat---A-T---------A---T-C----A-T--A----CCA-----T-A---CC----A-AA------T-----CA---T-A-TC-A-T-AC----T--A-------TA---T-C----G---T----------A--T-A----A-----C---A-T-A-A--T-A--T---CG----C----AGCATAC-C-------A-T-AT--T--G-----T---A--T-----------caatataatatttgaatctacgaaattcctctcccgttccataatatcctcgccatcataaccagtcatcatatcatgcaaaatcggtactaatatcgtgatcataccatatccgtatactatcgtatcaataccatatcaaaaaagaataatattgtatcatacgcaactcgtataactatcatatcatatcaatatcatattaaaccacactcattctcattcccattttatcgtatcataattatcccatccctgtataatatcaattcaccatattgtaataatatcattatttactgcataccattcatccatg
gi|45 : --A----TTG-----T-A---TA----A-TA------T-----CG---T-A-TC-G-T-AC----C--A-------TA---T-C----G---C----------A--T-A----A-----T---A-T-C-A--T-A--T---C-------------------------------------------T---A--T-----------C------A------A-T-A--T-CATAA-----A-------AT-A--T--------G---AAA--T-------CA-----TA--CC--A--T-A-TC---A----T-A-----T--A--------AT--A--T---
gi|35 : A-----T-A---TA----A-TA------T-----TA---C-A-TA-A-T-AT----C--A-------TA---A-T----A---T----------A--T-T----A-----T---A-T-C-A--T-A--T---TA----T----AT----CGT-------A-A-AT--T--A-----T---A--------------A-----TA-----GA-T-AA-T-C--AT-----A-------AT-----------------GTA--T---------G----TA--GT--A--T-A-AT---A----T-A-----T--A--------AT--A--T---A-GAT---G----T--T----A-TA---T-T--A--cata
gi|24 : ---TA----C-CA------TA----TG---T-A-TC-A-T-AC----C--A------------A-T----C---TT---------A--T-A----A---------A-T-C-A--T-T--T---CA----T----A-----C-C-------A-T-AT--C----------------------------------------------------TAT-----A-------AT-A--T-C------G---TT---T-------CA-----TA--CC--A--T-A-TC---T----T-A--------A--------AT--A--T---G-T-TTCAG----T--A---CA-TA---T-C-----G--T---------ATCATA--CCAT-AT-CA--T-A--TA------------T---T--T------AAAT-A----T-CA----TA--T--A----------AT-A-C-C---A-T-----A------T---C-GT------G---------TA-------A---T---AT-----C-G------T----AT----------A-----A-T--AC--C--A---T-A--T-T---GT----A--t
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Reference ( family-1561 ) : AAGATT-ACA-A--A-GC-TC-A--C-C--TC-------GAC-G-GGGC-AA-CA-C--C--TT-T--AT-A--TGGCAC-C-A---T-----T-AT--------T--N---TA-T-T-----A--TGC-T-TTA-TTT--TAG-CCC--ACA--G-G-A--TTT-CA--T-CCG--T--TT-ACAACT-TTATCA-TA-T---------TACACA-A--TACT-AAAAA--AAT-TATC--AT-AA-TG-TAC--A-T-AA-T-ATA--------A-ANATC-TATA-T-TATATAC-TTATA------A-ACATAT-AT--TT-ATG--AATTATCTAT-TATCAATATAGG-ATATA-A-A-TATG--AT----TAT-AATA-TAT--T-CATATAA---AATC--A-T-AT--T--ATTATGAT-A-TCAT-TG-A-TAT--TATAT-CATA-TGA-A-TA----TNAATGT--AA--TA----TA--TATG--T--AT-ATAATA-ATAT-ATC-GT-A----T-A-ATC-A-----TAT-TAT----A--C-C-ATA--T---GT-ANTA-T-A-CC----AT-----CGTA-T-A-A---TATCG-TA-ATCA-TAC-CAT--ATC-AAAC-A-TA-TGTA--ATCAT-CATATT-----CGT-A-ATAAT---AATATATC-AT--CAT--A-CACCAATA-A-TGTAAATCATA-CCATA-TCGTA---T-A-T--AT-C---GT-ATNAT----------------------ATC-AAA-CA--AT---A--TCGT-TA-----C--CAT-ATCG------TAT-C-A-T-A-TC-A-T-AT-AAT-ATCGT-ATCATA------C-CATAATC--T-T--TATC-CAA-AA--ATATCAT-T-CC-AT-CGAC----AATAC---C-TCGTATA--ATCGTATCAT-ACCATA-TCG---AAAT--CAT----AC-C--ATAACA---TATCATAC----C-A-TA-TCGA-T-----------TC---ATA-AT-ATAT--C------------GCATCAT-AC-C-AT---A--TCGTA-TAATA--TCGTA-CCATA----ANCATATAAT--C-ATCGTATCATATA-A--AT-AT-NNCGNNNCATNNTA--NA-CNNNNNNNNNNCANNNNC-NNT-NNT-ATN-ATNNNNNNNNN------A-NNNCGTANNNNNN-CNNNNTNNT---NNNNNNNNNNNNN---TAA-TATCG-TAT--CAATACCAT-A-TCGTAATAATA--AC--TATCATATA-AT------A-TCGTAAT------CA---TACC-------A-AT------ATCAT-ATC---GT--TA--ATA--CCATA-TCGTATC------A-TA---C-CA----------A-TATCGTA---AT-CAT-AC-----------CA-T---ATCATA--TCTA---------AT-----ATC-G---TAT-CCATAC---CA--TT--ATCAATA-ATAAC-------A-ACC-NTAT-----TCAT--AC--------TAATA--NC---------GTA--TCA-TACC-N--TATC-----AT-A---ATCA-ATACCA-A---ATCATA-T-C----CAT-A--CAA-AA----CGTATAG------T-AT-A-A-TA-T-CGTATC--AT------AC-CATAA-TCG-----TA-TNAT-ATC-GTATCA--------TA--C-----C-A-TAT---C-----G-T--AT--A---A----TAT-------CATA----A----TCA--TAC----CAT-A-TCGTATAAT-ATCAT-AT--C-TA---CA--AT--A----ACATAC-----CATA-A---TC-T----AT-------A---TATCATA----T-A----T---ATATCATA-C---AAT---ATCGTA-AT-A--A---TAT-C--AT-T--CAT-AC---C----CATAT-----TC--G--TATAAT---A----TCGT----ATNNNANCCNNNNNNNNNNNN-----AN---TATNNCNNNNNNNNNNNCNNNNNNNNNNNCNNNNNNNNNANANNNNNNNNCCA-TA-TCGTA-----TC---ATA--A-TA----T---AAT--CAT----A-C-ATAA-TCG--TAT-----C--AT--ACC--A-TA-T-CG-TA-T-----TA----AT-A---TC----GT----A--NCAT-ATCA----A--CACC--AT-A--TCGTAT-AAT-A---A--TATACCA-------AT-A----T-CATA---T----A-ATA-TC-GT-ATCA--TA--CCA-TA-NC---------------------GT----ATAATAT-C-AT-ATC-A--TA--C-CAT-A-TC-------G---TA-T-----------C--TA--------------CCA-----------------T-A-T-C-GTA-TA-AT----ATCGGTATCA-TA--C-CATA-TC--G-TAT-----AAT----A--T---ATT---G---------T--T---CATA---TCA-TA----A-C-CATAT-C--G--T--A-T--A-AT----NTCAAT-A-TC---A-T----ATAAT--ATC-GTATCATA--TA--CCAC-A------AATC-ATATCCA-T--ACCA-TAT--CG---TATAGTA-ATA-ATATCGCATCATAACCATATCGTATATCTCG-TAATTCATACNNNNNNTNNNNANNNCGNANANNNNNNTANCNAATNNNNNNCNNNNTNNNNTATANCGNCATNNANTNATNNNNANNNCGNNNNNCGATCGTATA--ATATCGTAT-----CATACCAGCATCT-AA-CTACTC-CAAATACC-----ATNTTAG-ATCACAAGACGCATTCTTAATCTAAGTTT----GATGAAANTTNAACAAAGCAAT
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Reference ( family-1561 ) : AAGATT-ACA-A--A-GC-TC-A--C-C--TC-------GAC-G-GGGC-AA-CA-C--C--TT-T--AT-A--TGGCAC-C-A---T-T-AT--------T---A-TA---T-T-----A--TGC-T-TTA-TTT--TAG-CCC--ACA--G-G-A--TTT-CAT--CCG--T--TT-ACAACT-TTATCA-T-A-T---------TACACA-A--TA-CT-AAAAA--AAT-TATC--AT-AA-TG-TAC--AT-AA-TATA-------A-ACAT-CTATA-T-T--ATATAC-TTATAA---ACATAT-AT--T-TA---TGA-TTATCTAT-TAT-A-ATATAGGATATA-AA-TATGATTAT-AATA-TATT-CAT-A-TAA-AATC--A-T-AT--T-ATTATGAT-A-TCAT-T--G-A-TAT--TAT-AT-CATA-TGA-A-TA----TCAAT-GT--AA--TA----TATA----TG--TAT--ATAA---TA-ATAT-ATCGT-A----TAAT-CA-----TANT-ATA--C-CATA--CG-----T-AT--TA-T-A-C------C----AT-----CGTA-T-G-ATATC------G-TA-ATCAT-ACCAT--ATC-AAAC-A-TA-TGTA------ATCAT-C-ATATT-----CGT-A-ATNAT---AACATATC---------AT--CAT--A-C---AC--C-A-TA-A-TGTANATCAT--ACCATA-TCGTA-T-A---T--AT-CGT-ATNAT-----A----TC-AAA-C-A--ATA--TC-GTAT--A----------CCAT-ATC-GTA----------------TC-A-T-A------TCA-T-AT-AA-----T-AT-TGT-ATCATA------C----CATA----------GTCT--NTAT------C-----C-A-------AAATAT-CATT-CATCG-C---A----ATAC--CTCG-TAT-------A--ATCGTATCATAC-CATA-TCG---AA--------AT--CAT----ACCAT-A-A----CGTATC-ATAC----C-A-TA-TCG-A-T-----------TC---ATA-AT-ATAT--C---GCATCAT-AC-C-A-T---ATCGTAT------AATA--T-C-------TA-CCATA----AT--CATATAATCATC-GTATC------ATATGAAT-AT-CNCGTNNTAT---ANCA--AACC-A-TA-C-NNNANC-ANNNCCCAT-CGT-ATNATATNGNANTCATNT-CGTATC-A-T-ATCNNANTNAT----A---T-TNNCNT-ANACCTAATATCG-TATCAATA--CCAT-A-TCGTA----ATAA--TA--AC-TATCA-TAT---A-A-T-A-TC-GTA-ATCA-TAC--C--A-------AT--ATCA-TA-T-CGT--TA---A-T-ACCA-T--AT--CGT-ATCA-T-A--C-C----A-A-TAT--CGTA---ATC---AT-ACCAT---ATCA-TA--T--NN---A-------AT-----ATCG-----TA--T-CC-ATACCA--TT--ATCA--ATA--A-------TANCA--A-T--CG-TAT----TCAT--A---CCAAT----AN--CG-TAT--C-ATACCATATC--AT-A------ATC-AATAC-CANAT--CATA-T--CCATAC------AAACGTATNGTAT---A--A-TAT-----C-GTAT---C--AT------AC-C-ATNAT--CGTA-TNAT-A-TC-GTATCA--------TA--C-----C-ATAT---C---------------------G-TAT--A---ATATCATA----AT-CA--TACCATA-TCGT------AT--A--AT-----AT---CGT---A--T--C-TAC-AAT--A----A-CATACCATA-AT----CTA-TG--TA-TCA---T-AT--A--T---ATATC-ATAC---AAT---ATC--GTA-ATA--A---TAT-C--AT-T-CATA-C---CCATAT-----TCG--TATAAT------ATCGT----ATCANNNCC---G-NN-CGNNTNNNN-----A---NTATA-NCCNNNNT---ANNNNCGNNNTNNCATNCNNNNNNNNNATA-TNTCNANA---CCATATCGT-A-TC-ATA--A-TAT---A---ATCATA-CATAAT--------CGTATCAT--A--CC--ATAT-CGT----AT-----TA----AT-----A---TC-GTA--T---CAT-----ATC-A----ATACC--A-T-A--TCGTA-TA--ATA----A-TAT-ACCA-A---T-A----T-C-A-TA---T----A-A-----TA-TCGTA-TCA--TA--CCA-TA-TC---------------------GT----ATAATATCAT-ATCA--TA--C-CATATCG---TA-T-----------CTA--------------CCAT-A-T-C-GTAT-A-ATATCGGTA-TCA-TA--CCATA-TC--GTAT-----AAT----A--TATT---G---------T--T---CATA---TCA-TA----A-C-CATAT-C--G--T--A-T--A-AT---------NTCGATA-TC---A-TATAATATC-G---TATCATA---TA--CCAC-A--NATC-A-TATC-----CATACCATAT--CG---TATAGTA-ATA-ATATCGCATCATAACCATATTGTATACCTCGCCAACTCATACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCGATCGTATA--ATAT--TATATCAT---ACCAGCATCTAAACTACTC-CAAATACC-----ATNTTA-G-ATCACAAGACGCATTCTTAATCTAAGTTT----GATGAAAATTGAACAAAGCAAT
gi|1 : AAGATT-ACACA--A-GC-TC-A--C-C--TC-------GAC-G-GG-C-AA-CA-C--C--TT-T--AT-A--TGGCAC-C-A---T-T-ATG-------T---C-TA---T-T-----A--TGC-T-TTA-TTT--TAA-CCC--A-A--G-G-A--TTT-CAT--CCA--T--TT-ACAACT-TTATCA-T-A-T---------TACACA-A--TA-CT-AAAAA--AAT-TATC--AT-AA-TG-TAC--ATCAA-TATA-------A-AAAT-CTATA-T-T--ATATAC-TTATAA---ACATAT-AT--T-TA---TGAATTATCTAT-TATCA-ATATAGGATATA-AA-TATGATTATGAATA-TATT-CAT-A-TAA-AATC--A-T-AT--T-ATTATGAT-A-TCAT-T--G-A-TAT--TAT-AT-CATA-TGA-A-TA----TGAAT-GT--AA--TA----TATA----TG--TAT--ATAA---TA-ATAT-ATCGT-A----TAAT-CA-----TATT-ATA--C-CATA--TG-----T-AA--TA-T-A-C------C----AT-----TGTACT-G-ATATT------GTTA-ATCAT-CCCAT--ATC-AAAC-A-TA-TGTA------ATCAT-C-ATATT-----TGT-A-ATAAT---AATATATCG--------AT--CAT--A-C---AC--CAA-TA-A-TGTAAATCAT--ACCATA-TCGTA-T-A---T--AT-TGT-ATGAT-----A----TC-AAAGC-A--ATA--TC-GT-T--A----------CCAT-ATC-GTA----------------TC-A-T-A------TCA-T-AT-AA-----T-AT-TGT-ATCATA------C----CATA----------ATCT--TTGT------C-----CAA-------AAACAT-CATTCCATCGAC---A----ACACCGCTCG-TAT-------A--ATTGTATCATAC-CATA-TCG---AA--------AT--CAT----ACCAT-A-A----CATATC-ATAC----C-A-TA-TTG-ATT-----------TC---ATA-AT-ATAT--T---GCATCAT-ACGC-A-T---ATCGTAT------AATA--TCC-------TA-CCATA----AA--CATATAATCATC-GTATC------ATAGAAAT-ATNNNNNNNNNNN---NNNN--NNNN-N-NN-N-NNNNNN-NNNNNNNNN-NNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNN-N-N-NNNNNNNNNNN----N---N-NNNNNN-NNNNNNAATATCG-TATCAACA--CCAT-A-TCGTA----ATAA--TA--AC-TATCA-TAT---A-A-T-A-TC-GTA-ATCA-TAC--C--A-------AT--ATCA-TA-T-TGT--TA---A-T-ACCA-T--AT--CGT-ATCA-T-A--C-C----A-ACTAT--TGTA---ATC---AT-ACCAT---ATCA-TA--T--CT---A-------AT-----ATTG-----TA--TCCC-ACACCA--TT--ATCA--ATA--A-------TAACA--A-C--CT-TAT----TCAT--A---CTAAT----AA--CG-TAT--C--TACCTTATC--AT-A------ATC-AATAC-CAAAT--CATAGT--CCATACA-----AAACGTATAGTAT---A--G-TAT-----C-GCAT---C--AT------AC-C-ATAAT--TGTA-TTAT-A-TT-GTATCA--------TA--C-----C-ATAT---C---------------------G-TAT--A---ATATCATA----AT-TA--TACCATA-TCGT------AT--A--AT-----AT---CAT---A--T--CTTAC-AAT--A----A-TATACCATA-AT----CTA-TA--TA-TCA---T-AT--A--T---ATGTC-ATAC---AAT---ATC--ATAGATA--A---CAT-C--AT-T-CATA-C---CCATAT-----TCG--TATAAT------ATCGT----GNNNNNNNN---N-NN-NNNNNNNNN-----N---NNNNN-NNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNCCCATATTGT-ACTC-ATA--A-TAT---A---ATCATA-CATAAT--------TGTATC-T--A--CC--ATAT-TGT----AT-----TA----AT-----A---TT-GTA--A---CAT-----ATC-A----ACATC--A-T-A--TCGTA-TA--ATA----A-TAT-ACCA-A---T-A----T-C-A-TA---T----A-A-----CA-TTGTA-TCA--TA--CCA-TA-AT---------------------AT----ATAATATCAT-ATCA--TAG-C-CATATTG---TA-T-----------CTA--------------CCAT-AGT-C-GTAT-A-ATATCGGTA-TCACTA--CCATA-TC--ATAT-----AAT----A--TATT---G---------T--T---CATA---TCAGGA----A-C-CATAT-C--G--T--A-T--A-AT---------TTCAGTA-TC---A-TATAATATC-A---TATCATA---TA--CCAC-A--AATC-A-TATC-----CATACCATAT--CG---TATAGTA-ATA-ATATCGCATCATAACCATATTGTATATCTTG-TAACTCATACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCGATCGTATA--ATAT--TATATCAT---ACCAGCATCT-AACTACTCACAAATA-C-----ATTTTA-GAATCATAAGACGCATTCTTAATATAAGTTCTGGAGATGAAATATGAACAAATCAAT
gi|10 : TA-CATT--AT-A-TAT-AATC--A-T-----T-AT-ACCA--A-TCAT-T--T-A-TAC--CAT-AT-CAT--T---A-TA----CCA-T-GTTCGA--TA----TATA----TTACCAT--ACAT---TC-AT-T-AT--T-T----TAAT-CA-----TA-----A--C-CAT----------------TA-T-A-C------C----AT-----GCCC-T-T-ATATC------A-TA---CA--ACTAT--ATC--------CA-TGT--------TCAT-T-ATATTATAGACAT-A-ATCATTTAAACATGTC---------AT--TAT--A-----AC----A-TACA-T-TAAATTAT--ACCATG-TCATT-C-A---T--AT-TAT-ACCAT-----ACATTTC-AAT-T-A--TTA--TA-GCAT--A----------CCAT---T-ATA----------------CC-A-T-G------TCA-TTAT-AA----------------CATA------C----CATA----------GTATTACTAT------T-----C-AT------ACGTATACATA-CGCCA-C---------TA---CTCT-TAT-------AC-ATATTATTATAG-TATA-CCA---AT--------AT--CATTATAACCAT---G----TGTATT-ATAC----T-A-TA-CCA----------------C---ACA-TT-ATAT--CTAGACATTAT-Agcctatttaaacaacat
gi|11 : tatcataccatatcattattccatgtcatTA-CATT--AT-A-TAT-AATC--A-T-----T-AT-ACCA--A-TCAT-T--T-A-TAC--CAT-AT-CAT--T---A-TA----CCA-T-GTTCGA--TA----TATA----TTACCAT--ACAT---TC-AT-T-AT--T-T----TAAT-CA-----TA-----A--C-CAT----------------TA-T-A-C------C----AT-----GCCC-T-T-ATATC------A-TA---CA--ACTAT--ATC--------CA-TGT--------TCAT-T-ATATTATAGACAT-A-ATCATTTAAACATGTC---------AT--TAT--A-----AC----A-TACA-T-TAAATTAT--ACCATG-TCATT-C-A---T--AT-TAT-ACCAT-----ACATTTC-AAT-T-A--TTA--TA-GCAT--A----------CCAT---T-ATA----------------CC-A-T-G------TCA-TTAT-AA----------------CATA------C----CATA----------GTATTACTAT------T-----C-AT------ACGTATACATA-CGCCA-C---------TA---CTCT-TAT-------AC-ATATTATTATAG-TATA-CCA---AT--------AT--CATTATAACCAT---G----TGTATT-ATAC----T-A-TA-CCA----------------C---ACA-TT-ATAT--CTAGACATTAT-Attaaccat
gi|12 : tatcataccatatcattattccatgtcatATACCGT-A-TC-GTA--A-TAT---A---AACATA-AA-AAT--------CATAT-AT--A--CCGAATAC-C-T----ATCTAGCTACCATAT-----G---TT-ATA--T---CATG----ATC-ATTCCATGTCTAA-T-AAGTCGTA-TA--A------G-TAT-ATCATG---T-ACT--T-C-A-TAATCT----G-A-----TA-TCAC--TCA--TA--C-A-TA-TC---------------------GT----ATAACA-----ATCA--TA--C-CATATCGATATAAT-----------CTATTCATTGATATTATCCAT-A-T-C-GAAT-G-ATATCCGT--TCA-TA--CC-TA-TCC-GTAT-----C-T----A--TGTT---AAGCATCTATC--T---CATA---TCG-TA----A-CTCATGTAC--G--T--A-TTCATAC---------CTCG-TA-TC---A-TAT-ATATTAG---TATAATA---TACTCTAT-A--GAAC---TATT-----CTTGATATAT--CGGGCTATTGTATATA-ATttaaccat
gi|13 : taatatgtattatgacagtatctgata-TTGT-A-TC-AAATCA--------TA--C-----A-ATAC---C---------------------A-TAT--C---ATATCATA----TT-AA--TACCATA-TCGT------AA--A--GT-----AT---CGT---A--T--TATAT-AAT--A----A-CA---CATT-GT----TTACTT--CG-CCAATTT-AT--A--T---NNNNN-NNNN---NNN---NNN--NNN-NNN--N---NNN-N--NN-N-NNNN-N---NNNNNN-----NNN--NNNNNN------NNNNN----NNNNNNNNN---N-NN-NNNNNNNNN-----N---NNNNN-NNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTATAATA-TCATAAAATA-CCACATCGT-A-TA-ATAT-A-CAT---GT--ATCATA-TACACT---------GTA--AT--A--CC--ATAT-CGT----A------TA----CT-----A---TC-ATA--T---CGT-----GT--A----ATATC--A-T-A--TCGTA-TA--ATA----A-CAT-A-AA-A---T-A----C-C-A-TA---T------------TG-TC-TA-C----TA--TCA-TA-TC---------------------AA----ATTATACCAT-ATCA--Tcattgatta
gi|14 : atgttaccttcgcctatT-ACA-A--A-GC-TC-AATCAC--TC-------GA----GGGC-AA-CA-C--C--TT-T--ATTA--TGGCAC-C-A---T---AT--------T---AATA---C-TTTA--A--TGC-T-T-A-TTTA-TAA-CCC--ACA--G-G-A--TTTTCATGTCCA--T--T--ACA-CT-TTATCA-TTA-T---------TACACA-A--TA-CT-AA-------T-TTTT---T-AA-T----C--ATTAA-TA-----------ACAT-CTATA-TAT--ACATA--TTATAA----TACAT-AA--T-TA---TGA-TTAATCAT-TAT-A-AAATAGGATATATAA-T-TGA-TAT-AATA-TAT---AT-A-TCATACTC--A-T-AT--T-AAT-TGAT-ATTCAT-T--G-ACTATAGTAT-GTATATATTGAGA-TA----TT-AT-GT--AAGTTACTATTATA----T---TAT--ATAA---T--ATA--ATCGT-T----TAAT-CA-----TGTT-ACAC-C-CATAATCG-----T-AT--TACT-A-C------CCATTAT-----CGTA-TGG-ATAT-------G-TGTATCAT-ACCc
gi|15 : AGATA-ACA-A--A-GT-TC-A--C-C--TC-------GAC-A-AGGA-AA--A-C--C--GT-T--AT-A--TGGCAC-C-G---T-T-AT--------T---A-TA---T-TC----A--TTC-T-----GTT--TAG-TCC--ATA--G-G-A--TTT-CAT--CTG-----TT-AC--CT-TTATCA-T-A-T---------CACA-A-G--CA-TA-AAGAA--AAT-TATC--AC-AGTTG-TA---AC-GA-TAT----------ATAT-CTATA-T-T--------------A---ACATGT-ATGAT-TAATGTGA-TCATC-A--TAT-A-TTA-ATGATATG-AATTAT-ATTGC--ATC-TATT-AAT-G-TAT-ATTC--A-T-A-------CATG-T-A-ATAT-T--------T--TAT-AT--ATA-TGA-ATTAATTTTTGAT-AT--AA--TA----TATA----TA--TATC-ATAA---TA-TTGT-ATTG--AGAGTTAAT--A-----CAAT-ATA--T-CATA--
gi|16 : tcAAGATT-ACA-ACCA-GT-TCCA--C-C--T---------AT-T-GGGC-AA-CA-C--C--TT-TT-AT-A--TGGTAC-C-A------------------------A---T-T--------TGCCT-TTA-ATTGATAG-CCC--ACACAG-C-A--TTTTCAT--CCA--TACTT--CA-CT-TT-TCA-T-A-T----------ACACA-A--TA-CT-AAAAA--CAT-TATC--AT-AA-TG-TACCAAT-AA-TGTA-------A--CAGGCTATA-T-T--A-GCACGTTATAAT--ACATCC-AG--T-TA---TGA-TTATCTAT-TAT-A-GTATAGGATATG-A---ATGATGAT-AATA-TATT-TAT-A--AA-AATC--A-T-AT--T-A-TGCAAT-A-TTA--T--A-A-TA---TATAAT-CTTA-TGG----------CCGT-AT--AA--T-------TG----CG--TAT--ATTA---TA-Attaaataagatgcatggtatgacgttatgtaaaatata
gi|17 : tcaAAGATT-ACA-G--A-GC-TC-A--C-G--TC-------CAC-G-GGGC-AA-AA-C--C--TT-T--AT-A--TGACAC-C-A---T-T-AT--------C---A-TA---T-TT----A--TGC-T-TTA-TCT--TAG-CCC--ACA--G-G-A--TTTTCAT--CTG--T--T--ACA-CT-TTATCA-T-A-T---------TACACA-A--CATTT-AAAAA--AAT-TAGC--AG-AA-TG-TAC--AA-GA-TAT--------A-ATAT-CTATA-T-T--A----------------------------GA---TGA-TTATGTAT-TGT-A-ATACA--ATAT--AA-TAC-ATCAT-ACTC-TA-T-CAT-A-TAT-GATT--A-T--T--T-AATATAAT-A-ATAT-TTCA-A-TAT--TAT-AT-CATa
gi|18 : atcaA-TAT---ATA-T-A-CCAGTA-TTTG-TAT--A--A-------AT---TCA-TA-T-------A---T-T-ACCAAT--AT--CATTATAA-T-A--T-C----A-A-TAC--CATA---ATCGTTAT-ACAAT---ATCAATA--T--A----A-------AT-----ATAG-----TC--A-AC-ATATCA--T---------ATA--A-------TATGA--A-T--AC-CAT------AT--A---CCATT----AT--CA--------AGATTACGTA--AT-A------ACC-AATATTCATAT--CATA----CCATAC-----------T-TAAT-T---A--AGTAT-----CAGTAT---C-------------C-ATTAC--CAT-----T-A-TT-GTATCA--------TA--C-----C-ATAC---C---------------------T-GAT--A---ATAATAGA----GTGCA--T--CACA-TAAG------AT--A--AA-----ATC--CGT---A--gaaatt
gi|18 : tAT----A---T-TACCA--ATATC-ATTATAA-TATCAATA--CCAT-AATCGTT----ATA---CA--A--TATCAATAT---A-AAT-A-TA-GTC-AACA-TAT--C--A--------T--ATAA-TA-T--G----A---A-T-ACCA-T--AT------ACCA-TTA--T-C----A-A-GATTACGTA---AT----A--ACCA-------A-TA--T--TC---A--------T-----ATCA-----TA----CC-ATAC----TT--A--A--TTA--AG------TATCA--------G-TAT----CCATT-A---CCATT----AT--TG-TAT--C-ATACCATACCTGAT-A------AT--AATA
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gi|19 : tctggtgataaaaattgtacgaatATCGTATA--ATAT--CATATC-T---AACCGCATCT-AACTACTC---AATA-C-----AT-TTACG-ATCACAtaactactcaatacatttacgatcacacaagcaatatacta
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Reference ( family-1561 ) : AAGATT-ACA-A--A-GC-TC-A--C-C--TC-------GAC-G-GGGC-AA-CA-C--C--TT-T--AT-A--TGGCAC-C-A---T-T-AT--------T---A-TA-T-T-----A--TGC-T-TTA-TTT--TAG-CCC--ACA--G-G-A--TTT-CAT--CCG--T--TT-ACAACT-TTATCA-T-A-T---------TA-------------------CACA-A--TA-CT-AAAAA-------AAT-TATC--AT-A-----A-TG-TAC--A--T----AA-TATA-A-ACAT-C-T--------AT-A-T-TA-T-----------ATA-T--TATAA-AC-AT-AT---AT-T-TATGA-TT-ATCTAT-T-AT-A-ATATAGGAT---AT--A-AATATGATTAT-AATA-TATT-CATA--TA-A-AATC--A-T-AT--TATTATGAT-A-TC--AT-T--G-A-------TAT--TAT-AT-CATA-TGA-ATA-TCA-AT-G--T--AA--T---A----T-ATAT-TA---TATAATA-AT-AT-AT--C-GT-AT-AATC-A-----TANTATA--C-C-ATA--C-GT-ATTA-T-A-C-C----AT-----CGTA-T-G-ATATCGT-A-ATCATACCAT--ATC-AAAC-A----TA-TGTA--ATCAT--CAT--ATT-----CGT-AATCAT---AACA-TAT-C-AT----CAT--A-CACCA-TA-A-TGTAAATC-ATA-CCATA-TCGTAT-A-T--A-T-CGT-ATNAT-----A----TC-AAA-C-A--AT-A--T-C-G-------TAT---ACCAT-ATC-GTA----------------TC-A-T-A------TCA-TAT-AAT-AT-TGTA--TCATA------C-CATAGTC-T--NTATC-CATAA--ATATCAT--CAT-CG-CAATA---C--TCGTATA-ATCGTATCA-T-ACCATATCGAAATCAT----AC-CATANCGTATCATACCAT---A-TCGA-T-----------T-C---ATA-ATATAT--C------------GCATCAT-AC-CA-TA--TCGT-AT-AATA--T-C-------TACCATA-ATCA--TATNA--T-AT---CGT-----ATCATAT-GA----ATAT-----NCGT---ANTA---TA-TC-A--NACCA-TACCNTATCAGNNCCC-ATCATATCATAT-AGTA-N-TCATATC-GTAC-CATATC----G-AT---NA-T---AT-TGT---CNT---AT-ACCA----AT-ATC-G-T-AT--CAAT--A-----CCAT-ATCGT-A----AT----A----A--T-A--C--TATCATA----T---A----AT-----AT-CGTAATCA---T-ACC----AAT-------ATC------AT-A-T-C---GT--TA--A-T--AC-CATATCG-TATCA-TA---CC--A----A-TATCGTAATCAT-ACC-ATA-TCATAT--T-NAAT-----ATCG---------------T-AT-C-----------CATAC-C-----------A-T-----T--AT-CA----A-----TA----AT-AT-C------AATC-GTAT----TCATA-CCAAT-AT--C--------GT-ATCA-TAC-C-A-TATCATA----ATCA-ATACCATATC--A-TA-T-C--CATA-CA----GTA----TC--GTAT-AA-T-ATC-GT-A---TC-A-T------AC---CA--T-----A-T---CGT-----------------ATA-----AT-ATCGTATCA--------TA-----C-----C-AT-ATCG-T----ATAA----TATCAT-----------A---------AT-CA--TACCATA--TCG-TATAAT-----AT-C-GTA--T--C-TA-CA----ATAACATACC--ATA-AT----CTA-TG--TA-TCATAT--AT---A----TATC-ATAC---NAT---ATC--GTA-ATA--A---TATC--AT-TCATAC---CCATAT-----TC-----GTATAAT-ATCGT----ATCATNNCCANNCG--TATNNNN-----ACTAT-ATCC-AANNTATC---ANCGNNNTNCCATNCNNANNNNNC-ATATNTCNAT--A---CCA-TA-TCGTA-TC--ATA--A-TAT---AATCATACATAAT--CGTAT-----CAT--A--CCAT-AT-CGTATTAATA---TCGT----ATCATA-T-CAAT-ACCAT-ATCG-----TA-----TA--ATA---AT--ATACC-----------AAT-A----T-CATA----T----A-AT----A--TCGT-ATC-A--TA--CCA-TA-TC-GTATAATAT-CAT-ATC--A--TA--C-CA-TA-TCGTAT-CTACC-AT---A-T-C-GTA-TA-ATATC-GTA---TCA-TA----C-CA--TAT-CG-TATAATA--TA-TC---GT-TCATATC-GTA----ACCATATCGT--AT-----AAT-N----TCGGT--A-TCA-T----ATAATAT-CATATCGT-A--TACC-------AC-A--N------ATCATATC-CAT--ACCATA--T--CG-TATA-G-TAATA-ATA--TCGCATCATGACCATA-TT-GTATATCTTGTAACTCATACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCGATCGTATA--ATAT--TATATCAT---ACCAGCATCTAAACTACT--CAAATACC-----AT-TTAG-ATCACAAGACGCATTCTTAATCTAAGTTT----GATGAAAATTGAACAAAGCAAT
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gi|11 : tatcataccatatcattattccatgtcatTA-CATT--ATA--TA-T-AATC--A-T-----TAT-ACCA--A-TC--AT-T--T-A-------TAC--CAT-AT-CAT--T---ATA-CCA--T-G--TTCGA--T---A----T-ATAT-TACCATACATTC-AT--T-AT-----T-TT-AATC-A-----TA----A--C-C-AT----------TA-T-A-C-C----AT-----GCCC-T-T-ATATCAT-A---CA-ACTAT--ATC-----------CA-TGT----TCAT--TAT--ATTATAGACAT-AATCATTTAAACA-TGT-C-AT----TAT--A--AC-A-TACA-T-TAAATT-ATA-CCATG-TCATTC-A-T--A-T-TAT-ACCAT-----ACATTTC-AAT-T-A--TT-A--T-A-G-------CAT---ACC---ATT-ATA----------------CC-A-T-G------TCATTAT-AA------------CATA------C-CATAGTA-TTACTATT-CATAC--GTAT-A---CATACGCCACTA---C--TCTTATACATATTATTA-T-AGTATACCAATATCATTATAAC-CAT-GTGTATTATACTAT---A-CCA----------------C---ACA-TTATAT--CTAG---------ACATTAT-Attaaccat
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gi|13 : atgttaccttcgccTATC--A-AA-T-C---ATA-CA----ATA----CC--ATAT-CA-T-ATC-AT-A---TT-AAT------AC---CA--T-----A-T---CGT-----------------AAA-----GT-ATCGTATTA--------TA-----T-----A-AT-Acttcgccaatttatatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtataatatcataaaataccacatcgtataatatacatgtatcatatacactgtaataccatatcgtatactatcatatcgtgtaatatcatatcgtataataacataaaataccatattgtctactatcatatcaaattataccatatcatc
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gi|17 : tcaAAGATT-ACA-G--A-GC-TC-A--C-G--TC-------CAC-G-GGGC-AA-AA-C--C--TT-T--AT-A--TGACAC-C-A---T-T-AT--------C---A-TA-T-TT----A--TGC-T-TTA-TCT--TAG-CCC--ACA--G-G-A--TTTTCAT--CTG--T--T--ACA-CT-TTATCA-T-A-T---------TA-------------------CACA-A--CATTT-AAAAA-------AAT-TAGC--AG-A-----A-TG-TAC--A--A----GA-TAT--A-ATAT-C-T--------AT-A-T-TA------------------------------------------GATGA-TT-ATGTAT-T-GT-A-ATACA--AT---AT----AATAC-ATCAT-ACTC-TA-T-CATA--TA-T-GATT--A-T--T--TAATATAAT-A-AT--AT-TTCA-A-------TAT--TAT-AT-CATaa
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gi|2 : atcAT-GT-CATA-C-A-ATAGTCA-ATTA--T--AA--T---A----TCATAT-CA---TACA-TA-TT-GT-AT--C-----T-ACTC-A------AAT-------C-ATA--C-GT-ATTA-G-A-T-C----ATTACATCATA-T-A-ATGTCGT-A-TCCATACCAC--AT------------TG-TATA--AT--T--CGT--ATC-----CATGAACCAT---ACCG-TAT-C-ATAC--CAT--ATCATTAATC-A-T-TAGTTC-ATA-CCATA-TTGTGT-AAT--A-TTCGT-ATCATGACCTA----TC-TTA-CTG--AT-A--T-CTG-------TATCA-ACCAT-ATCGGTATCCACCCATATTGAAATC-A-T-ACCATAATCA-TAT-AATTAT-TGTA--TCATAATTGAACGCATA----T--GTGTT--ATAA--ATAACAT---AT-CT-TA---------TCATACATATTGTATGA-T-ATCATA---AAAT--T----AC-CATATCGTATCATACCAT---A-TCTA-TAATATCTGTGAT-C---ATACAAACATTAC------------GCATTAT-AC-CA-TA--TCGT-AT-CATACAT-C-------TGATATA-AT-----ATAA--T-ATTACCAT-----ATCGT-T-GG----ATAT-------GT---ATCA---TA-TC-A--AACCA-TATCGTAT-AATACCC-AT-AT-TCATGT-A-TA-C-TCGTATC-ATAC-CTTATCCATTG-AT---CACT---AC-T-T---CTTTAGGT-AT-A----AT-ATC-A-C-AT--CA-T--A-----CCAT-AT-GT-ATAATAT----A----A--T-ATCC--TACCATA----TTGTAT---AT-----AT-CATGATCA---TTACCCCATAGTTGTATCCACC------AT-A-T-T---GTGATA--AAT--AT--ATAT-----TCA-GAAC-CC--AT---A-TACGGTTGTAAT-ATG-GT--TCATAT--T-CAACGCGAGATCGGGGGCTAAATTCTACTGAT-C-----------CATAC-CCCCCCCTGCCCA-T-----T--ATTCA----AAAGCCTA----AT-GT-G------GATC-GTAT----CGATA-AC-----T--C--------TT-ATTA-TAC-T-G-AATCAT-----ATCA-GTATAGTATA--A----------ATA-TG----GAA----TT--CCAT-AA-T-ACC-GT-AATTTT-G-T------AC---TACTT-----A-T---CG------------------GTC-----AT-----TTTCA--------TA-----C-----C-AT-ATCG-TGAAGA-AA----TAGCAT---------------------AT-----TACCAT---TCA------------AT-C-A---------TA-CA----ATAATATACC--ATATAT----C-A-GG--TA-TGACATG-ATC--A----TATC-AAAC---CAT----TCTTGTA-TCA--A---TGGA--GC-TAAGAT---CGGT--------------GTATATT-ATT-T----ATTGTTACC--TCG---ATAATC-----A--AT-ATTC-A--CTAT------CGTGATGCT-TCTGTATAATGA-AT---TTAGT--T---GCA-TA-TCG-A--C--ATA--T-TCG---AAT-ATACA-AATACCATAT------AT--ACTCCAT-AT-CCGA--AGTT---CCTT----ATCATA-C-CAAT---TATAATCG-----AG-----TT--ATA---AA--ATA-----------------A----T-TATA----T----G-AA----G--CGGC-AGC-AAGTACTCCACTAGTT-GTATAAT-T-CATAATC--ACTTT--C-CA-TA-TCGTA--CTA---AT---ACT-C-ATA-TA---GTC-G-A---T---TA----C-CA--TAT-TG-TTGAATAAGTA-TC---AT-ACATACC-TT------CCATATCGGAAAT-----AATAA----TC-AT--ACTCAGT----ATAATGT-CACATCAC-A--TATC-------AT-ATTC------ATCATACC-CAT--ATCggagctaagatcggtgtatattatttattgttacctcgataatcaatattcactatcgtgatgcttctgtataatgaatttagttgcatatcgacatattcgaatatacaaataccatatatactccatatccgaagttccttatcataccaattataatcgagttataaaataattatatgaagcggcagcaagtactccactagttgtataattcataatcactttccatatcgtactaatactcatatagtcgattaccatattgttgaataagtatcatacataccttccatatcggaaataataatcatactcagtataatgtcacatcacatatcatattcatcatacccatatc
gi|20 : atcaCA-G--A-GC-TC-A--A-C--TC-------GAC-G-GGGC-AA-CA-C--C--TTAT--AT----TGACAC-C-A---T-T-AT--------TCATG-TACT-T-----A--TGC-T-TTA-TTT--TAG-CCC--ACA--A-T-A--TTT--AT--CTG--T--T--AC--CT-TGATCA-T-A-T---------TA-------------------CACA-T--CA--T-AAAAATTATCATAAT-AATG--AT-A-----A-TA-TAT--A--TGAATAA-TATC-T-ATAT-C-TTTTGATGCATCA-T-TA-TGAATCTTTGCAATA-CAATATAATAC-ATCAT---AT-TCTATAA-TCCATGTAT---AT-G-ATATTTAAT---AT--A-AAT
gi|22 : AGATT-ACA-G--A-GC-TT-A--A-C--TCACTCAAGGAA-G-CGAC-AG-CA-C--C--TT-T--AT-A--TGGCAC-C-A---T-T-ATTATATACAT---A-TA-T-T-----A--TGC-T-TTG-TTT--TAG-CCCCAATA--G-G-GTTTTT-TAT--CTG-----CT-AC-ACT-TTATGATT-A-TCAGTGCATGTA-------------------CACA-A--CA-TA-AAAAA-------AAT-TATC--AT-A-----T-TA-TAT--A--T----GA-T------ACAT---T--------GT-A-T-TT-G-----------ATA-T----CAA-AT-AT--T---AT-C-TAT-A-TT-ATATATAT-AT-A-
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gi|27 : AAGATT-ACA-A--A-GC-TC-A--C-C--TC-------GAC-G-GGGC-AA-CA-C--C--TA-T--AT-A--TGGCAC-C-A---T-T-AT--------T---A-TATT-T-----A--TGC-T-TTA-TTT--TAA-CCC--ACA--G-G-AT-TTT-CAT--CCG-----TT-AC-ACT-TTATCA-T-A-T---------TA-------------------CACA-A--TA-TC-AAAAAC------AAA-TATC--AT-A-----A-TG-TAC--A--T----AA-TATA-
gi|28 : ggaaatca-AT-AT--C--T-AT-AATC-AGTTAATACTATATAC-C-ATAT-C-GT-ATTA-T-A-C-A----AT------G-A-T-G-ATATTGT-C-ATCATACCAT--ATC-AAACAA----TA-Tttta
gi|28 : TAT-CTAT--A----A-T-CAGT--TA-ATAC---TA---T-A-TA----C-CA--TAT-CG-TATTATA--CA-AT---GA-TGATATT-GTC----ATCATACCAT--ATCAAACAAT-A----TTGAT--A-TC--T----CGAATA--CGTGT-GTCC--TGCC-------ACGA--G------ATCTCATC-C-----TCATG--TTCTGTTATA-G-TAGTACATA--CC----CACGATCATA-Ttgatatctcgaatacgtgtgtcctgccacgagatctcatcctcatgttctgttatagtagtacatacccacgatcatatg
gi|29 : aAAGATT-ACA-A--AAGC-TC-A--C-C--TC-------GAC---GGGC-AA--A-C--C--TT-T---T-A--TGGCAC-C-A---T-T-AT--------T---A-AATT-T-----A--TGC---TTA-TTTA-TAG-CCC--ATAT-G-G-AT-TTT-CAT--TCGCAT--CTGACCACT-TTATCA-T-A-T---------T-----------------------A-A--TA-CTAAAAAA-------AATATATC--AT-------A-TG-TAC--A--g
gi|3 : caATA-AT-AT-AT--CTGT-ATCAACCCA-----TATCGTA--C-AGATA--TTGT-AT-A-T-A-C-C----A-------ATA-TTG-ATAT-AT-ATGTTATACCAT--ATC-GTAC------TA--------------CAT--ATT-----TGC-TATAAT---ATGA-TAT-C-AT------------ATC----------AAACC-ATATCCATA-T--TA--A-T--A-----T-GTTAT-----A----TA-AAA-C-C--AT-A--T-C-GATAACTTTAT---A-CAT-ATC-GTA----------------TT-A-T--------TCA-TAC-TAT-AC-TATA------------------AGCCAT--CTATCATATAC--ATATC-T--TAT-CA-TAATG---TTATC-TAGA-AT-GTATCATT-ACCATATCT--ATCAT----ACGCATAACAAATCAT-CCAT---A-T----------------------GTA-ATATAT--CCTATCTAAATCTGCATCAT-AC-CA-TACTTCATAAT-AATA--T-CA------TACCATA-GTCA--TATAATTT-AT---CGTTTATGACCATAT--C----ATAT-----T-GTATAATTAAATTA-TCGA--TATCA-TACCATATGGTATAAT-ATCGTATCATAC-AATAGG-TTGTATC-ATATACATATT----G-GTA--TA-T---AC-CAT---CATC--AT-ATAA----AT-ATC-G-C-ATTACAGTCAA-----TCGT-ATC---A----AT----T----A--C-A--T--TATCATA----T--------AT-----ATACGT-ATCA---A-ACC-----TT-------ATC-------T-A-T-CCAAAT--CAATA-T--AC-CATATCG-TGTCAGTATGTCCATA----A-TAGCATATTTGT-ACTAATA-TTGTAT--C-AAAT------------------------T-AT-C-----------C-TAC-C-----------A-------G--AT-CG----A-----TA----ATAAT-CATATGTAACC-ATA-----TCATA-CCAATAAT--CAATAATATAT-ATCAGTACTC-ATTATCGCT----ATTA-ATATCATACC--A-TT-TGT--CATA-CA----ATA----TCATATAT-AA-T-ATC-A---------A-T------AC---CA--T-----ACT---CGT-----------------ATA-----ATGATCGT-TCA--------TT-----A-----C-AT-ATCA-TTA--GTAA----TATCGG-----------T---------AT-CA--TACCATG--TCA-TATAAT-----AT----TA--T-----------------CATACC--ATA-AT----C----G--TA-TCATTT--CC---C----TAT-----T---GGT---ATC--G---ATA--A---TATT--AT-TCATAC---CGATAG-----TC-----GTATCAT-ACCAT----ACCATATTTGTATGAATATACGA-----AC-AT-ATTC--ACATATCAGTATCGTAATATCATACCATATAATA-ATGTATCTAC--A---CTA-TAGTCATA-TCGTACA--A-TATG--AAGTAT-CATAGT--TCTATATGTACAT--A---CATAAT-CATAT--ACA---T-GT----ATC--------AT-ACCAT-ATTG-----TA-------------------ATATC-----------A---A----T-CATA----T------AT----A--TCGC-ATC-A--TAG-CCA-GA-TT-GTATCATATCCAT-ATC--G--TA--TACA-TAGTCGTAT-ATACCAAT---A-T-T-AGATTA-ATATT-GTA---TCA-TACAATC-CA--TATCCG-TATAAT-----------------------------ACCATATCAT--A------------------GT--A-TCA-A----ACAA-AT-CATATC---A--TAC---------C-A--T------ATCATACC-CATA-ATCGTA--T---A-TATA-GATAAT--ATA--TCGCATCATAACCATACTT-GT
gi|30 : acC--GTAT-AA-T-ATC-AT-A---T-----------AC---CA--T-----A-T---CGT-----------------ATA-----TC-ATTATATCA--------nnnnnnn
gi|30 : ATCATATACCATATCGTATATCATTATATCAGCATCTAAACTACT--CAAATACTCAAAAATAATAG-ATCACAAGAC-CATTCTTAATCTAAGTTT----GATG-AAATTCAACAAAGCAATgcatctaaactactcaaatactcaaaaataatagatcacaagaccattcttaatctaagtttgatgaaattcaacaaagcaataactcaaatatcgcctg
gi|31 : cgtataatGATC-ACA-G--A-GC-TC-A--C-AGATC-------GAC-G-AGGCCAA-CA-C--A--TT-T--AT-A--TGGCGC-C-A---T-TCAT--------T---A-T--T-T-----A---GC-A-ATA-TT------------------------TTT-CAT----G-----TC-ACAATT-TTATTA-T-A-T---------TA-------------------CA----------T-AAACA-------TAC-TATT---T-A-----A----TAT--A--T----GA-TATA-ATACAT-aactcaaatatcgcctg
gi|32 : gtaatcaatAAGATT-ACA-G--A-GC-TC-A--C-C--TC-------GAC-G-GG---------------------------TAACAC-C-A---T-T-GT--------T---A-TATT-T-----A--TGC-T-TTA-TTT--TAG-TCC--ATA--G-G-AC-TTT-CAT--CTG-----TT-AT-ATT-TTATCA-T-A-T---------TA-------------------CACA-A--CC-TT-AAAAA-------A---TATC--AC-A-----A-TG-TAC--A--T----AA-TAT
gi|33 : tcaTATCA--------AA-----C-----C-AT-ATCG-T----ATAA----TACCAT-----------C---------A--CA--TACCATA--TTG-TATAAT-----AT-C-ATA--A-----A-CA----ATATCATACC--ATA------------------TCATAT--A----A----TGTC-ATAC---AAT---ATC--GTA--TA--A---TATT--GTGTCATAC---C-ATAT-----C-----------AT-ATCGT----ATCc
gi|34 : ccattttaTATCTTA-TA-T-T--CATG---------A----TC--ATAT-AA-TCATT-GT-A---TC-A-T------AC---AA--T-----A-TAATCAT-----------------ATA-----TG-ATCGTGTCA--------TA-----C-----C-AT-ATCG-C----ACCA----AACCATGATTGTAGTTCA---------AT-CA--TACCATAAGTCG-TAAAATA----AT-C-GTA--T--C-
gi|35 : tg--T----AA-TATA-A--CAT-C-T--------AT-A-T-TA-T-----------ATA-T--TATACTAC-AT-AC---A--T-TATGA-TT-ATCTAT-T-AT-A-ATTTACGAT---AT----AATATGA-TAT-AATA-TAT----TA--TG-A-TATT--A-T-GTAATATTATa
gi|36 : AGATT-ACA-A--A-GC-TC-A--C-C--TC-------GAC-G-GGGC-AA-GA-C--C--TT-T--AT-A--TGGCAC-T-A---T-C-AT--------T---A-TAGT-T-----A--TGC-T-TTA-TTT--TAG-CTC--ACA--G-G-AT-TTT-CAT--CCA-----TT-AC-ACA-TTATCatt
gi|37 : -T-AT--CAAT--A--------T-ATAAT-A-----T----G----A--T-A--C--T-TTATG----C---A----AT-----AT-TATA-TCA---T-AT-----AAT-------ATC------AT-G-T-C---GC--TC--G-T--AG-AATATCA-TATAA-TA---CC--A----A-TA
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Reference ( family-1561 ) : AAGATT-ACA-A--A-GC-TC-A--C-C--TC-------GAC-G-GGGC-AA-CA-C--C--TT-T--AT-A--TGGCAC-C-A---T-T-AT--------T---A-TA-T-T-----A--TGC-T-TTA-TTT--TAG-CCC--ACA--G-G-A--TTT-CAT--CCG--T--TT-ACAACT-TTATCA-T-A-T---------TA-------------------CACA-A--TA-CT-AAAAA-------AAT-TATC--AT-A-----A-TG-TAC--A--T----AA-TATA-A-ACAT-C-T--------AT-A-T-TA-T-----------ATA-T--TATAA-AC-AT-AT---AT-T-TATGA-TT-ATCTAT-T-AT-A-ATATAGGAT---AT--A-AATATGATTAT-AATA-TATT-CATA--TA-A-AATC--A-T-AT--TATTATGAT-A-TC--AT-T--G-A-------TAT--TAT-AT-CATA-TGA-ATA-TCA-AT-G--T--AA--T---A----T-ATAT-TA---TATAATA-AT-AT-AT--C-GT-AT-AATC-A-----TATTATA--C-C-ATA--C-GT-ATTA-T-A-C-C----AT-----CGTA-T-G-ATATCGT-A-ATCATACCAT--ATC-AAAC-A-TA-TGTA--ATCAT-CAT--ATT-----CG---T-AATCAT---AATA-T---AT-C-A--T--CAT--A-CACCA-TA-----A-TGTAA-ATCATACCATA-TCG---------TAT-A-T--ATT-GT-ATNAT-----A-----TC-AAA-C-A--AT-A--T-C-GTAT---ACCAT-ATC-GTA----------------TC-A-T-A------TCA-TAT-A-AT-AT-TGTA--TC-ATA------C-CATAGTC-T--NTATCCATAA--ATATCAT--CAT-CG-CA--ATA---CTC-TATA-AT-C-GTATCAT-ANCATATCGAAATCAT----ACCATANCGTATCATACCAT---A-TCGA-T-----------T-C---ATA-ATATAT--C---G-CATCAT-AC-CA-TA--TCGT-AT-AATA--T-C--TACCATA-ATCATATAA--T-AT---CGTATCATAC---------GA----ATAT------NG----TAT-TG-----------TATC-AT-ACCA-TAC-CG-TA-TCANNNCCC-ATCATAT-CAT---A-TAG----TA-NTCGTAT---CATAC-CATATC----G-AT--CA-T---ATCG---TCNT---AT-ACCAATATC-G-T----AT--CAAT----A--CCAT-ATCGTA----ATAA--T-A--C--TAT---CATAT---A-AT-----A-T---CGTAATCA---TA--CCA-------AT--ATCAT-A-T-C---GT--TA--A-TAC-CATATCGTATCA-TA---C-C--A----A-TATCGTA---GTCAT-AC----C-AT---AT--------CGT---A--TCN-------A--AT-----AT-CGT-A-T-CCATACC-----------A--T-----T--AT-CA----A-----TA----ATAT-CGAT-C-GTAT----TCA-T--A-CCAATAT--CGT-ATCATACC-ATATCAT-AATCA-------ATACCATATC-----A-TA-T-C--CATA------CA-A----T-----A----TC------G-TA-T-A-A-T-ATC-GTA-------TC-AT------AC-CA--T-AT---C--G-T-----------------AT--A-----------A-TATCGTA-TCA--------TA-----C-----C-A-T-A-TCG-T----ATAA----T------ATCAT-----------A---------ATCA--TAC-CATA--TCG-T--AT----AAT-----ATC-GTAT--C-TACAAT-ANCATACCATA-AT----CTA-TG--TA-TCAT---------A-T--AT--ATATC-ATAC---NA-------TATC-------GTA---ATAA---TATC--AT--TC---------A-TACCNATAT-T-CG---TATA--AT-ATCGTATCATNNCCGTNCG--TATNNNA-----ACNAT-ATCCAAC-GTATC---GTCGTNATNNCATNNNCAT-TAN--CCATATNTCNATA---CCATA-TCGTA-TC--ATA---ATAT-AATCATACANA-ATCGTAT-----CAT--AC--CG--------------TAT-CGTAT-TAATA---TCGT-ATCATACCAATACC--ATA--TCGTATAATA----AT-ATACCA-ATA----TCATA---TA-ATATCGTATCA--TA-C--CA-TA-TCGTATAATAT-CAT-A-TCA--TA--C-CATA-TCG---TA-T-CTA--------------CC-ATA-TCGT-A-T-AATATC-GTA-TCA-TA----CCATAT-C-G--TAT--------A--ATA--TATC---GTTCATATC-GTA----AC-CATAT-CGTA--T-AATA-TC-AGTA-TCA-TATAATATC-GTATCGTATA--CCACANATCATATCCAT-A---CCATATCG---TATAG-TA-ATAATATCGCATCATAACCATA-TTGTATACCTTGTAACTCATACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCGATCGTATA--ATAT--TATATCAT---ACCAGCATCTAAACTACT--CAAATAC-----NAT-TTAG-ATCACAAGACGCATTCTTAATCTAAGTTT----GATGAAAATTGAACAAAGCAAT
gi|1 : AAGATT-ACACA--A-GC-TC-A--C-C--TC-------GAC-G-GG-C-AA-CA-C--C--TT-T--AT-A--TGGCAC-C-A---T-T-ATG-------T---C-TA-T-T-----A--TGC-T-TTA-TTT--TAA-CCC--A-A--G-G-A--TTT-CAT--CCA--T--TT-ACAACT-TTATCA-T-A-T---------TA-------------------CACA-A--TA-CT-AAAAA-------AAT-TATC--AT-A-----A-TG-TAC--A--TC---AA-TATA-A-AAAT-C-T--------AT-A-T-TA-T-----------ATACT--TATAA-AC-AT-AT---AT-T-TATGAATT-ATCTAT-T-ATCA-ATATAGGAT---AT--A-AATATGATTATGAATA-TATT-CATA--TA-A-AATC--A-T-AT--TATTATGAT-A-TC--AT-T--G-A-------TAT--TAT-AT-CATA-TGA-ATA-TGA-AT-G--T--AA--T---A----T-ATATGTA---TATAATA-AT-AT-AT--C-GT-AT-AATC-A-----TATTATA--C-C-ATA--T-GT-AATA-T-A-C-C----AT-----TGTACT-G-ATATTGTTA-ATCATCCCAT--ATC-AAAC-A-TA-TGTA--ATCAT-CAT--ATT-----TG---T-AATAAT---AATA-T---AT-CGA--T--CAT--A-CACCAATA-----A-TGTAA-ATCATACCATA-TCG---------TAT-A-T--ATT-GT-ATGAT-----A-----TC-AAAGC-A--AT-A--T-C-GT-T---ACCAT-ATC-GTA----------------TC-A-T-A------TCA-TAT-A-AT-AT-TGTA--TC-ATA------C-CATAATC-T--TTGTCCAAAA--ACATCATTCCAT-CGACA--ACACCGCTCGTATA-AT-T-GTATCAT-ACCATATCGAAATCAT----ACCATAACATATCATACCAT---A-TTGATT-----------T-C---ATA-ATATAT--T---G-CATCAT-ACGCA-TA--TCGT-AT-AATA--TCC--TACCATA-AACATATAA--TCAT---CGTATCATAG---------AA----ATATNNNNNNNN----NNN-NN-----------NNNN-NN-NNNN-NNN-NN-NN-NNNNNNNNN-NNNNNNN-NNN---N-NNN----NN-NNNNNNN---NNNNN-NNNNNN----N-NN--NN-N---NNNN---NNNN---NN-NNNAATATC-G-T----AT--CAAC----A--CCAT-ATCGTA----ATAA--TAA--C--TAT---CATAT---A-AT-----A-T---CGTAATCA---TA--CCA-------AT--ATCAT-A-T-T---GT--TA--A-TAC-CATATCGTATCA-TA---C-C--A----ACTATTGTA---ATCAT-AC----C-AT---AT--------CAT---A--TCT-------A--AT-----AT-TGT-A-TCCCACACC-----------A--T-----T--AT-CA----A-----TA----ATAA-CAAC-C-TTAT----TCA-T--A-CTAATAA--CGT-ATC-TACC-TTATCAT-AATCA-------ATACCAAATC-----A-TAGT-C--CATA------CA-AAACGT-----A----TA------G-TA-T-A-G-T-ATC-GCA-------TC-AT------AC-CA--TAAT---T--G-T-----------------AT--T-----------A-TATTGTA-TCA--------TA-----C-----C-A-T-A-TCG-T----ATAA----T------ATCAT-----------A---------ATTA--TAC-CATA--TCG-T--AT----AAT-----ATC-ATAT--CTTACAAT-AATATACCATA-AT----CTA-TA--TA-TCAT---------A-T--AT--ATGTC-ATAC---AA-------TATC-------ATAG--ATAA---CATC--AT--TC---------A-TACCCATAT-T-CG---TATA--AT-ATCGTGNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNN-----NNNNN-NNNNNNN-NNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNN--NNNNNNNNNNNNNNNCCCATA-TTGTACTC--ATA---ATAT-AATCATACATA-ATTGTAT-----C-T--AC--CA--------------TAT-TGTAT-TAATA---TTGT-AACATATCAACATC--ATA--TCGTATAATA----AT-ATACCA-ATA----TCATA---TA-ACATTGTATCA--TA-C--CA-TA-ATATATAATAT-CAT-A-TCA--TAG-C-CATA-TTG---TA-T-CTA--------------CC-ATAGTCGT-A-T-AATATCGGTA-TCACTA----CCATAT-C-A--TAT--------A--ATA--TATT---GTTCATATCAGGA----AC-CATAT-CGTA--T-AATT-TC-AGTA-TCA-TATAATATC-ATATCATATA--CCACAAATCATATCCAT-A---CCATATCG---TATAG-TA-ATAATATCGCATCATAACCATA-TTGTATATCTTGTAACTCATACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCGATCGTATA--ATAT--TATATCAT---ACCAGCATCT-AACTACTCACAAATAC-----ATT-TTAGAATCATAAGACGCATTCTTAATATAAGTTCTGGAGATGAAATATGAACAAATCAAT
gi|10 : TA-CATT--ATA--TA-T-AATC--A-T-----TAT-ACCA--A-TC--AT-T--T-A-------TAC--CAT-AT-CAT--T---ATA-CCA--T-G--TTCGA--T---A----T-ATAT-TACCATACATTC-AT--T-AT-----T-TT-AATC-A-----TA----A--C-C-AT----------TA-T-A-C-C----AT-----GCCC-T-T-ATATCAT-A---CA-ACTAT--ATC--------CA-TGT----TCAT-TAT--ATTATAGACA---T-AATCATTTAAACA-T---GT-C-A--T--TAT--A--AC-A-TAC----A-T-TAA-ATTATACCATG-TCA---------TTC-A-T--ATT-AT-ACCAT-----ACATT-TC-AAT-T-A--TT-A--T-A-GCAT---ACC---ATT-ATA----------------CC-A-T-G------TCATTAT-A-A------------C-ATA------C-CATAGTA-TTACTATTCATAC--GTAT-A---CATACGCCA--CTA---CTCTTATACAT-A-TTATTAT-AGTATACCAATATCATTATAACCAT-GTGTATTATACTAT---A-CCA----------------C---ACA-TTATAT--CTAGA-CATTAT-Agcctatttaaacaacat
gi|11 : tatcataccatatcattattccatgtcatTA-CATT--ATA--TA-T-AATC--A-T-----TAT-ACCA--A-TC--AT-T--T-A-------TAC--CAT-AT-CAT--T---ATA-CCA--T-G--TTCGA--T---A----T-ATAT-TACCATACATTC-AT--T-AT-----T-TT-AATC-A-----TA----A--C-C-AT----------TA-T-A-C-C----AT-----GCCC-T-T-ATATCAT-A---CA-ACTAT--ATC--------CA-TGT----TCAT-TAT--ATTATAGACA---T-AATCATTTAAACA-T---GT-C-A--T--TAT--A--AC-A-TAC----A-T-TAA-ATTATACCATG-TCA---------TTC-A-T--ATT-AT-ACCAT-----ACATT-TC-AAT-T-A--TT-A--T-A-GCAT---ACC---ATT-ATA----------------CC-A-T-G------TCATTAT-A-A------------C-ATA------C-CATAGTA-TTACTATTCATAC--GTAT-A---CATACGCCA--CTA---CTCTTATACAT-A-TTATTAT-AGTATACCAATATCATTATAACCAT-GTGTATTATACTAT---A-CCA----------------C---ACA-TTATAT--CTAGA-CATTAT-Attaaccat
gi|12 : tatcataccatatcattattccatgtcatATATGTAT-TATGACAGTATCT-GATA-----ATA-CCGTA-TC--GTA---ATAT-AAACATA-AAA-ATCATAT------AT--AC--CGAATACCTATCTAGCTAC-CATATGTTATA---TCATGATCATTCCA-TGTCTAATAAGTCGTATAA------GT-ATATCATGTACT--TCATAATCTG-ATATCAC-TCA--TA-C---A-TA-TCGTATAACA------A-TCA--TA--C-CATA-TCGATATAAT-CTATTCATTGATATTATCC-ATA-TCGA-A-T-GATATCCGT--TCA-TA----CC-TAT-CCG--TATCTATGTTAAGCATC--TATC-----TCATATC-GTA----ACTCATGTACGTA--TTCATA-CCTCGTA-TCA-TAT-ATATTAGTATAATATACTCTATAGAAC-TATTCTT-G---ATATATCGGGCTATTG-TATATAATttaaccat
gi|13 : ta----TA-TTTGTAT---CAAAT-CATA-C----A-ATACCA-T---ATC------------------ATATC-A-T----AT--TAAT----A--CCAT-ATCGTA----A-AG--T-A--TCGTAT---TATAT---A-ATAACACA-T---TGT--TTACTTCG--CCA-------AT---TTAT-A-T-N---NN--NN--N-NNN-NNNNNNNNNNNN-NN---N-N--N----N-NNNNNNN---NNNNN-NN----N-NN---NN--------NNN---N--NNN-------N--NN-----NN-NNN-N-N-NNNNNNN-----------N--N-----N--NN-NN----N-----NN----NNNN-NNNN-N-NNNN----NNN-N--N-NNNNNNN--NNN-NNNGTATA-ATATCAT-AA--A-------ATACCACATC-----G-TA-TAA--TATA------CATG----T-----A----TC------A-TA-T---A-C-ACT-GTA----------AT------AC-CA--T-AT---C--G-T-----------------AT--ACTATC------A-TATCGTG-TAA--------TA-----T-----C-A-T-A-TCG-T----ATAA----T------AACAT-----------A---------A-AA--TAC-CATA--TTG-T--CT----ACT-----ATC-ATAT------CAA--ATTATACCATA-cattgatta
gi|14 : atgttaccttcgccT-ACA-A--A-GC-TC-AATCAC--TC-------GA----GGGC-AA-CA-C--C--TT-T--ATTA--TGGCAC-C-A---T---AT--------T---AATA-C-TTTA--A--TGC-T-T-A-TTTA-TAA-CCC--ACA--G-G-A--TTTTCATGTCCA--T--T--ACA-CT-TTATCA-TTA-T---------TA-------------------CACA-A--TA-CT-AA------------T-TTTT---T-A-----A-T----C--A--TT---AA-TA-----ACAT-C-T--------AT-A-TATA-C-----------ATA-T--TAT-A-AT-AC-AT---AA-T-TATGA-TT-AATCAT-T-AT-A-AAATAGGAT---AT--ATAAT-TGA-TAT-AATA-TAT---ATA--TC-ATACTC--A-T-AT--TAAT-TGAT-ATTC--AT-T--G-AC------TATAGTAT-GTATATATTGAGATA-TT--AT-G--T--AAGTT---ACTATT-ATAT-TA---TATAAT--AT-A--AT--C-GT-TT-AATC-A-----TGTTACAC-C-C-ATAATC-GT-ATTACT-A-C-CCATTAT-----CGTA-TGG-ATAT-GT-GTATCATACCtcatc
gi|15 : AGATA-ACA-A--A-GT-TC-A--C-C--TC-------GAC-A-AGGA-AA--A-C--C--GT-T--AT-A--TGGCAC-C-G---T-T-AT--------T---A-TA-T-TC----A--TTC-T-GT----T--TAG-TCC--ATA--G-G-A--TTT-CAT--CTG--T--T--AC--CT-TTATCA-T-A-T---------CACAAGCATAAAGAAAATTATCACA-G--TT-GT-AACGA-------TATATATCT-AT-ATTAACA-TG-TAT--GATT----AA-TGTG-A-TCAT-CAT--------AT-A-T-TA-------------ATG-A--TATGA-ATTAT-ATTGCAT-C-TATTA-AT-GTATAT-TCAT-ACATGTAATATTTTAT--A-TATATGAAT-T-AATT-T-TT-GATA--TA-A-TAT---A-T-ATA-TATCATAAT-A-TTGTAT-T--G-AGAGTTAATACAATAT-AT-CATA-TTA-A-A-TAAGAT-GCAT--GG--T---A----TGACGT-TA---TGTAA-A-AT-AT-A
gi|16 : tcAAGATT-ACA-ACCA-GT-TCCA--C-C--T---------AT-T-GGGC-AA-CA-C--C--TT-TT-AT-A--TGGTAC-C-A------------------------A-T-T--------TGCCT-TTA-ATTGATAG-CCC--ACACAG-C-A--TTTTCAT--CCA--TACTT--CA-CT-TT-TCA-T-A-T----------A-------------------CACA-A--TA-CT-AAAAA-------CAT-TATC--AT-A-----A-TG-TACCAA--T----AA-TGTA-A--CAGGC-T--------AT-A-T-TAGC-----------ACG-T--TATAATAC-AT-CC---AG-T-TATGA-TT-ATCTAT-T-AT-A-GTATAGGAT---AT--G-A--ATGATGAT-AATA-TATT-TATA---A-A-AATC--A-T-AT--TA-TGCAAT-A-TT--A--T--A-A-------TA---TATAAT-CTTA-TGG------CC-GT-A--T--AA--TTGCG----T-ATAT-TA---TA
gi|17 : tcaAAGATT-ACA-G--A-GC-TC-A--C-G--TC-------CAC-G-GGGC-AA-AA-C--C--TT-T--AT-A--TGACAC-C-A---T-T-AT--------C---A-TA-T-TT----A--TGC-T-TTA-TCT--TAG-CCC--ACA--G-G-A--TTTTCAT--CTG--T--T--ACA-CT-TTATCA-T-A-T---------TA-------------------CACA-A--CATTT-AAAAA-------AAT-TAGC--AG-A-----A-TG-TAC--A--A----GA-TAT--A-ATAT-C-T--------AT-A-T-TA------------------------------------------GATGA-TT-ATGTAT-T-GT-A-ATACA--AT---AT----AATAC-ATCAT-ACTC-TA-T-CATA--TA-T-GATT--A-T--T--TAATATAAT-A-AT--AT-TTCA-A-------TAT--TAT-AT-CATaa
gi|18 : atcaT---AT-ACCAGTATTTG-T----AT--AAAT-------------TCATA----------T-A--T--TAC---CA--------AT-----A-T---CATTATAA---TA--TCA-------AT--ACCAT-AAT-C---GT--TA----TAC-AATATCA----A-TA---T-A--A----A-TATAGTC---AACAT-AT----C-AT---AT--------AAT---A--T-G-------A--AT-----AC-CAT-A-T-----ACC-----------A--T-----T--AT-CA----A-----GA----TTA-------C-GTA-------A-T--AACCAATATT-CAT-ATCATACC-ATA-CTT-AATTA-------A----GTATC-----AGTA-T-C--CAT---------------T-----A----CC------A-T--------T-ATT-GTA-------TC-AT------AC-CA--T-AC---C--T-G-----------------AT--A-----------A-TAgaaatt
gi|19 : tatataATTGTAC---------GA----ATAT------G------AT-TT-----------TATC-AT-ACCA-AAT-CA-TA-T------CT-ATCATAT-CGT---ATTAG----TATATCA-AT---CATAC-CATATT----G-GT--AA-TAAAATCG---TCAT---ATGACCAATATC-G------------AT----A----AT-ATGATA----ACAA----A-----TAT---CATAC---C-AT-----A-T-------GCTA---TA--TC--------TT--ATCAT-A-TAT---GT------A-TA--CATATCATATCA-TA---C-G--A-------ATCGT-------AT-A-------AT---AT--------CAT---A--TCT-------A---------AC-CGC-A-T-CTA-ACT-----------A--C---------T-CA----A-----TAC---ATTTACGAT-C-ACA------CA----A-GCAATAT--atagagtgcatcacataagataaaatccgta
gi|19 : tctggtgataaaaTATCA-TA---C-C--A----A--ATCATA----TC-T-AT----C-AT---AT--------CGT---A--TTA-------GT-AT-----AT-CA--A-T-C-ATACC-----------A--TAT---T--GG-TA----A-----TA----AAAT-CG-T-C-ATAT----G------A-CCAATAT--CG-----ATA---ATATGAT-AACAA-------ATATCATACC-----A-TA-TGC--TATATCTTATCATA----T-----A----T-------G-TA-T-ACA-T-ATC-ATA-------TC-AT------AC-GA----AT---C--G-T-----------------AT--A-----------A-TATCATA-TCT--------AA-----C-----C-G-C-A-TCacta
gi|2 : tctggtgataaaaattgtacgaatatgatttAT-GT-CATA-C-A-ATAGTCA-ATTA--T--AA--T---A----TCATAT-CA---TACA-TA-TT-GT-AT--C-----T-ACTC-A-----AAT--------C-ATA--C-GT-ATTA-G-A-T-C----ATTACATCATA-T-A-ATGTCGT-A-TCCATACCAC--AT---------TG-TATA--AT--T-CGT--ATC-----CA---TGAACCAT---ACCG-T---AT-C-A--TACCAT--ATCATTAATC-----A-T-TAG-TTCATACCATA-TTG---------TGT-AAT--ATTCGT-ATCATGACCTA-----TC-TTA-CTG--AT-A--T-CTGTATCA-ACCAT-ATCGGTATCCACCCATATTGAAATC-A-T-ACCATAATCA-TAT-A-ATTAT-TGTA--TC-ATAATTGAACGCATA----T--GTGTT-ATAA--ATAACAT---AT-CT-TATCATA---C----ATA--T-T-GTATGAT-ATCATA---AAAT--T----ACCATATCGTATCATACCAT---A-TCTA-TAATATCTGTGAT-C---ATACAAACATTAC---G-CATTAT-AC-CA-TA--TCGT-AT-CATACAT-C--TGATATA-AT---ATAA--T-ATTACCATATCGT-T---------GG----ATAT-------G----TAT-CA-----------TATC-AA-ACCA-TAT-CG-TA-T-AATACCC-AT-AT-T-CAT---G-TA-----TA-CTCGTAT---CATAC-CTTATCCATTG-AT--CACT---A-CT---TCTTTAGGT-AT-AATATC-A-C----AT--CA-T----A--CCAT-AT-GTATAATATAA--T-ATCC--TAC---CATATTGTATAT-----A-T---CATGATCAT--TACCCCATAGTTGTATCCACCAT-A-T-T---GTGATA--AATAT--ATAT----TCA-GAAC-C-C--AT---A-TACGGTT---GTAAT-ATGGTTC-AT---ATTCAA----CGCGAGA--TCGGGGGCTAA--ATTCT--AC-TG--A-T-CCATACCCCCCCCTGCCCA--T-----T--ATTCA----AAAGCCTA----ATGT-GGAT-C-GTAT----CGA-T--A-AC----T--CTT-ATTATACT-GAATCAT-A-TCA-------GTATAGTATA-----A--A-T-----ATG------GA-A----T----------TC--------CA-T-A-A-T-ACC-GTAATT----TT-GT------AC-TACTT-AT---C--G-------------------GT--C-----------A-TTT-----TCA--------TA-----C-----C-A-T-A-TCG-TGAAGA-AA----T------AGCAT-----------A----------T----TAC-CAT---TCA------------------ATC-ATA-------CAAT-AATATACCATATAT----C-A-GG--TA-TGAC---------A-TG-ATC-ATATC-AAAC---CA-------T-TCTT-----GTA---TCAA---TGGA--GC--TA---------A-GATCGGT------G---TATA--TT-ATT-TATTGTTACC--TCG---ATAAT-------CAAT-ATTCA-C--TATC---GTGATGCTTCTGTATA-AT-GA-------ATTTAGTTG---C-ATA-TCG-A--C--ATA---TTCG-AAT-ATACAAATACCATAT------AT--ACTCCA--------------TAT-CCGA---AGTT---CCTT-ATCATACCAAT--T--ATAA-TCGAGTTATA----AA-ATA------A----TTATA---TG-AAGCGGCAGCAAGTA-CTCCACTAGTTGTATAAT-T-CAT-AATCACTTT--C-CATA-TCG---TA---CTA-----------------ATACTCAT-A-T-AGT--C-G-A-T---TA----CCATAT-T-G--TTG--------A--ATAAGTATC---ATACATACC-TT------C-CATAT-CGGAAAT-AATAATC-A-TACTCAGTATAATGTC-ACATC---------ACATATCATATTCATCATACCCATATCtaactactcaatacatttacgatcacacaagcaatatacta
gi|2 : atca--TGT---CATAC---A-AT-----AGT---C--AATTA---TA------------AT--ATCAT-A-T-C-----------A-TAC--ATATTGTATC--TA---CTC--A----A--ATCATACGTATTAG-AT----C-ATTACAT--------CAT---A--T---------A--AT-----GT-CGT-A-T-CCATACC-----------ACAT-----T--GT-------A-----TA----AT------T-C-GTAT----CCA-TGAA-CCA-TAC--CGT-ATCATACC-ATATCATTAATCATTAGTTCATACCATATTGTGTAA-TA-T-T--CGTA------TC-A----TGACCTA----TC------T-TACT-G-A-T-ATCTGTA-------TC-A-------AC-CA--T-AT---C--GGT-----------------ATCCACCC--------A-TATTGAAATCA--------TA-----C-----C-A-T-AATCA-T----ATAA----TTATTGTATCAT-----------A---------ATTG--AACGCATA--T-G-T--GTTATAAAT-----AAC-ATAT--C-T----T-ATCATA-CATA-TT----GTA-TGA-TA-TCATAAAATTACCA-T--ATC-GTATC-ATAC---CA-------TATC--------T----ATAA---TATCT-GTGATC---------A-TACAAACAT-TACGCATTATACCAT-ATCGTATCATA--CATCTG---ATATAAT----ATAAT-AT-TACC-ATATC---GTTG-GAT---ATG------TAT--C---ATATCAA-A---CCATA-TCGTA-TA--ATACCCATAT---TCATGTATA-CTCGTAT-----CAT--AC--CT--------------TAT-C-CAT-TGAT-------------CACTACTTCT--TTA---GGTATAATATCACATCATACC--ATA----T-GTA---TA-ATATAATATCC--TA-C--CA-TA-TTGTAT-ATAT-CATGA-TCAT-TACCC-CATAGTTG---TA-T-CCA--------------CC-ATA-TTGTGA-TAAATAT--ATATTCA-GAAC--CCATATAC-GGTTGT--------A--ATA--TG-----GTTCATAT
gi|20 : atcaaCA-G--A-GC-TC-A--A-C--TC-------GAC-G-GGGC-AA-CA-C--C--TTAT--AT----TGACAC-C-A---T-T-AT--------TCATG-TACT-T-----A--TGC-T-TTA-TTT--TAG-CCC--ACA--A-T-A--TTT--AT--CTG--T--T--AC--CT-TGATCA-T-A-T---------TA-------------------CACA-T--CA--T-AAAAATTATCATAAT-AATG--AT-A-----A-TA-TAT--A--TGAATAA-TATC-T-ATAT-C-TTTTGATGCATCA-T-TA-TGAATCTTTGCAATA-CAATATAATAC-ATCAT---AT-TCTATAA-TCCATGTAT---AT-G-ATATTTAAT---AT--A-AATtcaacgcgagatcgggggctaaattctactgatccatacccccccctgcccattattcaaaagcctaatgtggatcgtatcgataactcttattatactgaatcatatcagtatagtataaatatggaattccataataccgtaattttgtactacttatcggtcattttcataccatatcgtgaagaaatagcatattaccattcaatcatacaataatataccatatatcaggtatgacatgatcatatcaaaccattcttgtatcaatggagctaagatcggtgtatattatttattgttacctcgataatcaatattcactatcgtgatgcttctgtataatgaatttagttgcatatcgacatattcgaatatacaaataccatatatactccatatccgaagttccttatcataccaattataatcgagttataaaataattatatgaagcggcagcaagtactccactagttgtataattcataatcactttccatatcgtactaatactcatatagtcgattaccatattgttgaataagtatcatacataccttccatatcggaaataataatcatactcagtataatgtcacatcacatatcatattcatcatacccatatc
gi|22 : AGATT-ACA-G--A-GC-TT-A--A-C--TCACTCAAGGAA-G-CGAC-AG-CA-C--C--TT-T--AT-A--TGGCAC-C-A---T-T-ATTATATACAT---A-TA-T-T-----A--TGC-T-TTG-TTT--TAG-CCCCAATA--G-G-GTTTTT-TAT--CTG-----CT-AC-ACT-TTATGATT-A-TCAGTGCATGTA-------------------CACA-A--CA-TA-AAAAA-------AAT-TATC--AT-A-----T-TA-TAT--A--T----GA-T------ACAT---T--------GT-A-T-TT-G-----------ATA-T----CAA-AT-AT--T---AT-C-TAT-A-TT-ATATATAT-AT-A-
gi|23 : ATG------TA-A----T-----A----TA------G-TA-T-A-AAT-ATC-GCA-------TC-AT------AC-CA--T-AT---T--G-T-----------------AT--------------A-TATTGTA-TCA--------TC-----C-----A-A-T-A-TCG-T----ATAA----T------ATCAT-----------AAAAT-----ATCA--TAC-CATA--T-G-T--AT----AAT-----ATC-GTAT--CATATAAT-GTCATAC---A-A-------------TA-TCAT---------A----A---ATATCAATAC---CA-------TATC-------GT----ATAA---TATT--ATA-TC---------A-TACCAGCAT-tcattact
gi|24 : atttattaggggattaaacagtaa-ATAT-GTATCA--TA-C--CA--A-TCTTATAA-AT-CAT-T-TCA--TA--C-CATA-TC------------------------------------T-A-T-AATATC-GTT-TCA-TA----CCATAT-C-T--TA---------A--ATA--TGTTTCAGTACATATC-GTATCATAC-CATAT-CATA--T--ATT-TA-AATA-TCA-TATAATACC-ATATCGTGTA------ATATCGTAT-AAT-A---CCATATTG---TActaaat
gi|25 : atgaattaccA----ATAT--GAT-----AT----T-A-T--G-C-AATAT--TAT-ATTATATT-ATATCAT-AACGA-------ATA--ATATC-----A-TA-T-A---ATAA-----CA-A----T-----AATTTTC------A-TA-T-A-A-A-ATA-ATA-------CC-AT------AT-CA--T-AT---C--A-T-----------------AT--T-----------G-TATAACA-TCA--------TA-----C-----C-A-T-A-TCG-T----ATAC----T------ATCAT-----------AATT------ATCA--TAC-CATAC-TCA-T--AT----CAG-----ATC-ATA
gi|26 : AGATT-ACA-A--A-GC-TC-A--C-C--T--------GAC-GCGGGC-AA-CA-CG-C--TA-TAGAT-AATTGGCAC-C-AAATT-T-AT--------T---A-TATT-T-----A--TG--T-TTA-TTT--TAA-CCC--ACA--G-G-AATTTT-CAT--CCG-----TT-ACACCT-TTATCC-T-ATT---------TA-------------------CACACA--TA-TC-AAGAAAC-----AAA-TACTAGATAA-----A-TG-TAC--A--T----AA-TATA-atattc
gi|27 : AAGATT-ACA-A--A-GC-TC-A--C-C--TC-------GAC-G-GGGC-AA-CA-C--C--TA-T--AT-A--TGGCAC-C-A---T-T-AT--------T---A-TATT-T-----A--TGC-T-TTA-TTT--TAA-CCC--ACA--G-G-AT-TTT-CAT--CCG-----TT-AC-ACT-TTATCA-T-A-T---------TA-------------------CACA-A--TA-TC-AAAAAC------AAA-TATC--AT-A-----A-TG-TAC--A--T----AA-TATA-
gi|28 : ggaaatca-AT-AT--C--T-AT-AATC-AGTTAATACTATATAC-C-ATAT-C-GT-ATTA-T-A-C-A----AT------G-A-T-G-ATATTGT-C-ATCATACCAT--ATC-AAACAA-TA-Tttta
gi|28 : --ATA----TC-TATA-AT-CAGT-TAAT-ACTATAT-------------ACCATATCGTATTATACAAT-------GA-T-----------G-----------ATAT--T---GTCATCAT-AC-CA-TA--TCAA-AC-AATA--T------------------TGA--T-AT---C-T------C---------GA----ATAC------G---------TG-----------TGTC-CT-GCCA-----CGAGA-TCTCATCC---TCATGT-TCT---G-TTA----TA-GTAGTA----CATAC-C-CA-C----G-AT--CA-T---ATtgatatctcgaatacgtgtgtcctgccacgagatctcatcctcatgttctgttatagtagtacatacccacgatcatatg
gi|29 : AAGATT-ACA-A--AAGC-TC-A--C-C--TC-------GAC---GGGC-AA--A-C--C--TT-T---T-A--TGGCAC-C-A---T-T-AT--------T---A-AATT-T-----A--TGC---TTA-TTTA-TAG-CCC--ATAT-G-G-AT-TTT-CAT--TCGCAT--CTGACCACT-TTATCA-T-A-T---------T-----------------------A-A--TA-CTAAAAAA-------AATATATC--AT-------A-TG-TAC--A--g
gi|3 : caATA-AT-AT-AT--CTGT-ATCAACCCA-----TATCGTA--C-AGATA--TTGT-AT-A-T-A-C-C----A-------ATA-TTG-ATAT-AT-ATGTTATACCAT--ATC-GTAC--------TA--------CAT--ATT-----TGCTAT-AAT-AT---GATA-TCATAT-C-AAAC--CAT--A-T-CCA-TATTAATA-TGTTATATAAAACCATA-TCGATAACTTTATAC-A-T--ATC-GT-ATTAT-----------TC-ATA-C---------------TAT---ACTAT-AAG-CCA----------------TC---T-A------TCA-TAT-ACAT-AT-CTTA--TC-ATA---------AT-GT------TATCTA-GA--ATGT-AT--CAT-TA-CC--ATA----TC-TATC-ATAC-G---CAT-AAC------AAATCAT-----CCATAT-GTAATATATCCT---A-TC----------------------TA-A---AT--CT--G-CATCAT-AC-CA-TACTTCATAAT-AATA--T-CA-TACCATA-GTCATATAATTT-AT---CGT-T--TAT---------GACC--ATAT------CA----TAT-TGTATAATTAAATTATCGAT-ATCA-TAC-CA-TA-TGGTATAAT-ATCGTAT-CAT---A-CAA----TAGGTTGTAT---CATATACATATT----G-GTA-TA-T---ACCA---TCATC--AT-ATAAATATC-G-C----ATTACAGTCA--A--TCGT-ATC--A----ATTA--C-A--T--TAT---CATAT-----AT-----A-TA--CGT-ATCA---AA--CC--------TT--ATC-T-A-T-CCAAAT--CAATA-TAC-CATATCGTGTCAGTATGTC-CATA----A-TAGCATA---TTTGT-AC----TAAT---AT--------TGT---A--TCA-------A--AT----------T-A-T-CC-TACC-----------A--------G--AT-CG----A-----TA----ATA----AT-C-ATAT----GTA----A-CCA--------T-ATCATACC-A----AT-AATCA-------ATA--ATAT------A-TA-T-C--AGTACT----CA-T----T-----A----TC------GCTATT-A-A-T-ATC-ATACCATTTGTC-AT------AC-AA--T-AT---CATA-T-----------------AT--A-----------A-TATCA-----A--------TA-----C-----C-A-T-ACTCG-T----ATAA----TG-----ATCGT----------------------TCA--TTA-CATA--TCA-TTAGT----AAT-----ATCGGTAT--CATACCAT-GTCAT---ATA-A------TA-T---TA-TCAT---------ACC--AT--A-ATC-GTAT---CA-------TTTCCCTATTGGTATCGATAA---TATT--AT--TC---------A-TACCGATAG-T-CG---TATC--AT-ACCATACCATATTTGTATGAATATACGA-----AC-AT-ATTC-AC-ATATCAGTATCGTAATATCAT-ACCATATAA--TAATGTATCTACA---CTATAGTCATA-TCGTACA---ATATGAAGTAT-CATA-GTTCTATATGTACAT--AC--AT--------------AAT-CATAT---ACA---T-GT-ATC------ATACC--ATA--TTGTA------------ATATCA---A----TCATA---T--ATATCGCATCA--TAGC--CA-GA-TTGTATCATATCCAT-A-TCG--TA--TACATAGTCG---TA-T-ATA--------------CCAATA-TTAG-ATT-AATATT-GTA-TCA-TACAATCCATATCC-G--TAT--------A--AT---------------------------AC-CATAT-CAT-------------AGTA-TCA-AACAA-ATC-ATATC--ATA--C--CATATCATACCCATAA---TCGTAT-A---TATAGATA-AT-ATATCGCATCATAACCATACTTGT
gi|30 : acC------G-TA-T-A-A-T-ATC-ATA-------T----------AC-CA--T-AT---C--G-T-----------------AT--A-----------T-CATTATA-TCA--------nnnnnnn
gi|30 : ATCATATACCATATCGTATATCATTATATCAGCATCTAAACTACT--CAAATACTCAAAAATAATAG-ATCACAAGAC-CATTCTTAATCTAAGTTT----GATG-AAATTCAACAAAGCAATgcatctaaactactcaaatactcaaaaataatagatcacaagaccattcttaatctaagtttgatgaaattcaacaaagcaataactcaaatatcgcctg
gi|31 : cgtataatGATC-ACA-G--A-GC-TC-A--C-AGATC-------GAC-G-AGGCCAA-CA-C--A--TT-T--AT-A--TGGCGC-C-A---T-TCAT--------T---A-T--T-T-----A---GC-A-ATA-TT------------------------TTT-CAT----G-----TC-ACAATT-TTATTA-T-A-T---------TA-------------------CA----------T-AAACA-------TAC-TATT---T-A-----A----TAT--A--T----GA-TATA-ATACAT-aactcaaatatcgcctg
gi|32 : gtaatcaatAAGATT-ACA-G--A-GC-TC-A--C-C--TC-------GAC-G-GG---------------------------TAACAC-C-A---T-T-GT--------T---A-TATT-T-----A--TGC-T-TTA-TTT--TAG-TCC--ATA--G-G-AC-TTT-CAT--CTG-----TT-AT-ATT-TTATCA-T-A-T---------TA-------------------CACA-A--CC-TT-AAAAA-------A---TATC--AC-A-----A-TG-TAC--A--T----AA-TAT
gi|33 : tcaTA-TCA--------AA-----C-----C-A-T-A-TCG-T----ATAA----T------ACCAT-----------C---------A-CA--TAC-CATA--TTG-T--AT----AAT-----ATC-ATAA-----ACAAT-ATCATACCATA------------------TCAT---------A-T--A---ATGTC-ATAC---AA-------TATC-------GTA----TAA---TATT--GTG-TC---------A-TACCA------------TATC--AT-ATCGTATCc
gi|34 : ccattttaTATCTT---A-TA-T-T--CATG--------------------A----TC------A-TA-T-A-A-TCATT-GTA-------TC-AT------AC-AA--T-ATAATC--A-T-----------------AT--A-----------T-GATCGTG-TCA--------TA-----C-----C-A-T-A-TCG-C----ACCA----A------ACCATGATTGTAGTTCA---------ATCA--TAC-CATAAGTCG-T--AA----AATA----ATC-GTAT--C-
gi|35 : tg--T----AA-TATA-A--CAT-C-T--------AT-A-T-TA-T-----------ATA-T--TATACTAC-AT-AC---A--T-TATGA-TT-ATCTAT-T-AT-A-ATTTACGAT---AT----AATATGA-TAT-AATA-TAT----TA--TG-A-TATT--A-T-GTAATATTATa
gi|36 : AGATT-ACA-A--A-GC-TC-A--C-C--TC-------GAC-G-GGGC-AA-GA-C--C--TT-T--AT-A--TGGCAC-T-A---T-C-AT--------T---A-TAGT-T-----A--TGC-T-TTA-TTT--TAG-CTC--ACA--G-G-AT-TTT-CAT--CCA-----TT-AC-ACA-TTATCatt
gi|37 : -T----AT--CAAT----A-----T-ATAATA-----TGA--T-A--C--T-T---TATGC---A-AT-----A-T---TATA-TCA---TA--T-A-------AT--ATCAT-G-T-C---GC--TC--G-TAG-AATATCATATAA-TA---C-C--A----A-TA-----------AT----------T---AT--------TGT---A--TCA-------A--A
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Reference ( family-1561 ) : AAGATT-ACA-A--A-GC-TC-A--C-C--TC-------GAC-G-GGGC-AA-CA-C--C--TT-T--AT-A--TGGCAC-C-A---T-T-AT--------T---A-TA-T-T-----A--TGC-T-TTA-TTT--TAG-CCC--ACA--G-G-A--TTT-CAT--CCG--T--TT-ACAACT-TTATCA-T-A-T---------TA-------------------CACA-A--TA-CT-AAAAA-------AAT-TATC--AT-A-----A-TG-T-AC--A--T----AA-TAT-A-A-AC---AT-C-T--------AT-A-T-TA-T-----------ATA-T--TATA---A-AC---AT--AT---A--T-T-TATGA-TT-ATC----TAT-T-AT-A-ATATAGGAT---ATA-AAT-ATGATTAT-AATA-TATT-CATATA-A-AATC--A-T-AT--TATTAT---GA---T-A-TC--AT-T--G--A-------TAT--TAT-AT-CATA-TGA-ATA-TCA-AT-G--T--AA--T---A----T-ATAT-TA---TATAATA-AT-AT-AT--CGT-AT---AATC-A-----TATTATA--C-CATA--C---------GT-ATTA-T-A-C-C----AT-----CGTA-T-G-AT--ATCGT-A-ATCAT-ACCAT--ATC-AAAC-A----TA-T--GTA--ATCA--T----CAT--AT-T-----CGTAATCAT---A----ATA-TAT-C---A------TCATA-AC-CA-TA----A--TGTAAATC-ATAC-CATA-TCG-TAT-A-T--A-TT-GT-ATCAT-----A----TC-AAA-C-A--ATA--TC-GTAT--AC---CAT-ATC-GTA----------------T---C-A-------T-A------TC-A-T-AT-A-AT-ATCGTATCATA------C-CATAGTCT--GTATCCA--TA-A--ATAT--CAT--C--AT-CG---CA--ATA---C-TC-TATA-ATC-GTAT---CATANCATATC-AA-ATCAT----ACCA-TANCGTATCATACCAT----A-TCGA-T-----------T-C---ATA--A-------------ATA-T--C---G-CAT-CAT-AC-CA-TA-TC-GTAT-AATA--T-C-------TACCA-TA-ATCA-T-------AT-AAT-AT---C-GTA-------TCATACGAATA-T--------CG----TAT-T--G-TATC-A-T-ACCATA-TCG-T----A-TCANNNCC---CAT--CATAT-CGT--A-TAATA-NTCG-T-A-TC-ATAC-CAT-ATC----G-AT--CA-TA--TCTCTA--TACCAATATC-G-T-ATCA-AT-ACC-AT-ATC------G-TA----ATAAT-A--C--T--AT---CATAT--AATA-TC-GT-ATCA-T-------AC-CAATATCATATCGT--TA-----AT--AC---CATATCGTATCATACCAA-TATCGTAGT--CAT-A--CCATAT-CGTAT-C-G-AAT-----ATCGT-AT-CCATACCA-T-----T--ATCA----A--TA----ATAT-CGATC-GT---AT----TCATA--CCAATAT--CGTATCATAC-----C-AT----AT-C--ATA-ATCA-ATA-C--C--AT----ATC---A-T--A-T-C---CATA------CA-A----TA----TCGTAT-A-A-T------ATCGTATC-AT------A-CCA-T-AT---CGT-----------------A------------T-A-----------ATA-TCGTAT--CA--------TA-----C-----C-AT-A----TCG-TA------TA-----A----TA--------TCAT-----------A---------ATCA--TA----CCATA--T-CG-T------ATA--AT-----AT---C-GT---ATC-TACA-AT-ATC--ATACCATA-AT-TATGTA-TCATAT--AT-ATATC-ATACC---A-------TATC--GTA-ATAA---TATC--AT-TC---------A-TACCGATATTCGTATAAT-ATCGTATCATNACCGTNCGTATANNAACNATATT----CAA-CGTATCGTCGTGATNTCATATNCATTAT--CNATATNTCGATA---CCATATCGTA-TCATAATATAATCATAC-ATAAT--CGTATCAT--A--CC--------------NTAT-CGTA---T-TAATA---TCGT-ATCATACCA------AT-CC-AT--------A--TC-GTATAATA---ATATACCA--ATA----TCATA---TA-ATAT-CGCATCA--TA--CCA-TA-TCGTATAATATCAT-ATC-A--TA-CCA-TAT-CGTAT-CTA--CCATA-----------------TC-------GTATAATATC-GTAT-CA-TACCATAT-CGTA-TAAT------A--TATCG--TTCATATC-GTAACCATATCGT--ATAA---T-AT-CAGTA-TC-A-TA-TAATAT-----CATATC-T-ATA-C-ACANA-TCATAT-C-CAT-A----C-CATATCGTA-TAGTAATAATATC------GCATCATAA-CCATATTGTATATCTTGTAACTCATACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCGATCGTATA--ATAT--TATATCAT---ACCAGCATCTAAACTACT--CAAATAC-----AAT-TTAG-ATCACAAGACGCATTCTTAATCTAAGTTT----GATGAAAATTGAACAAAGCAAT
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gi|11 : tatcataccatatcattattccatgtcatTA-CATT--ATATA-T-AATC--A-T-----TAT-AC---CA-----A-TC--AT-T--T--A-------TAC--CAT-AT-CAT--T---ATA-CCA--T-G--TTCGA--T---A----T-ATAT-TACCATACATTC-AT--T-AT----T-TT---AATC-A-----TA----A--C-CAT------------------TA-T-A-C-C----AT-----GCCC-T-T-AT--ATCAT-A---CA--ACTAT--ATC-----------CA-T--GT----TCA--T----TAT--AT-TATAGACATAATCATTTAA----ACA-TGT-C---A------TTATA-AC--A-TAC---A--T-TAAATT-ATAC-CATG-TCA-TTC-A-T--A-TT-AT-ACCAT-----ACATTTC-AAT-T-A--TTA--TA-GCAT--AC---C---ATT-ATA----------------C---C-A-------T-G------TC-ATT-AT-A-A---------CATA------C-CATAGTATTACTATTCA--TA-C--GTAT---A---C--ATACGC--CA--CTA---C-TCTTATACATA-TTAT---TATAGTATACC-AATATCATTATAACCA-T-GTGTATTATACTAT----A-CC-A-C-----------A-C---AT---T-------------ATA-T--CTAGA-CAT-TAT-Attaaccat
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gi|13 : taTA-TTTG-T-A-TC-AAAT-CAT-A-C----A-ATACCA-TA--TC-----------ATATC-A-T-ATTA-AT-ACC-AT-ATC------G-TA----A-AGT-A--TCGT--AT---TATAT--AATA-AC-AC-ATTG-TTTACTTCGC-CAAT-TTATATNNN--NN-----NN--NN---NNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNN--NNN-N--NNNNNN-NNNNN-N-N-NNN-----NNNNN-NN-NNNNNNNN-N-----N--NNNN----N--NN----NNNN-NNNNN-NN---NN----NNNNN--NNNNNNN--NNNNNNGTAT-----A-AT----AT-C--ATA-A--A-ATA-C--C--AC----ATC---G-T--A-TAA---TATA------CATG----TA----TCATAT---A-C------ACTGTA---AT------A-CCA-T-AT---CGT-----------------A------------T-ACTATC------ATA-TCGTGT--AA--------TA-----T-----C-AT-A----TCG-TA------TA-----A----TA--------ACAT-----------A---------A-AA--TA----CCATA--T-TG-T------CTA--CT-----AT---C-AT---AT----CA-A--ATT--ATACCATA-actctatagaactattcttgatatatcgggctattgtatataatcattgatta
gi|14 : atgttaccttcgccT-ACA-A--A-GC-TC-AATCAC--TC-------GA----GGGC-AA-CA-C--C--TT-T--ATTA--TGGCAC-C-A---T---AT--------T---AATA-C-TTTA--A--TGC-T-T-A-TTTA-TAA-CCC--ACA--G-G-A--TTTTCATGTCCA--T--T--ACA-CT-TTATCA-TTA-T---------TA-------------------CACA-A--TA-CT-AA------------T-TTTT---T-A-----A-T-----C--A--TT---AA-TA------AC---AT-C-T--------AT-A-TATA-C-----------ATA-T--TAT----A-AT---AC--AT---A--A-T-TATGA-TT-AAT----CAT-T-AT-A-AAATAGGAT---ATATAAT--TGA-TAT-AATA-TAT---ATATC-ATACTC--A-T-AT--TAAT-T---GA---T-ATTC--AT-T--G--AC------TATAGTAT-GTATATATTGAGATA-TT--AT-G--T--AAGTT---ACTATT-ATAT-TA---TATAAT--AT-A--AT--CGT-TT---AATC-A-----TGTTACAC-C-CATAATC---------GT-ATTACT-A-C-CCATTAT-----CGTA-TGG-AT--AT-GT-GTATCAT-ACCtcatc
gi|15 : AGATA-ACA-A--A-GT-TC-A--C-C--TC-------GAC-A-AGGA-AA--A-C--C--GT-T--AT-A--TGGCAC-C-G---T-T-AT--------T---A-TA-T-TC----A--TTC-T-GT----T--TAG-TCC--ATA--G-G-A--TTT-CAT--CTG--T--T--AC--CT-TTATCA-T-A-T---------CACAAGCATAAAGAAAATTATCACA-G--TT-GT-AACGA-------TATATATCT-AT-ATTAACA-TG-T-AT--GATT----AA-TGT-G-A-TC---AT-CAT--------AT-A-T-TA-------------ATG-A--TATG---A-ATT--AT--ATTGCA--T-C-TATTA-AT-GTA----TAT-TCAT-ACATGTAATATTTTATA-TAT-ATGAAT-T-AATT-T-TT-GATATA-A-TAT---A-T-ATA-TATCAT---AA---T-A-TTGTAT-T--G--AGAGTTAATACAATAT-AT-CATA-TTA-A-A-TAAGAT-GCAT--GG--T---A----TGACGT-TA---TGTAA-A-AT-AT-A
gi|16 : tcAAGATT-ACA-ACCA-GT-TCCA--C-C--T---------AT-T-GGGC-AA-CA-C--C--TT-TT-AT-A--TGGTAC-C-A------------------------A-T-T--------TGCCT-TTA-ATTGATAG-CCC--ACACAG-C-A--TTTTCAT--CCA--TACTT--CA-CT-TT-TCA-T-A-T----------A-------------------CACA-A--TA-CT-AAAAA-------CAT-TATC--AT-A-----A-TG-T-ACCAA--T----AA-TGT-A-A--C---AGGC-T--------AT-A-T-TAGC-----------ACG-T--TATA---ATAC---AT--CC---A--G-T-TATGA-TT-ATC----TAT-T-AT-A-GTATAGGAT---ATG-A---ATGATGAT-AATA-TATT-TATA-A-A-AATC--A-T-AT--TA-TGC---AA---T-A-TT--A--T--A--A-------TA---TATAAT-CTTA-TGG------CC-GT-A--T--AA--TTGCG----T-ATAT-TA---TA
gi|17 : tcaAAGATT-ACA-G--A-GC-TC-A--C-G--TC-------CAC-G-GGGC-AA-AA-C--C--TT-T--AT-A--TGACAC-C-A---T-T-AT--------C---A-TA-T-TT----A--TGC-T-TTA-TCT--TAG-CCC--ACA--G-G-A--TTTTCAT--CTG--T--T--ACA-CT-TTATCA-T-A-T---------TA-------------------CACA-A--CATTT-AAAAA-------AAT-TAGC--AG-A-----A-TG-T-AC--A--A----GA-TAT---A-AT---AT-C-T--------AT-A-T-TA--------------------------------------------------GATGA-TT-ATG----TAT-T-GT-A-ATACA--AT---AT--AAT-AC-ATCAT-ACTC-TA-T-CATATA-T-GATT--A-T--T--TAATAT---AA---T-A-AT--AT-TTCA--A-------TAT--TAT-AT-CATaa
gi|18 : atca-TA--TATATA--TACCAGTATTTG-T-ATAA-AT--TC-AT-ATA------T-TA----CCAAT-A--T--C--AT-----TAT--AATA-TC-A-----A-T-------AC-CA-TA----ATCGT--TA------T--AC---AATATCA----ATATAAA-TATAGTCAA--CAT-A--TCATAT-AATAT---G-AAT-----ACCAT-AT-----ACCA-T-----T--ATCA----A--GA----TTA------C-GT---A-------ATAA-CCAATATT-CATATCATAC-----C-AT----A--C--TTA-ATTA-A---------GT----ATC---AGT--A-T-C---CAT---------------TA----CCAT-------T------ATTGTATC-AT------A-CCA-T-AC---CTG-----------------A------------T-A-----------ATA-gaaatt
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gi|19 : tctggtgataaaaTATCATACCAA--ATCATA-T--C-T-A--TCATAT-CGTAT-TAG-TAT-----ATCA--AT-C-ATACCA-TAT---T--GGTA----A--TA----AAAT-CG-TC-AT---AT----G---A--CCAATAT--CG----ATA--------AT----AT-G--ATA-ACAA-ATA-T--C--AT----ACC---A-T--A-TGC---TATATCTTATCATA----TA----T-GTAT-ACA-T------ATCATATC-AT------A-CGA---AT---CGT-----------------A------------T-A-----------ATA-TCATAT--CT--------AA-----C-----C-GC-A----TCacta
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gi|20 : atcaCA-G--A-GC-TC-A--A-C--TC-------GAC-G-GGGC-AA-CA-C--C--TTAT--AT----TGACAC-C-A---T-T-AT--------TCATG-TACT-T-----A--TGC-T-TTA-TTT--TAG-CCC--ACA--A-T-A--TTT--AT--CTG--T--T--AC--CT-TGATCA-T-A-T---------TA-------------------CACA-T--CA--T-AAAAATTATCATAAT-AATG--AT-A-----A-TA-T-AT--A--TGAATAA-TAT-C-T-AT---AT-C-TTTTGATGCATCA-T-TA-TGAATCTTTGCAATA-CAATATA---ATAC---ATC-AT---A--T-TCTATAA-TCCATG----TAT---AT-G-ATATTTAAT---ATA-AAT-
gi|22 : AGATT-ACA-G--A-GC-TT-A--A-C--TCACTCAAGGAA-G-CGAC-AG-CA-C--C--TT-T--AT-A--TGGCAC-C-A---T-T-ATTATATACAT---A-TA-T-T-----A--TGC-T-TTG-TTT--TAG-CCCCAATA--G-G-GTTTTT-TAT--CTG-----CT-AC-ACT-TTATGATT-A-TCAGTGCATGTA-------------------CACA-A--CA-TA-AAAAA-------AAT-TATC--AT-A-----T-TA-T-AT--A--T----GA-T-------AC---AT---T--------GT-A-T-TT-G-----------ATA-T----CA---A-AT---AT---T---A--T-C-TAT-A-TT-ATA----TATAT-AT-A-
gi|23 : ATG------TA-A----TA----TAGTAT-A-AAT------ATCGCATC-AT------A-CCA-T-AT---TGT-----------------A------------T-------------ATA-TTGTAT--CA--------TC-----C-----A-AT-A----TCG-TA------TA-----A----TA--------TCAT-----------AAAAT-----ATCA--TA----CCATA--T--G-T------ATA--AT-----AT---C-GT---ATCATATA-AT-GTC--ATAC---A-A------TA-TCATA---A--ATATCAATACC---A-------TATC--GT--ATAA---TATT--ATATC---------A-TACCtcattact
gi|24 : atttattaggggattaaacagtaaTA--CCA-TAT---GTATCATAC-----C-A-----AT-CTTATA-A--------------------ATC---A-T----T-T---CATA------CC-A----TA----TC-TAT-A-A-T------ATCGTTTC-AT------A-CCA-T-AT---CTT-----------------AAATATGTTTCAGT-AC----------ATA-TCGTAT--CA--------TA-----C-----C-AT-A----TCA-TA------TATTTAAA----TA--------TCAT-----------A----------TAA--TA----CCATA--T-CG-T------GTA--AT-----AT---C-GT---AT-----A-AT-ACC--ATAagcatctaaat
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gi|26 : AGATT-ACA-A--A-GC-TC-A--C-C--T--------GAC-GCGGGC-AA-CA-CG-C--TA-TAGAT-AATTGGCAC-C-AAATT-T-AT--------T---A-TATT-T-----A--TG--T-TTA-TTT--TAA-CCC--ACA--G-G-AATTTT-CAT--CCG-----TT-ACACCT-TTATCC-T-ATT---------TA-------------------CACACA--TA-TC-AAGAAAC-----AAA-TACTAGATAA-----A-TG-T-AC--A--T----AA-TAT-A-atattc
gi|27 : AAGATT-ACA-A--A-GC-TC-A--C-C--TC-------GAC-G-GGGC-AA-CA-C--C--TA-T--AT-A--TGGCAC-C-A---T-T-AT--------T---A-TATT-T-----A--TGC-T-TTA-TTT--TAA-CCC--ACA--G-G-AT-TTT-CAT--CCG-----TT-AC-ACT-TTATCA-T-A-T---------TA-------------------CACA-A--TA-TC-AAAAAC------AAA-TATC--AT-A-----A-TG-T-AC--A--T----AA-TAT-A-
gi|28 : ggaaatca-AT-AT--C-T-AT---AATC-AGTTAATACTATATAC-CATAT-C---------GT-ATTA-T-A-C-A----AT------G-A-T-G-AT--ATTGT-C-ATCAT-ACCAT--ATC-AAACAA----TA-T--ttta
gi|28 : --ATA-----TC-TATA-ATCAGT-T---AATACTATAT--------------ACCA-TATCGTATTATACAAT--------GA-T----------------------G-------------ATA-T--T---GTCAT-CAT-AC-CA-TA-TC-AAAC-AATA--T--------------------------------T-GAT-AT---C--------------T-CGAATA----------CG----T------G-TGTC-C-T-GCCA----CGAG----A-TCTCATCC-----T--CATGT-TCT--G-TTATA-GTAG-T-A--C-ATAC-C-C-A-C----G-AT--CA-TA--Ttgatatctcgaatacgtgtgtcctgccacgagatctcatcctcatgttctgttatagtagtacatacccacgatcatatg
gi|29 : AAGATT-ACA-A--AAGC-TC-A--C-C--TC-------GAC---GGGC-AA--A-C--C--TT-T---T-A--TGGCAC-C-A---T-T-AT--------T---A-AATT-T-----A--TGC---TTA-TTTA-TAG-CCC--ATAT-G-G-AT-TTT-CAT--TCGCAT--CTGACCACT-TTATCA-T-A-T---------T-----------------------A-A--TA-CTAAAAAA-------AATATATC--AT-------A-TG-T-AC--A--g
gi|3 : ca-AT--------A--TCTGTATCA---------ACCC--ATA----TCGTA---CAGATAT-TGTAT-A--TA--CCAATA-TTG-ATA-TAT-AT-GTT-A--TA-CCA-TAT-CGTA--CTA---CATA-----------------TTTGCTATAATATGATATC-ATAT-CA-AACCATATCCATATTAAT------A--T---G--TT-ATATA-A-AACCATATCG---ATAACTTT-ATACA-TA-TC-G-TA-TTAT-T-----CATA-C-T-ATA-CTATAAG-CCATCTAT-CAT-A----TACATATCTTA-TCATAATGTTATCTAGAATGTATCATTA-CCATAT
gi|3 : acataatTACCA-T-A-T---------CG-------------------TAC-----TA-C-----AT-------ATT-TGCT--AT-A-----A-TA-TGAT--A--T----CA-TATCA-A-ACCATAT-C-C--------AT-A-T-TAAT-----------ATG-T--TATATAAA-ACCATATCGAT---AACT-T-TATAC-AT-ATCGTATTAT-TCAT-A-CTATAC--T---ATA-AGCCAT--CTAT-CATA-TA---CATATC-T-TATC--A-T-AA--TGTTATCTAGAATGT-A-TC--AT-T--ACCA-------TAT--C-T-AT-CATA-CGC-ATA-ACA-A--A--T--CA--T---C----C-ATAT----------GTA-AT-AT-AT--CCT-ATCTAAATCTG-----CATCATA--C-CATA--CTTCATAATAAT-ATCA-T-A-C-C----ATAGT--CATA-T-A-ATTTATCGT----TTATGACCAT--ATC-ATAT------TG-T--ATA--ATTAAAT----TATCGATAT-----CATA-CCAT---ATGGTATAATAT-CGT-A------TCATA--C-AA-TA----GGTTGTA--TC-ATATACATA-TTGGTAT-A-T--A-CC-ATCATCAT-----A----T----A---A--ATA--TC-GCATT-ACAGTCA--ATC-GTA----------------T---C-AATTACATT-A------TC-A-T-AT-ATAT-A-CGTATCAAA------C-CTTA-TCT----ATCCAAATC-A--ATATACCAT-----AT-CGTGTCA--GTA---TGTC-CATA-ATA-GCAT----AT-TTGTACT-AATATTGT----ATCA-AAT--TATCCTACCAG----A-TCGA-TAATAA------T-C---ATA--T-------------GTAAC--C---A-TAT-CAT-AC-CAATAATC-A-AT-AATA--T-A-------TATCAGTA-CTCA-TTATCGCTATTAAT-AT---C-ATACCATTTGTCATAC-AATA-T--------CA----TATAT--AATATC-AAT-ACCATACTCG-T----A-TAATGATCGTTCATTACATAT-CATTAG-TAATA-TCGG-T-A-TC-ATAC-CAT-GTC----ATAT--AA-TA--TTATCA--TACCATAATC-G-T-ATCA-TT-TCC-CT-ATT------GGTATCG-ATAAT-A--T--T--ATT--CATACC-GATAGTC-GT-ATCA-T-------AC-CA-TACCATATTTG--TATGAATAT--ACGAACATATT-CA-CATATCAG-TATCGTAATATCAT-A--CCATAT-----------AAT-----AATGT-AT-CTACACTA-TAGTCAT--ATCGT---A--CA----ATAT-GAA---GT---A-----TCATAGTTCTATAT---GTA-CATACATAATC-AT----ATAC--ATGTATC--ATA-C--C--AT----ATTGTAA-T--A-T-CAATCATA------T--A----TA----TCGCAT-C-A-TAGCCAGATTGTATC-AT------ATCCA-T-AT---CGT-----------------A------------T-AC----------ATAGTCGTAT---A--------TA-----C-----CAAT-A----TTA-GAT-----TA-----A----TA--------TTGT---------------------ATCA--TACAATCCATA--TCCG-T------ATA--AT-----AC---C-AT---ATC--ATA-GT-ATC--A-AACA-A-AT-CA--TA-TCATAC---C-ATATC-ATACC--------------C--ATA-ATCG---TAT-----------------A-TATAGATA-----AT-AT-ATCGCATCATAACCATACctatcatacgcataacaaatcatccatatgtaatatatcctatctaaatctgcatcataccatacttcataataatatcataccatagtcatataatttatcgtttatgaccatatcatattgtataattaaattatcgatatcataccatatggtataatatcgtatcatacaataggttgtatcatatacatattggtatataccatcatcatataaatatcgcattacagtcaatcgtatcaattacattatcatatatatacgtatcaaaccttatctatccaaatcaatataccatatcgtgtcagtatgtccataatagcatatttgtactaatattgtatcaaattatcctaccagatcgataataatcatatgtaaccatatcataccaataatcaataatatatatcagtactcattatcgctattaatatcataccatttgtcatacaatatcatatataatatcaataccatactcgtataatgatcgttcattacatatcattagtaatatcggtatcataccatgtcatataatattatcataccataatcgtatcatttccctattggtatcgataatattattcataccgatagtcgtatcataccataccatatttgtatgaatatacgaacatattcacatatcagtatcgtaatatcataccatataataatgtatctacactatagtcatatcgtacaatatgaagtatcatagttctatatgtacatacataatcatatacatgtatcataccatattgtaatatcaatcatatatatcgcatcatagccagattgtatcatatccatatcgtatacatagtcgtatataccaatattagattaatattgtatcatacaatccatatccgtataataccatatcatagtatcaaacaaatcatatcataccatatcatacccataatcgtatatatagataatatatcgcatcataaccatacttgtnnnnnnn
gi|30 : acataatatatctgtatcaacccatatcgtacagatattgtatataccaatattgatatatatgttaCGTAT-A-A-T------ATCATAT----------A-CCA-T-AT---CGT-----------------A------------T-A-----------TCA-TTATAT--CA--------ttgtnnnnnnn
gi|30 : ATCATATACCATATCGTATATCATTATATCAGCATCTAAACTACT--CAAATACTCAAAAATAATAG-ATCACAAGAC-CATTCTTAATCTAAGTTT----GATG-AAATTCAACAAAGCAATgcatctaaactactcaaatactcaaaaataatagatcacaagaccattcttaatctaagtttgatgaaattcaacaaagcaataactcaaatatcgcctg
gi|31 : cgtataatGATC-ACA-G--A-GC-TC-A--C-AGATC-------GAC-G-AGGCCAA-CA-C--A--TT-T--AT-A--TGGCGC-C-A---T-TCAT--------T---A-T--T-T-----A---GC-A-ATA-TT------------------------TTT-CAT----G-----TC-ACAATT-TTATTA-T-A-T---------TA-------------------CA----------T-AAACA-------TAC-TATT---T-A-----A----T-AT--A--T----GA-TAT-A-ATAC---AT-aactcaaatatcgcctg
gi|32 : gtaatcaatAAGATT-ACA-G--A-GC-TC-A--C-C--TC-------GAC-G-GG---------------------------TAACAC-C-A---T-T-GT--------T---A-TATT-T-----A--TGC-T-TTA-TTT--TAG-TCC--ATA--G-G-AC-TTT-CAT--CTG-----TT-AT-ATT-TTATCA-T-A-T---------TA-------------------CACA-A--CC-TT-AAAAA-------A---TATC--AC-A-----A-TG-T-AC--A--T----AA-TAT-
gi|33 : tcaTAT--CA--------AA-----C-----C-AT-A----TCG-TA------TA-----A----TA--------CCAT-----------C---------A-CA--TA----CCATA--T-TG-T------ATA--AT-----AT---C-AT---AA---ACA-AT-ATC--ATACCATA-----------TCATAT--A--ATGTC-ATACA---A-------TATC--GTA--TAA---TATT--GTGTC---------A-TACC-ATATC------AT-ATCGTATCc
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gi|36 : AGATT-ACA-A--A-GC-TC-A--C-C--TC-------GAC-G-GGGC-AA-GA-C--C--TT-T--AT-A--TGGCAC-T-A---T-C-AT--------T---A-TAGT-T-----A--TGC-T-TTA-TTT--TAG-CTC--ACA--G-G-AT-TTT-CAT--CCA-----TT-AC-ACA-TTATCatt
gi|37 : -T-ATCA-AT-A----T-ATA------A-TA-----TGAT-A--C--T---T---TATGC--AATA-TT-AT-ATCA-T-------AT--AATATCATGTCGC--TC-----GT--AG---AATATCATATAATACCAA-TA
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gi|14 : atgttaccttcgcctatttgT-ACA-A--A-GC-TC-AATCAC--TC-------GA----GGGC-AA-CA-C--C--TT-T--ATTA--TGGCAC-C-A---T---AT--------T---AATA-C-TTTA--A--TGC-T-T-A-TTTA-TAA-CCC--ACA--G-G-A--TTTTCATGTCCA--T--T--ACA-CT-TTATCA-TTA-T---------TACACA-A--TACT-AA------------T-TTTT---T-AA-T----C--ATT---AA-TA-----ACAT-CT--------AT-A-TATA-C-----------ATA-T--TAT-A-ATAC-AT-AA--T-TA---TGA-TT-AATCAT-TAT-A-AAATAGGAT-A-TATA-AT-TGAT-A---T-------A----AT-A-TAT-----ATA--TC--AT--ACTC--A-T---AT--T--AAT-TG--AT-ATTC--AT-TG-ACTATAGTAT-GTATATATTG---AG--A-TA----TT---ATGT--AAGTT---ACTATT-ATA--T-TA---TATAAT---AT---A--AT--CGT-TTAAT--CAT--G-T-T-ACACC-CATAAT----------CGT-ATTACT-A-C------CCATTA---T--CGTA-TGG-A---TAT--G-TGTATCATACCc
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gi|17 : tcaAAGATT-ACA-G--A-GC-TC-A--C-G--TC-------CAC-G-GGGC-AA-AA-C--C--TT-T--AT-A--TGACAC-C-A---T-T-AT--------C---A-TA-T-TT----A--TGC-T-TTA-TCT--TAG-CCC--ACA--G-G-A--TTTTCAT--CTG--T--T--ACA-CT-TTATCA-T-A-T---------TACACA-A--CATTTAAAAA-------AAT-TAGC--AG-AA-TG-TAC--AA----GA-TATA-A--TAT-CT--------AT-A-T-TA-G-----------AT-------------------------------GA-TT-ATGTAT-TGT-A-ATACA--AT-A-TA-ATACATCAT-ACTCT-------ATC--AT-A-TATGAT-TATT--TA--ATATAATA--A-T---AT--TTCAATATT--AT-A-TC--A--TG-A-AAT--Taa
gi|18 : atcaAT-AT-A-TA-CCA---GT-A-TTTG------T-AT--A-----A-AT---TC-AT-ATATTA--CCA--A----T-ATCAT----TATA-ATATC-A------ATA--C---------C-ATA----ATC---GT--TA-----TA--CAATATCA------A-TA---T-A----A--A-TATAGTCA-ACAT-ATCA-TATAATAT---G-A---AT-----ACCAT-A-T-----ACCA--T-----T--A-TCA----A-----GA----TTA------C-GTA------------AT--AACCAATA-TT-CA--------TATCA-TAC-C-AT-A-CTT-AATTA-------A----GTAT--C-----AGTA-T-C--CAT---------------T-----A----CCAT---------T-ATT-GTA---TC-AT------ACCA--T-A-C---CT-G-----------------AT--A---AT-A
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gi|19 : tctggtgataaaaTA--TCA-TA---C-C----A--A--ATCATA--TC-T-ATCA-TATCGTAT-TAG-T---AT-----ATCA--A-T-C-ATACCA--TAT---T--G-GTA----A-----TA----AAAT-CG-TC-ATAT---------G-----A-CCAATA-T--CG------------A-TA----AT-ATGAT-AACAA-------ATATCATAC--C-----A-TA-TGC--TATATCTTATCATA----T-----A----T-GTA-T-AC-A-T-ATC-ATA---TC-AT------ACGA----A-T---CG-T-----------------AT--A---AT-ATCATA-TCT--------AA-----C-----C-GC-A-TCacta
gi|2 : tctggtgataaaaattgtacgaatatgattt-AT--C-----A-AT--GTC-AT-AC--------A--A----T-A--GTCAATTATA-ATATC-A-T-ATCATA--C-----------ATATTGTATC--------------TA--C----TCAAA--TCA-TA---C---------G-TAT--TAGATCAT---TA-CATCATAT-----A---AT-----GTCGT-A-T-CCATACCACAT-----T--G-T------A-----TA----AT------TC-GTAT---------CCATGAA-CCA-TA-C--CG--------TATCA-TAC-C-AT-ATCATTAATCATTAGTTCATACCATAT--TGTGTAA-TA-T-T--CGTA------TC-A----TGACCTA----TCTTACT-G--A-T-ATCTGTA---TC-A-------ACCA--T-A-T---CGGT-----------------ATCCACCCAT-ATTGAAATCA--------TA-----C-----C-AT-AATCA-T----ATAA----TTATTGTATCAT-----------A---------ATTG--AACGCATA--TGTG-TTATAAATAACAT-----ATC-TTATCATACATATTGT-ATG--ATATCAT-A-A--AAT----TA--CCAT--A--T---C-----------GTATC-ATACC---A-------TATC---TA--TA--------ATATCT-GTGATC-----A-TACAAACA-TTACGCATTAT-ACCATATCGTATCATAC-AT-CTGATATAA-TATAA-TATT-----ACC-ATATCGTTGG-------ATATGTAT------CATAT-------CAA-----A---CCATATCGTA-TAAT-ACCCAT---A---TTCATGT-AT----ACT--CGTATC-A--T--A--CCTTAT-C-CATTGAT-------------CA---CT-ACTTCT-TT-A--G-GTATAATATCACATCATACC--ATA----T-GTA---T-----A-ATATAATATCC-----TA--CCA-TA-TTGTAT------ATATCATGATCAT-TACCCCATAGTT-GTAT-C-CA--CCATA-TTGTGATAA-ATA-T--ATATTCA-GAACCCA-TATACGGTTGTAATA--TG--GT-TCATATT--CAA-Ctaactactcaatacatttacgatcacacaagcaatatacta
gi|2 : -TA---CAA-TA-GTCAAT-TAT-A-ATATCATATCA-TA-C-ATATTGT-A---TCTACTCAA----ATCA-TA-----CGTA--TT--A---GATC--A-TTACAT--C--AT-ATA--AT-G-TCGTAT-CC-A-TAC--CAC-AT-TGTA-TA---ATTCG-TA----TCC--ATG---AA--C--------C-ATA--C-CG---TATCATA--CC---AT-AT--CAT--TAAT--CATTAG-T-TCATA-C-CATATTGTGTAATATTCGT-ATCA-TGA-C------CT---A---T--CTTACT-G-A---TATCTG-TA--TCA-ACCA-T--ATCGGTATCCAC-CC-A----TA-TTGAA--ATCATACCAT--AAT-----CAT-ATAATTAT------TG-TAT-C---A------TAATTGA-ACGC-ATAT---G-TGTTATAA-ATAAC-A-TATCTTA-TCATAC--AT--A-TTG---T-ATGAT--A-----TC-ATA-AA--AT-----------------T---ACCAT---ATCGTAT----C-A-T----ACC-A-T-A---T---------------CTATA---AT-ATCTGTGATCATACAA--ACATTA-----------CG-CA--TTA---TA-C-CATA---TC-GTATCA-T-AC----ATC-TG-A---T-AT----A--A-TAT-AATAT--TAC-CAT---A-TCGT-TG-G---ATA-T-GTATC---A-TATCAA-AC-CA-TA--TCGTA-T-AATAC------C-CATA-TTCAT----GT-AT--ACTCGTATCATAC-C--TTA-TC-------------CATTG--AT-----------------C-AC--T-ACT----TCTTTAGG-TA-TAATATCACATCATAC-CATATGTA-T-AATA--TAAT-AT--C-CTAC-CAT--ATTGTATATAT------CATGATCATTACCCC---AT-AGTT-G------T-AT--C--------C--ACC-AT-ATTGTG--ATA--A------------A--TAT--ATAT-------TCAGAACC---------C-AT---ATACG---GTTGTA---A-TA--TGGT-TCATAT-TCA--A---CGC----G--A-GATCGGGG------GCTA-AATTCTAC-T-G-ATCCAT-----ACCCC-C-C-CCTGCCCA--T-----T--ATTCA----AAAGCCTA----ATGT-GGATC-GTAT---------CGAT--A-AC-----T--CT--------TATTA-TAC-T-GA-ATCAT--ATCA-------GTATAGTAT--A-----A--A-T-----ATG------GA-A----T----------TC-CA-T-A--A-T-ACC-GTAATTTT-GT------ACTACTT-A-T---CG-------------------GT--C---AT-----TT-TCA--------TA-----C-----C-AT-A-TCG-TGAAGA-AA----T------AGCAT---------------------AT----TAC-CAT---T-CA-------------------ATC-A-----TACA----AT-AAT--ATACCAT---A--TATCAGGTA--TGAC--A--TG-ATC----------ATATC-AAACC---A-------T-TCTTGTA-TCA--------ATGGA--GC--TA-----A-GATCGGT------GTATATT-ATT-TATTGT----TACC---TCG--ATA---ATCAATATT----C-AC--TATCGTGATGCTTC-TGTATA-ATGA-------AT-------TTAG--TTG----CATATCG-A--CAT-ATT-CG---A---AT-ATAC-A-----AATACCATAT--A--T--ACTCCATAT-CCGA--AGTT---CCTT-ATCATA---CC-A-AT-T-ATAA--TCGAGTTATA----AA-ATA------A----TTATA---T-----G-AAGCGGCAGCAAG---TACTCCACTAGTTGTATA-----AT-TCATAATCACTTT--CCATA-TC-GTA--C-TA----ATACTCAT-AT-A---G-TC-G-A-T---TA--CCA-TAT-TG--TTGAATAAGTATCAT-ACATACC--T-T-CCATATC-GGAAATAATAATCA-TACTCA--GTAT--AATG--TCACAT--------CACATA-TCATATT-CATCATACCCATATCgcgagatcgggggctaaattctactgatccatacccccccctgcccattattcaaaagcctaatgtggatcgtatcgataactcttattatactgaatcatatcagtatagtataaatatggaattccataataccgtaattttgtactacttatcggtcattttcataccatatcgtgaagaaatagcatattaccattcaatcatacaataatataccatatatcaggtatgacatgatcatatcaaaccattcttgtatcaatggagctaagatcggtgtatattatttattgttacctcgataatcaatattcactatcgtgatgcttctgtataatgaatttagttgcatatcgacatattcgaatatacaaataccatatatactccatatccgaagttccttatcataccaattataatcgagttataaaataattatatgaagcggcagcaagtactccactagttgtataattcataatcactttccatatcgtactaatactcatatagtcgattaccatattgttgaataagtatcatacataccttccatatcggaaataataatcatactcagtataatgtcacatcacatatcatattcatcatacccatatc
gi|20 : atcaatgtcaCA-G--A-GC-TC-A--A-C--TC-------GAC-G-GGGC-AA-CA-C--C--TTAT--AT----TGACAC-C-A---T-T-AT--------TCATG-TACT-T-----A--TGC-T-TTA-TTT--TAG-CCC--ACA--A-T-A--TTT--AT--CTG--T--T--AC--CT-TGATCA-T-A-T---------TACACA-T--CA-T-AAAAATTATCATAAT-AATG--AT-AA-TA-TAT--ATGAATAA-TATC-T-ATAT-CTTTTGATGCATCA-T-TA-TGAATCTTTGCAATA-CAATATAATACATCAT-AT--TCTA---TAA-TCCATGTAT--AT-G-ATATTTAAT-A-TA-A-AT
gi|22 : AGATT-ACA-G--A-GC-TT-A--A-C--TCACTCAAGGAA-G-CGAC-AG-CA-C--C--TT-T--AT-A--TGGCAC-C-A---T-T-ATTATATACAT---A-TA-T-T-----A--TGC-T-TTG-TTT--TAG-CCCCAATA--G-G-GTTTTT-TAT--CTG-----CT-AC-ACT-TTATGATT-A-TCAGTGCATGTACACA-A--CATA-AAAAA-------AAT-TATC--AT-AT-TA-TAT--AT----GA-T------ACAT--T--------GT-A-T-TT-G-----------ATA-T----CAA-ATAT--T-AT--C-TA---T-A-TT-ATATATATAT-A-
gi|23 : ATG------TA-A----T-----A----TAGTA-T-A--AAT-ATC-GCA---TC-AT------ACCA--T-A-T---TG-T-----------------AT------AT-ATTGTA-TCA--------TC-----C-----A-AT-A-TCG-T----ATAA----T------ATCAT-----------AAAAT-----ATCA--TAC-CATA--T--G-T-----ATAA--T-----ATC-GTATCATATA----AT-GTC--ATAC----A-A---------TA--TCAT--A-----A------------ATATCAATACC---A-------TATC--GT--ATA--------ATATT--ATA-TC-----A-TACCAGCA-T--Ctcattact
gi|24 : atttattaggggattaaacagtaaTA---CCATAT-GTA-TCAT-ACC-A--------ATCTTAT-A-----AAT--CATTTC-A--T--A--CCATAT-C-TAT-AATA---TCGT-TTCATA---CC-ATATCT----------TA-AATA-----T-GTTTCA-GTA----C---------------ATATCGTATCA-----TA--CCA-TA-TCATATATTTAAATATCAT-ATAA--TA--CC--------------------ATA-TCGT-GT-A-ATA-TC-GTA-TAA-TA--CCA-TAT-TG--TAtaaat
gi|25 : atgaatA----ATAT--GAT----AT---------T-AT--G-C-AATA-T--TA--------TATTA-TAT-T-AT-ATCAT-AACGA-------ATA--ATAT--C-----A-TA-T-A---ATAA-----CA-A----T-----AATTTTCATA-T-A--A-A-ATA-ATA---CC-AT------ATCA--T-A-T---CA-T-----------------AT--T---GT-ATAACA-TCA--------TA-----C-----C-AT-A-TCG-T----ATAC----T------ATCAT-----------AATT------ATCA--TAC-CATAC-T-CA-T-----ATCA--G-----ATC-ATA
gi|26 : AGATT-ACA-A--A-GC-TC-A--C-C--T--------GAC-GCGGGC-AA-CA-CG-C--TA-TAGAT-AATTGGCAC-C-AAATT-T-AT--------T---A-TATT-T-----A--TG--T-TTA-TTT--TAA-CCC--ACA--G-G-AATTTT-CAT--CCG-----TT-ACACCT-TTATCC-T-ATT---------TACACACA--TATC-AAGAAAC-----AAA-TACTAGATAAA-TG-TAC--AT----AA-TATA-atattc
gi|27 : AAGATT-ACA-A--A-GC-TC-A--C-C--TC-------GAC-G-GGGC-AA-CA-C--C--TA-T--AT-A--TGGCAC-C-A---T-T-AT--------T---A-TATT-T-----A--TGC-T-TTA-TTT--TAA-CCC--ACA--G-G-AT-TTT-CAT--CCG-----TT-AC-ACT-TTATCA-T-A-T---------TACACA-A--TATC-AAAAAC------AAA-TATC--AT-AA-TG-TAC--AT----AA-TATA-
gi|28 : ggaaatca--ATA----T-C-TATA--ATCAGT-TAA-T-AC-TATAT-----------------ACCA-TAT-CGTATTATAC-AAT-------GA-T----------G-ATATT---GTCATCAT-AC-CA-TA--TCAAA-C-AATAT-----------------------TGAT--A-TC-T------CGA--ATA--C--------G-------TG-TGT-----------------C-C---T-GCCA----C-----GAGA-TC-TCATCC-TCATGT-T----CTG-T-TATAG-TAGT-A---C-ATAC-C-C--A-CG-----AT------CAT-ATttta
gi|29 : AAGATT-ACA-A--AAGC-TC-A--C-C--TC-------GAC---GGGC-AA--A-C--C--TT-T---T-A--TGGCAC-C-A---T-T-AT--------T---A-AATT-T-----A--TGC---TTA-TTTA-TAG-CCC--ATAT-G-G-AT-TTT-CAT--TCGCAT--CTGACCACT-TTATCA-T-A-T---------T----A-A--TACTAAAAAA-------AATATATC--AT--A-TG-TAC--Ag
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gi|30 : aCGTA-T-A--A-T-ATC-ATA---T----------ACCA--T-A-T---CG-T-----------------AT--A---TC-ATTATA-TCA--------nnnnnnn
gi|30 : ATCATATACCATATCGTATATCATTATATCAGCATCTAAACTACT--CAAATACTCAAAAA-TAATAG-ATCACAAGAC-CATTCTTAATCTAAGTTT----GATG-AAATTCAACAAAGCAATgcatctaaactactcaaatactcaaaaataatagatcacaagaccattcttaatctaagtttgatgaaattcaacaaagcaataactcaaatatcgcctg
gi|31 : cgtataatGATC-ACA-G--A-GC-TC-A--C-AGATC-------GAC-G-AGGCCAA-CA-C--A--TT-T--AT-A--TGGCGC-C-A---T-TCAT--------T---A-T--T-T-----A---GC-A-ATA-TT------------------------TTT-CAT----G-----TC-ACAATT-TTATTA-T-A-T---------TACA---------T-AAACA-------TAC-TATT---T-AA----TAT--AT----GA-TATA-ATACAT-aactcaaatatcgcctg
gi|32 : gtaatcaatAAGATT-ACA-G--A-GC-TC-A--C-C--TC-------GAC-G-GG---------------------------TAACAC-C-A---T-T-GT--------T---A-TATT-T-----A--TGC-T-TTA-TTT--TAG-TCC--ATA--G-G-AC-TTT-CAT--CTG-----TT-AT-ATT-TTATCA-T-A-T---------TACACA-A--CCTT-AAAAA-------A---TATC--AC-AA-TG-TAC--AT----AA-TAT
gi|33 : tcaTA-TCA--------AA-----C-----C-AT-A-TCG-T----ATAA----T------ACCAT-----------C---------A-CA--TAC-CATA--T-TG-T-----ATAA--T-----ATC-ATAA---ACA----AT-ATC--ATACCAT-A---------------TCAT--A--T--A------------ATGTC-ATACA---A-------TATC--GTA--TA--------ATATT--GTG-TC-----A-TACC-ATA-T--C-----AT-ATCGTATCc
gi|34 : ccattttaTAT--CTT---A-TA-T-T--CATG--------------------A----TCATA-T-A--A-TCATT-GTA---TC-AT------ACAA--T-A-TAATCA-T-----------------AT--A---TG-ATCGTG-TCA--------TA-----C-----C-AT-A-TCG-C----ACCA----A------ACCATGATTGTAGTTCA---------ATCA--TAC-CATAAGT-CG-T-----AAAA--TA----ATC-GTATC-
gi|35 : tgT----AA-TATA-A--CAT-CT--------AT-A-T-TA-T-----------ATA-T--TATACTACAT-AC-A---T-TA---TGA-TT-ATCTAT-TAT-A-ATTTACGAT-A-T--A-ATATGAT-A---T-------A----AT-A-TAT------TA--TG--A---TATT--A-T---GTAAT--ATTATa
gi|36 : AGATT-ACA-A--A-GC-TC-A--C-C--TC-------GAC-G-GGGC-AA-GA-C--C--TT-T--AT-A--TGGCAC-T-A---T-C-AT--------T---A-TAGT-T-----A--TGC-T-TTA-TTT--TAG-CTC--ACA--G-G-AT-TTT-CAT--CCA-----TT-AC-ACA-TTATCatt
gi|37 : ATA-TG---T---A-TA----TCAATATAT--AA--T---A----TGATACTT-TA---TGCAATA--TT---AT-AT--CAT-ATA-----AT--A-T-C-ATG-T-CGCT------------CGT-AGAA-T---------------A---T--CATA-T-A-A---TACCAA-TA-AT--TATTG-T--ATC-------AA-A
gi|37 : ------T-AT--C-----A-AT--A----T-ATAATA---TG--A----T-ACT-TTA--TGCA-ATATT-A-T-ATCATA--T---------A-ATATCATGTC---GC--TC---G-TA--GAATATCATA--TAA-TA---C-C----A--A-TA
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Reference ( family-1561 ) : AAGATT-ACA-A--A-GC-TC-A--C-C--TC-------GAC-G-GGGC-AA-CA-C--C--TT-T--AT-A--TGGCAC-C-A---T-T-AT--------T---A-TA-T-T-----A--TGC-T-TTA-TTT--TAG-CCC--ACA--G-G-A--TTT-CAT--CCG--T--TT-ACAACT-TTATCA-T-A-T---------TACACA-A--TACT-AAAAA-------AAT-TATC--AT-AA-TG-TAC--A--T----A----A-TATA--A-ACAT-CT--------AT-A-T-TA-T-----------ATA-T--TATAA-ACAT-AT-AT--T-TA---TGA-T-T-ATCTAT-TAT-A-ATATAGGAT-AT-------A-A--ATATG-AT-A---T-------A----AT-A-TAT--T-CATATA--A---AATC--A-T---AT---------T--AT---TATGAT-A-TC--AT-TG-A-TAT--TAT-AT-CATA-TGA---A-TA----TCAAT-GT--AA--T---A----TATAT-TA---TATAATA-AT-AT-AT--CGT-AT----AATCA-----T--ATT-AT-A--C-CAT-AT-----------CGT-ATTA-T-A-C------C----AT--CGTA-T-G-A---TATC-GT-A-ATCATACCAT--ATC-------AAAC-A----TA-T---GT---A--ATC---AT--CATATT-----CGTA--AT-CAT---AATA-TAT-C---A------T--CAT--A-AC-CA-TA----A-TGT---A--------AAT--C-ATACCATA-TCGTAT-AT--A-TTG---T-AT-GAT--A----TC-AAA-CA--ATA--TCGTATACCAT-ATCGTATC-A-T-ATC-A-T-AT-AATATCGTATCATAC-CAT-ATCNGT-AT---C-CATAA--ATATCAT--CAT-CG----CANTAC--TC-TATA-ATC-GTATCATACCATATC-AA-ATCAT----ACCATAT-CGTATCATACCAT---ATCGA--T---CATA-A-ATATC---G-CATCAT-AC-CA-TATCGTAT-AA-TAT--C--TACCATA-NT--CATATAAT-A-TCGTATCATACGAATA-T--CG----TATTG---TATC-A-T-ACC------------AT---A-TCGTA-TCAT--CCCATCATAT-CGTATAATATTNGT-ATC-ATAC-CA-T-A-TCG-----AT----CAT-ATCA-TA-C-CAAT-A-TC-G-T-ATCAATACCAT-A-----------TC----GTA-ATA--AT-ATTA--TCATATAATATC-G-T-ATCAT-A--C-C-ATAT-CGT-AT------C---GTTAATACCATATCA-TA-TCATAC-CA---------A-TATCG-TAGTCAT-ACCA--TATCGTAT-CG-A---AT-----ACCGTAT-CCATACCAT----T--A-TCA-A-----T--A-ATATCG-ATC-GTA-T----TCATA-CCA----ATAT--CGTATC-ATACC---ATAT---CATA----ATCA-ATA-CCATATC--A-TA-TCCATA-C-AA----TA----T-C-GTAT-AA-T-AT-CGTA---T------C-AT------AC---CA--T-AT---CGT-----------------ATAATATCGTAT-CA--------TA-----C-----C-ATATCG-T----AT-AATATCAT-----------A----ATCA--TACC-ATA--TCGT-ATAAT-----ATC-GTATC-TACAAT-----ATC--A--TACCATA-AT------T--GT---------A-T-------CATAT--AT-ATATC-ATACC---AT-------ATC--GTA-ATA----------AT---ATC--GT--TC-----AT-ACCGA-----TA-TCGTATAAT-AT-CGTATCGT-TAC-CA--T---TCGTATAATATANGTATT----CAA-CGTATCGTTGNNATTCCAT---ATNCATTAT--CCGTATC---TA-ATA----CCAT----------ATCGTA-T-NAT-A-NTAT---A---ATCATATAT----A--AT--CGTATC-A--T--A--CCATAT-CGTAT-TAAT-A---TCGT-ATCATACC-ATAT--CT-AT-A--TCGTATAATA---A-TATAC-CA-GTA----TCATA---TA-AT-ATCG-TATCA--TA--CCA-TA-TC-GTA-T-A-----ATATCA-T---ATCA--TA-CCATATC-GTAT-C-TA--CCATA-TCGTA-TA--ATATC-GTATC-A-TACCATATC------GTATAAT-A--TATCGT-TCATACC--TAACC-ATATCG----T--ATAA-T-ACCAGTA-TCA----ATAT-A--ATATCATA--TCATA---CACANA-T-C-ATATC-CA-T-A---CCA---TATCGTA-TAGT-ATAA-TATCGCATC-----ATA----------ACCAT-ATTGT----A-TAT-C---TTG---TAACT-CATACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCGATCGTATA--ATAT--TATATCAT---ACCAGCATCTAAACTACT--CAAATAC------A-T-TTAG-ATCACAAGACGCATTCTTAATCTAAGTTT----GATGAAAATTGAACAAAGCAAT
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gi|11 : tatcataccatatcattattccatgtcatT-A-CAT--T--ATATA--T---AATC--A-T--------------T--AT----ACCA--A-TC--AT-TT-A-TAC--CAT-AT-CAT--T-----A-TA----CCA-T-GTTCGA--T---A----TATAT-TACCATACATTC-AT--T-AT----T-TT----AATCA-----T--A------A--C-CAT--------------------TA-T-A-C------C----AT--GCCC-T-T-A---TATC-AT-A---CA-ACTAT--ATC-----------------CA-T---GT-------TC---AT--TATATTATAGACATA--AT-CATTTAAACA-TGT-C---A------T--TAT--A-AC--A-TAC---A-T-T---A--------AAT--T-ATACCATG-TCATTC-AT--A-TTA---T-AC-CAT--ACATTTC-AAT-TA--TTA--TAGCATACC---ATTATACC-A-T-GTC-ATT-AT-AA---CATACCATA---GT-ATTACT-AT---T-CATAC--GTAT-A---CATACGC---CACTAC--TCTTATACATA-TTATTATAGTATACC-AATATCATTATAACCATGT--GTATTATACTAT---ACCAC--A---CAT--T-ATATCTAGA-CATTAT-Attaaccat
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gi|14 : atgttaccttcgcctatttgT-ACA-A--A-GC-TC-AATCAC--TC-------GA----GGGC-AA-CA-C--C--TT-T--ATTA--TGGCAC-C-A---T---AT--------T---AATA-C-TTTA--A--TGC-T-T-A-TTTA-TAA-CCC--ACA--G-G-A--TTTTCATGTCCA--T--T--ACA-CT-TTATCA-TTA-T---------TACACA-A--TACT-AA------------T-TTTT---T-AA-T----C--A--TT---A----A-TA------ACAT-CT--------AT-A-TATA-C-----------ATA-T--TAT-A-ATAC-AT-AA--T-TA---TGA-T-T-AATCAT-TAT-A-AAATAGGAT-AT-------ATA--AT-TG-AT-A---T-------A----AT-A-TAT-----ATATC--AT--ACTC--A-T---AT---------T--AA---T-TGAT-ATTC--AT-TG-ACTATAGTAT-GTATATATTGAG--A-TA----TT-AT-GT--AAGTT---ACTATTATAT-TA---TATAAT--AT-A--AT--CGT-TT----AATCA-----T--GTT-AC-AC-C-CATAAT-----------CGT-ATTACT-A-C------CCATTAT--CGTA-TGG-A---TAT--GT-GTATCATACCc
gi|15 : AGATA-ACA-A--A-GT-TC-A--C-C--TC-------GAC-A-AGGA-AA--A-C--C--GT-T--AT-A--TGGCAC-C-G---T-T-AT--------T---A-TA-T-TC----A--TTC-T-----GTT--TAG-TCC--ATA--G-G-A--TTT-CAT--CTG-----TT-AC--CT-TTATCA-T-A-T---------CACA-A-G--CATA-AAGAA-------AAT-TATC--AC-AGTTG-TA---A--C----G----A-TAT-----ATAT-CT--------AT-A-T-T-------------------------A-ACAT-GT-ATGAT-TAATGTGA-T-C-ATC-A--TAT-A-TTA-ATGAT-AT-------G-A--AT-----T-A---T-------ATTGCAT-C-TAT--T-AATGTA--T---ATTC--A-T---A------------------CATG-T-A-AT--AT-T------T--TAT-AT--ATA-TGA---ATTAATTTTTGAT-AT--AA--T---A----TATA--TA---TATCATA----AT-AT--TGT-ATTGAGAGT-------T--AAT-AC-A--A-TAT-AT-----------CAT-ATTA-A-A-TAAGATGC----AT--GGTA-T-G-ACGTTAT--GT-A-A
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gi|27 : AAGATT-ACA-A--A-GC-TC-A--C-C--TC-------GAC-G-GGGC-AA-CA-C--C--TA-T--AT-A--TGGCAC-C-A---T-T-AT--------T---A-TATT-T-----A--TGC-T-TTA-TTT--TAA-CCC--ACA--G-G-AT-TTT-CAT--CCG-----TT-AC-ACT-TTATCA-T-A-T---------TACACA-A--TATC-AAAAAC------AAA-TATC--AT-AA-TG-TAC--A--T----A----A-TATA--
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gi|30 : acataatatatctgtatcaacc-C-GTAT-AA-T-AT-CATA---T----------------AC---CA--T-AT---CGT-----------------ATATCATTATAT-CA--------ttgtnnnnnnn
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gi|39 : -AT-A--TCATATAATA---------C-CA-ATAATAATCACA---TA-A--A-----ATAA--TA--CCA-CA-TC-GCA-T-A-----ATACCT-T---ATAA--TA-GCATAT----------A--CCATA-TCATA-TA--ATATC-
gi|4 : ataAAGATT-ACA-A--A-GCGTC-A--C-C--TC--------AC-G-GGGC-AA-CAACAAC--TT-T--AA-A--TGGCACGCGA---T-T-AT--------T---A-TA-T-T-----TCTTAT-T-TTA-TTT--TAAACCC--ACC--G-G-A--TTT-CAT--CA------TT-ACA-CT-TTATCA-T-A-T---------TACACA-A--TACTTAAAAA-------AAT-TATC--AT-AA-TG-TAC--A--T---------A-TATAT-T-ACAT-CT--------AT-A-T-TA-T-----------ATA-T--TATAA-ACAT-AT-AT--T-AA---TGA-T-T-ATCTAT-TAT-ATATATAGGAT-AT-------A-A----ATG-AT-A-----------A----AT-A-TAT--T-CATATA--A---AATCAGA-T---AT---------T--AT---ATTGAT-AGTC--ATATGAA-TAT--TAT-AT-AATA-TG----A-TA----TTTAT-GT--A-------A----TATAT-TA---TATAATA-ATAAT-ATGATGT-AT----AATCA-----T--TAT-AT-AG-C-CATAAT-----------CATAATTA-TAA-C------CAT--AT--CGTA-T-GAA---TATT-GT---ATCATACCAT--ATCA------AAACAA----TATT---GT---ATCATT---AC--CATATT------GTA-----CAT---AATA-TAT-TGTAA------T--CAT----AC-CA-TA----ACTGT-------------AT--C---ACTATA-TCGTAT-ATAAA-TTG---T-AT-GAT--A----TC-AAA-CC--ATG--ACGTATACCTA-ATCGTATC-AGT-ATC-AGT-ATAAATATTGTATCATAG-CAT-ATC-GT-AT-----AATAA--TTGT------AT-CA----AAA------C-CATA-ATC-GGATCATA-CATAAC--A-ATCAT----ACCA-----GTAT------------TTGA--TTCATATA-A-ATATT---G-CA-CATAAC-AA-TATCGTAT-AA-TAT--C--TACCATA--T--CATATAATAA-TCGTATCATA-GAATA-T--CA----TGATG---TATA-A-T-ACC------------AT---ACTCGTA-TCAT-----ACCATATGGGTATAATATT-GT-ATA-ATACGCA-T-A-TCG-------------T-ATCA-TA-C-C-AT-A-TC-G-T-ATC-ATACCATCA-----------TT----GTT-ATC--AT-A--A--TCATATAATATC-G-T-ATCAC-A--C-C-ATAT-CGT-------------GATAATAACA----A-TA-TCATAT------------A-GAACG-TAGTCATGACCA--TATCATATGTGTA---ATTTATCACCATAT-CCGTA-CAT----CAGA-CCA-A-----T--ATGTATTA-ATC-ATA-TGTTATCATA-CCA------------TATC-ATATC---ATAC---CATA----ATT---TA-TCATAAC--A-TA-T-CATA-T-AA----TA----T-C-GTTC-AA-C-AC-CATA---T------C-ATTATAACAC---CAT-T-AT---C-T-----------------ATAATAACGTAT-CATAAACACTTA-----T-----C-ATATCA-T----AC-AAAATCA------------A----TTCAAGTACC-ATA--TCGT-ATAGTA----ATA-GTATC--GC---------TCGAA--TACCAT--AT------T--GT---------AGT-------CATAT---T-GTATC-ATACCAAGAT-------ATC--GTA---A----------AT---ATCATAT--TA-----AT-ACC-A-----TA-TCGTATAATGAT-Ccatataa
gi|40 : tcaATT-ACA-G--A-GCCTA-A--C-C--TC--------AT-G-GCGC----CA-T--C--TT-TT-CT-A--TGACAC-C-A---T-T-ATC-------T---ATTA-TCT-----A--TGC-TCTCA-TTA--TAG-GCC--ACG--GCG-G--TTT-aat
gi|41 : gcattcaacatACC-ATATCG----T--ATAA-T-ACCA-TA-TCA-----TGT-A--CTATCATA--CCATA---C-CAAA-T-C-ACATC--A-T-A---CCA---TATCGTA-AAGT-ATAA-TATCGAATC-----AT-----------ACCAT-ATTG
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gi|43 : taatcaA--ATAT--AATATCAT---ACCAGCATCTAAACTACT--CAAATAC------A-T-TTAG-ATCACAAGACGCATTCTTAGTCTAAGTTT----GATGAAAATTGAACAtc
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Reference ( family-1561 ) : AAGATT-ACA-A--A-GC-TC-A--C-C--TC-------GAC-G-GGGC-AA-CA-C--C--TT-T--AT-A--TGGCAC-C-A---T-T-AT--------T---A-TA-T-T-----A--TGC-T-TTA-TTT--TAG-CCC--ACA--G-G-A--TTT-CAT--CCG--T--TT-ACAACT-TTATCA-T-A-T---------TACACA-A--TA-CT-AAAAA-------AAT-TATC--AT-AA-TG-TAC--AT----AA-TATA-A-A-CAT-CT--------AT-A-T-TA-T-----------ATA-T--TATAA-ACAT-AT-AT-T-TATG-ATT-ATCT-AT-TAT-A-AT-ATAGGATATA-A-ATATGA-T-AT-AATA-TAT--T-ATAT-AA-AATC--A-T-ATTATTATG-AT-A-TCAT-----T--G-A-TA--T--TAT-AT-CATA-TGA-A-TA----T-CNATGT--AA--T---A----TATAT-TA---TATAATA-AT-AT-AT--C-GT-AT----AATC-A-----T--ATT-ATA--C-C-AT-AT-----------CGT-ATTA-T-A-C------C----AT--CGTA-T-G-A---TATC-G-TA-ATCATACCAT--ATC-------AAAC-A----TA-T-GTA--ATCAT--CATATT-----CGTA--ATCAT---AATA-TAT-C---A------TCAT--A-AC-C-ATAC---A-TGT---AA-AT--C-ATA-CCATA-TCGTAT-A-T--A-TTGT-ATGAT--A----TC-A-AA-CA--ATA--TCG-------TATACCAT-ATCGTAT----C-A-T-ATC-A-T-A---T----AA--TATC-GT-ATCATA-------------------CAT-A-TC-G-TATC----CATA---AAT-AT--TAT--C----AT-CG----CAN-TAC-T-C-CATA-ATC-GTATCATAN-TATATC-AA-ATCAT----ACCATATCGT-ATCAT--------A-CCAT---ATCGA--T---CATA-A-ATA-TC---G-CAT-CAT-AC-CA-TA--TC-GTA-T-AATAT-C-------TACCAT--A-TCA--TATAAT--ATC-GTATCATACGA--A-------TA-T-----CG----T---AT--TGT-------AT-----------------C-AT-A-CCA--T---A-TCGTA-TC-ATA--C-CATAT-CG-TA-TAATA--TTGGTATC-ATAC-CAT-ATCGAT------CAT-ATCATA-CCAAT-A-TC-G-T-AT--CAATACCAT-AT-----------CGTA-ACA--AT---ATTATCATATA-ATATC-GT-ATCAT-A--C-C-ATAT-CGTAT------C---GTTAATA--CCATATCA---TA-TCA-TA---C-CA---------A-TATCGTAGTCAT-ACCA--TA-TCATAT-CG-A-------A---------T-----ACCGTAT-CC-ATACCATT--A-T--CA-------A-----TA--ATATCG--ATCGTAT---------TCATA-CCA----ATA-T-CG--------TATCA-TAC-C---AT-ATCATA----ATCAATATCGTATC--A-T--A-T-C----CATA-CAA----TA----TCGTAT-A--A-T-AT---CGTA---TC------------AT------ACCA--T-A-T---CGTATA-----AT-ATCGTATCA--------TA-----C-----C-ATA----TCG-T----AT-AATATCAT-----------A---A----TCA--TACCATA--TCGT-ATAA-T-----ATC-GTATC-TACA-A-T-----ATC--ATACCATAAT---TGTA-TCA--TAT--ATAT-ATCA-TACC---AT-------ATCGTA-ATA--------ATATCGTAT-C----AT---ACCGATA-TC---GTATAAT-ATCGTATCGTTACCANTCGTAT-AATACANGTATTN----AATTAT-CGTCGNTA-TTCATAT---NCATTAT--CCGTATC-T---A-ATA------CCATATCGTA-TCATAN-CATAA---TC--ATA-T-ATA----AT-CGTATC-A--T--A------CCATAT-CG---TATTAATA---TCGT-ATCATA---CC-ATATCTA-T-A--TCGTATAATA---ACA-TACCA--GTA--TCATA---TA-ATATCGTAT-CA--TA--CCA-TA-TCGTAT-A-------ATAT---CAT---ATC-A--TA-CCA-TA-TCGTAT-C-TA--CCAT-----------------A-TCGTA-TA--ATA-TC-GTA-TCA-TACC-ATATCGTATAAT------A--TATCG--T-TCATACC--TAA-CC-ATAT-CGT--ATAAT-AT-----C-------AGTA-TC-----A----ATATA--ATATCATA--TCATA---CACANA-T-CATATC-CAT-A---CCATA----TCGTA-TAGT-ATA------ATATCGCATCATAA-CCATA-TTGTA-TATCTTGTTAACTCATACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCGA-TCGTATA--ATAT--TATATCAT---ACCAGCATCTAAACTACT--CAAATAC------A-T-TTA-G-ATCACAAGACGCATTCTTAATCTAAGTTT----GATGAAAATTGAACAAAGCAAT
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gi|11 : tatcataccatatcattattccatgtcatTA-CAT--T-ATAT-AT-AATC--A-T---TAT-ACC-A--A-TCAT-----T--T-A-TA--C--CAT-AT-CAT--------TA----TACCATGTTCGA--T---A----TATAT-TACCATACATTC-AT--T-AT-----T-TT----AATC-A-----T--A-----A--C-C-AT--------------------TA-T-A-C------C----AT--GCCC-T-T-A---TATC-A-TA---CA-ACTAT--ATC-----------------CA-T-GT----TCAT--TATATTATAGACATA--ATCATTTAAACA-TGT-C---A------TTAT--A-AC---ATAC---A-T-T---AA-AT--T-ATA-CCATG-TCATTC-A-T--A-TTAT-ACCAT--ACATTTC-A-AT-TA--TTA--TAG-------CATACC---ATTATAC----C-A-T-GTC-ATT-A---T----AA-----C-AT-ACCATA--------------------GT-A-TT-ACTATT----CATA---CGT-A---TA---C----ATACGC---CAC-TAC-T-CTTATACATA-TTATTATAG-TATACC-AATATCATTATAACCATGT-GT-ATTAT--------A-CTAT---ACCAC--A---CAT--T-ATA-TCTAGA-CAT-TAT-Attaaccat
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gi|14 : atgttaccttcgccT-ACA-A--A-GC-TC-AATCAC--TC-------GA----GGGC-AA-CA-C--C--TT-T--ATTA--TGGCAC-C-A---T---AT--------T---AATA-C-TTTA--A--TGC-T-T-A-TTTA-TAA-CCC--ACA--G-G-A--TTTTCATGTCCA--T--T--ACA-CT-TTATCA-TTA-T---------TACACA-A--TA-CT-AA------------T-TTTT---T-AA-T----C--ATT---AA-TA-----A-CAT-CT--------AT-A-TATA-C-----------ATA-T--TATAA--TAC-AT-AA-T-TATG-ATT-AATC-AT-TAT-A-AA-ATAGGATATATA-AT-TGA-T-AT-AATA-TA---T-ATAT-CATACTC--A-T-ATTAAT-TG-AT-ATTCAT-----T--G-ACTA--TAGTAT-GTATATATTGAGA-TA----T--TATGT--AAGTT---ACTATTATAT-TA---TATAAT--AT-A--AT--C-GT-TT----AATC-A-----T--GTT-ACAC-C-C-ATAAT-----------CGT-ATTACT-A-C------CCATTAT--CGTA-TGG-A---TAT--G-TGTATCATACCtcatc
gi|15 : AGATA-ACA-A--A-GT-TC-A--C-C--TC-------GAC-A-AGGA-AA--A-C--C--GT-T--AT-A--TGGCAC-C-G---T-T-AT--------T---A-TA-T-TC----A--TTC-T-----GTT--TAG-TCC--ATA--G-G-A--TTT-CAT--CTG-----TT-AC--CT-TTATCA-T-A-T---------CACA-A-G--CA-TA-AAGAA-------AAT-TATC--AC-AGTTG-TA---AC----GA-TAT----A-TAT-CT--------AT-A-T-T-------------------------A-ACAT-G-------TATG-ATTAATGTGAT-CAT-C-AT-AT---AT-TA-----ATGA-T-AT-GA----AT--T-ATAT-TG-CATC----T-ATTA--ATGTAT-ATTCATACATGT--A-A-TATTT--TAT-AT--ATA-TGA-ATTAATTTT-TGATAT--AA--T---A----TATA--TA---TATCATA----AT-AT--T-GT-ATTGAGAGT--------T--AAT-ACA--A-T-AT-AT-----------CAT-ATTA-A-A-TAAGATGC----AT--GGTA-T-G-ACGTTAT--G-TA-A
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gi|19 : tctggtgataaaaCGAATCGTATA--ATAT--CATATC-T---AACCGCATCT-AACTACT--C-AATAC------A-T-TTACG-ATCACActaactactcaatacatttacgatcacacaagcaatatacta
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gi|24 : atttattaggggattaaacagtaaTA------CCATAT-GTA-TCATAC-CA--A---TC--TTA-T-A-A----AT-CATTTC-A--T--A------CCATAT-C----TAT-AATA---TCGT-TTCATA---CC-ATATCT----------TA-AATA----TG-TTTCA--GTA--C----------ATATCGTAT-CA--TA--CCA-TA-TCATAT-ATTTAA--ATAT---CAT---ATA-A--TA-CC--------------------AT-----------------A-TCGTG-TA--ATA-TC-GTA-TAA-TACC-ATATTGTAtaaat
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gi|27 : AAGATT-ACA-A--A-GC-TC-A--C-C--TC-------GAC-G-GGGC-AA-CA-C--C--TA-T--AT-A--TGGCAC-C-A---T-T-AT--------T---A-TATT-T-----A--TGC-T-TTA-TTT--TAA-CCC--ACA--G-G-AT-TTT-CAT--CCG-----TT-AC-ACT-TTATCA-T-A-T---------TACACA-A--TA-TC-AAAAAC------AAA-TATC--AT-AA-TG-TAC--AT----AA-TATA-
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gi|28 : -T-C-TATA-ATCAGT-TAATAC-TATAT--------------ACCATATCGT-ATTAT--------A-CAAT------GA--T--------G-ATA-TT---GTCAT-CAT-AC-CA-TA--TC-AAA-C-AATAT--------------------------TGAT--ATC-------T-CGA--A-------TA-------CG----T--------GT-------GT-----------------C-CT-G-CCA--CGAGA-TC----TC-ATC--CTCATGT-TC-TG-TTATA--GTAGTA-C-ATAC-C-C-A-CGAT------CAT-ATtgatatctcgaatacgtgtgtcctgccacgagatctcatcctcatgttctgttatagtagtacatacccacgatcatatg
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gi|39 : A-T-A--TCATATAATA---CCAATAATA----A--TCACA---TA-A-A----AT-AA--TA--CCA-CA-TCGCAT-A-------ATAC---CTT---ATA-A--TA-GCA-TA-T---------A--CCAT-----------------A-TCATA-TA--ATA-TC-
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gi|40 : tcaATT-ACA-G--A-GCCTA-A--C-C--TC--------AT-G-GCGC----CA-T--C--TT-TT-CT-A--TGACAC-C-A---T-T-ATC-------T---ATTA-TCT-----A--TGC-TCTCA-TTA--TAG-GCC--ACG--GCG-G--TTT-aat
gi|41 : gcattcaacatA-CC-ATAT-CGT--ATAAT-AC-----C-------A-TA-TC-----A-----TGTA--CTATCATA--CCATA---C-CAAA-T-CACATC--AT-A---CCATA----TCGTA-AAGT-ATA------ATATCGAATCAT-A-CCATA-TTG
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gi|44 : ATCTAAACTACT--GAAAT-C------A-T-CCA-G-ATCACGAGACGAATTCTTAAACTAAATTT----GATGGCAATTGAAC-AAGCAATgc
gi|45 : A----TTGTAT-A--A-T-AT---CGTA---TC------------GT------ACCA--T-A-T---CGCATA-----AT-ATCATATC---------TA-----T-----CAATA----TCA-T----AA-AATATGA------------A---A----TCA--TACCATA--TCAT-ATAA-T-----ATC-ATAaactccaatatttctat
gi|46 : AAGATT-ACA-A--A-GC-TC-A--C-C--TC-------GAC-G-GGGC-AACCA-C--C--TT-T--AT-AT-TGGCAC-C-A---T-T-AT--------T---A-CATT-T-----A--TGC---TTA-TTT--TAG-CCC--
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gi|14 : atgttaccttcgccT-ACA-A--A-GC-TC-AATCAC--TC-------GA----GGGC-AA-CA-C--C--TT-T--ATTA--TGGCAC-C-A---T---AT--------T---AATA-C-TTTA--A--TGC-T-T-A-TTTA-TAA-CCC--ACA--G-G-A--TTTTCATGTCCA--T--T--ACA-CT-TTATCA-TTA-T---------TACACA-A--TA-CT-AA------------T-TTTT---T-AA-T----C--ATT---AA-TA-----A-CAT-CT--------AT-ATATA-C-----------ATA-T--TAT-A-ATAC-AT-AA--T-TA---TG-ATT-AATCAT-TAT-A-AAATAGGAT-ATATA-AT-TGA-T-AT-------A----AT-A-TA---T-ATAT-CATACTC--A-T---ATTA-AT-TGAT-ATTC--AT-T--G-ACTATAGTAT-GTATATATTGAG--AT--AT--T---ATGT--AAGTT---ACTATTATAT-TA---TATAAT--AT-A--AT--C-GT-TT----AA-TCA-----T--GTT-ACAC-C-CATAAT-----------CGT-ATTACT-A-C------CCATTAT--CGTA-TGG-A---TAT--G-TGTATCATACCtcatc
gi|15 : AGATA-ACA-A--A-GT-TC-A--C-C--TC-------GAC-A-AGGA-AA--A-C--C--GT-T--AT-A--TGGCAC-C-G---T-T-AT--------T---A-TA-T-TC----A--TTC-T-----GTT--TAG-TCC--ATA--G-G-A--TTT-CAT--CTG-----TT-AC--CT-TTATCA-T-A-T---------CACA-A-G--CA-TA-AAGAA-------AAT-TATC--AC-AGTTGT-A---AC----GA-TAT----A-TAT-CT--------AT-AT-T-------------------------A-ACAT-GT-ATGAT-TAATGTG-ATC-ATC-A--TAT-A-TTA-ATGAT-ATG-A-AT-----T-AT-------ATTGCAT-C-TAT--TAATGT-AT-ATTC--A-T---A-CA-TG-TAAT-A-TT--------------T--TAT-AT--ATA-TGA---ATTAAT-TTTTGATAT--AA--T---A----TATA--TA---TATCATA----AT-AT--T-GT-ATTGAGAG-T-------T--AAT-ACA--A-TAT-AT-----------CAT-ATTA-A-A-TAAGATGC----AT--GGTA-T-G-ACGTTAT--G-TA-A
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gi|19 : tatatatataccaA-TTGTACGA-----ATATGATTTTATCA--TA-CCAAATCATATC-TA--TCATA-TCGTATTAGTATA-TC-A-ATCA-TACC-ATATTG-GTAATAA--AATCG--TCATA----TGA-CCAATAT-CGATAAT--ATGATAACA-------AATA-TCATACCATATGCTATATCTTA--TCATA---TATGTA-TACATAT--CAT-A---TCATA-CGAA-TCGT-ATA------ATATCATATC-TAACCGCA-Tgagtgcatcacataagataaaatccgta
gi|2 : tctggtgataaaa-TA---CA-ATA-GTCAAT-TAT-A-ATATCATATCATA-C-ATATTG-T-ATCTACTCAA----ATCA-TAC----GTAT-TA-GATC--A-TTACATCA-TA-TAAT-G-TCGTAT-C--C-A-TAC--CAC-AT-TGTA-TAATTCGT--AT-CC---ATG---AA--C--------CATAC-CG---TATCATA-CC-AT-AT--C-AT--T----AA-TCA-----TTAGTTCATA--C-CAT-ATTGTGTAATATTCGT-ATCA-TGA-C------CT---AT--CTTACT-G-A---TATCTG-TA--TCA-ACCAT--ATCGGTATCCACCC-A----TA-TTGAA--ATCATACCATAAT-----CATATAATTAT-----TG-TAT-C---A------TAATTGA-ACGC-ATAT---G-TGTTATAA-ATAAC-ATA-TCTTA-TCATAC-A-T--A-TTGT-ATGAT--A----TC-A-TA-AA--AT---------------TACCAT-ATCGTA----T---C-A-T-ACC-A---T-ATCTATAA--TATCTGTGATC--ATA-CA------------------------AAC-ATTA-----------CG----CAT-TAT-A-C-CATA--TC-GTATCATAC----ATC-TG-AT-AT----A--ATATAAT-AT--T--------ACCAT---ATCG---TTGGATA-T-GTATC---A-TAT-CAA-AC-CA-TA--TC-GT-AT-AATAC-C----------CAT--A-TTCA-TGTA---T-ACTC-GTATCATACCT----------TA-T-----C-----C---AT--TG--------ATC-ACT-A-CT----------TCT-T--------------TAG--G-TA-TAATATC-ACATC-ATAC-CAT-A--TGT-ATAATAT-----------------AAT-ATC------C--TAC--CAT--------AT-----------TGT-----A-TA---TAT---CATGATCATTACCCCATAGT-T-GT-ATC-C-AC-C-ATATTGT------------G-ATA--A------A---TAT-A-TATTCA-GAAC-CC--AT--------A-TACGGTTGTAAT----ATGGTTC-A--T---ATTCAACGCGAGAT-CGGGGGCTA-------AATTCT-----ACTG-AT-CC-ATACCCCCCCCTGCCCATT--ATTCA-AAAGCCTA--ATGTGG--AT----CGTAT---------CGATAAC---------TC--------TT-AT------TA-TAC-T---G-AATCAT-----ATCAGTATAG-TATA--A-A-T-----ATG-GAA----T-----TC----CAT-AA-T-AC---CGT-AATTTT------------GT------ACTACTT-A-T---CG-GT-C-----AT-----TTTCA--------TA-----C-----C-AT-ATCG----TGAAGA----AATAGC--AT----------------AT----TACCAT---TCA--------------ATC-A-----TACAAT-----AAT--AT-ACCATA-------TA-TCAGGTATG-ACATGATC-ATAT---CAA-------ACCAT--------------TCTTGTAT-CA---ATGGAGCTAAGA-TCGGTGTATATT-ATT-TATTGTTACC--TCG-AT-AAT-CA-ATATT----C-ACTA-TCG-TGATGCTTC---TGTATAAT----GAATT-T---A-GTT------GCATATCG--------A-CATAT---TCGAATA-TACA----A---ATACC--A-T--ATATACTCCATAT-CCGA--AGTT---CCTT-ATCATA---CC-A-AT-TA-TAA--TCGAGTTATA---AAATA------A----TTATA---TG-AAGCGGCAGCAAGTACTCCACTAGTTGTAT-A-----AT-TCATA--ATCACTTT-CCATATCGTA-C-TA----ATACTCATA-TA----G-TC-G-AT---TACC-ATATTGTTGAAT-AAGTATCAT-ACATACC--T-T-CC-ATAT-CG----GAAATAATAATC-------A-TACTCA----GTATA--ATGTCACA--T-------CACATA-T-CATATT-CATCATACCCATATCctaactactcaatacatttacgatcacacaagcaatatacta
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gi|28 : -T-C-TATA-ATCAGT-TAATAC-TATA----------T----ACCATATCGT-ATTAT--------ACAAT---G----------ATG-A--TATT---GTCAT-CAT-AC-CA-TA--TC-AA-AC-AATAT--------------------------TGA--T-A-TC-------T-CGA--A-------TA-------CG----T--------GT-------GTC-C-T-G-CCA---CGAGA-TC-----TC-ATC--CTCATGT-TC-TG-TTATAGTAGTA-C-ATAC-C-C-A---CG-ATCATAT-----------tgatatctcgaatacgtgtgtcctgccacgagatctcatcctcatgttctgttatagtagtacatacccacgatcatatg
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gi|40 : tcaATT-ACA-G--A-GCCTA-A--C-C--TC--------AT-G-GCGC----CA-T--C--TT-TT-CT-A--TGACAC-C-A---T-T-ATC-------T---ATTA-TCT-----A--TGC-TCTCA-TTA--TAG-GCC--ACG--GCG-G--TTT-aat
gi|41 : gcattcaacatA-CC-ATAT-CG----T--ATAAT-ACC-------A-TA-TCA-----TGTA--CTATCATA--CCATA---C-CAAA-T-CACATC--AT-A---CCATATCGTA-AAGT-ATA------ATATCGAATCAT-ACCATA-TTG
gi|42 : AAGATT-ACA-A--A-GC-TC-A--T-C--TC-------AAC-G-GGGC-AA-CA-C--C--TT-T--AT-A--TGGTAC-C-A---T-T-AT--------T---A-TA-T-TC----A--TGC-T-TTA-TTT--TAG-ACC--ACA--A-G-A--TTT-
gi|43 : taatcaA--ATAT--AATATCAT---ACCAGCATCTAAACTACT--CAAATAC------A-T-TTAG-ATCACAAGACGCATTCTTAGTCTAAGTTT----GATGAAAATTGAACAtc
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gi|45 : A----TT--G-TAT-AA-T-AT---CGT-A---TC------------GT------ACCA--T-A-T---CGCAT-A-----AT-ATCATATC---------TA-----T-----CAAT-ATCA----T----A--A-AATATG--A------------A----ATCA--TACCATA--TCAT-A--TAAT-----ATC-ATAaactccaatatttctat
gi|46 : AAGATT-ACA-A--A-GC-TC-A--C-C--TC-------GAC-G-GGGC-AACCA-C--C--TT-T--AT-AT-TGGCAC-C-A---T-T-AT--------T---A-CATT-T-----A--TGC---TTA-TTT--TAG-CCC--
gi|47 : gtaatcaT---AATAT--C-ATA-CCACA-TCGTAT-A-T-------C-ATAATT-A----TC-ATAA-CA---TA--TC---------AGACCAT-ATTATA----T---A-A-T-ATC-A---T-AT----CA--TACC-
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blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . C . . . . . . . . . . T . . ATTACA . . . . . . . CT . . . . . . . . . AA . . . . CATATTATAATACATAAT . . . . . . G . A A . . . . . . T TA . . A . . . . . . C . . . A A GCCGTATAATTGCG . . ATA C TT . . AT . . . TT . T . . . C C . . . . CATA T . CATGTTCAT GTA . . TA ACCATACTGTT . . . . . . A G . G . . . . A A . A AT TCA . . TTATAA . . . . . . ATATATATTTCATACCAGTA . G AT TA . . . G . TCAT AA CA . . T . . . . . . . T . . . . . . GAATATATATTGTATAATACCATA AT . . . G . . . . . TCAATATATA . A A . ATTGTATCATAT . . . . . . . . . G GATA . C CA . . TTAA C A . . . . . . ATAATTATCCCATCCCTGTATAATATCAATTCACCATATTGTAATAATATCA . CA . A A T . . TC T . . A . . . . . . AT . A . A . . C . . T T . TCA . . . . . . CAAT . . A . . TG . . C AA . . . . A . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . GTTACA . . . . . . . TA . . . . . . . . . AA . . . . TATATTTAATCTATATAT . . . . . . G . N N . . . . . . C AA . . A . . . . . . N . . . N A ATATTTATGTAA . . AT C AT . . TA . . . AT . T . . . C C . . . . GTAA . . GTACTA TG . . TA ATCAA . . . . . . G A . . . . . . A A . . A TAA . . TATCAT . . . . . . GTATAAATATTGTATCAAC . G CC AG . . . C . ATC AA CG . . . . . . . . . . . . . . . . . CCTTATCCATTGATCACTACT . . . . . . . . . . TCCGTATAC . T A . ATTGTATATAT . . . . . . . . . T GATA . T A . . TAG C A . . . . . . . CA . A . . . . TC T . . G . . . . . . AT . A . A . . C . . T C . TA . . . . . . CAA . . . . . GT . . T .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GCTACA . . . . . . . TC . . . . . . . . . AA . . . . TATATTATAATACCANN . . . . . . N . N N . . . . . . T AA . . A . . . . . . G . . . A . ATATTATGTA . . AT C AT . . A . . . AT . . . . . A C . . . . TGTA . . . . . . . . A . . . . . . . A . . . . TCA . . CATA . . . . . . AACATTACGCATTATAC . . C T . . . C . G A G . . . . . . . T . . ATCAAAAAAGA . . . . . . . . . G ATA . . A . . TAA . CA . A . . T C . . G . . . . . . AT . A . A . . A . . C C . AT . . . . . . CGC . . . . . A . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GTTACA . . . . . . . TC . . . . . . . . . AA . . . . GATATCAAATATTATC . . . . . . N . . A . . . . . . N NN . . N . . . . . . G . . . . . ATATTATCT . . AC . T . . A . . . . . . . . . C . . . . . TGTA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . C . . . . . . . A T . . . . . ATCGTAA . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . GT . A . C . . C . . T A . AA . . . . . . T . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GTTATA . . . . . . . TT . . . . . . . . . A . . . . AACATGTATGAT . . . . . . . . . . . . . . . . N NA . . A . . . . . . . . . . . . T . . T . . . . . . . . . C . . . . . GTA . . . G . . . . . . AT . A . A . . C . . T T . TA . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ATTACA . . . . . . . CT . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . T AA . . . . . . . . . . G . . . . . . AT . A . G . . T . . T C . AT . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ATTACA . . . . . . . TA . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . AC . . . . . . T . . T T . T . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GTTAC . . . . . . . CT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . T . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GTTAC . . . . . . . T . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TTACA . . . . . . . T . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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blockSeqCons : ******** GTTACA******* **** AA**** TATATTATAATACATANT********************** ******* T*** ATATCATGTA************************* ATAT*** CGTA**** AAACAATATTGTATCATAC*************** GTAA******** CA********** ANCATACACTGA*************** A* C* CA**** ATCGC********* NA** C* AT**** TCGTATCATACCA******************* ATCGTATCATAT****************************** ATCA*************** TATCA**** CTAAT*************** CA******* TC***** **** A** TAA*************** CAAT********* ATTG*** NG*** ATA********** TN* TAATCG***** GTA*********** CCGTAATA****** TATACATGTATCATATN************* A* GTATA*** CTGT**** AA**** CA*** **
originalCons : AAGATT-ACA-A--A-GC-TC-A--C-C--TC-------GAC-G-GGGC-AA-CA-C--C--TT-T--AT-A--TGGCAC-C-A---T-T-AT--------T---A-TA-T-T-----A--TGC-T-TTA-TTT--TAG-CCC--ACA--G-G-A--TTT-CAT--CCG--T--TT-ACAACT-TTATCA-T-A-T---------TACACA-A--TA-CT-AAAAA-------AAT-TATC--AT-AA-TGT-AC--AT----AA-TATA-A-A-CAT-CT--------AT-AT-TA-T-----------ATA-T--TATAA-ACAT-AT-AT--T-TA---TG-ATT-ATCTAT-TAT-A-ATATAGGAT-ATA-A-ATATGA-T-AT-------A----AT-A-TAT--T-ATAT-AA-AATC--A-T---ATTA-TA-TGAT-A-TC--AT-T--G-A-TAT--TAT-AT-CATA-TGA---AT--AT-CC---ATGT--AA--T---A----TATAT-TA---TATAATA-AT-AT-AT--C-GT-AT----AA-TCA-----T--ATT-ATA--C-CAT-AT-----------CGT-ATTA-T-A-C------C----AT--CGTA-T-G-A---TATC-G-TA-ATCATACCAT--ATC-------AAAC-A----TA-T-GTA--ATCAT--CATATT-----CGTA--ATCAT---AATA-TAT-C---A------TCAT--A-AC-C-ATAC---A-TGT---AA-AT--C-ATA-CCATA-TCGTAT-A-T--A-TTGT-ATGAT--A----TC-A-AA-CA--ATA--TCG-------TATACCAT-ATCGTA----T---C-A-T-ATC-A---T-AT----AA--TATC-GT-ATC--ATA-CAT-A-TC-G-TAT-----CATA---AAT-ATTAT--C----AT-CG----CAN-TAC-T-C-CATA-ATC-GTATCATAC-CATANC-AA-ATCAT----ACCATATCGT-ATCAT--------ACCAT---ATCG---TC--ATA-A-ATATC---G-CAT-CAT-AC-CA-TA--TC-GT-AT-AATAT-C-------TACCAT--A-T-CA-TATAA--T-A-TC-GTATCATACGA--A-------TA-T-----CG----T---AT--TGT-------ATC-A-T-A-CCA---T---A-TCG-TA-TC-ATA--C-CATAT--G-TA-TAATATCGGTATC-ATAC-CAT-A--TCG-AT-ATAT-----------CATACCAAT-ATCG-T-ATCAATAC--CAT--------AT-----------CGTA-ACAA-TA---TAT---CATA-----TA----ATA-T-C-GT-ATCAT-AC-C-ATATCGTAT------C---G-TTA--AT--ACCA---TATCA-TA-TCA-TA---CC--A---------A-TACCGTAGTCAT----A----CC-A--T---AT----CGT---AT-CG------A-------A----T-----ACCGTAT-CC-ATA-----------CCATT--A-TCA-A-----TA--ATATCG--AT----CGTAT---------TCATACCA----AT-ATC--------AT-AT------CA-TAC-C---A-TATCATA----ATCAATATCA-TACC--ATA-T-C--CATA-CAA----TA----TC--G-TAT-AA-T-AT---CGT-A---TC------------AT------ACCA--T-A-T---CGTAT-A-----AT-ATCGTATCA--------TA-----C-----C-AT-ATCG----T----A--T-AATATC--AT-----------A----ATCA--TACCATA--TCGT-A--TAAT-----ATC-GTATC-TACAAT-----ATC--AT-ACCATAAT---TGTA-TCA--TAT--ATAT-ATC-ATAC---GAT-------ATCGTA-ATA--------ATATCGTAT-C----AT---ACCAATA-TC---GTATAAT-ATCGTATCGTTACCATTCGTAT-AATACACGTATT----CAACTG-TCGTTGATA-TTCATACGTATTAT--CAGTATC-T---A-ATA------CCATATCGTA-TNATAA-CGTAA---TC--ATA-TATA----AT-CGTATC--G-T--A------CCATAT-CGTATTAATA---TCGT-ATCATA---CC-ATATCTA-T-A--TCGTATAATA---ATATACCA-GTA----TCATA---TA-ATATCGTATCA--TA--CCA-TA-TCGTAT-A-----ATATCAT---ATCA--TA-CCATATCGTATC-TA--CCATA-TCGTA-TA--ATA-TC-GTATCA-TACC-ATATCGTATNAT-A--TATCGT-TCATACC--TAA-CC-ATAT-CG----T--ATAAT-ACC-------AGTA-TCA----ATATA--ATATCATA--TCATA---CACGNA-T-CATATC-CAT-A---CCATATCGTA-TAGT-ATA------ATATCGCATCATAACCATA-TTGTATATCTTG-TAACTCATACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCGATCGTATA--ATAT--TATATCAT---ACCAGCATCTAAACTACT--CAAATAC------A-T-TTAG-ATCACAAGACGCATTCTTAATCTAAGTTT----GATGAAAATTGAACAAAGCAAT
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8 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|11 : tatcataccatatcattattccatgtcatTA-CAT--T-ATA-T-A----T-AATCA--T-----T-AT-AC-CA--A-TCAT-T--TA-TAC--CAT--AT---CA---T-T-------A-TACC-A-T-GTTCGATA---------T-ATAT-TACCAT-ACATTC--AT-----T-AT----T-TTAAT--CA-----T--A------A--C-C--------------------A-TTA-T-A------C------C----A---T--GCCC-T-TA-TAT-C-AT--A-CA-ACTATATC------------C--A-T-GT--T---CA-TTAT-ATTATA-GA-C-A-TAA--TCATTTAA-AC-A-T---GT-C---A------T-TAT--A--A--CATA---CAT------TA--A-AT--TAT--ACCATG-T-CATTC-AT--A--TTAT-A-CCAT--ACATTTC-A-AT-TA--TTA--TAGCATACC----A-TTATACC-A-T-GTC-ATT-AT----AA------C-AT-ACCATA--------G--TA----TTACTATTCAT--AC--GTA--TA---CATACGC---CACTACT-CTTATACATATTATTAT-AGTATACCAAT-A-T---C--AT--T---ATAACCAT--GT-GTATTA-T-ACTATACC------A----C---AC-ATTATATCTAGACATTAT---Attaaccat
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gi|13 : TA---TAA-T-----ATCA--TA----AAAT-ACCA------CA-T--C--G--TAT-AA-T-ATACATGT-A---TCATATACACTGTAAT------A--------CCA--T-A-T---CGTAT-------ACTATCAT-AT-CGTGTAA--TA-----T-----C-AT---ATCG----T----A--TAATAAC--AT-----------A--A-----A------ATA---CCA-TA--TTGTC--TACT-----ATCATAT----C----AA--------------ATT-A---T-ACCATA--c
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gi|20 : atcaatgtcatacaatagtcaCA-G--A-GC-TC-A--A-C--TC-------GA-CG-GGGC-AA-CA-C--C--TTAT--AT----TGACAC-C-A---T-T-AT--------TCATG-TACT-T-----A--TGC-T-TTA-TTT--TAG-CCC--ACA--A-T-A--TTT--A-T--CTG----T--T-A-C---CT-TG-ATCA-T-A-T---------TACACA--TCA--T-AAAAATTATCATAAT-AAT-G--AT-AA-TAT-AT--ATGA-A-TAATATCTAT-A-T-CTTTTGATGCATCAT-TA---TGAATCTTTGCAA-TA-CAATATA--A-TA-CATCATA-TTCTATAA-TCCATGTAT--AT-G-AT-ATTTAATATA-A-AT
gi|22 : AGATT-ACA-G--A-GC-TT-A--A-C--TCACTCAAGGA-AG-CGAC-AG-CA-C--C--TT-T--AT-A--TGGCAC-C-A---T-T-ATTATATACAT---A-TA-T-T-----A--TGC-T-TTG-TTT--TAG-CCCCAATA--G-G-GTTTTT-TA-T--CTG----C--T-A-C-A-CT-TT-ATGATT-A-TCAGTGCATGTACACA--ACA-TA-AAAAA-------AAT-TAT-C--AT-AT-TAT-AT--AT-G-A-T-------AC-A-T--T--------GT-AT-TT---G-----------A-TA-T--CA-A--A-TA-T-T---A-TC-TAT-A-TT-ATATATATAT-A-
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gi|27 : AAGATT-ACA-A--A-GC-TC-A--C-C--TC-------GA-CG-GGGC-AA-CA-C--C--TA-T--AT-A--TGGCAC-C-A---T-T-AT--------T---A-TATT-T-----A--TGC-T-TTA-TTT--TAA-CCC--ACA--G-G-AT-TTT-CA-T--CCG----T--T-A-C-A-CT-TT-ATCA-T-A-T---------TACACA--ATA-TC-AAAAAC------AAA-TAT-C--AT-AA-TGT-AC--AT-A-A-TA-TA---
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gi|28 : ATA-T-C--TA-TA--AT--CAGT-TA-ATAC--TA-TAT--------A-C-CAT-ATCG-TATTATACA-ATGATG------AT-ATTGTCAT------C-AT-A-C---C---------------ATA--TCAAACAATATT-GAT-ATCTCGAAT-A--CGT-GTGTC-CT----G---CCACGAGATCT-----CATCCTCATGTTC-TG--T-----T--A-TA--GTAGTACAT-AC---CC-ACGAT----CA-T---AT-tcgaatacgtgtgtcctgccacgagatctcatcctcatgttctgttatagtagtacatacccacgatcatatg
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gi|32 : gtaatcaatAAGATT-ACA-G--A-GC-TC-A--C-C--TC-------GA-CG-GG---------------------------TAACAC-C-A---T-T-GT--------T---A-TA-T-TT----A--TGC-T-TTA-TTT--TAG-TCC--ATA--G-G-AC-TTT-CA-T--CTG----T--T-A-T-A-TT-TT-ATCA-T-A-T---------TACACA--ACC-TT-AAAAA-------A---TAT-C--AC-AA-TGT-AC--AT-A-A-TA-Tcat
gi|33 : tcaTATCA--AA-----C-----C-AT---ATCG----T----A--TAATACC--AT-----------C--A-----C------ATA---CCA-TA--TTGTA--TAAT-----ATCATAAA---C----AA--------T-----ATC-A---T-ACCATA-----------TCA----TAT-AA----------TGTCA-TA-CAATATCG-T--AT-A--------A-----T-AT-T-GTGTC----AT---ACCA-TA-TC---------ATATC-GTATCc
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