lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 2 1 11 11111 111 111111 11111111111 3333333333333333333333333333333333333333333333333 333333333333333333333 222222222222222222222 444444444444444444444444444444444444444444444444444 2222222222 11111 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 11 1
lowQualScore : 3 2 4 66 77777 8 1 1 2 1 22222 1 1 1 6666666666 11 1 22 1 333 22222 111 22222 3 11 555555 66666666666 11 2 3333 11 111 1 22 2 66666666666666 777777777 1 1 11 1111111111111111111111111111111111111111111111111 1 1 11 22 3333 555555555555555555555 22 1 0 33333 111 22 0 0 33 0 22 22 6666666 22 1 1 2 9999999 1 000000000000000000000 222 11 33 444 555555 1 5555 3 0 888 1 111111111111111111111111111111111111111111111111111 44444 22 1 2 9999999999 33 2 7 4444 33 77777 2 77777 2 7777 2 2 4444 22 55 9999 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 22 222 1 3333 1 22 4444444 1 11 00 444444 1 33 8888 222 2222 111 222 6 1 1 2 22 66 1 6 22 99 2 2 2 6 2 99 2 5 33
lowQualScore : . . . .. ..... . . . . . ..... . . . .......... .. . .. . ... ..... ... ..... . .. ...... ........... .. . .... .. ... . .. . .............. ......... . . .. ................................................. . . .. .. .... ..................... .. . . ..... ... .. . . .. . .. .. ....... .. . . . ....... . ..................... ... .. .. ... ...... . .... . . ... . ................................................... ..... .. . . .......... .. . . .... .. ..... . ..... . .... . . .... .. .. .... ......................................................................................................... .. ... . .... . .. ....... . .. .. ...... . .. .... ... .... ... ... . . . . .. .. . . .. .. . . . . . .. . . ..
lowQualScore : 0 0 7 55 77777 3 3 3 5 1 99999 1 1 1 3333333333 55 1 66 1 777 66666 888 66666 1 44 888888 77777777777 33 9 1111 44 888 0 44 1 22222222222222 777777777 1 1 55 6666666666666666666666666666666666666666666666666 0 0 44 88 2222 333333333333333333333 00 7 9 66666 555 11 9 9 11 9 55 22 4444444 44 0 0 1 8888888 1 444444444444444444444 999 88 55 555 333333 5 4444 2 3 555 7 000000000000000000000000000000000000000000000000000 88888 66 9 1 5555555555 11 2 6 4444 11 22222 2 88888 2 3333 2 4 8888 88 66 3333 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 44 888 5 3333 5 11 6666666 4 99 66 000000 4 88 5555 333 8888 888 000 2 0 0 6 00 11 5 4 55 00 0 0 0 6 1 99 5 0 44
consensus : ATCAGAAGACGANACA-CACAATANT-ATAATATA-CA-AT-TA-TGG-AC-----TGTT-T-AG-C-------A--G--GG-AG--A-CAT--CAC-----A---A-----ATT-A--T---C--AGGT--------CGTA--G-TA----GG--GTT---A-T--C-AC--------------C-C--GA---G-G-G--C-GC--CTA--T------------GC--GC-CCGA-G-------G--G-TGA-T-AAC--C--C----TA------C--T-AC-G--ACC-TGA--T-AA-T-----T---TG--TGATG-T-C--T-C--CC--T-------G--CT-A-AACAGT-C---C---A-TAAT--A------------GT---T-T-TA--T--T---AT---C--C-T----GAAGA-ATCT---AA-AAA---G----T-----------A--------AA-A---AAAAA-------C--TATCT-----TGA--A-A-A-CA-----T-TT--C-TTGACTTGA-T--T--TTTT-----AT-G-----TA-AAA---CGTC-A-TCAA--G-ATC-GT--AACAA---CTTTTT---C--AAAGTNANATNNTGNNNNACANNGCGNGAGNCNTNAGANANNCNCGNNACGCGNANACNTCGCGNNNNNNNTTNCGGNGCTANT----T--------ATC--AT---CT-AAAGG----GAGA-CAA--CA-------CA-GT--TGT-CA------C-C--CCG-CG---CGT----GAGGGA---GACA--TCAC-GA-ATTATC-TCCC-TTC--A-CG-TGACCA--GCC-CT-A-G-ACCAAT-GAAANTGACTG-T-A--TTATTCTGAAGGATAATAA
Reference ( gi|7 ) : ATCAGGAGACAAAACA-CACAATACT-ATAATATA-CA-AT-TA-TGG-AC-----TGTT-T-AG-C-------A--G--GG-AG--A-CAT--AAC-----A---A-----ATT-A--T---G--AGGT--------TGTA--G-TA----GG--GTT---A-T--C-AC--------------C-C--GA---G-G-G--C-AC--CTA--T------------GT--GC-CTGA-G-------G--G-AGA-T-AAC--C--C----TA------A--T-AC-A--ACA-TGA--T-AA-T-----T---TG--TGATG-T-C--T-C--CC--T-------G--CT-A-AACAGT-C---T---A-TAAC--A------------GT---T-T-TA--T--T---AT---C--C-T----GAAGA-ATCT---AA-AAA---G----T-----------A--------AA-A---AACAA-------C--TATCT-----TGA--A-A-A-TG-----C-TT--C-TTGATTTGA-T--T--TTTT-----AT-G-----TA-AAA---TGTC-A-TCAA--G-ATT-GT--AACAA---TTTTGT---C--AAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----T--------ATC--AT---CT-AAAGG----GAGA-CAA--CA-------CA-GT--TGT-TA------C-C--CCA-TG---CGT----GAGGGA---GACA--TCAC-GA-ATTATC-TCCC-TTC--A-TG-TGACTA--GCT-CT-A-G-ACCTAT-GAAATCGACTG-T-A--TTATTCTGAAGGATAATAA
gi|23 : ATCAA-AGACAAACAA-CATATTTCTTATAATATA-CA-AT-TA-TGG-AC-----TGTT-T-AG-C-------A--G--GG-AG--A-CAT--CAC-----A---A-----ATT-A--T---C--AGTT--------CGTA--G-TA----GA--GTT---A-T--T-AC--------------C-A--GA---G-G-G--C-GT--CTA--T------------GC--TC-TCAA-G-------G--A-TGA-T-GAC--C--C----TA------C--T-A----------------AA-T-----C-------------C-CA-T-C--CC--T-------G--CT-A-AACAGT-
gi|30 : atTTAGAAGA-GAGACATCACAA-----ATA-TGTA-CA-TT-TA-TGG-AC-----TGTT-T-AG-A-------A--G--AG-AG--A-CAT--CAC-----A---A-----ATC-----------GGGT--------TGTG--G-Tt
gi|18 : cttgacttccaaaggaggaacaacatcttattcagttgtgtacatttatggactgtGATAATACA--ACTACATT-ATTATGTA-----T-TA-TGG-AC-----TGTT-T-AG-C-------A--G--GG-AG--A-CAT--
gi|15 : tacatgtatatatagatcgagtgacagtcagtactcaaactacttagtatgtaaaattatatacattatacaattatggactgtttagccggtgccagggagacataaaaaattatcaggtcgtagtggggttatcacccgaggaagcatgtgaaatgA-TACAAGAATGATAATATA-CA-AT-CA-TGG-AT-----TTTT-T-TG-C-------A--G--GG-AA--A-CAT--CAC-----A---A-----ATC-A--T---C--AAAA--------TGTA--G-TA----GG--CTT---A-T--C-AC--------------T-C--GA---T-G-G--C-GT--ATA--T------------GC--GT-CCAA-G-------G--G-TGA-T-ATA--C--C----TA------C--TAAC-A--GC--TGA--T-AA-T-----T---TG--TGGTG-T-A--T-T--CC--T-------G--CT-A-AACAGT-C---C---A-TAAT--A------------TT---T-C-TA--T--T---AA---C--C-T----GAAGA-ATCT---AA-CAA---G----------------A--------AA-ATAGAAAAA-------C--CTTCT-----TGA--A-A-A-CA-----T-TT--A-TTGATTTGATT--T--TTTT-----AT-G-----AAGAAA---CATC-A-TCAC--A-ATC-GT--AAAAACATTTTTAC---C--GAActaaaaatctatcttgaacatgtttcttgactttattctttttatgtatgtctttactaaaaacg
gi|38 : aacaatattatgcattcttaagctaACAAGATC-ACAATATA-CA-AT-TA-TGG-AC-----TGTT-T-AG-C-------G--G--GG-AG--G-CAT--CAC-----A---A-----ATT-A--T---C--AGGT--------CAAA--G-TA----GG--GTT---A-T--C-AC--------------C-C--GA---G-G-G--C-GC--CTA--aaaacgaggctga
gi|18 : gagttatctcagtgataATA-T-ACATTATA-CA-AT-TA-TGG-AC-----TGTT-T-AG-CCGGTGCCA--G--GG-AG--A-CAT--AAA-----A---A-----ATT-A--T---C--AGGT--------C-----G-TA----GT--G--------------------------------------G-G-G--T------TA--T-------------C--AC-CCGA-G-------G--A-AG-------------------------------------CA-TGT--G-AA------------A--TGATG-T-C--T-C--CC--T-------G--CT-A-AACAGT-C---C---A-TAAT--ACATAATAATGTAGT---T-G-TA--T--T---AT---C--C-T----AAA-A-ATCT---A----------------------------------------------------------TCT-----TGA--A-C-A-TG-----T-TT--C-TTGACTTTA-TTCT--TTTT-----AT-G-----T----A---TGTC-
gi|29 : tacatgtatatatagatcgagtgacagtcagtactcaaactacttagtatgtaaaattATAGT-AT--TATA-CA-CT-TA-TGG-ACATGACTGTT-T-AG-T-------A--G--AT-AG--A-CAT--CAA-----A---ATATATATT-A--T---C--AGGT--------CGAA--G-TA----GG--GTT---A-T--C-AC--------------C-C--GA---T-G-G--C-GC--ATA--tttactaaaaacg
gi|4 : attgcaatattatattacatttatcatgtaaaatT-ATAATG-A-CA-GA-TA-TGG-AC-----TG-T-T-AG-C-------A--GGTGG-AG--AGCAT--CAC-----A---A-----ATTCA--TATAG--AGTT--------CAAA--A-TA----GG--GTT---G-T-----C--------------C-C--GA---G-G-G--C-----------------------GT--GA-GTGG-G-------T--G-ATA-TAAAC--C--T----TA------C--T-AA-G--ACCTTGAT-T-AA-T-----TATATGTTTGATT-T-C--T-C--TCCAT-------GA-CT-A-ACTAG--CAAGC---A-TGAG--A---------------------TA-----T---AT------C-T----AAAG---TC-----A-TAA---G----G-----------A--------AA-C---AAAAA-------A--TATCT-----TGA--A-A-ggg
gi|5 : agatttaaggtcacaggctcatcaaagccacccataaattcagaatgagtgaacaggctctctcgaagaactattataatgaactgtagatactgtcacaaacacaataaagttaaaaccacagaactgtcaagcagttactgtcaaaaggaatatcacgtctatactgtagagcatgtcaaagacactgttcaaaatatttttcttgacatgaactattaatcctatgttgtcactacttgagcatggatccagtgcggatcta-ATAATAAAACT-AT-TA-TGG-AC-----TGTTAT-AG-C-------A--G--GG-AG--A--AT--CAC-----A---A-----ATT----T---C--AGTC--------T-TA--G-TA----GG---TT---A-T--C-AC--------------C-C--TC---G-G-G--C-GC---TA--G------------GCC-GCTCCG-------------G-TGA-T-AAC--C--C----TA------C--C-TT-G--ACC-TGA--T-AA-T-----A---TG--TGATG-TCC--T-C--GC--C-------G--CT---AACAGT-C---C---A-TAAT--T------------GTATAT-T-TG--T--TTCAAT---A--G-TTA--AAAGA-ATTT---AA-AAA---A----T-----------A--------AA-tctaaaaagtaataaaaaagaaaacaaaaatctcttgaaaaaacttttcc
gi|1 : tac-ACAATATA-CA-AT-TA-TGG-AC-----T-CT-T-AT-C-------------GG-A---A-CAT--CAC-----A---A-----ATTTA--T---A--AGTC--------TTTA--G-TA----GG--GTT---A-T--C-AC--------------C-T--GA---G-G------------------------------------------------G--G-TGA-T-AAC--C--C----TA------C--T-AA-G--ACT-TGA--T-AA-T-----T---TG--TGATG-T-C--T-C--CC--T-------G--AT-A-AACAGT-C---C---A-TAAT--A------------GT---T-T-TA--T--T---AT---C--A-T----GAAGA-ATCT---AA-GAA---T----T-----------A--------AA-A---AAAAT-------C--TTTTT-----TGA--A-A-A-CA-----T-TT--C-TTGACTTGA-T--T--TTTT-----GT-G-----TA-AAT---TGTC-A-TCAA--G-ATT-GG--AACAA---CTTTcctgaagaactaaaaagtattttttttaaaaattatctaaaacattttttgacttgattttttatgtaaaacgtcatcaagatcgtaaacaactttttctacaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgtttctgacccattatcatctacagggaacaacacattgtcccaccagcgcgtgagggagacatcacgaattatctcccttcacgtgaccagcctggacaataaagtgactgtaattatttaaaggataataa
gi|1 : tcacagacaatacaaagtatgtcagtaatgtgggtgtg-ATAATAAAACT-AT-TA-TGG-AC-----TGTT-T-AT-C-------A--G--GG-AG--A-CAT--CAC-----A---A-----ATT-A--T---C--AAGT--------CTTA--G-TA----GG--GTT---A-T--C-AC--------------C---------------------------------------------C-CTCA-G-------G--T--GA-T-AAC--C--C----TA------C--T-AA-AG-AC--TTA--TAAA-T-----T---TG--TGATG-T----T-C--C-----------G--AT-A-AG-AGT-C---C---A-TAAT--T------------G----T-A-TA--T--T---GT---C--tcctacaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgtgatgtatttcttcgctaattagcatctaaagggagacaacacagttgtcaccctgggcatgagggagagatcacaaattatctcccttcacatgaccagccctagacaaattgactttattattctgaaggatgattatattcaattatggactgtttatcagggtgatatcataattatcaggttgaagtagggttatcaaataagggtgcctatgcagtaagacatacaagtattcagttcagcgcccatgaaattcttacttttcctttgaaatagt
gi|11 : tcacagacaatacaaagtatgtcagtaatgtgggtgt-ATAATAAAACT-AT-TA-TGG-AC-----TGTT-T-AG-C-------A--G--GG-AG--A-CAT--CAC-----A---A-----ATA-A--T---C--AGGT--------CTTA--G-TA----GG--GTT---A-T--C-AC--------------C-C--TC---G-G-G--C-GC--ATA--G------------GT--catgaagaatctaagaattaaaaaaaatcttttttgaaaacatttcttgacttgattttttgtgtaaattgtcatcaagattggaacaacttttcctacaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgtgatgtatttcttcgctaattagcatctaaagggagacaacacagttgtcaccctgggcatgagggagagatcacaaattatctcccttcacatgaccagccctagacaaattgactttattattctgaaggatgattatattcaattatggactgtttatcagggtgatatcataattatcaggttgaagtagggttatcaaataagggtgcctatgcagtaagacatacaagtattcagttcagcgcccatgaaattcttacttttcctttgaaatagt
gi|16 : -ATATTATA-CA-AT-TG-TGG-GC-----TGTT-T-AG-C-------A--G--GG-AG--A-CAT--CAC-----A---A-----ATT-A--T---C--AGGT--------CATG--G-TA----GG--GTT---A-T--C-GC--------------C-A--AA---G-G-G--T-GC--CTAGGTGTCCAAGGAAAGGT--GC-CTGA-T-------A--G-TAA-T-AAC--C--C----TA------C--T-AA-G--ACT-TGA--T-AA-T-----T----------TG-T-C--T-C--CC--T-------G--CT-A-AGCAAT-C---T---A-TAAT--A------------GT---T-T-TA--T--T---AT---C--C-T----GAAGA-ATCT----A-AAA---G----A-----------A--------AA-A---AAAAA-------T--TAcctaaacaatccaaaaagtccaaaaaaaaactatcttgaaaatatttctcgactcgattttttgtgtaaatcgtcatcaagatcgtaacaattttttctacaaatagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatttctgcactaattatcatctaaagggagacaacacagttgtcaccccgcacgtgaggaagacatcgtgaattatctcccttcaagtgaccagccttagaccaatgaaattgactgtattattctgaaagataat
gi|16 : gaaaatttatttgaattttttgctgaaaaatttgctacaatcttgtcgatatt-ATAATAAAACT-AT-TA-TAG-AT-----TGCT-T-AG-C-------A--G--GG-AG--A-CA---------------A-----ATT-A--T---C--AAGT--------CTTA--G-TA----GG--GTT---A-T--T-ACTATCAGGCACCTTTC-C--TT---G-G-A--C-AC--CTA--G------------GC--AC-CCTT-T-------G--G-CGA-T-AAC--C--C----TA------C--C-AT-G--ACC-TGA--T-AA-T-----T---TG--TGATG-T-C--T-C--CC--T-------G--CT-A-AACAGC-C---C-------AC--A------------AT---T-G-TA--TAAT---AT---T--CAT----GAAGA-Atcatgaagaaaattgaaccgtttcagttaacattatttcaatatctatattttttttcattt
gi|2 : gaaaatttatttgaattttttgctgaaaaatttgctacaatcttgtcgatatttaattttttttttcttttagattcttcagg-ATAATAAAACT-AT-TAATGG-AC-----TG-T-T-AG-C-------AG-G--GG-AG--A-CAT--CAG-----A---A-----ATT-A--T---C--AGGG--------CTTA--G-CA----GGTTATT---A-T--C-AC--------------C-C--TC---G-GCGCTC-AC--ATA--G------------GC--GC-CCTC-G-------G--G--GA-C-AA---C--C----TA------C--T-TT-G--AC--TGA--T-AA-T-----T---TG--TGATG-T-CT-T-C--CC--T-------G--CT-A-AACAGT-T---C---A-TAAT--T------------GTATAT-T-TG--T--T---CG---A--C-T----GAAaattgaaccgtttcagttaacattatttcaatatctatattttttttcattt
gi|6 : ggcttcatcaaagcacattaaaacagaatgcaggtaaacaggctgaaatttaactgtagattctgttcccaacaaattaagtaaaccacagaacgtcaagcagtttacttgtcaaggacctactgtagactgtcaaagacatgttcacatattttctgcagaactgttaacctgtgttgtgttatctattgagcaagatg-ACAATATA-CA-AT-TA-TGGCAC-----TGTT-T-AG-C----------G--GG-AG--A-CAT--CA------A---A-----ATT-A--T---C--AGGT--------CGAA--G-TA----GG--GTT---A-T--C-A---------------C-C--GA---G-G-C--C-GC--CTA--T------------GC--GC-ATGGCGCCTC---G--G-TGACT-AAC--C--C------------A--C-TC-AAGACC-TGA--TAAA-T-----T---TG--TGATT-T-A--T-C--CT--T-------G--TT-A-A------------------------------------C---T-T-TA--T--T---AT------C-T----GAAG--ATCT---AA-AAA---------------------------------------AG-------T--TTTTC-----TGC--A-A-A-AC-----T-TT--C-TTGA-CTGA-T--T--TTTT-----AT-G-----TA-GAA---CGTC-A-T-AA--G-ATC-GCTAAACAA---GTTtatccgaagatctataaaaaaatcgaggaaaaaaatatcttgaatctctaaaaaagtaaaataaaaaaaaaaaattgaaaaacttttcttgacttgatttttttttaagtgtaaatgtcaatcaagtattggtaaccagaacgttttcttttacaaaaaaaggagtaaccagaagccttttcgaattatgacgtcatactaaga
gi|26 : ctgtttaacgaaaaattatattcaattcaaattctttattgcgtaacacacatgtaattggttattcccatgatggaatctagataacaatatttaaaaaaatacgtaaaataacatgggcatagtgtttg-ACAATATA-CA-AT-TA-TGG-AC-----TGTT-T-AG-C-------G--G--GG-AG--A-CAT--CAC-----A---A-----ATT-A--T---C--AGGT--------CAAA--G-TA----GG--GTT---G-T--C-AC--------------C-C--GA---G-G-G--C-G-----------------------------TGA-G-------GGTG-ATA-T-AAC--C--C----TA------C--T-AA-G--ACC-TGA--T-AA-T-----T---Tcttctacaaaaacgaccgaaagatttcgattgtgatgtacaactaattaaagagggcaaaactttacgtcaacagtacaattgataatttcagtcaactttccttgcgttccagtagctcacgtgaggagac
gi|43 : tgttgtgaactgagcatgtccagtcg-ATATTATA-TA-AT-TA-GGG-AT-----GGTT-T-AT-C-------G--G--GG-AG--G-CAT--CAC-----A---A-----ATT-A--C---C--AGGA--------TTTA--A-TA----AG--GCT---A-T--
gi|25 : caaaaatatcataatacaatgtacgtttg-ACAATATA-CA-AT-TA-TGG-AC-----TGTT-T-AG-C-------aa
gi|15 : cacagaactgtcaagcagttactgtcaaaggaactaactgtagaactgtcaaagacatgtcaaatattttctgcagaactattaacctgatgttgtgaactgagcatgtccagtcgTAATAGA-AATAT-TA-TGG-AC-----TGTT-T-AG-C-------A--G--GA-AT--A-CAC--CAC-----A---A-----ATT-A--T---C--AGCT--------GTTA--G-TA----GG--TAT---A-T--C-AC--------------C-C--TT---G-G-A--C-GC--ATA--T------------AC--GC-CATC-G-------A--G-TGA-T-AAG--C--C----TA------C--T-AC-A--TTT-TGA--T-GA-T-----T---TG--TGATG-T-T--T-C--CC--T-------G--CA-A-AAAAAT-C---C---A-TGAT--T------------G----T-A-TA--T--T---AT---C--
gi|10 : aacaatattatgcattcttaagctaatacaagaatTAATAAAACT-AT-TA-TGG-AA-----TGTT-A-AG-C-------T--G--GG-AA--A-CAT--CAC-----A---A-----ATT-A--T---C--AGGT--------CTTT--G-TG----AG--GTT---acctgaagaatctaacaagaaaatagaaaaaccttcttgaaaacatttattgatttgatttttttatgaagaaacatcatcacaatcgtaaaaacatttttaccgaaaaaacgaggctga
gi|3 : TATTATA-CA-ACACACTGG-AC-----TGTT-T-AG-CCC-----G--G--GG-ACTTA-CAT--CAC-----A---A-----AT--A--T---C--AAGG--------GGAA--GATA----GG--GTT---A-T--C-AC--------------C-C--GG---A-G-G--G-GC--CTA--T------------GCG-GC-CCGA-GCC-----G--GTTGA-T-AAC--C--CT---TA------A--T-AA-G--ACC-TGACCT-AA-TCGC--C---CG--AGTTT-T-C--T-C--TC--CGG-----G--CT-A-ACTAGTCC---C---C-TAGC--T------------CC---T-T-TATCT--T---AT---C--C-CCCTGGAAGACATCTTA-AA-AAA---GATTTT-----------T--------TA-A---GATAA-------T--TATCT-----TCA--ACA-ACCA-----T-TT--C-TTGACTTGA-T--TTGTTTT-----ATGG-----TA-AAAAACCGTC-A-TCAA----ATC-GT--AACAA---GTTTacctgaagaatctaaaacgtaaaagaaaacaattgtcatctatcttgaacacatttcttgacttgattttctttttacatgtaaaatgtcatcatcagatcataacaaacaatacggaaactttcagaaagtcacgtcaagcgtaaacattttgtagcatatttctgtgctaattatcgtctaaagggagacaacacagttgtcaccctgagcatgaggaagacatcacgaatatcttcccttcacgtgatcgtcaccctgagcatgagggagatgtcacgaattatctccctcacgtgatcaaacctagaccaatgaaattgactctattattctgaggggtaatatag
gi|9 : TAATATA-CA-AT-TA-TGG-AC-----TGTT-T-AG-C-------G--G--TG-GG--A-CTT--TAC---------A-----ATT-C--T---C--TGG----------GAA--G-TT----AG--GTT---T-T--CTTC--------------C-C--GA-----G-G--C-GC--CTA--T-------------C--GC-C-GA-G-------G-----TT-T-AAC--CTAC----TA------A--G-AC--------TGA--T--A-T-----T---TGT-TGAT--T-C--T----CC--T-------G--CTCA-AACAGT-C---C---A-T-AT--A------------GT---T-T-T---T-------T---C--C-T----GAAGATATCT---AA-ATATTTT----T-----------A--------AA-A---ATTA-----------TATCT-----TGA--A-A-A--A-----T-TT--C-TTGACTTGA----T--TTTT-----AT-G-----TA-AAA------C-G-TCAA--G--TC-GT--TAAAA---CTTTTT---C--tctacaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgtttctgcgccattatcatctacagggagactacacagttgtcaccaagcgcgtgagggagacatcatgaattatctcccttcacgtgaccagccctggaccaatgaaagtgactgtaattattctaaagaataataa
gi|5 : AATATA-CA-AT-TA-TGG-AC-----TGTT---AG-C-------G--G--CG-AGG-A-CAT--CAC-----A---T-----ATT-A--T---C--AGGT--------CAAG--G-TA----GG--GTT---A-T--C-AC--------------C-G--GA---GCG-G--C-----CTA---------------GC--GC-CCGA-G-------G--G-TGA-T-AAC--CTAC----TA------A--G-AC--------TGA----AA-T-----T---TG--TGAT--T-C--T-C--CC--T-------G--CT-ATAACAGT-C---C---A-TAAT--A------------GT---T-T-TA--T--T---AT---C--C-T----GAAGA-A-CT---AA-AAA---G----T-----------ATTTTTTTTAA-A---AAT------------TATCT-------A--A-A-A-CA-----T-TT--T-TTGACTTGA-T--T--TTTT-----AT-G-----TA-AAA---CGTC-A-TCAA--G-ATC-GTA-AACAA---CTTTTTCTAC--AAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTGT----TTCTGACCCATT--ATCATCT-ACAGG----GA-A-CAA--CA-------CA--T--TGT-CC------C-A--CCAGCG---CGT----GAGGGA---GACA--TCAC-GA-ATTATC-TCCC-TTC--A-CG-TGACCA--GC--CT-G-G-ACA-AT-AAAGT-GACTG-TAA--TTATT-TAAAGGATAATAAtacaaaacgagccggaaagctgcgaattgtgacgtcagaaagaatgaggcaaataacaacgtcaaacagtttaaatttcgaatcgtgtttctgcgctttatcatctcagggagaaaacacagtgtcaccccgcggtgaggagactacgaattaattccctttcacttgacagcaggaccaagaatgatgttatctaagaggatcat
gi|8 : tactttattttttaaattcttttaactattgaaacaAATATA-CA-AT-TA-TGG-AC-----TGTT-T-AG-C-------G--G--GG-AG--A-CAG--CAC-----A---A-----ATT-A--T---C--AGGT--------CGAA--G-TA----GG--GTT---A-T--C-AC--------------C-C--GA---G-G-G--C-GC--CTA--G------------AC--GC-CCGA-G-------G--G-TGA-T-ATC--C--T----TA------C--T-AA-G--ACC-TGA--T-AA-T-----T---TG--TGATG-T-C--T-C--CC--T-------G--CT-A-AACAAT-C---C---A-TAAT--A------------GT---T-T-------------------------------A-ATCT---AA-AAA---G----T-----------A--------AA-A---AA-AA-------A--TATGC-----TGA--A-A-A-CA-----T-TT--C-TTGACTTGA----T--TTTT-----AT-GTATCTTA-AAA---CGTC-A-TCAA--G-ATT-TT--AACAA---CTTTTT---C--
gi|2 : catgaaaaaagggaaataaaaaaaaattacaaaagattattttgatcgttaagttccgaggtagacagtcAATATA-CA-AT-TA-TGA-AC-----TGTT-T-AG-C-------A--G--GGAAG--A-CAT--CAC-----A---A-----ATT-A--T---C--A-GT--------CAAA--G-TA-----G--GTT---G-T--C--C--------------C-C--GA---G-G-G--C-GC--CTA--T------------GTGAGCGCCGA-G-------G--G-TGA-T-AATAAC--C----TG------C--T-AA-G--CCC-TGA--T-AA-T-----T---TC--TGATG-T-C--TCC--CC--T-------G--CT---AACAGT-C---C---ATTAAT--A------------GT---T-T-TA--T--T---ATTA-T--C-C----GAAG--ATCTATAAA-AAA---A----TCG---------A--------GG-A---AAAAA-------A--TATCT-----TGA--A-tacaaaaaaaacaaaaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgtttccgcacaattatcatctacatggagactaatagaatccttcattagtac
gi|58 : ggcttcatcaaagcacattaaaacagaatgcaggtaaacaggctgaaatttaactgtagattctgttcccaacaaattaagtaaaccacagaacgtcaagcagtttacttgtcaaggacctactgtagactgtcaaagacatgttcacatattttctgcagaactgttaacctgtgttgtgttatctattgagcaagatgttcagtcgaacaAATATA-CA-AT-TA-TGG-AC-----TGTT-T-AG-C-------G--G--tctctaaaaaagtaaaataaaaaaaaaaaattgaaaaacttttcttgacttgatttttttttaagtgtaaatgtcaatcaagtattggtaaccagaacgttttcttttacaaaaaaaggagtaaccagaagccttttcgaattatgacgtcatactaaga
gi|8 : tcTAAA-CT-AT-TA-TGG-AT-----TGTT-T-AG-C-------A--G--GG-AG--A-CAT--CAC-----A---A-----ATT-A--T---C--AGGT--------CTTA--G-TA----AG--GAT---A-T--C-AC--------------C-C--TC---G-G-G--C-GT--CTA--G------------GC--GC-CCTC-G-------G--G-TGA-T-AAC--C--C----TA------C--T-TC-G--ACC-TGA--T-AA-T-----T---TG--TGCTG-T-C--T-C--CC--C-------G--CT-A-AACAGT-C---C---A-TAA
gi|37 : catgaaaaaagggaaataaaaaaaaattacaaaagattattttgatcgttaagttccgaggtagacagtcaatatacaaTATA-CA-GT-TA-TGG-AC-----TGTT-T-AG-C-------A--G--GG-AG--A-CAT--CAC-----A---A-----ATT-A--T---C--AGGTCATTTAAATGAA--G-T-----GG--GTT---T-T--C-AC--------------A-A--GA---G-G-G--C-GC--CTA--atctaaaaagtaaaaaaaaatatgctgaaaacatttcttgacttgatttttatgtatcttaaaacgtcatcaagattttaacaactttttctacaaaaaaaacaaaaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgtttccgcacaattatcatctacatggagactaatagaatccttcattagtac
gi|13 : atactttttttgtccacagtctg-AT-TA-TGG-AC-----TGTT-T-AA-C-------A--G--GG-AG--A-CAT--CAC-----A---G-----ATT-A--T---C--AGGT--------TATA--A-TA----GT--GAT---G-T--C-AC--------------C-T--GA---G-G-G--
gi|9 : -TA-TGG-AC-----TGTT-TGAG-C-------A--G--G--AG--A--ATC-AAC-----A---A-----AT--A--T---C--AGTC--------T-TA--G-TA----GG---TT---A----A-AC--------------CTC--GG---C-G-A---------TA--G------------GC--GC-CTCG-G-------G--A-AGA---AAA--C--C----TA------ACTT-CC-----CA--GA--G-AA-T-----T----G--TAAAG-T-C--C-C--AC--C-------G--CT-A-AACAGT-C---C---A-TAAtgcgttttataatattatcctgaagaatctaaaaagttgtttttttttaatccatcttgaaaacatttctagacttgattttttttatgtacaacatcatctatattgtaacaactttttctataaaatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngcactaattatcatctaaagggaggcaacacagttgtcacccagtgcatgaggtagacatcatgaattgtttcccttcacatgactattgccctagaccagtgaatttgactattataattctgatggataat
gi|50 : taatatacaa-TGG-AC-----TGTT-----------------G--GG-AG--A-AAT--CAC-----A---A-----ATT-C---------AAGT--------CATA--T-TAAGGTGG--GTT---A-T--C-AC--------------C-A--GA---G-G-tagttttttcctgaagatatctaaatatttttaaaaattatatcttgaaaaatttcttgacttgatttttatgtaaaacgtcaagtcgttaaaactttttctacaaaacgagccggaaagctgcgaattgtgacgtcagaaagaatgaggcaaataacaacgtcaaacagtttaaatttcgaatcgtgtttctgcgctttatcatctcagggagaaaacacagtgtcaccccgcggtgaggagactacgaattaattccctttcacttgacagcaggaccaagaatgatgttatctaagaggatcat
gi|3 : ggcgcccggGG-AC-----TAGT-T-AG-C-------C--C--GG-AG--A-GAA--AACTCGGGC---G-----ATT-A--G---GTCAGGT--------CTTA--T-TAA---GG--GTT---A-T--C-AA--------------C-C--GGCTCG-G-G--CCGC--ATA--G------------GC--CC-CTCC-G-------G--G-TGA-T-AAC--C--C----TAT-----C--T-TC-C--CCT-TGA--T-A--T-----T---TG--TGATG-T-AAGT-C--CC--C-------GGGCT-A-AACAGT-C---C---A-
gi|40 : tattatacaacacacG-AC-----TGTT-T-AG-C-------A--G--GA-AG--A-CAT--CAC-----A---A-----ATT-A-----------AT--------TACC--T-TA----------T---A-T----AC--------------C-T--T----G-G-G--C-GC--ATA--G------------GC--GCTCTAATG-------T--G-AG----AAC--C--C----TAGCT---A--T-AT-A--ACC-TGA--T-AA-T-----T---TG--Tcctagctcctttatcttatccccctggaagacatcttaaaaaagattttttaagataattatcttcaacaaccatttcttgacttgatttgttttatggtaaaaaaccgtcatcaaatcgtaacaagttttctacaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgtttctgcgccattatcatctacagggagactacacagttgtcaccaagcgcgtgagggagacatcatgaattatctcccttcacgtgaccagccctggaccaatgaaagtgactgtaattattctaaagaataataa
gi|23 : a-AC-----TGTT-T-AG-C-------A--G--GG-A-----------------------------------T---G--GGAT--------T-TA--G-TA----GG--GTC---A-T--C-AT--------------C-CTTGA---G-A-G--C-A----TA--G------------AC--GC-CCTC-T-------G--G-TAA-T-AAC--T--C----TA------C--T-ACGA--AC--TGA--T-AA-T-----T---TG--TGATG-T-C--T-C--CC--T-------G--CT-A-AACAGT-C---C---A-TAAT--T------------G----T-A-TA--T--T---AT--------------AAGA-A
gi|42 : atatcaaagacaaacaacatatTT-T-AG-C-------A--G--AA-GA--A-CAT--CAC-----A---A-----ATT-A-----------AT--------TCC----------------TT---A-TA-T-AC--------------C-T--T----G-G-G--C-GC--ATA---------------GC--GCTCTAA-T-------G--T-TGA-G-AAC--C--C----TAGCT---A--T-AT-A--ACC-TGA--T-AA-T-----T---TG--Tt
gi|6 : tctaT-T-AA-C-------A--A--GG-AT--A-AAT--CAC-----A---A-----ATTTA--T---C--AGGTCT------TG-A--G-T-----GG--GTT---AGT--C-AC--------------C----GA---G-G----C-GC--C-A--T------------GC--GC-ATAG-GCGGCCTCG--G-TGA-T-AAC--C--C----TA------C--T-TC-G--ACC-TGA--T-AA-T-----T---T---TGATG-T-C--T-C--CC----------G--CT-A-AACAGTGC---C---A-TAAT--T------------G----T-A-TA--T--T---GT---C--ac
gi|4 : ctgtttaacgaaaaattatattcaattcaaattctttattgcgtaacacacatgtaattggttattcccatgatggaatctagataacaatatttaaaaaaatacgtaaaataacatgggcatagtgtttT-T-AGTC-------ATGG--AG-AG--A-AATCAAAC-----ATATA-----ATT-AATC---A--AGGT--------CTTA--G-TA----AG--GTTTATA-T--C-AC--------------C-C----------------AC--TCA--C------------GC---C-CTCG-G-------G------A-C-AAC--C--C----TATTTTGAA--C-TC-T--ATA-TGA-----A-T-----T---TG--TGATGCT-C--T-CCACC--T-------G--CT---AACAGT-C---C---A-TATC----------------T---G-T-CA--T--T---AT---ctttattatctgaagatctaaaaaagtttttctgcaaaactttcttgactgattttttatgtagaacgtcataagatcgctaaacaagttcttctacaaaaacgaccgaaagatttcgattgtgatgtacaactaattaaagagggcaaaactttacgtcaacagtacaattgataatttcagtcaactttccttgcgttccagtagctcacgtgaggagac
gi|42 : agatttaaggtcacaggctcatcaaagccacccataaattcagaatgagtgaacaggctctctcgaagaactattataatgaactgtagatactgtcacaaacacaataaagttaaaaccacagaactgtcaagcagttactgtcaaaaggaatatcacgtctatactgtagagcatgtcaaagacactgttcaaaatatttttcttgacatgaactattaatcctatgttgtcactacttgagcatggatccagtgcggatctatT--AAC-----A---A-----ATT-A--T---C--AGGTTA------TATA--GCTA----GG--GTT---C-T--CAAC--------------A-T--TA---G-A-G--C-G---CTA--T------------GC--GC-CCAA-G-------G--T-ATA-T-AA------G----GA------A--T----------------T-AA-T-----T---TG--TGATG-T-T--C-T--TC--T-------G--CT-A-AActagcaagcatgagatatatctaaagtcataaggaaacaaaaaatatcttgaaatctaaaaagtaataaaaaagaaaacaaaaatctcttgaaaaaacttttcc
gi|40 : tc--AAC-----A---A-----ATT-A--T---C--AGGT--------TATATAGCTA----GG--GTT---C-T--C-AC--------------A-T--TA---G-A-G--C-GC--CTA--T------------GC--GC-CCAA-G-------G--T-ATA-T-AA---G--G----TA------A--T----------------T-AA-T-----T---TG--TGATG-T-C--T-T--CC--T-------G--CT-A-AACAGT-C---ac
gi|26 : -----A---A-----ATT-A--T---C--AGGT--------CTTA--G-TA----GG--GTT---A-TATC-AC--------------C-C--T-----------C-AC------------------------GC-CCTC-G-------G--G-TGA-C-AAC--C--C----TA------C--T-TT-G--ACC-TGA--T-AA-T-----T---TG--TGATG-T-C--T-C--CC--C-------G--CT-A-AACAGT-C---C---A-TAAT--T------------G----T-A-TA--T--T---GT---CGAC-T----GGA
gi|49 : tgttgtgaactgagcatg---A-----ATT-G--T---C--TGGT--------CTTA--T-TA----GG--GTT---A-T--C-AC--------------C-CA-GA---G-A-C--T-ACTATTAT-T------------GT--GT-CCTC-G-------G--G-TGA-T-AAC--C--C----TA------C--T-A
gi|53 : --------TGAA--G-T-----GG--GTT---A-T--C-AC--------------A-T--TA---G-G-G--C-GC--CTA--T------------
gi|49 : aattgtacacaggtcattagaaaTA--G-TA----GG--GTT---A-T--C-AC--------------C-C--GA---G-G-A--C-ACAATAA--TA-----------GTA-GT-CTCT-G-------G--G-TGA-T-AAC--C--C----TA------A--T-AA-G--ACC-AGA--C-AA-T-----T---
gi|11 : -AC--CTA--T------------GC--GC-CCGA-G-------G--G-TGA-T-AAC--C--C----TA------C--T-AA-G--ACC-TGA--T-TA-T-----T---TG--TGATG-T-C--T-C--CC--T-------G--CT-A-AACAGT-C---C---A-TAAT--A------------GT---T-T-TA--T--T---AT---C--C-T----AAACA-ATCC---AA-AAA---G----TCC---------A--------AA-A---AAAAA-------C--TATCT-----TGA--A-A-A-TA-----T-TT--C-TCGACTCGA-T--T--TTTT-----GT-G-----TA-AAT---CGTC-A-TCAA--G-ATC-GT--AACAA---TTTTTT---C--
gi|29 : C--CTA--T------------GC--GC-CATC-G-------G--G-TGA-T-AAC--C--C----TA------C--T-TC-G--ACC-TGA--T-AA-TATATAT---TT--TGATG-T-C--T-A--TC--T-------A--CT-A-AACAGT-C---tacaaatagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatttctgcactaattatcatctaaagggagacaacacagttgtcaccccgcacgtgaggaagacatcgtgaattatctcccttcaagtgaccagccttagaccaatgaaattgactgtattattctgaaagataat
gi|38 : attgcaatattatattacatttatcatgtaaaatatagtattatacacttatggacatTA--G------------GC--GC-CCTC-G-------G--G-TGA-T-AAC--C--C----TA------C--T-TT-G--ACC-TGA--T-AA-T-----T---TG--TGATG-C-C--T-C--CC--C-------G--CT-A-AACAGT-C---C---A-TAAT--T------------GTA--TAT-TG--T--G---AT---C--T-T----Gg
gi|13 : gagttatctcagtgataaC-CTCA-G-------GT-G-ACA-T---C--A--C----TA------T--T-AT-A--ACC-TGA--T-AA-T-----C---TG--TGATG-T-C--T-C--CC--T-------G--TT-A-AACAGT-C---C---A-TAA
gi|18 : a-G-------G--G-TGA-T-AAC--C--C----CA------C--T-AC-G--ACC-TGA--T-AA-T-----T---TT--TTATG-T-C--T-C--CC--TGGCACCGG--CT-A-AACAGT-C---C---A-TAAgtgcgttttataatattatcctgaagaatctaaaaagttgtttttttttaatccatcttgaaaacatttctagacttgattttttttatgtacaacatcatctatattgtaacaactttttctataaaatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngcactaattatcatctaaagggaggcaacacagttgtcacccagtgcatgaggtagacatcatgaattgtttcccttcacatgactattgccctagaccagtgaatttgactattataattctgatggataat
gi|50 : tacatgtatatatagatcgagtgacagtcagtactcaaactacttagtatgtaaaattatatacattatacaa-------G--G-TGA-T-AAC--C--CACCTTA------A--T-AT-G--ACT-TGA-----A-T-----T---TG--TGATT-T-C--T-C--CC------------------AACAGT-C---C---A-gaggaagcatgtgaaatgatgtctccctgctaaacagtccataatacataataatgtagttgtattatcctaaaaatctatcttgaacatgtttcttgactttattctttttatgtatgtctttactaaaaacg
gi|1 : ggcgcccggcctctGA-T-AAC--C--C----TA------C--T-TC-A--ACC-TGA--T-AA-T-----T----A--TGATA-T-C--A-C--CC--T-------G--AT-A-AACAGT-C---C---A-TAATTGA------------AT---A-T-AA--T--C---AT---C--C-T----TCAGA-A--T---AATAAA---G----T-----------C--------AA-
gi|43 : tcacagacaatacaaagtatgtcagtaatgtgggtgtgacaatatacaattatggactcttatcggaacatcacaaatttataagtctttagtagggttatcacctgaggggtgataaccctactaagacttgataatttgtgatgtctccctgataaacagtccataatagttttattatcatgaagaatctaagaattaaaaaaaatcttttttgaaaacatttcttgacttgattttttgtgtaaattgtcatcaagattggaacaacttttcctacaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgtgatgtatttcttcgctaattagcatctaaagggagacaacacagttgtcaccctgggcatgagggagagatcacaaattatctcccttcacatgaccagccctagacaaaA-T-AGC--C--T----TA------T--T-AA-A--TCC-TGG--T-AA-T-----T---TG--TGATG-C-C--T-C--CC--C-------G--AT-A-AACCAT-C---C---C-TAAaaataagggtgcctatgcagtaagacatacaagtattcagttcagcgcccatgaaattcttacttttcctttgaaatagt
gi|30 : caaaaatatcataatacaatgtacgtttgatattatataa-AC-A--ACC-CGA--T----------T---TG--TGATG-T-C--T-C--TC--T-------T--CT-A-AACAGT-C---C---A-TAAaa
gi|10 : cttgacttccaaaggaggaacaacatcttattcagttgtgtacatttatggactgtttagaagagagacatcacaaatatgtacat--ACC-TGA--T-AA-T-----T---TG--TGATG-T-T--T-C--CC--A-------G--CT-T-AACATT-C---C---A-TAAT--A------------GT---T-T-TA--T--T---AA---C--C-T----GAAGA-ATCT---AA-AAC---G----T-----------A--------AA-AGAAAACAATTGTCATC--TATCT-----TGA--A-C-A-CA-----T-TT--C-TTGACTTGA-T--T--TTCT-----TT-T-----TA---------------CA-------T-GT--AA-AA---TGTCAT---C--A---TCAGATCATAACAAACAATACGGAAACTTTCAGAAAGTCACGTCAAGCGTAAACATTTTGTAGCATATTTCTGTGCTAAT----T--------ATC--GT---CT-AAAGG----GAGA-CAA--CA-------CA-GT--TGT-CA------C-C--CTG-AG---CAT----GAGGAA---GACA--TCAC-GA-A-TATCTTCCC-TTC--A-CG-TGAggt
gi|12 : aacctcacaaag--ACC-TGA--T-AATT-----T---TC--TGTTG-T-C--G-CTACCA-TTG-----G--CT---AACA-T-C---C---A-TAAT--A------------TT---T-T-TA--TACTTAAATAAAA--C-T----GAAG--ATCT----A-AAA---G----T-----------A--------AA-A---AA-AATAT----C--CATCT-----TGA--A-tcgtcaccctgagcatgagggagatgtcacgaattatctccctcacgtgatcaaacctagaccaatgaaattgactctattattctgaggggtaatatag
gi|37 : cgtatcaag--ACC-TGA--T-AA-T-----T---TG--TGATG-T-C--T-C--CC--T-------G--CT-A-AACAGT-C---C---A-TAAC--T------------GT---tctaaaaaggtaaaaaaaaacattatcttgataaacattcttcattgacttatttttatggtaaaacgtcataaagctgtaacaacaaggcgaaaagcttttgattgtatcatataggatgaggcataaaacacgttcaaaacataaacatttcgcaactatgtttatgcagccatttatctaatctacagggaacaacacatgttaccccgcgcgtgatggatcggacatacaagattacctccctttacataccacccaagcaccatggaaatagctttattcttaagataataata
gi|31 : atactttttttgtccacagtctgtatGA--T-AA-T-----T---CG--TGATG-T-C--T-C--CC--T-------catttaaatgaagtgggttttcacaagagggcgccta
gi|39 : tctgcgccattatcatctacagggagacaacacagttgtcaccccgcgcgtgGA--T-AA-T-----T---CG--TGATG-T-C--T-C--CC--T-------tcccttcacgtgaccagccctgaataaatgaaaatgacagtattattctaaagg
gi|45 : aacagttgtcacgccacacgtgGA--T-AA-T-----T---CG--TGATG-T-C--T-C--CC--T-------tcccttcacgtgatcagccctagaccaatgaaaatgactgtattattctaaaggataata
gi|44 : gGA--C-AA-T-----T---TG--TGATG-T-C--T-C--CC--TC------G--C--------GT-G---TGGGA-TGAC--A------------AT---T-G-TG--T--T---AT---C--tccctttacgtgaccagccctagaccaatgaaaatgattgtattattctaaaggataataa
gi|51 : tctaaagggaGA--T-AA-T-----T---CG--TGGTG-T-C--T-C--CC--T-------tctgctcacgtgaccagccctagacctatgaa
gi|14 : atctaaagggagacaacacagttatcacccaacgtgtgTG-T-C--T-T--CC--A-------G--CT-A-AACA-T-CG--T---A-TAAT--A------------AT---T-G-TA--T--T---AC---C--C-T----AAACA-AACT---AA-AAC---G----T-----------A--------AACA---GAAAA-------C--TATCT-----TGA--T-A-A-CA-----A-TT--C-TTGACTTCA-T--C--TTTT-----AT-G-----CA-AAA---CGTC-A----A--G-ATA-GT--AATAACA-TCTTCTA--C--AAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAATCTGCTCCATT--------ATC--AT---CT-AAAAG----GAGA-AAA--CA-------CA-GT--TGT-CG------C-C--CTG-TG---CGT----GATGGA---GACA--TCAA-TA-ATTAGT-TCCA-ATC--A-TG-TGACCA--GTC-CT-G-G-ACCAAT-TAAATTGACTG-T-A--TTATTTTtccctt
gi|34 : tt--A------------GT---T-TGTA--T--C---AT---C----T----GAGTA-AACC---CA-AAG---T----T-----------T--------TT-A---AATA-----------TATCT-----TGC--C-A-A-TGAAAAACATT--C-TTGACTTGA-T--T--TTTTTTAA-AT-G-----TA-AAA---TGTC-ATTCAA--G-ATC-GA--AACAA---CTTT
gi|33 : T---T-T-TA--T--T---CA---C--C-T----GAATA-ACCC---AA-AA----G----T-----------T--------TT-A---AACAA-------T--AATCTGCCAATGA--A-A-A--------C-TT--C-TTGACT-GA-T--T--TTTTTAA--AT-G-----TA-AAA---TGTC-A-TCAAAGA-ATC-GA--AACAC---TTTTt
gi|13 : -TA--T--T---AT---C--C-T----GAAGA-ATCT---AA-AAA---G----TTGTTTTTTTTTA--------AT-----------------C--CATCT-----TGA--A-A-A-CA-----T-TT--C-TAGACTTGA-T--T--TTTTTT---AT-G-----TA-CAA---CATC-A-TCTA--T-ATT-GT--AACAA---CTTTTT---C--TA--TAAAATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGCACTAAT----T--------ATC--AT---CT-AAAGG----GAGG-CAA--CA-------CA-GT--TGT-CA------C-C--CAG-TG---CAT----GAGGTA---GACA--TCAT-GA-ATTGTT-TCCC-TTC--A-CA-TGACTATTGCC-CT-A-G-ACCAGT-GAATTTGACTATT-A--TAATTCTGATGGATAATtctaaaacta
gi|2 : attatggactgtttaacagggagacatcacagattatcaggttataatagtgatgtcacctgagggtgcgttttataa--T---AT---C--T-T----GAA----TCTCTAAA-AAA---G----T-----------A--------AA-ATAAAAAAA-------A--AAAAT-----TGA--A-A-A--A-----C-TTTTC-TTGACTTGA-T--T--TTTTTTTAAGT-G-----T--AAA---TGTCAA-TCAA--GTATTGGT--AAC
gi|17 : ggcttcatcaaagcacattaaaacagaatgcaggtaaacaggctgaaatttaactgtagattctgttcccaacaaattaagtaaaccacagaacgtcaagcagtttacttgtcaaggacctactgtagactgtcaaagacatgttcacatattttctgcagaactgttaacctgtgttgtgttatctattgagcaagatgttcagtcgaacaaatatacaattatgaactgtttagcagggaagacatcacaaattatcagtcaaagtaggttgtccccgagggcgcctatgtgagcgccgagggtgataataacctgctaagccctgataatttctgatgtctcccctgctaacagtccattaatagttttattattatccgaagatctataaaaaaatcgaggaaaaaaaAAAA-A-CT---AA-AAA--------------------A--------AA-A---AA-AA-------C--TATCT-----GGA--A-A-A-CA-----------------------------TTTT-----AT-G-----TA-AAA---TATC-A-TCAC--C-ACT-GT--AACAA---TTTTcagaacgttttcttttacaaaaaaaggagtaaccagaagccttttcgaattatgacgtcatactaaga
gi|12 : ttGA-ATCT---AA-AAA---GG---T-----------A--------AA-A---AAAAA-------CATTATCT-----TGATAA-ACA-TT-----C-TT--CATTGACTTA-----T--TTTT-----AT-GG----TA-AAA---CGTC-A-TAAA--G--CT-GT--AACAA---CAAGG----CGAAAAGCTTTTGATTGTATCATATAGGATGAGGCATAAAACACGTTCAAAACATAAACATTTCGCAACTATGTTTATGCAGCCATT----T--------ATCTAAT---CT-ACAGG----GA-A-CAA--CA-------CA-----TGT-TA------C-C--CCG-CG---CGT----GATGGATCGGACA--T-AC-AAGATTACC-TCCC-TTT--A-CA-T-ACCA---CC-CA-A-GCACC-ATGGAAATAG-CT-------TTATTCTTAA-GATAATAAttatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttctgcgcaatttatcatttaaagggagatgacacagttgtcaccctgagcatcacaaattatctcccttcacatgaccagccctagaccaatgaaaatgactgtgttattctgaaggatagtaat
gi|47 : cgtatcaagacctgataattttctgttgtcgctaccattggctaacatccataatatttttatacttaaataaaactgaagatctaaaagtaaaaaaaatatccatctt-A---AAAAA-------C--TATCT-----TGA--A-A-A-CA-----T-TT--C-TTGACT--G-T--C--TTTT-----AT-G-----CA-AAA---CGCC-A-TCAA--G-ATC-AT--AACAA---CTTTTT---C--ta
gi|1 : ----T--------AGC--AT---CT-AAAGG----GAGA-CAA--CA-------CA-GT--TGT-CA------C-C--CTG-GG---CAT----GAGGGA---GAGA--TCAC-AA-ATTATC-TCCC-TTC--A-CA-TGACCA--GCC-CT-A-G-AC------AAATTGACTT-T-A--TTATTCTGAAGGATGATtacta
gi|11 : tcacagacaatacaaagtatgtcagtaatgtgggtgtgacaatatacaattatggactcttatcggaacatcacaaatttataagtctttagtagggttatcacctgaggggtgataaccctactaagacttgataatttgtgatgtctccctgataaacagtccataatagttttattatcatgaagaatctaagaattaaaaaaaatcttttttgaaaacatttcttgacttgattttttgtgtaaattgtcatcaagattggaacaacttttcctacaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgtgatgtatttcttcgctaat----T--------ATC--AT---CT-AAAGG----GAGA-CAA--CA-------CA-GT--TGT-CA------C-C--CCG-CA---CGT----GAGGAA---GACA--TCGT-GA-ATTATC-TCCC-TTC--A-AG-TGACCA--GCC-TT-A-G-ACCAAT-GAAATTGACTG-T-A--TTATTCTGAAAGATAATtatattcaattatggactgtttatcagggtgatatcataattatcaggttgaagtagggttatcaaataagggtgcctatgcagtaagacatacaagtattcagttcagcgcccatgaaattcttacttttcctttgaaatagt
gi|3 : acctatgcgcccgagggtgataaccctactaagacctgattatttgtgatgtctccctgctaaacagtccataatagttttattatcctaaacaatccaaaaagtccaaaaaaaaactatcttgaaaatatttctcgactcgattttttgtgtaaatcgtcatcaagatcgtaacaattttttctacaaatagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatttctgcactaat----T--------ATC--AT---CT-ACAGG----GAGA-CTA--CA-------CA-GT--TGT-CA------C-C--AAG-CG---CGT----GAGGGA---GACA--TCAT-GA-ATTATC-TCCC-TTC--A-CG-TGACCA--GCC-CT-G-G-ACCAAT-GAAAGTGACTG-TAA--TTATTCTAAAGAATAATAA
gi|31 : tattatacaacacactggactgtttagcccggggacttacatcacaaatatcaaggggaagatagggttatcacccggaggggcctatgcggcccgagccggttgataacccttaataagacctgacctaatcgcccgagttttctctccgggctaactagtcccctagctcctttatcttatccccctggaagacatcttaaaaaagattttttaagataattatcttcaacaaccatttcttgacttgatttgttttatggtaaaaaaccgtcatcaaatcgtaacaagttttctacaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgtttctgcgccat----T--------ATC--AT---CT-ACAGG----GAGA-CAA--CA-------CA-GT--TGT-CA------C-C--CCG-CG---CGT----GAGGGA---GACA--TCAC-GA-ATTATC-TCCC-TTC--A-CG-TGACCA--GCC-CT-G-A-ATAAAT-GAAAATGACAG-T-A--TTATTCTAAAGG
gi|9 : tctgcgccat----T--------ATC--AT---CT-CA-GG----GAGA-AAA--CA-------CA-G---TGT-CA------C-C--CCG-CG----GT----GA-GGA---GAC----TAC-GA-ATTAAT-TCCCTTTC--A-CT-TGAC-A--GC
gi|17 : taatatacaattatggactgtttagcggtgggactttacaattctctgggaagttaggttttcttcccgaggcgcctatcgccgaggtttaacctactaagactgatatttgttgattctcctgctcaaacagtccatatagttttttcctgaagatatctaaatatttttaaaaattatatcttgaaaaatttcttgacttgatttttatgtaaaacgtcaagtcgttaaaactttttctacaaaacgagccggaaagctgcgaattgtgacgtcagaaagaatgaggcaaataacaacgtcaaacagtttaaatttcgaatcgtgtttctgcgctt----T--------ATC--AT---TT-AAAGG----GAGA-TGA--CA-------CA-GT--TGT-CA------C-C--C----------T----GAG--------CA--TCAC-AA-ATTATC-TCCC-TTC--A-CA-TGACCA--GCC-CT-A-G-ACCAAT-GAAAATGACTG-T-G--TTATTCTGAAGGATAGTAAaggaccaagaatgatgttatctaagaggatcat
gi|19 : ttaaaaactaaaaaaaaaaaaactatctggaaaacattttatgtaaaatatcatcaccactgtaacaattttttatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttctgcgcaatt----T--------ATC--AT---CT-ACAGGTTCGGAGA-CAA--CA-------CA-GT--TGT-CA------C-CCTCCG-CA---CGT----GAGG-----GACA--TCAC-GA-ATTATC-TCCCTTTC--ACTG-TGACCA--GCC-CTGA-T-ACCAAT-GAAAATGACTG-T-A--TTATTCTAAAGG-TAATt
gi|21 : aataggatatgagcaaataacacaacgtcaaactgtaaacatttctgcaagtgtttttctgctctgtcat----T--------GTC--AT---CT-AAAGG----GAGA-TAA--CA-------CA-GT--TGG-TA------C-C--CCG-CG---CGT----GAGGTA---CACA--TTAC-GA-ATTACT-ACTC-TTC--C-CG-TGACCA--ACC-CT-T-G-ACCAAT-TAAATTCAT---T-A--TTATCATGAAGGATAATAA
gi|24 : atagaatgagatatagacaaaacataaagcgtaaacattgtgtaggtctcacgtatttctgcatcat----T--------ATC--AT---CT-ACAAG----GAGA-CAA--CA-------CA-AG--TAT-CA------C-T--CCG-TG---CGT----GAGGCA---GACA--TCAC-GA-ATTGTA-TCCC-TTC--A-CG-TGACCA--GCC-CT-A-G-ACCAAT-AAA
gi|35 : gaatagaatgagccgaaacacaacgtcaatcataaaaatttcgcaacgtgtttctgtgccat----T--------ATC--AT---CT-AAAGG----GAAG-CAA--CA-------CA-GT--TAC--A------C-C--CAA-CG---TGT----GAGG-A---GACA--CCAC-GA-ATTATC-TCCC-TTC--A-CG-TGAC-A--GCC-CT-GTG-ACCAAT-GAAA
gi|1 : atttcttgcactgattTC--AT---GT-GAAGG----GAGA-TAA--T------------T--TGT-GATCTCTCC-C--TCA-TG---CCC-----AGGGT---GACA----ACTGT-GTTGTC-TCCC-TTTAGA-TGCTAATTA--GC
gi|11 : tcacagacaatacaaagtatgtcagtaatgtgggtgtgacaatatacaattatggactcttatcggaacatcacaaatttataagtctttagtagggttatcacctgaggggtgataaccctactaagacttgataatttgtgatgtctccctgataaacagtccataatagttttattatcatgaagaatctaagaattaaaaaaaatcttttttgaaaacatttcttgacttgattttttgtgtaaattgtcatcaagattggaacaacttttcctacaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgtgatgtatttcttcTC--AC---TT-GAAGG----GAGA-TAATTCA-------C--GA--TGTCTT------C-C--TCA-CG---TGC----G-GGGT---GACA----ACTGT-GTTGTC-TCCC-TTT--A-GA-TGAccagccctagacaaattgactttattattctgaaggatgattatattcaattatggactgtttatcagggtgatatcataattatcaggttgaagtagggttatcaaataagggtgcctatgcagtaagacatacaagtattcagttcagcgcccatgaaattcttacttttcctttgaaatagt
gi|13 : acctatgcgcccgagggtgataaccctactaagacctgattatttgtgatgtctccctgctaaacagtccataatagttttattatcctaaacaatccaaaaagtccaaaaaaaaactatcttgaaaatatttctcgactcgattttttgtgtaaatcgtcatcaagatcgtaacaattttttctacaaatagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatttctgcactaattaTC--AT---GT-GAAGG----GAAA-CAA--TT-------CATGA--TGTCTA------C-C--TCA-TG---CAC----T-GGGT---GACA----ACTGT-GTTGCC-TCCC-TTT--A-GA-TGAccagccttagaccaatgaaattgactgtattattctgaaagataat
gi|31 : attatggactgtttaacagggagacatcacagattatcaggttataatagtgatgtcacctgagggtgcgttttataatattatcctgaagaatctaaaaagttgtttttttttaatccatcttgaaaacatttctagacttgattttttttatgtacaacatcatctatattgtaacaactttttctataaaatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngcactaattaTC--AC---GT-GAAGG----GAGA-TAA--TT-------C--GTGATGTCTC------C-C--TCA-CG---CGC----G-GGGT---GACA----ACTGT-GTTGTC-TCCC-Tctattgccctagaccagtgaatttgactattataattctgatggataat
gi|17 : tctgcgccattatcatctacTC--AT---GT-GAAGG----GAGA-TAA--T------------T--TGT---------------GA-TG---C-T----CAGGGT---GACA----ACTGT-GTCATC-TCCC-TTT--A-AA-TGAccagccctgaataaatgaaaatgacagtattattctaaagg
gi|27 : ttaaaaactaaaaaaaaaaaaactatctggaaaacattttatgtaaaatatcatcaccactgtaacaattttttatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttctgcgcaatttaTC--AT---CTTAAAGG----GAGA-CAA--CA-------CA-GT--TGT-CA------C-C--C----G---CGC----AAGGGA---GGCA--ACCT-GA-ATTATT-TCCC-TTC--A-CG-TGACTA--GCCACT-A-G-ACCAAT-GATTTC-ACTG-C-AATTCATTTCGAAGGATAATAAccagccctagaccaatgaaaatgactgtgttattctgaaggatagtaat
gi|27 : atttctgctctgttTC--AC---GT-GAAGG----GAAA-TAA--TT-------CA-G----GT-TG------C-CTCCCT-TG---CGC----G--GGT---GACA----ACTGT-GTTGTC-TCCC-TTT--A-
gi|51 : atttctgctctgtttcatct--AT---CT-AAAGG----GAGA-CAA--CA-------CA-GT--TAT-CA------C-C--CAA-CG---TGT----GAGGGA---GACA--CCAC-GA-ATTATC-TCCC-TTctagccactagaccaatgatttcactgcaattcatttcgaaggataataa
gi|44 : T---CT-AAAGG----GAGA-TAA--CA-------CA-AT--TGT-CA------T-C--CCA-CA---CGC----GAGGGA---GACA--TCAC-AA-ATTGTC-TCTG-CTC--A-CG-TGACCA--GCC-CT-A-G-ACCTAT-GAA
gi|30 : T---CC-AAAGG----AGGAACAA--CATCTTATTCA-GT--TGTGTA------CAT--TTA-TGGACTGTTTAGAAGAGA---GACA--TCAC-AA-A-TATG-TACA-TTT--A-TG--GACTG----T-TT-A-G-A
gi|57 : cttgact-AAAGG----GAGA-CAA--CA-------CA-GT--TGT-CA------C-C--CCG-CG---Cagagagacatcacaaatcgggttgtggt
gi|39 : taactaA-------CA-GT--TGT-CA------C-G--CCA-CA---CGT----GAGGGA---GACA--TCAC-GA-ATTATC-TCCC-TTC--A-CG-TGATCA--GCC-CT-A-G-ACCAAT-GAAAATGACTG-T-A--TTATTCTAAAGGATAATA
gi|41 : aA-------CA-GT--TTT-CA------C-T--C-G-CG---CGT----GAGGGA---GACA--T-AC-GA-ATTATC-TCCC-TTC--A-CG-TGACCA--GCC-CT-G-G-ACCTAT-GAAAATGAGTG-T-A--TTATTCTAAAGGATAATA
gi|10 : T--CGT-CA------C-C--CTG-AG---CAT----GAGGGA---GATG--TCAC-GA-ATTATC-TCCC-T-C--A-CG-TGATCA--AAC-CT-A-G-ACCAAT-GAAATTGACTC-T-A--TTATTCTGAGGGGTAATAc
gi|10 : aacctcacaaagacctgataatttgtgatgtttcccagcttaacattccataatagttttattaacctgaagaatctaaaacgtaaaagaaaacaattgtcatctatcttgaacacatttcttgacttgattttctttttacatgtaaaatgtcatcatcagatcataacaaacaatacggaaactttcagaaagtcacgtcaagcgtaaacattttgtagcatatttctgtgctaattatcgtctaaagggagacaacacagttgtcaccctgagcatgaggaagacatcacgaatatcttcccttcacgtga---CGT----GAGGGA---GATAATTCGT-GA---CATC-TCCC--TC--A-TG-tag
gi|45 : aacctcacaaagacctgataatttgtgatgtttcccagcttaacattccataatagttttattaacctgaagaatctaaaacgtaaaagaaaacaattgtcatctatcttgaacacatttcttgacttgattttctttttacatgtaaaatgtcatcatcagatcataacaaacaatacggaaactttcagaaagtcacgtcaagcgtaaacattttgtagcatatttctgtgctaattatcgtctaaagggagacaacacagttgtcaccctgagcatgaggaagacatcacgaatatcttcccttcacgtgatcgtcaccctgag----GAGGGA---GACA--TCAC-GA-ATTATC-TCCC-TTT--A-CG-TGACCA--GCC-CT-A-G-ACCAAT-GAAAATGATTG-T-A--TTATTCTAAAGGATAATAAtgatcaaacctagaccaatgaaattgactctattattctgaggggtaatatag
gi|8 : AGGGA---GACA--TCAC-AA-ATTATC-
gi|1 : catgaaaaaagggaaataaaaaaaaattacaaaagattattttgatcgttaagttccgaggtagacagtcaatatacaattatggactgtttagcggggagacagcacaaattatcaggtcgaagtagggttatcacccgagggcgcctagacgcccgagggtgatatccttactaagacctAGGGA---GACA--TCAC-AA-ATTATC-gctaaacaatccataatagtttaatctaaaaagtaaaaaaaaatatgctgaaaacatttcttgacttgatttttatgtatcttaaaacgtcatcaagattttaacaactttttctacaaaaaaaacaaaaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgtttccgcacaattatcatctacatggagactaatagaatccttcattagtac
gi|16 : tcacagacaatacaaagtatgtcagtaatgtgggtgtgacaatatacaattatggactcttatcggaacatcacaaatttataagtctttagtagggttatcacctgaggggtgataaccctactaagacttAGGGA---GACA--TCAC-AA-ATTATC-gataaacagtccataatagttttattatcatgaagaatctaagaattaaaaaaaatcttttttgaaaacatttcttgacttgattttttgtgtaaattgtcatcaagattggaacaacttttcctacaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgtgatgtatttcttcgctaattagcatctaaagggagacaacacagttgtcaccctgggcatgagggagagatcacaaattatctcccttcacatgaccagccctagacaaattgactttattattctgaaggatgattatattcaattatggactgtttatcagggtgatatcataattatcaggttgaagtagggttatcaaataagggtgcctatgcagtaagacatacaagtattcagttcagcgcccatgaaattcttacttttcctttgaaatagt
gi|23 : gaaaatttatttgaattttttgctgaaaaatttgctacaatcttgtcgatatttaattttttttttcttttagattcttcaggataataaaactattatagattgcttagcagggagacaaattatcaagtcttagtagggttattactatcaggcacctttccttggacacctaggcaccctttggcgataaccctaccatgacctAGGGA---GACA--TCAC-AA-ATTATC-gctaaacagcccacaattgtataatattcatgaagaaaattgaaccgtttcagttaacattatttcaatatctatattttttttcattt
gi|40 : atatcaaagacaaacaacatatttcttataatatacaattatggactgtttagcAGGAA---GACA--TCAC-AA-ATTAAT-TACC-TTagttcgtagtagagttattaccagagggcgtctatgctctcaaggatgatgaccctactaaatcccatccctgctaaacagtt
gi|37 : aacaaattatcaggttatatagctagggttctcacattagagcgcctatgcgcccaaggtatatAGGGA---GACA--TCAC-AA-ATTATC-gctaaacagtc
gi|2 : atactttttttgtccacagtctgtatacagttatggactgtttagcGGAA---GACA--TCAC-AA-ATTATC-aggtcatttaaatgaagtgggttttcacaagagggcgccta
gi|26 : ggcttcatcaaagcacattaaaacagaatgcaggtaaacaggctgaaatttaactgtagattctgttcccaacaaattaagtaaaccacagaacgtcaagcagtttacttgtcaaggacctactgtagactgtcaaagacatgttcacatattttctgcagaactgttaacctgtgttgtgttatctattgagcaagatgttcagtcgaacaaatatacaattatgaactgtttagcagGGGA---GACA--TCAC-AA-ATTATC-agtcaaagtaggttgtccccgagggcgcctatgtgagcgccgagggtgataataacctgctaagccctgataatttctgatgtctcccctgctaacagtccattaatagttttattattatccgaagatctataaaaaaatcgaggaaaaaaatatcttgaatctctaaaaaagtaaaataaaaaaaaaaaattgaaaaacttttcttgacttgatttttttttaagtgtaaatgtcaatcaagtattggtaaccagaacgttttcttttacaaaaaaaggagtaaccagaagccttttcgaattatgacgtcatactaaga
gi|38 : tgttgtgaactgagcatgtccagtcgacaatatacaattatggactgtttagcgGGGA---GGCA--TCAC-AA-ATTATC-aggtcaaagtagggttgtcacccgagggcgtgagggtgatataaccctactaagacctgataattt
11 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|20 ): TGGAGGGGGGGGGGGTCCTTGCAGTTTTATAATACCATACAATAAAATATGCATATATTTGTTGTGTTCTGATTTGCTTGTCTGTCATTATTAAATTTTTTTCTGTTAAAAGCAAATTGCAAATTCAAATTCTTTATTGGCGTAACACATTAACATGTAATGGTTATTGTCCATGAGGAGAACTAATAACAATAATT
Unaligned ( gi|22 ): AATTTAAATAGTCCAGGCTCATCAAAGCACCATTAACAGAATGCAGGTAACAGGCTGAAATTTAACTGTAGTTCTGTCAAACAAATAAGTAAACCACAGAACTGTCAAGCAGTTACTGTCAAAGGAACTAACTGTAGAACTGTCAAAGACATGTCAAATATTTTCTGCAGAACTATTAACCTGA
Unaligned ( gi|28 ): TCTATTGGCGCAACACATCAACATAATGGTTATTGCCCATGAGTAAAACTAATAACAATATGTAAATGATAGATAGCATGATGCTTTTCTGTTTCACGTATATATTCAATTTGTATTTTGTAAATGTTTGTAC
Unaligned ( gi|32 ): TGGGGGGGGGGGGGTGATTTTTCCTTGCGGTTTATAATACATAGAATAAATATGCATATATTATGTTGGTTTTGATTGGCTTGTCTGTCATTATTGAATTTTATTCCAGTTAAAAGTAAATTGCA
Unaligned ( gi|36 ): TGTTTGAAGATACCACAAGTTGTTGGGTCCAAGGATAAGGTTAGAGCCATGGAGTGGGCTAAAACACCCAGGGGATATAACCAAACCTAGACCTGACAACTTTTGATGTC
Unaligned ( gi|46 ): AATAAAATAGAATGGAGCCGAAAACAAACTCAAGCATAAAAAATTTCGCAACGGTTACTGGCCATTATCATCTTAAAGGAAC
Unaligned ( gi|48 ): AATAAGATATGCAAATATTTGTGGTTTTAATTGGCTTGTTTATTATTATTTGTTTTCATTTATAAACAAATTGT
Unaligned ( gi|52 ): ATGTTTCTGATATACCCCTGTCATCATGATGAGACTAATAGAGTCCTTCATTAGTACGAG
Unaligned ( gi|54 ): TTGGTAGGGGGATTAGTTTATAGTTTTTAGTAGATGGTTAGCAGATGA
Unaligned ( gi|55 ): TTTTCGCACAACTGTGAGAATAATAGAATCCTTCATTAGTAC
Unaligned ( gi|56 ): CGGTCATCAGAGAATAATATAATCCTTCATTAGTACGAGT
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 11 11 111111 1111111111111 11111111111111 1 1111111111111111 22222222222222222222222222222 1111111111111 222222 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 111111
lowQualScore : 6 88 1 66 4 222222 1 1 1 33333 88888888 22 1 1 22 1 33333 3 222 22 1111111111111 22 66 3333 3 333 3333 3333 44 2 0 2 7777 22222222222222 2 22 2 333 222 1 1 1 4 0 1 99 1 333 8888888 0 1 2 22 55 22 3 1 1 555 2 22 2222222222222222 1 22 22 333 555 22 3333 7777 0 9999 1 222 00000000000000000000000000000 1 4444444444444 22 44444 7777777 1 1 3 4444 22 2 3333 22 222222 2 77777 2 333 2 2 33 33 2 2 55 333 444 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 1 8 1 333333 5555 33 333 2 4444 1 22 4 0 333 1 1 3 1 22 22 1 1 1 1 1 2 4 33 2
lowQualScore : . .. . .. . ...... . . . ..... ........ .. . . .. . ..... . ... .. ............. .. .. .... . ... .... .... .. . . . .... .............. . .. . ... ... . . . . . . .. . ... ....... . . . .. .. .. . . . ... . .. ................ . .. .. ... ... .. .... .... . .... . ... ............................. . ............. .. ..... ....... . . . .... .. . .... .. ...... . ..... . ... . . .. .. . . .. ... ... ........................................................................................................... . . . ...... .... .. ... . .... . .. . . ... . . . . .. .. . . . . . . . .. .
lowQualScore : 7 77 0 55 9 888888 7 6 6 88888 88888888 22 7 7 33 7 66666 0 666 00 1111111111111 00 55 3333 2 000 4444 5555 88 1 8 1 4444 44444444444444 0 88 0 333 999 9 9 9 1 7 9 00 9 333 2222222 3 9 0 88 55 66 8 9 9 888 2 99 6666666666666666 9 66 44 000 444 44 7777 8888 5 3333 7 999 99999999999999999999999999999 7 0000000000000 33 22222 1111111 7 7 8 0000 66 0 7777 99 444444 1 44444 1 999 2 2 11 11 2 2 33 999 444 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 0 7 0 999999 3333 11 777 0 2222 7 44 7 1 000 7 7 5 8 55 66 9 9 9 9 8 2 4 11 4
consensus : ATCAGAAGACGAAACA-CACAATANT----ATAATATACAAT-TA-TGG-AC-----TGTTTAGC-------GG--GG-A-G--A-CATCACAA-----ATT-AT---CAGG--T--CGN--------A--G--TA----GGGTTATC-ACCC--GA----GGGCGCCTA----TGC--GC-CCGA-G----G--------------G-TG--A-T---AAC--CC-TAC-T-AAGACC-TGA--T-AAT---T---TG--TGATGTC-T-C--CC--T--G-CT-A-AACAGTC---CA-TAAT--A------------G---TTT-TA--T--T---AT---C--CT----GAA-GA-ATCT---AA-AAA---G----T-----------AAA-A--------AAAA-A----------C--T--ATCT-----TG-------A-A-AA-C----ATT--TC-TTGACTTGA-T--T--TTTT------AT-G-----TA-AAA---CGTC-A-TCA--A--G-ATC-GT--AAC---AACTTTTT---C---------------AAA----GC--NAAA------TNGT-G-CGTCANAAAGNATGAGGCATNAGACANNNACGTNAAGC-GTANACATTNCGNANCNTN------TTTCTGCGCC----A-T----TATC--AT---CT-AAAGG----GAGACAACACAGTTGTCAC-C--CCGCGCGTGAGGGA---GACATCACGA-ATTATC-TCCC-TTCAC-GTGAC--CA--GCC-CT-A-G-ACCAATGAAANTGACTG-T-A--TTATTCTGA-AGGATAATAA
Reference ( family-1347 ) : ATCAGAAGACGANACA-CACAATANT----ATAATATACAAT-TA-TGG-AC-----TGTTTAGC-------AG--GG-A-G--A-CATCACAA-----ATT-AT---CAGG--T--CGT--------A--G--TA----GGGTTATC-ACCC--GA----GGGCGCCTA----TGC--GC-CCGA-G----G--------------G-TG--A-T---AAC--CC-TAC-T-ACGACC-TGA--T-AAT---T---TG--TGATGTC-T-C--CC--T--G-CT-A-AACAGTC---CA-TAAT--A------------G---TTT-TA--T--T---AT---C--CT----GAA-GA-ATCT---AA-AAA---G----T-----------AAA-A--------AAAA-A----------C--T--ATCT-----TG-------A-A-AA-C----ATT--TC-TTGACTTGA-T--T--TTTT------AT-G-----TA-AAA---CGTC-A-TCA--A--G-ATC-GT--AAC---AACTTTTT---C---------------AAA----GT--NANA------TNNT-G-NNNNACANNGCGNGAGNCNTNAGANANNCNCGNNACGC-GNANACNTCGCGNNNNNNN------TTNCGGNGCT----ANT----TATC--AT---CT-AAAGG----GAGACAACACAGTTGTCAC-C--CCGCGCGTGAGGGA---GACATCACGA-ATTATC-TCCC-TTCAC-GTGAC--CA--GCC-CT-A-G-ACCAATGAAANTGACTG-T-A--TTATTCTGA-AGGATAATAA
gi|1 : ----ACAATATACAAT-TA-TGG-AC-----T-CTTATC-----------GG-A----A-CATCACAA-----ATTTAT----AAG--T--CTTT-------A--G--TA----GGGTTATC-ACCT--GA----GGG-------------------------------------------G-TG--A-T---AAC--CC-TAC-T-AAGACT-TGA--T-AAT---T---TG--TGATGTC-T-C--CC--T--G-AT-A-AACAGTC---CA-TAAT--A------------G---TTT-TA--T--T---AT---C--AT----GAA-GA-ATCT---AA-GAA---T----T-----------AAA-A--------AAAA-T----------C--T--TTTT-----TG-------A-A-AA-C----ATT--TC-TTGACTTGA-T--T--TTTT------GT-G-----TA-AAT---TGTC-A-TCA--A--G-ATT-GG--AAC---AACTTTTC---C---------------
gi|1 : tcacagacaatacaaagtatgtcagtaatgtgggtgtgGCT----AAT----TAGC--AT---CT-AAAGG----GAGACAACACAGTTGTCAC-C--CTGGGCATGAGGGA---GAGATCACAA-ATTATC-TCCC-TTCAC-ATGAC--CA--GCC-CT-A-G-AC-----AAATTGACTT-T-A--TTATTCTGA-AGGATGATtacaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgtgatgtatttcttcgctaattagcatctaaagggagacaacacagttgtcaccctgggcatgagggagagatcacaaattatctcccttcacatgaccagccctagacaaattgactttattattctgaaggatgattatattcaattatggactgtttatcagggtgatatcataattatcaggttgaagtagggttatcaaataagggtgcctatgcagtaagacatacaagtattcagttcagcgcccatgaaattcttacttttcctttgaaatagt
gi|1 : tcacagacaatacaaagtatgtcagtaatgtgggtgtgacaatatacaattatggactcttatcggaacatcacaaatttataagtctttagtagggttatcacctgaggggtgataaccctactaagacttgataatttgtgatgtctccctgataaacagtccataatagttttattatcatgaagaatctaagaattaaaaaaaatcttttttgaaaacatttcttgacttgattttttgtgtaaattgtcatcaagattggaacaacttttcctacaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgtgatgtatttcttc-TG--A-T---AAC--CC-TAC-T-TCAACC-TGA--T-AAT---T----A--TGATATC-A-C--CC--T--G-AT-A-AACAGTC---CA-TAATTGA------------A---TAT-AA--T--C---AT---C--CT----TCA-GA-A--T---AATAAA---G----T-----------CAA-tatattcaattatggactgtttatcagggtgatatcataattatcaggttgaagtagggttatcaaataagggtgcctatgcagtaagacatacaagtattcagttcagcgcccatgaaattcttacttttcctttgaaatagt
gi|1 : tcacagacaatacaaagtatgtcagtaatgtgggtgtgacaatatacaattatggactcttatcggaacatcacaaatttataagtctttagtagggttatcacctgaggggtgataaccctactaagacttgataatttgtgatgtctccctgataaacagtccataatagttttattatcatgaagaatctaagaattaaaaaaaatcttttttgaaaacatttcttgacttgattttttgtgtaaattgtcatcaagattggaacaacttttcctacaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgtgatgtatttcttcgctaattagcatctaaagggagacaacacagttgtcaccctgggcatgagggagagatcacaaattatctcccttcacatgaccagccctagacaaa----ATTATATTCAAT-TA-TGG-AC-----TGTTTATC-------AG--GG-T-G--A-TATCATAA------TT-AT---CAGG--T--TGA--------A--G--TA----GGGTTATC-AAAT--AA----GGGTGCCTA----TGC--aataagggtgcctatgcagtaagacatacaagtattcagttcagcgcccatgaaattcttacttttcctttgaaatagt
gi|10 : tcacagacaatacaaagtatgtcagtaatgtgggtgtgacaatatacaattatggactcttatcggaacatcacaaatttataagtctttagtagggttatcacctgaggggtgataaccctactaagacttgataatttgtgatgtctccctgataaacagtccataatagttttattatcatgaagaatctaagaattaaaaaaaatcttttttgaaaacatttcttgacttgattttttgtgtaaattgtcatcaagattggaacaacttttcctacaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgtgatgtatttcttcgctaattagcatctaaagggagacaacacagttgtcaccctgggcatgagggagagatcacaaattatctcccttcacatgaccagccctagacaaattgactttattattctgaaggatg---AAC--CT-CAC-A-AAGACC-TGA--T-AAT---T---TG--TGATGTT-T-C--CC--A--G-CT-T-AACATTC---CA-TAAT--A------------G---TTT-TA--T--T---AA---C--CT----GAA-GA-ATCT---AA-AAC---G----T-----------AAA-A--------GAAA-ACAATTGTCATC--T--ATCT-----TG-------A-A-CA-C----ATT--TC-TTGACTTGA-T--T--TTCTTTTTACAT-G-----TA-AAA---TGTC-A-TCATCA--G-ATC-AT--AAC---AA---------------------------------------------------------ACAATACGGAAACTTTCAGAAAGTCACGTCAAGC-GTAAACATTTTGTAGCATA------TTTCTGTGCT----AAT----TATC--GT---CT-AAAGG----GAGACAACACAGTTGTCAC-C--CTGAGCATGAGGAA---GACATCACGA-A-TATCTTCCC-TTCAC-GTGAT--Cagtaagacatacaagtattcagttcagcgcccatgaaattcttacttttcctttgaaatagt
gi|10 : TCGTCAC-C--CTGAGCATGAGGGA---GATGTCACGA-ATTATC-TCCC-T-CAC-GTGAT--CA--AAC-CT-A-G-ACCAATGAAATTGACTC-T-A--TTATTCTGA-GGGGTAATAgtcaccctgagcatgagggagatgtcacgaattatctccctcacgtgatcaaacctagaccaatgaaattgactctattattctgaggggtaatatag
gi|11 : aacctcacaaagacctgataatttgtgatgtttcccagcttaacattccataatagttttattaacctgaagaatctaaaacgtaaaagaaaacaattgtcatctatcttgaacacatttcttgacttgattttctttttacatgtaaaatgtcatcatcagatcataacaaacaatacggaaactttcagaaagtcacgtcaagcgtaaacattttgtagcatatttctgtgctaattatcgtctaaagggagacaacacagttgtcaccctgagcatgaggaagacatcacgaatatcttcccttcacgtgaCCTA----TGC--GC-CCGA-G----G--------------G-TG--A-T---AAC--CC-TAC-T-AAGACC-TGA--T-TAT---T---TG--TGATGTC-T-C--CC--T--G-CT-A-AACAGTC---CA-TAAT--A------------G---TTT-TA--T--T---AT---C--CT----AAA-CA-ATCC---AA-AAA---G----TCC---------AAA-A--------AAAA-A----------C--T--ATCT-----TG-------A-A-AA-T----ATT--TC-TCGACTCGA-T--T--TTTT------GT-G-----TA-AAT---CGTC-A-TCA--A--G-ATC-GT--AAC---AATTTTTT---C---------------tag
gi|11 : a------TTTCTGCACT----AAT----TATC--AT---CT-AAAGG----GAGACAACACAGTTGTCAC-C--CCGCACGTGAGGAA---GACATCGTGA-ATTATC-TCCC-TTCAA-GTGAC--CA--GCC-TT-A-G-ACCAATGAAATTGACTG-T-A--TTATTCTGA-AAGATAATtacaaatagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatttctgcactaattatcatctaaagggagacaacacagttgtcaccccgcacgtgaggaagacatcgtgaattatctcccttcaagtgaccagccttagaccaatgaaattgactgtattattctgaaagataat
gi|12 : acctatgcgcccgagggtgataaccctactaagacctgattatttgtgatgtctccctgctaaacagtccataatagttttattatcctaaacaatccaaaaagtccaaaaaaaaactatcttgaaaatatttctcgactcgattttttgtgtaaatcgtcatcaagatcgtaacaattttttctacaaatagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaGACC-TGA--T-AAT---T---TTC-TGTTGTC-G-CTACCATT--GGCT-A-A-CA-TC---CA-TAAT--A------------T---TTT-TA--TACTTAAATAAAA--CT----GAA-G--ATCT----A-AAA---G----T-----------AAA-A--------AAAATAT---------C--C--ATCT-----TG-------A-A-
gi|12 : cgtatcaa-GA-ATCT---AA-AAA---GG---T-----------AAA-A--------AAAA-A----------CATT--ATCT-----TG-------ATA-AA-C----ATTCTTCATTGACTTA-----T--TTTT------AT-GG----TA-AAA---CGTC-A-TAA--A--G-CT--GT--AAC---AAC------------------------AAG----GC--GAAAAGCTTTTGATTG-TATCATATAGGATGAGGCATAAAACACGTTCAAAACAT-AAACATTTCGCAACTATGT------TTATGCAGCC----ATT----TATCTAAT---CT-ACAGG----GA-ACAACACA--TGTTAC-C--CCGCGCGTGATGGATCGGACAT-ACAAGATTACC-TCCC-TTTAC-AT-AC--CA---CC-CA-A-GCACC-ATGGAAATAGCT-------TTATTCTTA-A-GATAATAAtctaaaaaggtaaaaaaaaacattatcttgataaacattcttcattgacttatttttatggtaaaacgtcataaagctgtaacaacaaggcgaaaagcttttgattgtatcatataggatgaggcataaaacacgttcaaaacataaacatttcgcaactatgtttatgcagccatttatctaatctacagggaacaacacatgttaccccgcgcgtgatggatcggacatacaagattacctccctttacataccacccaagcaccatggaaatagctttattcttaagataataata
gi|13 : cgtatcaagacctgataattttctgttgtcgctaccattggctaacatccataatatttttatacttaaataaaactgaagatctaaaagtaaaaaaaatatccatcttAT-TA-TGG-AC-----TGTTTAAC-------AG--GG-A-G--A-CATCACAG-----ATT-AT---CAGG--T--TAT--------A--A--TA----GTGATGTC-ACCT--GA----GGGTGCta
gi|13 : -TA--T--T---AT---C--CT----GAA-GA-ATCT---AA-AAA---G----TTGTTTTTTTTTAAT--------------------------C--C--ATCT-----TG-------A-A-AA-C----ATT--TC-TAGACTTGA-T--T--TTTTTT----AT-G-----TA-CAA---CATC-A-TCT--A--T-ATT-GT--AAC---AACTTTTT---C---------------TA------T--AAAA------TNNN-N-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNN------NNNNNGCACT----AAT----TATC--AT---CT-AAAGG----GAGGCAACACAGTTGTCAC-C--CAGTGCATGAGGTA---GACATCATGA-ATTGTT-TCCC-TTCAC-ATGAC--TATTGCC-CT-A-G-ACCAGTGAATTTGACTATT-A--TAATTCTGA-TGGATAATgttttataatattatcctgaagaatctaaaaagttgtttttttttaatccatcttgaaaacatttctagacttgattttttttatgtacaacatcatctatattgtaacaactttttctataaaatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngcactaattatcatctaaagggaggcaacacagttgtcacccagtgcatgaggtagacatcatgaattgtttcccttcacatgactattgccctagaccagtgaatttgactattataattctgatggataat
gi|14 : attatggactgtttaacagggagacatcacagattatcaggttataatagtgatgtcacctgagggtgcgttttataaTGTC-T-T--CC--A--G-CT-A-AACA-TCG--TA-TAAT--A------------A---TTG-TA--T--T---AC---C--CT----AAA-CA-AACT---AA-AAC---G----T-----------AAACA--------GAAA-A----------C--T--ATCT-----TG-------A-T-AA-C----AAT--TC-TTGACTTCA-T--C--TTTT------AT-G-----CA-AAA---CGTC-A------A--G-ATA-GT--AAT---AACATCTT---CTAC------------AAA----NN--NNNN------NNNN-N-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNN------NNNNAAATCT----GCTCCATTATC--AT---CT-AAAAG----GAGAAAACACAGTTGTCGC-C--CTGTGCGTGATGGA---GACATCAATA-ATTAGT-TCCA-ATCAT-GTGAC--CA--GTC-CT-G-G-ACCAATTAAATTGACTG-T-A--TTATTTT
gi|15 : ttA-TACAAGAATG---ATAATATACAAT-CA-TGG-AT-----TTTTTTGC-------AG--GG-A-A--A-CATCACAA-----ATC-AT---CAAA--A--TGT--------A--G--TA----GGCTTATC-ACTC--GA----TGGCGTATA----TGC--GT-CCAA-G----G--------------G-TG--A-T---ATA--CC-TAC-T-AACAGC-TGA--T-AAT---T---TG--TGGTGTA-T-T--CC--T--G-CT-A-AACAGTC---CA-TAAT--A------------T---TTC-TA--T--T---AA---C--CT----GAA-GA-ATCT---AA-CAA---G----------------AAA-ATAG-----AAAA-A----------C--C--TTCT-----TG-------A-A-AA-C----ATT--TA-TTGATTTGATT--T--TTTT------AT-G-----AAGAAA---CATC-A-TCA--C--A-ATC-GT--AAA---AACATTTT---T---------------A
gi|16 : aacaatattatgcattcttaagcta----ATATTATACAAT-TG-TGG-GC-----TGTTTAGC-------AG--GG-A-G--A-CATCACAA-----ATT-AT---CAGG--T--CAT--------G--G--TA----GGGTTATC-GCCA--AA----GGGTGCCTA----GGT--GT-CCAA-G----GAAAGGTGCCTGATAG-TA--A-T---AAC--CC-TAC-T-AAGACT-TGA--T-AAT---T----------TGTC-T-C--CC--T--G-CT-A-AGCAATC---TA-TAAT--A------------G---TTT-TA--T--T---AT---C--CT----GAA-GA-ATCT----A-AAA---G----A-----------AAA-A--------AAAA-A----------T--TAAATAT-----CG-------A-C-AA-G----ATT--ccgaaaaaacgaggctga
gi|17 : gaaaatttatttgaattttttgctgaaaaatttgctacAA-AA-A-CT---AA-AAA---------------------AA-A--------AAAA-A----------C--T--ATCT-----GG-------A-A-AA-C----A-----------------------TTTT------AT-G-----TA-AAA---TATC-A-TCA--C--C-ACT-GT--AAC---AATTTTTT---tcatgaagaaaattgaaccgtttcagttaacattatttcaatatctatattttttttcattt
gi|17 : ttTTCTGCGCA----ATT----TATC--AT---TT-AAAGG----GAGATGACACAGTTGTCAC-C--C------TGAG--------CATCACAA-ATTATC-TCCC-TTCAC-ATGAC--CA--GCC-CT-A-G-ACCAATGAAAATGACTG-T-G--TTATTCTGA-AGGATAGTAAatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttctgcgcaatttatcatttaaagggagatgacacagttgtcaccctgagcatcacaaattatctcccttcacatgaccagccctagaccaatgaaaatgactgtgttattctgaaggatagtaat
gi|18 : ttaaaaactaaaaaaaaaaaaactatctggaaaacattttatgtaaaatatcatcaccactgtaacaattttttatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnATA-T----ACATTATACAAT-TA-TGG-AC-----TGTTTAGCCGGTGCCAG--GG-A-G--A-CATAAAAA-----ATT-AT---CAGG--T--CGT--------A--G--TG----GGGT------------------------TA----T-C--AC-CCGA-G----G--------------------------AAG--C--------ATG----TGA----AAT------------GATGTC-T-C--CC--T--G-CT-A-AACAGTC---CA-TAAT--ACATAATAATGTAG---TTG-TA--T--T---AT---C--CT------------------------------------------------A--------AAAA-T----------C--T--ATCT-----TG-------A-A-CA-T----GTT--TC-TTGACTTTA-TTCT--TTTT------AT-G-----TA-t
gi|19 : tacatgtatatatagatcgagtgacagtcagtactcaaactacttagtatgtaaaattT----TATC--AT---CT-ACAGGTTCGGAGACAACACAGTTGTCAC-CCTCCGCACGTGAGG-----GACATCACGA-ATTATC-TCCCTTTCACTGTGAC--CA--GCC-CTGA-T-ACCAATGAAAATGACTG-T-A--TTATTCTAA-AGG-TAATtgtctttactaaaaacg
gi|2 : aataggatatgagcaaataacacaacgtcaaactgtaaacatttctgcaagtgtttttctgctctgtcaAATATACAAT-TA-TGA-AC-----TGTTTAGC-------AG--GGAA-G--A-CATCACAA-----ATT-AT---CA-G--T--CAA--------A--G--TA-----GGTTGTC--CCC--GA----GGGCGCCTA----TGTGAGCGCCGA-G----G--------------G-TG--A-T---AATAACC-TGC-T-AAGCCC-TGA--T-AAT---T---TC--TGATGTC-TCC--CC--T--G-CT---AACAGTC---CATTAAT--A------------G---TTT-TA--T--T---ATTA-T--CC----GAA-G--ATCTATAAA-AAA---A----TCG---------AGG-A--------AAAA-A----------A--T--ATCT-----TG-------A-A-
gi|2 : ggcttcatcaaagcacattaaaacagaatgcaggtaaacaggctgaaatttaactgtagattctgttcccaacaaattaagtaaaccacagaacgtcaagcagtttacttgtcaaggacctactgtagactgtcaaagacatgttcacatattttctgcagaactgttaacctgtgttgtgttatctattgagcaagatgttcagtcgaaca--T---AT---C--TT----GAA-----TCTCTAAA-AAA---G----T-----------AAA-ATAA-----AAAA-A----------A--A--AAAT-----TG-------A-A-AAAC----TTT--TC-TTGACTTGA-T--T--TTTTTTTAA-GT-G-----T--AAA---TGTCAA-TCA--A--GTATTGGT--AACCAGAACGTTTT---C---------------tctctaaaaaagtaaaataaaaaaaaaaaattgaaaaacttttcttgacttgatttttttttaagtgtaaatgtcaatcaagtattggtaaccagaacgttttcttttacaaaaaaaggagtaaccagaagccttttcgaattatgacgtcatactaaga
gi|21 : ggcttcatcaaagcacattaaaacagaatgcaggtaaacaggctgaaatttaactgtagattctgttcccaacaaattaagtaaaccacagaacgtcaagcagtttacttgtcaaggacctactgtagactgtcaaagacatgttcacatattttctgcagaactgttaacctgtgttgtgttatctattgagcaagatgttcagtcgaacaaatatacaattatgaactgtttagcagggaagacatcacaaattatcagtcaaagtaggttgtccccgagggcgcctatgtgagcgccgagggtgataataacctgctaagccctgataatttctgatgtctcccctgctaacagtccattaatagttttattattatccgaagatctataaaaaaatcgaggaaaaaaaGAGATAT-AGACAAA-ACATAAAGC-GTAAACATTGTGTAGGTCTCACGTATTTCTGCATC----A-T----TGTC--AT---CT-AAAGG----GAGATAACACAGTTGGTAC-C--CCGCGCGTGAGGTA---CACATTACGA-ATTACT-ACTC-TTCCC-GTGAC--CA--ACC-CT-T-G-ACCAATTAAATTCAT---T-A--TTATCATGA-AGGATAATAAttttacaaaaaaaggagtaaccagaagccttttcgaattatgacgtcatactaaga
gi|23 : atagaatATCA-AAGAC-AAACA--ACA-TATTTCTTATAATATACAAT-TA-TGG-AC-----TGTTTAGC-------AG--GG-A-G--A-CATCACAA-----ATT-AT---CAGT--T--CGT--------A--G--TA----GAGTTATT-ACCA--GA----GGGCGTCTA----TGC--TC-TCAA-G----G--------------A-TG--A-T---GAC--CC-TAC-T-A-------------AAT---C------------CCAT-C--CC--T--G-CT-A-AACAGT
gi|24 : atCGCAACGTG------TTTCTGTGCC----A-T----TATC--AT---CT-ACAAG----GAGACAACACAAGTATCAC-T--CCGTGCGTGAGGCA---GACATCACGA-ATTGTA-TCCC-TTCAC-GTGAC--CA--GCC-CT-A-G-ACCAATAAAt
gi|25 : gaatagaatgagccgaaacacaacgtcaatcataaaaattt--G-CT-A-AACAGTC---CA-TAAT--T------------G----TA-TA--T--T---GT---CGACT----GGA-
gi|25 : cacagaactgtcaagcagttactgtcaaaggaactaactgtagaactgtcaaagacatgtcaaatattttctgcagaactattaacctgatgttgtgaactgagcatg----ACAATATACAAT-TA-TGG-AC-----TGTTTAGC-------
gi|26 : cacagaactgtcaagcagttactgtcaaaggaactaactgtagaactgtcaaagacatgtcaaatattttctgcagaactattaacctgatgttgtgaactgagcatgtccagtcg----ACAATATACAAT-TA-TGG-AC-----TGTTTAGC-------GG--GG-A-G--A-CATCACAA-----ATT-AT---CAGG--T--CAA--------A--G--TA----GGGTTGTC-ACCC--GA----GGGCG-----------------TGA-G----G--------------G-TGATA-T---AAC--CC-TAC-T-AAGACC-TGA--T-AAT---T---T
gi|27 : tgttgtgaactgagcatgtccagtcgTC--AT---CTTAAAGG----GAGACAACACAGTTGTCAC-C--C---GCGCAAGGGA---GGCAACCTGA-ATTATT-TCCC-TTCAC-GTGAC--TA--GCCACT-A-G-ACCAATG-ATTTCACTG-C-AATTCATTTCGA-AGGATAATAA
gi|29 : atttctgctctgttATAGT----AT--TATACACT-TA-TGG-ACATGACTGTTTAGT-------AG--AT-A-G--A-CATCAAAATATATATT-AT---CAGG--T--CGA--------A--G--TA----GGGTTATC-ACCC--GA----TGGCGCATA----
gi|3 : attgcaatattatattacatttatcatgtaaaatTATTATACAACACACTGG-AC-----TGTTTAGCCC-----GG--GG-A-CTTA-CATCACAA-----A-T-AT---CAAG--G--GGA--------A--GA-TA----GGGTTATC-ACCC--GG----AGGGGCCTA----TGCG-GC-CCGA-GCC--G--------------GTTG--A-T---AAC--CCTTAA-T-AAGACC-TGACCT-AATCGCC---CG--AGTTTTC-T-C--TC--CGGG-CT-A-ACTAGTC---CC-C--T--A------------GCTCCTT-TATCT--T---AT---C--CCCCTGGAA-GACATCTTA-AA-AAA---GATTTT-----------TTA-A--------GATA-A----------T--T--ATCT-----TC-------A-ACAACC----ATT--TC-TTGACTTGA-T--TTGTTTT------ATGG-----TA-AAAAACCGTC-A-TCA--A----ATC-GT--AAC---AAGTTTTggg
gi|3 : ------TTTCTGCGCC----A-T----TATC--AT---CT-ACAGG----GAGACTACACAGTTGTCAC-C--AAGCGCGTGAGGGA---GACATCATGA-ATTATC-TCCC-TTCAC-GTGAC--CA--GCC-CT-G-G-ACCAATGAAAGTGACTG-TAA--TTATTCTAA-AGAATAATAActacaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgtttctgcgccattatcatctacagggagactacacagttgtcaccaagcgcgtgagggagacatcatgaattatctcccttcacgtgaccagccctggaccaatgaaagtgactgtaattattctaaagaataataa
gi|30 : tattatacaacacactggactgtttagcccggggacttacatcacaaatatcaaggggaagatagggttatcacccggaggggcctatgcggcccgagccggttgataacccttaataagacctgacctaatcgcccgagttttctctccgggctaactagtcccctagctcctttatcttatccccctggaagacatcttaaaaaagattttttaagataattatcttcaacaaccatttcttgacttgatttgttttatggtaaaaaaccgtcatcaaatcgtaacaagttttctacaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgTGTACATT-TA-TGG-AC-----TGTTTAGA-------AG--AG-A-G--A-CATCACAA-----AT
gi|30 : cttgacttccaaaggaggaacaacatcttattcagttgTTAGAAGA-GAGACATCACAA--------ATA-TGTACATT-TA-TGG-AC-----TGTTTAGA-------AG--AG-A-G--A-CATCACAA---------AT---CGGG--T--TGT--------G--G--Tatgtacatttatggactgtttagaagagagacatcacaaatcgggttgtggt
gi|31 : cttgacttccaaaggaggaacaacatcttattcagttgtgtacatttatggactgtGCGCC----A-T----TATC--AT---CT-ACAGG----GAGACAACACAGTTGTCAC-C--CCGCGCGTGAGGGA---GACATCACGA-ATTATC-TCCC-TTCAC-GTGAC--CA--GCC-CT-G-A-ATAAATGAAAATGACAG-T-A--TTATTCTAA-AGG
gi|33 : tct---TTT-TA--T--T---CA---C--CT----GAA-TA-ACCC----A-AAA---G----T-----------TTT-A--------AACA-A----------T--A--ATCTGCCAATG-------A-A-AA-C------T--TC-TTGAC-TGA-T--T--TTTTTAA---AT-G-----TA-AAA---TGTC-A-TCA--AAGA-ATC-GA--AAC----ACTTTTT---CT--------------AAA----
gi|34 : --A------------G---TTTGTA--T--C---AT---C---T----GAGTAA-ACCC---AA-A-----G----TTTTT-------AAA-T--------A------------------T--ATCT-----TGCCAATGAA-A-AA-C----ATT---C-TTGACTTGA-T--T--TTTTTTAA--AT-G-----TA-AAA---TGTC-ATTCA--A--G-ATC-GA--AAC---AACTTTTacta
gi|35 : ----ATT----TATC--AT---CT-AAAGG----GAAGCAACACAGTTA-CAC-C--CAACGTGTGAGG-A---GACACCACGA-ATTATC-TCCC-TTCAC-GTGA---CA--GCC-CT-GTG-ACCAATGAAA
gi|36 : atttcttgcactg-----TGTTT--------------GA-A-G--A-TACCACAA-----GTT-GT---TGGG--T--CCA--------A--GGATA----AGGTTAGA-GCCATGGA----GTGGGCTAA----AAC--AC-CCAG-G----G--------------G-AT--A-T---AAC--CA-AACCT-A-GACC-TGA--C-AAC---T---TT--TGATGTC-
gi|37 : TATACAGT-TA-TGG-AC-----TGTTTAGC-------AG--GG-A-G--A-CATCACAA-----ATT-AT---CAGG--T--CATTTAAATGAA--G--T-----GGGTTTTC-ACAA--GA----GGGCGCCTA----
gi|38 : atactttttttgtccacagtctgACAAGATC----ACAATATACAAT-TA-TGG-AC-----TGTTTAGC-------GG--GG-A-G--G-CATCACAA-----ATT-AT---CAGG--T--CAA--------A--G--TA----GGGTTATC-ACCC--GA----GGGCGCCTA----
gi|39 : gagttatctcagtgataACAGTTGTCAC-G--CCACACGTGAGGGA---GACATCACGA-ATTATC-TCCC-TTCAC-GTGAT--CA--GCC-CT-A-G-ACCAATGAAAATGACTG-T-A--TTATTCTAA-AGGATAATA
gi|4 : aT----ATAATG-ACAGA-TA-TGG-AC-----TG-TTAGC-------AGGTGG-A-G--AGCATCACAA-----ATTCATATAGAGT--T--CAA--------A--A--TA----GGGTTGT---CCC--GA----GGGCG--------TGA--GT------G----G--------------G-TG--A-TATAAAC--CT-TAC-T-AAGACCTTGAT-T-AAT---TATATGTTTGATTTC-T-C--TCCAT--GACT-A-ACTAG-CAAGCA-TGAG--A--------------------TA-----T---AT------CT----AAA-G---TC-----A-TAA---G----G-----------AAA-C--------AAAA-A----------A--T--ATCT-----TG-------A-A-A
gi|4 : agatttaaggtcacaggctcatcaaagccacccataaattcagaatgagtgaacaggctctctcgaagaactattataatgaactgtagatactgtcacaaacacaataaagttaaaaccacagaactgtcaagcagttactgtcaaaaggaatatcacgtctatactgtagagcatgtcaaagacactgttcaaaatatttttcttgacatgaactattaatcctatgttgtcactacttgagcatggatccagtgcggatcta--T---AT---C--TT----GAA----ATCT---AA-AAA---G----T-----------AAT-A--------AAAA-A--------------------------G-------A-A-AA-CAAAAATC--TC-TTGAtctaaaaagtaataaaaaagaaaacaaaaatctcttgaaaaaacttttcc
gi|40 : agatttaaggtcacaggctcatcaaagccacccataaattcagaatgagtgaacaggctctctcgaagaactattataatgaactgtagatactgtcacaaacacaataaagttaaaaccacagaactgtcaagcagttactgtcaaaaggaatatcacgtctatactgtagagcatgtcaaagacactgttcaaaatatttttcttgacatgaactattaatcctatgttgtcactacttgagcatggatccagtgcggatctatataatgacagatatggactgttagcaggtggagagcatcacaaattcatatagagttcaaaatagggttgtcccgagggcgtgagtgggtgatataaaccttactaagaccttgattaattatatgtttgatttctctccatgactaactagcaagcatgagatatatctaaagtcataaggaaacaaaaaaACAA-----ATT-AT---CAGG--T--TAT--------ATAGC-TA----GGGTTCTC-ACAT--TA----GAGCGCCTA----TGC--GC-CCAA-G----G----------------------T---A-----------T-ATAAGG-TAAT-T-AAT---T---TG--TGATGTC-T-T--CC--T--G-CT-A-AACAGTC---aaaaacttttcc
gi|41 : aACAGTTTTCAC-T--C-GCGCGTGAGGGA---GACAT-ACGA-ATTATC-TCCC-TTCAC-GTGAC--CA--GCC-CT-G-G-ACCTATGAAAATGAGTG-T-A--TTATTCTAA-AGGATAATA
gi|42 : ACAA-----ATT-AT---CAGG--TTATAT--------A--GC-TA----GGGTTCTCAACAT--TA----GAGCG-CTA----TGC--GC-CC-A-A----G--------------G-T---A-T---A-----------T-AAG-----GAATT-AAT---T---TG--TGATGTT-C-T--TC--T--G-CT-A-AAc
gi|43 : tcta----ATATTATATAAT-TA-GGG-AT-----GGTTTATC-------GG--GG-A-G--G-CATCACAA-----ATT-AC---CAGG--A--TTT--------A--A--TA----AGGCTATac
gi|44 : caaaaatatcataatacaatgtacgtttgT---CT-AAAGG----GAGATAACACAATTGTCAT-C--CCACACGCGAGGGA---GACATCACAA-ATTGTC-TCTG-CTCAC-GTGAC--CA--GCC-CT-A-G-ACCTATGAAaa
gi|45 : GAGGGA---GACATCACGA-ATTATC-TCCC-TTTAC-GTGAC--CA--GCC-CT-A-G-ACCAATGAAAATGATTG-T-A--TTATTCTAA-AGGATAATAA
gi|47 : -A--------AAAA-A----------C--T--ATCT-----TG-------A-A-AA-C----ATT--TC-TTGACT--G-T--C--TTTT------AT-G-----CA-AAA---CGCC-A-TCA--A--G-ATC-AT--AAC---AACTTTTT---C---------------
gi|49 : A-----ATT-GT---CTGG--T--CTT--------A--T--TA----GGGTTATC-ACCC--AG----AGACTACTATTATTGT--GT-CCTC-G----G--------------G-TG--A-T---AAC--CC-TAC-T-Atacta
gi|5 : AATATACAAT-TA-TGG-AC-----TG-TTAGC-------GG--CG-AGG--A-CATCACAT-----ATT-AT---CAGG--T--CAA--------G--G--TA----GGGTTATC-ACCG--GA----GCG-GCCTA-----GC--GC-CCGA-G----G--------------G-TG--A-T---AA---CC-TAC-T-AAGA-C-TGA----AAT---T---TG--TGAT-TC-T-C--CC--T--G-CT-ATAACAGTC---CA-TAAT--A------------G---TTT-TA--T--T---AT---C--CT----GAA-GA-A-CT---AA-AAA---G----T---------------ATTTTTTTTAAAA-A----------T--T--ATCT--------------A-A-AA-C----ATT--TT-TTGACTTGA-T--T--TTTT------AT-G-----TA-AAA---CGTC-A-TCA--A--G-ATC-GTA-AAC---AACTTTTTCTAC---------------AAANNNNNN--NNNN------NNNN-N-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNN------NNNNNGTGTTTCTGACC----CATT--ATCATCT-ACAGG----GA-ACAACACA-TTGTCCCAC--CAGCGCGTGAGGGA---GACATCACGA-ATTATC-TCCC-TTCAC-GTGAC--CA--G-C-CT-G-G-A-CAAT-AAAGTGACTG-TAA--TTATT-TAA-AGGATAATAA
gi|50 : tactttattttttaaattcttttaactattgaaaca-TGG-AC-----TGTT------------G--GG-A-G--A-AATCACAA-----AT---T---CAAG--T--CAT--------A--T--TAAGGTGGGTTATC-ACCA--GAGGCCGGGCGCC
gi|51 : --AT---CT-AAAGG----GAGACAACACAGTTATCAC-C--CAACGTGTGAGGGA---GACACCACGA-ATTATC-TCCC-TT
gi|53 : CACAG-----GTC-AT---TAGAAAT---GA--------A--G--T-----GGGTTATC-ACAT--TA----GGGCGCCTA----T
gi|57 : aattgta-AAAGG----GAGACAACACAGTTGTCAC-C--CCGCGC
gi|58 : taactaAATATACAAT-TA-TGG-AC-----TGTTTAGC-------GG--
gi|6 : tc----ACAATATACAAT-TA-TGGCAC-----TGTTTAGC--------G--GG-A-G--A-CATCA-AA-----ATT-AT---CAGG--T--CGA--------A--G--TA----GGGTTATC-A-CC--GA----GGCCGCCTA----TGC--GC-ATGGCGCCTCG--------------G-TG--ACT---AAC--CC--AC-TCAAGACC-TGA--TAAAT---T---TG--TGATTTA-T-C--CT--T--G-TT-A-A-----------------------------------CTT-TA--T--T---AT------CT----GAA-G--ATCT-------------------------------A-A--------AAAA-G----------T--T--TTTC-----TGC------A-A-AA-C-----TT--TC-TTGAC-TGA-T--T--TTTT------AT-G-----TA-GAA---CGTC-A-T-A--A--G-ATC-GCTAAAC---AAGTTCTT---C---------------
gi|7 : ctgtttaacgaaaaattatattcaattcaaattctttattgcgtaacacacatgtaattggttattcccatgatggaatctagataacaatatttaaaaaaatacgtaaaataacatgggcatagtgtttgATCAGGAGACAAAACA-CACAATACT----ATAATATACAAT-TA-TGG-AC-----TGTTTAGC-------AG--GG-A-G--A-CATAACAA-----ATT-AT---GAGG--T--TGT--------A--G--TA----GGGTTATC-ACCC--GA----GGGCACCTA----TGT--GC-CTGA-G----G--------------G-AG--A-T---AAC--CC-TAA-T-ACAACA-TGA--T-AAT---T---TG--TGATGTC-T-C--CC--T--G-CT-A-AACAGTC---TA-TAAC--A------------G---TTT-TA--T--T---AT---C--CT----GAA-GA-ATCT---AA-AAA---G----T-----------AAA-A--------AACA-A----------C--T--ATCT-----TG-------A-A-AA-T----GCT--TC-TTGATTTGA-T--T--TTTT------AT-G-----TA-AAA---TGTC-A-TCA--A--G-ATT-GT--AAC---AATTTTGT---C---------------AAA----NN--NNNN------NNNN-N-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNN------NNNNNNNNNN----NNN----TATC--AT---CT-AAAGG----GAGACAACACAGTTGTTAC-C--CCATGCGTGAGGGA---GACATCACGA-ATTATC-TCCC-TTCAT-GTGAC--TA--GCT-CT-A-G-ACCTATGAAATCGACTG-T-A--TTATTCTGA-AGGATAATAAtacaaaaacgaccgaaagatttcgattgtgatgtacaactaattaaagagggcaaaactttacgtcaacagtacaattgataatttcagtcaactttccttgcgttccagtagctcacgtgaggagac
gi|8 : AATATACAAT-TA-TGG-AC-----TGTTTAGC-------GG--GG-A-G--A-CAGCACAA-----ATT-AT---CAGG--T--CGA--------A--G--TA----GGGTTATC-ACCC--GA----GGGCGCCTA----GAC--GC-CCGA-G----G--------------G-TG--A-T---ATC--CT-TAC-T-AAGACC-TGA--T-AAT---T---TG--TGATGTC-T-C--CC--T--G-CT-A-AACAATC---CA-TAAT--A------------G---TTT-------------------------------A-ATCT---AA-AAA---G----T-----------AAA-A--------AAAA-A-------------T--ATGC-----TG-------A-A-AA-C----ATT--TC-TTGACTTGA----T--TTTT------AT-GTATCTTA-AAA---CGTC-A-TCA--A--G-ATT-TT--AAC---AACTTTTT---C---------------
gi|9 : catgaaaaaagggaaataaaaaaaaattacaaaagattattttgatcgttaagttccgaggtagacagtcTAATATACAAT-TA-TGG-AC-----TGTTTAGC-------GG--TG-G-G--A-CTTTAC-A-----ATT-CT---CTGG------GA--------A--G--TT----AGGTTTTCTTCCC--GA-----GGCGCCTA----T-C--G--CCGA-G----G--------------T-T-----T---AA---CC-TAC-T-AAGA-C-TGA--T--AT---T---TGT-TGAT-TC-T----CC--T--G-CTCA-AACAGTC---CA-T-AT--A------------G---TTT-T---T-------T---C--CT----GAA-GATATCT---AA-ATATTTT----T-----------AAA-A--------ATTA---------------T--ATCT-----TG-------A-A-AA------ATT--TC-TTGACTTGA----T--TTTT------AT-G-----TA-AAA---CG-----TCA--A--G--TC-GT--TAA---AACTTTTT---CTACAAAACGAGCCGGAAA----GCTGCGAA------TTGT-GACGTCAGAAAGAATGAGGC---AAATAACAACGTCAAACAGTTTAAATTTCGAATCGTG------TTTCTGCGCT------T----TATC--AT---CT--CAGG----GAGAAAACACAG-TGTCAC-C--CCGCG-GTGA-GGA---GAC--TACGA-ATTAAT-TCCCTTTCAC-TTGACAGCA--G--------G-ACCAA-GAA--TGA----T-G--TTA-TCTAAGAGGATCATtacaaaaaaaacaaaaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgtttccgcacaattatcatctacatggagactaatagaatccttcattagtac
10 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|20 ): TGGAGGGGGGGGGGGTCCTTGCAGTTTTATAATACCATACAATAAAATATGCATATATTTGTTGTGTTCTGATTTGCTTGTCTGTCATTATTAAATTTTTTTCTGTTAAAAGCAAATTGCAAATTCAAATTCTTTATTGGCGTAACACATTAACATGTAATGGTTATTGTCCATGAGGAGAACTAATAACAATAATT
Unaligned ( gi|22 ): AATTTAAATAGTCCAGGCTCATCAAAGCACCATTAACAGAATGCAGGTAACAGGCTGAAATTTAACTGTAGTTCTGTCAAACAAATAAGTAAACCACAGAACTGTCAAGCAGTTACTGTCAAAGGAACTAACTGTAGAACTGTCAAAGACATGTCAAATATTTTCTGCAGAACTATTAACCTGA
Unaligned ( gi|28 ): TCTATTGGCGCAACACATCAACATAATGGTTATTGCCCATGAGTAAAACTAATAACAATATGTAAATGATAGATAGCATGATGCTTTTCTGTTTCACGTATATATTCAATTTGTATTTTGTAAATGTTTGTAC
Unaligned ( gi|32 ): TGGGGGGGGGGGGGTGATTTTTCCTTGCGGTTTATAATACATAGAATAAATATGCATATATTATGTTGGTTTTGATTGGCTTGTCTGTCATTATTGAATTTTATTCCAGTTAAAAGTAAATTGCA
Unaligned ( gi|46 ): AATAAAATAGAATGGAGCCGAAAACAAACTCAAGCATAAAAAATTTCGCAACGGTTACTGGCCATTATCATCTTAAAGGAAC
Unaligned ( gi|48 ): AATAAGATATGCAAATATTTGTGGTTTTAATTGGCTTGTTTATTATTATTTGTTTTCATTTATAAACAAATTGT
Unaligned ( gi|52 ): ATGTTTCTGATATACCCCTGTCATCATGATGAGACTAATAGAGTCCTTCATTAGTACGAG
Unaligned ( gi|54 ): TTGGTAGGGGGATTAGTTTATAGTTTTTAGTAGATGGTTAGCAGATGA
Unaligned ( gi|55 ): TTTTCGCACAACTGTGAGAATAATAGAATCCTTCATTAGTAC
Unaligned ( gi|56 ): CGGTCATCAGAGAATAATATAATCCTTCATTAGTACGAGT
Alignments
lowQualScore : 11 11 111111 1111111111111111 2222222222222222222222222 111111111111111 222222 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 222222222222222222222
lowQualScore : 6 88 66 4 222222 1 1 1 33333 77777777 22 1 44 1 33333 444 1 22 77777777777 44 66 3333 1 3333 3333 222 1 4 6666 0 2 7777 2222222222222222 22 2 666 22 1 1 1 66 3 1 333 333 44 2 2 22 55555 1 1 1 1 555 2 22 777777777 1 22 22 333 555 22 3333 6666 9999 1 222 2222222222222222222222222 1 555 0 444444444444444 22 44444 7777777 1 1 3 4444 22 2 3333 22 222222 2 77777 2 333 2 2 33 33 2 2 33 2 333 0 444 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 4 1 0 7 1 0 3 1 3 1 777777777777777777777 1 55555 2 555 2 99 4 22 1 1 3333 22 55 0 333 1 1 3 1 22 22 1 1 1 1 1 2 4 33 2
lowQualScore : . .. .. . ...... . . . ..... ........ .. . .. . ..... ... . .. ........... .. .. .... . .... .... ... . . .... . . .... ................ .. . ... .. . . . .. . . ... ... .. . . .. ..... . . . . ... . .. ......... . .. .. ... ... .. .... .... .... . ... ......................... . ... . ............... .. ..... ....... . . . .... .. . .... .. ...... . ..... . ... . . .. .. . . .. . ... . ... ........................................................................ . . . . . . . . . . ..................... . ..... . ... . .. . .. . . .... .. .. . ... . . . . .. .. . . . . . . . .. .
lowQualScore : 7 77 55 9 888888 7 6 6 88888 44444444 33 7 00 7 77777 222 5 11 11111111111 11 55 3333 6 6666 4444 444 9 0 3333 3 1 4444 6666666666666666 88 0 000 66 8 8 8 88 6 8 222 222 88 7 0 88 55555 9 9 9 6 888 2 99 000000000 9 66 44 000 444 44 7777 4444 3333 7 999 6666666666666666666666666 6 888 2 444444444444444 33 22222 1111111 7 7 8 0000 66 0 7777 99 444444 1 44444 1 999 2 2 11 11 2 2 11 2 999 7 444 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 5 0 6 3 0 8 6 0 6 0 999999999999999999999 0 33333 1 888 1 22 2 88 9 8 9999 44 44 1 000 7 7 5 8 55 66 9 9 9 9 8 2 4 11 4
consensus : ATCAGAAGACGAAACA-CACAATANT----ATAATATACAAT-TA-TGG-AC-----TGTTTAGC-------GGG--GA-G--A-CATCACAA-----ATT---ATC-AGG--TC--------GN-A--G--TA----GGGTTATC-ACC-C--GA----GGGCGC--CTAT-GC-G--C-CCGA-G----G--------------G-TG--A-TA---AC--CC-TACT-AAGACC-TGA--T-AA-T---T---TG--TGATGTCT-C--CC--T--G-CT-A-AACAGTC---CA-TAAT--A-----G---TTT-TA--T--T---AT---C--CT----GAA-GA-ATCT---AA-AAA---G----T-----------A--------AA-A---AAAA-A----------C--T--ATCT-----TG-------A-A-AA-C----ATT--TC-TTGACTTGA-T--T--TTTT------AT-G-----TA-AAA---CGTC-A-TCA--A--G-ATC-GT--AA-C---AACTTTTT---C---------------AAA-AC--NAAA-----TCG--TG-CGTCAGAA-AGAATGAGGCA--TAAAACAAN-ACGTCAAGC-GTAAACA-TTTC-GCAA------CG------------TGTT-----TCT-GC---GCC-A--TT-ATC--ATC-T-AAAGG----GAGACAACACAGTTGTCACC--CC-GCGCGTGAGGGA---GACATCACGA-ATTATC-TCCC-TTCAC-GTGAC--CA--GCC-CT-A-G-ACCAATGAAANTGACTG-T-A--TTATTCTGA-AGGATAATAA
Reference ( family-1347 ) : ATCAGAAGACGAAACA-CACAATANT----ATAATATACAAT-TA-TGG-AC-----TGTTTAGC-------GGG--GA-G--A-CATCACAA-----ATT---ATC-AGG--TC--------GN-A--G--TA----GGGTTATC-ACC-C--GA----GGGCGC--CTAT-GC-G--C-CCGA-G----G--------------G-TG--A-TA---AC--CC-TACT-AAGACC-TGA--T-AA-T---T---TG--TGATGTCT-C--CC--T--G-CT-A-AACAGTC---CA-TAAT--A-----G---TTT-TA--T--T---AT---C--CT----GAA-GA-ATCT---AA-AAA---G----T-----------A--------AA-A---AAAA-A----------C--T--ATCT-----TG-------A-A-AA-C----ATT--TC-TTGACTTGA-T--T--TTTT------AT-G-----TA-AAA---CGTC-A-TCA--A--G-ATC-GT--AA-C---AACTTTTT---C---------------AAA-GC--NAAA-----TNG--TG-CGTCANAA-AGNATGAGGCA--TNAGACANNNACGTNAAGC-GTANACA-TTNC-GNAN------CN------------TNTT-----TCT-GC---GCC-A--TT-ATC--ATC-T-AAAGG----GAGACAACACAGTTGTCACC--CC-GCGCGTGAGGGA---GACATCACGA-ATTATC-TCCC-TTCAC-GTGAC--CA--GCC-CT-A-G-ACCAATGAAANTGACTG-T-A--TTATTCTGA-AGGATAATAA
gi|1 : ----ACAATATACAAT-TA-TGG-AC-----T-CTTATC-------GGA--------A-CATCACAA-----ATTT--AT--AAG--TC--------TTTA--G--TA----GGGTTATC-ACC-T--GA----GGG-------------------------------------------G-TG--A-TA---AC--CC-TACT-AAGACT-TGA--T-AA-T---T---TG--TGATGTCT-C--CC--T--G-AT-A-AACAGTC---CA-TAAT--A-----G---TTT-TA--T--T---AT---C--AT----GAA-GA-ATCT---AA-GAA---T----T-----------A--------AA-A---AAAA-T----------C--T--TTTT-----TG-------A-A-AA-C----ATT--TC-TTGACTTGA-T--T--TTTT------GT-G-----TA-AAT---TGTC-A-TCA--A--G-ATT-GG--AA-C---AACTTTTC---C---------------
gi|1 : tcacagacaatacaaagtatgtcagtaatgtgggtgtg------------TATT-----TCT-TC---GCT-AA-TT-AGC--ATC-T-AAAGG----GAGACAACACAGTTGTCACC--CT-GGGCATGAGGGA---GAGATCACAA-ATTATC-TCCC-TTCAC-ATGAC--CA--GCC-CT-A-G-AC-----AAATTGACTT-T-A--TTATTCTGA-AGGATGATtacaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgtgatgtatttcttcgctaattagcatctaaagggagacaacacagttgtcaccctgggcatgagggagagatcacaaattatctcccttcacatgaccagccctagacaaattgactttattattctgaaggatgattatattcaattatggactgtttatcagggtgatatcataattatcaggttgaagtagggttatcaaataagggtgcctatgcagtaagacatacaagtattcagttcagcgcccatgaaattcttacttttcctttgaaatagt
gi|1 : tcacagacaatacaaagtatgtcagtaatgtgggtgtgacaatatacaattatggactcttatcggaacatcacaaatttataagtctttagtagggttatcacctgaggggtgataaccctactaagacttgataatttgtgatgtctccctgataaacagtccataatagttttattatcatgaagaatctaagaattaaaaaaaatcttttttgaaaacatttcttgacttgattttttgtgtaaattgtcatcaagattggaacaacttttcctacaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgtgatg-TG--A-TA---AC--CC-TACT-TCAACC-TGA--T-AA-T---T----A--TGATATCA-C--CC--T--G-AT-A-AACAGTC---CA-TAATTGA-----A---TAT-AA--T--C---AT---C--CT----TCA-GA-A--T---AATAAA---G----T-----------C--------AA-tatattcaattatggactgtttatcagggtgatatcataattatcaggttgaagtagggttatcaaataagggtgcctatgcagtaagacatacaagtattcagttcagcgcccatgaaattcttacttttcctttgaaatagt
gi|1 : tcacagacaatacaaagtatgtcagtaatgtgggtgtgacaatatacaattatggactcttatcggaacatcacaaatttataagtctttagtagggttatcacctgaggggtgataaccctactaagacttgataatttgtgatgtctccctgataaacagtccataatagttttattatcatgaagaatctaagaattaaaaaaaatcttttttgaaaacatttcttgacttgattttttgtgtaaattgtcatcaagattggaacaacttttcctacaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgtgatgtatttcttcgctaattagcatctaaagggagacaacacagttgtcaccctgggcatgagggagagatcacaaattatctcccttcacatgaccagccctagacaaa----ATTATATTCAAT-TA-TGG-AC-----TGTTTATC-------AGG--GT-G--A-TATCATAA------TT---ATC-AGG--TT--------GA-A--G--TA----GGGTTATC-AAA-T--AA----GGGTGC--CTAT-GC-aataagggtgcctatgcagtaagacatacaagtattcagttcagcgcccatgaaattcttacttttcctttgaaatagt
gi|10 : tcacagacaatacaaagtatgtcagtaatgtgggtgtgacaatatacaattatggactcttatcggaacatcacaaatttataagtctttagtagggttatcacctgaggggtgataaccctactaagacttgataatttgtgatgtctccctgataaacagtccataatagttttattatcatgaagaatctaagaattaaaaaaaatcttttttgaaaacatttcttgacttgattttttgtgtaaattgtcatcaagattggaacaacttttcctacaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgtgatgtatttcttcgctaattagcatctaaagggagacaacacagttgtcaccctgggcatgagggagagatcacaaattatctcccttcacatgaccagccctagacaaattgactttattattctgaaggatgA---AC--CT-CACA-AAGACC-TGA--T-AA-T---T---TG--TGATGTTT-C--CC--A--G-CT-T-AACATTC---CA-TAAT--A-----G---TTT-TA--T--T---AA---C--CT----GAA-GA-ATCT---AA-AAC---G----T-----------A--------AA-A---GAAA-ACAATTGTCATC--T--ATCT-----TG-------A-A-CA-C----ATT--TC-TTGACTTGA-T--T--TTCTTTTTACAT-G-----TA-AAA---TGTC-A-TCATCA--G-ATC-AT--AA-C---AAA--------C---------------AAT-AC--GGAA-----ACT--T----TCAGAA-AG-------------------TCACGTCAAGC-GTAAACA-TTTT-GTAG------CA------------TATT-----TCT-GT---GCTAA--TT-ATC--GTC-T-AAAGG----GAGACAACACAGTTGTCACC--CT-GAGCATGAGGAA---GACATCACGA-A-TATCTTCCC-TTCAC-GTGAT--Cagtaagacatacaagtattcagttcagcgcccatgaaattcttacttttcctttgaaatagt
gi|10 : TCGTCACC--CT-GAGCATGAGGGA---GATGTCACGA-ATTATC-TCCC-T-CAC-GTGAT--CA--AAC-CT-A-G-ACCAATGAAATTGACTC-T-A--TTATTCTGA-GGGGTAATAgtcaccctgagcatgagggagatgtcacgaattatctccctcacgtgatcaaacctagaccaatgaaattgactctattattctgaggggtaatatag
gi|11 : aacctcacaaagacctgataatttgtgatgtttcccagcttaacattccataatagttttattaacctgaagaatctaaaacgtaaaagaaaacaattgtcatctatcttgaacacatttcttgacttgattttctttttacatgtaaaatgtcatcatcagatcataacaaacaatacggaaactttcagaaagtcacgtcaagcgtaaacattttgtagcatatttctgtgctaattatcgtctaaagggagacaacacagttgtcaccctgagcatgaggaagacatcacgaatatcttcccttcacgtgaC--CTAT-GC-G--C-CCGA-G----G--------------G-TG--A-TA---AC--CC-TACT-AAGACC-TGA--T-TA-T---T---TG--TGATGTCT-C--CC--T--G-CT-A-AACAGTC---CA-TAAT--A-----G---TTT-TA--T--T---AT---C--CT----AAA-CA-ATCC---AA-AAA---G----TCC---------A--------AA-A---AAAA-A----------C--T--ATCT-----TG-------A-A-AA-T----ATT--TC-TCGACTCGA-T--T--TTTT------GT-G-----TA-AAT---CGTC-A-TCA--A--G-ATC-GT--AA-C---AATTTTTT---C---------------TA------CAAA-----TAG--tag
gi|11 : a------------TATT-----TCT-GC---ACT-AA-TT-ATC--ATC-T-AAAGG----GAGACAACACAGTTGTCACC--CC-GCACGTGAGGAA---GACATCGTGA-ATTATC-TCCC-TTCAA-GTGAC--CA--GCC-TT-A-G-ACCAATGAAATTGACTG-T-A--TTATTCTGA-AAGATAATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatttctgcactaattatcatctaaagggagacaacacagttgtcaccccgcacgtgaggaagacatcgtgaattatctcccttcaagtgaccagccttagaccaatgaaattgactgtattattctgaaagataat
gi|12 : acctatgcgcccgagggtgataaccctactaagacctgattatttgtgatgtctccctgctaaacagtccataatagttttattatcctaaacaatccaaaaagtccaaaaaaaaactatcttgaaaatatttctcgactcgattttttgtgtaaatcgtcatcaagatcgtaacaattttttctacaaatagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-TATC-AAGACC-TGA--T-AATT---T---TC--TGTTGTCG-CTACCA-TTGG-CT---AACA-TC---CA-TAAT--A-----T---TTT-TA--TACTTAAATAAAA--CT----GAA-G--ATCT----A-AAA---G----T-----------A--------AA-A---AAAATAT---------C--C--ATCT-----TG-------A-A-
gi|12 : cg-GA-ATCT---AA-AAA---GG---T-----------A--------AA-A---AAAA-A----------CATT--ATCT-----TG-------ATA-AA-C----ATTCTTCATTGACTTA-----T--TTTT------AT-GG----TA-AAA---CGTC-A-TAA--A--G-CT--GT--AA-C---AAC------------------------AAG-GC--GAAAAGCTTTTGATTG-TATCATAT-AGGATGAGGCA--TAAAACACGTTC--AAAAC-ATAAACA-TTTC-GCAA------CTA-----------TGTT-----TAT-GCA--GCC-A--TTTATCTAATC-T-ACAGG----GA-ACAACACA--TGTTACC--CC-GCGCGTGATGGATCGGACAT-ACAAGATTACC-TCCC-TTTAC-AT-AC--CA---CC-CA-A-GCACC-ATGGAAATAGCT-------TTATTCTTA-A-GATAATAAtctaaaaaggtaaaaaaaaacattatcttgataaacattcttcattgacttatttttatggtaaaacgtcataaagctgtaacaacaaggcgaaaagcttttgattgtatcatataggatgaggcataaaacacgttcaaaacataaacatttcgcaactatgtttatgcagccatttatctaatctacagggaacaacacatgttaccccgcgcgtgatggatcggacatacaagattacctccctttacataccacccaagcaccatggaaatagctttattcttaagataataata
gi|13 : cgtatcaagacctgataattttctgttgtcgctaccattggctaacatccataatatttttatacttaaataaaactgaagatctaaaagtaaaaaaaatatccatcttAT-TA-TGG-AC-----TGTTTAAC-------AGG--GA-G--A-CATCACAG-----ATT---ATC-AGG--TT--------AT-A--A--TA----GTGATGTC-ACC-T--GA----GGGTGC--ta
gi|13 : -TA--T--T---AT---C--CT----GAA-GA-ATCT---AA-AAA---G----TTGTTTTTTTTTA--------AT---------------------C--C--ATCT-----TG-------A-A-AA-C----ATT--TC-TAGACTTGA-T--T--TTTTTT----AT-G-----TA-CAA---CATC-A-TCT--A--T-ATT-GT--AA-C---AACTTTTT---C---------------TA---T--AAAA-----TNN--NN-NNNNNNNN-NNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNN-NNNN-NNNN------NN------------NNNN-----NNN-GC---ACT-AA-TT-ATC--ATC-T-AAAGG----GAGGCAACACAGTTGTCACC--CA-GTGCATGAGGTA---GACATCATGA-ATTGTT-TCCC-TTCAC-ATGAC--TATTGCC-CT-A-G-ACCAGTGAATTTGACTATT-A--TAATTCTGA-TGGATAATgttttataatattatcctgaagaatctaaaaagttgtttttttttaatccatcttgaaaacatttctagacttgattttttttatgtacaacatcatctatattgtaacaactttttctataaaatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngcactaattatcatctaaagggaggcaacacagttgtcacccagtgcatgaggtagacatcatgaattgtttcccttcacatgactattgccctagaccagtgaatttgactattataattctgatggataat
gi|14 : attatggactgtttaacagggagacatcacagattatcaggttataatagtgatgtcacctgagggtgcgttttataaTGTCT-T--CC--A--G-CT-A-AACA-TCG--TA-TAAT--A-----A---TTG-TA--T--T---AC---C--CT----AAA-CA-AACT---AA-AAC---G----T-----------A--------AACA---GAAA-A----------C--T--ATCT-----TG-------A-T-AA-C----AAT--TC-TTGACTTCA-T--C--TTTT------AT-G-----CA-AAA---CGTC-A------A--G-ATA-GT--AA-T---AACATCTT---CTAC------------AAA-NN--NNNN-----NNN--NN-NNNNNNNN-NNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNN-NNNN-NNNN------NN------------NNNNNNAAATCT-GC---TCC-A--TT-ATC--ATC-T-AAAAG----GAGAAAACACAGTTGTCGCC--CT-GTGCGTGATGGA---GACATCAATA-ATTAGT-TCCA-ATCAT-GTGAC--CA--GTC-CT-G-G-ACCAATTAAATTGACTG-T-A--TTATTTT
gi|15 : ttA-TACAAGAATG---ATAATATACAAT-CA-TGG-AT-----TTTTTTGC-------AGG--GA-A--A-CATCACAA-----ATC---ATC-AAA--AT--------GT-A--G--TA----GGCTTATC-ACT-C--GA----TGGCGT--ATAT-GC-G--T-CCAA-G----G--------------G-TG--A-TA---TA--CC-TACT-AACAGC-TGA--T-AA-T---T---TG--TGGTGTAT-T--CC--T--G-CT-A-AACAGTC---CA-TAAT--A-----T---TTC-TA--T--T---AA---C--CT----GAA-GA-ATCT---AA-CAA---G----------------A--------AA-ATAGAAAA-A----------C--C--TTCT-----TG-------A-A-AA-C----ATT--TA-TTGATTTGATT--T--TTTT------AT-G-----AAGAAA---CATC-A-TCA--C--A-ATC-GT--AA-A---AACATTTT---T---------------A
gi|16 : aacaatattatgcattcttaagcta----ATATTATACAAT-TG-TGG-GC-----TGTTTAGC-------AGG--GA-G--A-CATCACAA-----ATT---ATC-AGG--TC--------AT-G--G--TA----GGGTTATC-GCC-A--AA----GGGTGC--CTAG-GT-G--T-CCAA-G----GAAAGGTGCCTGATAG-TA--A-TA---AC--CC-TACT-AAGACT-TGA--T-AA-T---T----------TGTCT-C--CC--T--G-CT-A-AGCAATC---TA-TAAT--A-----G---TTT-TA--T--T---AT---C--CT----GAA-GA-ATCT----A-AAA---G----A-----------A--------AA-A---AAAA-A----------T--TAAATAT-----CG-------A-C-AA-G----ATT--ccgaaaaaacgaggctga
gi|17 : gaaaatttatttgaattttttgctgaaaaatttgctacAA-AA-A-CT---AA-AAA-----------------------------AA-A---AAAA-A----------C--T--ATCT-----GG-------A-A-AA-C----A-----------------------TTTT------AT-G-----TA-AAA---TATC-A-TCA--C--C-ACT-GT--AA-C---AATTTTTT---tcatgaagaaaattgaaccgtttcagttaacattatttcaatatctatattttttttcattt
gi|17 : ttT-----TCT-GC---GCA-A--TTTATC--ATT-T-AAAGG----GAGATGACACAGTTGTCACC--C-------TGAG--------CATCACAA-ATTATC-TCCC-TTCAC-ATGAC--CA--GCC-CT-A-G-ACCAATGAAAATGACTG-T-G--TTATTCTGA-AGGATAGTAAatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttctgcgcaatttatcatttaaagggagatgacacagttgtcaccctgagcatcacaaattatctcccttcacatgaccagccctagaccaatgaaaatgactgtgttattctgaaggatagtaat
gi|18 : ttaaaaactaaaaaaaaaaaaactatctggaaaacattttatgtaaaatatcatcaccactgtaacaattttttatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnATA-T----ACATTATACAAT-TA-TGG-AC-----TGTTTAGCCGGTGCCAGG--GA-G--A-CATAAAAA-----ATT---ATC-AGG--TC--------GT-A--G--TG----GGGTTATC-ACC-C--GA----GGAAGC----AT-GT-G---------A----A--------------A-TG--A-TGTC-TC--CC-TGCT-AA-------A--C-AG-T---C---CA--TAAT-----------------------ACA---------TAAT--AATGTAG---TTG-TA--T--T---AT---C--CT-----AA-AA-AT---------------------------------------------------------------C--T--ATCT-----TG-------A-A-CA-T----GTT--TC-TTGACTTTA-TTCT--TTTT------AT-G-----TA-t
gi|19 : tacatgtatatatagatcgagtgacagtcagtactcaaactacttagtatgtaaaattATGAG-CAAATAACACA---ACGTCAAACTGTAAACA-TTTCTGCAAG-----TG------------TTTT-----TCT-GCTCTGTC-A--TT-ATC--ATC-T-ACAGGTTCGGAGACAACACAGTTGTCACCCTCC-GCACGTGAGG-----GACATCACGA-ATTATC-TCCCTTTCACTGTGAC--CA--GCC-CTGA-T-ACCAATGAAAATGACTG-T-A--TTATTCTAA-AGG-TAATtgtctttactaaaaacg
gi|2 : aataggatAATATACAAT-TA-TGA-AC-----TGTTTAGC-------AGG--GAAG--A-CATCACAA-----ATT---ATC-AG---TC--------AA-A--G--TA----GG-TTGTC--CC-C--GA----GGGCGC--CTAT-GT-GAGCGCCGA-G----G--------------G-TG--A-TA---ATAACC-TGCT-AAGCCC-TGA--T-AA-T---T---TC--TGATGTCTCC--CC--T--G-CT---AACAGTC---CATTAAT--A-----G---TTT-TA--T--T---ATTA-T--CC----GAA-G--ATCTATAAA-AAA---A----TCG---------A--------GG-A---AAAA-A----------A--T--ATCT-----TG-------A-A-
gi|2 : ggcttcatcaaagcacattaaaacagaatgcaggtaaacaggctgaaatttaactgtagattctgttcccaacaaattaagtaaaccacagaacgtcaagcagtttacttgtcaaggacctactgtagactgtcaaagacatgttcacatattttctgcagaactgttaacctgtgttgtgttatctattgagcaagatgttcagtcgaaca--T---AT---C--TT----GAA-----TCTCTAAA-AAA---G----T-----------A--------AA-ATAAAAAA-A----------A--A--AAAT-----TG-------A-A-AAAC----TTT--TC-TTGACTTGA-T--T--TTTTTTTAA-GT-G-----T--AAA---TGTCAA-TCA--A--GTATTGGT--AA-CCAGAACGTTTT---C---------------tctctaaaaaagtaaaataaaaaaaaaaaattgaaaaacttttcttgacttgatttttttttaagtgtaaatgtcaatcaagtattggtaaccagaacgttttcttttacaaaaaaaggagtaaccagaagccttttcgaattatgacgtcatactaaga
gi|21 : ggcttcatcaaagcacattaaaacagaatgcaggtaaacaggctgaaatttaactgtagattctgttcccaacaaattaagtaaaccacagaacgtcaagcagtttacttgtcaaggacctactgtagactgtcaaagacatgttcacatattttctgcagaactgttaacctgtgttgtgttatctattgagcaagatgttcagtcgaacaaatatacaattatgaactgtttagcagggaagacatcacaaattatcagtcaaagtaggttgtccccgagggcgcctatgtgagcgccgagggtgataataacctgctaagccctgataatttctgatgtctcccctgctaacagtccattaatagttttattattatccgaagatctataaaaaaatcgaggaaaaaaa-AGAATGAGATA--T-AGACAAA-ACATAAAGC-GTAAACA-TTGT-GTAGGTCTCACG------------TATT-----TCT-GC---ATC-A--TT-GTC--ATC-T-AAAGG----GAGATAACACAGTTGGTACC--CC-GCGCGTGAGGTA---CACATTACGA-ATTACT-ACTC-TTCCC-GTGAC--CA--ACC-CT-T-G-ACCAATTAAATTCAT---T-A--TTATCATGA-AGGATAATAAttttacaaaaaaaggagtaaccagaagccttttcgaattatgacgtcatactaaga
gi|23 : atATCA-AAGAC-AAACA--ACA-TATTTCTTATAATATACAAT-TA-TGG-AC-----TGTTTAGC-------AGG--GA-G--A-CATCACAA-----ATT---ATC-AGT--TC--------GT-A--G--TA----GAGTTATT-ACC-A--GA----GGGCGT--CTAT-GC-T--C-TCAA-G----G--------------A-TG--A-TG---AC--CC-TACT-AAATCC-CA---------------------------T-C--CC--T--G-CT-A-AACAGT
gi|24 : at-AGAATGAGCC----GAAACACA-ACGTCAATC-ATAAAAA-TTTC-GCAA------CG------------TGTT-----TCT-GT---GCC-A--TT-ATC--ATC-T-ACAAG----GAGACAACACAAGTATCACT--CC-GTGCGTGAGGCA---GACATCACGA-ATTGTA-TCCC-TTCAC-GTGAC--CA--GCC-CT-A-G-ACCAATAAAt
gi|25 : gaat--G-CT-A-AACAGTC---CA-TAAT--T-----G----TA-TA--T--T---GT---CGACT----GGA-
gi|25 : cacagaactgtcaagcagttactgtcaaaggaactaactgtagaactgtcaaagacatgtcaaatattttctgcagaactattaacctgatgttgtgaactgagcatg----ACAATATACAAT-TA-TGG-AC-----TGTTTAGC-------
gi|26 : cacagaactgtcaagcagttactgtcaaaggaactaactgtagaactgtcaaagacatgtcaaatattttctgcagaactattaacctgatgttgtgaactgagcatgtccagtcg----ACAATATACAAT-TA-TGG-AC-----TGTTTAGC-------GGG--GA-G--A-CATCACAA-----ATT---ATC-AGG--TC--------AA-A--G--TA----GGGTTGTC-ACC-C--GA----GGGCG-----------------TGA-G----G--------------G-TGATA-TA---AC--CC-TACT-AAGACC-TGA--T-AA-T---T---T
gi|27 : tgttgtgaactgagcatgtccagtcgTT-----TCT-GC---TCT-G--TT--TC--ATC-TTAAAGG----GAGACAACACAGTTGTCACC--C----GCGCAAGGGA---GGCAACCTGA-ATTATT-TCCC-TTCAC-GTGAC--TA--GCCACT-A-G-ACCAATG-ATTTCACTG-C-AATTCATTTCGA-AGGATAATAA
gi|29 : aATAGT----AT--TATACACT-TA-TGG-ACATGACTGTTTAGT-------AGA--TA-G--A-CATCAAAATATATATT---ATC-AGG--TC--------GA-A--G--TA----GGGTTATC-ACC-C--GA----TGGCGC--ATA
gi|3 : attgcaatattatattacatttatcatgtaaaatTATTATACAACACACTGG-AC-----TGTTTAGCCC-----GGG--GA-CTTA-CATCACAA-----A-T---ATC-AAG--GG--------GA-A--GA-TA----GGGTTATC-ACC-C--GG----AGGGGC--CTAT-GCGG--C-CCGA-GCC--G--------------GTTG--A-TA---AC--CCTTAAT-AAGACC-TGACCT-AA-TCGCC---CG--AGTTTTCT-C--TC--CGGG-CT-A-ACTAGTC---CC-C--T--A-----GCTCCTT-TATCT--T---AT---C--CCCCTGGAA-GACATCTTA-AA-AAA---GATTTT-----------T--------TA-A---GATA-A----------T--T--ATCT-----TC-------A-ACAACC----ATT--TC-TTGACTTGA-T--TTGTTTT------ATGG-----TA-AAAAACCGTC-A-TCA--A----ATC-GT--AA-C---AAGTTTTggg
gi|3 : ------------TGTT-----TCT-GC---GCC-A--TT-ATC--ATC-T-ACAGG----GAGACTACACAGTTGTCACC--AA-GCGCGTGAGGGA---GACATCATGA-ATTATC-TCCC-TTCAC-GTGAC--CA--GCC-CT-G-G-ACCAATGAAAGTGACTG-TAA--TTATTCTAA-AGAATAATAActacaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgtttctgcgccattatcatctacagggagactacacagttgtcaccaagcgcgtgagggagacatcatgaattatctcccttcacgtgaccagccctggaccaatgaaagtgactgtaattattctaaagaataataa
gi|30 : tattatacaacacactggactgtttagcccggggacttacatcacaaatatcaaggggaagatagggttatcacccggaggggcctatgcggcccgagccggttgataacccttaataagacctgacctaatcgcccgagttttctctccgggctaactagtcccctagctcctttatcttatccccctggaagacatcttaaaaaagattttttaagataattatcttcaacaaccatttcttgacttgatttgttttatggtaaaaaaccgtcatcaaatcgtaacaagttttctacaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngTGTACATT-TA-TGG-AC-----TGTTTAGA-------AGA--GA-G--A-CATCACAA-----AT
gi|30 : cttgacttccaaaggaggaacaacatcttattcagttgTTAGAAGA-GAGACATCACAA--------ATA-TGTACATT-TA-TGG-AC-----TGTTTAGA-------AGA--GA-G--A-CATCACAA-----------ATC-GGG--TT--------GT-G--G--Tatgtacatttatggactgtttagaagagagacatcacaaatcgggttgtggt
gi|31 : cttgacttccaaaggaggaacaacatcttattcagttgtgtacatttatggactgt-----TCT-GC---GCC-A--TT-ATC--ATC-T-ACAGG----GAGACAACACAGTTGTCACC--CC-GCGCGTGAGGGA---GACATCACGA-ATTATC-TCCC-TTCAC-GTGAC--CA--GCC-CT-G-A-ATAAATGAAAATGACAG-T-A--TTATTCTAA-AGG
gi|33 : ---TTT-TA--T--T---CA---C--CT----GAA-TA-ACCC----A-AAA---G----T-----------T--------TT-A---AACA-A----------T--A--ATCTGCCAATG-------A-A-AA-C------T--TC-TTGAC-TGA-T--T--TTTTTAA---AT-G-----TA-AAA---TGTC-A-TCA--AAGA-ATC-GA--AA-C----ACTTTTT---CT--------------AAA-AC--TA
gi|34 : --A-----G---TTTGTA--T--C---AT---C---T----GAGTAA-ACCC---AA-A-----G----TTTTT-------A--------AA-T---A------------------T--ATCT-----TGCCAATGAA-A-AA-C----ATT---C-TTGACTTGA-T--T--TTTTTTAA--AT-G-----TA-AAA---TGTC-ATTCA--A--G-ATC-GA--AA-C---AACTTTT
gi|35 : TT-----TCTTGC---ACT-GATTT-ATC--ATC-T-AAAGG----GAAGCAACACAGTTA-CACC--CA-ACGTGTGAGG-A---GACACCACGA-ATTATC-TCCC-TTCAC-GTGA---CA--GCC-CT-GTG-ACCAATGAAA
gi|36 : a-----TGTTT------------G--AA-G--A-TACCACAA-----GTT---GTT-GGG--TC--------CA-A--GGATA----AGGTTAGA-GCC-ATGGA----GTGGGC--TAAA-AC-A--C-CCAG-G----G--------------G-AT--A-TA---AC--CA-AACC-TAGACC-TGA--C-AA-C---T---TT--TGATGTC
gi|37 : TATACAGT-TA-TGG-AC-----TGTTTAGC-------AGG--GA-G--A-CATCACAA-----ATT---ATC-AGG--TCATTTAAATGA-A--G--T-----GGGTTTTC-ACA-A--GA----GGGCGC--CTA
gi|38 : atactttttttgtccacagtctgACAAGATC----ACAATATACAAT-TA-TGG-AC-----TGTTTAGC-------GGG--GA-G--G-CATCACAA-----ATT---ATC-AGG--TC--------AA-A--G--TA----GGGTTATC-ACC-C--GA----GGGCGC--CTA
gi|39 : gagttatctcagtgataACAGTTGTCACG--CC-ACACGTGAGGGA---GACATCACGA-ATTATC-TCCC-TTCAC-GTGAT--CA--GCC-CT-A-G-ACCAATGAAAATGACTG-T-A--TTATTCTAA-AGGATAATA
gi|4 : aT----ATAATG-ACAGA-TA-TGG-AC-----TGTT-AGC-------AGGTGGA-G--AGCATCACAA-----ATTCATATAGAGT--TC--------AA-A--A--TA----GGGTTGTC---C-C--GA----GGGCG------T-GA-G--T------G----G--------------G-TG--A-TATAAAC--CT-TACT-AAGACCTTGAT-T-AA-T---TATATGTTTGATTTCT-C--TCCAT--GACT-A-ACTAG-CAAGCA-TGAG--A-------------TA-----T---AT------CT----AAA-G---TC-----A-TAA---G----G-----------A--------AA-C---AAAA-A----------A--T--ATCT-----TG-------A-A-A
gi|4 : agatttaaggtcacaggctcatcaaagccacccataaattcagaatgagtgaacaggctctctcgaagaactattataatgaactgtagatactgtcacaaacacaataaagttaaaaccacagaactgtcaagcagttactgtcaaaaggaatatcacgtctatactgtagagcatgtcaaagacactgttcaaaatatttttcttgacatgaactattaatcctatgttgtcactacttgagcatggatccagtgcggatcta--T---AT---C--TT----GAA----ATCT---AA-AAA---G----T-----------A--------AT-A---AAAA-A--------------------------G-------A-A-AA-CAAAAATC--TC-TTGAtctaaaaagtaataaaaaagaaaacaaaaatctcttgaaaaaacttttcc
gi|40 : agatttaaggtcacaggctcatcaaagccacccataaattcagaatgagtgaacaggctctctcgaagaactattataatgaactgtagatactgtcacaaacacaataaagttaaaaccacagaactgtcaagcagttactgtcaaaaggaatatcacgtctatactgtagagcatgtcaaagacactgttcaaaatatttttcttgacatgaactattaatcctatgttgtcactacttgagcatggatccagtgcggatctatataatgacagatatggactgttagcaggtggagagcatcacaaattcatatagagttcaaaatagggttgtcccgagggcgtgagtgggtgatataaaccttactaagaccttgattaattatatgtttgatttctctccatgactaactagcaagcatgagatatatctaaagtcataaggaaacaaaaaaACAA-----ATT---ATC-AGG--TT--------AT-ATAGC-TA----GGGTTCTC-ACA-T--TA----GAGCGC--CTAT-GC-G--C-CCAA-G----G----------------------TA----------TA-T-AAGG---TAA--TTAA-T---T---TG--TGATGTCT-T--CC--T--G-CT-A-AACAGTC---aaaaacttttcc
gi|41 : aACAGTTTTCACT--C--GCGCGTGAGGGA---GACAT-ACGA-ATTATC-TCCC-TTCAC-GTGAC--CA--GCC-CT-G-G-ACCTATGAAAATGAGTG-T-A--TTATTCTAA-AGGATAATA
gi|42 : ACAA-----ATT---ATC-AGG--TT--------AT-ATAGC-TA----GGGTTCTC-AACAT--TA----GAGCGC---TAT-GC-G--C-CCAA-G----G----------------------TA----------TA-T-AAG-----GAATT-AA-T---T---TG--TGATGTTC-T--TC--T--G-CT-A-AAc
gi|43 : tcta----ATATTATATAAT-TA-GGG-AT-----GGTTTATC-------GGG--GA-G--G-CATCACAA-----ATT---ACC-AGG--AT--------TT-A--A--TA----AGGCTATac
gi|44 : caaaaatatcataatacaatgtacgtttgTC-T-AAAGG----GAGATAACACAATTGTCATC--CC-ACACGCGAGGGA---GACATCACAA-ATTGTC-TCTG-CTCAC-GTGAC--CA--GCC-CT-A-G-ACCTATGAAaa
gi|45 : GAGGGA---GACATCACGA-ATTATC-TCCC-TTTAC-GTGAC--CA--GCC-CT-A-G-ACCAATGAAAATGATTG-T-A--TTATTCTAA-AGGATAATAA
gi|46 : AAAATAGAATGGAGCC--GAAAACAA--AC-TCAAGC-ATAAAAAATTTC-GCAA------CG-------------GTT-----ACT-G----GCC-A--TT-ATC--ATCTT-AAAGG----AA
gi|47 : aat-A---AAAA-A----------C--T--ATCT-----TG-------A-A-AA-C----ATT--TC-TTGACT--G-T--C--TTTT------AT-G-----CA-AAA---CGCC-A-TCA--A--G-ATC-AT--AA-C---AACTTTTT---C---------------c
gi|49 : -A--G--TA----GGGTTATC-ACC-C--GA----GGACACAATAATAGTAG--T-CTCT-G----G--------------G-TG--A-TA---AC--CC-TAAT-AAGACC-AGA--C-AA-T---T---tacta
gi|5 : tAATATACAAT-TA-TGG-AC-----TGTT-AGC-------GGC--GA-GG-A-CATCACAT-----ATT---ATC-AGG--TC--------AA-G--G--TA----GGGTTATC-ACC-G--GA----GCG-GC--CTA--GC-G--C-CCGA-G----G--------------G-TG--A-TA---AC--C--TACT-AAGAC--TGA----AA-T---T---TG--TGAT-TCT-C--CC--T--G-CT-ATAACAGTC---CA-TAAT--A-----G---TTT-TA--T--T---AT---C--CT----GAA-GA-A-CT---AA-AAA---G----T-----------ATTTTTTTTAA-A---AA--------------T--T--ATCT--------------A-A-AA-C----ATT--TT-TTGACTTGA-T--T--TTTT------AT-G-----TA-AAA---CGTC-A-TCA--A--G-ATC-GT--AAAC---AACTTTTTCTAC---------------AAA-NN--NNNN-----NNN--NN-NNNNNNNN-NNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNN-NNNN-NNNN------NNNNNNNNNNNNNGTGTT-----TCT-GA---CCC-A--TT-ATC--ATC-T-ACAGG----GA-ACAACACA-TTGTCCCA--CCAGCGCGTGAGGGA---GACATCACGA-ATTATC-TCCC-TTCAC-GTGAC--CA--G-C-CT-G-G-A-CAAT-AAAGTGACTG-TAA--TTATT-TAA-AGGATAATAA
gi|50 : tactttattttttaaattcttttaactattgaaaca-TGG-AC-----TGTT------------GG--GA-G--A-AATCACAA-----AT-----TC-AAG--TC--------AT-A--T--TAAGGTGGGTTATC-ACC-A--GAGGCCGGGCGC--C
gi|51 : --ATC-T-AAAGG----GAGACAACACAGTTATCACC--CA-ACGTGTGAGGGA---GACACCACGA-ATTATC-TCCC-TT
gi|53 : CACAG-----GTC---ATT-AGAAAT---------GA-A--G--T-----GGGTTATC-ACA-T--TA----GGGCGC--CTAT-
gi|57 : aattgta-AAAGG----GAGACAACACAGTTGTCACC--CC-GCGC
gi|58 : taactaAATATACAAT-TA-TGG-AC-----TGTTTAGC-------GG
gi|6 : tc----ACAATATACAAT-TA-TGGCAC-----TGTTTAGC-------GGG---A-G--A-CATCA-AA-----ATT---ATC-AGG--TC--------GA-A--G--TA----GGGTTATC-A-C-C--GA----GGCCGC--CTAT-GC-G--C-ATGGCGCCTCG--------------G-TG--ACTA---AC--CC--ACTCAAGACC-TGA--TAAA-T---T---TG--TGATTTAT-C--CT--T--G-TT-A-A----------------------------CTT-TA--T--T---AT------CT----GAA-G--ATCT---------------------------------------A-A---AAAA-G----------T--T--TTTC-----TGC------A-A-AA-C-----TT--TC-TTGAC-TGA-T--T--TTTT------AT-G-----TA-GAA---CGTC-A-T-A--A--G-ATC-GCTAAA-C---AAGTTCTT---C---------------
gi|7 : ctgtttaacgaaaaattatattcaattcaaattctttattgcgtaacacacatgtaattggttattcccatgatggaatctagataacaatatttaaaaaaatacgtaaaataacatgggcatagtgtttgATCAGGAGACAAAACA-CACAATACT----ATAATATACAAT-TA-TGG-AC-----TGTTTAGC-------AGG--GA-G--A-CATAACAA-----ATT---ATG-AGG--TT--------GT-A--G--TA----GGGTTATC-ACC-C--GA----GGGCAC--CTAT-GT-G--C-CTGA-G----G--------------G-AG--A-TA---AC--CC-TAAT-ACAACA-TGA--T-AA-T---T---TG--TGATGTCT-C--CC--T--G-CT-A-AACAGTC---TA-TAAC--A-----G---TTT-TA--T--T---AT---C--CT----GAA-GA-ATCT---AA-AAA---G----T-----------A--------AA-A---AACA-A----------C--T--ATCT-----TG-------A-A-AA-T----GCT--TC-TTGATTTGA-T--T--TTTT------AT-G-----TA-AAA---TGTC-A-TCA--A--G-ATT-GT--AA-C---AATTTTGT---C---------------AAANNN--NNNN-----NNN--NN-NNNNNNNN-NNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNN-NNNN-NNNN------NN------------NNNN-----NNN-NN---NNN-N--NT-ATC--ATC-T-AAAGG----GAGACAACACAGTTGTTACC--CC-ATGCGTGAGGGA---GACATCACGA-ATTATC-TCCC-TTCAT-GTGAC--TA--GCT-CT-A-G-ACCTATGAAATCGACTG-T-A--TTATTCTGA-AGGATAATAAtacaaaaacgaccgaaagatttcgattgtgatgtacaactaattaaagagggcaaaactttacgtcaacagtacaattgataatttcagtcaactttccttgcgttccagtagctcacgtgaggagac
gi|8 : AATATACAAT-TA-TGG-AC-----TGTTTAGC-------GGG--GA-G--A-CAGCACAA-----ATT---ATC-AGG--TC--------GA-A--G--TA----GGGTTATC-ACC-C--GA----GGGCGC--CTAG-AC-G--C-CCGA-G----G--------------G-TG--A-TA---TC--CT-TACT-AAGACC-TGA--T-AA-T---T---TG--TGATGTCT-C--CC--T--G-CT-A-AACAATC---CA-TAAT--A-----G---TTT-------------------------------A-ATCT---AA-AAA---G----T-----------A--------AA-A---AAAA-A-------------T--ATGC-----TG-------A-A-AA-C----ATT--TC-TTGACTTGA----T--TTTT------AT-GTATCTTA-AAA---CGTC-A-TCA--A--G-ATT-TT--AA-C---AACTTTTT---CTACAAAA--------AAA-AC--AAAA-----
gi|8 : catgaaaaaagggaaataaaaaaaaattacaaaagattattttgatcgttaagttccgaggtagacagtc------------TGTT-----TCC-GC---ACA-A--TT-ATC--ATC-T-ACATG----GAGACaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgtttccgcacaattatcatctacatggagactaatagaatccttcattagtac
gi|9 : catgaaaaaagggaaataaaaaaaaattacaaaagattattttgatcgttaagttccgaggtagacagtcaatatacaattatggactgtttagcggggagacagcacaaattatcaggtcgaagtagggttatcacccgagggcgcctagacgcccgagggtgatatccttactaagacctgataatttgtgatgtctccctgctaaacaatccataatagtttaatctaaaaagtaaaaaaaaatatgctgaaaacatttcttgacttgatttttatgtatcttaaaacgtcatcaagattttaacaactttttctacaaaaaaaacaaaaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngTAATATACAAT-TA-TGG-AC-----TGTTTAGC-------GGT--GG-G--A-CTTTAC-A-----ATT---CTC-TGG------------GA-A--G--TT----AGGTTTTCTTCC-C--GA-----GGCGC--CTAT--C-G----CCGA-G----G--------------T-T-----TA---A---CC-TACT-AAGA-C-TGA--T--A-T---T---TGT-TGAT-TCT----CC--T--G-CTCA-AACAGTC---CA-T-AT--A-----G---TTT-T---T-------T---C--CT----GAA-GATATCT---AA-ATATTTT----T-----------A--------AA-A---ATTA---------------T--ATCT-----TG-------A-A-AA------ATT--TC-TTGACTTGA----T--TTTT------AT-G-----TA-AAA---CG-----TCA--A--G--TC-GT--TA-A---AACTTTTT---CTACAAAACGAGCCGGAAA-GCTGCGAA-----TTG--TGACGTCAGAA-AGAATGAGGC-----AAATAACAACGTCAAACAGTTTAAA-TTTC-GAAT------CG------------TGTT-----TCT-GC---GCT----TT-ATC--ATC-T--CAGG----GAGAAAACACAG-TGTCACC--CC-GCG-GTGA-GGA---GAC--TACGA-ATTAAT-TCCCTTTCAC-TTGACAGCA--G--------G-ACCAA-GAA--TGA----T-G--TTA-TCTAAGAGGATCATtaatagaatccttcattagtac
9 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|20 ): TGGAGGGGGGGGGGGTCCTTGCAGTTTTATAATACCATACAATAAAATATGCATATATTTGTTGTGTTCTGATTTGCTTGTCTGTCATTATTAAATTTTTTTCTGTTAAAAGCAAATTGCAAATTCAAATTCTTTATTGGCGTAACACATTAACATGTAATGGTTATTGTCCATGAGGAGAACTAATAACAATAATT
Unaligned ( gi|22 ): AATTTAAATAGTCCAGGCTCATCAAAGCACCATTAACAGAATGCAGGTAACAGGCTGAAATTTAACTGTAGTTCTGTCAAACAAATAAGTAAACCACAGAACTGTCAAGCAGTTACTGTCAAAGGAACTAACTGTAGAACTGTCAAAGACATGTCAAATATTTTCTGCAGAACTATTAACCTGA
Unaligned ( gi|28 ): TCTATTGGCGCAACACATCAACATAATGGTTATTGCCCATGAGTAAAACTAATAACAATATGTAAATGATAGATAGCATGATGCTTTTCTGTTTCACGTATATATTCAATTTGTATTTTGTAAATGTTTGTAC
Unaligned ( gi|32 ): TGGGGGGGGGGGGGTGATTTTTCCTTGCGGTTTATAATACATAGAATAAATATGCATATATTATGTTGGTTTTGATTGGCTTGTCTGTCATTATTGAATTTTATTCCAGTTAAAAGTAAATTGCA
Unaligned ( gi|48 ): AATAAGATATGCAAATATTTGTGGTTTTAATTGGCTTGTTTATTATTATTTGTTTTCATTTATAAACAAATTGT
Unaligned ( gi|52 ): ATGTTTCTGATATACCCCTGTCATCATGATGAGACTAATAGAGTCCTTCATTAGTACGAG
Unaligned ( gi|54 ): TTGGTAGGGGGATTAGTTTATAGTTTTTAGTAGATGGTTAGCAGATGA
Unaligned ( gi|55 ): TTTTCGCACAACTGTGAGAATAATAGAATCCTTCATTAGTAC
Unaligned ( gi|56 ): CGGTCATCAGAGAATAATATAATCCTTCATTAGTACGAGT
Alignments
lowQualScore : 11 11 111111 1111111111111111 2222222222222222222222222 111111111111111 222222 444444444444444444444444444444444444444444444444444 222222222222 222222222222222222222 11
lowQualScore : 6 88 66 4 222222 1 1 1 33333 77777777 22 1 44 1 33333 444 1 22 77777777777 44 66 3333 1 3333 3333 222 1 4 6666 0 2 7777 2222222222222222 22 2 666 22 1 1 1 66 3 1 333 333 44 2 2 22 55555 1 1 1 1 555 2 22 777777777 1 22 22 333 555 22 3333 6666 9999 1 222 2222222222222222222222222 1 555 0 444444444444444 22 44444 7777777 1 1 3 4444 22 2 3333 22 222222 2 77777 2 333 2 2 33 33 2 2 33 2 333 0 555555555555555555555555555555555555555555555555555 4 1 333333333333 55 0 99999 0 3 3 555555555555555555555 666666 22 4 555 2 11 2 22 1 1 3333 22 55 0 333 1 1 3 1 22 22 1 1 1 1 1 2 4 33 2
lowQualScore : . .. .. . ...... . . . ..... ........ .. . .. . ..... ... . .. ........... .. .. .... . .... .... ... . . .... . . .... ................ .. . ... .. . . . .. . . ... ... .. . . .. ..... . . . . ... . .. ......... . .. .. ... ... .. .... .... .... . ... ......................... . ... . ............... .. ..... ....... . . . .... .. . .... .. ...... . ..... . ... . . .. .. . . .. . ... . ................................................... . . ............ .. . ..... . . . ..................... ...... .. . ... . .. . .. . . .... .. .. . ... . . . . .. .. . . . . . . . .. .
lowQualScore : 7 77 55 9 888888 7 6 6 88888 44444444 33 7 00 7 77777 222 5 11 11111111111 11 55 3333 6 6666 4444 444 9 0 3333 3 1 4444 6666666666666666 88 0 000 66 8 8 8 88 6 8 222 222 88 7 0 88 55555 9 9 9 6 888 2 99 000000000 9 66 44 000 444 44 7777 4444 3333 7 999 6666666666666666666666666 6 888 2 444444444444444 33 22222 1111111 7 7 8 0000 66 0 7777 99 444444 1 44444 1 999 2 2 11 11 2 2 11 2 999 7 555555555555555555555555555555555555555555555555555 0 4 333333333333 00 6 88888 8 6 6 111111111111111111111 111111 99 2 888 1 33 1 88 9 8 9999 44 44 1 000 7 7 5 8 55 66 9 9 9 9 8 2 4 11 4
consensus : ATCAGAAGACGAAACA-CACAATANT----ATAATATACAAT-TA-TGG-AC-----TGTTTAGC-------GGG--GA-G--A-CATCACAA-----ATT---ATC-AGG--TC--------GN-A--G--TA----GGGTTATC-ACC-C--GA----GGGCGC--CTAT-GC-G--C-CCGA-G----G--------------G-TG--A-TA---AC--CC-TACT-AAGACC-TGA--T-AA-T---T---TG--TGATGTCT-C--CC--T--G-CT-A-AACAGTC---CA-TAAT--A-----G---TTT-TA--T--T---AT---C--CT----GAA-GA-ATCT---AA-AAA---G----T-----------A--------AA-A---AAAA-A----------C--T--ATCT-----TG-------A-A-AA-C----ATT--TC-TTGACTTGA-T--T--TTTT------AT-G-----TA-AAA---CGTC-A-TCA--A--G-ATC-GT--AA-C---AACTTTTT---C-------AAA--ACGA--------------AA-----TCG--TG-CGTCAGAA-AGAATGAGGCANANAACANAACGTC--AAGC-G---TAAACA-TTTC-GCA------AC-------------GTGTT------T--CT-GC---GCC-A--TT-ATC--ATC-T-AAAGG----GAGACAACACAGTTGTCACC--CC-GCGCGTGAGGGA---GACATCACGA-ATTATC-TCCC-TTCAC-GTGAC--CA--GCC-CT-A-G-ACCAATGAAANTGACTG-T-A--TTATTCTGA-AGGATAATAA
Reference ( family-1347 ) : ATCAGAAGACGAAACA-CACAATANT----ATAATATACAAT-TA-TGG-AC-----TGTTTAGC-------GGG--GA-G--A-CATCACAA-----ATT---ATC-AGG--TC--------GN-A--G--TA----GGGTTATC-ACC-C--GA----GGGCGC--CTAT-GC-G--C-CCGA-G----G--------------G-TG--A-TA---AC--CC-TACT-AAGACC-TGA--T-AA-T---T---TG--TGATGTCT-C--CC--T--G-CT-A-AACAGTC---CA-TAAT--A-----G---TTT-TA--T--T---AT---C--CT----GAA-GA-ATCT---AA-AAA---G----T-----------A--------AA-A---AAAA-A----------C--T--ATCT-----TG-------A-A-AA-C----ATT--TC-TTGACTTGA-T--T--TTTT------AT-G-----TA-AAA---CGTC-A-TCA--A--G-ATC-GT--AA-C---AACTTTTT---C-------AAA--ACNA--------------AA-----TCG--TG-CGTCAGAA-AGAATGAGGCATAAAACAANACGTC--AAGC-G---TAAACA-TTTC-GCA------AC-------------GTGTT------T--CT-GC---GCC-A--TT-ATC--ATC-T-AAAGG----GAGACAACACAGTTGTCACC--CC-GCGCGTGAGGGA---GACATCACGA-ATTATC-TCCC-TTCAC-GTGAC--CA--GCC-CT-A-G-ACCAATGAAANTGACTG-T-A--TTATTCTGA-AGGATAATAA
gi|1 : ----ACAATATACAAT-TA-TGG-AC-----T-CTTATC-------GGA--------A-CATCACAA-----ATTT--AT--AAG--TC--------TTTA--G--TA----GGGTTATC-ACC-T--GA----GGG-------------------------------------------G-TG--A-TA---AC--CC-TACT-AAGACT-TGA--T-AA-T---T---TG--TGATGTCT-C--CC--T--G-AT-A-AACAGTC---CA-TAAT--A-----G---TTT-TA--T--T---AT---C--AT----GAA-GA-ATCT---AA-GAA---T----T-----------A--------AA-A---AAAA-T----------C--T--TTTT-----TG-------A-A-AA-C----ATT--TC-TTGACTTGA-T--T--TTTT------GT-G-----TA-AAT---TGTC-A-TCA--A--G-ATT-GG--AA-C---AACTTTTC---C-------
gi|1 : tcacagacaatacaaagtatgtcagtaatgtgggtgtg------AT-------------GTATT------T--CT-TC---GCT-AA-TT-AGC--ATC-T-AAAGG----GAGACAACACAGTTGTCACC--CT-GGGCATGAGGGA---GAGATCACAA-ATTATC-TCCC-TTCAC-ATGAC--CA--GCC-CT-A-G-AC-----AAATTGACTT-T-A--TTATTCTGA-AGGATGATtacaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgtgatgtatttcttcgctaattagcatctaaagggagacaacacagttgtcaccctgggcatgagggagagatcacaaattatctcccttcacatgaccagccctagacaaattgactttattattctgaaggatgattatattcaattatggactgtttatcagggtgatatcataattatcaggttgaagtagggttatcaaataagggtgcctatgcagtaagacatacaagtattcagttcagcgcccatgaaattcttacttttcctttgaaatagt
gi|1 : tcacagacaatacaaagtatgtcagtaatgtgggtgtgacaatatacaattatggactcttatcggaacatcacaaatttataagtctttagtagggttatcacctgaggggtgataaccctactaagacttgataatttgtgatgtctccctgataaacagtccataatagttttattatcatgaagaatctaagaattaaaaaaaatcttttttgaaaacatttcttgacttgattttttgtgtaaattgtcatcaagattggaacaacttttcctacaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgtg-TG--A-TA---AC--CC-TACT-TCAACC-TGA--T-AA-T---T----A--TGATATCA-C--CC--T--G-AT-A-AACAGTC---CA-TAATTGA-----A---TAT-AA--T--C---AT---C--CT----TCA-GA-A--T---AATAAA---G----T-----------C--------AA-tatattcaattatggactgtttatcagggtgatatcataattatcaggttgaagtagggttatcaaataagggtgcctatgcagtaagacatacaagtattcagttcagcgcccatgaaattcttacttttcctttgaaatagt
gi|1 : tcacagacaatacaaagtatgtcagtaatgtgggtgtgacaatatacaattatggactcttatcggaacatcacaaatttataagtctttagtagggttatcacctgaggggtgataaccctactaagacttgataatttgtgatgtctccctgataaacagtccataatagttttattatcatgaagaatctaagaattaaaaaaaatcttttttgaaaacatttcttgacttgattttttgtgtaaattgtcatcaagattggaacaacttttcctacaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgtgatgtatttcttcgctaattagcatctaaagggagacaacacagttgtcaccctgggcatgagggagagatcacaaattatctcccttcacatgaccagccctagacaaa----ATTATATTCAAT-TA-TGG-AC-----TGTTTATC-------AGG--GT-G--A-TATCATAA------TT---ATC-AGG--TT--------GA-A--G--TA----GGGTTATC-AAA-T--AA----GGGTGC--CTAT-GC-aataagggtgcctatgcagtaagacatacaagtattcagttcagcgcccatgaaattcttacttttcctttgaaatagt
gi|10 : tcacagacaatacaaagtatgtcagtaatgtgggtgtgacaatatacaattatggactcttatcggaacatcacaaatttataagtctttagtagggttatcacctgaggggtgataaccctactaagacttgataatttgtgatgtctccctgataaacagtccataatagttttattatcatgaagaatctaagaattaaaaaaaatcttttttgaaaacatttcttgacttgattttttgtgtaaattgtcatcaagattggaacaacttttcctacaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgtgatgtatttcttcgctaattagcatctaaagggagacaacacagttgtcaccctgggcatgagggagagatcacaaattatctcccttcacatgaccagccctagacaaattgactttattattctgaaggatgA---AC--CT-CACA-AAGACC-TGA--T-AA-T---T---TG--TGATGTTT-C--CC--A--G-CT-T-AACATTC---CA-TAAT--A-----G---TTT-TA--T--T---AA---C--CT----GAA-GA-ATCT---AA-AAC---G----T-----------A--------AA-A---GAAA-ACAATTGTCATC--T--ATCT-----TG-------A-A-CA-C----ATT--TC-TTGACTTGA-T--T--TTCTTTTTACAT-G-----TA-AAA---TGTC-A-TCATCA--G-ATC-AT--AA-C---AAA--------C-------AAT--ACGG--------------AA-----ACT--T----TCAGAA-AG--T--------------CACGTC--AAGC-G---TAAACA-TTTT-GTA------GC-------------ATATT------T--CT-GT---GCTAA--TT-ATC--GTC-T-AAAGG----GAGACAACACAGTTGTCACC--CT-GAGCATGAGGAA---GACATCACGA-A-TATCTTCCC-TTCAC-GTGAT--Cagtaagacatacaagtattcagttcagcgcccatgaaattcttacttttcctttgaaatagt
gi|10 : TCGTCACC--CT-GAGCATGAGGGA---GATGTCACGA-ATTATC-TCCC-T-CAC-GTGAT--CA--AAC-CT-A-G-ACCAATGAAATTGACTC-T-A--TTATTCTGA-GGGGTAATAgtcaccctgagcatgagggagatgtcacgaattatctccctcacgtgatcaaacctagaccaatgaaattgactctattattctgaggggtaatatag
gi|11 : aacctcacaaagacctgataatttgtgatgtttcccagcttaacattccataatagttttattaacctgaagaatctaaaacgtaaaagaaaacaattgtcatctatcttgaacacatttcttgacttgattttctttttacatgtaaaatgtcatcatcagatcataacaaacaatacggaaactttcagaaagtcacgtcaagcgtaaacattttgtagcatatttctgtgctaattatcgtctaaagggagacaacacagttgtcaccctgagcatgaggaagacatcacgaatatcttcccttcacgtgaC--CTAT-GC-G--C-CCGA-G----G--------------G-TG--A-TA---AC--CC-TACT-AAGACC-TGA--T-TA-T---T---TG--TGATGTCT-C--CC--T--G-CT-A-AACAGTC---CA-TAAT--A-----G---TTT-TA--T--T---AT---C--CT----AAA-CA-ATCC---AA-AAA---G----TCC---------A--------AA-A---AAAA-A----------C--T--ATCT-----TG-------A-A-AA-T----ATT--TC-TCGACTCGA-T--T--TTTT------GT-G-----TA-AAT---CGTC-A-TCA--A--G-ATC-GT--AA-C---AATTTTTT---C-------tag
gi|11 : aTATT------T--CT-GC---ACT-AA-TT-ATC--ATC-T-AAAGG----GAGACAACACAGTTGTCACC--CC-GCACGTGAGGAA---GACATCGTGA-ATTATC-TCCC-TTCAA-GTGAC--CA--GCC-TT-A-G-ACCAATGAAATTGACTG-T-A--TTATTCTGA-AAGATAATtacaaatagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatttctgcactaattatcatctaaagggagacaacacagttgtcaccccgcacgtgaggaagacatcgtgaattatctcccttcaagtgaccagccttagaccaatgaaattgactgtattattctgaaagataat
gi|12 : acctatgcgcccgagggtgataaccctactaagacctgattatttgtgatgtctccctgctaaacagtccataatagttttattatcctaaacaatccaaaaagtccaaaaaaaaactatcttgaaaatatttctcgactcgattttttgtgtaaatcgtcatcaagatcgtaacaattttttctacaaatagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-TATC-AAGACC-TGA--T-AATT---T---TC--TGTTGTCG-CTACCA-TTGG-CT---AACA-TC---CA-TAAT--A-----T---TTT-TA--TACTTAAATAAAA--CT----GAA-G--ATCT----A-AAA---G----T-----------A--------AA-A---AAAATAT---------C--C--ATCT-----TG-------A-A-
gi|12 : cg-GA-ATCT---AA-AAA---GG---T-----------A--------AA-A---AAAA-A----------CATT--ATCT-----TG-------ATA-AA-C----ATTCTTCATTGACTTA-----T--TTTT------AT-GG----TA-AAA---CGTC-A-TAA--A--G-CT--GT--AA-C---AAC----------------AAG--GCGA--------------AAAGCTTTTGATTG-TATCATAT-AGGATGAGGCATAAAAC---ACGTTCAAAAC-A---TAAACA-TTTC-GCA------ACT------------ATGTT------T--AT-GCA--GCC-AT-TT-ATCTAATC-T-ACAGG----GA-ACAACACA--TGTTACC--CC-GCGCGTGATGGATCGGACAT-ACAAGATTACC-TCCC-TTTAC-AT-AC--CA---CC-CA-A-GCACC-ATGGAAATAGCT-------TTATTCTTA-A-GATAATAAtctaaaaaggtaaaaaaaaacattatcttgataaacattcttcattgacttatttttatggtaaaacgtcataaagctgtaacaacaaggcgaaaagcttttgattgtatcatataggatgaggcataaaacacgttcaaaacataaacatttcgcaactatgtttatgcagccatttatctaatctacagggaacaacacatgttaccccgcgcgtgatggatcggacatacaagattacctccctttacataccacccaagcaccatggaaatagctttattcttaagataataata
gi|13 : cgtatcaagacctgataattttctgttgtcgctaccattggctaacatccataatatttttatacttaaataaaactgaagatctaaaagtaaaaaaaatatccatcttAT-TA-TGG-AC-----TGTTTAAC-------AGG--GA-G--A-CATCACAG-----ATT---ATC-AGG--TT--------AT-A--A--TA----GTGATGTC-ACC-T--GA----GGGTGC--ta
gi|13 : -TA--T--T---AT---C--CT----GAA-GA-ATCT---AA-AAA---G----TTGTTTTTTTTTA--------AT---------------------C--C--ATCT-----TG-------A-A-AA-C----ATT--TC-TAGACTTGA-T--T--TTTTTT----AT-G-----TA-CAA---CATC-A-TCT--A--T-ATT-GT--AA-C---AACTTTTT---C-------TA----TAA--------------AA-----TNN--NN-NNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNN-N---NNNNNN-NNNN-NNN------NN-------------NNNNN------N--NNNGC---ACT-AA-TT-ATC--ATC-T-AAAGG----GAGGCAACACAGTTGTCACC--CA-GTGCATGAGGTA---GACATCATGA-ATTGTT-TCCC-TTCAC-ATGAC--TATTGCC-CT-A-G-ACCAGTGAATTTGACTATT-A--TAATTCTGA-TGGATAATgttttataatattatcctgaagaatctaaaaagttgtttttttttaatccatcttgaaaacatttctagacttgattttttttatgtacaacatcatctatattgtaacaactttttctataaaatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngcactaattatcatctaaagggaggcaacacagttgtcacccagtgcatgaggtagacatcatgaattgtttcccttcacatgactattgccctagaccagtgaatttgactattataattctgatggataat
gi|14 : attatggactgtttaacagggagacatcacagattatcaggttataatagtgatgtcacctgagggtgcgttttataaTGTCT-T--CC--A--G-CT-A-AACA-TCG--TA-TAAT--A-----A---TTG-TA--T--T---AC---C--CT----AAA-CA-AACT---AA-AAC---G----T-----------A--------AACA---GAAA-A----------C--T--ATCT-----TG-------A-T-AA-C----AAT--TC-TTGACTTCA-T--C--TTTT------AT-G-----CA-AAA---CGTC-A------A--G-ATA-GT--AA-T---AACATCTT---CTAC----AAA--NNNN--------------NN-----NNN--NN-NNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNN-N---NNNNNN-NNNN-NNN------NN-------------NNNNNNNNAAAT--CT-GC---TCC-A--TT-ATC--ATC-T-AAAAG----GAGAAAACACAGTTGTCGCC--CT-GTGCGTGATGGA---GACATCAATA-ATTAGT-TCCA-ATCAT-GTGAC--CA--GTC-CT-G-G-ACCAATTAAATTGACTG-T-A--TTATTTT
gi|15 : ttA-TACAAGAATG---ATAATATACAAT-CA-TGG-AT-----TTTTTTGC-------AGG--GA-A--A-CATCACAA-----ATC---ATC-AAA--AT--------GT-A--G--TA----GGCTTATC-ACT-C--GA----TGGCGT--ATAT-GC-G--T-CCAA-G----G--------------G-TG--A-TA---TA--CC-TACT-AACAGC-TGA--T-AA-T---T---TG--TGGTGTAT-T--CC--T--G-CT-A-AACAGTC---CA-TAAT--A-----T---TTC-TA--T--T---AA---C--CT----GAA-GA-ATCT---AA-CAA---G----------------A--------AA-ATAGAAAA-A----------C--C--TTCT-----TG-------A-A-AA-C----ATT--TA-TTGATTTGATT--T--TTTT------AT-G-----AAGAAA---CATC-A-TCA--C--A-ATC-GT--AA-A---AACATTTT---T-------A
gi|16 : aacaatattatgcattcttaagcta----ATATTATACAAT-TG-TGG-GC-----TGTTTAGC-------AGG--GA-G--A-CATCACAA-----ATT---ATC-AGG--TC--------AT-G--G--TA----GGGTTATC-GCC-A--AA----GGGTGC--CTAG-GT-G--T-CCAA-G----GAAAGGTGCCTGATAG-TA--A-TA---AC--CC-TACT-AAGACT-TGA--T-AA-T---T----------TGTCT-C--CC--T--G-CT-A-AGCAATC---TA-TAAT--A-----G---TTT-TA--T--T---AT---C--CT----GAA-GA-ATCT----A-AAA---G----A-----------A--------AA-A---AAAA-A----------T--TAAATAT-----CG-------A-C-AA-G----ATT--ccgaaaaaacgaggctga
gi|17 : gaaaatttatttgaattttttgctgaaaaatttgctacAA-AA-A-CT---AA-AAA-----------------------------AA-A---AAAA-A----------C--T--ATCT-----GG-------A-A-AA-C----A-----------------------TTTT------AT-G-----TA-AAA---TATC-A-TCA--C--C-ACT-GT--AA-C---AATTTTTT---tcatgaagaaaattgaaccgtttcagttaacattatttcaatatctatattttttttcattt
gi|17 : ttT------T--CT-GC---GCA-A--TTTATC--ATT-T-AAAGG----GAGATGACACAGTTGTCACC--C-------TGAG--------CATCACAA-ATTATC-TCCC-TTCAC-ATGAC--CA--GCC-CT-A-G-ACCAATGAAAATGACTG-T-G--TTATTCTGA-AGGATAGTAAatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttctgcgcaatttatcatttaaagggagatgacacagttgtcaccctgagcatcacaaattatctcccttcacatgaccagccctagaccaatgaaaatgactgtgttattctgaaggatagtaat
gi|18 : ttaaaaactaaaaaaaaaaaaactatctggaaaacattttatgtaaaatatcatcaccactgtaacaattttttatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnATA-T----ACATTATACAAT-TA-TGG-AC-----TGTTTAGCCGGTGCCAGG--GA-G--A-CATAAAAA-----ATT---ATC-AGG--TC--------GT-A--G--TG----GGGTTATC-ACC-C--GA----GGAAGC----AT-GT-G---------A----A--------------A-TG--A-TGTC-TC--CC-TGCT-AA-------A--C-AG-T---C---CA--TAAT-----------------------ACA---------TAAT--AATGTAG---TTG-TA--T--T---AT---C--CT-----AA-AA-AT---------------------------------------------------------------C--T--ATCT-----TG-------A-A-CA-T----GTT--TC-TTGACTTTA-TTCT--TTTT------AT-G-----TA-t
gi|19 : tacatgtatatatagatcgagtgacagtcagtactcaaactacttagtatgtaaaattATGAG-CAAATAACACAACGTC--AAACTG---TAAACA-TTTCTGCA------A--------------GTGTT------TTTCT-GCTCTGTC-A--TT-ATC--ATC-T-ACAGGTTCGGAGACAACACAGTTGTCACCCTCC-GCACGTGAGG-----GACATCACGA-ATTATC-TCCCTTTCACTGTGAC--CA--GCC-CTGA-T-ACCAATGAAAATGACTG-T-A--TTATTCTAA-AGG-TAATtgtctttactaaaaacg
gi|2 : aataggatAATATACAAT-TA-TGA-AC-----TGTTTAGC-------AGG--GAAG--A-CATCACAA-----ATT---ATC-AG---TC--------AA-A--G--TA----GG-TTGTC--CC-C--GA----GGGCGC--CTAT-GT-GAGCGCCGA-G----G--------------G-TG--A-TA---ATAACC-TGCT-AAGCCC-TGA--T-AA-T---T---TC--TGATGTCTCC--CC--T--G-CT---AACAGTC---CATTAAT--A-----G---TTT-TA--T--T---ATTA-T--CC----GAA-G--ATCTATAAA-AAA---A----TCG---------A--------GG-A---AAAA-A----------A--T--ATCT-----TG-------A-A-
gi|2 : ggcttcatcaaagcacattaaaacagaatgcaggtaaacaggctgaaatttaactgtagattctgttcccaacaaattaagtaaaccacagaacgtcaagcagtttacttgtcaaggacctactgtagactgtcaaagacatgttcacatattttctgcagaactgttaacctgtgttgtgttatctattgagcaagatgttcagtcgaaca--T---AT---C--TT----GAA-----TCTCTAAA-AAA---G----T-----------A--------AA-ATAAAAAA-A----------A--A--AAAT-----TG-------A-A-AAAC----TTT--TC-TTGACTTGA-T--T--TTTTTTTAA-GT-G-----T--AAA---TGTCAA-TCA--A--GTATTGGT--AA-CCAGAACGTTTT---C-------tctctaaaaaagtaaaataaaaaaaaaaaattgaaaaacttttcttgacttgatttttttttaagtgtaaatgtcaatcaagtattggtaaccagaacgttttcttttacaaaaaaaggagtaaccagaagccttttcgaattatgacgtcatactaaga
gi|21 : ggcttcatcaaagcacattaaaacagaatgcaggtaaacaggctgaaatttaactgtagattctgttcccaacaaattaagtaaaccacagaacgtcaagcagtttacttgtcaaggacctactgtagactgtcaaagacatgttcacatattttctgcagaactgttaacctgtgttgtgttatctattgagcaagatgttcagtcgaacaaatatacaattatgaactgtttagcagggaagacatcacaaattatcagtcaaagtaggttgtccccgagggcgcctatgtgagcgccgagggtgataataacctgctaagccctgataatttctgatgtctcccctgctaacagtccattaatagttttattattatccgaagatctataaaaaaatcgaggaaaaaaa-AGAATGAGATATAGA-CAAAACATA--AAGC-G---TAAACA-TTGT-GTAGGTCTCAC-------------GTATT------T--CT-GC---ATC-A--TT-GTC--ATC-T-AAAGG----GAGATAACACAGTTGGTACC--CC-GCGCGTGAGGTA---CACATTACGA-ATTACT-ACTC-TTCCC-GTGAC--CA--ACC-CT-T-G-ACCAATTAAATTCAT---T-A--TTATCATGA-AGGATAATAAttttacaaaaaaaggagtaaccagaagccttttcgaattatgacgtcatactaaga
gi|23 : atATCA-AAGAC-AAACA--ACA-TATTTCTTATAATATACAAT-TA-TGG-AC-----TGTTTAGC-------AGG--GA-G--A-CATCACAA-----ATT---ATC-AGT--TC--------GT-A--G--TA----GAGTTATT-ACC-A--GA----GGGCGT--CTAT-GC-T--C-TCAA-G----G--------------A-TG--A-TG---AC--CC-TACT-AAATCC-CA---------------------------T-C--CC--T--G-CT-A-AACAGT
gi|24 : atGAATAGAATGAGCCG--AAACACAACGTC--AATC-A---TAAAAA-TTTC-GCA------AC-------------GTGTT------T--CT-GT---GCC-A--TT-ATC--ATC-T-ACAAG----GAGACAACACAAGTATCACT--CC-GTGCGTGAGGCA---GACATCACGA-ATTGTA-TCCC-TTCAC-GTGAC--CA--GCC-CT-A-G-ACCAATAAAt
gi|25 : --G-CT-A-AACAGTC---CA-TAAT--T-----G----TA-TA--T--T---GT---CGACT----GGA-
gi|25 : cacagaactgtcaagcagttactgtcaaaggaactaactgtagaactgtcaaagacatgtcaaatattttctgcagaactattaacctgatgttgtgaactgagcatg----ACAATATACAAT-TA-TGG-AC-----TGTTTAGC-------
gi|26 : cacagaactgtcaagcagttactgtcaaaggaactaactgtagaactgtcaaagacatgtcaaatattttctgcagaactattaacctgatgttgtgaactgagcatgtccagtcg----ACAATATACAAT-TA-TGG-AC-----TGTTTAGC-------GGG--GA-G--A-CATCACAA-----ATT---ATC-AGG--TC--------AA-A--G--TA----GGGTTGTC-ACC-C--GA----GGGCG-----------------TGA-G----G--------------G-TGATA-TA---AC--CC-TACT-AAGACC-TGA--T-AA-T---T---T
gi|27 : tgttgtgaactgagcatgtccagtcgTT------T--CT-GC---TCT-G--TT--TC--ATC-TTAAAGG----GAGACAACACAGTTGTCACC--C----GCGCAAGGGA---GGCAACCTGA-ATTATT-TCCC-TTCAC-GTGAC--TA--GCCACT-A-G-ACCAATG-ATTTCACTG-C-AATTCATTTCGA-AGGATAATAA
gi|29 : aATAGT----AT--TATACACT-TA-TGG-ACATGACTGTTTAGT-------AGA--TA-G--A-CATCAAAATATATATT---ATC-AGG--TC--------GA-A--G--TA----GGGTTATC-ACC-C--GA----TGGCGC--ATA
gi|3 : attgcaatattatattacatttatcatgtaaaatTATTATACAACACACTGG-AC-----TGTTTAGCCC-----GGG--GA-CTTA-CATCACAA-----A-T---ATC-AAG--GG--------GA-A--GA-TA----GGGTTATC-ACC-C--GG----AGGGGC--CTAT-GCGG--C-CCGA-GCC--G--------------GTTG--A-TA---AC--CCTTAAT-AAGACC-TGACCT-AA-TCGCC---CG--AGTTTTCT-C--TC--CGGG-CT-A-ACTAGTC---CC-C--T--A-----GCTCCTT-TATCT--T---AT---C--CCCCTGGAA-GACATCTTA-AA-AAA---GATTTT-----------T--------TA-A---GATA-A----------T--T--ATCT-----TC-------A-ACAACC----ATT--TC-TTGACTTGA-T--TTGTTTT------ATGG-----TA-AAAAACCGTC-A-TCA--A----ATC-GT--AA-C---AAGTTTTggg
gi|3 : -------------GTGTT------T--CT-GC---GCC-A--TT-ATC--ATC-T-ACAGG----GAGACTACACAGTTGTCACC--AA-GCGCGTGAGGGA---GACATCATGA-ATTATC-TCCC-TTCAC-GTGAC--CA--GCC-CT-G-G-ACCAATGAAAGTGACTG-TAA--TTATTCTAA-AGAATAATAActacaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgtttctgcgccattatcatctacagggagactacacagttgtcaccaagcgcgtgagggagacatcatgaattatctcccttcacgtgaccagccctggaccaatgaaagtgactgtaattattctaaagaataataa
gi|30 : tattatacaacacactggactgtttagcccggggacttacatcacaaatatcaaggggaagatagggttatcacccggaggggcctatgcggcccgagccggttgataacccttaataagacctgacctaatcgcccgagttttctctccgggctaactagtcccctagctcctttatcttatccccctggaagacatcttaaaaaagattttttaagataattatcttcaacaaccatttcttgacttgatttgttttatggtaaaaaaccgtcatcaaatcgtaacaagttttctacaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGTACATT-TA-TGG-AC-----TGTTTAGA-------AGA--GA-G--A-CATCACAA-----AT
gi|30 : cttgacttccaaaggaggaacaacatcttattcagttgTTAGAAGA-GAGACATCACAA--------ATA-TGTACATT-TA-TGG-AC-----TGTTTAGA-------AGA--GA-G--A-CATCACAA-----------ATC-GGG--TT--------GT-G--G--Tatgtacatttatggactgtttagaagagagacatcacaaatcgggttgtggt
gi|31 : cttgacttccaaaggaggaacaacatcttattcagttgtgtacatttatggactgt------T--CT-GC---GCC-A--TT-ATC--ATC-T-ACAGG----GAGACAACACAGTTGTCACC--CC-GCGCGTGAGGGA---GACATCACGA-ATTATC-TCCC-TTCAC-GTGAC--CA--GCC-CT-G-A-ATAAATGAAAATGACAG-T-A--TTATTCTAA-AGG
gi|33 : ---TTT-TA--T--T---CA---C--CT----GAA-TA-ACCC----A-AAA---G----T-----------T--------TT-A---AACA-A----------T--A--ATCTGCCAATG-------A-A-AA-C------T--TC-TTGAC-TGA-T--T--TTTTTAA---AT-G-----TA-AAA---TGTC-A-TCA--AAGA-ATC-GA--AA-C----ACTTTTT---CT------AAA--ACTA--------------
gi|34 : --A-----G---TTTGTA--T--C---AT---C---T----GAGTAA-ACCC---AA-A-----G----TTTTT-------A--------AA-T---A------------------T--ATCT-----TGCCAATGAA-A-AA-C----ATT---C-TTGACTTGA-T--T--TTTTTTAA--AT-G-----TA-AAA---TGTC-ATTCA--A--G-ATC-GA--AA-C---AACTTTT
gi|35 : TT------T--CTTGC---ACT-GATTT-ATC--ATC-T-AAAGG----GAAGCAACACAGTTA-CACC--CA-ACGTGTGAGG-A---GACACCACGA-ATTATC-TCCC-TTCAC-GTGA---CA--GCC-CT-GTG-ACCAATGAAA
gi|36 : a-----TGTTT------------G--AA-G--A-TACCACAA-----GTT---GTT-GGG--TC--------CA-A--GGATA----AGGTTAGA-GCC-ATGGA----GTGGGC--TAAA-AC-A--C-CCAG-G----G--------------G-AT--A-TA---AC--CA-AACC-TAGACC-TGA--C-AA-C---T---TT--TGATGTC
gi|37 : TATACAGT-TA-TGG-AC-----TGTTTAGC-------AGG--GA-G--A-CATCACAA-----ATT---ATC-AGG--TCATTTAAATGA-A--G--T-----GGGTTTTC-ACA-A--GA----GGGCGC--CTA
gi|38 : atactttttttgtccacagtctgACAAGATC----ACAATATACAAT-TA-TGG-AC-----TGTTTAGC-------GGG--GA-G--G-CATCACAA-----ATT---ATC-AGG--TC--------AA-A--G--TA----GGGTTATC-ACC-C--GA----GGGCGC--CTA
gi|39 : gagttatctcagtgataACAGTTGTCACG--CC-ACACGTGAGGGA---GACATCACGA-ATTATC-TCCC-TTCAC-GTGAT--CA--GCC-CT-A-G-ACCAATGAAAATGACTG-T-A--TTATTCTAA-AGGATAATA
gi|4 : aT----ATAATG-ACAGA-TA-TGG-AC-----TGTT-AGC-------AGGTGGA-G--AGCATCACAA-----ATTCATATAGAGT--TC--------AA-A--A--TA----GGGTTGTC---C-C--GA----GGGCG------T-GA-G--T------G----G--------------G-TG--A-TATAAAC--CT-TACT-AAGACCTTGAT-T-AA-T---TATATGTTTGATTTCT-C--TCCAT--GACT-A-ACTAG-CAAGCA-TGAG--A-------------TA-----T---AT------CT----AAA-G---TC-----A-TAA---G----G-----------A--------AA-C---AAAA-A----------A--T--ATCT-----TG-------A-A-A
gi|4 : agatttaaggtcacaggctcatcaaagccacccataaattcagaatgagtgaacaggctctctcgaagaactattataatgaactgtagatactgtcacaaacacaataaagttaaaaccacagaactgtcaagcagttactgtcaaaaggaatatcacgtctatactgtagagcatgtcaaagacactgttcaaaatatttttcttgacatgaactattaatcctatgttgtcactacttgagcatggatccagtgcggatcta--T---AT---C--TT----GAA----ATCT---AA-AAA---G----T-----------A--------AT-A---AAAA-A--------------------------G-------A-A-AA-CAAAAATC--TC-TTGAtctaaaaagtaataaaaaagaaaacaaaaatctcttgaaaaaacttttcc
gi|40 : agatttaaggtcacaggctcatcaaagccacccataaattcagaatgagtgaacaggctctctcgaagaactattataatgaactgtagatactgtcacaaacacaataaagttaaaaccacagaactgtcaagcagttactgtcaaaaggaatatcacgtctatactgtagagcatgtcaaagacactgttcaaaatatttttcttgacatgaactattaatcctatgttgtcactacttgagcatggatccagtgcggatctatataatgacagatatggactgttagcaggtggagagcatcacaaattcatatagagttcaaaatagggttgtcccgagggcgtgagtgggtgatataaaccttactaagaccttgattaattatatgtttgatttctctccatgactaactagcaagcatgagatatatctaaagtcataaggaaacaaaaaaACAA-----ATT---ATC-AGG--TT--------AT-ATAGC-TA----GGGTTCTC-ACA-T--TA----GAGCGC--CTAT-GC-G--C-CCAA-G----G----------------------TA----------TA-T-AAGG---TAA--TTAA-T---T---TG--TGATGTCT-T--CC--T--G-CT-A-AACAGTC---aaaaacttttcc
gi|41 : aACAGTTTTCACT--C--GCGCGTGAGGGA---GACAT-ACGA-ATTATC-TCCC-TTCAC-GTGAC--CA--GCC-CT-G-G-ACCTATGAAAATGAGTG-T-A--TTATTCTAA-AGGATAATA
gi|42 : ACAA-----ATT---ATC-AGG--TT--------AT-ATAGC-TA----GGGTTCTC-AACAT--TA----GAGCGC---TAT-GC-G--C-CCAA-G----G----------------------TA----------TA-T-AAG-----GAATT-AA-T---T---TG--TGATGTTC-T--TC--T--G-CT-A-AAc
gi|43 : tcta----ATATTATATAAT-TA-GGG-AT-----GGTTTATC-------GGG--GA-G--G-CATCACAA-----ATT---ACC-AGG--AT--------TT-A--A--TA----AGGCTATac
gi|44 : caaaaatatcataatacaatgtacgtttgTC-T-AAAGG----GAGATAACACAATTGTCATC--CC-ACACGCGAGGGA---GACATCACAA-ATTGTC-TCTG-CTCAC-GTGAC--CA--GCC-CT-A-G-ACCTATGAAaa
gi|45 : GAGGGA---GACATCACGA-ATTATC-TCCC-TTTAC-GTGAC--CA--GCC-CT-A-G-ACCAATGAAAATGATTG-T-A--TTATTCTAA-AGGATAATAA
gi|46 : -AGAATGGAGCCGAAAACAA-AC-TC--AAGC-A---TAAAAAATTTC-GCA------AC-------------G-GTT------A--CT-G----GCC-A--TT-ATC--ATCTT-AAAGG----AA
gi|47 : aataaaat-A---AAAA-A----------C--T--ATCT-----TG-------A-A-AA-C----ATT--TC-TTGACT--G-T--C--TTTT------AT-G-----CA-AAA---CGCC-A-TCA--A--G-ATC-AT--AA-C---AACTTTTT---C-------c
gi|49 : -A--G--TA----GGGTTATC-ACC-C--GA----GGACACAATAATAGTAG--T-CTCT-G----G--------------G-TG--A-TA---AC--CC-TAAT-AAGACC-AGA--C-AA-T---T---tacta
gi|5 : tAATATACAAT-TA-TGG-AC-----TGTT-AGC-------GGC--GA-GG-A-CATCACAT-----ATT---ATC-AGG--TC--------AA-G--G--TA----GGGTTATC-ACC-G--GA----GCG-GC--CTA--GC-G--C-CCGA-G----G--------------G-TG--A-TA---AC--C--TACT-AAGAC--TGA----AA-T---T---TG--TGAT-TCT-C--CC--T--G-CT-ATAACAGTC---CA-TAAT--A-----G---TTT-TA--T--T---AT---C--CT----GAA-GA-A-CT---AA-AAA---G----T-----------ATTTTTTTTAA-A---AA--------------T--T--ATCT--------------A-A-AA-C----ATT--TT-TTGACTTGA-T--T--TTTT------AT-G-----TA-AAA---CGTC-A-TCA--A--G-ATC-GT--AAAC---AACTTTTTCTAC-------AAA--NNNN--------------NN-----NNN--NN-NNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNN-N---NNNNNN-NNNN-NNN------NNNNNNNNNNNNNNNGTGTT------T--CT-GA---CCC-A--TT-ATC--ATC-T-ACAGG----GA-ACAACACA-TTGTCCCA--CCAGCGCGTGAGGGA---GACATCACGA-ATTATC-TCCC-TTCAC-GTGAC--CA--G-C-CT-G-G-A-CAAT-AAAGTGACTG-TAA--TTATT-TAA-AGGATAATAA
gi|50 : tactttattttttaaattcttttaactattgaaaca-TGG-AC-----TGTT------------GG--GA-G--A-AATCACAA-----AT-----TC-AAG--TC--------AT-A--T--TAAGGTGGGTTATC-ACC-A--GAGGCCGGGCGC--C
gi|51 : --ATC-T-AAAGG----GAGACAACACAGTTATCACC--CA-ACGTGTGAGGGA---GACACCACGA-ATTATC-TCCC-TT
gi|53 : CACAG-----GTC---ATT-AGAAAT---------GA-A--G--T-----GGGTTATC-ACA-T--TA----GGGCGC--CTAT-
gi|57 : aattgta-AAAGG----GAGACAACACAGTTGTCACC--CC-GCGC
gi|58 : taactaAATATACAAT-TA-TGG-AC-----TGTTTAGC-------GG
gi|6 : tc----ACAATATACAAT-TA-TGGCAC-----TGTTTAGC-------GGG---A-G--A-CATCA-AA-----ATT---ATC-AGG--TC--------GA-A--G--TA----GGGTTATC-A-C-C--GA----GGCCGC--CTAT-GC-G--C-ATGGCGCCTCG--------------G-TG--ACTA---AC--CC--ACTCAAGACC-TGA--TAAA-T---T---TG--TGATTTAT-C--CT--T--G-TT-A-A----------------------------CTT-TA--T--T---AT------CT----GAA-G--ATCT---------------------------------------A-A---AAAA-G----------T--T--TTTC-----TGC------A-A-AA-C-----TT--TC-TTGAC-TGA-T--T--TTTT------AT-G-----TA-GAA---CGTC-A-T-A--A--G-ATC-GCTAAA-C---AAGTTCTT---CTACA---AAA--ACGA--------------
gi|7 : ctgtttaacgaaaaattatattcaattcaaattctttattgcgtaacacacatgtaattggttattcccatgatggaatctagataacaatatttaaaaaaatacgtaaaataacatgggcatagtgtttgATCAGGAGACAAAACA-CACAATACT----ATAATATACAAT-TA-TGG-AC-----TGTTTAGC-------AGG--GA-G--A-CATAACAA-----ATT---ATG-AGG--TT--------GT-A--G--TA----GGGTTATC-ACC-C--GA----GGGCAC--CTAT-GT-G--C-CTGA-G----G--------------G-AG--A-TA---AC--CC-TAAT-ACAACA-TGA--T-AA-T---T---TG--TGATGTCT-C--CC--T--G-CT-A-AACAGTC---TA-TAAC--A-----G---TTT-TA--T--T---AT---C--CT----GAA-GA-ATCT---AA-AAA---G----T-----------A--------AA-A---AACA-A----------C--T--ATCT-----TG-------A-A-AA-T----GCT--TC-TTGATTTGA-T--T--TTTT------AT-G-----TA-AAA---TGTC-A-TCA--A--G-ATT-GT--AA-C---AATTTTGT---C-------AAANNNNNN--------------NN-----NNN--NN-NNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNN-N---NNNNNN-NNNN-NNN------NN-------------NNNNN------N--NN-NN---NNN-N--NT-ATC--ATC-T-AAAGG----GAGACAACACAGTTGTTACC--CC-ATGCGTGAGGGA---GACATCACGA-ATTATC-TCCC-TTCAT-GTGAC--TA--GCT-CT-A-G-ACCTATGAAATCGACTG-T-A--TTATTCTGA-AGGATAATAAccgaaagatttcgattgtgatgtacaactaattaaagagggcaaaactttacgtcaacagtacaattgataatttcagtcaactttccttgcgttccagtagctcacgtgaggagac
gi|8 : AATATACAAT-TA-TGG-AC-----TGTTTAGC-------GGG--GA-G--A-CAGCACAA-----ATT---ATC-AGG--TC--------GA-A--G--TA----GGGTTATC-ACC-C--GA----GGGCGC--CTAG-AC-G--C-CCGA-G----G--------------G-TG--A-TA---TC--CT-TACT-AAGACC-TGA--T-AA-T---T---TG--TGATGTCT-C--CC--T--G-CT-A-AACAATC---CA-TAAT--A-----G---TTT-------------------------------A-ATCT---AA-AAA---G----T-----------A--------AA-A---AAAA-A-------------T--ATGC-----TG-------A-A-AA-C----ATT--TC-TTGACTTGA----T--TTTT------AT-GTATCTTA-AAA---CGTC-A-TCA--A--G-ATT-TT--AA-C---AACTTTTT---CTACAAAAAAA--ACAA--------------AA-----
gi|8 : catgaaaaaagggaaataaaaaaaaattacaaaagattattttgatcgttaagttccgaggtagacagtc-------------GTGTT------T--CC-GC---ACA-A--TT-ATC--ATC-T-ACATG----GAGACaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgtttccgcacaattatcatctacatggagactaatagaatccttcattagtac
gi|9 : catgaaaaaagggaaataaaaaaaaattacaaaagattattttgatcgttaagttccgaggtagacagtcaatatacaattatggactgtttagcggggagacagcacaaattatcaggtcgaagtagggttatcacccgagggcgcctagacgcccgagggtgatatccttactaagacctgataatttgtgatgtctccctgctaaacaatccataatagtttaatctaaaaagtaaaaaaaaatatgctgaaaacatttcttgacttgatttttatgtatcttaaaacgtcatcaagattttaacaactttttctacaaaaaaaacaaaaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTAATATACAAT-TA-TGG-AC-----TGTTTAGC-------GGT--GG-G--A-CTTTAC-A-----ATT---CTC-TGG------------GA-A--G--TT----AGGTTTTCTTCC-C--GA-----GGCGC--CTAT--C-G----CCGA-G----G--------------T-T-----TA---A---CC-TACT-AAGA-C-TGA--T--A-T---T---TGT-TGAT-TCT----CC--T--G-CTCA-AACAGTC---CA-T-AT--A-----G---TTT-T---T-------T---C--CT----GAA-GATATCT---AA-ATATTTT----T-----------A--------AA-A---ATTA---------------T--ATCT-----TG-------A-A-AA------ATT--TC-TTGACTTGA----T--TTTT------AT-G-----TA-AAA---CG-----TCA--A--G--TC-GT--TA-A---AACTTTTTCTAC-------AAA--ACGAGCCGGAAAGCTGCGAA-----TTG--TGACGTCAGAA-AGAATGAGGCAAATAACA--ACGTC--AAAC-AGTTTAA--A-TTTC-GAA------TC-------------GTGTT------T--CT-GC---GCT----TT-ATC--ATC-T--CAGG----GAGAAAACACAG-TGTCACC--CC-GCG-GTGA-GGA---GAC--TACGA-ATTAAT-TCCCTTTCAC-TTGACAGCA--G--------G-ACCAA-GAA--TGA----T-G--TTA-TCTAAGAGGATCATtaatagaatccttcattagtac
9 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|20 ): TGGAGGGGGGGGGGGTCCTTGCAGTTTTATAATACCATACAATAAAATATGCATATATTTGTTGTGTTCTGATTTGCTTGTCTGTCATTATTAAATTTTTTTCTGTTAAAAGCAAATTGCAAATTCAAATTCTTTATTGGCGTAACACATTAACATGTAATGGTTATTGTCCATGAGGAGAACTAATAACAATAATT
Unaligned ( gi|22 ): AATTTAAATAGTCCAGGCTCATCAAAGCACCATTAACAGAATGCAGGTAACAGGCTGAAATTTAACTGTAGTTCTGTCAAACAAATAAGTAAACCACAGAACTGTCAAGCAGTTACTGTCAAAGGAACTAACTGTAGAACTGTCAAAGACATGTCAAATATTTTCTGCAGAACTATTAACCTGA
Unaligned ( gi|28 ): TCTATTGGCGCAACACATCAACATAATGGTTATTGCCCATGAGTAAAACTAATAACAATATGTAAATGATAGATAGCATGATGCTTTTCTGTTTCACGTATATATTCAATTTGTATTTTGTAAATGTTTGTAC
Unaligned ( gi|32 ): TGGGGGGGGGGGGGTGATTTTTCCTTGCGGTTTATAATACATAGAATAAATATGCATATATTATGTTGGTTTTGATTGGCTTGTCTGTCATTATTGAATTTTATTCCAGTTAAAAGTAAATTGCA
Unaligned ( gi|48 ): AATAAGATATGCAAATATTTGTGGTTTTAATTGGCTTGTTTATTATTATTTGTTTTCATTTATAAACAAATTGT
Unaligned ( gi|52 ): ATGTTTCTGATATACCCCTGTCATCATGATGAGACTAATAGAGTCCTTCATTAGTACGAG
Unaligned ( gi|54 ): TTGGTAGGGGGATTAGTTTATAGTTTTTAGTAGATGGTTAGCAGATGA
Unaligned ( gi|55 ): TTTTCGCACAACTGTGAGAATAATAGAATCCTTCATTAGTAC
Unaligned ( gi|56 ): CGGTCATCAGAGAATAATATAATCCTTCATTAGTACGAGT
Alignments
lowQualScore : 11 11 111111 1111111111111111 2222222222222222222222222 111111111111111 222222 444444444444444444444444444444444444444444444444444 11111111111 222222222222222222222
lowQualScore : 6 88 66 4 222222 1 1 1 33333 77777777 22 1 44 1 33333 444 1 22 77777777777 44 66 3333 1 3333 3333 222 1 4 6666 0 2 7777 2222222222222222 22 2 666 22 1 1 1 66 3 1 333 333 44 2 2 22 55555 1 1 1 1 555 2 22 777777777 1 22 22 333 555 22 3333 6666 9999 1 222 2222222222222222222222222 1 555 0 444444444444444 22 44444 7777777 1 1 3 4444 22 2 3333 22 222222 2 77777 2 333 2 2 33 33 2 2 33 2 333 2 555555555555555555555555555555555555555555555555555 4 1 44444444444 55 0 99999 0 3 3 555555555555555555555 666666 22 4 555 2 99 4 22 1 1 3333 22 55 0 333 1 1 3 1 22 22 1 1 1 1 1 2 4 33 2
lowQualScore : . .. .. . ...... . . . ..... ........ .. . .. . ..... ... . .. ........... .. .. .... . .... .... ... . . .... . . .... ................ .. . ... .. . . . .. . . ... ... .. . . .. ..... . . . . ... . .. ......... . .. .. ... ... .. .... .... .... . ... ......................... . ... . ............... .. ..... ....... . . . .... .. . .... .. ...... . ..... . ... . . .. .. . . .. . ... . ................................................... . . ........... .. . ..... . . . ..................... ...... .. . ... . .. . .. . . .... .. .. . ... . . . . .. .. . . . . . . . .. .
lowQualScore : 7 77 55 9 888888 7 6 6 88888 44444444 33 7 00 7 77777 222 5 11 11111111111 11 55 3333 6 6666 4444 444 9 0 3333 3 1 4444 6666666666666666 88 0 000 66 8 8 8 88 6 8 222 222 88 7 0 88 55555 9 9 9 6 888 2 99 000000000 9 66 44 000 444 44 7777 4444 3333 7 999 6666666666666666666666666 6 888 2 444444444444444 33 22222 1111111 7 7 8 0000 66 0 7777 99 444444 1 44444 1 999 2 2 11 11 2 2 11 2 999 2 555555555555555555555555555555555555555555555555555 0 4 77777777777 00 6 88888 8 6 6 111111111111111111111 111111 99 2 888 1 22 2 88 9 8 9999 44 44 1 000 7 7 5 8 55 66 9 9 9 9 8 2 4 11 4
consensus : ATCAGAAGACGAAACA-CACAATANT----ATAATATACAAT-TA-TGG-AC-----TGTTTAGC-------GGG--GA-G--A-CATCACAA-----ATT---ATC-AGG--TC--------GN-A--G--TA----GGGTTATC-ACC-C--GA----GGGCGC--CTAT-GC-G--C-CCGA-G----G--------------G-TG--A-TA---AC--CC-TACT-AAGACC-TGA--T-AA-T---T---TG--TGATGTCT-C--CC--T--G-CT-A-AACAGTC---CA-TAAT--A-----G---TTT-TA--T--T---AT---C--CT----GAA-GA-ATCT---AA-AAA---G----T-----------A--------AA-A---AAAA-A----------C--T--ATCT-----TG-------A-A-AA-C----ATT--TC-TTGACTTGA-T--T--TTTT------AT-G-----TA-AAA---CGTC-A-TCA--A--G-ATC-GT--AA-C---AAC-TTTTT---C-------AAA--ACGA--------------AA-----TCG--TG-CGTCAGAA-AGAATGAGGCANANAACACAACGTC--AAGC-G---TAAACA-TTTC-GCA------AC-------------GTGTT------T--CT-GC---GCC-A--TT-ATC--ATC-T-AAAGG----GAGACAACACAGTTGTCACC--CC-GCGCGTGAGGGA---GACATCACGA-ATTATC-TCCC-TTCAC-GTGAC--CA--GCC-CT-A-G-ACCAATGAAANTGACTG-T-A--TTATTCTGA-AGGATAATAA
Reference ( family-1347 ) : ATCAGAAGACGAAACA-CACAATANT----ATAATATACAAT-TA-TGG-AC-----TGTTTAGC-------GGG--GA-G--A-CATCACAA-----ATT---ATC-AGG--TC--------GN-A--G--TA----GGGTTATC-ACC-C--GA----GGGCGC--CTAT-GC-G--C-CCGA-G----G--------------G-TG--A-TA---AC--CC-TACT-AAGACC-TGA--T-AA-T---T---TG--TGATGTCT-C--CC--T--G-CT-A-AACAGTC---CA-TAAT--A-----G---TTT-TA--T--T---AT---C--CT----GAA-GA-ATCT---AA-AAA---G----T-----------A--------AA-A---AAAA-A----------C--T--ATCT-----TG-------A-A-AA-C----ATT--TC-TTGACTTGA-T--T--TTTT------AT-G-----TA-AAA---CGTC-A-TCA--A--G-ATC-GT--AA-C---AAC-TTTTT---C-------AAA--ACGA--------------AA-----TCG--TG-CGTCAGAA-AGAATGAGGCANANAACANAACGTC--AAGC-G---TAAACA-TTTC-GCA------AC-------------GTGTT------T--CT-GC---GCC-A--TT-ATC--ATC-T-AAAGG----GAGACAACACAGTTGTCACC--CC-GCGCGTGAGGGA---GACATCACGA-ATTATC-TCCC-TTCAC-GTGAC--CA--GCC-CT-A-G-ACCAATGAAANTGACTG-T-A--TTATTCTGA-AGGATAATAA
gi|1 : ----ACAATATACAAT-TA-TGG-AC-----T-CTTATC-------GGA--------A-CATCACAA-----ATTT--AT--AAG--TC--------TTTA--G--TA----GGGTTATC-ACC-T--GA----GGG-------------------------------------------G-TG--A-TA---AC--CC-TACT-AAGACT-TGA--T-AA-T---T---TG--TGATGTCT-C--CC--T--G-AT-A-AACAGTC---CA-TAAT--A-----G---TTT-TA--T--T---AT---C--AT----GAA-GA-ATCT---AA-GAA---T----T-----------A--------AA-A---AAAA-T----------C--T--TTTT-----TG-------A-A-AA-C----ATT--TC-TTGACTTGA-T--T--TTTT------GT-G-----TA-AAT---TGTC-A-TCA--A--G-ATT-GG--AA-C---AAC-TTTTC---C-------
gi|1 : tcacagacaatacaaagtatgtcagtaatgtgggtgtg------AT-------------GTATT------T--CT-TC---GCT-AA-TT-AGC--ATC-T-AAAGG----GAGACAACACAGTTGTCACC--CT-GGGCATGAGGGA---GAGATCACAA-ATTATC-TCCC-TTCAC-ATGAC--CA--GCC-CT-A-G-AC-----AAATTGACTT-T-A--TTATTCTGA-AGGATGATtacaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgtgatgtatttcttcgctaattagcatctaaagggagacaacacagttgtcaccctgggcatgagggagagatcacaaattatctcccttcacatgaccagccctagacaaattgactttattattctgaaggatgattatattcaattatggactgtttatcagggtgatatcataattatcaggttgaagtagggttatcaaataagggtgcctatgcagtaagacatacaagtattcagttcagcgcccatgaaattcttacttttcctttgaaatagt
gi|1 : tcacagacaatacaaagtatgtcagtaatgtgggtgtgacaatatacaattatggactcttatcggaacatcacaaatttataagtctttagtagggttatcacctgaggggtgataaccctactaagacttgataatttgtgatgtctccctgataaacagtccataatagttttattatcatgaagaatctaagaattaaaaaaaatcttttttgaaaacatttcttgacttgattttttgtgtaaattgtcatcaagattggaacaacttttcctacaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgtg-TG--A-TA---AC--CC-TACT-TCAACC-TGA--T-AA-T---T----A--TGATATCA-C--CC--T--G-AT-A-AACAGTC---CA-TAATTGA-----A---TAT-AA--T--C---AT---C--CT----TCA-GA-A--T---AATAAA---G----T-----------C--------AA-tatattcaattatggactgtttatcagggtgatatcataattatcaggttgaagtagggttatcaaataagggtgcctatgcagtaagacatacaagtattcagttcagcgcccatgaaattcttacttttcctttgaaatagt
gi|1 : tcacagacaatacaaagtatgtcagtaatgtgggtgtgacaatatacaattatggactcttatcggaacatcacaaatttataagtctttagtagggttatcacctgaggggtgataaccctactaagacttgataatttgtgatgtctccctgataaacagtccataatagttttattatcatgaagaatctaagaattaaaaaaaatcttttttgaaaacatttcttgacttgattttttgtgtaaattgtcatcaagattggaacaacttttcctacaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgtgatgtatttcttcgctaattagcatctaaagggagacaacacagttgtcaccctgggcatgagggagagatcacaaattatctcccttcacatgaccagccctagacaaa----ATTATATTCAAT-TA-TGG-AC-----TGTTTATC-------AGG--GT-G--A-TATCATAA------TT---ATC-AGG--TT--------GA-A--G--TA----GGGTTATC-AAA-T--AA----GGGTGC--CTAT-GC-aataagggtgcctatgcagtaagacatacaagtattcagttcagcgcccatgaaattcttacttttcctttgaaatagt
gi|10 : tcacagacaatacaaagtatgtcagtaatgtgggtgtgacaatatacaattatggactcttatcggaacatcacaaatttataagtctttagtagggttatcacctgaggggtgataaccctactaagacttgataatttgtgatgtctccctgataaacagtccataatagttttattatcatgaagaatctaagaattaaaaaaaatcttttttgaaaacatttcttgacttgattttttgtgtaaattgtcatcaagattggaacaacttttcctacaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgtgatgtatttcttcgctaattagcatctaaagggagacaacacagttgtcaccctgggcatgagggagagatcacaaattatctcccttcacatgaccagccctagacaaattgactttattattctgaaggatgA---AC--CT-CACA-AAGACC-TGA--T-AA-T---T---TG--TGATGTTT-C--CC--A--G-CT-T-AACATTC---CA-TAAT--A-----G---TTT-TA--T--T---AA---C--CT----GAA-GA-ATCT---AA-AAC---G----T-----------A--------AA-A---GAAA-ACAATTGTCATC--T--ATCT-----TG-------A-A-CA-C----ATT--TC-TTGACTTGA-T--T--TTCTTTTTACAT-G-----TA-AAA---TGTC-A-TCATCA--G-ATC-AT--AA-C---AAA---------C-------AAT--ACGG--------------AA-----ACT--T----TCAGAA-AG----------------TCACGTC--AAGC-G---TAAACA-TTTT-GTA------GC-------------ATATT------T--CT-GT---GCTAA--TT-ATC--GTC-T-AAAGG----GAGACAACACAGTTGTCACC--CT-GAGCATGAGGAA---GACATCACGA-A-TATCTTCCC-TTCAC-GTGAT--Cagtaagacatacaagtattcagttcagcgcccatgaaattcttacttttcctttgaaatagt
gi|10 : TCGTCACC--CT-GAGCATGAGGGA---GATGTCACGA-ATTATC-TCCC-T-CAC-GTGAT--CA--AAC-CT-A-G-ACCAATGAAATTGACTC-T-A--TTATTCTGA-GGGGTAATAgtcaccctgagcatgagggagatgtcacgaattatctccctcacgtgatcaaacctagaccaatgaaattgactctattattctgaggggtaatatag
gi|11 : aacctcacaaagacctgataatttgtgatgtttcccagcttaacattccataatagttttattaacctgaagaatctaaaacgtaaaagaaaacaattgtcatctatcttgaacacatttcttgacttgattttctttttacatgtaaaatgtcatcatcagatcataacaaacaatacggaaactttcagaaagtcacgtcaagcgtaaacattttgtagcatatttctgtgctaattatcgtctaaagggagacaacacagttgtcaccctgagcatgaggaagacatcacgaatatcttcccttcacgtgaC--CTAT-GC-G--C-CCGA-G----G--------------G-TG--A-TA---AC--CC-TACT-AAGACC-TGA--T-TA-T---T---TG--TGATGTCT-C--CC--T--G-CT-A-AACAGTC---CA-TAAT--A-----G---TTT-TA--T--T---AT---C--CT----AAA-CA-ATCC---AA-AAA---G----TCC---------A--------AA-A---AAAA-A----------C--T--ATCT-----TG-------A-A-AA-T----ATT--TC-TCGACTCGA-T--T--TTTT------GT-G-----TA-AAT---CGTC-A-TCA--A--G-ATC-GT--AA-C---AAT-TTTTT---C-------tag
gi|11 : aTATT------T--CT-GC---ACT-AA-TT-ATC--ATC-T-AAAGG----GAGACAACACAGTTGTCACC--CC-GCACGTGAGGAA---GACATCGTGA-ATTATC-TCCC-TTCAA-GTGAC--CA--GCC-TT-A-G-ACCAATGAAATTGACTG-T-A--TTATTCTGA-AAGATAATtacaaatagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatttctgcactaattatcatctaaagggagacaacacagttgtcaccccgcacgtgaggaagacatcgtgaattatctcccttcaagtgaccagccttagaccaatgaaattgactgtattattctgaaagataat
gi|12 : acctatgcgcccgagggtgataaccctactaagacctgattatttgtgatgtctccctgctaaacagtccataatagttttattatcctaaacaatccaaaaagtccaaaaaaaaactatcttgaaaatatttctcgactcgattttttgtgtaaatcgtcatcaagatcgtaacaattttttctacaaatagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-TATC-AAGACC-TGA--T-AATT---T---TC--TGTTGTCG-CTACCA-TTGG-CT---AACA-TC---CA-TAAT--A-----T---TTT-TA--TACTTAAATAAAA--CT----GAA-G--ATCT----A-AAA---G----T-----------A--------AA-A---AAAATAT---------C--C--ATCT-----TG-------A-A-
gi|12 : cg-GA-ATCT---AA-AAA---GG---T-----------A--------AA-A---AAAA-A----------CATT--ATCT-----TG-------ATA-AA-C----ATTCTTCATTGACTTA-----T--TTTT------AT-GG----TA-AAA---CGTC-A-TAA--A--G-CT--GT--AA-C---AAC-----------------AAG--GCGA--------------AAAGCTTTTGATTG-TATCATAT-AGGATGAGGCATAAAACA---CGTTCAAAAC-A---TAAACA-TTTC-GCA------ACT------------ATGTT------T--AT-GCA--GCC-A--TTTATCTAATC-T-ACAGG----GA-ACAACACA--TGTTACC--CC-GCGCGTGATGGATCGGACAT-ACAAGATTACC-TCCC-TTTAC-AT-AC--CA---CC-CA-A-GCACC-ATGGAAATAGCT-------TTATTCTTA-A-GATAATAAtctaaaaaggtaaaaaaaaacattatcttgataaacattcttcattgacttatttttatggtaaaacgtcataaagctgtaacaacaaggcgaaaagcttttgattgtatcatataggatgaggcataaaacacgttcaaaacataaacatttcgcaactatgtttatgcagccatttatctaatctacagggaacaacacatgttaccccgcgcgtgatggatcggacatacaagattacctccctttacataccacccaagcaccatggaaatagctttattcttaagataataata
gi|13 : cgtatcaagacctgataattttctgttgtcgctaccattggctaacatccataatatttttatacttaaataaaactgaagatctaaaagtaaaaaaaatatccatcttAT-TA-TGG-AC-----TGTTTAAC-------AGG--GA-G--A-CATCACAG-----ATT---ATC-AGG--TT--------AT-A--A--TA----GTGATGTC-ACC-T--GA----GGGTGC--ta
gi|13 : -TA--T--T---AT---C--CT----GAA-GA-ATCT---AA-AAA---G----TTGTTTTTTTTTA--------AT---------------------C--C--ATCT-----TG-------A-A-AA-C----ATT--TC-TAGACTTGA-T--T--TTTTTT----AT-G-----TA-CAA---CATC-A-TCT--A--T-ATT-GT--AA-C---AAC-TTTTT---C-------TAT--A--A--------------AA-----TNN--NN-NNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNN-N---NNNNNN-NNNN-NNN------NN-------------NNNNN------N--NNNGC---ACT-AA-TT-ATC--ATC-T-AAAGG----GAGGCAACACAGTTGTCACC--CA-GTGCATGAGGTA---GACATCATGA-ATTGTT-TCCC-TTCAC-ATGAC--TATTGCC-CT-A-G-ACCAGTGAATTTGACTATT-A--TAATTCTGA-TGGATAATgttttataatattatcctgaagaatctaaaaagttgtttttttttaatccatcttgaaaacatttctagacttgattttttttatgtacaacatcatctatattgtaacaactttttctataaaatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngcactaattatcatctaaagggaggcaacacagttgtcacccagtgcatgaggtagacatcatgaattgtttcccttcacatgactattgccctagaccagtgaatttgactattataattctgatggataat
gi|14 : attatggactgtttaacagggagacatcacagattatcaggttataatagtgatgtcacctgagggtgcgttttataaTGTCT-T--CC--A--G-CT-A-AACA-TCG--TA-TAAT--A-----A---TTG-TA--T--T---AC---C--CT----AAA-CA-AACT---AA-AAC---G----T-----------A--------AACA---GAAA-A----------C--T--ATCT-----TG-------A-T-AA-C----AAT--TC-TTGACTTCA-T--C--TTTT------AT-G-----CA-AAA---CGTC-A------A--G-ATA-GT--AA-T---AAC-ATCTT---CTAC----AAA--NNNN--------------NN-----NNN--NN-NNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNN-N---NNNNNN-NNNN-NNN------NN-------------NNNNNNNNAAAT--CT-GC---TCC-A--TT-ATC--ATC-T-AAAAG----GAGAAAACACAGTTGTCGCC--CT-GTGCGTGATGGA---GACATCAATA-ATTAGT-TCCA-ATCAT-GTGAC--CA--GTC-CT-G-G-ACCAATTAAATTGACTG-T-A--TTATTTT
gi|15 : ttA-TACAAGAATG---ATAATATACAAT-CA-TGG-AT-----TTTTTTGC-------AGG--GA-A--A-CATCACAA-----ATC---ATC-AAA--AT--------GT-A--G--TA----GGCTTATC-ACT-C--GA----TGGCGT--ATAT-GC-G--T-CCAA-G----G--------------G-TG--A-TA---TA--CC-TACT-AACAGC-TGA--T-AA-T---T---TG--TGGTGTAT-T--CC--T--G-CT-A-AACAGTC---CA-TAAT--A-----T---TTC-TA--T--T---AA---C--CT----GAA-GA-ATCT---AA-CAA---G----------------A--------AA-ATAGAAAA-A----------C--C--TTCT-----TG-------A-A-AA-C----ATT--TA-TTGATTTGATT--T--TTTT------AT-G-----AAGAAA---CATC-A-TCA--C--A-ATC-GT--AA-A---AACATTTTTA--CCGAA---AAA--ACGA--------------
gi|16 : aacaatattatgcattcttaagcta----ATATTATACAAT-TG-TGG-GC-----TGTTTAGC-------AGG--GA-G--A-CATCACAA-----ATT---ATC-AGG--TC--------AT-G--G--TA----GGGTTATC-GCC-A--AA----GGGTGC--CTAG-GT-G--T-CCAA-G----GAAAGGTGCCTGATAG-TA--A-TA---AC--CC-TACT-AAGACT-TGA--T-AA-T---T----------TGTCT-C--CC--T--G-CT-A-AGCAATC---TA-TAAT--A-----G---TTT-TA--T--T---AT---C--CT----GAA-GA-ATCT----A-AAA---G----A-----------A--------AA-A---AAAA-A----------T--TAAATAT-----CG-------A-C-AA-G----ATT--ggctga
gi|17 : gaaaatttatttgaattttttgctgaaaaatttgctacAA-AA-A-CT---AA-AAA-----------------------------AA-A---AAAA-A----------C--T--ATCT-----GG-------A-A-AA-C----A-----------------------TTTT------AT-G-----TA-AAA---TATC-A-TCA--C--C-ACT-GT--AA-C---AAT-TTTTT---tcatgaagaaaattgaaccgtttcagttaacattatttcaatatctatattttttttcattt
gi|17 : ttT------T--CT-GC---GCA-A--TTTATC--ATT-T-AAAGG----GAGATGACACAGTTGTCACC--C-------TGAG--------CATCACAA-ATTATC-TCCC-TTCAC-ATGAC--CA--GCC-CT-A-G-ACCAATGAAAATGACTG-T-G--TTATTCTGA-AGGATAGTAAatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttctgcgcaatttatcatttaaagggagatgacacagttgtcaccctgagcatcacaaattatctcccttcacatgaccagccctagaccaatgaaaatgactgtgttattctgaaggatagtaat
gi|18 : ttaaaaactaaaaaaaaaaaaactatctggaaaacattttatgtaaaatatcatcaccactgtaacaattttttatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnATA-T----ACATTATACAAT-TA-TGG-AC-----TGTTTAGCCGGTGCCAGG--GA-G--A-CATAAAAA-----ATT---ATC-AGG--TC--------GT-A--G--TG----GGGTTATC-ACC-C--GA----GGAAGC----AT-GT-G---------A----A--------------A-TG--A-TGTC-TC--CC-TGCT-AA-------A--C-AG-T---C---CA--TAAT-----------------------ACA---------TAAT--AATGTAG---TTG-TA--T--T---AT---C--CT-----AA-AA-AT---------------------------------------------------------------C--T--ATCT-----TG-------A-A-CA-T----GTT--TC-TTGACTTTA-TTCT--TTTT------AT-G-----TA-t
gi|19 : tacatgtatatatagatcgagtgacagtcagtactcaaactacttagtatgtaaaattATGAG-CAAATAACACAACGTC--AAACTG---TAAACA-TTTCTGCA------A--------------GTGTT------TTTCT-GCTCTGTC-A--TT-ATC--ATC-T-ACAGGTTCGGAGACAACACAGTTGTCACCCTCC-GCACGTGAGG-----GACATCACGA-ATTATC-TCCCTTTCACTGTGAC--CA--GCC-CTGA-T-ACCAATGAAAATGACTG-T-A--TTATTCTAA-AGG-TAATtgtctttactaaaaacg
gi|2 : aataggatAATATACAAT-TA-TGA-AC-----TGTTTAGC-------AGG--GAAG--A-CATCACAA-----ATT---ATC-AG---TC--------AA-A--G--TA----GG-TTGTC--CC-C--GA----GGGCGC--CTAT-GT-GAGCGCCGA-G----G--------------G-TG--A-TA---ATAACC-TGCT-AAGCCC-TGA--T-AA-T---T---TC--TGATGTCTCC--CC--T--G-CT---AACAGTC---CATTAAT--A-----G---TTT-TA--T--T---ATTA-T--CC----GAA-G--ATCTATAAA-AAA---A----TCG---------A--------GG-A---AAAA-A----------A--T--ATCT-----TG-------A-A-
gi|2 : ggcttcatcaaagcacattaaaacagaatgcaggtaaacaggctgaaatttaactgtagattctgttcccaacaaattaagtaaaccacagaacgtcaagcagtttacttgtcaaggacctactgtagactgtcaaagacatgttcacatattttctgcagaactgttaacctgtgttgtgttatctattgagcaagatgttcagtcgaaca--T---AT---C--TT----GAA-----TCTCTAAA-AAA---G----T-----------A--------AA-ATAAAAAA-A----------A--A--AAAT-----TG-------A-A-AAAC----TTT--TC-TTGACTTGA-T--T--TTTTTTTAA-GT-G-----T--AAA---TGTCAA-TCA--A--GTATTGGT--AA-CCAGAAC-GTTTT---C-------tctctaaaaaagtaaaataaaaaaaaaaaattgaaaaacttttcttgacttgatttttttttaagtgtaaatgtcaatcaagtattggtaaccagaacgttttcttttacaaaaaaaggagtaaccagaagccttttcgaattatgacgtcatactaaga
gi|21 : ggcttcatcaaagcacattaaaacagaatgcaggtaaacaggctgaaatttaactgtagattctgttcccaacaaattaagtaaaccacagaacgtcaagcagtttacttgtcaaggacctactgtagactgtcaaagacatgttcacatattttctgcagaactgttaacctgtgttgtgttatctattgagcaagatgttcagtcgaacaaatatacaattatgaactgtttagcagggaagacatcacaaattatcagtcaaagtaggttgtccccgagggcgcctatgtgagcgccgagggtgataataacctgctaagccctgataatttctgatgtctcccctgctaacagtccattaatagttttattattatccgaagatctataaaaaaatcgaggaaaaaaa-AGAATGAGATATAGA-CAAAACATA--AAGC-G---TAAACA-TTGT-GTAGGTCTCAC-------------GTATT------T--CT-GC---ATC-A--TT-GTC--ATC-T-AAAGG----GAGATAACACAGTTGGTACC--CC-GCGCGTGAGGTA---CACATTACGA-ATTACT-ACTC-TTCCC-GTGAC--CA--ACC-CT-T-G-ACCAATTAAATTCAT---T-A--TTATCATGA-AGGATAATAAttttacaaaaaaaggagtaaccagaagccttttcgaattatgacgtcatactaaga
gi|23 : atATCA-AAGAC-AAACA--ACA-TATTTCTTATAATATACAAT-TA-TGG-AC-----TGTTTAGC-------AGG--GA-G--A-CATCACAA-----ATT---ATC-AGT--TC--------GT-A--G--TA----GAGTTATT-ACC-A--GA----GGGCGT--CTAT-GC-T--C-TCAA-G----G--------------A-TG--A-TG---AC--CC-TACT-AAATCC-CA---------------------------T-C--CC--T--G-CT-A-AACAGT
gi|24 : atGAATAGAATGAGCCGAA--ACACAACGTC--AATC-A---TAAAAA-TTTC-GCA------AC-------------GTGTT------T--CT-GT---GCC-A--TT-ATC--ATC-T-ACAAG----GAGACAACACAAGTATCACT--CC-GTGCGTGAGGCA---GACATCACGA-ATTGTA-TCCC-TTCAC-GTGAC--CA--GCC-CT-A-G-ACCAATAAAt
gi|25 : --G-CT-A-AACAGTC---CA-TAAT--T-----G----TA-TA--T--T---GT---CGACT----GGA-
gi|25 : cacagaactgtcaagcagttactgtcaaaggaactaactgtagaactgtcaaagacatgtcaaatattttctgcagaactattaacctgatgttgtgaactgagcatg----ACAATATACAAT-TA-TGG-AC-----TGTTTAGC-------
gi|26 : cacagaactgtcaagcagttactgtcaaaggaactaactgtagaactgtcaaagacatgtcaaatattttctgcagaactattaacctgatgttgtgaactgagcatgtccagtcg----ACAATATACAAT-TA-TGG-AC-----TGTTTAGC-------GGG--GA-G--A-CATCACAA-----ATT---ATC-AGG--TC--------AA-A--G--TA----GGGTTGTC-ACC-C--GA----GGGCG-----------------TGA-G----G--------------G-TGATA-TA---AC--CC-TACT-AAGACC-TGA--T-AA-T---T---T
gi|27 : tgttgtgaactgagcatgtccagtcgTT------T--CT-GC---TCT-G--TT--TC--ATC-TTAAAGG----GAGACAACACAGTTGTCACC--C----GCGCAAGGGA---GGCAACCTGA-ATTATT-TCCC-TTCAC-GTGAC--TA--GCCACT-A-G-ACCAATG-ATTTCACTG-C-AATTCATTTCGA-AGGATAATAA
gi|29 : aATAGT----AT--TATACACT-TA-TGG-ACATGACTGTTTAGT-------AGA--TA-G--A-CATCAAAATATATATT---ATC-AGG--TC--------GA-A--G--TA----GGGTTATC-ACC-C--GA----TGGCGC--ATA
gi|3 : attgcaatattatattacatttatcatgtaaaatTATTATACAACACACTGG-AC-----TGTTTAGCCC-----GGG--GA-CTTA-CATCACAA-----A-T---ATC-AAG--GG--------GA-A--GA-TA----GGGTTATC-ACC-C--GG----AGGGGC--CTAT-GCGG--C-CCGA-GCC--G--------------GTTG--A-TA---AC--CCTTAAT-AAGACC-TGACCT-AA-TCGCC---CG--AGTTTTCT-C--TC--CGGG-CT-A-ACTAGTC---CC-C--T--A-----GCTCCTT-TATCT--T---AT---C--CCCCTGGAA-GACATCTTA-AA-AAA---GATTTT-----------T--------TA-A---GATA-A----------T--T--ATCT-----TC-------A-ACAACC----ATT--TC-TTGACTTGA-T--TTGTTTT------ATGG-----TA-AAAAACCGTC-A-TCA--A----ATC-GT--AA-C---AAG-TTTTggg
gi|3 : -------------GTGTT------T--CT-GC---GCC-A--TT-ATC--ATC-T-ACAGG----GAGACTACACAGTTGTCACC--AA-GCGCGTGAGGGA---GACATCATGA-ATTATC-TCCC-TTCAC-GTGAC--CA--GCC-CT-G-G-ACCAATGAAAGTGACTG-TAA--TTATTCTAA-AGAATAATAActacaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgtttctgcgccattatcatctacagggagactacacagttgtcaccaagcgcgtgagggagacatcatgaattatctcccttcacgtgaccagccctggaccaatgaaagtgactgtaattattctaaagaataataa
gi|30 : tattatacaacacactggactgtttagcccggggacttacatcacaaatatcaaggggaagatagggttatcacccggaggggcctatgcggcccgagccggttgataacccttaataagacctgacctaatcgcccgagttttctctccgggctaactagtcccctagctcctttatcttatccccctggaagacatcttaaaaaagattttttaagataattatcttcaacaaccatttcttgacttgatttgttttatggtaaaaaaccgtcatcaaatcgtaacaagttttctacaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGTACATT-TA-TGG-AC-----TGTTTAGA-------AGA--GA-G--A-CATCACAA-----AT
gi|30 : cttgacttccaaaggaggaacaacatcttattcagttgTTAGAAGA-GAGACATCACAA--------ATA-TGTACATT-TA-TGG-AC-----TGTTTAGA-------AGA--GA-G--A-CATCACAA-----------ATC-GGG--TT--------GT-G--G--Tatgtacatttatggactgtttagaagagagacatcacaaatcgggttgtggt
gi|31 : cttgacttccaaaggaggaacaacatcttattcagttgtgtacatttatggactgt------T--CT-GC---GCC-A--TT-ATC--ATC-T-ACAGG----GAGACAACACAGTTGTCACC--CC-GCGCGTGAGGGA---GACATCACGA-ATTATC-TCCC-TTCAC-GTGAC--CA--GCC-CT-G-A-ATAAATGAAAATGACAG-T-A--TTATTCTAA-AGG
gi|33 : ---TTT-TA--T--T---CA---C--CT----GAA-TA-ACCC----A-AAA---G----T-----------T--------TT-A---AACA-A----------T--A--ATCTGCCAATG-------A-A-AA-C------T--TC-TTGAC-TGA-T--T--TTTTTAA---AT-G-----TA-AAA---TGTC-A-TCA--AAGA-ATC-GA--AA-C----AC-TTTTT---CT------AAA--AC
gi|34 : --A-----G---TTTGTA--T--C---AT---C---T----GAGTAA-ACCC---AA-A-----G----TTTTT-------A--------AA-T---A------------------T--ATCT-----TGCCAATGAA-A-AA-C----ATT---C-TTGACTTGA-T--T--TTTTTTAA--AT-G-----TA-AAA---TGTC-ATTCA--A--G-ATC-GA--AA-C---AAC-TTTTta
gi|35 : TT------T--CTTGC---ACT-GATTT-ATC--ATC-T-AAAGG----GAAGCAACACAGTTA-CACC--CA-ACGTGTGAGG-A---GACACCACGA-ATTATC-TCCC-TTCAC-GTGA---CA--GCC-CT-GTG-ACCAATGAAA
gi|36 : a-----TGTTT------------G--AA-G--A-TACCACAA-----GTT---GTT-GGG--TC--------CA-A--GGATA----AGGTTAGA-GCC-ATGGA----GTGGGC--TAAA-AC-A--C-CCAG-G----G--------------G-AT--A-TA---AC--CA-AACC-TAGACC-TGA--C-AA-C---T---TT--TGATGTC
gi|37 : TATACAGT-TA-TGG-AC-----TGTTTAGC-------AGG--GA-G--A-CATCACAA-----ATT---ATC-AGG--TCATTTAAATGA-A--G--T-----GGGTTTTC-ACA-A--GA----GGGCGC--CTA
gi|38 : atactttttttgtccacagtctgACAAGATC----ACAATATACAAT-TA-TGG-AC-----TGTTTAGC-------GGG--GA-G--G-CATCACAA-----ATT---ATC-AGG--TC--------AA-A--G--TA----GGGTTATC-ACC-C--GA----GGGCGC--CTA
gi|39 : gagttatctcagtgataACAGTTGTCACG--CC-ACACGTGAGGGA---GACATCACGA-ATTATC-TCCC-TTCAC-GTGAT--CA--GCC-CT-A-G-ACCAATGAAAATGACTG-T-A--TTATTCTAA-AGGATAATA
gi|4 : aT----ATAATG-ACAGA-TA-TGG-AC-----TGTT-AGC-------AGGTGGA-G--AGCATCACAA-----ATTCATATAGAGT--TC--------AA-A--A--TA----GGGTTGTC---C-C--GA----GGGCG------T-GA-G--T------G----G--------------G-TG--A-TATAAAC--CT-TACT-AAGACCTTGAT-T-AA-T---TATATGTTTGATTTCT-C--TCCAT--GACT-A-ACTAG-CAAGCA-TGAG--A-------------TA-----T---AT------CT----AAA-G---TC-----A-TAA---G----G-----------A--------AA-C---AAAA-A----------A--T--ATCT-----TG-------A-A-A
gi|4 : agatttaaggtcacaggctcatcaaagccacccataaattcagaatgagtgaacaggctctctcgaagaactattataatgaactgtagatactgtcacaaacacaataaagttaaaaccacagaactgtcaagcagttactgtcaaaaggaatatcacgtctatactgtagagcatgtcaaagacactgttcaaaatatttttcttgacatgaactattaatcctatgttgtcactacttgagcatggatccagtgcggatcta--T---AT---C--TT----GAA----ATCT---AA-AAA---G----T-----------A--------AT-A---AAAA-A--------------------------G-------A-A-AA-CAAAAATC--TC-TTGAtctaaaaagtaataaaaaagaaaacaaaaatctcttgaaaaaacttttcc
gi|40 : agatttaaggtcacaggctcatcaaagccacccataaattcagaatgagtgaacaggctctctcgaagaactattataatgaactgtagatactgtcacaaacacaataaagttaaaaccacagaactgtcaagcagttactgtcaaaaggaatatcacgtctatactgtagagcatgtcaaagacactgttcaaaatatttttcttgacatgaactattaatcctatgttgtcactacttgagcatggatccagtgcggatctatataatgacagatatggactgttagcaggtggagagcatcacaaattcatatagagttcaaaatagggttgtcccgagggcgtgagtgggtgatataaaccttactaagaccttgattaattatatgtttgatttctctccatgactaactagcaagcatgagatatatctaaagtcataaggaaacaaaaaaACAA-----ATT---ATC-AGG--TT--------AT-ATAGC-TA----GGGTTCTC-ACA-T--TA----GAGCGC--CTAT-GC-G--C-CCAA-G----G----------------------TA----------TA-T-AAGG---TAA--TTAA-T---T---TG--TGATGTCT-T--CC--T--G-CT-A-AACAGTC---aaaaacttttcc
gi|41 : aACAGTTTTCACT--C--GCGCGTGAGGGA---GACAT-ACGA-ATTATC-TCCC-TTCAC-GTGAC--CA--GCC-CT-G-G-ACCTATGAAAATGAGTG-T-A--TTATTCTAA-AGGATAATA
gi|42 : ACAA-----ATT---ATC-AGG--TT--------AT-ATAGC-TA----GGGTTCTC-AACAT--TA----GAGCGC---TAT-GC-G--C-CCAA-G----G----------------------TA----------TA-T-AAG-----GAATT-AA-T---T---TG--TGATGTTC-T--TC--T--G-CT-A-AAc
gi|43 : tcta----ATATTATATAAT-TA-GGG-AT-----GGTTTATC-------GGG--GA-G--G-CATCACAA-----ATT---ACC-AGG--AT--------TT-A--A--TA----AGGCTATac
gi|44 : caaaaatatcataatacaatgtacgtttgTC-T-AAAGG----GAGATAACACAATTGTCATC--CC-ACACGCGAGGGA---GACATCACAA-ATTGTC-TCTG-CTCAC-GTGAC--CA--GCC-CT-A-G-ACCTATGAAaa
gi|45 : GAGGGA---GACATCACGA-ATTATC-TCCC-TTTAC-GTGAC--CA--GCC-CT-A-G-ACCAATGAAAATGATTG-T-A--TTATTCTAA-AGGATAATAA
gi|46 : -AGAATGGAGCCGAAAACA-AAC-TC--AAGC-A---TAAAAAATTTC-GCA------AC-------------G-GTT------A--CT-G----GCC-A--TT-ATC--ATCTT-AAAGG----AA
gi|47 : aataaaat-A---AAAA-A----------C--T--ATCT-----TG-------A-A-AA-C----ATT--TC-TTGACT--G-T--C--TTTT------AT-G-----CA-AAA---CGCC-A-TCA--A--G-ATC-AT--AA-C---AAC-TTTTT---C-------c
gi|49 : -A--G--TA----GGGTTATC-ACC-C--GA----GGACACAATAATAGTAG--T-CTCT-G----G--------------G-TG--A-TA---AC--CC-TAAT-AAGACC-AGA--C-AA-T---T---tacta
gi|5 : tAATATACAAT-TA-TGG-AC-----TGTT-AGC-------GGC--GA-GG-A-CATCACAT-----ATT---ATC-AGG--TC--------AA-G--G--TA----GGGTTATC-ACC-G--GA----GCG-GC--CTA--GC-G--C-CCGA-G----G--------------G-TG--A-TA---AC--C--TACT-AAGAC--TGA----AA-T---T---TG--TGAT-TCT-C--CC--T--G-CT-ATAACAGTC---CA-TAAT--A-----G---TTT-TA--T--T---AT---C--CT----GAA-GA-A-CT---AA-AAA---G----T-----------ATTTTTTTTAA-A---AA--------------T--T--ATCT--------------A-A-AA-C----ATT--TT-TTGACTTGA-T--T--TTTT------AT-G-----TA-AAA---CGTC-A-TCA--A--G-ATC-GT--AAAC---AAC-TTTTTCTAC-------AAA--NNNN--------------NN-----NNN--NN-NNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNN-N---NNNNNN-NNNN-NNN------NNNNNNNNNNNNNNNGTGTT------T--CT-GA---CCC-A--TT-ATC--ATC-T-ACAGG----GA-ACAACACA-TTGTCCCA--CCAGCGCGTGAGGGA---GACATCACGA-ATTATC-TCCC-TTCAC-GTGAC--CA--G-C-CT-G-G-A-CAAT-AAAGTGACTG-TAA--TTATT-TAA-AGGATAATAA
gi|50 : tactttattttttaaattcttttaactattgaaaca-TGG-AC-----TGTT------------GG--GA-G--A-AATCACAA-----AT-----TC-AAG--TC--------AT-A--T--TAAGGTGGGTTATC-ACC-A--GAGGCCGGGCGC--C
gi|51 : --ATC-T-AAAGG----GAGACAACACAGTTATCACC--CA-ACGTGTGAGGGA---GACACCACGA-ATTATC-TCCC-TT
gi|53 : CACAG-----GTC---ATT-AGAAAT---------GA-A--G--T-----GGGTTATC-ACA-T--TA----GGGCGC--CTAT-
gi|57 : aattgta-AAAGG----GAGACAACACAGTTGTCACC--CC-GCGC
gi|58 : taactaAATATACAAT-TA-TGG-AC-----TGTTTAGC-------GG
gi|6 : tc----ACAATATACAAT-TA-TGGCAC-----TGTTTAGC-------GGG---A-G--A-CATCA-AA-----ATT---ATC-AGG--TC--------GA-A--G--TA----GGGTTATC-A-C-C--GA----GGCCGC--CTAT-GC-G--C-ATGGCGCCTCG--------------G-TG--ACTA---AC--CC--ACTCAAGACC-TGA--TAAA-T---T---TG--TGATTTAT-C--CT--T--G-TT-A-A----------------------------CTT-TA--T--T---AT------CT----GAA-G--ATCT---------------------------------------A-A---AAAA-G----------T--T--TTTC-----TGC------A-A-AA-C-----TT--TC-TTGAC-TGA-T--T--TTTT------AT-G-----TA-GAA---CGTC-A-T-A--A--G-ATC-GCTAAA-C---AAG-TTCTT---CTACA---AAA--ACGA--------------
gi|7 : ctgtttaacgaaaaattatattcaattcaaattctttattgcgtaacacacatgtaattggttattcccatgatggaatctagataacaatatttaaaaaaatacgtaaaataacatgggcatagtgtttgATCAGGAGACAAAACA-CACAATACT----ATAATATACAAT-TA-TGG-AC-----TGTTTAGC-------AGG--GA-G--A-CATAACAA-----ATT---ATG-AGG--TT--------GT-A--G--TA----GGGTTATC-ACC-C--GA----GGGCAC--CTAT-GT-G--C-CTGA-G----G--------------G-AG--A-TA---AC--CC-TAAT-ACAACA-TGA--T-AA-T---T---TG--TGATGTCT-C--CC--T--G-CT-A-AACAGTC---TA-TAAC--A-----G---TTT-TA--T--T---AT---C--CT----GAA-GA-ATCT---AA-AAA---G----T-----------A--------AA-A---AACA-A----------C--T--ATCT-----TG-------A-A-AA-T----GCT--TC-TTGATTTGA-T--T--TTTT------AT-G-----TA-AAA---TGTC-A-TCA--A--G-ATT-GT--AA-C---AAT-TTTGT---C-------AAANNNNNN--------------NN-----NNN--NN-NNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNN-N---NNNNNN-NNNN-NNN------NN-------------NNNNN------N--NN-NN---NNN-N--NT-ATC--ATC-T-AAAGG----GAGACAACACAGTTGTTACC--CC-ATGCGTGAGGGA---GACATCACGA-ATTATC-TCCC-TTCAT-GTGAC--TA--GCT-CT-A-G-ACCTATGAAATCGACTG-T-A--TTATTCTGA-AGGATAATAAccgaaagatttcgattgtgatgtacaactaattaaagagggcaaaactttacgtcaacagtacaattgataatttcagtcaactttccttgcgttccagtagctcacgtgaggagac
gi|8 : AATATACAAT-TA-TGG-AC-----TGTTTAGC-------GGG--GA-G--A-CAGCACAA-----ATT---ATC-AGG--TC--------GA-A--G--TA----GGGTTATC-ACC-C--GA----GGGCGC--CTAG-AC-G--C-CCGA-G----G--------------G-TG--A-TA---TC--CT-TACT-AAGACC-TGA--T-AA-T---T---TG--TGATGTCT-C--CC--T--G-CT-A-AACAATC---CA-TAAT--A-----G---TTT-------------------------------A-ATCT---AA-AAA---G----T-----------A--------AA-A---AAAA-A-------------T--ATGC-----TG-------A-A-AA-C----ATT--TC-TTGACTTGA----T--TTTT------AT-GTATCTTA-AAA---CGTC-A-TCA--A--G-ATT-TT--AA-C---AAC-TTTTT---CTACAAAAAAA--ACAA--------------AA-----
gi|8 : catgaaaaaagggaaataaaaaaaaattacaaaagattattttgatcgttaagttccgaggtagacagtc-------------GTGTT------T--CC-GC---ACA-A--TT-ATC--ATC-T-ACATG----GAGACaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgtttccgcacaattatcatctacatggagactaatagaatccttcattagtac
gi|9 : catgaaaaaagggaaataaaaaaaaattacaaaagattattttgatcgttaagttccgaggtagacagtcaatatacaattatggactgtttagcggggagacagcacaaattatcaggtcgaagtagggttatcacccgagggcgcctagacgcccgagggtgatatccttactaagacctgataatttgtgatgtctccctgctaaacaatccataatagtttaatctaaaaagtaaaaaaaaatatgctgaaaacatttcttgacttgatttttatgtatcttaaaacgtcatcaagattttaacaactttttctacaaaaaaaacaaaaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTAATATACAAT-TA-TGG-AC-----TGTTTAGC-------GGT--GG-G--A-CTTTAC-A-----ATT---CTC-TGG------------GA-A--G--TT----AGGTTTTCTTCC-C--GA-----GGCGC--CTAT--C-G----CCGA-G----G--------------T-T-----TA---A---CC-TACT-AAGA-C-TGA--T--A-T---T---TGT-TGAT-TCT----CC--T--G-CTCA-AACAGTC---CA-T-AT--A-----G---TTT-T---T-------T---C--CT----GAA-GATATCT---AA-ATATTTT----T-----------A--------AA-A---ATTA---------------T--ATCT-----TG-------A-A-AA------ATT--TC-TTGACTTGA----T--TTTT------AT-G-----TA-AAA---CG-----TCA--A--G--TC-GT--TA-A---AAC-TTTTTCTAC-------AAA--ACGAGCCGGAAAGCTGCGAA-----TTG--TGACGTCAGAA-AGAATGAGGCAAATAAC--AACGTC--AAAC-AGTTTAA--A-TTTC-GAA------TC-------------GTGTT------T--CT-GC---GCT----TT-ATC--ATC-T--CAGG----GAGAAAACACAG-TGTCACC--CC-GCG-GTGA-GGA---GAC--TACGA-ATTAAT-TCCCTTTCAC-TTGACAGCA--G--------G-ACCAA-GAA--TGA----T-G--TTA-TCTAAGAGGATCATtaatagaatccttcattagtac
9 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|20 ): TGGAGGGGGGGGGGGTCCTTGCAGTTTTATAATACCATACAATAAAATATGCATATATTTGTTGTGTTCTGATTTGCTTGTCTGTCATTATTAAATTTTTTTCTGTTAAAAGCAAATTGCAAATTCAAATTCTTTATTGGCGTAACACATTAACATGTAATGGTTATTGTCCATGAGGAGAACTAATAACAATAATT
Unaligned ( gi|22 ): AATTTAAATAGTCCAGGCTCATCAAAGCACCATTAACAGAATGCAGGTAACAGGCTGAAATTTAACTGTAGTTCTGTCAAACAAATAAGTAAACCACAGAACTGTCAAGCAGTTACTGTCAAAGGAACTAACTGTAGAACTGTCAAAGACATGTCAAATATTTTCTGCAGAACTATTAACCTGA
Unaligned ( gi|28 ): TCTATTGGCGCAACACATCAACATAATGGTTATTGCCCATGAGTAAAACTAATAACAATATGTAAATGATAGATAGCATGATGCTTTTCTGTTTCACGTATATATTCAATTTGTATTTTGTAAATGTTTGTAC
Unaligned ( gi|32 ): TGGGGGGGGGGGGGTGATTTTTCCTTGCGGTTTATAATACATAGAATAAATATGCATATATTATGTTGGTTTTGATTGGCTTGTCTGTCATTATTGAATTTTATTCCAGTTAAAAGTAAATTGCA
Unaligned ( gi|48 ): AATAAGATATGCAAATATTTGTGGTTTTAATTGGCTTGTTTATTATTATTTGTTTTCATTTATAAACAAATTGT
Unaligned ( gi|52 ): ATGTTTCTGATATACCCCTGTCATCATGATGAGACTAATAGAGTCCTTCATTAGTACGAG
Unaligned ( gi|54 ): TTGGTAGGGGGATTAGTTTATAGTTTTTAGTAGATGGTTAGCAGATGA
Unaligned ( gi|55 ): TTTTCGCACAACTGTGAGAATAATAGAATCCTTCATTAGTAC
Unaligned ( gi|56 ): CGGTCATCAGAGAATAATATAATCCTTCATTAGTACGAGT
Alignments
lowQualScore : 11 11 111111 1111111111111111 2222222222222222222222222 111111111111111 222222 444444444444444444444444444444444444444444444444444 11111111 222222222222222222222
lowQualScore : 6 88 66 4 222222 1 1 1 33333 77777777 22 1 44 1 33333 444 1 22 77777777777 44 66 3333 1 3333 3333 222 1 4 6666 0 2 7777 2222222222222222 22 2 666 22 1 1 1 66 3 1 333 333 44 2 2 22 55555 1 1 1 1 555 2 22 777777777 1 22 22 333 555 22 3333 6666 9999 1 222 2222222222222222222222222 1 555 0 444444444444444 22 44444 7777777 1 1 3 4444 22 2 3333 22 222222 2 77777 2 333 2 2 33 33 2 2 33 2 333 2 555555555555555555555555555555555555555555555555555 4 1 22222222 33 55 0 99999 0 3 3 555555555555555555555 666666 22 4 555 2 99 4 22 1 1 3333 22 55 0 333 1 1 3 1 22 22 1 1 1 1 1 2 4 33 2
lowQualScore : . .. .. . ...... . . . ..... ........ .. . .. . ..... ... . .. ........... .. .. .... . .... .... ... . . .... . . .... ................ .. . ... .. . . . .. . . ... ... .. . . .. ..... . . . . ... . .. ......... . .. .. ... ... .. .... .... .... . ... ......................... . ... . ............... .. ..... ....... . . . .... .. . .... .. ...... . ..... . ... . . .. .. . . .. . ... . ................................................... . . ........ .. .. . ..... . . . ..................... ...... .. . ... . .. . .. . . .... .. .. . ... . . . . .. .. . . . . . . . .. .
lowQualScore : 7 77 55 9 888888 7 6 6 88888 44444444 33 7 00 7 77777 222 5 11 11111111111 11 55 3333 6 6666 4444 444 9 0 3333 3 1 4444 6666666666666666 88 0 000 66 8 8 8 88 6 8 222 222 88 7 0 88 55555 9 9 9 6 888 2 99 000000000 9 66 44 000 444 44 7777 4444 3333 7 999 6666666666666666666666666 6 888 2 444444444444444 33 22222 1111111 7 7 8 0000 66 0 7777 99 444444 1 44444 1 999 2 2 11 11 2 2 11 2 999 2 555555555555555555555555555555555555555555555555555 0 4 33333333 55 00 6 88888 8 6 6 111111111111111111111 111111 99 2 888 1 22 2 88 9 8 9999 44 44 1 000 7 7 5 8 55 66 9 9 9 9 8 2 4 11 4
consensus : ATCAGAAGACGAAACA-CACAATANT----ATAATATACAAT-TA-TGG-AC-----TGTTTAGC-------GGG--GA-G--A-CATCACAA-----ATT---ATC-AGG--TC--------GN-A--G--TA----GGGTTATC-ACC-C--GA----GGGCGC--CTAT-GC-G--C-CCGA-G----G--------------G-TG--A-TA---AC--CC-TACT-AAGACC-TGA--T-AA-T---T---TG--TGATGTCT-C--CC--T--G-CT-A-AACAGTC---CA-TAAT--A-----G---TTT-TA--T--T---AT---C--CT----GAA-GA-ATCT---AA-AAA---G----T-----------A--------AA-A---AAAA-A----------C--T--ATCT-----TG-------A-A-AA-C----ATT--TC-TTGACTTGA-T--T--TTTT------AT-G-----TA-AAA---CGTC-A-TCA--A--G-ATC-GT--AA-C---AAC-TTTTT---C-------AAA--ACGA--------------AA-----TCG--TG-CGTCAGAA-AGAATGAGGCANANAACACAACGTC--AAGC-G---TAAACA-TTTC-GCA------AC-------------GTGTT------T--CT-GC---GCC-A--TT-ATC--ATC-T-AAAGG----GAGACAACACAGTTGTCACC--CC-GCGCGTGAGGGA---GACATCACGA-ATTATC-TCCC-TTCAC-GTGAC--CA--GCC-CT-A-G-ACCAATGAAANTGACTG-T-A--TTATTCTGA-AGGATAATAA
Reference ( family-1347 ) : ATCAGAAGACGAAACA-CACAATANT----ATAATATACAAT-TA-TGG-AC-----TGTTTAGC-------GGG--GA-G--A-CATCACAA-----ATT---ATC-AGG--TC--------GN-A--G--TA----GGGTTATC-ACC-C--GA----GGGCGC--CTAT-GC-G--C-CCGA-G----G--------------G-TG--A-TA---AC--CC-TACT-AAGACC-TGA--T-AA-T---T---TG--TGATGTCT-C--CC--T--G-CT-A-AACAGTC---CA-TAAT--A-----G---TTT-TA--T--T---AT---C--CT----GAA-GA-ATCT---AA-AAA---G----T-----------A--------AA-A---AAAA-A----------C--T--ATCT-----TG-------A-A-AA-C----ATT--TC-TTGACTTGA-T--T--TTTT------AT-G-----TA-AAA---CGTC-A-TCA--A--G-ATC-GT--AA-C---AAC-TTTTT---C-------AAA--ACGA--------------AA-----TCG--TG-CGTCAGAA-AGAATGAGGCANANAACACAACGTC--AAGC-G---TAAACA-TTTC-GCA------AC-------------GTGTT------T--CT-GC---GCC-A--TT-ATC--ATC-T-AAAGG----GAGACAACACAGTTGTCACC--CC-GCGCGTGAGGGA---GACATCACGA-ATTATC-TCCC-TTCAC-GTGAC--CA--GCC-CT-A-G-ACCAATGAAANTGACTG-T-A--TTATTCTGA-AGGATAATAA
gi|1 : ----ACAATATACAAT-TA-TGG-AC-----T-CTTATC-------GGA--------A-CATCACAA-----ATTT--AT--AAG--TC--------TTTA--G--TA----GGGTTATC-ACC-T--GA----GGG-------------------------------------------G-TG--A-TA---AC--CC-TACT-AAGACT-TGA--T-AA-T---T---TG--TGATGTCT-C--CC--T--G-AT-A-AACAGTC---CA-TAAT--A-----G---TTT-TA--T--T---AT---C--AT----GAA-GA-ATCT---AA-GAA---T----T-----------A--------AA-A---AAAA-T----------C--T--TTTT-----TG-------A-A-AA-C----ATT--TC-TTGACTTGA-T--T--TTTT------GT-G-----TA-AAT---TGTC-A-TCA--A--G-ATT-GG--AA-C---AAC-TTTTC---C-------
gi|1 : tcacagacaatacaaagtatgtcagtaatgtgggtgtg------AT-------------GTATT------T--CT-TC---GCT-AA-TT-AGC--ATC-T-AAAGG----GAGACAACACAGTTGTCACC--CT-GGGCATGAGGGA---GAGATCACAA-ATTATC-TCCC-TTCAC-ATGAC--CA--GCC-CT-A-G-AC-----AAATTGACTT-T-A--TTATTCTGA-AGGATGATtacaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgtgatgtatttcttcgctaattagcatctaaagggagacaacacagttgtcaccctgggcatgagggagagatcacaaattatctcccttcacatgaccagccctagacaaattgactttattattctgaaggatgattatattcaattatggactgtttatcagggtgatatcataattatcaggttgaagtagggttatcaaataagggtgcctatgcagtaagacatacaagtattcagttcagcgcccatgaaattcttacttttcctttgaaatagt
gi|1 : tcacagacaatacaaagtatgtcagtaatgtgggtgtgacaatatacaattatggactcttatcggaacatcacaaatttataagtctttagtagggttatcacctgaggggtgataaccctactaagacttgataatttgtgatgtctccctgataaacagtccataatagttttattatcatgaagaatctaagaattaaaaaaaatcttttttgaaaacatttcttgacttgattttttgtgtaaattgtcatcaagattggaacaacttttcctacaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgtg-TG--A-TA---AC--CC-TACT-TCAACC-TGA--T-AA-T---T----A--TGATATCA-C--CC--T--G-AT-A-AACAGTC---CA-TAATTGA-----A---TAT-AA--T--C---AT---C--CT----TCA-GA-A--T---AATAAA---G----T-----------C--------AA-tatattcaattatggactgtttatcagggtgatatcataattatcaggttgaagtagggttatcaaataagggtgcctatgcagtaagacatacaagtattcagttcagcgcccatgaaattcttacttttcctttgaaatagt
gi|1 : tcacagacaatacaaagtatgtcagtaatgtgggtgtgacaatatacaattatggactcttatcggaacatcacaaatttataagtctttagtagggttatcacctgaggggtgataaccctactaagacttgataatttgtgatgtctccctgataaacagtccataatagttttattatcatgaagaatctaagaattaaaaaaaatcttttttgaaaacatttcttgacttgattttttgtgtaaattgtcatcaagattggaacaacttttcctacaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgtgatgtatttcttcgctaattagcatctaaagggagacaacacagttgtcaccctgggcatgagggagagatcacaaattatctcccttcacatgaccagccctagacaaa----ATTATATTCAAT-TA-TGG-AC-----TGTTTATC-------AGG--GT-G--A-TATCATAA------TT---ATC-AGG--TT--------GA-A--G--TA----GGGTTATC-AAA-T--AA----GGGTGC--CTAT-GC-aataagggtgcctatgcagtaagacatacaagtattcagttcagcgcccatgaaattcttacttttcctttgaaatagt
gi|10 : tcacagacaatacaaagtatgtcagtaatgtgggtgtgacaatatacaattatggactcttatcggaacatcacaaatttataagtctttagtagggttatcacctgaggggtgataaccctactaagacttgataatttgtgatgtctccctgataaacagtccataatagttttattatcatgaagaatctaagaattaaaaaaaatcttttttgaaaacatttcttgacttgattttttgtgtaaattgtcatcaagattggaacaacttttcctacaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgtgatgtatttcttcgctaattagcatctaaagggagacaacacagttgtcaccctgggcatgagggagagatcacaaattatctcccttcacatgaccagccctagacaaattgactttattattctgaaggatgA---AC--CT-CACA-AAGACC-TGA--T-AA-T---T---TG--TGATGTTT-C--CC--A--G-CT-T-AACATTC---CA-TAAT--A-----G---TTT-TA--T--T---AA---C--CT----GAA-GA-ATCT---AA-AAC---G----T-----------A--------AA-A---GAAA-ACAATTGTCATC--T--ATCT-----TG-------A-A-CA-C----ATT--TC-TTGACTTGA-T--T--TTCTTTTTACAT-G-----TA-AAA---TGTC-A-TCATCA--G-ATC-AT--AA-C---AAA---------C-------AAT--ACGG--------------AA-----ACT--T----TCAGAA-AG----------------TCACGTC--AAGC-G---TAAACA-TTTT-GTA------GC-------------ATATT------T--CT-GT---GCTAA--TT-ATC--GTC-T-AAAGG----GAGACAACACAGTTGTCACC--CT-GAGCATGAGGAA---GACATCACGA-A-TATCTTCCC-TTCAC-GTGAT--Cagtaagacatacaagtattcagttcagcgcccatgaaattcttacttttcctttgaaatagt
gi|10 : TCGTCACC--CT-GAGCATGAGGGA---GATGTCACGA-ATTATC-TCCC-T-CAC-GTGAT--CA--AAC-CT-A-G-ACCAATGAAATTGACTC-T-A--TTATTCTGA-GGGGTAATAgtcaccctgagcatgagggagatgtcacgaattatctccctcacgtgatcaaacctagaccaatgaaattgactctattattctgaggggtaatatag
gi|11 : aacctcacaaagacctgataatttgtgatgtttcccagcttaacattccataatagttttattaacctgaagaatctaaaacgtaaaagaaaacaattgtcatctatcttgaacacatttcttgacttgattttctttttacatgtaaaatgtcatcatcagatcataacaaacaatacggaaactttcagaaagtcacgtcaagcgtaaacattttgtagcatatttctgtgctaattatcgtctaaagggagacaacacagttgtcaccctgagcatgaggaagacatcacgaatatcttcccttcacgtgaC--CTAT-GC-G--C-CCGA-G----G--------------G-TG--A-TA---AC--CC-TACT-AAGACC-TGA--T-TA-T---T---TG--TGATGTCT-C--CC--T--G-CT-A-AACAGTC---CA-TAAT--A-----G---TTT-TA--T--T---AT---C--CT----AAA-CA-ATCC---AA-AAA---G----TCC---------A--------AA-A---AAAA-A----------C--T--ATCT-----TG-------A-A-AA-T----ATT--TC-TCGACTCGA-T--T--TTTT------GT-G-----TA-AAT---CGTC-A-TCA--A--G-ATC-GT--AA-C---AAT-TTTTT---C-------tag
gi|11 : aTATT------T--CT-GC---ACT-AA-TT-ATC--ATC-T-AAAGG----GAGACAACACAGTTGTCACC--CC-GCACGTGAGGAA---GACATCGTGA-ATTATC-TCCC-TTCAA-GTGAC--CA--GCC-TT-A-G-ACCAATGAAATTGACTG-T-A--TTATTCTGA-AAGATAATtacaaatagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatttctgcactaattatcatctaaagggagacaacacagttgtcaccccgcacgtgaggaagacatcgtgaattatctcccttcaagtgaccagccttagaccaatgaaattgactgtattattctgaaagataat
gi|12 : acctatgcgcccgagggtgataaccctactaagacctgattatttgtgatgtctccctgctaaacagtccataatagttttattatcctaaacaatccaaaaagtccaaaaaaaaactatcttgaaaatatttctcgactcgattttttgtgtaaatcgtcatcaagatcgtaacaattttttctacaaatagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-TATC-AAGACC-TGA--T-AATT---T---TC--TGTTGTCG-CTACCA-TTGG-CT---AACA-TC---CA-TAAT--A-----T---TTT-TA--TACTTAAATAAAA--CT----GAA-G--ATCT----A-AAA---G----T-----------A--------AA-A---AAAATAT---------C--C--ATCT-----TG-------A-A-
gi|12 : cg-GA-ATCT---AA-AAA---GG---T-----------A--------AA-A---AAAA-A----------CATT--ATCT-----TG-------ATA-AA-C----ATTCTTCATTGACTTA-----T--TTTT------AT-GG----TA-AAA---CGTC-A-TAA--A--G-CT--GT--AA-C---AAC-----------------AAG--GCGA--------------AAAGCTTTTGATTG-TATCATAT-AGGATGAGGCATAAAACAC---GTTCAAAAC-A---TAAACA-TTTC-GCA------ACT------------ATGTT------T--AT-GCA--GCC-A--TTTATCTAATC-T-ACAGG----GA-ACAACACA--TGTTACC--CC-GCGCGTGATGGATCGGACAT-ACAAGATTACC-TCCC-TTTAC-AT-AC--CA---CC-CA-A-GCACC-ATGGAAATAGCT-------TTATTCTTA-A-GATAATAAtctaaaaaggtaaaaaaaaacattatcttgataaacattcttcattgacttatttttatggtaaaacgtcataaagctgtaacaacaaggcgaaaagcttttgattgtatcatataggatgaggcataaaacacgttcaaaacataaacatttcgcaactatgtttatgcagccatttatctaatctacagggaacaacacatgttaccccgcgcgtgatggatcggacatacaagattacctccctttacataccacccaagcaccatggaaatagctttattcttaagataataata
gi|13 : cgtatcaagacctgataattttctgttgtcgctaccattggctaacatccataatatttttatacttaaataaaactgaagatctaaaagtaaaaaaaatatccatcttAT-TA-TGG-AC-----TGTTTAAC-------AGG--GA-G--A-CATCACAG-----ATT---ATC-AGG--TT--------AT-A--A--TA----GTGATGTC-ACC-T--GA----GGGTGC--ta
gi|13 : -TA--T--T---AT---C--CT----GAA-GA-ATCT---AA-AAA---G----TTGTTTTTTTTTA--------AT---------------------C--C--ATCT-----TG-------A-A-AA-C----ATT--TC-TAGACTTGA-T--T--TTTTTT----AT-G-----TA-CAA---CATC-A-TCT--A--T-ATT-GT--AA-C---AAC-TTTTT---C-------TAT--A--A--------------AA-----TNN--NN-NNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNN-N---NNNNNN-NNNN-NNN------NN-------------NNNNN------N--NNNGC---ACT-AA-TT-ATC--ATC-T-AAAGG----GAGGCAACACAGTTGTCACC--CA-GTGCATGAGGTA---GACATCATGA-ATTGTT-TCCC-TTCAC-ATGAC--TATTGCC-CT-A-G-ACCAGTGAATTTGACTATT-A--TAATTCTGA-TGGATAATgttttataatattatcctgaagaatctaaaaagttgtttttttttaatccatcttgaaaacatttctagacttgattttttttatgtacaacatcatctatattgtaacaactttttctataaaatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngcactaattatcatctaaagggaggcaacacagttgtcacccagtgcatgaggtagacatcatgaattgtttcccttcacatgactattgccctagaccagtgaatttgactattataattctgatggataat
gi|14 : attatggactgtttaacagggagacatcacagattatcaggttataatagtgatgtcacctgagggtgcgttttataaTGTCT-T--CC--A--G-CT-A-AACA-TCG--TA-TAAT--A-----A---TTG-TA--T--T---AC---C--CT----AAA-CA-AACT---AA-AAC---G----T-----------A--------AACA---GAAA-A----------C--T--ATCT-----TG-------A-T-AA-C----AAT--TC-TTGACTTCA-T--C--TTTT------AT-G-----CA-AAA---CGTC-A------A--G-ATA-GT--AA-T---AAC-ATCTT---CTAC----AAA--NNNN--------------NN-----NNN--NN-NNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNN-N---NNNNNN-NNNN-NNN------NN-------------NNNNNNNNAAAT--CT-GC---TCC-A--TT-ATC--ATC-T-AAAAG----GAGAAAACACAGTTGTCGCC--CT-GTGCGTGATGGA---GACATCAATA-ATTAGT-TCCA-ATCAT-GTGAC--CA--GTC-CT-G-G-ACCAATTAAATTGACTG-T-A--TTATTTT
gi|15 : ttA-TACAAGAATG---ATAATATACAAT-CA-TGG-AT-----TTTTTTGC-------AGG--GA-A--A-CATCACAA-----ATC---ATC-AAA--AT--------GT-A--G--TA----GGCTTATC-ACT-C--GA----TGGCGT--ATAT-GC-G--T-CCAA-G----G--------------G-TG--A-TA---TA--CC-TACT-AACAGC-TGA--T-AA-T---T---TG--TGGTGTAT-T--CC--T--G-CT-A-AACAGTC---CA-TAAT--A-----T---TTC-TA--T--T---AA---C--CT----GAA-GA-ATCT---AA-CAA---G----------------A--------AA-ATAGAAAA-A----------C--C--TTCT-----TG-------A-A-AA-C----ATT--TA-TTGATTTGATT--T--TTTT------AT-G-----AAGAAA---CATC-A-TCA--C--A-ATC-GT--AA-A---AACATTTTTA--CCGAA---AAA--ACGA--------------
gi|16 : aacaatattatgcattcttaagcta----ATATTATACAAT-TG-TGG-GC-----TGTTTAGC-------AGG--GA-G--A-CATCACAA-----ATT---ATC-AGG--TC--------AT-G--G--TA----GGGTTATC-GCC-A--AA----GGGTGC--CTAG-GT-G--T-CCAA-G----GAAAGGTGCCTGATAG-TA--A-TA---AC--CC-TACT-AAGACT-TGA--T-AA-T---T----------TGTCT-C--CC--T--G-CT-A-AGCAATC---TA-TAAT--A-----G---TTT-TA--T--T---AT---C--CT----GAA-GA-ATCT----A-AAA---G----A-----------A--------AA-A---AAAA-A----------T--TAAATAT-----CG-------A-C-AA-G----ATT--ggctga
gi|17 : gaaaatttatttgaattttttgctgaaaaatttgctacAA-AA-A-CT---AA-AAA-----------------------------AA-A---AAAA-A----------C--T--ATCT-----GG-------A-A-AA-C----A-----------------------TTTT------AT-G-----TA-AAA---TATC-A-TCA--C--C-ACT-GT--AA-C---AAT-TTTTT---tcatgaagaaaattgaaccgtttcagttaacattatttcaatatctatattttttttcattt
gi|17 : ttT------T--CT-GC---GCA-A--TTTATC--ATT-T-AAAGG----GAGATGACACAGTTGTCACC--C-------TGAG--------CATCACAA-ATTATC-TCCC-TTCAC-ATGAC--CA--GCC-CT-A-G-ACCAATGAAAATGACTG-T-G--TTATTCTGA-AGGATAGTAAatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttctgcgcaatttatcatttaaagggagatgacacagttgtcaccctgagcatcacaaattatctcccttcacatgaccagccctagaccaatgaaaatgactgtgttattctgaaggatagtaat
gi|18 : ttaaaaactaaaaaaaaaaaaactatctggaaaacattttatgtaaaatatcatcaccactgtaacaattttttatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnATA-T----ACATTATACAAT-TA-TGG-AC-----TGTTTAGCCGGTGCCAGG--GA-G--A-CATAAAAA-----ATT---ATC-AGG--TC--------GT-A--G--TG----GGGTTATC-ACC-C--GA----GGAAGC----AT-GT-G---------A----A--------------A-TG--A-TGTC-TC--CC-TGCT-AA-------A--C-AG-T---C---CA--TAAT-----------------------ACA---------TAAT--AATGTAG---TTG-TA--T--T---AT---C--CT-----AA-AA-AT---------------------------------------------------------------C--T--ATCT-----TG-------A-A-CA-T----GTT--TC-TTGACTTTA-TTCT--TTTT------AT-G-----TA-t
gi|19 : tacatgtatatatagatcgagtgacagtcagtactcaaactacttagtatgtaaaattATGAG-CAAATAACACAACGTC--AAACTG---TAAACA-TTTCTGCA------A--------------GTGTT------TTTCT-GCTCTGTC-A--TT-ATC--ATC-T-ACAGGTTCGGAGACAACACAGTTGTCACCCTCC-GCACGTGAGG-----GACATCACGA-ATTATC-TCCCTTTCACTGTGAC--CA--GCC-CTGA-T-ACCAATGAAAATGACTG-T-A--TTATTCTAA-AGG-TAATtgtctttactaaaaacg
gi|2 : aataggatAATATACAAT-TA-TGA-AC-----TGTTTAGC-------AGG--GAAG--A-CATCACAA-----ATT---ATC-AG---TC--------AA-A--G--TA----GG-TTGTC--CC-C--GA----GGGCGC--CTAT-GT-GAGCGCCGA-G----G--------------G-TG--A-TA---ATAACC-TGCT-AAGCCC-TGA--T-AA-T---T---TC--TGATGTCTCC--CC--T--G-CT---AACAGTC---CATTAAT--A-----G---TTT-TA--T--T---ATTA-T--CC----GAA-G--ATCTATAAA-AAA---A----TCG---------A--------GG-A---AAAA-A----------A--T--ATCT-----TG-------A-A-
gi|2 : ggcttcatcaaagcacattaaaacagaatgcaggtaaacaggctgaaatttaactgtagattctgttcccaacaaattaagtaaaccacagaacgtcaagcagtttacttgtcaaggacctactgtagactgtcaaagacatgttcacatattttctgcagaactgttaacctgtgttgtgttatctattgagcaagatgttcagtcgaaca--T---AT---C--TT----GAA-----TCTCTAAA-AAA---G----T-----------A--------AA-ATAAAAAA-A----------A--A--AAAT-----TG-------A-A-AAAC----TTT--TC-TTGACTTGA-T--T--TTTTTTTAA-GT-G-----T--AAA---TGTCAA-TCA--A--GTATTGGT--AA-CCAGAAC-GTTTT---C-------tctctaaaaaagtaaaataaaaaaaaaaaattgaaaaacttttcttgacttgatttttttttaagtgtaaatgtcaatcaagtattggtaaccagaacgttttcttttacaaaaaaaggagtaaccagaagccttttcgaattatgacgtcatactaaga
gi|21 : ggcttcatcaaagcacattaaaacagaatgcaggtaaacaggctgaaatttaactgtagattctgttcccaacaaattaagtaaaccacagaacgtcaagcagtttacttgtcaaggacctactgtagactgtcaaagacatgttcacatattttctgcagaactgttaacctgtgttgtgttatctattgagcaagatgttcagtcgaacaaatatacaattatgaactgtttagcagggaagacatcacaaattatcagtcaaagtaggttgtccccgagggcgcctatgtgagcgccgagggtgataataacctgctaagccctgataatttctgatgtctcccctgctaacagtccattaatagttttattattatccgaagatctataaaaaaatcgaggaaaaaaa-AGAATGAGATATAGA-CAAAACATA--AAGC-G---TAAACA-TTGT-GTAGGTCTCAC-------------GTATT------T--CT-GC---ATC-A--TT-GTC--ATC-T-AAAGG----GAGATAACACAGTTGGTACC--CC-GCGCGTGAGGTA---CACATTACGA-ATTACT-ACTC-TTCCC-GTGAC--CA--ACC-CT-T-G-ACCAATTAAATTCAT---T-A--TTATCATGA-AGGATAATAAttttacaaaaaaaggagtaaccagaagccttttcgaattatgacgtcatactaaga
gi|23 : atATCA-AAGAC-AAACA--ACA-TATTTCTTATAATATACAAT-TA-TGG-AC-----TGTTTAGC-------AGG--GA-G--A-CATCACAA-----ATT---ATC-AGT--TC--------GT-A--G--TA----GAGTTATT-ACC-A--GA----GGGCGT--CTAT-GC-T--C-TCAA-G----G--------------A-TG--A-TG---AC--CC-TACT-AAATCC-CA---------------------------T-C--CC--T--G-CT-A-AACAGT
gi|24 : atGAATAGAATGAGCCGAA--ACACAACGTC--AATC-A---TAAAAA-TTTC-GCA------AC-------------GTGTT------T--CT-GT---GCC-A--TT-ATC--ATC-T-ACAAG----GAGACAACACAAGTATCACT--CC-GTGCGTGAGGCA---GACATCACGA-ATTGTA-TCCC-TTCAC-GTGAC--CA--GCC-CT-A-G-ACCAATAAAt
gi|25 : --G-CT-A-AACAGTC---CA-TAAT--T-----G----TA-TA--T--T---GT---CGACT----GGA-
gi|25 : cacagaactgtcaagcagttactgtcaaaggaactaactgtagaactgtcaaagacatgtcaaatattttctgcagaactattaacctgatgttgtgaactgagcatg----ACAATATACAAT-TA-TGG-AC-----TGTTTAGC-------
gi|26 : cacagaactgtcaagcagttactgtcaaaggaactaactgtagaactgtcaaagacatgtcaaatattttctgcagaactattaacctgatgttgtgaactgagcatgtccagtcg----ACAATATACAAT-TA-TGG-AC-----TGTTTAGC-------GGG--GA-G--A-CATCACAA-----ATT---ATC-AGG--TC--------AA-A--G--TA----GGGTTGTC-ACC-C--GA----GGGCG-----------------TGA-G----G--------------G-TGATA-TA---AC--CC-TACT-AAGACC-TGA--T-AA-T---T---T
gi|27 : tgttgtgaactgagcatgtccagtcgTT------T--CT-GC---TCT-G--TT--TC--ATC-TTAAAGG----GAGACAACACAGTTGTCACC--C----GCGCAAGGGA---GGCAACCTGA-ATTATT-TCCC-TTCAC-GTGAC--TA--GCCACT-A-G-ACCAATG-ATTTCACTG-C-AATTCATTTCGA-AGGATAATAA
gi|29 : aATAGT----AT--TATACACT-TA-TGG-ACATGACTGTTTAGT-------AGA--TA-G--A-CATCAAAATATATATT---ATC-AGG--TC--------GA-A--G--TA----GGGTTATC-ACC-C--GA----TGGCGC--ATA
gi|3 : attgcaatattatattacatttatcatgtaaaatTATTATACAACACACTGG-AC-----TGTTTAGCCC-----GGG--GA-CTTA-CATCACAA-----A-T---ATC-AAG--GG--------GA-A--GA-TA----GGGTTATC-ACC-C--GG----AGGGGC--CTAT-GCGG--C-CCGA-GCC--G--------------GTTG--A-TA---AC--CCTTAAT-AAGACC-TGACCT-AA-TCGCC---CG--AGTTTTCT-C--TC--CGGG-CT-A-ACTAGTC---CC-C--T--A-----GCTCCTT-TATCT--T---AT---C--CCCCTGGAA-GACATCTTA-AA-AAA---GATTTT-----------T--------TA-A---GATA-A----------T--T--ATCT-----TC-------A-ACAACC----ATT--TC-TTGACTTGA-T--TTGTTTT------ATGG-----TA-AAAAACCGTC-A-TCA--A----ATC-GT--AA-C---AAG-TTTTggg
gi|3 : -------------GTGTT------T--CT-GC---GCC-A--TT-ATC--ATC-T-ACAGG----GAGACTACACAGTTGTCACC--AA-GCGCGTGAGGGA---GACATCATGA-ATTATC-TCCC-TTCAC-GTGAC--CA--GCC-CT-G-G-ACCAATGAAAGTGACTG-TAA--TTATTCTAA-AGAATAATAActacaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgtttctgcgccattatcatctacagggagactacacagttgtcaccaagcgcgtgagggagacatcatgaattatctcccttcacgtgaccagccctggaccaatgaaagtgactgtaattattctaaagaataataa
gi|30 : tattatacaacacactggactgtttagcccggggacttacatcacaaatatcaaggggaagatagggttatcacccggaggggcctatgcggcccgagccggttgataacccttaataagacctgacctaatcgcccgagttttctctccgggctaactagtcccctagctcctttatcttatccccctggaagacatcttaaaaaagattttttaagataattatcttcaacaaccatttcttgacttgatttgttttatggtaaaaaaccgtcatcaaatcgtaacaagttttctacaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGTACATT-TA-TGG-AC-----TGTTTAGA-------AGA--GA-G--A-CATCACAA-----AT
gi|30 : cttgacttccaaaggaggaacaacatcttattcagttgTTAGAAGA-GAGACATCACAA--------ATA-TGTACATT-TA-TGG-AC-----TGTTTAGA-------AGA--GA-G--A-CATCACAA-----------ATC-GGG--TT--------GT-G--G--Tatgtacatttatggactgtttagaagagagacatcacaaatcgggttgtggt
gi|31 : cttgacttccaaaggaggaacaacatcttattcagttgtgtacatttatggactgt------T--CT-GC---GCC-A--TT-ATC--ATC-T-ACAGG----GAGACAACACAGTTGTCACC--CC-GCGCGTGAGGGA---GACATCACGA-ATTATC-TCCC-TTCAC-GTGAC--CA--GCC-CT-G-A-ATAAATGAAAATGACAG-T-A--TTATTCTAA-AGG
gi|33 : ---TTT-TA--T--T---CA---C--CT----GAA-TA-ACCC----A-AAA---G----T-----------T--------TT-A---AACA-A----------T--A--ATCTGCCAATG-------A-A-AA-C------T--TC-TTGAC-TGA-T--T--TTTTTAA---AT-G-----TA-AAA---TGTC-A-TCA--AAGA-ATC-GA--AA-C----AC-TTTTT---CT------AAA--AC
gi|34 : --A-----G---TTTGTA--T--C---AT---C---T----GAGTAA-ACCC---AA-A-----G----TTTTT-------A--------AA-T---A------------------T--ATCT-----TGCCAATGAA-A-AA-C----ATT---C-TTGACTTGA-T--T--TTTTTTAA--AT-G-----TA-AAA---TGTC-ATTCA--A--G-ATC-GA--AA-C---AAC-TTTTta
gi|35 : TT------T--CTTGC---ACT-GATTT-ATC--ATC-T-AAAGG----GAAGCAACACAGTTA-CACC--CA-ACGTGTGAGG-A---GACACCACGA-ATTATC-TCCC-TTCAC-GTGA---CA--GCC-CT-GTG-ACCAATGAAA
gi|36 : a-----TGTTT------------G--AA-G--A-TACCACAA-----GTT---GTT-GGG--TC--------CA-A--GGATA----AGGTTAGA-GCC-ATGGA----GTGGGC--TAAA-AC-A--C-CCAG-G----G--------------G-AT--A-TA---AC--CA-AACC-TAGACC-TGA--C-AA-C---T---TT--TGATGTC
gi|37 : TATACAGT-TA-TGG-AC-----TGTTTAGC-------AGG--GA-G--A-CATCACAA-----ATT---ATC-AGG--TCATTTAAATGA-A--G--T-----GGGTTTTC-ACA-A--GA----GGGCGC--CTA
gi|38 : atactttttttgtccacagtctgACAAGATC----ACAATATACAAT-TA-TGG-AC-----TGTTTAGC-------GGG--GA-G--G-CATCACAA-----ATT---ATC-AGG--TC--------AA-A--G--TA----GGGTTATC-ACC-C--GA----GGGCGC--CTA
gi|39 : gagttatctcagtgataACAGTTGTCACG--CC-ACACGTGAGGGA---GACATCACGA-ATTATC-TCCC-TTCAC-GTGAT--CA--GCC-CT-A-G-ACCAATGAAAATGACTG-T-A--TTATTCTAA-AGGATAATA
gi|4 : aT----ATAATG-ACAGA-TA-TGG-AC-----TGTT-AGC-------AGGTGGA-G--AGCATCACAA-----ATTCATATAGAGT--TC--------AA-A--A--TA----GGGTTGTC---C-C--GA----GGGCG------T-GA-G--T------G----G--------------G-TG--A-TATAAAC--CT-TACT-AAGACCTTGAT-T-AA-T---TATATGTTTGATTTCT-C--TCCAT--GACT-A-ACTAG-CAAGCA-TGAG--A-------------TA-----T---AT------CT----AAA-G---TC-----A-TAA---G----G-----------A--------AA-C---AAAA-A----------A--T--ATCT-----TG-------A-A-A
gi|4 : agatttaaggtcacaggctcatcaaagccacccataaattcagaatgagtgaacaggctctctcgaagaactattataatgaactgtagatactgtcacaaacacaataaagttaaaaccacagaactgtcaagcagttactgtcaaaaggaatatcacgtctatactgtagagcatgtcaaagacactgttcaaaatatttttcttgacatgaactattaatcctatgttgtcactacttgagcatggatccagtgcggatcta--T---AT---C--TT----GAA----ATCT---AA-AAA---G----T-----------A--------AT-A---AAAA-A--------------------------G-------A-A-AA-CAAAAATC--TC-TTGAtctaaaaagtaataaaaaagaaaacaaaaatctcttgaaaaaacttttcc
gi|40 : agatttaaggtcacaggctcatcaaagccacccataaattcagaatgagtgaacaggctctctcgaagaactattataatgaactgtagatactgtcacaaacacaataaagttaaaaccacagaactgtcaagcagttactgtcaaaaggaatatcacgtctatactgtagagcatgtcaaagacactgttcaaaatatttttcttgacatgaactattaatcctatgttgtcactacttgagcatggatccagtgcggatctatataatgacagatatggactgttagcaggtggagagcatcacaaattcatatagagttcaaaatagggttgtcccgagggcgtgagtgggtgatataaaccttactaagaccttgattaattatatgtttgatttctctccatgactaactagcaagcatgagatatatctaaagtcataaggaaacaaaaaaACAA-----ATT---ATC-AGG--TT--------AT-ATAGC-TA----GGGTTCTC-ACA-T--TA----GAGCGC--CTAT-GC-G--C-CCAA-G----G----------------------TA----------TA-T-AAGG---TAA--TTAA-T---T---TG--TGATGTCT-T--CC--T--G-CT-A-AACAGTC---aaaaacttttcc
gi|41 : aACAGTTTTCACT--C--GCGCGTGAGGGA---GACAT-ACGA-ATTATC-TCCC-TTCAC-GTGAC--CA--GCC-CT-G-G-ACCTATGAAAATGAGTG-T-A--TTATTCTAA-AGGATAATA
gi|42 : ACAA-----ATT---ATC-AGG--TT--------AT-ATAGC-TA----GGGTTCTC-AACAT--TA----GAGCGC---TAT-GC-G--C-CCAA-G----G----------------------TA----------TA-T-AAG-----GAATT-AA-T---T---TG--TGATGTTC-T--TC--T--G-CT-A-AAc
gi|43 : tcta----ATATTATATAAT-TA-GGG-AT-----GGTTTATC-------GGG--GA-G--G-CATCACAA-----ATT---ACC-AGG--AT--------TT-A--A--TA----AGGCTATac
gi|44 : caaaaatatcataatacaatgtacgtttgTC-T-AAAGG----GAGATAACACAATTGTCATC--CC-ACACGCGAGGGA---GACATCACAA-ATTGTC-TCTG-CTCAC-GTGAC--CA--GCC-CT-A-G-ACCTATGAAaa
gi|45 : GAGGGA---GACATCACGA-ATTATC-TCCC-TTTAC-GTGAC--CA--GCC-CT-A-G-ACCAATGAAAATGATTG-T-A--TTATTCTAA-AGGATAATAA
gi|46 : -AGAATGGAGCCGAAAACA-AAC-TC--AAGC-A---TAAAAAATTTC-GCA------AC-------------G-GTT------A--CT-G----GCC-A--TT-ATC--ATCTT-AAAGG----AA
gi|47 : aataaaat-A---AAAA-A----------C--T--ATCT-----TG-------A-A-AA-C----ATT--TC-TTGACT--G-T--C--TTTT------AT-G-----CA-AAA---CGCC-A-TCA--A--G-ATC-AT--AA-C---AAC-TTTTT---C-------c
gi|49 : -A--G--TA----GGGTTATC-ACC-C--GA----GGACACAATAATAGTAG--T-CTCT-G----G--------------G-TG--A-TA---AC--CC-TAAT-AAGACC-AGA--C-AA-T---T---tacta
gi|5 : tAATATACAAT-TA-TGG-AC-----TGTT-AGC-------GGC--GA-GG-A-CATCACAT-----ATT---ATC-AGG--TC--------AA-G--G--TA----GGGTTATC-ACC-G--GA----GCG-GC--CTA--GC-G--C-CCGA-G----G--------------G-TG--A-TA---AC--C--TACT-AAGAC--TGA----AA-T---T---TG--TGAT-TCT-C--CC--T--G-CT-ATAACAGTC---CA-TAAT--A-----G---TTT-TA--T--T---AT---C--CT----GAA-GA-A-CT---AA-AAA---G----T-----------ATTTTTTTTAA-A---AA--------------T--T--ATCT--------------A-A-AA-C----ATT--TT-TTGACTTGA-T--T--TTTT------AT-G-----TA-AAA---CGTC-A-TCA--A--G-ATC-GT--AAAC---AAC-TTTTTCTAC-------AAA--NNNN--------------NN-----NNN--NN-NNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNN-N---NNNNNN-NNNN-NNN------NNNNNNNNNNNNNNNGTGTT------T--CT-GA---CCC-A--TT-ATC--ATC-T-ACAGG----GA-ACAACACA-TTGTCCCA--CCAGCGCGTGAGGGA---GACATCACGA-ATTATC-TCCC-TTCAC-GTGAC--CA--G-C-CT-G-G-A-CAAT-AAAGTGACTG-TAA--TTATT-TAA-AGGATAATAA
gi|50 : tactttattttttaaattcttttaactattgaaaca-TGG-AC-----TGTT------------GG--GA-G--A-AATCACAA-----AT-----TC-AAG--TC--------AT-A--T--TAAGGTGGGTTATC-ACC-A--GAGGCCGGGCGC--C
gi|51 : --ATC-T-AAAGG----GAGACAACACAGTTATCACC--CA-ACGTGTGAGGGA---GACACCACGA-ATTATC-TCCC-TT
gi|53 : CACAG-----GTC---ATT-AGAAAT---------GA-A--G--T-----GGGTTATC-ACA-T--TA----GGGCGC--CTAT-
gi|57 : aattgta-AAAGG----GAGACAACACAGTTGTCACC--CC-GCGC
gi|58 : taactaAATATACAAT-TA-TGG-AC-----TGTTTAGC-------GG
gi|6 : tc----ACAATATACAAT-TA-TGGCAC-----TGTTTAGC-------GGG---A-G--A-CATCA-AA-----ATT---ATC-AGG--TC--------GA-A--G--TA----GGGTTATC-A-C-C--GA----GGCCGC--CTAT-GC-G--C-ATGGCGCCTCG--------------G-TG--ACTA---AC--CC--ACTCAAGACC-TGA--TAAA-T---T---TG--TGATTTAT-C--CT--T--G-TT-A-A----------------------------CTT-TA--T--T---AT------CT----GAA-G--ATCT---------------------------------------A-A---AAAA-G----------T--T--TTTC-----TGC------A-A-AA-C-----TT--TC-TTGAC-TGA-T--T--TTTT------AT-G-----TA-GAA---CGTC-A-T-A--A--G-ATC-GCTAAA-C---AAG-TTCTT---CTACA---AAA--ACGA--------------
gi|7 : ctgtttaacgaaaaattatattcaattcaaattctttattgcgtaacacacatgtaattggttattcccatgatggaatctagataacaatatttaaaaaaatacgtaaaataacatgggcatagtgtttgATCAGGAGACAAAACA-CACAATACT----ATAATATACAAT-TA-TGG-AC-----TGTTTAGC-------AGG--GA-G--A-CATAACAA-----ATT---ATG-AGG--TT--------GT-A--G--TA----GGGTTATC-ACC-C--GA----GGGCAC--CTAT-GT-G--C-CTGA-G----G--------------G-AG--A-TA---AC--CC-TAAT-ACAACA-TGA--T-AA-T---T---TG--TGATGTCT-C--CC--T--G-CT-A-AACAGTC---TA-TAAC--A-----G---TTT-TA--T--T---AT---C--CT----GAA-GA-ATCT---AA-AAA---G----T-----------A--------AA-A---AACA-A----------C--T--ATCT-----TG-------A-A-AA-T----GCT--TC-TTGATTTGA-T--T--TTTT------AT-G-----TA-AAA---TGTC-A-TCA--A--G-ATT-GT--AA-C---AAT-TTTGT---C-------AAANNNNNN--------------NN-----NNN--NN-NNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNN-N---NNNNNN-NNNN-NNN------NN-------------NNNNN------N--NN-NN---NNN-N--NT-ATC--ATC-T-AAAGG----GAGACAACACAGTTGTTACC--CC-ATGCGTGAGGGA---GACATCACGA-ATTATC-TCCC-TTCAT-GTGAC--TA--GCT-CT-A-G-ACCTATGAAATCGACTG-T-A--TTATTCTGA-AGGATAATAAccgaaagatttcgattgtgatgtacaactaattaaagagggcaaaactttacgtcaacagtacaattgataatttcagtcaactttccttgcgttccagtagctcacgtgaggagac
gi|8 : AATATACAAT-TA-TGG-AC-----TGTTTAGC-------GGG--GA-G--A-CAGCACAA-----ATT---ATC-AGG--TC--------GA-A--G--TA----GGGTTATC-ACC-C--GA----GGGCGC--CTAG-AC-G--C-CCGA-G----G--------------G-TG--A-TA---TC--CT-TACT-AAGACC-TGA--T-AA-T---T---TG--TGATGTCT-C--CC--T--G-CT-A-AACAATC---CA-TAAT--A-----G---TTT-------------------------------A-ATCT---AA-AAA---G----T-----------A--------AA-A---AAAA-A-------------T--ATGC-----TG-------A-A-AA-C----ATT--TC-TTGACTTGA----T--TTTT------AT-GTATCTTA-AAA---CGTC-A-TCA--A--G-ATT-TT--AA-C---AAC-TTTTT---CTACAAAAAAA--ACAA--------------AA-----
gi|8 : catgaaaaaagggaaataaaaaaaaattacaaaagattattttgatcgttaagttccgaggtagacagtc-------------GTGTT------T--CC-GC---ACA-A--TT-ATC--ATC-T-ACATG----GAGACaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgtttccgcacaattatcatctacatggagactaatagaatccttcattagtac
gi|9 : catgaaaaaagggaaataaaaaaaaattacaaaagattattttgatcgttaagttccgaggtagacagtcaatatacaattatggactgtttagcggggagacagcacaaattatcaggtcgaagtagggttatcacccgagggcgcctagacgcccgagggtgatatccttactaagacctgataatttgtgatgtctccctgctaaacaatccataatagtttaatctaaaaagtaaaaaaaaatatgctgaaaacatttcttgacttgatttttatgtatcttaaaacgtcatcaagattttaacaactttttctacaaaaaaaacaaaaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTAATATACAAT-TA-TGG-AC-----TGTTTAGC-------GGT--GG-G--A-CTTTAC-A-----ATT---CTC-TGG------------GA-A--G--TT----AGGTTTTCTTCC-C--GA-----GGCGC--CTAT--C-G----CCGA-G----G--------------T-T-----TA---A---CC-TACT-AAGA-C-TGA--T--A-T---T---TGT-TGAT-TCT----CC--T--G-CTCA-AACAGTC---CA-T-AT--A-----G---TTT-T---T-------T---C--CT----GAA-GATATCT---AA-ATATTTT----T-----------A--------AA-A---ATTA---------------T--ATCT-----TG-------A-A-AA------ATT--TC-TTGACTTGA----T--TTTT------AT-G-----TA-AAA---CG-----TCA--A--G--TC-GT--TA-A---AAC-TTTTTCTAC-------AAA--ACGAGCCGGAAAGCTGCGAA-----TTG--TGACGTCAGAA-AGAATGAGGCAAATA--ACAACGTC--AAAC-AGTTTAA--A-TTTC-GAA------TC-------------GTGTT------T--CT-GC---GCT----TT-ATC--ATC-T--CAGG----GAGAAAACACAG-TGTCACC--CC-GCG-GTGA-GGA---GAC--TACGA-ATTAAT-TCCCTTTCAC-TTGACAGCA--G--------G-ACCAA-GAA--TGA----T-G--TTA-TCTAAGAGGATCATtaatagaatccttcattagtac
blockSeqs : G CA TC T TTTCTT A C C ATGAC CGGTGCCA TG A TT G TATAT CAT G AA ATTTAAATGA TA GA AGGT T ATG GGCC AAT A G AGCG C CCTC AAAGGTGCCTGATAG AT C TAA AA T C T CC T T CGC ATA TT A C TA ATTG A C T G AAG T TG ATGTAG G TC AC TAA AAA GA CCTG GAC ATAA T TTT TTGTTTTTTTTTA C TAG ACAATTGTCATC AA GCCAA CCAATGA T C A AAAA CT A TTC TG TTTTAC G TATCT G AAC A T TC AG T G TA A CAG A CTACAAAACGAGCCGGAAAGCTGCGAATTGTGACG T G GCATAAAA NN CA AGTT A T NNNNNNNNNNNNNNN NNNAAA TT N TCT A AT T TA T T TTCG CT CA TCG G T T T AG TT A G T C T T A AT G
blockSeqs : G G C T GT . . . . CCG . . G . . . . . GA TA A . . AT . C . A C . CC GT . . TC . . . . AT A . . . T G . . CGG . . . T G . . GCTC . . . . TA . . TAA CTAA . . TATTTTTTTT . TAA TATC . . C . . C . . . TT . TTTAA . G . . . . . . . . . . . . AAGGCGAAAAGCTTTTGATTGTA . N NNNNNNNN NN . TG . . GGTCTCAC . . T A . A T . . . . . T . . . T . . . . . . . T . A . .
blockSeqs : . T TC . . . . A . . . . . . . . AT . C . . T . C . . T . . G . . . . . . . T . . . . . G . . CAT . . . G . . . A . . . . . . . GAT TAA . . ATTTTT . . ACAT . . . . . . . . . T . TTAA . . . . . . . . . . . . . . CTACAAANNNNNNNNNNNNN . N NNNNNNNN CA . A . . ACT . . . . . A . . . . . . T . . . . . . . . . . . A . . . .
blockSeqs : G CT . . . . A . . . . . . . . GT . C . . T . A . . T . . G . . . . . . . . . . . . . G . . T . . . G . . . G . . . . . . . GA A . . TTTTTA . . AC . . . . . . . . . T . TAA . . . . . . . . . . . . . . CTACAAANNNNNNNNNNNNN . A GCCGAAAA AA . N . . GC . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . T . . . .
blockSeqs : T T . . . . A . . . . . . . . AT . . . . C . C . . C . . A . . . . . . . . . . . . . G . . A . . . A . . . G . . . . . . . GA A . . TCCA . . AC . . . . . . . . . T . TT . . . . . . . . . . . . . . CAAANNNNNNNNNNNNNNN . A NNNNNNNN CA . N . . NN . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . T . . . .
blockSeqs : . . . . . . A . . . . . . . . GT . . . . A . C . . C . . G . . . . . . . . . . . . . G . . T . . . G . . . T . . . . . . . CA A . . TCGA . . AC . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . CTATAAAATNNNNNN . A NNNNNNNN NN . G . . NN . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . A . . . .
blockSeqs : . . . . A . . . . . . . . AA . . . . C . C . . C . . A . . . . . . . . . . . . . G . . A . . . G . . . A . . . . . . . GA A . . GTA . . AT . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . N CAAATAA NN . A . . AC . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . A . . . .
blockSeqs : . . . . A . . . . . . . . GT . . . . C . A . . T . . G . . . . . . . . . . . . . G . . T . . . G . . . T . . . . . . . GA A . . TC . . AC . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . N ATATAGA CA . A . . AC . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . T . . . .
blockSeqs : . . . . G . . . . . . . . AA . . . . A . C . . C . . G . . . . . . . . . . . . . T . . T . . . G . . . G . . . . . . . CA A . . TA . . AA . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . A GCAAATA C . N . . NN . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . T . . . .
blockSeqs : . . . . A . . . . . . . . GA . . . . C . T . . C . . G . . . . . . . . . . . . . G . . T . . . G . . . G . . . . . . . GA A . . TA . . AA . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . CCGAAA A . N . . TC . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . G . . . .
blockSeqs : . . . . A . . . . . . . . GA . . . . C . C . . T . . G . . . . . . . . . . . . . T . . T . . . G . . . G . . . . . . . GA A . . TA . . AT . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . A . . . .
blockSeqs : . . . . A . . . . . . . . GT . . . . C . C . . C . . G . . . . . . . . . . . . . G . . T . . . G . . . G . . . . . . . AA A . . AA . . AT . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . A . . . .
blockSeqs : . . . . A . . . . . . . . CA . . . . A . C . . C . . G . . . . . . . . . . . . . G . . T . . . G . . . G . . . . . . . AA A . . TA . . AA . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . A . . . .
blockSeqs : . . . . G . . . . . . . . AA . . . . C . C . . C . . G . . . . . . . . . . . . . T . . T . . . A . . . G . . . . . . . TA A . . TT . . AC . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . A . . . .
blockSeqs : . . . . A . . . . . . . . AA . . . . C . C . . C . . G . . . . . . . . . . . . . G . . T . . . G . . . G . . . . . . . GA A . . GA . . GT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . G . . . .
blockSeqs : . . . . G . . . . . . . . AT . . . . T . C . . . . . T . . . . . . . . . . . . . G . . T . . . . . . . G . . . . . . . GA A . . TA . . AC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . T . . . .
blockSeqs : . . . . G . . . . . . . . AT . . . . C . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . G A . . TA . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . G . . . . . . . . TT . . . . G . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . G . . . TA . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . G . . . . . . . . AA . . . . A . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . TA . . A . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . A . . . . . . . . AT . . . . T . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . A . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . G . . . . . . . . GA . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . G . . . . . . . . GA . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . GT . . . . C . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . GA . . . . C . . .
blockSeqs : . . . . . GA . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqCons : TT**** *** GN********* C** C*** GCNNAAAA **
originalCons : ATCAGAAGACGAAACA-CACAATANT----ATAATATACAAT-TA-TGG-AC-----TGTTTAGC-------GGG--GA-G--A-CATCACAA-----ATT---ATC-AGG--TC--------GN-A--G--TA----GGGTTATC-ACC-C--GA----GGGCGC--CTAT-GC-G--C-CCGA-G----G--------------G-TG--A-TA---AC--CC-TACT-AAGACC-TGA--T-AA-T---T---TG--TGATGTCT-C--CC--T--G-CT-A-AACAGTC---CA-TAAT--A-----G---TTT-TA--T--T---AT---C--CT----GAA-GA-ATCT---AA-AAA---G----T-----------A--------AA-A---AAAA-A----------C--T--ATCT-----TG-------A-A-AA-C----ATT--TC-TTGACTTGA-T--T--TTTT------AT-G-----TA-AAA---CGTC-A-TCA--A--G-ATC-GT--AA-C---AAC-TTTTT---C-------AAA--ACGA--------------AA-----TCG--TG-CGTCAGAA-AGAATGAGGCANANAACACAACGTC--AAGC-G---TAAACA-TTTC-GCA------AC-------------GTGTT------T--CT-GC---GCC-A--TT-ATC--ATC-T-AAAGG----GAGACAACACAGTTGTCACC--CC-GCGCGTGAGGGA---GACATCACGA-ATTATC-TCCC-TTCAC-GTGAC--CA--GCC-CT-A-G-ACCAATGAAANTGACTG-T-A--TTATTCTGA-AGGATAATAA
finalCons : ATCAGAAGACGAAACA-CACAATATT----ATAATATACAAT-TA-TGG-AC-----TGTTTAGC-------GGG--GA-G--A-CATCACAA-----ATT---ATC-AGG--TCGN---------A--G--TA----GGGTTATC-ACC-C--GA----GGGCGCC--TAT-GC-GC---CCGA-G----G--------------G-TG--A-TA---AC--CC-TACT-AAGACC-TGA--T-AA-T---T---TG--TGATGTCT-C--CC--T--G-CT-A-AACAGTC---CA-TAAT--A-----G---TTT-TA--T--T---AT---C--CT----GAA-GA-ATCT---AA-AAA---G----T-----------A--------AA-A---AAAA-A----------C--T--ATCT-----TG-------A-A-AA-C----ATT--TC-TTGACTTGA-T--T--TTTT------AT-G-----TA-AAA---CGTC-A-TCA--A--G-ATC-GT--AA-C---AAC-TTTTT---C-------AAA--ACGA--------------AA-----TCG--TG-CGTCAGAA-AGAATGAGGCNNAAAACACAACGTC--AAGC-G---TAAACA-TTTC-GCA------AC-------------GTGTT------T--CT-GC---GCC-A--TT-ATC--ATC-T-AAAGG----GAGACAACACAGTTGTCACC--CC-GCGCGTGAGGGA---GACATCACGA-ATTATC-TCCC-TTCAC-GTGAC--CA--GCC-CT-A-G-ACCAATGAAANTGACTG-T-A--TTATTCTGA-AGGATAATAA
9 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|20 ): TGGAGGGGGGGGGGGTCCTTGCAGTTTTATAATACCATACAATAAAATATGCATATATTTGTTGTGTTCTGATTTGCTTGTCTGTCATTATTAAATTTTTTTCTGTTAAAAGCAAATTGCAAATTCAAATTCTTTATTGGCGTAACACATTAACATGTAATGGTTATTGTCCATGAGGAGAACTAATAACAATAATT
Unaligned ( gi|22 ): AATTTAAATAGTCCAGGCTCATCAAAGCACCATTAACAGAATGCAGGTAACAGGCTGAAATTTAACTGTAGTTCTGTCAAACAAATAAGTAAACCACAGAACTGTCAAGCAGTTACTGTCAAAGGAACTAACTGTAGAACTGTCAAAGACATGTCAAATATTTTCTGCAGAACTATTAACCTGA
Unaligned ( gi|28 ): TCTATTGGCGCAACACATCAACATAATGGTTATTGCCCATGAGTAAAACTAATAACAATATGTAAATGATAGATAGCATGATGCTTTTCTGTTTCACGTATATATTCAATTTGTATTTTGTAAATGTTTGTAC
Unaligned ( gi|32 ): TGGGGGGGGGGGGGTGATTTTTCCTTGCGGTTTATAATACATAGAATAAATATGCATATATTATGTTGGTTTTGATTGGCTTGTCTGTCATTATTGAATTTTATTCCAGTTAAAAGTAAATTGCA
Unaligned ( gi|48 ): AATAAGATATGCAAATATTTGTGGTTTTAATTGGCTTGTTTATTATTATTTGTTTTCATTTATAAACAAATTGT
Unaligned ( gi|52 ): ATGTTTCTGATATACCCCTGTCATCATGATGAGACTAATAGAGTCCTTCATTAGTACGAG
Unaligned ( gi|54 ): TTGGTAGGGGGATTAGTTTATAGTTTTTAGTAGATGGTTAGCAGATGA
Unaligned ( gi|55 ): TTTTCGCACAACTGTGAGAATAATAGAATCCTTCATTAGTAC
Unaligned ( gi|56 ): CGGTCATCAGAGAATAATATAATCCTTCATTAGTACGAGT
Alignments
lowQualScore : 11 11111 1111111111111111 2222222222222222222222222 111111111111111 222222 444444444444444444444444444444444444444444444444444 11111111 222222222222222222222
lowQualScore : 6 88 8 4 44444 22 1 33333 77777777 22 1 44 1 33333 444 1 22 77777777777 44 66 3333 1 3333 3333 222 1 4 6666 0 2 7777 2222222222222222 22 2 666 22 1 1 1 66 3 1 333 333 44 2 2 22 55555 1 1 1 1 555 2 22 777777777 1 22 22 333 555 22 3333 6666 9999 1 222 2222222222222222222222222 1 555 0 444444444444444 22 44444 7777777 1 1 3 4444 22 2 3333 22 222222 2 77777 2 333 2 2 33 33 2 2 33 2 333 2 555555555555555555555555555555555555555555555555555 4 1 44444444 33 55 0 99999 0 3 3 555555555555555555555 666666 22 4 555 2 99 4 22 1 1 3333 22 55 0 333 1 1 3 1 22 22 1 1 1 1 1 2 4 33 2
lowQualScore : . .. . . ..... .. . ..... ........ .. . .. . ..... ... . .. ........... .. .. .... . .... .... ... . . .... . . .... ................ .. . ... .. . . . .. . . ... ... .. . . .. ..... . . . . ... . .. ......... . .. .. ... ... .. .... .... .... . ... ......................... . ... . ............... .. ..... ....... . . . .... .. . .... .. ...... . ..... . ... . . .. .. . . .. . ... . ................................................... . . ........ .. .. . ..... . . . ..................... ...... .. . ... . .. . .. . . .... .. .. . ... . . . . .. .. . . . . . . . .. .
lowQualScore : 7 77 0 6 55555 66 6 88888 44444444 33 7 00 7 77777 222 5 11 11111111111 11 55 3333 6 6666 4444 444 9 0 3333 3 1 4444 6666666666666666 88 0 000 66 8 8 8 88 6 8 222 222 88 7 0 88 55555 9 9 9 6 888 2 99 000000000 9 66 44 000 444 44 7777 4444 3333 7 999 6666666666666666666666666 6 888 2 444444444444444 33 22222 1111111 7 7 8 0000 66 0 7777 99 444444 1 44444 1 999 2 2 11 11 2 2 11 2 999 2 555555555555555555555555555555555555555555555555555 0 4 88888888 55 00 6 88888 8 6 6 111111111111111111111 111111 99 2 888 1 22 2 88 9 8 9999 44 44 1 000 7 7 5 8 55 66 9 9 9 9 8 2 4 11 4
consensus : ATCAGAAGACGAAACA-CACAATATT----ATA--ATATACAATTATGG-AC-----TGTTTAGC-------GGG--GA-G--A-CATCACAA-----ATT---ATC-AGG--TC--------GN-A--G--TA----GGGTTATC-ACC-C--GA----GGGCGC--CTAT-GC-G--C-CCGA-G----G--------------G-TG--A-TA---AC--CC-TACT-AAGACC-TGA--T-AA-T---T---TG--TGATGTCT-C--CC--T--G-CT-A-AACAGTC---CA-TAAT--A-----G---TTT-TA--T--T---AT---C--CT----GAA-GA-ATCT---AA-AAA---G----T-----------A--------AA-A---AAAA-A----------C--T--ATCT-----TG-------A-A-AA-C----ATT--TC-TTGACTTGA-T--T--TTTT------AT-G-----TA-AAA---CGTC-A-TCA--A--G-ATC-GT--AA-C---AAC-TTTTT---C-------AAA--ACGA--------------AA-----TCG--TG-CGTCAGAA-AGAATGAGGCANANAACACAACGTC--AAGC-G---TAAACA-TTTC-GCA------AC-------------GTGTT------T--CT-GC---GCC-A--TT-ATC--ATC-T-AAAGG----GAGACAACACAGTTGTCACC--CC-GCGCGTGAGGGA---GACATCACGA-ATTATC-TCCC-TTCAC-GTGAC--CA--GCC-CT-A-G-ACCAATGAAANTGACTG-T-A--TTATTCTGA-AGGATAATAA
Reference ( family-1347 ) : ATCAGAAGACGAAACA-CACAATATT----ATA--ATATACAATTATGG-AC-----TGTTTAGC-------GGG--GA-G--A-CATCACAA-----ATT---ATC-AGG--TC--------GN-A--G--TA----GGGTTATC-ACC-C--GA----GGGCGC--CTAT-GC-G--C-CCGA-G----G--------------G-TG--A-TA---AC--CC-TACT-AAGACC-TGA--T-AA-T---T---TG--TGATGTCT-C--CC--T--G-CT-A-AACAGTC---CA-TAAT--A-----G---TTT-TA--T--T---AT---C--CT----GAA-GA-ATCT---AA-AAA---G----T-----------A--------AA-A---AAAA-A----------C--T--ATCT-----TG-------A-A-AA-C----ATT--TC-TTGACTTGA-T--T--TTTT------AT-G-----TA-AAA---CGTC-A-TCA--A--G-ATC-GT--AA-C---AAC-TTTTT---C-------AAA--ACGA--------------AA-----TCG--TG-CGTCAGAA-AGAATGAGGCNNAAAACACAACGTC--AAGC-G---TAAACA-TTTC-GCA------AC-------------GTGTT------T--CT-GC---GCC-A--TT-ATC--ATC-T-AAAGG----GAGACAACACAGTTGTCACC--CC-GCGCGTGAGGGA---GACATCACGA-ATTATC-TCCC-TTCAC-GTGAC--CA--GCC-CT-A-G-ACCAATGAAANTGACTG-T-A--TTATTCTGA-AGGATAATAA
gi|1 : ----ACA--ATATACAATTATGG-AC-----T-CTTATC-------GGA--------A-CATCACAA-----ATTT--AT--AAG--TC--------TTTA--G--TA----GGGTTATC-ACC-T--GA----GGG-------------------------------------------G-TG--A-TA---AC--CC-TACT-AAGACT-TGA--T-AA-T---T---TG--TGATGTCT-C--CC--T--G-AT-A-AACAGTC---CA-TAAT--A-----G---TTT-TA--T--T---AT---C--AT----GAA-GA-ATCT---AA-GAA---T----T-----------A--------AA-A---AAAA-T----------C--T--TTTT-----TG-------A-A-AA-C----ATT--TC-TTGACTTGA-T--T--TTTT------GT-G-----TA-AAT---TGTC-A-TCA--A--G-ATT-GG--AA-C---AAC-TTTTC---C-------
gi|1 : tcacagacaatacaaagtatgtcagtaatgtgggtgtg------AT-------------GTATT------T--CT-TC---GCT-AA-TT-AGC--ATC-T-AAAGG----GAGACAACACAGTTGTCACC--CT-GGGCATGAGGGA---GAGATCACAA-ATTATC-TCCC-TTCAC-ATGAC--CA--GCC-CT-A-G-AC-----AAATTGACTT-T-A--TTATTCTGA-AGGATGATtacaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgtgatgtatttcttcgctaattagcatctaaagggagacaacacagttgtcaccctgggcatgagggagagatcacaaattatctcccttcacatgaccagccctagacaaattgactttattattctgaaggatgattatattcaattatggactgtttatcagggtgatatcataattatcaggttgaagtagggttatcaaataagggtgcctatgcagtaagacatacaagtattcagttcagcgcccatgaaattcttacttttcctttgaaatagt
gi|1 : tcacagacaatacaaagtatgtcagtaatgtgggtgtgacaatatacaattatggactcttatcggaacatcacaaatttataagtctttagtagggttatcacctgaggggtgataaccctactaagacttgataatttgtgatgtctccctgataaacagtccataatagttttattatcatgaagaatctaagaattaaaaaaaatcttttttgaaaacatttcttgacttgattttttgtgtaaattgtcatcaagattggaacaacttttcctacaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgtg-TG--A-TA---AC--CC-TACT-TCAACC-TGA--T-AA-T---T----A--TGATATCA-C--CC--T--G-AT-A-AACAGTC---CA-TAATTGA-----A---TAT-AA--T--C---AT---C--CT----TCA-GA-A--T---AATAAA---G----T-----------C--------AA-tatattcaattatggactgtttatcagggtgatatcataattatcaggttgaagtagggttatcaaataagggtgcctatgcagtaagacatacaagtattcagttcagcgcccatgaaattcttacttttcctttgaaatagt
gi|1 : tcacagacaatacaaagtatgtcagtaatgtgggtgtgacaatatacaattatggactcttatcggaacatcacaaatttataagtctttagtagggttatcacctgaggggtgataaccctactaagacttgataatttgtgatgtctccctgataaacagtccataatagttttattatcatgaagaatctaagaattaaaaaaaatcttttttgaaaacatttcttgacttgattttttgtgtaaattgtcatcaagattggaacaacttttcctacaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgtgatgtatttcttcgctaattagcatctaaagggagacaacacagttgtcaccctgggcatgagggagagatcacaaattatctcccttcacatgaccagccctagacaaaATG----ATT--ATATTCAATTATGG-AC-----TGTTTATC-------AGG--GT-G--A-TATCATAA------TT---ATC-AGG--TT--------GA-A--G--TA----GGGTTATC-AAA-T--AA----GGGTGC--CTAT-GC-aataagggtgcctatgcagtaagacatacaagtattcagttcagcgcccatgaaattcttacttttcctttgaaatagt
gi|10 : tcacagacaatacaaagtatgtcagtaatgtgggtgtgacaatatacaattatggactcttatcggaacatcacaaatttataagtctttagtagggttatcacctgaggggtgataaccctactaagacttgataatttgtgatgtctccctgataaacagtccataatagttttattatcatgaagaatctaagaattaaaaaaaatcttttttgaaaacatttcttgacttgattttttgtgtaaattgtcatcaagattggaacaacttttcctacaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgtgatgtatttcttcgctaattagcatctaaagggagacaacacagttgtcaccctgggcatgagggagagatcacaaattatctcccttcacatgaccagccctagacaaattgactttattattctgaaggA---AC--CT-CACA-AAGACC-TGA--T-AA-T---T---TG--TGATGTTT-C--CC--A--G-CT-T-AACATTC---CA-TAAT--A-----G---TTT-TA--T--T---AA---C--CT----GAA-GA-ATCT---AA-AAC---G----T-----------A--------AA-A---GAAA-ACAATTGTCATC--T--ATCT-----TG-------A-A-CA-C----ATT--TC-TTGACTTGA-T--T--TTCTTTTTACAT-G-----TA-AAA---TGTC-A-TCATCA--G-ATC-AT--AA-C---AAA---------C-------AAT--ACGG--------------AA-----ACT--T----TCAGAA-AG----------------TCACGTC--AAGC-G---TAAACA-TTTT-GTA------GC-------------ATATT------T--CT-GT---GCTAA--TT-ATC--GTC-T-AAAGG----GAGACAACACAGTTGTCACC--CT-GAGCATGAGGAA---GACATCACGA-A-TATCTTCCC-TTCAC-GTGAT--Cagtaagacatacaagtattcagttcagcgcccatgaaattcttacttttcctttgaaatagt
gi|10 : TCGTCACC--CT-GAGCATGAGGGA---GATGTCACGA-ATTATC-TCCC-T-CAC-GTGAT--CA--AAC-CT-A-G-ACCAATGAAATTGACTC-T-A--TTATTCTGA-GGGGTAATAgtcaccctgagcatgagggagatgtcacgaattatctccctcacgtgatcaaacctagaccaatgaaattgactctattattctgaggggtaatatag
gi|11 : aacctcacaaagacctgataatttgtgatgtttcccagcttaacattccataatagttttattaacctgaagaatctaaaacgtaaaagaaaacaattgtcatctatcttgaacacatttcttgacttgattttctttttacatgtaaaatgtcatcatcagatcataacaaacaatacggaaactttcagaaagtcacgtcaagcgtaaacattttgtagcatatttctgtgctaattatcgtctaaagggagacaacacagttgtcaccctgagcatgaggaagacatcacgaatatcttcccttcacgtgaC--CTAT-GC-G--C-CCGA-G----G--------------G-TG--A-TA---AC--CC-TACT-AAGACC-TGA--T-TA-T---T---TG--TGATGTCT-C--CC--T--G-CT-A-AACAGTC---CA-TAAT--A-----G---TTT-TA--T--T---AT---C--CT----AAA-CA-ATCC---AA-AAA---G----TCC---------A--------AA-A---AAAA-A----------C--T--ATCT-----TG-------A-A-AA-T----ATT--TC-TCGACTCGA-T--T--TTTT------GT-G-----TA-AAT---CGTC-A-TCA--A--G-ATC-GT--AA-C---AAT-TTTTT---C-------tag
gi|11 : aTATT------T--CT-GC---ACT-AA-TT-ATC--ATC-T-AAAGG----GAGACAACACAGTTGTCACC--CC-GCACGTGAGGAA---GACATCGTGA-ATTATC-TCCC-TTCAA-GTGAC--CA--GCC-TT-A-G-ACCAATGAAATTGACTG-T-A--TTATTCTGA-AAGATAATtacaaatagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatttctgcactaattatcatctaaagggagacaacacagttgtcaccccgcacgtgaggaagacatcgtgaattatctcccttcaagtgaccagccttagaccaatgaaattgactgtattattctgaaagataat
gi|12 : acctatgcgcccgagggtgataaccctactaagacctgattatttgtgatgtctccctgctaaacagtccataatagttttattatcctaaacaatccaaaaagtccaaaaaaaaactatcttgaaaatatttctcgactcgattttttgtgtaaatcgtcatcaagatcgtaacaattttttctacaaatagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-TATC-AAGACC-TGA--T-AATT---T---TC--TGTTGTCG-CTACCA-TTGG-CT---AACA-TC---CA-TAAT--A-----T---TTT-TA--TACTTAAATAAAA--CT----GAA-G--ATCT----A-AAA---G----T-----------A--------AA-A---AAAATAT---------C--C--ATCT-----TG-------A-A-
gi|12 : cg-GA-ATCT---AA-AAA---GG---T-----------A--------AA-A---AAAA-A----------CATT--ATCT-----TG-------ATA-AA-C----ATTCTTCATTGACTTA-----T--TTTT------AT-GG----TA-AAA---CGTC-A-TAA--A--G-CT--GT--AA-C---AAC-----------------AAG--GCGA--------------AAAGCTTTTGATTG-TATCATAT-AGGATGAGGCATAAAACAC---GTTCAAAAC-A---TAAACA-TTTC-GCA------ACT------------ATGTT------T--AT-GCA--GCC-A--TTTATCTAATC-T-ACAGG----GA-ACAACACA--TGTTACC--CC-GCGCGTGATGGATCGGACAT-ACAAGATTACC-TCCC-TTTAC-AT-AC--CA---CC-CA-A-GCACC-ATGGAAATAGCT-------TTATTCTTA-A-GATAATAAtctaaaaaggtaaaaaaaaacattatcttgataaacattcttcattgacttatttttatggtaaaacgtcataaagctgtaacaacaaggcgaaaagcttttgattgtatcatataggatgaggcataaaacacgttcaaaacataaacatttcgcaactatgtttatgcagccatttatctaatctacagggaacaacacatgttaccccgcgcgtgatggatcggacatacaagattacctccctttacataccacccaagcaccatggaaatagctttattcttaagataataata
gi|13 : cgtatcaagacctgataattttctgttgtcgctaccattggctaacatccataatatttttatacttaaataaaactgaagatctaaaagtaaaaaaaatatccatcttATTATGG-AC-----TGTTTAAC-------AGG--GA-G--A-CATCACAG-----ATT---ATC-AGG--TT--------AT-A--A--TA----GTGATGTC-ACC-T--GA----GGGTGC--ta
gi|13 : -TA--T--T---AT---C--CT----GAA-GA-ATCT---AA-AAA---G----TTGTTTTTTTTTA--------AT---------------------C--C--ATCT-----TG-------A-A-AA-C----ATT--TC-TAGACTTGA-T--T--TTTTTT----AT-G-----TA-CAA---CATC-A-TCT--A--T-ATT-GT--AA-C---AAC-TTTTT---C-------TAT--A--A--------------AA-----TNN--NN-NNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNN-N---NNNNNN-NNNN-NNN------NN-------------NNNNN------N--NNNGC---ACT-AA-TT-ATC--ATC-T-AAAGG----GAGGCAACACAGTTGTCACC--CA-GTGCATGAGGTA---GACATCATGA-ATTGTT-TCCC-TTCAC-ATGAC--TATTGCC-CT-A-G-ACCAGTGAATTTGACTATT-A--TAATTCTGA-TGGATAATgttttataatattatcctgaagaatctaaaaagttgtttttttttaatccatcttgaaaacatttctagacttgattttttttatgtacaacatcatctatattgtaacaactttttctataaaatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngcactaattatcatctaaagggaggcaacacagttgtcacccagtgcatgaggtagacatcatgaattgtttcccttcacatgactattgccctagaccagtgaatttgactattataattctgatggataat
gi|14 : attatggactgtttaacagggagacatcacagattatcaggttataatagtgatgtcacctgagggtgcgttttataaTGTCT-T--CC--A--G-CT-A-AACA-TCG--TA-TAAT--A-----A---TTG-TA--T--T---AC---C--CT----AAA-CA-AACT---AA-AAC---G----T-----------A--------AACA---GAAA-A----------C--T--ATCT-----TG-------A-T-AA-C----AAT--TC-TTGACTTCA-T--C--TTTT------AT-G-----CA-AAA---CGTC-A------A--G-ATA-GT--AA-T---AAC-ATCTT---CTAC----AAA--NNNN--------------NN-----NNN--NN-NNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNN-N---NNNNNN-NNNN-NNN------NN-------------NNNNNNNNAAAT--CT-GC---TCC-A--TT-ATC--ATC-T-AAAAG----GAGAAAACACAGTTGTCGCC--CT-GTGCGTGATGGA---GACATCAATA-ATTAGT-TCCA-ATCAT-GTGAC--CA--GTC-CT-G-G-ACCAATTAAATTGACTG-T-A--TTATTTT
gi|15 : ttAATA-CAAGA-ATG----ATA--ATATACAATCATGG-AT-----TTTTTTGC-------AGG--GA-A--A-CATCACAA-----ATC---ATC-AAA--AT--------GT-A--G--TA----GGCTTATC-ACT-C--GA----TGGCGT--ATAT-GC-G--T-CCAA-G----G--------------G-TG--A-TA---TA--CC-TACT-AACAGC-TGA--T-AA-T---T---TG--TGGTGTAT-T--CC--T--G-CT-A-AACAGTC---CA-TAAT--A-----T---TTC-TA--T--T---AA---C--CT----GAA-GA-ATCT---AA-CAA---G----------------A--------AA-ATAGAAAA-A----------C--C--TTCT-----TG-------A-A-AA-C----ATT--TA-TTGATTTGATT--T--TTTT------AT-G-----AAGAAA---CATC-A-TCA--C--A-ATC-GT--AA-A---AACATTTTTA--CCGAA---AAA--ACGA--------------
gi|16 : aacaatattatgcattcttaagct----ATA--TTATACAATTGTGG-GC-----TGTTTAGC-------AGG--GA-G--A-CATCACAA-----ATT---ATC-AGG--TC--------AT-G--G--TA----GGGTTATC-GCC-A--AA----GGGTGC--CTAG-GT-G--T-CCAA-G----GAAAGGTGCCTGATAG-TA--A-TA---AC--CC-TACT-AAGACT-TGA--T-AA-T---T----------TGTCT-C--CC--T--G-CT-A-AGCAATC---TA-TAAT--A-----G---TTT-TA--T--T---AT---C--CT----GAA-GA-ATCT----A-AAA---G----A-----------A--------AA-A---AAAA-A----------T--TAAATAT-----CG-------A-C-AA-G----ATT--ggctga
gi|17 : gaaaatttatttgaattttttgctgaaaaatttgctacAA-AA-A-CT---AA-AAA-----------------------------AA-A---AAAA-A----------C--T--ATCT-----GG-------A-A-AA-C----A-----------------------TTTT------AT-G-----TA-AAA---TATC-A-TCA--C--C-ACT-GT--AA-C---AAT-TTTTT---tcatgaagaaaattgaaccgtttcagttaacattatttcaatatctatattttttttcattt
gi|17 : ttT------T--CT-GC---GCA-A--TTTATC--ATT-T-AAAGG----GAGATGACACAGTTGTCACC--C-------TGAG--------CATCACAA-ATTATC-TCCC-TTCAC-ATGAC--CA--GCC-CT-A-G-ACCAATGAAAATGACTG-T-G--TTATTCTGA-AGGATAGTAAatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttctgcgcaatttatcatttaaagggagatgacacagttgtcaccctgagcatcacaaattatctcccttcacatgaccagccctagaccaatgaaaatgactgtgttattctgaaggatagtaat
gi|18 : ttaaaaactaaaaaaaaaaaaactatctggaaaacattttatgtaaaatatcatcaccactgtaacaattttttatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnATAT-----ACA--TTATACAATTATGG-AC-----TGTTTAGCCGGTGCCAGG--GA-G--A-CATAAAAA-----ATT---ATC-AGG--TC--------GT-A--G--TG----GGGTTATC-ACC-C--GA----GGAAGC----AT-GT-G---------A----A--------------A-TG--A-TGTC-TC--CC-TGCT-AA-------A--C-AG-T---C---CA--TAAT-----------------------ACA---------TAAT--AATGTAG---TTG-TA--T--T---AT---C--CT-----AA-AA-AT---------------------------------------------------------------C--T--ATCT-----TG-------A-A-CA-T----GTT--TC-TTGACTTTA-TTCT--TTTT------AT-G-----TA-t
gi|19 : tacatgtatatatagatcgagtgacagtcagtactcaaactacttagtatgtaaaattATGAG-CAAATAACACAACGTC--AAACTG---TAAACA-TTTCTGCA------A--------------GTGTT------TTTCT-GCTCTGTC-A--TT-ATC--ATC-T-ACAGGTTCGGAGACAACACAGTTGTCACCCTCC-GCACGTGAGG-----GACATCACGA-ATTATC-TCCCTTTCACTGTGAC--CA--GCC-CTGA-T-ACCAATGAAAATGACTG-T-A--TTATTCTAA-AGG-TAATtgtctttactaaaaacg
gi|2 : aataggatA--ATATACAATTATGA-AC-----TGTTTAGC-------AGG--GAAG--A-CATCACAA-----ATT---ATC-AG---TC--------AA-A--G--TA----GG-TTGTC--CC-C--GA----GGGCGC--CTAT-GT-GAGCGCCGA-G----G--------------G-TG--A-TA---ATAACC-TGCT-AAGCCC-TGA--T-AA-T---T---TC--TGATGTCTCC--CC--T--G-CT---AACAGTC---CATTAAT--A-----G---TTT-TA--T--T---ATTA-T--CC----GAA-G--ATCTATAAA-AAA---A----TCG---------A--------GG-A---AAAA-A----------A--T--ATCT-----TG-------A-A-
gi|2 : ggcttcatcaaagcacattaaaacagaatgcaggtaaacaggctgaaatttaactgtagattctgttcccaacaaattaagtaaaccacagaacgtcaagcagtttacttgtcaaggacctactgtagactgtcaaagacatgttcacatattttctgcagaactgttaacctgtgttgtgttatctattgagcaagatgttcagtcgaaca--T---AT---C--TT----GAA-----TCTCTAAA-AAA---G----T-----------A--------AA-ATAAAAAA-A----------A--A--AAAT-----TG-------A-A-AAAC----TTT--TC-TTGACTTGA-T--T--TTTTTTTAA-GT-G-----T--AAA---TGTCAA-TCA--A--GTATTGGT--AA-CCAGAAC-GTTTT---C-------tctctaaaaaagtaaaataaaaaaaaaaaattgaaaaacttttcttgacttgatttttttttaagtgtaaatgtcaatcaagtattggtaaccagaacgttttcttttacaaaaaaaggagtaaccagaagccttttcgaattatgacgtcatactaaga
gi|21 : ggcttcatcaaagcacattaaaacagaatgcaggtaaacaggctgaaatttaactgtagattctgttcccaacaaattaagtaaaccacagaacgtcaagcagtttacttgtcaaggacctactgtagactgtcaaagacatgttcacatattttctgcagaactgttaacctgtgttgtgttatctattgagcaagatgttcagtcgaacaaatatacaattatgaactgtttagcagggaagacatcacaaattatcagtcaaagtaggttgtccccgagggcgcctatgtgagcgccgagggtgataataacctgctaagccctgataatttctgatgtctcccctgctaacagtccattaatagttttattattatccgaagatctataaaaaaatcgaggaaaaaaa-AGAATGAGATATAGA-CAAAACATA--AAGC-G---TAAACA-TTGT-GTAGGTCTCAC-------------GTATT------T--CT-GC---ATC-A--TT-GTC--ATC-T-AAAGG----GAGATAACACAGTTGGTACC--CC-GCGCGTGAGGTA---CACATTACGA-ATTACT-ACTC-TTCCC-GTGAC--CA--ACC-CT-T-G-ACCAATTAAATTCAT---T-A--TTATCATGA-AGGATAATAAttttacaaaaaaaggagtaaccagaagccttttcgaattatgacgtcatactaaga
gi|23 : atATCA-AAGAC-AAACA--ACA-TATTTCTTATA--ATATACAATTATGG-AC-----TGTTTAGC-------AGG--GA-G--A-CATCACAA-----ATT---ATC-AGT--TC--------GT-A--G--TA----GAGTTATT-ACC-A--GA----GGGCGT--CTAT-GC-T--C-TCAA-G----G--------------A-TG--A-TG---AC--CC-TACT-AAATCC-CA---------------------------T-C--CC--T--G-CT-A-AACAGT
gi|24 : atGAATAGAATGAGCCG--AAACACAACGTC--AATC-A---TAAAAA-TTTC-GCA------AC-------------GTGTT------T--CT-GT---GCC-A--TT-ATC--ATC-T-ACAAG----GAGACAACACAAGTATCACT--CC-GTGCGTGAGGCA---GACATCACGA-ATTGTA-TCCC-TTCAC-GTGAC--CA--GCC-CT-A-G-ACCAATAAAt
gi|25 : --G-CT-A-AACAGTC---CA-TAAT--T-----G----TA-TA--T--T---GT---CGACT----GGA-
gi|25 : cacagaactgtcaagcagttactgtcaaaggaactaactgtagaactgtcaaagacatgtcaaatattttctgcagaactattaacctgatgttgtgaactgagcatg----ACA--ATATACAATTATGG-AC-----TGTTTAGC-------
gi|26 : cacagaactgtcaagcagttactgtcaaaggaactaactgtagaactgtcaaagacatgtcaaatattttctgcagaactattaacctgatgttgtgaactgagcatgtccagtcg----ACA--ATATACAATTATGG-AC-----TGTTTAGC-------GGG--GA-G--A-CATCACAA-----ATT---ATC-AGG--TC--------AA-A--G--TA----GGGTTGTC-ACC-C--GA----GGGCG-----------------TGA-G----G--------------G-TGATA-TA---AC--CC-TACT-AAGACC-TGA--T-AA-T---T---T
gi|27 : tgttgtgaactgagcatgtccagtcgTT------T--CT-GC---TCT-G--TT--TC--ATC-TTAAAGG----GAGACAACACAGTTGTCACC--C----GCGCAAGGGA---GGCAACCTGA-ATTATT-TCCC-TTCAC-GTGAC--TA--GCCACT-A-G-ACCAATG-ATTTCACTG-C-AATTCATTTCGA-AGGATAATAA
gi|29 : aAATATA----GTA--TTATACACTTATGG-ACATGACTGTTTAGT-------AGA--TA-G--A-CATCAAAATATATATT---ATC-AGG--TC--------GA-A--G--TA----GGGTTATC-ACC-C--GA----TGGCGC--ATA
gi|3 : attgcaatattatattacatttatcatgtaaTATT----ATACAACACAC-----TGG-AC-----TGTTTAGCCC-----GGG--GA-CTTA-CATCACAA-----A-T---ATC-AAG--GG--------GA-A--GA-TA----GGGTTATC-ACC-C--GG----AGGGGC--CTAT-GCGG--C-CCGA-GCC--G--------------GTTG--A-TA---AC--CCTTAAT-AAGACC-TGACCT-AA-TCGCC---CG--AGTTTTCT-C--TC--CGGG-CT-A-ACTAGTC---CC-C--T--A-----GCTCCTT-TATCT--T---AT---C--CCCCTGGAA-GACATCTTA-AA-AAA---GATTTT-----------T--------TA-A---GATA-A----------T--T--ATCT-----TC-------A-ACAACC----ATT--TC-TTGACTTGA-T--TTGTTTT------ATGG-----TA-AAAAACCGTC-A-TCA--A----ATC-GT--AA-C---AAG-TTTTggg
gi|3 : -------------GTGTT------T--CT-GC---GCC-A--TT-ATC--ATC-T-ACAGG----GAGACTACACAGTTGTCACC--AA-GCGCGTGAGGGA---GACATCATGA-ATTATC-TCCC-TTCAC-GTGAC--CA--GCC-CT-G-G-ACCAATGAAAGTGACTG-TAA--TTATTCTAA-AGAATAATAActacaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgtttctgcgccattatcatctacagggagactacacagttgtcaccaagcgcgtgagggagacatcatgaattatctcccttcacgtgaccagccctggaccaatgaaagtgactgtaattattctaaagaataataa
gi|30 : tattatacaacacactggactgtttagcccggggacttacatcacaaatatcaaggggaagatagggttatcacccggaggggcctatgcggcccgagccggttgataacccttaataagacctgacctaatcgcccgagttttctctccgggctaactagtcccctagctcctttatcttatccccctggaagacatcttaaaaaagattttttaagataattatcttcaacaaccatttcttgacttgatttgttttatggtaaaaaaccgtcatcaaatcgtaacaagttttctacaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGTACATTTATGG-AC-----TGTTTAGA-------AGA--GA-G--A-CATCACAA-----AT
gi|30 : cttgacttccaaaggaggaacaacatcttattcagttgTTAGAAGA-GAGACATCACAA--------ATA---TGTACATTTATGG-AC-----TGTTTAGA-------AGA--GA-G--A-CATCACAA-----------ATC-GGG--TT--------GT-G--G--Tatgtacatttatggactgtttagaagagagacatcacaaatcgggttgtggt
gi|31 : cttgacttccaaaggaggaacaacatcttattcagttgtgtacatttatggactgt------T--CT-GC---GCC-A--TT-ATC--ATC-T-ACAGG----GAGACAACACAGTTGTCACC--CC-GCGCGTGAGGGA---GACATCACGA-ATTATC-TCCC-TTCAC-GTGAC--CA--GCC-CT-G-A-ATAAATGAAAATGACAG-T-A--TTATTCTAA-AGG
gi|33 : ---TTT-TA--T--T---CA---C--CT----GAA-TA-ACCC----A-AAA---G----T-----------T--------TT-A---AACA-A----------T--A--ATCTGCCAATG-------A-A-AA-C------T--TC-TTGAC-TGA-T--T--TTTTTAA---AT-G-----TA-AAA---TGTC-A-TCA--AAGA-ATC-GA--AA-C----AC-TTTTT---CT------AAA--AC
gi|34 : --A-----G---TTTGTA--T--C---AT---C---T----GAGTAA-ACCC---AA-A-----G----TTTTT-------A--------AA-T---A------------------T--ATCT-----TGCCAATGAA-A-AA-C----ATT---C-TTGACTTGA-T--T--TTTTTTAA--AT-G-----TA-AAA---TGTC-ATTCA--A--G-ATC-GA--AA-C---AAC-TTTTta
gi|35 : TT------T--CTTGC---ACT-GATTT-ATC--ATC-T-AAAGG----GAAGCAACACAGTTA-CACC--CA-ACGTGTGAGG-A---GACACCACGA-ATTATC-TCCC-TTCAC-GTGA---CA--GCC-CT-GTG-ACCAATGAAA
gi|36 : a-----TGTTT------------G--AA-G--A-TACCACAA-----GTT---GTT-GGG--TC--------CA-A--GGATA----AGGTTAGA-GCC-ATGGA----GTGGGC--TAAA-AC-A--C-CCAG-G----G--------------G-AT--A-TA---AC--CA-AACC-TAGACC-TGA--C-AA-C---T---TT--TGATGTC
gi|37 : TATACAGTTATGG-AC-----TGTTTAGC-------AGG--GA-G--A-CATCACAA-----ATT---ATC-AGG--TCATTTAAATGA-A--G--T-----GGGTTTTC-ACA-A--GA----GGGCGC--CTA
gi|38 : atactttttttgtccacagtctgACAAGATC----ACA--ATATACAATTATGG-AC-----TGTTTAGC-------GGG--GA-G--G-CATCACAA-----ATT---ATC-AGG--TC--------AA-A--G--TA----GGGTTATC-ACC-C--GA----GGGCGC--CTA
gi|39 : gagttatctcagtgataACAGTTGTCACG--CC-ACACGTGAGGGA---GACATCACGA-ATTATC-TCCC-TTCAC-GTGAT--CA--GCC-CT-A-G-ACCAATGAAAATGACTG-T-A--TTATTCTAA-AGGATAATA
gi|4 : aT----ATA--ATG-ACAGATATGG-AC-----TGTT-AGC-------AGGTGGA-G--AGCATCACAA-----ATTCATATAGAGT--TC--------AA-A--A--TA----GGGTTGTC---C-C--GA----GGGCG------T-GA-G--T------G----G--------------G-TG--A-TATAAAC--CT-TACT-AAGACCTTGAT-T-AA-T---TATATGTTTGATTTCT-C--TCCAT--GACT-A-ACTAG-CAAGCA-TGAG--A-------------TA-----T---AT------CT----AAA-G---TC-----A-TAA---G----G-----------A--------AA-C---AAAA-A----------A--T--ATCT-----TG-------A-A-A
gi|4 : agatttaaggtcacaggctcatcaaagccacccataaattcagaatgagtgaacaggctctctcgaagaactattataatgaactgtagatactgtcacaaacacaataaagttaaaaccacagaactgtcaagcagttactgtcaaaaggaatatcacgtctatactgtagagcatgtcaaagacactgttcaaaatatttttcttgacatgaactattaatcctatgttgtcactacttgagcatggatccagtgcggatcta--T---AT---C--TT----GAA----ATCT---AA-AAA---G----T-----------A--------AT-A---AAAA-A--------------------------G-------A-A-AA-CAAAAATC--TC-TTGAtctaaaaagtaataaaaaagaaaacaaaaatctcttgaaaaaacttttcc
gi|40 : agatttaaggtcacaggctcatcaaagccacccataaattcagaatgagtgaacaggctctctcgaagaactattataatgaactgtagatactgtcacaaacacaataaagttaaaaccacagaactgtcaagcagttactgtcaaaaggaatatcacgtctatactgtagagcatgtcaaagacactgttcaaaatatttttcttgacatgaactattaatcctatgttgtcactacttgagcatggatccagtgcggatctatataatgacagatatggactgttagcaggtggagagcatcacaaattcatatagagttcaaaatagggttgtcccgagggcgtgagtgggtgatataaaccttactaagaccttgattaattatatgtttgatttctctccatgactaactagcaagcatgagatatatctaaagtcataaggaaacaaaaaaACAA-----ATT---ATC-AGG--TT--------AT-ATAGC-TA----GGGTTCTC-ACA-T--TA----GAGCGC--CTAT-GC-G--C-CCAA-G----G----------------------TA----------TA-T-AAGG---TAA--TTAA-T---T---TG--TGATGTCT-T--CC--T--G-CT-A-AACAGTC---aaaaacttttcc
gi|41 : aACAGTTTTCACT--C--GCGCGTGAGGGA---GACAT-ACGA-ATTATC-TCCC-TTCAC-GTGAC--CA--GCC-CT-G-G-ACCTATGAAAATGAGTG-T-A--TTATTCTAA-AGGATAATA
gi|42 : ACAA-----ATT---ATC-AGG--TT--------AT-ATAGC-TA----GGGTTCTC-AACAT--TA----GAGCGC---TAT-GC-G--C-CCAA-G----G----------------------TA----------TA-T-AAG-----GAATT-AA-T---T---TG--TGATGTTC-T--TC--T--G-CT-A-AAc
gi|43 : tcta----ATA--TTATATAATTAGGG-AT-----GGTTTATC-------GGG--GA-G--G-CATCACAA-----ATT---ACC-AGG--AT--------TT-A--A--TA----AGGCTATac
gi|44 : caaaaatatcataatacaatgtacgtttgTC-T-AAAGG----GAGATAACACAATTGTCATC--CC-ACACGCGAGGGA---GACATCACAA-ATTGTC-TCTG-CTCAC-GTGAC--CA--GCC-CT-A-G-ACCTATGAAaa
gi|45 : GAGGGA---GACATCACGA-ATTATC-TCCC-TTTAC-GTGAC--CA--GCC-CT-A-G-ACCAATGAAAATGATTG-T-A--TTATTCTAA-AGGATAATAA
gi|46 : -AGAATGGAGCCGAAAACA-AAC-TC--AAGC-A---TAAAAAATTTC-GCA------AC-------------G-GTT------A--CT-G----GCC-A--TT-ATC--ATCTT-AAAGG----AA
gi|47 : aataaaat-A---AAAA-A----------C--T--ATCT-----TG-------A-A-AA-C----ATT--TC-TTGACT--G-T--C--TTTT------AT-G-----CA-AAA---CGCC-A-TCA--A--G-ATC-AT--AA-C---AAC-TTTTT---C-------c
gi|49 : -A--G--TA----GGGTTATC-ACC-C--GA----GGACACAATAATAGTAG--T-CTCT-G----G--------------G-TG--A-TA---AC--CC-TAAT-AAGACC-AGA--C-AA-T---T---tacta
gi|5 : tA--ATATACAATTATGG-AC-----TGTT-AGC-------GGC--GA-GG-A-CATCACAT-----ATT---ATC-AGG--TC--------AA-G--G--TA----GGGTTATC-ACC-G--GA----GCG-GC--CTA--GC-G--C-CCGA-G----G--------------G-TG--A-TA---AC--C--TACT-AAGAC--TGA----AA-T---T---TG--TGAT-TCT-C--CC--T--G-CT-ATAACAGTC---CA-TAAT--A-----G---TTT-TA--T--T---AT---C--CT----GAA-GA-A-CT---AA-AAA---G----T-----------ATTTTTTTTAA-A---AA--------------T--T--ATCT--------------A-A-AA-C----ATT--TT-TTGACTTGA-T--T--TTTT------AT-G-----TA-AAA---CGTC-A-TCA--A--G-ATC-GT--AAAC---AAC-TTTTTCTAC-------AAA--NNNN--------------NN-----NNN--NN-NNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNN-N---NNNNNN-NNNN-NNN------NNNNNNNNNNNNNNNGTGTT------T--CT-GA---CCC-A--TT-ATC--ATC-T-ACAGG----GA-ACAACACA-TTGTCCCA--CCAGCGCGTGAGGGA---GACATCACGA-ATTATC-TCCC-TTCAC-GTGAC--CA--G-C-CT-G-G-A-CAAT-AAAGTGACTG-TAA--TTATT-TAA-AGGATAATAA
gi|50 : tactttattttttaaattcttttaactattgaaacaTGG-AC-----TGTT------------GG--GA-G--A-AATCACAA-----AT-----TC-AAG--TC--------AT-A--T--TAAGGTGGGTTATC-ACC-A--GAGGCCGGGCGC--C
gi|51 : --ATC-T-AAAGG----GAGACAACACAGTTATCACC--CA-ACGTGTGAGGGA---GACACCACGA-ATTATC-TCCC-TT
gi|53 : CACAG-----GTC---ATT-AGAAAT---------GA-A--G--T-----GGGTTATC-ACA-T--TA----GGGCGC--CTAT-
gi|57 : aattgta-AAAGG----GAGACAACACAGTTGTCACC--CC-GCGC
gi|58 : taactaA--ATATACAATTATGG-AC-----TGTTTAGC-------GG
gi|6 : tc-CATAGTGTTTG--ACA--ATATACAATTATGGCAC-----TGTTTAGC-------GGG---A-G--A-CATCA-AA-----ATT---ATC-AGG--TC--------GA-A--G--TA----GGGTTATC-A-C-C--GA----GGCCGC--CTAT-GC-G--C-ATGGCGCCTCG--------------G-TG--ACTA---AC--CC--ACTCAAGACC-TGA--TAAA-T---T---TG--TGATTTAT-C--CT--T--G-TT-A-A----------------------------CTT-TA--T--T---AT------CT----GAA-G--ATCT---------------------------------------A-A---AAAA-G----------T--T--TTTC-----TGC------A-A-AA-C-----TT--TC-TTGAC-TGA-T--T--TTTT------AT-G-----TA-GAA---CGTC-A-T-A--A--G-ATC-GCTAAA-C---AAG-TTCTT---CTACA---AAA--ACGA--------------
gi|7 : ctgtttaacgaaaaattatattcaattcaaattctttattgcgtaacacacatgtaattggttattcccatgatggaatctagataacaatatttaaaaaaatacgtaaaataacatgggATCAGGAGACAAAACA-CACAATACT----ATA--ATATACAATTATGG-AC-----TGTTTAGC-------AGG--GA-G--A-CATAACAA-----ATT---ATG-AGG--TT--------GT-A--G--TA----GGGTTATC-ACC-C--GA----GGGCAC--CTAT-GT-G--C-CTGA-G----G--------------G-AG--A-TA---AC--CC-TAAT-ACAACA-TGA--T-AA-T---T---TG--TGATGTCT-C--CC--T--G-CT-A-AACAGTC---TA-TAAC--A-----G---TTT-TA--T--T---AT---C--CT----GAA-GA-ATCT---AA-AAA---G----T-----------A--------AA-A---AACA-A----------C--T--ATCT-----TG-------A-A-AA-T----GCT--TC-TTGATTTGA-T--T--TTTT------AT-G-----TA-AAA---TGTC-A-TCA--A--G-ATT-GT--AA-C---AAT-TTTGT---C-------AAANNNNNN--------------NN-----NNN--NN-NNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNN-N---NNNNNN-NNNN-NNN------NN-------------NNNNN------N--NN-NN---NNN-N--NT-ATC--ATC-T-AAAGG----GAGACAACACAGTTGTTACC--CC-ATGCGTGAGGGA---GACATCACGA-ATTATC-TCCC-TTCAT-GTGAC--TA--GCT-CT-A-G-ACCTATGAAATCGACTG-T-A--TTATTCTGA-AGGATAATAAccgaaagatttcgattgtgatgtacaactaattaaagagggcaaaactttacgtcaacagtacaattgataatttcagtcaactttccttgcgttccagtagctcacgtgaggagac
gi|8 : A--ATATACAATTATGG-AC-----TGTTTAGC-------GGG--GA-G--A-CAGCACAA-----ATT---ATC-AGG--TC--------GA-A--G--TA----GGGTTATC-ACC-C--GA----GGGCGC--CTAG-AC-G--C-CCGA-G----G--------------G-TG--A-TA---TC--CT-TACT-AAGACC-TGA--T-AA-T---T---TG--TGATGTCT-C--CC--T--G-CT-A-AACAATC---CA-TAAT--A-----G---TTT-------------------------------A-ATCT---AA-AAA---G----T-----------A--------AA-A---AAAA-A-------------T--ATGC-----TG-------A-A-AA-C----ATT--TC-TTGACTTGA----T--TTTT------AT-GTATCTTA-AAA---CGTC-A-TCA--A--G-ATT-TT--AA-C---AAC-TTTTT---CTACAAAAAAA--ACAA--------------AA-----
gi|8 : catgaaaaaagggaaataaaaaaaaattacaaaagattattttgatcgttaagttccgaggtagacagtc-------------GTGTT------T--CC-GC---ACA-A--TT-ATC--ATC-T-ACATG----GAGACaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgtttccgcacaattatcatctacatggagactaatagaatccttcattagtac
gi|9 : catgaaaaaagggaaataaaaaaaaattacaaaagattattttgatcgttaagttccgaggtagacagtcaatatacaattatggactgtttagcggggagacagcacaaattatcaggtcgaagtagggttatcacccgagggcgcctagacgcccgagggtgatatccttactaagacctgataatttgtgatgtctccctgctaaacaatccataatagtttaatctaaaaagtaaaaaaaaatatgctgaaaacatttcttgacttgatttttatgtatcttaaaacgtcatcaagattttaacaactttttctacaaaaaaaacaaaaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTA--ATATACAATTATGG-AC-----TGTTTAGC-------GGT--GG-G--A-CTTTAC-A-----ATT---CTC-TGG------------GA-A--G--TT----AGGTTTTCTTCC-C--GA-----GGCGC--CTAT--C-G----CCGA-G----G--------------T-T-----TA---A---CC-TACT-AAGA-C-TGA--T--A-T---T---TGT-TGAT-TCT----CC--T--G-CTCA-AACAGTC---CA-T-AT--A-----G---TTT-T---T-------T---C--CT----GAA-GATATCT---AA-ATATTTT----T-----------A--------AA-A---ATTA---------------T--ATCT-----TG-------A-A-AA------ATT--TC-TTGACTTGA----T--TTTT------AT-G-----TA-AAA---CG-----TCA--A--G--TC-GT--TA-A---AAC-TTTTTCTAC-------AAA--ACGAGCCGGAAAGCTGCGAA-----TTG--TGACGTCAGAA-AGAATGAGGCAAATA--ACAACGTC--AAAC-AGTTTAA--A-TTTC-GAA------TC-------------GTGTT------T--CT-GC---GCT----TT-ATC--ATC-T--CAGG----GAGAAAACACAG-TGTCACC--CC-GCG-GTGA-GGA---GAC--TACGA-ATTAAT-TCCCTTTCAC-TTGACAGCA--G--------G-ACCAA-GAA--TGA----T-G--TTA-TCTAAGAGGATCATtaatagaatccttcattagtac
9 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|20 ): TGGAGGGGGGGGGGGTCCTTGCAGTTTTATAATACCATACAATAAAATATGCATATATTTGTTGTGTTCTGATTTGCTTGTCTGTCATTATTAAATTTTTTTCTGTTAAAAGCAAATTGCAAATTCAAATTCTTTATTGGCGTAACACATTAACATGTAATGGTTATTGTCCATGAGGAGAACTAATAACAATAATT
Unaligned ( gi|22 ): AATTTAAATAGTCCAGGCTCATCAAAGCACCATTAACAGAATGCAGGTAACAGGCTGAAATTTAACTGTAGTTCTGTCAAACAAATAAGTAAACCACAGAACTGTCAAGCAGTTACTGTCAAAGGAACTAACTGTAGAACTGTCAAAGACATGTCAAATATTTTCTGCAGAACTATTAACCTGA
Unaligned ( gi|28 ): TCTATTGGCGCAACACATCAACATAATGGTTATTGCCCATGAGTAAAACTAATAACAATATGTAAATGATAGATAGCATGATGCTTTTCTGTTTCACGTATATATTCAATTTGTATTTTGTAAATGTTTGTAC
Unaligned ( gi|32 ): TGGGGGGGGGGGGGTGATTTTTCCTTGCGGTTTATAATACATAGAATAAATATGCATATATTATGTTGGTTTTGATTGGCTTGTCTGTCATTATTGAATTTTATTCCAGTTAAAAGTAAATTGCA
Unaligned ( gi|48 ): AATAAGATATGCAAATATTTGTGGTTTTAATTGGCTTGTTTATTATTATTTGTTTTCATTTATAAACAAATTGT
Unaligned ( gi|52 ): ATGTTTCTGATATACCCCTGTCATCATGATGAGACTAATAGAGTCCTTCATTAGTACGAG
Unaligned ( gi|54 ): TTGGTAGGGGGATTAGTTTATAGTTTTTAGTAGATGGTTAGCAGATGA
Unaligned ( gi|55 ): TTTTCGCACAACTGTGAGAATAATAGAATCCTTCATTAGTAC
Unaligned ( gi|56 ): CGGTCATCAGAGAATAATATAATCCTTCATTAGTACGAGT