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Reference ( gi|4 )            :                                                                                    TAGATTTACCTCCTTTTTAATACATCTAGCTGAAAACTC--TGGTATAATACCTTTGCATTTG--------AAT--T--C-----AG--AA-A-AAATG---G-----TATGCTTT-TTG-TTTGA-T-A----G-TCACT----AACATTTATCACAG-AAAGTCTGAT----------ACC--ATT----CTATT-A-------ACTAT--T--A--A----GAGAGAAATC-G---TG-A-AA-AA-ATCGCTA-T-CA-G--GGACTTTCGGCA-ATCGGGTTTCAGCCGTACTACATTTACCGCT
gi|5                          :                                                                                    TAGATTTACCT-CTTTTTGG------TAGCTGAAAACTT--TGGTTTAGTACCTTTGTATTTG--------AATTCT--C-----AG--AATA-AATTGAATG-----TATGATTT-CTA-TTTGA-TGG----G-TAACA----ATTAATTAACACGA-AAGGTTTGAT----------ACC--AGT----CTATT-G-------ACTGT--G--A--A----GAGAGAAATC-C---TGAA-AA-AA-ATCGCTA-T-TA-A--GGACTTTC-------CGG--------CGTACTACTTTTACCGC
gi|10                         :                                                                                    TAGATTTAC-TCCTTTTTGGTA------GCTGAAAACTC--GGGTTTAGTGCCTTCGTAATTG--------AAT--T--CT----AA--AA-A-AAAT----A-----TACGGTTC-TAG-TTTAATT-G----G-TAGCA----AAAAGTTATCAC-G-AAAG--------------------------------T-A-------AGTAT--T--A--A-------------C-----TG-A-AA-AA-TTCTCT--------------CTTCGGAA-TTCGGGTTTCGACCGTACTGCTTTTACC
gi|11                         :                                                                                   cTAGATTTACCGCTATTTGGA-------AGCTGAAAACT----GGTTCAGTAC-TGTACATTTGTCTTAGATAAT--T--CC----AG--AA-AAAAATG---T-----TTTATTTT-TAA-TTTAA---G----G-TCACA----ATCATTTATCAGGA-AAAGTGTTAT----------GCC--ATT----ATTTT-T-------ACTGT--T--A--A----AGGGGActta
gi|1                          :                                                                                    TAGATTTATCGC-TCTTTGGTA------GCTGAAAACTC--CGTTTCAGTGTATT--CAT-----------AAT--T--CGTAAAAA--AA-A-AAATG---------CATTTTTC-TTA-TCTGG-T-GT---G-TC-CA----AA--------ACAGTAAAAT--GAC----------ACC--ATT----CTGTTTACTTGTTTACTAG--T--A--A----GAGAGAAATA-C---TG-A-AACAA-ATC-CTA-T-TA-tacagtccctgaa
gi|19                         : atatatgtaagttataacaattttactatacttaatacttcgatcgatcgcatgaccagtgactgtgcaattataaagcatacTAGATTTACCGCGCTTTGG-------TAGCTGAAAACTC--TAGTTTTATACCTTCGTAaaccgggttattatcgct
gi|3                          :                                                                                    tacATTTACCGC--TTTTGATAGATAAAA---AAAACCCGCTGGTTCAGTACCCTCGTAACAG--------AAT--TT-C-----GG--GG-G-GGGGG---GGGGGTCATTCTTG-TTT-TTTGG-A-A-------CACTTGTAAACAGTTATCATGG-GGAGTTTAAT----------GCC--ATTAATTCTATG-T-------ACTAT--TTAA--A----AGGAAAAATT-GCTATA-A-AG-AA-AT-GCCA-TTCACGCTGGATTTTCGG--------GTTTCGGCCGTACTACATTTAat
gi|6                          :                                                                                                              TGGCTGAAAACTC--TGCTTTAGTGCCTTTGTAATTG--------CAT--T--CTCAG-AGGAAA-A-AAATT---G-----CATGATTTCTTG-TTTGA-T-GATGGG-TCACA----AATAGTTATCACGA-AAAGTTTGAT----------GCC--ATT----CTTTT-C-------ACTAC--T--A--A----GAGA-----C--------------A-ATTGCTT-T-AC-G--GGACTTTCAGCATACC-GGTTTTGGCCGTACTACATTTACCGCTt
gi|8                          :                                                                                                     cctttgtggTAGCTGAAAACTC--TGGTTCAGTGTCTTCGTAATAG--------AAT--T--CTT---AGA-AA-A-AAAAA---G-----CTTAATTC-TTG-TTTGA-T------G-TCACA----AACAGTCATCACAA-AAAAATTGAA----------ATC--ATT----TTGTT-C-------AGTAT--T--ACTAGCATGAGAGAGATCTT---TT-T-AA-AA-ATCGCTA-T-CC-A--GGACTCTCGt
gi|12                         :                                                                                                       tttttggTAGCTGAAAACGC--TGGTTCACTACCTACGTAATAG--------AAT--TTCC-----AG--AA-A-AAATcccatactaaattcattgata
gi|7                          :                                                                                                                  ttttggCTC--TGGT-TCATGTCTTAGTAATAA--------AAT--T--CCC---AG--AA-A-AA-TT---G-----TATAATTC-TTG-TTTGA-T-A----GGTTACA----AACAGTTAT-ATTG-AAAGTTTGAT----------GAC--ATT----CTGTT-C-------ATAAT--T--C--A----GAGAGATGTC-A---TG-ATAA-AA-ATCTCTA-T-TT-T--GGACGTTCGGCT-TTCGACATTCCGTCGTACTACATTTACCGCtcaattatcatgaacagatcctctgttaagaaagaaatccttaaaaaatcgctatccgggattttcgggtttcggccgtactacatttaccgctaac
gi|9                          :                                                                                                                                      ctagatttaccgc--------AAT--T--C-----CA--CA-A-AAATG---T-----T-TGATTT-TTAATCTAA---G----G-TCACA----ATCAGTTATCAGGA-AAAGTTTGAT----------GCC--ATT----CTATT-T-------ACTGTG-T--A--A----G-GAGATACC-T---TGAA-AA-AA-ATCGCTAGT-C--G--AAACGTTCGGCcgctta
gi|14                         :                                                                                            tagatttaccgctattcggtttcactgtgggactagatttaccgctgtaatagat--------AAT--TTCC-----AG--AC-A-AAGTT---G-----TATGGTTC-TTG-TTTGATT-G----G-TCACA----AACAGTTATCAGGG-GAAATTTGAT----------GCCATATT----CTATT-C-------ACTAT--C--A--A----AAGAGAATTC-tctctacat
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gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         A-AA-ATCGCTA-T--A-G--GAACTTGTGGCA-TTAGGGTTTCAGCCGTACTACATATACCACTtacc
3 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|15 ): ATATATGGAACTCAGTATGATTCACCTCTATCCATGTTTAATACTCAAACGAAGTCTTTGATCGATTACACGATCAGCGATCCTGTTCTGCAGGTTTCGGCTTTACAA
Unaligned ( gi|16 ): CATTAGATTTACCGCTTTTTGGTAGTTGGAAACACTGATTCAATATTTTAGTAATAGAATTTGGAGGAGTAAAAAAG
Unaligned ( gi|21 ): TCAGAAGGCATCAGGGAAGCTGTAGTCGAGCTGCAGGTAACATTTTGG






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Reference ( family-1323 )     :                                                                                    TAGATTTACCGC-CTTTTTGGTA----TAGCTG-AAAA-----CTCTGGTTCAGTGCC-----TTCGTAAT---NGA--ATT--C----AG--AAAAAAT-G---GTATGATT-CTT-G-TTTGA-T--G----G-T-CAC----AAACAGTTATCACGAAAAGTTTGATGC----------C--ATT----C--------TATTNACTAT--T--A--A----GAGAGA---AAT-C-CTG--A-AA-AA-ATCGCTAT----CCGGGACTTTCGGCATTCGGGTTTCGGCCGTACTACATTTACCGCT
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-1323 )     :                                                                                    TAGATTTACCGC-CTTTTTGGTA------GCTGAAAA-----CTCTGGTTC-AG---TGCC-----TTCGTAATAGA--ATT--C----AG--AAAAAATNG----TATGATT-CTT-G-TTTGA-T--G----G-T-CAC----AAACAGTTATCACGAAAAGTTTGATGC----------C--ATT----C--------TATTNACTAT--T--A--A----GAGAGA---AAT-C-CTG--A-AA-AA-ATCGCTAT----CCGGGACTTTCGGCATTCGGGTTTCGGCCGTACTACATTTACCGCT
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-1323 )     :                                                                                    TAGATTTACCGC-CTTTTTGGTA------GCTGAAAA-----CTCTGGTTC-AG---TACC-----TTCGTAATAGA--ATT--C----AG--AAAAAATTG----TATGATT-CTT-G-TTTGA-T--G----G-T-CAC----AAACAGTTATCACGAAAAGTTTGATGC----------C--ATT----C--------TATTNACTAT--T--A--A----GAGAGA---AAT-C-CTG--A-AA-AA-ATCGCTAT----CCGGGACTTTCGGCATTCGGGTTTCGGCCGTACTACATTTACCGCT
gi|1                          :                                                                                    TAGATTTATCGC--TCTTTGGTA------GCTGAAAA-----CTCCGTTTC-AG---TGTA-----TTCAT-----A--ATT--CGTAAAA--AAAAAAATG----CATTTTT-CTT-A-TCTGG-T--GT---G-T-CCA----AAACAGT-------AAAA---TGACAC----------C--ATT----CTGTTTACTTGTTTACTAG--T--A--A----GAGAGA---AAT-A-CTG--A-AACAA-ATC-CTATTAAACCGGG
gi|10                         : atatatgtaagttataacaattttactatacttaatacttcgatcgatcgcatgaccagtgactgtgcaattataaagcatacTAGATTTACT-C-CTTTTTGGTA------GCTGAAAA-----CTCGGGTTT-AG---TGCC-----TTCGTAATTGA--ATT--C----TA--AAAAAAATA----TACGGTT-CTA-G-TTTAATT--G----G-T-AGC----AAAAAGTTATCACGAAAG-----------------------------------------TAAGTAT--T--A--A-------------------CTG--A-AA-AA-TTCTCT-------------CTTCGGAATTCGGGTTTCGACCGTACTGCTTTTACCttattatcgct
gi|11                         :                                                                                   cTAGATTTACCGC--TATTTGGAA------GCTGAAAA-----CT--GGTTC-AG---TACTGTACATTTGTCTTAGATAATT--CC---AG--AAAAAAATG----TTTTATT-TTTAA-TTTAA----G----G-T-CAC----AATCATTTATCAGGAAAAGTGTTATGC----------C--ATT----A--------TTTTTACTGT--T--A--A----AGGGGATACAGTCC-CTG--A-Actta
gi|12                         :                                                                                                   TTTTGGTA------GCTGAAAA-----CGCTGGTTC-AC---TACC-----TACGTAATAGA--ATTTCC----AG--AAAAA------------ATT-C----------------------------------AATTATCATGAACAG---------------------ATC----C--------T-----CTGT--T--A--A----GAAAGA---AAT-C-CTT--A-AA-AA-ATCGCTAT----CCGGGATT-------TTCGGGTTTCGGCCGTACTACATTTACCGCT
gi|13                         :                                                                                                                                                                                       TTA----TATGATT-TTT-G-TTTGA-TA-G----G-T-CAC----AAACAGTTATCCCAAAAGGTTTGATGAAGGTTTAGGGT--ATT----C--------TATTACCTATAAT--A--A----GAGAGA---AAT-C-----------------GTTAT----CTTAGACTTTCGGC-------TTTTAACCG---TACATTTAACGCaac
gi|14                         :                                                                                                                                               tC-----TTCGTAATATA--ATTTCC----AG--ACAAAGTTG----TATGGTT-CTT-G-TTTGA-TT-G----G-T-CAC----AAACAGTTATCAGGGGAAATTTGATGC----------CATATT----C--------TATTCACTAT--C--A--A----AAGAGA---ATT-C-Cg
gi|16                         :                                                                 atctagaacggaaagcttaTAGATTTACCGC--TTTTTGGTA------GTTGGAAA-----CACTGATTC-AA---TATT-----TTAGTAATAGA--ATT--T----GG--A
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  catG--A-GA-AATATCGCTAT----CCGA-ACATTTAGCATTTGGATTTTGGTTGTACTACATCTACCGCTggagtaaaaaag
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           A-AA-ATCGCTAT----A-GGAACTTGTGGCATTAGGGTTTCAGCCGTACTACATATACCACTtacc
gi|19                         :                                                                                    TAGATTTACCGCGCTTT--GGTA------GCTGAAAA-----CTCTAGTTT-TA---TACC-----TTCGTAATtacc
gi|2                          :                                                                                 tacTAGATTTACCGT-GTTTT-GGTA------GCTGACAA-----CTCC----C-AG------------------------------------G--AAAAAATTC----TACGATT-CTT-G-TTTGG-TAAG----G-T-CAT----AAACAGTTATCACGAAAAGTTTTATGC----------C--ATT----C--------CATGTACTAT--T--A--A----CAGAGA---AAT-C-CTG--A-AA-AA-ATCACTAT----CCGGGACTTTCGGCA-------TTCGGTCATACTATATTTACCGCT
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                        aatctttggtcgattacacgatcagcaagcgtgttccggtctcggctttataaaacgtacTAT--T--C--A----GAGAGA---ATT-C-CTG--A-AA-AA-ATCTCTAT----CCGGG---TTCGGa
gi|3                          :                                                                                tgtaccaATTTACCGC---TTTTGATA------GATAAAAAAAACCCGCTGGTTC-AG---TACC-----CTCGTAACAGA--ATT--TCGG-GG--GGGGGGGGG----GGTCATT-CTT-G-TTTTT-T--G----G-AACACTTGTAAACAGTTATCATGGGGAGTTTAATGC----------C--ATTAATTC--------TATGTACTAT--TTAA--A----AGGAAA---AAT-TGCTATAA-AG-AA-AT-GCCAT----TC---ACGCTGGATTTTCGGGTTTCGGCCGTACTACATTTA
gi|4                          :                                                                                    TAGATTTACCTC-CTTTTTAATACATCTAGCTGAAAA-----CTCTGGTAT-AA---TACC-----TTTGCATTTGA--ATT--C----AG--AAAAAATGG----TATGCTT-TTT-G-TTTGA-T--A----G-T-CAC----TAACATTTATCACAGAAAGTCTGATAC----------C--ATT----C--------TATTAACTAT--T--A--A----GAGAGA---AAT-C-GTG--A-AA-AA-ATCGCTAT----CAGGGACTTTCGGCAATCGGGTTTCAGCCGTACTACATTTACCGCTt
gi|5                          :                                                                                    TAGATTTACC-T-CTTTTTGGTA------GCTGAAAA-----CTTTGGTTT-AG---TACC-----TTTGTATTTGA--ATT--CTC--AG--AATAAATTGAATGTATGATT-TCT-A-TTTGA-T--G----GGT-AAC----AATTAATTAACACGAAAGGTTTGATAC----------C--AGT----C--------TATTGACTGT--G--A--A----GAGAGA---AAT-C-CTGA-A-AA-AA-ATCGCTAT----TAAGGACTTTC------CGG--------CGTACTACTTTTACCGC
gi|6                          :                                                                                               C-CTTTGTGGTG------GCTGAAAA-----CTCTGCTTT-AG---TGCC-----TTTGTAATTGC--ATT--CTCAGAGGAAAAAAATTG----CATGATTTCTT-G-TTTGA-T--GATGGG-T-CAC----AAATAGTTATCACGAAAAGTTTGATGC----------C--ATT----C--------TTTTCACTAC--T--A--A----GAGA---------C------------A-ATTGCTTT----ACGGGACTTTCAGCATACCGGTTTTGGCCGTACTACATTTACCGCT
gi|7                          :                                                                                    TAGATTTACCGC-CT-----------------------------CTGGTTC-A----TGTC-----TTAGTAATAAA--ATT--CCC--AG--AAAAA-TTG----TATAATT-CTT-G-TTTGA-TA-G----G-T-TAC----AAACAGTTAT-ATTGAAAGTTTGATGA----------C--ATT----C--------TGTTCATAAT--T--C--A----GAGAGA---TGT-C-ATG--ATAA-AA-ATCTCTAT----TTTGGACGTTCGGCTTTCGACATTCCGTCGTACTACATTTACCGCt
gi|8                          :                                                                                                 cTTTTTGGTA------GCTGAAAA-----CTCTGGTTC-AG---TGTC-----TTCGTAATAGA--ATT--CTT--AGA-AAAAAAAAG----CTTAATT-CTT-G-TTTGA-T-------G-T-CAC----AAACAGTCATCACAAAAAAATTGAAAT----------C--ATT----T--------TGTTCAGTAT--T--ACTAGCATGAGAGA---GAT-CTTTT--T-AA-AA-ATCGCTAT----CCAGGACTCTCGcgctta
gi|9                          :                                                                                    TAGATTTACCGC--TATTCGGTT------TC-----A-----CTGTGGGACTAGATTTACC-----GCTGTAATAGATAATT--C----CA--CAAAAAT-G----TTTGATT-TTT-AATCTAA----G----G-T-CAC----AATCAGTTATCAGGAAAAGTTTGATGC----------C--ATT----C--------TATTTACTGTG-T--A--A----G-GAGA---TAC-C-TTGA-A-AA-AA-ATCGCTAG----TCGAAACGTTCGGCcccatactaaattcattgata


blockSeqs                     :                                                                                              G GC         CATCTA        AAACC         T  ATT    GTACA        T  TA   CTCAG    GA     ATTGAATG       T   A A     TGATGG    G A   TTGT                           AGGTTTAGGG AT   AATTC         T  A     AA TA CT GCAT      TAC   C GC  TA T  .  T        CCG               AT    G
blockSeqs                     :                                                                                              G C          .             .             .  .      .            A  TA   TCGG     A      AATA           .   . .     TAAG      . .   .                              .          .    A             A  T     G  .  .  .         .     . TT  A  .  .  .        CTT               AT    A
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Unaligned ( gi|21 ): TCAGAAGGCATCAGGGAAGCTGTAGTCGAGCTGCAGGTAACATTTTGG






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Reference ( family-1323 )     :                                                                                    TAGATTTACCGC-CTTTTTGGTA------GCTGAAAA-----CTCTGGTTC-AG---TACC-----TTCGTAATAGA--ATTCCC--AG-A----AAAAAT----TGTA-TGATT-CTT-G-TTTGA-T--G----GT-CAC----AAACAGTTATCACGAAAAGTTTGATGC----------C--ATT----C--------TATTNACTAT--T--A--A----GAGAGA---AAT-C-CTG--A-AA-AA-ATCGCTAT----CCGGGACTTTCGGCATTCGGGTTTCGGCCGTACTACATTTACCGCT
gi|1                          :                                                                                    TAGATTTATCGC--TCTTTGGTA------GCTGAAAA-----CTCCGTTTC-AG---TGTA-----TTCAT-----A--ATTCGTAAAA-A----AAAAAA----TGCA-TTTTT-CTT-A-TCTGG-T--GT---GT-CCA----AAACAGT-------AAAA---TGACAC----------C--ATT----CTGTTTACTTGTTTACTAG--T--A--A----GAGAGA---AAT-A-CTG--A-AACAA-ATC-CTATTAAACCGGG
gi|10                         : atatatgtaagttataacaattttactatacttaatacttcgatcgatcgcatgaccagtgactgtgcaattataaagcatacTAGATTTACT-C-CTTTTTGGTA------GCTGAAAA-----CTCGGGTTT-AG---TGCC-----TTCGTAATTGA--ATT-CT--AA-A----AAAAA-----TATA-CGGTT-CTA-G-TTTAATT--G----GT-AGC----AAAAAGTTATCACGAAAG-----------------------------------------TAAGTAT--T--A--A-------------------CTG--A-AA-AA-TTCTCT-------------CTTCGGAATTCGGGTTTCGACCGTACTGCTTTTACCttattatcgct
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gi|16                         :                                                                 atctagaacggaaagcttaTAGATTTACCGC--TTTTTGGTA------GTTGGAAA-----CACTGATTC-AA---TATT-----TTAGTAATAGA--ATT
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   catG--A-GA-AATATCGCTAT----CCGA-ACATTTAGCATTTGGATTTTGGTTGTACTACATCTACCGCTtggaggagtaaaaaag
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            A-AA-ATCGCTAT----A-GGAACTTGTGGCATTAGGGTTTCAGCCGTACTACATATACCACTtacc
gi|19                         :                                                                                    TAGATTTACCGCGCTTT--GGTA------GCTGAAAA-----CTCTAGTTT-TA---TACC-----TTCGTAATtacc
gi|2                          :                                                                                 tacTAGATTTACCGT-GTTTT-GGTA------GCTGACAA-----CTC----CC-AG----------------------------------G-A----AAAAAT----TCTA-CGATT-CTT-G-TTTGG-TAAG----GT-CAT----AAACAGTTATCACGAAAAGTTTTATGC----------C--ATT----C--------CATGTACTAT--T--A--A----CAGAGA---AAT-C-CTG--A-AA-AA-ATCACTAT----CCGGGACTTTCGGCA-------TTCGGTCATACTATATTTACCGCT
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                         aatctttggtcgattacacgatcagcaagcgtgttccggtctcggctttataaaacgtacTAT--T--C--A----GAGAGA---ATT-C-CTG--A-AA-AA-ATCTCTAT----CCGGG---TTCGGa
gi|3                          :                                                                                tgtaccaATTTACCGC---TTTTGATA------GATAAAAAAAACCCGCTGGTTC-AG---TACC-----CTCGTAACAGA--ATTTCG--GG-G----GGGGGG----GGGGGTCATT-CTT-G-TTTTT-T--G----GAACACTTGTAAACAGTTATCATGGGGAGTTTAATGC----------C--ATTAATTC--------TATGTACTAT--TTAA--A----AGGAAA---AAT-TGCTATAA-AG-AA-AT-GCCAT----TC---ACGCTGGATTTTCGGGTTTCGGCCGTACTACATTTA
gi|4                          :                                                                                    TAGATTTACCTC-CTTTTTAATACATCTAGCTGAAAA-----CTCTGGTAT-AA---TACC-----TTTGCATTTGA--ATTC----AG-A----AAAAAT----GGTA-TGCTT-TTT-G-TTTGA-T--A----GT-CAC----TAACATTTATCACAGAAAGTCTGATAC----------C--ATT----C--------TATTAACTAT--T--A--A----GAGAGA---AAT-C-GTG--A-AA-AA-ATCGCTAT----CAGGGACTTTCGGCAATCGGGTTTCAGCCGTACTACATTTACCGCTt
gi|5                          :                                                                                    TAGATTTACC-T-CTTTTTGGTA------GCTGAAAA-----CTTTGGTTT-AG---TACC-----TTTGTATTTGA--ATTCTC--AG-A----ATAAATTGAATGTA-TGATT-TCT-A-TTTGA-TG-G----GT-AAC----AATTAATTAACACGAAAGGTTTGATAC----------C--AGT----C--------TATTGACTGT--G--A--A----GAGAGA---AAT-C-CTGA-A-AA-AA-ATCGCTAT----TAAGGACTTTC------CGG--------CGTACTACTTTTACCGC
gi|6                          :                                                                                               C-CTTTGTGGTG------GCTGAAAA-----CTCTGCTTT-AG---TGCC-----TTTGTAATTGC--ATTCTC--AG-AGGAAAAAAAT----TGCA-TGATTTCTT-G-TTTGA-T--GATGGGT-CAC----AAATAGTTATCACGAAAAGTTTGATGC----------C--ATT----C--------TTTTCACTAC--T--A--A----GAGA---------C------------A-ATTGCTTT----ACGGGACTTTCAGCATACCGGTTTTGGCCGTACTACATTTACCGCT
gi|7                          :                                                                                    TAGATTTACCGC-CT-----------------------------CTGGTTC-A----TGTC-----TTAGTAATAAA--ATTCCC--AG-A----AAAA-T----TGTA-TAATT-CTT-G-TTTGA-TA-G----GT-TAC----AAACAGTTAT-ATTGAAAGTTTGATGA----------C--ATT----C--------TGTTCATAAT--T--C--A----GAGAGA---TGT-C-ATG--ATAA-AA-ATCTCTAT----TTTGGACGTTCGGCTTTCGACATTCCGTCGTACTACATTTACCGCt
gi|8                          :                                                                                                 cTTTTTGGTA------GCTGAAAA-----CTCTGGTTC-AG---TGTC-----TTCGTAATAGA--ATTCTT--AGAA----AAAAAA----AGCT-TAATT-CTT-G-TTTGA-T-------GT-CAC----AAACAGTCATCACAAAAAAATTGAAAT----------C--ATT----T--------TGTTCAGTAT--T--ACTAGCATGAGAGA---GAT-CTTTT--T-AA-AA-ATCGCTAT----CCAGGACTCTCGcgctta
gi|9                          :                                                                                    TAGATTTACCGC--TATTCGGTT------TC-----A-----CTGTGGGACTAGATTTACC-----GCTGTAATAGATAATTCC---AC-A----AAAA------TGTT-TGATT-TTT-AATCTAA----G----GT-CAC----AATCAGTTATCAGGAAAAGTTTGATGC----------C--ATT----C--------TATTTACTGTG-T--A--A----G-GAGA---TAC-C-TTGA-A-AA-AA-ATCGCTAG----TCGAAACGTTCGGCcccatactaaattcattgata
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|15 ): ATATATGGAACTCAGTATGATTCACCTCTATCCATGTTTAATACTCAAACGAAGTCTTTGATCGATTACACGATCAGCGATCCTGTTCTGCAGGTTTCGGCTTTACAA
Unaligned ( gi|21 ): TCAGAAGGCATCAGGGAAGCTGTAGTCGAGCTGCAGGTAACATTTTGG