lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      1111111                         11                     2222222222222        11111               111111                                               2222222                      11            111111111             1111     22222222       1    7777777777777777777                               111   111   111  11111       22222              111                         111                                                  111              111    444444444                   22222222222                2222        111111          111                     1111      1111111   4444444444    1111       1111     22222         1111   22     111111      111      11      7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777          11        111     8888888888888888888888888888888888888888   22       222222222          11            111  1   6666666666666666666666   11      11   3333333333333333          11    222222                 11  333333333333333333        1          1   111         4444444              111111                                11111     11111111111111            111111                                    1111111    111111111                                                                                111111    11                                                             111                     33333333333         222222           11                                   11     4444444444                      111                  11111     333333333                                                 1      11     2222222222222                                                                    11111111                                           444444444                                                            11                        3333333                                        
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           22    22 333   2 6666666   22  333 22 2 22 7777777   333 7777 8  1  3 22 1 44  333 4444    333  2 1111111111111   0    66666  777     5 5  444444  66        5      888             66  777 4   2222222   5 77     8888      33      77    555555555             2222     33333333   5   1 5  4444444444444444444     0  99 77     77 0    5  5 222   888   000  00000    77 66666    6 99      111  6 6    6  6 6   6      111     6 99   6  99  6         88  0   6  6  99     888   6 99       222    444444444 1       6  99  5  66666666666  99   99       8888   99   888888          000     9  77 8888   77 2222   5  8888888   8888888888    2222  5  5 8888     44444 5 5     2222   00 5   444444      111 6 6  44      8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888          88 8  0   444     3333333333333333333333333333333333333333   22       777777777  5  8    11            444  6   6666666666666666666666   11   8  11   3333333333333333  8       33    333333    8 0    88  8 44  777777777777777777   88 8 8   99 1   3   111 6   99  4444444     66 5  66 444444 88888 4     8   777    99  1   55555     77777777777777 3 3 7777   444444   3 88888   6    3 44   888  9999  8888888    000000000 3  3 3   99999   777 55  55   4          55     444 4 4     55 4 99  4 4     4 111111  4 11   7 3   8888     99       4  99  4   8888 4  4 4 4 4     55 111 4      4 6       6  66666666666   8     888888           99  8  4 1 4     4      777 4        00     3333333333       66         55  666     8  99 4   4  77777  4  000000000     4 4       8 0   55   4  777      4 4 55     2      11  55 2222222222222      4      4         4    4     4  6 4     4 4     4      88   3  33333333  6           3  66666  3 3        5 3     444444444    8888    3   44   3 77777 44       2 22     666 666666   00 2  55  22 4444  2 4444 5555555 7777  333       6666   333     33      
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ..    .. ...   . .......   ..  ... .. . .. .......   ... .... .  .  . .. . ..  ... ....    ...  . .............   .    .....  ...     . .  ......  ..        .      ...             ..  ... .   .......   . ..     ....      ..      ..    .........             ....     ........   .   . .  ...................     .  .. ..     .. .    .  . ...   ...   ...  .....    .. .....    . ..      ...  . .    .  . .   .      ...     . ..   .  ..  .         ..  .   .  .  ..     ...   . ..       ...    ......... .       .  ..  .  ...........  ..   ..       ....   ..   ......          ...     .  .. ....   .. ....   .  .......   ..........    ....  .  . ....     ..... . .     ....   .. .   ......      ... . .  ..      .........................................................................          .. .  .   ...     ........................................   ..       .........  .  .    ..            ...  .   ......................   ..   .  ..   ................  .       ..    ......    . .    ..  . ..  ..................   .. . .   .. .   .   ... .   ..  .......     .. .  .. ...... ..... .     .   ...    ..  .   .....     .............. . . ....   ......   . .....   .    . ..   ...  ....  .......    ......... .  . .   .....   ... ..  ..   .          ..     ... . .     .. . ..  . .     . ......  . ..   . .   ....     ..       .  ..  .   .... .  . . . .     .. ... .      . .       .  ...........   .     ......           ..  .  . . .     .      ... .        ..     ..........       ..         ..  ...     .  .. .   .  .....  .  .........     . .       . .   ..   .  ...      . . ..     .      ..  .. .............      .      .         .    .     .  . .     . .     .      ..   .  ........  .           .  .....  . .        . .     .........    ....    .   ..   . ..... ..       . ..     ... ......   .. .  ..  .. ....  . .... ....... ....  ...       ....   ...     ..      
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           88    88 555   0 5555555   88  555 88 0 88 2222222   555 0000 8  9  8 66 9 55  555 2222    777  4 9999999999999   1    00000  222     0 0  444444  99        0      888             99  888 4   4444444   7 99     0000      66      99    888888888             1111     00000000   7   4 7  7777777777777777777     7  11 99     99 1    7  7 666   666   000  99999    11 88888    7 22      777  7 7    7  7 7   7      777     7 22   7  22  7         11  3   7  7  22     333   7 22       777    888888888 0       7  22  2  55555555555  22   22       3333   22   333333          111     3  99 1111   99 1111   7  6666666   0000000000    1111  7  7 9999     33333 7 7     1111   33 7   666666      777 7 7  00      3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333          22 0  8   000     0000000000000000000000000000000000000000   00       888888888  6  0    88            000  0   2222222222222222222222   00   0  00   4444444444444444  0       66    000000    0 8    88  0 00  000000000000000000   88 0 2   22 7   3   777 7   22  8888888     99 0  11 666666 44444 0     0   000    55  1   66666     77777777777777 3 3 1111   777777   3 33333   7    3 66   222  5555  5555555    555555555 6  6 6   11111   000 55  55   0          55     666 0 0     55 0 55  0 0     0 555555  0 00   3 6   5555     55       0  55  0   5555 0  0 0 0 0     55 000 0      0 0       0  99999999999   0     222222           99  0  0 4 0     0      000 0        66     3333333333       11         55  555     0  55 0   0  00000  0  000000000     0 0       0 9   55   0  000      0 0 33     0      00  55 0000000000000      0      0         0    0     0  9 0     0 0     0      66   6  22222222  4           1  88888  1 1        2 3     888888888    5555    3   99   1 77777 22       1 99     111 444444   44 2  77  55 5555  1 5555 8888888 4444  777       6666   777     11      
consensus                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   NACCCCTG--TAAA--C---GCG-C-------GAT--CG---T--T-A--AC------GCG---G----AAGC-GA-T--C-GGCAA---C----GCGG---AT-C-C--A---TT---GAGTCATA--G--CCG--AAGTT-T-GA------TA--GCGGGTAA-GTTTTG---ATGTTATTTATGT--AT---C-AAC--G--C-TAT-A--TCTAG-T--GTAAAT--ATTTGC--ACGA----TA---TTAGTAGAGGAGG----GGCAT--T--A-TATG-AGA-C-CTAC-AT--T-----ACG-A-TACAACTAN-A--AGACG--TTATTC-CC-A--CAAC-T-GAT---GG-T-G-TAAA-TG----TAATT-T--AATTGA---CC-G-ATTT-GG-T-TAC-AAAATA---TGGAA-T--TTC-TT--AC-TGTTATGTCA-TTTATT-TT-TA--TCATG---TCC-C--ACTTTATTC-CAAAA-TCNA-ATTGATTTTAC-AA--ATCAA-----GA--T-GA--TAT--AAACTTT----ATA--TAC-----ATTAACAAAAAA--GTGTATTT--A-TCAGGG--T----ATA-TG-------AAT------N---TTTT----TT-CA-T--G-AAAAA-----T-G-TCAAA----GTAN-A-GGC----A-ATCGGC---A-A-CGC-AACAAAATTGTTTG-----TA------------AG---------TA----CAA-----------T-GCGAAGAAAGCG-TCGTACAACT-CA-ATAGAT---ACAAGA------------TGA--T--T---A-GAAATGGTCG---AAAAATCATTTTTG-A----TTTTGT-GACT-TGACAGACATTTT---AAAGCA-C--------------------TGG--TGC-TT--ATTT-CC-----AA--TG-AG-GGTCCTTA-CGTT------TAAA-GACGAC-TAT-A-CATATTTAA-NGGTG------ACA-TA-TTCTA--TTATG-TTG---A-CAA--CAA-----CTTTGT--T-CT--A-----AT-A---G-TTGTA-CGA---TCGC--ATGCAT-----CTCAA-G--------T-A-C-A-T----TGG-----GTTG-T-----ACG-ATCG-C--TTA--TTA--C-GT---C--GTTGC------C--G-AT-C-GCA-----TAA---A--TT--CAT-CAGAGAGATG--CAAAT-C-A-A-ATCGT--T-A--TT-T-CAAAA-T------TG-T--GGG-A-TAT----GATGT--ACACTTT-AG--AA-GAA----G-AT-C-A-A-TTGCA--A---C-ATTATA-AGAGTGAGAATT--------AN-CTC-ATCTA-----TTTGAAAAATTC-TTT-TT-CAT-CCAAT-AAAATG---T-GAAATTTT--ACTTA--TATAT-T-AGTGGCA--TGGTACGTT--TT---AGTGG-AA--A-TAT-CA-----AT-GGAAAA---T-TGAAA-G-AAAACAG-AAAAT--GAA-TT---TGTTCT-G-CGATAAAT-GCAAAA--GT--A-------------AAACCA-TACTAT-GAAATCTTA-TCAA-TTGCC-CCAT-AATCG-C-AAAAT-TCGTTA--AAC-AA--------ATNTGGAAAATAAG-AC----ATT-G-CCATTTTTCC-TCACC----TC---ATCTCCATGGAA-TACG-AAA-A-----A--TAAACAA-T--CCGCG---T------TGC-CG-ATC-GC-TT----CC-G----CG------T----TA---ACGATCG----CGC---GTTTA--CAGGGG
Reference ( gi|4 )            :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TACCCCTG--TAAA--C---GCG-C-------GAT--CG---T--T-A--AT------GCG---G----ATGC-GA-T--C-GTTAA---C----GCGG---AT-C-C--A---TC---GAGTCATA--G--CCA--AAGTT-T-GA------TA--GCGGGTAA-GTTTTG---ATGTTATTTATGT--AT---C-AAC--G--C-TAT-A--TCTAG-T--GTAAAT--ATTTGC--ACGA----TA---TTAGTAGAGGAGG----GGCAT--T--A-CATG-AGA-C-CTAC-AT-GT-----ATG-A-TACAACTAA-A--AGACG--TTATTC-CC-A--AAAC-T-GAT---AG-T-G-TAAA-TG----TAATT-T--AATTGA---CC-G-ATTT-GG-T-TAC-AAAATA---TGGAA-T--TTC-TT--AC-TGTTATGTCA-TTTATT-TT-TA--TCATG---TTC-C--ACTTTATTC-CAAAA-GCCA-ACTGATTTTAC-AA--ATCAA-----GG--T-GA--TAT--AAACTTT----ATA--TAC-----ATTAACAAAAAA--GTGTAATT--A-TCAGGG--T----ATA-TG-------AAT------T---TTTT----TT-CA-T--G-AAAAA-----T-G-TCAAA----GTAC-A-GGC----A-ATCGGC---A-A-CGT-AACAAA----TTT------TA------------A----------TA----CAA-----------C-GCAA---------TCGTACAACT-AA-ATAGAT---ACAAG-------------TGA--T--T---A-GATATGATTT---AAA--TCATTTT-G-A----TTTTGT-GACT-TGACAGACATTTT---AA-GCA-C--------------------TGG--TGC-TT--ATTA-CC-----AA--T--AG-GGTCCTTA-CGTT------TAAA-GACGAC-TAT-A-TATAACTAA-TTGTG------ACA-TA-TGCTA--TTATG-TTG---A-CAA--CA------TTTTGT--T-CT--A-----GT-A---G-TTGTA-CGA---TCGC--ATGCAT-----CTCAA-G--------T-A-C-A-T----TGG-----ATTG-T-----ACG-ATCG-C--TTA--TTA--T-GT---C--TTTGC------C--G-AT-C-GCA-----TAA---A--TT--CAT-CAGAGAGATG--CAAAT-C-A-A-ATCGT--T-A--TT-T-CAAAA-T------TG-T--GGG-A-TAT----GATGT--ACACTTT-AG--AA-GAA----G-AT-C-A-A-TTGCA--A---C-ATTATA-AAAGTGAGAGTT--------AT-CTC-ATCTA-----ATTGAAAAATTC-ATT-TT-CAT-CCAAT-AAAATG---T-GAAATTTT--ACTTAT-TATATAT-AGTGGCA--TGGTACGTT--TT---AGTGG-AA--A-TAT-CA-----AT-GG--AA---T-TGAAA-G-AAAACAG-AAAAT--GAA-TT---TGTTCT-G-CAATAAAT-GCAAAA--GT--A-------------AAACCA-TACTAT-GAAATCTTA-TCAA-TTGCC-CCGT-AATCG-C-AAAAT-TCGTTA--AAC-AA--------ATATGGAAAATAAG-AT----ATT-G-CCATTTTTCC-TCACC----T----ATCTCCATGGAA-TACG-AAA-A-----A--TAAACAA-T--CCGCG---T------TGC-TG-ATT-GC-TT----CC-G----C-------T----TA---ACGATCG----CGC---GTTTA--CAGGGG
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ACCCCTG--TAAA--CCAGGTG-C-------GAT--CG---T--T-A--AC------GCG---G----AAGC-GA-T--C-GGCAA---C----GCGG---AT-C----A---TT---GAGTCATA--G--CCG--AATTG-TAGG------TA--GCGGGTAA-GTTTTG---ATGTTATTTATGT--ATAATC-AAC--G----TA--A--TCTAG-T--GTAAATT-ATTTGC--ACGA----TA---TTAGTAGAGGAGG----GGCAT--T--A-TATG-AGA-C-CTAC-A-------------A-TACAACTAC-A--AGACG--TTATTC-CC-A--CAAC-T-GAT---GG-T-G-TAAA-TG----TAATT-T--AATTGA---CC-G-ATTT-GG-T-TAC-AAAAAA---TGGAA-T--TTC-TT--AC-TGATATGTCA-TCTATT-TT-TA--TCATG---TTC-C--ACTTTATAC-CAAAA-TCAT-ATTGATTTTAC-AA--ATCAA-----GA--TTGA--TAT--AAACTTT----ATA--CAC-----ATTAACAAAAAA--GTGTATTT--A-TCAGGG--T----ATA-TG-------AAT------A---TTTT----TT-C--T--ACAAAAA-----T-G-TCAAA----GTAAGA-GGC----A-ATCGGG---A-AACGC-AACAAA----ATTGTTACATA------------AGCGATCG---TA----CAA-----------T-GCAAAGAAAGCGATCGTACAACT-CA-AT-GAT---ACAAG-------------TGA--T--T---A-GAAATGGTTG---AAA--TCATTTT-G-A----TTTTGT-GACT-TGACAGACATTTT---AA-GCAGC--------------------TGG--TGC-TT--ATTT-CC-----AA--T--AGTGGTCCTTA-CGTT------TAAA-GACGAC-TAT-A-CATATTTAA-GAGTG------ACT-TA-TTCTA--TTATGTTTG---A-CAA--CA-------TTTGT--T-CT--A-----AT-A---G-TTGTA-CGA---TCGC--ATGCAC-----CTCAA-G--------C-A-C-A-T----TGG-----G-TG-T-----ACA-TCCG-C--TTA--TTA--TCGT---C---GTGC------C--G-AT-C-GCA-----TAA---A--TT--CAT-CAGAGAGATG--CAAAT-CAA-A-ATCGT--T-A--TT-T-CAAAA-G------TATT--GGG-A-TAT----GATGT--ACACTTT-AG--AA-GAA----GAAT-CAA-A-TTGCAACA---C-ACTATA-AGAGTGAGAATT--------AA-CTC-ATCTAT----TTTGAAAAATTC-TTT-TT-CAT-CAATT-AAAATG---T-TAATATTT--ACTTA--TATAT-T-AGTGGCA--TGGTACGTT--TT---AGTGGAAA--A-TAT-CA-----AT-GGAAAA---T-TGAAA-GAAAAACAG-AAAAT--GAATTT---TGTTCT-G-CAATAAAT-GCAATA--GT--A-------------AAACCA-TACTAT-GAAATCTTAGTCAA-TTGCC-TCAT-AATCG-C--AAAT-TCGTTA--AACAAA--------ATA-GGAAAATAAGCAT----ATTGG-CCATTTTTCC-TCACC----TC---ATCTCCAGTGAA-TACG-AAA-A-----A--TAAAC-A-T--CCGCA---TGACCCGTGC-CG-ATC-GC-TT----CC-G----CCCCGCAGT----TA---AGCATCG----CTC---GTTTA--CAGGGG
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ccACCCCTG--TAAA--C---GAG-C-------GAT--GC---T--T-A--ACTGCGGGGCG---G----AAGC-GA-T--C-G---G---C----ACGG---GT-C-tg
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ccacccctgtaaaccaggtgcgatcgttaacgcggaagcgatcggcaacgcggatcattgagtcatagccgaattgtaggtagcgggtaagttttgatgttatttatgtataatcaacgtaatctagtgtaaattatttgcacgatattagtagaggaggggcattatatgagacctacaatacaactacaagacgttattcccacaactgatggtgtaaatgtaatttaattgaccgatttggttacaaaaaatggaatttcttactgatatgtcatctatttttatcatgttccactttataccaaaatcatattgattttacaaatcaagattgatataaactttatacacattaacaaaaaagtgtatttatcagggtatatgaatattttttctacaaaaatgtcaaagtaagaggcaatcgggaaacgcaacaaaattgttacataagcgatcgtacaatgcaaagaaagcgatcgtacaactcaatgatacaagtgattagaaatggttgaaatcattttgattttgtgacttgacagacattttaagcagctggtgcttatttccaatagtggtccttacgtttaaagacgactatacatatttaagagtgacttattctattatgtttgacaacatttgttctaatagttgtacgatcgcatgcacctcaagcacattgggtgtacatccgcttattatcgtcgtgccgatcgcataaattcatcagagagatgcaaatcaaaatcgttatttcaaaagtattgggatatgatgtacactttagaagaagaatcaaattgcaacacactataagagtgagaattaactcatctattttgaaaaattctttttcatcaattaaaatgttaatatttacttatatattagtggcatggtacgttttagtggaaaatatcaatggaaaattgaaagaaaaacagaaaatgaattttgttctgcaataaatgcaatagtaaaaccatactatgaaatcttagtcaattgcctcataatcgcaaattcgttaaacaaaataggaaaataagcatattggccatttttcctcacctcatctccagtgaatacgaaaaataaacatccgcatACCCCTG--TAAA--C---GCG-C-------GAT--AG---T--T-A--AC------GCG---G----AAGC-GA-T--C-GGCAA---C----GCGG---AT-g
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ccctgtaaacgcgcgatcgttaacgcggaagcgatcggcaacgcggatccattgagtcgtagccgaagtttgatagcgggtaagttttgatgttatttatgtatcaacgctatatctagtgtaaatatttgcatgatattagtagaggaggggcattatatgagacctactatacaactacaagacgttatttaccacaacgatggttaaagaattttaattgaccgtttggtgtacaaaatatggaatacttcttactgttatgtcattattttttatcatgcatttccacttattcccaaatatcatattgattttacaaatcaagatgatataaactttatatacattgacaaaaagtgtatttatagtgtaactgaattacgttttttcattgaaattgtcaatagatggcaatcggcataccaacaaaattgttttagatcaaagtgcgatgtgttcaattgcaaagaaagcgtcgtacaactcatatagatacaagacgttgattgtcgtctcggacatcattttgatttgtgacttgacagacattttaagcactggtgcttattcctaatttggggtccttacgttaatagacgactatacatattgaaggtacatatatactatcatgttgacaacattgttttaatagttgtacgatcgttgcatctcaagtcacattgggttgtacgatcgcttatatgtcgttgccgatctgcataaattcatcagagagatgcaaatcaaatcgtattattaaaattgtggatatatgatgtaaacttagataggaagatcaatttgcaacaattataagagtgagaattaactcatctatttgaaaaactctttttcatccaataaaatgtgaaatgttacttataagtggcatggtacgtttttgtggaaatatcaatggaaaattgaaagaaaacagataatgaatttgttctgcaataaatgcaaaagtaaaaccatactatgaaatcttatcaattgccccataatcgcaaaactcgttaaacaaatatgtaaaataatatattgccaattttcctcacctcatctccttggaatacgaaaaatatacaACCCCTG--TAAA--C---GCG-C-------GAT--CG---T--TAA--AC------GCG---G----AAGC-GA-T--C-GGCAA---C----GCGG---AT-
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    caaaaaaagtgtatttattagggtataatgaatattttttttttgatgaaagaaaatatgtcaaagtagaggccaaaaatcggcaacgccaacaaaattgtttacaaagccgattcgtacaattgcaagaaagcgaaatcgtacaactcaaatagataaaattgattttaggaaatggtcgaaaaatcattttttattttgtgacttgacagacattttaaagcattggcgtgcttttattatccaatagaatccttcgtttaaagacgactgtacatatttaaagtgtgacatatttattatgcttgacaaaacaattttgtttctaattagttgatcgatcgcatgcatatcaagtacattgggttggtacggatcgcttattattgtcgttgccgatcgcataaagtttcatcagagagatgcaaattcaaatcgtttattttcaaaattgtttgggatatgatgttacacttttagaagaagatcaattgcaacatataagagtgggaattaactcgatctatttgaaaaattcttttttcattccaataaaatgttgaaatttttaccttacatattagtggcatggtacgttttttagtgggaaatatcaattggaaaattgaaagaaaacaggaaaatgaatttgttcttgcaataaattgcaaaagtaaaccatactattgaaaccttatcaattgccccattaatcgcaaaattcgttaaacaaatatggaaaataagatattgccatttttccttcacctcatatcattggaattacgaaaaaataaacaACCCCTG--TAAA--C---GCG-C-------GAT--CGTCTT--T-ACGA-------GCG---G----AAGC-GA-T--C-GGCAA---C----GCGG---AT-
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        gtctagaaggccaaatacgagcatcgaagcaacaaagattgctttagcatatgaagccgatccattacaatagcaaagaatgcgatcgtacaactcaatagatgtaacaagtgctgctagaaatgttgaaatcatttttgatttgtgactgcgacagacattttaaagcactgtgccttatttcaatgaggttccttcggtttaaagcgacataacatatttagtgtgacaattctatatgttgaaaacaattccgttctaatagcttgtacgatcgcatgcatctcaagcaattggtcttgtacggatcgcctttattatgtcaggttgcccgatcgcataagttcatcagagagatgcagattaagtcgttagttcaaaattgtggacattaatgtacacttaagaagaaagaagatcaattgcaaacattataagagtgagaattaatcatctatttgaaaaattctgttttcatccaataaaatgtgaaattttacttataatattagtggcatgtaggttttagtggaaaatatcaatggaaaattgaaagaaaacagaaaatgatttgttctgcaataaatgcaaaagtaaaaccattactatgaaatcttatcaattgccccttaatcgcaaaatcggtaaacaaattgctaaataagatattgcccatttttcctcacctcatctccatggaatacgaaaaataaacaACCCCTG--TAAA--C---GCG-C-------GAT--CG---T--G-A--AC------GCA---G----ACGC-GA-T--C-GTTAA---C----GCGG---AT-C-C--A---GT---GAAGCAAA--T--CTA--CAGTT-T-GA------TATAGCGGA-AA-GTTTTG---ATGTTATTCATGT--GT---C-AAT--G--C-TTT-A--TCTAG-T--GTAAAT--GTTTGC--ACGA----TA---TTAGTAGAGGAGG----GACATTAT--A-TATG-AGA-C-TTATAAT-CTCAATAANGAA-TACA---AA-A--ATAAG--T--CTG-CC-A--ATA----------AG-G-G-------G----TAATT-T--AATTGA---TC-G-ATTT-GG-T-TTC-AAAATG---TGAAA-T--TTC-TT--GC-TGTTATATCT-TTTATT-TT-TA--TCATG---ACC-C--ACTTTATT---AAA---------T----------A--ATTAA-----GG--T-GA--TAC--AAACTTT----ATA--TGT-----ATTACCAAAAAA--GTGTATTT--A-TCAGGG--T----ATA-TG-------AATG-----C---TTTT----TT-CA-T--A-AAAAT-----T-G-TCAAA----GTAT-A-GGC----A-ATCAAC---A-A-TGC-AACAg
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   cACCCCTG--TACA--C---GCG-C-------GAT---G---T--G-A----------GCG---GCA--ACGCAGA-T--T-GTT
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ctttcgaagatgagcaattgcaacattaaaagagtgagaattgacatacaatgtatgtatttgaaaaattctttttctttcaataaagtaggaaatagtggcatggtacgttctagtgaaatatcaatggaaaactgaaagaaacagaaaatgaatttgttctgcgtaaaatgcaaaagtataaggatactatgaaatcttatcaattgtcccataatcgcaaaattcgtgaaaaaaatctggaaaataagacattacaatttttcctcaactcgtcttcatgaaatacaaaataaatttataACCCCTT--TAAA--C---GCG-C-------GAT--CG---T--T-A--AC------GCA---G----AAGC-GA-T--C-GGCAA---C----GCGG---AT-C-T--A---TT---GAGTCATA--A--CCG--AAAAT-T-GA------TA--TTGGGTAA-GTTTTG---ATGTCATTTATGT--AT---C-AAC--A--A-TAT-A--TCTAG-T--GTAAAT--ATTTGC--AC
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ACCCCTG--TAAA--C---GCG-C-------GAT--AG---T--C-A--AC------GCG---T----ATGC-AA-T--C-GGCAA---C----GCGG---A
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        aaaaaatctgaaaaataagacattgcccttttctctcacctcgtctaaaaataaacaattACCCCTT--GAAA--C---GCG-C-------GAG--CG---T--T-A--AC------GCG---A----ATGC-AA-T--C-GGCAA---C----GCGA---AT-g
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tggaaataaaaccttgccattttttcacctcgtaatcaaggaatacacaaaataatcaATCCCTT--TAAA--C---GCG-C-------GAG--CG---T--T-A--AC------GCG---A----ATG--AA-T--C-GGCAA---C----GCGA---AT-
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ttggaaataaaaccttgccattttttcacctcgtaatcaaggaatacacaaaataatcaACCCCTGCCTAAA--C---GCG-C-------GAT--CG---T----A--AC------GCG---G----AAGC-GAAT--C-GC-AA---C----GCGG---AT-C-C--AGACTG---CAATCATA--AGTCCGACAAGTT-T-GAGGGGAGTA--GCGGGTAA------A---ATGTTTTTTATGG--AT---C-A
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ccACCCCTG--TAAA--C---GCG-C-------GAT--CG---T--T-A--AC------ACG---G----AAGC-GA-T--C-GGCAA---C----GCGG---AT-C-C--A---Tgt
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   aACTCCTG--TAAA----------C-------GAT--CG---T--T-A--AC------GCG---GTTCCAAGC-GA-T--C-GGCAA---C----GCGG---AT-
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           aaaataaacaCCCTTG--TAAAATC---GCG-CTCAATACGAG--CT---T--T-A--AC------GCG---G----AAGC-AA-T--C-GTTAA---C----Gg
gi|12                         : gtgaacgcgcgattccgtattgacgcggacgcgaatagcggccacacaagcggctaattccgatttctgagtcatatagccgaagttatgatagggcataaagttttgttgatgttacttatgtgaatcgaacgacgtatatatagttggctaatatttgctgacgaagtataagtttagtagaggaggcagggacatctaatatggagatcctgagtacaagtacaactagacaagacgttattcgcacacctcgatgagagacgtaaaatgacattaattttgaattgacccgtatttaggttacagaataccctggaaatttcttttaccttttatgtcaatttatttttaactcatgtccctcactttattccaaaatcaatattgattttaccaactatgaacgaatgatgagttattgaaactttttaaataattactatgagttaacaaaaaatcatgtacttagggtgtttatatggtgaataaatgctttattattgcaatgaaaaatagtcaaaacaagtagagtcattcagcgccaacgcaacaaaaggtgtttacaaaagcgaccgtacaactcaatagataaaaaaaaaaagaattttcgaatttaagaaatggttgaaaaatcatttttgaactgtatggtcgactggcaacatttcttaaagcacactcgttcttttcttcaagattgtgcttgtttcctcagaaatggagggtccttagcgttaggtcttaaaagacggcctattacatactttatggtgtaggaaacagtaattctaatttatgttgtacatcaacagaggttctttgtcatcttaagtagttgtatcgactatcgctaatgcattcagtctcaaagcaccattggtgggtatagttaaacacgatcgcttaacttagctgtaagtttggcctagtatgcgcataatacattgacattcagagagagcaatcatatatcgtattacttttcaaaatctgatttgtaagggaatgatgttaaccctttaaaaagagatacacattcaatctcattatatagagtgagaatttaactccatactcatttattataattgaaaaattctttttcatccaataaaatgtgaaatttttagcttatataataaagtggcaactggtacgtttattatggaagatatacataggtagaaattttgaaagaaagcagaaaatgaattttctgttctgttaataaatgcaaaaaggtaatatgtgtttgctaaacgaaacatgaatctatcaatttgccaccataatcgacaaaattcgttaacaaatatggaaataaagattatcatggccttttttctcacctcatatctcataaacgaaaagattaaacaattccgcgtttgccgtattcgcattccagcCTCCTG--TAAA--C---GCG-C-------GAT--CG---T--T-A--GTGAA---GTG---G----ATGC-AA-T--C-TGCAA---C----GGGG---AT-gtg
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  gcgttgtgagtgggataacatcatctagatggaaaaatgaagaaacgaatttgttttgcgtaacttgcaaatgtgaaaacatgctgtaaaatcttattaattgtcccataatcgcaaaattcgtggggaagaaatctggaaaataagacattgccatttttctcacctcgtcttcaaggaatacaaataataaacaCCCTG--TAAA--C---GCG-C-------GAT--CG---T--T-A--AC------GCG---G----AAGC-GA-T--C-GGCAA---C----GCGG---AT-C-C--A---TT---GAGTCGTA--G--CCG--AAGTT-T-GA------TA--GCGGGTAA-GTTTTG---ATGTTATTTATGT--AT---C-AAC--G--C-TAT-A--TCTAG-T--GTAAAT--ATTTGC--ATGA----TA---TTAGTAGAGGAGG----GGCAT--T--A-TATG-AGA-C-CTAC------------T--A-TACAACTAC-A--AGACG--TTATTTACC-A--CAAC---GAT---GG-T---TAAA--G----AATTT-T--AATTGA---CC-G--TTT-GG-TGTAC-AAAATA---TGGAA-TACTTC-TT--AC-TGTTATGTCA-TTATTT-TT-TA--TCATGCATTTC-C--ACTT-ATTC-CCAAATATCATATTGATTTTAC-AA--ATCAA-----GA--T-GA--TAT--AAACTTT----ATA--TAC-----ATTGACAAAAA---GTGTATTT--A-T-AGTG--T----AAC-TG-------AAT------TACGTTTT----TT-CA-T--T-GAAAT-----T-G-TCAA------TAG-ATGGC----A-ATCGGC---ATA-C-C-AACAAAATTGTTT------TAGATCAAAGTGCGA----------TGTGTTCAA-----------TTGCAAAGAAAGCG-TCGTACAACT-CATATAGAT---ACAAGACGT---------TGA--T----------TGTCGTCTCGGACA--TCATTTT-G-A-----TTTGT-GACT-TGACAGACATTTT---AA-GCA-C--------------------TGG--TGC-TT--ATTC-CT-----AATTT--GG-GGTCCTTA-CGTT------AATA-GACGAC-TAT-A-CAT-ATTGA-AGGTAC-----ATA-TA-TACTA--TCATG-TTG---A-CAA--CA--------TTGT--T-TT--A-----AT-A---G-TTGTA-CGA---TCGT---TGCAT-----CTCAA-G--------TCA-C-A-T----TGG-----GTTG-T-----ACG-ATCG-C--TTA---TA--T-GT---C--GTTGC------C--G-AT-CTGCA-----TAA---A--TT--CAT-CAGAGAGATG--CAAAT-C-A-A-ATCG---T-A--TTAT-TAAAA-T------TG-T--GGATA-TAT----GATGT--AAAC-TT-AGATAG-GAA----G-AT-C-A-ATTTGCA--A---CAATTATA-AGAGTGAGAATT--------AA-CTC-ATCTA-----TTTGAAAAACTC-TTT-TT-CAT-CCAAT-AAAATG---T-GAAATGTT--ACTTA--TA------AGTGGCA--TGGTACGTT--TT---TGTGG-AA--A-TAT-CA-----AT-GGAAAA---T-TGAAA-G-AAAACAG-ATAAT--GAA-TT---TGTTCT-G-CAATAAAT-GCAAAA--GT--A-------------AAACCA-TACTAT-GAAATCTTA-TCAA-TTGCC-CCAT-AATCG-C-AAAAC-TCGTTA--AAC-AA--------ATATGTAAAATAAT-AT----ATT-G-CCAATTTTCC-TCACC----TC---ATCTCCTTGGAA-TACG-AAA-A-----A--TATACAA-T--CCGCG---T------TGC-CG-ATC-GC-TT----CC-G----CG------T----TA---ACTATCG----CGC---GTTTA--CAGGGG
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      CCTTG--TAAA--C---GCGAC-------GAT--CG---T--T-A--AA------ACGTTGG----ATGC-GA-T--CAGGTAAAATC----GCGG---AT-CAC--AA--TT---GAGTCATA--T--TCA--AGTTT-T-TA------TA--CCGGGTAA-GTTTTG---A-GT-ATTTATGT--AT---C-AACCAG--C-TATTACCTCTAGCT--GTAAAT--ATTTGC--G-----------------AGAGGAGG----GGCATA-T--AATATG-AGAAC-CT-------T-----ATG-A-TACAACTAA-A--AGGAG--TTATTC-CCAA--AAAC-TAGAT---AG-T-GATAAA-TGTT--TAATT-T--AATTGA---CC-G-ATTT-GGTT-TACAAAAATA---TGGAT-T--TTCTTT--AC-TATTATATCt
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     cacaTG--TAAA--C---GCG-C-------GAT--CG---T--T-A--AC------GCG---G----AAGC-ccccccccccccccccccccccccccccccccaatttcatttttatcatgttcacactttattcacaaaatctaattgattttacagatcaagagttgatataaactttaataatatacattaacaaaaggtgtaattattcaaggaatatatgaatgttttatttttatcatgagaaaaatgttcaaagtacgaccacatccacaacg
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          G--TGAA--C---GCG-C-------GATTCCG---TATT-G--AC------GCG---G----ACGC-GAATAGC-GGCCA---CACAAGCGGCTAAT-T-CCGA---TTTCTGAGTCATATAG--CCG--AAGTTAT-GA------TA--GGGCATAAAGTTTTGTTGATGTTACTTATGTGAAT---CGAAC--GA-CGTAT-A--TATAG-TTGGCTAAT--ATTTGCTGACGAAGTATAAGTTTAGTAGAGGAGGCAGGGACAT--CTAA-TATGGAGATC-CTG--A--GT-----ACA-AGTACAACTAG-ACAAGACG--TTATTC-GC-A--CACC-TCGATGAGAGAC-G-TAAAATGACATTAATT-TTGAATTGA---CCCGTATTTAGG-T-TAC-AGAATACCCTGGAAAT--TTC-TTTTACCTTTTATGTCAATTTATT-TT-TAACTCATG---TCC-CTCACTTTATTC-CAAAA-TCAATATTGATTTTACCAACTATGAACGAATGA--T-GAGTTATTGAAACTTTTTAAATAATTACTATGAGTTAACAAAAAATCATGTACTT--A----GGG--TGTTTATA-TGGTGAATAAAT------G---CTTTATTATTGCAAT--G-AAAAA-----TAG-TCAAAACAAGTAG-A-GTC----A-TTCAGCGCCA-A-CGC-AACAAAAGG-TGT------T------------------------TA----CAA-----------AAGCGA---------CCGTACAACT-CA-ATAGAT---AAAAAAAAAAAGAATTTTCGAATT--T---AAGAAATGGTTG---AAAAATCATTTTTG-AACTGTATGGTCGACT--GGCA-ACATTTCTTAAA-GCA-CACTCGTTCTTTTCTTCAAGATTG--TGC-TT--GTTT-CCTCAGAAA--TGGAG-GGTCCTTAGCGTTAGGTCTTAAAAGACGGCCTATTA-CATACTTTA-TGGTGTAGGAAACAGTAATTCTAATTTATG-TTGTACATCAA--CAGAGGTTCTTTGTCAT-CTTAA-----GT-A---G-TTGTATCGACTATCGCTAATGCATTCAGTCTCAAAG--------C-A-CCA-T----TGGTGGGTATAG-TTAAACACG-ATCG-C--TTAACTTAGCT-GTAAGT--TTGGC------CTAGTATGC-GCA-----TAATACA--TTGACATTCAGAGAGA-G--CAA-T-C-ATATATCGTATT-ACTTT-T-CAAAA-TCTGATTTG-TAAGGG-A--AT----GATGTTAACCCTTT-AA--AA-AGA----G-ATAC-ACA-TT-CA--ATCTC-ATTATATAGAGTGAGAATTTAACTCC-ATACTC-ATTTATTATAATTGAAAAATTC-TTT-TT-CAT-CCAAT-AAAATG---T-GAAATTTTTAGCTTATATA-ATAA-AGTGGCAACTGGTACGTTTATT---A-TGG-AAG-A-TATACATAG--GT-AG--AAATTT-TGAAA-G-AAAGCAG-AAAAT--GAA-TTTTCTGTTCT-GTTAATAAAT-GCAAAAAGGT--AATATGTGTTTGCTAAACGA-AAC-AT-G-AATC-TA-TCAATTTGCCACCAT-AATCGAC-AAAAT-TCGTT---AAC-AA--------ATATGGAAATAAAG-ATTATCATG-G-CC-TTTTTTC-TCACCTCA-T----ATCT-CAT--AA--ACG-AAA-A-----GATTAAACAATT--CCGCGT--T------TGC-CGTATTCGCATT----CCAG----CCG-----T----TA---ACGATTGCTTCCGC---GTT
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          GC-GA-T--C-GTTAA---C----GCGG---Aaaagctcgtattgagcgcgattttacaaggggtg
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            gct-T--C-ACTAA---C----GTGT---ATGC-C--G---TT---ATG-CAGA--A--CAA--CAGTT-T-GA------TA--GCGGGTAA-GTTTTG---ATTTTAATTATGT--GT---C-AAgcgtttaca
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gtT---C-AAT--GACT-TAT-A--TCT------GTAAATCGATT-GC--ACGA----TA---ATAGTATGGCAGG----GACAT--TA-A-TATA-GGA-CTTTAA-AT--T-----CT------CAA-TAATA--CGACGCTTTATTC-CC-ACGAAACAT-CGT---AG-TCG-TAAA-TG-----AATTAT--AATTGAGATAC-G-AATT-TG-T-TTC-AAAAAT---TGAAA-T--T---TT--GC-TGTTATATCT-TTCATTATTGTA--TCATGA--CCC-C--AC-TTAT-----AAT-GACA-CTTAAGTATAC-AA--CT------------------TAT--A----TT----GTA--TAC----------CAAAAAG--TTG-GATTCCA-TC---G--T-----TA-TG--------AT------G---CTTT----TT-CA-T-----AAAACTC--T-G-TCAAA----GTATAA-GGC----AGATC
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  aagccttggagttcttgtctattattagcagAGTAGAGGAGG----GGCAT--T--A-TATG-AGT-C-CTAC-ATTGT-----ACA-A-TACAACTAC-A--AGACG--TCATTA-CC-A--CAAC-T-GAT---GG-T-G-TAAA-Taaa
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        -TTCATT-TT-TA--TCATG---TTCAC--ACTTTATTCACAAAA-TCTA-ATTGATTTTAC-AG--ATCAA-----GAGTT-GA--TAT--AAACTTTAATAATA--TAC-----ATTAAC-AAAAG--GTGTAATT--ATTCAAGGAAT----ATA-TG-------AATGTTTTAT---TTTT----AT-CA-TGAG-AAAAA-----T-GTTCAAA----GTAC-G-ACC----ACATCCAC---A-A-CG
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                cacaccttgtaaacgcgacgatcgttaaaacgttggatgcgatcaggtaaaatcgcggatcacaattgagtcatattcaagtttttataccgggtaagttttgagtatttatgtatcaaccagctattacctctagctgtaaatatttgcgagaggaggggcatataatatgagaaccttatgatacaactaaaaggagttattcccaaaaactagatagtgataaatgtttaatttaattgaccgatttggtttacaaaaatatggattttctttactattatatcccccccccccccccccccccccccccccccccaatAAAAAA--GTGTATTT--A-TTAGGG--T----ATAATG-------AATATTT--T---TTTT----TT-GA-T--G-AAAGAAAATAT-G-TCAAA----GTAG-A-GGCCAAAA-ATCGGC---A-A-CGCCAACAAAATTGTTTA-----CA------------AAGCCGATTCGTA----CAATTGCAAGAAAGC-GAAA---------TCGTACAACTCAA-ATAGAT---AAAAT-------------TGA--T--TTTAG-GAAATGGTCG---AAAAATCATTTT-TTA----TTTTGT-GACT-TGACAGACATTTT---AAAGCA-T--------------------TGGCGTGC-TTTTATTATCC-----AA--T--AG-AATCCTT--CGTT------TAAA-GACGAC-TGT-A-CATATTTAAAGTGTG------ACA-TA-T-TTA--TTATGCTTG---A-CAAAACAA-----TTTTGT--TTCT--A-----ATTA---G-TTGAT-CGA---TCGC--ATGCAT-----ATCAA-G--------T-A-C-A-T----TGG-----GTTGGT-----ACGGATCG-C--TTA--TTA--TTGT---C--GTTGC------C--G-AT-C-GCA-----TAA---AGTTT--CAT-CAGAGAGATG--CAAATTC-A-A-ATCGT--TTA--TT-TTCAAAA-T------TG-TTTGGG-A-TAT----GATGTT-ACACTTTTAG--AA-GAA----G-AT-C-A-A-TTGCA--A---C-AT-ATA-AGAGTGGGAATT--------AA-CTCGATCTA-----TTTGAAAAATTC-TTT-TTTCATTCCAAT-AAAATG---TTGAAATTTTT-ACCT---TACATATTAGTGGCA--TGGTACGTT--TTTT-AGTGGGAA--A-TAT-CA-----ATTGG--AAAA-T-TGAAA-G-AAAACAGGAAAAT--GAA-TT---TGTTCTTG-CAATAAATTGCAAAA--GT--A-------------AA-CCA-TACTATTGAAACCTTA-TCAA-TTGCC-CCATTAATCG-C-AAAAT-TCGTTA--AAC-AA--------ATATGGAAAATAAG-AT----ATT-G-CCATTTTTCCTTCACC----TC---ATATCATTGGAATTACGAAAA-A-----A--TAAACAA-T--CCGCG---T------TGC-CG-ATC-GC-TT----CC-G----CGT-----T----TA---ACGATCG----CGC---GTTTA--CAGGGG
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         caAA-----------T-GCGA---------TCGTACAACT-CA-ATAGATGTAACAAG-------------TGC--TGCT---A-GAAATG-TTG---AAA--TCATTTTTG-A----TTT-GT-GACTGCGACAGACATTTT---AAAGCA-C--------------------TG---TGCCTT--ATT--TC-----AA--TG-AG-GTTCCTTC-GGTT------TAAA-G-CGAC--AT-AACATATTTAG-T-GTG------ACA--A-TTCTA--T-ATG-TTG---A-AAA--CAA-----TTCCGT--T-CT--A-----AT-A---GCTTGTA-CGA---TCGC--ATGCAT-----CTCAA-G--------C-A---A-T----TGGT----CTTG-T-----ACGGATCG-CCTTTA--TTA--T-GT---CAGGTTGC------CC-G-AT-C-GCA-----TAA---G--TT--CAT-CAGAGAGATG--CAGAT-T-A-A-GTCGT--T-A--GT-T-CAAAA-T------TG-T--GGACA-T-T----AATGT--ACACTTA-AG--AA-GAAAGAAG-AT-C-A-A-TTGCA--AA--C-ATTATA-AGAGTGAGAATT--------A--ATC-ATCTA-----TTTGAAAAATTCTGTT-TT-CAT-CCAAT-AAAATG---T-GAAATTTT--ACTTAT-AATAT-T-AGTGGCA--TG-TAGGTT--TT---AGTGG-AA--AATAT-CA-----AT-GG--AAAA-T-TGAAA-G-AAAACAG-AAAAT--G-A-TT---TGTTCT-G-CAATAAAT-GCAAAA--GT--A-------------AAACCATTACTAT-GAAATCTTA-TCAA-TTGCC-CCTT-AATCG-C-AAAA--TCGGTA--AAC-AA--------AT-TGCTAAATAAG-AT----ATT-GCCCATTTTTCC-TCACC----TC---ATCTCCATGGAA-TACG-AAA-A-----A--TAAACAA-T--CCGCG---T------TGC-CG-ATC-GC-TT----CC-G----C-------TCG--TAAAGACGATCG----CGC---GTTTA--CAGGGGt
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  gtctagaaggccaaatacgagcatcgaagcaacaaagattgctttagcatatgaagccgatccattacaatagcaaag--TTATG-TTG---A-CAA--CA------CTTTGT--T-CT--ACATATGT-AATTG-TTGTT-CGA---TCGC--ATGCAT-----CTTAC----------T-A-C-G-T----TGG-----GTTG-T-----ACG-ATTG-G--TTA--ATA--C-GT---C--GTTGC------C--G-AT-C-GCA-----TAA---A--TT--CTT-CAGAGACATG--CAAAT-A-A-A-ATTGC--T-A--TT-T-TAAAA-T------TG-T--GGG-A-Ttg
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              gTTGT--T-CT--C-----AT-C---G-TTGTATCCA---TCGCC-AT-CATA----CTCAC-T--------T---C-ACT----TGA-----GTTC-T-----ACT-ATCGAC--CTA--ATA--C-GTTG-C--TTCGC------C--G--T-T-GCA-----TAA---A--T----AT-CCCA----TG--CAAAT-G-A-A-ATCTT--C-AA-TT-T-CAAAT-T------GG-T--GCG-ACTAT----G-T-T--ACACTTT-AGC-AATGAA----G-AT-A-A-A-TTGCA--A---A-CTTATG-AGAGT--AAATT--------AT--TC--TCTA-----TTTGATAAATTC-TTT-TC-CTC-CCCAT-AAAGTACATT-GAAATT
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                aac--T-CT--A-----TTGA---G-TTGTA-CGA---TCGC--AT
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         gtctagaaggccaaatacgagcatcgaagcaacaaagattgctttagcatatgaagccgatccattacaatagcaaagaT--A-----AT-A---G-TTGTA-CGA---TCGC--ATGCAC-----CTCAA-GGAGTCAAGC-A-C-A-T----TGG-----GTTG-T-----ACG-ATCG-C--TTA--TTA--T-GT---C--GTTGC------C--G-AT-C-GCA-----TAA---A--TT--CAT-CAGACA--TG--CAAAT-C-A-A-ATCGT--T-A--TT-T-CAAAA-T------TG-T--GGG-A-TAT----GATGT--ACACTTT-AG--AA-GAA----G-AT-C-A-A-TTGCA--A---C-ATTACA-AGAGTGAGAATT--------AA-CTC-ATCTG-----TTTGAAtgtaacaagtgctgctagaaatgttgaaatcatttttgatttgtgactgcgacagacattttaaagcactgtgccttatttcaatgaggttccttcggtttaaagcgacataacatatttagtgtgacaattctatatgttgaaaacaattccgttctaatagcttgtacgatcgcatgcatctcaagcaattggtcttgtacggatcgcctttattatgtcaggttgcccgatcgcataagttcatcagagagatgcagattaagtcgttagttcaaaattgtggacattaatgtacacttaagaagaaagaagatcaattgcaaacattataagagtgagaattaatcatctatttgaaaaattctgttttcatccaataaaatgtgaaattttacttataatattagtggcatgtaggttttagtggaaaatatcaatggaaaattgaaagaaaacagaaaatgatttgttctgcaataaatgcaaaagtaaaaccattactatgaaatcttatcaattgccccttaatcgcaaaatcggtaaacaaattgctaaataagatattgcccatttttcctcacctcatctccatggaatacgaaaaataaacaatccgcgttgccgatcgcttccgctcgtaaagacgatcgcgcgtttacaggggtg
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   -A---G-TTGTA-CGA---TCGC--TT---T-----CT---------------------T----TGC-----ATTG-T-----ACG-ATCG-C--TTA--T
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ccacccctgtaaaccaggtgcgatcgttaacgcggaagcgatcggcaacgcggatcattgagtcatagccgaattgtaggtagcgggtaagttttgatgttatttatgtataatcaacgtaatctagtgtaaattatttgcacgatattagtagaggaggggcattatatgagacctacaatacaactacaagacgttattcccacaactgatggtgtaaatgtaatttaattgaccgatttggttacaaaaaatggaatttcttactgatatgtcatctatttttatcatgttccactttataccaaaatcatattgattttacaaatcaagattgatataaactttatacacattaacaaaaaagtgtatttatcagggtatatgaatattttttctacaaaaatgtcaaagtaagaggcaatcgggaaacgcaacaaaattgttacAA-G--------A-A-C-A-T----TGG-----GTTG-T-----ACG-ATCG-C--TTA--ATA--T-GT---C--GTTGC------C--G-AT-C-GCA-----TAA---A--TT--CAT-CAGAGAGATG--CAAAT-C-A-A-ATCGT--T-A--TT-T-CAAAA-T------TG-T--GGG-A-TAT----GATGT--ACACTTT-AG--AA-GAA----G-AT-C-A-A-TTGCA--A---C-ATTATA-AGAGTGAGAATT--------AA-CTC-ATCTA-----TTTAAAAAATTC-TTT-TT-CAT-CCAAT-AAAATG---T-GAAATTGT--ACTTA--TATAT-T-AGTGGCA---GGTACGTT--TT---AGTGG-AA--A-TAT-TA-----AT-GGAAAA---A-TGAAA-G-AAAACAG-AACAT--GAA-TT---TGTTCT-A-CAATAAAT-GCAAAA--GT--A-------------AAACCA-TACTAT-GAAATCTTA-TCAA-TTGCC-CCAT-AATCG-C-AAAAT-TCGTTA--AAC-AA--------ACATGGAAAATAAG-AT----CTT-G-CCATTTTTCC-TCCTC----TC---ATCTCCATGGAA-TACG-AAA-A-----A--TAAACcaatgatacaagtgattagaaatggttgaaatcattttgattttgtgacttgacagacattttaagcagctggtgcttatttccaatagtggtccttacgtttaaagacgactatacatatttaagagtgacttattctattatgtttgacaacatttgttctaatagttgtacgatcgcatgcacctcaagcacattgggtgtacatccgcttattatcgtcgtgccgatcgcataaattcatcagagagatgcaaatcaaaatcgttatttcaaaagtattgggatatgatgtacactttagaagaagaatcaaattgcaacacactataagagtgagaattaactcatctattttgaaaaattctttttcatcaattaaaatgttaatatttacttatatattagtggcatggtacgttttagtggaaaatatcaatggaaaattgaaagaaaaacagaaaatgaattttgttctgcaataaatgcaatagtaaaaccatactatgaaatcttagtcaattgcctcataatcgcaaattcgttaaacaaaataggaaaataagcatattggccatttttcctcacctcatctccagtgaatacgaaaaataaacatccgcatgacccgtgccgatcgcttccgccccgcagttaagcatcgctcgtttacaggggtg
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            -G--------T-ATC-A-T----TGA-----GTTG-T-----ACG-ATCG-C--TT-----------T---C--TTTGCATTGTAC--G-AT-C-GCT-----TA
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ccacccctgtaaaccaggtgcgatcgttaacgcggaagcgatcggcaacgcggatcattgagtcatagccgaattgtaggtagcgggtaagttttgatgttatttatgtataatcaacgtaatctagtgtaaattatttgcacgatattagtagaggaggggcattatatgagacctacaatacaactacaagacgttattcccacaactgatggtgtaaatgtaatttaattgaccgatttggttacaaaaaatggaatttcttactgatatgtcatctatttttatcatgttccactttataccaaaatcatattgattttacaaatcaagattgatataaactttatacacattaacaaaaaagtgtatttatcagggtatatgaatattttttctacaaaaatgtcaaagtaagaggcaatcgggaaacgcaacaaaattgttaca-G--------T-A-C-A-TGTGGTGG-----ATGG-T-----ACG-ATCG-C--TTT--TTA--C-AG---C--GTTGC------T--G-AT-C-GCAGAGCATAA---A--TT--C-T-C-GAGAGATGTACAAAT-C-A-A-ATCGT--T-A--TT-T-GAAAAGT------TG-T--TGA-C-TATTATAGATAT--GCAaagtgattagaaatggttgaaatcattttgattttgtgacttgacagacattttaagcagctggtgcttatttccaatagtggtccttacgtttaaagacgactatacatatttaagagtgacttattctattatgtttgacaacatttgttctaatagttgtacgatcgcatgcacctcaagcacattgggtgtacatccgcttattatcgtcgtgccgatcgcataaattcatcagagagatgcaaatcaaaatcgttatttcaaaagtattgggatatgatgtacactttagaagaagaatcaaattgcaacacactataagagtgagaattaactcatctattttgaaaaattctttttcatcaattaaaatgttaatatttacttatatattagtggcatggtacgttttagtggaaaatatcaatggaaaattgaaagaaaaacagaaaatgaattttgttctgcaataaatgcaatagtaaaaccatactatgaaatcttagtcaattgcctcataatcgcaaattcgttaaacaaaataggaaaataagcatattggccatttttcctcacctcatctccagtgaatacgaaaaataaacatccgcatgacccgtgccgatcgcttccgccccgcagttaagcatcgctcgtttacaggggtg
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   tgtgcaattgtgtgtttataatatggcgggtt-A-TAT----AATAT--ACACTTT-AG--AA-GAA----G-AT-C-A-A-ATGCA--A---C-ATAATA-AGAGCAAAAATTG-------AC-CCCTATTT-------TTGAGACATTC-TTTCTT-CTT-TCAATAAAAATA---T-CAAATTTT--ATTTA--TATATtcctgggaccttaatgcattgaaaaatccctttatgcatttgaaatatccttttcca
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       CTTT-CG--AA-GAT----G-AG-C-A-A-TTGCA--A---C-ATTAAA-AGAGTGAGAATTGACATACAAT-GT--ATGTA-----TTTGAAAAATTC-TTT-TT-CTT-TCAAT-AAAGTA---G-GAAAT--------------------AGTGGCA--TGGTACGTT--CT---AGT-G-AA--A-TAT-CA-----AT-GGAAAA---C-TGAAA-G--AAACAG-AAAAT--GAA-TT---TGTTCT-G-CGTAAAAT-GCAAAA--GT--A-------------TAAGGA-TACTAT-GAAATCTTA-TCAA-TTGTC-CCAT-AATCG-C-AAAAT-TCGTGA--AAA-AA--------ATCTGGAAAATAAG-AC----ATT-A-CAATTTTTCC-TCAAC----TC---GTCTTCATGAAA-TACA-AAATAAATTTA--TAAACAA-T--CTGCG---T------TG------------------CC-G----C-------T----C----AC-ATCG----CGC---GTGTA--CAGGGGgacaacagtcttggaaata
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 GAGACATTC-TTTCTT-CTT-TCAAT-AAAATA---T-TAAATTTT--ATTTAT--ATAT-T-AGTGGCA--TGGTGCGTT--TT---AATGG-AA--A-TAT-TA-----GT-GGA-AA---T-TGAAA-G-AAAACGG-A-----------T---TGTTCT-G-C-GTAAAT-ACAAAA--GT--A-------------AAA--A-CACTGC-TAAATGTTA-TCAG-TTGTC-CCAT-AATCG-C-AAAAC-CTGTGAC-AAC--A--------GTCTTGGAAATAAA-AC----CTT-G-Ct
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               -AGTCGCA--TGGT-CATT--TTCTAAGTGA-AA--A-TCT-AT-----GT-GA--AA---TATGAAA----AAACAGGAAAATACGAA-TT---T-TCTT-G-CG-TAACTTGCAACATGGTCAA-------------AAACAA-AACTGG-TAAA-CTTA-T-AA-T-GTC-CCAT-AATCG-CCAAAATCTCGTTG--GGC-AAGAGGAAAAATCTGGAAA-TAAG-AA----CTT-G-CCATTCTTCT-CAACCTCAGT----ATTTCAA-GGAA-TAC---AA-C-----A--T-AACAA-T--CC
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              CGTT--GTG--AGTGG-GATAA-CAT-CATCTAGAT-GG--AA-------AAATG-AAGA------AAC--GAA-TT---TGTTTT-G-CG-TAACTTGCAAAT--GT--G-------------AAAACA-TGCTGT-AAAATCTTA-TTAA-TTGTC-CCAT-AATCG-C-AAAAT-TCGTGGGGAAG-AA--------ATCTGGAAAATAAG-AC----ATT-G-CCATTTTT-C-TCACC----TC---GTCTTCAAGGAA-TACA-AAT-A-----A--TAAACAA-T--CCCCG---T------TGC-AG-ATT-GC-AT----CC-A----C-------TTCACTA---ACGATCG----CGC---GTTTA--CAGGAGc
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     g--AAA-AA--------ATCTGAAAAATAAG-AC----ATT-G-CCCTTTTCTC-TCACC----TC---GTCT--------------AAA-A-----A--TAAACAA-TTTCCGCG---T------TGC-CG-ATT-GC-AT----AC-G----CG------T----TG---ACTATCG----CGC---GTTTA--CAGGGG
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GGAAATAAA-AC----CTT-G-CCATTTTT---TCACC----TCGTAATC---AAGGAA-TACA-CAA-A-----A--TAATCAA-T--TCGCG---T------TGC-CG-ATT-GC-AT----TC-G----CG------T----TA---ACGCTCG----CGC---GTTTC--AAGGGGtg
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tGGAAATAAA-AC----CTT-G-CCATTTTT---TCACC----TCGTAATC---AAGGAA-TACA-CAA-A-----A--TAATCAA-T--TCGCG---T------TGC-CG-ATT--C-AT----TC-G----CG------T----TA---ACGCTCG----CGC---GTTTA--AAGGGt
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ttAA-A-----A--TAAACAA-T--CCGCG---T------TGC-CG-ATC-GC-TTGGAACC-G----CG------T----TA---ACGAT--------C---GTTTA--CAGGAGat
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           AATGA-T--CCGCG---T------TGC-CG-ATC-GC-TT----CC-G----CG------T----TA---ACGATCG----CACCTGGTTTA--CAGGGGtg
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ccaA-T--CCGCG---T------TGC-CG-ATC-GC-TT----CC-G----CG------T----TA---ACGATCG----CGC---GTTTA--CAGGGgagtcatagccgaattgtaggtagcgggtaagttttgatgttatttatgtataatcaacgtaatctagtgtaaattatttgcacgatattagtagaggaggggcattatatgagacctacaatacaactacaagacgttattcccacaactgatggtgtaaatgtaatttaattgaccgatttggttacaaaaaatggaatttcttactgatatgtcatctatttttatcatgttccactttataccaaaatcatattgattttacaaatcaagattgatataaactttatacacattaacaaaaaagtgtatttatcagggtatatgaatattttttctacaaaaatgtcaaagtaagaggcaatcgggaaacgcaacaaaattgttacataagcgatcgtacaatgcaaagaaagcgatcgtacaactcaatgatacaagtgattagaaatggttgaaatcattttgattttgtgacttgacagacattttaagcagctggtgcttatttccaatagtggtccttacgtttaaagacgactatacatatttaagagtgacttattctattatgtttgacaacatttgttctaatagttgtacgatcgcatgcacctcaagcacattgggtgtacatccgcttattatcgtcgtgccgatcgcataaattcatcagagagatgcaaatcaaaatcgttatttcaaaagtattgggatatgatgtacactttagaagaagaatcaaattgcaacacactataagagtgagaattaactcatctattttgaaaaattctttttcatcaattaaaatgttaatatttacttatatattagtggcatggtacgttttagtggaaaatatcaatggaaaattgaaagaaaaacagaaaatgaattttgttctgcaataaatgcaatagtaaaaccatactatgaaatcttagtcaattgcctcataatcgcaaattcgttaaacaaaataggaaaataagcatattggccatttttcctcacctcatctccagtgaatacgaaaaataaacatccgcatgacccgtgccgatcgcttccgccccgcagttaagcatcgctcgtttacaggggtg
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               A-T--CCGCG---T------TAA-CG-ATC-GC-GT----CT-G----CG------T----TC---ACGATCG----CGC---GTTTA--CAGGGGccattgagtcgtagccgaagtttgatagcgggtaagttttgatgttatttatgtatcaacgctatatctagtgtaaatatttgcatgatattagtagaggaggggcattatatgagacctactatacaactacaagacgttatttaccacaacgatggttaaagaattttaattgaccgtttggtgtacaaaatatggaatacttcttactgttatgtcattattttttatcatgcatttccacttattcccaaatatcatattgattttacaaatcaagatgatataaactttatatacattgacaaaaagtgtatttatagtgtaactgaattacgttttttcattgaaattgtcaatagatggcaatcggcataccaacaaaattgttttagatcaaagtgcgatgtgttcaattgcaaagaaagcgtcgtacaactcatatagatacaagacgttgattgtcgtctcggacatcattttgatttgtgacttgacagacattttaagcactggtgcttattcctaatttggggtccttacgttaatagacgactatacatattgaaggtacatatatactatcatgttgacaacattgttttaatagttgtacgatcgttgcatctcaagtcacattgggttgtacgatcgcttatatgtcgttgccgatctgcataaattcatcagagagatgcaaatcaaatcgtattattaaaattgtggatatatgatgtaaacttagataggaagatcaatttgcaacaattataagagtgagaattaactcatctatttgaaaaactctttttcatccaataaaatgtgaaatgttacttataagtggcatggtacgtttttgtggaaatatcaatggaaaattgaaagaaaacagataatgaatttgttctgcaataaatgcaaaagtaaaaccatactatgaaatcttatcaattgccccataatcgcaaaactcgttaaacaaatatgtaaaataatatattgccaattttcctcacctcatctccttggaatacgaaaaatatacaatccgcgttgccgatcgcttccgcgttaactatcgcgcgtttacaggggt
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             caA-T--CCGCGATTT------TACCTG-ATC-GC-AT----CC-AACGTT-------T----TA---ACGATCGT---CGC---GTTTA--CAAGGccagtgaagcaaatctacagtttgatatagcggaaagttttgatgttattcatgtgtcaatgctttatctagtgtaaatgtttgcacgatattagtagaggagggacattatatatgagacttataatctcaataangaatacaaaaataagtctgccaataaggggtaatttaattgatcgatttggtttcaaaatgtgaaatttcttgctgttatatcttttatttttatcatgacccactttattaaataattaaggtgatacaaactttatatgtattaccaaaaaagtgtatttatcagggtatatgaatgcttttttcataaaaattgtcaaagtataggcaatcaacaatgcaaca
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           cacaA-T--CCGCG---T------TGC-CG-ATC-GC-TT----CT-G----CG------T----TA---ACGATCG----CGC---GTTTA--AAGGGGcacaattgagtcatattcaagtttttataccgggtaagttttgagtatttatgtatcaaccagctattacctctagctgtaaatatttgcgagaggaggggcatataatatgagaaccttatgatacaactaaaaggagttattcccaaaaactagatagtgataaatgtttaatttaattgaccgatttggtttacaaaaatatggattttctttactattatatcccccccccccccccccccccccccccccccccaatttcatttttatcatgttcacactttattcacaaaatctaattgattttacagatcaagagttgatataaactttaataatatacattaacaaaaggtgtaattattcaaggaatatatgaatgttttatttttatcatgagaaaaatgttcaaagtacgaccacatccacaacg
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              aA-T--CCGCG---T------TGC--G-ATTCGC-TT----CC-G----C-------G----TT---ACGATCG----CGC---GTTTAGGCAGGGGctattgagtcataaccgaaaattgatattgggtaagttttgatgtcatttatgtatcaacaatatatctagtgtaaatatttgcac
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ccaA-T--CCGCG---T------TGC-CG-ATC-GC-TT----CC-G----TG------T----TA---ACGATCG----CGC---GTTTA--CAGGGGccagactgcaatcataagtccgacaagtttgaggggagtagcgggtaaaatgttttttatggatcagt
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        aatgg-GC-TT----CC-G----CG------T----TA---ACGATCG----CGC---GTTTA--CAt
1 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|29 ): GAATACAAAAATAAGTCTGCCAATAAGGGG






Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      
lowQualScore                  :                                                                                                                                          1111111                                                         1111                11111               111111                                                  1111                      11            1111  111             1111     22222               333333333333                                       111     11111111       22222              111                         111                                                  111              1111       11111                     222222222                 2222        111111                              1111       1111111   1111          222222222222222222     11111                                 111111              111     3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333                    111     6666666666666666666666666          222222      1      1111                           1       55555555555555555555        11        111111  111111              22222222                         111   222222   111             1            2222222222                   1111111                  11     11111         1111111111            11111111                             111         11                                                                      11         111111                                                                                                 222222222222222                                                   111                                                     111                  11111                                                                     11  2222222222222222                                                                    11111111                                                                                                                             11111111111                                 
lowQualScore                  :                                                                                                                         55    55 666   3 1111111   55   55   55   3   0   4 4 55 4     777 8888    777   4444 4  777 5       44444   66     4 4  222222  66        4      777             66  777 4   66 8888  5  66     5 66      11      66    2222  000             0000     11111     5   666   333333333333 5 5       1 66     66      5  5  66   222     99999999    55 11111    5 77      000  5 5    5  5 5   5      000     5 77   5  77  5          5      5  5  77     555   5 77  5    3333    5  77777          5   77  3  000000000   77   77       4444   77   444444     3     66       5  5 1    7777    5  6666666   4444  888  5  999999999999999999     88888 4 4   9999    4 55 4   9999 8   000000  5    5      222     9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999            6 6     111 2   3333333333333333333333333      1 0 555555 3    5      4444   3  6    6           99  5     6 44444444444444444444  99    55     6  777777  777777        99    11111111        6 6  6           111   555555   222      77 0   1   5  77    9999999999    5 66   66 4 4  4444444 4     8  777     00     11111 4   4   9999999999 3   7777   33333333 3  88    3 3    3 55   777  222  3 55   00   88 3  3 3   99999   666 55  55  3           55    3  3 3 3    88   22  3      444444   88 55   6 3   7777    3 55    3     77  3   7777 3  3 77 3 3     44 999 3      3          3   111111111111111 3 3     3 88888           3 3  6    3      3      000     3    55 4    4 4    5555       55       55  55  000   3  7  88    3  55555 3   1  3  3      3      3 3     55   3  666     3  3 66    3 7      00  1111111111111111      3     3          3    3     3   3      3 3     3    55  3     22222222  4           2 6666    2 2        4 3        3 3   3  2    3   33   2 77777 33       3 44     3 999999     3 3    7777777   22222222222 555  44       7777              
lowQualScore                  :                                                                                                                         ..    .. ...   . .......   ..   ..   ..   .   .   . . .. .     ... ....    ...   .... .  ... .       .....   ..     . .  ......  ..        .      ...             ..  ... .   .. ....  .  ..     . ..      ..      ..    ....  ...             ....     .....     .   ...   ............ . .       . ..     ..      .  .  ..   ...     ........    .. .....    . ..      ...  . .    .  . .   .      ...     . ..   .  ..  .          .      .  .  ..     ...   . ..  .    ....    .  .....          .   ..  .  .........   ..   ..       ....   ..   ......     .     ..       .  . .    ....    .  .......   ....  ...  .  ..................     ..... . .   ....    . .. .   .... .   ......  .    .      ...     ...................................................................            . .     ... .   .........................      . . ...... .    .      ....   .  .    .           ..  .     . ....................  ..    ..     .  ......  ......        ..    ........        . .  .           ...   ......   ...      .. .   .   .  ..    ..........    . ..   .. . .  ....... .     .  ...     ..     ..... .   .   .......... .   ....   ........ .  ..    . .    . ..   ...  ...  . ..   ..   .. .  . .   .....   ... ..  ..  .           ..    .  . . .    ..   ..  .      ......   .. ..   . .   ....    . ..    .     ..  .   .... .  . .. . .     .. ... .      .          .   ............... . .     . .....           . .  .    .      .      ...     .    .. .    . .    ....       ..       ..  ..  ...   .  .  ..    .  ..... .   .  .  .      .      . .     ..   .  ...     .  . ..    . .      ..  ................      .     .          .    .     .   .      . .     .    ..  .     ........  .           . ....    . .        . .        . .   .  .    .   ..   . ..... ..       . ..     . ......     . .    .......   ........... ...  ..       ....              
lowQualScore                  :                                                                                                                         00    00 444   6 8888888   00   00   00   6   1   0 0 55 0     000 5555    888   0000 4  888 0       00000   99     4 4  888888  11        4      888             11  000 0   99 2222  0  99     0 99      99      99    1111  000             6666     66666     0   222   222222222222 0 0       0 99     99      0  0  99   111     00000000    11 77777    7 99      000  7 7    7  7 7   7      000     7 99   7  99  7          7      7  7  99     777   7 99  0    9999    7  00000          7   99  0  111111111   99   99       3333   99   444444     2     99       0  0 4    5555    0  2222222   8888  888  0  222222222222222222     99999 4 4   4444    4 44 4   4444 9   666666  0    7      555     2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222            7 7     777 5   5555555555555555555555555      0 7 555555 2    5      2222   2  7    7           22  5     7 22222222222222222222  22    88     7  777777  888888        88    22222222        7 7  7           000   888888   555      99 1   4   7  99    8888888888    0 99   11 4 4  4444444 4     9  888     66     11111 4   0   3333333333 6   7777   22222222 6  66    6 6    6 00   555  555  6 00   00   66 6  6 6   11111   444 00  00  6           00    6  6 6 6    66   33  6      111111   66 00   7 3   7777    6 00    3     99  3   1111 3  3 99 3 3     66 222 3      3          3   111111111111111 3 3     3 33333           3 3  7    3      6      000     6    55 0    0 0    8888       55       00  00  000   6  3  66    6  55555 6   3  6  6      6      6 6     00   6  444     6  6 99    6 3      00  8888888888888888      6     6          6    6     6   6      6 6     6    00  3     11111111  2           9 1111    9 9        0 1        1 1   1  7    1   88   9 11111 99       1 22     3 666666     3 3    2222222   55555555555 888  66       1111              
consensus                     :                                                                                                                 NACCCCTG--TAAA--C---GCG-C-------GAT--CGT--TAA--CGC-GGAAGCG-A-T--C-GGCAA---C----GCGG---ATC-C--A-TT---G-AGTCATA--G--CCG--AAGTT-T-GA------TA--GCGGGTAA-GTTTTG---ATGTTATTTATGT--AT---C-AAC--G--C-TA-TA--TCTAG-T--GTAAAT--ATTTGC--ACGA----TA---TTAGTAGAGGAGG----GGCAT--T--ATATG-AGA-C-CTAC-AT-T--A-CGA-T-ACAACTACA--AGACG--TTATTC-CC-AC--AAC-T-GATGG----T-G-TAAA-TG----TAATT-T--AATTGA---CC-G-ATTT-GG-T-TAC-AAAATA---TGGAA-T--TTC-TT--AC-TGTTATGTCA-TTTATT-TT-TA--TCATG---TCC-C--ACTTTATT-C-CAAA-AT-CNA-ATTGATTTTA-CAA--ATCAA-----GA--TGA--TAT--AAACTTT----ATA--TAC-----ATTAACAAAAAA--GTGTATT-TA-TCAGGG----TATA-TG-------AAT---GTT---TT-TT----C----AT-----G-AAAAA-----T-G-TCA----AAGT-A-NA-GGC----A-ATC-GG---CA-ACGC-AACAAA-A-TTGTT-T---AT--A-----A---------G---------TACAA----------T-GCAAAGAAAGCGA--TCGTACAACTCA-A-TAGAT---ACAAG-------------CG-AT--T---AGAAATGGTCG----AAAAATCATTTTTGA----TTTTGT-GACT-TGACAGACATT--TTAAAGCA-C--------------------TG--GTGC--TTATT-TCC-----AA--T-GAGGGTCCTTA-CGTT---T----AAAGACGA-C-TA-TACATATTTAATG-GTG------ACA-T-ATTCTA--TTATG-TTG-AC--AACAA--------CTTTG-T--TCT--A-A-TA-------G-TTGTA-CG---ATCGC--ATGCA-----T-CTC-AAG--------T-A-CAT----TGG--------G-TT--GTAC-G-ATCG-C--TTA--TTA--CGT-C--GTT--GCC--G-AT-C-GCA-----TAA---A--TT--CA-TCAGAGAGATG--CAAA-TC-A-A-ATCG--TTA--TT-TCAAAA------TTG--T--GGG-A-TAT----GATG-T--ACAC-TTTAG--AA-GAA----G-AT-C--A-A-TTGCA--A---C-ATTATA-AGAGTGAGAA-TTA-------AC------T-C-ATCTA-T-----TTGAAAAATTC-T-TT-TTCA-TCCAAT-AAAATG---TGAAA-TTTT--A-CTTA-T-ATAT-T--AGTGGCA--TGGTACG--TT--TT---AGT-GG-AA--ATAT-CA-----A-TGGAAA-AT-TGAAAG-AAAACA-G-AAAAT--GAA-TT---TGTTC-TG-CGATAAA-T-GCAAAA--GT--A-------------AAACCA-TACTA-TGAAATCTTA-TCAA-TTGCC-CCA-TAATCG-C-AAAAT-TCGT--TA-AACAA--------ATNTGGAAAATAAG-A----CATT-G-CCATTTTTCC-TCACCTCG-T-CTC-CATGGAA-TACG-AAA-A-----A--TAAACAA-T--CCGCG-T------TGCCG-A-TCGC-TT----CCG--C------G-T---TA--ACGATCG----CGCGTTTACAGGGG
Reference ( family-1189 )     :                                                                                                                 NACCCCTG--TAAA--C---GCG-C-------GAT--CGT--TAA--CGC-GGAAGCG-A-T--C-GGCAA---C----GCGG---ATC-C--A-TT---G-AGTCATA--G--CCG--AAGTT-T-GA------TA--GCGGGTAA-GTTTTG---ATGTTATTTATGT--AT---C-AAC--G--C-TA-TA--TCTAG-T--GTAAAT--ATTTGC--ACGA----TA---TTAGTAGAGGAGG----GGCAT--T--ATATG-AGA-C-CTAC-AT-T--A-CGA-T-ACAACTANA--AGACG--TTATTC-CC-AC--AAC-T-GATGG----T-G-TAAA-TG----TAATT-T--AATTGA---CC-G-ATTT-GG-T-TAC-AAAATA---TGGAA-T--TTC-TT--AC-TGTTATGTCA-TTTATT-TT-TA--TCATG---TCC-C--ACTTTATT-C-CAAA-AT-CNA-ATTGATTTTA-CAA--ATCAA-----GA--TGA--TAT--AAACTTT----ATA--TAC-----ATTAACAAAAAA--GTGTATT-TA-TCAGGG----TATA-TG-------AAT---NTT---TT-TT----C----AT-----G-AAAAA-----T-G-TCA----AAGT-A-NA-GGC----A-ATC-GG---CA-ACGC-AACAAA-A-TTGTT-T---GT--A-----A---------G---------TACAA----------T-GCGAAGAAAGCG---TCGTACAACTCA-A-TAGAT---ACAAGA------------TG-AT--T---AGAAATGGTCG----AAAAATCATTTTTGA----TTTTGT-GACT-TGACAGACATT--TTAAAGCA-C--------------------TG--GTGC--TTATT-TCC-----AA--T-GAGGGTCCTTA-CGTT---T----AAAGACGA-C-TA-TACATATTTAANG-GTG------ACA-T-ATTCTA--TTATG-TTG-AC--AACAA--------CTTTG-T--TCT--A-A-TA-------G-TTGTA-CG---ATCGC--ATGCA-----T-CTC-AAG--------T-A-CAT----TGG--------G-TT--GTAC-G-ATCG-C--TTA--TTA--CGT-C--GTT--GCC--G-AT-C-GCA-----TAA---A--TT--CA-TCAGAGAGATG--CAAA-TC-A-A-ATCG--TTA--TT-TCAAAA------TTG--T--GGG-A-TAT----GATG-T--ACAC-TTTAG--AA-GAA----G-AT-C--A-A-TTGCA--A---C-ATTATA-AGAGTGAGAA-TTA-------NC------T-C-ATCTA-T-----TTGAAAAATTC-T-TT-TTCA-TCCAAT-AAAATG---TGAAA-TTTT--A-CTTA-T-ATAT-T--AGTGGCA--TGGTACG--TT--TT---AGT-GG-AA--ATAT-CA-----A-TGGAAA-AT-TGAAAG-AAAACA-G-AAAAT--GAA-TT---TGTTC-TG-CGATAAA-T-GCAAAA--GT--A-------------AAACCA-TACTA-TGAAATCTTA-TCAA-TTGCC-CCA-TAATCG-C-AAAAT-TCGT--TA-AACAA--------ATNTGGAAAATAAG-A----CATT-G-CCATTTTTCC-TCACCTCA-T-CTC-CATGGAA-TACG-AAA-A-----A--TAAACAA-T--CCGCG-T------TGCCG-A-TCGC-TT----CCG--C------G-T---TA--ACGATCG----CGCGTTTACAGGGG
gi|1                          :                                                                                                                        G--TGAA--C---GCG-C-------GATTCCGTATTGA--CGC-GGACGCG-AATAGC-GGCCA---CACAAGCGGCTAATT-CCGA-TTTCTG-AGTCATATAG--CCG--AAGTTAT-GA------TA--GGGCATAAAGTTTTGTTGATGTTACTTATGTGAAT---CGAAC--GA-CGTA-TA--TATAG-TTGGCTAAT--ATTTGCTGACGAAGTATAAGTTTAGTAGAGGAGGCAGGGACAT--CTAATATGGAGATC-CTG--AG-T--A-CAAGT-ACAACTAGACAAGACG--TTATTC-GC-AC--ACC-TCGATGAGAGAC-G-TAAAATGACATTAATT-TTGAATTGA---CCCGTATTTAGG-T-TAC-AGAATACCCTGGAAAT--TTC-TTTTACCTTTTATGTCAATTTATT-TT-TAACTCATG---TCC-CTCACTTTATT-C-CAAA-AT-CAATATTGATTTTACCAACTATGAACGAATGA--TGAGTTATTGAAACTTTTTAAATAATTACTATGAGTTAACAAAAAATCATGTACT-T----AGGGTGTTTATA-TGGTGAATAAAT---GCT---TTATTATTGCA---AT-----G-AAAAA-----TAG-TCAAAACAAGT-A-GA-GTC----A-TTC-AGCGCCA-ACGC-AACAAA-AGGTGTT-----------------------------------TACA-------------------AAAGCGA--CCGTACAACTCA-A-TAGAT---AAAAAAAAAAAGAATTTTCGAAT--TTA-AGAAATGGTTG----AAAAATCATTTTTGAACTGTATGGTCGAC--TGGCA-ACATTTCTTAAAGCA-CACTCGTTCTTTTCTTCAAGATT--GTGC--TTGTT-TCCTCAGAAA--TGGAGGGTCCTTAGCGTTAGGTCTTAAAAGACGGCC-TATTACATACTTTATG-GTGTAGGAAACAGTAATTCTAATTTATG-TTGTAC--ATCAACAGAGGTTCTTTG-TCATCTTAA-G-TA-------G-TTGTATCGACTATCGCTAATGCATTCAGT-CTCAAAG--------C-ACCAT----TGGTGGGTATAG-TTAAACAC-G-ATCG-C--TTAACTTAGCTGTAA--GTTTGGCCTAGTATGC-GCA-----TAATACA--TTGACATTCAGAGAGA-G--C-AA-TC-ATATATCGTATTACTTT-TCAAAATCTGATTTG--TAAGGG-A--AT----GATG-TTAACCC-TTTAA--AA-AGA----G-ATAC--ACA-TT-CA--ATCTC-ATTATATAGAGTGAGAATTTAACTCCATAC------T-C-ATTTA-TTATAATTGAAAAATTC-T-TT-TTCA-TCCAAT-AAAATG---TGAAA-TTTTTAG-CTTA-T-ATAA-TAAAGTGGCAACTGGTACG--TTTATT---A-T-GG-AAG-ATATACATAG--G-TAGAAATTT-TGAAAG-AAAGCA-G-AAAAT--GAA-TTTTCTGTTC-TGTTAATAAA-T-GCAAAAAGGT--AATATGTGTTTGCTAAACGA-AAC-A-TG-AATC-TA-TCAATTTGCCACCA-TAATCGAC-AAAAT-TCGT--T--AACAA--------ATATGGAAATAAAG-ATTATCATG-G-CC-TTTTTTC-TCACCTCA-T-ATCTCAT--AA--ACG-AAA-A-----GATTAAACAATT--CCGCGTT------TGCCGTATTCGCATT----CCAGCC------G-T---TA--ACGATTGCTTCCGCGTT
gi|1                          :                                                                                                                   CCCTTG--TAAAATC---GCG-CTCAATACGAG--CTT--TAA--CGC-GGAAGCA-A-T--C-GTTAA---C----Gaaagctcgtattgagcgcgattttacaaggggtg
gi|10                         : gtgaacgcgcgattccgtattgacgcggacgcgaatagcggccacacaagcggctaattccgatttctgagtcatatagccgaagttatgatagggcataaagttttgttgatgttacttatgtgaatcgaacgacgtatatatagttggctaatatttgctgacgaagtataagtttagtagaggaggcagggacatctaatatggagatcctgagtacaagtacaactagacaagacgttattcgcacacctcgatgagagacgtaaaatgacattaattttgaattgacccgtatttaggttacagaataccctggaaatttcttttaccttttatgtcaatttatttttaactcatgtccctcactttattccaaaatcaatattgattttaccaactatgaacgaatgatgagttattgaaactttttaaataattactatgagttaacaaaaaatcatgtacttagggtgtttatatggtgaataaatgctttattattgcaatgaaaaatagtcaaaacaagtagagtcattcagcgccaacgcaacaaaaggtgtttacaaaagcgaccgtacaactcaatagataaaaaaaaaaagaattttcgaatttaagaaatggttgaaaaatcatttttgaactgtatggtcgactggcaacatttcttaaagcacactcgttcttttcttcaagattgtgcttgtttcctcagaaatggagggtccttagcgttaggtcttaaaagacggcctattacatactttatggtgtaggaaacagtaattctaatttatgttgtacatcaacagaggttctttgtcatcttaagtagttgtatcgactatcgctaatgcattcagtctcaaagcaccattggtgggtatagttaaacacgatcgcttaacttagctgtaagtttggcctagtatgcgcataatacattgacattcagagagagcaatcatatatcgtattacttttcaaaatctgatttgtaagggaatgatgttaaccctttaaaaagagatacacattcaatctcattatatagagtgagaatttaactccatactcatttattataattgaaaaattctttttcatccaataaaatgtgaaatttttagcttatataataaagtggcaactggtacgtttattatggaagatatacataggtagaaattttgaaagaaagcagaaaatgaattttctgttctgttaataaatgcaaaaaggtaatatgtgtttgctaaacgaaacatgaatctatcaatttgccaccataatcgacaaaattcgttaacaaatatggaaataaagattatcatggccttttttctcacctcatatctcataaacgaaaagattaaacaattccgcgtttgccgtattcgcattccagcC-TTTCG--AA-GAT----G-AG-C--A-A-TTGCA--A---C-ATTAAA-AGAGTGAGAA-TTG-------ACATACAATGT-ATGTA-T-----TTGAAAAATTC-T-TT-TTCT-TTCAAT-AAAGTA---GGAAA-T----------------------AGTGGCA--TGGTACG--TT--CT---AGT-G--AA--ATAT-CA-----A-TGGAAA-AC-TGAAAG-AAA-CA-G-AAAAT--GAA-TT---TGTTC-TG-CGTAAAA-T-GCAAAA--GT--A-------------TAAGGA-TACTA-TGAAATCTTA-TCAA-TTGTC-CCA-TAATCG-C-AAAAT-TCGT--GA-AAAAA--------ATCTGGAAAATAAG-A----CATT-A-CAATTTTTCC-TCAACTCG-T-CTT-CATGAAA-TACA-AAATAAATTTA--TAAACAA-T--CTGCG-T------TGCCG-C-TCAC--------------------------------ATCG----CGCGTGTACAGGGGgtg
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                              T---C-AAT--GACT-TA-TA--TCT------GTAAATCGATT-GC--ACGA----TA---ATAGTATGGCAGG----GACAT--TA-ATATA-GGA-CTTTAA-AT-T--CTCAA-T-A-----ATA--CGACGCTTTATTC-CC-ACGAAACAT-CGTAG----TCG-TAAA-TG-----AATTAT--AATTGAGATAC-G-AATT-TG-T-TTC-AAAAAT---TGAAA-T--T---TT--GC-TGTTATATCT-TTCATTATTGTA--TCATGA--CCC-C--AC-TTAT-------A-ATGACA-CTTAAGTATA-CAA--CT-----------------TAT--A----TT----GTA--TAC----------CAAAAAG--TTGGATTCCA-TC---G----T-TA-TG--------AT---GCT---TT-TT----C----AT--------AAAACTC--T-G-TCA----AAGT-ATAA-GGC----AGATC-t
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       aagccttggagttcttgtctattattagcagCG--TT--GTG--AGT-GG-GATAACAT-CATCTAGA-TGGAAA-AA-TGAAG------------AAAC--GAA-TT---TGTTT-TG-CG-TAAC-TTGCAAAT--GT--G-------------AAAACA-TGCTG-TAAAATCTTA-TTAA-TTGTC-CCA-TAATCG-C-AAAAT-TCGTGGGG-AAGAA--------ATCTGGAAAATAAG-A----CATT-G-CCATTTTT-C-TCACCTCG-T-CTT-CAAGGAA-TACA-AAT-A-----A--TAAACAA-T--CCCCG-T------TGCAG-A-TTGC-AT----CCA--C------T-TCACTA--ACGATCG----CGCGTTTACAGGAGaaa
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        gAA--------CTT-G-T--TCT--C-A-TC-------G-TTGTATCC---ATCGCC-AT-CA-----TACTC-ACT--------TCA-C-T----TGA--------G-TT--CTAC-T-ATCGAC--CTA--ATA--CGT-T--GCTTCGCC--G--T-T-GCA-----TAA---A--T----A-TCCCA----TG--CAAA-TG-A-A-ATCT--TCAA-TT-TCAAAT------TGG--T--GCG-ACTAT----G-T--T--ACAC-TTTAGC-AATGAA----G-AT-A--A-A-TTGCA--A---A-CTTATG-AGAGTAA--A-TTA-------T-------T-C--TCTA-T-----TTGATAAATTC-T-TT-TCCT-CCCCAT-AAAGTACATTGAAA-TT
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      --AGTCGCA--TGGT-CA--TT--TTCTAAGT-GA-AA--ATCT--------A-TGTGAA-ATATGAAA---AAACA-GGAAAATACGAA-TT---T-TCT-TG-CG-TAAC-TTGCAACATGGTCAA-------------AAACAA-AACTG-GTAAA-CTTA-T-AA-T-GTC-CCA-TAATCG-CCAAAATCTCGT--TG-GGCAAGAGGAAAAATCTGGAAA-TAAG-A----ACTT-G-CCATTCTTCT-CAACCTCAGTATTT-CAAGGAA-TAC---AA-C-----A--T-AACAA-T--CC
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    G--------T-A-CATGTGGTGG--------A-TG--GTAC-G-ATCG-C--TTT--TTA--CAG-C--GTT--GCT--G-AT-C-GCAGAGCATAA---A--TT--C--TC-GAGAGATGTACAAA-TC-A-A-ATCG--TTA--TT-TGAAAAG-----TTG--T--TGA-C-TATTATAGATA-T--GCAT-CCTGG------------G-AC-CTTA-A-T------G---C-ATT-----GA---AAAA-TCC-------CT------T-T-ATGCA-T-----TTGAAATATCC-T-TT-TCCA-c
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tgtgcaattgtgtgtttataatatggcgggttGAGACATTC-T-TTCTTCT-TTCAAT-AAAATA---TTAAA-TTTT--A-TTTA-T-ATAT-T--AGTGGCA--TGGTGCG--TT--TT---AAT-GG-AA--ATAT-TA-----G-TGG-AA-AT-TGAAAG-AAAACG-G-A-----------T---TGTTC-TG-CG-TAAA-T-ACAAAA--GT--A-------------AAA--A-CACTG-CTAAATGTTA-TCAG-TTGTC-CCA-TAATCG-C-AAAAC-CTGT--GACAAC-A--------GTCTTGGAAATAAA-A----CCTT-G-C
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              T--A-A-TA-------G-TTGTA-CG---ATCGC--ATGCA-----C-CTC-AAGGAGTCAAGC-A-CAT----TGG--------G-TT--GTAC-G-ATCG-C--TTA--TTA--TGT-C--GTT--GCC--G-AT-C-GCA-----TAA---A--TT--CA-TCAGACA--TG--CAAA-TC-A-A-ATCG--TTA--TT-TCAAAA------TTG--T--GGG-A-TAT----GATG-T--ACAC-TTTAG--AA-GAA----G-AT-C--A-A-TTGCA--A---C-ATTACA-AGAGTGAGAA-TTA-------AC------T-C-ATCTG-T-----TTGAA
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      --TTATG-TTG-AC--AACA---------CTTTG-T--TCT--ACA-TATGTAATTG-TTGTT-CG---ATCGC--ATGCA-----T-CTT-AC---------T-A-CGT----TGG--------G-TT--GTAC-G-ATTG-G--TTA--ATA--CGT-C--GTT--GCC--G-AT-C-GCA-----TAA---A--TT--CT-TCAGAGACATG--CAAA-TA-A-A-ATTG--CTA--TT-TTAAAA------TTG--T--GGG-A-T
gi|19                         :                                                                                                                 gACCCCTT--TAAA--C---GCG-C-------GAT--CGT--TAA--CGC-AGAAGCG-A-T--C-GGCAA---C----GCGG---ATC-T--A-TT---G-AGTCATA--A--CCG--AAAAT-T-GA------TA--TTGGGTAA-GTTTTG---ATGTCATTTATGT--AT---C-AAC--A--A-TA-TA--TCTAG-T--GTAAAT--ATTTGC--AC
gi|2                          :                                                                                                                  ACCCCTG--TAAA--CCAGGTG-C-------GAT--CGT--TAA--CGC-GGAAGCG-A-T--C-GGCAA---C----GCGG---ATC----A-TT---G-AGTCATA--G--CCG--AATTG-TAGG------TA--GCGGGTAA-GTTTTG---ATGTTATTTATGT--ATAATC-AAC--G----TA--A--TCTAG-T--GTAAATT-ATTTGC--ACGA----TA---TTAGTAGAGGAGG----GGCAT--T--ATATG-AGA-C-CTAC-A---------A-T-ACAACTACA--AGACG--TTATTC-CC-AC--AAC-T-GATGG----T-G-TAAA-TG----TAATT-T--AATTGA---CC-G-ATTT-GG-T-TAC-AAAAAA---TGGAA-T--TTC-TT--AC-TGATATGTCA-TCTATT-TT-TA--TCATG---TTC-C--ACTTTATA-C-CAAA-AT-CAT-ATTGATTTTA-CAA--ATCAA-----GAT-TGA--TAT--AAACTTT----ATA--CAC-----ATTAACAAAAAA--GTGTATT-TA-TCAGGG----TATA-TG-------AAT---ATT---TT-TT----C-----T-----ACAAAAA-----T-G-TCA----AAGTAA-GA-GGC----A-ATCGGG---AA-ACGC-AACAAA-A-TTGTTAC---AT--A-----AGCGATC---G---------TACAA----------T-GCAAAGAAAGCGA--TCGTACAACTCA-A-T-GAT---ACAAG-------------TG-AT--T---AGAAATGGTTG------AAATCA-TTTTGA----TTTTGT-GACT-TGACAGACATT--TT-AAGCAGC--------------------TG--GTGC--TTATT-TCC-----AA--T-AGTGGTCCTTA-CGTT---T----AAAGACGA-C-TA-TACATATTTAAGA-GTG------ACT-T-ATTCTA--TTATGTTTG-AC--AACA----------TTTG-T--TCT--A-A-TA-------G-TTGTA-CG---ATCGC--ATGCA-----C-CTC-AAG--------C-A-CAT----TGG--------G--T--GTAC-A-TCCG-C--TTA--TTAT-CGT-C--G-T--GCC--G-AT-C-GCA-----TAA---A--TT--CA-TCAGAGAGATG--CAAA-TCAA-A-ATCG--TTA--TT-TCAAAA------GTAT-T--GGG-A-TAT----GATG-T--ACAC-TTTAG--AA-GAA----GAAT-CA-A-A-TTGCAACA---C-ACTATA-AGAGTGAGAA-TTA-------AC------T-C-ATCTATT-----TTGAAAAATTC-T-TT-TTCA-TCAATT-AAAATG---TTAAT-ATTT--A-CTTA-T-ATAT-T--AGTGGCA--TGGTACG--TT--TT---AGT-GGAAA--ATAT-CA-----A-TGGAAA-AT-TGAAAGAAAAACA-G-AAAAT--GAATTT---TGTTC-TG-CAATAAA-T-GCAATA--GT--A-------------AAACCA-TACTA-TGAAATCTTAGTCAA-TTGCC-TCA-TAATCG-C--AAAT-TCGT--TA-AACAA--------AATAGGAAAATAAGCA----TATTGG-CCATTTTTCC-TCACCTCA-T-CTC-CAGTGAA-TACG-AAA-A-----A--TAAAC-A-T--CCGCA-TGACCCGTGCCG-A-TCGC-TT----CCG--CCCCGCAG-T---TA--AGCATCG----CTCGTTTACAGGGG
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              cc-A-TAT----AATA-T--ACAC-TTTAG--AA-GAA----G-AT-C--A-A-ATGCA--A---C-ATAATA-AGAGCAAAAA-TTG-------AC------C-C-CTATT-T-----TTGAGACATTC-T-TTCTTCT-TTCAATAAAAATA---TCAAA-TTTT--A-TTTA-T-ATAT-tg
gi|21                         :                                                                                                                  ACCCCTGCCTAAA--C---GCG-C-------GAT--CGT---AA--CGC-GGAAGCGAA-T--C--GCAA---C----GCGG---ATC-CAGA-CT---GCAATCATA--AGTCCGACAAGTT-T-GAGGGGAGTA--GCGGGTAA------A---ATGTTTTTTATGG--AT---C-Agacaacagtcttggaaata
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               cc-AAAAA--------ATCTGAAAAATAAG-A----CATT-G-CCCTTTTCTC-TCACCTCG-T-CT---------------AAA-A-----A--TAAACAA-TTTCCGCG-T------TGCCG-A-TTGC-AT----ACG--C------G-T---TG--ACTATCG----CGCGTTTACAGGGGgt
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GGAAATAAA-A----CCTT-G-CCATTTTT---TCACCTCG-T-AAT-CAAGGAA-TACA-CAA-A-----A--TAATCAA-T--TCGCG-T------TGCCG-A-TT-C-AT----TCG--C------G-T---TA--ACGCTCG----CGCGTTTAAAGGGtg
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ttGGAAATAAA-A----CCTT-G-CCATTTTT---TCACCTCG-T-AAT-CAAGGAA-TACA-CAA-A-----A--TAATCAA-T--TCGCG-T------TGCCG-A-TTGC-AT----TCG--C------G-T---TA--ACGCTCG----CGCGTTTCAAGGGGat
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tAGTAGAGGAGG----GGCAT--T--ATATG-AGT-C-CTAC-AT-TGTA-CAA-T-ACAACTACA--AGACG--TCATTA-CC-AC--AAC-T-GATGG----T-G-TAAA-Tt
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                         AGTT-T-GA------TA--GCGGGTAA-GTTTTG---ATTTTAATTATGT--GT---C-AA
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gttcactaacgtgtatgccgttatgcagaacaacAA-A-----A--TAAACAA-T--CCGCG-T------TGCCG-A-TCGC-TTGGAACCG--C------G-T---TA--ACGAT--------CGTTTACAGGAG
gi|28                         :                                                                                                                  ACCCCTG--TAAA--C---GCG-C-------GAT--CGT--TAA--CAC-GGAAGCG-A-T--C-GGCAA---C----GCGG---ATC-C--A-TT---tg
gi|3                          :                                                                                                                    CCCTG--TAAA--C---GCG-C-------GAT--CGT--TAA--CGC-GGAAGCG-A-T--C-GGCAA---C----GCGG---ATC-C--A-TT---G-AGTCGTA--G--CCG--AAGTT-T-GA------TA--GCGGGTAA-GTTTTG---ATGTTATTTATGT--AT---C-AAC--G--C-TA-TA--TCTAG-T--GTAAAT--ATTTGC--ATGA----TA---TTAGTAGAGGAGG----GGCAT--T--ATATG-AGA-C-CTAC--T--------A-T-ACAACTACA--AGACG--TTATTTACC-AC--AAC---GATGG----T---TAAA--G----AATTT-T--AATTGA---CC-G--TTT-GG-TGTAC-AAAATA---TGGAA-TACTTC-TT--AC-TGTTATGTCA-TTATTT-TT-TA--TCATGCATTTC-C--AC-TTATTCC-CAAATAT-CAT-ATTGATTTTA-CAA--ATCAA-----GA--TGA--TAT--AAACTTT----ATA--TAC-----ATTGAC-AAAAA--GTGTATT-TA-T-AGTG----TAAC-TG-------AATTACGTT---TT-TT----C----AT-----T-GAAAT-----T-G-TCA----A--T-A-GATGGC----A-ATC-GG---CATAC-C-AACAAA-A-TTGTT-TTAGATCAA-----A---------G---------TGCGATGTGTTCAATT-GCAAAGAAAGCG---TCGTACAACTCATA-TAGAT---ACAAGA------------CG--T--T------GATTGTCGTCTCGGACATCA-TTTTGA-----TTTGT-GACT-TGACAGACATT--TT-AAGCA-C--------------------TG--GTGC--TTATT-CCT-----AATTT-G-GGGTCCTTA-CGTT---A----ATAGACGA-C-TA-TACATATTGAA-G-GTAC-----ATA-T-ATACTA--TCATG-TTG-AC--AACA-----------TTG-T--TTT--A-A-TA-------G-TTGTA-CG---ATCGT---TGCA-----T-CTC-AAG--------TCA-CAT----TGG--------G-TT--GTAC-G-ATCG-C--TTA---TA--TGT-C--GTT--GCC--G-AT-CTGCA-----TAA---A--TT--CA-TCAGAGAGATG--CAAA-TC-A-A-ATCG---TA--TTATTAAAA------TTG--T--GGATA-TAT----GATG-T--AAAC--TTAGATAG-GAA----G-AT-C--A-ATTTGCA--A---CAATTATA-AGAGTGAGAA-TTA-------AC------T-C-ATCTA-T-----TTGAAAAACTC-T-TT-TTCA-TCCAAT-AAAATG---TGAAA-TGTT--A-CTTA-T-A-------AGTGGCA--TGGTACG--TT--TT---TGT-GG-AA--ATAT-CA-----A-TGGAAA-AT-TGAAAG-AAAACA-G-ATAAT--GAA-TT---TGTTC-TG-CAATAAA-T-GCAAAA--GT--A-------------AAACCA-TACTA-TGAAATCTTA-TCAA-TTGCC-CCA-TAATCG-C-AAAAC-TCGT--TA-AACAA--------ATATGTAAAATAAT-A----TATT-G-CCAATTTTCC-TCACCTCA-T-CTC-CTTGGAA-TACG-AAA-A-----A--TATACAA-T--CCGCG-T------TGCCG-A-TCGC-TT----CCG--C------G-T---TA--ACTATCG----CGCGTTTACAGGGG
gi|30                         :                                                                                                                       TG--TAAA--C---GCG-C-------GAT--CGT--TAA--CGC-GGAAGCt
gi|4                          :                                                                                                                  ACCCCTG--TAAA--C---GCG-C-------GAT--CGT--TAA--TGC-GGATGCG-A-T--C-GTTAA---C----GCGG---ATC-C--A-TC---G-AGTCATA--G--CCA--AAGTT-T-GA------TA--GCGGGTAA-GTTTTG---ATGTTATTTATGT--AT---C-AAC--G--C-TA-TA--TCTAG-T--GTAAAT--ATTTGC--ACGA----TA---TTAGTAGAGGAGG----GGCAT--T--ACATG-AGA-C-CTAC-ATGT--A-TGA-T-ACAACTAAA--AGACG--TTATTC-CC-AA--AAC-T-GATAG----T-G-TAAA-TG----TAATT-T--AATTGA---CC-G-ATTT-GG-T-TAC-AAAATA---TGGAA-T--TTC-TT--AC-TGTTATGTCA-TTTATT-TT-TA--TCATG---TTC-C--ACTTTATT-C-CAAA-AG-CCA-ACTGATTTTA-CAA--ATCAA-----GG--TGA--TAT--AAACTTT----ATA--TAC-----ATTAACAAAAAA--GTGTAAT-TA-TCAGGG----TATA-TG-------AAT---TTT---TT-TT----C----AT-----G-AAAAA-----T-G-TCA----AAGT-A-CA-GGC----A-ATC-GG---CA-ACGT-AACAAA------TT-T----T--A-----A-------------------TACAA----------C-GCAA-----------TCGTACAACTAA-A-TAGAT---ACAAG-------------TG-AT--T---AGATATGATTT------AAATCA-TTTTGA----TTTTGT-GACT-TGACAGACATT--TT-AAGCA-C--------------------TG--GTGC--TTATT-ACC-----AA--T--AGGGTCCTTA-CGTT---T----AAAGACGA-C-TA-TATATAACTAATT-GTG------ACA-T-ATGCTA--TTATG-TTG-AC--AAC-A--------TTTTG-T--TCT--A-G-TA-------G-TTGTA-CG---ATCGC--ATGCA-----T-CTC-AAG--------T-A-CAT----TGG--------A-TT--GTAC-G-ATCG-C--TTA--TTA--TGT-C--TTT--GCC--G-AT-C-GCA-----TAA---A--TT--CA-TCAGAGAGATG--CAAA-TC-A-A-ATCG--TTA--TT-TCAAAA------TTG--T--GGG-A-TAT----GATG-T--ACAC-TTTAG--AA-GAA----G-AT-C--A-A-TTGCA--A---C-ATTATA-AAAGTGAGAG-TTA-------TC------T-C-ATCTA-A-----TTGAAAAATTC-A-TT-TTCA-TCCAAT-AAAATG---TGAAA-TTTT--A-CTTATT-ATATAT--AGTGGCA--TGGTACG--TT--TT---AGT-GG-AA--ATAT-CA-----A-TGG--A-AT-TGAAAG-AAAACA-G-AAAAT--GAA-TT---TGTTC-TG-CAATAAA-T-GCAAAA--GT--A-------------AAACCA-TACTA-TGAAATCTTA-TCAA-TTGCC-CCG-TAATCG-C-AAAAT-TCGT--TA-AACAA--------ATATGGAAAATAAG-A----TATT-G-CCATTTTTCC-TCACCT-A-T-CTC-CATGGAA-TACG-AAA-A-----A--TAAACAA-T--CCGCG-T------TGCTG-A-TTGC-TT----CCG--C--------T---TA--ACGATCG----CGCGTTTACAGGGG
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         tAAAAAA--GTGTATT-TA-TTAGGG----TATAATG-------AAT---ATT---TT-TT----TTTTGAT-----G-AAAGAAAATAT-G-TCA----AAGT-A-GA-GGCCAAAA-ATC-GG---CA-ACGCCAACAAA-A-TTGTT-T---AC--A-----AAGCCGATTCG---------TACAA----------TTGC-AAGAAAGCGAAATCGTACAACTCA-AATAGAT---A-AAAT------------TG-AT--TTTAGGAAATGGTCG----AAAAATCATTTTTTA----TTTTGT-GACT-TGACAGACATT--TTAAAGCA-T--------------------TGGCGTGCTTTTATTATCC-----AA--T--AGAATCCTT--CGTT---T----AAAGACGA-C-TG-TACATATTTAAAGTGTG------ACA-T-ATT-TA--TTATGCTTG-ACAAAACAA--------TTTTGTT--TCT--A-ATTA-------G-TTGAT-CG---ATCGC--ATGCA-----T-ATC-AAG--------T-A-CAT----TGG--------G-TTG-GTACGG-ATCG-C--TTA--TTAT-TGT-C--GTT--GCC--G-AT-C-GCA-----TAA---AGTTT--CA-TCAGAGAGATG--CAAATTC-A-A-ATCGT-TTAT-TT-TCAAAA------TTGTTT--GGG-A-TAT----GATGTT--ACACTTTTAG--AA-GAA----G-AT-C--A-A-TTGCA--A---C-A-TATA-AGAGTGGGAA-TTA-------AC------T-CGATCTA-T-----TTGAAAAATTCTT-TT-TTCATTCCAAT-AAAATGT--TGAAATTTTT--ACCTTA-C-ATAT-T--AGTGGCA--TGGTACGTTTT--TT---AGTGGG-AA--ATAT-CA-----ATTGGAAA-AT-TGAAAG-AAAACAGG-AAAAT--GAA-TT---TGTTCTTG-CAATAAATT-GCAAAA--GT----------------AAACCA-TACTATTGAAACCTTA-TCAA-TTGCC-CCATTAATCG-C-AAAAT-TCGT--TA-AACAA--------ATATGGAAAATAAG-A----TATT-G-CCATTTTTCCTTCACCTCA-T-ATC-ATTGGAATTACGAAAA-A-----A--TAAACAA-T--CCGCG-T------TGCCG-A-TCGC-TT----CCG--C------GTT---TA--ACGATCG----CGCGTTTACAGGGG
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       caAGAA-----G-G-CCA----AA-T-A-CG-AGC----A--TC-G-----A-A-GC-AACAAAGA-TTGCT-TTA-GC--ATATGAA---------GCCGATCCATTACAA----------TAGCAAAGAATGCGA--TCGTACAACTCA-A-TAGATGTAACAAG-------------TG-CTGCT---AGAAATG-TTG----AAA--TCATTTTTGA----TTT-GT-GACTGCGACAGACATT--TTAAAGCA-C--------------------TG---TGCC-TTATT-TC------AA--T-GAGGTTCCTTC-GGTT---T----AAAG-CGA-CATA--ACATATTTAGTG--TG------ACA---ATTCTA--T-ATG-TTG-AA--AACAA--------TTCCG-T--TCT--A-A-TA-------GCTTGTA-CG---ATCGC--ATGCA-----T-CTC-AAG--------C-A--AT----TGG--------TCTT--GTAC-GGATCG-CCTTTA--TTA--TGT-CAGGTT--GCCC-G-AT-C-GCA-----TAA---G--TT--CA-TCAGAGAGATG--CAGA-TT-A-A-GTCG--TTA--GT-TCAAAA------TTG--T--GGACA-T-T----AATG-T--ACAC-TTAAG--AA-GAAAGAAG-AT-C--A-A-TTGCA--AA--C-ATTATA-AGAGTGAGAA-TTA-------A-------T-C-ATCTA-T-----TTGAAAAATTC-TGTT-TTCA-TCCAAT-AAAATG---TGAAA-TTTT--A-CTTA-TAATAT-T--AGTGGCA--T-GTAGG--TT--TT---AGT-GGAAA--ATAT-CA-----A-TGGAAA-AT-TGAAAG-AAAACA-G-AAAAT--G-A-TT---TGTTC-TG-CAATAAA-T-GCAAAA--GT--A-------------AAACCATTACTA-TGAAATCTTA-TCAA-TTGCC-CCT-TAATCG-C-AAAA--TCGG--TA-AACAA--------AT-TGCTAAATAAG-A----TATT-GCCCATTTTTCC-TCACCTCA-T-CTC-CATGGAA-TACG-AAA-A-----A--TAAACAA-T--CCGCG-T------TGCCG-A-TCGC-TT----CCGCTC------G-T---AAAGACGATCG----CGCGTTTACAGGGGt
gi|7                          :                                                                                                                gtctCCTTG--TAAA--C---GCGAC-------GAT--CGT--TAAAACGTTGGATGCG-A-T--CAGGTAAAATC----GCGG---ATCAC--AATT---G-AGTCATA--T--TCA--AGTTT-T-TA------TA--CCGGGTAA-GTTTTG---A-G-TATTTATGT--AT---C-AACCAG--C-TATTACCTCTAGCT--GTAAAT--ATTTGC--G-----------------AGAGGAGG----GGCATA-TA-ATATG-AGA-----AC-CT-T--A-TGA-T-ACAACTAAA--AGGAG--TTATTC-CCAAA--AAC-TAGATAG----T-GATAAA-TGTT--TAATT-T--AATTGA---CC-G-ATTT-GGTT-TACAAAAATA---TGGAT-T--TTCTTT--AC-TATTATATCtg
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           caca-TTCATT-TT-TA--TCATG---TTCAC--ACTTTATT-CACAAA-AT-CTA-ATTGATTTTA-CAG--ATCAA-----GAGTTGA--TAT--AAACTTTAATAATA--TAC-----ATTAAC-AAAAG--GTGTAAT-TATTCAAGGAA--TATA-TG-------AAT---GTTTTATT-TT----T----ATCATGAG-AAAAA-----T-GTTCA----AAGT-A-CG-ACC----ACATC-CA---CA-ACGccccccccccccccccccccccccccccccccaatttcatttttatcatgttcacactttattcacaaaatctaattgattttacagatcaagagttgatataaactttaataatatacattaacaaaaggtgtaattattcaaggaatatatgaatgttttatttttatcatgagaaaaatgttcaaagtacgaccacatccacaacg
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               cacaccttgtaaacgcgacgatcgttaaaacgttggatgcgatcaggtaaaatcgcggatcacaattgagtcatattcaagtttttataccgggtaagttttgagtatttatgtatcaaccagctattacctctagctgtaaatatttgcgagaggaggggcatataatatgagaaccttatgatacaactaaaaggagttattcccaaaaactagatagtgataaatgtttaatttaattgaccgatttggtttacaaaaatatggattttctttactattatatcccccccccccccccccccccccccccccccccaat-AAG--------A-A-CAT----TGG--------G-TT--GTAC-G-ATCG-C--TTA--ATA--TGT-C--GTT--GCC--G-AT-C-GCA-----TAA---A--TT--CA-TCAGAGAGATG--CAAA-TC-A-A-ATCG--TTA--TT-TCAAAA------TTG--T--GGG-A-TAT----GATG-T--ACAC-TTTAG--AA-GAA----G-AT-C--A-A-TTGCA--A---C-ATTATA-AGAGTGAGAA-TTA-------AC------T-C-ATCTA-T-----TTAAAAAATTC-T-TT-TTCA-TCCAAT-AAAATG---TGAAA-TTGT--A-CTTA-T-ATAT-T--AGTGGCA---GGTACG--TT--TT---AGT-GG-AA--ATAT-TA-----A-TGGAAA-AA-TGAAAG-AAAACA-G-AACAT--GAA-TT---TGTTC-TA-CAATAAA-T-GCAAAA--GT--A-------------AAACCA-TACTA-TGAAATCTTA-TCAA-TTGCC-CCA-TAATCG-C-AAAAT-TCGT--TA-AACAA--------ACATGGAAAATAAG-A----TCTT-G-CCATTTTTCC-TCCTCTCA-T-CTC-CATGGAA-TACG-AAA-A-----A--TAAAC
gi|9                          :                                                                                                                  ACCCCTG--TAAA--C---GCG-C-------GAT--CGT--GAA--CGC-AGACGCG-A-T--C-GTTAA---C----GCGG---ATC-C--A-GT---G-AAGCAAA--T--CTA--CAGTT-T-GA------TATAGCGGA-AA-GTTTTG---ATGTTATTCATGT--GT---C-AAT--G--C-TT-TA--TCTAG-T--GTAAAT--GTTTGC--ACGA----TA---TTAGTAGAGGAGG----GACATTAT--ATATG-AGA-C-TTATAAT-C--T-CAA-TAANGAATACA--AAA-A--TAAGTC-TG-CC--AA--T-AAGGG--------------G----TAATT-T--AATTGA---TC-G-ATTT-GG-T-TTC-AAAATG---TGAAA-T--TTC-TT--GC-TGTTATATCT-TTTATT-TT-TA--TCATG---ACC-C--ACTTTATT-----AA-AT------------------A--ATTAA-----GG--TGA--TAC--AAACTTT----ATA--TGT-----ATTACCAAAAAA--GTGTATT-TA-TCAGGG----TATA-TG-------AATG--CTT---TT-TT----C----AT-----A-AAAAT-----T-G-TCA----AAGT-A-TA-GGC----A-ATC-AA---CA-ATGC-AACA
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|29 ): GAATACAAAAATAAGTCTGCCAATAAGGGG






Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  111111111111111111111111111111111111111111111111111                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    
lowQualScore                  :                                                                                                                                         1111111                                                         1111                11111               111111                                                  1111                      11            1111  111             1111     22222               333333333333                                       111     11111111       22222              111                         111                                                  111              11111      11111                     222222222                 2222        111111                                 1111      1111111   11111       1111    22222222222222     11111                                                     1111    111111111111111111111111111111111111111111111111111  11                              111     555555555555555555555555           222222             1111   1                               55555555555555555555        11        111111   2222              22222222                         111   222222   111             1            2222222222                   1111111                  11     11111         1111111111            11111111                             111         11                                                                      11         111111                                                                                                  111111111111111                                                   111                                                     111                  11111                                                                     11  2222222222222222                                                                    11111111                                                                                                                             11111111111                                 
lowQualScore                  :                                                                                                                        55    55 666   3 1111111   55   55   55   3   0   4 4 55 4     777 8888    777   4444 4  777 5       44444   66     4 4  222222  66        4      777             66  777 4   66 8888  5  66     5 66      11      66    2222  000             0000     11111     5   666   000000000000 5 5       66       66      5  5  66   222     99999999    55 11111    5 77      000  5 5    5  5 5   5      000     5 77   5  77  5          5      5  5  77     555   5 77       11111   5  77777           5  77  3  000000000   77   77       4444   77   444444          777       5  5 11   66 0000   5  6666666   00000  888  0000  5 44444444444444     88888 4 4     9999  4 55 4   9999 8   4 0 888 5    5      1111    666666666666666666666666666666666666666666666666666  00        99            6 6     111     555555555555555555555555       1 0 555555 3    7      4444   1  6    6           99  7     6 44444444444444444444  99    55     6  777777   6666        99    11111111        6 6  6           111   555555   222      77 0   1   5  77    9999999999    5 66   66 4 4  4444444 4     8  777     00     11111 4   4   9999999999 3   7777   33333333 3  88    3 3    3 55   55   222  3 55   00   88 3  3 3   99999   666 55  55  3           55    3  3 3 3    88   22  3      444444   88 55   6 3   7777    3 55    3     3 44 3   7777 3  3 77 3   3   44 999  3     3          3   666666666666666 3 3     3 88888           3 3  6    3      3      000     3    55 4    4 4    5555       55       55  55  000   3  7  88    3  55555 3   1  3  3      3      3 3     55   3  666     3  3 66    3 7      00  1111111111111111      3     3          3    3     3   3      3 3     3    55  3     22222222  4           2 6666    2 2        4 3       3  3   3  2    3   33   2 77777 33       3 44     3 999999     3 3    7777777   22222222222 555  44       7777              
lowQualScore                  :                                                                                                                        ..    .. ...   . .......   ..   ..   ..   .   .   . . .. .     ... ....    ...   .... .  ... .       .....   ..     . .  ......  ..        .      ...             ..  ... .   .. ....  .  ..     . ..      ..      ..    ....  ...             ....     .....     .   ...   ............ . .       ..       ..      .  .  ..   ...     ........    .. .....    . ..      ...  . .    .  . .   .      ...     . ..   .  ..  .          .      .  .  ..     ...   . ..       .....   .  .....           .  ..  .  .........   ..   ..       ....   ..   ......          ...       .  . ..   .. ....   .  .......   .....  ...  ....  . ..............     ..... . .     ....  . .. .   .... .   . . ... .    .      ....    ...................................................  ..        ..            . .     ...     ........................       . . ...... .    .      ....   .  .    .           ..  .     . ....................  ..    ..     .  ......   ....        ..    ........        . .  .           ...   ......   ...      .. .   .   .  ..    ..........    . ..   .. . .  ....... .     .  ...     ..     ..... .   .   .......... .   ....   ........ .  ..    . .    . ..   ..   ...  . ..   ..   .. .  . .   .....   ... ..  ..  .           ..    .  . . .    ..   ..  .      ......   .. ..   . .   ....    . ..    .     . .. .   .... .  . .. .   .   .. ...  .     .          .   ............... . .     . .....           . .  .    .      .      ...     .    .. .    . .    ....       ..       ..  ..  ...   .  .  ..    .  ..... .   .  .  .      .      . .     ..   .  ...     .  . ..    . .      ..  ................      .     .          .    .     .   .      . .     .    ..  .     ........  .           . ....    . .        . .       .  .   .  .    .   ..   . ..... ..       . ..     . ......     . .    .......   ........... ...  ..       ....              
lowQualScore                  :                                                                                                                        00    00 444   6 8888888   00   00   00   6   1   0 0 55 0     000 5555    888   0000 4  888 0       00000   99     4 4  888888  11        4      888             11  000 0   99 2222  0  99     0 99      99      99    1111  000             6666     66666     0   222   222222222222 0 0       99       99      0  0  99   111     00000000    11 77777    7 99      000  7 7    7  7 7   7      000     7 99   7  99  7          7      7  7  99     777   7 99       00000   7  00000           7  99  0  111111111   99   99       3333   99   444444          888       0  0 55   99 6666   0  2222222   99999  888  6666  0 66666666666666     99999 4 4     4444  4 44 4   4444 9   4 2 888 0    7      5555    555555555555555555555555555555555555555555555555555  33        22            7 7     777     888888888888888888888888       0 7 555555 2    3      2222   3  7    7           22  3     7 22222222222222222222  22    88     7  777777   8888        88    22222222        7 7  7           000   888888   555      99 1   4   7  99    8888888888    0 99   11 4 4  4444444 4     9  888     66     11111 4   0   3333333333 6   7777   22222222 6  66    6 6    6 00   00   555  6 00   00   66 6  6 6   11111   444 00  00  6           00    6  6 6 6    66   33  6      111111   66 00   7 3   7777    6 00    3     3 66 3   1111 3  3 99 3   3   66 222  3     3          3   555555555555555 3 3     3 33333           3 3  7    3      6      000     6    55 0    0 0    8888       55       00  00  000   6  3  66    6  55555 6   3  6  6      6      6 6     00   6  444     6  6 99    6 3      00  8888888888888888      6     6          6    6     6   6      6 6     6    00  3     11111111  2           9 1111    9 9        0 1       1  1   1  7    1   88   9 11111 99       1 22     3 666666     3 3    2222222   55555555555 888  66       1111              
consensus                     :                                                                                                                NACCCCTG--TAAA--C---GCG-C-------GAT--CGT--TAA--CGC-GGAAGCG-A-T--C-GGCAA---C----GCGG---ATC-C--A-TT---G-AGTCATA--G--CCG--AAGTT-T-GA------TA--GCGGGTAA-GTTTTG---ATGTTATTTATGT--AT---C-AAC--G--C-TA-TA--TCTAG-T--GTAAAT--ATTTGC--ACGA----TA---TTAGTAGAGGAGG----GGCAT--T--ATATG-AGA-C-CTAC-AT-T--A-CGA-T-ACAACTA--CAAGACG--TTATTC-CC-AC--AAC-T-GATGG----T-G-TAAA-TG----TAATT-T--AATTGA---CC-G-ATTT-GG-T-TAC-AAAATA---TGGAA-T--TTC-TT--AC-TGTTATGTCA-TTTATT-TT-TA--TCATG---TCC-C--ACTTTATTC-C-AAA-AT-CNA-ATTGATTTTAC-AA--ATCAA-----GA--TGA--TAT--AAACTTT----ATA--TAC-----ATTAACAAAAAA--GTGTATT-TA-TCAGGG--T----ATA-TG-------AAT---G-TT---TT----TT-C----A-T-----G-AAAAA-----T-G-TCAAA----GT-A-NA-GGC----A-ATC-GGC---A-ACGC-AACAAA-AT-TGTT-T------AT--AA---------G---------TACAAT-G----------CAAAGAAAGCGA--TCGTACAACTCA-A-TAGAT---ACAAG-------------CG-AT--T---AGAAATGGTCG----AAAAATCATTTTTGA----TTTTGT-GACT-TGACAGACATT--TTAAAGCA-C--------------------TG--GTGC--TTATT-TCC-----AAT--GAGGGTCCTTA-CGTT---T----AAAGACGA-C-TA-TACATATTTAATG-GTG------ACA-T-ATTCTA--TTATG-TTG-AC--AACAA--------CTTTG-T--TCT--A-A-TA-------G-TTGTA-CG---ATCGC--ATGCA-----T-CTC-AAG--------T-A-CAT----TGG--------G-TT--GTAC-G-ATCG-C--TTA--TTA--CGT-C--GTT--GCC--G-AT-C-GCA-----TAA---A--TT--CA-TCAGAGAGATG--CAAA-TC-A-A-ATCG--TTA--TT-TCAAAA------TTG--T--GGG-A-TAT----GATG-T--ACAC-TTTAG-A--A-GAA----G-AT-C--A-ATT-GCA--A---CA-TTATA-AGAGTGAGAA-TTA-------AC------T-C-ATCTA-T-----TTGAAAAATTC-T-TT-TTCA-TCCAAT-AAAATG---TGAAA-TTTT--A-CTTA-T-ATAT-T--AGTGGCA--TGGTACG--TT--TT---AGT-GG-AA--ATAT-CA-----A-TGGAAA-AT-TGAAAG-AAAACA-G-AAAAT--GAA-TT---TGTTC-TG-CGATAAA-T-GCAAAA--GT--A-------------AAACCA-TACTA-TGAAATCTTA-TCAA-TTGCC-CCA-TAATCG-C-AAAAT-TCGT--TA-AACAA--------ATNTGGAAAATAAG-A----CATT-G-CCATTTTTCC-TCACCTC-GT-CTC-CATGGAA-TACG-AAA-A-----A--TAAACAA-T--CCGCG-T------TGCCG-A-TCGC-TT----CCG--C------G-T---TA--ACGATCG----CGCGTTTACAGGGG
Reference ( family-1189 )     :                                                                                                                NACCCCTG--TAAA--C---GCG-C-------GAT--CGT--TAA--CGC-GGAAGCG-A-T--C-GGCAA---C----GCGG---ATC-C--A-TT---G-AGTCATA--G--CCG--AAGTT-T-GA------TA--GCGGGTAA-GTTTTG---ATGTTATTTATGT--AT---C-AAC--G--C-TA-TA--TCTAG-T--GTAAAT--ATTTGC--ACGA----TA---TTAGTAGAGGAGG----GGCAT--T--ATATG-AGA-C-CTAC-AT-T--A-CGA-T-ACAACTA--CAAGACG--TTATTC-CC-AC--AAC-T-GATGG----T-G-TAAA-TG----TAATT-T--AATTGA---CC-G-ATTT-GG-T-TAC-AAAATA---TGGAA-T--TTC-TT--AC-TGTTATGTCA-TTTATT-TT-TA--TCATG---TCC-C--ACTTTATTC-C-AAA-AT-CNA-ATTGATTTTAC-AA--ATCAA-----GA--TGA--TAT--AAACTTT----ATA--TAC-----ATTAACAAAAAA--GTGTATT-TA-TCAGGG--T----ATA-TG-------AAT---G-TT---TT----TT-C----A-T-----G-AAAAA-----T-G-TCAAA----GT-A-NA-GGC----A-ATC-GGC---A-ACGC-AACAAA-AT-TGTT-T------AT--AA---------G---------TACAAT-G----------CAAAGAAAGCGA--TCGTACAACTCA-A-TAGAT---ACAAG-------------CG-AT--T---AGAAATGGTCG----AAAAATCATTTTTGA----TTTTGT-GACT-TGACAGACATT--TTAAAGCA-C--------------------TG--GTGC--TTATT-TCC-----AAT--GAGGGTCCTTA-CGTT---T----AAAGACGA-C-TA-TACATATTTAATG-GTG------ACA-T-ATTCTA--TTATG-TTG-AC--AACAA--------CTTTG-T--TCT--A-A-TA-------G-TTGTA-CG---ATCGC--ATGCA-----T-CTC-AAG--------T-A-CAT----TGG--------G-TT--GTAC-G-ATCG-C--TTA--TTA--CGT-C--GTT--GCC--G-AT-C-GCA-----TAA---A--TT--CA-TCAGAGAGATG--CAAA-TC-A-A-ATCG--TTA--TT-TCAAAA------TTG--T--GGG-A-TAT----GATG-T--ACAC-TTTAG-A--A-GAA----G-AT-C--A-ATT-GCA--A---CA-TTATA-AGAGTGAGAA-TTA-------AC------T-C-ATCTA-T-----TTGAAAAATTC-T-TT-TTCA-TCCAAT-AAAATG---TGAAA-TTTT--A-CTTA-T-ATAT-T--AGTGGCA--TGGTACG--TT--TT---AGT-GG-AA--ATAT-CA-----A-TGGAAA-AT-TGAAAG-AAAACA-G-AAAAT--GAA-TT---TGTTC-TG-CGATAAA-T-GCAAAA--GT--A-------------AAACCA-TACTA-TGAAATCTTA-TCAA-TTGCC-CCA-TAATCG-C-AAAAT-TCGT--TA-AACAA--------ATNTGGAAAATAAG-A----CATT-G-CCATTTTTCC-TCACCTC-GT-CTC-CATGGAA-TACG-AAA-A-----A--TAAACAA-T--CCGCG-T------TGCCG-A-TCGC-TT----CCG--C------G-T---TA--ACGATCG----CGCGTTTACAGGGG
gi|1                          :                                                                                                                       G--TGAA--C---GCG-C-------GATTCCGTATTGA--CGC-GGACGCG-AATAGC-GGCCA---CACAAGCGGCTAATT-CCGA-TTTCTG-AGTCATATAG--CCG--AAGTTAT-GA------TA--GGGCATAAAGTTTTGTTGATGTTACTTATGTGAAT---CGAAC--GA-CGTA-TA--TATAG-TTGGCTAAT--ATTTGCTGACGAAGTATAAGTTTAGTAGAGGAGGCAGGGACAT--CTAATATGGAGATC-CTG--AG-T--A-CAAGT-ACAACTAGACAAGACG--TTATTC-GC-AC--ACC-TCGATGAGAGAC-G-TAAAATGACATTAATT-TTGAATTGA---CCCGTATTTAGG-T-TAC-AGAATACCCTGGAAAT--TTC-TTTTACCTTTTATGTCAATTTATT-TT-TAACTCATG---TCC-CTCACTTTATTC-C-AAA-AT-CAATATTGATTTTACCAACTATGAACGAATGA--TGAGTTATTGAAACTTTTTAAATAATTACTATGAGTTAACAAAAAATCATGTACT-TA----GGG--TGTTTATA-TGGTGAATAAAT---G-CT---TTATTATTGC----AAT-----G-AAAAA-----TAG-TCAAAACAAGT-A-GA-GTC----A-TTC-AGCGCCA-ACGC-AACAAA-AGGTGTT-T------AC--AA-------------------------------------------AAGCGA--CCGTACAACTCA-A-TAGAT---AAAAAAAAAAAGAATTTTCGAAT--TTA-AGAAATGGTTG----AAAAATCATTTTTGAACTGTATGGTCGAC--TGGCA-ACATTTCTTAAAGCA-CACTCGTTCTTTTCTTCAAGATT--GTGC--TTGTT-TCCTCAGAAATG-GAGGGTCCTTAGCGTTAGGTCTTAAAAGACGGCC-TATTACATACTTTATG-GTGTAGGAAACAGTAATTCTAATTTATG-TTGTAC--ATCAACAGAGGTTCTTTG-TCATCTTAA-G-TA-------G-TTGTATCGACTATCGCTAATGCATTCAGT-CTCAAAG--------C-ACCAT----TGGTGGGTATAG-TTAAACAC-G-ATCG-C--TTAACTTAGCTGTAA--GTTTGGCCTAGTATGC-GCA-----TAATACA--TTGACATTCAGAGAGA-G--C-AA-TC-ATATATCGTATTACTTT-TCAAAATCTGATTTG--TAAGGG-A--AT----GATG-TTAACCC-TTTAA-A--A-AGA----G-ATAC--ACATT--CA--ATCTCA-TTATATAGAGTGAGAATTTAACTCCATAC------T-C-ATTTA-TTATAATTGAAAAATTC-T-TT-TTCA-TCCAAT-AAAATG---TGAAA-TTTTTAG-CTTA-T-ATAA-TAAAGTGGCAACTGGTACG--TTTATT---A-T-GG-AAG-ATATACATAG--G-TAGAAATTT-TGAAAG-AAAGCA-G-AAAAT--GAA-TTTTCTGTTC-TGTTAATAAA-T-GCAAAAAGGT--AATATGTGTTTGCTAAACGA-AAC-A-TG-AATC-TA-TCAATTTGCCACCA-TAATCGAC-AAAAT-TCGT--T--AACAA--------ATATGGAAATAAAG-ATTATCATG-G-CC-TTTTTTC-TCACCTC-AT-ATCTCAT--AA--ACG-AAA-A-----GATTAAACAATT--CCGCGTT------TGCCGTATTCGCATT----CCAGCC------G-T---TA--ACGATTGCTTCCGCGTT
gi|1                          :                                                                                                                  CCCTTG--TAAAATC---GCG-CTCAATACGAG--CTT--TAA--CGC-GGAAGCA-A-T--C-GTTAA---C----Gaaagctcgtattgagcgcgattttacaaggggtg
gi|10                         : gtgaacgcgcgattccgtattgacgcggacgcgaatagcggccacacaagcggctaattccgatttctgagtcatatagccgaagttatgatagggcataaagttttgttgatgttacttatgtgaatcgaacgacgtatatatagttggctaatatttgctgacgaagtataagtttagtagaggaggcagggacatctaatatggagatcctgagtacaagtacaactagacaagacgttattcgcacacctcgatgagagacgtaaaatgacattaattttgaattgacccgtatttaggttacagaataccctggaaatttcttttaccttttatgtcaatttatttttaactcatgtccctcactttattccaaaatcaatattgattttaccaactatgaacgaatgatgagttattgaaactttttaaataattactatgagttaacaaaaaatcatgtacttagggtgtttatatggtgaataaatgctttattattgcaatgaaaaatagtcaaaacaagtagagtcattcagcgccaacgcaacaaaaggtgtttacaaaagcgaccgtacaactcaatagataaaaaaaaaaagaattttcgaatttaagaaatggttgaaaaatcatttttgaactgtatggtcgactggcaacatttcttaaagcacactcgttcttttcttcaagattgtgcttgtttcctcagaaatggagggtccttagcgttaggtcttaaaagacggcctattacatactttatggtgtaggaaacagtaattctaatttatgttgtacatcaacagaggttctttgtcatcttaagtagttgtatcgactatcgctaatgcattcagtctcaaagcaccattggtgggtatagttaaacacgatcgcttaacttagctgtaagtttggcctagtatgcgcataatacattgacattcagagagagcaatcatatatcgtattacttttcaaaatctgatttgtaagggaatgatgttaaccctttaaaaagagatacacattcaatctcattatatagagtgagaatttaactccatactcatttattataattgaaaaattctttttcatccaataaaatgtgaaatttttagcttatataataaagtggcaactggtacgtttattatggaagatatacataggtagaaattttgaaagaaagcagaaaatgaattttctgttctgttaataaatgcaaaaaggtaatatgtgtttgctaaacgaaacatgaatctatcaatttgccaccataatcgacaaaattcgttaacaaatatggaaataaagattatcatggccttttttctcacctcatatctcataaacgaaaagattaaacaattccgcgtttgccgtattcgcattccagcC-TTTCG-A--A-GAT----G-AG-C--A-ATT-GCA--A---CA-TTAAA-AGAGTGAGAA-TTG-------ACATACAATGT-ATGTA-T-----TTGAAAAATTC-T-TT-TTCT-TTCAAT-AAAGTA---GGAAA-T----------------------AGTGGCA--TGGTACG--TT--CT---AGT-G--AA--ATAT-CA-----A-TGGAAA-AC-TGAAAG-AAA-CA-G-AAAAT--GAA-TT---TGTTC-TG-CGTAAAA-T-GCAAAA--GT--A-------------TAAGGA-TACTA-TGAAATCTTA-TCAA-TTGTC-CCA-TAATCG-C-AAAAT-TCGT--GA-AAAAA--------ATCTGGAAAATAAG-A----CATT-A-CAATTTTTCC-TCAACTC-GT-CTT-CATGAAA-TACA-AAATAAATTTA--TAAACAA-T--CTGCG-T------TGCCG-C-TCAC--------------------------------ATCG----CGCGTGTACAGGGGgtg
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                             T---C-AAT--GACT-TA-TA--TCT------GTAAATCGATT-GC--ACGA----TA---ATAGTATGGCAGG----GACAT--TA-ATATA-GGA-CTTTAA-AT-T--CTCAA-T-A-----A--TACGACGCTTTATTC-CC-ACGAAACAT-CGTAG----TCG-TAAA-TG-----AATTAT--AATTGAGATAC-G-AATT-TG-T-TTC-AAAAAT---TGAAA-T--T---TT--GC-TGTTATATCT-TTCATTATTGTA--TCATGA--CCC-C--AC-TTAT-------A-ATGACA-CTTAAGTATAC-AA--CT-----------------TAT--A----TT----GTA--TAC----------CAAAAAG--TTGGATTCCA-TC---G--T-----TA-TG--------AT---G-CT---TT----TT-C----A-T--------AAAACTC--T-G-TCAAA----GT-ATAA-GGC----AGATC-t
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        aagccttggagttcttgtctattattagcagCG--TT--GTG--AGT-GG-GATAACAT-CATCTAGA-TGGAAA-AA-TGAAG------------AAAC--GAA-TT---TGTTT-TG-CG-TAAC-TTGCAAAT--GT--G-------------AAAACA-TGCTG-TAAAATCTTA-TTAA-TTGTC-CCA-TAATCG-C-AAAAT-TCGTGGGG-AAGAA--------ATCTGGAAAATAAG-A----CATT-G-CCATTTTT-C-TCACCTC-GT-CTT-CAAGGAA-TACA-AAT-A-----A--TAAACAA-T--CCCCG-T------TGCAG-A-TTGC-AT----CCA--C------T-TCACTA--ACGATCG----CGCGTTTACAGGAGaaa
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        gAA--------CTT-G-T--TCT--C-A-TC-------G-TTGTATCC---ATCGCC-AT-CA-----TACTC-ACT--------TCA-C-T----TGA--------G-TT--CTAC-T-ATCGAC--CTA--ATA--CGT-T--GCTTCGCC--G--T-T-GCA-----TAA---A--T----A-TCCCA----TG--CAAA-TG-A-A-ATCT--TCAA-TT-TCAAAT------TGG--T--GCG-ACTAT----G-T--T--ACAC-TTTAGCA--ATGAA----G-AT-A--A-ATT-GCA--A---AC-TTATG-AGAGTAA--A-TTA--------T------T-C--TCTA-T-----TTGATAAATTC-T-TT-TCCT-CCCCAT-AAAGTACATTGAAA-TT
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       --AGTCGCA--TGGT-CA--TT--TTCTAAGT-GA-AA--ATCT--------A-TGTGAA-ATATGAAA---AAACA-GGAAAATACGAA-TT---T-TCT-TG-CG-TAAC-TTGCAACATGGTCAA-------------AAACAA-AACTG-GTAAA-CTTA-T-AA-T-GTC-CCA-TAATCG-CCAAAATCTCGT--TG-GGCAAGAGGAAAAATCTGGAAA-TAAG-A----ACTT-G-CCATTCTTCT-CAACCTCAGTATTT-CAAGGAA-TAC---AA-C-----A--T-AACAA-T--CC
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    G--------T-A-CATGTGGTGG--------A-TG--GTAC-G-ATCG-C--TTT--TTA--CAG-C--GTT--GCT--G-AT-C-GCAGAGCATAA---A--TT--C--TC-GAGAGATGTACAAA-TC-A-A-ATCG--TTA--TT-TGAAAAG-----TTG--T--TGA-C-TATTATAGATA-T--GCAT-CCTGG-------------G-AC-CTTA-AT-------G---CA-TT-----GA---AAAA-TCC-------CT------T-T-ATGCA-T-----TTGAAATATCC-T-TT-TCCA-c
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tgtgcaattgtgtgtttataatatggcgggttGAGACATTC-T-TTCTTCT-TTCAAT-AAAATA---TTAAA-TTTT--A-TTTA-T-ATAT-T--AGTGGCA--TGGTGCG--TT--TT---AAT-GG-AA--ATAT-TA-----G-TGG-AA-AT-TGAAAG-AAAACG-G-A-----------T---TGTTC-TG-CG-TAAA-T-ACAAAA--GT--A-------------AAA--A-CACTG-CTAAATGTTA-TCAG-TTGTC-CCA-TAATCG-C-AAAAC-CTGT--GACAAC-A--------GTCTTGGAAATAAA-A----CCTT-G-C
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              T--A-A-TA-------G-TTGTA-CG---ATCGC--ATGCA-----C-CTC-AAGGAGTCAAGC-A-CAT----TGG--------G-TT--GTAC-G-ATCG-C--TTA--TTA--TGT-C--GTT--GCC--G-AT-C-GCA-----TAA---A--TT--CA-TCAGACA--TG--CAAA-TC-A-A-ATCG--TTA--TT-TCAAAA------TTG--T--GGG-A-TAT----GATG-T--ACAC-TTTAG-A--A-GAA----G-AT-C--A-ATT-GCA--A---CA-TTACA-AGAGTGAGAA-TTA-------AC------T-C-ATCTG-T-----TTGAA
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      --TTATG-TTG-AC--AACA---------CTTTG-T--TCT--ACA-TATGTAATTG-TTGTT-CG---ATCGC--ATGCA-----T-CTT-AC---------T-A-CGT----TGG--------G-TT--GTAC-G-ATTG-G--TTA--ATA--CGT-C--GTT--GCC--G-AT-C-GCA-----TAA---A--TT--CT-TCAGAGACATG--CAAA-TA-A-A-ATTG--CTA--TT-TTAAAA------TTG--T--GGG-A-T
gi|19                         :                                                                                                                gACCCCTT--TAAA--C---GCG-C-------GAT--CGT--TAA--CGC-AGAAGCG-A-T--C-GGCAA---C----GCGG---ATC-T--A-TT---G-AGTCATA--A--CCG--AAAAT-T-GA------TA--TTGGGTAA-GTTTTG---ATGTCATTTATGT--AT---C-AAC--A--A-TA-TA--TCTAG-T--GTAAAT--ATTTGC--AC
gi|2                          :                                                                                                                 ACCCCTG--TAAA--CCAGGTG-C-------GAT--CGT--TAA--CGC-GGAAGCG-A-T--C-GGCAA---C----GCGG---ATC----A-TT---G-AGTCATA--G--CCG--AATTG-TAGG------TA--GCGGGTAA-GTTTTG---ATGTTATTTATGT--ATAATC-AAC--G----TA--A--TCTAG-T--GTAAATT-ATTTGC--ACGA----TA---TTAGTAGAGGAGG----GGCAT--T--ATATG-AGA-C-CTAC-A---------A-T-ACAACTA--CAAGACG--TTATTC-CC-AC--AAC-T-GATGG----T-G-TAAA-TG----TAATT-T--AATTGA---CC-G-ATTT-GG-T-TAC-AAAAAA---TGGAA-T--TTC-TT--AC-TGATATGTCA-TCTATT-TT-TA--TCATG---TTC-C--ACTTTATAC-C-AAA-AT-CAT-ATTGATTTTAC-AA--ATCAA-----GAT-TGA--TAT--AAACTTT----ATA--CAC-----ATTAACAAAAAA--GTGTATT-TA-TCAGGG--T----ATA-TG-------AAT---A-TT---TT----TT-C------T-----ACAAAAA-----T-G-TCAAA----GTAA-GA-GGC----A-ATCGGGA---A-ACGC-AACAAA-AT-TGTTAC------AT--AAGCGATC---G---------TACAAT-G----------CAAAGAAAGCGA--TCGTACAACTCA-A-T-GAT---ACAAG-------------TG-AT--T---AGAAATGGTTG------AAATCA-TTTTGA----TTTTGT-GACT-TGACAGACATT--TT-AAGCAGC--------------------TG--GTGC--TTATT-TCC-----AAT--AGTGGTCCTTA-CGTT---T----AAAGACGA-C-TA-TACATATTTAAGA-GTG------ACT-T-ATTCTA--TTATGTTTG-AC--AACA----------TTTG-T--TCT--A-A-TA-------G-TTGTA-CG---ATCGC--ATGCA-----C-CTC-AAG--------C-A-CAT----TGG--------G--T--GTAC-A-TCCG-C--TTA--TTAT-CGT-C--G-T--GCC--G-AT-C-GCA-----TAA---A--TT--CA-TCAGAGAGATG--CAAA-TCAA-A-ATCG--TTA--TT-TCAAAA------GTAT-T--GGG-A-TAT----GATG-T--ACAC-TTTAG-A--A-GAA----GAAT-CA-A-ATT-GCAACA---CA-CTATA-AGAGTGAGAA-TTA-------AC------T-C-ATCTATT-----TTGAAAAATTC-T-TT-TTCA-TCAATT-AAAATG---TTAAT-ATTT--A-CTTA-T-ATAT-T--AGTGGCA--TGGTACG--TT--TT---AGT-GGAAA--ATAT-CA-----A-TGGAAA-AT-TGAAAGAAAAACA-G-AAAAT--GAATTT---TGTTC-TG-CAATAAA-T-GCAATA--GT--A-------------AAACCA-TACTA-TGAAATCTTAGTCAA-TTGCC-TCA-TAATCG-C--AAAT-TCGT--TA-AACAA--------AATAGGAAAATAAGCA----TATTGG-CCATTTTTCC-TCACCTC-AT-CTC-CAGTGAA-TACG-AAA-A-----A--TAAAC-A-T--CCGCA-TGACCCGTGCCG-A-TCGC-TT----CCG--CCCCGCAG-T---TA--AGCATCG----CTCGTTTACAGGGG
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              cc-A-TAT----AATA-T--ACAC-TTTAG-A--A-GAA----G-AT-C--A-AAT-GCA--A---CA-TAATA-AGAGCAAAAA-TTG-------AC------C-C-CTATT-T-----TTGAGACATTC-T-TTCTTCT-TTCAATAAAAATA---TCAAA-TTTT--A-TTTA-T-ATAT-tg
gi|21                         :                                                                                                                 ACCCCTGCCTAAA--C---GCG-C-------GAT--CGT---AA--CGC-GGAAGCGAA-T--C--GCAA---C----GCGG---ATC-CAGA-CT---GCAATCATA--AGTCCGACAAGTT-T-GAGGGGAGTA--GCGGGTAA------A---ATGTTTTTTATGG--AT---C-Agacaacagtcttggaaata
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                cc-AAAAA--------ATCTGAAAAATAAG-A----CATT-G-CCCTTTTCTC-TCACCTC-GT-CT---------------AAA-A-----A--TAAACAA-TTTCCGCG-T------TGCCG-A-TTGC-AT----ACG--C------G-T---TG--ACTATCG----CGCGTTTACAGGGGgt
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     GGAAATAAA-A----CCTT-G-CCATTTTT---TCACCTC-GT-AAT-CAAGGAA-TACA-CAA-A-----A--TAATCAA-T--TCGCG-T------TGCCG-A-TT-C-AT----TCG--C------G-T---TA--ACGCTCG----CGCGTTTAAAGGGtg
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ttGGAAATAAA-A----CCTT-G-CCATTTTT---TCACCTC-GT-AAT-CAAGGAA-TACA-CAA-A-----A--TAATCAA-T--TCGCG-T------TGCCG-A-TTGC-AT----TCG--C------G-T---TA--ACGCTCG----CGCGTTTCAAGGGGat
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           tAGTAGAGGAGG----GGCAT--T--ATATG-AGT-C-CTAC-AT-TGTA-CAA-T-ACAACTA--CAAGACG--TCATTA-CC-AC--AAC-T-GATGG----T-G-TAAA-Tt
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                        AGTT-T-GA------TA--GCGGGTAA-GTTTTG---ATTTTAATTATGT--GT---C-AA
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 gttcactaacgtgtatgccgttatgcagaacaacAA-A-----A--TAAACAA-T--CCGCG-T------TGCCG-A-TCGC-TTGGAACCG--C------G-T---TA--ACGAT--------CGTTTACAGGAG
gi|28                         :                                                                                                                 ACCCCTG--TAAA--C---GCG-C-------GAT--CGT--TAA--CAC-GGAAGCG-A-T--C-GGCAA---C----GCGG---ATC-C--A-TT---tg
gi|3                          :                                                                                                                   CCCTG--TAAA--C---GCG-C-------GAT--CGT--TAA--CGC-GGAAGCG-A-T--C-GGCAA---C----GCGG---ATC-C--A-TT---G-AGTCGTA--G--CCG--AAGTT-T-GA------TA--GCGGGTAA-GTTTTG---ATGTTATTTATGT--AT---C-AAC--G--C-TA-TA--TCTAG-T--GTAAAT--ATTTGC--ATGA----TA---TTAGTAGAGGAGG----GGCAT--T--ATATG-AGA-C-CTAC----T--A-----T-ACAACTA--CAAGACG--TTATTTACC-AC--AAC---GATGG----T---TAAA--G----AATTT-T--AATTGA---CC-G--TTT-GG-TGTAC-AAAATA---TGGAA-TACTTC-TT--AC-TGTTATGTCA-TTATTT-TT-TA--TCATGCATTTC-C--ACTT-ATTC-CCAAATAT-CAT-ATTGATTTTAC-AA--ATCAA-----GA--TGA--TAT--AAACTTT----ATA--TAC-----ATTGACAAAAA---GTGTATT-TA-T-AGTG--T----AAC-TG-------AATTACG-TT---TT----TT-C----A-T-----T-GAAAT-----T-G-TCAA------T-A-GATGGC----A-ATC-GGC---ATAC-C-AACAAA-AT-TGTT-TTAG---ATCAAA---------G---------TGCGAT-GTGTTCAATTGCAAAGAAAGCG---TCGTACAACTCATA-TAGAT---ACAAGA------------CG--T--T---G---ATTGTCGTCTCGGACATCATTTT-GA----TTT-GT-GACT-TGACAGACATT--TTAA-GCA-C--------------------TG--GTGC--TTATT-CCT-----AATTTG-GGGTCCTTA-CGTT---A----ATAGACGA-C-TA-TACATATTGAA-G-GTAC-----ATA-T-ATACTA--TCATG-TTG-AC--AACA-----------TTG-T--TTT--A-A-TA-------G-TTGTA-CG---ATCGT---TGCA-----T-CTC-AAG--------TCA-CAT----TGG--------G-TT--GTAC-G-ATCG-C--TTA--T-A--TGT-C--GTT--GCC--G-AT-CTGCA-----TAA---A--TT--CA-TCAGAGAGATG--CAAA-TC-A-A-ATCG--T-A--TTATTAAAA------TTG--T--GGATA-TAT----GATG-T--AAAC-TT-AG-ATAG-GAA----G-AT-C--A-ATTTGCA--A---CAATTATA-AGAGTGAGAA-TTA-------AC------T-C-ATCTA-T-----TTGAAAAACTC-T-TT-TTCA-TCCAAT-AAAATG---TGAAA-TGTT--A-CTTA-T-A-------AGTGGCA--TGGTACG--TT--TT---TGT-GG-AA--ATAT-CA-----A-TGGAAA-AT-TGAAAG-AAAACA-G-ATAAT--GAA-TT---TGTTC-TG-CAATAAA-T-GCAAAA--GT--A-------------AAACCA-TACTA-TGAAATCTTA-TCAA-TTGCC-CCA-TAATCG-C-AAAAC-TCGT--TA-AACAA--------ATATGTAAAATAAT-A----TATT-G-CCAATTTTCC-TCACCTC-AT-CTC-CTTGGAA-TACG-AAA-A-----A--TATACAA-T--CCGCG-T------TGCCG-A-TCGC-TT----CCG--C------G-T---TA--ACTATCG----CGCGTTTACAGGGG
gi|30                         :                                                                                                                      TG--TAAA--C---GCG-C-------GAT--CGT--TAA--CGC-GGAAGCt
gi|4                          :                                                                                                                 ACCCCTG--TAAA--C---GCG-C-------GAT--CGT--TAA--TGC-GGATGCG-A-T--C-GTTAA---C----GCGG---ATC-C--A-TC---G-AGTCATA--G--CCA--AAGTT-T-GA------TA--GCGGGTAA-GTTTTG---ATGTTATTTATGT--AT---C-AAC--G--C-TA-TA--TCTAG-T--GTAAAT--ATTTGC--ACGA----TA---TTAGTAGAGGAGG----GGCAT--T--ACATG-AGA-C-CTAC-ATGT--A-TGA-T-ACAACTA--AAAGACG--TTATTC-CC-AA--AAC-T-GATAG----T-G-TAAA-TG----TAATT-T--AATTGA---CC-G-ATTT-GG-T-TAC-AAAATA---TGGAA-T--TTC-TT--AC-TGTTATGTCA-TTTATT-TT-TA--TCATG---TTC-C--ACTTTATTC-C-AAA-AG-CCA-ACTGATTTTAC-AA--ATCAA-----GG--TGA--TAT--AAACTTT----ATA--TAC-----ATTAACAAAAAA--GTGTAAT-TA-TCAGGG--T----ATA-TG-------AAT---T-TT---TT----TT-C----A-T-----G-AAAAA-----T-G-TCAAA----GT-A-CA-GGC----A-ATC-GGC---A-ACGT-AACAAA------TT-T-------T--AA-------------------TACAAC-G----------CA---------A--TCGTACAACTAA-A-TAGAT---ACAAG-------------TG-AT--T---AGATATGATTT------AAATCA-TTTTGA----TTTTGT-GACT-TGACAGACATT--TT-AAGCA-C--------------------TG--GTGC--TTATT-ACC-----AAT---AGGGTCCTTA-CGTT---T----AAAGACGA-C-TA-TATATAACTAATT-GTG------ACA-T-ATGCTA--TTATG-TTG-AC--AAC-A--------TTTTG-T--TCT--A-G-TA-------G-TTGTA-CG---ATCGC--ATGCA-----T-CTC-AAG--------T-A-CAT----TGG--------A-TT--GTAC-G-ATCG-C--TTA--TTA--TGT-C--TTT--GCC--G-AT-C-GCA-----TAA---A--TT--CA-TCAGAGAGATG--CAAA-TC-A-A-ATCG--TTA--TT-TCAAAA------TTG--T--GGG-A-TAT----GATG-T--ACAC-TTTAG-A--A-GAA----G-AT-C--A-ATT-GCA--A---CA-TTATA-AAAGTGAGAG-TTA-------TC------T-C-ATCTA-A-----TTGAAAAATTC-A-TT-TTCA-TCCAAT-AAAATG---TGAAA-TTTT--A-CTTATT-ATATAT--AGTGGCA--TGGTACG--TT--TT---AGT-GG-AA--ATAT-CA-----A-TGG--A-AT-TGAAAG-AAAACA-G-AAAAT--GAA-TT---TGTTC-TG-CAATAAA-T-GCAAAA--GT--A-------------AAACCA-TACTA-TGAAATCTTA-TCAA-TTGCC-CCG-TAATCG-C-AAAAT-TCGT--TA-AACAA--------ATATGGAAAATAAG-A----TATT-G-CCATTTTTCC-TCACCT--AT-CTC-CATGGAA-TACG-AAA-A-----A--TAAACAA-T--CCGCG-T------TGCTG-A-TTGC-TT----CCG--C--------T---TA--ACGATCG----CGCGTTTACAGGGG
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tAAAAAA--GTGTATT-TA-TTAGGG--T----ATAATG-------AAT---A-TT---TT----TT-TTTTGA-T-----G-AAAGAAAATAT-G-TCAAA----GT-A-GA-GGCCAAAA-ATC-GGC---A-ACGCCAACAAA-AT-TGTT-T------AC--AAAGCCGATTCG---------TACAATTG----------CAA-GAAAGCGAAATCGTACAACTCA-AATAGAT---AAAAT-------------TG-AT--TTTAGGAAATGGTCG----AAAAATCATTTTTTA----TTTTGT-GACT-TGACAGACATT--TTAAAGCA-T--------------------TGGCGTGCTTTTATTATCC-----AAT---AGAATCCTT--CGTT---T----AAAGACGA-C-TG-TACATATTTAAAGTGTG------ACA-T-ATT-TA--TTATGCTTG-ACAAAACAA--------TTTTGTT--TCT--A-ATTA-------G-TTGAT-CG---ATCGC--ATGCA-----T-ATC-AAG--------T-A-CAT----TGG--------G-TTG-GTACGG-ATCG-C--TTA--TTAT-TGT-C--GTT--GCC--G-AT-C-GCA-----TAA---AGTTT--CA-TCAGAGAGATG--CAAATTC-A-A-ATCGT-TTAT-TT-TCAAAA------TTGTTT--GGG-A-TAT----GATGTT--ACACTTTTAG-A--A-GAA----G-AT-C--A-ATT-GCA--A---CA--TATA-AGAGTGGGAA-TTA-------AC------T-CGATCTA-T-----TTGAAAAATTCTT-TT-TTCATTCCAAT-AAAATGT--TGAAATTTTT--ACCTTA-C-ATAT-T--AGTGGCA--TGGTACGTTTT--TT---AGTGGG-AA--ATAT-CA-----ATTGGAAA-AT-TGAAAG-AAAACAGG-AAAAT--GAA-TT---TGTTCTTG-CAATAAATT-GCAAAA--GT----------------AAACCA-TACTATTGAAACCTTA-TCAA-TTGCC-CCATTAATCG-C-AAAAT-TCGT--TA-AACAA--------ATATGGAAAATAAG-A----TATT-G-CCATTTTTCCTTCACCTC-AT-ATC-ATTGGAATTACGAAAA-A-----A--TAAACAA-T--CCGCG-T------TGCCG-A-TCGC-TT----CCG--C------GTT---TA--ACGATCG----CGCGTTTACAGGGG
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          caAGAA-----G-G-CCAAA-----T-A-CG-AGC----A--TC-G-----A-A-GC-AACAAAGAT-TGCT-TTAGCATATG-AA---------GCCGATCCATTACAATAG----------CAAAGAATGCGA--TCGTACAACTCA-A-TAGATGTAACAAG-------------TG-CTGCT---AGAAATG-TTG----AAA--TCATTTTTGA----TTT-GT-GACTGCGACAGACATT--TTAAAGCA-C--------------------TG---TGCC-TTATT-TC------AAT--GAGGTTCCTTC-GGTT---T----AAAG-CGA-CATA--ACATATTTAGTG--TG------ACA---ATTCTA--T-ATG-TTG-AA--AACAA--------TTCCG-T--TCT--A-A-TA-------GCTTGTA-CG---ATCGC--ATGCA-----T-CTC-AAG--------C-A--AT----TGG--------TCTT--GTAC-GGATCG-CCTTTA--TTA--TGT-CAGGTT--GCCC-G-AT-C-GCA-----TAA---G--TT--CA-TCAGAGAGATG--CAGA-TT-A-A-GTCG--TTA--GT-TCAAAA------TTG--T--GGACA-T-T----AATG-T--ACAC-TTAAG-A--A-GAAAGAAG-AT-C--A-ATT-GCA--AA--CA-TTATA-AGAGTGAGAA-TTA-------A-------T-C-ATCTA-T-----TTGAAAAATTC-TGTT-TTCA-TCCAAT-AAAATG---TGAAA-TTTT--A-CTTA-TAATAT-T--AGTGGCA--T-GTAGG--TT--TT---AGT-GGAAA--ATAT-CA-----A-TGGAAA-AT-TGAAAG-AAAACA-G-AAAAT--G-A-TT---TGTTC-TG-CAATAAA-T-GCAAAA--GT--A-------------AAACCATTACTA-TGAAATCTTA-TCAA-TTGCC-CCT-TAATCG-C-AAAA--TCGG--TA-AACAA--------AT-TGCTAAATAAG-A----TATT-GCCCATTTTTCC-TCACCTC-AT-CTC-CATGGAA-TACG-AAA-A-----A--TAAACAA-T--CCGCG-T------TGCCG-A-TCGC-TT----CCGCTC------G-T---AAAGACGATCG----CGCGTTTACAGGGGt
gi|7                          :                                                                                                               gtctCCTTG--TAAA--C---GCGAC-------GAT--CGT--TAAAACGTTGGATGCG-A-T--CAGGTAAAATC----GCGG---ATCAC--AATT---G-AGTCATA--T--TCA--AGTTT-T-TA------TA--CCGGGTAA-GTTTTG---A-G-TATTTATGT--AT---C-AACCAG--C-TATTACCTCTAGCT--GTAAAT--ATTTGC--G-----------------AGAGGAGG----GGCATA-TA-ATATG-AGA-----AC-CT-T--A-TGA-T-ACAACTA--AAAGGAG--TTATTC-CCAAA--AAC-TAGATAG----T-GATAAA-TGTT--TAATT-T--AATTGA---CC-G-ATTT-GGTT-TACAAAAATA---TGGAT-T--TTCTTT--AC-TATTATATCtg
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          caca-TTCATT-TT-TA--TCATG---TTCAC--ACTTTATTCAC-AAA-AT-CTA-ATTGATTTTAC-AG--ATCAA-----GAGTTGA--TAT--AAACTTTAATAATA--TAC-----ATTAAC-AAAAG--GTGTAAT-TATTCAAGGAAT----ATA-TG-------AAT---G-TTTTATT----TT-T----A-TCATGAG-AAAAA-----T-GTTCAAA----GT-A-CG-ACC----ACATC-CAC---A-ACGccccccccccccccccccccccccccccccccaatttcatttttatcatgttcacactttattcacaaaatctaattgattttacagatcaagagttgatataaactttaataatatacattaacaaaaggtgtaattattcaaggaatatatgaatgttttatttttatcatgagaaaaatgttcaaagtacgaccacatccacaacg
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               cacaccttgtaaacgcgacgatcgttaaaacgttggatgcgatcaggtaaaatcgcggatcacaattgagtcatattcaagtttttataccgggtaagttttgagtatttatgtatcaaccagctattacctctagctgtaaatatttgcgagaggaggggcatataatatgagaaccttatgatacaactaaaaggagttattcccaaaaactagatagtgataaatgtttaatttaattgaccgatttggtttacaaaaatatggattttctttactattatatcccccccccccccccccccccccccccccccccaat-AAG--------A-A-CAT----TGG--------G-TT--GTAC-G-ATCG-C--TTA--ATA--TGT-C--GTT--GCC--G-AT-C-GCA-----TAA---A--TT--CA-TCAGAGAGATG--CAAA-TC-A-A-ATCG--TTA--TT-TCAAAA------TTG--T--GGG-A-TAT----GATG-T--ACAC-TTTAG-A--A-GAA----G-AT-C--A-ATT-GCA--A---CA-TTATA-AGAGTGAGAA-TTA-------AC------T-C-ATCTA-T-----TTAAAAAATTC-T-TT-TTCA-TCCAAT-AAAATG---TGAAA-TTGT--A-CTTA-T-ATAT-T--AGTGGCA---GGTACG--TT--TT---AGT-GG-AA--ATAT-TA-----A-TGGAAA-AA-TGAAAG-AAAACA-G-AACAT--GAA-TT---TGTTC-TA-CAATAAA-T-GCAAAA--GT--A-------------AAACCA-TACTA-TGAAATCTTA-TCAA-TTGCC-CCA-TAATCG-C-AAAAT-TCGT--TA-AACAA--------ACATGGAAAATAAG-A----TCTT-G-CCATTTTTCC-TCCTCTC-AT-CTC-CATGGAA-TACG-AAA-A-----A--TAAAC
gi|9                          :                                                                                                                 ACCCCTG--TAAA--C---GCG-C-------GAT--CGT--GAA--CGC-AGACGCG-A-T--C-GTTAA---C----GCGG---ATC-C--A-GT---G-AAGCAAA--T--CTA--CAGTT-T-GA------TATAGCGGA-AA-GTTTTG---ATGTTATTCATGT--GT---C-AAT--G--C-TT-TA--TCTAG-T--GTAAAT--GTTTGC--ACGA----TA---TTAGTAGAGGAGG----GACATTAT--ATATG-AGA-C-TTATAAT-C--T-CAA-TAANGAATA--CAAAA-A--TAAGTC-TG-CC--AA--T-AAGGG--------------G----TAATT-T--AATTGA---TC-G-ATTT-GG-T-TTC-AAAATG---TGAAA-T--TTC-TT--GC-TGTTATATCT-TTTATT-TT-TA--TCATG---ACC-C--ACTTTATT-----AA-AT------------------A--ATTAA-----GG--TGA--TAC--AAACTTT----ATA--TGT-----ATTACCAAAAAA--GTGTATT-TA-TCAGGG--T----ATA-TG-------AAT---GCTT---TT----TT-C----A-T-----A-AAAAT-----T-G-TCAAA----GT-A-TA-GGC----A-ATC-AAC---A-ATGC-AACA
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|29 ): GAATACAAAAATAAGTCTGCCAATAAGGGG






Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  111111111111111111111111111111111111111111111111111                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    
lowQualScore                  :                                                                                                                                         1111111                                                         1111                11111               111111                                                  1111                      11            1111  111             1111     22222               333333333333                                       111     11111111       22222              111                         111                                                  111              11111      11111                     222222222                 2222        111111                                 1111      1111111   11111       1111    22222222222222     11111                                                     1111    111111111111111111111111111111111111111111111111111  11                              111     555555555555555555555555           222222             1111   1                               55555555555555555555        11        111111   2222              22222222                         111   222222   111             1            2222222222                   1111111                  11     11111         1111111111            11111111                             111         11                                                                      11         111111                                                                                                  111111111111111                                                   111                                                     111                  11111                                                                     11  2222222222222222                                                                    11111111                                                                                                                             11111111111                                 
lowQualScore                  :                                                                                                                        55    55 666   3 1111111   55   55   55   3   0   4 4 55 4     777 8888    777   4444 4  777 5       44444   66     4 4  222222  66        4      777             66  777 4   66 8888  5  66     5 66      11      66    2222  000             0000     11111     5   666   000000000000 5 5       66       66      5  5  66   222     99999999    55 11111    5 77      000  5 5    5  5 5   5      000     5 77   5  77  5          5      5  5  77     555   5 77       11111   5  77777           5  77  3  000000000   77   77       4444   77   444444          777       5  5 11   66 0000   5  6666666   00000  888  0000  5 44444444444444     88888 4 4     9999  4 55 4   9999 8   4 0 888 5    5      1111    666666666666666666666666666666666666666666666666666  00        99            6 6     111     555555555555555555555555       1 0 555555 3    7      4444   1  6    6           99  7     6 44444444444444444444  99    55     6  777777   6666        99    11111111        6 6  6           111   555555   222      77 0   1   5  77    9999999999    5 66   66 4 4  4444444 4     8  777     00     11111 4   4   9999999999 3   7777   33333333 3  88    3 3    3 55   55   222  3 55   00   88 3  3 3   99999   666 55  55  3           55    3  3 3 3    88   22  3      444444   88 55   6 3   7777    3 55    3     3 44 3   7777 3  3 77 3   3   44 999  3     3          3   666666666666666 3 3     3 88888           3 3  6    3      3      000     3    55 4    4 4    5555       55       55  55  000   3  7  88    3  55555 3   1  3  3      3      3 3     55   3  666     3  3 66    3 7      00  1111111111111111      3     3          3    3     3   3      3 3     3    55  3     22222222  4           2 6666    2 2        4 3       3  3   3  2    3   33   2 77777 33       3 44     3 999999     3 3    7777777   22222222222 555  44       7777              
lowQualScore                  :                                                                                                                        ..    .. ...   . .......   ..   ..   ..   .   .   . . .. .     ... ....    ...   .... .  ... .       .....   ..     . .  ......  ..        .      ...             ..  ... .   .. ....  .  ..     . ..      ..      ..    ....  ...             ....     .....     .   ...   ............ . .       ..       ..      .  .  ..   ...     ........    .. .....    . ..      ...  . .    .  . .   .      ...     . ..   .  ..  .          .      .  .  ..     ...   . ..       .....   .  .....           .  ..  .  .........   ..   ..       ....   ..   ......          ...       .  . ..   .. ....   .  .......   .....  ...  ....  . ..............     ..... . .     ....  . .. .   .... .   . . ... .    .      ....    ...................................................  ..        ..            . .     ...     ........................       . . ...... .    .      ....   .  .    .           ..  .     . ....................  ..    ..     .  ......   ....        ..    ........        . .  .           ...   ......   ...      .. .   .   .  ..    ..........    . ..   .. . .  ....... .     .  ...     ..     ..... .   .   .......... .   ....   ........ .  ..    . .    . ..   ..   ...  . ..   ..   .. .  . .   .....   ... ..  ..  .           ..    .  . . .    ..   ..  .      ......   .. ..   . .   ....    . ..    .     . .. .   .... .  . .. .   .   .. ...  .     .          .   ............... . .     . .....           . .  .    .      .      ...     .    .. .    . .    ....       ..       ..  ..  ...   .  .  ..    .  ..... .   .  .  .      .      . .     ..   .  ...     .  . ..    . .      ..  ................      .     .          .    .     .   .      . .     .    ..  .     ........  .           . ....    . .        . .       .  .   .  .    .   ..   . ..... ..       . ..     . ......     . .    .......   ........... ...  ..       ....              
lowQualScore                  :                                                                                                                        00    00 444   6 8888888   00   00   00   6   1   0 0 55 0     000 5555    888   0000 4  888 0       00000   99     4 4  888888  11        4      888             11  000 0   99 2222  0  99     0 99      99      99    1111  000             6666     66666     0   222   222222222222 0 0       99       99      0  0  99   111     00000000    11 77777    7 99      000  7 7    7  7 7   7      000     7 99   7  99  7          7      7  7  99     777   7 99       00000   7  00000           7  99  0  111111111   99   99       3333   99   444444          888       0  0 55   99 6666   0  2222222   99999  888  6666  0 66666666666666     99999 4 4     4444  4 44 4   4444 9   4 2 888 0    7      5555    555555555555555555555555555555555555555555555555555  33        22            7 7     777     888888888888888888888888       0 7 555555 2    3      2222   3  7    7           22  3     7 22222222222222222222  22    88     7  777777   8888        88    22222222        7 7  7           000   888888   555      99 1   4   7  99    8888888888    0 99   11 4 4  4444444 4     9  888     66     11111 4   0   3333333333 6   7777   22222222 6  66    6 6    6 00   00   555  6 00   00   66 6  6 6   11111   444 00  00  6           00    6  6 6 6    66   33  6      111111   66 00   7 3   7777    6 00    3     3 66 3   1111 3  3 99 3   3   66 222  3     3          3   555555555555555 3 3     3 33333           3 3  7    3      6      000     6    55 0    0 0    8888       55       00  00  000   6  3  66    6  55555 6   3  6  6      6      6 6     00   6  444     6  6 99    6 3      00  8888888888888888      6     6          6    6     6   6      6 6     6    00  3     11111111  2           9 1111    9 9        0 1       1  1   1  7    1   88   9 11111 99       1 22     3 666666     3 3    2222222   55555555555 888  66       1111              
consensus                     :                                                                                                                NACCCCTG--TAAA--C---GCG-C-------GAT--CGT--TAA--CGC-GGAAGCG-A-T--C-GGCAA---C----GCGG---ATC-C--A-TT---G-AGTCATA--G--CCG--AAGTT-T-GA------TA--GCGGGTAA-GTTTTG---ATGTTATTTATGT--AT---C-AAC--G--C-TA-TA--TCTAG-T--GTAAAT--ATTTGC--ACGA----TA---TTAGTAGAGGAGG----GGCAT--T--ATATG-AGA-C-CTAC-AT-T--A-CGA-T-ACAACTA--CAAGACG--TTATTC-CC-AC--AAC-T-GATGG----T-G-TAAA-TG----TAATT-T--AATTGA---CC-G-ATTT-GG-T-TAC-AAAATA---TGGAA-T--TTC-TT--AC-TGTTATGTCA-TTTATT-TT-TA--TCATG---TCC-C--ACTTTATTC-C-AAA-AT-CNA-ATTGATTTTAC-AA--ATCAA-----GA--TGA--TAT--AAACTTT----ATA--TAC-----ATTAACAAAAAA--GTGTATT-TA-TCAGGG--T----ATA-TG-------AAT---G-TT---TT----TT-C----A-T-----G-AAAAA-----T-G-TCAAA----GT-A-NA-GGC----A-ATC-GGC---A-ACGC-AACAAA-AT-TGTT-T------AT--AA---------G---------TACAAT-G----------CAAAGAAAGCGA--TCGTACAACTCA-A-TAGAT---ACAAG-------------CG-AT--T---AGAAATGGTCG----AAAAATCATTTTTGA----TTTTGT-GACT-TGACAGACATT--TTAAAGCA-C--------------------TG--GTGC--TTATT-TCC-----AAT--GAGGGTCCTTA-CGTT---T----AAAGACGA-C-TA-TACATATTTAATG-GTG------ACA-T-ATTCTA--TTATG-TTG-AC--AACAA--------CTTTG-T--TCT--A-A-TA-------G-TTGTA-CG---ATCGC--ATGCA-----T-CTC-AAG--------T-A-CAT----TGG--------G-TT--GTAC-G-ATCG-C--TTA--TTA--CGT-C--GTT--GCC--G-AT-C-GCA-----TAA---A--TT--CA-TCAGAGAGATG--CAAA-TC-A-A-ATCG--TTA--TT-TCAAAA------TTG--T--GGG-A-TAT----GATG-T--ACAC-TTTAG-A--A-GAA----G-AT-C--A-ATT-GCA--A---CA-TTATA-AGAGTGAGAA-TTA-------AC------T-C-ATCTA-T-----TTGAAAAATTC-T-TT-TTCA-TCCAAT-AAAATG---TGAAA-TTTT--A-CTTA-T-ATAT-T--AGTGGCA--TGGTACG--TT--TT---AGT-GG-AA--ATAT-CA-----A-TGGAAA-AT-TGAAAG-AAAACA-G-AAAAT--GAA-TT---TGTTC-TG-CGATAAA-T-GCAAAA--GT--A-------------AAACCA-TACTA-TGAAATCTTA-TCAA-TTGCC-CCA-TAATCG-C-AAAAT-TCGT--TA-AACAA--------ATNTGGAAAATAAG-A----CATT-G-CCATTTTTCC-TCACCTC-GT-CTC-CATGGAA-TACG-AAA-A-----A--TAAACAA-T--CCGCG-T------TGCCG-A-TCGC-TT----CCG--C------G-T---TA--ACGATCG----CGCGTTTACAGGGG
Reference ( family-1189 )     :                                                                                                                NACCCCTG--TAAA--C---GCG-C-------GAT--CGT--TAA--CGC-GGAAGCG-A-T--C-GGCAA---C----GCGG---ATC-C--A-TT---G-AGTCATA--G--CCG--AAGTT-T-GA------TA--GCGGGTAA-GTTTTG---ATGTTATTTATGT--AT---C-AAC--G--C-TA-TA--TCTAG-T--GTAAAT--ATTTGC--ACGA----TA---TTAGTAGAGGAGG----GGCAT--T--ATATG-AGA-C-CTAC-AT-T--A-CGA-T-ACAACTA--CAAGACG--TTATTC-CC-AC--AAC-T-GATGG----T-G-TAAA-TG----TAATT-T--AATTGA---CC-G-ATTT-GG-T-TAC-AAAATA---TGGAA-T--TTC-TT--AC-TGTTATGTCA-TTTATT-TT-TA--TCATG---TCC-C--ACTTTATTC-C-AAA-AT-CNA-ATTGATTTTAC-AA--ATCAA-----GA--TGA--TAT--AAACTTT----ATA--TAC-----ATTAACAAAAAA--GTGTATT-TA-TCAGGG--T----ATA-TG-------AAT---G-TT---TT----TT-C----A-T-----G-AAAAA-----T-G-TCAAA----GT-A-NA-GGC----A-ATC-GGC---A-ACGC-AACAAA-AT-TGTT-T------AT--AA---------G---------TACAAT-G----------CAAAGAAAGCGA--TCGTACAACTCA-A-TAGAT---ACAAG-------------CG-AT--T---AGAAATGGTCG----AAAAATCATTTTTGA----TTTTGT-GACT-TGACAGACATT--TTAAAGCA-C--------------------TG--GTGC--TTATT-TCC-----AAT--GAGGGTCCTTA-CGTT---T----AAAGACGA-C-TA-TACATATTTAATG-GTG------ACA-T-ATTCTA--TTATG-TTG-AC--AACAA--------CTTTG-T--TCT--A-A-TA-------G-TTGTA-CG---ATCGC--ATGCA-----T-CTC-AAG--------T-A-CAT----TGG--------G-TT--GTAC-G-ATCG-C--TTA--TTA--CGT-C--GTT--GCC--G-AT-C-GCA-----TAA---A--TT--CA-TCAGAGAGATG--CAAA-TC-A-A-ATCG--TTA--TT-TCAAAA------TTG--T--GGG-A-TAT----GATG-T--ACAC-TTTAG-A--A-GAA----G-AT-C--A-ATT-GCA--A---CA-TTATA-AGAGTGAGAA-TTA-------AC------T-C-ATCTA-T-----TTGAAAAATTC-T-TT-TTCA-TCCAAT-AAAATG---TGAAA-TTTT--A-CTTA-T-ATAT-T--AGTGGCA--TGGTACG--TT--TT---AGT-GG-AA--ATAT-CA-----A-TGGAAA-AT-TGAAAG-AAAACA-G-AAAAT--GAA-TT---TGTTC-TG-CGATAAA-T-GCAAAA--GT--A-------------AAACCA-TACTA-TGAAATCTTA-TCAA-TTGCC-CCA-TAATCG-C-AAAAT-TCGT--TA-AACAA--------ATNTGGAAAATAAG-A----CATT-G-CCATTTTTCC-TCACCTC-GT-CTC-CATGGAA-TACG-AAA-A-----A--TAAACAA-T--CCGCG-T------TGCCG-A-TCGC-TT----CCG--C------G-T---TA--ACGATCG----CGCGTTTACAGGGG
gi|1                          :                                                                                                                       G--TGAA--C---GCG-C-------GATTCCGTATTGA--CGC-GGACGCG-AATAGC-GGCCA---CACAAGCGGCTAATT-CCGA-TTTCTG-AGTCATATAG--CCG--AAGTTAT-GA------TA--GGGCATAAAGTTTTGTTGATGTTACTTATGTGAAT---CGAAC--GA-CGTA-TA--TATAG-TTGGCTAAT--ATTTGCTGACGAAGTATAAGTTTAGTAGAGGAGGCAGGGACAT--CTAATATGGAGATC-CTG--AG-T--A-CAAGT-ACAACTAGACAAGACG--TTATTC-GC-AC--ACC-TCGATGAGAGAC-G-TAAAATGACATTAATT-TTGAATTGA---CCCGTATTTAGG-T-TAC-AGAATACCCTGGAAAT--TTC-TTTTACCTTTTATGTCAATTTATT-TT-TAACTCATG---TCC-CTCACTTTATTC-C-AAA-AT-CAATATTGATTTTACCAACTATGAACGAATGA--TGAGTTATTGAAACTTTTTAAATAATTACTATGAGTTAACAAAAAATCATGTACT-TA----GGG--TGTTTATA-TGGTGAATAAAT---G-CT---TTATTATTGC----AAT-----G-AAAAA-----TAG-TCAAAACAAGT-A-GA-GTC----A-TTC-AGCGCCA-ACGC-AACAAA-AGGTGTT-T------AC--AA-------------------------------------------AAGCGA--CCGTACAACTCA-A-TAGAT---AAAAAAAAAAAGAATTTTCGAAT--TTA-AGAAATGGTTG----AAAAATCATTTTTGAACTGTATGGTCGAC--TGGCA-ACATTTCTTAAAGCA-CACTCGTTCTTTTCTTCAAGATT--GTGC--TTGTT-TCCTCAGAAATG-GAGGGTCCTTAGCGTTAGGTCTTAAAAGACGGCC-TATTACATACTTTATG-GTGTAGGAAACAGTAATTCTAATTTATG-TTGTAC--ATCAACAGAGGTTCTTTG-TCATCTTAA-G-TA-------G-TTGTATCGACTATCGCTAATGCATTCAGT-CTCAAAG--------C-ACCAT----TGGTGGGTATAG-TTAAACAC-G-ATCG-C--TTAACTTAGCTGTAA--GTTTGGCCTAGTATGC-GCA-----TAATACA--TTGACATTCAGAGAGA-G--C-AA-TC-ATATATCGTATTACTTT-TCAAAATCTGATTTG--TAAGGG-A--AT----GATG-TTAACCC-TTTAA-A--A-AGA----G-ATAC--ACATT--CA--ATCTCA-TTATATAGAGTGAGAATTTAACTCCATAC------T-C-ATTTA-TTATAATTGAAAAATTC-T-TT-TTCA-TCCAAT-AAAATG---TGAAA-TTTTTAG-CTTA-T-ATAA-TAAAGTGGCAACTGGTACG--TTTATT---A-T-GG-AAG-ATATACATAG--G-TAGAAATTT-TGAAAG-AAAGCA-G-AAAAT--GAA-TTTTCTGTTC-TGTTAATAAA-T-GCAAAAAGGT--AATATGTGTTTGCTAAACGA-AAC-A-TG-AATC-TA-TCAATTTGCCACCA-TAATCGAC-AAAAT-TCGT--T--AACAA--------ATATGGAAATAAAG-ATTATCATG-G-CC-TTTTTTC-TCACCTC-AT-ATCTCAT--AA--ACG-AAA-A-----GATTAAACAATT--CCGCGTT------TGCCGTATTCGCATT----CCAGCC------G-T---TA--ACGATTGCTTCCGCGTT
gi|1                          :                                                                                                                  CCCTTG--TAAAATC---GCG-CTCAATACGAG--CTT--TAA--CGC-GGAAGCA-A-T--C-GTTAA---C----Gaaagctcgtattgagcgcgattttacaaggggtg
gi|10                         : gtgaacgcgcgattccgtattgacgcggacgcgaatagcggccacacaagcggctaattccgatttctgagtcatatagccgaagttatgatagggcataaagttttgttgatgttacttatgtgaatcgaacgacgtatatatagttggctaatatttgctgacgaagtataagtttagtagaggaggcagggacatctaatatggagatcctgagtacaagtacaactagacaagacgttattcgcacacctcgatgagagacgtaaaatgacattaattttgaattgacccgtatttaggttacagaataccctggaaatttcttttaccttttatgtcaatttatttttaactcatgtccctcactttattccaaaatcaatattgattttaccaactatgaacgaatgatgagttattgaaactttttaaataattactatgagttaacaaaaaatcatgtacttagggtgtttatatggtgaataaatgctttattattgcaatgaaaaatagtcaaaacaagtagagtcattcagcgccaacgcaacaaaaggtgtttacaaaagcgaccgtacaactcaatagataaaaaaaaaaagaattttcgaatttaagaaatggttgaaaaatcatttttgaactgtatggtcgactggcaacatttcttaaagcacactcgttcttttcttcaagattgtgcttgtttcctcagaaatggagggtccttagcgttaggtcttaaaagacggcctattacatactttatggtgtaggaaacagtaattctaatttatgttgtacatcaacagaggttctttgtcatcttaagtagttgtatcgactatcgctaatgcattcagtctcaaagcaccattggtgggtatagttaaacacgatcgcttaacttagctgtaagtttggcctagtatgcgcataatacattgacattcagagagagcaatcatatatcgtattacttttcaaaatctgatttgtaagggaatgatgttaaccctttaaaaagagatacacattcaatctcattatatagagtgagaatttaactccatactcatttattataattgaaaaattctttttcatccaataaaatgtgaaatttttagcttatataataaagtggcaactggtacgtttattatggaagatatacataggtagaaattttgaaagaaagcagaaaatgaattttctgttctgttaataaatgcaaaaaggtaatatgtgtttgctaaacgaaacatgaatctatcaatttgccaccataatcgacaaaattcgttaacaaatatggaaataaagattatcatggccttttttctcacctcatatctcataaacgaaaagattaaacaattccgcgtttgccgtattcgcattccagcC-TTTCG-A--A-GAT----G-AG-C--A-ATT-GCA--A---CA-TTAAA-AGAGTGAGAA-TTG-------ACATACAATGT-ATGTA-T-----TTGAAAAATTC-T-TT-TTCT-TTCAAT-AAAGTA---GGAAA-T----------------------AGTGGCA--TGGTACG--TT--CT---AGT-G--AA--ATAT-CA-----A-TGGAAA-AC-TGAAAG-AAA-CA-G-AAAAT--GAA-TT---TGTTC-TG-CGTAAAA-T-GCAAAA--GT--A-------------TAAGGA-TACTA-TGAAATCTTA-TCAA-TTGTC-CCA-TAATCG-C-AAAAT-TCGT--GA-AAAAA--------ATCTGGAAAATAAG-A----CATT-A-CAATTTTTCC-TCAACTC-GT-CTT-CATGAAA-TACA-AAATAAATTTA--TAAACAA-T--CTGCG-T------TGCCG-C-TCAC--------------------------------ATCG----CGCGTGTACAGGGGgtg
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                             T---C-AAT--GACT-TA-TA--TCT------GTAAATCGATT-GC--ACGA----TA---ATAGTATGGCAGG----GACAT--TA-ATATA-GGA-CTTTAA-AT-T--CTCAA-T-A-----A--TACGACGCTTTATTC-CC-ACGAAACAT-CGTAG----TCG-TAAA-TG-----AATTAT--AATTGAGATAC-G-AATT-TG-T-TTC-AAAAAT---TGAAA-T--T---TT--GC-TGTTATATCT-TTCATTATTGTA--TCATGA--CCC-C--AC-TTAT-------A-ATGACA-CTTAAGTATAC-AA--CT-----------------TAT--A----TT----GTA--TAC----------CAAAAAG--TTGGATTCCA-TC---G--T-----TA-TG--------AT---G-CT---TT----TT-C----A-T--------AAAACTC--T-G-TCAAA----GT-ATAA-GGC----AGATC-t
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        aagccttggagttcttgtctattattagcagCG--TT--GTG--AGT-GG-GATAACAT-CATCTAGA-TGGAAA-AA-TGAAG------------AAAC--GAA-TT---TGTTT-TG-CG-TAAC-TTGCAAAT--GT--G-------------AAAACA-TGCTG-TAAAATCTTA-TTAA-TTGTC-CCA-TAATCG-C-AAAAT-TCGTGGGG-AAGAA--------ATCTGGAAAATAAG-A----CATT-G-CCATTTTT-C-TCACCTC-GT-CTT-CAAGGAA-TACA-AAT-A-----A--TAAACAA-T--CCCCG-T------TGCAG-A-TTGC-AT----CCA--C------T-TCACTA--ACGATCG----CGCGTTTACAGGAGaaa
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        gAA--------CTT-G-T--TCT--C-A-TC-------G-TTGTATCC---ATCGCC-AT-CA-----TACTC-ACT--------TCA-C-T----TGA--------G-TT--CTAC-T-ATCGAC--CTA--ATA--CGT-T--GCTTCGCC--G--T-T-GCA-----TAA---A--T----A-TCCCA----TG--CAAA-TG-A-A-ATCT--TCAA-TT-TCAAAT------TGG--T--GCG-ACTAT----G-T--T--ACAC-TTTAGCA--ATGAA----G-AT-A--A-ATT-GCA--A---AC-TTATG-AGAGTAA--A-TTA--------T------T-C--TCTA-T-----TTGATAAATTC-T-TT-TCCT-CCCCAT-AAAGTACATTGAAA-TT
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       --AGTCGCA--TGGT-CA--TT--TTCTAAGT-GA-AA--ATCT--------A-TGTGAA-ATATGAAA---AAACA-GGAAAATACGAA-TT---T-TCT-TG-CG-TAAC-TTGCAACATGGTCAA-------------AAACAA-AACTG-GTAAA-CTTA-T-AA-T-GTC-CCA-TAATCG-CCAAAATCTCGT--TG-GGCAAGAGGAAAAATCTGGAAA-TAAG-A----ACTT-G-CCATTCTTCT-CAACCTCAGTATTT-CAAGGAA-TAC---AA-C-----A--T-AACAA-T--CC
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    G--------T-A-CATGTGGTGG--------A-TG--GTAC-G-ATCG-C--TTT--TTA--CAG-C--GTT--GCT--G-AT-C-GCAGAGCATAA---A--TT--C--TC-GAGAGATGTACAAA-TC-A-A-ATCG--TTA--TT-TGAAAAG-----TTG--T--TGA-C-TATTATAGATA-T--GCAT-CCTGG-------------G-AC-CTTA-AT-------G---CA-TT-----GA---AAAA-TCC-------CT------T-T-ATGCA-T-----TTGAAATATCC-T-TT-TCCA-c
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tgtgcaattgtgtgtttataatatggcgggttGAGACATTC-T-TTCTTCT-TTCAAT-AAAATA---TTAAA-TTTT--A-TTTA-T-ATAT-T--AGTGGCA--TGGTGCG--TT--TT---AAT-GG-AA--ATAT-TA-----G-TGG-AA-AT-TGAAAG-AAAACG-G-A-----------T---TGTTC-TG-CG-TAAA-T-ACAAAA--GT--A-------------AAA--A-CACTG-CTAAATGTTA-TCAG-TTGTC-CCA-TAATCG-C-AAAAC-CTGT--GACAAC-A--------GTCTTGGAAATAAA-A----CCTT-G-C
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              T--A-A-TA-------G-TTGTA-CG---ATCGC--ATGCA-----C-CTC-AAGGAGTCAAGC-A-CAT----TGG--------G-TT--GTAC-G-ATCG-C--TTA--TTA--TGT-C--GTT--GCC--G-AT-C-GCA-----TAA---A--TT--CA-TCAGACA--TG--CAAA-TC-A-A-ATCG--TTA--TT-TCAAAA------TTG--T--GGG-A-TAT----GATG-T--ACAC-TTTAG-A--A-GAA----G-AT-C--A-ATT-GCA--A---CA-TTACA-AGAGTGAGAA-TTA-------AC------T-C-ATCTG-T-----TTGAA
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      --TTATG-TTG-AC--AACA---------CTTTG-T--TCT--ACA-TATGTAATTG-TTGTT-CG---ATCGC--ATGCA-----T-CTT-AC---------T-A-CGT----TGG--------G-TT--GTAC-G-ATTG-G--TTA--ATA--CGT-C--GTT--GCC--G-AT-C-GCA-----TAA---A--TT--CT-TCAGAGACATG--CAAA-TA-A-A-ATTG--CTA--TT-TTAAAA------TTG--T--GGG-A-T
gi|19                         :                                                                                                                gACCCCTT--TAAA--C---GCG-C-------GAT--CGT--TAA--CGC-AGAAGCG-A-T--C-GGCAA---C----GCGG---ATC-T--A-TT---G-AGTCATA--A--CCG--AAAAT-T-GA------TA--TTGGGTAA-GTTTTG---ATGTCATTTATGT--AT---C-AAC--A--A-TA-TA--TCTAG-T--GTAAAT--ATTTGC--AC
gi|2                          :                                                                                                                 ACCCCTG--TAAA--CCAGGTG-C-------GAT--CGT--TAA--CGC-GGAAGCG-A-T--C-GGCAA---C----GCGG---ATC----A-TT---G-AGTCATA--G--CCG--AATTG-TAGG------TA--GCGGGTAA-GTTTTG---ATGTTATTTATGT--ATAATC-AAC--G----TA--A--TCTAG-T--GTAAATT-ATTTGC--ACGA----TA---TTAGTAGAGGAGG----GGCAT--T--ATATG-AGA-C-CTAC-A---------A-T-ACAACTA--CAAGACG--TTATTC-CC-AC--AAC-T-GATGG----T-G-TAAA-TG----TAATT-T--AATTGA---CC-G-ATTT-GG-T-TAC-AAAAAA---TGGAA-T--TTC-TT--AC-TGATATGTCA-TCTATT-TT-TA--TCATG---TTC-C--ACTTTATAC-C-AAA-AT-CAT-ATTGATTTTAC-AA--ATCAA-----GAT-TGA--TAT--AAACTTT----ATA--CAC-----ATTAACAAAAAA--GTGTATT-TA-TCAGGG--T----ATA-TG-------AAT---A-TT---TT----TT-C------T-----ACAAAAA-----T-G-TCAAA----GTAA-GA-GGC----A-ATCGGGA---A-ACGC-AACAAA-AT-TGTTAC------AT--AAGCGATC---G---------TACAAT-G----------CAAAGAAAGCGA--TCGTACAACTCA-A-T-GAT---ACAAG-------------TG-AT--T---AGAAATGGTTG------AAATCA-TTTTGA----TTTTGT-GACT-TGACAGACATT--TT-AAGCAGC--------------------TG--GTGC--TTATT-TCC-----AAT--AGTGGTCCTTA-CGTT---T----AAAGACGA-C-TA-TACATATTTAAGA-GTG------ACT-T-ATTCTA--TTATGTTTG-AC--AACA----------TTTG-T--TCT--A-A-TA-------G-TTGTA-CG---ATCGC--ATGCA-----C-CTC-AAG--------C-A-CAT----TGG--------G--T--GTAC-A-TCCG-C--TTA--TTAT-CGT-C--G-T--GCC--G-AT-C-GCA-----TAA---A--TT--CA-TCAGAGAGATG--CAAA-TCAA-A-ATCG--TTA--TT-TCAAAA------GTAT-T--GGG-A-TAT----GATG-T--ACAC-TTTAG-A--A-GAA----GAAT-CA-A-ATT-GCAACA---CA-CTATA-AGAGTGAGAA-TTA-------AC------T-C-ATCTATT-----TTGAAAAATTC-T-TT-TTCA-TCAATT-AAAATG---TTAAT-ATTT--A-CTTA-T-ATAT-T--AGTGGCA--TGGTACG--TT--TT---AGT-GGAAA--ATAT-CA-----A-TGGAAA-AT-TGAAAGAAAAACA-G-AAAAT--GAATTT---TGTTC-TG-CAATAAA-T-GCAATA--GT--A-------------AAACCA-TACTA-TGAAATCTTAGTCAA-TTGCC-TCA-TAATCG-C--AAAT-TCGT--TA-AACAA--------AATAGGAAAATAAGCA----TATTGG-CCATTTTTCC-TCACCTC-AT-CTC-CAGTGAA-TACG-AAA-A-----A--TAAAC-A-T--CCGCA-TGACCCGTGCCG-A-TCGC-TT----CCG--CCCCGCAG-T---TA--AGCATCG----CTCGTTTACAGGGG
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              cc-A-TAT----AATA-T--ACAC-TTTAG-A--A-GAA----G-AT-C--A-AAT-GCA--A---CA-TAATA-AGAGCAAAAA-TTG-------AC------C-C-CTATT-T-----TTGAGACATTC-T-TTCTTCT-TTCAATAAAAATA---TCAAA-TTTT--A-TTTA-T-ATAT-tg
gi|21                         :                                                                                                                 ACCCCTGCCTAAA--C---GCG-C-------GAT--CGT---AA--CGC-GGAAGCGAA-T--C--GCAA---C----GCGG---ATC-CAGA-CT---GCAATCATA--AGTCCGACAAGTT-T-GAGGGGAGTA--GCGGGTAA------A---ATGTTTTTTATGG--AT---C-Agacaacagtcttggaaata
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                cc-AAAAA--------ATCTGAAAAATAAG-A----CATT-G-CCCTTTTCTC-TCACCTC-GT-CT---------------AAA-A-----A--TAAACAA-TTTCCGCG-T------TGCCG-A-TTGC-AT----ACG--C------G-T---TG--ACTATCG----CGCGTTTACAGGGGgt
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     GGAAATAAA-A----CCTT-G-CCATTTTT---TCACCTC-GT-AAT-CAAGGAA-TACA-CAA-A-----A--TAATCAA-T--TCGCG-T------TGCCG-A-TT-C-AT----TCG--C------G-T---TA--ACGCTCG----CGCGTTTAAAGGGtg
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ttGGAAATAAA-A----CCTT-G-CCATTTTT---TCACCTC-GT-AAT-CAAGGAA-TACA-CAA-A-----A--TAATCAA-T--TCGCG-T------TGCCG-A-TTGC-AT----TCG--C------G-T---TA--ACGCTCG----CGCGTTTCAAGGGGat
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           tAGTAGAGGAGG----GGCAT--T--ATATG-AGT-C-CTAC-AT-TGTA-CAA-T-ACAACTA--CAAGACG--TCATTA-CC-AC--AAC-T-GATGG----T-G-TAAA-Tt
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                        AGTT-T-GA------TA--GCGGGTAA-GTTTTG---ATTTTAATTATGT--GT---C-AA
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 gttcactaacgtgtatgccgttatgcagaacaacAA-A-----A--TAAACAA-T--CCGCG-T------TGCCG-A-TCGC-TTGGAACCG--C------G-T---TA--ACGAT--------CGTTTACAGGAG
gi|28                         :                                                                                                                 ACCCCTG--TAAA--C---GCG-C-------GAT--CGT--TAA--CAC-GGAAGCG-A-T--C-GGCAA---C----GCGG---ATC-C--A-TT---tg
gi|3                          :                                                                                                                   CCCTG--TAAA--C---GCG-C-------GAT--CGT--TAA--CGC-GGAAGCG-A-T--C-GGCAA---C----GCGG---ATC-C--A-TT---G-AGTCGTA--G--CCG--AAGTT-T-GA------TA--GCGGGTAA-GTTTTG---ATGTTATTTATGT--AT---C-AAC--G--C-TA-TA--TCTAG-T--GTAAAT--ATTTGC--ATGA----TA---TTAGTAGAGGAGG----GGCAT--T--ATATG-AGA-C-CTAC----T--A-----T-ACAACTA--CAAGACG--TTATTTACC-AC--AAC---GATGG----T---TAAA--G----AATTT-T--AATTGA---CC-G--TTT-GG-TGTAC-AAAATA---TGGAA-TACTTC-TT--AC-TGTTATGTCA-TTATTT-TT-TA--TCATGCATTTC-C--ACTT-ATTC-CCAAATAT-CAT-ATTGATTTTAC-AA--ATCAA-----GA--TGA--TAT--AAACTTT----ATA--TAC-----ATTGACAAAAA---GTGTATT-TA-T-AGTG--T----AAC-TG-------AATTACG-TT---TT----TT-C----A-T-----T-GAAAT-----T-G-TCAA------T-A-GATGGC----A-ATC-GGC---ATAC-C-AACAAA-AT-TGTT-TTAG---ATCAAA---------G---------TGCGAT-GTGTTCAATTGCAAAGAAAGCG---TCGTACAACTCATA-TAGAT---ACAAGA------------CG--T--T---G---ATTGTCGTCTCGGACATCATTTT-GA----TTT-GT-GACT-TGACAGACATT--TTAA-GCA-C--------------------TG--GTGC--TTATT-CCT-----AATTTG-GGGTCCTTA-CGTT---A----ATAGACGA-C-TA-TACATATTGAA-G-GTAC-----ATA-T-ATACTA--TCATG-TTG-AC--AACA-----------TTG-T--TTT--A-A-TA-------G-TTGTA-CG---ATCGT---TGCA-----T-CTC-AAG--------TCA-CAT----TGG--------G-TT--GTAC-G-ATCG-C--TTA--T-A--TGT-C--GTT--GCC--G-AT-CTGCA-----TAA---A--TT--CA-TCAGAGAGATG--CAAA-TC-A-A-ATCG--T-A--TTATTAAAA------TTG--T--GGATA-TAT----GATG-T--AAAC-TT-AG-ATAG-GAA----G-AT-C--A-ATTTGCA--A---CAATTATA-AGAGTGAGAA-TTA-------AC------T-C-ATCTA-T-----TTGAAAAACTC-T-TT-TTCA-TCCAAT-AAAATG---TGAAA-TGTT--A-CTTA-T-A-------AGTGGCA--TGGTACG--TT--TT---TGT-GG-AA--ATAT-CA-----A-TGGAAA-AT-TGAAAG-AAAACA-G-ATAAT--GAA-TT---TGTTC-TG-CAATAAA-T-GCAAAA--GT--A-------------AAACCA-TACTA-TGAAATCTTA-TCAA-TTGCC-CCA-TAATCG-C-AAAAC-TCGT--TA-AACAA--------ATATGTAAAATAAT-A----TATT-G-CCAATTTTCC-TCACCTC-AT-CTC-CTTGGAA-TACG-AAA-A-----A--TATACAA-T--CCGCG-T------TGCCG-A-TCGC-TT----CCG--C------G-T---TA--ACTATCG----CGCGTTTACAGGGG
gi|30                         :                                                                                                                      TG--TAAA--C---GCG-C-------GAT--CGT--TAA--CGC-GGAAGCt
gi|4                          :                                                                                                                 ACCCCTG--TAAA--C---GCG-C-------GAT--CGT--TAA--TGC-GGATGCG-A-T--C-GTTAA---C----GCGG---ATC-C--A-TC---G-AGTCATA--G--CCA--AAGTT-T-GA------TA--GCGGGTAA-GTTTTG---ATGTTATTTATGT--AT---C-AAC--G--C-TA-TA--TCTAG-T--GTAAAT--ATTTGC--ACGA----TA---TTAGTAGAGGAGG----GGCAT--T--ACATG-AGA-C-CTAC-ATGT--A-TGA-T-ACAACTA--AAAGACG--TTATTC-CC-AA--AAC-T-GATAG----T-G-TAAA-TG----TAATT-T--AATTGA---CC-G-ATTT-GG-T-TAC-AAAATA---TGGAA-T--TTC-TT--AC-TGTTATGTCA-TTTATT-TT-TA--TCATG---TTC-C--ACTTTATTC-C-AAA-AG-CCA-ACTGATTTTAC-AA--ATCAA-----GG--TGA--TAT--AAACTTT----ATA--TAC-----ATTAACAAAAAA--GTGTAAT-TA-TCAGGG--T----ATA-TG-------AAT---T-TT---TT----TT-C----A-T-----G-AAAAA-----T-G-TCAAA----GT-A-CA-GGC----A-ATC-GGC---A-ACGT-AACAAA------TT-T-------T--AA-------------------TACAAC-G----------CA---------A--TCGTACAACTAA-A-TAGAT---ACAAG-------------TG-AT--T---AGATATGATTT------AAATCA-TTTTGA----TTTTGT-GACT-TGACAGACATT--TT-AAGCA-C--------------------TG--GTGC--TTATT-ACC-----AAT---AGGGTCCTTA-CGTT---T----AAAGACGA-C-TA-TATATAACTAATT-GTG------ACA-T-ATGCTA--TTATG-TTG-AC--AAC-A--------TTTTG-T--TCT--A-G-TA-------G-TTGTA-CG---ATCGC--ATGCA-----T-CTC-AAG--------T-A-CAT----TGG--------A-TT--GTAC-G-ATCG-C--TTA--TTA--TGT-C--TTT--GCC--G-AT-C-GCA-----TAA---A--TT--CA-TCAGAGAGATG--CAAA-TC-A-A-ATCG--TTA--TT-TCAAAA------TTG--T--GGG-A-TAT----GATG-T--ACAC-TTTAG-A--A-GAA----G-AT-C--A-ATT-GCA--A---CA-TTATA-AAAGTGAGAG-TTA-------TC------T-C-ATCTA-A-----TTGAAAAATTC-A-TT-TTCA-TCCAAT-AAAATG---TGAAA-TTTT--A-CTTATT-ATATAT--AGTGGCA--TGGTACG--TT--TT---AGT-GG-AA--ATAT-CA-----A-TGG--A-AT-TGAAAG-AAAACA-G-AAAAT--GAA-TT---TGTTC-TG-CAATAAA-T-GCAAAA--GT--A-------------AAACCA-TACTA-TGAAATCTTA-TCAA-TTGCC-CCG-TAATCG-C-AAAAT-TCGT--TA-AACAA--------ATATGGAAAATAAG-A----TATT-G-CCATTTTTCC-TCACCT--AT-CTC-CATGGAA-TACG-AAA-A-----A--TAAACAA-T--CCGCG-T------TGCTG-A-TTGC-TT----CCG--C--------T---TA--ACGATCG----CGCGTTTACAGGGG
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tAAAAAA--GTGTATT-TA-TTAGGG--T----ATAATG-------AAT---A-TT---TT----TT-TTTTGA-T-----G-AAAGAAAATAT-G-TCAAA----GT-A-GA-GGCCAAAA-ATC-GGC---A-ACGCCAACAAA-AT-TGTT-T------AC--AAAGCCGATTCG---------TACAATTG----------CAA-GAAAGCGAAATCGTACAACTCA-AATAGAT---AAAAT-------------TG-AT--TTTAGGAAATGGTCG----AAAAATCATTTTTTA----TTTTGT-GACT-TGACAGACATT--TTAAAGCA-T--------------------TGGCGTGCTTTTATTATCC-----AAT---AGAATCCTT--CGTT---T----AAAGACGA-C-TG-TACATATTTAAAGTGTG------ACA-T-ATT-TA--TTATGCTTG-ACAAAACAA--------TTTTGTT--TCT--A-ATTA-------G-TTGAT-CG---ATCGC--ATGCA-----T-ATC-AAG--------T-A-CAT----TGG--------G-TTG-GTACGG-ATCG-C--TTA--TTAT-TGT-C--GTT--GCC--G-AT-C-GCA-----TAA---AGTTT--CA-TCAGAGAGATG--CAAATTC-A-A-ATCGT-TTAT-TT-TCAAAA------TTGTTT--GGG-A-TAT----GATGTT--ACACTTTTAG-A--A-GAA----G-AT-C--A-ATT-GCA--A---CA--TATA-AGAGTGGGAA-TTA-------AC------T-CGATCTA-T-----TTGAAAAATTCTT-TT-TTCATTCCAAT-AAAATGT--TGAAATTTTT--ACCTTA-C-ATAT-T--AGTGGCA--TGGTACGTTTT--TT---AGTGGG-AA--ATAT-CA-----ATTGGAAA-AT-TGAAAG-AAAACAGG-AAAAT--GAA-TT---TGTTCTTG-CAATAAATT-GCAAAA--GT----------------AAACCA-TACTATTGAAACCTTA-TCAA-TTGCC-CCATTAATCG-C-AAAAT-TCGT--TA-AACAA--------ATATGGAAAATAAG-A----TATT-G-CCATTTTTCCTTCACCTC-AT-ATC-ATTGGAATTACGAAAA-A-----A--TAAACAA-T--CCGCG-T------TGCCG-A-TCGC-TT----CCG--C------GTT---TA--ACGATCG----CGCGTTTACAGGGG
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          caAGAA-----G-G-CCAAA-----T-A-CG-AGC----A--TC-G-----A-A-GC-AACAAAGAT-TGCT-TTAGCATATG-AA---------GCCGATCCATTACAATAG----------CAAAGAATGCGA--TCGTACAACTCA-A-TAGATGTAACAAG-------------TG-CTGCT---AGAAATG-TTG----AAA--TCATTTTTGA----TTT-GT-GACTGCGACAGACATT--TTAAAGCA-C--------------------TG---TGCC-TTATT-TC------AAT--GAGGTTCCTTC-GGTT---T----AAAG-CGA-CATA--ACATATTTAGTG--TG------ACA---ATTCTA--T-ATG-TTG-AA--AACAA--------TTCCG-T--TCT--A-A-TA-------GCTTGTA-CG---ATCGC--ATGCA-----T-CTC-AAG--------C-A--AT----TGG--------TCTT--GTAC-GGATCG-CCTTTA--TTA--TGT-CAGGTT--GCCC-G-AT-C-GCA-----TAA---G--TT--CA-TCAGAGAGATG--CAGA-TT-A-A-GTCG--TTA--GT-TCAAAA------TTG--T--GGACA-T-T----AATG-T--ACAC-TTAAG-A--A-GAAAGAAG-AT-C--A-ATT-GCA--AA--CA-TTATA-AGAGTGAGAA-TTA-------A-------T-C-ATCTA-T-----TTGAAAAATTC-TGTT-TTCA-TCCAAT-AAAATG---TGAAA-TTTT--A-CTTA-TAATAT-T--AGTGGCA--T-GTAGG--TT--TT---AGT-GGAAA--ATAT-CA-----A-TGGAAA-AT-TGAAAG-AAAACA-G-AAAAT--G-A-TT---TGTTC-TG-CAATAAA-T-GCAAAA--GT--A-------------AAACCATTACTA-TGAAATCTTA-TCAA-TTGCC-CCT-TAATCG-C-AAAA--TCGG--TA-AACAA--------AT-TGCTAAATAAG-A----TATT-GCCCATTTTTCC-TCACCTC-AT-CTC-CATGGAA-TACG-AAA-A-----A--TAAACAA-T--CCGCG-T------TGCCG-A-TCGC-TT----CCGCTC------G-T---AAAGACGATCG----CGCGTTTACAGGGGt
gi|7                          :                                                                                                               gtctCCTTG--TAAA--C---GCGAC-------GAT--CGT--TAAAACGTTGGATGCG-A-T--CAGGTAAAATC----GCGG---ATCAC--AATT---G-AGTCATA--T--TCA--AGTTT-T-TA------TA--CCGGGTAA-GTTTTG---A-G-TATTTATGT--AT---C-AACCAG--C-TATTACCTCTAGCT--GTAAAT--ATTTGC--G-----------------AGAGGAGG----GGCATA-TA-ATATG-AGA-----AC-CT-T--A-TGA-T-ACAACTA--AAAGGAG--TTATTC-CCAAA--AAC-TAGATAG----T-GATAAA-TGTT--TAATT-T--AATTGA---CC-G-ATTT-GGTT-TACAAAAATA---TGGAT-T--TTCTTT--AC-TATTATATCtg
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          caca-TTCATT-TT-TA--TCATG---TTCAC--ACTTTATTCAC-AAA-AT-CTA-ATTGATTTTAC-AG--ATCAA-----GAGTTGA--TAT--AAACTTTAATAATA--TAC-----ATTAAC-AAAAG--GTGTAAT-TATTCAAGGAAT----ATA-TG-------AAT---G-TTTTATT----TT-T----A-TCATGAG-AAAAA-----T-GTTCAAA----GT-A-CG-ACC----ACATC-CAC---A-ACGccccccccccccccccccccccccccccccccaatttcatttttatcatgttcacactttattcacaaaatctaattgattttacagatcaagagttgatataaactttaataatatacattaacaaaaggtgtaattattcaaggaatatatgaatgttttatttttatcatgagaaaaatgttcaaagtacgaccacatccacaacg
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               cacaccttgtaaacgcgacgatcgttaaaacgttggatgcgatcaggtaaaatcgcggatcacaattgagtcatattcaagtttttataccgggtaagttttgagtatttatgtatcaaccagctattacctctagctgtaaatatttgcgagaggaggggcatataatatgagaaccttatgatacaactaaaaggagttattcccaaaaactagatagtgataaatgtttaatttaattgaccgatttggtttacaaaaatatggattttctttactattatatcccccccccccccccccccccccccccccccccaat-AAG--------A-A-CAT----TGG--------G-TT--GTAC-G-ATCG-C--TTA--ATA--TGT-C--GTT--GCC--G-AT-C-GCA-----TAA---A--TT--CA-TCAGAGAGATG--CAAA-TC-A-A-ATCG--TTA--TT-TCAAAA------TTG--T--GGG-A-TAT----GATG-T--ACAC-TTTAG-A--A-GAA----G-AT-C--A-ATT-GCA--A---CA-TTATA-AGAGTGAGAA-TTA-------AC------T-C-ATCTA-T-----TTAAAAAATTC-T-TT-TTCA-TCCAAT-AAAATG---TGAAA-TTGT--A-CTTA-T-ATAT-T--AGTGGCA---GGTACG--TT--TT---AGT-GG-AA--ATAT-TA-----A-TGGAAA-AA-TGAAAG-AAAACA-G-AACAT--GAA-TT---TGTTC-TA-CAATAAA-T-GCAAAA--GT--A-------------AAACCA-TACTA-TGAAATCTTA-TCAA-TTGCC-CCA-TAATCG-C-AAAAT-TCGT--TA-AACAA--------ACATGGAAAATAAG-A----TCTT-G-CCATTTTTCC-TCCTCTC-AT-CTC-CATGGAA-TACG-AAA-A-----A--TAAAC
gi|9                          :                                                                                                                 ACCCCTG--TAAA--C---GCG-C-------GAT--CGT--GAA--CGC-AGACGCG-A-T--C-GTTAA---C----GCGG---ATC-C--A-GT---G-AAGCAAA--T--CTA--CAGTT-T-GA------TATAGCGGA-AA-GTTTTG---ATGTTATTCATGT--GT---C-AAT--G--C-TT-TA--TCTAG-T--GTAAAT--GTTTGC--ACGA----TA---TTAGTAGAGGAGG----GACATTAT--ATATG-AGA-C-TTATAAT-C--T-CAA-TAANGAATA--CAAAA-A--TAAGTC-TG-CC--AA--T-AAGGG--------------G----TAATT-T--AATTGA---TC-G-ATTT-GG-T-TTC-AAAATG---TGAAA-T--TTC-TT--GC-TGTTATATCT-TTTATT-TT-TA--TCATG---ACC-C--ACTTTATT-----AA-AT------------------A--ATTAA-----GG--TGA--TAC--AAACTTT----ATA--TGT-----ATTACCAAAAAA--GTGTATT-TA-TCAGGG--T----ATA-TG-------AAT---GCTT---TT----TT-C----A-T-----A-AAAAT-----T-G-TCAAA----GT-A-TA-GGC----A-ATC-AAC---A-ATGC-AACA


blockSeqs                     :                                                                                                                        CC    AT CAG   A TCAATAC   .    .    AA   T       A . .  A     AAT .       .     CAG  A  .   C       AGT     AC     . A  GGGGAG  TA        .      .               .   AAT .   CA ACT   T  CC     C .       CG      .     .     .               .        ATA       .   CT    CATTGTACA    . A       .        CT      A  A  GA   AT      TCG         T  TTT      A .       GAT  . .    .  T G   A      .       . AC   T  .   .          .      A  G  .      CAT   A .        TCCC    T  GACA            .  .   C  GAGT        .    .        AATA   .    A               G         C  T CA   AA .      A  .         TACG   TTA  .     . ATCATGAG           AAATA . T     .     A TA T   CAAA G   G   .   T    C      GAT     TTAGCATATGAAGCCGATCCATTACAATAG                       AA        AA            T A     GTA     TGATTTTA                       G   TCTCGG A    T      .      T  .    G           .   A     G .                     GC    TT     A  C        TTG         A     T               . A  .           AGT   C        T        .      T   .  AA    AC            T .    .  C T  TGTAATT C     T  .       C      .     A   .   GAGTCAAGC  .   GTGG   .        C  G     G G    A CT   .    TC   . AG   TC   C  .  . T   GAGCA   .   GT  .   .           TA    T  A . .    T    A   A      G        TT .    T C   TATA    T .     T     C TA T   AGAA A  . TT .   T   AC A    A     .          .   ACATACAA        G G     T .               T G  C    T      A      CAT     T    .  C    T A    AT         .        TT  .   CTA   G  A  TA    .  TCTAG T   A  .  A      A      G G     AC   T  .       T  . GT    T T      TG  CAA                   T     T          G    .     .   T      . C     C    GG  C     GAGGAAAA  C           C .       G C        C T       A  A   .  T    T   GA   T AATTT .        . TT     . GACCCG     . .    TTGGAA    CCCCGCAG    CAC  AG       .   
blockSeqs                     :                                                                                                                        .     .  .     . .         .    .    .    .       . . .  .     .   .       .     AC   .  .   .       A       .      . .  .       .         .      .               .   .   .   .  A     .  .      . .       T       .     .     .               .        TAT       .   C     AATTCTCA     . .       .        .       .  .  .    TA      TGA         T  T        . .       .    . .    .  . .   .      .       . .    .  .   .          .      .  .  .      A     . .        TCAC    .  CAT             .  .   C  GAT         .    .        .      .    A               A         .  . CA   .  .      .  .         GC     .    .     . TTTGATG            CTC   . .     .     . G  .   .    C   .   .   .    .      AT      TTAGATCAAAGTGCGATGTGTTCAATTG                         AA        .             . .     .       TGCTGCT                        G   AA     C    T      .      T  .    .           .   A     . .                     .     C      .  T        AG          A     A               . .  .           GA    .        T        .      C   .  .     AT            . .    .  . .  .       .     .  .       .      .     .   .   TC         .   .      .        .  .     . .    . .    .    TT   . .    .    .  .  . .   .       .   .   .   .           .     .  . . .    .    T   .      .        T  .    C .   .       . .     .     . .  .   .    .  . A  .   .   .  .    .     .          .   CT              . .     . .               . .  C    .      .      T       .    .  .    . .    T          .        .   .   G     .  A  .     .  .     .   A  .  .      .      . .     .    .  .       .  . AA    . T      .   A                     .     .          .    .     .   .      . .     .    .   .     .         C           . .       . .        C .       .  .   .  A    .   A    . .     .        . .      . .          . .    AT        CTCG        .    .        .   
blockSeqs                     :                                                                                                                        .     .  .     . .         .    .    .    .       . . .  .     .   .       .     T    .  .   .       G       .      . .  .       .         .      .               .   .   .   .  C     .  .      . .       .       .     .     .               .        TA        .   C     CATGTATG     . .       .        .       .  .  .    T       TG          T  A        . .       .    . .    .  . .   .      .       . .    .  .   .          .      .  .  .      .     . .        ACC     .  CAT             .  .   C  GA          .    .        .      .    A               A         .  . TA   .  .      .  .         G      .    .     . TAC                .     . .     .     . G  .   .    .   .   .   .    .      AT      TACAAAGCCGATTCGTACAATTG                              AA        .             . .     .       TGATT                          A   AA     A    T      .      T  .    .           .   A     . .                     .     .      .  C        GA          A     T               . .  .           TT    .        T        .      .   .  .     AT            . .    .  . .  .       .     .  .       .      .     .   .   TC         .   .      .        .  .     . .    . .    .    C    . .    .    .  .  . .   .       .   .   .   .           .     .  . . .    .    .   .      .        .  .    . .   .       . .     .     . .  .   .    .  . .  .   .   .  .    .     .          .   AC              . .     . .               . .  .    .      .      .       .    .  .    . .    T          .        .   .   .     .  .  .     .  .     .   G  .  .      .      . .     .    .  .       .  . AA    . .      .   G                     .     .          .    .     .   .      . .     .    .   .     .         C           . .       . .        C .       .  .   .  A    .   A    . .     .        . .      . .          . .    TT        CGT         .    .        .   
blockSeqs                     :                                                                                                                        .     .  .     . .         .    .    .    .       . . .  .     .   .       .     C    .  .   .       G       .      . .  .       .         .      .               .   .   .   .  C     .  .      . .       .       .     .     .               .        T         .   C     TAATCTCA     . .       .        .       .  .  .    T       TG          T  T        . .       .    . .    .  . .   .      .       . .    .  .   .          .      .  .  .      .     . .        TCC     .  CCA             .  .   C  GG          .    .        .      .    A               A         .  . CA   .  .      .  .         A      .    .     . ATT                .     . .     .     . C  .   .    .   .   .   .    .      AT      ACATAAGCGATCGTACAATG                                 A         .             . .     .       ACGTT                          G   .      A    .      .      .  .    .           .   .     . .                     .     .      .  C        A           C     T               . .  .           TG    .        T        .      .   .  .     AT            . .    .  . .  .       .     .  .       .      .     .   .   T          .   .      .        .  .     . .    . .    .    C    . .    .    .  .  . .   .       .   .   .   .           .     .  . . .    .    .   .      .        .  .    . .   .       . .     .     . .  .   .    .  . .  .   .   .  .    .     .          .   AC              . .     . .               . .  .    .      .      .       .    .  .    . .    T          .        .   .   .     .  .  .     .  .     .   A  .  .      .      . .     .    .  .       .  . AA    . .      .   A                     .     .          .    .     .   .      . .     .    .   .     .         C           . .       . .        T .       .  .   .  G    .   G    . .     .        . .      . .          . .    AT        CT          .    .        .   
blockSeqs                     :                                                                                                                        .     .  .     . .         .    .    .    .       . . .  .     .   .       .     C    .  .   .       G       .      . .  .       .         .      .               .   .   .   .  C     .  .      . .       .       .     .     .               .        T         .   C     CCTTATG      . .       .        .       .  .  .    T       TG          T  T        . .       .    . .    .  . .   .      .       . .    .  .   .          .      .  .  .      .     . .        T       .  CTA             .  .   T  GG          .    .        .      .    A               G         .  . CA   .  .      .  .         T      .    .     . ATG                .     . .     .     . G  .   .    .   .   .   .    .      .       TTAATACAACG                                          .         .             . .     .       TGATT                          .   .      .    .      .      .  .    .           .   .     . .                     .     .      .  .        A           .     T               . .  .           G     .        .        .      .   .  .     C             . .    .  . .  .       .     .  .       .      .     .   .   T          .   .      .        .  .     . .    . .    .    T    . .    .    .  .  . .   .       .   .   .   .           .     .  . . .    .    .   .      .        .  .    . .   .       . .     .     . .  .   .    .  . .  .   .   .  .    .     .          .   AC              . .     . .               . .  .    .      .      .       .    .  .    . .    T          .        .   .   .     .  .  .     .  .     .   A  .  .      .      . .     .    .  .       .  . AA    . .      .   A                     .     .          .    .     .   .      . .     .    .   .     .         T           . .       . .        C .       .  .   .  A    .   A    . .     .        . .      . .          . .    AT        CG          .    .        .   
blockSeqs                     :                                                                                                                        .     .  .     . .         .    .    .    .       . . .  .     .   .       .     C    .  .   .       T       .      . .  .       .         .      .               .   .   .   .  C     .  .      . .       .       .     .     .               .        T         .   C     CTA          . .       .        .       .  .  .    T       T           .  .        . .       .    . .    .  . .   .      .       . .    .  .   .          .      .  .  .      .     . .        .       .  .               .  .   .  .           .    .        .      .    .               A         .  . C    .  .      .  .         A      .    .     . ATA                .     . .     .     . C  .   .    .   .   .   .    .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  .      .   .  .     .             . .    .  . .  .       .     .  .       .      .     .   .   C          .   .      .        .  .     . .    . .    .    C    . .    .    .  .  . .   .       .   .   .   .           .     .  . . .    .    .   .      .        .  .    . .   .       . .     .     . .  .   .    .  . .  .   .   .  .    .     .          .   AC              . .     . .               . .  .    .      .      .       .    .  .    . .    T          .        .   .   .     .  .  .     .  .     .   A  .  .      .      . .     .    .  .       .  . AA    . .      .   A                     .     .          .    .     .   .      . .     .    .   .     .         C           . .       . .        C .       .  .   .  A    .   A    . .     .        . .      . .          . .    AT        CG          .    .        .   
blockSeqs                     :                                                                                                                        .     .  .     . .         .    .    .    .       . . .  .     .   .       .     C    .  .   .       T       .      . .  .       .         .      .               .   .   .   .  .     .  .      . .       .       .                           .        T         .   .     CA           . .       .        .       .  .  .    .       .           .                                                                                                                                                                                                                  .         .  . A    .  .      .  .         G      .    .     . AT                 .     . .     .     . C  .   .    .   .   .   .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           .             . .    .  . .  .       .     .  .       .      .     .   .   T          .   .      .        .  .     . .    . .    .    T    . .    .    .  .  . .   .       .   .   .   .           .     .  . . .    .    .   .      .        .  .    . .   .       . .     .     . .  .   .    .  . .  .   .   .  .    .     .          .   TC              . .     . .               . .  .    .      .      .       .    .  .    . .    .          .        .   .   .     .  .  .     .  .     .   A  .  .      .      . .     .    .  .       .  . AA    . .      .   A                     .     .          .    .     .   .      . .     .    .   .     .         A           . .       . .        C .       .  .   .  T    .   G    . .     .        . .      . .          . .    TT        CG          .    .        .   
blockSeqs                     :                                                                                                                        .     .  .     . .         .    .    .    .       . . .  .     .   .       .     .    .  .                          . .  .       .         .      .               .   .   .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             .     . .     .     . T  .   .    .   .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        .  . .  .       .     .  .       .      .     .   .   T          .   .      .        .  .     . .    . .    .    T    . .    .    .  .  . .   .       .   .   .   .           .     .  . . .    .    .   .      .        .  .    . .   .       . .     .     . .  .   .    .  . .  .   .   .  .    .     .          .   AC              . .     . .               . .  .    .      .      .       .    .  .    . .    .          .        .   .   .     .  .  .     .  .     .   A  .  .      .      . .     .    .  .       .  . G     . .      .   A                     .     .          .    .     .   .      . .     .    .   .     .         A           . .       . .        C .       .  .   .  T    .   G    . .     .        . .      . .          . .    TT        CG          .    .        .   
blockSeqs                     :                                                                                                                        .     .  .     . .         .    .    .    .       . . .  .     .   .                                                                                                  .   .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              .   C          .   .      .        .  .     . .    . .    .    T    . .    .    .  .  . .   .       .   .   .   .           .     .  . . .    .    .   .      .        .  .    . .   .       . .     .     . .  .   .    .  . .  .   .   .  .    .     .          .   AC              . .     . .               . .  .    .      .      .       .    .  .    . .               .        .   .   .     .  .  .     .  .     .   .  .  .      .      . .     .    .  .       .  . G     . .      .   A                     .     .          .    .     .   .      . .     .    .   .     .         A           . .       . .        C .       .  .   .  T    .   G    . .     .        . .      . .          . .    TT        CG          .    .        .   
blockSeqs                     :                                                                                                                        .     .  .     . .         .    .    .    .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  A          .   .      .        .  .     . .    . .    .    T    . .    .    .  .  . .   .       .   .   .   .           .     .  . . .    .    .   .      .        .  .    . .   .       . .     .     . .  .   .    .  . .  .   .   .  .    .     .          .   T               . .     . .               . .  .    .      .      .       .                                       .   .   .     .  .  .     .  .     .   .  .  .      .      . .     .    .  .       .  . G     . .      .   .                     .     .          .    .     .   .      . .     .    .   .     .         A           . .       . .        . .       .  .   .  T    .   G    . .     .        . .      . .          . .    TT        C           .    .        .   
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                . .                   .     . .  .   .    .  . .  .   .   .  .    .     .          .   A               . .     . .               . .  .    .                                                                                                                                                                                                                                                      .     .         .           . .       . .        . .       .  .   .  T    .   .    . .     .        . .      . .          . .    .         .           .    .        .   
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              . .       . .        . .       .  .   .  .    .   .    . .     .        . .                                                                  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              . .       . .                                          . .     .                                                                             


blockSeqCons                  :                                                                                                                                                   **   **                    **           ****    ***   C***    ***         G****                                        ***             **             C***              **              **    ****  ***             ****     T****         C**   CATTTCG*****           **                          T**     TG******    T* T****      **                                  ***               **                          **             **       TCC**      CNN**              **     GG*******   **   **       ****   **   A*****          A**            CA      ****      *******               ****    ATN***********                   ****                        ***             AT**                                                         AA                                      TGATT*******************           GG****             ****                       **          ********************                  C*****   A***        A*    T*******                               ******   T**      **                  AT********      **   **                       ***     **     *****                               ********    **                  **   T**         **   **                  ***     **                                **   **         ******      **                   **                                           ***                       AC*************           *****                                                **             T***       **           **              **       *****                                         ***                         **  A***************                                                                                            ****                                                         **                                    NT*****   CG*********               ****
originalCons                  :                                                                                                                NACCCCTG--TAAA--C---GCG-C-------GAT--CGT--TAA--CGC-GGAAGCG-A-T--C-GGCAA---C----GCGG---ATC-C--A-TT---G-AGTCATA--G--CCG--AAGTT-T-GA------TA--GCGGGTAA-GTTTTG---ATGTTATTTATGT--AT---C-AAC--G--C-TA-TA--TCTAG-T--GTAAAT--ATTTGC--ACGA----TA---TTAGTAGAGGAGG----GGCAT--T--ATATG-AGA-C-CTAC-AT-T--A-CGA-T-ACAACTA--CAAGACG--TTATTC-CC-AC--AAC-T-GATGG----T-G-TAAA-TG----TAATT-T--AATTGA---CC-G-ATTT-GG-T-TAC-AAAATA---TGGAA-T--TTC-TT--AC-TGTTATGTCA-TTTATT-TT-TA--TCATG---TCC-C--ACTTTATTC-C-AAA-AT-CNA-ATTGATTTTAC-AA--ATCAA-----GA--TGA--TAT--AAACTTT----ATA--TAC-----ATTAACAAAAAA--GTGTATT-TA-TCAGGG--T----ATA-TG-------AAT---G-TT---TT----TT-C----A-T-----G-AAAAA-----T-G-TCAAA----GT-A-NA-GGC----A-ATC-GGC---A-ACGC-AACAAA-AT-TGTT-T------AT--AA---------G---------TACAAT-G----------CAAAGAAAGCGA--TCGTACAACTCA-A-TAGAT---ACAAG-------------CG-AT--T---AGAAATGGTCG----AAAAATCATTTTTGA----TTTTGT-GACT-TGACAGACATT--TTAAAGCA-C--------------------TG--GTGC--TTATT-TCC-----AAT--GAGGGTCCTTA-CGTT---T----AAAGACGA-C-TA-TACATATTTAATG-GTG------ACA-T-ATTCTA--TTATG-TTG-AC--AACAA--------CTTTG-T--TCT--A-A-TA-------G-TTGTA-CG---ATCGC--ATGCA-----T-CTC-AAG--------T-A-CAT----TGG--------G-TT--GTAC-G-ATCG-C--TTA--TTA--CGT-C--GTT--GCC--G-AT-C-GCA-----TAA---A--TT--CA-TCAGAGAGATG--CAAA-TC-A-A-ATCG--TTA--TT-TCAAAA------TTG--T--GGG-A-TAT----GATG-T--ACAC-TTTAG-A--A-GAA----G-AT-C--A-ATT-GCA--A---CA-TTATA-AGAGTGAGAA-TTA-------AC------T-C-ATCTA-T-----TTGAAAAATTC-T-TT-TTCA-TCCAAT-AAAATG---TGAAA-TTTT--A-CTTA-T-ATAT-T--AGTGGCA--TGGTACG--TT--TT---AGT-GG-AA--ATAT-CA-----A-TGGAAA-AT-TGAAAG-AAAACA-G-AAAAT--GAA-TT---TGTTC-TG-CGATAAA-T-GCAAAA--GT--A-------------AAACCA-TACTA-TGAAATCTTA-TCAA-TTGCC-CCA-TAATCG-C-AAAAT-TCGT--TA-AACAA--------ATNTGGAAAATAAG-A----CATT-G-CCATTTTTCC-TCACCTC-GT-CTC-CATGGAA-TACG-AAA-A-----A--TAAACAA-T--CCGCG-T------TGCCG-A-TCGC-TT----CCG--C------G-T---TA--ACGATCG----CGCGTTTACAGGGG
finalCons                     :                                                                                                                NACCCCTG--TAAA--C---GCG-C-------GAT--CGT--TAA--CGC-GGAAGCG-A-T--C-GGCAA---C----GCGG---ATCC---A-TT---G-AGTCATAG----CCG--AAGTT-T-GA------TA--GCGGGTAA-GTTTTG---ATGTTATTTATGT--AT---C-AAC--GC---TA-TA--TCTAG-T--GTAAAT--ATTTGC--ACGA----TA---TTAGTAGAGGAGG----GGCATT----ATATG-AGAC--CTACATTTCG-----A-T-ACAACTA--CAAGACG--TTATTC-CC-AC--AACT--GATGGTG------TAAAT-GT----AATT-T--AATTGA---CC-G-ATTT-GG-T-TAC-AAAATA---TGGAA-T--TTC-TT--AC-TGTTATGTCA-TTTATT-TT-TA--TCATG---TCC-C--ACTTTATTCC--AAA-ATCNN--ATTGATTTTAC-AA--ATCAAGG-------TGA--TAT--AAACTTT----ATA--TACA-----TTAACAAAAAA--GTGTATT-TA-TCAGGG--T----ATA-TG-------AAT---G-TT---TT----TT-CATN-----------AAAAA-----T-G-TCAAA----GT-A-NA-GGC----A-ATC-GGC---A-ACGC-AACAAAAT--TGTT-T------AT--AA---------G---------TACAAT-G----------CAAAGAAAGCGA--TCGTACAACTCA-A-TAGAT---ACAAGTGATT-------------------AGAAATGGTCGGG----AAATCATTTTTGA----TTTTGT-GACT-TGACAGACATT--TTAAAGCA-C--------------------TG--GTGC--TTATT-TCC-----AATA---GGGTCCTTA-CGTTT-------AAAGACGA-C-TA-TACATATTTAATG-GTG------ACAT--ATTCTA--TTATG-TTG-AC--AACAAT--------TTTG-T--TCT--A-A-TA-------G-TTGTA-CG---ATCGC--ATGCA-----T-CTC-AAG--------T-A-CAT----TGG--------G-TT--GTAC-G-ATCG-C--TTA--TTAT--GT-C--GTT--GCC--G-AT-C-GCA-----TAA---A--TT--CA-TCAGAGAGATG--CAAA-TC-A-A-ATCG--TTA--TT-TCAAAA------TTG--T--GGG-A-TAT----GATG-T--ACAC-TTTAG-A--A-GAA----G-AT-C--A-ATT-GCA--A---CA-TTATA-AGAGTGAGAA-TTAAC-------------T-C-ATCTA-T-----TTGAAAAATTC-T-TT-TTCA-TCCAAT-AAAATG---TGAAA-TTTT--A-CTTA-T-ATATT---AGTGGCA--TGGTACG--TT--TT---AGT-GG-AA--ATAT-CA-----A-TGGAAA-AT-TGAAAG-AAAACA-G-AAAAT--GAA-TT---TGTTC-TG-CGATAAA-T-GCAAAA--GTA---------------AAACCA-TACTA-TGAAATCTTA-TCAA-TTGCC-CCA-TAATCG-C-AAAAT-TCGT--TA-AACAA--------ATNTGGAAAATAAG-A----CATT-G-CCATTTTTCC-TCACCTC-GT-CTC-CATGGAA-TACG-AAA-A-----A--TAAACAA-T--CCGCG-T------TGCCG-A-TCGCNT-----CCGCG---------T---TA--ACGATCG----CGCGTTTACAGGGG
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|29 ): GAATACAAAAATAAGTCTGCCAATAAGGGG






Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                111111111111111111111111111111111111111111111111111                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 
lowQualScore                  :                                                                                                                                         1111111                                                         1111                11111               111111                                                  1111                      11            1111  111             1111     22222               3333333333                                       111     11111111       22222              111                         111                                                  111              11111      111111                    222222222                 2222        111111                                 1111      1111111   11111       1111    1111111111111    1111111                                                     1111    111111111111111111111111111111111111111111111111111  11                              111     5555555555555     2222222        3333333              1111   1                               55555555555555555555                   111111   22                22222222                         111   222222   111             1            3333333333                   1111111                  11     11111         1111111111            11111111                                          11                                                                                   111111     11                                                                                         111111111111111                                                                                                         111     1           11111                                                            1      11     2222222222222                                                                    11111111                                                                                                                             11111111111                                 
lowQualScore                  :                                                                                                                        55    55 666   3 1111111   55   55   55   3   0   4 4 55 4     777 8888    777   4444 4  777 5       44444   66     4 4  222222  66        4      777             66  777 4   66 8888  5  66     5 66      11      66    2222  000             0000     11111     5   666   9999999999 5 5       66       66      5  5  66   222     99999999    55 11111    5 77      000  5 5    5  5 5   5      000     5 77   5  77  5          5      5  5  77     555   5 77       11111   5  222222          5  77  3  444444444   77   77       4444   77   444444          777       5  5 11   66 0000   5  6666666   00000  888  0000  5 7777777777777    5555555 4 4     9999  4 55 4   9999 8   4 0 888 5    5      1111    666666666666666666666666666666666666666666666666666  00        99            6 6     111     0000000000000  6  2222222        9999999       7      4444   1  6    6           99  7     6 44444444444444444444   99   6  99   6  777777   55  6       99    11111111        6 6  6           111   555555   222      77 0   1   5    77  4444444444     66 5  66 4  4 4444444 4     8  777     00     11111 4   4   9999999999 3   7777   33333333 3  55 3    7    3 55   55   7777  3 55   00   88 3  3 3   99999   666 55  55  3           55     3 3 3 3    55  3 88  3 3     444444   3 00   6 3   7777     88       3  3 44 3   7777 3  3 77 3   3   44 999  3     3          3   666666666666666 3 3     3 88888            3  6  3   3     3      666 3        99  4   4 4    5555       55         55  555     0  88    3  55555  3  1  3  3      3       7     55   3  666      3 3 66     0      00  55 0000000000000      3      3         3    3     3    3     3 3     3    55  3     22222222  4           2 6666    2 2        4 3       3  3   3  2    3   33   2 77777 33       3 44     3 999999     3 3    7777777   22222222222 555  44       7777              
lowQualScore                  :                                                                                                                        ..    .. ...   . .......   ..   ..   ..   .   .   . . .. .     ... ....    ...   .... .  ... .       .....   ..     . .  ......  ..        .      ...             ..  ... .   .. ....  .  ..     . ..      ..      ..    ....  ...             ....     .....     .   ...   .......... . .       ..       ..      .  .  ..   ...     ........    .. .....    . ..      ...  . .    .  . .   .      ...     . ..   .  ..  .          .      .  .  ..     ...   . ..       .....   .  ......          .  ..  .  .........   ..   ..       ....   ..   ......          ...       .  . ..   .. ....   .  .......   .....  ...  ....  . .............    ....... . .     ....  . .. .   .... .   . . ... .    .      ....    ...................................................  ..        ..            . .     ...     .............  .  .......        .......       .      ....   .  .    .           ..  .     . ....................   ..   .  ..   .  ......   ..  .       ..    ........        . .  .           ...   ......   ...      .. .   .   .    ..  ..........     .. .  .. .  . ....... .     .  ...     ..     ..... .   .   .......... .   ....   ........ .  .. .    .    . ..   ..   ....  . ..   ..   .. .  . .   .....   ... ..  ..  .           ..     . . . .    ..  . ..  . .     ......   . ..   . .   ....     ..       .  . .. .   .... .  . .. .   .   .. ...  .     .          .   ............... . .     . .....            .  .  .   .     .      ... .        ..  .   . .    ....       ..         ..  ...     .  ..    .  .....  .  .  .  .      .       .     ..   .  ...      . . ..     .      ..  .. .............      .      .         .    .     .    .     . .     .    ..  .     ........  .           . ....    . .        . .       .  .   .  .    .   ..   . ..... ..       . ..     . ......     . .    .......   ........... ...  ..       ....              
lowQualScore                  :                                                                                                                        00    00 444   6 8888888   00   00   00   6   1   0 0 55 0     000 5555    888   0000 4  888 0       00000   99     4 4  888888  11        4      888             11  000 0   99 2222  0  99     0 99      99      99    1111  000             6666     66666     0   222   6666666666 0 0       99       99      0  0  99   111     00000000    11 77777    7 99      000  7 7    7  7 7   7      000     7 99   7  99  7          7      7  7  99     777   7 99       00000   7  666666          7  99  0  111111111   99   99       3333   99   444444          888       0  0 55   99 6666   0  2222222   99999  888  6666  0 6666666666666    0000000 4 4     4444  4 44 4   4444 9   4 2 888 0    7      5555    555555555555555555555555555555555555555555555555555  33        22            7 7     777     8888888888888  7  7777777        2222222       3      2222   3  7    7           22  3     7 22222222222222222222   22   7  22   7  777777   00  7       88    22222222        7 7  7           000   888888   555      99 1   4   7    99  9999999999     99 0  11 4  4 4444444 4     9  888     66     11111 4   0   3333333333 6   7777   22222222 6  00 6    3    6 00   00   4444  6 00   00   66 6  6 6   11111   444 00  00  6           00     6 6 6 6    00  6 66  6 6     111111   6 00   7 3   7777     66       3  3 66 3   1111 3  3 99 3   3   66 222  3     3          3   555555555555555 3 3     3 33333            3  7  3   6     6      444 6        55  0   0 0    8888       55         00  000     9  66    6  55555  6  3  6  6      6       3     00   6  444      6 6 99     9      00  00 0000000000000      6      6         6    6     6    6     6 6     6    00  3     11111111  2           9 1111    9 9        0 1       1  1   1  7    1   88   9 11111 99       1 22     3 666666     3 3    7777777   55555555555 888  66       1111              
consensus                     :                                                                                                                NACCCCTG--TAAA--C---GCG-C-------GAT--CGT--TAA--CGC-GGAAGCG-A-T--C-GGCAA---C----GCGG---ATC-C--A-TT---G-AGTCATA--G--CCG--AAGTT-T-GA------TA--GCGGGTAA-GTTTTG---ATGTTATTTATGT--AT---C-AAC--G--C-TA-TA--TCTAG-T--GTAAAT--ATTTGC--ACGA----TA---TTAGTAGAGGAGG----GGCAT--T--ATATG-AGA-C-CTAC-ATT-T-CGA-T-ACAACTA--CAAGACG--TTATTC-CC-AC--AAC-T-GATGG----T-G-TAAA-TG----TAATT-T--AATTGA---CC-G-ATTT-GG-T-TAC-AAAATA---TGGAA-T--TTC-TT--AC-TGTTATGTCA-TTTATT-TT-TA--TCATG---TCC-C--ACTTTATTC-C-AAA-ATCAN-A-TTGATTTTAC-AA--ATCAA-----GA--TGA--TAT--AAACTTT----ATA--TAC-----ATTAACAAAAAA--GTGTATT-TA-TCAGGG--T----ATA-TG-------AAT---G-TT---TT----TT-C----A-T-----GAAAA-A-----T-G-TCAAA----GT-A-NA-GGC----A-ATC-GGC---A-ACGC-AACAAA-AT-TGTT-T------AT--AA---------G---------TACAAT-G----------CAAAGAAAGCGA--TCGTACAACTCA-A-TAGAT---ACAAG-------------TG-AT--T---AGAAATGGTCG----AGAAATCATTTTTGA----TTTTGT-GACT-TGACAGACATT--TTAAAGCA-C--------------------TGG--TGC-TT--ATT-TCC-----AAT--AG-GGTCCTTA-CGTT---T----AAAGACGA-C-TA-TACATATTTAATG-GTG------ACA-T-ATTCTA--TTATG-TTG-ACAA--CAA--------TTTTGT--T-CT--A-AT-A-------G-TTGTA-CG---ATCGC--ATGCA-----T-CTC-AAG--------T-A-CAT----TGG--------G-TT--G-TACG-ATCG-C--TTA--TTA--C-GT-C--GTT--GCC--G-AT-C-GCA-----TAA---A--TT--CA-TCAGAGAGATG--CAAAT-C-A-A-ATCG--TT-A--TT-T-CAAAA------TTG-T--GGG-A-TAT----GATGT--ACACTTT-AG-A--A-GAA----G-AT-C--A-ATT-GCA--A---CA-TTATA-AGAGTGAGAA-TTA-------AC------T-C-ATCTA-T-----TTGAAAAATTCT-TT-TT-CAT-CCAAT-AAAATG---T-GAAATTTT--AC-TTA-T-ATAT-T--AGTGGCA--TGGTACGTT--TT---AGTGG-AA--ATAT-CA-----AT-GGAAA-AT-TGAAAG-AAAACAG-AAAAT--GAA-TT---TGTTCT-G-CGATAAAT-GCAAAA--GT--A-------------AAACCA-TACTAT-GAAATCTTA-TCAA-TTGCC-CCAT-AATCG-C-AAAAT-TCGT--TA-AACAA--------ATNTGGAAAATAAG-A----CATT-G-CCATTTTTCC-TCACCTC-GT-CTC-CATGGAA-TACG-AAA-A-----A--TAAACAA-T--CCGCG-T------TGCCG-A-TCGC-TT----CCG--C------G-T---TA--ACGATCG----CGCGTTTACAGGGG
Reference ( family-1189 )     :                                                                                                                NACCCCTG--TAAA--C---GCG-C-------GAT--CGT--TAA--CGC-GGAAGCG-A-T--C-GGCAA---C----GCGG---ATC-C--A-TT---G-AGTCATA--G--CCG--AAGTT-T-GA------TA--GCGGGTAA-GTTTTG---ATGTTATTTATGT--AT---C-AAC--G--C-TA-TA--TCTAG-T--GTAAAT--ATTTGC--ACGA----TA---TTAGTAGAGGAGG----GGCAT--T--ATATG-AGA-C-CTAC-ATT-T-CGA-T-ACAACTA--CAAGACG--TTATTC-CC-AC--AAC-T-GATGG----T-G-TAAA-TG----TAATT-T--AATTGA---CC-G-ATTT-GG-T-TAC-AAAATA---TGGAA-T--TTC-TT--AC-TGTTATGTCA-TTTATT-TT-TA--TCATG---TCC-C--ACTTTATTC-C-AAA-ATCNN-A-TTGATTTTAC-AA--ATCAA-----GG--TGA--TAT--AAACTTT----ATA--TAC-----ATTAACAAAAAA--GTGTATT-TA-TCAGGG--T----ATA-TG-------AAT---G-TT---TT----TT-C----A-T-----NAAAA-A-----T-G-TCAAA----GT-A-NA-GGC----A-ATC-GGC---A-ACGC-AACAAA-AT-TGTT-T------AT--AA---------G---------TACAAT-G----------CAAAGAAAGCGA--TCGTACAACTCA-A-TAGAT---ACAAG-------------TG-AT--T---AGAAATGGTCG----GGAAATCATTTTTGA----TTTTGT-GACT-TGACAGACATT--TTAAAGCA-C--------------------TGG--TGC-TT--ATT-TCC-----AAT--AG-GGTCCTTA-CGTT---T----AAAGACGA-C-TA-TACATATTTAATG-GTG------ACA-T-ATTCTA--TTATG-TTG-ACAA--CAA--------TTTTGT--T-CT--A-AT-A-------G-TTGTA-CG---ATCGC--ATGCA-----T-CTC-AAG--------T-A-CAT----TGG--------G-TT--G-TACG-ATCG-C--TTA--TTA--T-GT-C--GTT--GCC--G-AT-C-GCA-----TAA---A--TT--CA-TCAGAGAGATG--CAAAT-C-A-A-ATCG--TT-A--TT-T-CAAAA------TTG-T--GGG-A-TAT----GATGT--ACACTTT-AG-A--A-GAA----G-AT-C--A-ATT-GCA--A---CA-TTATA-AGAGTGAGAA-TTA-------AC------T-C-ATCTA-T-----TTGAAAAATTCT-TT-TT-CAT-CCAAT-AAAATG---T-GAAATTTT--AC-TTA-T-ATAT-T--AGTGGCA--TGGTACGTT--TT---AGTGG-AA--ATAT-CA-----AT-GGAAA-AT-TGAAAG-AAAACAG-AAAAT--GAA-TT---TGTTCT-G-CGATAAAT-GCAAAA--GT--A-------------AAACCA-TACTAT-GAAATCTTA-TCAA-TTGCC-CCAT-AATCG-C-AAAAT-TCGT--TA-AACAA--------ATNTGGAAAATAAG-A----CATT-G-CCATTTTTCC-TCACCTC-GT-CTC-CATGGAA-TACG-AAA-A-----A--TAAACAA-T--CCGCG-T------TGCCG-A-TCGC-NT----CCG--C------G-T---TA--ACGATCG----CGCGTTTACAGGGG
gi|1                          :                                                                                                                       G--TGAA--C---GCG-C-------GATTCCGTATTGA--CGC-GGACGCG-AATAGC-GGCCA---CACAAGCGGCTAATT-CCGA-TTTCTG-AGTCATATAG--CCG--AAGTTAT-GA------TA--GGGCATAAAGTTTTGTTGATGTTACTTATGTGAAT---CGAAC--GA-CGTA-TA--TATAG-TTGGCTAAT--ATTTGCTGACGAAGTATAAGTTTAGTAGAGGAGGCAGGGACAT--CTAATATGGAGATC-CTG--AGT-A-CAAGT-ACAACTAGACAAGACG--TTATTC-GC-AC--ACC-TCGATGAGAGAC-G-TAAAATGACATTAATT-TTGAATTGA---CCCGTATTTAGG-T-TAC-AGAATACCCTGGAAAT--TTC-TTTTACCTTTTATGTCAATTTATT-TT-TAACTCATG---TCC-CTCACTTTATTC-C-AAA-ATCAATA-TTGATTTTACCAACTATGAACGAATGA--TGAGTTATTGAAACTTTTTAAATAATTACTATGAGTTAACAAAAAATCATGTACT-TA----GGG--TGTTTATA-TGGTGAATAAAT---G-CT---TTATTATTGC----AAT-----GAAAA-A-----TAG-TCAAAACAAGT-A-GA-GTC----A-TTC-AGCGCCA-ACGC-AACAAA-AGGTGTT-T------AC--AA-------------------------------------------AAGCGA--CCGTACAACTCA-A-TAGAT---AAAAAAAAAAAGAATTTTCGAAT--TTA-AGAAATGGTTG----AAAAATCATTTTTGAACTGTATGGTCGAC--TGGCA-ACATTTCTTAAAGCA-CACTCGTTCTTTTCTTCAAGATTG--TGC-TT--GTT-TCCTCAGAAATGGAG-GGTCCTTAGCGTTAGGTCTTAAAAGACGGCC-TATTACATACTTTATG-GTGTAGGAAACAGTAATTCTAATTTATG-TTGTACAT--CAACAGAGGTTCTTTGTCAT-CTTAA-GT-A-------G-TTGTATCGACTATCGCTAATGCATTCAGT-CTCAAAG--------C-ACCAT----TGGTGGGTATAG-TTAAA-CACG-ATCG-C--TTAACTTAGCT-GTAA--GTTTGGCCTAGTATGC-GCA-----TAATACA--TTGACATTCAGAGAGA-G--C-AAT-C-ATATATCGTATT-ACTTT-T-CAAAATCTGATTTG-TAAGGG-A--AT----GATGTTAACCCTTT-AA-A--A-AGA----G-ATAC--ACATT--CA--ATCTCA-TTATATAGAGTGAGAATTTAACTCCATAC------T-C-ATTTA-TTATAATTGAAAAATTCT-TT-TT-CAT-CCAAT-AAAATG---T-GAAATTTTTAGC-TTA-T-ATAA-TAAAGTGGCAACTGGTACGTTTATT---A-TGG-AAG-ATATACATAG--GT-AGAAATTT-TGAAAG-AAAGCAG-AAAAT--GAA-TTTTCTGTTCT-GTTAATAAAT-GCAAAAAGGT--AATATGTGTTTGCTAAACGA-AAC-AT-G-AATC-TA-TCAATTTGCCACCAT-AATCGAC-AAAAT-TCGT--T--AACAA--------ATATGGAAATAAAG-ATTATCATG-G-CC-TTTTTTC-TCACCTC-AT-ATCTCAT--AA--ACG-AAA-A-----GATTAAACAATT--CCGCGTT------TGCCGTATTCGCATT----CCAGCC------G-T---TA--ACGATTGCTTCCGCGTT
gi|1                          :                                                                                                                  CCCTTG--TAAAATC---GCG-CTCAATACGAG--CTT--TAA--CGC-GGAAGCA-A-T--C-GTTAA---C----Gaaagctcgtattgagcgcgattttacaaggggtg
gi|10                         : gtgaacgcgcgattccgtattgacgcggacgcgaatagcggccacacaagcggctaattccgatttctgagtcatatagccgaagttatgatagggcataaagttttgttgatgttacttatgtgaatcgaacgacgtatatatagttggctaatatttgctgacgaagtataagtttagtagaggaggcagggacatctaatatggagatcctgagtacaagtacaactagacaagacgttattcgcacacctcgatgagagacgtaaaatgacattaattttgaattgacccgtatttaggttacagaataccctggaaatttcttttaccttttatgtcaatttatttttaactcatgtccctcactttattccaaaatcaatattgattttaccaactatgaacgaatgatgagttattgaaactttttaaataattactatgagttaacaaaaaatcatgtacttagggtgtttatatggtgaataaatgctttattattgcaatgaaaaatagtcaaaacaagtagagtcattcagcgccaacgcaacaaaaggtgtttacaaaagcgaccgtacaactcaatagataaaaaaaaaaagaattttcgaatttaagaaatggttgaaaaatcatttttgaactgtatggtcgactggcaacatttcttaaagcacactcgttcttttcttcaagattgtgcttgtttcctcagaaatggagggtccttagcgttaggtcttaaaagacggcctattacatactttatggtgtaggaaacagtaattctaatttatgttgtacatcaacagaggttctttgtcatcttaagtagttgtatcgactatcgctaatgcattcagtctcaaagcaccattggtgggtatagttaaacacgatcgcttaacttagctgtaagtttggcctagtatgcgcataatacattgacattcagagagagcaatcatatatcgtattacttttcaaaatctgatttgtaagggaatgatgttaaccctttaaaaagagatacacattcaatctcattatatagagtgagaatttaactccatactcatttattataattgaaaaattctttttcatccaataaaatgtgaaatttttagcttatataataaagtggcaactggtacgtttattatggaagatatacataggtagaaattttgaaagaaagcagaaaatgaattttctgttctgttaataaatgcaaaaaggtaatatgtgtttgctaaacgaaacatgaatctatcaatttgccaccataatcgacaaaattcgttaacaaatatggaaataaagattatcatggccttttttctcacctcatatctcataaacgaaaagattaaacaattccgcgtttgccgtattcgcattccagcCTTT-CG-A--A-GAT----G-AG-C--A-ATT-GCA--A---CA-TTAAA-AGAGTGAGAA-TTG-------ACATACAATGT-ATGTA-T-----TTGAAAAATTCT-TT-TT-CTT-TCAAT-AAAGTA---G-GAAAT----------------------AGTGGCA--TGGTACGTT--CT---AGTG--AA--ATAT-CA-----AT-GGAAA-AC-TGAAAG-AAA-CAG-AAAAT--GAA-TT---TGTTCT-G-CGTAAAAT-GCAAAA--GT--A-------------TAAGGA-TACTAT-GAAATCTTA-TCAA-TTGTC-CCAT-AATCG-C-AAAAT-TCGT--GA-AAAAA--------ATCTGGAAAATAAG-A----CATT-A-CAATTTTTCC-TCAACTC-GT-CTT-CATGAAA-TACA-AAATAAATTTA--TAAACAA-T--CTGCG-T------TGCCG-C-TCAC--------------------------------ATCG----CGCGTGTACAGGGGgtg
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                             T---C-AAT--GACT-TA-TA--TCT------GTAAATCGATT-GC--ACGA----TA---ATAGTATGGCAGG----GACAT--TA-ATATA-GGA-CTTTAA-ATTCT-CAA-T-A-----A--TACGACGCTTTATTC-CC-ACGAAACAT-CGTAG----TCG-TAAA-TG-----AATTAT--AATTGAGATAC-G-AATT-TG-T-TTC-AAAAAT---TGAAA-T--T---TT--GC-TGTTATATCT-TTCATTATTGTA--TCATGA--CCC-C--AC-TTAT-------A-ATGAC-ACTTAAGTATAC-AA--CT-----------------TAT--A----TT----GTA--TAC----------CAAAAAG--TTGGATTCCA-TC---G--T-----TA-TG--------AT---G-CT---TT----TT-C----A-T-----AAAACTC-----T-G-TCAAA----GT-ATAA-GGC----AGATC-t
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        aagccttggagttcttgtctattattagcagCGTT--GTG--AGTGG-GATAACAT-CATCTAGAT-GGAAA-AA-TGAAG-----------AAAC--GAA-TT---TGTTTT-G-CG-TAACTTGCAAAT--GT--G-------------AAAACA-TGCTGT-AAAATCTTA-TTAA-TTGTC-CCAT-AATCG-C-AAAAT-TCGTGGGG-AAGAA--------ATCTGGAAAATAAG-A----CATT-G-CCATTTTT-C-TCACCTC-GT-CTT-CAAGGAA-TACA-AAT-A-----A--TAAACAA-T--CCCCG-T------TGCAG-A-TTGC-AT----CCA--C------T-TCACTA--ACGATCG----CGCGTTTACAGGAGaaa
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   gTTGT--T-CT--C-AT-C-------G-TTGTATCC---ATCGCC-AT-CA-----TACTC-ACT--------TCA-C-T----TGA--------G-TT--C-TACT-ATCGAC--CTA--ATA--C-GT-T--GCTTCGCC--G--T-T-GCA-----TAA---A--T----A-TCCCA----TG--CAAAT-G-A-A-ATCT--TC-AA-TT-T-CAAAT------TGG-T--GCG-ACTAT----G-T-T--ACACTTT-AGCA--ATGAA----G-AT-A--A-ATT-GCA--A---AC-TTATG-AGAGTAA--A-TTA--------T------T-C--TCTA-T-----TTGATAAATTCT-TT-TC-CTC-CCCAT-AAAGTACATT-GAAATT
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    aac--AGTCGCA--TGGT-CATT--TTCTAAGTGA-AA--ATCT--------AT-GTGAA-ATATGAAA---AAACAGGAAAATACGAA-TT---T-TCTT-G-CG-TAACTTGCAACATGGTCAA-------------AAACAA-AACTGG-TAAA-CTTA-T-AA-T-GTC-CCAT-AATCG-CCAAAATCTCGT--TG-GGCAAGAGGAAAAATCTGGAAA-TAAG-A----ACTT-G-CCATTCTTCT-CAACCTCAGTATTT-CAAGGAA-TAC---AA-C-----A--T-AACAA-T--CC
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   G--------T-A-CATGTGGTGG--------A-TG--G-TACG-ATCG-C--TTT--TTA--C-AG-C--GTT--GCT--G-AT-C-GCAGAGCATAA---A--TT--C--TC-GAGAGATGTACAAAT-C-A-A-ATCG--TT-A--TT-T-GAAAAG-----TTG-T--TGA-C-TATTATAGATAT--GCATCCT-GG-------------G-AC-CTTA-AT-------G---CA-TT-----GA---AAAA-TCC-------CT------T-T-ATGCA-T-----TTGAAATATCCT-TT-TC-CAc
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tgtgcaattgtgtgtttataatatggcgggttGAGACATTCT-TTCTT-CTT-TCAAT-AAAATA---T-TAAATTTT--AT-TTA-T-ATAT-T--AGTGGCA--TGGTGCGTT--TT---AATGG-AA--ATAT-TA-----GT-GG-AA-AT-TGAAAG-AAAACGG-A-----------T---TGTTCT-G-CG-TAAAT-ACAAAA--GT--A-------------AAA--A-CACTGC-TAAATGTTA-TCAG-TTGTC-CCAT-AATCG-C-AAAAC-CTGT--GACAAC-A--------GTCTTGGAAATAAA-A----CCTT-G-C
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             T--A-AT-A-------G-TTGTA-CG---ATCGC--ATGCA-----C-CTC-AAGGAGTCAAGC-A-CAT----TGG--------G-TT--G-TACG-ATCG-C--TTA--TTA--T-GT-C--GTT--GCC--G-AT-C-GCA-----TAA---A--TT--CA-TCAGACA--TG--CAAAT-C-A-A-ATCG--TT-A--TT-T-CAAAA------TTG-T--GGG-A-TAT----GATGT--ACACTTT-AG-A--A-GAA----G-AT-C--A-ATT-GCA--A---CA-TTACA-AGAGTGAGAA-TTA-------AC------T-C-ATCTG-T-----TTGAA
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     --TTATG-TTG-ACAA--CA---------CTTTGT--T-CT--ACAT-ATGTAATTG-TTGTT-CG---ATCGC--ATGCA-----T-CTT-AC---------T-A-CGT----TGG--------G-TT--G-TACG-ATTG-G--TTA--ATA--C-GT-C--GTT--GCC--G-AT-C-GCA-----TAA---A--TT--CT-TCAGAGACATG--CAAAT-A-A-A-ATTG--CT-A--TT-T-TAAAA------TTG-T--GGG-A-T
gi|19                         :                                                                                                                gACCCCTT--TAAA--C---GCG-C-------GAT--CGT--TAA--CGC-AGAAGCG-A-T--C-GGCAA---C----GCGG---ATC-T--A-TT---G-AGTCATA--A--CCG--AAAAT-T-GA------TA--TTGGGTAA-GTTTTG---ATGTCATTTATGT--AT---C-AAC--A--A-TA-TA--TCTAG-T--GTAAAT--ATTTGC--AC
gi|2                          :                                                                                                                 ACCCCTG--TAAA--CCAGGTG-C-------GAT--CGT--TAA--CGC-GGAAGCG-A-T--C-GGCAA---C----GCGG---ATC----A-TT---G-AGTCATA--G--CCG--AATTG-TAGG------TA--GCGGGTAA-GTTTTG---ATGTTATTTATGT--ATAATC-AAC--G----TA--A--TCTAG-T--GTAAATT-ATTTGC--ACGA----TA---TTAGTAGAGGAGG----GGCAT--T--ATATG-AGA-C-CTAC-A-------A-T-ACAACTA--CAAGACG--TTATTC-CC-AC--AAC-T-GATGG----T-G-TAAA-TG----TAATT-T--AATTGA---CC-G-ATTT-GG-T-TAC-AAAAAA---TGGAA-T--TTC-TT--AC-TGATATGTCA-TCTATT-TT-TA--TCATG---TTC-C--ACTTTATAC-C-AAA-ATCAT-A-TTGATTTTAC-AA--ATCAA-----GAT-TGA--TAT--AAACTTT----ATA--CAC-----ATTAACAAAAAA--GTGTATT-TA-TCAGGG--T----ATA-TG-------AAT---A-TT---TT----TT-C----T-A-----CAAAA-A-----T-G-TCAAA----GTAA-GA-GGC----A-ATCGGGA---A-ACGC-AACAAA-AT-TGTTAC------AT--AAGCGATC---G---------TACAAT-G----------CAAAGAAAGCGA--TCGTACAACTCA-A-T-GAT---ACAAG-------------TG-AT--T---AGAAATGGTT------GAAATCA-TTTTGA----TTTTGT-GACT-TGACAGACATT--TT-AAGCAGC--------------------TGG--TGC-TT--ATT-TCC-----AAT--AGTGGTCCTTA-CGTT---T----AAAGACGA-C-TA-TACATATTTAAGA-GTG------ACT-T-ATTCTA--TTATGTTTG-ACAA--CA----------TTTGT--T-CT--A-AT-A-------G-TTGTA-CG---ATCGC--ATGCA-----C-CTC-AAG--------C-A-CAT----TGG--------G--T--G-TACA-TCCG-C--TTA--TTA--TCGT-C--G-T--GCC--G-AT-C-GCA-----TAA---A--TT--CA-TCAGAGAGATG--CAAAT-CAA-A-ATCG--TT-A--TT-T-CAAAA------GTATT--GGG-A-TAT----GATGT--ACACTTT-AG-A--A-GAA----GAAT-CA-A-ATT-GCAACA---CA-CTATA-AGAGTGAGAA-TTA-------AC------T-C-ATCTATT-----TTGAAAAATTCT-TT-TT-CAT-CAATT-AAAATG---T-TAATATTT--AC-TTA-T-ATAT-T--AGTGGCA--TGGTACGTT--TT---AGTGGAAA--ATAT-CA-----AT-GGAAA-AT-TGAAAGAAAAACAG-AAAAT--GAATTT---TGTTCT-G-CAATAAAT-GCAATA--GT--A-------------AAACCA-TACTAT-GAAATCTTAGTCAA-TTGCC-TCAT-AATCG-C--AAAT-TCGT--TA-AACAA--------AATAGGAAAATAAGCA----TATTGG-CCATTTTTCC-TCACCTC-AT-CTC-CAGTGAA-TACG-AAA-A-----A--TAAAC-A-T--CCGCA-TGACCCGTGCCG-A-TCGC-TT----CCG--CCCCGCAG-T---TA--AGCATCG----CTCGTTTACAGGGG
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               cc-A-TAT----AATAT--ACACTTT-AG-A--A-GAA----G-AT-C--A-AAT-GCA--A---CA-TAATA-AGAGCAAAAA-TTG-------AC------C-C-CTATT-T-----TTGAGACATTCT-TTCTT-CTT-TCAATAAAAATA---T-CAAATTTT--AT-TTA-T-ATAT-tg
gi|21                         :                                                                                                                 ACCCCTGCCTAAA--C---GCG-C-------GAT--CGT---AA--CGC-GGAAGCGAA-T--C--GCAA---C----GCGG---ATC-CAGA-CT---GCAATCATA--AGTCCGACAAGTT-T-GAGGGGAGTA--GCGGGTAA------A---ATGTTTTTTATGG--AT---C-Agacaacagtcttggaaata
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           cc-AAAAA--------ATCTGAAAAATAAG-A----CATT-G-CCCTTTTCTC-TCACCTC-GT-CT---------------AAA-A-----A--TAAACAA-TTTCCGCG-T------TGCCG-A-TTGC-AT----ACG--C------G-T---TG--ACTATCG----CGCGTTTACAGGGGgt
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                GGAAATAAA-A----CCTT-G-CCATTTTT---TCACCTC-GT-AAT-CAAGGAA-TACA-CAA-A-----A--TAATCAA-T--TCGCG-T------TGCCG-A-TT-C-AT----TCG--C------G-T---TA--ACGCTCG----CGCGTTTAAAGGGtg
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ttGGAAATAAA-A----CCTT-G-CCATTTTT---TCACCTC-GT-AAT-CAAGGAA-TACA-CAA-A-----A--TAATCAA-T--TCGCG-T------TGCCG-A-TTGC-AT----TCG--C------G-T---TA--ACGCTCG----CGCGTTTCAAGGGGat
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           tAGTAGAGGAGG----GGCAT--T--ATATG-AGT-C-CTAC-ATTGTACAA-T-ACAACTA--CAAGACG--TCATTA-CC-AC--AAC-T-GATGG----T-G-TAAA-Tt
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                        AGTT-T-GA------TA--GCGGGTAA-GTTTTG---ATTTTAATTATGT--GT---C-AA
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            gttcactaacgtgtatgccgttatgcagaacaacAA-A-----A--TAAACAA-T--CCGCG-T------TGCCG-A-TCGC-TTGGAACCG--C------G-T---TA--ACGAT--------CGTTTACAGGAG
gi|28                         :                                                                                                                 ACCCCTG--TAAA--C---GCG-C-------GAT--CGT--TAA--CAC-GGAAGCG-A-T--C-GGCAA---C----GCGG---ATC-C--A-TT---tg
gi|3                          :                                                                                                                   CCCTG--TAAA--C---GCG-C-------GAT--CGT--TAA--CGC-GGAAGCG-A-T--C-GGCAA---C----GCGG---ATC-C--A-TT---G-AGTCGTA--G--CCG--AAGTT-T-GA------TA--GCGGGTAA-GTTTTG---ATGTTATTTATGT--AT---C-AAC--G--C-TA-TA--TCTAG-T--GTAAAT--ATTTGC--ATGA----TA---TTAGTAGAGGAGG----GGCAT--T--ATATG-AGA-C-CTAC-----T---A-T-ACAACTA--CAAGACG--TTATTTACC-AC--AAC---GATGG----T---TAAA--G----AATTT-T--AATTGA---CC-G--TTT-GG-TGTAC-AAAATA---TGGAA-TACTTC-TT--AC-TGTTATGTCA-TTATTT-TT-TA--TCATGCATTTC-C--ACTT-ATTC-CCAAATATCAT-A-TTGATTTTAC-AA--ATCAA-----GA--TGA--TAT--AAACTTT----ATA--TAC-----ATTGACAAAAA---GTGTATT-TA-T-AGTG--T----AAC-TG-------AATTACG-TT---TT----TT-C----A-T-----TGAAA-T-----T-G-TCAA------T-A-GATGGC----A-ATC-GGC---ATAC-C-AACAAA-AT-TGTT-TTAG---ATCAAA---------G---------TGCGAT-GTGTTCAATTGCAAAGAAAGCG---TCGTACAACTCATA-TAGAT---ACAAGACGT---------TG-AT--T----------GTCGTCTCGGACATCATTTT-GA----TTT-GT-GACT-TGACAGACATT--TTAA-GCA-C--------------------TGG--TGC-TT--ATT-CCT-----AATTTGG-GGTCCTTA-CGTT---A----ATAGACGA-C-TA-TACATATTGAA-G-GTAC-----ATA-T-ATACTA--TCATG-TTG-ACAA--CA-----------TTGT--T-TT--A-AT-A-------G-TTGTA-CG---ATCGT---TGCA-----T-CTC-AAG--------TCA-CAT----TGG--------G-TT--G-TACG-ATCG-C--TTA--T-A--T-GT-C--GTT--GCC--G-AT-CTGCA-----TAA---A--TT--CA-TCAGAGAGATG--CAAAT-C-A-A-ATCG--T--A--TTAT-TAAAA------TTG-T--GGATA-TAT----GATGT--AAACTT--AG-ATAG-GAA----G-AT-C--A-ATTTGCA--A---CAATTATA-AGAGTGAGAA-TTA-------AC------T-C-ATCTA-T-----TTGAAAAACTCT-TT-TT-CAT-CCAAT-AAAATG---T-GAAATGTT--AC-TTA-T-A-------AGTGGCA--TGGTACGTT--TT---TGTGG-AA--ATAT-CA-----AT-GGAAA-AT-TGAAAG-AAAACAG-ATAAT--GAA-TT---TGTTCT-G-CAATAAAT-GCAAAA--GT--A-------------AAACCA-TACTAT-GAAATCTTA-TCAA-TTGCC-CCAT-AATCG-C-AAAAC-TCGT--TA-AACAA--------ATATGTAAAATAAT-A----TATT-G-CCAATTTTCC-TCACCTC-AT-CTC-CTTGGAA-TACG-AAA-A-----A--TATACAA-T--CCGCG-T------TGCCG-A-TCGC-TT----CCG--C------G-T---TA--ACTATCG----CGCGTTTACAGGGG
gi|30                         :                                                                                                                      TG--TAAA--C---GCG-C-------GAT--CGT--TAA--CGC-GGAAGCt
gi|4                          :                                                                                                                 ACCCCTG--TAAA--C---GCG-C-------GAT--CGT--TAA--TGC-GGATGCG-A-T--C-GTTAA---C----GCGG---ATC-C--A-TC---G-AGTCATA--G--CCA--AAGTT-T-GA------TA--GCGGGTAA-GTTTTG---ATGTTATTTATGT--AT---C-AAC--G--C-TA-TA--TCTAG-T--GTAAAT--ATTTGC--ACGA----TA---TTAGTAGAGGAGG----GGCAT--T--ACATG-AGA-C-CTAC-ATG-TATGA-T-ACAACTA--AAAGACG--TTATTC-CC-AA--AAC-T-GATAG----T-G-TAAA-TG----TAATT-T--AATTGA---CC-G-ATTT-GG-T-TAC-AAAATA---TGGAA-T--TTC-TT--AC-TGTTATGTCA-TTTATT-TT-TA--TCATG---TTC-C--ACTTTATTC-C-AAA-AGCCA-A-CTGATTTTAC-AA--ATCAA-----GG--TGA--TAT--AAACTTT----ATA--TAC-----ATTAACAAAAAA--GTGTAAT-TA-TCAGGG--T----ATA-TG-------AAT---T-TT---TT----TT-C----A-T-----GAAAA-A-----T-G-TCAAA----GT-A-CA-GGC----A-ATC-GGC---A-ACGT-AACAAA------TT-T-------T--AA-------------------TACAAC-G----------CA---------A--TCGTACAACTAA-A-TAGAT---ACAAG-------------TG-AT--T---AGATATGATT------TAAATCA-TTTTGA----TTTTGT-GACT-TGACAGACATT--TT-AAGCA-C--------------------TGG--TGC-TT--ATT-ACC-----AAT--AG-GGTCCTTA-CGTT---T----AAAGACGA-C-TA-TATATAACTAATT-GTG------ACA-T-ATGCTA--TTATG-TTG-ACAA--C-A--------TTTTGT--T-CT--A-GT-A-------G-TTGTA-CG---ATCGC--ATGCA-----T-CTC-AAG--------T-A-CAT----TGG--------A-TT--G-TACG-ATCG-C--TTA--TTA--T-GT-C--TTT--GCC--G-AT-C-GCA-----TAA---A--TT--CA-TCAGAGAGATG--CAAAT-C-A-A-ATCG--TT-A--TT-T-CAAAA------TTG-T--GGG-A-TAT----GATGT--ACACTTT-AG-A--A-GAA----G-AT-C--A-ATT-GCA--A---CA-TTATA-AAAGTGAGAG-TTA-------TC------T-C-ATCTA-A-----TTGAAAAATTCA-TT-TT-CAT-CCAAT-AAAATG---T-GAAATTTT--AC-TTATT-ATATAT--AGTGGCA--TGGTACGTT--TT---AGTGG-AA--ATAT-CA-----AT-GG--A-AT-TGAAAG-AAAACAG-AAAAT--GAA-TT---TGTTCT-G-CAATAAAT-GCAAAA--GT--A-------------AAACCA-TACTAT-GAAATCTTA-TCAA-TTGCC-CCGT-AATCG-C-AAAAT-TCGT--TA-AACAA--------ATATGGAAAATAAG-A----TATT-G-CCATTTTTCC-TCACCT--AT-CTC-CATGGAA-TACG-AAA-A-----A--TAAACAA-T--CCGCG-T------TGCTG-A-TTGC-TT----CCG--C--------T---TA--ACGATCG----CGCGTTTACAGGGG
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      tAAAAAA--GTGTATT-TA-TTAGGG--T----ATAATG-------AAT---A-TT---TT----TT-TTTTGA-T-----GAAAG-AAAATAT-G-TCAAA----GT-A-GA-GGCCAAAA-ATC-GGC---A-ACGCCAACAAA-AT-TGTT-T------AC--AAAGCCGATTCG---------TACAATTG----------CAA-GAAAGCGAAATCGTACAACTCA-AATAGAT---AAAAT-------------TG-AT--TTTAGGAAATGGTCG----AAAAATCATTTTTTA----TTTTGT-GACT-TGACAGACATT--TTAAAGCA-T--------------------TGGCGTGC-TTTTATTATCC-----AAT--AG-AATCCTT--CGTT---T----AAAGACGA-C-TG-TACATATTTAAAGTGTG------ACA-T-ATT-TA--TTATGCTTG-ACAAAACAA--------TTTTGT--TTCT--A-ATTA-------G-TTGAT-CG---ATCGC--ATGCA-----T-ATC-AAG--------T-A-CAT----TGG--------G-TT--GGTACGGATCG-C--TTA--TTA--TTGT-C--GTT--GCC--G-AT-C-GCA-----TAA---AGTTT--CA-TCAGAGAGATG--CAAATTC-A-A-ATCG--TTTA--TT-TTCAAAA------TTG-TTTGGG-A-TAT----GATGTT-ACACTTTTAG-A--A-GAA----G-AT-C--A-ATT-GCA--A---CA-T-ATA-AGAGTGGGAA-TTA-------AC------T-CGATCTA-T-----TTGAAAAATTCT-TT-TTTCATTCCAAT-AAAATG---TTGAAATTTTT-ACCTTA-C-ATAT-T--AGTGGCA--TGGTACGTT--TTTT-AGTGGGAA--ATAT-CA-----ATTGGAAA-AT-TGAAAG-AAAACAGGAAAAT--GAA-TT---TGTTCTTG-CAATAAATTGCAAAA--GT--A-------------AA-CCA-TACTATTGAAACCTTA-TCAA-TTGCC-CCATTAATCG-C-AAAAT-TCGT--TA-AACAA--------ATATGGAAAATAAG-A----TATT-G-CCATTTTTCCTTCACCTC-AT-ATC-ATTGGAATTACGAAAA-A-----A--TAAACAA-T--CCGCG-T------TGCCG-A-TCGC-TT----CCG--C------GTT---TA--ACGATCG----CGCGTTTACAGGGG
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       caAGA-A-----G-G-CCAAA-----T-A-CG-AGC----A--TC-G-----A-A-GC-AACAAAGAT-TGCT-TTAGCATATG-AA---------GCCGATCCATTACAATAG----------CAAAGAATGCGA--TCGTACAACTCA-A-TAGATGTAACAAG-------------TG-CTGCT---AGAAATGTT-------GAAATCATTTTTGA----TTT-GT-GACTGCGACAGACATT--TTAAAGCA-C--------------------TG---TGCCTT--ATT-TC------AATG-AG-GTTCCTTC-GGTT---T----AAAG-CGA-CATA--ACATATTTAGTG--TG------ACA---ATTCTA--T-ATG-TTG-AAAA--CAA--------TTCCGT--T-CT--A-AT-A-------GCTTGTA-CG---ATCGC--ATGCA-----T-CTC-AAG--------C-A--AT----TGG--------TCTT--G-TACGGATCG-CCTTTA--TTA--T-GT-CAGGTT--GCCC-G-AT-C-GCA-----TAA---G--TT--CA-TCAGAGAGATG--CAGAT-T-A-A-GTCG--TT-A--GT-T-CAAAA------TTG-T--GGACA-T-T----AATGT--ACACTTA-AG-A--A-GAAAGAAG-AT-C--A-ATT-GCA--AA--CA-TTATA-AGAGTGAGAA-TTA-------A-------T-C-ATCTA-T-----TTGAAAAATTCTGTT-TT-CAT-CCAAT-AAAATG---T-GAAATTTT--AC-TTA-TAATAT-T--AGTGGCA--T-GTAGGTT--TT---AGTGGAAA--ATAT-CA-----AT-GGAAA-AT-TGAAAG-AAAACAG-AAAAT--G-A-TT---TGTTCT-G-CAATAAAT-GCAAAA--GT--A-------------AAACCATTACTAT-GAAATCTTA-TCAA-TTGCC-CCTT-AATCG-C-AAAA--TCGG--TA-AACAA--------AT-TGCTAAATAAG-A----TATT-GCCCATTTTTCC-TCACCTC-AT-CTC-CATGGAA-TACG-AAA-A-----A--TAAACAA-T--CCGCG-T------TGCCG-A-TCGC-TT----CCGCTC------G-T---AAAGACGATCG----CGCGTTTACAGGGGt
gi|7                          :                                                                                                               gtctCCTTG--TAAA--C---GCGAC-------GAT--CGT--TAAAACGTTGGATGCG-A-T--CAGGTAAAATC----GCGG---ATCAC--AATT---G-AGTCATA--T--TCA--AGTTT-T-TA------TA--CCGGGTAA-GTTTTG---A-G-TATTTATGT--AT---C-AACCAG--C-TATTACCTCTAGCT--GTAAAT--ATTTGC--G-----------------AGAGGAGG----GGCATA-TA-ATATG-AGA-----AC-CTT-A-TGA-T-ACAACTA--AAAGGAG--TTATTC-CCAAA--AAC-TAGATAG----T-GATAAA-TGTT--TAATT-T--AATTGA---CC-G-ATTT-GGTT-TACAAAAATA---TGGAT-T--TTCTTT--AC-TATTATATCtg
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        caca-TTCATT-TT-TA--TCATG---TTCAC--ACTTTATTCAC-AAA-ATCTA-A-TTGATTTTAC-AG--ATCAA-----GAGTTGA--TAT--AAACTTTAATAATA--TAC-----ATTAAC-AAAAG--GTGTAAT-TATTCAAGGAAT----ATA-TG-------AAT---G-TTTTATT----TT-T----A-TCATGAGAAAA-A-----T-GTTCAAA----GT-A-CG-ACC----ACATC-CAC---A-ACGccccccccccccccccccccccccccccccccaatttcatttttatcatgttcacactttattcacaaaatctaattgattttacagatcaagagttgatataaactttaataatatacattaacaaaaggtgtaattattcaaggaatatatgaatgttttatttttatcatgagaaaaatgttcaaagtacgaccacatccacaacg
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              cacaccttgtaaacgcgacgatcgttaaaacgttggatgcgatcaggtaaaatcgcggatcacaattgagtcatattcaagtttttataccgggtaagttttgagtatttatgtatcaaccagctattacctctagctgtaaatatttgcgagaggaggggcatataatatgagaaccttatgatacaactaaaaggagttattcccaaaaactagatagtgataaatgtttaatttaattgaccgatttggtttacaaaaatatggattttctttactattatatcccccccccccccccccccccccccccccccccaat-AAG--------A-A-CAT----TGG--------G-TT--G-TACG-ATCG-C--TTA--ATA--T-GT-C--GTT--GCC--G-AT-C-GCA-----TAA---A--TT--CA-TCAGAGAGATG--CAAAT-C-A-A-ATCG--TT-A--TT-T-CAAAA------TTG-T--GGG-A-TAT----GATGT--ACACTTT-AG-A--A-GAA----G-AT-C--A-ATT-GCA--A---CA-TTATA-AGAGTGAGAA-TTA-------AC------T-C-ATCTA-T-----TTAAAAAATTCT-TT-TT-CAT-CCAAT-AAAATG---T-GAAATTGT--AC-TTA-T-ATAT-T--AGTGGCA---GGTACGTT--TT---AGTGG-AA--ATAT-TA-----AT-GGAAA-AA-TGAAAG-AAAACAG-AACAT--GAA-TT---TGTTCT-A-CAATAAAT-GCAAAA--GT--A-------------AAACCA-TACTAT-GAAATCTTA-TCAA-TTGCC-CCAT-AATCG-C-AAAAT-TCGT--TA-AACAA--------ACATGGAAAATAAG-A----TCTT-G-CCATTTTTCC-TCCTCTC-AT-CTC-CATGGAA-TACG-AAA-A-----A--TAAAC
gi|9                          :                                                                                                                 ACCCCTG--TAAA--C---GCG-C-------GAT--CGT--GAA--CGC-AGACGCG-A-T--C-GTTAA---C----GCGG---ATC-C--A-GT---G-AAGCAAA--T--CTA--CAGTT-T-GA------TATAGCGGA-AA-GTTTTG---ATGTTATTCATGT--GT---C-AAT--G--C-TT-TA--TCTAG-T--GTAAAT--GTTTGC--ACGA----TA---TTAGTAGAGGAGG----GACATTAT--ATATG-AGA-C-TTATAATC-T-CAA-TAANGAATA--CAAAA-A--TAAGTC-TG-CC--AA--T-AAGGG--------------G----TAATT-T--AATTGA---TC-G-ATTT-GG-T-TTC-AAAATG---TGAAA-T--TTC-TT--GC-TGTTATATCT-TTTATT-TT-TA--TCATG---ACC-C--ACTTTATT-----AA-AT------------------A--ATTAA-----GG--TGA--TAC--AAACTTT----ATA--TGT-----ATTACCAAAAAA--GTGTATT-TA-TCAGGG--T----ATA-TG-------AAT---GCTT---TT----TT-C----A-T-----AAAAA-T-----T-G-TCAAA----GT-A-TA-GGC----A-ATC-AAC---A-ATGC-AACA
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|29 ): GAATACAAAAATAAGTCTGCCAATAAGGGG