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gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                    gttGTTCCAAGAGTCATTCAAGAATGGAACTCTCTACCTTTGGAGACTAGAAAATCTTGAAACTCTATCAAATTTTGTGA---------------TTCTAAAAAA-TC-CCTCCCTGGTATTTCTCTATTGGAGAGAGACGTTTA-------------CAAGGCTTT----CGACATAACTGCATTCTTAATAAAGATTTATTTCGCTGTAATATAATTG-C-GTCCTTTATGCTCTTGTTGATCAGTGGGAGGGTGACTACCATTATTTCTTTTCATGAAACAAGTTACAGAAATGCCAGATATGAAACTATTTAACAAAATATTCAATATTGAAAAACTGAAAATTGTAAA-ACACATGTTCTGCTGTGGGGTGACCCTTCTCT----A--ATGAGGAA---AA--TGAAT-AT-TTTTCTCTCTTTATACACATAATTATTAAACAAAGT-----------A-GTCGAT----TTAAT-----CA-----AATGCT-----ACTTTGATGTACATC-AATATCA-AATAC--GTA-T--------------ATGTGTGTAGACACCTACATGACATTT------AAGTATAT---CAATGTA----TAAAGCATATATAGAACGGTTAT-TAGATGCCATGGTCTGATATGTTT-TTTTT---TTTTTTTTTTTTTTTATTACCAT-GCATTTTATAAAGCACA--TG--TATTTATG-T-----TA-TATCTATATAT
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AGGCGTGTAAATATTACACAAACAAGACTTGAAGTCAACACAGCCGTATTTCCATTAAACATTCATTCCTATGCCTTATCATGGATACTGCTTTATGCACTTGTGGAACAATAA-CGGATGACAACCATAAGTTCTTTTCTTGTATTAAGC-ATA--------------------ATTAAACAAAATATTTAGCATCGGCAAACTttcttgggcaaaaacaaaaagcagagtagactttggtagaaagacttaatcacgtcgtgtgtgttgtatagcctgagacgatggt
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           atttttcgttcgatgccATTGGCAGTCCTTTATGCACTTGTTGATCAGTGG-AGGATGACTACCATTATTTCT
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     AATTGCACATTGTAAATACACATGTTCTTC-GAGAGAAGACATTTCTGTTAGTATTCTCCTGGA---AA--CAAAT-ATTTATTCACAG-CTGTACAAGTATACATCAAGCAGAGT-----------A-ACCGAT----T
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ACACTTGTTTTGCTGTTGGGTGACGCTTCTCTCAGCA--ATGAGGAAATCAA--TGAAT-ATTTTTGCTCTC---A-------------TAAACAAAGT-----------A-GTCGATCACATCAATGTG--CAT--T-AA-TCT------A--TCATATATATT-AA-ATT--AATAT--GCAGT--------------ATG
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            GTCCTACTGTG------TCTTTCTCTCCGTA--ATGAGGCA---AA--TGAAT-ATCTTTTCTGT---TACTCACACATCTATTAAATAATGT-----------G-GTCGAC----------------A--T-AATT--------A--T-ATATCAATC-AATATTA-ctgacatggttagttaattacatcaaaatagatttataaaagatgca
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TCAATA--TTGA--AA---AACTTAAAATATCTTTTCTCTC-TTATACACATATTTATTAAACAAAGT-----------A-GTCGAT----TTAATATAATCAA--T-AAGTCT-----AA--TGATGTACATC-AATATCA-GATTC--GTA-T--------------ATGTGTGTAGATGCCTACATG-----T------ATGTATAT---CAATGTA----T-AAATATATAT-GAAC-GTTAT-TAGATGCCAT-GTCTGATATGTT--TTTTTAAAT-------TTATTTAATTACCAT-GCATTTTATAGAGTACA-ATGTTTATTTATG-T-----TATTATCA-TGTAT
gi|4                          :                                                                                         atctcgcacgtgaatcgttaatgggttaacattattggcatcaagagagtctctatattttgaaagcgggtgggaacctcttcatatcaaaagaaaaacagcaagactaaaaacattatgtaaagtaaaccgcaacttagctcctgattttctatctgatatttttccaagcataagatcccattcttcaaattatgtaacaagacatttctgagactatagcacaccaaaatgtagattacaaatttataaaaattcctttgttccaagagtcatcgaagaatggaactctctacctttggagactagaaaatctgagactttatcaaattttgtaaactgcatcagtaatactaaaaaaatctcccttgtatttctcttttggagagagaagtttaaatattatacatacaaggcttcgacataactgcattcttaataaagatttatttcgctgtaatatcattggcagccctttacgcacttgtggatcactggagggtgactatcattatttcttttcatgtaacaagtacagaaatgtcagacatgatctatttaacaacatatAA---AA--TGAAT-GTCTTTTCTTCC-TTATTCACATATTTAATATACAAAGTACATGTACATGTAGTTGAT----TTAAT-----CAG--TCAAGTCTTTTAAAA--TAATGTACATC-AATATCA-GATAC--GCA-T--------------ATATGTGGAGGTACCTATGTA-----TATCTACATGTACATGTACACTGTACGTGT-AAGTATATAT--AAC-TTTAT-TAGATACCAT-GTCTAATA---TTG---TCCGATT------TTATTTTATTACCAT-GCATTTTATGAAATACA-ATG--TATTGATG-T-----TA
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AAT-ATCTTTTCTCTC-TTATACACATATTTATTAAACAAAGT-----------A-GTCGAT----TTAAT-----CAA--T-AATCC-----------GATGTACATC-AATATCA-GGTAC--GTA-TGTATACGTATATATATGTGTGTAGACACCTACATG-----------------------------A----T-AGGTATATATAGAAC-GTTAT-TAGATGCCAT-GTCTGATATGTTT-----------------TTATTTAATTACCAT-GCATTTTATGAAGCACA-ATT--TATTTATGATACATGTATTATCcatgtatt
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TC-TTCTACACATATTTATTAAACAAAGT-----------T-GTCG------TTAAT-----CAGACT-AATTCT-----AA--TGATGTACATCAAATATCATATTACGAGTA-T--------------ATGTGTGTAGACACCTACATG-----T-------------------ATGTA----T-AAGCATATA-AGAAC-GTTATCTAGATGCCAT-GTTCGATATG-TTG-TTTTGGGTTTGT------TTTTATTACCTTGGCATTTTAT-AAGCAAACCTG--TATTTA-G-T-----TATTATCA-TATat
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               GATGCCAT-GTCTGATATGTTTTCTTTTTAATTA------------ATTATCAT-GCATTCTATAAAGTACA-ATG--TATTTATG-T-----TATTATCA-TGTAgata
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Reference ( family-1377 )     :                                                                                                                                       TTTCCAAGCATAAGATCNCATTCTTCAAATTATGTAACAAGANATTTCCGAGACTATAGCACACCAAAATGTAGATTACAAATTTATAAAANNTCCTTTGTTCCAAGAGTCATCGAAGAATGGAACTCTCTACCTTTGGAGACTAGAAAATCTTGAGACTCTATCAAATTTTGTGAACTGCATCAG--TAATNCTAAAAAAATCTCCTCCCTNGTATTTCTCTNTTGGAGAGAGACGTTTAAATATTACACA-A-CAAGGC-TT-----CGACATAACCGCATTCTTAATAAAGATTTATTTCGCTGTAATATCATTGGCAGTCCTTTATGCACTTGTNGATCAGT-GGAGGGTGACTACCATTATTTCTTTTCATGTAACAAG-TACAGAAATGCCAGACATG--A-CTATTTAACAAAATATTCAATATCGAAAAACTGAAAATTGTAAATACACATGTTCTGCTGTGGGGTGACNCTTCTCTCAGTA--ATGAGGAA---AATGAATATCTTTTCTCTC-TTATACACATATTTATTAAACAAAGTA------------GTCGATTTAAT-----CAA--T-A---AT---TCT-----AA--TGATGTACATC-AATATCAGA-TAC--GTA-T--------------ATGTGTGTAGACACCTACATG-----TAT------GTATAT---CAATGTA----T-AAGTATATATAGAAC-GTTAT-TAGATGCCAT-GTCTGATATG----TT--TTTTTTGATT------TTATTTTATTACCAT-GCATTTTATAAAGCACAA--TG--TATTTATG-T-----TATTATC-ATATAT
gi|1                          :                                                                                                                                       TTTCCAAGCATAAGATCCCATTCTTCAAATTATGTAACAAGACATTTCTGAGACTATAGCACACCAAAATGTAGATTACAAATTTATAAAAATTCCTTTGTTCCAAGAGTCATCGAAGAATGGAACTCTCTACCTTTGGAGACTAGAAAATC-TGAGACTTTATCAAATTTTGTAAACTGCATCAG--TAATACTAAAAAAAT---CTCCCTTGTATTTCTCTTTTGGAGAGAGAAGTTTAAATATTATACATA-CAAGGC-TT-----CGACATAACTGCATTCTTAATAAAGATTTATTTCGCTGTAATATCATTGGCAGCCCTTTACGCACTTGTGGATCACT-GGAGGGTGACTATCATTATTTCTTTTCATGTAACAAG-TACAGAAATGTCAGACATG--ATCTATTTAACAACATATTCAATATTGAAAAACTTAAAAT
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        atctcgcacgtgaatcgttaatgggttaacattattggcatcaagagagtctctatattttgaaagcgggtgggaacctcttcatatcaaaagaaaaacagcaagactaaaaacattatgtaaagtaaaccgcaacttagctcctgattttctatctgatattTCAATA--TTGAAAAACTTAA--AATATCTTTTCTCTC-TTATACACATATTTATTAAACAAAGTA------------GTCGATTTAATATAATCAA--T-A---AG---TCT-----AA--TGATGTACATC-AATATCAGA-TTC--GTA-T--------------ATGTGTGTAGATGCCTACATG-----TAT------GTATAT---CAATGTA----T-AAATATATAT-GAAC-GTTAT-TAGATGCCAT-GTCTGATATG-----T--TTTTTTAAAT------TTATTTAATTACCAT-GCATTTTATAGAGTACAA--TGTTTATTTATG-T-----TATTATC-ATGTATatcttttctctcttatacacatatttattaaacaaagtagtcgatttaatataatcaataagtctaatgatgtacatcaatatcagattcgtatatgtgtgtagatgcctacatgtatgtatatcaatgtataaatatatatgaacgttattagatgccatgtctgatatgtttttttaaatttatttaattaccatgcattttatagagtacaatgtttatttatgttattatcatgtat
gi|10                         : atctcgcacgtgaatcgttaatgggttaacattattggcatcaagagagtctctatattttgaaagcgggtgggaacctcttcatatcaaaagaaaaacagcaagactaaaaacattatgtaaagtaaaccgcaacttagctcctgattttctatctgatatttttccaagcataagatcccattcttcaaattatgtaacaagacatttctgagactatagcacaccaaaatgtagattacaaatttataaaaattcctttgttccaagagtcatcgaagaatggaactctctacctttggagactagaaaatctgagactttatcaaattttgtaaactgcatcagtaatactaaaaaaatctcccttgtatttctcttttggagagagaagtttaaatattatacatacaaggcttcgacataactgcattcttaataaagatttatttcgctgtaatatcattggcagccctttacgcacttgtggatcactggagggtgactatcattatttcttttcatgtaacaagtacagaaatgtcagacatgatctatttaacaacatatAATTGCACATTGTAAATACACATGTTCTTC-GAGAGAAGACATTTCTGTTAGTATTCTCCTGGA---AACAAATATTTATTCACAG-CTGTACAAGTATACATCAAGCAGAGTA------------ACCGATT
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GTCCTACTGTG------TCTTTCTCTCCGTA--ATGAGGCA---AATGAATATCTTTTCTGT---TACTCACACATCTATTAAATAATGTG------------GTCGAC------------A--T-A---AT---T--------A--T-ATATCAATC-AATATTA
gi|12                         :                                                                                                                                       TTTCCAAGCATAAGATCTCATTCTTCAAATGATGTAACAAGAAAT--CCAAGACTATAGCACACCAAAATGTCGATTACAAATTTATAAAACATCCTTTGTTCCA
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tattGATGCCAT-GTCTGATATG----TT--TTCTTT----------TTAATTAATTATCAT-GCATTCTATAAAGTACAA--TG--TATTTATG-T-----TATTATC-ATGTA
gi|14                         :                                                                                                                                       TTTCCAAGC-T----TCACATTCCTCAAATTATGTAGCAACGGATTTCCGAGACTATAGCACACCAAAATATAGGCTACAA
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              gttATTGGCAGTCCTTTATGCACTTGTTGATCAGT-GGAGGATGACTACCATTATTTCT
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TTT-TAAAGCACAT--TG--TATTTATG-TTA---TATTATC-ATATAT
gi|2                          :                                                                                                                                       TTTCCAATGATAAGATCCCAATCTTCAAATTATGTAACAAGAAATTCCAAAGACTATAGCACACCAAAATGTCGATTACAAATTTATAAAAATTCCTTTGTTCCAAGAGTCATTCAAGAATGGAATATCCTACCTTTGGAGACTAGACA-TCT-GAAACTCTATCAAATTTTGTAAAATGCATTCGATTAATTCTAAAAAA-TCTCCTCCCTTGTATTTCTCTATTGGAGAGAGACGTTTAAATATTATACATA-CAAGGC-TT-----CGACATAACTGCATTCTTAATAAAGATTTATTTCGCTGTAATATCATTGGCAGCCCTTTATGCACTTGTGGATCAGT-GGAGGATGACTACCATTATTTCTTTTCATGTAACAAG-TACAGAAATGCCAGATATG--AACTATTTAACAAAATATTCAATATTGAAAAACTGAAAATTGTAAATACACATGTTCTGCTGTGGGGTGACCCTTCTCTCAGTA--ATGAGGAA---AATGAAAATCTTTTCTCTC-TTATACAAATATTTATTAAACAAAGTT------------GTCGATTTAAT-----CAA--T-A---AT---TCT-----AA--TGATGTACATC-AATATCAAA-TAC--GTA-T--------------ATGTGTGTAGACACCTACATG-----TAT------GTATAT---CAATGTA----T-AAGCATATATAGAAC-GTTAT-TAGATGCCAT-GTCTGATATG----TTTGTTTTTTGGTTTTTTTCTTCTTTTATTACCAT-GCATTTTATAAAGCACAT--TG--TATTTATG-T-----TATTATC-TTATATa
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Reference ( family-1377 )     :                                                                                                                                          TTTCCAAGCATAAGATCCCATTCTTCAAATTATGTAACAAGAAATTTCCGAGACTATAGCACACCAAAATGTNGATTACAAATTTATAAAAATTCCTTTGTTCCAAGAGTCATTCAAGAATGGAACTCTCTACCTTTGGAGACTAGAAAATCTTGAAACTCTATCAAATTTTGTAAA-TGCAT-C-G--TAATTCTAAAAAATC-CCTCCCTTGTATTTCTCTNTTGGAGAGAGACGTTTAAATATTATACATACAAGGCTT-----CGACATAACTGCATTCTTAATAAAGATTTATTTCGCTGTAATATCATTGGCAGTCCTTTATGCACTTGTGGATCAGTGG-AGGATGACTACCATTATTTCTTTTCATGTAACAAGT-ACAGAAATGCCAGACATGA--CTATTTAACAAAATATTCAATATTGAAAAACTGAAAATTGTAAATACACATGTTCTGCTGTGGGGTGACCCTTCTCTCAGTA--ATGAGGAA---AATGAATATCTTTTCTCTC-TTATACACATATTTATTAAACAAAGTA------------GTCGATTTAAT-----CAA--T-A---AT---TCT-----AA--TGATGTACATC-AATATCAGA-TAC--GTA-T--------------ATGTGTGTAGACACCTACATG-----T------ATGTATAT---CAATGTA----T-AAGCATATATAGAAC-GTTAT-TAGATGCCAT-GTCTGATATG----TT--TTTTTTGGTT------TTATTTNATTACCAT-GCATTTTATAAAGCACAA--TG--TATTTATGT--TATTATC-ATGTAT
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gi|14                         :                                                                                                                                          TTTCCAAGC-T----TCACATTCCTCAAATTATGTAGCAACGGATTTCCGAGACTATAGCACACCAAAATATAGGCTACAA
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gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TTT-TAAAGCACAT--TG--TATTTATGTTATATTATC-ATATAT
gi|2                          :                                                                                                                                          TTTCCAATGATAAGATCCCAATCTTCAAATTATGTAACAAGAAATTCCAAAGACTATAGCACACCAAAATGTCGATTACAAATTTATAAAAATTCCTTTGTTCCAAGAGTCATTCAAGAATGGAATATCCTACCTTTGGAGACTAGACA-TCT-GAAACTCTATCAAATTTTGTAAAATGCATTC-GATTAATTCTAAAAAATCTCCTCCCTTGTATTTCTCTATTGGAGAGAGACGTTTAAATATTATACATACAAGGCTT-----CGACATAACTGCATTCTTAATAAAGATTTATTTCGCTGTAATATCATTGGCAGCCCTTTATGCACTTGTGGATCAGTGG-AGGATGACTACCATTATTTCTTTTCATGTAACAAGT-ACAGAAATGCCAGATATGAA-CTATTTAACAAAATATTCAATATTGAAAAACTGAAAATTGTAAATACACATGTTCTGCTGTGGGGTGACCCTTCTCTCAGTA--ATGAGGAA---AATGAAAATCTTTTCTCTC-TTATACAAATATTTATTAAACAAAGTT------------GTCGATTTAAT-----CAA--T-A---AT---TCT-----AA--TGATGTACATC-AATATCAAA-TAC--GTA-T--------------ATGTGTGTAGACACCTACATG-----T------ATGTATAT---CAATGTA----T-AAGCATATATAGAAC-GTTAT-TAGATGCCAT-GTCTGATATG----TTTGTTTTTTGGTTTTTTTCTTCTTTTATTACCAT-GCATTTTATAAAGCACAT--TG--TATTTATGT--TATTATC-TTATATa
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Unaligned ( gi|9 ): ATTGGCATGAAGAAATTTTTTATATTTTCGAATCGGGTTTGATCAACTTCACATTAGTAGAAAAACAAGACTAAAAACAATGTAAAGTAAACCAAAATTTAGCTCCTGATTATCTAA

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Reference ( family-1377 )     :                                                                                                                                          TTTCCAAGCATAAGATCCCATTCTTCAAATTATGTAACAAGAAATTTCCGAGACTATAGCACACCAAAATGTNGATTACAAATTTATAAAAATTCCTTTGTTCCAAGAGTCATTCAAGAATGGAACTCTCTACCTTTGGAGACTAGAAAATCTTGAAACTCTATCAAATTTTGTAAA-TGCAT-C-G--TAATTCTAAAAAATC-CCTCCCTTGTATTTCTCTNTTGGAGAGAGACGTTTAAATATTATACATACAAGGCTT-----CGACATAACTGCATTCTTAATAAAGATTTATTTCGCTGTAATATCATTGGCAGTCCTTTATGCACTTGTGGATCAGTGG-AGGATGACTACCATTATTTCTTTTCATGTAACAAGT-ACAGAAATGCCAGACATGAA-CTATTTAACAAAATATTCAATATTGAAAAACTGAAAATTGTAAATACACATGTTCTGCTGTGGGGTGACCCTTCTCTCAGTA--ATGAGGAA---AATGAATATCTTTTCTCTC-TTATACACATATTTATTAAACAAAGTA------------GTCGATTTAAT-----CAA--T-A---AT---TCT-----AA--TGATGTACATC-AATATCAGA-TAC--GTA-T--------------ATGTGTGTAGACACCTACATG-----T------ATGTATAT---CAATGTA----T-AAGCATATATAGAAC-GTTAT-TAGATGCCAT-GTCTGATATG----TT--TTTTTTGGTT------TTATTTNATTACCAT-GCATTTTATAAAGCACAA--TG--TATTTATGT--TATTATC-ATGTAT
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gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GTCCTACTGTG------TCTTTCTCTCCGTA--ATGAGGCA---AATGAATATCTTTTCTGT---TACTCACACATCTATTAAATAATGTG------------GTCGAC------------A--T-A---AT---T--------A--T-ATATCAATC-AATATTA
gi|12                         :                                                                                                                                          TTTCCAAGCATAAGATCTCATTCTTCAAATGATGTAACAAGAAAT--CCAAGACTATAGCACACCAAAATGTCGATTACAAATTTATAAAACATCCTTTGTTCCA
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tattGATGCCAT-GTCTGATATG----TT--TTCTTT----------TTAATTAATTATCAT-GCATTCTATAAAGTACAA--TG--TATTTATGT--TATTATC-ATGTA
gi|14                         :                                                                                                                                          TTTCCAAGC-T----TCACATTCCTCAAATTATGTAGCAACGGATTTCCGAGACTATAGCACACCAAAATATAGGCTACAA
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               gttATTGGCAGTCCTTTATGCACTTGTTGATCAGTGG-AGGATGACTACCATTATTTCT
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TTT-TAAAGCACAT--TG--TATTTATGTTATATTATC-ATATAT
gi|2                          :                                                                                                                                          TTTCCAATGATAAGATCCCAATCTTCAAATTATGTAACAAGAAATTCCAAAGACTATAGCACACCAAAATGTCGATTACAAATTTATAAAAATTCCTTTGTTCCAAGAGTCATTCAAGAATGGAATATCCTACCTTTGGAGACTAGACA-TCT-GAAACTCTATCAAATTTTGTAAAATGCATTC-GATTAATTCTAAAAAATCTCCTCCCTTGTATTTCTCTATTGGAGAGAGACGTTTAAATATTATACATACAAGGCTT-----CGACATAACTGCATTCTTAATAAAGATTTATTTCGCTGTAATATCATTGGCAGCCCTTTATGCACTTGTGGATCAGTGG-AGGATGACTACCATTATTTCTTTTCATGTAACAAGT-ACAGAAATGCCAGATATGAA-CTATTTAACAAAATATTCAATATTGAAAAACTGAAAATTGTAAATACACATGTTCTGCTGTGGGGTGACCCTTCTCTCAGTA--ATGAGGAA---AATGAAAATCTTTTCTCTC-TTATACAAATATTTATTAAACAAAGTT------------GTCGATTTAAT-----CAA--T-A---AT---TCT-----AA--TGATGTACATC-AATATCAAA-TAC--GTA-T--------------ATGTGTGTAGACACCTACATG-----T------ATGTATAT---CAATGTA----T-AAGCATATATAGAAC-GTTAT-TAGATGCCAT-GTCTGATATG----TTTGTTTTTTGGTTTTTTTCTTCTTTTATTACCAT-GCATTTTATAAAGCACAT--TG--TATTTATGT--TATTATC-TTATATa
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                             GTTCCAAGAGTCATTCAAGAATGGAACTCTCTACCTTTGGAGACTAGAAAATCTTGAAACTCTATCAAATTTTGTGA----------------TTCTAAAAAATC-CCTCCCTGGTATTTCTCTATTGGAGAGAGACGTTTA-------------CAAGGCTTT----CGACATAACTGCATTCTTAATAAAGATTTATTTCGCTGTAATATAATTG-C-GTCCTTTATGCTCTTGTTGATCAGTGGGAGGGTGACTACCATTATTTCTTTTCATGAAACAAGTTACAGAAATGCCAGATATGAAACTATTTAACAAAATATTCAATATTGAAAAACTGAAAATTGTAAA-ACACATGTTCTGCTGTGGGGTGACCCTTCTCT----A--ATGAGGAA---AATGAATAT-TTTTCTCTCTTTATACACATAATTATTAAACAAAGTA------------GTCGATTTAAT-----CA-----A---AT---GCT-----ACTTTGATGTACATC-AATATCAAA-TAC--GTA-T--------------ATGTGTGTAGACACCTACATGACATTT------AAGTATAT---CAATGTA----TAAAGCATATATAGAACGGTTAT-TAGATGCCATGGTCTGATATGTTTTTT--TTTTTTTTTT------TTTTTTTATTACCAT-GCATTTTATAAAGCAC-A--TG--TATTTATGT--TA-TATCTATATAT
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         AA---AATGAATGTCTTTTCTTCC-TTATTCACATATTTAATATACAAAGTACATGTACATGTAGTTGATTTAAT-----CAG--TCA---AG---TCTTTTAAAA--TAATGTACATC-AATATCAGA-TAC--GCA-T--------------ATATGTGGAGGTACCTATGTA-----TATCTACATGTACATGTACACTGTACGTGT-AAGTATATAT--AAC-TTTAT-TAGATACCAT-GTCTAATA----------TTGTCCGATT------TTATTTTATTACCAT-GCATTTTATGAAATACAA--TG--TATTGATGT--TA----C-ATGTATttcttgggcaaaaacaaaaagcagagtagactttggtagaaagacttaatcacgtcgtgtgtgttgtatagcctgagacgatggt
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AATATCTTTTCTCTC-TTATACACATATTTATTAAACAAAGTA------------GTCGATTTAAT-----CAA--T-A---AT---CC-----------GATGTACATC-AATATCAGG-TAC--GTA-TGTATACGTATATATATGTGTGTAGACACCTACATG-----------------------------A----T-AGGTATATATAGAAC-GTTAT-TAGATGCCAT-GTCTGATATG----T-----------TT------TTATTTAATTACCAT-GCATTTTATGAAGCACAA--TT--TATTTATGA--TA----C-ATGTATt
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TC-TTCTACACATATTTATTAAACAAAGTT------------GTCG--TTAAT-----CAGACT-A---AT---TCT-----AA--TGATGTACATCAAATATCATATTACGAGTA-T--------------ATGTGTGTAGACACCTACATG-----T-------------------ATGTA----T-AAGCATATA-AGAAC-GTTATCTAGATGCCAT-GTTCGATATG----TT--GTTTTGGGTT------TGTTTTTATTACCTTGGCATTTTAT-AAGCA-AACCTG--TATTTA-GT--TATTATC-ATATtatcat
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ATTTTTCGTTCGATGCCAGGCGTGTAAATATTACACAAACAAGACTTGAAGTCAACACAGCCGTATTTCCATTAAACATTCATTCCTATGCCTTATCATGGATACTGCTTTATGCACTTGTGGAACAATAA-CGGATGACAACCATAAGTTCTTTTCTTGTATTAAG----------------CAT-AA-TTA---AACAAAATATTTAGCATCGGCAAACTgata
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ACACTTGTTTTGCTGTTGGGTGACGCTTCTCTCAGCA--ATGAGGAAATCAATGAATATTTTTGCTCTC---A-------------TAAACAAAGTA------------GTCGATCACAT-----CAA--T-GTGCATTAATCT------A--TCATATATATT-AA-ATTA-A-TAT--GCAGT--------------ATG


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Unaligned ( gi|9 ): ATTGGCATGAAGAAATTTTTTATATTTTCGAATCGGGTTTGATCAACTTCACATTAGTAGAAAAACAAGACTAAAAACAATGTAAAGTAAACCAAAATTTAGCTCCTGATTATCTAA

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Reference ( family-1377 )     :                                                                                                                                          TTTCCAAGCATAAGATCCCATTCTTCAAATTATGTAACAAGAAATTTCCGAGACTATAGCACACCAAAATGTNGATTACAAATTTATAAAAATTCCTTTGTTCCAAGAGTCATTCAAGAATGGAACTCTCTACCTTTGGAGACTAGAAAATCTTGAAACTCTATCAAATTTTGTAAA-TGCAT-C-G--TAATTCTAAAAAATC-CCTCCCTTGTATTTCTCTNTTGGAGAGAGACGTTTAAATATTATACATACAAGGCTT-----CGACATAACTGCATTCTTAATAAAGATTTATTTCGCTGTAATATCATTGGCAGTCCTTTATGCACTTGTGGATCAGTGG-AGGATGACTACCATTATTTCTTTTCATGTAACAAGT-ACAGAAATGCCAGACATGAA-CTATTTAACAAAATATTCAATATTGAAAAACTGAAAATTGTAAATACACATGTTCTGCTGTGGGGTGACCCTTCTCTCAGTA--ATGAGGAA---AATGAATATCTTTTCTCTC-TTATACACATATTTATTAAACAAAGTA------------GTCGATTTAAT-----CAA--T-A---AT---TCT-----AA--TGATGTACATC-AATATCAGA-TAC--G--------------TA-TATGTGTGTAGACACCTACATG---T---A-------GTACAT---CAATGTA----T-AAGCATATATAGAAC-GTTAT-TAGATGCCAT-GTCTGATA----TG-------TT-TTTT--G-------T---TTTATTTNATTACCAT-GCATTTTATAAAGCACAA--TG--TATTTATGT--TATTATC-ATGTAT
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gi|12                         :                                                                                                                                          TTTCCAAGCATAAGATCTCATTCTTCAAATGATGTAACAAGAAAT--CCAAGACTATAGCACACCAAAATGTCGATTACAAATTTATAAAACATCCTTTGTTCCA
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tattGATGCCAT-GTCTGATA----TG-------TT-TTCT----------T---TTTAATTAATTATCAT-GCATTCTATAAAGTACAA--TG--TATTTATGT--TATTATC-ATGTA
gi|14                         :                                                                                                                                          TTTCCAAGC-T----TCACATTCCTCAAATTATGTAGCAACGGATTTCCGAGACTATAGCACACCAAAATATAGGCTACAA
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               gttATTGGCAGTCCTTTATGCACTTGTTGATCAGTGG-AGGATGACTACCATTATTTCT
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TTT-TAAAGCACAT--TG--TATTTATGTTATATTATC-ATATAT
gi|2                          :                                                                                                                                          TTTCCAATGATAAGATCCCAATCTTCAAATTATGTAACAAGAAATTCCAAAGACTATAGCACACCAAAATGTCGATTACAAATTTATAAAAATTCCTTTGTTCCAAGAGTCATTCAAGAATGGAATATCCTACCTTTGGAGACTAGACA-TCT-GAAACTCTATCAAATTTTGTAAAATGCATTC-GATTAATTCTAAAAAATCTCCTCCCTTGTATTTCTCTATTGGAGAGAGACGTTTAAATATTATACATACAAGGCTT-----CGACATAACTGCATTCTTAATAAAGATTTATTTCGCTGTAATATCATTGGCAGCCCTTTATGCACTTGTGGATCAGTGG-AGGATGACTACCATTATTTCTTTTCATGTAACAAGT-ACAGAAATGCCAGATATGAA-CTATTTAACAAAATATTCAATATTGAAAAACTGAAAATTGTAAATACACATGTTCTGCTGTGGGGTGACCCTTCTCTCAGTA--ATGAGGAA---AATGAAAATCTTTTCTCTC-TTATACAAATATTTATTAAACAAAGTT------------GTCGATTTAAT-----CAA--T-A---AT---TCT-----AA--TGATGTACATC-AATATCAAA-TAC--G--------------TA-TATGTGTGTAGACACCTACATG---T---AT------GTATAT---CAATGTA----T-AAGCATATATAGAAC-GTTAT-TAGATGCCAT-GTCTGATATGTTTG-------TT-TTTT--GGTTTTTTT---CTTCTTTTATTACCAT-GCATTTTATAAAGCACAT--TG--TATTTATGT--TATTATC-TTATATa
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                             GTTCCAAGAGTCATTCAAGAATGGAACTCTCTACCTTTGGAGACTAGAAAATCTTGAAACTCTATCAAATTTTGTGA----------------TTCTAAAAAATC-CCTCCCTGGTATTTCTCTATTGGAGAGAGACGTTTA-------------CAAGGCTTT----CGACATAACTGCATTCTTAATAAAGATTTATTTCGCTGTAATATAATTG-C-GTCCTTTATGCTCTTGTTGATCAGTGGGAGGGTGACTACCATTATTTCTTTTCATGAAACAAGTTACAGAAATGCCAGATATGAAACTATTTAACAAAATATTCAATATTGAAAAACTGAAAATTGTAAA-ACACATGTTCTGCTGTGGGGTGACCCTTCTCT----A--ATGAGGAA---AATGAATAT-TTTTCTCTCTTTATACACATAATTATTAAACAAAGTA------------GTCGATTTAAT-----CA-----A---AT---GCT-----ACTTTGATGTACATC-AATATCAAA-TAC--G--------------TA-TATGTGTGTAGACACCTACATGACATTTAA-------GTATAT---CAATGTA----TAAAGCATATATAGAACGGTTAT-TAGATGCCATGGTCTGATA----TGTTTTTTTTT-TTTT--T-------T---TTTTTTTTATTACCAT-GCATTTTATAAAGCAC-A--TG--TATTTATGT--TA-TATCTATATAT
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         AA---AATGAATGTCTTTTCTTCC-TTATTCACATATTTAATATACAAAGTACATGTACATGTAGTTGATTTAAT-----CAG--TCA---AG---TCTTTTAAAA--TAATGTACATC-AATATCAGA-TAC--G--------------CA-TATATGTGGAGGTACCTATGTA---T---ATCTACATGTACATGTACACTGTACGTGT-AAGTATATATA--AC-TTTAT-TAGATACCAT-GTCTAATA----T---------T-GTCC--GA------T---TTTATTTTATTACCAT-GCATTTTATGAAATACAA--TG--TATTGATGT--TA----C-ATGTATttcttgggcaaaaacaaaaagcagagtagactttggtagaaagacttaatcacgtcgtgtgtgttgtatagcctgagacgatggt
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AATATCTTTTCTCTC-TTATACACATATTTATTAAACAAAGTA------------GTCGATTTAAT-----CAA--T-A---AT---CC-----------GATGTACATC-AATATCAGG-TAC--GTATGTATACGTATATA-TATGTGTGTAGACACCTACATG------------------------------A----T-AGGTATATATAGAAC-GTTAT-TAGATGCCAT-GTCTGATA----TG-------T----------------T---TTTATTTAATTACCAT-GCATTTTATGAAGCACAA--TT--TATTTATGA--TA----C-ATGTATt
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TC-TTCTACACATATTTATTAAACAAAGTT------------GTCG--TTAAT-----CAGACT-A---AT---TCT-----AA--TGATGTACATCAAATATCATATTACGAG--------------TA-TATGTGTGTAGACACCTACATG---T----------------------ATGTA----T-AAGCATATA-AGAAC-GTTATCTAGATGCCAT-GTTCGATA----TG-------TTGTTTTGGG-------T---TTGTTTTTATTACCTTGGCATTTTAT-AAGCA-AACCTG--TATTTA-GT--TATTATC-ATATtatcat
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ATTTTTCGTTCGATGCCAGGCGTGTAAATATTACACAAACAAGACTTGAAGTCAACACAGCCGTATTTCCATTAAACATTCATTCCTATGCCTTATCATGGATACTGCTTTATGCACTTGTGGAACAATAA-CGGATGACAACCATAAGTTCTTTTCTTGTATTAAG----------------CAT-AA-TTA---AACAAAATATTTAGCATCGGCAAACTgata
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ACACTTGTTTTGCTGTTGGGTGACGCTTCTCTCAGCA--ATGAGGAAATCAATGAATATTTTTGCTCTC---A-------------TAAACAAAGTA------------GTCGATCACAT-----CAA--T-GTGCATTAATCT------A--TCATATATATT-AA-ATTA-A-TAT--G--------------CAGTATG

Unaligned ( gi|9 ): ATTGGCATGAAGAAATTTTTTATATTTTCGAATCGGGTTTGATCAACTTCACATTAGTAGAAAAACAAGACTAAAAACAATGTAAAGTAAACCAAAATTTAGCTCCTGATTATCTAA