lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 11 11111111111111 111111111 11 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 2222222222222222222222222222222222222222222222222222 11111111 666666666666666666666666666666666 1111 111111111 22222222222 333333 111 22222222222222222222222222222
lowQualScore : 3 44 1 333333 11111111111111 22 5555555 1 1 88 666666666 22222 111 0 1 1 0 0 222 999999999 22 22 2 11 1 33 8888 1 44 99999 11 1 111 1 1 2222 333 2222 2222 2 0 2222 88888888888888888 1 11 1 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 55 1 11 5 6666666666666666666666666666666666666666666666666666 2 66666666 222 333 33333 2 2 666 444444444444444444444444444444444 1 1 2 2 2222 44444444 1 44 222222222 1 1 1 33333333333 11 1 333333 11 1 1 1 22 11 2222 0 2 9999 333 2222 1 2222 1 111 1 11 7 2222 0 666 0 11 111 0 11 0 22 3333333 222222 22 222 0 0 0 2 111 0 2222222 444 1 11 2 1 11 88888888888888888888888888888 1 1 33333333 11 1 6 1 77 1
lowQualScore : . .. . ...... .............. .. ....... . . .. ......... ..... ... . . . . . ... ......... .. .. . .. . .. .... . .. ..... .. . ... . . .... ... .... .... . . .... ................. . .. . ......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... .. . .. . .................................................... . ........ ... ... ..... . . ... ................................. . . . . .... ........ . .. ......... . . . ........... .. . ...... .. . . . .. .. .... . . .... ... .... . .... . ... . .. . .... . ... . .. ... . .. . .. ....... ...... .. ... . . . . ... . ....... ... . .. . . .. ............................. . . ........ .. . . . .. .
lowQualScore : 6 00 2 444444 55555555555555 66 5555555 0 0 11 777777777 22222 666 9 0 8 9 9 666 555555555 33 33 0 33 0 11 7777 0 99 22222 44 0 888 1 1 2222 333 6666 4444 2 2 5555 22222222222222222 2 77 2 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 33 4 88 2 0000000000000000000000000000000000000000000000000000 7 33333333 333 333 22222 9 6 888 888888888888888888888888888888888 3 3 5 4 6666 44444444 2 11 000000000 2 2 2 99999999999 77 2 888888 66 1 1 1 55 44 3333 5 1 0000 111 1111 0 1111 0 888 0 33 3 0000 9 888 9 22 666 9 33 9 22 0000000 777777 55 555 9 9 9 2 555 9 9999999 555 0 44 0 0 44 11111111111111111111111111111 0 0 77777777 44 0 0 1 22 3
consensus : TCAACT-CAAATATGC-CTG------GA-------------TTT--AC------GTA-A-C-AGACAA-GT------TAT-----T---T-CCA-C-A-A-C-T------T--T--AA--CA-T--T-AAT--GC--A-TGCA-T-CTGTCACAAG----G--A-AAT---CA-ACA-CT----T---AC--T-C----G-CTGTTAAT----C-----------------CATT-T--T-CA---------------C------------A-----C-----C--G-----------G---------T--------T---T-G-AATTGTG---TGTT--A-ATCT--CT----ATCGG--C-GGT---CGG------A---AAAT--AT----T--AA-A--A-ATT-CG-A-AGT-C-GGA-N-AA--T-T---G-G---A-AA-A----A---------T-TAG-TAA----ACA-C---GC-A---T---TTT--GCT--TCT--CANAAAGCTT----TTT---G-ACATTT--C----AA--NTCT--A--TT-N---AA---ACA--T-GTTTTCCTATT-------G------A-TATCAAC-A---A--GAAN-A-ATN-------T--T----A-T---A--A----T----A-AC---------T--CA-AA---A-------------G--C-------T------------------TTT-T-GAG--AACCAAA-----A-TGC------------G-TGTT---T--AT--TA-A---------TT-T-TT--CC-A---A-A-T-----TGT-CCGA--CTT-------C-G-A-A----T-NTT-CGA------A-T-TT-TT-TA---TA--------C-CGCCNATNG----G--GA-T-TA-ACAC-AC-A-A---T--T-CAAACCCG--GGACAA--GGA-ACG-T-GT--GA--AAATGG----ATTAACAG-C--GNGT---A----A-GTG----T-TG---ATT-T--CCTTGTGAC----A-GATGCA--TGC-A--T---T-A--A-TG--T-------TA------A--AA---T-T-G-TGGA---AA-TA------A-C-T-TGT--C-TG-T--TAC-G-----TAA-A-TC------------CAG-G-CA--------T--AT-TTGAGTTG-AAA-NG-TCGATCGAA
Reference ( gi|2 ) : TCAATT-AAAATATGC-CTG------GG-------------TTT--AC------GTA-A-C-GGACAA-AT------TAT-----T---T-CCA-C-A-A-C-T------A--T--AA--CA-T--T-AAT--GC--G-TGCA-T-GTGTCACAAA----G--A-AAT---CA-ACA-CT----T---AC--T-C----G-CTGTTAAT----C-----------------CATT-T--T-CA---------------C------------A--------------G-----------G---------A--------T---T-G-AATTATG---TGAT--A-ATCT--CT----ATTAA--T-GAT---CGG------A---AAAT--AT----T--AA-A--A-ACC-CA-A-AGT-C-GGA-A-AA--T-T---G-G---A-AA-A----A---------T-TAG-TAA----ACA-C---AC-A---T---TTC--GCT--TCT--AGGAAAGCTT----TCT---A-ACATCT--T----AA--ATCT--A--TT-G---AA---ACG--T-GTTTTCCTATT-------G------A-TATCTGC-A---A--GAAT-A-ATA-------T--T----ACT---A--A----T----A-AC---------T--CA-AA---AT----T-------G--C-------T------------------CTT-T-GAG--AACCAAG-----A-TAC------------G-TATC---T--AT--TA-A---------TT-T-GT--CA-A---A-A-T-----TAT-CCGA--TTT-------T-G-A-A----T-GAT-CGA------A-T-TT-TT-TA---TA--------C-CGCCAATCG----G--GA-T-TA-ACAC-GC-A-T---T--T-CAAACCCG--TAAAAA--GGA-ACA-T-GT--GA--AAATGG----ATTAACAG-C--ATGT---A----A-GTG----T-TG---ATT-T--CTTTGTGAC----A-GATGCG--TGC-A--T---T-A--A-TG--T-------TA------A--AA---T-T-G-TGGA---AA-TA------A-G-T-TGT--C-TG-T--TGC-T-----TAA-A-CT------------CAG-G-CA--------T--AT-TTAAGTTG-AAA-CG-TCGATCGAA
gi|4 : TCAACT-CAAATA--C-ATG------G-------------------AC--------A-A-T-G--CAA-GT------AAT-----T---C-CCA-A-A-A-C-G------T--T--AA--CA-T--T-AAT--GC--A-TGCC-C-CTACCACAAG----G--A-AATATACATGCA-CT----T---AC--T-C----G-CTGTTATT----C-----------------CATT-T--T-CA---------------C------------A--------------T-----------GTCC------C--------T---A-G-AATTGCG---TGTT--A-ATCC---------------T-GATA--CGG------C---GATC--AT----T--------------CG-A-AGT-C-TAA-T-AA--TCT---A-G---T-AA-A----A---------T-TAA-TAA----ACG-T---GC-A---T---TTT--GGT--TCC--CCAAAAGCTT----TTT-------GTTT--T----A------C--A--TT-A---AA-----------TATTCTTATT-------G------A-TATCAAT-A---G--GAAA-ACATG-------T--TTG--AAT---A--A----A----A-ATGAAATG---T--TA-AA---A-----A-------G--C-------T------------------TTC-G-GAG--ATGCAA------A-TGC------------G-TGTT---T--AC--TA-A---------TT-T-TT--CC-A---A-A-T-----TTT-CCGA--CT-----------------------T-CGA------A-T-TT-CT-TAT--TA--------T-TTCCTACT--------GA-T-AA-AAA-----------T--T-CAATCCCA--GGACAA--TGA-AC----GT--TA--AAATGG----ATTAGCAG-C--GGGT---A----A-GTG----T-TG---ATT-T--TCTTATGAC----A-GACGCA--TGC-A--T---TCA--A-TG--T-------TA------A--AA---T-T-G-TGGA---AA-TA------A-C-T-TGT--C-TG-T--TAC-------------------------------G-AA--------T--GT-----GTTG-AAATCG-TCGGTCGAA
gi|1 : aatagacgttTCAACT-CAACTATGC-CTG------GG-------------TTT--AA------GTA-A-C-AG------T------T-T-----T---T-CTAAC-A-A-T-T------T--T--AA--TA-T--T-AAT--GC--A-TGCA-T-CTGTCACAAT----G--A-AAT---CA-AAT-TT----T---GC--A-T----G-CTGTTAAT----C-----------------CATT-T--T-CA---------------C------------ATGCTTCTTATCCC-G-----------G---------G--------TG--T-G-AATTGTC---TGTT--A-ATCT--CT----A--GA--G-G-----CGGTAT---A---AAAA--AT----A--AA-C--A-GTC-TG-A-AGT-C-GGA-A-TA--T-T---T-G---A-AACA----A---------T-TAGAAAA----ACA-C---GT-AT--T---TTT--GCT--TCT--CATAGAACGT----TTT---G-GCAT-T--T----AA--TTTTG-A--TT-C---AA---ACA--T-GTTTTCCTAAT-------A------G-TATCAAC-A---A--CAAA-A-ACC-------C--T----TTT---A--AT---T----G-AA---------T--CATGA---A-------------G--C-------T------------------TTT-T-GAG--AACCAAA-----A-TGC------------A-TGTT---T--A---TA-C---------TT-T-TTC-CC-A---A-A-T-----TGT-CCGA--CTT-------C-G-A-AGTTTT-GAT----------A-T-TT-TT-C----TA--------C-CTCTTATTA----G--GA-C-AA-ACAC-AC-T-A---T--T-CAAACCCA--GAACAG--GGA-AAG-T-AT---A--AAATGA----ATTAAAAG-C--GAGT---A----A-GTA----T-CA---ATT-T--TCTCATGGT----A-AATGCA--TGC-A--T---C-A--A-TG--T-------TG------A--AA---T-T-A-TGGA---AA-Tgt
gi|3 : atgtgtaactatgtaactgttaaactgacttattagggaccaagatgtaacagttatgccTCAACT-CAAATATGC-CTG------GA-------------TTT--ACGTACATGTA-A-C-AGACAA-G-------TAT-----G---C-CAA-C-A-A-G-T------T--T--AA--CA----T-AAT--GT--A-TGCA-T-CTGACACATG----A--A-AAT---CA-ACACCT----T---AC--A-T----G-CTGTTAAT----C-----------------CTTT-T--T-CA---------------C------------A--------------G------------------------------T---T----------------T--G-ATCT--CT----ATGGG--C-GTT---TAT------A---AAA---A--------AA-A--A-A---CG-A-AGT-C-GGA-A-TA--T-T---T-G---A-AA-A----A---------T-TA--TAA----ACA-CATTAT-A---T---TTT--GCT--TCT--CATAACACTT----T-T---G-ACATTT--C----AT--TTTG--A--TT-C---AA---ACA--T-GTTTTCCTA-T-------A------A-GATC-----------GAACAA-AAA-------T--T----A-----A--A----T----A-AT---------T--TT-AA-------------------------------------------------T-T-GAA--AA--AA---------AC-------------------------C--CA-A---------CT-T--T--CC-A---A-A-T-----TGT-CTGA--CTT-------C-G-A-ATTT-T-GAT----------A-T-TT-TC-T----TA--------C-AGCCGAACG----GA-GA-C-TA-ACAC-AC-T-A---T--T-CAAGCCCG--GAACAA--TGA-ACG-T-GTTGGATTAAAT-G----ATTAAAAG-C--GAGT---AAGTCA-GTG----T-TG---ATT-T---TCTCTGAC----A-GGTGCG--TGC-A--T---T-A--A-TG--T-------TA------A--AA---T-T-A-TTAA---AA-T---------G-T-TATGAC-TG-T--TAC-G-----TAA-A-ATC-----------CAG-G-CA--------T---T-TTGAGTAG-AAA-AG-TCaaagtcgatcgaagt
gi|5 : tattgacttttTCAACT-CAAATATGC-C--------GG-------------ATT--ACC-----GTA-A-T-AG-------------TAT-----GCCAT-CCA-TTA-A-T-T------T--T--AA--C--T--T-ATT--GC--A-TGCA-C-CTGTCATGAG----A--A-AAC---CA--CA-CT----T---AC--T-T----G-CT-TTAAT----C-----------------CATT-T--T-CA---------------C------------ACATTCCCATGCTTCGC----------G---------T--------T---T-G-AATAGT----TGTT--A-GCCCACCC----ATTGG--A-GGT---AGA------A---AAAT--AC----TTCAA-A--A-GTT-CG-AGAGT-CCGGA-C-AA--T-TTCGA-A---A-AA-A----A---------T-TA--TAA----CTC-T---GC-A---T---TTT--GGT--TCT--AAGAAAGCT------CC---ATGCGTTC--C----AA----CC--A--TT-A---AA---GGG--A-TTCTTTTTGTT-------T------A-TATT------------AAT-A-ATA-------A--T----AGG---A--A---------A-ACATGTTTGAAT--CA-AA---ATGAAAT-------G--TCGAAAAGT------------------TTTAT-AAG--AAGCAAGT----A-TAC------------A-TGTT---T--AC--TA-A---------TT-T-TT--CC-A---A-A-T-----ATT-CTGA--CTT-------C-G-G-A----T-ATT-TTA------T-T-TT-TT-TA---TA--------C-CGCCCTTAG----A--GA-A-TG-ACAA-AC-A-A---A--T-CAAACCCG--GGACAA--GAA-ACA-T-GT--GA--AAATGG----ATTAACAG-C--ATGT---A----A-GTG----T-TG---ATT-T--CACTGTG
gi|11 : TCAACT-CAAATATGC-CTG------GA-------------TTT--AC------ACA-A-C-AGATAA-GT------CAT-----T---C-CAA-C-A-A-T-T------T--T--AA--CA-T--T-ATT--GC--A-TGCA-T-CTGTCACAAT----G--A-GAT---CA-ACA-CT----T---AC--A-T----G-CTTTTAAT----C-----------------CATT-T--T-CA---------------C------------ATGTTTCTTGTACCGG-----------G---------T--------T---T-G-AATTGTT---TGGT--A-ATCT--CT----AAGGG--C-GGTA--TAG------A---AAAT--AA-------AA-A--A-ATT-CG-A-AGT-C-GGA-A-TA--T-TTG-G-A---A-AA-A----A---------T-TAG-TAA----ATA-T---GT-A---TA--TTT--GCT--TCT--CATAAAACTT----TTT---G-GCATTT--C----AT--TTTG--A--TT-C---AA---ACA--T-GTTTTCCTAAT-------T------A-TATCCTT----------AT-A---A-------T--T----G-----A--A----A----A-A--------------A-GA---A-------------G--C-------T------------------TTT-T-GGA--AGCCAAA-----T-TGC------------A-TGTT---T--AT--AT-G---------TT-T-TT--CC-A---A-A-T-----TGT-CCaaagatcgatcg
gi|12 : TCAACT-CAAATATGC-CTA------GA-------------TTT--AC------ATA-A-T-AGACAA-GT------TAT-----T---C-CAA-C-A-A-T-C------T--T--AA--CA-T--T-A-T--GC--A-TACA-T-CTGTCACAAT----G--A-AAT---CA-ACA-CT----T---AC--A-T----G-CTGTTAAT----C-----------------CATT-T--T-TA---------------C------------AAGTTTCTTGTCCC-G-----------G---------T--------T---T-G-AATTGTT---TGTT--A-ATCT--T------CTAA-----------GG------G---CAGT--------------A--A-ATC-CG-A-AGT-C-GAA-T-AT--T-T---GAA---A-AA-A----A---------T-TAA-TAA----ACA-C---GT-A---TA--TTT--GCT--TCT--CATAAA-CTT----TTT---G-ACATTT--C----AT--TTTT--A--TT-C---AA---ACA--T-GTTT--CTATC-------A------A-TATCAAC-A---A--AAA--A-CTA-------TCCT----TTT---A--A----TTTGAA-AC------------AA-AA---A-------------G--C-------G------------------TTC-T-GAG--AACCAAA-----A-TGC------------G-TGTA---T--AT--CA-T---------TT-T-CT--CC-A---A-A-T-----TGT-TCaaag
gi|7 : actttTCAACT-CAAGTATGC-CTA------GA-------------TTT--AC------GTA-A-C-ATTCAT-GC------CAT-----T---T-CCA-T-A-A----------------AA--CA-T--T-AAT--GC--A-TGCA-C-CTACCACGAG----A--A-AAT---CA-ACA-CT----T---AC--T-T----G-CTTTTAAT----C-----------------CATT-T--T-CA---------------C------------AT-------------GTTCCCTATTCCG---------AGT------T---T-G-AATAATG---TGTT--A-GTCC--CTGGCAGTTGG--C-GGT---AGA------A---AAAT--AT----A--AA-A--A-ATT-CG-A-AGT-G-GGA-C-AAT-T-T---G-G---A-AA-A----A------------AA-TGATGT-ACA-C---TC-A---T---TTT--GGT--TCT--CAGAAAGCTT----TTT---G-AAATGT--C----AA--A
gi|13 : atcatgcatgcatctgtcacaatgaaatcaacacttacatgctgttaatccatttttacatatttcttgtcccgggtttgaattgtttgttaatctctaagggcggtatataaaaatgattaatccgaagtcggaatatttggaaaaattaataaacacatatatttgcttctcataaaacttTCCACT-CAAATATGC-CTG------GA-------------TTT--GC------GTA-A-C-AGACAA-GT------GAT-----T---T-C-A-C-A-A-C-T------T--A--AA--AA-T--T-AAT--AA--A-TACA-T-CTGTCATTAA----G--A-AAC---CA-ATA-AT----C---AC--T-C----A-TTACCAAC----C-----------------CATT-T--T-CA---------------T------------ATGTCTCCCCTCCC-G-----------GT--------T--------T---T-G-AATTATG---TGTT--T-ATTT--CT----ATCGG--C-TGT---AGG------A---AAGA--AT----C--GA-A--A-ATT-CG-A-AGT-C-GGA-C-AA--C-T---T-A---T-AG-A----A---------T-TAG-TAA----ACA-C---GT-A---T---TTT--GAT--TCTC-AAAAAAACTT----GTT---G-CCAT----------A--GT-------TT-G---AA---AGA--T--TATTCTTGTT-------G------A-TATaaagtcgatcgaagtgt
gi|17 : tcgacggatgttTCAATT-CAAAAATGC-CTG------GA-------------TTT--AC------GTA-A-T------A-AT------TATGCCATT---T-CCA-T-A-A-T-T------T--T--AA--CA-C--T-AAT--GC------CA-T-G---AAAAAA----A--A-AAT---CC-ACA-CT----T---AC--T-C----G-CTTTTAAT----C-----------------CATT-T--T-CA---------------C------------ACATTCCTTGTTCCGG-----------G---------T--------T---T-G-AATAGTG---TGTT--A-GTCC--CA----ATTGG--C-GGT---AGA------A---AAAT--AT----C--AA-A--A-GTT-CG-A-AGT-C-GGA-C-AA--T-T---T-G---G-AA-ATTTTT---------T-TA--TAA----ACA-T---GC-A---T---TTT--GGT--TCT--Ataataaaaacaggtttgaataagaaagaaa
gi|8 : TCAACTCAAAAT-TGC--TA------GA-------------TTT--AC------ATA-A-T-AGACAA-GT------TTA-----T---T-CCA-A-A-A-T-C------T--T--AA--CA-T-----AT--GC--A-TACA-TCATGTCACAAT----G--A-AAT---CA-ACA-CT----T---ACA-T--------CTGTTAAT----C-----------------CATT-T--T-TA---------------C------------AAGGTTCTTGTCCCGG-----------G---------T--------T---T-G-AATTGTT---TGTT--A-ATCT--CT----A--A-----GGG---CAG------T---AAAT-----------------------CG-A-AGT---GGA-A-TA--T-T---T-G---A-AA-A----AAAAT-----T-TAA--AA----ACA-C---GT-A---TA--TTT--GCT--TCT--CATAAA-CTT----TTT---G-ACATTT--C----AT--TTTT--A--TTCC---AA---ACA--T-G-TTTCCTATC-------A------A-TATCAAC-A---A--AAAC-T-ATC-------C--T----TTT---A--A----TTGA-A-AC------------AA-AA---A-------------G--C-------G------------------TTC-T-GAG--AACCAAA-----A-TGC------------G-TGTA---T--AT--CA-T---------TT-T-CT--C--C---A-A-T-----TGT-CCGA--CT-----------------------T-CGA------A-T-TT-TA-TA---TA--------aaagtcgatcgaag
gi|20 : aaaTCAACT-CAAATATGC-CTA------GA-------------TTT--AC------GTA-A-C-AGTCAT-GC------AAT-----C---T-CCA-T-A-A-T-T------T--T--AA--CA-T--T-AAT--AC--A-TGCA-T-CTACCACGAG----A--A-AAT---CA-ACA-CT----T---AC--T-T----G-CTTTTAAT----C-----------------CATT-T--T-CA---------------C------------ATGTTCCCTGATCCGG-----------G---------T--------T---T-G-AATAGTG---TGTT--A-GTCC--Caag
gi|32 : tTCAACT-CAAATATGC-CTG------GA-------------TTT--AC------ATA-A-C-AGACAA-GT------TAT-----T---C-CAA-C-A-A-T-T------T--T--AA--CA-T--A-AAT--GT--A-TGCA-T-CTGTCACAAT----G--A-AAT---CA-ATA-CT----T---AC--aaagtcgatcgaggtgt
gi|25 : ctcaatcgactttTCAACG-CAAATAGGAACTG------GA-------------TTT--ACC-----GTA-ATC-AGACAA-GT------T-T-----T---T-CAA-C-A-A-T-T------T--T--AA--CA-T--T-AAT--GC--C-TGCA-T-CTGTTACAAT----G--A-AAT---CA-ACA-CT----TAA-AC--A-T----GCCTGTTCAT----C-----------------CATT-T--T-CA---------------C------------A--------------at
gi|28 : gattgactttTCAATT-GACG-ATGC-CTG------GG-------------CTT--AC------ATA-A-C-AGACAA-AT------TAC-----T---T-CCC-C-A-A-C-T------T--T--AA--CA-T--T-AAC--GC--A-TGCA-T-CTATCACAAG----G--A-ATT---CA-ACA-CT----T---AC--T-T----G-CTGTTGGC----C-----------------CATT-T--ttgtttct
gi|21 : attTCAACT-CAAATATGG-CTG------GA-------------TTT--AC------GTA-A-C-AGACAA---------------------------------C-T------G--T--AA--CA-T--T-AAT--GT--A-AGCA-T-CTATCACAAG----G--A-AAT---CA-ACA-CT----T---AC--A-C----G-CTGTTTGT----T-----------------TCTT-A--T-CT---------------C---------------------------G-----------G---------A--------TTTAT-A-AATAGTG---TGTT--A-GTC-------------A--T-GATACGCGGTAGA--A---AAAT--AT----agggtacatagtctggttcc
gi|26 : TCAACT-CAAATATGC-CTG------GA-------------TTT--TC------GCA-A-C---ACGA-GT------TAT-----T---TTCCG-C-A-G-C-T------ACTT--AG--TACT--T-TATA-GT--AATGCA-C-TTGTCACAAG----G--A-AAT---CA-ACA-TT----C---AC--T-TATGTG-CTGTTAAT----C-----------------CATT-T--T-CA---------------C------------A--------------agtca
gi|27 : gTCGACT-CAAATATAC-CTGTACCTAGA-------------TGT--AG------GCA-A-T-AGACGT-GT------TAT-----T---T-CGA-C-A-A-T-T---------T--GA--TA-T--T-GCT--GC--A-TGCT-T-ATGTCATAAA----T--A-AAT---TA-ACA-TT----T---TT--TTC----G-ATGTTAAT----C-----------------CATT-T--T-CA---------------C------------A--------------aatgttgatcgaa
gi|10 : agagaacaTCAAT-----ATATGC--TG------GT-------------ATT--AT------TTA-A-C-AGGCAATGC------TAT-----T-----CTA-T-ATA-C-T------A--T--AAACCA-T--A-AATT-GC--A-TGCA-----ATCA---------------T---CA-ACA-CA----T---AC--T-C----GACTGCCTAT----C-----------------TATT-T----CA---------------C------------G--------------T-----------GTTCCTATCCG--------T---T-G-AATT-CG---TGGT--GCATTT--C-----A--GA--T-GGT----GG-------------T--AT----TT-AA-A--A-AT---A-A-TGT-A-TGT-G-AA--T-C---G-G---A-TA-T----T---------T-GAA-AAA----ACA-T---AC-A---T---TAC--A------T--GCAAAAGCTT----T-------ACGT-T--T----AA--GT-T--A--T------AA---A------GATTTCGTGTT-------A------A--ATC--C-AT--A--GAA----ACA-------T--T-----TT---A--A----T----A-AC---------T--TG-AA---AT----GACAGACAG--C-------C------------------TTC-T-G-------CAAG-------CAA------------G-T-TC---TTGGT--TA-AAAG------TT-T-TC--CA-A---A-ATT-----TAT-CCGA--CTT-------C-GTA-G----T-TTT-GGA------A-T-TT-aacgtcgt
gi|38 : TCAACT-GAAATATGG-CTG------GA-------------TTT--AC-------TAGA-T-AGACAA-TTTACTCGTAT-----T---T-CCACC-A-A-C-TC-----A--T------CA-C--C-AAT--GC--A-TGCA-T-gtcgaaacatcagtcgaagtg
gi|48 : cgcttcgatcgacgttTCAACT-CAAATATGC-CCG------AA-------------TTT--AC------GTA-A-C-AAACAA-GT------TAT-----
gi|35 : aatgttaaaaattttctTCAACT-CAAATATGC-CTG------GAATGGCTGCACAGATTT--AC------ATT-A-C-AGACAA-GT------TAT-----T---T-CAA-C-A-A-T-TTAAATAA--T--AA--CA-T--C-AA---------TGCA-T-GTGTaaagtcgatcg
gi|58 : tgtgatcgaatttTCGACT-CAAATATTC-CCG------GA-------------TTT--A---------A-A-C-AGACAA-AT------TAT-----T---T-
gi|56 : ttcggtcgacgttTCAACT-CAAATATGG-CTG------GA-------------TTT--AC------TTA-A-CAGGACAA-GT------TAT-----T---
gi|49 : tgCAGCT-CAAATATGC-CTT------GA-------------TTT--AC------TTA-A-T-AGGTAT-GC------TCT-----T---T-CCA-T-A-A-aagtcaatcgaa
gi|24 : aATT-AAAA---GT-C-G------GA-------------TTT--AC------GTA-T-C-AGTCAT-GC------CAT-----T---T-CCA-T-A-A-T-T------T--C--AA--CA-T----GAT--GG--A-TGCA-T-CTGCCATGAG----G--A-AAT---CA-ACT-CT----T---AC--T-C----G-CTTTTAAT----C-----------------AATG-T--T-CA---------------C------------A--------------taacgtcgattgaaatgt
gi|3 : aaaaagtagcacactattcaaacccggaacacggaacaAAA-ATGC-CTG------GA-------------TTTT-AC------GTA-A-C-AGTCAT-AA------CAT-----T---T-TAA-T-A-A-T-T------T--T--AA--CA-T--T-AAT--GC--A-CGCA-C-CTGTCAGAGA-------A-AAT---CA-ACA-CTGACTT---AC--T-C----G-CTTTTAAT----CATTTAATCCAACACGTTCATTGT--T-C----------------C------------G--------------G-----------G---------C--------T---T-G-AATAGTG---TGTT--A-GTCT--CC----GTTCGGCT-G-T---AAG------A---AAAT--AT----C--AA-A--A--TT-CG-A-AGT-C-AGA-C-AA--T-T---T-G---G-AA-A----G---------T-TGG-------------------G---T---TTT---TT--TCA--ATTAAAATTA----TTT---A-ATTTTTGTT----CG--ATCTT-A--TA-GGA-AA---ACA--T-GTTT--------------G------A--ATC--------A--AAAT-G-A-----------------------A--A----T----G------------T--CA-AA---AG----T-------G--T-------T------------------AT----GAG--AAGCAAA-----A-TATAAT---------G-TGTT---T--AT---A-A---------TT-T-TT--CA-A---A---------TATTCCGA--CTT-------C-G--------T-TTT------------T-TT-TT-TA---TA--------AACGCCCATAG----A--GA-T-----------------------CAAAC---------------------T-GT--GA--AAAAGG----ATTAACAG-C--ATGT---A----AGGTG----T-TG---ATT-T--TCATGTGTC----A-GATGCA--TAC-A--T---T----A-TG--T-------TA------A--AC---T-T-G-TTGG---CA-T-------A-C-T-TGT--C-TG-T--TACATGTACGTAA-A-TC------------CAG-G-CA--------T--AT-TTGAGTTGAAAA-AG-TCAAT
gi|23 : tAAATAT-T-CTG------GA-------------ATT--CC------ATA-A-------AA-GT------TAT-----T---T-CCA-C-C-A-C-T------T--T--AA--AA-T--T-TGT--GA--A-TGCA-T-CTG---CAAGTCAGG--A-AAT---CA-ATA-CT----T---AC--T-C----G-TTATT-AC----C-----------------CACT-T--T-AA---------------C------------A--------------T-----------G----------------------C-G-AATTATG---gagtagaaaagtc
gi|41 : aaagacaaactAAATATGG-CTT------GA-------------TTT--AC------ATA-A-C-AGACAA-GT------TAC-----T---T-CCG-C-A-T-C-G------T--T--AA--CA-T--T-GAT--AA--A-TGCA-T-CTGTCATAAA----gattcaaaatatcagtcagagtgt
gi|50 : tttcgacacAAATATGC-CTG------GA-------------TTT--AC------GTA-A-C-AGACAA-GT------TAT-----T---C-CAA-C-A-a
gi|39 : acttcgatagacttttcatctcACATGC-CTG------GA-------------TTT--AC------TTA-A-C-AGACTA-GC------TAT-----T---T-CCA-T-A-A-T-T------T--T--AA--CA-TTAT-AAT--GT--A-TGTA-T-CTGTCATATG----G--A-A
gi|53 : ATATGC-CTG------GA-------------TTT--AC------GTA-A-C-AGTCAT-GC------AAT-----T---T-CCA-T-A-A-G-T------T--T--AA--CA-G--T-AAT--GC--A-TGCcgatcgaag
gi|43 : ATGTAT-CTG------GA-------------TTT--AC------GTA-A-C-AGATAA-GT------TAT-----T---T-CCA-C-A-A-C-T------A--
gi|18 : atgttcaataactgtaacttaagtgtggatTATGT-CTG------GA-------------TTT--AT------ATA-A-C-AGAAAA-GT------TAT-----T---T-CCG-C-A-A-C-T------T--T--AA--CA-T--T-ATT--GCATG-TGTA-T-CTGACATAAG----G--T-GAT---CG-ACA-CC----T---AG--T-C--------GTTAAT----C-----------------CATT-TTAT-CATGTTCTCTGTC----C------------C--------------G-----------G---------G--------T---TAA-AATTATG---TGTT--G-ATTT--Caca
gi|30 : caaagTG------GA-------------TTT--AC------ATA-A-C-AGACAA-AG------TCT-----T---T-CCA-C-A-A-T-T---------T--A---CA-T--C-AATTTAC--A-TGTA-T-CTATAACAAG----G--A-AAT---CA-ACA-TT----T---AC--T-C----G-CTTTTAcatatgtatttgagtcaagccgttgatcgatgt
gi|47 : aagG-------------TTTCAAC------TCA-A-A-AGACAA-GT------TAT-----T---T-CAA-A-A-T-T-T------T--T--AA--CA-T--T-AAC--AC--A-TGCA-T-CTGTTACAtccagtgaaaacgtccgtcgacgcg
gi|52 : acttcaatcgac-------------TTT--AC------GTA-A-C-AGACAA-GT------TAT-----T---C-CAA-C-A-A-CTT------T--T--AA--CA-T--T-AAT--GG--A-TGCA-T-
gi|1 : gatcgac--AT------GTA-A-C-AGTTAT-GC------CAT-----T---T-CCA-T-A-A-T-T------T--C--AA--CA-T--T-GAT--GC--A-TGCA-T-TTACCATGAG----A--A-AAT---TG-ATA-CT----T---AC--T-C----G-CTTTTAAT----T-----------------CATT-T--TATA---------------CTTTCCCTGTTCTG--------------G-----------G---------T--------T---T-G-AATAGTG---TGTT--T-GTC---CT----AATAA--GAGGT---AGA------A---AAAT--AT----C--AA-A--A-CTT-CG-A-AGT-C-GGA-C-AA--T-TTG-G-G---A-AA-A----A---------G-TA--TAA----ACA-T---GC-A---T---TTT--GGT--TCT--CAAAAAGCTT-------------CAT---------GA--TTCA--A--TT-A---AA---AGG--G-TTTTTGTTGTT-------G------A-TA-CTATTA---G--GAAA-ACATG-------T--TTGA-ATC---A--AAAT-T----A-AA---------TGCCA-AA---AC------------G--T-------T------------------CTA-T-GAG--AAGCAAA-----AATAC------------G-TGTT---T--TTC-TA-A---------TTGT-TT--CA-A---A---------TATTCCGA--CTT-------CAG-A-C----T-GTT-T--------A-T-TT-TT-TA---TA--------C-CGCCTCTAG----A--GA-T-TA-ACAG-AC-A-A---T--T-CACACCCG--GGATAA--GAA-GCA-T-GT--GA--AAATGG----ATTAACAG-C--ATGC---A----A-AAT----T-TG---ATT-T--CATTGTGAC----A-GATGCA--TGC-A--T---T-A--A-TA--T-------TA------A--AA---T-T-GTTAGA---AA--A------A----------C-TG-T--TAC-T-----TAA-A-CC------------CAG-G-CA--------T--AG-TTGAGTTG-AAA-AG-TCGATCGAAct
gi|4 : atgtgtaactatgtaactgttaaactgacttattagggaccaagC------GTA-A-C-AGACAA-GT------TAT-----T---T-CCA-C-A-A-T-T------T--T--AA--CA-T--TGAAT--GC--A-TGCG-T-CTGTCATAAG----A--A-AAT---CA-ACA-CT----T---AC--C-C----G-CTGCTAAT----C-----------------CATT-T--T-AA---------------C---------------------------------------GTTC------A--------T---T-G---TCCTG---GGATTGA-ATTT--TT----ATCAG--T-A-------G------G---AAAT--AA----T--AAGA--A-ATT-CG-A-AGT-C-GGA-A-AA--T-TT--G-G---A-AA-A----A---------T-TAG-TAA----ACA-C---GC-A---T---TT---GCA--TCT--CCGAAAGCTT----TTT---A-ACATTT--C----AT--TTTT--A--TT-C---AA---ACA--T-GTTTTCCTATT-------G------A-TATC----A---A--TAAG-A-ATA-------T--T------T---A--A----TGT--A-AA---------A--CA-AA---AA------------G--C-------T------------------TTT-G-GGG--AACCAAA-----A-TGC------------A-CGTT---T--AT--TA-A---------TT-T-TA--CT-A---G-A-T-----TAT-TAGA--CTT-------C-G-A-A----T-GAT-CG--------------------------------C-CGT--ATCA----G--GA-T-TA-ACAC-GC-A-A---T--T-C---------T----A--GGG-ACA-T-GT--GA--AAATGG----AATAACAG-C--GAGT---A----A-GTG----CATGTATATT-T--CCTTGTGGT----A-GGGGCA--TGC-A--T---T-A--A-TG--T-------TA------A--CG---T-T-T-TGGG---AA-TT------A-C-T-TG-----CA-T--TG--------------TC------------CAT-G-----------T--AT-TTGAGTTG-AAA-CG-TCTATgt
gi|34 : a------GCA-A-G-AGACAA-GT-------AT-----T---T-CAA-C-A-A-T-T---------T--AAG-CA-T--T-AAT--GC--A-TACA-T--T-TCACAAT----G----AAT---CA-ACA-CT----T---AC--aatgtgttgaaatcgtcggtcgaagt
gi|60 : ctatgactttttccatcaaatgacttaaatttatcctA-A-C-AGACAA-GT------TAT-----T---C-CAA-C-A-A-T-C------T--T--AA--TA-T--T-AAT--GC--A-TGCA-T-CTTTCACAA
gi|33 : CAA-GT------TAT-----T---T-CCA-C-G-A-C-T---------T--AA--CAAT--T-AAG--TC--A-TTCA-T-TTGTCACAA-----G--A-AGT---GA-ACA-CT----T---AT--T-C----G-TCGTTAAT----G-----------------CATT-T--C-CA---------------C------------A--------------t
gi|9 : acagagagcaA-AC------TGT-----T---T-TCA-C-A-A-C-T------T--T--TA--CA-T--T-AAT--GA--A-TGCA-A-TTGTAATGTA----GGTA-AAG---CA-CCA-CT----T---AC--G-C----G-TTGTAAAT----C-----------------CATT-T--T-CA---------------C------------AC-------------G-----------T---------ACCCCGTGTT---T-G-AATTGTG---TGTT--T-ATCT--CA----ATTAA--C-GAT----AA------A---AAAT--AT----T------------C-AA-A-AGT-------A-TT--T-T---G-G---A-CA-A----A---------A-TAG-AAA----AGA-C---GC-A---T---TTT--GGT--TCT----CAAAGCTT----TTT------CTTCT--TTTACAA--ACCA--AAGTT-G---AATTTAT---T-GTTTT--TGTT-------G------A-TATCAAC-A---G--AAAA-A-AGG-------T--G----AC-------A----T-------T---------T--CA-AA---A-----A-------G--C-------T------------------C---C-GCG--AAACAAA-----T-TGT------------G-TGTT---T--AC--TATAATATATTTTTT-T-TT--CC-A---A-A-T-----T-C-CCGA--ATC-------T-G-G-A----T-TTT-CCACTTTCCA-T-TTCTT-TT---TA--------C-TGCCAAatgtctacagtacgca
gi|6 : aatccA-AG------TAA-----T---T-CCT-C-A-A-C--------A--TTAAA--CA-T--A-GAG--AG--G-TACACT-CTATTACAAA----A--ACAAT---CA-AC--CT----TGTGACGTT-C----G-TTGTTAATTAGCC-----------------CATT-T--T-CAAAATGTCTTTCTGTCC------------A--------------G-----------G---------G--------T---T-GCAATTGTGAGTTTAT--A-ACCA--CT----GGCGG--G-AAG---CAA------A---AAAA--GT----CG-AA-A--A-ATT-C--A-AGT-A-GGC-A-AA--T-T---G-T---ATTA-T----A---------T-TAGACAA----ACAGC---GCAA---T---TTT--GCT--CTC--AGG-AAGC---------------CCTCT--T----GG----CT--T--TT-----------CC--T-ATTTTCTTACC-------T------C-TATC-GC-A---ACCAAAT-A-ATAATCATTTT--T----TTT---A--AAAATT----ATAC---------T--GG-AA---A-------------G--T-------T------------------TTT-T-CAA--GTTGAAA-----A-TAT------------G-TGTT---T--GA--TATA---------TT-T-TT--CA-A---A-T-T-----GGT-CCGA--ACT-------T--------------C-CGG------A-T-TT-T-------TA--------C-C-CCA----------------TA-G-------A-T---T--T--AAATCCG--GGACAG--GGATACG-A-GT--G---AATTGG----ATTAACAG-A--AT---------------------------CT-T--CTGTATGGC----A-GTCGCA--TTT-A--T---T-G--A-TG--T-------TG------ATCGT---T-T-G-TAGA---AA-Taaaggat
gi|6 : AT-----T---T-CTA-C-A-AAC-G------A--TC-AA--CA-T--C-AAT--AA--A-TGCG-A-CTGCCATACA----G--A-AG---------------------AT--T-C-------TGTTAAT----C-----------------CAAT-T----CA---------------C--------------------------------------------------------------------TCGT------------ATCC--CT----GTC--------C---CGG------ATTTAAATCTATGGGGT--AA-A--A-ATC-CGGA-AGTTC-GGA-CCAA--T-T---T-G---A-AA-A----A---------TATAT-CAA----ACA-C---AT-A---T---TTTCAACT--T----GAAAAAACTT----TCC---A-GTAT----------A--ATTT-----TT-A---AA---AAAAAT-GATT-ATTATTTGGTTGCG------A-TAGAGGT-A---A--GAA--A-ATA-------G--G----A-----A--A---------A-GC------------CA-AG---AG----G-------G--C-------T------------------TCC-T-GAG--AGCAAAA-----T-TGC------------G----C---T--GT--T---------------T-GT--CT-A---ATA-T-----AAT-ACAA--TTTGCCTACTT-G-A-A----T-TTTTCGA------C-T-TT-TT-TTGCTTC--------C-CGCCAGTGG----T--TA-T-AA-ACTC-AC-AAT---T--G-CAACCCTGGACAGAAA--G---ACA-T-TTT-GA--AAATGGGCTAATTAACAA-CGAACGTCACA----A-G-G----T-TG---ATTGT--TTTTGTAAT----A-GA-GTG--TAC-C--TCTCT----A-TGT-T-------TA------A--TG---T-T-G-AGGA---AT-TA------gctcag
gi|40 : -----T---T-TCA-T-A-A-T-T------T--T--AA--CA-T--T-AAT--GC--A-TGTA-C-CTGCCATGAG----A--A-AAT---CT-ACA-CT----T---TC--T-C----G-CTTTTAAT----C-----------------CATT-T--T-CA---------------C------------A--------------cttgctcag
gi|55 : gggaacg---T-CAA-C-A-A-T-T------T--T--AG--CA-T--T-AAT--GC--A-TACA-T-TTGTCACAAT----G--A-AAT---CA-ACA-CT----T---AC--A-C----G-C
gi|14 : -C-A-T-C-T------T--T--AA--CA-T--C-AAT--GA--A-TGCA-G-CTGTCTTAAG----A--A-AAT---TA-GCA-CT----T---AC--C-C----G-CTGCTAAT----T-----------------CATT-T--T-TA---------------C------------ATGTTTCCTGTCCCGG-----------G---------T--------T---T-G-ACTTTCG---TTAT--G-ATCT--CT----ATTGG--T-GGT---AGA------A---AGA------------AA-ACGA-ACA-TGTA-AGT-C-GGA-T-GA--T-TTA-A-G---A-TA-A----A-----------TAA-TAA----ACA-C---GT-A---T---TTCA-GCTGAGCTGGAGAAAAGCTT----T--------TGTTT--T----AG----CT--G--TT-G---AA---A----T-GTTT
gi|7 : ttgaaaaaaaattgtaaacatgcattctattccccagaattctcttttacatttgtttttgtccAT--GC--A-TGCA-T-CTGTCACAAT----G--A-AAT---CA-ACA-CT----T---AC--A-T----G-CTGTTAAT----C-----------------CATT-T--T-TA---------------C------------ATATTTCTTGTCCCGG-----------G---------T--------T---T-G-AATTGTT---TGTT--A-ATCT--CT----A--A-----GGG---CGGTATATAA---AAATG-AT----T--------A-ATC-CG-A-AGT-C-GGA-ATAT--T-T---G-G---A-AA-A----A---------T-TAA-TAA----ACA-C---AT-A---TA--TTT--GCT--TCT--CATAAAACTT----TTT---G-ACATTT--C----AA--A
gi|51 : atcT--GC--A-TGCA-T-CTGTCACAAT----G--A-AAT---CA-AC--------T---AC--T-T----G-CTTTTAAT----C-----------------CATT-T--T-CA---------------C------------aagctttctgagaaccaaaatgagtgtacatcatttttttccaaattgtcccacttcgaattttttatatttttctaccgccaactgccagggactaacacattattcaaactcggaatagggaacatgtgaaaatggattaaaagcaagtaagtgttgattttctcgtggtaggtgcatgcattaatgttttatggaaatggcatgaatgttacgtaaatctaggcatacttgagttgaaaagtcgatcgaagtgt
gi|19 : TGCCATGAG----A--A-AAT---CC-ACA-CT----T---AC--T-C----G-CTGTTAAT----C-----------------CATG-T--T-CA---------------C------------GCACTCCTTTCCCT-G-----------G---------T--------T---T-G-AATAGTG---TGTT--A-GTCC--GA----ATTGG----------CGG-------------T--A-----T--AA-A---------G-A-AGT-C-GGA-C-AAT-T-T---G-GAAAA-AA-A----A---------A-TA--TAG----ATA-T---GC-A---T---TTT--GGA--TCTC-ATAAAAGCTT----ctgttccgg
gi|5 : ccttttaattgaaacaagCACAGT----G--A-AAT---CA-ACA-CT----T---AC--A-T----G-CTGTTAAT----C-----------------CATT-T--T-CA---------------C------------ATGTTTCTTGTCCCGG-----------G---------T--------T---T-G-ATTTGTT---TGTC--A-TTCT--CT----A---A--G-GG----CGGTAT---A---AAAA--AA----T--AA-A--ATATC-CG-A-AGT-C-AGA-A-TA--T-TT--G-G---A-AA-A----A---------T-TAG-TAA----ACA-T---GT-A---TA--CTT--GCT--TCT--TATAAAACTT----TTC---G-ACATTT--C----AT--TTTG--A--TT-C---AA---ACA--T-GTTTTCCTATT-------ATTATTAA-TATAAAC-A---A--AAAG-A-ATC-------C--C----TTT---A--A----T----G-GT---------T--GG-AACGCAT----G-------GAGC-------T------------------TTC-T-TAG--AACCAAA-----A-TGC------------A-GAGT---T--AT---A-A---------TT-T-TTTTCG-A---A-A-T-----TGT-CCGGACTCT-------C-G-A-A----C-TTT-TGA------AGTATT-TT-TC---TA--------C-CTCCAATGG----GTGGG-C-TA-ACAA-CT-A-T---T----CAAACGCG---AAGCATGGGA-ATG-T-GT--GA--AAATGG----ATTAA-AG-C--AAGT---A----A-GTG------TG---GTT-T--TCTCATGAC----A-GGTGCA--TGC-A--A---T-A--A--G--T-------TA------A--AA---T-TAA-TGGATGGCA-TA-----------------C-TA-T--TACGG-----TAA----T------------CCG-G-CA--------T--AT-TTGAGTTG-AAA-AGATCGATCG
gi|61 : CACTAG----A--A-AAT---CA-GCA-CT----T---AC--T-T----G-CTTTTAAT----C-----------------CA
gi|36 : T--A-ATCT--CT----ATGGG--A-GGT---ATA------A---ACAA--AT----A--AG-A--A-ATC-CA-A-AGT-C-GGA-ATAT--T-T---G-G---A-AA-A----A---------A-TAG-TGATATCATA-T---AA-A---TA--TTT--GCT--TCT--gtattggaatgcagtaa
gi|57 : aacgttttatg--A-GTCC--CA----ATTGG--T-GGT---AGG------A---AAAT--AT----C--AA-A--A-GTT-CG-A-AGT-C-GGA-C-AA--T-T---a
gi|9 : ttacaaGG------A---AAGT--G--------GA-A--A-ATC-CA-G-ATT-C-GGG-A-AT--T-T---G-G---A-AA-A----AAAAATATATTATAG-TAA----ACA-C---AC-A---A---TTT--GTT--TCG--CGGA--GCTT----TTT---G-AAATGT--C----A----CCT-------------------------TTTTTCTGTT-------G------A-TATCAAC-A---A--AAAC-A-ATA----------------------------------A-AT---------T--CA-AC---TT----T-------G--G-------TTTGTAAAAGAAGAAAAAGCTT-T-GAG--AACCAAA-----A-TGC------------G-TCTT---T--TC--TA-T---------TT-T-GT--CC-A---A-A-A-----TAC-------TTT-------T-G-A-A----T--------------A-T-TT-TT-TA---T-----------CGTTAATTG----A--GA-T-AA-ACAC-AC-A-A---T--T-CAAACACG-------G--GGT-ACG-T-GT--GA--AAATGG----ATTTACAA-C--GCGT---A----A-GTG----G-TG---CTT-TACCTACATTAC----A-ATTGCA--TTC-A--T---T-A--A-TG--T-------AA------A--AG---T-T-G-TGAA---AA-C-------A-G-T-TG
gi|8 : aatc---AAAT--AT----A--TA-A--A-ATT-CG-A-AGT-C-GGA-C-AA--T-T---G-G---A-GA-A----A---------A-TGA-TAT----ACA-C---GC-A---T---TTT--GGT--TCT--CAGAACGCTT----TTT---G------T--T---------TCA--A--TT-A---AA---AGGA-TAGTTTT--TGTT-------G------A-TATTGAT-A---G--GAAA-C-ATG-------T--TTGG-AAT---A--A----A----A-ATGAAATG---T--CA-AA---A-------------A--G-------T------------------TTA-T-GAG--AAGCAAAT----A-TAC------------G-TGTT---T---T--TA-AATTT-----TT-T-TT--CA-A---A---------TAT-TCCA--CTT-------C-G-A-----------------------------T-T----TA--------C-TGCCCTTAG----A--GA-T-TA-ACAA-AC-A-A---T--T-CAAACCCG--GGACAA--GAA-CCT-T-GT--AA--AAATGG----ATTAACAG----ATGT---A----A-GTG----T-TG---ATT-T--CATTGTGAC----ATGATGTA--TGC-A--T--------A-TG--T-------TA------A--GA---T-T-T-TGG----AA-TA------A-ACT-TGT--C-TA-T--TAT-G-----TAA-A--T------------CTA-G-CA--------A--TT-TTGAGTTG-AAA-atttctttttactgccaaaaaggat
gi|10 : A-A--A-ACTACG-A-AGT-C-GGATA-AATTT-T---G-G---A-AA-A----C---------T-T-T-TAA----CCA-A---GA-A---C---TT---GCT--TGC--A-GAAGGCTG----TCT---G-TCATTT--C----AA--GT-T--A--TT-A---AA---A----T-GTTT--CTATG-------G------A-T-TTAAC-A---C--GA---A-ATC-------T--T------T------A----T----A-AC---------T--TA-AA---CG----TAAA----G--C-------T-------------------TT-T-G-------CATG-----T-AAT------------G-TATG---T-------------------TT-T-TT--CA-A---A---------TAT-CCGA--TTCACA----T-A-C-A----T-TAT------------T-TT-TA-AA---TA--------C-CACCATCTG----A--AA-TGCA-CCAC-GA-A-----T--T-CAA---CG----GATA--GGA-ACA-C-GT--G---AAATAG----ATAGGCAGTC--GAGT---A----T-GTG----T-TG---A-----------TGAT--------TGCA--TGCAA--T---T-T--A-TGGTT-------TA------T--AG---TAT-A-TAG----AA-TA------GCA-T-TGC--C-TG-T--TAA-A-----TAATA-C-------------CA--G-CA--------T--ATATTGAGTCG-AAA-CA-TCAGTCGAAg
gi|15 : aaattcc-AGT-C-GGT-A-AT--T-TTG-G-G---A-AA-A----A---------T-TAG-TAA----AC--C---GT-AATTT---TTG--GCT--TCTC-ATGAAA--TT----TTT---G-ACAATT--T----TA--ATTT--A--TT-C---AAAT-ACA--T-GTTGTTCTATT-------A------A-TATCAAC-A---A--AAAG-A-ATAATCC---T--T----AATTGAA--A----T----A-A--------------A-AA---A-------------G--C-------T------------------TCT-T--AG--AA-AAAA-----A-TAG------------C-TATTTTAT--AT--TT-T---------TT-TAGA--CA-ATTGA-A-TNNNNNNNN-NNNN--NNN-------N-N-N-N----N-NNN-NNA------A-T-TT-TT-GA---TATTTTTCTCC-CGCCAATTG----G--GACT-TGCACACTAC-A-TGTAT--T-CAAACCCG--GAACAG--GGgtg
gi|22 : aT-C-GGA-A-TA--T-TT--G-G---A-AA-A----A---------T-TAA-TAA----ACATT---AC-AAG-TATATTT--GCT--TCT--CTTAAAACTT----TTT---G-ACAT-T--T----GA--TTTTTAA--TT-C---AA---ATA--T-G-TTTCCTATT-------A------A-TATC-----------AACT-A-AT------------------T---G--A---------A-AC------------AA-AA---A-------------G--C-------T------------------TTC-T-GAG--AACCGAC-----ATTAC------------A-T----------T--TA-A---------TT-T-a
gi|11 : -GGA-C-AA--T-TT--G-G---A-AA-A----A---------CATA--TAA----ACA-T---GC-AA--T---TTG--GCT--TCC--AA-AAAGCTTCTTTTTT---C-A-ATTA--T----AAGGATAT--AA-TT-AGGAAA---ACA--T-GTTT--------------G------A--ATC--------A--AAAT-G-A-----------------------A--A----T----G--C---------C--AA-AA---A-------------G--T-------T------------------TTA-T-GAG--AAGCAAAT----A-TAC------------A-TATT---T--AC--TA-A---------TT-T-TTT-CC-A---A-A-T-----ATT-CCGA--CTT-------C-G-A-A----T-TTT-TTT------A-T-TT-TC-TA---TA--------C-CGCCCTTAG----A--GA-T-TA-CCAA-AC-A-A---T--T-CAAACCCG--GTACAA--GAA-ACA-T-GT--GA--AAATGG----ATTAAAAG-C--ATGT---A----A-GTG----T-TG---ATC-T--CATTGTGAC----A-GATGCA--TGC-A--A---T-A--A-TG--T-------TA------A--AA---T-T-G-TTGG---AA-TG------A-C-T-TAT--C-TG-T--TGT-G-----TAA-A-TC------------CAG-G-CA--------T--AT-TTGAGTTG-AAA-ta
gi|12 : -A-AT--T-T---G-G---A-GA-A----A---------A-TGA-TAT----ACA-C---GC-A---T---TTT--GGT--TCT--CAGAACGCTT----TTT---G----TTT--C----AA--AT--------T-A---AA---AGGA-T-AGTTTTTTGTT-------G------A-TAT-TGA-T---A--GAAA-C-ATG-------T--TTG--AAT---A--A----A----A-ATGAAATG---T--CA-AA---A-------------A--G-------T------------------TTA-T-GAG--AAGCAAAT----A-TAC------------G-TGTT---T--AT--TA-A---------TT-T-TTTTCA-A---A---------TAT-TCGA--CTT------------------------CGG------A-T-TT----------A--------C-TGCCCTTAG----AA-GA-T-TA-ACAA-AC-A-A---T--T-CAAACCGG---GACAA--GAA-ACT-T-GT--AA--AAATGG----ATTAACAG-C--ATGT---A----A-GTG----T-TG---ATT-T--CATTGTGAC----A-GATGTA--TGC-A------T-A--A-TG--T-------TA------A--GA---T-T-G-TTGG---AA-TA------A-C-T-TGT--C-TA-T--TAT-G-----TAA-A-TC------------TAG-G-CA--------T--AT-TTGAGTTG-AAA-AG-ag
gi|16 : -G---A-AATA----G---------C-TA--TAC----ACA-C---AC-A---C---TTT--GCC--CCT--CGGAAAGCTT----TTTTCAA-AAA----------AA--AAAT--A--TT-C---AA---AAA--T-GTTTTCCTTTC-------G------A-TG--TAC-AAAGA--GAGT-A-ATC-------T--T----TTTTTCA--A----T----G-A-------------AA-AA---AG----T-------A--T-------T------------------TTT-A-GAGAAAAACAAA-----A-CACAAACACACCCTTG-CATG---TTAAT--TA-A---------TT-T-TT--CA-A---A-G-T-----TAT-CAAA--ATT-------C-A-A-T----T-AAT-CAT------A-T-TC-TTATA---TA--------C-CGC------------------TA-AAAT-GA-A-TG--T--T-CAAACTCGCATAAGAG--GGG-GTA-C-GT--Ggttc
gi|13 : T--A--TT-C---AA---ACC--T-GTTTT--TATT-------A------A-TATCAAC-A---A--GAAT-A-ATC-------T--TTCAAACT---ATGG----C----A-AC---------------AA---GT----T------------------T------------------TTT-T-GAG--AATCAAA-----A-TAC------------G-TGTT---T--AC--TA-A---------TTCT-AT-----A---A-G-T-----TGT-CCGA--CTT-------C-G-A-A----T-TTT-CGA------T-T-CT-TT-CC---TA--------C-AGCCGATAG----A--AA-T-AA-ACAC-AT-A-A---T--T-CAAAACCG--GGAGGG--GAG-ACA-T-AT--GA--AAATGG----GTTGGTAA-T--GAGT---G----A-TTA----T-TG---GTT-T--CTTAATGAC----A-GATGTA--TTT-A--T---T-A--A-TT--T-------TT------A--AG---T-T-G-T-GA---AA-TC------A-C-T-TGT--C-TG-T--TAC-G-----CAA-A-TC------------CAG-G-CA--------T--AT-TTGAGTGG-AAA-CA-TCCGTCGA
gi|29 : TTTCCTATT-------G------AATATCAAC-A---A--GAAT-G-ATC-------T--TTTTAGCT---A--A----A----A-A--------------A-AA---AA----T-------G--C-------T------------------TTT-TCGAG--Aagaaagaaa
gi|7 : aaaataataaatcatggcgttattaggcaa---------T--CA-AA---AA------------G--C-------T------------------TTC-T-GAG--AACCAAA-----A-TGA------------G-TGTA---C--AT--CA-T---------TT-T-TTT-CC-A---A-A-T-----TGT-CCCA--CTT-------C-G-A-A----T-TTT-TTAT-----A-T-TT-TT-C----TA--------C-CGCCAACTGCCAGG--GA-C-TA-ACAC----A-T---TATT-CAAACTCG--GAATAG--GGA-ACA-T-GT--GA--AAATGG----ATTAAAAG-C--AAGT---A----A-GTG----T-TG---ATT-T--TCTCGTGGT----A-GGTGCA--TGC-A--T---T-A--A-TG--T-------T---------------T-T-A-TGGA---AA-TG------G-C-A-TGA--A-TG-T--TAC-G-----TAA-A-TC------------TAG-G-CA--------T--AC-TTGAGTTG-AAA-AG-TCGATCGAAcgtgaatgccaagaagcttgccgagacagttaaacacacgag
gi|7 : atcatgcatgcatctgtcacaatgaaatcaacacttacatgctgttaatccatttttacatatttcttgtcccgggtttgaattgtttgttaatctctaagggcggtatataaaaatgattaatccgaagtcggaatatttggaaaaattaataaacacatatatttgcttctcataaaactttttgacatt---------T--CA-AA---AA------------G--T-------T------------------TTA-T-GAG--AAGCAAAT----A-TAT------------G-TGTT---T--AT--TA-A---------TT-T-TT--CC-A---A-A-T-----ATT-CCGA--CTT-------C-G-G-A----TTAAT-C--------A-T-TT-TTATA---TA--------C-CGCCCTTAG----A--GA-T-TA-ACAA-AC-A-A---T--T-CAAACCCG--GGACAA--GAA-ATA-T-GT--AA--AAATGG----ATTAACAG-C--ATGT---A----A-GTG----T-TG---ATT-T--CATTGTGAC----A-GATGCA--TGC-A--T---gtgt
gi|19 : atc-------G--C-------T------------------TTTAT-GAG--ATCCAAA-----A-TGC------------A-TATC---T--ATATTT-T---------TT-T-TT--CC-A---A-A-T-----TGT-CCGA--CTT-------C--------------------------------TT-TA---TA--------C-CGCCAATTC----G--GA-C-TA-ACAC-AC-T-A---T--T-CAAACCAG---GGAAA--GGA-GTG-C-GT--GA--ACATGG----ATTAACAG-C--GAGT---A----A-GTG----T-GG---ATT-T--TCTCATGGC----A-catttcaaaaagctttctgagaaccaaaatgagtgtacatcatttttttccaaattgtcccacttcgaattttttatatttttctaccgccaactgccagggactaacacattattcaaactcggaatagggaacatgtgaaaatggattaaaagcaagtaagtgttgattttctcgtggtaggtgcatgcattaatgttttatggaaatggcatgaatgttacgtaaatctaggcatacttgagttgaaaagtcgatcgaagtgt
gi|36 : ccttttaattgaaacaagaa-T-GAG--AAGCAAATATTTA-TAT------------GATATC------AC--TA-T---------TT-T-TT--CC-A---A-A-T-----ATT-CCGA--CTT-------T-G-G-A----T-T-T-CTT------A-T-TTGTT-TA---TA--------C-CTCCCATAG----A--GA-T-TA-A
gi|17 : aacgttttaAG--AACCAAA-----A-TGC------------A-TGTT---T--AT--AA-AAAAA-----TT-T-----CC-A---A-A-T-----TGT-CCGA--CTT-------C-G-A-ACTTTT-GAT----------A-T-TT-TT-C----TA--------C-CGCCAATTG----G--GA-C-TA-ACAC-AC-T-A---T--T-CAAACCCG--GAACAA--GGA-ATG-T-GT--GA--AAATGG----ATTAAAAG-C--GAGT---A----A-GTG----T-GG---ATT-T--TTTTTTT-C-------ATG-----GC-A--T---T-A--G-TG--T-------TA------A--AA---T-T-A-TGGA---AA-TG------G-C-A-TAA--T-TA-T--TAC-G-----TAA-A-TC------------CAG-G-CA--------T--TT-TTGAATTG-AAA-AG-TCGATCGAA
gi|14 : t--AGCTGAA-----A-TAC------------G-TGTT---T--AT--TA-----------TT-T-AT--CTTA---A-A-T-----CAT-CCGA--CTT-----------ACA----T-GTT-CGT------T-T-TC-TT-TC---TA--------C-CACCAATAG----A--GA-T-CA-TAAC-GA-A-A---G--T-CAAACCCG--GGACAG--GAA-ACA-T-GT--AA--AAATGA----ATTAGCAG-C--GGGT---A----A-GTG----C-TA---ATT-T--TCTTAAGAC----A-GCTGCA--TTC-A--T---T-G--A-TG--T-------TA------A--Ag
gi|31 : ttgaaaaaaaattgtaaacatgcattctattccccagaattctcttttacatttgtttttgtccaaacatttcaacagctaaaacaaaagcttttctccagctc-GT--CC-A---A-A-T-----TAA-CTGA--CTT-------C-G-A-A----T-GTT-CGAT-----A-T-TT-TT-TC---TA--------C-TGCCAATCG----G--GA-G-TA-ACAC-TC-T-A---T--T-CAAACCCG--GGACAG--GGA-ACG-T-GT--GA--Agatg
gi|57 : tgtgttaatctctattggcg--CA-A---A-A-T-----TGT-CCGA--CTT-------C-G-A-ACTTTT-GAT----------A-T-TT-TC-C----TA--------C-CACCAATTG----G--GA-C-T
gi|54 : tta------A-T-TT-TT-TT---CA--------C-CGCCCATAG----A--G--T-TA-ACAA-AC-A-A---T--C---AATCCG--GGACA----GA-ACA-T-GT--GA--A
gi|21 : -TT-TT-TC---TA--------C-CGCGTATCA----T--GA-C-TA-ACAC-ACTA-T---T--TATAAATCCG--AGATAA--GAA-ACA------------------------AACAG-C--GTGT---A----A-GTG----T-TG---ATT-T--CCTTGTGAT----A-GATGCT--TAC-A--T---T-A--A-TG--T-------TA------C--A------------------------------G-T-TGT--C-TG-T--TAC-G-----TAA-A-TC------------CAG-C-CA--------T--AT-TTGAGTTG-AA
gi|31 : ata-TT-TG---GA--------C-CGCCAATAG----A--GA-T-TA-ACAC-gtca
gi|46 : tT-TC---TA--------C-CGCCAGTCG----G--GG-C-TA-ACAC-ACTA-T---T--T--AAACCAG----ACGA--GGA-ACA-TCAT--GG--AAATG------------G-C--AAGT---C----A-GTG----T-Tttaactgacttcgaatgttcgatattttttctactgccaatcgggagtaacactctattcaaacccgggacagggaacgtgtgaa
gi|45 : -TA---TA--------C-CGCCCTTAG----A--GA-T-TA-ACAA-AC-AATA--T--T-CAAAACCG--GGACAA--GAA-ACA-T-GT--AA--AAATGG----ATTAACAG-T--A
gi|20 : G----G--GA-C-TA-ACAC-AC-T-A---T--T-CAAACCCG--GATCAG--GGA-ACA-T-GT--GA--AAATGG----ATTAAAAG-C--AAGT---A----A-GTG----T-TG---ATT-T--TCTCGTGGT----A-GATGCA--TGT-A--T---T-A--A-TG--T-------TA------A--AA---T-T-A-TGGA---GA-TT------G-C-A-TGA--C-TG-T--TAC-G-----TAA-A-TC------------TAG-G-CA--------T--AT-TTGAGTTG-AAA-AG-TCGATCGA
gi|18 : tA-T-CA-ACAC-AT-A-A---T--T-TTAACCCG--GGACAG--AGA-ACA-T-GA--TA--AAATGG----ATTAACGA-C-----T---A----G-GTG----T-CG---ATC-A--CCTTATGTC----A-GATACACATGC-A--A---T-A--A-TG--T-------TA------A--AG---T-T-G-CGGA---AA-TA------A-C-T-TTT--C-TG-T--TAT-A-----TAA-A-TC------------CAG-A-CATACATATGT--AT-TTGAGTCA-AGC-CG-TTGATCGAggtgt
gi|24 : caaaggaa-TA-GCAC-AC-T-A---T--T-CAAACCCG--GAACAC--GGA-ACA-T-GT--GA--ACATTG----ATTAAAAG-C--GAGT---A----A-GAG----T-TG---ATT-T--CCTCATGGC----A-GATGCA--TCC-A--T---C----A-TG--T-------TG------A--AA---T-T-A-TGGA---AA-TG------G-C-A-TGA--C-TG-A--TAC-G-----TAA-A-tgt
gi|44 : aaaaag---T--T-CAAACCC--------A--GGA-TTA-T-AT--AA--AAAAAA----AT--ATAG-G--AAGG---A----A-GTG----T-AT---ATT-T--CATTATGAC----G-GGCGCA--TAC-A--T---tccgacttttaat
gi|25 : A--GAA-ACAAT-GT--GA--AAATGG----ATGAACAGGC--ATGTTT-A----A-GTG----T-TG---ATT-T--CATTGTAAC----A-GATGCA--GGC-A--T---T-A--A-TG--T-------TA------A--AA---T-T-G-TTGA---AA--A------A-C-T-TGT--C-TGAT--TACGG-----TAA-A-TC------------CAGTT-CC--------T--AT-TTGCGTTG-AAA-AG-TCAATCtgtg
gi|40 : --GGA-ACG-T-GT--GA--AAATGG----ATTAAAAG-C--GAGA---A----A-GTG----T-AG---ATT-T--TCTCATGGC----A-GGTACA--TGC-A--T---T-A--A-TG--T-------TA------A--AA---T-T-A-TGAA---A
gi|51 : g--GGA-ACA-G-GT--GA--AAATGG----ATTAAAAG-C--AAGT---A--------G----T-TG---ATT-T--CATTGTGAC----A-GATGCA--TGC-A--
gi|27 : GA-ACA-T-GT--GA--AAATGG----ATTAACAT-CG-AAAA---A----A-ATG----T-TA---ATT-T--ATTTATGAC----A-TAAGCA--TGC-A--G---C-A--A-TA--T-------C-------A--AA---T-T-G-TCGA---AA-TA------A-C-A-CGT--C-TA-T--TGC-C-----TAC-ATCTAGGTA-------CAG-G-TA--------T--AT-TTGAGTCG-AAA-CG-TCGgg
gi|33 : agaGA-GCA-T-GT--GG--AAATGC----ATTAACGA-C--GAAT---A----A-GTG----T-TC---ACT-T--C-TTGTGAC----A-AATGAA--TGA-C--T---T-A--ATTG--T-------T-------A--AG---T-C-G-TGGA---AA-TA------A-C-T-TGt
gi|23 : acagaCA-T-GT--TA--AAGTGG----GT-AATAA-C--GAGT---A----A-GTA----T-TG---ATT-T--CCT---GACTTGCA-GATGCA--TTC-A--C---A-A--A-TT--T-------TA------A--AG---T-G-G-TGGA---AA-TA------A-C-T-TTT--A-TG---------------GA-A-TT------------CCA-G-AA--------T--AT-TTGATTCA-AAA-TA-TCAGTCatgtctacagtacgca
gi|26 : aaagacaaactcataattcg-T-GT--GA--AAATGG----ATTAACAG-C--ACAT---A----A-GTGAATGT-TG---ATT-T--CCTTGTGAC----A-A----G--TGC-A--T---T-A--C-TA--TAAAGTACTA------AGTAG---C-T-G-CGGA---AAATA------A-C-T-CGT-----G-T--TGC-G-----AAA-A-TC------------CAG-G-CA--------T--AT-TTGAGTTG-AAA-TG-TTGATCGAAagagtgt
gi|28 : g--AAATGG----GCCAACAG-C--AAGT---A----A-GTG----T-TG---AAT-T--CCTTGTGAT----A-GATGCA--TGC-G--T---T-A--A-TG--T-------TA------A--AG---T-T-G-GGGA---AG-TA------A-T-T-TGT--C-TG-T--TAT-G-----TAA-G-CC------------CAG-G-CA--------T--CG-TCAA-TTG-AAA-
gi|61 : aTGG----ATTAAAAG-C--AAGT---A----A-GTG----C-TG---ATT-T--TCTAGTGagggtacatagtctggttcc
gi|30 : TAAAAG-C--GAGT---A----A-ATG----T-TG---ATT-T--CCTTGTTAT----A-GATACA--TGT-AAAT---T-G--A-TG--T---------------A--AA---T-T-G-TGGA---AA-GA------C-T-T-TGT--C-TG-T--TAT-G-----TAA-A-TC------------CA--------------------TCCAGTGA-AAA-CG-TCCGTCGAgtattggaatgcagtaa
gi|55 : aagG-C--GTGT---A----A-GTG----T-TG---ATT-T--CATTGTGAC----A-AATGTA--TGC-A--T---T-A--A-TG--C-------TA------A--AA---T-T-G-TTGA---cgcg
gi|32 : --ATGT---A----A-GTA----T-TG---ATT-T--CATTGTGAC----A-GATGCA--TAC-A--T---T-T--A-TG--T-------TA------A--AA---T-T-G-TTGG---AA-TA------A-C-T-TGT--C-TG-T--TAT-G-----TAA-A-TC------------CAG-G-CA--------T--AT-TTGAGTTG-AAA-AG-TCGATTGA
gi|34 : cGT---A----A-GTG----T-TG---ATT----CATTGTGA-------AATGTA--TGC-A--T---T-A--A-TG--C-------TT------A--AA---T-T-G-TTGA---AA-T-------A-C-T-TGT--C-TC-T--TG----------------------------CAG-G--A--------TAAAT-TTAAGT
gi|39 : ctatgactttttccatcaaatgT-T--CCATATGAC----A-GATACA--TAC-A--T---T-ATAA-TG--T-------TA------A--AA---T-T-A-TGGA---AA-TA------G-C-T-AGT--C-TG-T--TAA-G-----TAA-A-TC------------CAG-G-CA--------T-------------------G-TCGATCGAA
gi|42 : --CCTTATGAC----A-GAT-------C-A--T---T-A--A--G--T-------TA------G--AG---T-T-G-TTGA---AA-CA------A-C-T-TGT--CTTG-T--TAT-G-----TAA-A-TT------------CAG-A-C------------AT-TTAAg
gi|41 : TTTATGAC----A-GATGCA--TTT-A--T---C-A--A-TG--T-------TA------A--CG---A-T-G-CGGA---AG-TA------A-C-T-TGT--C-TG-T--TAT-G-----TAA-A--T------------CAA-GCCA--------T--AT-TTGTGTCG-AAA-taagagttg
gi|60 : TTGTGAA----A-GATGCA--TGC-A--T---T-A--A-TA--T-------TA------A--GA---T-T-G-TTGG---AA-TA------A-C-T-TGT--C-TG-T--Ta
gi|47 : TGTAAC----A-GATGCA--TGT-G--T---T-A--A-TG--T-------TA------A--AA---A-T-T-TTGA---AA-TA------A-C-T-TGT--C-T-------------------------------------------------------T-TTGAGTTG-AAA-CG-TCGATTGAAt
gi|52 : ac----A-GATGCA--TCC-A--T---T-A--A-TG--T-------TA------A--AAG--T-T-G-TTGG---AA-TA------A-C-T-TGT--C-TG-T--TAC-G-----TAA-A-GT------------C
gi|38 : gatcATGCA--TGC-A--T---T-G--G-TG--A-------TG------A--GT---T-G-G-TGGA---AA-TACGAGTAA-A-T-TGT--C-TA-T----C-TAG---TAA-A-TC------------CAG-C-CA--------T--AT-TTCAGTTG-AAA-CG-TCGATCGAA
gi|53 : cgcGCA--TGC-A--T---T-A--C-TG--T-------TA------A--AC---T-T-A-TGGA---AA-TT------G-C-A-TGA--C-TG-T--TAC-G-----TAA-A-TC------------CAG-G-CA--------T--AT-
gi|35 : CA--TGC-A--T---T-G--A-TG--T-------TATTATTTA--AA---T-T-G-TTGA---AA-TA------A-C-T-TGT--C-TG-TAATG--------TAA-ATCTGTGCAGCCATTCCAG-G-CA--------T--AT-TTGAGTTG-AAA-AT-TCGATC
gi|48 : tgt-A--A-TG--T-------TA------A--AAATTT-T-C-T-------A-TA------A-C-T-TGT--T-TG-T--TAC-G-----TAA-A-TT------------CGG-G-CA--------T--AT-TTGAGTTG-AAA-AG-TCGATCGtgt
gi|43 : --AG---T-T-G-TGGA---AA-TA------A-C-T-TAT--C-TG-T--TAC-G-----TAA-A-TC------------CAG-A-TA--------C--AT-
gi|49 : atgttcaataactgtaacttaagtgtggattA---T-T-A-TGGA---AA--G------A-G-CATAC--C-TA-T--TAA-G-----TAA-A-TC------------AAG-G-CA--------T--AT-TTGAGCTG-TAA-CG-TCGATTGAAaca
gi|50 : -T-G-TTGG---AA-TA------A-C-T-TGT--C-TG-T--TAC-G-----TAA-A-TC------------CAG-G-CA--------T--AT-TTGAGATG-AAA-AG-TCTATCGAAatgt
gi|58 : acA---AA-TA------A-T-T-TGT--C-TG-T--T---------TAA-A-TC------------CGG-G-AA--------T--AT-TTGAGTCG-AAA-CG-TCGACCGAA
gi|56 : ---AA-TA------A-C-T-TGT--CCTG-T--TAA-G-----TAA-A-TC------------CAG-C-CA--------T--AT-TTGAGTTG-AAA--G-TCAATCGAA
gi|64 : tgT------------CAG-G-CA--------T--AT-TTGAGTTT-AAA-AG-TCGATCAAA
gi|66 : acac------------CAG-G-CA--------T--GT-TTCAATTG-AAA-AG-TCGATCGAAa
5 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|37 ): TTTTTCACACTTTCATGCGGTTTTTTTTTTTATTCTAGTTGACATTTCCACAATTTGATCAAAGTGGTTCAATCAAGGGATATGTGGGGAGA
Unaligned ( gi|59 ): TCATGGAAATGGCAAGTCAGTGTTAAGTAAATGAAGGCATATTTGAGTTGAAA
Unaligned ( gi|62 ): GAAAAGTTATTGTTAGCCATTTTTCTTTTTATTACATGTATA
Unaligned ( gi|63 ): ATTGTCTGTTACACAAGATTCGAAATGTTGGTTGAAGTG
Unaligned ( gi|65 ): TAAAACTATTCGTTGAAAACACCTTTTTTAAAATAC
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111
lowQualScore : 2222222222222222222222222222 111111 11 4444444444444 111 111111111 1 22222222222 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 111111 11111111111111 111111111111111111 111111111 1111
lowQualScore : 555 888888 2 2 2 2 2 1 2 777 5555 3 3 3 555 999 6666 9999999999999999999999999999 3 3 3 222222 3 3 44 666 0000000000000 3 5 2 2 1 444 333 2 2 5 444444444 2 33 5555 2 2 9999999999 33 5 2 2 1 66 2 1 77777777777 55 33 666 666666 00 2 2 2 777 2 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 4 2 55555 000000 2 2 777777 333 22 1 1 1 33333333333333 1 1 2 1 666 1 77777777 22 1 2 333 444444444444444444 2 2 2 2 2 777777777 2 2 555555 6666 1 1 777777 1 1 1 99999 22 22 0 77 1 22 1 22 22 1 2 33 11 2222 2222 1 222 1 2 0 11 2 44 11 1 1 11 333333 33 222 1 1 3 1 333333 11 1 33 1 1 4444 1 7777777777777 333333 1 55555555 1 11 3 1
lowQualScore : ... ...... . . . . . . . ... .... . . . ... ... .... ............................ . . . ...... . . .. ... ............. . . . . . ... ... . . . ......... . .. .... . . .......... .. . . . . .. . . ........... .. .. ... ...... .. . . . ... . .................................................................... . . ..... ...... . . ...... ... .. . . . .............. . . . . ... . ........ .. . . ... .................. . . . . . ......... . . ...... .... . . ...... . . . ..... .. .. . .. . .. . .. .. . . .. .. .... .... . ... . . . .. . .. .. . . .. ...... .. ... . . . . ...... .. . .. . . .... . ............. ...... . ........ . .. . .
lowQualScore : 888 222222 9 7 7 9 7 4 7 333 7777 0 1 1 444 555 5555 1111111111111111111111111111 6 6 6 444444 3 3 33 444 1111111111111 1 5 7 7 0 777 777 7 5 0 444444444 5 33 3333 5 5 2222222222 44 0 5 5 0 33 5 4 00000000000 00 22 444 888888 77 4 4 4 444 1 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 0 0 00000 555555 0 0 666666 333 66 9 9 9 11111111111111 9 9 4 9 000 9 66666666 66 8 0 555 888888888888888888 0 1 1 1 1 444444444 1 0 888888 0000 0 0 444444 7 7 7 33333 44 44 6 00 5 00 4 00 00 7 9 55 99 9999 9999 4 555 4 6 2 77 5 22 88 3 3 88 777777 55 333 2 2 1 2 666666 55 3 22 3 3 6666 4 6666666666666 888888 4 00000000 4 99 0 5
consensus : TCAACTCAAAT---ATGCCTGGATTTACGTA------ACA-GACAAGTTATTTCCA-CAAC-TTTAA-CATT-AATGCATGCA-TC---TGTCACA----ANGA-AATCAACAC-TT---AC--NCGCTGTTAAT----CCATTTTCAC-----------A-G-TTCTT-T--CC--GG-TT-TG-AATTGT----NTGTT-AATC-TCTANGGGCGG---T-NGGAAAATAT--AA-AAATCCGAAGTC-GG-ANAA---TT---G-GA-AA-AA---------T-TAG-TAA----A-CA-C-----GC---A--TATTT-G-CTTCTCANAAAG-CTTTTTGACA-TTTCATTTT-----T-ATTC-AAA--CATGTTTTC-C------TATTGA-TAT-C-AAC---AAGAA--TAA-----T--C-T--T--N-T----AA----T------A-ACT----N-----------------A-A-A-----A------GC-TTTT-T---G--AG---A--ACC-AA-A-A--------------T-G-CGTG-T---T-TAT--TA-A--TT--TT-T-CCA---AATTG------------------TCC-GACT-T-C-GAA-TN--TTCGA-A-T-TT------TT-T--TACCGCCAATCG----G-GA-CTA-ACAC-AC-N---AT--TCA--AACCCGGGACA-GGGA-ACG-T-GT--GA--AAATGGATTAACAG-CG-AGT--A----AGTG----T-TG---ATTT-CCT-CGTGACAGATGCA--T-GC--ATTA--A-T-G--TTA------A--AA---T-T-GTGGAAA-TA------AC-TTGTC--TG-T-TAC---GT-AAA-------------TC------CAG-GCA--------TAT-TTGAGTTG--AAANG-TCGATCGAA
Reference ( family-1049 ) : TCAACTCAAAT---ATGCCTGGATTTACGTA------ACA-GACAAGTTATTTCCA-CAAC-TTTAA-CATT-AATGCATGCA-TC---TGTCACA----AGGA-AATCAACAC-TT---AC--TCGCTGTTAAT----CCATTTTCAC-----------A------------CC--GG-TT-TG-AATTGT----GTGTT-AATC-TCTATCGGCGG---T-CGGAAAATATT-AA-AAATTCGAAGTC-GG-ANAA---TT---G-GA-AA-AA---------T-TAG-TAA----A-CA-C-----GC---A--T-TTT-G-CTTCTCANAAAG-CTTTTTGACA-TTTCAANTC-----T-ATTN-AAA--CATGTTTTC-C------TATTGA-TAT-C-AAC---AAGAA--NAA-----T--N-T--T--A-T----AA----T------A-ACT----C-----------------A-A-A-----A------GC-TTTT-T---G--AG---A--ACC-AA-A-A--------------T-G-CGTG-T---T-TAT--TA-A--TT--TT-T-CCA---AATTG------------------TCC-GACT-T-C-GAA-TN--TTCGA-A-T-TT------TT-TA-TACCGCCNATNG----G-GA-TTA-ACAC-AC-A---AT--TCA--AACCCGGGACA-AGGA-ACG-T-GT--GA--AAATGGATTAACAG-CG-NGT--A----AGTG----T-TG---ATTT-CCT-TGTGACAGATGCA--T-GC--ATTA--A-T-G--TTA------A--AA---T-T-GTGGAAA-TA------AC-TTGTC--TG-T-TAC---GT-AAA-------------TC------CAG-GCA--------TAT-TTGAGTTG--AAANG-TCGATCGAA
gi|1 : TCAACTCAACT---ATGCCTGGGTTTAAGTA------ACA-G-----TT-TTTCTAACAAT-TTTAA-TATT-AATGCATGCA-TC---TGTCACA----ATGA-AATCAAATT-TT---GC--ATGCTGTTAAT----CCATTTTCAC-----------ATGCTTCTTATC-CC--GG-GTGTG-AATTGT----CTGTT-AATC-TCTAGAGGCGG---TATAAAAAATA---AA-CAGTCTGAAGTC-GG-AATA---TT---T-GA-AACAA---------T-TAG-AAA----AACA-C-----GT---A--T-TTTTG-CTTCTCATAGAA-CGTTTTGGCA-TTT-AATTT-----TGATTC-AAA--CATGTTTTC-C------TAATAG-TAT-C-AAC---AACAA--AAA-----C--CCT--T--T-T----AA----TTG----A-A-T----C-----------------ATG-A-----A------GC-TTTT-T---G--AG---A--ACC-AA-A-A--------------T-G-CATG-T---T-TA---TA-C--TT--TT-TCCCA---AATTG------------------TCC-GACT-T-C-GAA-GT--TTTGATA-T-TT------TT-C--TACCTCTTATTA----G-GA-CAA-ACAC-AC-T---AT--TCA--AACCCAGAACA-GGGA-AAG-T-AT---A--AAATGAATTAAAAG-CG-AGT--A----AGTA----T-CA---ATTT-TCT-CATGGTAAATGCA--T-GC--ATCA--A-T-G--TTG------A--AA---T-T-ATGGAAA-TG------GC-ATAAC--TG-T-TAC---AT-
gi|10 : atgtgtaactatgtaactgttaaactgacttattagggaccaagAAATTCC-AA-AACTACGAAGTC-GG-ATAAATTTT---G-GA-AA-AC---------T-T-T-TAA----C-CA-A-----GA---A--C-TT--G-CTTG-CAGAAGG-CTGTCTGTCA-TTTCAAGT------T-ATTA-AAA----TGTTT---C------TATGGA-T-T-T-AAC---ACGAA----A-----T--C-T--T----T----A-----T------A-ACT----T-----------------A-A-ACGTAAA------GC-TTTT------------------------------------------G-CATG-TAA-TGTAT-----G--TT--TT-T-TCA---AAT-A------------------TCC-GA-T-T-C-ACA-TACATT----A-T-TT------TT-AAATACCACCATCTG----A-AA-TGC-AC-C-ACGA---AT--TCA--A---CGG-ATA--GGA-ACA-C-GT--GA--AA-TAGATAGGCAGTCG-AGT--A----TGTG----T-TG---AT----------GAT---TGCA--T-GCA-ATTT--A-T-GGTTTA------T--AG---TAT-ATAG-AA-TA------GCATTGCC--TG-T-TAA---AT-AAT-------------AC------CA--GCA--------TATATTGAGTCG--AAACA-TCAGTCGAAaaagtcgatcgaagt
gi|11 : TCAACTCAAAT---ATGCCTGGATTTACACA------ACA-GATAAGTCATTCCAA-CAAT-TTTAA-CATT-ATTGCATGCA-TC---TGTCACA----ATGA-GATCAACAC-TT---AC--ATGCTTTTAAT----CCATTTTCACATGTTTCTTGTA------------CCG-GG-TT-TG-AATTGT----TTGGT-AATC-TCTAAGGGCGG---TATAGAAAATA-A-AA-AAATTCGAAGTC-GG-AATA---TTTG-G-AA-AA-AA---------T-TAG-TAA----A-TA-T-----GT---A--TATTT-G-CTTCTCATAAAA-CTTTTTGGCA-TTTCATTTT-----G-ATTC-AAA--CATGTTTTC-C------TAATTA-TAT-C-------------------------C-T--T--A-T----AA----TTG----A-AAA----A-----------------A-G-A-----A------GC-TTTT-T---G--GA---A--GCC-AA-A-T--------------T-G-CATG-T---T-TAT--AT-G--TT--TT-T-CCA---AATTG------------------TCC-gtg
gi|12 : TCAACTCAAAT---ATGCCTAGATTTACATA------ATA-GACAAGTTATTCCAA-CAAT-CTTAA-CATT--ATGCATACA-TC---TGTCACA----ATGA-AATCAACAC-TT---AC--ATGCTGTTAAT----CCATTTTTAC-----------AAGTTTCTTGTC-CC--GG-TT-TG-AATTGT----TTGTT-AATCTTCTAAGGGCAG---T----------------AAATCCGAAGTC-GA-ATAT---TT---GAAA-AA-AA---------T-TAA-TAA----A-CA-C-----GT---A--TATTT-G-CTTCTCATAAA--CTTTTTGACA-TTTCATTTT-----T-ATTC-AAA--CATGTTT---C------TATCAA-TAT-C-AAC---AAAAAACTAT-----C--C-T--T--T-T----AA----TTTGA--A-AC-----A-----------------A-A-A-----A------GC-GTTC-T---G--AG---A--ACC-AA-A-A--------------T-G-CGTG-T---A-TAT--CA-T--TT--TC-T-CCA---AATTG------------------TTC-aaag
gi|13 : acttt-----T-ATTC-AAA--CCTGTTTT---------TATTAA-TAT-C-AAC---AAGAA--TAA-----T--C-T--T--T-C----AA-------------ACTATGGC-----------------A-ACA-----A------GT-TTTT-TT--G--AG---A--ATC-AA-A-A--------------T-A-CGTG-T---T-TAC--TA-A--TT--CTAT---A---AGTTG------------------TCC-GACT-T-C-GAA-TT--TTCGA-T-T-CT------TT-CC-TACAGCCGATAG----A-AA-TAA-ACAC-AT-A---AT--TCA--AAACCGGGAGG-GGAG-ACA-T-AT--GA--AAATGGGTTGGTAA-TG-AGT--G----ATTA----T-TG---GTTT-CTT-AATGACAGATGTA--T-TT--ATTA--A-T-T--TTT------A--AG---T-T-GT-GAAA-TC------AC-TTGTC--TG-T-TAC---GC-AAA-------------TC------CAG-GCA--------TAT-TTGAGTGG--AAACA-TCCGTCGA
gi|14 : A-AA-AA---------T-T-G-TAA----A-CA-T-----GC---A--T-TCT-A-TTCCCCAGAATT-CTCTTTTACA-TTT-GTTTT-----T-GTCC-AAA--CAT---------------------T-T-C-AAC---A-----------------G-C--T--A-A----AA--------------------C-----------------A-A-A-----A------GC-TTTT-C---TCCAGCTCA--GCT-GA-A-A--------------T-A-CGTG-T---T-TAT--TA-T--TT--AT-C-TTA---AATCA------------------TCC-GACT-TAC---A-TG--TTCGT-T-T-TC------TT-TC-TACCACCAATAG----A-GA-TCA-TAAC-GA-A---AG--TCA--AACCCGGGACA-GGAA-ACA-T-GT--AA--AAATGAATTAGCAG-CG-GGT--A----AGTG----C-TA---ATTT-TCT-TAAGACAGCTGCA--T-TC--ATTG--A-T-G--TTA------A--Aagaaagaaa
gi|15 : ttgaaaAGTC-GG--TAA---TTTTGG-GA-AA-AA---------T-TAG-TAA----A-C--C-----GT---AATT-TTT-GGCTTCTCATGAAA--TTTTTGACAATTTTAATT------T-ATTC-AAATACATGTTGTT-C------TATTAA-TAT-C-AACAAAAAGAA--TAA-----T--C-C--TTAA-TTGA-AA----T------A-A------------------------A-A-A-----A------GC-TTCT-T------AG---A--A-A-AA-A-A--------------TAG-C-TA-T---T---T--TATA--TT--TT-T-TTAGACAATTGAATNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNN-N-N-NAA-TT--TTTGATA-T-TT------TT-C--TCCCGCCAATTG----G-GACTTGCACACTAC-ATGTAT--TCA--AACCCGGAACA-GGGgatg
gi|16 : a-GA-AATAG---------C-TA--TAC----A-CA-C-----AC---A--C-TTT-G-CCCCTCGGAAAG-CTTTTT-------TCAAAAAAAAAAT-ATTC-AAA--AATGTTTTC-C------TTTCGA-TGTAC-AAA---GAGAG--TAA-----T--C-T--T--T-TTTTCAA----T------G-AA-----------------------A-A-A-----A------GTATTTT-TAGAG--AA---A--AAC-AA-A-ACACAAACACACCCTT-G-CATG-T---T-AAT--TA-A--TT--TT-T-CAA---AGTTA------------------TCA-AAAT-T-C-AAT-TA--ATCAT-A-T-TC------TTATA-TACCGCTAAa
gi|17 : --AG---A--ACC-AA-A-A--------------T-G-CATG-T---T-TAT--AA-A--AAAATT-T-CCA---AATTG------------------TCC-GACT-T-C-GAA-CT--TTTGATA-T-TT------TT-C--TACCGCCAATTG----G-GA-CTA-ACAC-AC-T---AT--TCA--AACCCGGAACA-AGGA-ATG-T-GT--GA--AAATGGATTAAAAG-CG-AGT--A----AGTG----T-GG---ATTT-TTT-T-T------TTCA--TGGC--ATTA--G-T-G--TTA------A--AA---T-T-ATGGAAA-TG------GC-ATAAT--TA-T-TAC---GT-AAA-------------TC------CAG-GCA--------TTT-TTGAATTG--AAAAG-TCGATCGAAaatgaatgttcaaactcgcataagagggggtacgtg
gi|18 : tA-TCA-ACAC-AT-A---AT--TTT--AACCCGGGACA-GAGA-ACA-T-GA--TA--AAATGGATTAACGA-C----T--A----GGTG----T-CG---ATCA-CCT-TATGTCAGATACACAT-GC--AATA--A-T-G--TTA------A--AG---T-T-GCGGAAA-TA------AC-TTTTC--TG-T-TAT---AT-AAA-------------TC------CAG-ACATACATATGTAT-TTGAGTCA--AGCCG-TTGATCGAg
gi|19 : caaaggaa-----------------A-G-A-----A------GC-TTTTAT---G--AG---A--TCC-AA-A-A--------------T-G-CATA-T---C-TATATTT-T--TT--TT-T-CCA---AATTG------------------TCC-GACT-T-C---------------------------TT-TA-TACCGCCAATTC----G-GA-CTA-ACAC-AC-T---AT--TCA--AACCAGGGA-A-AGGA-GTG-C-GT--GA--ACATGGATTAACAG-CG-AGT--A----AGTG----T-GG---ATTT-TCT-CATGGCAtgt
gi|2 : ccttttaattgaaacaTCAATTAAAAT---ATGCCTGGGTTTACGTA------ACG-GACAAATTATTTCCA-CAAC-TATAA-CATT-AATGCGTGCA-TG---TGTCACA----AAGA-AATCAACAC-TT---AC--TCGCTGTTAAT----CCATTTTCAC-----------A----------------GG-AT-TG-AATTAT----GTGAT-AATC-TCTATTAATGA---T-CGGAAAATATT-AA-AAACCCAAAGTC-GG-AAAA---TT---G-GA-AA-AA---------T-TAG-TAA----A-CA-C-----AC---A--T-TTC-G-CTTCTAGGAAAG-CTTTCTAACA-TCTTAAATC-----T-ATTG-AAA--CGTGTTTTC-C------TATTGA-TAT-C-TGC---AAGAA--TAA-----T--A-T--T--ACT----AA----T------A-ACT----C-----------------A-A-A-----ATT----GC-TCTT-T---G--AG---A--ACC-AA-G-A--------------T-A-CGTA-T---C-TAT--TA-A--TT--TG-T-CAA---AATTA------------------TCC-GATT-T-T-GAA-TG--ATCGA-A-T-TT------TT-TA-TACCGCCAATCG----G-GA-TTA-ACAC-GC-A---TT--TCA--AACCCGTAAAA-AGGA-ACA-T-GT--GA--AAATGGATTAACAG-CA-TGT--A----AGTG----T-TG---ATTT-CTT-TGTGACAGATGCG--T-GC--ATTA--A-T-G--TTA------A--AA---T-T-GTGGAAA-TA------AG-TTGTC--TG-T-TGC---TT-AAA-------------CT------CAG-GCA--------TAT-TTAAGTTG--AAACG-TCGATCGAA
gi|20 : G----G-GA-CTA-ACAC-AC-T---AT--TCA--AACCCGGATCA-GGGA-ACA-T-GT--GA--AAATGGATTAAAAG-CA-AGT--A----AGTG----T-TG---ATTT-TCT-CGTGGTAGATGCA--T-GT--ATTA--A-T-G--TTA------A--AA---T-T-ATGGAGA-TT------GC-ATGAC--TG-T-TAC---GT-AAA-------------TC------TAG-GCA--------TAT-TTGAGTTG--AAAAG-TCGATCGA
gi|21 : t-TT------TT-TC-TACCGCGTATCA----T-GA-CTA-ACAC-AC-T---AT--TTATAAATCCGAGATA-AGAA-ACA--------------------AACAG-CG-TGT--A----AGTG----T-TG---ATTT-CCT-TGTGATAGATGCT--T-AC--ATTA--A-T-G--TTA------C--AG---T-T-GT---------------------C--TG-T-TAC---GT-AAA-------------TC------CAG-CCA--------TAT-TTGAGTTG--AAggtgt
gi|22 : ataTC-GG-AATA---TTT--G-GA-AA-AA---------T-TAA-TAA----A-CA-TTACAAGT---A--TATTT-G-CTTCTCTTAAAA-CTTTTTGACA-TTTGATTTT-----TAATTC-AAA--TATG-TTTC-C------TATTAA-TAT-C-AAC----------TAA----------T--T--G-A----AA----C------A--------------------------A-A-A-----A------GC-TTTC-T---G--AG---A--ACC-GA-C-AT-------------T-A-CAT----------T--TA-A--TT--TT-gtca
gi|23 : TCAAAT---AT-TCTGGAATTCCATA------A------AAGTTATTTCCA-CCAC-TTTAA-AATT-TGTGAATGCA-TC---TG---CAAGTCAGGA-AATCAATAC-TT---AC--TCGTTATT-AC----CCACTTTAAC-----------A-------------------TG-CG-AATTAT----GAGTT-TGTC-TTTa
gi|24 : TA-GCAC-AC-T---AT--TCA--AACCCGGAACA-CGGA-ACA-T-GT--GA--ACATTGATTAAAAG-CG-AGT--A----AGAG----T-TG---ATTT-CCT-CATGGCAGATGCA--T-CC--ATC---A-T-G--TTG------A--AA---T-T-ATGGAAA-TG------GC-ATGAC--TG-A-TAC---GT-AAA-------------TC------Cttcaaaatatcagtcagagtgt
gi|25 : aaaaag-AGAA-ACAAT-GT--GA--AAATGGATGAACAGGCA-TGTTTA----AGTG----T-TG---ATTT-CAT-TGTAACAGATGCA--G-GC--ATTA--A-T-G--TTA------A--AA---T-T-GTTGAAA--A------AC-TTGTC--TGAT-TACG--GT-AAA-------------TC------CAGTTCC--------TAT-TTGCGTTG--AAAAG-TCAATCgacttttaat
gi|26 : G-T-GT--GA--AAATGGATTAACAG-CA-CAT--A----AGTGAATGT-TG---ATTT-CCT-TGTGACAAGTGCA--TTACT-ATAA--AGT-A--CTA------AGTAG---C-T-GCGGAAAATA------AC-TCGT----G-T-TGC---GA-AAA-------------TC------CAG-GCA--------TAT-TTGAGTTG--AAATG-TTGATCGAA
gi|27 : GA-ACA-T-GT--GA--AAATGGATTAACAT-CGAAAA--A----AATG----T-TA---ATTT-ATT-TATGACATAAGCA--T-GC--AGCA--A-T-A--TC-------A--AA---T-T-GTCGAAA-TA------AC-ACGTC--TA-T-TGC---CT-ACA-------------TCTAGGTACAG-GTA--------TAT-TTGAGTCG--AAACG-TCG
gi|28 : aga---ATGCCTGGGCTTACATA------ACA-GACAAATTACTTCCC-CAAC-TTTAA-CATT-AACGCATGCA-TC---TATCACA----AGGA-ATTCAACAC-TT---AC--TTGCTGTTGGC----CCATTTt
gi|29 : atttcaattgacgTCTCGGCAAG-CTTCTTGGCA-TT------------------------CACGTTT-C-C------TATTGAATAT-C-AAC---AAGAA--TGA-----T--C-T--T--T-T----------T------A-GCT----A-----------------A-A-A-----AAAAAATGC-TTTT-TC--G--AG---ATTGCCTAATA-A--------------C-GCCATGAT---T-TAT--T--A--TT--TT-agggtacatagtctggttcc
gi|3 : TCAACTCAAAT---ATGCCTGGATTTACGTACATGTAACA-GACAAGT-ATGCCAA-CAAG-TTTAA-CAT--AATGTATGCA-TC---TGACACA----TGAA-AATCAACACCTT---AC--ATGCTGTTAAT----CCTTTTTCAC-----------A-----------------G-TT-TG-A-----------------TC-TCTATGGGCGT---T-TATAAAA-A---AA-AAA--CGAAGTC-GG-AATA---TT---T-GA-AA-AA---------T-TA--TAA----A-CA-C-----ATTATA--T-TTT-G-CTTCTCATAACA-CTTTT-GACA-TTTCATTTT-----G-ATTC-AAA--CATGTTTTC-C------TAT-AA-GAT-CGAAC---AAAAA---------------T--T--A------AA----T------A-ATT----T-----------------T-A-A------------------T-T---G--AA---A--A----A-A-A--------------C-C-C----------------A-A--CT--TT---CCA---AATTG------------------TCT-GACT-T-C-GAA-TT--TT-GATA-T-TT------TC-T--TACAGCCGAACG----GAGA-CTA-ACAC-AC-T---AT--TCA--AGCCCGGAACA-ATGA-ACG-T-GTTGGATTAAAT-GATTAAAAG-CG-AGT--AAGTCAGTG----T-TG---ATTT-TCT-C-TGACAGGTGCG--T-GC--ATTA--A-T-G--TTA------A--AA---T-T-ATTAAAA-TG------TT-ATGAC--TG-T-TAC---GTAAAA-------------TC------CAG-GCA--------T-T-TTGAGTAG--AAAAG-TCcagttaaacacacgag
gi|30 : tattgacttttTAAAAG-CG-AGT--A----AATG----T-TG---ATTT-CCT-TGTTATAGATACA--T-GTAAATTG--A-T-G--T--------A--AA---T-T-GTGGAAA-GA------CT-TTGTC--TG-T-TAT---GT-AAA-------------TC------CA-----------------TCCAGTGA--AAACG-TCCGTCGA
gi|31 : aag-T-C-GAA-CA--TTCGA-A-G-TCAGTTAATT-TG-GACCGCCAATAG----A-GA-TTA-ACAC-Acgcg
gi|31 : -T-CCA---AATTA------------------ACT-GACT-T-C-GAA-TG--TTCGATA-T-TT------TT-TC-TACTGCCAATCG----G-GA-GTA-ACAC-TC-T---AT--TCA--AACCCGGGACA-GGGA-ACG-T-GT--GA--Atattttttctactgccaatcgggagtaacactctattcaaacccgggacagggaacgtgtgaa
gi|32 : tgtgttaatctctattggcggGT--A----AGTA----T-TG---ATTT-CAT-TGTGACAGATGCA--T-AC--ATTT--A-T-G--TTA------A--AA---T-T-GTTGGAA-TA------AC-TTGTC--TG-T-TAT---GT-AAA-------------TC------CAG-GCA--------TAT-TTGAGTTG--AAAAG-TCGATTGA
gi|33 : cACA-GAGA-GCA-T-GT--GG--AAATGCATTAACGA-CG-AAT--A----AGTG----T-TC---ACTT-C-T-TGTGACAAATGAA--T-GA--CTTA--A-TTG--TTA------A--G----T-C-GTGGAAA-TA------AC-TTGat
gi|34 : GT--A----AGTG----T-TG---ATT--CAT-TGTGA--AATGTA--T-GC--ATTA--A-T-G--CTT------A--AA---T-T-GTTGAAA-T-------AC-TTGTC--TC-T-TGCAGGAT-AAA-------------TT------TAA-GT---------CAT-TTGA--TGGAAAAAG-TCatgtctacagtacgca
gi|35 : ctatCA--T-GC--ATTG--A-T-G--TTATTATTTA--AA---T-T-GTTGAAA-TA------AC-TTGTC--TG-T-AAT---GT-AAATCTGTGCAGCCATTC------CAG-GCA--------TAT-TTGAGTTG--AAAAT-TCGATC
gi|36 : tgtTT-AATC-TCTATGGGAGG---T-ATAAACAAATA-AG-AAATCCAAAGTC-GGAATAT---TT---G-GA-AA-AA---------A-TAG-TGATATCA-TA-T-----AA---A--TATTT-G-CTTCTCATAAAA-CGTTtgt
gi|38 : ATGCA--T-GC--ATTG--G-T-G--ATG------A--GT---T-G-GTGGAAA-TACGAGTAAA-TTGTC--TA-TCTA----GT-AAA-------------TC------CAG-CCA--------TAT-TTCAGTTG--AAACG-TCGATCGAA
gi|39 : cgcTT-CCA-TATGACAGATACA--T-AC--ATTATAA-T-G--TTA------A--AA---T-T-ATGGAAA-TA------GC-TAGTC--TG-T-TAA---GT-AAA-------------TC------CAG-GCA--------T-----------------G-TCGATCGAA
gi|4 : CGTA------ACA-GACAAGTTATTTCCA-CAAT-TTTAA-CATTGAATGCATGCG-TC---TGTCATA----AGAA-AATCAACAC-TT---AC--CCGCTGCTAAT----CCATTTTAAC-----------------------------G-TT-C---ATTGTCCTGGGATTGAATT-TTTATCAG------T-AGGAAA-TAAT-AAGAAATTCGAAGTC-GG-AAAA---TTT--G-GA-AA-AA---------T-TAG-TAA----A-CA-C-----GC---A--T-TT--G-CATCTCCGAAAG-CTTTTTAACA-TTTCATTTT-----T-ATTC-AAA--CATGTTTTC-C------TATTGA-TAT-C-AAT---AAGAA--TA------T--T-TAAT--G-T----AA-----------A-AC-----A-----------------A-A-A-----A------GC-TTTT-G---G--GG---A--ACC-AA-A-A--------------T-G-CACG-T---T-TAT--TA-A--TT--TT-A-CTA---GATTA------------------TTA-GACT-T-C-GAA-TG--ATCG----------------------CCG--TATCA----G-GA-TTA-ACAC-GC-A---AT--TCT--A----GGGACA----------T-GT--GA--AAATGGAATAACAG-CG-AGT--A----AGTG----CATGTATATTT-CCT-TGTGGTAGGGGCA--T-GC--ATTA--A-T-G--TTA------A--CG---T-T-TTGGGAA-TT------AC-TTG----CA-T-T----------G-------------TC------CAT-G----------TAT-TTGAGTTG--AAACG-TCTATg
gi|40 : aGGA-ACG-T-GT--GA--AAATGGATTAAAAG-CG-AGA--A----AGTG----T-AG---ATTT-TCT-CATGGCAGGTACA--T-GC--ATTA--A-T-G--TTA------A--AA---T-T-ATGAAAaatgtgttgaaatcgtcggtcgaagt
gi|41 : gTCGACACAAAT---ATGGCTTGATTTACATA------ACA-GACAAGTTACTTCCG-CATC-GTTAA-CATT-GATAAATGCA-TC---TGTCATA----A
gi|42 : ttCAACTCTTATTAAATGTCTGAATTTACATA------ACAAGACAAGTTGTTTCAA-CAAC-TCTAA-C-TT-AATG-----A-TC---TGTCATA----AGGaa
gi|43 : AT---GTATCTGGATTTACGTA------ACA-GATAAGTTATTTCCA-CAAC-T
gi|44 : atgttcaataactgtaacttaagtgtggattATGTATGCG-CC---CGTCATA----ATGA-AATATACAC-TT---CC--TTCCTAT--AT----TTTTTTTTAT-----------ATAAT--------CCTGGG-TT-TG-AA-TGT----Gaca
gi|45 : -TA-TACCGCCCTTAG----A-GA-TTA-ACAA-AC-A---ATATTCA--AAACCGGGACA-AGAA-ACA-T-GT--AA--AAATGGATTAACAG-
gi|46 : taT-TC-TACCGCCAGTCG----G-GG-CTA-ACAC-AC-T---AT--TTA--AACC--AGACG-AGGA-ACA-TCAT--GG--AAATG--------G-CA-AGT--C----AGTG----T-T
gi|47 : -TGTAACAGATGCA--T-GT--GTTA--A-T-G--TTA------A--AA---A-T-TTTGAAA-TA------AC-TTGTC--T------------------------------------------------------T-TTGAGTTG--AAACG-TCGATTGAA
gi|48 : acA--A-T-G--TTA------A--AAATTT-T-CT----A-TA------AC-TTGTT--TG-T-TAC---GT-AAA-------------TT------CGG-GCA--------TAT-TTGAGTTG--AAAAG-TCGATCG
gi|49 : A---T-T-ATGGAAA-GA------GC-ATACC--TA-T-TAA---GT-AAA-------------TC------AAG-GCA--------TAT-TTGAGCTG--TAACG-TCGATTGAA
gi|5 : CACA----GTGA-AATCAACAC-TT---AC--ATGCTGTTAAT----CCATTTTCAC-----------ATGTTTCTTGT--CCCGGG-TT-TG-ATTTGT----TTGTC-ATTC-TCTAAGGGCGG---T-ATAAAAAAATA-AA-ATATCCGAAGTCAGA-ATAT---TT---G-GA-AA-AA---------T-TAG-TAA----A-CA-T-----GT---A--TACTT-G-CTTCTTATAAAA-CTTTTCGACA-TTTCATTTT-----G-ATTC-AAA--CATGTTTTC-CTATTATTATTAA-TAT-A-AAC---AAAAA--GAA-----TCCC-T--T----T----AA----TGGTTGGA-ACG----C-----------------ATG-G-----A------GC-TTTC-T---T--AG---A--ACC-AA-A-A--------------T-G-CAGA-G---T-TA---TA-ATTTT--TT-T-CGA---AATTG------------------TCCGGACTCT-C-GAA-CT--TTTGA-AGTATT------TT-TC-TACCTCCAATGGGT--G-GG-CTA-ACA--AC-T---AT--TCA--AACGCGAAGCATGGGA-ATG-T-GT--GA--AAATGGATTAA-AG-CA-AGT--A----AGTG------TG---GTTT-TCT-CATGACAGGTGCA--T-GC--AATA--A---G--TTA------A--AA---T-TAATGG--A-TG------GC-ATA-C--TA-T-TAC---GG-TAA-------------TC------C-G-GCA--------TAT-TTGAGTTG--AAAAGATCGATCGatgt
gi|50 : -T-GTTGGAA-TA------AC-TTGTC--TG-T-TAC---GT-AAA-------------TC------CAG-GCA--------TAT-TTGAGATG--AAAAG-TCTATCGAA
gi|51 : acGGA-ACA-G-GT--GA--AAATGGATTAAAAG-CA-AGT--A-------G----T-TG---ATTT-CAT-TGTGACAGATGCA--T-GC--A
gi|52 : TTTACGTA------ACA-GACAAGTTATTCCAA-CAACTTTTAA-CATT-AATGGATGCA-TC---Tgg
gi|53 : gatcgacAT---ATGCCTGGATTTACGTA------ACA-GTCATGCAATTTCCA-TAAG-TTTAA-CAGT-AATGCATGC
gi|54 : -A-T-TT------TT-TT-CACCGCCCATAG----A-G--TTA-ACAA-AC-A---AT--C----AATCCGGGACA---GA-ACA-T-GT--GA--A
gi|55 : G-CG-TGT--A----AGTG----T-TG---ATTT-CAT-TGTGACAAATGTA--T-GC--ATTA--A-T-G--CTA------A--AA---T-T-GTTGA
gi|56 : AA-TA------AC-TTGTCC-TG-T-TAA---GT-AAA-------------TC------CAG-CCA--------TAT-TTGAGTTG--AAA-G-TCAATCGAA
gi|57 : tg-AGTC-CCAATTGGTGG---T-AGGAAAATATC-AA-AAGTTCGAAGTC-GG-ACAA---TT---
gi|58 : ttacaaAAA-TA------AT-TTGTC--TG-T-T------T-AAA-------------TC------CGG-GAA--------TAT-TTGAGTCG--AAACG-TCGACCGAA
gi|59 : TGGAAA-TG------GC-AAGTCAGTG-T-TAA---GT-AAA-------------TG------AAG-GCA--------TAT-TTGAGTTG--AAA
gi|6 : tcaCAAGTAATT-CCT-CAAC-ATTAAACATA-GAGAGGTACACTC---TATTACA----AAAACAATCAAC-C-TTGTGACGTTCGTTGTTAATTAGCCCATTTTCAA-----------AATGTCTTTCTGTCCA-GG-GT-TGCAATTGT----GAGTT-TATA-ACCACTGGCGGGAAG-CAAAAAAAGTCGAA-AAATTC-AAGTA-GG-CAAA---TT---G-TATTA-TA---------T-TAGACAA----A-CAGC-----GCA--A--T-TTT-G-C-TCTCAGGAAGCCCTCTTGGCT-TTTC----C-----T-ATTT--------TCTTACCTC------TATCG------C-AACCA-AATAA--TAATCATTT--T-T--T--T-T----AAAAATT------ATACT----G-----------------G-A-A-----A------GT-TTTT-T---C--AA---G--TTG-AA-A-A--------------T-A-TGTG-T---T-TGA--TATA--TT--TT-T--CA---AATTG----------------------G--T-C-C-GAA-CT--TCCGG-A-T-TT------T-----TAC--CCCATAG-------------------------AT--TTA--AATCCGGGACA-GGGATACG-A-GT--G---AATTGGATTAACAG-------------------------A---ATCT-TCTGTATGGCAGTCGCA--T-TT--ATTG--A-T-G--TTG------ATCGT---T-T-GTAGAAA-T
gi|60 : T-TGTGAAAGATGCA--T-GC--ATTA--A-T-A--TTA------A--GA---T-T-GTTGGAA-TA------AC-TTGTC--TG-T-Tctcag
gi|61 : TT-ACTGCAT----TCCAATACCACT----AGAA-AATCAGCAC-TT---AC--TTGCTTTTAAT----CCAt
gi|64 : -------------TT------CAG-GCA--------TAT-TTGAGTTT--AAAAG-TCGATCAAA
gi|66 : acac------CAG-GCA--------TGT-TTCAATTG--AAAAG-TCGATCGAA
gi|7 : -----------------A-A-A-----A------GT-TTTA-T---G--AG---A--AGC-AA-ATA--------------T-A-TGTG-T---T-TAT--TA-A--TT--TT-T-CCA---AATAT------------------TCC-GACT-T-C-GGATTA--ATC---A-T-TT------TTATA-TACCGCCCTTAG----A-GA-TTA-ACAA-AC-A---AT--TCA--AACCCGGGACA-AGAA-ATA-T-GT--AA--AAATGGATTAACAG-CA-TGT--A----AGTG----T-TG---ATTT-CAT-TGTGACAGATGCA--T-GC--ATgtgt
gi|7 : atcA--AAA-----C--T-T--T--T-T----GA----C------A-TTT----C-----------------A-A-A-----AA-----GC-TTTC-T---G--AG---A--ACC-AA-A-A--------------T-G-AGTG-TACAT-CAT--T-----TT--TT-T-CCA---AATTG------------------TCC-CACT-T-C-GAA-TT--TTTTATA-T-TT------TT-C--TACCGCCAACTGCCAGG-GA-CTA-ACAC-AT-T---AT--TCA--AACTCGGAATA-GGGA-ACA-T-GT--GA--AAATGGATTAAAAG-CA-AGT--A----AGTG----T-TG---ATTT-TCT-CGTGGTAGGTGCA--T-GC--ATTA--A-T-G--TT---------------T-T-ATGGAAA-TG------GC-ATGAA--TG-T-TAC---GT-AAA-------------TC------TAG-GCA--------TAC-TTGAGTTG--AAAAG-TCGATCGAAtgacatttcaaaaagctttctgagaaccaaaatgagtgtacatcatttttttccaaattgtcccacttcgaattttttatatttttctaccgccaactgccagggactaacacattattcaaactcggaatagggaacatgtgaaaatggattaaaagcaagtaagtgttgattttctcgtggtaggtgcatgcattaatgttttatggaaatggcatgaatgttacgtaaatctaggcatacttgagttgaaaagtcgatcgaagtgt
gi|8 : atcatgcatgcatctgtcacaatgaaatcaacacttacatgctgttaatccatttttacatatttcttgtcccgggtttgaattgtttgttaatctctaagggcggtatataaaaatgattaatccgaagtcggaatatttggaaaaattaataaacacatatatttgcttctcatTCAACTCAAA----ATTGCTAGATTTACATA------ATA-GACAAGTTTATTCCA-AAAT-CTTAA-CAT---ATGCATACA-TCA--TGTCACA----ATGA-AATCAACAC-TT---ACA-TC--TGTTAAT----CCATTTTTAC-----------AAGGTTCTTGTC-CC--GGGTT-TG-AATTGT----TTGTT-AATC-TCTAAGGGCAG---T----------------AAAT-CGAAGTG-GA-ATAT---TT---G-AA-AA-AAAAT------T-TAA--AA----A-CA-C-----GT---A--TATTT-G-CTTCTCATAAA--CTTTTTGACA-TTTCATTTT-----T-ATTCCAAA--CATGTTT-C-C------TATCAA-TAT-C-AAC---AAAAA--CTA-----T--CCT--T--T-T----AA----TTGA---A-AC-----A-----------------A-A-A-----A------GC-GTTC-T---G--AG---A--ACC-AA-A-A--------------T-G-CGTG-T---A-TAT--CA-T--TT--TC-T-CCA---A-TTG------------------TCC-GACT-T-C-GAA-TT--TTgtgt
gi|9 : aaatatatGGAAAGTG---GA-AAATCCAGATTC-GG-GAAT---TT---G-GA-AA-AAAAAATATATTATAG-TAA----A-CA-C-----AC---A--A-TTT-G-TTTCGCGGA--G-CTTTTTGAAA-TGTCACCT----------------------TTTTT-C------TGTTGA-TAT-C-AAC---AAAAA--CAA-----T--A--------------AA----TTC----A-ACT----TTGGTTTGTAAAAGAAGAA-A-A-----A------GC-TTT------G--AG---A--ACC-AA-A-A--------------T-G-CGTC-T---T-TTC--TA-T--TT--TG-T-CCA---AAAT------------------------ACT-T-TTGAA-T---------A-T-TT------TT-TA-T--CGTTAATTG----A-GA-TAA-ACAC-AC-A---AT--TCA--AACACGG------GGT-ACG-T-GT--GA--AAATGGATTTACAA-CG-CGT--A----AGTG----G-TG---CTTTACCTACATTACAATTGCA--T-TC--ATTA--A-T-G--TAA------A--AG---T-T-GTGAAAA-CA------aag
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|37 ): TTTTTCACACTTTCATGCGGTTTTTTTTTTTATTCTAGTTGACATTTCCACAATTTGATCAAAGTGGTTCAATCAAGGGATATGTGGGGAGA
Unaligned ( gi|62 ): GAAAAGTTATTGTTAGCCATTTTTCTTTTTATTACATGTATA
Unaligned ( gi|63 ): ATTGTCTGTTACACAAGATTCGAAATGTTGGTTGAAGTG
Unaligned ( gi|65 ): TAAAACTATTCGTTGAAAACACCTTTTTTAAAATAC
Alignments
lowQualScore : 666666666666666666666666666 333333333333333333333333333 111 111111111 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 11111111111111 11111111111111 111111111111111111 222222 1111
lowQualScore : 555 555 777777 2 1 2 2 22 2 2 2 2 1 2 2 555 6666 6666 44 333333333333333333333333333 3 3 3 44 3 3 1 666666666666666666666666666 3 77777777 666 2 2 2 333333333 2 7 5555 2 66666666 666 666 2 2 1 66 2 99999999999 77 22 33 1 33 666666 00 2 2 2 777 3 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 77777 44444444444444 2 2 888888 333 22 2 2 33333333333333 2 2 3 2 9999999999999999 22 2 333 444444444444444444 2 2 2 666 000000 2 555 22 3333 22 2 2 7777 2 1 8888888 1 22 0 1 1 11 1 22 22 2 3 4444 22 3333 1 222 1 8888 222 11 2 44 11 2 11 444444 33 222 1 1 1 1 333333 11 2 33 1 1 22 1 7777777777777 333333 1 55555555 1 3 1
lowQualScore : ... ... ...... . . . . .. . . . . . . . ... .... .... .. ........................... . . . .. . . . ........................... . ........ ... . . . ......... . . .... . ........ ... ... . . . .. . ........... .. .. .. . .. ...... .. . . . ... . .......................................................... ..... .............. . . ...... ... .. . . .............. . . . . ................ .. . ... .................. . . . ... ...... . ... .. .... .. . . .... . . ....... . .. . . . .. . .. .. . . .... .. .... . ... . .... ... .. . .. .. . .. ...... .. ... . . . . ...... .. . .. . . .. . ............. ...... . ........ . . .
lowQualScore : 888 000 777777 7 3 7 4 88 5 5 4 4 0 9 9 000 3333 5555 22 888888888888888888888888888 4 3 3 66 3 1 0 777777777777777777777777777 1 22222222 333 7 5 4 555555555 4 1 0000 2 22222222 666 111 2 2 0 33 2 11111111111 66 66 22 0 22 888888 77 4 4 4 444 5 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 44444 66666666666666 1 1 555555 555 88 0 0 88888888888888 0 0 0 0 6666666666666666 88 1 555 888888888888888888 0 1 1 111 999999 1 888 88 8888 88 0 5 0000 0 9 3333333 9 66 4 7 7 77 5 11 11 9 0 6666 00 0000 4 666 4 4444 444 88 7 55 88 7 99 000000 88 444 3 3 5 2 777777 88 4 33 4 4 88 4 6666666666666 888888 4 00000000 4 0 5
consensus : TCAACTCAAAT---ATGCCTGGATTTAC---GTA------ACA-GACAAGTTATTTCNA-CAAC-TTTAA-CATT-AATGCATGCA-TC-TGTCACAATGA-AATCAACAC-TT---ACA--CGCTGTTAAT----CCATTTT--CACAT-G--T-T-C-T--T-T---CC-----GGTTT-G-AAT--TGTTTGTTAATC-TCTANGGGCGGT-ANG---AAAANAT--AA-A-------A-ATCCGAAGTCGG-AAAA---TT---G-GA-AA-AA---------T-TAG-TAA----ACA-C-----GT-ATA-TTT---G-CT-TCTCATAAAG-CTTTTTGACA-TTTCA---------T-TTTT-ATT-CAAA--CATGTTTTCC------TATTGA-TAT-C-AAC---AAGAA--TAAT--------------C-----T--TT-T----AA----T----A-ACTA----AA-----A-------A------GC-TTTT-T---G--AG---A--ACC-AA-AA--------------T-G-CGTG-T---T-TAT--TA-A--TT--TTT-CCA---AATTG------------------TCC-GACT-T-CGAATT--TTCGA---AT-T---TT--T-C--T--ACCGCCA-ATCG----G-GACTA-ACACAC------TA-TTCA--AACCCGGGACA-GGGA-ACG-T-GT--GA--AAATGGATTAACAG-CG----AGT--AAGT----GT-TG---ATTT-CCT--CGTGACA---GATGCA--T-GC--ATTA--A-TG--TTA------A--AA---T-T-GTGGAAA-TA------AC-TTGTC--TG-T-TAC-GT-AAA-------------TC------CAG-GCA--------TAT-TTGAGTTGAAANG-TCGATCGAA
Reference ( family-1049 ) : TCAACTCAAAT---ATGCCTGGATTTAC---GTA------ACA-GACAAGTTATTTCCA-CAAC-TTTAA-CATT-AATGCATGCA-TC-TGTCACAANGA-AATCAACAC-TT---ACN--CGCTGTTAAT----CCATTTT--CACA--G--T-T-C-T--T-T---CC-----GGTTT-G-AAT--TGTNTGTTAATC-TCTANGGGCGGT-NGG---AAAATAT--AA-A-------A-ATCCGAAGTCGG-ANAA---TT---G-GA-AA-AA---------T-TAG-TAA----ACA-C-----GC-ATA-TTT---G-CT-TCTCANAAAG-CTTTTTGACA-TTTCA---------T-TTTT-ATT-CAAA--CATGTTTTCC------TATTGA-TAT-C-AAC---AAGAA--TAAT--------------C-----T--TN-T----AA----T----A-ACTN----AA-----A-------A------GC-TTTT-T---G--AG---A--ACC-AA-AA--------------T-G-CGTG-T---T-TAT--TA-A--TT--TTT-CCA---AATTG------------------TCC-GACT-T-CGAATN--TTCGA---AT-T---TT--T-T--T--ACCGCCA-ATCG----G-GACTA-ACACAC------NA-TTCA--AACCCGGGACA-GGGA-ACG-T-GT--GA--AAATGGATTAACAG-CG----AGT--AAGT----GT-TG---ATTT-CCT--CGTGACA---GATGCA--T-GC--ATTA--A-TG--TTA------A--AA---T-T-GTGGAAA-TA------AC-TTGTC--TG-T-TAC-GT-AAA-------------TC------CAG-GCA--------TAT-TTGAGTTGAAANG-TCGATCGAA
gi|1 : TCAACTCAACT---ATGCCTGGGTTTAA---GTA------ACA-G-----TT-TTTCTAACAAT-TTTAA-TATT-AATGCATGCA-TC-TGTCACAATGA-AATCAAATT-TT---GCA--TGCTGTTAAT----CCATTTT--CACAT-GC-T-T-C-T--TAT---CCCG---GGTGT-G-AAT--TGTCTGTTAATC-TCTAGAGGCGGT-ATA---AAAA-AT--AA-AC------A-GTCTGAAGTCGG-AATA---TT---T-GA-AACAA---------T-TAGAAAA----ACA-C-----GT-ATT-TTT---G-CT-TCTCATAGAA-CGTTTTGGCA-TTTAA---------T-TTTG-ATT-CAAA--CATGTTTTCC------TAATAG-TAT-C-AAC---AACAA--AAAC--------------C-----C--TT-T----------T----A-ATTG----AATCATGA-------A------GC-TTTT-T---G--AG---A--ACC-AA-AA--------------T-G-CATG-T---T-TA---TA-C--TT--TTTCCCA---AATTG------------------TCC-GACT-T-CGAAGT--TTTGAT--AT-T---TT--T-C--T--ACCTCTT-ATTA----G-GACAA-ACACAC------TA-TTCA--AACCCAGAACA-GGGA-AAG-T-AT---A--AAATGAATTAAAAG-CG----AGT--AAGT----AT-CA---ATTT-TCT--CATGGTA---AATGCA--T-GC--ATCA--A-TG--TTG------A--AA---T-T-ATGGAAA-TG------GC-ATAAC--TG-T-TAC-AT-
gi|10 : atgtgtaactatgtaactgttaaactgacttattagggaccaag--AA-A-------A-CTACGAAGTCGG-ATAAATTTT---G-GA-AA-AC---------T-T-T-TAA----CCA-A-----G--A-A-CTT---G-CT-TG-CAGAAGG-CTGTCTGTCA-TTTCA---------A-GTT--ATT--AAA---ATGTTT--C------TATGGA-T-T-T-AAC---ACGAA----AT--------------C-----T--TT-------A----T----A-ACTT----AA-----ACGTAA--A------GC-TTTT-----------------------------------------G-CATG-TAA-TGTAT-----G--TT--TTT-TCA---AAT-A------------------TCC-GA-T-T-CACATACATT------AT-T---TT--T-AAAT--ACCACCA--TCT----G-AAATGCAC-CAC------GAATTCA--A---CGG-ATA-GG-A-ACA-C-GT--GA--AA-TAGATAGGCAGTCG----AGT--ATGT----GT-TG---AT-----------GAT------TGCA--T-GCA-ATTT--A-TGGTTTA------T--AG---TAT-ATAG-AA-TA------GCATTGCC--TG-T-TAA-AT-AAT-------------AC------CA--GCA--------TATATTGAGTCGAAACA-TCAGTCGAAaaagtcgatcgaagt
gi|11 : aaattccTCAACTCAAAT---ATGCCTGGATTTAC---ACA------ACA-GATAAGTCATTCCAA-CAAT-TTTAA-CATT-ATTGCATGCA-TC-TGTCACAATGA-GATCAACAC-TT---ACA--TGCTTTTAAT----CCATTTT--CACAT-G--T-T-T-C--T-TGTACCG----GGTTT-G-AAT--TGTTTGGTAATC-TCTAAGGGCGGTATAG---AAAATAA--AA-A-------A-ATTCGAAGTCGG-AATA---TTTG-G-AA-AA-AA---------T-TAG-TAA----ATA-T-----GT-ATA-TTT---G-CT-TCTCATAAAA-CTTTTTGGCA-TTTCA---------T-TTTG-ATT-CAAA--CATGTTTTCC------TAATTA-TAT-C--------------------------------C-----T--TA-T----AA----TTG--A-AAAA----AG-----A-------A------GC-TTTT-T---G--GA---A--GCC-AA-AT--------------T-G-CATG-T---T-TAT--AT-G--TT--TTT-CCA---AATTG------------------TCC-gtg
gi|12 : TCAACTCAAAT---ATGCCTAGATTTAC---ATA------ATA-GACAAGTTATTCCAA-CAAT-CTTAA-CATT-A-TGCATACA-TC-TGTCACAATGA-AATCAACAC-TT---ACA--TGCTGTTAAT----CCATTTT--TACA--AGTT-T-C-TTGT-C---CC-----GGTTT-G-AAT--TGTTTGTTAATCTTCTAAGGGCAGT-------------------A-------A-ATCCGAAGTCGA-ATAT---TT---GAAA-AA-AA---------T-TAA-TAA----ACA-C-----GT-ATA-TTT---G-CT-TCTCATAAA--CTTTTTGACA-TTTCA---------T-TTTT-ATT-CAAA--CATGTTT--C------TATCAA-TAT-C-AAC---AAAAAACTATC--------------C-----T--TT-T----AA----TTTGAA-AC-A----AA-----A-------A------GC-GTTC-T---G--AG---A--ACC-AA-AA--------------T-G-CGTG-T---A-TAT--CA-T--TT--TCT-CCA---AATTG------------------TTC-aaag
gi|13 : acttt-TTTCT---------T-TCTT-ATT-CAAA--CCTGTTTT--------TATTAA-TAT-C-AAC---AAGAA--TAAT--------------C-----T--TT-C----AA-----------ACTATGGCAAC----A-------A------GT-TTTT-TT--G--AG---A--ATC-AA-AA--------------T-A-CGTG-T---T-TAC--TA-A---T--TCT-ATA---AGTTG------------------TCC-GACT-T-CGAATT--TTCG----AT-T---CT--T-TCCT--ACAGCCG-ATAG----A-AATAA-ACACAT------AA-TTCA--AAACCGGGAGG-GGAG-ACA-T-AT--GA--AAATGGGTTGGTAA-TG----AGT--GATT----AT-TG---GTTT-CTT--AATGACA---GATGTA--T-TT--ATTA--A-TT--TTT------A--AG---T-T-GT-GAAA-TC------AC-TTGTC--TG-T-TAC-GC-AAA-------------TC------CAG-GCA--------TAT-TTGAGTGGAAACA-TCCGTCGA
gi|14 : A-AA-AA---------T-T-G-TAA----ACA-T-----GC-AT--TCT---A-TT-CCCCAGAATT-CTCTTTTACA-TTT-G---------T-TTTT-GTC-CAAA--CAT--------------------T-T-C-AAC---AG---------------------------------C-T----AA---------A-AC------AA-----A-------A------GC-TTTT-C---TCCAGCTCA--GCT-GA-AA--------------T-A-CGTG-T---T-TAT--TA-T--TT--ATC-TTA---AATCA------------------TCC-GACT-TAC--ATG--TTCGT---TT-TC--TT--T-C--T--ACCACCA-ATAG----A-GATCA-TAACGA------AA-GTCA--AACCCGGGACA-GGAA-ACA-T-GT--AA--AAATGAATTAGCAG-CG----GGT--AAGT----GC-TA---ATTT-TCT--TAAGACA---GCTGCA--T-TC--ATTG--A-TG--TTA------A--A
gi|15 : ttgaaaAGTCGG--TAA---TTTTGG-GA-AA-AA---------T-TAG-TAA----AC--C-----GT-A-A-TTTTTGG-CT-TCTCATGAAA--TTTTTGACAATTTTA---------A-TTT--ATT-CAAATACATGTTGTTC------TATTAA-TAT-C-AACAAAAAGAA--TAAT--------------C-----C--T--T----AA----TTGA-A-ATAA----AA-----A-------A------GC-TTCT-T------AG---A--A-A-AA-AA--------------TAG-C-TA-T---T---T--TATA--TT--TTT-TTAGACAATTGAATNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNN-N-NNAATT--TTTGAT--AT-T---TT--T-C--T--CCCGCCA-ATTG----G-GACTT-GCACACTACATGTA-TTCA--AACCCGGAACA-GGGgatg
gi|16 : aA-AA---------T--AGCTAT----ACA-C-----AC-ACACTTT---G-CC-CCTCGGAAAG-CTTTTT-------TCAAAAAAAAAAT------ATT-CAAA--AATGTTTTCC------TTTCGA-TGTAC-AAA---GAGAG--TAAT--------------C-----T--TT-TTTTCAA----T----G-A--A----AA-----A-------A------GTATTTT-TAGAG--AA---A--AAC-AA-AACACAAACACACCCTT-G-CATG-T---T-AAT--TA-A--TT--TTT-CAA---AGTTA------------------TCA-AAAT-T-CAATTA--ATCAT---AT-T---CT--TATA-T--ACCGCTA-Aa
gi|17 : g--AG---A--ACC-AA-AA--------------T-G-CATG-T---T-TAT--AA-A--AAAATTT-CCA---AATTG------------------TCC-GACT-T-CGAACT--TTTGAT--AT-T---TT--T-C--T--ACCGCCA-ATTG----G-GACTA-ACACAC------TA-TTCA--AACCCGGAACA-AGGA-ATG-T-GT--GA--AAATGGATTAAAAG-CG----AGT--AAGT----GT-GG---ATTT-TTT--T-T---------TTCA--TGGC--ATTA--G-TG--TTA------A--AA---T-T-ATGGAAA-TG------GC-ATAAT--TA-T-TAC-GT-AAA-------------TC------CAG-GCA--------TTT-TTGAATTGAAAAG-TCGATCGAAaatgaatgttcaaactcgcataagagggggtacgtg
gi|18 : tA-ACACAT------AA-TTTT--AACCCGGGACA-GAGA-ACA-T-GA--TA--AAATGGATTAAC----G----ACT--AGGT----GT-CG---ATCA-CCT--TATGTCA---GATACACAT-GC--AATA--A-TG--TTA------A--AG---T-T-GCGGAAA-TA------AC-TTTTC--TG-T-TAT-AT-AAA-------------TC------CAG-ACATACATATGTAT-TTGAGTCAAGCCG-TTGATCGAg
gi|19 : caaaggaaatc--------------C-----T--TT-T----AA----TTGA-A-AC-A----AG-----A-------A------GC-TTTTAT---G--AG---A--TCC-AA-AA--------------T-G-CATA-T---C-TATATTT-T--TT--TTT-CCA---AATTG------------------TCC-GACT-T-C----------------------TT--T-A--T--ACCGCCA-ATTC----G-GACTA-ACACAC------TA-TTCA--AACCAGGGA-A-AGGA-GTG-C-GT--GA--ACATGGATTAACAG-CG----AGT--AAGT----GT-GG---ATTT-TCT--CATGGCA---tgt
gi|2 : cTCAATTAAAAT---ATGCCTGGGTTTAC---GTA------ACG-GACAAATTATTTCCA-CAAC-TATAA-CATT-AATGCGTGCA-TG-TGTCACAAAGA-AATCAACAC-TT---ACT--CGCTGTTAAT----CCATTTT--CACA--G-------------------------GATT-G-AAT--TATGTGATAATC-TCTATTAATGAT-CGG---AAAATATT-AA-A-------A-ACCCAAAGTCGG-AAAA---TT---G-GA-AA-AA---------T-TAG-TAA----ACA-C-----AC-AT--TTC---G-CT-TCTAGGAAAG-CTTTCTAACA-TCTTA---------A-ATCT-ATT-GAAA--CGTGTTTTCC------TATTGA-TAT-C-TGC---AAGAA--TAAT--------------A-----T--TACT----AA----T----A-ACTC----AA-----A-------ATT----GC-TCTT-T---G--AG---A--ACC-AA-GA--------------T-A-CGTA-T---C-TAT--TA-A--TT--TGT-CAA---AATTA------------------TCC-GATT-T-TGAATG--ATCGA---AT-T---TT--T-TA-T--ACCGCCA-ATCG----G-GATTA-ACACGC------AT-TTCA--AACCCGTAAAA-AGGA-ACA-T-GT--GA--AAATGGATTAACAG-CA----TGT--AAGT----GT-TG---ATTT-CTT--TGTGACA---GATGCG--T-GC--ATTA--A-TG--TTA------A--AA---T-T-GTGGAAA-TA------AG-TTGTC--TG-T-TGC-TT-AAA-------------CT------CAG-GCA--------TAT-TTAAGTTGAAACG-TCGATCGAA
gi|20 : G----G-GACTA-ACACAC------TA-TTCA--AACCCGGATCA-GGGA-ACA-T-GT--GA--AAATGGATTAAAAG-CA----AGT--AAGT----GT-TG---ATTT-TCT--CGTGGTA---GATGCA--T-GT--ATTA--A-TG--TTA------A--AA---T-T-ATGGAGA-TT------GC-ATGAC--TG-T-TAC-GT-AAA-------------TC------TAG-GCA--------TAT-TTGAGTTGAAAAG-TCGATCGA
gi|21 : t---AT-T---TT--T-C--T--ACCGCGT-ATCA----T-GACTA-ACACAC------TA-TTTATAAATCCGAGATA-AGAA-ACA--------------------AACAG-CG----TGT--AAGT----GT-TG---ATTT-CCT--TGTGATA---GATGCT--T-AC--ATTA--A-TG--TTA------C--AG---T-T-GT---------------------C--TG-T-TAC-GT-AAA-------------TC------CAG-CCA--------TAT-TTGAGTTGAAggtgt
gi|22 : atTCGG-AATA---TTT--G-GA-AA-AA---------T-TAA-TAA----ACA-TTACAAGT-ATA-TTT---G-CT-TCTCTTAAAA-CTTTTTGACA-TTTGA---------T-TTTTAATT-CAAA--TATG-TTTCC------TATTAA-TAT-C-AAC----------TAAT--------------------------T----GA---------A-AC-A----AA-----A-------A------GC-TTTC-T---G--AG---A--ACC-GA-CAT-------------T-A-CAT----------T--TA-A--TT--TTgtca
gi|23 : CA-T-GT--TA--AAGTGGGT-AATAA-CG----AGT--AAGT----AT-TG---ATTT-CCTGACTTG-CA---GATGCA--T-TC--ACAA--A-TT--TTA------A--AG---T-G-GTGGAAA-TA------AC-TT--------T-TAT-GG-AAT-------------TC------CAG-A-A--------TAT-TTGATTCAAAATA-TCAGTCa
gi|24 : aaagacaaactcataattcgTA-GCACAC------TA-TTCA--AACCCGGAACA-CGGA-ACA-T-GT--GA--ACATTGATTAAAAG-CG----AGT--AAGA----GT-TG---ATTT-CCT--CATGGCA---GATGCA--T-CC--ATC---A-TG--TTG------A--AA---T-T-ATGGAAA-TG------GC-ATGAC--TG-A-TAC-GT-AAA-------------TC------Cagagtgt
gi|25 : aaaaagGAA-ACAAT-GT--GA--AAATGGATGAACAGGCA----TGTTTAAGT----GT-TG---ATTT-CAT--TGTAACA---GATGCA--G-GC--ATTA--A-TG--TTA------A--AA---T-T-GTTGAAA--A------AC-TTGTC--TGAT-TACGGT-AAA-------------TC------CAGTTCC--------TAT-TTGCGTTGAAAAG-TCAATCgacttttaat
gi|26 : G-T-GT--GA--AAATGGATTAACAG-CACATAAGT--GAAT----GT-TG---ATTT-CCT--TGTGACA---AGTGCA--TTACT-ATAA--AGTA--CTA------AGTAG---C-T-GCGGAAAATA------AC-TCGT----G-T-TGC-GA-AAA-------------TC------CAG-GCA--------TAT-TTGAGTTGAAATG-TTGATCGAAt
gi|27 : A-GAGA-ACA-T-GT--GA--AAATGGATTAACAT-CGA---AAA--AAAT----GT-TA---ATTT-ATT--TATGACA---TAAGCA--T-GC--AGCA--A-TA--TC-------A--AA---T-T-GTCGAAA-TA------AC-ACGTC--TA-T-TGC-CT-ACA-------------TCTAGGTACAG-GTA--------TAT-TTGAGTCGAAACG-TCG
gi|28 : ---ATGCCTGGGCTTAC---ATA------ACA-GACAAATTACTTCCC-CAAC-TTTAA-CATT-AACGCATGCA-TC-TATCACAAGGA-ATTCAACAC-TT---ACT--TGCTGTTGGC----CCATTTt
gi|29 : atttcaattgacg-C-----GT-GTG-TTT---AACTGTCTCGGCAAG-CTTCTTGGCA-TT-----------------------------CACGTTT-CC------TATTGAATAT-C-AAC---AAGAA--TGAT--------------C-----T--TT-T----------T----A-GCTA----AA-----A-------AAAAAATGC-TTTT-TC--G--AG---ATTGCCTAATAA--------------C-GCCATGAT---T-TAT--T--A--TT--TTagggtacatagtctggttcc
gi|3 : TCAACTCAAAT---ATGCCTGGATTTAC---GTACATGTAACA-GACAAGT-ATGCCAA-CAAG-TTTAA-CAT--AATGTATGCA-TC-TGACACATGAA-AATCAACACCTT---ACA--TGCTGTTAAT----CCTTTTT--CACA--G--T-T---------------------------------------TGATC-TCTATGGGCGTT-TAT---AAAA-A---AA-A-------A-A--CGAAGTCGG-AATA---TT---T-GA-AA-AA---------T-TA--TAA----ACA-C-----ATTATA-TTTT--G-CT-TCTCATAACA-CTTTT-GACA-TTTCA---------T-TTTG-ATT-CAAA--CATGTTTTCC------TAT-AA-GAT-CGAAC---AAAAA--TTA--------------------------------AA----T----A-ATTT----TA-----A--------------------T-T---G--AA---A--A----A-AA--------------C-C-C----------------A-A--CT--TT--CCA---AATTG------------------TCT-GACT-T-CGAATT--TT-GAT--AT-T---TT--C-T--T--ACAGCCG-AACG----GAGACTA-ACACAC------TA-TTCA--AGCCCGGAACA-ATGA-ACG-T-GTTGGATTAAATG-ATTAAAAG-CG----AGT--AAGTCAGTGT-TG---ATTT-TCT--C-TGACA---GGTGCG--T-GC--ATTA--A-TG--TTA------A--AA---T-T-ATTAAAA-TG------TT-ATGAC--TG-T-TAC-GTAAAA-------------TC------CAG-GCA--------T-T-TTGAGTAGAAAAG-TCag
gi|30 : tattgacttttTAAAAG-CG----AGT--AAAT----GT-TG---ATTT-CCT--TGTTATA---GATACA--T-GTAAATTG--A-TG--T--------A--AA---T-T-GTGGAAA-GA------CT-TTGTC--TG-T-TAT-GT-AAA-------------TC------CA-----------------TCCAGTGAAAACG-TCCGTCGA
gi|31 : aag-T-CGAACA--TTCGA---AG-TCAGTTAAT-T--TGGACCGCCA-ATAG----A-GATTA-ACACAcgcg
gi|31 : T-CCA---AATTA------------------ACT-GACT-T-CGAATG--TTCGAT--AT-T---TT--T-TC-T--ACTGCCA-ATCG----G-GAGTA-ACACTC------TA-TTCA--AACCCGGGACA-GGGA-ACG-T-GT--GA--Atattttttctactgccaatcgggagtaacactctattcaaacccgggacagggaacgtgtgaa
gi|32 : tgtgttaatctctattggcggGT--AAGT----AT-TG---ATTT-CAT--TGTGACA---GATGCA--T-AC--ATTT--A-TG--TTA------A--AA---T-T-GTTGGAA-TA------AC-TTGTC--TG-T-TAT-GT-AAA-------------TC------CAG-GCA--------TAT-TTGAGTTGAAAAG-TCGATTGA
gi|33 : cACA-GAGA-GCA-T-GT--GG--AAATGCATTAACGA-CG----AAT--AAGT----GT-TC---ACTT--CT--TGTGACA---AATGAA--T-GA--CTTA--ATTG--TT-------A--AG---T-C-GTGGAAA-TA------AC-TTGat
gi|34 : TCAAAT---G-ACTTAAATTTATCCTGCA------AGA-GACAAGT-ATTTCAA-CAAT-TTAAG-CATT-AATGCATACA-TT---TCACAATG--AATCAACAC-TT---ACatgtctacagtacgca
gi|35 : ctatgactttttccaCA--T-GC--ATTG--A-TG--TTATTATTTA--AA---T-T-GTTGAAA-TA------AC-TTGTC--TG-T-AAT-GT-AAATCTGTGCAGCCATTC------CAG-GCA--------TAT-TTGAGTTGAAAAT-TCGATC
gi|36 : tgtTTAATC-TCTATGGGAGGT-ATA---AACAAAT--AAGA-------A-ATCCAAAGTCGGAATAT---TT---G-GA-AA-AA---------A-TAG-TGATATCATA-T-----AA-ATA-TTT---G-CT-TCTCATAAAA-CGTTtgt
gi|38 : ATGCA--T-GC--ATTG--G-TG--ATG------A--GT---T-G-GTGGAAA-TACGAGTAAA-TTGTC--TA-TCTA--GT-AAA-------------TC------CAG-CCA--------TAT-TTCAGTTGAAACG-TCGATCGAA
gi|39 : cgcTT-CCA--TATGACA---GATACA--T-AC--ATTATAA-TG--TTA------A--AA---T-T-ATGGAAA-TA------GC-TAGTC--TG-T-TAA-GT-AAA-------------TC------CAG-GCA--------T---------------G-TCGATCGAA
gi|4 : C---GTA------ACA-GACAAGTTATTTCCA-CAAT-TTTAA-CATTGAATGCATGCG-TC-TGTCATAAGAA-AATCAACAC-TT---ACC--CGCTGCTAAT----CCATTTT--AAC---G--T-T-CAT--TGT---CC-----TG----G-GAT--TG------AATT-TTTAT---CAGT-AGG---AAATAAT--AAGA-------A-ATTCGAAGTCGG-AAAA---TTT--G-GA-AA-AA---------T-TAG-TAA----ACA-C-----GC-AT---TT---G-CA-TCTCCGAAAG-CTTTTTAACA-TTTCA---------T-TTTT-ATT-CAAA--CATGTTTTCC------TATTGA-TAT-C-AAT---AAGAA--TA-T--------------T-----TAATG-T----AA---------A-AC-A----AA-----A-------A------GC-TTTT-G---G--GG---A--ACC-AA-AA--------------T-G-CACG-T---T-TAT--TA-A--TT--TTA-CTA---GATTA------------------TTA-GACT-T-CGA-------------A------------T--G--ATCGCCGTATCA----G-GATTA-ACACGC------AA-TTCT--A----GGGACA----------T-GT--GA--AAATGGAATAACAG-CG----AGT--AAGT----GCATGTATATTT-CCT--TGTGGTA---GGGGCA--T-GC--ATTA--A-TG--TTA------A--CG---T-T-TTGGGAA-TT------AC-TTG----CA-T-T--------G-------------TC------CAT-G----------TAT-TTGAGTTGAAACG-TCTATg
gi|40 : a-GGGA-ACG-T-GT--GA--AAATGGATTAAAAG-CG----AGA--AAGT----GT-AG---ATTT-TCT--CATGGCA---GGTACA--T-GC--ATTA--A-TG--TTA------A--AA---T-T-ATGAAAaatgtgttgaaatcgtcggtcgaagt
gi|41 : TCGACACAAAT---ATGGCTTGATTTAC---ATA------ACA-GACAAGTTACTTCCG-CATC-GTTAA-CATT-GATAAATGCA-TC-TGTCATAA
gi|42 : ttCAACTCTTATTAAATGTCTGAATTTAC---ATA------ACAAGACAAGTTGTTTCAA-CAAC-TCTAA-C-TT-AATG-----A-TC-TGTCATAAGGaa
gi|43 : AT---GTATCTGGATTTAC---GTA------ACA-GATAAGTTATTTCCA-CAAC-T
gi|44 : atgttcaataactgtaacttaagtgtggattCAC-------A-TTCA--AACCCAGGAT--------TA-T-AT--AA--AAAAAAAT--ATAG-GA----AGG--AAGT----GT-AT---ATTT-CAT--TATGACG---GGCGCA--T-AC--ATaca
gi|45 : CTGTTAAT----CCATTTT--TACAT-G--T-T-T-C--T-TGTCCC-----GGTTTTG-AATATTGTTTGTTAATC-TCTAAGGGCGGT-
gi|46 : taT--T-C--T--ACCGCCA-GTCG----G-GGCTA-ACACAC------TA-TTTA--AACC--AGACG-AGGA-ACA-TCAT--GG--AAATG--------G-CA----AGT--CAGT----GT-Tata
gi|47 : GTAACA---GATGCA--T-GT--GTTA--A-TG--TTA------A--AA---A-T-TTTGAAA-TA------AC-TTGTC--T----------------------------------------------------T-TTGAGTTGAAACG-TCGATTGAA
gi|48 : acA--A-TG--TTA------A--AAATTT-T-CT----A-TA------AC-TTGTT--TG-T-TAC-GT-AAA-------------TT------CGG-GCA--------TAT-TTGAGTTGAAAAG-TCGATCGa
gi|49 : A---T-T-ATGGAAA-GA------GC-ATACC--TA-T-TAA-GT-AAA-------------TC------AAG-GCA--------TAT-TTGAGCTGTAACG-TCGATTGAA
gi|5 : CACAGTGA-AATCAACAC-TT---ACA--TGCTGTTAAT----CCATTTT--CACAT-G--T-TTC-T--TGT---CCCG---GGTTT-G-ATT--TGTTTGTCATTC-TCTAAGGGCGGT-ATA---AAAAAAT--AA-A-------ATATCCGAAGTCAG-AATA---TTT--G-GA-AA-AA---------T-TAG-TAA----ACA-T-----GT-ATA-CTT---G-CT-TCTTATAAAA-CTTTTCGACA-TTTCA---------T-TTTG-ATT-CAAA--CATGTTTTCCTATTATTATTAA-TAT-A-AAC---AAAAA--GAATC-------------C-----C--TT-T----AA----T----G-GTTG----GA-----ACGCATGGA------GC-TTTC-T---T--AG---A--ACC-AA-AA--------------T-G-CAGA-G---T-TA---TA-ATTTT--TTT-CGA---AATTG------------------TCCGGACTCT-CGAACT--TTTGAAGTAT-T---TT--T-C--T--ACCTCCA-ATGGGT--G-GGCTA-ACA-AC------TA-TTCA--AACGCGAAGCATGGGA-ATG-T-GT--GA--AAATGGATTAA-AG-CA----AGT--AAGT----G--TG---GTTT-TCT--CATGACA---GGTGCA--T-GC--AATA--A--G--TTA------A--AA---T-TAATGG--A-TG------GC-ATA-C--TA-T-TAC-GG-TAA-------------TC------C-G-GCA--------TAT-TTGAGTTGAAAAGATCGATCGatgt
gi|50 : -T-GTTGGAA-TA------AC-TTGTC--TG-T-TAC-GT-AAA-------------TC------CAG-GCA--------TAT-TTGAGATGAAAAG-TCTATCGAA
gi|51 : acTGCATGCA-TC-TGTCACAATGA-AATCAAC----T---ACT--TGCTTTTAAT----CCATTTT--CAC----------C-TG-T-T---CC-----GG
gi|52 : TTTAC---GTA------ACA-GACAAGTTATTCCAA-CAACTTTTAA-CATT-AATGGATGCA-TC-T
gi|53 : gatcgacAT---ATGCCTGGATTTAC---GTA------ACA-GTCATGCAATTTCCA-TAAG-TTTAA-CAGT-AATGCATGC
gi|54 : TT--CACAT-G--T-T-C-TG-T-C---CC-----GGATT-G-A-T--TGTTTGTTAA-C-TCTATGGGCGGT-GAA---AAAA
gi|55 : TCAA-CAAT-TTTAG-CATT-AATGCATACA-TT-TGTCACAATGA-AATCAACAC-TT---ACA--CGCat
gi|56 : AA-TA------AC-TTGTCC-TG-T-TAA-GT-AAA-------------TC------CAG-CCA--------TAT-TTGAGTTGAAA-G-TCAATCGAA
gi|57 : tgA---AATTG------------------TCC-GACT-T-CGAACT--TTTGAT--AT-T---TT--C-C--T--ACCACCA-ATTG----G-GACT
gi|58 : ttacaAAA-TA------AT-TTGTC--TG-T-T----T-AAA-------------TC------CGG-GAA--------TAT-TTGAGTCGAAACG-TCGACCGAA
gi|59 : TGGAAA-TG------GC-AAGTCAGTG-T-TAA-GT-AAA-------------TG------AAG-GCA--------TAT-TTGAGTTGAAA
gi|6 : tcaCAAGTAATT-CCT-CAAC-ATTAAACATA-GAGAGGTACACTC-TATTACAAAAACAATCAAC-C-TTGTGACGTTCGTTGTTAATTAGCCCATTTT--CAAA--A--TGT-C-T--T-T---CTGTCCAGGGTT-GCAAT--TGTGAGTTTATA-ACCACTGGCGGG-AAGCAAAAAAAGTCGAA-A-------A-ATTC-AAGTAGG-CAAA---TT---G-TATTA-TA---------T-TAGACAA----ACAGC-----GC-AAT-TTT---G-C--TCTCAGGAAGCCCTCTTGGCT-TTTCC---------TATTTT-CTT----A--CCT------C------TATCG------C-AACCA-AATAA--TAAT--------------CATTTTT--TT-T----AAAAATT----ATACTG----GA-----A-------A------GT-TTTT-T---C--AA---G--TTG-AA-AA--------------T-A-TGTG-T---T-TGA--TATA--TT--TTT--CA---AATTG----------------------G--T-C-CGAACT--TCCGG---A------TT--T-T--T--ACC-CCA--------------TA-------------GA-TTTA--AATCCGGGACA-GGGATACG-A-GT--G---AATTGGATTAACAG------------------------A---ATCT-TCTG-TATGGCA---GTCGCA--T-TT--ATTG--A-TG--TTG------ATCGT---T-T-GTAGAAA-T
gi|60 : A------ACA-GACAAGTTATTCCAA-CAAT-CTTAA-TATT-AATGCATGCA-TC-TTTCACAActcag
gi|61 : TGGATTAAAAG-CA----AGT--AAGT----GC-TG---ATTT-TCT--AGTGGTATTGGA---A--T-GC--AGTA--A-t
gi|64 : -------------TT------CAG-GCA--------TAT-TTGAGTTTAAAAG-TCGATCAAA
gi|66 : acac------CAG-GCA--------TGT-TTCAATTGAAAAG-TCGATCGAA
gi|7 : ATGCATGCA-TC-TGTCACAATGA-AATCAACAC-TT---ACA--TGCTGTTAAT----CCATTTTTACATA--T--T-T-C-T--TGT---CCCG---GGTTT-G-AAT--TGTTTGTTAATC-TCTAAGGGCGGT----------ATAT--AA-AAATGATTA-ATCCGAAGTCGGAATAT---TT---G-GA-AA-AA---------T-TAA-TAA----ACA-C-----AT-ATA-TTT---G-CT-TCTCATAAAA-CTTTTTGACA-TTTCA---------gtgt
gi|7 : atc----AA-----A-------A------GC-TTTC-T---G--AG---A--ACC-AA-AA--------------T-G-AGTG-TACAT-CAT--T-----TT--TTT-CCA---AATTG------------------TCC-CACT-T-CGAATT--TTTTAT--AT-T---TT--T-C--T--ACCGCCA-ACTGCCAGG-GACTA-ACACAT------TA-TTCA--AACTCGGAATA-GGGA-ACA-T-GT--GA--AAATGGATTAAAAG-CA----AGT--AAGT----GT-TG---ATTT-TCT--CGTGGTA---GGTGCA--T-GC--ATTA--A-TG--TT---------------T-T-ATGGAAA-TG------GC-ATGAA--TG-T-TAC-GT-AAA-------------TC------TAG-GCA--------TAC-TTGAGTTGAAAAG-TCGATCGAAaaaagctttctgagaaccaaaatgagtgtacatcatttttttccaaattgtcccacttcgaattttttatatttttctaccgccaactgccagggactaacacattattcaaactcggaatagggaacatgtgaaaatggattaaaagcaagtaagtgttgattttctcgtggtaggtgcatgcattaatgttttatggaaatggcatgaatgttacgtaaatctaggcatacttgagttgaaaagtcgatcgaagtgt
gi|8 : atcatgcatgcatctgtcacaatgaaatcaacacttacatgctgttaatccatttttacatatttcttgtcccgggtttgaattgtttgttaatctctaagggcggtatataaaaatgattaatccgaagtcggaatatttggaaaaattaataaacacatatatttgcttctcataaaactttttgacatttcaTCAACTCAAA----ATTGCTAGATTTAC---ATA------ATA-GACAAGTTTATTCCA-AAAT-CTTAA-CAT---ATGCATACA-TCATGTCACAATGA-AATCAACAC-TT---ACA--T-CTGTTAAT----CCATTTT--TACAAGG--T-T-C-T--TGT---CCCG---GGTTT-G-AAT--TGTTTGTTAATC-TCTAAGGGCAGT--------AAAT--------------------CGAAGTGGA-ATAT---TT---G-AA-AA-AAAAT------T-TAA--AA----ACA-C-----GT-ATA-TTT---G-CT-TCTCATAAA--CTTTTTGACA-TTTCA---------T-TTTT-ATTCCAAA--CATG-TTTCC------TATCAA-TAT-C-AAC---AAAAAC-TATC--------------C-----T--TT-T----AA----TTGA-A-AC-A----AA-----A-------A------GC-GTTC-T---G--AG---A--ACC-AA-AA--------------T-G-CGTG-T---A-TAT--CA-T--TT--TCT-CC----AATTG------------------TCC-GACT-T-CGAATT--TTgtgt
gi|9 : aaatatatGG---AAAGTG---GA-A-------A-ATCCAGATTCGG-GAAT---TT---G-GA-AA-AAAAAATATATTATAG-TAA----ACA-C-----AC-A-A-TTT---G-TT-TCGCGGA--G-CTTTTTGAAA-TGTCA---------C-CTTT-----------------TTTC------TGTTGA-TAT-C-AAC---AAAAA--CAATAAATTCAACTTTGGT-----T--TG-T----AA----A----AGAAGA----AA-----A-------A------GC-TTT------G--AG---A--ACC-AA-AA--------------T-G-CGTC-T---T-TTC--TA-T--TT--TGT-CCA---AAAT------------------------ACT-T----------TTGA---ATAT---TT--T-T--T--ATCGTTA-ATTG----A-GATAA-ACACAC------AA-TTCA--AAC-----ACG-GGGT-ACG-T-GT--GA--AAATGGATTTACAA-CG----CGT--AAGT----GG-TG---CTTTACCTA-CATTACA---ATTGCA--T-TC--ATTA--A-TG--TAA------A--AG---T-T-GTGAAAA-CA------aag
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|37 ): TTTTTCACACTTTCATGCGGTTTTTTTTTTTATTCTAGTTGACATTTCCACAATTTGATCAAAGTGGTTCAATCAAGGGATATGTGGGGAGA
Unaligned ( gi|62 ): GAAAAGTTATTGTTAGCCATTTTTCTTTTTATTACATGTATA
Unaligned ( gi|63 ): ATTGTCTGTTACACAAGATTCGAAATGTTGGTTGAAGTG
Unaligned ( gi|65 ): TAAAACTATTCGTTGAAAACACCTTTTTTAAAATAC
Alignments
lowQualScore : 55555555555555555555555 2222222222222222222222222222 11 111111111 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 11111111 11111111111111 1111111111111111 111111111111111111 2222222222
lowQualScore : 777 4 999 888888 3 3 33 1 33 2 2 2 2 2 2 2 2 888 666 2 6666 2 00000000000000000000000 2 3 3 44 0 3 1 9999999999999999999999999999 3 3 2 66 99 2 2 2 444444444 2 7 2 2 2 55555 55 666 666 2 2 3 66 2 99999999999 77 22 33 1 33 666666 00 2 2 2 777 3 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 333 2 6666666 888888 2 00000000 333 22 2 2 33333333333333 2 2 1 2 2222222222222222 22 2 333 444444444444444444 2 2 2 0 44444 1 0000000000 4 55 22 6666 666666 1 22 1 6666666 1 22 4444 0 1 1 1 22 22 2 1 4444 3333 1 222 11 8888 222 11 2 44 11 2 11 333333 33 222 1 1 0 1 333333 11 2 33 1 1 1 7777777777777 333333 44444444 1 3 1
lowQualScore : ... . ... ...... . . .. . .. . . . . . . . . ... ... . .... . ....................... . . . .. . . . ............................ . . . .. .. . . . ......... . . . . . ..... .. ... ... . . . .. . ........... .. .. .. . .. ...... .. . . . ... . ............................................................. ... . ....... ...... . ........ ... .. . . .............. . . . . ................ .. . ... .................. . . . . ..... . .......... . .. .. .... ...... . .. . ....... . .. .... . . . . .. .. . . .... .... . ... .. .... ... .. . .. .. . .. ...... .. ... . . . . ...... .. . .. . . . ............. ...... ........ . . .
lowQualScore : 000 0 222 888888 1 1 88 0 99 9 9 4 4 7 7 7 7 333 000 7 1111 7 66666666666666666666666 5 1 1 22 5 1 0 0000000000000000000000000000 1 1 7 77 00 7 5 4 444444444 4 1 4 4 2 66666 33 666 111 2 2 1 33 2 11111111111 66 66 22 0 22 888888 77 4 4 4 444 5 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 777 1 8888888 999999 1 11111111 555 88 0 0 88888888888888 0 0 8 0 0000000000000000 88 1 555 888888888888888888 0 1 1 6 55555 8 1111111111 2 00 88 7777 888888 9 55 8 1111111 9 66 0000 4 7 7 6 33 22 8 5 8888 1111 5 777 77 3333 444 88 6 44 77 5 88 777777 55 333 2 2 1 2 555555 99 5 11 3 7 3 1111111111111 666666 77777777 3 0 5
consensus : TCAACTCAAAT---ATGC-CTGGATTTAC---GTA------A-CA-GACAAGTT-ATTCCAACAAT-TTTAA-CATT-AATGCATGCA-TC-TGTCACAATGA-AA-TCAAC-AC-TT---ACA--CG-CTGTTAAT----CCATTTTC-ACA-TG---TT-C-T-T-T---CC--GGTTT-G-AAT--TGTTTGTTAATC-TCTANGGGCGGT-A-NG---AAAAAAT--A--------A-A-A-ATCCGAAGTCGGA-A-AATTT-G-GA-AA-AA---------T-TAG-TAA-A-CA-C-----GT--ATA-TTT---G-CT-TCTCATAAAG-CTTTTTGACA-TTTCA---------T-TTTT-ATT-CAAA--CATGTTTTCC------TATTGA-TAT-C-AAC---AAGAA--T--AA-T--------C-----TT-T------T----AA----T----A-ACT--A----A---A-A-------A------GC-TTTT-T---G--AG---A--ACC-AA-AA--------------T-G-CGTG-T---T-TAT--TA-A--TT--TTT-CCA---AATTG------------------TCC-GACT-T-CGAAT---T-TTCGA---A-----T-T--TT--T-C--TACCGCCAATCG----G-GAC--TA-ACACAC------TA-TTCA--AACCCG----GGACA-GGGA-ACGT-GT--GA--AAATGGATTAACAG-CG----AGTAAGT----GT-TG---ATTT-CCT--CGTGACA---GATGCA--T-GC--ATTA--A-TG--TTA------A--AA---T-T-GTGGAAA-TA------AC-TTGTC--TGT-TACGT-AAA-------------TC------CAGGCA--------TAT-TTGAGTTGAAACG-TCGATCGAA
Reference ( family-1049 ) : TCAACTCAAAT---ATGC-CTGGATTTAC---GTA------A-CA-GACAAGTT-ATTTCNACAAC-TTTAA-CATT-AATGCATGCA-TC-TGTCACAATGA-AA-TCAAC-AC-TT---ACA--CG-CTGTTAAT----CCATTTTC-ACA-TG---TT-C-T-T-T---CC--GGTTT-G-AAT--TGTTTGTTAATC-TCTANGGGCGGT-A-NG---AAAANAT--A--------A-A-A-ATCCGAAGTCGGA-A-AATT--G-GA-AA-AA---------T-TAG-TAA-A-CA-C-----GT--ATA-TTT---G-CT-TCTCATAAAG-CTTTTTGACA-TTTCA---------T-TTTT-ATT-CAAA--CATGTTTTCC------TATTGA-TAT-C-AAC---AAGAA--T--AA-T--------C-----TT-T------T----AA----T----A-ACT--A----A---A-A-------A------GC-TTTT-T---G--AG---A--ACC-AA-AA--------------T-G-CGTG-T---T-TAT--TA-A--TT--TTT-CCA---AATTG------------------TCC-GACT-T-CGAAT---T-TTCGA---A-----T-T--TT--T-C--TACCGCCAATCG----G-GAC--TA-ACACAC------TA-TTCA--AACCCG----GGACA-GGGA-ACGT-GT--GA--AAATGGATTAACAG-CG----AGTAAGT----GT-TG---ATTT-CCT--CGTGACA---GATGCA--T-GC--ATTA--A-TG--TTA------A--AA---T-T-GTGGAAA-TA------AC-TTGTC--TGT-TACGT-AAA-------------TC------CAGGCA--------TAT-TTGAGTTGAAANG-TCGATCGAA
gi|1 : TCAACTCAACT---ATGC-CTGGGTTTAA---GTA------A-CA-G-----TT-TTTCTAACAAT-TTTAA-TATT-AATGCATGCA-TC-TGTCACAATGA-AA-TCAAA-TT-TT---GCA--TG-CTGTTAAT----CCATTTTC-ACA-TGC--TT-C-T-TAT---CCCGGGTGT-G-AAT--TGTCTGTTAATC-TCTAGAGGCGGT-A-T----AAAAAAT--A--------A-ACA-GTCTGAAGTCGGA-A-TATT--T-GA-AACAA---------T-TAGAAAA-A-CA-C-----GT--ATT-TTT---G-CT-TCTCATAGAA-CGTTTTGGCA-TTTAA---------T-TTTG-ATT-CAAA--CATGTTTTCC------TAATAG-TAT-C-AAC---AACAA--A--AACC--------C-----TT-T------T----AA----TTG--A-ATC--A----T---G-A-------A------GC-TTTT-T---G--AG---A--ACC-AA-AA--------------T-G-CATG-T---T-TA---TA-C--TT--TTTCCCA---AATTG------------------TCC-GACT-T-CGAAG---T-TTTGAT--A-----T-T--TT--T-C--TACCTCTTATTA----G-GAC--AA-ACACAC------TA-TTCA--AACCCA----GAACA-GGGA-AAGT-AT---A--AAATGAATTAAAAG-CG----AGTAAGT----AT-CA---ATTT-TCT--CATGGTA---AATGCA--T-GC--ATCA--A-TG--TTG------A--AA---T-T-ATGGAAA-TG------GC-ATAAC--TGT-TACAT-
gi|10 : atgtgtaactatgtaactgttaaactgacttattagggaccaag--A--------A-A-A-CTACGAAGTCGGATA-AATTTTG-GA-AA-AC---------T-T-T-TAA-C-CA-A-----G---A-A-CTT---G-CT-TG-CAGAAGG-CTGTCTGTCA-TTTCA---------A-GTT--ATT--AAA---ATGTTT--C------TATGGA-T-T-T-AAC---ACGAA------A-T--------C-----TT-T------------A----T----A-ACTTAA----ACGTA-A-------A------GC-TTTT-----------------------------------------G-CATG-TAA-TGTAT-----G--TT--TTT-TCA---AAT-A------------------TCC-GA-T-T-CACATACAT-T-------A-----T-T--TT--T-AAATACCACCA-TCT----G-AAA--TGCAC-CAC------GAATTCA--A---CG----G-ATA-GG-A-ACAC-GT--GA--AA-TAGATAGGCAGTCG----AGTATGT----GT-TG---AT-----------GAT------TGCA--T-GCA-ATTT--A-TGGTTTA------T--AG---TAT-ATAG-AA-TA------GCATTGCC--TGT-TAAAT-AAT-------------AC------CA-GCA--------TATATTGAGTCGAAACA-TCAGTCGAAaaagtcgatcgaagt
gi|11 : aaattccTCAACTCAAAT---ATGC-CTGGATTTAC---ACA------A-CA-GATAAGTC-ATTCCAACAAT-TTTAA-CATT-ATTGCATGCA-TC-TGTCACAATGA-GA-TCAAC-AC-TT---ACA--TG-CTTTTAAT----CCATTTTC-ACA-TG---TT-T-C-T-TGTACCG-GGTTT-G-AAT--TGTTTGGTAATC-TCTAAGGGCGGT-ATAG---AAAATAA--A--------A-A-A-ATTCGAAGTCGGA-A-TATTTGG-AA-AA-AA---------T-TAG-TAA-A-TA-T-----GT--ATA-TTT---G-CT-TCTCATAAAA-CTTTTTGGCA-TTTCA---------T-TTTG-ATT-CAAA--CATGTTTTCC------TAATTA-TAT-C-----------------------------C-----TT-A------T----AA----TTG--A-AAA--A----A---G-A-------A------GC-TTTT-T---G--GA---A--GCC-AA-AT--------------T-G-CATG-T---T-TAT--AT-G--TT--TTT-CCA---AATTG------------------TCC-gtg
gi|12 : TCAACTCAAAT---ATGC-CTAGATTTAC---ATA------A-TA-GACAAGTT-ATTCCAACAAT-CTTAA-CATT-A-TGCATACA-TC-TGTCACAATGA-AA-TCAAC-AC-TT---ACA--TG-CTGTTAAT----CCATTTTT-ACA-AG---TT-T-C-T-TGTCCC--GGTTT-G-AAT--TGTTTGTTAATCTTCTAAGGGCAGT----------------------------A-A-ATCCGAAGTCGAA-T-ATTT--GAAA-AA-AA---------T-TAA-TAA-A-CA-C-----GT--ATA-TTT---G-CT-TCTCATAAA--CTTTTTGACA-TTTCA---------T-TTTT-ATT-CAAA--CATGTTT--C------TATCAA-TAT-C-AAC---AAAAAACT--AT-C--------C-----TT-T------T----AA----TTTGAA-AC---A----A---A-A-------A------GC-GTTC-T---G--AG---A--ACC-AA-AA--------------T-G-CGTG-T---A-TAT--CA-T--TT--TCT-CCA---AATTG------------------TTC-aaag
gi|13 : acttt-TTTCT---------T-TCTT-ATT-CAAA--CCTGTTTT--------TATTAA-TAT-C-AAC---AAGAA--T--AA-T--------C-----TT-T------C----AA-----------ACT--ATGGCA---ACA-------A------GT-TTTT-TT--G--AG---A--ATC-AA-AA--------------T-A-CGTG-T---T-TAC--TA-A---T--TCT-ATA---AGTTG------------------TCC-GACT-T-CGAAT---T-TTCGA---T-----TCT--TT--C-C--TACAGCCGATAG----A-AAT--AA-ACACAT------AA-TTCA--AAACCG----GGAGG-GGAG-ACAT-AT--GA--AAATGGGTTGGTAA-TG----AGTGATT----AT-TG---GTTT-CTT--AATGACA---GATGTA--T-TT--ATTA--A-TT--TTT------A--AG---T-T-GT-GAAA-TC------AC-TTGTC--TGT-TACGC-AAA-------------TC------CAGGCA--------TAT-TTGAGTGGAAACA-TCCGTCGA
gi|14 : A-AA-AA---------T-T-G-TAA-A-CA-T-----GC--AT--TCT---A-TT-CCCCAGAATT-CTCTTTTACA-TTT-G---------T-TTTT-GTC-CAAA--CAT--------------------T-T-C-AAC---AG-----------------------------C------T----AA---------A-AC--------A---A-A-------A------GC-TTTT-C---TCCAGCTCA--GCT-GA-AA--------------T-A-CGTG-T---T-TAT--TA-T--TT--ATC-TTA---AATCA------------------TCC-GACT-TAC--AT---G-TTCGT---T-----T-TC-TT--T-C--TACCACCAATAG----A-GATCATA-ACGAA--------A-GTCA--AACCCG----GGACA-GGAA-ACAT-GT--AA--AAATGAATTAGCAG-CG----GGTAAGT----GC-TA---ATTT-TCT--TAAGACA---GCTGCA--T-TC--ATTG--A-TG--TTA------A--A
gi|15 : ttgaaaAGTCGGT-A-ATTTTGG-GA-AA-AA---------T-TAG-TAA-A-C--C-----GT--A-A-TTTTTGG-CT-TCTCATGAAA--TTTTTGACAATTTTA---------A-TTT--ATT-CAAATACATGTTGTTC------TATTAA-TAT-C-AACAAAAAGAA--T--AA-T--------C------C-T------T----AA----TTGA-A-ATA--A----A---A-A-------A------GC-TTCT-T------AG---A--A-A-AA-AA--------------TAG-C-TA-T---T---T--TATA--TT--TTT-TTAGACAATTGAATNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNN-N-NNAAT---T-TTTGAT--A-----T-T--TT--T-C--TCCCGCCAATTG----G-GAC--TT-GCACACTACATGTA-TTCA--AACCCG----GAACA-GGGgatg
gi|16 : aA-AA---------T--AGCTAT-A-CA-C-----AC--ACACTTT---G-CC-CCTCGGAAAG-CTTTTT-------TCAAAAAAAAAAT------ATT-CAAA--AATGTTTTCC------TTTCGA-TGTAC-AAA---GAGAG--T--AA-T--------C-----TT-T------TTTTCAA----T----G-A----A----A---A-A-------A------GTATTTT-TAGAG--AA---A--AAC-AA-AACACAAACACACCCTT-G-CATG-T---T-AAT--TA-A--TT--TTT-CAA---AGTTA------------------TCA-AAAT-T-C-AAT---TAATCAT---A-----T-T--CTTAT-A--TACCGCTAA---------------A-ATG-AA------TG-TTCA--AACTCGCATAAGAGG-GGGT-ACGT-Ga
gi|17 : g--AG---A--ACC-AA-AA--------------T-G-CATG-T---T-TAT--AA-A--AAAATTT-CCA---AATTG------------------TCC-GACT-T-CGAAC---T-TTTGAT--A-----T-T--TT--T-C--TACCGCCAATTG----G-GAC--TA-ACACAC------TA-TTCA--AACCCG----GAACA-AGGA-ATGT-GT--GA--AAATGGATTAAAAG-CG----AGTAAGT----GT-GG---ATTT-TTT--T-T---------TTCA--TGGC--ATTA--G-TG--TTA------A--AA---T-T-ATGGAAA-TG------GC-ATAAT--TAT-TACGT-AAA-------------TC------CAGGCA--------TTT-TTGAATTGAAAAG-TCGATCGAA
gi|18 : tA-ACACAT------AA-TTTT--AACCCG----GGACA-GAGA-ACAT-GA--TA--AAATGGATTAAC----G----ACTAGGT----GT-CG---ATCA-CCT--TATGTCA---GATACACAT-GC--AATA--A-TG--TTA------A--AG---T-T-GCGGAAA-TA------AC-TTTTC--TGT-TATAT-AAA-------------TC------CAGACATACATATGTAT-TTGAGTCAAGCCG-TTGATCGAg
gi|19 : caaaggaaatc--------C-----TT-T------T----AA----TTGA-A-AC---A----A---G-A-------A------GC-TTTTAT---G--AG---A--TCC-AA-AA--------------T-G-CATA-T---C-TATATTT-T--TT--TTT-CCA---AATTG------------------TCC-GACT-T-C----------------------------TT--T-A--TACCGCCAATTC----G-GAC--TA-ACACAC------TA-TTCA--AACCAG----GGA-A-AGGA-GTGC-GT--GA--ACATGGATTAACAG-CG----AGTAAGT----GT-GG---ATTT-TCT--CATGGCA---tgt
gi|2 : cTCAATTAAAAT---ATGC-CTGGGTTTAC---GTA------A-CG-GACAAATT-ATTTCCACAAC-TATAA-CATT-AATGCGTGCA-TG-TGTCACAAAGA-AA-TCAAC-AC-TT---ACT--CG-CTGTTAAT----CCATTTTC-ACA-----------------------GGATT-G-AAT--TATGTGATAATC-TCTATTAATGAT-C-GG---AAAATATT-A--------A-A-A-ACCCAAAGTCGGA-A-AATT--G-GA-AA-AA---------T-TAG-TAA-A-CA-C-----AC--AT--TTC---G-CT-TCTAGGAAAG-CTTTCTAACA-TCTTA---------A-ATCT-ATT-GAAA--CGTGTTTTCC------TATTGA-TAT-C-TGC---AAGAA--T--AA-T--------A-----TTAC------T----AA----T----A-ACT--C----A---A-A-------ATT----GC-TCTT-T---G--AG---A--ACC-AA-GA--------------T-A-CGTA-T---C-TAT--TA-A--TT--TGT-CAA---AATTA------------------TCC-GATT-T-TGAAT---G-ATCGA---A-----T-T--TT--T-TA-TACCGCCAATCG----G-GAT--TA-ACACGC------AT-TTCA--AACCCG----TAAAA-AGGA-ACAT-GT--GA--AAATGGATTAACAG-CA----TGTAAGT----GT-TG---ATTT-CTT--TGTGACA---GATGCG--T-GC--ATTA--A-TG--TTA------A--AA---T-T-GTGGAAA-TA------AG-TTGTC--TGT-TGCTT-AAA-------------CT------CAGGCA--------TAT-TTAAGTTGAAACG-TCGATCGAA
gi|20 : G----G-GAC--TA-ACACAC------TA-TTCA--AACCCG----GATCA-GGGA-ACAT-GT--GA--AAATGGATTAAAAG-CA----AGTAAGT----GT-TG---ATTT-TCT--CGTGGTA---GATGCA--T-GT--ATTA--A-TG--TTA------A--AA---T-T-ATGGAGA-TT------GC-ATGAC--TGT-TACGT-AAA-------------TC------TAGGCA--------TAT-TTGAGTTGAAAAG-TCGATCGA
gi|21 : t---A-----T-T--TT--T-C--TACCGCGTATCA----T-GAC--TA-ACACAC------TA-TTTATAAATCCG----AGATA-AGAA-ACA-------------------AACAG-CG----TGTAAGT----GT-TG---ATTT-CCT--TGTGATA---GATGCT--T-AC--ATTA--A-TG--TTA------C--AG---T-T-GT---------------------C--TGT-TACGT-AAA-------------TC------CAGCCA--------TAT-TTGAGTTGAAggtgt
gi|22 : atTCGGA-A-TATTT-G-GA-AA-AA---------T-TAA-TAA-A-CA-TTACAAGT--ATA-TTT---G-CT-TCTCTTAAAA-CTTTTTGACA-TTTGA---------T-TTTTAATT-CAAA--TATG-TTTCC------TATTAA-TAT-C-AAC----------T--AA-------------------T------T----GA---------A-AC---A----A---A-A-------A------GC-TTTC-T---G--AG---A--ACC-GA-CAT-------------T-A-CAT----------T--TA-A--TT--TTgtca
gi|23 : CAT-GT--TA--AAGTGGGT-AATAA-CG----AGTAAGT----AT-TG---ATTT-CCTGACTTG-CA---GATGCA--T-TC--ACAA--A-TT--TTA------A--AG---T-G-GTGGAAA-TA------AC-TT-------T-TATGG-AAT-------------TC------CAGA-A--------TAT-TTGATTCAAAATA-TCAGTCa
gi|24 : aaagacaaactcataattcg--TA-GCACAC------TA-TTCA--AACCCG----GAACA-CGGA-ACAT-GT--GA--ACATTGATTAAAAG-CG----AGTAAGA----GT-TG---ATTT-CCT--CATGGCA---GATGCA--T-CC--ATC---A-TG--TTG------A--AA---T-T-ATGGAAA-TG------GC-ATGAC--TGA-TACGT-AAA-------------TC------Cagagtgt
gi|25 : aaaaagTCAACGCAAAT---AGGAACTGGATTTACC--GTA------ATCA-GACAAGTT--TTTCAACAAT-TTTAA-CATT-AATGCCTGCA-TC-TGTTACAATGA-AA-TCAAC-AC-TTAA-ACA--TGCCTGTTCAT----CCATTTTC-ACATTG---TT-gacttttaat
gi|26 : gattgactttGT-GT--GA--AAATGGATTAACAG-CACATAAGTGAAT----GT-TG---ATTT-CCT--TGTGACA---AGTGCA--TTACT-ATAA--AGTA--CTA------AGTAG---C-T-GCGGAAAATA------AC-TCGT----GT-TGCGA-AAA-------------TC------CAGGCA--------TAT-TTGAGTTGAAATG-TTGATCGAAtct
gi|27 : A-GAGA-ACAT-GT--GA--AAATGGATTAACAT-CGA---AAAAAAT----GT-TA---ATTT-ATT--TATGACA---TAAGCA--T-GC--AGCA--A-TA--TC-------A--AA---T-T-GTCGAAA-TA------AC-ACGTC--TAT-TGCCT-ACA-------------TCTAGGTACAGGTA--------TAT-TTGAGTCGAAACG-TCG
gi|28 : --AAATGGGCCAACAG-CA----AGTAAGT----GT-TG---AATT-CCT--TGTGATA---GATGCA--T-GC--GTTA--A-TG--TTA------A--AG---T-T-GGGGAAG-TA------AT-TTGTC--TGT-TATGT-AAG-------------CC------CAGGCA--------T-C-GTCAATTGAAAt
gi|29 : a-C-----GT--GTG-TTT---AACTGTCTCGGCAAG-CTTCTTGGCA-TT-----------------------------CACGTTT-CC------TATTGAATAT-C-AAC---AAGAA--T--GA-T--------C-----TT-T------T----------T----A-GCT--A----A---A-A-------AAAAAATGC-TTTT-TC--G--AG---ATTGCCTAATAA--------------C-GCCATGAT---T-TAT--T--A--TT--TTagggtacatagtctggttcc
gi|3 : TCAACTCAAAT---ATGC-CTGGATTTAC---GTACATGTAA-CA-GACAAGT--ATGCCAACAAG-TTTAA-CAT--AATGTATGCA-TC-TGACACA-TGA-AAATCAAC-ACCTT---ACA--TG-CTGTTAAT----CCTTTTTC-ACA-------------------------------------GTTTG---ATC-TCTATGGGCGTTTA-TA---AAAA-----A--------A-A-A-A--CGAAGTCGGA-A-TATT--T-GA-AA-AA---------T-TA--TAA-A-CA-C-----ATT-ATA-TTTT--G-CT-TCTCATAACA-CTTTT-GACA-TTTCA---------T-TTTG-ATT-CAAA--CATGTTTTCC------TAT-AA-GAT-CGAAC---AAAAA--TTAAA-T--------AA----TT-T------T----AA----T--------T--G----A---A-A-------A------A-------------------A--ACC-CA-A------------------------------------------C--TTT-CCA---AATTG------------------TCT-GACT-T-CGAAT---T-TT-GAT--A-----T-T--TT--C-T--TACAGCCGAACG----GAGAC--TA-ACACAC------TA-TTCA--AGCCCG----GAACA-ATGA-ACGT-GTTGGATTAAATG-ATTAAAAG-CG----AGTAAGTCAGTGT-TG---ATTT-TCT--C-TGACA---GGTGCG--T-GC--ATTA--A-TG--TTA------A--AA---T-T-ATTAAAA-TG------TT-ATGAC--TGT-TACGTAAAA-------------TC------CAGGCA--------T-T-TTGAGTAGAAAAG-TCag
gi|30 : tattgacttttTAAAAG-CG----AGTAAAT----GT-TG---ATTT-CCT--TGTTATA---GATACA--T-GTAAATTG--A-TG--T--------A--AA---T-T-GTGGAAA-GA------CT-TTGTC--TGT-TATGT-AAA-------------TC------CA----------------TCCAGTGAAAACG-TCCGTCGA
gi|31 : aag-T-CGAAC---A-TTCGA---AGTCAGT-TAATT--T-G--GACCGCCAATAG----A-GAT--TA-ACACAcgcg
gi|31 : T-CCA---AATTA------------------ACT-GACT-T-CGAAT---G-TTCGAT--A-----T-T--TT--TTC--TACTGCCAATCG----G-GAG--TA-ACACTC------TA-TTCA--AACCCG----GGACA-GGGA-ACGT-GT--GA--Atattttttctactgccaatcgggagtaacactctattcaaacccgggacagggaacgtgtgaa
gi|32 : tgtgttaatctctattggcggGTAAGT----AT-TG---ATTT-CAT--TGTGACA---GATGCA--T-AC--ATTT--A-TG--TTA------A--AA---T-T-GTTGGAA-TA------AC-TTGTC--TGT-TATGT-AAA-------------TC------CAGGCA--------TAT-TTGAGTTGAAAAG-TCGATTGA
gi|33 : cACA-GAGA-GCAT-GT--GG--AAATGCATTAACGA-CG----AATAAGT----GT-TC---ACTT--CT--TGTGACA---AATGAA--T-GA--CTTA--ATTG--TT-------A--AG---T-C-GTGGAAA-TA------AC-TTGat
gi|34 : TCAAAT---G-AC-TTAAATTTATCCTGCA------A-GA-GACAAGT--ATTTCAACAAT-TTAAG-CATT-AATGCATACA-TT---TCACAATG--AA-TCAAC-AC-TT---ACatgtctacagtacgca
gi|35 : ctatgactttttccaCA--T-GC--ATTG--A-TG--TTATTATTTA--AA---T-T-GTTGAAA-TA------AC-TTGTC--TGT-AATGT-AAATCTGTGCAGCCATTC------CAGGCA--------TAT-TTGAGTTGAAAAT-TCGATC
gi|36 : tgtTTAATC-TCTATGGGAGGT-A-TA---AACAAAT--A--------AGA-A-ATCCAAAGTCGGA-ATATTT--G-GA-AA-AA---------A-TAG-TGATATCA-T-----ATAAATA-TTT---G-CT-TCTCATAAAA-CGTTtgt
gi|38 : ATGCA--T-GC--ATTG--G-TG--ATG------A--GT---T-G-GTGGAAA-TACGAGTAAA-TTGTC--TATCTA-GT-AAA-------------TC------CAGCCA--------TAT-TTCAGTTGAAACG-TCGATCGAA
gi|39 : cgcTT-CCA--TATGACA---GATACA--T-AC--ATTATAA-TG--TTA------A--AA---T-T-ATGGAAA-TA------GC-TAGTC--TGT-TAAGT-AAA-------------TC------CAGGCA--------T---------------G-TCGATCGAA
gi|4 : C---GTA------A-CA-GACAAGTT-ATTTCCACAAT-TTTAA-CATTGAATGCATGCG-TC-TGTCATAAGAA-AA-TCAAC-AC-TT---ACC--CG-CTGCTAAT----CCATTTTA-AC---G---TT-CAT-TGT---CC--TG----G-GAT--TG------AATT-TTTAT---CAGT-A-GG---AAATAAT--A--------AGA-A-ATTCGAAGTCGGA-A-AATTT-G-GA-AA-AA---------T-TAG-TAA-A-CA-C-----GC--AT---TT---G-CA-TCTCCGAAAG-CTTTTTAACA-TTTCA---------T-TTTT-ATT-CAAA--CATGTTTTCC------TATTGA-TAT-C-AAT---AAGAA--T--A------------------T-T------T----AA----TGTAAA-AC---A----A---A-A-------A------GC-TTTT-G---G--GG---A--ACC-AA-AA--------------T-G-CACG-T---T-TAT--TA-A--TT--TTA-CTA---GATTA------------------TTA-GACT-T-CGAAT---G-ATCG--------------------------CCGT--ATCA----G-GAT--TA-ACACGC------AA-TTCT--A----G----GGACA---------T-GT--GA--AAATGGAATAACAG-CG----AGTAAGT----GCATGTATATTT-CCT--TGTGGTA---GGGGCA--T-GC--ATTA--A-TG--TTA------A--CG---T-T-TTGGGAA-TT------AC-TTG----CAT-T-------G-------------TC------CATG----------TAT-TTGAGTTGAAACG-TCTATg
gi|40 : a-GGGA-ACGT-GT--GA--AAATGGATTAAAAG-CG----AGAAAGT----GT-AG---ATTT-TCT--CATGGCA---GGTACA--T-GC--ATTA--A-TG--TTA------A--AA---T-T-ATGAAAaatgtgttgaaatcgtcggtcgaagt
gi|41 : TGACA---GATGCA--T-TT--ATCA--A-TG--TTA------A--CG---A-T-GCGGAAG-TA------AC-TTGTC--TGT-TATGT-AAA-------------TC------AAGCCA--------TAT-TTGTGTCGAAA
gi|42 : CAACTCTTATTAAATGT-CTGAATTTAC---ATA------A-CAAGACAAGTT-GTTTCAACAAC-TCTAA-C-TT-AATG-----A-TC-TGTCATAAtaaaa
gi|43 : ccAT---GTAT-CTGGATTTAC---GTA------A-CA-GATAAGTT-ATTTCCACAAC-T
gi|44 : atgttcaataactgtaacttaagtgtggattATGTATGCG-CC-CGTCATAATGA-AA-TATAC-AC-TT---CCT--TC-CTAT--AT----TTTTTTTT-ATA-TA---AT-C-C-T------G--GGTTT-G-AAT--aca
gi|45 : -CTGTTAAT----CCATTTTT-ACA-TG---TT-T-C-T-TGTCCC--GGTTTTG-AATATTGTTTGTTAATC-TCTAAGGGCGGT-A-gtg
gi|46 : taT--T-C--TACCGCCAGTCG----G-GGC--TA-ACACAC------TA-TTTA--AACC------AGACG-AGGA-ACATCAT--GG--AAATG--------G-CA----AGTCAGT----GT-Tta
gi|47 : GTAACA---GATGCA--T-GT--GTTA--A-TG--TTA------A--AA---A-T-TTTGAAA-TA------AC-TTGTC--T-------------------------------------------------T-TTGAGTTGAAACG-TCGATTGAA
gi|48 : acA--A-TG--TTA------A--AAATTT-T-CT----A-TA------AC-TTGTT--TGT-TACGT-AAA-------------TT------CGGGCA--------TAT-TTGAGTTGAAAAG-TCGATCGa
gi|49 : A---T-T-ATGGAAA-GA------GC-ATACC--TAT-TAAGT-AAA-------------TC------AAGGCA--------TAT-TTGAGCTGTAACG-TCGATTGAA
gi|5 : CACAGTGA-AA-TCAAC-AC-TT---ACA--TG-CTGTTAAT----CCATTTTC-ACA-TG---TTTC-T-TGT---CCCGGGTTT-G-ATT--TGTTTGTCATTC-TCTAAGGGCGGT-A-TA---AAAAAAT--A--------A-A-ATATCCGAAGTCAGA-A-TATTT-G-GA-AA-AA---------T-TAG-TAA-A-CA-T-----GT--ATA-CTT---G-CT-TCTTATAAAA-CTTTTCGACA-TTTCA---------T-TTTG-ATT-CAAA--CATGTTTTCCTATTATTATTAA-TAT-A-AAC---AAAAA--G--AA-TC-------C-----CT-T------T----AA----T----G-GTT--G----G---A-ACGCATGGA------GC-TTTC-T---T--AG---A--ACC-AA-AA--------------T-G-CAGA-G---T-TA---TA-ATTTT--TTT-CGA---AATTG------------------TCCGGACTCT-CGAAC---T-TTTGAAGTA-----T-T--TT--T-C--TACCTCCAATGGGT--G-GGC--TA-ACA-AC------TA-TTCA--AACGCG----AAGCATGGGA-ATGT-GT--GA--AAATGGATTAA-AG-CA----AGTAAGT----G--TG---GTTT-TCT--CATGACA---GGTGCA--T-GC--AATA--A--G--TTA------A--AA---T-TAATGG--A-TG------GC-ATA-C--TAT-TACGG-TAA-------------TC------C-GGCA--------TAT-TTGAGTTGAAAAGATCGATCGatgt
gi|50 : -T-GTTGGAA-TA------AC-TTGTC--TGT-TACGT-AAA-------------TC------CAGGCA--------TAT-TTGAGATGAAAAG-TCTATCGAA
gi|51 : acTGCATGCA-TC-TGTCACAATGA-AA-TCAACTAC-TT---------G-CTTTTAAT----CCATTTTC-ACC-TG---TT-C-
gi|52 : TTTAC---GTA------A-CA-GACAAGTT-ATTCCAACAACTTTTAA-CATT-AATGGATGCA-TC-Tcgg
gi|53 : gatcgacGCA--T-GC--ATTA--C-TG--TTA------A--AC---T-T-ATGGAAA-TT------GC-ATGAC--TGT-TACGT-AAA-------------TC------CAGGCA--------TAT-
gi|54 : TTC-ACA-TG---TT-C-TGT-C---CC--GGATT-G--AT--TGTTTGTTAA-C-TCTATGGGCGGT----G---AAAAAA
gi|55 : TCAACAAT-TTTAG-CATT-AATGCATACA-TT-TGTCACAATGA-AA-TCAAC-AC-TT---ACA--CG-Cat
gi|56 : AA-TA------AC-TTGTCC-TGT-TAAGT-AAA-------------TC------CAGCCA--------TAT-TTGAGTTGAAA-G-TCAATCGAA
gi|57 : tgA---AATTG------------------TCC-GACT-T-CGAAC---T-TTTGAT--A-----T-T--TT--C-C--TACCACCAATTG----G-GAC--T
gi|58 : ttacaAAA-TA------AT-TTGTC--TGT-T---T-AAA-------------TC------CGGGAA--------TAT-TTGAGTCGAAACG-TCGACCGAA
gi|59 : TGGAAA-TG------GC-AAGTCAGTGT-TAAGT-AAA-------------TG------AAGGCA--------TAT-TTGAGTTGAAA
gi|6 : tcaCAAGTA-ATTCCT-CAAC-ATTAAACATA-GAGAGGTACACTC-TATTACAAAAACAA-TCAAC--C-TTGTGACGTTCG-TTGTTAATTAGCCCATTTTCAAAA-TGTCTTT-C-T-G-T---CCA-GGGTT-GCAAT--TGTGAGTTTATA-ACCACTGGCGGG-A-AGCAAAAAAAGTCGA--------A-A-A-ATTC-AAGTAGGC-A-AATT--G-TATTA-TA---------T-TAGACAA-A-CAGC-----GC--AAT-TTT---G-C--TCTCAGGAAGCCCTCTTGGCT-TTTCC---------TATTTT-CTT----A--CCT------C------TATCG------C-AACCA-AATAA--T--AA-T--------CATTTTTT-T------T----AAAAATT----ATACT--G----G---A-A-------A------GT-TTTT-T---C--AA---G--TTG-AA-AA--------------T-A-TGTG-T---T-TGA--TATA--TT--TTT--CA---AATTG----------------------G--T-C-CGAAC---T-TCCGG---A-----T-T--TT-------TACC-CCA---------------TA-G------------A-TTTA--AATCCG----GGACA-GGGATACGA-GT--G---AATTGGATTAACAG----------------------A---ATCT-TCTG-TATGGCA---GTCGCA--T-TT--ATTG--A-TG--TTG------ATCGT---T-T-GTAGAAA-T
gi|60 : A------A-CA-GACAAGTT-ATTCCAACAAT-CTTAA-TATT-AATGCATGCA-TC-TTTCACAATctcag
gi|61 : TGGATTAAAAG-CA----AGTAAGT----GC-TG---ATTT-TCT--AGTGGTATTGGA---A--T-GC--AGTA--A-
gi|64 : -------------TT------CAGGCA--------TAT-TTGAGTTTAAAAG-TCGATCAAA
gi|66 : acac------CAGGCA--------TGT-TTCAATTGAAAAG-TCGATCGAA
gi|7 : ATGCATGCA-TC-TGTCACAATGA-AA-TCAAC-AC-TT---ACA--TG-CTGTTAAT----CCATTTTT-ACA-TAT--TT-C-T-TGT---CCCGGGTTT-G-AAT--TGTTTGTTAATC-TCTAAGGGCGGT-A-TA---TAAAAAT--G--------ATT-A-ATCCGAAGTCGGA-ATATTT--G-GA-AA-AA---------T-TAA-TAA-A-CA-C-----AT--ATA-TTT---G-CT-TCTCATAAAA-CTTTTTGACA-TTTCA---------gtgt
gi|7 : atc--AA-C--------T-----TT-T------T----GA----C----A-TTTC-A----A---A-A-------A------GC-TTTC-T---G--AG---A--ACC-AA-AA--------------T-G-AGTG-TACAT-CAT--T-----TT--TTT-CCA---AATTG------------------TCC-CACT-T-CGAAT---T-TTTTAT--A-----T-T--TT--T-C--TACCGCCAACTGCCAGG-GAC--TA-ACACAT------TA-TTCA--AACTCG----GAATA-GGGA-ACAT-GT--GA--AAATGGATTAAAAG-CA----AGTAAGT----GT-TG---ATTT-TCT--CGTGGTA---GGTGCA--T-GC--ATTA--A-TG--TT---------------T-T-ATGGAAA-TG------GC-ATGAA--TGT-TACGT-AAA-------------TC------TAGGCA--------TAC-TTGAGTTGAAAAG-TCGATCGAAaaaagctttctgagaaccaaaatgagtgtacatcatttttttccaaattgtcccacttcgaattttttatatttttctaccgccaactgccagggactaacacattattcaaactcggaatagggaacatgtgaaaatggattaaaagcaagtaagtgttgattttctcgtggtaggtgcatgcattaatgttttatggaaatggcatgaatgttacgtaaatctaggcatacttgagttgaaaagtcgatcgaagtgt
gi|8 : atcatgcatgcatctgtcacaatgaaatcaacacttacatgctgttaatccatttttacatatttcttgtcccgggtttgaattgtttgttaatctctaagggcggtatataaaaatgattaatccgaagtcggaatatttggaaaaattaataaacacatatatttgcttctcataaTCAACTCAAA----ATTG-CTAGATTTAC---ATA------A-TA-GACAAGTTTATTCCAA-AAT-CTTAA-CAT---ATGCATACA-TCATGTCACAATGA-AA-TCAAC-AC-TT---ACA--T--CTGTTAAT----CCATTTTT-ACAAGG---TT-C-T-TGT---CCCGGGTTT-G-AAT--TGTTTGTTAATC-TCTAAGGGCAGT-A----------------------------A-ATC-GAAGT-GGA-A-TATT--T-GA-AA-AAAAAT-----T-TAA--AA-A-CA-C-----GT--ATA-TTT---G-CT-TCTCATAAA--CTTTTTGACA-TTTCA---------T-TTTT-ATTCCAAA--CATG-TTTCC------TATCAA-TAT-C-AAC---AAAAAC-T--AT-C--------C-----TT-T------T----AA----TTGA-A-AC---A----A---A-A-------A------GC-GTTC-T---G--AG---A--ACC-AA-AA--------------T-G-CGTG-T---A-TAT--CA-T--TT--TCT-CC----AATTG------------------TCC-GACT-T-CGAAT---T-TTgtgt
gi|9 : aaatatatGGCAGT-A-AA---AAGAAAT--GGAAAGTGGA-A-A-ATCCAGATTCGGG-A-ATTT--G-GA-AA-AAAAAATATATTATAG-TAA-A-CA-C-----AC--A-A-TTT---G-TT-TCGCG--GAG-CTTTTTGAAA-TGTCA---------C-CTTT-----------------TTTC------TGTTGA-TAT-C-AAC---AAAAA--C--AA-TAAATTCAAC-----TT-TGGTTTGT----AA----A----AGAAG--A----A---A-A-------A------GC-TTT------G--AG---A--ACC-AA-AA--------------T-G-CGTC-T---T-TTC--TA-T--TT--TGT-CCA---AAAT---------------------------------AC---T-TTTGA---A-----TAT--TT--T-T--TATCGTTAATTG----A-GAT--AA-ACACAC------AA-TTCA--AAC---------ACG-GGGT-ACGT-GT--GA--AAATGGATTTACAA-CG----CGTAAGT----GG-TG---CTTTACCTA-CATTACA---ATTGCA--T-TC--ATTA--A-TG--TAA------A--AG---T-T-GTGAAAA-CA------aag
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|37 ): TTTTTCACACTTTCATGCGGTTTTTTTTTTTATTCTAGTTGACATTTCCACAATTTGATCAAAGTGGTTCAATCAAGGGATATGTGGGGAGA
Unaligned ( gi|62 ): GAAAAGTTATTGTTAGCCATTTTTCTTTTTATTACATGTATA
Unaligned ( gi|63 ): ATTGTCTGTTACACAAGATTCGAAATGTTGGTTGAAGTG
Unaligned ( gi|65 ): TAAAACTATTCGTTGAAAACACCTTTTTTAAAATAC
Alignments
lowQualScore : 111 55555555555555555555555 2222222 2222222222222222 111111111 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 11111111 11111111111111 1111111111111111 111111111111111111 2222222222
lowQualScore : 4 000 999999 3 44 33 2 44 2 2 2 2 2 2 777 555 2 6666 2 00000000000000000000000 2 3 3 44 0 3 1 2222222 6666666666666666 3 2 6 2 5 33 333333333 2 7 2 2 2 55555 55 666 666 2 2 3 66 2 99999999999 77 22 33 1 33 666666 00 2 2 2 777 3 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 333 2 6666666 888888 2 00000000 333 22 2 2 33333333333333 2 2 1 2 2222222222222222 22 2 333 444444444444444444 2 2 2 0 44444 1 0000000000 4 55 22 6666 666666 1 22 1 6666666 1 22 4444 0 1 1 1 22 22 2 1 4444 3333 1 222 11 8888 222 11 2 44 11 2 11 333333 33 2222 1 1 1 333333 11 2 44 1 1 1 6666666666666 333333 44444444 222 1 4 1
lowQualScore : . ... ...... . .. .. . .. . . . . . . ... ... . .... . ....................... . . . .. . . . ....... ................ . . . . . .. ......... . . . . . ..... .. ... ... . . . .. . ........... .. .. .. . .. ...... .. . . . ... . ............................................................. ... . ....... ...... . ........ ... .. . . .............. . . . . ................ .. . ... .................. . . . . ..... . .......... . .. .. .... ...... . .. . ....... . .. .... . . . . .. .. . . .... .... . ... .. .... ... .. . .. .. . .. ...... .. .... . . . ...... .. . .. . . . ............. ...... ........ ... . . .
lowQualScore : 4 000 666666 3 88 99 9 66 4 4 5 5 5 5 888 777 7 1111 7 66666666666666666666666 5 1 1 22 5 1 0 1111111 5555555555555555 1 7 6 7 0 22 555555555 4 1 4 4 2 66666 33 666 111 2 2 1 33 2 11111111111 66 66 22 0 22 888888 77 4 4 4 444 5 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 777 1 8888888 999999 1 11111111 555 88 0 0 88888888888888 0 0 8 0 0000000000000000 88 1 555 888888888888888888 0 1 1 6 55555 8 1111111111 2 00 88 7777 888888 9 55 8 1111111 9 66 0000 4 7 7 6 33 22 8 5 8888 3333 5 888 77 9999 444 88 6 44 77 5 88 777777 44 4444 2 2 1 444444 66 2 22 2 3 2 9999999999999 555555 55555555 222 2 3 6
consensus : TCAACTCAAATATGC-CTGGATTTAC---GTA------A-CAGACAAGTT-ATTCC--AACAA-TTTTAACATT-AATGCATGCA-TC-TGTCACAATGA-AA-TCAAC-AC-TT---ACA--CG-CTGTTAAT----CCATTTTC-ACA-TG---TT-C-T-T-T---CC--GGTTT-G-AAT--TGTTTGTTAATC-TCTANGGGCGGTA-NG---AAAAAAT---A--------A-A-A-ATCCGAAGTCGGA-ATATTTG-G-AA--AAA---------T-TAG-TAA-A-CA-C-----GT--ATA-TTT---G-CT-TCTCATAAAG-CTTTTTGACA-TTTCA---------T-TTTT-ATT-CAAA--CATGTTTTCC------TATTGA-TAT-C-AAC---AAGAA--T--AA-T--------C-----TT-T------T----AA----T----A-ACT--A----A---A-A-------A------GC-TTTT-T---G--AG---A--ACC-AA-AA--------------T-G-CGTG-T---T-TAT--TA-A--TT--TTT-CCA---AATTG------------------TCC-GACT-T-CGAAT---T-TTCGA---A-----T-T--TT--T-C--TACCGCCAATCG----G-GAC--TA-ACACAC------TA-TTCA--AACCCG----GGACA-GGGA-ACGT-GT--GA--AAATGGATTAACAG-CG----AGTAAGT----GT-TG---ATTT-CCT--CGTGACA---GATGCA--T-GC--ATTA--A-TG--TTA------A--AG---T-T-GTGGAAA-TA------AC-TTGTC--TGT-TACGT-AAA-------------TC------CAGGCA--------T---AT-TTGAGTTGAAACG-TCGATCGAA
Reference ( family-1049 ) : TCAACTCAAATATGC-CTGGATTTAC---GTA------A-CAGACAAGTT-ATTCC--AACAA-TTTTAACATT-AATGCATGCA-TC-TGTCACAATGA-AA-TCAAC-AC-TT---ACA--CG-CTGTTAAT----CCATTTTC-ACA-TG---TT-C-T-T-T---CC--GGTTT-G-AAT--TGTTTGTTAATC-TCTANGGGCGGTA-NG---AAAAAAT---A--------A-A-A-ATCCGAAGTCGGA-AAATTTG-G-AA--AAA---------T-TAG-TAA-A-CA-C-----GT--ATA-TTT---G-CT-TCTCATAAAG-CTTTTTGACA-TTTCA---------T-TTTT-ATT-CAAA--CATGTTTTCC------TATTGA-TAT-C-AAC---AAGAA--T--AA-T--------C-----TT-T------T----AA----T----A-ACT--A----A---A-A-------A------GC-TTTT-T---G--AG---A--ACC-AA-AA--------------T-G-CGTG-T---T-TAT--TA-A--TT--TTT-CCA---AATTG------------------TCC-GACT-T-CGAAT---T-TTCGA---A-----T-T--TT--T-C--TACCGCCAATCG----G-GAC--TA-ACACAC------TA-TTCA--AACCCG----GGACA-GGGA-ACGT-GT--GA--AAATGGATTAACAG-CG----AGTAAGT----GT-TG---ATTT-CCT--CGTGACA---GATGCA--T-GC--ATTA--A-TG--TTA------A--AA---T-T-GTGGAAA-TA------AC-TTGTC--TGT-TACGT-AAA-------------TC------CAGGCA--------T---AT-TTGAGTTGAAACG-TCGATCGAA
gi|1 : TCAACTCAACTATGC-CTGGGTTTAA---GTA------A-CAG-----TT-TTTCT--AACAA-TTTTAATATT-AATGCATGCA-TC-TGTCACAATGA-AA-TCAAA-TT-TT---GCA--TG-CTGTTAAT----CCATTTTC-ACA-TGC--TT-C-T-TAT---CCCGGGTGT-G-AAT--TGTCTGTTAATC-TCTAGAGGCGGTA-T----AAAAAAT---A--------A-ACA-GTCTGAAGTCGGA-ATATTTG-A-AA--CAA---------T-TAGAAAA-A-CA-C-----GT--ATT-TTT---G-CT-TCTCATAGAA-CGTTTTGGCA-TTTAA---------T-TTTG-ATT-CAAA--CATGTTTTCC------TAATAG-TAT-C-AAC---AACAA--A--AACC--------C-----TT-T------T----AA----TTG--A-ATC--A----T---G-A-------A------GC-TTTT-T---G--AG---A--ACC-AA-AA--------------T-G-CATG-T---T-TA---TA-C--TT--TTTCCCA---AATTG------------------TCC-GACT-T-CGAAG---T-TTTGAT--A-----T-T--TT--T-C--TACCTCTTATTA----G-GAC--AA-ACACAC------TA-TTCA--AACCCA----GAACA-GGGA-AAGT-AT---A--AAATGAATTAAAAG-CG----AGTAAGT----AT-CA---ATTT-TCT--CATGGTA---AATGCA--T-GC--ATCA--A-TG--TTG------A--AA---T-T-ATGGAAA-TG------GC-ATAAC--TGT-TACAT-
gi|10 : atgtgtaactatgtaactgttaaactgacttattagggaccaagAAATTCCA--------A-A-A-CTACGAAGTCGGATAAATTTT-G-GA--AAA---------C-TTT-TAA-C-CA-A-----G---A-A-CTT---G-CT-TG-CAGAAGG-CTGTCTGTCA-TTTCA---------A-GTT--ATT--AAA---ATGTTT--C------TATGGA-T-T-T-AAC---ACGAA------A-T--------C-----TT-T------------A----T----A-ACTTAA----ACGTA-A-------A------GC-TTTT-----------------------------------------G-CATG-TAA-TGTAT-----G--TT--TTT-TCA---AAT-A------------------TCC-GA-T-T-CACATACAT-T-------A-----T-T--TT--T-AAATACCACCA-TCT----G-AAA--TGCAC-CAC------GAATTCA--A---CG----G-ATA-GG-A-ACAC-GT--GA--AA-TAGATAGGCAGTCG----AGTATGT----GT-TG---AT-----------GAT------TGCA--T-GCA-ATTT--A-TGGTTTA------T--AG---TAT-ATAG-AA-TA------GCATTGCC--TGT-TAAAT-AAT-------------AC------CA-GCA--------T---ATATTGAGTCGAAACA-TCAGTCGAAaaagtcgatcgaagt
gi|11 : TCAACTCAAATATGC-CTGGATTTAC---ACA------A-CAGATAAGTC-ATTCC--AACAA-TTTTAACATT-ATTGCATGCA-TC-TGTCACAATGA-GA-TCAAC-AC-TT---ACA--TG-CTTTTAAT----CCATTTTC-ACA-TG---TT-T-C-T-TGTACCG-GGTTT-G-AAT--TGTTTGGTAATC-TCTAAGGGCGGTATAG---AAAATAA---A--------A-A-A-ATTCGAAGTCGGA-ATATTTG-GAAA--AAA---------T-TAG-TAA-A-TA-T-----GT--ATA-TTT---G-CT-TCTCATAAAA-CTTTTTGGCA-TTTCA---------T-TTTG-ATT-CAAA--CATGTTTTCC------TAATTA-TAT-C-----------------------------C-----TT-A------T----AA----TTG--A-AAA--A----A---G-A-------A------GC-TTTT-T---G--GA---A--GCC-AA-AT--------------T-G-CATG-T---T-TAT--AT-G--TT--TTT-CCA---AATTG------------------TCC-gtg
gi|12 : TCAACTCAAATATGC-CTAGATTTAC---ATA------A-TAGACAAGTT-ATTCC--AACAA-TCTTAACATT-A-TGCATACA-TC-TGTCACAATGA-AA-TCAAC-AC-TT---ACA--TG-CTGTTAAT----CCATTTTT-ACA-AG---TT-T-C-T-TGTCCC--GGTTT-G-AAT--TGTTTGTTAATCTTCTAAGGGCAGT----------------------------A-A-ATCCGAAGTC-GA-ATATTTGAA-AA--AAA---------T-TAA-TAA-A-CA-C-----GT--ATA-TTT---G-CT-TCTCATAAA--CTTTTTGACA-TTTCA---------T-TTTT-ATT-CAAA--CATGTTT--C------TATCAA-TAT-C-AAC---AAAAAACT--AT-C--------C-----TT-T------T----AA----TTTGAA-AC---A----A---A-A-------A------GC-GTTC-T---G--AG---A--ACC-AA-AA--------------T-G-CGTG-T---A-TAT--CA-T--TT--TCT-CCA---AATTG------------------TTC-aaag
gi|13 : acttt-TTTCT---------T-TCTT-ATT-CAAA--CCTGTTTT--------TATTAA-TAT-C-AAC---AAGAA--T--AA-T--------C-----TT-T------C----AA-----------ACT--ATGGCA---ACA-------A------GT-TTTT-TT--G--AG---A--ATC-AA-AA--------------T-A-CGTG-T---T-TAC--TA-A---T--TCT-ATA---AGTTG------------------TCC-GACT-T-CGAAT---T-TTCGA---T-----TCT--TT--C-C--TACAGCCGATAG----A-AAT--AA-ACACAT------AA-TTCA--AAACCG----GGAGG-GGAG-ACAT-AT--GA--AAATGGGTTGGTAA-TG----AGTGATT----AT-TG---GTTT-CTT--AATGACA---GATGTA--T-TT--ATTA--A-TT--TTT------A--AG---T-T-GT-GAAA-TC------AC-TTGTC--TGT-TACGC-AAA-------------TC------CAGGCA--------T---AT-TTGAGTGGAAACA-TCCGTCGA
gi|14 : -AA--AAA---------T-T-G-TAA-A-CA-T-----GC--AT--TCT---A-TT-CCCCAGAATT-CTCTTTTACA-TTT-G---------T-TTTT-GTC-CAAA--CAT--------------------T-T-C-AAC---AG-----------------------------C------T----AA---------A-AC--------A---A-A-------A------GC-TTTT-C---TCCAGCTCA--GCT-GA-AA--------------T-A-CGTG-T---T-TAT--TA-T--TT--ATC-TTA---AATCA------------------TCC-GACT-TAC--AT---G-TTCGT---T-----T-TC-TT--T-C--TACCACCAATAG----A-GATCATA-ACGAA--------A-GTCA--AACCCG----GGACA-GGAA-ACAT-GT--AA--AAATGAATTAGCAG-CG----GGTAAGT----GC-TA---ATTT-TCT--TAAGACA---GCTGCA--T-TC--ATTG--A-TG--TTA------A--A
gi|15 : ttgaaaAGTCGGT-AATTTTG-GGAA--AAA---------T-TAG-TAA-A-C--C-----GT--A-A-TTTTTGG-CT-TCTCATGAAA--TTTTTGACAATTTTA---------A-TTT--ATT-CAAATACATGTTGTTC------TATTAA-TAT-C-AACAAAAAGAA--T--AA-T--------C------C-T------T----AA----TTGA-A-ATA--A----A---A-A-------A------GC-TTCT-T------AG---A--A-A-AA-AA--------------TAG-C-TA-T---T---T--TATA--TT--TTT-TTAGACAATTGAATNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNN-N-NNAAT---T-TTTGAT--A-----T-T--TT--T-C--TCCCGCCAATTG----G-GAC--TT-GCACACTACATGTA-TTCA--AACCCG----GAACA-GGGgatg
gi|16 : a--AAA---------T--AGCTAT-A-CA-C-----AC--ACACTTT---G-CC-CCTCGGAAAG-CTTTTT-------TCAAAAAAAAAAT------ATT-CAAA--AATGTTTTCC------TTTCGA-TGTAC-AAA---GAGAG--T--AA-T--------C-----TT-T------TTTTCAA----T----G-A----A----A---A-A-------A------GTATTTT-TAGAG--AA---A--AAC-AA-AACACAAACACACCCTT-G-CATG-T---T-AAT--TA-A--TT--TTT-CAA---AGTTA------------------TCA-AAAT-T-C-AAT---TAATCAT---A-----T-T--CTTAT-A--TACCGCTAA---------------A-ATG-AA------TG-TTCA--AACTCGCATAAGAGG-GGGT-ACGT-Ga
gi|17 : g--AG---A--ACC-AA-AA--------------T-G-CATG-T---T-TAT--AA-A--AAAATTT-CCA---AATTG------------------TCC-GACT-T-CGAAC---T-TTTGAT--A-----T-T--TT--T-C--TACCGCCAATTG----G-GAC--TA-ACACAC------TA-TTCA--AACCCG----GAACA-AGGA-ATGT-GT--GA--AAATGGATTAAAAG-CG----AGTAAGT----GT-GG---ATTT-TTT--T-T---------TTCA--TGGC--ATTA--G-TG--TTA------A--AA---T-T-ATGGAAA-TG------GC-ATAAT--TAT-TACGT-AAA-------------TC------CAGGCA--------T---TT-TTGAATTGAAAAG-TCGATCGAA
gi|18 : tA-ACACAT------AA-TTTT--AACCCG----GGACA-GAGA-ACAT-GA--TA--AAATGGATTAAC----G----ACTAGGT----GT-CG---ATCA-CCT--TATGTCA---GATACACAT-GC--AATA--A-TG--TTA------A--AG---T-T-GCGGAAA-TA------AC-TTTTC--TGT-TATAT-AAA-------------TC------CAGACATACATATGT---AT-TTGAGTCAAGCCG-TTGATCGAg
gi|19 : caaaggaaatc--------C-----TT-T------T----AA----TTGA-A-AC---A----A---G-A-------A------GC-TTTTAT---G--AG---A--TCC-AA-AA--------------T-G-CATA-T---C-TATATTT-T--TT--TTT-CCA---AATTG------------------TCC-GACT-T-C----------------------------TT--T-A--TACCGCCAATTC----G-GAC--TA-ACACAC------TA-TTCA--AACCAG----GGA-A-AGGA-GTGC-GT--GA--ACATGGATTAACAG-CG----AGTAAGT----GT-GG---ATTT-TCT--CATGGCA---tgt
gi|2 : cTCAATTAAAATATGC-CTGGGTTTAC---GTA------A-CGGACAAATT-ATTTC--CACAA-CTATAACATT-AATGCGTGCA-TG-TGTCACAAAGA-AA-TCAAC-AC-TT---ACT--CG-CTGTTAAT----CCATTTTC-ACA-----------------------GGATT-G-AAT--TATGTGATAATC-TCTATTAATGATC-GG---AAAATATT--A--------A-A-A-ACCCAAAGTCGGA-AAATT-G-G-AA--AAA---------T-TAG-TAA-A-CA-C-----AC--AT--TTC---G-CT-TCTAGGAAAG-CTTTCTAACA-TCTTA---------A-ATCT-ATT-GAAA--CGTGTTTTCC------TATTGA-TAT-C-TGC---AAGAA--T--AA-T--------A-----TTAC------T----AA----T----A-ACT--C----A---A-A-------ATT----GC-TCTT-T---G--AG---A--ACC-AA-GA--------------T-A-CGTA-T---C-TAT--TA-A--TT--TGT-CAA---AATTA------------------TCC-GATT-T-TGAAT---G-ATCGA---A-----T-T--TT--T-TA-TACCGCCAATCG----G-GAT--TA-ACACGC------AT-TTCA--AACCCG----TAAAA-AGGA-ACAT-GT--GA--AAATGGATTAACAG-CA----TGTAAGT----GT-TG---ATTT-CTT--TGTGACA---GATGCG--T-GC--ATTA--A-TG--TTA------A--AA---T-T-GTGGAAA-TA------AG-TTGTC--TGT-TGCTT-AAA-------------CT------CAGGCA--------T---AT-TTAAGTTGAAACG-TCGATCGAA
gi|20 : G----G-GAC--TA-ACACAC------TA-TTCA--AACCCG----GATCA-GGGA-ACAT-GT--GA--AAATGGATTAAAAG-CA----AGTAAGT----GT-TG---ATTT-TCT--CGTGGTA---GATGCA--T-GT--ATTA--A-TG--TTA------A--AA---T-T-ATGGAGA-TT------GC-ATGAC--TGT-TACGT-AAA-------------TC------TAGGCA--------T---AT-TTGAGTTGAAAAG-TCGATCGA
gi|21 : t---A-----T-T--TT--T-C--TACCGCGTATCA----T-GAC--TA-ACACAC------TA-TTTATAAATCCG----AGATA-AGAA-ACA-------------------AACAG-CG----TGTAAGT----GT-TG---ATTT-CCT--TGTGATA---GATGCT--T-AC--ATTA--A-TG--TTA------C--AG---T-T-GT---------------------C--TGT-TACGT-AAA-------------TC------CAGCCA--------T---AT-TTGAGTTGAAggtgt
gi|22 : atTCGGA-ATATTTG-G-AA--AAA---------T-TAA-TAA-A-CA-TTACAAGT--ATA-TTT---G-CT-TCTCTTAAAA-CTTTTTGACA-TTTGA---------T-TTTTAATT-CAAA--TATG-TTTCC------TATTAA-TAT-C-AAC----------T--AA-------------------T------T----GA---------A-AC---A----A---A-A-------A------GC-TTTC-T---G--AG---A--ACC-GA-CAT-------------T-A-CAT----------T--TA-A--TT--TTgtca
gi|23 : CAT-GT--TA--AAGTGGGT-AATAA-CG----AGTAAGT----AT-TG---ATTT-CCTGACTTG-CA---GATGCA--T-TC--ACAA--A-TT--TTA------A--AG---T-G-GTGGAAA-TA------AC-TT-------T-TATGG-AAT-------------TC------CAGA-A--------T---AT-TTGATTCAAAATA-TCAGTCa
gi|24 : aaagacaaactcataattcg--TA-GCACAC------TA-TTCA--AACCCG----GAACA-CGGA-ACAT-GT--GA--ACATTGATTAAAAG-CG----AGTAAGA----GT-TG---ATTT-CCT--CATGGCA---GATGCA--T-CC--ATC---A-TG--TTG------A--AA---T-T-ATGGAAA-TG------GC-ATGAC--TGA-TACGT-AAA-------------TC------Cagagtgt
gi|25 : aaaaagTCAACGCAAATAGGAACTGGATTTACC--GTA------ATCAGACAAGTT--TTTC--AACAA-TTTTAACATT-AATGCCTGCA-TC-TGTTACAATGA-AA-TCAAC-AC-TTAA-ACA--TGCCTGTTCAT----CCATTTTC-ACATTG---TT-gacttttaat
gi|26 : gattgactttGT-GT--GA--AAATGGATTAACAG-CACATAAGTGAAT----GT-TG---ATTT-CCT--TGTGACA---AGTGCA--TTACT-ATAA--AGTA--CTA------AGTAG---C-T-GCGGAAAATA------AC-TCGT----GT-TGCGA-AAA-------------TC------CAGGCA--------T---AT-TTGAGTTGAAATG-TTGATCGAAtct
gi|27 : A-GAGA-ACAT-GT--GA--AAATGGATTAACAT-CGA---AAAAAAT----GT-TA---ATTT-ATT--TATGACA---TAAGCA--T-GC--AGCA--A-TA--TC-------A--AA---T-T-GTCGAAA-TA------AC-ACGTC--TAT-TGCCT-ACA-------------TCTAGGTACAGGTA--------T---AT-TTGAGTCGAAACG-TCG
gi|28 : --AAATGGGCCAACAG-CA----AGTAAGT----GT-TG---AATT-CCT--TGTGATA---GATGCA--T-GC--GTTA--A-TG--TTA------A--AG---T-T-GGGGAAG-TA------AT-TTGTC--TGT-TATGT-AAG-------------CC------CAGGCA--------T----C-GTCAATTGAAAt
gi|29 : a-C-----GT--GTG-TTT---AACTGTCTCGGCAAG-CTTCTTGGCA-TT-----------------------------CACGTTT-CC------TATTGAATAT-C-AAC---AAGAA--T--GA-T--------C-----TT-T------T----------T----A-GCT--A----A---A-A-------AAAAAATGC-TTTT-TC--G--AG---ATTGCCTAATAA--------------C-GCCATGAT---T-TAT--T--A--TT--TTagggtacatagtctggttcc
gi|3 : TCAACTCAAATATGC-CTGGATTTAC---GTACATGTAA-CAGACAAGT--ATGCC--AACAA-GTTTAACAT--AATGTATGCA-TC-TGACACA-TGA-AAATCAAC-ACCTT---ACA--TG-CTGTTAAT----CCTTTTTC-ACA-------------------------------------GTTTG---ATC-TCTATGGGCGTTT-AT---AAAAAA-------------A-A-A-A--CGAAGTCGGA-ATATTTG---AA--AAA---------T-TA--TAA-A-CA-C-----ATT-ATA-TTTT--G-CT-TCTCATAACA-CTTTT-GACA-TTTCA---------T-TTTG-ATT-CAAA--CATGTTTTCC------TAT-AA-GAT-CGAAC---AAAAA--TTAAA-T--------AA----TT-T------T----AA----T--------T--G----A---A-A-------A------A-------------------A--ACC-CA-A------------------------------------------C--TTT-CCA---AATTG------------------TCT-GACT-T-CGAAT---T-TT-GAT--A-----T-T--TT--C-T--TACAGCCGAACG----GAGAC--TA-ACACAC------TA-TTCA--AGCCCG----GAACA-ATGA-ACGT-GTTGGATTAAATG-ATTAAAAG-CG----AGTAAGTCAGTGT-TG---ATTT-TCT--C-TGACA---GGTGCG--T-GC--ATTA--A-TG--TTA------A--AA---T-T-ATTAAAA-TG------TT-ATGAC--TGT-TACGTAAAA-------------TC------CAGGCA--------T----T-TTGAGTAGAAAAG-TCag
gi|30 : tattgacttttTAAAAG-CG----AGTAAAT----GT-TG---ATTT-CCT--TGTTATA---GATACA--T-GTAAATTG--A-TG--T--------A--AA---T-T-GTGGAAA-GA------CT-TTGTC--TGT-TATGT-AAA-------------TC------CA-------------------TCCAGTGAAAACG-TCCGTCGA
gi|31 : aag-T-CGAAC---A-TTCGA---AGTCAGT-TAATT--T-G--GACCGCCAATAG----A-GAT--TA-ACACAcgcg
gi|31 : T-CCA---AATTA------------------ACT-GACT-T-CGAAT---G-TTCGAT--A-----T-T--TT--TTC--TACTGCCAATCG----G-GAG--TA-ACACTC------TA-TTCA--AACCCG----GGACA-GGGA-ACGT-GT--GA--Atattttttctactgccaatcgggagtaacactctattcaaacccgggacagggaacgtgtgaa
gi|32 : tgtgttaatctctattggcggTCAACTCAAATATGC-CTGGATTTAC---ATA------A-CAGACAAGTT-ATTCC--AACAA-TTTTAACATA-AATGTATGCA-TC-TGTCACAATGA-AA-TCAAT-AC-TT---ACA--
gi|33 : ctcaatcgactttACA-GAGA-GCAT-GT--GG--AAATGCATTAACGA-CG----AATAAGT----GT-TC---ACTT--CT--TGTGACA---AATGAA--T-GA--CTTA--ATTG--TT-------A--AG---T-C-GTGGAAA-TA------AC-TTGt
gi|34 : TCAAATG-AC-TTAAATTTATCCTGCA------A-GAGACAAGT--ATTTC--AACAA-TTTAAGCATT-AATGCATACA-TT---TCACAATG--AA-TCAAC-AC-TT---ACatgtctacagtacgca
gi|35 : ctatgactttttccaCA--T-GC--ATTG--A-TG--TTATTATTTA--AA---T-T-GTTGAAA-TA------AC-TTGTC--TGT-AATGT-AAATCTGTGCAGCCATTC------CAGGCA--------T---AT-TTGAGTTGAAAAT-TCGATC
gi|36 : tgtTTAATC-TCTATGGGAGGTA-TA---AACAAAT---A--------AGA-A-ATCCAAAGTCGGA-ATATTTG-G-AA--AAA---------A-TAG-TGATATCA-T-----ATAAATA-TTT---G-CT-TCTCATAAAA-CGTTtgt
gi|38 : ATGCA--T-GC--ATTG--G-TG--ATG------A--GT---T-G-GTGGAAA-TACGAGTAAA-TTGTC--TATCTA-GT-AAA-------------TC------CAGCCA--------T---AT-TTCAGTTGAAACG-TCGATCGAA
gi|39 : cgcTT-CCA--TATGACA---GATACA--T-AC--ATTATAA-TG--TTA------A--AA---T-T-ATGGAAA-TA------GC-TAGTC--TGT-TAAGT-AAA-------------TC------CAGGCA--------T------------------G-TCGATCGAA
gi|4 : C---GTA------A-CAGACAAGTT-ATTTC--CACAA-TTTTAACATTGAATGCATGCG-TC-TGTCATAAGAA-AA-TCAAC-AC-TT---ACC--CG-CTGCTAAT----CCATTTTA-AC---G---TT-CAT-TGT---CC--TG----G-GAT--TG------AATT-TTTAT---CAGTA-GG---AAATAAT---A--------AGA-A-ATTCGAAGTCGGA-AAATTTG-G-AA--AAA---------T-TAG-TAA-A-CA-C-----GC--AT---TT---G-CA-TCTCCGAAAG-CTTTTTAACA-TTTCA---------T-TTTT-ATT-CAAA--CATGTTTTCC------TATTGA-TAT-C-AAT---AAGAA--T--A------------------T-T------T----AA----TGTAAA-AC---A----A---A-A-------A------GC-TTTT-G---G--GG---A--ACC-AA-AA--------------T-G-CACG-T---T-TAT--TA-A--TT--TTA-CTA---GATTA------------------TTA-GACT-T-CGAAT---G-ATCG--------------------------CCGT--ATCA----G-GAT--TA-ACACGC------AA-TTCT--A----G----GGACA---------T-GT--GA--AAATGGAATAACAG-CG----AGTAAGT----GCATGTATATTT-CCT--TGTGGTA---GGGGCA--T-GC--ATTA--A-TG--TTA------A--CG---T-T-TTGGGAA-TT------AC-TTG----CAT-T-------G-------------TC------CATG----------T---AT-TTGAGTTGAAACG-TCTATg
gi|40 : a-GGGA-ACGT-GT--GA--AAATGGATTAAAAG-CG----AGAAAGT----GT-AG---ATTT-TCT--CATGGCA---GGTACA--T-GC--ATTA--A-TG--TTA------A--AA---T-T-ATGAAAaatgtgttgaaatcgtcggtcgaagt
gi|41 : TGACA---GATGCA--T-TT--ATCA--A-TG--TTA------A--CG---A-T-GCGGAAG-TA------AC-TTGTC--TGT-TATGT-AAA-------------TC------AAGCCA--------T---AT-TTGTGTCGAAA
gi|42 : -CCT--TATGACA---GAT--------C--ATTA--A--G--TTA------G--AG---T-T-GTTGAAA-CA------AC-TTGTCT-TGT-TATGT-AAA-------------TT------CAGACA--------TTTAAT-AAGAGTTGtaaaa
gi|43 : --AG---T-T-GTGGAAA-TA------AC-TTATC--TGT-TACGT-AAA-------------TC------CAGATA--------C---AT-
gi|44 : atgttcaataactgtaacttaagtgtggattATGTATGCG-CC-CGTCATAATGA-AA-TATAC-AC-TT---CCT--TC-CTAT--AT----TTTTTTTT-ATA-TA---AT-C-C-T------G--GGTTT-G-AAT--aca
gi|45 : -CTGTTAAT----CCATTTTT-ACA-TG---TT-T-C-T-TGTCCC--GGTTTTG-AATATTGTTTGTTAATC-TCTAAGGGCGGTA-gtg
gi|46 : taT--T-C--TACCGCCAGTCG----G-GGC--TA-ACACAC------TA-TTTA--AACC------AGACG-AGGA-ACATCAT--GG--AAATG--------G-CA----AGTCAGT----GT-Tta
gi|47 : GTAACA---GATGCA--T-GT--GTTA--A-TG--TTA------A--AA---A-T-TTTGAAA-TA------AC-TTGTC--T----------------------------------------------------T-TTGAGTTGAAACG-TCGATTGAA
gi|48 : acA--A-TG--TTA------A--AAATTT-T-CT----A-TA------AC-TTGTT--TGT-TACGT-AAA-------------TT------CGGGCA--------T---AT-TTGAGTTGAAAAG-TCGATCGa
gi|49 : A---T-T-ATGGAAA-GA------GC-ATACC--TAT-TAAGT-AAA-------------TC------AAGGCA--------T---AT-TTGAGCTGTAACG-TCGATTGAA
gi|5 : CACAGTGA-AA-TCAAC-AC-TT---ACA--TG-CTGTTAAT----CCATTTTC-ACA-TG---TTTC-T-TGT---CCCGGGTTT-G-ATT--TGTTTGTCATTC-TCTAAGGGCGGTA-TA---AAAAAAT---A--------A-A-ATATCCGAAGTCAGA-ATATTTG-G-AA--AAA---------T-TAG-TAA-A-CA-T-----GT--ATA-CTT---G-CT-TCTTATAAAA-CTTTTCGACA-TTTCA---------T-TTTG-ATT-CAAA--CATGTTTTCCTATTATTATTAA-TAT-A-AAC---AAAAA--G--AA-TC-------C-----CT-T------T----AA----T----G-GTT--G----G---A-ACGCATGGA------GC-TTTC-T---T--AG---A--ACC-AA-AA--------------T-G-CAGA-G---T-TA---TA-ATTTT--TTT-CGA---AATTG------------------TCCGGACTCT-CGAAC---T-TTTGAAGTA-----T-T--TT--T-C--TACCTCCAATGGGT--G-GGC--TA-ACA-AC------TA-TTCA--AACGCG----AAGCATGGGA-ATGT-GT--GA--AAATGGATTAA-AG-CA----AGTAAGT----G--TG---GTTT-TCT--CATGACA---GGTGCA--T-GC--AATA--A--G--TTA------A--AA---T-TAATGG--A-TG------GC-ATA-C--TAT-TACGG-TAA-------------TC------C-GGCA--------T---AT-TTGAGTTGAAAAGATCGATCGatgt
gi|50 : -T-GTTGGAA-TA------AC-TTGTC--TGT-TACGT-AAA-------------TC------CAGGCA--------T---AT-TTGAGATGAAAAG-TCTATCGAA
gi|51 : acTGCATGCA-TC-TGTCACAATGA-AA-TCAACTAC-TT---------G-CTTTTAAT----CCATTTTC-ACC-TG---TT-C-
gi|52 : TTTAC---GTA------A-CAGACAAGTT-ATTCC--AACAACTTTTAACATT-AATGGATGCA-TC-Tcgg
gi|53 : gatcgacGCA--T-GC--ATTA--C-TG--TTA------A--AC---T-T-ATGGAAA-TT------GC-ATGAC--TGT-TACGT-AAA-------------TC------CAGGCA--------T---AT-
gi|54 : TTC-ACA-TG---TT-C-TGT-C---CC--GGATT-G--AT--TGTTTGTTAA-C-TCTATGGGCGGT---G---AAAAAA
gi|55 : C--AACAA-TTTTAGCATT-AATGCATACA-TT-TGTCACAATGA-AA-TCAAC-AC-TT---ACA--CG-Cat
gi|56 : tAA-TA------AC-TTGTCC-TGT-TAAGT-AAA-------------TC------CAGCCA--------T---AT-TTGAGTTGAAA-G-TCAATCGAA
gi|57 : tgA---AATTG------------------TCC-GACT-T-CGAAC---T-TTTGAT--A-----T-T--TT--C-C--TACCACCAATTG----G-GAC--T
gi|58 : ttacaAAA-TA------AT-TTGTC--TGT-T---T-AAA-------------TC------CGGGAA--------T---AT-TTGAGTCGAAACG-TCGACCGAA
gi|59 : TGGAAA-TG------GC-AAGTCAGTGT-TAAGT-AAA-------------TG------AAGGCA--------T---AT-TTGAGTTGAAA
gi|6 : tcaCAAGTA-ATTCCTCAACA---TTAAACATA-GAGAGGTACACTC-TATTACAAAAACAA-TCAAC--C-TTGTGACGTTCG-TTGTTAATTAGCCCATTTTCAAAA-TGTCTTT-C-T-G-T---CCA-GGGTT-GCAAT--TGTGAGTTTATA-ACCACTGGCGGGA-AGCAAAAAAAGTCG-A--------A-A-A-ATTC-AAGTAGGC-AAATT---G-TATTATA---------T-TAGACAA-A-CAGC-----GC--AAT-TTT---G-C--TCTCAGGAAGCCCTCTTGGCT-TTTCC---------TATTTT-CTT----A--CCT------C------TATCG------C-AACCA-AATAA--T--AA-T--------CATTTTTT-T------T----AAAAATT----ATACT--G----G---A-A-------A------GT-TTTT-T---C--AA---G--TTG-AA-AA--------------T-A-TGTG-T---T-TGA--TATA--TT--TTT--CA---AATTG----------------------G--T-C-CGAAC---T-TCCGG---A-----T-T--TT-------TACC-CCA---------------TA-G------------A-TTTA--AATCCG----GGACA-GGGATACGA-GT--G---AATTGGATTAACAG----------------------A---ATCT-TCTG-TATGGCA---GTCGCA--T-TT--ATTG--A-TG--TTG------ATCGT---T-T-GTAGAAA-T
gi|60 : A------A-CAGACAAGTT-ATTCC--AACAA-TCTTAATATT-AATGCATGCA-TC-TTTCACAATctcag
gi|61 : TGGATTAAAAG-CA----AGTAAGT----GC-TG---ATTT-TCT--AGTGGTATTGGA---A--T-GC--AGTA--A-
gi|64 : -------------TT------CAGGCA--------T---AT-TTGAGTTTAAAAG-TCGATCAAA
gi|66 : acac------CAGGCA--------T---GT-TTCAATTGAAAAG-TCGATCGAA
gi|7 : ATGCATGCA-TC-TGTCACAATGA-AA-TCAAC-AC-TT---ACA--TG-CTGTTAAT----CCATTTTT-ACA-TA---TTTC-T-TGT---CCCGGGTTT-G-AAT--TGTTTGTTAATC-TCTAAGGGCGGTA-TA---TAAAAAT---G--------A-TTA-ATCCGAAGTCGGA-ATATTTG-G-AA--AAA---------T-TAA-TAA-A-CA-C-----AT--ATA-TTT---G-CT-TCTCATAAAA-CTTTTTGACA-TTTCA---------gtgt
gi|7 : atc--AA-C--------T-----TT-T------T----GA----C----A-TTTC-A----A---A-A-------A------GC-TTTC-T---G--AG---A--ACC-AA-AA--------------T-G-AGTG-TACAT-CAT--T-----TT--TTT-CCA---AATTG------------------TCC-CACT-T-CGAAT---T-TTTTAT--A-----T-T--TT--T-C--TACCGCCAACTGCCAGG-GAC--TA-ACACAT------TA-TTCA--AACTCG----GAATA-GGGA-ACAT-GT--GA--AAATGGATTAAAAG-CA----AGTAAGT----GT-TG---ATTT-TCT--CGTGGTA---GGTGCA--T-GC--ATTA--A-TG--TT---------------T-T-ATGGAAA-TG------GC-ATGAA--TGT-TACGT-AAA-------------TC------TAGGCA--------T---AC-TTGAGTTGAAAAG-TCGATCGAAaaaagctttctgagaaccaaaatgagtgtacatcatttttttccaaattgtcccacttcgaattttttatatttttctaccgccaactgccagggactaacacattattcaaactcggaatagggaacatgtgaaaatggattaaaagcaagtaagtgttgattttctcgtggtaggtgcatgcattaatgttttatggaaatggcatgaatgttacgtaaatctaggcatacttgagttgaaaagtcgatcgaagtgt
gi|8 : atcatgcatgcatctgtcacaatgaaatcaacacttacatgctgttaatccatttttacatatttcttgtcccgggtttgaattgtttgttaatctctaagggcggtatataaaaatgattaatccgaagtcggaatatttggaaaaattaataaacacatatatttgcttctcataaTCAACTCAAA-ATTG-CTAGATTTAC---ATA------A-TAGACAAGTTTATTCC--AA-AA-TCTTAACAT---ATGCATACA-TCATGTCACAATGA-AA-TCAAC-AC-TT---ACA--T--CTGTTAAT----CCATTTTT-ACAAGG---TT-C-T-TGT---CCCGGGTTT-G-AAT--TGTTTGTTAATC-TCTAAGGGCAGT----------AAAT---------------------CGAAGT-GGA-ATATTTG-A-AA--AAAAAT------T-TAA--AA-A-CA-C-----GT--ATA-TTT---G-CT-TCTCATAAA--CTTTTTGACA-TTTCA---------T-TTTT-ATTCCAAA--CATG-TTTCC------TATCAA-TAT-C-AAC---AAAAAC-T--AT-C--------C-----TT-T------T----AA----TTGA-A-AC---A----A---A-A-------A------GC-GTTC-T---G--AG---A--ACC-AA-AA--------------T-G-CGTG-T---A-TAT--CA-T--TT--TCT-CC----AATTG------------------TCC-GACT-T-CGAAT---T-TTgtgt
gi|9 : aaatatatGGCAGTA-AA---AAGAAAT---GGAAAGTGGA-A-A-ATCCAGATTCGGG-AA-TTTG-G-AA--AAAAAAATATATTATAG-TAA-A-CA-C-----AC--A-A-TTT---G-TT-TCGCG--GAG-CTTTTTGAAA-TGTCA---------C-CTTT-----------------TTTC------TGTTGA-TAT-C-AAC---AAAAA--C--AA-TAAATTCAAC-----TT-TGGTTTGT----AA----A----AGAAG--A----A---A-A-------A------GC-TTT------G--AG---A--ACC-AA-AA--------------T-G-CGTC-T---T-TTC--TA-T--TT--TGT-CCA---AAAT---------------------------------AC---T-TTTGA---A-----TAT--TT--T-T--TATCGTTAATTG----A-GAT--AA-ACACAC------AA-TTCA--AAC---------ACG-GGGT-ACGT-GT--GA--AAATGGATTTACAA-CG----CGTAAGT----GG-TG---CTTTACCTA-CATTACA---ATTGCA--T-TC--ATTA--A-TG--TAA------A--AG---T-T-GTGAAAA-CA------aag
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|37 ): TTTTTCACACTTTCATGCGGTTTTTTTTTTTATTCTAGTTGACATTTCCACAATTTGATCAAAGTGGTTCAATCAAGGGATATGTGGGGAGA
Unaligned ( gi|62 ): GAAAAGTTATTGTTAGCCATTTTTCTTTTTATTACATGTATA
Unaligned ( gi|63 ): ATTGTCTGTTACACAAGATTCGAAATGTTGGTTGAAGTG
Unaligned ( gi|65 ): TAAAACTATTCGTTGAAAACACCTTTTTTAAAATAC
Alignments
lowQualScore : 111 55555555555555555555555 2222222 2222222222222222 111111111 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 11111111 11111111111111 1111111111111111 111111111111111111 2222222222
lowQualScore : 4 000 999999 3 44 33 2 44 2 2 2 2 2 2 777 555 2 6666 2 00000000000000000000000 2 3 3 44 0 3 1 2222222 6666666666666666 3 2 444 2 2 33 333333333 2 7 2 2 2 55555 55 666 666 2 2 3 66 2 99999999999 77 22 33 1 33 666666 00 2 2 2 777 3 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 333 2 6666666 888888 2 00000000 333 22 2 2 33333333333333 2 2 1 2 2222222222222222 22 2 333 444444444444444444 2 2 2 0 44444 1 0000000000 4 55 22 6666 666666 1 22 1 6666666 1 22 4444 0 1 1 1 22 22 2 1 4444 3333 1 222 11 8888 222 11 2 44 11 2 11 333333 33 2222 1 1 1 1 333333 11 2 44 1 1 1 6666666666666 333333 44444444 222 1 4 1
lowQualScore : . ... ...... . .. .. . .. . . . . . . ... ... . .... . ....................... . . . .. . . . ....... ................ . . ... . . .. ......... . . . . . ..... .. ... ... . . . .. . ........... .. .. .. . .. ...... .. . . . ... . ............................................................. ... . ....... ...... . ........ ... .. . . .............. . . . . ................ .. . ... .................. . . . . ..... . .......... . .. .. .... ...... . .. . ....... . .. .... . . . . .. .. . . .... .... . ... .. .... ... .. . .. .. . .. ...... .. .... . . . . ...... .. . .. . . . ............. ...... ........ ... . . .
lowQualScore : 4 000 666666 3 88 99 9 66 4 4 5 5 5 5 888 777 7 1111 7 66666666666666666666666 5 1 1 22 5 1 0 1111111 5555555555555555 1 7 777 7 5 22 555555555 4 1 4 4 2 66666 33 666 111 2 2 1 33 2 11111111111 66 66 22 0 22 888888 77 4 4 4 444 5 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 777 1 8888888 999999 1 11111111 555 88 0 0 88888888888888 0 0 8 0 0000000000000000 88 1 555 888888888888888888 0 1 1 6 55555 8 1111111111 2 00 88 7777 888888 9 55 8 1111111 9 66 0000 4 7 7 6 33 22 8 5 8888 3333 5 888 77 9999 444 88 6 44 77 5 88 777777 44 5555 2 2 1 1 444444 66 2 22 2 3 2 9999999999999 555555 55555555 222 2 3 6
consensus : TCAACTCAAATATGC-CTGGATTTAC---GTA------A-CAGACAAGTT-ATTCC--AACAA-TTTTAACATT-AATGCATGCA-TC-TGTCACAATGA-AA-TCAAC-AC-TT---ACA--CG-CTGTTAAT----CCATTTTC-ACA-TG---TT-C-T-T-T---CC--GGTTT-G-AAT--TGTTTGTTAATC-TCTANGGGCGGTA-NG---AAAAAAT---A--------A-A-A-ATCCGAAGTCGG-A---ATATTTG-G-AA--AAA---------T-TAG-TAA-A-CA-C-----GT--ATA-TTT---G-CT-TCTCATAAAG-CTTTTTGACA-TTTCA---------T-TTTT-ATT-CAAA--CATGTTTTCC------TATTGA-TAT-C-AAC---AAGAA--T--AA-T--------C-----TT-T------T----AA----T----A-ACT--A----A---A-A-------A------GC-TTTT-T---G--AG---A--ACC-AA-AA--------------T-G-CGTG-T---T-TAT--TA-A--TT--TTT-CCA---AATTG------------------TCC-GACT-T-CGAAT---T-TTCGA---A-----T-T--TT--T-C--TACCGCCAATCG----G-GAC--TA-ACACAC------TA-TTCA--AACCCG----GGACA-GGGA-ACGT-GT--GA--AAATGGATTAACAG-CG----AGTAAGT----GT-TG---ATTT-CCT--CGTGACA---GATGCA--T-GC--ATTA--A-TG--TTA------A--AG---T-T-G-TGGAAA-TA------AC-TTGTC--TGT-TACGT-AAA-------------TC------CAGGCA--------T---AT-TTGAGTTGAAACG-TCGATCGAA
Reference ( family-1049 ) : TCAACTCAAATATGC-CTGGATTTAC---GTA------A-CAGACAAGTT-ATTCC--AACAA-TTTTAACATT-AATGCATGCA-TC-TGTCACAATGA-AA-TCAAC-AC-TT---ACA--CG-CTGTTAAT----CCATTTTC-ACA-TG---TT-C-T-T-T---CC--GGTTT-G-AAT--TGTTTGTTAATC-TCTANGGGCGGTA-NG---AAAAAAT---A--------A-A-A-ATCCGAAGTCGG-A---ATATTTG-G-AA--AAA---------T-TAG-TAA-A-CA-C-----GT--ATA-TTT---G-CT-TCTCATAAAG-CTTTTTGACA-TTTCA---------T-TTTT-ATT-CAAA--CATGTTTTCC------TATTGA-TAT-C-AAC---AAGAA--T--AA-T--------C-----TT-T------T----AA----T----A-ACT--A----A---A-A-------A------GC-TTTT-T---G--AG---A--ACC-AA-AA--------------T-G-CGTG-T---T-TAT--TA-A--TT--TTT-CCA---AATTG------------------TCC-GACT-T-CGAAT---T-TTCGA---A-----T-T--TT--T-C--TACCGCCAATCG----G-GAC--TA-ACACAC------TA-TTCA--AACCCG----GGACA-GGGA-ACGT-GT--GA--AAATGGATTAACAG-CG----AGTAAGT----GT-TG---ATTT-CCT--CGTGACA---GATGCA--T-GC--ATTA--A-TG--TTA------A--AG---T-T-G-TGGAAA-TA------AC-TTGTC--TGT-TACGT-AAA-------------TC------CAGGCA--------T---AT-TTGAGTTGAAACG-TCGATCGAA
gi|1 : TCAACTCAACTATGC-CTGGGTTTAA---GTA------A-CAG-----TT-TTTCT--AACAA-TTTTAATATT-AATGCATGCA-TC-TGTCACAATGA-AA-TCAAA-TT-TT---GCA--TG-CTGTTAAT----CCATTTTC-ACA-TGC--TT-C-T-TAT---CCCGGGTGT-G-AAT--TGTCTGTTAATC-TCTAGAGGCGGTA-T----AAAAAAT---A--------A-ACA-GTCTGAAGTCGG-A---ATATTTG-A-AA--CAA---------T-TAGAAAA-A-CA-C-----GT--ATT-TTT---G-CT-TCTCATAGAA-CGTTTTGGCA-TTTAA---------T-TTTG-ATT-CAAA--CATGTTTTCC------TAATAG-TAT-C-AAC---AACAA--A--AACC--------C-----TT-T------T----AA----TTG--A-ATC--A----T---G-A-------A------GC-TTTT-T---G--AG---A--ACC-AA-AA--------------T-G-CATG-T---T-TA---TA-C--TT--TTTCCCA---AATTG------------------TCC-GACT-T-CGAAG---T-TTTGAT--A-----T-T--TT--T-C--TACCTCTTATTA----G-GAC--AA-ACACAC------TA-TTCA--AACCCA----GAACA-GGGA-AAGT-AT---A--AAATGAATTAAAAG-CG----AGTAAGT----AT-CA---ATTT-TCT--CATGGTA---AATGCA--T-GC--ATCA--A-TG--TTG------A--AA---T-T-A-TGGAAA-TG------GC-ATAAC--TGT-TACAT-
gi|10 : atgtgtaactatgtaactgttaaactgacttattagggaccaagAAATTCCA--------A-A-A-CTACGAAGTCGG-ATAAAT-TTTG-G-AA--AAC---------T-T-T-TAA-C-CA-A-----G---A-A-CTT---G-CT-TG-CAGAAGG-CTGTCTGTCA-TTTCA---------A-GTT--ATT--AAA---ATGTTT--C------TATGGA-T-T-T-AAC---ACGAA------A-T--------C-----TT-T------------A----T----A-ACTTAA----ACGTA-A-------A------GC-TTTT-----------------------------------------G-CATG-TAA-TGTAT-----G--TT--TTT-TCA---AAT-A------------------TCC-GA-T-T-CACATACAT-T-------A-----T-T--TT--T-AAATACCACCA-TCT----G-AAA--TGCAC-CAC------GAATTCA--A---CG----G-ATA-GG-A-ACAC-GT--GA--AA-TAGATAGGCAGTCG----AGTATGT----GT-TG---AT-----------GAT------TGCA--T-GCA-ATTT--A-TGGTTTA------T--AG---TAT-A-TAG-AA-TA------GCATTGCC--TGT-TAAAT-AAT-------------AC------CA-GCA--------T---ATATTGAGTCGAAACA-TCAGTCGAAaaagtcgatcgaagt
gi|11 : TCAACTCAAATATGC-CTGGATTTAC---ACA------A-CAGATAAGTC-ATTCC--AACAA-TTTTAACATT-ATTGCATGCA-TC-TGTCACAATGA-GA-TCAAC-AC-TT---ACA--TG-CTTTTAAT----CCATTTTC-ACA-TG---TT-T-C-T-TGTACCG-GGTTT-G-AAT--TGTTTGGTAATC-TCTAAGGGCGGTATAG---AAAATAA---A--------A-A-A-ATTCGAAGTCGG-A---ATATTTG-GAAA--AAA---------T-TAG-TAA-A-TA-T-----GT--ATA-TTT---G-CT-TCTCATAAAA-CTTTTTGGCA-TTTCA---------T-TTTG-ATT-CAAA--CATGTTTTCC------TAATTA-TAT-C-----------------------------C-----TT-A------T----AA----TTG--A-AAA--A----A---G-A-------A------GC-TTTT-T---G--GA---A--GCC-AA-AT--------------T-G-CATG-T---T-TAT--AT-G--TT--TTT-CCA---AATTG------------------TCC-gtg
gi|12 : TCAACTCAAATATGC-CTAGATTTAC---ATA------A-TAGACAAGTT-ATTCC--AACAA-TCTTAACATT-A-TGCATACA-TC-TGTCACAATGA-AA-TCAAC-AC-TT---ACA--TG-CTGTTAAT----CCATTTTT-ACA-AG---TT-T-C-T-TGTCCC--GGTTT-G-AAT--TGTTTGTTAATCTTCTAAGGGCAGT----------------------------A-A-ATCCGAAGTC-G-A---ATATTTGAA-AA--AAA---------T-TAA-TAA-A-CA-C-----GT--ATA-TTT---G-CT-TCTCATAAA--CTTTTTGACA-TTTCA---------T-TTTT-ATT-CAAA--CATGTTT--C------TATCAA-TAT-C-AAC---AAAAAACT--AT-C--------C-----TT-T------T----AA----TTTGAA-AC---A----A---A-A-------A------GC-GTTC-T---G--AG---A--ACC-AA-AA--------------T-G-CGTG-T---A-TAT--CA-T--TT--TCT-CCA---AATTG------------------TTC-aaag
gi|13 : acttt-TTTCT---------T-TCTT-ATT-CAAA--CCTGTTTT--------TATTAA-TAT-C-AAC---AAGAA--T--AA-T--------C-----TT-T------C----AA-----------ACT--ATGGCA---ACA-------A------GT-TTTT-TT--G--AG---A--ATC-AA-AA--------------T-A-CGTG-T---T-TAC--TA-A---T--TCT-ATA---AGTTG------------------TCC-GACT-T-CGAAT---T-TTCGA---T-----TCT--TT--C-C--TACAGCCGATAG----A-AAT--AA-ACACAT------AA-TTCA--AAACCG----GGAGG-GGAG-ACAT-AT--GA--AAATGGGTTGGTAA-TG----AGTGATT----AT-TG---GTTT-CTT--AATGACA---GATGTA--T-TT--ATTA--A-TT--TTT------A--AG---T-T-G-T-GAAA-TC------AC-TTGTC--TGT-TACGC-AAA-------------TC------CAGGCA--------T---AT-TTGAGTGGAAACA-TCCGTCGA
gi|14 : -AA--AAA---------T-T-G-TAA-A-CA-T-----GC--AT--TCT---A-TT-CCCCAGAATT-CTCTTTTACA-TTT-G---------T-TTTT-GTC-CAAA--CAT--------------------T-T-C-AAC---AG-----------------------------C------T----AA---------A-AC--------A---A-A-------A------GC-TTTT-C---TCCAGCTCA--GCT-GA-AA--------------T-A-CGTG-T---T-TAT--TA-T--TT--ATC-TTA---AATCA------------------TCC-GACT-TAC--AT---G-TTCGT---T-----T-TC-TT--T-C--TACCACCAATAG----A-GATCATA-ACGAA--------A-GTCA--AACCCG----GGACA-GGAA-ACAT-GT--AA--AAATGAATTAGCAG-CG----GGTAAGT----GC-TA---ATTT-TCT--TAAGACA---GCTGCA--T-TC--ATTG--A-TG--TTA------A--AG---A-T-G-
gi|15 : ttgaaaAGTCGGTA---ATTTTGG-G-AA--AAA---------T-TAG-TAA-A-C--C-----GT--A-A-TTTTTGG-CT-TCTCATGAAA--TTTTTGACAATTTTA---------A-TTT--ATT-CAAATACATGTTGTTC------TATTAA-TAT-C-AACAAAAAGAA--T--AA-T--------C------C-T------T----AA----TTGA-A-ATA--A----A---A-A-------A------GC-TTCT-T------AG---A--A-A-AA-AA--------------TAG-C-TA-T---T---T--TATA--TT--TTT-TTAGACAATTGAATNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNN-N-NNAAT---T-TTTGAT--A-----T-T--TT--T-C--TCCCGCCAATTG----G-GAC--TT-GCACACTACATGTA-TTCA--AACCCG----GAACA-GGG
gi|16 : a--AAA---------T--AGCTAT-A-CA-C-----AC--ACACTTT---G-CC-CCTCGGAAAG-CTTTTT-------TCAAAAAAAAAAT------ATT-CAAA--AATGTTTTCC------TTTCGA-TGTAC-AAA---GAGAG--T--AA-T--------C-----TT-T------TTTTCAA----T----G-A----A----A---A-A-------A------GTATTTT-TAGAG--AA---A--AAC-AA-AACACAAACACACCCTT-G-CATG-T---T-AAT--TA-A--TT--TTT-CAA---AGTTA------------------TCA-AAAT-T-C-AAT---TAATCAT---A-----T-T--CTTAT-A--TACCGCTAA---------------A-ATG-AA------TG-TTCA--AACTCGCATAAGAGG-GGGT-ACGT-Ga
gi|17 : g--AG---A--ACC-AA-AA--------------T-G-CATG-T---T-TAT--AA-A--AAAATTT-CCA---AATTG------------------TCC-GACT-T-CGAAC---T-TTTGAT--A-----T-T--TT--T-C--TACCGCCAATTG----G-GAC--TA-ACACAC------TA-TTCA--AACCCG----GAACA-AGGA-ATGT-GT--GA--AAATGGATTAAAAG-CG----AGTAAGT----GT-GG---ATTT-TTT--T-T---------TTCA--TGGC--ATTA--G-TG--TTA------A--AA---T-T-A-TGGAAA-TG------GC-ATAAT--TAT-TACGT-AAA-------------TC------CAGGCA--------T---TT-TTGAATTGAAAAG-TCGATCGAA
gi|18 : tA-ACACAT------AA-TTTT--AACCCG----GGACA-GAGA-ACAT-GA--TA--AAATGGATTAAC----G----ACTAGGT----GT-CG---ATCA-CCT--TATGTCA---GATACACAT-GC--AATA--A-TG--TTA------A--AG---T-T-G-CGGAAA-TA------AC-TTTTC--TGT-TATAT-AAA-------------TC------CAGACATACATATGT---AT-TTGAGTCAAGCCG-TTGATCGAg
gi|19 : caaaggaaatc--------C-----TT-T------T----AA----TTGA-A-AC---A----A---G-A-------A------GC-TTTTAT---G--AG---A--TCC-AA-AA--------------T-G-CATA-T---C-TATATTT-T--TT--TTT-CCA---AATTG------------------TCC-GACT-T-C----------------------------TT--T-A--TACCGCCAATTC----G-GAC--TA-ACACAC------TA-TTCA--AACCAG----GGA-A-AGGA-GTGC-GT--GA--ACATGGATTAACAG-CG----AGTAAGT----GT-GG---ATTT-TCT--CATGGCA---tgt
gi|2 : cTCAATTAAAATATGC-CTGGGTTTAC---GTA------A-CGGACAAATT-ATTTC--CACAA-CTATAACATT-AATGCGTGCA-TG-TGTCACAAAGA-AA-TCAAC-AC-TT---ACT--CG-CTGTTAAT----CCATTTTC-ACA-----------------------GGATT-G-AAT--TATGTGATAATC-TCTATTAATGATC-GG---AAAATATT--A--------A-A-A-ACCCAAAGTCGG-A---AAATT-G-G-AA--AAA---------T-TAG-TAA-A-CA-C-----AC--AT--TTC---G-CT-TCTAGGAAAG-CTTTCTAACA-TCTTA---------A-ATCT-ATT-GAAA--CGTGTTTTCC------TATTGA-TAT-C-TGC---AAGAA--T--AA-T--------A-----TTAC------T----AA----T----A-ACT--C----A---A-A-------ATT----GC-TCTT-T---G--AG---A--ACC-AA-GA--------------T-A-CGTA-T---C-TAT--TA-A--TT--TGT-CAA---AATTA------------------TCC-GATT-T-TGAAT---G-ATCGA---A-----T-T--TT--T-TA-TACCGCCAATCG----G-GAT--TA-ACACGC------AT-TTCA--AACCCG----TAAAA-AGGA-ACAT-GT--GA--AAATGGATTAACAG-CA----TGTAAGT----GT-TG---ATTT-CTT--TGTGACA---GATGCG--T-GC--ATTA--A-TG--TTA------A--AA---T-T-G-TGGAAA-TA------AG-TTGTC--TGT-TGCTT-AAA-------------CT------CAGGCA--------T---AT-TTAAGTTGAAACG-TCGATCGAA
gi|20 : G----G-GAC--TA-ACACAC------TA-TTCA--AACCCG----GATCA-GGGA-ACAT-GT--GA--AAATGGATTAAAAG-CA----AGTAAGT----GT-TG---ATTT-TCT--CGTGGTA---GATGCA--T-GT--ATTA--A-TG--TTA------A--AA---T-T-A-TGGAGA-TT------GC-ATGAC--TGT-TACGT-AAA-------------TC------TAGGCA--------T---AT-TTGAGTTGAAAAG-TCGATCGA
gi|21 : t---A-----T-T--TT--T-C--TACCGCGTATCA----T-GAC--TA-ACACAC------TA-TTTATAAATCCG----AGATA-AGAA-ACA-------------------AACAG-CG----TGTAAGT----GT-TG---ATTT-CCT--TGTGATA---GATGCT--T-AC--ATTA--A-TG--TTA------C--AG---T-T-G-T---------------------C--TGT-TACGT-AAA-------------TC------CAGCCA--------T---AT-TTGAGTTGAAggtgt
gi|22 : atTCGG-A---ATATTTG-G-AA--AAA---------T-TAA-TAA-A-CA-TTACAAGT--ATA-TTT---G-CT-TCTCTTAAAA-CTTTTTGACA-TTTGA---------T-TTTTAATT-CAAA--TATG-TTTCC------TATTAA-TAT-C-AAC----------T--AA-------------------T------T----GA---------A-AC---A----A---A-A-------A------GC-TTTC-T---G--AG---A--ACC-GA-CAT-------------T-A-CAT----------T--TA-A--TT--TTgtca
gi|23 : CAT-GT--TA--AAGTGGGT-AATAA-CG----AGTAAGT----AT-TG---ATTT-CCTGACTTG-CA---GATGCA--T-TC--ACAA--A-TT--TTA------A--AG---T-G-G-TGGAAA-TA------AC-TT-------T-TATGG-AAT-------------TC------CAGA-A--------T---AT-TTGATTCAAAATA-TCAGTCa
gi|24 : aaagacaaactcataattcg--TA-GCACAC------TA-TTCA--AACCCG----GAACA-CGGA-ACAT-GT--GA--ACATTGATTAAAAG-CG----AGTAAGA----GT-TG---ATTT-CCT--CATGGCA---GATGCA--T-CC--ATC---A-TG--TTG------A--AA---T-T-A-TGGAAA-TG------GC-ATGAC--TGA-TACGT-AAA-------------TC------Cagagtgt
gi|25 : aaaaagTCAACGCAAATAGGAACTGGATTTACC--GTA------ATCAGACAAGTT--TTTC--AACAA-TTTTAACATT-AATGCCTGCA-TC-TGTTACAATGA-AA-TCAAC-AC-TTAA-ACA--TGCCTGTTCAT----CCATTTTC-ACATTG---TT-gacttttaat
gi|26 : gattgactttGT-GT--GA--AAATGGATTAACAG-CACATAAGTGAAT----GT-TG---ATTT-CCT--TGTGACA---AGTGCA--TTACT-ATAA--AGTA--CTA------AGTAG---C-T-G-CGGAAAATA------AC-TCGT----GT-TGCGA-AAA-------------TC------CAGGCA--------T---AT-TTGAGTTGAAATG-TTGATCGAAtct
gi|27 : A-GAGA-ACAT-GT--GA--AAATGGATTAACAT-CGA---AAAAAAT----GT-TA---ATTT-ATT--TATGACA---TAAGCA--T-GC--AGCA--A-TA--TCA------A--A----T-T-G-TCGAAA-TA------AC-ACGTC--TAT-TGCCT-ACA-------------TCTAGGTACAGGTA--------T---AT-TTGAGTCGAAACG-TCG
gi|28 : --AAATGGGCCAACAG-CA----AGTAAGT----GT-TG---AATT-CCT--TGTGATA---GATGCA--T-GC--GTTA--A-TG--TTA------A--AG---T-T-G-GGGAAG-TA------AT-TTGTC--TGT-TATGT-AAG-------------CC------CAGGCA--------T----C-GTCAATTGAAAt
gi|29 : a-C-----GT--GTG-TTT---AACTGTCTCGGCAAG-CTTCTTGGCA-TT-----------------------------CACGTTT-CC------TATTGAATAT-C-AAC---AAGAA--T--GA-T--------C-----TT-T------T----------T----A-GCT--A----A---A-A-------AAAAAATGC-TTTT-TC--G--AG---ATTGCCTAATAA--------------C-GCCATGAT---T-TAT--T--A--TT--TTagggtacatagtctggttcc
gi|3 : TCAACTCAAATATGC-CTGGATTTAC---GTACATGTAA-CAGACAAGT--ATGCC--AACAA-GTTTAACAT--AATGTATGCA-TC-TGACACA-TGA-AAATCAAC-ACCTT---ACA--TG-CTGTTAAT----CCTTTTTC-ACA-------------------------------------GTTTG---ATC-TCTATGGGCGTTT-AT---AAAAAA-------------A-A-A-A--CGAAGTCGG-A---ATATTTG---AA--AAA---------T-TA--TAA-A-CA-C-----ATT-ATA-TTTT--G-CT-TCTCATAACA-CTTTT-GACA-TTTCA---------T-TTTG-ATT-CAAA--CATGTTTTCC------TAT-AA-GAT-CGAAC---AAAAA--TTAAA-T--------AA----TT-T------T----AA----T--------T--G----A---A-A-------A------A-------------------A--ACC-CA-A------------------------------------------C--TTT-CCA---AATTG------------------TCT-GACT-T-CGAAT---T-TT-GAT--A-----T-T--TT--C-T--TACAGCCGAACG----GAGAC--TA-ACACAC------TA-TTCA--AGCCCG----GAACA-ATGA-ACGT-GTTGGATTAAATG-ATTAAAAG-CG----AGTAAGTCAGTGT-TG---ATTT-TCT--C-TGACA---GGTGCG--T-GC--ATTA--A-TG--TTA------A--AA---T-T-A-TTAAAA-TG------TT-ATGAC--TGT-TACGTAAAA-------------TC------CAGGCA--------T----T-TTGAGTAGAAAAG-TCag
gi|30 : tattgacttttTAAAAG-CG----AGTAAAT----GT-TG---ATTT-CCT--TGTTATA---GATACA--T-GTAAATTG--A-TG--T--------A--AA---T-T-G-TGGAAA-GA------CT-TTGTC--TGT-TATGT-AAA-------------TC------CA-------------------TCCAGTGAAAACG-TCCGTCGA
gi|31 : aag-T-CGAAC---A-TTCGA---AGTCAGT-TAATT--T-G--GACCGCCAATAG----A-GAT--TA-ACACAcgcg
gi|31 : T-CCA---AATTA------------------ACT-GACT-T-CGAAT---G-TTCGAT--A-----T-T--TT--TTC--TACTGCCAATCG----G-GAG--TA-ACACTC------TA-TTCA--AACCCG----GGACA-GGGA-ACGT-GT--GA--Atattttttctactgccaatcgggagtaacactctattcaaacccgggacagggaacgtgtgaa
gi|32 : tgtgttaatctctattggcggTCAACTCAAATATGC-CTGGATTTAC---ATA------A-CAGACAAGTT-ATTCC--AACAA-TTTTAACATA-AATGTATGCA-TC-TGTCACAATGA-AA-TCAAT-AC-TT---ACA--
gi|33 : ctcaatcgactttACA-GAGA-GCAT-GT--GG--AAATGCATTAACGA-CG----AATAAGT----GT-TC---ACTT--CT--TGTGACA---AATGAA--T-GA--CTTA--ATTG--TT-------A--AG---T-C-G-TGGAAA-TA------AC-TTGt
gi|34 : TCAAATG-AC-TTAAATTTATCCTGCA------A-GAGACAAGT--ATTTC--AACAA-TTTAAGCATT-AATGCATACA-TT---TCACAATG--AA-TCAAC-AC-TT---ACatgtctacagtacgca
gi|35 : ctatgactttttccaCA--T-GC--ATTG--A-TG--TTATTATTTA--AA---T-T-G-TTGAAA-TA------AC-TTGTC--TGT-AATGT-AAATCTGTGCAGCCATTC------CAGGCA--------T---AT-TTGAGTTGAAAAT-TCGATC
gi|36 : tgtTTAATC-TCTATGGGAGGTA-TA---AACAAAT---A--------AGA-A-ATCCAAAGTCGG-A---ATATTTG-G-AA--AAA---------A-TAG-TGATATCA-T-----ATAAATA-TTT---G-CT-TCTCATAAAA-CGTTtgt
gi|38 : ATGCA--T-GC--ATTG--G-TG--ATG------A---G---T-T-GGTGGAAA-TACGAGTAAA-TTGTC--TATCTA-GT-AAA-------------TC------CAGCCA--------T---AT-TTCAGTTGAAACG-TCGATCGAA
gi|39 : cgcTT-CCA--TATGACA---GATACA--T-AC--ATTATAA-TG--TTA------A--AA---T-T-A-TGGAAA-TA------GC-TAGTC--TGT-TAAGT-AAA-------------TC------CAGGCA--------T------------------G-TCGATCGAA
gi|4 : C---GTA------A-CAGACAAGTT-ATTTC--CACAA-TTTTAACATTGAATGCATGCG-TC-TGTCATAAGAA-AA-TCAAC-AC-TT---ACC--CG-CTGCTAAT----CCATTTTA-AC---G---TT-CAT-TGT---CC--TG----G-GAT--TG------AATT-TTTAT---CAGTA-GG---AAATAAT---A--------AGA-A-ATTCGAAGTCGG-A---AAATTTG-G-AA--AAA---------T-TAG-TAA-A-CA-C-----GC--AT---TT---G-CA-TCTCCGAAAG-CTTTTTAACA-TTTCA---------T-TTTT-ATT-CAAA--CATGTTTTCC------TATTGA-TAT-C-AAT---AAGAA--T--A------------------T-T------T----AA----TGTAAA-AC---A----A---A-A-------A------GC-TTTT-G---G--GG---A--ACC-AA-AA--------------T-G-CACG-T---T-TAT--TA-A--TT--TTA-CTA---GATTA------------------TTA-GACT-T-CGAAT---G-ATCG--------------------------CCGT--ATCA----G-GAT--TA-ACACGC------AA-TTCT--A----G----GGACA---------T-GT--GA--AAATGGAATAACAG-CG----AGTAAGT----GCATGTATATTT-CCT--TGTGGTA---GGGGCA--T-GC--ATTA--A-TG--TTA------A--CG---T-T-T-TGGGAA-TT------AC-TTG----CAT-T-------G-------------TC------CATG----------T---AT-TTGAGTTGAAACG-TCTATg
gi|40 : a-GGGA-ACGT-GT--GA--AAATGGATTAAAAG-CG----AGAAAGT----GT-AG---ATTT-TCT--CATGGCA---GGTACA--T-GC--ATTA--A-TG--TTA------A--AA---T-T-A-TGAAAaatgtgttgaaatcgtcggtcgaagt
gi|41 : TGACA---GATGCA--T-TT--ATCA--A-TG--TTA------A--CG---A-T-G-CGGAAG-TA------AC-TTGTC--TGT-TATGT-AAA-------------TC------AAGCCA--------T---AT-TTGTGTCGAAA
gi|42 : -CCT--TATGACA---GAT--------C--ATTA--A--G--TTA------G--AG---T-T-G-TTGAAA-CA------AC-TTGTCT-TGT-TATGT-AAA-------------TT------CAGACA--------TTTAAT-AAGAGTTGtaaaa
gi|43 : --AG---T-T-G-TGGAAA-TA------AC-TTATC--TGT-TACGT-AAA-------------TC------CAGATA--------C---AT-
gi|44 : atgttcaataactgtaacttaagtgtggattATGTATGCG-CC-CGTCATAATGA-AA-TATAC-AC-TT---CCT--TC-CTAT--AT----TTTTTTTT-ATA-TA---AT-C-C-T------G--GGTTT-G-AAT--aca
gi|45 : -CTGTTAAT----CCATTTTT-ACA-TG---TT-T-C-T-TGTCCC--GGTTTTG-AATATTGTTTGTTAATC-TCTAAGGGCGGTA-gtg
gi|46 : taT--T-C--TACCGCCAGTCG----G-GGC--TA-ACACAC------TA-TTTA--AACC------AGACG-AGGA-ACATCAT--GG--AAATG--------G-CA----AGTCAGT----GT-Tta
gi|47 : GTAACA---GATGCA--T-GT--GTTA--A-TG--TTA------A--AA---A-T-T-TTGAAA-TA------AC-TTGTC--T----------------------------------------------------T-TTGAGTTGAAACG-TCGATTGAA
gi|48 : acA--A-TG--TTA------A--AAATTT-T-C-T----A-TA------AC-TTGTT--TGT-TACGT-AAA-------------TT------CGGGCA--------T---AT-TTGAGTTGAAAAG-TCGATCGa
gi|49 : ---T-T-A-TGGAAA-GA------GC-ATACC--TAT-TAAGT-AAA-------------TC------AAGGCA--------T---AT-TTGAGCTGTAACG-TCGATTGAA
gi|5 : aCACAGTGA-AA-TCAAC-AC-TT---ACA--TG-CTGTTAAT----CCATTTTC-ACA-TG---TTTC-T-TGT---CCCGGGTTT-G-ATT--TGTTTGTCATTC-TCTAAGGGCGGTA-TA---AAAAAAT---A--------A-A-ATATCCGAAGTCAG-A---ATATTTG-G-AA--AAA---------T-TAG-TAA-A-CA-T-----GT--ATA-CTT---G-CT-TCTTATAAAA-CTTTTCGACA-TTTCA---------T-TTTG-ATT-CAAA--CATGTTTTCCTATTATTATTAA-TAT-A-AAC---AAAAA--G--AA-TC-------C-----CT-T------T----AA----T----G-GTT--G----G---A-ACGCATGGA------GC-TTTC-T---T--AG---A--ACC-AA-AA--------------T-G-CAGA-G---T-TA---TA-ATTTT--TTT-CGA---AATTG------------------TCCGGACTCT-CGAAC---T-TTTGAAGTA-----T-T--TT--T-C--TACCTCCAATGGGT--G-GGC--TA-ACA-AC------TA-TTCA--AACGCG----AAGCATGGGA-ATGT-GT--GA--AAATGGATTAA-AG-CA----AGTAAGT----G--TG---GTTT-TCT--CATGACA---GGTGCA--T-GC--AATA--A--G--TTA------A--AA---T-TAA-TGG--A-TG------GC-ATA-C--TAT-TACGG-TAA-------------TC------C-GGCA--------T---AT-TTGAGTTGAAAAGATCGATCGatgt
gi|50 : -T-G-TTGGAA-TA------AC-TTGTC--TGT-TACGT-AAA-------------TC------CAGGCA--------T---AT-TTGAGATGAAAAG-TCTATCGAA
gi|51 : acTGCATGCA-TC-TGTCACAATGA-AA-TCAACTAC-TT---------G-CTTTTAAT----CCATTTTC-ACC-TG---TT-C-
gi|52 : TTTAC---GTA------A-CAGACAAGTT-ATTCC--AACAACTTTTAACATT-AATGGATGCA-TC-Tcgg
gi|53 : gatcgacGCA--T-GC--ATTA--C-TG--TTA------A--AC---T-T-A-TGGAAA-TT------GC-ATGAC--TGT-TACGT-AAA-------------TC------CAGGCA--------T---AT-
gi|54 : TTC-ACA-TG---TT-C-TGT-C---CC--GGATT-G--AT--TGTTTGTTAA-C-TCTATGGGCGGT---G---AAAAAA
gi|55 : C--AACAA-TTTTAGCATT-AATGCATACA-TT-TGTCACAATGA-AA-TCAAC-AC-TT---ACA--CG-Cat
gi|56 : tAA-TA------AC-TTGTCC-TGT-TAAGT-AAA-------------TC------CAGCCA--------T---AT-TTGAGTTGAAA-G-TCAATCGAA
gi|57 : tgA---AATTG------------------TCC-GACT-T-CGAAC---T-TTTGAT--A-----T-T--TT--C-C--TACCACCAATTG----G-GAC--T
gi|58 : ttacaAAA-TA------AT-TTGTC--TGT-T---T-AAA-------------TC------CGGGAA--------T---AT-TTGAGTCGAAACG-TCGACCGAA
gi|59 : -TGGAAA-TG------GC-AAGTCAGTGT-TAAGT-AAA-------------TG------AAGGCA--------T---AT-TTGAGTTGAAA
gi|6 : tcaCAAGTA-ATTCCTCAACA---TTAAACATA-GAGAGGTACACTC-TATTACAAAAACAA-TCAAC--C-TTGTGACGTTCG-TTGTTAATTAGCCCATTTTCAAAA-TGTCTTT-C-T-G-T---CCA-GGGTT-GCAAT--TGTGAGTTTATA-ACCACTGGCGGGA-AGCAAAAAAAGTCG-A--------A-A-A-ATTC-AAGTAGG-C---AAATT---G-TATTATA---------T-TAGACAA-A-CAGC-----GC--AAT-TTT---G-C--TCTCAGGAAGCCCTCTTGGCT-TTTCC---------TATTTT-CTT----A--CCT------C------TATCG------C-AACCA-AATAA--T--AA-T--------CATTTTTT-T------T----AAAAATT----ATACT--G----G---A-A-------A------GT-TTTT-T---C--AA---G--TTG-AA-AA--------------T-A-TGTG-T---T-TGA--TATA--TT--TTT--CA---AATTG----------------------G--T-C-CGAAC---T-TCCGG---A-----T-T--TT-------TACC-CCA---------------TA-G------------A-TTTA--AATCCG----GGACA-GGGATACGA-GT--G---AATTGGATTAACAG----------------------A---ATCT-TCTG-TATGGCA---GTCGCA--T-TT--ATTG--A-TG--TTG------ATCGT---T-T-G-TAGAAA-T
gi|60 : A------A-CAGACAAGTT-ATTCC--AACAA-TCTTAATATT-AATGCATGCA-TC-TTTCACAATctcag
gi|61 : TGGATTAAAAG-CA----AGTAAGT----GC-TG---ATTT-TCT--AGTGGTATTGGA---A--T-GC--AGTA--A-
gi|64 : -------------TT------CAGGCA--------T---AT-TTGAGTTTAAAAG-TCGATCAAA
gi|66 : acac------CAGGCA--------T---GT-TTCAATTGAAAAG-TCGATCGAA
gi|7 : ATGCATGCA-TC-TGTCACAATGA-AA-TCAAC-AC-TT---ACA--TG-CTGTTAAT----CCATTTTT-ACA-TA---TTTC-T-TGT---CCCGGGTTT-G-AAT--TGTTTGTTAATC-TCTAAGGGCGGTA-TA---TAAAAAT---G--------A-TTA-ATCCGAAGTCGG-A---ATATTTG-G-AA--AAA---------T-TAA-TAA-A-CA-C-----AT--ATA-TTT---G-CT-TCTCATAAAA-CTTTTTGACA-TTTCA---------gtgt
gi|7 : atc--AA-C--------T-----TT-T------T----GA----C----A-TTTC-A----A---A-A-------A------GC-TTTC-T---G--AG---A--ACC-AA-AA--------------T-G-AGTG-TACAT-CAT--T-----TT--TTT-CCA---AATTG------------------TCC-CACT-T-CGAAT---T-TTTTAT--A-----T-T--TT--T-C--TACCGCCAACTGCCAGG-GAC--TA-ACACAT------TA-TTCA--AACTCG----GAATA-GGGA-ACAT-GT--GA--AAATGGATTAAAAG-CA----AGTAAGT----GT-TG---ATTT-TCT--CGTGGTA---GGTGCA--T-GC--ATTA--A-TG--TT---------------T-T-A-TGGAAA-TG------GC-ATGAA--TGT-TACGT-AAA-------------TC------TAGGCA--------T---AC-TTGAGTTGAAAAG-TCGATCGAAaaaagctttctgagaaccaaaatgagtgtacatcatttttttccaaattgtcccacttcgaattttttatatttttctaccgccaactgccagggactaacacattattcaaactcggaatagggaacatgtgaaaatggattaaaagcaagtaagtgttgattttctcgtggtaggtgcatgcattaatgttttatggaaatggcatgaatgttacgtaaatctaggcatacttgagttgaaaagtcgatcgaagtgt
gi|8 : atcatgcatgcatctgtcacaatgaaatcaacacttacatgctgttaatccatttttacatatttcttgtcccgggtttgaattgtttgttaatctctaagggcggtatataaaaatgattaatccgaagtcggaatatttggaaaaattaataaacacatatatttgcttctcataaTCAACTCAAA-ATTG-CTAGATTTAC---ATA------A-TAGACAAGTTTATTCC--AA-AA-TCTTAACAT---ATGCATACA-TCATGTCACAATGA-AA-TCAAC-AC-TT---ACA--T--CTGTTAAT----CCATTTTT-ACAAGG---TT-C-T-TGT---CCCGGGTTT-G-AAT--TGTTTGTTAATC-TCTAAGGGCAGT----------AAAT---------------------CGAAGT-GG-A---ATATTTG-A-AA--AAAAAT------T-TAA--AA-A-CA-C-----GT--ATA-TTT---G-CT-TCTCATAAA--CTTTTTGACA-TTTCA---------T-TTTT-ATTCCAAA--CATG-TTTCC------TATCAA-TAT-C-AAC---AAAAAC-T--AT-C--------C-----TT-T------T----AA----TTGA-A-AC---A----A---A-A-------A------GC-GTTC-T---G--AG---A--ACC-AA-AA--------------T-G-CGTG-T---A-TAT--CA-T--TT--TCT-CC----AATTG------------------TCC-GACT-T-CGAAT---T-TTgtgt
gi|9 : aaatatatGGCAGTA-AA---AAGAAAT---GGAAAGTGGA-A-A-ATCCAGATTCGG-G---A-ATTTG-G-AA--AAAAAAATATATTATAG-TAA-A-CA-C-----AC--A-A-TTT---G-TT-TCGCG--GAG-CTTTTTGAAA-TGTCA---------C-CTTT-----------------TTTC------TGTTGA-TAT-C-AAC---AAAAA--C--AA-TAAATTCAAC-----TT-TGGTTTGT----AA----A----AGAAG--A----A---A-A-------A------GC-TTT------G--AG---A--ACC-AA-AA--------------T-G-CGTC-T---T-TTC--TA-T--TT--TGT-CCA---AAAT---------------------------------AC---T-TTTGA---A-----TAT--TT--T-T--TATCGTTAATTG----A-GAT--AA-ACACAC------AA-TTCA--AAC---------ACG-GGGT-ACGT-GT--GA--AAATGGATTTACAA-CG----CGTAAGT----GG-TG---CTTTACCTA-CATTACA---ATTGCA--T-TC--ATTA--A-TG--TAA------A--AG---T-T-G-TGAAAA-CA------aag
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|37 ): TTTTTCACACTTTCATGCGGTTTTTTTTTTTATTCTAGTTGACATTTCCACAATTTGATCAAAGTGGTTCAATCAAGGGATATGTGGGGAGA
Unaligned ( gi|62 ): GAAAAGTTATTGTTAGCCATTTTTCTTTTTATTACATGTATA
Unaligned ( gi|63 ): ATTGTCTGTTACACAAGATTCGAAATGTTGGTTGAAGTG
Unaligned ( gi|65 ): TAAAACTATTCGTTGAAAACACCTTTTTTAAAATAC
Alignments
lowQualScore : 111 55555555555555555555555 2222222 2222222222222222 111111111 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 11111111 11111111111111 1111111111111111 111111111111111111 2222222222
lowQualScore : 4 000 999999 3 44 33 2 44 2 2 2 2 2 2 777 555 2 6666 2 00000000000000000000000 2 3 3 44 0 3 1 2222222 6666666666666666 3 2 444 2 2 33 333333333 2 7 2 2 2 55555 55 666 666 2 2 3 66 2 99999999999 77 22 33 1 33 666666 00 2 2 2 777 3 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 333 2 6666666 888888 2 00000000 333 22 2 2 33333333333333 2 2 1 2 2222222222222222 22 2 333 444444444444444444 2 2 2 0 44444 1 0000000000 4 55 22 6666 666666 1 22 1 6666666 1 22 4444 0 1 1 1 22 22 2 1 4444 3333 1 222 11 8888 222 11 2 44 11 2 11 333333 33 2222 1 1 1 1 333333 11 2 44 1 1 1 6666666666666 333333 44444444 222 1 4 1
lowQualScore : . ... ...... . .. .. . .. . . . . . . ... ... . .... . ....................... . . . .. . . . ....... ................ . . ... . . .. ......... . . . . . ..... .. ... ... . . . .. . ........... .. .. .. . .. ...... .. . . . ... . ............................................................. ... . ....... ...... . ........ ... .. . . .............. . . . . ................ .. . ... .................. . . . . ..... . .......... . .. .. .... ...... . .. . ....... . .. .... . . . . .. .. . . .... .... . ... .. .... ... .. . .. .. . .. ...... .. .... . . . . ...... .. . .. . . . ............. ...... ........ ... . . .
lowQualScore : 4 000 666666 3 88 99 9 66 4 4 5 5 5 5 888 777 7 1111 7 66666666666666666666666 5 1 1 22 5 1 0 1111111 5555555555555555 1 7 777 7 5 22 555555555 4 1 4 4 2 66666 33 666 111 2 2 1 33 2 11111111111 66 66 22 0 22 888888 77 4 4 4 444 5 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 777 1 8888888 999999 1 11111111 555 88 0 0 88888888888888 0 0 8 0 0000000000000000 88 1 555 888888888888888888 0 1 1 6 55555 8 1111111111 2 00 88 7777 888888 9 55 8 1111111 9 66 0000 4 7 7 6 33 22 8 5 8888 3333 5 888 77 9999 444 88 6 44 77 5 88 777777 44 5555 2 2 1 1 444444 66 2 22 2 3 2 9999999999999 555555 55555555 222 2 3 6
consensus : TCAACTCAAATATGC-CTGGATTTAC---GTA------A-CAGACAAGTT-ATTCC--AACAA-TTTTAACATT-AATGCATGCA-TC-TGTCACAATGA-AA-TCAAC-AC-TT---ACA--CG-CTGTTAAT----CCATTTTC-ACA-TG---TT-C-T-T-T---CC--GGTTT-G-AAT--TGTTTGTTAATC-TCTANGGGCGGTA-NG---AAAAAAT---A--------A-A-A-ATCCGAAGTCGG-A---ATATTTG-G-AA--AAA---------T-TAG-TAA-A-CA-C-----GT--ATA-TTT---G-CT-TCTCATAAAG-CTTTTTGACA-TTTCA---------T-TTTT-ATT-CAAA--CATGTTTTCC------TATTGA-TAT-C-AAC---AAGAA--T--AA-T--------C-----TT-T------T----AA----T----A-ACT--A----A---A-A-------A------GC-TTTT-T---G--AG---A--ACC-AA-AA--------------T-G-CGTG-T---T-TAT--TA-A--TT--TTT-CCA---AATTG------------------TCC-GACT-T-CGAAT---T-TTCGA---A-----T-T--TT--T-C--TACCGCCAATCG----G-GAC--TA-ACACAC------TA-TTCA--AACCCG----GGACA-GGGA-ACGT-GT--GA--AAATGGATTAACAG-CG----AGTAAGT----GT-TG---ATTT-CCT--CGTGACA---GATGCA--T-GC--ATTA--A-TG--TTA------A--AG---T-T-G-TGGAAA-TA------AC-TTGTC--TGT-TACGT-AAA-------------TC------CAGGCA--------T---AT-TTGAGTTGAAACG-TCGATCGAA
Reference ( family-1049 ) : TCAACTCAAATATGC-CTGGATTTAC---GTA------A-CAGACAAGTT-ATTCC--AACAA-TTTTAACATT-AATGCATGCA-TC-TGTCACAATGA-AA-TCAAC-AC-TT---ACA--CG-CTGTTAAT----CCATTTTC-ACA-TG---TT-C-T-T-T---CC--GGTTT-G-AAT--TGTTTGTTAATC-TCTANGGGCGGTA-NG---AAAAAAT---A--------A-A-A-ATCCGAAGTCGG-A---ATATTTG-G-AA--AAA---------T-TAG-TAA-A-CA-C-----GT--ATA-TTT---G-CT-TCTCATAAAG-CTTTTTGACA-TTTCA---------T-TTTT-ATT-CAAA--CATGTTTTCC------TATTGA-TAT-C-AAC---AAGAA--T--AA-T--------C-----TT-T------T----AA----T----A-ACT--A----A---A-A-------A------GC-TTTT-T---G--AG---A--ACC-AA-AA--------------T-G-CGTG-T---T-TAT--TA-A--TT--TTT-CCA---AATTG------------------TCC-GACT-T-CGAAT---T-TTCGA---A-----T-T--TT--T-C--TACCGCCAATCG----G-GAC--TA-ACACAC------TA-TTCA--AACCCG----GGACA-GGGA-ACGT-GT--GA--AAATGGATTAACAG-CG----AGTAAGT----GT-TG---ATTT-CCT--CGTGACA---GATGCA--T-GC--ATTA--A-TG--TTA------A--AG---T-T-G-TGGAAA-TA------AC-TTGTC--TGT-TACGT-AAA-------------TC------CAGGCA--------T---AT-TTGAGTTGAAACG-TCGATCGAA
gi|1 : TCAACTCAACTATGC-CTGGGTTTAA---GTA------A-CAG-----TT-TTTCT--AACAA-TTTTAATATT-AATGCATGCA-TC-TGTCACAATGA-AA-TCAAA-TT-TT---GCA--TG-CTGTTAAT----CCATTTTC-ACA-TGC--TT-C-T-TAT---CCCGGGTGT-G-AAT--TGTCTGTTAATC-TCTAGAGGCGGTA-T----AAAAAAT---A--------A-ACA-GTCTGAAGTCGG-A---ATATTTG-A-AA--CAA---------T-TAGAAAA-A-CA-C-----GT--ATT-TTT---G-CT-TCTCATAGAA-CGTTTTGGCA-TTTAA---------T-TTTG-ATT-CAAA--CATGTTTTCC------TAATAG-TAT-C-AAC---AACAA--A--AACC--------C-----TT-T------T----AA----TTG--A-ATC--A----T---G-A-------A------GC-TTTT-T---G--AG---A--ACC-AA-AA--------------T-G-CATG-T---T-TA---TA-C--TT--TTTCCCA---AATTG------------------TCC-GACT-T-CGAAG---T-TTTGAT--A-----T-T--TT--T-C--TACCTCTTATTA----G-GAC--AA-ACACAC------TA-TTCA--AACCCA----GAACA-GGGA-AAGT-AT---A--AAATGAATTAAAAG-CG----AGTAAGT----AT-CA---ATTT-TCT--CATGGTA---AATGCA--T-GC--ATCA--A-TG--TTG------A--AA---T-T-A-TGGAAA-TG------GC-ATAAC--TGT-TACAT-
gi|10 : atgtgtaactatgtaactgttaaactgacttattagggaccaagAAATTCCA--------A-A-A-CTACGAAGTCGG-ATAAAT-TTTG-G-AA--AAC---------T-T-T-TAA-C-CA-A-----G---A-A-CTT---G-CT-TG-CAGAAGG-CTGTCTGTCA-TTTCA---------A-GTT--ATT--AAA---ATGTTT--C------TATGGA-T-T-T-AAC---ACGAA------A-T--------C-----TT-T------------A----T----A-ACTTAA----ACGTA-A-------A------GC-TTTT-----------------------------------------G-CATG-TAA-TGTAT-----G--TT--TTT-TCA---AAT-A------------------TCC-GA-T-T-CACATACAT-T-------A-----T-T--TT--T-AAATACCACCA-TCT----G-AAA--TGCAC-CAC------GAATTCA--A---CG----G-ATA-GG-A-ACAC-GT--GA--AA-TAGATAGGCAGTCG----AGTATGT----GT-TG---AT-----------GAT------TGCA--T-GCA-ATTT--A-TGGTTTA------T--AG---TAT-A-TAG-AA-TA------GCATTGCC--TGT-TAAAT-AAT-------------AC------CA-GCA--------T---ATATTGAGTCGAAACA-TCAGTCGAAaaagtcgatcgaagt
gi|11 : TCAACTCAAATATGC-CTGGATTTAC---ACA------A-CAGATAAGTC-ATTCC--AACAA-TTTTAACATT-ATTGCATGCA-TC-TGTCACAATGA-GA-TCAAC-AC-TT---ACA--TG-CTTTTAAT----CCATTTTC-ACA-TG---TT-T-C-T-TGTACCG-GGTTT-G-AAT--TGTTTGGTAATC-TCTAAGGGCGGTATAG---AAAATAA---A--------A-A-A-ATTCGAAGTCGG-A---ATATTTG-GAAA--AAA---------T-TAG-TAA-A-TA-T-----GT--ATA-TTT---G-CT-TCTCATAAAA-CTTTTTGGCA-TTTCA---------T-TTTG-ATT-CAAA--CATGTTTTCC------TAATTA-TAT-C-----------------------------C-----TT-A------T----AA----TTG--A-AAA--A----A---G-A-------A------GC-TTTT-T---G--GA---A--GCC-AA-AT--------------T-G-CATG-T---T-TAT--AT-G--TT--TTT-CCA---AATTG------------------TCC-gtg
gi|12 : TCAACTCAAATATGC-CTAGATTTAC---ATA------A-TAGACAAGTT-ATTCC--AACAA-TCTTAACATT-A-TGCATACA-TC-TGTCACAATGA-AA-TCAAC-AC-TT---ACA--TG-CTGTTAAT----CCATTTTT-ACA-AG---TT-T-C-T-TGTCCC--GGTTT-G-AAT--TGTTTGTTAATCTTCTAAGGGCAGT----------------------------A-A-ATCCGAAGTC-G-A---ATATTTGAA-AA--AAA---------T-TAA-TAA-A-CA-C-----GT--ATA-TTT---G-CT-TCTCATAAA--CTTTTTGACA-TTTCA---------T-TTTT-ATT-CAAA--CATGTTT--C------TATCAA-TAT-C-AAC---AAAAAACT--AT-C--------C-----TT-T------T----AA----TTTGAA-AC---A----A---A-A-------A------GC-GTTC-T---G--AG---A--ACC-AA-AA--------------T-G-CGTG-T---A-TAT--CA-T--TT--TCT-CCA---AATTG------------------TTC-aaag
gi|13 : acttt-TTTCT---------T-TCTT-ATT-CAAA--CCTGTTTT--------TATTAA-TAT-C-AAC---AAGAA--T--AA-T--------C-----TT-T------C----AA-----------ACT--ATGGCA---ACA-------A------GT-TTTT-TT--G--AG---A--ATC-AA-AA--------------T-A-CGTG-T---T-TAC--TA-A---T--TCT-ATA---AGTTG------------------TCC-GACT-T-CGAAT---T-TTCGA---T-----TCT--TT--C-C--TACAGCCGATAG----A-AAT--AA-ACACAT------AA-TTCA--AAACCG----GGAGG-GGAG-ACAT-AT--GA--AAATGGGTTGGTAA-TG----AGTGATT----AT-TG---GTTT-CTT--AATGACA---GATGTA--T-TT--ATTA--A-TT--TTT------A--AG---T-T-G-T-GAAA-TC------AC-TTGTC--TGT-TACGC-AAA-------------TC------CAGGCA--------T---AT-TTGAGTGGAAACA-TCCGTCGA
gi|14 : -AA--AAA---------T-T-G-TAA-A-CA-T-----GC--AT--TCT---A-TT-CCCCAGAATT-CTCTTTTACA-TTT-G---------T-TTTT-GTC-CAAA--CAT--------------------T-T-C-AAC---AG-----------------------------C------T----AA---------A-AC--------A---A-A-------A------GC-TTTT-C---TCCAGCTCA--GCT-GA-AA--------------T-A-CGTG-T---T-TAT--TA-T--TT--ATC-TTA---AATCA------------------TCC-GACT-TAC--AT---G-TTCGT---T-----T-TC-TT--T-C--TACCACCAATAG----A-GATCATA-ACGAA--------A-GTCA--AACCCG----GGACA-GGAA-ACAT-GT--AA--AAATGAATTAGCAG-CG----GGTAAGT----GC-TA---ATTT-TCT--TAAGACA---GCTGCA--T-TC--ATTG--A-TG--TTA------A--AG---A-T-G-
gi|15 : ttgaaaAGTCGGTA---ATTTTGG-G-AA--AAA---------T-TAG-TAA-A-C--C-----GT--A-A-TTTTTGG-CT-TCTCATGAAA--TTTTTGACAATTTTA---------A-TTT--ATT-CAAATACATGTTGTTC------TATTAA-TAT-C-AACAAAAAGAA--T--AA-T--------C------C-T------T----AA----TTGA-A-ATA--A----A---A-A-------A------GC-TTCT-T------AG---A--A-A-AA-AA--------------TAG-C-TA-T---T---T--TATA--TT--TTT-TTAGACAATTGAATNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNN-N-NNAAT---T-TTTGAT--A-----T-T--TT--T-C--TCCCGCCAATTG----G-GAC--TT-GCACACTACATGTA-TTCA--AACCCG----GAACA-GGG
gi|16 : a--AAA---------T--AGCTAT-A-CA-C-----AC--ACACTTT---G-CC-CCTCGGAAAG-CTTTTT-------TCAAAAAAAAAAT------ATT-CAAA--AATGTTTTCC------TTTCGA-TGTAC-AAA---GAGAG--T--AA-T--------C-----TT-T------TTTTCAA----T----G-A----A----A---A-A-------A------GTATTTT-TAGAG--AA---A--AAC-AA-AACACAAACACACCCTT-G-CATG-T---T-AAT--TA-A--TT--TTT-CAA---AGTTA------------------TCA-AAAT-T-C-AAT---TAATCAT---A-----T-T--CTTAT-A--TACCGCTAA---------------A-ATG-AA------TG-TTCA--AACTCGCATAAGAGG-GGGT-ACGT-Ga
gi|17 : g--AG---A--ACC-AA-AA--------------T-G-CATG-T---T-TAT--AA-A--AAAATTT-CCA---AATTG------------------TCC-GACT-T-CGAAC---T-TTTGAT--A-----T-T--TT--T-C--TACCGCCAATTG----G-GAC--TA-ACACAC------TA-TTCA--AACCCG----GAACA-AGGA-ATGT-GT--GA--AAATGGATTAAAAG-CG----AGTAAGT----GT-GG---ATTT-TTT--T-T---------TTCA--TGGC--ATTA--G-TG--TTA------A--AA---T-T-A-TGGAAA-TG------GC-ATAAT--TAT-TACGT-AAA-------------TC------CAGGCA--------T---TT-TTGAATTGAAAAG-TCGATCGAA
gi|18 : tA-ACACAT------AA-TTTT--AACCCG----GGACA-GAGA-ACAT-GA--TA--AAATGGATTAAC----G----ACTAGGT----GT-CG---ATCA-CCT--TATGTCA---GATACACAT-GC--AATA--A-TG--TTA------A--AG---T-T-G-CGGAAA-TA------AC-TTTTC--TGT-TATAT-AAA-------------TC------CAGACATACATATGT---AT-TTGAGTCAAGCCG-TTGATCGAg
gi|19 : caaaggaaatc--------C-----TT-T------T----AA----TTGA-A-AC---A----A---G-A-------A------GC-TTTTAT---G--AG---A--TCC-AA-AA--------------T-G-CATA-T---C-TATATTT-T--TT--TTT-CCA---AATTG------------------TCC-GACT-T-C----------------------------TT--T-A--TACCGCCAATTC----G-GAC--TA-ACACAC------TA-TTCA--AACCAG----GGA-A-AGGA-GTGC-GT--GA--ACATGGATTAACAG-CG----AGTAAGT----GT-GG---ATTT-TCT--CATGGCA---tgt
gi|2 : cTCAATTAAAATATGC-CTGGGTTTAC---GTA------A-CGGACAAATT-ATTTC--CACAA-CTATAACATT-AATGCGTGCA-TG-TGTCACAAAGA-AA-TCAAC-AC-TT---ACT--CG-CTGTTAAT----CCATTTTC-ACA-----------------------GGATT-G-AAT--TATGTGATAATC-TCTATTAATGATC-GG---AAAATATT--A--------A-A-A-ACCCAAAGTCGG-A---AAATT-G-G-AA--AAA---------T-TAG-TAA-A-CA-C-----AC--AT--TTC---G-CT-TCTAGGAAAG-CTTTCTAACA-TCTTA---------A-ATCT-ATT-GAAA--CGTGTTTTCC------TATTGA-TAT-C-TGC---AAGAA--T--AA-T--------A-----TTAC------T----AA----T----A-ACT--C----A---A-A-------ATT----GC-TCTT-T---G--AG---A--ACC-AA-GA--------------T-A-CGTA-T---C-TAT--TA-A--TT--TGT-CAA---AATTA------------------TCC-GATT-T-TGAAT---G-ATCGA---A-----T-T--TT--T-TA-TACCGCCAATCG----G-GAT--TA-ACACGC------AT-TTCA--AACCCG----TAAAA-AGGA-ACAT-GT--GA--AAATGGATTAACAG-CA----TGTAAGT----GT-TG---ATTT-CTT--TGTGACA---GATGCG--T-GC--ATTA--A-TG--TTA------A--AA---T-T-G-TGGAAA-TA------AG-TTGTC--TGT-TGCTT-AAA-------------CT------CAGGCA--------T---AT-TTAAGTTGAAACG-TCGATCGAA
gi|20 : G----G-GAC--TA-ACACAC------TA-TTCA--AACCCG----GATCA-GGGA-ACAT-GT--GA--AAATGGATTAAAAG-CA----AGTAAGT----GT-TG---ATTT-TCT--CGTGGTA---GATGCA--T-GT--ATTA--A-TG--TTA------A--AA---T-T-A-TGGAGA-TT------GC-ATGAC--TGT-TACGT-AAA-------------TC------TAGGCA--------T---AT-TTGAGTTGAAAAG-TCGATCGA
gi|21 : t---A-----T-T--TT--T-C--TACCGCGTATCA----T-GAC--TA-ACACAC------TA-TTTATAAATCCG----AGATA-AGAA-ACA-------------------AACAG-CG----TGTAAGT----GT-TG---ATTT-CCT--TGTGATA---GATGCT--T-AC--ATTA--A-TG--TTA------C--AG---T-T-G-T---------------------C--TGT-TACGT-AAA-------------TC------CAGCCA--------T---AT-TTGAGTTGAAggtgt
gi|22 : atTCGG-A---ATATTTG-G-AA--AAA---------T-TAA-TAA-A-CA-TTACAAGT--ATA-TTT---G-CT-TCTCTTAAAA-CTTTTTGACA-TTTGA---------T-TTTTAATT-CAAA--TATG-TTTCC------TATTAA-TAT-C-AAC----------T--AA-------------------T------T----GA---------A-AC---A----A---A-A-------A------GC-TTTC-T---G--AG---A--ACC-GA-CAT-------------T-A-CAT----------T--TA-A--TT--TTgtca
gi|23 : CAT-GT--TA--AAGTGGGT-AATAA-CG----AGTAAGT----AT-TG---ATTT-CCTGACTTG-CA---GATGCA--T-TC--ACAA--A-TT--TTA------A--AG---T-G-G-TGGAAA-TA------AC-TT-------T-TATGG-AAT-------------TC------CAGA-A--------T---AT-TTGATTCAAAATA-TCAGTCa
gi|24 : aaagacaaactcataattcg--TA-GCACAC------TA-TTCA--AACCCG----GAACA-CGGA-ACAT-GT--GA--ACATTGATTAAAAG-CG----AGTAAGA----GT-TG---ATTT-CCT--CATGGCA---GATGCA--T-CC--ATC---A-TG--TTG------A--AA---T-T-A-TGGAAA-TG------GC-ATGAC--TGA-TACGT-AAA-------------TC------Cagagtgt
gi|25 : aaaaagTCAACGCAAATAGGAACTGGATTTACC--GTA------ATCAGACAAGTT--TTTC--AACAA-TTTTAACATT-AATGCCTGCA-TC-TGTTACAATGA-AA-TCAAC-AC-TTAA-ACA--TGCCTGTTCAT----CCATTTTC-ACATTG---TT-gacttttaat
gi|26 : gattgactttGT-GT--GA--AAATGGATTAACAG-CACATAAGTGAAT----GT-TG---ATTT-CCT--TGTGACA---AGTGCA--TTACT-ATAA--AGTA--CTA------AGTAG---C-T-G-CGGAAAATA------AC-TCGT----GT-TGCGA-AAA-------------TC------CAGGCA--------T---AT-TTGAGTTGAAATG-TTGATCGAAtct
gi|27 : A-GAGA-ACAT-GT--GA--AAATGGATTAACAT-CGA---AAAAAAT----GT-TA---ATTT-ATT--TATGACA---TAAGCA--T-GC--AGCA--A-TA--TCA------A--A----T-T-G-TCGAAA-TA------AC-ACGTC--TAT-TGCCT-ACA-------------TCTAGGTACAGGTA--------T---AT-TTGAGTCGAAACG-TCG
gi|28 : --AAATGGGCCAACAG-CA----AGTAAGT----GT-TG---AATT-CCT--TGTGATA---GATGCA--T-GC--GTTA--A-TG--TTA------A--AG---T-T-G-GGGAAG-TA------AT-TTGTC--TGT-TATGT-AAG-------------CC------CAGGCA--------T----C-GTCAATTGAAAt
gi|29 : a-C-----GT--GTG-TTT---AACTGTCTCGGCAAG-CTTCTTGGCA-TT-----------------------------CACGTTT-CC------TATTGAATAT-C-AAC---AAGAA--T--GA-T--------C-----TT-T------T----------T----A-GCT--A----A---A-A-------AAAAAATGC-TTTT-TC--G--AG---ATTGCCTAATAA--------------C-GCCATGAT---T-TAT--T--A--TT--TTagggtacatagtctggttcc
gi|3 : TCAACTCAAATATGC-CTGGATTTAC---GTACATGTAA-CAGACAAGT--ATGCC--AACAA-GTTTAACAT--AATGTATGCA-TC-TGACACA-TGA-AAATCAAC-ACCTT---ACA--TG-CTGTTAAT----CCTTTTTC-ACA-------------------------------------GTTTG---ATC-TCTATGGGCGTTT-AT---AAAAAA-------------A-A-A-A--CGAAGTCGG-A---ATATTTG---AA--AAA---------T-TA--TAA-A-CA-C-----ATT-ATA-TTTT--G-CT-TCTCATAACA-CTTTT-GACA-TTTCA---------T-TTTG-ATT-CAAA--CATGTTTTCC------TAT-AA-GAT-CGAAC---AAAAA--TTAAA-T--------AA----TT-T------T----AA----T--------T--G----A---A-A-------A------A-------------------A--ACC-CA-A------------------------------------------C--TTT-CCA---AATTG------------------TCT-GACT-T-CGAAT---T-TT-GAT--A-----T-T--TT--C-T--TACAGCCGAACG----GAGAC--TA-ACACAC------TA-TTCA--AGCCCG----GAACA-ATGA-ACGT-GTTGGATTAAATG-ATTAAAAG-CG----AGTAAGTCAGTGT-TG---ATTT-TCT--C-TGACA---GGTGCG--T-GC--ATTA--A-TG--TTA------A--AA---T-T-A-TTAAAA-TG------TT-ATGAC--TGT-TACGTAAAA-------------TC------CAGGCA--------T----T-TTGAGTAGAAAAG-TCag
gi|30 : tattgacttttTAAAAG-CG----AGTAAAT----GT-TG---ATTT-CCT--TGTTATA---GATACA--T-GTAAATTG--A-TG--T--------A--AA---T-T-G-TGGAAA-GA------CT-TTGTC--TGT-TATGT-AAA-------------TC------CA-------------------TCCAGTGAAAACG-TCCGTCGA
gi|31 : aag-T-CGAAC---A-TTCGA---AGTCAGT-TAATT--T-G--GACCGCCAATAG----A-GAT--TA-ACACAcgcg
gi|31 : T-CCA---AATTA------------------ACT-GACT-T-CGAAT---G-TTCGAT--A-----T-T--TT--TTC--TACTGCCAATCG----G-GAG--TA-ACACTC------TA-TTCA--AACCCG----GGACA-GGGA-ACGT-GT--GA--Atattttttctactgccaatcgggagtaacactctattcaaacccgggacagggaacgtgtgaa
gi|32 : tgtgttaatctctattggcggTCAACTCAAATATGC-CTGGATTTAC---ATA------A-CAGACAAGTT-ATTCC--AACAA-TTTTAACATA-AATGTATGCA-TC-TGTCACAATGA-AA-TCAAT-AC-TT---ACA--
gi|33 : ctcaatcgactttACA-GAGA-GCAT-GT--GG--AAATGCATTAACGA-CG----AATAAGT----GT-TC---ACTT--CT--TGTGACA---AATGAA--T-GA--CTTA--ATTG--TT-------A--AG---T-C-G-TGGAAA-TA------AC-TTGt
gi|34 : TCAAATG-AC-TTAAATTTATCCTGCA------A-GAGACAAGT--ATTTC--AACAA-TTTAAGCATT-AATGCATACA-TT---TCACAATG--AA-TCAAC-AC-TT---ACatgtctacagtacgca
gi|35 : ctatgactttttccaCA--T-GC--ATTG--A-TG--TTATTATTTA--AA---T-T-G-TTGAAA-TA------AC-TTGTC--TGT-AATGT-AAATCTGTGCAGCCATTC------CAGGCA--------T---AT-TTGAGTTGAAAAT-TCGATC
gi|36 : tgtTTAATC-TCTATGGGAGGTA-TA---AACAAAT---A--------AGA-A-ATCCAAAGTCGG-A---ATATTTG-G-AA--AAA---------A-TAG-TGATATCA-T-----ATAAATA-TTT---G-CT-TCTCATAAAA-CGTTtgt
gi|38 : ATGCA--T-GC--ATTG--G-TG--ATG------A---G---T-T-GGTGGAAA-TACGAGTAAA-TTGTC--TATCTA-GT-AAA-------------TC------CAGCCA--------T---AT-TTCAGTTGAAACG-TCGATCGAA
gi|39 : cgcTT-CCA--TATGACA---GATACA--T-AC--ATTATAA-TG--TTA------A--AA---T-T-A-TGGAAA-TA------GC-TAGTC--TGT-TAAGT-AAA-------------TC------CAGGCA--------T------------------G-TCGATCGAA
gi|4 : C---GTA------A-CAGACAAGTT-ATTTC--CACAA-TTTTAACATTGAATGCATGCG-TC-TGTCATAAGAA-AA-TCAAC-AC-TT---ACC--CG-CTGCTAAT----CCATTTTA-AC---G---TT-CAT-TGT---CC--TG----G-GAT--TG------AATT-TTTAT---CAGTA-GG---AAATAAT---A--------AGA-A-ATTCGAAGTCGG-A---AAATTTG-G-AA--AAA---------T-TAG-TAA-A-CA-C-----GC--AT---TT---G-CA-TCTCCGAAAG-CTTTTTAACA-TTTCA---------T-TTTT-ATT-CAAA--CATGTTTTCC------TATTGA-TAT-C-AAT---AAGAA--T--A------------------T-T------T----AA----TGTAAA-AC---A----A---A-A-------A------GC-TTTT-G---G--GG---A--ACC-AA-AA--------------T-G-CACG-T---T-TAT--TA-A--TT--TTA-CTA---GATTA------------------TTA-GACT-T-CGAAT---G-ATCG--------------------------CCGT--ATCA----G-GAT--TA-ACACGC------AA-TTCT--A----G----GGACA---------T-GT--GA--AAATGGAATAACAG-CG----AGTAAGT----GCATGTATATTT-CCT--TGTGGTA---GGGGCA--T-GC--ATTA--A-TG--TTA------A--CG---T-T-T-TGGGAA-TT------AC-TTG----CAT-T-------G-------------TC------CATG----------T---AT-TTGAGTTGAAACG-TCTATg
gi|40 : a-GGGA-ACGT-GT--GA--AAATGGATTAAAAG-CG----AGAAAGT----GT-AG---ATTT-TCT--CATGGCA---GGTACA--T-GC--ATTA--A-TG--TTA------A--AA---T-T-A-TGAAAaatgtgttgaaatcgtcggtcgaagt
gi|41 : TGACA---GATGCA--T-TT--ATCA--A-TG--TTA------A--CG---A-T-G-CGGAAG-TA------AC-TTGTC--TGT-TATGT-AAA-------------TC------AAGCCA--------T---AT-TTGTGTCGAAA
gi|42 : -CCT--TATGACA---GAT--------C--ATTA--A--G--TTA------G--AG---T-T-G-TTGAAA-CA------AC-TTGTCT-TGT-TATGT-AAA-------------TT------CAGACA--------TTTAAT-AAGAGTTGtaaaa
gi|43 : --AG---T-T-G-TGGAAA-TA------AC-TTATC--TGT-TACGT-AAA-------------TC------CAGATA--------C---AT-
gi|44 : atgttcaataactgtaacttaagtgtggattATGTATGCG-CC-CGTCATAATGA-AA-TATAC-AC-TT---CCT--TC-CTAT--AT----TTTTTTTT-ATA-TA---AT-C-C-T------G--GGTTT-G-AAT--aca
gi|45 : -CTGTTAAT----CCATTTTT-ACA-TG---TT-T-C-T-TGTCCC--GGTTTTG-AATATTGTTTGTTAATC-TCTAAGGGCGGTA-gtg
gi|46 : taT--T-C--TACCGCCAGTCG----G-GGC--TA-ACACAC------TA-TTTA--AACC------AGACG-AGGA-ACATCAT--GG--AAATG--------G-CA----AGTCAGT----GT-Tta
gi|47 : GTAACA---GATGCA--T-GT--GTTA--A-TG--TTA------A--AA---A-T-T-TTGAAA-TA------AC-TTGTC--T----------------------------------------------------T-TTGAGTTGAAACG-TCGATTGAA
gi|48 : acA--A-TG--TTA------A--AAATTT-T-C-T----A-TA------AC-TTGTT--TGT-TACGT-AAA-------------TT------CGGGCA--------T---AT-TTGAGTTGAAAAG-TCGATCGa
gi|49 : ---T-T-A-TGGAAA-GA------GC-ATACC--TAT-TAAGT-AAA-------------TC------AAGGCA--------T---AT-TTGAGCTGTAACG-TCGATTGAA
gi|5 : aCACAGTGA-AA-TCAAC-AC-TT---ACA--TG-CTGTTAAT----CCATTTTC-ACA-TG---TTTC-T-TGT---CCCGGGTTT-G-ATT--TGTTTGTCATTC-TCTAAGGGCGGTA-TA---AAAAAAT---A--------A-A-ATATCCGAAGTCAG-A---ATATTTG-G-AA--AAA---------T-TAG-TAA-A-CA-T-----GT--ATA-CTT---G-CT-TCTTATAAAA-CTTTTCGACA-TTTCA---------T-TTTG-ATT-CAAA--CATGTTTTCCTATTATTATTAA-TAT-A-AAC---AAAAA--G--AA-TC-------C-----CT-T------T----AA----T----G-GTT--G----G---A-ACGCATGGA------GC-TTTC-T---T--AG---A--ACC-AA-AA--------------T-G-CAGA-G---T-TA---TA-ATTTT--TTT-CGA---AATTG------------------TCCGGACTCT-CGAAC---T-TTTGAAGTA-----T-T--TT--T-C--TACCTCCAATGGGT--G-GGC--TA-ACA-AC------TA-TTCA--AACGCG----AAGCATGGGA-ATGT-GT--GA--AAATGGATTAA-AG-CA----AGTAAGT----G--TG---GTTT-TCT--CATGACA---GGTGCA--T-GC--AATA--A--G--TTA------A--AA---T-TAA-TGG--A-TG------GC-ATA-C--TAT-TACGG-TAA-------------TC------C-GGCA--------T---AT-TTGAGTTGAAAAGATCGATCGatgt
gi|50 : -T-G-TTGGAA-TA------AC-TTGTC--TGT-TACGT-AAA-------------TC------CAGGCA--------T---AT-TTGAGATGAAAAG-TCTATCGAA
gi|51 : acTGCATGCA-TC-TGTCACAATGA-AA-TCAACTAC-TT---------G-CTTTTAAT----CCATTTTC-ACC-TG---TT-C-
gi|52 : TTTAC---GTA------A-CAGACAAGTT-ATTCC--AACAACTTTTAACATT-AATGGATGCA-TC-Tcgg
gi|53 : gatcgacGCA--T-GC--ATTA--C-TG--TTA------A--AC---T-T-A-TGGAAA-TT------GC-ATGAC--TGT-TACGT-AAA-------------TC------CAGGCA--------T---AT-
gi|54 : TTC-ACA-TG---TT-C-TGT-C---CC--GGATT-G--AT--TGTTTGTTAA-C-TCTATGGGCGGT---G---AAAAAA
gi|55 : C--AACAA-TTTTAGCATT-AATGCATACA-TT-TGTCACAATGA-AA-TCAAC-AC-TT---ACA--CG-Cat
gi|56 : tAA-TA------AC-TTGTCC-TGT-TAAGT-AAA-------------TC------CAGCCA--------T---AT-TTGAGTTGAAA-G-TCAATCGAA
gi|57 : tgA---AATTG------------------TCC-GACT-T-CGAAC---T-TTTGAT--A-----T-T--TT--C-C--TACCACCAATTG----G-GAC--T
gi|58 : ttacaAAA-TA------AT-TTGTC--TGT-T---T-AAA-------------TC------CGGGAA--------T---AT-TTGAGTCGAAACG-TCGACCGAA
gi|59 : -TGGAAA-TG------GC-AAGTCAGTGT-TAAGT-AAA-------------TG------AAGGCA--------T---AT-TTGAGTTGAAA
gi|6 : tcaCAAGTA-ATTCCTCAACA---TTAAACATA-GAGAGGTACACTC-TATTACAAAAACAA-TCAAC--C-TTGTGACGTTCG-TTGTTAATTAGCCCATTTTCAAAA-TGTCTTT-C-T-G-T---CCA-GGGTT-GCAAT--TGTGAGTTTATA-ACCACTGGCGGGA-AGCAAAAAAAGTCG-A--------A-A-A-ATTC-AAGTAGG-C---AAATT---G-TATTATA---------T-TAGACAA-A-CAGC-----GC--AAT-TTT---G-C--TCTCAGGAAGCCCTCTTGGCT-TTTCC---------TATTTT-CTT----A--CCT------C------TATCG------C-AACCA-AATAA--T--AA-T--------CATTTTTT-T------T----AAAAATT----ATACT--G----G---A-A-------A------GT-TTTT-T---C--AA---G--TTG-AA-AA--------------T-A-TGTG-T---T-TGA--TATA--TT--TTT--CA---AATTG----------------------G--T-C-CGAAC---T-TCCGG---A-----T-T--TT-------TACC-CCA---------------TA-G------------A-TTTA--AATCCG----GGACA-GGGATACGA-GT--G---AATTGGATTAACAG----------------------A---ATCT-TCTG-TATGGCA---GTCGCA--T-TT--ATTG--A-TG--TTG------ATCGT---T-T-G-TAGAAA-T
gi|60 : A------A-CAGACAAGTT-ATTCC--AACAA-TCTTAATATT-AATGCATGCA-TC-TTTCACAATctcag
gi|61 : TGGATTAAAAG-CA----AGTAAGT----GC-TG---ATTT-TCT--AGTGGTATTGGA---A--T-GC--AGTA--A-
gi|64 : -------------TT------CAGGCA--------T---AT-TTGAGTTTAAAAG-TCGATCAAA
gi|66 : acac------CAGGCA--------T---GT-TTCAATTGAAAAG-TCGATCGAA
gi|7 : ATGCATGCA-TC-TGTCACAATGA-AA-TCAAC-AC-TT---ACA--TG-CTGTTAAT----CCATTTTT-ACA-TA---TTTC-T-TGT---CCCGGGTTT-G-AAT--TGTTTGTTAATC-TCTAAGGGCGGTA-TA---TAAAAAT---G--------A-TTA-ATCCGAAGTCGG-A---ATATTTG-G-AA--AAA---------T-TAA-TAA-A-CA-C-----AT--ATA-TTT---G-CT-TCTCATAAAA-CTTTTTGACA-TTTCA---------gtgt
gi|7 : atc--AA-C--------T-----TT-T------T----GA----C----A-TTTC-A----A---A-A-------A------GC-TTTC-T---G--AG---A--ACC-AA-AA--------------T-G-AGTG-TACAT-CAT--T-----TT--TTT-CCA---AATTG------------------TCC-CACT-T-CGAAT---T-TTTTAT--A-----T-T--TT--T-C--TACCGCCAACTGCCAGG-GAC--TA-ACACAT------TA-TTCA--AACTCG----GAATA-GGGA-ACAT-GT--GA--AAATGGATTAAAAG-CA----AGTAAGT----GT-TG---ATTT-TCT--CGTGGTA---GGTGCA--T-GC--ATTA--A-TG--TT---------------T-T-A-TGGAAA-TG------GC-ATGAA--TGT-TACGT-AAA-------------TC------TAGGCA--------T---AC-TTGAGTTGAAAAG-TCGATCGAAaaaagctttctgagaaccaaaatgagtgtacatcatttttttccaaattgtcccacttcgaattttttatatttttctaccgccaactgccagggactaacacattattcaaactcggaatagggaacatgtgaaaatggattaaaagcaagtaagtgttgattttctcgtggtaggtgcatgcattaatgttttatggaaatggcatgaatgttacgtaaatctaggcatacttgagttgaaaagtcgatcgaagtgt
gi|8 : atcatgcatgcatctgtcacaatgaaatcaacacttacatgctgttaatccatttttacatatttcttgtcccgggtttgaattgtttgttaatctctaagggcggtatataaaaatgattaatccgaagtcggaatatttggaaaaattaataaacacatatatttgcttctcataaTCAACTCAAA-ATTG-CTAGATTTAC---ATA------A-TAGACAAGTTTATTCC--AA-AA-TCTTAACAT---ATGCATACA-TCATGTCACAATGA-AA-TCAAC-AC-TT---ACA--T--CTGTTAAT----CCATTTTT-ACAAGG---TT-C-T-TGT---CCCGGGTTT-G-AAT--TGTTTGTTAATC-TCTAAGGGCAGT----------AAAT---------------------CGAAGT-GG-A---ATATTTG-A-AA--AAAAAT------T-TAA--AA-A-CA-C-----GT--ATA-TTT---G-CT-TCTCATAAA--CTTTTTGACA-TTTCA---------T-TTTT-ATTCCAAA--CATG-TTTCC------TATCAA-TAT-C-AAC---AAAAAC-T--AT-C--------C-----TT-T------T----AA----TTGA-A-AC---A----A---A-A-------A------GC-GTTC-T---G--AG---A--ACC-AA-AA--------------T-G-CGTG-T---A-TAT--CA-T--TT--TCT-CC----AATTG------------------TCC-GACT-T-CGAAT---T-TTgtgt
gi|9 : aaatatatGGCAGTA-AA---AAGAAAT---GGAAAGTGGA-A-A-ATCCAGATTCGG-G---A-ATTTG-G-AA--AAAAAAATATATTATAG-TAA-A-CA-C-----AC--A-A-TTT---G-TT-TCGCG--GAG-CTTTTTGAAA-TGTCA---------C-CTTT-----------------TTTC------TGTTGA-TAT-C-AAC---AAAAA--C--AA-TAAATTCAAC-----TT-TGGTTTGT----AA----A----AGAAG--A----A---A-A-------A------GC-TTT------G--AG---A--ACC-AA-AA--------------T-G-CGTC-T---T-TTC--TA-T--TT--TGT-CCA---AAAT---------------------------------AC---T-TTTGA---A-----TAT--TT--T-T--TATCGTTAATTG----A-GAT--AA-ACACAC------AA-TTCA--AAC---------ACG-GGGT-ACGT-GT--GA--AAATGGATTTACAA-CG----CGTAAGT----GG-TG---CTTTACCTA-CATTACA---ATTGCA--T-TC--ATTA--A-TG--TAA------A--AG---T-T-G-TGAAAA-CA------aag
blockSeqs : A CCT CATGTA T TT TC C TG C A C A T C GTG TTC C TAGC A TGTTTCTTGTACCG T T C AT T A AAGCAA GGAAAGTGGAA T T TAA A A TT AAAATATAT A C T T G TACAA AA CAC TTG A G G GC A AAAAAAAAAT TA CC TA T TC TATTAT A A G AAA G CAATAAATTCAACTTTGGTTTGTAAAAGAAGA CGT C CGCATGG AAAAAT A TAGAG CTC TT T T CACAAACACACCCT A C A A CTATATTTT AA . GAC AATNNNNNNNNNNNNNNN G C A ACAT C AAGTCAG C AA TA AAA TGCCAG A CA C TACATGT A TA CATA T T C TG TT C T CATA CAGT A TAT AC GACT TTG CA G AA TA G GT TTATTT GT AATT A A G A CGAGTA AT C AG C A A TCTGTGCAGCCAT TAGGTA TACATATG TTA . C A
blockSeqs : . C . . C . . T . . . . . . AA T . . . TGTTTCTTGTCCCG T . . . . A ATAG TCCAAA . . . . . . AAT . A . . . . T TA T . . T G . TA G C . T TT . . . . CA A TAATCATTTTTTTTAAAAATTATACTG . . . TT . CTCC . . . . T . . A . AATGTATG . . . . . . . TA C AAGTA A C . TA GGGT . . . G . . . . . . . . T . A . . . C GTA . . T A . T . . TC G . . . . . T T T . C . . . . . . A .
blockSeqs : . . . . T . . T . . . . . . . T . . . TGTCTTTCTGTCCA A . . . . T CGG CGAAA . . . . . . . . . . . . . . TA . . . T A . A T C . T TC . . . . . G ACTATCCTTTTAATTTGAAACA . . . . . TTG . . . . . . . G . TTATAATT . . . . . . . T T ATA . . . TC CT . . . A . . . . . . . . C . . . . . T ACA . . . T . . . . . G . . . . . A A C . C . . . . . . C .
blockSeqs : . . . . T . . T . . . . . . . C . . . TATTTCTTGTCCCG T . . . . T TAT TAAA . . . . . . . . . . . . . . TA . . . G T . T T C . T TC . . . . . G CTATCCTTTTAATTGAAACA . . . . . ATG . . . . . . . G . TTGATATA . . . . . . . G C ATA . . . C AG . . . T . . . . . . . . A . . . . . T AA . . . . . . . . . G . . . . . T T . . T . . . . . . C .
blockSeqs : . . . . T . . T . . . . . . . T . . . AGGTTCTTGTCCCG T . . . . T ATA AAGA . . . . . . . . . . . . . . TG . . . T A . T T C . T TC . . . . . G TAATCTTTCAAACTATGGC . . . . . TCG . . . . . . . G . ACATCATT . . . . . . . T T ATA . . . C AG . . . T . . . . . . . . C . . . . . C TA . . . . . . . . . A . . . . . T T . . C . . . . . . A .
blockSeqs : . . . . T . . A . . . . . . . T . . . AGTTTCTTGTCCC T . . . . T AGG AAGA . . . . . . . . . . . . . . TA . . . G G . T T C . T TC . . . . . G TAATCCTTAATTGAAATAA . . . . . TG . . . . . . . A . TTATATG . . . . . . . T C ATA . . . C TG . . . A . . . . . . . . C . . . . . T TA . . . . . . . . . G . . . . . A A . . C . . . . . . T .
blockSeqs : . . . . T . . T . . . . . . . C . . . TGTTTCTTGTCCC A . . . . A ATA GATT . . . . . . . . . . . . . . TA . . . G G . T G C . T TC . . . . . G TAATCTTTTTTTCAATGAA . . . . . TG . . . . . . . A . ATATCAT . . . . . . . G C ATA . . . A TG . . . T . . . . . . . . C . . . . . C CA . . . . . . . . . A . . . . . T A . . C . . . . . . T .
blockSeqs : . . . . T . . T . . . . . . . T . . . GTTCATTGTCC G . . . . A ATA AAA . . . . . . . . . . . . . . TA . . . T A . A T G . T TC . . . . . A TAATATTACTAATAACTC . . . . . TG . . . . . . . A . TTACTAA . . . . . . . T C ATA . . . C TC . . . A . . . . . . . . A . . . . . T TG . . . . . . . . . A . . . . . A T . . T . . . . . . C .
blockSeqs : . . . A . . T . . . . . . . T . . . TGTTCTGTCCC T . . . . T AAA AAA . . . . . . . . . . . . . . AT . . . G G . A G C . T TC . . . . . G GAATCCCTTTAATGGTTG . . . . . TG . . . . . . . G . TTATTAT . . . . . . . A C AT . . . A CG . . . T . . . . . . . . C . . . . . C CG . . . . . . . . . G . . . . . T T . . C . . . . . . A .
blockSeqs : . . . T . . A . . . . . . . C . . . TAATCCTG T . . . . C G AA . . . . . . . . . . . . . . TA . . . T A . T T C . T TT . . . . . A TTAAATAATTTTAATTG . . . . . GG . . . . . . . A . TAATTAA . . . . . . . G T TT . . . C CA . . . T . . . . . . . . T . . . . . C TG . . . . . . . . . G . . . . . A T . . C . . . . . . C .
blockSeqs : . . . . . T . . . . . . . T . . . . . . . . . A . A . . . . . . . . . . . . . . TA . . . T A . T T C . T T . . . . . T TATTTAATGTAAAACA . . . . . TT . . . . . . . A . TTATAAA . . . . . . . G T TA . . . T CG . . . T . . . . . . . . A . . . . . C CA . . . . . . . . . A . . . . . T A . . C . . . . . . A .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . G G . T T C . . C . . . . . A ATCTTTATAACTTAA . . . . . TC . . . . . . . A . CTATTAA . . . . . . . T C AA . . . G AG . . . T . . . . . . . . C . . . . . C TG . . . . . . . . . G . . . . . A T . . T . . . . . . C .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . T A . T . . . . . . . . . . A CTTATAATTGAAAAA . . . . . TG . . . . . . . A . TTATTAA . . . . . . . T T GA . . . C CG . . . T . . . . . . . . C . . . . . A TA . . . . . . . . . G . . . . . T T . . C . . . . . . C .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . G A . T . . . . . . . . . . . TGATCTTTTTAGCTA . . . . . TG . . . . . . . G . ATATCAT . . . . . . . T T AA . . . C CA . . . A . . . . . . . . C . . . . . C TG . . . . . . . . . A . . . . . T T . . T . . . . . . C .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . T G . C . . . . . . . . . . . TAATTGAAACA . . . . . T . . . . . . . G . TTTCTAT . . . . . . . T . A . . . C CG . . . T . . . . . . . . A . . . . . T TG . . . . . . . . . A . . . . . T T . . T . . . . . . A .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . T . . . T . . . . . . . . . . . . . . CTAAAAC . . . . . G . . . . . . . G . TTTATA . . . . . . . T . . . . . C TG . . . T . . . . . . . . A . . . . . C TG . . . . . . . . . G . . . . . T T . . A . . . . . . C .
blockSeqs : . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . TTATTA . . . . . . . T . . . . . T TG . . . T . . . . . . . . C . . . . . C TA . . . . . . . . . A . . . . . T T . . T . . . . . . A .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . TTAA . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . C . . . . . C TG . . . . . . . . . G . . . . . T T . . T . . . . . . A .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . T CA . . . . . . . . . A . . . . . T T . . C . . . . . . C .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . C . . . . . C TA . . . . . . . . . G . . . . . T T . . C . . . . . . A .
blockSeqs : . . . . . . . A . . . . . T CA . . . . . . . . . A . . . . . T C . . A . . . . . . A .
blockSeqs : . . . . . A . . . . . T AG . . . . . . . . . G . . . . . T T . . C . . . . . . A .
blockSeqs : . . . . C . . . . . T CG . . . . . . . . . G . . . . . T A . . C . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T T . . . . . . . . . G . . . . . A T . . C . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . C . . . . . . . . . A . . . . . A T . . A . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . A . . . . . T T . . A . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . C . . . . . A A . . C . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . T . . . . . T . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . G . . . . . T . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . A . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . .
blockSeqCons : ANA**** TTATTAN********* ATA*******
originalCons : TCAACTCAAATATGC-CTGGATTTAC---GTA------A-CAGACAAGTT-ATTCC--AACAA-TTTTAACATT-AATGCATGCA-TC-TGTCACAATGA-AA-TCAAC-AC-TT---ACA--CG-CTGTTAAT----CCATTTTC-ACA-TG---TT-C-T-T-T---CC--GGTTT-G-AAT--TGTTTGTTAATC-TCTANGGGCGGTA-NG---AAAAAAT---A--------A-A-A-ATCCGAAGTCGG-A---ATATTTG-G-AA--AAA---------T-TAG-TAA-A-CA-C-----GT--ATA-TTT---G-CT-TCTCATAAAG-CTTTTTGACA-TTTCA---------T-TTTT-ATT-CAAA--CATGTTTTCC------TATTGA-TAT-C-AAC---AAGAA--T--AA-T--------C-----TT-T------T----AA----T----A-ACT--A----A---A-A-------A------GC-TTTT-T---G--AG---A--ACC-AA-AA--------------T-G-CGTG-T---T-TAT--TA-A--TT--TTT-CCA---AATTG------------------TCC-GACT-T-CGAAT---T-TTCGA---A-----T-T--TT--T-C--TACCGCCAATCG----G-GAC--TA-ACACAC------TA-TTCA--AACCCG----GGACA-GGGA-ACGT-GT--GA--AAATGGATTAACAG-CG----AGTAAGT----GT-TG---ATTT-CCT--CGTGACA---GATGCA--T-GC--ATTA--A-TG--TTA------A--AG---T-T-G-TGGAAA-TA------AC-TTGTC--TGT-TACGT-AAA-------------TC------CAGGCA--------T---AT-TTGAGTTGAAACG-TCGATCGAA
finalCons : TCAACTCAAATATGC-CTGGATTTAC---GTA------A-CAGACAAGTT-ATTCC--AACAA-TTTTAACATT-AATGCATGCA-TC-TGTCACAATGA-AA-TCAAC-AC-TT---ACA--CG-CTGTTAAT----CCATTTTC-ACA-TG---TT-C-T-T-T---CC--GGTTT-G-AAT--TGTTTGTTAATC-TCTANGGGCGGTANA----AAAAAAT---A--------A-A-A-ATCCGAAGTCGG-A---ATATTTG-G-AA--AAA---------T-TAG-TAA-A-CA-C-----GT--ATA-TTT---G-CT-TCTCATAAAG-CTTTTTGACA-TTTCA---------T-TTTT-ATT-CAAA--CATGTTTTCC------TATTGA-TAT-C-AAC---AAGAA--T--AA-T--------C-----TT-T------T----AA----T----A-ACT--A----A---A-A-------A------GC-TTTT-T---G--AG---A--ACC-AA-AA--------------T-G-CGTG-TTTATTAN---------TT--TTT-CCA---AATTG------------------TCC-GACT-T-CGAAT---T-TTCGATA-------T-T--TT--T-C--TACCGCCAATCG----G-GAC--TA-ACACAC------TA-TTCA--AACCCG----GGACA-GGGA-ACGT-GT--GA--AAATGGATTAACAG-CG----AGTAAGT----GT-TG---ATTT-CCT--CGTGACA---GATGCA--T-GC--ATTA--A-TG--TTA------A--AG---T-T-G-TGGAAA-TA------AC-TTGTC--TGT-TACGT-AAA-------------TC------CAGGCA--------T---AT-TTGAGTTGAAACG-TCGATCGAA
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|37 ): TTTTTCACACTTTCATGCGGTTTTTTTTTTTATTCTAGTTGACATTTCCACAATTTGATCAAAGTGGTTCAATCAAGGGATATGTGGGGAGA
Unaligned ( gi|62 ): GAAAAGTTATTGTTAGCCATTTTTCTTTTTATTACATGTATA
Unaligned ( gi|63 ): ATTGTCTGTTACACAAGATTCGAAATGTTGGTTGAAGTG
Unaligned ( gi|65 ): TAAAACTATTCGTTGAAAACACCTTTTTTAAAATAC
Alignments
lowQualScore : 111 55555555555555555555555 2222222222222222222 111111111 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 11111111 11111111111111 111111111111111111
lowQualScore : 4 000 999999 3 44 33 2 44 2 2 2 2 2 2 777 555 2 6666 2 00000000000000000000000 2 3 3 44 0 3 1 999999 9999999999999999999 3 2 444 2 2 33 333333333 2 4 2 4 2 55555 55 666 666 2 2 3 66 2 99999999999 77 22 33 1 33 666666 00 2 2 2 777 3 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 333 2 6666666 888888 2 00000000 333 22 2 2 11111111111111 2 2 1 2 2222 777 1 2 44444 2 444444444444444444 2 2 2 1 44 3 22 8888888 2 2 7777 2 22 1 6666666 1 22 4444 0 1 1 1 22 22 2 1 4444 3333 1 222 11 8888 222 11 2 44 11 2 11 333333 33 2222 1 1 1 1 333333 11 2 44 1 1 1 6666666666666 333333 44444444 222 1 4 1
lowQualScore : . ... ...... . .. .. . .. . . . . . . ... ... . .... . ....................... . . . .. . . . ...... ................... . . ... . . .. ......... . . . . . ..... .. ... ... . . . .. . ........... .. .. .. . .. ...... .. . . . ... . ............................................................ ... . ....... ...... . ........ ... .. . . .............. . . . . .... ... . . ..... . .................. . . . . .. . .. ....... . . .... . .. . ....... . .. .... . . . . .. .. . . .... .... . ... .. .... ... .. . .. .. . .. ...... .. .... . . . . ...... .. . .. . . . ............. ...... ........ ... . . .
lowQualScore : 4 000 666666 3 88 99 9 66 4 4 5 5 5 5 888 777 7 1111 7 66666666666666666666666 5 1 1 22 5 1 0 999999 3333333333333333333 1 7 777 7 5 22 555555555 4 7 4 7 2 66666 33 666 111 2 2 1 33 2 11111111111 66 66 22 0 22 888888 77 4 4 4 444 5 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 777 1 8888888 999999 1 11111111 555 88 0 0 88888888888888 0 1 5 1 9999 111 7 1 77777 0 888888888888888888 0 2 2 2 11 7 99 1111111 1 5 0000 0 66 9 1111111 9 66 0000 4 7 7 6 33 22 8 5 8888 3333 5 888 77 9999 444 88 6 44 77 5 88 777777 44 5555 2 2 1 1 444444 66 2 22 2 3 2 9999999999999 555555 55555555 222 2 3 6
consensus : TCAACTCAAATATGC-CTGGATTTAC---GTA------A-CAGACAAGTT-ATTCC--AACAA-TTTTAACATT-AATGCATGCA-TC-TGTCACAATGA-AA-TCAAC-AC-TT---ACA--CG-CTGTTAAT----CCATTTTC-ACA-TG---TT-C-T-T-T---CC--GGTTT-G-AAT--TGTTTGTTAATC-TCTANGGGCGGT-A---TAAAAAA-AT---A--------A-A-A-ATCCGAAGTCGG-A---ATATTTG-G-AA--AAA---------T-TAG-TAA-A-CA-C-----GT--ATA-TTT---G-CT-TCTCATAAAG-CTTTTTGACA-TTTCA---------T-TTTT-ATT-CAAA--CATGTTTTCC------TATTGA-TAT-C-AAC---AAGAA--T--AAT--------C-----TT-T------T----AA----T----A-ACT--A----A---A-A-------A------GC-TTTT-T---G--AG---A--ACC-AA-AA--------------T-G-CGTG-T--T-TAT--TATTTTT-T-C---C-AAATTG------------------TCC-GACT-T-CGAATT-TTCGA--TATTTT--T-C--TACCGCCA-ATCG----G-GAC--TA-ACACAC------TA-TTCA--AACCCG----GGACA-GGGA-ACGT-GT--GA--AAATGGATTAACAG-CG----AGTA----AGTGT-TG---ATTT-CCT--CGTGACA---GATGCA--T-GC--ATTA--A-TG--TTA------A--AG---T-T-G-TGGAAA-TA------AC-TTGTC--TGT-TACGT-AAA-------------TC------CAGGCA--------T---AT-TTGAGTTGAAACG-TCGATCGAA
Reference ( family-1049 ) : TCAACTCAAATATGC-CTGGATTTAC---GTA------A-CAGACAAGTT-ATTCC--AACAA-TTTTAACATT-AATGCATGCA-TC-TGTCACAATGA-AA-TCAAC-AC-TT---ACA--CG-CTGTTAAT----CCATTTTC-ACA-TG---TT-C-T-T-T---CC--GGTTT-G-AAT--TGTTTGTTAATC-TCTANGGGCGGT-A---NAAAAAA-AT---A--------A-A-A-ATCCGAAGTCGG-A---ATATTTG-G-AA--AAA---------T-TAG-TAA-A-CA-C-----GT--ATA-TTT---G-CT-TCTCATAAAG-CTTTTTGACA-TTTCA---------T-TTTT-ATT-CAAA--CATGTTTTCC------TATTGA-TAT-C-AAC---AAGAA--T--AAT--------C-----TT-T------T----AA----T----A-ACT--A----A---A-A-------A------GC-TTTT-T---G--AG---A--ACC-AA-AA--------------T-G-CGTG-T--T-TAT--TANTTTT-T-C---C-AAATTG------------------TCC-GACT-T-CGAATT-TTCGA--TATTTT--T-C--TACCGCCA-ATCG----G-GAC--TA-ACACAC------TA-TTCA--AACCCG----GGACA-GGGA-ACGT-GT--GA--AAATGGATTAACAG-CG----AGTA----AGTGT-TG---ATTT-CCT--CGTGACA---GATGCA--T-GC--ATTA--A-TG--TTA------A--AG---T-T-G-TGGAAA-TA------AC-TTGTC--TGT-TACGT-AAA-------------TC------CAGGCA--------T---AT-TTGAGTTGAAACG-TCGATCGAA
gi|1 : TCAACTCAACTATGC-CTGGGTTTAA---GTA------A-CAG-----TT-TTTCT--AACAA-TTTTAATATT-AATGCATGCA-TC-TGTCACAATGA-AA-TCAAA-TT-TT---GCA--TG-CTGTTAAT----CCATTTTC-ACA-TGC--TT-C-T-TAT---CCCGGGTGT-G-AAT--TGTCTGTTAATC-TCTAGAGGCGGT-A---TAAAAAA--T---A--------A-ACA-GTCTGAAGTCGG-A---ATATTTG-A-AA--CAA---------T-TAG-AAA-AACA-C-----GT--ATT-TTT---G-CT-TCTCATAGAA-CGTTTTGGCA-TTTAA---------T-TTTG-ATT-CAAA--CATGTTTTCC------TAATAG-TAT-C-AAC---AACAA--A--AAC--------CC----TT-T------T----AA----TTG--A-ATC--A----T---G-A-------A------GC-TTTT-T---G--AG---A--ACC-AA-AA--------------T-G-CATG-T--T-TA---TACTTTT-TCC---C-AAATTG------------------TCC-GACT-T-CGAAGT-TTTGA--TATTTT--T-C--TACCTCTT-ATTA----G-GAC--AA-ACACAC------TA-TTCA--AACCCA----GAACA-GGGA-AAGT-AT---A--AAATGAATTAAAAG-CG----AGTA----AGTAT-CA---ATTT-TCT--CATGGTA---AATGCA--T-GC--ATCA--A-TG--TTG------A--AA---T-T-A-TGGAAA-TG------GC-ATAAC--TGT-TACAT-
gi|10 : atgtgtaactatgtaactgttaaactgacttattagggaccaagAA-ATTCCA--------A-A-A-CTACGAAGTCGG-ATAAAT-TTTG-G-AA--AAC---------T-T-T-TAA-C-CA-A-----G---A-A-CTT---G-CT-TG-CAGAAGG-CTGTCTGTCA-TTTCA---------A-GTT--ATT--AAA---ATGTTT--C------TATGGA-T-T-T-AAC---ACGAA------AT--------C-----TT-T------------A----T----A-ACTTAA----ACGTA-A-------A------GC-TTTT-----------------------------------------G-CATG-TAATGTAT----GTTTT-T-T---C-AAAT-A------------------TCC-GA-T-T-CACATA---CAT--TATTTT--T-AAATACCACCA--TCT----G-AAA--TGCAC-CAC------GAATTCA--A---CG----G-ATA-GG-A-ACAC-GT--GA--AA-TAGATAGGCAGTCG----AGTA----TGTGT-TG---AT-----------GAT------TGCA--T-GCA-ATTT--A-TGGTTTA------T--AG---TAT-A-TAG-AA-TA------GCATTGCC--TGT-TAAAT-AAT-------------AC------CA-GCA--------T---ATATTGAGTCGAAACA-TCAGTCGAAaaagtcgatcgaagt
gi|11 : TCAACTCAAATATGC-CTGGATTTAC---ACA------A-CAGATAAGTC-ATTCC--AACAA-TTTTAACATT-ATTGCATGCA-TC-TGTCACAATGA-GA-TCAAC-AC-TT---ACA--TG-CTTTTAAT----CCATTTTC-ACA-TG---TT-T-C-T-TGTACCG-GGTTT-G-AAT--TGTTTGGTAATC-TCTAAGGGCGGT-A---TAGAAAATAA---A--------A-A-A-ATTCGAAGTCGG-A---ATATTTG-GAAA--AAA---------T-TAG-TAA-A-TA-T-----GT--ATA-TTT---G-CT-TCTCATAAAA-CTTTTTGGCA-TTTCA---------T-TTTG-ATT-CAAA--CATGTTTTCC------TAATTA-TAT-C----------------------------C-----TT-A------T----AA----TTG--A-AAA--A----A---G-A-------A------GC-TTTT-T---G--GA---A--GCC-AA-AT--------------T-G-CATG-T--T-TAT--ATGTTTT-T-C---C-AAATTG------------------TCC-gtg
gi|12 : TCAACTCAAATATGC-CTAGATTTAC---ATA------A-TAGACAAGTT-ATTCC--AACAA-TCTTAACATT-A-TGCATACA-TC-TGTCACAATGA-AA-TCAAC-AC-TT---ACA--TG-CTGTTAAT----CCATTTTT-ACA-AG---TT-T-C-T-TGTCCC--GGTTT-G-AAT--TGTTTGTTAATCTTCTAAGGGCAGT-----------------------------A-A-ATCCGAAGTC-G-A---ATATTTGAA-AA--AAA---------T-TAA-TAA-A-CA-C-----GT--ATA-TTT---G-CT-TCTCATAAA--CTTTTTGACA-TTTCA---------T-TTTT-ATT-CAAA--CATGTTT--C------TATCAA-TAT-C-AAC---AAAAAACT--ATC--------C-----TT-T------T----AA----TTTGAA-AC---A----A---A-A-------A------GC-GTTC-T---G--AG---A--ACC-AA-AA--------------T-G-CGTG-T--A-TAT--CATTTTC-T-C---C-AAATTG------------------TTC-aaag
gi|13 : acttt-TTTCT---------T-TCTT-ATT-CAAA--CCTGTTTT--------TATTAA-TAT-C-AAC---AAGAA--T--AAT--------C-----TT-T------C----AA-----------ACT--ATGGCA---ACA-------A------GT-TTTT-TT--G--AG---A--ATC-AA-AA--------------T-A-CGTG-T--T-TAC--TAATTCTAT-------AAGTTG------------------TCC-GACT-T-CGAATT-TTCGA--TTCTTT--C-C--TACAGCCG-ATAG----A-AAT--AA-ACACAT------AA-TTCA--AAACCG----GGAGG-GGAG-ACAT-AT--GA--AAATGGGTTGGTAA-TG----AGTG----ATTAT-TG---GTTT-CTT--AATGACA---GATGTA--T-TT--ATTA--A-TT--TTT------A--AG---T-T-G-T-GAAA-TC------AC-TTGTC--TGT-TACGC-AAA-------------TC------CAGGCA--------T---AT-TTGAGTGGAAACA-TCCGTCGA
gi|14 : -AA--AAA---------T-T-G-TAA-A-CA-T-----GC--AT--TCT---A-TT-CCCCAGAATT-CTCTTTTACA-TTT-G---------T-TTTT-GTC-CAAA--CAT--------------------T-T-C-AAC---AG----------------------------C------T----AA---------A-AC--------A---A-A-------A------GC-TTTT-C---TCCAGCTCA--GCT-GA-AA--------------T-A-CGTG-T--T-TAT--TATTTAT-C-T---T-AAATCA------------------TCC-GACT-TAC--ATG-TTCGT--TTTCTT--T-C--TACCACCA-ATAG----A-GATCATA-ACGAA--------A-GTCA--AACCCG----GGACA-GGAA-ACAT-GT--AA--AAATGAATTAGCAG-CG----GGTA----AGTGC-TA---ATTT-TCT--TAAGACA---GCTGCA--T-TC--ATTG--A-TG--TTA------A--AG---A-T-G-
gi|15 : ttgaaaAGTCGGTA---ATTTTGG-G-AA--AAA---------T-TAG-TAA-A-C--C-----GT--A-A-TTTTTGG-CT-TCTCATGAAA--TTTTTGACAATTTTA---------A-TTT--ATT-CAAATACATGTTGTTC------TATTAA-TAT-C-AACAAAAAGAA--T--AAT--------C------C-T------T----AA----TTGA-A-ATA--A----A---A-A-------A------GC-TTCT-T------AG---A--A-A-AA-AA--------------TAG-C-TA-T--T-TTA--TATTTTT-T-TAGAC--AATTGAATNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNN-N-NNAATT-TTTGA--TATTTT--T-C--TCCCGCCA-ATTG----G-GAC--TT-GCACACTACATGTA-TTCA--AACCCG----GAACA-GGG
gi|16 : a--AAA---------T--AGCTAT-A-CA-C-----AC--ACACTTT---G-CC-CCTCGGAAAG-CTTTTT-------TCAAAAAAAAAAT------ATT-CAAA--AATGTTTTCC------TTTCGA-TGTAC-AAA---GAGAG--T--AAT--------C-----TT-T------TTTTCAA----T----G-A----A----A---A-A-------A------GTATTTT-TAGAG--AA---A--AAC-AA-AACACAAACACACCCTT-G-CATG-T--T-AAT--TAATTTT-T-C---A-AAGTTA------------------TCA-AAAT-T-C-AATTAATC-A--TATTCTTAT-A--TACCGCTA-A---------------A-ATG-AA------TG-TTCA--AACTCGCATAAGAGG-GGGT-ACGT-Ga
gi|17 : g--AG---A--ACC-AA-AA--------------T-G-CATG-T--T-TATAAAAAAATT-T-C---C-AAATTG------------------TCC-GACT-T-CGAACT-TTTGA--TATTTT--T-C--TACCGCCA-ATTG----G-GAC--TA-ACACAC------TA-TTCA--AACCCG----GAACA-AGGA-ATGT-GT--GA--AAATGGATTAAAAG-CG----AGTA----AGTGT-GG---ATTT-TTT--T-T---------TTCA--TGGC--ATTA--G-TG--TTA------A--AA---T-T-A-TGGAAA-TG------GC-ATAAT--TAT-TACGT-AAA-------------TC------CAGGCA--------T---TT-TTGAATTGAAAAG-TCGATCGAA
gi|18 : tA-ACACAT------AA-TTTT--AACCCG----GGACA-GAGA-ACAT-GA--TA--AAATGGATTAAC----G----ACTA----GGTGT-CG---ATCA-CCT--TATGTCA---GATACACAT-GC--AATA--A-TG--TTA------A--AG---T-T-G-CGGAAA-TA------AC-TTTTC--TGT-TATAT-AAA-------------TC------CAGACATACATATGT---AT-TTGAGTCAAGCCG-TTGATCGAg
gi|19 : caaaggaaatc--------C-----TT-T------T----AA----TTGA-A-AC---A----A---G-A-------A------GC-TTTTAT---G--AG---A--TCC-AA-AA--------------T-G-CATA-T--C-TATATTTTTTTT-T-C---C-AAATTG------------------TCC-GACT-T-C-----------------TT--T-A--TACCGCCA-ATTC----G-GAC--TA-ACACAC------TA-TTCA--AACCAG----GGA-A-AGGA-GTGC-GT--GA--ACATGGATTAACAG-CG----AGTA----AGTGT-GG---ATTT-TCT--CATGGCA---tgt
gi|2 : cTCAATTAAAATATGC-CTGGGTTTAC---GTA------A-CGGACAAATT-ATTTC--CACAA-CTATAACATT-AATGCGTGCA-TG-TGTCACAAAGA-AA-TCAAC-AC-TT---ACT--CG-CTGTTAAT----CCATTTTC-ACA-----------------------GGATT-G-AAT--TATGTGATAATC-TCTATTAATGAT-C---GGAAAAT-ATT--A--------A-A-A-ACCCAAAGTCGG-A---AAATT-G-G-AA--AAA---------T-TAG-TAA-A-CA-C-----AC--AT--TTC---G-CT-TCTAGGAAAG-CTTTCTAACA-TCTTA---------A-ATCT-ATT-GAAA--CGTGTTTTCC------TATTGA-TAT-C-TGC---AAGAA--T--AAT--------A-----TTAC------T----AA----T----A-ACT--C----A---A-A-------ATT----GC-TCTT-T---G--AG---A--ACC-AA-GA--------------T-A-CGTA-T--C-TAT--TAATTTG-T-C---A-AAATTA------------------TCC-GATT-T-TGAATG-ATCGA---ATTTT--T-TA-TACCGCCA-ATCG----G-GAT--TA-ACACGC------AT-TTCA--AACCCG----TAAAA-AGGA-ACAT-GT--GA--AAATGGATTAACAG-CA----TGTA----AGTGT-TG---ATTT-CTT--TGTGACA---GATGCG--T-GC--ATTA--A-TG--TTA------A--AA---T-T-G-TGGAAA-TA------AG-TTGTC--TGT-TGCTT-AAA-------------CT------CAGGCA--------T---AT-TTAAGTTGAAACG-TCGATCGAA
gi|20 : G----G-GAC--TA-ACACAC------TA-TTCA--AACCCG----GATCA-GGGA-ACAT-GT--GA--AAATGGATTAAAAG-CA----AGTA----AGTGT-TG---ATTT-TCT--CGTGGTA---GATGCA--T-GT--ATTA--A-TG--TTA------A--AA---T-T-A-TGGAGA-TT------GC-ATGAC--TGT-TACGT-AAA-------------TC------TAGGCA--------T---AT-TTGAGTTGAAAAG-TCGATCGA
gi|21 : tA--TATTTT--T-C--TACCGCGT-ATCA----T-GAC--TA-ACACAC------TA-TTTATAAATCCG----AGATA-AGAA-ACA-------------------AACAG-CG----TGTA----AGTGT-TG---ATTT-CCT--TGTGATA---GATGCT--T-AC--ATTA--A-TG--TTA------C--AG---T-T-G-T---------------------C--TGT-TACGT-AAA-------------TC------CAGCCA--------T---AT-TTGAGTTGAAggtgt
gi|22 : TCGG-A---ATATTTG-G-AA--AAA---------T-TAA-TAA-A-CA-TTACAAGT--ATA-TTT---G-CT-TCTCTTAAAA-CTTTTTGACA-TTTGA---------T-TTTTAATT-CAAA--TATG-TTTCC------TATTAA-TAT-C-AAC----------T--AA------------------T------T----GA---------A-AC---A----A---A-A-------A------GC-TTTC-T---G--AG---A--ACC-GA-CA--------------T-gtca
gi|23 : CAT-GT--TA--AAGTGGGT-AATAA-CG----AGTA----AGTAT-TG---ATTT-CCTGACTTG-CA---GATGCA--T-TC--ACAA--A-TT--TTA------A--AG---T-G-G-TGGAAA-TA------AC-TT-------T-TATGG-AAT-------------TC------CAGA-A--------T---AT-TTGATTCAAAATA-TCAGTCtacatttaatttta
gi|24 : aaagacaaactcataattcg--TA-GCACAC------TA-TTCA--AACCCG----GAACA-CGGA-ACAT-GT--GA--ACATTGATTAAAAG-CG----AGTA----AGAGT-TG---ATTT-CCT--CATGGCA---GATGCA--T-CC--ATC---A-TG--TTG------A--AA---T-T-A-TGGAAA-TG------GC-ATGAC--TGA-TACGT-AAA-------------TC------Cagagtgt
gi|25 : aaaaagTCAACGCAAATAGGAACTGGATTTACC--GTA------ATCAGACAAGTT--TTTC--AACAA-TTTTAACATT-AATGCCTGCA-TC-TGTTACAATGA-AA-TCAAC-AC-TTAA-ACA--TGCCTGTTCAT----CCATTTTC-ACATTG---TT-gacttttaat
gi|26 : gattgactttGT-GT--GA--AAATGGATTAACAG-CACATAAGTG----AATGT-TG---ATTT-CCT--TGTGACA---AGTGCA--TTACT-ATAA--AGTA--CTA------AGTAG---C-T-G-CGGAAAATA------AC-TCGT----GT-TGCGA-AAA-------------TC------CAGGCA--------T---AT-TTGAGTTGAAATG-TTGATCGAAtct
gi|27 : A-GAGA-ACAT-GT--GA--AAATGGATTAACAT-CGA---AAAA----AATGT-TA---ATTT-ATT--TATGACA---TAAGCA--T-GC--AGCA--A-TA--TCA------A--A----T-T-G-TCGAAA-TA------AC-ACGTC--TAT-TGCCT-ACA-------------TCTAGGTACAGGTA--------T---AT-TTGAGTCGAAACG-TCG
gi|28 : --AAATGGGCCAACAG-CA----AGTA----AGTGT-TG---AATT-CCT--TGTGATA---GATGCA--T-GC--GTTA--A-TG--TTA------A--AG---T-T-G-GGGAAG-TA------AT-TTGTC--TGT-TATGT-AAG-------------CC------CAGGCA--------T----C-GTCAATTGAAAt
gi|29 : a-C-----GT--GTG-TTT---AACTGTCTCGGCAAG-CTTCTTGGCA-TT-----------------------------CACGTTT-CC------TATTGAATAT-C-AAC---AAGAA--T--GAT--------C-----TT-T------T----------T----A-GCT--A----A---A-A-------AAAAAATGC-TTTT-TC--G--AG---ATTGCCTAATAA--------------C-GCCATGAT--T-TAT--TATTTTagggtacatagtctggttcc
gi|3 : TCAACTCAAATATGC-CTGGATTTAC---GTACATGTAA-CAGACAAGT--ATGCC--AACAA-GTTTAACAT--AATGTATGCA-TC-TGACACA-TGA-AAATCAAC-ACCTT---ACA--TG-CTGTTAAT----CCTTTTTC-ACA-------------------------------------GTTTG---ATC-TCTATGGGCGTTTA---TAAAAAA-A---------------A-A-A--CGAAGTCGG-A---ATATTTG---AA--AAA---------T-TA--TAA-A-CA-C-----ATT-ATA-TTTT--G-CT-TCTCATAACA-CTTTT-GACA-TTTCA---------T-TTTG-ATT-CAAA--CATGTTTTCC------TAT-AA-GAT-CGAAC---AAAAA--TTAAAT--------AA----TT-T------T----AA----T--------T--G----A---A-A-------A------A-------------------A--ACC-CA-A--------------------------------------CTT-T-C---C-AAATTG------------------TCT-GACT-T-CGAATT-TT-GA--TATTTT--C-T--TACAGCCG-AACG----GAGAC--TA-ACACAC------TA-TTCA--AGCCCG----GAACA-ATGA-ACGT-GTTGGATTAAAT-GATTAAAAG-CG----AGTAAGTCAGTGT-TG---ATTT-TCT--C-TGACA---GGTGCG--T-GC--ATTA--A-TG--TTA------A--AA---T-T-A-TTAAAA-TG------TT-ATGAC--TGT-TACGTAAAA-------------TC------CAGGCA--------T----T-TTGAGTAGAAAAG-TCag
gi|30 : tattgacttttTAAAAG-CG----AGTA----AATGT-TG---ATTT-CCT--TGTTATA---GATACA--T-GTAAATTG--A-TG--T--------A--AA---T-T-G-TGGAAA-GA------CT-TTGTC--TGT-TATGT-AAA-------------TC------CA-------------------TCCAGTGAAAACG-TCCGTCGA
gi|31 : aag-T-C---C-AAATTA------------------ACT-GACT-T-CGAATG-TTCGA--TATTTT--TTC--TACTGCCA-ATCG----G-GAG--TA-ACACTC------TA-TTCA--AACCCG----GGACA-GGGA-ACGT-GT--GA--Acgcg
gi|32 : tgtgttaatctctattggcggTCAACTCAAATATGC-CTGGATTTAC---ATA------A-CAGACAAGTT-ATTCC--AACAA-TTTTAACATA-AATGTATGCA-TC-TGTCACAATGA-AA-TCAAT-AC-TT---ACA--
gi|33 : ctcaatcgactttACA-GAGA-GCAT-GT--GG--AAATGCATTAACGA-CG----AATA----AGTGT-TC---ACTT--CT--TGTGACA---AATGAA--T-GA--CTTA--ATTG--TT-------A--AG---T-C-G-TGGAAA-TA------AC-TTGt
gi|34 : TCAAATG-AC-TTAAATTTATCCTGCA------A-GAGACAAGT--ATTTC--AACAA-TTTAAGCATT-AATGCATACA-TT---TCACAATG--AA-TCAAC-AC-TT---ACatgtctacagtacgca
gi|35 : ctatgactttttccaCA--T-GC--ATTG--A-TG--TTATTATTTA--AA---T-T-G-TTGAAA-TA------AC-TTGTC--TGT-AATGT-AAATCTGTGCAGCCATTC------CAGGCA--------T---AT-TTGAGTTGAAAAT-TCGATC
gi|36 : tgtTTAATC-TCTATGGGAGGT-A---TAAACAA-AT---A--------AGA-A-ATCCAAAGTCGG-A---ATATTTG-G-AA--AAA---------A-TAG-TGATATCA-T-----ATAAATA-TTT---G-CT-TCTCATAAAA-CGTTtgt
gi|38 : ATGCA--T-GC--ATTG--G-TG--ATG------A---G---T-T-GGTGGAAA-TACGAGTAAA-TTGTC--TATCTA-GT-AAA-------------TC------CAGCCA--------T---AT-TTCAGTTGAAACG-TCGATCGAA
gi|39 : cgcTT-CCA--TATGACA---GATACA--T-AC--ATTATAA-TG--TTA------A--AA---T-T-A-TGGAAA-TA------GC-TAGTC--TGT-TAAGT-AAA-------------TC------CAGGCA--------T------------------G-TCGATCGAA
gi|4 : C---GTA------A-CAGACAAGTT-ATTTC--CACAA-TTTTAACATTGAATGCATGCG-TC-TGTCATAAGAA-AA-TCAAC-AC-TT---ACC--CG-CTGCTAAT----CCATTTTA-AC---G---TT-CAT-TGT---CC--TG----G-GAT--TG------AATT-TTTAT---CAGT-A---GGAAATA-AT---A--------AGA-A-ATTCGAAGTCGG-A---AAATTTG-G-AA--AAA---------T-TAG-TAA-A-CA-C-----GC--AT---TT---G-CA-TCTCCGAAAG-CTTTTTAACA-TTTCA---------T-TTTT-ATT-CAAA--CATGTTTTCC------TATTGA-TAT-C-AAT---AAGAA--T--A-----------------T-T------T----AA----TGTAAA-AC---A----A---A-A-------A------GC-TTTT-G---G--GG---A--ACC-AA-AA--------------T-G-CACG-T--T-TAT--TAATTTT-A-C---T-AGATTA------------------TTA-GACT-T-CGAAT-----GA--T---------------CGCCGTATCA----G-GAT--TA-ACACGC------AA-TTCT--A----G----GGACA---------T-GT--GA--AAATGGAATAACAG-CG----AGTA----AGTGCATGTATATTT-CCT--TGTGGTA---GGGGCA--T-GC--ATTA--A-TG--TTA------A--CG---T-T-T-TGGGAA-TT------AC-TTG----CAT-T-------G-------------TC------CATG----------T---AT-TTGAGTTGAAACG-TCTATg
gi|40 : a-GGGA-ACGT-GT--GA--AAATGGATTAAAAG-CG----AGAA----AGTGT-AG---ATTT-TCT--CATGGCA---GGTACA--T-GC--ATTA--A-TG--TTA------A--AA---T-T-A-TGAAAaatgtgttgaaatcgtcggtcgaagt
gi|41 : TGACA---GATGCA--T-TT--ATCA--A-TG--TTA------A--CG---A-T-G-CGGAAG-TA------AC-TTGTC--TGT-TATGT-AAA-------------TC------AAGCCA--------T---AT-TTGTGTCGAAA
gi|42 : -CCT--TATGACA---GAT--------C--ATTA--A--G--TTA------G--AG---T-T-G-TTGAAA-CA------AC-TTGTCT-TGT-TATGT-AAA-------------TT------CAGACA--------TTTAAT-AAGAGTTGtaaaa
gi|43 : --AG---T-T-G-TGGAAA-TA------AC-TTATC--TGT-TACGT-AAA-------------TC------CAGATA--------C---AT-
gi|44 : atgttcaataactgtaacttaagtgtggattATGTATGCG-CC-CGTCATAATGA-AA-TATAC-AC-TT---CCT--TC-CTAT--AT----TTTTTTTT-ATA-TA---AT-C-C-T------G--GGTTT-G-AAT--aca
gi|45 : -CTGTTAAT----CCATTTTT-ACA-TG---TT-T-C-T-TGTCCC--GGTTTTG-AATATTGTTTGTTAATC-TCTAAGGGCGGT-A---TAgtg
gi|46 : taT--T-C--TACCGCCA-GTCG----G-GGC--TA-ACACAC------TA-TTTA--AACC------AGACG-AGGA-ACATCAT--GG--AAATG--------G-CA----AGTC----AGTGT-T
gi|47 : GTAACA---GATGCA--T-GT--GTTA--A-TG--TTA------A--AA---A-T-T-TTGAAA-TA------AC-TTGTC--T----------------------------------------------------T-TTGAGTTGAAACG-TCGATTGAA
gi|48 : acA--A-TG--TTA------A--AAATTT-T-C-T----A-TA------AC-TTGTT--TGT-TACGT-AAA-------------TT------CGGGCA--------T---AT-TTGAGTTGAAAAG-TCGATCGa
gi|49 : ---T-T-A-TGGAAA-GA------GC-ATACC--TAT-TAAGT-AAA-------------TC------AAGGCA--------T---AT-TTGAGCTGTAACG-TCGATTGAA
gi|5 : aCACAGTGA-AA-TCAAC-AC-TT---ACA--TG-CTGTTAAT----CCATTTTC-ACA-TG---TTTC-T-TGT---CCCGGGTTT-G-ATT--TGTTTGTCATTC-TCTAAGGGCGGT-A---TAAAAAA-AT---A--------A-A-ATATCCGAAGTCAG-A---ATATTTG-G-AA--AAA---------T-TAG-TAA-A-CA-T-----GT--ATA-CTT---G-CT-TCTTATAAAA-CTTTTCGACA-TTTCA---------T-TTTG-ATT-CAAA--CATGTTTTCCTATTATTATTAA-TAT-A-AAC---AAAAA--G--AATC-------C-----CT-T------T----AA----T----G-GTT--G----G---A-ACGCATGGA------GC-TTTC-T---T--AG---A--ACC-AA-AA--------------T-G-CAGA-G--T-TAT--AATTTTT-T-T---CGAAATTG------------------TCCGGACTCT-CGAACT-TTTGAAGTATTTT--T-C--TACCTCCA-ATGGGT--G-GGC--TA-ACA-AC------TA-TTCA--AACGCG----AAGCATGGGA-ATGT-GT--GA--AAATGGATTAA-AG-CA----AGTA----AGTG--TG---GTTT-TCT--CATGACA---GGTGCA--T-GC--AATA--A--G--TTA------A--AA---T-TAA-TGG--A-TG------GC-ATA-C--TAT-TACGG-TAA-------------TC------C-GGCA--------T---AT-TTGAGTTGAAAAGATCGATCGatgt
gi|50 : -T-G-TTGGAA-TA------AC-TTGTC--TGT-TACGT-AAA-------------TC------CAGGCA--------T---AT-TTGAGATGAAAAG-TCTATCGAA
gi|51 : acTGCATGCA-TC-TGTCACAATGA-AA-TCAACTAC-TT---------G-CTTTTAAT----CCATTTTC-ACC-TG---TT-C-
gi|52 : TTTAC---GTA------A-CAGACAAGTT-ATTCC--AACAACTTTTAACATT-AATGGATGCA-TC-Tcgg
gi|53 : gatcgacGCA--T-GC--ATTA--C-TG--TTA------A--AC---T-T-A-TGGAAA-TT------GC-ATGAC--TGT-TACGT-AAA-------------TC------CAGGCA--------T---AT-
gi|54 : TTC-ACA-TG---TT-C-TGT-C---CC--GGATT-G--AT--TGTTTGTTAA-C-TCTATGGGCGGT-G---AAAAAAA-
gi|55 : C--AACAA-TTTTAGCATT-AATGCATACA-TT-TGTCACAATGA-AA-TCAAC-AC-TT---ACA--CG-Ct
gi|56 : tAA-TA------AC-TTGTCC-TGT-TAAGT-AAA-------------TC------CAGCCA--------T---AT-TTGAGTTGAAA-G-TCAATCGAA
gi|57 : tg-AAATTG------------------TCC-GACT-T-CGAACT-TTTGA--TATTTT--C-C--TACCACCA-ATTG----G-GAC--T
gi|58 : ttacaAAA-TA------AT-TTGTC--TGT-T---T-AAA-------------TC------CGGGAA--------T---AT-TTGAGTCGAAACG-TCGACCGAA
gi|59 : -TGGAAA-TG------GC-AAGTCAGTGT-TAAGT-AAA-------------TG------AAGGCA--------T---AT-TTGAGTTGAAA
gi|6 : tcaCAAGTA-ATTCCTCAACA---TTAAACATA-GAGAGGTACACTC-TATTACAAAAACAA-TCAAC--C-TTGTGACGTTCG-TTGTTAATTAGCCCATTTTCAAAA-TGTCTTT-C-T-G-T---CCA-GGGTT-GCAAT--TGTGAGTTTATA-ACCACTGGCGGG-AAGCAAAAAAA-GTCG-A--------A-A-A-ATTC-AAGTAGG-C---AAATT---G-TATTATA---------T-TAGACAA-A-CAGC-----GC--AAT-TTT---G-C--TCTCAGGAAGCCCTCTTGGCT-TTTCC---------TATTTT-CTT----A--CCT------C------TATCG------C-AACCA-AATAA--T--AAT--------CATTTTTT-T------T----AAAAATT----ATACT--G----G---A-A-------A------GT-TTTT-T---C--AA---G--TTG-AA-AA--------------T-A-TGTG-T--T-TGA--TATATTT-T-T---C-AAATTG----------------------G--T-C-CGAACT-TCCGG---ATTTT-------TACC-CCA----------------TA-G------------A-TTTA--AATCCG----GGACA-GGGATACGA-GT--G---AATTGGATTAACAG----------------------A---ATCT-TCTG-TATGGCA---GTCGCA--T-TT--ATTG--A-TG--TTG------ATCGT---T-T-G-TAGAAA-T
gi|60 : A------A-CAGACAAGTT-ATTCC--AACAA-TCTTAATATT-AATGCATGCA-TC-TTTCACAATctcag
gi|61 : TGGATTAAAAG-CA----AGTA----AGTGC-TG---ATTT-TCT--AGTGGTATTGGA---A--T-GC--AGTA--A-
gi|64 : -------------TT------CAGGCA--------T---AT-TTGAGTTTAAAAG-TCGATCAAA
gi|66 : acac------CAGGCA--------T---GT-TTCAATTGAAAAG-TCGATCGAA
gi|7 : ATGCATGCA-TC-TGTCACAATGA-AA-TCAAC-AC-TT---ACA--TG-CTGTTAAT----CCATTTTT-ACA-TA---TTTC-T-TGT---CCCGGGTTT-G-AAT--TGTTTGTTAATC-TCTAAGGGCGGT-A---TATAAAA-AT---G--------A-TTA-ATCCGAAGTCGG-A---ATATTTG-G-AA--AAA---------T-TAA-TAA-A-CA-C-----AT--ATA-TTT---G-CT-TCTCATAAAA-CTTTTTGACA-TTTCA---------gtgt
gi|7 : atc--AAC--------T-----TT-T------T----GA----C----A-TTTC-A----A---A-A-------A------GC-TTTC-T---G--AG---A--ACC-AA-AA--------------T-G-AGTG-T--A-CAT--CATTTTT-TTC---C-AAATTG------------------TCC-CACT-T-CGAATT-TTTTA--TATTTT--T-C--TACCGCCA-ACTGCCAGG-GAC--TA-ACACAT------TA-TTCA--AACTCG----GAATA-GGGA-ACAT-GT--GA--AAATGGATTAAAAG-CA----AGTA----AGTGT-TG---ATTT-TCT--CGTGGTA---GGTGCA--T-GC--ATTA--A-TG--TT---------------T-T-A-TGGAAA-TG------GC-ATGAA--TGT-TACGT-AAA-------------TC------TAGGCA--------T---AC-TTGAGTTGAAAAG-TCGATCGAAaaaagctttctgagaaccaaaatgagtgtacatcatttttttccaaattgtcccacttcgaattttttatatttttctaccgccaactgccagggactaacacattattcaaactcggaatagggaacatgtgaaaatggattaaaagcaagtaagtgttgattttctcgtggtaggtgcatgcattaatgttttatggaaatggcatgaatgttacgtaaatctaggcatacttgagttgaaaagtcgatcgaagtgt
gi|8 : atcatgcatgcatctgtcacaatgaaatcaacacttacatgctgttaatccatttttacatatttcttgtcccgggtttgaattgtttgttaatctctaagggcggtatataaaaatgattaatccgaagtcggaatatttggaaaaattaataaacacatatatttgcttctcataaTCAACTCAAA-ATTG-CTAGATTTAC---ATA------A-TAGACAAGTTTATTCC--AA-AA-TCTTAACAT---ATGCATACA-TCATGTCACAATGA-AA-TCAAC-AC-TT---ACA--T--CTGTTAAT----CCATTTTT-ACAAGG---TT-C-T-TGT---CCCGGGTTT-G-AAT--TGTTTGTTAATC-TCTAAGGGCAGT-A-----------------------------A-ATC-GAAGT-GG-A---ATATTTG-A-AA--AAAAAT------T-TAA--AA-A-CA-C-----GT--ATA-TTT---G-CT-TCTCATAAA--CTTTTTGACA-TTTCA---------T-TTTT-ATTCCAAA--CATG-TTTCC------TATCAA-TAT-C-AAC---AAAAAC-T--ATC--------C-----TT-T------T----AA----TTGA-A-AC---A----A---A-A-------A------GC-GTTC-T---G--AG---A--ACC-AA-AA--------------T-G-CGTG-T--A-TAT--CATTTTC-T-C---C--AATTG------------------TCC-GACT-T-CGAATT-TTATA--TATTTgtgt
gi|9 : GGCAGT-A---AAAAGAA-AT---GGAAAGTGGA-A-A-ATCCAGATTCGG-G---A-ATTTG-G-AA--AAAAAAATATATTATAG-TAA-A-CA-C-----AC--A-A-TTT---G-TT-TCGCG--GAG-CTTTTTGAAA-TGTCA---------C-CTTT-----------------TTTC------TGTTGA-TAT-C-AAC---AAAAA--C--AATAAATTCAAC-----TT-TGGTTTGT----AA----A----AGAAG--A----A---A-A-------A------GC-TTT------G--AG---A--ACC-AA-AA--------------T-G-CGTC-T--T-TTC--TATTTTG-T-C---C-AAAAT------------------------ACT-T--------TTGAA--TATTTT--T----TATCGTTA-ATTG----A-GAT--AA-ACACAC------AA-TTCA--AAC---------ACG-GGGT-ACGT-GT--GA--AAATGGATTTACAA-CG----CGTA----AGTGG-TG---CTTTACCTA-CATTACA---ATTGCA--T-TC--ATTA--A-TG--TAA------A--AG---T-T-G-TGAAAA-CA------aag
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|37 ): TTTTTCACACTTTCATGCGGTTTTTTTTTTTATTCTAGTTGACATTTCCACAATTTGATCAAAGTGGTTCAATCAAGGGATATGTGGGGAGA
Unaligned ( gi|62 ): GAAAAGTTATTGTTAGCCATTTTTCTTTTTATTACATGTATA
Unaligned ( gi|63 ): ATTGTCTGTTACACAAGATTCGAAATGTTGGTTGAAGTG
Unaligned ( gi|65 ): TAAAACTATTCGTTGAAAACACCTTTTTTAAAATAC