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Reference ( gi|5 ) : TAATC---GGGGCGCCATCTAT---A-GGCA------GGTGCCCTAT----AGTGATCAACCT----G---TGTA--T-C---------AT----CTG----T---------CCA--CG---TA--A---ACGC-TCTT-CTGGAC-TTT--T-C-T-----G-GCAATCCC--AGC-AG-TTGT--T-GA-----ATTG-ATG----AT-TTATATCTGAACTT---G-----TGT--A----A--ATGG-TTTGCAGATC-AA--CATGGAGTTTTGGC--TTTG-TTG-ACCTA--TT-TTT-G---A---A-G--AGTTATGGACCTTG-AACGTAGTCAA--T-AATGCCACAAA-GC-----GAGACTCTT-TTT
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gi|11 : atttattaggcccttccAT---T-GGCA------GATACTCCAT----GGTGA--AAATC----G---TGTG--TGC---------ATGTGCCTA----T---------CTG--TA---TA--A---ATGC-TTGT-GCGGAC-TTT--T-T-G-----G-GCCATCCT--TTG-AG-CTAT--T-GA-----ATTG-AAA----AT-TTATACATGAACTT---A-----CAT--ACAACA--ATGG-ATTATTGATC-AAAGCCT--AGTTTGGGC--TTTG-TTG-ACATA--TT-TTT-GAAAA---A-G--AGCTATGGACCTgcaaattcagtaatttctaggcttgtttggctatcactgcagctatacttgaacttatatcaatggaatacaaatc
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gi|7 : ttgacaggt-TTT--T-C-T----------ATCCC--TGC-AG-CTTT--T-GA-----TTTG-AAA----AT-TTGCACATTAAATT---G-----TAT--C----A--GT-----TACAGATC-AA--gtatacatg
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gi|28 : T-TTATACATGAACTT---G-----TGT--C----A--ATGG-ATTACATATC-AA--GTTTGACTTCAGGC--TTTC-TTG-ACCTA--TT-TT
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gi|2 : tattgaattgaaaatatattgatgggtagcAGTTGTGAC--CTTG-----AACTA-------------A---A-G--AGTTGTA-ACCTT--AACTTTG-CAA-----ATGCCACAAA-GC-----ACGACCCCT-gtgatgccatccgaatgat
gi|23 : taattagggctctgcctatgggtacatatgggagccctatagtaatcagttcatgcttttcatgcattgatagtttttcccagacttttttaggctattgctgcagttattgaactgaaaatatataaacttacaattctaaggtttcggctttcaggacaatacccatgtccataatgaagaaaagatttgtaaaattttaaagagttgttaaaTG-ACCTA--TT-TATAG---A---A-T--AGTTATTGATTTTG-AACATACCAAA--T-TATGTCACAAA-GT-----GGGGCTCTT-TT
gi|17 : TT-G---A---A-G--AGCCAAAGACTTTG-AATGTTACAAA--TCAATGCCACAAA-GC-----AGGGCTCTA-TTatgataattgtcatctcaatggata
6 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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Unaligned ( gi|25 ): TATTTATAAGGCCTTTGTATATACTAGGCAAGAGCCGTATGTCTAGTTATCGGTCTATGTGTGCGTCTGTGAATTGACAGTGTTTT
Unaligned ( gi|27 ): ATGGCCTCTGGGAGCCAGTGATCAGTCAGCCGGTGCATGTTTCCATGCATTGAAAGTTTTCCAGATTTTTATATTATGTTATGGC
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Reference ( family-1156 ) : TAATTAGGGC-C--C-GCCTAT---A-GGCA------GGAGCCCTAT----AGTGATCAGCCT----GT--GTG-T---C---------G--TCTG----TCCGT---------------G------TG--AACG-NTTTT-CCGGA-C-TTT--T-CT-----G-GCCATCCCTG--C-A-G-CT-AT--TGAATTG-A---AAA-TT-TA------TACATGAAC-T-T---G-----T----AT----C-AA-TGGGTT-ACAGATC-AA-NN-T-GAGTTTGGGC--T-TTGTTG-ACCTA--TT-TTT-G---AA--GA-GTTATGGACCTTG-A-AC-TTAGCNAA-T-AATGCCACAA--AGC-GGGGCCCTT-TTT
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gi|2 : C-TT----G-AACTA-------------AA--GA-GTTGTA-ACCTT-A-A-C-TTTGCAAA-T----GCCACAA--AGC-ACGACCCCT-aggacaatacccatgtccataatgaagaaaagatttgtaaaattttaaagagttgttaaaagttgtgaccttgaactaaagagttgtaaccttaactttgcaaatgccacaaagcacgacccctt
gi|20 : taattagggctctgcctatgggtacatatgggagccctatagtaatcagttcatgcttttcatgcattgatagtttttcccagacttttttaggctattgctgcagttattgaactgaaaatatataaacttacaattctaaggtttcggctttcaggacaatacccatgtccataatgaagaaaagatttgtaaaattttaaagagttgttaaaagttgtgacTAATTACGGC-C--CTGCCTATCCTA-GGTA------GGAGCACTAC----AGTGATCTGCTT----AT--GTG-TG--C---------A--TCAA----TCC----------------------------AA---ATTT-------ATT-TTT--T-T-T-----G-TCTATTGCTG--C-A-G-CT-AG--TGATTTT-G---AAA-TT-TA------
gi|21 : TAT----GGTGATCAGCCT----TC--GCGTT---T---------G--TCTATTACTCAAT---------------G------CA--AAC-------------A-C-TTT--T-T-TG----G-GCTATTCCTG--C-A-G-CT-TT--TGCATTG-A---
gi|22 : attccactgtaatgatttcattaaggccctgtggACA-GTTTT--CCTGA-C-TTT--T-T-------G-GCTATC-------------T-AT--TGATTTG-A---AAA-TG-TATAGGCCTACATGAAT-T-T---G-----TTTTGAT----C-AA-TACGTT-ACAGATC-
gi|23 : tgT----G-ACCTA--TT-TATAG---AA--TA-GTTATTGATTTTGA-A-C-ATACCAAA-T-TATGTCACAA--AGT-GGGGCTCTT-TTcaccttga
gi|26 : AATCAGGGCGC--C-ATCTAT---A-GGCA------GGTGCCCTAC----AGTGATTAACCT----GT--GTA-T---C---------C--TCTG----TCCAC---------------G------TG--AACG-CTCTT--CTGGA-C-TTT--T-atgataattgtcatctcaatggata
gi|27 : ------GGAGCC--------AGTGATCAGTCA----GCCGGTG-----C---------A--TGTT----TCCAT---------------GCAT---TG--AA-A-GTTTT--CCAGA-T-TTT--T-c
gi|28 : atggcctctg-TT-TA------TACATGAAC-T-T---G-----T----GT----C-AA-TGGATT-ACATATC-AA-GTTT---G---ACTTCAGGCTTTC-TT----G-ACCTA--TT-TTatattatgttatggc
gi|29 : ACA-GGTTT--CTGTATC-TTT--C-T-T-----G-GCGACCCCTG--C-A-G-TT-AT--TGAGATG-ATTTACA-TG-TA------TACATG
gi|3 : ttgAGATC-AA-GATT---G---GATTTGGAATTTG-TC----G-ATCTA--TA-ATT-G---AA--AAAGTTATGGATCGTGA-T-C-TTAGCA
gi|3 : ACA-GTTTT--CTGGA-C-CTT--T-C-TTTCGGG-G-------TG--T-A-GGTT-AT---GCATTGGA---AAA-TT-TA------TACATGAAT-T-T---A-----A----AT----C-AA-TGGGTT-ACAAATC-AA-GA-TA--G---AATTTCGGCATTC-TG----T-ACC-A--CTATTT-G---AA--AT-GTTATGGATTCT-A-A-C-TTGGCAAA-T-AATGCTGCAA--TGT-GGGGtgggtttgacagttttctggacctttctttcggggtgtaggttatgcattggaaaatttatacatgaatttaaatcaatgggttacaaatcaagatagaatttcggcattctgtaccactatttgaaatgttatggattctaacttggcaaataatgctgcaatgtggggtggggtgggttagatgctagcttactattacaataatat
gi|30 : agatcaagattggatttggaatttgtcgatctataattgaaaaagttatggatcgtgatcttagcatgggtttgTTAGGGC-C--C-AGCTAT---ATGGCA------GGTGCCCTAT----AGTGAT--GTCT----GT--CTG-TC--C---------C--TCTG----TCCtggggtgggttagatgctagcttactattacaataatat
gi|32 : CCTCT---A-GTCA------GGGACCCTAT----AATGATCAGGCT----GT--GTA-TA--C---------A--TCTG----Ttt
gi|4 : aATTAGGCC-CTTC--CCTAC---A-GGCG------GGAGCCATGT----AATGGTCATCCT----AT--GTG-TG--C---------G--TCTG----TGCAT----------------------TG--A-----------CCGGA---TGT--T-T-T-----G-GCCATTCCTC--A-A-G-CT-GT--TGAATTG-A---AAA--T-TG------TATGTGCAC-T-T---------T----AT----C-AA-TGAGGT-GCA---T-AA-G--T---------TTTG--------TA----A-ACCTA--TT-TTT-GA--AA--GA-ATTA
gi|4 : atttTTT--CTAGG-C-TTG--T-T-T-----G-GCTATCACTG--C-A-G-C-------------------------TA------TACTTGAAC-T-T---A-----T----AT----C-AA-TGGAAT-ACAAATC-gcaaattcagtaatttctaggcttgtttggctatcactgcagctatacttgaacttatatcaatggaatacaaatc
gi|5 : atttattaggcccttccctacaggcgggagccatgtaatggtcatcctatgtgtgcgtctgtgcattgaccggatgttttggccattcctcaagctgttgaattgaaaattgtatgtgcactttatcaatgaggtgcataagttttgtaaacctatttttgaaagaattagcaaattcagtaaTAATCGGGGCGC--C-ATCTAT---A-GGCA------GGTGCCCTAT----AGTGATCAACCT----GT--GTA-T---C---------A--TCTG----TCCAC---------------G------TA--AACG-CTCTT--CTGGA-C-TTT--T-C-T-----G-GCAATCCCAG--C-A-G-TT-GT--TGAATTG-A---TGA-TT-TA------TATCTGAAC-T-T---G-----T----GT----A-AA-TGGTTT-GCAGATC-AACA--TG--G---AGTTTTGGCTTTG-TT----G-ACCTA--TT-TTT-G---AA--GA-GTTATGGACCTTGA-A-C-GTAGTCAA-T-AATGCCACAA--AGC-GAGACTCTT-TTT
gi|6 : ATTAGGGG-T--C-GCCTAC---A-GGTG------GGAGCCTTGT----AGTGATCAGCTT----GT--GTA-T-------------G--TGTG----TCCAT---------------G------TG--TTTGTGTTTT--CTAGA-C---G--T-T-T-----G-GCTATCTCTG--C-A-G-TT-AT--T
gi|6 : C-AA-G--TTT-G---AGTTTGGGCTTTC-TTTCTCT-ACCTC--TT-TTT-G---AAAGAA-GTTAatacaagtttgagtttgggctttctttctctacctctttttgaaagaagttagaaaagttcaggaatttgacagttttctggacttttcttggttatccctgcagctattgatttttatcaatgggttacatatcaat
gi|6 : attaggggtcgcctacaggtgggagccttgtagtgatcagcttgtgtatgtgtgtccatgtgtttgtgttttctagacgtttggctatctctgcagttattataACA-GTTTT--CTGGA-C-TTT--TCT-T-----G-GTTATCCCTG--C-A-G-CT-AT--TG--------------------------------AT-T-T---T-----T----AT----C-AA-TGGGTT-ACATATC-AA-gaaaagttcaggaatttgacagttttctggacttttcttggttatccctgcagctattgatttttatcaatgggttacatatcaat
gi|7 : attaggggtcgcctacaggtgggagccttgtagtgatcagcttgtgtatgtgtgtccatgtgtttgtgttttctagacgtttggctatctctgcagttattatacaagtttgagtttgggctttctttctctacctctttttgaaagaagttagaaaagttcaggaatttgT--T-T-T--------CTATCCCTG--C-A-G-CT-TT--TGATTTG-A---AAA-TT-TG------CACATTAAA-T-T---G-----T----AT----C-A-----GTT-ACAGATC-AA-A--T---t
gi|7 : ttgacagGA-A-C-TTAACAAA-T-AATGGCACAA--AGCTGGGGCCTTT-CTTctgaaaaggtcatcaaagaacttaacaaataatggcacaaagctggggcctttcttggtgttttccatcacaatgagattttaatttgatctcttttctatccgtacatctacagagataacgttttatatttgtattacagatagtaacgtctctga
gi|8 : ttgacagttttctatccctgcagcttttgatttgaaaatttgcacattaaattgtatcagttacagatcaaatctgaaaaggtcatcaaaTTT--TTGGA-C-TCT--T-T-T-----A-GTCATCCCTA--C-A-G-CT-ATATTGAATTG-A---GAA-TT------------------------------------AT----C-AG-T-----------TC-AA-G--TTT-G---AGTTTGTGATATC-TT----A-ACCTA--TT-TTT-G---AAA-GA-GTTATGTACCTTGA-T-T-TTAGCAAggtgttttccatcacaatgagattttaatttgatctcttttctatccgtacatctacagagataacgttttatatttgtattacagatagtaacgtctctga
gi|8 : acacacaTTTT--CTGGA-CATTTG-T-T-T-----G-GCTATCTATG--TTG-G-CT-AT--CCA--TG-A---AAAGTT-TG------TACATAAAC-T-T---A-----T----AT----C-AT-TAGGCT-ACAGATC-AA-G--T---tttgtgatatatgatatttttctggacatttgtttggctatctatgttggctatccatgaaaagtttgtacataaacttatatcattaggctacagatcaagta
gi|9 : acacacatttttggactcttttagtcatccctacagctatattgaattgagaattatcagttcaagtttgagtttgtgatatcttaacctatttttgaaagagttatgtaccttgattttagcaatttgtgatatatgatatCA------GAAGACCTAT----AATGATCAGCCTTTGGGT--GTG-T---CCATGCATGCA--TGTG----TCAGT---------------GCA----TT--AACA-ATTTG--C-AGA-C-TTG--T-T-------G-GCCATTCCTG--C-A-G-CT-AT--TGAATTG-------------A------TGTATGAAA-T-C---A-----T----AT----T-AA-T-----------TC-AA-G--T----------------TTTC-------A-ACCAA--TTCTTC-T---CA--GA-GTTATGGGCCTTGA-A-C-TTa
blockSeqs : TCTGC CCT T CATATG CTAG TTGG CG T TATGTCCGTTGCGTTTCGCCATCCGTGC GTG TC C T A GT C . TTCGG C AG T A G T AT A G TTT G GTATAGGCC G A GTTTTG ACAA T C T G T GTTTGG CC TCTC C AT A A AAA AG A G AC T C . T A
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blockSeqs : GCCAT . . . . . . . TGTAAGTCCTGCATTAATT AG . T . . . . . G . . . . . . . A . . . TTA . . AC . . . . G . ATTAG G . . . . . A A . . A . . . . .
blockSeqs : CTTCC . . . . . . . TGTCTATTACTCAATGCA AG . T . . . . . . . . . . . . . A . . . TTA . . TT . . . . G . GGCTG T . . . . . . A . . T . . . . .
blockSeqs : GCCAT . . . . . . . ATGTGCCTATCTGTATA GC . C . . . . . . . . . . . . . A . . . TTA . . GT . . . . T . GTTTG C . . . . . . A . . T . . . . .
blockSeqs : CCTG . . . . . . . CATGTTTCCATGCATTG AG . C . . . . . . . . . . . . . T . . . TTA . . AT . . . . G . GATTG G . . . . . . . . . C . . . . .
blockSeqs : CCAG . . . . . . . GATTCTGCCGTATATT AG . T . . . . . . . . . . . . . A . . . ATA . . AT . . . . G . GATAG C . . . . . . . . . A . . . . .
blockSeqs : TCGC . . . . . . . CTTTTCATGCATTG GC . C . . . . . . . . . . . . . A . . . TTA . . GT . . . . G . CATGG C . . . . . . . . . C . . . .
blockSeqs : . . . . . . . CCTCTGTCCACGTG AG . T . . . . . . . . . . . . . T . . . TTA . . AA . . . . T . GTTTG C . . . . . . . . . C . . . .
blockSeqs : . . . . . . . GCGTCTGTGCATTG AG . T . . . . . . . . . . . . . A . . . GTA . . AT . . . . G . GTTTG C . . . . . . . . . C . . .
blockSeqs : . . . . . . . CATCTGTCCACGTA AG . C . . . . . . . . . . . . . T . . . TTA . . GT . . . . A . CTAG G . . . . . . . . . C . .
blockSeqs : . . . . . GTGTGTCCATGTG GC . T . . . . . . . . . . . . . G . . . TTG . . TT . . . . A . TG C . . . . . . . . . C . .
blockSeqs : . . . . . GCATCAATCC AG . T . . . . . . . . . . . . . A . . . TTA . . GT . . . . G . TG G . . . . . . . . . C
blockSeqs : . . . . AA . T . . . . . . . . . . . . . A . . . TTG . . AT . . . . T . GT C . . . . . . . . . T
blockSeqs : . . . . A . T . . . . . . . . . . . . . A . . . TTG . . AT . . . . G . GT C . . . . . . . . . C
blockSeqs : . . T . . . . . . . . . . . . . T . . . AA . . G . . . . G . G C . . . . . . . .
blockSeqs : . . T . . . . . . . . . . . . . A . . . TA . . A . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . A . . . TA . . T . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . A .
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqs : . .
blockSeqCons : NCCGC*** AT************ GNTTG******* C* *** **
originalCons : TAATTAGGGC-C--C-GCCTAT---A-GGCA------GGAGCCCTAT----AGTGATCAGCCT----GT--GTG-T---C---------G--TCTG----TCCGT---------------G------TG--AACG-GTTTT--CCGGA-C-TTT--T-T-T-----G-GCTATCCCTG--C-A-G-CT-AT--TGAATTG-A---AAA-TT-TA------TACATGAAC-T-T---G-----T----AT----C-AA-TGGGTT-ACAGATC-AA-G--T---G---AGTTTGGGCTTTC-TT----G-ACCTA--TT-TTT-G---AA--GA-GTTATGGACCTTGA-A-C-TTAGCAAA-T-AATGCCACAA--AGC-GGGGCCCTT-TTT
finalCons : TAATTAGGGCNCCGC---CTAT---A-GGCA------GGAGCCCTAT----AGTGATCAGCCT----GT--GTG-T---C---------G--TCTG----TCCGT---------------G------TG--AACG-GTTTT--CCGGA-C-TTT--T-T-T-----G-GCTATCCCTG--C-A-G-CT-AT--TGAATTG-A---AAA-TT-TA------TACATGAAC-T-TAT------------AT----C-AA-TGGGTT-ACAGATC-AAGNTTG-------AGTTTGGGCTTTC-TT----G-ACCTA--TT-TTT-G---AA--GA-GTTATGGACCTTGA-A-C-TTAGCAAA-T-AATGCCACAA--AGC-GGGGCCCTT-TTT
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|24 ): AATTATGCTACAAAAGAGGGGGCTTTTGCATGCTTGTCATCAACAATAATATCTAGTTCCAATAATTTTGAAAATCTATTCTTGCT
Unaligned ( gi|25 ): TATTTATAAGGCCTTTGTATATACTAGGCAAGAGCCGTATGTCTAGTTATCGGTCTATGTGTGCGTCTGTGAATTGACAGTGTTTT
Unaligned ( gi|31 ): ACACCACAAAGCTAGGCTCGTACATGATGCTTGCCATCTCAATGATATCTAGTTTAT
Unaligned ( gi|33 ): TGATGTTTGCAAGTTGAAAACTATGTATGTTGTATAC
Alignments
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lowQualScore : . . ... . ...... . .... .... .. . ....................................................... ... .. . . . .. . . ..... . . .. . . . . .. . . ... . .......... . ............... .... . . . . .. .. .... . . .. . . ... .. . ... . . .. . .
lowQualScore : 0 1 888 3 222222 5 3333 3333 44 5 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777 888 66 9 8 8 33 8 0 00000 0 1 55 8 7 7 7 33 4 7 000 7 1111111111 0 333333333333333 5555 1 1 1 1 77 11 7777 2 7 11 4 2 333 11 5 777 1 1 00 0 0
consensus : TAATTAGGGCCCCGCCTAT---A-GGCA------GGAGCCCTAT----AGTGATCAGCCT----GT--GTG-T---C---------G--TCTG----TCCGT---------------G------TG--AACG-GTTTT--CCGGA-C-TTT--T-T-T-----G-GCTATCCCTG--C-A-G-CT-AT--TGAATTG-A---AAA-TT-TA------TACATGAAC-T-TA-------T----AT----C-AA-TGGGTT-ACAGATCAAGNTTGAGTTTGGGCTTTC-TT----G-ACCTA--TT-TTT-GA--AA--GAGTTATGGACCTTGA-A-C-TTAGCAAA-T-AATGCCACAA--AGC-GGGGCCCTT-TTT
Reference ( family-1156 ) : TAATTAGGGCNCCGCCTAT---A-GGCA------GGAGCCCTAT----AGTGATCAGCCT----GT--GTG-T---C---------G--TCTG----TCCGT---------------G------TG--AACG-GTTTT--CCGGA-C-TTT--T-T-T-----G-GCTATCCCTG--C-A-G-CT-AT--TGAATTG-A---AAA-TT-TA------TACATGAAC-T-TA-------T----AT----C-AA-TGGGTT-ACAGATCAAGNTTGAGTTTGGGCTTTC-TT----G-ACCTA--TT-TTT-G---AA--GAGTTATGGACCTTGA-A-C-TTAGCAAA-T-AATGCCACAA--AGC-GGGGCCCTT-TTT
gi|1 : CTAT---A-GACA------AGAGCCCTAT----A----TCAGCCC----GT--GCG-T---CCTCCC----A--TCTG----CCTGT---------------A------TATTGACA-GTTTT--CTAGA-C-TTT--T-TCT-----G-GCT----CTG--C-A-C-CT-AT--TGAATTG-A---AAA-TC-CG------TATATGAACTT-TAAGTCTTTT----AT----T-AT-TGGATT-ACAAATCAA-------------CT----TT----G-ACGGA--TT-TTA-GA--AA--GAGTTATGGACCTTGG-A-A-TAAGCAAA-T-AATGCTACAATTAAT-GTGGTCCCT-TTT
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gi|11 : gctgttgaatggaatagAT---T-GGCA------GATACTCCAT----GGTGAAAATCGT----GT--GTG-CATGT---------G--CCTA----TCTGT---------------A------TA--AATG-CTTGT--GCGGA-C-TTT--T-T-G-----G-GCCATCCTTT--G-A-G-CT-AT--TGAATTG-A---AAA-TT-TA------TACATGAAC-T-TA-------C----ATACAAC-AA-TGGATT-ATTGATCAAAGCCTAGTTTGGGCTTTG-TT----G-ACATA--TT-TTT-GAAAAA--GAGCTATGGACCTCAAGA-T-TTAGCAAA-T-gtgatgcttgtcatcacaagggtatctagttttaatcattttaaaaatatttattttacttcagcctgtaaattatgtagtttaactgaaaata
gi|12 : TTGGGGCCCTGC-TAC---A-GGCA------GGAGCC-TAT----ACTAATTAGCC-----G---GAG-T---T---------G--TAAG----TCC-T---------------GCATTAATT--AACA-GTTA---CCAAA-T-TTT--T-T-T-----GCGCAATCCCTG--C-AAG-CT-TT--TTGATGA-A---AAA-AT-TA------CATATGAAC-T---------------AT----C-AA-TGGCTTTACAGAT------TGGGTTTGGACTTTT-TA----A-AAC----------------A--GAGTTATGGAC
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gi|14 : T-AT--TGAATTG-A---AAA-T-----------------------A-------T----AT----T-GA-TGGGTA-GCATAT------TGAGTTTGAGCTTGC-TT----A-GCCTA--TT-TTT-GGA-AA--GAGTTAAGGACCTTGA-A-T-TTAGCAAA-T-AATGACAAAA--AG
gi|15 : ---A-GGCG------GGAGTCTTAT----TTTGATTAGCGT----GT--GCG-T-------------GATTCTG-----CCGT---------------A------TATTGACA-GTTTT--TTGGA-C-TTTGTT-T-T-----G-GTTATCTCGG--C-A-G-TT-AT--TTGATTG-A---AAA-TT-TA------TACATGAAC-T-TG-------T----gcaactgaaggctctttgtgatgccatccgaatgat
gi|16 : CTATCCCTG--C-G-G-CTTAT--T----TG-A---GAA-TAATA------TACATCCAC-T-GA-------T----AT----T-AG-TGTTTT-ACAGATCAAATTAGAGTTTGGGCTTTG-TT----G-A--TAATTT-TTT-GA--AA--GAGTTATAGACCTTTA-C-C-TTA-----------GCTACAA--AGC-AGGtgtgaccatgggaatgtttg
gi|17 : TT-G---AA--GAGCCAAAGACTTTGA-A-TGTTA-CAAA-TCAATGCCACAA--AGC-AGGGCTCTA-TTaatctct
gi|18 : -G-CT-AT--CGATTTG-A---AAA-TT--A------TACACAAACGTATA-------T----AT----C-AA-TGGGTA-GCAGGTCAAGGCTGAGCTTGGGCTTTC-TA----G-ACCTT--TT-CTC-A---AAAGAAGTTACAAGCCTTGA-A-A-TTAGCCAA-T-gtgatgctcatcatctcaatgatatgtagtttatcacaaaagttgttcagagtaaagtacttggttctgaagatga
gi|19 : GCCCTATCTAGAGTGACCAGACT----GT--ATA-T----------------TATG----TCCGTTGCGTTTCGCCATCCG------TGC-AACG-CTTTT--CTGAA-CATCT--T-T-T-----G-GCTATCCCAG--C-A-G-C--AT--TGAATTG-A---AAA-TT-TA------
gi|2 : cggccTAATTAGGGCTCTGCCTAT---G-GGTACATATGGGAGCCCTAT----AGTAATCAGTTC----AT--G---------------------CTT----TTCAT---------------GCAT---TG--A-TA-GTTTTTCCCAGA-C-TTT--T-T-TA----G-GCTATTGCTG--C-A-G-TT-AT--TGAACTG-A---AAA-TA-TA------TA----AAC-T-TA-------C----A
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gi|20 : taattagggctctgcctatgggtacatatgggagccctatagtaatcagttcatgcttttcatgcattgatagtttttcccagacttttttaggctattgctgcagttattgaactgaaaatatataaacttacaattctaaggtttcggctttcaggacaatacccatgtccataatgaagaaaagatttgtaaaattttaaagagttgttaaaagttgtgacTAATTACGGCCCTGCCTATCCTA-GGTA------GGAGCACTAC----AGTGATCTGCTT----AT--GTG-TG--C---------A--TCAA----TCC----------------------------AA---ATTT-------ATT-TTT--T-T-T-----G-TCTATTGCTG--C-A-G-CT-AG--TGATTTT-G---AAA-TT-TA------
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gi|27 : ------GGAGCC--------AGTGATCAGTCA----GCCGGTG-----C---------A--TGTT----TCCAT---------------GCAT---TG--AA-A-GTTTT--CCAGA-T-TTT--T-c
gi|28 : atggcctctg-TT-TA------TACATGAAC-T-TG-------T----GT----C-AA-TGGATT-ACATATCAAGTTTGACTTCAGGCTTTC-TT----G-ACCTA--TT-TTatattatgttatggc
gi|29 : ACA-GGTTT--CTGTATC-TTT--C-T-T-----G-GCGACCCCTG--C-A-G-TT-AT--TGAGATG-ATTTACA-TG-TA------TACATG
gi|3 : ttgAGATCAAGATTGGATTTGGAATTTG-TC----G-ATCTA--TA-ATT-GA--AA--AAGTTATGGATCGTGA-T-C-TTAGCA
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