lowQualScore : 222222 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 222222222222 22222222222222222222 33333333333 111111 111 11 1 222222222222222222222222222 11111111111 2222 111 1111111111 1 1 1111 1111111
lowQualScore : 1 33 0 111 3333 0 0 0 11 333333 22222 0 3333 4444 11 11 0 1 0 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 666 4444 22 444 3 1 7777 33 1 1 4 77777 33 44 22 1 22 3 55 1 5 1 1 1 1 66666666 1 5 44 1 1 111111111111 1 555 1 0 1 1 44444444444444444444 4 333 777 33333333333 22 2 2 44 2 66 8888 2 2 4 2 2 222222 1 555555 4444 1 22 1 66 2 22 4444 22 555 2 777 555 2 2 6 2 4444 2 333 333 55 5 222222222222222222222222222 2 555 88888 33 2 55555 33 777 33 2 2 4 2 55 33 55 2 33 5 555 33 2 7777 5555 2 2 7 33 5 2 5 4 4444 2 33 444 2 33 2 2 2 55555 444 2 4 2 2 2 2 4 55 55 2 2 2 2 2 2 7777 55555 444 2 777 33333333333 2222 2 2 777 55 33 2 5555555555 6 4 4 33 44 33 2 2 4 55 2 2 1 2 33 5 2 0 33 33 3 3333 2 2 2 33 8888888 2 2 66666 2 33 2 2 22 1111 3 1 333 33 2222 1 1 11 2222222 444 333 333 1 11 3333 0 2222222 22 111 22 0 555555555555 333333333333 1 0 0 33 222 0 11 11 5 888 44444 6666 33 55555555 0 1 1 0 111 222 11
lowQualScore : . .. . ... .... . . . .. ...... ..... . .... .... .. .. . . . ................................................................... ... .... .. ... . . .... .. . . . ..... .. .. .. . .. . .. . . . . . . ........ . . .. . . ............ . ... . . . . .................... . ... ... ........... .. . . .. . .. .... . . . . . ...... . ...... .... . .. . .. . .. .... .. ... . ... ... . . . . .... . ... ... .. . ........................... . ... ..... .. . ..... .. ... .. . . . . .. .. .. . .. . ... .. . .... .... . . . .. . . . . .... . .. ... . .. . . . ..... ... . . . . . . . .. .. . . . . . . .... ..... ... . ... ........... .... . . ... .. .. . .......... . . . .. .. .. . . . .. . . . . .. . . . .. .. . .... . . . .. ....... . . ..... . .. . . .. .... . . ... .. .... . . .. ....... ... ... ... . .. .... . ....... .. ... .. . ............ ............ . . . .. ... . .. .. . ... ..... .... .. ........ . . . . ... ... ..
lowQualScore : 0 11 9 444 3333 8 8 8 11 555555 00000 8 5555 6666 11 11 8 6 8 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 555 0000 33 000 2 3 5555 33 4 4 3 66666 11 00 44 7 55 6 99 7 5 8 7 7 7 00000000 7 0 00 7 7 222222222222 8 000 8 9 9 9 00000000000000000000 0 555 444 11111111111 88 0 0 88 0 88 2222 0 0 0 0 0 888888 9 555555 0000 9 66 0 88 0 66 2222 88 111 0 111 555 0 5 0 0 2222 0 555 555 22 8 666666666666666666666666666 1 555 22222 11 2 66666 11 444 11 2 2 4 2 33 11 33 5 44 0 999 44 5 8888 3333 5 5 5 44 0 5 0 7 9999 4 77 666 7 44 5 5 4 99999 111 2 4 2 2 2 2 4 33 33 2 2 4 4 4 4 4444 99999 111 4 444 00000000000 7777 4 4 555 66 22 4 0000000000 5 7 7 44 88 22 4 6 7 66 4 5 9 5 44 0 5 0 77 77 3 9999 7 7 7 77 7777777 5 5 22222 5 44 4 4 99 6666 8 9 333 22 8888 6 3 88 5555555 000 111 111 1 44 2222 9 8888888 88 444 88 8 444444444444 888888888888 5 7 7 88 000 7 00 77 9 555 33333 0000 11 11111111 7 5 5 7 333 999 22
consensus : TCT-CGTG-C-A---AC----C-A-GACGC-T--C---G--C-----T-A----T----C--TC--C-GTA-A-A---------T---C----------T-------G--C--G------A---A----C----C-------GAG---AG----T--CT---GG-TAAA-GATA---C--G-C-G-A----NAA--CG--TTT--G-TA--A-CGT--C-AAAA-CGAG-GCT-T-AC-C--------AGA-A-TC--CCGGT-A-T---G--TGA---TTT-GA---T-TGGCTG-A-T--C-----A-------GGC-C-A---CAA---T-C-GA------AAAT--AA-CG-A--C-T--A----T-C-GAAG-AAAG-C-T---GT-AAT-A------GA----T-TG--AAAG--T-GG-C----G--TT--TA-A-GCGTG---A-GGATTT-AC-A----AGT---AG---AGTGTGTTTAG--------A---AA-----T---AT-AAAAT-G--ATAGAA--G--AGGAA--A-GGAT-----TT--ATT--AG--CT-G-TTC-T-A--C--CT--ACGGG-A--TA-TGAT-AAAA--C-CGTT----GCG----TAT-TT-AA-TT--TT-A-C-CAAAATT-AC-T--TTGG--AG--GGC-A--AA-G-TGAA-A-----GTA---CG-A-T-T-T-C-CAG-TT--GA--C-A-G-CG-AT-CG-C----GGTTTT-----T---CTG-TT---GTAN-T--------GGTAA-T-TTT-TC-C--NTT--AGT--A-TC----------ACTAAT-GA-AG-TATC-AAT--TA-ATTAAC-A--TC-AAATCTTTCG-GAATTGA-CTG--TG-TT-T-T--G--TGGG-GG-AG-ATT-CAAA-C--C-------G-AAACT-GAA-----TTAG-C--GC-TC-CCTA--G----CG-GT-AACA---GTTA--T----TATC-G--CGG-G----T---CTTT---A---CCA-G--A----CT-CTC---T---G--T---T--C-G---------T--CG------------G-A-G-A--T---T-T--GC--GGAG--ACA---G-C----CG--AG--------CGTC-T-G-G-T---TG-A-ACG--AGAC
Reference ( gi|8 ) : TCT-CGTG-C-A---AC----C-A-GACGC-T--C---G--C-----T-A----T----C--TC--C-GTA-A-A---------T---C----------T-------G--T--A------A---A----C----C-------GAG---AG----T--CT---GG-TAAA-GATA---C--G-C-G-A----AAA--CG--TTT--G-TA--A-CGT--C-AAAA-CGAG-GCT-T-AC-C--------AGA-A-TC--CTGGT-A-T---G--TTA---TTT-GA---T-TGGCTG-A-T--C-----A-------GGC-C-A---CAA---T-A-AA------AAAT--AA-CG-A--C-T--A----T-C-GAAG-AAAG-C-T---GC-AAT-A------GA----T-TG--AAAG--T-GA-C----G--TT--TA-A-GAGTG---A-GGATTT-AC-A----AGT---AG---AGTGTGTTTAG--------A---AA-----T---AT-AAAAT-G--ATAGAA--G--AGGAA--A-GGAT-----TT--ATT--AG--CT-G-TTC-T-A--C--CT--ACGGG-A--TA-TGAT-AAAA--C-CGTT----GCG----TAT-TT-AA-TT--TT-A-C-CAAAATT-AC-T--TTGG--AG--GGC-A--AA-G-TGAA-A-----GTA---TG-A-T-T-T-C-CAG-TT--GA--C-A-G-CG-AT-CG-C----GGTTTT-----T---CTG-TT---GTAC-T--------GGTAA-T-ATT-TC-C--GTT--AGT--A-TC----------ACTGAT-GA-AG-TATT-AAT--TA-ATTAAC-A--TC-AAATCTTTCG-GAATTCA-CTG--TG-TT-T-T--G--TGGG-GG-AG-ATT-CAAA-C--C-------G-AAACT-GAA-----TTAG-C--GC-TC-CCTA--G----CG-GT-AACA---GTTA--T----TATC-G--CGG-G----T---CTTT---A---CCA-G--A----CT-CTC---T---G--T---T--C-G---------T--CG------------G-A-G-A--T---T-T--GC--GTAG--GCA---A-C----CG--AG--------TGTC-T-G-G-T---TG-A-ACG--AGAC
gi|9 : TCT-CGTG-C-A---AC----C-A-GACGC-T--T---GG-C-----T-A----T----C--TC--C-GTA-A-A---------T---C-----------------------------------------------------GAG---AG----T--CT---GG-TAAA-GATA---C--G-C-G-A----AAA--CG--TTT--G-TA--A-CAT--C-AAAA-CGAG-GCT-T-AC-C--------AGA-A-TC--CTGGT-A-T---G--TGA---TTT-GA---T-TGGCTG-A-T--C-----A-------GGC-C-A---CAA---T-C-GA------AAAT--AA-CG-A--C-T--A----T-C-GAAG-AAAG-C-T---GT-AAT-A------GA----T-TG--AAAG--T-GA-C----G--TT--TA-A-GTGTG---A-GGA-TT-AC-A----AGT---AG---A--GTGTTTAG--------A---AA-----T---AT-AAAAT-G--ATAGAA--G--AGAAA--A-GGAT-----TT--ATT--AG--CT-GTTTC-T-A--C--CT--ACGGG-A--CA-TGAA-AAAA--C-CGTT----GCG----TAT-TT-AATTT--TT-A-C-CAGAATT-AC-T--TTGG--AG--GGC-A--AA-G-TGAA-A-----GTA---TA-A-T-T-T-C-CAG-TT--GA--C-A-G-CG-AT-CG-A----GGTTTT-----T---CTG-TT---GTAT-T--------GGTAA-T-TTT-TC-C--TTT--AGT----TC----------ACTAAT-CA-AG-TATT-AAT--TA-ATTAAC-A--TC-AAATCTTTC--GAATTGA-CTG--TG-TT-T-T--G--TGGG-GG-AG-ATT-CAAA-C--C-------G-AAACT-GAA-----TTAG-C--GC-TC-CCTA--G----CG-GT-AACA---GTTAT-T----TATC-G--CGG-G----T---CTTT---A---CCA-G--A----CT-CTC---T---G--T---T--C-G---------T--CA------------G-A-G-A--T---T-T--GC--GTAG--ACA---A-C----CG--TG--------TGTC-T-G-G-T---TG-A-ACG--AGAC
gi|9 : TCT-CGTT-C-A---AC----C-A-GACAC-A--C---GG-T-----T-G----T----C--TA--C-GCA-A-A---------T---C----------T-------C--T--G------ACGAA----C----A-------GAG---AG----T--CT---GG-TAAA-GACC---C--G-C-G-AT---AAA--t
gi|7 : tctcgtgcaaccagacgcttggctatctccgtaaatcgagagtctggtaaagatacgcgaaaacgtttgtaacatcaaaacgaggcttaccagaatcctggtatgtgatttgattggctgatcaggccacaatcgaaaataacgactatcgaagaaagctgtaatagattgaaagtgacgtttaagtgtgaggattacaagtagagtgtttagaaatataaaatgatagaagagaaaaggatttattagctgtttctacctacgggacatgaaaaaaccgttgcgtatttaatttttaccagaattactttggagggcaaagtgaaagtataatttccagttgacagcgatcgaggtttttctgttgtattggtaatttttcctttagttcactaatcaagtattaattaattaacatcaaatctttcgaattgactgtgttttgtgggggagattcaaaccgaaactgaattagcgctccctagcggtaacagttaTCT-CGTG-C-A---AC----C-A-GAC---C--C---G--C-----T-A----T----C--TC--C-GTA-A-AATTC-----T---C----------C-------G--T--A------A---A----C----C-------GAG---AG----T--CT---GG-TAAA-GATA---C--G-C-G-A----AAA--CG--TTT--G-AA--A-CGTGTC-AAAAACGAG-GCT-T-AC-C--------AGA-A-TC--CTGGT-A-T---G--TGA---TTT-GA---T-TGGCTG-A-T--C-----AA------GGC-C-A---CAA---T-C-AT------AAAT--AA-CG-A--C-T--A----C-C-GAAG-AAAG-C-T---GTTAAT-A------GA----T-TG--AAAAGTT-GA-C----G--TTATTATA-GTGTG---A-GGATT--AC-A----AGT---AG---AGTGT-TATA---------A---AA-----T---AT-AAAATTG--ATAGAA--G--AGGAA--G-GATT-----TT--ATTTTAG--CT-G-TTC-T-A--C--CT--ACAGG-A--TA-TGAT-AAGA--C-CGTT----GCG----TAT-TT-AA-TT--TTTA-C-CAAAATTCAC-T--TTGG--AG--GGC-A--AA-AATGAA-A-----GTA---TG-G-A-T-T-T-CAG-TT--GA--C-A-G-CG-AT-CG-C----GGTTTT-----T---CTG-TT---GTAC-T--------GGTAA-T-TTT-TC-C---TT--A-T--A-TC----------ACTAAT-GA-AG-TATTTAAT--TA-AT-AAC-A--TT-AAATCTTTCG-GAATTGA-CTG--TG-TT-T-T--G--TGGG-GG-AG-ATT-AAAA-C--C-------G-AAACT-GAA-----TTAG-C--GC-TC-CCTA--G----CG-GT-AACA---GTTA--T----TATC-G--CGG-G----T---CTTT---A---CCA-G--A----CT-CTC---T---G--T---T--C-G---------T--CG------------G-A-G-A----------------------CA---A-C----CG--AG--------TGTC-T-GCG-T---TG-A-ACG--AGACct
gi|7 : gTCT-CGTT-C-A---ACG---C-A-GACAC-T--C---GG-T-----T-G----T----C--TC--C-G--------------------------------------A--C--G------A---A----C----A-------GAG---AG----T--CT---GG-TAAA-GACC---C--G-C-G-A----TAA--
gi|6 : gtctcgtgcaaccagacccgctatctccgtaaaattctccgtaaaccgagagtctggtaaagatacgcgaaaacgtttgaaacgtgtcaaaaacgaggcttaccagaatcctggtatgtgatttgattggctgatcaaggccacaatcataaataacgactaccgaagaaagctgttaatagattgaaaagttgacgttattatagtgtgaggattacaagtagagtgttataaaatataaaattgatagaagaggaaggattttattttagctgttctacctacaggatatgataagaccgttgcgtatttaatttttaccaaaattcactttggagggcaaaaatgaaagtatggatttcagttgacagcgatcgcggtttttctgttgtactggtaatttttccttatatcactaatgaagtatttaattaataacattaaatctttcggaattgactgtgttttgtgggggagattaaaaccgaaactgaattagcgctccctagcggtaacagttaTCT-CGTT-C-A---AC----C-A-GAC-C-T--C---GT-T-----T-G----T----C--TA--C-GCA-A-AATC------T---C----------C-------GA-C--G------A---A----C-------------AG---AG----TC-CT---GG-TAAA--ACC---C--G-C-G-A----TAA--c
gi|4 : ctcgtgcaccagacgctcgcttgtctccgtaaatctccgtaaaccgagagtctggtaaagatactgcgaaaaacgtgtgtaacgtcaaaaacgaggctacacagaatcctggtatgtgatttgatctggatgatcaggcccacaatcgaaaataacgactatcgaagaaagcttgtaatagattaaaagtgacgtttaagtgtgaggatttacaagtacagtgttatagaaatataaaatgatagtatcgaggaaaggatgcattagctgttttacctacgggacattgataaaaccgttcgtatttaatttaccaaaattacttttggagggcaaagtgaaagtatgatttccagttgacagtgatcgggtttttctgttgtattaggtaacttttcctttaatatcactaatgaagtattaattaattaacatcaaatctttcggaatctgactgttttgtgggggagattcaaaccgaaactggaatcagccactccctagcggtaacagttaTCT-CGTTTC-A---AC----C-ACGACAC-T--C---GG-T-----T-G----T----C--TA--C-GCA-A-A---------T---C----------TCCG----A--C--G------A---A----C----A-------GAG---AG----T--CT---GGCTAAA-GAC----C--G-C-G-A----TAA--
gi|10 : tcgtggcaaccagacgctcgctaatctccgtaaacttcccgtaatccgaagaagtctggtaaagatacgcaaaacgttgtaacgtcaaaacgaggcttaccagatatcctggtaatgtgatttgattggctgatcaggccacaatcgaaaataacgacttatcgaagaaagctgcaatagattgaaagtgacgttaaagtgtgaaggatttacaagtagagtgttttagaaaatataaaatatagaagaggaatgattttattagctgttctccctacgggataagatacaaccgttgcgtatttaatttttaccaaattactttggatgcaaagtgaaagtatgatttctcagtttgaacacggatcgccggtttttctgttgtactggtaaattttcctttagtacccactaatgaagttataagttaattaaaataaaatcttttggaattgatctgtgtttttgtgggaggagattcaaaccgaaaactgaattagcgctcacctgcggtaacagttaTCTACGTG-C-A---ACGTACC-A-GACGC-T--C---GG-C-----C-A----T----C--TC-------------------------------------------G--T--A------A---A----C----C-------GAG---AGC---T--CT---GGATAAAAGATA---C--G-CCG-A----AAA--CG--TTT--G-TA--A-CGT--C-AAAA-CATG-ACT-T-AC-C--------AGA-A-TT--CTGGT-A-T---G--TGA---TTTGGA---T-TGGCTG-A-T--C-----A--------GC-C-A---CAA---T-C-GA------AAAT--AA-CG-A--C-T--A----T-CGGAAG-AAAG-C-T---GT-AAT-A------GA----T-TG--AAAG--T-GA-C----G--TT--TA-A-G-GTG---A-GGA-TT-AC-A------T---AG---A--GTGTTTAG--------A---AA-----T---AT-AAAAT-G--ATAGAA--G--AGAAA--A-GGAT-----TC--ATT--AG--CT---TTC-T-A-----CT--ACGGG-A--CA-TGAC-----------TT----GCG----TAT-TT-AA-TT--TTGA-C-CAAATTT-AC----TTGG--AG--GGC-A--AA-G-TGAA-ATACATGTA---TG-A-T-T-T-C-CA--TT--GA--C-A-G-CG-AT-CG-C----GGTTTT-----T---TTG-TT---GTAT-T--------GGTAA-C-TTT-TC-C---TT--AGT--A-TC----------ACTAA--GACAG-TATT-AAT--TA-AAGAACAA--TC-AAATCTTTC--GAATTGA--TG--TG-TT-T-T--G--TGGG-G---A-ATT-CAAA-C--C-------G-AAACT-GAA-----TTAG-C--GC-TC-CCTA--GGCACCGAGT-AAAA---GTTG--T----c
gi|1 : gTCT-CGTG-C-A---ACG---C-A-GACGC-T--C---GG-C-----T-A----T----C--TC--C-GTA----------------------------------------------------------C----C-------GAG---AG----T--CT---GG-TAA--GATA---C--G-C-G-A----AAA--TGGTTTT--G-TA--AACGTT-C-AAAA-CGAG-GCT-T-AC-C--------AAA-A-TC--CTGAT-A-T---T--AAA---TTT-GA---T-TGGCTGAA-TCGC-----A-------GG--------CAA---T-GCCA------AACT--AA-CG-A--C-T--A----TCC-GAAG-AAAG-C-T---GCTAAT-AACATGTAA----T-TG--AAAG--TCGG-C----GTTTT--TA-A-GTGTG---A-GGATTT-AC-A----AAT---AG---AG-GTGTTTGGGGGGGGTAG---AA-----T---AT--AAAT-A--ATAGAA--GC-AGAAA--A-GGAT-----TT--ATT--AGGCTT-G-TTCTT-A--CCGCT--ACGGT-AAGTA--GAT-AAAA--A-CGTTG---GCG----TAT-TT-AA-TT--TT-AGC-CAAAATTCAC-T--T--G--AA--GGC-A--AA-G-TAAA-A-----GTA---TA-ATT-T-T-C-TAGTTT--GAG-G-A-G-CG-AT-CG-C----GGTTTT-----TTTCCTGTTT---GTA--T--------GTTAA-T-TTT-TT-C--TTT--AGT--A----------------AAT---------CT-AAT--T---TTAACAA--TA-AAATCTTTTG-AAATTGA-CTG--TGTTT-T-T--G--T-GG-GG-AG-ATT-CAAAGC--C-------G-AAACT-GAA-----TTAG----GC-GC-TCTA--G----GGCGT-AACA---ATTA--T----TATC-G--CGG-G----T---CTTTTTAA---CCA-G--AG---CT-CTC---T---G--T---T--C-G---------T--CG------------GAA-G-A--T---T-TGCGC--GTAG--ACAT--G-C----CG--AAAT------TGTT-TGG-G-T---TG-AGGCG--AGAaacc
gi|12 : TCT-CGTT-A-A---AC----C-A-GACAC-T--C---G--T-----G-G----TG---C--TC--C-GCA-A-A---------T---C----------T-------T--C--G------A-------------C-------GAGCAAAG----T--CT---
gi|14 : aacgtttgtaacgtcagaacgaggtttaccaaaatttcggtatttcattaatttgattgattcaccacacctccaattaacgactatcgaagaaaaaaacgttgcatttaaacctaagaacttacaattagagtgtttaaaaatgttggaaagaaaattatttatttgtgttctacgttgtaaacgtattaaattaccaattacttagagcaaagtgaaagcacgatttcagctgacagcgatcgcagtttttctgttacagtggtaatttccccattagtatcactaatgaaggatcaactaattaccatcaaatctttcgaaattaactatgtttctgtcgaagagattcaaaccgaaatcaaattagcgctccctagcgaacagttaatatcgcgTCT-CGTT-A-A---AC----C-A-GACAC-T--C---G--T-----G-G----TGA--C--TC--C-GCA-A-A---------T---C----------T-------T--C--G------A-------------C-------GAGCAAAG----T--CT---tt
gi|11 : tatgatttgttgattcaccacacctccaattacgacctaatcgaagaaaaacgttgcatttaaacctaagaacttacaattagagtgtttaaaaatgttggaaaagaaaattatttatttgctgttctcctacggatatggtaaaactgttgtgtattaaagttttccaaaaattacttagaaggcaaagtgaaagccgatttccagctgacagcgatcgcagtttttctgttagtggtaatttccccattagtatcactaatgaaggatcaactaattaccatcaaatctttcgaaattaactatgtttctgtcgaagagattcaaaccgaaatcaaattagcgctccctagcgtaacagttaatatcgcgTCT-CGTT-G-A---AC----C-A-GACGC-T--CG--G--C-----T-G----T----C--TC--C-GCA-A-A---------T---C----------T----------C--A------A---ACGAGC----T-------GAG---AG----T--Ct
gi|23 : gaatctattggtatagacacacgatgacgttttacaccagaaatctcggtattcagtcccattggttgattccacaaaccttcaaaacaacgattactgaagaaagttcgcagtacattgaacgcggcgttgtgcaagcagagtatttaaaaaatgttgaaaaggggtaagtatttacttgctgctctaccttagggatatatatgtgtacacaattttaccaaaatgactttgaaaggcaaaagttaaaatacgatttctagctaacagcgatcgcggctttaattttctattgtagtgatgaattctccattagtatcactaatgaagtatcaactaataaccatccaatctttcggaattgactatgtttataccggtgaagcagatgctaaattagcactccctagtggtaatagttattatcgcaagttTCT-CGTG-C-A---AC----C-A-GACGC-T--C---GG-C-----T-A---------C--TC--C-ATA-A-A---------T---C----------TCC-----G--T--A------A---A----C----C-------GAA---AG----T--CT---GG-TAAA-GATA---C--G-C-A-A----AAA--CG--TTT--G-TA--A-CGT--C-AAAA-CGAG-GCT-T-AC-C--------ATA-A-TC--CTGGT-A-T---T--TAA---TTT-GA---T-TGACTG-A-T------------------C-C-A---CAC---T-C-CA------AAAT--AA-CG-A--C-T--A----T-C-GAAG-AAAG-C-T---GT-GAT-A------GA----T-TG--AAAG--T-GG-C----G--TT--TA-A-TTGTG---A-GGATTT-AC-A----ACT---AT---A--GTGTTTAG--------A---AA-----T---AT-AAAAT-A--ATAGAA--G--A
gi|3 : gTCT-CGTT-C-A---AC----C-A-GTCA--T--C---G--G-----T-A----TGTAAC--TA--C-GCA-G-A---------T---A----------T-------G--CCGG------A---A----CGAAAC-------AAG---AGACGCT--CT---GG-TAAA-GA
gi|13 : caaaatcgaggcttcagaatctcctggtatgtattgattggctgatccagacaggccacaatcgttagtaaacgactgatcgaaggaaagcatgcaatggagttcttgaaaggtgacgttataaaggtggcgattttactaagttatagagattttgtagaaatttgataaatgtatagaaggaaggaaatagatattagctagttctaaccttacggaatatgataagacgcgttgcgattatatttaattttactcaaaattactatttggtgagacggcacaaagggaatcgtaaagtgagtgtcccagtttgaatcaggtgattcgctgacagtttttctcgtgtatttgctctgtggtaaatgattcccctttagtatccattaattgaagtatttaattaattaacaatcaaatctatcggaattcactgtgttcttgtttggggatagctgcaaactcgagtgagaaactgaaatctgctggcgcctattgctcggtagagttattgtataccgatctggagctTCT-CGTT-A-A---AC----C-A-GACAC-T--C---G--T-----G-G----TGA--C--TC--C-GCA-A-A---------T---C----------T-------T--C--G------A-------------C-------GAGCAAAG----T--CT---c
gi|35 : aacgtttgtaacgccagaacgaggtttaccaaattttcggtatttcattagattgattgattcaccacacttccaattaacgactatcgaagaaatttgtaatatattgaatgttgcatttaaacctaagaacttacattagaggttttttaaaaatgtttggaaagaaaattatttatttgctgttctacctaagtgaaagcacgattccagctggcagcgatcgcagtttttctgttacatgtggtaatttcccccattagtatcactaatgaaggatcaactaatcatcaaatctttcgaaattaactatgtttctgtcgaagagattcaaaccgaaatcaaattagcgctccctagcggtaacagttaatatcgcgTCT-CGTT-C-A---AC----C-A-GGCAC-T--CA--G--T-----T-G----T----C--TA--C-GCA-A-A---------T---C----------TCCG----A--C--G------A---A----C----A-------GAG---AG----T--CT---GG-TAAA-GACC---C--G-C-G-A----TAA--tt
gi|30 : ctccctagcggtaacagttaTCT-TGTT-C-A---AC----T-A-GACAC-T--CA--G--C-----T-G----T----C--TC--C-GCA-A-T---------T---T----------C-------T--T--ACG----A---G----C----A-------GAG---AG----T--CT---AG-TAAA-GATG---C--T-C-G-A----TAA--TA--ACT--GTTA--C-CGC--T-AGG---GAGCGCT-G-A--T--------AGA-G-TA--C-GGT-A-T---G--TAA---Tct
gi|31 : gTCT-CGTT-C-A---AC----C-A-GACGC-T--C---GG-C-----T-G----C----C--TT--C-TCA-A-A---------T---T----------T------------------------A----C----CACGAGAAGAG---AG----T--CT---GG-TAAA-GATT---C--G-C-G-A----TAA--TG--c
gi|36 : aaattccaaataatccatctagcggtaacattTCT-CGTG-C-ATGAGC----C-A-GACGC-T--C---GGCC-----T-A----T----C--TC--T-ATA-A-A---------C--------------------------------------------C----C-------AAG---AGA---T--CTGGGGG-TAAA-GATATC-C--G-C-GAA----AAA--CAT-TTT--G-TA--A-CGT--C-ct
gi|37 : gTCT-CGTG-C-A---AC----C-A-GACGC-T--CG--G--C-----T-A----T----A--TC--C-GTA-A-A---------C---C----------T-------G--T--
gi|33 : TCT-CGTG-C-A---AC----C-A-GACGC-T--CG--G--C-----T-A----T----C--TC--C-GTG-A-A---------T---C----------TCC-----G--T--A------A---A----C----tcgtcggagaattgcgtagacaaccaagtgtctggttgaac
gi|52 : gTCT-CGTG-C-A---AC----C-A-GACGC-T--CG--G--C-----T-A----T----C--TC--C-GTA-A-A---------T---C----------G-------A--C--G------A---G----C----A-------GAG---AG----T--tctgttcgttggcgatttgcgtagacaaccatgcaagtgtctggttgaacgag
gi|47 : TCT-CGTG---A---AC----C-A-GACGC-T--C---GG-C-----T-A----T----C--TC--C-GTA-A-A---------T---C----------G-------A--C--G------A---G----C----A-------GAG---AG----T--AG---GG-TAAg
gi|40 : TCT-CGTG-C-A---AC----C-A-GACGC-T--CCG-G--C-----T-A----T----C--TC--C-GTA-A-A---------C---CGTCGGAGATTT-------G--T--GTTGAGCA---A----C----C-------GAG---TG----T--CT---GG-Tt
gi|48 : TCT-CGTT-A-T---AC----C-A-GACAC-T--CG--G--T-----T-G----T----C--TA--C-GCA-A-A---------T---C----------T-------tgaacg
gi|54 : taaatctccgtaaaccgTCT-CGTG-C-A---AC----C-A-GATGC-T--CG--G--C-----T-A----T----C--TC--C-GTA-A-A---------T---C----------T-------c
gi|58 : TCT-CGTG-C-A---AC----C-A-GACGC-T--CG--G--C-----T-A----T----C--TC--C-GTA-A-A---------ccgactaacaaag
gi|46 : agTCT-CTTT-C-A---AC----C-A-GACAC-C--CG--G--C-----T-G----T----T--TC--C-GCA-A-A---------T---C----------T-------
gi|44 : aatctccgacaagcaatgtcgtcaaTCT-CATG-C-A---AC----C-A-GACAC-T--TG--G--C-----T-A----T----C--TC--C-GTA-A-A---------T---T----------T-------c
gi|51 : agTCT-CGTT-C-A---AC----C-A-GGCAC-T--C---A--G-----T-AACGGT----T--TA--C-GGA-G-A---------T-----------------------------------A---G----C----C-------GAG---CG----T--CT---GG-ccacccatcagaagtattctctgttcgtcg
gi|59 : TCT-CGTG-C-A---AC----C-A-GACGC-T--CG--G--C-----T-A----ct
gi|6 : ctagCT-CGTG-C-A----C----C-A-GACGC-T--C---G--C-----TTG----T----C--TC--C-GTA-A-A---------T---C----------TCC-----G--T--A------A---A----C----C-------GAG---AG----T--CT---GG-TAAA-GATA---CT-G-C-G-A----AAAA-CG--TGT--G-TA--A-CGT--C-AAAAACGAG-GCT---ACAC--------AGA-A-TC--CTGGT-A-T---G--TGA---TTT-GA---TCTGGATG-A-T--C-----A-------GGC-CCA---CAA---T-C-GA------AAAT--AA-CG-A--C-T--A----T-C-GAAG-AAAG-C-TT--GT-AAT-A------GA----T-TA--AAAG--T-GA-C----G--TT--TA-A-GTGTG---A-GGATTT-AC-A----AGT---AC---AGTGT-TATAG--------A---AA-----T---AT-AAAAT-G--ATAGTATCG--AGGAA--A-GGAT-----GC--ATT--AG--CT-G-TTT-T-A--C--CT--ACGGG-A--CATTGAT-AAAA--C-CGTT-----CG----TAT-TT-AA--T--TT-A-C-CAAAATT-ACTT--TTGG--AG--GGC-A--AA-G-TGAA-A-----GTA---TG-A-T-T-T-C-CAG-TT--GA--C-A-G-TG-AT-CG------GGTTTT-----T---CTG-TT---GTAT-TA-------GGTAA-C-TTT-TC-C--TTT--AAT--A-TC----------ACTAAT-GA-AG-TATT-AAT--TA-ATTAAC-A--TC-AAATCTTTCG-GAAT----CTGACTG-TT-T-T--G--TGGG-GG-AG-ATT-CAAA-C--C-------G-AAACTGGAA-----TCAGCC--AC-TC-CCTA--G----CG-GT-AACA---GTTA--T----TATC-G--CGG-G----T----TTT---A---CCAGG--A-------CTC---T---G--T---T--C-G---------T--CG------------G-A-G-AT-T---T-T--GC--GTAG--ACA---A-A----CG--AG---------GTC-T-G-G-T---TG-A-ACG--AGA
gi|26 : CT-TGTT-C-A---AC----C-A-AACAC-T--CA--G--C-----T-G----T----C--TC--C-ACA-A-A---------T---C----------TTCG----A--C--G------A---G----C----A-------GAG---AG----T--AC---GA-TAAA-AATT---C--A-A-G-A----TAA--CA--TTT--G-TA--A-CAT--C-AGAA-CGAG-GCT-T-AC-T--------AAA-A-TT--TCATT-A-T---T--TAA---TTT-GG---T-TG
gi|33 : CT-CGTT-C-A---AC----C-A-GACAC-T--T---G--CATGGTT-G----T----C--TA--C-GCA-A-A---------T---C----------tttcaatacacctccaaa
gi|34 : gtctcgtgcaaccagacgctcggctatctccgtgaatctccgtaaactctgttcgttggcCT-CGTG-C-A---AC----C-A-GACGC-T--CG--G--C-----T-A----T----C--TC--C-GTA-A-A---------T---C----------TCC-----G--T--A------A---A----C----T--------------G----T--TC---GT-TGGA-GATAATTC--G-C-G-T----AGA--C
gi|4 : T-CGTGGC-A---AC----C-A-GACGC-T--C---G--C-----T-AA---T----C--TC--C-GTA-A-A---------CTTCC----------C-------G--T--A------A---T----C----C-------GAAGA-AG----T--CT---GG-TAAA-GATA---C--G-C---A----AAA--CG--TT---G-TA--A-CGT--C-AAAA-CGAG-GCT-T-AC-C--------AGATA-TC--CTGGT-AAT---G--TGA---TTT-GA---T-TGGCTG-A-T--C-----A-------GGC-C-A---CAA---T-C-GA------AAAT--AA-CG-A--C-TT-A----T-C-GAAG-AAAG-C-T---GC-AAT-A------GA----T-TG--AAAG--T-GA-C----G--TT--AA-A-GTGTGA--A-GGATTT-AC-A----AGT---AG---AGTGT-TTTAGA-------A---AA-----T---AT-AAAAT----ATAGAA--G--AGGAA--T-GATT-----TT--ATT--AG--CT-G-TTC-T-C--C--CT--ACGGG-A--TA-AGAT-ACAA--C-CGTT----GCG----TAT-TT-AATTT--TT-A-C-C-AAATT-AC-T--TTGG--A---TGC-A--AA-G-TGAA-A-----GTA---TG-A-T-T-T-CTCAG-TTTGAA--C-A-C-GG-AT-CGCC----GGTTTT-----T---CTG-TT---GTAC-T--------GGTAA-A-TTT-TC-C--TTT--AGT--ACCC----------ACTAAT-GA-AGTTATA-AGT--TA-ATTAAA-A--TA-AAATCTTTTG-GAATTGATCTG--TGTTT-T-T--G--TGGGAGG-AG-ATT-CAAA-C--C-------GAAAACT-GAA-----TTAG-C--GC-TCACCT---G----CG-GT-AACA---GTTA--T----TATC-G--C-G-G----T---CTTT---AG--CCA-G--A----CT-CTC---T---G--T---T--C-G---------T--CG------------G-A-G-A--T---T-T--GC--GTAG--ACA---A-C----CG--AG--------TGTCGT-G-G-T---TGAA-ACG--AGACaaccgtgtttctggttgaacgagact
gi|5 : T-CGTG-C-A---AC------A-GACGC-T--C---GG-C-----T-A----T----C--TC--C-GTA-A-A---------T---C----------TCC-----G--T--A------A---AA---C----C-------GAG---AG----T--CT---GG-TAAA-GATA---C--G-C-G-A----AAA--CG--TTT--G-TA--A-CGTC-C-AAAA-CGAG-GCT-T-AC-A--------AGA-A-T---CTGGT-A-T---G--TGA---TTT-GA---T-TGGCTG-A-T--C-----A-------GG--C-A---CAA---T-C-GA------AAAT--AA-CG-A--C-T--AT---T-C-GAAG-AAAG-C-T---GT-AATAA------GA----T-TG--AAAG--T-GA-C----G--TT--TA-A-GTGTG---A-GGATTT-AC-A----AGG---AG---A--GTGTTTAG--------C---AA-----T---ATAAAAAT-G--ATAGAA--G--AGGAA--A-GGA------TT--ATT--AG--CT-G-TTC-T-A--C--CT--ACGGGAA--TA-TGAT--AAA--C-CGTT----GCG----TAT-TT-AA-TT--TT-A-C-CAAAATT-CC-T--TTGG--A---GGC-A--AA-G-TG---A-----GTA---TGCA-T-T-T-C-CAG-TT--GA--CAA-G-CG-AT-CG-CA---GGTTTT-----T---CTG-TTCA-AAAC-C--------GGTAA-T-TCT-TC-T--CTTTAAGT----TCA---------ACTAAT-G--AG-TATT-GAT--TACATTAAC-AATTC-AAAACTTCAG-GAATTCA-CTG--TG-TT-T-TGGG--TGGG-TA-AGAATT-CAAA-C--C-------G-AAACT-GAA-----TT-G-C--GCTTC-CCTA--G----CG-GT-AACA---GTTA--T----TATC-G--CGG-G----T---CTTTA--A---CCA-G--A----CT-CTC---T---G--T---T--C-GA--------T--CG------------G-A-G-AT-T---T-T--GC--GTAG--ACA---A-C----TGA-AG--------TGTC-T-G-G-T---TG-A-ACG--
gi|41 : T-CGTG-C-A---AC----C-A-GACGCCT--C---GG-C-----T-A----T----C--TC--C-GTA-A-ACGTCGGAGAT---T----------T-------G--T--GTTGAC-A---A----C----C-------GAG---TG----T--CT---GG-T
gi|5 : -CGTT-C-A---AC----C-A-GACAC-T--TCA-G--T-----T-G----T----C--TA--C-GCA-A-AATC------T---C----------C-------GATC--G------A---A----C----A-------GAG---AG----T--CT---GGTTAAA-GACC---C--G-C-G-A----TAA--tgaa
gi|28 : tcgtgcaacagacgctcggctatctccgtaaatctccgtaaaaccgagagtctggtaaagatacgcgaaaacgtttgtaacgtccaaaacgaggcttacaagaatctggtatgtgatttgattggctgatcaggcacaatcgaaaataacgactattcgaagaaagctgtaataagattgaaagtgacgtttaagtgtgaggatttacaaggagagtgtttagcaatataaaaatgatagaagaggaaaggattattagctgttctacctacgggaatatgataaaccgttgcgtatttaattttaccaaaattcctttggaggcaaagtgagtatgcatttccagttgacaagcgatcgcaggtttttctgttcaaaaccggtaattcttctctttaagttcaactaatgagtattgattacattaacaattcaaaacttcaggaattcactgtgttttgggtgggtaagaattcaaaccgaaactgaattgcgcttccctagcggtaacagtta-CGTG-C-A---AC----C-A-GACGC-T--TCG-G--C-----T-A----T----C--TC--CCGTA-ATA---------TTCTC----------C-------G--T--A------A---A----C----C-------GAG---AG----T--CT---GG-TAAA-GATAATTC--G-C-GAA----AAA--CG--TTT--G-TA--A-CGT--CGAAAA-CGAG-GTT-T-AC-T--------CGA-A-TC--CC-GT-A-T---
gi|32 : gtctag-CGTG-C-A---AC----T-A-GACGC-TGAC---GG-C-----T-A----T----C--TC--C-GTA-A-ATC-------T---C----------T-------G--T--A------A---A----cccagggtttggaat
gi|40 : -CGTT-C-A---AC----C-A-GACAC-T--C---G--G-----T-T----G----C--TCAAC-ACA-A-A---------T---C----------T-----------------------------C----C-------GAC---GG----T--TTAC-GG----A-GATA------G-C-C-G----GAG--CG--TCT--G-actgttcgtcggagatttgcgtgtagacaaccgagtagtgttatgtctggttcaacgagac
gi|43 : tctcgtgcaac-CGTG-CCA---AC----C-A-GACGC-T--TTCGG--C-----T-ATC--T----C--TC--C-GTG-A-A---------T---C----------TCC-----G--T--A------A---A----C----C-------G-G---AG----T--TT---
gi|29 : GTT-C-A---AC----C-G-GATGT-T--C---GA-C-----T-G----T----C--TC--C-GCA-A-A---------T---C----------T-----------------------------T----C--------AG---AG----T--CT---GG-TAAA-atgttcgtcagaga
gi|24 : agtatctaatgtagattcaactaattaccaatggtgattatgatttgtcagaaagttaaattagcgctccctagcggtaccagtTG-C-A---AC----C-A-GACGC-T--CT--G--C-----T-A----T----C--TG--C-GTA-A-A---------TT--C----------C-------G--T--A------A--------C----G-------GAG---AG----T--CT---GT-TAAA-AATA---C--G-C-GAA----AAA--CG--TTT--G-TT--A-CGT--C-AAAA-CGA--GCT-T-AC-C--------AAA-A-GC--CTGA----------------------------TGGCTG-A-T------------------C-C-A---CAA---TCC-AG------AAAT--AA-CG-A--C-T--A----T-C-GAAGTAAAG-C-T------AAT-A------A-------TG--AAAG--T-G--------------CA-A---------A-GGATTT-AC-A----AGT---AG---A--GTGTTTAA--------A---AA-----T---A----------------------AGGAA--A-GGAT-----TT--ATT--a
gi|2 : tttc-C-A---AC----CCA-GACAC-T--C---GGCT-----T-G----T----C--TA--C-GCAGA-A---------T---C----------TCCGAC--G-----A------A---A----C----A-------GAG---AG----TGCTT---GG-TAAA-GACC---C--G-C-t
gi|18 : accagacgctcgctatctccgtaaaatctccgtgaatcgagagtctggtaaagatacggcaaaaaaacgtttgtaaacgtcaaaacgaggctctaccagaaatcctggtatgtgaatttgaattggctgatcaggccacaatccgaaaataagaaactaacgaagacgctgcgaatagatctgaaagtgaacgttaaaagtgttgaggattttacaagtagaaagtgtttagaaatataaaatgatagaagaggaaaggatttattaagttgttcttacctaacgggataagatcacaaccgttgcgtatttcaattttacgcaaaattacttggagtgcaagtgaaagtatgatttcccagtttgacagcgatcgcggtttttctgttgtagtactggtaaattttcctttagtacactaatgatgtattaattaattaaaatcaaaatcttttggaattgactgtgttttgtgggagattcaaaccgaactgaattagcgctcctagccggtcaacagttatcttatct-A---AC----C-A-GACGC-T--T---GG-C-----T-G----T----C--TC--C-ATA-G-A---------T---T----------TCCGACGAG--T--A----------------------------GAG---AG----T--CT---GG-TAA----------------------------CG--TTT--G-TA--A-AGT--C-AGAA-CGAT-GCT-T-GC-C--------AAA-T-TA--CTGCTCA-T---GACTGA---TCT-GA---T-TGATTG-A-T--T-----GATGGATTGAT-T-AATTCAA---C-A-CACCTCCCAAAT--AA-CA-AG-C-T--T----T-C-GAAG-AAAT-T-T---GT-AAT-A------GA----T-TG--AATG--C-GC-C----G--TT--TA-A-GCTTA---A-GGATTT-AC-A----ACT---AA---AGTGT-TTC---------------A-----T--------AAT-G--TTGCAA--A--AAGAA--A-GGAT-----TT--A-C--A----T-G-----T-A--T--TT--ACAAG-A--TA-TGGC--AAA--C-CATT----CTG----TAT-TC-AA--G--TT-A-C-CAAGATT-AC-T--TGAG--AG--GGA-A--GA-G-TAAA-A-----TTA---CA-A-T-T-T-T-Caaaacga
gi|56 : -A---AC----C-A-GACGC-T--T---GA-C-----T-A----T----C--TC--T-GTT-A-A---------T---C----------T-------
gi|2 : ---AC----C-A-GACGC-T--C---G--C-----T-A----T----C--TC--C-GTA-A-AATC------T---C----------C-------G--T--G------A---A----T----C-------GAG---AG----T--CT---GG-TAAA-GATA---C--GGC-A-A----AAAAACG--TTT--G-TA--AACGT--C-AAAA-CGAG-GCTCT-AC-C--------AGA-AATC--CTGGT-A-T---G--TGAA--TTT-GAA--T-TGGCTG-A-T--C-----A-------GGC-C-A---CAA---T-CCGA------AAAT--AA--G-AAAC-T--A----A-C-GAAG-AC-G-C-T---GCGAAT-A------GA----TCTG--AAAG--T-GAAC----G--TT---A-A-AAGTGTTGA-GGATTTTAC-A----AGT---AG---AAAGTGTTTAG--------A---AA-----T---AT-AAAAT-G--ATAGAA--G--AGGAA--A-GGAT-----TT--ATTA-AG--TT-G-TTCTT-A--C--CTA-ACGGG-A--TA-AGATCACAA--C-CGTT----GCG----TAT-TTCAA-TT--TT-A-CGCAAAATT-AC----TTGG--AG--TGC----AA-G-TGAA-A-----GTA---TG-A-T-T-TCC-CAGTTT--GA--C-A-G-CG-AT-CG-C----GGTTTT-----T---CTG-TTGTAGTAC-T--------GGTAA-A-TTT-TC-C--TTT--AGT--A--C----------ACTAAT-GA-TG-TATT-AAT--TA-ATTAAA-A--TCAAAATCTTTTG-GAATTGA-CTG--TG-TT-T-T--G--T--G-GG-AG-ATT-CAAA-C--C-------G--AACT-GAA-----TTAG-C--GC-T--CCTA--GC---CG-GTCAACA---GTTATCT----TATCTG--CGG-G----T---CTTT---A---CCA-AGCA----CT-CTC---T---GT-T---T--C-G---------T--CG------------G-A-G-A--T---TCT--GC--GTAG--ACA---AGC----CG--AG--------TGTC-TGG-G-T---TG-A-Atcgacgagtagagagt
gi|45 : ---AC----C-A-GACGC-T--C---GG-C-----T-A----T----C--TC--C-GTA-A-A---------T---C----------T-------aacga
gi|51 : ccC----C-A-GACGC-T--C---GG-C-----T-A----T----C--TC--C-GTA-A-A-------------C----------C-------G--T---------T---A----C----T-------GAG---TG----C--CT---GG-Tccgacctgttcgtcagagatttgcatagacaacca
gi|17 : C-T--C---T--C-----C-A----T----CCCTC--C-GTTTA-A---------T---T----------T-------T--T------------------C----A-------GAG---AG----T--CTT--GG-TAAG-GATA---CCAG-C-A-ACTTTGAA--CG--TTTTTG-TAGGA-CG---C-TAAA-CGAG-GCT-TGAC-CTAGCGCGAAAA-A-TCA-TTGGT-A-TAG-G--TTGCAGTTT-GACTCT-TGGATG-A-T--C-----A-------GGA-C-----CAA---TCC-AA------AAATAAAA-CGAA--CGT--AAGTTT-C-GAAG---AG-T-TATAGT-ATT-A------GA----T-TGAAAAAA--T-GA-CAGTTG--TT--TA-GTGGGTG---ATGGAGAT-AT-ATCGTACT---GGATCAGTGT-CTTAG--------ATATAATTTATT---AT-ATTAT-G--TTGGAA--GA-AGGAA--A-GGATGATACTTTAATT--AG---T-G-TTT-TAA--C--CTTAAAGGG-A--TA-TGAT-TAAAGGC-CGTTGCTGGCG----TATGTT-AA-TTTATT-A-C-CAAAATT-tgaacgagact
gi|48 : acgctccggctat-A----T----C--TC--C-GTA-A-A---------C---CGAGATTTG--C-------G--T--AGAC---A---A----C----C-------GAG---TG----T--CT---GG-TAct
gi|16 : taaAG---GG----T--CT---GG-TAAA-GACA---C--G-C-G-A----TAA--CG--TTT--G-CA--A-CAT--C-AGAA-CGAG-GTT-T-AC-C--------AAG-A-TT--TCAG------------TA---TTT-GA---T-TGGTTG-A-taacgagac
gi|11 : cnnnnnnnnnnnnnnT---GG-TATA-GACA---C--A-C-G-A----TGA--CG--TTT----TA-------------------------C-AC-C--------AGA-AATC--TCGGT-A-T------TCAG--TCC-CA---T-TGGTTG-A-T--T---------------C-C-A---CAAACCT-T-CA------AAAC--AA-CG-A--T-T--A----C-T-GAAG-AAAG-T-TC--GC-AGT-A------CA----T-TG--AACG--C-GG-C----G--TT---------GTG-------------C-A----AGC---AG---AGTAT-TTAAA--------A---AA-----T---GT-----T-G--A--AAA--G--GGGTA--A-GTAT-----TT--ACT--TG--CT-G-CTC-T-A--C--CT--TAGGG-A--TA-T-AT-A----------T----GTG----TAC-AC-AA-TT--TT-A-C-CAAAATG-AC-T--TTGA--AA--GGC-A--AAAG-TTAA-A-----ATA---CG-A-T-T-T-C-TAG-CT--AA--C-A-G-CG-AT-CG-C----GGCTTTAATTTT---CTA-TT---GTAG-T--------GATGA---ATTCTC-C--ATT--AGT--A-TC----------ACTAAT-GA-AG-TATC-AAC--TA-ATAACC-A--TC-CAATCTTTCG-GAATTGA-CTA--TG-TT-TAT--A--CCGG-TG---------AAG-C--A-------G-ATGCT-AAA-----TTAG-C--AC-TC-CCTA--G----TG-GT-AATA---GTTA--T----TATC-G--CAA-G----T---T--------------G--A----CT-CTC---A---G--C---T--C-G---------T--TT------------G-A-G-A--T---T-T--GC--GGAG--ACA---G-C----CG--AG--------CGTC-T-G-G-T---TC-A-ACG--AGAcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagttgacagcgatcgcggtgtttctgttgtactggtactttctccatttgtattcttaatgaaatatcaactaattaacatcaaa
gi|27 : gaatctat---GG-TATA-GACA---C--A-C-G-A----TGA--CG--TTT----TA-------------------------C-AC-C--------AGA-AATC--TCGGT-A-T------TCAG--TCC-CA---T-TGGTTG-A-T--T---------------C-C-A---CAAACCT-T-CA------AAAC--AA-CG-A--T-T--A----C-T-GAAG-AAAG-T-TC--GC-AGT-A------CA----T-TG--AACG--C-GG-C----G--TT---------GTG-------------C-A----AGC---AG---A--GTATTTAA--------A---AA-----
gi|12 : AA--CG--TTT--G-TA--A-CGT--C-AGAA-CGAG-GTT-T-AC-C--------AAA-A-TT--TCGGT-A-TTTCA--TTAA--TTT-GA---T-TGATTC-A-C--C-----A-------CAC-CTC---CAA---T--------------T--AA-CG-A--C-T--A----T-C-GAAG-AAA-----------AA---------------------AACG--T-TG-C----A--TT--TA-A-ACCTA---A-GAACTT-AC-A----ATT---AG---AGTGT--TTA---------------------------AAAAT-G--TTGGAA-----AGAAA--A-TTAT-----TT--ATT--TG---T-G-TTC-T-A--C--GT--------------TG-T-AAA--------------CG----TAT-TA-AA-TT-----A-C-CAA--TT-AC-T--T-----AG--AGC-A--AA-G-TGAA-A-----GCA---CG-A-T-T-T-C--AG-CT--GA--C-A-G-CG-AT-CG-C----AGTTTT-----T---CTG-TT---ACAG-T--------GGTAA-T-TTC-CC-C--ATT--AGT--A-TC----------ACTAAT-GA-AG-GATC-AAC--TA-ATTACC-A--TC-AAATCTTTCG-AAATTAA-CTA--TG-TT-TCT--G--TCGA-AG-AG-ATT-CAAA-C--C-------G-AAATC-AAA-----TTAG-C--GC-TC-CCTA--G----CG----AACA---GTTA--A----TATC-G--CG------------------------A-G--A-------CTT---T---G--C---T--C-G---------T--CG------------A-A-G-A--T---T-T--GC--GGA---GCA---C-CA---CG--AG--------TGTC-T-G-G-T---TT-A-ACG--AGA
gi|13 : AA--CG--TTT--G-TA--A-CGC--C-AGAA-CGAG-GTT-T-AC-C--------AAA-T-TT--TCGGT-A-T---T--TCA---TTA-GA---T-TGATTG-ATT--C-----A---------C-C-A---CAC---T-T-CC------AATT--AA-CG-A--C-T--A----T-C-GAAG-AAAT-T-T---GT-AAT-A------TA----T-TG--AATG--T-TG-C----A--TT--TA-A-ACCTA---A-GAACTT-AC------ATT---AG---AG-GTTTTT---------------------T---A--AAAAT-G--TTTGGA--A--AGAAA--A-TTAT-----TT--ATT--TG--CT-G-TTC-T-A--C--CT--Att
gi|15 : A--CG--TT---G-TA--A-C----C-AAA---GAG-TTT-A-AC-C--------AAA-T-TT--TCGGT-A-A---T--TCA---ATA-GA---T-TGA-TG-A-TT-C-----A---------C-C-A---CAT---T-C-AA------T--T--AA-CG-A--C-T--AA---T-C-GAAG-AAAATT-T---GT--AT-A------TA----T-TG--AATGT-T-GA---------TT--TA-A-GCCTA---A-GAACTTAAC-A----ATT----G---A--GTGTTTAA--------A-----------------AAAAT-GTTATGGGA--A--AGAAATTA-GG-------TT--ATT---G--CT---TTC-T-AT-C--CT--Aagtgaaagcacgattccagctggcagcgatcgcagtttttctgttacatgtggtaatttcccccattagtatcactaatgaaggatcaactaatcatcaaatctttcgaaattaactatgtttctgtcgaagagattcaaaccgaaatcaaattagcgctccctagcggtaacagttaatatcgcgagactttgctcgtcgaagatttgcggagtcaccacgagtgtctggtttaacgagatt
gi|3 : --C-AAAATCGAG-GCT-T----C--------AGA-A-TCTCCTGGT-A-T---G--T-A---TT--GA---T-TGGCTG-A-T--CCAGACA-------GGC-C-A---CAA---T-C-GT------TAGT--AAACG-A--C-TG-A----T-C-GAAGGAAAG-CAT---GC-AAT-G------GAGTTCT-TG--AAAGG-T-GA-C----G--TTA-TA-A-AGGTG---G-CGATTTTACTA----AGTTATAG---AGATTTTGTAG--------A---AA-----TTTGAT-AAA-T-GT-ATAGAA--GGAAGGAA--ATAGAT---------ATT--AG--CTAG-TTC-T-AACC--TT--ACGGA-A--TA-TGAT-AAGA--CGCGTT----GCGATTATAT-TT-AA-TT--TT-A-CTCAAAATT-AC-TATTTGGTGAGACGGC-ACAAA-G-GGAATC-----GTAAAGTG-AGTGT-C-C-CAG-TTT-GAATC-A-GGTG-ATTCG-CTGACAGTTTT-----T---CTC-GT---GTAT-TTGCTCTGTGGTAAATGATT-CC-C--CTTT-AGT--A-TCC---------ATTAATTGA-AG-TATTTAAT--TA-ATTAAC-AA-TC-AAATCTATCG-GAATTCA-CTG--TG-TTCT-T--GTTTGGG-GATAG-CTG-CAAA-C--TCGAGTGAG-AAACT-GAAATCTGCTGG-C--G-----CCTATTGCT--CG-GT-AG-A---GTTA--TTGTATACC-GATCTG-GAGCTT---CTTT---A---CCA-G--AGCGTCT-CT----T---GT-T---T--C-G---------TTCCG------------GCA-T-A--T---C-T--GC--GTAGTTACAT--A-C----CG--A---------TGAC-T-G-G-T---TG-A-ACG--AGACgatgaagcacaattgtccagctggcaagcggatcgcagttttctgttccagtgtagatttccattagttaatctaatagagagaatcaaggataatacatcatcttcgcaaattaactatgttttgtgagagattcaaacttcgaaataaattagcacgctcctgagcgtaacagttaatatggcacttgctcgtcgagatttgcggagacacccacgagtgttggttaagat
gi|49 : CT-C-AC-C--------AAA-A-TT--TTGGT-A-T---T--TAA---TTT-GA---T-CAGTTG-A-T--T-----A-------AACAC-A---C
gi|39 : gcC-C--------AAG-A-TT--TCGGT-A-T---T--TGA---TTT-GA---T-TGGTTG-A-T--C-----A-------------A---AAA---T-C-CA------AAAT--AA-CG-A--C-T--A----T-C-GAAG-AAAG-C-T---GT-AAT-G------GA----T-TG--Actccaaa
gi|14 : AAT--TA-CG-A--C-CTAA----T-C-GAAG-AAA----------------------------------AACG--T-TG-C----A--TT--TA-A-ACCTA---A-GAACTT-AC-A----ATT---AG---AGTGT--TTA---------------------------AAAAT-G--TTGGAA--A--AGAAA--A-TTAT-----TT--ATT--TG--CT-G-TTC-T----C--CT--ACGG--A--TA-TGGT-AAAA--C-TGTT----GTG----TAT-TA-AAGTT--TT-C-C-AAAAATT-AC-T--T-AG--AA--GGC-A--AA-G-TGAA-A-----GC----CG-A-T-T-T-C-CAG-CT--GA--C-A-G-CG-AT-CG-C----AGTTTT-----T---CTG-TT-----AG-T--------GGTAA-T-TTC-CC-C--ATT--AGT--A-TC----------ACTAAT-GA-AG-GATC-AAC--TA-ATTACC-A--TC-AAATCTTTCG-AAATTAA-CTA--TG-TT-TCT--G--TCGA-AG-AG-ATT-CAAA-C--C-------G-AAATC-AAA-----TTAG-C--GC-TC-CCTA--G----C--GT-AACA---GTTA--A----TATC-G--CG------------------------A-G--A-------CTT---T---G--C---T--C-G---------T--CG------------A-A-G-A--T---T-T--GC--GGAG--TCA---C-CA---CG--AG--------TGTC-T-G-G-T---TT-A-ACG--AGA
gi|20 : tatgatttgttgattcaccacacctcc-AAT-T------GA----T-TG--AATG--T-GG-T----A--TT--TA-A-GCTTA---A-AGATTT-AC-A----ACT---AG---AGTGT--TTA---------------------------AAAAT-G--TTGGAA--A--AGGAA--A-GGAT-----TT--ATT--TG--CT-G-TTC-T-A--C--CT--ACAGG-A--TA-AGGT-AAAA--C-AGTT----TTG----TTT-CA-AA-TT--TT-A-C-CAAGATT-AC-C--TTGG--GA--GGCAA--AA-G-TGAA-A-----GAA---CG-A-A-T-T-C-CAG-CT--GA--C-A-G-CA-AT-CG-C----AGTTTT-----T---CTG-TT---GTGG-T--------GGTGA-T--TT-CCAC--ATT--CGT--A-TCAGTGGTGATTACTAAT-GA-AG-GATC-AGT--TA-ACTACC-G--TT-AACTCTTTCA-GTATTGA-CTG--CG-TT-T-t
gi|50 : TT--TG--CT-G-TTC-T-A--C--GT--ACGGG-A--AACTG---------C-CGTT----TTG----TAC-CA-AA-TT--TT-A-C-CAAAATT-
gi|57 : g-AC-T--TTGG--AG--GGC-A--AA-G-TGAA-A-----GTA---TA-A-T-T-T-C-CAG-TT--GA--C-A-
gi|13 : --AA-G-TGAA-A-----GCA---CG-A-T-T---C-CAG-CT--GG--C-A-G-CG-AT-CG-C----AGTTTT-----T---CTG-TT---ACATGT--------GGTAA-T--TT-CC-CCCATT--AGT--A-TC----------ACTAAT-GA-AG-GATC-AAC--TA-AT---C-A--TC-AAATCTTTCG-AAATTAA-CTA--TG-TT-TCT--G--TCGA-AG-AG-ATT-CAAA-C--C-------G-AAATC-AAA-----TTAG-C--GC-TC-CCTA--G----CG-GT-AACA---GTTA--A----TATC-G--CG------------------------A-G--A-------CTT---T---G--C---T--C-G---------T--CG------------A-A-G-A--T---T-T--GC--GGAG--TCA---C-CA---CG--AG--------TGTC-T-G-G-T---TT-A-ACG--AGA
gi|15 : aacgtttgtaacgccagaacgaggtttaccaaattttcggtatttcattagattgattgattcaccacacttccaattaacgactatcgaagaaatttgtaatatattgaatgttgcatttaaacctaagaacttacattagaggttttttaaaaatgtttggaaagaaaattatttatttgctgttctacctA-A-----GCA---CA-A-T-TGT-C-CAG-CT--GG--C-AAG-CGGAT-CG-C----AGTTTT---------CTG-TT---CCAG-T--------G-TAG---ATT-TC-C--ATT--AGTTAA-TC------------TAATAGAGAG-AATC-AAGGATA-AT--AC-A--TC-A--TCTT-CGCAAATTAA-CTA--TG-TT-T-T--G--TGAG----AG-ATT-CAAA-CTTC-------G-AAA-T-AAA-----TTAG-CACGC-TC-CTGA--G----CG--T-AACA---GTTA--A----TATG-G--C------------------------------A----CT-------T---G--C---T--C-G---------T--C-------------G-A-G-A--T---T-T--GC--GGAG--ACA---C-CCA--CG--AG--------TGT--T-G-G-T---TA-A-tt
gi|38 : acgttgtaaccaaagagtttaaccaaattttcggtaattcaatagattgatgattcaccacattcaattaacgactaatcgaagaaaatttgtatatattgaatgttgatttaagcctaagaacttaacaattgagtgtttaaaaaaatgttatgggaaagaaattaggttattgctttctatcctagatgG-A-T-T-T-C-CAG-TT--GA--C-A-G-CA-AT-CG-C----GGTTT------------------------------------------TC-TC-C--CTT--AGT--A-TC----------AC--------------------------TAAC-A--TT-AAATTGTTCG-AAATTGA-CTG--T--CT-T-T--G--TGgat
gi|16 : AG-TT--GA--C-A-G-CG-AT-CG-C----GGTGTT-----T---CTG-TT---GTAC-T--------GGTAC-T-TTC-TC-C--ATT--TGT--A-TT----------CTTAAT-GA-AA-TATC-AAC--TA-ATTAAC-A--TC-AAA
gi|30 : cnnnnnnnnnnnnnnagggtctggtaaagacacgcgataacgtttgcaacatcagaacgaggtttaccaagatttcagtatttgattggttgacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnG-ATTACATA-C--C-------G-TA-CT-CTA-----TCAG-C--GC-TC-CCTA--G----CG-GT-AACA---GTTA--T----TATC-G--AGC-A----T---CTTT---A---CTA-G--A----CT-CTC---T---G--C---T--C-G---------T--AA------------G-A-A-A------T-T--GC--GGAG--ACA---G-C----TG--AG--------TGTC-T-A-G-T---TG-A-ACA--AGAC
gi|29 : -AAGTT-AAA-----TTAG-C--GC-TC-CCTA--G----CG-GT-ACCA---GTT-------------------------------TT---A---CCA-G--A----CT-CT----------------------------------G------------A-A-G-A--T---T-T--GC--GGAG--ACA---G-T----CG--AA--------CATC-C-G-G-T---TG-A-AC
gi|35 : agtatctaatgtagattcaactaattaccaatggtgattatgatttgtcagaC-TC-CCTA--G----CG-GT-AACA---GTTA--T----TATC-G--CGG-G----T---CTTT---A---CCA-G--A----CT-CTC---T---G--T---T--C-G---------T--CG------------G-A-G-A--T---T-T--GC--GTAG--ACA---A-C----TG--AG--------TGCC-T-G-G-T---TG-A-ACG--AGACa
gi|31 : CTA--G----CG-GT-AACA---TTCA--T----TATC-G--CGA-A----T---CTTT---A---CCA-G--A----CT-CTC---T---T--C---T--C-G---------T--GG------------T-A-A-A--T---T-T--GA--GAAG--GCA---G-C----CG--AG--------CGTC-T-G-G-T---TG-A-ACG--AGACt
gi|32 : aaattccaaataatccatCTA--GA---CG-CT-GACG---GCTA--T----CTCC-G--TAA-A----T---CTCT---G---TAA-A--A----CT-----------G--T---T--C-G---------T--CG------------G-A-G-A--T---T-T--GCGTGTAG--ACA---A-C----CG--AGTAGTGTTATGTC-T-G-G-T---TC-A-ACG--AGACt
gi|24 : cgtgcaa-GT-AACAAACGTT---T----T-TC-G--CGT-A----T---TTTT---A---ACA-G--A----CT-CTC---C---G--T---T--A--------------CG------------G-A---A--T---T-T--AC--GCAG--ATA---G-C----AG--AG--------CGTC-T-G-G-T---TG-
gi|26 : tttctg-GT-TACA---AATG--T----TATC-T--TGA-A----T---TTTT---A---TCG-T--A----CT-CTC---T---G--C---T--C-G---------T--CG------------A-A-G-A--T---T-T--GT--GGAG--ACA---G-C----TG--AG--------TGTT-T-G-G-T---TG-A-ACA--AGgtcaaaacgagcttaccaaaagcctgatggctgatccacaatccagaaataacgactatcgaagtaaagctaataatgaaagtgcaaaggatttacaagtagagtgtttaaaaataaggaaaggatttattt
gi|1 : A--T----TTTC-G--CGT-A----T---CTT----A---CCA-G--A----CT-CTC---G---G--T------------------A--CG------------G-A-G-A--T--------------------A---G-C----CG--AG--------CGTC-T-GCG-T---TG-C-ACG--AGAatcagaacgaggcttactaaaatttcattatttaatttggttgtttcaatacacctccaaa
gi|9 : --T----TTTC-G--CGT-A----T---CTTT---A---CCA-G--A----CT-CTC--------------------------------------------------G-A--T---T-T--AC--GGAG--ATA---G-C----CA--AG--------CGTC-T-G-G-T---TG-C-ACG--AGAggttttgtaaacgttcaaaacgaggcttaccaaaatcctgatattaaatttgattggctgaatcgcaggcaatgccaaactaacgactatccgaagaaagctgctaataacatgtaattgaaagtcggcgtttttaagtgtgaggatttacaaatagaggtgtttggggggggtagaatataaataatagaagcagaaaaggatttattaggcttgttcttaccgctacggtaagtagataaaaacgttggcgtatttaattttagccaaaattcacttgaaggcaaagtaaaagtataattttctagtttgaggagcgatcgcggtttttttcctgtttgtatgttaattttttctttagtaaatctaattttaacaataaaatcttttgaaattgactgtgtttttgtggggagattcaaagccgaaactgaattaggcgctctagggcgtaacaattattatcgcgggtctttttaaccagagctctctgttcgtcggaagatttgcgcgtagacatgccgaaattgtttgggttgaggcgaga
gi|7 : --T----TTTC-G--CGT-A----T---CTTT---A---CCA-G--A----CT-CTC---G---G--T---T--T-A------------CG------------G-A-G-AATT---T-T--AC--GGAG--ATA---G-C---------G--------GGTC-T-G-G-T---TG-C-ACG--AGACcgtttgtaacatcaaaacgaggcttaccagaatcctggtatgtgatttgattggctgatcaggccacaatcgaaaataacgactatcgaagaaagctgtaatagattgaaagtgacgtttaagtgtgaggattacaagtagagtgtttagaaatataaaatgatagaagagaaaaggatttattagctgtttctacctacgggacatgaaaaaaccgttgcgtatttaatttttaccagaattactttggagggcaaagtgaaagtataatttccagttgacagcgatcgaggtttttctgttgtattggtaatttttcctttagttcactaatcaagtattaattaattaacatcaaatctttcgaattgactgtgttttgtgggggagattcaaaccgaaactgaattagcgctccctagcggtaacagttatttatcgcgggtctttaccagactctctgttcgtcagagatttgcgtagacaaccgtgtgtctggttgaacgagact
gi|6 : --T----TTTC-G--CAGTA----T---CTTT---A---CCA-G--A----CT-CTC---G---G--T---T--T-A------------CG------------G-A-G-A--T---T-T--AC--GGAG--ACA---A-G----CG--AG--------CGTC-T-G-G-----TG-C-ACG--AGcgtttgaaacgtgtcaaaaacgaggcttaccagaatcctggtatgtgatttgattggctgatcaaggccacaatcataaataacgactaccgaagaaagctgttaatagattgaaaagttgacgttattatagtgtgaggattacaagtagagtgttataaaatataaaattgatagaagaggaaggattttattttagctgttctacctacaggatatgataagaccgttgcgtatttaatttttaccaaaattcactttggagggcaaaaatgaaagtatggatttcagttgacagcgatcgcggtttttctgttgtactggtaatttttccttatatcactaatgaagtatttaattaataacattaaatctttcggaattgactgtgttttgtgggggagattaaaaccgaaactgaattagcgctccctagcggtaacagttattatcgcgggtctttaccagactctctgttcgtcggagacaaccgagtgtctgcgttgaacgagac
gi|5 : --T----TTTC-G--CGT-A----T---CTTT---A---CCA-G--A----CT-CTC---G---G--T---T--T-T---------A--CG------------G-A-G-A--T---T-T--AC--GGAG--ATA---G-C----CG--AG--------CGTC-T---G-T---TG-C-ACG--acgtgtgtaacgtcaaaaacgaggctacacagaatcctggtatgtgatttgatctggatgatcaggcccacaatcgaaaataacgactatcgaagaaagcttgtaatagattaaaagtgacgtttaagtgtgaggatttacaagtacagtgttatagaaatataaaatgatagtatcgaggaaaggatgcattagctgttttacctacgggacattgataaaaccgttcgtatttaatttaccaaaattacttttggagggcaaagtgaaagtatgatttccagttgacagtgatcgggtttttctgttgtattaggtaacttttcctttaatatcactaatgaagtattaattaattaacatcaaatctttcggaatctgactgttttgtgggggagattcaaaccgaaactggaatcagccactccctagcggtaacagttattatcgcgggttttaccaggactctgttcgtcggagattttgcgtagacaaacgaggtctggttgaacgaga
gi|23 : --T----TTTT-G--CGT-A----T---CTTT---A---CCA-G--A----CT-TTC---G---G--T---T--T-A------------CG------------G-A-G-A--T---T-T--AT--GGAG---TA---G-C----CG--AG--------CGTC-T-G-G-T---TG-C-ACG--AGACcgtttgtaacgtccaaaacgaggcttacaagaatctggtatgtgatttgattggctgatcaggcacaatcgaaaataacgactattcgaagaaagctgtaataagattgaaagtgacgtttaagtgtgaggatttacaaggagagtgtttagcaatataaaaatgatagaagaggaaaggattattagctgttctacctacgggaatatgataaaccgttgcgtatttaattttaccaaaattcctttggaggcaaagtgagtatgcatttccagttgacaagcgatcgcaggtttttctgttcaaaaccggtaattcttctctttaagttcaactaatgagtattgattacattaacaattcaaaacttcaggaattcactgtgttttgggtgggtaagaattcaaaccgaaactgaattgcgcttccctagcggtaacagttattatcgcgggtctttaaccagactctctgttcgatcggagattttgcgtagacaactgaagtgtctggttgaacg
gi|28 : --T----TTTC-G--CGA-A----TTATCTTT---A---CCA-G--A----CT-CTC---G---G--T---T--T-A------------CG------------G-A-GAA--TA--T-T--ACG-GGAG--ATA---G-C----CGA-AG--------CGTC-T-G-G-T---TG-C-ACGCTAGACcgtttgtaacgtcaaaacgaggcttaccataatcctggtatttaatttgattgactgatccacactccaaaataacgactatcgaagaaagctgtgatagattgaaagtggcgtttaattgtgaggatttacaactatagtgtttagaaatataaaataatagaaga
gi|16 : --T----TATC-G--CGT-G----T---CTTT---A---CCA-G--A----CC-CTacgtttgtaacgtcgaaaacgaggtttactcgaatcccgtatcccagggtttggaat
gi|36 : cnnnnnnnnnnnnnn--T----TTTC-G--CGG-A----TAT-CTTT---ACCCCCA-G--A-----T-CTC---TTGGG--T---T--T-A---------T---A------------G-A-G-A----------------TAG--G-------C----CG--AG--------CGTC-T-G-G-CTCATG-C-ACG--AGACcgtttgcaacatcagaacgaggtttaccaagatttcagtatttgattggttgacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagttgacagcgatcgcggtgtttctgttgtactggtactttctccatttgtattcttaatgaaatatcaactaattaacatcaaa
gi|4 : TT-G--CGT-A----T---CTTT---A---CCA-G--A----CTTCTT---C---GGAT---TA-C-G-------------G------------G-A-A-G--T---T-T--AC--GGAG--ATT---A-G----CG--AG--------CGTC-T-G-G-T---TG-acattttgtaacgtc
gi|2 : tcgtgg----T---CTTT---A---CCA-G--A----CT-CTC---G---A--T---T--C-A------------CG------------G-A-G-AT-T---T-T--AC--GGAG--ATA---G------CG--AG--------CGTC-T-G-G-T---aacgttgtaacgtcaaaacgaggcttaccagatatcctggtaatgtgatttgattggctgatcaggccacaatcgaaaataacgacttatcgaagaaagctgcaatagattgaaagtgacgttaaagtgtgaaggatttacaagtagagtgttttagaaaatataaaatatagaagaggaatgattttattagctgttctccctacgggataagatacaaccgttgcgtatttaatttttaccaaattactttggatgcaaagtgaaagtatgatttctcagtttgaacacggatcgccggtttttctgttgtactggtaaattttcctttagtacccactaatgaagttataagttaattaaaataaaatcttttggaattgatctgtgtttttgtgggaggagattcaaaccgaaaactgaattagcgctcacctgcggtaacagttattatcgcggtctttagccagactctctgttcgtcggagatttgcgtagacaaccgagtgtcgtggttgaaacgagac
gi|18 : TT---A---CCA-G--A----CT-CTC---T---A--C---T--C-G---------T--CG------------G-A-A-A--T---C-T--AT--GGAG--ACA---G-C----CA--AG--------CGTC-T-G-G-T---Ttacggcaaaaaaacgtttgtaaacgtcaaaacgaggctctaccagaaatcctggtatgtgaatttgaattggctgatcaggccacaatccgaaaataagaaactaacgaagacgctgcgaatagatctgaaagtgaacgttaaaagtgttgaggattttacaagtagaaagtgtttagaaatataaaatgatagaagaggaaaggatttattaagttgttcttacctaacgggataagatcacaaccgttgcgtatttcaattttacgcaaaattacttggagtgcaagtgaaagtatgatttcccagtttgacagcgatcgcggtttttctgttgtagtactggtaaattttcctttagtacactaatgatgtattaattaattaaaatcaaaatcttttggaattgactgtgttttgtgggagattcaaaccgaactgaattagcgctcctagccggtcaacagttatcttatctgcgggtctttaccaagcactctctgtttcgtcggagattctgcgtagacaagccgagtgtctgggttgaaaacga
gi|47 : TT---A---CCC-T--A----CT-CTC---T---G--C---T--C-G---------T--CG------------------A--T---T-T--AC--GGAG--ATA---G-C----CG--AG--------CGTC-T-G-G-T---T--C-ACG--AGAcgtttgtaaagtcagaacgatgcttgccaaattactgctcatgactgatctgattgattgattgatggattgattaattcaacacacctcccaaataacaagctttcgaagaaatttgtaatagattgaatgcgccgtttaagcttaaggatttacaactaaagtgtttcataatgttgcaaaaagaaaggatttacatgtatttacaagatatggcaaaccattctgtattcaagttaccaagattacttgagagggaagagtaaaattacaattttc
gi|40 : ---A---CCA-G--A----CA-CTCGGTT---G--C---T--C-AACACAAATCT--CC------------G-ACG-G--T---T-T--AC--GGAG--ATA---G-C----CGG-AG--------CGTC-T-G-G-T---TG-C-ACG--AGAt
gi|41 : ---A---CCA-G--A----CA-CTC---G---G--T---T----G---------T--CAACACAAATCTCCG-A-C-G--T---T-T--AC--GGAG--ATA---G-C----CG--AGG-------CGTC-T-G-G-T---TG-C-ACG--tgaacg
gi|51 : ---CCA-G--A----CG-CTC---G---G--C---T-------------------------------------A--T---C-T--CC--GTAA--ACCGTTA-C----TG--AG--------TGCC-T-G-G-T---TG-A-ACG--AGACtgaa
gi|52 : --A----CT-CTC---T---G--C---T--C-G---------T--CG------------------A--T---T-T--AC--GGAG--ATA---G-C----CG--AG--------CGTC-T-G-G-T---TG-C-ACG--AGAt
gi|44 : --A----CT--TC---T---G--A---T--G-G---------G--TG------------G-A-A-A--T---T-T--AC--GGAG--ATA---G-C----CA--AG--------TGTC-T-G-G-T---TG-C-ATG--AGACg
gi|56 : a--A----CT-CTC---T---A--C---T--C-G---------T--CG------------A-A-G-A--T---T-A--AC--AGAG--ATA---G-T----CA--AG--------CGTC-T-G-G-T---Tattctctgttcgtcg
gi|40 : T-CTC---C---G--TAAAC--C-G---------T--CG------------G-A-G-A--T---T-T--GT--GTTGA-GCA---A-C----CG--AG--------TGTC-T-G-G-T---TG-A-ACG--
gi|41 : tctcgtgcaaccagacgctccggctaT-CTC---C---G--T---AAAC-G---------T--CG------------G-A-G-A--T---T-T--GT--GTTG--ACA---A-C----CG--AG--------TGTC-T-G-G-T---TG-A-A
gi|33 : tcgtgcaaccagacgcctcggcta-CTC---T---G--T---T--C-G---------T--TG------------G-C-G-A--T---T-T--GC--GTAG--ACA---A-CCATGCA--AG--------TGTC-T-G-G-T---TG-A-ACG--AG
gi|54 : gtctcgtgcaaccagacgctcggctatctccgtgaatctccgtaaa-CTT---T---G--T---T--A-G---------T--CG------------G-A-G-A--T---T-T--AC--GGAG--ATA---G-C----CG--AG--------CATC-T-G-G-T---TG-C-ACG--AGA
gi|53 : -CTC---A---G--T---T--C-G---------T--CG------------G-A-G-A--T---T-T--TC--GTAA--ACA---A-C----CG--
gi|37 : cgctcggctatctccgtgtaC---T---G--T---T--C-G---------T--CG------------G-A-G-A--A---T-T--GC--GTAG--ACA---A-C----CA--AG--------TGTC-T-G-G-T---TG-A-AC
gi|34 : tctcgtgcaaccagacgctcggctatatccgtaaacC---T---G--T---T--C-G---------T--TG------------G-A-G-A--TAATT-C--GC--GTAG--ACA---A-C----CG--TG--------TTTC-T-G-G-T---TG-A-ACG--AGAC
gi|45 : ctcgtgcaaccagacgctcggctatctccgtaaatctccgtaaaC---T---G--T---T--C-G---------T--CA------------G-A-G-A--T---T-T--GC--ATAG--ACA---A-C----Ct
gi|55 : ccaccagacgctcggctatctccgtaaatctccgacC---T---G--T---T--CCG---------T--CG------------G-A-G-AT-T---T-T--TC--GTAGA-ACA---A-CT---TG--AG--------TGT--T-G-G-T---TG-C-ACG--a
gi|42 : ---T---G--T---TG-C-A---------T--CG------------G-A-G-A--T---T-T--GC--GTAG--ACA---A-CG---CG--AAT-------TGTC-T-G-GTT---TG-A-ACG--AAACg
gi|46 : gcgtaatttccgtaaacgt---T--C-G---------T--CA------------A-A-G-A--T---T-T--GC--GGAA--ACA---G-C----CG--GG--------TGTC-T-G-G-T---TG-A-AAG--AGACt
gi|45 : aatctccgacaagcaatg-G---------T--CG------------G-A-G-A--T---T-T--AC--GGAG--ATA---G-C----CG--AG--------CGTC-T-G-G-T---
gi|33 : cc--CG------------G-A-G-A--T---T-C--AC--GGAG--ATA---G-C----CG--AG--------CGTC-T-G-G-T---TG-C-ACG--AGACctgttcgtcagagatttgcatagacaacca
gi|34 : --CG------------G-A-G-A--T---T-T--AC--GGAG--ATA---G-C----CG--AG--------CGTC-T-G-G-T---TG-C-ACG--AGtaaactctgttcgttggcgatttgcgtagacaaccatgcaagtgtctggttgaacgag
gi|32 : --CA------------G-A-G-A--T---T-T--AC--GGAG--ATA---G-C----CGTCAG--------CGTC-T-A-G-T---TG-C-ACG--taaactgttcgttggagataattcgcgtagacaaccgtgtttctggttgaacgagact
gi|48 : ------------G-A-G-A--T---T-T--GC--GTAG--ACA---A-C----CG--AG--------TGTC-T-G-G-T---AT-A-ACG--AGACtaaaactgttcgtcggagatttgcgtgtagacaaccgagtagtgttatgtctggttcaacgagac
gi|37 : taaatctccgtaaacc-A-G-G--T---T-T--AC--GGAT--ATA---G-C----CG--AG--------CGTC-T-G-G-T---TG-C-ACG--AGA
gi|58 : --T---T-T--AC--GGAG--ATA---G-C----CG--AG--------CGTC-T-G-G-T---TG-C-ACG--AGACgttcgtcggagaattgcgtagacaaccaagtgtctggttgaac
gi|59 : aA---G-C----CG--AG--------CGTC-T-G-G-T---TG-C-ACG--AGAC
4 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|19 ): CATCGAAGTTCCCATACACATGTCACATGATGACCTAATATCCTGAATGGCAAGTCAATGTTACATGCTGTGGTCATCCTACAATGCTACACCTTGCAGGAAGTAATCGTTCGGCCATCTTATAAGAAGTAAGTCTCTACCTATCTATAGGAAGTAATATTCACCTATCTTTATAGCGAAGTAATAACTTCACCTATCTTATAGAAGTAATCAGTATTGTATAGGTTAAATTAACTATTGATGCGAAGTGACAGCAAGCATGAGGGAAGGGACTTGACATAGGATACATCTGCTGCTCAAACCCCCCTCCCATTCAGTA
Unaligned ( gi|21 ): AGAAACACAAGCACATCTGGAAGTTCCATGACCATCTATGTCACATGAGACATAATTTCCTGAATGGCAAGTCAATGTCTACATGCTTGGTCCACTCCTACATGCTACCATCCACTTTGCAGGAAGTAATCGTTCGCCTATCTTATAGGAAGTATTCCTTCACCTATCTTATAGGAAGTATATCCAGTATGCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGTATTGTAATAGGTTAATTAACTTTGTGCGAATGCAGC
Unaligned ( gi|22 ): TGACCATCTATGTCACATGAGACATAATTTCCTGAATGGCAAGTCAATGTCTACATGCTTGGTCCACTCCTACATGTACCATCCACCTTTGCAGGAAGTAATCGTTCGCCTATCTTATAGGAAGTACTTCCTTCACCTATCTTATAGGAAGTAATCCTAAAGTATGCAATAGGTTAATTAACTTTTGTGCGAATGCAGCATCATTAGGAGAGGGCTGACATATAGGTTCATCCTGCTGCCCAATCCCATCAGTAT
Unaligned ( gi|25 ): AGAAACACAAGCACATCTGGAAGTTCCATGACCATCTATGTCACATGAGACATAATTTCCTGAATGGCAAGTCAATGTCTACATGCTTGGTCCACTCCTACATGTTACCATCCACTTTGCAGGAAGTAATCGTTCGCCTATCTTATAGGAAGTAATCCTTCACC
Alignments
lowQualScore : 222222 7777777777777777777777777777777777777 22222222222222222222222 111111111 11 1 2222222222222222222222222 11111111 1111111111 1111
lowQualScore : 2 2 2 333 5555 1 555555 1 44 1 1 3333333333333333333333333333333333333 44444 22 3 444 1 2 999 44 2 77777 55555 44 333 44 22 22 3 55 1 5 1 1 1 66666666 1 5 1 333 1 1 99999999 44444 1 1 444 1 0 1 99999999999999999999999 44 3 111111111 1 22 1 1 44 1 88 6666 3 3 1 1 999 1 3 1 555555 3333 1 22 0 44 1 33 4444 777 22 1 666 1 1 1 0 5 1 4444 2 333 333 11 5 0000000000000000000000000 2 44 77777 22 2 55555 22 666 22 2 2 2 4 55 22 55 2 33 4 44 33 2 666666 5555 2 2 7 33 4 2 4 4 4444 1 33 333 2 33 2 2 666666 55555 0 2 2 2 2 2 2 77 22 4 2 2 2 2 2 6666 55555 333 999 66 00000000 2 2 33 0 77 22 22 2 3333333333 4 4 33 2 22 22 2 2 77 2 2 2 2 2 2 8 55 33 1 7777 2 2 2 33 7777777 2 2 55555 4 33 2 2 22 1111 4 2 6666666 2 22 777777 0 555 2 2 22 3 1 1 2 1 1 1 11 2 3 1 666 22 1 22 9999 1 999999999 1 2 1 1 1 1
lowQualScore : . . . ... .... . ...... . .. . . ..................................... ..... .. . ... . . ... .. . ..... ..... .. ... .. .. .. . .. . . . . . ........ . . . ... . . ........ ..... . . ... . . . ....................... .. . ......... . .. . . .. . .. .... . . . . ... . . . ...... .... . .. . .. . .. .... ... .. . ... . . . . . . .... . ... ... .. . ......................... . .. ..... .. . ..... .. ... .. . . . . .. .. .. . .. . .. .. . ...... .... . . . .. . . . . .... . .. ... . .. . . ...... ..... . . . . . . . .. .. . . . . . . .... ..... ... ... .. ........ . . .. . .. .. .. . .......... . . .. . .. .. . . .. . . . . . . . .. .. . .... . . . .. ....... . . ..... . .. . . .. .... . . ....... . .. ...... . ... . . .. . . . . . . . .. . . . ... .. . .. .... . ......... . . . . . .
lowQualScore : 2 1 0 333 7777 7 222222 7 00 7 7 6666666666666666666666666666666666666 55555 44 5 444 7 0 888 88 0 66666 66666 11 000 11 44 44 5 66 7 2 7 7 7 00000000 7 0 7 000 7 7 66666666 33333 7 7 666 7 6 7 55555555555555555555555 33 6 999999999 9 66 9 9 55 9 33 0000 8 8 9 9 000 9 6 8 222222 9999 8 55 5 55 9 11 0000 999 66 9 000 9 9 9 8 7 9 0000 0 555 555 55 0 2222222222222222222222222 0 88 22222 99 1 33333 99 555 99 1 1 1 2 00 99 00 4 22 7 99 22 4 222222 0000 4 4 1 22 7 4 7 4 0000 7 44 777 5 22 4 4 444444 66666 3 1 1 1 1 0 1 11 99 2 1 2 2 2 2 9999 66666 999 222 22 33333333 2 2 11 4 66 99 99 1 4444444444 2 2 44 1 33 99 1 1 11 1 2 2 2 2 2 9 66 22 8 2222 4 4 4 22 6666666 4 4 99999 7 22 2 2 88 0000 0 0 4444444 1 99 999999 1 555 0 0 44 5 7 3 7 3 2 2 77 4 5 2 222 88 1 55 7777 2 555555555 2 4 2 2 3 3
consensus : TCT-CGTG-C-A---AC----CAGACGC-TC---GG-CT-A--TCTCC-GTAA-A---------T---C----------T---NCGT-----AA-----CCGAG--AG-TCT---GG-TAAA-GATA---C--G-C---G-AA----AA--C---G--TTT--GTA--A-CGT--C-AAAA-CGAGGCT-T-AC-C--------AGA-A-TC-CC--GGT-A-T-----G--T----GA-TTT-GA---T-TGGCTGA-T-C-----A--GG-----------C--C-ACAA----T-C-GA-AAAT--AA-CG-A--C-T--A----TC-GAAG-AAAG-C-T---G-T-AAT-AG------A----T-TG--AAAG--T-GG-C----GTT---T--A-A-GCGT-G-A-GGATTT-AC-A----AGT---AG---AGTGTGTTTAG-A--------AA-----T---AT-AAAAT-G--ATAGAA--G--AGGAA--A-GGAT-----TT--ATT--AG--CT-G-TTC-T-A--CC--T--ACGGG-A--TA-TGAT-AAAA--C-CGTT----G-CG----TAT-TT-AA-TT--TT-A-C-CAAAATT-AC-T--TTGG--AG--GGC-A--AA-G-TGAA------A-----GTACG-ATT-T-C-C-AG-TT--GA--C-A-G-CG-AT-CG-C----GGTTTT-----T---CTGTT---GTAC-T--------GGTA-A-T--TTCTCCN-TT--AGT--A-TC----------ACTAAT-GA-AG-TA-TC-AAT--TA-ATTAAC-A--TC-AAATCTTTCG-GAAT-TGA-CTGTG-TT-T-T--G--TGGG-GG-AG-ATT-CAAA-C--C-------G-AAACT-GAA-----TTAG-C--GC-TC-CCTA--G----CG-GT-AACAGTTA--T----TATC-G--CGGG----TCTTT---A-CCA-G--A-C-TCTC-TG-TT-C-G-T--CGG-AGA-TT-TGCG-G-AG--AC-A-GC----CG-AG--------CGTC-T-G-G-TTG-A-ACGAGAC
Reference ( family-1405 ) : TCT-CGTG-C-A---AC----CAGACGC-TC---G--CT-A--TCTCC-GTAA-A---------T---C----------T---GCG------AA-----CCGAG--AG-TCT---GG-TAAA-GATA---C--G-C---G-AN----AA--C---G--TTT--GTA--A-CGT--C-AAAA-CGAGGCT-T-AC-C--------AGA-A-TC-CC--GGT-A-T-----G--T----GA-TTT-GA---T-TGGCTGA-T-C-----A--GG-----------C--C-ACAA----T-C-GA-AAAT--AA-CG-A--C-T--A----TC-GAAG-AAAG-C-T---G-T-AAT-AG------A----T-TG--AAAG--T-GG-C----GTT---T--A-A-GCGT-G-A-GGATTT-AC-A----AGT---AG---AGTGTGTTTAG-A--------AA-----T---AT-AAAAT-G--ATAGAA--G--AGGAA--A-GGAT-----TT--ATT--AG--CT-G-TTC-T-A--CC--T--ACGGG-A--TA-TGAT-AAAA--C-CGTT----G-CG----TAT-TT-AA-TT--TT-A-C-CAAAATT-AC-T--TTGG--AG--GGC-A--AA-G-TGAA------A-----GTACG-ATT-T-C-C-AG-TT--GA--C-A-G-CG-AT-CG-C----GGTTTT-----T---CTGTT---GTAN-T--------GGTA-A-T--TTTTCCN-TT--AGT--A-TC----------ACTAAT-GA-AG-TA-TC-AAT--TA-ATTAAC-A--TC-AAATCTTTCG-GAAT-TGA-CTGTG-TT-T-T--G--TGGG-GG-AG-ATT-CAAA-C--C-------G-AAACT-GAA-----TTAG-C--GC-TC-CCTA--G----CG-GT-AACAGTTA--T----TATC-G--CGGG----TCTTT---A-CCA-G--A-C-TCTC-TG-TT-C-G-T--CGG-AGA-TT-TGCG-G-AG--AC-A-GC----CG-AG--------CGTC-T-G-G-TTG-A-ACGAGAC
gi|1 : TCT-CGTG-C-A---ACG---CAGACGC-TC---GG-CT-A--TCTCC-GTA-----------------------------------------------CCGAG--AG-TCT---GG-TAA--GATA---C--G-C---G-AA----AA--T---GGTTTT--GTA--AACGTT-C-AAAA-CGAGGCT-T-AC-C--------AAA-A-TC-CT--GAT-A-T-----T--A----AA-TTT-GA---T-TGGCTGAAT-CGC---A--GG-----------C------AA----TGC-CA-AACT--AA-CG-A--C-T--A----TCCGAAG-AAAG-C-T---GCT-AAT-AACATGTAA----T-TG--AAAG--TCGG-C----GTT---TTTA-A-GTGT-G-A-GGATTT-AC-A----AAT---AG---AG-GTGTTTGG-GGGGGGTAGAA-----T---AT-AAA-T-A--ATAGAA--GC-AGAAA--A-GGAT-----TT--ATT--AGGCTT-G-TTC-TTA--CCGCT--ACGGT-AAGTA--GAT-AAAA--A-CGTT----GGCG----TAT-TT-AA-TT--TT-AGC-CAAAATTCAC-T--T--G--AA--GGC-A--AA-G-TAAA------A-----GTATA-ATT-T-T-CTAG-TTT-GA--GGA-G-CG-AT-CG-C----GGTTTT-----TTTCCTGTTT--GTA--T--------GTTA-A-T--TTTTTCT-TT--AGT--A----------------AAT----------CT-AAT--T---TTAAC-AA-TA-AAATCTTTTG-AAAT-TGA-CTGTG-TT-T-TT-G--TGGG-G--AG-ATT-CAAAGC--C-------G-AAACT-GAA-----TTAGGC--GC-TC---TA--G----GGCGT-AACAATTA--T----TATC-G--CGGG----TCTTTTTAA-CCA-G--AGC-TCTC-TG-TT-C-G-T--CGGAAGA-TT-TGCGCGTAG--AC-ATGC----CG-AAAT------TGTT-TGG-G-TTG-AGGCGAGA
gi|10 : TCTACGTG-C-A---ACGTACCAGACGC-TC---GG-CC-A--TCTC--GTAA-A--------------------------------------------CCGAG--AGCTCT---GGATAAAAGATA---C--G-CC--G-AA----AA--C---G--TTT--GTA--A-CGT--C-AAAA-CATGACT-T-AC-C--------AGA-A-TT-CT--GGT-A-T-----G--T----GA-TTTGGA---T-TGGCTGA-T-C-----A---G-----------C--C-ACAA----T-C-GA-AAAT--AA-CG-A--C-T--A----TCGGAAG-AAAG-C-T---G-T-AAT-AG------A----T-TG--AAAG--T-GA-C----GTT---T--A-A-G-GT-G-A-GGA-TT-AC-A------T---AG---A--GTGTTTAG-A--------AA-----T---AT-AAAAT-G--ATAGAA--G--AGAAA--A-GGAT-----TC--ATT--AG--CT---TTC-T-A---C--T--ACGGG-A--CA-TGAC-----------TT----G-CG----TAT-TT-AA-TT--TTGA-C-CAAATTT-AC----TTGG--AG--GGC-A--AA-G-TGAA------ATACATGTATG-ATT-T-C-C-A--TT--GA--C-A-G-CG-AT-CG-C----GGTTTT-----T---TTGTT---GTAT-T--------GGTA-A-C--TTTTCC--TT--AGT--A-TC----------ACTAA--GACAG-TA-TT-AAT--TA-AAGAACAA--TC-AAATCTTTC--GAAT-TGA--TGTG-TT-T-T--G--TGGG-G---A-ATT-CAAA-C--C-------G-AAACT-GAA-----TTAG-C--GC-TC-CCTA--GGCACCGAGT-AAAAGTTG--T----
gi|11 : gT---GG-TATA-GACA---C--A-C---G-AT----GA--C---G--TTT---TA------------------------C-AC-C--------AGA-AATC-TC--GGT-A-T-----T--C----AG-TCC-CA---T-TGGTTGA-T-T---------------------C--C-ACAAACCTT-C--A-AAAC--AA-CG-A--T-T--A----CT-GAAG-AAAG-T-TC--G-C-AGT-AC------A----T-TG--AACG--C-GG-C----GTT------------GT-G-----------C-A----AGC---AG---AGTAT-TTAAA-A--------AA-----T---GT-----T-G--A--AAA--G--GGGTA--A-GTAT-----TT--ACT--TG--CT-G-CTC-T-A--CC--T--TAGGG-A--TA-T-AT-A----------T----G-TG----TAC-AC-AA-TT--TT-A-C-CAAAATG-AC-T--TTGA--AA--GGC-A--AAAG-TTAA------A-----ATACG-ATT-T-C-T-AG-CT--AA--C-A-G-CG-AT-CG-C----GGCTTTAATTTT---CTATT---GTAG-T--------GATG-A-A--TTCTCCA-TT--AGT--A-TC----------ACTAAT-GA-AG-TA-TC-AAC--TA-ATAACC-A--TC-CAATCTTTCG-GAAT-TGA-CTATG-TT-TAT--A--CCGG-TG---------AAG-C--A-------G-ATGCT-AAA-----TTAG-C--AC-TC-CCTA--G----TG-GT-AATAGTTA--T----TATC-G--CAAG----TT------------G--A-C-TCTC-AG-CT-C-G-T--TTG-AGA-TT-TGCG-G-AG--AC-A-GC----CG-AG--------CGTC-T-G-G-TTC-A-ACGAGAaacc
gi|12 : gaatctat----AA--C---G--TTT--GTA--A-CGT--C-AGAA-CGAGGTT-T-AC-C--------AAA-A-TT-TC--GGT-A-T-----T--TCATTAA-TTT-GA---T-TGATTCA-C-C-----A--CA-----------C--CTCCAA----T---------T--AA-CG-A--C-T--A----TC-GAAG-AAA------------AA---------------------AACG--T-TG-C----ATT---T--A-A-ACCT-A-A-GAACTT-AC-A----ATT---AG---AGTGT--TTA-------------------------AAAAT-G--TTGGAA-----AGAAA--A-TTAT-----TT--ATT--TG---T-G-TTC-T-A--CG--T--------------TG-T-AAA---------------CG----TAT-TA-AA-TT-----A-C-CAA--TT-AC-T--T-----AG--AGC-A--AA-G-TGAA------A-----GCACG-ATT-T-C---AG-CT--GA--C-A-G-CG-AT-CG-C----AGTTTT-----T---CTGTT---ACAG-T--------GGTA-A-T--TTCCCCA-TT--AGT--A-TC----------ACTAAT-GA-AG-GA-TC-AAC--TA-ATTACC-A--TC-AAATCTTTCG-AAAT-TAA-CTATG-TT-TCT--G--TCGA-AG-AG-ATT-CAAA-C--C-------G-AAATC-AAA-----TTAG-C--GC-TC-CCTA--G----CG----AACAGTTA--A----TATC-G--CG------------------A-G--A-C-TTT---G-CT-C-G-T--CGA-AGA-TT-TGCG-G-AG---C-A-CCA---CG-AG--------TGTC-T-G-G-TTT-A-ACGAGA
gi|13 : ----AA--C---G--TTT--GTA--A-CGC--C-AGAA-CGAGGTT-T-AC-C--------AAA-T-TT-TC--GGT-A-T-----T--T----CA-TTA-GA---T-TGATTGA-TTC-----A---------------C--C-ACAC----T-T-CC-AATT--AA-CG-A--C-T--A----TC-GAAG-AAAT-T-T---G-T-AAT-AT------A----T-TG--AATG--T-TG-C----ATT---T--A-A-ACCT-A-A-GAACTT-AC------ATT---AG---AG-GTTTTT-------------------T---A--AAAAT-G--TTTGGA--A--AGAAA--A-TTAT-----TT--ATT--TG--CT-G-TTC-T-A--CC--T--Att
gi|13 : --AA-G-TGAA------A-----GCACG-ATT---C-C-AG-CT--GG--C-A-G-CG-AT-CG-C----AGTTTT-----T---CTGTT---ACATGT--------GGTA-A-T--TTCCCCCATT--AGT--A-TC----------ACTAAT-GA-AG-GA-TC-AAC--TA-AT---C-A--TC-AAATCTTTCG-AAAT-TAA-CTATG-TT-TCT--G--TCGA-AG-AG-ATT-CAAA-C--C-------G-AAATC-AAA-----TTAG-C--GC-TC-CCTA--G----CG-GT-AACAGTTA--A----TATC-G--CG------------------A-G--A-C-TTT---G-CT-C-G-T--CGA-AGA-TT-TGCG-G-AG--TC-A-CCA---CG-AG--------TGTC-T-G-G-TTT-A-ACGAGAagtgaaagcacgattccagctggcagcgatcgcagtttttctgttacatgtggtaatttcccccattagtatcactaatgaaggatcaactaatcatcaaatctttcgaaattaactatgtttctgtcgaagagattcaaaccgaaatcaaattagcgctccctagcggtaacagttaatatcgcgagactttgctcgtcgaagatttgcggagtcaccacgagtgtctggtttaacgagatt
gi|14 : aacgtttgtaacgccagaacgaggtttaccaaattttcggtatttcattagattgattgattcaccacacttccaattaacgactatcgaagaaatttgtaatatattgaatgttgcatttaaacctaagaacttacattagaggttttttaaaaatgtttggaaagaaaattatttatttgctgttctacctT-GA---T-TTGTTGA-TTC-----A---------------C--C-ACACC---T-C-CA-A--T--TA-CG-A--C-CTAA----TC-GAAG-AAA-----------------------------------AACG--T-TG-C----ATT---T--A-A-ACCT-A-A-GAACTT-AC-A----ATT---AG---AGTGT--TTA-------------------------AAAAT-G--TTGGAA--A--AGAAA--A-TTAT-----TT--ATT--TG--CT-G-TTC-T----CC--T--ACGG--A--TA-TGGT-AAAA--C-TGTT----G-TG----TAT-TA-AAGTT--TT-C-C-AAAAATT-AC-T--T-AG--AA--GGC-A--AA-G-TGAA------A-----GC-CG-ATT-T-C-C-AG-CT--GA--C-A-G-CG-AT-CG-C----AGTTTT-----T---CTGTT-----AG-T--------GGTA-A-T--TTCCCCA-TT--AGT--A-TC----------ACTAAT-GA-AG-GA-TC-AAC--TA-ATTACC-A--TC-AAATCTTTCG-AAAT-TAA-CTATG-TT-TCT--G--TCGA-AG-AG-ATT-CAAA-C--C-------G-AAATC-AAA-----TTAG-C--GC-TC-CCTA--G----CG--T-AACAGTTA--A----TATC-G--CG------------------A-G--A-C-TTT---G-CT-C-G-T--CGA-AGA-TT-TGCG-G-AG--TC-A-CCA---CG-AG--------TGTC-T-G-G-TTT-A-ACGAGAtt
gi|15 : taA--C---G--TT---GTA--A-C----C-AAA---GAGTTT-A-AC-C--------AAA-T-TT-TC--GGT-A-A-----T--T----CA-ATA-GA---T-TGA-TGA-TTC-----A---------------C--C-ACAT----T-C----AATT--AA-CG-A--C-TA-A----TC-GAAG-AAAATT-T---G-T--AT-AT------A----T-TG--AATG--T-TG------ATT---T--A-A-GCCT-A-A-GAACTTAAC-A----ATT----G---A--GTGTTTAA-A----------------------AAAAT-GTTATGGGA--A--AGAAATTA-GG-------TT--ATT---G--CT---TTC-T-AT-CC--T--At
gi|15 : A------A-----GCACA-ATTGT-C-C-AG-CT--GG--C-AAG-CGGAT-CG-C----AGTTTT---------CTGTT---CCAG-T--------G-TAGA-T--TT--CCA-TT--AGTTAA-TC------------TAATAGAGAG-AA-TC-AAGGATA-AT--AC-A--TC-A--TCTT-CGCAAAT-TAA-CTATG-TT-T-T--G--TGAG----AG-ATT-CAAA-CTTC-------G-AAA-T-AAA-----TTAG-CACGC-TC-CTGA--G----CG--T-AACAGTTA--A----TATG-G--C------------------------A-C-T----TG-CT-C-G-T--C-G-AGA-TT-TGCG-G-AG--AC-A-CCCA--CG-AG--------TGT--T-G-G-TTA-A-gatgaagcacaattgtccagctggcaagcggatcgcagttttctgttccagtgtagatttccattagttaatctaatagagagaatcaaggataatacatcatcttcgcaaattaactatgttttgtgagagattcaaacttcgaaataaattagcacgctcctgagcgtaacagttaatatggcacttgctcgtcgagatttgcggagacacccacgagtgttggttaagat
gi|16 : acgttgtaaccaaagagtttaaccaaattttcggtaattcaatagattgatgattcaccacattcaattaacgactaatcgaagaaaatttgtatatattgaatgttgatttaagcctaagaacttaacaattgagtgtttaaaaaaatgttatgggaaagaaattaggttattgctttctatcctagatgAG--GG-TCT---GG-TAAA-GACA---C--G-C---G-AT----AA--C---G--TTT--GCA--A-CAT--C-AGAA-CGAGGTT-T-AC-C--------AAG-A-TT-TC--AGT------------------A-TTT-GA---T-TGGTTGA-gat
gi|16 : cnnnnnnnnnnnnnn-AG-TT--GA--C-A-G-CG-AT-CG-C----GGTGTT-----T---CTGTT---GTAC-T--------GGTA-C-T--TTCTCCA-TT--TGT--A-TT----------CTTAAT-GA-AA-TA-TC-AAC--TA-ATTAAC-A--TC-AAAcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagttgacagcgatcgcggtgtttctgttgtactggtactttctccatttgtattcttaatgaaatatcaactaattaacatcaaa
gi|17 : cnnnnnnnnnnnnnnagggtctggtaaagacacgcgataacgtttgcaacatcagaacgaggtttaccaagatttcagtatttgattggttgacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnACGC-TCCG-G--CT-A--TCTCT-CCAT-C---------C---C----------T---CCGTTT---AATTTTTCAGAG--AG-TCTT--GG-TAAG-GATA---CCAG-C---A-ACTTTGAA--C---G--TTTTTGTAGGA-CG---C-TAAA-CGAGGCT-TGAC-CTAGCGCGAAAA-A-TCATT--GGT-A-TAGGTTG--C----AG-TTT-GACTCT-TGGATGA-T-C-----A--GG-----------A--C--CAA----TCC-AA-AAATAAAA-CGAA--CGT--AAGTTTC-GAAG---AG-T-TATAG-T-ATT-AG------A----T-TGAAAAAA--T-GA-CAGTTGTT---T--A-GTGGGT-G-ATGGAGAT-AT-ATCGTACT---GGATCAGTGT-CTTAG-ATAT-----AATTTATT---AT-ATTAT-G--TTGGAA--GA-AGGAA--A-GGATGATACTTTAATT--AG---T-G-TTT-TAA--CC--TTAAAGGG-A--TA-TGAT-TAAAGGC-CGTTGCTGG-CG----TATGTT-AA-TTTATT-A-C-CAAAATT-
gi|18 : -A---AC----CAGACGC-TT---GG-CT-G--TCTCC-ATAG-A---------T---T----------TCCGACG------AG-----TAGAG--AG-TCT---GG-TAA------------------------------C---G--TTT--GTA--A-AGT--C-AGAA-CGATGCT-T-GC-C--------AAA-T-TA-CT--GCTCA-T-----GACT----GA-TCT-GA---T-TGATTGA-T-T-----GATGGATTGATTAATTCAAC-ACACC---T-C-CC-AAAT--AA-CA-AG-C-T--T----TC-GAAG-AAAT-T-T---G-T-AAT-AG------A----T-TG--AATG--C-GC-C----GTT---T--A-A-GCTT-A-A-GGATTT-AC-A----ACT---AA---AGTGT-TTC-------------A-----T--------AAT-G--TTGCAA--A--AAGAA--A-GGAT-----TT--A-C--A----T-G-----T-A--TT--T--ACAAG-A--TA-TGGC--AAA--C-CATT----C-TG----TAT-TC-AA--G--TT-A-C-CAAGATT-AC-T--TGAG--AG--GGA-A--GA-G-TAAA------A-----TTACA-ATT-T-T-C-ct
gi|2 : ---AC----CAGACGC-TC---G--CT-A--TCTCC-GTAA-AATC------T---C----------C---GTG------AA-----TCGAG--AG-TCT---GG-TAAA-GATA---C--GGC---A-AA----AAAAC---G--TTT--GTA--AACGT--C-AAAA-CGAGGCTCT-AC-C--------AGA-AATC-CT--GGT-A-T-----G--T----GAATTT-GAA--T-TGGCTGA-T-C-----A--GG-----------C--C-ACAA----T-CCGA-AAAT--AA--G-AAAC-T--A----AC-GAAG-AC-G-C-T---G-CGAAT-AG------A----TCTG--AAAG--T-GAAC----GTT---A--A-AAGTGTTG-A-GGATTTTAC-A----AGT---AG---AAAGTGTTTAG-A--------AA-----T---AT-AAAAT-G--ATAGAA--G--AGGAA--A-GGAT-----TT--ATTA-AG--TT-G-TTCTT-A--CC--TA-ACGGG-A--TA-AGATCACAA--C-CGTT----G-CG----TAT-TTCAA-TT--TT-A-CGCAAAATT-AC----TTGG--AG--TGC----AA-G-TGAA------A-----GTATG-ATT-TCC-C-AGTTT--GA--C-A-G-CG-AT-CG-C----GGTTTT-----T---CTGTTGTAGTAC-T--------GGTA-A-A--TTTTCCT-TT--AGT--A--C----------ACTAAT-GA-TG-TA-TT-AAT--TA-ATTAAA-A--TCAAAATCTTTTG-GAAT-TGA-CTGTG-TT-T-T--G--T--G-GG-AG-ATT-CAAA-C--C-------G--AACT-GAA-----TTAG-C--GC-T--CCTA--GC---CG-GTCAACAGTTATCT----TATCTG--CGGG----TCTTT---A-CCA-AGCA-C-TCTC-TGTTT-C-G-T--CGG-AGA-TTCTGCG-T-AG--ACAA-GC----CG-AG--------TGTC-TGG-G-TTG-A-
gi|20 : -AAT-TG------A----T-TG--AATG--T-GG-T----ATT---T--A-A-GCTT-A-A-AGATTT-AC-A----ACT---AG---AGTGT--TTA-------------------------AAAAT-G--TTGGAA--A--AGGAA--A-GGAT-----TT--ATT--TG--CT-G-TTC-T-A--CC--T--ACAGG-A--TA-AGGT-AAAA--C-AGTT----T-TG----TTT-CA-AA-TT--TT-A-C-CAAGATT-AC-C--TTGG--GA--GGCAA--AA-G-TGAA------A-----GAACG-AAT-T-C-C-AG-CT--GA--C-A-G-CA-AT-CG-C----AGTTTT-----T---CTGTT---GTGG-T--------GGTG-A-T--TTCCACA-TT--CGT--A-TCAGTGGTGATTACTAAT-GA-AG-GA-TC-AGT--TA-ACTACC-G--TT-AACTCTTTCA-GTAT-TGA-CTGCG-TT-T-aacga
gi|23 : TCT-CGTG-C-A---AC----CAGACGC-TC---GG-CT-A---CTCC-ATAA-A---------T---C----------T---CCGTA----AA-----CCGAA--AG-TCT---GG-TAAA-GATA---C--G-C---A-AA----AA--C---G--TTT--GTA--A-CGT--C-AAAA-CGAGGCT-T-AC-C--------ATA-A-TC-CT--GGT-A-T-----T--T----AA-TTT-GA---T-TGACTGA-T-----------------------C--C-ACAC----T-C-CA-AAAT--AA-CG-A--C-T--A----TC-GAAG-AAAG-C-T---G-T-GAT-AG------A----T-TG--AAAG--T-GG-C----GTT---T--A-A-TTGT-G-A-GGATTT-AC-A----ACT---AT---A--GTGTTTAG-A--------AA-----T---AT-AAAAT-A--ATAGAA--G--A
gi|24 : gTG-C-A---AC----CAGACGC-TCT--G--CT-A--TCTGC-GTAA-A---------T--------------T---CCGT-----AA-----CGGAG--AG-TCT---GT-TAAA-AATA---C--G-C---GAAA----AA--C---G--TTT--GTT--A-CGT--C-AAAA-CGA-GCT-T-AC-C--------AAA-A-GC-C------------------T----GA------------TGGCTGA-T-----------------------C--C-ACAA----T-C-CAGAAAT--AA-CG-A--C-T--A----TC-GAAGTAAAG-C-------T-AAT-AA-------------TG--AAAG--T-G-------------C--A-A--------A-GGATTT-AC-A----AGT---AG---A--GTGTTTAA-A--------AA-----T---A----------------------AGGAA--A-GGAT-----TT--ATT--
gi|26 : tttcCT-TGTT-C-A---AC----CAAACAC-TCA--G--CT-G--TCTCC-ACAA-A---------T---C----------TTCGACG------AG-----CAGAG--AG-TAC---GA-TAAA-AATT---C--A-A---G-AT----AA--C---A--TTT--GTA--A-CAT--C-AGAA-CGAGGCT-T-AC-T--------AAA-A-TT-TC--ATT-A-T-----T--T----AA-TTT-GG---T-TGt
gi|27 : ---GG-TATA-GACA---C--A-C---G-AT----GA--C---G--TTT---TA------------------------C-AC-C--------AGA-AATC-TC--GGT-A-T-----T--C----AG-TCC-CA---T-TGGTTGA-T-T---------------------C--C-ACAAACCTT-C--A-AAAC--AA-CG-A--T-T--A----CT-GAAG-AAAG-T-TC--G-C-AGT-AC------A----T-TG--AACG--C-GG-C----GTTGTGC--A-A-GCA--G-A-GTATTT-AA-A----Atttcaatacacctccaaa
gi|28 : -CGTG-C-A---AC----CAGACGC-TTCG-G--CT-A--TCTCCCGTAATA---------TT--C----------T---CCGTA----AA-----CCGAG--AG-TCT---GG-TAAA-GATAATTC--G-C---GAAA----AA--C---G--TTT--GTA--A-CGT--CGAAAA-CGAGGTT-T-AC-T--------CGA-A-TC-CC---GT-A-T-----a
gi|29 : gtctag--AGT--A-TC------------TAAT-GT-AG-AT-TC-AAC--TA-ATTACC-A-------AT-----G-G----TGA-TTATG-AT-T-T--G--T--------------CAGA--------------AAGTT-AAA-----TTAG-C--GC-TC-CCTA--G----CG-GT-ACCAGTT---------------------------TT---A-CCA-G--A-C-TCT----------------GA-AGA-TT-TGCG-G-AG--AC-A-GT----CG-AA--------CATC-C-G-G-TTG-A-ACcccagggtttggaat
gi|3 : --C-AAAATCGAGGCT-T----C--------AGA-A-TC-TCCTGGT-A-T-----G--T----A---TT-GA---T-TGGCTGA-T-CCAGACA--GG-----------C--C-ACAA----T-C-GT-TAGT--AAACG-A--C-TG-A----TC-GAAGGAAAG-CAT---G-C-AAT-GG------AGTTCT-TG--AAAGG-T-GA-C----GTTA--T--A-A-AGGT-G-G-CGATTTTACTA----AGTTATAG---AGATTTTGTAG-A--------AA-----TTTGAT-AAA-T-GT-ATAGAA--GGAAGGAA--ATAGAT---------ATT--AG--CTAG-TTC-T-AACCT--T--ACGGA-A--TA-TGAT-AAGA--CGCGTT----G-CGATTATAT-TT-AA-TT--TT-A-CTCAAAATT-AC-TATTTGGTGAGACGGC-ACAAA-G-GGAATCGTAAA-----GTGAG-TGT-C-C-C-AG-TTT-GAATC-A-GGTG-ATTCG-CTGACAGTTTT-----T---CTCGT---GTAT-TTGCTCTGTGGTA-AATGATTCCCCT-TT--AGT--A-TCC---------ATTAATTGA-AG-TA-TTTAAT--TA-ATTAAC-AA-TC-AAATCTATCG-GAAT-TCA-CTGTG-TTCT-T--GTTTGGG-GATAG-CTG-CAAA-C--TCGAGTGAG-AAACT-GAAATCTGCTGG-C--G-----CCTATTGCT--CG-GT-AG-AGTTA--TTGTATACC-GATCTGGAGCTTCTTT---A-CCA-G--AGCGTCTCTTGTTT-C-G-TTCCGGCATA-TC-TGCG-T-AGTTAC-ATAC----CG-A---------TGAC-T-G-G-TTG-A-ACGAGACa
gi|30 : G-ATTACATA-C--C-------G-TA-CT-CTA-----TCAG-C--GC-TC-CCTA--G----CG-GT-AACAGTTA--T----TATC-G--AGCA----TCTTT---A-CTA-G--A-C-TCTC-TG-CT-C-G-T--AAG-AAA--T-TGCG-G-AG--AC-A-GC----TG-AG--------TGTC-T-A-G-TTG-A-ACAAGAC
gi|31 : CTA--G----CG-GT-AACATTCA--T----TATC-G--CGAA----TCTTT---A-CCA-G--A-C-TCTC-TT-CT-C-G-T--GGT-AAA-TT-TGAG-A-AG--GC-A-GC----CG-AG--------CGTC-T-G-G-TTG-A-ACGAGAC
gi|32 : aaattccaaataatccatCTA--GA---CG-CT-GACGGCTA--T----CTCC-G--TAAA----TCTCT---G-TAA-A--A-C-T-----G-TT-C-G-T--CGG-AGA-TT-TGCGTGTAG--AC-A-AC----CG-AGTAGTGTTATGTC-T-G-G-TTC-A-ACGAGACt
gi|33 : cgtgcaa--CGG-AGA-TT-CACG-G-AG--AT-A-GC----CG-AG--------CGTC-T-G-G-TTG-C-ACGAGAC
gi|33 : CTC-TG-TT-C-G-T--TGG-CGA-TT-TGCG-T-AG--AC-A-ACCATGCA-AG--------TGTC-T-G-G-TTG-A-ACGAGtaaactctgttcgttggcgatttgcgtagacaaccatgcaagtgtctggttgaacgag
gi|34 : gtctcgtgcaaccagacgctcggctatctccgtgaatctccgtaaaCT-CGTG-C-A---AC----CAGACGC-TCG--G--CT-A--TCTCC-GTAA-A---------T---C----------T---CCGTA----AA-----CT------G-TTC---GT-TGGA-GATAATTC--G-CGTAG-AC----AA--CCGTG--TTT--CTG-----GT--T--GAA-CGAGACT-
gi|35 : C-TC-CCTA--G----CG-GT-AACAGTTA--T----TATC-G--CGGG----TCTTT---A-CCA-G--A-C-TCTC-TG-TT-C-G-T--CGG-AGA-TT-TGCG-T-AG--AC-A-AC----TG-AG--------TGCC-T-G-G-TTG-A-ACGAGAC
gi|36 : TCT-CGTG-C-ATGAGC----CAGACGC-TC---GGCCT-A--TCTCT-ATAA-A---------C----------------------------------CCAAG--AGATCTGGGGG-TAAA-GATATC-C--G-C---GAAA----AA--C---AT-TTT--GTA--A-CGT--C-t
gi|37 : gTCT-CGTG-C-A---AC----CAGACGC-TCG--G--CT-A--TATCC-GTAA-A---------C---C----------T---G
gi|37 : C-TG-TT-C-G-T--CGG-AGA-AT-TGCG-T-AG--AC-A-AC----CA-AG--------TGTC-T-G-G-TTG-A-ACttcgtcggagaattgcgtagacaaccaagtgtctggttgaac
gi|38 : tctcgtgcaaccagacgctcggctatatccgtaaacG-ATT-T-C-C-AG-TT--GA--C-A-G-CA-AT-CG-C----GGT-----------------------------------------T--TTCTCCC-TT--AGT--A-TC----------AC---------------------------TAAC-A--TT-AAATTGTTCG-AAAT-TGA-CTGT--CT-T-T--G--TG
gi|39 : C-C--------AAG-A-TT-TC--GGT-A-T-----T--T----GA-TTT-GA---T-TGGTTGA-T-C-----A--------------------AAAA----T-C-CA-AAAT--AA-CG-A--C-T--A----TC-GAAG-AAAG-C-T---G-T-AAT-GG------A----T-TG--A
gi|4 : T-CGTGGC-A---AC----CAGACGC-TC---G--CT-AA-TCTCC-GTAA-A---------CTTCC----------C---GTA------AT-----CCGAAGAAG-TCT---GG-TAAA-GATA---C--G-C-----AA----AA--C---G--TT---GTA--A-CGT--C-AAAA-CGAGGCT-T-AC-C--------AGATA-TC-CT--GGT-AAT-----G--T----GA-TTT-GA---T-TGGCTGA-T-C-----A--GG-----------C--C-ACAA----T-C-GA-AAAT--AA-CG-A--C-TT-A----TC-GAAG-AAAG-C-T---G-C-AAT-AG------A----T-TG--AAAG--T-GA-C----GTT---A--A-A-GTGT-GAA-GGATTT-AC-A----AGT---AG---AGTGT-TTTAGAA--------AA-----T---AT-AAAAT----ATAGAA--G--AGGAA--T-GATT-----TT--ATT--AG--CT-G-TTC-T-C--CC--T--ACGGG-A--TA-AGAT-ACAA--C-CGTT----G-CG----TAT-TT-AATTT--TT-A-C-C-AAATT-AC-T--TTGG--A---TGC-A--AA-G-TGAA------A-----GTATG-ATT-T-CTC-AG-TTTGAA--C-A-C-GG-AT-CGCC----GGTTTT-----T---CTGTT---GTAC-T--------GGTA-A-A--TTTTCCT-TT--AGT--ACCC----------ACTAAT-GA-AGTTA-TA-AGT--TA-ATTAAA-A--TA-AAATCTTTTG-GAAT-TGATCTGTGTTT-T-T--G--TGGGAGG-AG-ATT-CAAA-C--C-------GAAAACT-GAA-----TTAG-C--GC-TCACCT---G----CG-GT-AACAGTTA--T----TATC-G--C-GG----TCTTT---AGCCA-G--A-C-TCTC-TG-TT-C-G-T--CGG-AGA-TT-TGCG-T-AG--AC-A-AC----CG-AG--------TGTCGT-G-G-TTGAA-ACGAGAC
gi|40 : TCT-CGTG-C-A---AC----CAGACGC-TCCG-G--CT-A--TCTCC-GTAA-A---------C---CGTCGGAGATTT---GTGTTGAGCAA-----CCGAG--TG-TCT---GG-T
gi|41 : T-CGTG-C-A---AC----CAGACGCCTC---GG-CT-A--TCTCC-GTAA-ACGTCGGAGAT---T----------T---GTGTTGAC-AA-----CCGAG--TG-TCT---GG-Ttgaacg
gi|42 : -TG-TTGC-A-T--CGG-AGA-TT-TGCG-T-AG--AC-A-ACG---CG-AAT-------TGTC-T-G-GTTTG-A-ACGAAACtgaa
gi|43 : gcgtaatttccgtaaacgt-CGTG-CCA---AC----CAGACGC-TTTCGG--CT-ATCTCTCC-GTGA-A---------T---C----------T---CCGTA----AA-----CCG-G--AG-TTT---t
gi|44 : --A-C-T-TC-TG-AT-G-G-G--TGG-AAA-TT-TACG-G-AG--AT-A-GC----CA-AG--------TGTC-T-G-G-TTG-C-ATGAGACatgttcgtcagaga
gi|45 : a-G-T--CGG-AGA-TT-TACG-G-AG--AT-A-GC----CG-AG--------CGTC-T-G-G-Tattctctgttcgtcg
gi|45 : ccC-TG-TT-C-G-T--CAG-AGA-TT-TGCA-T-AG--AC-A-AC----Cctgttcgtcagagatttgcatagacaacca
gi|46 : ccaccagacgctcggctatctccgtaaatctccgacT-C-G-T--CAA-AGA-TT-TGCG-G-AA--AC-A-GC----CG-GG--------TGTC-T-G-G-TTG-A-AAGAGACa
gi|47 : aatctccgacaagcaatgTT---A-CCC-T--A-C-TCTC-TG-CT-C-G-T--CG----A-TT-TACG-G-AG--AT-A-GC----CG-AG--------CGTC-T-G-G-TT--C-ACGAGA
gi|48 : -A--TCTCC-GTAA-A---------C---CGAGATT----T---GCGTAGAC-AA-----CCGAG--TG-TCT---GG-TAt
gi|48 : taaG-AGA-TT-TGCG-T-AG--AC-A-AC----CG-AG--------TGTC-T-G-G-TAT-A-ACGAGACtaacgagac
gi|49 : taaatctccgtaaaccCT-C-AC-C--------AAA-A-TT-TT--GGT-A-T-----T--T----AA-TTT-GA---T-CAGTTGA-T-T-----A--AA-----------CA-C-AC
gi|5 : gcT-CGTG-C-A---AC-----AGACGC-TC---GG-CT-A--TCTCC-GTAA-A---------T---C----------T---CCGTAA---AA-----CCGAG--AG-TCT---GG-TAAA-GATA---C--G-C---G-AA----AA--C---G--TTT--GTA--A-CGTC-C-AAAA-CGAGGCT-T-AC-A--------AGA-A-T--CT--GGT-A-T-----G--T----GA-TTT-GA---T-TGGCTGA-T-C-----A--GG--------------C-ACAA----T-C-GA-AAAT--AA-CG-A--C-T--AT---TC-GAAG-AAAG-C-T---G-T-AATAAG------A----T-TG--AAAG--T-GA-C----GTT---T--A-A-GTGT-G-A-GGATTT-AC-A----AGG---AG---A--GTGTTTAG-C--------AA-----T---ATAAAAAT-G--ATAGAA--G--AGGAA--A-GGA------TT--ATT--AG--CT-G-TTC-T-A--CC--T--ACGGGAA--TA-TGAT--AAA--C-CGTT----G-CG----TAT-TT-AA-TT--TT-A-C-CAAAATT-CC-T--TTGG--A---GGC-A--AA-G-TG--------A-----GTATGCATT-T-C-C-AG-TT--GA--CAA-G-CG-AT-CG-CA---GGTTTT-----T---CTGTTCA-AAAC-C--------GGTA-A-T--TCTTCTC-TTTAAGT----TCA---------ACTAAT-G--AG-TA-TT-GAT--TACATTAAC-AATTC-AAAACTTCAG-GAAT-TCA-CTGTG-TT-T-TGGG--TGGG-TA-AGAATT-CAAA-C--C-------G-AAACT-GAA-----TT-G-C--GCTTC-CCTA--G----CG-GT-AACAGTTA--T----TATC-G--CGGG----TCTTTA--A-CCA-G--A-C-TCTC-TG-TT-C-GAT--CGG-AGATTT-TGCG-T-AG--AC-A-AC----TGAAG--------TGTC-T-G-G-TTG-A-ACGctccaaa
gi|50 : TT--TG--CT-G-TTC-T-A--CG--T--ACGGG-A--AACTG---------C-CGTT----T-TG----TAC-CA-AA-TT--TT-A-C-CAAAATT-
gi|51 : gC----CAGACGC-TC---GG-CT-A--TCTCC-GTAA-A---------C---CGT--------T-------------A-----CTGAG--TG-CCT---GG-T
gi|52 : --A-C-TCTC-TG-CT-C-G-T--CG----A-TT-TACG-G-AG--AT-A-GC----CG-AG--------CGTC-T-G-G-TTG-C-ACGAGAtgaacgagact
gi|53 : CTC-AG-TT-C-G-T--CGG-AGA-TT-TTCG-T-AA--AC-A-AC----CG-g
gi|54 : cgctcggctatctccgtgtaCTT-TG-TT-A-G-T--CGG-AGA-TT-TACG-G-AG--AT-A-GC----CG-AG--------CATC-T-G-G-TTG-C-ACGAGA
gi|55 : C-TG-TT-CCG-T--CGG-AGATTT-TTCG-T-AGA-AC-A-ACT---TG-AG--------TGT--T-G-G-TTG-C-ACG
gi|56 : --A-C-TCTC-TA-CT-C-G-T--CGA-AGA-TT-AACA-G-AG--AT-A-GT----CA-AG--------CGTC-T-G-G-TTg
gi|57 : -AC-T--TTGG--AG--GGC-A--AA-G-TGAA------A-----GTATA-ATT-T-C-C-AG-TT--GA--C-A-
gi|58 : TCT-CGTG-C-A---AC----CAGACGC-TCG--G--CT-A--TCTCC-GTAA-A---------
gi|59 : ag-A-GC----CG-AG--------CGTC-T-G-G-TTG-C-ACGAGAC
gi|6 : ctaCT-CGTG-C-A----C----CAGACGC-TC---G--CTTG--TCTCC-GTAA-A---------T---C----------T---CCGTA----AA-----CCGAG--AG-TCT---GG-TAAA-GATA---CT-G-C---G-AA----AAA-C---G--TGT--GTA--A-CGT--C-AAAAACGAGGCT---ACAC--------AGA-A-TC-CT--GGT-A-T-----G--T----GA-TTT-GA---TCTGGATGA-T-C-----A--GG-----------C--CCACAA----T-C-GA-AAAT--AA-CG-A--C-T--A----TC-GAAG-AAAG-C-TT--G-T-AAT-AG------A----T-TA--AAAG--T-GA-C----GTT---T--A-A-GTGT-G-A-GGATTT-AC-A----AGT---AC---AGTGT-TATAG-A--------AA-----T---AT-AAAAT-G--ATAGTATCG--AGGAA--A-GGAT-----GC--ATT--AG--CT-G-TTT-T-A--CC--T--ACGGG-A--CATTGAT-AAAA--C-CGTT------CG----TAT-TT-AA--T--TT-A-C-CAAAATT-ACTT--TTGG--AG--GGC-A--AA-G-TGAA------A-----GTATG-ATT-T-C-C-AG-TT--GA--C-A-G-TG-AT-CG------GGTTTT-----T---CTGTT---GTAT-TA-------GGTA-A-C--TTTTCCT-TT--AAT--A-TC----------ACTAAT-GA-AG-TA-TT-AAT--TA-ATTAAC-A--TC-AAATCTTTCG-GAATCTGA-C--TG-TT-T-T--G--TGGG-GG-AG-ATT-CAAA-C--C-------G-AAACTGGAA-----TCAGCC--AC-TC-CCTA--G----CG-GT-AACAGTTA--T----TATC-G--CGGG----T-TTT---A-CCAGG--A----CTC-TG-TT-C-G-T--CGG-AGATTT-TGCG-T-AG--AC-A-AA----CG-AG---------GTC-T-G-G-TTG-A-ACGAGAa
gi|7 : TCT-CGTG-C-A---AC----CAGAC---CC---G--CT-A--TCTCC-GTAA-AAT-------T---C----------T---CCGTA----AA-----CCGAG--AG-TCT---GG-TAAA-GATA---C--G-C---G-AA----AA--C---G--TTT--GAA--A-CGTGTC-AAAAACGAGGCT-T-AC-C--------AGA-A-TC-CT--GGT-A-T-----G--T----GA-TTT-GA---T-TGGCTGA-T-C-----AA-GG-----------C--C-ACAA----T-C-AT-AAAT--AA-CG-A--C-T--A----CC-GAAG-AAAG-C-T---G-TTAAT-AG------A----T-TG--AAAAGTT-GA-C----GTTAT-T--ATA-GTGT-G-A-GGATT--AC-A----AGT---AG---AGTGT-TATA--A--------AA-----T---AT-AAAATTG--ATAGAA--G--AGGAA--G-GATT-----TT--ATTTTAG--CT-G-TTC-T-A--CC--T--ACAGG-A--TA-TGAT-AAGA--C-CGTT----G-CG----TAT-TT-AA-TT--TTTA-C-CAAAATTCAC-T--TTGG--AG--GGC-A--AA-AATGAA------A-----GTATG-GAT-T-T-C-AG-TT--GA--C-A-G-CG-AT-CG-C----GGTTTT-----T---CTGTT---GTAC-T--------GGTA-A-T--TTTTCC--TT--A-T--A-TC----------ACTAAT-GA-AG-TATTT-AAT--TA-A-TAAC-A--TT-AAATCTTTCG-GAAT-TGA-CTGTG-TT-T-T--G--TGGG-GG-AG-ATT-AAAA-C--C-------G-AAACT-GAA-----TTAG-C--GC-TC-CCTA--G----CG-GT-AACAGTTA--T----TATC-G--CGGG----TCTTT---A-CCA-G--A-C-TCTC-TG-TT-C-G-T---------------CG-G-AG--AC-A-AC----CG-AG--------TGTC-T-GCG-TTG-A-ACGAGAC
gi|8 : gTCT-CGTG-C-A---AC----CAGACGC-TC---G--CT-A--TCTCC-GTAA-A---------T---C----------T---GTA------AA-----CCGAG--AG-TCT---GG-TAAA-GATA---C--G-C---G-AA----AA--C---G--TTT--GTA--A-CGT--C-AAAA-CGAGGCT-T-AC-C--------AGA-A-TC-CT--GGT-A-T-----G--T----TA-TTT-GA---T-TGGCTGA-T-C-----A--GG-----------C--C-ACAA----T-A-AA-AAAT--AA-CG-A--C-T--A----TC-GAAG-AAAG-C-T---G-C-AAT-AG------A----T-TG--AAAG--T-GA-C----GTT---T--A-A-GAGT-G-A-GGATTT-AC-A----AGT---AG---AGTGTGTTTAG-A--------AA-----T---AT-AAAAT-G--ATAGAA--G--AGGAA--A-GGAT-----TT--ATT--AG--CT-G-TTC-T-A--CC--T--ACGGG-A--TA-TGAT-AAAA--C-CGTT----G-CG----TAT-TT-AA-TT--TT-A-C-CAAAATT-AC-T--TTGG--AG--GGC-A--AA-G-TGAA------A-----GTATG-ATT-T-C-C-AG-TT--GA--C-A-G-CG-AT-CG-C----GGTTTT-----T---CTGTT---GTAC-T--------GGTA-A-T--ATTTCCG-TT--AGT--A-TC----------ACTGAT-GA-AG-TA-TT-AAT--TA-ATTAAC-A--TC-AAATCTTTCG-GAAT-TCA-CTGTG-TT-T-T--G--TGGG-GG-AG-ATT-CAAA-C--C-------G-AAACT-GAA-----TTAG-C--GC-TC-CCTA--G----CG-GT-AACAGTTA--T----TATC-G--CGGG----TCTTT---A-CCA-G--A-C-TCTC-TG-TT-C-G-T--CGG-AGA-TT-TGCG-T-AG--GC-A-AC----CG-AG--------TGTC-T-G-G-TTG-A-ACGAGAC
gi|9 : TCT-CGTG-C-A---AC----CAGACGC-TT---GG-CT-A--TCTCC-GTAA-A---------T---C--------------------------------GAG--AG-TCT---GG-TAAA-GATA---C--G-C---G-AA----AA--C---G--TTT--GTA--A-CAT--C-AAAA-CGAGGCT-T-AC-C--------AGA-A-TC-CT--GGT-A-T-----G--T----GA-TTT-GA---T-TGGCTGA-T-C-----A--GG-----------C--C-ACAA----T-C-GA-AAAT--AA-CG-A--C-T--A----TC-GAAG-AAAG-C-T---G-T-AAT-AG------A----T-TG--AAAG--T-GA-C----GTT---T--A-A-GTGT-G-A-GGA-TT-AC-A----AGT---AG---A--GTGTTTAG-A--------AA-----T---AT-AAAAT-G--ATAGAA--G--AGAAA--A-GGAT-----TT--ATT--AG--CT-GTTTC-T-A--CC--T--ACGGG-A--CA-TGAA-AAAA--C-CGTT----G-CG----TAT-TT-AATTT--TT-A-C-CAGAATT-AC-T--TTGG--AG--GGC-A--AA-G-TGAA------A-----GTATA-ATT-T-C-C-AG-TT--GA--C-A-G-CG-AT-CG-A----GGTTTT-----T---CTGTT---GTAT-T--------GGTA-A-T--TTTTCCT-TT--AGT----TC----------ACTAAT-CA-AG-TA-TT-AAT--TA-ATTAAC-A--TC-AAATCTTTC--GAAT-TGA-CTGTG-TT-T-T--G--TGGG-GG-AG-ATT-CAAA-C--C-------G-AAACT-GAA-----TTAG-C--GC-TC-CCTA--G----CG-GT-AACAGTTAT-T----TATC-G--CGGG----TCTTT---A-CCA-G--A-C-TCTC-TG-TT-C-G-T--CAG-AGA-TT-TGCG-T-AG--AC-A-AC----CG-TG--------TGTC-T-G-G-TTG-A-ACGAGAC
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|19 ): CATCGAAGTTCCCATACACATGTCACATGATGACCTAATATCCTGAATGGCAAGTCAATGTTACATGCTGTGGTCATCCTACAATGCTACACCTTGCAGGAAGTAATCGTTCGGCCATCTTATAAGAAGTAAGTCTCTACCTATCTATAGGAAGTAATATTCACCTATCTTTATAGCGAAGTAATAACTTCACCTATCTTATAGAAGTAATCAGTATTGTATAGGTTAAATTAACTATTGATGCGAAGTGACAGCAAGCATGAGGGAAGGGACTTGACATAGGATACATCTGCTGCTCAAACCCCCCTCCCATTCAGTA
Unaligned ( gi|21 ): AGAAACACAAGCACATCTGGAAGTTCCATGACCATCTATGTCACATGAGACATAATTTCCTGAATGGCAAGTCAATGTCTACATGCTTGGTCCACTCCTACATGCTACCATCCACTTTGCAGGAAGTAATCGTTCGCCTATCTTATAGGAAGTATTCCTTCACCTATCTTATAGGAAGTATATCCAGTATGCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGTATTGTAATAGGTTAATTAACTTTGTGCGAATGCAGC
Unaligned ( gi|22 ): TGACCATCTATGTCACATGAGACATAATTTCCTGAATGGCAAGTCAATGTCTACATGCTTGGTCCACTCCTACATGTACCATCCACCTTTGCAGGAAGTAATCGTTCGCCTATCTTATAGGAAGTACTTCCTTCACCTATCTTATAGGAAGTAATCCTAAAGTATGCAATAGGTTAATTAACTTTTGTGCGAATGCAGCATCATTAGGAGAGGGCTGACATATAGGTTCATCCTGCTGCCCAATCCCATCAGTAT
Unaligned ( gi|25 ): AGAAACACAAGCACATCTGGAAGTTCCATGACCATCTATGTCACATGAGACATAATTTCCTGAATGGCAAGTCAATGTCTACATGCTTGGTCCACTCCTACATGTTACCATCCACTTTGCAGGAAGTAATCGTTCGCCTATCTTATAGGAAGTAATCCTTCACC
Alignments
lowQualScore : 4444444444444444444444444444444444444444444444444444 22222222222222222222222 111111111 11 1 2222222222222222222222222 11111111111 1111111111 1111 1111 111111111
lowQualScore : 1 1 1 222 4444 1 44 1 1 1 11 1 1 0000000000000000000000000000000000000000000000000000 22 3 444 1 2 666 55 2 2 6 4444 44 44 22 22 3 55 1 5 1 1 1 66666666 1 5 1 333 1 1 99999999 44444 1 1 444 1 0 1 99999999999999999999999 44 3 111111111 1 22 1 1 44 1 88 6666 3 3 1 1 999 1 3 1 555555 3333 1 22 0 44 1 33 4444 777 22 1 666 1 1 1 0 5 1 4444 2 333 333 11 5 0000000000000000000000000 2 44 77777 22 2 55555 22 666 22 2 2 2 4 55 22 55 2 33 4 44 33 2 666666 5555 2 2 7 33 4 2 4 4 4444 1 33 333 2 33 2 2 666666 55555 0 2 2 2 2 2 2 77 22 4 2 2 2 2 2 6666 55555 333 999 11111111111 2 2 66 77 22 2 3333333333 4 4 33 2 22 22 2 2 77 2 2 2 2 2 2 8 55 33 1 7777 2 2 2 33 7777777 2 2 55555 4 33 2 2 22 1111 4 2 6666666 2 22 777777 0 66666 2 22 3 1 1 2 1 1 1 11 2 3 222 1 888 33 1 44 1111 1 222222222 1 2 1 1 1 1
lowQualScore : . . . ... .... . .. . . . .. . . .................................................... .. . ... . . ... .. . . . .... .. .. .. .. . .. . . . . . ........ . . . ... . . ........ ..... . . ... . . . ....................... .. . ......... . .. . . .. . .. .... . . . . ... . . . ...... .... . .. . .. . .. .... ... .. . ... . . . . . . .... . ... ... .. . ......................... . .. ..... .. . ..... .. ... .. . . . . .. .. .. . .. . .. .. . ...... .... . . . .. . . . . .... . .. ... . .. . . ...... ..... . . . . . . . .. .. . . . . . . .... ..... ... ... ........... . . .. .. .. . .......... . . .. . .. .. . . .. . . . . . . . .. .. . .... . . . .. ....... . . ..... . .. . . .. .... . . ....... . .. ...... . ..... . .. . . . . . . . .. . . ... . ... .. . .. .... . ......... . . . . . .
lowQualScore : 7 7 6 666 5555 3 55 3 3 3 88 3 3 5555555555555555555555555555555555555555555555555555 11 1 222 6 0 666 00 1 1 3 5555 33 33 55 55 6 99 7 5 7 7 7 00000000 7 0 7 000 7 7 66666666 33333 7 7 666 7 6 7 55555555555555555555555 33 6 999999999 9 66 9 9 55 9 33 0000 8 8 9 9 000 9 6 8 222222 9999 8 55 5 55 9 11 0000 999 66 9 000 9 9 9 8 7 9 0000 0 555 555 55 0 2222222222222222222222222 0 88 22222 99 1 33333 99 555 99 1 1 1 2 00 99 00 4 22 7 99 22 4 222222 0000 4 4 1 22 7 4 7 4 0000 7 44 777 5 22 4 4 444444 66666 3 1 1 1 1 0 1 11 99 2 1 2 2 2 2 9999 66666 999 222 22222222222 2 2 11 66 99 1 4444444444 2 2 44 1 33 99 1 1 11 1 2 2 2 2 2 9 66 22 8 2222 4 4 4 22 6666666 4 4 99999 7 22 2 2 88 0000 0 0 4444444 1 99 999999 1 00000 1 66 8 9 4 8 3 3 3 88 6 9 333 3 666 11 3 66 0000 3 777777777 4 8 4 4 4 4
consensus : TCT-CGTG-C-A---AC----CAGACGC-T--C-GG-CTA-TCTC--C-GTA-A---------A--T-C--------TCC-G-----T-------A----A-----CCGAG--AG-TCT---GG-TAAA-GATA---C--G-C-G-A----AAA--CG--TTT--GTA--A-CGT--C-AAAA-CGAGGCT-T-AC-C--------AGA-A-TC-CC--GGT-A-T-----G--T----GA-TTT-GA---T-TGGCTGA-T-C-----A--GG-----------C--C-ACAA----T-C-GA-AAAT--AA-CG-A--C-T--A----TC-GAAG-AAAG-C-T---G-T-AAT-AG------A----T-TG--AAAG--T-GG-C----GTT---T--A-A-GCGT-G-A-GGATTT-AC-A----AGT---AG---AGTGTGTTTAG-A--------AA-----T---AT-AAAAT-G--ATAGAA--G--AGGAA--A-GGAT-----TT--ATT--AG--CT-G-TTC-T-A--CC--T--ACGGG-A--TA-TGAT-AAAA--C-CGTT----G-CG----TAT-TT-AA-TT--TT-A-C-CAAAATT-AC-T--TTGG--AG--GGC-A--AA-G-TGAA------A-----GTACG-ATT-T-C-C-AG-TT--GA--C-A-G-CG-AT-CG-C----GGTTTT-----T---CTGTT---GTAC-T--------GGTA-A-T--TTCTCCN-TTAGT--A-TC----------ACTAAT-GA-AG-TA-TC-AAT--TA-ATTAAC-A--TC-AAATCTTTCG-GAAT-TGA-CTGTG-TT-T-T--G--TGGG-GG-AG-ATT-CAAA-C--C-------G-AAACT-GAA-----TTAG-C--GC-TC-CCTA--G----CG-GT-AACAGTTA--T----TATC-G--CGGG----TCTTT---A-CCA-G--A-C-TCTC-TG-TT-C-G-T--CGG-AGA-T---T-TGCG-N-AG--AC-A-AC----CG-AG--------TGTC-T-G-G-TTG-A-ACGAGAC
Reference ( family-1405 ) : TCT-CGTG-C-A---AC----CAGACGC-T--C-GG-CTA-TCTC--C-GTA-A---------A--T-C--------TNC-G-----T-------A----A-----CCGAG--AG-TCT---GG-TAAA-GATA---C--G-C-G-A----AAA--CG--TTT--GTA--A-CGT--C-AAAA-CGAGGCT-T-AC-C--------AGA-A-TC-CC--GGT-A-T-----G--T----GA-TTT-GA---T-TGGCTGA-T-C-----A--GG-----------C--C-ACAA----T-C-GA-AAAT--AA-CG-A--C-T--A----TC-GAAG-AAAG-C-T---G-T-AAT-AG------A----T-TG--AAAG--T-GG-C----GTT---T--A-A-GCGT-G-A-GGATTT-AC-A----AGT---AG---AGTGTGTTTAG-A--------AA-----T---AT-AAAAT-G--ATAGAA--G--AGGAA--A-GGAT-----TT--ATT--AG--CT-G-TTC-T-A--CC--T--ACGGG-A--TA-TGAT-AAAA--C-CGTT----G-CG----TAT-TT-AA-TT--TT-A-C-CAAAATT-AC-T--TTGG--AG--GGC-A--AA-G-TGAA------A-----GTACG-ATT-T-C-C-AG-TT--GA--C-A-G-CG-AT-CG-C----GGTTTT-----T---CTGTT---GTAC-T--------GGTA-A-T--TTCTCCN-TTAGT--A-TC----------ACTAAT-GA-AG-TA-TC-AAT--TA-ATTAAC-A--TC-AAATCTTTCG-GAAT-TGA-CTGTG-TT-T-T--G--TGGG-GG-AG-ATT-CAAA-C--C-------G-AAACT-GAA-----TTAG-C--GC-TC-CCTA--G----CG-GT-AACAGTTA--T----TATC-G--CGGG----TCTTT---A-CCA-G--A-C-TCTC-TG-TT-C-G-T--CGG-AGA-T---T-TGCG-G-AG--AC-A-GC----CG-AG--------CGTC-T-G-G-TTG-A-ACGAGAC
gi|1 : TCT-CGTG-C-A---ACG---CAGACGC-T--C-GG-CTA-TCTC--C-GTA------------------------------------------------------CCGAG--AG-TCT---GG-TAA--GATA---C--G-C-G-A----AAA--TGGTTTT--GTA--AACGTT-C-AAAA-CGAGGCT-T-AC-C--------AAA-A-TC-CT--GAT-A-T-----T--A----AA-TTT-GA---T-TGGCTGAAT-CGC---A--GG-----------C------AA----TGC-CA-AACT--AA-CG-A--C-T--A----TCCGAAG-AAAG-C-T---GCT-AAT-AACATGTAA----T-TG--AAAG--TCGG-C----GTT---TTTA-A-GTGT-G-A-GGATTT-AC-A----AAT---AG---AG-GTGTTTGG-GGGGGGTAGAA-----T---AT-AAA-T-A--ATAGAA--GC-AGAAA--A-GGAT-----TT--ATT--AGGCTT-G-TTC-TTA--CCGCT--ACGGT-AAGTA--GAT-AAAA--A-CGTT----GGCG----TAT-TT-AA-TT--TT-AGC-CAAAATTCAC-T--T--G--AA--GGC-A--AA-G-TAAA------A-----GTATA-ATT-T-T-CTAG-TTT-GA--GGA-G-CG-AT-CG-C----GGTTTT-----TTTCCTGTTT--GTA--T--------GTTA-A-T--TTTTTCT-TTAGT--A----------------AAT----------CT-AAT--T---TTAAC-AA-TA-AAATCTTTTG-AAAT-TGA-CTGTG-TT-T-TT-G--TGGG-G--AG-ATT-CAAAGC--C-------G-AAACT-GAA-----TTAGGC--GC-TC---TA--G----GGCGT-AACAATTA--T----TATC-G--CGGG----TCTTTTTAA-CCA-G--AGC-TCTC-TG-TT-C-G-T--CGGAAGA-T---T-TGCGCGTAG--AC-ATGC----CG-AAAT------TGTT-TGG-G-TTG-AGGCGAGA
gi|10 : TCTACGTG-C-A---ACGTACCAGACGC-T--C-GG-CCA-TCTC----GTA-A---------A------------------------------------------CCGAG--AGCTCT---GGATAAAAGATA---C--G-CCG-A----AAA--CG--TTT--GTA--A-CGT--C-AAAA-CATGACT-T-AC-C--------AGA-A-TT-CT--GGT-A-T-----G--T----GA-TTTGGA---T-TGGCTGA-T-C-----A---G-----------C--C-ACAA----T-C-GA-AAAT--AA-CG-A--C-T--A----TCGGAAG-AAAG-C-T---G-T-AAT-AG------A----T-TG--AAAG--T-GA-C----GTT---T--A-A-G-GT-G-A-GGA-TT-AC-A------T---AG---A--GTGTTTAG-A--------AA-----T---AT-AAAAT-G--ATAGAA--G--AGAAA--A-GGAT-----TC--ATT--AG--CT---TTC-T-A---C--T--ACGGG-A--CA-TGAC-----------TT----G-CG----TAT-TT-AA-TT--TTGA-C-CAAATTT-AC----TTGG--AG--GGC-A--AA-G-TGAA------ATACATGTATG-ATT-T-C-C-A--TT--GA--C-A-G-CG-AT-CG-C----GGTTTT-----T---TTGTT---GTAT-T--------GGTA-A-C--TTTTCC--TTAGT--A-TC----------ACTAA--GACAG-TA-TT-AAT--TA-AAGAACAA--TC-AAATCTTTC--GAAT-TGA--TGTG-TT-T-T--G--TGGG-G---A-ATT-CAAA-C--C-------G-AAACT-GAA-----TTAG-C--GC-TC-CCTA--GGCACCGAGT-AAAAGTTG--T----
gi|11 : gT---GG-TATA-GACA---C--A-C-G-A----TGA--CG--TTT---TA------------------------C-AC-C--------AGA-AATC-TC--GGT-A-T-----T--C----AG-TCC-CA---T-TGGTTGA-T-T---------------------C--C-ACAAACCTT-C--A-AAAC--AA-CG-A--T-T--A----CT-GAAG-AAAG-T-TC--G-C-AGT-AC------A----T-TG--AACG--C-GG-C----GTT------------GT-G-----------C-A----AGC---AG---AGTAT-TTAAA-A--------AA-----T---GT-----T-G--A--AAA--G--GGGTA--A-GTAT-----TT--ACT--TG--CT-G-CTC-T-A--CC--T--TAGGG-A--TA-T-AT-A----------T----G-TG----TAC-AC-AA-TT--TT-A-C-CAAAATG-AC-T--TTGA--AA--GGC-A--AAAG-TTAA------A-----ATACG-ATT-T-C-T-AG-CT--AA--C-A-G-CG-AT-CG-C----GGCTTTAATTTT---CTATT---GTAG-T--------GATG-A-A--TTCTCCA-TTAGT--A-TC----------ACTAAT-GA-AG-TA-TC-AAC--TA-ATAACC-A--TC-CAATCTTTCG-GAAT-TGA-CTATG-TT-TAT--A--CCGG-TG---------AAG-C--A-------G-ATGCT-AAA-----TTAG-C--AC-TC-CCTA--G----TG-GT-AATAGTTA--T----TATC-G--CAAG----TT------------G--A-C-TCTC-AG-CT-C-G-T--TTG-AGA-T---T-TGCG-G-AG--AC-A-GC----CG-AG--------CGTC-T-G-G-TTC-A-ACGAGAaacc
gi|12 : gaatctatAA--CG--TTT--GTA--A-CGT--C-AGAA-CGAGGTT-T-AC-C--------AAA-A-TT-TC--GGT-A-T-----T--TCATTAA-TTT-GA---T-TGATTCA-C-C-----A--CA-----------C--CTCCAA----T---------T--AA-CG-A--C-T--A----TC-GAAG-AAA------------AA---------------------AACG--T-TG-C----ATT---T--A-A-ACCT-A-A-GAACTT-AC-A----ATT---AG---AGTGT--TTA-------------------------AAAAT-G--TTGGAA-----AGAAA--A-TTAT-----TT--ATT--TG---T-G-TTC-T-A--CG--T--------------TG-T-AAA---------------CG----TAT-TA-AA-TT-----A-C-CAA--TT-AC-T--T-----AG--AGC-A--AA-G-TGAA------A-----GCACG-ATT-T-C---AG-CT--GA--C-A-G-CG-AT-CG-C----AGTTTT-----T---CTGTT---ACAG-T--------GGTA-A-T--TTCCCCA-TTAGT--A-TC----------ACTAAT-GA-AG-GA-TC-AAC--TA-ATTACC-A--TC-AAATCTTTCG-AAAT-TAA-CTATG-TT-TCT--G--TCGA-AG-AG-ATT-CAAA-C--C-------G-AAATC-AAA-----TTAG-C--GC-TC-CCTA--G----CG----AACAGTTA--A----TATC-G--CG------------------A-G--A-C-TTT---G-CT-C-G-T--CGA-AGA-T---T-TGCG-G-AG---C-A-CCA---CG-AG--------TGTC-T-G-G-TTT-A-ACGAGA
gi|13 : AA--CG--TTT--GTA--A-CGC--C-AGAA-CGAGGTT-T-AC-C--------AAA-T-TT-TC--GGT-A-T-----T--T----CA-TTA-GA---T-TGATTGA-TTC-----A---------------C--C-ACAC----T-T-CC-AATT--AA-CG-A--C-T--A----TC-GAAG-AAAT-T-T---G-T-AAT-AT------A----T-TG--AATG--T-TG-C----ATT---T--A-A-ACCT-A-A-GAACTT-AC------ATT---AG---AG-GTTTTT-------------------T---A--AAAAT-G--TTTGGA--A--AGAAA--A-TTAT-----TT--ATT--TG--CT-G-TTC-T-A--CC--T--Att
gi|13 : --AA-G-TGAA------A-----GCACG-ATT---C-C-AG-CT--GG--C-A-G-CG-AT-CG-C----AGTTTT-----T---CTGTT---ACATGT--------GGTA-A-T--TTCCCCCATTAGT--A-TC----------ACTAAT-GA-AG-GA-TC-AAC--TA-AT---C-A--TC-AAATCTTTCG-AAAT-TAA-CTATG-TT-TCT--G--TCGA-AG-AG-ATT-CAAA-C--C-------G-AAATC-AAA-----TTAG-C--GC-TC-CCTA--G----CG-GT-AACAGTTA--A----TATC-G--CG------------------A-G--A-C-TTT---G-CT-C-G-T--CGA-AGA-T---T-TGCG-G-AG--TC-A-CCA---CG-AG--------TGTC-T-G-G-TTT-A-ACGAGAagtgaaagcacgattccagctggcagcgatcgcagtttttctgttacatgtggtaatttcccccattagtatcactaatgaaggatcaactaatcatcaaatctttcgaaattaactatgtttctgtcgaagagattcaaaccgaaatcaaattagcgctccctagcggtaacagttaatatcgcgagactttgctcgtcgaagatttgcggagtcaccacgagtgtctggtttaacgagatt
gi|14 : aacgtttgtaacgccagaacgaggtttaccaaattttcggtatttcattagattgattgattcaccacacttccaattaacgactatcgaagaaatttgtaatatattgaatgttgcatttaaacctaagaacttacattagaggttttttaaaaatgtttggaaagaaaattatttatttgctgttctacctT-GA---T-TTGTTGA-TTC-----A---------------C--C-ACACC---T-C-CA-A--T--TA-CG-A--C-CTAA----TC-GAAG-AAA-----------------------------------AACG--T-TG-C----ATT---T--A-A-ACCT-A-A-GAACTT-AC-A----ATT---AG---AGTGT--TTA-------------------------AAAAT-G--TTGGAA--A--AGAAA--A-TTAT-----TT--ATT--TG--CT-G-TTC-T----CC--T--ACGG--A--TA-TGGT-AAAA--C-TGTT----G-TG----TAT-TA-AAGTT--TT-C-C-AAAAATT-AC-T--T-AG--AA--GGC-A--AA-G-TGAA------A-----GC-CG-ATT-T-C-C-AG-CT--GA--C-A-G-CG-AT-CG-C----AGTTTT-----T---CTGTT-----AG-T--------GGTA-A-T--TTCCCCA-TTAGT--A-TC----------ACTAAT-GA-AG-GA-TC-AAC--TA-ATTACC-A--TC-AAATCTTTCG-AAAT-TAA-CTATG-TT-TCT--G--TCGA-AG-AG-ATT-CAAA-C--C-------G-AAATC-AAA-----TTAG-C--GC-TC-CCTA--G----CG--T-AACAGTTA--A----TATC-G--CG------------------A-G--A-C-TTT---G-CT-C-G-T--CGA-AGA-T---T-TGCG-G-AG--TC-A-CCA---CG-AG--------TGTC-T-G-G-TTT-A-ACGAGAtt
gi|15 : taA--CG--TT---GTA--A-C----C-AAA---GAGTTT-A-AC-C--------AAA-T-TT-TC--GGT-A-A-----T--T----CA-ATA-GA---T-TGA-TGA-TTC-----A---------------C--C-ACAT----T-C----AATT--AA-CG-A--C-TA-A----TC-GAAG-AAAATT-T---G-T--AT-AT------A----T-TG--AATG--T-TG------ATT---T--A-A-GCCT-A-A-GAACTTAAC-A----ATT----G---A--GTGTTTAA-A----------------------AAAAT-GTTATGGGA--A--AGAAATTA-GG-------TT--ATT---G--CT---TTC-T-AT-CC--T--At
gi|15 : A------A-----GCACA-ATTGT-C-C-AG-CT--GG--C-AAG-CGGAT-CG-C----AGTTTT---------CTGTT---CCAG-T--------G-TAGA-T--TTC--CA-TTAGTTAA-TC------------TAATAGAGAG-AA-TC-AAGGATA-AT--AC-A--TC-A--TCTT-CGCAAAT-TAA-CTATG-TT-T-T--G--TGAG----AG-ATT-CAAA-CTTC-------G-AAA-T-AAA-----TTAG-CACGC-TC-CTGA--G----CG--T-AACAGTTA--A----TATG-G--C------------------------A-C-T----TG-CT-C-G-T--C-G-AGA-T---T-TGCG-G-AG--AC-A-CCCA--CG-AG--------TGT--T-G-G-TTA-A-gatgaagcacaattgtccagctggcaagcggatcgcagttttctgttccagtgtagatttccattagttaatctaatagagagaatcaaggataatacatcatcttcgcaaattaactatgttttgtgagagattcaaacttcgaaataaattagcacgctcctgagcgtaacagttaatatggcacttgctcgtcgagatttgcggagacacccacgagtgttggttaagat
gi|16 : acgttgtaaccaaagagtttaaccaaattttcggtaattcaatagattgatgattcaccacattcaattaacgactaatcgaagaaaatttgtatatattgaatgttgatttaagcctaagaacttaacaattgagtgtttaaaaaaatgttatgggaaagaaattaggttattgctttctatcctagatgAG--GG-TCT---GG-TAAA-GACA---C--G-C-G-A----TAA--CG--TTT--GCA--A-CAT--C-AGAA-CGAGGTT-T-AC-C--------AAG-A-TT-TC--AGT------------------A-TTT-GA---T-TGGTTGA-gat
gi|16 : cnnnnnnnnnnnnnn-AG-TT--GA--C-A-G-CG-AT-CG-C----GGTGTT-----T---CTGTT---GTAC-T--------GGTA-C-T--TTCTCCA-TTTGT--A-TT----------CTTAAT-GA-AA-TA-TC-AAC--TA-ATTAAC-A--TC-AAAcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagttgacagcgatcgcggtgtttctgttgtactggtactttctccatttgtattcttaatgaaatatcaactaattaacatcaaa
gi|17 : cnnnnnnnnnnnnnnagggtctggtaaagacacgcgataacgtttgcaacatcagaacgaggtttaccaagatttcagtatttgattggttgacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnACGC-T--CCGG-CTA-TCTC--T-CCA-T---------C--C-C--------TCC-G-----TTT-----A----ATTTTTCAGAG--AG-TCTT--GG-TAAG-GATA---CCAG-C-A-ACTTTGAA--CG--TTTTTGTAGGA-CG---C-TAAA-CGAGGCT-TGAC-CTAGCGCGAAAA-A-TCATT--GGT-A-TAGGTTG--C----AG-TTT-GACTCT-TGGATGA-T-C-----A--GG-----------A--C--CAA----TCC-AA-AAATAAAA-CGAA--CGT--AAGTTTC-GAAG---AG-T-TATAG-T-ATT-AG------A----T-TGAAAAAA--T-GA-CAGTTGTT---T--A-GTGGGT-G-ATGGAGAT-AT-ATCGTACT---GGATCAGTGT-CTTAG-ATAT-----AATTTATT---AT-ATTAT-G--TTGGAA--GA-AGGAA--A-GGATGATACTTTAATT--AG---T-G-TTT-TAA--CC--TTAAAGGG-A--TA-TGAT-TAAAGGC-CGTTGCTGG-CG----TATGTT-AA-TTTATT-A-C-CAAAATT-
gi|18 : -A---AC----CAGACGC-T--T-GG-CTG-TCTC--C-ATA-G---------A--T-T--------TCC-GACGAGT-------A------------GAG--AG-TCT---GG-TAA----------------------------CG--TTT--GTA--A-AGT--C-AGAA-CGATGCT-T-GC-C--------AAA-T-TA-CT--GCTCA-T-----GACT----GA-TCT-GA---T-TGATTGA-T-T-----GATGGATTGATTAATTCAAC-ACACC---T-C-CC-AAAT--AA-CA-AG-C-T--T----TC-GAAG-AAAT-T-T---G-T-AAT-AG------A----T-TG--AATG--C-GC-C----GTT---T--A-A-GCTT-A-A-GGATTT-AC-A----ACT---AA---AGTGT-TTC-------------A-----T--------AAT-G--TTGCAA--A--AAGAA--A-GGAT-----TT--A-C--A----T-G-----T-A--TT--T--ACAAG-A--TA-TGGC--AAA--C-CATT----C-TG----TAT-TC-AA--G--TT-A-C-CAAGATT-AC-T--TGAG--AG--GGA-A--GA-G-TAAA------A-----TTACA-ATT-T-T-C-ct
gi|2 : ---AC----CAGACGC-T--C-G--CTA-TCTC--C-GTA-A---------AA-T-C--------TCC-G-----TG------A----A-----TCGAG--AG-TCT---GG-TAAA-GATA---C--GGC-A-A----AAAAACG--TTT--GTA--AACGT--C-AAAA-CGAGGCTCT-AC-C--------AGA-AATC-CT--GGT-A-T-----G--T----GAATTT-GAA--T-TGGCTGA-T-C-----A--GG-----------C--C-ACAA----T-CCGA-AAAT--AA--G-AAAC-T--A----AC-GAAG-AC-G-C-T---G-CGAAT-AG------A----TCTG--AAAG--T-GAAC----GTT---A--A-AAGTGTTG-A-GGATTTTAC-A----AGT---AG---AAAGTGTTTAG-A--------AA-----T---AT-AAAAT-G--ATAGAA--G--AGGAA--A-GGAT-----TT--ATTA-AG--TT-G-TTCTT-A--CC--TA-ACGGG-A--TA-AGATCACAA--C-CGTT----G-CG----TAT-TTCAA-TT--TT-A-CGCAAAATT-AC----TTGG--AG--TGC----AA-G-TGAA------A-----GTATG-ATT-TCC-C-AGTTT--GA--C-A-G-CG-AT-CG-C----GGTTTT-----T---CTGTTGTAGTAC-T--------GGTA-A-A--TTTTCCT-TTAGT--A--C----------ACTAAT-GA-TG-TA-TT-AAT--TA-ATTAAA-A--TCAAAATCTTTTG-GAAT-TGA-CTGTG-TT-T-T--G--T--G-GG-AG-ATT-CAAA-C--C-------G--AACT-GAA-----TTAG-C--GC-T--CCTA--GC---CG-GTCAACAGTTATCT----TATCTG--CGGG----TCTTT---A-CCA-AGCA-C-TCTC-TGTTT-C-G-T--CGG-AGA-T---TCTGCG-T-AG--ACAA-GC----CG-AG--------TGTC-TGG-G-TTG-A-
gi|20 : -AAT-TG------A----T-TG--AATG--T-GG-T----ATT---T--A-A-GCTT-A-A-AGATTT-AC-A----ACT---AG---AGTGT--TTA-------------------------AAAAT-G--TTGGAA--A--AGGAA--A-GGAT-----TT--ATT--TG--CT-G-TTC-T-A--CC--T--ACAGG-A--TA-AGGT-AAAA--C-AGTT----T-TG----TTT-CA-AA-TT--TT-A-C-CAAGATT-AC-C--TTGG--GA--GGCAA--AA-G-TGAA------A-----GAACG-AAT-T-C-C-AG-CT--GA--C-A-G-CA-AT-CG-C----AGTTTT-----T---CTGTT---GTGG-T--------GGTG-A-T--TTCCACA-TTCGT--A-TCAGTGGTGATTACTAAT-GA-AG-GA-TC-AGT--TA-ACTACC-G--TT-AACTCTTTCA-GTAT-TGA-CTGCG-TT-T-aacga
gi|23 : TCT-CGTG-C-A---AC----CAGACGC-T--C-GG-CTA--CTC--C-ATA-A---------A--T-C--------TCC-G-----TA------A----A-----CCGAA--AG-TCT---GG-TAAA-GATA---C--G-C-A-A----AAA--CG--TTT--GTA--A-CGT--C-AAAA-CGAGGCT-T-AC-C--------ATA-A-TC-CT--GGT-A-T-----T--T----AA-TTT-GA---T-TGACTGA-T-----------------------C--C-ACAC----T-C-CA-AAAT--AA-CG-A--C-T--A----TC-GAAG-AAAG-C-T---G-T-GAT-AG------A----T-TG--AAAG--T-GG-C----GTT---T--A-A-TTGT-G-A-GGATTT-AC-A----ACT---AT---A--GTGTTTAG-A--------AA-----T---AT-AAAAT-A--ATAGAA--G--A
gi|24 : gTG-C-A---AC----CAGACGC-T--C-TG-CTA-TCTG--C-GTA-A---------A--T----------TCC-G-----T-------A----A-----CGGAG--AG-TCT---GT-TAAA-AATA---C--G-C-GAA----AAA--CG--TTT--GTT--A-CGT--C-AAAA-CGA-GCT-T-AC-C--------AAA-A-GC-C------------------T----GA------------TGGCTGA-T-----------------------C--C-ACAA----T-C-CAGAAAT--AA-CG-A--C-T--A----TC-GAAGTAAAG-C-------T-AAT-AA-------------TG--AAAG--T-G-------------C--A-A--------A-GGATTT-AC-A----AGT---AG---A--GTGTTTAA-A--------AA-----T---A----------------------AGGAA--A-GGAT-----TT--ATT--
gi|26 : tttcCT-TGTT-C-A---AC----CAAACAC-T--C-AG-CTG-TCTC--C-ACA-A---------A--T-C--------TTC-GAC---G-------A----G-----CAGAG--AG-TAC---GA-TAAA-AATT---C--A-A-G-A----TAA--CA--TTT--GTA--A-CAT--C-AGAA-CGAGGCT-T-AC-T--------AAA-A-TT-TC--ATT-A-T-----T--T----AA-TTT-GG---T-TGt
gi|27 : ---GG-TATA-GACA---C--A-C-G-A----TGA--CG--TTT---TA------------------------C-AC-C--------AGA-AATC-TC--GGT-A-T-----T--C----AG-TCC-CA---T-TGGTTGA-T-T---------------------C--C-ACAAACCTT-C--A-AAAC--AA-CG-A--T-T--A----CT-GAAG-AAAG-T-TC--G-C-AGT-AC------A----T-TG--AACG--C-GG-C----GTTGTGC--A-A-GCA--G-A-GTATTT-AA-A----Atttcaatacacctccaaa
gi|28 : -CGTG-C-A---AC----CAGACGC-TT-C-GG-CTA-TCTC--CCGTA-AT--------A--TTC--------TCC-G-----T-------A----AA----CCGAG--AG-TCT---GG-TAAA-GATAATTC--G-C-GAA----AAA--CG--TTT--GTA--A-CGT--CGAAAA-CGAGGTT-T-AC-T--------CGA-A-TC-CC---GT-A-T-----a
gi|29 : gtctagAGT--A-TC------------TAAT-GT-AG-AT-TC-AAC--TA-ATTACC-A-------AT-----G-G----TGA-TTATG-AT-T-T--G--T--------------CAGA--------------AAGTT-AAA-----TTAG-C--GC-TC-CCTA--G----CG-GT-ACCAGTT---------------------------TT---A-CCA-G--A-C-TCT----------------GA-AGA-T---T-TGCG-G-AG--AC-A-GT----CG-AA--------CATC-C-G-G-TTG-A-ACcccagggtttggaat
gi|3 : --C-AAAATCGAGGCT-T----C--------AGA-A-TC-TCCTGGT-A-T-----G--T----A---TT-GA---T-TGGCTGA-T-CCAGACA--GG-----------C--C-ACAA----T-C-GT-TAGT--AAACG-A--C-TG-A----TC-GAAGGAAAG-CAT---G-C-AAT-GG------AGTTCT-TG--AAAGG-T-GA-C----GTTA--T--A-A-AGGT-G-G-CGATTTTACTA----AGTTATAG---AGATTTTGTAG-A--------AA-----TTTGAT-AAA-T-GT-ATAGAA--GGAAGGAA--ATAGAT---------ATT--AG--CTAG-TTC-T-AACCT--T--ACGGA-A--TA-TGAT-AAGA--CGCGTT----G-CGATTATAT-TT-AA-TT--TT-A-CTCAAAATT-AC-TATTTGGTGAGACGGC-ACAAA-G-GGAATCGTAAA-----GTGAG-TGT-C-C-C-AG-TTT-GAATC-A-GGTG-ATTCG-CTGACAGTTTT-----T---CTCGT---GTAT-TTGCTCTGTGGTA-AATGATTCCCCT-TTAGT--A-TCC---------ATTAATTGA-AG-TA-TTTAAT--TA-ATTAAC-AA-TC-AAATCTATCG-GAAT-TCA-CTGTG-TTCT-T--GTTTGGG-GATAG-CTG-CAAA-C--TCGAGTGAG-AAACT-GAAATCTGCTGG-C--G-----CCTATTGCT--CG-GT-AG-AGTTA--TTGTATACC-GATCTGGAGCTTCTTT---A-CCA-G--AGCGTCTCTTGTTT-C-G-TTCCGGCATA-T---C-TGCG-T-AGTTAC-ATAC----CG-A---------TGAC-T-G-G-TTG-A-ACGAGACa
gi|30 : G-ATTACATA-C--C-------G-TA-CT-CTA-----TCAG-C--GC-TC-CCTA--G----CG-GT-AACAGTTA--T----TATC-G--AGCA----TCTTT---A-CTA-G--A-C-TCTC-TG-CT-C-G-T--AAG-AAA-----T-TGCG-G-AG--AC-A-GC----TG-AG--------TGTC-T-A-G-TTG-A-ACAAGAC
gi|31 : CTA--G----CG-GT-AACATTCA--T----TATC-G--CGAA----TCTTT---A-CCA-G--A-C-TCTC-TT-CT-C-G-T--GGT-AAA-T---T-TGAG-A-AG--GC-A-GC----CG-AG--------CGTC-T-G-G-TTG-A-ACGAGAC
gi|32 : aaattccaaataatccatCTA--GA---CG-CT-GACGGCTA--T----CTCC-G--TAAA----TCTCT---G-TAA-A--A-C-T-----G-TT-C-G-T--CGG-AGA-T---T-TGCGTGTAG--AC-A-AC----CG-AGTAGTGTTATGTC-T-G-G-TTC-A-ACGAGACt
gi|33 : cgtgcaaTCT-CGTG-C-A---AC----CAGACGC-T--C-GG-CTA-TCTC--C-GTG-A---------A--T-C--------TCC-G-----T-------A----A-----
gi|33 : gCTC-TG-TT-C-G-T--TGG-CGA-T---T-TGCG-T-AG--AC-A-ACCATGCA-AG--------TGTC-T-G-G-TTG-A-ACGAGactctgttcgttggcgatttgcgtagacaaccatgcaagtgtctggttgaacgag
gi|34 : gtctcgtgcaaccagacgctcggctatctccgtgaatctccgtaaaCT-CGTG-C-A---AC----CAGACGC-T--C-GG-CTA-TCTC--C-GTA-A---------A--T-C--------TCC-G-----T-------A----A-----
gi|34 : C-TG-TT-C-G-T--TGG-AGA-TAATT-CGCG-T-AG--AC-A-AC----CG-TG--------TTTC-T-G-G-TTG-A-ACGAGACactgttcgttggagataattcgcgtagacaaccgtgtttctggttgaacgagact
gi|35 : ctcgtgcaaccagacgctcggctatctccgtaaatctccgtaaaC-TC-CCTA--G----CG-GT-AACAGTTA--T----TATC-G--CGGG----TCTTT---A-CCA-G--A-C-TCTC-TG-TT-C-G-T--CGG-AGA-T---T-TGCG-T-AG--AC-A-AC----TG-AG--------TGCC-T-G-G-TTG-A-ACGAGACt
gi|36 : TCT-CGTG-C-ATGAGC----CAGACGC-T--C-GGCCTA-TCTC--T-ATA-A---------A--C---------------------------------------CCAAG--AGATCTGGGGG-TAAA-GATATC-C--G-C-GAA----AAA--CAT-TTT--GTA--A-CGT--C-t
gi|37 : gTCT-CGTG-C-A---AC----CAGACGC-T--C-GG-CTA-TATC--C-GTA-A---------A--C-CTG------TTC-G-----T------------------CGGAG--AA-T
gi|37 : C-TG-TT-C-G-T--CGG-AGA-A---T-TGCG-T-AG--AC-A-AC----CA-AG--------TGTC-T-G-G-TTG-A-ACtgcgtagacaaccaagtgtctggttgaac
gi|38 : tctcgtgcaaccagacgctcggctatatccgtaaacG-ATT-T-C-C-AG-TT--GA--C-A-G-CA-AT-CG-C----GGT-----------------------------------------T--TTCTCCC-TTAGT--A-TC----------AC---------------------------TAAC-A--TT-AAATTGTTCG-AAAT-TGA-CTGT--CT-T-T--G--TG
gi|39 : C-C--------AAG-A-TT-TC--GGT-A-T-----T--T----GA-TTT-GA---T-TGGTTGA-T-C-----A--------------------AAAA----T-C-CA-AAAT--AA-CG-A--C-T--A----TC-GAAG-AAAG-C-T---G-T-AAT-GG------A----T-TG--A
gi|4 : T-CGTGGC-A---AC----CAGACGC-T--C-G--CTAATCTC--C-GTA-A---------A--C-T--------TCCCG-----T-------A----AT----CCGAAGAAG-TCT---GG-TAAA-GATA---C--G-C---A----AAA--CG--TT---GTA--A-CGT--C-AAAA-CGAGGCT-T-AC-C--------AGATA-TC-CT--GGT-AAT-----G--T----GA-TTT-GA---T-TGGCTGA-T-C-----A--GG-----------C--C-ACAA----T-C-GA-AAAT--AA-CG-A--C-TT-A----TC-GAAG-AAAG-C-T---G-C-AAT-AG------A----T-TG--AAAG--T-GA-C----GTT---A--A-A-GTGT-GAA-GGATTT-AC-A----AGT---AG---AGTGT-TTTAGAA--------AA-----T---AT-AAAAT----ATAGAA--G--AGGAA--T-GATT-----TT--ATT--AG--CT-G-TTC-T-C--CC--T--ACGGG-A--TA-AGAT-ACAA--C-CGTT----G-CG----TAT-TT-AATTT--TT-A-C-C-AAATT-AC-T--TTGG--A---TGC-A--AA-G-TGAA------A-----GTATG-ATT-T-CTC-AG-TTTGAA--C-A-C-GG-AT-CGCC----GGTTTT-----T---CTGTT---GTAC-T--------GGTA-A-A--TTTTCCT-TTAGT--ACCC----------ACTAAT-GA-AGTTA-TA-AGT--TA-ATTAAA-A--TA-AAATCTTTTG-GAAT-TGATCTGTGTTT-T-T--G--TGGGAGG-AG-ATT-CAAA-C--C-------GAAAACT-GAA-----TTAG-C--GC-TCACCT---G----CG-GT-AACAGTTA--T----TATC-G--C-GG----TCTTT---AGCCA-G--A-C-TCTC-TG-TT-C-G-T--CGG-AGA-T---T-TGCG-T-AG--AC-A-AC----CG-AG--------TGTCGT-G-G-TTGAA-ACGAGAC
gi|40 : TCT-CGTG-C-A---AC----CAGACGC-TC-C-GG-CTA-TCTC--C-GTA-A---------A--C-CGTCGGAGATTT-G-----TGTTGAGCA----A-----CCGAG--TG-TCT---GG-T
gi|41 : T-CGTG-C-A---AC----CAGACGCCT--C-GG-CTA-TCTC--C-GTA-AACGTCGGAGA--T-T--------TGT-G-----TTGAC---A----A-----CCGAG--TG-TCT---GG-Ttgaacg
gi|42 : -TG-TTGC-A-T--CGG-AGA-T---T-TGCG-T-AG--AC-A-ACG---CG-AAT-------TGTC-T-G-GTTTG-A-ACGAAACtgaa
gi|43 : gcgtaatttccgtaaacgt-CGTG-CCA---AC----CAGACGC-TTTC-GG-CTA-TCTCTCC-GTG-A---------A--T-C--------TCC-G-----TA------A----A-----CCG-G--AG-TTT---t
gi|44 : --A-C-T-TC-TG-AT-G-G-G--TGG-AAA-T---T-TACG-G-AG--AT-A-GC----CA-AG--------TGTC-T-G-G-TTG-C-ATGAGACatgttcgtcagaga
gi|44 : aTCT-CATG-C-A---AC----CAGACAC-T--T-GG-CTA-TCTC--C-GTA-A---------A--T-T--------TCC-attctctgttcgtcg
gi|45 : ag---AC----CAGACGC-T--C-GG-CTA-TCTC--C-GTA-A---------A--T-C--------TCC-G-----acccatcagaagtattctctgttcgtcg
gi|45 : ccC-TG-TT-C-G-T--CAG-AGA-T---T-TGCA-T-AG--AC-A-AC----Cacctgttcgtcagagatttgcatagacaacca
gi|46 : ccaccagacgctcggctatctccgtaaatctccgacT-C-G-T--CAA-AGA-T---T-TGCG-G-AA--AC-A-GC----CG-GG--------TGTC-T-G-G-TTG-A-AAGAGACa
gi|47 : aatctccgacaagcaatgTCT-CGTG---A---AC----CAGACGC-T--C-GG-CTA-TCTC--C-GTA-A---------A--T-C--------GAC-G-------------A----G-----CAGAG--AG-TAG---GG-TAA
gi|48 : A-TCTC--C-GTA-A---------A--C-CGAGATT--TGC-G-----T-------AGACAA-----CCGAG--TG-TCT---GG-TAt
gi|48 : taaG-AGA-T---T-TGCG-T-AG--AC-A-AC----CG-AG--------TGTC-T-G-G-TAT-A-ACGAGACtaacgagac
gi|49 : taaatctccgtaaaccCT-C-AC-C--------AAA-A-TT-TT--GGT-A-T-----T--T----AA-TTT-GA---T-CAGTTGA-T-T-----A--AA-----------CA-C-AC
gi|5 : gcT-CGTG-C-A---AC-----AGACGC-T--C-GG-CTA-TCTC--C-GTA-A---------A--T-C--------TCC-G-----T-------A----AAA---CCGAG--AG-TCT---GG-TAAA-GATA---C--G-C-G-A----AAA--CG--TTT--GTA--A-CGTC-C-AAAA-CGAGGCT-T-AC-A--------AGA-A-T--CT--GGT-A-T-----G--T----GA-TTT-GA---T-TGGCTGA-T-C-----A--GG--------------C-ACAA----T-C-GA-AAAT--AA-CG-A--C-T--AT---TC-GAAG-AAAG-C-T---G-T-AATAAG------A----T-TG--AAAG--T-GA-C----GTT---T--A-A-GTGT-G-A-GGATTT-AC-A----AGG---AG---A--GTGTTTAG-C--------AA-----T---ATAAAAAT-G--ATAGAA--G--AGGAA--A-GGA------TT--ATT--AG--CT-G-TTC-T-A--CC--T--ACGGGAA--TA-TGAT--AAA--C-CGTT----G-CG----TAT-TT-AA-TT--TT-A-C-CAAAATT-CC-T--TTGG--A---GGC-A--AA-G-TG--------A-----GTATGCATT-T-C-C-AG-TT--GA--CAA-G-CG-AT-CG-CA---GGTTTT-----T---CTGTTCA-AAAC-C--------GGTA-A-TTCTTCTCTT-TAAGT----TCA---------ACTAAT-G--AG-TA-TT-GAT--TACATTAAC-AATTC-AAAACTTCAG-GAAT-TCA-CTGTG-TT-T-TGGG--TGGG-TA-AGAATT-CAAA-C--C-------G-AAACT-GAA-----TT-G-C--GCTTC-CCTA--G----CG-GT-AACAGTTA--T----TATC-G--CGGG----TCTTTA--A-CCA-G--A-C-TCTC-TG-TT-C-GAT--CGG-AGATT---T-TGCG-T-AG--AC-A-AC----TGAAG--------TGTC-T-G-G-TTG-A-ACGctccaaa
gi|50 : TT--TG--CT-G-TTC-T-A--CG--T--ACGGG-A--AACTG---------C-CGTT----T-TG----TAC-CA-AA-TT--TT-A-C-CAAAATT-
gi|51 : gC----CAGACGC-T--C-GG-CTA-TCTC--C-GTA-A---------A--------------CC-G-----T-------T----A-----CTGAG--TG-CCT---GG-T
gi|52 : TCT-CGTG-C-A---AC----CAGACGC-T--C-GG-CTA-TCTC--C-GTA-A---------A--T-C--------GAC-G-------------A----G-----CAGAG--AG-Ttgaacgagact
gi|53 : CGC-T--C-GG-CTA-TCTC--C-GTGTA---------C--T-CAG------TTC-G-----T------------------CGGAG--AT-TTT---CG-TAAA-g
gi|53 : CTC-AG-TT-C-G-T--CGG-AGA-T---T-TTCG-T-AA--AC-A-AC----CG-caaccg
gi|54 : cgctcggctatctccgtgtaCTT-TG-TT-A-G-T--CGG-AGA-T---T-TACG-G-AG--AT-A-GC----CG-AG--------CATC-T-G-G-TTG-C-ACGAGA
gi|55 : C-TG-TT-CCG-T--CGG-AGATT---T-TTCG-T-AGA-AC-A-ACT---TG-AG--------TGT--T-G-G-TTG-C-ACG
gi|56 : --A-C-TCTC-TA-CT-C-G-T--CGA-AGA-T---T-AACA-G-AG--AT-A-GT----CA-AG--------CGTC-T-G-G-TTg
gi|57 : -AC-T--TTGG--AG--GGC-A--AA-G-TGAA------A-----GTATA-ATT-T-C-C-AG-TT--GA--C-A-
gi|58 : TCT-CGTG-C-A---AC----CAGACGC-T--C-GG-CTA-TCTC--C-GTA-A---------A--
gi|59 : agTCT-CGTG-C-A---AC----CAGACGC-T--C-GG-CTA-
gi|6 : ctagCT-CGTG-C-A----C----CAGACGC-T--C-GC-TTG-TCTC--C-GTA-A---------A--T-C--------TCC-G-----T-------A----AA----CCGAG--AG-TCT---GG-TAAA-GATA---CT-G-C-G-A----AAAA-CG--TGT--GTA--A-CGT--C-AAAAACGAGGCT---ACAC--------AGA-A-TC-CT--GGT-A-T-----G--T----GA-TTT-GA---TCTGGATGA-T-C-----A--GG-----------C--CCACAA----T-C-GA-AAAT--AA-CG-A--C-T--A----TC-GAAG-AAAG-C-TT--G-T-AAT-AG------A----T-TA--AAAG--T-GA-C----GTT---T--A-A-GTGT-G-A-GGATTT-AC-A----AGT---AC---AGTGT-TATAG-A--------AA-----T---AT-AAAAT-G--ATAGTATCG--AGGAA--A-GGAT-----GC--ATT--AG--CT-G-TTT-T-A--CC--T--ACGGG-A--CATTGAT-AAAA--C-CGTT------CG----TAT-TT-AA--T--TT-A-C-CAAAATT-ACTT--TTGG--AG--GGC-A--AA-G-TGAA------A-----GTATG-ATT-T-C-C-AG-TT--GA--C-A-G-TG-AT-CG------GGTTTT-----T---CTGTT---GTAT-TA-------GGTA-A-C--TTTTCCT-TTAAT--A-TC----------ACTAAT-GA-AG-TA-TT-AAT--TA-ATTAAC-A--TC-AAATCTTTCG-GAATCTGA-C--TG-TT-T-T--G--TGGG-GG-AG-ATT-CAAA-C--C-------G-AAACTGGAA-----TCAGCC--AC-TC-CCTA--G----CG-GT-AACAGTTA--T----TATC-G--CGGG----T-TTT---A-CCAGG--A----CTC-TG-TT-C-G-T--CGG-AGATT---T-TGCG-T-AG--AC-A-AA----CG-AG---------GTC-T-G-G-TTG-A-ACGAGA
gi|7 : TCT-CGTG-C-A---AC----CAGACCC-------G-CTA-TCTC--C-GTA-A---------AATT-C--------TCC-G-----T-------A----AA----CCGAG--AG-TCT---GG-TAAA-GATA---C--G-C-G-A----AAA--CG--TTT--GAA--A-CGTGTC-AAAAACGAGGCT-T-AC-C--------AGA-A-TC-CT--GGT-A-T-----G--T----GA-TTT-GA---T-TGGCTGA-T-C-----AA-GG-----------C--C-ACAA----T-C-AT-AAAT--AA-CG-A--C-T--A----CC-GAAG-AAAG-C-T---G-TTAAT-AG------A----T-TG--AAAAGTT-GA-C----GTTAT-T--ATA-GTGT-G-A-GGATT--AC-A----AGT---AG---AGTGT-TATA--A--------AA-----T---AT-AAAATTG--ATAGAA--G--AGGAA--G-GATT-----TT--ATTTTAG--CT-G-TTC-T-A--CC--T--ACAGG-A--TA-TGAT-AAGA--C-CGTT----G-CG----TAT-TT-AA-TT--TTTA-C-CAAAATTCAC-T--TTGG--AG--GGC-A--AA-AATGAA------A-----GTATG-GAT-T-T-C-AG-TT--GA--C-A-G-CG-AT-CG-C----GGTTTT-----T---CTGTT---GTAC-T--------GGTA-A-T--TTTTCC--TTA-T--A-TC----------ACTAAT-GA-AG-TATTT-AAT--TA-A-TAAC-A--TT-AAATCTTTCG-GAAT-TGA-CTGTG-TT-T-T--G--TGGG-GG-AG-ATT-AAAA-C--C-------G-AAACT-GAA-----TTAG-C--GC-TC-CCTA--G----CG-GT-AACAGTTA--T----TATC-G--CGGG----TCTTT---A-CCA-G--A-C-TCTC-TG-TT-C-G-T------------------CG-G-AG--AC-A-AC----CG-AG--------TGTC-T-GCG-TTG-A-ACGAGAC
gi|8 : gTCT-CGTG-C-A---AC----CAGACGC-T--C-G--CTA-TCTC--C-GTA-A---------A--T-C--------T---G-----T-------A----AA----CCGAG--AG-TCT---GG-TAAA-GATA---C--G-C-G-A----AAA--CG--TTT--GTA--A-CGT--C-AAAA-CGAGGCT-T-AC-C--------AGA-A-TC-CT--GGT-A-T-----G--T----TA-TTT-GA---T-TGGCTGA-T-C-----A--GG-----------C--C-ACAA----T-A-AA-AAAT--AA-CG-A--C-T--A----TC-GAAG-AAAG-C-T---G-C-AAT-AG------A----T-TG--AAAG--T-GA-C----GTT---T--A-A-GAGT-G-A-GGATTT-AC-A----AGT---AG---AGTGTGTTTAG-A--------AA-----T---AT-AAAAT-G--ATAGAA--G--AGGAA--A-GGAT-----TT--ATT--AG--CT-G-TTC-T-A--CC--T--ACGGG-A--TA-TGAT-AAAA--C-CGTT----G-CG----TAT-TT-AA-TT--TT-A-C-CAAAATT-AC-T--TTGG--AG--GGC-A--AA-G-TGAA------A-----GTATG-ATT-T-C-C-AG-TT--GA--C-A-G-CG-AT-CG-C----GGTTTT-----T---CTGTT---GTAC-T--------GGTA-A-T--ATTTCCG-TTAGT--A-TC----------ACTGAT-GA-AG-TA-TT-AAT--TA-ATTAAC-A--TC-AAATCTTTCG-GAAT-TCA-CTGTG-TT-T-T--G--TGGG-GG-AG-ATT-CAAA-C--C-------G-AAACT-GAA-----TTAG-C--GC-TC-CCTA--G----CG-GT-AACAGTTA--T----TATC-G--CGGG----TCTTT---A-CCA-G--A-C-TCTC-TG-TT-C-G-T--CGG-AGA-T---T-TGCG-T-AG--GC-A-AC----CG-AG--------TGTC-T-G-G-TTG-A-ACGAGAC
gi|9 : TCT-CGTG-C-A---AC----CAGACGC-T--T-GG-CTA-TCTC--C-GTA-A---------A--T-C---------------------------------------GAG--AG-TCT---GG-TAAA-GATA---C--G-C-G-A----AAA--CG--TTT--GTA--A-CAT--C-AAAA-CGAGGCT-T-AC-C--------AGA-A-TC-CT--GGT-A-T-----G--T----GA-TTT-GA---T-TGGCTGA-T-C-----A--GG-----------C--C-ACAA----T-C-GA-AAAT--AA-CG-A--C-T--A----TC-GAAG-AAAG-C-T---G-T-AAT-AG------A----T-TG--AAAG--T-GA-C----GTT---T--A-A-GTGT-G-A-GGA-TT-AC-A----AGT---AG---A--GTGTTTAG-A--------AA-----T---AT-AAAAT-G--ATAGAA--G--AGAAA--A-GGAT-----TT--ATT--AG--CT-GTTTC-T-A--CC--T--ACGGG-A--CA-TGAA-AAAA--C-CGTT----G-CG----TAT-TT-AATTT--TT-A-C-CAGAATT-AC-T--TTGG--AG--GGC-A--AA-G-TGAA------A-----GTATA-ATT-T-C-C-AG-TT--GA--C-A-G-CG-AT-CG-A----GGTTTT-----T---CTGTT---GTAT-T--------GGTA-A-T--TTTTCCT-TTAGT----TC----------ACTAAT-CA-AG-TA-TT-AAT--TA-ATTAAC-A--TC-AAATCTTTC--GAAT-TGA-CTGTG-TT-T-T--G--TGGG-GG-AG-ATT-CAAA-C--C-------G-AAACT-GAA-----TTAG-C--GC-TC-CCTA--G----CG-GT-AACAGTTAT-T----TATC-G--CGGG----TCTTT---A-CCA-G--A-C-TCTC-TG-TT-C-G-T--CAG-AGA-T---T-TGCG-T-AG--AC-A-AC----CG-TG--------TGTC-T-G-G-TTG-A-ACGAGAC
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|19 ): CATCGAAGTTCCCATACACATGTCACATGATGACCTAATATCCTGAATGGCAAGTCAATGTTACATGCTGTGGTCATCCTACAATGCTACACCTTGCAGGAAGTAATCGTTCGGCCATCTTATAAGAAGTAAGTCTCTACCTATCTATAGGAAGTAATATTCACCTATCTTTATAGCGAAGTAATAACTTCACCTATCTTATAGAAGTAATCAGTATTGTATAGGTTAAATTAACTATTGATGCGAAGTGACAGCAAGCATGAGGGAAGGGACTTGACATAGGATACATCTGCTGCTCAAACCCCCCTCCCATTCAGTA
Unaligned ( gi|21 ): AGAAACACAAGCACATCTGGAAGTTCCATGACCATCTATGTCACATGAGACATAATTTCCTGAATGGCAAGTCAATGTCTACATGCTTGGTCCACTCCTACATGCTACCATCCACTTTGCAGGAAGTAATCGTTCGCCTATCTTATAGGAAGTATTCCTTCACCTATCTTATAGGAAGTATATCCAGTATGCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGTATTGTAATAGGTTAATTAACTTTGTGCGAATGCAGC
Unaligned ( gi|22 ): TGACCATCTATGTCACATGAGACATAATTTCCTGAATGGCAAGTCAATGTCTACATGCTTGGTCCACTCCTACATGTACCATCCACCTTTGCAGGAAGTAATCGTTCGCCTATCTTATAGGAAGTACTTCCTTCACCTATCTTATAGGAAGTAATCCTAAAGTATGCAATAGGTTAATTAACTTTTGTGCGAATGCAGCATCATTAGGAGAGGGCTGACATATAGGTTCATCCTGCTGCCCAATCCCATCAGTAT
Unaligned ( gi|25 ): AGAAACACAAGCACATCTGGAAGTTCCATGACCATCTATGTCACATGAGACATAATTTCCTGAATGGCAAGTCAATGTCTACATGCTTGGTCCACTCCTACATGTTACCATCCACTTTGCAGGAAGTAATCGTTCGCCTATCTTATAGGAAGTAATCCTTCACC
Alignments
lowQualScore : 333333333333333333333333333333333333333333 22222222222222222222222 111111111 11 1 2222222222222222222222222 11111111111 1111111111 1111 1111
lowQualScore : 1 1 1 222 4444 1 6666 1 1 1 11 1 1 1 777777777777777777777777777777777777777777 222 22 3 666 1 1 666 44 2 2 6 4444 44 44 22 22 3 55 1 5 1 1 1 66666666 1 5 1 333 1 1 99999999 44444 1 1 444 1 0 1 99999999999999999999999 44 3 111111111 1 22 1 1 44 1 88 6666 3 3 1 1 999 1 3 1 555555 3333 1 22 0 44 1 33 4444 777 22 1 666 1 1 1 0 5 1 4444 2 333 333 11 5 0000000000000000000000000 2 44 77777 22 2 55555 22 666 22 2 2 2 4 55 22 55 2 33 4 44 33 2 666666 5555 2 2 7 33 4 2 4 4 4444 1 33 333 2 33 2 2 666666 55555 0 2 2 2 2 2 2 77 22 4 2 2 2 2 2 6666 55555 333 999 11111111111 2 2 66 77 22 2 3333333333 4 4 33 2 22 22 2 2 77 2 2 2 2 2 2 8 55 33 1 7777 2 2 2 33 7777777 2 2 55555 4 33 2 2 22 1111 4 2 6666666 2 22 777777 0 66666 2 22 3 1 1 2 33 1 1 11 2 3 222 1 11 11 1 33 2 1 1111 1 88888888 1 2 1 1 1 1
lowQualScore : . . . ... .... . .... . . . .. . . . .......................................... ... .. . ... . . ... .. . . . .... .. .. .. .. . .. . . . . . ........ . . . ... . . ........ ..... . . ... . . . ....................... .. . ......... . .. . . .. . .. .... . . . . ... . . . ...... .... . .. . .. . .. .... ... .. . ... . . . . . . .... . ... ... .. . ......................... . .. ..... .. . ..... .. ... .. . . . . .. .. .. . .. . .. .. . ...... .... . . . .. . . . . .... . .. ... . .. . . ...... ..... . . . . . . . .. .. . . . . . . .... ..... ... ... ........... . . .. .. .. . .......... . . .. . .. .. . . .. . . . . . . . .. .. . .... . . . .. ....... . . ..... . .. . . .. .... . . ....... . .. ...... . ..... . .. . . . . .. . . .. . . ... . .. .. . .. . . .... . ........ . . . . . .
lowQualScore : 6 5 5 444 2222 2 9999 2 2 2 77 2 2 2 111111111111111111111111111111111111111111 777 11 1 111 5 9 222 88 0 0 0 2222 11 33 55 55 6 99 7 5 7 7 7 00000000 7 0 7 000 7 7 66666666 33333 7 7 666 7 6 7 55555555555555555555555 33 6 999999999 9 66 9 9 55 9 33 0000 8 8 9 9 000 9 6 8 222222 9999 8 55 5 55 9 11 0000 999 66 9 000 9 9 9 8 7 9 0000 0 555 555 55 0 2222222222222222222222222 0 88 22222 99 1 33333 99 555 99 1 1 1 2 00 99 00 4 22 7 99 22 4 222222 0000 4 4 1 22 7 4 7 4 0000 7 44 777 5 22 4 4 444444 66666 3 1 1 1 1 0 1 11 99 2 1 2 2 2 2 9999 66666 999 222 22222222222 2 2 11 66 99 1 4444444444 2 2 44 1 33 99 1 1 11 1 2 2 2 2 2 9 66 22 8 2222 4 4 4 22 6666666 4 4 99999 7 22 2 2 88 0000 0 0 4444444 1 99 999999 1 00000 1 66 8 8 4 8 22 3 3 88 6 9 333 3 88 88 5 11 6 3 0000 3 33333333 4 8 4 4 4 4
consensus : TCT-CGTG-C-A---AC----CAGACGC-T----C-GG-CTA-TCTC--C-GTA-A-A--T-C--------TCC-G-----T-------A----A-----CCG---AG--AG-TCT---GG-TAAA-GATA---C--G-C-G-A----AAA--CG--TTT--GTA--A-CGT--C-AAAA-CGAGGCT-T-AC-C--------AGA-A-TC-CC--GGT-A-T-----G--T----GA-TTT-GA---T-TGGCTGA-T-C-----A--GG-----------C--C-ACAA----T-C-GA-AAAT--AA-CG-A--C-T--A----TC-GAAG-AAAG-C-T---G-T-AAT-AG------A----T-TG--AAAG--T-GG-C----GTT---T--A-A-GCGT-G-A-GGATTT-AC-A----AGT---AG---AGTGTGTTTAG-A--------AA-----T---AT-AAAAT-G--ATAGAA--G--AGGAA--A-GGAT-----TT--ATT--AG--CT-G-TTC-T-A--CC--T--ACGGG-A--TA-TGAT-AAAA--C-CGTT----G-CG----TAT-TT-AA-TT--TT-A-C-CAAAATT-AC-T--TTGG--AG--GGC-A--AA-G-TGAA------A-----GTACG-ATT-T-C-C-AG-TT--GA--C-A-G-CG-AT-CG-C----GGTTTT-----T---CTGTT---GTAC-T--------GGTA-A-T--TTCTCCN-TTAGT--A-TC----------ACTAAT-GA-AG-TA-TC-AAT--TA-ATTAAC-A--TC-AAATCTTTCG-GAAT-TGA-CTGTG-TT-T-T--G--TGGG-GG-AG-ATT-CAAA-C--C-------G-AAACT-GAA-----TTAG-C--GC-TC-CCTA--G----CG-GT-AACAGTTA--T----TATC-G--CGGG----TCTTT---A-CCA-G--A-C-TCTC-TG-TT--C-G-T--CGG-AGA-T---T-T--GC--GTAG--ACA-A-C----CG-AG--------TGTC-T-G-G-TTG-A-ACGAGAC
Reference ( family-1405 ) : TCT-CGTG-C-A---AC----CAGACGC-T----C-GG-CTA-TCTC--C-GTA-A-A--T-C--------TCC-G-----T-------A----A-----CCG---AG--AG-TCT---GG-TAAA-GATA---C--G-C-G-A----AAA--CG--TTT--GTA--A-CGT--C-AAAA-CGAGGCT-T-AC-C--------AGA-A-TC-CC--GGT-A-T-----G--T----GA-TTT-GA---T-TGGCTGA-T-C-----A--GG-----------C--C-ACAA----T-C-GA-AAAT--AA-CG-A--C-T--A----TC-GAAG-AAAG-C-T---G-T-AAT-AG------A----T-TG--AAAG--T-GG-C----GTT---T--A-A-GCGT-G-A-GGATTT-AC-A----AGT---AG---AGTGTGTTTAG-A--------AA-----T---AT-AAAAT-G--ATAGAA--G--AGGAA--A-GGAT-----TT--ATT--AG--CT-G-TTC-T-A--CC--T--ACGGG-A--TA-TGAT-AAAA--C-CGTT----G-CG----TAT-TT-AA-TT--TT-A-C-CAAAATT-AC-T--TTGG--AG--GGC-A--AA-G-TGAA------A-----GTACG-ATT-T-C-C-AG-TT--GA--C-A-G-CG-AT-CG-C----GGTTTT-----T---CTGTT---GTAC-T--------GGTA-A-T--TTCTCCN-TTAGT--A-TC----------ACTAAT-GA-AG-TA-TC-AAT--TA-ATTAAC-A--TC-AAATCTTTCG-GAAT-TGA-CTGTG-TT-T-T--G--TGGG-GG-AG-ATT-CAAA-C--C-------G-AAACT-GAA-----TTAG-C--GC-TC-CCTA--G----CG-GT-AACAGTTA--T----TATC-G--CGGG----TCTTT---A-CCA-G--A-C-TCTC-TG-TT--C-G-T--CGG-AGA-T---T-T--GC--GNAG--ACA-A-C----CG-AG--------TGTC-T-G-G-TTG-A-ACGAGAC
gi|1 : TCT-CGTG-C-A---ACG---CAGACGC-T----C-GG-CTA-TCTC--C-GTA----------------------------------------------CCG---AG--AG-TCT---GG-TAA--GATA---C--G-C-G-A----AAA--TGGTTTT--GTA--AACGTT-C-AAAA-CGAGGCT-T-AC-C--------AAA-A-TC-CT--GAT-A-T-----T--A----AA-TTT-GA---T-TGGCTGAAT-CGC---A--GG-----------C------AA----TGC-CA-AACT--AA-CG-A--C-T--A----TCCGAAG-AAAG-C-T---GCT-AAT-AACATGTAA----T-TG--AAAG--TCGG-C----GTT---TTTA-A-GTGT-G-A-GGATTT-AC-A----AAT---AG---AG-GTGTTTGG-GGGGGGTAGAA-----T---AT-AAA-T-A--ATAGAA--GC-AGAAA--A-GGAT-----TT--ATT--AGGCTT-G-TTC-TTA--CCGCT--ACGGT-AAGTA--GAT-AAAA--A-CGTT----GGCG----TAT-TT-AA-TT--TT-AGC-CAAAATTCAC-T--T--G--AA--GGC-A--AA-G-TAAA------A-----GTATA-ATT-T-T-CTAG-TTT-GA--GGA-G-CG-AT-CG-C----GGTTTT-----TTTCCTGTTT--GTA--T--------GTTA-A-T--TTTTTCT-TTAGT--A----------------AAT----------CT-AAT--T---TTAAC-AA-TA-AAATCTTTTG-AAAT-TGA-CTGTG-TT-T-TT-G--TGGG-G--AG-ATT-CAAAGC--C-------G-AAACT-GAA-----TTAGGC--GC-TC---TA--G----GGCGT-AACAATTA--T----TATC-G--CGGG----TCTTTTTAA-CCA-G--AGC-TCTC-TG-TT--C-G-T--CGGAAGA-T---T-TGCGC--GTAG--ACATG-C----CG-AAAT------TGTT-TGG-G-TTG-AGGCGAGA
gi|10 : TCTACGTG-C-A---ACGTACCAGACGC-T----C-GG-CCA-TCTC----GTA-A-A------------------------------------------CCG---AG--AGCTCT---GGATAAAAGATA---C--G-CCG-A----AAA--CG--TTT--GTA--A-CGT--C-AAAA-CATGACT-T-AC-C--------AGA-A-TT-CT--GGT-A-T-----G--T----GA-TTTGGA---T-TGGCTGA-T-C-----A---G-----------C--C-ACAA----T-C-GA-AAAT--AA-CG-A--C-T--A----TCGGAAG-AAAG-C-T---G-T-AAT-AG------A----T-TG--AAAG--T-GA-C----GTT---T--A-A-G-GT-G-A-GGA-TT-AC-A------T---AG---A--GTGTTTAG-A--------AA-----T---AT-AAAAT-G--ATAGAA--G--AGAAA--A-GGAT-----TC--ATT--AG--CT---TTC-T-A---C--T--ACGGG-A--CA-TGAC-----------TT----G-CG----TAT-TT-AA-TT--TTGA-C-CAAATTT-AC----TTGG--AG--GGC-A--AA-G-TGAA------ATACATGTATG-ATT-T-C-C-A--TT--GA--C-A-G-CG-AT-CG-C----GGTTTT-----T---TTGTT---GTAT-T--------GGTA-A-C--TTTTCC--TTAGT--A-TC----------ACTAA--GACAG-TA-TT-AAT--TA-AAGAACAA--TC-AAATCTTTC--GAAT-TGA--TGTG-TT-T-T--G--TGGG-G---A-ATT-CAAA-C--C-------G-AAACT-GAA-----TTAG-C--GC-TC-CCTA--GGCACCGAGT-AAAAGTTG--T----
gi|11 : gT---GG-TATA-GACA---C--A-C-G-A----TGA--CG--TTT---TA------------------------C-AC-C--------AGA-AATC-TC--GGT-A-T-----T--C----AG-TCC-CA---T-TGGTTGA-T-T---------------------C--C-ACAAACCTT-C--A-AAAC--AA-CG-A--T-T--A----CT-GAAG-AAAG-T-TC--G-C-AGT-AC------A----T-TG--AACG--C-GG-C----GTT------------GT-G-----------C-A----AGC---AG---AGTAT-TTAAA-A--------AA-----T---GT-----T-G--A--AAA--G--GGGTA--A-GTAT-----TT--ACT--TG--CT-G-CTC-T-A--CC--T--TAGGG-A--TA-T-AT-A----------T----G-TG----TAC-AC-AA-TT--TT-A-C-CAAAATG-AC-T--TTGA--AA--GGC-A--AAAG-TTAA------A-----ATACG-ATT-T-C-T-AG-CT--AA--C-A-G-CG-AT-CG-C----GGCTTTAATTTT---CTATT---GTAG-T--------GATG-A-A--TTCTCCA-TTAGT--A-TC----------ACTAAT-GA-AG-TA-TC-AAC--TA-ATAACC-A--TC-CAATCTTTCG-GAAT-TGA-CTATG-TT-TAT--A--CCGG-TG---------AAG-C--A-------G-ATGCT-AAA-----TTAG-C--AC-TC-CCTA--G----TG-GT-AATAGTTA--T----TATC-G--CAAG----TT------------G--A-C-TCTC-AG-CT--C-G-T--TTG-AGA-T---T-T--GC--GGAG--ACA-G-C----CG-AG--------CGTC-T-G-G-TTC-A-ACGAGAaacc
gi|12 : gaatctatAA--CG--TTT--GTA--A-CGT--C-AGAA-CGAGGTT-T-AC-C--------AAA-A-TT-TC--GGT-A-T-----T--TCATTAA-TTT-GA---T-TGATTCA-C-C-----A--CA-----------C--CTCCAA----T---------T--AA-CG-A--C-T--A----TC-GAAG-AAA------------AA---------------------AACG--T-TG-C----ATT---T--A-A-ACCT-A-A-GAACTT-AC-A----ATT---AG---AGTGT--TTA-------------------------AAAAT-G--TTGGAA-----AGAAA--A-TTAT-----TT--ATT--TG---T-G-TTC-T-A--CG--T--------------TG-T-AAA---------------CG----TAT-TA-AA-TT-----A-C-CAA--TT-AC-T--T-----AG--AGC-A--AA-G-TGAA------A-----GCACG-ATT-T-C---AG-CT--GA--C-A-G-CG-AT-CG-C----AGTTTT-----T---CTGTT---ACAG-T--------GGTA-A-T--TTCCCCA-TTAGT--A-TC----------ACTAAT-GA-AG-GA-TC-AAC--TA-ATTACC-A--TC-AAATCTTTCG-AAAT-TAA-CTATG-TT-TCT--G--TCGA-AG-AG-ATT-CAAA-C--C-------G-AAATC-AAA-----TTAG-C--GC-TC-CCTA--G----CG----AACAGTTA--A----TATC-G--CG------------------A-G--A-C-TTT---G-CT--C-G-T--CGA-AGA-T---T-T--GC--GGAG---CA-C-CA---CG-AG--------TGTC-T-G-G-TTT-A-ACGAGA
gi|13 : AA--CG--TTT--GTA--A-CGC--C-AGAA-CGAGGTT-T-AC-C--------AAA-T-TT-TC--GGT-A-T-----T--T----CA-TTA-GA---T-TGATTGA-TTC-----A---------------C--C-ACAC----T-T-CC-AATT--AA-CG-A--C-T--A----TC-GAAG-AAAT-T-T---G-T-AAT-AT------A----T-TG--AATG--T-TG-C----ATT---T--A-A-ACCT-A-A-GAACTT-AC------ATT---AG---AG-GTTTTT-------------------T---A--AAAAT-G--TTTGGA--A--AGAAA--A-TTAT-----TT--ATT--TG--CT-G-TTC-T-A--CC--T--Att
gi|13 : --AA-G-TGAA------A-----GCACG-ATT---C-C-AG-CT--GG--C-A-G-CG-AT-CG-C----AGTTTT-----T---CTGTT---ACATGT--------GGTA-A-T--TTCCCCCATTAGT--A-TC----------ACTAAT-GA-AG-GA-TC-AAC--TA-AT---C-A--TC-AAATCTTTCG-AAAT-TAA-CTATG-TT-TCT--G--TCGA-AG-AG-ATT-CAAA-C--C-------G-AAATC-AAA-----TTAG-C--GC-TC-CCTA--G----CG-GT-AACAGTTA--A----TATC-G--CG------------------A-G--A-C-TTT---G-CT--C-G-T--CGA-AGA-T---T-T--GC--GGAG--TCA-C-CA---CG-AG--------TGTC-T-G-G-TTT-A-ACGAGAagtgaaagcacgattccagctggcagcgatcgcagtttttctgttacatgtggtaatttcccccattagtatcactaatgaaggatcaactaatcatcaaatctttcgaaattaactatgtttctgtcgaagagattcaaaccgaaatcaaattagcgctccctagcggtaacagttaatatcgcgagactttgctcgtcgaagatttgcggagtcaccacgagtgtctggtttaacgagatt
gi|14 : aacgtttgtaacgccagaacgaggtttaccaaattttcggtatttcattagattgattgattcaccacacttccaattaacgactatcgaagaaatttgtaatatattgaatgttgcatttaaacctaagaacttacattagaggttttttaaaaatgtttggaaagaaaattatttatttgctgttctacctT-GA---T-TTGTTGA-TTC-----A---------------C--C-ACACC---T-C-CA-A--T--TA-CG-A--C-CTAA----TC-GAAG-AAA-----------------------------------AACG--T-TG-C----ATT---T--A-A-ACCT-A-A-GAACTT-AC-A----ATT---AG---AGTGT--TTA-------------------------AAAAT-G--TTGGAA--A--AGAAA--A-TTAT-----TT--ATT--TG--CT-G-TTC-T----CC--T--ACGG--A--TA-TGGT-AAAA--C-TGTT----G-TG----TAT-TA-AAGTT--TT-C-C-AAAAATT-AC-T--T-AG--AA--GGC-A--AA-G-TGAA------A-----GC-CG-ATT-T-C-C-AG-CT--GA--C-A-G-CG-AT-CG-C----AGTTTT-----T---CTGTT-----AG-T--------GGTA-A-T--TTCCCCA-TTAGT--A-TC----------ACTAAT-GA-AG-GA-TC-AAC--TA-ATTACC-A--TC-AAATCTTTCG-AAAT-TAA-CTATG-TT-TCT--G--TCGA-AG-AG-ATT-CAAA-C--C-------G-AAATC-AAA-----TTAG-C--GC-TC-CCTA--G----CG--T-AACAGTTA--A----TATC-G--CG------------------A-G--A-C-TTT---G-CT--C-G-T--CGA-AGA-T---T-T--GC--GGAG--TCA-C-CA---CG-AG--------TGTC-T-G-G-TTT-A-ACGAGAtt
gi|15 : taA--CG--TT---GTA--A-C----C-AAA---GAGTTT-A-AC-C--------AAA-T-TT-TC--GGT-A-A-----T--T----CA-ATA-GA---T-TGA-TGA-TTC-----A---------------C--C-ACAT----T-C----AATT--AA-CG-A--C-TA-A----TC-GAAG-AAAATT-T---G-T--AT-AT------A----T-TG--AATG--T-TG------ATT---T--A-A-GCCT-A-A-GAACTTAAC-A----ATT----G---A--GTGTTTAA-A----------------------AAAAT-GTTATGGGA--A--AGAAATTA-GG-------TT--ATT---G--CT---TTC-T-AT-CC--T--At
gi|15 : A------A-----GCACA-ATTGT-C-C-AG-CT--GG--C-AAG-CGGAT-CG-C----AGTTTT---------CTGTT---CCAG-T--------G-TAGA-T--TTC--CA-TTAGTTAA-TC------------TAATAGAGAG-AA-TC-AAGGATA-AT--AC-A--TC-A--TCTT-CGCAAAT-TAA-CTATG-TT-T-T--G--TGAG----AG-ATT-CAAA-CTTC-------G-AAA-T-AAA-----TTAG-CACGC-TC-CTGA--G----CG--T-AACAGTTA--A----TATG-G--C------------------------A-C-T----TG-CT--C-G-T--C-G-AGA-T---T-T--GC--GGAG--ACA-C-CCA--CG-AG--------TGT--T-G-G-TTA-A-gatgaagcacaattgtccagctggcaagcggatcgcagttttctgttccagtgtagatttccattagttaatctaatagagagaatcaaggataatacatcatcttcgcaaattaactatgttttgtgagagattcaaacttcgaaataaattagcacgctcctgagcgtaacagttaatatggcacttgctcgtcgagatttgcggagacacccacgagtgttggttaagat
gi|16 : acgttgtaaccaaagagtttaaccaaattttcggtaattcaatagattgatgattcaccacattcaattaacgactaatcgaagaaaatttgtatatattgaatgttgatttaagcctaagaacttaacaattgagtgtttaaaaaaatgttatgggaaagaaattaggttattgctttctatcctagatg---AG--GG-TCT---GG-TAAA-GACA---C--G-C-G-A----TAA--CG--TTT--GCA--A-CAT--C-AGAA-CGAGGTT-T-AC-C--------AAG-A-TT-TC--AGT------------------A-TTT-GA---T-TGGTTGA-gat
gi|16 : cnnnnnnnnnnnnnn-AG-TT--GA--C-A-G-CG-AT-CG-C----GGTGTT-----T---CTGTT---GTAC-T--------GGTA-C-T--TTCTCCA-TTTGT--A-TT----------CTTAAT-GA-AA-TA-TC-AAC--TA-ATTAAC-A--TC-AAAcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagttgacagcgatcgcggtgtttctgttgtactggtactttctccatttgtattcttaatgaaatatcaactaattaacatcaaa
gi|17 : cnnnnnnnnnnnnnnagggtctggtaaagacacgcgataacgtttgcaacatcagaacgaggtttaccaagatttcagtatttgattggttgacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnACGC-T----CCGG-CTA-TCTC--T-CCA-T-C--C-C--------TCC-G-----TTT-----A----ATTTTTCAG---AG--AG-TCTT--GG-TAAG-GATA---CCAG-C-A-ACTTTGAA--CG--TTTTTGTAGGA-CG---C-TAAA-CGAGGCT-TGAC-CTAGCGCGAAAA-A-TCATT--GGT-A-TAGGTTG--C----AG-TTT-GACTCT-TGGATGA-T-C-----A--GG-----------A--C--CAA----TCC-AA-AAATAAAA-CGAA--CGT--AAGTTTC-GAAG---AG-T-TATAG-T-ATT-AG------A----T-TGAAAAAA--T-GA-CAGTTGTT---T--A-GTGGGT-G-ATGGAGAT-AT-ATCGTACT---GGATCAGTGT-CTTAG-ATAT-----AATTTATT---AT-ATTAT-G--TTGGAA--GA-AGGAA--A-GGATGATACTTTAATT--AG---T-G-TTT-TAA--CC--TTAAAGGG-A--TA-TGAT-TAAAGGC-CGTTGCTGG-CG----TATGTT-AA-TTTATT-A-C-CAAAATT-
gi|18 : -A---AC----CAGACGC-T----T-GG-CTG-TCTC--C-ATA-G-A--T-T--------TCC-GACGAGT-------A------------G---AG--AG-TCT---GG-TAA----------------------------CG--TTT--GTA--A-AGT--C-AGAA-CGATGCT-T-GC-C--------AAA-T-TA-CT--GCTCA-T-----GACT----GA-TCT-GA---T-TGATTGA-T-T-----GATGGATTGATTAATTCAAC-ACACC---T-C-CC-AAAT--AA-CA-AG-C-T--T----TC-GAAG-AAAT-T-T---G-T-AAT-AG------A----T-TG--AATG--C-GC-C----GTT---T--A-A-GCTT-A-A-GGATTT-AC-A----ACT---AA---AGTGT-TTC-------------A-----T--------AAT-G--TTGCAA--A--AAGAA--A-GGAT-----TT--A-C--A----T-G-----T-A--TT--T--ACAAG-A--TA-TGGC--AAA--C-CATT----C-TG----TAT-TC-AA--G--TT-A-C-CAAGATT-AC-T--TGAG--AG--GGA-A--GA-G-TAAA------A-----TTACA-ATT-T-T-C-ct
gi|2 : ---AC----CAGACGC-T----C-G--CTA-TCTC--C-GTA-A-AA-T-C--------TCC-G-----TG------A----A-----TCG---AG--AG-TCT---GG-TAAA-GATA---C--GGC-A-A----AAAAACG--TTT--GTA--AACGT--C-AAAA-CGAGGCTCT-AC-C--------AGA-AATC-CT--GGT-A-T-----G--T----GAATTT-GAA--T-TGGCTGA-T-C-----A--GG-----------C--C-ACAA----T-CCGA-AAAT--AA--G-AAAC-T--A----AC-GAAG-AC-G-C-T---G-CGAAT-AG------A----TCTG--AAAG--T-GAAC----GTT---A--A-AAGTGTTG-A-GGATTTTAC-A----AGT---AG---AAAGTGTTTAG-A--------AA-----T---AT-AAAAT-G--ATAGAA--G--AGGAA--A-GGAT-----TT--ATTA-AG--TT-G-TTCTT-A--CC--TA-ACGGG-A--TA-AGATCACAA--C-CGTT----G-CG----TAT-TTCAA-TT--TT-A-CGCAAAATT-AC----TTGG--AG--TGC----AA-G-TGAA------A-----GTATG-ATT-TCC-C-AGTTT--GA--C-A-G-CG-AT-CG-C----GGTTTT-----T---CTGTTGTAGTAC-T--------GGTA-A-A--TTTTCCT-TTAGT--A--C----------ACTAAT-GA-TG-TA-TT-AAT--TA-ATTAAA-A--TCAAAATCTTTTG-GAAT-TGA-CTGTG-TT-T-T--G--T--G-GG-AG-ATT-CAAA-C--C-------G--AACT-GAA-----TTAG-C--GC-T--CCTA--GC---CG-GTCAACAGTTATCT----TATCTG--CGGG----TCTTT---A-CCA-AGCA-C-TCTC-TGTTT--C-G-T--CGG-AGA-T---TCT--GC--GTAG--ACA-AGC----CG-AG--------TGTC-TGG-G-TTG-A-
gi|20 : -AAT-TG------A----T-TG--AATG--T-GG-T----ATT---T--A-A-GCTT-A-A-AGATTT-AC-A----ACT---AG---AGTGT--TTA-------------------------AAAAT-G--TTGGAA--A--AGGAA--A-GGAT-----TT--ATT--TG--CT-G-TTC-T-A--CC--T--ACAGG-A--TA-AGGT-AAAA--C-AGTT----T-TG----TTT-CA-AA-TT--TT-A-C-CAAGATT-AC-C--TTGG--GA--GGCAA--AA-G-TGAA------A-----GAACG-AAT-T-C-C-AG-CT--GA--C-A-G-CA-AT-CG-C----AGTTTT-----T---CTGTT---GTGG-T--------GGTG-A-T--TTCCACA-TTCGT--A-TCAGTGGTGATTACTAAT-GA-AG-GA-TC-AGT--TA-ACTACC-G--TT-AACTCTTTCA-GTAT-TGA-CTGCG-TT-T-aacga
gi|23 : TCT-CGTG-C-A---AC----CAGACGC-T----C-GG-CTA--CTC--C-ATA-A-A--T-C--------TCC-G-----TA------A----A-----CCG---AA--AG-TCT---GG-TAAA-GATA---C--G-C-A-A----AAA--CG--TTT--GTA--A-CGT--C-AAAA-CGAGGCT-T-AC-C--------ATA-A-TC-CT--GGT-A-T-----T--T----AA-TTT-GA---T-TGACTGA-T-----------------------C--C-ACAC----T-C-CA-AAAT--AA-CG-A--C-T--A----TC-GAAG-AAAG-C-T---G-T-GAT-AG------A----T-TG--AAAG--T-GG-C----GTT---T--A-A-TTGT-G-A-GGATTT-AC-A----ACT---AT---A--GTGTTTAG-A--------AA-----T---AT-AAAAT-A--ATAGAA--G--A
gi|24 : gTG-C-A---AC----CAGACGC-T----C-TG-CTA-TCTG--C-GTA-A-A--T----------TCC-G-----T-------A----A-----CGG---AG--AG-TCT---GT-TAAA-AATA---C--G-C-GAA----AAA--CG--TTT--GTT--A-CGT--C-AAAA-CGA-GCT-T-AC-C--------AAA-A-GC-C------------------T----GA------------TGGCTGA-T-----------------------C--C-ACAA----T-C-CAGAAAT--AA-CG-A--C-T--A----TC-GAAGTAAAG-C-------T-AAT-AA-------------TG--AAAG--T-G-------------C--A-A--------A-GGATTT-AC-A----AGT---AG---A--GTGTTTAA-A--------AA-----T---A----------------------AGGAA--A-GGAT-----TT--ATT--
gi|26 : tttcCT-TGTT-C-A---AC----CAAACAC-T----C-AG-CTG-TCTC--C-ACA-A-A--T-C--------TTC-GAC---G-------A----G-----CAG---AG--AG-TAC---GA-TAAA-AATT---C--A-A-G-A----TAA--CA--TTT--GTA--A-CAT--C-AGAA-CGAGGCT-T-AC-T--------AAA-A-TT-TC--ATT-A-T-----T--T----AA-TTT-GG---T-TGt
gi|27 : ---GG-TATA-GACA---C--A-C-G-A----TGA--CG--TTT---TA------------------------C-AC-C--------AGA-AATC-TC--GGT-A-T-----T--C----AG-TCC-CA---T-TGGTTGA-T-T---------------------C--C-ACAAACCTT-C--A-AAAC--AA-CG-A--T-T--A----CT-GAAG-AAAG-T-TC--G-C-AGT-AC------A----T-TG--AACG--C-GG-C----GTTGTGC--A-A-GCA--G-A-GTATTT-AA-A----Atttcaatacacctccaaa
gi|28 : -CGTG-C-A---AC----CAGACGC-TT---C-GG-CTA-TCTC--CCGTA-ATA--TTC--------TCC-G-----T-------A----AA----CCG---AG--AG-TCT---GG-TAAA-GATAATTC--G-C-GAA----AAA--CG--TTT--GTA--A-CGT--CGAAAA-CGAGGTT-T-AC-T--------CGA-A-TC-CC---GT-A-T-----a
gi|29 : gtctagAGT--A-TC------------TAAT-GT-AG-AT-TC-AAC--TA-ATTACC-A-------AT-----G-G----TGA-TTATG-AT-T-T--G--T--------------CAGA--------------AAGTT-AAA-----TTAG-C--GC-TC-CCTA--G----CG-GT-ACCAGTT---------------------------TT---A-CCA-G--A-C-TCT-----------------GA-AGA-T---T-T--GC--GGAG--ACA-G-T----CG-AA--------CATC-C-G-G-TTG-A-ACcccagggtttggaat
gi|3 : --C-AAAATCGAGGCT-T----C--------AGA-A-TC-TCCTGGT-A-T-----G--T----A---TT-GA---T-TGGCTGA-T-CCAGACA--GG-----------C--C-ACAA----T-C-GT-TAGT--AAACG-A--C-TG-A----TC-GAAGGAAAG-CAT---G-C-AAT-GG------AGTTCT-TG--AAAGG-T-GA-C----GTTA--T--A-A-AGGT-G-G-CGATTTTACTA----AGTTATAG---AGATTTTGTAG-A--------AA-----TTTGAT-AAA-T-GT-ATAGAA--GGAAGGAA--ATAGAT---------ATT--AG--CTAG-TTC-T-AACCT--T--ACGGA-A--TA-TGAT-AAGA--CGCGTT----G-CGATTATAT-TT-AA-TT--TT-A-CTCAAAATT-AC-TATTTGGTGAGACGGC-ACAAA-G-GGAATCGTAAA-----GTGAG-TGT-C-C-C-AG-TTT-GAATC-A-GGTG-ATTCG-CTGACAGTTTT-----T---CTCGT---GTAT-TTGCTCTGTGGTA-AATGATTCCCCT-TTAGT--A-TCC---------ATTAATTGA-AG-TA-TTTAAT--TA-ATTAAC-AA-TC-AAATCTATCG-GAAT-TCA-CTGTG-TTCT-T--GTTTGGG-GATAG-CTG-CAAA-C--TCGAGTGAG-AAACT-GAAATCTGCTGG-C--G-----CCTATTGCT--CG-GT-AG-AGTTA--TTGTATACC-GATCTGGAGCTTCTTT---A-CCA-G--AGCGTCTCTTGTTT--C-G-TTCCGGCATA-T---C-T--GC--GTAGTTACATA-C----CG-A---------TGAC-T-G-G-TTG-A-ACGAGACa
gi|30 : G-ATTACATA-C--C-------G-TA-CT-CTA-----TCAG-C--GC-TC-CCTA--G----CG-GT-AACAGTTA--T----TATC-G--AGCA----TCTTT---A-CTA-G--A-C-TCTC-TG-CT--C-G-T--AAG-AAA-----T-T--GC--GGAG--ACA-G-C----TG-AG--------TGTC-T-A-G-TTG-A-ACAAGAC
gi|31 : CTA--G----CG-GT-AACATTCA--T----TATC-G--CGAA----TCTTT---A-CCA-G--A-C-TCTC-TT-CT--C-G-T--GGT-AAA-T---T-T--GA--GAAG--GCA-G-C----CG-AG--------CGTC-T-G-G-TTG-A-ACGAGAC
gi|32 : aaattccaaataatccatCTA--GA---CG-CT-GACGGCTA--T----CTCC-G--TAAA----TCTCT---G-TAA-A--A-C-T-----G-TT--C-G-T--CGG-AGA-T---T-T--GCGTGTAG--ACA-A-C----CG-AGTAGTGTTATGTC-T-G-G-TTC-A-ACGAGACt
gi|33 : cgtgcaaTCT-CGTG-C-A---AC----CAGACGC-T----C-GG-CTA-TCTC--C-GTG-A-A--T-C--------TCC-G-----T-------A----A-----
gi|33 : gCT-CGTT-C-A---AC----CAGACAC-TTGCAT-GG-TTG-TCTA--C-GCA-A-A--T-C--------GCC---------------A----A------CGAACAG--AG-TTTAC-GG----A-GATT---C--A-C-G-G----AGA--actctgttcgttggcgatttgcgtagacaaccatgcaagtgtctggttgaacgag
gi|33 : gtctcgtgcaaccagacgctcggctaCTC-TG-TT--C-G-T--TGG-CGA-T---T-T--GC--GTAG--ACA-A-CCATGCA-AG--------TGTC-T-G-G-TTG-A-ACGAG
gi|34 : gtctcgtgcaaccagacgctcggctatctccgtgaatctccgtaaaCT-CGTG-C-A---AC----CAGACGC-T----C-GG-CTA-TCTC--C-GTA-A-A--T-C--------TCC-G-----T-------A----A-----
gi|34 : C-TG-TT--C-G-T--TGG-AGA-TAATT-C--GC--GTAG--ACA-A-C----CG-TG--------TTTC-T-G-G-TTG-A-ACGAGACactgttcgttggagataattcgcgtagacaaccgtgtttctggttgaacgagact
gi|35 : ctcgtgcaaccagacgctcggctatctccgtaaatctccgtaaaC-TC-CCTA--G----CG-GT-AACAGTTA--T----TATC-G--CGGG----TCTTT---A-CCA-G--A-C-TCTC-TG-TT--C-G-T--CGG-AGA-T---T-T--GC--GTAG--ACA-A-C----TG-AG--------TGCC-T-G-G-TTG-A-ACGAGACt
gi|36 : TCT-CGTG-C-ATGAGC----CAGACGC-T----C-GGCCTA-TCTC--T-ATA-A-A--C---------------------------------------CCA---AG--AGATCTGGGGG-TAAA-GATATC-C--G-C-GAA----AAA--CAT-TTT--GTA--A-CGT--C-t
gi|37 : gTCT-CGTG-C-A---AC----CAGACGC-T----C-GG-CTA-TATC--C-GTA-A-A--C-C--------T
gi|37 : C-TG-TT--C-G-T--CGG-AGA-A---T-T--GC--GTAG--ACA-A-C----CA-AG--------TGTC-T-G-G-TTG-A-ACgttcgtcggagaattgcgtagacaaccaagtgtctggttgaac
gi|38 : tctcgtgcaaccagacgctcggctatatccgtaaacG-ATT-T-C-C-AG-TT--GA--C-A-G-CA-AT-CG-C----GGT-----------------------------------------T--TTCTCCC-TTAGT--A-TC----------AC---------------------------TAAC-A--TT-AAATTGTTCG-AAAT-TGA-CTGT--CT-T-T--G--TG
gi|39 : C-C--------AAG-A-TT-TC--GGT-A-T-----T--T----GA-TTT-GA---T-TGGTTGA-T-C-----A--------------------AAAA----T-C-CA-AAAT--AA-CG-A--C-T--A----TC-GAAG-AAAG-C-T---G-T-AAT-GG------A----T-TG--A
gi|4 : T-CGTGGC-A---AC----CAGACGC-T----C-G--CTAATCTC--C-GTA-A-A--C-T--------TCCCG-----T-------A----AT----CCG---AAGAAG-TCT---GG-TAAA-GATA---C--G-C---A----AAA--CG--TT---GTA--A-CGT--C-AAAA-CGAGGCT-T-AC-C--------AGATA-TC-CT--GGT-AAT-----G--T----GA-TTT-GA---T-TGGCTGA-T-C-----A--GG-----------C--C-ACAA----T-C-GA-AAAT--AA-CG-A--C-TT-A----TC-GAAG-AAAG-C-T---G-C-AAT-AG------A----T-TG--AAAG--T-GA-C----GTT---A--A-A-GTGT-GAA-GGATTT-AC-A----AGT---AG---AGTGT-TTTAGAA--------AA-----T---AT-AAAAT----ATAGAA--G--AGGAA--T-GATT-----TT--ATT--AG--CT-G-TTC-T-C--CC--T--ACGGG-A--TA-AGAT-ACAA--C-CGTT----G-CG----TAT-TT-AATTT--TT-A-C-C-AAATT-AC-T--TTGG--A---TGC-A--AA-G-TGAA------A-----GTATG-ATT-T-CTC-AG-TTTGAA--C-A-C-GG-AT-CGCC----GGTTTT-----T---CTGTT---GTAC-T--------GGTA-A-A--TTTTCCT-TTAGT--ACCC----------ACTAAT-GA-AGTTA-TA-AGT--TA-ATTAAA-A--TA-AAATCTTTTG-GAAT-TGATCTGTGTTT-T-T--G--TGGGAGG-AG-ATT-CAAA-C--C-------GAAAACT-GAA-----TTAG-C--GC-TCACCT---G----CG-GT-AACAGTTA--T----TATC-G--C-GG----TCTTT---AGCCA-G--A-C-TCTC-TG-TT--C-G-T--CGG-AGA-T---T-T--GC--GTAG--ACA-A-C----CG-AG--------TGTCGT-G-G-TTGAA-ACGAGAC
gi|40 : TCT-CGTG-C-A---AC----CAGACGC-TC---C-GG-CTA-TCTC--C-GTA-A-A--C-CGTCGGAGATTT-G-----TGTTGAGCA----A-----CCG---AG--TG-TCT---GG-T
gi|41 : T-CGTG-C-A---AC----CAGACGCCT----C-GG-CTA-TCTC--C-GTA-A-ACGT-CGGAGA---TTT-G-----TGTTGAC-A----A-----CCG---AG--TG-TCT---GG-Ttgaacg
gi|41 : -TCTC-CG-TAAAC-G-T--CGG-AGA-T---T-T--GT--GTTG--ACA-A-C----CG-AG--------TGTC-T-G-G-TTG-A-tgaa
gi|42 : tcgtgcaaccagacgcctcggcta-TG-TTG-C-A-T--CGG-AGA-T---T-T--GC--GTAG--ACA-A-CG---CG-AAT-------TGTC-T-G-GTTTG-A-ACGAAAC
gi|43 : gcgtaatttccgtaaacgt-CGTG-CCA---AC----CAGACGC-TTT--C-GG-CTA-TCTCTCC-GTG-A-A--T-C--------TCC-G-----TA------A----A-----CCG----G--AG-TTT---t
gi|44 : --A-C-T-TC-TG-AT--G-G-G--TGG-AAA-T---T-T--AC--GGAG--ATA-G-C----CA-AG--------TGTC-T-G-G-TTG-C-ATGAGACatgttcgtcagaga
gi|44 : aTCT-CATG-C-A---AC----CAGACAC-T----T-GG-CTA-TCTC--C-GTA-A-A--T-T--------TCC-attctctgttcgtcg
gi|45 : ag---AC----CAGACGC-T----C-GG-CTA-TCTC--C-GTA-A-A--T-C--------TCC-G-----acccatcagaagtattctctgttcgtcg
gi|45 : ccC-TG-TT--C-G-T--CAG-AGA-T---T-T--GC--ATAG--ACA-A-C----Cacctgttcgtcagagatttgcatagacaacca
gi|46 : ccaccagacgctcggctatctccgtaaatctccgacT--C-G-T--CAA-AGA-T---T-T--GC--GGAA--ACA-G-C----CG-GG--------TGTC-T-G-G-TTG-A-AAGAGACa
gi|47 : aatctccgacaagcaatgTCT-CGTG---A---AC----CAGACGC-T----C-GG-CTA-TCTC--C-GTA-A-A--T-C--------GAC-G-------------A----G-----CAG---AG--AG-TAG---GG-TAA
gi|48 : A-TCTC--C-GTA-A-A--C-CGAGATT--TGC-G-----T-------AGACAA-----CCG---AG--TG-TCT---GG-TAt
gi|48 : taaG-AGA-T---T-T--GC--GTAG--ACA-A-C----CG-AG--------TGTC-T-G-G-TAT-A-ACGAGACtaacgagac
gi|49 : taaatctccgtaaaccCT-C-AC-C--------AAA-A-TT-TT--GGT-A-T-----T--T----AA-TTT-GA---T-CAGTTGA-T-T-----A--AA-----------CA-C-AC
gi|5 : gcT-CGTG-C-A---AC-----AGACGC-T----C-GG-CTA-TCTC--C-GTA-A-A--T-C--------TCC-G-----T-------A----AAA---CCG---AG--AG-TCT---GG-TAAA-GATA---C--G-C-G-A----AAA--CG--TTT--GTA--A-CGTC-C-AAAA-CGAGGCT-T-AC-A--------AGA-A-T--CT--GGT-A-T-----G--T----GA-TTT-GA---T-TGGCTGA-T-C-----A--GG--------------C-ACAA----T-C-GA-AAAT--AA-CG-A--C-T--AT---TC-GAAG-AAAG-C-T---G-T-AATAAG------A----T-TG--AAAG--T-GA-C----GTT---T--A-A-GTGT-G-A-GGATTT-AC-A----AGG---AG---A--GTGTTTAG-C--------AA-----T---ATAAAAAT-G--ATAGAA--G--AGGAA--A-GGA------TT--ATT--AG--CT-G-TTC-T-A--CC--T--ACGGGAA--TA-TGAT--AAA--C-CGTT----G-CG----TAT-TT-AA-TT--TT-A-C-CAAAATT-CC-T--TTGG--A---GGC-A--AA-G-TG--------A-----GTATGCATT-T-C-C-AG-TT--GA--CAA-G-CG-AT-CG-CA---GGTTTT-----T---CTGTTCA-AAAC-C--------GGTA-A-TTCTTCTCTT-TAAGT----TCA---------ACTAAT-G--AG-TA-TT-GAT--TACATTAAC-AATTC-AAAACTTCAG-GAAT-TCA-CTGTG-TT-T-TGGG--TGGG-TA-AGAATT-CAAA-C--C-------G-AAACT-GAA-----TT-G-C--GCTTC-CCTA--G----CG-GT-AACAGTTA--T----TATC-G--CGGG----TCTTTA--A-CCA-G--A-C-TCTC-TG-TT--C-GAT--CGG-AGATT---T-T--GC--GTAG--ACA-A-C----TGAAG--------TGTC-T-G-G-TTG-A-ACGctccaaa
gi|50 : TT--TG--CT-G-TTC-T-A--CG--T--ACGGG-A--AACTG---------C-CGTT----T-TG----TAC-CA-AA-TT--TT-A-C-CAAAATT-
gi|51 : gC----CAGACGC-T----C-GG-CTA-TCTC--C-GTA-A-A--------------CC-G-----T-------T----A-----CTG---AG--TG-CCT---GG-T
gi|52 : TCT-CGTG-C-A---AC----CAGACGC-T----C-GG-CTA-TCTC--C-GTA-A-A--T-C--------GAC-G-------------A----G-----CAG---AG--AG-Ttgaacgagact
gi|53 : CGC-T----C-GG-CTA-TCTC--C-GTGTA-C--T-CAG------TTC-G-----T------------------CGG---AG--AT-TTT---CG-TAAA-g
gi|53 : CTC-AG-TT--C-G-T--CGG-AGA-T---T-T--TC--GTAA--ACA-A-C----CG-caaccg
gi|54 : cgctcggctatctccgtgtaTCT-CGTG-C-A---AC----CAGATGC-T----C-GG-CTA-TCTC--C-GTA-A-A--T-C--------TCC-GAC---T-------A----A-----C
gi|55 : C-TG-TT--CCG-T--CGG-AGATT---T-T--TC--GTAGA-ACA-A-CT---TG-AG--------TGT--T-G-G-TTG-C-ACGaaag
gi|56 : --A-C-TCTC-TA-CT--C-G-T--CGA-AGA-T---T-A--AC--AGAG--ATA-G-T----CA-AG--------CGTC-T-G-G-TTg
gi|57 : -AC-T--TTGG--AG--GGC-A--AA-G-TGAA------A-----GTATA-ATT-T-C-C-AG-TT--GA--C-A-
gi|58 : TCT-CGTG-C-A---AC----CAGACGC-T----C-GG-CTA-TCTC--C-GTA-A-A--
gi|59 : agTCT-CGTG-C-A---AC----CAGACGC-T----C-GG-CTA-
gi|6 : ctagCT-CGTG-C-A----C----CAGACGC-T----C-GC-TTG-TCTC--C-GTA-A-A--T-C--------TCC-G-----T-------A----AA----CCG---AG--AG-TCT---GG-TAAA-GATA---CT-G-C-G-A----AAAA-CG--TGT--GTA--A-CGT--C-AAAAACGAGGCT---ACAC--------AGA-A-TC-CT--GGT-A-T-----G--T----GA-TTT-GA---TCTGGATGA-T-C-----A--GG-----------C--CCACAA----T-C-GA-AAAT--AA-CG-A--C-T--A----TC-GAAG-AAAG-C-TT--G-T-AAT-AG------A----T-TA--AAAG--T-GA-C----GTT---T--A-A-GTGT-G-A-GGATTT-AC-A----AGT---AC---AGTGT-TATAG-A--------AA-----T---AT-AAAAT-G--ATAGTATCG--AGGAA--A-GGAT-----GC--ATT--AG--CT-G-TTT-T-A--CC--T--ACGGG-A--CATTGAT-AAAA--C-CGTT------CG----TAT-TT-AA--T--TT-A-C-CAAAATT-ACTT--TTGG--AG--GGC-A--AA-G-TGAA------A-----GTATG-ATT-T-C-C-AG-TT--GA--C-A-G-TG-AT-CG------GGTTTT-----T---CTGTT---GTAT-TA-------GGTA-A-C--TTTTCCT-TTAAT--A-TC----------ACTAAT-GA-AG-TA-TT-AAT--TA-ATTAAC-A--TC-AAATCTTTCG-GAATCTGA-C--TG-TT-T-T--G--TGGG-GG-AG-ATT-CAAA-C--C-------G-AAACTGGAA-----TCAGCC--AC-TC-CCTA--G----CG-GT-AACAGTTA--T----TATC-G--CGGG----T-TTT---A-CCAGG--A----CTC-TG-TT--C-G-T--CGG-AGATT---T-T--GC--GTAG--ACA-A-A----CG-AG---------GTC-T-G-G-TTG-A-ACGAGA
gi|7 : TCT-CGTG-C-A---AC----CAGACCC---------G-CTA-TCTC--C-GTA-A-AATT-C--------TCC-G-----T-------A----AA----CCG---AG--AG-TCT---GG-TAAA-GATA---C--G-C-G-A----AAA--CG--TTT--GAA--A-CGTGTC-AAAAACGAGGCT-T-AC-C--------AGA-A-TC-CT--GGT-A-T-----G--T----GA-TTT-GA---T-TGGCTGA-T-C-----AA-GG-----------C--C-ACAA----T-C-AT-AAAT--AA-CG-A--C-T--A----CC-GAAG-AAAG-C-T---G-TTAAT-AG------A----T-TG--AAAAGTT-GA-C----GTTAT-T--ATA-GTGT-G-A-GGATT--AC-A----AGT---AG---AGTGT-TATA--A--------AA-----T---AT-AAAATTG--ATAGAA--G--AGGAA--G-GATT-----TT--ATTTTAG--CT-G-TTC-T-A--CC--T--ACAGG-A--TA-TGAT-AAGA--C-CGTT----G-CG----TAT-TT-AA-TT--TTTA-C-CAAAATTCAC-T--TTGG--AG--GGC-A--AA-AATGAA------A-----GTATG-GAT-T-T-C-AG-TT--GA--C-A-G-CG-AT-CG-C----GGTTTT-----T---CTGTT---GTAC-T--------GGTA-A-T--TTTTCC--TTA-T--A-TC----------ACTAAT-GA-AG-TATTT-AAT--TA-A-TAAC-A--TT-AAATCTTTCG-GAAT-TGA-CTGTG-TT-T-T--G--TGGG-GG-AG-ATT-AAAA-C--C-------G-AAACT-GAA-----TTAG-C--GC-TC-CCTA--G----CG-GT-AACAGTTA--T----TATC-G--CGGG----TCTTT---A-CCA-G--A-C-TCTC-TG-TT--C-G-T--CGG--------------------AG--ACA-A-C----CG-AG--------TGTC-T-GCG-TTG-A-ACGAGAC
gi|8 : gTCT-CGTG-C-A---AC----CAGACGC-T----C-G--CTA-TCTC--C-GTA-A-A--T-C--------T---G-----T-------A----AA----CCG---AG--AG-TCT---GG-TAAA-GATA---C--G-C-G-A----AAA--CG--TTT--GTA--A-CGT--C-AAAA-CGAGGCT-T-AC-C--------AGA-A-TC-CT--GGT-A-T-----G--T----TA-TTT-GA---T-TGGCTGA-T-C-----A--GG-----------C--C-ACAA----T-A-AA-AAAT--AA-CG-A--C-T--A----TC-GAAG-AAAG-C-T---G-C-AAT-AG------A----T-TG--AAAG--T-GA-C----GTT---T--A-A-GAGT-G-A-GGATTT-AC-A----AGT---AG---AGTGTGTTTAG-A--------AA-----T---AT-AAAAT-G--ATAGAA--G--AGGAA--A-GGAT-----TT--ATT--AG--CT-G-TTC-T-A--CC--T--ACGGG-A--TA-TGAT-AAAA--C-CGTT----G-CG----TAT-TT-AA-TT--TT-A-C-CAAAATT-AC-T--TTGG--AG--GGC-A--AA-G-TGAA------A-----GTATG-ATT-T-C-C-AG-TT--GA--C-A-G-CG-AT-CG-C----GGTTTT-----T---CTGTT---GTAC-T--------GGTA-A-T--ATTTCCG-TTAGT--A-TC----------ACTGAT-GA-AG-TA-TT-AAT--TA-ATTAAC-A--TC-AAATCTTTCG-GAAT-TCA-CTGTG-TT-T-T--G--TGGG-GG-AG-ATT-CAAA-C--C-------G-AAACT-GAA-----TTAG-C--GC-TC-CCTA--G----CG-GT-AACAGTTA--T----TATC-G--CGGG----TCTTT---A-CCA-G--A-C-TCTC-TG-TT--C-G-T--CGG-AGA-T---T-T--GC--GTAG--GCA-A-C----CG-AG--------TGTC-T-G-G-TTG-A-ACGAGAC
gi|9 : TCT-CGTG-C-A---AC----CAGACGC-T----T-GG-CTA-TCTC--C-GTA-A-A--T-C---------------------------------------G---AG--AG-TCT---GG-TAAA-GATA---C--G-C-G-A----AAA--CG--TTT--GTA--A-CAT--C-AAAA-CGAGGCT-T-AC-C--------AGA-A-TC-CT--GGT-A-T-----G--T----GA-TTT-GA---T-TGGCTGA-T-C-----A--GG-----------C--C-ACAA----T-C-GA-AAAT--AA-CG-A--C-T--A----TC-GAAG-AAAG-C-T---G-T-AAT-AG------A----T-TG--AAAG--T-GA-C----GTT---T--A-A-GTGT-G-A-GGA-TT-AC-A----AGT---AG---A--GTGTTTAG-A--------AA-----T---AT-AAAAT-G--ATAGAA--G--AGAAA--A-GGAT-----TT--ATT--AG--CT-GTTTC-T-A--CC--T--ACGGG-A--CA-TGAA-AAAA--C-CGTT----G-CG----TAT-TT-AATTT--TT-A-C-CAGAATT-AC-T--TTGG--AG--GGC-A--AA-G-TGAA------A-----GTATA-ATT-T-C-C-AG-TT--GA--C-A-G-CG-AT-CG-A----GGTTTT-----T---CTGTT---GTAT-T--------GGTA-A-T--TTTTCCT-TTAGT----TC----------ACTAAT-CA-AG-TA-TT-AAT--TA-ATTAAC-A--TC-AAATCTTTC--GAAT-TGA-CTGTG-TT-T-T--G--TGGG-GG-AG-ATT-CAAA-C--C-------G-AAACT-GAA-----TTAG-C--GC-TC-CCTA--G----CG-GT-AACAGTTAT-T----TATC-G--CGGG----TCTTT---A-CCA-G--A-C-TCTC-TG-TT--C-G-T--CAG-AGA-T---T-T--GC--GTAG--ACA-A-C----CG-TG--------TGTC-T-G-G-TTG-A-ACGAGAC
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|19 ): CATCGAAGTTCCCATACACATGTCACATGATGACCTAATATCCTGAATGGCAAGTCAATGTTACATGCTGTGGTCATCCTACAATGCTACACCTTGCAGGAAGTAATCGTTCGGCCATCTTATAAGAAGTAAGTCTCTACCTATCTATAGGAAGTAATATTCACCTATCTTTATAGCGAAGTAATAACTTCACCTATCTTATAGAAGTAATCAGTATTGTATAGGTTAAATTAACTATTGATGCGAAGTGACAGCAAGCATGAGGGAAGGGACTTGACATAGGATACATCTGCTGCTCAAACCCCCCTCCCATTCAGTA
Unaligned ( gi|21 ): AGAAACACAAGCACATCTGGAAGTTCCATGACCATCTATGTCACATGAGACATAATTTCCTGAATGGCAAGTCAATGTCTACATGCTTGGTCCACTCCTACATGCTACCATCCACTTTGCAGGAAGTAATCGTTCGCCTATCTTATAGGAAGTATTCCTTCACCTATCTTATAGGAAGTATATCCAGTATGCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGTATTGTAATAGGTTAATTAACTTTGTGCGAATGCAGC
Unaligned ( gi|22 ): TGACCATCTATGTCACATGAGACATAATTTCCTGAATGGCAAGTCAATGTCTACATGCTTGGTCCACTCCTACATGTACCATCCACCTTTGCAGGAAGTAATCGTTCGCCTATCTTATAGGAAGTACTTCCTTCACCTATCTTATAGGAAGTAATCCTAAAGTATGCAATAGGTTAATTAACTTTTGTGCGAATGCAGCATCATTAGGAGAGGGCTGACATATAGGTTCATCCTGCTGCCCAATCCCATCAGTAT
Unaligned ( gi|25 ): AGAAACACAAGCACATCTGGAAGTTCCATGACCATCTATGTCACATGAGACATAATTTCCTGAATGGCAAGTCAATGTCTACATGCTTGGTCCACTCCTACATGTTACCATCCACTTTGCAGGAAGTAATCGTTCGCCTATCTTATAGGAAGTAATCCTTCACC
Alignments
lowQualScore : 333333333333333333333333333333333333333333 22222222222222222222222 111111111 11 1 2222222222222222222222222 11111111111 1111111111 1111 1111
lowQualScore : 1 1 1 222 4444 1 6666 1 1 1 11 1 1 1 777777777777777777777777777777777777777777 222 22 3 666 1 1 666 44 2 2 6 4444 44 44 22 22 3 55 1 5 1 1 1 66666666 1 5 1 333 1 1 99999999 44444 1 1 444 1 0 1 99999999999999999999999 44 3 111111111 1 22 1 1 44 1 88 6666 3 3 1 1 999 1 3 1 555555 3333 1 22 0 44 1 33 4444 777 22 1 666 1 1 1 0 5 1 4444 2 333 333 11 5 0000000000000000000000000 2 44 77777 22 2 55555 22 666 22 2 2 2 4 55 22 55 2 33 4 44 33 2 666666 5555 2 2 7 33 4 2 4 4 4444 1 33 333 2 33 2 2 666666 55555 0 2 2 2 2 2 2 77 22 4 2 2 2 2 2 6666 55555 333 999 11111111111 2 2 66 77 22 2 3333333333 4 4 33 2 22 22 2 2 77 2 2 2 2 2 2 8 55 33 1 7777 2 2 2 33 7777777 2 2 55555 4 33 2 2 22 1111 4 2 6666666 2 22 777777 0 66666 2 22 3 1 1 2 33 1 1 11 2 3 222 1 11 11 0 33 2 1 1111 1 88888888 1 2 1 1 1 1
lowQualScore : . . . ... .... . .... . . . .. . . . .......................................... ... .. . ... . . ... .. . . . .... .. .. .. .. . .. . . . . . ........ . . . ... . . ........ ..... . . ... . . . ....................... .. . ......... . .. . . .. . .. .... . . . . ... . . . ...... .... . .. . .. . .. .... ... .. . ... . . . . . . .... . ... ... .. . ......................... . .. ..... .. . ..... .. ... .. . . . . .. .. .. . .. . .. .. . ...... .... . . . .. . . . . .... . .. ... . .. . . ...... ..... . . . . . . . .. .. . . . . . . .... ..... ... ... ........... . . .. .. .. . .......... . . .. . .. .. . . .. . . . . . . . .. .. . .... . . . .. ....... . . ..... . .. . . .. .... . . ....... . .. ...... . ..... . .. . . . . .. . . .. . . ... . .. .. . .. . . .... . ........ . . . . . .
lowQualScore : 6 5 5 444 2222 2 9999 2 2 2 77 2 2 2 111111111111111111111111111111111111111111 777 11 1 111 5 9 222 88 0 0 0 2222 11 33 55 55 6 99 7 5 7 7 7 00000000 7 0 7 000 7 7 66666666 33333 7 7 666 7 6 7 55555555555555555555555 33 6 999999999 9 66 9 9 55 9 33 0000 8 8 9 9 000 9 6 8 222222 9999 8 55 5 55 9 11 0000 999 66 9 000 9 9 9 8 7 9 0000 0 555 555 55 0 2222222222222222222222222 0 88 22222 99 1 33333 99 555 99 1 1 1 2 00 99 00 4 22 7 99 22 4 222222 0000 4 4 1 22 7 4 7 4 0000 7 44 777 5 22 4 4 444444 66666 3 1 1 1 1 0 1 11 99 2 1 2 2 2 2 9999 66666 999 222 22222222222 2 2 11 66 99 1 4444444444 2 2 44 1 33 99 1 1 11 1 2 2 2 2 2 9 66 22 8 2222 4 4 4 22 6666666 4 4 99999 7 22 2 2 88 0000 0 0 4444444 1 99 999999 1 00000 1 66 8 8 4 8 22 3 3 88 6 9 333 3 88 88 4 11 6 3 0000 3 33333333 4 8 4 4 4 4
consensus : TCT-CGTG-C-A---AC----CAGACGC-T----C-GG-CTA-TCTC--C-GTA-A-A--T-C--------TCC-G-----T-------A----A-----CCG---AG--AG-TCT---GG-TAAA-GATA---C--G-C-G-A----AAA--CG--TTT--GTA--A-CGT--C-AAAA-CGAGGCT-T-AC-C--------AGA-A-TC-CC--GGT-A-T-----G--T----GA-TTT-GA---T-TGGCTGA-T-C-----A--GG-----------C--C-ACAA----T-C-GA-AAAT--AA-CG-A--C-T--A----TC-GAAG-AAAG-C-T---G-T-AAT-AG------A----T-TG--AAAG--T-GG-C----GTT---T--A-A-GCGT-G-A-GGATTT-AC-A----AGT---AG---AGTGTGTTTAG-A--------AA-----T---AT-AAAAT-G--ATAGAA--G--AGGAA--A-GGAT-----TT--ATT--AG--CT-G-TTC-T-A--CC--T--ACGGG-A--TA-TGAT-AAAA--C-CGTT----G-CG----TAT-TT-AA-TT--TT-A-C-CAAAATT-AC-T--TTGG--AG--GGC-A--AA-G-TGAA------A-----GTACG-ATT-T-C-C-AG-TT--GA--C-A-G-CG-AT-CG-C----GGTTTT-----T---CTGTT---GTAC-T--------GGTA-A-T--TTCTCCN-TTAGT--A-TC----------ACTAAT-GA-AG-TA-TC-AAT--TA-ATTAAC-A--TC-AAATCTTTCG-GAAT-TGA-CTGTG-TT-T-T--G--TGGG-GG-AG-ATT-CAAA-C--C-------G-AAACT-GAA-----TTAG-C--GC-TC-CCTA--G----CG-GT-AACAGTTA--T----TATC-G--CGGG----TCTTT---A-CCA-G--A-C-TCTC-TG-TT--C-G-T--CGG-AGA-T---T-T--GC--GTAG--ACA-A-C----CG-AG--------TGTC-T-G-G-TTG-A-ACGAGAC
Reference ( family-1405 ) : TCT-CGTG-C-A---AC----CAGACGC-T----C-GG-CTA-TCTC--C-GTA-A-A--T-C--------TCC-G-----T-------A----A-----CCG---AG--AG-TCT---GG-TAAA-GATA---C--G-C-G-A----AAA--CG--TTT--GTA--A-CGT--C-AAAA-CGAGGCT-T-AC-C--------AGA-A-TC-CC--GGT-A-T-----G--T----GA-TTT-GA---T-TGGCTGA-T-C-----A--GG-----------C--C-ACAA----T-C-GA-AAAT--AA-CG-A--C-T--A----TC-GAAG-AAAG-C-T---G-T-AAT-AG------A----T-TG--AAAG--T-GG-C----GTT---T--A-A-GCGT-G-A-GGATTT-AC-A----AGT---AG---AGTGTGTTTAG-A--------AA-----T---AT-AAAAT-G--ATAGAA--G--AGGAA--A-GGAT-----TT--ATT--AG--CT-G-TTC-T-A--CC--T--ACGGG-A--TA-TGAT-AAAA--C-CGTT----G-CG----TAT-TT-AA-TT--TT-A-C-CAAAATT-AC-T--TTGG--AG--GGC-A--AA-G-TGAA------A-----GTACG-ATT-T-C-C-AG-TT--GA--C-A-G-CG-AT-CG-C----GGTTTT-----T---CTGTT---GTAC-T--------GGTA-A-T--TTCTCCN-TTAGT--A-TC----------ACTAAT-GA-AG-TA-TC-AAT--TA-ATTAAC-A--TC-AAATCTTTCG-GAAT-TGA-CTGTG-TT-T-T--G--TGGG-GG-AG-ATT-CAAA-C--C-------G-AAACT-GAA-----TTAG-C--GC-TC-CCTA--G----CG-GT-AACAGTTA--T----TATC-G--CGGG----TCTTT---A-CCA-G--A-C-TCTC-TG-TT--C-G-T--CGG-AGA-T---T-T--GC--GTAG--ACA-A-C----CG-AG--------TGTC-T-G-G-TTG-A-ACGAGAC
gi|1 : TCT-CGTG-C-A---ACG---CAGACGC-T----C-GG-CTA-TCTC--C-GTA----------------------------------------------CCG---AG--AG-TCT---GG-TAA--GATA---C--G-C-G-A----AAA--TGGTTTT--GTA--AACGTT-C-AAAA-CGAGGCT-T-AC-C--------AAA-A-TC-CT--GAT-A-T-----T--A----AA-TTT-GA---T-TGGCTGAAT-CGC---A--GG-----------C------AA----TGC-CA-AACT--AA-CG-A--C-T--A----TCCGAAG-AAAG-C-T---GCT-AAT-AACATGTAA----T-TG--AAAG--TCGG-C----GTT---TTTA-A-GTGT-G-A-GGATTT-AC-A----AAT---AG---AG-GTGTTTGG-GGGGGGTAGAA-----T---AT-AAA-T-A--ATAGAA--GC-AGAAA--A-GGAT-----TT--ATT--AGGCTT-G-TTC-TTA--CCGCT--ACGGT-AAGTA--GAT-AAAA--A-CGTT----GGCG----TAT-TT-AA-TT--TT-AGC-CAAAATTCAC-T--T--G--AA--GGC-A--AA-G-TAAA------A-----GTATA-ATT-T-T-CTAG-TTT-GA--GGA-G-CG-AT-CG-C----GGTTTT-----TTTCCTGTTT--GTA--T--------GTTA-A-T--TTTTTCT-TTAGT--A----------------AAT----------CT-AAT--T---TTAAC-AA-TA-AAATCTTTTG-AAAT-TGA-CTGTG-TT-T-TT-G--TGGG-G--AG-ATT-CAAAGC--C-------G-AAACT-GAA-----TTAGGC--GC-TC---TA--G----GGCGT-AACAATTA--T----TATC-G--CGGG----TCTTTTTAA-CCA-G--AGC-TCTC-TG-TT--C-G-T--CGGAAGA-T---T-TGCGC--GTAG--ACATG-C----CG-AAAT------TGTT-TGG-G-TTG-AGGCGAGA
gi|10 : TCTACGTG-C-A---ACGTACCAGACGC-T----C-GG-CCA-TCTC----GTA-A-A------------------------------------------CCG---AG--AGCTCT---GGATAAAAGATA---C--G-CCG-A----AAA--CG--TTT--GTA--A-CGT--C-AAAA-CATGACT-T-AC-C--------AGA-A-TT-CT--GGT-A-T-----G--T----GA-TTTGGA---T-TGGCTGA-T-C-----A---G-----------C--C-ACAA----T-C-GA-AAAT--AA-CG-A--C-T--A----TCGGAAG-AAAG-C-T---G-T-AAT-AG------A----T-TG--AAAG--T-GA-C----GTT---T--A-A-G-GT-G-A-GGA-TT-AC-A------T---AG---A--GTGTTTAG-A--------AA-----T---AT-AAAAT-G--ATAGAA--G--AGAAA--A-GGAT-----TC--ATT--AG--CT---TTC-T-A---C--T--ACGGG-A--CA-TGAC-----------TT----G-CG----TAT-TT-AA-TT--TTGA-C-CAAATTT-AC----TTGG--AG--GGC-A--AA-G-TGAA------ATACATGTATG-ATT-T-C-C-A--TT--GA--C-A-G-CG-AT-CG-C----GGTTTT-----T---TTGTT---GTAT-T--------GGTA-A-C--TTTTCC--TTAGT--A-TC----------ACTAA--GACAG-TA-TT-AAT--TA-AAGAACAA--TC-AAATCTTTC--GAAT-TGA--TGTG-TT-T-T--G--TGGG-G---A-ATT-CAAA-C--C-------G-AAACT-GAA-----TTAG-C--GC-TC-CCTA--GGCACCGAGT-AAAAGTTG--T----
gi|11 : gT---GG-TATA-GACA---C--A-C-G-A----TGA--CG--TTT---TA------------------------C-AC-C--------AGA-AATC-TC--GGT-A-T-----T--C----AG-TCC-CA---T-TGGTTGA-T-T---------------------C--C-ACAAACCTT-C--A-AAAC--AA-CG-A--T-T--A----CT-GAAG-AAAG-T-TC--G-C-AGT-AC------A----T-TG--AACG--C-GG-C----GTT------------GT-G-----------C-A----AGC---AG---AGTAT-TTAAA-A--------AA-----T---GT-----T-G--A--AAA--G--GGGTA--A-GTAT-----TT--ACT--TG--CT-G-CTC-T-A--CC--T--TAGGG-A--TA-T-AT-A----------T----G-TG----TAC-AC-AA-TT--TT-A-C-CAAAATG-AC-T--TTGA--AA--GGC-A--AAAG-TTAA------A-----ATACG-ATT-T-C-T-AG-CT--AA--C-A-G-CG-AT-CG-C----GGCTTTAATTTT---CTATT---GTAG-T--------GATG-A-A--TTCTCCA-TTAGT--A-TC----------ACTAAT-GA-AG-TA-TC-AAC--TA-ATAACC-A--TC-CAATCTTTCG-GAAT-TGA-CTATG-TT-TAT--A--CCGG-TG---------AAG-C--A-------G-ATGCT-AAA-----TTAG-C--AC-TC-CCTA--G----TG-GT-AATAGTTA--T----TATC-G--CAAG----TT------------G--A-C-TCTC-AG-CT--C-G-T--TTG-AGA-T---T-T--GC--GGAG--ACA-G-C----CG-AG--------CGTC-T-G-G-TTC-A-ACGAGAaacc
gi|12 : gaatctatAA--CG--TTT--GTA--A-CGT--C-AGAA-CGAGGTT-T-AC-C--------AAA-A-TT-TC--GGT-A-T-----T--TCATTAA-TTT-GA---T-TGATTCA-C-C-----A--CA-----------C--CTCCAA----T---------T--AA-CG-A--C-T--A----TC-GAAG-AAA------------AA---------------------AACG--T-TG-C----ATT---T--A-A-ACCT-A-A-GAACTT-AC-A----ATT---AG---AGTGT--TTA-------------------------AAAAT-G--TTGGAA-----AGAAA--A-TTAT-----TT--ATT--TG---T-G-TTC-T-A--CG--T--------------TG-T-AAA---------------CG----TAT-TA-AA-TT-----A-C-CAA--TT-AC-T--T-----AG--AGC-A--AA-G-TGAA------A-----GCACG-ATT-T-C---AG-CT--GA--C-A-G-CG-AT-CG-C----AGTTTT-----T---CTGTT---ACAG-T--------GGTA-A-T--TTCCCCA-TTAGT--A-TC----------ACTAAT-GA-AG-GA-TC-AAC--TA-ATTACC-A--TC-AAATCTTTCG-AAAT-TAA-CTATG-TT-TCT--G--TCGA-AG-AG-ATT-CAAA-C--C-------G-AAATC-AAA-----TTAG-C--GC-TC-CCTA--G----CG----AACAGTTA--A----TATC-G--CG------------------A-G--A-C-TTT---G-CT--C-G-T--CGA-AGA-T---T-T--GC--GGAG---CA-C-CA---CG-AG--------TGTC-T-G-G-TTT-A-ACGAGA
gi|13 : AA--CG--TTT--GTA--A-CGC--C-AGAA-CGAGGTT-T-AC-C--------AAA-T-TT-TC--GGT-A-T-----T--T----CA-TTA-GA---T-TGATTGA-TTC-----A---------------C--C-ACAC----T-T-CC-AATT--AA-CG-A--C-T--A----TC-GAAG-AAAT-T-T---G-T-AAT-AT------A----T-TG--AATG--T-TG-C----ATT---T--A-A-ACCT-A-A-GAACTT-AC------ATT---AG---AG-GTTTTT-------------------T---A--AAAAT-G--TTTGGA--A--AGAAA--A-TTAT-----TT--ATT--TG--CT-G-TTC-T-A--CC--T--Att
gi|13 : --AA-G-TGAA------A-----GCACG-ATT---C-C-AG-CT--GG--C-A-G-CG-AT-CG-C----AGTTTT-----T---CTGTT---ACATGT--------GGTA-A-T--TTCCCCCATTAGT--A-TC----------ACTAAT-GA-AG-GA-TC-AAC--TA-AT---C-A--TC-AAATCTTTCG-AAAT-TAA-CTATG-TT-TCT--G--TCGA-AG-AG-ATT-CAAA-C--C-------G-AAATC-AAA-----TTAG-C--GC-TC-CCTA--G----CG-GT-AACAGTTA--A----TATC-G--CG------------------A-G--A-C-TTT---G-CT--C-G-T--CGA-AGA-T---T-T--GC--GGAG--TCA-C-CA---CG-AG--------TGTC-T-G-G-TTT-A-ACGAGAagtgaaagcacgattccagctggcagcgatcgcagtttttctgttacatgtggtaatttcccccattagtatcactaatgaaggatcaactaatcatcaaatctttcgaaattaactatgtttctgtcgaagagattcaaaccgaaatcaaattagcgctccctagcggtaacagttaatatcgcgagactttgctcgtcgaagatttgcggagtcaccacgagtgtctggtttaacgagatt
gi|14 : aacgtttgtaacgccagaacgaggtttaccaaattttcggtatttcattagattgattgattcaccacacttccaattaacgactatcgaagaaatttgtaatatattgaatgttgcatttaaacctaagaacttacattagaggttttttaaaaatgtttggaaagaaaattatttatttgctgttctacctT-GA---T-TTGTTGA-TTC-----A---------------C--C-ACACC---T-C-CA-A--T--TA-CG-A--C-CTAA----TC-GAAG-AAA-----------------------------------AACG--T-TG-C----ATT---T--A-A-ACCT-A-A-GAACTT-AC-A----ATT---AG---AGTGT--TTA-------------------------AAAAT-G--TTGGAA--A--AGAAA--A-TTAT-----TT--ATT--TG--CT-G-TTC-T----CC--T--ACGG--A--TA-TGGT-AAAA--C-TGTT----G-TG----TAT-TA-AAGTT--TT-C-C-AAAAATT-AC-T--T-AG--AA--GGC-A--AA-G-TGAA------A-----GC-CG-ATT-T-C-C-AG-CT--GA--C-A-G-CG-AT-CG-C----AGTTTT-----T---CTGTT-----AG-T--------GGTA-A-T--TTCCCCA-TTAGT--A-TC----------ACTAAT-GA-AG-GA-TC-AAC--TA-ATTACC-A--TC-AAATCTTTCG-AAAT-TAA-CTATG-TT-TCT--G--TCGA-AG-AG-ATT-CAAA-C--C-------G-AAATC-AAA-----TTAG-C--GC-TC-CCTA--G----CG--T-AACAGTTA--A----TATC-G--CG------------------A-G--A-C-TTT---G-CT--C-G-T--CGA-AGA-T---T-T--GC--GGAG--TCA-C-CA---CG-AG--------TGTC-T-G-G-TTT-A-ACGAGAtt
gi|15 : taA--CG--TT---GTA--A-C----C-AAA---GAGTTT-A-AC-C--------AAA-T-TT-TC--GGT-A-A-----T--T----CA-ATA-GA---T-TGA-TGA-TTC-----A---------------C--C-ACAT----T-C----AATT--AA-CG-A--C-TA-A----TC-GAAG-AAAATT-T---G-T--AT-AT------A----T-TG--AATG--T-TG------ATT---T--A-A-GCCT-A-A-GAACTTAAC-A----ATT----G---A--GTGTTTAA-A----------------------AAAAT-GTTATGGGA--A--AGAAATTA-GG-------TT--ATT---G--CT---TTC-T-AT-CC--T--At
gi|15 : A------A-----GCACA-ATTGT-C-C-AG-CT--GG--C-AAG-CGGAT-CG-C----AGTTTT---------CTGTT---CCAG-T--------G-TAGA-T--TTC--CA-TTAGTTAA-TC------------TAATAGAGAG-AA-TC-AAGGATA-AT--AC-A--TC-A--TCTT-CGCAAAT-TAA-CTATG-TT-T-T--G--TGAG----AG-ATT-CAAA-CTTC-------G-AAA-T-AAA-----TTAG-CACGC-TC-CTGA--G----CG--T-AACAGTTA--A----TATG-G--C------------------------A-C-T----TG-CT--C-G-T--C-G-AGA-T---T-T--GC--GGAG--ACA-C-CCA--CG-AG--------TGT--T-G-G-TTA-A-gatgaagcacaattgtccagctggcaagcggatcgcagttttctgttccagtgtagatttccattagttaatctaatagagagaatcaaggataatacatcatcttcgcaaattaactatgttttgtgagagattcaaacttcgaaataaattagcacgctcctgagcgtaacagttaatatggcacttgctcgtcgagatttgcggagacacccacgagtgttggttaagat
gi|16 : acgttgtaaccaaagagtttaaccaaattttcggtaattcaatagattgatgattcaccacattcaattaacgactaatcgaagaaaatttgtatatattgaatgttgatttaagcctaagaacttaacaattgagtgtttaaaaaaatgttatgggaaagaaattaggttattgctttctatcctagatg---AG--GG-TCT---GG-TAAA-GACA---C--G-C-G-A----TAA--CG--TTT--GCA--A-CAT--C-AGAA-CGAGGTT-T-AC-C--------AAG-A-TT-TC--AGT------------------A-TTT-GA---T-TGGTTGA-gat
gi|16 : cnnnnnnnnnnnnnn-AG-TT--GA--C-A-G-CG-AT-CG-C----GGTGTT-----T---CTGTT---GTAC-T--------GGTA-C-T--TTCTCCA-TTTGT--A-TT----------CTTAAT-GA-AA-TA-TC-AAC--TA-ATTAAC-A--TC-AAAcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagttgacagcgatcgcggtgtttctgttgtactggtactttctccatttgtattcttaatgaaatatcaactaattaacatcaaa
gi|17 : cnnnnnnnnnnnnnnagggtctggtaaagacacgcgataacgtttgcaacatcagaacgaggtttaccaagatttcagtatttgattggttgacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnACGC-T----CCGG-CTA-TCTC--T-CCA-T-C--C-C--------TCC-G-----TTT-----A----ATTTTTCAG---AG--AG-TCTT--GG-TAAG-GATA---CCAG-C-A-ACTTTGAA--CG--TTTTTGTAGGA-CG---C-TAAA-CGAGGCT-TGAC-CTAGCGCGAAAA-A-TCATT--GGT-A-TAGGTTG--C----AG-TTT-GACTCT-TGGATGA-T-C-----A--GG-----------A--C--CAA----TCC-AA-AAATAAAA-CGAA--CGT--AAGTTTC-GAAG---AG-T-TATAG-T-ATT-AG------A----T-TGAAAAAA--T-GA-CAGTTGTT---T--A-GTGGGT-G-ATGGAGAT-AT-ATCGTACT---GGATCAGTGT-CTTAG-ATAT-----AATTTATT---AT-ATTAT-G--TTGGAA--GA-AGGAA--A-GGATGATACTTTAATT--AG---T-G-TTT-TAA--CC--TTAAAGGG-A--TA-TGAT-TAAAGGC-CGTTGCTGG-CG----TATGTT-AA-TTTATT-A-C-CAAAATT-
gi|18 : -A---AC----CAGACGC-T----T-GG-CTG-TCTC--C-ATA-G-A--T-T--------TCC-GACGAGT-------A------------G---AG--AG-TCT---GG-TAA----------------------------CG--TTT--GTA--A-AGT--C-AGAA-CGATGCT-T-GC-C--------AAA-T-TA-CT--GCTCA-T-----GACT----GA-TCT-GA---T-TGATTGA-T-T-----GATGGATTGATTAATTCAAC-ACACC---T-C-CC-AAAT--AA-CA-AG-C-T--T----TC-GAAG-AAAT-T-T---G-T-AAT-AG------A----T-TG--AATG--C-GC-C----GTT---T--A-A-GCTT-A-A-GGATTT-AC-A----ACT---AA---AGTGT-TTC-------------A-----T--------AAT-G--TTGCAA--A--AAGAA--A-GGAT-----TT--A-C--A----T-G-----T-A--TT--T--ACAAG-A--TA-TGGC--AAA--C-CATT----C-TG----TAT-TC-AA--G--TT-A-C-CAAGATT-AC-T--TGAG--AG--GGA-A--GA-G-TAAA------A-----TTACA-ATT-T-T-C-ct
gi|2 : ---AC----CAGACGC-T----C-G--CTA-TCTC--C-GTA-A-AA-T-C--------TCC-G-----TG------A----A-----TCG---AG--AG-TCT---GG-TAAA-GATA---C--GGC-A-A----AAAAACG--TTT--GTA--AACGT--C-AAAA-CGAGGCTCT-AC-C--------AGA-AATC-CT--GGT-A-T-----G--T----GAATTT-GAA--T-TGGCTGA-T-C-----A--GG-----------C--C-ACAA----T-CCGA-AAAT--AA--G-AAAC-T--A----AC-GAAG-AC-G-C-T---G-CGAAT-AG------A----TCTG--AAAG--T-GAAC----GTT---A--A-AAGTGTTG-A-GGATTTTAC-A----AGT---AG---AAAGTGTTTAG-A--------AA-----T---AT-AAAAT-G--ATAGAA--G--AGGAA--A-GGAT-----TT--ATTA-AG--TT-G-TTCTT-A--CC--TA-ACGGG-A--TA-AGATCACAA--C-CGTT----G-CG----TAT-TTCAA-TT--TT-A-CGCAAAATT-AC----TTGG--AG--TGC----AA-G-TGAA------A-----GTATG-ATT-TCC-C-AGTTT--GA--C-A-G-CG-AT-CG-C----GGTTTT-----T---CTGTTGTAGTAC-T--------GGTA-A-A--TTTTCCT-TTAGT--A--C----------ACTAAT-GA-TG-TA-TT-AAT--TA-ATTAAA-A--TCAAAATCTTTTG-GAAT-TGA-CTGTG-TT-T-T--G--T--G-GG-AG-ATT-CAAA-C--C-------G--AACT-GAA-----TTAG-C--GC-T--CCTA--GC---CG-GTCAACAGTTATCT----TATCTG--CGGG----TCTTT---A-CCA-AGCA-C-TCTC-TGTTT--C-G-T--CGG-AGA-T---TCT--GC--GTAG--ACA-AGC----CG-AG--------TGTC-TGG-G-TTG-A-
gi|20 : -AAT-TG------A----T-TG--AATG--T-GG-T----ATT---T--A-A-GCTT-A-A-AGATTT-AC-A----ACT---AG---AGTGT--TTA-------------------------AAAAT-G--TTGGAA--A--AGGAA--A-GGAT-----TT--ATT--TG--CT-G-TTC-T-A--CC--T--ACAGG-A--TA-AGGT-AAAA--C-AGTT----T-TG----TTT-CA-AA-TT--TT-A-C-CAAGATT-AC-C--TTGG--GA--GGCAA--AA-G-TGAA------A-----GAACG-AAT-T-C-C-AG-CT--GA--C-A-G-CA-AT-CG-C----AGTTTT-----T---CTGTT---GTGG-T--------GGTG-A-T--TTCCACA-TTCGT--A-TCAGTGGTGATTACTAAT-GA-AG-GA-TC-AGT--TA-ACTACC-G--TT-AACTCTTTCA-GTAT-TGA-CTGCG-TT-T-aacga
gi|23 : TCT-CGTG-C-A---AC----CAGACGC-T----C-GG-CTA--CTC--C-ATA-A-A--T-C--------TCC-G-----TA------A----A-----CCG---AA--AG-TCT---GG-TAAA-GATA---C--G-C-A-A----AAA--CG--TTT--GTA--A-CGT--C-AAAA-CGAGGCT-T-AC-C--------ATA-A-TC-CT--GGT-A-T-----T--T----AA-TTT-GA---T-TGACTGA-T-----------------------C--C-ACAC----T-C-CA-AAAT--AA-CG-A--C-T--A----TC-GAAG-AAAG-C-T---G-T-GAT-AG------A----T-TG--AAAG--T-GG-C----GTT---T--A-A-TTGT-G-A-GGATTT-AC-A----ACT---AT---A--GTGTTTAG-A--------AA-----T---AT-AAAAT-A--ATAGAA--G--A
gi|24 : gTG-C-A---AC----CAGACGC-T----C-TG-CTA-TCTG--C-GTA-A-A--T----------TCC-G-----T-------A----A-----CGG---AG--AG-TCT---GT-TAAA-AATA---C--G-C-GAA----AAA--CG--TTT--GTT--A-CGT--C-AAAA-CGA-GCT-T-AC-C--------AAA-A-GC-C------------------T----GA------------TGGCTGA-T-----------------------C--C-ACAA----T-C-CAGAAAT--AA-CG-A--C-T--A----TC-GAAGTAAAG-C-------T-AAT-AA-------------TG--AAAG--T-G-------------C--A-A--------A-GGATTT-AC-A----AGT---AG---A--GTGTTTAA-A--------AA-----T---A----------------------AGGAA--A-GGAT-----TT--ATT--
gi|26 : tttcCT-TGTT-C-A---AC----CAAACAC-T----C-AG-CTG-TCTC--C-ACA-A-A--T-C--------TTC-GAC---G-------A----G-----CAG---AG--AG-TAC---GA-TAAA-AATT---C--A-A-G-A----TAA--CA--TTT--GTA--A-CAT--C-AGAA-CGAGGCT-T-AC-T--------AAA-A-TT-TC--ATT-A-T-----T--T----AA-TTT-GG---T-TGt
gi|27 : ---GG-TATA-GACA---C--A-C-G-A----TGA--CG--TTT---TA------------------------C-AC-C--------AGA-AATC-TC--GGT-A-T-----T--C----AG-TCC-CA---T-TGGTTGA-T-T---------------------C--C-ACAAACCTT-C--A-AAAC--AA-CG-A--T-T--A----CT-GAAG-AAAG-T-TC--G-C-AGT-AC------A----T-TG--AACG--C-GG-C----GTTGTGC--A-A-GCA--G-A-GTATTT-AA-A----Atttcaatacacctccaaa
gi|28 : -CGTG-C-A---AC----CAGACGC-TT---C-GG-CTA-TCTC--CCGTA-ATA--TTC--------TCC-G-----T-------A----AA----CCG---AG--AG-TCT---GG-TAAA-GATAATTC--G-C-GAA----AAA--CG--TTT--GTA--A-CGT--CGAAAA-CGAGGTT-T-AC-T--------CGA-A-TC-CC---GT-A-T-----a
gi|29 : gtctagAGT--A-TC------------TAAT-GT-AG-AT-TC-AAC--TA-ATTACC-A-------AT-----G-G----TGA-TTATG-AT-T-T--G--T--------------CAGA--------------AAGTT-AAA-----TTAG-C--GC-TC-CCTA--G----CG-GT-ACCAGTT---------------------------TT---A-CCA-G--A-C-TCT-----------------GA-AGA-T---T-T--GC--GGAG--ACA-G-T----CG-AA--------CATC-C-G-G-TTG-A-ACcccagggtttggaat
gi|3 : --C-AAAATCGAGGCT-T----C--------AGA-A-TC-TCCTGGT-A-T-----G--T----A---TT-GA---T-TGGCTGA-T-CCAGACA--GG-----------C--C-ACAA----T-C-GT-TAGT--AAACG-A--C-TG-A----TC-GAAGGAAAG-CAT---G-C-AAT-GG------AGTTCT-TG--AAAGG-T-GA-C----GTTA--T--A-A-AGGT-G-G-CGATTTTACTA----AGTTATAG---AGATTTTGTAG-A--------AA-----TTTGAT-AAA-T-GT-ATAGAA--GGAAGGAA--ATAGAT---------ATT--AG--CTAG-TTC-T-AACCT--T--ACGGA-A--TA-TGAT-AAGA--CGCGTT----G-CGATTATAT-TT-AA-TT--TT-A-CTCAAAATT-AC-TATTTGGTGAGACGGC-ACAAA-G-GGAATCGTAAA-----GTGAG-TGT-C-C-C-AG-TTT-GAATC-A-GGTG-ATTCG-CTGACAGTTTT-----T---CTCGT---GTAT-TTGCTCTGTGGTA-AATGATTCCCCT-TTAGT--A-TCC---------ATTAATTGA-AG-TA-TTTAAT--TA-ATTAAC-AA-TC-AAATCTATCG-GAAT-TCA-CTGTG-TTCT-T--GTTTGGG-GATAG-CTG-CAAA-C--TCGAGTGAG-AAACT-GAAATCTGCTGG-C--G-----CCTATTGCT--CG-GT-AG-AGTTA--TTGTATACC-GATCTGGAGCTTCTTT---A-CCA-G--AGCGTCTCTTGTTT--C-G-TTCCGGCATA-T---C-T--GC--GTAGTTACATA-C----CG-A---------TGAC-T-G-G-TTG-A-ACGAGACa
gi|30 : G-ATTACATA-C--C-------G-TA-CT-CTA-----TCAG-C--GC-TC-CCTA--G----CG-GT-AACAGTTA--T----TATC-G--AGCA----TCTTT---A-CTA-G--A-C-TCTC-TG-CT--C-G-T--AAG-AAA-----T-T--GC--GGAG--ACA-G-C----TG-AG--------TGTC-T-A-G-TTG-A-ACAAGAC
gi|31 : CTA--G----CG-GT-AACATTCA--T----TATC-G--CGAA----TCTTT---A-CCA-G--A-C-TCTC-TT-CT--C-G-T--GGT-AAA-T---T-T--GA--GAAG--GCA-G-C----CG-AG--------CGTC-T-G-G-TTG-A-ACGAGAC
gi|32 : aaattccaaataatccatCTA--GA---CG-CT-GACGGCTA--T----CTCC-G--TAAA----TCTCT---G-TAA-A--A-C-T-----G-TT--C-G-T--CGG-AGA-T---T-T--GCGTGTAG--ACA-A-C----CG-AGTAGTGTTATGTC-T-G-G-TTC-A-ACGAGACt
gi|33 : cgtgcaaTCT-CGTG-C-A---AC----CAGACGC-T----C-GG-CTA-TCTC--C-GTG-A-A--T-C--------TCC-G-----T-------A----A-----
gi|33 : gCT-CGTT-C-A---AC----CAGACAC-TTGCAT-GG-TTG-TCTA--C-GCA-A-A--T-C--------GCC---------------A----A------CGAACAG--AG-TTTAC-GG----A-GATT---C--A-C-G-G----AGA--actctgttcgttggcgatttgcgtagacaaccatgcaagtgtctggttgaacgag
gi|33 : gtctcgtgcaaccagacgctcggctaCTC-TG-TT--C-G-T--TGG-CGA-T---T-T--GC--GTAG--ACA-A-CCATGCA-AG--------TGTC-T-G-G-TTG-A-ACGAG
gi|34 : gtctcgtgcaaccagacgctcggctatctccgtgaatctccgtaaaCT-CGTG-C-A---AC----CAGACGC-T----C-GG-CTA-TCTC--C-GTA-A-A--T-C--------TCC-G-----T-------A----A-----
gi|34 : C-TG-TT--C-G-T--TGG-AGA-TAATT-C--GC--GTAG--ACA-A-C----CG-TG--------TTTC-T-G-G-TTG-A-ACGAGACactgttcgttggagataattcgcgtagacaaccgtgtttctggttgaacgagact
gi|35 : ctcgtgcaaccagacgctcggctatctccgtaaatctccgtaaaC-TC-CCTA--G----CG-GT-AACAGTTA--T----TATC-G--CGGG----TCTTT---A-CCA-G--A-C-TCTC-TG-TT--C-G-T--CGG-AGA-T---T-T--GC--GTAG--ACA-A-C----TG-AG--------TGCC-T-G-G-TTG-A-ACGAGACt
gi|36 : TCT-CGTG-C-ATGAGC----CAGACGC-T----C-GGCCTA-TCTC--T-ATA-A-A--C---------------------------------------CCA---AG--AGATCTGGGGG-TAAA-GATATC-C--G-C-GAA----AAA--CAT-TTT--GTA--A-CGT--C-t
gi|37 : gTCT-CGTG-C-A---AC----CAGACGC-T----C-GG-CTA-TATC--C-GTA-A-A--C-C--------T
gi|37 : C-TG-TT--C-G-T--CGG-AGA-A---T-T--GC--GTAG--ACA-A-C----CA-AG--------TGTC-T-G-G-TTG-A-ACgttcgtcggagaattgcgtagacaaccaagtgtctggttgaac
gi|38 : tctcgtgcaaccagacgctcggctatatccgtaaacG-ATT-T-C-C-AG-TT--GA--C-A-G-CA-AT-CG-C----GGT-----------------------------------------T--TTCTCCC-TTAGT--A-TC----------AC---------------------------TAAC-A--TT-AAATTGTTCG-AAAT-TGA-CTGT--CT-T-T--G--TG
gi|39 : C-C--------AAG-A-TT-TC--GGT-A-T-----T--T----GA-TTT-GA---T-TGGTTGA-T-C-----A--------------------AAAA----T-C-CA-AAAT--AA-CG-A--C-T--A----TC-GAAG-AAAG-C-T---G-T-AAT-GG------A----T-TG--A
gi|4 : T-CGTGGC-A---AC----CAGACGC-T----C-G--CTAATCTC--C-GTA-A-A--C-T--------TCCCG-----T-------A----AT----CCG---AAGAAG-TCT---GG-TAAA-GATA---C--G-C---A----AAA--CG--TT---GTA--A-CGT--C-AAAA-CGAGGCT-T-AC-C--------AGATA-TC-CT--GGT-AAT-----G--T----GA-TTT-GA---T-TGGCTGA-T-C-----A--GG-----------C--C-ACAA----T-C-GA-AAAT--AA-CG-A--C-TT-A----TC-GAAG-AAAG-C-T---G-C-AAT-AG------A----T-TG--AAAG--T-GA-C----GTT---A--A-A-GTGT-GAA-GGATTT-AC-A----AGT---AG---AGTGT-TTTAGAA--------AA-----T---AT-AAAAT----ATAGAA--G--AGGAA--T-GATT-----TT--ATT--AG--CT-G-TTC-T-C--CC--T--ACGGG-A--TA-AGAT-ACAA--C-CGTT----G-CG----TAT-TT-AATTT--TT-A-C-C-AAATT-AC-T--TTGG--A---TGC-A--AA-G-TGAA------A-----GTATG-ATT-T-CTC-AG-TTTGAA--C-A-C-GG-AT-CGCC----GGTTTT-----T---CTGTT---GTAC-T--------GGTA-A-A--TTTTCCT-TTAGT--ACCC----------ACTAAT-GA-AGTTA-TA-AGT--TA-ATTAAA-A--TA-AAATCTTTTG-GAAT-TGATCTGTGTTT-T-T--G--TGGGAGG-AG-ATT-CAAA-C--C-------GAAAACT-GAA-----TTAG-C--GC-TCACCT---G----CG-GT-AACAGTTA--T----TATC-G--C-GG----TCTTT---AGCCA-G--A-C-TCTC-TG-TT--C-G-T--CGG-AGA-T---T-T--GC--GTAG--ACA-A-C----CG-AG--------TGTCGT-G-G-TTGAA-ACGAGAC
gi|40 : TCT-CGTG-C-A---AC----CAGACGC-TC---C-GG-CTA-TCTC--C-GTA-A-A--C-CGTCGGAGATTT-G-----TGTTGAGCA----A-----CCG---AG--TG-TCT---GG-T
gi|41 : T-CGTG-C-A---AC----CAGACGCCT----C-GG-CTA-TCTC--C-GTA-A-ACGT-CGGAGA---TTT-G-----TGTTGAC-A----A-----CCG---AG--TG-TCT---GG-Ttgaacg
gi|41 : -TCTC-CG-TAAAC-G-T--CGG-AGA-T---T-T--GT--GTTG--ACA-A-C----CG-AG--------TGTC-T-G-G-TTG-A-tgaa
gi|42 : tcgtgcaaccagacgcctcggcta-TG-TTG-C-A-T--CGG-AGA-T---T-T--GC--GTAG--ACA-A-CG---CG-AAT-------TGTC-T-G-GTTTG-A-ACGAAAC
gi|43 : gcgtaatttccgtaaacgt-CGTG-CCA---AC----CAGACGC-TTT--C-GG-CTA-TCTCTCC-GTG-A-A--T-C--------TCC-G-----TA------A----A-----CCG----G--AG-TTT---t
gi|44 : --A-C-T-TC-TG-AT--G-G-G--TGG-AAA-T---T-T--AC--GGAG--ATA-G-C----CA-AG--------TGTC-T-G-G-TTG-C-ATGAGACatgttcgtcagaga
gi|44 : aTCT-CATG-C-A---AC----CAGACAC-T----T-GG-CTA-TCTC--C-GTA-A-A--T-T--------TCC-attctctgttcgtcg
gi|45 : ag---AC----CAGACGC-T----C-GG-CTA-TCTC--C-GTA-A-A--T-C--------TCC-G-----acccatcagaagtattctctgttcgtcg
gi|45 : ccC-TG-TT--C-G-T--CAG-AGA-T---T-T--GC--ATAG--ACA-A-C----Cacctgttcgtcagagatttgcatagacaacca
gi|46 : ccaccagacgctcggctatctccgtaaatctccgacT--C-G-T--CAA-AGA-T---T-T--GC--GGAA--ACA-G-C----CG-GG--------TGTC-T-G-G-TTG-A-AAGAGACa
gi|47 : aatctccgacaagcaatgTCT-CGTG---A---AC----CAGACGC-T----C-GG-CTA-TCTC--C-GTA-A-A--T-C--------GAC-G-------------A----G-----CAG---AG--AG-TAG---GG-TAA
gi|48 : A-TCTC--C-GTA-A-A--C-CGAGATT--TGC-G-----T-------AGACAA-----CCG---AG--TG-TCT---GG-TAt
gi|48 : taaG-AGA-T---T-T--GC--GTAG--ACA-A-C----CG-AG--------TGTC-T-G-G-TAT-A-ACGAGACtaacgagac
gi|49 : taaatctccgtaaaccCT-C-AC-C--------AAA-A-TT-TT--GGT-A-T-----T--T----AA-TTT-GA---T-CAGTTGA-T-T-----A--AA-----------CA-C-AC
gi|5 : gcT-CGTG-C-A---AC-----AGACGC-T----C-GG-CTA-TCTC--C-GTA-A-A--T-C--------TCC-G-----T-------A----AAA---CCG---AG--AG-TCT---GG-TAAA-GATA---C--G-C-G-A----AAA--CG--TTT--GTA--A-CGTC-C-AAAA-CGAGGCT-T-AC-A--------AGA-A-T--CT--GGT-A-T-----G--T----GA-TTT-GA---T-TGGCTGA-T-C-----A--GG--------------C-ACAA----T-C-GA-AAAT--AA-CG-A--C-T--AT---TC-GAAG-AAAG-C-T---G-T-AATAAG------A----T-TG--AAAG--T-GA-C----GTT---T--A-A-GTGT-G-A-GGATTT-AC-A----AGG---AG---A--GTGTTTAG-C--------AA-----T---ATAAAAAT-G--ATAGAA--G--AGGAA--A-GGA------TT--ATT--AG--CT-G-TTC-T-A--CC--T--ACGGGAA--TA-TGAT--AAA--C-CGTT----G-CG----TAT-TT-AA-TT--TT-A-C-CAAAATT-CC-T--TTGG--A---GGC-A--AA-G-TG--------A-----GTATGCATT-T-C-C-AG-TT--GA--CAA-G-CG-AT-CG-CA---GGTTTT-----T---CTGTTCA-AAAC-C--------GGTA-A-TTCTTCTCTT-TAAGT----TCA---------ACTAAT-G--AG-TA-TT-GAT--TACATTAAC-AATTC-AAAACTTCAG-GAAT-TCA-CTGTG-TT-T-TGGG--TGGG-TA-AGAATT-CAAA-C--C-------G-AAACT-GAA-----TT-G-C--GCTTC-CCTA--G----CG-GT-AACAGTTA--T----TATC-G--CGGG----TCTTTA--A-CCA-G--A-C-TCTC-TG-TT--C-GAT--CGG-AGATT---T-T--GC--GTAG--ACA-A-C----TGAAG--------TGTC-T-G-G-TTG-A-ACGctccaaa
gi|50 : TT--TG--CT-G-TTC-T-A--CG--T--ACGGG-A--AACTG---------C-CGTT----T-TG----TAC-CA-AA-TT--TT-A-C-CAAAATT-
gi|51 : gC----CAGACGC-T----C-GG-CTA-TCTC--C-GTA-A-A--------------CC-G-----T-------T----A-----CTG---AG--TG-CCT---GG-T
gi|52 : TCT-CGTG-C-A---AC----CAGACGC-T----C-GG-CTA-TCTC--C-GTA-A-A--T-C--------GAC-G-------------A----G-----CAG---AG--AG-Ttgaacgagact
gi|53 : CGC-T----C-GG-CTA-TCTC--C-GTGTA-C--T-CAG------TTC-G-----T------------------CGG---AG--AT-TTT---CG-TAAA-g
gi|53 : CTC-AG-TT--C-G-T--CGG-AGA-T---T-T--TC--GTAA--ACA-A-C----CG-caaccg
gi|54 : cgctcggctatctccgtgtaTCT-CGTG-C-A---AC----CAGATGC-T----C-GG-CTA-TCTC--C-GTA-A-A--T-C--------TCC-GAC---T-------A----A-----C
gi|55 : C-TG-TT--CCG-T--CGG-AGATT---T-T--TC--GTAGA-ACA-A-CT---TG-AG--------TGT--T-G-G-TTG-C-ACGaaag
gi|56 : --A-C-TCTC-TA-CT--C-G-T--CGA-AGA-T---T-A--AC--AGAG--ATA-G-T----CA-AG--------CGTC-T-G-G-TTg
gi|57 : -AC-T--TTGG--AG--GGC-A--AA-G-TGAA------A-----GTATA-ATT-T-C-C-AG-TT--GA--C-A-
gi|58 : TCT-CGTG-C-A---AC----CAGACGC-T----C-GG-CTA-TCTC--C-GTA-A-A--
gi|59 : agTCT-CGTG-C-A---AC----CAGACGC-T----C-GG-CTA-
gi|6 : ctagCT-CGTG-C-A----C----CAGACGC-T----C-GC-TTG-TCTC--C-GTA-A-A--T-C--------TCC-G-----T-------A----AA----CCG---AG--AG-TCT---GG-TAAA-GATA---CT-G-C-G-A----AAAA-CG--TGT--GTA--A-CGT--C-AAAAACGAGGCT---ACAC--------AGA-A-TC-CT--GGT-A-T-----G--T----GA-TTT-GA---TCTGGATGA-T-C-----A--GG-----------C--CCACAA----T-C-GA-AAAT--AA-CG-A--C-T--A----TC-GAAG-AAAG-C-TT--G-T-AAT-AG------A----T-TA--AAAG--T-GA-C----GTT---T--A-A-GTGT-G-A-GGATTT-AC-A----AGT---AC---AGTGT-TATAG-A--------AA-----T---AT-AAAAT-G--ATAGTATCG--AGGAA--A-GGAT-----GC--ATT--AG--CT-G-TTT-T-A--CC--T--ACGGG-A--CATTGAT-AAAA--C-CGTT------CG----TAT-TT-AA--T--TT-A-C-CAAAATT-ACTT--TTGG--AG--GGC-A--AA-G-TGAA------A-----GTATG-ATT-T-C-C-AG-TT--GA--C-A-G-TG-AT-CG------GGTTTT-----T---CTGTT---GTAT-TA-------GGTA-A-C--TTTTCCT-TTAAT--A-TC----------ACTAAT-GA-AG-TA-TT-AAT--TA-ATTAAC-A--TC-AAATCTTTCG-GAATCTGA-C--TG-TT-T-T--G--TGGG-GG-AG-ATT-CAAA-C--C-------G-AAACTGGAA-----TCAGCC--AC-TC-CCTA--G----CG-GT-AACAGTTA--T----TATC-G--CGGG----T-TTT---A-CCAGG--A----CTC-TG-TT--C-G-T--CGG-AGATT---T-T--GC--GTAG--ACA-A-A----CG-AG---------GTC-T-G-G-TTG-A-ACGAGA
gi|7 : TCT-CGTG-C-A---AC----CAGACCC---------G-CTA-TCTC--C-GTA-A-AATT-C--------TCC-G-----T-------A----AA----CCG---AG--AG-TCT---GG-TAAA-GATA---C--G-C-G-A----AAA--CG--TTT--GAA--A-CGTGTC-AAAAACGAGGCT-T-AC-C--------AGA-A-TC-CT--GGT-A-T-----G--T----GA-TTT-GA---T-TGGCTGA-T-C-----AA-GG-----------C--C-ACAA----T-C-AT-AAAT--AA-CG-A--C-T--A----CC-GAAG-AAAG-C-T---G-TTAAT-AG------A----T-TG--AAAAGTT-GA-C----GTTAT-T--ATA-GTGT-G-A-GGATT--AC-A----AGT---AG---AGTGT-TATA--A--------AA-----T---AT-AAAATTG--ATAGAA--G--AGGAA--G-GATT-----TT--ATTTTAG--CT-G-TTC-T-A--CC--T--ACAGG-A--TA-TGAT-AAGA--C-CGTT----G-CG----TAT-TT-AA-TT--TTTA-C-CAAAATTCAC-T--TTGG--AG--GGC-A--AA-AATGAA------A-----GTATG-GAT-T-T-C-AG-TT--GA--C-A-G-CG-AT-CG-C----GGTTTT-----T---CTGTT---GTAC-T--------GGTA-A-T--TTTTCC--TTA-T--A-TC----------ACTAAT-GA-AG-TATTT-AAT--TA-A-TAAC-A--TT-AAATCTTTCG-GAAT-TGA-CTGTG-TT-T-T--G--TGGG-GG-AG-ATT-AAAA-C--C-------G-AAACT-GAA-----TTAG-C--GC-TC-CCTA--G----CG-GT-AACAGTTA--T----TATC-G--CGGG----TCTTT---A-CCA-G--A-C-TCTC-TG-TT--C-G-T--CGG--------------------AG--ACA-A-C----CG-AG--------TGTC-T-GCG-TTG-A-ACGAGAC
gi|8 : gTCT-CGTG-C-A---AC----CAGACGC-T----C-G--CTA-TCTC--C-GTA-A-A--T-C--------T---G-----T-------A----AA----CCG---AG--AG-TCT---GG-TAAA-GATA---C--G-C-G-A----AAA--CG--TTT--GTA--A-CGT--C-AAAA-CGAGGCT-T-AC-C--------AGA-A-TC-CT--GGT-A-T-----G--T----TA-TTT-GA---T-TGGCTGA-T-C-----A--GG-----------C--C-ACAA----T-A-AA-AAAT--AA-CG-A--C-T--A----TC-GAAG-AAAG-C-T---G-C-AAT-AG------A----T-TG--AAAG--T-GA-C----GTT---T--A-A-GAGT-G-A-GGATTT-AC-A----AGT---AG---AGTGTGTTTAG-A--------AA-----T---AT-AAAAT-G--ATAGAA--G--AGGAA--A-GGAT-----TT--ATT--AG--CT-G-TTC-T-A--CC--T--ACGGG-A--TA-TGAT-AAAA--C-CGTT----G-CG----TAT-TT-AA-TT--TT-A-C-CAAAATT-AC-T--TTGG--AG--GGC-A--AA-G-TGAA------A-----GTATG-ATT-T-C-C-AG-TT--GA--C-A-G-CG-AT-CG-C----GGTTTT-----T---CTGTT---GTAC-T--------GGTA-A-T--ATTTCCG-TTAGT--A-TC----------ACTGAT-GA-AG-TA-TT-AAT--TA-ATTAAC-A--TC-AAATCTTTCG-GAAT-TCA-CTGTG-TT-T-T--G--TGGG-GG-AG-ATT-CAAA-C--C-------G-AAACT-GAA-----TTAG-C--GC-TC-CCTA--G----CG-GT-AACAGTTA--T----TATC-G--CGGG----TCTTT---A-CCA-G--A-C-TCTC-TG-TT--C-G-T--CGG-AGA-T---T-T--GC--GTAG--GCA-A-C----CG-AG--------TGTC-T-G-G-TTG-A-ACGAGAC
gi|9 : TCT-CGTG-C-A---AC----CAGACGC-T----T-GG-CTA-TCTC--C-GTA-A-A--T-C---------------------------------------G---AG--AG-TCT---GG-TAAA-GATA---C--G-C-G-A----AAA--CG--TTT--GTA--A-CAT--C-AAAA-CGAGGCT-T-AC-C--------AGA-A-TC-CT--GGT-A-T-----G--T----GA-TTT-GA---T-TGGCTGA-T-C-----A--GG-----------C--C-ACAA----T-C-GA-AAAT--AA-CG-A--C-T--A----TC-GAAG-AAAG-C-T---G-T-AAT-AG------A----T-TG--AAAG--T-GA-C----GTT---T--A-A-GTGT-G-A-GGA-TT-AC-A----AGT---AG---A--GTGTTTAG-A--------AA-----T---AT-AAAAT-G--ATAGAA--G--AGAAA--A-GGAT-----TT--ATT--AG--CT-GTTTC-T-A--CC--T--ACGGG-A--CA-TGAA-AAAA--C-CGTT----G-CG----TAT-TT-AATTT--TT-A-C-CAGAATT-AC-T--TTGG--AG--GGC-A--AA-G-TGAA------A-----GTATA-ATT-T-C-C-AG-TT--GA--C-A-G-CG-AT-CG-A----GGTTTT-----T---CTGTT---GTAT-T--------GGTA-A-T--TTTTCCT-TTAGT----TC----------ACTAAT-CA-AG-TA-TT-AAT--TA-ATTAAC-A--TC-AAATCTTTC--GAAT-TGA-CTGTG-TT-T-T--G--TGGG-GG-AG-ATT-CAAA-C--C-------G-AAACT-GAA-----TTAG-C--GC-TC-CCTA--G----CG-GT-AACAGTTAT-T----TATC-G--CGGG----TCTTT---A-CCA-G--A-C-TCTC-TG-TT--C-G-T--CAG-AGA-T---T-T--GC--GTAG--ACA-A-C----CG-TG--------TGTC-T-G-G-TTG-A-ACGAGAC
blockSeqs : A G C TGA GTAC C TGCA C C A TC C T T CCGTCGGAGATTTGTGTTGAGCAA AAC GA C GGG A A ATT CA G C A CTTT AA T TT GG A GT G T C G A TAGCGCGA T A A CCT C A AGGTTG CATTA A G CTC C . TGATGGATTGATTAATT AA T ACCTTC G AA A A AA G TA AGTT G T T A ATA . G A . GTTC C AA GT . AA AGTT GTG . T TGG T A T A T TCGT G TAT ATC GT G GATATAATTTATTAT T TT GGA TT T GATAC TA TTA . A T T A AC . TA A . C CA GG G GCTGG ATTA G C G TA G . G C TAT T TG GAC A CA A A TCGTAA TACAT C G C T . T TG AT A A G G T C TGAC AATTT . GTA TTTGCTCTGT G A GA CA TA C AGTGGTGATT A C TT T TT GA C A AT A C C T T C A GG TT G GAT A A . TT CGAGTGA A G ATCTG C AC T A TT GCAC A C TTGTA T AT GGAGCT AG G GC G G T T AA C A TC C T AAT C . GT TT T G CATG A TAGTGTTA G G C T A .
blockSeqs : . . . . . . TT . . . . . . . CGTCGGAGATTTGTGTTGACAA . . A AC . . TC T . . A . A . . . . C . A . . . . . A . T . . GAC G . . A . . CCAGACAGG A C ACCTTC . . . . G . A T . G . . C . T . . . . . G . A . AT . . AGT . . . T . . T . . GT T GAAATTTGAT . T TCG . . . . AA . . . . . T . A . . T A . . G . . . T . T . T . TT T . G . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . A . . CA TGT . . TC A . . C T G T . T . . . A . . . . . . C . . C AGG . . . . . . . . . . . . . CT . . TCT . . AG AA . . . . . T G . . . . T . . . . A . . CA . T . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . T . . . . . . . CCGAGATTTGCGTAGACAA . . . T . . . . . . A . . . . . . . . A . . . . . A . C . . G A . . . . . CAAGG . . CTCC . . . . . . G . . . . . C . . . . . . . . . G . A . . AC . . . T . . T . . GT G GAAAATAT . . GA . . . . A . . . . . . . . . . . A . . G . . . T . . . . . T G . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TTA . . . A . . A . . T . C . . . . . . . . . . C . . C TG . . . . . . . . . . . . . C . . TT . . GG A . . . . . . . . . . . T . . . . . . . A . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . C . . . . . . . CCTCCGTTTAATTTTT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . T C . . . . . CACA . . TCCA . . . . . . T . . . . . T . . . . . . . . . G . . . . AC . . . . . . T . . GT G GCAATATA . . G . . . . T . . . . . . . . . . . A . . G . . . . . . . . . T T . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TT . . . A . . . . . G . C . . . . . . . . . . C . . C AG . . . . . . . . . . . . . A . . T . . CA A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . TTTCCGACGAGTA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . T C . . . . . CAGG . . CTCC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . AC . . . . . . T . . GT G GAAATAT . . G . . . . T . . . . . . . . . . . T . . C . . . . . . . . . T T . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GT . . . A . . . . . G . C . . . . . . . . . . . . . C AG . . . . . . . . . . . . . . . . T . . AA A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . ATTCTCCGTAAA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . T A . . . . . CAGG . . TCCG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . GC . . . . . . C . . AA G AAAATGT . . A . . . . T . . . . . . . . . . . A . . G . . . . . . . . . T T . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GT . . . A . . . . . G . C . . . . . . . . . . . . . G AG . . . . . . . . . . . . . . . . A . . AA A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . ATCTCCGTGAA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . T G . . . . . CAGG . . TCG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . GC . . . . . . C . . GT T GAAATAT . . A . . . . T . . . . . . . . . . . A . . T . . . . . . . . . C T . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GT . . . T . . . . . A . C . . . . . . . . . . . . . G GG . . . . . . . . . . . . . . . . A . . GG A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . TCTTCGACGAG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . G G . . . . . TAAA . . TTC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . GC . . . . . . G . . GA G GAAATAT . . A . . . . A . . . . . . . . . . . A . . G . . . . . . . . . T T . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GT . . . A . . . . . T . C . . . . . . . . . . . . . G TA . . . . . . . . . . . . . . . . A . . GG G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . TTCTCCGTAAA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . T A . . . . . CAGG . . TCC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . TT . . . . . . C . . GT G GAAATAT . . A . . . . A . . . . . . . . . . . A . . G . . . . . . . . . T T . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CT . . . T . . . . . T . T . . . . . . . . . . . . . G GG . . . . . . . . . . . . . . . . A . . GG A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . CTTCCCGTAAT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . T G . . . . . CAGG . . TCC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . GC . . . . . . C . . GT G GAAATAT . . G . . . . T . . . . . . . . . . . A . . G . . . . . . . . . T T . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CT . . . C . . . . . G . C . . . . . . . . . . . . . G GG . . . . . . . . . . . . . . . . T . . GG A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . TCTCCGTAAAA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . T A . . . . . CAGG . . TCG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . AG . . . . . . G . . GT . GAAATAT . . A . . . . A . . . . . . . . . . . A . . T . . . . . . . . . T T . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GT . . . T . . . . . A . C . . . . . . . . . . . . . G GG . . . . . . . . . . . . . . . . T . . GG A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . TCTCCGACTAA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . G A . . . . . CAGG . . TCC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . GT . . . . . . G . . GT . AAAATA . . G . . . . A . . . . . . . . . . . A . . G . . . . . . . . . T T . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CT . . . T . . . . . T . A . . . . . . . . . . . . . G GG . . . . . . . . . . . . . . . . T . . GG A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . TCTCCGTAAA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . T A . . . . . CAG . . TCG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . GT . . . . . . G . . G . AAATAT . . G . . . . A . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . T T . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CC . . . T . . . . . T . T . . . . . . . . . . . . . G G . . . . . . . . . . . . . . . . T . . GG A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . TCTCCGTAAA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . G G . . . . . TCA . . TCG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . GT . . . . . . G . . . . TA . . G . . . . T . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CT . . . G . . . . . T . T . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . TCTCCGTAAA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . T G . . . . . TCA . . TCG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . GT . . . . . . G . . . . AA . . G . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CT . . . T . . . . . T . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . TCTCCGTAA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . G A . . . . . TCA . . TCA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . GA . . . . . . G . . . . AT . . G . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TT . . . . . . . . . T . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . TCTCCGTAA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . G G . . . . . CA . . TAA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . GT . . . . . . G . . . . . . . G . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . T . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . TCAGTTCGT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . G G . . . . . T . . TCG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . G . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . TTCCGTAA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . G G . . . . . T . . TC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . TCGACGAG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . G T . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . TCGACGAG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . TCTGTAAA . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . TCGCCAA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . CCGTTA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . TC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqs : .
blockSeqCons : **** TCTCCGTAAA******************************** ** ** CAGG******************* TCG****** ****** ** GT GAAATAT****************** G**** ** ** ** G***** ** *** *** CT********* T* ** ** GG** A**** ** ********
originalCons : TCT-CGTG-C-A---AC----CAGACGC-T----C-GG-CTA-TCTC--C-GTA-A-A--T-C--------TCC-G-----T-------A----A-----CCG---AG--AG-TCT---GG-TAAA-GATA---C--G-C-G-A----AAA--CG--TTT--GTA--A-CGT--C-AAAA-CGAGGCT-T-AC-C--------AGA-A-TC-CC--GGT-A-T-----G--T----GA-TTT-GA---T-TGGCTGA-T-C-----A--GG-----------C--C-ACAA----T-C-GA-AAAT--AA-CG-A--C-T--A----TC-GAAG-AAAG-C-T---G-T-AAT-AG------A----T-TG--AAAG--T-GG-C----GTT---T--A-A-GCGT-G-A-GGATTT-AC-A----AGT---AG---AGTGTGTTTAG-A--------AA-----T---AT-AAAAT-G--ATAGAA--G--AGGAA--A-GGAT-----TT--ATT--AG--CT-G-TTC-T-A--CC--T--ACGGG-A--TA-TGAT-AAAA--C-CGTT----G-CG----TAT-TT-AA-TT--TT-A-C-CAAAATT-AC-T--TTGG--AG--GGC-A--AA-G-TGAA------A-----GTACG-ATT-T-C-C-AG-TT--GA--C-A-G-CG-AT-CG-C----GGTTTT-----T---CTGTT---GTAC-T--------GGTA-A-T--TTCTCCN-TTAGT--A-TC----------ACTAAT-GA-AG-TA-TC-AAT--TA-ATTAAC-A--TC-AAATCTTTCG-GAAT-TGA-CTGTG-TT-T-T--G--TGGG-GG-AG-ATT-CAAA-C--C-------G-AAACT-GAA-----TTAG-C--GC-TC-CCTA--G----CG-GT-AACAGTTA--T----TATC-G--CGGG----TCTTT---A-CCA-G--A-C-TCTC-TG-TT--C-G-T--CGG-AGA-T---T-T--GC--GTAG--ACA-A-C----CG-AG--------TGTC-T-G-G-TTG-A-ACGAGAC
finalCons : TCT-CGTG-C-A---AC----CAGACGC-T----C-GG-CTA-TCTC--C-GTA-A-ATCTCCGTAAA--------------------------------CCG---AG--AG-TCT---GG-TAAA-GATA---C--G-C-G-A----AAA--CG--TTT--GTA--A-CGT--C-AAAA-CGAGGCT-T-AC-C--------AGA-A-TC-CC--GGT-A-T-----G--T----GA-TTT-GA---T-TGGCTGA-TCAGG-------------------C--C-ACAATCG------A-AAAT--AA-CG-A--C-T--A----TC-GAAG-AAAG-C-T---G-T-AAT-AG------A----T-TG--AAAG--T-GG-C----GTT---T--A-A-GCGT-G-A-GGATTT-AC-A----AGT---AG---AGTGTGTTTAGAAATAT------------------AAAAT-G--ATAGAAG----AGGAA--A-GGAT-----TT--ATT--AG--CT-G-TTC-T-A--CC--T--ACGGG-A--TA-TGAT-AAAA--C-CGTTG-----CG----TAT-TT-AA-TT--TT-A-C-CAAAATT-AC-T--TTGG--AG--GGC-A--AA-G-TGAA------A-----GTACG-ATT-T-C-C-AG-TT--GA--C-A-G-CG-AT-CG-C----GGTTTT-----T---CTGTT---GTACT---------GGTA-A-T--TTCTCCN-TTAGT--A-TC----------ACTAAT-GA-AGT-A-TC-AAT--TA-ATTAAC-A--TC-AAATCTTTCG-GAAT-TGA-CTGTG-TT-T-T--G--TGGGGG--AG-ATT-CAAA-C--C-------G-AAACT-GAA-----TTAG-C--GC-TC-CCTA--G----CG-GT-AACAGTTA--T----TATC-G--CGGG----TCTTTA----CCA-G--A-C-TCTC-TG-TT--C-G-T--CGG-AGA-T---T-T--GC--GTAG--ACA-A-C----CG-AG--------TGTC-T-G-G-TTG-A-ACGAGAC
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|19 ): CATCGAAGTTCCCATACACATGTCACATGATGACCTAATATCCTGAATGGCAAGTCAATGTTACATGCTGTGGTCATCCTACAATGCTACACCTTGCAGGAAGTAATCGTTCGGCCATCTTATAAGAAGTAAGTCTCTACCTATCTATAGGAAGTAATATTCACCTATCTTTATAGCGAAGTAATAACTTCACCTATCTTATAGAAGTAATCAGTATTGTATAGGTTAAATTAACTATTGATGCGAAGTGACAGCAAGCATGAGGGAAGGGACTTGACATAGGATACATCTGCTGCTCAAACCCCCCTCCCATTCAGTA
Unaligned ( gi|21 ): AGAAACACAAGCACATCTGGAAGTTCCATGACCATCTATGTCACATGAGACATAATTTCCTGAATGGCAAGTCAATGTCTACATGCTTGGTCCACTCCTACATGCTACCATCCACTTTGCAGGAAGTAATCGTTCGCCTATCTTATAGGAAGTATTCCTTCACCTATCTTATAGGAAGTATATCCAGTATGCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGTATTGTAATAGGTTAATTAACTTTGTGCGAATGCAGC
Unaligned ( gi|22 ): TGACCATCTATGTCACATGAGACATAATTTCCTGAATGGCAAGTCAATGTCTACATGCTTGGTCCACTCCTACATGTACCATCCACCTTTGCAGGAAGTAATCGTTCGCCTATCTTATAGGAAGTACTTCCTTCACCTATCTTATAGGAAGTAATCCTAAAGTATGCAATAGGTTAATTAACTTTTGTGCGAATGCAGCATCATTAGGAGAGGGCTGACATATAGGTTCATCCTGCTGCCCAATCCCATCAGTAT
Unaligned ( gi|25 ): AGAAACACAAGCACATCTGGAAGTTCCATGACCATCTATGTCACATGAGACATAATTTCCTGAATGGCAAGTCAATGTCTACATGCTTGGTCCACTCCTACATGTTACCATCCACTTTGCAGGAAGTAATCGTTCGCCTATCTTATAGGAAGTAATCCTTCACC
Alignments
lowQualScore : 22222222222222222 22222222222222222222222 111111111 11 1 2222222222222222222222222 11111111111 1111111111 1111 1111
lowQualScore : 1 1 1 222 4444 1 6666 1 1 1 11 1 1 1 6666666666 2 00000000000000000 55555 0 22 3 666 1 1 999 44 1 1 5 4444 44 44 22 22 3 44 3 5 1 1 1 66666666 1 5 1 444 1 1 99999999 44444 1 1 444 1 0 1 99999999999999999999999 44 3 111111111 1 22 1 1 44 1 88 4444 1 3 3 1 1 999 1 3 1 555555 3333 1 22 0 44 1 33 4444 777 22 1 666 1 1 1 0 5 1 4444 2 333 333 11 5 0000000000000000000000000 2 44 77777 22 2 55555 22 666 22 2 2 2 4 55 22 55 2 33 4 44 33 2 666666 5555 2 2 7 33 4 2 4 4 4444 1 33 333 2 33 2 2 666666 55555 0 2 2 2 2 2 2 77 22 4 2 2 2 2 2 6666 55555 333 999 11111111111 2 2 66 77 22 2 3333333333 4 4 33 2 22 22 2 2 77 2 2 2 2 2 2 8 55 33 1 7777 2 2 2 33 7777777 2 2 55555 4 33 2 2 22 1111 4 2 6666666 2 22 777777 0 66666 2 22 3 1 1 2 33 1 1 11 2 3 222 1 11 11 0 33 2 1 0000 1 88888888 1 2 1 1 1 1
lowQualScore : . . . ... .... . .... . . . .. . . . .......... . ................. ..... . .. . ... . . ... .. . . . .... .. .. .. .. . .. . . . . . ........ . . . ... . . ........ ..... . . ... . . . ....................... .. . ......... . .. . . .. . .. .... . . . . . ... . . . ...... .... . .. . .. . .. .... ... .. . ... . . . . . . .... . ... ... .. . ......................... . .. ..... .. . ..... .. ... .. . . . . .. .. .. . .. . .. .. . ...... .... . . . .. . . . . .... . .. ... . .. . . ...... ..... . . . . . . . .. .. . . . . . . .... ..... ... ... ........... . . .. .. .. . .......... . . .. . .. .. . . .. . . . . . . . .. .. . .... . . . .. ....... . . ..... . .. . . .. .... . . ....... . .. ...... . ..... . .. . . . . .. . . .. . . ... . .. .. . .. . . .... . ........ . . . . . .
lowQualScore : 5 5 4 333 0000 2 7777 2 2 2 77 2 2 2 3333333333 7 33333333333333333 22222 8 00 1 111 5 8 333 55 9 9 7 0000 00 33 55 55 6 11 5 5 7 7 7 00000000 7 0 7 555 7 7 66666666 33333 7 7 666 7 6 7 55555555555555555555555 33 6 999999999 9 66 9 9 55 9 33 0000 9 8 8 9 9 000 9 6 8 222222 9999 8 55 5 55 9 11 0000 999 66 9 000 9 9 9 8 7 9 0000 0 555 555 55 0 2222222222222222222222222 0 88 22222 99 1 33333 99 555 99 1 1 1 2 00 99 00 4 22 7 99 22 4 222222 0000 4 4 1 22 7 4 7 4 0000 7 44 777 5 22 4 4 444444 66666 3 1 1 1 1 0 1 11 99 2 1 2 2 2 2 9999 66666 999 222 22222222222 2 2 11 66 99 1 4444444444 2 2 44 1 33 99 1 1 11 1 2 2 2 2 2 9 66 22 8 2222 4 4 4 22 6666666 4 4 99999 7 22 2 2 88 0000 0 0 4444444 1 99 999999 1 00000 1 66 8 8 3 7 11 3 3 88 5 8 222 2 77 77 8 00 5 2 6666 3 00000000 3 7 3 3 4 4
consensus : TCT-CGTG-C-A---AC----CAGACGC-T----C-GG-CTA-TCTC--C-GTA-A-A--T-C-----TCC-G-TA--------------AA-----CCGAG--AG-TCT---GG-TAAA-GATA---C--G-C-G-A----AAA--CG--TTT--GTA--A-CGT--C-AAAA-CGAGGCT-T-AC-C--------AGA-A-TC-CC--GGT-A-T-----G--T----GA-TTT-GA---T-TGGCTGA-T-C-----A--GG-----------C--C-ACAA----T-C-GA-AAAT--AA-CG-A--C-T--A----T-C-GAAG-AAAG-C-T---G-T-AAT-AG------A----T-TG--AAAG--T-GG-C----GTT---T--A-A-GCGT-G-A-GGATTT-AC-A----AGT---AG---AGTGTGTTTAG-A--------AA-----T---AT-AAAAT-G--ATAGAA--G--AGGAA--A-GGAT-----TT--ATT--AG--CT-G-TTC-T-A--CC--T--ACGGG-A--TA-TGAT-AAAA--C-CGTT----G-CG----TAT-TT-AA-TT--TT-A-C-CAAAATT-AC-T--TTGG--AG--GGC-A--AA-G-TGAA------A-----GTACG-ATT-T-C-C-AG-TT--GA--C-A-G-CG-AT-CG-C----GGTTTT-----T---CTGTT---GTAC-T--------GGTA-A-T--TTCTCCN-TTAGT--A-TC----------ACTAAT-GA-AG-TA-TC-AAT--TA-ATTAAC-A--TC-AAATCTTTCG-GAAT-TGA-CTGTG-TT-T-T--G--TGGG-GG-AG-ATT-CAAA-C--C-------G-AAACT-GAA-----TTAG-C--GC-TC-CCTA--G----CG-GT-AACAGTTA--T----TATC-G--CGGG----TCTTT---A-CCA-G--A-C-TCTC-TG-TT--C-G-T--CGG-AGA-T---T-T--GC--GTAG--ACA-A-C----CG-AG--------TGTC-T-G-G-TTG-A-ACGAGAC
Reference ( family-1405 ) : TCT-CGTG-C-A---AC----CAGACGC-T----C-GG-CTA-TCTC--C-GTA-A-A--T-C-----TCC-G-TA--------------AA-----CCGAG--AG-TCT---GG-TAAA-GATA---C--G-C-G-A----AAA--CG--TTT--GTA--A-CGT--C-AAAA-CGAGGCT-T-AC-C--------AGA-A-TC-CC--GGT-A-T-----G--T----GA-TTT-GA---T-TGGCTGA-T-C-----A--GG-----------C--C-ACAA----T-C-GA-AAAT--AA-CG-A--C-T--A----T-C-GAAG-AAAG-C-T---G-T-AAT-AG------A----T-TG--AAAG--T-GG-C----GTT---T--A-A-GCGT-G-A-GGATTT-AC-A----AGT---AG---AGTGTGTTTAG-A--------AA-----T---AT-AAAAT-G--ATAGAA--G--AGGAA--A-GGAT-----TT--ATT--AG--CT-G-TTC-T-A--CC--T--ACGGG-A--TA-TGAT-AAAA--C-CGTT----G-CG----TAT-TT-AA-TT--TT-A-C-CAAAATT-AC-T--TTGG--AG--GGC-A--AA-G-TGAA------A-----GTACG-ATT-T-C-C-AG-TT--GA--C-A-G-CG-AT-CG-C----GGTTTT-----T---CTGTT---GTAC-T--------GGTA-A-T--TTCTCCN-TTAGT--A-TC----------ACTAAT-GA-AG-TA-TC-AAT--TA-ATTAAC-A--TC-AAATCTTTCG-GAAT-TGA-CTGTG-TT-T-T--G--TGGG-GG-AG-ATT-CAAA-C--C-------G-AAACT-GAA-----TTAG-C--GC-TC-CCTA--G----CG-GT-AACAGTTA--T----TATC-G--CGGG----TCTTT---A-CCA-G--A-C-TCTC-TG-TT--C-G-T--CGG-AGA-T---T-T--GC--GTAG--ACA-A-C----CG-AG--------TGTC-T-G-G-TTG-A-ACGAGAC
gi|1 : TCT-CGTG-C-A---ACG---CAGACGC-T----C-GG-CTA-TCTC--C-GTA-------------------------------------------CCGAG--AG-TCT---GG-TAA--GATA---C--G-C-G-A----AAA--TGGTTTT--GTA--AACGTT-C-AAAA-CGAGGCT-T-AC-C--------AAA-A-TC-CT--GAT-A-T-----T--A----AA-TTT-GA---T-TGGCTGAAT-CGC---A--GG-----------C------AA----TGC-CA-AACT--AA-CG-A--C-T--A----T-CCGAAG-AAAG-C-T---GCT-AAT-AACATGTAA----T-TG--AAAG--TCGG-C----GTT---TTTA-A-GTGT-G-A-GGATTT-AC-A----AAT---AG---AG-GTGTTTGG-GGGGGGTAGAA-----T---AT-AAA-T-A--ATAGAA--GC-AGAAA--A-GGAT-----TT--ATT--AGGCTT-G-TTC-TTA--CCGCT--ACGGT-AAGTA--GAT-AAAA--A-CGTT----GGCG----TAT-TT-AA-TT--TT-AGC-CAAAATTCAC-T--T--G--AA--GGC-A--AA-G-TAAA------A-----GTATA-ATT-T-T-CTAG-TTT-GA--GGA-G-CG-AT-CG-C----GGTTTT-----TTTCCTGTTT--GTA--T--------GTTA-A-T--TTTTTCT-TTAGT--A----------------AAT----------CT-AAT--T---TTAAC-AA-TA-AAATCTTTTG-AAAT-TGA-CTGTG-TT-T-TT-G--TGGG-G--AG-ATT-CAAAGC--C-------G-AAACT-GAA-----TTAGGC--GC-TC---TA--G----GGCGT-AACAATTA--T----TATC-G--CGGG----TCTTTTTAA-CCA-G--AGC-TCTC-TG-TT--C-G-T--CGGAAGA-T---T-TGCGC--GTAG--ACATG-C----CG-AAAT------TGTT-TGG-G-TTG-AGGCGAGA
gi|10 : TCTACGTG-C-A---ACGTACCAGACGC-T----C-GG-CCA-TCTC-------------------------G-TA--------------AA-----CCGAG--AGCTCT---GGATAAAAGATA---C--G-CCG-A----AAA--CG--TTT--GTA--A-CGT--C-AAAA-CATGACT-T-AC-C--------AGA-A-TT-CT--GGT-A-T-----G--T----GA-TTTGGA---T-TGGCTGA-T-C-----A---G-----------C--C-ACAA----T-C-GA-AAAT--AA-CG-A--C-T--A----T-CGGAAG-AAAG-C-T---G-T-AAT-AG------A----T-TG--AAAG--T-GA-C----GTT---T--A-A-G-GT-G-A-GGA-TT-AC-A------T---AG---A--GTGTTTAG-A--------AA-----T---AT-AAAAT-G--ATAGAA--G--AGAAA--A-GGAT-----TC--ATT--AG--CT---TTC-T-A---C--T--ACGGG-A--CA-TGAC-----------TT----G-CG----TAT-TT-AA-TT--TTGA-C-CAAATTT-AC----TTGG--AG--GGC-A--AA-G-TGAA------ATACATGTATG-ATT-T-C-C-A--TT--GA--C-A-G-CG-AT-CG-C----GGTTTT-----T---TTGTT---GTAT-T--------GGTA-A-C--TTTTCC--TTAGT--A-TC----------ACTAA--GACAG-TA-TT-AAT--TA-AAGAACAA--TC-AAATCTTTC--GAAT-TGA--TGTG-TT-T-T--G--TGGG-G---A-ATT-CAAA-C--C-------G-AAACT-GAA-----TTAG-C--GC-TC-CCTA--GGCACCGAGT-AAAAGTTG--T----
gi|11 : gT---GG-TATA-GACA---C--A-C-G-A----TGA--CG--TTT---TA------------------------C-AC-C--------AGA-AATC-TC--GGT-A-T-----T--C----AG-TCC-CA---T-TGGTTGA-T-T---------------------C--C-ACAAACCTT-C--A-AAAC--AA-CG-A--T-T--A----C-T-GAAG-AAAG-T-TC--G-C-AGT-AC------A----T-TG--AACG--C-GG-C----GTT------------GT-G-----------C-A----AGC---AG---AGTAT-TTAAA-A--------AA-----T---GT-----T-G--A--AAA--G--GGGTA--A-GTAT-----TT--ACT--TG--CT-G-CTC-T-A--CC--T--TAGGG-A--TA-T-AT-A----------T----G-TG----TAC-AC-AA-TT--TT-A-C-CAAAATG-AC-T--TTGA--AA--GGC-A--AAAG-TTAA------A-----ATACG-ATT-T-C-T-AG-CT--AA--C-A-G-CG-AT-CG-C----GGCTTTAATTTT---CTATT---GTAG-T--------GATG-A-A--TTCTCCA-TTAGT--A-TC----------ACTAAT-GA-AG-TA-TC-AAC--TA-ATAACC-A--TC-CAATCTTTCG-GAAT-TGA-CTATG-TT-TAT--A--CCGG-TG---------AAG-C--A-------G-ATGCT-AAA-----TTAG-C--AC-TC-CCTA--G----TG-GT-AATAGTTA--T----TATC-G--CAAG----TT------------G--A-C-TCTC-AG-CT--C-G-T--TTG-AGA-T---T-T--GC--GGAG--ACA-G-C----CG-AG--------CGTC-T-G-G-TTC-A-ACGAGAaacc
gi|12 : gaatctatAA--CG--TTT--GTA--A-CGT--C-AGAA-CGAGGTT-T-AC-C--------AAA-A-TT-TC--GGT-A-T-----T--TCATTAA-TTT-GA---T-TGATTCA-C-C-----A--CA-----------C--CTCCAA----T---------T--AA-CG-A--C-T--A----T-C-GAAG-AAA------------AA---------------------AACG--T-TG-C----ATT---T--A-A-ACCT-A-A-GAACTT-AC-A----ATT---AG---AGTGT--TTA-------------------------AAAAT-G--TTGGAA-----AGAAA--A-TTAT-----TT--ATT--TG---T-G-TTC-T-A--CG--T--------------TG-T-AAA---------------CG----TAT-TA-AA-TT-----A-C-CAA--TT-AC-T--T-----AG--AGC-A--AA-G-TGAA------A-----GCACG-ATT-T-C---AG-CT--GA--C-A-G-CG-AT-CG-C----AGTTTT-----T---CTGTT---ACAG-T--------GGTA-A-T--TTCCCCA-TTAGT--A-TC----------ACTAAT-GA-AG-GA-TC-AAC--TA-ATTACC-A--TC-AAATCTTTCG-AAAT-TAA-CTATG-TT-TCT--G--TCGA-AG-AG-ATT-CAAA-C--C-------G-AAATC-AAA-----TTAG-C--GC-TC-CCTA--G----CG----AACAGTTA--A----TATC-G--CG------------------A-G--A-C-TTT---G-CT--C-G-T--CGA-AGA-T---T-T--GC--GGAG---CA-C-CA---CG-AG--------TGTC-T-G-G-TTT-A-ACGAGA
gi|13 : AA--CG--TTT--GTA--A-CGC--C-AGAA-CGAGGTT-T-AC-C--------AAA-T-TT-TC--GGT-A-T-----T--T----CA-TTA-GA---T-TGATTGA-TTC-----A---------------C--C-ACAC----T-T-CC-AATT--AA-CG-A--C-T--A----T-C-GAAG-AAAT-T-T---G-T-AAT-AT------A----T-TG--AATG--T-TG-C----ATT---T--A-A-ACCT-A-A-GAACTT-AC------ATT---AG---AG-GTTTTT-------------------T---A--AAAAT-G--TTTGGA--A--AGAAA--A-TTAT-----TT--ATT--TG--CT-G-TTC-T-A--CC--T--Att
gi|13 : --AA-G-TGAA------A-----GCACG-ATT---C-C-AG-CT--GG--C-A-G-CG-AT-CG-C----AGTTTT-----T---CTGTT---ACATGT--------GGTA-A-T--TTCCCCCATTAGT--A-TC----------ACTAAT-GA-AG-GA-TC-AAC--TA-AT---C-A--TC-AAATCTTTCG-AAAT-TAA-CTATG-TT-TCT--G--TCGA-AG-AG-ATT-CAAA-C--C-------G-AAATC-AAA-----TTAG-C--GC-TC-CCTA--G----CG-GT-AACAGTTA--A----TATC-G--CG------------------A-G--A-C-TTT---G-CT--C-G-T--CGA-AGA-T---T-T--GC--GGAG--TCA-C-CA---CG-AG--------TGTC-T-G-G-TTT-A-ACGAGAagtgaaagcacgattccagctggcagcgatcgcagtttttctgttacatgtggtaatttcccccattagtatcactaatgaaggatcaactaatcatcaaatctttcgaaattaactatgtttctgtcgaagagattcaaaccgaaatcaaattagcgctccctagcggtaacagttaatatcgcgagactttgctcgtcgaagatttgcggagtcaccacgagtgtctggtttaacgagatt
gi|14 : aacgtttgtaacgccagaacgaggtttaccaaattttcggtatttcattagattgattgattcaccacacttccaattaacgactatcgaagaaatttgtaatatattgaatgttgcatttaaacctaagaacttacattagaggttttttaaaaatgtttggaaagaaaattatttatttgctgttctacctT-GA---T-TTGTTGA-TTC-----A---------------C--C-ACACC---T-C-CA-A--T--TA-CG-A--C-CTAA----T-C-GAAG-AAA-----------------------------------AACG--T-TG-C----ATT---T--A-A-ACCT-A-A-GAACTT-AC-A----ATT---AG---AGTGT--TTA-------------------------AAAAT-G--TTGGAA--A--AGAAA--A-TTAT-----TT--ATT--TG--CT-G-TTC-T----CC--T--ACGG--A--TA-TGGT-AAAA--C-TGTT----G-TG----TAT-TA-AAGTT--TT-C-C-AAAAATT-AC-T--T-AG--AA--GGC-A--AA-G-TGAA------A-----GC-CG-ATT-T-C-C-AG-CT--GA--C-A-G-CG-AT-CG-C----AGTTTT-----T---CTGTT-----AG-T--------GGTA-A-T--TTCCCCA-TTAGT--A-TC----------ACTAAT-GA-AG-GA-TC-AAC--TA-ATTACC-A--TC-AAATCTTTCG-AAAT-TAA-CTATG-TT-TCT--G--TCGA-AG-AG-ATT-CAAA-C--C-------G-AAATC-AAA-----TTAG-C--GC-TC-CCTA--G----CG--T-AACAGTTA--A----TATC-G--CG------------------A-G--A-C-TTT---G-CT--C-G-T--CGA-AGA-T---T-T--GC--GGAG--TCA-C-CA---CG-AG--------TGTC-T-G-G-TTT-A-ACGAGAtt
gi|15 : taA--CG--TT---GTA--A-C----C-AAA---GAGTTT-A-AC-C--------AAA-T-TT-TC--GGT-A-A-----T--T----CA-ATA-GA---T-TGA-TGA-TTC-----A---------------C--C-ACAT----T-C----AATT--AA-CG-A--C-TA-A----T-C-GAAG-AAAATT-T---G-T--AT-AT------A----T-TG--AATG--T-TG------ATT---T--A-A-GCCT-A-A-GAACTTAAC-A----ATT----G---A--GTGTTTAA-A----------------------AAAAT-GTTATGGGA--A--AGAAATTA-GG-------TT--ATT---G--CT---TTC-T-AT-CC--T--At
gi|15 : A------A-----GCACA-ATTGT-C-C-AG-CT--GG--C-AAG-CGGAT-CG-C----AGTTTT---------CTGTT---CCAG-T--------G-TAGA-T--TTC--CA-TTAGTTAA-TC------------TAATAGAGAG-AA-TC-AAGGATA-AT--AC-A--TC-A--TCTT-CGCAAAT-TAA-CTATG-TT-T-T--G--TGAG----AG-ATT-CAAA-CTTC-------G-AAA-T-AAA-----TTAG-CACGC-TC-CTGA--G----CG--T-AACAGTTA--A----TATG-G--C------------------------A-C-T----TG-CT--C-G-T--C-G-AGA-T---T-T--GC--GGAG--ACA-C-CCA--CG-AG--------TGT--T-G-G-TTA-A-gatgaagcacaattgtccagctggcaagcggatcgcagttttctgttccagtgtagatttccattagttaatctaatagagagaatcaaggataatacatcatcttcgcaaattaactatgttttgtgagagattcaaacttcgaaataaattagcacgctcctgagcgtaacagttaatatggcacttgctcgtcgagatttgcggagacacccacgagtgttggttaagat
gi|16 : acgttgtaaccaaagagtttaaccaaattttcggtaattcaatagattgatgattcaccacattcaattaacgactaatcgaagaaaatttgtatatattgaatgttgatttaagcctaagaacttaacaattgagtgtttaaaaaaatgttatgggaaagaaattaggttattgctttctatcctagatgAG--GG-TCT---GG-TAAA-GACA---C--G-C-G-A----TAA--CG--TTT--GCA--A-CAT--C-AGAA-CGAGGTT-T-AC-C--------AAG-A-TT-TC--AGT------------------A-TTT-GA---T-TGGTTGA-gat
gi|16 : cnnnnnnnnnnnnnn-AG-TT--GA--C-A-G-CG-AT-CG-C----GGTGTT-----T---CTGTT---GTAC-T--------GGTA-C-T--TTCTCCA-TTTGT--A-TT----------CTTAAT-GA-AA-TA-TC-AAC--TA-ATTAAC-A--TC-AAAcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagttgacagcgatcgcggtgtttctgttgtactggtactttctccatttgtattcttaatgaaatatcaactaattaacatcaaa
gi|17 : cnnnnnnnnnnnnnnagggtctggtaaagacacgcgataacgtttgcaacatcagaacgaggtttaccaagatttcagtatttgattggttgacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnACGC-T----CCGG-CTA-TCTC--T-CCA-T-C--C-C-----TCC-G-TTT-------------AATTTTTCAGAG--AG-TCTT--GG-TAAG-GATA---CCAG-C-A-ACTTTGAA--CG--TTTTTGTAGGA-CG---C-TAAA-CGAGGCT-TGAC-CTAGCGCGAAAA-A-TCATT--GGT-A-TAGGTTG--C----AG-TTT-GACTCT-TGGATGA-T-C-----A--GG-----------A--C--CAA----TCC-AA-AAATAAAA-CGAA--CGT--AAGTTT-C-GAAG---AG-T-TATAG-T-ATT-AG------A----T-TGAAAAAA--T-GA-CAGTTGTT---T--A-GTGGGT-G-ATGGAGAT-AT-ATCGTACT---GGATCAGTGT-CTTAG-ATAT-----AATTTATT---AT-ATTAT-G--TTGGAA--GA-AGGAA--A-GGATGATACTTTAATT--AG---T-G-TTT-TAA--CC--TTAAAGGG-A--TA-TGAT-TAAAGGC-CGTTGCTGG-CG----TATGTT-AA-TTTATT-A-C-CAAAATT-
gi|18 : -A---AC----CAGACGC-T----T-GG-CTG-TCTC--C-ATA-G-A--T-T-----TCC-GACG--------------AG-----TAGAG--AG-TCT---GG-TAA----------------------------CG--TTT--GTA--A-AGT--C-AGAA-CGATGCT-T-GC-C--------AAA-T-TA-CT--GCTCA-T-----GACT----GA-TCT-GA---T-TGATTGA-T-T-----GATGGATTGATTAATTCAAC-ACACC---T-C-CC-AAAT--AA-CA-AG-C-T--T----T-C-GAAG-AAAT-T-T---G-T-AAT-AG------A----T-TG--AATG--C-GC-C----GTT---T--A-A-GCTT-A-A-GGATTT-AC-A----ACT---AA---AGTGT-TTC-------------A-----T--------AAT-G--TTGCAA--A--AAGAA--A-GGAT-----TT--A-C--A----T-G-----T-A--TT--T--ACAAG-A--TA-TGGC--AAA--C-CATT----C-TG----TAT-TC-AA--G--TT-A-C-CAAGATT-AC-T--TGAG--AG--GGA-A--GA-G-TAAA------A-----TTACA-ATT-T-T-C-ct
gi|2 : ---AC----CAGACGC-T----C-G--CTA-TCTC--C-GTA-A-AA-T-C-----TCC-G-TG--------------AA-----TCGAG--AG-TCT---GG-TAAA-GATA---C--GGC-A-A----AAAAACG--TTT--GTA--AACGT--C-AAAA-CGAGGCTCT-AC-C--------AGA-AATC-CT--GGT-A-T-----G--T----GAATTT-GAA--T-TGGCTGA-T-C-----A--GG-----------C--C-ACAA----T-CCGA-AAAT--AA--G-AAAC-T--A----A-C-GAAG-AC-G-C-T---G-CGAAT-AG------A----TCTG--AAAG--T-GAAC----GTT---A--A-AAGTGTTG-A-GGATTTTAC-A----AGT---AG---AAAGTGTTTAG-A--------AA-----T---AT-AAAAT-G--ATAGAA--G--AGGAA--A-GGAT-----TT--ATTA-AG--TT-G-TTCTT-A--CC--TA-ACGGG-A--TA-AGATCACAA--C-CGTT----G-CG----TAT-TTCAA-TT--TT-A-CGCAAAATT-AC----TTGG--AG--TGC----AA-G-TGAA------A-----GTATG-ATT-TCC-C-AGTTT--GA--C-A-G-CG-AT-CG-C----GGTTTT-----T---CTGTTGTAGTAC-T--------GGTA-A-A--TTTTCCT-TTAGT--A--C----------ACTAAT-GA-TG-TA-TT-AAT--TA-ATTAAA-A--TCAAAATCTTTTG-GAAT-TGA-CTGTG-TT-T-T--G--T--G-GG-AG-ATT-CAAA-C--C-------G--AACT-GAA-----TTAG-C--GC-T--CCTA--GC---CG-GTCAACAGTTATCT----TATCTG--CGGG----TCTTT---A-CCA-AGCA-C-TCTC-TGTTT--C-G-T--CGG-AGA-T---TCT--GC--GTAG--ACA-AGC----CG-AG--------TGTC-TGG-G-TTG-A-
gi|20 : -AAT-TG------A----T-TG--AATG--T-GG-T----ATT---T--A-A-GCTT-A-A-AGATTT-AC-A----ACT---AG---AGTGT--TTA-------------------------AAAAT-G--TTGGAA--A--AGGAA--A-GGAT-----TT--ATT--TG--CT-G-TTC-T-A--CC--T--ACAGG-A--TA-AGGT-AAAA--C-AGTT----T-TG----TTT-CA-AA-TT--TT-A-C-CAAGATT-AC-C--TTGG--GA--GGCAA--AA-G-TGAA------A-----GAACG-AAT-T-C-C-AG-CT--GA--C-A-G-CA-AT-CG-C----AGTTTT-----T---CTGTT---GTGG-T--------GGTG-A-T--TTCCACA-TTCGT--A-TCAGTGGTGATTACTAAT-GA-AG-GA-TC-AGT--TA-ACTACC-G--TT-AACTCTTTCA-GTAT-TGA-CTGCG-TT-T-aacga
gi|23 : TCT-CGTG-C-A---AC----CAGACGC-T----C-GG-CTA--CTC--C-ATA-A-A--T-C-----TCC-G-TA--------------AA-----CCGAA--AG-TCT---GG-TAAA-GATA---C--G-C-A-A----AAA--CG--TTT--GTA--A-CGT--C-AAAA-CGAGGCT-T-AC-C--------ATA-A-TC-CT--GGT-A-T-----T--T----AA-TTT-GA---T-TGACTGA-T-----------------------C--C-ACAC----T-C-CA-AAAT--AA-CG-A--C-T--A----T-C-GAAG-AAAG-C-T---G-T-GAT-AG------A----T-TG--AAAG--T-GG-C----GTT---T--A-A-TTGT-G-A-GGATTT-AC-A----ACT---AT---A--GTGTTTAG-A--------AA-----T---AT-AAAAT-A--ATAGAA--G--A
gi|24 : gTG-C-A---AC----CAGACGC-T----C-TG-CTA-TCTG--C-GTA-A-A--T-------TCC-G-T---------------AA-----CGGAG--AG-TCT---GT-TAAA-AATA---C--G-C-GAA----AAA--CG--TTT--GTT--A-CGT--C-AAAA-CGA-GCT-T-AC-C--------AAA-A-GC-C------------------T----GA------------TGGCTGA-T-----------------------C--C-ACAA----T-C-CAGAAAT--AA-CG-A--C-T--A----T-C-GAAGTAAAG-C-------T-AAT-AA-------------TG--AAAG--T-G-------------C--A-A--------A-GGATTT-AC-A----AGT---AG---A--GTGTTTAA-A--------AA-----T---A----------------------AGGAA--A-GGAT-----TT--ATT--
gi|26 : tttcCT-TGTT-C-A---AC----CAAACAC-T----C-AG-CTG-TCTC--C-ACA-A-A--T-C-----TTC-GACG--------------AG-----CAGAG--AG-TAC---GA-TAAA-AATT---C--A-A-G-A----TAA--CA--TTT--GTA--A-CAT--C-AGAA-CGAGGCT-T-AC-T--------AAA-A-TT-TC--ATT-A-T-----T--T----AA-TTT-GG---T-TGt
gi|27 : ---GG-TATA-GACA---C--A-C-G-A----TGA--CG--TTT---TA------------------------C-AC-C--------AGA-AATC-TC--GGT-A-T-----T--C----AG-TCC-CA---T-TGGTTGA-T-T---------------------C--C-ACAAACCTT-C--A-AAAC--AA-CG-A--T-T--A----C-T-GAAG-AAAG-T-TC--G-C-AGT-AC------A----T-TG--AACG--C-GG-C----GTTGTGC--A-A-GCA--G-A-GTATTT-AA-A----Atttcaatacacctccaaa
gi|28 : -CGTG-C-A---AC----CAGACGC-TT---C-GG-CTA-TCTC--CCGTA-ATA--TTC-----TCC-G-TA--------------AA-----CCGAG--AG-TCT---GG-TAAA-GATAATTC--G-C-GAA----AAA--CG--TTT--GTA--A-CGT--CGAAAA-CGAGGTT-T-AC-T--------CGA-A-TC-CC---GT-A-T-----a
gi|29 : gtctagAGT--A-TC------------TAAT-GT-AG-AT-TC-AAC--TA-ATTACC-A-------AT-----G-G----TGA-TTATG-AT-T-T--G--T--------------CAGA--------------AAGTT-AAA-----TTAG-C--GC-TC-CCTA--G----CG-GT-ACCAGTT---------------------------TT---A-CCA-G--A-C-TCT-----------------GA-AGA-T---T-T--GC--GGAG--ACA-G-T----CG-AA--------CATC-C-G-G-TTG-A-ACcccagggtttggaat
gi|3 : --C-AAAATCGAGGCT-T----C--------AGA-A-TC-TCCTGGT-A-T-----G--T----A---TT-GA---T-TGGCTGA-T-CCAGACA--GG-----------C--C-ACAA----T-C-GT-TAGT--AAACG-A--C-TG-A----T-C-GAAGGAAAG-CAT---G-C-AAT-GG------AGTTCT-TG--AAAGG-T-GA-C----GTTA--T--A-A-AGGT-G-G-CGATTTTACTA----AGTTATAG---AGATTTTGTAG-A--------AA-----TTTGAT-AAA-T-GT-ATAGAA--GGAAGGAA--ATAGAT---------ATT--AG--CTAG-TTC-T-AACCT--T--ACGGA-A--TA-TGAT-AAGA--CGCGTT----G-CGATTATAT-TT-AA-TT--TT-A-CTCAAAATT-AC-TATTTGGTGAGACGGC-ACAAA-G-GGAATCGTAAA-----GTGAG-TGT-C-C-C-AG-TTT-GAATC-A-GGTG-ATTCG-CTGACAGTTTT-----T---CTCGT---GTAT-TTGCTCTGTGGTA-AATGATTCCCCT-TTAGT--A-TCC---------ATTAATTGA-AG-TA-TTTAAT--TA-ATTAAC-AA-TC-AAATCTATCG-GAAT-TCA-CTGTG-TTCT-T--GTTTGGG-GATAG-CTG-CAAA-C--TCGAGTGAG-AAACT-GAAATCTGCTGG-C--G-----CCTATTGCT--CG-GT-AG-AGTTA--TTGTATACC-GATCTGGAGCTTCTTT---A-CCA-G--AGCGTCTCTTGTTT--C-G-TTCCGGCATA-T---C-T--GC--GTAGTTACATA-C----CG-A---------TGAC-T-G-G-TTG-A-ACGAGACa
gi|30 : G-ATTACATA-C--C-------G-TA-CT-CTA-----TCAG-C--GC-TC-CCTA--G----CG-GT-AACAGTTA--T----TATC-G--AGCA----TCTTT---A-CTA-G--A-C-TCTC-TG-CT--C-G-T--AAG-AAA-----T-T--GC--GGAG--ACA-G-C----TG-AG--------TGTC-T-A-G-TTG-A-ACAAGAC
gi|31 : CTA--G----CG-GT-AACATTCA--T----TATC-G--CGAA----TCTTT---A-CCA-G--A-C-TCTC-TT-CT--C-G-T--GGT-AAA-T---T-T--GA--GAAG--GCA-G-C----CG-AG--------CGTC-T-G-G-TTG-A-ACGAGAC
gi|32 : aaattccaaataatccatCTA--GA---CG-CT-GACGGCTA--T----CTCC-G--TAAA----TCTCT---G-TAA-A--A-C-T-----G-TT--C-G-T--CGG-AGA-T---T-T--GCGTGTAG--ACA-A-C----CG-AGTAGTGTTATGTC-T-G-G-TTC-A-ACGAGACt
gi|33 : cgtgcaaTCT-CGTG-C-A---AC----CAGACGC-T----C-GG-CTA-TCTC--C-GTG-A-A--T-C-----TCC-G-TA--------------AA-----C
gi|33 : gCT-CGTT-C-A---AC----CAGACAC-TTGCAT-GG-TTG-TCTA--C-GCA-A-A--T-C-----GCCAA-CG--------------AA-----C--AG--AG-TTTAC-GG----A-GATT---C--A-C-G-G----AGA--tctgttcgttggcgatttgcgtagacaaccatgcaagtgtctggttgaacgag
gi|33 : gtctcgtgcaaccagacgctcggctaCTC-TG-TT--C-G-T--TGG-CGA-T---T-T--GC--GTAG--ACA-A-CCATGCA-AG--------TGTC-T-G-G-TTG-A-ACGAG
gi|34 : gtctcgtgcaaccagacgctcggctatctccgtgaatctccgtaaaCT-CGTG-C-A---AC----CAGACGC-T----C-GG-CTA-TCTC--C-GTA-A-A--T-C-----TCC-G-TA--------------AA-----CT------G-TTC---GT-TGGA-GATAATTC--G-C-G-T----AGA--C
gi|34 : C-TG-TT--C-G-T--TGG-AGA-TAATT-C--GC--GTAG--ACA-A-C----CG-TG--------TTTC-T-G-G-TTG-A-ACGAGACaaccgtgtttctggttgaacgagact
gi|35 : ctcgtgcaaccagacgctcggctatctccgtaaatctccgtaaaC-TC-CCTA--G----CG-GT-AACAGTTA--T----TATC-G--CGGG----TCTTT---A-CCA-G--A-C-TCTC-TG-TT--C-G-T--CGG-AGA-T---T-T--GC--GTAG--ACA-A-C----TG-AG--------TGCC-T-G-G-TTG-A-ACGAGACt
gi|36 : TCT-CGTG-C-ATGAGC----CAGACGC-T----C-GGCCTA-TCTC--T-ATA-A-A--C------------------------------------CCAAG--AGATCTGGGGG-TAAA-GATATC-C--G-C-GAA----AAA--CAT-TTT--GTA--A-CGT--C-t
gi|37 : gTCT-CGTG-C-A---AC----CAGACGC-T----C-GG-CTA-TATC--C-GTA-A-A--C-C-----T
gi|37 : C-TG-TT--C-G-T--CGG-AGA-A---T-T--GC--GTAG--ACA-A-C----CA-AG--------TGTC-T-G-G-TTG-A-ACgttcgtcggagaattgcgtagacaaccaagtgtctggttgaac
gi|38 : tctcgtgcaaccagacgctcggctatatccgtaaacG-ATT-T-C-C-AG-TT--GA--C-A-G-CA-AT-CG-C----GGT-----------------------------------------T--TTCTCCC-TTAGT--A-TC----------AC---------------------------TAAC-A--TT-AAATTGTTCG-AAAT-TGA-CTGT--CT-T-T--G--TG
gi|39 : C-C--------AAG-A-TT-TC--GGT-A-T-----T--T----GA-TTT-GA---T-TGGTTGA-T-C-----A--------------------AAAA----T-C-CA-AAAT--AA-CG-A--C-T--A----T-C-GAAG-AAAG-C-T---G-T-AAT-GG------A----T-TG--A
gi|4 : T-CGTGGC-A---AC----CAGACGC-T----C-G--CTAATCTC--C-GTA-A-A--C-T-----TCCCG-TA--------------AT-----CCGAAGAAG-TCT---GG-TAAA-GATA---C--G-C---A----AAA--CG--TT---GTA--A-CGT--C-AAAA-CGAGGCT-T-AC-C--------AGATA-TC-CT--GGT-AAT-----G--T----GA-TTT-GA---T-TGGCTGA-T-C-----A--GG-----------C--C-ACAA----T-C-GA-AAAT--AA-CG-A--C-TT-A----T-C-GAAG-AAAG-C-T---G-C-AAT-AG------A----T-TG--AAAG--T-GA-C----GTT---A--A-A-GTGT-GAA-GGATTT-AC-A----AGT---AG---AGTGT-TTTAGAA--------AA-----T---AT-AAAAT----ATAGAA--G--AGGAA--T-GATT-----TT--ATT--AG--CT-G-TTC-T-C--CC--T--ACGGG-A--TA-AGAT-ACAA--C-CGTT----G-CG----TAT-TT-AATTT--TT-A-C-C-AAATT-AC-T--TTGG--A---TGC-A--AA-G-TGAA------A-----GTATG-ATT-T-CTC-AG-TTTGAA--C-A-C-GG-AT-CGCC----GGTTTT-----T---CTGTT---GTAC-T--------GGTA-A-A--TTTTCCT-TTAGT--ACCC----------ACTAAT-GA-AGTTA-TA-AGT--TA-ATTAAA-A--TA-AAATCTTTTG-GAAT-TGATCTGTGTTT-T-T--G--TGGGAGG-AG-ATT-CAAA-C--C-------GAAAACT-GAA-----TTAG-C--GC-TCACCT---G----CG-GT-AACAGTTA--T----TATC-G--C-GG----TCTTT---AGCCA-G--A-C-TCTC-TG-TT--C-G-T--CGG-AGA-T---T-T--GC--GTAG--ACA-A-C----CG-AG--------TGTCGT-G-G-TTGAA-ACGAGAC
gi|40 : TCT-CGTG-C-A---AC----CAGACGC-TC---C-GG-CTA-TCTC--C-GTA-A-A--C-C-----GTC-G-GAGATTTGTGTTGAGCAA-----CCGAG--TG-TCT---GG-T
gi|41 : T-CGTG-C-A---AC----CAGACGCCT----C-GG-CTA-TCTC--C-GTA-A-ACGT-CGGAGATTT-G-TGTTGAC---------AA-----CCGAG--TG-TCT---GG-Ttgaacg
gi|41 : -TCTC-CG-TAAAC-G-T--CGG-AGA-T---T-T--GT--GTTG--ACA-A-C----CG-AG--------TGTC-T-G-G-TTG-A-tgaa
gi|42 : tcgtgcaaccagacgcctcggcta-TG-TTG-C-A-T--CGG-AGA-T---T-T--GC--GTAG--ACA-A-CG---CG-AAT-------TGTC-T-G-GTTTG-A-ACGAAAC
gi|43 : gcgtaatttccgtaaacgt-CGTG-CCA---AC----CAGACGC-TTT--C-GG-CTA-TCTCTCC-GTG-A-A--T-C-----TCC-G-TA--------------AA-----CCG-G--AG-TTT---t
gi|44 : --A-C-T-TC-TG-AT--G-G-G--TGG-AAA-T---T-T--AC--GGAG--ATA-G-C----CA-AG--------TGTC-T-G-G-TTG-C-ATGAGACatgttcgtcagaga
gi|44 : aTCT-CATG-C-A---AC----CAGACAC-T----T-GG-CTA-TCTC--C-GTA-A-A--T-T-----TCC-attctctgttcgtcg
gi|45 : ag---AC----CAGACGC-T----C-GG-CTA-TCTC--C-GTA-A-A--T-C-----TCC-G-acccatcagaagtattctctgttcgtcg
gi|45 : ccC-TG-TT--C-G-T--CAG-AGA-T---T-T--GC--ATAG--ACA-A-C----Cacctgttcgtcagagatttgcatagacaacca
gi|46 : ccaccagacgctcggctatctccgtaaatctccgacT--C-G-T--CAA-AGA-T---T-T--GC--GGAA--ACA-G-C----CG-GG--------TGTC-T-G-G-TTG-A-AAGAGACa
gi|47 : aatctccgacaagcaatgTCT-CGTG---A---AC----CAGACGC-T----C-GG-CTA-TCTC--C-GTA-A-A--T-C-----GAC-G-----------------AG-----CAGAG--AG-TAG---GG-TAA
gi|48 : TCT-CGTT-A-T---AC----CAGACAC-T----C-GG-TTG-TCTA--C-GCA-A-A--T-C-----TCG-G-TT--------------TA-----CGGAG--At
gi|48 : taaaG-AGA-T---T-T--GC--GTAG--ACA-A-C----CG-AG--------TGTC-T-G-G-TAT-A-ACGAGACc
gi|49 : taaatctccgtaaaccCT-C-AC-C--------AAA-A-TT-TT--GGT-A-T-----T--T----AA-TTT-GA---T-CAGTTGA-T-T-----A--AA-----------CA-C-AC
gi|5 : gcT-CGTG-C-A---AC-----AGACGC-T----C-GG-CTA-TCTC--C-GTA-A-A--T-C-----TCC-G-TA--------------AAA----CCGAG--AG-TCT---GG-TAAA-GATA---C--G-C-G-A----AAA--CG--TTT--GTA--A-CGT--CCAAAA-CGAGGCT-T-AC-A--------AGA-A-TC-T---GGT-A-T-----G--T----GA-TTT-GA---T-TGGCTGA-T-C-----A--GG-----------C----ACAA----T-C-GA-AAAT--AA-CG-A--C-T--A----TTC-GAAG-AAAG-C-T---G-T-AATAAG------A----T-TG--AAAG--T-GA-C----GTT---T--A-A-GTGT-G-A-GGATTT-AC-A----AGG---AG---A--GTGTTTAG-C--------AA-----T---ATAAAAAT-G--ATAGAA--G--AGGAA--A-GGA------TT--ATT--AG--CT-G-TTC-T-A--CC--T--ACGGGAA--TA-TGAT--AAA--C-CGTT----G-CG----TAT-TT-AA-TT--TT-A-C-CAAAATT-CC-T--TTGG--A---GGC-A--AA-G-TG--------A-----GTATGCATT-T-C-C-AG-TT--GA--CAA-G-CG-AT-CG-CA---GGTTTT-----T---CTGTTCA-AAAC-C--------GGTA-A-TTCTTCTCTT-TAAGT----TCA---------ACTAAT-G--AG-TA-TT-GAT--TACATTAAC-AATTC-AAAACTTCAG-GAAT-TCA-CTGTG-TT-T-TGGG--TGGG-TA-AGAATT-CAAA-C--C-------G-AAACT-GAA-----TT-G-C--GCTTC-CCTA--G----CG-GT-AACAGTTA--T----TATC-G--CGGG----TCTTTA--A-CCA-G--A-C-TCTC-TG-TT--C-GAT--CGG-AGATT---T-T--GC--GTAG--ACA-A-C----TGAAG--------TGTC-T-G-G-TTG-A-ACGctccaaa
gi|50 : TT--TG--CT-G-TTC-T-A--CG--T--ACGGG-A--AACTG---------C-CGTT----T-TG----TAC-CA-AA-TT--TT-A-C-CAAAATT-
gi|51 : gC----CAGACGC-T----C-GG-CTA-TCTC--C-GTA-A-A-----------CC-G-T---------------TA-----CTGAG--TG-CCT---GG-T
gi|52 : TCT-CGTG-C-A---AC----CAGACGC-T----C-GG-CTA-TCTC--C-GTA-A-A--T-C-----GAC-G-----------------AG-----CAGAG--AG-Ttgaacgagact
gi|53 : CGC-T----C-GG-CTA-TCTC--C-GTGTA-C--T-CAG---TTC-G-T----------------------CGGAG--AT-TTT---CG-TAAA-g
gi|53 : CTC-AG-TT--C-G-T--CGG-AGA-T---T-T--TC--GTAA--ACA-A-C----CG-caaccg
gi|54 : cgctcggctatctccgtgtaTCT-CGTG-C-A---AC----CAGATGC-T----C-GG-CTA-TCTC--C-GTA-A-A--T-C-----TCC-G-
gi|54 : CTT-TG-TT--A-G-T--CGG-AGA-T---T-T--AC--GGAG--ATA-G-C----CG-AG--------CATC-T-G-G-TTG-C-ACGAGAactaacaaag
gi|55 : C-TG-TT--CCG-T--CGG-AGATT---T-T--TC--GTAGA-ACA-A-CT---TG-AG--------TGT--T-G-G-TTG-C-ACG
gi|56 : --A-C-TCTC-TA-CT--C-G-T--CGA-AGA-T---T-A--AC--AGAG--ATA-G-T----CA-AG--------CGTC-T-G-G-TTg
gi|57 : -AC-T--TTGG--AG--GGC-A--AA-G-TGAA------A-----GTATA-ATT-T-C-C-AG-TT--GA--C-A-
gi|58 : TCT-CGTG-C-A---AC----CAGACGC-T----C-GG-CTA-TCTC--C-GTA-A-A--
gi|59 : agTCT-CGTG-C-A---AC----CAGACGC-T----C-GG-CTA-
gi|6 : ctagCT-CGTG-C-A----C----CAGACGC-T----C-GC-TTG-TCTC--C-GTA-A-A--T-C-----TCC-G-TA--------------AA-----CCGAG--AG-TCT---GG-TAAA-GATA---CT-G-C-G-A----AAAA-CG--TGT--GTA--A-CGT--C-AAAAACGAGGCT---ACAC--------AGA-A-TC-CT--GGT-A-T-----G--T----GA-TTT-GA---TCTGGATGA-T-C-----A--GG-----------C--CCACAA----T-C-GA-AAAT--AA-CG-A--C-T--A----T-C-GAAG-AAAG-C-TT--G-T-AAT-AG------A----T-TA--AAAG--T-GA-C----GTT---T--A-A-GTGT-G-A-GGATTT-AC-A----AGT---AC---AGTGT-TATAG-A--------AA-----T---AT-AAAAT-G--ATAGTATCG--AGGAA--A-GGAT-----GC--ATT--AG--CT-G-TTT-T-A--CC--T--ACGGG-A--CATTGAT-AAAA--C-CGTT------CG----TAT-TT-AA--T--TT-A-C-CAAAATT-ACTT--TTGG--AG--GGC-A--AA-G-TGAA------A-----GTATG-ATT-T-C-C-AG-TT--GA--C-A-G-TG-AT-CG------GGTTTT-----T---CTGTT---GTAT-TA-------GGTA-A-C--TTTTCCT-TTAAT--A-TC----------ACTAAT-GA-AG-TA-TT-AAT--TA-ATTAAC-A--TC-AAATCTTTCG-GAATCTGA-C--TG-TT-T-T--G--TGGG-GG-AG-ATT-CAAA-C--C-------G-AAACTGGAA-----TCAGCC--AC-TC-CCTA--G----CG-GT-AACAGTTA--T----TATC-G--CGGG----T-TTT---A-CCAGG--A----CTC-TG-TT--C-G-T--CGG-AGATT---T-T--GC--GTAG--ACA-A-A----CG-AG---------GTC-T-G-G-TTG-A-ACGAGA
gi|7 : TCT-CGTG-C-A---AC----CAGACCC---------G-CTA-TCTC--C-GTA-A-AATT-C-----TCC-G-TA--------------AA-----CCGAG--AG-TCT---GG-TAAA-GATA---C--G-C-G-A----AAA--CG--TTT--GAA--A-CGTGTC-AAAAACGAGGCT-T-AC-C--------AGA-A-TC-CT--GGT-A-T-----G--T----GA-TTT-GA---T-TGGCTGA-T-C-----AA-GG-----------C--C-ACAA----T-C-AT-AAAT--AA-CG-A--C-T--A----C-C-GAAG-AAAG-C-T---G-TTAAT-AG------A----T-TG--AAAAGTT-GA-C----GTTAT-T--ATA-GTGT-G-A-GGATT--AC-A----AGT---AG---AGTGT-TATA--A--------AA-----T---AT-AAAATTG--ATAGAA--G--AGGAA--G-GATT-----TT--ATTTTAG--CT-G-TTC-T-A--CC--T--ACAGG-A--TA-TGAT-AAGA--C-CGTT----G-CG----TAT-TT-AA-TT--TTTA-C-CAAAATTCAC-T--TTGG--AG--GGC-A--AA-AATGAA------A-----GTATG-GAT-T-T-C-AG-TT--GA--C-A-G-CG-AT-CG-C----GGTTTT-----T---CTGTT---GTAC-T--------GGTA-A-T--TTTTCC--TTA-T--A-TC----------ACTAAT-GA-AG-TATTT-AAT--TA-A-TAAC-A--TT-AAATCTTTCG-GAAT-TGA-CTGTG-TT-T-T--G--TGGG-GG-AG-ATT-AAAA-C--C-------G-AAACT-GAA-----TTAG-C--GC-TC-CCTA--G----CG-GT-AACAGTTA--T----TATC-G--CGGG----TCTTT---A-CCA-G--A-C-TCTC-TG-TT--C-G-T--CGG--------------------AG--ACA-A-C----CG-AG--------TGTC-T-GCG-TTG-A-ACGAGAC
gi|8 : gTCT-CGTG-C-A---AC----CAGACGC-T----C-G--CTA-TCTC--C-GTA-A-A--T-C-----T---G-TA--------------AA-----CCGAG--AG-TCT---GG-TAAA-GATA---C--G-C-G-A----AAA--CG--TTT--GTA--A-CGT--C-AAAA-CGAGGCT-T-AC-C--------AGA-A-TC-CT--GGT-A-T-----G--T----TA-TTT-GA---T-TGGCTGA-T-C-----A--GG-----------C--C-ACAA----T-A-AA-AAAT--AA-CG-A--C-T--A----T-C-GAAG-AAAG-C-T---G-C-AAT-AG------A----T-TG--AAAG--T-GA-C----GTT---T--A-A-GAGT-G-A-GGATTT-AC-A----AGT---AG---AGTGTGTTTAG-A--------AA-----T---AT-AAAAT-G--ATAGAA--G--AGGAA--A-GGAT-----TT--ATT--AG--CT-G-TTC-T-A--CC--T--ACGGG-A--TA-TGAT-AAAA--C-CGTT----G-CG----TAT-TT-AA-TT--TT-A-C-CAAAATT-AC-T--TTGG--AG--GGC-A--AA-G-TGAA------A-----GTATG-ATT-T-C-C-AG-TT--GA--C-A-G-CG-AT-CG-C----GGTTTT-----T---CTGTT---GTAC-T--------GGTA-A-T--ATTTCCG-TTAGT--A-TC----------ACTGAT-GA-AG-TA-TT-AAT--TA-ATTAAC-A--TC-AAATCTTTCG-GAAT-TCA-CTGTG-TT-T-T--G--TGGG-GG-AG-ATT-CAAA-C--C-------G-AAACT-GAA-----TTAG-C--GC-TC-CCTA--G----CG-GT-AACAGTTA--T----TATC-G--CGGG----TCTTT---A-CCA-G--A-C-TCTC-TG-TT--C-G-T--CGG-AGA-T---T-T--GC--GTAG--GCA-A-C----CG-AG--------TGTC-T-G-G-TTG-A-ACGAGAC
gi|9 : TCT-CGTG-C-A---AC----CAGACGC-T----T-GG-CTA-TCT-----------------------CC-G-TA--------------AA-----TCGAG--AG-TCT---GG-TAAA-GATA---C--G-C-G-A----AAA--CG--TTT--GTA--A-CAT--C-AAAA-CGAGGCT-T-AC-C--------AGA-A-TC-CT--GGT-A-T-----G--T----GA-TTT-GA---T-TGGCTGA-T-C-----A--GG-----------C--C-ACAA----T-C-GA-AAAT--AA-CG-A--C-T--A----T-C-GAAG-AAAG-C-T---G-T-AAT-AG------A----T-TG--AAAG--T-GA-C----GTT---T--A-A-GTGT-G-A-GGA-TT-AC-A----AGT---AG---A--GTGTTTAG-A--------AA-----T---AT-AAAAT-G--ATAGAA--G--AGAAA--A-GGAT-----TT--ATT--AG--CT-GTTTC-T-A--CC--T--ACGGG-A--CA-TGAA-AAAA--C-CGTT----G-CG----TAT-TT-AATTT--TT-A-C-CAGAATT-AC-T--TTGG--AG--GGC-A--AA-G-TGAA------A-----GTATA-ATT-T-C-C-AG-TT--GA--C-A-G-CG-AT-CG-A----GGTTTT-----T---CTGTT---GTAT-T--------GGTA-A-T--TTTTCCT-TTAGT----TC----------ACTAAT-CA-AG-TA-TT-AAT--TA-ATTAAC-A--TC-AAATCTTTC--GAAT-TGA-CTGTG-TT-T-T--G--TGGG-GG-AG-ATT-CAAA-C--C-------G-AAACT-GAA-----TTAG-C--GC-TC-CCTA--G----CG-GT-AACAGTTAT-T----TATC-G--CGGG----TCTTT---A-CCA-G--A-C-TCTC-TG-TT--C-G-T--CAG-AGA-T---T-T--GC--GTAG--ACA-A-C----CG-TG--------TGTC-T-G-G-TTG-A-ACGAGAC
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|19 ): CATCGAAGTTCCCATACACATGTCACATGATGACCTAATATCCTGAATGGCAAGTCAATGTTACATGCTGTGGTCATCCTACAATGCTACACCTTGCAGGAAGTAATCGTTCGGCCATCTTATAAGAAGTAAGTCTCTACCTATCTATAGGAAGTAATATTCACCTATCTTTATAGCGAAGTAATAACTTCACCTATCTTATAGAAGTAATCAGTATTGTATAGGTTAAATTAACTATTGATGCGAAGTGACAGCAAGCATGAGGGAAGGGACTTGACATAGGATACATCTGCTGCTCAAACCCCCCTCCCATTCAGTA
Unaligned ( gi|21 ): AGAAACACAAGCACATCTGGAAGTTCCATGACCATCTATGTCACATGAGACATAATTTCCTGAATGGCAAGTCAATGTCTACATGCTTGGTCCACTCCTACATGCTACCATCCACTTTGCAGGAAGTAATCGTTCGCCTATCTTATAGGAAGTATTCCTTCACCTATCTTATAGGAAGTATATCCAGTATGCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGTATTGTAATAGGTTAATTAACTTTGTGCGAATGCAGC
Unaligned ( gi|22 ): TGACCATCTATGTCACATGAGACATAATTTCCTGAATGGCAAGTCAATGTCTACATGCTTGGTCCACTCCTACATGTACCATCCACCTTTGCAGGAAGTAATCGTTCGCCTATCTTATAGGAAGTACTTCCTTCACCTATCTTATAGGAAGTAATCCTAAAGTATGCAATAGGTTAATTAACTTTTGTGCGAATGCAGCATCATTAGGAGAGGGCTGACATATAGGTTCATCCTGCTGCCCAATCCCATCAGTAT
Unaligned ( gi|25 ): AGAAACACAAGCACATCTGGAAGTTCCATGACCATCTATGTCACATGAGACATAATTTCCTGAATGGCAAGTCAATGTCTACATGCTTGGTCCACTCCTACATGTTACCATCCACTTTGCAGGAAGTAATCGTTCGCCTATCTTATAGGAAGTAATCCTTCACC