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Reference ( gi|4 )            :                                                    ATTTGA--TTTTAT-ATCAAA-TAGTCC-GAAT-TAATTTTGGGC-------TTGCGTCTT---TT-GTCGTCCT--A-T-TCCATTC-AACTT-CAA-C--C--CC-GCTTTCCAACACGAGT-ATT-ATCG--GTACGAACTACTCAATT--TCTGT-T-CACC---T--AAACCAGT----GG----AGT---GGCT----------TG---TTTACCT---CACC-TAATT-A-TG----------TTATTT-CAATC-CGATGG-CATCTT-C-AATTAAC--CATCGCCA-TAT-TAT-TGTACAATTGATATCTACGCTTCTCGTTAGATCCGCAGAGAC-GAACACAC---TGCT-C--AAAT-----GCTACCAGG-AGACA-T-TTTACACCCCTTT---CC-AAA-TA---GGGGGGGTTAGATAGAATTTAA-ACT--ATC--CCGATAGACC----------ACATA-TGCATTCAGTGCGTT----TTGAGGAAGTT--GTGAC-TG--ACACCACCACCTTCCTATCTACATCCAT-G-TTGTTTAGTCGGAC-GTTTGCTATCCAAACCAGCTAGCGGGATGCCTATT---CTGAGAC-GG--------TCCCACGTGTGTTGTCACCCG-AATTATCTCTCTCTAC-C-AAATGCCATGCAACGGAGC-GACTTGATCCACGA-ACGACCA-GAAAAAATGCAGTCAGCATGTC-TTGAAGAGGTTGTTCCT-GGCACCCCTCGCC---CACCTTCCTATCAAC-ATCCATGTTTCCGTGTTGTCCAG-TTGGATGTTTTTC-CCCGTCAACC-G--CC------TGC--GT-TTT-------------GC---------T--------------GTGTCGTCGCC-CAAA-TTATCTCTCTTCA--AGTCAAG-CTACATGT--GTC-CGACAACTGTTTAGTTTCTTGGGTGAG-TTTCATATAC-CTCGATTATTTC----TAAATTCAC-CAGTCAGCAAATAAGCTGCATCTATTCACGGGGGG----------CA-TC-ACTTGCATTTAG-----TCA----ACT-------A----------AGTT--AAATCC-GGTCATTAATTACTAGGTAAAT--AGCTC-TTTAGAGCT-AATG----TTAT------TTGT-A-A-GTATAC-CCGACTTC----A--AT-ATT--TA--TTATTTGATTCTTTATTTGGCCA-GTGTGTCTTCCCG-TGTATTGCTCTACGGGTG-CTAAGT-GGCT-TGGGAACTTTTT
gi|3                          :                                                    ATTAGA--TTTTAT-ATCAAA-TAGTCCCGACT-TAATTTTGGGC-------TTGCGT-TG---TT-GTTGTCCT--A-T-TCCATTC-AACTT-CAA-C--CT-CC-GCTTTCCAGCACGAGT-ATT-ATTG--GTACGAACTATTCAATT--TTTGC-T-CACC---T--AAACCAGT----GG----AAT---GACT----------TG---TTTACCT---GACC-AAATT-A-TG----------TTATTT-CAATC-CGATGG-CATCTT-C-AATTAAC--CATCGCCA-TAT-TAT-CGTAGAATTGATATCTATGCTTCTCGTTAGACCCGGAGAGAC-GAACGCAC---TGCT-C--AAAC-----GCTACCATG-AGACA-T-TTTACACCCCTTT---CC-AAA-TA----GGGGGGTTAGATAGACTT-----CT--ATC--CCGATAGATC----------ACAAA-TGCATTCAGTGCGTC----ATGAGGAAGCT--GTGA-----------AGCACCTTCCTATCTACATCCAT-G-TTTTTTAGTCGGAC-GTTTGCTATCCAAACCAGCTAGCGGGATGCCTATT---CTGAGAC-GG--------TCCCACGTGTGTTGTCACCCG-AATTATCTCTATCTCC-CTAAATGCCATGCAACGGAGC-GACTTGATCT-CGA-CCGACC---AAAAAATGCAGTCAGCATGTC-TTGACGAGGTTGTTACT-ATCACCCCTCGCC---CACCTTCCTATCAAC-ATTCATGTTTCCGTGTTGTCCAG-TTGGATG-TTTTC-CACGTCAA-T-GAACC------TGA--GA-TTT-------------GC---------TTATTCCAGACGGTCGTGTCGTCGCC-CGAATTTATCTCTCTACA--G--CAAC-CTACATGT---TG-CGACAACTAGTTAG--TCCGGGTTGAGTTTTCATATAC-CTCGA-TA--TC----TATATCCACTCAGTCAGCAAATAAGCTGCA--TATTC-CGGGGGGGGGGGGGGTTCATTC-ACTGGCATATAGTAAATTCACAAGACC-------A----------AGTTAAAAATCCGGGTCATCAA-TAC---GTAAATAAAGCTC--TTAGAGCTAAATG----TTATCG----TCCT-----GTATAC-CCGCCGTT----G--TC-ACA--TA--TGATTTA----TTTATTT---CATTTGTGTATTCCTGTTGTA-TGCTCTACGGGCGATTAAGTAGGCTATGGAAACTTTTT
gi|2                          :                                               ggattATTTGA--TTTTATTATCAAA-TAGTC--GAAT-TAATTTTGGA--------TAAGGCTTT---TT-GTTGTCCT--A-T-TCGATTC-CGCTT-CAG-C--C--CC-GTTTCCCAGCACGAGT-ATT-ATTG--GTACGGGCTATTCGATT--TCTGC-T-AGCC---T--AAACCAGT----GC----AGC---GGCT----------TC---TTTACCT---GACC-AAAAT-T-CGT---------TTATTT-CAATC-CGATGGACATCTT-C--ATTAGC--CATCGCCA-TAT-TAT-CGTATATTTGATGTCTACGCTTCTC--TAGATCCGGAGAGAC-GAACGCTC---TGCT-C--AAAC-----ACTACCATG-AGCCA-T-TTTACACCCCTTTTCACT-AAA-GG---GGAGGGGGTAGATAGACTT-----CT--ATC--CCGTTAGACC----------ACATATTGCATTCAGTACGTA----TTTCGGAAGTT--GTGAC-TG--ACACC--------CCTG---ACATCCAT-GTTTGCTTGG-CGGAC-GTTTTCTATCCAAACC-GAAAGC-GGATGCCTATT---CCGAGACGGG--------TCCCACGTGTGTTGTTACCCG-AATTATCTCATTCTAC-CTAAGTGCCATGCAACGGAGC-GACTCGATTC-CGACCCGACCACG----AATGCAGTCAGCATGTCTTTGAAGAGGTTG-TGCT-GGCACCCCTC-TC---CACCATCTTATCAACAATCCATGTTTCCGTGTTGTCCAG-TTGGAAGTTTTCC-CACGTCAACCAG--CC------TGA--ATATTT-------------GC---------TTATTCCAGACGGTCGTGT-GTCGCCGGGAA-TTATCTCTCTACA--AGTCAAACCTACACGT--GTC-CGACAACTG-TTAGTTCC--AGGTGGA-GTTCATATAC-CTTGATTATTTC----T-TATTCAC-CAGTCAACAAATAAGCTGCATCTATTCACGGGGGGGGGGT-----CA-TC-ACTTGCATATAG-----TAA----ACTCAAGACCA----------AGTT--AAAT-C-GGTCATCAATCATTACGTAAATA-AGCTCTTTTAGAGCT-AATG----TTAT------TCGT-C-CTGTATAC-CCGCCTTT----A--TC-ATA--TA--TGATTT-ATTATACATTTG---------GTATTCCTG-TGTATTGCTCTACGGGCG-TTAAGT-GGCT-TGGGAACTTTTTtcctat
gi|1                          :                         aaaagtgattttcacataatcaggattATCTGAAACTTTAT-ATCAAA-TAGTCC-GAATCTAATTT--GAT-------AAGTGT-TT---TT-GTTGTCCT--A-T-TCGATTCTAGCTT-CAA-C--C--CCCGCTTTCTAG-ACGAGT-GTT-ATTG--GTACGGGCGATTCGATT--TCTGC-T-CGCC---T--AAACCAGT----GC----AGT---GGCT----------TG---TT-ACCT---GACC-AAAAT-T-TG----------TTATTT-CAATC-CGATGA-CATCTT-C-AATTAGC--CATCGCCA-TAT-TAT-CATATATTTGAAGTCTACGCTTCTCGTTAGATCCGGAGAGAC-GAACGCTC---TGCT-C--TAAC-----ACTACCATG-AG-CA-T-TTTACA-CCCTTT---CC-GAA--A---GGGGG---TAGATA-AACTT----CT--ATC--CGTTTAGACCACATTATGGGACATA-TGCATTCAGTGCGTC----TTTCGGAAGTT--GTGAA-TG--ACA--ACCCCC---------ACATCCAT-G-TTGCTTGGTCGGACTGTTT-CTATCCAAACCAG-TAGC-GAATGCCTATT---CTGAAAC-GG--------TCCCACGTGTGTTGTCACCCG-AATTATCTCTCTCTACTC-AAGTGCCATGCAACGGAGC-GAC-CGATCC-CG--AC-ACCACGCAAAA---CAGTCAGCATGTC-TTGAAGAGATTGTGCCT-GGCACCCCTCTCC---CACCAT-CTATCAACAAACCATG-TTCCGT-TTGT-CAG-TTGGA--ATTTTC-CACGTCAACC-A--GC------CGA--TT-TTT-------------GC---------TTATTCCAGACGGTCGTGTCGTCG-C-CAGA-TTATCTCTCT--A--AGTCAAC-CTACATGT--GTC-CGACAACTG-TTAGTCC----GGTGAGTTTTCATATAC-CTCGATTATTTC----TATATC--C-CAGTCAGCAAATAAGCTGCATCTATTCACGGGGGGGGGT------CA-TCAACTTGCATTTAG-----TAA----ACTC------AAGACCAAGATAGTT--AAAT-C-GGTCATCAATTAC---GTAAAT--AGCTC-TTTAGAGCT-AATG----TTATA-----TTCT-A-CTGTATAC-CCGCCTTT----ATCAT-ATA--TAATTTATTTGAACATTTATTTAGCAT-TTGTGTC-TCCTG-TGTATTGCTCTACGGGTG-TTAAGT--GCT-TGGGAACTTTCTtttctgt
gi|5                          :         attgtactaacctaacaatgaaaatatttgtttaatcaggattATTTGA--TTTTAT-ATCAAA-TAGTCC-AAAT-CAATTTTGAACACAGAGTTTGCGT-------T-GTCAAACT--AAT-TACATTG-AA-TC-CAA-GTGC--CC-ATTTTCTAGTGCGTCG-ATT-ATTG--GTACGACCTGCTC----------T-T-TATC---TGCAAGCCAG------A----AGTC--AACTGTACAAACCGTA---TTTACTT---GGCC-AAATA-A-TT----------TTGTTT-CAATC-CGCCGA-CATCT-----ATTATT--CATTGCCA-TAT-TAC-CGGATAATCTATGTATATGCCTCATGTTAGATCCTGAGAGAC---ACTCAC---TGTC-C--ATAC-----GCCAC-AGTCAGACA-A-TTTGCACTCCTTT---CC-GAAGTA---AGAAG--------AGAAT------CG--ATC--CCGATCGACC----------GAATA-TGCAGTTAGTGTGTC----TTGCAAAGGTT--GTGAC-TG--ACACCCCCACCCTATTGTCAAACTCCAT-G-TTGTCCAGT-------TTTAC-ATCCTAACCAGCCAG-GAGATGCCTAAT---TTAAGAC-GG--------TCACAGGTATATTGTCACCCG-CATTATCTCCATCTACTC-A-----CATGAAAGGAAGA-TATTCGATCC-CGA-TCAATT----GAATATGCACTCAGTGTATC-TTGCGGAGGCTGTGATT-GACAC------AA---CACCTCCCAATCAAC-ATCCA--------TGTTGTCCAT-TTAG-TATTTTACACCC--CAACCAG--CCAGAGGATGCCTGT-TTTTGAG---------ACGATCACACGT--------------GTGTTGTCACC-CAAA-TTATCTCCTTTTACCAGTTTAT-CTACATGTAAATG-AGACAGCTGAT--GGATCCCGGGCGAG-TTCTAAATACACTCAATTAGTTCAGGTTTTATTTAC-CAGTCAGCAAAtcctat
gi|7                          : ccatcgtgttcagcaaatattaaacagaaattgatttattataatcaggattTTTAA--TTTTAT-ATCAAAATTGACC--AAT-TAATTATGGGC-------ACAGGACTTACCTTAGTCAAATT--G-T-TTAATTC-AAATTACAA-T--CGCCC-ACTTTCTAGCGCTCATGATC-ATAGTAATACAAACTATTCAATTCTTCTGC-AACACC---C--AAA--AGT----CA----AC------CT----------TG---A--ACCA---CACCGTAATTTACTGGCCAATCTTTTTATTC-AAATCACGTCGA-GATCTTTC-AATTA-CTTCATCGCCG-TAT-AACGTGGATAATTGATATCTGTGTCTCTCAT--G------AGAGTT-GGACGCAC---TGTC-CAAAAAC-----GCC-CCGTC-GGACA-TAGTTGCACTCCTTT---CC-GAA-
gi|9                          :                                                                   atCAAA-TAGTCC-GAAT-TAATTTTGGAC-------TTGCGTGTT---TT-GTTGTCCT----T-TCCATTC-AACTT-CAATT--C--CC-GCTTTCCGACACGAGT-ATT-ATTG--GTACGAACTACTCAATT--TCTGC-T-
gi|11                         :                                                                           AGTCA-AAAT-TAAATTTGGGCA------CTGCATCTT---TC--TTGTCCTTTA-TGTGCAATG-AAATT-CAA-C--C--CCCACTTTCCAGTACGAGA-ATC-ATTG--GCACGAAC
gi|14                         :                                                                                                                                aa-T-TACATTC-AACTT-CAA-C--C--CCCACTTTCTGGCGCGA---ATT-ATTG--GTACAAACTATTCAATT--TCTGCAT-CACTGCAC--AAACCA
gi|6                          :                                                                                                                                          tC-AGCTT-CAC-C--C--CC-GCTTTCCAGC-CGAGT-ATTTATTG--GTACGG-CTATCGAAAT--TCTGC-T-CGCC---T--AAACCAGT----AGCCCGAGTTGGGGCT----------TGGTTTTTACCT---GACC-AAATT----G----------TTATTTTCAATC-CGATGA-CATCTT-CCAATGAGC--CATCGCCAATATCTAT-CGT-TATTTGCTGTCT-CGGCTCTCGT-AGATCCGGAGAAACCGAAAACGCCTCTGCTGC--AAAC-----ACTACC-GT-AGCCAAT-TTTACACCCCTTT---TCGAAA-CAAGAGGGGGGG--GGGTAGGAT---A-GCT--GTCATCCGTTAGACC----------ACAT---GCATTC-GTGCGTTCTTTTTACGGAAGTTCGGTGACGTGGGACACC--CAC---------TACATCCATTGCTTGCTTGG-CGGAC-GTTTTCTATACAAACAAGGTAGCGG-ATGCCTATTATTCTGAGCC-GG--------TCCCACGTGTTGTGTCACCCGCAATTATCTCTCT--AC-T-AAGTGCCATGCAACGGAGCCGA-TCGATCC-CGA-CCGACCT---ACGAATGCAGTCAGCATGTC-TTGAAGAGGTTGTGCCTGGGCACCCCTCTCCCCACACAT---TATCAAC-ATCAATGTTT-CGTGTTATCCAGTTTGGAAGTTTT---CACGTCATCCAG--CC------TGA--TT-TTTGTTATTCCAGAAGGC---------C--------------GTGTCGTCGCC-CAAA-TTATCTCTCTACA--AGTCAAC-CTACATGT--GTCACGACAACTG--TAG-TACCAGGGTAGGCTTTCAt
gi|8                          :                                                                                                                                                                           CGAGG-ATT-ATTG--GTATGAATTATTCATTT--TCTGC-A-CACC---G--GAA---GTTTTTGC----AAA---AACA----------TG---TTTACTTGGCCAAC-AAATT-G-TA----------T-GCTG-CAATC-CGCCGA-CATCTT-C-GATTATT--CATCGCCA-TAT-TAC-TGGATAATTGATGTATATTCCCCTGGTTAGATCCTGAGAGAC-GAACGCAC---GGTC-C--AAATTAAACGTCACTGTC-GAACA-A-TTTGCTCTACTTT---CC-GAA-AA---AGAAGGGATAG---GAA---AAGACTCGATC--CCGATTGACC----------
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         gCCTATT---CTGAAAC-GGTTCCACGGTCCCACGTGTGTTGTAACAAG-AATTATATCTCTCTAC-CTAAGTACCATGCAACGACGC-GACTCGATCC-CGA-gaat
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             cGA-CCGACCACGAA----TGCAGTCAGCATGTC-TTCAAGAGGTTGTGCCT-GGCACCCC-CTCC---CACCATCTTATCAACAATCCATTTTTCCGTGTTGTCCTG-TTGGAAGTTTTCC-c
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   GGTAAAT--AGCTC-TTTAGAGCT-AATT----TTAT------TTGT-A-ATATATAC-CAGACTTTA---A--ATAATTA-TA--TCATTTGATT
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tGGTAAAT--GGCTC-TTTAAAGCT-AATG----TTAT------TTGTAA-A-GTATAC-CCTTCTTTA---A--AT-AAA--TA--TTATTTGAT--TTGATTTGgatt
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gtcGGTAAAT--AGCTC-TTTAGAGCT-AATG----TTATAAAGTATTGT-----GTACCCACCGACTTTA---A--AT-AAA--TA--TTATTTGa
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gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   tcTATAT--AGCTC-TTTAGAACT-AACG---------------TGT-A-ATATATAC-CCGACTTTTTAAA--AT-AAA--TA--TTATTTGAtattt
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3 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|13 ): ATAATCTTCACTATCGCATTCTCTCTAAAACAGTACACCTTAACATCACATGAAAGGAAGAGACTCGATCCCGATCGACTAAAT
Unaligned ( gi|19 ): TTTGAGAATATACACTGTGTTTTGATACCAAATCAGCTATTTTTACATCAGTTTATCTACATGTACGTGA
Unaligned ( gi|22 ): TAGTATATGCCCGACTTTTTAAAATAAATATTATTTGA






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gi|11                         :                             AGTCA-AAAT-TAAATTTGGGCACTGCA--T-C---TTTCTTGTC---CTTTA-TGTGCAATG-AAATT-CAAC--C--CCCACTTTCCAGTACGAGA-ATC-AT--TGGCACGAAC
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         aaCCTATT---CTGAAAC-GGTTCCACGGTCCCACGTGTGTTGTAACAAG-AATTATATCTCTCTACCTAAGTACCATGCAACGACGC-GACTCGATCC-CGA-C
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   cCATGAAAGGAAGA-GACTCGATCC-CGA-TCGACT-A
gi|14                         :                                  ataatcttcactatcgcattctctctaaaacagtacaccttaacatca-T-TACATTC-AACTT-CAAC--C--CCCACTTTCTGGCGCGA---ATT-AT--TGGTACAAACTATTCAATT--TCTGCAT-CACTGCACAAA--CCAaat
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tC--GGTAAAT--GGCTC-TTTAAAGCT-AATG----TTAT-TTGTAAAGTATAC---CCTTCTTTA---A--ATA--AATA--TTATTTGAT---TTG-ATTTG----t
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     gt--GGTAAAT--AGCTC-TTTAGAGCT-AATT----TTAT-TTGTAATATATAC---CAGACTTTA---A--ATAATTATA--TCATTTGATTGATTa
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tC--GGTAAAT--AGCTC-TTTAGAGCT-AATG----TTATAAAGTATTGTGTACCCACCGACTTTA---A--ATA--AATA--TTATTTG
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      C--GGTAAAT--AGCTC-TTTA-----------------T-TTGTATTGTATAC---CCGACTTTG---A--ATA--AATA--TTATTTGAT---TTT-ATTT
gi|2                          :     tATTTGA--TTTTATTATCAAA-TAGT-C-GAAT-TAATTTTGGATAA-GGC--T-T---TTTGTTGTC---CT--A-T-TCGATTC-CGCTT-CAGC--C--CC-GTTTCCCAGCACGAGT-ATT-AT--TGGTACGGGCTATTCGATT--TCTGC-T-A---GCCTAAA--CCAGT----GC----AGC---GGCT-TC-------------TTTACCTGACCAA---AATTCGTTTATTT-CAATC-CGATGGACATCTT-C--ATTAGC--CATCGCCA-TAT-TATCGT--ATATTTGATGTCTACGCTTCTC--TAGATCCGGAGAGAC---GAACGCT-CTGCT-C-----AAACACTACCATGAGCCA-T-TTTACACCCCTTTTCACTAAA----GGGGAGGGGG-TA-GATAGACT-T----CTATC--CCGTTAGACCACAT----------ATTGCATTCAGTACGTA----TTTCGGAAGTT--GTGAC-TG--ACACC---------CCTG---ACATCCAT-GTTTGCTTGG-CGGACGTTTTCTATCCAAACC-GAAAGC-GGATGCCTATT---CCGAGACGGG--------TCCCACGTGTGTTGTTACCCG-AATTATCTCATTCTACCTAAGTGCCATGCAACGGAGC-GACTCGATTC-CGACCCGACC-ACG---AATGCAGTCAGCATGTCTTTGAAGAGGTTGTG-CTGG-CACCCCTCT-CC-AC-CATCTTATCAACAATCCATGTTTCCGTGTTGTCCAGTT-GGAAGT-TTTCCCACGTCAACCAGCCTGAATATTTGCTTATTCC--AGACGGTC------GTGT-GTCGCCGGGAA-TTATCTC--TCTACAAGTCAAACCTACACGT--GTC-CGACAACT-G-TTAG-TTCCAGGT-GGAG--TTCATATAC-CTTGATTATTTC----T-TATTCAC-CAGTCAACAAATAAGCTGCATCTATTCACGGGGGGGGGGT-----CA-TC-ACTTGCATATAGTAAACTCAAGAC--CA----------AGTT--AAAT-C--GGTCATCAATCATTAC---GTAAATA-AGCTCTTTTAGAGCT-AATG----TTAT-TCGTCCTGTATAC---CCGCCTTT----A--TCA--TATA--TGATTT-ATT-ATAC-ATTTG--------GTATTCCTG-TGTATTGCTCTACGGGCG-TTAAGT-GGCT-TGGGAACTTTTTtattt
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  aaaagtgattttcacataatcaggattAAT--AGCTC-TTTAGAGCT-AATGTTAATTAT-TTGTAATGTACAC---CCAACTTTA---A--ATG--AATA--TCATTTGATT-tttctgt
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TATAT--AGCTC-TTTAGAACT-AACG----T------GTAATATATAC---CCGACTTTTTAAA--ATA--AATA--TTATTTGA
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tataTAGTATATGC---CCGACTTTTTAAA--ATA--AATA--TTATTTGA
gi|3                          :      ATTAGA--TTTTA-TATCAAA-TAGTCCCGACT-TAATTTTGGGCTT-GCG--T-T---GTTGTTGTC---CT--A-T-TCCATTC-AACTT-CAAC--CT-CC-GCTTTCCAGCACGAGT-ATT-AT--TGGTACGAACTATTCAATT--TTTGC-T-C---ACCTAAA--CCAGT----GG----AAT---GACT-TG-------------TTTACCTGACCAA---ATTATG-TTATTT-CAATC-CGAT-GGCATCTT-C-AATTAAC--CATCGCCA-TAT-TATCGT--AGAATTGATATCTATGCTTCTCGTTAGACCCGGAGAGAC---GAACGCA-CTGCT-C-----AAACGCTACCATGAGACA-T-TTTACACCCCTTTCCA--AAT----AGG--GGGGT-TA-GATAGACT-T----CTATC--CCGATAGATCACAA----------A-TGCATTCAGTGCGTC----ATGAGGAAGCT--GTGA--------AGCAC---CT-TCCTATCTACATCCAT-G-TTTTTTAGTCGGACGTTTGCTATCCAAACCAGCTAGCGGGATGCCTATT---CTGAGAC-GG--------TCCCACGTGTGTTGTCACCCG-AATTATCTCTATCTCCCTAAATGCCATGCAACGGAGC-GACTTGATCT-CGA-CCGACC-A--AAAAATGCAGTCAGCATGTC-TTGACGAGGTTGTTACTAT-CACCCCTCGCCC-AC-CTTCCTATCAAC-ATTCATGTTTCCGTGTTGTCCAGTT-GGATGT-TTT-CCACGTCAATGAACCTGAGA-TTTGCTTATTCC--AGACGGTC------GTGTCGTCGCC-CGAATTTATCTC--TCTACAG--C-AACCTACATGT---TG-CGACAACTAG-TTAG-T--CCGGGTTGAGTTTTCATATAC-CTCGA-TA--TC----TATATCCACTCAGTCAGCAAATAAGCTGCA--TATTC-CGGGGGGGGGGGGGGTTCATTC-ACTGGCATATAGTAAATTCACAAGACCA----------AGTTAAAAAT-CCGGGTCATCA---A-TAC---GTAAATAAAGCTC--TTAGAGCTAAATG----TTA--TCGTCCTGTATAC---CCGCCGTT----G--TCA--CATA--TGATTTATTT-ATTTCAT-------TTGTGTATTCCTGTTGTA-TGCTCTACGGGCGATTAAGTAGGCTATGGAAACTTTTT
gi|4                          : ggattATTTGA--TTTTA-TATCAAA-TAGTCC-GAAT-TAATTTTGGGCTT-GCG--TCT---TTTGTCGTC---CT--A-T-TCCATTC-AACTT-CAAC--C--CC-GCTTTCCAACACGAGT-ATT-AT--CGGTACGAACTACTCAATT--TCTGT-T-C---ACCTAAA--CCAGT----GG----AGT---GGCT-TG-------------TTTACCTCACCTA---ATTATG-TTATTT-CAATC-CGAT-GGCATCTT-C-AATTAAC--CATCGCCA-TAT-TATTGT--ACAATTGATATCTACGCTTCTCGTTAGATCCGCAGAGAC---GAACACA-CTGCT-C-----AAATGCTACCAGGAGACA-T-TTTACACCCCTTTCCA--AAT----AGG--GGGGGTTA-GATAGAAT-TTAAACTATC--CCGATAGACCACAT----------A-TGCATTCAGTGCGTT----TTGAGGAAGTT--GTGAC-TG--ACACCACCA-CCTTCCTATCTACATCCAT-G-TTGTTTAGTCGGACGTTTGCTATCCAAACCAGCTAGCGGGATGCCTATT---CTGAGAC-GG--------TCCCACGTGTGTTGTCACCCG-AATTATCTCTCTCTACC-AAATGCCATGCAACGGAGC-GACTTGATCCACGA-ACGACC-AGAAAAAATGCAGTCAGCATGTC-TTGAAGAGGTTGTTCCTGG-CACCCCTCGCCC-AC-CTTCCTATCAAC-ATCCATGTTTCCGTGTTGTCCAGTT-GGATGT-TTTTCCCCGTCAACC-GCCTGCGT-TTTGCT----------------------GTGTCGTCGCC-CAAA-TTATCTC--TCTTCAAGTC-AAGCTACATGT--GTC-CGACAACT-GTTTAGTTTCTTGGG-TGAG-TTTCATATAC-CTCGATTATTTC----TAAATTCAC-CAGTCAGCAAATAAGCTGCATCTATTCAC----GGGGGG------CA-TC-ACTTGCATTTAGTCAACT---------A----------AGTT--AAATCC--GGTCATTA---ATTACTAGGTAAAT--AGCTC-TTTAGAGCT-AATG----TTAT-TTGTAA-GTATAC---CCGACTTC----A--ATA--TTTA--TTATTTGATT-CTTT-ATTTGGCCAGTGTGTCTTCCCG-TGTATTGCTCTACGGGTG-CTAAGT-GGCT-TGGGAACTTTTTtcctat
gi|5                          :      ATTTGA--TTTTA-TATCAAA-TAGTCC-AAAT-CAATTTTGAACACAGAG--T-T---TGCGTTGTCAAACT--AAT-TACATTG-AA-TC-CAAGTGC--CC-ATTTTCTAGTGCGTCG-ATT-AT--TGGTACGACCTGCTCTTTA--TCTGC-A-A---GCCAGAAGTCAACT----GT----ACA---AACCGTA-------------TTTACTTGGCCAA---ATAATT-TTGTTT-CAATC-CGCC-GACATCT-----ATTATT--CATTGCCA-TAT-TACCGG--ATAATCTATGTATATGCCTCATGTTAGATCCTGAGAGAC-----ACTCA-CTGTC-C-----ATACGCCACAGTCAGACA-A-TTTGCACTCCTTTCCG--AAGT---AAG--AAG---------AGAAT------CGATC--CCGATCGACCGAAT----------A-TGCAGTTAGTGTGTC----TTGCAAAGGTT--GTGAC-TG--ACACCCCCACCC-TATTGTCAAACTCCAT-G-TTGTCCAGT------TTTAC-ATCCTAACCAGCCAG-GAGATGCCTAAT---TTAAGAC-GG--------TCACAGGTATATTGTCACCCG-CATTATCTCCATCTACTCA-----CATGAAAGGAAGA-TATTCGATCC-CGA-TCAATT----GAATATGCACTCAGTGTATC-TTGCGGAGGCTGTGATTGA-CAC------AAC-AC-CTCCCAATCAACA---------TCCATGTTGTCCATTT----AGTATTTTACACCCCAACCAGCCAGAG--GATGCCTGTTTTTGAGACGATCACACGTGTGTTGTCACC-CAAA-TTATCTCCTTTTACCAGTT-TATCTACATGTAAATG-AGACAGCT-G-ATGG-ATCCCGGG-CGAGTTCTAA-ATACACTCAATTAGTTCAGGTTTTATTTAC-CAGTCAGCAAA
gi|6                          :                                       ccatcgtgttcagcaaatattaaacagaaattgatttattataatcaggattC-AGCTT-CACC--C--CC-GCTTTCCAGC-CGAGT-ATTTAT--TGGTACGG-CTATCGAAAT--TCTGC-T-C---GCCTAAA--CCAGT----AGCCCGAGTTGGGGCT-TGGTT----------TTTACCTGACCAA---ATT--G-TTATTTTCAATC-CGAT-GACATCTT-CCAATGAGC--CATCGCCAATATCTATCGT---TATTTGCTGTCT-CGGCTCTCGT-AGATCCGGAGAAACCGAAAACGCCTCTGCTGC-----AAACACTACCGT-AGCCAAT-TTTACACCCCTTTTCG--AAACAAGAGG--GGGGG--G-GGTAGGATAG----CTGTCATCCGTTAGACCACAT-------------GCATTC-GTGCGTTCTTTTTACGGAAGTTCGGTGACGTGGGACACC--CA-C---------TACATCCATTGCTTGCTTGG-CGGACGTTTTCTATACAAACAAGGTAGCGG-ATGCCTATTATTCTGAGCC-GG--------TCCCACGTGTTGTGTCACCCGCAATTATCTCTCT--AC-TAAGTGCCATGCAACGGAGCCGA-TCGATCC-CGA-CCGACCTACGAA---TGCAGTCAGCATGTC-TTGAAGAGGTTGTGCCTGGGCACCCCTCTCCCCACACAT--TATCAACA-TCAATGTTTC-GTGTTATCCAGTTTGGAAGT-TTTC--ACGTCATCCAGCCTGATT-TTTG-TTATTCC--AGAAGGCC------GTGTCGTCGCC-CAAA-TTATCTC--TCTACAAGTC-AACCTACATGT--GTCACGACAACT-G--TAG-TACCAGGG-TAGGCTTTCA
gi|7                          :       TTTAA--TTTTA-TATCAAAATTGACC--AAT-TAATTATGGGCAC-AGGACT-TACCTTAGTCAAA---TT--G-T-TTAATTC-AAATTACAAT--CGCCC-ACTTTCTAGCGCTCATGATC-ATAGTAATACAAACTATTCAATTCTTCTGC-AAC---ACCCAAA----AGT----CA----AC------CT-TGAACCACACCGTAATTTAC-TGGCCAA----TCTTT-TTATTC-AAATCACGTC-GAGATCTTTC-AATTA-CTTCATCGCCG-TAT--AACGTGGATAATTGATATCTGTGTCTCTCAT--------GAGAGTT---GGACGCA-CTGTC-CAA---AAACGCC-CCGTCGGACA-TAGTTGCACTCCTTTCCG--AA
gi|8                          :                                                                                                                       atGCGAGG-ATT-AT--TGGTATGAATTATTCATTT--TCTGC-A-C---ACCGGAA-----GTTTTTGC----AAA---AACA-TG-------------TTTACTTGGCCAACAAATTGTA-T-GCTG-CAATC-CGCC-GACATCTT-C-GATTATT--CATCGCCA-TAT-TACTGG--ATAATTGATGTATATTCCCCTGGTTAGATCCTGAGAGAC---GAACGCA-CGGTC-CAAATTAAACGTCACTGTCGAACA-A-TTTGCTCTACTTTCCGA-AAA----AGA--AGGGA-TAGGAAAAGAC-T----CGATC--CCGATTGACC
gi|9                          :                       CAAA-TAGTCC-GAAT-TAATTTTGGACTT-GCG--TGT---TTTGTTGTC---CT----T-TCCATTC-AACTT-CAATT-C--CC-GCTTTCCGACACGAGT-ATT-AT--TGGTACGAACTACTCAATT--TCTGC-T-gaat
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|19 ): TTTGAGAATATACACTGTGTTTTGATACCAAATCAGCTATTTTTACATCAGTTTATCTACATGTACGTGA






Alignments
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Reference ( family-1434 )     :      ATTTGA--TTTTA-TATCAAA-TAGTCC-GAAT-TAATTTTGGGCAC-GCGT-TTT-TGTT-GTC---CT--A-T-TCCATTC-AACTT-CAA-C--C--CC-GCTTTCCAGCGCGAGT-ATT-AT--TGGTACGAACTATTCAATT--TCTGC-T-C---GCC-TAAACCA---GT----GNAG--C---------GGCTTG-------------TTTACCTGACCAA---ATTNTG-TTATTT-CAATC-CGAC-GACATCTT-C-AATTAGC--CATCGCCA-TAT-TATCGT--ATAATTGATGTCTACGCCTCTCGTTAGATCCGGAGAGAC---GAACGCA-CTGCT-C-----AAACGCTACCGTGAGACA-T-TTTACACCCCTTTCCG--AA--A----AGG--GGGGG-TA-GATAGAAT-T----CTATC--CCGNTAGACCACAT----------A-TGCATTCAGTGCGTC----TTGCGGAAGTT--GTGAC-TGACA-C-C-CCA-CC-TCCTGTCTACATCCAT-G-TTGCTTGGTCGGACGTTTNCTATCCAAACCAGCTAGCGGGATGCCTATT---CTGAGAC-GG--------TCCCACGTGTGTTGTCACCCG-AATTATCTCTCTCTACCTAAGTGCCATGCAACGGAGC-GACTCGATCC-CGA-CCGACC-ACGAAAAATGCAGTCAGCATGTC-TTGAAGAGGTTGTGCCTGG-CACCCCTCTCCC-AC-CNTCCTATCAACAATCCATGTTTCCGTGTTGTCCAGTT-GGAAGT-TTTCCCACGTCAACCAGCCTGAGT-TTTGCTTATTCC--AGACGGTC------GTGTCGTCGCC-CGAA-TTATCTC--TCTACAAGTC-AACCTACATGT--GTC-CGACAACT-G-TTAG-TTCCCGGG-TGAGTTTTCATATAC-CTCGATTATTTC----TATATTCAC-CAGTCAGCAAATAAGCTGCATCTATTCACGGGGGGGGGG------CA-TC-ACTTGCATNTAGTAAACTC---AGA-CA----AGTT--AAAT-C--GGTCATCA---ATTAC--GGTAAAT--AGCTC-TTTAGAGCT-AATGTTA----T-TTGTANTGTATAC---CCGACTTT---A-AAT-A--NATA--TTATTTGATT-ATTTATTTGGC--T--TGTGTATTCCTG-TGTATTGCTCTACGGGCG-TTAAGT-GGCT-TGGGAACTTTTT
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gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        attgtactaacctaacaatgaaaatatttgtttaatcaggattGA-CCGACC-ACGAA---TGCAGTCAGCATGTC-TTCAAGAGGTTGTGCCTGG-CACCCC-CTCCC-AC-CATCTTATCAACAATCCATTTTTCCGTGTTGTCCTGTT-GGAAGT-TTTCCtcctat
gi|11                         :                             AGTCA-AAAT-TAAATTTGGGCACTGCAT-CTT-TCTT-GTC---CTTTA-TGTGCAATG-AAATT-CAA-C--C--CCCACTTTCCAGTACGAGA-ATC-AT--TGGCACGAAC
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              aaCCTATT---CTGAAAC-GGTTCCACGGTCCCACGTGTGTTGTAACAAG-AATTATATCTCTCTACCTAAGTACCATGCAACGACGC-GACTCGATCC-CGA-C
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        cCATGAAAGGAAGA-GACTCGATCC-CGA-TCGACT-A
gi|14                         :                               ataatcttcactatcgcattctctctaaaacagtacaccttaacatca-T-TACATTC-AACTT-CAA-C--C--CCCACTTTCTGGCGCGA---ATT-AT--TGGTACAAACTATTCAATT--TCTGCAT-CACTGCA-CAAACCA---aat
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tC--GGTAAAT--GGCTC-TTTAAAGCT-AATGTTA----T-TTGTAAAGTATAC---CCTTCTTT---A-AAT-A--AATA--TTATTTGAT---TTGATTTGt
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    gt--GGTAAAT--AGCTC-TTTAGAGCT-AATTTTA----T-TTGTAATATATAC---CAGACTTT---A-AAT-AATTATA--TCATTTGATTGATTa
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tC--GGTAAAT--AGCTC-TTTAGAGCT-AATGTTA----TAAAGTATTGTGTACCCACCGACTTT---A-AAT-A--AATA--TTATTTG
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     C--GGTAAAT--AGCTC-TTTA-----------------T-TTGTATTGTATAC---CCGACTTT---G-AAT-A--AATA--TTATTTGAT---TTTATTT
gi|2                          :     tATTTGA--TTTTATTATCAAA-TAGT-C-GAAT-TAATTTTGGATAA-GGCT-TTT-TGTT-GTC---CT--A-T-TCGATTC-CGCTT-CAG-C--C--CC-GTTTCCCAGCACGAGT-ATT-AT--TGGTACGGGCTATTCGATT--TCTGC-T-A---GCC-TAAACCA---GT----GCAG--C---------GGCTTC-------------TTTACCTGACCAA---AATTCGTTTATTT-CAATC-CGATGGACATCTT-C--ATTAGC--CATCGCCA-TAT-TATCGT--ATATTTGATGTCTACGCTTCTC--TAGATCCGGAGAGAC---GAACGCT-CTGCT-C-----AAACACTACCATGAGCCA-T-TTTACACCCCTTTTCACTAA--A----GGGGAGGGGG-TA-GATAGACT-T----CTATC--CCGTTAGACCACAT----------ATTGCATTCAGTACGTA----TTTCGGAAGTT--GTGAC-TGACA-C-C---------CCTG---ACATCCAT-GTTTGCTTGG-CGGACGTTTTCTATCCAAACC-GAAAGC-GGATGCCTATT---CCGAGACGGG--------TCCCACGTGTGTTGTTACCCG-AATTATCTCATTCTACCTAAGTGCCATGCAACGGAGC-GACTCGATTC-CGACCCGACC-ACG---AATGCAGTCAGCATGTCTTTGAAGAGGTTGTG-CTGG-CACCCCTCT-CC-AC-CATCTTATCAACAATCCATGTTTCCGTGTTGTCCAGTT-GGAAGT-TTTCCCACGTCAACCAGCCTGAATATTTGCTTATTCC--AGACGGTC------GTGT-GTCGCCGGGAA-TTATCTC--TCTACAAGTCAAACCTACACGT--GTC-CGACAACT-G-TTAG-TTCCAGGT-GGAG--TTCATATAC-CTTGATTATTTC----T-TATTCAC-CAGTCAACAAATAAGCTGCATCTATTCACGGGGGGGGGGT-----CA-TC-ACTTGCATATAGTAAACTCA--AGACCA----AGTT--AAAT-C--GGTCATCAATCATTAC---GTAAATA-AGCTCTTTTAGAGCT-AATGTTA----T-TCGTCCTGTATAC---CCGCCTTT------ATCA--TATA--TGATTT-ATT-ATACATTTG----------GTATTCCTG-TGTATTGCTCTACGGGCG-TTAAGT-GGCT-TGGGAACTTTTTtattt
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 aaaagtgattttcacataatcaggattAAT--AGCTC-TTTAGAGCT-AATGTTAATTAT-TTGTAATGTACAC---CCAACTTT---A-AAT-G--AATA--TCATTTGATT-tttctgt
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TATAT--AGCTC-TTTAGAACT-AACGT----------GTAATATATAC---CCGACTTTTTAA-AAT-A--AATA--TTATTTGA
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tataTAGTATATGC---CCGACTTTTTAA-AAT-A--AATA--TTATTTGA
gi|3                          :      ATTAGA--TTTTA-TATCAAA-TAGTCCCGACT-TAATTTTGGGCTT-GCGT-TGT-TGTT-GTC---CT--A-T-TCCATTC-AACTT-CAA-C--CT-CC-GCTTTCCAGCACGAGT-ATT-AT--TGGTACGAACTATTCAATT--TTTGC-T-C---ACC-TAAACCA---GT----GGAA--T---------GACTTG-------------TTTACCTGACCAA---ATTATG-TTATTT-CAATC-CGAT-GGCATCTT-C-AATTAAC--CATCGCCA-TAT-TATCGT--AGAATTGATATCTATGCTTCTCGTTAGACCCGGAGAGAC---GAACGCA-CTGCT-C-----AAACGCTACCATGAGACA-T-TTTACACCCCTTTCCA--AA--T----AGG--GGGGT-TA-GATAGACT-T----CTATC--CCGATAGATCACAA----------A-TGCATTCAGTGCGTC----ATGAGGAAGCT--GTGA---AGCA-C-------CT-TCCTATCTACATCCAT-G-TTTTTTAGTCGGACGTTTGCTATCCAAACCAGCTAGCGGGATGCCTATT---CTGAGAC-GG--------TCCCACGTGTGTTGTCACCCG-AATTATCTCTATCTCCCTAAATGCCATGCAACGGAGC-GACTTGATCT-CGA-CCGACC-A--AAAAATGCAGTCAGCATGTC-TTGACGAGGTTGTTACTAT-CACCCCTCGCCC-AC-CTTCCTATCAAC-ATTCATGTTTCCGTGTTGTCCAGTT-GGATGT-TTT-CCACGTCAATGAACCTGAGA-TTTGCTTATTCC--AGACGGTC------GTGTCGTCGCC-CGAATTTATCTC--TCTACAG--C-AACCTACATGT---TG-CGACAACTAG-TTAG-T--CCGGGTTGAGTTTTCATATAC-CTCGA-TA--TC----TATATCCACTCAGTCAGCAAATAAGCTGCA--TATTC-CGGGGGGGGGGGGGGTTCATTC-ACTGGCATATAGTAAATTCACAAGACCA----AGTTAAAAAT-CCGGGTCATCA---A-TAC---GTAAATAAAGCTC--TTAGAGCTAAATGTTA------TCGTCCTGTATAC---CCGCCGTT------GTCA--CATA--TGAT----TT-ATTTATTTCAT--T--TGTGTATTCCTGTTGTA-TGCTCTACGGGCGATTAAGTAGGCTATGGAAACTTTTT
gi|4                          : ggattATTTGA--TTTTA-TATCAAA-TAGTCC-GAAT-TAATTTTGGGCTT-GCGTCTTT-TGTC-GTC---CT--A-T-TCCATTC-AACTT-CAA-C--C--CC-GCTTTCCAACACGAGT-ATT-AT--CGGTACGAACTACTCAATT--TCTGT-T-C---ACC-TAAACCA---GT----GGAG--T---------GGCTTG-------------TTTACCTCACCTA---ATTATG-TTATTT-CAATC-CGAT-GGCATCTT-C-AATTAAC--CATCGCCA-TAT-TATTGT--ACAATTGATATCTACGCTTCTCGTTAGATCCGCAGAGAC---GAACACA-CTGCT-C-----AAATGCTACCAGGAGACA-T-TTTACACCCCTTTCCA--AA--T----AGG--GGGGGTTA-GATAGAAT-TTAAACTATC--CCGATAGACCACAT----------A-TGCATTCAGTGCGTT----TTGAGGAAGTT--GTGAC-TGACA-C-CACCA-CCTTCCTATCTACATCCAT-G-TTGTTTAGTCGGACGTTTGCTATCCAAACCAGCTAGCGGGATGCCTATT---CTGAGAC-GG--------TCCCACGTGTGTTGTCACCCG-AATTATCTCTCTCTACC-AAATGCCATGCAACGGAGC-GACTTGATCCACGA-ACGACC-AGAAAAAATGCAGTCAGCATGTC-TTGAAGAGGTTGTTCCTGG-CACCCCTCGCCC-AC-CTTCCTATCAAC-ATCCATGTTTCCGTGTTGTCCAGTT-GGATGT-TTTTCCCCGTCAACC-GCCTGCGT-TTTGCT----------------------GTGTCGTCGCC-CAAA-TTATCTC--TCTTCAAGTC-AAGCTACATGT--GTC-CGACAACT-GTTTAGTTTCTTGGG-TGAG-TTTCATATAC-CTCGATTATTTC----TAAATTCAC-CAGTCAGCAAATAAGCTGCATCTATTCAC----GGGGGG------CA-TC-ACTTGCATTTAGTCAACT---------A----AGTT--AAATCC--GGTCATTA---ATTACTAGGTAAAT--AGCTC-TTTAGAGCT-AATGTTA----T-TTGTAA-GTATAC---CCGACTTC-----AAT-A--TTTA--TTATTTGATT-CTTTATTTGGC--CAGTGTGTCTTCCCG-TGTATTGCTCTACGGGTG-CTAAGT-GGCT-TGGGAACTTTTTtcctat
gi|5                          :      ATTTGA--TTTTA-TATCAAA-TAGTCC-AAAT-CAATTTTGAACACAGAGT-TTG-CGTT-GTCAAACT--AAT-TACATTG-AA-TC-CAA-GTGC--CC-ATTTTCTAGTGCGTCG-ATT-AT--TGGTACGACCTGCTCTTTA--TCTGC-A-A---GCCAGAAGTCAACTGT----ACAAACC---------G---TA-------------TTTACTTGGCCAA---ATAATT-TTGTTT-CAATC-CGCC-GACATCT-----ATTATT--CATTGCCA-TAT-TACCGG--ATAATCTATGTATATGCCTCATGTTAGATCCTGAGAGAC-----ACTCA-CTGTC-C-----ATACGCCACAGTCAGACA-A-TTTGCACTCCTTTCCG--AAGTA----AGA--AG----------AGAAT------CGATC--CCGATCGACCGAAT----------A-TGCAGTTAGTGTGTC----TTGCAAAGGTT--GTGAC-TGACACC-C-CCACCC-TATTGTCAAACTCCAT-G-TTGTCCAGT------TTTAC-ATCCTAACCAGCCAG-GAGATGCCTAAT---TTAAGAC-GG--------TCACAGGTATATTGTCACCCG-CATTATCTCCATCTACTCA-----CATGAAAGGAAGA-TATTCGATCC-CGA-TCAATT----GAATATGCACTCAGTGTATC-TTGCGGAGGCTGTGATTGA-CAC------AAC-AC-CTCCCAATCAACA---------TCCATGTTGTCCATTT----AGTATTTTACACCCCAACCAGCCAGAG--GATGCCTGTTTTTGAGACGATCACACGTGTGTTGTCACC-CAAA-TTATCTCCTTTTACCAGTT-TATCTACATGTAAATG-AGACAGCT-G-ATGG-ATCCCGGG-CGAGTTCTAA-ATACACTCAATTAGTTCAGGTTTTATTTAC-CAGTCAGCAAA
gi|6                          :                                    ccatcgtgttcagcaaatattaaacagaaattgatttattataatcaggattC-AGCTT-CAC-C--C--CC-GCTTTCCAGC-CGAGT-ATTTAT--TGGTACGG-CTATCGAAAT--TCTGC-T-C---GCC-TAAACCA---GT------AG--CCCGAGTTGGGGCTTGGTT----------TTTACCTGACCAA---ATT--G-TTATTTTCAATC-CGAT-GACATCTT-CCAATGAGC--CATCGCCAATATCTATCGT---TATTTGCTGTCT-CGGCTCTCGT-AGATCCGGAGAAACCGAAAACGCCTCTGCTGC-----AAACACTACCGT-AGCCAAT-TTTACACCCCTTTTCG--AA--ACAAGAGG--GGGGG--G-GGTAGGATAG----CTGTCATCCGTTAGACCACAT-------------GCATTC-GTGCGTTCTTTTTACGGAAGTTCGGTGACGTGGGA-CAC-CCA-C---------TACATCCATTGCTTGCTTGG-CGGACGTTTTCTATACAAACAAGGTAGCGG-ATGCCTATTATTCTGAGCC-GG--------TCCCACGTGTTGTGTCACCCGCAATTATCTCTCT--AC-TAAGTGCCATGCAACGGAGCCGA-TCGATCC-CGA-CCGACCTACGAA---TGCAGTCAGCATGTC-TTGAAGAGGTTGTGCCTGGGCACCCCTCTCCCCACACAT--TATCAACA-TCAATGTTTC-GTGTTATCCAGTTTGGAAGT-TTTC--ACGTCATCCAGCCTGATT-TTTG-TTATTCC--AGAAGGCC------GTGTCGTCGCC-CAAA-TTATCTC--TCTACAAGTC-AACCTACATGT--GTCACGACAACT-G--TAG-TACCAGGG-TAGGCTTTCA
gi|7                          :       TTTAA--TTTTA-TATCAAAATTGACC--AAT-TAATTATGGGCAC-AGGA-CTTACCTTAGTCAAATT--G-T-TTAATTC-AAATTACAA-T--CGCCC-ACTTTCTAGCGCTCATGATC-ATAGTAATACAAACTATTCAATTCTTCTGC-AAC---ACC-CAAA--A---GT-----CAA--C-----------CTTGAACCACACCGTAATTTAC-TGGCCAA----TCTTT-TTATTC-AAATCACGTC-GAGATCTTTC-AATTA-CTTCATCGCCG-TAT-AA-CGTGGATAATTGATATCTGTGTCTCTCAT--------GAGAGTT---GGACGCA-CTGTC-CAA---AAACGCC-CCGTCGGACA-TAGTTGCACTCCTTTCCG--AA--
gi|8                          :                                                                                                                     atGCGAGG-ATT-AT--TGGTATGAATTATTCATTT--TCTGC-A-C---ACC-GGAA------GTTTTTGCAA--A---------AACATG-------------TTTACTTGGCCAACAAATTGTA-T-GCTG-CAATC-CGCC-GACATCTT-C-GATTATT--CATCGCCA-TAT-TACTGG--ATAATTGATGTATATTCCCCTGGTTAGATCCTGAGAGAC---GAACGCA-CGGTC-CAAATTAAACGTCACTGTCGAACA-A-TTTGCTCTACTTTCCGA-AA--A----AGA--AGGGA-TAGGAAAAGAC-T----CGATC--CCGATTGACC
gi|9                          :                       CAAA-TAGTCC-GAAT-TAATTTTGGACTT-GCGTGTTT-TGTT-GTC---CT----T-TCCATTC-AACTT-CAATT--C--CC-GCTTTCCGACACGAGT-ATT-AT--TGGTACGAACTACTCAATT--TCTGC-T-gaat
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|19 ): TTTGAGAATATACACTGTGTTTTGATACCAAATCAGCTATTTTTACATCAGTTTATCTACATGTACGTGA






Alignments
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Reference ( family-1434 )     :      ATTTGA--TTTTA-TATCAAA-TAGTCC-GAAT-TAATTTTGGGCAC-GCGT-TTT-TGTT-GTC---CT--A-T-TCCATTC-AACTT-CAA-C--C--CC-GCTTTCCAGCGCGAGT-ATT-AT--TGGTACGAACTATTCAATT--TCTGC-T-C---GCC-TAAACCA---GT----GC---AG--C---GGCTTG-------------TTTACCTGACCAA---ATTNTG-TTATTT-CAATC-CGAC-GACATCTT-C-AATTAGC--CATCGCCA-TAT-TATCGT--ATAATTGATGTCTACGCCTCTCGTTAGATCCGGAGAGAC---GAACGCA-CTGCT-C-----AAACGCTACCGTGAGACA-T-TTTACACCCCTTTCCG--AA--A----AGG--GGGGG-TA-GATAGAAT-T----CTATC--CCGNTAGACCACAT----------A-TGCATTCAGTGCGTC----TTGCGGAAGTT--GTGAC-TGACA-C-C-CCA-CC-TCCTGTCTACATCCAT-G-TTGCTTGGTCGGACGTTTNCTATCCAAACCAGCTAGCGGGATGCCTATT---CTGAGAC-GG--------TCCCACGTGTGTTGTCACCCG-AATTATCTCTCTCTACCTAAGTGCCATGCAACGGAGC-GACTCGATCC-CGA-CCGACC-ACGAAAAATGCAGTCAGCATGTC-TTGAAGAGGTTGTGCCTGG-CACCCCTCTCCC-AC-CNTCCTATCAACAATCCATGTTTCCGTGTTGTCCAGTT-GGAAGT-TTTCCCACGTCAACCAGCCTGAGT-TTTGCTTATTCC--AGACGGTC------GTGTCGTCGCC-CGAA-TTATCTC--TCTACAAGTC-AACCTACATGT--GTC-CGACAACT-G-TTAG-TTCCCGGG-TGAGTTTTCATATAC-CTCGATTATTTC----TATATTCAC-CAGTCAGCAAATAAGCTGCATCTATTCACGGGGGGGGGG------CA-TC-ACTTGCATNTAGTAAACT--CAAGACCA----AGTT--AAAT-C--GGTCATCA---ATTAC--GGTAAAT--AGCTC-TTTAGAGCT-AATGTTA----T-TTGTANTGTATAC---CCGACTTT---A-AAT-A--NATA--TTATTTGATT-ATTTATTTGGC--T--TGTGTATTCCTG-TGTATTGCTCTACGGGCG-TTAAGT-GGCT-TGGGAACTTTTT
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gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     attgtactaacctaacaatgaaaatatttgtttaatcaggattGA-CCGACC-ACGAA---TGCAGTCAGCATGTC-TTCAAGAGGTTGTGCCTGG-CACCCC-CTCCC-AC-CATCTTATCAACAATCCATTTTTCCGTGTTGTCCTGTT-GGAAGT-TTTCCtcctat
gi|11                         :                             AGTCA-AAAT-TAAATTTGGGCACTGCAT-CTT-TCTT-GTC---CTTTA-TGTGCAATG-AAATT-CAA-C--C--CCCACTTTCCAGTACGAGA-ATC-AT--TGGCACGAAC
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           aaCCTATT---CTGAAAC-GGTTCCACGGTCCCACGTGTGTTGTAACAAG-AATTATATCTCTCTACCTAAGTACCATGCAACGACGC-GACTCGATCC-CGA-C
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     cCATGAAAGGAAGA-GACTCGATCC-CGA-TCGACT-A
gi|14                         :                               ataatcttcactatcgcattctctctaaaacagtacaccttaacatca-T-TACATTC-AACTT-CAA-C--C--CCCACTTTCTGGCGCGA---ATT-AT--TGGTACAAACTATTCAATT--TCTGCAT-CACTGCA-CAAACCA---aat
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tC--GGTAAAT--GGCTC-TTTAAAGCT-AATGTTA----T-TTGTAAAGTATAC---CCTTCTTT---A-AAT-A--AATA--TTATTTGAT---TTGATTTGt
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 gt--GGTAAAT--AGCTC-TTTAGAGCT-AATTTTA----T-TTGTAATATATAC---CAGACTTT---A-AAT-AATTATA--TCATTTGATTGATTa
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tC--GGTAAAT--AGCTC-TTTAGAGCT-AATGTTA----TAAAGTATTGTGTACCCACCGACTTT---A-AAT-A--AATA--TTATTTG
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  C--GGTAAAT--AGCTC-TTTA-----------------T-TTGTATTGTATAC---CCGACTTT---G-AAT-A--AATA--TTATTTGAT---TTTATTT
gi|2                          :     tATTTGA--TTTTATTATCAAA-TAGT-C-GAAT-TAATTTTGGATAA-GGCT-TTT-TGTT-GTC---CT--A-T-TCGATTC-CGCTT-CAG-C--C--CC-GTTTCCCAGCACGAGT-ATT-AT--TGGTACGGGCTATTCGATT--TCTGC-T-A---GCC-TAAACCA---GT----GC---AG--C---GGCTTC-------------TTTACCTGACCAA---AATTCGTTTATTT-CAATC-CGATGGACATCTT-C--ATTAGC--CATCGCCA-TAT-TATCGT--ATATTTGATGTCTACGCTTCTC--TAGATCCGGAGAGAC---GAACGCT-CTGCT-C-----AAACACTACCATGAGCCA-T-TTTACACCCCTTTTCACTAA--A----GGGGAGGGGG-TA-GATAGACT-T----CTATC--CCGTTAGACCACAT----------ATTGCATTCAGTACGTA----TTTCGGAAGTT--GTGAC-TGACA-C-C---------CCTG---ACATCCAT-GTTTGCTTGG-CGGACGTTTTCTATCCAAACC-GAAAGC-GGATGCCTATT---CCGAGACGGG--------TCCCACGTGTGTTGTTACCCG-AATTATCTCATTCTACCTAAGTGCCATGCAACGGAGC-GACTCGATTC-CGACCCGACC-ACG---AATGCAGTCAGCATGTCTTTGAAGAGGTTGTG-CTGG-CACCCCTCT-CC-AC-CATCTTATCAACAATCCATGTTTCCGTGTTGTCCAGTT-GGAAGT-TTTCCCACGTCAACCAGCCTGAATATTTGCTTATTCC--AGACGGTC------GTGT-GTCGCCGGGAA-TTATCTC--TCTACAAGTCAAACCTACACGT--GTC-CGACAACT-G-TTAG-TTCCAGGT-GGAG--TTCATATAC-CTTGATTATTTC----T-TATTCAC-CAGTCAACAAATAAGCTGCATCTATTCACGGGGGGGGGGT-----CA-TC-ACTTGCATATAGTAAACT--CAAGACCA----AGTT--AAAT-C--GGTCATCAATCATTAC---GTAAATA-AGCTCTTTTAGAGCT-AATGTTA----T-TCGTCCTGTATAC---CCGCCTTT------ATCA--TATA--TGATTT-ATT-ATACATTTG----------GTATTCCTG-TGTATTGCTCTACGGGCG-TTAAGT-GGCT-TGGGAACTTTTTtattt
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              aaaagtgattttcacataatcaggattAAT--AGCTC-TTTAGAGCT-AATGTTAATTAT-TTGTAATGTACAC---CCAACTTT---A-AAT-G--AATA--TCATTTGATT-tttctgt
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TATAT--AGCTC-TTTAGAACT-AACGT----------GTAATATATAC---CCGACTTTTTAA-AAT-A--AATA--TTATTTGA
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tataTAGTATATGC---CCGACTTTTTAA-AAT-A--AATA--TTATTTGA
gi|3                          :      ATTAGA--TTTTA-TATCAAA-TAGTCCCGACT-TAATTTTGGGCTT-GCGT-TGT-TGTT-GTC---CT--A-T-TCCATTC-AACTT-CAA-C--CT-CC-GCTTTCCAGCACGAGT-ATT-AT--TGGTACGAACTATTCAATT--TTTGC-T-C---ACC-TAAACCA---GT----GG---AA--T---GACTTG-------------TTTACCTGACCAA---ATTATG-TTATTT-CAATC-CGAT-GGCATCTT-C-AATTAAC--CATCGCCA-TAT-TATCGT--AGAATTGATATCTATGCTTCTCGTTAGACCCGGAGAGAC---GAACGCA-CTGCT-C-----AAACGCTACCATGAGACA-T-TTTACACCCCTTTCCA--AA--T----AGG--GGGGT-TA-GATAGACT-T----CTATC--CCGATAGATCACAA----------A-TGCATTCAGTGCGTC----ATGAGGAAGCT--GTGA---AGCA-C-------CT-TCCTATCTACATCCAT-G-TTTTTTAGTCGGACGTTTGCTATCCAAACCAGCTAGCGGGATGCCTATT---CTGAGAC-GG--------TCCCACGTGTGTTGTCACCCG-AATTATCTCTATCTCCCTAAATGCCATGCAACGGAGC-GACTTGATCT-CGA-CCGACC-A--AAAAATGCAGTCAGCATGTC-TTGACGAGGTTGTTACTAT-CACCCCTCGCCC-AC-CTTCCTATCAAC-ATTCATGTTTCCGTGTTGTCCAGTT-GGATGT-TTT-CCACGTCAATGAACCTGAGA-TTTGCTTATTCC--AGACGGTC------GTGTCGTCGCC-CGAATTTATCTC--TCTACAG--C-AACCTACATGT---TG-CGACAACTAG-TTAG-T--CCGGGTTGAGTTTTCATATAC-CTCGA-TA--TC----TATATCCACTCAGTCAGCAAATAAGCTGCA--TATTC-CGGGGGGGGGGGGGGTTCATTC-ACTGGCATATAGTAAATTCACAAGACCA----AGTTAAAAAT-CCGGGTCATCA---A-TAC---GTAAATAAAGCTC--TTAGAGCTAAATGTTA------TCGTCCTGTATAC---CCGCCGTT------GTCA--CATA--TGAT----TT-ATTTATTTCAT--T--TGTGTATTCCTGTTGTA-TGCTCTACGGGCGATTAAGTAGGCTATGGAAACTTTTT
gi|4                          : ggattATTTGA--TTTTA-TATCAAA-TAGTCC-GAAT-TAATTTTGGGCTT-GCGTCTTT-TGTC-GTC---CT--A-T-TCCATTC-AACTT-CAA-C--C--CC-GCTTTCCAACACGAGT-ATT-AT--CGGTACGAACTACTCAATT--TCTGT-T-C---ACC-TAAACCA---GT----GG---AG--T---GGCTTG-------------TTTACCTCACCTA---ATTATG-TTATTT-CAATC-CGAT-GGCATCTT-C-AATTAAC--CATCGCCA-TAT-TATTGT--ACAATTGATATCTACGCTTCTCGTTAGATCCGCAGAGAC---GAACACA-CTGCT-C-----AAATGCTACCAGGAGACA-T-TTTACACCCCTTTCCA--AA--T----AGG--GGGGGTTA-GATAGAAT-TTAAACTATC--CCGATAGACCACAT----------A-TGCATTCAGTGCGTT----TTGAGGAAGTT--GTGAC-TGACA-C-CACCA-CCTTCCTATCTACATCCAT-G-TTGTTTAGTCGGACGTTTGCTATCCAAACCAGCTAGCGGGATGCCTATT---CTGAGAC-GG--------TCCCACGTGTGTTGTCACCCG-AATTATCTCTCTCTACC-AAATGCCATGCAACGGAGC-GACTTGATCCACGA-ACGACC-AGAAAAAATGCAGTCAGCATGTC-TTGAAGAGGTTGTTCCTGG-CACCCCTCGCCC-AC-CTTCCTATCAAC-ATCCATGTTTCCGTGTTGTCCAGTT-GGATGT-TTTTCCCCGTCAACC-GCCTGCGT-TTTGCT----------------------GTGTCGTCGCC-CAAA-TTATCTC--TCTTCAAGTC-AAGCTACATGT--GTC-CGACAACT-GTTTAGTTTCTTGGG-TGAG-TTTCATATAC-CTCGATTATTTC----TAAATTCAC-CAGTCAGCAAATAAGCTGCATCTATTCAC----GGGGGG------CA-TC-ACTTGCATTTAGTCAACT---------A----AGTT--AAATCC--GGTCATTA---ATTACTAGGTAAAT--AGCTC-TTTAGAGCT-AATGTTA----T-TTGTAA-GTATAC---CCGACTTC-----AAT-A--TTTA--TTATTTGATT-CTTTATTTGGC--CAGTGTGTCTTCCCG-TGTATTGCTCTACGGGTG-CTAAGT-GGCT-TGGGAACTTTTTtcctat
gi|5                          :      ATTTGA--TTTTA-TATCAAA-TAGTCC-AAAT-CAATTTTGAACACAGAGT-TTG-CGTT-GTCAAACT--AAT-TACATTG-AA-TC-CAA-GTGC--CC-ATTTTCTAGTGCGTCG-ATT-AT--TGGTACGACCTGCTCTTTA--TCTGC-A-A---GCCAGAAGTCAACTGT----AC---AAACC---G---TA-------------TTTACTTGGCCAA---ATAATT-TTGTTT-CAATC-CGCC-GACATCT-----ATTATT--CATTGCCA-TAT-TACCGG--ATAATCTATGTATATGCCTCATGTTAGATCCTGAGAGAC-----ACTCA-CTGTC-C-----ATACGCCACAGTCAGACA-A-TTTGCACTCCTTTCCG--AAGTA----AGA--AG----------AGAAT------CGATC--CCGATCGACCGAAT----------A-TGCAGTTAGTGTGTC----TTGCAAAGGTT--GTGAC-TGACACC-C-CCACCC-TATTGTCAAACTCCAT-G-TTGTCCAGT------TTTAC-ATCCTAACCAGCCAG-GAGATGCCTAAT---TTAAGAC-GG--------TCACAGGTATATTGTCACCCG-CATTATCTCCATCTACTCA-----CATGAAAGGAAGA-TATTCGATCC-CGA-TCAATT----GAATATGCACTCAGTGTATC-TTGCGGAGGCTGTGATTGA-CAC------AAC-AC-CTCCCAATCAACA---------TCCATGTTGTCCATTT----AGTATTTTACACCCCAACCAGCCAGAG--GATGCCTGTTTTTGAGACGATCACACGTGTGTTGTCACC-CAAA-TTATCTCCTTTTACCAGTT-TATCTACATGTAAATG-AGACAGCT-G-ATGG-ATCCCGGG-CGAGTTCTAA-ATACACTCAATTAGTTCAGGTTTTATTTAC-CAGTCAGCAAA
gi|6                          :                                    ccatcgtgttcagcaaatattaaacagaaattgatttattataatcaggattC-AGCTT-CAC-C--C--CC-GCTTTCCAGC-CGAGT-ATTTAT--TGGTACGG-CTATCGAAAT--TCTGC-T-C---GCC-TAAACCA---GTA---GCCCGAG--TTGGGGCTTGGTT----------TTTACCTGACCAA---ATT--G-TTATTTTCAATC-CGAT-GACATCTT-CCAATGAGC--CATCGCCAATATCTATCGT---TATTTGCTGTCT-CGGCTCTCGT-AGATCCGGAGAAACCGAAAACGCCTCTGCTGC-----AAACACTACCGT-AGCCAAT-TTTACACCCCTTTTCG--AA--ACAAGAGG--GGGGG--G-GGTAGGATAG----CTGTCATCCGTTAGACCACAT-------------GCATTC-GTGCGTTCTTTTTACGGAAGTTCGGTGACGTGGGA-CAC-CCA-C---------TACATCCATTGCTTGCTTGG-CGGACGTTTTCTATACAAACAAGGTAGCGG-ATGCCTATTATTCTGAGCC-GG--------TCCCACGTGTTGTGTCACCCGCAATTATCTCTCT--AC-TAAGTGCCATGCAACGGAGCCGA-TCGATCC-CGA-CCGACCTACGAA---TGCAGTCAGCATGTC-TTGAAGAGGTTGTGCCTGGGCACCCCTCTCCCCACACAT--TATCAACA-TCAATGTTTC-GTGTTATCCAGTTTGGAAGT-TTTC--ACGTCATCCAGCCTGATT-TTTG-TTATTCC--AGAAGGCC------GTGTCGTCGCC-CAAA-TTATCTC--TCTACAAGTC-AACCTACATGT--GTCACGACAACT-G--TAG-TACCAGGG-TAGGCTTTCA
gi|7                          :       TTTAA--TTTTA-TATCAAAATTGACC--AAT-TAATTATGGGCAC-AGGA-CTTACCTTAGTCAAATT--G-T-TTAATTC-AAATTACAA-T--CGCCC-ACTTTCTAGCGCTCATGATC-ATAGTAATACAAACTATTCAATTCTTCTGC-AAC---ACC-CAAA--A---GT-----C---AA--C-----CTTGAACCACACCGTAATTTAC-TGGCCAA----TCTTT-TTATTC-AAATCACGTC-GAGATCTTTC-AATTA-CTTCATCGCCG-TAT-AA-CGTGGATAATTGATATCTGTGTCTCTCAT--------GAGAGTT---GGACGCA-CTGTC-CAA---AAACGCC-CCGTCGGACA-TAGTTGCACTCCTTTCCG--AA--
gi|8                          :                                                                                                                     atGCGAGG-ATT-AT--TGGTATGAATTATTCATTT--TCTGC-A-C---ACC-GGAA------GTTTTTGC---AA--A---AACATG-------------TTTACTTGGCCAACAAATTGTA-T-GCTG-CAATC-CGCC-GACATCTT-C-GATTATT--CATCGCCA-TAT-TACTGG--ATAATTGATGTATATTCCCCTGGTTAGATCCTGAGAGAC---GAACGCA-CGGTC-CAAATTAAACGTCACTGTCGAACA-A-TTTGCTCTACTTTCCGA-AA--A----AGA--AGGGA-TAGGAAAAGAC-T----CGATC--CCGATTGACC
gi|9                          :                       CAAA-TAGTCC-GAAT-TAATTTTGGACTT-GCGTGTTT-TGTT-GTC---CT----T-TCCATTC-AACTT-CAATT--C--CC-GCTTTCCGACACGAGT-ATT-AT--TGGTACGAACTACTCAATT--TCTGC-T-gaat
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|19 ): TTTGAGAATATACACTGTGTTTTGATACCAAATCAGCTATTTTTACATCAGTTTATCTACATGTACGTGA






Alignments
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Reference ( family-1434 )     :      ATTTGA--TTTTA-TATCAAA-TAGTCC-GAAT-TAATTTTGGGCAC-GCGT-TTT-TGTT-GTC---CT--A-T-TCCATTC-AACTT-CAA-C--C--CC-GCTTTCCAGCGCGAGT-ATT-AT--TGGTACGAACTATTCAATT--TCTGC-T-C---GCC-TAAACCA---GT----GC---AG--C---GGCTTG-------------TTTACCTGACCAA---ATTNTG-TTATTT-CAATC-CGAC-GACATCTT-C-AATTAGC--CATCGCCA-TAT-TATCGT--ATAATTGATGTCTACGCCTCTCGTTAGATCCGGAGAGAC---GAACGCA-CTGCT-C-----AAACGCTACCGTGAGACA-T-TTTACACCCCTTTCCG--AA--A----AGG--GGGGG-TA-GATAGAAT-T----CTATC--CCGNTAGACCACAT----------A-TGCATTCAGTGCGTC----TTGCGGAAGTT--GTGAC-TGACA-C-C-CCA-CC-TCCTGTCTACATCCAT-G-TTGCTTGGTCGGACGTTTNCTATCCAAACCAGCTAGCGGGATGCCTATT---CTGAGAC-GG--------TCCCACGTGTGTTGTCACCCG-AATTATCTCTCTCTACCTAAGTGCCATGCAACGGAGC-GACTCGATCC-CGA-CCGACC-ACGAAAAATGCAGTCAGCATGTC-TTGAAGAGGTTGTGCCTGG-CACCCCTCTCCC-AC-CNTCCTATCAACAATCCATGTTTCCGTGTTGTCCAGTT-GGAAGT-TTTCCCACGTCAACCAGCCTGAGT-TTTGCTTATTCC--AGACGGTC------GTGTCGTCGCC-CGAA-TTATCTC--TCTACAAGTC-AACCTACATGT--GTC-CGACAACT-G-TTAG-TTCCCGGG-TGAGTTTTCATATAC-CTCGATTATTTC----TATATTCAC-CAGTCAGCAAATAAGCTGCATCTATTCACGGGGGGGGGG------CA-TC-ACTTGCATNTAGTAAACT--CAAGACCA----AGTT--AAAT-C--GGTCATCA---ATTAC--GGTAAAT--AGCTC-TTTAGAGCT-AATGTTA----T-TTGTANTGTATAC---CCGACTTT---A-AAT-A--NATA--TTATTTGATT-ATTTATTTGGC--T--TGTGTATTCCTG-TGTATTGCTCTACGGGCG-TTAAGT-GGCT-TGGGAACTTTTT
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gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     attgtactaacctaacaatgaaaatatttgtttaatcaggattGA-CCGACC-ACGAA---TGCAGTCAGCATGTC-TTCAAGAGGTTGTGCCTGG-CACCCC-CTCCC-AC-CATCTTATCAACAATCCATTTTTCCGTGTTGTCCTGTT-GGAAGT-TTTCCtcctat
gi|11                         :                             AGTCA-AAAT-TAAATTTGGGCACTGCAT-CTT-TCTT-GTC---CTTTA-TGTGCAATG-AAATT-CAA-C--C--CCCACTTTCCAGTACGAGA-ATC-AT--TGGCACGAAC
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           aaCCTATT---CTGAAAC-GGTTCCACGGTCCCACGTGTGTTGTAACAAG-AATTATATCTCTCTACCTAAGTACCATGCAACGACGC-GACTCGATCC-CGA-C
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     cCATGAAAGGAAGA-GACTCGATCC-CGA-TCGACT-A
gi|14                         :                               ataatcttcactatcgcattctctctaaaacagtacaccttaacatca-T-TACATTC-AACTT-CAA-C--C--CCCACTTTCTGGCGCGA---ATT-AT--TGGTACAAACTATTCAATT--TCTGCAT-CACTGCA-CAAACCA---aat
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tC--GGTAAAT--GGCTC-TTTAAAGCT-AATGTTA----T-TTGTAAAGTATAC---CCTTCTTT---A-AAT-A--AATA--TTATTTGAT---TTGATTTGt
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 gt--GGTAAAT--AGCTC-TTTAGAGCT-AATTTTA----T-TTGTAATATATAC---CAGACTTT---A-AAT-AATTATA--TCATTTGATTGATTa
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tC--GGTAAAT--AGCTC-TTTAGAGCT-AATGTTA----TAAAGTATTGTGTACCCACCGACTTT---A-AAT-A--AATA--TTATTTG
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  C--GGTAAAT--AGCTC-TTTA-----------------T-TTGTATTGTATAC---CCGACTTT---G-AAT-A--AATA--TTATTTGAT---TTTATTT
gi|2                          :     tATTTGA--TTTTATTATCAAA-TAGT-C-GAAT-TAATTTTGGATAA-GGCT-TTT-TGTT-GTC---CT--A-T-TCGATTC-CGCTT-CAG-C--C--CC-GTTTCCCAGCACGAGT-ATT-AT--TGGTACGGGCTATTCGATT--TCTGC-T-A---GCC-TAAACCA---GT----GC---AG--C---GGCTTC-------------TTTACCTGACCAA---AATTCGTTTATTT-CAATC-CGATGGACATCTT-C--ATTAGC--CATCGCCA-TAT-TATCGT--ATATTTGATGTCTACGCTTCTC--TAGATCCGGAGAGAC---GAACGCT-CTGCT-C-----AAACACTACCATGAGCCA-T-TTTACACCCCTTTTCACTAA--A----GGGGAGGGGG-TA-GATAGACT-T----CTATC--CCGTTAGACCACAT----------ATTGCATTCAGTACGTA----TTTCGGAAGTT--GTGAC-TGACA-C-C---------CCTG---ACATCCAT-GTTTGCTTGG-CGGACGTTTTCTATCCAAACC-GAAAGC-GGATGCCTATT---CCGAGACGGG--------TCCCACGTGTGTTGTTACCCG-AATTATCTCATTCTACCTAAGTGCCATGCAACGGAGC-GACTCGATTC-CGACCCGACC-ACG---AATGCAGTCAGCATGTCTTTGAAGAGGTTGTG-CTGG-CACCCCTCT-CC-AC-CATCTTATCAACAATCCATGTTTCCGTGTTGTCCAGTT-GGAAGT-TTTCCCACGTCAACCAGCCTGAATATTTGCTTATTCC--AGACGGTC------GTGT-GTCGCCGGGAA-TTATCTC--TCTACAAGTCAAACCTACACGT--GTC-CGACAACT-G-TTAG-TTCCAGGT-GGAG--TTCATATAC-CTTGATTATTTC----T-TATTCAC-CAGTCAACAAATAAGCTGCATCTATTCACGGGGGGGGGGT-----CA-TC-ACTTGCATATAGTAAACT--CAAGACCA----AGTT--AAAT-C--GGTCATCAATCATTAC---GTAAATA-AGCTCTTTTAGAGCT-AATGTTA----T-TCGTCCTGTATAC---CCGCCTTT------ATCA--TATA--TGATTT-ATT-ATACATTTG----------GTATTCCTG-TGTATTGCTCTACGGGCG-TTAAGT-GGCT-TGGGAACTTTTTtattt
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              aaaagtgattttcacataatcaggattAAT--AGCTC-TTTAGAGCT-AATGTTAATTAT-TTGTAATGTACAC---CCAACTTT---A-AAT-G--AATA--TCATTTGATT-tttctgt
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TATAT--AGCTC-TTTAGAACT-AACGT----------GTAATATATAC---CCGACTTTTTAA-AAT-A--AATA--TTATTTGA
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tataTAGTATATGC---CCGACTTTTTAA-AAT-A--AATA--TTATTTGA
gi|3                          :      ATTAGA--TTTTA-TATCAAA-TAGTCCCGACT-TAATTTTGGGCTT-GCGT-TGT-TGTT-GTC---CT--A-T-TCCATTC-AACTT-CAA-C--CT-CC-GCTTTCCAGCACGAGT-ATT-AT--TGGTACGAACTATTCAATT--TTTGC-T-C---ACC-TAAACCA---GT----GG---AA--T---GACTTG-------------TTTACCTGACCAA---ATTATG-TTATTT-CAATC-CGAT-GGCATCTT-C-AATTAAC--CATCGCCA-TAT-TATCGT--AGAATTGATATCTATGCTTCTCGTTAGACCCGGAGAGAC---GAACGCA-CTGCT-C-----AAACGCTACCATGAGACA-T-TTTACACCCCTTTCCA--AA--T----AGG--GGGGT-TA-GATAGACT-T----CTATC--CCGATAGATCACAA----------A-TGCATTCAGTGCGTC----ATGAGGAAGCT--GTGA---AGCA-C-------CT-TCCTATCTACATCCAT-G-TTTTTTAGTCGGACGTTTGCTATCCAAACCAGCTAGCGGGATGCCTATT---CTGAGAC-GG--------TCCCACGTGTGTTGTCACCCG-AATTATCTCTATCTCCCTAAATGCCATGCAACGGAGC-GACTTGATCT-CGA-CCGACC-A--AAAAATGCAGTCAGCATGTC-TTGACGAGGTTGTTACTAT-CACCCCTCGCCC-AC-CTTCCTATCAAC-ATTCATGTTTCCGTGTTGTCCAGTT-GGATGT-TTT-CCACGTCAATGAACCTGAGA-TTTGCTTATTCC--AGACGGTC------GTGTCGTCGCC-CGAATTTATCTC--TCTACAG--C-AACCTACATGT---TG-CGACAACTAG-TTAG-T--CCGGGTTGAGTTTTCATATAC-CTCGA-TA--TC----TATATCCACTCAGTCAGCAAATAAGCTGCA--TATTC-CGGGGGGGGGGGGGGTTCATTC-ACTGGCATATAGTAAATTCACAAGACCA----AGTTAAAAAT-CCGGGTCATCA---A-TAC---GTAAATAAAGCTC--TTAGAGCTAAATGTTA------TCGTCCTGTATAC---CCGCCGTT------GTCA--CATA--TGAT----TT-ATTTATTTCAT--T--TGTGTATTCCTGTTGTA-TGCTCTACGGGCGATTAAGTAGGCTATGGAAACTTTTT
gi|4                          : ggattATTTGA--TTTTA-TATCAAA-TAGTCC-GAAT-TAATTTTGGGCTT-GCGTCTTT-TGTC-GTC---CT--A-T-TCCATTC-AACTT-CAA-C--C--CC-GCTTTCCAACACGAGT-ATT-AT--CGGTACGAACTACTCAATT--TCTGT-T-C---ACC-TAAACCA---GT----GG---AG--T---GGCTTG-------------TTTACCTCACCTA---ATTATG-TTATTT-CAATC-CGAT-GGCATCTT-C-AATTAAC--CATCGCCA-TAT-TATTGT--ACAATTGATATCTACGCTTCTCGTTAGATCCGCAGAGAC---GAACACA-CTGCT-C-----AAATGCTACCAGGAGACA-T-TTTACACCCCTTTCCA--AA--T----AGG--GGGGGTTA-GATAGAAT-TTAAACTATC--CCGATAGACCACAT----------A-TGCATTCAGTGCGTT----TTGAGGAAGTT--GTGAC-TGACA-C-CACCA-CCTTCCTATCTACATCCAT-G-TTGTTTAGTCGGACGTTTGCTATCCAAACCAGCTAGCGGGATGCCTATT---CTGAGAC-GG--------TCCCACGTGTGTTGTCACCCG-AATTATCTCTCTCTACC-AAATGCCATGCAACGGAGC-GACTTGATCCACGA-ACGACC-AGAAAAAATGCAGTCAGCATGTC-TTGAAGAGGTTGTTCCTGG-CACCCCTCGCCC-AC-CTTCCTATCAAC-ATCCATGTTTCCGTGTTGTCCAGTT-GGATGT-TTTTCCCCGTCAACC-GCCTGCGT-TTTGCT----------------------GTGTCGTCGCC-CAAA-TTATCTC--TCTTCAAGTC-AAGCTACATGT--GTC-CGACAACT-GTTTAGTTTCTTGGG-TGAG-TTTCATATAC-CTCGATTATTTC----TAAATTCAC-CAGTCAGCAAATAAGCTGCATCTATTCAC----GGGGGG------CA-TC-ACTTGCATTTAGTCAACT---------A----AGTT--AAATCC--GGTCATTA---ATTACTAGGTAAAT--AGCTC-TTTAGAGCT-AATGTTA----T-TTGTAA-GTATAC---CCGACTTC-----AAT-A--TTTA--TTATTTGATT-CTTTATTTGGC--CAGTGTGTCTTCCCG-TGTATTGCTCTACGGGTG-CTAAGT-GGCT-TGGGAACTTTTTtcctat
gi|5                          :      ATTTGA--TTTTA-TATCAAA-TAGTCC-AAAT-CAATTTTGAACACAGAGT-TTG-CGTT-GTCAAACT--AAT-TACATTG-AA-TC-CAA-GTGC--CC-ATTTTCTAGTGCGTCG-ATT-AT--TGGTACGACCTGCTCTTTA--TCTGC-A-A---GCCAGAAGTCAACTGT----AC---AAACC---G---TA-------------TTTACTTGGCCAA---ATAATT-TTGTTT-CAATC-CGCC-GACATCT-----ATTATT--CATTGCCA-TAT-TACCGG--ATAATCTATGTATATGCCTCATGTTAGATCCTGAGAGAC-----ACTCA-CTGTC-C-----ATACGCCACAGTCAGACA-A-TTTGCACTCCTTTCCG--AAGTA----AGA--AG----------AGAAT------CGATC--CCGATCGACCGAAT----------A-TGCAGTTAGTGTGTC----TTGCAAAGGTT--GTGAC-TGACACC-C-CCACCC-TATTGTCAAACTCCAT-G-TTGTCCAGT------TTTAC-ATCCTAACCAGCCAG-GAGATGCCTAAT---TTAAGAC-GG--------TCACAGGTATATTGTCACCCG-CATTATCTCCATCTACTCA-----CATGAAAGGAAGA-TATTCGATCC-CGA-TCAATT----GAATATGCACTCAGTGTATC-TTGCGGAGGCTGTGATTGA-CAC------AAC-AC-CTCCCAATCAACA---------TCCATGTTGTCCATTT----AGTATTTTACACCCCAACCAGCCAGAG--GATGCCTGTTTTTGAGACGATCACACGTGTGTTGTCACC-CAAA-TTATCTCCTTTTACCAGTT-TATCTACATGTAAATG-AGACAGCT-G-ATGG-ATCCCGGG-CGAGTTCTAA-ATACACTCAATTAGTTCAGGTTTTATTTAC-CAGTCAGCAAA
gi|6                          :                                    ccatcgtgttcagcaaatattaaacagaaattgatttattataatcaggattC-AGCTT-CAC-C--C--CC-GCTTTCCAGC-CGAGT-ATTTAT--TGGTACGG-CTATCGAAAT--TCTGC-T-C---GCC-TAAACCA---GTA---GCCCGAG--TTGGGGCTTGGTT----------TTTACCTGACCAA---ATT--G-TTATTTTCAATC-CGAT-GACATCTT-CCAATGAGC--CATCGCCAATATCTATCGT---TATTTGCTGTCT-CGGCTCTCGT-AGATCCGGAGAAACCGAAAACGCCTCTGCTGC-----AAACACTACCGT-AGCCAAT-TTTACACCCCTTTTCG--AA--ACAAGAGG--GGGGG--G-GGTAGGATAG----CTGTCATCCGTTAGACCACAT-------------GCATTC-GTGCGTTCTTTTTACGGAAGTTCGGTGACGTGGGA-CAC-CCA-C---------TACATCCATTGCTTGCTTGG-CGGACGTTTTCTATACAAACAAGGTAGCGG-ATGCCTATTATTCTGAGCC-GG--------TCCCACGTGTTGTGTCACCCGCAATTATCTCTCT--AC-TAAGTGCCATGCAACGGAGCCGA-TCGATCC-CGA-CCGACCTACGAA---TGCAGTCAGCATGTC-TTGAAGAGGTTGTGCCTGGGCACCCCTCTCCCCACACAT--TATCAACA-TCAATGTTTC-GTGTTATCCAGTTTGGAAGT-TTTC--ACGTCATCCAGCCTGATT-TTTG-TTATTCC--AGAAGGCC------GTGTCGTCGCC-CAAA-TTATCTC--TCTACAAGTC-AACCTACATGT--GTCACGACAACT-G--TAG-TACCAGGG-TAGGCTTTCA
gi|7                          :       TTTAA--TTTTA-TATCAAAATTGACC--AAT-TAATTATGGGCAC-AGGA-CTTACCTTAGTCAAATT--G-T-TTAATTC-AAATTACAA-T--CGCCC-ACTTTCTAGCGCTCATGATC-ATAGTAATACAAACTATTCAATTCTTCTGC-AAC---ACC-CAAA--A---GT-----C---AA--C-----CTTGAACCACACCGTAATTTAC-TGGCCAA----TCTTT-TTATTC-AAATCACGTC-GAGATCTTTC-AATTA-CTTCATCGCCG-TAT-AA-CGTGGATAATTGATATCTGTGTCTCTCAT--------GAGAGTT---GGACGCA-CTGTC-CAA---AAACGCC-CCGTCGGACA-TAGTTGCACTCCTTTCCG--AA--
gi|8                          :                                                                                                                     atGCGAGG-ATT-AT--TGGTATGAATTATTCATTT--TCTGC-A-C---ACC-GGAA------GTTTTTGC---AA--A---AACATG-------------TTTACTTGGCCAACAAATTGTA-T-GCTG-CAATC-CGCC-GACATCTT-C-GATTATT--CATCGCCA-TAT-TACTGG--ATAATTGATGTATATTCCCCTGGTTAGATCCTGAGAGAC---GAACGCA-CGGTC-CAAATTAAACGTCACTGTCGAACA-A-TTTGCTCTACTTTCCGA-AA--A----AGA--AGGGA-TAGGAAAAGAC-T----CGATC--CCGATTGACC
gi|9                          :                       CAAA-TAGTCC-GAAT-TAATTTTGGACTT-GCGTGTTT-TGTT-GTC---CT----T-TCCATTC-AACTT-CAATT--C--CC-GCTTTCCGACACGAGT-ATT-AT--TGGTACGAACTACTCAATT--TCTGC-T-gaat


blockSeqs                     :            .      T       A      CG   .           ACT C  C   A    A   AAA  TTA  G       .     A   T TG GC  C          A     G   T  AG                   CT     ATCACT    A    C  ACT  AGCCCGAGTTGGGGCTTGGTT                            CAA   T  T      T     A  ATG        T CA    CTT         A   C      GG                        T              CGA      CT     G AAATT            G  C  AT                 CT  ACAAGA    GA     TTA       C TTAAA      AT   T          AT                         CTTT  T        CG    CG     CCACCACCTTCCTATCT           T T        T         T             A      G         ATT       G  TTCCACGG                     C                CT                   C          A   C      AGAAAAA                 T              C    G      T TC  C  A A C        AA      T                 T      A   CC              T  ATA            TG        ACACGT    C      G    T       CT   A      A           AAA  A        A TT   TTTCTT   T    T          A        T   AGGT A    C  T                    T      A G         GGGGTT  T  .        A         CAC       .       AA    C CG        ATC T   TAG      AA     T         A       ATTAT      A       CCA        TTAA    C ATT   .          TGA        GCCAG       A      T    T             A      AG   A
blockSeqs                     :            .      .       .      A    .           ACA G  G   .    .   AAA  AA   .       .     .   . .  T   C          G     .   .  .                    .      AAC       .    C  .    CAACCTTGAACCACACCGTAA                            .     A  .      .     .  AT         . A     GC          .   .      .                         T              .        T      . AA               G  A  TA                 A   GTAA      .      TAG       C AG         .    A          A                          .     G        .     C      CCCCCACCCTATTGTCA           . C        T         G             C      G         .         .  .                            .                CT                   .          .   .      TACGAA                  .              A    .      T GC  .  . A C        AA      T                 .      .   CC              T  GA             .         .         C      .    .       .    A      .           G    .        . T    TTCCA    .    T          .        T   .    A    C  .                    T      A G         T       .  .        A         C         .       .     . .         .   T   G        A      .         .       TA         A       .          TTAA    C A     .          TA         ATT         A      .    T             .      G    .
blockSeqs                     :            .      .       .      G    .           AA  C  .   .    .   .    A    .       .     .   . .  .   .          A     .   .  .                    .      TA        .    C  .    TTTTGCAAAAACATG                                  .     A  .      .     .  AT         . A     AC          .   .      .                         T              .        A      . .                G  A  T                  .   AG        .      TA        A T          .    A          A                          .     G        .     C      CCTTCCTATCT                 . .        T         G             C      G         .         .  .                            .                CT                   .          .   .      ACGAA                   .              C    .      T GC  .  . T C        A       T                 .      .   TC              T  GT             .         .         T      .    .       .    T      .           G    .        . T    ATCCC    .    C          .        G   .    T    C  .                    .      . .         .       .  .        T         .         .       .     . .         .   .   G        .      .         .       T          T       .          A       . A     .          TA         .           C      .    .             .      G    .
blockSeqs                     :            .      .       .      G    .           TT  C  .   .    .   .    A    .       .     .   . .  .   .          A     .   .  .                    .      TC        .    C  .    GCAGCGGCTTC                                      .     A  .      .     .  CC         . A     AC          .   .      .                         T              .        A      . .                C  A  T                  .   TA        .      TA        A T          .    A          A                          .     G        .     C      CACCCACT                    . .        .         A             C      G         .         .  .                            .                TC                   .          .   .      AAAAA                   .              A    .      T TC  .  . T C        A       T                 .      .   TA              A  TT             .         .         C      .    .       .    A      .           G    .        . A    TACCA    .    .          .        .   .    .    T  .                                                                                                                 G        .      .         .       T          T       .          A       . A     .          TC                                                            
blockSeqs                     :            .      .       .      A    .           TT  A  .   .    .   .    A    .       .     .   . .  .   .          A     .   .  .                    .      TC        .    T  .    GGAATGACTTG                                      .     T  .      .     .  AT         . G     TT          .   .      .                         T              .        A      . .                C  C  T                  .   TA        .      G         A T          .    T          .                          .     A        .     .      CCCCTG                      . .        .         T             G      .         .         .  .                            .                C                    .          .   .      ACGA                    .              C    .      . T   .  . T C        A       T                 .      .   C               T  G              .         .         .      .    .       .    A      .           .    .        . .    TCC      .    .                                                                                                                                                      G        .      .         .       T          C       .          A       . T     .          .                                                             
blockSeqs                     :                           .      G    .           AC  G  .   .    .   .    G    .       .     .   . .  .   .          G     .   .  .                    .      AA        .    C  .    GGAGTGGCTTG                                      .     G  .      .     .  TC         . .     GC          .   .      .                         .              .        A      . .                C  A  A                  .   AA        .      .         A .          .    A                                                                                                                                                 .         .  .                            .                T                    .          .   .      GAAT                    .              .    .      . A   .  . A .        A       .                 .      .   C                                                                                                                                                                                                                                                                                           .        .      .         .       T          A       .          G       . A     .          .                                                             
blockSeqs                     :                                  .    .           TT  C  .   .    .   .    .    .       .     .   . .  .   .          G     .   .  .                    .      TC        .    .  .    ACAAACCGTA                                       .     .  .      .     .  CC         . .     TT          .   .      .                         .              .        A      . .                .  A  A                  .                                                                                                                                                                                                                                                                                  .          .   .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                .        .      .         .       T          A       .          A       . A     .                                                                        
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blockSeqs                     :                                                                                         .     .   . .  .   .          A     .   .  .                    .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  .      .         .       .          C       .          .       . C     .                                                                        
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Reference ( family-1434 )     :      ATTTGA--TTTTAT-ATCAAA-TAGTCC-GAAT-TAATTTTGGGCAC-GCGT-TTT-TGTT-GTC---CT--A-T-TCCATTC-AACTT-CAA-C--C--CC-GCTTTCCAGCGCGAGT-ATT-AT--TGGTACGAACTATTCAATT--TCTGC-T-C---GCC-TAAACCA---GT----GC---AG--C---GGCTTG-------------TTTACCTGACCAA---ATTNTGTT-ATTT-CAATC-CGACG-ACATCTT-C-AATTAGC--CATCGCCA-TAT-TATCGT--ATAATTGATGTCTACGCCTCTCGTTAGATCCGGAGAGAC---GAACGCA-CTGCT-C-----AAACGCTACCGTGAGACA-T-TTTACACCCCTTTCCG---AAN----AGG-GGGGG-TA-GATAGAAT-T----CTATC--CCGNTAGACCACAT----------AT-GCATTCAGTGCGTC----TTGCGGAAGTT--GTGAC-TGACACCCCCA-CC-TCCTGTCTACATCCAT-G-TT-GCTTGGTCGGACGTTTNCTATCCAAACCAGCTAGCGGGATGCCTATT---CTGAGACGG--------TCCCACGTGTGTTGTCACCCG-AATTATCTCTCTCTACCTAAGTGCCATGCAACGGAG-CGACTCGATCC-CGA-CCGACC-ACG---AA-ATGCAGTCAGCATGTC-TTGAAGAGGTTGTGCCT-GGCACCCCTCT-CCCAC-CNTCCTATCAAC-ATCCATGTTTCCGTGTTGTCCAG-TTGGAAGT-TTTCCCACGTCAACCAGCCTGAGT-TTTGCTTATTCC--AGACGGTC------GTGTCGTCGCC-CGAA-TTATCTC--TCTACAAGTC-AACCTACATGT--GTC-CGACAACT-G-TTAG-TTCCAGGGTGAGTTTTCATATAC-CTCGATTATTTC----TATATTCAC-CAGTCAGCAAATAAGCTGCATCTATTCACGGGGGGGGGG------CA-TC-ACTTGCATNTAGTAAACT--CAAGACCA----AGTT--AAAT-C--GGTCATCA---ATTAC--GGTAAAT--AGCTC-TTTAGAGCT-AATGTTA----T-TTGTANTGTATAC---CCGACTTT---A-AAT-A--NATA--TTATTTGATT-ATTTATTTGGC--T--TGTGTATTCCTG-TGTATTGCTCTACGGGCG-TTAAGT-GGCT-TGGGAACTTTTT
gi|1                          :      ATCTGAAACTTTAT-ATCAAA-TAGTCC-GAATCTAATTT--GATAA-GTGT-TTT-TGTT-GTC---CT--A-T-TCGATTCTAGCTT-CAA-C--C--CCCGCTTTCTAG-ACGAGT-GTT-AT--TGGTACGGGCGATTCGATT--TCTGC-T-C---GCC-TAAACCA---GT----GC---AG--T---GGCTTG-------------TT-ACCTGACCAA---AATTTGTT-ATTT-CAATC-CGATG-ACATCTT-C-AATTAGC--CATCGCCA-TAT-TATCAT--ATATTTGAAGTCTACGCTTCTCGTTAGATCCGGAGAGAC---GAACGCT-CTGCT-C-----TAACACTACCATGAG-CA-T-TTTACACCC-TTTCCG---AAA--------GGGGG-TA-GATAAACT-T----CTATC--CGTTTAGACCACATTATGGGACATAT-GCATTCAGTGCGTC----TTTCGGAAGTT--GTGAA-TGACA-----A-CC-CCC-----ACATCCAT-G-TT-GCTTGGTCGGACTGTTTCTATCCAAACCAG-TAGCGA-ATGCCTATT---CTGAAACGG--------TCCCACGTGTGTTGTCACCCG-AATTATCTCTCTCTACTCAAGTGCCATGCAACGGAG-CGAC-CGATCC-CGA-C--ACC-ACG---CA-AAACAGTCAGCATGTC-TTGAAGAGATTGTGCCT-GGCACCCCTCT-CCCAC-CAT-CTATCAACAAACCATG-TTCCGT-TTGT-CAG-TTGGAA---TTTTCCACGTCAACCAGCC-GATT-TTTGCTTATTCC--AGACGGTC------GTGTCGTCGCC-AG-A-TTATCTC--TCT--AAGTC-AACCTACATGT--GTC-CGACAACT-G-TTAG-TCC---GGTGAGTTTTCATATAC-CTCGATTATTTC----TATATC--C-CAGTCAGCAAATAAGCTGCATCTATTCACGGGGGGGGGT------CA-TCAACTTGCATTTAGTAAACT--CAAGACCAAGATAGTT--AAAT-C--GGTCATCA---ATTAC---GTAAAT--AGCTC-TTTAGAGCT-AATGTTA----TATTCTACTGTATAC---CCGCCTTT---ATCAT-A--TATAATTTATTTGAAC-ATTTATTTAGCATT--TGTGT-CTCCTG-TGTATTGCTCTACGGGTG-TTAAGT--GCT-TGGGAACTTTCT
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 attgtactaacctaacaatgaaaatatttgtttaatcaggattGA-CCGACC-ACG---AA--TGCAGTCAGCATGTC-TTCAAGAGGTTGTGCCT-GGCACCCC-CT-CCCAC-CATCTTATCAACAATCCATTTTTCCGTGTTGTCCTG-TTGGAAGT-TTTCCtcctat
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gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tC--GGTAAAT--GGCTC-TTTAAAGCT-AATGTTA----T-TTGTAAAGTATAC---CCTTCTTT---A-AAT-A--AATA--TTATTTGAT---TTGATTTGt
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              gt--GGTAAAT--AGCTC-TTTAGAGCT-AATTTTA----T-TTGTAATATATAC---CAGACTTT---A-AAT-AATTATA--TCATTTGATTGATTa
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tC--GGTAAAT--AGCTC-TTTAGAGCT-AATGTTA----TAAAGTATTGTGTACCCACCGACTTT---A-AAT-A--AATA--TTATTTG
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               C--GGTAAAT--AGCTC-TTTA-----------------T-TTGTATTGTATAC---CCGACTTT---G-AAT-A--AATA--TTATTTGAT---TTTATTT
gi|2                          :     tATTTGA--TTTTATTATCAAA-TAGTC--GAAT-TAATTTTGGATAA-GGCT-TTT-TGTT-GTC---CT--A-T-TCGATTC-CGCTT-CAG-C--C--CC-GTTTCCCAGCACGAGT-ATT-AT--TGGTACGGGCTATTCGATT--TCTGC-T-A---GCC-TAAACCA---GT----GC---AG--C---GGCTTC-------------TTTACCTGACCAA---AATTCGTTTATTT-CAATC-CGATGGACATCTT-C-A-TTAGC--CATCGCCA-TAT-TATCGT--ATATTTGATGTCTACGCTTCTC--TAGATCCGGAGAGAC---GAACGCT-CTGCT-C-----AAACACTACCATGAGCCA-T-TTTACACCCCTTTTCACTAAAG----GGGAGGGGG-TA-GATAGACT-T----CTATC--CCGTTAGACCACAT----------ATTGCATTCAGTACGTA----TTTCGGAAGTT--GTGAC-TGACACCCC---------TG---ACATCCAT-G-TTTGCTTGG-CGGACGTTTTCTATCCAAACC-GAAAGCGG-ATGCCTATT---CCGAGACGGG-------TCCCACGTGTGTTGTTACCCG-AATTATCTCATTCTACCTAAGTGCCATGCAACGGAG-CGACTCGATTC-CGACCCGACC-ACG----A-ATGCAGTCAGCATGTCTTTGAAGAGGTTGTG-CT-GGCACCCCTCT--CCAC-CATCTTATCAACAATCCATGTTTCCGTGTTGTCCAG-TTGGAAGT-TTTCCCACGTCAACCAGCCTGAATATTTGCTTATTCC--AGACGGTC------GTGT-GTCGCCGGGAA-TTATCTC--TCTACAAGTCAAACCTACACGT--GTC-CGACAACT-G-TTAG-TTCCAGGTGGAG--TTCATATAC-CTTGATTATTTC----T-TATTCAC-CAGTCAACAAATAAGCTGCATCTATTCACGGGGGGGGGGT-----CA-TC-ACTTGCATATAGTAAACT--CAAGACCA----AGTT--AAAT-C--GGTCATCAATCATTAC---GTAAATA-AGCTCTTTTAGAGCT-AATGTTA----T-TCGTCCTGTATAC---CCGCCTTT------ATCA--TATA--TGATTT-ATT-ATACATTTG----------GTATTCCTG-TGTATTGCTCTACGGGCG-TTAAGT-GGCT-TGGGAACTTTTTtattt
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           aaaagtgattttcacataatcaggattAAT--AGCTC-TTTAGAGCT-AATGTTAATTAT-TTGTAATGTACAC---CCAACTTT---A-AAT-G--AATA--TCATTTGATT-tttctgt
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TATAT--AGCTC-TTTAGAACT-AACGT----------GTAATATATAC---CCGACTTTTTAA-AAT-A--AATA--TTATTTGA
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tataTAGTATATGC---CCGACTTTTTAA-AAT-A--AATA--TTATTTGA
gi|3                          :      ATTAGA--TTTTAT-ATCAAA-TAGTCCCGACT-TAATTTTGGGCTT-GCGT-TGT-TGTT-GTC---CT--A-T-TCCATTC-AACTT-CAA-C--CT-CC-GCTTTCCAGCACGAGT-ATT-AT--TGGTACGAACTATTCAATT--TTTGC-T-C---ACC-TAAACCA---GT----GG---AA--T---GACTTG-------------TTTACCTGACCAA---ATTATGTT-ATTT-CAATC-CGATG-GCATCTT-C-AATTAAC--CATCGCCA-TAT-TATCGT--AGAATTGATATCTATGCTTCTCGTTAGACCCGGAGAGAC---GAACGCA-CTGCT-C-----AAACGCTACCATGAGACA-T-TTTACACCCCTTTCCA---AAT----AGG-GGGGT-TA-GATAGACT-T----CTATC--CCGATAGATCACAA----------AT-GCATTCAGTGCGTC----ATGAGGAAGCT--GTGA---AGCAC------CT-TCCTATCTACATCCAT-G-TT-TTTTAGTCGGACGTTTGCTATCCAAACCAGCTAGCGGGATGCCTATT---CTGAGACGG--------TCCCACGTGTGTTGTCACCCG-AATTATCTCTATCTCCCTAAATGCCATGCAACGGAG-CGACTTGATCT-CGA-CCGACC-AAA---AA-ATGCAGTCAGCATGTC-TTGACGAGGTTGTTACT-ATCACCCCTCG-CCCAC-CTTCCTATCAAC-ATTCATGTTTCCGTGTTGTCCAG-TTGGATGT-TTT-CCACGTCAATGAACCTGAGA-TTTGCTTATTCC--AGACGGTC------GTGTCGTCGCC-CGAATTTATCTC--TCTACAG--C-AACCTACATGT---TG-CGACAACTAG-TTAG--TCCGGGTTGAGTTTTCATATAC-CTCGA-TA--TC----TATATCCACTCAGTCAGCAAATAAGCTGCA--TATTC-CGGGGGGGGGGGGGGTTCATTC-ACTGGCATATAGTAAATTCACAAGACCA----AGTTAAAAAT-CCGGGTCATCA---A-TAC---GTAAATAAAGCTC--TTAGAGCTAAATGTTA------TCGTCCTGTATAC---CCGCCGTT------GTCA--CATA--TGAT----TT-ATTTATTTCAT--T--TGTGTATTCCTGTTGTA-TGCTCTACGGGCGATTAAGTAGGCTATGGAAACTTTTT
gi|4                          : ggattATTTGA--TTTTAT-ATCAAA-TAGTCC-GAAT-TAATTTTGGGCTT-GCGTCTTT-TGTC-GTC---CT--A-T-TCCATTC-AACTT-CAA-C--C--CC-GCTTTCCAACACGAGT-ATT-AT--CGGTACGAACTACTCAATT--TCTGT-T-C---ACC-TAAACCA---GT----GG---AG--T---GGCTTG-------------TTTACCTCACCTA---ATTATGTT-ATTT-CAATC-CGATG-GCATCTT-C-AATTAAC--CATCGCCA-TAT-TATTGT--ACAATTGATATCTACGCTTCTCGTTAGATCCGCAGAGAC---GAACACA-CTGCT-C-----AAATGCTACCAGGAGACA-T-TTTACACCCCTTTCCA---AAT----AGG-GGGGGTTA-GATAGAAT-TTAAACTATC--CCGATAGACCACAT----------AT-GCATTCAGTGCGTT----TTGAGGAAGTT--GTGAC-TGACACCACCA-CCTTCCTATCTACATCCAT-G-TT-GTTTAGTCGGACGTTTGCTATCCAAACCAGCTAGCGGGATGCCTATT---CTGAGACGG--------TCCCACGTGTGTTGTCACCCG-AATTATCTCTCTCTACC-AAATGCCATGCAACGGAG-CGACTTGATCCACGA-ACGACC-A-GAAAAA-ATGCAGTCAGCATGTC-TTGAAGAGGTTGTTCCT-GGCACCCCTCG-CCCAC-CTTCCTATCAAC-ATCCATGTTTCCGTGTTGTCCAG-TTGGATGT-TTTTCCCCGTCAACC-GCCTGCGT-TTTGCT----------------------GTGTCGTCGCC-CAAA-TTATCTC--TCTTCAAGTC-AAGCTACATGT--GTC-CGACAACT-GTTTAGTTTCTTGGGTGAG-TTTCATATAC-CTCGATTATTTC----TAAATTCAC-CAGTCAGCAAATAAGCTGCATCTATTCAC----GGGGGG------CA-TC-ACTTGCATTTAGTCAACT---------A----AGTT--AAATCC--GGTCATTA---ATTACTAGGTAAAT--AGCTC-TTTAGAGCT-AATGTTA----T-TTGTAA-GTATAC---CCGACTTC-----AAT-A--TTTA--TTATTTGATT-CTTTATTTGGC--CAGTGTGTCTTCCCG-TGTATTGCTCTACGGGTG-CTAAGT-GGCT-TGGGAACTTTTTtcctat
gi|5                          :      ATTTGA--TTTTAT-ATCAAA-TAGTCC-AAAT-CAATTTTGAACACAGAGT-TTG-CGTT-GTCAAACT--AAT-TACATTG-AA-TC-CAA-GTGC--CC-ATTTTCTAGTGCGTCG-ATT-AT--TGGTACGACCTGCTCTTTA--TCTGC-A-A---GCCAGAAGTCAACTGT----AC---AAACC---G---TA-------------TTTACTTGGCCAA---ATAATTTT-GTTT-CAATC-CGCCG-ACATCT-----ATTATT--CATTGCCA-TAT-TACCGG--ATAATCTATGTATATGCCTCATGTTAGATCCTGAGAGAC-----ACTCA-CTGTC-C-----ATACGCCACAGTCAGACA-A-TTTGCACTCCTTTCCG---AAGT---AAG-AAG---------AGAAT------CGATC--CCGATCGACCGAAT----------AT-GCAGTTAGTGTGTC----TTGCAAAGGTT--GTGAC-TGACACCCCCACCC-TATTGTCAAACTCCAT-G-TT-GTCCAGT------TTTAC-ATCCTAACCAGCCAG-GAGATGCCTAAT---TTAAGACGG--------TCACAGGTATATTGTCACCCG-CATTATCTCCATCTACTCA-----CATGAAAGGAAG-ATATTCGATCC-CGA-TCAAT---TG---AATATGCACTCAGTGTATC-TTGCGGAGGCTGTGATT-GACAC-------AACAC-CTCCCAATCAAC-ATCCA--------TGTTGTCCAT-TT---AGTATTTTACACCCCAACCAGCCAGAG--GATGCCTGTTTTTGAGACGATCACACGTGTGTTGTCACC-CAAA-TTATCTCCTTTTACCAGTT-TATCTACATGTAAATG-AGACAGCT-G-ATGG-ATCCCGGGCGAGTTCTAA-ATACACTCAATTAGTTCAGGTTTTATTTAC-CAGTCAGCAAA
gi|6                          :                                    ccatcgtgttcagcaaatattaaacagaaattgatttattataatcaggattC-AGCTT-CAC-C--C--CC-GCTTTCCAGC-CGAGT-ATTTAT--TGGTACGG-CTATCGAAAT--TCTGC-T-C---GCC-TAAACCA---GTA---GCCCGAG--TTGGGGCTTGGTT----------TTTACCTGACCAA---ATT--GTT-ATTTTCAATC-CGATG-ACATCTT-CCAATGAGC--CATCGCCAATATCTATCGT---TATTTGCTGTCT-CGGCTCTCGT-AGATCCGGAGAAACCGAAAACGCCTCTGCTGC-----AAACACTACCGT-AGCCAAT-TTTACACCCCTTTTCG---AAACAAGAGG-GGGGG--G-GGTAGGATAG----CTGTCATCCGTTAGACCACAT-------------GCATTC-GTGCGTTCTTTTTACGGAAGTTCGGTGACGTGGGACACCCA-C---------TACATCCATTGCTT-GCTTGG-CGGACGTTTTCTATACAAACAAGGTAGCGG-ATGCCTATTATTCTGAGCCGG--------TCCCACGTGTTGTGTCACCCGCAATTATCTCTCT--AC-TAAGTGCCATGCAACGGAGCCGA-TCGATCC-CGA-CCGACCTACG----A-ATGCAGTCAGCATGTC-TTGAAGAGGTTGTGCCTGGGCACCCCTCTCCCCACACAT--TATCAAC-ATCAATGTTT-CGTGTTATCCAGTTTGGAAGT-TTT--CACGTCATCCAGCCTGATT-TTTG-TTATTCC--AGAAGGCC------GTGTCGTCGCC-CAAA-TTATCTC--TCTACAAGTC-AACCTACATGT--GTCACGACAACT-G--TAG-TACCAGGGTAGGCTTTCA
gi|7                          :       TTTAA--TTTTAT-ATCAAAATTGACC--AAT-TAATTATGGGCAC-AGGA-CTTACCTTAGTCAAATT--G-T-TTAATTC-AAATTACAA-T--CGCCC-ACTTTCTAGCGCTCATGATC-ATAGTAATACAAACTATTCAATTCTTCTGC-AAC---ACC-CAAA--A---GT-----C---AA--C-----CTTGAACCACACCGTAATTTAC-TGGCCAA----TCTTTTT-ATTC-AAATCACGTCG-AGATCTTTC-AATTA-CTTCATCGCCG-TAT-AA-CGTGGATAATTGATATCTGTGTCTCTCAT--------GAGAGTT---GGACGCA-CTGTC-CAA---AAACGCC-CCGTCGGACA-TAGTTGCACTCCTTTCCG---AA
gi|8                          :                                                                                                                     atGCGAGG-ATT-AT--TGGTATGAATTATTCATTT--TCTGC-A-C---ACC-GGAA------GTTTTTGC---AA--A---AACATG-------------TTTACTTGGCCAACAAATTGTAT--GCTG-CAATC-CGCCG-ACATCTT-C-GATTATT--CATCGCCA-TAT-TACTGG--ATAATTGATGTATATTCCCCTGGTTAGATCCTGAGAGAC---GAACGCA-CGGTC-CAAATTAAACGTCACTGTCGAACA-A-TTTGCTCTACTTTCCGA--AAA----AGA-AGGGA-TAGGAAAAGAC-T----CGATC--CCGATTGACC
gi|9                          :                       CAAA-TAGTCC-GAAT-TAATTTTGGACTT-GCGTGTTT-TGTT-GTC---CT----T-TCCATTC-AACTT-CAATT--C--CC-GCTTTCCGACACGAGT-ATT-AT--TGGTACGAACTACTCAATT--TCTGC-T-gaat
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|19 ): TTTGAGAATATACACTGTGTTTTGATACCAAATCAGCTATTTTTACATCAGTTTATCTACATGTACGTGA