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gi|4 : TTCAGTCCGG--G-A-TTGAGTACCAGCTC-TACTGTACCTAAACAGATCGATTCGATAGCGGCAGTTCCT-GTTACA---AA--TA---CCGCAG--GTAAA----------TTCT-----------GCGTTTGCC------------T---CTCC----CA--GTACTGCCACAGATGTTACCC--TTTGTCGTCTGCGC-TGTC-CCCCCCCC-C--CCACTGGTCATCTCTT------TTGCTTTCACA-CAAC-TGAATACTG-GTCTTCACTGCGAGCCCCCAA---ATGTCTCGGTTAGCA------GCCATAGAT-----TCAAGGTCGATGAGGTGG---ATGTAGCCAGGTTTCAGATCTCTCTTGTATA-----CAACCTTGAAACTGAGGAGCGGTATGTAGGTTTGTCTAGTGCC-----GGTAGCGAGCTCACCATACA--GAATGTCTTTGGAAATTCGGCCATCCT---------------GACCGAGGCAGCGTA-G--ACGTC-TCTGAG-AGAG----------GAGT--GCAAACAG--GCTTGGGATTT--------TTAC----TCTGGCAAGCACAT-CTTTGGTGGGGACACGGTCCTGCCAGGTG----------ATGTCAAGGATCCTTACGAGAC--------TGCACAGGTGGAAGGCATT---CA--GT----CTACGT-TCT----GGATGAGTATTCAGAGTTCTTGACTTGCTGCTGTAGAGGAGAGTGCTTAGAATACAGGCT-TGGT-AC-ATTTTC--ATCTTTGTGTCGGTAGTCAGAATGG--T--G---TTGTTC---CACACCCTCTTTGCCAGGCG----TG---CCATTGCCGTTGCTGCTTTGCCGATA------CGAGTGTTGATTTCGG-----T-----GTCCAGC------------GAGA-GG-------------TTGCTAGATATGGCG-G-AAACCAGGTA-AGTAA----AATATTCCACCACCT-CCAG-GGT-GCTATCGCCG---ATG-GTCA-TGCACGGGATGT--TACT--G--ACT-ATTTGAGCAATGATG-TTAGTTTTT-CTGAAGGCTATT-GTC-GTTCTAACTCACCACATAC---------GTG-AGC-----GAAGT---GATCGATGA-------------GTCGTTGTAGGGACTTTCGAGAGTGG------AAAGCCAGGG-CAG-------------------CGTCATCTCCTTGATGCCTTGC-GGACT---------------TTGCTCCTAGCG---------CG----------------C--A--G------A--CTGGT-TAGGTTGAAGAGGCTACTG---CC-TC--TC----CGTGTGT-GAATGTAGACGTCGTCTTCAC-------TCTGGTTAA----AGGTATATTTC--CG---------------ATACCGAA--G-AG--GGT--TTGGA-CGAGGACACATCATTGTTT------TT--CG---------CTGCTGAAGAT---AGGG-
gi|8 : atttttcaacagtaagtaatcatattttgcttgacatctatggtacactattaatgttagcgtccgtctgtctcaggagacaatggaaaatttgcgcccggTTCAGTCCGT--G-G-TAGAATGACAGCTCCTACTGTGGCTAAACAGACCTATTCGAGAGCTGCAGTTCCTCGT-ACA---GT--TG---CCGCAG--GTAAA----------TTCTGCGTCTGCCTCTC-----CCAGTACAGCCAGAT---TTGC----TG--C------------------CC--TTTGTCGTCTTCGT-TGTC-TTTTCTCTTC--CCATTGGTTTTCTCTC------CTGCTCTCATA-CAAC-TACACGTTG-GTCTTTATTGCGAGCCTCCAA---ATGTCTCGATCAGCA------GCGGTCAAT-----TCTCGATCGACGGGGCGG---GTGTCG---GATTTCAGATCTCTCTTGCAAATAAAACATTCTTGAACATCAGGAGCGGTCTGCCGGTTGGTCTAGTTCC-----TTA-GCCAGCACGCCATACA--GAGTGTCTTTGGGAATTCGGCCATCCTGCATGCGTATAACGTGCCCGAGCCAGCGTA-G--TCGTC-TCTAGG-AAAA----------GAGG--GCGAACAT--GCTTGGGATTT--------TCGC----TCTGGCAAGCA-------AGTTGGGGGCACG-------G---TACTGCCAGGTGATGTCCAGGATCCTTATGGGACTGCGCAAGTG--------GAAGTCATC---CA--GT----CTGCCT-TCT----TGGT-GGTGTAGAAAGTCCATGACTCGCTGCTGTAGAGGAAAGTGCTTAGAACAAAGGCC-TGGT-AT-ACTCTC--ATTTT-GTGTTGGTAGTCAGCATttcaa
gi|9 : attatttcaccaatcataattattcgctattgatattattatgcgaaatgttgtagttgctgacgtacgtctgcctcgggagacttatataatggacacgttgtgcccggGTCTGTTCG-GCTTGAG---CAGCGCCTTTTGTGGCTG-------CAATGTGAGAGTGGCAGTCTTT-GT-GCACTGATCCTGGTCTGTTAGATGTTAA----------TTGT-----------TT-----CC------------T---CT-C----TG--G-------------------------GTCACCCG-GT-GCTC-GCCTCTCTTCTGCCA-----CCGCTGTCAGCTAATT-CTCTT-CGTCAGCATGCA-GCTGTGTGTGAACAGTGCTTCTCTAGCTGATGCCGTCATTTGCAAGGTTCTCCCAGGAC-----TC------T---GTGTCG---ATGTCAAGCGCCTTAACGTCTCTCTTGCACA-----CATCTATGTATCTTAGCTGTGGGCGGCCAGTACCTC-ATTGCCTTTCTA----TAAGCTCTCCATAGA--GGACATCCTTTGGGATTCGACCATCCTCCGTACGGCGAACATGGCCGAGCCAGCGCAGCCGACGTCATCTCAGTAGAATGTACATTGTGGGGATGCCAGCACGAGATAGGACATCAGTGTTGGTCACCTTGTCTTGCAAGGAGATACTTAGT---------------------------------ATGCGTTGGAGGCTTCTGAGG---------TG--------GAAGGTATT---CT--ATTGAGCCATTTCTCT----TGACGGGCGTACATATTCCACGTCTCACTGCCATACAGTAGGGTGCT-------CAGGCA-TTGT-AC-A--GCC--ATCTt
gi|15 : acctaggcctccttcggtcctggctgaccagggatggtgaccctccgtccactatcaggtattGT--GTG-TTGAGTGGC---TCC-GTTGTGGCTAAAT-GATTGATTCAAGAGCGGCCGTTCT--GT-ACC---AG--TG---CGT--G--GTAAAAGTCTGCCTCTTGT-----------TC-----CC------------TAGACTGCAAGATGCTG------------------CCGTTTTGT----TGCGTCTGTCGTTCTTTCCTC--CCTCTG--TCTCTC--------CTGCTCTCAC-------TGCACGCTG-GTTCTTACTGCGAA-CTTCAG---ATGTTTCCGTCAGCG------TTGTCGATTCCAGGTC------GATGGAGGCAAGGATGTTGCCGGAATTCAA---TCTC-TGCG--------ACTCTT-AACGAGAGCAGC-GTCT-CCAGTATGGCTAGTG-C-----AGTAGCGAG-TTGCTATATATTGAATGTCTTTG
gi|25 : tgttggtgtcatctgtctcaggcatggagacttttgctccacttcggCGT----TCCGGTAAGCACAT-CTCTGTTGGGGACACGGTTTACCCAGATG----------ATGCCCAGGGTATTTCTGGGACTGCGCATGTG--------GAAGGCATT---C
gi|11 : cGCCCAAGATCCTTTGCAGACACCACATGTG--------AAACACATTAAGCCTAGT----CTCTTC-TCTACCCCGGTAG-CATATGTCGTACATGTTTCGCTTCCATATAGCATAGTGCTAAGAACGCAGGa
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gi|7 : gaGTCCATCCTTCGCTTCTATATCGCAGAGTGCTGAGGACGCAGGCT-TGAT-AG-AC--CTTAAGCTTTGTGTT--TAGT-GTCA-GG--TTCC---TTGTTATCCCACACTTTCTTTGTCAGCTT----CG---ACATCACAGCAGCAGCCTTGCCGATC------TCAACATCAAGT--GAAAGACT-----GTC--G-------------GAGA-TG-------------T-------------G-ACAGCC-----A-GG-AACTTGAATT-TGCAACAACTGCTAGTGGC-GCG----CC----ATT-GAT------TGAGGTGGA--GTTGGG--ATG-TCCTGCCCCATGAC---CTCTTTTCTTTGATGCTGATT-GTGAGACTGAAGTCATCACAAGCTTTGGAGAAGTT-GTCCATGAGACGCTGGGG---ACGA--------------TC----------AT---AAGAGTGGCTTGCAAAAGT---GG-CAACATCA------T----GAATAGCATATCTCTGA------GGAGGACA---------------ggtcctaaagctgaaaccgttacaggttcaggagaagctgtccatgagggtcagtagctcttcctctctgtctgtggcaacagctacctcatcagcaaagcgtatgttcgtaatgagcacctcacgaaccttggtctttgctttcaggcggtaagggttgagcagttttccatctgacctggtgtggaggaggatgccctctgtagattgtccaaagacatgtttcagcacgacggcaaagaaaatgcggaggatgtgcttgcatcaagcacacagttttgcttttgaccaccgcggacttttgaccactgcggatcctggaggagtcagctgatgaaccgttaaactcccttcatatcgaaatggaaggactgaatcatgagtagctttgtggaacattcgatcttttcccaaagtctttaacagactatctcagctgacaagatcgaaggcttttgtcagaatgatgaaggacacatacaaggggtatcactgttctctggattattttgctggcctagagaaaggggcatgtcgataatggagcgttccgatctaaagccacagtgttttgggatagaaccagtcagcaatttgtgtttgcagtctctttagcagcacgtggaagaagagactt
gi|1 : caaagagtcctttggtgaagcaaattaagcctagtccctagtctagcatatgtcCTTGTGTAGAGGAGAGTGATTATAACGCAGGCCCTGGTTACCATTATC--ATCTTGGC-TCGGTAGTCAGCATGG--T--GA--TTGTC------CACCC-CTTTGTCAGGTG----GG---C---TG-TGTTGATGCTTTGC---TG------C---TGTT-AGTTCGG-----TTCTTCGTGAAGTTTGTG-------GATATGG-------------T-------------G-GGATCCCAGGTAAGGTAA----AATCATCCACC---T-CCAG-GGT-GATCTCATCG---ATGCGAT--TT--CGGAGGATGATGCT------CGCTCTTGG-CCATGATGTGTTGTTTTC-TTGAGACTTATTTGTCAGTCCAAACTCATCGCATGT---------GTGGAGC-----AAAGT---GATC-ATGAGACATAGGGC---TTC----------CG---CAGAATGA------ACAGC--AGGTCAG--TTGCA----TCTGCAAACAGCATCTCCCTGA------GGAGGACC---------------TT---------G---------CGGACTTTGTGTC-----T--A--GCGCGCAA--C-AGGCCAGGTTGAAGAGGCT-CC----TA-TCACTC----CGTGTG---AATGTAGATGCCATGT-CAC-------TCTGGTCAA----ATGTGT-TTGCAACAGGAGG---AGAGAGAGTGCCG----A-AG--AGTG-TTGG-GCGAGGACACATCCTTGTTT--------CACG---------CCGCTGAGGAT---GGGA-AAGGT-CTTGAAGA--TGAGCCATCGTAC-TT-------G-ACAGTGCCTTT-CATATCT--ATGGAA-GA------GATTA-TCATCCTCAGAAGCTTGGGTGGG-C---ATCC-ATCCTCAC--AGTAG-CGTGAAGAGGCCACTCT-G-CTGAC---TGG--G-TCAAATGCTTTGTTC-AGAT-AATGAAGG----CGAG-TGGAGTGGTTGTCTCTGCT-CACAGCACTTCTACTGCAGCTGTCGC--A--ATGA-GA--ATATCA--TGTCGACAGTC-ACC-T----TCCT-G--TGCTGAAGCCCACACTGCGCCCCTGGG-TATA--TGCATT-C-TCAA-GGAGACTGcgggtgattttggtgttggcactgagtcgttcaagttgaacagcttgccatatattgatgagtatgcagatagaccccatccgggaagatttgaatgcatgaaacaggaggagtgagaatatcccaaaagtgttggagctagcacacagccttgttttacaccactgagaatctggaagcctcggatgtctccccttcgaagcaaacgatgctttttcatgttagtgtgaaaggacttgattaagctgaaagctttgtgggcatccaatcttctgtagaatcttgaacaaccatctctgctaacaagggtcaaacgccttcgtcaagtcgacgaaagccaggtacaaaggtttgcgctgctctctgcatttttcctggagttctcacggagaagatcatttcaggagg
gi|11 : aTCTTTGTCAGCTT----CG---ACATCACAGCAGCAGCCTTGACAATG------CGGGGATTGATCTCAA-----A-----ATCAAGTAAAAGATTGTCGGAGA-TG-------------T-------------GAG-AGCCCAGGTA-CTTGA----ATTTGTCAA-CAACTGCTAGTGAC-GCG----CCATTGATT-GAGA-TG--GGAGGTGGA--GTT--GGAATT-TTCTGCCCCATGACC-TCTGTTTTC-CTGATGCTGATT-GTGAGACCGAAATCATCACgagtctgtttagaccacaacacgaagacctcaccgacatgctgaacagggagataccgcggtagttattgcacatgaggtctcctctttttttgtacgcattgtggtgttggcatcacctatgtcctgtgaactgacccttcctcccagcactgaagcaggagtttgtggaggtggtcaagaacatcctgcgccttgatgacttcagatggaatgccatcaccacttgagctttgccgctggtgagggtgtcaggctttgctgagctccatgaaggaaggtgggcatcaagtttcccatgactgacagggggtgatgcactcaactgctgttgtcaggtgatgttctccaatgagtaccgctgctggtagtgctccacccaactctccttcgcttggcgcccgtgatgatgtcacctagacgacagatttgcggtgccatcttcatggggctgccaaccactcttttcagtcccctcattactgcagttggggaagagttggcatagttcagccagtagtcattggaacagaattggcgttatcctgggtctttgcctttctaagtgcagcgaggtcttctctgatgggtctctcttgtgcttgagcagtgcggcgcatttagatgagattactgtcctagttcggatcctgctccagtctggatacttctcctgcttgccaaatggtatgggtttgtaatctcgatgtttcatctatgcctggttgggcagtctttgagggcctcctggagtaagtttgcgaagcacacacaagcatcaggtacagaggtcatggttttgttgatgcgaggccatccttcctgcttggaattttggatccgcctgggctggaggcaaactctggccatgaccagtgagtagtcagtgtcgcagtcagcgctgtggtagctaagggtgttg
gi|18 : atccaggccaccgtaggcgtcgttggctgagcattgcaaagactgtttgttgtgctgagaatatcggagttggtaaccttgttcttccaggtgaggcccaagatcctttgcagacaccacatgtgaaacacattaagcctagtctcttctctaccccggtagcatatgtcgtacatgtttcgcttccatatagcatagtgctaagaacgcaggcataatagaccttaagatttgtgtttagtgccaggttcttattttcccacactctttgtcagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGGACCATGATG-CACGTCTTC-TTTAGGCTGATG-GTCAAACTGAAAGTGTCGCAAAC---------TTG-GTA-----GAAGC---
gi|13 : tggtaatttctagaggttgctccataagcTCATCGCATGC---------ATG-AGC-----AAAGC---GATTGATGAATCGTCGCAGGGCTTC----------CC---GAGAGTGG------ACAGTCAGGA-CAGCGTCG------TCTACAAACAGCATCTCTCTGA------GGAGGACC---------------TT---------G---------CGGAATGCCTTACAAGCGCGAA--G------A--C-GGGCCAGGTTGAACAGGCT-CAC---AT--CACTC----CGTGTGT-GAATGTAAACGCCGTCTTCAC-------TCTGGCCAA----AGGTGTATTGCAACAGGAGG---GA-GAAGAAGATG-CCGA-AG--AGTG-TTGGTGCAAGGACACATCCTTGTT--------TCAAT---------CCGTTGAGGAT---GGGGAAAGGT-TCTGAAG--ATGAGCCGTCGTA-CTT-------G-ACAGTGCTTTT-TATATCTT-ATGGAA---------GATTA-TCATTCTCGGAAGATTGGGTGGA-C---ATCCAATCCTTCAC-AGTAG-CGTGAAGAGGCCACTCC-TGCGAAC---CAG--G-TCGAATGCCATCGTC-AGATCAAT----------GAGATAGAGTGGTTGCCtgtccttgaggttctgcagctcttcctttgtatgtttggtaacacctgcatcatcagcaaagtgaatgtccctgaccttgagctttgctttcaggcag
gi|16 : ---GG---ACGA-------------T-C----------AT---AAGAGTGGCTTGCAAAAGT---GG-CAACAT---------CAGTGAATAGCATATCTCTGA------GGAGGACACGGGTGATTTTGGTGTT---------G----------G----------------C--ACTG------AGTC-GGTTCAAGTTGAACAGCTT-GCCATATTATGA-TG----AGTATGCAGAT---AGACCCCATC----CGGGAAGATTTGA--------ATGCAT---GAAACAGGAGGAGTGA-GAATATCCCA-A--A-AA---GTG-TTGGAGCTAGCACACAGCCTTGTT--------TTACA---------CCACTGAGAAT---CTGG-AAGGC-
gi|6 : ataagctttggagaagttgtccatgagacgctggC----------CT---GTGAGTGG------GAGGACAGGG-CAGCATCGGTATTTCCCGCAA-CATCAGTTTAC------------GGACC---------------TT---------GGTTTGGGCTCA----------------C--A--G------A--C-GAGTGAGGTTGAACAG------C---TTGTCA-TCAGAGTGTGTGT-GGAGGAGAACTCCATCCTC-----------TGATGAACTGAAGGGGTAGGACAGCAGCAGG---GA-GAATATACCAAC--A-AG--TGTG-GTG---CAAGGACACACCCCTGTT--------TCACT---------CTGCTTGTGATG--GGAA-AGGGG-GCGGAAG--ATGATCCGCCAAA--TT-------GTATGGTGCCTTG-CATGTCCTCATGAAA-AG---A--GAAGG-TCACACTGAGCAGTTTCctcggatgtctccccttcgaagcaaacgatgcttttcatgttagtgtgaaaggacttgattaa
gi|5 : tatgtgccaggcggtcgaccagcctctggagtccaa----------------C--A--G------G--C-GGTAAGGGTTGAGCAGTTT-TCCA--TC-TGA-CC----TG-GTGT-GGAGGAGGATGCCCTCTGTAG-------ATTGTCCAA----AGACATGTTTCAGCACGACG---GC-AAAGAAAATG-C--GGAGGATGTGCTTGCATCAAGCACACAGTTTTGCTTTTGACCACCGCGGACTTTTGACCACTGCGGATCCTGGAG-GAGTCAGCTGA-----TGAACCGT--TA-----------A-AC--TCCCT-T-CATATCGAAATGGAA-GGAC-T--GAAT------CATGAGTAGCTT-TGTGGAAC---ATTCGATCTTTTCC-CAAAGTCTTTAACAGACTAT--C-T-C-AGCTGACAA--GATCGAAGGCTTTTGTC-AGAATGATGAAGG----ACACATACAAGGGGTATCACTGTT-CTCTGGA-TTATTTTGC---TGGCCT--A--GAGA-AA--GGGGCA--TGTCGATAATGGAGC-G----TTCC-GATCTA--AAG-CCACAGTG---TTTTGGGATAGA---AC-CA-G-TCAG-CAATgagcttgaagaggccctttctgctgacgagatcgaanggagaaggtcacactgagcagtttcggtggtcatcctatcctttcaaggagcttgaagaggccctttctgctgacgatatcgaatgtcttggtcaggtcaatgaaggcaaggtacaggggcctcttctgcttcctgcacttttgctgcagttgtctcatgatgaagatagtgtcgatggttgatttctctgttcggaatccacattgaaactcgtggtacactaacccagcgagctgacgcagtctcaacagggtgactcggggaaacgccttacctacgatgcttagcagcgagatgccccggtattgttgcaattgctgcgatctccctttgtcgttatataagatgatgataattgcatcacgcgtgtcgtgggtgacagaaccttccttccagcgcttgaggagaagctcgtgcaggttgaggaagaaagtgggcttggcacactggaaaacctcttccgggatgccgtaatttcctggagccttgccactggcagttttctaagcgttgtt
gi|7 : gagtaaagggttctgacttcttcccgtacagctgcacgcaagctcgacaaactgccaccttagtgtgttctgttggcttgcaatttttccacactctctttgtcagttgacttagtacccagcgttgttgccgcacgacctatatatatccgtctttaagttcgacgtccatggagatgttaaccatcaccatggaccaagtaggtgaacgcgtgcaccacatccaaactcatggtcgccgacggtgactgccggggccgttccacaccctgaacaatgatgtacgtcttcttcaggctggtcctaaagctgaaaccgttacaggttcaggagaagctgtccatgagggtcagtagctcttcctctctgtctgtggcaacagctacctcatcagcaaagcgtatgttcgtaatgagcacctcacgaaccttggtctttgctttTGAAACAGGAGG---AGTGAGAATATCC-C--A-AA--AGTG-TTGGAGCTAGCACACAGCCTTGTTT--------TACA---------CCACTGAGAAT---CTGG-AAGCC-TCGGA----------TGTCTCCCCTTCGAAGCAA-ACGATGCTTTTTCATGTTAGTGTGAAA-GGACTT--GATTAAGCT-----GAAAGCTT-TGTGGG-C---ATCCAAT-CTTCTGTAGAAT-CTTGAACA-ACCATCTC-TGCTA-A---CAAGGG-TCAAACGCCTTCGTC-AAGTCGACGAAAG----CCAGGTACAAAGGTTTGCGCTGCT-CTCTGCATTTTTCCTGGAGT--TCTC--A--CGGA-GA--AGATCA--TTTCttgtgtttgcagtctctttagcagcacgtggaagaagagactt
gi|10 : caaagagtcctttggtgaagcaaattaagcctagtccctagtctagcatatgtcgtccatccttcgcttctatatcgcagagtgctgaggacgcaggcttgatagaccttaagctttgtgtttagtgtcaggttccttgttatcccacactttctttgtcagcttcgacatcacagcagcagccttgccgatctcaacatcaagtgaaagactgtcggagatgtgacagccaggaacttgaatttgcaacaactgctagtggcgcgccattgattgaggtggagttgggatgtcctgccccatgacctcttttctttgatgctgattgtgagactgaagtcatcacaagctttggagaagttgtccatgagacgctggggacgatcataagagtggcttgcaaaagtggcaacatcatgaatagcatatctctgaggaggacacgggtgattttggtgttggcactgagtcgttcaagttgaacagcttgccatatattgatgagtatgcagatagaccccatccgggaagatttgaatgca-ACGGTGCTTTT-CATGTTAGTGTGAAATGA---CTTGATTA-TGTTA---AGAAGCTCTGGTGGA-C---ATCCAATC-TTCTGTAGCAT-CTTGAACAAGCCATCTC-TGCTAAC---AAG--G-TCAAACGCCTTCGTC-AAGTCGACGAAAG----CCAGGTACAAAGGTTGGCGCTGCT-CTCTGCATTTTTCCTGGAGTTGTCTC--A--CAGA-GAAGATATTATTTGTCAATAGTGAATC-T----TCCT-GATCTG--AAG-CCGCACTGTGACTCTGGG-TACA--TAC--G-T-TCAGCCAATACaggagg
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gi|21 : tgtgaaaagacgcgaTGTGGG-GGAGATCCGATCTTCCCC-AGAAG-TGTAAAAAA---------------C---CAG--A-TCGAAT------GTCACG-TCCATGAAGA-----GACAAACAGTGGCTG-CGTGGTTCTA-GTCTCTTCTCCTGCAACTGTTCG--G--GTGA-GA--AGATAT--TGTCAAgtgctgcagcttgtttagtattacttgggcaaaggctttcccaaggttgcttagaagaaatattcgatggtagttgttggagtcactgcggtctcctttcttcttatagagtatgacgatatcggtgtcacaaatatctttctcagcactggagtgaaagctcatgcaggtggtaaagtataacagtactcgtatccttgcctgatttgatgaccttcacgggagaatgccatcatttcctgttgcttatccactggccagggagtctatgacctttctgagttcgttattgaaggatggagcatctatttcctccatgagatgtagggggttggtgctgacaacgatctctctgaagtaaagttcctgatagtgtttggtccatctttccatctgctttcctctatctatgataatgtcgctgaaggctgacttcaaaggtgtgatcttggtaacgtttggaccaacgtctaacgtggtgcgaatgttggcacagtcagtagagagctgggtgctctggtaaagattcagccattagtcgttggtgctgcgccagcctatccatttgggtgtcgtttctggccttcctgagtatagcaagtgtcttctccgaaggctctctcttataccactagttactagtaagccatgctttgattttagctgcgaatgctggctcaagttttgtgattccagcttcaaaccagtctggatttggcctctctctctcttgccaaaggtgtccatggcggagttgtagatggcgtcacgaatgcgattccacatctcttcagcactgtttatagggcagtctcgaagggcctcttctacaaaatcagcacttgcacaggtctggtatttttgtcctggctgtgttggtatatggacatcatttcttgcatggagtgttagatatttgcttgggatgaacacgtaccttgcgaccaaccattgagtaatcaatgtcacagccactgttgtggtaactgtgggttttg
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8 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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gi|12 : gtttggtaacacctgcatcatcagcaaagtgaatgtccctgaccttgagctttgctttcaggcagaacaggcttcaaacttgatagattgaatcaatgaatcatgagtagctactAGA--C-C-T-GCC-C-AACGATGCTA-A-GCAGTGAGATTCCACGATAGTTGTTG-------C-------ATTCATCCC----TGTCT-CCTTTG-TTTTGTA---CATAAC----TTTGCACCACTACTCCCTCTC--------C--------CCAG--CACTG-G-Catttgaattctgttcagcaatattcgggcgaagacctgcccaacgatgctaagcagtgagattccacgatagttgttgcattcatccctgtctcctttgttttgtacataactttgcaccactactccctctccccagcactggcgaaatagcttatgcaggtgacctaatacgacttgatgaactcgg
gi|13 : gtttggtaacacctgcatcatcagcaaagtgaatgtccctgaccttgagctttgctttcaggcagaacaggcttcaaacttgatagattgaatcaatgaatcatgagtagctactagctaggatggatgtccagtattttcaagaatacttaacagatcgttcagctaacaagattgaagactttagttaaatcaatgaagtacacctacatgggttatctctgtctcttgcagctggcgctgagtgaggaccatgtccatggtggaactctctgacgtgaagccacactggtttgggatacacccagtcaacaatgatttgaattctgttcagcaatattcgggcgaTCATCGCATGCATG-AGCAAAGCGATT-----GAT----GAATCGTCGCAGGGCT------T-------CCC--GAGAGTGG------ACAGTCAGGACAG---CGTCG-----TCTACAAACAGCATCTCTCTGA-G----GAGGAC---------CTT--------G---------C---------GGAATGCCTTACAAGCGCGAAG------A--CG--GGCCAGGTTGAACAGGCT--CAC--ATCACTC----CGT--GTGTGAATGTAAACGCCGTCTTCACTCTGG-----CCA----AAGGTGTATTGCAACAGGAGG---GAGAAGAAGA-TGCC-G-AAGA--GTG-TTGGTGCAAGGACACATCCTTG-TT-T-------CAAT---------CCGTTGAGGAT---GGGGAAA-GGTT-CTGA--AG--ATGAG----CCGT--CGTA---CTT-------G-ACAGTGC-TTTTTATAT-C-TT-A-TG-----GAA------GATT--ATCATTCTCGGAAGATTGGGTGGA-CATCCAATCCTTCACAGTAG-CGTGAAGAGGCCACTCCTGCGAACCA-GGTCGAATGCCATCGTCAGATCAAT------GAGATAGAGTGGTTGC----Cgaaatagcttatgcaggtgacctaatacgacttgatgaactcgg
gi|15 : GT--GTG-TTGAGTG---GCTCC-GTTGTGGCTAAAT-GATTGATTCAAGAGCGGCCGTT-CT-GT-ACCAGTG---------CGT--G--GTAAAAGTCTGCCTCTTGT---TC-----CCTAGACT---------GCAAGATGCTG------------------CCGTTTTGT----TGCGTCTG-TCGTTCTTTCCTC--CCTCTG------------TCTCTC----CTGCTCTC-----ACTGCACGCTG-GTTCTTACTGCGAA-CTTCAGATGTTTCCGTCA---GCGTTGTC-------GAT--TCCAGGTCGATGGAGGCAAGGATGTT----GCCGGAATTCA-ATCTC---TGC------GAC-TCTT--AACGAGAGCAGC-GTCT-CCAGTATGGCTAGTG-CA----GTAGCGAG-TTGCTATATATTGAATGTCT----TTG
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gi|22 : agCTTCTCCTGCAGCTGTCTC--ACGGT-AAAA--ATAA--TTTTGATGGTTGATCT--CTGCTCT-GAAT-CCACGC--TAAG--A-TTCGGG-G-T--A--TTC-T-CACTC-AGCGAT-CTG-A-
gi|24 : TAGC-AGCTCGACATAGA--GGATGTCTAAAGTTAGGAATGCGGTCATCCTCC-AT---GCGGTG---GATGTGGCCCAGCCAcacaatctc
gi|25 : ggcggcccacactccttcctatCGTTCCGGTAAGCACATCTCTGTTGGGGACACGGTTTAC--CCAGATGATGCCCAGGGTATTTCTGGGACTGCGCATGTGGAAGGCATTC
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gi|29 : atgagaAGGGAGATGCCCCGGTAGCTGTTG-------CAGTTGCTA-------C----GGTCG-CCTTTGTTTTT
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gi|7 : tatgtgccaggcggtcgaccagcctctggagtccaacctgtgagtgggaggacagggcagcatcggtatttcccgcaacatcagtttacggaccttggtttgggctcacagacgagtgaggttgaacagcttgtcatcagagtgtgtgtggaggagaactccatcctctgatgaactgaaggggtaggacagcagcagggagaatataccaacaagtgtggtgcaaggacacacccctgtttcactctgcttgtgatgggaaagggggcggaagatgatccgccaaattgtatggtgccttgcatgtcctcatgaaaagagaaggtcacactgagcagtttcgagcttgaagaggccctttctgctgacgagatcgaanggagaaggtcacactgagcagtttcggtggtcatcctatcctttcaaggagcttgaagaggccctttctgctgacgatatcgaatgtcttggtcaggtcaatgaaggcaaggtacaggggcctcttctgcttcctgcacttttgctgcagttgtctcatgatgaagatagtgtcgatggttgatttctctgttcggaatccacattgaaactcgtggtacactaacccagcgagctgacgcagtctcaacagggGCATATGTCGTCCATCCTTCGCTTCTATATCGCAGAGTGCTGAGGACGCAGGCT-TGAT-AG-ACCTTAAGCTTTGTGTT--TA--GT-GTCA-GGTTCCTTG-TTATC---CCACACTTTCTTTGTCAGCTT--------CGACATCACAGCAGCAGCCTTGCCGATC------TCAACATCAAGT--GAAAGACTG----------T-----------C----G-GAGAT-----------G-T-------------G-ACAG-CCAGGAA-CTTGAATTTG--CAACAACTGCTAG--TGGCG--C-GCCATTGATTGA-----------GG--TGG-A--GTTGGG--ATGTCCTGCCCCATGACCTC---TTTTCTTTGA-TGCTGATT-GTGAGACTGAAGTCATCACAAGCTTT-GGAGAAGTTGTCCATGAGAC----G-CT---------G-GGGACGAT-------CAT--AAGAGTGGCTTGCAAAAGT---GGCAA---CATCA-----T----GAATAGCATATCTCTGA-G----GAGGACACGGGTGA-TTTTGGTGTTGG---------C---------A----------------C--TG------A---GTCGTTCAAGTTGAACAGCTT--GCC-ATATA-TT----GATGAGTATGCAGATAGACCCCATC------CGGGAAGATTTG----AATGCA---TGAAACAGGAGGAGTG---AGAATA-T-CC--CAAAA--GTG-TTGGAGCTAGCACACAGCCTTGTTT-T--------ACA---------CCACTGAGAAT---CTGG-AA-GCCT-C-----GG--AT---------GT--CTCCC--CTTCGAAGCAA-ACGATGCTTTTTCATGT-TAGT-G-TG-----AAA-G----GACTTGATTAAGCTGA-AAGCTTT-GTGGG-CATCCAATCTTCTGTAGAAT-CTTGAACA-ACCATCTCTGCTAACAAGGGTCAAACGCCTTCGTCAAGTCGACGAAAGCCAGGTACAAAGGTTTG----CGCTGCTCTCTGCATTTTTCCTGGAGT--TCTC--ACGGA-GAAG--ATCA--TTTCagttttctaagcgttgtt
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gi|11 : tctggaaggcctcggatttctccccgtcgaagcaaacggtgcttttcatgttagtgtgaaatgacttgattatgttaagaagctctggtggacatccaatcttctgtagcatcttgaacaagccatctctgctaacaaggtcaaacgccttcgtcaagtcgacgaaagccaggtacaaaggttggcgctgctctctgcatttttcctggagttgtctcacagagaagatattatttgtcaatagtgaatcttcctgatctgaagccgcactgtgactctgggtacatacgttcagccaatacctgcagtcttgtgggtacagctctggcatagCCAGGCCACCGTAG---GCGTC-GTT-----------GGCTGAGCAT---TGCAAAGACTGTTTGTTGTGCTGAGAATATCGGAGTTGGTAACCTTGTTCTTCCAGGTGAGGCCCAAGATCCTTTGCAGACACCACATGTGAAACACATTA-----AGCCTAGTC-TCTTCTCTACCCCGGT--AGCATATGTCGTACATGTTTCGCTTCCATATAGCATAGTGCTAAGAACGCAGGCA-TAAT-AG-ACCTTAAGATTTGTGTT--TA--GT-GCCA-GGTTCTT-----A-TTTTCCCACA--CTCTTTGTCAG
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gi|12 : atccaggccaccgtaggcgtcgttggctgagcattgcaaagactgtttgttgtgctgagaatatcggagttggtaaccttgttcttccaggtgaggcccaagatcctttgcagacaccacatgtgaaacacattaagcctagtctcttctctaccccggtagcatatgtcgtacatgtttcgcttccatatagcatagtgctaagaacgcaggcataatagaccttaagatttgtgtttagtgccaggttcttattttcccacactctttgtcagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAGCTAGGATGGA-TGTCCAGTATTTTCAAGAAT-ACTTAACAGATCGTTCA-GCTAACAAGA-TTGAAGACTTTAGTTAAATCAATGAAGTACACCTACATGGGTTAT----CTCTG-----------TCTCTTGCAGCTGGCGCTGAGTGA-G--G--ACCA--TGTCCATGGTGGAACTCTCTGACGTGAAG-CCACAC--T--G--G-TTTGGG-ATACA--C-C-C-AGT-C-AACAATG
gi|12 : gtttggtaacacctgcatcatcagcaaagtgaatgtccctgaccttgagctttgctttcaggcagaacaggcttcaaacttgatagattgaatcaatgaatcatgagtagctactTCGGGCGAAGA--C-C-T-GCC-C-AACGATGCTA-A---GCAGTGAGATTCCACGATAGTTGTTG-------C-------ATTCATCCC----TGTCT-CCTTTG-TTTTGTACA---TAAC----TTTGCACCACTACTCCCTCTC--------C--------CCAG--CACTG-G-Catttgaattctgttcagcaatattcgggcgaagacctgcccaacgatgctaagcagtgagattccacgatagttgttgcattcatccctgtctcctttgttttgtacataactttgcaccactactccctctccccagcactggcgaaatagcttatgcaggtgacctaatacgacttgatgaactcgg
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gi|16 : tgttggtgtcatctgtctcaggcatggagacttttgctccacttcgg-----GACG------A-----T---------------CATAAGAGTGGCTTGCAAAAGT---GGCAACATCA--------GTG-AATAGCATATCTCTGA-G----GAGGACACGGGTGATTTTGGTGTTGG--C---------A----------------C--TG------AGTCGGTTCAAGTTGAACAG-CTTGCCA-TATTA-TGA---TGAG--TA-TGCAGATAGACCCC---ATC------CGGGAAGATT----TGAATGCAT---GAAACAGGAGGAGTG---AGAATA---TC--CC-A-AAAA-GTG-T-TGGAGCTAGCACACAGCCTTGTTT-T--------ACA---------CCAC-TGAGAAT---CTGG-AA-GG---CC-TCG----G--ATGTCTCC----CCTT--CGAAG--C-AA-ACGATGCTTTT-CATGT-TAG-TG----TGAAAGGACTTGATTA
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gi|19 : tggtaatttctagaggttgctccataagAGGGTGTC-----GATGGCTTTGCTGAGCTC--CA-TGAAGGAGGGCGGGGtgcagctcttcctttgtatgtttggtaacacctgcatcatcagcaaagtgaatgtccctgaccttgagctttgctttcaggcag
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gi|25 : ggcggcccacactccttcctatCGTTCCGGTAAGCACATCTCTGTTGGGGACACGGTTTACCCAGATGATGCCCAGGGTATTTCTGGGACTGCGCATGTGGAAGGCATTC-----A
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gi|12 : atccaggccaccgtaggcgtcgttggctgagcattgcaaagactgtttgttgtgctgagaatatcggagttggtaaccttgttcttccaggtgaggcccaagatcctttgcagacaccacatgtgaaacacattaagcctagtctcttctctaccccggtagcatatgtcgtacatgtttcgcttccatatagcatagtgctaagaacgcaggcataatagaccttaagatttgtgtttagtgccaggttcttattttcccacactctttgtcagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAGCTAGGATGGA-TGTCCAGTATTTTCAAGAAT-ACTTAACAGATCGTTCA-GCTAACAAGA-TTGAAGACTTTAGTTAAATCAATGAAGTACACCTACATGGGTTAT----CTCTG-----------TCTCTTGCAGCTGGCGCTGAGTGA-G--G--ACCA--TGTCCATGGTGGAACTCTCTGACGTGAAG-CCACAC--T--G--G-TTTGGG-ATACA--C-C-C-AGT-C-AACAATG
gi|12 : gtttggtaacacctgcatcatcagcaaagtgaatgtccctgaccttgagctttgctttcaggcagaacaggcttcaaacttgatagattgaatcaatgaatcatgagtagctactTCGGGCGAAGA--C-C-T-GCC-C-AACGATGCTA-A---GCAGTGAGATTCCACGATAGTTGTTG-------C-------ATTCATCCC----TGTCT-CCTTTG-TTTTGTACA---TAAC----TTTGCACCACTACTCCCTCTC--------C--------CCAG--CACTG-G-Catttgaattctgttcagcaatattcgggcgaagacctgcccaacgatgctaagcagtgagattccacgatagttgttgcattcatccctgtctcctttgttttgtacataactttgcaccactactccctctccccagcactggcgaaatagcttatgcaggtgacctaatacgacttgatgaactcgg
gi|13 : gtttggtaacacctgcatcatcagcaaagtgaatgtccctgaccttgagctttgctttcaggcagaacaggcttcaaacttgatagattgaatcaatgaatcatgagtagctactagctaggatggatgtccagtattttcaagaatacttaacagatcgttcagctaacaagattgaagactttagttaaatcaatgaagtacacctacatgggttatctctgtctcttgcagctggcgctgagtgaggaccatgtccatggtggaactctctgacgtgaagccacactggtttgggatacacccagtcaacaatgatttgaattctgttcagcaatatTCATCGCATGCATGA-GCAAAGCGATT-----GAT---------G------AATCGTCGCAGGGC-----TT-------C---CC----GAGAGTGG------ACA----------GTCAGGACAGCGT-CG------TCTACAAACAGCATCTCTCTGA-G----GAGGAC---------CTTGCGGAATGCC-T--T---ACAA-----GC--G--CGAAGA--CGGGCCAGGTTGAACAGGCT--CAC--ATCACTC----CGTG--TG-TGAATGTAAACGCC---GTCTTCACTCTGG-----C----CAAAGGTGTATTGCAACAGGAGG---GAGAAGAAGA---TG--CC-G-AAGA-GTG-T-TGGTGCAAGGACACATCCTTG-TT-T-------CAAT---------CCGT-TGAGGAT---GGGGAAA-GG---TT-CTGA--AG--ATG---AG----CCGT--CGTA---CTTG-ACAGTGCTTTT-TATAT-C-T-T-A----TGGA---A---GATTATCATTCTCGGAAGATTGGGTGGA-CATCCAATCCTTCACAGTAG-CGTGAAGAGGCCACTCCTGCGAACCAGG-TCGAATGCCATCGTCAGATCAAT------GAGATAGAGTGGTTGC----Cgaaatagcttatgcaggtgacctaatacgacttgatgaactcgg
gi|14 : TTCA-GGAGGAATCGCATCA-TTACCTTGTGCTTTGGCACTCGCTAAGGTGTTTTAAAAATAGCCTTTTCAAGCTC--
gi|15 : atcatGT--GTG-TTGAGTG----GCTCC-GTTGTGGCTAAAT-GATTGATTCAAGAGCGGCCGTTC-T-GT-ACCAGTG---------CGT--G--GTAAAAGTCTGCCTCTTGT---TC-----CCTAGACT---------GCAAG-AT--GC---------TGCCGTTTTGT----TGCGTCTG-TCGTTCTTTCCTC--CCTCTG------------TCTCTC----CTGCTCTCAC-----TGCACGCTG-GTTCTTACTGCGAA-CTTCAGATGTTTCCGTCA---GCGTTGTC------GATTCC-A-G-GTCGATGGAGGCAAGGATGTTGCCGGAATTCA-ATCTC---TGC------GAC-TCTT--AACGAGAGCAGC-GTCT-CCAGTATGGCTAGTG-CA----GTAGCGAG-TTGCTATATATTGAATGTCT----TTGttcagtggttggttcggcatccaagttcttggaggactgacatagcttgaatgttaatgagggcttcctcagaaacttgttctctgtggagtacagttccgggtagtgttccacccatctctccatttgttccttgcggtcatgatgactgcacctgttttttatttttaaagggacactcattaaggctgtctagttgcttgctttataccttcgtccatggctctggtgttgccagaattggaggccttttcaatggaagagcacagctgtaaccaacagtcgttggcacattttctggccgtctcctgactttcacctctggcttttctcagtgcatttaggttgctctgtgatgggtct
gi|16 : tgttggtgtcatctgtctcaggcatggagacttttgctccacttcgg---------G------A-----CG-----------AT-------C---AT----AAGAGTGGCTTGCAAAA----------GT---GGCAACAT-CA---------GTGAATAGCATATCTCTGA-G----GAGGACACGGGTGATTTTG------G---TGTT---G--------GC--A--C--TGAGTCGGTTCAAGTTGAACAG-CTTGCCA-TATTA-TGA---TGAG--TA-TGCAGATAGACCCC---ATC------CGGGAAGATT----TGAATGCAT---GAAACAGGAGGAGTG---AGAATA---TC--CC-A-AAAA-GTG-T-TGGAGCTAGCACACAGCCTTGTTT-T--------ACA---------CCAC-TGAGAAT---CTGG-AA-GG---CC-TCG----G--ATGTCTCC----CCTT--CGAAG--C-AA-ACGATGCTTTT-CATGT-TAG-T-G----TGAAAGGACTTGATTA
gi|17 : ataagctttggagaagttgtccatgagacgctgggTGCCGTAGAGTAGGGTGCTCAACACACAGGCT-TTGC-AC-ACGGAGATCTTCGTGTTGATG--GTAAGCTTGT----T-----A-CTATCCCACACTCTTTTGGTCAGTCT--------TCCCAATGTGTTTGTTGCTCTCG--GCTTCTAA--AGAC---AGGTT--GC------------------T----G-GAGATG----------G-T-------------T-G-AGTCGCGGTA-GGTGAACTCG---ACAAATT-CCAG---AGTG--TAGTCACCGATGAAGA-TGC-TGG-Ga
gi|18 : CTGGACCATGATGCAC-GTCTTCTT-T-AGGCTGATG-GTCAAACTGAAAGTGTCGCAAACTTGG-TAGAAGCTGTC-----CTT---------G------A-----GG-----------TT-------C---tgtttc
gi|19 : tggtaatttctagaggttgctccataagAGGGTGTC-----GATGGCTTTGCTGAGCTC--CA-TGAAGGAGGGCGGGGtgcagctcttcctttgtatgtttggtaacacctgcatcatcagcaaagtgaatgtccctgaccttgagctttgctttcaggcag
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gi|21 : AGTTGTGGGGGA-GATCCGATCTTCCCCAGAAG-TGTAAAAA--------------ACCAGA-TCGAATG------TCACGTCCATGAAGA-GACAAACAGTGGCTGCGTGGTTCTAGTCTCT-----TCTCCTGCAACTGTTCG--GGTGA-GAAG--ATAT--TGTCAATGGgagggggggggtgtctttcggaaagccttgaagaggaaatct
gi|22 : agCTTCTCCTGCAGCTGTCTC--ACGGT-AAAA--ATAA--TTTTGATGGTTGATCT--CTGCTCTGAAT-CCACGC--TAAG--A-TTCGGG-GT--A--TTC-T-CACTC-AGCGAT-CTG-A---
gi|24 : TAGC-AGCTCGACATAGA--GGATGTCTAAAGTTAGGAATGCGGTCATCCTCCATGCGGTGGATG----TGGCCCAGCCAcacaatctc
gi|25 : ggcggcccacactccttcctatCGTTCCGGTAAGCACATCTCTGTTGGGGACACGGTTTACCCAGATGATGCCCAGGGTATTTCTGGGACTGCGCATGTGGAAGGCATTC-----A
gi|26 : cCAGTAGAAGT---G---AAAATAATATC--CC-AAAAAA-GTA-T-CGGAGCTAGCACACAGCCTTGTTT-TA------CAC
gi|27 : atgagaTTCA-GGAGGAATCGCATCA-TTACCTTGTGCTTTGGCACTCGCTAAGGTGT
gi|29 : atcatAGGGAGATGCCCCGGTAGCTGTTG-------CAGTTGCTA-------C----GGTCG-CCTTTGTTTTTtttaaaatag
gi|3 : CTCAGGAGCTTGAGAGGA-CATCCAATCCTTTGTAGCAG-GGTGAAAAGGCCTTACCAGCTGACCAAG-TCAAAGGCCTTTATCAAGTCGATGAATGTGATATACAGTGGGTAC----TTCTGTTCTTGGAACTTCTCCTGCAGTTGCCTT--AGTGA-AAAG--GCCA--TGTCGATGGTTGACCTTTCTCCTTTGAAG-CTGCAC--T--GT-GCCTCAGG-GTAGAATCGC-T-CTG-C-AA--GTGCTGCA---GC
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gi|4 : tgtgaaaagacgcgagaatactcaggagcttgagaggacatccaatcctttgtagcagggtgaaaaggccttaccagctgaccaagtcaaaggcctttatcaagtcgatgaatgtgatatacagtgggtacttctgttcttggaacttctcctgcagttgccttagtgaaaaggccatgtcgatggttgacctttctcctttgaagctgcactgtgcctcagggtagaatcgctctgcaagtgctgcagcttgtttagtattacttTTCAGTCCGG--G-A-TTGAGTA-CCAGCTC-TACTGTACCTAAACAGATCGATTCGATAGCGGCAGTTCCT-GTTACAAATA---------CCGCAG--GTAAA----------TTCT---GCGTTTGCCT---CT---------CCCAGTACT-GCCACAGATGTTACC-CTTTGTCGTCTGCGC-TG-TC-CCCCCCCC-C--CCACTG--GTC------ATCTCTT----TTGCTTTCACACAACTGAATACTG-GTCTTCACTGCGAGCCCCCAAATGTCTCGGTTA---GCAGCCAT------AGATTC-AAG-GTCGATGAGGTG---GATGTAGCCAGGTTTCAGATCTCTCTTGT-----ATACAACCTTGAAACTGAGGAGCGGTATGTAGGTTTGTCTAGTGCCG----GTAGCGAGCTCACCATACA--GAATGTCT----TTGGAAATTCGGCCATCCT-------------------GACCGAGGCAGCGTAG---ACGTC-TCTGAG-AGAGGAGTGC-AAACAGGCTTG---GGATT-TTTACTCTGGCAAGCACATCTTTGGTGGGGACACGGTCCTGCCAGGTGATGTCAAGGATCCTTACGAGACTGCACAGGTGGAAGGCATTC-----AGTCTACGT-TCTG---------GATG-AGTATTCAGAGTTCTTGACTTGCTGCTGTAGAGGAGAGTGCTTAGAATACAGGCT-TGGT-AC-ATTTTCATCTTTGTGTCGGTA--GTCAGAATGG----T-----G-TTGTTCCACACCCTCTTTGCCAGGCG--------TGCCATTGCCGTTGCTGC-TTTGCCGATACGAG--TGTT---GATTTCGGT-GTCCAG-----------C----GAGAGGTTGCTAGATATGG-C-------------G-G-AAACCAGGTA-AGTAAAATATTCCACCACCT-CCAG---GGTG--CTATCGCCGATGGTCA-TGCACGG-GA--TG-TT-ACTG--ACTATTTGAGCAATGATGTTA-GTTTTTCT-GAAGGCT-ATT-GTC-GTTCTAACTCACCACATACGTGA-GCGAAGTGATC-----GAT---------G------AGT---CG-----------TTGTAGGGAC---TTTC--GAGAGTGG------AAA----------GCCAGGGCAGCGT--------------------CATCTCCTTGATGCCTTGCGGAC---------TTTG------C---T--CCTAGC-------GC--G--C--AGA--CTGGTTAGGTTGAAGAGGCTA-CTG-CCTC--TC----CGTG--TG-TGAATGTAGACGTC---GTCTTCACTCTGG-----T----TAAAGGTATATTTC--C-----------------GA---TA--CC-G-AAGA-GGG-T-TTGGACGAGGACACATCATTGTTT-T-------T-CG---------CTGC-TGAAGAT---AGGG-tatttcctccatgagatgtagggggttggtgctgacaacgatctctctgaagtaaagttcctgatagtgtttggtccatctttccatctgctttcctctatctatgataatgtcgctgaaggctgacttcaaaggtgtgatcttggtaacgtttggaccaacgtctaacgtggtgcgaatgttggcacagtcagtagagagctgggtgctctggtaaagattcagccattagtcgttggtgctgcgccagcctatccatttgggtgtcgtttctggccttcctgagtatagcaagtgtcttctccgaaggctctctcttataccactagttactagtaagccatgctttgattttagctgcgaatgctggctcaagttttgtgattccagcttcaaaccagtctggatttggcctctctctctcttgccaaaggtgtccatggcggagttgtagatggcgtcacgaatgcgattccacatctcttcagcactgtttatagggcagtctcgaagggcctcttctacaaaatcagcacttgcacaggtctggtatttttgtcctggctgtgttggtatatggacatcatttcttgcatggagtgttagatatttgcttgggatgaacacgtaccttgcgaccaaccattgagtaatcaatgtcacagccactgttgtggtaactgtgggttttg
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gi|8 : caaagagtcctttggtgaagcaaTTCAGTCCGT--G-G-TAGAATGAC-AGCTCCTACTGTGGCTAAACAGACCTATTCGAGAGCTGCAGTTCCTCGT-ACAGTTG---------CCGCAG--GTAAA----------TTCTGCGTCTG---CCT---CTCCCAGTACAGCCAG-ATTTGC---------TGCC-CTTTGTCGTCTTCGT-TG-TC-TTTTCTCTTC--CCATTG--GTT------TTCTCTC----CTGCTCTCATACAACTACACGTTG-GTCTTTATTGCGAGCCTCCAAATGTCTCGATCA---GCAGCGGT------CAATTCTC-G-ATCGACGGGGCG---GGTGT---CGGATTTCAGATCTCTCTTGCAAATAAAACATTCTTGAACATCAGGAGCGGTCTGCCGGTTGGTCTAGTTCC-----TTAGCCAGCACGCCATACA--GAGTGTCT----TTGGGAATTCGGCCATCCTGCATGCGTATAACG----TGCCCGAGCCAGCGTAG---TCGTC-TCTAGG-AAAAGAGGGC-GAACATGCTTG---GGATT-TTCGCTCTGGCAAGCA------AGTTGGGGGCACGGTACTGCCAGGTGATGTCCAGGATCCTTATGGGACTGCGCAAGTGGAAGTCATCC-----AGTCTGCCT-TCTT---------GGT--GGTGTAGAAAGTCCATGACTCGCTGCTGTAGAGGAAAGTGCTTAGAACAAAGGCC-TGGT-AT-ACTCTCAT-TTTGTGTTGGTA--GTCAGCATaggagg
gi|9 : attatttcaccaatcataattattcgctattgatattattatgcgaaatgttgtagttgctgacgtacgtctgcctcgggagacttatataatggacacgttgtgcccggGTCTGTTCG-GCTTGAG---C-AGCGCCTTTTGTGGCTG-------CAATGTGAGAGTGGCAGTCTTT-GT-GCA-CTGATCCTGGTCTGTTAGATGTTAA----------TTGT---TT-----CCT---CT----------CTGG-------------------------GTCACC--CGG-TGCTC-GCCTCTCTTCTGCCACCGCTGTCAGCTAATTCTCTT----C-G---TCA-GCA--TGCA-GCTGTGTGTGAACAGTGCTTCTCTAGCTGATGCCGTCATTTGCAAGGTTCTCCCAGGACTC-T-GTGTCGATG---TC---AA-G-CGCC----TTAACGTCTCTCTTGC-----ACACATCTATGTATCTTAGCTGTGGGCGGCCAGTACCTC-ATTGCCTTTCTATA---AGCTCTCCATAGA--GGACATCC----TTTGGGATTCGACCATCCT-C---CGTACGGCGAACATGGCCGAGCCAGCGCAGCCGACGTCATCTCAGTAGAA-----T-GTACATTGTGG---GGATG-CCAGCACGAGATAGGACATCAGTGTTGGTCACCTTGTCTTGCAAGGAGATACTTAGTATGCGTTGGAGGCTTCTGAGGTGGAAGGTATTCTATTGAGCC-ATTTCTCTT---------GACG-GGCGTACATATTCCACGTCTCACTGCCATACAGTAGGGTGCT-------CAGGCA-TTGT-AC-A--GCCATCTt
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|23 ): GTCACGATCTTTGCATCTCTCATATCTTGTGTATCTCCCCCGTCTTTCCAGCAGAGTTGCATAAGCTCGTGGTGTGGAGGTAGAGCTGATTTCCCTTGT
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gi|10 : acttgtgtagaggagagtgattataacgcaggccctggttaccattatcatcttggctcggtagtcagcatggtgattgtccacccctttgtcaggtgggctgtgttgatgctttgctgctgttagttcggttcttcgtgaagtttgtggatatggtgggatcccaggtaaggtaaaatcatccacctccagggtgatctcatcgatgcgatttcggaggatgatgctcgctcttggccatgatgtgttgttttcttgagacttatttgtcagtccaaactcatcgcatgtgtggagcaaagtgatcatgagacatagggcttccgcagaatgaacagcaggtcagttgcatctgcaaacagcatctccctgaggaggaccttgcggactttgtgtctagcgcgcaacaggccaggttgaagaggctcctatcactccgtgtgaatgtagatgccatgtcactctggtcaaatgtgtttgcaacaggaggagagagagtgccgaagagtgttgggcgaggacacatccttgtttcacgccgctgaggatgggaaaggtcttgaagatgagccatcgtacttgacagtgcctttcatatctatggaagagattatcatcctcagaagcttgggtgggcatccatcctcacagtagcgtgaagaggccactctgctgactgggtcaaatgctttgttcagataatgaaggcgagtggagtggttgtctctgctcacagcacttctactgcagctgtcgcaatgagaatatcatgtcgacagtcaccttcctgtgctgaagcccacactgcgcccctgggtatatgcattctcaaggagactggagtctgtttagaccacaacacga----CCGT--CGAA--GCA-A-ACGGTGCTTTT-CATGT-TAG-T-G----TGAAATGACTTGATTAT---GTTAAGAAGCTCTGGTGGA-CATCCAATCTTCTGTAGCAT-CTTGAACAAGCCATCTCTGCTAACAAGG-TCAAACGCCTTCGTCAAGTCGACGAAAGCCAGGTACAAAGGTTGG----CGCTGCTCTCTGCATTTTTCCTGGAGTTGTCTC--ACAGA-GAAGATATTATTTGTCAATAGTGAATCTTCCTGATCTGAAG-CCGCACTGT--G--A-CTCTGG-GTAaagtttcccatgactgacagggggtgatgcactcaactgctgttgtcaggtgatgttctccaatgagtaccgctgctggtagtgctccacccaactctccttcgcttggcgcccgtgatgatgtcacctagacgacagatttgcggtgccatcttcatggggctgccaaccactcttttcagtcccctcattactgcagttggggaagagttggcatagttcagccagtagtcattggaacagaattggcgttatcctgggtctttgcctttctaagtgcagcgaggtcttctctgatgggtctctcttgtgcttgagcagtgcggcgcatttagatgagattactgtcctagttcggatcctgctccagtctggatacttctcctgcttgccaaatggtatgggtttgtaatctcgatgtttcatctatgcctggttgggcagtctttgagggcctcctggagtaagtttgcgaagcacacacaagcatcaggtacagaggtcatggttttgttgatgcgaggccatccttcctgcttggaattttggatccgcctgggctggaggcaaactctggccatgaccagtgagtagtcagtgtcgcagtcagcgctgtggtagctaagggtgttg
gi|10 : tctggaaggcctcggatttctccACCATGCTA-ATTAGCAGGGAGATTCCGCGGTAGTTGTTG-------C-------AATCATTTC----GGTCA-CCCTTATTTTTGAAAAGCGTCACGATCTTTGCATCTC----TCATATC--------TTCTTTCCAGCAG--AGTTG---CA-T------A--------------AGC--------------CCATGGAGGTGTGGAAGTAGAACTGATTT---C----CCTTG------TTTGAT-AG--TTTCA-GGAGGAATCGCATCATTTACCGGGTGCTTTGGCACTCGCTAAGGCGTT-----AATcatacgttcagccaatacctgcagtcttgtgggtacagctctggcatagaccatgctaattagcagggagattccgcggtagttgttgcaatcatttcggtcacccttatttttgaaaagcgtcacgatctttgcatctctcatatcttctttccagcagagttgcataagcccatggaggtgtggaagtagaactgatttcccttgtttgatagtttcaggaggaatcgcatcatttaccgggtgctttggcactcgctaaggcgttaat
gi|11 : tctggaaggcctcggatttctccccgtcgaagcaaacggtgcttttcatgttagtgtgaaatgacttgattatgttaagaagctctggtggacatccaatcttctgtagcatcttgaacaagccatctctgctaacaaggtcaaacgccttcgtcaagtcgacgaaagccaggtacaaaggttggcgctgctctctgcatttttcctggagttgtctcacagagaagatattatttgtcaatagtgaatcttcctgatctgaagccgcactgtgactctgggtacatacgttcagccaatacctgcagtcttgtgggtacagctctggcatagCCAGGCCACCGTAG---GCGTC-GTT-----------GGCTGAGCAT---TGCAAAGACTGTTTGTTGTGCTGAGAATATCGGAGTTGGTAACCTTGTTCTTCCAGGTGAGGCCCAAGATCCTTTGCAGACACCACATGTGAAACACATTA-----AGCCTA-GTCTCTTCTCTACCCCGGT--AGCATATGTCGTACATGTTTCGCTTCCATATAGCATAGTGCTAAGAACGCAGGCA-TAAT-AG-ACCTTAAGATTTGTGTT--TA--GT-GCCA-GGTTCTT-----A-TTTTCCCACA--CTCTTTGTCAG
gi|11 : atTCTTTGTCAGCTT--------CGACATCACAGCAGCAGC-CTTGACAATGCGGG--GATT---GATCTCAAA-ATCAAGTAAAAGATTGTC----G-GAGAT-----------G-T-------------GAG-AGCCCAGGTA-CTTGAATTTGT-CAACAACTGCTAG--TGACG--C-GCCATTGATTGAGA-TG---GGAGG--TG-GA-GTTGGAATTTTCTGCCCCATGACCTCT-GTTTTCCT-G-ATGCTGATT-GTGAGACCGAAATCATCACnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntctttgtcagcttcgacatcacagcagcagccttgacaatgcggggattgatctcaaaatcaagtaaaagattgtcggagatgtgagagcccaggtacttgaatttgtcaacaactgctagtgacgcgccattgattgagatgggaggtggagttggaattttctgccccatgacctctgttttcctgatgctgattgtgagaccgaaatcatcac
gi|12 : atccaggccaccgtaggcgtcgttggctgagcattgcaaagactgtttgttgtgctgagaatatcggagttggtaaccttgttcttccaggtgaggcccaagatcctttgcagacaccacatgtgaaacacattaagcctagtctcttctctaccccggtagcatatgtcgtacatgtttcgcttccatatagcatagtgctaagaacgcaggcataatagaccttaagatttgtgtttagtgccaggttcttattttcccacactctttgtcagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAGCTAGGATGGA-TGTCCAGTATTTTCAAGAAT-ACTTAACAGATCGTTCA-GCTAACAAGA-TTGAAGACTTTAGTTAAATCAATGAAGTACACCTACATGGGTTAT----CTCTG-----------TCTCTTGCAGCTGGCGCTGAGTGA-G--G--ACCA--TGTCCATGGTGGAACTCTCTGACGTGAAG-CCACAC--T--G--G-TTTGGG-ATACA--C-C-C-AGT-C-AACAATG
gi|12 : gtttggtaacacctgcatcatcagcaaagtgaatgtccctgaccttgagctttgctttcaggcagaacaggcttcaaacttgatagattgaatcaatgaatcatgagtagctactTCGGGCGAAGA--C-C-T-GCC-C-AACGATGCTA-A---GCAGTGAGATTCCACGATAGTTGTTG-------C-------ATTCATCCC----TGTCT-CCTTTG-TTTTGTACA---TAAC----TTTGCACCACTACTCCCTCTC--------C--------CCAG--CACTG-G-Catttgaattctgttcagcaatattcgggcgaagacctgcccaacgatgctaagcagtgagattccacgatagttgttgcattcatccctgtctcctttgttttgtacataactttgcaccactactccctctccccagcactggcgaaatagcttatgcaggtgacctaatacgacttgatgaactcgg
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gi|14 : TTCA-GGAGGAATCGCATCA-TTACCTTGTGCTTTGGCACTCGCTAAGGTGTTTTAAAAATAGCCTTTTCAAGCTC--
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gi|16 : tgttggtgtcatctgtctcaggcatggagacttttgctccacttcgg---------G------A-----CG-----------AT-------C---AT----AAGAGTGGCTTGCAAAA----------GT---GGCAACAT-CA---------GTGAATAGCA-TATCTCTGA-G----GAGGACACGGGTGATTTTG------G--TG-TT----G--------G---CA--C--TGAGTCGGTTCAAGTTGAACAG-CTTGCCATATTA-TGA---TGAG--TA-TGCAGATAGACCCC---ATC------CGGGAAGATT----TGAATGCAT---GAAACAGGAGGAGTG---AGAATA---TC--CC-A-AAAA-GTG-T-TGGAGCTAGCACACAGCCTTGTTT-T--------ACA---------CCAC-TGAGAAT---CTGG-AA-GG---CC-TCG----G--ATGTCTCC----CCTT--CGAA--GC-AA-ACGATGCTTTT-CATGT-TAG-T-G----TGAAAGGACTTGATTA
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gi|18 : CTGGACCATGATGCAC-GTCTTCTT-T-AGGCTGATG-GTCAAACTGAAAGTGTCGCAAACTTGG-TAGAAGCTGTC-----CTT---------G------A-----GG-----------TT-------C---tgtttc
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gi|21 : AGTTGTGGGGGA-GATCCGATCTTCCCCAGAAG-TGTAAAAA--------------ACCAGA-TCGAATG------TCACGTCCATGAAGA-GACAAACAGTGGCTGCGTGGTTCTAGTCTCT-----TCTCCTGCAACTGTTCG--GGTGA-GAAG--ATAT--TGTCAATGGgagggggggggtgtctttcggaaagccttgaagaggaaatct
gi|22 : agCTTCTCCTGCAGCTGTCTC--ACGGT-AAAA--ATAA--TTTTGATGGTTGATCT--CTGCTCTGAAT-CCACGC--TAAG--A-TTCGGG-GT--A--TTC-T-CACTC-AGCGAT-CTG-A---
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gi|25 : ggcggcccacactccttcctatCGTTCCGGTAAGCACATCTCTGTTGGGGACACGGTTTACCCAGATGATGCCCAGGGTATTTCTGGGACTGCGCATGTGGAAGGCATTC-----A
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gi|29 : atcatAGGGAGATGCCCCGGTAGCTGTTG-------CAGTTGCTA-------C----GGTCG-CCTTTGTTTTTtttaaaatag
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gi|4 : tgtgaaaagacgcgagaatactcaggagcttgagaggacatccaatcctttgtagcagggtgaaaaggccttaccagctgaccaagtcaaaggcctttatcaagtcgatgaatgtgatatacagtgggtacttctgttcttggaacttctcctgcagttgccttagtgaaaaggccatgtcgatggttgacctttctcctttgaagctgcactgtgcctcagggtagaatcgctctgcaagtgctgcagcttgtttagtattacttTTCAGTCCGG--G-A-TTGAGTA-CCAGCTC-TACTGTACCTAAACAGATCGATTCGATAGCGGCAGTTCCT-GTTACAAATA---------CCGCAG--GTAAA----------TTCT---GCGTTTGCCT---CT---------CCCAGTACT-GCCACAGATGTTACC-CTTTGTCGTCTGCGC-TG-TC-CCCCCCCC-C--CCACTG--GTC------ATCTCTT----TTGCTTTCACACAACTGAATACTG-GTCTTCACTGCGAGCCCCCAAATGTCTCGGTTA---GCAGCCAT------AGATTC-AAG-GTCGATGAGGTG---GATGTAGCCAGGTTTCAGATCTCTCTTGT-----ATACAACCTTGAAACTGAGGAGCGGTATGTAGGTTTGTCTAGTGCCG----GTAGCGAGCTCACCATACA--GAATGTCT----TTGGAAATTCGGCCATCCT-------------------GACCGAGGCAGCGTAG---ACGTC-TCTGAG-AGAGGAGTGC-AAACAGGCTTG---GGATT-TTTACTCTGGCAAGCACATCTTTGGTGGGGACACGGTCCTGCCAGGTGATGTCAAGGATCCTTACGAGACTGCACAGGTGGAAGGCATTC-----AGTCTACGT-TCTG---------GATG-AGTATTCAGAGTTCTTGACTTGCTGCTGTAGAGGAGAGTGCTTAGAATACAGGCT-TGGT-AC-ATTTTCATCTTTGTGTCGGTA--GTCAGAATGG----T-----G-TTGTTCCACACCCTCTTTGCCAGGCG--------TGCCATTGCCGTTGCTGC-TTTGCCGATACGAG--TGTT---GATTTCGGT-GTCCAG-----------C----GAGAGGTTGCTAGATATGG-C-------------G-G-AAACCAGGTA-AGTAAAATATTCCACCACCT-CCAG---GGTG--CTATCGCCGATGGTCA-TGCACGG-GA--TG-TT-ACTG--ACTATTTGAGCAATGATGTTA-GTTTTTCT-GAAGGCT-ATT-GTC-GTTCTAACTCACCACATACGTGA-GCGAAGTGATC-----GAT---------G------AGT---CG-----------TTGTAGGGAC---TTTC--GAGAGTGG------AAA----------GCCAGGGCAGCGT--------------------CA-TCTCCTTGATGCCTTGCGGAC---------TTTG------C--TCCTA----GC-------G---CG--C--AGA--CTGGTTAGGTTGAAGAGGCTA-CTGCCTC--TC----CGTG--TG-TGAATGTAGACGTC---GTCTTCACTCTGG-----T----TAAAGGTATATTTC--C-----------------GA---TA--CC-G-AAGA-GGG-T-TTGGACGAGGACACATCATTGTTT-T-------T-CG---------CTGC-TGAAGAT---AGGG-tatttcctccatgagatgtagggggttggtgctgacaacgatctctctgaagtaaagttcctgatagtgtttggtccatctttccatctgctttcctctatctatgataatgtcgctgaaggctgacttcaaaggtgtgatcttggtaacgtttggaccaacgtctaacgtggtgcgaatgttggcacagtcagtagagagctgggtgctctggtaaagattcagccattagtcgttggtgctgcgccagcctatccatttgggtgtcgtttctggccttcctgagtatagcaagtgtcttctccgaaggctctctcttataccactagttactagtaagccatgctttgattttagctgcgaatgctggctcaagttttgtgattccagcttcaaaccagtctggatttggcctctctctctcttgccaaaggtgtccatggcggagttgtagatggcgtcacgaatgcgattccacatctcttcagcactgtttatagggcagtctcgaagggcctcttctacaaaatcagcacttgcacaggtctggtatttttgtcctggctgtgttggtatatggacatcatttcttgcatggagtgttagatatttgcttgggatgaacacgtaccttgcgaccaaccattgagtaatcaatgtcacagccactgttgtggtaactgtgggttttg
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gi|16 : tgttggtgtcatctgtctcaggcatggagacttttgctccacttcgg---------G------A-----CG-----------AT-------C---AT----AAGAGTGGCTTGCAAAA----------GT---GGCAACAT-CA---------GTGAATAGCA-TATCTCTGA-G----GAGGACACGGGTGATTTTG------G--TG-TT----G--------G---CA--C--TGAGTCGGTTCAAGTTGAACAG-CTTGCCATATTA-TGA---TGAG--TA-TGCAGATAGACCCC---ATC------CGGGAAGATT----TGAATGCAT---GAAACAGGAGGAGTG---AGAATA---TC--CC-A-AAAA-GTG-T-TGGAGCTAGCACACAGCCTTGTTT-T--------ACA---------CCAC-TGAGAAT---CTGG-AA-GG---CC-TCG----G--ATGTCTCC----CCTT--CGAA--GC-AA-ACGATGCTTTT-CATGT-TAG-T-G----TGAAAGGACTTGATTA
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gi|2 : TTTAGTCCGT--G-G-TTGAGTGGC-AGCTCCTACTGGGGCTAAACAGGCCGATTCGAGAGTGGCAG------GT-ACAATTG---------CATCAG--GTAAA----------TTCT---TC-----CCT---CT---------GCTGG-------------------C-CTTTGTCATCTGTGT-TG-TC-TTTTCTCTTC--CCATTG--GTC------CCCTCTTAGAACTACTCTTACACAACTGCACGCTG-GTCTTCACTGCGAGCCTCCAAATGTCTACATCA---GCACCCCT------GAATTC--------GACGGGGCC---AATCTCACCAGGTTTAAAA-CTCTCTTGC-----AGACACCCTTGAACCCGAGGAGCGGTCTGCCGGTAGGTCTAGTGCCA----GAAGCAAGCTTGCCATACA--AAATGTTT----TTGGGAATTAGGCCACCCTACATGCGTATGACG----TGACTAAGCCAGCGTAC---ACGTC-TCTTAG-AGAAGAGGGC-AAACATGCTCG---GAAAT-TTCGCTCTGGCAAGTACATCTTAGTTGGTGACACG-------C---TAATGCCCAGGATCCTTCTAAGACTG--------GAGGGCATTC-----CGTCTGTGT-TCTT---------GGTG-GGTGTACAGAGTCCATGACTCGCTTCTGTAGAGAAGAGTGCTTAAAATGCAGGTC-TGGT-AC-ACTGCTACCTTAGTGTTGGTA--GTCATCATGG----T-----G-TTGTTAAACATCCTCTTTGACAGGCG--------GGCCATTGCTGTTGCTGC-TTTGCCGATGCGAG--TGTT---GAGTTCGGT-GTCCAG-----------T------GAGAG-----------G-T-------------G-G-AGCCCACGTA-GGTAAAATCATCCATCAACT-CCAG---GGTG--TGGTAACCAATGGATA-TG--CGG-GG--TGTACTGTTG--ACGTCTTGGACCATGATGGTG-GTTTTCTT-G-AGGCTTATT-GTCAGTCCAAACTCATCGCACGCGTGA-TCGAAGCG--------AAT---------G------A------------------TT-------C---CT----AAGAGTGG------AGA----------GCCTAGGCAGCAT-TG------TCTGCAAACATCA-TCTTCCTGA-G----TAGGAC---------ATT----------------------------G---CG--C--AGA--CGGTCCAGGTTGAAGAGGCT--CCCTTTCA-TC----CGTG--TG-TGATTGTAAACGCC---GTCTTCACTTTGA-----T----CAAAAGCGTATTGCAACAGGAGG---G---GGATTA---TA--CT-GCGAGT-GTA-T-TGAAGCAAGGACACATCCTTATTTAT-------CACG---------CCGC-TGAGGAT---GGAG-AA-GG---CT-CTGA--AGACATG---AA----CCGT--CGTA--CCTTG-ACAGTGCCTCT-CATAT-CTT-C-G----TGGAAGGC---GAATATCTTCCTCAGAAGTTTCTGTGGG-CATCCGATCCTTCCGAAAAG-CGTGAATAGGCCATTCCT-CTATCCAAG-TCGAATTCCTTCGCCCGATCAATGAAGGCGAGATGTAGTGGTTGT----CTCTGTTTACGGCACTTCTCTTGCAACTGTCTC--AGTGA-GAAT--ATCA--TGTCGACAATCGACCTTCTCAATCGCAAG-CCGCAC--T--GC-GCCTCTGG-GTAGA--CAC-T-TTT-C-AACAATACTG-A---GCAGGGAGATACCGCGATATTTATT----------------G-------C----AGTCT-CCTTTGTTCTTGTACAGCGTCGTGATGTTGGCGTCAC----GCATGTC--------CA-------GTGG--GACTG-ATCC-TCCCTCCC--------------AAT--------------TAGTGGACGTGGTCATGGA-AACAT---T---CATA---TTGGCGG-CCTTGATGA---CTTAA-GGTGAAATGCCATCG-CAACCGAGAGCTTTGCCGCTAGTGAGGTTGTT-----GATTACTTTGCTGAGGTC--TA-TGAGGGAGGGTGGGGCATCgtcaagttaattcatgactggcaggagatgatgtgctcaactgctgtgtcggtgatgatgttcacccgtgagtacagctgctggtagtggagcactaactctccatctgcttgtcgcggcccgtgatga
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gi|22 : agCTTCTCCTGCAGCTGTCTC--ACGGT-AAAA--ATAA--TTTTGATGGTTGATCT--CTGCTCTGAAT-CCACGC--TAAG--A-TTCGGG-GT--A--TTC-T-CACTC-AGCGAT-CTG-A---
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gi|25 : ggcggcccacactccttcctatCGTTCCGGTAAGCACATCTCTGTTGGGGACACGGTTTACCCAGATGATGCCCAGGGTATTTCTGGGACTGCGCATGTGGAAGGCATTC-----A
gi|26 : cCAGTAGAAGT---G---AAAATAATATC--CC-AAAAAA-GTA-T-CGGAGCTAGCACACAGCCTTGTTT-TA------CAC
gi|27 : atgagaTTCA-GGAGGAATCGCATCA-TTACCTTGTGCTTTGGCACTCGCTAAGGTGT
gi|29 : atcatAGGGAGATGCCCCGGTAGCTGTTG-------CAGTTGCTA-------C----GGTCG-CCTTTGTTTTTtttaaaatag
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gi|4 : tgtgaaaagacgcgagaatactcaggagcttgagaggacatccaatcctttgtagcagggtgaaaaggccttaccagctgaccaagtcaaaggcctttatcaagtcgatgaatgtgatatacagtgggtacttctgttcttggaacttctcctgcagttgccttagtgaaaaggccatgtcgatggttgacctttctcctttgaagctgcactgtgcctcagggtagaatcgctctgcaagtgctgcagcttgtttagtattacttTTCAGTCCGG--G-A-TTGAGTA-CCAGCTC-TACTGTACCTAAACAGATCGATTCGATAGCGGCAGTTCCT-GTTACAAATA---------CCGCAG--GTAAA----------TTCT---GCGTTTGCCT---CT---------CCCAGTACT-GCCACAGATGTTACC-CTTTGTCGTCTGCGC-TG-TC-CCCCCCCC-C--CCACTG--GTC------ATCTCTT----TTGCTTTCACACAACTGAATACTG-GTCTTCACTGCGAGCCCCCAAATGTCTCGGTTA---GCAGCCAT------AGATTC-AAG-GTCGATGAGGTG---GATGTAGCCAGGTTTCAGATCTCTCTTGT-----ATACAACCTTGAAACTGAGGAGCGGTATGTAGGTTTGTCTAGTGCCG----GTAGCGAGCTCACCATACA--GAATGTCT----TTGGAAATTCGGCCATCCT-------------------GACCGAGGCAGCGTAG---ACGTC-TCTGAG-AGAGGAGTGC-AAACAGGCTTG---GGATT-TTTACTCTGGCAAGCACATCTTTGGTGGGGACACGGTCCTGCCAGGTGATGTCAAGGATCCTTACGAGACTGCACAGGTGGAAGGCATTC-----AGTCTACGT-TCTG---------GATG-AGTATTCAGAGTTCTTGACTTGCTGCTGTAGAGGAGAGTGCTTAGAATACAGGCT-TGGT-AC-ATTTTCATCTTTGTGTCGGTA--GTCAGAATGG----T-----G-TTGTTCCACACCCTCTTTGCCAGGCG--------TGCCATTGCCGTTGCTGC-TTTGCCGATACGAG--TGTT---GATTTCGGT-GTCCAG-----------C----GAGAGGTTGCTAGATATGG-C-------------G-G-AAACCAGGTA-AGTAAAATATTCCACCACCT-CCAG---GGTG--CTATCGCCGATGGTCA-TGCACGG-GA--TG-TT-ACTG--ACTATTTGAGCAATGATGTTA-GTTTTTCT-GAAGGCT-ATT-GTC-GTTCTAACTCACCACATACGTGA-GCGAAGTGATC-----GAT---------G------AGT---CG-----------TTGTAGGGAC---TTTC--GAGAGTGG------AAA----------GCCAGGGCAGCGT--------------------CA-TCTCCTTGATGCCTTGCGGAC---------TTTG------C--TCCTA----GC-------G---CG--C--AGA--CTGGTTAGGTTGAAGAGGCTA-CTGCCTC--TC----CGTG--TG-TGAATGTAGACGTC---GTCTTCACTCTGG-----T----TAAAGGTATATTTC--C-----------------GA---TA--CC-G-AAGA-GGG-T-TTGGACGAGGACACATCATTGTTT-T-------T-CG---------CTGC-TGAAGAT---AGGG-tatttcctccatgagatgtagggggttggtgctgacaacgatctctctgaagtaaagttcctgatagtgtttggtccatctttccatctgctttcctctatctatgataatgtcgctgaaggctgacttcaaaggtgtgatcttggtaacgtttggaccaacgtctaacgtggtgcgaatgttggcacagtcagtagagagctgggtgctctggtaaagattcagccattagtcgttggtgctgcgccagcctatccatttgggtgtcgtttctggccttcctgagtatagcaagtgtcttctccgaaggctctctcttataccactagttactagtaagccatgctttgattttagctgcgaatgctggctcaagttttgtgattccagcttcaaaccagtctggatttggcctctctctctcttgccaaaggtgtccatggcggagttgtagatggcgtcacgaatgcgattccacatctcttcagcactgtttatagggcagtctcgaagggcctcttctacaaaatcagcacttgcacaggtctggtatttttgtcctggctgtgttggtatatggacatcatttcttgcatggagtgttagatatttgcttgggatgaacacgtaccttgcgaccaaccattgagtaatcaatgtcacagccactgttgtggtaactgtgggttttg
gi|5 : atttttcaacagtaagtaatcatattttgcttgacatctatggtacactattaatgttagcgtccgtctgtctcaggagacaatggaaaatttgcgcccggTGACTTCTTCCCGTACAGC----TGC-----ACGCAAGCT-CGAC-AA-ACTGCCACCTTAGTGT--GTTCTGTTGGCTTGC----A-----A-TTTTTCCACACTCTCTTTGTCAGTTGACTTAGTAC-CCAGCGTTGTTGCCGC-ACGACCTATATATATCCGTCTTTAAGTTCGAC-GTCCA------------T----G-GAGAT-----------G-TTAACCATCACCATG-G-A--CCAAGTA-GGTGAACGCGTGCACCACAT-CCAAACTCATG----GTCGCCGACGGTGACTGC-CGG-GG--C---C-GTTCC-ACACCCTGAACAATGATGTAC-GTCTTCTT-C-AGGCTGGTC-CTAAAGCTGAAACCGTTACAGGTTCAG-GAGAAGCTGTC-----CAT---------G------A-----GGGTCAGTAGCTCTT-------C---CTCTCTGTCTGTGG------CAACAGCTACCTCATCAGCAAAGCGTATG------TTCGTAATGAGCA-CCTCAC-----------GAAC---------CTTG------G--TC-TT----T--------G---CTTTC--AGG--CGGTAAGGGTTGAGCAGTTTT-CCATCTGA-CC----TG-G--TG-TGGAGGAGGATGCC---CTCTGTAGATTGT-----C----CAAAGACATGTTTCAGCACGACG---GCAAAGAAAA---TG--CG-G-AGGATGTGCT-TGCATCAAGCACACAGTTTTGCTT-TTGACCACCGCGGACTTTTGACCAC-TGCGGATCCTGGAG-GA-GT---CAGCTGA-------TG---AA----CCGT--TAAA---CT---------CCCTT-CATAT-C-G-A-AA---TGGAAGGACT-GA--ATCA---TGAGTAGCTTTG-TGGAACATTCGATCTTTTCCCAAAGTCTTTAACAGACTATCTCAGCTGACAAGA-TCGAAGGCTTTTGTCAGAATGATGAAGGACACATACAAGGGGTAT----CACTGTTCTCTGGA-TTATTTT---GCTGGCCT--AGAGA-AAGG--GGCA--TGTCGATAATGGAGCGTTCCGATCTAAAG-CCACAG--T--G--T-TTTGGG-ATAGA--ttcaa
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gi|6 : taGTG--TGGTGCAAGGACACACCCCTGT-TTCACTCTGC-----T----TG----TG-ATGGGAA-AGGGGG---C---GGAAGA---TGATCC-GCCAAA-TTG-TATGGTGC-----------CTTG------------CATGT--------CCTCATGAAAA-----GAG-AA-GGTCACA-CTGA-------------G----CAGTTTCGA---GCTTG-AAGAGGCCCTT-TCTGC-T-GAC-GAGATCGAANGGA---GAAGGTCACACTGAGCAGTTTCGGTGGT-CATCCTATCCTTTCAAGGAG-CTTGAAGAGGCCCTTTCTGCTGACGATA-TCGAATGTCTTGGTCAGGTCAATGAAGGCAAGGTACAGGGGCCTC----TTCTGCTTCCTGCACTTTTGCTGCAGTTGTCTC--A-TGATGAAG--ATAG--TGTCGATGGTTGATTTCTCTGTTCGGAAT-CCACAT--T--GAAA-CTCGTG-GT--A--CAC-TAACC-C-AGCGA-GCTG-AC--GCAGgagaaggtcacactgagcagtttcggtggtcatcctatcctttcaaggagcttgaagaggccctttctgctgacgatatcgaatgtcttggtcaggtcaatgaaggcaaggtacaggggcctcttctgcttcctgcacttttgctgcagttgtctcatgatgaagatagtgtcgatggttgatttctctgttcggaatccacattgaaactcgtggtacactaacccagcgagctgacgcagtctcaacagggtgactcggggaaacgccttacctacgatgcttagcagcgagatgccccggtattgttgcaattgctgcgatctccctttgtcgttatataagatgatgataattgcatcacgcgtgtcgtgggtgacagaaccttccttccagcgcttgaggagaagctcgtgcaggttgaggaagaaagtgggcttggcacactggaaaacctcttccgggatgccgtaatttcctggagccttgccactggcagttttctaagcgttgtt
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gi|7 : tatgtgccaggcggtcgaccagcctctggagtccaacctgtgagtgggaggacagggcagcatcggtatttcccgcaacatcagtttacggaccttggtttgggctcacagacgagtgaggttgaacagcttgtcatcagagtgtgtgtggaggagaactccatcctctgatgaactgaaggggtaggacagcagcagggagaatataccaacaagtgtggtgcaaggacacacccctgtttcactctgcttgtgatgggaaagggggcggaagatgatccgccaaattgtatggtgccttgcatgtcctcatgaaaagagaaggtcacactgagcagtttcgagcttgaagaggccctttctgctgacgagatcgaanggagaaggtcacactgagcagtttcggtggtcatcctatcctttcaaggagcttgaagaggccctttctgctgacgatatcgaatgtcttggtcaggtcaatgaaggcaaggtacaggggcctcttctgcttcctgcacttttgctgcagttgtctcatgatgaagatagtgtcgatggttgatttctctgttcggaatccacattgaaactcgtggtacactaacccagcgagctgacgcagtctcaacagggATTA-----AGCCTA-GT-CCCT---------AGTCTAGCATATGTCGTCCATCCTTCGCTTCTATATCGCAGAGTGCTGAGGACGCAGGCT-TGAT-AG-ACCTTAAGCTTTGTGTT--TA--GT-GTCA-GG----TTCCTTG-TTATCCCACACTTTCTTTGTCAGCTT--------CGACATCACAGCAGCAGC-CTTGCCGATCTCAA--CATC---AAGT--GAAAGACTGT-----------C----G-GAGAT-----------G-T-------------G-ACAGCC-AGGAA-CTTGAATTTG--CAACAACTGCTAG--TGGCG--C-GCCATTGATTGAGG-TG---GA-GT--TG-G-----G--ATGTCCTGCCCCATGACCTC---TTTTCTTTG-ATGCTGATT-GTGAGACTGAAGTCATCACAAGCTTTG-GAGAAGTTGTCCATGAGAC---------GCTGGGGA-----CG-----------AT-------C---AT----AAGAGTGGCTTGCAAAA----------GT---GGCAACAT-CA------T----GAATAGCA-TATCTCTGA-G----GAGGACACGGGTGATTTTG------G--TG-TT----G--------G---CA--C--TGAGTCG-TTCAAGTTGAACAG-CTTGCCATAT-A-TT----GATGAGTA-TGCAGATAGACCCC---ATC------CGGGAAGATT----TGAATGCAT---GAAACAGGAGGAGTG---AGAATA---T---CC--CAAAA-GTG-T-TGGAGCTAGCACACAGCCTTGTTT-T--------ACA---------CCAC-TGAGAAT---CTGG-AA-GC---CT-C-----GG--ATGTCTCC----CCTT--CGAA--GCA-A-ACGATGCTTTTTCATGT-TAG-T-G----TGAAAGGA---CTTGATTAAGCTGA-AAGCTTTG-TGGG-CATCCAATCTTCTGTAGAAT-CTTGAACAA-CCATCTCTGCTAACAAGGGTCAAACGCCTTCGTCAAGTCGACGAAAGCCAGGTACAAAGGTTTG----CGCTGCTCTCTGCATTTTTCCTGGAGT--TCTC--ACGGA-GAAG--ATCA--TTTCagttttctaagcgttgtt
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blockSeqs : . T . . C . . . A . . G . TACA . . . . CT . CTTA . . G A T C . . A CTGT A . T G A . G . T . G G A G . . T . . . . . C . TAC . . .
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|19 : tggtaatttctagaggttgctccataagAGGGTGTC-----GATGGCTTTGCTGAGCTC--CA-TGAAGGAGGGCGGGGtgcagctcttcctttgtatgtttggtaacacctgcatcatcagcaaagtgaatgtccctgaccttgagctttgctttcaggcag
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gi|21 : AGTTGTGGGGGA-GATCCGATCTTCCCCAGAAG-TGTAAAAA--------------ACCAGA-TCGAATG------TCACGTCCATGAAGA-GACAAACAGTGGCTGCGTGGTTCTAGTCTCT-----TCTCCTGCAACTGTTCG--GGTGA-GAAG--ATAT--TGTCAATGGgagggggggggtgtctttcggaaagccttgaagaggaaatct
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gi|4 : tgtgaaaagacgcgagaatactcaggagcttgagaggacatccaatcctttgtagcagggtgaaaaggccttaccagctgaccaagtcaaaggcctttatcaagtcgatgaatgtgatatacagtgggtacttctgttcttggaacttctcctgcagttgccttagtgaaaaggccatgtcgatggttgacctttctcctttgaagctgcactgtgcctcagggtagaatcgctctgcaagtgctgcagcttgtttagtattacttTTCAGTCCGG--G-A-TTGAGTACCAGCTC-TACTGTACCTAAACAGATCGATTCGATAGCGGCAGTTCCT-GTTACAAATA--------CCGC-AG--GTAAA----------TTCT---GCGTTTGCCT---CT---------CCCAGTACT-GCCACAGATGTTACC-CTTTGTCGTCTGCGC-TG-TC-CCCCCCCC-C--CCACTG--GTCATCTC-TT----TTGCTT-TCACACAACTGAATACTG-GTCTTCACTGCGAGCCCCCAAATGTCTCGGTTA---GCAGCCAT------AGATTCAAGGTCGATGA-GGT--GGATGTA----GCCAGGTTTCAGATCTCTCTTGT-----ATACAACCTTGAAACTGAGGAGCGGTATGTAGGTTTGTCTAGTGCCG----GTAGCGAGCTCACCATACA--GAATGTCT----TTGGAAATTCGGCCATCCT-------------------GACCGAGGCAGCGTAG---ACGTC-TCTGAG-AGAGGAGTGC-AAACAGGCTTG---GGATT-TTTACTCTGGCAAGCACATCTTTGGTGGGGACACGGTCCTGCCAGGTGATGTCAAGGATCCTTACGAGACTGCACAGGTGGAAGGCATTC-----AGTCTACGT-TCTG---------GATG-AGTATTCAGAGTTCTTGACTTGCTGCTGTAGAGGAGAGTGCTTAGAATACAGGCT-TGGT-AC-ATTTTCATCTTTGTGTCGGTA--GTCAGAATGG----T-----G-TTGTTCCACACCCTCTTTGCCAGGCG--------TGCCATTGCCGTTGCTGC-TTTGCCGATACGAG--TGTT---GATTTCGGT-GTCCAG-----------C----GAGAGGTTGCTAGATATGG-C-------------G-G-AAACCAGGTA-AGTAAAATATTCCACCACCT-CCAGGGT-GCTATCGCC---GATGGTCA-TGCACGG-GAT-GT--TACTG--A----CTATTTGAGCAATGATGTTA-GTTTTTCT-GAAGGCT-ATT-GTC-GTTCTAACTCACCACATACGTGA-GCGAAGTGATC-----GAT---------G------AGT---CG-----------TTGTAGGGAC---TTTC--GAGAGTGG------AA-AGC--------CAGGGCAGCGT--------------------CATCTCCTTGATGCCTTGCGGAC---------TTTG------C--TCCTA----GC-------G---CG--C--AGA--CTGGTTAGGTTGAAGAGGCTA-CTGCCTC--TC----CGTG--TG-TGAATGTAGACGTC---GTCTTCACTCTGG-----T----TAAAGGTATATTTC--C-----------------GA---TA--CC-G-AAGA-GGG-T-TTGGACGAGGACACATCATTGTTT-T-------T-CG---------CTGC-TGAAGAT---AGGG-tatttcctccatgagatgtagggggttggtgctgacaacgatctctctgaagtaaagttcctgatagtgtttggtccatctttccatctgctttcctctatctatgataatgtcgctgaaggctgacttcaaaggtgtgatcttggtaacgtttggaccaacgtctaacgtggtgcgaatgttggcacagtcagtagagagctgggtgctctggtaaagattcagccattagtcgttggtgctgcgccagcctatccatttgggtgtcgtttctggccttcctgagtatagcaagtgtcttctccgaaggctctctcttataccactagttactagtaagccatgctttgattttagctgcgaatgctggctcaagttttgtgattccagcttcaaaccagtctggatttggcctctctctctcttgccaaaggtgtccatggcggagttgtagatggcgtcacgaatgcgattccacatctcttcagcactgtttatagggcagtctcgaagggcctcttctacaaaatcagcacttgcacaggtctggtatttttgtcctggctgtgttggtatatggacatcatttcttgcatggagtgttagatatttgcttgggatgaacacgtaccttgcgaccaaccattgagtaatcaatgtcacagccactgttgtggtaactgtgggttttg
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Unaligned ( gi|28 ): TGATCCGCCAAACTGTATGGTGTCTTGCATGTCCTCATGAATCACAATCACGTTGAGCAG