lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 11 1111111111 111111111 11111 11 1111111 1111111111 2222222 2222222 111111111 111 111 11111111 111111 1111111 1111111111 33333333333 2222 1111 33333333 222222222 11111111 22 111111111111 1 222222222222222 11 1111 1 22 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 111 1111 11111 33333333333333333333333333333 1111 22222222 33333333333333333333333 11111 11 2222222 222222222 1 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 222222222222222222 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 111111 111111 1 11111 1111111111 111 1111 22222 1111 11 222222 11111111 1 22222222222 9999999999999999999999999999999999999999999999 11 11 111 222222222222 1111 2222222222222 111111 111 4444444444444444444444444 444444444444444444444444444444444444444444444 111 11 111 2222 11 111111111 1 222 1 22222222222222222 2 22 2 2 2
lowQualScore : 1 5 5 6 66 0 555 00 88 3333333333 4 4 4 666 7777 44 444 3 3 3 2 2 555 77777 888888888 2 00000 2 2 2 1 00 5555555 5555555555 0000000 7 8888 4 55 99 1111111 4 666666666 55 222 4 1 3 3 44 3 000 6666 22222222 55555 666 333 888888 3333 0000000 2 9999999999 4 2 2 2 55 2 99999999 00000000000 3 66666 44 3 6666 3 77777 77 9 1 999 3 3 3 1111 3 22222222 8888 0 111111111 55555555 5 33 999999999999 4 3 3 2 111111111111111 6 66 4444 1 3 55 6 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 111 0000 3 88888 3 8888 333 44 888888 00000 22222222222222222222222222222 0 66 1111 5 2 00000000 44 2 2 00000000000000000000000 2 0 33333 11 6 3 6666666 3 6666 3 66 3 3 4 77 555555555 4 6 3 1 6 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 2 2 88888888 77777 999999999999999999 2 2 333 2 88 2 33 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 8 4 66 3 222222 333333 2 6 99999 7777777777 222 5 0000 66 77 0 66 1 66666 55 9999 33 555555 5 3 5 55555555 6 1 99999999999 77 666 7777777777777777777777777777777777777777777777 6 44 33 5 5 5 5 88 555 666666666666 4444 4 2222222222222 4 777 4 4 4 000000 5 5 000 7 0000000000000000000000000 6 6 111111111111111111111111111111111111111111111 111 11 999 2222 3 99 777777777 0 0 222 6 77777777777777777 0 2 4 3 3 77 0 0 0
lowQualScore : . . . . .. . ... .. .. .......... . . . ... .... .. ... . . . . . ... ..... ......... . ..... . . . . .. ....... .......... ....... . .... . .. .. ....... . ......... .. ... . . . . .. . ... .... ........ ..... ... ... ...... .... ....... . .......... . . . . .. . ........ ........... . ..... .. . .... . ..... .. . . ... . . . .... . ........ .... . ......... ........ . .. ............ . . . . ............... . .. .... . . .. . .............................................................................................................. ... .... . ..... . .... ... .. ...... ..... ............................. . .. .... . . ........ .. . . ....................... . . ..... .. . . ....... . .... . .. . . . .. ......... . . . . . ........................................................................................................................... . . ........ ..... .................. . . ... . .. . .. .............................................................................................. . . .. . ...... ...... . . ..... .......... ... . .... .. .. . .. . ..... .. .... .. ...... . . . ........ . . ........... .. ... .............................................. . .. .. . . . . .. ... ............ .... . ............. . ... . . . ...... . . ... . ......................... . . ............................................. ... .. ... .... . .. ......... . . ... . ................. . . . . . .. . . .
lowQualScore : 4 7 0 2 99 2 999 11 22 2222222222 0 0 0 444 3333 22 888 1 1 1 9 9 000 11111 666666666 9 00000 7 7 7 2 66 9999999 0000000000 6666666 2 5555 0 55 22 6666666 0 000000000 66 555 0 4 0 3 22 1 999 5555 55555555 66666 000 999 111111 0000 6666666 1 8888888888 2 1 1 1 33 2 77777777 44444444444 3 00000 66 1 8888 1 77777 33 2 0 000 6 6 6 0000 6 66666666 5555 6 555555555 11111111 0 55 444444444444 0 3 3 2 777777777777777 7 00 2222 0 3 00 7 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 222 4444 3 88888 1 5555 888 22 888888 00000 66666666666666666666666666666 1 88 2222 7 9 99999999 44 9 9 33333333333333333333333 9 1 33333 88 2 1 8888888 1 5555 1 66 1 1 0 33 777777777 0 2 6 7 7 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 5 4 11111111 44444 888888888888888888 1 1 777 2 44 1 88 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 9 4 11 7 888888 666666 2 0 33333 0000000000 000 0 6666 99 00 1 99 4 11111 55 9999 66 000000 7 7 0 99999999 6 4 33333333333 99 111 8888888888888888888888888888888888888888888888 7 22 66 7 7 0 0 22 666 222222222222 0000 0 0000000000000 0 000 4 4 4 333333 0 4 000 0 0000000000000000000000000 7 7 555555555555555555555555555555555555555555555 777 66 888 6666 2 00 666666666 8 0 000 0 33333333333333333 0 5 0 0 0 55 0 0 0
consensus : GATG-GC-AACGA-AACCTTT--ATTGGAT-T-ATA-GAGGCCAATT-AGC-AGGN-TT-AG-T-GGG-T---ACA-A--TAAAC--GAA-G-GGAT-TC-A-A-TG-A---CC-----CCT-----T-A-A-A--G--AG-TTATT-GC-CCCTTGAATTTT--AC--G----ATTTCTAT-G--T----AAAATGG---AAAAAA----CT-TGA--GAAC-CGTT-T----GTC-G---------TA-GAGGC---A-CGGGACCAACTGCA-A--T-G--TG----AT-T--A---GTG-----AC-C-T---TT-----GACCTT--G-A---A---AA-T-TA-G---G-T-CA-AG-G-TCAAAGG--T-CAAG--------GTCAT-----NTA--AA-AAT-T-TGAAA--AAA-TA--G-CA-T-----TT--TT-ATACCN--TCTTTCCT-AC-A-GG-A--GAT-A--N--CN-TGA----AAACAT----T-TA-AAGCNNA-----AGTA-TNCTCATC--T-T--A----ATNG-GTNTCGG----C-GTA-ATAA-A-TTGN-AA----TTCTGAAC-TTT-GAC-C--T-T-A-TT---AGAANTAC---AACGA-T-TCG-CGT-CAAAAA-TCTTGTTA---GCGCTAC-C-T-AAAAATCTT-GTTAGC--GCT-AC---TCCT---ACTG--AACC-GAAAGT----CAA-A----GA-GA--C-G-T-AA--A------A-----CCTT---CA--AT---G-A-TT-T--A-----GTCA--CT--G-T-AA-AA-CG-CCC-TT-G-C-AGTG----ACA--AA-N--TA-A--CCGAAG-GGAT-CCA-ATGA-CCC-T-T--A-ANCAT-A----GTTA-TT-G-C-CCCTG-AAA-NTCT---A-----CA-ATATCATTAT-TT-NAG--CC-TA---------T-AG------CT---TTNACA----TTA-------ATCAA-G-ATA-G--A----GTCA--T---GG-NACC-AC----NT-----A-CAG--TTA-------G-AC-C--------TTT-----GACCTT-GA---AA--T-T-AAGGTCAA-G-GT---CA-AAGGTCAA-GGTCAT-CATN----------------A--A-A-A--------T---T--------A-----T--T----T-----GTCTTT--AAG------A------A---T-AT-TTTT--AAGNACA-A-T--AAAT--GTCATTTGACTCCAAA-ATG-GACCTTT----A----CATCCTT-TT-TG----A--CA-TATTTA--CCTCCCT--TT-TG-AGA-TGTTTTN-TGATATT--T---A-AAATTT-A-TTTT-TTTGAT-ACTAC------T---A--AAGA-T-A--T-C----AAA--G-G--------------------GACCNT---CA-GCTTTCAA-TCTT--A-A-ATCATTG-ACCT-T-NA---TTTTT------T----GTC----AAGGT-CA-------------AAAGT-C---AA-GG-TC-ATTC----A-TATNTTAAAAA---CGTTTTCA-ACATTTTC---A-CAG-T-AANANT-TTG-AGGGT-A-G-ACGA-TAG-NAAAT-TTT-CGT---GNT-T---------TTTACACAGT---ACTGCN-TTCG--CGTTCATGAAATTTTCTA-AAATT--T-TTTAAAAATCTT-TT-NCATCC-TTTTTTC---ACA-TTCCATATCGGGTGGGAAAGCCNTCTANTNGNTCGCCAAGACATATTCAGGATCCACTAGT
Reference ( gi|4 ) : GATG-GC-AATAA-AACTTTT--ATTGGAT-T-ATG-GAGGCTAATT-AGC-CGAT-TT-GG-T-GGG-T---ACA-A--TAAAC--GAA-G-GGAT-TC-A-A-TG-A---CC-----CTT-----T-G-A-A--G--AG-TTATT-GC-CCCTTGAATTTT--AC--A----ATTTCTAT-G--T----AAATTGG---AGAAAA----CT-TAA--GAAC-TATT-T----GTC-G---------TA-GAGGC---A-CGGGACCAATTGCA-A--T-G--TG----AT-C--A---GTG-----AC-T-T---TC-----GACCTT--G-A---A---AA-T-TA-G---G-T-CA-AG-G-TCAAAGG--T-CAAG--------GTCAT-----ATA--TA-AAT-T-TGAAA--AAA-TA--T-CA-T-----TT--TT-ATACCC--TCTTTCCT-AC-A-GG-A--GAT-A--G--CA-TGA----AAACAT----T-TA-AAGCTCA-----AGTA-TGCTCATC--T-T--A----ATAG-GTATCAG----T-ATA-ATAA-A-TTAC-AA----TTTTGAAC-TT--GAC-C--T-TAA-TT---AGAAATAC---AACGA-T-TTG-CAT-TAAAAA-TCTTGTTA---GCACTACCC-TNAAAAATCTT-GTTAGC--ACT-AC---TCTT---ACTA--AACC-AAAAGT----CAA-A----AA-GA--C-A-T-AA--A------A-----CCTT---CG--AT---G-A-TT-T--A-----GTCA--CT--G-T-AA-AA-CG-CTC-TT-G-C-AGTG----ACA--AA-G--TA-A--TGGAAG-GGAT-CTG-ATGG-CCC-T-T--A-GCCAT-A----GTTA-TC-G-C-CCCTG-AAA-ATCT---A-----CA-ACATCGTTAT-TT-CAG--CC-TA---------T-AG------CT---TTGATA----TTA-------ATCAA-G-ATA-G--A----ATCA--T---GG-GACC-AC----AT-----A-CAG--TCA-------G-AC-C--------TTT-----GACCTT-CA---AA--T-T-AAGGTCAA-G-GT---CA-AAGGTCAA-GGTCAT-CATT----------------A--A-A-A--------T---T--------A-----T--T----T-----GTCTTT--AAG------A------A---T-AT-TTTT--AAGGACA-A-T--AAAT--GTCATTTAACACCAAA-GTG-GACCTTT----A----CATCCAT-TT-TG----A--CA-CATTTA--CCTCCCC--AT-TG-AGA-TGTTTTT-TGATATT--C---A-AGATTT-A-TTTTATTTCAT-ACTAC------T---A--AAGA-T-A--T-C----AAA--G-A--------------------GATCAT---CA-GCTTTCAA-TCTT--A-A-ATCATTG-ACCT-T-TA---TTTTT------T----GTC----AAGGT-CA-------------AAAGT-C---AA-GG-TC-ATTC----A-TATTTTAAAAA---CATTTTAA-AGTTTTTC---A-CAG-T-AAGAGT-TTG-AGGGT-A-A-ACGA-TAA-TAAAT-TTC-CGT---GAT-T---------TTTACACAAT---ACTGCA-TTCT--CATTCATATAATTTTCT--AAATT--T-TTTAAAAATCTT-TT-GAATCCATTTTTTC---ACA-TTTCATATTTGGT-GGAAAGCCCTCTAATTGTTCGC--AAACA-ATT-AGGAT-CACTAGT
gi|3 : GATG-GCCAATAA-A-CTTTT--ATTGGAT-TCATG-GAGGCTAATT-AGCGCGAT-TT-GGGT-GGG-TGTGACA-A--TAAAC--GAA-G-GGAT-TC-A-A-TG-AGACCC-----TTT-----T-G-A-ACGA--AG-TTATT--C-CCCTTGAATTTTT-AC--A----ATTTCTAT-G--T----AAATTGGG--AGAAAA----CTGTAAAAGAACGTATTCT----GTC-G---------TA-GAGGC---ATCGGGACCAATTGCA-A--T-G--TT----AT-CCCA---GTGGNNNNNN-N-N---NN-----NNNNNN--N-N---N---NN-N-NN-N---N-N-NN-NN-N-NNNNNNN--N-NNNN--------NNNNN-----NNN--NA-AAT-T-TGAAA--AAA-TA--TACA-T-----TTA-TT-ATACCC--TCTTTCCTTAC-ACGG-AACGATTA--G--CA-TGA----AAACAT----T-TAGAAGCT-A-----AGTA-TGCTCATC--T-T--A----ATAG-GTA-CAG----T-ATA-ATAA-AATTAC-AA----TTTTGAA--TT--GAC-C--TATAAATT---AGAAATAC---AACGA-TGTTG-CAT-T-----------------------------AAAAATCTT--TTAGC--ACTTAC---TCTT---ACTACTAAC--AAAAGT----CAA-A----AA-GA--C-A-T-AA--A------A-----ACCTGTACG--AT---G-A-TT-T--A-----GTCA--CT--GCT-AA-AA-CG-CTC-TT-G-C-AGTG----ACA--AAAG--TA-A--TGGAAG-G-AT-CTG-ATG---CC-T-T--AAGCCAT-A----GTTA-TC-G-C-CC-TGCAAA-ATCTT--A-----CA-ACATCGTTGT-TTTCAG--CT-TA---------TCAG------CT---TT-ATA----TTAG------ATCAA-G-ATA-GC-A----ATCA--TTTGGG-AACC-AC----AT-----A-CAG--TAA-------G-AC-C--------TTT-----GACCTT-CA---AA--T-TCAAGGTCAA-G--T---AA-AAGGTCAA-G-TCAT-CATT----------------A--A-A-A--------T---T--------A-----T--T----T-----G-CTTT--AAG------A------A---T-AT-TTTT--AAGGACA-ACT--AAAT--GTC--TTAACACCAAA-GTG-GACCTTT----A----CATCCAT-TT-TG----A--CA-CA-TTA--CCTCCCC--AT-TG-AGATTGTTTTT-TGATATT--C---A-AGATTTCATTTTTATTTCAT-ACTAC------TAA-A--AAGA-T-A--TGC----AAA--GAA--------------------GATCAT---CA-GC-TTCAA-GCTT--A-A-ATCA-TG-ACCT-T-TA---TTTTT------TG---GTC----A--GT-CA-------------AAAGTCC---AA-GG-TC-ATTC------TATTTTTAAAA---AATTTTAA-AG-TTTTC---A-CAG-T-AAGAGT-TTT--GAGT---A-ACGA-TAT-AAAAT-TTC-CGT---GAT-T---------TTTACACAAT---ACTGCATTTCT--CATTCATATAATTTTCTAAAAATT--T-TT---AAATTTTGTT-GAATCCATTTTTAC---ACATTTTCATA-TTGGTGGGAAAGCCCTCTAATTGTTCGC--AAACA-ATTCAGGAT-CACTAGT
gi|2 : cgttatttacacagttcttcttgacccttattacggacgttattggcctattcatataaaaatccttgttagatcacgtacttctctttaactgttcaatgttaGATG-GC-TACGACAACCTT---ATTGGATGC-ATT--AGATTAAT--AGC-AGGGATT-AG-T-GGG-T---ACACA--CAAAC--GAACA-GGAT-TC-ACA-TGGA---CC-----CCT-----T-A-A-A--G--AGGTTATT-GC-CCCTTAAATTTT--AA--AAAAGATTTCTAT-GGCTCTAGAAATT-G---AAAAAA----CC-TGA--GAAC-CG-T-T----ATC-G---------TA-TGGGC---A-C-GAACCAACTGCA-A--TAG--AG----ATGT--A---GTG-----AC-C-T---TT-----GACCTT--G-A---A---AA-TCTA-GT--G-T-CA-AG-GTTCAAAGG--T-GAAG--------GTCAG-----TCA--AA-AATCC-T--AA--AAA-TG----CA-T-----TT--TC-ATA-CT--TTTTTCCT-AC-A-GG-G--AAT-AT-T--CT-TGA----AACC------T-TA-AAACAGA-----ATCA-TA-TCATA----T--A----ATTGCTTTTTTG----C-ATG-ATAC-A-TTGA-AA----TTCTGAACTTT--GAC-CCAT-T---TC---CGAATTAC---AATGA-C-TAA-CGT-CAAAGC-T-TTATTACGCGCACT----------------------C--ACA-A-----CTT---GC----AACCGAAAAGT----CAT-A----GA-GA--C-G-C-AA--A------A-----CCTT---CAGTAT---G-A--T-T--A--------A--CT--A-T-AA-AA-AATCCC-TT-G-C-AGTG----AGATGAT-T--TA-A--CCGACA-GGAT-CTA-AGGA-CCC-T-T--A-CACAT-A----GTTA-CT-GCC-CCCTG-AAC-ATCT---------CATATATC-TGAT-TT--AT--CCATA---------C-AG------CT---TTTACA----TTACAAAGATATCAA-G-ACATG--G----ATAC--T---GGTTATT-AA----TT-----A-CCC--TT--------G-AC-C--------TTT-----GACCTT--A---CA--T-T-AAAGTCAA-G-GT---CA-AA--TCAA-GGTAAT-CATCACAAAACTTTGAAAAAA--A-A-A--------T---TC-------A-----T--T----TCAAA-GTCTTT--TTG------A------A---T-AT-ATTT--AAATAAACA-T--AAAT--AGTATTTGACCTCATA-AAA-GACCTTTAATAA----TATCCTTGTT-TG----A--CA-TATTTA--CCTCCCT--TTGTG-AGA-T-TTCTA-TTATATTA-T---A-AAA-TT-A-GTTTCTTTGATGACTAC------T---ATTAAGA-A-A--T-C----AAT--T-G--------------------GACTTT---CA-GCTTTTAA--CTT--A-ACATCATTA-ACTT-T-AA---TTTTT------T----GTC----AATGG-CA-------------ACAGT-C---AA-GG-TC-ATTC----A-TATGTTTAAAA---CATTTCAACA--TTCTG---A-CAC-T-GAAATTATTG-AGGGT-A-GTGCTA-TAA-TG-----TG-CGTGTCGAT-T-------------CAC-AT---ACTACC-TTGC--TGTCCATGAAATTTTCT--AAATT--C-TATTAAAACCTT-TTCGCATCCta
gi|5 : tagggctttccacctttctgtcctggaaaagtctattgttagagttctgtttcttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttccgccgtcaaaaaacaattttcgtttgaagactatttcaaaaaactttatagttcatccatataggacatcttgagaaatgattaaagtatcaccaacgtcatgtgaccttgaccccttaatgaagttattgcccttttcataaagaaaccctttttaactacttctctttaactgatcaatgaGATG-GC-AATGA-AAACTTT--ATTGAAT-T-ATA-TAGGCCAATT-AGC-AGGA-AT-AG-TGGGG-T---ACA-A--TAAAC--GAA-A-GGAT-TCAA-A-TG-A---CC-----CCT-----TAA-A-A--G--TG-TTATT-GCACCCTTGAATTTT--AC--G----ATTTTTCT-C--C----TAAT------AAAAA---------GA--TAGC-AATT-TC---GTC-A---------TA-GAGGCAA-A-TGGTACCGACTGTA-A--T-GGTTG----AT----A---GTA-----AC-C-C---TT-----TACCTT--GAA---A---AA-T-TC-A---G-T-CA-AG-G-TCAAAGG--T-CAAG--------GTCAT-----ACAAGAA-AAT-G-TGAAA--AAA-TG----CA-T-----TT--TT-TAATCA--TCTTTCCT-GC-A-GGAA--GAT-A--AC-CA-TTA----AAACAT----C-AT-ATGCTCA-----AGTA-T-CTCATC--C-TACA----ATAG-GTCTCAG----T-GTA-TAAA-A-TTAT-AA----TCCCGAAC-TTTGAAC-C--T-TTG-TT---AGAAATAC---AAAGA-T-TCG-CATAAAAAAA-TCTTGTTA----CACTAC--------------------------------TCCT---ACAT--AACC-AAAAAG----CAA-A----GA-GA--CAA-T-GA--A------A-----CATT---CA--AT---T---TT-T--A-----GTCAC-CT--G-TAAA-AA-CA-C-C-TT-GAA-AGTG----AGA--AA-AT-TA-A--CGGAAG-GGAT-CTGTATGC-CTC-T-T--T-ACTTT-A----GTTA-TT-G-C-CCCTG-CAA-GTCT---AC----CA-ACATC
gi|8 : tgttagggctttctacctttctgtggaaagtcccaattgttatgttcagtttaattattattttcctgtagttcaaaaatcgttttttgtttgaaagaccttattgatagaacctcctctacatcattaaatagtacttctcgagaatcgatcaaatttaacctcaacgttattgaccttcgacctccttagaaagttataaacccttgtataaaaattcttgttagcactactcctcttgaactgtcaaatgcGATG-GC-AATGA-A-CCTTT--ATTGGAT-T-ATA-GAGGCTAATT-AGC-CGGT-CT-AG-T-GGG-T---ACA-A--TAAAC--GAA-G-GGAT-TC-A-A-TG-A---CC-----CCT-----T-A-A-A--G--AG-TT-TT-GC-CCCTTGAATTTT--AC--A----ATTTCTAT-G--T----AAAATGGAAAAAAAAA----CT-TAA--GAAC-AATT-T----CTC-G---------CA-GAGAC---A-CGGGAATAACTGCA-A--T-G--TA----AT-C--A---GTG-----AC-C-T---TT-----GACCTT--G-A---A---AA-T-TA-G---G-T-C----------AAGG--T-CAAG--------GTCAT-----ATA--GA-AAT-T-TGAAA--AAA-TA--T-CA-T-----TT--TGAATACCC--TCTTT
gi|9 : aggcttttccaaccttctgtggaaagtcctattggatattgttctttctgcgtcaaatgctttttttgttgttgaagacgtttattggaaaaaattatactacttcaaatcatataagtacttctctcgagaatgtcgtcaatatatcaccccaacgtcatttgacctttgatcccttatacggaagttattggtctttgttataaaaactgttagcactactcttttttaactgtcaacgaGATG-GT-AACAT-GACCTTT--ATTGAAT-T-ATA-GAGGTTAATT-AGG-AGGA-TT-AG-T-GGG-T---ACA-A--TAAAC--AAA-A-GGAT-TC-A-A-TG-A---CC-----CCT-----T-A-A-A--G--AG-TTATT-GC-CCCTGAAATTTT--AC--G----ATTTCTAA-G--T----AAAATGG---AAAAAA----CT-TGA--GAAC-CGTT-A----ATC-G---------TA-TAGGC---A-CGGAACCAACTGCA-A--T-G--AG----AT-T--A---GTG-----AT-C-T---TT-----GACCTT--G-A---A---AA-T-TA-A---G-T-CA-AG-G-T
gi|7 : attagggctttccacctttcttgtggacaagtcctattgttttcttcgtgtttcttacttccttattatttattatttttcccgcgtcaaaaaaaatctttgtttcaagacttatcgaaagactttatagttcatctcatactggacatctcgagaaatgattaattatcacccaacgtcattgacctttgaccccttactgaggttatttgcctttcataaaaaccgttgttataactactacctttacctatttaaaacttcgatgATGAGC-ATCGA-AATTTTT---CTGTCT-G-ATA-GAGGTCATTTTAGA-AGAA-TG-AA-T-AGG-T---ACG-T--AAAAC----A-G-GGAT-TC-A-AATG-G---CCATAAATTT-----A-G-G-A--A--AG-TTATT--T-CCCTTG--TTTT--ACCTA----ATTCTTAAAG--T----AAAACAC---GTGAAA----CT-CGA--GAAT-CATT-A----ATCCG---------TA-CAGG--------GAACTAACTGGA-AAAT-G--GG----AT-T--A---GAG-----ACAC-T---TT-----GGCCTT--G-A---A---AA-T-TG-G---G-T-C--AG-G-TCAAA--------------------TAT-----GTA---A-AAA-T-TGACA--A----------------------TT-GT------TCT---------G-AG-A--GAT-A--C--CC-T-C----AAACAT----G-AT-AAGCATA-----AGTATTTTTCATC--T-T--A----ATTA-GTATCGG----CGGTA-AT-T-A-TTACAAA----TTTTGAACTTT--GAC-C--T-C-A-TC---AGAACTAC---GATGATT-TTG-TGT-CAAAAA---TTGTTA---GTGCTACTC-TAGGAA---------------------------------G--AACC-TAAAGT----CAA-A----GACGA--C-A-T-AT--A------A-----ACTT---CA--AC---G-A-TT-T--A-----TTCA--CA--A-TAAA-AA-TA-TCC-TT-A-CGAGTA----GGA--GA-T--TA-ACCCGAAAG-GGAT-GTA-AAGA-CCC--------AC--T-A----GTTATTT-G-C-CCCTG-AAGTATC----------CA-GTATCAT
gi|18 : cacaATGTGC-ATCAA-ACCTTTTCTATT---C-T-ATA-GAGGTCATTT-AAA-AGAA-TT-TA-T-AGG-G---ACA-T--TAAAC--AAA-A-AGAT-TC-A-A-TG-G---CC-----CTT-----T---A-A--GACAG-TTATT-GC-a
gi|1 : ttaattattacccaacgtcattgaccttagaccccttacagagttaagaatctttgttatcactatccctctttatccgtaaatgcaAA-GACTCTT--ATTGGAT-T-ATAAGACGCCAAT--ATC-CGGT-TTTAG-T-GGG-T---ACA-G--AAAAC--GAA-A-G-AT-TC-A-A-TA-A---CC-----CCT-----T-A-A-A--G--AG-TTAT--GC-CCTAACAATTTT--AC--G----ATTTCTTT-GG-T----AAAATGG---AAAAAAAAAACT-TGA--GGAA-CGTT-TAATAGTC-GGTGTTCTGTTATGCGGCCTCA-CGTGACCAACTGCA-A--T-GA-TGGAATAT-T--AAATGTG------C-T-T---AT-----GACCTTTCG-A---ATA-AA-T-TA-G---G-TTCATAG-G-TCAAAAGGTT-CAAA--------GTCTT-----TTT--CA-AAT-T-ATCAT--AAA-TA--G-CA-T-----TT--TC-ACACCG--TCTTTTCT-TCTA-GG-G--AAT-A--ATTCC-TTA----AACCATCA--T-TA-TAATTCATCTAAAGTA-TTTTAATCATT-T--ATATTATAA-ATCTTTGCTTTT-TTAGATTA-A-TTGG-AAATTTTTCTGAAC-TTT-GACTC--T-CTA-TTTTCCGAATTATTCGAATGA-C-TTAACGT-CAAAAAGCCTTGTTA----TGCTACTC-----AAAT-TT-A--AAC--GTT-AA---T-TT---AC-----ACA-ACAAGT----CAT-A----TA-GAA-C-G-C-AA--ATTAATTA-----CCTTT--CA--ATTTTGTA-TT-TTTA-----ATTAACTT--A-T-AAGAA-TT-CCC-TTTG-C-AGTG----A----GA-G--TTTA--CCGAAG-G-AT-CT--ATGGACCC-TCT--A-ACCATTA----GTTA-CT-G-C-CC-TG-AAA-GTCTTCCA-----TA-ATATCATTAT-CC-TAGGCCT-TA---------C-AG------CT---TTTACA----TTA-------A-CAATG-ATA-GCAA----GACA--T---GG-A--C-AC----TT-----G-CA---TAA-------TTAC-C--------TTTT----GACC---------A--T-T-GACTTCA-----T---CATAATGTCAA-GGTCAT-CATC----------------C--A-A-A--------TATTT--------AATTTTT--T----T-----ATTTTC--AAGTCTTTTG------A---TGAT-TTTTTAAATAACA-T-TTAAAATTAGT-ATTTGACTCTAAT-TTACGACTCTT----AATATCTTCCTT-TT-TG----A--CA-TATTTA--CCTCCTT--TG-TG-AGA-T--TGTA-TGATATTATT---A-AAATTT-A-GTTT-TTTGAT-ACTAT------T---A--CAGA-T-AA-T-C----ATG--G-------------------------CACTTGCA-GCTGTCAA-TCTT--A-A-ATCATTG-ACCT-TGGA---TATTT------T----GTC----AAGGTAAA-------------AAAGT-CACAAG-GG-TC-ATTC----ATTATGTT-AAAA---CACTTTCA-CCATTTTCTGGA-C-G-T-A--AAT-TTG-AGGGTGA-G-ACGC-TAG-GAAATGTGT-TGT---GTTCT---------TTTACACAGT---ACTACC-TTCGCACATTCATGAAATTTCTTA-AAATC--TATTT---AATCTT-TT-TTATCC-TTTTTTT---TCA-TT
gi|29 : caagtaatggttaattattcatctctaaatcgtcattgacccttattgaccccgctcttatttacttactgagttatgtgcttcctttccatataacgttgtataactatgcctctttaacttgttttcttctaattttagtagtgagatagttggctaacgga-T-AGG-G---ACA-A--TAAAT--GAA-A-GGAT-TC-A-A-TG-G---CC-----GTT-----T---A-A--GACAG-TTATT-GC-CCCTTaataagtacaaagaaatatcagggtggggaggaaggccctcaattagatttcaagtctgcacaacgccgagaatataatggactcact
gi|14 : aaatgcaatgtgcatcaaaccttttctaatttaaaagaatgta-T-GGGCT---ACC-T--TAAGC--AAA-A-GGAA-TC-A-A-TG-G---CC-----CTT-----T-ATG-A--T--AG-TTATT-GC-CCCTTat
gi|22 : ---ACA-AATTAATG--GAA-G-GGAT-AT-G-A-TG-A---CC-----CTT-----A-A-ACA--T--AG-TTATC-GC-CCCTannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaggtcatctaaaatatgtaaaaatagcatttttatagcttctcctgcaggagatacc
gi|23 : ctactcctactaaaccaaaagtcaaaaagaaatgataccttttatgatttagtcactgtagaacacccttgcaatg--TAACC--GAG-G-GGAT-CC-A-A-GG-A---CC-----CTT-----A-C-A-C--A--TA-TTATT-GC-CCC
gi|6 : aagtcatagagacacaaaaccttcagtgatgtattaactataaacactccttgcagtgagagtt--TAAACCGGAA-GAGGATACC-A-A-GG-A---CC-----CTTACACAT-A-A-G--C--GG-TTATTAGC-CCCTGGAAagaaagtatccaatatcatt
gi|15 : gaatgggatcagtgtctctttgaccttaaaaaattagggtgcaaggtcaaagggtcacgcgttgttagccattttctattacaattatcaaataataattgcatgcttgttcatcatactcgttctttcctactcgagggaatatggccttaaacatgattctatagcaaaagtatgtaggataaattgcgtatcagcatagatcacattgaattctgaacttttgacctatttccgattaactcacactggactaaacgtcaaaaagcttttaatctgctacatatcgcgagactgaaacgaaagtgtagcgatagagagtcatcaaaagaggtccttcataaaactataaaaacccctttgcagtgaggagtt-TG-A---CC-----CCT-----T-A-A-A--G--AG-TCATT-GC-CCCTTGAATTTT--A--------------------T----AAAATGG---ACTAAA----AT-TAA--AAAC-CATT-T----GTC-A---------TA-GAGGC---A-CGCAACCAACTGCA-A--T-G--TG----AT-T--A---GTG-----AC-C-T---TT-----GACCTT--G-A---A---AA-T-------------A-AA-G-TCAAAGG--T-CTAG--------GTCAT-----ATA--AA-AAT-T-CGAAA--AA--TA--T-CACT-----TT--TT-ATACCC--TTTTTCCT-AC-A-GG-A--GAT-A--G--CA-TGA----AAACGG----T-AT-ATGCTCA-----AGTA-TTCTCATatagaattcccaattccattatattaggcctatacctctcttagcattacacgatagaggacatcggggcaccacttagttgttacacccccttgagcttgaccttcaataaggtcaacgcgtacaaacagacatcatcaaaaagcttagtttatttatcttccaaatgtctctttagaattaaagaggacatttaaacataatatatgaccattaaaagactcgcaatagtcctctttccgcacaattttacttggctctctttgtgaagttttctatgatatttattgcttaatatatattaa
gi|27 : --AG-TTATT-GC-CCCT--AATTTTTAAC--G----ATTTCTAA-G--T----GAAACAC---ATCAAA----CT-TGA--GACC-CGTT-A----ATC-G---------TA-TGGGT---T-CGGGACCAACTGCA-A--T-G--GG----AT-C--A---GTG-----AC-C-T---gt
gi|3 : ttaagac----CT-TAA--AAA--TATT--------C-T---------TA-AAG-C---A-----AATAATTTTA-A--T-GA-TG----AC-T-------TG-----AC-C-T---TTTACTTGACCTT--G-A---A------T-T--------T-GA-AG-G-TCAAAGG--T-C
gi|20 : cgttatttacacagttcttcttgacccttattacggacgttattggcctattcatataaaaatccttgttagatcacgtacttctctttaactgttcaatgttagatggccaataaacttttattggattcatggaggctaattagcgcgatttgggtgggtgtgacaataaacgaagggattcaatgagacccttttgaacgaagttattccccttgaatttttacaatttctatgtaaattgggagaaaactgtaaaagaacgtattctgtcgtagaggcatcgggaccaattgcaatgttatcccagtggnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaatttgaaaaaatatacatttattataccctctttccttacacggaacgattagcatgaaaacatttagaagctaagtatgctcatcttaataggtacagtataataaaattacaattttgaattgacctataaattagaaatacaacgatgttgcattaaaaatcttttagcacttactcttactactaacaaaagtcaaaaagacataaaaacctgtacgatgatttagtcactgctaaaacgctcttgcagtgacaaaagtaatggaaggatctgatgccttaagccatagttatcgccctgcaaaatcttacaacatcgttgttttcagcttatcagctttatattagatcaagatagcaatcatttgggaaccacatacagtaaTGCACA--T-G--TG----AG-A--A---ATA-----AT-T-T---T-------GTTGT--G-A---T---AA-T-TA-AAGAG-C-CC-AG-G--CAAAGG--TTCAAA--------GTCAT------TA--AA-AAC-T-C-AAA--AAA-TA--GGCA-T-----TT--TTCATACTG--TTTTTCCT-AC-A-GG-AT-AAT-AT-T--CT-TGA----AACGAT----TATA-AAGCgacaactaaatgtcttaacaccaaagtggacctttacatccattttgacacattacctccccattgagattgttttttgatattcaagatttcatttttatttcatactactaaaaagatatgcaaagaagatcatcagcttcaagcttaaatcatgacctttattttttggtcagtcaaaagtccaaggtcattctatttttaaaaaattttaaagttttcacagtaagagttttgagtaacgatataaaatttccgtgatttttacacaatactgcatttctcattcatataattttctaaaaatttttaaattttgttgaatccatttttacacattttcatattggtgggaaagccctctaattgttcgcaaacaattcaggatcactagtta
gi|6 : agA-A--T-G--GG----AT-C--A---GTG-----TC-TCT---TT-----GACCTT--A-A---A---AAAT-TA-G---GGTGCA-AG-G-TCAAAGGG-T-CACGCGTTGTTAGCCATTTTCTAT---TACAAT-TATCAAA--TAA-TAATTGCA-TGCTTGTTCATC-ATACTCGTTCTTTCCT-AC-T-CG-A--GGG-A--A--TA-TGGCCTTAAACATGATTC-TA-TAGCAAA-----AGTA-TG-TAGGA--T-A--A----ATTGCGTATCAG----C-ATAGATCACA-TTG--AA----TTCTGAAC-TTTTGAC-C--T---A-TT--------T-C-----CGA-T-T----------AAC-TCACACTG---G-ACTAAACGTCAAAAAGCTT--TTAATCTGCT-ACATATCGCGAGACTG--AAAC-GAAAGTGTAGCGATA----GA-GAGTC-A-TCAA--A------AGAGGTCCTT---C---AT---A-A-------A--------A--CT--A-T-AA-AAACC-CCT-TT-G-C-AGTG----A-G--GA-GTTTA-AACCGGAAGAGGATACCA-AGGA-CCC-T-T--A-CACAT-AAGCGGTTA-TTAG-C-CCCTG-GAA-ATAG---AATTCCCA-ATTCCATTATATT-AGG--CC-TA---------T-AC------CTCTCTTAGCA----TTA---------CAC-G-ATA-G--AGGACATCG--G---GG-CACC-AC----TT-----AGTTG--TTA-------C-AC-CCCCTTGAGCTT-----GACCTT-CA---A-----T-AAGGTCAA-C-GCGTACA-AA---CA---GACAT-CATC----------------A--A-A-AAGCTTAGTT---T--------A-----T--T----T-----ATCTTC--CA-------A------A---T-GTCTCTT--TAGAATT-A-A--AGAG--GACATTTAAagaag
gi|2 : g--T-G--TG----AT-G--A---TTA-----CC-T-TGATTT-----GACCTT--G-A---CTTTAA-T--------G-T--A-AG-G-TCAAAGG--T-CAAG--------Gacataatatatgaccattaaaagactcgcaatagtcctctttccgcacaattttacttggctctctttgtgaagttttctatgatatttattgcttaatatatattaa
gi|5 : tagggctttccacctttctgtcctggaaaagtctattgttagagttctgtttcttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttccgccgtcaaaaaacaattttcgtttgaagactatttcaaaaaactttatagttcatccatataggacatcttgagaaatgattaaagtatcaccaacgtcatgtgaccttgaccccttaatgaagttattgcccttttcataaagaaaccctttttaactacttctctttaactgatcaatgagatggctacgacaaccttattggatgcattagattaatagcagggattagtgggtacacacaaacgaacaggattcacatggaccccttaaagaggttattgccccttaaattttaaaaaagatttctatggctctagaaattgaaaaaacctgagaaccgttatcgtatgggcacgaaccaactgcaatagagatgtagtgacctttgaccttgaaaatctagtgtcaaggttcaaaggtgaaggtcagtcaaaaatcctaaaaatgcattttcatacttttttcctacagggaatattcttgaaaccttaaaacagaatcatatcatataattgcttttttgcatgatacattgaaattctgaactttgacccatttccgaattacaatgactaacgtcaaagctttattacgcgcactcacaacttgcaaccgaaaagtcatagagacgcaaaaccttcagtatgattaactataaaaaatcccttgcagtgagatgatttaaccgacaggatctaaggacccttacacatagttactgccccctgaacatctcatatatctgatttatccatacagcttttacattacaaagatatcaagacatggatactggttattaattacTG-----AC-C-T---TT-----GACCTT--G-ACT-G---AA-T-T--T---T-T-CA-AG-G-TAAAGGG--T-TAaaactttgaaaaaaaaattcatttcaaagtctttttgaatatatttaaataaacataaatagtatttgacctcataaaagacctttaataatatccttgtttgacatatttacctccctttgtgagatttctattatattataaaattagtttctttgatgactactattaagaaatcaattggactttcagcttttaacttaacatcattaactttaattttttgtcaatggcaacagtcaaggtcattcatatgtttaaaacatttcaacattctgacactgaaattattgagggtagtgctataatgtgcgtgtcgattcacatactaccttgctgtccatgaaattttctaaattctattaaaaccttttcgcatcc
gi|8 : tgttagggctttctacctttctgtggaaagtcccaattgttatgttcagtttaattattattttcctgtagttcaaaaatcgttttttgtttgaaagaccttattgatagaacctcctctacatcattaaatagtacttctcgagaatcgatcaaatttaacctcaacgttattgaccttcgacctccttagaaagttataaacccttgtataaaaattcttgttagcactactcctcttgaactgtcaaatgcgatggcaatgaaaactttattgaattatataggccaattagcaggaatagtggggtacaataaacgaaaggattcaaatgaccccttaaaagtgttattgcacccttgaattttacgatttttctcctaataaaaagatagcaatttcgtcatagaggcaaatggtaccgactgtaatggttgatagTG-----AC-C-T---T------GACCTT--G-ACCTA---AT-T-T--------T-CA-AG-G-TCAAAGG--T-CAaggtcatacaagaaaatgtgaaaaaatgcattttttaatcatctttcctgcaggaagataaccattaaaacatcatatgctcaagtatctcatcctacaataggtctcagtgtataaaattataatcccgaactttgaacctttgttagaaatacaaagattcgcataaaaaaatcttgttacactactcctacataaccaaaaagcaaagagacaatgaaacattcaatttttagtcacctgtaaaaacaccttgaaagtgagaaaattaacggaagggatctgtatgcctctttactttagttattgcccctgcaagtctaccaacatc
gi|21 : aggcttttccaaccttctgtggaaagtcctattggatattgttctttctgcgtcaaatgctttttttgttgttgaagacgtttattggaaaaaattatactacttcaaatcatataagtacttctctcgagaatgtcgtcaatatatcaccccaacgtcatttgacctttgatcccttatacggaagttattggtctttgttataaaaactgttagcactactcttttttaactgtcaacgagatggcaatgaacctttattggattatagaggctaattagccggtctagtgggtacaataaacgaagggattcaatgaccccttaaagagttttgccccttgaattttacaatttctatgtaaaatggaaaaaaaaacttaagaacaatttctcgcagagacacgggaataactgcaatgtaatcagTG-----AC-T-T---G------GACCTT------------AC-T-T--------T-GA-AG-G-TCAAAGG--T-CAAG--------Gtatagaaatttgaaaaaatatcattttgaataccctcttt
gi|15 : cattaagacG-----AC-C-T---TT-----GACTTT-------------A-T-T------T-T-CA-AG-G-TCAAAGG--T-CAtcatgaaatattttcttttcatttctaaggtcattaagattatttttaaggacaataaatataatttgaccccaaaatggacctttacaccca
gi|32 : tgaccccttaaagagtcattgccccttgaattttataaaatggactaaaattaaaaaccatttgtcatagaggcacgcaaccaactgcaatgtgattag-----AC-C-T---TG-----AATCTT--G-A---A---AC-T-GAAG---G-T-CA-ACTG-TCAAAGG--T-CAAC--------GTCAtaggtcatataaaaattcgaaaaatatcactttttataccctttttcctacaggagatagcatgaaaacggtatatgctcaagtattctcatgt
gi|11 : ggtagagtctggtcactacaggcttgaCTT--T-G---A---AA-T-TA-G---G-T-CA-AG-G-TCAA-GG--T-CAAG--------G-CAT-----TCA--AA-AAT-C-TAAAACAAAACTG--G-CA-T-----TT--TC-ATACTG--TTTTTCCT-AC-A-AG-G--GAT-ACTT--CT-TG-----AAACAT----T-TATAAGCAGA-----AGTA-T--TCATC--TAT--A----Acctgaaa
gi|16 : CTT--G-A---A---AA-T-TA-G---G-T-CA-AG-G-TCAAAGA--T-CA-----------TCAT-----A-A--T--GAT-T-AGATT--ATA-CA----CA-T-----TT--TT-Aattgctttttgattggagaattgaattaacatgaacatttgacacatctataatttctgaatatacaatgagcaaacgatcgagataataaagttgtcataaatgaacgcgacatatcttgacacactcaaactagagactaagaaatgtcatagtggattctagcacaaatacctcttcagctgatttcgattactttaaaaaaatcacctt
gi|14 : attacaagacatggggcaaccttttagacccctaaaAG--------GTCAT-----CTA---A-AAT-A-TGTAA--AAA-TA--G-CA-T-----TT--TT-ATAGCT--TC--TCCT-GC-A-GG-A--GAT-A--agatgttttaggttcttttcaaatacagtgaatggcttgacctaactgtggaactttagatcccttttaataccagttattctctttgatatttt
gi|33 : tgggctaccttaagcaaaaggaatcaatggccctttatgatagttattgccccttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAA-TA--G-CA-T-----TT--TTCATATTT--TTTTTTCA-AT-A-GGAA--GAT-AT-A--TATTGA----AACCAT----C-TA-AAGcc
gi|5 : -TAAAAATTCTT-GTTAGC--ACT-AC---TCCT---CTTG--AACT-----GT----CAA-ATGCGAT-GG--C-AAT-GA--A------A-----ACTT---TA--TT---G-A-AT-T--ATATAGGCCA--ATTAG-C-AG-GA-----------A-T-AGTGGGGTACA--A-----TA-A--ACGAAA-GGATTCAA-ATGA-CCCCT-T--A-AAAGT------GTTA-TT-G-CACCCTT-GAA-TTTT---A-----CG-A-----TT-T-TT-C-T--CC-TAATAAAAAGAT-AG------C------AAT-----TTC-------GTCA-----TA-G--A----GGCAAAT---GG-TACCGACTGTAATGGTTGA-TAG--T---------A-AC-C--------CTT-----TACCTT-GA---AAAAT-T-CAG-TCAA-G-GT---CA-AAGGTCAA-GGTCATACAAG----------------A--A-A-A--------T---tagaa
gi|18 : tgttagggctttctacctttctgtggaaagtcccaattgttatgttcagtttaattattattttcctgtagttcaaaaatcgttttttgtttgaaagaccttattgatagaacctcctctacatcattaaatagtacttctcgagaatcgatcaaatttaacctcaacgttattgaccttcgacctccttagaaagttataaacccttgta-TTAAGAATCTTTGTTATC--ACT-AT---CCCT---CTTT--ATCC-GTAAATG---CAA-T----GT-G---C-A-T-CA--A------A-----CCTTTT-CT--AT-------TC-T--ATAGAGGTCA--TT----T-AA-AA-GA-AT--TT-A-T-AGGG----ACATTAA-A--CA-A------AA-AGAT-TCA-ATGG-CCC-T-TTAA-G--AC-A----GTTA-TT-G-C-gtgaaaaaatgcattttttaatcatctttcctgcaggaagataaccattaaaacatcatatgctcaagtatctcatcctacaataggtctcagtgtataaaattataatcccgaactttgaacctttgttagaaatacaaagattcgcataaaaaaatcttgttacactactcctacataaccaaaaagcaaagagacaatgaaacattcaatttttagtcacctgtaaaaacaccttgaaagtgagaaaattaacggaagggatctgtatgcctctttactttagttattgcccctgcaagtctaccaacatc
gi|8 : ttaattattacccaacgtcattgaccttagaccccttacagagAAAAAC--T-GTTAGC--ACT-AC---TCTT---TTTT--AACT-----GT----CAA-C----GA-GA--TGG-C-AATGA------A-----CCTT---T---ATTG-G-A-TTAT--A-----GAGG--CTA-A-T-TA-GC-CG-GTC-T------AGTGGGT-ACA--A-----TA-A--ACGAAG-GGAT-TCA-ATGACCCC-T-T--A-A--AG-A----GTT--TT-G-C-CCCTT-GAA-TTTT---A-----CA-A
gi|24 : aggcttttccaaccttctgtggaaagtcctattggatattgttctttctgcgtcaaatgctttttttgttgttgaagacgtttattggaaaaaattatactacttcaaatcatataagtacttctctcgagaatgtcgtcaatatatcaccccaacgtcatttgacctttgatcccttatacggaagttattggtctttgttatAAAAGCTT-ATTATG--GCT-AC---TCCA---ACTG--AAAT-GAAAGT----CAT-A----GA-GA--A-G-A-AA--A------A-----CCTT---CA--AT---T-A-TT-C--A-----TTAA--CT--A-T-AA-AA-AT-CCT-TT-G-C-GGTG----Atttctatgtaaaatggaaaaaaaaacttaagaacaatttctcgcagagacacgggaataactgcaatgtaatcagtgacctttgaccttgaaaattaggtcaaggtcaaggtcatatagaaatttgaaaaaatatcattttgaataccctcttt
gi|22 : CT-AC---TCCT---ACTA--AACC-AAAAGT----CAA-A----AA-GA--A-A-T-GA--T------A-----CCTT---TT--AT---G-A-TT-T--A-----GTCA--CT--G-T-AG-AA-CA-CCC-TT-G-C-AATG----ACA--AA-T--TA-A--TGGAAG-GGAT-ATG-ATGA-CCC-T-T--A-AACAT-A----GTTA-TC-G-C-CCCTgtgtttaaccgaaaggatataaggac
gi|23 : AAGT----CAT-A----GA-GA--C-A-C-AA--A------A-----CCTT---CA--GT---G-A-TG-T--A-----TTAA--CT--A-T-AA-A--CA-CTCCTT-G-C-AGTG----AGA--GT-T--TA-A--CCGAGG-GGAT-CCA-AGGA-CCC-T-T--A-CACAT-A-----TTA-TT-G-C-CCCAG-AAA-GTAT---C-----CA-ATATCATT
gi|3 : ----AA-GG--C-A-T-CA--G------AT----CCTT---CC--AT---T-ACTT-T--T-----GTCA--CT--G-C-AA-GAGCG-TTT-TA-G-C-AGTG----ACT--AA-A--TC-A--T
gi|22 : cgttatttacacagttcttcttgacccttattacggacgttattggcctattcatataaaaatccttgttagatcacgtacttctctttaactgttcaatgttagatggccaataaacttttattggattcatggaggctaattagcgcgatttgggtgggtgtgacaataaacgaagggattcaatgagacccttttgaacgaagttattccccttgaatttttacaatttctatgtaaattgggagaaaactgtaaaagaacgtattctgtcgtagaggcatcgggaccaattgcaatgttatcccagtggnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaatttgaaaaaatatacatttattataccctctttccttacacggaacgattagcatgaaaacatttagaagctaagtatgctcatcttaataggtacagtataataaaattacaattttgaattgacctataaattagaaatacaacgatgttgcattaaaaatcttttagcacttactcttactactaacaaaagtcaaaaagacataaaaacctgtacg-----CCTT---CC--ATT--A-A-TT-T--------GTCA--TT--G-C-AA-GGGTG-TTC-T--A-C-AGTG----ACT--AA-A--TC-A--TAAAAG-GTAT-Caagccatagttatcgccctgcaaaatcttacaacatcgttgttttcagcttatcagctttatattagatcaagatagcaatcatttgggaaccacatacagtaagacctttgaccttcaaattcaaggtcaagtaaaaggtcaagtcatcattaaaattatttgctttaagaatatttttaaggacaactaaatgtcttaacaccaaagtggacctttacatccattttgacacattacctccccattgagattgttttttgatattcaagatttcatttttatttcatactactaaaaagatatgcaaagaagatcatcagcttcaagcttaaatcatgacctttattttttggtcagtcaaaagtccaaggtcattctatttttaaaaaattttaaagttttcacagtaagagttttgagtaacgatataaaatttccgtgatttttacacaatactgcatttctcattcatataattttctaaaaatttttaaattttgttgaatccatttttacacattttcatattggtgggaaagccctctaattgttcgcaaacaattcaggatcactagtta
gi|14 : ctactcctactaaaccaaaagtcaaaaagaaat--AA-G--CA-A-----AAG-GAAT-C-A-ATGG-CCC-T-T--T-ATGAT-A----GTTA-TT-G-C-CCCTgatatgatgacccttaaacatagttatcgcccct
gi|9 : tgggctaccttAAA-GGAT-TCA-ATGA-CCCCT-T--A-A--AG-A----GTTA-TT-G-C-CCCTG-AAA-TTTT---A-----CG-ATTTC--TAA-GT-AAA------A---------T-GGAAAAAAC----TTGAGAACCGTTA-------ATC---GTATA-G--G------CA--C---GG-AACC-AA----CT-----G-CAA--TGAGATTAGTG-AT-C--------TTT-----GACCTTGAA---AA--T-T-AA-GTCAA-G-GT---tannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaggtcatctaaaatatgtaaaaatagcatttttatagcttctcctgcaggagatacc
gi|16 : attagggctttccacctttcttgtggacaagtcctattgttttcttcgtgtttcttacttccttattatttattatttttcccgcgtcaaaaaaaatctttgtttcaagacttatcgaaagactttatagttcatctcatactggacatctcgagaaatgattaattatcacccaacgtcattgacctttgaccccttactgaggttatttgcctttcataaaaaccgttgttataactactacctttacctatttaaaacttcgatggatggtaacatgacctttattgaattatagaggttaattaggaggattagtgggtacaataaacaA----TTA---------CAA-G-A-------------CA--T---GG-GGCA-AC----CT---------T--TTA-------G-AC-C--------CCT-----AAACTT-GA---AA--A-T-TAGGTCAA-G-GT---CA-AAGATCA----TCAT-AATG----------------ATTA-G-A--------T---T--------A-----TACA----C-----ATTTTT--AAG------ATGTTTTAGGTT-CT-TTTC--AAATACA-G-T--GAAT--GGC--TTGAC-CTAACTGTG-GAACTTT----A----GATCCCT-TT-TA----A--TACCAGTTA----TTCTC--TT-T---GA-TATTTT
gi|32 : -G-GTA-G--A----GTC---T---GG---TC-AC-----T-----A-CAGGCTTG-------A-AC-C--------TTG-----AATCTT-GA---AA--C-TGAAGGTCAA-CTGT---CA-AAGGTCAA-CGTCAC-C
gi|8 : -CAG--T---------G-AC-C--------TTT-----GACCTT-GA---AA--A-T-TAGGTCAA-G-GT---C--AAGGTCAtgaaa
gi|15 : aggcttttccaaccttctgtggaaagtcctattggatattgttctttctgcgtcaaatgctttttttgttgttgaagacgtttattggaaaaaattatactacttcaaatcatataagtacttctctcgagaatgtcgtcaatatatcaccccaacgtcatttgacctttgatcccttatacggaagttattggtctttgttataaaaactgttagcactactcttttttaactgtcaacgagatggcaatgaacctttattggattatagaggctaattagccggtctagtgggtacaataaacgaagggattcaatgaccccttaaagagttttgccccttgaattttacaatttctatgtaaaatggaaaaaaaaacttaagaacaatttctcgcagagacacgggaataactgcaatgtaatA-------G-AC-C--------TTT-----GACTTT-------A--T-T----TTCAA-G-GT---CA-AAGGTCACTAATCA--CATT----------------G--C-A-G--------T---TG-------G-----T--TGCG-T-----GCCTCT--ATGACA---A------A---TGGT-TTTT--AAtatagaaatttgaaaaaatatcattttgaataccctcttt
gi|7 : tgaccccttaaagagtcattgccccttgaattttataaaatggactaaaaA-------G-ACAC--------TTT-----GGCCTT-GA---AA--A-T-TGGGTCA--G-GT---CA-AAaggtcatataaaaattcgaaaaatatcactttttataccctttttcctacaggagatagcatgaaaacggtatatgctcaagtattctcatgt
gi|3 : cacaatgagcatcgaaatttttctgtctgatagaggtcattttagaagaatgaataggtacgtaaaacagggattcaaatggccataaatttaggaaagttatttcccttgttttacctaattcttaaagtaaaacacgtgaaactcgagaatcattaatccgtacagggaactaactggaaaatgggattag-------G-AC-C--------TTTTACTTGACCTT--G---AA--T-T-----TGAA-G-GT---CA-AAGGTCtatgtaaaaattgacaattgttctgagagataccctcaaacatgataagcataagtatttttcatcttaattagtatcggcggtaattattacaaattttgaactttgacctcatcagaactacgatgattttgtgtcaaaaattgttagtgctactctaggaagaacctaaagtcaaagacgacatataaacttcaacgatttattcacaataaaaatatccttacgagtaggagattaacccgaaagggatgtaaagacccactagttatttgcccctgaagtatccagtatcata
gi|2 : cgttatttacacagttcttcttgacccttattacggacgttattggcctattcatataaaaatccttgttagatcacgtacttctctttaactgttcaatgttagatggccaataaacttttattggattcatggaggctaattagcgcgatttgggtgggtgtgacaataaacgaagggattcaatgagacccttttgaacgaagttattccccttgaatttttacaatttctatgtaaattgggagaaaactgtaaaagaacgtattctgtcgtagaggcatcgggaccaattgcaatgttatcccagtggnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaatttgaaaaaatatacatttattataccctctttccttacacggaacgattagcatgaaaacatttagaagctaagtatgctcatcttaataggtacagtataataaaattacaattttgaattgacctataaattagaaatacaacgatgttgcattaaaaatcttttagcacttactcttactactaacaaaagtcaaaaagacataaaaacctgtacgatgatttagtcactgctaaaacgctcttgcagtgacaaaagtaatggaaggatctgatgccttaagccatagttatcgccctgcaaaatcttacaacatcgttgttttcagcttatcagctttatattagatcaagatagcaatcatttgggaaccacatacagtaa-------G-AC-C--------TT------GACTTT------AA--TGT-AAGGTCAAAG-GT---CA-AGGGTaagtcatcattaaaattatttgctttaagaatatttttaaggacaactaaatgtcttaacaccaaagtggacctttacatccattttgacacattacctccccattgagattgttttttgatattcaagatttcatttttatttcatactactaaaaagatatgcaaagaagatcatcagcttcaagcttaaatcatgacctttattttttggtcagtcaaaagtccaaggtcattctatttttaaaaaattttaaagttttcacagtaagagttttgagtaacgatataaaatttccgtgatttttacacaatactgcatttctcattcatataattttctaaaaatttttaaattttgttgaatccatttttacacattttcatattggtgggaaagccctctaattgttcgcaaacaattcaggatcactagtta
gi|8 : tagggctttccacctttctgtcctggaaaagtctattgttagagttctgtttcttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttccgccgtcaaaaaacaattttcgtttgaagactatttcaaaaaactttatagttcatccatataggacatcttgagaaatgattaaagtatcaccaacgtcatgtgaccttgaccccttaatgaagttattgcccttttcataaagaaaccctttttaactacttctctttaactgatcaatgagatggctacgacaaccttattggatgcattagattaatagcagggattagtgggtacacacaaacgaacaggattcacatggaccccttaaagaggttattgccccttaaattttaaaaaagatttctatggctctagaaattgaaaaaacctgagaaccgttatcgtatgggcacgaaccaactgcaatagagatgtagtgacctttgaccttgaaaatctagtgtcaaggttcaaaggtgaaggtcagtcaaaaatcctaaaaatgcattttcatacttttttcctacagggaatattcttgaaaccttaaaacagaatcatatcatataattgcttttttgcatgatacattgaaattctgaactttgacccatttccgaattacaatgactaacgtcaaagctttattacgcgcactcacaacttgcaaccgaaaagtcatagagacgcaaaaccttcagtatgattaactataaaaaatcccttgcagtgagatgatttaaccgacaggatctaaggacccttacacatagttactgccccctgaacatctcatatatctgatttatccatacagcttttacattacaaagatatcaagacatggatactggttattaatt-------G-AC-C--------TT------GACCTT-GACCTAA--T-T----TTCAA-G-GT---CA-AAGGTCACTGATTA--CATT----------------G--C-A-G--------T---T--------A-----T--TCCCGT-----GTCTCTGCGAG------A------AAT-T-GT-TCTT--AAGaaatcaaggtaatcatcacaaaactttgaaaaaaaaattcatttcaaagtctttttgaatatatttaaataaacataaatagtatttgacctcataaaagacctttaataatatccttgtttgacatatttacctccctttgtgagatttctattatattataaaattagtttctttgatgactactattaagaaatcaattggactttcagcttttaacttaacatcattaactttaattttttgtcaatggcaacagtcaaggtcattcatatgtttaaaacatttcaacattctgacactgaaattattgagggtagtgctataatgtgcgtgtcgattcacatactaccttgctgtccatgaaattttctaaattctattaaaaccttttcgcatcc
gi|15 : aggcttttccaaccttctgtggaaagtcctattggatattgttctttctgcgtcaaatgctttttttgttgttgaagacgtttattggaaaaaattatactacttcaaatcatataagtacttctctcgagaatgtcgtcaatatatcaccccaacgtcatttgacctttgatcccttatacggaagttattggtctttgttataaaaactgttagcactactcttttttaactgtcaacgagatggcaatgaacctttattggattatagaggctaattagccggtctagtgggtacaataaacgaagggattcaatgaccccttaaagagttttgccccttgaattttacaatttctatgtaaaatggaaaaaaaaa-------G-AC-C--------TTT-----GACCTT-GA---AA--A-T-------AA-A-GT---CA-AAGGTCTA-GGTCAT--ATA----------------A--A-A-A--------T---T--------atatagaaatttgaaaaaatatcattttgaataccctcttt
gi|21 : tgaccccttaaagagtcattgccccttgaattttataaaatggactaaaattaaaaaccatttgtcatagaggcacgcaaccaactgcaatgtgattagt-------G-AC-C--------TTT-----GACCTT-CA---AA--G-T-AAGGTC------------------CAA-G-TCAT-CATG----------------A--A-ATA--------T---TTTCTTTTCA-----T--T----TCTAAGGTCATT--AAG------A------T---T-AT-TTTT--AAGGACA-A-T--AAAT--ATAATTTGACCCCAAA-ATG-GACCTTT----A----CACCCAcgaaaaatatcactttttataccctttttcctacaggagatagcatgaaaacggtatatgctcaagtattctcatgt
gi|21 : cattaagaccctt-C--------TTG-----GACCTT------AC--T-T-----TGAA-G-GT---CA-AAGGTCAA-GG
gi|2 : cattaagac--------TTT-----GACCTT-GA---CT--T-T-AATGT-AA-G-GT---CA-AAGGTCAA-GG--GT-AATT----------------A--ATA-A--------CCAGT--------A-----T--CCA--T-----GTCTT------------G------A---T-AT-CTTT--tcatcatgaaatattttcttttcatttctaaggtcattaagattatttttaaggacaataaatataatttgaccccaaaatggacctttacaccca
gi|6 : tagggctttccacctttctgtcctggaaaagtctattgttagagttctgtttcttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttccgccgtcaaaaaacaattttcgtttgaagactatttcaaaaaactttatagttcatccatataggacatcttgagaaatgattaaagtatcaccaacgtcatgtgaccttgaccccttaatgaagttattgcccttttcataaagaaaccctttttaactacttctctttaactgatcaatgagatggctacgacaaccttattggatgcattagattaatagcagggattagtgggtacacacaaacgaacaggattcacatggaccccttaaagaggttattgccccttaaattttaaaaaagatttctatggctctagaaattgaaaaaacctgagaaccgttatcgtatgggcacgaaccaactgcaatagagatgtagtgacctttgaccttgaaaatctagtgtcaaggttcaaaggtgaaggtcagtcaaaaatcctaaaaatgcattttcatacttttttcctacagggaatattcttgaaaccttaaaacagaatcatatcatataattgcttttttgcatgatacattgaaattctgaactttgacccatttccgaattacaatgactaacgtcaaagctttattacgcgcactcacaacttgcaaccgaaaagtcatagagacgcaaaaccttcagtatgattaactataaaaaatcccttgcagtgagatgatttaaccgacaggatctaaggacccttacacatagttactgccccctgaacatctcatatatctgatttatccatacagcttttacattacTT-----GACCTT-------A--T-TGAAGGTCAA-G-CT---CA-AGGGtcaaggtaatcatcacaaaactttgaaaaaaaaattcatttcaaagtctttttgaatatatttaaataaacataaatagtatttgacctcataaaagacctttaataatatccttgtttgacatatttacctccctttgtgagatttctattatattataaaattagtttctttgatgactactattaagaaatcaattggactttcagcttttaacttaacatcattaactttaattttttgtcaatggcaacagtcaaggtcattcatatgtttaaaacatttcaacattctgacactgaaattattgagggtagtgctataatgtgcgtgtcgattcacatactaccttgctgtccatgaaattttctaaattctattaaaaccttttcgcatcc
gi|10 : gaatgggatcagtgtctctttgaccttaaaaaattagggtgcaaggtcaaagggtcacgcgttgttagccattttctattacaattatcaaataataattgcatgcttgttcatcatactcgttctttcctactcgagggaatatggccttaaacatgattctatagcaaaagtatgtaggataaattgcgtatcagcatagatcacattgaattctgaacttttgacctatttccgattaactcacactggactaaacgtcaaaaagcttttaatctgctacatatcgcgagactgaaacgaaagtgtagcgatagagagtcatcaaaagaggtccttcataaaactataaaaacccctttgcagtgaggagtttaaaccggaagaggataccaaggacccttacacataagcggttattagcccctggaaatagaattcccaattccattatattaggcctatacctctcttagcattacacgatagaggacatcggggcaccacttagttgttacacc-T--AAAT--ATTATTTGACTCTAAA-AAT-TACCTTT----A----AATCCTTCTT-TG----A--CA-TATTTAAACCTCCCTTTGT-TGCAGA-T-TTTAT-TAGTATT--TGATA-AAATTA-G-TTTCATTTGATTACTAT------TTTTA--AATA-T-ACAT-T----AAATTG-G--------------------GACTTT---CA-GCTT-CAA-ACTTTGACA-ATCATTA-ACCT-T-GAAAGTTTTT------T----GTCCC--AAGGT-CA-------------AAA-T-C---AA-G--TC-ATTC----A-TATTTTAAAAA---CATTTTCA-AGATCTGG---A-CAC-TTAACATT-TTG-AGGGT-A-G-ACGACTAGGTAATC-TTG-CTT---GTC-G---------TATACACAATTACACCG-G-TTCG--CGTCC-TGAAATTTTCT--AAATTCCT-ATTAAA--TCTT-TC-TCATCCTTTTTTTCCAAAAA-GACCA-ATCGGGT-GGAAAGCCATCTATTGGGTCGCCAAGACATATT-AGGATCCACTAGcgcgtacaaacagacatcatcaaaaagcttagtttatttatcttccaaatgtctctttagaattaaagaggacatttaaacataatatatgaccattaaaagactcgcaatagtcctctttccgcacaattttacttggctctctttgtgaagttttctatgatatttattgcttaatatatattaa
gi|25 : atTTATTTGACTCTAAA-A-A-GACCTTC----A----TATTTTT-TT-TTTTTTA--CA-TATTTA--CTTCCCT--TTATG-AGA-T--TATA-TGATATT--T---ATAAA----G-TTTTCTTTGAT-CCTAT------T---A--AAGA-TAA--T-C----AA
gi|28 : -GACCTTA----A----TATCCTT-TT-TG----G--TA-TATTTA--CCTTTCT---T-TG-TGA--GCTTTTATGATATT--T---A-AAATTT---TTT--TTTTAT-ACTACATGTATT---A--AAGA-T-A--
gi|13 : ctctaaaaaACCTTC----AG---TATCCTT-TTGTG----AACCA-TATTTA--C-TCGGC--TT-TG-TGA-TGCCTTTATAATGT---C---A-AACTTT-A-TT---TTTCAT-AGTA-------T---A--ATGACT-A--T-CCCATAAA--G-ATTAAATCCACGCTTCTATATGGTC-T---CAGGCTCTCAA-TCTT--A-A-ATCATTGAACCTGT-TAAG-TTGCTGAAACAT----G-CAAAAAAGGT-CA-------------AAA---C---GA-GC-TCAAATC----A-AATATGA--------GTTTTCA-ACCTTTT-------AA-T-GATATT-TTG-AGGGCAA-A-AAGA-TAA-AGAAT-TAT-CGT---TAC-C---------ATCAAACAG------TGCA-TAGA--CGATC----AATTCT-T--AAACT--T-TTTAAAAAattg
gi|17 : T---CA-GCTTTCAAATCTTT-A-A-ATCATTG-ACC--T-TA---TTTTT------TGGGGGTC----AGGGT-CAGAGATCACAGTCGAAAGT-C---AA-GGTTC-ATTC----A-TA-TTTAAAGA---CGTTTTCA-ACATTTGC---AGCTGAT-AAT-GT-TTATAGGGT-CTG-ACGC-TAG-GAAAT-TTTGCGT---GTT-TGTTTCGTTATTTACACAGT---TCT
gi|15 : atgggacttCCT--A-G-ACCTTTG-AC-T-T-TA---TTTT--------------C----AAGGT-CA-------------AAGGT-C---At
gi|2 : tgaccccttaaagagtcattgccccttgaattttataaaatggactaaaattaaaaaccatttgtcatagaggcacgcaaccaactgcaatgtgattagTTG-ACCT-T-GA---CTTTAA-----T----GT-----AAGGT-CA-------------AAGGT-C---AAGGG-TA-ATTA----A-TAtcatataaaaattcgaaaaatatcactttttataccctttttcctacaggagatagcatgaaaacggtatatgctcaagtattctcatgt
gi|5 : tagggctttccacctttctgtcctggaaaagtctattgttagagttctgtttcttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttccgccgtcaaaaaacaattttcgtttgaagactatttcaaaaaactttatagttcatccatataggacatcttgagaaatgattaaagtatcaccaacgtcatgtgaccttgaccccttaatgaagttattgcccttttcataaagaaaccctttttaactacttctctttaactgatcaatgagatggctacgacaaccttattggatgcattagattaatagcagggattagtgggtacacacaaacgaacaggattcacatggaccccttaaagaggttattgccccttaaattttaaaaaagatttctatggctctagaaattgaaaaaacctgagaaccgttatcgtatgggcacgaaccaactgcaatagagatgtagtgacctttgaccttgaaaatctagtgtcaaggttcaaaggtgaaggtcagtcaaaaatcctaaaaatgcattttcatacttttttcctacagggaatattcttgaaaccttaaaacagaatcatatcatataattgcttttttgcatgatacattgaaattctgaactttgacccatttccgaattacaatgactaacgtcaaagctttattacgcgcactcacaacttgcaaccgaaaagtcatagagacgcaaaaccttcagtatgattaactataaaaaatcccttgcagtgagatgatttaaccgacaggatctaaggacccttacacatagttactgccccctgaacatctcatatatctgatttatccatacagcttttacattacaaagatatcaagacatggatactggt----GTC----AAGGT-CA-------------AAGGT-C---AA-GG-TC-ATACAAGAA-AATGTGAAAAAATGCATTTTatcaaggtaatcatcacaaaactttgaaaaaaaaattcatttcaaagtctttttgaatatatttaaataaacataaatagtatttgacctcataaaagacctttaataatatccttgtttgacatatttacctccctttgtgagatttctattatattataaaattagtttctttgatgactactattaagaaatcaattggactttcagcttttaacttaacatcattaactttaattttttgtcaatggcaacagtcaaggtcattcatatgtttaaaacatttcaacattctgacactgaaattattgagggtagtgctataatgtgcgtgtcgattcacatactaccttgctgtccatgaaattttctaaattctattaaaaccttttcgcatcc
gi|11 : tgttagggctttctacctttctgtggaaagtcccaattgttatgttcagtttaattattattttcctgtagttcaaaaatcgttttttgtttgaaagaccttattgatagaacctcctctacatcattaaatagtacttctcgagaatcgatcaaatttaacctcaacgttattgaccttcgacctccttagaaagttataaacccttgtataaaaattcttgttagcactactcctcttgaactgtcaaatgcgatggcaatgaaaactttattgaattatataggccaattagcaggaatagtggggtacaataaacgaaaggattcaaatgaccccttaaaagtgttattgcacccttgaattttacgatttttctcctaataaaaagatagcaatttcgtcatagaggcaaatggtaccgactgtaatggttgatagtaaccctttaccttgaaaaattca----GTC----AAGGT-C--------------AAGGT-C---AA-GG--C-ATTC----A-ttaatcatctttcctgcaggaagataaccattaaaacatcatatgctcaagtatctcatcctacaataggtctcagtgtataaaattataatcccgaactttgaacctttgttagaaatacaaagattcgcataaaaaaatcttgttacactactcctacataaccaaaaagcaaagagacaatgaaacattcaatttttagtcacctgtaaaaacaccttgaaagtgagaaaattaacggaagggatctgtatgcctctttactttagttattgcccctgcaagtctaccaacatc
7 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|12 ): NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTATTTTTCTGCCATGAAAAAAATATGTTTGAAGACTTGTCGAAACACTTCATAATTCATCACATAGCACATCTCCAGAAACGATCACATATCACCCAACGCGATTGACCTTTGACTCCTCCCGGAGTTTTGAACTTTGTGTAAGAATCCTTGTTAGCACTGATCCTCTTTATCCATTAATGCAATGAACATAAAACCTTTTCTTTTCTATAGAAGTCATAGAGAAGAATCGATAGGTACATTA
Unaligned ( gi|19 ): ATTAGGGCTTTCCATCTTACTGTGGAAAGTCCTATTGCTTTTCTTCTGTTTCTTCTTAATATTTTTCAGCCGTCAAAAAAAATTTCATTTCAAGACTTTATAATTCATCATATAGGAAATCTCGAGAAATGAATAATTATATCACCCAACGTCATTGAACTTTGACCC
Unaligned ( gi|26 ): TTCGTTTCAAGACTTATCGAAAGACTTTATCCTTCATCACATAGGACATCTCGAGAAATGATCGCATATCACCCTGCATCTTTGACCTTTGACCCCTTACGGAGTTATTG
Unaligned ( gi|30 ): AGGACTTTCCACCTTCTTGTGGAAAGTCCTATTGTTACAATTGTTCTGTTATTATTTTCCTGTCGTCAAAATAAAGTTTCGTTTCAAGACT
Unaligned ( gi|31 ): ATTGGTTTCCACCTTCCTGTGGAGAATCCTAATGTTCTTGCTGTGTTTCTTATCATTTTCCTGCCGTCAAAAGAAAACTCGTTCCAACAC
Unaligned ( gi|34 ): GGGCTTTCCACCTTTCAGTGTTATTGTTATTGTTCTGTT
Unaligned ( gi|35 ): TAGGGCTTTCCACCTCCCTATGGAAAGTCCTATNN
Alignments
lowQualScore : 11 1 1111111 111111111 1111111 111111 111111 111111111 111 11111111 111111 111111 222222 111111111 11 111111111 1111111111111111111 11 1111 22222 111 2222222222222222222222 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777 1111 11111111111 111 111111 1111 222222222 222222222 111111 22222222222 111111 222 111111111111 111 33333333333333333333333333 11111111 11 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 33333333333333333 11111 222222222222222 1111 1 111 111 111 11 111111 1 3333333333 222 3333333333333 11 11 111111 222222222222222222 3333333333333 111 22222222222 11111 1 22222222222 11111 1111 111 1 7777777777777777777777 11 33333 11 2 2 2
lowQualScore : 5 5 4 777 777 4 4 4 4 66 0 55 00 3 3 666 3 33 3 3 2 2 33 5555 66 2 0 5 2 2 0000000 7777 444444444 5555555 3 000000 77777 0 7777 3 7777 444 777777 3 444444444 3 111 3 1 3 44 3 999 6666 6666 555 88888888 88 44 3 44 3 3 999 3 6 55 3 88 3 22222222 4 555 99 3 1 44 3 222222 3 77777 77 9 666 3 999 3 3 000000 6 333333 1 2 55 555555555 666 55 4 77 66 888888888 1 5 1 7777777777777777777 5 55 0000 7777 4 4 66 4 55555 555 1 3333333333333333333333 2 5 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111 0 3 0000 3 3 3 44444444444 999999 88888 333 44 88888 44 888888 1 77 66 6 3 2222 3 44 3 3 999999 7777 000000000 44 77 3 3 0 3 66 3 3 22 3 3 7777 3 3 3 3 66 1 0 999999999 4 3 6 999999 6 99999999999 111111 7 3 999 5 66 999999999999 999999 111 5 11111111111111111111111111 66666666 4 9 66 22 1 44 777 4 3 22 4 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 00000000000000000 5 5 77 1 888888 777777 5 66666 7777 777777777777777 8 4 55 2222 55 4 55 8888 55 6 4 888 4 1 66 222 4 222 66 444444 4 5 0 1111111111 66 66 555 5 1 3333333333333 99 5 5 00 33 5 5 5 77 333333 888888888888888888 0 5 1111111111111 4 5 000 5 5 5 6 5 11 0 11 00000000000 3 1 5 99999 5 555 5 1 1 88888888888 22222 77 2222 6 3 55 6 777 8 44 6 3 6666666666666666666666 3 88 66666 1 1 1 1 2 88 3 3 3
lowQualScore : . . . ... ... . . . . .. . .. .. . . ... . .. . . . . .. .... .. . . . . . ....... .... ......... ....... . ...... ..... . .... . .... ... ...... . ......... . ... . . . .. . ... .... .... ... ........ .. .. . .. . . ... . . .. . .. . ........ . ... .. . . .. . ...... . ..... .. . ... . ... . . ...... . ...... . . .. ......... ... .. . .. .. ......... . . . ................... . .. .... .... . . .. . ..... ... . ...................... . . ....................................................... . . .... . . . ........... ...... ..... ... .. ..... .. ...... . .. .. . . .... . .. . . ...... .... ......... .. .. . . . . .. . . .. . . .... . . . . .. . . ......... . . . ...... . ........... ...... . . ... . .. ............ ...... ... . .......................... ........ . . .. .. . .. ... . . .. . ............................................................. ................. . . .. . ...... ...... . ..... .... ............... . . .. .... .. . .. .... .. . . ... . . .. ... . ... .. ...... . . . .......... .. .. ... . . ............. .. . . .. .. . . . .. ...... .................. . . ............. . . ... . . . . . .. . .. ........... . . . ..... . ... . . . ........... ..... .. .... . . .. . ... . .. . . ...................... . .. ..... . . . . . .. . . .
lowQualScore : 0 0 4 888 888 4 4 4 4 33 7 44 66 6 6 444 6 88 6 6 9 9 99 7777 33 7 7 3 7 9 0000000 7777 555555555 7777777 6 555555 55555 6 7777 6 7777 444 555555 6 555555555 6 444 6 2 1 22 1 777 5555 1111 444 11111111 66 66 3 66 3 3 222 3 7 33 3 66 6 11111111 2 888 22 3 8 66 1 000000 1 77777 33 2 333 3 222 3 3 444444 7 999999 0 8 00 777777777 444 55 4 11 99 999999999 0 0 0 0000000000000000000 0 88 6666 3333 4 4 11 4 11111 666 0 1111111111111111111111 2 0 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333 4 3 4444 3 3 3 88888888888 666666 33333 888 66 88888 66 444444 8 99 88 7 3 7777 3 66 3 3 666666 1111 777777777 66 99 3 3 7 3 55 6 6 11 6 6 7777 6 6 6 6 99 0 1 666666666 4 9 7 222222 7 33333333333 888888 5 7 444 7 44 111111111111 666666 111 9 66666666666666666666666666 11111111 4 4 11 66 1 66 888 4 9 00 4 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 77777777777777777 7 7 99 0 777777 777777 6 66666 7777 444444444444444 0 0 55 5555 55 0 55 5555 55 0 0 888 0 0 11 222 4 555 99 444444 5 0 0 8888888888 99 99 666 7 4 7777777777777 33 7 0 99 66 7 7 7 99 333333 999999999999999999 1 7 4444444444444 3 7 000 7 7 7 6 4 66 7 00 66666666666 0 0 7 00000 7 000 7 4 0 66666666666 00000 77 7777 7 5 33 7 333 0 22 0 5 0000000000000000000000 2 88 22222 0 0 0 0 5 00 7 3 3
consensus : GATG-GC-AACGA-AA---CCTTT---ATTGGAT-T-AT-A-GAGGCCAATT-AGCAGGA-TT--AGT-GGG-T---ACA-ATAAACGAA-AGGATTC-A-A-TG-A--CCCC----TT--A-A-AGA-G-TTATTGC-CCCTT-------GAA----TTTT--AC----GATTTCTAT-G----TA-A------AATGG---AAAAAA----CT-TG----AGAAC-CGTT-T----GTC-G---------TA-GAGGC---A-CGGGACCAACTGCA-A--T-G--NG----AT-C--A---GTG-----AC-CTT--TGACCTT--G-AA--AA-T-TAG---G-T-CA-AGGT-CAAAGG--T-CAAG--------GTCATNT---A--AAAATT-TGAAA--AAA-TA---G-CA-T-----TT--TT-ATACCC--TCTTTCCT-AC---A-GG-A--G---AT-A--N---CNTGAA--AACAT----T-TA-A---AGCNNAAGTA-TNCTCATC--T-T--A----ATNG-GTNTCG-GC-GT-----A-ATAA-A-TTG-NAA----TT--C-TGAAC-TTT-GA--C-CT-TA--TT---AGAANTA---C---A-AC--GA-T-TCG-CGTCA-AAAA-TCTTGTTA-GC--GCT-AC-C--TAAAAAT-CTT-GTTA-CGCTACTCCTACTGAACCGAAA-GT----CAA-A-GA-GA--C-G----T-AAA------A-----CCTT---CA--AT---G-ATTT--A-----GTCA--CTA-T-AA-AA-CG-C-C--CTT-GC-AG------TG----A-NA--ANT-T--AACC--GAAG-GGAT-CTA-A-NGACCC-T-TAAAC-AT-A----GTTA-TT-G-C-CCCTG-AAAGTCT---A-----CA-ATATCGTTAT-TTT-AG--CC-TA---------T-AGC--T---TTNACATTA-ATC-AA-GATA--G--AG----TCA--T---GG-NACCACNTA-CA--G--T------TA-----G--ACC--------CTT-GACCTTNAAA--TT-AAGGTCAAG-GT---CA-AAGGTCAAGGTCAT-CAT----------------NA--AA-A--------T---T--------A-----T--TT-----GTCTTTAAG------A------A---T-AT-TTTT--AAGGACA-A-T--AAAT--GTCATTTGACCCTAAA-ATG-GACCTTT----A---------CA----TCCTT-TT-T--G----A--CA-TATTT--AC----CTCCCTT--T-TG-AGA-T-T-TTTATGATAT--T---TA-AAATTT-ATTTT--TT------TGA-T-ACTA---C------T--A--AAGAT---AT-CAAN--G---------GGACTTTCAG-CTTTCAA-TCTT--A-A-ATCATTG-ACC--TT-NA---TTTTTT----G-----T--C----AAGGT-CA-------------AAAGT-C---AAGG-TC-ATTCA-TATNTTAAAAACGTTTTCAACATTTTC---A-CA-G-TAANATT-TTGAGGGT-A-G-ACGA-TAGGAAAT-TTT-CGTGNC-T---------TTTACACAGT---ACTGC-NTTCG--C-GTTCATGAAATTTTCTAAAATTT-TTTA-AAAATCTT-TCGNATCCATTTTTTCNC----A-TT--------C-----CATATC-GGGTG----GGAAAGCCCTCTANTNGNTCGCCAAGACA-ATT-AGGAT-CACTAGT
Reference ( family-1352 ) : GATG-GC-AACGA-AA---CCTTT---ATTGGAT-T-AT-A-GAGGCCAATT-AGCAGGN-TT--AGT-GGG-T---ACA-ATAAACGAA-GGGATTC-A-A-TG-A--CCCC----TT--A-A-AGA-G-TTATTGC-CCCTT-------GAA----TTTT--AC----GATTTCTAT-G----TA-A------AATGG---AAAAAA----CT-TG----AGAAC-CGTT-T----GTC-G---------TA-GAGGC---A-CGGGACCAACTGCA-A--T-G--TG----AT-T--A---GTG-----AC-CTT--TGACCTT--G-AA--AA-T-TAG---G-T-CA-AGGT-CAAAGG--T-CAAG--------GTCATNT---A--AAAATT-TGAAA--AAA-TA---G-CA-T-----TT--TT-ATACCN--TCTTTCCT-AC---A-GG-A--G---AT-A--N---CNTGAA--AACAT----T-TA-A---AGCNNAAGTA-TNCTCATC--T-T--A----ATNG-GTNTCG-GC-GT-----A-ATAA-A-TTG-NAA----TT--C-TGAAC-TTT-GA--C-CT-TA--TT---AGAANTA---C---A-AC--GA-T-TCG-CGTCA-AAAA-TCTTGTTA-GC--GCT-AC-C--TAAAAAT-CTT-GTTAGCGCTACTCCTACTGAACCGAAA-GT----CAA-A-GA-GA--C-G----T-AAA------A-----CCTT---CA--AT---G-ATTT--A-----GTCA--CTG-T-AA-AA-CG-C-C--CTT-GC-AG------TG----A-CA--AAN-T--AACC--GAAG-GGAT-CCA-A-TGACCC-T-TAANC-AT-A----GTTA-TT-G-C-CCCTG-AAANTCT---A-----CA-ATATCATTAT-TTN-AG--CC-TA---------T-AGC--T---TTNACATTA-ATC-AA-GATA--G--AG----TCA--T---GG-NACCACNTA-CA--G--T------TA-----G--ACC--------TTT-GACCTTGAAA--TT-AAGGTCAAG-GT---CA-AAGGTCAAGGTCAT-CAT----------------NA--AA-A--------T---T--------A-----T--TT-----GTCTTTAAG------A------A---T-AT-TTTT--AAGNACA-A-T--AAAT--GTCATTTGACTCCAAA-ATG-GACCTTT----A---------CA----TCCTT-TT-T--G----A--CA-TATTT--AC----CTCCCTT--T-TG-AGA-TGT-TTTNTGATAT--T---TA-AAATTT-ATTTT--TT------TGA-T-ACTA---C------T--A--AAGAT---AT-CAAA--G---------GGACCNTCAG-CTTTCAA-TCTT--A-A-ATCATTG-ACC--TT-NA---TTTTTT----G-----T--C----AAGGT-CA-------------AAAGT-C---AAGG-TC-ATTCA-TATNTTAAAAACGTTTTCAACATTTTC---A-CA-G-TAANANT-TTGAGGGT-A-G-ACGA-TAGNAAAT-TTT-CGTGNT-T---------TTTACACAGT---ACTGC-NTTCG--C-GTTCATGAAATTTTCTAAAATTT-TTTA-AAAATCTT-TTNCATCC-TTTTTTCAC----A-TT--------C-----CATATC-GGGTG----GGAAAGCCNTCTANTNGNTCGCCAAGACATATTCAGGATCCACTAGT
gi|1 : TG-GCTAACGG-AAAGACTCTT---ATTGGAT-T-AT-AAGACGCCAAT--ATCCGGT-TTT-AGT-GGG-T---ACA-GAAAACGAA-AG-ATTC-A-A-TA-A--CCCC----TT--A-A-AGA-G-TTAT-GC-CCTAA-------CAA----TTTT--AC----GATTTCTTT-GG---TA-A------AATGG---AAAAAAAAAACT-TG----AGGAA-CGTT-TAATAGTC-GGTGTTCTGTTATGCGGCCTCA-CGTGACCAACTGCA-A--T-GA-TGGAATAT-T--AAATGTG--------CTTA-TGACCTTTCG-AATAAA-T-TAG---G-TTCATAGGT-CAAAAGGTT-CAAA--------GTCTTTT---T--CAAATT-ATCAT--AAA-TA---G-CA-T-----TT--TC-ACACCG--TCTTTTCT-TCT--A-GG-G--A---AT-A--ATTCCTTAAACCATCAT----TATA-ATTCATCTAAAGTA-TTTTAATCATT-T--ATATTATAA-ATCTTT-GC-TTTTTTAG-ATTA-A-TTG-GAAATTTTT--C-TGAAC-TTT-GA--CTCTCTA--TTTTCCGAATTA---TTCGA-AT--GACT-TAA-CGTCA-AAAAGCCTTGTTA--T--GCT-AC-T--CAAA-----TT--TAAACGTTAATT-TACACAAC---AA-GT----CAT-A-TA-GAA-C-G----C-AAATTAATTA-----CCTTT--CA--ATTTTGTATTTTTA-----ATTAACTTA-T-AAGAA-TT-C-C--CTTTGC-AG------TG----A--G--AGT-T--TACC--GAAG-G-AT-CTA-T-GGACCC-TCTAACC-ATTA----GTTA-CT-G-C-CC-TG-AAAGTCTTCCA-----TA-ATATCATTAT-CCT-AGGCCT-TA---------C-AGC--T---TTTACATTA-A-C-AATGATA--GCAAG----ACA--T---GG-A--CACTTG-CATAA--T------TA---------CC--------TTTTGACC-----A--TT-GACTTCA----T---CATAATGTCAAGGTCAT-CAT----------------CC--AA-A--------TATTT--------AATTTTT--TT-----ATTTTCAAGTCTTTTG------A---TGAT-TTTTTAAATAACA-T-TTAAAATTAGT-ATTTGACTCTAAT-TTACGACTCTT----AATAT-----CT----TCCTT-TT-T--G----A--CA-TATTT--AC----CTCCTTT--G-TG-AGA---T-TGTATGATATTAT---TA-AAATTT-AGTTT--TT------TGA-T-ACTA---T------T--A--CAGATA--AT-C-AT--G---------GCACTTGCAG-CTGTCAA-TCTT--A-A-ATCATTG-ACC--TTGGA---TATTTT----G-----T--C----AAGGTAAA-------------AAAGT-CACAAGGG-TC-ATTCATTATGTT-AAAACACTTTCACCATTTTCTGGA-C--G-TA--AAT-TTGAGGGTGA-G-ACGC-TAGGAAATGTGT-TGTGTTCT---------TTTACACAGT---ACTAC-CTTCGCAC-ATTCATGAAATTTCTTAAAATCTATTT----AATCTT-TTTTATCC-TTTTTTTTC----A-TTAATAAGTACAAAGAAATATCAGGGTGGGGAGGAAGGCCCTCAATTAGATT-TCAAG
gi|10 : caagtaatggttaattattcatctctaaatcgtcattgacccttattgaccccgctcttatttacttactgagttatgtgcttcctttccatataacgttgtataactatgcctctttaacttgttttcttctaattttagtagtgagatagt-T--AAAT--ATTATTTGACTCTAAA-AAT-TACCTTT----A---------AA----TCCTTCTT-T--G----A--CA-TATTTAAAC----CTCCCTTTGT-TGCAGA-T-T-TTATTAGTAT--TTGATA-AAATTA-GTTTCA-TT------TGATT-ACTATTTT------T--A--AATATAC-AT-TAAATTG---------GGACTTTCAG-C-TTCAA-ACTTTGACA-ATCATTA-ACC--TT-GAAAGTTTTTT----G-----TCCC----AAGGT-CA-------------AAA-T-C---AA-G-TC-ATTCA-TATTTTAAAAACATTTTCAAGATCTGG---A-CACT-TAACATT-TTGAGGGT-A-G-ACGACTAGGTAAT-CTTGCTTGTC-G---------TATACACAATTACACCG--GTTCG--C-GTCC-TGAAATTTTCTAAA--TT-CCTATTAAATCTT-TCTCATCC-TTTTTTTCCAAAAA-GA--------C-----CA-ATC-GGGT-----GGAAAGCCATCTATTGGGTCGCCAAGACATATT-AGGATCCACTAGtctgcacaacgccgagaatataatggactcact
gi|11 : atCTT--T-GA--AA-T-TAG---G-T-CA-AGGT-CAA-GG--T-CAAG--------G-CATTC---A--AAAATC-TAAAACAAAACTG---G-CA-T-----TT--TC-ATACTG--TTTTTCCT-AC---A-AG-G--G---AT-ACTT---CTTG-A--AACAT----T-TATA---AGCAGAAGTA-T--TCATC--TATA-A----ATTG-CTTTTT-GA-TT-----G-GAGA-A-TTG--AA----TTAACATGAACATTT-GA--C-
gi|13 : ACCTTC----AG--------TA----TCCTT-TTGT--G----AACCA-TATTT--AC-----TCGGCT--T-TG-TGA-TGCCTTTATAATGT--C----A-AACTTT-ATTTT--TCATAGTATAA-TGACTA---TCCCA--T--A--AAGATTAAAT-CCAC--GCTTCTATATGGTC--TCAGGCTCTCAA-TCTT--A-A-ATCATTGAACCTGTT-AA---GTTGCT----GAAACATG-CAAAAAAGGT-CA-------------AAA---C---GAGC-TCAAATCA-AATATGA-----GTTTTCAACCTTTT-------A-A-TGATATT-TTGAGGGCAA-A-AAGA-TAAAGAAT-TAT-CGTTAC-C---------ATCAAACAG------TGC-ATAGA--C-G---ATCAA---TTCTTAAACTT-TTTA-AAAAacatctataatttctgaatatacaatgagcaaacgatcgagataataaagttgtcataaatgaacgcgacatatcttgacacactcaaactagagactaagaaatgtcatagtggattctagcacaaatacctcttcagctgatttcgattactttaaaaaaatcacctt
gi|14 : T-GGGCT---ACC-TTAAGCAAA-AGGAATC-A-A-TG-G--CCCT----TT--ATG-ATA-G-TTATTGC-CCCTT-------
gi|14 : AG--------GTCATCT---A--AAA-TA-TGTAA--AAA-TA---G-CA-T-----TT--TT-ATAGCT--TC--TCCT-GC---A-GG-A--G---AT-A--C---Cannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaggtcatctaaaatatgtaaaaatagcatttttatagcttctcctgcaggagatacc
gi|15 : tgggctaccttaagcaaaaggaatcaatggccctttatgatagttattgccccttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-TG-A--CCCC----TT--A-A-AGA-G-TCATTGC-CCCTT-------GAA----TTTT--A--------------------TA-A------AATGG---ACTAAA----AT-TA----AAAAC-CATT-T----GTC-A---------TA-GAGGC---A-CGCAACCAACTGCA-A--T-G--TG----AT-T--A---GTG-----AC-CTT--TGACCTT--G-AA--AA-T------------A-AAGT-CAAAGG--T-CTAG--------GTCATAT---A--AAAATT-CG-AA--AAA-TA---T-CACT-----TT--TT-ATACCC--TTTTTCCT-AC---A-GG-A--G---AT-A--G---CATGAA--AACGG----T-AT-A---TGCTCAAGTA-TTCTCAT
gi|16 : ATTA---C-AA-GA--------------CA--T---GG-GGCAACCT------T--T------TA-----G--ACC--------CCT-AAACTTGAAA--AT-TAGGTCAAG-GT---CA-AAGATCA---TCAT-AAT----------------GATTAG-A--------T---T--------A-----TACAC-----ATTTTTAAG------ATGTTTTAGGTT-CT-TTTC--AAATACA-G-T--GAAT--GGC--TTGAC-CTAACTGTG-GAACTTT----A---------GA----TCCCT-TT-T--A----A--TACCAGTT--A-----TTCTCTT--T-----GA-TAT-TTTgt
gi|17 : --G---------GGACTTTCAG-CTTTCAAATCTTT-A-A-ATCATTG-ACC--TT--A---TTTTTTGGGGG-----T--C----AGGGT-CAGAGATCACAGTCGAAAGT-C---AAGGTTC-ATTCA-TAT-TTAAAGACGTTTTCAACATTTGC---AGCT-GATAATGTT-TATAGGGT-CTG-ACGC-TAGGAAAT-TTTGCGTGTT-TGTTTCGTTATTTACACAGT---TCT
gi|18 : at--TAAGAAT-CTTTGTTATCACTATCCCTCTTTATCCGTAA-ATG---CAA-T-GT-G---C-A----T-CAA------A-----CCTTTT-CT--AT------TCT--ATAGAGGTCA--TT--T-AA-AA--G-A-A--TTT-AT-AG------GG----A-CA----T-T--AAAC--AAAA-AGAT-TCA-A-TGGCCC-T-TTAAG-AC-A----GTTA-TT-G-C-t
gi|18 : ttaattattacccaacgtcattgaccttagaccccttacagagtA-AA---CCTTTTCTATT---C-T-AT-A-GAGGTCATTT-AAAAGAA-TT--TAT-AGG-G---ACA-TTAAACAAA-AAGATTC-A-A-TG-G--CCCT----TT--A-AGACA-G-TTATTGC-
gi|2 : ttaattattacccaacgtcattgaccttagaccccttacagagttaagaatctttgttatcactatccctctttatccgtaaatgcaatgtgcatc-TG-A--CCCC----TT--A-A-TGAAG-TTATTGC-CCTTTTCATAAAGAAACCCTTTTTAAC----TACTTCTCT-T----TA-ACTGATCAAT-G---AGATGG----CTACG----ACAAC-C--T-T----ATT-G------------GATGC---A-TTAGATTAATAGCA------G--GG----AT-T--A---GTG-----
gi|2 : tagggctttccacctttctgtcctggaaaagtctattgttagagttctgtttcttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttccgccgtcaaaaaacaattttcgtttgaagactatttcaaaaaactttatagttcatccatataggacatcttgagaaatgattaaagtatcaccaacgtcatgtgacctGATG-GC-TACGACAA---CCTT----ATTGGATGC-ATTA-GA--TTAAT--AGCAGGGATT--AGT-GGG-T---ACACACAAACGAACAGGATTC-ACA-TGGA--CCCC----TT--A-A-AGA-GGTTATTGC-CCCTT-------AAA----TTTT--AAAAAAGATTTCTAT-GGCTCTAGA------AATTG---AAAAAA----CC-TG----AGAAC-CGTT------ATC-G---------TA-TGGGC---A-CGA-ACCAACTGCA-A--TAG--AG----ATGT--A---GTG-----AC-CTT--TGACCTT--G-AA--AA-TCTAGT--G-T-CA-AGGTTCAAAGG--T-GAAG--------GTCAGTC---A--AAAATC-CTAAA--AA--T----G-CA-T-----TT--TC-ATACTT--T-TTTCCT-AC---A-GG-G--A---AT-A--TT--CTTGAA--ACC------T-TA-A---AACAGAATCA-TA-TCATA--T----A----ATTG-CTTTTTTGC-AT-----G-ATAC-A-TTG-AAA----TT--C-TGAAC-TTT-GA--C-CC--A--TTTC-CGAATTA---C---A-AT--GA-C-TAA-CGTCA-AAGC-T-TTATTACGC--GC--AC-T--CACAA---CTT-GC-----------------AACCGAAAAGT----CAT-A-GA-GA--C-G----C-AAA------A-----CCTT---CAGTAT---G-ATT---A--------A--CTA-T-AA-AA-AATC-C--CTT-GC-AG------TG----A-GATGATT-T--AACC--GACA-GGAT-CTA-A-GGACCC-T-TACAC-AT-A----GTTA-CT-GCC-CCCTG-AACATCT---------CATATATC-TGAT-TT--AT--CCATA---------C-AGC--T---TTTACATTA---CAAA-GATATCA--AG----ACA--T---GGATACTGGTTATTA--A--T------TACCCTTG--ACC--------TTT-GACCTT-ACA--TT-AAAGTCAAG-GT---CA-AA--TCAAGGTAAT-CATCACAAAACTTTGAAAAAA--AA-A--------T---TC-------A-----T--TTCAAA-GTCTTTTTG------A------A---T-AT-ATTT--AAATAAACA-T--AAAT--AGTATTTGACCTCATA-AAA-GACCTTTAATAA---------TA----TCCTTGTT-T--G----A--CA-TATTT--AC----CTCCCTT--TGTG-AGA-T-T-TCTATTATAT--TA--TA-AAATTA-GTTTC--TT------TGA-TGACTA---C------T--ATTAAGAA---AT-CAAT--T---------GGACTTTCAG-CTTTTAA--CTT--A-ACATCATTA-ACT--TT-AA---TTTTTT----G-----T--C----AATGG-CA-------------ACAGT-C---AAGG-TC-ATTCA-TATGTTTAAAACA-TTTCAACATTCTG---A-CA-C-TGAAATTATTGAGGGT-A-GTGCTA-T----AAT-GTG-CGTGTC-G---------ATT-CACA-T---ACTAC-CTT-G--CTGTCCATGAAATTTTCTAAATTCT-ATTA-AAACCTTT-TCGCATCC-ggtacacacaaacgaacaggattcacatggaccccttaaagaggttattgccccttaaattttaaaaaagatttctatggctctagaaattgaaaaaacctgagaaccgttatcgtatgggcacgaaccaactgcaatagagatgtagtgacctttgaccttgaaaatctagtgtcaaggttcaaaggtgaaggtcagtcaaaaatcctaaaaatgcattttcatacttttttcctacagggaatattcttgaaaccttaaaacagaatcatatcatataattgcttttttgcatgatacattgaaattctgaactttgacccatttccgaattacaatgactaacgtcaaagctttattacgcgcactcacaacttgcaaccgaaaagtcatagagacgcaaaaccttcagtatgattaactataaaaaatcccttgcagtgagatgatttaaccgacaggatctaaggacccttacacatagttactgccccctgaacatctcatatatctgatttatccatacagcttttacattacaaagatatcaagacatggatactggttattaattacccttgacctttgaccttacattaaagtcaaggtcaaatcaaggtaatcatcacaaaactttgaaaaaaaaattcatttcaaagtctttttgaatatatttaaataaacataaatagtatttgacctcataaaagacctttaataatatccttgtttgacatatttacctccctttgtgagatttctattatattataaaattagtttctttgatgactactattaagaaatcaattggactttcagcttttaacttaacatcattaactttaattttttgtcaatggcaacagtcaaggtcattcatatgtttaaaacatttcaacattctgacactgaaattattgagggtagtgctataatgtgcgtgtcgattcacatactaccttgctgtccatgaaattttctaaattctattaaaaccttttcgcatcc
gi|20 : tagggctttccacctttctgtcctggaaaagtctattgttagagttctgtttcttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttccgccgtcaaaaaacaattttcgtttgaagactatttcaaaaaactttatagttcatccatataggacatcttgagaaatgattaaagtatcaccaacgtcatgtgaccttgaccccttaatgaagttattgcccttttcataaagaaaccctttttaactacttctctttaactgatcaatgaTGCACA--T-G--TG----AG-A--A---ATA-----AT-TTTGTTG----T--G-AT--AA-T-TAAAGAG-C-CC-AGG--CAAAGG--TTCAAA--------GTCAT-T---A--AAAACT-C-AAA--AAA-TA---GGCA-T-----TT--TTCATACTG--TTTTTCCT-AC---A-GG-AT-A---AT-AT-T---CTTGAA--ACGAT----TATA-A---AGCAGAAG
gi|21 : agA-----G--ACC--------CTT-GACCTTTGAC--CT-----TCAAA-GT------AAGGTCCAAGTCAT-CAT----------------GA--AATA--------T---TTTCTTTTCA-----T--TTCTAAGGTCATTAAG------A------T---T-AT-TTTT--AAGGACA-A-T--AAAT--ATAATTTGACCCCAAA-ATG-GACCTTT----A---------CA----CCC
gi|22 : cattaCTACTCCTACTAAACCAAAA-GT----CAA-A-AA-GA--A-A----T-GAT------A-----CCTT---TT--AT---G-ATTT--A-----GTCA--CTG-T-AG-AA-CA-C-C--CTT-GC-AA------TG----A-CA--AAT-T--AATG--GAAG-GGAT-ATG-A-TGACCC-T-TAAAC-AT-A----GTTA-TC-G-C-CCCTa
gi|23 : AA-GT----CAT-A-GA-GA--C-A----C-AAA------A-----CCTT---CA--GT---G-ATGT--A-----TTAA--CTA-T-AA-A--CA-CTC--CTT-GC-AG------TG----A-GA--GTT-T--AACC--GAGG-GGAT-CCA-A-GGACCC-T-TACAC-AT-A-----TTA-TT-G-C-CCCAG-AAAGTAT---C-----CA-ATATCATT
gi|24 : AAAAG-CTT-ATTATGGCTACTCCAACTGAAATGAAA-GT----CAT-A-GA-GA--A-G----A-AAA------A-----CCTT---CA--AT---T-ATTC--A-----TTAA--CTA-T-AA-AA-AT-C-C--TTT-GC-GG------TG----A-GT--GTT-T--AACC--GAAA-GGAT-ATA-A-GGAC
gi|25 : TTATTTGACTCTAAA-A-A-GACCTTC----A---------TA----TTTTT-TT-T--TTTTTA--CA-TATTT--AC----TTCCCTT--TATG-AGA---T-TATATGATAT--T---TATAAAGT---TTTC--TT------TGA-T-CCTA---T------T--A--AAGATA--AT-CAA
gi|26 : -TG-A--CCCC----TT--A-C-GGA-G-TTATTG
gi|27 : ttcgtttcaagacttatcgaaagactttatccttcatcacataggacatctcgagaaatgatcgcatatcaccctgcatctttgacctt----TT--A-AGACA-G-TTATTGC-CCCT---------AA----TTTTTAAC----GATTTCTAA-G----TG-A------AACAC---ATCAAA----CT-TG----AGACC-CGTT-A----ATC-G---------TA-TGGGT---T-CGGGACCAACTGCA-A--T-G--GG----AT-C--A---GTG-----AC-CT
gi|28 : CTCTAAA-A-A-GACCTTA----A---------TA----TCCTT-TT-T--G----G--TA-TATTT--AC----CTTTCTT--TGTG-AG---CT-TTTATGATAT--T---TA-AAATTT--TTTT--TT------T-A-T-ACTA---CATGTATT--A--AAGAT---A
gi|29 : T-AGG-G---ACA-ATAAATGAA-AGGATTC-A-A-TG-G--CCGT----TT--A-AGACA-G-TTATTGC-CCCTT-------attg
gi|3 : aaatgcaatgtgcatcaaaccttttctaatttaaaagaatgtaGATG-GC-CAATA-AA---CTTTT---ATTGGAT-TCAT-G-GAGGCTAATT-AGCGCGA-TTTGGGT-GGG-TGTGACA-ATAAACGAA-GGGATTC-A-A-TG-AGACCCT----TTTGA-A-CGAAG-TTATT-C-CCCTT-------GAA----TTTTT-AC----AATTTCTAT-G----TA-A------ATTGG---GAGAAA----AC-TGTAAAAGAACGTATTCT----GTC-G---------TA-GAGGC---ATCGGGACCAATTGCA-A--T-G--TT----AT-CCCA---GTGGNNNNNN-NNN--NNNNNNN--N-NN--NN-N-NNN---N-N-NN-NNNN-NNNNNN--N-NNNN--------NNNNNNN---N--NAAATT-TGAAA--AAA-TAT--A-CA-T-----TTA-TT-ATACCC--TCTTTCCTTAC---ACGG-AACG---ATTA--G---CATGAA--AACAT----T-TAGA---AGCT-AAGTA-TGCTCATC--T-T--A----ATAG-GTA-CA-GT-AT-----A-ATAA-AATTA-CAA----TT--T-TGAA---TT-GA--C-CTATAAATT---AGAAATA---C---A-AC--GA-TGTTG-CATTA-AAAA-TCTT-TTA-GC--ACTTAC----------T-CTT-A------------CTACTAA--CAAAA-GT----CAA-A-AA-GA--C-A----T-AAA------A-----ACCTGTACG--AT---G-ATTT--A-----GTCA--CTGCT-AA-AA-CG-C-T--CTT-GC-AG------TG----A-CA--AAAGT--AATG--GAAG-G-AT-CTG-A-TG--CC-T-TAAGCCAT-A----GTTA-TC-G-C-CC-TGCAAAATCTT--A-----CA-ACATCGTTGT-TTTCAG--CT-TA---------TCAGC--T---TT-ATATTAGATC-AA-GATA--GC-AA----TCA--TTTGGG-AACCACATA-CA--G--T------AA-----G--ACC--------TTT-GACCTTCAAA--TTCAAGGTCAAG--T---AA-AAGGTCAAG-TCAT-CAT----------------TA--AA-A--------T---T--------A-----T--TT-----G-CTTTAAG------A------A---T-AT-TTTT--AAGGACA-ACT--AAAT--GTC--TTAACACCAAA-GTG-GACCTTT----A---------CA----TCCAT-TT-T--G----A--CA-CA-TT--AC----CTCCCCA--T-TG-AGATTGT-TTTTTGATAT--T---CA-AGATTTCATTTTTATT------TCA-T-ACTA---C------TAAA--AAGAT---ATGCAAA--GA--------AGATCATCAG-C-TTCAA-GCTT--A-A-ATCA-TG-ACC--TT-TA---TTTTTTG---G-----T--C----A--GT-CA-------------AAAGTCC---AAGG-TC-ATTC--TATTTTTAAAAAATTTT-AAAGTTTTC---A-CA-G-TAAGAGT-TTT-GAGT-A---ACGA-TATAAAAT-TTC-CGTGAT-T---------TTTACACAAT---ACTGCATTTCT--C-ATTCATATAATTTTCTAAAAATT-TTT---AAATTTTGTTGAATCCATTTTTACAC----ATTT--------T-----CATATT--GGTG----GGAAAGCCCTCTAATTGTTCGC--AAACA-ATTCAGGAT-CACTAGTat
gi|32 : cgttatttacacagttcttcttgacccttattacggacgttattggcctattcatataaaaatccttgttagatcacgtacttctctttaactgttcaatgtta-GGTA--G--AG----TC---T---GG-T--CAC-TA-CA--GGCT------TG-----A--ACC--------TTG-AATCTTGAAA--CTGAAGGTCAACTGT---CA-AAGGTCAACGTCAC-C-T----------------GA--AA-ta
gi|33 : AA-TA---G-CA-T-----TT--TTCATATTT--TTTTTTCA-AT---A-GG-A--AGATAT-A--T---ATTGAA--ACCAT----C-TA-A---AGTAGAA
gi|4 : GATG-GC-AATAA-AA---CTTTT---ATTGGAT-T-AT-G-GAGGCTAATT-AGCCGAT-TT--GGT-GGG-T---ACA-ATAAACGAA-GGGATTC-A-A-TG-A--CCCT----TT--G-A-AGA-G-TTATTGC-CCCTT-------GAA----TTTT--AC----AATTTCTAT-G----TA-A------ATTGG---AGAAAA----CT-TA----AGAAC-TATT-T----GTC-G---------TA-GAGGC---A-CGGGACCAATTGCA-A--T-G--TG----AT-C--A---GTG-----AC-TTT--CGACCTT--G-AA--AA-T-TAG---G-T-CA-AGGT-CAAAGG--T-CAAG--------GTCATAT---A--TAAATT-TGAAA--AAA-TA---T-CA-T-----TT--TT-ATACCC--TCTTTCCT-AC---A-GG-A--G---AT-A--G---CATGAA--AACAT----T-TA-A---AGCTCAAGTA-TGCTCATC--T-T--A----ATAG-GTATCA-GT-AT-----A-ATAA-A-TTA-CAA----TT--T-TGAAC-TT--GA--C-CT-TAA-TT---AGAAATA---C---A-AC--GA-T-TTG-CATTA-AAAA-TCTTGTTA-GC--ACT-AC-CCTNAAAAAT-CTT-GTTAGCACTACTCTTACTAAACCAAAA-GT----CAA-A-AA-GA--C-A----T-AAA------A-----CCTT---CG--AT---G-ATTT--A-----GTCA--CTG-T-AA-AA-CG-C-T--CTT-GC-AG------TG----A-CA--AAG-T--AATG--GAAG-GGAT-CTG-A-TGGCCC-T-TAGCC-AT-A----GTTA-TC-G-C-CCCTG-AAAATCT---A-----CA-ACATCGTTAT-TTC-AG--CC-TA---------T-AGC--T---TTGATATTA-ATC-AA-GATA--G--AA----TCA--T---GG-GACCACATA-CA--G--T------CA-----G--ACC--------TTT-GACCTTCAAA--TT-AAGGTCAAG-GT---CA-AAGGTCAAGGTCAT-CAT----------------TA--AA-A--------T---T--------A-----T--TT-----GTCTTTAAG------A------A---T-AT-TTTT--AAGGACA-A-T--AAAT--GTCATTTAACACCAAA-GTG-GACCTTT----A---------CA----TCCAT-TT-T--G----A--CA-CATTT--AC----CTCCCCA--T-TG-AGA-TGT-TTTTTGATAT--T---CA-AGATTT-ATTTTA-TT------TCA-T-ACTA---C------T--A--AAGAT---AT-CAAA--G---------AGATCATCAG-CTTTCAA-TCTT--A-A-ATCATTG-ACC--TT-TA---TTTTTT----G-----T--C----AAGGT-CA-------------AAAGT-C---AAGG-TC-ATTCA-TATTTTAAAAACATTTTAAAGTTTTTC---A-CA-G-TAAGAGT-TTGAGGGT-A-A-ACGA-TAATAAAT-TTC-CGTGAT-T---------TTTACACAAT---ACTGC-ATTCT--C-ATTCATATAATTTTCT-AAATTT-TTTA-AAAATCTT-TTGAATCCATTTTTTCAC----A-TT--------T-----CATATT-TGGT-----GGAAAGCCCTCTAATTGTTCGC--AAACA-ATT-AGGAT-CACTAGT
gi|5 : -TGACC-TTC-GA--C-CT-CC--TT---AGAAA-------------------------GTTATAAAC-CCTTGT-----------A-----TAAAAATTCTT-GTTAGCACTACTCCTCTTGAACTG-----T----CAA-ATGC-GA--T-GGCAAT-GAA------A-----ACTT---TA--TT---G-AATT--A------------TA-T-AG-----G-C-CAATTA-GC-AGGAATAGTGGGGTA-CA--A---T--AAAC--GAAA-GGAT-TCA-AATGACCCCT-TAAAA-GT------GTTA-TT-G-CACCCTT-GAATTTT---A-----CG-AT-------T-TTT-CT--CC-TAATAAAAAGAT-AGCAAT---TTCG-------TC-A----TA--G--AG----GCAAAT---GG-TACCGACTG-TA--A--TGGTTGATA-----GTAACC--------CTT-TACCTTGAAAAATT-CAG-TCAAG-GT---CA-AAGGTCAAGGTCATACAA----------------GA--AA-A--------T---
gi|5 : tgttagggctttctacctttctgtggaaagtcccaattgttatgttcagtttaattattattttcctgtagttcaaaaatcgttttttgtttgaaagaccttattgatagaacctcctctacatcattaaatagtacttctcgagaatcgatcaaatttaacctcaacgttatGATG-GC-AATGA-AA---ACTTT---ATTGAAT-T-AT-A-TAGGCCAATT-AGCAGGA-AT--AGTGGGG-T---ACA-ATAAACGAA-AGGATTCAA-A-TG-A--CCCC----TTA-A-A-AGT-G-TTATTGCACCCTT-------GAA----TTTT--AC----GATTTTTCTCC----T---------AAT-----AAAAA---------G----ATAGC-AATT-TC---GTC-A---------TA-GAGGCAA-A-TGGTACCGACTGTA-A--T-GGTTG----A--T--A---GTA-----AC-CCT--TTACCTT--GAAA--AA-T-TCA---G-T-CA-AGGT-CAAAGG--T-CAAG--------GTCATAC---AAGAAAATG-TGAAA--AAA-T----G-CA-T-----TT--TT-TAATCA--TCTTTCCT-GC---A-GGAA--G---ATAA--C---CATTAA--AACAT----C-AT-A---TGCTCAAGTA-T-CTCATC--C-TACA----ATAG-GTCTCA-GT-GT-----A-TAAA-A-TTA-TAA----TC--C-CGAAC-TTT-GAACC-TT-TG--TT---AGAAATA---C---A-AA--GA-T-TCG-CAT-A-A----------------------------AAAAAT-CTT-GTTA-CACTACTCCTACATAACCAAAA-AG----CAA-A-GA-GA--CAA----T-GAA------A-----CATT---CA--AT---T--TTT--A-----GTCAC-CTG-TAAA-AA-CA-C-C--TTG-AA-AG------TG----AGAA--AAT-T--AACG--GAAG-GGAT-CTGTA-TGCCTC-T-TTACT-TT-A----GTTA-TT-G-C-CCCTG-CAAGTCT---AC----CA-ACATCgtgaaaaaatgcattttttaatcatctttcctgcaggaagataaccattaaaacatcatatgctcaagtatctcatcctacaataggtctcagtgtataaaattataatcccgaactttgaacctttgttagaaatacaaagattcgcataaaaaaatcttgttacactactcctacataaccaaaaagcaaagagacaatgaaacattcaatttttagtcacctgtaaaaacaccttgaaagtgagaaaattaacggaagggatctgtatgcctctttactttagttattgcccctgcaagtctaccaacatc
gi|6 : tgttagggctttctacctttctgtggaaagtcccaattgttatgttcagtttaattattattttcctgtagttcaaaaatcgttttttgtttgaaagaccttattgatagaacctcctctacatcattaaatagtacttctcgagaatcgatcaaatttaacctcaacgttattgaccttcgacctccttagaaagttataaacccttgtataaaaattcttgttagcactactcctcttgaactgtcaaatgcA-A--T-G--GG----AT-C--A---GTG-----TCTCTT--TGACCTT--A-AA--AAAT-TAG---GGTGCA-AGGT-CAAAGGG-T-CACGCGTTGTTAGCCATTTTCTATTACAATTATCAAA--TAA-TAATTG-CA-TGCTTGTTCATC-ATACTCGTTCTTTCCT-ACTCGA-GG-G--A---AT-A--TGGCCTT--A--AACATGATTC-TA-T---AGCAAAAGTA-TG-TAGGA--T-A--A----ATTGCGTATCA-GC-AT-----AGATCACA-TTG--AA----TT--C-TGAAC-TTTTGA--C-CT-AT--TT---CCGATTAACTC---ACACTGGA-C-TAAACGTCA-AAAA-GCTT-TTA-ATCTGCT-AC-A--TA-------TC-GCGAG----------ACTGAAACGAAA-GTGTAGCGATA-GA-GAGTC-A----TCAAA------AGAGGTCCTT---CA---T---A-A-----A--------A--CTA-T-AA-AAACC-C-C--TTT-GC-AG------TG----A-GG--AGT-TTAAACCG-GAAGAGGATACCA-A-GGACCC-T-TACAC-AT-AAGCGGTTA-TTAG-C-CCCTG-GAAATAG---AATTCCCA-ATTCCATTATATTA-GG--CC-TA---------T-ACC--TCTCTTAGCATTA---C-AC-GATA--G--AGGACATCG--G---GG-CACCACTTAGTT--G--T------TA-----C--ACCCCCTTGAGCTT-GACCTTCAA----T-AAGGTCAAC-GCGTACA-AA---CA--GACAT-CAT----------------CA--AA-AAGCTTAGTT---T--------A-----T--TT-----ATCTTCCA-------A------A---T-GTCTCTT--TAGAATT-A-A--AGAG--GACATTTAAACATAAT-ATATGACCATT----AAAAGACTCGCAATAGTCCTC-TT-TCCGC---A--CA-ATTTT--ACTTGGCTCTCTT--TGTG-AAG-TTT-TCTATGATAT--T---TA-
gi|7 : gATGAGC-ATCGA-AA---TTTTT----CTGTCT-G-AT-A-GAGGTCATTTTAGAAGAA-TG--AAT-AGG-T---ACG-TAAAAC--A-GGGATTC-A-AATG-G--CCATAAATTT--A-GGAAA-G-TTATT-T-CCCTT-------G------TTTT--ACCT--AATTCTTAAAG----TA-A------AACAC---GTGAAA----CT-CG----AGAAT-CATT-A----ATCCG---------TA-CAGG--------GAACTAACTGGA-AAAT-G--GG----AT-T--A---GAG-----ACACTT--TGGCCTT--G-AA--AA-T-TGG---G-T-C--AGGT-CAAA--------------------TATGT---A--AAAA-T-TGACA--A-----------------------TT-GT------TCT-----------G-AG-A--G---AT-A--C---CCT-CA--AACAT----G-AT-A---AGCATAAGTATTTTTCATC--T-T--A----ATTA-GTATCG-GCGGT-----A-AT-T-A-TTACAAA----TT--T-TGAAC-TTT-GA--C-CT-CA--TC---AGAACTA---C---G-AT--GATT-TTG-TGTCA-AAAA---TTGTTA-GT--GCT-ACTC--TAGGAA------------------------GAACCTAAA-GT----CAA-A-GACGA--C-A----T-ATA------A-----ACTT---CA--AC---G-ATTT--A-----TTCA--CAA-TAAA-AA-TA-T-C--CTT-ACGAG------TA----G-GA--GAT-T--AACCCGAAAG-GGAT-GTA-A-AGACCC------AC--T-A----GTTATTT-G-C-CCCTG--AAGTAT---C-----CA-GTATCATttgcttaatatatattaa
gi|8 : cacaGATG-GC-AATGA-A----CCTTT---ATTGGAT-T-AT-A-GAGGCTAATT-AGCCGGT-CT--AGT-GGG-T---ACA-ATAAACGAA-GGGATTC-A-A-TG-A--CCCC----TT--A-A-AGA-G-TT-TTGC-CCCTT-------GAA----TTTT--AC----AATTTCTAT-G----TA-A------AATGGAAAAAAAAA----CT-TA----AGAAC-AATT-T----CTC-G---------CA-GAGAC---A-CGGGAATAACTGCA-A--T-G--TA----AT-C--A---GTG-----AC-CTT--TGACCTT--G-AA--AA-T-TAG---G-T-C---------AAGG--T-CAAG--------GTCATAT---A--GAAATT-TGAAA--AAA-TA---T-CA-T-----TT--TGAATACCC--TCTTTa
gi|9 : aggcttttccaaccttctgtggaaagtcctattggatattgttctttctgcgtcaaatgctttttttgttgttgaagacgtttattggaaaaaattatactacttcaaatcatataagtacttctctcgagaatgtcgtcaatatatcaccccaacgtcatttgacctttgatcccttatacggaagttattggtctttgttataaaaactgttagcactactcttttttaactgtcaacgaGATG-GT-AACAT-GA---CCTTT---ATTGAAT-T-AT-A-GAGGTTAATT-AGGAGGA-TT--AGT-GGG-T---ACA-ATAAACAAA-AGGATTC-A-A-TG-A--CCCC----TT--A-A-AGA-G-TTATTGC-CCCTG-------AAA----TTTT--AC----GATTTCTAA-G----TA-A------AATGG---AAAAAA----CT-TG----AGAAC-CGTT-A----ATC-G---------TA-TAGGC---A-CGGAACCAACTGCA-A--T-G--AG----AT-T--A---GTG-----AT-CTT--TGACCTT--G-AA--AA-T-TAA---G-T-CA-AGGT-
6 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|12 ): NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTATTTTTCTGCCATGAAAAAAATATGTTTGAAGACTTGTCGAAACACTTCATAATTCATCACATAGCACATCTCCAGAAACGATCACATATCACCCAACGCGATTGACCTTTGACTCCTCCCGGAGTTTTGAACTTTGTGTAAGAATCCTTGTTAGCACTGATCCTCTTTATCCATTAATGCAATGAACATAAAACCTTTTCTTTTCTATAGAAGTCATAGAGAAGAATCGATAGGTACATTA
Unaligned ( gi|19 ): ATTAGGGCTTTCCATCTTACTGTGGAAAGTCCTATTGCTTTTCTTCTGTTTCTTCTTAATATTTTTCAGCCGTCAAAAAAAATTTCATTTCAAGACTTTATAATTCATCATATAGGAAATCTCGAGAAATGAATAATTATATCACCCAACGTCATTGAACTTTGACCC
Unaligned ( gi|30 ): AGGACTTTCCACCTTCTTGTGGAAAGTCCTATTGTTACAATTGTTCTGTTATTATTTTCCTGTCGTCAAAATAAAGTTTCGTTTCAAGACT
Unaligned ( gi|31 ): ATTGGTTTCCACCTTCCTGTGGAGAATCCTAATGTTCTTGCTGTGTTTCTTATCATTTTCCTGCCGTCAAAAGAAAACTCGTTCCAACAC
Unaligned ( gi|34 ): GGGCTTTCCACCTTTCAGTGTTATTGTTATTGTTCTGTT
Unaligned ( gi|35 ): TAGGGCTTTCCACCTCCCTATGGAAAGTCCTATNN
Alignments
lowQualScore : 1 1111111 111111111 1111111 111111 1111 111111 111111111 111 11111 1111 11111111 111111 111 222222 1111111111111 11 111111111 1111111111111111111 11 1111 222222 2222222222222222222222 6666666666666666666666666666666666666666666 11111111111 111 11111 11111111111 1111 222222222222222222 222222222 11 22222222222 111111 222 111111111111 111 33333333333333333333333333 11111111 11 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 33333333333333333 222222222 111111 11111111 22222 111111111111111 1111 1 111 111 11111111111 1 3333333333 222 222222222222222 111111 2222222222222 11111 3333333333333 111 22222222222 11111 1 2222222222222 1111 11111 6666666666666666666666 1 33333 11 1 1 1
lowQualScore : 5 5 4 777 777 4 4 4 4 44 4 4 99 3 3 666 3 3 3 3 2 2 33 5555 66 2 0 5 2 2 0000000 7777 444444444 5555555 3 000000 4 0 4444 3 7777 444 777777 3 444444444 3 111 3 1 44 3 00000 7777 0000 88888 7 4 44 3 44 3 3 999 3 6 55 3 88 3 22222222 4 555 99 3 1 44 3 444444 3 88888 77 6 777 3 000 3 8888 7 666666 1 44 55 9999999999999 55 4 77 66 888888888 1 5 1 7777777777777777777 5 55 0000 7777 4 4 66 4 66 555555 888 1 3333333333333333333333 2 5 8888888888888888888888888888888888888888888 777777777 66 9999 3 3 3 66666666666 44 888888 77777 222 44 00000 0 3 44 88888888888 6 6 3 0000 3 44 3 3 555 000000000000000000 44 44 3 3 6 3 1 3 3 3 3333 3 7777 3 3 3 3 66 1 0 555555555 4 1 7 6 55 6 99999999999 111111 7 3 999 5 66 999999999999 999999 111 5 33333333333333333333333333 66666666 4 4 6 66 22 1 44 777 4 3 22 4 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 88888888888888888 5 77 222222222 444444 44444444 55 55 11111 222222222222222 8 4 55 2222 55 4 55 8888 55 6 4 99 55 88 888 4 222 55555555555 4 5 0 1111111111 66 66 000 5 5 444444444444444 0 5 5 5 5 77 5 5 5 77 333333 6666666666666 22222 5 1111111111111 4 555 5 5 5 6 5 11 44 00000000000 666 5 33333 5 5 333 5 1 6666666666666 4 1111 1 99999 6 3 55 6 6 8 1 9 9999999999999999999999 3 0 2 66666 1 1 1 2 88 3 3 3
lowQualScore : . . . ... ... . . . . .. . . .. . . ... . . . . . . .. .... .. . . . . . ....... .... ......... ....... . ...... . . .... . .... ... ...... . ......... . ... . . .. . ..... .... .... ..... . . .. . .. . . ... . . .. . .. . ........ . ... .. . . .. . ...... . ..... .. . ... . ... . .... . ...... . .. .. ............. .. . .. .. ......... . . . ................... . .. .... .... . . .. . .. ...... ... . ...................... . . ........................................... ......... .. .... . . . ........... .. ...... ..... ... .. ..... . . .. ........... . . . .... . .. . . ... .................. .. .. . . . . . . . . .... . .... . . . . .. . . ......... . . . . .. . ........... ...... . . ... . .. ............ ...... ... . .......................... ........ . . . .. .. . .. ... . . .. . ............................................................. ................. . .. ......... ...... ........ .. .. ..... ............... . . .. .... .. . .. .... .. . . .. .. .. ... . ... ........... . . . .......... .. .. ... . . ............... . . . . . .. . . . .. ...... ............. ..... . ............. . ... . . . . . .. .. ........... ... . ..... . . ... . . ............. . .... . ..... . . .. . . . . . ...................... . . . ..... . . . . .. . . .
lowQualScore : 0 0 4 888 888 4 4 4 4 88 0 0 55 6 6 444 6 6 6 6 9 9 99 7777 33 7 7 3 7 9 0000000 7777 555555555 7777777 6 555555 3 6 1111 6 7777 444 555555 6 555555555 6 444 6 2 66 3 22222 1111 8888 33333 3 0 66 3 66 3 3 222 3 7 33 3 66 6 11111111 2 888 22 3 8 66 3 666666 3 33333 99 7 777 6 000 6 7777 3 000000 0 88 55 1111111111111 99 4 11 99 999999999 0 0 0 0000000000000000000 0 88 6666 3333 4 4 11 4 99 111111 888 0 1111111111111111111111 2 0 8888888888888888888888888888888888888888888 111111111 77 6666 1 1 1 88888888888 22 888888 77777 777 22 55555 5 1 22 88888888888 2 2 1 2222 1 22 1 1 444 888888888888888888 22 22 1 1 2 1 0 1 3 3 5555 3 1111 3 3 3 3 88 4 7 777777777 0 1 4 7 88 7 33333333333 888888 5 7 444 7 44 111111111111 666666 111 9 66666666666666666666666666 11111111 4 4 9 11 66 1 66 888 4 9 00 4 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 66666666666666666 7 99 999999999 222222 77777777 44 55 66666 999999999999999 0 0 55 5555 55 0 55 5555 55 0 0 55 55 88 333 4 555 11111111111 5 0 0 8888888888 99 99 666 0 7 666666666666666 6 7 7 1 7 99 7 7 7 99 333333 7777777777777 33333 7 4444444444444 3 777 7 7 7 6 4 66 66 66666666666 999 7 33333 7 7 777 7 4 4444444444444 0 7777 0 33333 7 5 33 7 7 0 0 8 5555555555555555555555 2 0 5 22222 0 0 0 5 00 3 3 3
consensus : GATG-GC-AACGA-AA---CCTTT---ATTGGAT-T-AT-A-GAGGCCAATT-AGCAGG-AT-T--AGT-GGG-T---ACA-ATAAACGAA-AGGATTC-A-A-TG-A--CCCC----TT--A-A-AGA-G-TTATTGC-CCCTT-------GAA----TTTT--AC----GATTTCTAT-G----TA-A------AATGGAAAAAA----CT-TG----AGAAC-CGTT-T----GTC-G---------TA-GAGGC---A-CGGGACCAACTGCAA--T-G--N--GA----T-C--AGTG-----AC-CTT-TGACCTT--G-AA--AA-T-TAG---G-T-CA-AGGT-CAAAGG--T-CAAG--------GTCATNT---A--AAAATT-TGAAA--AAA-TA---G-CA-T-----TT--TT-ATACCC--TCTTTCCT-AC---A-GG-A--GAT-A--N---CNTGAA--AACAT----T-TA-A---AGCNNAAGTA-TNCTCATC--T-T--A----ATNG-GTNTCG-GC-GT-----A-ATAA-A-TTG-NAA----TT--C-TGAAC-TTT-GA--C-C--T-T-A--TT---AGAANTA---C---A-AC--GA-T-TCG-CGTCA-AAAA-TCTTGTTA-GC--GCTAC-C--TAAAAAT-CTT-GTTA-CG-CTACTCCTACTNAACCG-AAAGT----CAA-A-GA-GA--C-G----T-AA--A------A-----CCTT---CA--AT---G-ATT-T--A-----GTCA--CTA-T-AA-AA-CG-C-C--CTT-GC-AGTG---A-GA--AN-T---------T--AACC--G-AAG-GGAT-CTA-ANGA-CCC-T-TAAAC-AT-A----GTTA-TT-G-C-CCCTG-AAAGTCT---A-----CA-ATATCGTTATTTT-AG--CC-TA---------T-AGC--T---TTNACATTA-ATC-AA-GATA--G--AG----TCA--T---GG-NACCACNTA-CA--G--T------TA-----G--ACCC--------TT-GA-CCTTNAAA--TT-AAGGTCAAG-GT---CA-AAGGTCAAGGTCAT-CAT----------------NA--AA-A--------T---T--------A-----T--TT-----GTCTTTAAG------A------A---T-ATTTTT--A---------AGGACA-A-T--AAAT--GT--CATTTGACC-C--TAAA-ATG-GACCTTT----A----CA----TCCTT-TT-T--G----A--CA-TATTT--AC----CTCCCTT--T-TG-AGAT--T--TT-TATGATATT---TA-AAATTT-ATTTT-T--T------TGA-T-ACTA---C------TA--AA--GAT---A-T-CAA--TG---------G-GACTTTCAG-CTTTC-AATC-TT--A-A-ATCATTGA-CCT--T-NA---TTTTTT----G-----T--CAA----GGT-CA-------------AAAGTC---AAGG-TCAT-TCA-TATNTTAAAAACGTTTTCAACATTTTC---A-CA-G-TAANA-TT-TTGAGGGT-A-G-AC-GA-TAGGAAAT-TTT-CGTG-NCT---------TTTACACAGT---ACTGCATT-CG--C-GTTCATGAAATTTTCTAAAATTT-TTTA-AAAATCTT-TCGNATCCATTTTTTC---ACATT--------C-----CATATC-GGGTG----GGAAAGCCCTCTANTNGNTCGCCAAGACA-ATT-AGGAT-CACTAGT
Reference ( family-1352 ) : GATG-GC-AACGA-AA---CCTTT---ATTGGAT-T-AT-A-GAGGCCAATT-AGCAGG-AT-T--AGT-GGG-T---ACA-ATAAACGAA-AGGATTC-A-A-TG-A--CCCC----TT--A-A-AGA-G-TTATTGC-CCCTT-------GAA----TTTT--AC----GATTTCTAT-G----TA-A------AATGGAAAAAA----CT-TG----AGAAC-CGTT-T----GTC-G---------TA-GAGGC---A-CGGGACCAACTGCAA--T-G--N--GA----T-C--AGTG-----AC-CTT-TGACCTT--G-AA--AA-T-TAG---G-T-CA-AGGT-CAAAGG--T-CAAG--------GTCATNT---A--AAAATT-TGAAA--AAA-TA---G-CA-T-----TT--TT-ATACCC--TCTTTCCT-AC---A-GG-A--GAT-A--N---CNTGAA--AACAT----T-TA-A---AGCNNAAGTA-TNCTCATC--T-T--A----ATNG-GTNTCG-GC-GT-----A-ATAA-A-TTG-NAA----TT--C-TGAAC-TTT-GA--C-C--T-T-A--TT---AGAANTA---C---A-AC--GA-T-TCG-CGTCA-AAAA-TCTTGTTA-GC--GCTAC-C--TAAAAAT-CTT-GTTA-CG-CTACTCCTACTGAACCG-AAAGT----CAA-A-GA-GA--C-G----T-AA--A------A-----CCTT---CA--AT---G-ATT-T--A-----GTCA--CTA-T-AA-AA-CG-C-C--CTT-GC-AGTG---A-NA--AN-T---------T--AACC--G-AAG-GGAT-CTA-ANGA-CCC-T-TAAAC-AT-A----GTTA-TT-G-C-CCCTG-AAAGTCT---A-----CA-ATATCGTTATTTT-AG--CC-TA---------T-AGC--T---TTNACATTA-ATC-AA-GATA--G--AG----TCA--T---GG-NACCACNTA-CA--G--T------TA-----G--ACCC--------TT-GA-CCTTNAAA--TT-AAGGTCAAG-GT---CA-AAGGTCAAGGTCAT-CAT----------------NA--AA-A--------T---T--------A-----T--TT-----GTCTTTAAG------A------A---T-ATTTTT--A---------AGGACA-A-T--AAAT--GT--CATTTGACC-C--TAAA-ATG-GACCTTT----A----CA----TCCTT-TT-T--G----A--CA-TATTT--AC----CTCCCTT--T-TG-AGAT--T--TT-TATGATATT---TA-AAATTT-ATTTT-T--T------TGA-T-ACTA---C------TA--AA--GAT---A-T-CAA--NG---------G-GACTTTCAG-CTTTC-AATC-TT--A-A-ATCATTGA-CCT--T-NA---TTTTTT----G-----T--CAA----GGT-CA-------------AAAGTC---AAGG-TCAT-TCA-TATNTTAAAAACGTTTTCAACATTTTC---A-CA-G-TAANA-TT-TTGAGGGT-A-G-AC-GA-TAGGAAAT-TTT-CGTG-NCT---------TTTACACAGT---ACTGCNTT-CG--C-GTTCATGAAATTTTCTAAAATTT-TTTA-AAAATCTT-TCGNATCCATTTTTTC---NCATT--------C-----CATATC-GGGTG----GGAAAGCCCTCTANTNGNTCGCCAAGACA-ATT-AGGAT-CACTAGT
gi|1 : TG-GCTAACGG-AAAGACTCTT---ATTGGAT-T-AT-AAGACGCCAAT--ATCCGG-TT-TT-AGT-GGG-T---ACA-GAAAACGAA-AG-ATTC-A-A-TA-A--CCCC----TT--A-A-AGA-G-TTAT-GC-CCTAA-------CAA----TTTT--AC----GATTTCTTT-GG---TA-A------AATGGAAAAAAAAAACT-TG----AGGAA-CGTT-TAATAGTC-GGTGTTCTGTTATGCGGCCTCA-CGTGACCAACTGCAA--T-G--ATGGAATATT-A--AATG-----TG-CTTATGACCTTTCG-AATAAA-T-TAG---G-TTCATAGGT-CAAAAGGTT-CAAA--------GTCTTTT---T--CAAATT-ATCAT--AAA-TA---G-CA-T-----TT--TC-ACACCG--TCTTTTCT-TCT--A-GG-G--AAT-A--ATTCCTTAAACCATCAT----TATA-ATTCATCTAAAGTA-TTTTAATCATT-T--ATATTATAA-ATCTTT-GC-TTTTTTAG-ATTA-A-TTG-GAAATTTTT--C-TGAAC-TTT-GA--CTC--TCT-A--TTTTCCGAATTA---TTCGA-AT--GACT-TAA-CGTCA-AAAAGCCTTGTTA--T--GCTAC-T--CAAA-----TT-TAAA-CG-TTAATT-TACACAAC----AAGT----CAT-A-TA-GAA-C-G----C-AA--ATTAATTA-----CCTTT--CA--ATTTTGTATT-TTTA-----ATTAACTTA-T-AAGAA-TT-C-C--CTTTGC-AGTG---A-GA--GT-T---------T--A-CC--G-AAG-G-AT-CTA-TGGA-CCC-TCTAACC-ATTA----GTTA-CT-G-C-CC-TG-AAAGTCTTCCA-----TA-ATATCATTATCCT-AGGCCT-TA---------C-AGC--T---TTTACATTA-A-C-AATGATA--GCAAG----ACA--T---GG-A--CACTTG-CATAA--T------TA---------CCT--------TTTGA-CC-----A--TT-GACTTCA----T---CATAATGTCAAGGTCAT-CAT----------------CC--AA-A--------TATTT--------AATTTTT--TT-----ATTTTCAAGTCTTTTG------A---TGATTTTTTAA---------ATAACA-T-TTAAAATTAGT---ATTTGACT-C--TAAT-TTACGACTCTT----AATATCT----TCCTT-TT-T--G----A--CA-TATTT--AC----CTCCTTT--G-TG-AGAT--T--GT--ATGATATTAT-TA-AAATTT-AGTTT-T--T------TGA-T-ACTA---T------TA--CA--GAT---AAT-CA---TG---------G-CACTTGCAG-CTGTC-AATC-TT--A-A-ATCATTGA-CCT--TGGA---TATTTT----G-----T--CAA----GGTAAA-------------AAAGTCACAAGGG-TCAT-TCATTATGTT-AAAACACTTTCACCATTTTCTGGA-C--G-TAAA---T-TTGAGGGTGA-G-AC-GC-TAGGAAATGTGT-TGTGTTCT---------TTTACACAGT---ACTACCTT-CGCAC-ATTCATGAAATTTCTTAAAATCTATTT----AATCTT-TTTTATCC-TTTTTTT---TCATTAATAAGTACAAAGAAATATCAGGGTGGGGAGGAAGGCCCTCAATTAGATT-TCAAG
gi|10 : caagtaatggttaattattcatctctaaatcgtcattgacccttattgaccccgctcttatttacttactgagttatgtgcttcctttccatataacgttgtataactatgcctctttaacttgttttcttctaattttagtagtgagatagt-T--AAAT--AT--TATTTGACT-C--TAAA-AAT-TACCTTT----A----AA----TCCTTCTT-T--G----A--CA-TATTTAAAC----CTCCCTTTGT-TGCAGAT--T--TT-ATTAGTATTTGATA-AAATTA-GTTTCAT--T------TGATT-ACTATTTT------TA--AA--TATAC-A-T-TAAATTG---------G-GACTTTCAG-C-TTC-AAAC-TTTGACA-ATCATTAA-CCT--T-GAAAGTTTTTT----G-----TCCCAA----GGT-CA-------------AAA-TC---AA-G-TCAT-TCA-TATTTTAAAAACATTTTCAAGATCTGG---A-CACT-TAACA-TT-TTGAGGGT-A-G-AC-GACTAGGTAAT-CTTGCTTG-TCG---------TATACACAATTACACCG-GTT-CG--C-GTCC-TGAAATTTTCTAAA--TT-CCTATTAAATCTT-TCTCATCCTTTTTTTCCAAAAAGA--------C-----CA-ATC-GGGT-----GGAAAGCCATCTATTGGGTCGCCAAGACATATT-AGGATCCACTAGtctgcacaacgccgagaatataatggactcact
gi|11 : atCTT--T-GA--AA-T-TAG---G-T-CA-AGGT-CAA-GG--T-CAAG--------G-CATTC---A--AAAATC-TAAAACAAAACTG---G-CA-T-----TT--TC-ATACTG--TTTTTCCT-AC---A-AG-G--GAT-ACTT---CTTG-A--AACAT----T-TATA---AGCAGAAGTA-T--TCATC--TATA-A----ATTG-CTTTTT-GA-TT-----G-GAGA-A-TTG--AA----TTAACATGAACATTT-GA--C-
gi|13 : ACCTTC----AG---TA----TCCTT-TTGT--G----AACCA-TATTT--AC-----TCGGCT--T-TG-TGATGCC--TT-TATAATGTC----A-AACTTT-ATTTT-T--CATAGTATAA-TGACTA---TCCCA--TA--AA--GATTAAA-T-CCA--CGCTTCTATATG-G--TCTCAGGCTCTC-AATC-TT--A-A-ATCATTGAACCTGTT-AA---GTTGCT----GAAACATG-CAAAAAAGGT-CA-------------AAA--C---GAGC-TCAAATCA-AATATGA-----GTTTTCAACCTTTT-------A-A-TGATA-TT-TTGAGGGC-A-A-AAAGA-TAAAGAAT-TAT-CGTT-ACC---------ATCAAACAGT------GCATA-GA--C-G---ATCAA---TTCTTAAACTT-TTTA-AAAAacatctataatttctgaatatacaatgagcaaacgatcgagataataaagttgtcataaatgaacgcgacatatcttgacacactcaaactagagactaagaaatgtcatagtggattctagcacaaatacctcttcagctgatttcgattactttaaaaaaatcacctt
gi|14 : T-GGGCT---ACC-TTAAGCAAA-AGGAATC-A-A-TG-G--CCCT----TT--ATG-ATA-G-TTATTGC-CCCTT-------
gi|14 : AG--------GTCATCT---A--AAA-TA-TGTAA--AAA-TA---G-CA-T-----TT--TT-ATAGCT--TC--TCCT-GC---A-GG-A--GAT-A--C---Cannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaggtcatctaaaatatgtaaaaatagcatttttatagcttctcctgcaggagatacc
gi|15 : tgggctaccttaagcaaaaggaatcaatggccctttatgatagttattgccccttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-TG-A--CCCC----TT--A-A-AGA-G-TCATTGC-CCCTT-------GAA----TTTT--A--------------------TA-A------AATGGACTAAA----AT-TA----AAAAC-CATT-T----GTC-A---------TA-GAGGC---A-CGCAACCAACTGCAA--T-G--T--GA----T-T--AGTG-----AC-CTT-TGACCTT--G-AA--AA-T------------A-AAGT-CAAAGG--T-CTAG--------GTCATAT---A--AAAATT-CG-AA--AAA-TA---T-CACT-----TT--TT-ATACCC--TTTTTCCT-AC---A-GG-A--GAT-A--G---CATGAA--AACGG----T-AT-A---TGCTCAAGTA-TTCTCAT
gi|16 : ATTA---C-AA-GA--------------CA--T---GG-GGCAACCT------T--T------TA-----G--ACCC--------CT-AA-ACTTGAAA--AT-TAGGTCAAG-GT---CA-AAGATCA---TCAT-AAT----------------GATTAG-A--------T---T--------A-----TACAC-----ATTTTTAAG------ATGTTTTAGGTT-CTTTTC--A---------AATACA-G-T--GAAT--GG--C--TTGA-C-C--TAACTGTG-GAACTTT----A----GA----TCCCT-TT-T--A----A--TACCAGTT--A------TTCTCT--T-TG-ATAT--T--TT-gt
gi|17 : A--TG---------G-GACTTTCAG-CTTTCAAATCTTT--A-A-ATCATTGA-CCT--T--A---TTTTTTGGGGG-----T--CAG----GGT-CAGAGATCACAGTCGAAAGTC---AAGGTTCAT-TCA-TAT-TTAAAGACGTTTTCAACATTTGC---AGCT-GATAATG-TT-TATAGGGT-CTG-AC-GC-TAGGAAAT-TTTGCGTG-TTTGTTTCGTTATTTACACAGT---TCT
gi|18 : --TAAGAAT-CTTTGTTATCA-CTATCCCTCTTTATCCG-TAAATG---CAA-T-GT-G---C-A----T-CA--A------A-----CCTTTT-CT--AT------TC-T--ATAGAGGTCA--TT--T-AA-AA--G-A-A--TTT-AT-AGGG---A-CA-----T---------T--AAAC--A-AAA-AGAT-TCA-ATGG-CCC-T-TTAAG-AC-A----GTTA-TT-G-C-t
gi|18 : ttaattattacccaacgtcattgaccttagaccccttacagagtA-AA---CCTTTTCTATT---C-T-AT-A-GAGGTCATTT-AAAAGA-AT-T--TAT-AGG-G---ACA-TTAAACAAA-AAGATTC-A-A-TG-G--CCCT----TT--A-AGACA-G-TTATTGC-
gi|2 : ttaattattacccaacgtcattgaccttagaccccttacagagttaagaatctttgttatcactatccctctttatccgtaaatgcaatgtgcatc-TG-A--CCCC----TT--A-A-TGAAG-TTATTGC-CCTTTTCATAAAGAAACCCTTTTTAAC----TACTTCTCT-T----TA-ACTGATCAAT-GAGATGG----CTACG----ACAAC-C--T-T----ATT-G------------GATGC---A-TTAGATTAATAGCA-----G--G--GA----T-T--AGTG-----
gi|2 : tagggctttccacctttctgtcctggaaaagtctattgttagagttctgtttcttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttccgccgtcaaaaaacaattttcgtttgaagactatttcaaaaaactttatagttcatccatataggacatcttgagaaatgattaaagtatcaccaacgtcatgtgacctGATG-GC-TACGACAA---CCTT----ATTGGATGC-ATTA-GA--TTAAT--AGCAGGGAT-T--AGT-GGG-T---ACACACAAACGAACAGGATTC-ACA-TGGA--CCCC----TT--A-A-AGA-GGTTATTGC-CCCTT-------AAA----TTTT--AAAAAAGATTTCTAT-GGCTCTAGA------AATTGAAAAAA----CC-TG----AGAAC-CGTT------ATC-G---------TA-TGGGC---A-CGA-ACCAACTGCAA--TAG--A--GA----TGT--AGTG-----AC-CTT-TGACCTT--G-AA--AA-TCTAGT--G-T-CA-AGGTTCAAAGG--T-GAAG--------GTCAGTC---A--AAAATC-CTAAA--AA--T----G-CA-T-----TT--TC-ATACTT--T-TTTCCT-AC---A-GG-G--AAT-A--TT--CTTGAA--ACC------T-TA-A---AACAGAATCA-TA-TCATA--T----A----ATTG-CTTTTTTGC-AT-----G-ATAC-A-TTG-AAA----TT--C-TGAAC-TTT-GA--C-CCAT-T----TC---CGAATTA---C---A-AT--GA-C-TAA-CGTCA-AAGC-T-TTATTACGC--GC-AC-T--CACAA---CTT-GC------------------AACCGAAAAGT----CAT-A-GA-GA--C-G----C-AA--A------A-----CCTT---CAGTAT---G-A-T-T--A--------A--CTA-T-AA-AA-AATC-C--CTT-GC-AGTG---A-GATGAT-T---------T--AACC--G-ACA-GGAT-CTA-AGGA-CCC-T-TACAC-AT-A----GTTA-CT-GCC-CCCTG-AACATCT---------CATATATC--TGATTT-AT--CCATA---------C-AGC--T---TTTACATTA---CAAA-GATATCA--AG----ACA--T---GGATACTGGTTATTA--A--T------TACCCTTG--ACCT--------TT-GA-CCTT-ACA--TT-AAAGTCAAG-GT---CA-AA--TCAAGGTAAT-CATCACAAAACTTTGAAAAAA--AA-A--------T---TC-------A-----T--TTCAAA-GTCTTTTTG------A------A---T-ATATTT--A---------AATAAACA-T--AAAT--AG--TATTTGACC-TCATAAA-A---GACCTTTAATAA----TA----TCCTTGTT-T--G----A--CA-TATTT--AC----CTCCCTT--TGTG-AGAT--T--TC-TATTATATTA--TA-AAATTA-GTTTC-T--T------TGA-TGACTA---C------TATTAA--GAA---A-T-CAA--TT---------G-GACTTTCAG-CTTTT-AA-C-TT--A-ACATCATTAA-CTT--T-AA---TTTTTT----G-----T--CAA----TGG-CA-------------ACAGTC---AAGG-TCAT-TCA-TATGTTTAAAACA-TTTCAACATTCTG---A-CA-C-TGAAA-TTATTGAGGGT-A-GTGC-TA-T----AAT-GTG-CGTG-TCG---------ATT-CACA-T---ACTACCTT--G--CTGTCCATGAAATTTTCTAAATTCT-ATTA-AAACCTTT-TCGCATCCggtacacacaaacgaacaggattcacatggaccccttaaagaggttattgccccttaaattttaaaaaagatttctatggctctagaaattgaaaaaacctgagaaccgttatcgtatgggcacgaaccaactgcaatagagatgtagtgacctttgaccttgaaaatctagtgtcaaggttcaaaggtgaaggtcagtcaaaaatcctaaaaatgcattttcatacttttttcctacagggaatattcttgaaaccttaaaacagaatcatatcatataattgcttttttgcatgatacattgaaattctgaactttgacccatttccgaattacaatgactaacgtcaaagctttattacgcgcactcacaacttgcaaccgaaaagtcatagagacgcaaaaccttcagtatgattaactataaaaaatcccttgcagtgagatgatttaaccgacaggatctaaggacccttacacatagttactgccccctgaacatctcatatatctgatttatccatacagcttttacattacaaagatatcaagacatggatactggttattaattacccttgacctttgaccttacattaaagtcaaggtcaaatcaaggtaatcatcacaaaactttgaaaaaaaaattcatttcaaagtctttttgaatatatttaaataaacataaatagtatttgacctcataaaagacctttaataatatccttgtttgacatatttacctccctttgtgagatttctattatattataaaattagtttctttgatgactactattaagaaatcaattggactttcagcttttaacttaacatcattaactttaattttttgtcaatggcaacagtcaaggtcattcatatgtttaaaacatttcaacattctgacactgaaattattgagggtagtgctataatgtgcgtgtcgattcacatactaccttgctgtccatgaaattttctaaattctattaaaaccttttcgcatcc
gi|20 : tagggctttccacctttctgtcctggaaaagtctattgttagagttctgtttcttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttccgccgtcaaaaaacaattttcgtttgaagactatttcaaaaaactttatagttcatccatataggacatcttgagaaatgattaaagtatcaccaacgtcatgtgaccttgaccccttaatgaagttattgcccttttcataaagaaaccctttttaactacttctctttaactgatcaatgaT--G-AT--AA-T-TAAAGAG-C-CC-AGG--CAAAGG--TTCAAA--------GTCAT-T---A--AAAACT-C-AAA--AAA-TA---GGCA-T-----TT--TTCATACTG--TTTTTCCT-AC---A-GG-AT-AAT-AT-T---CTTGAA--ACGAT----TATA-A---AGCAGAAG
gi|21 : agtgcacatgtgagaaataattttgttgA-----G--ACCC--------TT-GA-CCTTTGAC--CT-----TCAAA-GT------AAGGTCCAAGTCAT-CAT----------------GA--AATA--------T---TTTCTTTTCA-----T--TTCTAAGGTCATTAAG------A------T---T-ATTTTT--A---------AGGACA-A-T--AAAT--AT--AATTTGACC-C--CAAA-ATG-GACCTTT----A----CA----CCC
gi|22 : catta-CTACTCCTACTAAACCA-AAAGT----CAA-A-AA-GA--A-A----T-GA--T------A-----CCTT---TT--AT---G-ATT-T--A-----GTCA--CTG-T-AG-AA-CA-C-C--CTT-GC-AATG---A-CA--AA-T---------T--AATG--G-AAG-GGAT-ATG-ATGA-CCC-T-TAAAC-AT-A----GTTA-TC-G-C-CCCTa
gi|23 : AAGT----CAT-A-GA-GA--C-A----C-AA--A------A-----CCTT---CA--GT---G-ATG-T--A-----TTAA--CTA-T-AA-A--CA-CTC--CTT-GC-AGTG---A-GA--GT-T---------T--AACC--G-AGG-GGAT-CCA-AGGA-CCC-T-TACAC-AT-A-----TTA-TT-G-C-CCCAG-AAAGTAT---C-----CA-ATATCATT
gi|24 : AAAAG-CTT-ATTA-TGGCTACTCCAACTGAAATG-AAAGT----CAT-A-GA-GA--A-G----A-AA--A------A-----CCTT---CA--AT---T-ATT-C--A-----TTAA--CTA-T-AA-AA-AT-C-C--TTT-GC-GGTG---A-GT--GT-T---------T--AACC--G-AAA-GGAT-ATA-AGGA-C
gi|25 : T--TATTTGACT-C--TAAA-A-A-GACCTTC----A----TA----TTTTT-TT-T--TTTTTA--CA-TATTT--AC----TTCCCTT--TATG-AGAT--T--AT--ATGATATT---TATAAAGT---TTTC-T--T------TGA-T-CCTA---T------TA--AA--GATA--A-T-CAA--
gi|26 : -TG-A--CCCC----TT--A-C-GGA-G-TTATTG
gi|27 : ttcgtttcaagacttatcgaaagactttatccttcatcacataggacatctcgagaaatgatcgcatatcaccctgcatctttgacctt----TT--A-AGACA-G-TTATTGC-CCCT---------AA----TTTTTAAC----GATTTCTAA-G----TG-A------AACACATCAAA----CT-TG----AGACC-CGTT-A----ATC-G---------TA-TGGGT---T-CGGGACCAACTGCAA--T-G--G--GA----T-C--AGTG-----AC-CT
gi|28 : CT-C--TAAA-A-A-GACCTTA----A----TA----TCCTT-TT-T--G----G--TA-TATTT--AC----CTTTCTT--TGTG-AG-C--T--TT-TATGATATT---TA-AAATTT--TTTT-T--T------T-A-T-ACTA---CATGTATTA--AA--GAT---A-
gi|29 : TT-AAAAGA-ATGT--A-T-AGG-G---ACA-ATAAATGAA-AGGATTC-A-A-TG-G--CCGT----TT--A-AGACA-G-TTATTGC-CCCTT-------attg
gi|3 : aaatgcaatgtgcatcaaaccttttctaatGATG-GC-CAATA-AA---CTTTT---ATTGGAT-TCAT-G-GAGGCTAATT-AGCGCG-AT-TTGGGT-GGG-TGTGACA-ATAAACGAA-GGGATTC-A-A-TG-AGACCCT----TTTGA-A-CGAAG-TTATT-C-CCCTT-------GAA----TTTTT-AC----AATTTCTAT-G----TA-A------ATTGGGAGAAA----AC-TGTAAAAGAACGTATTCT----GTC-G---------TA-GAGGC---ATCGGGACCAATTGCAA--T-G--T--TA----T-CCCAGTGGNNNNNN-NNN-NNNNNNN--N-NN--NN-N-NNN---N-N-NN-NNNN-NNNNNN--N-NNNN--------NNNNNNN---N--NAAATT-TGAAA--AAA-TAT--A-CA-T-----TTA-TT-ATACCC--TCTTTCCTTAC---ACGG-AACGATTA--G---CATGAA--AACAT----T-TAGA---AGCT-AAGTA-TGCTCATC--T-T--A----ATAG-GTA-CA-GT-AT-----A-ATAA-AATTA-CAA----TT--T-TGAA---TT-GA--C-C--TAT-AAATT---AGAAATA---C---A-AC--GA-TGTTG-CATTA-AAAA-TCTT-TTA-GC--ACT--------------------TA-CT-CT--TACTACTAA--CA-AAAGT----CAA-A-AA-GA--C-A----T-AA--A------A-----ACCTGTACG--AT---G-ATT-T--A-----GTCA--CTGCT-AA-AA-CG-C-T--CTT-GC-AGTG---A-CA--AAAG---------T--AATG--G-AAG-G-AT-CTG-ATG---CC-T-TAAGCCAT-A----GTTA-TC-G-C-CC-TGCAAAATCTT--A-----CA-ACATCGTTGTTTTCAG--CT-TA---------TCAGC--T---TT-ATATTAGATC-AA-GATA--GC-AA----TCA--TTTGGG-AACCACATA-CA--G--T------AA-----G--ACCT--------TT-GA-CCTTCAAA--TTCAAGGTCAAG--T---AA-AAGGTCAAG-TCAT-CAT----------------TA--AA-A--------T---T--------A-----T--TT-----G-CTTTAAG------A------A---T-ATTTTT--A---------AGGACA-ACT--AAAT--GT--C--TTAACA-C--CAAA-GTG-GACCTTT----A----CA----TCCAT-TT-T--G----A--CA-CATT---AC----CTCCCCA--T-TG-AGAT--TGTTT-TTTGATATT---CA-AGATTTCATTTT-TATT------TCA-T-ACTA---C------TA--AAAAGAT---A-TGCAA--AG---------AAGATCATCAG-CTT-C-AAGC-TT--A-A-ATCAT-GA-CCT--T-TA---TTTTTT----GG----T--CA------GT-CA-------------AAAGTCC--AAGG-TCAT-TC--TATTTTTAAAAAATTTTAAA-GTTTTC---A-CA-G-TAAGAGTT-TTGAG--T-A---AC-GA-TATAAAAT-TTC-CGTG-ATT---------TTTACACAAT---ACTGCATTTCT--C-ATTCATATAATTTTCTAAAAATT-TTTA-AA--TTTTGTTGAATCCATTTTTAC---ACATT--------TT----CATATT-GG-TG----GGAAAGCCCTCTAATTGTTCGC--AAACA-ATTCAGGAT-CACTAGTat
gi|32 : cgttatttacacagttcttcttgacccttattacggacgttattggcctattcatataaaaatccttgttagatcacgtacttctctttaactgttcaatgtta-GGTA--G--AG----TC---T---GG-T--CAC-TA-CA--GGCT------T------G--AACC--------TT-GAATCTTGAAA--CTGAAGGTCAACTGT---CA-AAGGTCAACGTCAC-C-T----------------GA--AA-ta
gi|4 : GATG-GC-AATAA-AA---CTTTT---ATTGGAT-T-AT-G-GAGGCTAATT-AGCCGA-TT-T--GGT-GGG-T---ACA-ATAAACGAA-GGGATTC-A-A-TG-A--CCCT----TT--G-A-AGA-G-TTATTGC-CCCTT-------GAA----TTTT--AC----AATTTCTAT-G----TA-A------ATTGGAGAAAA----CT-TA----AGAAC-TATT-T----GTC-G---------TA-GAGGC---A-CGGGACCAATTGCAA--T-G--T--GA----T-C--AGTG-----AC-TTT-CGACCTT--G-AA--AA-T-TAG---G-T-CA-AGGT-CAAAGG--T-CAAG--------GTCATAT---A--TAAATT-TGAAA--AAA-TA---T-CA-T-----TT--TT-ATACCC--TCTTTCCT-AC---A-GG-A--GAT-A--G---CATGAA--AACAT----T-TA-A---AGCTCAAGTA-TGCTCATC--T-T--A----ATAG-GTATCA-GT-AT-----A-ATAA-A-TTA-CAA----TT--T-TGAAC--TT-GA--C-C--T-TAA--TT---AGAAATA---C---A-AC--GA-T-TTG-CATTA-AAAA-TCTTGTTA-GC--ACTAC-CCTNAAAAAT-CTT-GTTAGCA-CTACTCTTACTAAACCA-AAAGT----CAA-A-AA-GA--C-A----T-AA--A------A-----CCTT---CG--AT---G-ATT-T--A-----GTCA--CTG-T-AA-AA-CG-C-T--CTT-GC-AGTG---A-CA--AA-G---------T--AATG--G-AAG-GGAT-CTG-ATGG-CCC-T-TAGCC-AT-A----GTTA-TC-G-C-CCCTG-AAAATCT---A-----CA-ACATCGTTATTTC-AG--CC-TA---------T-AGC--T---TTGATATTA-ATC-AA-GATA--G--AA----TCA--T---GG-GACCACATA-CA--G--T------CA-----G--ACCT--------TT-GA-CCTTCAAA--TT-AAGGTCAAG-GT---CA-AAGGTCAAGGTCAT-CAT----------------TA--AA-A--------T---T--------A-----T--TT-----GTCTTTAAG------A------A---T-ATTTTT--A---------AGGACA-A-T--AAAT--GT--CATTTAACA-C--CAAA-GTG-GACCTTT----A----CA----TCCAT-TT-T--G----A--CA-CATTT--AC----CTCCCCA--T-TG-AGATG-T--TT-TTTGATATT---CA-AGATTT-ATTTTAT--T------TCA-T-ACTA---C------TA--AA--GAT---A-T-CAA--AG---------A-GATCATCAG-CTTTC-AATC-TT--A-A-ATCATTGA-CCT--T-TA---TTTTTT----G-----T--CAA----GGT-CA-------------AAAGTC---AAGG-TCAT-TCA-TATTTTAAAAACATTTTAAAGTTTTTC---A-CA-G-TAAGA-GT-TTGAGGGT-A-A-AC-GA-TAATAAAT-TTC-CGTG-ATT---------TTTACACAAT---ACTGCATT-CT--C-ATTCATATAATTTTCT-AAATTT-TTTA-AAAATCTT-TTGAATCCATTTTTTC---ACATT--------T-----CATATT-TGGT-----GGAAAGCCCTCTAATTGTTCGC--AAACA-ATT-AGGAT-CACTAGT
gi|5 : -TGACC-TTC-GA--C-C--T-C-C--TT---AGAAA-------------------------GTTATAAAC-CCTTGT----------A-----TAAAAATTCTT-GTTAGCA-CTACTCCTCTTGAACTG-----T----CAA-ATGC-GA--T-GGCAAT-GA--A------A-----ACTT---TA--TT---G-AAT-T--A------------TA-T-AG-----G-C-CAATTA-GC-AG-G---A-AT--AG-TGGGGTACAAT--AAAC--G-AAA-GGATTCAA-ATGA-CCCCT-TAAAA-GT------GTTA-TT-G-CACCCTT-GAATTTT---A-----CG-AT-------TTTT-CT--CC-TAATAAAAAGAT-AGCAAT---TTCG-------TC-A----TA--G--AG----GCAAAT---GG-TACCGACTG-TA--A--TGGTTGATA-----GTAACCC--------TT-TA-CCTTGAAAAATT-CAG-TCAAG-GT---CA-AAGGTCAAGGTCATACAA----------------GA--AA-A--------T---
gi|5 : tgttagggctttctacctttctgtggaaagtcccaattgttatgttcagtttaattattattttcctgtagttcaaaaatcgttttttgtttgaaagaccttattgatagaacctcctctacatcattaaatagtacttctcgagaatcgatcaaatttaacctcaacgttatGATG-GC-AATGA-AA---ACTTT---ATTGAAT-T-AT-A-TAGGCCAATT-AGCAGG-AA-T--AGTGGGG-T---ACA-ATAAACGAA-AGGATTCAA-A-TG-A--CCCC----TTA-A-A-AGT-G-TTATTGCACCCTT-------GAA----TTTT--AC----GATTTTTCTCC----T---------AAT--AAAAA---------G----ATAGC-AATT-TC---GTC-A---------TA-GAGGCAA-A-TGGTACCGACTGTAA--T-GGTT--GA----T----AGTA-----AC-CCT-TTACCTT--GAAA--AA-T-TCA---G-T-CA-AGGT-CAAAGG--T-CAAG--------GTCATAC---AAGAAAATG-TGAAA--AAA-T----G-CA-T-----TT--TT-TAATCA--TCTTTCCT-GC---A-GGAA--GATAA--C---CATTAA--AACAT----C-AT-A---TGCTCAAGTA-T-CTCATC--C-TACA----ATAG-GTCTCA-GT-GT-----A-TAAA-A-TTA-TAA----TC--C-CGAAC-TTT-GAACC-T--T-T-G--TT---AGAAATA---C---A-AA--GA-T-TCG-CAT-A-A---------------------------AAAAAT-CTT-GTTA-CA-CTACTCCTACATAACCA-AAAAG----CAA-A-GA-GA--CAA----T-GA--A------A-----CATT---CA--AT---T--TT-T--A-----GTCAC-CTG-TAAA-AA-CA-C-C--TTG-AA-AGTG---AGAA--AA-T---------T--AACG--G-AAG-GGAT-CTGTATGC-CTC-T-TTACT-TT-A----GTTA-TT-G-C-CCCTG-CAAGTCT---AC----CA-ACATCgtgaaaaaatgcattttttaatcatctttcctgcaggaagataaccattaaaacatcatatgctcaagtatctcatcctacaataggtctcagtgtataaaattataatcccgaactttgaacctttgttagaaatacaaagattcgcataaaaaaatcttgttacactactcctacataaccaaaaagcaaagagacaatgaaacattcaatttttagtcacctgtaaaaacaccttgaaagtgagaaaattaacggaagggatctgtatgcctctttactttagttattgcccctgcaagtctaccaacatc
gi|6 : tgttagggctttctacctttctgtggaaagtcccaattgttatgttcagtttaattattattttcctgtagttcaaaaatcgttttttgtttgaaagaccttattgatagaacctcctctacatcattaaatagtacttctcgagaatcgatcaaatttaacctcaacgttattgaccttcgacctccttagaaagttataaacccttgtataaaaattcttgttagcactactcctcttgaactgtcaaatgcAA--T-G--G--GA----T-C--AGTG-----TCTCTT-TGACCTT--A-AA--AAAT-TAG---GGTGCA-AGGT-CAAAGGG-T-CACGCGTTGTTAGCCATTTTCTATTACAATTATCAAA--TAA-TAATTG-CA-TGCTTGTTCATC-ATACTCGTTCTTTCCT-ACTCGA-GG-G--AAT-A--TGGCCTT--A--AACATGATTC-TA-T---AGCAAAAGTA-TG-TAGGA--T-A--A----ATTGCGTATCA-GC-AT-----AGATCACA-TTG--AA----TT--C-TGAAC-TTTTGA--C-C--T-A-T--TT---CCGATTAACTC---ACACTGGA-C-TAAACGTCA-AAAA-GCTT-TTA-ATCTGCTAC-A--TA------------T--CG-CGAG----ACTGAAACG-AAAGTGTAGCGATA-GA-GAGTC-A----TCAA--A------AGAGGTCCTT---CA---T---A-A------A--------A--CTA-T-AA-AAACC-C-C--TTT-GC-AGTG---A-GG--AG-T---------TTAAACC--GGAAGAGGATACCA-AGGA-CCC-T-TACAC-AT-AAGCGGTTA-TTAG-C-CCCTG-GAAATAG---AATTCCCA-ATTCCATTATATT-AGG-CC-TA---------T-ACC--TCTCTTAGCATTA---C-AC-GATA--G--AGGACATCG--G---GG-CACCACTTAGTT--G--T------TA-----C--ACCCCCTTGAGCTT-GA-CCTTCAA----T-AAGGTCAAC-GCGTACA-AA---CA--GACAT-CAT----------------CA--AA-AAGCTTAGTT---T--------A-----T--TT-----ATCTTCCAA------AT-----G---T-CTCTTT--AGAATTAAAGAGGACA-T-TT-AAAC--ATAATATATGACCAT--TAAA-A---GAC--TC----G----CAATAGTCCTC-TT-TCCGC---A--CA-ATTTT--ACTTGGCTCTCTT--TGTG-AAGT--T--TTCTATGATATT---TA-
gi|7 : gATGAGC-ATCGA-AA---TTTTT----CTGTCT-G-AT-A-GAGGTCATTTTAGAAGA-AT-G--AAT-AGG-T---ACG-TAAAAC--A-GGGATTC-A-AATG-G--CCATAAATTT--A-GGAAA-G-TTATT-T-CCCTT-------G------TTTT--ACCT--AATTCTTAAAG----TA-A------AACACGTGAAA----CT-CG----AGAAT-CATT-A----ATCCG---------TA-CAGG--------GAACTAACTGGAAAAT-G--G--GA----T-T--AGAG-----ACACTT-TGGCCTT--G-AA--AA-T-TGG---G-T-C--AGGT-CAAA--------------------TATGT---A--AAAA-T-TGACA--A-----------------------TT-GT------TCT-----------G-AG-A--GAT-A--C---CCT-CA--AACAT----G-AT-A---AGCATAAGTATTTTTCATC--T-T--A----ATTA-GTATCG-GCGGT-----A-AT-T-A-TTACAAA----TT--T-TGAAC-TTT-GA--C-C--T-C-A--TC---AGAACTA---C---G-AT--GATT-TTG-TGTCA-AAAA---TTGTTA-GT--GCTACTC--TAGGAA-------------------------GAACCT-AAAGT----CAA-A-GACGA--C-A----T-AT--A------A-----ACTT---CA--AC---G-ATT-T--A-----TTCA--CAA-TAAA-AA-TA-T-C--CTT-ACGAGTA---G-GA--GA-T---------T--AACCCGA-AAG-GGAT-GTA-AAGA-CCC------AC--T-A----GTTATTT-G-C-CCCTG--AAGTAT---C-----CA-GTATCATttgcttaatatatattaa
gi|8 : caca--TAAAAAC---T-GTTAGCA-CTACTCTTTTTTAACTG-----T----CAA-C-GA-GA--T-GG---C-AATGA------A-----CCTT---TA--TT---GGATTAT--A-----GAGG--CTAAT-TA-GC-CG-G-T--CT-----AGTGGGTA-CA--A------------T--AAAC--G-AAG-GGAT-TCA-ATGACCCC-T-TAA---AG-A----GTT--TT-G-C-CCCTT-GAATTTT---A-----CA-ATTTCa
gi|8 : aggcttttccaaccttctgtggaaagtcctattggatattgttctttctgcgtcaaatgctttttttgttgttgaagacgtttattggaaaaaattatactacttcaaatcatataagtacttctctcgagaatgtcgtcaatatatcaccccaacgtcatttgacctttgatcccttatacggaagttattggtctttgttaGATG-GC-AATGA-A----CCTTT---ATTGGAT-T-AT-A-GAGGCTAATT-AGCCGG-TC-T--AGT-GGG-T---ACA-ATAAACGAA-GGGATTC-A-A-TG-A--CCCC----TT--A-A-AGA-G-TT-TTGC-CCCTT-------GAA----TTTT--AC----AATTTCTAT-G----TA-A------AATGGAAAAAAAAA-CT-TA----AGAAC-AATT-T----CTC-G---------CA-GAGAC---A-CGGGAATAACTGCAA--T-G--T--AA----T-C--AGTG-----AC-CTT-TGACCTT--G-AA--AA-T-TAG---G-T-C---------AAGG--T-CAAG--------GTCATAT---A--GAAATT-TGAAA--AAA-TA---T-CA-T-----TT--TGAATACCC--TCTTTtatgtaaaatggaaaaaaaaacttaagaacaatttctcgcagagacacgggaataactgcaatgtaatcagtgacctttgaccttgaaaattaggtcaaggtcaaggtcatatagaaatttgaaaaaatatcattttgaataccctcttt
gi|9 : aggcttttccaaccttctgtggaaagtcctattggatattgttctttctgcgtcaaatgctttttttgttgttgaagacgtttattggaaaaaattatactacttcaaatcatataagtacttctctcgagaatgtcgtcaatatatcaccccaacgtcatttgacctttgatcccttatacggaagttattggtctttgttataaaaactgttagcactactcttttttaactgtcaacgaGATG-GT-AACAT-GA---CCTTT---ATTGAAT-T-AT-A-GAGGTTAATT-AGGAGG-AT-T--AGT-GGG-T---ACA-ATAAACAAA-AGGATTC-A-A-TG-A--CCCC----TT--A-A-AGA-G-TTATTGC-CCCTG-------AAA----TTTT--AC----GATTTCTAA-G----TA-A------AATGGAAAAAA----CT-TG----AGAAC-CGTT-A----ATC-G---------TA-TAGGC---A-CGGAACCAACTGCAA--T-G--A--GA----T-T--AGTG-----AT-CTT-TGACCTT--G-AA--AA-T-TAA---G-T-CA-AGGT-
7 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|12 ): NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTATTTTTCTGCCATGAAAAAAATATGTTTGAAGACTTGTCGAAACACTTCATAATTCATCACATAGCACATCTCCAGAAACGATCACATATCACCCAACGCGATTGACCTTTGACTCCTCCCGGAGTTTTGAACTTTGTGTAAGAATCCTTGTTAGCACTGATCCTCTTTATCCATTAATGCAATGAACATAAAACCTTTTCTTTTCTATAGAAGTCATAGAGAAGAATCGATAGGTACATTA
Unaligned ( gi|19 ): ATTAGGGCTTTCCATCTTACTGTGGAAAGTCCTATTGCTTTTCTTCTGTTTCTTCTTAATATTTTTCAGCCGTCAAAAAAAATTTCATTTCAAGACTTTATAATTCATCATATAGGAAATCTCGAGAAATGAATAATTATATCACCCAACGTCATTGAACTTTGACCC
Unaligned ( gi|30 ): AGGACTTTCCACCTTCTTGTGGAAAGTCCTATTGTTACAATTGTTCTGTTATTATTTTCCTGTCGTCAAAATAAAGTTTCGTTTCAAGACT
Unaligned ( gi|31 ): ATTGGTTTCCACCTTCCTGTGGAGAATCCTAATGTTCTTGCTGTGTTTCTTATCATTTTCCTGCCGTCAAAAGAAAACTCGTTCCAACAC
Unaligned ( gi|33 ): AATAGCATTTTTCATATTTTTTTTTCAATAGGAAGATATATATTGAAACCATCTAAAGTAGAA
Unaligned ( gi|34 ): GGGCTTTCCACCTTTCAGTGTTATTGTTATTGTTCTGTT
Unaligned ( gi|35 ): TAGGGCTTTCCACCTCCCTATGGAAAGTCCTATNN
Alignments
lowQualScore : 1 1111111 111111111 1111111 111111 1111 111111 111111111 111 11111 1111 11111111 111111 111 222222 1111111111111 11 111111111 11111111111111 1 1111 222222 22222222222222222222222 6666666666666666666666666666666666666666666 11111111111 111 11111 11111111111 1111 22222222222222222222 222222222 11 22222222222 111111 222 111111111111 111 33333333333333333333333333 11111111 11 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 33333333333333333 222222222 111111 11111111 22222 111111111111111 1111 1 111 111 11111111111 1 3333333333 222 222222222222222 111111 222222222222222222 3333333333333 111 22222222222 11111 1 2222222222222 11111 11111 111 66666666666666 1 33333 11 1 1 1
lowQualScore : 5 5 4 777 777 4 4 4 4 44 4 4 99 3 3 666 3 3 3 3 2 2 33 5555 66 2 0 5 2 2 0000000 7777 444444444 5555555 3 000000 4 0 4444 3 7777 444 777777 3 444444444 3 111 3 1 44 3 00000 7777 0000 88888 7 4 44 3 44 3 3 999 3 6 3 3 88 3 22222222 4 555 99 666 44 3 444444 3 88888 77 6 777 3 000 3 8888 7 666666 1 1 55 3 9999999999999 55 77 4 66 888888888 1 5 1 55555555555555 2 777 0 5555 7777 4 4 66 4 66 555555 888 1 33333333333333333333333 2 5 9999999999999999999999999999999999999999999 555555 1 66 9999 3 3 3 66666666666 44 888888 77777 222 44 00000 0 3 44 88888888888 6 6 3 0000 3 44 3 3 33333333333333333333 44 44 3 3 6 3 1 3 3 3 3333 3 7777 3 3 3 3 66 1 0 555555555 4 1 7 6 55 6 99999999999 111111 7 3 999 5 66 999999999999 999999 111 5 33333333333333333333333333 66666666 4 4 6 66 22 1 44 777 4 3 22 4 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 88888888888888888 5 77 222222222 444444 44444444 55 55 11111 222222222222222 8 4 55 2222 55 4 55 8888 55 6 4 99 55 88 888 4 222 55555555555 4 5 0 1111111111 66 66 000 5 5 444444444444444 0 5 5 5 5 77 5 5 5 77 333333 888888888888888888 0 5 1111111111111 4 555 5 5 5 6 5 11 44 00000000000 666 5 99999 5 333 5 1 6666666666666 22222 1 99999 6 3 55 6 6 8 1 9 777 99999999999999 3 0 2 66666 1 1 1 2 88 3 3 3
lowQualScore : . . . ... ... . . . . .. . . .. . . ... . . . . . . .. .... .. . . . . . ....... .... ......... ....... . ...... . . .... . .... ... ...... . ......... . ... . . .. . ..... .... .... ..... . . .. . .. . . ... . . . . .. . ........ . ... .. ... .. . ...... . ..... .. . ... . ... . .... . ...... . . .. . ............. .. .. . .. ......... . . . .............. . ... . .... .... . . .. . .. ...... ... . ....................... . . ........................................... ...... . .. .... . . . ........... .. ...... ..... ... .. ..... . . .. ........... . . . .... . .. . . .................... .. .. . . . . . . . . .... . .... . . . . .. . . ......... . . . . .. . ........... ...... . . ... . .. ............ ...... ... . .......................... ........ . . . .. .. . .. ... . . .. . ............................................................. ................. . .. ......... ...... ........ .. .. ..... ............... . . .. .... .. . .. .... .. . . .. .. .. ... . ... ........... . . . .......... .. .. ... . . ............... . . . . . .. . . . .. ...... .................. . . ............. . ... . . . . . .. .. ........... ... . ..... . ... . . ............. ..... . ..... . . .. . . . . . ... .............. . . . ..... . . . . .. . . .
lowQualScore : 0 0 4 888 888 4 4 4 4 88 0 0 55 6 6 444 6 6 6 6 9 9 99 7777 33 7 7 3 7 9 0000000 7777 555555555 7777777 6 555555 3 6 1111 6 7777 444 555555 6 555555555 6 444 6 2 66 3 22222 1111 8888 33333 3 0 66 3 66 3 3 222 3 7 3 3 66 6 11111111 2 888 22 111 66 3 666666 3 33333 99 7 777 6 000 6 7777 3 000000 0 6 55 3 1111111111111 99 11 4 99 999999999 0 0 0 99999999999999 4 111 8 6666 3333 4 4 11 4 99 111111 888 0 11111111111111111111111 2 0 6666666666666666666666666666666666666666666 222222 0 77 6666 1 1 1 88888888888 22 888888 77777 777 22 55555 5 1 22 88888888888 2 2 1 2222 1 22 1 1 55555555555555555555 22 22 1 1 2 1 0 1 3 3 5555 3 1111 3 3 3 3 88 4 7 777777777 0 1 4 7 88 7 33333333333 888888 5 7 444 7 44 111111111111 666666 111 9 66666666666666666666666666 11111111 4 4 9 11 66 1 66 888 4 9 00 4 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 66666666666666666 7 99 999999999 222222 77777777 44 55 66666 999999999999999 0 0 55 5555 55 0 55 5555 55 0 0 55 55 88 333 4 555 11111111111 5 0 0 8888888888 99 99 666 0 7 222222222222222 6 7 7 1 7 99 7 7 7 99 333333 999999999999999999 1 7 4444444444444 3 777 7 7 7 6 4 66 66 66666666666 999 7 00000 7 777 7 4 4444444444444 00000 5 33333 7 5 33 7 7 0 0 8 555 22222222222222 2 0 5 22222 0 0 0 5 00 3 3 3
consensus : GATG-GC-AACGA-AA---CCTTT---ATTGGAT-T-AT-A-GAGGCCAATT-AGCAGG-AT-T--AGT-GGG-T---ACA-ATAAACGAA-AGGATTC-A-A-TG-A--CCCC----TT--A-A-AGA-G-TTATTGC-CCCTT-------GAA----TTTT--AC----GATTTCTAT-G----TA-A------AATGGAAAAAA----CT-TG----AGAAC-CGTT-T----GTC-G---------TA-GAGGC---A-CGGGACCAACTGCAA--T-G--N--GA----T-C--AGTG-----AC-CTT-TGACCTT--G-AA--AA-T-TAG---G-T-CA-AGGT-CAAAGG--T-CAAG--------GTCATNT---A--AAAATT-CGAAA--AAA-TA---G-CA-T-----TT--TT-ATACCC--TCTTTCCT-AC---A-GG-A--GAT-A--N---CNTGAA--AACAT----T-TA-A---AGCNNAAGTATNCT-CATC--T-T--A----ATNG-GTNTCG-GCG-T-----A-ATNA-A-TTGCAA----TT--C-TGAAC-TTT-GA--C-C--T-T-A--TT---AGAANTA---C---A-AC--GA-T-TC-G-CGTCA-AAAA-TCTTGTTA-GC--GCTAC-C--TAAAAAT-CTT-GTTA-CG-CTACTCCTACTNAACCG-AAAGT----CAA-A-GA-GA--C-G----T-AA--A------A-----CCTT---CA--AT---G-ATT-T--A-----GTCA--CTA-T-AA-AA-CG-C-C--CTT-GC-AGTGA-G---A--ANT---------T--AACC--G-AAG-GGAT-CTA-ANGA-CCC-T-TAAAC-AT-A----GTTA-TT-G-C-CCCTG-AAAGTCT---A-----CA-ATATCGTTATTTT-AG--CC-TA---------T-AGC--T---TTNACATTA-ATC-AA-GATA--G--AG----TCA--T---GG-NACCACNTA-CA--G--T------TA-----G--ACCC--------TT-GA-CCTTNAAA--TT-AAGGTCAAG-GT---CA-AAGGTCAAGGTCAT-CAT----------------NA--AA-A--------T---T--------A-----T--TT-----GTCTTTAAG------A------A---T-ATTTTT--A---------AGGACA-A-T--AAAT--GT--CATTTGACC-C--TAAA-ATG-GACCTTT----A----CA----TCCTT-TT-T--G----A--CA-TATTT--AC----CTCCCTT--T-TG-AGAT--T--TT-TATGATATT---TA-AAATTT-ATTTT-T--T------TGA-T-ACTA---C------TA--AA--GAT---A-T-CAA--TG---------G-GACTTTCAG-CTTTC-AATC-TT--A-A-ATCATTG-ACC--TT-NA---TTTTTT----G-----T--C----AAGGT-CA-------------AAAGTC---AAGG-TC-ATTCA-TATNTTAAAAACGTTTTCAACATTTTC---A-CA-G-TAANA-TT-TTGAGGGT-A-G-ACGA-TAGGAAAT-TTT-CGTG-NCT---------TTTACACAGT---ACTGCATT-CG--C-GTTCATGAAATTTTCTAAAATTT-TTTA-AAAATCTT-TCGNATCCATTTTTTC---ACATT--------C-----CATATC-GGGTG----GGAAAGCCCTCTANTNGNTCGCCAAGACA-ATT-AGGAT-CACTAGT
Reference ( family-1352 ) : GATG-GC-AACGA-AA---CCTTT---ATTGGAT-T-AT-A-GAGGCCAATT-AGCAGG-AT-T--AGT-GGG-T---ACA-ATAAACGAA-AGGATTC-A-A-TG-A--CCCC----TT--A-A-AGA-G-TTATTGC-CCCTT-------GAA----TTTT--AC----GATTTCTAT-G----TA-A------AATGGAAAAAA----CT-TG----AGAAC-CGTT-T----GTC-G---------TA-GAGGC---A-CGGGACCAACTGCAA--T-G--N--GA----T-C--AGTG-----AC-CTT-TGACCTT--G-AA--AA-T-TAG---G-T-CA-AGGT-CAAAGG--T-CAAG--------GTCATNT---A--AAAATT-TGAAA--AAA-TA---G-CA-T-----TT--TT-ATACCC--TCTTTCCT-AC---A-GG-A--GAT-A--N---CNTGAA--AACAT----T-TA-A---AGCNNAAGTATNCT-CATC--T-T--A----ATNG-GTNTCG-GCG-T-----A-ATAA-A-TTGNAA----TT--C-TGAAC-TTT-GA--C-C--T-T-A--TT---AGAANTA---C---A-AC--GA-T-TC-G-CGTCA-AAAA-TCTTGTTA-GC--GCTAC-C--TAAAAAT-CTT-GTTA-CG-CTACTCCTACTNAACCG-AAAGT----CAA-A-GA-GA--C-G----T-AA--A------A-----CCTT---CA--AT---G-ATT-T--A-----GTCA--CTA-T-AA-AA-CG-C-C--CTT-GC-AGTGA-G---A--ANT---------T--AACC--G-AAG-GGAT-CTA-ANGA-CCC-T-TAAAC-AT-A----GTTA-TT-G-C-CCCTG-AAAGTCT---A-----CA-ATATCGTTATTTT-AG--CC-TA---------T-AGC--T---TTNACATTA-ATC-AA-GATA--G--AG----TCA--T---GG-NACCACNTA-CA--G--T------TA-----G--ACCC--------TT-GA-CCTTNAAA--TT-AAGGTCAAG-GT---CA-AAGGTCAAGGTCAT-CAT----------------NA--AA-A--------T---T--------A-----T--TT-----GTCTTTAAG------A------A---T-ATTTTT--A---------AGGACA-A-T--AAAT--GT--CATTTGACC-C--TAAA-ATG-GACCTTT----A----CA----TCCTT-TT-T--G----A--CA-TATTT--AC----CTCCCTT--T-TG-AGAT--T--TT-TATGATATT---TA-AAATTT-ATTTT-T--T------TGA-T-ACTA---C------TA--AA--GAT---A-T-CAA--TG---------G-GACTTTCAG-CTTTC-AATC-TT--A-A-ATCATTG-ACC--TT-NA---TTTTTT----G-----T--C----AAGGT-CA-------------AAAGTC---AAGG-TC-ATTCA-TATNTTAAAAACGTTTTCAACATTTTC---A-CA-G-TAANA-TT-TTGAGGGT-A-G-ACGA-TAGGAAAT-TTT-CGTG-NCT---------TTTACACAGT---ACTGCATT-CG--C-GTTCATGAAATTTTCTAAAATTT-TTTA-AAAATCTT-TCGNATCCATTTTTTC---ACATT--------C-----CATATC-GGGTG----GGAAAGCCCTCTANTNGNTCGCCAAGACA-ATT-AGGAT-CACTAGT
gi|1 : TG-GCTAACGG-AAAGACTCTT---ATTGGAT-T-AT-AAGACGCCAAT--ATCCGG-TT-TT-AGT-GGG-T---ACA-GAAAACGAA-AG-ATTC-A-A-TA-A--CCCC----TT--A-A-AGA-G-TTAT-GC-CCTAA-------CAA----TTTT--AC----GATTTCTTT-GG---TA-A------AATGGAAAAAAAAAACT-TG----AGGAA-CGTT-TAATAGTC-GGTGTTCTGTTATGCGGCCTCA-CGTGACCAACTGCAA--T-G--ATGGAATATT-A--AATG-----TG-CTTATGACCTTTCG-AATAAA-T-TAG---G-TTCATAGGT-CAAAAGGTT-CAAA--------GTCTTTT---T--CAAATT-ATCAT--AAA-TA---G-CA-T-----TT--TC-ACACCG--TCTTTTCT-TCT--A-GG-G--AAT-A--ATTCCTTAAACCATCAT----TATA-ATTCATCTAAAGTATTTT-AATCATT-T--ATATTATAA-ATCTTT-GCT-TTTTTAG-ATTA-A-TTGGAAATTTTT--C-TGAAC-TTT-GA--CTC--TCT-A--TTTTCCGAATTA---TTCGA-AT--GACT-TA-A-CGTCA-AAAAGCCTTGTTA--T--GCTAC-T--CAAA-----TT-TAAA-CG-TTAATT-TACACAAC----AAGT----CAT-A-TA-GAA-C-G----C-AA--ATTAATTA-----CCTTT--CA--ATTTTGTATT-TTTA-----ATTAACTTA-T-AAGAA-TT-C-C--CTTTGC-AGTGA-G---A--GTT---------T--A-CC--G-AAG-G-AT-CTA-TGGA-CCC-TCTAACC-ATTA----GTTA-CT-G-C-CC-TG-AAAGTCTTCCA-----TA-ATATCATTATCCT-AGGCCT-TA---------C-AGC--T---TTTACATTA-A-C-AATGATA--GCAAG----ACA--T---GG-A--CACTTG-CATAA--T------TA---------CCT--------TTTGA-CC-----A--TT-GACTTCA----T---CATAATGTCAAGGTCAT-CAT----------------CC--AA-A--------TATTT--------AATTTTT--TT-----ATTTTCAAGTCTTTTG------A---TGATTTTTTAA---------ATAACA-T-TTAAAATTAGT---ATTTGACT-C--TAAT-TTACGACTCTT----AATATCT----TCCTT-TT-T--G----A--CA-TATTT--AC----CTCCTTT--G-TG-AGAT--T--GT--ATGATATTAT-TA-AAATTT-AGTTT-T--T------TGA-T-ACTA---T------TA--CA--GAT---AAT-CA---TG---------G-CACTTGCAG-CTGTC-AATC-TT--A-A-ATCATTG-ACC--TTGGA---TATTTT----G-----T--C----AAGGTAAA-------------AAAGTCACAAGGG-TC-ATTCATTATGTT-AAAACACTTTCACCATTTTCTGGA-C--G-TAAA---T-TTGAGGGTGA-G-ACGC-TAGGAAATGTGT-TGTGTTCT---------TTTACACAGT---ACTACCTT-CGCAC-ATTCATGAAATTTCTTAAAATCTATTT----AATCTT-TTTTATCC-TTTTTTT---TCATTAATAAGTACAAAGAAATATCAGGGTGGGGAGGAAGGCCCTCAATTAGATT-TCAAG
gi|10 : caagtaatggttaattattcatctctaaatcgtcattgacccttattgaccccgctcttatttacttactgagttatgtgcttcctttccatataacgttgtataactatgcctctttaacttgttttcttctaattttagtagtgagatagt-T--AAAT--AT--TATTTGACT-C--TAAA-AAT-TACCTTT----A----AA----TCCTTCTT-T--G----A--CA-TATTTAAAC----CTCCCTTTGT-TGCAGAT--T--TT-ATTAGTATTTGATA-AAATTA-GTTTCAT--T------TGATT-ACTATTTT------TA--AA--TATAC-A-T-TAAATTG---------G-GACTTTCAG-C-TTC-AAAC-TTTGACA-ATCATTA-ACC--TT-GAAAGTTTTTT----G-----TCCC----AAGGT-CA-------------AAA-TC---AA-G-TC-ATTCA-TATTTTAAAAACATTTTCAAGATCTGG---A-CACT-TAACA-TT-TTGAGGGT-A-G-ACGACTAGGTAAT-CTTGCTTG-TCG---------TATACACAATTACACCG-GTT-CG--C-GTCC-TGAAATTTTCTAAA--TT-CCTATTAAATCTT-TCTCATCCTTTTTTTCCAAAAAGA--------C-----CA-ATC-GGGT-----GGAAAGCCATCTATTGGGTCGCCAAGACATATT-AGGATCCACTAGtctgcacaacgccgagaatataatggactcact
gi|11 : atCTT--T-GA--AA-T-TAG---G-T-CA-AGGT-CAA-GG--T-CAAG--------G-CATTC---A--AAAATC-TAAAACAAAACTG---G-CA-T-----TT--TC-ATACTG--TTTTTCCT-AC---A-AG-G--GAT-ACTT---CTTG-A--AACAT----T-TATA---AGCAGAAGTAT--T-CATC--TATA-A----ATTG-CTTTTT-GAT-T-----G-GAGA-A-TTG-AA----TTAACATGAACATTT-GA--C-
gi|13 : ACCTTC----AG---TA----TCCTT-TTGT--G----AACCA-TATTT--AC-----TCGGCT--T-TG-TGATGCC--TT-TATAATGTC----A-AACTTT-ATTTT-T--CATAGTATAA-TGACTA---TCCCA--TA--AA--GATTAAA-T-CCA--CGCTTCTATATG-G--TCTCAGGCTCTC-AATC-TT--A-A-ATCATTGAACCTGTT-AA---GTTGCT----GAAACATG-CAAAAAAGGT-CA-------------AAA--C---GAGC-TCAAATCA-AATATGA-----GTTTTCAACCTTTT-------A-A-TGATA-TT-TTGAGGGCAA-A-AAGA-TAAAGAAT-TAT-CGTT-ACC---------ATCAAACAG------TGCATA-GA--C-G---ATCAA---TTCTTAAACTT-TTTA-AAAAacatctataatttctgaatatacaatgagcaaacgatcgagataataaagttgtcataaatgaacgcgacatatcttgacacactcaaactagagactaagaaatgtcatagtggattctagcacaaatacctcttcagctgatttcgattactttaaaaaaatcacctt
gi|14 : T-GGGCT---ACC-TTAAGCAAA-AGGAATC-A-A-TG-G--CCCT----TT--ATG-ATA-G-TTATTGC-CCCTT-------
gi|14 : AG--------GTCATCT---A--AAA-TA-TGTAA--AAA-TA---G-CA-T-----TT--TT-ATAGCT--TC--TCCT-GC---A-GG-A--GAT-A--C---Cannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaggtcatctaaaatatgtaaaaatagcatttttatagcttctcctgcaggagatacc
gi|15 : tgggctaccttaagcaaaaggaatcaatggccctttatgatagttattgccccttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-TG-A--CCCC----TT--A-A-AGA-G-TCATTGC-CCCTT-------GAA----TTTT--A--------------------TA-A------AATGGACTAAA----AT-TA----AAAAC-CATT-T----GTC-A---------TA-GAGGC---A-CGCAACCAACTGCAA--T-G--T--GA----T-T--AGTG-----AC-CTT-TGACCTT--G-AA--AA-T------------A-AAGT-CAAAGG--T-CTAG--------GTCATAT---A--AAAATT-CG-AA--AAA-TA---T-CACT-----TT--TT-ATACCC--TTTTTCCT-AC---A-GG-A--GAT-A--G---CATGAA--AACGG----T-AT-A---TGCTCAAGTATTCT-CAT
gi|16 : ATTA---C-AA-GA--------------CA--T---GG-GGCAACCT------T--T------TA-----G--ACCC--------CT-AA-ACTTGAAA--AT-TAGGTCAAG-GT---CA-AAGATCA---TCAT-AAT----------------GATTAG-A--------T---T--------A-----TACAC-----ATTTTTAAG------ATGTTTTAGGTT-CTTTTC--A---------AATACA-G-T--GAAT--GG--C--TTGA-C-C--TAACTGTG-GAACTTT----A----GA----TCCCT-TT-T--A----A--TACCAGTT--A------TTCTCT--T-TG-ATAT--T--TT-gt
gi|17 : A--TG---------G-GACTTTCAG-CTTTCAAATCTTT--A-A-ATCATTG-ACC--TT--A---TTTTTTGGGGG-----T--C----AGGGT-CAGAGATCACAGTCGAAAGTC---AAGGTTC-ATTCA-TAT-TTAAAGACGTTTTCAACATTTGC---AGCT-GATAATG-TT-TATAGGGT-CTG-ACGC-TAGGAAAT-TTTGCGTG-TTTGTTTCGTTATTTACACAGT---TCT
gi|18 : --TAAGAAT-CTTTGTTATCA-CTATCCCTCTTTATCCG-TAAATG---CAA-T-GT-G---C-A----T-CA--A------A-----CCTTTT-CT--AT------TC-T--ATAGAGGTCA--TT--T-AA-AA--G-A-A--TTT-AT-AGGGA-C---A----T---------T--AAAC--A-AAA-AGAT-TCA-ATGG-CCC-T-TTAAG-AC-A----GTTA-TT-G-C-t
gi|18 : ttaattattacccaacgtcattgaccttagaccccttacagagtA-AA---CCTTTTCTATT---C-T-AT-A-GAGGTCATTT-AAAAGA-AT-T--TAT-AGG-G---ACA-TTAAACAAA-AAGATTC-A-A-TG-G--CCCT----TT--A-AGACA-G-TTATTGC-
gi|2 : ttaattattacccaacgtcattgaccttagaccccttacagagttaagaatctttgttatcactatccctctttatccgtaaatgcaatgtgcatc-TG-A--CCCC----TT--A-A-TGAAG-TTATTGC-CCTTTTCATAAAGAAACCCTTTTTAAC----TACTTCTCT-T----TA-ACTGATCAAT-GAGATGG----CTACG----ACAAC-C--T-T----ATT-G------------GATGC---A-TTAGATTAATAGCA-----G--G--GA----T-T--AGTG-----
gi|2 : tagggctttccacctttctgtcctggaaaagtctattgttagagttctgtttcttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttccgccgtcaaaaaacaattttcgtttgaagactatttcaaaaaactttatagttcatccatataggacatcttgagaaatgattaaagtatcaccaacgtcatgtgacctGATG-GC-TACGACAA---CCTT----ATTGGATGC-ATTA-GA--TTAAT--AGCAGGGAT-T--AGT-GGG-T---ACACACAAACGAACAGGATTC-ACA-TGGA--CCCC----TT--A-A-AGA-GGTTATTGC-CCCTT-------AAA----TTTT--AAAAAAGATTTCTAT-GGCTCTAGA------AATTGAAAAAA----CC-TG----AGAAC-CGTT------ATC-G---------TA-TGGGC---A-CGA-ACCAACTGCAA--TAG--A--GA----TGT--AGTG-----AC-CTT-TGACCTT--G-AA--AA-TCTAGT--G-T-CA-AGGTTCAAAGG--T-GAAG--------GTCAGTC---A--AAAATC-CTAAA--AA--T----G-CA-T-----TT--TC-ATACTT--T-TTTCCT-AC---A-GG-G--AAT-A--TT--CTTGAA--ACC------T-TA-A---AACAGAATCATA-T-CATA--T----A----ATTG-CTTTTTTGCA-T-----G-ATAC-A-TTGAAA----TT--C-TGAAC-TTT-GA--C-CCAT-T----TC---CGAATTA---C---A-AT--GA-C-TA-A-CGTCA-AAGC-T-TTATTACGC--GC-AC-T--CACAA---CTT-G------------------CAACCGAAAAGT----CAT-A-GA-GA--C-G----C-AA--A------A-----CCTT---CAGTAT---G-A-T-T--A--------A--CTA-T-AA-AA-AATC-C--CTT-GC-AGTGA-G---ATGATT---------T--AACC--G-ACA-GGAT-CTA-AGGA-CCC-T-TACAC-AT-A----GTTA-CT-GCC-CCCTG-AACATCT---------CATATATC--TGATTT-AT--CCATA---------C-AGC--T---TTTACATTA---CAAA-GATATCA--AG----ACA--T---GGATACTGGTTATTA--A--T------TACCCTTG--ACCT--------TT-GA-CCTT-ACA--TT-AAAGTCAAG-GT---CA-AA--TCAAGGTAAT-CATCACAAAACTTTGAAAAAA--AA-A--------T---TC-------A-----T--TTCAAA-GTCTTTTTG------A------A---T-ATATTT--A---------AATAAACA-T--AAAT--AG--TATTTGACC-TCATAAA-A---GACCTTTAATAA----TA----TCCTTGTT-T--G----A--CA-TATTT--AC----CTCCCTT--TGTG-AGAT--T--TC-TATTATATTA--TA-AAATTA-GTTTC-T--T------TGA-TGACTA---C------TATTAA--GAA---A-T-CAA--TT---------G-GACTTTCAG-CTTTT-AA-C-TT--A-ACATCATTA-ACT--TT-AA---TTTTTT----G-----T--C----AATGG-CA-------------ACAGTC---AAGG-TC-ATTCA-TATGTTTAAAACA-TTTCAACATTCTG---A-CA-C-TGAAA-TTATTGAGGGT-A-GTGCTA-T----AAT-GTG-CGTG-TCG---------ATT-CACA-T---ACTACCTT--G--CTGTCCATGAAATTTTCTAAATTCT-ATTA-AAACCTTT-TCGCATCCggtacacacaaacgaacaggattcacatggaccccttaaagaggttattgccccttaaattttaaaaaagatttctatggctctagaaattgaaaaaacctgagaaccgttatcgtatgggcacgaaccaactgcaatagagatgtagtgacctttgaccttgaaaatctagtgtcaaggttcaaaggtgaaggtcagtcaaaaatcctaaaaatgcattttcatacttttttcctacagggaatattcttgaaaccttaaaacagaatcatatcatataattgcttttttgcatgatacattgaaattctgaactttgacccatttccgaattacaatgactaacgtcaaagctttattacgcgcactcacaacttgcaaccgaaaagtcatagagacgcaaaaccttcagtatgattaactataaaaaatcccttgcagtgagatgatttaaccgacaggatctaaggacccttacacatagttactgccccctgaacatctcatatatctgatttatccatacagcttttacattacaaagatatcaagacatggatactggttattaattacccttgacctttgaccttacattaaagtcaaggtcaaatcaaggtaatcatcacaaaactttgaaaaaaaaattcatttcaaagtctttttgaatatatttaaataaacataaatagtatttgacctcataaaagacctttaataatatccttgtttgacatatttacctccctttgtgagatttctattatattataaaattagtttctttgatgactactattaagaaatcaattggactttcagcttttaacttaacatcattaactttaattttttgtcaatggcaacagtcaaggtcattcatatgtttaaaacatttcaacattctgacactgaaattattgagggtagtgctataatgtgcgtgtcgattcacatactaccttgctgtccatgaaattttctaaattctattaaaaccttttcgcatcc
gi|20 : tagggctttccacctttctgtcctggaaaagtctattgttagagttctgtttcttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttccgccgtcaaaaaacaattttcgtttgaagactatttcaaaaaactttatagttcatccatataggacatcttgagaaatgattaaagtatcaccaacgtcatgtgaccttgaccccttaatgaagttattgcccttttcataaagaaaccctttttaactacttctctttaactgatcaatgaT--G-AT--AA-T-TAAAGAG-C-CC-AGG--CAAAGG--TTCAAA--------GTCAT-T---A--AAAACT-C-AAA--AAA-TA---GGCA-T-----TT--TTCATACTG--TTTTTCCT-AC---A-GG-AT-AAT-AT-T---CTTGAA--ACGAT----TATA-A---AGCAGAAG
gi|21 : agtgcacatgtgagaaataattttgttgA-----G--ACCC--------TT-GA-CCTTTGAC--CT-----TCAAA-GT------AAGGTCCAAGTCAT-CAT----------------GA--AATA--------T---TTTCTTTTCA-----T--TTCTAAGGTCATTAAG------A------T---T-ATTTTT--A---------AGGACA-A-T--AAAT--AT--AATTTGACC-C--CAAA-ATG-GACCTTT----A----CA----CCC
gi|22 : catta-CTACTCCTACTAAACCA-AAAGT----CAA-A-AA-GA--A-A----T-GA--T------A-----CCTT---TT--AT---G-ATT-T--A-----GTCA--CTG-T-AG-AA-CA-C-C--CTT-GC-AATGA-C---A--AAT---------T--AATG--G-AAG-GGAT-ATG-ATGA-CCC-T-TAAAC-AT-A----GTTA-TC-G-C-CCCTa
gi|23 : AAGT----CAT-A-GA-GA--C-A----C-AA--A------A-----CCTT---CA--GT---G-ATG-T--A-----TTAA--CTA-T-AA-A--CA-CTC--CTT-GC-AGTGA-G---A--GTT---------T--AACC--G-AGG-GGAT-CCA-AGGA-CCC-T-TACAC-AT-A-----TTA-TT-G-C-CCCAG-AAAGTAT---C-----CA-ATATCATT
gi|24 : AAAAG-CTT-ATTA-TGGCTACTCCAACTGAAATG-AAAGT----CAT-A-GA-GA--A-G----A-AA--A------A-----CCTT---CA--AT---T-ATT-C--A-----TTAA--CTA-T-AA-AA-AT-C-C--TTT-GC-GGTGA-G---T--GTT---------T--AACC--G-AAA-GGAT-ATA-AGGA-C
gi|25 : T--TATTTGACT-C--TAAA-A-A-GACCTTC----A----TA----TTTTT-TT-T--TTTTTA--CA-TATTT--AC----TTCCCTT--TATG-AGAT--T--AT--ATGATATT---TATAAAGT---TTTC-T--T------TGA-T-CCTA---T------TA--AA--GATA--A-T-CAA--
gi|26 : -TG-A--CCCC----TT--A-C-GGA-G-TTATTG
gi|27 : ttcgtttcaagacttatcgaaagactttatccttcatcacataggacatctcgagaaatgatcgcatatcaccctgcatctttgacctt----TT--A-AGACA-G-TTATTGC-CCCT---------AA----TTTTTAAC----GATTTCTAA-G----TG-A------AACACATCAAA----CT-TG----AGACC-CGTT-A----ATC-G---------TA-TGGGT---T-CGGGACCAACTGCAA--T-G--G--GA----T-C--AGTG-----AC-CT
gi|28 : CT-C--TAAA-A-A-GACCTTA----A----TA----TCCTT-TT-T--G----G--TA-TATTT--AC----CTTTCTT--TGTG-AG-C--T--TT-TATGATATT---TA-AAATTT--TTTT-T--T------T-A-T-ACTA---CATGTATTA--AA--GAT---A-
gi|29 : TT-AAAAGA-ATGT--A-T-AGG-G---ACA-ATAAATGAA-AGGATTC-A-A-TG-G--CCGT----TT--A-AGACA-G-TTATTGC-CCCTT-------attg
gi|3 : aaatgcaatgtgcatcaaaccttttctaatGATG-GC-CAATA-AA---CTTTT---ATTGGAT-TCAT-G-GAGGCTAATT-AGCGCG-AT-TTGGGT-GGG-TGTGACA-ATAAACGAA-GGGATTC-A-A-TG-AGACCCT----TTTGA-A-CGAAG-TTATT-C-CCCTT-------GAA----TTTTT-AC----AATTTCTAT-G----TA-A------ATTGGGAGAAA----AC-TGTAAAAGAACGTATTCT----GTC-G---------TA-GAGGC---ATCGGGACCAATTGCAA--T-G--T--TA----T-CCCAGTGGNNNNNN-NNN-NNNNNNN--N-NN--NN-N-NNN---N-N-NN-NNNN-NNNNNN--N-NNNN--------NNNNNNN---N--NAAATT-TGAAA--AAA-TAT--A-CA-T-----TTA-TT-ATACCC--TCTTTCCTTAC---ACGG-AACGATTA--G---CATGAA--AACAT----T-TAGA---AGCT-AAGTATGCT-CATC--T-T--A----ATAG-GTA-CA-GTA-T-----A-ATAA-AATTACAA----TT--T-TGAA---TT-GA--C-C--TAT-AAATT---AGAAATA---C---A-AC--GA-TGTT-G-CATTA-AAAA-TCTT-TTA-GC--ACT--------------------TA-CT-CT--TACTACTAA--CA-AAAGT----CAA-A-AA-GA--C-A----T-AA--A------A-----ACCTGTACG--AT---G-ATT-T--A-----GTCA--CTGCT-AA-AA-CG-C-T--CTT-GC-AGTGACA---A--AAG---------T--AATG--G-AAG-G-AT-CTG-ATG---CC-T-TAAGCCAT-A----GTTA-TC-G-C-CC-TGCAAAATCTT--A-----CA-ACATCGTTGTTTTCAG--CT-TA---------TCAGC--T---TT-ATATTAGATC-AA-GATA--GC-AA----TCA--TTTGGG-AACCACATA-CA--G--T------AA-----G--ACCT--------TT-GA-CCTTCAAA--TTCAAGGTCAAG--T---AA-AAGGTCAAG-TCAT-CAT----------------TA--AA-A--------T---T--------A-----T--TT-----G-CTTTAAG------A------A---T-ATTTTT--A---------AGGACA-ACT--AAAT--GT--C--TTAACA-C--CAAA-GTG-GACCTTT----A----CA----TCCAT-TT-T--G----A--CA-CATT---AC----CTCCCCA--T-TG-AGAT--TGTTT-TTTGATATT---CA-AGATTTCATTTT-TATT------TCA-T-ACTA---C------TA--AAAAGAT---A-TGCAA--AG---------AAGATCATCAG-CTT-C-AAGC-TT--A-A-ATCAT-G-ACC--TT-TA---TTTTTT----GG----T--C----A--GT-CA-------------AAAGTCC--AAGG-TC-ATTC--TATTTTTAAAAAATTTTAAA-GTTTTC---A-CA-G-TAAGAGTT-TTGAG--T-A---ACGA-TATAAAAT-TTC-CGTG-ATT---------TTTACACAAT---ACTGCATTTCT--C-ATTCATATAATTTTCTAAAAATT-TTTA-AA--TTTTGTTGAATCCATTTTTAC---ACATT--------TT----CATATT-GG-TG----GGAAAGCCCTCTAATTGTTCGC--AAACA-ATTCAGGAT-CACTAGTat
gi|32 : cgttatttacacagttcttcttgacccttattacggacgttattggcctattcatataaaaatccttgttagatcacgtacttctctttaactgttcaatgtta-GGTA--G--AG----TC---T---GG-T--CAC-TA-CA--GGCT------T------G--AACC--------TT-GAATCTTGAAA--CTGAAGGTCAACTGT---CA-AAGGTCAACGTCAC-C-T----------------GA--AA-ta
gi|4 : GATG-GC-AATAA-AA---CTTTT---ATTGGAT-T-AT-G-GAGGCTAATT-AGCCGA-TT-T--GGT-GGG-T---ACA-ATAAACGAA-GGGATTC-A-A-TG-A--CCCT----TT--G-A-AGA-G-TTATTGC-CCCTT-------GAA----TTTT--AC----AATTTCTAT-G----TA-A------ATTGGAGAAAA----CT-TA----AGAAC-TATT-T----GTC-G---------TA-GAGGC---A-CGGGACCAATTGCAA--T-G--T--GA----T-C--AGTG-----AC-TTT-CGACCTT--G-AA--AA-T-TAG---G-T-CA-AGGT-CAAAGG--T-CAAG--------GTCATAT---A--TAAATT-TGAAA--AAA-TA---T-CA-T-----TT--TT-ATACCC--TCTTTCCT-AC---A-GG-A--GAT-A--G---CATGAA--AACAT----T-TA-A---AGCTCAAGTATGCT-CATC--T-T--A----ATAG-GTATCA-GTA-T-----A-ATAA-A-TTACAA----TT--T-TGAAC--TT-GA--C-C--T-TAA--TT---AGAAATA---C---A-AC--GA-T-TT-G-CATTA-AAAA-TCTTGTTA-GC--ACTAC-CCTNAAAAAT-CTT-GTTAGCA-CTACTCTTACTAAACCA-AAAGT----CAA-A-AA-GA--C-A----T-AA--A------A-----CCTT---CG--AT---G-ATT-T--A-----GTCA--CTG-T-AA-AA-CG-C-T--CTT-GC-AGTGA-C---A--AAG---------T--AATG--G-AAG-GGAT-CTG-ATGG-CCC-T-TAGCC-AT-A----GTTA-TC-G-C-CCCTG-AAAATCT---A-----CA-ACATCGTTATTTC-AG--CC-TA---------T-AGC--T---TTGATATTA-ATC-AA-GATA--G--AA----TCA--T---GG-GACCACATA-CA--G--T------CA-----G--ACCT--------TT-GA-CCTTCAAA--TT-AAGGTCAAG-GT---CA-AAGGTCAAGGTCAT-CAT----------------TA--AA-A--------T---T--------A-----T--TT-----GTCTTTAAG------A------A---T-ATTTTT--A---------AGGACA-A-T--AAAT--GT--CATTTAACA-C--CAAA-GTG-GACCTTT----A----CA----TCCAT-TT-T--G----A--CA-CATTT--AC----CTCCCCA--T-TG-AGATG-T--TT-TTTGATATT---CA-AGATTT-ATTTTAT--T------TCA-T-ACTA---C------TA--AA--GAT---A-T-CAA--AG---------A-GATCATCAG-CTTTC-AATC-TT--A-A-ATCATTG-ACC--TT-TA---TTTTTT----G-----T--C----AAGGT-CA-------------AAAGTC---AAGG-TC-ATTCA-TATTTTAAAAACATTTTAAAGTTTTTC---A-CA-G-TAAGA-GT-TTGAGGGT-A-A-ACGA-TAATAAAT-TTC-CGTG-ATT---------TTTACACAAT---ACTGCATT-CT--C-ATTCATATAATTTTCT-AAATTT-TTTA-AAAATCTT-TTGAATCCATTTTTTC---ACATT--------T-----CATATT-TGGT-----GGAAAGCCCTCTAATTGTTCGC--AAACA-ATT-AGGAT-CACTAGT
gi|5 : -TGACC-TTC-GA--C-C--T-C-C--TT---AGAAA--------------------------GTTATAAAC-CCTTGT----------A-----TAAAAATTCTT-GTTAGCA-CTACTCCTCTTGAACTG-----T----CAA-ATGC-GA--T-GGCAAT-GA--A------A-----ACTT---TA--TT---G-AAT-T--A------------TA-T-AG-----G-C-CAATTA-GC-AG-GA-A---T--AGTGGGGTACAAT--AAAC--G-AAA-GGATTCAA-ATGA-CCCCT-TAAAA-GT------GTTA-TT-G-CACCCTT-GAATTTT---A-----CG-AT-------TTTT-CT--CC-TAATAAAAAGAT-AGCAAT---TTCG-------TC-A----TA--G--AG----GCAAAT---GG-TACCGACTG-TA--A--TGGTTGATA-----GTAACCC--------TT-TA-CCTTGAAAAATT-CAG-TCAAG-GT---CA-AAGGTCAAGGTCATACAA----------------GA--AA-A--------T---
gi|5 : tgttagggctttctacctttctgtggaaagtcccaattgttatgttcagtttaattattattttcctgtagttcaaaaatcgttttttgtttgaaagaccttattgatagaacctcctctacatcattaaatagtacttctcgagaatcgatcaaatttaacctcaacgttatGATG-GC-AATGA-AA---ACTTT---ATTGAAT-T-AT-A-TAGGCCAATT-AGCAGG-AA-T--AGTGGGG-T---ACA-ATAAACGAA-AGGATTCAA-A-TG-A--CCCC----TTA-A-A-AGT-G-TTATTGCACCCTT-------GAA----TTTT--AC----GATTTTTCTCC----T---------AAT--AAAAA---------G----ATAGC-AATT-TC---GTC-A---------TA-GAGGCAA-A-TGGTACCGACTGTAA--T-GGTT--GA----T----AGTA-----AC-CCT-TTACCTT--GAAA--AA-T-TCA---G-T-CA-AGGT-CAAAGG--T-CAAG--------GTCATAC---AAGAAAATG-TGAAA--AAA-T----G-CA-T-----TT--TT-TAATCA--TCTTTCCT-GC---A-GGAA--GATAA--C---CATTAA--AACAT----C-AT-A---TGCTCAAGTAT-CT-CATC--C-TACA----ATAG-GTCTCA-GTG-T-----A-TAAA-A-TTATAA----TC--C-CGAAC-TTT-GAACC-T--T-T-G--TT---AGAAATA---C---A-AA--GA-T-TC-G-CAT-A-A---------------------------AAAAAT-CTT-GTTA-CA-CTACTCCTACATAACCA-AAAAG----CAA-A-GA-GA--CAA----T-GA--A------A-----CATT---CA--AT---T--TT-T--A-----GTCAC-CTG-TAAA-AA-CA-C-C--TTG-AA-AGTGA-GA--A--AAT---------T--AACG--G-AAG-GGAT-CTGTATGC-CTC-T-TTACT-TT-A----GTTA-TT-G-C-CCCTG-CAAGTCT---AC----CA-ACATCgtgaaaaaatgcattttttaatcatctttcctgcaggaagataaccattaaaacatcatatgctcaagtatctcatcctacaataggtctcagtgtataaaattataatcccgaactttgaacctttgttagaaatacaaagattcgcataaaaaaatcttgttacactactcctacataaccaaaaagcaaagagacaatgaaacattcaatttttagtcacctgtaaaaacaccttgaaagtgagaaaattaacggaagggatctgtatgcctctttactttagttattgcccctgcaagtctaccaacatc
gi|6 : tgttagggctttctacctttctgtggaaagtcccaattgttatgttcagtttaattattattttcctgtagttcaaaaatcgttttttgtttgaaagaccttattgatagaacctcctctacatcattaaatagtacttctcgagaatcgatcaaatttaacctcaacgttattgaccttcgacctccttagaaagttataaacccttgtataaaaattcttgttagcactactcctcttgaactgtcaaatgcAA--T-G--G--GA----T-C--AGTG-----TCTCTT-TGACCTT--A-AA--AAAT-TAG---GGTGCA-AGGT-CAAAGGG-T-CACGCGTTGTTAGCCATTTTCTATTACAATTATCAAA--TAA-TAATTG-CA-TGCTTGTTCATC-ATACTCGTTCTTTCCT-ACTCGA-GG-G--AAT-A--TGGCCTT--A--AACATGATTC-TA-T---AGCAAAAGTATG-T-AGGA--T-A--A----ATTGCGTATCA-GCA-T-----AGATCACA-TTG-AA----TT--C-TGAAC-TTTTGA--C-C--T-A-T--TT---CCGATTAACTC---ACACTGGA-C-TA-AACGTCA-AAAA-GCTT-TTA-ATCTGCTAC-A--TA------------T--CG-CGAG----ACTGAAACG-AAAGTGTAGCGATA-GA-GAGTC-A----TCAA--A------AGAGGTCCTT---CA---T---A-A------A--------A--CTA-T-AA-AAACC-C-C--TTT-GC-AGTGA-G---G--AGT---------TTAAACC--GGAAGAGGATACCA-AGGA-CCC-T-TACAC-AT-AAGCGGTTA-TTAG-C-CCCTG-GAAATAG---AATTCCCA-ATTCCATTATATT-AGG-CC-TA---------T-ACC--TCTCTTAGCATTA---C-AC-GATA--G--AGGACATCG--G---GG-CACCACTTAGTT--G--T------TA-----C--ACCCCCTTGAGCTT-GA-CCTTCAA----T-AAGGTCAAC-GCGTACA-AA---CA--GACAT-CAT----------------CA--AA-AAGCTTAGTT---T--------A-----T--TT-----ATCTTCCAA------AT-----G---T-CTCTTT--AGAATTAAAGAGGACA-T-TT-AAAC--ATAATATATGACCAT--TAAA-A---GAC--TC----G----CAATAGTCCTC-TT-TCCGC---A--CA-ATTTT--ACTTGGCTCTCTT--TGTG-AAGT--T--TTCTATGATATT---TA-
gi|7 : gATGAGC-ATCGA-AA---TTTTT----CTGTCT-G-AT-A-GAGGTCATTTTAGAAGA-AT-G--AAT-AGG-T---ACG-TAAAAC--A-GGGATTC-A-AATG-G--CCATAAATTT--A-GGAAA-G-TTATT-T-CCCTT-------G------TTTT--ACCT--AATTCTTAAAG----TA-A------AACACGTGAAA----CT-CG----AGAAT-CATT-A----ATCCG---------TA-CAGG--------GAACTAACTGGAAAAT-G--G--GA----T-T--AGAG-----ACACTT-TGGCCTT--G-AA--AA-T-TGG---G-T-CA--GGT-CAAA--------------------TATGT---A--AAAATT--GACA--A-----------------------TT-GT------TCT-----------G-AG-A--GAT-A--C---CCTCAA--A-CAT----G-AT-A---AGCATAAGTATTTTTCATC--T-T--A----ATTA-GTATCG-GCGGT-----A-ATTA---TTACAAA---TT--T-TGAAC-TTT-GA--C-C--T-C-A--TC---AGAACTA---C---G-AT--GA-T-TTTG-TGTCA-AAAA-T--TGTTA-GT--GCTACTC--TAGGAA-------------------------GAACCT-AAAGT----CAA-A-GACGA--C-A----T-AT--A------A-----ACTT---CA--AC---G-ATT-T--A-----TTCA--CAA-TAAA-AA-TA-T-C--CTT-ACGAGTAG-G---A--GAT---------T--AACCCGA-AAG-GGAT-GTA-AAGA-CCC------AC--T-A----GTTATTT-G-C-CCCTG--AAGTAT---C-----CA-GTATCATttgcttaatatatattaa
gi|8 : caca--TAAAAAC---T-GTTAGCA-CTACTCTTTTTTAACTG-----T----CAA-C-GA-GA--T-GG---C-AATGA------A-----CCTT---TA--TT---GGATTAT--A-----GAGG--CTAAT-TA-GC-CG-G-T--CT-----AGTGG-GTACA--A-----------T--AAAC--G-AAG-GGAT-TCA-ATGACCCC-T-TAA---AG-A----GTT--TT-G-C-CCCTT-GAATTTT---A-----CA-ATTTCa
gi|8 : aggcttttccaaccttctgtggaaagtcctattggatattgttctttctgcgtcaaatgctttttttgttgttgaagacgtttattggaaaaaattatactacttcaaatcatataagtacttctctcgagaatgtcgtcaatatatcaccccaacgtcatttgacctttgatcccttatacggaagttattggtctttgttaGATG-GC-AATGA-A----CCTTT---ATTGGAT-T-AT-A-GAGGCTAATT-AGCCGG-TC-T--AGT-GGG-T---ACA-ATAAACGAA-GGGATTC-A-A-TG-A--CCCC----TT--A-A-AGA-G-TT-TTGC-CCCTT-------GAA----TTTT--AC----AATTTCTAT-G----TA-A------AATGGAAAAAAAAA-CT-TA----AGAAC-AATT-T----CTC-G---------CA-GAGAC---A-CGGGAATAACTGCAA--T-G--T--AA----T-C--AGTG-----AC-CTT-TGACCTT--G-AA--AA-T-TAG---G-T-C---------AAGG--T-CAAG--------GTCATAT---A--GAAATT-TGAAA--AAA-TA---T-CA-T-----TT--TGAATACCC--TCTTTtatgtaaaatggaaaaaaaaacttaagaacaatttctcgcagagacacgggaataactgcaatgtaatcagtgacctttgaccttgaaaattaggtcaaggtcaaggtcatatagaaatttgaaaaaatatcattttgaataccctcttt
gi|9 : aggcttttccaaccttctgtggaaagtcctattggatattgttctttctgcgtcaaatgctttttttgttgttgaagacgtttattggaaaaaattatactacttcaaatcatataagtacttctctcgagaatgtcgtcaatatatcaccccaacgtcatttgacctttgatcccttatacggaagttattggtctttgttataaaaactgttagcactactcttttttaactgtcaacgaGATG-GT-AACAT-GA---CCTTT---ATTGAAT-T-AT-A-GAGGTTAATT-AGGAGG-AT-T--AGT-GGG-T---ACA-ATAAACAAA-AGGATTC-A-A-TG-A--CCCC----TT--A-A-AGA-G-TTATTGC-CCCTG-------AAA----TTTT--AC----GATTTCTAA-G----TA-A------AATGGAAAAAA----CT-TG----AGAAC-CGTT-A----ATC-G---------TA-TAGGC---A-CGGAACCAACTGCAA--T-G--A--GA----T-T--AGTG-----AT-CTT-TGACCTT--G-AA--AA-T-TAA---G-T-CA-AGGT-
7 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|12 ): NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTATTTTTCTGCCATGAAAAAAATATGTTTGAAGACTTGTCGAAACACTTCATAATTCATCACATAGCACATCTCCAGAAACGATCACATATCACCCAACGCGATTGACCTTTGACTCCTCCCGGAGTTTTGAACTTTGTGTAAGAATCCTTGTTAGCACTGATCCTCTTTATCCATTAATGCAATGAACATAAAACCTTTTCTTTTCTATAGAAGTCATAGAGAAGAATCGATAGGTACATTA
Unaligned ( gi|19 ): ATTAGGGCTTTCCATCTTACTGTGGAAAGTCCTATTGCTTTTCTTCTGTTTCTTCTTAATATTTTTCAGCCGTCAAAAAAAATTTCATTTCAAGACTTTATAATTCATCATATAGGAAATCTCGAGAAATGAATAATTATATCACCCAACGTCATTGAACTTTGACCC
Unaligned ( gi|30 ): AGGACTTTCCACCTTCTTGTGGAAAGTCCTATTGTTACAATTGTTCTGTTATTATTTTCCTGTCGTCAAAATAAAGTTTCGTTTCAAGACT
Unaligned ( gi|31 ): ATTGGTTTCCACCTTCCTGTGGAGAATCCTAATGTTCTTGCTGTGTTTCTTATCATTTTCCTGCCGTCAAAAGAAAACTCGTTCCAACAC
Unaligned ( gi|33 ): AATAGCATTTTTCATATTTTTTTTTCAATAGGAAGATATATATTGAAACCATCTAAAGTAGAA
Unaligned ( gi|34 ): GGGCTTTCCACCTTTCAGTGTTATTGTTATTGTTCTGTT
Unaligned ( gi|35 ): TAGGGCTTTCCACCTCCCTATGGAAAGTCCTATNN
Alignments
lowQualScore : 1 1111111 111111111 1111111 111111 1111 111111 111111111 111 11111 1111 11111111 11111 1111 111 222222 1111111111111 11 111111111111 1 1111111111 1 1111 222222 22222222222222222222222 6666666666666666666666666666666666666666666 11111111111 111 11111 11111111111 1111 22222222222222222222 222222222 11 22222222222 111111 222 111111111111 111 33333333333333333333333333 11111111 11 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 33333333333333333 222222222 111111 11111111 22222 111111111111111 1111 1 111 111 11111111111 1 3333333333 222 222222222222222 111111 222222222222222222 3333333333333 111 22222222222 11111 1 2222222222222 11111 11111 111 66666666666666 1 33333 11 1 1 1
lowQualScore : 5 5 4 777 777 4 4 4 4 44 4 4 99 3 3 666 3 3 3 3 2 2 33 5555 66 2 0 5 2 2 0000000 7777 444444444 5555555 3 000000 4 0 4444 3 7777 444 777777 3 444444444 3 111 3 1 44 3 00000 7777 0000 88888 7 4 44 3 44 3 3 999 3 6 3 3 88 3 22222222 4 555 99 3 33333 3 44 3 3 0000 3 88888 77 6 777 3 000 3 8888 7 666666 1 1 55 3 9999999999999 55 77 4 888888888888 1 0 1 7 4444444444 1 777 0 5555 7777 4 4 66 4 66 555555 888 1 33333333333333333333333 2 5 9999999999999999999999999999999999999999999 555555 1 66 9999 3 3 3 66666666666 44 888888 77777 222 44 00000 0 3 44 88888888888 6 6 3 0000 3 44 3 3 33333333333333333333 44 44 3 3 6 3 1 3 3 3 3333 3 7777 3 3 3 3 66 1 0 555555555 4 1 7 6 55 6 99999999999 111111 7 3 999 5 66 999999999999 999999 111 5 33333333333333333333333333 66666666 4 4 6 66 22 1 44 777 4 3 22 4 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 88888888888888888 5 77 222222222 444444 44444444 55 55 11111 222222222222222 8 4 55 2222 55 4 55 8888 55 6 4 99 55 88 888 4 222 55555555555 4 5 0 1111111111 66 66 000 5 5 444444444444444 0 5 5 5 5 77 5 5 5 77 333333 888888888888888888 0 5 1111111111111 4 555 5 5 5 6 5 11 44 00000000000 666 5 99999 5 333 5 1 6666666666666 22222 1 99999 6 3 55 6 6 8 1 9 777 99999999999999 3 0 2 66666 1 1 1 2 88 3 3 3
lowQualScore : . . . ... ... . . . . .. . . .. . . ... . . . . . . .. .... .. . . . . . ....... .... ......... ....... . ...... . . .... . .... ... ...... . ......... . ... . . .. . ..... .... .... ..... . . .. . .. . . ... . . . . .. . ........ . ... .. . ..... . .. . . .... . ..... .. . ... . ... . .... . ...... . . .. . ............. .. .. . ............ . . . . .......... . ... . .... .... . . .. . .. ...... ... . ....................... . . ........................................... ...... . .. .... . . . ........... .. ...... ..... ... .. ..... . . .. ........... . . . .... . .. . . .................... .. .. . . . . . . . . .... . .... . . . . .. . . ......... . . . . .. . ........... ...... . . ... . .. ............ ...... ... . .......................... ........ . . . .. .. . .. ... . . .. . ............................................................. ................. . .. ......... ...... ........ .. .. ..... ............... . . .. .... .. . .. .... .. . . .. .. .. ... . ... ........... . . . .......... .. .. ... . . ............... . . . . . .. . . . .. ...... .................. . . ............. . ... . . . . . .. .. ........... ... . ..... . ... . . ............. ..... . ..... . . .. . . . . . ... .............. . . . ..... . . . . .. . . .
lowQualScore : 0 0 4 888 888 4 4 4 4 88 0 0 55 6 6 444 6 6 6 6 9 9 99 7777 33 7 7 3 7 9 0000000 7777 555555555 7777777 6 555555 3 6 1111 6 7777 444 555555 6 555555555 6 444 6 2 66 3 22222 1111 8888 33333 3 0 66 3 66 3 3 222 3 7 3 3 66 6 11111111 2 888 22 3 99999 3 66 3 3 9999 3 33333 99 7 777 6 000 6 7777 3 000000 0 6 55 3 1111111111111 99 11 4 666666666666 0 0 0 4 4444444444 0 111 8 6666 3333 4 4 11 4 99 111111 888 0 11111111111111111111111 2 0 6666666666666666666666666666666666666666666 222222 0 77 6666 1 1 1 88888888888 22 888888 77777 777 22 55555 5 1 22 88888888888 2 2 1 2222 1 22 1 1 55555555555555555555 22 22 1 1 2 1 0 1 3 3 5555 3 1111 3 3 3 3 88 4 7 777777777 0 1 4 7 88 7 33333333333 888888 5 7 444 7 44 111111111111 666666 111 9 66666666666666666666666666 11111111 4 4 9 11 66 1 66 888 4 9 00 4 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 66666666666666666 7 99 999999999 222222 77777777 44 55 66666 999999999999999 0 0 55 5555 55 0 55 5555 55 0 0 55 55 88 333 4 555 11111111111 5 0 0 8888888888 99 99 666 0 7 222222222222222 6 7 7 1 7 99 7 7 7 99 333333 999999999999999999 1 7 4444444444444 3 777 7 7 7 6 4 66 66 66666666666 999 7 00000 7 777 7 4 4444444444444 00000 5 33333 7 5 33 7 7 0 0 8 555 22222222222222 2 0 5 22222 0 0 0 5 00 3 3 3
consensus : GATG-GC-AACGA-AA---CCTTT---ATTGGAT-T-AT-A-GAGGCCAATT-AGCAGG-AT-T--AGT-GGG-T---ACA-ATAAACGAA-AGGATTC-A-A-TG-A--CCCC----TT--A-A-AGA-G-TTATTGC-CCCTT-------GAA----TTTT--AC----GATTTCTAT-G----TA-A------AATGGAAAAAA----CT-TG----AGAAC-CGTT-T----GTC-G---------TA-GAGGC---A-CGGGACCAACTGCAA--T-G--N--GA----T-C--AGTG-----AC-CTT-TGACCTT--G-AA--AA-T-TAG---G-T-CA-AGG-TCAAAGG--T-CAAG--------GTCATNT---A--AAA-ATT--CGAA-A--A-AA-TA-G-CA-T-----TT--TT-ATACCC--TCTTTCCT-AC---A-GG-A--GAT-A--N---CNTGAA--AACAT----T-TA-A---AGCNNAAGTATNCT-CATC--T-T--A----ATNG-GTNTCGGCG-T-----A-ATNA-A-TTGCAA----TT--C-TGAAC-TTT-GA--C-C--T-T-A--TT---AGAANTA---C---A-AC--GA-T-TC-G-CGTCA-AAAA-TCTTGTTA-GC--GCTAC-C--TAAAAAT-CTT-GTTA-CG-CTACTCCTACTNAACCG-AAAGT----CAA-A-GA-GA--C-G----T-AA--A------A-----CCTT---CA--AT---G-ATT-T--A-----GTCA--CTA-T-AA-AA-CG-C-C--CTT-GC-AGTGA-G---A--ANT---------T--AACC--G-AAG-GGAT-CTA-ANGA-CCC-T-TAAAC-AT-A----GTTA-TT-G-C-CCCTG-AAAGTCT---A-----CA-ATATCGTTATTTT-AG--CC-TA---------T-AGC--T---TTNACATTA-ATC-AA-GATA--G--AG----TCA--T---GG-NACCACNTA-CA--G--T------TA-----G--ACCC--------TT-GA-CCTTNAAA--TT-AAGGTCAAG-GT---CA-AAGGTCAAGGTCAT-CAT----------------NA--AA-A--------T---T--------A-----T--TT-----GTCTTTAAG------A------A---T-ATTTTT--A---------AGGACA-A-T--AAAT--GT--CATTTGACC-C--TAAA-ATG-GACCTTT----A----CA----TCCTT-TT-T--G----A--CA-TATTT--AC----CTCCCTT--T-TG-AGAT--T--TT-TATGATATT---TA-AAATTT-ATTTT-T--T------TGA-T-ACTA---C------TA--AA--GAT---A-T-CAA--TG---------G-GACTTTCAG-CTTTC-AATC-TT--A-A-ATCATTG-ACC--TT-NA---TTTTTT----G-----T--C----AAGGT-CA-------------AAAGTC---AAGG-TC-ATTCA-TATNTTAAAAACGTTTTCAACATTTTC---A-CA-G-TAANA-TT-TTGAGGGT-A-G-ACGA-TAGGAAAT-TTT-CGTG-NCT---------TTTACACAGT---ACTGCATT-CG--C-GTTCATGAAATTTTCTAAAATTT-TTTA-AAAATCTT-TCGNATCCATTTTTTC---ACATT--------C-----CATATC-GGGTG----GGAAAGCCCTCTANTNGNTCGCCAAGACA-ATT-AGGAT-CACTAGT
Reference ( family-1352 ) : GATG-GC-AACGA-AA---CCTTT---ATTGGAT-T-AT-A-GAGGCCAATT-AGCAGG-AT-T--AGT-GGG-T---ACA-ATAAACGAA-AGGATTC-A-A-TG-A--CCCC----TT--A-A-AGA-G-TTATTGC-CCCTT-------GAA----TTTT--AC----GATTTCTAT-G----TA-A------AATGGAAAAAA----CT-TG----AGAAC-CGTT-T----GTC-G---------TA-GAGGC---A-CGGGACCAACTGCAA--T-G--N--GA----T-C--AGTG-----AC-CTT-TGACCTT--G-AA--AA-T-TAG---G-T-CA-AGG-TCAAAGG--T-CAAG--------GTCATNT---A--AAA-ATT--CGAA-A--A-AA-TA-G-CA-T-----TT--TT-ATACCC--TCTTTCCT-AC---A-GG-A--GAT-A--N---CNTGAA--AACAT----T-TA-A---AGCNNAAGTATNCT-CATC--T-T--A----ATNG-GTNTCGGCG-T-----A-ATNA-A-TTGCAA----TT--C-TGAAC-TTT-GA--C-C--T-T-A--TT---AGAANTA---C---A-AC--GA-T-TC-G-CGTCA-AAAA-TCTTGTTA-GC--GCTAC-C--TAAAAAT-CTT-GTTA-CG-CTACTCCTACTNAACCG-AAAGT----CAA-A-GA-GA--C-G----T-AA--A------A-----CCTT---CA--AT---G-ATT-T--A-----GTCA--CTA-T-AA-AA-CG-C-C--CTT-GC-AGTGA-G---A--ANT---------T--AACC--G-AAG-GGAT-CTA-ANGA-CCC-T-TAAAC-AT-A----GTTA-TT-G-C-CCCTG-AAAGTCT---A-----CA-ATATCGTTATTTT-AG--CC-TA---------T-AGC--T---TTNACATTA-ATC-AA-GATA--G--AG----TCA--T---GG-NACCACNTA-CA--G--T------TA-----G--ACCC--------TT-GA-CCTTNAAA--TT-AAGGTCAAG-GT---CA-AAGGTCAAGGTCAT-CAT----------------NA--AA-A--------T---T--------A-----T--TT-----GTCTTTAAG------A------A---T-ATTTTT--A---------AGGACA-A-T--AAAT--GT--CATTTGACC-C--TAAA-ATG-GACCTTT----A----CA----TCCTT-TT-T--G----A--CA-TATTT--AC----CTCCCTT--T-TG-AGAT--T--TT-TATGATATT---TA-AAATTT-ATTTT-T--T------TGA-T-ACTA---C------TA--AA--GAT---A-T-CAA--TG---------G-GACTTTCAG-CTTTC-AATC-TT--A-A-ATCATTG-ACC--TT-NA---TTTTTT----G-----T--C----AAGGT-CA-------------AAAGTC---AAGG-TC-ATTCA-TATNTTAAAAACGTTTTCAACATTTTC---A-CA-G-TAANA-TT-TTGAGGGT-A-G-ACGA-TAGGAAAT-TTT-CGTG-NCT---------TTTACACAGT---ACTGCATT-CG--C-GTTCATGAAATTTTCTAAAATTT-TTTA-AAAATCTT-TCGNATCCATTTTTTC---ACATT--------C-----CATATC-GGGTG----GGAAAGCCCTCTANTNGNTCGCCAAGACA-ATT-AGGAT-CACTAGT
gi|1 : TG-GCTAACGG-AAAGACTCTT---ATTGGAT-T-AT-AAGACGCCAAT--ATCCGG-TT-TT-AGT-GGG-T---ACA-GAAAACGAA-AG-ATTC-A-A-TA-A--CCCC----TT--A-A-AGA-G-TTAT-GC-CCTAA-------CAA----TTTT--AC----GATTTCTTT-GG---TA-A------AATGGAAAAAAAAAACT-TG----AGGAA-CGTT-TAATAGTC-GGTGTTCTGTTATGCGGCCTCA-CGTGACCAACTGCAA--T-G--ATGGAATATT-A--AATG-----TG-CTTATGACCTTTCG-AATAAA-T-TAG---G-TTCATAGG-TCAAAAGGTT-CAAA--------GTCTTTT---T--CAA-ATT--ATCA-T--A-AA-TA-G-CA-T-----TT--TC-ACACCG--TCTTTTCT-TCT--A-GG-G--AAT-A--ATTCCTTAAACCATCAT----TATA-ATTCATCTAAAGTATTTT-AATCATT-T--ATATTATAA-ATCTTTGCT-TTTTTAG-ATTA-A-TTGGAAATTTTT--C-TGAAC-TTT-GA--CTC--TCT-A--TTTTCCGAATTA---TTCGA-AT--GACT-TA-A-CGTCA-AAAAGCCTTGTTA--T--GCTAC-T--CAAA-----TT-TAAA-CG-TTAATT-TACACAAC----AAGT----CAT-A-TA-GAA-C-G----C-AA--ATTAATTA-----CCTTT--CA--ATTTTGTATT-TTTA-----ATTAACTTA-T-AAGAA-TT-C-C--CTTTGC-AGTGA-G---A--GTT---------T--A-CC--G-AAG-G-AT-CTA-TGGA-CCC-TCTAACC-ATTA----GTTA-CT-G-C-CC-TG-AAAGTCTTCCA-----TA-ATATCATTATCCT-AGGCCT-TA---------C-AGC--T---TTTACATTA-A-C-AATGATA--GCAAG----ACA--T---GG-A--CACTTG-CATAA--T------TA---------CCT--------TTTGA-CC-----A--TT-GACTTCA----T---CATAATGTCAAGGTCAT-CAT----------------CC--AA-A--------TATTT--------AATTTTT--TT-----ATTTTCAAGTCTTTTG------A---TGATTTTTTAA---------ATAACA-T-TTAAAATTAGT---ATTTGACT-C--TAAT-TTACGACTCTT----AATATCT----TCCTT-TT-T--G----A--CA-TATTT--AC----CTCCTTT--G-TG-AGAT--T--GT--ATGATATTAT-TA-AAATTT-AGTTT-T--T------TGA-T-ACTA---T------TA--CA--GAT---AAT-CA---TG---------G-CACTTGCAG-CTGTC-AATC-TT--A-A-ATCATTG-ACC--TTGGA---TATTTT----G-----T--C----AAGGTAAA-------------AAAGTCACAAGGG-TC-ATTCATTATGTT-AAAACACTTTCACCATTTTCTGGA-C--G-TAAA---T-TTGAGGGTGA-G-ACGC-TAGGAAATGTGT-TGTGTTCT---------TTTACACAGT---ACTACCTT-CGCAC-ATTCATGAAATTTCTTAAAATCTATTT----AATCTT-TTTTATCC-TTTTTTT---TCATTAATAAGTACAAAGAAATATCAGGGTGGGGAGGAAGGCCCTCAATTAGATT-TCAAG
gi|10 : caagtaatggttaattattcatctctaaatcgtcattgacccttattgaccccgctcttatttacttactgagttatgtgcttcctttccatataacgttgtataactatgcctctttaacttgttttcttctaattttagtagtgagatagt-T--AAAT--AT--TATTTGACT-C--TAAA-AAT-TACCTTT----A----AA----TCCTTCTT-T--G----A--CA-TATTTAAAC----CTCCCTTTGT-TGCAGAT--T--TT-ATTAGTATTTGATA-AAATTA-GTTTCAT--T------TGATT-ACTATTTT------TA--AA--TATAC-A-T-TAAATTG---------G-GACTTTCAG-C-TTC-AAAC-TTTGACA-ATCATTA-ACC--TT-GAAAGTTTTTT----G-----TCCC----AAGGT-CA-------------AAA-TC---AA-G-TC-ATTCA-TATTTTAAAAACATTTTCAAGATCTGG---A-CACT-TAACA-TT-TTGAGGGT-A-G-ACGACTAGGTAAT-CTTGCTTG-TCG---------TATACACAATTACACCG-GTT-CG--C-GTCC-TGAAATTTTCTAAA--TT-CCTATTAAATCTT-TCTCATCCTTTTTTTCCAAAAAGA--------C-----CA-ATC-GGGT-----GGAAAGCCATCTATTGGGTCGCCAAGACATATT-AGGATCCACTAGtctgcacaacgccgagaatataatggactcact
gi|11 : atCTT--T-GA--AA-T-TAG---G-T-CA-AGG-TCAA-GG--T-CAAG--------G-CATTC---A--AAA-ATC--TAAA-ACAA-AACTG-G-CA-T-----TT--TC-ATACTG--TTTTTCCT-AC---A-AG-G--GAT-ACTT---CTTG-A--AACAT----T-TATA---AGCAGAAGTAT--T-CATC--TATA-A----ATTG-CTTTTTGAT-T-----G-GAGA-A-TTG-AA----TTAACATGAACATTT-GA--C-
gi|13 : ACCTTC----AG---TA----TCCTT-TTGT--G----AACCA-TATTT--AC-----TCGGCT--T-TG-TGATGCC--TT-TATAATGTC----A-AACTTT-ATTTT-T--CATAGTATAA-TGACTA---TCCCA--TA--AA--GATTAAA-T-CCA--CGCTTCTATATG-G--TCTCAGGCTCTC-AATC-TT--A-A-ATCATTGAACCTGTT-AA---GTTGCT----GAAACATG-CAAAAAAGGT-CA-------------AAA--C---GAGC-TCAAATCA-AATATGA-----GTTTTCAACCTTTT-------A-A-TGATA-TT-TTGAGGGCAA-A-AAGA-TAAAGAAT-TAT-CGTT-ACC---------ATCAAACAG------TGCATA-GA--C-G---ATCAA---TTCTTAAACTT-TTTA-AAAAacatctataatttctgaatatacaatgagcaaacgatcgagataataaagttgtcataaatgaacgcgacatatcttgacacactcaaactagagactaagaaatgtcatagtggattctagcacaaatacctcttcagctgatttcgattactttaaaaaaatcacctt
gi|14 : T-GGGCT---ACC-TTAAGCAAA-AGGAATC-A-A-TG-G--CCCT----TT--ATG-ATA-G-TTATTGC-CCCTT-------
gi|14 : AG--------GTCATCT---A--AAATAT----GTA-A--A-AA-TA-G-CA-T-----TT--TT-ATAGCT--TC--TCCT-GC---A-GG-A--GAT-A--C---Cannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaggtcatctaaaatatgtaaaaatagcatttttatagcttctcctgcaggagatacc
gi|15 : tgggctaccttaagcaaaaggaatcaatggccctttatgatagttattgccccttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-TG-A--CCCC----TT--A-A-AGA-G-TCATTGC-CCCTT-------GAA----TTTT--A--------------------TA-A------AATGGACTAAA----AT-TA----AAAAC-CATT-T----GTC-A---------TA-GAGGC---A-CGCAACCAACTGCAA--T-G--T--GA----T-T--AGTG-----AC-CTT-TGACCTT--G-AA--AA-T------------A-AAG-TCAAAGG--T-CTAG--------GTCATAT---A--AAA-ATT--CG-A-A--A-AA-TA-T-CACT-----TT--TT-ATACCC--TTTTTCCT-AC---A-GG-A--GAT-A--G---CATGAA--AACGG----T-AT-A---TGCTCAAGTATTCT-CAT
gi|16 : ATTA---C-AA-GA--------------CA--T---GG-GGCAACCT------T--T------TA-----G--ACCC--------CT-AA-ACTTGAAA--AT-TAGGTCAAG-GT---CA-AAGATCA---TCAT-AAT----------------GATTAG-A--------T---T--------A-----TACAC-----ATTTTTAAG------ATGTTTTAGGTT-CTTTTC--A---------AATACA-G-T--GAAT--GG--C--TTGA-C-C--TAACTGTG-GAACTTT----A----GA----TCCCT-TT-T--A----A--TACCAGTT--A------TTCTCT--T-TG-ATAT--T--TT-gt
gi|17 : A--TG---------G-GACTTTCAG-CTTTCAAATCTTT--A-A-ATCATTG-ACC--TT--A---TTTTTTGGGGG-----T--C----AGGGT-CAGAGATCACAGTCGAAAGTC---AAGGTTC-ATTCA-TAT-TTAAAGACGTTTTCAACATTTGC---AGCT-GATAATG-TT-TATAGGGT-CTG-ACGC-TAGGAAAT-TTTGCGTG-TTTGTTTCGTTATTTACACAGT---TCT
gi|18 : --TAAGAAT-CTTTGTTATCA-CTATCCCTCTTTATCCG-TAAATG---CAA-T-GT-G---C-A----T-CA--A------A-----CCTTTT-CT--AT------TC-T--ATAGAGGTCA--TT--T-AA-AA--G-A-A--TTT-AT-AGGGA-C---A----T---------T--AAAC--A-AAA-AGAT-TCA-ATGG-CCC-T-TTAAG-AC-A----GTTA-TT-G-C-t
gi|18 : ttaattattacccaacgtcattgaccttagaccccttacagagtA-AA---CCTTTTCTATT---C-T-AT-A-GAGGTCATTT-AAAAGA-AT-T--TAT-AGG-G---ACA-TTAAACAAA-AAGATTC-A-A-TG-G--CCCT----TT--A-AGACA-G-TTATTGC-
gi|2 : ttaattattacccaacgtcattgaccttagaccccttacagagttaagaatctttgttatcactatccctctttatccgtaaatgcaatgtgcatc-TG-A--CCCC----TT--A-A-TGAAG-TTATTGC-CCTTTTCATAAAGAAACCCTTTTTAAC----TACTTCTCT-T----TA-ACTGATCAAT-GAGATGG----CTACG----ACAAC-C--T-T----ATT-G------------GATGC---A-TTAGATTAATAGCA-----G--G--GA----T-T--AGTG-----
gi|2 : tagggctttccacctttctgtcctggaaaagtctattgttagagttctgtttcttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttccgccgtcaaaaaacaattttcgtttgaagactatttcaaaaaactttatagttcatccatataggacatcttgagaaatgattaaagtatcaccaacgtcatgtgacctGATG-GC-TACGACAA---CCTT----ATTGGATGC-ATTA-GA--TTAAT--AGCAGGGAT-T--AGT-GGG-T---ACACACAAACGAACAGGATTC-ACA-TGGA--CCCC----TT--A-A-AGA-GGTTATTGC-CCCTT-------AAA----TTTT--AAAAAAGATTTCTAT-GGCTCTAGA------AATTGAAAAAA----CC-TG----AGAAC-CGTT------ATC-G---------TA-TGGGC---A-CGA-ACCAACTGCAA--TAG--A--GA----TGT--AGTG-----AC-CTT-TGACCTT--G-AA--AA-TCTAGT--G-T-CA-AGGTTCAAAGG--T-GAAG--------GTCAGTC---A--AAA-ATC--CT-A-A--A-AA-T--G-CA-T-----TT--TC-ATA-CT--TTTTTCCT-AC---A-GG-G--AAT-AT-T---CTTGAA--ACC------T-TA-A---AACAGAATCATA-T-CATA----T--A----ATTGCTTTTTTGCA-T-----G-ATAC-A-TTGAAA----TT--C-TGAAC-TTT-GA--C-CCAT-T----TC---CGAATTA---C---A-AT--GA-C-TA-A-CGTCA-AAGC-T-TTATTACGC--GC-AC-T--CACAA---CTT-G------------------CAACCGAAAAGT----CAT-A-GA-GA--C-G----C-AA--A------A-----CCTT---CAGTAT---G-A-T-T--A--------A--CTA-T-AA-AA-AATC-C--CTT-GC-AGTGA-G---ATGATT---------T--AACC--G-ACA-GGAT-CTA-AGGA-CCC-T-TACAC-AT-A----GTTA-CT-GCC-CCCTG-AACATCT---------CATATATC--TGATTT-AT--CCATA---------C-AGC--T---TTTACATTA---CAAA-GATATCA--AG----ACA--T---GGATACTGGTTATTA--A--T------TACCCTTG--ACCT--------TT-GA-CCTT-ACA--TT-AAAGTCAAG-GT---CA-AA--TCAAGGTAAT-CATCACAAAACTTTGAAAAAA--AA-A--------T---TC-------A-----T--TTCAAA-GTCTTTTTG------A------A---T-ATATTT--A---------AATAAACA-T--AAAT--AG--TATTTGACC-TCATAAA-A---GACCTTTAATAA----TA----TCCTTGTT-T--G----A--CA-TATTT--AC----CTCCCTT--TGTG-AGAT--T--TC-TATTATATTA--TA-AAATTA-GTTTC-T--T------TGA-TGACTA---C------TATTAA--GAA---A-T-CAA--TT---------G-GACTTTCAG-CTTTT-AA-C-TT--A-ACATCATTA-ACT--TT-AA---TTTTTT----G-----T--C----AATGG-CA-------------ACAGTC---AAGG-TC-ATTCA-TATGTTTAAAACA-TTTCAACATTCTG---A-CA-C-TGAAA-TTATTGAGGGT-A-GTGCTA-T----AAT-GTG-CGTG-TCG---------ATT-CACA-T---ACTACCTT--G--CTGTCCATGAAATTTTCTAAATTCT-ATTA-AAACCTTT-TCGCATCCggtacacacaaacgaacaggattcacatggaccccttaaagaggttattgccccttaaattttaaaaaagatttctatggctctagaaattgaaaaaacctgagaaccgttatcgtatgggcacgaaccaactgcaatagagatgtagtgacctttgaccttgaaaatctagtgtcaaggttcaaaggtgaaggtcagtcaaaaatcctaaaaatgcattttcatacttttttcctacagggaatattcttgaaaccttaaaacagaatcatatcatataattgcttttttgcatgatacattgaaattctgaactttgacccatttccgaattacaatgactaacgtcaaagctttattacgcgcactcacaacttgcaaccgaaaagtcatagagacgcaaaaccttcagtatgattaactataaaaaatcccttgcagtgagatgatttaaccgacaggatctaaggacccttacacatagttactgccccctgaacatctcatatatctgatttatccatacagcttttacattacaaagatatcaagacatggatactggttattaattacccttgacctttgaccttacattaaagtcaaggtcaaatcaaggtaatcatcacaaaactttgaaaaaaaaattcatttcaaagtctttttgaatatatttaaataaacataaatagtatttgacctcataaaagacctttaataatatccttgtttgacatatttacctccctttgtgagatttctattatattataaaattagtttctttgatgactactattaagaaatcaattggactttcagcttttaacttaacatcattaactttaattttttgtcaatggcaacagtcaaggtcattcatatgtttaaaacatttcaacattctgacactgaaattattgagggtagtgctataatgtgcgtgtcgattcacatactaccttgctgtccatgaaattttctaaattctattaaaaccttttcgcatcc
gi|20 : tagggctttccacctttctgtcctggaaaagtctattgttagagttctgtttcttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttccgccgtcaaaaaacaattttcgtttgaagactatttcaaaaaactttatagttcatccatataggacatcttgagaaatgattaaagtatcaccaacgtcatgtgaccttgaccccttaatgaagttattgcccttttcataaagaaaccctttttaactacttctctttaactgatcaatgaT--G-AT--AA-T-TAAAGAG-C-CC-AGG--CAAAGG--TTCAAA--------GTCAT-T---A--AAA-ACT--C-AA-A--A-AA-TA-GGCA-T-----TT--TTCATACTG--TTTTTCCT-AC---A-GG-AT-AAT-AT-T---CTTGAA--ACGAT----TATA-A---AGCAGAAG
gi|21 : agtgcacatgtgagaaataattttgttgA-----G--ACCC--------TT-GA-CCTTTGAC--CT-----TCAAA-GT------AAGGTCCAAGTCAT-CAT----------------GA--AATA--------T---TTTCTTTTCA-----T--TTCTAAGGTCATTAAG------A------T---T-ATTTTT--A---------AGGACA-A-T--AAAT--AT--AATTTGACC-C--CAAA-ATG-GACCTTT----A----CA----CCC
gi|22 : catta-CTACTCCTACTAAACCA-AAAGT----CAA-A-AA-GA--A-A----T-GA--T------A-----CCTT---TT--AT---G-ATT-T--A-----GTCA--CTG-T-AG-AA-CA-C-C--CTT-GC-AATGA-C---A--AAT---------T--AATG--G-AAG-GGAT-ATG-ATGA-CCC-T-TAAAC-AT-A----GTTA-TC-G-C-CCCTa
gi|23 : AAGT----CAT-A-GA-GA--C-A----C-AA--A------A-----CCTT---CA--GT---G-ATG-T--A-----TTAA--CTA-T-AA-A--CA-CTC--CTT-GC-AGTGA-G---A--GTT---------T--AACC--G-AGG-GGAT-CCA-AGGA-CCC-T-TACAC-AT-A-----TTA-TT-G-C-CCCAG-AAAGTAT---C-----CA-ATATCATT
gi|24 : AAAAG-CTT-ATTA-TGGCTACTCCAACTGAAATG-AAAGT----CAT-A-GA-GA--A-G----A-AA--A------A-----CCTT---CA--AT---T-ATT-C--A-----TTAA--CTA-T-AA-AA-AT-C-C--TTT-GC-GGTGA-G---T--GTT---------T--AACC--G-AAA-GGAT-ATA-AGGA-C
gi|25 : T--TATTTGACT-C--TAAA-A-A-GACCTTC----A----TA----TTTTT-TT-T--TTTTTA--CA-TATTT--AC----TTCCCTT--TATG-AGAT--T--AT--ATGATATT---TATAAAGT---TTTC-T--T------TGA-T-CCTA---T------TA--AA--GATA--A-T-CAA--
gi|26 : -TG-A--CCCC----TT--A-C-GGA-G-TTATTG
gi|27 : ttcgtttcaagacttatcgaaagactttatccttcatcacataggacatctcgagaaatgatcgcatatcaccctgcatctttgacctt----TT--A-AGACA-G-TTATTGC-CCCT---------AA----TTTTTAAC----GATTTCTAA-G----TG-A------AACACATCAAA----CT-TG----AGACC-CGTT-A----ATC-G---------TA-TGGGT---T-CGGGACCAACTGCAA--T-G--G--GA----T-C--AGTG-----AC-CT
gi|28 : CT-C--TAAA-A-A-GACCTTA----A----TA----TCCTT-TT-T--G----G--TA-TATTT--AC----CTTTCTT--TGTG-AG-C--T--TT-TATGATATT---TA-AAATTT--TTTT-T--T------T-A-T-ACTA---CATGTATTA--AA--GAT---A-
gi|29 : TT-AAAAGA-ATGT--A-T-AGG-G---ACA-ATAAATGAA-AGGATTC-A-A-TG-G--CCGT----TT--A-AGACA-G-TTATTGC-CCCTT-------attg
gi|3 : aaatgcaatgtgcatcaaaccttttctaatGATG-GC-CAATA-AA---CTTTT---ATTGGAT-TCAT-G-GAGGCTAATT-AGCGCG-AT-TTGGGT-GGG-TGTGACA-ATAAACGAA-GGGATTC-A-A-TG-AGACCCT----TTTGA-A-CGAAG-TTATT-C-CCCTT-------GAA----TTTTT-AC----AATTTCTAT-G----TA-A------ATTGGGAGAAA----AC-TGTAAAAGAACGTATTCT----GTC-G---------TA-GAGGC---ATCGGGACCAATTGCAA--T-G--T--TA----T-CCCAGTGGNNNNNN-NNN-NNNNNNN--N-NN--NN-N-NNN---N-N-NN-NNN-NNNNNNN--N-NNNN--------NNNNNNN---N--NAA-ATT--TGAA-A--A-AA-TATA-CA-T-----TTA-TT-ATACCC--TCTTTCCTTAC---ACGG-AACGATTA--G---CATGAA--AACAT----T-TAGA---AGCT-AAGTATGCT-CATC--T-T--A----ATAG-GTA-CAGTA-T-----A-ATAA-AATTACAA----TT--T-TGAA---TT-GA--C-C--TAT-AAATT---AGAAATA---C---A-AC--GA-TGTT-G-CATTA-AAAA-TCTT-TTA-GC--ACT--------------------TA-CT-CT--TACTACTAA--CA-AAAGT----CAA-A-AA-GA--C-A----T-AA--A------A-----ACCTGTACG--AT---G-ATT-T--A-----GTCA--CTGCT-AA-AA-CG-C-T--CTT-GC-AGTGACA---A--AAG---------T--AATG--G-AAG-G-AT-CTG-ATG---CC-T-TAAGCCAT-A----GTTA-TC-G-C-CC-TGCAAAATCTT--A-----CA-ACATCGTTGTTTTCAG--CT-TA---------TCAGC--T---TT-ATATTAGATC-AA-GATA--GC-AA----TCA--TTTGGG-AACCACATA-CA--G--T------AA-----G--ACCT--------TT-GA-CCTTCAAA--TTCAAGGTCAAG--T---AA-AAGGTCAAG-TCAT-CAT----------------TA--AA-A--------T---T--------A-----T--TT-----G-CTTTAAG------A------A---T-ATTTTT--A---------AGGACA-ACT--AAAT--GT--C--TTAACA-C--CAAA-GTG-GACCTTT----A----CA----TCCAT-TT-T--G----A--CA-CATT---AC----CTCCCCA--T-TG-AGAT--TGTTT-TTTGATATT---CA-AGATTTCATTTT-TATT------TCA-T-ACTA---C------TA--AAAAGAT---A-TGCAA--AG---------AAGATCATCAG-CTT-C-AAGC-TT--A-A-ATCAT-G-ACC--TT-TA---TTTTTT----GG----T--C----A--GT-CA-------------AAAGTCC--AAGG-TC-ATTC--TATTTTTAAAAAATTTTAAA-GTTTTC---A-CA-G-TAAGAGTT-TTGAG--T-A---ACGA-TATAAAAT-TTC-CGTG-ATT---------TTTACACAAT---ACTGCATTTCT--C-ATTCATATAATTTTCTAAAAATT-TTTA-AA--TTTTGTTGAATCCATTTTTAC---ACATT--------TT----CATATT-GG-TG----GGAAAGCCCTCTAATTGTTCGC--AAACA-ATTCAGGAT-CACTAGTat
gi|32 : cgttatttacacagttcttcttgacccttattacggacgttattggcctattcatataaaaatccttgttagatcacgtacttctctttaactgttcaatgtta-GGTA--G--AG----TC---T---GG-T--CAC-TA-CA--GGCT------T------G--AACC--------TT-GAATCTTGAAA--CTGAAGGTCAACTGT---CA-AAGGTCAACGTCAC-C-T----------------GA--AA-ta
gi|4 : GATG-GC-AATAA-AA---CTTTT---ATTGGAT-T-AT-G-GAGGCTAATT-AGCCGA-TT-T--GGT-GGG-T---ACA-ATAAACGAA-GGGATTC-A-A-TG-A--CCCT----TT--G-A-AGA-G-TTATTGC-CCCTT-------GAA----TTTT--AC----AATTTCTAT-G----TA-A------ATTGGAGAAAA----CT-TA----AGAAC-TATT-T----GTC-G---------TA-GAGGC---A-CGGGACCAATTGCAA--T-G--T--GA----T-C--AGTG-----AC-TTT-CGACCTT--G-AA--AA-T-TAG---G-T-CA-AGG-TCAAAGG--T-CAAG--------GTCATAT---A--TAA-ATT--TGAA-A--A-AA-TA-T-CA-T-----TT--TT-ATACCC--TCTTTCCT-AC---A-GG-A--GAT-A--G---CATGAA--AACAT----T-TA-A---AGCTCAAGTATGCT-CATC--T-T--A----ATAG-GTATCAGTA-T-----A-ATAA-A-TTACAA----TT--T-TGAAC--TT-GA--C-C--T-TAA--TT---AGAAATA---C---A-AC--GA-T-TT-G-CATTA-AAAA-TCTTGTTA-GC--ACTAC-CCTNAAAAAT-CTT-GTTAGCA-CTACTCTTACTAAACCA-AAAGT----CAA-A-AA-GA--C-A----T-AA--A------A-----CCTT---CG--AT---G-ATT-T--A-----GTCA--CTG-T-AA-AA-CG-C-T--CTT-GC-AGTGA-C---A--AAG---------T--AATG--G-AAG-GGAT-CTG-ATGG-CCC-T-TAGCC-AT-A----GTTA-TC-G-C-CCCTG-AAAATCT---A-----CA-ACATCGTTATTTC-AG--CC-TA---------T-AGC--T---TTGATATTA-ATC-AA-GATA--G--AA----TCA--T---GG-GACCACATA-CA--G--T------CA-----G--ACCT--------TT-GA-CCTTCAAA--TT-AAGGTCAAG-GT---CA-AAGGTCAAGGTCAT-CAT----------------TA--AA-A--------T---T--------A-----T--TT-----GTCTTTAAG------A------A---T-ATTTTT--A---------AGGACA-A-T--AAAT--GT--CATTTAACA-C--CAAA-GTG-GACCTTT----A----CA----TCCAT-TT-T--G----A--CA-CATTT--AC----CTCCCCA--T-TG-AGATG-T--TT-TTTGATATT---CA-AGATTT-ATTTTAT--T------TCA-T-ACTA---C------TA--AA--GAT---A-T-CAA--AG---------A-GATCATCAG-CTTTC-AATC-TT--A-A-ATCATTG-ACC--TT-TA---TTTTTT----G-----T--C----AAGGT-CA-------------AAAGTC---AAGG-TC-ATTCA-TATTTTAAAAACATTTTAAAGTTTTTC---A-CA-G-TAAGA-GT-TTGAGGGT-A-A-ACGA-TAATAAAT-TTC-CGTG-ATT---------TTTACACAAT---ACTGCATT-CT--C-ATTCATATAATTTTCT-AAATTT-TTTA-AAAATCTT-TTGAATCCATTTTTTC---ACATT--------T-----CATATT-TGGT-----GGAAAGCCCTCTAATTGTTCGC--AAACA-ATT-AGGAT-CACTAGT
gi|5 : -TGACC-TTC-GA--C-C--T-C-C--TT---AGAAA--------------------------GTTATAAAC-CCTTGT----------A-----TAAAAATTCTT-GTTAGCA-CTACTCCTCTTGAACTG-----T----CAA-ATGC-GA--T-GGCAAT-GA--A------A-----ACTT---TA--TT---G-AAT-T--A------------TA-T-AG-----G-C-CAATTA-GC-AG-GA-A---T--AGTGGGGTACAAT--AAAC--G-AAA-GGATTCAA-ATGA-CCCCT-TAAAA-GT------GTTA-TT-G-CACCCTT-GAATTTT---A-----CG-AT-------TTTT-CT--CC-TAATAAAAAGAT-AGCAAT---TTCG-------TC-A----TA--G--AG----GCAAAT---GG-TACCGACTG-TA--A--TGGTTGATA-----GTAACCC--------TT-TA-CCTTGAAAAATT-CAG-TCAAG-GT---CA-AAGGTCAAGGTCATACAA----------------GA--AA-A--------T---
gi|5 : tgttagggctttctacctttctgtggaaagtcccaattgttatgttcagtttaattattattttcctgtagttcaaaaatcgttttttgtttgaaagaccttattgatagaacctcctctacatcattaaatagtacttctcgagaatcgatcaaatttaacctcaacgttatGATG-GC-AATGA-AA---ACTTT---ATTGAAT-T-AT-A-TAGGCCAATT-AGCAGG-AA-T--AGTGGGG-T---ACA-ATAAACGAA-AGGATTCAA-A-TG-A--CCCC----TTA-A-A-AGT-G-TTATTGCACCCTT-------GAA----TTTT--AC----GATTTTTCTCC----T---------AAT--AAAAA---------G----ATAGC-AATT-TC---GTC-A---------TA-GAGGCAA-A-TGGTACCGACTGTAA--T-GGTT--GA----T----AGTA-----AC-CCT-TTACCTT--GAAA--AA-T-TCA---G-T-CA-AGG-TCAAAGG--T-CAAG--------GTCATAC---AAGAAA-ATG--TGAA-A--A-AA-T--G-CA-T-----TT--TT-TAATCA--TCTTTCCT-GC---A-GGAA--GATAA--C---CATTAA--AACAT----C-AT-A---TGCTCAAGTAT-CT-CATC--C-TACA----ATAG-GTCTCAGTG-T-----A-TAAA-A-TTATAA----TC--C-CGAAC-TTT-GAACC-T--T-T-G--TT---AGAAATA---C---A-AA--GA-T-TC-G-CAT-A-A---------------------------AAAAAT-CTT-GTTA-CA-CTACTCCTACATAACCA-AAAAG----CAA-A-GA-GA--CAA----T-GA--A------A-----CATT---CA--AT---T--TT-T--A-----GTCAC-CTG-TAAA-AA-CA-C-C--TTG-AA-AGTGA-GA--A--AAT---------T--AACG--G-AAG-GGAT-CTGTATGC-CTC-T-TTACT-TT-A----GTTA-TT-G-C-CCCTG-CAAGTCT---AC----CA-ACATCgtgaaaaaatgcattttttaatcatctttcctgcaggaagataaccattaaaacatcatatgctcaagtatctcatcctacaataggtctcagtgtataaaattataatcccgaactttgaacctttgttagaaatacaaagattcgcataaaaaaatcttgttacactactcctacataaccaaaaagcaaagagacaatgaaacattcaatttttagtcacctgtaaaaacaccttgaaagtgagaaaattaacggaagggatctgtatgcctctttactttagttattgcccctgcaagtctaccaacatc
gi|6 : tgttagggctttctacctttctgtggaaagtcccaattgttatgttcagtttaattattattttcctgtagttcaaaaatcgttttttgtttgaaagaccttattgatagaacctcctctacatcattaaatagtacttctcgagaatcgatcaaatttaacctcaacgttattgaccttcgacctccttagaaagttataaacccttgtataaaaattcttgttagcactactcctcttgaactgtcaaatgcAA--T-G--G--GA----T-C--AGTG-----TCTCTT-TGACCTT--A-AA--AAAT-TAG---GGTGCA-AGG-TCAAAGGG-T-CACGCGTTGTTAGCCATTTTCTATTACA-ATTATCAAATA--ATAA-TT-G-CA-TGCTTGTTCATC-ATACTCGTTCTTTCCT-ACTCGA-GG-G--AAT-A--TGGCCTT--A--AACATGATTC-TA-T---AGCAAAAGTATG-T-AGGA--T-A--A----ATTGCGTATCAGCA-T-----AGATCACA-TTG-AA----TT--C-TGAAC-TTTTGA--C-C--T-A-T--TT---CCGATTAACTC---ACACTGGA-C-TA-AACGTCA-AAAA-GCTT-TTA-ATCTGCTAC-A--TA------------T--CG-CGAG----ACTGAAACG-AAAGTGTAGCGATA-GA-GAGTC-A----TCAA--A------AGAGGTCCTT---CA---T---A-A------A--------A--CTA-T-AA-AAACC-C-C--TTT-GC-AGTGA-G---G--AGT---------TTAAACC--GGAAGAGGATACCA-AGGA-CCC-T-TACAC-AT-AAGCGGTTA-TTAG-C-CCCTG-GAAATAG---AATTCCCA-ATTCCATTATATT-AGG-CC-TA---------T-ACC--TCTCTTAGCATTA---C-AC-GATA--G--AGGACATCG--G---GG-CACCACTTAGTT--G--T------TA-----C--ACCCCCTTGAGCTT-GA-CCTTCAA----T-AAGGTCAAC-GCGTACA-AA---CA--GACAT-CAT----------------CA--AA-AAGCTTAGTT---T--------A-----T--TT-----ATCTTCCAA------AT-----G---T-CTCTTT--AGAATTAAAGAGGACA-T-TT-AAAC--ATAATATATGACCAT--TAAA-A---GAC--TC----G----CAATAGTCCTC-TT-TCCGC---A--CA-ATTTT--ACTTGGCTCTCTT--TGTG-AAGT--T--TTCTATGATATT---TA-
gi|7 : gATGAGC-ATCGA-AA---TTTTT----CTGTCT-G-AT-A-GAGGTCATTTTAGAAGA-AT-G--AAT-AGG-T---ACG-TAAAAC--A-GGGATTC-A-AATG-G--CCATAAATTT--A-GGAAA-G-TTATT-T-CCCTT-------G------TTTT--ACCT--AATTCTTAAAG----TA-A------AACACGTGAAA----CT-CG----AGAAT-CATT-A----ATCCG---------TA-CAGG--------GAACTAACTGGAAAAT-G--G--GA----T-T--AGAG-----ACACTT-TGGCCTT--G-AA--AA-T-TGG---G-T-CA--GG-TCAAA--------------------TATGT---A--AAA-ATT---GAC-A--A----------------------TT-GT------TCT-----------G-AG-A--GAT-A--C---CCTCAA--A-CAT----G-AT-A---AGCATAAGTATTTTTCATC--T-T--A----ATTA-GTATCGGCGGT-----A-ATTA---TTACAAA---TT--T-TGAAC-TTT-GA--C-C--T-C-A--TC---AGAACTA---C---G-AT--GA-T-TTTG-TGTCA-AAAA-T--TGTTA-GT--GCTACTC--TAGGAA-------------------------GAACCT-AAAGT----CAA-A-GACGA--C-A----T-AT--A------A-----ACTT---CA--AC---G-ATT-T--A-----TTCA--CAA-TAAA-AA-TA-T-C--CTT-ACGAGTAG-G---A--GAT---------T--AACCCGA-AAG-GGAT-GTA-AAGA-CCC------AC--T-A----GTTATTT-G-C-CCCTG--AAGTAT---C-----CA-GTATCATttgcttaatatatattaa
gi|8 : caca--TAAAAAC---T-GTTAGCA-CTACTCTTTTTTAACTG-----T----CAA-C-GA-GA--T-GG---C-AATGA------A-----CCTT---TA--TT---GGATTAT--A-----GAGG--CTAAT-TA-GC-CG-G-T--CT-----AGTGG-GTACA--A-----------T--AAAC--G-AAG-GGAT-TCA-ATGACCCC-T-TAA---AG-A----GTT--TT-G-C-CCCTT-GAATTTT---A-----CA-ATTTCa
gi|8 : aggcttttccaaccttctgtggaaagtcctattggatattgttctttctgcgtcaaatgctttttttgttgttgaagacgtttattggaaaaaattatactacttcaaatcatataagtacttctctcgagaatgtcgtcaatatatcaccccaacgtcatttgacctttgatcccttatacggaagttattggtctttgttaGATG-GC-AATGA-A----CCTTT---ATTGGAT-T-AT-A-GAGGCTAATT-AGCCGG-TC-T--AGT-GGG-T---ACA-ATAAACGAA-GGGATTC-A-A-TG-A--CCCC----TT--A-A-AGA-G-TT-TTGC-CCCTT-------GAA----TTTT--AC----AATTTCTAT-G----TA-A------AATGGAAAAAAAAA-CT-TA----AGAAC-AATT-T----CTC-G---------CA-GAGAC---A-CGGGAATAACTGCAA--T-G--T--AA----T-C--AGTG-----AC-CTT-TGACCTT--G-AA--AA-T-TAG---G-T-C---------AAGG--T-CAAG--------GTCATAT---A--GAA-ATT--TGAA-A--A-AA-TA-T-CA-T-----TT--TGAATACCC--TCTTTtatgtaaaatggaaaaaaaaacttaagaacaatttctcgcagagacacgggaataactgcaatgtaatcagtgacctttgaccttgaaaattaggtcaaggtcaaggtcatatagaaatttgaaaaaatatcattttgaataccctcttt
gi|9 : aggcttttccaaccttctgtggaaagtcctattggatattgttctttctgcgtcaaatgctttttttgttgttgaagacgtttattggaaaaaattatactacttcaaatcatataagtacttctctcgagaatgtcgtcaatatatcaccccaacgtcatttgacctttgatcccttatacggaagttattggtctttgttataaaaactgttagcactactcttttttaactgtcaacgaGATG-GT-AACAT-GA---CCTTT---ATTGAAT-T-AT-A-GAGGTTAATT-AGGAGG-AT-T--AGT-GGG-T---ACA-ATAAACAAA-AGGATTC-A-A-TG-A--CCCC----TT--A-A-AGA-G-TTATTGC-CCCTG-------AAA----TTTT--AC----GATTTCTAA-G----TA-A------AATGGAAAAAA----CT-TG----AGAAC-CGTT-A----ATC-G---------TA-TAGGC---A-CGGAACCAACTGCAA--T-G--A--GA----T-T--AGTG-----AT-CTT-TGACCTT--G-AA--AA-T-TAA---G-T-CA-AGG-T
7 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|12 ): NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTATTTTTCTGCCATGAAAAAAATATGTTTGAAGACTTGTCGAAACACTTCATAATTCATCACATAGCACATCTCCAGAAACGATCACATATCACCCAACGCGATTGACCTTTGACTCCTCCCGGAGTTTTGAACTTTGTGTAAGAATCCTTGTTAGCACTGATCCTCTTTATCCATTAATGCAATGAACATAAAACCTTTTCTTTTCTATAGAAGTCATAGAGAAGAATCGATAGGTACATTA
Unaligned ( gi|19 ): ATTAGGGCTTTCCATCTTACTGTGGAAAGTCCTATTGCTTTTCTTCTGTTTCTTCTTAATATTTTTCAGCCGTCAAAAAAAATTTCATTTCAAGACTTTATAATTCATCATATAGGAAATCTCGAGAAATGAATAATTATATCACCCAACGTCATTGAACTTTGACCC
Unaligned ( gi|30 ): AGGACTTTCCACCTTCTTGTGGAAAGTCCTATTGTTACAATTGTTCTGTTATTATTTTCCTGTCGTCAAAATAAAGTTTCGTTTCAAGACT
Unaligned ( gi|31 ): ATTGGTTTCCACCTTCCTGTGGAGAATCCTAATGTTCTTGCTGTGTTTCTTATCATTTTCCTGCCGTCAAAAGAAAACTCGTTCCAACAC
Unaligned ( gi|33 ): AATAGCATTTTTCATATTTTTTTTTCAATAGGAAGATATATATTGAAACCATCTAAAGTAGAA
Unaligned ( gi|34 ): GGGCTTTCCACCTTTCAGTGTTATTGTTATTGTTCTGTT
Unaligned ( gi|35 ): TAGGGCTTTCCACCTCCCTATGGAAAGTCCTATNN
Alignments
lowQualScore : 1 1111111 111111111 1111111 111111 1111 111111 111111111 111 11111 1111 11111111 11111 1111 111 222222 1111111111111 11 111111111111 1 1111111111 1 1111 222222 22222222222222222222222 6666666666666666666666666666666666666666666 11111111111 111 11111 11111111111 1111 22222222222222222222 222222222 11 22222222222 111111 222 111111111111 111 33333333333333333333333333 11111111 11 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 33333333333333333 222222222 111111 11111111 22222 111111111111111 1111 1 111 111 11111111111 1 3333333333 222 222222222222222 111111 222222222222222222 3333333333333 111 22222222222 11111 1 2222222222222 11111 11111 111 66666666666666 1 33333 11 1 1 1
lowQualScore : 5 5 4 777 777 4 4 4 4 44 4 4 99 3 3 666 3 3 3 3 2 2 33 5555 66 2 0 5 2 2 0000000 7777 444444444 5555555 3 000000 4 0 4444 3 7777 444 777777 3 444444444 3 111 3 1 44 3 00000 7777 0000 88888 7 4 44 3 44 3 3 999 3 6 3 3 88 3 22222222 4 555 99 3 33333 3 44 3 3 0000 3 88888 77 6 777 3 000 3 8888 7 666666 1 1 55 3 9999999999999 55 77 4 888888888888 1 0 1 7 4444444444 1 777 0 5555 7777 4 4 66 4 66 555555 888 1 33333333333333333333333 2 5 9999999999999999999999999999999999999999999 555555 1 66 9999 3 3 3 66666666666 44 888888 77777 222 44 00000 0 3 44 88888888888 6 6 3 0000 3 44 3 3 33333333333333333333 44 44 3 3 6 3 1 3 3 3 3333 3 7777 3 3 3 3 66 1 0 555555555 4 1 7 6 55 6 99999999999 111111 7 3 999 5 66 999999999999 999999 111 5 33333333333333333333333333 66666666 4 4 6 66 22 1 44 777 4 3 22 4 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 88888888888888888 5 77 222222222 444444 44444444 55 55 11111 222222222222222 8 4 55 2222 55 4 55 8888 55 6 4 99 55 88 888 4 222 55555555555 4 5 0 1111111111 66 66 000 5 5 444444444444444 0 5 5 5 5 77 5 5 5 77 333333 888888888888888888 0 5 1111111111111 4 555 5 5 5 6 5 11 44 00000000000 666 5 99999 5 333 5 1 6666666666666 22222 1 99999 6 3 55 6 6 8 1 9 777 99999999999999 3 0 2 66666 1 1 1 2 88 3 3 3
lowQualScore : . . . ... ... . . . . .. . . .. . . ... . . . . . . .. .... .. . . . . . ....... .... ......... ....... . ...... . . .... . .... ... ...... . ......... . ... . . .. . ..... .... .... ..... . . .. . .. . . ... . . . . .. . ........ . ... .. . ..... . .. . . .... . ..... .. . ... . ... . .... . ...... . . .. . ............. .. .. . ............ . . . . .......... . ... . .... .... . . .. . .. ...... ... . ....................... . . ........................................... ...... . .. .... . . . ........... .. ...... ..... ... .. ..... . . .. ........... . . . .... . .. . . .................... .. .. . . . . . . . . .... . .... . . . . .. . . ......... . . . . .. . ........... ...... . . ... . .. ............ ...... ... . .......................... ........ . . . .. .. . .. ... . . .. . ............................................................. ................. . .. ......... ...... ........ .. .. ..... ............... . . .. .... .. . .. .... .. . . .. .. .. ... . ... ........... . . . .......... .. .. ... . . ............... . . . . . .. . . . .. ...... .................. . . ............. . ... . . . . . .. .. ........... ... . ..... . ... . . ............. ..... . ..... . . .. . . . . . ... .............. . . . ..... . . . . .. . . .
lowQualScore : 0 0 4 888 888 4 4 4 4 88 0 0 55 6 6 444 6 6 6 6 9 9 99 7777 33 7 7 3 7 9 0000000 7777 555555555 7777777 6 555555 3 6 1111 6 7777 444 555555 6 555555555 6 444 6 2 66 3 22222 1111 8888 33333 3 0 66 3 66 3 3 222 3 7 3 3 66 6 11111111 2 888 22 3 99999 3 66 3 3 9999 3 33333 99 7 777 6 000 6 7777 3 000000 0 6 55 3 1111111111111 99 11 4 666666666666 0 0 0 4 4444444444 0 111 8 6666 3333 4 4 11 4 99 111111 888 0 11111111111111111111111 2 0 6666666666666666666666666666666666666666666 222222 0 77 6666 1 1 1 88888888888 22 888888 77777 777 22 55555 5 1 22 88888888888 2 2 1 2222 1 22 1 1 55555555555555555555 22 22 1 1 2 1 0 1 3 3 5555 3 1111 3 3 3 3 88 4 7 777777777 0 1 4 7 88 7 33333333333 888888 5 7 444 7 44 111111111111 666666 111 9 66666666666666666666666666 11111111 4 4 9 11 66 1 66 888 4 9 00 4 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 66666666666666666 7 99 999999999 222222 77777777 44 55 66666 999999999999999 0 0 55 5555 55 0 55 5555 55 0 0 55 55 88 333 4 555 11111111111 5 0 0 8888888888 99 99 666 0 7 222222222222222 6 7 7 1 7 99 7 7 7 99 333333 999999999999999999 1 7 4444444444444 3 777 7 7 7 6 4 66 66 66666666666 999 7 00000 7 777 7 4 4444444444444 00000 5 33333 7 5 33 7 7 0 0 8 555 22222222222222 2 0 5 22222 0 0 0 5 00 3 3 3
consensus : GATG-GC-AACGA-AA---CCTTT---ATTGGAT-T-AT-A-GAGGCCAATT-AGCAGG-AT-T--AGT-GGG-T---ACA-ATAAACGAA-AGGATTC-A-A-TG-A--CCCC----TT--A-A-AGA-G-TTATTGC-CCCTT-------GAA----TTTT--AC----GATTTCTAT-G----TA-A------AATGGAAAAAA----CT-TG----AGAAC-CGTT-T----GTC-G---------TA-GAGGC---A-CGGGACCAACTGCAA--T-G--N--GA----T-C--AGTG-----AC-CTT-TGACCTT--G-AA--AA-T-TAG---G-T-CA-AGG-TCAAAGG--T-CAAG--------GTCATNT---A--AAA-ATT--CGAA-A--A-AA-TA-G-CA-T-----TT--TT-ATACCC--TCTTTCCT-AC---A-GG-A--GAT-A--N---CNTGAA--AACAT----T-TA-A---AGCNNAAGTATNCT-CATC--T-T--A----ATNG-GTNTCGGCG-T-----A-ATNA-A-TTGCAA----TT--C-TGAAC-TTT-GA--C-C--T-T-A--TT---AGAANTA---C---A-AC--GA-T-TC-G-CGTCA-AAAA-TCTTGTTA-GC--GCTAC-C--TAAAAAT-CTT-GTTA-CG-CTACTCCTACTNAACCG-AAAGT----CAA-A-GA-GA--C-G----T-AA--A------A-----CCTT---CA--AT---G-ATT-T--A-----GTCA--CTA-T-AA-AA-CG-C-C--CTT-GC-AGTGA-G---A--ANT---------T--AACC--G-AAG-GGAT-CTA-ANGA-CCC-T-TAAAC-AT-A----GTTA-TT-G-C-CCCTG-AAAGTCT---A-----CA-ATATCGTTATTTT-AG--CC-TA---------T-AGC--T---TTNACATTA-ATC-AA-GATA--G--AG----TCA--T---GG-NACCACNTA-CA--G--T------TA-----G--ACCC--------TT-GA-CCTTNAAA--TT-AAGGTCAAG-GT---CA-AAGGTCAAGGTCAT-CAT----------------NA--AA-A--------T---T--------A-----T--TT-----GTCTTTAAG------A------A---T-ATTTTT--A---------AGGACA-A-T--AAAT--GT--CATTTGACC-C--TAAA-ATG-GACCTTT----A----CA----TCCTT-TT-T--G----A--CA-TATTT--AC----CTCCCTT--T-TG-AGAT--T--TT-TATGATATT---TA-AAATTT-ATTTT-T--T------TGA-T-ACTA---C------TA--AA--GAT---A-T-CAA--TG---------G-GACTTTCAG-CTTTC-AATC-TT--A-A-ATCATTG-ACC--TT-NA---TTTTTT----G-----T--C----AAGGT-CA-------------AAAGTC---AAGG-TC-ATTCA-TATNTTAAAAACGTTTTCAACATTTTC---A-CA-G-TAANA-TT-TTGAGGGT-A-G-ACGA-TAGGAAAT-TTT-CGTG-NCT---------TTTACACAGT---ACTGCATT-CG--C-GTTCATGAAATTTTCTAAAATTT-TTTA-AAAATCTT-TCGNATCCATTTTTTC---ACATT--------C-----CATATC-GGGTG----GGAAAGCCCTCTANTNGNTCGCCAAGACA-ATT-AGGAT-CACTAGT
Reference ( family-1352 ) : GATG-GC-AACGA-AA---CCTTT---ATTGGAT-T-AT-A-GAGGCCAATT-AGCAGG-AT-T--AGT-GGG-T---ACA-ATAAACGAA-AGGATTC-A-A-TG-A--CCCC----TT--A-A-AGA-G-TTATTGC-CCCTT-------GAA----TTTT--AC----GATTTCTAT-G----TA-A------AATGGAAAAAA----CT-TG----AGAAC-CGTT-T----GTC-G---------TA-GAGGC---A-CGGGACCAACTGCAA--T-G--N--GA----T-C--AGTG-----AC-CTT-TGACCTT--G-AA--AA-T-TAG---G-T-CA-AGG-TCAAAGG--T-CAAG--------GTCATNT---A--AAA-ATT--CGAA-A--A-AA-TA-G-CA-T-----TT--TT-ATACCC--TCTTTCCT-AC---A-GG-A--GAT-A--N---CNTGAA--AACAT----T-TA-A---AGCNNAAGTATNCT-CATC--T-T--A----ATNG-GTNTCGGCG-T-----A-ATNA-A-TTGCAA----TT--C-TGAAC-TTT-GA--C-C--T-T-A--TT---AGAANTA---C---A-AC--GA-T-TC-G-CGTCA-AAAA-TCTTGTTA-GC--GCTAC-C--TAAAAAT-CTT-GTTA-CG-CTACTCCTACTNAACCG-AAAGT----CAA-A-GA-GA--C-G----T-AA--A------A-----CCTT---CA--AT---G-ATT-T--A-----GTCA--CTA-T-AA-AA-CG-C-C--CTT-GC-AGTGA-G---A--ANT---------T--AACC--G-AAG-GGAT-CTA-ANGA-CCC-T-TAAAC-AT-A----GTTA-TT-G-C-CCCTG-AAAGTCT---A-----CA-ATATCGTTATTTT-AG--CC-TA---------T-AGC--T---TTNACATTA-ATC-AA-GATA--G--AG----TCA--T---GG-NACCACNTA-CA--G--T------TA-----G--ACCC--------TT-GA-CCTTNAAA--TT-AAGGTCAAG-GT---CA-AAGGTCAAGGTCAT-CAT----------------NA--AA-A--------T---T--------A-----T--TT-----GTCTTTAAG------A------A---T-ATTTTT--A---------AGGACA-A-T--AAAT--GT--CATTTGACC-C--TAAA-ATG-GACCTTT----A----CA----TCCTT-TT-T--G----A--CA-TATTT--AC----CTCCCTT--T-TG-AGAT--T--TT-TATGATATT---TA-AAATTT-ATTTT-T--T------TGA-T-ACTA---C------TA--AA--GAT---A-T-CAA--TG---------G-GACTTTCAG-CTTTC-AATC-TT--A-A-ATCATTG-ACC--TT-NA---TTTTTT----G-----T--C----AAGGT-CA-------------AAAGTC---AAGG-TC-ATTCA-TATNTTAAAAACGTTTTCAACATTTTC---A-CA-G-TAANA-TT-TTGAGGGT-A-G-ACGA-TAGGAAAT-TTT-CGTG-NCT---------TTTACACAGT---ACTGCATT-CG--C-GTTCATGAAATTTTCTAAAATTT-TTTA-AAAATCTT-TCGNATCCATTTTTTC---ACATT--------C-----CATATC-GGGTG----GGAAAGCCCTCTANTNGNTCGCCAAGACA-ATT-AGGAT-CACTAGT
gi|1 : TG-GCTAACGG-AAAGACTCTT---ATTGGAT-T-AT-AAGACGCCAAT--ATCCGG-TT-TT-AGT-GGG-T---ACA-GAAAACGAA-AG-ATTC-A-A-TA-A--CCCC----TT--A-A-AGA-G-TTAT-GC-CCTAA-------CAA----TTTT--AC----GATTTCTTT-GG---TA-A------AATGGAAAAAAAAAACT-TG----AGGAA-CGTT-TAATAGTC-GGTGTTCTGTTATGCGGCCTCA-CGTGACCAACTGCAA--T-G--ATGGAATATT-A--AATG-----TG-CTTATGACCTTTCG-AATAAA-T-TAG---G-TTCATAGG-TCAAAAGGTT-CAAA--------GTCTTTT---T--CAA-ATT--ATCA-T--A-AA-TA-G-CA-T-----TT--TC-ACACCG--TCTTTTCT-TCT--A-GG-G--AAT-A--ATTCCTTAAACCATCAT----TATA-ATTCATCTAAAGTATTTT-AATCATT-T--ATATTATAA-ATCTTTGCT-TTTTTAG-ATTA-A-TTGGAAATTTTT--C-TGAAC-TTT-GA--CTC--TCT-A--TTTTCCGAATTA---TTCGA-AT--GACT-TA-A-CGTCA-AAAAGCCTTGTTA--T--GCTAC-T--CAAA-----TT-TAAA-CG-TTAATT-TACACAAC----AAGT----CAT-A-TA-GAA-C-G----C-AA--ATTAATTA-----CCTTT--CA--ATTTTGTATT-TTTA-----ATTAACTTA-T-AAGAA-TT-C-C--CTTTGC-AGTGA-G---A--GTT---------T--A-CC--G-AAG-G-AT-CTA-TGGA-CCC-TCTAACC-ATTA----GTTA-CT-G-C-CC-TG-AAAGTCTTCCA-----TA-ATATCATTATCCT-AGGCCT-TA---------C-AGC--T---TTTACATTA-A-C-AATGATA--GCAAG----ACA--T---GG-A--CACTTG-CATAA--T------TA---------CCT--------TTTGA-CC-----A--TT-GACTTCA----T---CATAATGTCAAGGTCAT-CAT----------------CC--AA-A--------TATTT--------AATTTTT--TT-----ATTTTCAAGTCTTTTG------A---TGATTTTTTAA---------ATAACA-T-TTAAAATTAGT---ATTTGACT-C--TAAT-TTACGACTCTT----AATATCT----TCCTT-TT-T--G----A--CA-TATTT--AC----CTCCTTT--G-TG-AGAT--T--GT--ATGATATTAT-TA-AAATTT-AGTTT-T--T------TGA-T-ACTA---T------TA--CA--GAT---AAT-CA---TG---------G-CACTTGCAG-CTGTC-AATC-TT--A-A-ATCATTG-ACC--TTGGA---TATTTT----G-----T--C----AAGGTAAA-------------AAAGTCACAAGGG-TC-ATTCATTATGTT-AAAACACTTTCACCATTTTCTGGA-C--G-TAAA---T-TTGAGGGTGA-G-ACGC-TAGGAAATGTGT-TGTGTTCT---------TTTACACAGT---ACTACCTT-CGCAC-ATTCATGAAATTTCTTAAAATCTATTT----AATCTT-TTTTATCC-TTTTTTT---TCATTAATAAGTACAAAGAAATATCAGGGTGGGGAGGAAGGCCCTCAATTAGATT-TCAAG
gi|10 : caagtaatggttaattattcatctctaaatcgtcattgacccttattgaccccgctcttatttacttactgagttatgtgcttcctttccatataacgttgtataactatgcctctttaacttgttttcttctaattttagtagtgagatagt-T--AAAT--AT--TATTTGACT-C--TAAA-AAT-TACCTTT----A----AA----TCCTTCTT-T--G----A--CA-TATTTAAAC----CTCCCTTTGT-TGCAGAT--T--TT-ATTAGTATTTGATA-AAATTA-GTTTCAT--T------TGATT-ACTATTTT------TA--AA--TATAC-A-T-TAAATTG---------G-GACTTTCAG-C-TTC-AAAC-TTTGACA-ATCATTA-ACC--TT-GAAAGTTTTTT----G-----TCCC----AAGGT-CA-------------AAA-TC---AA-G-TC-ATTCA-TATTTTAAAAACATTTTCAAGATCTGG---A-CACT-TAACA-TT-TTGAGGGT-A-G-ACGACTAGGTAAT-CTTGCTTG-TCG---------TATACACAATTACACCG-GTT-CG--C-GTCC-TGAAATTTTCTAAA--TT-CCTATTAAATCTT-TCTCATCCTTTTTTTCCAAAAAGA--------C-----CA-ATC-GGGT-----GGAAAGCCATCTATTGGGTCGCCAAGACATATT-AGGATCCACTAGtctgcacaacgccgagaatataatggactcact
gi|11 : atCTT--T-GA--AA-T-TAG---G-T-CA-AGG-TCAA-GG--T-CAAG--------G-CATTC---A--AAA-ATC--TAAA-ACAA-AACTG-G-CA-T-----TT--TC-ATACTG--TTTTTCCT-AC---A-AG-G--GAT-ACTT---CTTG-A--AACAT----T-TATA---AGCAGAAGTAT--T-CATC--TATA-A----ATTG-CTTTTTGAT-T-----G-GAGA-A-TTG-AA----TTAACATGAACATTT-GA--C-
gi|13 : ACCTTC----AG---TA----TCCTT-TTGT--G----AACCA-TATTT--AC-----TCGGCT--T-TG-TGATGCC--TT-TATAATGTC----A-AACTTT-ATTTT-T--CATAGTATAA-TGACTA---TCCCA--TA--AA--GATTAAA-T-CCA--CGCTTCTATATG-G--TCTCAGGCTCTC-AATC-TT--A-A-ATCATTGAACCTGTT-AA---GTTGCT----GAAACATG-CAAAAAAGGT-CA-------------AAA--C---GAGC-TCAAATCA-AATATGA-----GTTTTCAACCTTTT-------A-A-TGATA-TT-TTGAGGGCAA-A-AAGA-TAAAGAAT-TAT-CGTT-ACC---------ATCAAACAG------TGCATA-GA--C-G---ATCAA---TTCTTAAACTT-TTTA-AAAAacatctataatttctgaatatacaatgagcaaacgatcgagataataaagttgtcataaatgaacgcgacatatcttgacacactcaaactagagactaagaaatgtcatagtggattctagcacaaatacctcttcagctgatttcgattactttaaaaaaatcacctt
gi|14 : T-GGGCT---ACC-TTAAGCAAA-AGGAATC-A-A-TG-G--CCCT----TT--ATG-ATA-G-TTATTGC-CCCTT-------
gi|14 : AG--------GTCATCT---A--AAATAT----GTA-A--A-AA-TA-G-CA-T-----TT--TT-ATAGCT--TC--TCCT-GC---A-GG-A--GAT-A--C---Cannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaggtcatctaaaatatgtaaaaatagcatttttatagcttctcctgcaggagatacc
gi|15 : tgggctaccttaagcaaaaggaatcaatggccctttatgatagttattgccccttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-TG-A--CCCC----TT--A-A-AGA-G-TCATTGC-CCCTT-------GAA----TTTT--A--------------------TA-A------AATGGACTAAA----AT-TA----AAAAC-CATT-T----GTC-A---------TA-GAGGC---A-CGCAACCAACTGCAA--T-G--T--GA----T-T--AGTG-----AC-CTT-TGACCTT--G-AA--AA-T------------A-AAG-TCAAAGG--T-CTAG--------GTCATAT---A--AAA-ATT--CG-A-A--A-AA-TA-T-CACT-----TT--TT-ATACCC--TTTTTCCT-AC---A-GG-A--GAT-A--G---CATGAA--AACGG----T-AT-A---TGCTCAAGTATTCT-CAT
gi|16 : ATTA---C-AA-GA--------------CA--T---GG-GGCAACCT------T--T------TA-----G--ACCC--------CT-AA-ACTTGAAA--AT-TAGGTCAAG-GT---CA-AAGATCA---TCAT-AAT----------------GATTAG-A--------T---T--------A-----TACAC-----ATTTTTAAG------ATGTTTTAGGTT-CTTTTC--A---------AATACA-G-T--GAAT--GG--C--TTGA-C-C--TAACTGTG-GAACTTT----A----GA----TCCCT-TT-T--A----A--TACCAGTT--A------TTCTCT--T-TG-ATAT--T--TT-gt
gi|17 : A--TG---------G-GACTTTCAG-CTTTCAAATCTTT--A-A-ATCATTG-ACC--TT--A---TTTTTTGGGGG-----T--C----AGGGT-CAGAGATCACAGTCGAAAGTC---AAGGTTC-ATTCA-TAT-TTAAAGACGTTTTCAACATTTGC---AGCT-GATAATG-TT-TATAGGGT-CTG-ACGC-TAGGAAAT-TTTGCGTG-TTTGTTTCGTTATTTACACAGT---TCT
gi|18 : --TAAGAAT-CTTTGTTATCA-CTATCCCTCTTTATCCG-TAAATG---CAA-T-GT-G---C-A----T-CA--A------A-----CCTTTT-CT--AT------TC-T--ATAGAGGTCA--TT--T-AA-AA--G-A-A--TTT-AT-AGGGA-C---A----T---------T--AAAC--A-AAA-AGAT-TCA-ATGG-CCC-T-TTAAG-AC-A----GTTA-TT-G-C-t
gi|18 : ttaattattacccaacgtcattgaccttagaccccttacagagtA-AA---CCTTTTCTATT---C-T-AT-A-GAGGTCATTT-AAAAGA-AT-T--TAT-AGG-G---ACA-TTAAACAAA-AAGATTC-A-A-TG-G--CCCT----TT--A-AGACA-G-TTATTGC-
gi|2 : ttaattattacccaacgtcattgaccttagaccccttacagagttaagaatctttgttatcactatccctctttatccgtaaatgcaatgtgcatc-TG-A--CCCC----TT--A-A-TGAAG-TTATTGC-CCTTTTCATAAAGAAACCCTTTTTAAC----TACTTCTCT-T----TA-ACTGATCAAT-GAGATGG----CTACG----ACAAC-C--T-T----ATT-G------------GATGC---A-TTAGATTAATAGCA-----G--G--GA----T-T--AGTG-----
gi|2 : tagggctttccacctttctgtcctggaaaagtctattgttagagttctgtttcttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttccgccgtcaaaaaacaattttcgtttgaagactatttcaaaaaactttatagttcatccatataggacatcttgagaaatgattaaagtatcaccaacgtcatgtgacctGATG-GC-TACGACAA---CCTT----ATTGGATGC-ATTA-GA--TTAAT--AGCAGGGAT-T--AGT-GGG-T---ACACACAAACGAACAGGATTC-ACA-TGGA--CCCC----TT--A-A-AGA-GGTTATTGC-CCCTT-------AAA----TTTT--AAAAAAGATTTCTAT-GGCTCTAGA------AATTGAAAAAA----CC-TG----AGAAC-CGTT------ATC-G---------TA-TGGGC---A-CGA-ACCAACTGCAA--TAG--A--GA----TGT--AGTG-----AC-CTT-TGACCTT--G-AA--AA-TCTAGT--G-T-CA-AGGTTCAAAGG--T-GAAG--------GTCAGTC---A--AAA-ATC--CT-A-A--A-AA-T--G-CA-T-----TT--TC-ATA-CT--TTTTTCCT-AC---A-GG-G--AAT-AT-T---CTTGAA--ACC------T-TA-A---AACAGAATCATA-T-CATA----T--A----ATTGCTTTTTTGCA-T-----G-ATAC-A-TTGAAA----TT--C-TGAAC-TTT-GA--C-CCAT-T----TC---CGAATTA---C---A-AT--GA-C-TA-A-CGTCA-AAGC-T-TTATTACGC--GC-AC-T--CACAA---CTT-G------------------CAACCGAAAAGT----CAT-A-GA-GA--C-G----C-AA--A------A-----CCTT---CAGTAT---G-A-T-T--A--------A--CTA-T-AA-AA-AATC-C--CTT-GC-AGTGA-G---ATGATT---------T--AACC--G-ACA-GGAT-CTA-AGGA-CCC-T-TACAC-AT-A----GTTA-CT-GCC-CCCTG-AACATCT---------CATATATC--TGATTT-AT--CCATA---------C-AGC--T---TTTACATTA---CAAA-GATATCA--AG----ACA--T---GGATACTGGTTATTA--A--T------TACCCTTG--ACCT--------TT-GA-CCTT-ACA--TT-AAAGTCAAG-GT---CA-AA--TCAAGGTAAT-CATCACAAAACTTTGAAAAAA--AA-A--------T---TC-------A-----T--TTCAAA-GTCTTTTTG------A------A---T-ATATTT--A---------AATAAACA-T--AAAT--AG--TATTTGACC-TCATAAA-A---GACCTTTAATAA----TA----TCCTTGTT-T--G----A--CA-TATTT--AC----CTCCCTT--TGTG-AGAT--T--TC-TATTATATTA--TA-AAATTA-GTTTC-T--T------TGA-TGACTA---C------TATTAA--GAA---A-T-CAA--TT---------G-GACTTTCAG-CTTTT-AA-C-TT--A-ACATCATTA-ACT--TT-AA---TTTTTT----G-----T--C----AATGG-CA-------------ACAGTC---AAGG-TC-ATTCA-TATGTTTAAAACA-TTTCAACATTCTG---A-CA-C-TGAAA-TTATTGAGGGT-A-GTGCTA-T----AAT-GTG-CGTG-TCG---------ATT-CACA-T---ACTACCTT--G--CTGTCCATGAAATTTTCTAAATTCT-ATTA-AAACCTTT-TCGCATCCggtacacacaaacgaacaggattcacatggaccccttaaagaggttattgccccttaaattttaaaaaagatttctatggctctagaaattgaaaaaacctgagaaccgttatcgtatgggcacgaaccaactgcaatagagatgtagtgacctttgaccttgaaaatctagtgtcaaggttcaaaggtgaaggtcagtcaaaaatcctaaaaatgcattttcatacttttttcctacagggaatattcttgaaaccttaaaacagaatcatatcatataattgcttttttgcatgatacattgaaattctgaactttgacccatttccgaattacaatgactaacgtcaaagctttattacgcgcactcacaacttgcaaccgaaaagtcatagagacgcaaaaccttcagtatgattaactataaaaaatcccttgcagtgagatgatttaaccgacaggatctaaggacccttacacatagttactgccccctgaacatctcatatatctgatttatccatacagcttttacattacaaagatatcaagacatggatactggttattaattacccttgacctttgaccttacattaaagtcaaggtcaaatcaaggtaatcatcacaaaactttgaaaaaaaaattcatttcaaagtctttttgaatatatttaaataaacataaatagtatttgacctcataaaagacctttaataatatccttgtttgacatatttacctccctttgtgagatttctattatattataaaattagtttctttgatgactactattaagaaatcaattggactttcagcttttaacttaacatcattaactttaattttttgtcaatggcaacagtcaaggtcattcatatgtttaaaacatttcaacattctgacactgaaattattgagggtagtgctataatgtgcgtgtcgattcacatactaccttgctgtccatgaaattttctaaattctattaaaaccttttcgcatcc
gi|20 : tagggctttccacctttctgtcctggaaaagtctattgttagagttctgtttcttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttccgccgtcaaaaaacaattttcgtttgaagactatttcaaaaaactttatagttcatccatataggacatcttgagaaatgattaaagtatcaccaacgtcatgtgaccttgaccccttaatgaagttattgcccttttcataaagaaaccctttttaactacttctctttaactgatcaatgaT--G-AT--AA-T-TAAAGAG-C-CC-AGG--CAAAGG--TTCAAA--------GTCAT-T---A--AAA-ACT--C-AA-A--A-AA-TA-GGCA-T-----TT--TTCATACTG--TTTTTCCT-AC---A-GG-AT-AAT-AT-T---CTTGAA--ACGAT----TATA-A---AGCAGAAG
gi|21 : agtgcacatgtgagaaataattttgttgA-----G--ACCC--------TT-GA-CCTTTGAC--CT-----TCAAA-GT------AAGGTCCAAGTCAT-CAT----------------GA--AATA--------T---TTTCTTTTCA-----T--TTCTAAGGTCATTAAG------A------T---T-ATTTTT--A---------AGGACA-A-T--AAAT--AT--AATTTGACC-C--CAAA-ATG-GACCTTT----A----CA----CCC
gi|22 : catta-CTACTCCTACTAAACCA-AAAGT----CAA-A-AA-GA--A-A----T-GA--T------A-----CCTT---TT--AT---G-ATT-T--A-----GTCA--CTG-T-AG-AA-CA-C-C--CTT-GC-AATGA-C---A--AAT---------T--AATG--G-AAG-GGAT-ATG-ATGA-CCC-T-TAAAC-AT-A----GTTA-TC-G-C-CCCTa
gi|23 : AAGT----CAT-A-GA-GA--C-A----C-AA--A------A-----CCTT---CA--GT---G-ATG-T--A-----TTAA--CTA-T-AA-A--CA-CTC--CTT-GC-AGTGA-G---A--GTT---------T--AACC--G-AGG-GGAT-CCA-AGGA-CCC-T-TACAC-AT-A-----TTA-TT-G-C-CCCAG-AAAGTAT---C-----CA-ATATCATT
gi|24 : AAAAG-CTT-ATTA-TGGCTACTCCAACTGAAATG-AAAGT----CAT-A-GA-GA--A-G----A-AA--A------A-----CCTT---CA--AT---T-ATT-C--A-----TTAA--CTA-T-AA-AA-AT-C-C--TTT-GC-GGTGA-G---T--GTT---------T--AACC--G-AAA-GGAT-ATA-AGGA-C
gi|25 : T--TATTTGACT-C--TAAA-A-A-GACCTTC----A----TA----TTTTT-TT-T--TTTTTA--CA-TATTT--AC----TTCCCTT--TATG-AGAT--T--AT--ATGATATT---TATAAAGT---TTTC-T--T------TGA-T-CCTA---T------TA--AA--GATA--A-T-CAA--
gi|26 : -TG-A--CCCC----TT--A-C-GGA-G-TTATTG
gi|27 : ttcgtttcaagacttatcgaaagactttatccttcatcacataggacatctcgagaaatgatcgcatatcaccctgcatctttgacctt----TT--A-AGACA-G-TTATTGC-CCCT---------AA----TTTTTAAC----GATTTCTAA-G----TG-A------AACACATCAAA----CT-TG----AGACC-CGTT-A----ATC-G---------TA-TGGGT---T-CGGGACCAACTGCAA--T-G--G--GA----T-C--AGTG-----AC-CT
gi|28 : CT-C--TAAA-A-A-GACCTTA----A----TA----TCCTT-TT-T--G----G--TA-TATTT--AC----CTTTCTT--TGTG-AG-C--T--TT-TATGATATT---TA-AAATTT--TTTT-T--T------T-A-T-ACTA---CATGTATTA--AA--GAT---A-
gi|29 : TT-AAAAGA-ATGT--A-T-AGG-G---ACA-ATAAATGAA-AGGATTC-A-A-TG-G--CCGT----TT--A-AGACA-G-TTATTGC-CCCTT-------attg
gi|3 : aaatgcaatgtgcatcaaaccttttctaatGATG-GC-CAATA-AA---CTTTT---ATTGGAT-TCAT-G-GAGGCTAATT-AGCGCG-AT-TTGGGT-GGG-TGTGACA-ATAAACGAA-GGGATTC-A-A-TG-AGACCCT----TTTGA-A-CGAAG-TTATT-C-CCCTT-------GAA----TTTTT-AC----AATTTCTAT-G----TA-A------ATTGGGAGAAA----AC-TGTAAAAGAACGTATTCT----GTC-G---------TA-GAGGC---ATCGGGACCAATTGCAA--T-G--T--TA----T-CCCAGTGGNNNNNN-NNN-NNNNNNN--N-NN--NN-N-NNN---N-N-NN-NNN-NNNNNNN--N-NNNN--------NNNNNNN---N--NAA-ATT--TGAA-A--A-AA-TATA-CA-T-----TTA-TT-ATACCC--TCTTTCCTTAC---ACGG-AACGATTA--G---CATGAA--AACAT----T-TAGA---AGCT-AAGTATGCT-CATC--T-T--A----ATAG-GTA-CAGTA-T-----A-ATAA-AATTACAA----TT--T-TGAA---TT-GA--C-C--TAT-AAATT---AGAAATA---C---A-AC--GA-TGTT-G-CATTA-AAAA-TCTT-TTA-GC--ACT--------------------TA-CT-CT--TACTACTAA--CA-AAAGT----CAA-A-AA-GA--C-A----T-AA--A------A-----ACCTGTACG--AT---G-ATT-T--A-----GTCA--CTGCT-AA-AA-CG-C-T--CTT-GC-AGTGACA---A--AAG---------T--AATG--G-AAG-G-AT-CTG-ATG---CC-T-TAAGCCAT-A----GTTA-TC-G-C-CC-TGCAAAATCTT--A-----CA-ACATCGTTGTTTTCAG--CT-TA---------TCAGC--T---TT-ATATTAGATC-AA-GATA--GC-AA----TCA--TTTGGG-AACCACATA-CA--G--T------AA-----G--ACCT--------TT-GA-CCTTCAAA--TTCAAGGTCAAG--T---AA-AAGGTCAAG-TCAT-CAT----------------TA--AA-A--------T---T--------A-----T--TT-----G-CTTTAAG------A------A---T-ATTTTT--A---------AGGACA-ACT--AAAT--GT--C--TTAACA-C--CAAA-GTG-GACCTTT----A----CA----TCCAT-TT-T--G----A--CA-CATT---AC----CTCCCCA--T-TG-AGAT--TGTTT-TTTGATATT---CA-AGATTTCATTTT-TATT------TCA-T-ACTA---C------TA--AAAAGAT---A-TGCAA--AG---------AAGATCATCAG-CTT-C-AAGC-TT--A-A-ATCAT-G-ACC--TT-TA---TTTTTT----GG----T--C----A--GT-CA-------------AAAGTCC--AAGG-TC-ATTC--TATTTTTAAAAAATTTTAAA-GTTTTC---A-CA-G-TAAGAGTT-TTGAG--T-A---ACGA-TATAAAAT-TTC-CGTG-ATT---------TTTACACAAT---ACTGCATTTCT--C-ATTCATATAATTTTCTAAAAATT-TTTA-AA--TTTTGTTGAATCCATTTTTAC---ACATT--------TT----CATATT-GG-TG----GGAAAGCCCTCTAATTGTTCGC--AAACA-ATTCAGGAT-CACTAGTat
gi|32 : cgttatttacacagttcttcttgacccttattacggacgttattggcctattcatataaaaatccttgttagatcacgtacttctctttaactgttcaatgtta-GGTA--G--AG----TC---T---GG-T--CAC-TA-CA--GGCT------T------G--AACC--------TT-GAATCTTGAAA--CTGAAGGTCAACTGT---CA-AAGGTCAACGTCAC-C-T----------------GA--AA-ta
gi|4 : GATG-GC-AATAA-AA---CTTTT---ATTGGAT-T-AT-G-GAGGCTAATT-AGCCGA-TT-T--GGT-GGG-T---ACA-ATAAACGAA-GGGATTC-A-A-TG-A--CCCT----TT--G-A-AGA-G-TTATTGC-CCCTT-------GAA----TTTT--AC----AATTTCTAT-G----TA-A------ATTGGAGAAAA----CT-TA----AGAAC-TATT-T----GTC-G---------TA-GAGGC---A-CGGGACCAATTGCAA--T-G--T--GA----T-C--AGTG-----AC-TTT-CGACCTT--G-AA--AA-T-TAG---G-T-CA-AGG-TCAAAGG--T-CAAG--------GTCATAT---A--TAA-ATT--TGAA-A--A-AA-TA-T-CA-T-----TT--TT-ATACCC--TCTTTCCT-AC---A-GG-A--GAT-A--G---CATGAA--AACAT----T-TA-A---AGCTCAAGTATGCT-CATC--T-T--A----ATAG-GTATCAGTA-T-----A-ATAA-A-TTACAA----TT--T-TGAAC--TT-GA--C-C--T-TAA--TT---AGAAATA---C---A-AC--GA-T-TT-G-CATTA-AAAA-TCTTGTTA-GC--ACTAC-CCTNAAAAAT-CTT-GTTAGCA-CTACTCTTACTAAACCA-AAAGT----CAA-A-AA-GA--C-A----T-AA--A------A-----CCTT---CG--AT---G-ATT-T--A-----GTCA--CTG-T-AA-AA-CG-C-T--CTT-GC-AGTGA-C---A--AAG---------T--AATG--G-AAG-GGAT-CTG-ATGG-CCC-T-TAGCC-AT-A----GTTA-TC-G-C-CCCTG-AAAATCT---A-----CA-ACATCGTTATTTC-AG--CC-TA---------T-AGC--T---TTGATATTA-ATC-AA-GATA--G--AA----TCA--T---GG-GACCACATA-CA--G--T------CA-----G--ACCT--------TT-GA-CCTTCAAA--TT-AAGGTCAAG-GT---CA-AAGGTCAAGGTCAT-CAT----------------TA--AA-A--------T---T--------A-----T--TT-----GTCTTTAAG------A------A---T-ATTTTT--A---------AGGACA-A-T--AAAT--GT--CATTTAACA-C--CAAA-GTG-GACCTTT----A----CA----TCCAT-TT-T--G----A--CA-CATTT--AC----CTCCCCA--T-TG-AGATG-T--TT-TTTGATATT---CA-AGATTT-ATTTTAT--T------TCA-T-ACTA---C------TA--AA--GAT---A-T-CAA--AG---------A-GATCATCAG-CTTTC-AATC-TT--A-A-ATCATTG-ACC--TT-TA---TTTTTT----G-----T--C----AAGGT-CA-------------AAAGTC---AAGG-TC-ATTCA-TATTTTAAAAACATTTTAAAGTTTTTC---A-CA-G-TAAGA-GT-TTGAGGGT-A-A-ACGA-TAATAAAT-TTC-CGTG-ATT---------TTTACACAAT---ACTGCATT-CT--C-ATTCATATAATTTTCT-AAATTT-TTTA-AAAATCTT-TTGAATCCATTTTTTC---ACATT--------T-----CATATT-TGGT-----GGAAAGCCCTCTAATTGTTCGC--AAACA-ATT-AGGAT-CACTAGT
gi|5 : -TGACC-TTC-GA--C-C--T-C-C--TT---AGAAA--------------------------GTTATAAAC-CCTTGT----------A-----TAAAAATTCTT-GTTAGCA-CTACTCCTCTTGAACTG-----T----CAA-ATGC-GA--T-GGCAAT-GA--A------A-----ACTT---TA--TT---G-AAT-T--A------------TA-T-AG-----G-C-CAATTA-GC-AG-GA-A---T--AGTGGGGTACAAT--AAAC--G-AAA-GGATTCAA-ATGA-CCCCT-TAAAA-GT------GTTA-TT-G-CACCCTT-GAATTTT---A-----CG-AT-------TTTT-CT--CC-TAATAAAAAGAT-AGCAAT---TTCG-------TC-A----TA--G--AG----GCAAAT---GG-TACCGACTG-TA--A--TGGTTGATA-----GTAACCC--------TT-TA-CCTTGAAAAATT-CAG-TCAAG-GT---CA-AAGGTCAAGGTCATACAA----------------GA--AA-A--------T---
gi|5 : tgttagggctttctacctttctgtggaaagtcccaattgttatgttcagtttaattattattttcctgtagttcaaaaatcgttttttgtttgaaagaccttattgatagaacctcctctacatcattaaatagtacttctcgagaatcgatcaaatttaacctcaacgttatGATG-GC-AATGA-AA---ACTTT---ATTGAAT-T-AT-A-TAGGCCAATT-AGCAGG-AA-T--AGTGGGG-T---ACA-ATAAACGAA-AGGATTCAA-A-TG-A--CCCC----TTA-A-A-AGT-G-TTATTGCACCCTT-------GAA----TTTT--AC----GATTTTTCTCC----T---------AAT--AAAAA---------G----ATAGC-AATT-TC---GTC-A---------TA-GAGGCAA-A-TGGTACCGACTGTAA--T-GGTT--GA----T----AGTA-----AC-CCT-TTACCTT--GAAA--AA-T-TCA---G-T-CA-AGG-TCAAAGG--T-CAAG--------GTCATAC---AAGAAA-ATG--TGAA-A--A-AA-T--G-CA-T-----TT--TT-TAATCA--TCTTTCCT-GC---A-GGAA--GATAA--C---CATTAA--AACAT----C-AT-A---TGCTCAAGTAT-CT-CATC--C-TACA----ATAG-GTCTCAGTG-T-----A-TAAA-A-TTATAA----TC--C-CGAAC-TTT-GAACC-T--T-T-G--TT---AGAAATA---C---A-AA--GA-T-TC-G-CAT-A-A---------------------------AAAAAT-CTT-GTTA-CA-CTACTCCTACATAACCA-AAAAG----CAA-A-GA-GA--CAA----T-GA--A------A-----CATT---CA--AT---T--TT-T--A-----GTCAC-CTG-TAAA-AA-CA-C-C--TTG-AA-AGTGA-GA--A--AAT---------T--AACG--G-AAG-GGAT-CTGTATGC-CTC-T-TTACT-TT-A----GTTA-TT-G-C-CCCTG-CAAGTCT---AC----CA-ACATCgtgaaaaaatgcattttttaatcatctttcctgcaggaagataaccattaaaacatcatatgctcaagtatctcatcctacaataggtctcagtgtataaaattataatcccgaactttgaacctttgttagaaatacaaagattcgcataaaaaaatcttgttacactactcctacataaccaaaaagcaaagagacaatgaaacattcaatttttagtcacctgtaaaaacaccttgaaagtgagaaaattaacggaagggatctgtatgcctctttactttagttattgcccctgcaagtctaccaacatc
gi|6 : tgttagggctttctacctttctgtggaaagtcccaattgttatgttcagtttaattattattttcctgtagttcaaaaatcgttttttgtttgaaagaccttattgatagaacctcctctacatcattaaatagtacttctcgagaatcgatcaaatttaacctcaacgttattgaccttcgacctccttagaaagttataaacccttgtataaaaattcttgttagcactactcctcttgaactgtcaaatgcAA--T-G--G--GA----T-C--AGTG-----TCTCTT-TGACCTT--A-AA--AAAT-TAG---GGTGCA-AGG-TCAAAGGG-T-CACGCGTTGTTAGCCATTTTCTATTACA-ATTATCAAATA--ATAA-TT-G-CA-TGCTTGTTCATC-ATACTCGTTCTTTCCT-ACTCGA-GG-G--AAT-A--TGGCCTT--A--AACATGATTC-TA-T---AGCAAAAGTATG-T-AGGA--T-A--A----ATTGCGTATCAGCA-T-----AGATCACA-TTG-AA----TT--C-TGAAC-TTTTGA--C-C--T-A-T--TT---CCGATTAACTC---ACACTGGA-C-TA-AACGTCA-AAAA-GCTT-TTA-ATCTGCTAC-A--TA------------T--CG-CGAG----ACTGAAACG-AAAGTGTAGCGATA-GA-GAGTC-A----TCAA--A------AGAGGTCCTT---CA---T---A-A------A--------A--CTA-T-AA-AAACC-C-C--TTT-GC-AGTGA-G---G--AGT---------TTAAACC--GGAAGAGGATACCA-AGGA-CCC-T-TACAC-AT-AAGCGGTTA-TTAG-C-CCCTG-GAAATAG---AATTCCCA-ATTCCATTATATT-AGG-CC-TA---------T-ACC--TCTCTTAGCATTA---C-AC-GATA--G--AGGACATCG--G---GG-CACCACTTAGTT--G--T------TA-----C--ACCCCCTTGAGCTT-GA-CCTTCAA----T-AAGGTCAAC-GCGTACA-AA---CA--GACAT-CAT----------------CA--AA-AAGCTTAGTT---T--------A-----T--TT-----ATCTTCCAA------AT-----G---T-CTCTTT--AGAATTAAAGAGGACA-T-TT-AAAC--ATAATATATGACCAT--TAAA-A---GAC--TC----G----CAATAGTCCTC-TT-TCCGC---A--CA-ATTTT--ACTTGGCTCTCTT--TGTG-AAGT--T--TTCTATGATATT---TA-
gi|7 : gATGAGC-ATCGA-AA---TTTTT----CTGTCT-G-AT-A-GAGGTCATTTTAGAAGA-AT-G--AAT-AGG-T---ACG-TAAAAC--A-GGGATTC-A-AATG-G--CCATAAATTT--A-GGAAA-G-TTATT-T-CCCTT-------G------TTTT--ACCT--AATTCTTAAAG----TA-A------AACACGTGAAA----CT-CG----AGAAT-CATT-A----ATCCG---------TA-CAGG--------GAACTAACTGGAAAAT-G--G--GA----T-T--AGAG-----ACACTT-TGGCCTT--G-AA--AA-T-TGG---G-T-CA--GG-TCAAA--------------------TATGT---A--AAA-ATT---GAC-A--A----------------------TT-GT------TCT-----------G-AG-A--GAT-A--C---CCTCAA--A-CAT----G-AT-A---AGCATAAGTATTTTTCATC--T-T--A----ATTA-GTATCGGCGGT-----A-ATTA---TTACAAA---TT--T-TGAAC-TTT-GA--C-C--T-C-A--TC---AGAACTA---C---G-AT--GA-T-TTTG-TGTCA-AAAA-T--TGTTA-GT--GCTACTC--TAGGAA-------------------------GAACCT-AAAGT----CAA-A-GACGA--C-A----T-AT--A------A-----ACTT---CA--AC---G-ATT-T--A-----TTCA--CAA-TAAA-AA-TA-T-C--CTT-ACGAGTAG-G---A--GAT---------T--AACCCGA-AAG-GGAT-GTA-AAGA-CCC------AC--T-A----GTTATTT-G-C-CCCTG--AAGTAT---C-----CA-GTATCATttgcttaatatatattaa
gi|8 : caca--TAAAAAC---T-GTTAGCA-CTACTCTTTTTTAACTG-----T----CAA-C-GA-GA--T-GG---C-AATGA------A-----CCTT---TA--TT---GGATTAT--A-----GAGG--CTAAT-TA-GC-CG-G-T--CT-----AGTGG-GTACA--A-----------T--AAAC--G-AAG-GGAT-TCA-ATGACCCC-T-TAA---AG-A----GTT--TT-G-C-CCCTT-GAATTTT---A-----CA-ATTTCa
gi|8 : aggcttttccaaccttctgtggaaagtcctattggatattgttctttctgcgtcaaatgctttttttgttgttgaagacgtttattggaaaaaattatactacttcaaatcatataagtacttctctcgagaatgtcgtcaatatatcaccccaacgtcatttgacctttgatcccttatacggaagttattggtctttgttaGATG-GC-AATGA-A----CCTTT---ATTGGAT-T-AT-A-GAGGCTAATT-AGCCGG-TC-T--AGT-GGG-T---ACA-ATAAACGAA-GGGATTC-A-A-TG-A--CCCC----TT--A-A-AGA-G-TT-TTGC-CCCTT-------GAA----TTTT--AC----AATTTCTAT-G----TA-A------AATGGAAAAAAAAA-CT-TA----AGAAC-AATT-T----CTC-G---------CA-GAGAC---A-CGGGAATAACTGCAA--T-G--T--AA----T-C--AGTG-----AC-CTT-TGACCTT--G-AA--AA-T-TAG---G-T-C---------AAGG--T-CAAG--------GTCATAT---A--GAA-ATT--TGAA-A--A-AA-TA-T-CA-T-----TT--TGAATACCC--TCTTTtatgtaaaatggaaaaaaaaacttaagaacaatttctcgcagagacacgggaataactgcaatgtaatcagtgacctttgaccttgaaaattaggtcaaggtcaaggtcatatagaaatttgaaaaaatatcattttgaataccctcttt
gi|9 : aggcttttccaaccttctgtggaaagtcctattggatattgttctttctgcgtcaaatgctttttttgttgttgaagacgtttattggaaaaaattatactacttcaaatcatataagtacttctctcgagaatgtcgtcaatatatcaccccaacgtcatttgacctttgatcccttatacggaagttattggtctttgttataaaaactgttagcactactcttttttaactgtcaacgaGATG-GT-AACAT-GA---CCTTT---ATTGAAT-T-AT-A-GAGGTTAATT-AGGAGG-AT-T--AGT-GGG-T---ACA-ATAAACAAA-AGGATTC-A-A-TG-A--CCCC----TT--A-A-AGA-G-TTATTGC-CCCTG-------AAA----TTTT--AC----GATTTCTAA-G----TA-A------AATGGAAAAAA----CT-TG----AGAAC-CGTT-A----ATC-G---------TA-TAGGC---A-CGGAACCAACTGCAA--T-G--A--GA----T-T--AGTG-----AT-CTT-TGACCTT--G-AA--AA-T-TAA---G-T-CA-AGG-T
blockSeqs : A . C . TCT G C T . TT G G TG G C GTG C C A C A G GA AAAT TG T G A G A TCATAAA ACCC AAAAAAG TGGCTC G CTGATC G AAA A TAAA GTA CT C . . AA T A AA A GTT . CCC GNNNN T . . A . A C AGA G G . T G T CGTTGTTA T TCT AG T ATCAA T CA T C AGG C GCTTG CA C CGT T TCG C AAC T TGGC T G . A GATTCTAT AG TC T TATAA T C T T ATAG G AA A A AACA A T AC . CA ATAAA . T ACTCACACTGGACTAAA C T TCTTGTTAGCACTACCCTNAAAAATCTTGTTAGCA TCCCTC T AA GTAG T T C TGGCAAT TG . GAGGT GTA GT GG A . TAGAGGTCA C A . AAT T AA . G ATAGTGGGGTACAA TA CG G A T T T C C . AGCC . AGCG T A C A CA A AATTCC T A A C G A ATAAAAAGAT TCTC T C GAT A A GAGGACAT TTTG ATA C GTAATGGTTGATAGTA CCTTGAGC . A G AA CA G CT GTA . G AG A CACAAAACTTTGAAAAAAAAATTCATTTCAAA ATGTTTTAGGT . . GAATTAAAG CAT ATAATA CA CA TGTG AATAATA C G CC TTTT AC C AA TTGG TG G C GC GT CT TGA T TCA TCATAGTA G T G CATGTAT TT AA TAA . G CGCTTCTATATG G A A T TG C C A TG GAAAG GAAACATGCAAAA . GAGATCACAGTCG G C T A . T A AT GA CAGCTGA GAG A AAA C GGT . G TTTGTTTCGTTA ATTAC G TCT T A AC . T G C T CAA TT T . G G T G G G CA . C .
blockSeqs : . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . A . G A . . . . TAACT TCC . . T . . . CA TC . . . . . G . . T . GT . A . . . . . . T . . . . . . . C . TT . TAA . . . . ATA . . A A G . . . AT A CTT A G . A TTATA TC GC . CTACA T C T T GGTA A CA C . C . . . . . TAA . A CAACGATGTTG T . CCTTGTATAAAAATTCTTGTTAGCA CTCCTA C T G . . . GTCATC . . . TT . G . . GTCAC A A . ACC . . . . GATGATT . . . . A . G . . . AAG . . . . . . A G TA . A G . . . TC AAT G T AT . A TCAAGA AAT GG T ATTAATTACCCTTG . . . T . GA G G . . G AA . GAAATATTTTCTTTTCATTTCTAAG ATG . . . ACT ATTA T . AAT GCAATAG G . . C . . . . . A . G . A A . AG TATT A . G TCCCA . . AC . . ATTGG . . T . . . . . . AA GGGGGTC . . G . . . . A A GT CC GACACT CA . CTG . AAG . G TCG GT A CG . T TT . . . C A . C T . G . A T T G . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . TAACG AAG . . A . . . CG T . . . . . G . . G . T . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . TGA . . . . GG . . . . T . . . AA . TT T G . C TATAA AG GC . TTA A . A A TTG A A C . T . . . . . CC . A CGATGATTTTG T . TTTATTACGCGCACTCACAACTTG CTCCAA A A . . . . CAAT . . . . . G . . GTCA . . . CA . . . . CAAAAG . . . . . . T . . . CAC . . . . . . A A AC . A G . . . C T C T T . A GCAAT T AA A ACAGGCTTG . . . C . T G G . . G AG . CAAAAAGCTTAGTTTATTT AA . . . TTT AGTA C . ATG AGTA . . . . . . . . . G . . . T . . TA ATT G . . TTTT . . A . . AGAA . . T . . . . . . AA GTCCC . . G . . . . G A GT CA GACAC TA . AGT . GGA . . ACC AT C GA . A AA . . . A A . T . . . . A T T G .
blockSeqs : . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . ACCTA TT . . G . . . CG T . . . . . G . . A . T . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . TGA . . . . AG . . . . C . . . G . TT T G . C TTAGA AG TT . TTA A . A A ATG A A T . T . . . . . TG . A CAATGACTAA T . GCTTTTAATCTGCTACATATCG CTCTTA G A . . . . TGGC . . . . . G . . TTAA . . . CA . . . . GAAAAT . . . . . . G . . . AAC . . . . . . A A C . A A . . . T T A C . . A GAGT T GA A AGTTGTTAC . . . G . A G A . . G AC . GATTAGATTATACAC AT . . . GT ATAA C . GTG AAA . . . . . . . . . G . . . T . . AG ATT G . . C . . . . . TGG . . G . . . . . . TA GGTC . . G . . . . T T AT CA CACAG TG . AG . TAA . . TCG AT A CT . A AT . . . A
blockSeqs : . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TACA AG . . G . . . TA A . . . . . G . . G . C . . . . . . . . . . . . . . . . N . . . TGA . . . . AT . . . . T . . . A . C A G . A TATA TC A . TAA A . C A ATA A A C . C . . . . . AT . A CAACGATTTG C . TTGTTAGTGCTACTCTAGGAA CTCCTC A A . . . . CAT . . . . . T . . TTAA . . . AT . . . . GTACAA . . . . . . G . . . CAC . . . . . . G T A . A A . . . T T . . . . C GAAT T TA C ACAGTAAG . . . C . A G G . . G AG . TAAAATTATTT AA . . . AT GTCA C . GTG AGA . . . . . . . . . . . . . T . . TA TT C . . T . . . . . TTG . . T . . . . . . TA GTC . . . . . . . T T AT GT CACAG AA . AA . ATA . . ATT G A G . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ACA TG . . A . . . AA T . . . . . T . . T . C . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . TGA . . . . AT . . . . G . . . A . G A G . A TTAA TC C . TTA T . A A ATA C A . . C . . . . . CA . T CAAAGATTCG C . TCTTTTAGCACTTACT CTCCTA A A . . . . CGC . . . . . G . . GTCA . . . CG . . . . CAAAT . . . . . . T . . . GCC . . . . . . C G A . T . . . . GAGG T CA T ACAGTCAG . . . G . C G G . . G AG . TAAAATTATTT AA . . . AT GGC T . AA ACA . . . . . . . . . . . . . T . . T TT C . . C . . . . . AGA . . . . . . . . . A GTC . . . . . . . . A A G AA GA . A . . . . ATT T
blockSeqs : . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ACG TG . . G . . . CA A . . . . . A . . T . C . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . GT . . . . TG . . . . C . . . G . G A T . A TTAA AA G . TA T . A G GTA T . . . T . . . . . T . C . . . AAAAATCTTGTTACA CTCTTT G A . . . . AAT . . . . . G . . GTCA . . . CG . . . . GAGTT . . . . . . T . . . AAA . . . . . . G A C . A . . G T . TTTAG . . . C . A . G . . . . . GTC T . AA ATA . . . . . . . . . . . . . T . . . TT . . . C . . . .
blockSeqs : . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ACA TG . . G . . . AA T . . . . . G . . G . T . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . CG . . . . AT . . . . C . . . A . G T C . A CATA AT . . . . . . TACTA T A . . . . CAC . . . . . G . . TTCA . . . CA . . . . GTGTT . . . . . . T . . . ACT . . . . . . G G A . T . . . . . . . C . . . . . A . A ATA . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ACG AG . . . . . . CG A . . . . . A . . G . C . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . CT . . . . G . . . . A . . . G . C C . . . GATA T GA G A . . . . AGA . . . . . T . . GAGG . . . TA . . . . CAAAG . . . . . . T . . . CAC . . . . . . . T . . . A . A ACA . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . C . . . . . . . . . T . T . . . . . . . . . . . . . . . A . . . CA . . . . G . . . . C . . . A . C . G . . . . . CAT . . . . . A . . A . . . CG . . . . GGAGT . . . . . . G . . . AC . . . . . . ACA
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . GA . . . . . . . . . . . T . . . . . CAT . . . . . G . . A . . . G . . . . GAGAT . . . . . . A . . . A . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . CAT . . . . . . . . . . . . G . . . . CAT . . . . . . T .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqCons : *** T* ** TG***** **** N***** ********* *** N**** **** ** ** ** CGA** *** N***** ** TATA********* TTA********* ATA******* **** CN**** *** CAACGATTCG************* TCTTGTTAGCGCTGCTANAACTTGTACA*************** CTCCTA A* CAT******** ****** *** G**** ** GTCA******* A******** ** *** A* GAGT******** NA* ATAGTTAG****************** G* AA*************** ** AT**** ATTA**** AG*** ACA************ T* *** NA**** *** NACAN****** NA* ACN********** CG***
originalCons : GATG-GC-AACGA-AA---CCTTT---ATTGGAT-T-AT-A-GAGGCCAATT-AGCAGG-AT-T--AGT-GGG-T---ACA-ATAAACGAA-AGGATTC-A-A-TG-A--CCCC----TT--A-A-AGA-G-TTATTGC-CCCTT-------GAA----TTTT--AC----GATTTCTAT-G----TA-A------AATGGAAAAAA----CT-TG----AGAAC-CGTT-T----GTC-G---------TA-GAGGC---A-CGGGACCAACTGCAA--T-G--N--GA----T-C--AGTG-----AC-CTT-TGACCTT--G-AA--AA-T-TAG---G-T-CA-AGG-TCAAAGG--T-CAAG--------GTCATNT---A--AAA-ATT--CGAA-A--A-AA-TA-G-CA-T-----TT--TT-ATACCC--TCTTTCCT-AC---A-GG-A--GAT-A--N---CNTGAA--AACAT----T-TA-A---AGCNNAAGTATNCT-CATC--T-T--A----ATNG-GTNTCGGCG-T-----A-ATNA-A-TTGCAA----TT--C-TGAAC-TTT-GA--C-C--T-T-A--TT---AGAANTA---C---A-AC--GA-T-TC-G-CGTCA-AAAA-TCTTGTTA-GC--GCTAC-C--TAAAAAT-CTT-GTTA-CG-CTACTCCTACTNAACCG-AAAGT----CAA-A-GA-GA--C-G----T-AA--A------A-----CCTT---CA--AT---G-ATT-T--A-----GTCA--CTA-T-AA-AA-CG-C-C--CTT-GC-AGTGA-G---A--ANT---------T--AACC--G-AAG-GGAT-CTA-ANGA-CCC-T-TAAAC-AT-A----GTTA-TT-G-C-CCCTG-AAAGTCT---A-----CA-ATATCGTTATTTT-AG--CC-TA---------T-AGC--T---TTNACATTA-ATC-AA-GATA--G--AG----TCA--T---GG-NACCACNTA-CA--G--T------TA-----G--ACCC--------TT-GA-CCTTNAAA--TT-AAGGTCAAG-GT---CA-AAGGTCAAGGTCAT-CAT----------------NA--AA-A--------T---T--------A-----T--TT-----GTCTTTAAG------A------A---T-ATTTTT--A---------AGGACA-A-T--AAAT--GT--CATTTGACC-C--TAAA-ATG-GACCTTT----A----CA----TCCTT-TT-T--G----A--CA-TATTT--AC----CTCCCTT--T-TG-AGAT--T--TT-TATGATATT---TA-AAATTT-ATTTT-T--T------TGA-T-ACTA---C------TA--AA--GAT---A-T-CAA--TG---------G-GACTTTCAG-CTTTC-AATC-TT--A-A-ATCATTG-ACC--TT-NA---TTTTTT----G-----T--C----AAGGT-CA-------------AAAGTC---AAGG-TC-ATTCA-TATNTTAAAAACGTTTTCAACATTTTC---A-CA-G-TAANA-TT-TTGAGGGT-A-G-ACGA-TAGGAAAT-TTT-CGTG-NCT---------TTTACACAGT---ACTGCATT-CG--C-GTTCATGAAATTTTCTAAAATTT-TTTA-AAAATCTT-TCGNATCCATTTTTTC---ACATT--------C-----CATATC-GGGTG----GGAAAGCCCTCTANTNGNTCGCCAAGACA-ATT-AGGAT-CACTAGT
finalCons : GATG-GC-AACGA-AA---CCTTT---ATTGGAT-T-AT-A-GAGGCCAATT-AGCAGG-AT-T--AGT-GGG-T---ACA-ATAAACGAA-AGGATTC-A-A-TG-A--CCCC----TT--A-A-AGA-G-TTATTGC-CCCTT-------GAA----TTTT--AC----GATTTCTATG-----TA-A------AATGGAAAAAA----CT-TG----AGAAC-CGTTN-----GTC-G---------TA-GAGGC---A-CGGGACCAACTGCAA--T-GN----GA----T-C--AGTG-----AC-CTT-TGACCTT--G-AA--AA-T-TAG---G-T-CA-AGG-TCAAAGG--T-CAAG--------GTCATNT---A--AAA-ATTCGA--A-A--A-AA-TA-G-CA-T-----TT--TT-ATACCC--TCTTTCCT-AC---A-GG-A--GAT-AN-----CNTGAA--AACATTATA---------AGCNNAAGTATNCT-CATCTTA---------ATNG-GTNTCGGCATA-------ATNA-A-TTGCAA----TT--C-TGAAC-TTT-GA--C-C--TCN----TT---AGAANTACAACGATTCG-------------CGTCA-AAAATCTTGTTAGCGCTGCTANAACTTGTACA---------------CTACTCCTACTNAACCGA-AAGT----CAA-A-GA-GACAT--------AA--A------A-----CCTT---CA--ATG----ATT-T--AGTCA-------CTA-T-AA-AA-CG-C-C--CTT-GC-AGTGA-G---A--ANT---------T--AACC--G-AAG-GGAT-CTA-ANGA-CCC-T-TAAAC-AT-A----GTTA-TT-G-C-CCCTG-AAAGTCTA--------CA-ATATCGTTATTTT-AG--CC-TA---------T-AGC--T---TTNACATTA---C-AA-GATAGAGT--------CA--T---GGNA-CCACNTATAGTTAG------------------ACCC--------TT-GA-CCTTNAAA--TT-AAGGTCAAG-GT---CA-AAGGTCAAGGTCAT-CAT----------------NA--AA-A--------T---T--------A-----T--TT-----GTCTTTAAGAA---------------T-ATTTTT--A---------AGGACAAT----AAATATTA----TTTGACC-C--TAAAAG---GACCTTTACA------------TCCTT-TT-T--G----A--CA-TATTT--AC----CTCCCTT--T-TG-AGAT--T--TTT-ATGATATT---TA-AAATTT-ATTTT-T--T------TGA-T-ACTA---C------TA--AA--GAT---A-T-CAA--TG---------G-GACTTTCAG-CTTTC-AATC-TT--A-A-ATCATTG-ACC--TTNA----TTTTTT----G-----T--C----AAGGT-CA-------------AAAGTC---AAGG-TC-ATTCA-TATNTTAAAAACGTTTTCAACATTTTNACAN------TAANA-TT-TTGAGGGT-A-G-ACGA-TAGGAAAT-TTT-CGTGACN----------TTTACACAGT---ACTGCATTCG---C-GTTCATGAAATTTTCTAAAATTT-TTTA-AAAATCTT-TCGNATCCATTTTTTC---ACATT--------C-----CATATC-GGGTG----GGAAAGCCCTCTANTNGNTCGCCAAGACA-ATT-AGGAT-CACTAGT
7 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|12 ): NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTATTTTTCTGCCATGAAAAAAATATGTTTGAAGACTTGTCGAAACACTTCATAATTCATCACATAGCACATCTCCAGAAACGATCACATATCACCCAACGCGATTGACCTTTGACTCCTCCCGGAGTTTTGAACTTTGTGTAAGAATCCTTGTTAGCACTGATCCTCTTTATCCATTAATGCAATGAACATAAAACCTTTTCTTTTCTATAGAAGTCATAGAGAAGAATCGATAGGTACATTA
Unaligned ( gi|19 ): ATTAGGGCTTTCCATCTTACTGTGGAAAGTCCTATTGCTTTTCTTCTGTTTCTTCTTAATATTTTTCAGCCGTCAAAAAAAATTTCATTTCAAGACTTTATAATTCATCATATAGGAAATCTCGAGAAATGAATAATTATATCACCCAACGTCATTGAACTTTGACCC
Unaligned ( gi|30 ): AGGACTTTCCACCTTCTTGTGGAAAGTCCTATTGTTACAATTGTTCTGTTATTATTTTCCTGTCGTCAAAATAAAGTTTCGTTTCAAGACT
Unaligned ( gi|31 ): ATTGGTTTCCACCTTCCTGTGGAGAATCCTAATGTTCTTGCTGTGTTTCTTATCATTTTCCTGCCGTCAAAAGAAAACTCGTTCCAACAC
Unaligned ( gi|33 ): AATAGCATTTTTCATATTTTTTTTTCAATAGGAAGATATATATTGAAACCATCTAAAGTAGAA
Unaligned ( gi|34 ): GGGCTTTCCACCTTTCAGTGTTATTGTTATTGTTCTGTT
Unaligned ( gi|35 ): TAGGGCTTTCCACCTCCCTATGGAAAGTCCTATNN
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 1111 1111111 111111 111111111 111111 111 1111 11111111 1111 1111 111 222222 11111 11 111111111 11 1111111 1 1111 11111111111111111 1111111111111 1111111 1 111 00000000000000000000000000000 11111111111111 22222222222 111111111 22222222222222222222 222222222 111111 22222222222 111111 1 22222 111111111111 111 33333333333333333333333333 11111111 11 11 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 33333333333333333 222222222 111 111111 11111111 222222222222222 22 11 111111 111 11 111111 1 3333333333 111111 2222222222222 111111 2222222222 11111 3333333333333 111 22222222222 11111 1 222222222222 1111 1111 111 66666666666666666666666 11 33333 11 1 1 1
lowQualScore : 5 5 4 777 777 4 4 4 4 44 4 4 99 99999 3 3 3 5 2 33 5555 33 2 0 2 5 2 2 99 4444 6666666 4 777 0 8888 8888 4 555 555555 4 666666666 4 222222 2 55 3 111 7777 1111 99999 7 4 44 44 6 3 999 3 6 3 3 88 3 22222222 4 555 99 3 0000 3 44 3 3 0000 3 88888 77 6 777 3 000 3 8888 7 222222 1 4 55 0 4 00000 4 44 1 8888 55 77 4 66 888888888 1 5 1 22 66 4444444 66 5 0 5555 7777 4 4 66 99999999999999999 777 2222222222222 4444444 0 222 4 66666666666666666666666666666 444444 1 3 3 9999 3 555 6 66 2 5 2 33 888888 77777 22222222222222 4444 33333333333 5 5 2 111111111 2 2 55555555555555555555 33 0 66 2 5 2 1 2 3 3 44 3 6666 3 3 3 3 66 1 44 111111111 4 1 7 555555 6 99999999999 111111 4 66666 5 999999999999 999999 111 5 22222222222222222222222222 66666666 4 4 6 66 22 1 00 777 4 3 77 4 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 88888888888888888 5 77 222222222 777 66 333333 1 4 55555555 3 000000000000000 8 4 55 4 55 4 9999999 11 4 55 4 888888 4 222 66 444444 4 5 1111111111 66 666666 5 9999999999999 0 5 5 5 5 77 5 5 5 77 333333 2222222222 5 77 22222 5 1111111111111 4 5 000 66 5 5 6 5 11 0 11 11111111111 666 5 33333 5 5 333 5 1 888888888888 1 4 1111 88 2222 6 3 55 6 777 8 1 9 66666666666666666666666 3 88 66666 1 1 1 2 88 3 3 3
lowQualScore : . . . ... ... . . . . .. . . .. ..... . . . . . .. .... .. . . . . . . .. .... ....... . ... . .... .... . ... ...... . ......... . ...... . .. . ... .... .... ..... . . .. .. . . ... . . . . .. . ........ . ... .. . .... . .. . . .... . ..... .. . ... . ... . .... . ...... . . .. . . ..... . .. . .... .. .. . .. ......... . . . .. .. ....... .. . . .... .... . . .. ................. ... ............. ....... . ... . ............................. ...... . . . .... . ... . .. . . . .. ...... ..... .............. .... ........... . . . ......... . . .................... .. . .. . . . . . . . .. . .... . . . . .. . .. ......... . . . ...... . ........... ...... . ..... . ............ ...... ... . .......................... ........ . . . .. .. . .. ... . . .. . ............................................................. ................. . .. ......... ... .. ...... . . ........ . ............... . . .. . .. . ....... .. . .. . ...... . ... .. ...... . . .......... .. ...... . ............. . . . . . .. . . . .. ...... .......... . .. ..... . ............. . . ... .. . . . . .. . .. ........... ... . ..... . . ... . . ............ . . .... .. .... . . .. . ... . . . ....................... . .. ..... . . . . .. . . .
lowQualScore : 0 0 4 888 888 4 4 4 4 88 0 0 55 00000 6 6 6 7 9 99 7777 77 7 7 7 3 7 9 55 0000 7777777 0 000 1 5555 5555 0 222 888888 0 000000000 0 555555 3 00 6 000 7777 3333 11111 3 0 66 66 7 3 222 3 7 3 3 66 6 11111111 2 888 22 3 6666 3 66 3 3 9999 3 33333 99 7 777 6 000 6 7777 3 444444 0 1 55 9 0 00000 0 99 1 5555 99 11 4 99 999999999 0 0 0 44 22 1111111 00 0 8 6666 3333 4 4 11 00000000000000000 999 6666666666666 0000000 0 000 5 88888888888888888888888888888 444444 0 3 1 6666 1 444 2 88 9 7 9 99 222222 11111 22222222222222 1111 66666666666 7 7 9 222222222 9 9 55555555555555555555 99 6 88 9 7 9 0 9 1 1 55 1 5555 1 1 1 1 88 4 77 777777777 0 1 4 888888 7 33333333333 888888 0 44444 0 111111111111 666666 111 9 44444444444444444444444444 11111111 4 4 9 11 66 1 11 888 4 9 66 4 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 66666666666666666 7 99 999999999 000 99 222222 4 0 22222222 6 666666666666666 0 0 55 0 55 0 0000000 55 0 00 0 111111 4 555 99 444444 5 0 6666666666 99 666666 7 6666666666666 6 7 7 1 7 99 7 7 7 99 333333 1111111111 7 99 33333 7 4444444444444 3 7 000 44 7 7 6 4 66 7 00 66666666666 999 7 33333 7 7 777 7 4 000000000000 0 0 7777 22 7777 7 5 33 7 333 0 0 8 00000000000000000000000 2 88 22222 0 0 0 5 00 3 3 3
consensus : GATG-GC-AACGA-AA---CCTTT---ATTGGAT-T-AT-A-GAGGCCAATT-AGCAGG-AT-T--AGTGGG-T---ACA-ATAAACGAA-AGGATTCA-A-TG-A--CCCC----TT--A-A-A-GA-G-TTATTGC-CCCTTGAATTTT--AC----GATTTCTAT-G----TA-AAATGG---AAAAAA----CTTG----AG-AAC-CGTTC----GTC-G---------TA-GAGGC---A--CGGGACCAACTGCAA--T-GN--GA----T-C--AGTG-----AC-CTT-TGACCTT--GAA--AA-T-TAG---G-T-CA-AGGT-CAAAGG--T-CAAG--------GTCATNT---A--AAA-ATT--CGAA-A--A-AA-TA-G-CA-T-----TT--TT-ATACCC--TCTTTCCT-AC---A-GG-A--GAT-A--N---CNTGAA--AACA-T-----T-AT-AAG----CNNAAGTATNCT-CATC--T-T--A----ATNG-GTNTCG-GCG-T-----A-AT-NA-ATTGCAA----TT--C-TGAAC-TTT-GA--CCT---C-NTT--A------GAAN--TA---C---A-AC--GA-T-TCG-CGT-CAAAAA-T-CTTGTTA-GCGCTA--CT-A-AA---CTTGT--A-CACTACTCCTACTNAACCGAAA-GT----CAA-A---GA-GA--C-G-T-AA--A------A-----CCTT---CA--AT---G-ATT-T--A-----GTCA--CTA-T-AA-AA-CG-C-C--CTT-GC-AGTGA-G---A--ANT---------T--AACC--GAAG-GGAT-CCG-ATGA-CCC-T-TAAA-CAT-A----GTTA-TT-G-C-CCCTG-AAAGTC-T---A-----CA-ATATCGTTATTTT-A-G--CC-TA---------T-AGC--T---TT-ACATTA---C-AA-GATA--G--AG----TCA--T---GG-NACCACNT--A-TAG--T------TA-----G--ACC--------CTT-GA-CCTTNAAA--TT-AAGGTCAAG-GT---CA-AAGGTCAAGGTCAT-CAT----------------NA--AA-A--------T---T--------A-----T--TT-----GTCTTTAAG------A------A---T-ATTTTT--A---------AGGACA-A-T--AAAT-AT--TATTTGACCCTA-A--A--A-GG-ACCTTT----A----CA----TCCTT-TT-T--G-A--CA-TATTTA--C----CTCCCTTTG-TG-AGAT--TTT-TATGATATT--T---A-AAATTT-ATTTT--TT------TGAT-ACTAC------T---A--AAGAT---A--T-CAA--TG---------GGACTTTCAG-CTTTC-AATC-TT--A-A-ATCATTGA-CCT--T-NA---TTTTTT----G-----T-C--AA----GGT-CA-------------AAAGT-C---AAGG-TCAT-TCA-TATNTTAAAAACGTTTTCAACATTTT---NA--CA-GTAANA-TT-TTGAGGGT-A-G-AC-GA-TAGGAAAT-TTT-CGT---------G-NCNTTTACACAGT---ACTGCA-TTCG--C-GTTCATGAAATTTTCTAAAATTT-TTTA-AAAATCTT-TCGNATCCATTTTTTC---ACA-TT--------C-----CATATC-GGGTG----GGAAAGCCCTCTANTNGNTCGCCAAGACA-ATT-AGGAT-CACTAGT
Reference ( family-1352 ) : GATG-GC-AACGA-AA---CCTTT---ATTGGAT-T-AT-A-GAGGCCAATT-AGCAGG-AT-T--AGTGGG-T---ACA-ATAAACGAA-AGGATTCA-A-TG-A--CCCC----TT--A-A-A-GA-G-TTATTGC-CCCTTGAATTTT--AC----GATTTCTAT-G----TA-AAATGG---AAAAAA----CTTG----AG-AAC-CGTTN----GTC-G---------TA-GAGGC---A--CGGGACCAACTGCAA--T-GN--GA----T-C--AGTG-----AC-CTT-TGACCTT--GAA--AA-T-TAG---G-T-CA-AGGT-CAAAGG--T-CAAG--------GTCATNT---A--AAA-ATT--CGAA-A--A-AA-TA-G-CA-T-----TT--TT-ATACCC--TCTTTCCT-AC---A-GG-A--GAT-A--N---CNTGAA--AACA-T-----T-AT-AAG----CNNAAGTATNCT-CATC--T-T--A----ATNG-GTNTCG-GCA-T-----A-AT-NA-ATTGCAA----TT--C-TGAAC-TTT-GA--CCT---C-NTT--A------GAAN--TA---C---A-AC--GA-T-TCG-CGT-CAAAAA-T-CTTGTTA-GCGCTG--CT-ANAA---CTTGT--A-CACTACTCCTACTNAACCGAAA-GT----CAA-A---GA-GA--C-A-T-AA--A------A-----CCTT---CA--AT---G-ATT-T--A-----GTCA--CTA-T-AA-AA-CG-C-C--CTT-GC-AGTGA-G---A--ANT---------T--AACC--GAAG-GGAT-CTA-ANGA-CCC-T-TAAA-CAT-A----GTTA-TT-G-C-CCCTG-AAAGTC-T---A-----CA-ATATCGTTATTTT-A-G--CC-TA---------T-AGC--T---TTNACATTA---C-AA-GATA--G--AG----TCA--T---GG-NACCACNT--A-TAG--T------TA-----G--ACC--------CTT-GA-CCTTNAAA--TT-AAGGTCAAG-GT---CA-AAGGTCAAGGTCAT-CAT----------------NA--AA-A--------T---T--------A-----T--TT-----GTCTTTAAG------A------A---T-ATTTTT--A---------AGGACA-A-T--AAAT-AT--TATTTGACCCTA-A--A--A-GG-ACCTTT----A----CA----TCCTT-TT-T--G-A--CA-TATTTA--C----CTCCCTTT--TG-AGAT--TTT-TATGATATT--T---A-AAATTT-ATTTT--TT------TGAT-ACTAC------T---A--AAGAT---A--T-CAA--TG---------GGACTTTCAG-CTTTC-AATC-TT--A-A-ATCATTGA-CCT--T-NA---TTTTTT----G-----T-C--AA----GGT-CA-------------AAAGT-C---AAGG-TCAT-TCA-TATNTTAAAAACGTTTTCAACATTTT---NA--CA-NTAANA-TT-TTGAGGGT-A-G-AC-GA-TAGGAAAT-TTT-CGT---------G-ACNTTTACACAGT---ACTGCA-TTCG--C-GTTCATGAAATTTTCTAAAATTT-TTTA-AAAATCTT-TCGNATCCATTTTTTC---ACA-TT--------C-----CATATC-GGGTG----GGAAAGCCCTCTANTNGNTCGCCAAGACA-ATT-AGGAT-CACTAGT
gi|1 : TG-GCTAACGG-AAAGACTCTT---ATTGGAT-T-AT-AAGACGCCAAT--ATCCGG-TT-TT-AGTGGG-T---ACA-GAAAACGAA-AG-ATTCA-A-TA-A--CCCC----TT--A-A-A-GA-G-TTAT-GC-CCTAACAATTTT--AC----GATTTCTTT-GG---TA-AAATGG---AAAAAAAAAACTTG----AG-GAA-CGTTTAATAGTC-GGTGTTCTGTTATGCGGCCTCA--CGTGACCAACTGCAA--T-GATGGAATATT-A--AATG-----TG-CTTATGACCTTTCGAATAAA-T-TAG---G-TTCATAGGT-CAAAAGGTT-CAAA--------GTCTTTT---T--CAA-ATT--ATCA-T--A-AA-TA-G-CA-T-----TT--TC-ACACCG--TCTTTTCT-TCT--A-GG-G--AAT-A--ATTCCTTAAACCATCA-T-----T-AT-AATTCATCTAAAGTATTTT-AATCATT-T--ATATTATAA-ATCTTT-GCT-TTTTTAG-AT-TA-ATTGGAAATTTTT--C-TGAAC-TTT-GA--C-T---C-TCT--ATTTTCCGAAT--TA---TTCGA-AT--GACT-TAA-CGT-CAAAAAGC-CTTGTTA--TGCTA--CT-CAAA---TTTAA--A-CGTTAATT-TACACAAC---AA-GT----CAT-A---TA-GAA-C-G-C-AA--ATTAATTA-----CCTTT--CA--ATTTTGTATT-TTTA-----ATTAACTTA-T-AAGAA-TT-C-C--CTTTGC-AGTGA-G---A--GTT---------T--A-CC--GAAG-G-AT-CTA-TGGA-CCC-TCTAAC-CATTA----GTTA-CT-G-C-CC-TG-AAAGTC-TTCCA-----TA-ATATCATTATCCT-A-GGCCT-TA---------C-AGC--T---TTTACATTAA--C-AATGATA--GCAAG----ACA--T---GG-A--CACTTGCA-TAA--T------TA---------CC--------TTTTGA-CC-----A--TT-GACTTCA----T---CATAATGTCAAGGTCAT-CAT----------------CC--AA-A--------TATTT--------AATTTTT--TT-----ATTTTCAAGTCTTTTG------A---TGATTTTTTAA---------ATAACA-T-TTAAAATTAG--TATTTGACTCTA-A--TTTA-CG-ACTCTT----AATATCT----TCCTT-TT-T--G-A--CA-TATTTA--C----CTCCTTTG--TG-AGAT--TGT--ATGATATTATT---A-AAATTT-AGTTT--TT------TGAT-ACTAT------T---A--CAGAT---AA-T-CA---TG---------GCACTTGCAG-CTGTC-AATC-TT--A-A-ATCATTGA-CCT--TGGA---TATTTT----G-----T-C--AA----GGTAAA-------------AAAGT-CACAAGGG-TCAT-TCATTATGTT-AAAACACTTTCACCATTTTCTGGA--C--GTAAA---T-TTGAGGGTGA-G-AC-GC-TAGGAAATGTGT-TGT---------GTTCTTTTACACAGT---ACTACC-TTCGCAC-ATTCATGAAATTTCTTAAAATCTATTT----AATCTT-TTTTATCC-TTTTTTT---TCA-TTAATAAGTACAAAGAAATATCAGGGTGGGGAGGAAGGCCCTCAATTAGATT-TCAAG
gi|10 : caagtaatggttaattattcatctctaaatcgtcattgacccttattgaccccgctcttatttacttactgagttatgtgcttcctttccatataacgttgtataactatgcctctttaacttgttttcttctaattttagtagtgagatagt-T--AAAT-AT--TATTTGACTCTA-A--A--A-ATTACCTTT----A----AA----TCCTTCTT-T--G-A--CA-TATTTAAAC----CTCCCTTTGTTGCAGAT--TTT-ATTAGTATT--TGATA-AAATTA-GTTTCA-TT------TGATTACTAT------TTTTA--AATAT---ACAT-TAAATTG---------GGACTTTCAG-CTT-C-AAAC-TTTGACA-ATCATTAA-CCT--T-GAAAGTTTTTT----G-----T-CCCAA----GGT-CA-------------AAA-T-C---AAG--TCAT-TCA-TATTTTAAAAACATTTTCAAGATCTG---GA--CACTTAACA-TT-TTGAGGGT-A-G-AC-GACTAGGTAAT-CTTGCTT---------G-TCGTATACACAATTACACCG-G-TTCG--C-GTCC-TGAAATTTTCTAAA--TT-CCTATTAAATCTT-TCTCATCCTTTTTTTCCAAAAA-GA--------C-----CA-ATC-GGGT-----GGAAAGCCATCTATTGGGTCGCCAAGACATATT-AGGATCCACTAGtctgcacaacgccgagaatataatggactcact
gi|11 : atCTT--TGA--AA-T-TAG---G-T-CA-AGGT-CAA-GG--T-CAAG--------G-CATTC---A--AAA-ATC--TAAA-ACAA-AACTG-G-CA-T-----TT--TC-ATACTG--TTTTTCCT-AC---A-AG-G--GAT-ACTT---CTTG-A--AACATT-----T-AT-AAG----CAGAAGTAT--T-CATC--TATA-A----ATTG-CTTTTT-GAT-T-----G-GA-GA-ATTG-AA----TTAACATGAACATTT-GA--C
gi|13 : -ACCTTC----AG---TA----TCCTT-TTGT--G-AACCA-TATTTA--C-----TCGGCTT--TG-TGATGCCTT-TATAATGTC------A-AACTTT-ATTTT--TCATAGTATAATGACTATCCCA--T---A--AAGATTAAA--T-CCA--CGCTTCTATATGG--TCTCAGGCTCTC-AATC-TT--A-A-ATCATTGAACCTGTT-AA---GTTGCT----GAAACATGC--AAAAAAGGT-CA-------------AAA---C---GAGC-TCAAATCA-AATATGA-----GTTTTCAACCTTTT---AA------TGATA-TT-TTGAGGGC-A-A-AAAGA-TAAAGAAT-TAT-CGT---------T-ACCATCAAACAGT------GCA-TAGA--C-G---ATCAA---TTCTTAAACTT-TTTA-AAAAacatctataatttctgaatatacaatgagcaaacgatcgagataataaagttgtcataaatgaacgcgacatatcttgacacactcaaactagagactaagaaatgtcatagtggattctagcacaaatacctcttcagctgatttcgattactttaaaaaaatcacctt
gi|14 : TGGGCT---ACC-TTAAGCAAA-AGGAATCA-A-TG-G--CCCT----TT--ATG-A-TA-G-TTATTGC-CCCTT
gi|14 : AG--------GTCATCT---A--AAATAT----GTA-A--A-AA-TA-G-CA-T-----TT--TT-ATAGCT--TC--TCCT-GC---A-GG-A--GAT-A--C---Cannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaggtcatctaaaatatgtaaaaatagcatttttatagcttctcctgcaggagatacc
gi|15 : tgggctaccttaagcaaaaggaatcaatggccctttatgatagttattgccccttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-TG-A--CCCC----TT--A-A-A-GA-G-TCATTGC-CCCTTGAATTTT--A--------------------TA-AAATGG---ACTAAA----ATTA----AA-AAC-CATTT----GTC-A---------TA-GAGGC---A--CGCAACCAACTGCAA--T-GT--GA----T-T--AGTG-----AC-CTT-TGACCTT--GAA--AA-T------------A-AAGT-CAAAGG--T-CTAG--------GTCATAT---A--AAA-ATT--CG-A-A--A-AA-TA-T-CACT-----TT--TT-ATACCC--TTTTTCCT-AC---A-GG-A--GAT-A--G---CATGAA--AACG-G-----T-AT-ATG----CTCAAGTATTCT-CAT
gi|16 : ATTA---C-AA-GA--------------CA--T---GG-GGCAACCT----T----T------TA-----G--ACC--------CCT-AA-ACTTGAAA--AT-TAGGTCAAG-GT---CA-AAGATCA---TCAT-AAT----------------GATTAG-A--------T---T--------A-----TACAC-----ATTTTTAAG------ATGTTTTAGGTT-CTTTTC--A---------AATACA-G-T--GAAT-G----GCTTGA-CCTA-ACTG--T-GG-AACTTT----A----GA----TCCCT-TT-T--A-A--TACCAGTTA--------TTCTCTT--TG-ATAT--TTT-gt
gi|17 : A--TG---------GGACTTTCAG-CTTTCAAATCTTT--A-A-ATCATTGA-CCT--T--A---TTTTTTGGGGG-----T-C--AG----GGT-CAGAGATCACAGTCGAAAGT-C---AAGGTTCAT-TCA-TAT-TTAAAGACGTTTTCAACATTTG---CAGCTG-ATAATG-TT-TATAGGGT-CTG-AC-GC-TAGGAAAT-TTTGCGTGTTTGTTTCG-TTATTTACACAGT---TCT
gi|18 : -CACTATCCCTCTTTATCCGTAA-ATG---CAA-T---GT-G---C-A-T-CA--A------A-----CCTTTT-CT--AT------TC-T--ATAGAGGTCA--TT--T-AA-AA--G-A-A--TTT-AT-AGGGA-C---A----T---------T--AAAC--AAAA-AGAT-TCA-ATGG-CCC-T-TTAA-GAC-A----GTTA-TT-G-C-t
gi|18 : ttaattattacccaacgtcattgaccttagaccccttacagagttaagaatctttgttatA-AA---CCTTTTCTATT---C-T-AT-A-GAGGTCATTT-AAAAGA-AT-T--TATAGG-G---ACA-TTAAACAAA-AAGATTCA-A-TG-G--CCCT----TT--A-AGA-CA-G-TTATTGC-
gi|2 : ttaattattacccaacgtcattgaccttagaccccttacagagttaagaatctttgttatcactatccctctttatccgtaaatgcaatgtgcatc-TG-A--CCCC----TT--A-A-T-GAAG-TTATTGC-CCTTT
gi|2 : tagggctttccacctttctgtcctggaaaagtctattgttagagttctgtttcttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttccgccgtcaaaaaacaattttcgtttgaagactatttcaaaaaactttatagttcatccatataggacatcttgagaaatgattaaagtatcaccaacgtcatgtgacctGATG-GC-TACGACAA---CCTT----ATTGGATGC-ATTA-GA--TTAAT--AGCAGGGAT-T--AGTGGG-T---ACACACAAACGAACAGGATTCACA-TGGA--CCCC----TT--A-A-A-GA-GGTTATTGC-CCCTTAAATTTT--AAAAAAGATTTCTAT-GGCTCTAGAAATTG---AAAAAA----CCTG----AG-AAC-CGTTA-----TC-G---------TA-TGGGC---A--CGA-ACCAACTGCAA--TAGA--GA----TGT--AGTG-----AC-CTT-TGACCTT--GAA--AA-TCTAGT--G-T-CA-AGGTTCAAAGG--T-GAAG--------GTCAGTC---A--AAA-ATC--CTAA-A--A-A--T--G-CA-T-----TT--TC-ATACTT--T-TTTCCT-AC---A-GG-G--AAT-A--T---TCTTGA--AACC-T-----T-A--AAA----CAGAATCATA-T-CATA--T----A----ATTG-CTTTTTTGCA-T-----G-AT-AC-ATTGAAA----TT--C-TGAAC-TTT-GA--CC----C-ATTTCC------GAAT--TA---C---A-AT--GA-C-TAA-CGT-CAAAGC-T--TTATTACGCGC-A--CTCACAA---CTTG------------------CAACCGAAAAGT----CAT-A---GA-GA--C-G-C-AA--A------A-----CCTT---CAGTAT---G-ATT----A--------A--CTA-T-AA-AA-AATC-C--CTT-GC-AGTGA-G---ATGATT---------T--AACC--GACA-GGAT-CTA-AGGA-CCC-T-TACA-CAT-A----GTTA-CT-GCC-CCCTG-AACATC-T---------CATATATC--TGATTT-A-T--CCATA---------C-AGC--T---TTTACATTA---CAAA-GATATCA--AG----ACA--T---GGATACTGGTT--ATTAA--T------TACCCTTG--ACC--------TTT-GA-CCTT-ACA--TT-AAAGTCAAG-GT---CA-AA--TCAAGGTAAT-CATCACAAAACTTTGAAAAAA--AA-A--------T---TC-------A-----T--TTCAAA-GTCTTTTTG------A------A---T-ATATTT--A---------AATAAACA-T--AAAT-AG--TATTTGACCTCATA--A--A-AG-ACCTTTAATAA----TA----TCCTTGTT-T--G-A--CA-TATTTA--C----CTCCCTTTG-TG-AGAT--TTC-TATTATATTA-T---A-AAATTA-GTTTC--TT------TGATGACTAC------T---ATTAAGAA---A--T-CAA--TT---------GGACTTTCAG-CTTTT-AA-C-TT--A-ACATCATTAA-CTT--T-AA---TTTTTT----G-----T-C--AA----TGG-CA-------------ACAGT-C---AAGG-TCAT-TCA-TATGTTTAAAACA-TTTCAACATTCT---GA--CA-CTGAAA-TTATTGAGGGT-A-GTGC-TA-T----AAT-GTG-CGT---------G-TCGATT-CACA-T---ACTACC-TT-G--CTGTCCATGAAATTTTCTAAATTCT-ATTA-AAACCTTT-TCGCATCCtcataaagaaaccctttttaactacttctctttaactgatcaatgagatggctacgacaaccttattggatgcattagattaatagcagggattagtgggtacacacaaacgaacaggattcacatggaccccttaaagaggttattgccccttaaattttaaaaaagatttctatggctctagaaattgaaaaaacctgagaaccgttatcgtatgggcacgaaccaactgcaatagagatgtagtgacctttgaccttgaaaatctagtgtcaaggttcaaaggtgaaggtcagtcaaaaatcctaaaaatgcattttcatacttttttcctacagggaatattcttgaaaccttaaaacagaatcatatcatataattgcttttttgcatgatacattgaaattctgaactttgacccatttccgaattacaatgactaacgtcaaagctttattacgcgcactcacaacttgcaaccgaaaagtcatagagacgcaaaaccttcagtatgattaactataaaaaatcccttgcagtgagatgatttaaccgacaggatctaaggacccttacacatagttactgccccctgaacatctcatatatctgatttatccatacagcttttacattacaaagatatcaagacatggatactggttattaattacccttgacctttgaccttacattaaagtcaaggtcaaatcaaggtaatcatcacaaaactttgaaaaaaaaattcatttcaaagtctttttgaatatatttaaataaacataaatagtatttgacctcataaaagacctttaataatatccttgtttgacatatttacctccctttgtgagatttctattatattataaaattagtttctttgatgactactattaagaaatcaattggactttcagcttttaacttaacatcattaactttaattttttgtcaatggcaacagtcaaggtcattcatatgtttaaaacatttcaacattctgacactgaaattattgagggtagtgctataatgtgcgtgtcgattcacatactaccttgctgtccatgaaattttctaaattctattaaaaccttttcgcatcc
gi|20 : tagggctttccacctttctgtcctggaaaagtctattgttagagttctgtttcttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttccgccgtcaaaaaacaattttcgtttgaagactatttcaaaaaactttatagttcatccatataggacatcttgagaaatgattaaagtatcaccaacgtcatgtgaccttgaccccttaatgaagttattgcccttttcataaagaaaccctttttaactacttctctttaactgatcaatgaT--GAT--AA-T-TAAAGAG-C-CC-AGG--CAAAGG--TTCAAA--------GTCAT-T---A--AAA-ACT--C-AA-A--A-AA-TA-GGCA-T-----TT--TTCATACTG--TTTTTCCT-AC---A-GG-AT-AAT-AT-T---CTTGAA--ACGA-T-----T-ATAAAG----CAGAAG
gi|21 : agtgcacatgtgagaaataattttgttgA-----G--ACC--------CTT-GA-CCTTTGAC--CT-----TCAAA-GT------AAGGTCCAAGTCAT-CAT----------------GA--AATA--------T---TTTCTTTTCA-----T--TTCTAAGGTCATTAAG------A------T---T-ATTTTT--A---------AGGACA-A-T--AAAT-AT--AATTTGACCCCA-A--A--ATGG-ACCTTT----A----CA----CCC
gi|22 : cattaCTACTCCTACTAAACCAAAA-GT----CAA-A---AA-GA--A-A-T-GA--T------A-----CCTT---TT--AT---G-ATT-T--A-----GTCA--CTG-T-AG-AA-CA-C-C--CTT-GC-AATGA-C---A--AAT---------T--AATG--GAAG-GGAT-ATG-ATGA-CCC-T-TAAA-CAT-A----GTTA-TC-G-C-CCCTa
gi|23 : AA-GT----CAT-A---GA-GA--C-A-C-AA--A------A-----CCTT---CA--GT---G-ATG-T--A-----TTAA--CTA-T-AA-A--CA-CTC--CTT-GC-AGTGA-G---A--GTT---------T--AACC--GAGG-GGAT-CCA-AGGA-CCC-T-TACA-CAT-A-----TTA-TT-G-C-CCCAG-AAAGTA-T---C-----CA-ATATCATT
gi|24 : CTACTCCAACTGAAATGAAA-GT----CAT-A---GA-GA--A-G-A-AA--A------A-----CCTT---CA--AT---T-ATT-C--A-----TTAA--CTA-T-AA-AA-AT-C-C--TTT-GC-GGTGA-G---T--GTT---------T--AACC--GAAA-GGAT-ATA-AGGA-C
gi|25 : aaaagcttattatggT--TATTTGACTCTA-A--A--A-AG-ACCTTC----A----TATTTTTTTTT-TT-T--T-A--CA-TATTTA--C----TTCCCTTTA-TG-AGA---TTA-TATGATATT--T---ATAAAGT---TTTC--TT------TGAT-CCTAT------T---A--AAGATA--A--T-CAA--
gi|26 : -TG-A--CCCC----TT--A-C-G-GA-G-TTATTG
gi|27 : ttcgtttcaagacttatcgaaagactttatccttcatcacataggacatctcgagaaatgatcgcatatcaccctgcatctttgacctt----TT--A-AGA-CA-G-TTATTGC-CCCT--AATTTTTAAC----GATTTCTAA-G----TG-AAACAC---ATCAAA----CTTG----AG-ACC-CGTTA----ATC-G---------TA-TGGGT---T--CGGGACCAACTGCAA--T-GG--GA----T-C--AGTG-----AC-CT
gi|28 : CTCTA-A--A--A-AG-ACCTTA----A----TA----TCCTT-TT-T--G-G--TA-TATTTA--C----CTTTCTTTG-TG-AG-C--TTT-TATGATATT--T---A-AAATTT--TTTT--TT------T-AT-ACTACATGTATT---A--AAGAT---A--
gi|29 : --C-A-T-CA--A------A-----CCTT---TT--CT---A-ATT-T--A-------------A-A-AG-AA-TG--------T-AT-AGGGA-C---A--A-----------T--AAAT--GAAA-GGAT-TCA-ATGG-CCG-T-TTAA-GAC-A----GTTA-TT-G-C-CCCTattg
gi|29 : aaatgcaatgtgTT-AAAAGA-ATGT--A-TAGG-G---ACA-ATAAATGAA-AGGATTCA-A-TG-G--CCGT----TT--A-AGA-CA-G-TTATTGC-CCCTTtat
gi|3 : aaatgcaatgtgcatcaaaccttttctaatGATG-GC-CAATA-AA---CTTTT---ATTGGAT-TCAT-G-GAGGCTAATT-AGCGCG-AT-TTGGGTGGG-TGTGACA-ATAAACGAA-GGGATTCA-A-TG-AGACCCT----TTTGA-A-C-GAAG-TTATT-C-CCCTTGAATTTTT-AC----AATTTCTAT-G----TA-AATTGG---GAGAAA----ACTGTAAAAG-AACGTATTCT---GTC-G---------TA-GAGGC---AT-CGGGACCAATTGCAA--T-GT--TA----T-CCCAGTGGNNNNNN-NNN-NNNNNNN--NNN--NN-N-NNN---N-N-NN-NNNN-NNNNNN--N-NNNN--------NNNNNNN---N--NAA-ATT--TGAA-A--A-AA-TATA-CA-T-----TTA-TT-ATACCC--TCTTTCCTTAC---ACGG-AACGATTA--G---CATGAA--AACA-T-----TTAG-AAG----CT-AAGTATGCT-CATC--T-T--A----ATAG-GTA-CA-GTA-T-----A-ATAAA-ATTACAA----TT--T-TGAA---TT-GA--CCTATAA-ATT--A------GAAA--TA---C---A-AC--GA-TGTTG-CAT-TAAAAA-T-CTT-TTA-GC------------A---CTT-------ACTCTTACTACTAA--CAAAA-GT----CAA-A---AA-GA--C-A-T-AA--A------A-----ACCTGTACG--AT---G-ATT-T--A-----GTCA--CTGCT-AA-AA-CG-C-T--CTT-GC-AGTGACA---A--AAG---------T--AATG--GAA--GGAT-CTG-ATG---CC-T-TAAGCCAT-A----GTTA-TC-G---CCCTGCAAAATCTT---A-----CA-ACATCGTTGTTTTCA-G--CT-TA---------TCAGC--T---TT-ATATTAGATC-AA-GATA--GC-AA----TCA--TTTGGG-AACCACAT--A-CAG--T------AA-----G--ACC--------TTT-GA-CCTTCAAA--TTCAAGGTCAA--GT---AA-AAGGTCAA-GTCAT-CAT----------------TA--AA-A--------T---T--------A-----T--TT-----G-CTTTAAG------A------A---T-ATTTTT--A---------AGGACA-ACT--AAAT-GT----CTTAACACCA-A--A--GTGG-ACCTTT----A----CA----TCCAT-TT-T--G-A--CA-CA-TTA--C----CTCCCCAT--TG-AGATTGTTT-TTTGATATT--C---A-AGATTTCATTTTTATT------TCAT-ACTAC------TAA-A--AAGAT---A--TGCAA--AGA--------AGATCATCAG-C-TTC-AAGC-TT--A-A-ATCA-TGA-CCT--T-TA---TTTTTTG---G-----T-C--A------GT-CA-------------AAAGTCC---AAGG-TCAT-TC--TATTTTTAAAAAATTTT-AAAGTTTT---CA--CA-GTAAGAGTT-TTGA--GT-A---AC-GA-TATAAAAT-TTC-CGT---------G-ATTTTTACACAAT---ACTGCATTTCT--C-ATTCATATAATTTTCTAAAAATT-TTT---AAATTTTGTTGAATCCATTTTTAC---ACATTT--------T-----CATATT--GGTG----GGAAAGCCCTCTAATTGTTCGC--AAACA-ATTCAGGAT-CACTAGTat
gi|32 : cgttatttacacagttcttcttgacccttattacggacgttattggcctattcatataaaaatccttgttagatcacgtacttctctttaactgttcaatgtta-GGTA--G--AG----TC---T---GG-T--CAC-T--A-CAGGCT------T------G--AAC--------CTT-GAATCTTGAAA--CTGAAGGTCAACTGT---CA-AAGGTCAACGTCAC-C-T----------------GA--AA-ta
gi|4 : GATG-GC-AATAA-AA---CTTTT---ATTGGAT-T-AT-G-GAGGCTAATT-AGCCGA-TT-T--GGTGGG-T---ACA-ATAAACGAA-GGGATTCA-A-TG-A--CCCT----TT--G-A-A-GA-G-TTATTGC-CCCTTGAATTTT--AC----AATTTCTAT-G----TA-AATTGG---AGAAAA----CTTA----AG-AAC-TATTT----GTC-G---------TA-GAGGC---A--CGGGACCAATTGCAA--T-GT--GA----T-C--AGTG-----AC-TTT-CGACCTT--GAA--AA-T-TAG---G-T-CA-AGGT-CAAAGG--T-CAAG--------GTCATAT---A--TAA-ATT--TGAA-A--A-AA-TA-T-CA-T-----TT--TT-ATACCC--TCTTTCCT-AC---A-GG-A--GAT-A--G---CATGAA--AACA-T-----T-TA-AAG----CTCAAGTATGCT-CATC--T-T--A----ATAG-GTATCA-GTA-T-----A-AT-AA-ATTACAA----TT--T-TGAAC--TT-GA--CCT---TAATT--A------GAAA--TA---C---A-AC--GA-T-TTG-CAT-TAAAAA-T-CTTGTTA-GCACTACCCT-NAAAAATCTTGTTAG-CACTACTCTTACTAAACCAAAA-GT----CAA-A---AA-GA--C-A-T-AA--A------A-----CCTT---CG--AT---G-ATT-T--A-----GTCA--CTG-T-AA-AA-CG-C-T--CTT-GC-AGTGA-C---A--AAG---------T--AATG--GAAG-GGAT-CTG-ATGG-CCC-T-TAGC-CAT-A----GTTA-TC-G-C-CCCTG-AAAATC-T---A-----CA-ACATCGTTATTTC-A-G--CC-TA---------T-AGC--T---TTGATATTAAT-C-AA-GATA--G--AA----TCA--T---GG-GACCACAT--A-CAG--T------CA-----G--ACC--------TTT-GA-CCTTCAAA--TT-AAGGTCAAG-GT---CA-AAGGTCAAGGTCAT-CAT----------------TA--AA-A--------T---T--------A-----T--TT-----GTCTTTAAG------A------A---T-ATTTTT--A---------AGGACA-A-T--AAAT-GT--CATTTAACACCA-A--A--GTGG-ACCTTT----A----CA----TCCAT-TT-T--G-A--CA-CATTTA--C----CTCCCCAT--TG-AGATG-TTT-TTTGATATT--C---A-AGATTT-ATTTTA-TT------TCAT-ACTAC------T---A--AAGAT---A--T-CAA--AG---------AGATCATCAG-CTTTC-AATC-TT--A-A-ATCATTGA-CCT--T-TA---TTTTTT----G-----T-C--AA----GGT-CA-------------AAAGT-C---AAGG-TCAT-TCA-TATTTTAAAAACATTTTAAAGTTTTT---CA--CA-GTAAGA-GT-TTGAGGGT-A-A-AC-GA-TAATAAAT-TTC-CGT---------G-ATTTTTACACAAT---ACTGCA-TTCT--C-ATTCATATAATTTTCT-AAATTT-TTTA-AAAATCTT-TTGAATCCATTTTTTC---ACA-TT--------T-----CATATT-TGGT-----GGAAAGCCCTCTAATTGTTCGC--AAACA-ATT-AGGAT-CACTAGT
gi|5 : -TGACC-TTC-GA--CCT---C-CTT--A------GAAAGTTA---T---A-A----A-C-CCT-TGTATAAAAA-TTCTTGTTA-GC--------------------------ACTACTCCTCTTGAACTG-----T----CAA-ATGCGATGG--C-AAT-GA--A------A-----ACTT---TA--TT---G-AAT-T--A------------TA-T-AG-----G-C-CAATTA-GC-AG-GA-A---T--AGTGGGGTACAAT--AAAC--GAAA-GGATTCAA-ATGA-CCCCT-TAAA-AGT------GTTA-TT-G-CACCCTT-GAATTT-T---A-----CG-AT-------TTTT-C-T--CC-TAATAAAAAGAT-AGCAAT---TT--CGTCA----------TA--G--AG----GCAAAT---GG-TACCGACT--G-TAA--TGGTTGATA-----GTAACC--------CTT-TA-CCTTGAAAAATT-CAG-TCAAG-GT---CA-AAGGTCAAGGTCATACAA----------------GA--AA-A--------T---
gi|5 : tgttagggctttctacctttctgtggaaagtcccaattgttatgttcagtttaattattattttcctgtagttcaaaaatcgttttttgtttgaaagaccttattgatagaacctcctctacatcattaaatagtacttctcgagaatcgatcaaatttaacctcaacgttatGATG-GC-AATGA-AA---ACTTT---ATTGAAT-T-AT-A-TAGGCCAATT-AGCAGG-AA-T--AGTGGGGT---ACA-ATAAACGAA-AGGATTCA-AATG-A--CCCC----TT--A-A-AAGT-G-TTATTGCACCCTTGAATTTT--AC----GATTTTTCT-CC---TA-ATA------AAAAGA----T-------AGCAAT---TTC----GTC-A---------TA-GAGGC---AAATGGTACCGACTGTAA--T-GGTTGA----T----AGTA-----AC-CCT-TTACCTT--GAA--AAAT-TCA---G-T-CA-AGGT-CAAAGG--T-CAAG--------GTCATAC---AAGAAA-ATG--TGAA-A--A-AA-T--G-CA-T-----TT--TT-TAATCA--TCTTTCCT-GC---A-GGAA--GATAA--C---CATTAA--AACA-T-----C-AT-ATG----CTCAAGTAT-CT-CATC--C-TACA----ATAG-GTCTCA-GTG-T-----A-TA-AA-ATTATAA----TC--C-CGAAC-TTT-GAACCTT---T-GTT--A------GAAA--TA---C---A-AA--GA-T-TCG-CATAAAAAAA-T-CTTGT-------------------------T--A-CACTACTCCTACATAACCAAAA-AG----CAA-A---GA-GA--CAA-T-GA--A------A-----CATT---CA--AT---T--TT-T--A-----GTCAC-CTG-TAAA-AA-CA-C-C--TTG-AA-AGTGA-GA--A--AAT---------T--AACG--GAAG-GGAT-CTGTATGC-CTC-T-TTAC-TTT-A----GTTA-TT-G-C-CCCTG-CAAGTC-T---AC----CA-ACATCgtgaaaaaatgcattttttaatcatctttcctgcaggaagataaccattaaaacatcatatgctcaagtatctcatcctacaataggtctcagtgtataaaattataatcccgaactttgaacctttgttagaaatacaaagattcgcataaaaaaatcttgttacactactcctacataaccaaaaagcaaagagacaatgaaacattcaatttttagtcacctgtaaaaacaccttgaaagtgagaaaattaacggaagggatctgtatgcctctttactttagttattgcccctgcaagtctaccaacatc
gi|6 : tgttagggctttctacctttctgtggaaagtcccaattgttatgttcagtttaattattattttcctgtagttcaaaaatcgttttttgtttgaaagaccttattgatagaacctcctctacatcattaaatagtacttctcgagaatcgatcaaatttaacctcaacgttattgaccttcgacctccttagaaagttataaacccttgtataaaaattcttgttagcactactcctcttgaactgtcaaatgcAA--T-GG--GA----T-C--AGTG-----TCTCTT-TGACCTT--AAA--AAAT-TAG---GGTGCA-AGGT-CAAAGGG-T-CACGCGTTGTTAGCCATTTTCTATTACA-ATTATCAAATA--ATAA-TT-G-CA-TGCTTGTTCATC-ATACTCGTTCTTTCCT-ACTCGA-GG-G--AAT-A--TGGCCTT--A--AACA-TGATTCT-AT-A-G----CAAAAGTATG-T-AGGA--T-A--A----ATTGCGTATCA-GCA-T-----AGAT-CACATTG-AA----TT--C-TGAAC-TTTTGA--CCT---A-TTT--C------CGAT--TAACTC---ACACTGGA-C-TAAACGT-CAAAAA-G-CTT-TTA-AT-CTG--CT-ACA------TAT----CGCGAG----ACTGAAACGAAA-GTGTAGCGATA---GA-GAGTC-A-TCAA--A------AGAGGTCCTT---CA---T---A-A------A--------A--CTA-T-AA-AAACC-C-C--TTT-GC-AGTGA-G---G--AGT---------TTAAACCG-GAAGAGGATACCA-AGGA-CCC-T-TACA-CAT-AAGCGGTTA-TTAG-C-CCCTG-GAAATA-G---AATTCCCA-ATTCCATTATATT-AGG--CC-TA---------T-ACC--TCTCTTAGCATTA---C-AC-GATA--G--AGGACATCG--G---GG-CACCACTT--AGTTG--T------TA-----C--ACCCCCTTGAGCTT-GA-CCTTCAA----T-AAGGTCAAC-GCGTACA-AA---CA--GACAT-CAT----------------CA--AA-AAGCTTAGTT---T--------A-----T--TT-----ATCTTCCAA------AT-----G---T-CTCTTT--AGAATTAAAGAGGACATT-T--AAAC-ATAATATATGACCATT-A--A--A-AG-AC--TC----G----CAATAGTCCTC-TT-TCCGCA--CA-ATTTTA--CTTGGCTCTCTTTG-TG-AAGT--TTTCTATGATATT--T---A-
gi|7 : gATGAGC-ATCGA-AA---TTTTT----CTGTCT-G-AT-A-GAGGTCATTTTAGAAGA-AT-G--AATAGG-T---ACG-TAAAAC--A-GGGATTCA-AATG-G--CCATAAATTT--A-GGA-AA-G-TTATT-T-CCCTTG--TTTT--ACCT--AATTCTTAAAG----TA-AAACAC---GTGAAA----CTCG----AG-AAT-CATTA----ATCCG---------TA-CAGG---------GAACTAACTGGAAAAT-GG--GA----T-T--AGAG-----ACACTT-TGGCCTT--GAA--AA-T-TGG---G-T-CA--GGT-CAAA--------------------TATGT---A--AAA-ATT---GAC-A--A----------------------TT-GT------TCT-----------G-AG-A--GAT-A--C---CCTCAA--A-CA-T-----G-AT-AAG----CATAAGTATTTTTCATC--T-T--A----ATTA-GTATCG-GCGGT-----A-AT-TA--TTACAAA---TT--T-TGAAC-TTT-GA--CCT---C-ATC--A------GAAC--TA---C---G-AT--GATT-TTG-TGT-CAAAAA----TTGTTA-GTGCTA--CT--------CTAGG--A--A-----------GAACCTAAA-GT----CAA-A---GACGA--C-A-T-AT--A------A-----ACTT---CA--AC---G-ATT-T--A-----TTCA--CAA-TAAA-AA-TA-T-C--CTT-ACGAGTAG-G---A--GAT---------T--AACCCGAAAG-GGAT-GTA-AAGA-CCC------A-C-T-A----GTTATTT-G-C-CCCTG--AAGTA-T---C-----CA-GTATCATttgcttaatatatattaa
gi|8 : caca-AAAA---CTGTT--AGCACTACTCTTTTTTAACTG-----T----CAA-C---GA-GA--T-GGC-AATGA------A-----CCTT---TA--TT---GGATTAT--A-----GAGG--CTAAT-TA-GC-CG-G-T--CT-----AGTGG-GTACA--A-----------T--AAAC--GAAG-GGAT-TCA-ATGACCCC-T-TAA---AG-A----GTT--TT-G-C-CCCTT-GAATTT-T---A-----CA-ATTTCa
gi|8 : aggcttttccaaccttctgtggaaagtcctattggatattgttctttctgcgtcaaatgctttttttgttgttgaagacgtttattggaaaaaattatactacttcaaatcatataagtacttctctcgagaatgtcgtcaatatatcaccccaacgtcatttgacctttgatcccttatacggaagttattggtctttgttataGATG-GC-AATGA-A----CCTTT---ATTGGAT-T-AT-A-GAGGCTAATT-AGCCGG-TC-T--AGTGGG-T---ACA-ATAAACGAA-GGGATTCA-A-TG-A--CCCC----TT--A-A-A-GA-G-TT-TTGC-CCCTTGAATTTT--AC----AATTTCTAT-G----TA-AAATGGAAAAAAAAA----CTTA----AG-AAC-AATTT----CTC-G---------CA-GAGAC---A--CGGGAATAACTGCAA--T-GT--AA----T-C--AGTG-----AC-CTT-TGACCTT--GAA--AA-T-TAG---G-T-C---------AAGG--T-CAAG--------GTCATAT---A--GAA-ATT--TGAA-A--A-AA-TA-T-CA-T-----TT--TGAATACCC--TCTTTtatgtaaaatggaaaaaaaaacttaagaacaatttctcgcagagacacgggaataactgcaatgtaatcagtgacctttgaccttgaaaattaggtcaaggtcaaggtcatatagaaatttgaaaaaatatcattttgaataccctcttt
gi|9 : aggcttttccaaccttctgtggaaagtcctattggatattgttctttctgcgtcaaatgctttttttgttgttgaagacgtttattggaaaaaattatactacttcaaatcatataagtacttctctcgagaatgtcgtcaatatatcaccccaacgtcatttgacctttgatcccttatacggaagttattggtctttgttataaaaactgttagcactactcttttttaactgtcaacgaGATG-GT-AACAT-GA---CCTTT---ATTGAAT-T-AT-A-GAGGTTAATT-AGGAGG-AT-T--AGTGGG-T---ACA-ATAAACAAA-AGGATTCA-A-TG-A--CCCC----TT--A-A-A-GA-G-TTATTGC-CCCTGAAATTTT--AC----GATTTCTAA-G----TA-AAATGG---AAAAAA----CTTG----AG-AAC-CGTTA----ATC-G---------TA-TAGGC---A--CGGAACCAACTGCAA--T-GA--GA----T-T--AGTG-----AT-CTT-TGACCTT--GAA--AA-T-TAA---G-T-CA-AGGT-
7 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|12 ): NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTATTTTTCTGCCATGAAAAAAATATGTTTGAAGACTTGTCGAAACACTTCATAATTCATCACATAGCACATCTCCAGAAACGATCACATATCACCCAACGCGATTGACCTTTGACTCCTCCCGGAGTTTTGAACTTTGTGTAAGAATCCTTGTTAGCACTGATCCTCTTTATCCATTAATGCAATGAACATAAAACCTTTTCTTTTCTATAGAAGTCATAGAGAAGAATCGATAGGTACATTA
Unaligned ( gi|19 ): ATTAGGGCTTTCCATCTTACTGTGGAAAGTCCTATTGCTTTTCTTCTGTTTCTTCTTAATATTTTTCAGCCGTCAAAAAAAATTTCATTTCAAGACTTTATAATTCATCATATAGGAAATCTCGAGAAATGAATAATTATATCACCCAACGTCATTGAACTTTGACCC
Unaligned ( gi|30 ): AGGACTTTCCACCTTCTTGTGGAAAGTCCTATTGTTACAATTGTTCTGTTATTATTTTCCTGTCGTCAAAATAAAGTTTCGTTTCAAGACT
Unaligned ( gi|31 ): ATTGGTTTCCACCTTCCTGTGGAGAATCCTAATGTTCTTGCTGTGTTTCTTATCATTTTCCTGCCGTCAAAAGAAAACTCGTTCCAACAC
Unaligned ( gi|33 ): AATAGCATTTTTCATATTTTTTTTTCAATAGGAAGATATATATTGAAACCATCTAAAGTAGAA
Unaligned ( gi|34 ): GGGCTTTCCACCTTTCAGTGTTATTGTTATTGTTCTGTT
Unaligned ( gi|35 ): TAGGGCTTTCCACCTCCCTATGGAAAGTCCTATNN