lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1111111111111111111 888888888888888888888888888888888 111 1111111111 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 1111111 111111 7777777777777777777777777777777777777777777777 333333333333333333333333 1 1 1 11111 666666666666 11111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111 111 3333333333 111111 11111 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 11 22 66666666666666666666666 1
lowQualScore : 0 77 1111 4 2 1 666 7777777777777777777 444 2 666666666666666666666666666666666 0 555 1 1 3 1 444 1 44444 44444 22 22 2 1 333 22 3 2 0000000000 2 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 4 4 2 88 333 2 3333333 33 6 6666666 555555 8 66 7777777777777777777777777777777777777777777777 666 77 3 3 77 555555555555555555555555 888 1 5 2 00000 2 333 222222222222 88888 2 2 2 55 33 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 33 2 5 22222 888 3 222 1 3 0 55 0000000000 777 999999 0 0 1 55555 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 2 6 33 0 33 3 3 66666666666666666666666 7 0
lowQualScore : . .. .... . . . ... ................... ... . ................................. . ... . . . . ... . ..... ..... .. .. . . ... .. . . .......... . .......................................................................................................... . . . .. ... . ....... .. . ....... ...... . .. .............................................. ... .. . . .. ........................ ... . . . ..... . ... ............ ..... . . . .. .. ....................................................................... .. . . ..... ... . ... . . . .. .......... ... ...... . . . ..... .............................................................. . . .. . .. . . ....................... . .
lowQualScore : 6 99 9999 1 5 1 999 2222222222222222222 111 4 333333333333333333333333333333333 1 111 8 8 8 9 888 7 33333 55555 55 55 9 8 222 88 4 0 2222222222 1 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 2 0 2 33 999 2 7777777 44 7 0000000 666666 0 99 0000000000000000000000000000000000000000000000 999 99 3 3 99 222222222222222222222222 555 2 0 9 00000 9 000 999999999999 22222 4 4 4 66 22 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 99 9 7 88888 111 1 111 6 3 4 00 7777777777 888 111111 9 3 4 77777 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 5 8 88 8 88 2 2 22222222222222222222222 8 0
consensus : GAGAGGGAG--GTTGTGACAAAATNT-CAGTG--CAATA-----TC--T-G-----T---AT-CC---GTG---ATGAC--GAA-AA---A-A----AGTCCAG--G-AAAC-TA-TT-TGACCT-ACT-T-----TT-----A--GC--CCTAA-A---GT--AGGTC-A--T--GG---TGC-AC-----T--A-----A----GC-----TG---AAA-----TG-----CGA------ACT---G-A---T-C-AT-G--T-A---T-T--T--C--------T----GA-GAGGA-AGNTT---GT-GA----C-CAAA--TTTC--A-AG-GTAAT----A-CCTGTACT--TTTAG---C--------------AT--A-T-AG-G-CGGAT--CGAG----TGC-G-C--C-A-AT--CCAGCTGAAATG-----CGAA---CTGA-ACT----TGTATTCCTCC-GAGAGGAAACTTGTTTGACCTACTTTT-----AG-C-CCTAAAGTAGGTC-ACG--AC-GGTGCACCAAT-CCA-GC-T-GA-A--A--TGC-------A--------C--T------T---------------C--------T-----T-------------TTT--GA-G-GGAG---ANA-T-TGTG--ACCAA-ATTTC--A--ACGN----TGTACA---TGCATC---CG-TTACGGAAAAAA----GTCCGG-----AA-A---TCACG---ACC-TCA--GACGGACTCA-CTAACCAAGCGAGTTACGCTCTCAGCTGGACGNA--CGGAG-CAACGCCATAAC-A-AGACATATG---CACGT--CCCGCCTGANGACGGG-CGTATAAAA
Reference ( gi|3 ) : GAGAAGGAG--GTTGTGACAAAATGT-CAGTG--TAACA-----TC--T-G-----T---AT-CT---GTG---AGGAC--AAA-AACTTACA----AGTCCAA--G-AAAC-TA-TT-TGACTA-ACT-T-----TT-----A--GC--CCTGA-A---GT--AGATC-A--T--GG---TGC-A------T--A-----A----GC-----TG---AAA-----TG-----TGA------TCT---G-A---T-C-AT-G--T-A---T-T--T--C--------T----GA-GAAGA-AGGTT---GT-GA----C-CAAA--TCTC--A-AG-GTATT----A-CCTGTACT--TTTAG---T--------------AT--A-T-AG-G-CAGAT--TGAG----TGT-G-C--C-A-AT--CCAGCTGAAATA-----TGAT---CTGA-ACT----TGTATTCCTCC-AAGAGGAACCTTGTTTGACGTATGTTT-----AG-C-TCTAAAGTAGCCC-ACGT-AC-GGTGCACCAAT-TCT-GC-T-GA-A--A--TGC-------A--------C--T------T---------------C--------T-----T-------------TTT--GA-G-GGCG---ACA-T-TGTG--GCCAA-ATTTC--A--ACAA----TGTACA---TGCATC---CT-TTATGGAAAAAG----GTCCAG-----CA-A---TCACG---ACC-TCA--GACAGACTCAGCCAAC-AAGCCAGTTA-GC---CAGCTGGACGTA--CAGA--CAACACCATAACAAAAGACATATG---CATGT--CCTGTCTGATGATGGG-CATATAAAA
gi|4 : GAGATGAAG--CTTTCGCCTAAATTT-CAGGG--CAATACACTGTC--T-GACAGGT---AT-AT---GTA---TTGAA--AAA-AGCT-------------GG--A-AAAC-TA-TT-TGTCCT-ACT-T-----TC-----C--GC--CTTAA-A---GT--GGGTC-A--T--GG---TGC-AC-----C--A-----A----TCCCCT-TG---AAA-----TG-----AAA------ACT---C-A---T-T-CT----T-ACGCT-T--C--C--------T----GAGGGAGA-A-ATT---GT-GA----T-TAAA--TTTT--A-AG-GT
gi|8 : ccacaaaactgtttgactacttttagctctaatgtaggtcacagtgcatcaaccccgctgaaatgcaatcccactcttgcgcttattgagggagaaattgtgaccaaatttcaatgctatacatgcatccatcacagaaaagtcttaaaaacatgaccttggatggacatatagatggatggatatattgcgccaatccagccgaaatgcaaaatgattttgtattcctccGAGAGGGAA--GCTGTGACAAA----------------G-----TC--T-G-----T---AT-CC---ATGC--ATGAT--GAG-AG---A-A----AGTTCAG--G-AAAA-TA-TTATACCTA-TTT-T-----TC-----A--GC--CCTAA-A---GT--AGGTC-A--T--GG---TGC-ACC----C--ATGC--A----GC-----TG---AAA-----TG-----CAA------ACC---G-AACTT-CAAT-G--T-A---T-T--C--C--------TTA--GA-GATGA-TGCTT---GT-GA----C-TAAA--TTTC--A-GG-GCAtcttttactataaa
gi|18 : gaacaagagtacaaccaaaggtaccaaaatacactattaaacagtgaatttcaacccgtcagcacattatgcattattcgccttagagtatgtcttggtgcatcaatccagctgataaagtatttctctGAGAGGGAG--GTTGTGATATAATGT-CAGTG--CAATA-----TC--T-GTATA-T---AT-CT---ATG---ATGAG--AAA--------A----AGTCCAA--G-AAAC-TA-TT-TGACCT-ACT-T-----at
gi|12 : ttttagctttcaagtagggcatgatgcaccaatgtagctgacacgtgaactcacgtatttttctGAGTGGGAGA-GTTATGATAAAATGT-TGGTG--CAATA-----TC--T-G-----TATAAT-CC---ATG---ATATG--AGA-AA-----A----AGTTCAG--G-AAAC-TA-aagct
gi|1 : gcaagattttgaacatgagtaccacaaagactacatcctatgcccgccggacagtgacaattcatcctgcataagcacttttaccatggcacactaatccagctggcgtgtgaacagattatgtataattccccAGAAGGAG--GTTGTGACAAA-TGT-CAGTGGGTAACA-----TC--TCG-----T---ATACT---GTG---AGGAC--AAACAACTTACA----AGTCCAA--G-AAAC--A-TT--GACTA-CCT-T-----TT-----CCCGC--CCTGA-A---GTTAGGATTTA--T--TG---TGC-C------T--A-----A----GC-----TGCTAAAA-----TGA----TGA------TCT---G-A---T-C-ATTG--TTA---TGT--T--C--------T----GA-GAAGACAGGTTCTAAT-GAAGCCC-CAAAGATCTCCAA-AG-GTATTTCAGA-CCTGTATCGGTTTAG---T--------------AT--A-TTAT-G-CAGAT--TGAG----TGT-GGC--C-ATATTACCAGCTGAAATA-----TGAT---CTGA-CTT----TGTAATTCTCC-AAGAGGAACCTTGTTTGACGTATTGTT-----AG-CTTCTAAAGTAGCCC-ACGT-AC-GG-GC-CCAAT-TTT-GC-TCGA-A--A--TGC-------AG-------C--TC-----T---------------C--------T-----TA------------TTT--GAGG-GGCG---ACA-T-TGTGGTGCCAACCTTTC--A--A-AA----TGTACACATTGCATC---CT-TTATGG-AAAAG----GTCCAG-----CAGA---TCAC-----CC------GACCGACT-AGC
gi|7 : caatgctatctaaccacgtgtcaactcgctagcatgcttatgtatttgctctgaGAAAGAGATGTTGTGACGAAA----CA-TG--TA--------TA--T-G-----C---AT-CC---ATG---AGGAG--AAA-AA-----------GTCCAG--A-AAAC-TT-TG-CGACTT-ACT-T-----TT-----A--GC--CTTAA-A---Gttaatgcaggattccattcccccgagaacccagacctcaagtcactaaccaagcgagttacgctctcagctgacgtaaacagaacaacaccaaacaaaagacatatgcatgtcccctgctggatgatgggccatataaaaatgtatactttatttc
gi|13 : aacagaaaaacacaagagtgtctcaaatggtacattgtacatcccatcttacagtgagattcggccagtatctagcacaggtcatggtgaaccaaaccagctgatatatgaactacgtatttctccGAGGAAG--GTTCAGACAAAATTT-CAGTG--CAATA-----TTATT-GA----T---AT-CC---ATT---A--AC--GAA-AA----------AGCCAAG--G-AAAC-TC-TT-CGACTT-ATT-T-----TT-----A--GC--CCgcaaaatctgtaatgaaaaaaaagtccagaaaactgatatacttttagcacgaacggatggaccgagtgcaccaattcagctgaaattgtattcccctgagagaaagcctgtgactaaattttagggcagtatatcc
gi|5 : ggaatggtaaactggttatacatatctccgcAAGAG--GTTGTGT-----TGT-CAGCG--CAATA-----TC--T-G-----T---AT-CC---GCA---ATGAG--AAA-AA-----------GTCCAG--G-AAAG-TG-TC-TGACAT-ACT-G-----TT-----A--GCTCCCTG-------T--ACATC--------------T-C------T--A-----A----GA-----GG---AAGGT---TG-----TGA------T-T---A-A---C-C--T-G--T-A---T-C--T--A--------TAGTGGG-GAAAA-AATCT---G--GA-------AAA--TT---------GTTTG----A-CCT--ACT--TTTAG------------------AT--A-T-AAAG-TAAGT--CAAGG---TAT-A-C--C-A-AT--GCAGCTGAAATA------------CT-----T----TG-----------AGAGGAAACTTGTGTGACaatagggggcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngttaaggtaaaaccttgcgattatattttatg
gi|16 : acagtatatctggttgtgtttaaattttagggttgtgtctctaccagaataaagtctggaaaaccttgacctactttaagcctaaaagcaggtcattgtgcaccaatccagctcacatgaaaattgcatgattatgtcttcctctgAGGAG--GTTGTAATATAATGTCCAGTG--CAATA-----TCT-T-G-----T---AT-ATATCATG---ATGAC--GAA-A------A----AGTCCAA--GAAAAC-TA-TT-Ttaaacagggcaacatctatatccgtaacaaaaa
gi|11 : cttttagctttcaagtagggcatgatgcaccaatgtaggctgacacttctcgtgaactcacgtattttcttagAG--GTTGTGACTACATTG-GAGAA--CAATG-----CC--T-G-----T---AT-CC---ATA---A---C--CAA-TAGTTAAA----A----AATGG-AAACCTG-TT-TGACCT-ACT-T-----TT-----A--GT--CTTGA-A---GT--AGGTC-A--C--GG---TGC-A------C--AATTCCA----GC-----TG---AAG-----TACAAACTGT------TCT---T-A---TAC-AT-G--T-C---T-T--C--CTT------T----CA-GAGGA-TATTT---GT-GA----C-TAAA--TTTCT-G-AA-CTA-T----A-TCTGTAtgaaacctacttaagctgtaacaa
gi|19 : aG--GTTGTTACAT--TGT-C-GTGC-TACTA-----TT--A-C-----T---AT-C----ATG---ATGAC----------TAAA----AGTCCAA--G-CAAT-TA-TG-TGGCTT-ACTCT-----TT-----A--GC--CCTAA-A---G---AGATT-A--TACGA---TGC-AAGT---T--A-----A----TC-----TG---AAA-----CG-----TAA-------AT---A-A---T-T-A--G--T-A---T-C--C--C--------T----GA-GAGGG-ATGTT---GTCGA----CTCAAtctgtaacgaaaaaatatcc
gi|17 : --GTGGTGACAAAATTT-CAGTG--CAATAG----TC--T-----------AT-C--------------C--AAA-AG-------------------A-AAAC-TAACT-TGACCT-ATT-C-----TTTAGTCA--GC--CCTAT-A---GT--AGGTC-A--C--AGA--TGC-ACTAAT-T--A-----A----GCC----TG---AAA-----TG-----CAA------ACT---G-A-------AT-A--T-A---T-T--T--C--------T----G
gi|15 : TTGTGACTTGATGT-CAAGG--TAATG-----TC--T-G-----T---AT-GC---ATA---A---CTGAAA-AA-----A----AGTTCGG--A-AAAC-TG-TT-TGTCCT-ACC-T-----TT-----A--GC--CCTAA-A---GT--AGGTG-AACT--GA---TGC-A------CCGATCC--A----GT-----GG---AAA-----TGC----TAACTCGC-TCTCCAG-A---T-A-A-----C-A---C-T--T--CT-------T----GA-GGGAG-ATATT---GT-GA----C-CAAA--TTTA--A-AG-GTtcgtgacccacatttgaatctattctg
gi|10 : gcTTGTGACTACATTT-CAGGG--CAACA-----CC--T-------T---AT-CG---GTA---AT--T--GAA-A------A----AGTCTGG--G-AAAC-TG-TT-TGACCT-ACT-T-----TC-----A--GC--CCTGA-A---
gi|2 : aaatgtggggttatacctgtaccacaacatctaaaatcggcgaaactgtttgacctacttttgggccctaaagtaggtcatggtgtaccGACAAATTTT-CAGTG--TAA-----------T-A-----T---AT-CT----TGTCCAAGAC--AAG-GA---A-A----AATATAG--A-AAAC-CACCT-T--CTT-ACT-TAAGAATT-----A--GC--CCCAT-A---AT--AGGTA-A--T---A---CGA-AT-----T--A-----A----GC-----TA---AAA-----TG-----CAA------AAT---GAA---T-C--T-G--C-A---T-T--T--CCATAGCTGT----GA-GAGGA-ATGCT---GT-GA----C-TACA--TTTC--A-AA-GTGAT----A-CATGTGTC--CATAA---CCAATAACAAAAAAAAT--A-T--G-G-AAAAC--TG-T----TTT-A-C--CTA-CT--GTAGCTGAAATA-----CAAA---CTGA-AC------GTATTCCTTC-TAGTGAAAGCTTGTtttctgcctaaattaggtcattatgcacctgctgactcactc
gi|21 : aaaatagatcatggtataccaatattgctgaaatgtgaactgatgatgcatgtatttttctaagaATTT-CAGGA--TAATA-----CC--T-G-----T---AT-CC---GTC---AGAAA--AAA-AA---ACAATTTAATCCGA--A-AAAC-gactaagtctgtattcatagcaaaaaaaaaaaaaatcccgaaagtgtttaacttgaagtagctagaccatggtgcatcaattaagctgaaatgcaaactctctacttacgtttttgaggaagaaattgagactaaatctcaatatatgcatccgttacagaaaaaaaaatatctggaaaacgtatatctcagacggactca
gi|7 : aaaaacgtccccaaactataagtcttagagtagctaggttacagaacaccgattaagctgaaatgtagactgaatctgtatctctctggctac---AT-CT---GTA---ATGA---AAA-AA-----A----AGTCCAG--A-AAAC-------TGA-TATACT-T-----TT-----A--GC--AC-GA-ACGGAT--GGACC-G-----AG---TGC-ACCAAT-T--C-----A----GC-----TG---AAA-----T--------------------------------T-G--T-A---T-TCCC--C--------T----GA-GAGAA-AGCCT---GT-GA----C-TAAA--TTTT--A-GG-GCAGT----A-g
gi|14 : aacagaaaaacacaagagtgtctcaaatggtacattgtacatcccatcttacagtgagattcggccagtatctagcacaggtcatggtgaaccaaaccagctgatatatgaactacgtatttctccgaaagagatgttgtgacgaaacatgtatatgcatccatgaggagaaaaagtccagaaaactttgcgacttacttttagccttaaaggcaaaACA----A---CAG--A-AAAC-TA-TT-TGATCT-ACT-T-----TT-----A--GC--CATAA-A---GT--AGGTC-A--T--GG---TGCAA------C--AATCC-A----GC-----TG---ACA-----TG-----TGA------ACT---G-A---T-T-AT-G--T-AAT-T-C--T--C--------T----GA-GAtatcc
gi|4 : tgtgagtcttaatgaaaatctccaaactggctgatggtaataaaatcaaatatggtatatctgatcacgagtaagcatgaaaccaaatacatgtacctatatccCCAC--A-AAAC-TG-TT-TGACTA--CT-T-----TT-----A--GC--TCTAA-T---GT--AGGTC-A--C--AG---TGC-A------TC-A-----ACCCCGC-----TG---AAA-----TG-----CAA------TCC---C-AC--T-C-TT-G--C-G---C-T--TA-T--------T----GAGGGAGA-A-ATT---GT-GA----C-CAAA--TTTC--A-A
gi|24 : CTAG--A-AAAA-TA-TT--GATCT-ATT-T-----TT-----A--GC--CCTTA-A---GT--AGGTC-A--TACAA---TGC-A------C--C-----A----GTCCAGATG---AAA-----TG-----tgctatacatgcatccatcacagaaaagtcttaaaaacatgaccttggatggacatatagatggatggatatattgcgccaatccagccgaaatgcaaaatgattttgtattcctccgagatgaagctttcgcctaaatttcagggcaatacactgtctgacaggtatatgtattgaaaaaagctggaaaactatttgtcctactttccgccttaaagtgggtcatggtgcaccaatccccttgaaatgaaaactcattcttacgcttcctgagggagaaattgtgattaaattttaaggttcttttactataaa
gi|20 : -AAAC-TC-TC-TGACCT-ACT-T-----TG-----A--GC--ACGGATA---GT---------------G---TGC-AC-----T--A-----ATCTAGC-----TG---AAA-----TG-----CAAAGTCCCTCT---T-A---C---------T-A---T-T--T--T--------C----GA-GAGAA-AAATT---GT-GA----C-CAAA--TTTT--A-Acaaaattcttgggggagatattttaatgctatacat
gi|6 : ga-AAAC-TG-TC-TGACCT-TCT-T-----TT-----A--GC--CTTAA-A---GT--AGGGC-A--T--GGGACTCC-AAT----T--A-----A----GC-----TA---ACA-----AG-----TGA------ACT---G-A---T-T-AT-G--T-A---T-TACT--CCA------T----GA-GA--A-AGATT---GT-AA----cactgtacatgcatcgatctgttatgggaaaaagtcaggaaaacatg
gi|5 : aagatcacaataaatctggttgagtagagtatggaacaaaacctggatccaaaggagaattcatga-TGACCT-GCT-T-----TT-----A--GG--CTTAA-A---GT--AGGTC-A--A--GG---Taaaaaatggcaatgcaatataaatctgtatccaacatgagaaacatcctgggaacactatttcaagatgcaccataacccacgaatcagaatacatctcggaggaagctgtgactgcatttcaggcaatatattatctaaacccatgatgcaaaaaatttaattgttacctgcagaagactaataggaaacccagcgtgttcttcag
gi|9 : acagtatatctggttgtgtttaaattttagggttgtgtctctaccagaataaagtctggaaaGACCT-ACT-T-----AT-----A--GC--CCTAA-A---GT--AGGTC-A--C--AG---TGC-A------C--AAATCCA----GC-----TG---AAACT---TG-----TGttgtgcaccaatccagctcacatgaaaattgcatgattatgtcttcctctgaagaggttgtgttgtcagcgcaatatctgtatccgcaatgagaaaaagtccaggaaagtgtctgacatactgttagctccctgtacatctctaagaggaaggttgtgattaacctgtatctatagtggggaaaaaatctggaaaattgtttgacctacttttagatataaagtaagtcaaggtataccaatgcagctgaaatactttgagaggaaacttgtgtgactaaacagggcaacatctatatccgtaacaaaaa
gi|16 : CT-T-----TT-----A--GC--TTTCA-A---GT--AGGGC-A--T--GA---TGC-ACCAATGT--A-----G----GC-----TG---ACACTTCTCG-----TGA------AC----------T-C-AC-G--T-AT--T-T--T--C--------T----TA-G-AGG-AGGTT---GT-AA----T-ATAA--TGTC--C-AGTGCAAT----ATCTTGTAccttttgagggagctcaccttgtaaaatctcaatgctgaacatgcatccattatgtaaaaaagtaaggaaaacaatatgaccttcatggacaaacacacagatggatggacagagtcacaacataattaatacatcccctctgacgataggagtagagg
gi|18 : T-T-----TT-----A--GC--TTTCA-A---GT--AGGGC-A--T--GA---TGC-A------CCAATGT--A----GC-----TG---ACA-----CG-----TGA------ACT-----------C-AC-G--T-A---T-T--TTTC--------T----GA-GAGGG-AGGTT---GT-GA----T-ATAA--TGTC--A-GT-GCAAT----A-TCTGTAtatatcatgatgacgaaaaagtccaagaaaactattttgaaacctacttaagctgtaacaa
gi|28 : TAA-A---AC--AAGTC-A--T--GG---TGC-ACCAAT-T--A-----A----GC-----TG---ACA-----TA-----TGA------------G-C---T-T-AT-G--T-A---T-T--T--C--------T----tatatctatgatgagaaaaagtccaagaaactatttgacctacttaagct
gi|21 : t------T--A-----A----GC-----TG---AAA-----TG-----TAG------ACT---GAA---T-C--T-G--T-A---T-C--T--C--------------------------T---CT-GG----C-TACA--TTTC--A-GG-ATAAT----A-CCTGTActaagagg
gi|13 : aaaaacgtccccaaactataagtcttagagtagctaggttacagaacaccgatG---GAA-----TGG----TAA------ACT---G-G---T-T-AT-ACAT-A---T-C--T--C--------C----GC-GAGGA-AGGTT---CA-GA----C-AAAA--TTTC--A-tccgtcagaaaaaaaaacaatttaatccgaaaaacg
gi|8 : -----TG-----TGACAAAG-TCT---GTA---T-CCAT-G--C-A---T-G-----A--------T----GA-GAGAA-AGTTC---AG-GA-------AAA--TATT--A--------T----A-CCTAT-TT--TTCAGCCCT--------------AA--AGT-AG-GTCA-----TG-G----TGC-A-C--C-C-AT--GCAGCTGAAATG-----CAAA---CCGA-ACTTCAATGTATTCCTTA-GAGATGATGCTTGTgtgcaatattattgatatccattaacgaaaaagccaaggaaactcttcgacttatttttagcccaatagggggcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngttaaggtaaaaccttgcgattatattttatg
gi|22 : gaacaagagtacaaccaaaggtaccaaaatacactattaaacagtgaatttcaacccgtcagcacattatgcattattcgccttagagtatgtcttggtgcatcaatccagctgataaagtatttctctgagagggaagcCT---G-A---A-C-TT-G--T-A---T-T--C--C--------TTTG-GA-GAAGA-AAATT---GT-GATT--T-TACA--TTTC--CTAG-GCAAT----ATCCTGTAgactaaatttcagggcaat
gi|7 : ggtgtcaccaatccagctggattgccacacaTATACT--TTTAG---C--------------ACGAA-C-GG-A-TGGAC--CGAG----TGC-A-C--C-A-AT--TCAGCTGAAA---------------------T----TGTATTCCCCT-GAGAGAAAGCCTGTtacataataaagaagtcaggaaaaattttgacactattttttaagccctaaagt
gi|20 : aacagaaaaacacaagagtgtctcaaatggtacattgtacatcccatcttacagtgagattcggccagtatctagcacaggtcatggtgaaccaaaccagctgatatatgaactacgtatttctccgaaagagatgttgtgacgaaacatgtatatgcatccatgaggagaaaaagtccagaaaactttgcgacttacttttagccttaaaggcaaaatctgtaatgaaaaaaaagtccagaaaactgaTACT--TTGAG---C--------------A------------CGGAT----AG----TGT-G-CACT-A-AT--CTAGCTGAAATgactaaattttagggcagtatatcc
gi|14 : gaaaactctctgaccTACT--TTTAG---CC-------------AT--A---AA-G-TAGGTCATG-G----TGC-A-A--C-A-AT--CCAGCTGACATG-----TGAA---CTGA-TTA----TGTAATTCTCT-GAGAgcaaagtccctcttactattttcgagagaaaaattgtgaccaaattttaacactgtacatgcatcgatctgttatgggaaaaagtcaggaaaacatg
gi|11 : tgtgagtcttaatgaaaatctccaaactggctgatggtaataaaatcaaatatggtatatctgatcacgagtaagcatgaaaccaaatacatgtacctatatccacaacagaaaactatttgatcTACT--TTTAG---T--------------CT--T-G-AA-G-TAGGT--CACG-----GT-G-CA-C-A-ATT-CCAGCTGAAGTACAAACTGTT---CTTATACA----TGTCTTCCTTT-CAGAGGA
gi|4 : aaggttgtgactacattggagaacaatgcctgtatccataaccaatagttaaaaaatggaaacctgtttgacc--------------AT--A-T-AG-A-TGGAT--GGATATATTGC-G-C--C-A-AT--CCAGCCGAAATG-----CAAA---ATGA-TTT----TGTATTCCTCC-GAGATGAAGCTTtatttgtgactaaatttctgaactatatctgtatctgtaacgaaaaaatatcc
gi|22 : ccacaaaactgtttgactacttttagctctaatgtaggtcacagtgcatcaaccccgctgaaatgcaatcccactcttgcgcttattgagggagaaattgtgaccaaatttcaatgctatacatgcatccatcacagaaaagtcttaaaaacatgaccttggatggacG----TGTCA-C--C-A-AT--CCAGCTGGATTG-----CCACACACTGA-ACT----TGTATTCCTTTGGAGAAGAAAATTGTtcgcctaaatttcagggcaatacactgtctgacaggtatatgtattgaaaaaagctggaaaactatttgtcctactttccgccttaaagtgggtcatggtgcaccaatccccttgaaatgaaaactcattcttacgcttcctgagggagaaattgtgattaaattttaaggttcttttactataaa
gi|23 : g-C--C-A-AT--CCAGCTGAAACA-----TAAA---CTgattttacatttcctaggcaatatcctgtatacataataaagaagtcaggaaaaattttgacactattttttaagccctaaagt
gi|21 : gtcacggttca-C--C-G-AT--TAAGCTGAAATG-----TAGA---CTGA-ATC----TGTATCTCTCcactcttacgattctgagggacaaattgtgatcaaattcaacgctgttacggaaaatagtccggaaaacaaggtttcagacagaca
gi|14 : aaaaacgtccccaaactataagtcttagagtagctaggttacagaacaTGT-ACC----TATATCCA--C-AACAGAAAACT-ATTTGATCTACTTTT-----AG-C-CATAAAGTAGGTC------AT-GGTGCAACAAT-CCA-GC-T-GA-C--A--TGtggctacatttcaggataatacctgtatccgtcagaaaaaaaaacaatttaatccgaaaaacg
gi|17 : tgtgagtcttaatgaaaatctccaaactggctgatggtaataaaatcaaatatggtatatctgatcacgagtaagcatgaaaccaaatacaTCC-AAAAGAAAACTAACTTGACCTATTCTTTAGTCAG-C-CCTATAGTAGGTC-ACA-----GATGCACTAAT-TAA-GCCT-GA-A--A--TGC-------A--------tgaactgattatgtaattctctgaga
gi|5 : gtggtgacaaaatttcagtgcaatagtctaGGAAAATTGTTTGACCTACTTTT-----AG-A-TATAAAGTAAGTC-A----A--GGTATACCAAT-GCA-GC-T-GA-A--A--TAC-----------------------------------------------------------------------TTT--GA-GAGGAA---ACT-TGTGTG--ACTAA-Aaactgaatatatttctgtcgtgacccacatttgaatctattctg
gi|11 : acagtatatctggttgtgtttaaattttagggttgtgtctctaccagaataaagtctggaaaaccttgacctactttaagcctaaaagcaggtcattgtgcaccaatccagctcacatgaaaattgcatgattatgtcttcctctgaagaggttgtgttgtcagcgcaatatctgtatccgcaatgagaaaaagtccaggaaagtgtctgacatactgttagctccctgtacatctctaagaggaaggttgtgattaacctgtatctatagtggggaaaaaatctGGAAACCTGTTTGACCTACTTTT-----AG-T-CTTGAAGTAGGTC------AC-GGTGCA-CAAT-TCCAGC-T-GA-A--G--TACAA-----A--------CTGT------T---------------C--------T-----TATACATGTCTTCCTTT--CA-G-AG-G---ATATT-TGTG--ACTAA-ATTTCTGA--AC------TATATC---TGTATC---TG-TAACGAAAAAAT----ATCCcagggcaacatctatatccgtaacaaaaa
gi|15 : aaggttgtgactacattggagaacaatgcctgtatccataaccaatagttaaaaaatGGAAAACTGTTTGTCCTACCTTT-----AG-C-CCTAAAGTAG----GTGA-ACTGATGCACCGAT-CCA-GT-G-GA-A--A--TGCTA-----A--------C--T------CGCTCTCCAGATAACAC--------T-----T-------------CTT--GA-G-GGAG---ATA-T-TGTG--ACCAA-ATTTA--A--A
gi|10 : gcttgtgacttgatgtcaaggtaatgtctgtatgcataactgaaaaaaagttcGAAAC--TGTTTGACCTACTTTT-----GGGC-CCTAAAGTAGGTC------AT-GGTGTACC--T-TGT-G-------A--C--TAC-------A--------T--T------T---------------C----------------------------------A-G-GGCA---ACA-ggt
gi|4 : aaatgtggggttatacctgtaccacaacatctaaaatcggcTGTTTGAC-TACTTTT-----AG-C-TCTAATGTAGGTC-ACA------GTGCATCAAC-CCC-GC-T-GA-A--A--TGC-------AATCCCACTC--T------TGCG------------C--------T-----T-------------ATT--GA-G-GGAG---AAA-T-TGTG--ACCAA-ATTTC--A--ATGC----TATACA---TGCATC---CA-TCACAGAAAA------GTCTTA-----AA-A---ACATG---ACC-TTG--GATGGACccttatcggtaattgaaaaagtctgggaaactgtttgacctactttcagccctgaatttctgcctaaattaggtcattatgcacctgctgactcactc
gi|24 : ccacaaaacTTGATCTATTTTT-----AG-C-CCTTAAGTAGGTC-A--T-AC-AATGCACCAGT-CCA-GA-T-GA-A--A--TGCAA-----A--------A--T------T---------------C-----------------------------TT--GG-G-GGAG---ATA-T-Tatatagatggatggatatattgcgccaatccagccgaaatgcaaaatgattttgtattcctccgagatgaagctttcgcctaaatttcagggcaatacactgtctgacaggtatatgtattgaaaaaagctggaaaactatttgtcctactttccgccttaaagtgggtcatggtgcaccaatccccttgaaatgaaaactcattcttacgcttcctgagggagaaattgtgattaaattttaaggttcttttactataaa
gi|9 : ctagaaaaataGACCTACTTAT-----AG-C-CCTAAAGTAGGTC-ACA------GTGCACAAAT-CCA-GC-T-GA-A--A---------------------C--T------TGTG------------C--------C-----T-------------TTT--GA-G-GGAGCTCACC-T-TGTA-----AA-ATCTC--A--ATGC----TGAACA---TGCATC---CA-TTATGTAAAAAA----GT-AAGGAAAACA-A---T-ATG---ACCTTCATGGACAAAC-------AC-A---------------CAGATGGATGGA--CAGAGTC-ACAACATAATTA-------ATA---CA--T--CCCCTCTGACGATAGG-ttaatgctatacat
gi|8 : ACCTATTTTTC----AG-C-CCTAAAGTAGGTC-ATG------GTGCACCCAT-GCA-GC-T-GA-A--A--TGCAAACCGAA--------C--T------T---------------CAATGTA--T-----T-------------CCT--TA-GAGATG---ATGCT-TGTG--ACTAA-ATTTC--AGGGCAA----Tagtagagg
gi|2 : gaacaagagtacaaccaaaggtaccaaaatacactattaaacagtgaatttcaacccgtcagcacattatgcattattcgccttagagtatgtcttggtgcatcaatccagctgataaagtatttctctgagagggaagctgtgacaaagtctgtatccatgcatgatgagagaaagttcaggaaaatattatTGTTT-----AA-C-T-TGAAGTAGCTAGAC-C-AT-GGTGCATCAAT-TAA-GC-T-GA-A--A--TGCAA-----A--------C--TC-----T---------------CTACTTACGT-----T-------------TTT--GA-G-GAAG---AAA-T-TGAG--ACTAA-ATCTC--A--A---------TATA---TGCATC---CG-TTACAGAAAAAAAAATATCTGG-----AA-A-----ACGTATATC-TCA--GACGGACTCA
gi|18 : aaaatagatcatggtataccaatattgctgaaatgtgaactgatgatgcatgtatttttctaagagacaaattttcagtgtaatatatcttgtccaagacaaggaaaaatatagaaaaccaccttcttacttaagaattagccccataataggtaatacgaattaagctaaaatgcaaaatgaatctgcatttccatagctgtgagaggaatgctgtgactacatttcaaagtgatacatgtgtccataaccaataacaaaaaaaatatggaaaactgttttacctactgtagctgaaatacaaactgaacgtattccttctagtgaaagcttgtgactaagtctgtattcatagcaaaaaaaaaaaaaatcccgaaagTTT-----AG-C-TTTCAAGTAG-----GGC-AT-GATGCACCAAT-GTA-GC-T-GA-C--ACGTGA-------A--------C--TCACGTAT---------------T--------T-----T-------------TCT--GA-G-AGGG---AGG-T-TGTG--ATATA-ATGTC--AGTGCAATATCTGTATA---T--ATC---TA-TGATGAGAAAAA----GTCCA
gi|16 : tTTT-----AG-C-TTTCAAGTAG-----GGC-AT-GATGCACCAATGTAG-GC-T-GA---------C-------A--------C--T------T---------------C--------T-----agaaactatttgacctacttaagct
gi|7 : ctTAGCAC-AGGTCAT-GGTGAACCAAA-CCA-GC-T-GATAT-A--TGA-------A--------C--TACG---T---------------A--------T-----T-------------TCTCCGA-A-AGAG---ATG-T-TGTG--ACGAA-AC-----------A----TGTATA---TGCATC---CA-TGAGGAGAAAAA----GTCCAG-----AA-AACTTTGCG---ACT-Tcgtgaactcacgtattttcttagaggaggttgtaatataatgtccagtgcaatatcttgtatatatcatgatgacgaaaaagtccaagaaaactattttgaaacctacttaagctgtaacaa
gi|23 : aacagaaaaacacaagagtgtctcaaatggtacattgtacatcccatcttacagtgagattcggccagtatc-AC-GGTTCACCAAT-CCA-GC-T-GA-AACA--TAA-------A--------C--TCAC---T---------------C--------TTACGAT-------------TCT--GA-G-GGAC---AAA-T-TGTG--ATCAA-A-TTC--A--ACGC----TG-------------------TTACGGAAAATA----GTCCGG-----AA-A---ACAAG---GTT-TCA--GACAGACacttttagccttaaaggcaaaatctgtaatgaaaaaaaagtccagaaaactgatatacttttagcacgaacggatggaccgagtgcaccaattcagctgaaattgtattcccctgagagaaagcctgtgactaaattttagggcagtatatcc
gi|20 : gtcGTGCACTAAT-CTA-GC-T-GA-A--A--TGC-------AAAGTC---C--C------T---------------C--------T-----TACTATT-------TTC--GA-G-AGAA---AAA-T-TGTG--ACCAA-ATTTT--A--ACAC----TGTACA---TGCATCGATCTGTTATGGGAAAAA----GTCa
gi|1 : gaaaactctctgacctactttgagcacggatagtG---ACC-TCA-----AG--TCA-CTAACCAAGCGAGTTACGCTCTCAGCTG-ACGTAAACAGAA-CAACACCA-AACAAAAGACATATG---CATGTCCCCTGCTGGATGATGGGCCATATAAAAaggaaaacatg
gi|27 : caatgctatctaaccacgtgtcaactcgctagcatgcttatgtatttgctctgaagaaggaggttgtgacaaatgtcagtgggtaacatctcgtatactgtgaggacaaacaacttacaagtccaagaaacattgactaccttttcccgccctgaagttaggatttattgtgcctaagctgctaaaatgatgatctgatcattgttatgttctgagaagacaggttctaatgaagccccaaagatctccaaaggtatttcagacctgtatcggtttagtatattatgcagattgagtgtggccatattaccagctgaaatatgatctgactttgtaattctccaagaggaaccttgtttgacgtattgttagcttctaaagtagcccacgtacgggcccaattttgctcgaaatgcagctctcttatttgaggggcgacattgtggtgccaacctttcaaaatgtacacattgcatcctttatggaaaaggtccagcagatcacccgaccgactagcttaatgcaggattccattcccccgagaacccaGCCGGACGCA--CGGA--CAACGCCATAAC---ATACATATGTAATACAT--CCCGCCTGAAGACGCG-CGTATGAAAatgtatactttatttc
gi|25 : GCTGGCCAGA--CCGA--CAACGCCATAA-----GAT-TATA---CAC----TCTGTCTAAAGACGGG-CATATAAAA
1 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|26 ): GTGTTCCATATCAATAAATAAAGTCCGGATGCTAAGGCCTAAAGTAGATTACTGTGACTAATCCAGCTGACATGACAATT
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 33333333333333333 11111 3333333333333333333 11111111111111111111 111 1111111111111 11111111111111 1111111111111111111111 1111 5555555555555555555555555 2222222222 1111 33333333 1111111 111111 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 1111111 222222222222222222222222222222 222222222222 111111 333333333333333 111 2 333333 11111 11
lowQualScore : 2 666 3 44 4 22 1 55555 22 44 6666666 222 444 66666666666666666 44444 222 55555 1 1 1 44 222 1 222 1 33333 3333 00000 33 777777777777 1 1 1 3333 22 222 22 33 3333 9999999999999999999 1 3333 222 66666 666 3333 1 77777777777777777777 3 22 1 000 1 66 444 9999999999999 3 00000000000000 33 222 3 3333333333333333333333 22 1 22 33333 333 7777 4444 2 3 2 0000 1 3333333333333333333333333 5 77 5 8888888888 66 9999 777777777 5 0 0 33 0 77777 2 0 2 66666666 2 2222222 2 2 111111 66 2 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 2 44444 1 2 2 0000000 2 222 444 444444444444444444444444444444 5555 0 9999999 5555 6666 55 2 333333333333 666 4 666 0 888888 8 555555555555555 222 4 3 0 666666 0 0 66666 11 1 8
lowQualScore : . ... . .. . .. . ..... .. .. ....... ... ... ................. ..... ... ..... . . . .. ... . ... . ..... .... ..... .. ............ . . . .... .. ... .. .. .... ................... . .... ... ..... ... .... . .................... . .. . ... . .. ... ............. . .............. .. ... . ...................... .. . .. ..... ... .... .... . . . .... . ......................... . .. . .......... .. .... ......... . . . .. . ..... . . . ........ . ....... . . ...... .. . ......................................................................... . ..... . . . ....... . ... ... .............................. .... . ....... .... .... .. . ............ ... . ... . ...... . ............... ... . . . ...... . . ..... .. . .
lowQualScore : 2 555 4 33 0 44 7 88888 33 00 5555555 999 666 00000000000000000 00000 777 44444 5 6 6 44 999 7 888 5 66666 3333 22222 77 999999999999 4 5 5 3333 11 888 22 88 4444 1111111111111111111 7 5555 888 55555 666 4444 6 22222222222222222222 1 11 5 666 5 33 888 0000000000000 1 00000000000000 11 999 3 7777777777777777777777 44 7 55 22222 555 8888 7777 4 1 9 6666 7 7777777777777777777777777 7 99 7 0000000000 99 4444 888888888 0 4 4 99 2 11111 9 6 9 99999999 2 8888888 2 2 777777 11 2 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 5 44444 0 5 7 3333333 7 999 777 555555555555555555555555555555 7777 8 1111111 1111 1111 77 7 222222222222 444 0 666 4 999999 8 888888888888888 000 6 2 8 888888 8 8 88888 00 0 0
consensus : GAGAGGGAG-GTTGTGACN--AAATTTC--AGTG--C-AATA-----T--C--T-G-----T---AT---CCGT-G--A----TGAC-GAA-----AA---A-----AAGTCC-G-GGAAAC-T-ATTT---GAC-CT---ACT-T-----T----T-----AG--C------------CCTAAAG-T-A-G----G--T---CA--T--GGTGC----A--C-----CA----A----G-C----TG---AAA-----TG-CGAAC----T-G-----A---T----C-----AT-G--T-A---T-T--T---C--------T----GA-GAGG------------A-AGGTT---GT-GA----C-NA--------------AA--TT-TC--A--GG-G---CA----AT----A-C-CT-GTACT--TTTAGCA-TAT-AAGCAGATCG-A-GTG-CG-CCA-AT--CCAGCTGAAA-TG--CGA---ACTG--AACT----TGTAT--TCCTCC-GAG-AGGAAACTTGT--TTGACCTACTT-----TTAGC-CCTAA-AGTAGGTC-ACG-ACGGTG-CACCAATCCAGC-------T-GA-A------A--TG-C------A---------C--------------T------T---C---T-----T------TT---------T--GAG-GGA-G---ANAT-TGT-G--A--CCAA-ATT-TC---A-------ACG------CTGT---ACA----TGC----ATCCGT------TACGGAAAAAAG----TCC-GG-AAA---NC---A--CG---ACC-TC-AGACGGACTCA-CTAACCAAGCGAGTTA-GC-C-CAGCTGGACG--NACAGA-CAACGCCATAACAAAAGACATATGCA---CGTCCC--GTCTGANGACGGG-CGTATAAAA
Reference ( family-1432 ) : GAGAGGGAG-GTTGTGACA--AAATNTC--AGTG--C-AATA-----T--C--T-G-----T---AT---CCGT-G--A----TGAC-GAA-----AA---A-----AAGTCC-A-GGAAAC-T-ATTT---GAC-CT---ACT-T-----T----T-----AG--C------------CCTAAAG-T-A-G----G--T---CA--T--GGTGC----A--C-----TA----A----G-C----TG---AAA-----TG-CGAAC----T-G-----A---T----C-----AT-G--T-A---T-T--T---C--------T----GA-GAGG------------A-AGNTT---GT-GA----C-CA--------------AA--TT-TC--A--AG-G---TA----AT----A-C-CT-GTACT--TTTAGCA-TAT-AGGCGGATCG-A-GTG-CG-CCA-AT--CCAGCTGAAA-TG--CGA---ACTG--AACT----TGTAT--TCCTCC-GAG-AGGAAACTTGT--TTGACCTACTT-----TTAGC-CCTAA-AGTAGGTC-ACG-ACGGTG-CACCAATCCAGC-------T-GA-A------A--TG-C------A---------C--------------T------T---C---T-----T------TT---------T--GAG-GGA-G---ANAT-TGT-G--A--CCAA-ATT-TC---A-------ACG------NTGT---ACA----TGC----ATCCGT------TACGGAAAAAAG----TCC-GG-AAA---TC---A--CG---ACC-TC-AGACGGACTCA-CTAACCAAGCGAGTTACGCTCTCAGCTGGACG--NACGGAGCAACGCCATAAC--AAGACATATGCA---CGTCCC--GCCTGANGACGGG-CGTATAAAA
gi|1 : ----T-G-----C---T----T-----AT-G--T-A---T-T--TGCTC--------T----GAAGAAG------------G-AGGTT---GT-GA------CA--------------AA--TG-TC--AGTGG-G---TA----AC----A-T-CTCGTA
gi|1 : caatgctatctaaccacgtgtcaactcgctagcaAGAAGGAG-GTTGTGACA--AA-TGTC--AGTGGGT-AACA-----T--C--TCG-----T---ATA--CTGT-G--A----GGAC-AAA-----CA---ACTTACAAGTCC-A-AGAAAC---ATT----GAC--T---ACC-T-----T----TTCC--CG--C------------CCTGAAG-TTA-G----GATT---TA--T--TGTGC-------C-----TA----A----G-C----TGCTAAAA-----TGATGATC----T-G-----A---T----C-----ATTG--TTA---TGT--T---C--------T----GA-GAAG------------ACAGGTTCTAAT-GAAGCCC-CA--------------AAGATC-TCCAA--AG-G---TATTTCAG----A-C-CT-GTATCGGTTTAGTA-TATTATGCAGATTG-A-GTG-TGGCCATATTACCAGCTGAAA-TA--TGA---TCTG--ACTT----TGTAA--TTCTCC-AAG-AGGAACCTTGT--TTGACGTATTG-----TTAGCTTCTAA-AGTAGCCC-ACGTACGG-G-C-CCAATTTTGC-------TCGA-A------A--TG-C------AG--------C--------------TC-----T---C---T-----TA-----TT---------T--GAG-GGGCG---ACAT-TGT-GGTG--CCAACCTT-TC---A-------A-A------ATGT---ACACAT-TGC----ATCCTT------TATGG-AAAAGG----TCC-AGCAGA---TC---ACCCG---ACC-tactgtgaggacaaacaacttacaagtccaagaaacattgactaccttttcccgccctgaagttaggatttattgtgcctaagctgctaaaatgatgatctgatcattgttatgttctgagaagacaggttctaatgaagccccaaagatctccaaaggtatttcagacctgtatcggtttagtatattatgcagattgagtgtggccatattaccagctgaaatatgatctgactttgtaattctccaagaggaaccttgtttgacgtattgttagcttctaaagtagcccacgtacgggcccaattttgctcgaaatgcagctctcttatttgaggggcgacattgtggtgccaacctttcaaaatgtacacattgcatcctttatggaaaaggtccagcagatcacccgaccgactagcttaatgcaggattccattcccccgagaacccagacctcaagtcactaaccaagcgagttacgctctcagctgacgtaaacagaacaacaccaaacaaaagacatatgcatgtcccctgctggatgatgggccatataaaaatgtatactttatttc
gi|1 : caatgctatctaaccacgtgtcaactcgctagcatgcttatgtatttgctctgaCC-GA-GAA---CC---C--AG---ACC-TC-A-----AGTCA-CTAACCAAGCGAGTTACGCTCTCAGCT-GACGTAAACAGAACAACACCA-AACAAAAGACATATGCA---TGTCCCCTGCTGGATGATGGGCCATATAAAAgactagcttaatgcaggattccattcccccgagaacccagacctcaagtcactaaccaagcgagttacgctctcagctgacgtaaacagaacaacaccaaacaaaagacatatgcatgtcccctgctggatgatgggccatataaaaatgtatactttatttc
gi|10 : caatgctatctaaccacgtgtcaactcgctagcatgcttatgtatttgctctgaagaaggaggttgtgacaaatgtcagtgggtaacatctcgtatactgtgaggacaaacaacttacaagtccaagaaacattgactaccttttcccgccctgaagttaggatttattgtgcctaagctgctaaaatgatgatctgatcattgttatgttctgagaagacaggttctaatgaagccccaaagatctccaaaggtatttcagacctgtatcggtttagtatattatgcagattgagtgtggccatattaccagctgaaatatgatctgactttgtaattctccaagaggaaccttgtttgacgtattgttagcttctaaagtagcccacgtacgggcccaattttgctcgaaatgcagctctcttatttgaggggcgacattgtggtgccaacctttcaaaatgtacacattgcatcctttatggaaaaggtccagcagatcacccgaccgactagcttaatgcaggattccattccc---A-----AAATCG-G-CGAAAC-T-GTTT---GAC-CT---ACT-T-----T----T-----GGG-C------------CCTAAAG-T-A-G----G--T---CA--T--GGTGT----A--C-----atgtatactttatttc
gi|10 : aaatgtggggttatacctgtaccacaacatctTTGTGACT--ACATTTC--AGGG--C-AACA-----C--C--T-------T---AT---CGGT-A--A----T--T-GAA-----AA---A-------GTCT-G-GGAAAC-T-GTTT---GAC-CT---ACT-T-----T----C-----AG--CCCTGAATTTCTGCCTAAAT-T-A-G----G--T---CA--T--TATGC----AC-C-----T----------G-C----TG---Acttgtgactacatttcagggcaacaccttatcggtaattgaaaaagtctgggaaactgtttgacctactttcagccctgaatttctgcctaaattaggtcattatgcacctgctgactcactc
gi|11 : aaatgtggggttatacctgtaccacaacatctaaaatcggcgaaactgtttgacctacttttgggccctaaagtaggtcatggtgtaccAG-GTTGTGACT--ACATTGG--AGAA--C-AATG-----C--C--T-G-----T---AT---CC------A----TAAC-CAATAGTTAA---A-----AAAT-----GGAAACCT-GTTT---GAC-CT---ACT-T-----T----T-----AG--T------------CTTGAAG-T-A-G----G--T---CA--C--GGTGC----A--C-----AATTCCA----G-C----TG---AAG-----TA-CAAAC----T-GTTCTTA---TA---C-----AT-G--T-C---T-T--C---CTT------T----CA-GAGG------------A-TATTT---GT-GA----C-TA--------------AA--TT-TC--T--GA-A---CT----AT----A-T-CT-GTATC--TGTAACctcactc
gi|11 : aAGAGGATA-TTTGTGACT--AAATTTC--TGAA--C-TATA-----T--C--T-G-----T---AT---CTG----------TAAC-GAA-----AA---A-----ATATCC-gaaaaaatatcc
gi|12 : aaggttgtgactacattggagaacaatgcctgtatccataaccaatagttaaaaaatggaaacctgtttgacctacttttagtcttgaagtaggtcacggtgcacaattccagctgaagtacaaactgttcttatacatgtcttcctttc-GCACT--TTTACCA-T----GGCA------------CA-CTA-AT--CCAGCTGGCG-TG--TGA---ACAG--ATTA----TGTATAATTCCCC-GAGTGGGAGAGTTAT--
gi|12 : gcaagattttgaacatgagtaccacaaagactacatcctatgcccgccggacagtgacaattcatcctgcataaGAGTGGGAGAGTTATGATA--AAATGTT--GGTG--C-AATA-----T--C--T-G-----TATAAT---CCAT-G--A----T-AT-GAG-----AA---A-----AAGTTC-A-GGAAAC-T-Agataaaatgttggtgcaatatctgtataatccatgatatgagaaaaagttcaggaaacta
gi|13 : gcaagattttgaacatgagtaccacaaagactacatcctatgcccgccggacagtgacaattcatcctgcataagcacttttaccatggcacactaatccagctggcgtgtgaacagattatgtataattccccG---GAA-----TGGTAAAC----T-G-----G---T----T-----AT-ACAT-A---T-C--T---C--------C----GC-GAGG------------A-AGGTT---CA-GA----C-AA--------------AA--TT-TC--A--GT-G---CA----AT----A-
gi|13 : GAGGAAG-GTTCAGACA--AAATTTC--AGTG--C-AATA-----T--TATT-GA----T---AT---CCAT---------TAAC-GAA-----AA---A-------GCCA-A-GGAAAC-T-CTTC---GAC-TT---ATT-T-----T----T-----AG--C------------CC---AA-T-A-G----G--ttattgatatccattaacgaaaaagccaaggaaactcttcgacttatttttagcccaatagggggcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngttaaggtaaaaccttgcgattatattttatg
gi|14 : ggaatggtaaactggttatacatatctccgcTG--TACC----TATAT--CCA--C-AAC-AGAAAACT-AT--TTGATCTACTT-----TTAGC-CATAA-AGTAGGTC-----ATGGTG-CAACAATCCAGC-------T-GA-C------A--TG-gggcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngttaaggtaaaaccttgcgattatattttatg
gi|14 : tgtgagtcttaatgaaaatctccaaactggctgatggtaataaaatcaaatatggtatatctgatcacgagtaagcatgaaaccaaatacaC-A-GAAAAC-T-ATTT---GAT-CT---ACT-T-----T----T-----AG--C------------CATAAAG-T-A-G----G--T---CA--T--GGTGC----A--A-----CAATCCA----G-C----TG---ACA-----TG-TGAAC----T-G-----A---T----T-----AT-G--T-AAT-T-C--T---C--------T----GA-GAtgaactgattatgtaattctctgaga
gi|15 : tgtgagtcttaatgaaaatctccaaactggctgatggtaataaaatcaaatatggtatatctgatcacgagtaagcatgaaaccaaatacatgtacctatatccacaaTTGTGACT--TGATGTC--AAGG--T-AATG-----T--C--T-G-----T---AT---GC------A----TAACTGAA-----AA---A-----AAGTTC-G-GAAAAC-T-GTTT---GTC-CT---ACC-T-----T----T-----AG--C------------CCTAAAG-T-A-G----G--T---GAACT--GATGC----A--C-----CGATCCA----G-T----GG---AAA-----TG-CTAAC----TCG-----C---T----CTCCAGATAA--C-A---C-T--T---CT-------T----GA-GGGA------------G-ATATT---GT-GA----C-CA--------------AA--TT-TA--A--AG-G---T
gi|16 : gcCT-T-----T----T-----AG--C------------TTTCAAG-T-A-G----G--G---CA--T--GATGC----A--CCAATGTA----G----G-C----TG---ACACTTCTCG-TGAAC----------------T----C-----AC-G--T-AT--T-T--T---C--------T----TA-GAGG--------------AGGTT---GT-AA----T-AT--------------AA--TG-TC--C--AGTG---CA----AT----ATC-TT-GTA
gi|16 : AGAGG-AG-GTTGTAATA--TAATGTCC-AGTG--C-AATA-----T--C--TTG-----T---ATATATCAT-G--A----TGAC-G-------AA---A-----AAGTCCAA-GAAAAC-T-ATTTTGAAAC-CT---ACT-T-----tatatcatgatgacgaaaaagtccaagaaaactattttgaaacctacttaagctgtaacaa
gi|17 : cttttagctttcaagtagggcatgatgcaccaatgtaggctgacacttctcgtgaactcacgtattttctt-GTGGTGACA--AAATTTC--AGTG--C-AATAG----T--C----------T---AT---CC-----------------AA-----A-----------------A-GAAAAC-TAACTT---GAC-CT---ATT-C-----T----TTAGTCAG--C------------CCTATAG-T-A-G----G--T---CA--CA-GATGC----A--CTAAT-TA----A----GCC----TG---AAA-----TG-CAAAC----T-G-----A--------------AT-A--T-A---T-T--T---C--------T----G-----------------------TC---GT-GAC---C-CA--------------CA--TT-TG--A--Aaagctgtaacaa
gi|18 : T-T-----T----T-----AG--C------------TTTCAAG-T-A-G----G--G---CA--T--GATGC----A--C-----CA----ATGTAG-C----TG---ACA-----CG-TGAAC----T----------------C-----AC-G--T-A---T-T--TTT-C--------T----GA-GAGG------------G-AGGTT---GT-GA----T-AT--------------AA--TG-TC--A--GT-G---CA----AT----A-T-CT-GTAtctattctg
gi|18 : TT-----TTAGC-TTTCA-AGTAGGGC-ATG-A---TG-CACCAATGTAGC-------T-GA-C------ACGTG-A------A---------C--------------TCACGTAT---T---T-----T------TC---------T--GAG-AGG-G---AGGT-TGT-G--A--TATA-ATG-TC---A-------GTGCAATATCTGT---ATA----T------ATCTAT------GATGAGAAAAAG----TCCAAG-AAA---CT---ATTTG---ACC-Ttatatctatgatgagaaaaagtccaagaaactatttgacctacttaagct
gi|18 : GAGAGGGAG-GTTGTGATA--TAATGTC--AGTG--C-AATA-----T--C--T-G-----T---AT---ATATCT--A----TGAT-GAG-----AA---A-----AAGTCC-A-AGAAAC-T-ATTT---GAC-CT---ACT-T-----acttaagct
gi|19 : ttttagctttcaagtagggcatgatgcaccaatgtagctgacacgtgaactcacgtatttttctG-GTTGTTACA--T--TGTC---GTG--CTACTA-----T--T--A-C-----T---AT---C-AT-G--A----TGAC-TAA-----AA-----------GTCC-A-AGCAAT-T-ATGT---GGC-TT---ACTCT-----T----T-----AG--C------------CCTAAAG---A-G----A--T---TA--TACGATGC----AAGT-----TA----A----T-C----TG---AAA-----CG-TAAA-----T-A-----A---T----T-----A--G--T-A---T-C--C---C--------T----GA-GAGG------------G-ATGTT---GTCGA----CTCA--------------Aaagct
gi|2 : AAAA-T-A-G----A--T---CA--T--GGTAT----A--C-----CA----ATATTG-C----TG---AAA-----TG-TGAAC----T-G-----A---TGATGC-----AT-G--T-ATT-T-T--T---C--------T----AA-GA---------------------------GA----C-AA--------------AT--TT-TC--A--GT-G---TA----AT----A-
gi|2 : GACA--AATTTTC--AGTG--T-AATA-----TATC--T-------T---GT---CC------A----AGAC-AAG-----GA---A-----AAATAT-A-GAAAAC-C-ACCT---T-C-TT---ACT-TAAGAAT----T-----AG--C------------CCCATAA-T-A-G----G--T---AA--T--A-CGA----A--T-----TA----A----G-C----TA---AAA-----TG-CAAAA----T-G-----AA--T----C------T-G--C-A---T-T--T---CCATAGCTGT----GA-GAGG------------A-ATGCT---GT-GA----C-TA--------------CA--TT-TC--A--AA-G---TG----AT----A-C-AT-GTtatcttgtccaagacaaggaaaaatatagaaaaccaccttcttacttaagaattagccccataataggtaatacgaattaagctaaaatgcaaaatgaatctgcatttccatagctgtgagaggaatgctgtgactacatttcaaagtgatacatgtgtccataaccaataacaaaaaaaatatggaaaactgttttacctactgtagctgaaatacaaactgaacgtattccttctagtgaaagcttgtgactaagtctgtattcatagcaaaaaaaaaaaaaatcccgaaagtgtttaacttgaagtagctagaccatggtgcatcaattaagctgaaatgcaaactctctacttacgtttttgaggaagaaattgagactaaatctcaatatatgcatccgttacagaaaaaaaaatatctggaaaacgtatatctcagacggactca
gi|2 : aaaatagatcatggtataccaatattgctgaaatgtgaactgatgatgcatgtatttttctaagaCTTACTTAAGAATTAGC-CCCAT-AATAGGTA-AT--ACG--------AATTAAGC-------T-AA-A------A--TG-C------AAAATGAAT-C--------------T------G---C---A-----T------TTCCATAGCTGT--GAG-AGG-A---ATGC-TGT-G--A--CTAC-ATT-TC---A-------AAG------TGAT---ACA----TGT----GTCCATAACCAATAACAAAAAAAA----TAT-GG-AAA---gtccataaccaataacaaaaaaaatatggaaaactgttttacctactgtagctgaaatacaaactgaacgtattccttctagtgaaagcttgtgactaagtctgtattcatagcaaaaaaaaaaaaaatcccgaaagtgtttaacttgaagtagctagaccatggtgcatcaattaagctgaaatgcaaactctctacttacgtttttgaggaagaaattgagactaaatctcaatatatgcatccgttacagaaaaaaaaatatctggaaaacgtatatctcagacggactca
gi|2 : aaaatagatcatggtataccaatattgctgaaatgtgaactgatgatgcatgtatttttctaagagacaaattttcagtgtaatatatcttgtccaagacaaggaaaaatatagaaaaccaccttGAGAGGAAT-GCTGTGACT--ACATTTC--AAAG--T-GATA-----C--A--T-G-----T---GT---CCAT-A--ACCAATAAC--AA-----AA---A-----AAATAT-G-GAAAAC-T-GTTT---TAC-CT---ACT-----------------------------------------G-T-A-G-------------------------------------------------C----TG---AAA-----TA-CAAAC----T-G-----A--------------AC-G--T-A---T-T--C---C--------TTC--TA-GTGA------------A-AGCTT---GT-GA----C-TA--------------AG--TC-Tactgttttacctactgtagctgaaatacaaactgaacgtattccttctagtgaaagcttgtgactaagtctgtattcatagcaaaaaaaaaaaaaatcccgaaagtgtttaacttgaagtagctagaccatggtgcatcaattaagctgaaatgcaaactctctacttacgtttttgaggaagaaattgagactaaatctcaatatatgcatccgttacagaaaaaaaaatatctggaaaacgtatatctcagacggactca
gi|2 : aaaatagatcatggtataccaatattgctgaaatgtgaactgatgatgcatgtatttttctaagagacaaattttcagtgtaatatatcttgtccaagacaaggaaaaatatagaaaaccaccttcttacttaagaattagccccataataggtaatacgaattaagctaaaatgcaaaatgaatctgcatttccatagctgt-----T--C--T-G-----T---AT---TCAT-AGCA----AAAA-AAA-----AA---A-----AAATCC-C-G-AAAG-T-GTTT---AAC----------T-----TGAAGT-----AG--C--------------------T-A-G----A--C---CA--T--GGTGC----A--TCAAT-TA----A----G-C----TG---AAA-----TG-CAAAC----T-C-----T---C----T-----AC-T--T-ACG-T-T--T---T--------T----GAGGAAG------------A-A-ATT---GA-GA----C-TA--------------AA--TC-TC--A--Agtattcatagcaaaaaaaaaaaaaatcccgaaagtgtttaacttgaagtagctagaccatggtgcatcaattaagctgaaatgcaaactctctacttacgtttttgaggaagaaattgagactaaatctcaatatatgcatccgttacagaaaaaaaaatatctggaaaacgtatatctcagacggactca
gi|2 : aaaatagatcatggtataccaatattgctgaaatgtgaactgatgatgcatgtatttttctaagagacaaattttcagtgtaatatatcttgtccaagacaaggaaaaatatagaaaaccaccttcttacttaagaattagccccataataggtaatacgaattaagctaaaatgcaaaatgaatctgcatttccatagctgtgagaggaatgctgtgactacatttcaaagtgatacatgtgtccataaccaataacaaaaaaaatatggaaaactgttttacctactgtagctgaaatacaaactgaacgtattccttctagtgaaagcttgtgactaagT-----TTAAC-T-TGA-AGTAGCTAGACC-ATGGTG-CATCAATTAAGC-------T-GA-A------A--TG-C------AAACTCTCTAC--------------T------TA--CG--T-----T------TT---------T--GAG-GAA-G---AAAT-TGA-G--A--CTAA-ATC-TC---A-------A-----------T---ATA----TGC----ATCCGT------TACAGAAAAAAAAATATCT-GG-AAA--------A--CGTATATC-TC-AGACGGACTCA-tatatgcatccgttacagaaaaaaaaatatctggaaaacgtatatctcagacggactca
gi|20 : aaaatagatcatggtataccaatattgctgaaatgtgaactgatgatgcatgtatttttctaagagacaaattttcagtgtaatatatcttgtccaagacaaggaaaaatatagaaaaccaccttcttacttaagaattagccccataataggtaatacgaattaagctaaaatgcaaaatgaatctgcatttccatagctgtgagaggaatgctgtgactacatttcaaagtgatacatgtgtccataaccaataacaaaaaaaatatggaaaactgttttacctactgtagctgaaatacaaactgaacgtattccttctagtgaaagcttgtgactaagtctgtattcatagcaaaaaaaaaaaaaatcccgaaagtgGAAAACTC-T--CTGACCTACTT-----TGAGC-ACGGATAGT-------------GTG-CACTAATCTAGC-------T-GA-A------A--TG-C------AAAGTC----C--------------C------T---C---T-----TACTATTTT---------C--GAG-AGA-A---AAAT-TGT-G--A--CCAA-ATT-TT---A-------ACA------CTGT---ACA----TGCATCGATCTGT------TATGGGAAAAAG----TCA-GG-AAA---AC---A--TG---
gi|21 : ---ACT-A-----T----A-----AG--T------------CTTAGAG-T-A-GCTAGG--T---TA--C--AGAAC----A--CCGAT-TA----A----G-C----TG---AAA-----TG-TAGAC----T-GA----A---T----C------T-G--T-A---T-C--T---C--------------------------------------T---CT-GG----C-TA--------------CA--TT-TC--A--GG-A---TA----AT----A-C-CT-GTA
gi|21 : aaaaacgtccccaaATTTC--AGGA--T-AATA-----C--C--T-G-----T---AT---CCGT-C--A---------GAA-----AA---A-----AAtccgtcagaaaaaaaaacaatttaatccgaaaaacg
gi|22 : aaaaacgtccccaaactataagtcttagagtagctaggttacagaacaccgattaagctgaaatgtagactgaatctgtatctctctggctacGGTGTCACCAATCCAGC-------T-GG-A------T--TGCC------A---------CACACTGAACTTGTAT------T---C---C-----T------TT---------G--GAG-AAG-A---AAAT-TGT-G--ATTTTAC-ATT-TCCTAG-------GCA------ATAT----CC----TGT----ATACAT------AAT--AAAGAAG----TCA-GG-AAA---aacaatttaatccgaaaaacg
gi|22 : -GTGTCA-CCA-AT--CCAGCTGGAT-TG--CCACACACTG--AACT----TGTAT--TCCTTTGGAG-AAGAAAATTGT--aattttgacactattttttaagccctaaagt
gi|22 : gGAGAAGAAA-ATTGTGATTTTACATTTCCTAG-G--C-AATA-----T--CC-T-G-----T---AT---ACAT-A--A----T------A-----AA---G-----AAGTC--A-GGAAAA-A-TTTT---GACACT---ATT-T-----T----TTA---AG--C------------CCTAAAG-T-gattttacatttcctaggcaatatcctgtatacataataaagaagtcaggaaaaattttgacactattttttaagccctaaagt
gi|23 : ggtgtcaccaatccagctggattgccacacactgaacttgtattcctttg-ACGGTT-CACCAATCCAGC-------T-GA-AAC----A--TA-A------A---------C--------------TCAC---T---C---TTACGAT------TC---------T--GAG-GGA-C---AAAT-TGT-G--A--TCAA-A-T-TC---A-------ACG------CT-----------------------GT------TACGGAAAATAG----TCC-GG-AAA---AC---A--AG---GTT-TC-AGACAGAC
gi|24 : gtc--TTGATCTATTT-----TTAGC-CCTTA-AGTAGGTC-AT--ACAATG-CACCAGTCCAGA-------T-GA-A------A--TG-CAA----A---------A--------------T------T---C-----------------T---------T--GGG-GGA-G---ATAT-Ta
gi|25 : ctagaaaaataGCTGGCCA--GACCGA-CAACGCCATAA-----GAT-TATACA---C--TCT--GTCTAAAGACGGG-CATATAAAAttaatgctatacat
gi|26 : tAGG-CCTAA-AGTAGATT-ACT----GTG--ACTAATCCAGC-------T-GA-C------A--TG-atgacacagtcagccaaaaaatgaaa
gi|27 : gtgttccatatcaataaataaagtccggatgctaGCCGGACG--CACGGA-CAACGCCATAAC--A-TACATATGTAATACATCCC--GCCTGAAGACGCG-CGTATGAAAacaatt
gi|28 : TAAAA-C-A-A----G--T---CA--T--GGTGC----A--CCAAT-TA----A----G-C----TG---ACA-----TA-TGAGC----------------T----T-----AT-G--T-A---T-TTCT---C--------T----AA-GAGG------------
gi|3 : tGAGAAGGAG-GTTGTGACA--AAATGTC--AGTG--T-AACA-----T--C--T-G-----T---AT---CTGT-G--A----GGAC-AAA-----AACTTAC----AAGTCC-A-AGAAAC-T-ATTT---GAC-TA---ACT-T-----T----T-----AG--C------------CCTGAAG-T-A-G----A--T---CA--T--GGTGC----A--------TA----A----G-C----TG---AAA-----TG-TGATC----T-G-----A---T----C-----AT-G--T-A---T-T--T---C--------T----GA-GAAG------------A-AGGTT---GT-GA----C-CA--------------AA--TC-TC--A--AG-G---TA----TT----A-C-CT-GTACT--TTTAGTA-TAT-AGGCAGATTG-A-GTG-TG-CCA-AT--CCAGCTGAAA-TA--TGA---TCTG--AACT----TGTAT--TCCTCC-AAG-AGGAACCTTGT--TTGACGTATGT-----TTAGC-TCTAA-AGTAGCCC-ACGTACGGTG-CACCAATTCTGC-------T-GA-A------A--TG-C------A---------C--------------T------T---C---T-----T------TT---------T--GAG-GGC-G---ACAT-TGT-G--G--CCAA-ATT-TC---A-------ACA------ATGT---ACA----TGC----ATCCTT------TATGGAAAAAGG----TCC-AG-CAA---TC---A--CG---ACC-TC-AGACAGACTCAGCCAA-CAAGCCAGTTA-GC---CAGCTGGACG--TACAGA-CAACACCATAACAAAAGACATATGCA---TGTCCT--GTCTGATGATGGG-CATATAAAA
gi|4 : AAACT-GT--TTGAC-TACTT-----TTAGC-TCTAA-TGTAGGTC-ACA----GTG-CATCAACCCCGC-------T-GA-A------A--TG-C------AATCCCACT-C--------------T------TGCGC---T-----T------AT---------T--GAG-GGA-G---AAAT-TGT-G--A--CCAA-ATT-TC---A-------ATG------CTAT---ACA----TGC----ATCCAT------CACAG--AAAAG----TCT-TA-AAA---AC---A--TG---ACC-TT-GGATGGAC
gi|4 : ccacaGAGGGAGAA-ATTGTGACC--AAATTTC--AATG--C-TATA-----C--A--T-G-----C---AT---CC------A----TCAC---A-----GA---A-----AAGTCT-T-AAAAAC---AT-----GAC-CTTGGA--------------T-----GG--A------------CATATAGAT-G-G----A--TGGATA--T--ATTGC----G--C-----CA----ATCCAG-C----CG---AAA-----TG-CAAAA----T-G-----A---T----T-----TT-G--T-A---T-T--C---C--------TCC--GA-GATG------------A-AGCTT---TC-GC----C-TA--------------AA--TT-TC--A--GG-G---CA----AT----A-CACT-GTatatagatggatggatatattgcgccaatccagccgaaatgcaaaatgattttgtattcctccgagatgaagctttcgcctaaatttcagggcaatacactgtctgacaggtatatgtattgaaaaaagctggaaaactatttgtcctactttccgccttaaagtgggtcatggtgcaccaatccccttgaaatgaaaactcattcttacgcttcctgagggagaaattgtgattaaattttaaggttcttttactataaa
gi|4 : ccacaaaactgtttgactacttttagctctaatgtaggtcacagtgcatcaaccccgctgaaatgcaatcccactcttgcgcttattTG-CGCCAATCCAGC-------C-GA-A------A--TG-CAAAATGA---------T--------------T------T---TGTAT-----TCC----TC---------C--GAG-ATG-A---AGCT-TTC-G--C--CTAA-ATT-TC---AGGGCAATACA------CTGTCTGACA----GGT----ATATG-------TATTGAAAAAAG-----CT-GG-AAA---ctgacaggtatatgtattgaaaaaagctggaaaactatttgtcctactttccgccttaaagtgggtcatggtgcaccaatccccttgaaatgaaaactcattcttacgcttcctgagggagaaattgtgattaaattttaaggttcttttactataaa
gi|4 : ccacaaaactgtttgactacttttagctctaatgtaggtcacagtgcatcaaccccgctgaaatgcaatcccactcttgcgcttattgagggagaaattgtgaccaaatttcaatgctatacatgcatccatcacagaaaagtcttaaaaacatgaccttggatggacatatagatggatggatatatGAGATGAAG-CTTTCGCCT--AAATTTC--AGGG--C-AATACACTGT--C--T-GACAGGT---AT---ATGT-A--T----TGA----------AA---A-----AAG-CT-G-GAAAAC-T-ATTT---GTC-CT---ACT-T-----T----C-----CG--C------------CTTAAAG-T-G-G----G--T---CA--T--GGTGC----A--C-----CA----A----T-CCCCTTG---AAA-----TG-AAAAC----T-C-----A---T----T-----CT----T-ACGCT-T--C---C--------T----GA-GGGA------------G-AAATT---GT-GA----T-TA--------------AA--TT-TT--A--AG-G---Tactatttgtcctactttccgccttaaagtgggtcatggtgcaccaatccccttgaaatgaaaactcattcttacgcttcctgagggagaaattgtgattaaattttaaggttcttttactataaa
gi|5 : ccacaaaactgtttgactacttttagctctaatgtaggtcacagtgcatcaaccccgctgaaatgcaatcccactcttgcgcttattgagggagaaattgtgaccaaatttcaatgctatacatgcatccatcacagaaaagtcttaaaaacatgaccttggatggacatatagatggatggatatattgcgccaatccagccgaaatgcaaaatgattttgtattcctccG-GTTGTGTTT--AAATTTT--AGGG--T-TGTG-----T--C--T-C-----T---AC---CAG-----------------A-----AT---A-----AAGTCT-G-GAAAAC-C---TT---GAC-CT---ACT-T-----T----A-----AG--C------------CTAAAAG-C-A-G----G--T---CA--T--TGTGC----A--C-----CAATCCA----G-C----TC---ACA-----TG-AAAATTGCAT-G-----A---T----T-----AT-G--T-C---T-TCCT---C--------T----GA--AG---------------AGGTT---GT-G---------------------------TTGTC--A--GC-G---CA----AT----A-T-CT-GTA-----TCCGCA--AT-GAGAAAA---------------A-GT--CCAG--GAAAGTGTCTGACATACTGTTAGCTCCC-TGTAC--ATCTCT-AAG-AGGAAGGTTGTGATTAACCTtcttttactataaa
gi|5 : acagtatatct--TTGACCTACTT-----TAAGC-CTAAA-AGCAGGTC-----ATTGTG-CACCAATCCAGCTCACA--T-GA-A------AATTG-C------ATGATTATGTC--------------T------T---C---C-----T------CT----------------GAA-G---AGGT-TGT-G-----------TTGTC---A-------GCG------CAAT---ATC----TGT----ATCCGC------AATGAGAAAAAG----TCCAGG-AAA---gtatctatagtggggaaaaaatctggaaaattgtttgacctacttttagatataaagtaagtcaaggtataccaatgcagctgaaatactttgagaggaaacttgtgtgactaaacagggcaacatctatatccgtaacaaaaa
gi|5 : acagtatatctggttgtgtttaaattttagggttgtgtctctaccagaataaagtctggaaaaccGAG-GTTGTGT-------TGTC--AGCG--C-AATA-----T--C--T-G-----T---AT---CCGC-A--A----TGA----G-----AA---A-----AAGTCC-A-GGAAAG-T-GTCT---GAC-AT---ACT-G-----T----T-----AGCTC------------CCT---G-T-A-------------CA--T------C----T--C-----TA----A----G-A----GG---AAGGT---TG-TG-AT----T-A-----A---C----C------T-G--T-A---T-C--T---A--------TAGTGGG-GAAA------------A-AATCT---G--GA-------A--------------AA--TT-----------G---TT----TG----A-C-C---TACT--TTTAG-A-TATAAAGTAAGTCA-AGGTA-TA-CCA-AT--GCAGCTGAAA-T----------------ACT----T-----------T-GAG-AGGAAACTTGT--GTGACgtgtctgacatactgttagctccctgtacatctctaagaggaaggttgtgattaacctgtatctatagtggggaaaaaatctggaaaattgtttgacctacttttagatataaagtaagtcaaggtataccaatgcagctgaaatactttgagaggaaacttgtgtgactaaacagggcaacatctatatccgtaacaaaaa
gi|5 : acagtatatctggttgtgtttaaattttagggttgtgtctctaccagaataaagtctggaaaaccttgacctactttaagcctaaaagcaggtcattgtgcaccaatccagctcacatgaaaattgcatgattatgtcttcctctgaaGGAAAATTGT--TTGACCTACTT-----TTAGA-TATAA-AGTAAGTC-A---A-GGTA-TACCAATGCAGC-------T-GA-A------A--TA-C-----------------------------------------------------------TT---------T--GAGAGGA-A---ACTTGTGT-G--A--CTAA-A----C---A-------GGG------CAAC---ATC----TAT----ATCCGT------AACAAAAAtaaacagggcaacatctatatccgtaacaaaaa
gi|6 : acagtatatctggttgtgtttaaattttagggttgtgtctctaccagaataaagtctggaaaaccttgacctactttaagcctaaaagcaggtcattgtgcaccaatccagctcacatgaaaattgcatgattatgtcttcctctgaagaggttgtgttgtcagcgcaatatctgtatccgcaatgagaaaaagtccaggaaagtgtctgacatactgttagctccctgtacatctctaagaggaaggttgtgattaacctgtatctatagtggggaaaaaatctC-AAA-----GG---A-----GAATTC-ATGAAAAC-T-GTCT---GAC-CT---TCT-T-----T----T-----AG--C------------CTTAAAG-T-A-G----G--G---CA--T--GGGACTCCAA--T-----TA----A----G-C----TA---ACA-----AG-TGAAC----T-G-----A---T----T-----AT-G--T-A---T-TACT---C--------C----AT-GAGA------------A-AGATT---GTAAA----A-AA--------------AA--TG-GC--A--AT-G---CA----ATATAAA-T-CT-GTA
gi|6 : aagatcacaataaatctggttgagtagagtatggaacaaaacctggatcGAAAACTGT--CTGACCTTCTT-----TTAGC-CTTAA-AGTAGGGC-ATG---GG-A-CTCCAATTAAGCTAACAAGT-GA-ACTGATTA--TG-T------A---------T--------------T------A---C---T-----C------CA---------T--GA---GA-A---AGAT-TGTAA--A--AAAA-ATG-GC---A-------ATG------CAAT---ATAAATCTGT----ATCCAA------CATGAGAAACAT----CCT-GG-GAA----C---A--CT---ATT-TCAAGATGCAC-CA--TAACCCA-CGAATCAtccaacatgagaaacatcctgggaacactatttcaagatgcaccataacccacgaatcagaatacatctcggaggaagctgtgactgcatttcaggcaatatattatctaaacccatgatgcaaaaaatttaattgttacctgcagaagactaataggaaacccagcgtgttcttcag
gi|6 : aagatcacaataaatctggttgagtagagtatggaacaaaacctggatccaaaggagaattcat-----AT-A--C-A---T-C--T---C--------------G-GAGG------------A-AGC-T---GT-GA----C-TG--------------CA--TT-TC-----AG-G---CA----AT----A-gaatacatctcggaggaagctgtgactgcatttcaggcaatatattatctaaacccatgatgcaaaaaatttaattgttacctgcagaagactaataggaaacccagcgtgttcttcag
gi|7 : aagatcacaataaatctggttgagtagagtatggaacaaaacctggatccaaaggagaattcatgaaaactgtctgaccttcttttagccttaaagtagggcatgggactccaattaagctaacaagtgaactgattatgtattactccatgagaaagattgtaaaaaaaatggcaatgcaatataaatctgtatccaacatgagaaacatcctgggaacactatttcaagatgcaccataacccacgaatcagaAGGTC-ATG----GTG-AACCAAACCAGC-------T-GATAT-----A--TG-A------A---------C--------------TACG---T---A---T-----T------TC---------TCCGAA-AGA-G---ATGT-TGT-G--A--CGAA-A----C---A-----------------TGT---ATA----TGC----ATCCAT------GAGGAGAAAAAG----TCC-AG-AAAACTTT---G--CG---ACT-Ttattatctaaacccatgatgcaaaaaatttaattgttacctgcagaagactaataggaaacccagcgtgttcttcag
gi|7 : aacagaaaaacacaagagtgtctcaaatggtacattgtacatcccatcttacagtgagattcggccagtatctagcacGAAAGAGAT-GTTGTGACG--AAA---C--A-TG------TA-----T--A--T-G-----C---AT---CC------A----TGAG-GAG-----AA---A-----AAGTCC-A-GAAAAC-T-TTGC---GAC-TT---ACT-T-----T----T-----AG--C------------CTTAAAG-acttttagccttaaaggcaaaatctgtaatgaaaaaaaagtccagaaaactgatatacttttagcacgaacggatggaccgagtgcaccaattcagctgaaattgtattcccctgagagaaagcctgtgactaaattttagggcagtatatcc
gi|7 : aacagaaaaacacaagagtgtctcaaatggtacattgtacatcccatcttacagtgagattcggccagtatctagcacaggtcatggtgaaccaaaccagctgatatatgaactacgtatttctccG--C-AAAA-----T--C--T-G-----T---A------------A----TGA---AA-----AA---A-----AAGTCC-A-GAAAAC-T--------GAT-AT---ACT-T-----T----T-----AG--C------------ACGAACG-G-ATG----G--A---CC--G--AGTGC----A--C-----CA----ATTCAG-C----TG---AAA-----T-----------------------------------T-G--T-A---T-T--C---CCC------T----GA-GAGA------------A-AGCCT---GT-GA----C-TA--------------AA--TT-TT--A--GG-G---CA----GT----A-gcaaaatctgtaatgaaaaaaaagtccagaaaactgatatacttttagcacgaacggatggaccgagtgcaccaattcagctgaaattgtattcccctgagagaaagcctgtgactaaattttagggcagtatatcc
gi|8 : aacagaaaaacacaagagtgtctcaaatggtacattgtacatcccatcttacagtgagattcggccagtatctagcacaggtcatggtgaaccaaaccagctgatatatgaactacgtatttctccgaaagagatgttgtgacgaaacatgtatatgcatccatgaggagaaaaagtccagaaaactttgcgacttacttttagccttaaag-----T----T-----CG--C------------CTTAGAG-T-A-T----G--T---CT--T--GGTGC----A--T-----CA----A----T-C----C-----------------AGC----T-G-----A---T----A-----AA-G--T-A---T-T--T---C--------TCT--GA-GAGGGAAGCTGTGACAA-AGTCT---GT-AT----C-CATGCATGATGAGAGAAA--GT-TC--A--GG-AAAATATT--AT----A-C-CT-AT-TT--TTCAGCCCTA--AAGTAGGTCATG-GTG-CA-CCC-AT--GCAGCTGAAA-TG--CAA---ACCG--AACTTCAATGTAT--TCCTTA-GAG-ATGATGCTTG----TGACTAAATT-----TCAGtatcc
gi|8 : gaacaagagtacaaccaaaggtaccaaaatacactattaaacagtgaatttcaacccgtcagcacattatgcattaGAGAGGGAA-GCTGTGACA--AAGT-------------------------C--T-G-----T---AT---CCAT-GC-A----TGAT-GAG-----AG---A-----AAGTTC-A-GGAAAA-T-ATTA---TAC-CT---ATT-T-----T----TC----AG--C------------CCTAAAG-T-A-G----G--T---CA--T--GGTGC----AC-C-----CATGC-A----G-C----TG---AAA-----TG-CAAAC----C-G-----AACTT----CA----AT-G--T-A---T-T--C---C--------TTA--GA-GATG------------A-TGCTT---GT-GA----C-TA--------------AA--TT-TC--A--GG-G---CA----AT----ggcaat
gi|9 : gaacaagagtacaaccaaaggtaccaaaatacactattaaacagtgaatttcaacccgtcagcacattatgcattattcgccttagagtatgtcttggtgcatcaatccagctgataaagtatttctctGACCTACTT-----ATAGC-CCTAA-AGTAGGTC-ACA----GTG-CACAAATCCAGC-------T-GA-A------A----------------------C--------------T------TGTGC---C-----T------TT---------T--GAG-GGA-GCTCACCT-TGT-A-------AA-ATC-TC---A-------ATG------CTGA---ACA----TGC----ATCCAT------TATGTAAAAAAG----TAA-GG-AAA---ACAATA--TG---ACCTTC---ATGGAC------AAACA-------------CACAGATGGATG--GACAGAGTCACAACATAAT--TA---AT----A---CATCCC--CTCTGACGATAGG-AGTA
Alignments
lowQualScore : 11111111 33333333333333333 33333333333333333333 111111111111111111111111111 111 11111111111 1111111111111111111111 11111111111 111111 66666666666666666666666666666666666666666666 111111111 11111 333333 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999 1111111 2222222222222222 1111 1111111 111111 2222222222222222 11 11 111
lowQualScore : 2 666 1 444 22 00000000 22 1 44444 5555555555 55 1 55555 222 444 33333333333333333 33333 222 888888888888 44 0 1 1 44 222 11 222 1 33333 3333 99999 33 777777777777 1 1 1 3333 22 222 22 33 33 66666666666666666666 1 3333 222 66666 555 1 888888888888888888888888888 3 22 1 000 1 66 444 77777777777 3 11 55 333 5555555555555555555555 1 44444 3 3333 1 66666 1 22 22 4444 666666 88888888888 2 2 666666 55555555555555555555555555555555555555555555 4 666 4 777777777 66 88888 66 11 4 4 33 0 444 3 3 555555 2 8888888 2 2 999999 66 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555 33 2 55555 22 2 2 0000000 2 1 3333333333333333 1 555 2 1111 6666 1 1 444 2 7777 3 3 1 9999999 3 4 666 0 888888 8 7777777777777777 1 11 8 44 11 0 5 0 444 6 8 8 1 8
lowQualScore : . ... . ... .. ........ .. . ..... .......... .. . ..... ... ... ................. ..... ... ............ .. . . . .. ... .. ... . ..... .... ..... .. ............ . . . .... .. ... .. .. .. .................... . .... ... ..... ... . ........................... . .. . ... . .. ... ........... . .. .. ... ...................... . ..... . .... . ..... . .. .. .... ...... ........... . . ...... ............................................ . ... . ......... .. ..... .. .. . . .. . ... . . ...... . ....... . . ...... .. ........................................................ .. . ..... .. . . ....... . . ................ . ... . .... .... . . ... . .... . . . ....... . . ... . ...... . ................ . .. . .. .. . . . ... . . . . .
lowQualScore : 0 999 6 555 22 22222222 22 6 00000 6666666666 22 5 44444 777 222 66666666666666666 88888 666 111111111111 88 1 5 5 77 888 88 777 4 44444 1111 88888 55 666666666666 4 4 5 1111 00 777 11 77 77 44444444444444444444 6 4444 777 22222 666 6 666666666666666666666666666 1 11 5 666 5 33 888 33333333333 2 99 55 000 4444444444444444444444 7 33333 3 7777 7 44444 8 55 55 5555 111111 33333333333 9 9 111111 00000000000000000000000000000000000000000000 4 222 4 000000000 11 22222 11 77 4 4 99 5 444 3 1 777777 5 1111111 5 5 777777 99 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666 99 9 44444 99 9 9 2222222 9 5 4444444444444444 1 000 9 1111 5555 2 7 333 0 1111 1 1 0 4444444 6 0 666 4 999999 8 7777777777777777 0 00 0 66 44 8 6 8 000 4 0 0 0 0
consensus : GAGAGGGAG-GTTGTGACN--AAA-T-T-TC--AGT-------G--C-AA-----TA-----T----C--T-G-----T---AT---CCGT-G--A----TGAC-GAA-----AA---A-----A------AGTCC-GGGAA-AC-T-ATTT---GAC-CT---ACT-T-----T----T-----AG--C------------CCTAAAG-T-A-G----G--T---CA--T--GGTGCA--C----C----A----A-----G-C----TG---AAA-----TG-CGAA-C----T-G-----A---T----C-----AT-G--T-A---T-T--T---C--------T--GA-GAGGA-AGGTT---G----------------------T-GA-----CNA----A-AT-----T-TC--A--GGGCA----AT------A-----------C-CT-GTA--TC--TTTAGCA-TAT-AA-GCAGATCG-A-----GTG-CG--------------CCA-AT--CCAGCTGAAA-TG--CGA---ACTG--AACT----TGTAT--TCCTCC-GAG-AGGAAACTTGT--TTGACCTACTTTTAGC-CCTAA-AGTAGGTC-ACG-A-GGTG-CACCAATCCAGC-------T-GA-A------A--TG-C------A---------C--------------T------T---C---TT------TTT--GAG-GGA-G---ANAT-TGT-G--A--CCAA-ATTTCA-------ACG------CTGT---A-CA----TGC----ATCCGTTACG-GAAAAAAG----TCC-GG-AAAAC---A--CG-ACC-TC-AGACGGACTCA-CTAACCAAGCGAGTTA-GCNC--AGCTGGACGNA--CAGA-CAACGCCATAACAAAAGACATATG---CACGTCCCGT-CT-GANGACGGG-CGTATAAAA
Reference ( family-1432 ) : GAGAGGGAG-GTTGTGACN--AAA-T-T-TC--AGT-------G--C-AA-----TA-----T----C--T-G-----T---AT---CCGT-G--A----TGAC-GAA-----AA---A-----A------AGTCC-GGGAA-AC-T-ATTT---GAC-CT---ACT-T-----T----T-----AG--C------------CCTAAAG-T-A-G----G--T---CA--T--GGTGCA--C----C----A----A-----G-C----TG---AAA-----TG-CGAA-C----T-G-----A---T----C-----AT-G--T-A---T-T--T---C--------T--GA-GAGGA-AGGTT---G----------------------T-GA-----CNA----A-AT-----T-TC--A--GGGCA----AT------A-----------C-CT-GTA--CT--TTTAGCA-TAT-AA-GCAGATCG-A-----GTG-CG--------------CCA-AT--CCAGCTGAAA-TG--CGA---ACTG--AACT----TGTAT--TCCTCC-GAG-AGGAAACTTGT--TTGACCTACTTTTAGC-CCTAA-AGTAGGTC-ACG-ACGGTG-CACCAATCCAGC-------T-GA-A------A--TG-C------A---------C--------------T------T---C---TT------TTT--GAG-GGA-G---ANAT-TGT-G--A--CCAA-ATTTCA-------ACG------CTGT---A-CA----TGC----ATCCGTTACG-GAAAAAAG----TCC-GG-AAANC---A--CG-ACC-TC-AGACGGACTCA-CTAACCAAGCGAGTTA-GCCC--AGCTGGACGNA--CAGA-CAACGCCATAACAAAAGACATATG---CACGTCCCGT-CT-GANGACGGG-CGTATAAAA
gi|1 : ----T-G-----C---T----T-----AT-G--T-A---T-T--TGCTC--------T--GAAGAAGG-AGGTT---G----------------------T-GA-----C-A----A-AT-----G-TC--AGTGGGTA----AC------A-----------T-CTCGTA--
gi|1 : caatgctatctaaccacgtgtcaactcgctagcaAGAAGGAG-GTTGTGAC---AAA-T-G-TC--AGT-------GGGT-AA-----CA-----T----C--TCG-----T---ATA--CTGT-G--A----GGAC-AAA-----CA---ACTTACA------AGTCC-AAGAA-AC---ATT----GAC--T---ACC-T-----T----TTCC--CG--C------------CCTGAAG-TTA-G----GATT---TA--T--TGTGC---C----T----A----A-----G-C----TGCTAAAA-----TGATGAT-C----T-G-----A---T----C-----ATTG--TTA---TGT--T---C--------T--GA-GAAGACAGGTTCTAA----------------------T-GAAGCCCCAA----AGAT-----C-TCCAA--AGGTATTTCAG------A-----------C-CT-GTA--TCGGTTTAGTA-TAT-TATGCAGATTG-A-----GTG-TGG-------------CCATATTACCAGCTGAAA-TA--TGA---TCTG--ACTT----TGTAA--TTCTCC-AAG-AGGAACCTTGT--TTGACGTATTGTTAGCTTCTAA-AGTAGCCC-ACGTACGG-G-C-CCAATTTTGC-------TCGA-A------A--TG-C------AG--------C--------------TC-----T---C---TTA-----TTT--GAG-GGGCG---ACAT-TGT-GGTG--CCAACCTTTCA-------A-A------ATGT---A-CACAT-TGC----ATCCTTTATG-G-AAAAGG----TCC-AGCAGATC---ACCCG-ACC-tactgtgaggacaaacaacttacaagtccaagaaacattgactaccttttcccgccctgaagttaggatttattgtgcctaagctgctaaaatgatgatctgatcattgttatgttctgagaagacaggttctaatgaagccccaaagatctccaaaggtatttcagacctgtatcggtttagtatattatgcagattgagtgtggccatattaccagctgaaatatgatctgactttgtaattctccaagaggaaccttgtttgacgtattgttagcttctaaagtagcccacgtacgggcccaattttgctcgaaatgcagctctcttatttgaggggcgacattgtggtgccaacctttcaaaatgtacacattgcatcctttatggaaaaggtccagcagatcacccgaccgactagcttaatgcaggattccattcccccgagaacccagacctcaagtcactaaccaagcgagttacgctctcagctgacgtaaacagaacaacaccaaacaaaagacatatgcatgtcccctgctggatgatgggccatataaaaatgtatactttatttc
gi|1 : caatgctatctaaccacgtgtcaactcgctagcatgcttatgtatttgctctgaCC-GA-GAACC---C--AG-ACC-TC-A-----AGTCA-CTAACCAAGCGAGTTACGCTCTCAGCTG-ACGTAAACAGAACAACACCA-AACAAAAGACATATG---CATGTCCCCTGCTGGATGATGGGCCATATAAAAgactagcttaatgcaggattccattcccccgagaacccagacctcaagtcactaaccaagcgagttacgctctcagctgacgtaaacagaacaacaccaaacaaaagacatatgcatgtcccctgctggatgatgggccatataaaaatgtatactttatttc
gi|10 : caatgctatctaaccacgtgtcaactcgctagcatgcttatgtatttgctctgaagaaggaggttgtgacaaatgtcagtgggtaacatctcgtatactgtgaggacaaacaacttacaagtccaagaaacattgactaccttttcccgccctgaagttaggatttattgtgcctaagctgctaaaatgatgatctgatcattgttatgttctgagaagacaggttctaatgaagccccaaagatctccaaaggtatttcagacctgtatcggtttagtatattatgcagattgagtgtggccatattaccagctgaaatatgatctgactttgtaattctccaagaggaaccttgtttgacgtattgttagcttctaaagtagcccacgtacgggcccaattttgctcgaaatgcagctctcttatttgaggggcgacattgtggtgccaacctttcaaaatgtacacattgcatcctttatggaaaaggtccagcagatcacccgaccgactagcttaatgcaggattccattccc---A-----A------AATCG-GCGAA-AC-T-GTTT---GAC-CT---ACT-T-----T----T-----GGG-C------------CCTAAAG-T-A-G----G--T---CA--T--GGTGTA--C----C----atgtatactttatttc
gi|10 : aaatgtggggttatacctgtaccacaacatctTTGTGACT--ACA-T-T-TC--AGG-------G--C-AA-----CA-----C----C--T-------T---AT---CGGT-A--A----T--T-GAA-----AA---A-------------GTCT-GGGAA-AC-T-GTTT---GAC-CT---ACT-T-----T----C-----AG--CCCTGAATTTCTGCCTAAAT-T-A-G----G--T---CA--T--TATGCA--C----C---------T-----G-C----TG---Attgtgactacatttcagggcaacaccttatcggtaattgaaaaagtctgggaaactgtttgacctactttcagccctgaatttctgcctaaattaggtcattatgcacctgctgactcactc
gi|11 : aaatgtggggttatacctgtaccacaacatctaaaatcggcgaaactgtttgacctacttttgggccctaaagtaggtcatggtgtaccAG-GTTGTGACT--ACA-T-T-GG--AGA-------A--C-AA-----TG-----C----C--T-G-----T---AT---CC------A----TAAC-CAATAGTTAA---A-----A------AAT----GGAA-ACCT-GTTT---GAC-CT---ACT-T-----T----T-----AG--T------------CTTGAAG-T-A-G----G--T---CA--C--GGTGCA--CAATTC----C----A-----G-C----TG---AAG-----TA-CAAA-C----T-GTTCTTA---TA---C-----AT-G--T-C---T-T--C---CTT------T--CA-GAGGA-TATTT---G----------------------T-GA-----CTA----A-AT-----T-TC--T--GAACT----AT------A-----------T-CT-GTA--TC--TGTAACctcactc
gi|11 : aAGAGGATA-TTTGTGACT--AAA-T-T-TC--TGA-------A--C-TA-----TA-----T----C--T-G-----T---AT---CTG----------TAAC-GAA-----AA---A-----A------TATCC-gaaaaaatatcc
gi|12 : aaggttgtgactacattggagaacaatgcctgtatccataaccaatagttaaaaaatggaaacctgtttgacctacttttagtcttgaagtaggtcacggtgcacaattccagctgaagtacaaactgttcttatacatgtcttcctttc-GCA--CT--TTTACCA-TG-----GCA----------------CA--------------CTA-AT--CCAGCTGGCG-TG--TGA---ACAG--ATTA----TGTATAATTCCCC-GAGTGGGAGAGTTAT--
gi|12 : gcaagattttgaacatgagtaccacaaagactacatcctatgcccgccggacagtgacaattcatcctgcataaGAGTGGGAGAGTTATGATA--AAA-T-G-TT--GGT-------G--C-AA-----TA-----T----C--T-G-----TATAAT---CCAT-G--A----T-AT-GAG-----AA---A-----A------AGTTC-AGGAA-AC-T-Agataaaatgttggtgcaatatctgtataatccatgatatgagaaaaagttcaggaaacta
gi|13 : gcaagattttgaacatgagtaccacaaagactacatcctatgcccgccggacagtgacaattcatcctgcataagcacttttaccatggcacactaatccagctggcgtgtgaacagattatgtataattccccG---GAA-----TGGTAAA-C----T-G-----G---T----T-----AT-ACAT-A---T-C--T---C--------C--GC-GAGGA-AGGTT---C----------------------A-GA-----CAA----A-AT-----T-TC--A--GTGCA----AT------A-----------
gi|13 : GAGGAAG-GTTCAGACA--AAA-T-T-TC--AGT-------G--C-AA-----TA-----T----TATT-GA----T---AT---CCAT---------TAAC-GAA-----AA---A-------------GCCA-AGGAA-AC-T-CTTC---GAC-TT---ATT-T-----T----T-----AG--C------------CC---AA-T-A-G----G--ttattgatatccattaacgaaaaagccaaggaaactcttcgacttatttttagcccaatagggggcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngttaaggtaaaaccttgcgattatattttatg
gi|14 : ggaatggtaaactggttatacatatctccgcTG--TACC----TATAT--CCA--C-AAC-AGAAAACT-AT--TTGATCTACTTTTAGC-CATAA-AGTAGGTC-----ATGGTG-CAACAATCCAGC-------T-GA-C------A--TG-gggcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngttaaggtaaaaccttgcgattatattttatg
gi|14 : tgtgagtcttaatgaaaatctccaaactggctgatggtaataaaatcaaatatggtatatctgatcacgagtaagcatgaaaccaaatacaC-AGAAA-AC-T-ATTT---GAT-CT---ACT-T-----T----T-----AG--C------------CATAAAG-T-A-G----G--T---CA--T--GGTGCA--A----C----AATCCA-----G-C----TG---ACA-----TG-TGAA-C----T-G-----A---T----T-----AT-G--T-AAT-T-C--T---C--------T--GA-GAtgaactgattatgtaattctctgaga
gi|15 : tgtgagtcttaatgaaaatctccaaactggctgatggtaataaaatcaaatatggtatatctgatcacgagtaagcatgaaaccaaatacatgtacctatatccacaaTTGTGACT--TGA-T-G-TC--AAG-------G--T-AA-----TG-----T----C--T-G-----T---AT---GC------A----TAACTGAA-----AA---A-----A------AGTTC-GGAAA-AC-T-GTTT---GTC-CT---ACC-T-----T----T-----AG--C------------CCTAAAG-T-A-G----G--T---GAACT--GATGCA--C----C----GATCCA-----G-T----GG---AAA-----TG-CTAA-C----TCG-----C---T----CTCCAGATAA--C-A---C-T--T---CT-------T--GA-GGGAG-ATATT---G----------------------T-GA-----CCA----A-AT-----T-TA--A--AGG
gi|16 : gcCT-T-----T----T-----AG--C------------TTTCAAG-T-A-G----G--G---CA--T--GATGCA--C----C----A----ATGTAGG-C----TG---ACACTTCTCG-TGAA-C----------------T----C-----AC-G--T-AT--T-T--T---C--------T--TA-GAGG--AGGTT---G----------------------T-AA-----TAT----A-ATG----T-CC--A--GTGCA----AT------AT----------C-TT-GTA--t
gi|16 : AGAGG-AG-GTTGTAATA--TAA-TGT-CC--AGT-------G--C-AA-----TA-----T----CT-T-G-----T---ATATATCAT-G--A----TGAC-G-------AA---A-----A------AGTCCAAGAAA-AC-T-ATTTTGAAAC-CT---ACT-T-----tatatcatgatgacgaaaaagtccaagaaaactattttgaaacctacttaagctgtaacaa
gi|17 : cttttagctttcaagtagggcatgatgcaccaatgtaggctgacacttctcgtgaactcacgtattttctt-GTGGTGACA--AAA-T-T-TC--AGT-------G--C-AA-----TAG----T----C----------T---AT---CC-----------------AA-----AA-----------------------GAAA-AC-TAACTT---GAC-CT---ATT-C-----T----TTAGTCAG--C------------CCTATAG-T-A-G----G--T---CA--CA-GATGCA--CTAATT----A----A-----GCC----TG---AAA-----TG-CAAA-C----T-G-----A--------------AT-A--T-A---T-T--T---C--------T--Gaagctgtaacaa
gi|18 : T-T-----T----T-----AG--C------------TTTCAAG-T-A-G----G--G---CA--T--GATGCA--C----C----A----ATGTA-G-C----TG---ACA-----CG-TGAA-C----T----------------C-----AC-G--T-A---T-T--TTT-C--------T--GA-GAGGG-AGGTT---G----------------------T-GA-----TAT----A-AT-----G-TC--A--GTGCA----AT------A-----------T-CT-GTA--tcgtgacccacatttgaatctattctg
gi|18 : TTTTAGC-TTTCA-AGTAGGGC-ATG-A---TG-CACCAATGTAGC-------T-GA-C------ACGTG-A------A---------C--------------TCACGTAT---T---TT------TCT--GAG-AGG-G---AGGT-TGT-G--A--TATA-ATGTCA-------GTGCAATATCTGT---A-TA----T------ATCTATGATG-AGAAAAAG----TCCAAG-AAACT---ATTTG-ACC-Ttatatctatgatgagaaaaagtccaagaaactatttgacctacttaagct
gi|18 : GAGAGGGAG-GTTGTGATA--TAA-T-G-TC--AGT-------G--C-AA-----TA-----T----C--T-G-----T---AT---ATATCT--A----TGAT-GAG-----AA---A-----A------AGTCC-AAGAA-AC-T-ATTT---GAC-CT---ACT-T-----acttaagct
gi|19 : ttttagctttcaagtagggcatgatgcaccaatgtagctgacacgtgaactcacgtatttttctG-GTTGTTAC-----A-T-TGTC---GT-------G--CTAC-----TA-----T----T--A-C-----T---AT---C-AT-G--A----TGAC-TAA-----AA-----------------GTCC-AAGCA-AT-T-ATGT---GGC-TT---ACTCT-----T----T-----AG--C------------CCTAAAG---A-G----A--T---TA--TACGATGCAAGT----T----A----A-----T-C----TG---AAA-----CG-TAAA------T-A-----A---T----T-----A--G--T-A---T-C--C---C--------T--GA-GAGGG-ATGTT---G----------------------TCGA-----CTC----A-Aaagct
gi|2 : AAAA-T-A-G----A--T---CA--T--GGTATA--C----C----A----ATATT-G-C----TG---AAA-----TG-TGAA-C----T-G-----A---TGATGC-----AT-G--T-ATT-T-T--T---C--------T--AA-GA-------------------------------------GA-----CAA----A-TT-----T-TC--A--GTGTA----AT------A-----------
gi|2 : GACA--AAT-T-T-TC--AGT-------G--T-AA-----TA-----TAT--C--T-------T---GT---CC------A----AGAC-AAG-----GA---A-----A------AATAT-AGAAA-AC-C-ACCT---T-C-TT---ACT-TAAGAAT----T-----AG--C------------CCCATAA-T-A-G----G--T---AA--T--A-CGAA--T----T----A----A-----G-C----TA---AAA-----TG-CAAA-A----T-G-----AA--T----C------T-G--C-A---T-T--T---CCATAGCTGT--GA-GAGGA-ATGCT---G----------------------T-GA-----CTA----C-AT-----T-TC--A--AAGTG----AT------A-----------C-AT-GTG--TC--CATAACC-AAT-AA--CAAAAAA-A-----ATA-TGGAAAACTGTTTTACCTA-CT--GTAGCTGAAA-TA--CAA---ACTG--AAC------GTAT--TCCTTC-TAG-TGAAAGCTTGT--tatcttgtccaagacaaggaaaaatatagaaaaccaccttcttacttaagaattagccccataataggtaatacgaattaagctaaaatgcaaaatgaatctgcatttccatagctgtgagaggaatgctgtgactacatttcaaagtgatacatgtgtccataaccaataacaaaaaaaatatggaaaactgttttacctactgtagctgaaatacaaactgaacgtattccttctagtgaaagcttgtgactaagtctgtattcatagcaaaaaaaaaaaaaatcccgaaagtgtttaacttgaagtagctagaccatggtgcatcaattaagctgaaatgcaaactctctacttacgtttttgaggaagaaattgagactaaatctcaatatatgcatccgttacagaaaaaaaaatatctggaaaacgtatatctcagacggactca
gi|2 : aaaatagatcatggtataccaatattgctgaaatgtgaactgatgatgcatgtatttttctaagaGAGAGGAAT-GCTGTGACT--ACA-T-T-TC--AAA-------G--T-GA-----TA-----C----A--T-G-----T---GT---CCAT-A--ACCAATAAC--AA-----AA---A-----A------AATAT-GGAAA-AC-T-GTTT---TAC-CT---ACT-----------------------------------------G-T-A-G-------------------------------------------------C----TG---AAA-----TA-CAAA-C----T-G-----A--------------AC-G--T-A---T-T--C---C--------TTCTA-GTGAA-AGCTT---G----------------------T-GA-----CTA----A-GTCTGTAT-TC--A--TAGCA----AA------AAAAAAAAAAATC-CC-GAAAGTG--TTTAACT-TG--AA-GTAGCTAG-ACCATGGTG-CA--------------TCA-AT--TAAGCTGAAA-TG--CAA---ACTgactaagtctgtattcatagcaaaaaaaaaaaaaatcccgaaagtgtttaacttgaagtagctagaccatggtgcatcaattaagctgaaatgcaaactctctacttacgtttttgaggaagaaattgagactaaatctcaatatatgcatccgttacagaaaaaaaaatatctggaaaacgtatatctcagacggactca
gi|2 : aaaatagatcatggtataccaatattgctgaaatgtgaactgatgatgcatgtatttttctaagagacaaattttcagtgtaatatatcttgtccaagacaaggaaaaatatagaaaaccaccttcttacttaagaattagccccataataggtaatacgaattaagctaaaatgcaaaatgaatctgcatttccatagctgt-----T----C--T-G-----T---AT---TCAT-AGCA----AAAA-AAA-----AA---A-----A------AATCC-CG-AA-AG-T-GTTT---AAC----------T-----TGAAGT-----AG--C--------------------T-A-G----A--C---CA--T--GGTGCA--T----C----A----ATTAA-G-C----TG---AAA-----TG-CAAA-C----T-C-----T---C----T-----AC-T--T-ACG-T-T--T---T--------T--GAGGAAGA-A-ATT---G----------------------A-GA-----CTA----A-AT-----C-TC--A--ctctacttacgtttttgaggaagaaattgagactaaatctcaatatatgcatccgttacagaaaaaaaaatatctggaaaacgtatatctcagacggactca
gi|2 : aaaatagatcatggtataccaatattgctgaaatgtgaactgatgatgcatgtatttttctaagagacaaattttcagtgtaatatatcttgtccaagacaaggaaaaatatagaaaaccaccttcttacttaagaattagccccataataggtaatacgaattaagctaaaatgcaaaatgaatctgcatttccatagctgtgagaggaatgctgtgactacatttcaaagtgatacatgtgtccataaccaataacaaaaaaaatatggaaaactgttttacctactgtagctgaaatacaaactgaacgtattccttctagtgaaagcttgtgactaagTTTAAC-T-TGA-AGTAGCTAGACC-ATGGTG-CATCAATTAAGC-------T-GA-A------A--TG-C------AAACTCTCTAC--------------T------TA--CG--TT------TTT--GAG-GAA-G---AAAT-TGA-G--A--CTAA-ATCTCA-------A-----------T---A-TA----TGC----ATCCGTTACA-GAAAAAAAAATATCT-GG-AAAAC---G--TATATC-TC-AGACGGACTCA-atatatgcatccgttacagaaaaaaaaatatctggaaaacgtatatctcagacggactca
gi|20 : aaaatagatcatggtataccaatattgctgaaatgtgaactgatgatgcatgtatttttctaagagacaaattttcagtgtaatatatcttgtccaagacaaggaaaaatatagaaaaccaccttcttacttaagaattagccccataataggtaatacgaattaagctaaaatgcaaaatgaatctgcatttccatagctgtgagaggaatgctgtgactacatttcaaagtgatacatgtgtccataaccaataacaaaaaaaatatggaaaactgttttacctactgtagctgaaatacaaactgaacgtattccttctagtgaaagcttgtgactaagtctgtattcatagcaaaaaaaaaaaaaatcccgaaagtgGAAAACTC-T--CTGACCTACTTTGAGC-ACGGATAGT-------------GTG-CACTAATCTAGC-------T-GA-A------A--TG-C------AAAGTC----C--------------C------T---C---TTACTATTTTC--GAG-AGA-A---AAAT-TGT-G--A--CCAA-ATTTTA-------ACA------CTGT---A-CA----TGCATCGATCTGTTATG-GGAAAAAG----TCA-GG-AAAAC---A--TG-
gi|21 : ---ACT-A-----T----A-----AG--T------------CTTAGAG-T-A-GCTAGG--T---TA--C--AGAACA--C----CGATTA----A-----G-C----TG---AAA-----TG-TAGA-C----T-GA----A---T----C------T-G--T-A---T-C--T---C------------------------T---C----------------------T-GG-----CTA----C-AT-----T-TC--A--GGATA----AT------A-----------C-CT-GTA--
gi|21 : aaaaacgtccccaaTGGCT--ACA-T-T-TC--AGG-------A--T-AA-----TA-----C----C--T-G-----T---AT---CCGT-C--A-----GAA-AAA-----AA---A-----ACAATTTAATCC-GAAAA-AC-tccgtcagaaaaaaaaacaatttaatccgaaaaacg
gi|22 : aaaaacgtccccaaactataagtcttagagtagctaggttacagaacaccgattaagctgaaatgtagactgaatctgtatctctcGGTGTCACCAATCCAGC-------T-GG-A------T--TGCC------A---------CACACTGAACTTGTAT------T---C---CT------TTG--GAG-AAG-A---AAAT-TGT-G--ATTTTAC-ATTTCCT------AGG------CAAT---ATCC----TGT----ATACATAAT---AAAGAAG----TCA-GG-AAAg
gi|22 : -----GTGTCA--------------CCA-AT--CCAGCTGGAT-TG--CCACACACTG--AACT----TGTAT--TCCTTTGGAG-AAGAAAATTGT--aattttgacactattttttaagccctaaagt
gi|22 : gGAGAAGAAA-ATTGTGATTTTACA-T-T-TCCTAG--------G--C-AA-----TA-----T----CC-T-G-----T---AT---ACAT-A--A----T------A-----AA---G-----A------AGTCA-GGAAA-AA-T--TTT---GACACT---ATT-T-----T----TTA---AG--C------------CCTAAAG-T-gattttacatttcctaggcaatatcctgtatacataataaagaagtcaggaaaaattttgacactattttttaagccctaaagt
gi|23 : ggtgtcaccaatccagctggattgccacacactgaacttgtattcctttg-ACGGTT-CACCAATCCAGC-------T-GA-A------ACATA-A------A---------C--------------TCAC---T---C---TTACGAT-TCT--GAG-GGA-C---AAAT-TGT-G--A--TCAA-A-TTCA-------ACG------CT------------------------GTTACG-GAAAATAG----TCC-GG-AAAAC---A--AG-GTT-TC-AGACAGAC
gi|24 : gtc--TTGATCTATTTTTAGC-CCTTA-AGTAGGTC-AT--ACAATG-CACCAGTCCAGA-------T-GA-A------A--TG-CAA----A---------A--------------T------T---C------------TT--GGG-GGA-G---AT------------------ATTTTA-------ATG------CTAT---A-CA----Ta
gi|25 : ctagaaaaataGCTGGCCAGA--CCGA-CAACGCCAT-----AAGAT-TATA---CAC--TCTGT-CT-AAAGACGGG-CATATAAAA
gi|26 : tAGG-CCTAA-AGTAGATT-ACT----GTG--ACTAATCCAGC-------T-GA-C------A--TG-atgacacagtcagccaaaaaatgaaa
gi|27 : gtgttccatatcaataaataaagtccggatgctaGCCGGACGCA--CGGA-CAACGCCATAAC---ATACATATGTAATACATCCCGC-CT-GAAGACGCG-CGTATGAAAacaatt
gi|28 : TAAAA-C-A-A----G--T---CA--T--GGTGCA--C----CAATTA----A-----G-C----TG---ACA-----TA-TGAG-C----------------T----T-----AT-G--T-A---T-TTCT---C--------T--AA-GAGG
gi|3 : tGAGAAGGAG-GTTGTGACA--AAA-T-G-TC--AGT-------G--T-AA-----CA-----T----C--T-G-----T---AT---CTGT-G--A----GGAC-AAA-----AACTTAC----A------AGTCC-AAGAA-AC-T-ATTT---GAC-TA---ACT-T-----T----T-----AG--C------------CCTGAAG-T-A-G----A--T---CA--T--GGTGCA--T---------A----A-----G-C----TG---AAA-----TG-TGAT-C----T-G-----A---T----C-----AT-G--T-A---T-T--T---C--------T--GA-GAAGA-AGGTT---G----------------------T-GA-----CCA----A-AT-----C-TC--A--AGGTA----TT------A-----------C-CT-GTA--CT--TTTAGTA-TAT-AG-GCAGATTG-A-----GTG-TG--------------CCA-AT--CCAGCTGAAA-TA--TGA---TCTG--AACT----TGTAT--TCCTCC-AAG-AGGAACCTTGT--TTGACGTATGTTTAGC-TCTAA-AGTAGCCC-ACGTACGGTG-CACCAATTCTGC-------T-GA-A------A--TG-C------A---------C--------------T------T---C---TT------TTT--GAG-GGC-G---ACAT-TGT-G--G--CCAA-ATTTCA-------ACA------ATGT---A-CA----TGC----ATCCTTTATG-GAAAAAGG----TCC-AG-CAATC---A--CG-ACC-TC-AGACAGACTCAGCCAA-CAAGCCAGTTA-G-CC--AGCTGGACGTA--CAGA-CAACACCATAACAAAAGACATATG---CATGTCCTGT-CT-GATGATGGG-CATATAAAA
gi|4 : AAACT-GT--TTGAC-TACTTTTAGC-TCTAA-TGTAGGTC-ACA----GTG-CATCAACCCCGC-------T-GA-A------A--TG-C------AATCCCACT-C--------------T------TGCGC---TT------ATT--GAG-GGA-G---AAAT-TGT-G--A--CCAA-ATTTCA-------ATG------CTAT---A-CA----TGC----ATCCATCACA-G--AAAAG----TCT-TA-AAAAC---A--TG-ACC-TT-GGATGGAC
gi|4 : ccacaGAGGGAGAA-ATTGTGACC--AAA-T-T-TC--AAT-------G--C-TA-----TA-----C----A--T-G-----C---AT---CC------A----TCAC---A-----GA---A-----A------AGTCT-TAAAA-AC---AT-----GAC-CTTGGA--------------T-----GG--A------------CATATAGAT-G-G----A--TGGATA--T--ATTGCG--C----C----A----ATCCA-G-C----CG---AAA-----TG-CAAA-A----T-G-----A---T----T-----TT-G--T-A---T-T--C---C--------TCCGA-GATGA-AGCTT---T----------------------C-GC-----CTA----A-AT-----T-TC--A--GGGCA----AT------A-----------CACT-GTatatagatggatggatatattgcgccaatccagccgaaatgcaaaatgattttgtattcctccgagatgaagctttcgcctaaatttcagggcaatacactgtctgacaggtatatgtattgaaaaaagctggaaaactatttgtcctactttccgccttaaagtgggtcatggtgcaccaatccccttgaaatgaaaactcattcttacgcttcctgagggagaaattgtgattaaattttaaggttcttttactataaa
gi|4 : ccacaaaactgtttgactacttttagctctaatgtaggtcacagtgcatcaaccccgctgaaatgcaatcccactcttgcgcttattTG-CGCCAATCCAGC-------C-GA-A------A--TG-CAAAATGA---------T--------------T------T---TGTATTCC----TCC--GAG-ATG-A---AGCT-TTC-G--C--CTAA-ATTTCAGGGCAATACA------CTGTCTGA-CA----GGT----ATATG-TATT-GAAAAAAG-----CT-GG-AAAAC---ctgacaggtatatgtattgaaaaaagctggaaaactatttgtcctactttccgccttaaagtgggtcatggtgcaccaatccccttgaaatgaaaactcattcttacgcttcctgagggagaaattgtgattaaattttaaggttcttttactataaa
gi|4 : ccacaaaactgtttgactacttttagctctaatgtaggtcacagtgcatcaaccccgctgaaatgcaatcccactcttgcgcttattgagggagaaattgtgaccaaatttcaatgctatacatgcatccatcacagaaaagtcttaaaaacatgaccttggatggacatatagatggatggatatatGAGATGAAG-CTTTCGCCT--AAA-T-T-TC--AGG-------G--C-AA-----TACACTGT----C--T-GACAGGT---AT---ATGT-A--T----TGA----------AA---A-----A------AG-CT-GGAAA-AC-T-ATTT---GTC-CT---ACT-T-----T----C-----CG--C------------CTTAAAG-T-G-G----G--T---CA--T--GGTGCA--C----C----A----A-----T-CCCCTTG---AAA-----TG-AAAA-C----T-C-----A---T----T-----CT----T-ACGCT-T--C---C--------T--GA-GGGAG-AAATT---G----------------------T-GA-----TTA----A-AT-----T-TT--A--AGGtatttgtcctactttccgccttaaagtgggtcatggtgcaccaatccccttgaaatgaaaactcattcttacgcttcctgagggagaaattgtgattaaattttaaggttcttttactataaa
gi|5 : ccacaaaactgtttgactacttttagctctaatgtaggtcacagtgcatcaaccccgctgaaatgcaatcccactcttgcgcttattgagggagaaattgtgaccaaatttcaatgctatacatgcatccatcacagaaaagtcttaaaaacatgaccttggatggacatatagatggatggatatattgcgccaatccagccgaaatgcaaaatgattttgtattcctccG-GTTGTGTTT--AAA-T-T-TT--AGG-------G--T-TG-----TG-----T----C--T-C-----T---AC---CAG-----------------A-----AT---A-----A------AGTCT-GGAAA-AC-C---TT---GAC-CT---ACT-T-----T----A-----AG--C------------CTAAAAG-C-A-G----G--T---CA--T--TGTGCA--C----C----AATCCA-----G-C----TC---ACA-----TG-AAAA-TTGCAT-G-----A---T----T-----AT-G--T-C---T-TCCT---C--------T--GA--AG---AGGTT---G----------------------T-G----------------T-----TGTC--A--GCGCA----AT------A-----------T-CT-GTA-------TCCGCA--AT-GA-GAAAA--------------------------------A-GT--CCAG--GAAAGTGTCTGACATACTGTTAGCTCCC-TGTAC--ATCTCT-AAG-AGGAAGGTTGTGATTAACCTttcttttactataaa
gi|5 : acagtatatctGAG-GTTGTG---------T-TGTC--AGC-------G--C-AA-----TA-----T----C--T-G-----T---AT---CCGC-A--A----TGA----G-----AA---A-----A------AGTCC-AGGAA-AG-T-GTCT---GAC-AT---ACT-G-----T----T-----AGCTC------------CCT---G-T-A-------------CA--T------CT--C----T----A----A-----G-A----GG---AAGGT---TG-TG-A-T----T-A-----A---C----C------T-G--T-A---T-C--T---A--------TA-GT-GGGGA-A----------------------------------------AA----A-AT-----C-T------GGAAA----ATTGTTTGA-----------C-C---TA--CT--TTTAG-A-TATAAA-GTAAGTCA-AG----GTA-TA--------------CCA-AT--GCAGCTGAAA-T----------------ACT----T-----------T-GAG-AGGAAACTTGT--GTGACgtatctatagtggggaaaaaatctggaaaattgtttgacctacttttagatataaagtaagtcaaggtataccaatgcagctgaaatactttgagaggaaacttgtgtgactaaacagggcaacatctatatccgtaacaaaaa
gi|5 : acagtatatctggttgtgtttaaattttagggttgtgtctctaccagaataaagtctggaaaaccttgacctactttaagcctaaaagcaggtcattgtgcaccaatccagctcacatgaaaattgcatgattatgtcttcctctgaaGGAAAATTGT--TTGACCTACTTTTAGA-TATAA-AGTAAGTC-A---A-GGTA-TACCAATGCAGC-------T-GA-A------A--TA-C------------------------------------------------------TTT--GAGAGGA-A---ACTTGTGT-G--A--CTAA-A---CA-------GGG------CAAC---A-TC----TAT----ATCCGTAACA-AAAAtaaacagggcaacatctatatccgtaacaaaaa
gi|6 : acagtatatctggttgtgtttaaattttagggttgtgtctctaccagaataaagtctggaaaaccttgacctactttaagcctaaaagcaggtcattgtgcaccaatccagctcacatgaaaattgcatgattatgtcttcctctgaagaggttgtgttgtcagcgcaatatctgtatccgcaatgagaaaaagtccaggaaagtgtctgacatactgttagctccctgtacatctctaagaggaaggttgtgattaacctgtatctatagtggggaaaaaatctGAAA-AC-T-GTCT---GAC-CT---TCT-T-----T----T-----AG--C------------CTTAAAG-T-A-G----G--G---CA--T--GGGACT--C----CAATTA----A-----G-C----TA---ACA-----AG-TGAA-C----T-G-----A---T----T-----AT-G--T-A---T-TACT---C--------C--AT-GAGAA-AGATT---G----------------------T-AA-----AAA----A-A------------A--TGGCA----AT------G-----------C-
gi|6 : aagatcacaataaatctggttgagtagagtatggaacaaaacctggatccaaaggagaattcatGAAAACTGT--CTGACCTTCTTTTAGC-CTTAA-AGTAGGGC-ATG---GG-A-CTCCAATTAAGCTAACAAGT-GA-ACTGATTA--TG-T------A---------T--------------T------A---C---TC------CAT--GA---GA-A---AGAT-TGTAA--A--AAAA-ATGGCA-------ATG------CAAT---A-TAAATCTGT----ATCCA--ACATGAGAAACA----TCC-TG-GGAAC---A--CT-ATT-TCAAGATGCAC-CA--TAACCCA-CGAATCA-Gaatataaatctgtatccaacatgagaaacatcctgggaacactatttcaagatgcaccataacccacgaatcagaatacatctcggaggaagctgtgactgcatttcaggcaatatattatctaaacccatgatgcaaaaaatttaattgttacctgcagaagactaataggaaacccagcgtgttcttcag
gi|6 : aagatcacaataaatctggttgagtagagtatggaacaaaacctggatccaaaggagaattcatGAGAAAG-ATTGTAAAA--AAAAT-G-GC--AAT-------G--C-AA-----TA-----TAAATC--T-G-----T---AT---CCAA-C--A----TGA--GAA-----AC---A--------------TCCTGGGAACAC-T-ATT-----------------------------------------------------------------------T---CA--A--GATGCA--C----C----AT---A-----A-C----CC---A----------CGAATC----A-G-----A--------------AT-A--C-A---T-C--T---C------------G-GAGGA-A-GCT---G----------------------T-GA-----CTG----C-AT-----T-TC--A---GGCA----AT------A-----------aatacatctcggaggaagctgtgactgcatttcaggcaatatattatctaaacccatgatgcaaaaaatttaattgttacctgcagaagactaataggaaacccagcgtgttcttcag
gi|6 : aagatcacaataaatctggttgagtagagtatggaacaaaacctggatccaaaggagaattcatgaaaactgtctgaccttcttttagccttaaagtagggcatgggactccaattaagctaacaagtgaactgattatgtattactccatGGAA-GCTGTGACT--GCA-T-T-TC--AG--------G--C-AATATATTA-----T----C--T-A-----A---AC---CCAT-G--A----TG-C-AAA-----AA---A-----tattatctaaacccatgatgcaaaaaatttaattgttacctgcagaagactaataggaaacccagcgtgttcttcag
gi|7 : aagatcacaataaatctggttgagtagagtatggaacaaaacctggatccaaaggagaattcatgaaaactgtctgaccttcttttagccttaaagtagggcatgggactccaattaagctaacaagtgaactgattatgtattactccatgagaaagattgtaaaaaaaatggcaatgcaatataaatctgtatccaacatgagaaacatcctgggaacactatttcaagatgcaccataacccacgaatcagaatacatctcggaAGGTC-ATG----GTG-AACCAAACCAGC-------T-GATAT-----A--TG-A------A---------C--------------TACG---T---A---TT------TCTCCGAA-AGA-G---ATGT-TGT-G--A--CGAA-A---CA-----------------TGT---A-TA----TGC----ATCCATGAGG-AGAAAAAG----TCC-AG-AAAACTTTG--CG-ACT-Ttttaattgttacctgcagaagactaataggaaacccagcgtgttcttcag
gi|7 : aacagaaaaacacaagagtgtctcaaatggtacattgtacatcccatcttacagtgagattcggccagtatctagcacGAAAGAGAT-GTTGTGACG--AAA------C--A-T-------G-----------TA-----T----A--T-G-----C---AT---CC------A----TGAG-GAG-----AA---A-----A------AGTCC-AGAAA-AC-T-TTGC---GAC-TT---ACT-T-----T----T-----AG--C------------CTTAAAG-acttttagccttaaaggcaaaatctgtaatgaaaaaaaagtccagaaaactgatatacttttagcacgaacggatggaccgagtgcaccaattcagctgaaattgtattcccctgagagaaagcctgtgactaaattttagggcagtatatcc
gi|7 : aacagaaaaacacaagagtgtctcaaatggtacattgtacatcccatcttacagtgagattcggccagtatctagcacaggtcatggtgaaccaaaccagctgatatatgaactacgtatttctccTTGCGACT--TAC-T-T-TT--AGCCTTAAAGG--C-AA-----AA-----T----C--T-G-----T---A------------A----TGA---AA-----AA---A-----A------AGTCC-AGAAA-AC-T--------GAT-AT---ACT-T-----T----T-----AG--C------------ACGAACG-G-ATG----G--A---CC--G--AGTGCA--C----C----A----ATTCA-G-C----TG---AAA-----T------------------------------------T-G--T-A---T-T--C---CCC------T--GA-GAGAA-AGCCT---G----------------------T-GA-----CTA----A-AT-----T-TT--A--GGGCA----GT------A-----------gcaaaatctgtaatgaaaaaaaagtccagaaaactgatatacttttagcacgaacggatggaccgagtgcaccaattcagctgaaattgtattcccctgagagaaagcctgtgactaaattttagggcagtatatcc
gi|8 : aacagaaaaacacaagagtgtctcaaatggtacattgtacatcccatcttacagtgagattcggccagtatctagcacaggtcatggtgaaccaaaccagctgatatatgaactacgtatttctccgaaagagatgttgtgacgaaacatgtatatgcatccatgaggagaaaaagtccagaaaact-----T----T-----CG--C------------CTTAGAG-T-A-T----G--T---CT--T--GGTGCA--T----C----A----A-----T-C----C-----------------AG-C----T-G-----A---T----A-----AA-G--T-A---T-T--T---C--------TCTGA-GAGGG-AAGCT---GTGACAAAGTCTGTATCCATGCAT-GA-----TGAGAGAA-AG-----T-TC--A--GGAAA----AT------ATTATA------C-CT-AT---TT--TTCAGCCCTA--AA-GTAGGTCATG-----GTG-CA--------------CCC-AT--GCAGCTGAAA-TG--CAA---ACCG--AACTTCAATGTAT--TCCTTA-GAG-ATGATGCTTG----TGACTAAATTTCAGtatcc
gi|8 : gaacaagagtacaaccaaaggtaccaaaatacactattaaacagtgaatttcaacccgtcagcacattatgcattaGAGAGGGAA-GCTGTGACA--AAG-T-----------------------------------------C--T-G-----T---AT---CCAT-GC-A----TGAT-GAG-----AG---A-----A------AGTTC-AGGAA-AA-T-ATTA---TAC-CT---ATT-T-----T----TC----AG--C------------CCTAAAG-T-A-G----G--T---CA--T--GGTGCAC-C----C----ATGC-A-----G-C----TG---AAA-----TG-CAAA-C----C-G-----AACTT----CA----AT-G--T-A---T-T--C---C--------TTAGA-GATGA-TGCTT---G----------------------T-GA-----CTA----A-AT-----T-TC--A--GGGCA----AT------ggcaat
gi|9 : gaacaagagtacaaccaaaggtaccaaaatacactattaaacagtgaatttcaacccgtcagcacattatgcattattcgccttagagtatgtcttggtgcatcaatccagctgataaagtatttctctGACCTACTTATAGC-CCTAA-AGTAGGTC-ACA----GTG-CACAAATCCAGC-------T-GA-A------A----------------------C--------------T------TGTGC---CT------TTT--GAG-GGA-GCTCACCT-TGT-A-------AA-ATCTCA-------ATG------CTGA---A-CA----TGC----ATCCATTATG-TAAAAAAG----TAA-GG-AAAACAATA--TG-ACCTTC---ATGGAC------AAACA-----------CAC--AGATGGATGGA--CAGA-----GTCACAACATAAT---TA-A---TACATCCCCT-CT-GACGATAGG-AGTA
Alignments
lowQualScore : 11111111 33333333333333333 33333333333333333333 2222222222222222222222 111 11111111111 1111111111111111111111 11111111111111111111 1111111 5555555555555555555555555555555 111111111 11111 33333 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 1111111 2222222222222222 1111 11111111 111111 111111 1111111111 2222 11 11111111 111
lowQualScore : 1 666 1 444 22 22222222 1 33333 7777777777 3 1 55555 222 444 22222222222222222 33333 222 555555555555 44 0 1 1 44 222 1 222 1 33333 3333 99999 33 777777777777 0 2 1 3333 22 222 22 33 33 33333333333333333333 1 3333 222 0 66666 666 1 3333 1 0000000000000000000000 1 33 000 1 66 444 66666666666 3 1 66 222 4444444444444444444444 3 22 3333 3 3333 22 66666 1 22 22 4444 99999999999999999999 2 33 33 3 6666666 0 0000000000000000000000000000000 4 666 4 777777777 66 88888 66 11 4 4 0 44 1 333 3 2 77777 2 2 8888888 2 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 2 33 33 555 22 2 2222222 2 2 2222222222222222 1 555 5 1111 6666 2 0 11111111 6666 33 2 33 222222 4 4 666 0 888888 8 2222222222 2222 1 11 8 3 22222222 0 444 6 8 8 1 8
lowQualScore : . ... . ... .. ........ . ..... .......... . . ..... ... ... ................. ..... ... ............ .. . . . .. ... . ... . ..... .... ..... .. ............ . . . .... .. ... .. .. .. .................... . .... ... . ..... ... . .... . ...................... . .. ... . .. ... ........... . . .. ... ...................... . .. .... . .... .. ..... . .. .. .... .................... . .. .. . ....... . ............................... . ... . ......... .. ..... .. .. . . . .. . ... . . ..... . . ....... . .................................................................................... . .. .. ... .. . ....... . . ................ . ... . .... .... . . ........ .... .. . .. ...... . . ... . ...... . .......... .... . .. . . ........ . ... . . . . .
lowQualScore : 9 777 5 999 11 55555555 5 88888 6666666666 0 5 22222 666 111 44444444444444444 77777 555 777777777777 33 4 4 4 88 777 5 666 4 33333 0000 55555 44 333333333333 5 7 4 0000 00 666 00 55 55 99999999999999999999 5 3333 666 3 00000 555 5 1111 5 2222222222222222222222 5 55 222 5 11 666 33333333333 1 7 22 999 8888888888888888888888 3 33 5555 2 5555 33 11111 7 44 44 0000 11111111111111111111 2 22 99 3 5555555 4 0000000000000000000000000000000 4 222 4 000000000 11 22222 11 77 4 4 4 22 6 777 3 9 55555 5 5 1111111 5 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 9 99 44 000 11 9 0000000 9 9 7777777777777777 1 000 7 1111 5555 5 8 11111111 5555 99 9 99 555555 0 4 666 4 999999 8 8888888888 3333 0 00 0 8 44444444 8 000 4 0 0 0 0
consensus : GAGAGGGAG-GTTGTGACN--AAA-T-T-TC--AGT-------GC-AA-----TA-----T----C-T-G-----T---AT---CCGT-G--A----TGAC-GAA-----AA---A-----A------AGTCC-GGGAA-AC-T-ATTT---GAC-CT---ACT-T-----T----T-----AG--C------------CCTAAAG-TA-G----G--T---CA--T--GGTGCA--C----C----A----A-----G-C----TG---AAA-----TG-CGAA-C----T-G-----A---T----C-----A-T-G--TA---T-T--T---C--------T--GA-GAGGA-AGGTT---G----------------------T-G--A----CTA----A--AT-----T-TC--A--GGGCA----AT------A-----------C-CT-GTA--TC--TTTAGCA-TA-T-AAGCAGATCG-A-----GTG-C-G--------------CCA-AT--CCAGCTGAAA-TG--CGA---ACTG--AACT----TGTAT--TCCTCC-GAG-AGGAAACTTGT--TTGACCTACTTTTAGC-CCTAA-AGTAGGTC-ACG-A-GGTG-CACCAATCCA-GC-------T-GA-----------A------A--TG-C------A---------C--------------T------T---C---T-----T------TT-T--GAGGGA-G---ANATTGT-G--A--CCAA-AT-TTCA-------ACG------CTGT---A-CA----TGC----ATCCGTTACG--GA--AAAAAG----TCC-GG-AAA--AC---AC-G-ACC-TC-AGACGGACTCA-CTAACCAAGCGAGTTA-GC-C--AGCTGGACGNA--CAGA-CAACGCCATAACAAAAGACATATG---CACGTCCCGT-CT-GANGACGGG-CGTATAAAA
Reference ( family-1432 ) : GAGAGGGAG-GTTGTGACN--AAA-T-T-TC--AGT-------GC-AA-----TA-----T----C-T-G-----T---AT---CCGT-G--A----TGAC-GAA-----AA---A-----A------AGTCC-GGGAA-AC-T-ATTT---GAC-CT---ACT-T-----T----T-----AG--C------------CCTAAAG-TA-G----G--T---CA--T--GGTGCA--C----C----A----A-----G-C----TG---AAA-----TG-CGAA-C----T-G-----A---T----C-----A-T-G--TA---T-T--T---C--------T--GA-GAGGA-AGGTT---G----------------------T-G--A----CNA----A--AT-----T-TC--A--GGGCA----AT------A-----------C-CT-GTA--TC--TTTAGCA-TA-T-AAGCAGATCG-A-----GTG-C-G--------------CCA-AT--CCAGCTGAAA-TG--CGA---ACTG--AACT----TGTAT--TCCTCC-GAG-AGGAAACTTGT--TTGACCTACTTTTAGC-CCTAA-AGTAGGTC-ACG-A-GGTG-CACCAATCCA-GC-------T-GA-----------A------A--TG-C------A---------C--------------T------T---C---T-----T------TT-T--GAGGGA-G---ANATTGT-G--A--CCAA-AT-TTCA-------ACG------CTGT---A-CA----TGC----ATCCGTTACG--GA--AAAAAG----TCC-GG-AAA--AC---AC-G-ACC-TC-AGACGGACTCA-CTAACCAAGCGAGTTA-GCNC--AGCTGGACGNA--CAGA-CAACGCCATAACAAAAGACATATG---CACGTCCCGT-CT-GANGACGGG-CGTATAAAA
gi|1 : ----T-G-----C---T----T-----A-T-G--TA---T-T--TGCTC--------T--GAAGAAGG-AGGTT---G----------------------T-G--A----C-A----A--AT-----G-TC--AGTGGGTA----AC------A-----------T-CTCGTA--T
gi|1 : caatgctatctaaccacgtgtcaactcgctagcaAGAAGGAG-GTTGTGAC---AAA-T-G-TC--AGTGG-----GT-AA-----CA-----T----C-TCG-----T---ATA--CTGT-G--A----GGAC-AAA-----CA---ACTTACA------AGTCC-AAGAA-AC---A-TT---GA--CT---ACC-T-----T----TTCC--CG--C------------CCTGAAGTTA-G----GATT---TA--T--TGTGC---C----T----A----A-----G-C----TGCTAAAA-----TGATGAT-C----T-G-----A---T----C-----ATT-GT-TA---TGT--T---C--------T--GA-GAAGACAGGTTCTAA----------------------T-G--AAGCCCCA----AAGAT-----C-TCCAA--AGGTATTTCAG------A-----------C-CT-GTA--TCGGTTTAGTA-TATT-ATGCAGATTG-A-----GTG-TGG--------------CCATATTACCAGCTGAAA-TA--TGA---TCTG--ACTT----TGTAA--TTCTCC-AAG-AGGAACCTTGT--TTGACGTATTGTTAGCTTCTAA-AGTAGCCC-ACGTA-CGGG-C-CCAATTTT-GC-------TCGA-----------A------A--TG-C------AG--------C--------------TC-----T---C---T-----TA-----TT-T--GAGGGGCG---ACATTGT-GGTG--CCAACCT-TTCA-------A-A------ATGT---A-CACAT-TGC----ATCCTTTATG--G---AAAAGG----TCC-AGCAGATCAC---CC-G-ACC-actgtgaggacaaacaacttacaagtccaagaaacattgactaccttttcccgccctgaagttaggatttattgtgcctaagctgctaaaatgatgatctgatcattgttatgttctgagaagacaggttctaatgaagccccaaagatctccaaaggtatttcagacctgtatcggtttagtatattatgcagattgagtgtggccatattaccagctgaaatatgatctgactttgtaattctccaagaggaaccttgtttgacgtattgttagcttctaaagtagcccacgtacgggcccaattttgctcgaaatgcagctctcttatttgaggggcgacattgtggtgccaacctttcaaaatgtacacattgcatcctttatggaaaaggtccagcagatcacccgaccgactagcttaatgcaggattccattcccccgagaacccagacctcaagtcactaaccaagcgagttacgctctcagctgacgtaaacagaacaacaccaaacaaaagacatatgcatgtcccctgctggatgatgggccatataaaaatgtatactttatttc
gi|1 : caatgctatctaaccacgtgtcaactcgctagcatgcttatgtatttgctctgaCC-CG-AGA--AC---CCAG-ACC-TC-A-----AGTCA-CTAACCAAGCGAGTTACGCTCTCAGCTG-ACGTAAACAGAACAACACCA-AACAAAAGACATATG---CATGTCCCCTGCTGGATGATGGGCCATATAAAAgactagcttaatgcaggattccattcccccgagaacccagacctcaagtcactaaccaagcgagttacgctctcagctgacgtaaacagaacaacaccaaacaaaagacatatgcatgtcccctgctggatgatgggccatataaaaatgtatactttatttc
gi|10 : caatgctatctaaccacgtgtcaactcgctagcatgcttatgtatttgctctgaagaaggaggttgtgacaaatgtcagtgggtaacatctcgtatactgtgaggacaaacaacttacaagtccaagaaacattgactaccttttcccgccctgaagttaggatttattgtgcctaagctgctaaaatgatgatctgatcattgttatgttctgagaagacaggttctaatgaagccccaaagatctccaaaggtatttcagacctgtatcggtttagtatattatgcagattgagtgtggccatattaccagctgaaatatgatctgactttgtaattctccaagaggaaccttgtttgacgtattgttagcttctaaagtagcccacgtacgggcccaattttgctcgaaatgcagctctcttatttgaggggcgacattgtggtgccaacctttcaaaatgtacacattgcatcctttatggaaaaggtccagcagatcacccgaccgactagcttaatgcaggattccattcc---A-----A------AATCG-GCGAA-AC-T-GTTT---GAC-CT---ACT-T-----T----T-----GGG-C------------CCTAAAG-TA-G----G--T---CA--T--GGTGTA--C----C----atgtatactttatttc
gi|10 : aaatgtggggttatacctgtaccacaacatctTTGTGACT--ACA-T-T-TC--AGG-------GC-AA-----CA-----C----C-T-------T---AT---CGGT-A--A----T--T-GAA-----AA---A-------------GTCT-GGGAA-AC-T-GTTT---GAC-CT---ACT-T-----T----C-----AG--CCCTGAATTTCTGCCTAAAT-TA-G----G--T---CA--T--TATGCA--C----C---------T-----G-C----TG---Attgtgactacatttcagggcaacaccttatcggtaattgaaaaagtctgggaaactgtttgacctactttcagccctgaatttctgcctaaattaggtcattatgcacctgctgactcactc
gi|11 : aaatgtggggttatacctgtaccacaacatctaaaatcggcgaaactgtttgacctacttttgggccctaaagtaggtcatggtgtaccAG-GTTGTGACT--ACA-T-T-GG--AGA-------AC-AA-----TG-----C----C-T-G-----T---AT---CC------A----TAAC-CAATAGTTAA---A-----A------AAT----GGAA-ACCT-GTTT---GAC-CT---ACT-T-----T----T-----AG--T------------CTTGAAG-TA-G----G--T---CA--C--GGTGCA--CAATTC----C----A-----G-C----TG---AAG-----TA-CAAA-C----T-GTTCTTA---TA---C-----A-T-G--TC---T-T--C---CTT------T--CA-GAGGA-TATTT---G----------------------T-G--A----CTA----A--AT-----T-TC--T--GAACT----AT------A-----------T-CT-GTA--TC--TGTAACctcactc
gi|11 : aAGAGGATA-TTTGTGACT--AAA-T-T-TC--TGA-------AC-TA-----TA-----T----C-T-G-----T---AT---CTG----------TAAC-GAA-----AA---A-----A------TATCC-gaaaaaatatcc
gi|12 : aaggttgtgactacattggagaacaatgcctgtatccataaccaatagttaaaaaatggaaacctgtttgacctacttttagtcttgaagtaggtcacggtgcacaattccagctgaagtacaaactgttcttatacatgtcttcctttc-C-A--------------CTA-AT--CCAGCTGGCG-TG--TGA---ACAG--ATTA----TGTATAATTCCCC-GAGTGGGAGAGTTAT--
gi|12 : gcaagattttgaacatgagtaccacaaagactacatcctatgcccgccggacagtgacaattcatcctgcataagcacttttaccatggcaGAGTGGGAGAGTTATGATA--AAA-T-G-TT--GGT-------GC-AA-----TA-----T----C-T-G-----TATAAT---CCAT-G--A----T-AT-GAG-----AA---A-----A------AGTTC-AGGAA-AC-T-Agataaaatgttggtgcaatatctgtataatccatgatatgagaaaaagttcaggaaacta
gi|13 : gcaagattttgaacatgagtaccacaaagactacatcctatgcccgccggacagtgacaattcatcctgcataagcacttttaccatggcacactaatccagctggcgtgtgaacagattatgtataattccccG---GAA-----TGGTAAA-C----T-G-----G---T----T-----A-T-ACATA---T-C--T---C--------C--GC-GAGGA-AGGTT---C----------------------A-G--A----CAA----A--AT-----T-TC--A--GTGCA----AT------A-----------
gi|13 : GAGGAAG-GTTCAGACA--AAA-T-T-TC--AGT-------GC-AA-----TA-----TTA--T-T-GA----T---AT---CCAT---------TAAC-G-------AA---A-----A------AGCCA-AGGAA-AC-T-CTTC---GAC-TT---ATT-T-----T----T-----AG--C------------CC---AA-TA-G----G--ttattgatatccattaacgaaaaagccaaggaaactcttcgacttatttttagcccaatagggggcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngttaaggtaaaaccttgcgattatattttatg
gi|14 : ggaatggtaaactggttatacatatctccgcTG--TACC----TATAT--CCA--C-AAC-AGAAAACT-AT--TTGATCTACTTTTAGC-CATAA-AGTAGGTC-AT----GGTG-CAACAATCCA-GC-------T-GA-----------C------A--TG-gggcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngttaaggtaaaaccttgcgattatattttatg
gi|14 : tgtgagtcttaatgaaaatctccaaactggctgatggtaataaaatcaaatatggtatatctgatcacgagtaagcatgaaaccaaatacaC-AGAAA-AC-T-ATTT---GAT-CT---ACT-T-----T----T-----AG--C------------CATAAAG-TA-G----G--T---CA--T--GGTGCA--A----C----AATCCA-----G-C----TG---ACA-----TG-TGAA-C----T-G-----A---T----T-----A-T-G--TAAT-T-C--T---C--------T--GA-GAtgaactgattatgtaattctctgaga
gi|15 : tgtgagtcttaatgaaaatctccaaactggctgatggtaataaaatcaaatatggtatatctgatcacgagtaagcatgaaaccaaatacatgtacctatatccacaaTTGTGACT--TGA-T-G-TC--AAG-------GT-AA-----TG-----T----C-T-G-----T---AT---GC------A----TAACTGAA-----AA---A-----A------AGTTC-GGAAA-AC-T-GTTT---GTC-CT---ACC-T-----T----T-----AG--C------------CCTAAAG-TA-G----G--T---GAACT--GATGCA--C----C----GATCCA-----G-T----GG---AAA-----TG-CTAA-C----TCG-----C---T----CTCCAGA-TAA--CA---C-T--T---CT-------T--GA-GGGAG-ATATT---G----------------------T-G--A----CCA----A--AT-----T-TA--A--AGG
gi|16 : gcCT-T-----T----T-----AG--C------------TTTCAAG-TA-G----G--G---CA--T--GATGCA--C----C----A----ATGTAGG-C----TG---ACACTTCTCG-TGAA-C----------------T----C-----A-C-G--TAT--T-T--T---C--------T--TA-GAGG--AGGTT---G----------------------T-A--A----TAT----A--ATG----T-CC--A--GTGCA----AT------AT----------C-TT-GTA--Tt
gi|16 : CTTTTAGC-TTTCA-AGTAGGGC-ATG-A---TG-CACCAATGTAGGC-------T-GACACTTCTCGTGA------A--CT-C------A---------C--------------G------T---A---T-----T------TTCT--TAGAG--G---AGGTTGT-A--A--TATA-ATGTCCA-------GTG------CAAT---ATCT----TGT----ATATATCATGATGACGAAAAAG----TCCAAG-AAA--AC---atatcatgatgacgaaaaagtccaagaaaactattttgaaacctacttaagctgtaacaa
gi|16 : AGAGG-AG-GTTGTAATA--TAA-TGT-CC--AGT-------GC-AA-----TA-----T----CTT-G-----T---ATATATCAT-G--A----TGAC-G-------AA---A-----A------AGTCCAAGAAA-AC-T-ATTTTGAAAC-CT---ACT-T-----tattttgaaacctacttaagctgtaacaa
gi|17 : cttttagctttcaagtagggcatgatgcaccaatgtaggctgacacttctcgtgaactcacgtattttctt-GTGGTGACA--AAA-T-T-TC--AGT-------GC-AA-----TAG----T----C---------T---AT---CC-----------------AA-----AA-----------------------GAAA-AC-TAACTT---GAC-CT---ATT-C-----T----TTAGTCAG--C------------CCTATAG-TA-G----G--T---CA--CA-GATGCA--CTAATT----A----A-----GCC----TG---AAA-----TG-CAAA-C----T-G-----A--------------A-T-A--TA---T-T--T---C--------T--Gaagctgtaacaa
gi|18 : T-T-----T----T-----AG--C------------TTTCAAG-TA-G----G--G---CA--T--GATGCA--C----C----A----ATGTA-G-C----TG---ACA-----CG-TGAA-C----T----------------C-----A-C-G--TA---T-T--TTT-C--------T--GA-GAGGG-AGGTT---G----------------------T-G--A----TAT----A--AT-----G-TC--A--GTGCA----AT------A-----------T-CT-GTA--Ttcgtgacccacatttgaatctattctg
gi|18 : TTTTAGC-TTTCA-AGTAGGGC-ATG-A---TG-CACCAATGTA-GC-------T-GA-----------C------ACGTG-A------A---------C--------------TCACGTAT---T---T-----T------TC-T--GAGAGG-G---AGGTTGT-G--A--TATA-AT-GTCA-------GTGCAATATCTGT---A-TA----T------ATCTATGATG--AG--AAAAAG----TCC-AA-GAA--AC---atatctatgatgagaaaaagtccaagaaactatttgacctacttaagct
gi|18 : GAGAGGGAG-GTTGTGATA--TAA-T-G-TC--AGT-------GC-AA-----TA-----T----C-T-G-----T---AT---ATATCT--A----TGAT-GAG-----AA---A-----A------AGTCC-AAGAA-AC-T-ATTT---GAC-CT---ACT-T-----tatttgacctacttaagct
gi|19 : ttttagctttcaagtagggcatgatgcaccaatgtagctgacacgtgaactcacgtatttttctG-GTTGTTAC-----A-T-TGTC---GT-------GCTAC-----TA-----T----T-A-C-----T---AT---C-AT-G--A----TGAC-TAA-----AA-----------------GTCC-AAGCA-AT-T-ATGT---GGC-TT---ACTCT-----T----T-----AG--C------------CCTAAAG--A-G----A--T---TA--TACGATGCAAGT----T----A----A-----T-C----TG---AAA-----CG-TAAA------T-A-----A---T----T-----A---G--TA---T-C--C---C--------T--GA-GAGGG-ATGTT---G----------------------TCG--A----CTC----A--Aaagct
gi|2 : AAAA-TA-G----A--T---CA--T--GGTATA--C----C----A----ATATT-G-C----TG---AAA-----TG-TGAA-C----T-G-----A---TGATGC-----A-T-G--TATT-T-T--T---C--------T--AA-GA-------------------------------------G--A----CAA----A--TT-----T-TC--A--GTGTA----AT------A-----------------TA--TC--TT
gi|2 : GACA--AAT-T-T-TC--AGT-------GT-AA-----TA-----TAT--C-T-------T---GT---CC------A----AGAC-AAG-----GA---A-----A------AATAT-AGAAA-AC-C-ACCT---T-C-TT---ACT-TAAGAAT----T-----AG--C------------CCCATAA-TA-G----G--T---AA--T--A-CGAA--T----T----A----A-----G-C----TA---AAA-----TG-CAAA-A----T-G-----AA--T----C-------T-G--CA---T-T--T---CCATAGCTGT--GA-GAGGA-ATGCT---G----------------------T-G--A----CTA----C--AT-----T-TC--A--AAGTG----AT------A-----------C-AT-GTG--TC--CATAACC-AA-T-AA-CAAAAAA-A-----ATA-T-GGAAAACTGTTTTACCTA-CT--GTAGCTGAAA-TA--CAA---ACTG--AAC------GTAT--TCCTTC-TAG-TGAAAGCTTGT--gtccaagacaaggaaaaatatagaaaaccaccttcttacttaagaattagccccataataggtaatacgaattaagctaaaatgcaaaatgaatctgcatttccatagctgtgagaggaatgctgtgactacatttcaaagtgatacatgtgtccataaccaataacaaaaaaaatatggaaaactgttttacctactgtagctgaaatacaaactgaacgtattccttctagtgaaagcttgtgactaagtctgtattcatagcaaaaaaaaaaaaaatcccgaaagtgtttaacttgaagtagctagaccatggtgcatcaattaagctgaaatgcaaactctctacttacgtttttgaggaagaaattgagactaaatctcaatatatgcatccgttacagaaaaaaaaatatctggaaaacgtatatctcagacggactca
gi|2 : aaaatagatcatggtataccaatattgctgaaatgtgaactgatgatgcatgtatttttctaagaGAGAGGAAT-GCTGTGACT--ACA-T-T-TC--AAA-------GT-GA-----TA-----C----A-T-G-----T---GT---CCAT-A--ACCAATAAC--AA-----AA---A-----A------AATAT-GGAAA-AC-T-GTTT---TAC-CT---ACT-----------------------------------------G-TA-G-------------------------------------------------C----TG---AAA-----TA-CAAA-C----T-G-----A--------------A-C-G--TA---T-T--C---C--------TTCTA-GTGAA-AGCTT---G----------------------T-G--A----CTA----A--GTCTGTAT-TC--A--TAGCA----AA------AAAAAAAAAAATC-CC-GAAAGTG--TTTAACT-TG---AAGTAGCTAG-ACCATGGTG-C-A--------------TCA-AT--TAAGCTGAAA-TG--CAA---ACTgactaagtctgtattcatagcaaaaaaaaaaaaaatcccgaaagtgtttaacttgaagtagctagaccatggtgcatcaattaagctgaaatgcaaactctctacttacgtttttgaggaagaaattgagactaaatctcaatatatgcatccgttacagaaaaaaaaatatctggaaaacgtatatctcagacggactca
gi|2 : aaaatagatcatggtataccaatattgctgaaatgtgaactgatgatgcatgtatttttctaagagacaaattttcagtgtaatatatcttgtccaagacaaggaaaaatatagaaaaccaccttcttacttaagaattagccccataataggtaatacgaattaagctaaaatgcaaaatgaatctgcatttccatagctgt-----T----C-T-G-----T---AT---TCAT-AGCA----AAAA-AAA-----AA---A-----A------AATCC-CG-AA-AG-T-GTTT---AAC----------T-----TGAAGT-----AG--C--------------------TA-G----A--C---CA--T--GGTGCA--T----C----A----ATTAA-G-C----TG---AAA-----TG-CAAA-C----T-C-----T---C----T-----A-C-T--TACG-T-T--T---T--------T--GAGGAAGA-A-ATT---G----------------------A-G--A----CTA----A--AT-----C-T---------CA----AT------A-----------T-AT-GCA--TC--ctctacttacgtttttgaggaagaaattgagactaaatctcaatatatgcatccgttacagaaaaaaaaatatctggaaaacgtatatctcagacggactca
gi|2 : aaaatagatcatggtataccaatattgctgaaatgtgaactgatgatgcatgtatttttctaagagacaaattttcagtgtaatatatcttgtccaagacaaggaaaaatatagaaaaccaccttcttacttaagaattagccccataataggtaatacgaattaagctaaaatgcaaaatgaatctgcatttccatagctgtgagaggaatgctgtgactacatttcaaagtgatacatgtgtccataaccaataacaaaaaaaatatggaaaactgttttacctactgtagctgaaatacaaactgaacgtattccttctagtgaaagcttgtgactaagTTTAAC-T-TGA-AGTAGCTAGACC-ATGGTG-CATCAATTAA-GC-------T-GA-----------A------A--TG-C------AAACTCTCTAC--------------T------TA--CG--T-----T------TT-T--GAGGAA-G---AAATTGA-G--A--CTAA-AT-CTCA-------A-----------T---A-TA----TGC----ATCCGTTACA--GA--AAAAAAAATATCT-GG-AAA--AC---GT-ATATC-TC-AGACGGACTCA-cgttacagaaaaaaaaatatctggaaaacgtatatctcagacggactca
gi|20 : aaaatagatcatggtataccaatattgctgaaatgtgaactgatgatgcatgtatttttctaagagacaaattttcagtgtaatatatcttgtccaagacaaggaaaaatatagaaaaccaccttcttacttaagaattagccccataataggtaatacgaattaagctaaaatgcaaaatgaatctgcatttccatagctgtgagaggaatgctgtgactacatttcaaagtgatacatgtgtccataaccaataacaaaaaaaatatggaaaactgttttacctactgtagctgaaatacaaactgaacgtattccttctagtgaaagcttgtgactaagtctgtattcatagcaaaaaaaaaaaaaatcccgaaagtgGAAAACTC-T--CTGACCTACTTTGAGC-ACGGATAGT-------------GTG-CACTAATCTA-GC-------T-GA-----------A------A--TG-C------AAAGTC----C--------------C------T---C---T-----TACTATTTT-C--GAGAGA-A---AAATTGT-G--A--CCAA-AT-TTTA-------ACA------CTGT---A-CA----TGCATCGATCTGTTATG--GG--AAAAAG----TCA-GG-AAA--AC---AT-G-
gi|21 : ---ACT-A-----T----A-----AG--T------------CTTAGAG-TA-GCTAGG--T---TA--C--AGAACA--C----CGATTA----A-----G-C----TG---AAA-----TG-TAGA-C----T-GA----A---T----C-------T-G--TA---T-C--T---C------------------------T---C----------------------T-G--G----CTA----C--AT-----T-TC--A--GGATA----AT------A-----------C-CT-GTA--TC--
gi|21 : aaaaacgtccccaaTGGCT--ACA-T-T-TC--AGG-------AT-AA-----TA-----C----C-T-G-----T---AT---CCGT-C--A-----GAA-AAA-----AA---A-----ACAATTTAATCC-GAAAA-AC-cgtcagaaaaaaaaacaatttaatccgaaaaacg
gi|22 : aaaaacgtccccaaactataagtcttagagtagctaggttacagaacaccgattaagctgaaatgtagactgaatctgtatctctc-GGTGTCACCAATCCA-GC-------T-GG-----------A------T--TGCC------A---------CACACTGAACTTGTAT------T---C---C-----T------TT-G--GAGAAG-A---AAATTGT-G--ATTTTAC-AT-TTCCT------AGG------CAAT---ATCC----TGT----ATACATAAT----A--AAGAAG----TCA-GG-AAA--Ag
gi|22 : -----GTGTC-A--------------CCA-AT--CCAGCTGGAT-TG--CCACACACTG--AACT----TGTAT--TCCTTTGGAG-AAGAAAATTGT--attttgacactattttttaagccctaaagt
gi|22 : gGAGAAGAAA-ATTGTGATTTTACA-T-T-TCCTAG--------GC-AA-----TA-----T----CCT-G-----T---AT---ACAT-A--A----T------A-----AA---G-----A------AGTCA-GGAAA-AA-T--TTT---GACACT---ATT-T-----T----TTA---AG--C------------CCTAAAG-Tgattttacatttcctaggcaatatcctgtatacataataaagaagtcaggaaaaattttgacactattttttaagccctaaagt
gi|23 : ggtgtcaccaatccagctggattgccacacactgaacttgtattcctttgGTC-ACG----GTT-CACCAATCCA-GC-------T-GA-----------AAC----A--TA-A------A---------C--------------TCAC---T---C---TTACGAT------TC-T--GAGGGA-C---AAATTGT-G--A--TCAA-A--TTCA-------ACG------CT------------------------GTTACG--GA--AAATAG----TCC-GG-AAA--AC---AA-G-GTT-TC-AGACAGAC
gi|24 : --TTGATCTATTTTTAGC-CCTTA-AGTAGGTC-ATA-C-AATG-CACCAGTCCA-GA-------T-GA-----------A------A--TG-CAA----A---------A--------------T------T---C-----------------T-T--GGGGGA-G---AT-----------------AT-TTTA-------ATG------CTAT---A-CA----Ta
gi|25 : ctagaaaaataGCTGGCCAGA--CCGA-CAACGCCATAA-----GAT-TATA---CAC--TCTGT-CT-AAAGACGGG-CATATAAAA
gi|26 : tAGG-CCTAA-AGTAGATT-ACT----GTG--ACTAATCCA-GC-------T-GA-----------C------A--TG-atgacacagtcagccaaaaaatgaaa
gi|27 : gtgttccatatcaataaataaagtccggatgctaGCCGGACGCA--CGGA-CAACGCCATAAC---ATACATATGTAATACATCCCGC-CT-GAAGACGCG-CGTATGAAAacaatt
gi|28 : TAAAA-CA-A----G--T---CA--T--GGTGCA--C----CAATTA----A-----G-C----TG---ACA-----TA-TGAG-C----------------T----T-----A-T-G--TA---T-TTCT---C--------T--AA-GAGG
gi|3 : tGAGAAGGAG-GTTGTGACA--AAA-T-G-TC--AGT-------GT-AA-----CA-----T----C-T-G-----T---AT---CTGT-G--A----GGAC-AAA-----AACTTAC----A------AGTCC-AAGAA-AC-T-ATTT---GAC-TA---ACT-T-----T----T-----AG--C------------CCTGAAG-TA-G----A--T---CA--T--GGTGCA--T---------A----A-----G-C----TG---AAA-----TG-TGAT-C----T-G-----A---T----C-----A-T-G--TA---T-T--T---C--------T--GA-GAAGA-AGGTT---G----------------------T-G--A----CCA----A--AT-----C-TC--A--AGGTA----TT------A-----------C-CT-GTA--CT--TTTAGTA-TA-T-AGGCAGATTG-A-----GTG-T-G--------------CCA-AT--CCAGCTGAAA-TA--TGA---TCTG--AACT----TGTAT--TCCTCC-AAG-AGGAACCTTGT--TTGACGTATGTTTAGC-TCTAA-AGTAGCCC-ACGTACGGTG-CACCAATTCT-GC-------T-GA-----------A------A--TG-C------A---------C--------------T------T---C---T-----T------TT-T--GAGGGC-G---ACATTGT-G--G--CCAA-AT-TTCA-------ACA------ATGT---A-CA----TGC----ATCCTTTATG--GA--AAAAGG----TCC-AG-CAA--TC---AC-G-ACC-TC-AGACAGACTCAGCCAA-CAAGCCAGTTA-GC-C--AGCTGGACGTA--CAGA-CAACACCATAACAAAAGACATATG---CATGTCCTGT-CT-GATGATGGG-CATATAAAA
gi|4 : AAACT-GT--TTGAC-TACTTTTAGC-TCTAA-TGTAGGTC-ACA----GTG-CATCAACCCC-GC-------T-GA-----------A------A--TG-C------AATCCCACT-C--------------T------TGCGC---T-----T------AT-T--GAGGGA-G---AAATTGT-G--A--CCAA-AT-TTCA-------ATG------CTAT---A-CA----TGC----ATCCATCACA--G----AAAAG----TCT-TA-AAA--AC---AT-G-ACC-TT-GGATGGAC
gi|4 : ccacaGAGGGAGAA-ATTGTGACC--AAA-T-T-TC--AAT-------GC-TA-----TA-----C----A-T-G-----C---AT---CC------A----TCAC---A-----GA---A-----A------AGTCT-TAAAA-AC---AT-----GAC-CTTGGA--------------T-----GG--A------------CATATAGATG-G----A--TGGATA--T--ATTGCG--C----C----A----ATCCA-G-C----CG---AAA-----TG-CAAA-A----T-G-----A---T----T-----T-T-G--TA---T-T--C---C--------TCCGA-GATGA-AGCTT---T----------------------C-G--C----CTA----A--AT-----T-TC--A--GGGCA----AT------A-----------CACT-GTatatagatggatggatatattgcgccaatccagccgaaatgcaaaatgattttgtattcctccgagatgaagctttcgcctaaatttcagggcaatacactgtctgacaggtatatgtattgaaaaaagctggaaaactatttgtcctactttccgccttaaagtgggtcatggtgcaccaatccccttgaaatgaaaactcattcttacgcttcctgagggagaaattgtgattaaattttaaggttcttttactataaa
gi|4 : ccacaaaactgtttgactacttttagctctaatgtaggtcacagtgcatcaaccccgctgaaatgcaatcccactcttgcgcttattTG-CGCCAATCCA-GC-------C-GA-----------A------A--TG-CAAAATGA---------T--------------T------T---TGTAT-----TCC----TC-C--GAGATG-A---AGCTTTC-G--C--CTAA-AT-TTCAGGGCAATACA------CTGTCTGA-CA----GGT----ATATG-TATT--GA--AAAAAG-----CT-GG-AAA--AC---ctgacaggtatatgtattgaaaaaagctggaaaactatttgtcctactttccgccttaaagtgggtcatggtgcaccaatccccttgaaatgaaaactcattcttacgcttcctgagggagaaattgtgattaaattttaaggttcttttactataaa
gi|4 : ccacaaaactgtttgactacttttagctctaatgtaggtcacagtgcatcaaccccgctgaaatgcaatcccactcttgcgcttattgagggagaaattgtgaccaaatttcaatgctatacatgcatccatcacagaaaagtcttaaaaacatgaccttggatggacatatagatggatggatatatGAGATGAAG-CTTTCGCCT--AAA-T-T-TC--AGG-------GC-AA-----TACACTGT----C-T-GACAGGT---AT---ATGT-A--T----TGA----------AA---A-----A------AG-CT-GGAAA-AC-T-ATTT---GTC-CT---ACT-T-----T----C-----CG--C------------CTTAAAG-TG-G----G--T---CA--T--GGTGCA--C----C----A----A-----T-CCCCTTG---AAA-----TG-AAAA-C----T-C-----A---T----T-----C-T----TACGCT-T--C---C--------T--GA-GGGAG-AAATT---G----------------------T-G--A----TTA----A--AT-----T-TT--A--AGGtatttgtcctactttccgccttaaagtgggtcatggtgcaccaatccccttgaaatgaaaactcattcttacgcttcctgagggagaaattgtgattaaattttaaggttcttttactataaa
gi|5 : ccacaaaactgtttgactacttttagctctaatgtaggtcacagtgcatcaaccccgctgaaatgcaatcccactcttgcgcttattgagggagaaattgtgaccaaatttcaatgctatacatgcatccatcacagaaaagtcttaaaaacatgaccttggatggacatatagatggatggatatattgcgccaatccagccgaaatgcaaaatgattttgtattcctccG-GTTGTGTTT--AAA-T-T-TT--AGG-------GT-TG-----TG-----T----C-T-C-----T---AC---CAG-----------------A-----AT---A-----A------AGTCT-GGAAA-AC-C---TT---GAC-CT---ACT-T-----T----A-----AG--C------------CTAAAAG-CA-G----G--T---CA--T--TGTGCA--C----C----AATCCA-----G-C----TC---ACA-----TG-AAAA-TTGCAT-G-----A---T----T-----A-T-G--TC---T-TCCT---C--------T--GA--AG---AGGTT---G----------------------T-G------------------T-----TGTC--A--GCGCA----AT------A-----------T-CT-GTA--TC--C---GCA--A-T-GAGAAAA---------------------------------A-GT--CCAG--GAAAGTGTCTGACATACTGTTAGCTCCC-TGTAC--ATCTCT-AAG-AGGAAGGTTGTGATTAACCTttcttttactataaa
gi|5 : acagtatatctGAG-GTTGTG---------T-TGTC--AGC-------GC-AA-----TA-----T----C-T-G-----T---AT---CCGC-A--A----TGA----G-----AA---A-----A------AGTCC-AGGAA-AG-T-GTCT---GAC-AT---ACT-G-----T----T-----AGCTC------------CCT---G-TA-------------CA--T------CT--C----T----A----A-----G-A----GG---AAGGT---TG-TG-A-T----T-A-----A---C----C-------T-G--TA---T-C--T---A--------TA-GT-GGGGA-A-----------------------------------------AA----A--AT-----C-T------GGAAA----ATTGTTTGA-----------C-C---TA--CT--TTTAG-A-TA-TAAAGTAAGTCA-AG----GTA-T-A--------------CCA-AT--GCAGCTGAAA-T----------------ACT----T-----------T-GAG-AGGAAACTTGT--GTGACgtatctatagtggggaaaaaatctggaaaattgtttgacctacttttagatataaagtaagtcaaggtataccaatgcagctgaaatactttgagaggaaacttgtgtgactaaacagggcaacatctatatccgtaacaaaaa
gi|5 : acagtatatctggttgtgtttaaattttagggttgtgtctctaccagaataaagtctggaaaaccttgacctactttaagcctaaaagcaggtcattgtgcaccaatccagctcacatgaaaattgcatgattatgtcttcctctgaaAGAGGAAG-GTTGTGATT--AA-------------------------------------C----C-T-G-----T---AT---CTAT-A--G----TGGG-GAA-----AA---A-----A--------TCT-GGAAA-AT-T-GTTT---GAC-CT---ACT-T-----T----T-----AG--A------------TATAAAG-TA-A----G--T---CA--A--GGTATA--C----C----A----A-------------------------TG-C-AG-C----T-G-----A--------------A---A--TA---C-T--T------------T--GA-GAGGA-AACTT---G----------------------T-GTGA----CTA----A--A---------C--A--GGGCA----AC------A-----------T-CT-ATA--TC--CGTAACA-taaacagggcaacatctatatccgtaacaaaaa
gi|6 : acagtatatctggttgtgtttaaattttagggttgtgtctctaccagaataaagtctggaaaaccttgacctactttaagcctaaaagcaggtcattgtgcaccaatccagctcacatgaaaattgcatgattatgtcttcctctgaagaggttgtgttgtcagcgcaatatctgtatccgcaatgagaaaaagtccaggaaagtgtctgacatactgttagctccctgtacatctctaGAAA-AC-T-GTCT---GAC-CT---TCT-T-----T----T-----AG--C------------CTTAAAG-TA-G----G--G---CA--T--GGGACT--C----CAATTA----A-----G-C----TA---ACA-----AG-TGAA-C----T-G-----A---T----T-----A-T-G--TA---T-TACT---C--------C--AT-GAGAA-AGATT---G----------------------TAA--A----AAA----A--AT-----G-GC--A--ATGCA----ATATAA--A-----------T-CT-GTA--TC--aaaa
gi|6 : aagatcacaataaatctggttgagtagagtatggaacaaaacctggatccaaaggagaattcatGAAAACTGT--CTGACCTTCTTTTAGC-CTTAA-AGTAGGGC-ATG-G-G--A-CTCCAATTAA-GCTAACAAGT-GA-----------ACTGATTA--TG-T------A---------T--------------T------A---C---T-----C------CA-T--GA--GA-A---AGATTGTAA--A--AAAA-AT-GGCA-------ATG------CAAT---A-TAAATCTGT----ATCCA--ACAT-GA--GAAACA----TCC-TG-GGA--AC---AC-T-ATT-TCAAGATGCAC-CA--TAACCCA-CGAATCA-Gcaacatgagaaacatcctgggaacactatttcaagatgcaccataacccacgaatcagaatacatctcggaggaagctgtgactgcatttcaggcaatatattatctaaacccatgatgcaaaaaatttaattgttacctgcagaagactaataggaaacccagcgtgttcttcag
gi|6 : aagatcacaataaatctggttgagtagagtatggaacaaaacctggatccaaaggagaattcatGAGAAAG-ATTGTAAAA--AAAAT-G-GC--AAT-------GC-AA-----TA-----TAAATC-T-G-----T---AT---CCAA-C--A----TGA--GAA-----AC---A--------------TCCTGGGAACAC-T-ATT----------------------------------------------------------------------T---CA--A--GATGCA--C----C----AT---A-----A-C----CC---A----------CGAATC----A-G-----A--------------A-T-A--CA---T-C--T---C------------G-GAGGA-A-GCT---G----------------------T-G--A----CTG----C--AT-----T-TC--A---GGCA----AT------A-----------T-AT--TA--TC--Taatacatctcggaggaagctgtgactgcatttcaggcaatatattatctaaacccatgatgcaaaaaatttaattgttacctgcagaagactaataggaaacccagcgtgttcttcag
gi|6 : aagatcacaataaatctggttgagtagagtatggaacaaaacctggatccaaaggagaattcatgaaaactgtctgaccttcttttagccttaaagtagggcatgggactccaattaagctaacaagtgaactgattatgtattactccatGGAA-GCTGTGACT--GCA-T-T-TC--AG--------GC-AATATATTA-----T----C-T-A-----A---AC---CCAT-G--A----TG-C-AAA-----AA---A-----aaacccatgatgcaaaaaatttaattgttacctgcagaagactaataggaaacccagcgtgttcttcag
gi|7 : aagatcacaataaatctggttgagtagagtatggaacaaaacctggatccaaaggagaattcatgaaaactgtctgaccttcttttagccttaaagtagggcatgggactccaattaagctaacaagtgaactgattatgtattactccatgagaaagattgtaaaaaaaatggcaatgcaatataaatctgtatccaacatgagaaacatcctgggaacactatttcaagatgcaccataacccacgaatcagaatacatctcggaAGGTC-ATG----GTG-AACCAAACCA-GC-------T-GAT----------AT-----A--TG-A------A---------C--------------TACG---T---A---T-----T------TC-TCCGAAAGA-G---ATGTTGT-G--A--CGAA-A----CA-----------------TGT---A-TA----TGC----ATCCATGAGG--AG--AAAAAG----TCC-AG-AAA--ACTTTGC-G-ACT-Ttttaattgttacctgcagaagactaataggaaacccagcgtgttcttcag
gi|7 : aacagaaaaacacaagagtgtctcaaatggtacattgtacatcccatcttacagtgagattcggccagtatctagcacGAAAGAGAT-GTTGTGACG--AAA------C--A-T-------G---------TA-----T----A-T-G-----C---AT---CC------A----TGAG-GAG-----AA---A-----A------AGTCC-AGAAA-AC-T-TTGC---GAC-TT---ACT-T-----T----T-----AG--C------------CTTAAAG-acttttagccttaaaggcaaaatctgtaatgaaaaaaaagtccagaaaactgatatacttttagcacgaacggatggaccgagtgcaccaattcagctgaaattgtattcccctgagagaaagcctgtgactaaattttagggcagtatatcc
gi|7 : aacagaaaaacacaagagtgtctcaaatggtacattgtacatcccatcttacagtgagattcggccagtatctagcacaggtcatggtgaaccaaaccagctgatatatgaactacgtatttctccTTGCGACT--TAC-T-T-TT--AGCCTTAAAGGC-AA-----AA-----T----C-T-G-----T---A------------A----TGA---AA-----AA---A-----A------AGTCC-AGAAA-AC-T--------GAT-AT---ACT-T-----T----T-----AG--C------------ACGAACG-GATG----G--A---CC--G--AGTGCA--C----C----A----ATTCA-G-C----TG---AAA-----T-------------------------------------T-G--TA---T-T--C---CCC------T--GA-GAGAA-AGCCT---G----------------------T-G--A----CTA----A--AT-----T-TT--A--GGGCA----GT------A-----------gcaaaatctgtaatgaaaaaaaagtccagaaaactgatatacttttagcacgaacggatggaccgagtgcaccaattcagctgaaattgtattcccctgagagaaagcctgtgactaaattttagggcagtatatcc
gi|8 : aacagaaaaacacaagagtgtctcaaatggtacattgtacatcccatcttacagtgagattcggccagtatctagcacaggtcatggtgaaccaaaccagctgatatatgaactacgtatttctccgaaagagatgttgtgacgaaacatgtatatgcatccatgaggagaaaaagtccagaaaact-----T----T-----CG--C------------CTTAGAG-TA-T----G--T---CT--T--GGTGCA--T----C----A----A-----T-C----C-----------------AG-C----T-G-----A---T----A-----A-A-G--TA---T-T--T---C--------TCTGA-GAGGG-AAGCT---GTGACAAAGTCTGTATCCATGCAT-G--A----TGAGAGAA--AG-----T-TC--A--GGAAA----AT------ATTATA------C-CT-AT---TT--TTCAGCCCTA---AAGTAGGTCATG-----GTG-C-A--------------CCC-AT--GCAGCTGAAA-TG--CAA---ACCG--AACTTCAATGTAT--TCCTTA-GAG-ATGATGCTTG----TGACTAAATTTCAGtatcc
gi|8 : gaacaagagtacaaccaaaggtaccaaaatacactattaaacagtgaatttcaacccgtcagcacattatgcattaGAGAGGGAA-GCTGTGACA--AAG-T---------------------------------------C-T-G-----T---AT---CCAT-GC-A----TGAT-GAG-----AG---A-----A------AGTTC-AGGAA-AA-T-ATTA---TAC-CT---ATT-T-----T----TC----AG--C------------CCTAAAG-TA-G----G--T---CA--T--GGTGCAC-C----C----ATGC-A-----G-C----TG---AAA-----TG-CAAA-C----C-G-----AACTT----CA----A-T-G--TA---T-T--C---C--------TTAGA-GATGA-TGCTT---G----------------------T-G--A----CTA----A--AT-----T-TC--A--GGGCA----AT------ggcaat
gi|9 : gaacaagagtacaaccaaaggtaccaaaatacactattaaacagtgaatttcaacccgtcagcacattatgcattattcgccttagagtatgtcttggtgcatcaatccagctgataaagtatttctctGACCTACTTATAGC-CCTAA-AGTAGGTC-ACA----GTG-CACAAATCCA-GC-------T-GA-----------A------A----------------------C--------------T------TGTGC---C-----T------TT-T--GAGGGA-GCTCACCTTGT-A-------AA-AT-CTCA-------ATG------CTGA---A-CA----TGC----ATCCATTATG--TA--AAAAAG----TAA-GG-AAA--ACAATAT-G-ACCTTC---ATGGAC------AAACA-----------CAC--AGATGGATGGA--CAGA-----GTCACAACATAAT---TA-A---TACATCCCCT-CT-GACGATAGG-AGTA
Alignments
lowQualScore : 11111111 33333333333333333 33333333333333333333 11111111111111111111 111 11111111111 11111111111111 11111111111111111111 111111 555555555555555555555555555555 111111111 11111 33333 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 1111111 2222222222222222 1111 11111111 111111 333333333333333333333333 11 11111111 111
lowQualScore : 1 666 1 444 22 00000000 22 1 33333 7777777777 3 1 55555 222 444 22222222222222222 33333 222 555555555555 44 0 1 1 44 222 1 222 1 33333 3333 99999 33 777777777777 0 1 1 1 3333 22 222 22 33 33 33333333333333333333 1 3333 222 0 66666 666 1 3333 1 99999999999999999999 3 22 1 000 1 66 444 66666666666 3 9999999999999999 1 222 3 22 3333 0 33333333333333 22 66666 1 22 22 4444 99999999999999999999 2 33 33 3 000000 5 0 000000000000000000000000000000 4 666 4 777777777 66 88888 66 11 4 4 0 44 1 333 3 2 77777 2 2 8888888 2 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 2 33 33 555 22 2 2222222 2 2 2222222222222222 1 555 5 1111 6666 2 0 11111111 6666 33 2 33 222222 4 4 666 0 66 555555555555555555555555 1 11 8 3 22222222 0 444 6 8 8 1 8
lowQualScore : . ... . ... .. ........ .. . ..... .......... . . ..... ... ... ................. ..... ... ............ .. . . . .. ... . ... . ..... .... ..... .. ............ . . . . .... .. ... .. .. .. .................... . .... ... . ..... ... . .... . .................... . .. . ... . .. ... ........... . ................ . ... . .. .... . .............. .. ..... . .. .. .... .................... . .. .. . ...... . . .............................. . ... . ......... .. ..... .. .. . . . .. . ... . . ..... . . ....... . .................................................................................... . .. .. ... .. . ....... . . ................ . ... . .... .... . . ........ .... .. . .. ...... . . ... . .. ........................ . .. . . ........ . ... . . . . .
lowQualScore : 9 777 5 999 11 44444444 11 5 88888 6666666666 0 5 22222 666 111 44444444444444444 77777 555 777777777777 33 4 4 4 88 777 5 666 4 33333 0000 55555 44 333333333333 5 3 4 4 0000 00 666 00 55 55 99999999999999999999 5 3333 666 3 00000 555 5 1111 5 66666666666666666666 0 00 5 222 5 11 666 33333333333 1 4444444444444444 7 999 3 33 5555 8 11111111111111 33 11111 7 44 44 0000 11111111111111111111 2 22 99 3 888888 7 4 000000000000000000000000000000 4 222 4 000000000 11 22222 11 77 4 4 4 22 6 777 3 9 55555 5 5 1111111 5 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 9 99 44 000 11 9 0000000 9 9 7777777777777777 1 000 7 1111 5555 5 8 11111111 5555 99 9 99 555555 0 4 666 4 33 999999999999999999999999 0 00 0 8 44444444 8 000 4 0 0 0 0
consensus : GAGAGGGAG-GTTGTGACN--AAA-T-T-TC--AGT-------G--C-AA-----TA-----T----C-T-G-----T---AT---CCGT-G--A----TGAC-GAA-----AA---A-----A------AGTCC-GGGAA-AC-T-ATTT---GAC-CT---ACT-T-----T----T-----AG--C------------CCTAAAG-T-A-G----G--T---CA--T--GGTGCA--C----C----A----A-----G-C----TG---AAA-----TG-CGAA-C----T-G-----A---T----C-----AT-G--T-A---T-T--T---C--------T--GA-GAGG-----------A-AGGT-T---GT-G--A----CTA--------------AA--T-----T-TC--A--GGGCA----AT------A-----------C-CT-GTA--TC--TTTAGCA-TAT-AA-GCAGATCG-A-----GTG-CG--------------CCA-AT--CCAGCTGAAA-TG--CGA---ACTG--AACT----TGTAT--TCCTCC-GAG-AGGAAACTTGT--TTGACCTACTTTTAGC-CCTAA-AGTAGGTC-ACG-A-GGTG-CACCAATCCA-GC-------T-GA-----------A------A--TG-C------A---------C--------------T------T---C---T-----T------TT-T--GAGGGA-G---ANATTGT-G--A--CCAA-AT-TTCA-------ACG------CTGT---A-CA----TGC----ATCCGTTACG--GA--AAAAAG----TCC-GG-AAA--AC---AC-G-ACC-TC-AGACGGACTCA-CTAAC-CAAGCGAGTTA-GC---CAGCTGGACGNA--CAGA-CAACGCCATAACAAAAGACATATG---CACGTCCCGT-CT-GANGACGGG-CGTATAAAA
Reference ( family-1432 ) : GAGAGGGAG-GTTGTGACN--AAA-T-T-TC--AGT-------G--C-AA-----TA-----T----C-T-G-----T---AT---CCGT-G--A----TGAC-GAA-----AA---A-----A------AGTCC-GGGAA-AC-T-ATTT---GAC-CT---ACT-T-----T----T-----AG--C------------CCTAAAG-T-A-G----G--T---CA--T--GGTGCA--C----C----A----A-----G-C----TG---AAA-----TG-CGAA-C----T-G-----A---T----C-----AT-G--T-A---T-T--T---C--------T--GA-GAGG-----------A-AGGT-T---GT-G--A----CTA--------------AA--T-----T-TC--A--GGGCA----AT------A-----------C-CT-GTA--TC--TTTAGCA-TAT-AA-GCAGATCG-A-----GTG-CG--------------CCA-AT--CCAGCTGAAA-TG--CGA---ACTG--AACT----TGTAT--TCCTCC-GAG-AGGAAACTTGT--TTGACCTACTTTTAGC-CCTAA-AGTAGGTC-ACG-A-GGTG-CACCAATCCA-GC-------T-GA-----------A------A--TG-C------A---------C--------------T------T---C---T-----T------TT-T--GAGGGA-G---ANATTGT-G--A--CCAA-AT-TTCA-------ACG------CTGT---A-CA----TGC----ATCCGTTACG--GA--AAAAAG----TCC-GG-AAA--AC---AC-G-ACC-TC-AGACGGACTCA-CTAAC-CAAGCGAGTTA-GC---CAGCTGGACGNA--CAGA-CAACGCCATAACAAAAGACATATG---CACGTCCCGT-CT-GANGACGGG-CGTATAAAA
gi|1 : ----T-G-----C---T----T-----AT-G--T-A---T-T--TGCTC--------T--GAAGAAG-----------G-AGGT-T---GT-G--A----C-A--------------AA--T-----G-TC--AGTGGGTA----AC------A-----------T-CTCGTA--T
gi|1 : caatgctatctaaccacgtgtcaactcgctagcaAGAAGGAG-GTTGTGAC---AAA-T-G-TC--AGT-------GGGT-AA-----CA-----T----C-TCG-----T---ATA--CTGT-G--A----GGAC-AAA-----CA---ACTTACA------AGTCC-AAGAA-AC---ATT----GAC--T---ACC-T-----T----TTCC--CG--C------------CCTGAAG-TTA-G----GATT---TA--T--TGTGC---C----T----A----A-----G-C----TGCTAAAA-----TGATGAT-C----T-G-----A---T----C-----ATTG--TTA---TGT--T---C--------T--GA-GAAG-----------ACAGGT-TCTAAT-G--AAGCCCCA--------------AAGAT-----C-TCCAA--AGGTATTTCAG------A-----------C-CT-GTA--TCGGTTTAGTA-TAT-TATGCAGATTG-A-----GTG-TGG-------------CCATATTACCAGCTGAAA-TA--TGA---TCTG--ACTT----TGTAA--TTCTCC-AAG-AGGAACCTTGT--TTGACGTATTGTTAGCTTCTAA-AGTAGCCC-ACGTA-CGGG-C-CCAATTTT-GC-------TCGA-----------A------A--TG-C------AG--------C--------------TC-----T---C---T-----TA-----TT-T--GAGGGGCG---ACATTGT-GGTG--CCAACCT-TTCA-------A-A------ATGT---A-CACAT-TGC----ATCCTTTATG--G---AAAAGG----TCC-AGCAGATCAC---CC-G-ACC-actgtgaggacaaacaacttacaagtccaagaaacattgactaccttttcccgccctgaagttaggatttattgtgcctaagctgctaaaatgatgatctgatcattgttatgttctgagaagacaggttctaatgaagccccaaagatctccaaaggtatttcagacctgtatcggtttagtatattatgcagattgagtgtggccatattaccagctgaaatatgatctgactttgtaattctccaagaggaaccttgtttgacgtattgttagcttctaaagtagcccacgtacgggcccaattttgctcgaaatgcagctctcttatttgaggggcgacattgtggtgccaacctttcaaaatgtacacattgcatcctttatggaaaaggtccagcagatcacccgaccgactagcttaatgcaggattccattcccccgagaacccagacctcaagtcactaaccaagcgagttacgctctcagctgacgtaaacagaacaacaccaaacaaaagacatatgcatgtcccctgctggatgatgggccatataaaaatgtatactttatttc
gi|1 : caatgctatctaaccacgtgtcaactcgctagcatgcttatgtatttgctctgaCC-CG-AGA--AC---CCAG-ACC-TC-A-----AGTCA-CTAAC-CAAGCGAGTTACGCTCTCAGCTG-ACGTAAACAGAACAACACCA-AACAAAAGACATATG---CATGTCCCCTGCTGGATGATGGGCCATATAAAAgactagcttaatgcaggattccattcccccgagaacccagacctcaagtcactaaccaagcgagttacgctctcagctgacgtaaacagaacaacaccaaacaaaagacatatgcatgtcccctgctggatgatgggccatataaaaatgtatactttatttc
gi|10 : caatgctatctaaccacgtgtcaactcgctagcatgcttatgtatttgctctgaagaaggaggttgtgacaaatgtcagtgggtaacatctcgtatactgtgaggacaaacaacttacaagtccaagaaacattgactaccttttcccgccctgaagttaggatttattgtgcctaagctgctaaaatgatgatctgatcattgttatgttctgagaagacaggttctaatgaagccccaaagatctccaaaggtatttcagacctgtatcggtttagtatattatgcagattgagtgtggccatattaccagctgaaatatgatctgactttgtaattctccaagaggaaccttgtttgacgtattgttagcttctaaagtagcccacgtacgggcccaattttgctcgaaatgcagctctcttatttgaggggcgacattgtggtgccaacctttcaaaatgtacacattgcatcctttatggaaaaggtccagcagatcacccgaccgactagcttaatgcaggattccattcc---A-----A------AATCG-GCGAA-AC-T-GTTT---GAC-CT---ACT-T-----T----T-----GGG-C------------CCTAAAG-T-A-G----G--T---CA--T--GGTGTA--C----C----atgtatactttatttc
gi|10 : aaatgtggggttatacctgtaccacaacatctTTGTGACT--ACA-T-T-TC--AGG-------G--C-AA-----CA-----C----C-T-------T---AT---CGGT-A--A----T--T-GAA-----AA---A-------------GTCT-GGGAA-AC-T-GTTT---GAC-CT---ACT-T-----T----C-----AG--CCCTGAATTTCTGCCTAAAT-T-A-G----G--T---CA--T--TATGCA--C----C---------T-----G-C----TG---Attgtgactacatttcagggcaacaccttatcggtaattgaaaaagtctgggaaactgtttgacctactttcagccctgaatttctgcctaaattaggtcattatgcacctgctgactcactc
gi|11 : aaatgtggggttatacctgtaccacaacatctaaaatcggcgaaactgtttgacctacttttgggccctaaagtaggtcatggtgtaccAG-GTTGTGACT--ACA-T-T-GG--AGA-------A--C-AA-----TG-----C----C-T-G-----T---AT---CC------A----TAAC-CAATAGTTAA---A-----A------AAT----GGAA-ACCT-GTTT---GAC-CT---ACT-T-----T----T-----AG--T------------CTTGAAG-T-A-G----G--T---CA--C--GGTGCA--CAATTC----C----A-----G-C----TG---AAG-----TA-CAAA-C----T-GTTCTTA---TA---C-----AT-G--T-C---T-T--C---CTT------T--CA-GAGG-----------A-TATT-T---GT-G--A----CTA--------------AA--T-----T-TC--T--GAACT----AT------A-----------T-CT-GTA--TC--TGTAACctcactc
gi|11 : aAGAGGATA-TTTGTGACT--AAA-T-T-TC--TGA-------A--C-TA-----TA-----T----C-T-G-----T---AT---CTG----------TAAC-GAA-----AA---A-----A------TATCC-gaaaaaatatcc
gi|12 : aaggttgtgactacattggagaacaatgcctgtatccataaccaatagttaaaaaatggaaacctgtttgacctacttttagtcttgaagtaggtcacggtgcacaattccagctgaagtacaaactgttcttatacatgtcttcctttc-CA--------------CTA-AT--CCAGCTGGCG-TG--TGA---ACAG--ATTA----TGTATAATTCCCC-GAGTGGGAGAGTTAT--
gi|12 : gcaagattttgaacatgagtaccacaaagactacatcctatgcccgccggacagtgacaattcatcctgcataagcacttttaccatggcaGAGTGGGAGAGTTATGATA--AAA-T-G-TT--GGT-------G--C-AA-----TA-----T----C-T-G-----TATAAT---CCAT-G--A----T-AT-GAG-----AA---A-----A------AGTTC-AGGAA-AC-T-Agataaaatgttggtgcaatatctgtataatccatgatatgagaaaaagttcaggaaacta
gi|13 : gcaagattttgaacatgagtaccacaaagactacatcctatgcccgccggacagtgacaattcatcctgcataagcacttttaccatggcacactaatccagctggcgtgtgaacagattatgtataattccccG---GAA-----TGGTAAA-C----T-G-----G---T----T-----AT-ACAT-A---T-C--T---C--------C--GC-GAGG-----------A-AGGT-T---CA-G--A----CAA--------------AA--T-----T-TC--A--GTGCA----AT------A-----------
gi|13 : GAGGAAG-GTTCAGACA--AAA-T-T-TC--AGT-------G--C-AA-----TA-----TTA--T-T-GA----T---AT---CCAT---------TAAC-G-------AA---A-----A------AGCCA-AGGAA-AC-T-CTTC---GAC-TT---ATT-T-----T----T-----AG--C------------CC---AA-T-A-G----G--ttattgatatccattaacgaaaaagccaaggaaactcttcgacttatttttagcccaatagggggcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngttaaggtaaaaccttgcgattatattttatg
gi|14 : ggaatggtaaactggttatacatatctccgcTG--TACC----TATAT--CCA--C-AAC-AGAAAACT-AT--TTGATCTACTTTTAGC-CATAA-AGTAGGTC-AT----GGTG-CAACAATCCA-GC-------T-GA-----------C------A--TG-gggcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngttaaggtaaaaccttgcgattatattttatg
gi|14 : tgtgagtcttaatgaaaatctccaaactggctgatggtaataaaatcaaatatggtatatctgatcacgagtaagcatgaaaccaaatacaC-AGAAA-AC-T-ATTT---GAT-CT---ACT-T-----T----T-----AG--C------------CATAAAG-T-A-G----G--T---CA--T--GGTGCA--A----C----AATCCA-----G-C----TG---ACA-----TG-TGAA-C----T-G-----A---T----T-----AT-G--T-AAT-T-C--T---C--------T--GA-GAtgaactgattatgtaattctctgaga
gi|15 : tgtgagtcttaatgaaaatctccaaactggctgatggtaataaaatcaaatatggtatatctgatcacgagtaagcatgaaaccaaatacatgtacctatatccacaaTTGTGACT--TGA-T-G-TC--AAG-------G--T-AA-----TG-----T----C-T-G-----T---AT---GC------A----TAACTGAA-----AA---A-----A------AGTTC-GGAAA-AC-T-GTTT---GTC-CT---ACC-T-----T----T-----AG--C------------CCTAAAG-T-A-G----G--T---GAACT--GATGCA--C----C----GATCCA-----G-T----GG---AAA-----TG-CTAA-C----TCG-----C---T----CTCCAGATAA--C-A---C-T--T---CT-------T--GA-GGGA-----------G-ATAT-T---GT-G--A----CCA--------------AA--T-----T-TA--A--AGG
gi|16 : gcCT-T-----T----T-----AG--C------------TTTCAAG-T-A-G----G--G---CA--T--GATGCA--C----C----A----ATGTAGG-C----TG---ACACTTCTCG-TGAA-C----------------T----C-----AC-G--T-AT--T-T--T---C--------T--TA-GAGG-------------AGGT-T---GT-A--A-----TAT-------------AA--TG----T-CC--A--GTGCA----AT------AT----------C-TT-GTA--Tt
gi|16 : CTTTTAGC-TTTCA-AGTAGGGC-ATG-A---TG-CACCAATGTAGGC-------T-GACACTTCTCGTGA------A--CT-C------A---------C--------------G------T---A---T-----T------TTCT--TAGAG--G---AGGTTGT-A--A--TATA-ATGTCCA-------GTG------CAAT---ATCT----TGT----ATATATCATGATGACGAAAAAG----TCCAAG-AAA--AC---atatcatgatgacgaaaaagtccaagaaaactattttgaaacctacttaagctgtaacaa
gi|16 : AGAGG-AG-GTTGTAATA--TAA-TGT-CC--AGT-------G--C-AA-----TA-----T----CTT-G-----T---ATATATCAT-G--A----TGAC-G-------AA---A-----A------AGTCCAAGAAA-AC-T-ATTTTGAAAC-CT---ACT-T-----tattttgaaacctacttaagctgtaacaa
gi|17 : cttttagctttcaagtagggcatgatgcaccaatgtaggctgacacttctcgtgaactcacgtattttctt-GTGGTGACA--AAA-T-T-TC--AGT-------G--C-AA-----TAG----T----C---------T---AT---CC-----------------AA-----AA-----------------------GAAA-AC-TAACTT---GAC-CT---ATT-C-----T----TTAGTCAG--C------------CCTATAG-T-A-G----G--T---CA--CA-GATGCA--CTAATT----A----A-----GCC----TG---AAA-----TG-CAAA-C----T-G-----A--------------AT-A--T-A---T-T--T---C--------T--Gaagctgtaacaa
gi|18 : T-T-----T----T-----AG--C------------TTTCAAG-T-A-G----G--G---CA--T--GATGCA--C----C----A----ATGTA-G-C----TG---ACA-----CG-TGAA-C----T----------------C-----AC-G--T-A---T-T--TTT-C--------T--GA-GAGG-----------G-AGGT-T---GT-G--A-----TAT-------------AA--T-----G-TC--A--GTGCA----AT------A-----------T-CT-GTA--Ttcgtgacccacatttgaatctattctg
gi|18 : TTTTAGC-TTTCA-AGTAGGGC-ATG-A---TG-CACCAATGTA-GC-------T-GA-----------C------ACGTG-A------A---------C--------------TCACGTAT---T---T-----T------TC-T--GAGAGG-G---AGGTTGT-G--A--TATA-AT-GTCA-------GTGCAATATCTGT---A-TA----T------ATCTATGATG--AG--AAAAAG----TCC-AA-GAA--AC---atatctatgatgagaaaaagtccaagaaactatttgacctacttaagct
gi|18 : GAGAGGGAG-GTTGTGATA--TAA-T-G-TC--AGT-------G--C-AA-----TA-----T----C-T-G-----T---AT---ATATCT--A----TGAT-GAG-----AA---A-----A------AGTCC-AAGAA-AC-T-ATTT---GAC-CT---ACT-T-----tatttgacctacttaagct
gi|19 : ttttagctttcaagtagggcatgatgcaccaatgtagctgacacgtgaactcacgtatttttctG-GTTGTTAC-----A-T-TGTC---GT-------G--CTAC-----TA-----T----T-A-C-----T---AT---C-AT-G--A----TGAC-TAA-----AA-----------------GTCC-AAGCA-AT-T-ATGT---GGC-TT---ACTCT-----T----T-----AG--C------------CCTAAAG---A-G----A--T---TA--TACGATGCAAGT----T----A----A-----T-C----TG---AAA-----CG-TAAA------T-A-----A---T----T-----A--G--T-A---T-C--C---C--------T--GA-GAGG-----------G-ATGT-T---GTCG--A----CTC--------------AA--aagct
gi|2 : AAAA-T-A-G----A--T---CA--T--GGTATA--C----C----A----ATATT-G-C----TG---AAA-----TG-TGAA-C----T-G-----A---TGATGC-----AT-G--T-ATT-T-T--T---C--------T--AA-GA---------------------------G--A----CAA--------------AT--T-----T-TC--A--GTGTA----AT------A-----------------TA--TC--TT
gi|2 : GACA--AAT-T-T-TC--AGT-------G--T-AA-----TA-----TAT--C-T-------T---GT---CC------A----AGAC-AAG-----GA---A-----A------AATAT-AGAAA-AC-C-ACCT---T-C-TT---ACT-TAAGAAT----T-----AG--C------------CCCATAA-T-A-G----G--T---AA--T--A-CGAA--T----T----A----A-----G-C----TA---AAA-----TG-CAAA-A----T-G-----AA--T----C------T-G--C-A---T-T--T---CCATAGCTGT--GA-GAGG-----------A-ATGC-T---GT-G--A----CTA--------------CA--T-----T-TC--A--AAGTG----AT------A-----------C-AT-GTG--TC--CATAACC-AAT-AA--CAAAAAA-A-----ATA-TGGAAAACTGTTTTACCTA-CT--GTAGCTGAAA-TA--CAA---ACTG--AAC------GTAT--TCCTTC-TAG-TGAAAGCTTGT--gtccaagacaaggaaaaatatagaaaaccaccttcttacttaagaattagccccataataggtaatacgaattaagctaaaatgcaaaatgaatctgcatttccatagctgtgagaggaatgctgtgactacatttcaaagtgatacatgtgtccataaccaataacaaaaaaaatatggaaaactgttttacctactgtagctgaaatacaaactgaacgtattccttctagtgaaagcttgtgactaagtctgtattcatagcaaaaaaaaaaaaaatcccgaaagtgtttaacttgaagtagctagaccatggtgcatcaattaagctgaaatgcaaactctctacttacgtttttgaggaagaaattgagactaaatctcaatatatgcatccgttacagaaaaaaaaatatctggaaaacgtatatctcagacggactca
gi|2 : aaaatagatcatggtataccaatattgctgaaatgtgaactgatgatgcatgtatttttctaagaGAGAGGAAT-GCTGTGACT--ACA-T-T-TC--AAA-------G--T-GA-----TA-----C----A-T-G-----T---GT---CCAT-A--ACCAATAAC--AA-----AA---A-----A------AATAT-GGAAA-AC-T-GTTT---TAC-CT---ACT-----------------------------------------G-T-A-G-------------------------------------------------C----TG---AAA-----TA-CAAA-C----T-G-----A--------------AC-G--T-A---T-T--C---C--------TTCTA-GTGA-----------A-AGCT-T---GT-G--A----CTA--------------AG--TCTGTAT-TC--A--TAGCA----AA------AAAAAAAAAAATC-CC-GAAAGTG--TTTAACT-TG--AA-GTAGCTAG-ACCATGGTG-CA--------------TCA-AT--TAAGCTGAAA-TG--CAA---ACTgactaagtctgtattcatagcaaaaaaaaaaaaaatcccgaaagtgtttaacttgaagtagctagaccatggtgcatcaattaagctgaaatgcaaactctctacttacgtttttgaggaagaaattgagactaaatctcaatatatgcatccgttacagaaaaaaaaatatctggaaaacgtatatctcagacggactca
gi|2 : aaaatagatcatggtataccaatattgctgaaatgtgaactgatgatgcatgtatttttctaagagacaaattttcagtgtaatatatcttgtccaagacaaggaaaaatatagaaaaccaccttcttacttaagaattagccccataataggtaatacgaattaagctaaaatgcaaaatgaatctgcatttccatagctgt-----T----C-T-G-----T---AT---TCAT-AGCA----AAAA-AAA-----AA---A-----A------AATCC-CG-AA-AG-T-GTTT---AAC----------T-----TGAAGT-----AG--C--------------------T-A-G----A--C---CA--T--GGTGCA--T----C----A----ATTAA-G-C----TG---AAA-----TG-CAAA-C----T-C-----T---C----T-----AC-T--T-ACG-T-T--T---T--------T--GAGGAAG-----------A-A-AT-T---GA-G--A----CTA--------------AA--T-----C-T---------CA----AT------A-----------T-AT-GCA--TC--ctctacttacgtttttgaggaagaaattgagactaaatctcaatatatgcatccgttacagaaaaaaaaatatctggaaaacgtatatctcagacggactca
gi|2 : aaaatagatcatggtataccaatattgctgaaatgtgaactgatgatgcatgtatttttctaagagacaaattttcagtgtaatatatcttgtccaagacaaggaaaaatatagaaaaccaccttcttacttaagaattagccccataataggtaatacgaattaagctaaaatgcaaaatgaatctgcatttccatagctgtgagaggaatgctgtgactacatttcaaagtgatacatgtgtccataaccaataacaaaaaaaatatggaaaactgttttacctactgtagctgaaatacaaactgaacgtattccttctagtgaaagcttgtgactaagTTTAAC-T-TGA-AGTAGCTAGACC-ATGGTG-CATCAATTAA-GC-------T-GA-----------A------A--TG-C------AAACTCTCTAC--------------T------TA--CG--T-----T------TT-T--GAGGAA-G---AAATTGA-G--A--CTAA-AT-CTCA-------A-----------T---A-TA----TGC----ATCCGTTACA--GA--AAAAAAAATATCT-GG-AAA--AC---GT-ATATC-TC-AGACGGACTCA-cgttacagaaaaaaaaatatctggaaaacgtatatctcagacggactca
gi|20 : aaaatagatcatggtataccaatattgctgaaatgtgaactgatgatgcatgtatttttctaagagacaaattttcagtgtaatatatcttgtccaagacaaggaaaaatatagaaaaccaccttcttacttaagaattagccccataataggtaatacgaattaagctaaaatgcaaaatgaatctgcatttccatagctgtgagaggaatgctgtgactacatttcaaagtgatacatgtgtccataaccaataacaaaaaaaatatggaaaactgttttacctactgtagctgaaatacaaactgaacgtattccttctagtgaaagcttgtgactaagtctgtattcatagcaaaaaaaaaaaaaatcccgaaagtgGAAAACTC-T--CTGACCTACTTTGAGC-ACGGATAGT-------------GTG-CACTAATCTA-GC-------T-GA-----------A------A--TG-C------AAAGTC----C--------------C------T---C---T-----TACTATTTT-C--GAGAGA-A---AAATTGT-G--A--CCAA-AT-TTTA-------ACA------CTGT---A-CA----TGCATCGATCTGTTATG--GG--AAAAAG----TCA-GG-AAA--AC---AT-G-
gi|21 : ---ACT-A-----T----A-----AG--T------------CTTAGAG-T-A-GCTAGG--T---TA--C--AGAACA--C----CGATTA----A-----G-C----TG---AAA-----TG-TAGA-C----T-GA----A---T----C------T-G--T-A---T-C--T---C------------------------------------T---CT-G--G----CTA--------------CA--T-----T-TC--A--GGATA----AT------A-----------C-CT-GTA--TC--
gi|21 : aaaaacgtccccaaTGGCT--ACA-T-T-TC--AGG-------A--T-AA-----TA-----C----C-T-G-----T---AT---CCGT-C--A-----GAA-AAA-----AA---A-----ACAATTTAATCC-GAAAA-AC-cgtcagaaaaaaaaacaatttaatccgaaaaacg
gi|22 : aaaaacgtccccaaactataagtcttagagtagctaggttacagaacaccgattaagctgaaatgtagactgaatctgtatctctc-GGTGTCACCAATCCA-GC-------T-GG-----------A------T--TGCC------A---------CACACTGAACTTGTAT------T---C---C-----T------TT-G--GAGAAG-A---AAATTGT-G--ATTTTAC-AT-TTCCT------AGG------CAAT---ATCC----TGT----ATACATAAT----A--AAGAAG----TCA-GG-AAA--Ag
gi|22 : -----GTGTCA--------------CCA-AT--CCAGCTGGAT-TG--CCACACACTG--AACT----TGTAT--TCCTTTGGAG-AAGAAAATTGT--attttgacactattttttaagccctaaagt
gi|22 : gGAGAAGAAA-ATTGTGATTTTACA-T-T-TCCTAG--------G--C-AA-----TA-----T----CCT-G-----T---AT---ACAT-A--A----T------A-----AA---G-----A------AGTCA-GGAAA-AA-T--TTT---GACACT---ATT-T-----T----TTA---AG--C------------CCTAAAG-T-gattttacatttcctaggcaatatcctgtatacataataaagaagtcaggaaaaattttgacactattttttaagccctaaagt
gi|23 : ggtgtcaccaatccagctggattgccacacactgaacttgtattcctttgGTC-ACG----GTT-CACCAATCCA-GC-------T-GA-----------AAC----A--TA-A------A---------C--------------TCAC---T---C---TTACGAT------TC-T--GAGGGA-C---AAATTGT-G--A--TCAA-A--TTCA-------ACG------CT------------------------GTTACG--GA--AAATAG----TCC-GG-AAA--AC---AA-G-GTT-TC-AGACAGAC
gi|24 : --TTGATCTATTTTTAGC-CCTTA-AGTAGGTC-ATA-C-AATG-CACCAGTCCA-GA-------T-GA-----------A------A--TG-CAA----A---------A--------------T------T---C-----------------T-T--GGGGGA-G---AT-----------------AT-TTTA-------ATG------CTAT---A-CA----Ta
gi|25 : ctagaaaaataGCTGGCCAGA--CCGA-CAACGCCATAA-----GAT-TATA---CAC--TCTGT-CT-AAAGACGGG-CATATAAAA
gi|26 : tAGG-CCTAA-AGTAGATT-ACT----GTG--ACTAATCCA-GC-------T-GA-----------C------A--TG-atgacacagtcagccaaaaaatgaaa
gi|27 : gtgttccatatcaataaataaagtccggatgctaGCCGGACGCA--CGGA-CAACGCCATAAC---ATACATATGTAATACATCCCGC-CT-GAAGACGCG-CGTATGAAAacaatt
gi|28 : TAAAA-C-A-A----G--T---CA--T--GGTGCA--C----CAATTA----A-----G-C----TG---ACA-----TA-TGAG-C----------------T----T-----AT-G--T-A---T-TTCT---C--------T--AA-GAGG-----------
gi|3 : tGAGAAGGAG-GTTGTGACA--AAA-T-G-TC--AGT-------G--T-AA-----CA-----T----C-T-G-----T---AT---CTGT-G--A----GGAC-AAA-----AACTTAC----A------AGTCC-AAGAA-AC-T-ATTT---GAC-TA---ACT-T-----T----T-----AG--C------------CCTGAAG-T-A-G----A--T---CA--T--GGTGCA--T---------A----A-----G-C----TG---AAA-----TG-TGAT-C----T-G-----A---T----C-----AT-G--T-A---T-T--T---C--------T--GA-GAAG-----------A-AGGT-T---GT-G--A----CCA--------------AA--T-----C-TC--A--AGGTA----TT------A-----------C-CT-GTA--CT--TTTAGTA-TAT-AG-GCAGATTG-A-----GTG-TG--------------CCA-AT--CCAGCTGAAA-TA--TGA---TCTG--AACT----TGTAT--TCCTCC-AAG-AGGAACCTTGT--TTGACGTATGTTTAGC-TCTAA-AGTAGCCC-ACGTACGGTG-CACCAATTCT-GC-------T-GA-----------A------A--TG-C------A---------C--------------T------T---C---T-----T------TT-T--GAGGGC-G---ACATTGT-G--G--CCAA-AT-TTCA-------ACA------ATGT---A-CA----TGC----ATCCTTTATG--GA--AAAAGG----TCC-AG-CAA--TC---AC-G-ACC-TC-AGACAGACTCAGCCAA--CAAGCCAGTTA-GC---CAGCTGGACGTA--CAGA-CAACACCATAACAAAAGACATATG---CATGTCCTGT-CT-GATGATGGG-CATATAAAA
gi|4 : AAACT-GT--TTGAC-TACTTTTAGC-TCTAA-TGTAGGTC-ACA----GTG-CATCAACCCC-GC-------T-GA-----------A------A--TG-C------AATCCCACT-C--------------T------TGCGC---T-----T------AT-T--GAGGGA-G---AAATTGT-G--A--CCAA-AT-TTCA-------ATG------CTAT---A-CA----TGC----ATCCATCACA--G----AAAAG----TCT-TA-AAA--AC---AT-G-ACC-TT-GGATGGAC
gi|4 : ccacaGAGGGAGAA-ATTGTGACC--AAA-T-T-TC--AAT-------G--C-TA-----TA-----C----A-T-G-----C---AT---CC------A----TCAC---A-----GA---A-----A------AGTCT-TAAAA-AC---AT-----GAC-CTTGGA--------------T-----GG--A------------CATATAGAT-G-G----A--TGGATA--T--ATTGCG--C----C----A----ATCCA-G-C----CG---AAA-----TG-CAAA-A----T-G-----A---T----T-----TT-G--T-A---T-T--C---C--------TCCGA-GATG-----------A-AGCT-T---TC-G--C----CTA--------------AA--T-----T-TC--A--GGGCA----AT------A-----------CACT-GTatatagatggatggatatattgcgccaatccagccgaaatgcaaaatgattttgtattcctccgagatgaagctttcgcctaaatttcagggcaatacactgtctgacaggtatatgtattgaaaaaagctggaaaactatttgtcctactttccgccttaaagtgggtcatggtgcaccaatccccttgaaatgaaaactcattcttacgcttcctgagggagaaattgtgattaaattttaaggttcttttactataaa
gi|4 : ccacaaaactgtttgactacttttagctctaatgtaggtcacagtgcatcaaccccgctgaaatgcaatcccactcttgcgcttattTG-CGCCAATCCA-GC-------C-GA-----------A------A--TG-CAAAATGA---------T--------------T------T---TGTAT-----TCC----TC-C--GAGATG-A---AGCTTTC-G--C--CTAA-AT-TTCAGGGCAATACA------CTGTCTGA-CA----GGT----ATATG-TATT--GA--AAAAAG-----CT-GG-AAA--AC---ctgacaggtatatgtattgaaaaaagctggaaaactatttgtcctactttccgccttaaagtgggtcatggtgcaccaatccccttgaaatgaaaactcattcttacgcttcctgagggagaaattgtgattaaattttaaggttcttttactataaa
gi|4 : ccacaaaactgtttgactacttttagctctaatgtaggtcacagtgcatcaaccccgctgaaatgcaatcccactcttgcgcttattgagggagaaattgtgaccaaatttcaatgctatacatgcatccatcacagaaaagtcttaaaaacatgaccttggatggacatatagatggatggatatatGAGATGAAG-CTTTCGCCT--AAA-T-T-TC--AGG-------G--C-AA-----TACACTGT----C-T-GACAGGT---AT---ATGT-A--T----TGA----------AA---A-----A------AG-CT-GGAAA-AC-T-ATTT---GTC-CT---ACT-T-----T----C-----CG--C------------CTTAAAG-T-G-G----G--T---CA--T--GGTGCA--C----C----A----A-----T-CCCCTTG---AAA-----TG-AAAA-C----T-C-----A---T----T-----CT----T-ACGCT-T--C---C--------T--GA-GGGA-----------G-AAAT-T---GT-G--A----TTA--------------AA--T-----T-TT--A--AGGtatttgtcctactttccgccttaaagtgggtcatggtgcaccaatccccttgaaatgaaaactcattcttacgcttcctgagggagaaattgtgattaaattttaaggttcttttactataaa
gi|5 : ccacaaaactgtttgactacttttagctctaatgtaggtcacagtgcatcaaccccgctgaaatgcaatcccactcttgcgcttattgagggagaaattgtgaccaaatttcaatgctatacatgcatccatcacagaaaagtcttaaaaacatgaccttggatggacatatagatggatggatatattgcgccaatccagccgaaatgcaaaatgattttgtattcctccG-GTTGTGTTT--AAA-T-T-TT--AGG-------G--T-TG-----TG-----T----C-T-C-----T---AC---CAG-----------------A-----AT---A-----A------AGTCT-GGAAA-AC-C---TT---GAC-CT---ACT-T-----T----A-----AG--C------------CTAAAAG-C-A-G----G--T---CA--T--TGTGCA--C----C----AATCCA-----G-C----TC---ACA-----TG-AAAA-TTGCAT-G-----A---T----T-----AT-G--T-C---T-TCCT---C--------T--GA--AG--------------AGGT-T---GT-G----------------------------T-----TGTC--A--GCGCA----AT------A-----------T-CT-GTA--TC--C---GCA--AT-GA-GAAAA--------------------------------A-GT--CCAG--GAAAGTGTCTGACATACTGTTAGCTCCC-TGTAC--ATCTCT-AAG-AGGAAGGTTGTGATTAACCTttcttttactataaa
gi|5 : acagtatatctGAG-GTTGTG---------T-TGTC--AGC-------G--C-AA-----TA-----T----C-T-G-----T---AT---CCGC-A--A----TGA----G-----AA---A-----A------AGTCC-AGGAA-AG-T-GTCT---GAC-AT---ACT-G-----T----T-----AGCTC------------CCT---G-T-A-------------CA--T------CT--C----T----A----A-----G-A----GG---AAGGT---TG-TG-A-T----T-A-----A---C----C------T-G--T-A---T-C--T---A--------TA-GT-GGGG-----------A-AA--------------------A--------------AA--T-----C-T------GGAAA----ATTGTTTGA-----------C-C---TA--CT--TTTAG-A-TATAAA-GTAAGTCA-AG----GTA-TA--------------CCA-AT--GCAGCTGAAA-T----------------ACT----T-----------T-GAG-AGGAAACTTGT--GTGACgtatctatagtggggaaaaaatctggaaaattgtttgacctacttttagatataaagtaagtcaaggtataccaatgcagctgaaatactttgagaggaaacttgtgtgactaaacagggcaacatctatatccgtaacaaaaa
gi|5 : acagtatatctggttgtgtttaaattttagggttgtgtctctaccagaataaagtctggaaaaccttgacctactttaagcctaaaagcaggtcattgtgcaccaatccagctcacatgaaaattgcatgattatgtcttcctctgaaAGAGGAAG-GTTGTGATT--AA---------------------------------------C----C-T-G-----T---AT---CTAT-A--G----TGGG-GAA-----AA---A-----A--------TCT-GGAAA-AT-T-GTTT---GAC-CT---ACT-T-----T----T-----AG--A------------TATAAAG-T-A-A----G--T---CA--A--GGTATA--C----C----A----A-------------------------TG-C-AG-C----T-G-----A--------------A--A--T-A---C-T--T------------T--GA-GAGG-----------A-AACT-T---GT-GTGA----CTA--------------AA-----------C--A--GGGCA----AC------A-----------T-CT-ATA--TC--CGTAACA-taaacagggcaacatctatatccgtaacaaaaa
gi|6 : acagtatatctggttgtgtttaaattttagggttgtgtctctaccagaataaagtctggaaaaccttgacctactttaagcctaaaagcaggtcattgtgcaccaatccagctcacatgaaaattgcatgattatgtcttcctctgaagaggttgtgttgtcagcgcaatatctgtatccgcaatgagaaaaagtccaggaaagtgtctgacatactgttagctccctgtacatctctaGAAA-AC-T-GTCT---GAC-CT---TCT-T-----T----T-----AG--C------------CTTAAAG-T-A-G----G--G---CA--T--GGGACT--C----CAATTA----A-----G-C----TA---ACA-----AG-TGAA-C----T-G-----A---T----T-----AT-G--T-A---T-TACT---C--------C--AT-GAGA-----------A-AGAT-T---GTAA--A----AAA--------------AA--T-----G-GC--A--ATGCA----ATATAA--A-----------T-CT-GTA--TC--aaaa
gi|6 : aagatcacaataaatctggttgagtagagtatggaacaaaacctggatccaaaggagaattcatGAAAACTGT--CTGACCTTCTTTTAGC-CTTAA-AGTAGGGC-ATG-G-G--A-CTCCAATTAA-GCTAACAAGT-GA-----------ACTGATTA--TG-T------A---------T--------------T------A---C---T-----C------CA-T--GA--GA-A---AGATTGTAA--A--AAAA-AT-GGCA-------ATG------CAAT---A-TAAATCTGT----ATCCA--ACAT-GA--GAAACA----TCC-TG-GGA--AC---AC-T-ATT-TCAAGATGCAC-CA--TAAC-CCA-CGAATCA-Gcaacatgagaaacatcctgggaacactatttcaagatgcaccataacccacgaatcagaatacatctcggaggaagctgtgactgcatttcaggcaatatattatctaaacccatgatgcaaaaaatttaattgttacctgcagaagactaataggaaacccagcgtgttcttcag
gi|6 : aagatcacaataaatctggttgagtagagtatggaacaaaacctggatccaaaggagaattcatGAGAAAG-ATTGTAAAA--AAAAT-G-GC--AAT-------G--C-AA-----TA-----TAAATC-T-G-----T---AT---CCAA-C--A----TGA--GAA-----AC---A--------------TCCTGGGAACAC-T-ATT-----------------------------------------------------------------------T---CA--A--GATGCA--C----C----AT---A-----A-C----CC---A----------CGAATC----A-G-----A--------------AT-A--C-A---T-C--T---C------------G-GAGG-----------A-A-GC-T---GT-G--A----CTG--------------CA--T-----T-TC--A---GGCA----AT------A-----------T-AT--TA--TC--Taatacatctcggaggaagctgtgactgcatttcaggcaatatattatctaaacccatgatgcaaaaaatttaattgttacctgcagaagactaataggaaacccagcgtgttcttcag
gi|6 : aagatcacaataaatctggttgagtagagtatggaacaaaacctggatccaaaggagaattcatgaaaactgtctgaccttcttttagccttaaagtagggcatgggactccaattaagctaacaagtgaactgattatgtattactccatGGAA-GCTGTGACT--GCA-T-T-TC--AG--------G--C-AATATATTA-----T----C-T-A-----A---AC---CCAT-G--A----TG-C-AAA-----AA---A-----aaacccatgatgcaaaaaatttaattgttacctgcagaagactaataggaaacccagcgtgttcttcag
gi|7 : aagatcacaataaatctggttgagtagagtatggaacaaaacctggatccaaaggagaattcatgaaaactgtctgaccttcttttagccttaaagtagggcatgggactccaattaagctaacaagtgaactgattatgtattactccatgagaaagattgtaaaaaaaatggcaatgcaatataaatctgtatccaacatgagaaacatcctgggaacactatttcaagatgcaccataacccacgaatcagaatacatctcggaAGGTC-ATG----GTG-AACCAAACCA-GC-------T-GAT----------AT-----A--TG-A------A---------C--------------TACG---T---A---T-----T------TC-TCCGAAAGA-G---ATGTTGT-G--A--CGAA-A----CA-----------------TGT---A-TA----TGC----ATCCATGAGG--AG--AAAAAG----TCC-AG-AAA--ACTTTGC-G-ACT-Ttttaattgttacctgcagaagactaataggaaacccagcgtgttcttcag
gi|7 : aacagaaaaacacaagagtgtctcaaatggtacattgtacatcccatcttacagtgagattcggccagtatctagcacGAAAGAGAT-GTTGTGACG--AAA------C--A-T-------G-----------TA-----T----A-T-G-----C---AT---CC------A----TGAG-GAG-----AA---A-----A------AGTCC-AGAAA-AC-T-TTGC---GAC-TT---ACT-T-----T----T-----AG--C------------CTTAAAG-acttttagccttaaaggcaaaatctgtaatgaaaaaaaagtccagaaaactgatatacttttagcacgaacggatggaccgagtgcaccaattcagctgaaattgtattcccctgagagaaagcctgtgactaaattttagggcagtatatcc
gi|7 : aacagaaaaacacaagagtgtctcaaatggtacattgtacatcccatcttacagtgagattcggccagtatctagcacaggtcatggtgaaccaaaccagctgatatatgaactacgtatttctccTTGCGACT--TAC-T-T-TT--AGCCTTAAAGG--C-AA-----AA-----T----C-T-G-----T---A------------A----TGA---AA-----AA---A-----A------AGTCC-AGAAA-AC-T--------GAT-AT---ACT-T-----T----T-----AG--C------------ACGAACG-G-ATG----G--A---CC--G--AGTGCA--C----C----A----ATTCA-G-C----TG---AAA-----T------------------------------------T-G--T-A---T-T--C---CCC------T--GA-GAGA-----------A-AGCC-T---GT-G--A----CTA--------------AA--T-----T-TT--A--GGGCA----GT------A-----------gcaaaatctgtaatgaaaaaaaagtccagaaaactgatatacttttagcacgaacggatggaccgagtgcaccaattcagctgaaattgtattcccctgagagaaagcctgtgactaaattttagggcagtatatcc
gi|8 : aacagaaaaacacaagagtgtctcaaatggtacattgtacatcccatcttacagtgagattcggccagtatctagcacaggtcatggtgaaccaaaccagctgatatatgaactacgtatttctccgaaagagatgttgtgacgaaacatgtatatgcatccatgaggagaaaaagtccagaaaact-----T----T-----CG--C------------CTTAGAG-T-A-T----G--T---CT--T--GGTGCA--T----C----A----A-----T-C----C-----------------AG-C----T-G-----A---T----A-----AA-G--T-A---T-T--T---C--------TCTGA-GAGGGAAGCTGTGACA-AAGTCT---GT-A--T----CCATGCATGATGAGAGAAA--G-----T-TC--A--GGAAA----AT------ATTATA------C-CT-AT---TT--TTCAGCCCTA--AA-GTAGGTCATG-----GTG-CA--------------CCC-AT--GCAGCTGAAA-TG--CAA---ACCG--AACTTCAATGTAT--TCCTTA-GAG-ATGATGCTTG----TGACTAAATTTCAGtatcc
gi|8 : gaacaagagtacaaccaaaggtaccaaaatacactattaaacagtgaatttcaacccgtcagcacattatgcattaGAGAGGGAA-GCTGTGACA--AAG-T-----------------------------------------C-T-G-----T---AT---CCAT-GC-A----TGAT-GAG-----AG---A-----A------AGTTC-AGGAA-AA-T-ATTA---TAC-CT---ATT-T-----T----TC----AG--C------------CCTAAAG-T-A-G----G--T---CA--T--GGTGCAC-C----C----ATGC-A-----G-C----TG---AAA-----TG-CAAA-C----C-G-----AACTT----CA----AT-G--T-A---T-T--C---C--------TTAGA-GATG-----------A-TGCT-T---GT-G--A----CTA--------------AA--T-----T-TC--A--GGGCA----AT------ggcaat
gi|9 : gaacaagagtacaaccaaaggtaccaaaatacactattaaacagtgaatttcaacccgtcagcacattatgcattattcgccttagagtatgtcttggtgcatcaatccagctgataaagtatttctctGACCTACTTATAGC-CCTAA-AGTAGGTC-ACA----GTG-CACAAATCCA-GC-------T-GA-----------A------A----------------------C--------------T------TGTGC---C-----T------TT-T--GAGGGA-GCTCACCTTGT-A-------AA-AT-CTCA-------ATG------CTGA---A-CA----TGC----ATCCATTATG--TA--AAAAAG----TAA-GG-AAA--ACAATAT-G-ACCTTC---ATGGA--CA---AACACA---------------CAGATGGATGGA--CAGA-----GTCACAACATAAT---TA-A---TACATCCCCT-CT-GACGATAGG-AGTA
Alignments
lowQualScore : 11111111 33333333333333333 33333333333333333333 11111111111111111111 111 11111111111 11111111111111 11111111111111111111 111111 555555555555555555555555555555 111111111 11111 33333 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 1111111 2222222222222222 1111 11111111 111111 333333333333333333333333 11 11111111 111
lowQualScore : 1 666 1 444 22 00000000 22 1 33333 7777777777 3 1 55555 222 444 22222222222222222 33333 222 555555555555 44 0 1 1 44 222 1 222 1 33333 3333 99999 33 777777777777 0 1 1 1 3333 22 222 22 33 33 33333333333333333333 1 3333 222 0 66666 666 1 3333 1 99999999999999999999 3 22 1 000 1 66 444 66666666666 3 9999999999999999 1 222 3 22 3333 0 33333333333333 22 66666 1 22 22 4444 99999999999999999999 2 33 33 3 000000 5 0 000000000000000000000000000000 4 666 4 777777777 66 88888 66 11 4 4 0 44 1 333 3 2 77777 2 2 8888888 2 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 2 33 33 555 22 2 2222222 2 2 2222222222222222 1 555 5 1111 6666 2 0 11111111 6666 33 2 33 222222 4 4 666 0 66 555555555555555555555555 1 11 8 3 22222222 0 444 6 8 8 1 8
lowQualScore : . ... . ... .. ........ .. . ..... .......... . . ..... ... ... ................. ..... ... ............ .. . . . .. ... . ... . ..... .... ..... .. ............ . . . . .... .. ... .. .. .. .................... . .... ... . ..... ... . .... . .................... . .. . ... . .. ... ........... . ................ . ... . .. .... . .............. .. ..... . .. .. .... .................... . .. .. . ...... . . .............................. . ... . ......... .. ..... .. .. . . . .. . ... . . ..... . . ....... . .................................................................................... . .. .. ... .. . ....... . . ................ . ... . .... .... . . ........ .... .. . .. ...... . . ... . .. ........................ . .. . . ........ . ... . . . . .
lowQualScore : 9 777 5 999 11 44444444 11 5 88888 6666666666 0 5 22222 666 111 44444444444444444 77777 555 777777777777 33 4 4 4 88 777 5 666 4 33333 0000 55555 44 333333333333 5 3 4 4 0000 00 666 00 55 55 99999999999999999999 5 3333 666 3 00000 555 5 1111 5 66666666666666666666 0 00 5 222 5 11 666 33333333333 1 4444444444444444 7 999 3 33 5555 8 11111111111111 33 11111 7 44 44 0000 11111111111111111111 2 22 99 3 888888 7 4 000000000000000000000000000000 4 222 4 000000000 11 22222 11 77 4 4 4 22 6 777 3 9 55555 5 5 1111111 5 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 9 99 44 000 11 9 0000000 9 9 7777777777777777 1 000 7 1111 5555 5 8 11111111 5555 99 9 99 555555 0 4 666 4 33 999999999999999999999999 0 00 0 8 44444444 8 000 4 0 0 0 0
consensus : GAGAGGGAG-GTTGTGACN--AAA-T-T-TC--AGT-------G--C-AA-----TA-----T----C-T-G-----T---AT---CCGT-G--A----TGAC-GAA-----AA---A-----A------AGTCC-GGGAA-AC-T-ATTT---GAC-CT---ACT-T-----T----T-----AG--C------------CCTAAAG-T-A-G----G--T---CA--T--GGTGCA--C----C----A----A-----G-C----TG---AAA-----TG-CGAA-C----T-G-----A---T----C-----AT-G--T-A---T-T--T---C--------T--GA-GAGG-----------A-AGGT-T---GT-G--A----CTA--------------AA--T-----T-TC--A--GGGCA----AT------A-----------C-CT-GTA--TC--TTTAGCA-TAT-AA-GCAGATCG-A-----GTG-CG--------------CCA-AT--CCAGCTGAAA-TG--CGA---ACTG--AACT----TGTAT--TCCTCC-GAG-AGGAAACTTGT--TTGACCTACTTTTAGC-CCTAA-AGTAGGTC-ACG-A-GGTG-CACCAATCCA-GC-------T-GA-----------A------A--TG-C------A---------C--------------T------T---C---T-----T------TT-T--GAGGGA-G---ANATTGT-G--A--CCAA-AT-TTCA-------ACG------CTGT---A-CA----TGC----ATCCGTTACG--GA--AAAAAG----TCC-GG-AAA--AC---AC-G-ACC-TC-AGACGGACTCA-CTAAC-CAAGCGAGTTA-GC---CAGCTGGACGNA--CAGA-CAACGCCATAACAAAAGACATATG---CACGTCCCGT-CT-GANGACGGG-CGTATAAAA
Reference ( family-1432 ) : GAGAGGGAG-GTTGTGACN--AAA-T-T-TC--AGT-------G--C-AA-----TA-----T----C-T-G-----T---AT---CCGT-G--A----TGAC-GAA-----AA---A-----A------AGTCC-GGGAA-AC-T-ATTT---GAC-CT---ACT-T-----T----T-----AG--C------------CCTAAAG-T-A-G----G--T---CA--T--GGTGCA--C----C----A----A-----G-C----TG---AAA-----TG-CGAA-C----T-G-----A---T----C-----AT-G--T-A---T-T--T---C--------T--GA-GAGG-----------A-AGGT-T---GT-G--A----CTA--------------AA--T-----T-TC--A--GGGCA----AT------A-----------C-CT-GTA--TC--TTTAGCA-TAT-AA-GCAGATCG-A-----GTG-CG--------------CCA-AT--CCAGCTGAAA-TG--CGA---ACTG--AACT----TGTAT--TCCTCC-GAG-AGGAAACTTGT--TTGACCTACTTTTAGC-CCTAA-AGTAGGTC-ACG-A-GGTG-CACCAATCCA-GC-------T-GA-----------A------A--TG-C------A---------C--------------T------T---C---T-----T------TT-T--GAGGGA-G---ANATTGT-G--A--CCAA-AT-TTCA-------ACG------CTGT---A-CA----TGC----ATCCGTTACG--GA--AAAAAG----TCC-GG-AAA--AC---AC-G-ACC-TC-AGACGGACTCA-CTAAC-CAAGCGAGTTA-GC---CAGCTGGACGNA--CAGA-CAACGCCATAACAAAAGACATATG---CACGTCCCGT-CT-GANGACGGG-CGTATAAAA
gi|1 : ----T-G-----C---T----T-----AT-G--T-A---T-T--TGCTC--------T--GAAGAAG-----------G-AGGT-T---GT-G--A----C-A--------------AA--T-----G-TC--AGTGGGTA----AC------A-----------T-CTCGTA--T
gi|1 : caatgctatctaaccacgtgtcaactcgctagcaAGAAGGAG-GTTGTGAC---AAA-T-G-TC--AGT-------GGGT-AA-----CA-----T----C-TCG-----T---ATA--CTGT-G--A----GGAC-AAA-----CA---ACTTACA------AGTCC-AAGAA-AC---ATT----GAC--T---ACC-T-----T----TTCC--CG--C------------CCTGAAG-TTA-G----GATT---TA--T--TGTGC---C----T----A----A-----G-C----TGCTAAAA-----TGATGAT-C----T-G-----A---T----C-----ATTG--TTA---TGT--T---C--------T--GA-GAAG-----------ACAGGT-TCTAAT-G--AAGCCCCA--------------AAGAT-----C-TCCAA--AGGTATTTCAG------A-----------C-CT-GTA--TCGGTTTAGTA-TAT-TATGCAGATTG-A-----GTG-TGG-------------CCATATTACCAGCTGAAA-TA--TGA---TCTG--ACTT----TGTAA--TTCTCC-AAG-AGGAACCTTGT--TTGACGTATTGTTAGCTTCTAA-AGTAGCCC-ACGTA-CGGG-C-CCAATTTT-GC-------TCGA-----------A------A--TG-C------AG--------C--------------TC-----T---C---T-----TA-----TT-T--GAGGGGCG---ACATTGT-GGTG--CCAACCT-TTCA-------A-A------ATGT---A-CACAT-TGC----ATCCTTTATG--G---AAAAGG----TCC-AGCAGATCAC---CC-G-ACC-actgtgaggacaaacaacttacaagtccaagaaacattgactaccttttcccgccctgaagttaggatttattgtgcctaagctgctaaaatgatgatctgatcattgttatgttctgagaagacaggttctaatgaagccccaaagatctccaaaggtatttcagacctgtatcggtttagtatattatgcagattgagtgtggccatattaccagctgaaatatgatctgactttgtaattctccaagaggaaccttgtttgacgtattgttagcttctaaagtagcccacgtacgggcccaattttgctcgaaatgcagctctcttatttgaggggcgacattgtggtgccaacctttcaaaatgtacacattgcatcctttatggaaaaggtccagcagatcacccgaccgactagcttaatgcaggattccattcccccgagaacccagacctcaagtcactaaccaagcgagttacgctctcagctgacgtaaacagaacaacaccaaacaaaagacatatgcatgtcccctgctggatgatgggccatataaaaatgtatactttatttc
gi|1 : caatgctatctaaccacgtgtcaactcgctagcatgcttatgtatttgctctgaCC-CG-AGA--AC---CCAG-ACC-TC-A-----AGTCA-CTAAC-CAAGCGAGTTACGCTCTCAGCTG-ACGTAAACAGAACAACACCA-AACAAAAGACATATG---CATGTCCCCTGCTGGATGATGGGCCATATAAAAgactagcttaatgcaggattccattcccccgagaacccagacctcaagtcactaaccaagcgagttacgctctcagctgacgtaaacagaacaacaccaaacaaaagacatatgcatgtcccctgctggatgatgggccatataaaaatgtatactttatttc
gi|10 : caatgctatctaaccacgtgtcaactcgctagcatgcttatgtatttgctctgaagaaggaggttgtgacaaatgtcagtgggtaacatctcgtatactgtgaggacaaacaacttacaagtccaagaaacattgactaccttttcccgccctgaagttaggatttattgtgcctaagctgctaaaatgatgatctgatcattgttatgttctgagaagacaggttctaatgaagccccaaagatctccaaaggtatttcagacctgtatcggtttagtatattatgcagattgagtgtggccatattaccagctgaaatatgatctgactttgtaattctccaagaggaaccttgtttgacgtattgttagcttctaaagtagcccacgtacgggcccaattttgctcgaaatgcagctctcttatttgaggggcgacattgtggtgccaacctttcaaaatgtacacattgcatcctttatggaaaaggtccagcagatcacccgaccgactagcttaatgcaggattccattcc---A-----A------AATCG-GCGAA-AC-T-GTTT---GAC-CT---ACT-T-----T----T-----GGG-C------------CCTAAAG-T-A-G----G--T---CA--T--GGTGTA--C----C----atgtatactttatttc
gi|10 : aaatgtggggttatacctgtaccacaacatctTTGTGACT--ACA-T-T-TC--AGG-------G--C-AA-----CA-----C----C-T-------T---AT---CGGT-A--A----T--T-GAA-----AA---A-------------GTCT-GGGAA-AC-T-GTTT---GAC-CT---ACT-T-----T----C-----AG--CCCTGAATTTCTGCCTAAAT-T-A-G----G--T---CA--T--TATGCA--C----C---------T-----G-C----TG---Attgtgactacatttcagggcaacaccttatcggtaattgaaaaagtctgggaaactgtttgacctactttcagccctgaatttctgcctaaattaggtcattatgcacctgctgactcactc
gi|11 : aaatgtggggttatacctgtaccacaacatctaaaatcggcgaaactgtttgacctacttttgggccctaaagtaggtcatggtgtaccAG-GTTGTGACT--ACA-T-T-GG--AGA-------A--C-AA-----TG-----C----C-T-G-----T---AT---CC------A----TAAC-CAATAGTTAA---A-----A------AAT----GGAA-ACCT-GTTT---GAC-CT---ACT-T-----T----T-----AG--T------------CTTGAAG-T-A-G----G--T---CA--C--GGTGCA--CAATTC----C----A-----G-C----TG---AAG-----TA-CAAA-C----T-GTTCTTA---TA---C-----AT-G--T-C---T-T--C---CTT------T--CA-GAGG-----------A-TATT-T---GT-G--A----CTA--------------AA--T-----T-TC--T--GAACT----AT------A-----------T-CT-GTA--TC--TGTAACctcactc
gi|11 : aAGAGGATA-TTTGTGACT--AAA-T-T-TC--TGA-------A--C-TA-----TA-----T----C-T-G-----T---AT---CTG----------TAAC-GAA-----AA---A-----A------TATCC-gaaaaaatatcc
gi|12 : aaggttgtgactacattggagaacaatgcctgtatccataaccaatagttaaaaaatggaaacctgtttgacctacttttagtcttgaagtaggtcacggtgcacaattccagctgaagtacaaactgttcttatacatgtcttcctttc-CA--------------CTA-AT--CCAGCTGGCG-TG--TGA---ACAG--ATTA----TGTATAATTCCCC-GAGTGGGAGAGTTAT--
gi|12 : gcaagattttgaacatgagtaccacaaagactacatcctatgcccgccggacagtgacaattcatcctgcataagcacttttaccatggcaGAGTGGGAGAGTTATGATA--AAA-T-G-TT--GGT-------G--C-AA-----TA-----T----C-T-G-----TATAAT---CCAT-G--A----T-AT-GAG-----AA---A-----A------AGTTC-AGGAA-AC-T-Agataaaatgttggtgcaatatctgtataatccatgatatgagaaaaagttcaggaaacta
gi|13 : gcaagattttgaacatgagtaccacaaagactacatcctatgcccgccggacagtgacaattcatcctgcataagcacttttaccatggcacactaatccagctggcgtgtgaacagattatgtataattccccG---GAA-----TGGTAAA-C----T-G-----G---T----T-----AT-ACAT-A---T-C--T---C--------C--GC-GAGG-----------A-AGGT-T---CA-G--A----CAA--------------AA--T-----T-TC--A--GTGCA----AT------A-----------
gi|13 : GAGGAAG-GTTCAGACA--AAA-T-T-TC--AGT-------G--C-AA-----TA-----TTA--T-T-GA----T---AT---CCAT---------TAAC-G-------AA---A-----A------AGCCA-AGGAA-AC-T-CTTC---GAC-TT---ATT-T-----T----T-----AG--C------------CC---AA-T-A-G----G--ttattgatatccattaacgaaaaagccaaggaaactcttcgacttatttttagcccaatagggggcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngttaaggtaaaaccttgcgattatattttatg
gi|14 : ggaatggtaaactggttatacatatctccgcTG--TACC----TATAT--CCA--C-AAC-AGAAAACT-AT--TTGATCTACTTTTAGC-CATAA-AGTAGGTC-AT----GGTG-CAACAATCCA-GC-------T-GA-----------C------A--TG-gggcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngttaaggtaaaaccttgcgattatattttatg
gi|14 : tgtgagtcttaatgaaaatctccaaactggctgatggtaataaaatcaaatatggtatatctgatcacgagtaagcatgaaaccaaatacaC-AGAAA-AC-T-ATTT---GAT-CT---ACT-T-----T----T-----AG--C------------CATAAAG-T-A-G----G--T---CA--T--GGTGCA--A----C----AATCCA-----G-C----TG---ACA-----TG-TGAA-C----T-G-----A---T----T-----AT-G--T-AAT-T-C--T---C--------T--GA-GAtgaactgattatgtaattctctgaga
gi|15 : tgtgagtcttaatgaaaatctccaaactggctgatggtaataaaatcaaatatggtatatctgatcacgagtaagcatgaaaccaaatacatgtacctatatccacaaTTGTGACT--TGA-T-G-TC--AAG-------G--T-AA-----TG-----T----C-T-G-----T---AT---GC------A----TAACTGAA-----AA---A-----A------AGTTC-GGAAA-AC-T-GTTT---GTC-CT---ACC-T-----T----T-----AG--C------------CCTAAAG-T-A-G----G--T---GAACT--GATGCA--C----C----GATCCA-----G-T----GG---AAA-----TG-CTAA-C----TCG-----C---T----CTCCAGATAA--C-A---C-T--T---CT-------T--GA-GGGA-----------G-ATAT-T---GT-G--A----CCA--------------AA--T-----T-TA--A--AGG
gi|16 : gcCT-T-----T----T-----AG--C------------TTTCAAG-T-A-G----G--G---CA--T--GATGCA--C----C----A----ATGTAGG-C----TG---ACACTTCTCG-TGAA-C----------------T----C-----AC-G--T-AT--T-T--T---C--------T--TA-GAGG-------------AGGT-T---GT-A--A-----TAT-------------AA--TG----T-CC--A--GTGCA----AT------AT----------C-TT-GTA--Tt
gi|16 : CTTTTAGC-TTTCA-AGTAGGGC-ATG-A---TG-CACCAATGTAGGC-------T-GACACTTCTCGTGA------A--CT-C------A---------C--------------G------T---A---T-----T------TTCT--TAGAG--G---AGGTTGT-A--A--TATA-ATGTCCA-------GTG------CAAT---ATCT----TGT----ATATATCATGATGACGAAAAAG----TCCAAG-AAA--AC---atatcatgatgacgaaaaagtccaagaaaactattttgaaacctacttaagctgtaacaa
gi|16 : AGAGG-AG-GTTGTAATA--TAA-TGT-CC--AGT-------G--C-AA-----TA-----T----CTT-G-----T---ATATATCAT-G--A----TGAC-G-------AA---A-----A------AGTCCAAGAAA-AC-T-ATTTTGAAAC-CT---ACT-T-----tattttgaaacctacttaagctgtaacaa
gi|17 : cttttagctttcaagtagggcatgatgcaccaatgtaggctgacacttctcgtgaactcacgtattttctt-GTGGTGACA--AAA-T-T-TC--AGT-------G--C-AA-----TAG----T----C---------T---AT---CC-----------------AA-----AA-----------------------GAAA-AC-TAACTT---GAC-CT---ATT-C-----T----TTAGTCAG--C------------CCTATAG-T-A-G----G--T---CA--CA-GATGCA--CTAATT----A----A-----GCC----TG---AAA-----TG-CAAA-C----T-G-----A--------------AT-A--T-A---T-T--T---C--------T--Gaagctgtaacaa
gi|18 : T-T-----T----T-----AG--C------------TTTCAAG-T-A-G----G--G---CA--T--GATGCA--C----C----A----ATGTA-G-C----TG---ACA-----CG-TGAA-C----T----------------C-----AC-G--T-A---T-T--TTT-C--------T--GA-GAGG-----------G-AGGT-T---GT-G--A-----TAT-------------AA--T-----G-TC--A--GTGCA----AT------A-----------T-CT-GTA--Ttcgtgacccacatttgaatctattctg
gi|18 : TTTTAGC-TTTCA-AGTAGGGC-ATG-A---TG-CACCAATGTA-GC-------T-GA-----------C------ACGTG-A------A---------C--------------TCACGTAT---T---T-----T------TC-T--GAGAGG-G---AGGTTGT-G--A--TATA-AT-GTCA-------GTGCAATATCTGT---A-TA----T------ATCTATGATG--AG--AAAAAG----TCC-AA-GAA--AC---atatctatgatgagaaaaagtccaagaaactatttgacctacttaagct
gi|18 : GAGAGGGAG-GTTGTGATA--TAA-T-G-TC--AGT-------G--C-AA-----TA-----T----C-T-G-----T---AT---ATATCT--A----TGAT-GAG-----AA---A-----A------AGTCC-AAGAA-AC-T-ATTT---GAC-CT---ACT-T-----tatttgacctacttaagct
gi|19 : ttttagctttcaagtagggcatgatgcaccaatgtagctgacacgtgaactcacgtatttttctG-GTTGTTAC-----A-T-TGTC---GT-------G--CTAC-----TA-----T----T-A-C-----T---AT---C-AT-G--A----TGAC-TAA-----AA-----------------GTCC-AAGCA-AT-T-ATGT---GGC-TT---ACTCT-----T----T-----AG--C------------CCTAAAG---A-G----A--T---TA--TACGATGCAAGT----T----A----A-----T-C----TG---AAA-----CG-TAAA------T-A-----A---T----T-----A--G--T-A---T-C--C---C--------T--GA-GAGG-----------G-ATGT-T---GTCG--A----CTC--------------AA--aagct
gi|2 : AAAA-T-A-G----A--T---CA--T--GGTATA--C----C----A----ATATT-G-C----TG---AAA-----TG-TGAA-C----T-G-----A---TGATGC-----AT-G--T-ATT-T-T--T---C--------T--AA-GA---------------------------G--A----CAA--------------AT--T-----T-TC--A--GTGTA----AT------A-----------------TA--TC--TT
gi|2 : GACA--AAT-T-T-TC--AGT-------G--T-AA-----TA-----TAT--C-T-------T---GT---CC------A----AGAC-AAG-----GA---A-----A------AATAT-AGAAA-AC-C-ACCT---T-C-TT---ACT-TAAGAAT----T-----AG--C------------CCCATAA-T-A-G----G--T---AA--T--A-CGAA--T----T----A----A-----G-C----TA---AAA-----TG-CAAA-A----T-G-----AA--T----C------T-G--C-A---T-T--T---CCATAGCTGT--GA-GAGG-----------A-ATGC-T---GT-G--A----CTA--------------CA--T-----T-TC--A--AAGTG----AT------A-----------C-AT-GTG--TC--CATAACC-AAT-AA--CAAAAAA-A-----ATA-TGGAAAACTGTTTTACCTA-CT--GTAGCTGAAA-TA--CAA---ACTG--AAC------GTAT--TCCTTC-TAG-TGAAAGCTTGT--gtccaagacaaggaaaaatatagaaaaccaccttcttacttaagaattagccccataataggtaatacgaattaagctaaaatgcaaaatgaatctgcatttccatagctgtgagaggaatgctgtgactacatttcaaagtgatacatgtgtccataaccaataacaaaaaaaatatggaaaactgttttacctactgtagctgaaatacaaactgaacgtattccttctagtgaaagcttgtgactaagtctgtattcatagcaaaaaaaaaaaaaatcccgaaagtgtttaacttgaagtagctagaccatggtgcatcaattaagctgaaatgcaaactctctacttacgtttttgaggaagaaattgagactaaatctcaatatatgcatccgttacagaaaaaaaaatatctggaaaacgtatatctcagacggactca
gi|2 : aaaatagatcatggtataccaatattgctgaaatgtgaactgatgatgcatgtatttttctaagaGAGAGGAAT-GCTGTGACT--ACA-T-T-TC--AAA-------G--T-GA-----TA-----C----A-T-G-----T---GT---CCAT-A--ACCAATAAC--AA-----AA---A-----A------AATAT-GGAAA-AC-T-GTTT---TAC-CT---ACT-----------------------------------------G-T-A-G-------------------------------------------------C----TG---AAA-----TA-CAAA-C----T-G-----A--------------AC-G--T-A---T-T--C---C--------TTCTA-GTGA-----------A-AGCT-T---GT-G--A----CTA--------------AG--TCTGTAT-TC--A--TAGCA----AA------AAAAAAAAAAATC-CC-GAAAGTG--TTTAACT-TG--AA-GTAGCTAG-ACCATGGTG-CA--------------TCA-AT--TAAGCTGAAA-TG--CAA---ACTgactaagtctgtattcatagcaaaaaaaaaaaaaatcccgaaagtgtttaacttgaagtagctagaccatggtgcatcaattaagctgaaatgcaaactctctacttacgtttttgaggaagaaattgagactaaatctcaatatatgcatccgttacagaaaaaaaaatatctggaaaacgtatatctcagacggactca
gi|2 : aaaatagatcatggtataccaatattgctgaaatgtgaactgatgatgcatgtatttttctaagagacaaattttcagtgtaatatatcttgtccaagacaaggaaaaatatagaaaaccaccttcttacttaagaattagccccataataggtaatacgaattaagctaaaatgcaaaatgaatctgcatttccatagctgt-----T----C-T-G-----T---AT---TCAT-AGCA----AAAA-AAA-----AA---A-----A------AATCC-CG-AA-AG-T-GTTT---AAC----------T-----TGAAGT-----AG--C--------------------T-A-G----A--C---CA--T--GGTGCA--T----C----A----ATTAA-G-C----TG---AAA-----TG-CAAA-C----T-C-----T---C----T-----AC-T--T-ACG-T-T--T---T--------T--GAGGAAG-----------A-A-AT-T---GA-G--A----CTA--------------AA--T-----C-T---------CA----AT------A-----------T-AT-GCA--TC--ctctacttacgtttttgaggaagaaattgagactaaatctcaatatatgcatccgttacagaaaaaaaaatatctggaaaacgtatatctcagacggactca
gi|2 : aaaatagatcatggtataccaatattgctgaaatgtgaactgatgatgcatgtatttttctaagagacaaattttcagtgtaatatatcttgtccaagacaaggaaaaatatagaaaaccaccttcttacttaagaattagccccataataggtaatacgaattaagctaaaatgcaaaatgaatctgcatttccatagctgtgagaggaatgctgtgactacatttcaaagtgatacatgtgtccataaccaataacaaaaaaaatatggaaaactgttttacctactgtagctgaaatacaaactgaacgtattccttctagtgaaagcttgtgactaagTTTAAC-T-TGA-AGTAGCTAGACC-ATGGTG-CATCAATTAA-GC-------T-GA-----------A------A--TG-C------AAACTCTCTAC--------------T------TA--CG--T-----T------TT-T--GAGGAA-G---AAATTGA-G--A--CTAA-AT-CTCA-------A-----------T---A-TA----TGC----ATCCGTTACA--GA--AAAAAAAATATCT-GG-AAA--AC---GT-ATATC-TC-AGACGGACTCA-cgttacagaaaaaaaaatatctggaaaacgtatatctcagacggactca
gi|20 : aaaatagatcatggtataccaatattgctgaaatgtgaactgatgatgcatgtatttttctaagagacaaattttcagtgtaatatatcttgtccaagacaaggaaaaatatagaaaaccaccttcttacttaagaattagccccataataggtaatacgaattaagctaaaatgcaaaatgaatctgcatttccatagctgtgagaggaatgctgtgactacatttcaaagtgatacatgtgtccataaccaataacaaaaaaaatatggaaaactgttttacctactgtagctgaaatacaaactgaacgtattccttctagtgaaagcttgtgactaagtctgtattcatagcaaaaaaaaaaaaaatcccgaaagtgGAAAACTC-T--CTGACCTACTTTGAGC-ACGGATAGT-------------GTG-CACTAATCTA-GC-------T-GA-----------A------A--TG-C------AAAGTC----C--------------C------T---C---T-----TACTATTTT-C--GAGAGA-A---AAATTGT-G--A--CCAA-AT-TTTA-------ACA------CTGT---A-CA----TGCATCGATCTGTTATG--GG--AAAAAG----TCA-GG-AAA--AC---AT-G-
gi|21 : ---ACT-A-----T----A-----AG--T------------CTTAGAG-T-A-GCTAGG--T---TA--C--AGAACA--C----CGATTA----A-----G-C----TG---AAA-----TG-TAGA-C----T-GA----A---T----C------T-G--T-A---T-C--T---C------------------------------------T---CT-G--G----CTA--------------CA--T-----T-TC--A--GGATA----AT------A-----------C-CT-GTA--TC--
gi|21 : aaaaacgtccccaaTGGCT--ACA-T-T-TC--AGG-------A--T-AA-----TA-----C----C-T-G-----T---AT---CCGT-C--A-----GAA-AAA-----AA---A-----ACAATTTAATCC-GAAAA-AC-cgtcagaaaaaaaaacaatttaatccgaaaaacg
gi|22 : aaaaacgtccccaaactataagtcttagagtagctaggttacagaacaccgattaagctgaaatgtagactgaatctgtatctctc-GGTGTCACCAATCCA-GC-------T-GG-----------A------T--TGCC------A---------CACACTGAACTTGTAT------T---C---C-----T------TT-G--GAGAAG-A---AAATTGT-G--ATTTTAC-AT-TTCCT------AGG------CAAT---ATCC----TGT----ATACATAAT----A--AAGAAG----TCA-GG-AAA--Ag
gi|22 : -----GTGTCA--------------CCA-AT--CCAGCTGGAT-TG--CCACACACTG--AACT----TGTAT--TCCTTTGGAG-AAGAAAATTGT--attttgacactattttttaagccctaaagt
gi|22 : gGAGAAGAAA-ATTGTGATTTTACA-T-T-TCCTAG--------G--C-AA-----TA-----T----CCT-G-----T---AT---ACAT-A--A----T------A-----AA---G-----A------AGTCA-GGAAA-AA-T--TTT---GACACT---ATT-T-----T----TTA---AG--C------------CCTAAAG-T-gattttacatttcctaggcaatatcctgtatacataataaagaagtcaggaaaaattttgacactattttttaagccctaaagt
gi|23 : ggtgtcaccaatccagctggattgccacacactgaacttgtattcctttgGTC-ACG----GTT-CACCAATCCA-GC-------T-GA-----------AAC----A--TA-A------A---------C--------------TCAC---T---C---TTACGAT------TC-T--GAGGGA-C---AAATTGT-G--A--TCAA-A--TTCA-------ACG------CT------------------------GTTACG--GA--AAATAG----TCC-GG-AAA--AC---AA-G-GTT-TC-AGACAGAC
gi|24 : --TTGATCTATTTTTAGC-CCTTA-AGTAGGTC-ATA-C-AATG-CACCAGTCCA-GA-------T-GA-----------A------A--TG-CAA----A---------A--------------T------T---C-----------------T-T--GGGGGA-G---AT-----------------AT-TTTA-------ATG------CTAT---A-CA----Ta
gi|25 : ctagaaaaataGCTGGCCAGA--CCGA-CAACGCCATAA-----GAT-TATA---CAC--TCTGT-CT-AAAGACGGG-CATATAAAA
gi|26 : tAGG-CCTAA-AGTAGATT-ACT----GTG--ACTAATCCA-GC-------T-GA-----------C------A--TG-atgacacagtcagccaaaaaatgaaa
gi|27 : gtgttccatatcaataaataaagtccggatgctaGCCGGACGCA--CGGA-CAACGCCATAAC---ATACATATGTAATACATCCCGC-CT-GAAGACGCG-CGTATGAAAacaatt
gi|28 : TAAAA-C-A-A----G--T---CA--T--GGTGCA--C----CAATTA----A-----G-C----TG---ACA-----TA-TGAG-C----------------T----T-----AT-G--T-A---T-TTCT---C--------T--AA-GAGG-----------
gi|3 : tGAGAAGGAG-GTTGTGACA--AAA-T-G-TC--AGT-------G--T-AA-----CA-----T----C-T-G-----T---AT---CTGT-G--A----GGAC-AAA-----AACTTAC----A------AGTCC-AAGAA-AC-T-ATTT---GAC-TA---ACT-T-----T----T-----AG--C------------CCTGAAG-T-A-G----A--T---CA--T--GGTGCA--T---------A----A-----G-C----TG---AAA-----TG-TGAT-C----T-G-----A---T----C-----AT-G--T-A---T-T--T---C--------T--GA-GAAG-----------A-AGGT-T---GT-G--A----CCA--------------AA--T-----C-TC--A--AGGTA----TT------A-----------C-CT-GTA--CT--TTTAGTA-TAT-AG-GCAGATTG-A-----GTG-TG--------------CCA-AT--CCAGCTGAAA-TA--TGA---TCTG--AACT----TGTAT--TCCTCC-AAG-AGGAACCTTGT--TTGACGTATGTTTAGC-TCTAA-AGTAGCCC-ACGTACGGTG-CACCAATTCT-GC-------T-GA-----------A------A--TG-C------A---------C--------------T------T---C---T-----T------TT-T--GAGGGC-G---ACATTGT-G--G--CCAA-AT-TTCA-------ACA------ATGT---A-CA----TGC----ATCCTTTATG--GA--AAAAGG----TCC-AG-CAA--TC---AC-G-ACC-TC-AGACAGACTCAGCCAA--CAAGCCAGTTA-GC---CAGCTGGACGTA--CAGA-CAACACCATAACAAAAGACATATG---CATGTCCTGT-CT-GATGATGGG-CATATAAAA
gi|4 : AAACT-GT--TTGAC-TACTTTTAGC-TCTAA-TGTAGGTC-ACA----GTG-CATCAACCCC-GC-------T-GA-----------A------A--TG-C------AATCCCACT-C--------------T------TGCGC---T-----T------AT-T--GAGGGA-G---AAATTGT-G--A--CCAA-AT-TTCA-------ATG------CTAT---A-CA----TGC----ATCCATCACA--G----AAAAG----TCT-TA-AAA--AC---AT-G-ACC-TT-GGATGGAC
gi|4 : ccacaGAGGGAGAA-ATTGTGACC--AAA-T-T-TC--AAT-------G--C-TA-----TA-----C----A-T-G-----C---AT---CC------A----TCAC---A-----GA---A-----A------AGTCT-TAAAA-AC---AT-----GAC-CTTGGA--------------T-----GG--A------------CATATAGAT-G-G----A--TGGATA--T--ATTGCG--C----C----A----ATCCA-G-C----CG---AAA-----TG-CAAA-A----T-G-----A---T----T-----TT-G--T-A---T-T--C---C--------TCCGA-GATG-----------A-AGCT-T---TC-G--C----CTA--------------AA--T-----T-TC--A--GGGCA----AT------A-----------CACT-GTatatagatggatggatatattgcgccaatccagccgaaatgcaaaatgattttgtattcctccgagatgaagctttcgcctaaatttcagggcaatacactgtctgacaggtatatgtattgaaaaaagctggaaaactatttgtcctactttccgccttaaagtgggtcatggtgcaccaatccccttgaaatgaaaactcattcttacgcttcctgagggagaaattgtgattaaattttaaggttcttttactataaa
gi|4 : ccacaaaactgtttgactacttttagctctaatgtaggtcacagtgcatcaaccccgctgaaatgcaatcccactcttgcgcttattTG-CGCCAATCCA-GC-------C-GA-----------A------A--TG-CAAAATGA---------T--------------T------T---TGTAT-----TCC----TC-C--GAGATG-A---AGCTTTC-G--C--CTAA-AT-TTCAGGGCAATACA------CTGTCTGA-CA----GGT----ATATG-TATT--GA--AAAAAG-----CT-GG-AAA--AC---ctgacaggtatatgtattgaaaaaagctggaaaactatttgtcctactttccgccttaaagtgggtcatggtgcaccaatccccttgaaatgaaaactcattcttacgcttcctgagggagaaattgtgattaaattttaaggttcttttactataaa
gi|4 : ccacaaaactgtttgactacttttagctctaatgtaggtcacagtgcatcaaccccgctgaaatgcaatcccactcttgcgcttattgagggagaaattgtgaccaaatttcaatgctatacatgcatccatcacagaaaagtcttaaaaacatgaccttggatggacatatagatggatggatatatGAGATGAAG-CTTTCGCCT--AAA-T-T-TC--AGG-------G--C-AA-----TACACTGT----C-T-GACAGGT---AT---ATGT-A--T----TGA----------AA---A-----A------AG-CT-GGAAA-AC-T-ATTT---GTC-CT---ACT-T-----T----C-----CG--C------------CTTAAAG-T-G-G----G--T---CA--T--GGTGCA--C----C----A----A-----T-CCCCTTG---AAA-----TG-AAAA-C----T-C-----A---T----T-----CT----T-ACGCT-T--C---C--------T--GA-GGGA-----------G-AAAT-T---GT-G--A----TTA--------------AA--T-----T-TT--A--AGGtatttgtcctactttccgccttaaagtgggtcatggtgcaccaatccccttgaaatgaaaactcattcttacgcttcctgagggagaaattgtgattaaattttaaggttcttttactataaa
gi|5 : ccacaaaactgtttgactacttttagctctaatgtaggtcacagtgcatcaaccccgctgaaatgcaatcccactcttgcgcttattgagggagaaattgtgaccaaatttcaatgctatacatgcatccatcacagaaaagtcttaaaaacatgaccttggatggacatatagatggatggatatattgcgccaatccagccgaaatgcaaaatgattttgtattcctccG-GTTGTGTTT--AAA-T-T-TT--AGG-------G--T-TG-----TG-----T----C-T-C-----T---AC---CAG-----------------A-----AT---A-----A------AGTCT-GGAAA-AC-C---TT---GAC-CT---ACT-T-----T----A-----AG--C------------CTAAAAG-C-A-G----G--T---CA--T--TGTGCA--C----C----AATCCA-----G-C----TC---ACA-----TG-AAAA-TTGCAT-G-----A---T----T-----AT-G--T-C---T-TCCT---C--------T--GA--AG--------------AGGT-T---GT-G----------------------------T-----TGTC--A--GCGCA----AT------A-----------T-CT-GTA--TC--C---GCA--AT-GA-GAAAA--------------------------------A-GT--CCAG--GAAAGTGTCTGACATACTGTTAGCTCCC-TGTAC--ATCTCT-AAG-AGGAAGGTTGTGATTAACCTttcttttactataaa
gi|5 : acagtatatctGAG-GTTGTG---------T-TGTC--AGC-------G--C-AA-----TA-----T----C-T-G-----T---AT---CCGC-A--A----TGA----G-----AA---A-----A------AGTCC-AGGAA-AG-T-GTCT---GAC-AT---ACT-G-----T----T-----AGCTC------------CCT---G-T-A-------------CA--T------CT--C----T----A----A-----G-A----GG---AAGGT---TG-TG-A-T----T-A-----A---C----C------T-G--T-A---T-C--T---A--------TA-GT-GGGG-----------A-AA--------------------A--------------AA--T-----C-T------GGAAA----ATTGTTTGA-----------C-C---TA--CT--TTTAG-A-TATAAA-GTAAGTCA-AG----GTA-TA--------------CCA-AT--GCAGCTGAAA-T----------------ACT----T-----------T-GAG-AGGAAACTTGT--GTGACgtatctatagtggggaaaaaatctggaaaattgtttgacctacttttagatataaagtaagtcaaggtataccaatgcagctgaaatactttgagaggaaacttgtgtgactaaacagggcaacatctatatccgtaacaaaaa
gi|5 : acagtatatctggttgtgtttaaattttagggttgtgtctctaccagaataaagtctggaaaaccttgacctactttaagcctaaaagcaggtcattgtgcaccaatccagctcacatgaaaattgcatgattatgtcttcctctgaaAGAGGAAG-GTTGTGATT--AA---------------------------------------C----C-T-G-----T---AT---CTAT-A--G----TGGG-GAA-----AA---A-----A--------TCT-GGAAA-AT-T-GTTT---GAC-CT---ACT-T-----T----T-----AG--A------------TATAAAG-T-A-A----G--T---CA--A--GGTATA--C----C----A----A-------------------------TG-C-AG-C----T-G-----A--------------A--A--T-A---C-T--T------------T--GA-GAGG-----------A-AACT-T---GT-GTGA----CTA--------------AA-----------C--A--GGGCA----AC------A-----------T-CT-ATA--TC--CGTAACA-taaacagggcaacatctatatccgtaacaaaaa
gi|6 : acagtatatctggttgtgtttaaattttagggttgtgtctctaccagaataaagtctggaaaaccttgacctactttaagcctaaaagcaggtcattgtgcaccaatccagctcacatgaaaattgcatgattatgtcttcctctgaagaggttgtgttgtcagcgcaatatctgtatccgcaatgagaaaaagtccaggaaagtgtctgacatactgttagctccctgtacatctctaGAAA-AC-T-GTCT---GAC-CT---TCT-T-----T----T-----AG--C------------CTTAAAG-T-A-G----G--G---CA--T--GGGACT--C----CAATTA----A-----G-C----TA---ACA-----AG-TGAA-C----T-G-----A---T----T-----AT-G--T-A---T-TACT---C--------C--AT-GAGA-----------A-AGAT-T---GTAA--A----AAA--------------AA--T-----G-GC--A--ATGCA----ATATAA--A-----------T-CT-GTA--TC--aaaa
gi|6 : aagatcacaataaatctggttgagtagagtatggaacaaaacctggatccaaaggagaattcatGAAAACTGT--CTGACCTTCTTTTAGC-CTTAA-AGTAGGGC-ATG-G-G--A-CTCCAATTAA-GCTAACAAGT-GA-----------ACTGATTA--TG-T------A---------T--------------T------A---C---T-----C------CA-T--GA--GA-A---AGATTGTAA--A--AAAA-AT-GGCA-------ATG------CAAT---A-TAAATCTGT----ATCCA--ACAT-GA--GAAACA----TCC-TG-GGA--AC---AC-T-ATT-TCAAGATGCAC-CA--TAAC-CCA-CGAATCA-Gcaacatgagaaacatcctgggaacactatttcaagatgcaccataacccacgaatcagaatacatctcggaggaagctgtgactgcatttcaggcaatatattatctaaacccatgatgcaaaaaatttaattgttacctgcagaagactaataggaaacccagcgtgttcttcag
gi|6 : aagatcacaataaatctggttgagtagagtatggaacaaaacctggatccaaaggagaattcatGAGAAAG-ATTGTAAAA--AAAAT-G-GC--AAT-------G--C-AA-----TA-----TAAATC-T-G-----T---AT---CCAA-C--A----TGA--GAA-----AC---A--------------TCCTGGGAACAC-T-ATT-----------------------------------------------------------------------T---CA--A--GATGCA--C----C----AT---A-----A-C----CC---A----------CGAATC----A-G-----A--------------AT-A--C-A---T-C--T---C------------G-GAGG-----------A-A-GC-T---GT-G--A----CTG--------------CA--T-----T-TC--A---GGCA----AT------A-----------T-AT--TA--TC--Taatacatctcggaggaagctgtgactgcatttcaggcaatatattatctaaacccatgatgcaaaaaatttaattgttacctgcagaagactaataggaaacccagcgtgttcttcag
gi|6 : aagatcacaataaatctggttgagtagagtatggaacaaaacctggatccaaaggagaattcatgaaaactgtctgaccttcttttagccttaaagtagggcatgggactccaattaagctaacaagtgaactgattatgtattactccatGGAA-GCTGTGACT--GCA-T-T-TC--AG--------G--C-AATATATTA-----T----C-T-A-----A---AC---CCAT-G--A----TG-C-AAA-----AA---A-----aaacccatgatgcaaaaaatttaattgttacctgcagaagactaataggaaacccagcgtgttcttcag
gi|7 : aagatcacaataaatctggttgagtagagtatggaacaaaacctggatccaaaggagaattcatgaaaactgtctgaccttcttttagccttaaagtagggcatgggactccaattaagctaacaagtgaactgattatgtattactccatgagaaagattgtaaaaaaaatggcaatgcaatataaatctgtatccaacatgagaaacatcctgggaacactatttcaagatgcaccataacccacgaatcagaatacatctcggaAGGTC-ATG----GTG-AACCAAACCA-GC-------T-GAT----------AT-----A--TG-A------A---------C--------------TACG---T---A---T-----T------TC-TCCGAAAGA-G---ATGTTGT-G--A--CGAA-A----CA-----------------TGT---A-TA----TGC----ATCCATGAGG--AG--AAAAAG----TCC-AG-AAA--ACTTTGC-G-ACT-Ttttaattgttacctgcagaagactaataggaaacccagcgtgttcttcag
gi|7 : aacagaaaaacacaagagtgtctcaaatggtacattgtacatcccatcttacagtgagattcggccagtatctagcacGAAAGAGAT-GTTGTGACG--AAA------C--A-T-------G-----------TA-----T----A-T-G-----C---AT---CC------A----TGAG-GAG-----AA---A-----A------AGTCC-AGAAA-AC-T-TTGC---GAC-TT---ACT-T-----T----T-----AG--C------------CTTAAAG-acttttagccttaaaggcaaaatctgtaatgaaaaaaaagtccagaaaactgatatacttttagcacgaacggatggaccgagtgcaccaattcagctgaaattgtattcccctgagagaaagcctgtgactaaattttagggcagtatatcc
gi|7 : aacagaaaaacacaagagtgtctcaaatggtacattgtacatcccatcttacagtgagattcggccagtatctagcacaggtcatggtgaaccaaaccagctgatatatgaactacgtatttctccTTGCGACT--TAC-T-T-TT--AGCCTTAAAGG--C-AA-----AA-----T----C-T-G-----T---A------------A----TGA---AA-----AA---A-----A------AGTCC-AGAAA-AC-T--------GAT-AT---ACT-T-----T----T-----AG--C------------ACGAACG-G-ATG----G--A---CC--G--AGTGCA--C----C----A----ATTCA-G-C----TG---AAA-----T------------------------------------T-G--T-A---T-T--C---CCC------T--GA-GAGA-----------A-AGCC-T---GT-G--A----CTA--------------AA--T-----T-TT--A--GGGCA----GT------A-----------gcaaaatctgtaatgaaaaaaaagtccagaaaactgatatacttttagcacgaacggatggaccgagtgcaccaattcagctgaaattgtattcccctgagagaaagcctgtgactaaattttagggcagtatatcc
gi|8 : aacagaaaaacacaagagtgtctcaaatggtacattgtacatcccatcttacagtgagattcggccagtatctagcacaggtcatggtgaaccaaaccagctgatatatgaactacgtatttctccgaaagagatgttgtgacgaaacatgtatatgcatccatgaggagaaaaagtccagaaaact-----T----T-----CG--C------------CTTAGAG-T-A-T----G--T---CT--T--GGTGCA--T----C----A----A-----T-C----C-----------------AG-C----T-G-----A---T----A-----AA-G--T-A---T-T--T---C--------TCTGA-GAGGGAAGCTGTGACA-AAGTCT---GT-A--T----CCATGCATGATGAGAGAAA--G-----T-TC--A--GGAAA----AT------ATTATA------C-CT-AT---TT--TTCAGCCCTA--AA-GTAGGTCATG-----GTG-CA--------------CCC-AT--GCAGCTGAAA-TG--CAA---ACCG--AACTTCAATGTAT--TCCTTA-GAG-ATGATGCTTG----TGACTAAATTTCAGtatcc
gi|8 : gaacaagagtacaaccaaaggtaccaaaatacactattaaacagtgaatttcaacccgtcagcacattatgcattaGAGAGGGAA-GCTGTGACA--AAG-T-----------------------------------------C-T-G-----T---AT---CCAT-GC-A----TGAT-GAG-----AG---A-----A------AGTTC-AGGAA-AA-T-ATTA---TAC-CT---ATT-T-----T----TC----AG--C------------CCTAAAG-T-A-G----G--T---CA--T--GGTGCAC-C----C----ATGC-A-----G-C----TG---AAA-----TG-CAAA-C----C-G-----AACTT----CA----AT-G--T-A---T-T--C---C--------TTAGA-GATG-----------A-TGCT-T---GT-G--A----CTA--------------AA--T-----T-TC--A--GGGCA----AT------ggcaat
gi|9 : gaacaagagtacaaccaaaggtaccaaaatacactattaaacagtgaatttcaacccgtcagcacattatgcattattcgccttagagtatgtcttggtgcatcaatccagctgataaagtatttctctGACCTACTTATAGC-CCTAA-AGTAGGTC-ACA----GTG-CACAAATCCA-GC-------T-GA-----------A------A----------------------C--------------T------TGTGC---C-----T------TT-T--GAGGGA-GCTCACCTTGT-A-------AA-AT-CTCA-------ATG------CTGA---A-CA----TGC----ATCCATTATG--TA--AAAAAG----TAA-GG-AAA--ACAATAT-G-ACCTTC---ATGGA--CA---AACACA---------------CAGATGGATGGA--CAGA-----GTCACAACATAAT---TA-A---TACATCCCCT-CT-GACGATAGG-AGTA
blockSeqs : A TTT A GT CT CCTTAAAG . T TATAT CACTGT T . ACAGG ATA ATA ATAACCAATAAC TAGTT CTT ACAATTT AA C C AA TGA A TGG C AAGAA GAAG TAGTC CT CCTGAATTTCTG A . T CTAG . GGA AC AC AG CAATGTAG C CCCT . CTTCT GTA T TGCA C TTCTTATAC T CA T CGC G TC TT CATAGCTGT G GAAGCTGTGACAAAG C CTA C TG AGCC TGCATGATGAGAGA GA CTGTA G CA . TTTC AAAAAAAAAAATC . AG . G ATATA . AAAAATATGGAAAACTGTTTTAC . C G GTCTGACAT TT TTCAA AA CC G T GA C CA T G GTACG T G TAACAAG . ATTGCCACACACTGAACTTGTATTCCT C CC G CTC GG A ATTTT . G GGGCAATACA A CTG T AATC ATCG A TGATGACG AATA AA . . TTTGC T T AAG CT GCCAACAAGCCAGTTAGC G . . T AAAAGACA TAA A . . A .
blockSeqs : . T . TG . G . . . TAAAT C . A . . ATAGCAAAAAA . . CA TG . . G . . . . . . TA G . . . . . . . . A C AATTCCA . . . GT CA . . . CTCTCCAG A . . AT . CC . TTT . ACAGG . . A . . T . G . . . . TGTTTGAC . . . T CAAT . TAGACCATGGTGCA . G . GCCACAC . TCCC . TT . . . C TT . . CATG . . . . CACTTCTCGTGAACTCACGTATT . . A . GG . ATA . . GTGCAATAT G . T . . A CATGA . C . . AATAT . . AG CT AACACA C . . T ATACA . G . . A .
blockSeqs : . T . TG . A . . . TTA . . . . . ATCTATGATG . . A G . . G . . . . . . C . . . . . . . . . . . CAATCCA . . . . TG . . . ATGATGC . . . TT . AC . TTC . ATAT . . . . . T . . . . . . ATTATAC . . . A ATAT . TCAAGGTATA . T . GTGA . A . TT . . . C TT . . ACA . . . . AATGCAAACTCTCTACTTACGTT . . A . AA . ATA . . TAGG G . . . . G TGAG . A . . CCA . . AG C T . . T ATAAT . A . . T .
blockSeqs : . T . T . A . . . TAT . . . . . ATGCATGATG . . A G . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . CGATCCA . . . . CT . . . AACTTCA . . . CG . . . TCC . AAGG . . . . . . . . . . . . ATAAAT . . . T CCTA . TCATGGTGCA . C . ACAA . C . TC . . . G AC . . GGG . . . . AATGCAAAGTCCCTCTTACTATT . . G . AA . ACT . . GTG A . . . . G CAGA . G . . GT . . AG . G . . C GAT . . . . C .
blockSeqs : . A . T . T . . . GT . . . . . ATGATGACG . . A A . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . TAATTAA . . . . TG . . . AATC . . . T . . . CCT . GATA . . . . . . . . . . . . ATC . . . T TTG . TTGAGTGTG . C . GCAA . T . TC . . . C CC . . GA . . . . AATGCAATCCCACTCTTGCGCTT . . A . AA . ACC . . ACA A . . . . A TGGG . G . . AT . . GG
blockSeqs : . A . T . T . . . C . . . . . ATGATGACT . . A A . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . CAATGTA . . . . CA . . . AATC . . . . . . . TCT . GAGG . . . . . . . . . . . . ACA . . . T AAT . . . C . ATGA . T . TT . . . C CC . . GA . . . . AATGCAAAATGATTTTGTATTCC . . A . AA . ATC . . ACG G . . . . G CGGA . G . . AA . . .
blockSeqs : . T . G . G . . . C . . . . . GTGAGGACA . . A A . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . CAATATT . . . . TG . . . ATC . . . . . . . TTA . GATG . . . . . . . . . . . . AC . . . G . G . GCAA . T . . . . . T TC . . G . . . . AACATAAACTCACTCTTACGAT . . C . CA . GCC . . ATG A . . . . T TGGA . G . . AC . .
blockSeqs : . A . T . T . . . T . . . . . ATAGTGGGG . . A G . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . CAATTAA . . . . TA . . . GTT . . . . . . . TT . AATG . . . . . . . . . . . . AT . . . T . G . . . . . . . . . C TC . . G . . . . CACGTGAACTCACGTATTTT . . A . AA . ACC . . ACA G . . . . A TTGA . A . . AT . .
blockSeqs : . A . G . T . . . T . . . . . ATGATATG . . A A . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . CGATTAA . . . . TG . . . ATT . . . . . . . TA . AAGC . . . . . . . . . . . . AT . . . . . . CT . . T . . . . ACTGATTATGTATTACTC . . G . GC . CCT . . ATG A . . . . G GGAG . T . . AC .
blockSeqs : . A . T . T . . . T . . . . . GTCAGAAA . . A A . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . CAATTAA . . . . CA . . . ATT . . . . . . . T . AAGG . . . . . . . . . . . . AC . . . . CC . . A . . . . TATATGAACTACGTATT . . A . GA . AAA . . ATG G . . . . A TGTA . G . .
blockSeqs : . A . G . T . . . T . . . . . AACATGAG . . A A . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . CAATCCA . . . . CA . . . TCT . . . . . . . C . AAGC . . . . . . . . . . . . AT . . . . T . . G . . . . AATGCAAAATTC . . A . TG . ACG . . ATG G . . . . A CAG . T . .
blockSeqs : . T . T . T . . . T . . . . . ATGATGCA . . A G . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . CAATCCA . . . . CA . . . ATC . . . . . . . T . GAAA . . . . . . . . . . . . AC . . . . . A . . . . AATGCACTTCTT . . A . CC . . . . A . . . . . A TA . A . .
blockSeqs : . T . T . A . . . T . . . . . GTAATTG . . A C . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . CAATTAA . . . . TA . . . ATT . . . . . . . T . AAAC . . . . . . . . . . . . AC . . . . . . . . . AACTTGTGCCT . . . . T . . . . . . . . . G . .
blockSeqs : . A . T . G . . . C . . . . . ATTAACG . . A G . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . CAATTCA . . . . TG . . . ATT . . . . . . . T . AAGA . . . . . . . . . . . . AT . . . . . .
blockSeqs : . C . T . T . . . T . . . . . ATAACTG . . A G . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . CATGCA . . . . TG . . . ATT . . . . . . . T . AAGC . . . . . . . . . . . . AT . . . . . .
blockSeqs : . T . G . T . . . C . . . . . GTATTGA . . A A . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . CATA . . . . CA . . . ACC . . . . . . . T . ATGC . . . . . . . . . . . . AT . .
blockSeqs : . T . T . G . . . T . . . . . GCAATGA . . A T . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . TAA . . . . AA . . . ATT . . . . . . . T . AGG . . . . . . . . . . . . A .
blockSeqs : . T . T . G . . . T . . . . . ATAACC . . A G . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . TAA . . . . AA . . . ATA . . . . . . . T . AAA . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A . T . C . . . C . . . . . GTAACG . . A G . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . CAA . . . . TG . . . TC . . . . . . . T . AGG . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . T . G . T . . . T . . . . . AAGACA . . A A . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . TAA . . . . TG . . . TT . . . . . . . T . AAA . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : G . T . T . . . T . . . . . ATGAGG . . A G . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . CAA . . . . CG . . . A . . . . . . . T . AAG . . . . . . . . . . .
blockSeqs : T . T . . . . . C . . . . . ATAAT . . A A . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . CAA . . . . CA . . . C . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : A . . . . . . . T . . . . . ATCAC . . . A . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . CT . . . . C . . . A . . . . . . . T . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T . . . . . ATGA . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AA . . . . . . . . A . . . . . . . C .
blockSeqs : . . . . . . . . T . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . .
blockSeqCons : N** ** *** ATAATGACG******** A*********** ***** ** CAATCCA************* *** CG* *** ** ** C** CC* G**** A* ACN**** ACG************* **** CGGA**** ** AG* ** ATA*****
originalCons : GAGAGGGAG-GTTGTGACN--AAA-T-T-TC--AGT-------G--C-AA-----TA-----T----C-T-G-----T---AT---CCGT-G--A----TGAC-GAA-----AA---A-----A------AGTCC-GGGAA-AC-T-ATTT---GAC-CT---ACT-T-----T----T-----AG--C------------CCTAAAG-T-A-G----G--T---CA--T--GGTGCA--C----C----A----A-----G-C----TG---AAA-----TG-CGAA-C----T-G-----A---T----C-----AT-G--T-A---T-T--T---C--------T--GA-GAGG-----------A-AGGT-T---GT-G--A----CTA--------------AA--T-----T-TC--A--GGGCA----AT------A-----------C-CT-GTA--TC--TTTAGCA-TAT-AA-GCAGATCG-A-----GTG-CG--------------CCA-AT--CCAGCTGAAA-TG--CGA---ACTG--AACT----TGTAT--TCCTCC-GAG-AGGAAACTTGT--TTGACCTACTTTTAGC-CCTAA-AGTAGGTC-ACG-A-GGTG-CACCAATCCA-GC-------T-GA-----------A------A--TG-C------A---------C--------------T------T---C---T-----T------TT-T--GAGGGA-G---ANATTGT-G--A--CCAA-AT-TTCA-------ACG------CTGT---A-CA----TGC----ATCCGTTACG--GA--AAAAAG----TCC-GG-AAA--AC---AC-G-ACC-TC-AGACGGACTCA-CTAAC-CAAGCGAGTTA-GC---CAGCTGGACGNA--CAGA-CAACGCCATAACAAAAGACATATG---CACGTCCCGT-CT-GANGACGGG-CGTATAAAA
finalCons : GAGAGGGAG-GTTGTGACN--AAA-T-T-TC--AGT-------G--C-AA-----TA-----T----C-T-G-----T---AT---CCATAATGACG--------AA-----AA---AA-----------AGTCC-GGGAA-AC-T-ATTT---GAC-CT---ACT-T-----T----T-----AG--C------------CCTAAAG-T-A-G----G--T---CA--T--GGTGCA--CCAATCCA-------------G-C----TG---AAA-----TGCG-AA-C----T-G-----A---T----C-----AT-G--T-A---T-T--T---C--------T--GA-GAGG-----------A-AGGT-T---GT-G--A----CTA--------------AA--T-----T-TC--A--GGGCA----AT------A-----------C-CT-GTA--TC--TTTAGCA-TAT-AA-GCAGATCG-A-----GTG-CG--------------CCA-ATC--CAGCTGAAA-TG--CGA---ACTG--AACT----TGTAT--TCCTCC-GAG-AGGAAACTTGT--TTGACCTACTTTTAGCCC-TAA-AGTAGGTC-ACG----GTG-CACCAATCCA-GC-------T-GA-----------A------A--TG-C------A---------C--------------T------T---C---T-----T------TT-T--GAGGGA-G---ANATTGT-GACN----AA-AT-TTCAACG-------------CTGT---A-CA----TGC----ATCCGTTACGGA----AAAAAG----TCC-GG-AAA--AC---AC-G-ACC-TCAG-ACGGACTCA-CTAAC-CAAGCGAGTTA-GC---CAGCTGGACGNA--CAGA-CAACGCCATAACATA-----TATG---CACGTCCCGT-CT-GANGACGGG-CGTATAAAA
Alignments
lowQualScore : 11111111 3333333333333333333333333 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 11111111111111 1111111111111 111111 66666666666666666666666666666 111 1111111111 22222 111111111111111 1111111 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 2222222222222222 11111111111 111111111 111111 333333333333333333333333 111 4444444444444444444
lowQualScore : 0 2 777 1 444 22 11111111 22 1 1 8888 2 111 222 333 1 6666666666666666666666666 222 55555 555 0 1 1 44 222 1 222 1 33333 3333 99999 33 777777777777 1 1 1 2222 11 222 11 33 1 11 22 1 1 55555 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 2 99999999999999999 1 222 3 22 5555 1 22222222222222 22 55555 1 22 33 3333 888888 8888888888888 2 22 33 3 000000 5 0 00000000000000000000000000000 5 000 5 9999999999 77 22222 00 4444 11 444 2 2 1 2 000000000000000 444 2 0000000 7777777 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 33 0 33 444 66 2 2 33 1 2 5 5555 3333333333333333 0 444 2 00000000000 1 33 4 999999 111111111 6666 44 2 33 111111 4 4 666 0 66 555555555555555555555555 222 8 3 4444444444444444444 6 8 8 1 8
lowQualScore : . . ... . ... .. ........ .. . . .... . ... ... ... . ......................... ... ..... ... . . . .. ... . ... . ..... .... ..... .. ............ . . . .... .. ... .. .. . .. .. . . ..... ........................................................................ . ................. . ... . .. .... . .............. .. ..... . .. .. .... ...... ............. . .. .. . ...... . . ............................. . ... . .......... .. ..... .. .... .. ... . . . . ............... ... . ....... ....... .......................................................................... .. . .. ... .. . . .. . . . .... ................ . ... . ........... . .. . ...... ......... .... .. . .. ...... . . ... . .. ........................ ... . . ................... . . . . .
lowQualScore : 1 0 111 7 000 33 00000000 22 6 5 7777 9 888 555 999 4 0000000000000000000000000 555 00000 777 1 5 5 77 777 5 666 4 33333 0000 55555 44 333333333333 3 3 4 9999 99 444 99 22 3 88 99 4 4 33333 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 9 11111111111111111 5 777 1 11 4444 0 11111111111111 11 66666 6 22 88 7777 777777 5555555555555 0 99 99 3 888888 7 4 66666666666666666666666666666 7 999 7 0000000000 99 33333 66 0000 88 999 0 9 1 9 444444444444444 444 4 0000000 6666666 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 77 3 11 777 33 7 7 77 9 7 3 7777 5555555555555555 3 777 7 99999999999 6 99 5 444444 444444444 1111 11 7 77 000000 0 4 666 4 33 999999999999999999999999 000 0 8 0000000000000000000 4 0 0 0 0
consensus : GAGAGGGAG-GTTGTGACN--AAA-T-T-TC--AGT-------G--C-AATA-T----C-T-G-T---AT---C-CA--T----A---ATG-ACGAA-----AA---A-----AAGTCC-G-GGAA-AC-TA-TTT---GAC-CT---ACT-T-----T----T-----AG--C------------CCTAAAG-T-A-G----G--T---CA--T--GGTG-CACC--AATCCA-G-CTGAAA-----TG-CGA---A-C----T-G-----A---T----C-----AT-G--T-A---T--T--T---C--------T---GA-GAGG-----------A-AG-GT-T---GT-G--A----CTA--------------AA--T-----T-TC--A--GGGCA----AT------A-----------C-CT-GTA--TC--TTTAGCA-TAT-AA-GCAGATCG-A-----GTGCG--------------CCA-AT--NCAGCTGAAA-TG--CGA---ACTG--AACT----TGTATTCCTCCGAGAGGAAACTTGT--TTGACCTACTTTTAGC-CCTAA-AGTAG----GT----C----ACG---GTGCACCAATCCA-GCT-------G-------A-----------A------A--TGC------A---------C--T------T---C---T-----T------TT-T--GAGGGA-G---ANAT-TGT-G--ACNAA-AT-TT----CA-------ACG------CTGT---A-CA----TGC----ATCCGT--TACG--GA--AAAA---------AG----TCC-GG-AAA--AC---AC-G-ACC-TC-AGACGGACTCA-CTAAC-CAAGCGAGTTA-GC---CAGCTGGACG--NACAG-ACAACGCCATAACAAAAGAT--ATAT--G---CACGTCCCGT-CT-GANGACGGG-CGTATAAAA
Reference ( family-1432 ) : GAGAGGGAG-GTTGTGACN--AAA-T-T-TC--AGT-------G--C-AATA-T----C-T-G-T---AT---C-CA--T----A---ATG-ACGAA-----AA---A-----AAGTCC-G-GGAA-AC-TA-TTT---GAC-CT---ACT-T-----T----T-----AG--C------------CCTAAAG-T-A-G----G--T---CA--T--GGTG-CACC--AATCCA-G-CTGAAA-----TG-CGA---A-C----T-G-----A---T----C-----AT-G--T-A---T--T--T---C--------T---GA-GAGG-----------A-AG-GT-T---GT-G--A----CTA--------------AA--T-----T-TC--A--GGGCA----AT------A-----------C-CT-GTA--TC--TTTAGCA-TAT-AA-GCAGATCG-A-----GTGCG--------------CCA-AT--CCAGCTGAAA-TG--CGA---ACTG--AACT----TGTATTCCTCCGAGAGGAAACTTGT--TTGACCTACTTTTAGC-CCTAA-AGTAG----GT----C----ACG---GTGCACCAATCCA-GCT-------G-------A-----------A------A--TGC------A---------C--T------T---C---T-----T------TT-T--GAGGGA-G---ANAT-TGT-G--ACNAA-AT-TT----CA-------ACG------CTGT---A-CA----TGC----ATCCGT--TACG--GA--AAAA---------AG----TCC-GG-AAA--AC---AC-G-ACC-TC-AGACGGACTCA-CTAAC-CAAGCGAGTTA-GC---CAGCTGGACG--NACAG-ACAACGCCATAAC-----AT--ATAT--G---CACGTCCCGT-CT-GANGACGGG-CGTATAAAA
gi|1 : ----T-G-----C---T----T-----AT-G--T-A---T--T--TGCTC--------T---GAAGAAG-----------G-AG-GT-T---GT-G--A----C-A--------------AA--T-----G-TC--AGTGGGTA----AC------A-----------T-CTCGTA--T
gi|1 : caatgctatctaaccacgtgtcaactcgctagcaAGAAGGAG-GTTGTGAC---AAA-T-G-TC--AGT-------GGGT-AACA-T----C-TCG-T---ATA--C-TG--T----G---AGG-ACAAA-----CA---ACTTACAAGTCC-A-AGAA-AC--A-TT----GAC--T---ACC-T-----T----TTCC--CG--C------------CCTGAAG-TTA-G----GATT---TA--T--TGTG-C-CT--AAGCT--G-CTAAAA-----TGATGA---T-C----T-G-----A---T----C-----ATTG--TTA---TG-T--T---C--------T---GA-GAAG-----------ACAG-GT-TCTAAT-G--AAGCCCCA--------------AAGAT-----C-TCCAA--AGGTATTTCAG------A-----------C-CT-GTA--TCGGTTTAGTA-TAT-TATGCAGATTG-A-----GTGTGG-------------CCATATTACCAGCTGAAA-TA--TGA---TCTG--ACTT----TGTAATTCTCCAAGAGGAACCTTGT--TTGACGTATTGTTAGCTTCTAA-AGTAG----CC----C----ACGTACGGGC-CCAATTTT-GCTC------G-------A-----------A------A--TGC------AG--------C--TC-----T---C---T-----TA-----TT-T--GAGGGGCG---ACAT-TGT-GGTGCCAACCT-TT----CA-------A-A------ATGT---A-CACAT-TGC----ATCCTT--TATG--G---AAAA---------GG----TCC-AGCAGATCAC---CC-G-ACC-actgtgaggacaaacaacttacaagtccaagaaacattgactaccttttcccgccctgaagttaggatttattgtgcctaagctgctaaaatgatgatctgatcattgttatgttctgagaagacaggttctaatgaagccccaaagatctccaaaggtatttcagacctgtatcggtttagtatattatgcagattgagtgtggccatattaccagctgaaatatgatctgactttgtaattctccaagaggaaccttgtttgacgtattgttagcttctaaagtagcccacgtacgggcccaattttgctcgaaatgcagctctcttatttgaggggcgacattgtggtgccaacctttcaaaatgtacacattgcatcctttatggaaaaggtccagcagatcacccgaccgactagcttaatgcaggattccattcccccgagaacccagacctcaagtcactaaccaagcgagttacgctctcagctgacgtaaacagaacaacaccaaacaaaagacatatgcatgtcccctgctggatgatgggccatataaaaatgtatactttatttc
gi|1 : caatgctatctaaccacgtgtcaactcgctagcatgcttatgtatttgctctgaCC-CG-AGA--AC---CCAG-ACC-TC-A-----AGTCA-CTAAC-CAAGCGAGTTACGCTCTCAGCT-GACGTAAACAGAACAACACCA-AACAAAAGAC--ATAT--G---CATGTCCCCTGCTGGATGATGGGCCATATAAAAgactagcttaatgcaggattccattcccccgagaacccagacctcaagtcactaaccaagcgagttacgctctcagctgacgtaaacagaacaacaccaaacaaaagacatatgcatgtcccctgctggatgatgggccatataaaaatgtatactttatttc
gi|10 : caatgctatctaaccacgtgtcaactcgctagcatgcttatgtatttgctctgaagaaggaggttgtgacaaatgtcagtgggtaacatctcgtatactgtgaggacaaacaacttacaagtccaagaaacattgactaccttttcccgccctgaagttaggatttattgtgcctaagctgctaaaatgatgatctgatcattgttatgttctgagaagacaggttctaatgaagccccaaagatctccaaaggtatttcagacctgtatcggtttagtatattatgcagattgagtgtggccatattaccagctgaaatatgatctgactttgtaattctccaagaggaaccttgtttgacgtattgttagcttctaaagtagcccacgtacgggcccaattttgctcgaaatgcagctctcttatttgaggggcgacattgtggtgccaacctttcaaaatgtacacattgcatcctttatggaaaaggtccagcagatcacccgaccgactagcttaatgcaggattccattccATA-C----C-T-G-T---A----C-CA--C----A---ACA-TCTAA-----AA------------TCG-G-CGAA-AC-TG-TTT---GAC-CT---ACT-T-----T----T-----GGG-C------------CCTAAAG-T-A-G----G--T---CA--T--GGTG-TACC--atgtatactttatttc
gi|10 : aaatgtggggttTTGTGACT--ACA-T-T-TC--AGG-------G--C-AACA-C----C-T---T---AT---C-GG--T----A---AT---TGAA-----AA---A-------GTCT-G-GGAA-AC-TG-TTT---GAC-CT---ACT-T-----T----C-----AG--CCCTGAATTTCTGCCTAAAT-T-A-G----G--T---CA--T--TATG-CACC--ttgtgactacatttcagggcaacaccttatcggtaattgaaaaagtctgggaaactgtttgacctactttcagccctgaatttctgcctaaattaggtcattatgcacctgctgactcactc
gi|11 : aaatgtggggttatacctgtaccacaacatctaaaatcggcgaaactgtttgacctacttttgggccctaaagtaggtcatggtgtaccAG-GTTGTGACT--ACA-T-T-GG--AGA-------A--C-AATG-C----C-T-G-T---AT---C-CA--T----A---A----CCAATAGTTAA---A-----AAAT-----GGAA-ACCTG-TTT---GAC-CT---ACT-T-----T----T-----AG--T------------CTTGAAG-T-A-G----G--T---CA--C--GGTG-CACA--ATTCCA-G-CTGAAG-----TA-CAA---A-C----T-GTTCTTA---TA---C-----AT-G--T-C---T--T--C---CTT------T---CA-GAGG-----------A-TA-TT-T---GT-G--A----CTA--------------AA--T-----T-TC--T--GAACT----AT------A-----------T-CT-GTA--TC--TGTAACtgctgactcactc
gi|11 : aAGAGGATA-TTTGTGACT--AAA-T-T-TC--TGA-------A--C-TATA-T----C-T-G-T---AT---C-TG--T----A-------ACGAA-----AA---A-----ATATCC-gaaaaaatatcc
gi|12 : aaggttgtgactacattggagaacaatgcctgtatccataaccaatagttaaaaaatggaaacctgtttgacctacttttagtcttgaagtaggtcacggtgcacaattccagctgaagtacaaactgttcttatacatgtcttcctttc---CA--T--GGCA-CACT--AATCCA-G-CTGGCG-----TG-TGA---A-C----A-G-----A---T----T-----AT-G--T-A---TAAT--TCC-C--------C---GA-GTGG-----------G-AGAGT-T---AT-G--A----TAA--------------AA--T-----G-TT--G--GTGCA----AT------A-----------T-CT-GTA--T
gi|12 : gcaagattttgaacatgagtaccacaaagactacatcctatgcccgccggacagtgacaattcatcctgcataagcacttttac----C----ATG---GCACACTAATCCA-GCT-------GGCGTGTGA-----------ACAGATTA--TGT------A---------TAAT------T---C---C-----C------CG-A--GTGGGA-G---AG-T-TAT-G--ATAAA-ATGTTGGTGCA-------ATAT-----CTGT---A-TA-----------ATCCATGATATG--AG--AAAA---------AG----TTC-AG-GAA--AC---aatccatgatatgagaaaaagttcaggaaacta
gi|12 : gcaagattttgaacatgagtaccacaaagactacatcctatgcccgccggacagtgacaattcatcctgcataagcacttttacGAGTGGGAGAGTTATGATA--AAA-T-G-TT--GGT-------G--C-AATA-T----C-T-G-TATAAT---C-CA--T----G---AT--ATGAG-----AA---A-----AAGTTC-A-GGAA-AC-TA-ta
gi|13 : gcaagattttgaacatgagtaccacaaagactacatcctatgcccgccggacagtgacaattcatcctgcataagcacttttaccatggcacactaatccagctggcgtgtgaacagattatgtataattccccGGAA-----TGGTAA---A-C----T-G-----G---T----T-----AT-ACAT-A---T--C--T---C--------C---GC-GAGG-----------A-AG-GT-T---CA-G--A----CAA--------------AA--T-----T-TC--A--GTGCA----AT------A-----------
gi|13 : GAGGAAG-GTTCAGACA--AAA-T-T-TC--AGT-------G--C-AATA-TTA--T-T-GAT---AT---C-CA--T---------TA-ACG-------AA---A-----AAGCCA-A-GGAA-AC-TC-TTC---GAC-TT---ATT-T-----T----T-----AG--C------------CC---AA-T-A-G----G--ttattgatatccattaacgaaaaagccaaggaaactcttcgacttatttttagcccaatagggggcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngttaaggtaaaaccttgcgattatattttatg
gi|14 : ggaatggtaaactggttatacatatctccgcTG--TACC----TATATCCA--CAACAGAAAACT-AT--TTGATCTACTTTTAGC-CATAA-AGTAG----GT----C----ATG---GTGCAACAATCCA-GCT-------G-------A-----------C------A--TGgggcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngttaaggtaaaaccttgcgattatattttatg
gi|14 : tgtgagtcttaatgaaaatctccaaactggctgatggtaataaaatcaaatatggtatatctgatcacgagtaagcatgaaaccaaatacaC-A-GAAA-AC-TA-TTT---GAT-CT---ACT-T-----T----T-----AG--C------------CATAAAG-T-A-G----G--T---CA--T--GGTG-CAAC--AATCCA-G-CTGACA-----TG-TGA---A-C----T-G-----A---T----T-----AT-G--T-AAT-T--C--T---C--------T---GA-GAtgaactgattatgtaattctctgaga
gi|15 : tgtgagtcttaatgaaaatctccaaactggctgatggtaataaaatcaaatatggtatatctgatcacgagtaagcatgaaaccaaatacatgtacctatatccacaaTTGTGACT--TGA-T-G-TC--AAG-------G--T-AATG-T----C-T-G-T---AT---G-CA--T----A---AC---TGAA-----AA---A-----AAGTTC-G-GAAA-AC-TG-TTT---GTC-CT---ACC-T-----T----T-----AG--C------------CCTAAAG-T-A-G----G--T---GAACT--GATG-CACC--GATCCA-G-TGGAAA-----TG-CTA---A-C----TCG-----C---T----CTCCAGATAA--C-A---C--T--T---CT-------T---GA-GGGA-----------G-AT-AT-T---GT-G--A----CCA--------------AA--T-----T-TA--A--AGG
gi|16 : gcCT-T-----T----T-----AG--C------------TTTCAAG-T-A-G----G--G---CA--T--GATG-CACC--AATGTAGG-CTGACACTTCTCG-TGA---A-C----------------T----C-----AC-G--T-AT--T--T--T---C--------T---TA-GAGG-------------AG-GT-T---GT-A--A-----TAT-------------AA--TG----T-CC--A--GTGCA----AT------AT----------C-TT-GTA--Tt
gi|16 : CTTTTAGC-TTTCA-AGTAG----GG----C----ATG---ATGCACCAATGTAGGCT-------G-------ACACTTCTCGTGA------A--CTC------A---------C--G------T---A---T-----T------TTCT--TAGAG--G---AGGT-TGT-A--ATATA-ATGTC----CA-------GTG------CAAT---ATCT----TGT----ATATAT--CATGATGACGAAAA---------AG----TCCAAG-AAA--AC---atatcatgatgacgaaaaagtccaagaaaactattttgaaacctacttaagctgtaacaa
gi|16 : AGAGG-AG-GTTGTAATA--TAA-TGT-CC--AGT-------G--C-AATA-T----CTT-G-T---ATATAT-CA--T----G---ATG-ACG-------AA---A-----AAGTCCAA-GAAA-AC-TA-TTTTGAAAC-CT---ACT-T-----tattttgaaacctacttaagctgtaacaa
gi|17 : cttttagctttcaagtagggcatgatgcaccaatgtaggctgacacttctcgtgaactcacgtattttctt-GTGGTGACA--AAA-T-T-TC--AGT-------G--C-AATAGT----C-T-------AT---C-CA------------------------------A-----AAG-------AAA-AC-TAACTT---GAC-CT---ATT-C-----T----TTAGTCAG--C------------CCTATAG-T-A-G----G--T---CA--CA-GATG-CACT--AATTAA-GCCTGAAA-----TG-CAA---A-C----T-G-----A--------------AT-A--T-A---T--T--T---C--------T---Gaagctgtaacaa
gi|18 : T-T-----T----T-----AG--C------------TTTCAAG-T-A-G----G--G---CA--T--GATG-CACC--AATGTA-G-CTGACA-----CG-TGA---A-C----------------T----C-----AC-G--T-ATT-T--T--T---C--------T---GA-GAGG-----------G-AG-GT-T---GT-G--A-----TAT-------------AA--T-----G-TC--A--GTGCA----AT------A-----------T-CT-GTA--Ttcgtgacccacatttgaatctattctg
gi|18 : TTTTAGC-TTTCA-AGTAG----GG----C----ATG---ATGCACCAATGTA-GCT-------G-------A-----------C------ACGTGA------A---------C--TCACGTAT---T---T-----T------TC-T--GAGAGG-G---AGGT-TGT-G--ATATA-AT-GT----CA-------GTGCAATATCTGT---A-TA----T------ATCTAT--GATG--AG--AAAA---------AG----TCC-AA-GAA--AC---atatctatgatgagaaaaagtccaagaaactatttgacctacttaagct
gi|18 : GAGAGGGAG-GTTGTGATA--TAA-T-G-TC--AGT-------G--C-AATA-T----C-T-G-T---AT------A--T----ATCTATG-ATGAG-----AA---A-----AAGTCC-A-AGAA-AC-TA-TTT---GAC-CT---ACT-T-----tatttgacctacttaagct
gi|19 : ttttagctttcaagtagggcatgatgcaccaatgtagctgacacgtgaactcacgtatttttctG-GTTGTTAC-----A-T-TGTC---GT-------G--CTACTA-T----T-A-C-T---AT---C--A--T----G---ATG-ACTAA-----AA-----------GTCC-A-AGCA-AT-TA-TGT---GGC-TT---ACTCT-----T----T-----AG--C------------CCTAAAG---A-G----A--T---TA--TACGATG-CA----AGTTAA-T-CTGAAA-----CG-TAA---A------T-A-----A---T----T-----A--G--T-A---T--C--C---C--------T---GA-GAGG-----------G-AT-GT-T---GTCG--A----CTC--------------AA--aagct
gi|2 : AAAA-T-A-G----A--T---CA--T--GGTA-TACC--AATATT-G-CTGAAA-----TG-TGA---A-C----T-G-----A---TGATGC-----AT-G--T-ATT-T--T--T---C--------T---AA-GA----------------------------G--A----CAA--------------AT--T-----T-TC--A--GTGTA----AT------A-----------------TA--TC--TT
gi|2 : GACA--AAT-T-T-TC--AGT-------G--T-AATA-TAT--C-T---T---GT---C-CA-----------A-G-ACAAG-----GA---A-----AAATAT-A-GAAA-AC-CA-CCT---T-C-TT---ACT-TAAGAAT----T-----AG--C------------CCCATAA-T-A-G----G--T---AA--T--------ACG--AATTAA-G-CTAAAA-----TG-CAA---A-A----T-G-----AA--T----C------T-G--C-A---T--T--T---CCATAGCTGT---GA-GAGG-----------A-AT-GC-T---GT-G--A----CTA--------------CA--T-----T-TC--A--AAGTG----AT------A-----------C-AT-GTG--TC--CATAACC-AAT-AA--CAAAAAA-A-----ATATGGAAAACTGTTTTACCTA-CT--GTAGCTGAAA-TA--CAA---ACTG--AAC------GTATTCCTTCTAGTGAAAGCTTGT--gtccaagacaaggaaaaatatagaaaaccaccttcttacttaagaattagccccataataggtaatacgaattaagctaaaatgcaaaatgaatctgcatttccatagctgtgagaggaatgctgtgactacatttcaaagtgatacatgtgtccataaccaataacaaaaaaaatatggaaaactgttttacctactgtagctgaaatacaaactgaacgtattccttctagtgaaagcttgtgactaagtctgtattcatagcaaaaaaaaaaaaaatcccgaaagtgtttaacttgaagtagctagaccatggtgcatcaattaagctgaaatgcaaactctctacttacgtttttgaggaagaaattgagactaaatctcaatatatgcatccgttacagaaaaaaaaatatctggaaaacgtatatctcagacggactca
gi|2 : aaaatagatcatggtataccaatattgctgaaatgtgaactgatgatgcatgtatttttctaagaGAGAGGAAT-GCTGTGACT--ACA-T-T-TC--AAA-------G--T-GATA-C----A-T-G-T---GT---C-CA--TAACCA---ATA-AC-AA-----AA---A-----AAATAT-G-GAAA-AC-TG-TTT---TAC-CT---AC--T-----G----T-----AG----------------CTGAAA-T-A-------------CA---------------------A-A-CTGAA---------CG----------------------------------------T-A---T--T--C---C--------TTC-TA-GTGA-----------A-AG-CT-T---GT-G--A----CTA--------------AG--TCTGTAT-TC--A--TAGCA----AA------AAAAAAAAAAATC-CC-GAAAGTG--TTTAACT-TG--AA-GTAGCTAG-ACCATGGTGCA--------------TCA-AT--TAAGCTGAAA-TG--CAA---ACTgactaagtctgtattcatagcaaaaaaaaaaaaaatcccgaaagtgtttaacttgaagtagctagaccatggtgcatcaattaagctgaaatgcaaactctctacttacgtttttgaggaagaaattgagactaaatctcaatatatgcatccgttacagaaaaaaaaatatctggaaaacgtatatctcagacggactca
gi|2 : aaaatagatcatggtataccaatattgctgaaatgtgaactgatgatgcatgtatttttctaagagacaaattttcagtgtaatatatcttgtccaagacaaggaaaaatatagaaaaccaccttcttacttaagaattagccccataataggtaatacgaattaagctaaaatgcaaaatgaatctgcatttccatagctgt-T----C-T-G-T---AT---T-CA--T----AGC-AAA-AAAAA-----AA---A-----AAATCC-C-G-AA-AG-TG-TTT---AAC----------T-----TGAAGT-----AG--C--------------------T-A-G----A--C---CA--T--GGTG-CATC--AATTAA-G-CTGAAA-----TG-CAA---A-C----T-C-----T---C----T-----AC-T--T-ACG-T--T--T---T--------T---GAGGAAG-----------A-A--AT-T---GA-G--A----CTA--------------AA--T-----C-T---------CA----AT------A-----------T-AT-GCA--TC--ctctacttacgtttttgaggaagaaattgagactaaatctcaatatatgcatccgttacagaaaaaaaaatatctggaaaacgtatatctcagacggactca
gi|2 : aaaatagatcatggtataccaatattgctgaaatgtgaactgatgatgcatgtatttttctaagagacaaattttcagtgtaatatatcttgtccaagacaaggaaaaatatagaaaaccaccttcttacttaagaattagccccataataggtaatacgaattaagctaaaatgcaaaatgaatctgcatttccatagctgtgagaggaatgctgtgactacatttcaaagtgatacatgtgtccataaccaataacaaaaaaaatatggaaaactgttttacctactgtagctgaaatacaaactgaacgtattccttctagtgaaagcttgtgactaagTTTAAC-T-TGA-AGTAG----CTAGACC----ATG---GTGCATCAATTAA-GCT-------G-------A-----------A------A--TGC------AAACTCTCTAC--T------TA--CG--T-----T------TT-T--GAGGAA-G---AAAT-TGA-G--ACTAA-AT-CT----CA-------A-----------T---A-TA----TGC----ATCCGT--TACA--GA--AAAA---------AAAATATCT-GG-AAA--AC---GT-ATATC-TC-AGACGGACTCA-cgttacagaaaaaaaaatatctggaaaacgtatatctcagacggactca
gi|20 : aaaatagatcatggtataccaatattgctgaaatgtgaactgatgatgcatgtatttttctaagagacaaattttcagtgtaatatatcttgtccaagacaaggaaaaatatagaaaaccaccttcttacttaagaattagccccataataggtaatacgaattaagctaaaatgcaaaatgaatctgcatttccatagctgtgagaggaatgctgtgactacatttcaaagtgatacatgtgtccataaccaataacaaaaaaaatatggaaaactgttttacctactgtagctgaaatacaaactgaacgtattccttctagtgaaagcttgtgactaagtctgtattcatagcaaaaaaaaaaaaaatcccgaaagtgGAAAACTC-T--CTGACCTACTTTGAGC-ACGGATAGT-----------------------GTGCACTAATCTA-GCT-------G-------A-----------A------A--TGC------AAAGTC----C--C------T---C---T-----TACTATTTT-C--GAGAGA-A---AAAT-TGT-G--ACCAA-AT-TT----TA-------ACA------CTGT---A-CA----TGCATCGATCTGT--TATG--GG--AAAA---------AG----TCA-GG-AAA--AC---AT-G-
gi|21 : ---ACT-A-----T----A-----AG--T------------CTTAGAG-T-A-GCTAGG--T---TA--C--AGAA-CACC--GATTAA-G-CTGAAA-----TG-TAG---A-C----T-GA----A---T----C------T-G--T-A---T--C--T---C--------------------------------------T---CT-G--G----CTA--------------CA--T-----T-TC--A--GGATA----AT------A-----------C-CT-GTA--TC--
gi|21 : aaaaacgtccccaaACTATAAGT-CTTAG-AGTAGCTAGGT----T----ACA---GAACACCGATTAA-GCT-------G-------A-----------A------A--TGTAG----A---------C--TGAA---T---C---T-----G------T----------------ATCTCTCT-G--GCTAC-AT-TT----CA-------GGA------TAAT---A-CC----TGT----ATCCGT--CA-G--AA--AAAAAAACAATTTAA----TCC-GA-AAA--AC---cgtcagaaaaaaaaacaatttaatccgaaaaacg
gi|22 : aaaaacgtccccaa--GGTGTCACC--AATCCA-G-CTGGAT-----TG-CCACACA-C----T-G-----A---A----C-----TT-G--T-A---T--T--C---C--------TTTGGA-GAAG-----------A-AA-AT-T---GT-G--ATT--TTA--------------CA--T-----T-TC--CT-AGGCA----AT------AT----------C-CT-GTA--Tg
gi|22 : GAGAAGAAA-ATTGTGATTTTACA-T-T-TCCTAG--------G--C-AATA-T----CCT-G-T---AT---A-CA--T----A---AT------A-----AA---G-----AAGTCA-G-GAAA-AA-T--TTT---GACACT---ATT-T-----T----TTA---AG--C------------CCTAAAG-T-acataataaagaagtcaggaaaaattttgacactattttttaagccctaaagt
gi|23 : ggtgtcaccaatccagctggattgccacacactgaacttgtattcctttg----GT----C----ACG---GTTCACCAATCCA-GCT-------G-------A-----------AAC----A--TAA------A---------C--TCAC---T---C---TTACGAT------TC-T--GAGGGA-C---AAAT-TGT-G--ATCAA-A--TT----CA-------ACG------CT------------------------GT--TACG--GA--AAAT---------AG----TCC-GG-AAA--AC---AA-G-GTT-TC-AGACAGAC
gi|24 : --TTGATCTATTTTTAGC-CCTTA-AGTAG----GT----CAT--ACA---ATGCACCAGTCCA-GAT-------G-------A-----------A------A--TGCAA----A---------A--T------T---C-----------------T-T--GGGGGA-G---AT----------------AT-TT----TA-------ATG------CTAT---A-CA----Ta
gi|25 : ctagaaaaataGCTGGCCA--GACCG-ACAACGCCATAAG-----AT---TAT--A---CAC--TCTGT-CT-AAAGACGGG-CATATAAAA
gi|26 : t-T-G-T----T---C-CA--T----A---TCA-AT-AA-----AT---A-----AAGTCC-G-GA-----------T---G---CT---A--------------------AG--G------------CCTAAAG-T-A-G----A--T---TA--C--TGTG--ACT--AATCCA-G-CTGACA-----TG-atgacacagtcagccaaaaaatgaaa
gi|26 : gAGG-CCTAA-AGTAG----AT----T----ACT---GTG-ACTAATCCA-GCT-------G-------A-----------C------A--TGacaatt
gi|27 : gtgttccatatcaataaataaagtccggatgctaGCCGGACG--CACGG-ACAACGCCATAAC-----ATACATAT--GTAATACATCCCGC-CT-GAAGACGCG-CGTATGAAAacaatt
gi|28 : TAAAA-C-A-A----G--T---CA--T--GGTG-CACC--AATTAA-G-CTGACA-----TA-TGA---G-C----------------T----T-----AT-G--T-A---T--TTCT---C--------T---AA-GAGG-----------
gi|3 : tGAGAAGGAG-GTTGTGACA--AAA-T-G-TC--AGT-------G--T-AACA-T----C-T-G-T---AT---C-TG--T----G---AGG-ACAAA-----AACTTAC----AAGTCC-A-AGAA-AC-TA-TTT---GAC-TA---ACT-T-----T----T-----AG--C------------CCTGAAG-T-A-G----A--T---CA--T--GGTG-CAT----A---A-G-CTGAAA-----TG-TGA---T-C----T-G-----A---T----C-----AT-G--T-A---T--T--T---C--------T---GA-GAAG-----------A-AG-GT-T---GT-G--A----CCA--------------AA--T-----C-TC--A--AGGTA----TT------A-----------C-CT-GTA--CT--TTTAGTA-TAT-AG-GCAGATTG-A-----GTGTG--------------CCA-AT--CCAGCTGAAA-TA--TGA---TCTG--AACT----TGTATTCCTCCAAGAGGAACCTTGT--TTGACGTATGTTTAGC-TCTAA-AGTAG----CC----CACGTACG---GTGCACCAATTCT-GCT-------G-------A-----------A------A--TGC------A---------C--T------T---C---T-----T------TT-T--GAGGGC-G---ACAT-TGT-G--GCCAA-AT-TT----CA-------ACA------ATGT---A-CA----TGC----ATCCTT--TATG--GA--AAAA---------GG----TCC-AG-CAA--TC---AC-G-ACC-TC-AGACAGACTCAGCCAA--CAAGCCAGTTA-GC---CAGCTGGACG--TACAG-ACAACACCATAACAAAAGAC--ATAT--G---CATGTCCTGT-CT-GATGATGGG-CATATAAAA
gi|4 : AAACT-GT--TTGAC-TACTTTTAGC-TCTAA-TGTAG----GT----C----ACA---GTGCATCAACCCC-GCT-------G-------A-----------A------A--TGC------AATCCCACT-C--T------TGCGC---T-----T------AT-T--GAGGGA-G---AAAT-TGT-G--ACCAA-AT-TT----CA-------ATG------CTAT---A-CA----TGC----ATCCAT--CACA--G----AAA---------AG----TCT-TA-AAA--AC---AT-G-ACC-TT-GGATGGAC
gi|4 : ccacaGAGGGAGAA-ATTGTGACC--AAA-T-T-TC--AAT-------G--C-TATA-C----A-T-G-C---AT---C-CA--T-------------CACA-----GA---A-----AAGTCT-T-AAAA-AC--A-T-----GAC-CTTGGA--------------T-----GG--A------------CATATAGAT-G-G----A--TGGATA--T--ATTG-CGCC--AATCCA-G-CCGAAA-----TG-CAA---A-A----T-G-----A---T----T-----TT-G--T-A---T--TCCT---C--------C---GA-GATG-----------A-AG-CT-T---TC-G--C----CTA--------------AA--T-----T-TC--A--GGGCA----AT------A-----------CACT-GTatatagatggatggatatattgcgccaatccagccgaaatgcaaaatgattttgtattcctccgagatgaagctttcgcctaaatttcagggcaatacactgtctgacaggtatatgtattgaaaaaagctggaaaactatttgtcctactttccgccttaaagtgggtcatggtgcaccaatccccttgaaatgaaaactcattcttacgcttcctgagggagaaattgtgattaaattttaaggttcttttactataaa
gi|4 : ccacaaaactgtttgactacttttagctctaatgtaggtcacagtgcatcaaccccgctgaaatgcaatcccactcttgcgcttattTGCGCCAATCCA-GCC-------G-------A-----------A------A--TGCAAAATGA---------T--T------T---TGTAT-----TCC----TC-C--GAGATG-A---AGCT-TTC-G--CCTAA-AT-TT----CAGGGCAATACA------CTGTCTGA-CA----GGT----ATATG---TATT--GA--AAAA---------AG-----CT-GG-AAA--AC---ctgacaggtatatgtattgaaaaaagctggaaaactatttgtcctactttccgccttaaagtgggtcatggtgcaccaatccccttgaaatgaaaactcattcttacgcttcctgagggagaaattgtgattaaattttaaggttcttttactataaa
gi|4 : ccacaaaactgtttgactacttttagctctaatgtaggtcacagtgcatcaaccccgctgaaatgcaatcccactcttgcgcttattgagggagaaattgtgaccaaatttcaatgctatacatgcatccatcacagaaaagtcttaaaaacatgaccttggatggacatatagatggatggatatatGAGATGAAG-CTTTCGCCT--AAA-T-T-TC--AGG-------G--C-AATA-CA---C-T-G-T---CT---GACAGGT----AT--ATGTATTGA-----AA---A-----AAG-CT-G-GAAA-AC-TA-TTT---GTC-CT---ACT-T-----T----C-----CG--C------------CTTAAAG-T-G-G----G--T---CA--T--GGTG-CACC--AATCCC-C-TTGAAA-----TG-AAA---A-C----T-C-----A---T----T-----CT----T-ACGCT--T--C---C--------T---GA-GGGA-----------G-AA-AT-T---GT-G--A----TTA--------------AA--T-----T-TT--A--AGGtatttgtcctactttccgccttaaagtgggtcatggtgcaccaatccccttgaaatgaaaactcattcttacgcttcctgagggagaaattgtgattaaattttaaggttcttttactataaa
gi|5 : ccacaaaactgtttgactacttttagctctaatgtaggtcacagtgcatcaaccccgctgaaatgcaatcccactcttgcgcttattgagggagaaattgtgaccaaatttcaatgctatacatgcatccatcacagaaaagtcttaaaaacatgaccttggatggacatatagatggatggatatattgcgccaatccagccgaaatgcaaaatgattttgtattcctccG-GTTGTGTTT--AAA-T-T-TT--AGG-------G--T-TGTG-T----C-T-C-T---A----C-CA--G----A---AT-----------------A-----AAGTCT-G-GAAA-AC-C---TT---GAC-CT---ACT-T-----T----A-----AG--C------------CTAAAAG-C-A-G----G--T---CA--T--TGTG-CACC--AATCCA-G-CTCACA-----TG-AAA---A-TTGCAT-G-----A---T----T-----AT-G--T-C---T--TCCT---C--------T---GA--AG--------------AG-GT-T---GT-G----------------------------T-----TGTC--A--GCGCA----AT------A-----------T-CT-GTA--TC--C---GCA--AT-GA-GAAAA-------------------------------A-GT--CCAG--GAAAGTGTCTGACATACTGTTAGCTCCC-TGTACATCTCTAAGAGGAAGGTTGTGATTAACCTttcttttactataaa
gi|5 : acagtatatctGAG-GTTGTG---------T-TGTC--AGC-------G--C-AATA-T----C-T-G-T---AT---C-CG--C----A---ATG-A---G-----AA---A-----AAGTCC-A-GGAA-AG-TG-TCT---GAC-AT---ACT-G-----T----T-----AGCTC------------CCT---G-T-A-------------CA--T-------CTCT--AA--GA-G---GAAGGT---TG-TG----A-T----T-A-----A---C----C------T-G--T-A---T--C--T---A--------TA--GT-GGGG-----------A-AA---------------------A--------------AA--T-----C-T------GGAAA----ATTGTTTGA-----------C-C---TA--CT--TTTAG-A-TATAAA-GTAAGTCA-AG----GTATA--------------CCA-AT--GCAGCTGAAA-T----------------ACT----T---------TGAGAGGAAACTTGT--GTGACgtatctatagtggggaaaaaatctggaaaattgtttgacctacttttagatataaagtaagtcaaggtataccaatgcagctgaaatactttgagaggaaacttgtgtgactaaacagggcaacatctatatccgtaacaaaaa
gi|5 : acagtatatctggttgtgtttaaattttagggttgtgtctctaccagaataaagtctggaaaaccttgacctactttaagcctaaaagcaggtcattgtgcaccaatccagctcacatgaaaattgcatgattatgtcttcctctgaaAGAGGAAG-GTTGTGATT--AA------------------------------C----C-T-G-T---AT---C-TA--T----A---GTG-GGGAA-----AA---A-----A--TCT-G-GAAA-AT-TG-TTT---GAC-CT---ACT-T-----T----T-----AG--A------------TATAAAG-T-A-A----G--T---CA--A--GGTA-TACC--AATGCA-G-CTGAAA-----TA-C-----------------------------------------------------T---T--------T---GA-GAGG-----------A-AA-CT-T---GT-GTGA----CTA--------------AA-----------C--A--GGGCA----AC------A-----------T-CT-ATA--TC--CGTAACA-taaacagggcaacatctatatccgtaacaaaaa
gi|6 : acagtatatctggttgtgtttaaattttagggttgtgtctctaccagaataaagtctggaaaaccttgacctactttaagcctaaaagcaggtcattgtgcaccaatccagctcacatgaaaattgcatgattatgtcttcctctgaagaggttgtgttgtcagcgcaatatctgtatccgcaatgagaaaaagtccaggaaagtgtctgacatactgttagctccctgtacatctcta--C-AAAA-C----C-T-G-G---AT---C-CA------------------AA-----GG---A-----GAATTC-ATGAAA-AC-TG-TCT---GAC-CT---TCT-T-----T----T-----AG--C------------CTTAAAG-T-A-G----G--G---CA--T--GGGA-CTCC--AATTAA-G-CTAACA-----AG-TGA---A-C----T-G-----A---T----T-----AT-G--T-A---T--TACT---C--------C---AT-GAGA-----------A-AG-AT-T---GTAA--A----AAA--------------AA--T-----G-GC--A--ATGCA----ATATAA--A-----------T-CT-GTA--TC--aaaa
gi|6 : aagatcacaataaatctggttgagtagagtatggaaGAAAACTGT--CTGACCTTCTTTTAGC-CTTAA-AGTAG----GG----C----ATG---GGACTCCAATTAA-GCTAACAAGTG-------A-----------ACTGATTA--TGT------A---------T--T------A---C---T-----C------CA-T--GAG--A-A---AGAT-TGTAA--AAAAA-AT-GG----CA-------ATG------CAAT---A-TAAATCTGT----ATCCA----ACAT-GA--GAAA---------CA----TCC-TG-GGA--AC---AC-T-ATT-TCAAGATGCAC-CA--TAAC-CCA-CGAATCA-Gcaacatgagaaacatcctgggaacactatttcaagatgcaccataacccacgaatcagaatacatctcggaggaagctgtgactgcatttcaggcaatatattatctaaacccatgatgcaaaaaatttaattgttacctgcagaagactaataggaaacccagcgtgttcttcag
gi|6 : aagatcacaataaatctggttgagtagagtatggaacaaaacctggatccaaaggagaattcatGAGAAAG-ATTGTAAAA--AAAAT-G-GC--AAT-------G--C-AATA-TAAATC-T-G-T---AT---C-CA--A----C---ATG-A-GAA-----AC---A--------TCCTG-GGAACAC-TA-TT-----------------------------------------------------------------------T---CA--A--GATG-CACCATAACCCA-----------------CGA---ATC----A-G-----A--------------AT-A--C-A---T--C--T---C-------------G-GAGG-----------A-A--GC-T---GT-G--A----CTG--------------CA--T-----T-TC--A---GGCA----AT------A-----------T-AT--TA--TC--Taatacatctcggaggaagctgtgactgcatttcaggcaatatattatctaaacccatgatgcaaaaaatttaattgttacctgcagaagactaataggaaacccagcgtgttcttcag
gi|6 : aagatcacaataaatctggttgagtagagtatggaacaaaacctggatccaaaggagaattcatgaaaactgtctgaccttcttttagccttaaagtagggcatgggactccaattaagctaacaagtgaactgattatgtattactccatGGAA-GCTGTGACT--GCA-T-T-TC--AG--------G--C-AATA-T----A-T---T---AT---C-TA--A----ACCCATG-ATGCA-----AA---A-----AAaaacccatgatgcaaaaaatttaattgttacctgcagaagactaataggaaacccagcgtgttcttcag
gi|7 : aagatcacaataaatctggttgagtagagtatggaacaaaacctggatccaaaggagaattcatgaaaactgtctgaccttcttttagccttaaagtagggcatgggactccaattaagctaacaagtgaactgattatgtattactccatgagaaagattgtaaaaaaaatggcaatgcaatataaatctgtatccaacatgagaaacatcctgggaacactatttcaagatgcaccataacccacgaatcagaatacatctcggaAG----GT----C----ATG---GTGAACCAAACCA-GCT-------G-------AT----------AT-----A--TGA------A---------C--TACG---T---A---T-----T------TC-TCCGAAAGA-G---ATGT-TGT-G--ACGAA-A--------CA-----------------TGT---A-TA----TGC----ATCCAT--GAGG--AG--AAAA---------AG----TCC-AG-AAA--ACTTTGC-G-ACT-Ttttaattgttacctgcagaagactaataggaaacccagcgtgttcttcag
gi|7 : aacagaaaaacacaagagtgtctcaaatggtacattgtacatcccatcttacagtgagattcggccagtatctagcacAGAAAACTT-T--GCGACTTACTTTTAGC-CTTAA-AGacttttagccttaaaggcaaaatctgtaatgaaaaaaaagtccagaaaactgatatacttttagcacgaacggatggaccgagtgcaccaattcagctgaaattgtattcccctgagagaaagcctgtgactaaattttagggcagtatatcc
gi|7 : aacagaaaaacacaagagtgtctcaaatggtacattgtacatcccatcttacagtgagattcggccagtatctagcacaggtcatggtgaaccaaaccagctgatatatgaactacgtatttctccgaaagagatgttgtgacgaaacatgtatatgcatccatgaggagaaaaagtccTTGCGACT--TAC-T-T-TT--AGCCTTAAAGG--C-AAAA-T----C-T-G-T---A-------------------ATG-A--AA-----AA---A-----AAGTCC-A-GAAA-AC-T--------GAT-AT---ACT-T-----T----T-----AG--C------------ACGAACG-G-ATG----G--A---CC--G--AGTG-CACC--AATTCA-G-CTGAAA-----T---------------------------------------T-G--T-A---T--T--C---CCC------T---GA-GAGA-----------A-AG-CC-T---GT-G--A----CTA--------------AA--T-----T-TT--A--GGGCA----GT------A-----------gcaaaatctgtaatgaaaaaaaagtccagaaaactgatatacttttagcacgaacggatggaccgagtgcaccaattcagctgaaattgtattcccctgagagaaagcctgtgactaaattttagggcagtatatcc
gi|8 : aacagaaaaacacaagagtgtctcaaatggtacattgtacatcccatcttacagtgagattcggccagtatctagcacaggtcatggtgaaccaaaccagctgatatatgaactacgtatttctccgaaagagatgttgtgacgaaacatgtatatgcatccatgaggagaaaaagtccagaaaact-----T----T-----CG--C------------CTTAGAG-T-A-T----G--T---CT--T--GGTG-CATC--AATCCA-G-CTGATA----------A---A--------------------------------G--T-A---T--T--T---C--------TCT-GA-GAGGGAAGCTGTGACA-AA-GTCT---GT-A--T----CCATGCATGATGAGAGAAA--G-----T-TC--A--GGAAA----AT------ATTATA------C-CT-AT---TT--TTCAGCCCTA--AA-GTAGGTCATG-----GTGCA--------------CCC-AT--GCAGCTGAAA-TG--CAA---ACCG--AACTTCAATGTATTCCTTAGAGATGATGCTTG----TGACTAAATTTCAGtatcc
gi|8 : gaacaagagtacaaccaaaggtaccaaaatacactattaaacagtgaatttcaacccgtcagcacattatgcattaGAGAGGGAA-GCTGTGACA--AA----------------------------G-T----C-T-G-T---AT---C-CA--T----GC--ATG-ATGAG-----AG---A-----AAGTTC-A-GGAA-AA-TA-TTA---TAC-CT---ATT-T-----T----TC----AG--C------------CCTAAAG-T-A-G----G--T---CA--T--GGTG-CACC--CATGCA-G-CTGAAA-----TG-CAA---A-C----C-G-----AACTT----CA----AT-G--T-A---T--T--C---C--------TTA-GA-GATG-----------A-TG-CT-T---GT-G--A----CTA--------------AA--T-----T-TC--A--GGGCA----AT------ggcaat
gi|9 : gaacaagagtacaaccaaaggtaccaaaatacactattaaacagtgaatttcaacccgtcagcacattatgcattattcgccttagagtatgtcttggtgcatcaatccagctgataaagtatttctctGACCTACTTATAGC-CCTAA-AGTAG----GT----C----ACA---GTGCACAAATCCA-GCT-------G-------A-----------A------------------A---------C--T------TGTGC---C-----T------TT-T--GAGGGA-GCTCACCT-TGT------AAA-AT-CT----CA-------ATG------CTGA---A-CA----TGC----ATCCAT--TATG--TA--AAAA---------AG----TAA-GG-AAA--ACAATAT-G-ACCTTC---ATGGA--CA---AACACA---------------CAGATGGATG--GACAG-A----GTCACAAC-----AT--A-ATTAA---TACATCCCCT-CT-GACGATAGG-AGTA