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consensus : GGCCCGGTCCCAC-------NGG--------CCGA------------GTATGCAA-AA-----GG---------ACACAG----CGGACGAGC--AAA-ATTT-CG-GGG-TT----GGCTC----------CAT--------------CCG----------CTCCAGA-AATGGA-------C--AAAATTGGC-----GA----------A-AACAG--------------AA----------CGGA-CG-AGGG----T-A--G-------TA----TGTAGCGGGGATGTTAAACGGCTGTTCATC--GGAA-GCC--T--AGC--G-A---------TGG------------AAGTGGATGACAGCTC-C-----------GACATAC-------TCCAGACAT----CCTAAATAATACGAGAT----ACATCCCA-----G-----ATAC-----AAACGCT-TTGTCCGTTT-------------------TGAATAC-----TT--TATATA-----CG---AGA-TGCATA--------------CGTT----CCCTT---ATTTC----C-GTGC-TACTAACGATGTATAGACGTT-CCA-TGTAC-----CTTATCT-TCCT-CCCTCTTTCCGT-TTTT-CAGCTG-C-AGCGGAT-GTGAGT--------TGC---GA-GGATG-CAGA--C-GAGAGGAT---ACAGC-GGACGTTT-AACGG-A-TGATAACGGACATAGAACG-TTTGCTGC--T-CG--TATATGTCGC--GGATTGACATCG-TA-CACGGC-------GGA----AAGT-TCATCC------------GTTCTA-----AAAA--TTTC--------------GTGCT-----GGATAGAG---CGT---ATGAAATA-------C-GTA--T------------GC-A-ATG-A-----G----TAC-ACA-TG--------ACGGA-TGCAT-AGCGTTTTCCAACG-GATGGCA-----------AGA-T-TT-----CATTT---------N----A-------CATCCT---------CTTTGCATCCGTAA-GTGCAGTAGGACC-GGGGCT
Reference ( gi|2 ) : GGCCCGGTCCCAC-------AGG--------C---------------GTATGCAA-AA-----GG---------ACACAG----CAGACGAAC--AAA-ATTT-TG-GAG-TT----GGCTC----------CAT--------------CCG----------CTCCAGA-AATGGA-------C--AAAACTGGC-----GA----------A-AACAC--------------AA----------CGGA-TA-AGGG----T-A--G-------TA----TGTAGAGGGGATGTTAAACGACTGTTCATC--GGAA-GCC--A--AAC--G-----------TGT------------AAGTGGATGACAGCTC-C-----------GACATAC-------TCCAGACAT----CCTAAACAATACGAGAT----ACATCCCA-----G-----ACAC-----TAACGCT-TTGTCCGTTT-------------------TGTATAC-----TT--TATATA-----CG---AGA-TGCATG--------------CG--------------ATTTA----T-GTGC-TATTAACGATGTATAGACGTT-CCA-TGTAC-----CTTATCTGTCCT-CCCTCTTTCCGT-TTTT-CAGCTG-C-AGCGGAT-GCAAGT-------ATGCCCAGA-GGATG-TAGAGTCTGAGAGGAT---ACAGC-GGACGTTT-AACGG-A-TGATAACGGACATAAAACG-TTTGTTGC--T-CGAATATATGTCGT--GGATTGACATCG-TA-CACGGC-------GGA----AAGT-TCATCC------------GTTCTA-----AAAA-CTTTT--------------GTGCT-----GGGTAGAG---CAT---ATGAAATA-------A-ATA--T------------GC-A-ATG-A-----G----TAT-ACA-----------ACGGA-TGCAT-AGCGTTTTCCAACG-GGTGGCA-----------A------------CA------------G----A-------CATCCT---------CTTTGCATCTGTAA-GTGTAGTGGGACC-GGGACT
gi|24 : GGCCCGGTCTCAC-------TGG--------C---------------CGATG------------G---------ACACAA----CGGACGAGC--AAA-ACTT-CG-GGGGTT----GGCTC----------CAT--------------CCGTTTTCATCGGCTCCAGA-AATGGA-------C--AGAATTGGC-----GA----------A-A
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gi|8 : tattttgtctccatccgtagttaatcCCCGTTCCCAC-------AGG--------CCAATAGACACAAAACGTATGCAACAA-----GG---------ACACAG----CGGACGAGC--AAA-ATTT-CA-GGG-TT----GGCTC----------CAT--------------CCGTTTTCATCCGCTCCAGA-AATTGA-------C--AAAATTGGG-----GA----------A-AACAG--------------AAAGGAAAAGAACGGA-CG-AGGG----T-A--G-------TA----TGTAACGGGAATATTTAACGGATGTTCATC--GGAA-GCC--T--AGC--GGA---------TGG------------AAGTGGATGACAGCTC-C-----------GACATAC-------TCCAGACAT----CCTAAAT-ATACGAAAT----GCATCCCA-----
gi|22 : CGGTCCAAC-------CGA--------CTGAT-----------GTACACAA-AACGCAAGG---------ATAAAA----CGGACGAGC--AAA-GTTT-CA-GGG-TT----GGCTC----------CAT--------------CCA----------TTC---A-TTTTCATCCGCTCC--AAAATTGGC-----GA----------A-AACAG--------------AA----------CGG
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gi|14 : cattcatacattaaaggtccggtcccactggccgatggacacaaaacaaaaAA-AA-----GG---------ACACAG----CAGACGAGC--AAA-ATTTCTG-GA--TT----GACTCCATCCGTTTTCAT--------------CCG----------CTTCAGA-AAGGGG-------C--AAAATTGGCTAAATTA----------A-AACAG--------------AA----------AGAA-CA-GAAGAATTT-A--G-------TA----TTTAGCCGGGAAGTTAAACGGTTGTTCATC--GGAA-cttcagggttgcaatgaaaatattggaggaaaaaatatagacaaaga
gi|12 : agaccaggtcccacgggctgatggaccaaacacgtttgaaAG----CGGACGAGCGAAAA-ATTT-CGTGAG-TTAATTGGCTC----------CATCCGCTTATTTCAAGCCG----------CTCCAAACAATGGA-------CCAAAAGTTGAC-----GAAAAAGTTACGA-AACACGGTACGGGGGAAAGAA----------CGGACTATAGGG----T-AATA-------TA----TGTAGTGTGGA--------GA-TGTTCATCAGGAAA-GCC--T--AGC--GAATGAGCGGACTGG------------AATTGGATG-CAGCTC-C-----------G-TATACA------TCTCGACt
gi|19 : aAAA-AATTG--------C--AAAACAGAA-----CA----------G-AAAAG--------------AA----------TGAA-CA-AGGG----T-A--G-------TT----AGTAGTGGGAATGTTAAACGGCTAATCATC--GGAA-ACC----------------------T---------------AGTGGATGACAGCTC-C-----------GACATAC-------TCCAG
gi|16 : ggacaaaattgatgA----------A-AACAG--------------AA----------TGGA-AA-AGAA----C-A--GACGAGGGTA----TGTTGCGGGGATGTTAAACAACTGTTCATC--GGAA-TCC--T--AGC--GGA---------TGG------------AAGTGGATGACAGTTT-CTACATAATCTAAACATAC-------TCCAGACAT----CCTAAAT-ATACTAGAT----
gi|4 : -AACAG--------------AA----------CGGA-CG-AGGGG---T-A--GGATG---TACGGGTGTAGCGGGAATGTTAAACGGCTGTTCATC--GGAA-GGC--T--AGT--GGA---------TGG------------AAGTGGATGACATCTT-C-----------CACATAC-------CCCTGACAT----CCTAAATA-TACAAAAT----ACATCCCA-----G-----ATGT-----AAACACT-TTTTCCGTTT-------------------TGAATAC-----TT--AATATA-----CG---AGA-AGCATA--------------CGCTTACTCCCTTTCTATTTC----C-GTGC-CACTGACGATGTATAGACGTT-ACA-TGTAC-----CTCATCTGTCCT-CCCTCT--CCGT-TTTT-CAGCTG-C-AGCGGAT-GTGAGT--------TGC---GT-GGATG-T-----CCAA-AGGAT---ACAGC-GGATGTTT-AACGG-A-TGATAACGGACTTGAAAAG-TTTGTTGC--T-TG--TATACGTCGC--GGATTGACATCG-TG-CACGGC-------GGA----AAGT-TTATTC------------GTTCTA-----AAG---TTTT--------------GTGCgtaaagcgatggcaagattttttttttacgtttt
gi|1 : --------------AA----------CGGA-CG-AGGG----TTAT-A-------TA----TGTATCGGGGATGTTAAACGGATCTTCATC--GGAA-GCT--T--AAC--G-----------GAT------------GAATGGATGGCAGCTC-C-----------GACATACGCCAGAGTCCAGATAT----CCTAAATA--------T----ACATCCCA-----G-----ATAC-----GAACGCT-TTGTCCGTTT-------------------TGAATACATGTACT--TATATAATAAACG---AGA-TGCATGTATA----------CGTTTCAGCCTTTCT-ACTTG----TCGTGC-TAC-AAAGACGTGTAGACGTT-CCA-TGTACATGGTCTTATTTTTCC--CCCTCTTTCCGTCTTTT-TAGCTGAC-CTCGGAT-GTGAGTTTTGAGGATGCCCAGC-GGATGCCAGA----GAG-GGATATAACAGC-GGCTGTTTAAACGG-ATTGATAACGGACAT-AGACGTTTTGCTGCAAT-CCTATA-ATGTCGC--GGATTGACATCGCTATCACTGCG------GGA----AAGT-TCAATC------------GTTCTT-----AAAA-ATTTC--------------ATGCagcttgaaactttttatgcggatgaaatcacagtggacggatgctcgatggatagagcgtatgaaatacgtttgcaatgagtacacaacggatgcacggcgttttccaacggatggcaagattttttttttacgttttacatcctcttagcatccacaagtgcagtaggactg
gi|27 : A----TGTAGCGGGGATGTTAAACGGCTGTTCAGC--GGGA-TCCTTA--AGCTGA-----------TGG------------AAGTGGATGACAGCTC-C-----------AACATAC-------CCagctcaaattgtgagatgaaacgcacagtggacggaagatcgacggcagagatctaatgaaataacatatgcattgaagtatatattatcacggagtgcattagcgtttgtcaacgcgatggcaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttatcttttacatcctctttgcatccctaatttgcagtgaccgggcct
gi|3 : TAAAAAAGTGTT-ATC--AGAATGTT--AGCAAT--G--------------------------AAGTGGATGACAGCTC-------------GACATACA------TCCAGACAT----CCTAAATA-TACGATAT----ACATCCCAAGCAAG-----ATAC-----AAAAAATCTTGTCCGTTT-------------------CGAATAC-----TT--TATAT-------G---AGA-TGCATA--------------CGTTACTCTTTCT---ATTCA----C--TGCGTACTAACCATGTATAGGCGCT-CAAATGT-----------------TT-CCCTCTTTCCTT-TTTTTCAG-TG-CCAGCGGTTTGTAAGT--------TGC---GATGGATG-CA-------AGAG-AT---ACAGCCAGACGTAT-AACGATA-T-ATAACGGGCATAGAATG-TTTTTTGC--TGC---TATATGCTGTTAGAACTAA--TCT-TA-CACGGC-------GGA----AAGTCTCGTCTTATCTAAATTTTGTTCCAGCGTCAATA-CTTTTTGCTCAGAGGCGGGATGCTCGCATGGG-AAAGAATCGT---ATGAAATA-------C-GTACAT------------GCGA-ATG-A-----GCACGTATCACA-----------ACGGA-TG-AT-AGCG-TTTCCGACT-GGTGACA-----------AGACTATT-----TA------------T----A-------CGTTCTAATCAGCTACTTTGCATCCGT-A-GTGCA-T-GGACCAGGGGCT
gi|11 : gctaaaacgaacggaaaaacgacgagggtattgtagcgggatatacatcgataacagtgaataaagtataataaaACGGTTATTCATC--AGAA-GCC--T--AGC--G-----------TATGAACATGGATGGAAGTGGATGACAGGTC-C-----------GACATAC-------TCCAGACAT----CTTAAATA-TACGAGAT----ACATCCCA-----G-----ATAC-----AAACACT-ATGT----TT-------------------TG----C-----TT--TA---A-----CGCTTACA-TTCTTT--------------CT--------------ATTTC----C-GGTC-TATGAACGATGTTTAGACGTT-CCA-TGTTC-----CTTATCTTTCCT-CCCCCTTTCCG--ATTT-CAGCTG-T-AGCGGAT-Gt
gi|13 : -----------TGG------------AAGTGGATGACAGCAC-C-----------GACATAC-------CCCAGGCAT----CCCAAAC-ATACGAGAT----ACATCCTA-----AATTTTATAC-----AAATGCT-TTGTCCGTTT-------------------TTAATAC-----TT--TATATA-----GA---AGCTTACACC--------------CT--------------TTTTAGTTCT-GTGC-TACAAACGATATATAGACATTCCCA-TGTAC-----CTTATC-GTTCTAACCTCTTTCCGC-TTTT-CAGt
gi|10 : ggaCTCTC-----------GACATAC-------TCCAGACATGTATCCTAAATA-TACGAGATCTATACATTCCA-----G-----ACAC-----AAACGCT-TTCTTTGTTTTGAATACTATATATATACATGTATAC-----TTTATATATA-----CG---AGA-TGCATA--------------TGTTTACATCCTTTCTATTTC----C-GTGT-TACTAACGATGTATAGACGTT-CCA-TGTAC-----CTAA------------TTTTTGCA----TT-CAGCTG-C-AGCAGAT-GCGAGT--------TGC---GA-GGATG-CA------GAGAGGAT---ACAGC-GGA
gi|21 : ataAGAT----GCATTCCA-----G-----ATAC-----AAATGGT-TTGTCCGTTT-------------------TGAATAC-----AT--TATATA-----CG---AGA-TGAATAAGCTACCATCCTTTCT--------------ATTTC----T-ATGC-TACTACTGATGTATAGACATT-CCA-TGTAC-----C
gi|6 : TCCCC-----G-----ATACATATATAAC-CC-TCGTCCGTTT------------------------------------ATAAA-----CG---AGA-TGCATGTATCAGCCTTT---CT--------------ACTT-----C-GTGC-TACCAAAGACGTGTAGAC-TT-CCA-TGTAC-----C------------CCCTCTTTCCGT-TTTT-TAGCTG-C-CTCGGAT-GTGAGTTTTGAGGATGCCCAGC-GGATG-CAGAG------AGGAT---ACAGC-GGCTGTTT-AACGG-A-TGATAACGGACATAGAACG-TTTGCTGC--T-C--CTATATGTCGC--GGATTGACATCG-TA-TACTGC-------GGA----AAGT-TCATCC------------GTTCTA-----AAAA--TTTC--------------ATGC------------AG---C------TCAAAT-----------TG--T------------GC-AGATGAA-----G----T-C-ACAGTGG-------ACGGA-TG
gi|9 : TTCT-CCCTCTT-CCAT-TTTT-CAGCTG-C-----------------------TGC-------GAT--T-GAGT-TGAGAGGAT---ACAGC-AGACGTTT-AATGG-A-TGATAACGGACATAGAATG-TTTGCTGC--T-CG--TATGTGTCGA--GAATTGACATCG-TA-CATGACGGAAACAGGA----AAGT-TCATCT------------GTTTTA-----AAAG----TT--------------GTGCatcgacgga
gi|7 : t-TTTT-CAGCTG-C-AGCGGAT-GTGAGT--------TGC---GA-GGATG-C----CCAGAGAGGAT---ACAGT-GGACGTTT-AACGG-A-TGATAACAAACATAGAAAG-TTTGTTGC--T-CG--TATAAGTCGC---AATTGATATCG-TA-CACGGC-------GGA----ATGT-TCATTC------------GTTCTA-----AAAACCTTTT--------------GCGC------GGATTTAA---CAC---ATGTAACAGTGGACGA-ACG--TTCGATGGAAAGAGCGA-ATG-AAATACG----TAT-GCAATGAGTACACAACGGA-TGCAT-AGCGTTTTCCAACG-GATGGCA-----------agctcaaaactttttgcgcagatgaaatcacagaagacggatgctcgatggatagggagtatgaaatatgtatgaaatgagta
gi|17 : G-C-AGCGGTT-GTGAGTTATGAGAATGTCCAGA-GAATG-------CTGAGAGGAA---ACAGC-AGACGTTT-AATGG-C-TGATAACGGACGTACAATG-TTTGTAGC--T-CG--TATATGTCAG--GAATTGACATCG-TA-CACAGT-------GAAAATTAAGT-TTATCC------------GTTCTT-----AAAG-TTTt
gi|5 : G-C-AGCGAAT-GTGAGT--------TGC-------GA----AGAGGCAGAGAGAAT---ACAGT-GGACATTT-AACGG-A-TGATAGCAGACATAGAACG-TT
gi|4 : cT-----GGATAGAG---CGT---ATGAAATA-------C-GTT--T------------GC-A-ATG-A-----G----TAC-ACA-----------ACGGA-TGCAC-GGCGTTTTCCAACG-GATGGCA-----------A------------GATTTTTTTTTTACGTTTTA-------CATCCT---------CTTAGCATCCACAA-GTGCAGTAGGACT-Gaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggtgctttccaacggatggcaagatttttttaaacaaatttaatacatcctctttgcatacgtaagtgcagtgggaccaggg
gi|9 : aacagaacggacgaggggtaggatgtacgggtgtagcgggaatgttaaacggctgttcatcggaaggctagtggatggaagtggatgacatcttccacatacccctgacatcctaaatatacaaaatacatcccagatgtaaacactttttccgttttgaatacttaatatacgagaagcatacgcttactccctttctatttccgtgccactgacgatgtatagacgttacatgtacctcatctgtcctccctctccgtttttcagctgcagcggatgtgagttgcgtggatgtccaaaggatacagcggatgtttaacggatgataacggacttgaaaagtttgttgcttgtatacgtcgcggattgacatcgtgcacggcggaaagtttattcgttctaaagttttgtgcagcttgaaactttttatgcggatgaaatcacagtggacggatgctcgaT-----GGATAGGG---AGT---ATGAAATA-------T-GTA--T------------GA-A-ATG-A-----G----TA
gi|18 : tttctccctcttccatttttcagctgctgcgattgagttgagaggatacagcagacgtttaatggatgataacggacatagaatgtttgctgctcgtatgtgtcgagaattgacatcgtacatgacggaaacaggaaagttcatctgttttaaaagttgtgcagctcaaaactttttgcgcagatgaaatcacagaagacggatgctcgaT-----GGATAGTG---CGC---TTGAAACT-------C-GTA--T------------GC-A-TTG-C-----G----TAC-ACA-----------GCGGA-TGCAT-AGCGTTATCTAACG-GATGGAAAGACTTTTTTGA------------CATTT---------T----A-------CATCCT---------CTTTGC
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gi|1 : cgcagcgaatgtgagttgcgaagaggcagagagaatacagtggacatttaacggatgatagcagacatagaacgttaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnng----A-------CATCCT---------CTTTGCATCCCTAATTTGCAGT--GACC-GGGCCTg
gi|28 : aacggacgagggttatatatgtatcggggatgttaaacggatcttcatcggaagcttaacggatgaatggatggcagctccgacatacgccagagtccagatatcctaaatatacatcccagatacgaacgctttgtccgttttgaatacatgtacttatataataaacgagatgcatgtatacgtttcagcctttctacttgtcgtgctacaaagacgtgtagacgttccatgtacatggtcttatttttccccctctttccgtctttttagctgacctcggatgtgagttttgaggatgcccagcggatgccagagagggatataacagcggctgtttaaacggattgataacggacatagacgttttgctgcaatcctataatgtcgcggattgacatcgctatcactgcgggaaagttcaatcgttcttaaaaatttcatgcagctcaaattgtgagatgaaacgcacagtggacggaagatcgacggcagagatctaatgaaataacatatgcattgaagtatatattatcacggagtgcattagcgtttgtcaacgcgatggcaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttatcttttATCCT---------CTCAGCATCCGTAA-GTGCAGTAAGACC-GGGGCT
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gi|4 : --------------------T--------GGATAGAGCGT---AT--GAAA-TA--CGTTTGC-A-ATG-A-GTA---------CA-----------------CA----A---CGGA-TGCAC-GGCGTTTTCCAACG-GATGGCAAGATTTTTTTTTTAC---------GTTT-TA--CATCCT---------CTTAGCATCCACAA-GTGCAGTAGGACT-tcgatggatagagcgtatgaaatacgtttgcaatgagtacacaacggatgcacggcgttttccaacggatggcaagattttttttttacgttttacatcctcttagcatccacaagtgcagtaggactg
gi|5 : aacagaacggacgaggggtaggatgtacgggtgtagcgggaatgttaaacggctgttcatcggaaggctagtggatggaagtggatgacatcttccacatacccctgacatcctaaatatacaaaatacatcccagatgtaaacactttttccgttttgaatacttaatatacgagaagcatacgcttactccctttctatttccgtgccactgacgatgtatagacgttacatgtacctcatctgtcctccctctccgtttttcagctgcagcggatgtgagttgcgtggatgtccaaaggatacagcggatgtttaacggatgataacggacttgaaaagtttgttgcttgtatacgtcgcggattgacatcgtgcacggcggaaagtttattcgttctaaagttttgtgcagcttgaaactttttatgcggatgaaatcacagtggacggatgctcgaG-C-AGCGAAT-GTGAGT-TGC---GA-AGAG-----G--C-----AGA------------GA---GAAT---ACAGT-GGACATTT-AACGG-A-TGATAGCAGACATAGAACG-TT
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gi|6 : cgcagcgaatgtgagttgcgaagaggcagagagaatacagtggacatttaacggatgatagcagacatagaacgttaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngTCCCC-----G-----ATACATATATAAC-CC-TCGTCCGTTT----------------------------------ATAA-----A--CGAGATGC----ATGTATCAG--C----CT---T---T---CTACT-TCGTGC-TACCAAAGACGTGTAGAC-TT-CCATGTAC-----C-------------CCCTCTTTCCGT-TTTT-TAGCTG-C-CTCGGAT-GTGAGT-TTT---GA-GGAT-----G--CCCAGCGGA------TGCAGAGA---GGAT---ACAGC-GGCTGTTT-AACGG-A-TGATAACGGACATAGAACG-TTTGCTGC--TCC--TAT-ATGTCGC--GGATTGACATCG-TA-TACTGC-------GGA----AAGT-TCATCCGTTC-TAAA---------------AA--T--TTCATGC-----------------------------------AGC------T--CAAA-T-----TGTGC-AGATGAA-GT----------CA-----------------CAGTGGA---CGGA-TG
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gi|9 : -T-TTCT-CCCTCTT-CCAT-TTTT-CAGCTG-C-TGCG-AT--TGAGT-TG---------------------------------------AGA---GGAT---ACAGC-AGACGTTT-AATGG-A-TGATAACGGACATAGAATG-TTTGCTGC--TCG--TAT-GTGTCGA--GAATTGACATCG-TA-CATGACGGAAACAGGA----AAGT-TCATCTGTTT-TAAA---------------AG--T--T--GTGC--------------------
gi|9 : --------------------T--------GGATAGGGAGT---AT--GAAA-TA--TGTATGA-A-ATG-A-GTA---------agctcaaaactttttgcgcagatgaaatcacagaagacggatgctcgatggatagggagtatgaaatatgtatgaaatgagta
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Reference ( family-1055 ) : GGCCCGGTCCCACTGGCCGATGGAC------CAAA-ACGTATGC-AA-AA--GG---------ACACAGCGGACGA-GC--AAAATTTCG-GGG-TT----GGCTC----------CAT----------CCG----------CT--------------CCAGA-AATGGA-------C--AAAATTGGC-----GAA-AA-----------------C-------AGAA----------CGGA----------C-GA--GGG---T-A-G----TA----T--GTAGCGGGGATGTTAAACGGCTGTTCATCGG--AAGCCT--AGC-G-----------A----------TGGAAGTGGATGACAGCTC-C-----------GACATAC-------TCCAGACAT----CCTAAATAATACGAGAT----ACATCCCA-----G-----ATACA-----AACGCT-TTGTCCGTTTTGAATA-------------------C-----TTTATAT-----A--CGAGATGC----ATACGTT----C----CC---T---T---AT-TT-CCGTGC-TACTAACGATGTATAGACGTT-CCATGTAC-----CTTATC-T-TCCT-CCCTCTTTCCGT-TTTT-CAGCTG-C-AGCGGAT-GTGAGT-TGC---GA-GGAT-----G--C-----AGA------TG---AGA---GGAT---ACAGC-GGACGTTT-AACGG-A-TGATAACGGACATAGAACG-TTTGTTGC--TCG--TAT-ATGTCGC--GGATTGACATCG-TA-CACGGC-------GGA----AAGT-TCATCCGTTC-TAAA---------------AA--T--TTCGTGC--------------------T--------GGA------TAGAGCGT---AT--GAAAT--------A--CGTATG--CA-ATG-A-GTA---------CA-----------------CA----C----GA-CGGA-TG-CAT-AGCGTTTTC----------CAACG-GATGGCAAGACT-TTT-TT---C-------------A------------------------TTT--T-------------ACATC--CT-CTTTGCATCCGTAA-GTGCAGTGGGACC-GGGGCT
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gi|10 : aacggacgagggttatatatgtatcggggatgttaaacggatcttcatcggaagcttaacggatgaatggatggcagctccgacatacgccagagtccagatatcctaaatatacatcccagatacgaacgctttgtccgttttgaatacatgtacttatataataaacgagatgcatgtatacgtttcagcctttctacttgtcgtgctacaaagacgtgtagacgttccatgtacatggtcttatttttccccctctttccgtctttttagctgacctcggatgtgagttttgaggatgcccagcggatgccagagagggatataacagcggctgtttaaacggattgataacggacatagacgttttgctgcaatcctataatgtcgcggattgacatcgctatcactgcgggaaagttcaatcgttcttaaaaatttcatgcagctcaaattgtgagatgaaacgcacagtggacggaagatcgacggcagagatctaCTCTC-----------GACATAC-------TCCAGACATGTATCCTAAATA-TACGAGATCTATACATTCCA-----G-----ACACA-----AACGCT-TTCTTTGTTTTGAATACTATATATATACATGTATAC-----TTTATAT-----ATACGAGATGC----ATATGTT----TACATCC---T---TTCTAT-TT-CCGTGT-TACTAACGATGTATAGACGTT-CCATGTAC-----CTAA-------------TTTTTGCA----TT-CAGCTG-C-AGCAGAT-GCGAGT-TGC---GA-GGAT-----G--C-----A---------G---AGA---GGAT---ACAGC-GGA
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gi|4 : gctaaaacgaacggaaaaacgacgagggtattgtagcgggatatacatcgataacagtgaataaagtataataaataaaaaag-AA-----------------C-------AGAA----------CGGA----------C-GA--GGGG--T-A-GGATGTACGGGT--GTAGCGGGAATGTTAAACGGCTGTTCATCGG--AAGGCT--AGT-GG----------A----------TGGAAGTGGATGACATCTT-C-----------CACATAC-------CCCTGACAT----CCTAAATA-TACAAAAT----ACATCCCA-----G-----ATGTA-----AACACT-TTTTCCGTTTTGAATA-------------------C-----TTAATAT-----A--CGAGAAGC----ATACGCTTACTC----CC---T---TTCTAT-TT-CCGTGC-CACTGACGATGTATAGACGTT-ACATGTAC-----CTCATC-TGTCCT-CCCTCT--CCGT-TTTT-CAGCTG-C-AGCGGAT-GTGAGT-TGC---GT-GGAT-----G--T--------------CC---AAA---GGAT---ACAGC-GGATGTTT-AACGG-A-TGATAACGGACTTGAAAAG-TTTGTTGC--TTG--TAT-ACGTCGC--GGATTGACATCG-TG-CACGGC-------GGA----AAGT-TTATTCGTTC-T-AA---------------AG--T--TTTGTGCAGCT----------------T--------GAAACTTTTTAT-GCGG---AT--GAAATCACAGTGGA--CGGATGCTCG-ATG-G-ATA---------------------------------------GAGCGTA-TGAAAT-A-CGTTTGCAATGAGTACACAACG-GAT-GCACGGCG-TTT-TC---CAACGGATGGCAAGA------------------------TTT--TTTTTTTACGTTTTACATC--CT-CTTAGCATCCACAA-GTGCAGTAGGACT-t
gi|5 : G-C-AGCGAAT-GTGAGT-TGC---GA-AGAG-----G--C-----AGA------------GA---GAAT---ACAGT-GGACATTT-AACGG-A-TGATAGCAGACATAGAACG-TT
gi|5 : cGTGCTTTC----------CAACG-GATGGCAAGATT-TTT-TTAAAC-------------AAA----------------------TTTAAT-------------ACATC--CT-CTTTGCATACGTAA-GTGCAGTGGGACC-AGGGaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggtgctttccaacggatggcaagatttttttaaacaaatttaatacatcctctttgcatacgtaagtgcagtgggaccaggg
gi|6 : cgcagcgaatgtgagttgcgaagaggcagagagaatacagtggacatttaacggatgatagcagacatagaacgttaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngTCCCC-----G-----ATACATATATAAC-CC-TCGTCCGTTT----------------------------------ATAA-----A--CGAGATGC----ATGTATCAG--C----CT---T---T---CTACT-TCGTGC-TACCAAAGACGTGTAGAC-TT-CCATGTAC-----C-------------CCCTCTTTCCGT-TTTT-TAGCTG-C-CTCGGAT-GTGAGT-TTT---GA-GGAT-----G--CCCAGCGGA------TGCAGAGA---GGAT---ACAGC-GGCTGTTT-AACGG-A-TGATAACGGACATAGAACG-TTTGCTGC--TCC--TAT-ATGTCGC--GGATTGACATCG-TA-TACTGC-------GGA----AAGT-TCATCCGTTC-TAAA---------------AA--T--TTCATGC-----------------------------------------AGC------T--CAAAT-------------TGTG--CAGATGAA-GT----------CA-----------------CAGT--G----GA-CGGA-TG-
gi|7 : -TTTT-CAGCTG-C-AGCGGAT-GTGAGT-TGC---GA-GGAT-----G--C-----CCA-------G---AGA---GGAT---ACAGT-GGACGTTT-AACGG-A-TGATAACAAACATAGAAAG-TTTGTTGC--TCG--TAT-AAGTCGC---AATTGATATCG-TA-CACGGC-------GGA----ATGT-TCATTCGTTC-TAAA---------------AACCT--TTTGCGCGGATTTAACACATGTAACAGT--------GGA------C-GAACGTTCGATG-GAAAG--------AG-CGAATG--AA-ATA-C-GTATGCAATGAGTA-----------------CA----C----AA-CGGA-TG-CAT-AGCGTTTTC----------CAACG-GATGGCAatcgacgga
gi|8 : CCCGTTCCCACAGGCCAATAGACA-----CAAA-ACGTATGC-AACAA--GG---------ACACAGCGGACGA-GC--AAAATTTCA-GGG-TT----GGCTC----------CAT----------CCGTTTTCATCCGCT--------------CCAGA-AATTGA-------C--AAAATTGGG-----GAA-AA-----------------C-------AGAAAGGAAAAGAACGGA----------C-GA--GGG---T-A-G----TA----T--GTAACGGGAATATTTAACGGATGTTCATCGG--AAGCCT--AGCGG-----------A----------TGGAAGTGGATGACAGCTC-C-----------GACATAC-------TCCAGACAT----CCTAAAT-ATACGAAAT----GCATCCCA-----t
gi|9 : -T-TTCT-CCCTCTT-CCAT-TTTT-CAGCTG-C-TGCG-AT--TGAGT-TG---------------------------------------AGA---GGAT---ACAGC-AGACGTTT-AATGG-A-TGATAACGGACATAGAATG-TTTGCTGC--TCG--TAT-GTGTCGA--GAATTGACATCG-TA-CATGACGGAAACAGGA----AAGT-TCATCTGTTT-TAAA---------------AG--T--T--GTGC--------------------
gi|9 : --------------------T--------GGA------TAGGGAGT---AT--GAAAT--------A--TGTATG--AA-ATG-A-GTA---------agctcaaaactttttgcgcagatgaaatcacagaagacggatgctcgatggatagggagtatgaaatatgtatgaaatgagta
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gi|10 : aacggacgagggttatatatgtatcggggatgttaaacggatcttcatcggaagcttaacggatgaatggatggcagctccgacatacgccagagtccagatatcctaaatatacatcccagatacgaacgctttgtccgttttgaatacatgtacttatataataaacgagatgcatgtatacgtttcagcctttctacttgtcgtgctacaaagacgtgtagacgttccatgtacatggtcttatttttccccctctttccgtctttttagctgacctcggatgtgagttttgaggatgcccagcggatgccagagagggatataacagcggctgtttaaacggattgataacggacatagacgttttgctgcaatcctataatgtcgcggattgacatcgctatcactgcgggaaagttcaatcgttcttaaaaatttcatgcagctcaaattgtgagatgaaacgcacagtggacggaagatcgacggcagagatctaCTCTC-----------GACATAC-------TCCAGACATGTATCCTAAATA-TACGAGATCTATACATTCCA-----G-----ACACA-----AACGCT-TTCTTTGTTTTGAATACTATATATATACATGTATAC-----TTTATAT-----ATACGAGATGC----ATATGTT----TACATCC---T---TTCTAT-TT-CCGTGT-TACTAACGATGTATAGACGTT-CCATGTAC-----CTAA-------------TTTTTGCA----TT-CAGCTG-C-AGCAGAT-GCGAGT-TGC---GA-GGAT-----G--C-----A---------G---AGA---GGAT---ACAGC-GGA
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gi|28 : ATC--CT-CTCAGCATCCGTAA-GTGCAGTAAGACC-GGGGCT
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gi|5 : G-C-AGCGAAT-GTGAGT-TGC---GA-AGAG-----G--C-----AGA------------GA---GAAT---ACAGT-GGACATTT-AACGG-A-TGATAGCAGACATAGAACG-TT
gi|5 : cGTGCTTTC----------CAACG-GATGGCAAG------------------------ATT-TTT-T--TAAAC-------------AAATTTAA-----------TACATC--CT-CTTTGCATACGTAA-GTGCAGTGGGACC-AGGGaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggtgctttccaacggatggcaagatttttttaaacaaatttaatacatcctctttgcatacgtaagtgcagtgggaccaggg
gi|6 : cgcagcgaatgtgagttgcgaagaggcagagagaatacagtggacatttaacggatgatagcagacatagaacgttaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngTCCCC-----G-----ATACATATATAAC-CC-TCGTCCGTTT----------------------------------ATAA-----A--CGAGATGC----ATGTATCAG--C----CT---T---T---CTACT-TCGTGC-TACCAAAGACGTGTAGAC-TT-CCATGTAC-----C-------------CCCTCTTTCCGT-TTTT-TAGCTG-C-CTCGGAT-GTGAGT-TTT---GA-GGAT-----G--CCCAGCGGA------TGCAGAGA---GGAT---ACAGC-GGCTGTTT-AACGG-A-TGATAACGGACATAGAACG-TTTGCTGC--TCC--TAT-ATGTCGC--GGATTGACATCG-TA-TACTGC-------GGA----AAGT-TCATCCGTTC-TAAA---------------AA--T--TTCATGC-----------------------------------------AGC------T--CAAAT-------------TGTG--CAGATGAA-GT----------CA-----------------CAGT--G----GA-CGGA-TG-
gi|7 : -TTTT-CAGCTG-C-AGCGGAT-GTGAGT-TGC---GA-GGAT-----G--C-----CCA-------G---AGA---GGAT---ACAGT-GGACGTTT-AACGG-A-TGATAACAAACATAGAAAG-TTTGTTGC--TCG--TAT-AAGTCGC---AATTGATATCG-TA-CACGGC-------GGA----ATGT-TCATTCGTTC-TAAA---------------AACCT--TTTGCGCGGATTTAACACATGTAACAGT--------GGA------C-GAACGTTCGATG-GAAAG--------AG-CGAATG--AA-ATA-C-GTATGCAATGAGTA-----------------CA----C----AA-CGGA-TG-CAT-AGCGTTTTC----------CAACG-GATGGCAatcgacgga
gi|8 : CCCGTTCCCACAGGCCAATAGACACAAA-AC-----GTATGC-A---------ACAA--GGACACAGCGGACGA-GC--AAAATTTCA-GGG-TT----GGCTC----------CAT----------CCGTTTTCATCCGCT--------------CCAGA-AATTGA-------C--AAAATTGGG-----GAA-AA-----------------C-------AGAAAGGAAAAGAACGGA----------C-GA--GGG---T-A-G----TA----T--GTAACGGGAATATTTAACGGATGTTCATCGG--AAGCCT--AGCGG-----------A----------TGGAAGTGGATGACAGCTC-C-----------GACATAC-------TCCAGACAT----CCTAAAT-ATACGAAAT----GCATCCCA-----t
gi|9 : -T-TTCT-CCCTCTT-CCAT-TTTT-CAGCTG-C-TGCG-AT--TGAGT-TG---------------------------------------AGA---GGAT---ACAGC-AGACGTTT-AATGG-A-TGATAACGGACATAGAATG-TTTGCTGC--TCG--TAT-GTGTCGA--GAATTGACATCG-TA-CATGACGGAAACAGGA----AAGT-TCATCTGTTT-TAAA---------------AG--T--T--GTGC--------------------
gi|9 : --------------------T--------GGA------TAGGGAGT---AT--GAAAT--------A--TGTATG--AA-ATG-A-GTA---------agctcaaaactttttgcgcagatgaaatcacagaagacggatgctcgatggatagggagtatgaaatatgtatgaaatgagta
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Reference ( family-1055 ) : GGCCCGGTCCCACTGGCCGATGGACGCAAA-AC-----GTATGC-A---------A-AA--GGACACAGCGGACGA-GC--AAAATTTCG-GGG-TT----GGCTC----------CAT----------CCG----------CT--------------CCAGA-AATGGA-------C--AAAATTGGC-----GAA-AA-----------------C-------AGAA----------CGGA----------C-GA--GGG---T-A-G----TA----T--GTAGCGGGGATGTTAAACGGCTGTTCATCGG--AAGCCT--AGC-G-----------A----------TGGAAGTGGATGACAGCTC-C-----------GACATAC-------TCCAGACAT----CCTAAATAATACGAGAT----ACATCCCA-----G-----ATACA-----AACGCT-TTGTCCGTTTTGAATA-------------------C-----TTTATAT-----A--CGAGATGC----ATACGTT----C----CC---T---T---AT-TT-CCGTGC-TACTAACGATGTATAGACGTT-CCATGTAC-----CTTATC-T-TCCT-CCCTCTTTCCGT-TTTT-CAGCTG-C-AGCGGAT-GTGAGT-TGC---GA-GGAT-----G--C-----AGA------TG---AGA---GGAT---ACAGC-GGACGTTT-AACGG-A-TGATAACGGACATAGAACG-TTTGTTGC--TCG--TAT-ATGTCGC--GGATTGACATCG-TA-CACGGC-------GGA----AAGT-TCATCCGTTC-TAAA---------------AA--T--TTCGTGC--------------------T--------GGA------TAGAGCGT---AT--GAAAT--------A--CGTATG--CA-ATG-A-GTA---------CA-----------------CA----C----GA-CGGA-TG-CAT-AGCGTTTTC----------CAACG-GATGGCAAGACT-TT------------------------T-T---AC----------A--TTT--T-------------ACATC--CT-CTTTGCATCCGTAA-GTGCAGTGGGACC-GGGGCT
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gi|10 : aacggacgagggttatatatgtatcggggatgttaaacggatcttcatcggaagcttaacggatgaatggatggcagctccgacatacgccagagtccagatatcctaaatatacatcccagatacgaacgctttgtccgttttgaatacatgtacttatataataaacgagatgcatgtatacgtttcagcctttctacttgtcgtgctacaaagacgtgtagacgttccatgtacatggtcttatttttccccctctttccgtctttttagctgacctcggatgtgagttttgaggatgcccagcggatgccagagagggatataacagcggctgtttaaacggattgataacggacatagacgttttgctgcaatcctataatgtcgcggattgacatcgctatcactgcgggaaagttcaatcgttcttaaaaatttcatgcagctcaaattgtgagatgaaacgcacagtggacggaagatcgacggcagagatctaCTCTC-----------GACATAC-------TCCAGACATGTATCCTAAATA-TACGAGATCTATACATTCCA-----G-----ACACA-----AACGCT-TTCTTTGTTTTGAATACTATATATATACATGTATAC-----TTTATAT-----ATACGAGATGC----ATATGTT----TACATCC---T---TTCTAT-TT-CCGTGT-TACTAACGATGTATAGACGTT-CCATGTAC-----CTAA-------------TTTTTGCA----TT-CAGCTG-C-AGCAGAT-GCGAGT-TGC---GA-GGAT-----G--C-----A---------G---AGA---GGAT---ACAGC-GGA
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gi|27 : taatcA----T--GTAGCGGGGATGTTAAACGGCTGTTCAGCGG--GATCCTTAAGCTG-----------A----------TGGAAGTGGATGACAGCTC-C-----------AACATAC-------CCttcatccgct
gi|28 : ATC--CT-CTCAGCATCCGTAA-GTGCAGTAAGACC-GGGGCT
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gi|5 : G-C-AGCGAAT-GTGAGT-TGC---GA-AGAG-----G--C-----AGA------------GA---GAAT---ACAGT-GGACATTT-AACGG-A-TGATAGCAGACATAGAACG-TT
gi|5 : cGTGCTTTC----------CAACG-GATGGCAAGATT-TT------------------------T-TTAAAC----------AAATTTAAT-------------ACATC--CT-CTTTGCATACGTAA-GTGCAGTGGGACC-AGGGaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggtgctttccaacggatggcaagatttttttaaacaaatttaatacatcctctttgcatacgtaagtgcagtgggaccaggg
gi|6 : cgcagcgaatgtgagttgcgaagaggcagagagaatacagtggacatttaacggatgatagcagacatagaacgttaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngTCCCC-----G-----ATACATATATAAC-CC-TCGTCCGTTT----------------------------------ATAA-----A--CGAGATGC----ATGTATCAG--C----CT---T---T---CTACT-TCGTGC-TACCAAAGACGTGTAGAC-TT-CCATGTAC-----C-------------CCCTCTTTCCGT-TTTT-TAGCTG-C-CTCGGAT-GTGAGT-TTT---GA-GGAT-----G--CCCAGCGGA------TGCAGAGA---GGAT---ACAGC-GGCTGTTT-AACGG-A-TGATAACGGACATAGAACG-TTTGCTGC--TCC--TAT-ATGTCGC--GGATTGACATCG-TA-TACTGC-------GGA----AAGT-TCATCCGTTC-TAAA---------------AA--T--TTCATGC-----------------------------------------AGC------T--CAAAT-------------TGTG--CAGATGAA-GT----------CA-----------------CAGT--G----GA-CGGA-TG-
gi|7 : -TTTT-CAGCTG-C-AGCGGAT-GTGAGT-TGC---GA-GGAT-----G--C-----CCA-------G---AGA---GGAT---ACAGT-GGACGTTT-AACGG-A-TGATAACAAACATAGAAAG-TTTGTTGC--TCG--TAT-AAGTCGC---AATTGATATCG-TA-CACGGC-------GGA----ATGT-TCATTCGTTC-TAAA---------------AACCT--TTTGCGCGGATTTAACACATGTAACAGT--------GGA------C-GAACGTTCGATG-GAAAG--------AG-CGAATG--AA-ATA-C-GTATGCAATGAGTA-----------------CA----C----AA-CGGA-TG-CAT-AGCGTTTTC----------CAACG-GATGGCAatcgacgga
gi|8 : CCCGTTCCCACAGGCCAATAGACACAAA-AC-----GTATGC-A---------ACAA--GGACACAGCGGACGA-GC--AAAATTTCA-GGG-TT----GGCTC----------CAT----------CCGTTTTCATCCGCT--------------CCAGA-AATTGA-------C--AAAATTGGG-----GAA-AA-----------------C-------AGAAAGGAAAAGAACGGA----------C-GA--GGG---T-A-G----TA----T--GTAACGGGAATATTTAACGGATGTTCATCGG--AAGCCT--AGCGG-----------A----------TGGAAGTGGATGACAGCTC-C-----------GACATAC-------TCCAGACAT----CCTAAAT-ATACGAAAT----GCATCCCA-----t
gi|9 : -T-TTCT-CCCTCTT-CCAT-TTTT-CAGCTG-C-TGCG-AT--TGAGT-TG---------------------------------------AGA---GGAT---ACAGC-AGACGTTT-AATGG-A-TGATAACGGACATAGAATG-TTTGCTGC--TCG--TAT-GTGTCGA--GAATTGACATCG-TA-CATGACGGAAACAGGA----AAGT-TCATCTGTTT-TAAA---------------AG--T--T--GTGC--------------------
gi|9 : --------------------T--------GGA------TAGGGAGT---AT--GAAAT--------A--TGTATG--AA-ATG-A-GTA---------agctcaaaactttttgcgcagatgaaatcacagaagacggatgctcgatggatagggagtatgaaatatgtatgaaatgagta
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Reference ( family-1055 ) : GGCCCGGTCCCACTGGCCGATGGACGCAAA-AC-----GTATGC-A---------A-AA--GGACACAGCGGACGA-GC--AAAATTTCG-GGG-TT----GGCTC----------CAT----------CCG----------CT--------------CCAGA-AATGGA-------C--AAAATTGGC-----GAA-AA-----------------C-------AGAA----------CGGA----------C-GA--GGG---T-A-G----TA----T--GTAGCGGGGATGTTAAACGGCTGTTCATCGG--AAGCCT--AGC-G-----------A----------TGGAAGTGGATGACAGCTC-C-----------GACATAC-------TCCAGACAT----CCTAAATAATACGAGAT----ACATCCCA-----G-----ATACA-----AACGCT-TTGTCCGTTTTGAATA-------------------C-----TTTATAT-----A--CGAGATGC----ATACGTT----C----CC---T---T---AT-TT-CCGTGC-TACTAACGATGTATAGACGTT-CCATGTAC-----CTTATC-T-TCCT-CCCTCTTTCCGT-TTTT-CAGCTG-C-AGCGGAT-GTGAGT-TGC---GA-GGAT-----G--C-----AGA------TG---AGA---GGAT---ACAGC-GGACGTTT-AACGG-A-TGATAACGGACATAGAACG-TTTGTTGC--TCG--TAT-ATGTCGC--GGATTGACATCG-TA-CACGGC-------GGA----AAGT-TCATCCGTTC-TAAA---------------AA--T--TTCGTGC--------------------T--------GGA------TAGAGCGT---AT--GAAAT--------A--CGTATG--CA-ATG-A-GTA---------CA-----------------CA----C----GA-CGGA-TG-CAT-AGCGTTTTC----------CAACG-GATGGCAAGACT-TTT-----------------------TT--A--C----------A--TTT--T-------------ACATC--CT-CTTTGCATCCGTAA-GTGCAGTGGGACC-GGGGCT
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gi|10 : aacggacgagggttatatatgtatcggggatgttaaacggatcttcatcggaagcttaacggatgaatggatggcagctccgacatacgccagagtccagatatcctaaatatacatcccagatacgaacgctttgtccgttttgaatacatgtacttatataataaacgagatgcatgtatacgtttcagcctttctacttgtcgtgctacaaagacgtgtagacgttccatgtacatggtcttatttttccccctctttccgtctttttagctgacctcggatgtgagttttgaggatgcccagcggatgccagagagggatataacagcggctgtttaaacggattgataacggacatagacgttttgctgcaatcctataatgtcgcggattgacatcgctatcactgcgggaaagttcaatcgttcttaaaaatttcatgcagctcaaattgtgagatgaaacgcacagtggacggaagatcgacggcagagatctaCTCTC-----------GACATAC-------TCCAGACATGTATCCTAAATA-TACGAGATCTATACATTCCA-----G-----ACACA-----AACGCT-TTCTTTGTTTTGAATACTATATATATACATGTATAC-----TTTATAT-----ATACGAGATGC----ATATGTT----TACATCC---T---TTCTAT-TT-CCGTGT-TACTAACGATGTATAGACGTT-CCATGTAC-----CTAA-------------TTTTTGCA----TT-CAGCTG-C-AGCAGAT-GCGAGT-TGC---GA-GGAT-----G--C-----A---------G---AGA---GGAT---ACAGC-GGA
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gi|5 : G-C-AGCGAAT-GTGAGT-TGC---GA-AGAG-----G--C-----AGA------------GA---GAAT---ACAGT-GGACATTT-AACGG-A-TGATAGCAGACATAGAACG-TT
gi|5 : cGTGCTTTC----------CAACG-GATGGCAAGATT-TTT-----------------------TT--AAAC----------AAATTTAAT-------------ACATC--CT-CTTTGCATACGTAA-GTGCAGTGGGACC-AGGGaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggtgctttccaacggatggcaagatttttttaaacaaatttaatacatcctctttgcatacgtaagtgcagtgggaccaggg
gi|6 : cgcagcgaatgtgagttgcgaagaggcagagagaatacagtggacatttaacggatgatagcagacatagaacgttaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngTCCCC-----G-----ATACATATATAAC-CC-TCGTCCGTTT----------------------------------ATAA-----A--CGAGATGC----ATGTATCAG--C----CT---T---T---CTACT-TCGTGC-TACCAAAGACGTGTAGAC-TT-CCATGTAC-----C-------------CCCTCTTTCCGT-TTTT-TAGCTG-C-CTCGGAT-GTGAGT-TTT---GA-GGAT-----G--CCCAGCGGA------TGCAGAGA---GGAT---ACAGC-GGCTGTTT-AACGG-A-TGATAACGGACATAGAACG-TTTGCTGC--TCC--TAT-ATGTCGC--GGATTGACATCG-TA-TACTGC-------GGA----AAGT-TCATCCGTTC-TAAA---------------AA--T--TTCATGC-----------------------------------------AGC------T--CAAAT-------------TGTG--CAGATGAA-GT----------CA-----------------CAGT--G----GA-CGGA-TG-
gi|7 : -TTTT-CAGCTG-C-AGCGGAT-GTGAGT-TGC---GA-GGAT-----G--C-----CCA-------G---AGA---GGAT---ACAGT-GGACGTTT-AACGG-A-TGATAACAAACATAGAAAG-TTTGTTGC--TCG--TAT-AAGTCGC---AATTGATATCG-TA-CACGGC-------GGA----ATGT-TCATTCGTTC-TAAA---------------AACCT--TTTGCGCGGATTTAACACATGTAACAGT--------GGA------C-GAACGTTCGATG-GAAAG--------AG-CGAATG--AA-ATA-C-GTATGCAATGAGTA-----------------CA----C----AA-CGGA-TG-CAT-AGCGTTTTC----------CAACG-GATGGCAatcgacgga
gi|8 : CCCGTTCCCACAGGCCAATAGACACAAA-AC-----GTATGC-A---------ACAA--GGACACAGCGGACGA-GC--AAAATTTCA-GGG-TT----GGCTC----------CAT----------CCGTTTTCATCCGCT--------------CCAGA-AATTGA-------C--AAAATTGGG-----GAA-AA-----------------C-------AGAAAGGAAAAGAACGGA----------C-GA--GGG---T-A-G----TA----T--GTAACGGGAATATTTAACGGATGTTCATCGG--AAGCCT--AGCGG-----------A----------TGGAAGTGGATGACAGCTC-C-----------GACATAC-------TCCAGACAT----CCTAAAT-ATACGAAAT----GCATCCCA-----t
gi|9 : -T-TTCT-CCCTCTT-CCAT-TTTT-CAGCTG-C-TGCG-AT--TGAGT-TG---------------------------------------AGA---GGAT---ACAGC-AGACGTTT-AATGG-A-TGATAACGGACATAGAATG-TTTGCTGC--TCG--TAT-GTGTCGA--GAATTGACATCG-TA-CATGACGGAAACAGGA----AAGT-TCATCTGTTT-TAAA---------------AG--T--T--GTGC--------------------
gi|9 : --------------------T--------GGA------TAGGGAGT---AT--GAAAT--------A--TGTATG--AA-ATG-A-GTA---------agctcaaaactttttgcgcagatgaaatcacagaagacggatgctcgatggatagggagtatgaaatatgtatgaaatgagta
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gi|6 : cgcagcgaatgtgagttgcgaagaggcagagagaatacagtggacatttaacggatgatagcagacatagaacgttaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngTCCCC-----G-----ATACATATATAAC-CC-TCGTCCGTTT----------------------------------ATAA-----A--CGAGATGC----ATGTATCAG--C----CT---T---T---CTACT-TCGTGC-TACCAAAGACGTGTAGAC-TT-CCATGTAC-----C-------------CCCTCTTTCCGT-TTTT-TAGCTG-C-CTCGGAT-GTGAGT-TTT---GA-GGAT-----G--CCCAGCGGA------TGCAGAGA---GGAT---ACAGC-GGCTGTTT-AACGG-A-TGATAACGGACATAGAACG-TTTGCTGC--TCC--TAT-ATGTCGC--GGATTGACATCG-TA-TACTGC-------GGA----AAGT-TCATCCGTTC-TAAA---------------AA--T--TTCATGC-----------------------------------------AGC------T--CAAAT-------------TGTG--CAGATGAA-GT----------CA-----------------CAGT--G----GA-CGGA-TG-
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Reference ( family-1055 ) : GGCCCGGTCCCACTGGCCGATGGACGCAAA-AC-----GTATGCAAAAA-G--------GACACAGCGGACGA-GC--AAAATTTCG-GGG-TT----GGCTC----------CAT----------CCG----------CT--------------CCAGA-AATGGA-------C--AAAATTGGC-----GAA-AA-----------------C----------AGAACGGA----------C-GA--GGG---T-A-G----TA----T--GTAGCGGGGATGTTAAACGGCTGTTCATCGG--AAGCCT--AGC-G-----------A----------TGGAAGTGGATGACAGCTC-C-----------GACATAC-------TCCAGACAT----CCTAAATAATACGAGAT----ACATCCCA-----G-----ATACA-----AACGCT-TTGTCCGTTTTGAATA-------------------C-----TTTATATA-----CGAGATGCAT----ACGCT--CA-C---CTTTCTATTT-CCGTGC-TACTAACGATGTATAGACGTT-C-CATGTAC-----CTTATCTNTCCTCCCTCTTTCC-GT-TTTTCAGCTG-CAGCGG-ATGTGAGT-TGC---GA-----------GGATG--C------------A---------GAGAGG---ATA-CAG-CGGACGTTTAA-CGGAT-G-ATAACGGACATAGAACGTTT-GTTGC--TCG--TATA-TGTCGC--GGATTGACATCG-TA-CACGGC-------GGA----AAGT-TCATCCGTTC-TAAA---------------AA--T--TTCGTGC--------------------T--------GGA------TAGAGCGT---AT--GAAAT--------A--CGTATG--CA-ATG-A-GTA---------CA-----------------CA----C----GA-CGGA-TG-CAT-AGCGTTTTC----------CAACG-GATGGCAAGACT-TTT-----------------------TT--A--C----------A--TTT--T-------------ACATC--CT-CTTTGCATCCGTAA-GTGCAGTGGGACC-GGGGCT
gi|1 : AACGGA----------C-GA--GGG---TTATA----TA----T--GTATCGGGGATGTTAAACGGATCTTCATCGG--AAGCTT--AAC-GG----------A----------TGAA--TGGATGGCAGCTC-C-----------GACATACGCCAGAGTCCAGATAT----CCTAAATA--------T----ACATCCCA-----G-----ATACG-----AACGCT-TTGTCCGTTTTGAATA-------------------CATGTACTTATATAATAAACGAGATGCATGTATACGTTT-CAGC---CTTTCTACTTGTCGTGC-TAC-AAAGACGTGTAGACGTT-C-CATGTACATGGTCTTATTTTTCC-CCCTCTTTCC-GTCTTTTTAGCTGACCTCGG-ATGTGAGT-TTT---GA-----------GGATG--CCCAGCGGATGCCA---------GAGAGGGATATAACAG-CGGCTGTTTAAACGGATTG-ATAACGGACATAGA-CGTTTTGCTGCAATCC--TATAATGTCGC--GGATTGACATCGCTATCACTGCG------GGA----AAGT-TCAATCGTTCTTAAA---------------AA--T--TTCATGC-----------------------------------------AGC------T--CAAAT-------------TGTG--AG-ATG-A-A-A---------CG-----------------CA----CAGTGGA-CGGA-
gi|1 : ---AT--GAAAT--------AA-CATATG--CA-TTG-AAGTA---------TA-----------------TATTATC-----A-CGGAGTG-CATTAGCGTTTGT----------CAACGCGATGGCAAGNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTT--A--T----------C--TTT--T-------------ACATC--CT-CTTTGCATCCCTAATTTGCAGT--GACC-GGGCCTagatcgacggcagagatctaatgaaataacatatgcattgaagtatatattatcacggagtgcattagcgtttgtcaacgcgatggcaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttatcttttacatcctctttgcatccctaatttgcagtgaccgggcct
gi|10 : aacggacgagggttatatatgtatcggggatgttaaacggatcttcatcggaagcttaacggatgaatggatggcagctccgacatacgccagagtccagatatcctaaatatacatcccagatacgaacgctttgtccgttttgaatacatgtacttatataataaacgagatgcatgtatacgtttcagcctttctacttgtcgtgctacaaagacgtgtagacgttccatgtacatggtcttatttttccccctctttccgtctttttagctgacctcggatgtgagttttgaggatgcccagcggatgccagagagggatataacagcggctgtttaaacggattgataacggacatagacgttttgctgcaatcctataatgtcgcggattgacatcgctatcactgcgggaaagttcaatcgttcttaaaaatttcatgcagctcaaattgtgagatgaaacgcacagtggacggaagatcgacggcagagatctaCTCTC-----------GACATAC-------TCCAGACATGTATCCTAAATA-TACGAGATCTATACATTCCA-----G-----ACACA-----AACGCT-TTCTTTGTTTTGAATACTATATATATACATGTATAC-----TTTATATATA---CGAGATGCAT----ATGTT--TA-CATCCTTTCTATTT-CCGTGT-TACTAACGATGTATAGACGTT-C-CATGTAC-----CTAA-----------TTTTTGC-A----TTCAGCTG-CAGCAG-ATGCGAGT-TGC---GA-----------GGATG--C------------A---------GAGAGG---ATA-CAG-CGGA
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gi|18 : --------------------T--------GGA------TAGTGCGC---TT--GAAAC--------T--CGTATG--CA-TTG-C-GTA---------CA-----------------CA----------G-CGGA-TG-CAT-AGCGTTATC----------TAACG-GATGGAAAGACT-TTT-----------------------TTG-A--C----------A--TTT--T-------------ACATC--CT-CTTTGC
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gi|27 : taatcA----T--GTAGCGGGGATGTTAAACGGCTGTTCAGCGG--GATCCTTAAGCTG-----------A----------TGGAAGTGGATGACAGCTC-C-----------AACATAC-------CCttcatccgct
gi|28 : ATC--CT-CTCAGCATCCGTAA-GTGCAGTAAGACC-GGGGCT
gi|3 : TGTT-ATCAG--AATGTT--AGC-A-----------A----------TG-AAGTGGATGACAGCTC-------------GACATACA------TCCAGACAT----CCTAAATA-TACGATAT----ACATCCCAAGCAAG-----ATACA-----AAAAATCTTGTCCGTTTCGAATA-------------------C-----TTTATAT-------GAGATGCAT----ACG-T--TA-CT--CTTTCTATTC-AC-TGCGTACTAACCATGTATAGGCGCT-CAAATGT-----------------TTCCCTCTTTCCTTT-TTTTCAG-TGCCAGCGGTTTGTAAGT-TGC---GAT----------GGATG--C------------A----------AGA-G---ATA-CAGCCAGACGTATAA-C-GAT-ATATAACGGGCATAGAATGTTT-TTTGC--TGC--TATA-TGCTGTTAGAACTA--ATCT-TA-CACGGC-------GGA----AAGTCTCGTCTTATC-TAAATTTTGTTCCAGCGTCAA--TACTTTTTGC--------------------TCAGAGGCGGGA------T-GCTCGC---ATGGGAAAG--------AATCGTATG--AA-ATA-C-GTA---------CATGCGAATGAGCACGTATCA----C----AA-CGGA-TG--AT-AGCG-TTTC----------CGACT-GGTGACAAGACTATTT-----------------------AT--A--C----------G--TTC--T-------------A-ATCAGCTACTTTGCATCCGT-A-GTGCA-T-GGACCAGGGGCT
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gi|5 : G-CAGCGA-ATGTGAGT-TGC---GA-----------AGAGG--C------------A---------GAGAGA---ATA-CAG-TGGACATTTAA-CGGAT-G-ATAGCAGACATAGAACGTT
gi|5 : cGTGCTTTC----------CAACG-GATGGCAAGATT-TTT-----------------------TT--AAAC----------AAATTTAAT-------------ACATC--CT-CTTTGCATACGTAA-GTGCAGTGGGACC-AGGGaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggtgctttccaacggatggcaagatttttttaaacaaatttaatacatcctctttgcatacgtaagtgcagtgggaccaggg
gi|6 : cgcagcgaatgtgagttgcgaagaggcagagagaatacagtggacatttaacggatgatagcagacatagaacgttaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngTCCCC-----G-----ATACATATATAAC-CC-TCGTCCGTTT----------------------------------ATAAA-----CGAGATGCAT----GTA-T--CAGC---CTTTCTACTT-C-GTGC-TACCAAAGACGTGTAGAC-TT-C-CATGTAC-----C-----------CCCTCTTTCC-GT-TTTTTAGCTG-CCTCGG-ATGTGAGT-TTT---GAGGATGCCCAGCGGATG--C------------A---------GAGAGG---ATA-CAG-CGGCTGTTTAA-CGGAT-G-ATAACGGACATAGAACGTTT-GCTGC--TCC--TATA-TGTCGC--GGATTGACATCG-TA-TACTGC-------GGA----AAGT-TCATCCGTTC-TAAA---------------AA--T--TTCATGC-----------------------------------------AGC------T--CAAAT-------------TGTG--CAGATGAA-GT----------CA-----------------CAGT--G----GA-CGGA-TG-
gi|7 : -TTTTCAGCTG-CAGCGG-ATGTGAGT-TGC---GA-----------GGATG--CCC----------A---------GAGAGG---ATA-CAG-TGGACGTTTAA-CGGAT-G-ATAACAAACATAGAAAGTTT-GTTGC--TCG--TATA-AGTCGC---AATTGATATCG-TA-CACGGC-------GGA----ATGT-TCATTCGTTC-TAAA---------------AACCT--TTTGCGCGGATTTAACACATGTAACAGT--------GGA------C-GAACGTTCGATG-GAAAG--------AG-CGAATG--AA-ATA-C-GTATGCAATGAGTA-----------------CA----C----AA-CGGA-TG-CAT-AGCGTTTTC----------CAACG-GATGGCAatcgacgga
gi|8 : CCCGTTCCCACAGGCCAATAGACACAAA-AC-----GTATGCAACAA-G--------GACACAGCGGACGA-GC--AAAATTTCA-GGG-TT----GGCTCCATCCGTTTTCAT----------CCG----------CT--------------CCAGA-AATTGA-------C--AAAATTGGG-----GAA-AA-----------------CAGAAAGGAAAAGAACGGA----------C-GA--GGG---T-A-G----TA----T--GTAACGGGAATATTTAACGGATGTTCATCGG--AAGCCT--AGCGG-----------A----------TGGAAGTGGATGACAGCTC-C-----------GACATAC-------TCCAGACAT----CCTAAAT-ATACGAAAT----GCATCCCA-----t
gi|9 : TTCTCCCTCTT-CC-AT-TTTTCAGCTG-CTGCG--AT-TGAGT-TG------------------------------------------------AGAGG---ATA-CAG-CAGACGTTTAA-TGGAT-G-ATAACGGACATAGAATGTTT-GCTGC--TCG--TATG-TGTCGA--GAATTGACATCG-TA-CATGACGGAAACAGGA----AAGT-TCATCTGTTT-TAAA---------------AG--T--T--GTGC--------------------
gi|9 : t--------------------T--------GGA------TAGGGAGT---AT--GAAAT--------A--TGTATG--AA-ATG-A-GTA---------agctcaaaactttttgcgcagatgaaatcacagaagacggatgctcgatggatagggagtatgaaatatgtatgaaatgagta