lowQualScore : 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
lowQualScore : 3 1111111111 1111 111 1 333333333333333333 1 333333333 11 2222222 1111 55555555555555555 1 33333333333 22 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 2 3333333333333333333333333333333333333333 4444 33333333333 111 11 11111111111111 2222222222 111111111111111 3333333333333333 22222222 22222222222222
lowQualScore : 1 1 999999 3 33 0000000000 88 2 2 66666 2 2 2 3333 77777 99 6 8 222 55 0 0 3 0 3 3 3 3 9 4 88888 55 777 111111111111111111 4 1 66 66 0 0 1 66 222222222 4 4 2222 55 9999 0 6666666 0000 3 88888888888888888 5 66 66 6 5 5 9 4 66 4 66 66 66666666666 1 33 1 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 66 1 0000000000000000000000000000000000000000 555 6666 3 22222222222 3 000 00 2 9999 2 99999999999999 3333333333 55 33 2 2 333333333333333 2 7777777777777777 1 1 44 11111111 4 333 22 2 999 222 2 1 55 22222222222222 4444 3 2 1 1 22 1 1 1 555555 1 1 2 2
lowQualScore : . . ...... . .. .......... .. . . ..... . . . .... ..... .. . . ... .. . . . . . . . . . . ..... .. ... .................. . . .. .. . . . .. ......... . . .... .. .... . ....... .... . ................. . .. .. . . . . . .. . .. .. ........... . .. . ................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ .. . ........................................ ... .... . ........... . ... .. . .... . .............. .......... .. .. . . ............... . ................ . . .. ........ . ... .. . ... ... . . .. .............. .... . . . . .. . . . ...... . . . .
lowQualScore : 6 2 666666 3 00 9999999999 44 5 5 77777 7 5 7 9999 77777 44 2 6 111 55 3 0 1 2 1 1 1 6 7 0 22222 55 000 111111111111111111 4 2 11 11 1 1 4 99 333333333 4 4 3333 88 4444 4 2222222 6666 4 66666666666666666 0 11 99 0 0 0 3 0 11 4 11 11 66666666666 1 99 4 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 11 9 8888888888888888888888888888888888888888 999 1111 6 55555555555 6 000 00 4 7777 4 66666666666666 3333333333 99 11 2 0 999999999999999 2 8888888888888888 9 9 55 55555555 2 777 99 1 444 333 2 8 99 44444444444444 0000 8 0 9 7 44 8 7 8 555555 9 9 0 4
consensus : TCACC-GGGGTGGGACCAGTGCA------AAAC-ACG-ATGGGACACA----------AACTTT-TTT-TT-----A-TGAC-AACA-GG---ACAT-----GGG-ACA-ATGATTTTT-T-G-TGTG-GATA-ATTTGG-ATGGGA-CATC-TA-TTTT-TTCATTG-ACA---AA--AA---TGCAAAGATTTTC-CCCCN---ATTGA-TTTGAAGAGAA--T--GATTTACAGGAAA--G--AACAAGATATTCAGCAA-ATTGT-ATCCCTAAGCAAGTGTTCCA----TCCGTTTTTG-TCTTTGT----AACTTGCAT--------AT----TATCTTTGTCATTAT-TTCAAATTCAAATCATATA--GC--ACGA-GCA-TTCACAACTG-GCG--CGAC--TAGT--AAG----------TCAGACAGGGGATGCTTACTCCTTGGCAA----T----G-----AG--------TT---------CT----A--C---GAC----TTG---GGG-TTCAT-C-TGG--GGGTC--CATCAATGTTCCCAGTGT-T--TAACTCCAT--GTG-A----A----------T---------------G----------TC-A--------GG-------AT--GTTACTCA-TT-TACATCCA-CA-CA-T-GT--AA-T-TTT-AGAAAT-GC-AATAAA-AATCT-ACTT-TTA--TGTT--TGCAT--TTA----TCAT-----A--TACT---T--C--T-----TAT---A-C--------------G-----A--TTTGTC-C-TA--------T-C--TGCAATGCGT-GTC-TG-TT---A---G--G-G-AA-AA--------------AA----C---------------A--TT---TC-GTAGTA-----NT---G------G---CTGTT--ATT-AAAAAGTCTTA------ATTGTGCCAGAGAC-ATA-----TA-TATAACATG--TTATA--CA-TGTCTC---T----G-ATTGT-G---CT--TTGTGGT-GG----GAC-ACCAAC------N--T----TTTTAC----------T--CA--A-AGCA---------------T-AT---------------TATGG-GAC-ACA--AAC-----GTTTT-CT---TAAA--G-ATG--TTTG-C-ATGGGA-CACATACTTT--TT--TTAACATTGA--ATTTTCAAA----TGC-AC-CGGTC-CCAC-CC--CG-GTGAGA-AA------T-ATT-G-C-ATGGT
Reference ( gi|2 ) : TCACCTGGGGTGGGACCGGTGCA------AAAC-ACG-ATGGGACACA----------AACTTT-TTT-TT-----A-TGAC-AACA-GG---GCAT-----GGA-ACA-ATGATTTTT-T-A-TGTG-AATA-ATTTGG-ATGGGA-CATC-TA-TTTT-TTCAATG-ATA---AA--AA---TGCAAAGATTTTTGTCCCAT--ATTGA-TTTCAAGAGAA--T--GATTTACAGGAAA--G--AACAAGATATTCAGCAA-ATTGT-ATCCCTAAGCAAGTCTTCCA----TCTGTTTTTC-CCTTGGT----AACTTGTAT--------AT----TATCTTTGTCATTAT-TTCAAATTCAAATCATATA--GC--ACAA-GCA-TTCACTACTG-GTG--CGAC--TAGT--AAG----------ACAGACAGAAGATGCTTACTCC----------------G-----AG--------TT---------CT----A--T---GAC----TTA---GGG-CTCAT-C-TGA--GGGTT--CATC------------GT-T--TAACTCCAT--ATG-A----A----------T---------------G----------TC-A--------TG-------AT--GTTACTCA-TT-TACATTCA-CA-CA-T-GT--AA-T-TTT-AGAAAT-GC-TATAAA-ATTCT-ACTT-TCA--TGTT--TGCAT--TTA----TCAT-----G--TACT---T--C--T-----TA----A-C--------------G-----A--TTTGT----TA--------T-C--AGCA-TGCGT-GTC-TG-T----A---G--G-G-AA-AA--------------AA----C---------------A--TT--GTC-GC-GTA-----AT---A------G---TTCTT--ATTTAAAAAGTCTTG------ATTGTGTCAGGGAC-ATA-----TA-TATAACATG--TTATAGATA-TGTCTC---T----A-ATTGT-G---CT--TTGTGGT-GG----GAC-ACCAAC------A--T----TTTTAC----------T--CA--A-AGCA---------------T-AT-T-------------TATGG-GAC-ACA--AAC-----ATCTT-CT---TAAA--G-ATG--TTTG-C-ATGGGA-CACATACTTT--TT--TTAACATTGA--ATTTTCAAA----TGC-AC-CGGTC-CCAC-CC--CG-GTGAGA-AA------T-ATT-G-C-ATGGT
gi|4 : TCACC-AGGGTTGGACAAGTGCA------AAAC-ACT-ATGGGACACA----------AACGGT-TTT-TT-----A-TGAA-AACA-GG---ACAT-----GGG-CTA-ATGATTTTTGT-A-GGT---ATAGATTTG--ATGGGA-CATC-TA-TTTT-TTCATTA-ACA---AATAAA---TGCAAAGAGTTTT--CCCAT----TGA-TTTGAAGAGAA--T--GATTTACAGTA--------------TATTCAGCAA-AGTGT-ATCCCTA-GCA--TGTTCCA----TTCGTTTAAG-TCTTTGT----AACTTGTAG--------AT-----AT--TTGTCATTAT-TTCAAATCCAAATCATATA--AC--ATGA-GCA-TACACAACTA-TCC--CAAC--GAGT--AAG----------TCAGAAAGGGGATACTTACTCC--------------------------------TT---------C-----G--C---AACAG--TTG---CGA-TCTAC-CTTGATTGGG----------------------------ACTCCAT--ATG-A----A----------TTC-------------GATTCTCCC--TC-A--------GGAC-----AT--CTTACTCA-TT-TACATCCA-CA-TA-T-GT--AA-T-TTT-AGAAAT-GC-AATAAA-AATCT-ACTGATTA--TGTT--TGCAT--TTA----TCATTATAAA--CACT---T--T--T-----CA----A-C--------------------A--TTTAT----T
gi|1 : ggaccatgcaatatttaTCAC--AGGGTGGGAACA-TGCATAAAAAAAACCAC--ATGGGA-ACACTTTTCTTACAACCTT-TTT-T------A-T-AC-AAC--GG---ATAG-----GGA-TTA-AAGATTTTT-T-GGTGTGGAATA-ATTTGGTATGG-A-CATT-AA-CTTA-T--AATT-ACA---AA--A-----GCAAAGATTT----CCCTG--ATTGA-TTTGAAGGAAAATT--GATTT-C-GAAAA--G--AATAAGATACT-AGCAAGATTGT-TTCCCCTACAAAGTGGTCCAAAAATCTGTTTTTG-T-TTAGTCCCTAACTTGCATC-------AT----T--CTTTGTCATTAT-T-------CAAATCATATA--GC--ACGATGCA-TTCACAACTG-GTGCACAAC--TA-T--AAT-----------CAGACAG-GGGTGTCTATTCTTTTGGCAATAGTTG--A-----AG--------TTC--------CT----T--C---GAC----TTAG--GGG-TTCAT-C-T----GGGTCCGCATCA-----------ATGT--CAACTCAAT--GTG-A----A----------T---------------GCGA-------TC----------TGTCAGAT-AT--GTTAGTC---C-TACATT-A-CT-AA-T-GT--A----TTT-AGAAAT-GCATATAAAGAATCTAACTT-GTATTTGTT--TGCA---TAA----TCAT-----A--TAtaagggttactttgtctaatgttttgtctatctgcaatgcgt
gi|18 : agtgaccagcaatattcactattTCACC-GTGATGGTACCAGTGCA------AAAC-ACG-ATGGGACACA----------AAC-AT-TTT-TT-----A-TGAC-AACA-GG---ACAT-----GAG-ACA-ATGATTTTTGT-A-TGTG-GATA-ATTTGG-ATGGGA-CATC-TA-TTTT-TTCATTG-ACA---AA--AA---TACAATGATTTT--TCCC----ATTAA-TTTTGAGAGAA--T--GATTaaacatatttacacttcttaaataatttaaggttacttactttttttcaattatttgtctaccatttcataggcatacttgatgctgtaaaaaggtcttaactggtgcaaaaataacttacatgttatatataccgcgcgattggtgtctgattatctttgtggtgtggatcaagaaattagacaatataataaaaattataacatcaattttttaacttcaaatcatataatggacaaatcaacgttttcttaagattttgcatgggacatactttttgaacaaagaattttcaaatgcaaccagtccctaccggtgagaaatatgcatggtcccat
gi|20 : accatgcgatatttaTCACC-GGGGTGGGACCAGTGCA------AAAC-ACG-ATGGGACACA----------AAC--T-TTT-TA-----A-TGAC-AACA-GG---CAAT-----GG--GCA-ATGACTTGT-T-G-TGTA-GATA-AATTGG-ACGGGA-CATT-TA-TTTc
gi|36 : gacgatgcaatgtttaTCACC-GCGGTGGGACCAGTGCA------AAAC-ACG-ATGGG--ACA----------GAC--T-TTT-TT-----A-TGAC-AATA-GG---ACA
gi|45 : tcatacaatattaTCACC-GGGGTGGGACCGGTGCA------
gi|7 : aCCGGGGTGGGACCAGTGCA------AAAC-ACG-ATGGGACACA----------AAC--T-TTG-TT-----A-TGAC-AATA-GA---ACAT-----GGG-ACA-ATGATTTTTGT-G-TGTG-GATA-ATTTGG-ATGGAA-CATCTTT-TTTT-TTCATTG-ACA---AA--AA---TGCAAAAAGTTTTTCCCCG-------------AAGAGAA--G--GGTTTACAAGAAA--G---------TGATCAGCAA-ATTGT-TTCCCT-AGCAAGTGTTCCA----TCCGTTTTTG-TCTTTGT----AACTTGCA---------------TATCTTTGTCATTAT-TTCAAATTCAAATACTATA--GC--GCGA-TCA-TTCACAACTG-GTG--CGAC--TAGT--CAG----------TCAGACAGGCGATACTTGGTCCTT--------------GGCAACAG--------TTGGATTCCACCT----A------GAT----TTG---GGG-TCCAT-C---A--GTGTTCCCAGT------------GT-T--TAACTCCAT--GTG-A----ATGTGATTCTCT---------------G----------TC-A--------GG-------AT--ATT--TCA-T-----ATTCA------------------TCT-ACAAAT-GC-AACAAA-AATCT-ACTTGTCA--TATgaaatacatgtattgcatggtccct
gi|33 : ggaccatgcaatatttatgaGGGTTGGGACCGGTGCC------AAAT-GTA-ATAGGACACA----------CACTTA-TTG-AT-----A-AGAC-Aaaaactaag
gi|14 : ttagggactggtcaatatttattgggGGTGGGACCAGTGCA------ACAC-TCG-ATGGGACACA----------AATCTT-TTT-TTAGCAAA-TGCC-AACATGG---TCAT-----GGG-A-A-ATGAGTTTT-T-G-TGTG---------TGG-ATAT---CATT-TA-TTTTCTTCATTG-ACG---AA--AA---TGC--AGATTT---TCCCAA--ATTGA-TTTGAAGAGAA--T--GATTTATAGGAAAGTG--AACACGATATTCCGCAA-ATTGT-ATCCC-AAACAAGCGTTCCA----TCCGTTTTTG-TCTTTGT----AACTTGCA---------------TATCTTTGCCATTAT-TTCAAATc
gi|38 : attatcggcctGGTGCA------AAAC-ACT-ATGGGACACA----------AACTTTATTT-TT-----A-TGAC-AACA-
gi|42 : gggaccatgggatgtttatcaccggGTGCA------AAGC-ATG-ATGGGACAGA----------CA-TAT-TTT-TA-----A-TGAC-AGCA-GG---ACAT-----GGG-ACA-ACGATTTTT-
gi|10 : A------AAGC-ATATATGGGACACA----------AACTTT-TTC-TT-----A------AAGA-TGTTTGCAA-----GGG-ACACATACTTTTT-T-a
gi|12 : catgtgaatgcgattctctgtcaggatacgttaatttacatccacacatgtaattttagaaataccataaaagtctacttttatgctaattgtacacttcttaacctttatttaaggatgactttgtctagttttgtctctgcaatgcatgtctattatggaaaaaccatttcagagtactcgatgctgttattaaaaagtcttaattgtgccagatacatatataccattttatgtttgtatctgattgtgctttctggtgggacaccaacttttttctttttactcatC-AGG-GTGGGACACA----------AACTTT-TTT--------A-TGAC-AACA-AG---ACAT-----GGG-ACG-ATGAGTTTC-T-G-TGTG-GATA-ATATGG-ATTGAA-CATC-TA-TTTT-TTC--------------------TTCA-------TTGCCCCCC--ATTGC-TTTGAAGAGAA--T--GATTTACAAGAAA--GTGAACAAGATGTTCAGCAA-ATTGT-ATCCCTAAGCAAGTGTCCCA----TCCGTTTTTTGTCTTTGT----AACTTGCAT--------AT-------CTTTGTCATTAT-TTCAAATTCAAATCATATA--GC--ACGA-GCA-TTCCCAACTG-taacattgaattttcaaatgtaccggtcccaccccggagagaaatattgcatggtacct
gi|10 : gataccatgcaatttttctcacG-GTGGGACACC----------AACTTT-TTTCTT-----T-TTACTCATA-AA---GCATATATGGGACACA-A--ACTTTT-T-C-T-TA-AAGATGTTTGC-AAGGGA-CACA-TACTTTT-TTTAA
gi|21 : catgtgaatgcgattctctgtcaggatacgttaatttacatccacacatgtaattttagaaataccataaaagtctacttttatgctaattgtacacttcttaacctttatttaaggatgactttgtctagttttgtctctgcaatgcatgtctattatggaaaaaccatttcagagtactcgatgctgttattaaaaagtcttaattgtgccagatacatatataccattttatgtttgtatctgattgtgctttct-ATGGGACACA----------TACTTT-TTT-Tcattgaattttcaaatgtaccggtcccaccccggagagaaatattgcatggtacct
gi|24 : taagcatatatgggtcacaaaagttttctgcaagatgtttgcTGGGACACA----------AACGTT-TTC-TT-----A------AAGA-TGTTCGCAT-----GGG-ACACATACTTTTG-T-T-TG-G-AATaacattgaattttcaaatgcaccggtcccatcccggtgagaaatattgcatggtctct
gi|13 : GGACACC----------AACTTT---T-TT-----ACTCAA-AGCA--T---ACAT-----GGG-ACA-AAAACGTTT-T-C-T-TA-AAGATGTTTGC-ATGGGA-CATA-TA-tttcaaatgcaccggccccaccccggtgaaaaatagtgcatggtccc
gi|22 : atcacgtcttcatatctcacgcatgcattaattattgcttgtctgttatggaataaaccatttcatagtactcgatgttgttatcaaaaagtcttaattgtgccagagacatacagtgtatataacatgctgtgcatgtctctgattgagctttgtgtt-AACA-GG---ACAT-----GGG-ACA-ATGATTTTT-TTG-TGTA-GATA-ATCTGG-ATGGGA-CTTC-TA-TTTT-TT-ATTG-ACA---AA--AA---TGCAAAGATTTTCCTC------ATTGG-TTTGAAGAGAA--T--GATTTACAGGcgcaccggtcccacccggtgagaaatattg
gi|17 : -T-G-TGTG-AATG-ATTTGG-GTGGGA-TATC-TA-TTTT-TTCATTG-AGA---CA--AA---TGCAACCCCCCCCCCCCCA---ATTGAGTTTCAAGAGAA--TATGATTTATAGGAAA--G------------TGAACAA-ATTGT-ATCCCTAAGCAAGTGTTCCA----TCCGTTTTTG-CCTTTGT----AACTTGCA---------------TATCTTTATCATTAT-TTCAAATTCAAATCATATA--
gi|16 : tg-TGTG-AA---ATTTGG-ATGGGAGCATC-TA-TTTT---CATTG-ACA---GA--AA---TGCACAGACCCCCCCCCCCCCCATTGA-TTTAGAGGAAA--T--GA----------A--G--AACG---TATTCAGCAA-ATTGT-ATCCGTA-GAAAG-------------TGTT-----CC---AT----AGC--------------AT----T-------TCAATAT-TTCAAATTCAAATTATATATAGC--ACGA-GCA-TTCAC-ACTGAGTG--CGAC--TAGT--AAG----------TCAGACAG-GGATGCTTACT
gi|34 : tgtgt-ATGGGA-CATA-CA-TTTT-TTCAATGTATATCTAA--AAGTTTGCA------TCTGTCCCAT--
gi|47 : gc--G--AACAAGCTATTCAGCAA-ATTGT-ATCCTAAAGCAAGTGTTCCA----Ttccggtgataaatattgacca
gi|3 : ATATTC-GCGG-AATGTCATCCCTAA--AA--------------TGTTTTTC-CGT--AT----AAATTGTATTTTGTAACATAGCATATCTCTGTCAATATATTTAAATTCAAATCACACC--ACCTACGA-GCACTTCACAAATG-TTG--C------------AG----------G--GACAGGGGATGCTTATCCCTTGGCAAAACATTGGGA-----AG--------TT---------CT----A--TCTCGATGTGTTTG---GGG-TTCATGC-TGG--GGGTC--CATCAGTGTTCCA---GT-TGTTAACTCCAT--GTG-A----A----------TAGGCGATTTTACCTTG----------TC-GATACATTGTA-------GT--GTTAATCA-TT-GACATCCA-CA-CA-A-GT--GACT-TTT-CGATATTGC-AATAAA-AATCG-ACCT-TTA--CTTTCTTGTAT--TTA----TCAT-----t
gi|8 : atATATA--AC--ACGA-GCA-TTCACAACTG-GCA--CAAC--TAGT--AGG----------TCAGAAAGGGGATGTTTACTCCTTGACAACAGTT----G-----AG--------TT---------TTTTTAACTT---GAC----TTG---GGG-TTTAT-C-TTG--GGGTC--CATCAATGTTTCCAGTGT-T--TAATGCCAT--GTG-A----A----------T---------------GCGATTCTCTGTC-A--------GG-------ATATGTTACTCA-TG-TACATCCA-CA-CA-T-GT--AA-T-TTT-AGAAAT-GC-AATCAA-A-TCT-ACTT-T-A--TGTT--TGCAT--TTA----TCAT-----A--TAtataattaatttatagctttttaaactttatcacagtaattactttatatgggttttgtggcttactggcaatgcattgtctgttatagaaaaacaacgagttcatagtatcgatgcttcaatttaaaagtcttaaagtgtccagttatatatgtctctggattatgccttgtggtggacacattttgtttacca
gi|5 : ggtaATATA--AC--ACGA-GCA-TTCACAACTG-GCA--CAAC--TAGT--AGG----------TCAGAAAGGGGATGTTTACTCCTTGACAACAGTT----G-----AG--------TT---------TTTTTAACTT---GAC----TTG---GGG-TTTAT-C-TTG--GGGTC--CATCAATGTTTCCAGTGT-T--TAATGCCAT--GTG-A----A----------T---------------GCGATTCTCTGTC-A--------GG-------ATATGTTACTCA-TG-TACATCCAACA-CA-T-GT--AA-T-TTT-AGAAAT-GC-AATCAA-A-TCT-ACTT-T-A--TGTT--TGCAT--TTA----TCAT-----A--Taaactaatcaacacttcccaacccttaattttaaaggattacattgtgtaatttgtgtctatctgcaatgcgtgtctgttatgggggaaaaaacccaaaacaaacaacatttcgtagtgtattcgaggctgttattagaaatttgccagagacaataatgtaacatgctgtacatgtctctgttttaattgtggtgacttttacactaacat
gi|9 : ggtaTCACGACTG-GTG--CGAC--TAGT--AAGTTATTCATTGGCA-ACAATAGA-G-TTATTTC----------------T-----AC--------CT---------C------------GAC----TTA---AGG-TTCAT-C-TGG--GGGTC--CATCAATGTTCCCAGTGT-T--TAACTTCAT--GTG-A----A----------T---------------GCGAT------TCTA--------TGTCGGGATAT--GTTACTCA-TT-TATATCCA-CA-CA-T-GT--AA-T-TTT-AGAAA--------------TCT-ACTTATCA--TA----TACAT--GTAAAACTAAT-----G--TAATAAAT--C--TACAAGTAT---A-T--------------GTCTA-A--TTTTTCTC-TA--------T-C--TGCATTGCGT-GTCTTT-T----AT--G--A-A-AA-AA--------------AA----C---------------C--CA--GTT--C-ATA-----GT---ACTCGATG---CTGTT--A-TTAAAAAG----------------GTC--------TA-----------AATATG----ATA-----TGTCTC------------TGT-G---CT--TTGTGGT-GG----GAC-ACCAAC------T--C----TTTTTC----------T--CA--A-AGCA---------------T-A----------------TAAGG-AAC-AC---AAC-----A-GTT-AT---GGGA--A---------G-C-ATGGGA-CACATAC-----------------------TTTCAAA----AGC-AC-CGGTC-CCAC-CC--CG-GTGAGA-AA------T-ATT-G-C-GTGGTtaaaaactaatcaacacttcccaacccttaattttaagagattacatgtgtaattttgtgtctatctgcaatgcgtgtctgttatgggggaaaaaacccaaaaacaaacaacatttcgtagtgtattcgaggctgttattagaaatttgccagagacaataatgtaacatgctgtacatgtctctgttttaattgtggtgactttacactaacatatacttttacaaaattctaattaaagtctatctatcaaactgtaaatctttcatataaagtatgt
gi|6 : aCTG-GCA--CAACACTAGTTTAGG----------TCAGAAAGG-GATTTTTACTCCTT--------------G-----ACAACATTATTT---------CT----T--T---AAC----TTGACTGGGTCTTAT-C-TTG--GGGTC--CATCAATGTCTTCAT-GT-T--TAATGCCATGGATGCG----A----------TTCTCT----------G----------TC-A--------GG-------ATATGTTACTCA-CTGTACATCCAACA-CA-TTGT--AA-T-TTTTAGAAAT-GC-AATCAA-ATT-T-ACTT-T-A--TTTT--TGCATACTTT----TCAT-----A--Tccc
gi|11 : TGCTTACTCCTTGGCAATGGTT----G-----AG--------TT---------CT----A--CCTCGAC----TTG---GTG-TTCCT-C-TGG--CGGCC--TATCAATGTTCTCAGTGT-T--TAACTCCAT--GTG-ATGCGA----------TTCTTT----------G----------TC-A--------AG-------ATTTGTTACTAA-TT-TACATCCA-CA-CA-T-G--------------------C-GATGAA-AATCT-ACTT-TTA--TGTT--TCTAT--TTT----TTATTTAAGGATTACT---TTGC--C-----TA----ATC-----------------------TTAGTC---TA--------T-G--TGCACTGCGT-G-A-TG-G----A---ACTG-A-AA-AA--------------AAAACCC---------------A--TT---TC-ATAGTA-----CT---G------GATGTTGTT--ATT-AGAAAGTCTTACATGTAATTGTGCCAGATAC-ATA--------TATGACATtaaaactaatcaacacttcccaacctaatttaaaggattcacattgtgtaatttgtgtctatctcaactgcgtgtctgtatatgggcaaaaaaccaaaacaaaacaacatttcgtagtgatatgcgaggtgtattcagaaatttgccagagacaatagatgtactatgctttgttacatgtctctgttaattgtgtgacttttacacaacatacttttacaaaattctaattaaatcatatctatcaaaacgtaaatctttcatataaagtatg
gi|32 : CT----------------G-----AG--------TT---------CT----A--CCTCGAC----TTA---GGG-TTCAT-C-TGG--GAGTC--TATCAATGTTCCCAGTGT-T--TAACTCAAC--GTG-A----A----------T---------------G----------c
gi|44 : ttggcaacag---GAC----T-A---GGG-TTCAT-C-TG---GGGTC--CATC------------
gi|39 : ctgcctc----A----------T---------------G----------TC-G--------CGG------ATTGGTCACTAAATT-TACATCCA-CA-CATT-GT--AA-TCTTT-AGAAAT-GC-aatgttccccagttgtttaacttcaac
gi|10 : gcgaatgctc----------T---------------G----------TC-A--------GG-------ATACGTTA---A-TT-TACATCCA-CA-CA-T-GT--AA-T-TTT-AGAAAT-AC-CATAAA-AGTCT-ACTT-TTA--TGCT-----A-----A----TTGT-----A--CACT---T--C--T-----TA----A-CCTTTATTTAAGGATG-----AC-TTTGTC---TAGTTTTGTCT-C--TGCAATGCAT-GTC-TA-TT---A---T--G-G-AA-AA--------------AC----C---------------A--TT---TCAGA-GTACTCG-AT----------G---CTGTT--ATT-AAAAAGTCTTA------ATTGTGCCAGATAC-ATA-----TA-TAC--CATT--TTATG--TT-TGTATC---T----G-ATTGT-G---CT--TTCTGGT-GG----GAC-ACCAACTTTTTTC--T----TTTTAC----------T--CATAA-AGCA---------------T-AT----------------ATGG-GAC-ACA--AAC-----TTTTT-CT---TAAA--G-ATG--TTTG-C-AAGGGA-CACATACTTT--TT--TTAACATTGA--ATTTTCAAA----TGT-AC-CGGTC-CCAC-CC--CG-GAGAGA-AA------T-ATT-G-C-ATGGTaaat
gi|37 : catgtgaatgcgattctc-------AT--GTCACTAA-TT-TACATCCA-CA-CA-T-GT--AA-T-TCT-AAAAAT-GC-AATacct
gi|43 : tgaatgcgattctctgtcgggat-TT-TAC--TCA-CAGTA-T-TTCTAG-T-TTT-AGAAAT-GC-TATAAA-AATCT-ACTT-TTA--TGTT--TGCAT--TTA----Ttttca
gi|3 : T--TTA----TCACA----G--TAAT---TACT--T-----TAT---A-T--------------G-----GGTTTTGTGGCTTA--------C-T--GGCAATGCATTGTC-TG-TTAT-A---G--A-A-AA-AC--------------AA----C---------------GAGTT-------C-ATA-----GT---ATCG---A---TGCTTCAATTTAAAA-GTCTTA------AA-GTGTC-----------------------CA-G--TTATA--TA-TGTCTC---T----GGATTAT-G---CC--TTGTGGT--G----GAC-----AC------A--T----TTT
gi|13 : atatattcgcggaatgtcatccctaaaatgtttttccgtataaattgtattttgtaacatagcatatctctgtcaatatatttaaattcaaatcacaccacctacgagcacttcacaaatgttgcagggacaggggatgcttatcccttggcaaaacattgggaagttctatctcgatgtgtttggggttcatgctgggggtccatcagtgttccagttgttaactccatgtgaataggcgattttaccttgtcgatacattgtagtgttaatcattgacatccacacaagtgacttttcgatattgcaataaaaatcgacctttactttcttgtatttatcattataattaatttatagctttttaaacA----TCAC-----G--T-CT---T--C--A-----TATCTCA-C--------------GCATGCA--TTAAT----TA--------T---------TGCTT-GTC-TG-TT---A---T--G-G-AATAA--------------AC----C---------------A--TT---TC-ATAGTACTCG-AT----------G---TTGTT--ATC-AAAAAGTCTTA------ATTGTGCCAGAGAC-ATACAGTGTA-TATAACATG--CTGTG--CA-TGTCTC---T----G-ATTGA-G---CT--TTGTGTT-GG-----AC-ACCAAC------T--T----TTTTAC----------T--CA--A-AGCA---------------T-AC----------------ATGG-GAC-AAA--AAC-----GTTTT-CT---TAAA--G-ATG--TTTG-C-ATGGGA-CATATAC-----------------------------------GC-AC-CGGTC-CCA--CC--CG-GTGAGA-AA------T-ATT-G-gtttacca
gi|28 : --TACT---T--TGTC-----TA----A-T--------------G--------TTTGTC---TA--------TTC--TGCAATGCGT-GTC-TGTT----A---T--G-A-AA-AA--------------AA----
gi|8 : ttatcatataaaactaattaacacttctcagcctttatttaaggat-----A--TTTGTGTC-TA--------T-C--TGCAATGCGT-GTC-TG-TTATGG---G--G-G-AA-AA--------------AA----CCCAAAACAAACAAC-A--TTTCGTA-GT-GTA-----TTCGAG------G---CTGTT--ATT--AGAA------------ATT-TGCCAGAGAC-A-A-----TAATGTAACATG--CTGT--ACA-TGTCTC------------TGT-T---TTAATTGTGGT-GACTTTTAC-ACTAAC------A--T----a
gi|6 : ggtaatataacacgagcattcacaactggcacaactagtaggtcagaaaggggatgtttactccttgacaacagttgagtttttttaacttgacttggggtttatcttggggtccatcaatgtttccagtgtttaatgccatgtgaatgcgattctctgtcaggatatgttactcatgtacatccacacatgtaattttagaaatgcaatcaaatctactttatgtttgcatttatcatataaaactaatcaacacttcccaacccttaattttaaaggattacattgtgta-----A--TTTGTGTC-TA--------T-CTCAAC--TGCGT-GTC-TG-T----ATATG--G-GCAA-AAAACCAAAACAAAACAA----C---------------A--TT---TC-GTAGTG-----AT---ATGCGAGG---T--GT--ATTCAGAAA---TT-----------TGCCAGAGACAATA-----GA-TGTACTATGCTTTGT-TACA-TGTCTCTGTT----A-ATTGT-GTGACT--TT-T-----------AC-A-CAAC------A--TAC--TTTTACAAAATTCTAAT--TA--A-ATCA---------------T-AT-C-------------TAT
gi|15 : ctggcacaacactagtttaggtcagaaagggatttttactccttgacaacattatttctttaacttgactgggtcttatcttggggtccatcaatgtcttcatgtttaatgccatggatgcgattctctgtcaggatatgttactcactgtacatccaacacattgtaatttttagaaatgcaatcaaatttactttatttttgcatacttttcatattaaaactaatcaacacttcccaacctaatttaaaggattcacattgtgta--TTTGTC---TA--------T-C--TGCAATGCGT-GTC-TG-TT---A---C--GCG-AA-AA--------------AA----C---------------A--TT---TC-ATAGTACACACAT---AT-----G---CTGTT--ATC-AAAAAGTCTTA------ATTGTG-CAGAGAC-A-G-----TA--ATAACATG--TTATAGTAA-TGTCTC---T----G-ACTTTCG---CT--TTG--GTAGG----GAC--CCAAC------T--T----TTTTAC----------T--CA--A-G--A---------------T-AT----------------ATGAAGAC-ACA--AAC-----GTTTT-CT---TAAA--G-ATG--TTTG-C-ATGGGA--ACATAC---------------------ATTTTC-AA----TGC-AA-CGGT--CCAC-CC--CA-GTGAG--AA------T-ATT-GCC-ATGGTcaaaacgtaaatctttcatataaagtatg
gi|5 : tctaat--TTTGTGTC-TA--------T-C--TGCAATGCGT-GTC-TG-TTATGG---G--G-G-AA-AA--------------AA----CCCAAAAACAAACAACA--TTTCGTA-GT-GTA-----TTCGAG------G---CTGTT--ATT--AGAA------------ATT-TGCCAGAGAC-A-A-----TAATGTAACATG--CTGT--ACA-TGTCTC------------TGT-T---TTAATTGTGGT-GACTT-TAC-ACTAAC------A--TATACTTTTACAAAATTCTAAT--TA--A-AGTC---------------T-AT-C-------------TAT--------CA--AACTGTAAATCTT-TCATATAAA--GTATG--Tccc
gi|30 : ggtaatataacacgagcattcacaactggcacaactagtaggtcagaaaggggatgtttactccttgacaacagttgagtttttttaacttgacttggggtttatcttggggtccatcaatgtttccagtgtttaatgccatgtgaatgcgattctctgtcaggatatgttactcatgtacatccaacacatgtaattttagaaatgcaatcaaatctactttatgtttgcatttatcatattaaaaactaatcaacacttcccaacccttaattttaagagattacatgtgtaatTTAAAACGTCTTA------ATTGTACCAG--AC-ATA-----TA-T
gi|15 : gtattaagtatttgttcggactctaaccatttctagatctagtatcgatgctgttgGTCAGAGAC-AT------TACTATAACATG--TTAT---TACTGTCTC---TGCACA-ATTAA-GA--CT--TTTTGAT-
gi|25 : tctaattttgtctatctgcaatgcgtgtctgttacgcgaaaaaacatttcatagtacacacatatgctgttTG--TTATA--TA-T-TCTC---T----G-GTTGT-G---CA--TTGTGGT-GG----GAC-GCCAAC------T--T----TTTTAC----------T--CA--T-AGCA---------------T-ATGTTTGTACATGTATATATGA-GAC-ACA--AAC-----GTTTT-CT---TAAA--G-Atttcgctttggtagggacccaacttttttactcaagatatatgaagacacaaacgttttcttaaagatgtttgcatgggaacatacattttcaatgcaacggtccaccccagtgagaatattgccatggtccc
gi|19 : ATA-TATCTC--------G-GTTGT-G---CA--TTGTGGT-GG----GACGGCCAAC------T--T----TTTTAC----------T--CA--T-AGCATTGTTTCGTAACATGT-AT-A-------------TATGA-GACAACAC-AAC-----GT-TT-CT---T-AA--G-AT---TTTG-C-AT------------TTTGGTT--TTGA-----A--ATTTTCAAA----TGCTACACGGCC-CCGC-CC--CG-GT--AA-AA------T-ATTGG-CAATGGT
gi|41 : TGTGGT-GG----GAC-ACCAAC------T--A----TTTTAC----------T--CA--A-A-CA---------------T-AT-A-------------TATGG-GGC-ACA--ccct
gi|40 : TGTGGT-GG----GAC-ACCAAC------T--A----TTTTAC----------T--CA--A-A-CA---------------T-AT-A-------------TATGG-GGC-ACA--tgatgttataccggtaag
gi|18 : GAT-GG----GAC-ACAAAC------A--T----TTTTTA----------TGACA--ACAGGA---------------C-AT---------------------GAG-ACA--ATG-----ATTTT-TG---TATGTGG-ATAA-TTTG-G-ATGGGA-CATCTATTTT--TT------CATTGA--tgatgttataccggtaag
gi|4 : accatgcgatatttatcaccgtgatggtaccagtgcaaaacacT-GG----GAC-ACAAAC------GGTT----TTTTA-----------T--GA--A-AACA--------------------------------------G-GAC-ATG--GGCTAATGATTTT-TG---TAGG--T-ATAGATTTG---ATGGGA-CATCTATTTT--TTCATTAACA---A--AT----AAA----TGC-Acaaaaatacaatgatttttcccattaattttgagagaatgattc
gi|27 : ggaccatgcaatatttatcaccagggttggacaagtgcaaaacactaT-GG----GAC-ACAAAC------A--T----GTT--C----------T--TA--A-AG-A---------------TGAT-TG------------CATGG-GAC-ACG--CAC------TTTT-TT---TAAaagagttttcccattgatttgaagagaatgatttacagtatattcagcaaagtgtatccctagcatgttccattcgtttaagtctttgtaacttgtagatatttgtcattatttcaaatccaaatcatataacatgagcatacacaactatcccaacgagtaagtcagaaaggggatacttactccttcgcaacagttgcgatctaccttgattgggactccatatgaattcgattctccctcaggacatcttactcatttacatccacatatgtaattttagaaatgcaataaaaatctactgattatgtttgcatttatcattataaacacttttcaacatttatttaagggttactttgtctaatgttttgtctatctgcaatgcgt
gi|24 : caaagcatatttaT-GG----GAC-ACAAAC------G--T----TTT--C----------T--TA--A-AG-A---------------T-GT-TCG-----------CATGG-GAC-ACA--TAC-----cactaaattttcaaatgcaccggtcccacccc
gi|1 : AC-ATCAAT------T--T----TTTAAC----------TT-CA--A-ATCA---------------T-AT-A--------------ATGG--AC-AAATCAAC-----GTTTT-CT---TAA---G-AT---TTTG-C-ATGGGA-CA--TACTTT--TT--G-AACAAAGA--ATTTTCAAA----TGCAAC-CAGTC-CC-T-AC--CG-GTGAGA-AA------T-A-T-G-C-ATGGTttttgtttggaattttcaaatgcaccggccccaccccggtgaaaaatagtgcatggtccc
gi|27 : agtgaccagcaatattcactatttcacagggtgggaacatgcataaaaaaaaccacatgggaacacttttcttacaaccttttttatacaacggatagggattaaagattttttggtgtggaataatttggtatggacattaacttataattacaaaagcaaagatttccctgattgatttgaaggaaaattgatttcgaaaagaataagatactagcaagattgtttcccctacaaagtggtccaaaaatctgtttttgtttagtccctaacttgcatcattctttgtcattattcaaatcatatagcacgatgcattcacaactggtgcacaactataatcagacaggggtgtctattcttttggcaatagttgaagttccttcgacttaggggttcatctgggtccgcatcaatgtcaactcaatgtgaatgcgatctgtcagatatgttagtcctacattactaatgtatttagaaatgcatataaagaatctaacttgtatttgtttgcataatcatataaaacatatttacacttcttaaataatttaaggttacttactttttttcaattatttgtctaccatttcataggcatacttgatgctgtaaaaaggtcttaactggtgcaaaaataacttacatgttatatataccgcgcgattggtgtctgattatctttgtggtgtggatcaagaaattagacaatataataaaaattata--CA--A-AGCA---------------T-AT-T-------------TATGG-GAC-ACA--AAC-----ATGTT-CT---TAAA--G-ATG--ATTG-C-ATGGGA-CACGCACTTT--TT--TTAACACTAA--ATTTTCAAA----TGC-AC-CGGTC-CCAC-CC--Ccccat
gi|35 : A--A-AGCA---------------T-AT-T-------------T-TGG--AC-ATA--TAC-----GTTTT--T---AAAA--G-ATGC-TTTC-C-TTGGGA-CACATGCTTA--TT--TAAACATTGA--ATT
gi|21 : t--A-AGCA---------------T-AT----------------ATGG-GTC-ACA--AAA-----GTTTT-CT---GCAA--G-ATG--TTTG-C-ATGGGA-CACATACTTT--TT--TTAACATTGA--ATTTTCAAA----TGC-AC-CGGTC-CCAT-CC--CG-GTGAGA-AA------T-ATT-G-C-ATGGT
gi|24 : tTGG-GAC-ACA--AAC-----GTTTT-CT---TAAA--G-ATG--TTCG-C-ATGGGA-CACATACTTT--TG--TT----TGGA--ATTTTCAAA----TGC-AC-CGGCC-CCAC-CC--CG-GTGAAA-AA------T-AGT-G-C-ATGGTctct
gi|41 : TGG-GAC-ACC--AACT----ATTTTACT---CAAA--C-ATA--TAT----ATGGGG-CACATccc
gi|40 : tgtggTGG-GAC-ACC--AACT----ATTTTACT---CAAA--C-ATA--TAT----ATGGGG-CACATgatgttataccggtaag
gi|23 : tgtggG-GAC-ACT--ACC------TGTT-CT---TAAA--G-ATC--TTTT-TTGTGGGAACACATACTTTA-TT--TTGAAATT-A--ATTTT-AAA------C-AC-CG-TC-CCAC-CC--C--GTGATAGAA------T-ATT-G-C-ATGGTgatgttataccggtaag
gi|31 : tTT-CT---TAA---G-ATG--TTTGAC-AAGAGA-CACATACTTT--TT--TAAACGATGAGCATTTTCAAA----TGT-AC---GCCATCAC-TTTACT-GTGAGA-Accctt
gi|29 : aAAA--A-A-G--TTTG-C-ATGGGA-TAAATACATT--TT--TAAACATTGAC-ATTTTCAAA----TGC-AC-CGGTC-CCCC-AT--TGCGTGAGA-AA------TGATT-G-
gi|34 : G-C-ATGGGA-CATACA-TTT--TT--TCAA---TGT--ATATCTAAAAGTTTGC-AT-CTGTC-CCAT-TC--CG-GTGATA-AA------T-ATT-G-tgccattgtcccta
gi|46 : ACATTGA--ATTT-CAAA----TGC-AC-CGGT--CCACTCC--CG-GTGAGA-AA--------ATT-acca
gi|45 : A----TGC-AC-CGGTC-CCAC-CC--CG-GTGAGA-AATACATGT-ATT-G-C-ATGGTtcgt
gi|7 : ----TGC-AC-TGGTC-CCAC-CC--CG-GTCATA-AA------T-ATT-G-C-ATGGTccct
gi|4 : gg----TGC-AC-TTGTC-CAAC-CC--TG-GTGATA-AA------T-ATT-G-C-ATGGTaaacacgatgggacacaaactttgttatgacaatagaacatgggacaatgatttttgtgtgtggataatttggatggaacatctttttttttcattgacaaaaatgcaaaaagtttttccccgaagagaagggtttacaagaaagtgatcagcaaattgtttccctagcaagtgttccatccgtttttgtctttgtaacttgcatatctttgtcattatttcaaattcaaatactatagcgcgatcattcacaactggtgcgactagtcagtcagacaggcgatacttggtccttggcaacagttggattccacctagatttggggtccatcagtgttcccagtgtttaactccatgtgaatgtgattctctgtcaggatatttcatattcatctacaaatgcaacaaaaatctacttgtcatataaaactaag
gi|18 : gg----TGC-AC-TGGTA-CCAT-CA--CG-GTGATA-AA------T-ATC-G-C-ATGGTaaacactatgggacacaaacggttttttatgaaaacaggacatgggctaatgatttttgtaggtatagatttgatgggacatctattttttcattaacaaataaatgcaaagagttttcccattgatttgaagagaatgatttacagtatattcagcaaagtgtatccctagcatgttccattcgtttaagtctttgtaacttgtagatatttgtcattatttcaaatccaaatcatataacatgagcatacacaactatcccaacgagtaagtcagaaaggggatacttactccttcgcaacagttgcgatctaccttgattgggactccatatgaattcgattctccctcaggacatcttactcatttacatccacatatgtaattttagaaatgcaataaaaatctactgattatgtttgcatttatcattataaacacttttcaacatttatttaagggttactttgtctaatgttttgtctatctgcaatgcgt
gi|20 : ----TGC-AC-TGGTC-CCAC-CC--CG-GTGATA-AA------C-ATT-G-C-ATCGTaaacacgatgggacacaaacattttttatgacaacaggacatgagacaatgatttttgtatgtggataatttggatgggacatctattttttcattgacaaaaatacaatgatttttcccattaattttgagagaatgattc
gi|36 : g----TGC-AC-TGGTC-CCAC-CG--CG-GTGAT--AA------T-ATT-G-T-ATGaaacacgatgggacacaaactttttaatgacaacaggcaatgggcaatgacttgttgtgtagataaattggacgggacatttattt
gi|12 : tGTC-CCAC-CC--TG-GTGAGA-AA------A-ATT-G-C-ATGGTaaacacgatgggacagacttttttatgacaataggaca
gi|38 : gatCAC-CC--CG-GTGATA-AA------C-ATC-C-C-ATGGTacaaacttttttatgacaacaagacatgggacgatgagtttctgtgtggataatatggattgaacatctattttttcttcattgccccccattgctttgaagagaatgatttacaagaaagtgaacaagatgttcagcaaattgtatccctaagcaagtgtcccatccgttttttgtctttgtaacttgcatatctttgtcattatttcaaattcaaatcatatagcacgagcattcccaactg
gi|49 : ggg-CC--CG-GTGATA-AA------T-ATT-G-C-ATGGTcaaaacactatgggacacaaactttatttttatgacaaca
4 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|26 ): AAAATCTACTTTTTATGTTTACATTTTTCATATAAAACTAATTAACACTTCTCAACTTTTATATAAGGATTACTCCGTCTAATTTTTGTCTATCTGCAATGC
Unaligned ( gi|48 ): ACCGGTCAATAATTATTGGGGGGTTGGGACCGGTGCATT
Unaligned ( gi|50 ): CCACCATATTAAGGGACTGGTCAATATTTATTG
Unaligned ( gi|51 ): GTTAGGGACTGGTCAATATTTATTGGGGGGTT
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 111111 1111111 1111 22 222222222 2222222 77777777777777777777777777777777777777777777 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 1111111 1111 666666666666666666666666666666666666666666666666666 22222222222 111111111111 1111 1111 1111111111 4444444444444444444444444444444 11111111111
lowQualScore : 4 777 000000 3 3 0000000 3 99 3 44 88888 3 4 7 4 3 1 3 3 3 2 3 4 4 1 55 44 2222 5555 33 4 4 55 55 777777777 4 4 0 8888 4 888888 44 9999 4 8888888 4 66 4 4 88 3 55 55 5 4 99999999999999999999999999999999999999999999 3 555 3 3 0 0 44 44 666 33 44 3 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 3 3 3 3 3 3 2 2 2 2 2 4 3 555 3 3 6 77 99 3 77 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 7777 3 3 3 1111111 7777 3 3 44 999 888888888888888888888888888888888888888888888888888 7777 3 33 999999 77 1 2 44444444444 22 3 55 3 44 666 777777777777 3 9999 66666 4 2 2 1111 2 1 0000 3 888888 3333333333 3 33 1 4444444444444444444444444444444 2 55 0 33 2 2 2 2 66 44444444444 4444 3 1 1 1 22 1 1 1 555555 1 1 1 2
lowQualScore : . ... ...... . . ....... . .. . .. ..... . . . . . . . . . . . . . . .. .. .... .... .. . . .. .. ......... . . . .... . ...... .. .... . ....... . .. . . .. . .. .. . . ............................................ . ... . . . . .. .. ... .. .. . ......................................................................... . . . . . . . . . . . . . ... . . . .. .. . .. ......................................................................................................................................... .... . . . ....... .... . . .. ... ................................................... .... . .. ...... .. . . ........... .. . .. . .. ... ............ . .... ..... . . . .... . . .... . ...... .......... . .. . ............................... . .. . .. . . . . .. ........... .... . . . . .. . . . ...... . . . .
lowQualScore : 0 000 555555 3 3 8888888 3 11 3 88 33333 3 0 3 0 6 2 6 6 6 0 6 0 0 6 55 00 5555 7777 22 0 0 55 55 999999999 0 0 8 5555 0 111111 66 4444 4 7777777 4 11 4 4 66 0 55 55 0 0 33333333333333333333333333333333333333333333 3 888 3 3 4 4 66 66 777 88 66 3 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 1 1 1 1 1 1 9 9 9 9 9 4 1 444 1 1 2 99 22 3 33 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 1111 3 1 1 3333333 6666 3 3 22 666 000000000000000000000000000000000000000000000000000 1111 3 88 666666 99 2 5 00000000000 99 5 00 6 66 000 111111111111 3 5555 00000 8 9 9 1111 9 0 0000 1 888888 5555555555 3 99 9 5555555555555555555555555555555 5 99 8 66 7 7 7 5 33 66666666666 0000 8 9 8 7 33 7 2 7 222222 8 8 9 2
consensus : TCACC-GG---GGTGGGACCAGTGCA------AAAC-ACGATGGGA-CAC-------A-AACTTT-TTTTTA-----TGACAACA-GGACATGGGAC-AATGATTTTT-T-G-TGTGGA-TA-ATTTGG-ATGGGA-CATCTATTTT-TT-CATTGACAAA--AATGCAAAGA----TTTTC--CCCC-A-TTGA-TTTGAAGAGAA--T--GATTTACAGGAAAG--AACAAGATATTCAGCAA-ATTGT-ATCCCTAAGCAAGTGTTCC----AT-CCGTTT---TT-GT-CTTTG----TAACTT-GCAT-ATTATCTTTGTCATTAT-TTCAAATTCAAATCATATAGC--ACGA-GCA-TTCACAACTG--GCGCGAC--TAGT--AAGTCAGACAGGGGATGCTTACTC-CTTGGCAACAGT-T-----G----AGTT----CT----A---C-T-GA----CTT-G---GGGT-TCAT-CTGGGGGTC--CATCAATG--TT-CCCAG-TGTTTAACTCCATG--TG-A----------A---------------T-----G----------T----------CG-GG--A--------T--GTTACTCA-TT-TACATCC-A-CACA-T-GTAA-T-TTT-AGA-AATGCA-ATAAA-A---A-TCT-ACTT-TT--A--TG-TTTGCAT--TTA-------T------CA--T-----A-----T----ACT---T--C------------------------T-----TA----------------TA----TG----A-TTT---GT--C-----------C-------TA----T-CTGCAA-TGCGT-GTCTG---T---TA---NG-GAA-AA--AA---C---------------ATT-TC--G---TAG---T--AC-----TC--GAT-GC----TGTTA-TTAAAAA-GTCT------TAATT-GTGCCAGAGAC-ATA-----T-ATATAACATG--TTA-T--AT--AT------------GTCTCT-G---ATTGT-G---CTTTGTGGT-G-G----GACA-CCAACTT----T-TTT------AC----------T-CA--AAGCAT-----------A-T---------------T-ATGGGAC-ACA--AACGTTTTCTTAAAGATG-TTTG-C-ATGGGA-CACATACTTT--TTTTAACATTGA--ATTTTCAAA----TGC-AC-CGGTC-CCAC-CC--CG-GTGAGA-AA------T-ATT-G-C-ATGGT
Reference ( family-1488 ) : TCACC-GG---GGTGGGACCAGTGCA------AAAC-ACGATGGGA-CAC-------A-AACTTT-TTTTTA-----TGACAACA-GGACATGGGAC-AATGATTTTT-T-G-TGTGGA-TA-ATTTGG-ATGGGA-CATCTATTTT-TT-CATTGACAAA--AATGCAAAGA----TTTTC--CCCCNA-TTGA-TTTGAAGAGAA--T--GATTTACAGGAAAG--AACAAGATATTCAGCAA-ATTGT-ATCCCTAAGCAAGTGTTCC----AT-CCGTTT---TT-GT-CTTTG----TAACTT-GCAT-ATTATCTTTGTCATTAT-TTCAAATTCAAATCATATAGC--ACGA-GCA-TTCACAACTG--GCGCGAC--TAGT--AAGTCAGACAGGGGATGCTTACTC-CTTGGCAA-----T-----G----AGTT----CT----A---C---GA----CTT-G---GGGT-TCAT-CTGGGGGTC--CATCAATG--TT-CCCAG-TGTTTAACTCCATG--TG-A----------A---------------T-----G----------T----------CA-GG--A--------T--GTTACTCA-TT-TACATCC-A-CACA-T-GTAA-T-TTT-AGA-AATGCA-ATAAA-A---A-TCT-ACTT-TT--A--TG-TTTGCAT--TTA-------T------CA--T-----A-----T----ACT---T--C------------------------T-----TA----------------TA----CG----A-TTT---GT--C-----------C-------TA----T-CTGCAA-TGCGT-GTCTG---T---TA---GG-GAA-AA--AA---C---------------ATT-TC--G---TAG---T--AN-----T---G---GC----TGTTA-TTAAAAA-GTCT------TAATT-GTGCCAGAGAC-ATA-----T-ATATAACATG--TTA-T--AC--AT------------GTCTCT-G---ATTGT-G---CTTTGTGGT-G-G----GACA-CCAACNT----T-TTT------AC----------T-CA--AAGCAT-----------A-T---------------T-ATGGGAC-ACA--AACGTTTTCTTAAAGATG-TTTG-C-ATGGGA-CACATACTTT--TTTTAACATTGA--ATTTTCAAA----TGC-AC-CGGTC-CCAC-CC--CG-GTGAGA-AA------T-ATT-G-C-ATGGT
gi|1 : TCAC--AG---GGTGGGAACA-TGCATAAAAAAAACCAC-ATGGGAACACTTTTCTTACAACCTT-TTTT-A-----T-ACAAC--GGATA-GGGATTAAAGATTTTT-T-GGTGTGGAATA-ATTTGGTATGG-A-CAT-TAACTT-AT-AATT-ACAAA--A--GCAAAGA----TTT----CCCTGA-TTGA-TTTGAAGGAAAATT--GATTT-C-GAAAAG--AATAAGATACT-AGCAAGATTGT-TTCCCCTACAAAGTGGTCCAAAAAT-CTGTTT---TT-GT--TTAGTCCCTAACTT-GCATCAT--TCTTTGTCATT--------ATTCAAATCATATAGC--ACGATGCA-TTCACAACTGGTGCACAAC--TA-T--AA-TCAGACAGGGG-TGTCTATTCTTTTGGCAA-----TAGTTGA----AGTTC---CT----T---C---GA----CTTAG---GGGT-TCAT-CT--GGGTCCGCATCAATG--------------TCAACTCAATG--TG-A----------ATGCGATC--------T-----G----------T----------CA-GAT-A--------T--GTTAGTC---C-TACAT-T-A-CTAA-T-GTA----TTT-AGA-AATGCATATAAAGA---A-TCTAACTT-GT--ATTTG-TTTGCATAATCA-------TATAAAACA--T-----A-----TTTACACT---T--C------------------------T-----TA----------------AA----TA----A-TTTAAGGTTAC-----------T-------TACTTTT-TTTCAA-T---T-ATTTG---TC--T---------------AC---C---------------ATT-TC--A---TAGGCAT--AC-----T---T---GA----TGCTG-TAAAAAG-GTCT------TAACTGGTGCAAAA------A-----T-AACTTACATG--TTA-T--AT--ATACCGCGCGATTGGTGTCT-G---ATTAT-----CTTTGTGGT-GTG----GA
gi|1 : agtgaccagcaatattcactattACA-TCAATTT----T-TTA------AC----------TTCA--AATCAT-----------A-T---------------A-ATGG-AC-AAATCAACGTTTTCTTAA-GAT--TTTG-C-ATGGGA-CA--TACTTT--TTG-AACAAAGA--ATTTTCAAA----TGCAAC-CAGTC-CC-T-AC--CG-GTGAGA-AA------T-A-T-G-C-ATGGTtcaagaaattagacaatataataaaaattataacatcaattttttaacttcaaatcatataatggacaaatcaacgttttcttaagattttgcatgggacatactttttgaacaaagaattttcaaatgcaaccagtccctaccggtgagaaatatgcatggtcccat
gi|10 : agtgaccagcaatattcactatttcacagggtgggaacatgcataaaaaaaaccacatgggaacacttttcttacaaccttttttatacaacggatagggattaaagattttttggtgtggaataatttggtatggacattaacttataattacaaaagcaaagatttccctgattgatttgaaggaaaattgatttcgaaaagaataagatactagcaagattgtttcccctacaaagtggtccaaaaatctgtttttgtttagtccctaacttgcatcattctttgtcattattcaaatcatatagcacgatgcattcacaactggtgcacaactataatcagacaggggtgtctattcttttggcaatagttgaagttccttcgacttaggggttcatctgggtccgcatcaatgtcaactcaatgtgaatgcgatctgtcagatatgttagtcctacattactaatgtatttagaaatgcatataaagaatctaacttgtatttgtttgcataatcatataaaacatatttacacttcttaaataatttaaggttacttactttttttcaattatttgtctaccatttcataggcatacttgatgctgtaaaaaggtcttaactggtgcaaaaataacttacatgttatatataccgcgcgattggtgtctgattatctttgtggtgtggatcaagaaattagacaatataataaaaattataCATG--TG-A----------A---------------T-----GCGATTCTCTGT----------CA-GG--A--------TACGTTA---A-TT-TACATCC-A-CACA-T-GTAA-T-TTT-AGA-AATACC-ATAAA-A---G-TCT-ACTT-TT--A--TG-CT---A-----A-------T------TG--T-----A-----C----ACT---T--C------------------------T-----TAACCTTTATT-------TAAGGATG----ACTTT---GT--C-----------TAGTTTTGTC----T-CTGCAA-TGCAT-GTCTA---T---TA---TG-GAA-AA--AC---C---------------ATT-TC--A---GAG---T--AC-----TC--GAT-GC----TGTTA-TTAAAAA-GTCT------TAATT-GTGCCAGATAC-ATA-----T-ATAC--CATT--TTA-T--GT--TT------------GTATCT-G---ATTGT-G---CTTTCTGGT-G-G----GACA-CCAACTT----T-TTTCTTTTTAC----------T-CATAAAGCAT-----------A-T-----------------ATGGGAC-ACA--AACTTTTTCTTAAAGATG-TTTG-C-AAGGGA-CACATACTTT--TTTTAACATTGA--ATTTTCAAA----TGT-AC-CGGTC-CCAC-CC--CG-GAGAGA-AA------T-ATT-G-C-ATGGTcccat
gi|11 : TGCTTACTC-CTTGGCAA-----T-----GGTTGAGTT----CT----A---CCTCGA----CTT-G---GTGT-TCCT-CTGGCGGCC--TATCAATG--TT-CTCAG-TGTTTAACTCCATG--TG-ATGCG------ATTCTT----------T-----G----------T----------CA-AG--ATT------T--GTTACTAA-TT-TACATCC-A-CAC--------------------ATGCG-ATGAA-A---A-TCT-ACTT-TT--A--TG-TTTCTAT--TTT-------T------TATTT-----AAGGATT----ACT---TTGC------------------------C-----TA----------------------------A-TCTTA-GT--------------C-------TA----T-GTGCAC-TGCGT-G-ATGGAAC---TG---AA-AAA-AA--AACC-C---------------ATT-TC--A---TAG---T--AC-----T---GGATGT----TGTTA-TTAGAAA-GTCTTACATGTAATT-GTGCCAGATAC---A-----T-ATATGACATacct
gi|12 : GTC-CCAC-CC--TG-GTGAGA-AA------A-ATT-G-C-ATGGTc
gi|12 : gatC-AGGGTGGGA-CAC-------A-AACTTT-TTT--A-----TGACAACA-AGACATGGGAC-GATGAGTTTC-T-G-TGTGGA-TA-ATATGG-ATTGAA-CATCTATTTT-TT-C-TT------------CA---------TTGC--CCCCCA-TTGC-TTTGAAGAGAA--T--GATTTACAAGAAAGTGAACAAGATGTTCAGCAA-ATTGT-ATCCCTAAGCAAGTGTCCC----AT-CCGTTT---TTTGT-CTTTG----TAACTT-GCAT-AT---CTTTGTCATTAT-TTCAAATTCAAATCATATAGC--ACGA-GCA-TTCCCAACTG--acaaacttttttatgacaacaagacatgggacgatgagtttctgtgtggataatatggattgaacatctattttttcttcattgccccccattgctttgaagagaatgatttacaagaaagtgaacaagatgttcagcaaattgtatccctaagcaagtgtcccatccgttttttgtctttgtaacttgcatatctttgtcattatttcaaattcaaatcatatagcacgagcattcccaactg
gi|13 : gataccatgcaatttttctcac-TGCTT-GTCTG---T---TA---TG-GAATAA--AC---C---------------ATT-TC--A---TAG---T--AC-----TC--GAT-GT----TGTTA-TCAAAAA-GTCT------TAATT-GTGCCAGAGAC-ATACAGTGT-ATATAACATG--CTG-T--GC--AT------------GTCTCT-G---ATTGA-G---CTTTGTGTT-G-G-----ACA-CCAACTT----T-TTT------AC----------T-CA--AAGCAT-----------A-C-----------------ATGGGAC-AAA--AACGTTTTCTTAAAGATG-TTTG-C-ATGGGA-CATATAC---------------------------------GC-AC-CGGTC-CCA--CC--CG-GTGAGA-AA------T-ATT-G-
gi|14 : atcacgtcttcatatctcacgcatgcattaattatTTATC-GGCCTGGTGGGACCAGTGCA------ACAC-TCGATGGGA-CAC-------A-AATCTT-TTTTTAGCAAATGCCAACATGGTCATGGGA--AATGAGTTTT-T-G-TGTG---------TGG-ATAT---CATTTATTTTCTT-CATTGACGAA--AATGCA--GA----TTTTC--CCA-AA-TTGA-TTTGAAGAGAA--T--GATTTATAGGAAAGTGAACACGATATTCCGCAA-ATTGT-ATCCC-AAACAAGCGTTCC----AT-CCGTTT---TT-GT-CTTTG----TAACTT-GCA----TATCTTTGCCATTAT-TTCAAAT
gi|15 : a-TTT---GT--C-------------------TA----T-CTGCAA-TGCGT-GTCTG---T---TA---CGCGAA-AA--AA---C---------------ATT-TC--A---TAG---T--ACACACAT---AT--GC----TGTTA-TCAAAAA-GTCT------TAATT-GTGC-AGAGAC-A-G-----T-A-ATAACATG--TTA-T--AGTAAT------------GTCTCT-G---ACTTTCG---CTTTG--GTAG-G----GAC--CCAACTT----T-TTT------AC----------T-CA--AGATAT-----------A-T---------------G-A--AGAC-ACA--AACGTTTTCTTAAAGATG-TTTG-C-ATGGGA--ACATAC-------------------ATTTTC-AA----TGC-AA-CGGT--CCAC-CC--CA-GTGAG--AA------T-ATT-GCC-ATGGT
gi|16 : tctaat-TGTGAA----ATTTGG-ATGGGAGCATCTATTTT----CATTGACAGA--AATGCACAGACCCCCCCCC--CCCCCA-TTGA-TTTAGAGGAAA--T--G----------AAG--AAC---GTATTCAGCAA-ATTGT-ATCCGT-AGAAAGTGTTCC----ATAGCATTT------------------CA-------AT-ATT-------TCA--AA-TTCAAATT---AT-ATATAGC--ACGA-GCA-TTCAC-ACTGA-GTGCGAC--TAGT--AAGTCAGACA-GGGATGCTTACTccc
gi|17 : tgtgt-T-G-TGTGAA-TG-ATTTGG-GTGGGA-TATCTATTTT-TT-CATTGAGACA--AATGCAACCC----CCCCC--CCCCCAATTGAGTTTCAAGAGAA--TATGATTTATAGGAAAG------------TGAACAA-ATTGT-ATCCCTAAGCAAGTGTTCC----AT-CCGTTT---TT-GC-CTTTG----TAACTT-GCA----TATCTTTATCATTAT-TTCAAATTCAAATCATATA
gi|18 : tg----TGC-AC-TGGTA-CCAT-CA--CG-GTGATA-AA------T-ATC-G-C-ATGGT
gi|18 : TCACC-GT---GATGGTACCAGTGCA------AAAC-ACGATGGGA-CAC-------A-AAC-AT-TTTTTA-----TGACAACA-GGACATGAGAC-AATGATTTTTGT-A-TGTGGA-TA-ATTTGG-ATGGGA-CATCTATTTT-TT-CATTGACAAA--AATACAATGA----TTTTT--CCC--A-TTAA-TTTTGAGAGAA--T--GATTaaacacgatgggacacaaacattttttatgacaacaggacatgagacaatgatttttgtatgtggataatttggatgggacatctattttttcattgacaaaaatacaatgatttttcccattaattttgagagaatgattc
gi|19 : accatgcgatattta--AT--AT------------ATCTC--G---GTTGT-G---CATTGTGGT-G-G----GACGGCCAACTT----T-TTT------AC----------T-CA--TAGCATTGTTTCGTAACA-TGTATA----------T-ATGAGACAACAC-AACG-TTTCTT-AAGAT--TTTG-C-AT------------TTTGGTTTTGA-----A--ATTTTCAAA----TGCTACACGGCC-CCGC-CC--CG-GT--AA-AA------T-ATTGG-CAATGGTc
gi|2 : TCACCTGG---GGTGGGACCGGTGCA------AAAC-ACGATGGGA-CAC-------A-AACTTT-TTTTTA-----TGACAACA-GGGCATGGAAC-AATGATTTTT-T-A-TGTGAA-TA-ATTTGG-ATGGGA-CATCTATTTT-TT-CAATGATAAA--AATGCAAAGA----TTTTTGTCCCATA-TTGA-TTTCAAGAGAA--T--GATTTACAGGAAAG--AACAAGATATTCAGCAA-ATTGT-ATCCCTAAGCAAGTCTTCC----AT-CTGTTT---TT-CC-CTTGG----TAACTT-GTAT-ATTATCTTTGTCATTAT-TTCAAATTCAAATCATATAGC--ACAA-GCA-TTCACTACTG--GTGCGAC--TAGT--AAGACAGACAGAAGATGCTTACTC-C------------------G----AGTT----CT----A---T---GA----CTT-A---GGGC-TCAT-CTGAGGGTT--CATC----------------GTTTAACTCCATA--TG-A----------A---------------T-----G----------T----------CA-TG--A--------T--GTTACTCA-TT-TACATTC-A-CACA-T-GTAA-T-TTT-AGA-AATGCT-ATAAA-A---T-TCT-ACTT-TC--A--TG-TTTGCAT--TTA-------T------CA--T-----G-----T----ACT---T--C------------------------T-----TA-----------------A----CG----A-TTT---GT----------------------TA----T-CAGC-A-TGCGT-GTCTG-------TA---GG-GAA-AA--AA---C---------------ATTGTC--G---C-G---T--AA-----T---A---GT----TCTTATTTAAAAA-GTCT------TGATT-GTGTCAGGGAC-ATA-----T-ATATAACATG--TTA-TAGAT--AT------------GTCTCT-A---ATTGT-G---CTTTGTGGT-G-G----GACA-CCAACAT----T-TTT------AC----------T-CA--AAGCAT-----------ATT---------------T-ATGGGAC-ACA--AACATCTTCTTAAAGATG-TTTG-C-ATGGGA-CACATACTTT--TTTTAACATTGA--ATTTTCAAA----TGC-AC-CGGTC-CCAC-CC--CG-GTGAGA-AA------T-ATT-G-C-ATGGTccct
gi|20 : ----TGC-AC-TGGTC-CCAC-CC--CG-GTGATA-AA------C-ATT-G-C-ATCGT
gi|20 : gTCACC-GG---GGTGGGACCAGTGCA------AAAC-ACGATGGGA-CAC-------A-AAC--T-TTTTAA-----TGACAACA-GGCAATGGG-C-AATGACTTGT-T-G-TGTAGA-TA-AATTGG-ACGGGA-CATTTATTTaaacacgatgggacacaaactttttaatgacaacaggcaatgggcaatgacttgttgtgtagataaattggacgggacatttattt
gi|21 : gacgatgcaatgttta--AAGCAT-----------A-T-----------------ATGGGTC-ACA--AAAGTTTTCTGCAAGATG-TTTG-C-ATGGGA-CACATACTTT--TTTTAACATTGA--ATTTTCAAA----TGC-AC-CGGTC-CCAT-CC--CG-GTGAGA-AA------T-ATT-G-C-ATGGT
gi|22 : tAACA-GGACATGGGAC-AATGATTTTT-TTG-TGTAGA-TA-ATCTGG-ATGGGA-CTTCTATTTT-TT--ATTGACAAA--AATGCAAAGA----TTTTC--CTC--A-TTGG-TTTGAAGAGAA--T--GATTTACAGGctct
gi|23 : GGAC-ACT--ACC-TGTTCTTAAAGATC-TTTT-TTGTGGGAACACATACTTTA-TTTTGAAATT-A--ATTTT-AAA------C-AC-CG-TC-CCAC-CC--C--GTGATAGAA------T-ATT-G-C-ATGGT
gi|24 : tTGGGAC-ACA--AACGTTTTCTTAAAGATG-TTCG-C-ATGGGA-CACATACTTT--TGTT----TGGA--ATTTTCAAA----TGC-AC-CGGCC-CCAC-CC--CG-GTGAAA-AA------T-AGT-G-C-ATGGTccctt
gi|25 : TG--TTA-T--AT--AT-------------TCTCT-G---GTTGT-G---CATTGTGGT-G-G----GACG-CCAACTT----T-TTT------AC----------T-CA--TAGCAT-----------A-TGTTTGTACATGTATAT-ATGAGAC-ACA--AACGTTTTCTTAAAGAccc
gi|26 : AA-A---A-TCT-ACTT-TTT-A--TG-TTTACAT--TTT-------T------CA--T-----A-----T----A
gi|27 : -CA--AAGCAT-----------A-T---------------TTATGGGAC-ACA--AACATGTTCTTAAAGATG-ATTG-C-ATGGGA-CACGCACTTT--TTTTAACACTAA--ATTTTCAAA----TGC-AC-CGGTC-CCAC-CC--Caaactaattaacacttctcaacttttatataaggattactccgtctaatttttgtctatctgcaatgc
gi|28 : -----T----ACT---T--T------------------------G-----TC----------------TA----AT----G-TTT---GT--C-------------------TA----TTCTGCAA-TGCGT-GTCTG---T---TA---TG-AAA-AA--AA---
gi|29 : ttatcatataaaactaattaacacttctcagcctttatttaaggatAAAAA-G-TTTG-C-ATGGGA-TAAATACATT--TTTAAACATTGAC-ATTTTCAAA----TGC-AC-CGGTC-CCCC-AT--TGCGTGAGA-AA------TGATT-G-a
gi|3 : ATATTC-GCGG-AATGTCATCCCTAA---AATGTTTT-----T-CCGTATAAATT-GTATTTTG----TAACATAGCAT-AT---CTCTGTCAATATATTTAAATTCAAATCACACCACCTACGA-GCACTTCACAAATG--TTGC------AG--------GGACAGGGGATGCTTATCC-CTTGGCAAAACATT-----GGGA-AGTT----CT----ATCTC---GATGTGTTT-G---GGGT-TCATGCTGGGGGTC--CATCAGTG--TT--CCAG-TTGTTAACTCCATG--TG-A----------ATAGGCGATTTTACCTT-----G----------T----------CG-AT--ACATTGTAGT--GTTAATCA-TT-GACATCC-A-CACA-A-GTGACT-TTT-CGATATTGCA-ATAAA-A---A-TCG-ACCT-TT--ACTTT-CTTGTAT--TTA-------T------CAT-T-----A-----T----AAT---TAAT------------------------T-----TA----------------TA----tgccattgtcccta
gi|3 : atT--TTA-------T------CA--C-----AGTAATT----ACT---T--T------------------------A-----TA----------------TG----GG----T-TTT---GTGGC-----------T-------TA----C-TGGCAA-TGCATTGTCTG---T---TA---TA-GAA-AAACAA---CG--------------AGT-TC--A---TAG---T--AT-----C---GAT-GC----TTCAA-TTTAAAA-GTCT------TAA-A-GTGTC-----C-A------------------G--TTA-T--AT--AT------------GTCTCTGG---ATTAT-G---CCTTGTGGT---G----GACA-C--ATTT----TGTTT------AC----------gctttttaaactttatcacagtaattactttatatgggttttgtggcttactggcaatgcattgtctgttatagaaaaacaacgagttcatagtatcgatgcttcaatttaaaagtcttaaagtgtccagttatatatgtctctggattatgccttgtggtggacacattttgtttacca
gi|30 : atatattcgcggaatgtcatccctaaaatgtttttccgtataaattgtattttgtaacatagcatatctctgtcaatatatttaaattcaaatcacaccacctacgagcacttcacaaatgttgcagggacaggggatgcttatcccttggcaaaacattgggaagttctatctcgatgtgtttggggttcatgctgggggtccatcagtgttccagttgttaactccatgtgaataggcgattttaccttgtcgatacattgtagtgttaatcattgacatccacacaagtgacttttcgatattgcaataaaaatcgacctttactttcttgtatttatcattataattaatttatagctttttaaacA--AC---C---------------ATT-TCTAGATCTAG---T--AT-----C---GAT-GC----TGTTG-TTAAAAC-GTCT------TAATT-GTACC--AGAC-ATA-----T-ATca
gi|31 : gtattaagtatttgttcggactctTTCTTAA-GATG-TTTGAC-AAGAGA-CACATACTTT--TTTAAACGATGAGCATTTTCAAA----TGT-AC---GCCATCAC-TTTACT-GTGAGA-A
gi|32 : aTTGGCAACAGC-T-----G----AGTT----CT----A---CCTCGA----CTT-A---GGGT-TCAT-CTGGGAGTC--TATCAATG--TT-CCCAG-TGTTTAACTCAACG--TG-A----------A---------------T-----G----------
gi|33 : -GG---GTTGGGACCGGTGCC------AAAT-GTAATAGGA-CAC-------A-CACTTA-TTGATA-----AGACA
gi|34 : ttagggactggtcaatatttattgggG-C-ATGGGA-CATACA-TTT--TTTCAA---TGT--ATATCTAAAAGTTTGC-AT-CTGTC-CCAT-TC--CG-GTGATA-AA------T-ATT-G-c
gi|35 : A--AAGCAT-----------A-T---------------T--TTGGAC-ATA--TACGTTTT-TAAAAGATGCTTTC-C-TTGGGA-CACATGCTTA--TTTAAACATTGA--ATTacca
gi|36 : t----TGC-AC-TGGTC-CCAC-CG--CG-GTGAT--AA------T-ATT-G-T-ATG
gi|36 : tTCACC-GC---GGTGGGACCAGTGCA------AAAC-ACGATGGG---AC-------A-GAC--T-TTTTTA-----TGACAATA-GGACAaaacacgatgggacagacttttttatgacaataggaca
gi|37 : tcatacaatatta---------------T-----G----------T----------CG-GG--A--------TATGTCACTAA-TT-TACATCC-A-CACA-T-GTAA-T-TCT-AAA-AATGCA-AT
gi|38 : tgaatgcgattctcCAC-CC--CG-GTGATA-AA------C-ATC-C-C-ATGGTtttca
gi|38 : gggTCACC-GG---GGTG---------CA------AAAC-ACTATGGGA-CAC-------A-AACTTTATTTTTA-----TGACAACA-caaaacactatgggacacaaactttatttttatgacaaca
gi|39 : gggaccatgggatgttta----------A---------------T-----G----------T----------CGCGG--A--------TTGGTCACTAAATT-TACATCC-A-CACATT-GTAA-TCTTT-AGA-AATGCA-A
gi|4 : gcgaatgctc----TGC-AC-TTGTC-CAAC-CC--TG-GTGATA-AA------T-ATT-G-C-ATGGTat
gi|4 : ggTCACC-AG---GGTTGGACAAGTGCA------AAAC-ACTATGGGA-CAC-------A-AACGGT-TTTTTA-----TGAAAACA-GGACATGGGCT-AATGATTTTT---G-TAGGTA-TAGATTTG--ATGGGA-CATCTATTTT-TT-CATTAACAAATAAATGCAAAGA----GTTTT--CCC--A-TTGA-TTTGAAGAGAA--T--GATTTACAGTA------------TATTCAGCAA-AGTGT-ATCCCTA-GCA--TGTTCC----AT-TCGTTT---AA-GT-CTTTG----TAACTT-GTAG-AT-AT--TTGTCATTAT-TTCAAATCCAAATCATATAAC--ATGA-GCA-TACACAACTA--TCCCAAC--GAGT--AAGTCAGAAAGGGGATACTTACTC-CTTCGCAACAGT-T-----G----CGAT----CT----A---C---------CTT-G----------AT--TGGGACTC--CAT--ATGAATT-C------GATT--CTCC-----------------------------------------C----------T----------CA-GGACA--------T--CTTACTCA-TT-TACATCC-A-CATA-T-GTAA-T-TTT-AGA-AATGCA-ATAAA-A---A-TCT-ACTGATT--A--TG-TTTGCAT--TTA-------T------CA--TTATAAA-----C----ACT---T--T------------------------T-----CAACATTTATTTAAGGGTTA----C-------TTT---GT--CTAATGTTTTGTC-------TA----T-CTGCAA-TGCGT-aaacactatgggacacaaacggttttttatgaaaacaggacatgggctaatgatttttgtaggtatagatttgatgggacatctattttttcattaacaaataaatgcaaagagttttcccattgatttgaagagaatgatttacagtatattcagcaaagtgtatccctagcatgttccattcgtttaagtctttgtaacttgtagatatttgtcattatttcaaatccaaatcatataacatgagcatacacaactatcccaacgagtaagtcagaaaggggatacttactccttcgcaacagttgcgatctaccttgattgggactccatatgaattcgattctccctcaggacatcttactcatttacatccacatatgtaattttagaaatgcaataaaaatctactgattatgtttgcatttatcattataaacacttttcaacatttatttaagggttactttgtctaatgttttgtctatctgcaatgcgt
gi|40 : ggaccatgcaatatttaTGTGGT-G-G----GACA-CCAACTA----T-TTT------AC----------T-CA--AA-CAT-----------A-TA--------------T-ATGGGGC-ACA--
gi|41 : TGTGGT-G-G----GACA-CCAACTA----T-TTT------AC----------T-CA--AA-CAT-----------A-TA--------------T-ATGGGGC-ACA--tgatgttataccggtaag
gi|42 : GTGCA------AAGC-ATGATGGGA-CAG-------A-CA-TAT-TTTTAA-----TGACAGCA-GGACATGGGAC-AACGATTTTT-tgatgttataccggtaag
gi|43 : TAG-T-TTT-AGA-AATGCT-ATAAA-A---A-TCT-ACTT-TT--A--TG-TTTGCAT--TTA-------T------a
gi|44 : tttactcacagtatttc---C---GA----CT--A---GGGT-TCAT-CTGGGG-TC--CATCAATG--TTCCCCAGTTGTTTAACTTCA
gi|45 : ctgcctA----TGC-AC-CGGTC-CCAC-CC--CG-GTGAGA-AATACATGT-ATT-G-C-ATGGTac
gi|46 : ACATTGA--ATTT-CAAA----TGC-AC-CGGT--CCACTCC--CG-GTGAGA-AA--------ATT-ccct
gi|47 : G--AACAAGCTATTCAGCAA-ATTGT-ATCCTAAAGCAAGTGTTCC----AT-tcgt
gi|49 : -CC--CG-GTGATA-AA------T-ATT-G-C-ATGGTt
gi|5 : cggtATATAAC--ACGA-GCA-TTCACAACTG--GCACAAC--TAGT--AGGTCAGAAAGGGGATGTTTACTC-CTTGACAACAGT-T-----G----AGTT----TTTTTAA---CTT-GA----CTT-G---GGGT-TTAT-CTTGGGGTC--CATCAATG--TT-TCCAG-TGTTTAATGCCATG--TG-A----------ATGCGATTCTC-----T-----G----------T----------CA-GGATA--------T--GTTACTCA-TG-TACATCCAA-CACA-T-GTAA-T-TTT-AGA-AATGCA-AT-CA-A---A-TCT-AC-T-TT--A--TG-TTTGCAT--TTA-------T------CA--T-----A-----T----ccctaa
gi|5 : ggta-TTT---GTG-T-----------C-------TA----T-CTGCAA-TGCGT-GTCTG---T---TATGGGG-GAA-AA--AA---CCCAAAAACAAACAACATT-TC--G---TAG---TGTAT-----TCGAG---GC----TGTTA-TTAGAAA--------------TT--TGCCAGAGAC-A-A-----TAATGTAACATG--CTG-T--AC--AT------------GTCTCT-G----TTTT-A---A-TTGTGGT-G-ACTT-TACA-CTAACATATACT-TTT------AC----------taaaaactaatcaacacttcccaacccttaattttaagagattacatgtgtaattttgtgtctatctgcaatgcgtgtctgttatgggggaaaaaacccaaaaacaaacaacatttcgtagtgtattcgaggctgttattagaaatttgccagagacaataatgtaacatgctgtacatgtctctgttttaattgtggtgactttacactaacatatacttttacaaaattctaattaaagtctatctatcaaactgtaaatctttcatataaagtatgt
gi|6 : ggtaatataacacgagcattcacaactggcacaactagtaggtcagaaaggggatgtttactccttgacaacagttgagtttttttaacttgacttggggtttatcttggggtccatcaatgtttccagtgtttaatgccatgtgaatgcgattctctgtcaggatatgttactcatgtacatccaacacatgtaattttagaaatgcaatcaaatctactttatgtttgcatttatcatattaaaaactaatcaacacttcccaacccttaattttaagagattacatgtgtaatCTG--GCACAACACTAGTTTAGGTCAGA-AAGGGATTTTTACTC-CTTGACAACA---T-----T----ATTT----CT----T---T---AA----CTT-GACTGGGTCTTAT-CTTGGGGTC--CATCAATG--TC-TTCA--TGTTTAATGCCATGGATGCG----------A---------------TTCTCTG----------T----------CA-GG--A--------TATGTTACTCA-CTGTACATCC-AACACA-TTGTAA-T-TTTTAGA-AATGCA-ATCAA-ATTTACTTT-ATTT-TTGCA--TACTTTTCATA-TTAAAACTAAT------CA--------A-----C----ACT---T--CCCAACCTAATTTAAAGGATTCACAT-----TG----------------TG----TA----A-TTT---GTG-T-----------C-------TA----T-CT-CAACTGCGT-GTCTG---TATATG---GG-CAA-AA--AA---CCAAAACAAAACAAC-ATT-TC--G---TAG---T--GA-----T---AT--GCGAGGTG-TA-TTCAGA-------------AATT--TGCCAGAGACAATA-----G-ATGTACTATGCTTTGTT--AC--AT------------GTCTCT-GTTAATTGT-GTGACTTT-T------------ACA--CAACATAC--T-TTT------ACAAAATTCTAAT-TA--AATCAT-----------A-TC--------------T-AT----C-A-A--AACGTaaaattctaattaaagtctatctatcaaactgtaaatctttcatataaagtatgt
gi|7 : ----TGC-AC-TGGTC-CCAC-CC--CG-GTCATA-AA------T-ATT-G-C-ATGGTaaatctttcatataaagtatg
gi|7 : ggACC-GG---GGTGGGACCAGTGCA------AAAC-ACGATGGGA-CAC-------A-AACTTT-GTT--A-----TGACAATA-GAACATGGGAC-AATGATTTTTGT-G-TGTGGA-TA-ATTTGG-ATGGAA-CATCTTTTTT-TTTCATTGACAAA--AATGCAAAAAG---TTTTT--CCCC-----------GAAGAGAA--G--GGTTTACAAGAAAG---------TGATCAGCAA-ATTGT-TTCCCTA-GCAAGTGTTCC----AT-CCGTTT---TT-GT-CTTTG----TAACTT-GCAT-AT---CTTTGTCATTAT-TTCAAATTCAAATACTATAGC--GCGA-TCA-TTCACAACTG--GTGCGAC--TAGT--CAGTCAGACAGGCGATACTTGGTC-CTTGGCAACAGT-T-----G----GATT----CC----A---C---------CTA-G----------AT-TTGGGG-TC--CATCAGTG--TT-CCCAG-TGTTTAACTCCATG--TG-A----------A---------------T-----G----------TGATTCTCTGTCA-GG--A--------T--ATT--TCA-TA-TTCATCT-A-CA--------------------AATGCA-ACAAA-A---A-TCT-ACTT-aaacacgatgggacacaaactttgttatgacaatagaacatgggacaatgatttttgtgtgtggataatttggatggaacatctttttttttcattgacaaaaatgcaaaaagtttttccccgaagagaagggtttacaagaaagtgatcagcaaattgtttccctagcaagtgttccatccgtttttgtctttgtaacttgcatatctttgtcattatttcaaattcaaatactatagcgcgatcattcacaactggtgcgactagtcagtcagacaggcgatacttggtccttggcaacagttggattccacctagatttggggtccatcagtgttcccagtgtttaactccatgtgaatgtgattctctgtcaggatatttcatattcatctacaaatgcaacaaaaatctacttgtcatataaaactaag
gi|8 : ggaccatgcaatatttatgATATAAC--ACGA-GCA-TTCACAACTG--GCACAAC--TAGT--AGGTCAGAAAGGGGATGTTTACTC-CTTGACAACAGT-T-----G----AGTT----TTTTTAA---CTT-GA----CTT-G---GGGT-TTAT-CTTGGGGTC--CATCAATG--TT-TCCAG-TGTTTAATGCCATG--TG-A----------ATGCGATTCTC-----T-----G----------T----------CA-GGATA--------T--GTTACTCA-TG-TACATCC-A-CACA-T-GTAA-T-TTT-AGA-AATGCA-AT-CA-A---A-TCT-AC-T-TT--A--TG-TTTGCAT--TTA-------T------CA--T-----A-----T----Agtcatataaaactaag
gi|8 : ggta------------------------T-----TG----------------TG----TA----A-TTT---GTG-T-----------C-------TA----T-CTGCAA-TGCGT-GTCTG---T---TATGGGG-GAA-AA--AA---CCCAAAACAAACAAC-ATT-TC--G---TAG---TGTAT-----TCGAG---GC----TGTTA-TTAGAAA--------------TT--TGCCAGAGAC-A-A-----TAATGTAACATG--CTG-T--AC--AT------------GTCTCT-G----TTTT-A---A-TTGTGGT-G-ACTTTTACA-CTAACAT----aaactaatcaacacttcccaacccttaattttaaaggattacattgtgtaatttgtgtctatctgcaatgcgtgtctgttatgggggaaaaaacccaaaacaaacaacatttcgtagtgtattcgaggctgttattagaaatttgccagagacaataatgtaacatgctgtacatgtctctgttttaattgtggtgacttttacactaacat
gi|9 : ggtaatataacacgagcattcacaactggcacaactagtaggtcagaaaggggatgtttactccttgacaacagttgagtttttttaacttgacttggggtttatcttggggtccatcaatgtttccagtgtttaatgccatgtgaatgcgattctctgtcaggatatgttactcatgtacatccacacatgtaattttagaaatgcaatcaaatctactttatgtttgcatttatcatataaaactaatcaacacttcccaacccttaattttaaaggattacaTCACGACTG--GTGCGAC--TAGT--AAGT---------------TATTC-ATTGGCAA-----CAATA-G----AGTTATTTCT----A---CCTCGA----CTT-A---AGGT-TCAT-CTGGGGGTC--CATCAATG--TT-CCCAG-TGTTTAACTTCATG--TG-AATGCGATTCTA---------------T-----G----------T----------CG-GGATA--------T--GTTACTCA-TT-TATATCC-A-CACA-T-GTAA-T-TTT-AG-------------A-A---A-TCT-ACTTATC--A--TA---TACAT--GTAAAAC---T------AA--T-----G-----T----AATAAAT--C------------------------TACAAGTA----------------TA----TGTCTAA-TTT---TT--CT----------C-------TA----T-CTGCAT-TGCGT-GTCTT---T---TA---TG-AAA-AA--AAACCC---------------AGT-TC--A---TAG---T--AC-----TC--GAT-GC----TGTTA-TTAAAAAGGTCT------AAAT-------------------------------ATG---------AT--AT------------GTCTC--------TGT-G---CTTTGTGGT-G-G----GACA-CCAACTC----T-TTT------TC----------T-CA--AAGCAT-----------A-----------------T-AAGGAAC-ACA--ACAGTTATGGGAA---------G-C-ATGGGA-CACATAC---------------------TTTCAAA----AGC-AC-CGGTC-CCAC-CC--CG-GTGAGA-AA------T-ATT-G-C-GTGGT
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|48 ): ACCGGTCAATAATTATTGGGGGGTTGGGACCGGTGCATT
Unaligned ( gi|50 ): CCACCATATTAAGGGACTGGTCAATATTTATTG
Unaligned ( gi|51 ): GTTAGGGACTGGTCAATATTTATTGGGGGGTT
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 111111 1111111 1111111111111 222222222 2222222 111 44444444444 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 11 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 5555555555555555555555555555555555 1111111111 22222222222222222 111111111111 11111111 4444444444444444444444444444444 11111111111
lowQualScore : 4 777 000000 3 3 0000000 3 99 3 44 88888 3 4 7 4 3 1 3 3 3 2 3 4 4 55 11 7777777777777 777 4 55 55 777777777 4 4 0 8888 4 888888 44 9999 4 8888888 4 66 4 4 88 3 55 55 5 4 55 2 000 7777 33333333333 7777 3 555 3 3 0 0 44 44 666 33 44 3 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 3 3 6 3 3 2 2 2 2 2 2 3 66666 3 77777 6 99999 3 33 00 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 7777 3 3 3 6 1 3 8888888888888888888888888888888888 3 3 999999 555 99 7 555 3 6666 3 3 3 3333333333 77 0 1 22222222222222222 44 3 44 6 6 555555555555 3 9999 66666 4 2 2 555 3 44 3 77777777 3 888888 3 33 1 4444444444444444444444444444444 2 55 0 33 2 2 2 2 66 44444444444 4444 3 1 1 1 22 1 1 1 555555 1 1 1 2
lowQualScore : . ... ...... . . ....... . .. . .. ..... . . . . . . . . . . . . . .. .. ............. ... . .. .. ......... . . . .... . ...... .. .... . ....... . .. . . .. . .. .. . . .. . ... .... ........... .... . ... . . . . .. .. ... .. .. . ......................................................................... . . . . . . . . . . . . ..... . ..... . ..... . .. .. .............................................................................................................................................. .... . . . . . . .................................. . . ...... ... .. . ... . .... . . . .......... .. . . ................. .. . .. . . ............ . .... ..... . . . ... . .. . ........ . ...... . .. . ............................... . .. . .. . . . . .. ........... .... . . . . .. . . . ...... . . . .
lowQualScore : 0 000 555555 3 3 8888888 3 11 3 88 33333 3 0 3 0 6 2 6 6 6 0 6 0 0 55 55 1111111111111 111 0 55 55 999999999 0 0 8 5555 0 111111 66 4444 4 7777777 4 11 4 4 66 0 55 55 0 0 00 8 000 7777 88888888888 1111 3 888 3 3 4 4 66 66 777 88 66 3 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 1 1 2 1 1 9 9 9 9 9 3 1 44444 1 77777 2 33333 3 66 44 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 1111 3 1 1 7 0 3 4444444444444444444444444444444444 3 3 777777 888 22 2 888 3 5555 1 1 1 9999999999 88 4 5 77777777777777777 66 3 22 2 2 888888888888 1 1111 00000 8 9 9 444 1 22 1 77777777 1 888888 3 99 9 5555555555555555555555555555555 5 99 8 66 7 7 7 5 33 66666666666 0000 8 9 8 7 33 7 2 7 222222 8 8 9 2
consensus : TCACC-GG---GGTGGGACCAGTGCA------AAAC-ACGATGGGA-CAC-------A-AACTTT-TTTTTA-----TGACAACA-GGACATGGGAC-AATGATTTTT-T-G-TGTGGA-TA-ATTTGG-ATGGGA-CATCTATTTT-TT-CATTGACAAA--AATGCAAAGA-----TTTT---CCCCC--ATTGA-TTTGAAGAGAA--T--GATTTACAGGAAAG--AACAAGATATTCAGCAA-ATTGT-ATCCCTAAGCAAGTGTTCC----AT-CCGTTT---TT-GT-CTTTG----TAACTT-GCAT-ATTATCTTTGTCATTAT-TTCAAATTCAAATCATATAGC--ACGA-GCA-TTCACAACTG--GCGCGAC--TAGT--AAGTCAGACAGGGGATGCTTACTC-CTTGGC--AACAGTTG---AGTT----CT----A-C-C--GA----CTT-G---GGGT-TCAT-CTGGGGGTC--CATCAATG--TT-CCCAG-TGTTTAACTCCATG--TG-A----------A---------------T-----G----------T----------CG-GG--A--------T--GTTACTCA-TT-TACATCCA-CACA-T-GTAA-T-TTT-AGA-AATGCA-ATAAA-A---A-TCT-ACT-----T-TT--A--TG-TTTG-CAT--TTA--------T------CA--T-----A-----T----ACT---T-------C------------------------T-----TA---------TA----TG----A-------TTT---GT--C-----------C-------TA----T-CTGCAA-TGCGT-GTCTGT-TATG-G---------------AA-AA-----A--A-----C-ATT-TC--G---TAG---T--ACTCG---AT-GC----TGTTA-TTA-AAAA-GTCT------T---AATT-GTGCCAGAGAC-ATA-----T-ATATAACATG--TTA-T--A-TA-T------------GTCTCT-G---ATTGT-G---CTTTGTGGT-G-G---GACA-C--CA-ACTT--------T-TTT------ACT-CA--AAGCAT-----------A-T---------------T-ATGGGAC-ACA--AACGTTTTCTTAAAGATG-TTTG-C-ATGGGA-CACATACTTT--TTTTAACATTGA--ATTTTCAAA----TGC-AC-CGGTC-CCAC-CC--CG-GTGAGA-AA------T-ATT-G-C-ATGGT
Reference ( family-1488 ) : TCACC-GG---GGTGGGACCAGTGCA------AAAC-ACGATGGGA-CAC-------A-AACTTT-TTTTTA-----TGACAACA-GGACATGGGAC-AATGATTTTT-T-G-TGTGGA-TA-ATTTGG-ATGGGA-CATCTATTTT-TT-CATTGACAAA--AATGCAAAGA-----TTTT---CCCCC--ATTGA-TTTGAAGAGAA--T--GATTTACAGGAAAG--AACAAGATATTCAGCAA-ATTGT-ATCCCTAAGCAAGTGTTCC----AT-CCGTTT---TT-GT-CTTTG----TAACTT-GCAT-ATTATCTTTGTCATTAT-TTCAAATTCAAATCATATAGC--ACGA-GCA-TTCACAACTG--GCGCGAC--TAGT--AAGTCAGACAGGGGATGCTTACTC-CTTGGC--AACAGTTG---AGTT----CT----A-C-T--GA----CTT-G---GGGT-TCAT-CTGGGGGTC--CATCAATG--TT-CCCAG-TGTTTAACTCCATG--TG-A----------A---------------T-----G----------T----------CG-GG--A--------T--GTTACTCA-TT-TACATCCA-CACA-T-GTAA-T-TTT-AGA-AATGCA-ATAAA-A---A-TCT-ACT-----T-TT--A--TG-TTTG-CAT--TTA--------T------CA--T-----A-----T----ACT---T-------C------------------------T-----TA---------TA----TG----A-------TTT---GT--C-----------C-------TA----T-CTGCAA-TGCGT-GTCTGT-TANG-G---------------AA-AA-----A--A-----C-ATT-TC--G---TAG---T--ACTCG---AT-GC----TGTTA-TTA-AAAA-GTCT------T---AATT-GTGCCAGAGAC-ATA-----T-ATATAACATG--TTA-T--A-TA-T------------GTCTCT-G---ATTGT-G---CTTTGTGGT-G-G---GACA-C--CA-ACTT--------T-TTT------ACT-CA--AAGCAT-----------A-T---------------T-ATGGGAC-ACA--AACGTTTTCTTAAAGATG-TTTG-C-ATGGGA-CACATACTTT--TTTTAACATTGA--ATTTTCAAA----TGC-AC-CGGTC-CCAC-CC--CG-GTGAGA-AA------T-ATT-G-C-ATGGT
gi|1 : TCAC--AG---GGTGGGAACA-TGCATAAAAAAAACCAC-ATGGGAACACTTTTCTTACAACCTT-TTTT-A-----T-ACAAC--GGATA-GGGATTAAAGATTTTT-T-GGTGTGGAATA-ATTTGGTATGG-A-CAT-TAACTT-AT-AATT-ACAAA--A--GCAAAGA-----TTT----CCCTG--ATTGA-TTTGAAGGAAAATT--GATTT-C-GAAAAG--AATAAGATACT-AGCAAGATTGT-TTCCCCTACAAAGTGGTCCAAAAAT-CTGTTT---TT-GT--TTAGTCCCTAACTT-GCATCAT--TCTTTGTCATT--------ATTCAAATCATATAGC--ACGATGCA-TTCACAACTGGTGCACAAC--TA-T--AA-TCAGACAGGGG-TGTCTATTCTTTTGGC--AATAGTTGA--AGTT----CC----T-T-C--GA----CTTAG---GGGT-TCAT-CT--GGGTCCGCATCAATG--------------TCAACTCAATG--TG-A----------ATGCGATC--------T-----G----------T----------CA-GAT-A--------T--GTTAGTC---C-TACAT-TA-CTAA-T-GTA----TTT-AGA-AATGCATATAAAGA---A-TCTAACT-----T-GT--ATTTG-TTTG-CATAATCA--------TATAAAACA--T-----A-----TTTACACT---T-------C------------------------T-----TA---------AA----TA----A-------TTTAAGGTTAC-----------T-------TACTTTT-TTTCAA-T---T-ATTTGTCTAC-------------------------------------C-ATT-TC--A---TAGGCAT--ACTTG---AT-GC----TG-TA---A-AAAG-GTCT------T---AACTGGTGCAAAA------A-----T-AACTTACATG--TTA-T--A-TA-TACCGCGCGATTGGTGTCT-G---ATTAT-----CTTTGTGGT-GTG---GA
gi|1 : agtgaccagcaatattcactattACA-T--CA-ATTT--------T-TTA------ACTTCA--AATCAT-----------A-T---------------A-ATGG-AC-AAATCAACGTTTTCTTAA-GAT--TTTG-C-ATGGGA-CA--TACTTT--TTG-AACAAAGA--ATTTTCAAA----TGCAAC-CAGTC-CC-T-AC--CG-GTGAGA-AA------T-A-T-G-C-ATGGTtcaagaaattagacaatataataaaaattataacatcaattttttaacttcaaatcatataatggacaaatcaacgttttcttaagattttgcatgggacatactttttgaacaaagaattttcaaatgcaaccagtccctaccggtgagaaatatgcatggtcccat
gi|10 : agtgaccagcaatattcactatttcacagggtgggaacatgcataaaaaaaaccacatgggaacacttttcttacaaccttttttatacaacggatagggattaaagattttttggtgtggaataatttggtatggacattaacttataattacaaaagcaaagatttccctgattgatttgaaggaaaattgatttcgaaaagaataagatactagcaagattgtttcccctacaaagtggtccaaaaatctgtttttgtttagtccctaacttgcatcattctttgtcattattcaaatcatatagcacgatgcattcacaactggtgcacaactataatcagacaggggtgtctattcttttggcaatagttgaagttccttcgacttaggggttcatctgggtccgcatcaatgtcaactcaatgtgaatgcgatctgtcagatatgttagtcctacattactaatgtatttagaaatgcatataaagaatctaacttgtatttgtttgcataatcatataaaacatatttacacttcttaaataatttaaggttacttactttttttcaattatttgtctaccatttcataggcatacttgatgctgtaaaaaggtcttaactggtgcaaaaataacttacatgttatatataccgcgcgattggtgtctgattatctttgtggtgtggatcaagaaattagacaatataataaaaattataCATG--TG-A----------A---------------T-----GCGATTCTCTGT----------CA-GG--A--------TACGTTA---A-TT-TACATCCA-CACA-T-GTAA-T-TTT-AGA-AATACC-ATAAA-A---G-TCT-ACT-----T-TT--A--TG-CT----A-----A--------T------TG--T-----A-----C----ACT---T-------C------------------------T-----TAACCTTTATTTAAGGATG----AC------TTT---GT--C-----------TAGTTTTGTC----T-CTGCAA-TGCAT-GTCTAT-TATG-G---------------AA-AA-----A--C-----C-ATT-TC--A---GAG---T--ACTCG---AT-GC----TGTTA-TTA-AAAA-GTCT------T---AATT-GTGCCAGATAC-ATA-----T-ATAC--CATT--TTA-T--G-TT-T------------GTATCT-G---ATTGT-G---CTTTCTGGT-G-G---GACA-C--CA-ACTT--------T-TTTCTTTTTACT-CATAAAGCAT-----------A-T-----------------ATGGGAC-ACA--AACTTTTTCTTAAAGATG-TTTG-C-AAGGGA-CACATACTTT--TTTTAACATTGA--ATTTTCAAA----TGT-AC-CGGTC-CCAC-CC--CG-GAGAGA-AA------T-ATT-G-C-ATGGTcccat
gi|11 : TGCTTACTC-CTTGGC--AATGGTTG---AGTT----CT----A-C-CTCGA----CTT-G---GTGT-TCCT-CTGGCGGCC--TATCAATG--TT-CTCAG-TGTTTAACTCCATG--TG-ATGCG------ATTCTT----------T-----G----------T----------CA-AG--ATT------T--GTTACTAA-TT-TACATCCA-CAC--------------------ATGCG-ATGAA-A---A-TCT-ACT-----T-TT--A--TG-TTTC-TAT--TTT--------T------TATTT-----AAGGATT----ACT---TTG-----C------------------------C-----TA----------A----T-------------CTT---AG--T-----------C-------TA----T-GTGCAC-TGCGT-G-ATGG-AACT-G---------------AA-AA-----A--AAAACCC-ATT-TC--A---TAG---T--ACTGG---AT-GT----TGTTA-TTA-GAAA-GTCTTACATGT---AATT-GTGCCAGATAC---A-----T-ATATGACATacct
gi|12 : GTC-CCAC-CC--TG-GTGAGA-AA------A-ATT-G-C-ATGGTc
gi|12 : gatC-AGGGTGGGA-CAC-------A-AACTTT-TTT--A-----TGACAACA-AGACATGGGAC-GATGAGTTTC-T-G-TGTGGA-TA-ATATGG-ATTGAA-CATCTATTTT-TT-C-TTCAT-------TGC-----------------CCCCC--ATTGC-TTTGAAGAGAA--T--GATTTACAAGAAAGTGAACAAGATGTTCAGCAA-ATTGT-ATCCCTAAGCAAGTGTCCC----AT-CCGTTT---TTTGT-CTTTG----TAACTT-GCAT-AT---CTTTGTCATTAT-TTCAAATTCAAATCATATAGC--ACGA-GCA-TTCCCAACTG--acaaacttttttatgacaacaagacatgggacgatgagtttctgtgtggataatatggattgaacatctattttttcttcattgccccccattgctttgaagagaatgatttacaagaaagtgaacaagatgttcagcaaattgtatccctaagcaagtgtcccatccgttttttgtctttgtaacttgcatatctttgtcattatttcaaattcaaatcatatagcacgagcattcccaactg
gi|13 : gataccatgcaatttttctcac-TGCTT-GTCTGT-TATG-G---------------AATAA-----A--C-----C-ATT-TC--A---TAG---T--ACTCG---AT-GT----TGTTA-TCA-AAAA-GTCT------T---AATT-GTGCCAGAGAC-ATACAGTGT-ATATAACATG--CTG-T--G-CA-T------------GTCTCT-G---ATTGA-G---CTTTGT-GT-T-G---GACA-C--CA-ACTT--------T-TTT------ACT-CA--AAGCAT-----------A-----------------C-ATGGGAC-AAA--AACGTTTTCTTAAAGATG-TTTG-C-ATGGGA-CATATAC---------------------------------GC-AC-CGGTC-CCA--CC--CG-GTGAGA-AA------T-ATT-G-
gi|14 : atcacgtcttcatatctcacgcatgcattaattatTTATC-GGCCTGGTGGGACCAGTGCA------ACAC-TCGATGGGA-CAC-------A-AATCTT-TTTTTAGCAAATGCCAACATGGTCATGGGA--AATGAGTTTT-T-G-TGTG---------TGG-ATAT---CATTTATTTTCTT-CATTGACGAA--AATGCA--GA-----TTTT---CCCAA--ATTGA-TTTGAAGAGAA--T--GATTTATAGGAAAGTGAACACGATATTCCGCAA-ATTGT-ATCCC-AAACAAGCGTTCC----AT-CCGTTT---TT-GT-CTTTG----TAACTT-GCA----TATCTTTGCCATTAT-TTCAAAT
gi|15 : a-------TTT---GT--C-------------------TA----T-CTGCAA-TGCGT-GTCTGT-TACGCG---------------AA-AA-----A--A-----C-ATT-TC--A---TAG---T--ACACACATAT-GC----TGTTA-TCA-AAAA-GTCT------T---AATT-GTGC-AGAGAC-A-G-----T-A-ATAACATG--TTA-T--AGTAAT------------GTCTCT-G---ACTTTCG---CTTTG--GTAG-G---GAC--C--CA-ACTT--------T-TTT------ACT-CA--AGATAT-----------A-T---------------G-A--AGAC-ACA--AACGTTTTCTTAAAGATG-TTTG-C-ATGGGA--ACATAC-------------------ATTTTC-AA----TGC-AA-CGGT--CCAC-CC--CA-GTGAG--AA------T-ATT-GCC-ATGGT
gi|16 : tctaat-TGTGAA----ATTTGG-ATGGGAGCATCTATTTT----CATTGACAGA--AATGCACAGACCCCCCCCC---CCCCC--ATTGA-TTTAGAGGAAA--T--G----------AAG--AAC---GTATTCAGCAA-ATTGT-ATCCGT-AGAAAGTGTTCC----ATAGCATTT------------------CA-------AT-ATT-------TCA--AA-TTCAAATT---AT-ATATAGC--ACGA-GCA-TTCAC-ACTGA-GTGCGAC--TAGT--AAGTCAGACA-GGGATGCTTACTccc
gi|17 : tgtgt-T-G-TGTGAA-TG-ATTTGG-GTGGGA-TATCTATTTT-TT-CATTGAGACA--AATGCAACCC-----CCCC---CCCCCCAATTGAGTTTCAAGAGAA--TATGATTTATAGGAAAG------------TGAACAA-ATTGT-ATCCCTAAGCAAGTGTTCC----AT-CCGTTT---TT-GC-CTTTG----TAACTT-GCA----TATCTTTATCATTAT-TTCAAATTCAAATCATATA
gi|18 : tg----TGC-AC-TGGTA-CCAT-CA--CG-GTGATA-AA------T-ATC-G-C-ATGGT
gi|18 : TCACC-GT---GATGGTACCAGTGCA------AAAC-ACGATGGGA-CAC-------A-AAC-AT-TTTTTA-----TGACAACA-GGACATGAGAC-AATGATTTTTGT-A-TGTGGA-TA-ATTTGG-ATGGGA-CATCTATTTT-TT-CATTGACAAA--AATACAATGA-----TTTT----TCCC--ATTAA-TTTTGAGAGAA--T--GATTaaacacgatgggacacaaacattttttatgacaacaggacatgagacaatgatttttgtatgtggataatttggatgggacatctattttttcattgacaaaaatacaatgatttttcccattaattttgagagaatgattc
gi|19 : accatgcgatattta--A-TA-T------------ATCTC--G---GTTGT-G---CATTGTGGT-G-G---GACGGC--CA-ACTT--------T-TTT------ACT-CA--TAGCATTGTTTCGTAACA-TGTATA----------T-ATGAGACAACAC-AACG-TTTCTT-AAGAT--TTTG-C-AT------------TTTGGTTTTGA-----A--ATTTTCAAA----TGCTACACGGCC-CCGC-CC--CG-GT--AA-AA------T-ATTGG-CAATGGTc
gi|2 : TCACCTGG---GGTGGGACCGGTGCA------AAAC-ACGATGGGA-CAC-------A-AACTTT-TTTTTA-----TGACAACA-GGGCATGGAAC-AATGATTTTT-T-A-TGTGAA-TA-ATTTGG-ATGGGA-CATCTATTTT-TT-CAATGATAAA--AATGCAAAGA-----TTTTTGTCCCAT--ATTGA-TTTCAAGAGAA--T--GATTTACAGGAAAG--AACAAGATATTCAGCAA-ATTGT-ATCCCTAAGCAAGTCTTCC----AT-CTGTTT---TT-CC-CTTGG----TAACTT-GTAT-ATTATCTTTGTCATTAT-TTCAAATTCAAATCATATAGC--ACAA-GCA-TTCACTACTG--GTGCGAC--TAGT--AAGACAGACAGAAGATGCTTACTC-C--------------G---AGTT----CT----A---T--GA----CTT-A---GGGC-TCAT-CTGAGGGTT--CATC----------------GTTTAACTCCATA--TG-A----------A---------------T-----G----------T----------CA-TG--A--------T--GTTACTCA-TT-TACATTCA-CACA-T-GTAA-T-TTT-AGA-AATGCT-ATAAA-A---T-TCT-ACT-----T-TC--A--TG-TTTG-CAT--TTA--------T------CA--T-----G-----T----ACT---T-------C------------------------T-----TA----------A----CG----A-------TTT---GT----------------------TA----T-CAGC-A-TGCGT-GTCTG--TAGG-G---------------AA-AA-----A--A-----C-ATTGTC--G---C-G---T--A-------ATAGT----TCTTATTTA-AAAA-GTCT------T---GATT-GTGTCAGGGAC-ATA-----T-ATATAACATG--TTA-TAGA-TA-T------------GTCTCT-A---ATTGT-G---CTTTGTGGT-G-G---GACA-C--CA-ACAT--------T-TTT------ACT-CA--AAGCAT-----------ATT---------------T-ATGGGAC-ACA--AACATCTTCTTAAAGATG-TTTG-C-ATGGGA-CACATACTTT--TTTTAACATTGA--ATTTTCAAA----TGC-AC-CGGTC-CCAC-CC--CG-GTGAGA-AA------T-ATT-G-C-ATGGTccct
gi|20 : ----TGC-AC-TGGTC-CCAC-CC--CG-GTGATA-AA------C-ATT-G-C-ATCGT
gi|20 : gTCACC-GG---GGTGGGACCAGTGCA------AAAC-ACGATGGGA-CAC-------A-AAC--T-TTTTAA-----TGACAACA-GGCAATGGG-C-AATGACTTGT-T-G-TGTAGA-TA-AATTGG-ACGGGA-CATTTATTTaaacacgatgggacacaaactttttaatgacaacaggcaatgggcaatgacttgttgtgtagataaattggacgggacatttattt
gi|21 : gacgatgcaatgttta--AAGCAT-----------A-T-----------------ATGGGTC-ACA--AAAGTTTTCTGCAAGATG-TTTG-C-ATGGGA-CACATACTTT--TTTTAACATTGA--ATTTTCAAA----TGC-AC-CGGTC-CCAT-CC--CG-GTGAGA-AA------T-ATT-G-C-ATGGT
gi|22 : tAACA-GGACATGGGAC-AATGATTTTT-TTG-TGTAGA-TA-ATCTGG-ATGGGA-CTTCTATTTT-TT--ATTGACAAA--AATGCAAAGA-----TTTT----CCTC--ATTGG-TTTGAAGAGAA--T--GATTTACAGGctct
gi|23 : GGAC-ACT--ACC-TGTTCTTAAAGATC-TTTT-TTGTGGGAACACATACTTTA-TTTTGAAATT-A--ATTTT-AAA------C-AC-CG-TC-CCAC-CC--C--GTGATAGAA------T-ATT-G-C-ATGGT
gi|24 : tTGGGAC-ACA--AACGTTTTCTTAAAGATG-TTCG-C-ATGGGA-CACATACTTT--TGTT----TGGA--ATTTTCAAA----TGC-AC-CGGCC-CCAC-CC--CG-GTGAAA-AA------T-AGT-G-C-ATGGTccctt
gi|25 : TG--TTA-T--A-TA-T-------------TCTCT-G---GTTGT-G---CATTGTGGT-G-G---GACG-C--CA-ACTT--------T-TTT------ACT-CA--TAGCAT-----------A-TGTTTGTACATGTATAT-ATGAGAC-ACA--AACGTTTTCTTAAAGAccc
gi|26 : AA-A---A-TCT-ACT-----T-TTT-A--TG-TTTA-CAT--TTT--------T------CA--T-----A-----T----A
gi|27 : -CA--AAGCAT-----------A-T---------------TTATGGGAC-ACA--AACATGTTCTTAAAGATG-ATTG-C-ATGGGA-CACGCACTTT--TTTTAACACTAA--ATTTTCAAA----TGC-AC-CGGTC-CCAC-CC--Caaactaattaacacttctcaacttttatataaggattactccgtctaatttttgtctatctgcaatgc
gi|28 : -----T----ACT---T-------T------------------------G-----TC---------TAA---TG------------TTT---GT--C-------------------TA----TTCTGCAA-TGCGT-GTCTGT-TATG-A---------------AA-AA-----A--A-----
gi|29 : ttatcatataaaactaattaacacttctcagcctttatttaaggatAAAAA-G-TTTG-C-ATGGGA-TAAATACATT--TTTAAACATTGAC-ATTTTCAAA----TGC-AC-CGGTC-CCCC-AT--TGCGTGAGA-AA------TGATT-G-a
gi|3 : ATATTC-GCGG-AATGTCATCCCTAA---AATGTTTT-----T-CCGTATAAATT-GTATTTTG----TAACATAGCAT-AT---CTCTGTCAATATATTTAAATTCAAATCACACCACCTACGA-GCACTTCACAAATG--TTGC------AG--------GGACAGGGGATGCTTATCC-CTTGGCAAAACA-TTGGGAAGTT----CT----ATC-TC-GATGTGTTT-G---GGGT-TCATGCTGGGGGTC--CATCAGTG--TT--CCAG-TTGTTAACTCCATG--TG-A----------ATAGGCGATTTTACCTT-----G----------T----------CG-AT--ACATTGTAGT--GTTAATCA-TT-GACATCCA-CACA-A-GTGACT-TTT-CGATATTGCA-ATAAA-A---A-TCG-ACC-----T-TT--ACTTT-CTTG-TAT--TTA--------T------CAT-T-----A-----T----AAT---TAA-----T------------------------T-----TA---------TA----tgccattgtcccta
gi|3 : atT--TTA--------T------CA--C-----AGTAATT----ACT---T--------------------------------------TA---------TA----TG----GGT-----TTT---GTGGC-----------T-------TA----C-TGGCAA-TGCATTGTCTGT-TATA-G---------------AA-AA-----ACAA-----CGAGT-TC--A---TAG---T--A-TCG---AT-GC----TTCAA-TTT-AAAA-GTCT------T---AA-A-GTGTC-----C-A------------------G--TTA-T--A-TA-T------------GTCTCTGG---ATTAT-G---CCTTGTGGT---G---GACA-C-----ATTT--------TGTTT------ACgctttttaaactttatcacagtaattactttatatgggttttgtggcttactggcaatgcattgtctgttatagaaaaacaacgagttcatagtatcgatgcttcaatttaaaagtcttaaagtgtccagttatatatgtctctggattatgccttgtggtggacacattttgtttacca
gi|30 : atatattcgcggaatgtcatccctaaaatgtttttccgtataaattgtattttgtaacatagcatatctctgtcaatatatttaaattcaaatcacaccacctacgagcacttcacaaatgttgcagggacaggggatgcttatcccttggcaaaacattgggaagttctatctcgatgtgtttggggttcatgctgggggtccatcagtgttccagttgttaactccatgtgaataggcgattttaccttgtcgatacattgtagtgttaatcattgacatccacacaagtgacttttcgatattgcaataaaaatcgacctttactttcttgtatttatcattataattaatttatagctttttaaacA-----A--C-----C-ATT-TCTAGATCTAG---T--A-TCG---AT-GC----TGTTG-TTA-AAAC-GTCT------T---AATT-GTACC--AGAC-ATA-----T-ATca
gi|31 : gtattaagtatttgttcggactctTTCTTAA-GATG-TTTGAC-AAGAGA-CACATACTTT--TTTAAACGATGAGCATTTTCAAA----TGT-AC---GCCATCAC-TTTACT-GTGAGA-A
gi|32 : aTTGGC--AACAGCTG---AGTT----CT----A-C-CTCGA----CTT-A---GGGT-TCAT-CTGGGAGTC--TATCAATG--TT-CCCAG-TGTTTAACTCAACG--TG-A----------A---------------T-----G----------
gi|33 : -GG---GTTGGGACCGGTGCC------AAAT-GTAATAGGA-CAC-------A-CACTTA-TTGATA-----AGACA
gi|34 : ttagggactggtcaatatttattgggG-C-ATGGGA-CATACA-TTT--TTTCAA---TGT--ATATCTAAAAGTTTGC-AT-CTGTC-CCAT-TC--CG-GTGATA-AA------T-ATT-G-c
gi|35 : A--AAGCAT-----------A-T---------------T--TTGGAC-ATA--TACGTTTT-TAAAAGATGCTTTC-C-TTGGGA-CACATGCTTA--TTTAAACATTGA--ATTacca
gi|36 : t----TGC-AC-TGGTC-CCAC-CG--CG-GTGAT--AA------T-ATT-G-T-ATG
gi|36 : tTCACC-GC---GGTGGGACCAGTGCA------AAAC-ACGATGGG---AC-------A-GAC--T-TTTTTA-----TGACAATA-GGACAaaacacgatgggacagacttttttatgacaataggaca
gi|37 : tcatacaatatta---------------T-----G----------T----------CG-GG--A--------TATGTCACTAA-TT-TACATCCA-CACA-T-GTAA-T-TCT-AAA-AATGCA-AT
gi|38 : tgaatgcgattctcCAC-CC--CG-GTGATA-AA------C-ATC-C-C-ATGGTtttca
gi|38 : gggTCACC-GG---GGTG---------CA------AAAC-ACTATGGGA-CAC-------A-AACTTTATTTTTA-----TGACAACA-caaaacactatgggacacaaactttatttttatgacaaca
gi|39 : gggaccatgggatgttta----------A---------------T-----G----------T----------CGCGG--A--------TTGGTCACTAAATT-TACATCCA-CACATT-GTAA-TCTTT-AGA-AATGCA-A
gi|4 : gcgaatgctc----TGC-AC-TTGTC-CAAC-CC--TG-GTGATA-AA------T-ATT-G-C-ATGGTat
gi|4 : ggTCACC-AG---GGTTGGACAAGTGCA------AAAC-ACTATGGGA-CAC-------A-AACGGT-TTTTTA-----TGAAAACA-GGACATGGGCT-AATGATTTTT---G-TAGGTA-TAGATTTG--ATGGGA-CATCTATTTT-TT-CATTAACAAATAAATGCAAAGA-----GTTT---TCCC---ATTGA-TTTGAAGAGAA--T--GATTTACAGTA------------TATTCAGCAA-AGTGT-ATCCCTA-GCA--TGTTCC----AT-TCGTTT---AA-GT-CTTTG----TAACTT-GTAG-AT-AT--TTGTCATTAT-TTCAAATCCAAATCATATAAC--ATGA-GCA-TACACAACTA--TCCCAAC--GAGT--AAGTCAGAAAGGGGATACTTACTC-CTTCGC--AACAGTTG---CGAT----CT----A-C----------CTT-G----------AT--TGGGACTC--CAT--ATGAATT-C------GATT--CTCCCTC--AG-G----------A---------------C-----A----------T----------C-------------------TTACTCA-TT-TACATCCA-CATA-T-GTAA-T-TTT-AGA-AATGCA-ATAAA-A---A-TCT-ACT-----GATT--A--TG-TTTG-CAT--TTA--------T------CA--TTATAAA-----C----ACT---TTTCAACAT------------------------T-----TA---------TT----TA----AGGGTTACTTT---GT--CTAATGTTTTGTC-------TA----T-CTGCAA-TGCGT-aaacactatgggacacaaacggttttttatgaaaacaggacatgggctaatgatttttgtaggtatagatttgatgggacatctattttttcattaacaaataaatgcaaagagttttcccattgatttgaagagaatgatttacagtatattcagcaaagtgtatccctagcatgttccattcgtttaagtctttgtaacttgtagatatttgtcattatttcaaatccaaatcatataacatgagcatacacaactatcccaacgagtaagtcagaaaggggatacttactccttcgcaacagttgcgatctaccttgattgggactccatatgaattcgattctccctcaggacatcttactcatttacatccacatatgtaattttagaaatgcaataaaaatctactgattatgtttgcatttatcattataaacacttttcaacatttatttaagggttactttgtctaatgttttgtctatctgcaatgcgt
gi|40 : ggaccatgcaatatttaTGTGGT-G-G---GACA-C--CA-ACTA--------T-TTT------ACT-CA--AA-CAT-----------A-TA--------------T-ATGGGGC-ACA--
gi|41 : TGTGGT-G-G---GACA-C--CA-ACTA--------T-TTT------ACT-CA--AA-CAT-----------A-TA--------------T-ATGGGGC-ACA--tgatgttataccggtaag
gi|42 : GTGCA------AAGC-ATGATGGGA-CAG-------A-CA-TAT-TTTTAA-----TGACAGCA-GGACATGGGAC-AACGATTTTT-tgatgttataccggtaag
gi|43 : TAG-T-TTT-AGA-AATGCT-ATAAA-A---A-TCT-ACT-----T-TT--A--TG-TTTG-CAT--TTA--------T------a
gi|44 : tttactcacagtatttc--GA----CT--A---GGGT-TCAT-CTGGGG-TC--CATCAATG--TTCCCCAGTTGTTTAACTTCA
gi|45 : ctgcctcA----TGC-AC-CGGTC-CCAC-CC--CG-GTGAGA-AATACATGT-ATT-G-C-ATGGTac
gi|46 : ACATTGA--ATTT-CAAA----TGC-AC-CGGT--CCACTCC--CG-GTGAGA-AA--------ATT-ccct
gi|47 : G--AACAAGCTATTCAGCAA-ATTGT-ATCCTAAAGCAAGTGTTCC----AT-tcgt
gi|49 : -CC--CG-GTGATA-AA------T-ATT-G-C-ATGGTt
gi|5 : cggtATATAAC--ACGA-GCA-TTCACAACTG--GCACAAC--TAGT--AGGTCAGAAAGGGGATGTTTACTC-CTTGAC--AACAGTTG---AGTT----TTTTTAA-C-TT-GA----CTT-G---GGGT-TTAT-CTTGGGGTC--CATCAATG--TT-TCCAG-TGTTTAATGCCATG--TG-A----------A---------------T-----GCGATTCTCTGT----------CA-GG--A--------TATGTTACTCA-TG-TACATCCAACACA-T-GTAA-T-TTT-AGA-AATGCA-ATCAA-A-----TCT-ACTTTATGT-TT--G--CA-TTTATCATA-TTAAAAACTAAT------CA--------A-----C----ACT---T-------CCCAACCCTTAATTTTAAGAGA---T-----TA---------CA----TGTGTAA-------TTTT--GTG-T-----------C-------TA----T-CTGCAA-TGCGT-GTCTGT-TATG-GGGGAAAAAACCCA--AA-AACAAACA--A-----C-ATT-TC--G---TAG---TGTATTCG---AG-GC----TGTTA-TTA-GAAA-----------------TT--TGCCAGAGAC-A-A-----TAATGTAACATG--CTG-T--A-CA-T------------GTCTCT-G----TTTT-A---A-TTGTGGT-G-ACTTTACA-C--TA-ACATATAC----T-TTT------ACccctaa
gi|6 : ggtaCTG--GCACAACACTAGTTTAGGTCAGA-AAGGGATTTTTACTC-CTTGAC--AACA-TT----ATTT----CT------T-T--AA----CTT-GACTGGGTCTTAT-CTTGGGGTC--CATCAATG--TC-TTCA--TGTTTAATGCCATGGATGCG----------A---------------TTCTCTG----------T----------CA-GG--A--------TATGTTACTCA-CTGTACATCCAACACA-TTGTAA-T-TTTTAGA-AATGCA-ATCAA-ATTTACTTT-ATT-----T-TTGCA--TACTTTT-CATA-TTAAAACTAA-T------CA--------A-----C----ACT---T-------CCCAACCTAATTTAAAGGATTCACAT-----TG---------TG----TA----A-------TTT---GTG-T-----------C-------TA----T-CT-CAACTGCGT-GTCTGTATATG-GGCAAAAAACCAAAACAA-AAC----A--A-----C-ATT-TC--G---TAG---T--GAT-----AT-GCGAGGTG-TA-TTC-AGA----------------AATT--TGCCAGAGACAATA-----G-ATGTACTATGCTTTGTT--A-CA-T------------GTCTCT-GTTAATTGT-GTGACTTT-T-----------ACA-CAACATACTTTTACAAAAT-TCT------AAT-TA--AATCAT-----------A-TC--------------T-AT----C-A-A--AACGTaaaattctaattaaagtctatctatcaaactgtaaatctttcatataaagtatgt
gi|7 : ----TGC-AC-TGGTC-CCAC-CC--CG-GTCATA-AA------T-ATT-G-C-ATGGTaaatctttcatataaagtatg
gi|7 : ggACC-GG---GGTGGGACCAGTGCA------AAAC-ACGATGGGA-CAC-------A-AACTTT-GTT--A-----TGACAATA-GAACATGGGAC-AATGATTTTTGT-G-TGTGGA-TA-ATTTGG-ATGGAA-CATCTTTTTT-TTTCATTGACAAA--AATGCAAAAAG----TTTT---TCCCC-----------GAAGAGAA--G--GGTTTACAAGAAAG---------TGATCAGCAA-ATTGT-TTCCCTA-GCAAGTGTTCC----AT-CCGTTT---TT-GT-CTTTG----TAACTT-GCAT-AT---CTTTGTCATTAT-TTCAAATTCAAATACTATAGC--GCGA-TCA-TTCACAACTG--GTGCGAC--TAGT--CAGTCAGACAGGCGATACTTGGTC-CTTGGC--AACAGTTG---GATT----CC----A-C----------CTA-G----------AT-TTGGGG-TC--CATCAGTG--TT-CCCAG-TGTTTAACTCCATG--TG-A----------A---------------T-----G----------TGATTCTCTGTCA-GG--A--------T--ATT--TCA-TA-TTCATCTA-CA--------------------AATGCA-ACAAA-A---A-TCT-ACT-----T-aaacacgatgggacacaaactttgttatgacaatagaacatgggacaatgatttttgtgtgtggataatttggatggaacatctttttttttcattgacaaaaatgcaaaaagtttttccccgaagagaagggtttacaagaaagtgatcagcaaattgtttccctagcaagtgttccatccgtttttgtctttgtaacttgcatatctttgtcattatttcaaattcaaatactatagcgcgatcattcacaactggtgcgactagtcagtcagacaggcgatacttggtccttggcaacagttggattccacctagatttggggtccatcagtgttcccagtgtttaactccatgtgaatgtgattctctgtcaggatatttcatattcatctacaaatgcaacaaaaatctacttgtcatataaaactaag
gi|8 : ggaccatgcaatatttatgATATAAC--ACGA-GCA-TTCACAACTG--GCACAAC--TAGT--AGGTCAGAAAGGGGATGTTTACTC-CTTGAC--AACAGTTG---AGTT----TTTTTAA-CTT--GA----CTT-G---GGGT-TTAT-CTTGGGGTC--CATCAATG--TT-TCCAG-TGTTTAATGCCATG--TG-A----------ATGCGATTCTC-----T-----G----------T----------CA-GGATA--------T--GTTACTCA-TG-TACATCCA-CACA-T-GTAA-T-TTT-AGA-AATGCA-AT-CA-A---A-TCT-AC------T-TT--A--TG-TTTG-CAT--TTA--------T------CA--T-----A-----T----Agtcatataaaactaag
gi|8 : ggta------------------------T-----TG---------TG----TA----A-------TTT---GTG-T-----------C-------TA----T-CTGCAA-TGCGT-GTCTGT-TATG-GGGGAAAAAACCC---AA-AACAAACA--A-----C-ATT-TC--G---TAG---TGTATTCG---AG-GC----TGTTA-TTA-GAAA-----------------TT--TGCCAGAGAC-A-A-----TAATGTAACATG--CTG-T--A-CA-T------------GTCTCT-G----TTTT-A---A-TTGTGGT-G-aaactaatcaacacttcccaacccttaattttaaaggattacattgtgtaatttgtgtctatctgcaatgcgtgtctgttatgggggaaaaaacccaaaacaaacaacatttcgtagtgtattcgaggctgttattagaaatttgccagagacaataatgtaacatgctgtacatgtctctgttttaattgtggtgacttttacactaacat
gi|8 : ggtaatataacacgagcattcacaactggcacaactagtaggtcagaaaggggatgtttactccttgacaacagttgagtttttttaacttgacttggggtttatcttggggtccatcaatgtttccagtgtttaatgccatgtgaatgcgattctctgtcaggatatgttactcatgtacatccacacatgtaattttagaaatgcaatcaaatctactttatgtttgcatttatcatataaaactaatcaacacttcccaacccttaattttaaaggattaca----TGTTA-GTGTAAAA-GTCA------CCACAATT-AAAACAGAGAC-ATG-----T-ACA--GCATG--TTA-C--ATTATT------------GTCTCT-G---acttttacactaacat
gi|9 : ggtaatataacacgagcattcacaactggcacaactagtaggtcagaaaggggatgtttactccttgacaacagttgagtttttttaacttgacttggggtttatcttggggtccatcaatgtttccagtgtttaatgccatgtgaatgcgattctctgtcaggatatgttactcatgtacatccacacatgtaattttagaaatgcaatcaaatctactttatgtttgcatttatcatataaaactaatcaacacttcccaacccttaattttaaaggattacattgtgtaatttgtgtctatctgcaatgcgtgtctgttatgggggaaaaaacccaaaacaaacaacatttcgtagtgtattcgaggctgttattagaaatttgcTCACGACTG--GTGCGAC--TAGT--AAGT---------------TATTC-ATTGGC--AACAATAG---AGTTATTTCT----A-C-CTCGA----CTT-A---AGGT-TCAT-CTGGGGGTC--CATCAATG--TT-CCCAG-TGTTTAACTTCATG--TG-AATGCGATTCTA---------------T-----G----------T----------CG-GGATA--------T--GTTACTCA-TT-TATATCCA-CACA-T-GTAA-T-TTT-AG-------------A-A---A-TCT-ACT-----TATC--A--TA---TA-CAT--GTAAAAC----T------AA--T-----G-----T----AATAAAT-------C------------------------TACAAGTA---------TA----TGTCTAA-------TTT---TT--CT----------C-------TA----T-CTGCAT-TGCGT-GTCTTT-TATG-A---------------AA-AA-----A--AACC--C-AGT-TC--A---TAG---T--ACTCG---AT-GC----TGTTA-TTA-AAAAGGTCT------A---AAT-------------------------------ATG---------A-TA-T------------GTCTC--------TGT-G---CTTTGTGGT-G-G---GACA-C--CA-ACTC--------T-TTT------TCT-CA--AAGCAT-----------A-----------------T-AAGGAAC-ACA--ACAGTTATGGGAA---------G-C-ATGGGA-CACATAC---------------------TTTCAAA----AGC-AC-CGGTC-CCAC-CC--CG-GTGAGA-AA------T-ATT-G-C-GTGGTt
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|48 ): ACCGGTCAATAATTATTGGGGGGTTGGGACCGGTGCATT
Unaligned ( gi|50 ): CCACCATATTAAGGGACTGGTCAATATTTATTG
Unaligned ( gi|51 ): GTTAGGGACTGGTCAATATTTATTGGGGGGTT
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 111111 1111111 1111111111111 222222222 2222222 111 333333333333 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 11 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 555555555555555555555555555555555 1111111111 22222222222222222 11 111111111111 11111111 444444444444444444444444444444 11111111111
lowQualScore : 4 777 000000 3 3 0000000 3 99 3 44 88888 3 4 7 4 3 1 3 3 3 2 3 4 4 55 11 7777777777777 777 4 55 55 777777777 4 4 0 8888 4 888888 44 9999 4 8888888 4 66 4 4 88 3 55 55 5 4 55 2 000 7777 666666666666 7777 3 555 3 3 0 0 44 44 666 33 44 3 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 3 3 6 3 3 2 2 2 2 2 2 3 66666 3 77777 6 99999 3 33 00 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 7777 3 3 3 6 3 3 777777777777777777777777777777777 3 3 999999 555 99 7 555 3 6666 3 3 3 3333333333 77 0 1 22222222222222222 44 3 00 6 555555555555 3 9999 66666 4 2 2 555 3 44 3 77777777 3 888888 3 33 1 444444444444444444444444444444 2 55 0 33 2 2 2 2 66 44444444444 4444 3 1 1 1 22 1 1 1 555555 1 1 1 2
lowQualScore : . ... ...... . . ....... . .. . .. ..... . . . . . . . . . . . . . .. .. ............. ... . .. .. ......... . . . .... . ...... .. .... . ....... . .. . . .. . .. .. . . .. . ... .... ............ .... . ... . . . . .. .. ... .. .. . ......................................................................... . . . . . . . . . . . . ..... . ..... . ..... . .. .. .............................................................................................................................................. .... . . . . . . ................................. . . ...... ... .. . ... . .... . . . .......... .. . . ................. .. . .. . ............ . .... ..... . . . ... . .. . ........ . ...... . .. . .............................. . .. . .. . . . . .. ........... .... . . . . .. . . . ...... . . . .
lowQualScore : 0 000 555555 3 3 8888888 3 11 3 88 33333 3 0 3 0 6 2 6 6 6 0 6 0 0 55 55 1111111111111 111 0 55 55 999999999 0 0 8 5555 0 111111 66 4444 4 7777777 4 11 4 4 66 0 55 55 0 0 00 8 000 7777 888888888888 1111 3 888 3 3 4 4 66 66 777 88 66 3 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 1 1 2 1 1 9 9 9 9 9 3 1 44444 1 77777 2 33333 3 66 44 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 1111 3 1 1 7 3 3 333333333333333333333333333333333 3 3 777777 888 22 2 888 3 5555 1 1 1 9999999999 88 4 5 77777777777777777 66 3 44 2 888888888888 1 1111 00000 8 9 9 444 1 22 1 77777777 1 888888 3 99 9 555555555555555555555555555555 5 99 8 66 7 7 7 5 33 66666666666 0000 8 9 8 7 33 7 2 7 222222 8 8 9 2
consensus : TCACC-GG---GGTGGGACCAGTGCA------AAAC-ACGATGGGA-CAC-------A-AACTTT-TTTTTA-----TGACAACA-GGACATGGGAC-AATGATTTTT-T-G-TGTGGA-TA-ATTTGG-ATGGGA-CATCTATTTT-TT-CATTGACAAA--AATGCAAAGA-----TTTT---CCCCC--ATTGA-TTTGAAGAGAA--T--GATTTACAGGAAAG--AACAAGATATTCAGCAA-ATTGT-ATCCCTAAGCAAGTGTTCC----AT-CCGTTT---TT-GT-CTTTG----TAACTT-GCAT-ATTATCTTTGTCATTAT-TTCAAATTCAAATCATATAGC--ACGA-GCA-TTCACAACTG--GCGCGAC--TAGT--AAGTCAGACAGGGGATGCTTACTC-CTTGGC--AACAGTTG---AGTT----CT----A--C-C--GA----CTT-G---GGGT-TCAT-CTGGGGGTC--CATCAATG--TT-CCCAG-TGTTTAACTCCATG--TG-A----------A---------------T-----G----------T----------CG-GG--A--------T--GTTACTCA-TT-TACATCCA-CACA-T-GTAA-T-TTT-AGA-AATGCA-ATAAA-A---A-TCT-ACT-----T-TT--A--TG-TTTG-CAT--TTA--------T------CA--T-----A-----T----ACT---T-------C------------------------T-----TA---------TA----TG----A-------TTT---GT--C-----------C-------TA----T-CTGCAA-TGCGT-GTCTGT-TA-TG-G---------------AA-AA-----A--A----C-ATT-TC--G---TAG---T--ACTCG---AT-GC----TGTTATT-A-AAAA-GTCT------T---AATT-GTGCCAGAGAC-ATA-----T-ATATAACATG--TTA-TA--TA-T------------GTCTCT-G---ATTGT-G---CTTTGTGGT-G-G---GACA-C--CA-ACTT--------T-TTT------ACT-CA--AAGCAT-----------AT---------------T-ATGGGAC-ACA--AACGTTTTCTTAAAGATG-TTTG-C-ATGGGA-CACATACTTT--TTTTAACATTGA--ATTTTCAAA----TGC-AC-CGGTC-CCAC-CC--CG-GTGAGA-AA------T-ATT-G-C-ATGGT
Reference ( family-1488 ) : TCACC-GG---GGTGGGACCAGTGCA------AAAC-ACGATGGGA-CAC-------A-AACTTT-TTTTTA-----TGACAACA-GGACATGGGAC-AATGATTTTT-T-G-TGTGGA-TA-ATTTGG-ATGGGA-CATCTATTTT-TT-CATTGACAAA--AATGCAAAGA-----TTTT---CCCCC--ATTGA-TTTGAAGAGAA--T--GATTTACAGGAAAG--AACAAGATATTCAGCAA-ATTGT-ATCCCTAAGCAAGTGTTCC----AT-CCGTTT---TT-GT-CTTTG----TAACTT-GCAT-ATTATCTTTGTCATTAT-TTCAAATTCAAATCATATAGC--ACGA-GCA-TTCACAACTG--GCGCGAC--TAGT--AAGTCAGACAGGGGATGCTTACTC-CTTGGC--AACAGTTG---AGTT----CT----A--C-C--GA----CTT-G---GGGT-TCAT-CTGGGGGTC--CATCAATG--TT-CCCAG-TGTTTAACTCCATG--TG-A----------A---------------T-----G----------T----------CG-GG--A--------T--GTTACTCA-TT-TACATCCA-CACA-T-GTAA-T-TTT-AGA-AATGCA-ATAAA-A---A-TCT-ACT-----T-TT--A--TG-TTTG-CAT--TTA--------T------CA--T-----A-----T----ACT---T-------C------------------------T-----TA---------TA----TG----A-------TTT---GT--C-----------C-------TA----T-CTGCAA-TGCGT-GTCTGT-TA-TG-G---------------AA-AA-----A--A----C-ATT-TC--G---TAG---T--ACTCG---AT-GC----TGTTATT-A-AAAA-GTCT------T---AATT-GTGCCAGAGAC-ATA-----T-ATATAACATG--TTA-TA--TA-T------------GTCTCT-G---ATTGT-G---CTTTGTGGT-G-G---GACA-C--CA-ACTT--------T-TTT------ACT-CA--AAGCAT-----------AT---------------T-ATGGGAC-ACA--AACGTTTTCTTAAAGATG-TTTG-C-ATGGGA-CACATACTTT--TTTTAACATTGA--ATTTTCAAA----TGC-AC-CGGTC-CCAC-CC--CG-GTGAGA-AA------T-ATT-G-C-ATGGT
gi|1 : TCAC--AG---GGTGGGAACA-TGCATAAAAAAAACCAC-ATGGGAACACTTTTCTTACAACCTT-TTTT-A-----T-ACAAC--GGATA-GGGATTAAAGATTTTT-T-GGTGTGGAATA-ATTTGGTATGG-A-CAT-TAACTT-AT-AATT-ACAAA--A--GCAAAGA-----TTT----CCCTG--ATTGA-TTTGAAGGAAAATT--GATTT-C-GAAAAG--AATAAGATACT-AGCAAGATTGT-TTCCCCTACAAAGTGGTCCAAAAAT-CTGTTT---TT-GT--TTAGTCCCTAACTT-GCATCAT--TCTTTGTCATT--------ATTCAAATCATATAGC--ACGATGCA-TTCACAACTGGTGCACAAC--TA-T--AA-TCAGACAGGGG-TGTCTATTCTTTTGGC--AATAGTTGA--AGTT----CC----T--T-C--GA----CTTAG---GGGT-TCAT-CT--GGGTCCGCATCAATG--------------TCAACTCAATG--TG-A----------ATGCGATC--------T-----G----------T----------CA-GAT-A--------T--GTTAGTC---C-TACAT-TA-CTAA-T-GTA----TTT-AGA-AATGCATATAAAGA---A-TCTAACT-----T-GT--ATTTG-TTTG-CATAATCA--------TATAAAACA--T-----A-----TTTACACT---T-------C------------------------T-----TA---------AA----TA----A-------TTTAAGGTTAC-----------T-------TACTTTT-TTTCAA-T---T-ATTTGTCTA-C------------------------------------C-ATT-TC--A---TAGGCAT--ACTTG---AT-GC----TG-TA---A-AAAG-GTCT------T---AACTGGTGCAAAA------A-----T-AACTTACATG--TTA-TA--TA-TACCGCGCGATTGGTGTCT-G---ATTAT-----CTTTGTGGT-GTG---GA
gi|1 : agtgaccagcaatattcactattACA-T--CA-ATTT--------T-TTA------ACTTCA--AATCAT-----------AT---------------A-ATGG-AC-AAATCAACGTTTTCTTAA-GAT--TTTG-C-ATGGGA-CA--TACTTT--TTG-AACAAAGA--ATTTTCAAA----TGCAAC-CAGTC-CC-T-AC--CG-GTGAGA-AA------T-A-T-G-C-ATGGTtcaagaaattagacaatataataaaaattataacatcaattttttaacttcaaatcatataatggacaaatcaacgttttcttaagattttgcatgggacatactttttgaacaaagaattttcaaatgcaaccagtccctaccggtgagaaatatgcatggtcccat
gi|10 : agtgaccagcaatattcactatttcacagggtgggaacatgcataaaaaaaaccacatgggaacacttttcttacaaccttttttatacaacggatagggattaaagattttttggtgtggaataatttggtatggacattaacttataattacaaaagcaaagatttccctgattgatttgaaggaaaattgatttcgaaaagaataagatactagcaagattgtttcccctacaaagtggtccaaaaatctgtttttgtttagtccctaacttgcatcattctttgtcattattcaaatcatatagcacgatgcattcacaactggtgcacaactataatcagacaggggtgtctattcttttggcaatagttgaagttccttcgacttaggggttcatctgggtccgcatcaatgtcaactcaatgtgaatgcgatctgtcagatatgttagtcctacattactaatgtatttagaaatgcatataaagaatctaacttgtatttgtttgcataatcatataaaacatatttacacttcttaaataatttaaggttacttactttttttcaattatttgtctaccatttcataggcatacttgatgctgtaaaaaggtcttaactggtgcaaaaataacttacatgttatatataccgcgcgattggtgtctgattatctttgtggtgtggatcaagaaattagacaatataataaaaattataCATG--TG-A----------A---------------T-----GCGATTCTCTGT----------CA-GG--A--------TACGTTA---A-TT-TACATCCA-CACA-T-GTAA-T-TTT-AGA-AATACC-ATAAA-A---G-TCT-ACT-----T-TT--A--TG-CT----A-----A--------T------TG--T-----A-----C----ACT---T-------C------------------------T-----TAACCTTTATTTAAGGATG----AC------TTT---GT--C-----------TAGTTTTGTC----T-CTGCAA-TGCAT-GTCTAT-TA-TG-G---------------AA-AA-----A--C----C-ATT-TC--A---GAG---T--ACTCG---AT-GC----TGTTATT-A-AAAA-GTCT------T---AATT-GTGCCAGATAC-ATA-----T-ATAC--CATT--TTA-TG--TT-T------------GTATCT-G---ATTGT-G---CTTTCTGGT-G-G---GACA-C--CA-ACTT--------T-TTTCTTTTTACT-CATAAAGCAT-----------AT-----------------ATGGGAC-ACA--AACTTTTTCTTAAAGATG-TTTG-C-AAGGGA-CACATACTTT--TTTTAACATTGA--ATTTTCAAA----TGT-AC-CGGTC-CCAC-CC--CG-GAGAGA-AA------T-ATT-G-C-ATGGTcccat
gi|11 : TGCTTACTC-CTTGGC--AATGGTTG---AGTT----CT----A--C-CTCGA----CTT-G---GTGT-TCCT-CTGGCGGCC--TATCAATG--TT-CTCAG-TGTTTAACTCCATG--TG-ATGCG------ATTCTT----------T-----G----------T----------CA-AG--ATT------T--GTTACTAA-TT-TACATCCA-CAC--------------------ATGCG-ATGAA-A---A-TCT-ACT-----T-TT--A--TG-TTTC-TAT--TTT--------T------TATTT-----AAGGATT----ACT---TTG-----C------------------------C-----TA----------A----T-------------CTT---AG--T-----------C-------TA----T-GTGCAC-TGCGT-G-ATGG-AACTG-A---------------AA-AA-----A--AAACCC-ATT-TC--A---TAG---T--ACTGG---AT-GT----TGTTATT-A-GAAA-GTCTTACATGT---AATT-GTGCCAGATAC---A-----T-ATATGACATacct
gi|12 : GTC-CCAC-CC--TG-GTGAGA-AA------A-ATT-G-C-ATGGTc
gi|12 : gatC-AGGGTGGGA-CAC-------A-AACTTT-TTT--A-----TGACAACA-AGACATGGGAC-GATGAGTTTC-T-G-TGTGGA-TA-ATATGG-ATTGAA-CATCTATTTT-TT-C-TTCAT-------TGC-----------------CCCCC--ATTGC-TTTGAAGAGAA--T--GATTTACAAGAAAGTGAACAAGATGTTCAGCAA-ATTGT-ATCCCTAAGCAAGTGTCCC----AT-CCGTTT---TTTGT-CTTTG----TAACTT-GCAT-AT---CTTTGTCATTAT-TTCAAATTCAAATCATATAGC--ACGA-GCA-TTCCCAACTG--acaaacttttttatgacaacaagacatgggacgatgagtttctgtgtggataatatggattgaacatctattttttcttcattgccccccattgctttgaagagaatgatttacaagaaagtgaacaagatgttcagcaaattgtatccctaagcaagtgtcccatccgttttttgtctttgtaacttgcatatctttgtcattatttcaaattcaaatcatatagcacgagcattcccaactg
gi|13 : gataccatgcaatttttctcac-TGCTT-GTCTGT-TA-TG-G---------------AATAA-----A--C----C-ATT-TC--A---TAG---T--ACTCG---AT-GT----TGTTATC-A-AAAA-GTCT------T---AATT-GTGCCAGAGAC-ATACAGTGT-ATATAACATG--CTG-TG--CA-T------------GTCTCT-G---ATTGA-G---CTTTGT-GT-T-G---GACA-C--CA-ACTT--------T-TTT------ACT-CA--AAGCAT-----------A----------------C-ATGGGAC-AAA--AACGTTTTCTTAAAGATG-TTTG-C-ATGGGA-CATATAC---------------------------------GC-AC-CGGTC-CCA--CC--CG-GTGAGA-AA------T-ATT-G-
gi|14 : atcacgtcttcatatctcacgcatgcattaattatTTATC-GGCCTGGTGGGACCAGTGCA------ACAC-TCGATGGGA-CAC-------A-AATCTT-TTTTTAGCAAATGCCAACATGGTCATGGGA--AATGAGTTTT-T-G-TGTG---------TGG-ATAT---CATTTATTTTCTT-CATTGACGAA--AATGCA--GA-----TTTT---CCCAA--ATTGA-TTTGAAGAGAA--T--GATTTATAGGAAAGTGAACACGATATTCCGCAA-ATTGT-ATCCC-AAACAAGCGTTCC----AT-CCGTTT---TT-GT-CTTTG----TAACTT-GCA----TATCTTTGCCATTAT-TTCAAAT
gi|15 : a-------TTT---GT--C-------------------TA----T-CTGCAA-TGCGT-GTCTGT-TA-CGCG---------------AA-AA-----A--A----C-ATT-TC--A---TAG---T--ACACACATAT-GC----TGTTATC-A-AAAA-GTCT------T---AATT-GTGC-AGAGAC-A-G-----T-A-ATAACATG--TTA-TAG-TAAT------------GTCTCT-G---ACTTTCG---CTTTG--GTAG-G---GAC--C--CA-ACTT--------T-TTT------ACT-CA--AGATAT-----------AT---------------G-A--AGAC-ACA--AACGTTTTCTTAAAGATG-TTTG-C-ATGGGA--ACATAC-------------------ATTTTC-AA----TGC-AA-CGGT--CCAC-CC--CA-GTGAG--AA------T-ATT-GCC-ATGGT
gi|16 : tctaat-TGTGAA----ATTTGG-ATGGGAGCATCTATTTT----CATTGACAGA--AATGCACAGACCCCCCCCC---CCCCC--ATTGA-TTTAGAGGAAA--T--G----------AAG--AAC---GTATTCAGCAA-ATTGT-ATCCGT-AGAAAGTGTTCC----ATAGCATTT------------------CA-------AT-ATT-------TCA--AA-TTCAAATT---AT-ATATAGC--ACGA-GCA-TTCAC-ACTGA-GTGCGAC--TAGT--AAGTCAGACA-GGGATGCTTACTccc
gi|17 : tgtgt-T-G-TGTGAA-TG-ATTTGG-GTGGGA-TATCTATTTT-TT-CATTGAGACA--AATGCAACCC-----CCCC---CCCCCCAATTGAGTTTCAAGAGAA--TATGATTTATAGGAAAG------------TGAACAA-ATTGT-ATCCCTAAGCAAGTGTTCC----AT-CCGTTT---TT-GC-CTTTG----TAACTT-GCA----TATCTTTATCATTAT-TTCAAATTCAAATCATATA
gi|18 : tg----TGC-AC-TGGTA-CCAT-CA--CG-GTGATA-AA------T-ATC-G-C-ATGGT
gi|18 : TCACC-GT---GATGGTACCAGTGCA------AAAC-ACGATGGGA-CAC-------A-AAC-AT-TTTTTA-----TGACAACA-GGACATGAGAC-AATGATTTTTGT-A-TGTGGA-TA-ATTTGG-ATGGGA-CATCTATTTT-TT-CATTGACAAA--AATACAATGA-----TTTT----TCCC--ATTAA-TTTTGAGAGAA--T--GATTaaacacgatgggacacaaacattttttatgacaacaggacatgagacaatgatttttgtatgtggataatttggatgggacatctattttttcattgacaaaaatacaatgatttttcccattaattttgagagaatgattc
gi|19 : accatgcgatatttaA--TA-T------------ATCTC--G---GTTGT-G---CATTGTGGT-G-G---GACGGC--CA-ACTT--------T-TTT------ACT-CA--TAGCATTGTTTCGTAACATGTATA----------T-ATGAGACAACAC-AACG-TTTCTT-AAGAT--TTTG-C-AT------------TTTGGTTTTGA-----A--ATTTTCAAA----TGCTACACGGCC-CCGC-CC--CG-GT--AA-AA------T-ATTGG-CAATGGTc
gi|2 : TCACCTGG---GGTGGGACCGGTGCA------AAAC-ACGATGGGA-CAC-------A-AACTTT-TTTTTA-----TGACAACA-GGGCATGGAAC-AATGATTTTT-T-A-TGTGAA-TA-ATTTGG-ATGGGA-CATCTATTTT-TT-CAATGATAAA--AATGCAAAGA-----TTTTTGTCCCAT--ATTGA-TTTCAAGAGAA--T--GATTTACAGGAAAG--AACAAGATATTCAGCAA-ATTGT-ATCCCTAAGCAAGTCTTCC----AT-CTGTTT---TT-CC-CTTGG----TAACTT-GTAT-ATTATCTTTGTCATTAT-TTCAAATTCAAATCATATAGC--ACAA-GCA-TTCACTACTG--GTGCGAC--TAGT--AAGACAGACAGAAGATGCTTACTC-C--------------G---AGTT----CT----A--T----GA----CTT-A---GGGC-TCAT-CTGAGGGTT--CATC----------------GTTTAACTCCATA--TG-A----------A---------------T-----G----------T----------CA-TG--A--------T--GTTACTCA-TT-TACATTCA-CACA-T-GTAA-T-TTT-AGA-AATGCT-ATAAA-A---T-TCT-ACT-----T-TC--A--TG-TTTG-CAT--TTA--------T------CA--T-----G-----T----ACT---T-------C------------------------T-----TA----------A----CG----A-------TTT---GT----------------------TA----T-CAGCA--TGCGT-GTCTGT--A-GG-G---------------AA-AA-----A--A----C-ATTGTC--G---C-G---T--A-------ATAGT----TCTTATTTA-AAAA-GTCT------T---GATT-GTGTCAGGGAC-ATA-----T-ATATAACATG--TTA-TAGATA-T------------GTCTCT-A---ATTGT-G---CTTTGTGGT-G-G---GACA-C--CA-ACAT--------T-TTT------ACT-CA--AAGCAT-----------AT---------------TTATGGGAC-ACA--AACATCTTCTTAAAGATG-TTTG-C-ATGGGA-CACATACTTT--TTTTAACATTGA--ATTTTCAAA----TGC-AC-CGGTC-CCAC-CC--CG-GTGAGA-AA------T-ATT-G-C-ATGGTccct
gi|20 : ----TGC-AC-TGGTC-CCAC-CC--CG-GTGATA-AA------C-ATT-G-C-ATCGT
gi|20 : gTCACC-GG---GGTGGGACCAGTGCA------AAAC-ACGATGGGA-CAC-------A-AAC--T-TTTTAA-----TGACAACA-GGCAATGGG-C-AATGACTTGT-T-G-TGTAGA-TA-AATTGG-ACGGGA-CATTTATTTaaacacgatgggacacaaactttttaatgacaacaggcaatgggcaatgacttgttgtgtagataaattggacgggacatttattt
gi|21 : gacgatgcaatgttta--AAGCAT-----------AT-----------------ATGGGTC-ACA--AAAGTTTTCTGCAAGATG-TTTG-C-ATGGGA-CACATACTTT--TTTTAACATTGA--ATTTTCAAA----TGC-AC-CGGTC-CCAT-CC--CG-GTGAGA-AA------T-ATT-G-C-ATGGT
gi|22 : tAACA-GGACATGGGAC-AATGATTTTT-TTG-TGTAGA-TA-ATCTGG-ATGGGA-CTTCTATTTT-TT--ATTGACAAA--AATGCAAAGA-----TTTT----CCTC--ATTGG-TTTGAAGAGAA--T--GATTTACAGGctct
gi|23 : GGAC-ACT--ACC-TGTTCTTAAAGATC-TTTT-TTGTGGGAACACATACTTTA-TTTTGAAATT-A--ATTTT-AAA------C-AC-CG-TC-CCAC-CC--C--GTGATAGAA------T-ATT-G-C-ATGGT
gi|24 : tTGGGAC-ACA--AACGTTTTCTTAAAGATG-TTCG-C-ATGGGA-CACATACTTT--TGTT----TGGA--ATTTTCAAA----TGC-AC-CGGCC-CCAC-CC--CG-GTGAAA-AA------T-AGT-G-C-ATGGTccctt
gi|25 : TG--TTA-TA--TA-T-------------TCTCT-G---GTTGT-G---CATTGTGGT-G-G---GACG-C--CA-ACTT--------T-TTT------ACT-CA--TAGCAT-----------ATGTTTGTACATGTATAT-ATGAGAC-ACA--AACGTTTTCTTAAAGAccc
gi|26 : AA-A---A-TCT-ACT-----T-TTT-A--TG-TTTA-CAT--TTT--------T------CA--T-----A-----T----A
gi|27 : -CA--AAGCAT-----------AT---------------TTATGGGAC-ACA--AACATGTTCTTAAAGATG-ATTG-C-ATGGGA-CACGCACTTT--TTTTAACACTAA--ATTTTCAAA----TGC-AC-CGGTC-CCAC-CC--Caaactaattaacacttctcaacttttatataaggattactccgtctaatttttgtctatctgcaatgc
gi|28 : -----T----ACT---T-------T------------------------G-----TC---------TAA---TG------------TTT---GT--C-------------------TA----TTCTGCAA-TGCGT-GTCTGT-TA-TG-A---------------AA-AA-----A--A----
gi|29 : ttatcatataaaactaattaacacttctcagcctttatttaaggatAAAAA-G-TTTG-C-ATGGGA-TAAATACATT--TTTAAACATTGAC-ATTTTCAAA----TGC-AC-CGGTC-CCCC-AT--TGCGTGAGA-AA------TGATT-G-a
gi|3 : ATATTC-GCGG-AATGTCATCCCTAA---AATGTTTT-----T-CCGTATAAATT-GTATTTTG----TAACATAGCAT-AT---CTCTGTCAATATATTTAAATTCAAATCACACCACCTACGA-GCACTTCACAAATG--TTGC------AG--------GGACAGGGGATGCTTATCC-CTTGGCAAAACA-TTGGGAAGTT----CT----ATCT-C--GATGTGTTT-G---GGGT-TCATGCTGGGGGTC--CATCAGTG--TT--CCAG-TTGTTAACTCCATG--TG-A----------ATAGGCGATTTTACCTT-----G----------T----------CG-AT--ACATTGTAGT--GTTAATCA-TT-GACATCCA-CACA-A-GTGACT-TTT-CGATATTGCA-ATAAA-A---A-TCG-ACC-----T-TT--ACTTT-CTTG-TAT--TTA--------T------CAT-T-----A-----T----AAT---TAA-----T------------------------T-----TA---------TA----tgccattgtcccta
gi|3 : atT--TTA--------T------CA--C-----AGTAATT----ACT---T--------------------------------------TA---------TA----TG----GGT-----TTT---GTGGC-----------T-------TA----C-TGGCAA-TGCATTGTCTGT-TA-TA-G---------------AA-AA-----ACAA----CGAGT-TC--A---TAG---T--A-TCG---AT-GC----TTCAATT-T-AAAA-GTCT------T---AA-A-GTGTC-----C-A------------------G--TTA-TA--TA-T------------GTCTCTGG---ATTAT-G---CCTTGTGGT---G---GACA-C-----ATTT--------TGTTT------ACgctttttaaactttatcacagtaattactttatatgggttttgtggcttactggcaatgcattgtctgttatagaaaaacaacgagttcatagtatcgatgcttcaatttaaaagtcttaaagtgtccagttatatatgtctctggattatgccttgtggtggacacattttgtttacca
gi|30 : atatattcgcggaatgtcatccctaaaatgtttttccgtataaattgtattttgtaacatagcatatctctgtcaatatatttaaattcaaatcacaccacctacgagcacttcacaaatgttgcagggacaggggatgcttatcccttggcaaaacattgggaagttctatctcgatgtgtttggggttcatgctgggggtccatcagtgttccagttgttaactccatgtgaataggcgattttaccttgtcgatacattgtagtgttaatcattgacatccacacaagtgacttttcgatattgcaataaaaatcgacctttactttcttgtatttatcattataattaatttatagctttttaaacA-----A--C----C-ATT-TCTAGATCTAG---T--A-TCG---AT-GC----TGTTGTT-A-AAAC-GTCT------T---AATT-GTACC--AGAC-ATA-----T-ATca
gi|31 : gtattaagtatttgttcggactctTTCTTAA-GATG-TTTGAC-AAGAGA-CACATACTTT--TTTAAACGATGAGCATTTTCAAA----TGT-AC---GCCATCAC-TTTACT-GTGAGA-A
gi|32 : aTTGGC--AACAGCTG---AGTT----CT----A--C-CTCGA----CTT-A---GGGT-TCAT-CTGGGAGTC--TATCAATG--TT-CCCAG-TGTTTAACTCAACG--TG-A----------A---------------T-----G----------
gi|33 : -GG---GTTGGGACCGGTGCC------AAAT-GTAATAGGA-CAC-------A-CACTTA-TTGATA-----AGACA
gi|34 : ttagggactggtcaatatttattgggG-C-ATGGGA-CATACA-TTT--TTTCAA---TGT--ATATCTAAAAGTTTGC-AT-CTGTC-CCAT-TC--CG-GTGATA-AA------T-ATT-G-c
gi|35 : A--AAGCAT-----------AT---------------T--TTGGAC-ATA--TACGTTTT-TAAAAGATGCTTTC-C-TTGGGA-CACATGCTTA--TTTAAACATTGA--ATTacca
gi|36 : t----TGC-AC-TGGTC-CCAC-CG--CG-GTGAT--AA------T-ATT-G-T-ATG
gi|36 : tTCACC-GC---GGTGGGACCAGTGCA------AAAC-ACGATGGG---AC-------A-GAC--T-TTTTTA-----TGACAATA-GGACAaaacacgatgggacagacttttttatgacaataggaca
gi|37 : tcatacaatatta---------------T-----G----------T----------CG-GG--A--------TATGTCACTAA-TT-TACATCCA-CACA-T-GTAA-T-TCT-AAA-AATGCA-AT
gi|38 : tgaatgcgattctcCAC-CC--CG-GTGATA-AA------C-ATC-C-C-ATGGTtttca
gi|38 : gggTCACC-GG---GGTG---------CA------AAAC-ACTATGGGA-CAC-------A-AACTTTATTTTTA-----TGACAACA-caaaacactatgggacacaaactttatttttatgacaaca
gi|39 : gggaccatgggatgttta----------A---------------T-----G----------T----------CGCGG--A--------TTGGTCACTAAATT-TACATCCA-CACATT-GTAA-TCTTT-AGA-AATGCA-A
gi|4 : gcgaatgctc----TGC-AC-TTGTC-CAAC-CC--TG-GTGATA-AA------T-ATT-G-C-ATGGTat
gi|4 : ggTCACC-AG---GGTTGGACAAGTGCA------AAAC-ACTATGGGA-CAC-------A-AACGGT-TTTTTA-----TGAAAACA-GGACATGGGCT-AATGATTTTT---G-TAGGTA-TAGATTTG--ATGGGA-CATCTATTTT-TT-CATTAACAAATAAATGCAAAGA-----GTTT---TCCC---ATTGA-TTTGAAGAGAA--T--GATTTACAGTA------------TATTCAGCAA-AGTGT-ATCCCTA-GCA--TGTTCC----AT-TCGTTT---AA-GT-CTTTG----TAACTT-GTAG-AT-AT--TTGTCATTAT-TTCAAATCCAAATCATATAAC--ATGA-GCA-TACACAACTA--TCCCAAC--GAGT--AAGTCAGAAAGGGGATACTTACTC-CTTCGC--AACAGTTG---CGAT----CT----A--C----------CTT-G----------AT--TGGGACTC--CAT--ATGAATT-C------GATT--CTCCCTC--AG-G----------A---------------C-----A----------T----------C-------------------TTACTCA-TT-TACATCCA-CATA-T-GTAA-T-TTT-AGA-AATGCA-ATAAA-A---A-TCT-ACT-----GATT--A--TG-TTTG-CAT--TTA--------T------CA--TTATAAA-----C----ACT---TTTCAACAT------------------------T-----TA---------TT----TA----AGGGTTACTTT---GT--CTAATGTTTTGTC-------TA----T-CTGCAA-TGCGT-aaacactatgggacacaaacggttttttatgaaaacaggacatgggctaatgatttttgtaggtatagatttgatgggacatctattttttcattaacaaataaatgcaaagagttttcccattgatttgaagagaatgatttacagtatattcagcaaagtgtatccctagcatgttccattcgtttaagtctttgtaacttgtagatatttgtcattatttcaaatccaaatcatataacatgagcatacacaactatcccaacgagtaagtcagaaaggggatacttactccttcgcaacagttgcgatctaccttgattgggactccatatgaattcgattctccctcaggacatcttactcatttacatccacatatgtaattttagaaatgcaataaaaatctactgattatgtttgcatttatcattataaacacttttcaacatttatttaagggttactttgtctaatgttttgtctatctgcaatgcgt
gi|40 : ggaccatgcaatatttaTGTGGT-G-G---GACA-C--CA-ACTA--------T-TTT------ACT-CA--AA-CAT-----------ATA--------------T-ATGGGGC-ACA--
gi|41 : TGTGGT-G-G---GACA-C--CA-ACTA--------T-TTT------ACT-CA--AA-CAT-----------ATA--------------T-ATGGGGC-ACA--tgatgttataccggtaag
gi|42 : GTGCA------AAGC-ATGATGGGA-CAG-------A-CA-TAT-TTTTAA-----TGACAGCA-GGACATGGGAC-AACGATTTTT-tgatgttataccggtaag
gi|43 : TAG-T-TTT-AGA-AATGCT-ATAAA-A---A-TCT-ACT-----T-TT--A--TG-TTTG-CAT--TTA--------T------a
gi|44 : tttactcacagtatttc-C--GA----CT--A---GGGT-TCAT-CTGGGG-TC--CATCAATG--TTCCCCAGTTGTTTAACTTCA
gi|45 : ctgcctA----TGC-AC-CGGTC-CCAC-CC--CG-GTGAGA-AATACATGT-ATT-G-C-ATGGTac
gi|46 : ACATTGA--ATTT-CAAA----TGC-AC-CGGT--CCACTCC--CG-GTGAGA-AA--------ATT-ccct
gi|47 : G--AACAAGCTATTCAGCAA-ATTGT-ATCCTAAAGCAAGTGTTCC----AT-tcgt
gi|49 : -CC--CG-GTGATA-AA------T-ATT-G-C-ATGGTt
gi|5 : cggtATATAAC--ACGA-GCA-TTCACAACTG--GCACAAC--TAGT--AGGTCAGAAAGGGGATGTTTACTC-CTTGAC--AACAGTTG---AGTT----TTTTTAA--C-TT-GA----CTT-G---GGGT-TTAT-CTTGGGGTC--CATCAATG--TT-TCCAG-TGTTTAATGCCATG--TG-A----------A---------------T-----GCGATTCTCTGT----------CA-GG--A--------TATGTTACTCA-TG-TACATCCAACACA-T-GTAA-T-TTT-AGA-AATGCA-ATCAA-A-----TCT-ACTTTATGT-TT--G--CA-TTTATCATA-TTAAAAACTAAT------CA--------A-----C----ACT---T-------CCCAACCCTTAATTTTAAGAGA---T-----TA---------CA----TGTGTAA-------TTTT--GTG-T-----------C-------TA----T-CTGCAA-TGCGT-GTCTGT-TA-TG-GGGGAAAAAACCCA--AA-AACAAACA--A----C-ATT-TC--G---TAG---TGTATTCG---AG-GC----TGTTATT-A-GAAA-----------------TT--TGCCAGAGAC-A-A-----TAATGTAACATG--CTG-TA--CA-T------------GTCTCT-G----TTTT-A---A-TTGTGGT-G-ACTTTACA-C--TA-ACATATAC----T-TTT------ACccctaa
gi|6 : ggtaCTG--GCACAACACTAGTTTAGGTCAGA-AAGGGATTTTTACTC-CTTGAC--AACA-TT----ATTT----CT-------T-T--AA----CTT-GACTGGGTCTTAT-CTTGGGGTC--CATCAATG--TC-TTCA--TGTTTAATGCCATGGATGCG----------A---------------TTCTCTG----------T----------CA-GG--A--------TATGTTACTCA-CTGTACATCCAACACA-TTGTAA-T-TTTTAGA-AATGCA-ATCAA-ATTTACTTT-ATT-----T-TTGCA--TACTTTT-CATA-TTAAAACTAA-T------CA--------A-----C----ACT---T-------CCCAACCTAATTTAAAGGATTCACAT-----TG---------TG----TA----A-------TTT---GTG-T-----------C-------TA----T-CT-CAACTGCGT-GTCTGTATA-TG-GGCAAAAAACCAAAACAA-AAC----A--A----C-ATT-TC--G---TAG---T--GAT-----AT-GCGAGGTG-TATT-C-AGA----------------AATT--TGCCAGAGACAATA-----G-ATGTACTATGCTTTGTTA--CA-T------------GTCTCT-GTTAATTGT-GTGACTTT-T-----------ACA-CAACATACTTTTACAAAAT-TCT------AAT-TA--AATCAT-----------ATC--------------T-AT----C-A-A--AACGTaaaattctaattaaagtctatctatcaaactgtaaatctttcatataaagtatgt
gi|7 : ----TGC-AC-TGGTC-CCAC-CC--CG-GTCATA-AA------T-ATT-G-C-ATGGTaaatctttcatataaagtatg
gi|7 : ggACC-GG---GGTGGGACCAGTGCA------AAAC-ACGATGGGA-CAC-------A-AACTTT-GTT--A-----TGACAATA-GAACATGGGAC-AATGATTTTTGT-G-TGTGGA-TA-ATTTGG-ATGGAA-CATCTTTTTT-TTTCATTGACAAA--AATGCAAAAAG----TTTT---TCCCC-----------GAAGAGAA--G--GGTTTACAAGAAAG---------TGATCAGCAA-ATTGT-TTCCCTA-GCAAGTGTTCC----AT-CCGTTT---TT-GT-CTTTG----TAACTT-GCAT-AT---CTTTGTCATTAT-TTCAAATTCAAATACTATAGC--GCGA-TCA-TTCACAACTG--GTGCGAC--TAGT--CAGTCAGACAGGCGATACTTGGTC-CTTGGC--AACAGTTG---GATT----CC----A--C-C----------T-A---G------AT-TTGGGG-TC--CATCAGTG--TT-CCCAG-TGTTTAACTCCATG--TG-A----------A---------------T-----G----------TGATTCTCTGTCA-GG--A--------T--ATT--TCA-TA-TTCATCTA-CA--------------------AATGCA-ACAAA-A---A-TCT-ACT-----T-aaacacgatgggacacaaactttgttatgacaatagaacatgggacaatgatttttgtgtgtggataatttggatggaacatctttttttttcattgacaaaaatgcaaaaagtttttccccgaagagaagggtttacaagaaagtgatcagcaaattgtttccctagcaagtgttccatccgtttttgtctttgtaacttgcatatctttgtcattatttcaaattcaaatactatagcgcgatcattcacaactggtgcgactagtcagtcagacaggcgatacttggtccttggcaacagttggattccacctagatttggggtccatcagtgttcccagtgtttaactccatgtgaatgtgattctctgtcaggatatttcatattcatctacaaatgcaacaaaaatctacttgtcatataaaactaag
gi|8 : ggaccatgcaatatttatgATATAAC--ACGA-GCA-TTCACAACTG--GCACAAC--TAGT--AGGTCAGAAAGGGGATGTTTACTC-CTTGAC--AACAGTTG---AGTT----TTTTTAA--CTT--GA----CTT-G---GGGT-TTAT-CTTGGGGTC--CATCAATG--TT-TCCAG-TGTTTAATGCCATG--TG-A----------ATGCGATTCTC-----T-----G----------T----------CA-GGATA--------T--GTTACTCA-TG-TACATCCA-CACA-T-GTAA-T-TTT-AGA-AATGCA-AT-CA-A---A-TCT-AC------T-TT--A--TG-TTTG-CAT--TTA--------T------CA--T-----A-----T----Agtcatataaaactaag
gi|8 : ggta------------------------T-----TG---------TG----TA----A-------TTT---GTG-T-----------C-------TA----T-CTGCAA-TGCGT-GTCTGT-TA-TG-GGGGAAAAAACCC---AA-AACAAACA--A----C-ATT-TC--G---TAG---TGTATTCG---AG-GC----TGTTATT-A-GAAA-----------------TT--TGCCAGAGAC-A-A-----TAATGTAACATG--CTG-TA--CA-T------------GTCTCT-G----TTTT-A---A-TTGTGGT-G-aaactaatcaacacttcccaacccttaattttaaaggattacattgtgtaatttgtgtctatctgcaatgcgtgtctgttatgggggaaaaaacccaaaacaaacaacatttcgtagtgtattcgaggctgttattagaaatttgccagagacaataatgtaacatgctgtacatgtctctgttttaattgtggtgacttttacactaacat
gi|8 : ggtaatataacacgagcattcacaactggcacaactagtaggtcagaaaggggatgtttactccttgacaacagttgagtttttttaacttgacttggggtttatcttggggtccatcaatgtttccagtgtttaatgccatgtgaatgcgattctctgtcaggatatgttactcatgtacatccacacatgtaattttagaaatgcaatcaaatctactttatgtttgcatttatcatataaaactaatcaacacttcccaacccttaattttaaaggattaca----TGTTAGT-GTAAAA-GTCA------CCACAATT-AAAACAGAGAC-ATG-----T-ACA--GCATG--TTA-CAT-TATT------------GTCTCT-G---acttttacactaacat
gi|9 : ggtaatataacacgagcattcacaactggcacaactagtaggtcagaaaggggatgtttactccttgacaacagttgagtttttttaacttgacttggggtttatcttggggtccatcaatgtttccagtgtttaatgccatgtgaatgcgattctctgtcaggatatgttactcatgtacatccacacatgtaattttagaaatgcaatcaaatctactttatgtttgcatttatcatataaaactaatcaacacttcccaacccttaattttaaaggattacattgtgtaatttgtgtctatctgcaatgcgtgtctgttatgggggaaaaaacccaaaacaaacaacatttcgtagtgtattcgaggctgttattagaaatttgcTCACGACTG--GTGCGAC--TAGT--AAGT---------------TATTC-ATTGGC--AACAATAG---AGTTATTTCT----A--C-CTCGA----CTT-A---AGGT-TCAT-CTGGGGGTC--CATCAATG--TT-CCCAG-TGTTTAACTTCATG--TG-AATGCGATTCTA---------------T-----G----------T----------CG-GGATA--------T--GTTACTCA-TT-TATATCCA-CACA-T-GTAA-T-TTT-AG-------------A-A---A-TCT-ACT-----TATC--A--TA---TA-CAT--GTAAAAC----T------AA--T-----G-----T----AATAAAT-------C------------------------TACAAGTA---------TA----TGTCTAA-------TTT---TT--CT----------C-------TA----T-CTGCAT-TGCGT-GTCTTT-TA-TG-A---------------AA-AA-----A--AACC-C-AGT-TC--A---TAG---T--ACTCG---AT-GC----TGTTATT-A-AAAAGGTCT------A---AAT-------------------------------ATG-------A--TA-T------------GTCTC--------TGT-G---CTTTGTGGT-G-G---GACA-C--CA-ACTC--------T-TTT------TCT-CA--AAGCAT-----------A----------------T-AAGGAAC-ACA--ACAGTTATGGGAA---------G-C-ATGGGA-CACATAC---------------------TTTCAAA----AGC-AC-CGGTC-CCAC-CC--CG-GTGAGA-AA------T-ATT-G-C-GTGGTt
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|48 ): ACCGGTCAATAATTATTGGGGGGTTGGGACCGGTGCATT
Unaligned ( gi|50 ): CCACCATATTAAGGGACTGGTCAATATTTATTG
Unaligned ( gi|51 ): GTTAGGGACTGGTCAATATTTATTGGGGGGTT
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 111111 1111111 1111111111111 222222222 2222222 111 333333333333 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 11 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 555555555555555555555555555555555 1111111111 22222222222222222 11 111111111111 11111111 444444444444444444444444444444 11111111111
lowQualScore : 4 777 000000 3 3 0000000 3 99 3 44 88888 3 4 7 4 3 1 3 3 3 2 3 4 4 55 11 7777777777777 777 4 55 55 777777777 4 4 0 8888 4 888888 44 9999 4 8888888 4 66 4 4 88 3 55 55 5 4 55 2 000 7777 666666666666 7777 3 555 3 3 0 0 44 44 666 33 44 3 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 3 3 6 3 3 2 2 2 2 2 2 3 66666 3 77777 6 99999 3 33 00 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 7777 3 3 3 6 3 3 777777777777777777777777777777777 3 3 999999 555 99 7 555 3 6666 3 3 3 3333333333 77 0 1 22222222222222222 44 3 00 6 555555555555 3 9999 66666 4 2 2 555 3 44 3 77777777 3 888888 3 33 1 444444444444444444444444444444 2 55 0 33 2 2 2 2 66 44444444444 4444 3 1 1 1 22 1 1 1 555555 1 1 1 2
lowQualScore : . ... ...... . . ....... . .. . .. ..... . . . . . . . . . . . . . .. .. ............. ... . .. .. ......... . . . .... . ...... .. .... . ....... . .. . . .. . .. .. . . .. . ... .... ............ .... . ... . . . . .. .. ... .. .. . ......................................................................... . . . . . . . . . . . . ..... . ..... . ..... . .. .. .............................................................................................................................................. .... . . . . . . ................................. . . ...... ... .. . ... . .... . . . .......... .. . . ................. .. . .. . ............ . .... ..... . . . ... . .. . ........ . ...... . .. . .............................. . .. . .. . . . . .. ........... .... . . . . .. . . . ...... . . . .
lowQualScore : 0 000 555555 3 3 8888888 3 11 3 88 33333 3 0 3 0 6 2 6 6 6 0 6 0 0 55 55 1111111111111 111 0 55 55 999999999 0 0 8 5555 0 111111 66 4444 4 7777777 4 11 4 4 66 0 55 55 0 0 00 8 000 7777 888888888888 1111 3 888 3 3 4 4 66 66 777 88 66 3 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 1 1 2 1 1 9 9 9 9 9 3 1 44444 1 77777 2 33333 3 66 44 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 1111 3 1 1 7 3 3 333333333333333333333333333333333 3 3 777777 888 22 2 888 3 5555 1 1 1 9999999999 88 4 5 77777777777777777 66 3 44 2 888888888888 1 1111 00000 8 9 9 444 1 22 1 77777777 1 888888 3 99 9 555555555555555555555555555555 5 99 8 66 7 7 7 5 33 66666666666 0000 8 9 8 7 33 7 2 7 222222 8 8 9 2
consensus : TCACC-GG---GGTGGGACCAGTGCA------AAAC-ACGATGGGA-CAC-------A-AACTTT-TTTTTA-----TGACAACA-GGACATGGGAC-AATGATTTTT-T-G-TGTGGA-TA-ATTTGG-ATGGGA-CATCTATTTT-TT-CATTGACAAA--AATGCAAAGA-----TTTT---CCCCC--ATTGA-TTTGAAGAGAA--T--GATTTACAGGAAAG--AACAAGATATTCAGCAA-ATTGT-ATCCCTAAGCAAGTGTTCC----AT-CCGTTT---TT-GT-CTTTG----TAACTT-GCAT-ATTATCTTTGTCATTAT-TTCAAATTCAAATCATATAGC--ACGA-GCA-TTCACAACTG--GCGCGAC--TAGT--AAGTCAGACAGGGGATGCTTACTC-CTTGGC--AACAGTTG---AGTT----CT----A--C-C--GA----CTT-G---GGGT-TCAT-CTGGGGGTC--CATCAATG--TT-CCCAG-TGTTTAACTCCATG--TG-A----------A---------------T-----G----------T----------CG-GG--A--------T--GTTACTCA-TT-TACATCCA-CACA-T-GTAA-T-TTT-AGA-AATGCA-ATAAA-A---A-TCT-ACT-----T-TT--A--TG-TTTG-CAT--TTA--------T------CA--T-----A-----T----ACT---T-------C------------------------T-----TA---------TA----TG----A-------TTT---GT--C-----------C-------TA----T-CTGCAA-TGCGT-GTCTGT-TA-TG-G---------------AA-AA-----A--A----C-ATT-TC--G---TAG---T--ACTCG---AT-GC----TGTTATT-A-AAAA-GTCT------T---AATT-GTGCCAGAGAC-ATA-----T-ATATAACATG--TTA-TA--TA-T------------GTCTCT-G---ATTGT-G---CTTTGTGGT-G-G---GACA-C--CA-ACTT--------T-TTT------ACT-CA--AAGCAT-----------AT---------------T-ATGGGAC-ACA--AACGTTTTCTTAAAGATG-TTTG-C-ATGGGA-CACATACTTT--TTTTAACATTGA--ATTTTCAAA----TGC-AC-CGGTC-CCAC-CC--CG-GTGAGA-AA------T-ATT-G-C-ATGGT
Reference ( family-1488 ) : TCACC-GG---GGTGGGACCAGTGCA------AAAC-ACGATGGGA-CAC-------A-AACTTT-TTTTTA-----TGACAACA-GGACATGGGAC-AATGATTTTT-T-G-TGTGGA-TA-ATTTGG-ATGGGA-CATCTATTTT-TT-CATTGACAAA--AATGCAAAGA-----TTTT---CCCCC--ATTGA-TTTGAAGAGAA--T--GATTTACAGGAAAG--AACAAGATATTCAGCAA-ATTGT-ATCCCTAAGCAAGTGTTCC----AT-CCGTTT---TT-GT-CTTTG----TAACTT-GCAT-ATTATCTTTGTCATTAT-TTCAAATTCAAATCATATAGC--ACGA-GCA-TTCACAACTG--GCGCGAC--TAGT--AAGTCAGACAGGGGATGCTTACTC-CTTGGC--AACAGTTG---AGTT----CT----A--C-C--GA----CTT-G---GGGT-TCAT-CTGGGGGTC--CATCAATG--TT-CCCAG-TGTTTAACTCCATG--TG-A----------A---------------T-----G----------T----------CG-GG--A--------T--GTTACTCA-TT-TACATCCA-CACA-T-GTAA-T-TTT-AGA-AATGCA-ATAAA-A---A-TCT-ACT-----T-TT--A--TG-TTTG-CAT--TTA--------T------CA--T-----A-----T----ACT---T-------C------------------------T-----TA---------TA----TG----A-------TTT---GT--C-----------C-------TA----T-CTGCAA-TGCGT-GTCTGT-TA-TG-G---------------AA-AA-----A--A----C-ATT-TC--G---TAG---T--ACTCG---AT-GC----TGTTATT-A-AAAA-GTCT------T---AATT-GTGCCAGAGAC-ATA-----T-ATATAACATG--TTA-TA--TA-T------------GTCTCT-G---ATTGT-G---CTTTGTGGT-G-G---GACA-C--CA-ACTT--------T-TTT------ACT-CA--AAGCAT-----------AT---------------T-ATGGGAC-ACA--AACGTTTTCTTAAAGATG-TTTG-C-ATGGGA-CACATACTTT--TTTTAACATTGA--ATTTTCAAA----TGC-AC-CGGTC-CCAC-CC--CG-GTGAGA-AA------T-ATT-G-C-ATGGT
gi|1 : TCAC--AG---GGTGGGAACA-TGCATAAAAAAAACCAC-ATGGGAACACTTTTCTTACAACCTT-TTTT-A-----T-ACAAC--GGATA-GGGATTAAAGATTTTT-T-GGTGTGGAATA-ATTTGGTATGG-A-CAT-TAACTT-AT-AATT-ACAAA--A--GCAAAGA-----TTT----CCCTG--ATTGA-TTTGAAGGAAAATT--GATTT-C-GAAAAG--AATAAGATACT-AGCAAGATTGT-TTCCCCTACAAAGTGGTCCAAAAAT-CTGTTT---TT-GT--TTAGTCCCTAACTT-GCATCAT--TCTTTGTCATT--------ATTCAAATCATATAGC--ACGATGCA-TTCACAACTGGTGCACAAC--TA-T--AA-TCAGACAGGGG-TGTCTATTCTTTTGGC--AATAGTTGA--AGTT----CC----T--T-C--GA----CTTAG---GGGT-TCAT-CT--GGGTCCGCATCAATG--------------TCAACTCAATG--TG-A----------ATGCGATC--------T-----G----------T----------CA-GAT-A--------T--GTTAGTC---C-TACAT-TA-CTAA-T-GTA----TTT-AGA-AATGCATATAAAGA---A-TCTAACT-----T-GT--ATTTG-TTTG-CATAATCA--------TATAAAACA--T-----A-----TTTACACT---T-------C------------------------T-----TA---------AA----TA----A-------TTTAAGGTTAC-----------T-------TACTTTT-TTTCAA-T---T-ATTTGTCTA-C------------------------------------C-ATT-TC--A---TAGGCAT--ACTTG---AT-GC----TG-TA---A-AAAG-GTCT------T---AACTGGTGCAAAA------A-----T-AACTTACATG--TTA-TA--TA-TACCGCGCGATTGGTGTCT-G---ATTAT-----CTTTGTGGT-GTG---GA
gi|1 : agtgaccagcaatattcactattACA-T--CA-ATTT--------T-TTA------ACTTCA--AATCAT-----------AT---------------A-ATGG-AC-AAATCAACGTTTTCTTAA-GAT--TTTG-C-ATGGGA-CA--TACTTT--TTG-AACAAAGA--ATTTTCAAA----TGCAAC-CAGTC-CC-T-AC--CG-GTGAGA-AA------T-A-T-G-C-ATGGTtcaagaaattagacaatataataaaaattataacatcaattttttaacttcaaatcatataatggacaaatcaacgttttcttaagattttgcatgggacatactttttgaacaaagaattttcaaatgcaaccagtccctaccggtgagaaatatgcatggtcccat
gi|10 : agtgaccagcaatattcactatttcacagggtgggaacatgcataaaaaaaaccacatgggaacacttttcttacaaccttttttatacaacggatagggattaaagattttttggtgtggaataatttggtatggacattaacttataattacaaaagcaaagatttccctgattgatttgaaggaaaattgatttcgaaaagaataagatactagcaagattgtttcccctacaaagtggtccaaaaatctgtttttgtttagtccctaacttgcatcattctttgtcattattcaaatcatatagcacgatgcattcacaactggtgcacaactataatcagacaggggtgtctattcttttggcaatagttgaagttccttcgacttaggggttcatctgggtccgcatcaatgtcaactcaatgtgaatgcgatctgtcagatatgttagtcctacattactaatgtatttagaaatgcatataaagaatctaacttgtatttgtttgcataatcatataaaacatatttacacttcttaaataatttaaggttacttactttttttcaattatttgtctaccatttcataggcatacttgatgctgtaaaaaggtcttaactggtgcaaaaataacttacatgttatatataccgcgcgattggtgtctgattatctttgtggtgtggatcaagaaattagacaatataataaaaattataCATG--TG-A----------A---------------T-----GCGATTCTCTGT----------CA-GG--A--------TACGTTA---A-TT-TACATCCA-CACA-T-GTAA-T-TTT-AGA-AATACC-ATAAA-A---G-TCT-ACT-----T-TT--A--TG-CT----A-----A--------T------TG--T-----A-----C----ACT---T-------C------------------------T-----TAACCTTTATTTAAGGATG----AC------TTT---GT--C-----------TAGTTTTGTC----T-CTGCAA-TGCAT-GTCTAT-TA-TG-G---------------AA-AA-----A--C----C-ATT-TC--A---GAG---T--ACTCG---AT-GC----TGTTATT-A-AAAA-GTCT------T---AATT-GTGCCAGATAC-ATA-----T-ATAC--CATT--TTA-TG--TT-T------------GTATCT-G---ATTGT-G---CTTTCTGGT-G-G---GACA-C--CA-ACTT--------T-TTTCTTTTTACT-CATAAAGCAT-----------AT-----------------ATGGGAC-ACA--AACTTTTTCTTAAAGATG-TTTG-C-AAGGGA-CACATACTTT--TTTTAACATTGA--ATTTTCAAA----TGT-AC-CGGTC-CCAC-CC--CG-GAGAGA-AA------T-ATT-G-C-ATGGTcccat
gi|11 : TGCTTACTC-CTTGGC--AATGGTTG---AGTT----CT----A--C-CTCGA----CTT-G---GTGT-TCCT-CTGGCGGCC--TATCAATG--TT-CTCAG-TGTTTAACTCCATG--TG-ATGCG------ATTCTT----------T-----G----------T----------CA-AG--ATT------T--GTTACTAA-TT-TACATCCA-CAC--------------------ATGCG-ATGAA-A---A-TCT-ACT-----T-TT--A--TG-TTTC-TAT--TTT--------T------TATTT-----AAGGATT----ACT---TTG-----C------------------------C-----TA----------A----T-------------CTT---AG--T-----------C-------TA----T-GTGCAC-TGCGT-G-ATGG-AACTG-A---------------AA-AA-----A--AAACCC-ATT-TC--A---TAG---T--ACTGG---AT-GT----TGTTATT-A-GAAA-GTCTTACATGT---AATT-GTGCCAGATAC---A-----T-ATATGACATacct
gi|12 : GTC-CCAC-CC--TG-GTGAGA-AA------A-ATT-G-C-ATGGTc
gi|12 : gatC-AGGGTGGGA-CAC-------A-AACTTT-TTT--A-----TGACAACA-AGACATGGGAC-GATGAGTTTC-T-G-TGTGGA-TA-ATATGG-ATTGAA-CATCTATTTT-TT-C-TTCAT-------TGC-----------------CCCCC--ATTGC-TTTGAAGAGAA--T--GATTTACAAGAAAGTGAACAAGATGTTCAGCAA-ATTGT-ATCCCTAAGCAAGTGTCCC----AT-CCGTTT---TTTGT-CTTTG----TAACTT-GCAT-AT---CTTTGTCATTAT-TTCAAATTCAAATCATATAGC--ACGA-GCA-TTCCCAACTG--acaaacttttttatgacaacaagacatgggacgatgagtttctgtgtggataatatggattgaacatctattttttcttcattgccccccattgctttgaagagaatgatttacaagaaagtgaacaagatgttcagcaaattgtatccctaagcaagtgtcccatccgttttttgtctttgtaacttgcatatctttgtcattatttcaaattcaaatcatatagcacgagcattcccaactg
gi|13 : gataccatgcaatttttctcac-TGCTT-GTCTGT-TA-TG-G---------------AATAA-----A--C----C-ATT-TC--A---TAG---T--ACTCG---AT-GT----TGTTATC-A-AAAA-GTCT------T---AATT-GTGCCAGAGAC-ATACAGTGT-ATATAACATG--CTG-TG--CA-T------------GTCTCT-G---ATTGA-G---CTTTGT-GT-T-G---GACA-C--CA-ACTT--------T-TTT------ACT-CA--AAGCAT-----------A----------------C-ATGGGAC-AAA--AACGTTTTCTTAAAGATG-TTTG-C-ATGGGA-CATATAC---------------------------------GC-AC-CGGTC-CCA--CC--CG-GTGAGA-AA------T-ATT-G-
gi|14 : atcacgtcttcatatctcacgcatgcattaattatTTATC-GGCCTGGTGGGACCAGTGCA------ACAC-TCGATGGGA-CAC-------A-AATCTT-TTTTTAGCAAATGCCAACATGGTCATGGGA--AATGAGTTTT-T-G-TGTG---------TGG-ATAT---CATTTATTTTCTT-CATTGACGAA--AATGCA--GA-----TTTT---CCCAA--ATTGA-TTTGAAGAGAA--T--GATTTATAGGAAAGTGAACACGATATTCCGCAA-ATTGT-ATCCC-AAACAAGCGTTCC----AT-CCGTTT---TT-GT-CTTTG----TAACTT-GCA----TATCTTTGCCATTAT-TTCAAAT
gi|15 : a-------TTT---GT--C-------------------TA----T-CTGCAA-TGCGT-GTCTGT-TA-CGCG---------------AA-AA-----A--A----C-ATT-TC--A---TAG---T--ACACACATAT-GC----TGTTATC-A-AAAA-GTCT------T---AATT-GTGC-AGAGAC-A-G-----T-A-ATAACATG--TTA-TAG-TAAT------------GTCTCT-G---ACTTTCG---CTTTG--GTAG-G---GAC--C--CA-ACTT--------T-TTT------ACT-CA--AGATAT-----------AT---------------G-A--AGAC-ACA--AACGTTTTCTTAAAGATG-TTTG-C-ATGGGA--ACATAC-------------------ATTTTC-AA----TGC-AA-CGGT--CCAC-CC--CA-GTGAG--AA------T-ATT-GCC-ATGGT
gi|16 : tctaat-TGTGAA----ATTTGG-ATGGGAGCATCTATTTT----CATTGACAGA--AATGCACAGACCCCCCCCC---CCCCC--ATTGA-TTTAGAGGAAA--T--G----------AAG--AAC---GTATTCAGCAA-ATTGT-ATCCGT-AGAAAGTGTTCC----ATAGCATTT------------------CA-------AT-ATT-------TCA--AA-TTCAAATT---AT-ATATAGC--ACGA-GCA-TTCAC-ACTGA-GTGCGAC--TAGT--AAGTCAGACA-GGGATGCTTACTccc
gi|17 : tgtgt-T-G-TGTGAA-TG-ATTTGG-GTGGGA-TATCTATTTT-TT-CATTGAGACA--AATGCAACCC-----CCCC---CCCCCCAATTGAGTTTCAAGAGAA--TATGATTTATAGGAAAG------------TGAACAA-ATTGT-ATCCCTAAGCAAGTGTTCC----AT-CCGTTT---TT-GC-CTTTG----TAACTT-GCA----TATCTTTATCATTAT-TTCAAATTCAAATCATATA
gi|18 : tg----TGC-AC-TGGTA-CCAT-CA--CG-GTGATA-AA------T-ATC-G-C-ATGGT
gi|18 : TCACC-GT---GATGGTACCAGTGCA------AAAC-ACGATGGGA-CAC-------A-AAC-AT-TTTTTA-----TGACAACA-GGACATGAGAC-AATGATTTTTGT-A-TGTGGA-TA-ATTTGG-ATGGGA-CATCTATTTT-TT-CATTGACAAA--AATACAATGA-----TTTT----TCCC--ATTAA-TTTTGAGAGAA--T--GATTaaacacgatgggacacaaacattttttatgacaacaggacatgagacaatgatttttgtatgtggataatttggatgggacatctattttttcattgacaaaaatacaatgatttttcccattaattttgagagaatgattc
gi|19 : accatgcgatatttaA--TA-T------------ATCTC--G---GTTGT-G---CATTGTGGT-G-G---GACGGC--CA-ACTT--------T-TTT------ACT-CA--TAGCATTGTTTCGTAACATGTATA----------T-ATGAGACAACAC-AACG-TTTCTT-AAGAT--TTTG-C-AT------------TTTGGTTTTGA-----A--ATTTTCAAA----TGCTACACGGCC-CCGC-CC--CG-GT--AA-AA------T-ATTGG-CAATGGTc
gi|2 : TCACCTGG---GGTGGGACCGGTGCA------AAAC-ACGATGGGA-CAC-------A-AACTTT-TTTTTA-----TGACAACA-GGGCATGGAAC-AATGATTTTT-T-A-TGTGAA-TA-ATTTGG-ATGGGA-CATCTATTTT-TT-CAATGATAAA--AATGCAAAGA-----TTTTTGTCCCAT--ATTGA-TTTCAAGAGAA--T--GATTTACAGGAAAG--AACAAGATATTCAGCAA-ATTGT-ATCCCTAAGCAAGTCTTCC----AT-CTGTTT---TT-CC-CTTGG----TAACTT-GTAT-ATTATCTTTGTCATTAT-TTCAAATTCAAATCATATAGC--ACAA-GCA-TTCACTACTG--GTGCGAC--TAGT--AAGACAGACAGAAGATGCTTACTC-C--------------G---AGTT----CT----A--T----GA----CTT-A---GGGC-TCAT-CTGAGGGTT--CATC----------------GTTTAACTCCATA--TG-A----------A---------------T-----G----------T----------CA-TG--A--------T--GTTACTCA-TT-TACATTCA-CACA-T-GTAA-T-TTT-AGA-AATGCT-ATAAA-A---T-TCT-ACT-----T-TC--A--TG-TTTG-CAT--TTA--------T------CA--T-----G-----T----ACT---T-------C------------------------T-----TA----------A----CG----A-------TTT---GT----------------------TA----T-CAGCA--TGCGT-GTCTGT--A-GG-G---------------AA-AA-----A--A----C-ATTGTC--G---C-G---T--A-------ATAGT----TCTTATTTA-AAAA-GTCT------T---GATT-GTGTCAGGGAC-ATA-----T-ATATAACATG--TTA-TAGATA-T------------GTCTCT-A---ATTGT-G---CTTTGTGGT-G-G---GACA-C--CA-ACAT--------T-TTT------ACT-CA--AAGCAT-----------AT---------------TTATGGGAC-ACA--AACATCTTCTTAAAGATG-TTTG-C-ATGGGA-CACATACTTT--TTTTAACATTGA--ATTTTCAAA----TGC-AC-CGGTC-CCAC-CC--CG-GTGAGA-AA------T-ATT-G-C-ATGGTccct
gi|20 : ----TGC-AC-TGGTC-CCAC-CC--CG-GTGATA-AA------C-ATT-G-C-ATCGT
gi|20 : gTCACC-GG---GGTGGGACCAGTGCA------AAAC-ACGATGGGA-CAC-------A-AAC--T-TTTTAA-----TGACAACA-GGCAATGGG-C-AATGACTTGT-T-G-TGTAGA-TA-AATTGG-ACGGGA-CATTTATTTaaacacgatgggacacaaactttttaatgacaacaggcaatgggcaatgacttgttgtgtagataaattggacgggacatttattt
gi|21 : gacgatgcaatgttta--AAGCAT-----------AT-----------------ATGGGTC-ACA--AAAGTTTTCTGCAAGATG-TTTG-C-ATGGGA-CACATACTTT--TTTTAACATTGA--ATTTTCAAA----TGC-AC-CGGTC-CCAT-CC--CG-GTGAGA-AA------T-ATT-G-C-ATGGT
gi|22 : tAACA-GGACATGGGAC-AATGATTTTT-TTG-TGTAGA-TA-ATCTGG-ATGGGA-CTTCTATTTT-TT--ATTGACAAA--AATGCAAAGA-----TTTT----CCTC--ATTGG-TTTGAAGAGAA--T--GATTTACAGGctct
gi|23 : GGAC-ACT--ACC-TGTTCTTAAAGATC-TTTT-TTGTGGGAACACATACTTTA-TTTTGAAATT-A--ATTTT-AAA------C-AC-CG-TC-CCAC-CC--C--GTGATAGAA------T-ATT-G-C-ATGGT
gi|24 : tTGGGAC-ACA--AACGTTTTCTTAAAGATG-TTCG-C-ATGGGA-CACATACTTT--TGTT----TGGA--ATTTTCAAA----TGC-AC-CGGCC-CCAC-CC--CG-GTGAAA-AA------T-AGT-G-C-ATGGTccctt
gi|25 : TG--TTA-TA--TA-T-------------TCTCT-G---GTTGT-G---CATTGTGGT-G-G---GACG-C--CA-ACTT--------T-TTT------ACT-CA--TAGCAT-----------ATGTTTGTACATGTATAT-ATGAGAC-ACA--AACGTTTTCTTAAAGAccc
gi|26 : AA-A---A-TCT-ACT-----T-TTT-A--TG-TTTA-CAT--TTT--------T------CA--T-----A-----T----A
gi|27 : -CA--AAGCAT-----------AT---------------TTATGGGAC-ACA--AACATGTTCTTAAAGATG-ATTG-C-ATGGGA-CACGCACTTT--TTTTAACACTAA--ATTTTCAAA----TGC-AC-CGGTC-CCAC-CC--Caaactaattaacacttctcaacttttatataaggattactccgtctaatttttgtctatctgcaatgc
gi|28 : -----T----ACT---T-------T------------------------G-----TC---------TAA---TG------------TTT---GT--C-------------------TA----TTCTGCAA-TGCGT-GTCTGT-TA-TG-A---------------AA-AA-----A--A----
gi|29 : ttatcatataaaactaattaacacttctcagcctttatttaaggatAAAAA-G-TTTG-C-ATGGGA-TAAATACATT--TTTAAACATTGAC-ATTTTCAAA----TGC-AC-CGGTC-CCCC-AT--TGCGTGAGA-AA------TGATT-G-a
gi|3 : ATATTC-GCGG-AATGTCATCCCTAA---AATGTTTT-----T-CCGTATAAATT-GTATTTTG----TAACATAGCAT-AT---CTCTGTCAATATATTTAAATTCAAATCACACCACCTACGA-GCACTTCACAAATG--TTGC------AG--------GGACAGGGGATGCTTATCC-CTTGGCAAAACA-TTGGGAAGTT----CT----ATCT-C--GATGTGTTT-G---GGGT-TCATGCTGGGGGTC--CATCAGTG--TT--CCAG-TTGTTAACTCCATG--TG-A----------ATAGGCGATTTTACCTT-----G----------T----------CG-AT--ACATTGTAGT--GTTAATCA-TT-GACATCCA-CACA-A-GTGACT-TTT-CGATATTGCA-ATAAA-A---A-TCG-ACC-----T-TT--ACTTT-CTTG-TAT--TTA--------T------CAT-T-----A-----T----AAT---TAA-----T------------------------T-----TA---------TA----tgccattgtcccta
gi|3 : atT--TTA--------T------CA--C-----AGTAATT----ACT---T--------------------------------------TA---------TA----TG----GGT-----TTT---GTGGC-----------T-------TA----C-TGGCAA-TGCATTGTCTGT-TA-TA-G---------------AA-AA-----ACAA----CGAGT-TC--A---TAG---T--A-TCG---AT-GC----TTCAATT-T-AAAA-GTCT------T---AA-A-GTGTC-----C-A------------------G--TTA-TA--TA-T------------GTCTCTGG---ATTAT-G---CCTTGTGGT---G---GACA-C-----ATTT--------TGTTT------ACgctttttaaactttatcacagtaattactttatatgggttttgtggcttactggcaatgcattgtctgttatagaaaaacaacgagttcatagtatcgatgcttcaatttaaaagtcttaaagtgtccagttatatatgtctctggattatgccttgtggtggacacattttgtttacca
gi|30 : atatattcgcggaatgtcatccctaaaatgtttttccgtataaattgtattttgtaacatagcatatctctgtcaatatatttaaattcaaatcacaccacctacgagcacttcacaaatgttgcagggacaggggatgcttatcccttggcaaaacattgggaagttctatctcgatgtgtttggggttcatgctgggggtccatcagtgttccagttgttaactccatgtgaataggcgattttaccttgtcgatacattgtagtgttaatcattgacatccacacaagtgacttttcgatattgcaataaaaatcgacctttactttcttgtatttatcattataattaatttatagctttttaaacA-----A--C----C-ATT-TCTAGATCTAG---T--A-TCG---AT-GC----TGTTGTT-A-AAAC-GTCT------T---AATT-GTACC--AGAC-ATA-----T-ATca
gi|31 : gtattaagtatttgttcggactctTTCTTAA-GATG-TTTGAC-AAGAGA-CACATACTTT--TTTAAACGATGAGCATTTTCAAA----TGT-AC---GCCATCAC-TTTACT-GTGAGA-A
gi|32 : aTTGGC--AACAGCTG---AGTT----CT----A--C-CTCGA----CTT-A---GGGT-TCAT-CTGGGAGTC--TATCAATG--TT-CCCAG-TGTTTAACTCAACG--TG-A----------A---------------T-----G----------
gi|33 : -GG---GTTGGGACCGGTGCC------AAAT-GTAATAGGA-CAC-------A-CACTTA-TTGATA-----AGACA
gi|34 : ttagggactggtcaatatttattgggG-C-ATGGGA-CATACA-TTT--TTTCAA---TGT--ATATCTAAAAGTTTGC-AT-CTGTC-CCAT-TC--CG-GTGATA-AA------T-ATT-G-c
gi|35 : A--AAGCAT-----------AT---------------T--TTGGAC-ATA--TACGTTTT-TAAAAGATGCTTTC-C-TTGGGA-CACATGCTTA--TTTAAACATTGA--ATTacca
gi|36 : t----TGC-AC-TGGTC-CCAC-CG--CG-GTGAT--AA------T-ATT-G-T-ATG
gi|36 : tTCACC-GC---GGTGGGACCAGTGCA------AAAC-ACGATGGG---AC-------A-GAC--T-TTTTTA-----TGACAATA-GGACAaaacacgatgggacagacttttttatgacaataggaca
gi|37 : tcatacaatatta---------------T-----G----------T----------CG-GG--A--------TATGTCACTAA-TT-TACATCCA-CACA-T-GTAA-T-TCT-AAA-AATGCA-AT
gi|38 : tgaatgcgattctcCAC-CC--CG-GTGATA-AA------C-ATC-C-C-ATGGTtttca
gi|38 : gggTCACC-GG---GGTG---------CA------AAAC-ACTATGGGA-CAC-------A-AACTTTATTTTTA-----TGACAACA-caaaacactatgggacacaaactttatttttatgacaaca
gi|39 : gggaccatgggatgttta----------A---------------T-----G----------T----------CGCGG--A--------TTGGTCACTAAATT-TACATCCA-CACATT-GTAA-TCTTT-AGA-AATGCA-A
gi|4 : gcgaatgctc----TGC-AC-TTGTC-CAAC-CC--TG-GTGATA-AA------T-ATT-G-C-ATGGTat
gi|4 : ggTCACC-AG---GGTTGGACAAGTGCA------AAAC-ACTATGGGA-CAC-------A-AACGGT-TTTTTA-----TGAAAACA-GGACATGGGCT-AATGATTTTT---G-TAGGTA-TAGATTTG--ATGGGA-CATCTATTTT-TT-CATTAACAAATAAATGCAAAGA-----GTTT---TCCC---ATTGA-TTTGAAGAGAA--T--GATTTACAGTA------------TATTCAGCAA-AGTGT-ATCCCTA-GCA--TGTTCC----AT-TCGTTT---AA-GT-CTTTG----TAACTT-GTAG-AT-AT--TTGTCATTAT-TTCAAATCCAAATCATATAAC--ATGA-GCA-TACACAACTA--TCCCAAC--GAGT--AAGTCAGAAAGGGGATACTTACTC-CTTCGC--AACAGTTG---CGAT----CT----A--C----------CTT-G----------AT--TGGGACTC--CAT--ATGAATT-C------GATT--CTCCCTC--AG-G----------A---------------C-----A----------T----------C-------------------TTACTCA-TT-TACATCCA-CATA-T-GTAA-T-TTT-AGA-AATGCA-ATAAA-A---A-TCT-ACT-----GATT--A--TG-TTTG-CAT--TTA--------T------CA--TTATAAA-----C----ACT---TTTCAACAT------------------------T-----TA---------TT----TA----AGGGTTACTTT---GT--CTAATGTTTTGTC-------TA----T-CTGCAA-TGCGT-aaacactatgggacacaaacggttttttatgaaaacaggacatgggctaatgatttttgtaggtatagatttgatgggacatctattttttcattaacaaataaatgcaaagagttttcccattgatttgaagagaatgatttacagtatattcagcaaagtgtatccctagcatgttccattcgtttaagtctttgtaacttgtagatatttgtcattatttcaaatccaaatcatataacatgagcatacacaactatcccaacgagtaagtcagaaaggggatacttactccttcgcaacagttgcgatctaccttgattgggactccatatgaattcgattctccctcaggacatcttactcatttacatccacatatgtaattttagaaatgcaataaaaatctactgattatgtttgcatttatcattataaacacttttcaacatttatttaagggttactttgtctaatgttttgtctatctgcaatgcgt
gi|40 : ggaccatgcaatatttaTGTGGT-G-G---GACA-C--CA-ACTA--------T-TTT------ACT-CA--AA-CAT-----------ATA--------------T-ATGGGGC-ACA--
gi|41 : TGTGGT-G-G---GACA-C--CA-ACTA--------T-TTT------ACT-CA--AA-CAT-----------ATA--------------T-ATGGGGC-ACA--tgatgttataccggtaag
gi|42 : GTGCA------AAGC-ATGATGGGA-CAG-------A-CA-TAT-TTTTAA-----TGACAGCA-GGACATGGGAC-AACGATTTTT-tgatgttataccggtaag
gi|43 : TAG-T-TTT-AGA-AATGCT-ATAAA-A---A-TCT-ACT-----T-TT--A--TG-TTTG-CAT--TTA--------T------a
gi|44 : tttactcacagtatttc-C--GA----CT--A---GGGT-TCAT-CTGGGG-TC--CATCAATG--TTCCCCAGTTGTTTAACTTCA
gi|45 : ctgcctA----TGC-AC-CGGTC-CCAC-CC--CG-GTGAGA-AATACATGT-ATT-G-C-ATGGTac
gi|46 : ACATTGA--ATTT-CAAA----TGC-AC-CGGT--CCACTCC--CG-GTGAGA-AA--------ATT-ccct
gi|47 : G--AACAAGCTATTCAGCAA-ATTGT-ATCCTAAAGCAAGTGTTCC----AT-tcgt
gi|49 : -CC--CG-GTGATA-AA------T-ATT-G-C-ATGGTt
gi|5 : cggtATATAAC--ACGA-GCA-TTCACAACTG--GCACAAC--TAGT--AGGTCAGAAAGGGGATGTTTACTC-CTTGAC--AACAGTTG---AGTT----TTTTTAA--C-TT-GA----CTT-G---GGGT-TTAT-CTTGGGGTC--CATCAATG--TT-TCCAG-TGTTTAATGCCATG--TG-A----------A---------------T-----GCGATTCTCTGT----------CA-GG--A--------TATGTTACTCA-TG-TACATCCAACACA-T-GTAA-T-TTT-AGA-AATGCA-ATCAA-A-----TCT-ACTTTATGT-TT--G--CA-TTTATCATA-TTAAAAACTAAT------CA--------A-----C----ACT---T-------CCCAACCCTTAATTTTAAGAGA---T-----TA---------CA----TGTGTAA-------TTTT--GTG-T-----------C-------TA----T-CTGCAA-TGCGT-GTCTGT-TA-TG-GGGGAAAAAACCCA--AA-AACAAACA--A----C-ATT-TC--G---TAG---TGTATTCG---AG-GC----TGTTATT-A-GAAA-----------------TT--TGCCAGAGAC-A-A-----TAATGTAACATG--CTG-TA--CA-T------------GTCTCT-G----TTTT-A---A-TTGTGGT-G-ACTTTACA-C--TA-ACATATAC----T-TTT------ACccctaa
gi|6 : ggtaCTG--GCACAACACTAGTTTAGGTCAGA-AAGGGATTTTTACTC-CTTGAC--AACA-TT----ATTT----CT-------T-T--AA----CTT-GACTGGGTCTTAT-CTTGGGGTC--CATCAATG--TC-TTCA--TGTTTAATGCCATGGATGCG----------A---------------TTCTCTG----------T----------CA-GG--A--------TATGTTACTCA-CTGTACATCCAACACA-TTGTAA-T-TTTTAGA-AATGCA-ATCAA-ATTTACTTT-ATT-----T-TTGCA--TACTTTT-CATA-TTAAAACTAA-T------CA--------A-----C----ACT---T-------CCCAACCTAATTTAAAGGATTCACAT-----TG---------TG----TA----A-------TTT---GTG-T-----------C-------TA----T-CT-CAACTGCGT-GTCTGTATA-TG-GGCAAAAAACCAAAACAA-AAC----A--A----C-ATT-TC--G---TAG---T--GAT-----AT-GCGAGGTG-TATT-C-AGA----------------AATT--TGCCAGAGACAATA-----G-ATGTACTATGCTTTGTTA--CA-T------------GTCTCT-GTTAATTGT-GTGACTTT-T-----------ACA-CAACATACTTTTACAAAAT-TCT------AAT-TA--AATCAT-----------ATC--------------T-AT----C-A-A--AACGTaaaattctaattaaagtctatctatcaaactgtaaatctttcatataaagtatgt
gi|7 : ----TGC-AC-TGGTC-CCAC-CC--CG-GTCATA-AA------T-ATT-G-C-ATGGTaaatctttcatataaagtatg
gi|7 : ggACC-GG---GGTGGGACCAGTGCA------AAAC-ACGATGGGA-CAC-------A-AACTTT-GTT--A-----TGACAATA-GAACATGGGAC-AATGATTTTTGT-G-TGTGGA-TA-ATTTGG-ATGGAA-CATCTTTTTT-TTTCATTGACAAA--AATGCAAAAAG----TTTT---TCCCC-----------GAAGAGAA--G--GGTTTACAAGAAAG---------TGATCAGCAA-ATTGT-TTCCCTA-GCAAGTGTTCC----AT-CCGTTT---TT-GT-CTTTG----TAACTT-GCAT-AT---CTTTGTCATTAT-TTCAAATTCAAATACTATAGC--GCGA-TCA-TTCACAACTG--GTGCGAC--TAGT--CAGTCAGACAGGCGATACTTGGTC-CTTGGC--AACAGTTG---GATT----CC----A--C-C----------T-A---G------AT-TTGGGG-TC--CATCAGTG--TT-CCCAG-TGTTTAACTCCATG--TG-A----------A---------------T-----G----------TGATTCTCTGTCA-GG--A--------T--ATT--TCA-TA-TTCATCTA-CA--------------------AATGCA-ACAAA-A---A-TCT-ACT-----T-aaacacgatgggacacaaactttgttatgacaatagaacatgggacaatgatttttgtgtgtggataatttggatggaacatctttttttttcattgacaaaaatgcaaaaagtttttccccgaagagaagggtttacaagaaagtgatcagcaaattgtttccctagcaagtgttccatccgtttttgtctttgtaacttgcatatctttgtcattatttcaaattcaaatactatagcgcgatcattcacaactggtgcgactagtcagtcagacaggcgatacttggtccttggcaacagttggattccacctagatttggggtccatcagtgttcccagtgtttaactccatgtgaatgtgattctctgtcaggatatttcatattcatctacaaatgcaacaaaaatctacttgtcatataaaactaag
gi|8 : ggaccatgcaatatttatgATATAAC--ACGA-GCA-TTCACAACTG--GCACAAC--TAGT--AGGTCAGAAAGGGGATGTTTACTC-CTTGAC--AACAGTTG---AGTT----TTTTTAA--CTT--GA----CTT-G---GGGT-TTAT-CTTGGGGTC--CATCAATG--TT-TCCAG-TGTTTAATGCCATG--TG-A----------ATGCGATTCTC-----T-----G----------T----------CA-GGATA--------T--GTTACTCA-TG-TACATCCA-CACA-T-GTAA-T-TTT-AGA-AATGCA-AT-CA-A---A-TCT-AC------T-TT--A--TG-TTTG-CAT--TTA--------T------CA--T-----A-----T----Agtcatataaaactaag
gi|8 : ggta------------------------T-----TG---------TG----TA----A-------TTT---GTG-T-----------C-------TA----T-CTGCAA-TGCGT-GTCTGT-TA-TG-GGGGAAAAAACCC---AA-AACAAACA--A----C-ATT-TC--G---TAG---TGTATTCG---AG-GC----TGTTATT-A-GAAA-----------------TT--TGCCAGAGAC-A-A-----TAATGTAACATG--CTG-TA--CA-T------------GTCTCT-G----TTTT-A---A-TTGTGGT-G-aaactaatcaacacttcccaacccttaattttaaaggattacattgtgtaatttgtgtctatctgcaatgcgtgtctgttatgggggaaaaaacccaaaacaaacaacatttcgtagtgtattcgaggctgttattagaaatttgccagagacaataatgtaacatgctgtacatgtctctgttttaattgtggtgacttttacactaacat
gi|8 : ggtaatataacacgagcattcacaactggcacaactagtaggtcagaaaggggatgtttactccttgacaacagttgagtttttttaacttgacttggggtttatcttggggtccatcaatgtttccagtgtttaatgccatgtgaatgcgattctctgtcaggatatgttactcatgtacatccacacatgtaattttagaaatgcaatcaaatctactttatgtttgcatttatcatataaaactaatcaacacttcccaacccttaattttaaaggattaca----TGTTAGT-GTAAAA-GTCA------CCACAATT-AAAACAGAGAC-ATG-----T-ACA--GCATG--TTA-CAT-TATT------------GTCTCT-G---acttttacactaacat
gi|9 : ggtaatataacacgagcattcacaactggcacaactagtaggtcagaaaggggatgtttactccttgacaacagttgagtttttttaacttgacttggggtttatcttggggtccatcaatgtttccagtgtttaatgccatgtgaatgcgattctctgtcaggatatgttactcatgtacatccacacatgtaattttagaaatgcaatcaaatctactttatgtttgcatttatcatataaaactaatcaacacttcccaacccttaattttaaaggattacattgtgtaatttgtgtctatctgcaatgcgtgtctgttatgggggaaaaaacccaaaacaaacaacatttcgtagtgtattcgaggctgttattagaaatttgcTCACGACTG--GTGCGAC--TAGT--AAGT---------------TATTC-ATTGGC--AACAATAG---AGTTATTTCT----A--C-CTCGA----CTT-A---AGGT-TCAT-CTGGGGGTC--CATCAATG--TT-CCCAG-TGTTTAACTTCATG--TG-AATGCGATTCTA---------------T-----G----------T----------CG-GGATA--------T--GTTACTCA-TT-TATATCCA-CACA-T-GTAA-T-TTT-AG-------------A-A---A-TCT-ACT-----TATC--A--TA---TA-CAT--GTAAAAC----T------AA--T-----G-----T----AATAAAT-------C------------------------TACAAGTA---------TA----TGTCTAA-------TTT---TT--CT----------C-------TA----T-CTGCAT-TGCGT-GTCTTT-TA-TG-A---------------AA-AA-----A--AACC-C-AGT-TC--A---TAG---T--ACTCG---AT-GC----TGTTATT-A-AAAAGGTCT------A---AAT-------------------------------ATG-------A--TA-T------------GTCTC--------TGT-G---CTTTGTGGT-G-G---GACA-C--CA-ACTC--------T-TTT------TCT-CA--AAGCAT-----------A----------------T-AAGGAAC-ACA--ACAGTTATGGGAA---------G-C-ATGGGA-CACATAC---------------------TTTCAAA----AGC-AC-CGGTC-CCAC-CC--CG-GTGAGA-AA------T-ATT-G-C-GTGGTt
blockSeqs : T CCT . . . . . TT A TT GCAAA T . G T . G . G . A G C T TA CA CCCCCCCCCC CCA G . AT TGAACAAGA . C . A AAATT AT . A TATTAT A CT . C A G AC TT C . AA G GGA ATTT TTTAACTT TGTG . ACT C G . AA CCC GT GA C ATAGGCGATTTTACCTTGTCGATACATTGTAGT A G A T T C C T T . A . TTTAC . TTATG A ACT C AT A AAAACTAATCAACACTTCCCAACCCTTAATTTTAAGAGATTACATGTGTAATTTTGTGTC . T C T A C C GGGAAAAAACCCAAAAACAAACAA G G TAGATC . GT C CAT A GAGG T T G TACATGT G T ATACAGTGTATATAA CT T GA A . G TTAA GTGA T A . CTT G AA T TTACAAAA G CTTTTT . TA G TGTTTCGTAACATGTATAT A C GC A T A T GG AAACGATGAGC AGTT T A A T TA C G G TACATG G G C A
blockSeqs : . . . . . . . CT . TT . . . G . . A . . . G . . . . AC TTTTTGTC C . . . TGAACACGA . . . . TTT C . . GATAT . . . . . G . . C . . G . . TTTAACTT . . . . . . . CT G . . ATGCGATTCTCTGTCAGGATAC . . A . . . . . . . G . G . . A GCA . C A AAACTAATCAACACTTCCCAACCTAATTTAAAGGATTCACATTGTGTAATTTGTGTC . . . . . . . GGGAAAAAACCCAAAACAAACAA . . A . GT C . . . . . . CCAC G T AATAGATGTAC . . G T . . A CG T . . . . . . ATAC . . . . G ATGTTTGTACATGTATAT . . G . . . T A AAACATTGAC . . . . . . . G . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . TT . TT . . . . . . A . . . G . . . . AT GTTTTT A . . . AACAAGA . . . . TT C . . TATT . . . . . A . . C . . G . . ACCTC . . . . . . . CC G . . ATGCGATTCTCTGTCAGGATAT . . . . . . . . . . A . A . . . TA . G . TCATTATAAACACTTTTCAACATTTATTTAAGGGTTACTTTGTCTAATGTTTTGTC . . . . . . . GCAAAAAACCAAAACAAAACAA . . A . . C . . . . . . T G G ATATATATAA . . T . . . A G T . . . . . . . . . . . A ATTT . . G . . . T . TAACATTGA . . . . . . . G . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . TT . TA . . . . . . G . . . G . . . . AA TTTTC C . . . AACAAGC . . . . TT C . . TAT . . . . . A . . A . . G . . ATCTC . . . . . . . TC G . . ATGCGATTCTCTGTCAGGATAT . . . . . . . . . . A . T . . . A . A . TTGTACACTTCTTAACCTTTATTTAAGGATGACTTTGTCTAGTTTTG . . . . . . . AAAAAAAACC . . A . . C . . . . . . T G G AATAATGTAA . . . . . . A G A . . . . . . . . . . . G ATTT . . G . . . T . TAACATTGA . . . . . . . G . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . TT . AT . . . . . . A . . . G . . . . AA CCCCC C . . . AACG . . . . TT C . . TAT . . . . . A . . A . . G . . ACCTC . . . . . . . TT G . . ATGCGATTCTATGTCGGGATAT . . . . . . . . . . A . A . . . A . G . AAACTAATGTAATAAATCTACAAGTATATGTCTAATTTTTCTC . . . . . . . AAAAAAACC . . A . . T . . . . . . T G G AATAATGTAA . . . . . . G G T . . . . . . . . . . . G ATAT . . G . . . T . TAACATTGA . . . . . . . T . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . GG . TT . . . . . . G . . . G . . . . AA GTTTT T . . . . . . . . AA C . . TAT . . . . . G . . C . . G . . ACCTC . . . . . . . CC G . . TGCGATTCTTTGTCAAGATTT . . . . . . . . . . A . A . . . A . G . TCACAGTAATTACTTTATATGGGTTTTGTGGCT . . . . . . . AAAAACAA . . G . . A . . . . . . T G G ATATATAC . . . . . . A G A . . . . . . . . . . . G ATAT . . G . . . T . TAACACTAA . . . . . . . A . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . TA . TT . . . . . . G . . . G . . . . AA TTTT C . . . . . . . . TT C . . TAT . . . . . A . . A . . A . . ACC . . . . . . . TC G . . ATGTGATTCTCTGTCAGGAT . . . . . . . . . . C . A . . . A . G . TTATTTAAGGATTACTTTGCCTAATCTTAGTC . . . . . . . AATAAAC . . A . . T . . . . . . T G G ATATATGA . . . . . . G G C . . . . . . . . . . . G ATCT . . C . . . T . AAACATTGA . . . . . . . G . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . TT . TT . . . . . . T . . . G . . . . . TTTT C . . . . . . . . . . . . TAT . . . . . G . . . . . . . . AT . . . . . . . CC G . . ATTCTCTGTCAGGATAT . . . . . . . . . . C . A . . . A . T . TCATGTACTTCTTAACGATTTGT . . . . . . . AAAAAC . . G . . C . . . . . . T A G AGTAATAA . . . . . . A G T . . . . . . . . . . . G ATG . . G . . . A . TGAAATTA . . . . . . . T . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . A . TA . . . . . . G . . . A . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . AC . . . . . . . C . . . ATGTCGCGGATTG . . . . . . . . . . A . A . . . G . G . . . . . . . . AAAAAA . . G . . . . . . . . . A . G ATGTACAG . . . . . . . A T . . . . . . . . . . . G ATT . . G . . . T . CAATGT . . . . . . . G . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TT . . . . . . . C . . . ATGTCATGAT . . . . . . . . . . . . A . . . A . A . . . . . . . . AAAAAA . . G . . . . . . . . . . . G A . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . T AT . . G . . . T . TTGGA . . . . . . . T . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ACATC . . . . . . . . . . . . A . . . A . . . . . . . . . . AAAAAA . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . G AC . . G . . . T . TGAA . . . . . . . A . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AT . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . AT . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . T . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . T . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . T . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . G . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . G . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . T . . . . .
blockSeqs : . . . . T . . . .
blockSeqs : . . . G .
blockSeqs : . .
blockSeqCons : ****** ******* TT TTTTC******** ** AACAG**** **** C* **** TAT**** ** *** ACCTC******* ** CC* G* A**** ** **** AAAAAAACC************************ *** G* ************ G**** ATT*************************** ** G* TAACATTGA**
originalCons : TCACC-GG---GGTGGGACCAGTGCA------AAAC-ACGATGGGA-CAC-------A-AACTTT-TTTTTA-----TGACAACA-GGACATGGGAC-AATGATTTTT-T-G-TGTGGA-TA-ATTTGG-ATGGGA-CATCTATTTT-TT-CATTGACAAA--AATGCAAAGA-----TTTT---CCCCC--ATTGA-TTTGAAGAGAA--T--GATTTACAGGAAAG--AACAAGATATTCAGCAA-ATTGT-ATCCCTAAGCAAGTGTTCC----AT-CCGTTT---TT-GT-CTTTG----TAACTT-GCAT-ATTATCTTTGTCATTAT-TTCAAATTCAAATCATATAGC--ACGA-GCA-TTCACAACTG--GCGCGAC--TAGT--AAGTCAGACAGGGGATGCTTACTC-CTTGGC--AACAGTTG---AGTT----CT----A--C-C--GA----CTT-G---GGGT-TCAT-CTGGGGGTC--CATCAATG--TT-CCCAG-TGTTTAACTCCATG--TG-A----------A---------------T-----G----------T----------CG-GG--A--------T--GTTACTCA-TT-TACATCCA-CACA-T-GTAA-T-TTT-AGA-AATGCA-ATAAA-A---A-TCT-ACT-----T-TT--A--TG-TTTG-CAT--TTA--------T------CA--T-----A-----T----ACT---T-------C------------------------T-----TA---------TA----TG----A-------TTT---GT--C-----------C-------TA----T-CTGCAA-TGCGT-GTCTGT-TA-TG-G---------------AA-AA-----A--A----C-ATT-TC--G---TAG---T--ACTCG---AT-GC----TGTTATT-A-AAAA-GTCT------T---AATT-GTGCCAGAGAC-ATA-----T-ATATAACATG--TTA-TA--TA-T------------GTCTCT-G---ATTGT-G---CTTTGTGGT-G-G---GACA-C--CA-ACTT--------T-TTT------ACT-CA--AAGCAT-----------AT---------------T-ATGGGAC-ACA--AACGTTTTCTTAAAGATG-TTTG-C-ATGGGA-CACATACTTT--TTTTAACATTGA--ATTTTCAAA----TGC-AC-CGGTC-CCAC-CC--CG-GTGAGA-AA------T-ATT-G-C-ATGGT
finalCons : TCACC-GG---GGTGGGACCAGTGCA------AAAC-ACGATGGGA-CAC-------A-AACTTT-TTTTTA-----TGACAACA-GGACATGGGAC-AATGATTTTT-T-G-TGTGGA-TA-ATTTGG-ATGGGA-CATCTATTTT-TT-CATTGACAAA--AATGCAAAGATTTTC--------CCCC--ATTGA-TTTGAAGAGAA--T--GATTTACAGGAAAGAACAG----TATTCAGCAA-ATTGT-ATCCCTAAGCAAGTGTTCC----AT-CCGTTT---TT-GTC-TTTG----TAACTT-GCATAT----CTTTGTCATTAT-TTCAAATTCAAATCATATAGC--ACGA-GCA-TTCACAACTG--GCGCGAC--TAGT--AAGTCAGACAGGGGATGCTTACTC-CTTGGC--AACAGTTG---AGTT----CTACCTC-------GA----CTT-G---GGGT-TCAT-CTGGGGGTC--CATCAATG--TTCC-CAG-TGTTTAACTCCATG--TG-A----------A---------------T-----G----------T----------CG-GG--A--------T--GTTACTCA-TT-TACATCCA-CACA-T-GTAA-T-TTT-AGA-AATGCA-ATAAA-A---A-TCT-ACT-----T-TTA----TG-TTTG-CAT--TTA--------T------CA--T-----A-----T----ACT---T-------C------------------------T-----TA---------TA----TG----A-------TTT---GT--C-----------C-------TA----T-CTGCAA-TGCGT-GTCTGT-TA-TG-GAAAAAAACC------------------------C-ATT-TC--G---TAG---T--ACTCG---AT-GC----TGTTATT-A-AAAA-GTCT------T---AATTG-TGCCAGAGAC-ATA-----T-ATATAACATG--TTA-TA--TA-T------------GTCTCT-G---ATTGTG----CTTTGTGGT-G-G---GACA-C--CA-ACTT--------T-TTT------ACT-CA--AAGCATATT---------------------------ATGGGAC-ACA--AACGTTTTCTTAAAGATG-TTTG-C-ATGGGA-CACATACTTT--TTTTAACATTGA--ATTTTCAAA----TGC-AC-CGGTC-CCAC-CC--CG-GTGAGA-AA------T-ATT-G-C-ATGGT
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|48 ): ACCGGTCAATAATTATTGGGGGGTTGGGACCGGTGCATT
Unaligned ( gi|50 ): CCACCATATTAAGGGACTGGTCAATATTTATTG
Unaligned ( gi|51 ): GTTAGGGACTGGTCAATATTTATTGGGGGGTT
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 111111 1111111 1111111111111 55555555555 111 111 111 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 11 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 2222222222 444444444444444444444444444444 1111111111 22222222222222222 11 111111111111 11111111 444444444444444444444444444444 11111111111
lowQualScore : 4 777 000000 3 3 0000000 3 99 3 44 88888 3 4 7 4 3 1 3 3 3 2 3 4 4 55 11 7777777777777 777 4 55 55 00000000000 4 4 4 0 8888 88888 44 9999 4 4 222 4 66 66 4 4 88 3 55 55 5 4 55 2 000 666 7777 000 7777 3 3 3 4 44 44 666 33 44 3 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 3 3 6 3 3 2 2 2 2 2 2 3 66666 3 77777 6 99999 3 33 00 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 7777 3 3 3 6 3 0000000000 000000000000000000000000000000 3 999999 555 99 7 555 3 6666 3 3 44 3333333333 77 0 1 22222222222222222 44 3 00 6 555555555555 3 9999 66666 4 2 2 555 3 44 3 77777777 3 888888 3 33 1 444444444444444444444444444444 2 55 0 33 2 2 2 2 66 44444444444 4444 3 1 1 1 22 1 1 1 555555 1 1 1 2
lowQualScore : . ... ...... . . ....... . .. . .. ..... . . . . . . . . . . . . . .. .. ............. ... . .. .. ........... . . . . .... ..... .. .... . . ... . .. .. . . .. . .. .. . . .. . ... ... .... ... .... . . . . .. .. ... .. .. . ......................................................................... . . . . . . . . . . . . ..... . ..... . ..... . .. .. .............................................................................................................................................. .... . . . . . .......... .............................. . ...... ... .. . ... . .... . . .. .......... .. . . ................. .. . .. . ............ . .... ..... . . . ... . .. . ........ . ...... . .. . .............................. . .. . .. . . . . .. ........... .... . . . . .. . . . ...... . . . .
lowQualScore : 0 000 555555 3 3 8888888 3 11 3 88 33333 3 0 3 0 6 2 6 6 6 0 6 0 0 55 55 1111111111111 111 0 55 55 22222222222 0 0 0 8 5555 88888 66 4444 4 4 222 4 99 11 4 4 66 0 55 55 0 0 00 8 000 444 1111 444 1111 3 3 3 6 66 66 777 88 66 3 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 1 1 2 1 1 9 9 9 9 9 3 1 44444 1 77777 2 33333 3 66 44 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 1111 3 1 1 7 3 1111111111 666666666666666666666666666666 3 888888 888 22 2 888 3 5555 1 1 66 9999999999 88 4 5 77777777777777777 66 3 44 2 888888888888 1 1111 00000 8 9 9 444 1 22 1 77777777 1 888888 3 99 9 555555555555555555555555555555 5 99 8 66 7 7 7 5 33 66666666666 0000 8 9 8 7 33 7 2 7 222222 8 8 9 2
consensus : TCACC-GG---GGTGGGACCAGTGCA------AAAC-ACGATGGGA-CAC-------A-AACTTT-TTTTTA-----TGACAACA-GGACATGGGAC-AATGATTTTT-T-G-TGTGGA-TA-ATTTGG-ATGGGA-CATCTATTTT-TT-CATTGACAAA--AATGCAAAGA-----TTTT---CCCCC--ATTGA-TTTGAAGAGAA--T--GATTTACAGGAAAG--AACA--A--TATTC-AGCAA-ATTGT-ATCCCTAAGCAAGTGTTCCA----TCCGTTT---T-TGT-CTTTGT----AACTT-GCAT-AT---CTTTGTCATTAT-TTCAAATTCAAAT--CATATAGC--ACGA-GCA-TTCACAACTG--GCGCGAC--TAGT--AAGTCAGACAGGGGATGCTTACTC-CTTGGC--AACAGTTG---AG---TT----CT---ACCTCGA----CTT-GGGGT-TCAT-CTGGGGGTC--CATCAATG--TT-CCCAG-TGTTTAACTCCATG--TG-A----------A---------------T-----G----------T----------CG-GG--A--------T--GTTACTCA-TT-TACATCCA-CACA-T-GTAA-T-TTT-AGA-AATGCA-ATAAA-A---A-TCT-ACT-----T-TT--A--TG-TTTG-CAT--TTA--------T------CA--T-----A-----T----ACT---T-------C------------------------T-----TA---------TA----TG----A-------TTT---GT--C-----------C-------TA----T-CTGCAA-TGCGT-GTCTGT-TATG-G-------A--AAAAAACC------------CA-------------TT-TC--G---TAG---T--ACTCG---AT-GC----TGTTATT-A-AAAA-GTCT------T---AATT-GTGCCAGAGAC-ATA-----T-ATATAACATG--TTA-TA--TA-T------------GTCTCT-G---ATTGT-G---CTTTGTGGT-G-G---GACA-C--CA-ACTT--------T-TTT------ACT-CA--AAGCAT-----------AT---------------T-ATGGGAC-ACA--AACGTTTTCTTAAAGATG-TTTG-C-ATGGGA-CACATACTTT--TTTTAACATTGA--ATTTTCAAA----TGC-AC-CGGTC-CCAC-CC--CG-GTGAGA-AA------T-ATT-G-C-ATGGT
Reference ( family-1488 ) : TCACC-GG---GGTGGGACCAGTGCA------AAAC-ACGATGGGA-CAC-------A-AACTTT-TTTTTA-----TGACAACA-GGACATGGGAC-AATGATTTTT-T-G-TGTGGA-TA-ATTTGG-ATGGGA-CATCTATTTT-TT-CATTGACAAA--AATGCAAAGA-----TTTT---CCCCC--ATTGA-TTTGAAGAGAA--T--GATTTACAGGAAAG--AACA--G--TATTC-AGCAA-ATTGT-ATCCCTAAGCAAGTGTTCCA----TCCGTTT---T-TGT-CTTTGT----AACTT-GCAT-AT---CTTTGTCATTAT-TTCAAATTCAAAT--CATATAGC--ACGA-GCA-TTCACAACTG--GCGCGAC--TAGT--AAGTCAGACAGGGGATGCTTACTC-CTTGGC--AACAGTTG---AG---TT----CT---ACCTCGA----CTT-GGGGT-TCAT-CTGGGGGTC--CATCAATG--TT-CCCAG-TGTTTAACTCCATG--TG-A----------A---------------T-----G----------T----------CG-GG--A--------T--GTTACTCA-TT-TACATCCA-CACA-T-GTAA-T-TTT-AGA-AATGCA-ATAAA-A---A-TCT-ACT-----T-TT--A--TG-TTTG-CAT--TTA--------T------CA--T-----A-----T----ACT---T-------C------------------------T-----TA---------TA----TG----A-------TTT---GT--C-----------C-------TA----T-CTGCAA-TGCGT-GTCTGT-TATG-G-------A--AAAAAACC------------CA-------------TT-TC--G---TAG---T--ACTCG---AT-GC----TGTTATT-A-AAAA-GTCT------T---AATT-GTGCCAGAGAC-ATA-----T-ATATAACATG--TTA-TA--TA-T------------GTCTCT-G---ATTGT-G---CTTTGTGGT-G-G---GACA-C--CA-ACTT--------T-TTT------ACT-CA--AAGCAT-----------AT---------------T-ATGGGAC-ACA--AACGTTTTCTTAAAGATG-TTTG-C-ATGGGA-CACATACTTT--TTTTAACATTGA--ATTTTCAAA----TGC-AC-CGGTC-CCAC-CC--CG-GTGAGA-AA------T-ATT-G-C-ATGGT
gi|1 : TCAC--AG---GGTGGGAACA-TGCATAAAAAAAACCAC-ATGGGAACACTTTTCTTACAACCTT-TTTT-A-----T-ACAAC--GGATA-GGGATTAAAGATTTTT-T-GGTGTGGAATA-ATTTGGTATGG-A-CAT-TAACTT-AT-AATT-ACAAA--A--GCAAAGA-----TTT----CCCTG--ATTGA-TTTGAAGGAAAATT--GATTT-C-GAAAAG--AATA--A--GATACTAGCAAGATTGT-TTCCCCTACAAAGTGGTCCAAAAATCTGTTT---T-TGT--TTAGTCCCTAACTT-GCATCATT--CTTTGTCATTAT-T-------CAAAT--CATATAGC--ACGATGCA-TTCACAACTGGTGCACAAC--TA-T--AA-TCAGACAGGGG-TGTCTATTCTTTTGGC--AATAGTTGA--AG---TT----C-----CTTCGA----CTTAGGGGT-TCAT-CT--GGGTCCGCATCAATG--------------TCAACTCAATG--TG-A----------ATGCGATC--------T-----G----------T----------CA-GAT-A--------T--GTTAGTC---C-TACAT-TA-CTAA-T-GTA----TTT-AGA-AATGCATATAAAGA---A-TCTAACT-----T-GT--ATTTG-TTTG-CATAATCA--------TATAAAACA--T-----A-----TTTACACT---T-------C------------------------T-----TA---------AA----TA----A-------TTTAAGGTTAC-----------T-------TACTTTT-TTTCAA-T---T-ATTTGTCTA---------------------C------------CA-------------TT-TC--A---TAGGCAT--ACTTG---AT-GC----TG-TA---A-AAAG-GTCT------T---AACTGGTGCAAAA------A-----T-AACTTACATG--TTA-TA--TA-TACCGCGCGATTGGTGTCT-G---ATTAT-----CTTTGTGGT-GTG---GA
gi|1 : agtgaccagcaatattcactattACA-T--CA-ATTT--------T-TTA------ACTTCA--AATCAT-----------AT---------------A-ATGG-AC-AAATCAACGTTTTCTTAA-GAT--TTTG-C-ATGGGA-CA--TACTTT--TTG-AACAAAGA--ATTTTCAAA----TGCAAC-CAGTC-CC-T-AC--CG-GTGAGA-AA------T-A-T-G-C-ATGGTtcaagaaattagacaatataataaaaattataacatcaattttttaacttcaaatcatataatggacaaatcaacgttttcttaagattttgcatgggacatactttttgaacaaagaattttcaaatgcaaccagtccctaccggtgagaaatatgcatggtcccat
gi|10 : agtgaccagcaatattcactatttcacagggtgggaacatgcataaaaaaaaccacatgggaacacttttcttacaaccttttttatacaacggatagggattaaagattttttggtgtggaataatttggtatggacattaacttataattacaaaagcaaagatttccctgattgatttgaaggaaaattgatttcgaaaagaataagatactagcaagattgtttcccctacaaagtggtccaaaaatctgtttttgtttagtccctaacttgcatcattctttgtcattattcaaatcatatagcacgatgcattcacaactggtgcacaactataatcagacaggggtgtctattcttttggcaatagttgaagttccttcgacttaggggttcatctgggtccgcatcaatgtcaactcaatgtgaatgcgatctgtcagatatgttagtcctacattactaatgtatttagaaatgcatataaagaatctaacttgtatttgtttgcataatcatataaaacatatttacacttcttaaataatttaaggttacttactttttttcaattatttgtctaccatttcataggcatacttgatgctgtaaaaaggtcttaactggtgcaaaaataacttacatgttatatataccgcgcgattggtgtctgattatctttgtggtgtggatcaagaaattagacaatataataaaaattataCATG--TG-A----------A---------------T-----GCGATTCTCTGT----------CA-GG--A--------TACGTTA---A-TT-TACATCCA-CACA-T-GTAA-T-TTT-AGA-AATACC-ATAAA-A---G-TCT-ACT-----T-TT--A--TG-CT----A-----A--------T------TG--T-----A-----C----ACT---T-------C------------------------T-----TAACCTTTATTTAAGGATG----AC------TTT---GT--C-----------TAGTTTTGTC----T-CTGCAA-TGCAT-GTCTAT-TATG-G-------A--AAAA---C------------CA-------------TT-TC--A---GAG---T--ACTCG---AT-GC----TGTTATT-A-AAAA-GTCT------T---AATT-GTGCCAGATAC-ATA-----T-ATAC--CATT--TTA-TG--TT-T------------GTATCT-G---ATTGT-G---CTTTCTGGT-G-G---GACA-C--CA-ACTT--------T-TTTCTTTTTACT-CATAAAGCAT-----------AT-----------------ATGGGAC-ACA--AACTTTTTCTTAAAGATG-TTTG-C-AAGGGA-CACATACTTT--TTTTAACATTGA--ATTTTCAAA----TGT-AC-CGGTC-CCAC-CC--CG-GAGAGA-AA------T-ATT-G-C-ATGGTcccat
gi|11 : TGCTTACTC-CTTGGC--AATGGTTG---AG---TT----CT---ACCTCGA----CTT-GGTGT-TCCT-CTGGCGGCC--TATCAATG--TT-CTCAG-TGTTTAACTCCATG--TG-ATGCG------ATTCTT----------T-----G----------T----------CA-AG--ATT------T--GTTACTAA-TT-TACATCCA-CAC--------------------ATGCG-ATGAA-A---A-TCT-ACT-----T-TT--A--TG-TTTC-TAT--TTT--------T------TATTT-----AAGGATT----ACT---TTG-----C------------------------C-----TA----------A----T-------------CTT---AG--T-----------C-------TA----T-GTGCAC-TGCGT-G-------ATG-GAACTGAAA--AAAAAACC------------CA-------------TT-TC--A---TAG---T--ACTGG---AT-GT----TGTTATT-A-GAAA-GTCTTACATGT---AATT-GTGCCAGATAC---A-----T-ATATGACATacct
gi|12 : GTC-CCAC-CC--TG-GTGAGA-AA------A-ATT-G-C-ATGGTc
gi|12 : gatC-AGGGTGGGA-CAC-------A-AACTTT-TTT--A-----TGACAACA-AGACATGGGAC-GATGAGTTTC-T-G-TGTGGA-TA-ATATGG-ATTGAA-CATCTATTTT-TT-C-TTCAT-------TGC-----------------CCCCC--ATTGC-TTTGAAGAGAA--T--GATTTACAAGAAAGTGAACA--AGATGTTC-AGCAA-ATTGT-ATCCCTAAGCAAGTGTCCCA----TCCGTTT---TTTGT-CTTTGT----AACTT-GCAT-AT---CTTTGTCATTAT-TTCAAATTCAAAT--CATATAGC--ACGA-GCA-TTCCCAACTG--acaaacttttttatgacaacaagacatgggacgatgagtttctgtgtggataatatggattgaacatctattttttcttcattgccccccattgctttgaagagaatgatttacaagaaagtgaacaagatgttcagcaaattgtatccctaagcaagtgtcccatccgttttttgtctttgtaacttgcatatctttgtcattatttcaaattcaaatcatatagcacgagcattcccaactg
gi|13 : gataccatgcaatttttctcac-TGCTT-GTCTGT-TATG-G-------A--ATAAA--C------------CA-------------TT-TC--A---TAG---T--ACTCG---AT-GT----TGTTATC-A-AAAA-GTCT------T---AATT-GTGCCAGAGAC-ATACAGTGT-ATATAACATG--CTG-TG--CA-T------------GTCTCT-G---ATTGA-G---CTTTGT-GT-T-G---GACA-C--CA-ACTT--------T-TTT------ACT-CA--AAGCAT-----------A----------------C-ATGGGAC-AAA--AACGTTTTCTTAAAGATG-TTTG-C-ATGGGA-CATATAC---------------------------------GC-AC-CGGTC-CCA--CC--CG-GTGAGA-AA------T-ATT-G-
gi|14 : atcacgtcttcatatctcacgcatgcattaattatTTATC-GGCCTGGTGGGACCAGTGCA------ACAC-TCGATGGGA-CAC-------A-AATCTT-TTTTTAGCAAATGCCAACATGGTCATGGGA--AATGAGTTTT-T-G-TGTG---------TGG-ATAT---CATTTATTTTCTT-CATTGACGAA--AATGCA--GA-----TTTT---CCCAA--ATTGA-TTTGAAGAGAA--T--GATTTATAGGAAAGTGAACACGA--TATTC-CGCAA-ATTGT-ATCCC-AAACAAGCGTTCCA----TCCGTTT---T-TGT-CTTTGT----AACTT-GCAT-AT---CTTTGCCATTAT-TTCAAAT
gi|15 : a-------TTT---GT--C-------------------TA----T-CTGCAA-TGCGT-GTCTGT-TACGCG-------A--AAAAA---------------CA-------------TT-TC--A---TAG---T--ACACACATAT-GC----TGTTATC-A-AAAA-GTCT------T---AATT-GTGC-AGAGAC-A-G-----T-A-ATAACATG--TTA-TAG-TAAT------------GTCTCT-G---ACTTTCG---CTTTG--GTAG-G---GAC--C--CA-ACTT--------T-TTT------ACT-CA--AGATAT-----------AT---------------G-A--AGAC-ACA--AACGTTTTCTTAAAGATG-TTTG-C-ATGGGA--ACATAC-------------------ATTTTC-AA----TGC-AA-CGGT--CCAC-CC--CA-GTGAG--AA------T-ATT-GCC-ATGGT
gi|16 : tctaat-TGTGAA----ATTTGG-ATGGGAGCATCTATTTT----CATTGACAGA--AATGCACAGACCCCCCCCC---CCCCC--ATTGA-TTTAGAGGAAA--T--G----------AAG--AAC---G--TATTC-AGCAA-ATTGT-ATCCGT-AGAAAGTGTTCCA-------------------------T----A-----GCAT-------TT---CAATAT-TTCAAATTCAAATTATATATAGC--ACGA-GCA-TTCAC-ACTGA-GTGCGAC--TAGT--AAGTCAGACA-GGGATGCTTACTccc
gi|17 : tgtgt-T-G-TGTGAA-TG-ATTTGG-GTGGGA-TATCTATTTT-TT-CATTGAGACA--AATGCAACCC-----CCCC---CCCCCCAATTGAGTTTCAAGAGAA--TATGATTTATAGGAAAG--------------TG-AACAA-ATTGT-ATCCCTAAGCAAGTGTTCCA----TCCGTTT---T-TGC-CTTTGT----AACTT-GCAT-AT---CTTTATCATTAT-TTCAAATTCAAAT--CATATA
gi|18 : tg----TGC-AC-TGGTA-CCAT-CA--CG-GTGATA-AA------T-ATC-G-C-ATGGT
gi|18 : TCACC-GT---GATGGTACCAGTGCA------AAAC-ACGATGGGA-CAC-------A-AAC-AT-TTTTTA-----TGACAACA-GGACATGAGAC-AATGATTTTTGT-A-TGTGGA-TA-ATTTGG-ATGGGA-CATCTATTTT-TT-CATTGACAAA--AATACAATGA-----TTTT----TCCC--ATTAA-TTTTGAGAGAA--T--GATTaaacacgatgggacacaaacattttttatgacaacaggacatgagacaatgatttttgtatgtggataatttggatgggacatctattttttcattgacaaaaatacaatgatttttcccattaattttgagagaatgattc
gi|19 : accatgcgatatttaA--TA-T------------ATCTC--G---GTTGT-G---CATTGTGGT-G-G---GACGGC--CA-ACTT--------T-TTT------ACT-CA--TAGCATTGTTTCGTAACATGTATA----------T-ATGAGACAACAC-AACG-TTTCTT-AAGAT--TTTG-C-AT------------TTTGGTTTTGA-----A--ATTTTCAAA----TGCTACACGGCC-CCGC-CC--CG-GT--AA-AA------T-ATTGG-CAATGGTc
gi|2 : TCACCTGG---GGTGGGACCGGTGCA------AAAC-ACGATGGGA-CAC-------A-AACTTT-TTTTTA-----TGACAACA-GGGCATGGAAC-AATGATTTTT-T-A-TGTGAA-TA-ATTTGG-ATGGGA-CATCTATTTT-TT-CAATGATAAA--AATGCAAAGA-----TTTTTGTCCCAT--ATTGA-TTTCAAGAGAA--T--GATTTACAGGAAAG--AACA--AGATATTC-AGCAA-ATTGT-ATCCCTAAGCAAGTCTTCCA----TCTGTTT---T-TCC-CTTGGT----AACTT-GTAT-ATTATCTTTGTCATTAT-TTCAAATTCAAAT--CATATAGC--ACAA-GCA-TTCACTACTG--GTGCGAC--TAGT--AAGACAGACAGAAGATGCTTACTC-C--------------G---AG---TT----CT---AT---GA----CTT-AGGGC-TCAT-CTGAGGGTT--CATC----------------GTTTAACTCCATA--TG-A----------A---------------T-----G----------T----------CA-TG--A--------T--GTTACTCA-TT-TACATTCA-CACA-T-GTAA-T-TTT-AGA-AATGCT-ATAAA-A---T-TCT-ACT-----T-TC--A--TG-TTTG-CAT--TTA--------T------CA--T-----G-----T----ACT---T-------C------------------------T-----TA----------A----CG----A-------TTT---GT----------------------TA----T-CAGCA--TGCGT-GTCTGT--AGG-G-------A--AAAAA---------------CA-------------TTGTC--G---C-G---T--A-------ATAGT----TCTTATTTA-AAAA-GTCT------T---GATT-GTGTCAGGGAC-ATA-----T-ATATAACATG--TTA-TAGATA-T------------GTCTCT-A---ATTGT-G---CTTTGTGGT-G-G---GACA-C--CA-ACAT--------T-TTT------ACT-CA--AAGCAT-----------AT---------------TTATGGGAC-ACA--AACATCTTCTTAAAGATG-TTTG-C-ATGGGA-CACATACTTT--TTTTAACATTGA--ATTTTCAAA----TGC-AC-CGGTC-CCAC-CC--CG-GTGAGA-AA------T-ATT-G-C-ATGGTccct
gi|20 : ----TGC-AC-TGGTC-CCAC-CC--CG-GTGATA-AA------C-ATT-G-C-ATCGT
gi|20 : gTCACC-GG---GGTGGGACCAGTGCA------AAAC-ACGATGGGA-CAC-------A-AAC--T-TTTTAA-----TGACAACA-GGCAATGGG-C-AATGACTTGT-T-G-TGTAGA-TA-AATTGG-ACGGGA-CATTTATTTaaacacgatgggacacaaactttttaatgacaacaggcaatgggcaatgacttgttgtgtagataaattggacgggacatttattt
gi|21 : gacgatgcaatgttta--AAGCAT-----------AT-----------------ATGGGTC-ACA--AAAGTTTTCTGCAAGATG-TTTG-C-ATGGGA-CACATACTTT--TTTTAACATTGA--ATTTTCAAA----TGC-AC-CGGTC-CCAT-CC--CG-GTGAGA-AA------T-ATT-G-C-ATGGT
gi|22 : tAACA-GGACATGGGAC-AATGATTTTT-TTG-TGTAGA-TA-ATCTGG-ATGGGA-CTTCTATTTT-TT--ATTGACAAA--AATGCAAAGA-----TTTT----CCTC--ATTGG-TTTGAAGAGAA--T--GATTTACAGGctct
gi|23 : GGAC-ACT--ACC-TGTTCTTAAAGATC-TTTT-TTGTGGGAACACATACTTTA-TTTTGAAATT-A--ATTTT-AAA------C-AC-CG-TC-CCAC-CC--C--GTGATAGAA------T-ATT-G-C-ATGGT
gi|24 : tTGGGAC-ACA--AACGTTTTCTTAAAGATG-TTCG-C-ATGGGA-CACATACTTT--TGTT----TGGA--ATTTTCAAA----TGC-AC-CGGCC-CCAC-CC--CG-GTGAAA-AA------T-AGT-G-C-ATGGTccctt
gi|25 : TG--TTA-TA--TA-T-------------TCTCT-G---GTTGT-G---CATTGTGGT-G-G---GACG-C--CA-ACTT--------T-TTT------ACT-CA--TAGCAT-----------ATGTTTGTACATGTATAT-ATGAGAC-ACA--AACGTTTTCTTAAAGAccc
gi|26 : AA-A---A-TCT-ACT-----T-TTT-A--TG-TTTA-CAT--TTT--------T------CA--T-----A-----T----A
gi|27 : -CA--AAGCAT-----------AT---------------TTATGGGAC-ACA--AACATGTTCTTAAAGATG-ATTG-C-ATGGGA-CACGCACTTT--TTTTAACACTAA--ATTTTCAAA----TGC-AC-CGGTC-CCAC-CC--Caaactaattaacacttctcaacttttatataaggattactccgtctaatttttgtctatctgcaatgc
gi|28 : -----T----ACT---T-------T------------------------G-----TC---------TAA---TG------------TTT---GT--C-------------------TA----TTCTGCAA-TGCGT-GTCTGT-TATG-A-------A--AAAAAA
gi|29 : ttatcatataaaactaattaacacttctcagcctttatttaaggatAAAAA-G-TTTG-C-ATGGGA-TAAATACATT--TTTAAACATTGAC-ATTTTCAAA----TGC-AC-CGGTC-CCCC-AT--TGCGTGAGA-AA------TGATT-G-
gi|3 : --TATTC--GCGG-AATGTCATCCCTAA---AATGTTTT-----TCCGTATAAAT-TGTATTTTGT----AACATAGCAT-AT---CTCTGTCAATATATTTAAATTCAAAT--CACACCACCTACGA-GCACTTCACAAATG--TTGC------AG--------GGACAGGGGATGCTTATCC-CTTGGCAAAACA-TTGGGAAG---TT----CT---ATCTCGATGTGTTT-GGGGT-TCATGCTGGGGGTC--CATCAGTG--TT--CCAG-TTGTTAACTCCATG--TG-A----------ATAGGCGATTTTACCTT-----G----------T----------CG-AT--ACATTGTAGT--GTTAATCA-TT-GACATCCA-CACA-A-GTGACT-TTT-CGATATTGCA-ATAAA-A---A-TCG-ACC-----T-TT--ACTTT-CTTG-TAT--TTA--------T------CAT-T-----A-----T----AAT---TAA-----T------------------------T-----TA---------TA----tgccattgtcccta
gi|3 : ataT--TTA--------T------CA--C-----AGTAATT----ACT---T--------------------------------------TA---------TA----TG----GGT-----TTT---GTGGC-----------T-------TA----C-TGGCAA-TGCATTGTCTGT-TATA-G-------A--AAAACAAC------------GA-------------GT-TC--A---TAG---T--A-TCG---AT-GC----TTCAATT-T-AAAA-GTCT------T---AA-A-GTGTC-----C-A------------------G--TTA-TA--TA-T------------GTCTCTGG---ATTAT-G---CCTTGTGGT---G---GACA-C-----ATTT--------TGTTT------ACgctttttaaactttatcacagtaattactttatatgggttttgtggcttactggcaatgcattgtctgttatagaaaaacaacgagttcatagtatcgatgcttcaatttaaaagtcttaaagtgtccagttatatatgtctctggattatgccttgtggtggacacattttgtttacca
gi|30 : atatattcgcggaatgtcatccctaaaatgtttttccgtataaattgtattttgtaacatagcatatctctgtcaatatatttaaattcaaatcacaccacctacgagcacttcacaaatgttgcagggacaggggatgcttatcccttggcaaaacattgggaagttctatctcgatgtgtttggggttcatgctgggggtccatcagtgttccagttgttaactccatgtgaataggcgattttaccttgtcgatacattgtagtgttaatcattgacatccacacaagtgacttttcgatattgcaataaaaatcgacctttactttcttgtatttatcattataattaatttatagctttttaaacC------------CA-------------TT-TCTAGATCTAG---T--A-TCG---AT-GC----TGTTGTT-A-AAAC-GTCT------T---AATT-GTACC--AGAC-ATA-----T-ATca
gi|31 : gtattaagtatttgttcggactctaaTTCTTAA-GATG-TTTGAC-AAGAGA-CACATACTTT--TTTAAACGATGAGCATTTTCAAA----TGT-AC---GCCATCAC-TTTACT-GTGAGA-A
gi|32 : aTTGGC--AACAGCTG---AG---TT----CT---ACCTCGA----CTT-AGGGT-TCAT-CTGGGAGTC--TATCAATG--TT-CCCAG-TGTTTAACTCAACG--TG-A----------A---------------T-----G----------
gi|33 : -GG---GTTGGGACCGGTGCC------AAAT-GTAATAGGA-CAC-------A-CACTTA-TTGATA-----AGACA
gi|34 : ttagggactggtcaatatttattgggG-C-ATGGGA-CATACA-TTT--TTTCAA---TGT--ATATCTAAAAGTTTGC-AT-CTGTC-CCAT-TC--CG-GTGATA-AA------T-ATT-G-c
gi|35 : A--AAGCAT-----------AT---------------T--TTGGAC-ATA--TACGTTTT-TAAAAGATGCTTTC-C-TTGGGA-CACATGCTTA--TTTAAACATTGA--ATTacca
gi|36 : t----TGC-AC-TGGTC-CCAC-CG--CG-GTGAT--AA------T-ATT-G-T-ATG
gi|36 : tTCACC-GC---GGTGGGACCAGTGCA------AAAC-ACGATGGG---AC-------A-GAC--T-TTTTTA-----TGACAATA-GGACAaaacacgatgggacagacttttttatgacaataggaca
gi|37 : tcatacaatatta---------------T-----G----------T----------CG-GG--A--------TATGTCACTAA-TT-TACATCCA-CACA-T-GTAA-T-TCT-AAA-AATGCA-AT
gi|38 : tgaatgcgattctcCAC-CC--CG-GTGATA-AA------C-ATC-C-C-ATGGTtttca
gi|38 : gggTCACC-GG---GGTG---------CA------AAAC-ACTATGGGA-CAC-------A-AACTTTATTTTTA-----TGACAACA-caaaacactatgggacacaaactttatttttatgacaaca
gi|39 : gggaccatgggatgttta----------A---------------T-----G----------T----------CGCGG--A--------TTGGTCACTAAATT-TACATCCA-CACATT-GTAA-TCTTT-AGA-AATGCA-A
gi|4 : gcgaatgctc----TGC-AC-TTGTC-CAAC-CC--TG-GTGATA-AA------T-ATT-G-C-ATGGTat
gi|4 : ggTCACC-AG---GGTTGGACAAGTGCA------AAAC-ACTATGGGA-CAC-------A-AACGGT-TTTTTA-----TGAAAACA-GGACATGGGCT-AATGATTTTT---G-TAGGTA-TAGATTTG--ATGGGA-CATCTATTTT-TT-CATTAACAAATAAATGCAAAGA-----GTTT---TCCC---ATTGA-TTTGAAGAGAA--T--GATTTACAGTA--------------TATTC-AGCAA-AGTGT-ATCCCTA-GCA--TGTTCCA----TTCGTTT---A-AGT-CTTTGT----AACTT-GTAG-AT---ATTTGTCATTAT-TTCAAATCCAAAT--CATATAAC--ATGA-GCA-TACACAACTA--TCCCAAC--GAGT--AAGTCAGAAAGGGGATACTTACTC-CTTCGC--AACAGTTG---CG---AT----CT---ACCTTGA-----TT-GGGAC-------------TC--CAT--ATGAATT-C------GATT--CTCCCTC--AG-G----------A---------------C-----A----------T----------C-------------------TTACTCA-TT-TACATCCA-CATA-T-GTAA-T-TTT-AGA-AATGCA-ATAAA-A---A-TCT-ACT-----GATT--A--TG-TTTG-CAT--TTA--------T------CA--TTATAAA-----C----ACT---TTTCAACAT------------------------T-----TA---------TT----TA----AGGGTTACTTT---GT--CTAATGTTTTGTC-------TA----T-CTGCAA-TGCGT-aaacactatgggacacaaacggttttttatgaaaacaggacatgggctaatgatttttgtaggtatagatttgatgggacatctattttttcattaacaaataaatgcaaagagttttcccattgatttgaagagaatgatttacagtatattcagcaaagtgtatccctagcatgttccattcgtttaagtctttgtaacttgtagatatttgtcattatttcaaatccaaatcatataacatgagcatacacaactatcccaacgagtaagtcagaaaggggatacttactccttcgcaacagttgcgatctaccttgattgggactccatatgaattcgattctccctcaggacatcttactcatttacatccacatatgtaattttagaaatgcaataaaaatctactgattatgtttgcatttatcattataaacacttttcaacatttatttaagggttactttgtctaatgttttgtctatctgcaatgcgt
gi|40 : ggaccatgcaatatttaTGTGGT-G-G---GACA-C--CA-ACTA--------T-TTT------ACT-CA--AA-CAT-----------ATA--------------T-ATGGGGC-ACA--
gi|41 : TGTGGT-G-G---GACA-C--CA-ACTA--------T-TTT------ACT-CA--AA-CAT-----------ATA--------------T-ATGGGGC-ACA--tgatgttataccggtaag
gi|42 : GTGCA------AAGC-ATGATGGGA-CAG-------A-CA-TAT-TTTTAA-----TGACAGCA-GGACATGGGAC-AACGATTTTT-tgatgttataccggtaag
gi|43 : TAG-T-TTT-AGA-AATGCT-ATAAA-A---A-TCT-ACT-----T-TT--A--TG-TTTG-CAT--TTA--------T------a
gi|44 : tttactcacagtatttc----CT---GCCTCGA----CT--AGGGT-TCAT-CTGGGG-TC--CATCAATG--TTCCCCAGTTGTTTAACTTCA
gi|45 : A----TGC-AC-CGGTC-CCAC-CC--CG-GTGAGA-AATACATGT-ATT-G-C-ATGGTac
gi|46 : ACATTGA--ATTT-CAAA----TGC-AC-CGGT--CCACTCC--CG-GTGAGA-AA--------ATT-ccct
gi|47 : G--AACA--AGCTATTC-AGCAA-ATTGT-ATCCTAAAGCAAGTGTTCCA----Ttcgt
gi|49 : -CC--CG-GTGATA-AA------T-ATT-G-C-ATGGTt
gi|5 : cggtATATAAC--ACGA-GCA-TTCACAACTG--GCACAAC--TAGT--AGGTCAGAAAGGGGATGTTTACTC-CTTGAC--AACAGTTG---AG---TT----TTTTTAACTTGA----CTT-GGGGT-TTAT-CTTGGGGTC--CATCAATG--TT-TCCAG-TGTTTAATGCCATG--TG-A----------A---------------T-----GCGATTCTCTGT----------CA-GG--A--------TATGTTACTCA-TG-TACATCCAACACA-T-GTAA-T-TTT-AGA-AATGCA-ATCAA-A-----TCT-ACTTTATGT-TT--G--CA-TTTATCATA-TTAAAAACTAAT------CA--------A-----C----ACT---T-------CCCAACCCTTAATTTTAAGAGA---T-----TA---------CA----TGTGTAA-------TTTT--GTG-T-----------C-------TA----T-CTGCAA-TGCGT-GTCTGT-TATG-G-------GGGAAAAAACC------------CAAAAACAAACAACATT-TC--G---TAG---TGTATTCG---AG-GC----TGTTATT-A-GAAA-----------------TT--TGCCAGAGAC-A-A-----TAATGTAACATG--CTG-TA--CA-T------------GTCTCT-G----TTTT-A---A-TTGTGGT-G-ACTTTACA-C--TA-ACATATAC----T-TTT------ACccctaa
gi|6 : ggtaCTG--GCACAACACTAGTTTAGGTCAGA-AAGGGATTTTTACTC-CTTGAC--AACA-TT----AT---TT----CTTT-AACTTGA----CT---GGGTCTTAT-CTTGGGGTC--CATCAATG--TC-TTCA--TGTTTAATGCCATGGATGCG----------A---------------TTCTCTG----------T----------CA-GG--A--------TATGTTACTCA-CTGTACATCCAACACA-TTGTAA-T-TTTTAGA-AATGCA-ATCAA-ATTTACTTT-ATT-----T-TTGCA--TACTTTT-CATA-TTAAAACTAA-T------CA--------A-----C----ACT---T-------CCCAACCTAATTTAAAGGATTCACAT-----TG---------TG----TA----A-------TTT---GTG-T-----------C-------TA----T-CT-CAACTGCGT-GTCTGTATATG-G-------GC-AAAAAACCAAAACAAAACAACA-------------TT-TC--G---TAG---T--GAT-----AT-GCGAGGTGT-ATT-C-AGAA----------------ATT--TGCCAGAGACAATA-----G-ATGTACTATGCTTTGTTA--CA-T------------GTCTCT-GTTAATTGT-GTGACTTT-T-----------ACA-CAACATACTTTTACAAAAT-TCT------AAT-TA--AATCAT-----------ATC--------------T-AT----C-A-A--AACGTaaaattctaattaaagtctatctatcaaactgtaaatctttcatataaagtatgt
gi|7 : ----TGC-AC-TGGTC-CCAC-CC--CG-GTCATA-AA------T-ATT-G-C-ATGGTaaatctttcatataaagtatg
gi|7 : ggACC-GG---GGTGGGACCAGTGCA------AAAC-ACGATGGGA-CAC-------A-AACTTT-GTT--A-----TGACAATA-GAACATGGGAC-AATGATTTTTGT-G-TGTGGA-TA-ATTTGG-ATGGAA-CATCTTTTTT-TTTCATTGACAAA--AATGCAAAAAG----TTTT---TCCCC-----------GAAGAGAA--G--GGTTTACAAGAAAG-----------TGATC-AGCAA-ATTGT-TTCCCTA-GCAAGTGTTCCA----TCCGTTT---T-TGT-CTTTGT----AACTT-GCAT-AT---CTTTGTCATTAT-TTCAAATTCAAAT--ACTATAGC--GCGA-TCA-TTCACAACTG--GTGCGAC--TAGT--CAGTCAGACAGGCGATACTTGGTC-CTTGGC--AACAGTTG---GA---TT----CC---ACCTAGA----TTT-GGGGT--------------C--CATCAGTG--TT-CCCAG-TGTTTAACTCCATG--TG-A----------A---------------T-----G----------TGATTCTCTGTCA-GG--A--------T--ATT--TCA-TA-TTCATCTA-CA--------------------AATGCA-ACAAA-A---A-TCT-ACT-----T-aaacacgatgggacacaaactttgttatgacaatagaacatgggacaatgatttttgtgtgtggataatttggatggaacatctttttttttcattgacaaaaatgcaaaaagtttttccccgaagagaagggtttacaagaaagtgatcagcaaattgtttccctagcaagtgttccatccgtttttgtctttgtaacttgcatatctttgtcattatttcaaattcaaatactatagcgcgatcattcacaactggtgcgactagtcagtcagacaggcgatacttggtccttggcaacagttggattccacctagatttggggtccatcagtgttcccagtgtttaactccatgtgaatgtgattctctgtcaggatatttcatattcatctacaaatgcaacaaaaatctacttgtcatataaaactaag
gi|8 : ggaccatgcaatatttatgATATAAC--ACGA-GCA-TTCACAACTG--GCACAAC--TAGT--AGGTCAGAAAGGGGATGTTTACTC-CTTGAC--AACAGTTG---AGTTTTT----TT---AACTTGA----CTT-GGGGT-TTAT-CTTGGGGTC--CATCAATG--TT-TCCAG-TGTTTAATGCCATG--TG-A----------ATGCGATTCTC-----T-----G----------T----------CA-GGATA--------T--GTTACTCA-TG-TACATCCA-CACA-T-GTAA-T-TTT-AGA-AATGCA-AT-CA-A---A-TCT-AC------T-TT--A--TG-TTTG-CAT--TTA--------T------CA--T-----A-----T----Agtcatataaaactaag
gi|8 : ggta------------------------T-----TG---------TG----TA----A-------TTT---GTG-T-----------C-------TA----T-CTGCAA-TGCGT-GTCTGT-TATG-G-------GGGAAAAAACC------------CAAAACAAACAACA-TT-TC--G---TAG---TGTATTCG---AG-GC----TGTTATT-A-GAAA-----------------TT--TGCCAGAGAC-A-A-----TAATGTAACATG--CTG-TA--CA-T------------GTCTCT-G----TTTT-A---A-TTGTGGT-G-aaactaatcaacacttcccaacccttaattttaaaggattacattgtgtaatttgtgtctatctgcaatgcgtgtctgttatgggggaaaaaacccaaaacaaacaacatttcgtagtgtattcgaggctgttattagaaatttgccagagacaataatgtaacatgctgtacatgtctctgttttaattgtggtgacttttacactaacat
gi|8 : ggtaatataacacgagcattcacaactggcacaactagtaggtcagaaaggggatgtttactccttgacaacagttgagtttttttaacttgacttggggtttatcttggggtccatcaatgtttccagtgtttaatgccatgtgaatgcgattctctgtcaggatatgttactcatgtacatccacacatgtaattttagaaatgcaatcaaatctactttatgtttgcatttatcatataaaactaatcaacacttcccaacccttaattttaaaggattaca----TGTTAGT-GTAAAA-GTCA------CCACAATT-AAAACAGAGAC-ATG-----T-ACA--GCATG--TTA-CAT-TATT------------GTCTCT-G---acttttacactaacat
gi|9 : ggtaatataacacgagcattcacaactggcacaactagtaggtcagaaaggggatgtttactccttgacaacagttgagtttttttaacttgacttggggtttatcttggggtccatcaatgtttccagtgtttaatgccatgtgaatgcgattctctgtcaggatatgttactcatgtacatccacacatgtaattttagaaatgcaatcaaatctactttatgtttgcatttatcatataaaactaatcaacacttcccaacccttaattttaaaggattacattgtgtaatttgtgtctatctgcaatgcgtgtctgttatgggggaaaaaacccaaaacaaacaacatttcgtagtgtattcgaggctgttattagaaatttgcTCACGACTG--GTGCGAC--TAGT--AAGT---------------TATTC-ATTGGC--AACAATAG---AG---TTATTTCT---ACCTCGA----CTT-AAGGT-TCAT-CTGGGGGTC--CATCAATG--TT-CCCAG-TGTTTAACTTCATG--TG-AATGCGATTCTA---------------T-----G----------T----------CG-GGATA--------T--GTTACTCA-TT-TATATCCA-CACA-T-GTAA-T-TTT-AG-------------A-A---A-TCT-ACT-----TATC--A--TA---TA-CAT--GTAAAAC----T------AA--T-----G-----T----AATAAAT-------C------------------------TACAAGTA---------TA----TGTCTAA-------TTT---TT--CT----------C-------TA----T-CTGCAT-TGCGT-GTCTTT-TATG-A-------A--AAAAAACC------------CA-------------GT-TC--A---TAG---T--ACTCG---AT-GC----TGTTATT-A-AAAAGGTCT------A---AAT-------------------------------ATG-------A--TA-T------------GTCTC--------TGT-G---CTTTGTGGT-G-G---GACA-C--CA-ACTC--------T-TTT------TCT-CA--AAGCAT-----------A----------------T-AAGGAAC-ACA--ACAGTTATGGGAA---------G-C-ATGGGA-CACATAC---------------------TTTCAAA----AGC-AC-CGGTC-CCAC-CC--CG-GTGAGA-AA------T-ATT-G-C-GTGGTt
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|48 ): ACCGGTCAATAATTATTGGGGGGTTGGGACCGGTGCATT
Unaligned ( gi|50 ): CCACCATATTAAGGGACTGGTCAATATTTATTG
Unaligned ( gi|51 ): GTTAGGGACTGGTCAATATTTATTGGGGGGTT