lowQualScore : 1 22222
lowQualScore : 6 0 9 4 88 2 2 33 4 0 33 2 2 44444 2 0 4
lowQualScore : . . . . .. . . .. . . .. . . ..... . . .
lowQualScore : 0 7 8 8 33 7 7 77 4 4 99 9 9 55555 9 8 2
consensus : NNTTACAGAATGCGATAACAANCATTACTCGAGTGACTGTAGCGGGNTATGTGGACACTGT-AAGA-ATGGAGAACGATGT--CACAACATCACAGGACATTGTGTTA--ATGGATGTC-AG-C-CAA-A-CTGGCAGGAACCTTTATGTCAAGGT
Reference ( gi|3 ) : AATTGCAGAATGCGATAACAACCATTACTCGGGTGACTGTAGCGGGGTATGTGGACACTGT-AAGA-ATGGAGAACGATGT--CACAACATCACAGGAGATTGTGTTA--ATGGATGTC-AA-C-CAT-A-CTGGCAGGAACCTTTGTGTCAAGGT
gi|4 : TTATAGAATGTGATAGCAAACATTACTCGAGTGACTGTAGCGGGGTATGTGGACACTGT-AAGA-ATGGAGAACGGTGT--CACAACATCACAGGACATTGCGTTG--ATGGATGTC-AATT-CA--G-CTGGCAGGGAACTTTATGTCAAGGT
gi|8 : tTTACAGAGTGCGATAGCAAACATTACTCAAGTGACTGTAGCGGTATATGTGGACACTGT-AAAA-ATGGAGAACGTTGT--CACAACATTACAGGGCATTGTGCTA--ATGGGTGTC-AG-CTCA--A-CTGGCAGGAACCTTTATGTCAAGGT
gi|2 : TTACAGAATGTGATAGCAGTCATTACTCGAGTGACTGTAGTGGGTTATGTGGAAACTGC-AAGA-ATGGAGAACAATGT--CACACTGACACAGGGCATTGTATTC--ACGGTTGTC-AA-C-CAA-A-CTTGCAGGAACCTTTCTGTCAAGGT
gi|5 : atCAGAATGTGACAACAAACATTACTGGAGTGATTGTAGCGGGTTATGTGGACACTGT-AAGA-ATGAAGAACGATGC--CGCAACATCACAGGGCATTGTGTTA--ATGGATGTC-GG-C-CAA-A-TTGGGAGGAACTTTTATGTCTAGGT
gi|9 : aCAGAGTGCGATAGCAAACATTACTCAAGTGACTGTAGCGGTATATGTGGACACTGT-AAAA-ATGGAAAACGATGC--CATAATATCACAGGACATTGTATTG--ATGGATGTCAAA-C-CA--A-CTGGTTGGGACCTTTATGTCAAGGTgaa
gi|6 : CAGAATGCGATGAAAACCATTACTCGAGTGACTGTAGCGGGGTATGTGGACATTGT-AAGA-ATGCGTCACGATGT--CACAACATCACAGGACACTGTAAAC--ATGGATGTC-AA-CTCA--A-CTGGAAGGAACCTTTCTGTCAAGGT
gi|16 : ttcaCAGTGTGTTATAACAACCAATACTCGAGTGACTGTAGTAGATTATGTGGACACTGT-AGGA-ATAGAGAAAGATGT--CACAACATAACAGGGAATT
gi|7 : AGAATGTGTTGACAAGCATTACTCGAGTGACTGTAGCAAATTATGTGGACACTGT-AAGA-ATGGAGAGGGATGT--AACGACATCACAGGACACTGTGTTT--ATGGATGTC-AA-C-CTA-A-TTGGCAGGAACCTTTATGTCAGGGT
gi|1 : gcaAGAATGTGACAACAAGCATTACTCAGTTGACTGTACTGAGGTATGTGGACACTGC-AAGA-ATGAAGAACGGTGC--CATAACATCACTAGACATTGTTTTA--ATGAATGTC-AG-C-CCA-A-CTTGAAGGAACCCTTATGTCAAGATa
gi|11 : tcaacattAGTGCGTTAGCAAACATTACTCAAGTGACTGTAGCGGTATATGTGGACACTGT-AAAA-ATGGAGAACGATGT--CACAACATCACAGGACATTGTGCTG--ATGGATGTC-AG-CTCA--A-TTGGAAGGAACCTTTGTGTCAAGGT
gi|10 : GTGATAACAAACACTACTTGATCGAATGTAGCGGTATATGTGGATACTTT-AAAA-ATGGAGAACGGTGT--CAATACATCACAGGACATTGTAGAA--ATGGATGTC-GG-C-CTA-A-CTGGCAGGAACCTTTGTGTCTAGGa
gi|13 : aaGTGACAACAAGCATTACTCGAGTGACTGCACTGGGTTATGTGGACACTGT-AAGA-ATGGGTCACGATAT--CATAACATCACAGGACAGTGTAACA--AAGTATGTC-GG-C-C-T-ACCTGGAAAGAcaaa
gi|12 : cTGACAATCATTACTCGAGTGACTGTAGCGAGGTATGTGGACACTGT-AAGG-ATGGAGAACGATGT--CACAACATCACAGGACATTGTGTTA--ATGGATGTC-AA-C-CAT-A-CTGGCAGGAACCTTTGTGTCAAG
gi|14 : atACTGTATCAA---ATGTGGAAACTGT-AAAG-ATGGCATATCATGTAACAGAACA--ACTGGACGGTGTGATA--ATGGCTG-C-AG-C-AATCA-CTGGt
gi|15 : ccatcatgtattgaatggaaGTGGATATTGTGAACACATGGA--ACGCTGC--CATAACGTCACTGGGCA--GTGTAAGCATGGATGTG-AA-C-CCA-C-CTGGCAGGAACCTTATTGTAAAGG
Alignments
lowQualScore : 1 2 444 44 2 2 33 33 7 33 0 1
lowQualScore : . . ... .. . . .. .. . .. . .
lowQualScore : 0 7 777 11 5 5 44 77 4 77 1 3
consensus : NNTTACAGAATGCGATAACAANCAT-TACTCGAGTG---ACTGTAGCGGGNTATGTGGACACTGT-AAGA-ATGGAGAACGATGT--CACAACATCACAGGACATTGTGTTA--ATGGATGTCAGCCCA--ACTGGCAGGAACCTTTATGTCAAGGT
Reference ( family-1037 ) : NNTTACAGAATGCGATAACAANCAT-TACTCGAGTG---ACTGTAGCGGGNTATGTGGACACTGT-AAGA-ATGGAGAACGATGT--CACAACATCACAGGACATTGTGTTA--ATGGATGTCAGCCAA--ACTGGCAGGAACCTTTATGTCAAGGT
gi|1 : AGAATGTGACAACAAGCAT-TACTCAGTTG---ACTGTACTGAGGTATGTGGACACTGC-AAGA-ATGAAGAACGGTGC--CATAACATCACTAGACATTGTTTTA--ATGAATGTCAGCCCA--ACTTGAAGGAACCCTTATGTCAAGAT
gi|10 : tcaacattGTGATAACAAACAC-TACTTGATCG---AATGTAGCGGTATATGTGGATACTTT-AAAA-ATGGAGAACGGTGT--CAATACATCACAGGACATTGTAGAA--ATGGATGTCGGCCTA--ACTGGCAGGAACCTTTGTGTCTAGG
gi|11 : aaAGTGCGTTAGCAAACAT-TACTCAAGTG---ACTGTAGCGGTATATGTGGACACTGT-AAAA-ATGGAGAACGATGT--CACAACATCACAGGACATTGTGCTG--ATGGATGTCAGCTCA--ATTGGAAGGAACCTTTGTGTCAAGGTcaaa
gi|12 : TGACAATCAT-TACTCGAGTG---ACTGTAGCGAGGTATGTGGACACTGT-AAGG-ATGGAGAACGATGT--CACAACATCACAGGACATTGTGTTA--ATGGATGTCAACCAT--ACTGGCAGGAACCTTTGTGTCAAGa
gi|13 : atGTGACAACAAGCAT-TACTCGAGTG---ACTGCACTGGGTTATGTGGACACTGT-AAGA-ATGGGTCACGATAT--CATAACATCACAGGACAGTGTAACA--AAGTATGTCGGCCTA--CCTGGAAAGAt
gi|14 : cATCATGTATT-GAATGGAAACTGTATCAA---ATGTGGAAACTGT-AAAG-ATGGCATATCATGTAACAGAACA--ACTGGACGGTGTGATA--ATGGCTG-CAG-CAATCACTGG
gi|15 : ccGTGGATATTGTGAACACATGGA--ACGCTGC--CATAACGTCACTGGGCA--GTGTAAGCATGGATGTGAACCCA--CCTGGCAGGAACCTTATTGTAAAGG
gi|16 : CAGTGTGTTATAACAACCAA-TACTCGAGTG---ACTGTAGTAGATTATGTGGACACTGT-AGGA-ATAGAGAAAGATGT--CACAACATAACAGGGAATT
gi|2 : TTACAGAATGTGATAGCAGTCAT-TACTCGAGTG---ACTGTAGTGGGTTATGTGGAAACTGC-AAGA-ATGGAGAACAATGT--CACACTGACACAGGGCATTGTATTC--ACGGTTGTCAACCAA--ACTTGCAGGAACCTTTCTGTCAAGGT
gi|3 : atTTGCAGAATGCGATAACAACCAT-TACTCGGGTG---ACTGTAGCGGGGTATGTGGACACTGT-AAGA-ATGGAGAACGATGT--CACAACATCACAGGAGATTGTGTTA--ATGGATGTCAACCAT--ACTGGCAGGAACCTTTGTGTCAAGGT
gi|4 : aaTTATAGAATGTGATAGCAAACAT-TACTCGAGTG---ACTGTAGCGGGGTATGTGGACACTGT-AAGA-ATGGAGAACGGTGT--CACAACATCACAGGACATTGCGTTG--ATGGATGTCAATTCA--GCTGGCAGGGAACTTTATGTCAAGGT
gi|5 : tACAGAATGTGACAACAAACAT-TACTGGAGTG---ATTGTAGCGGGTTATGTGGACACTGT-AAGA-ATGAAGAACGATGC--CGCAACATCACAGGGCATTGTGTTA--ATGGATGTCGGCCAA--ATTGGGAGGAACTTTTATGTCTAGGT
gi|6 : TCACAGAATGCGATGAAAACCAT-TACTCGAGTG---ACTGTAGCGGGGTATGTGGACATTGT-AAGA-ATGCGTCACGATGT--CACAACATCACAGGACACTGTAAAC--ATGGATGTCAACTCA--ACTGGAAGGAACCTTTCTGTCAAGGTgaa
gi|7 : tAGAATGTGTTGACAAGCAT-TACTCGAGTG---ACTGTAGCAAATTATGTGGACACTGT-AAGA-ATGGAGAGGGATGT--AACGACATCACAGGACACTGTGTTT--ATGGATGTCAACCTA--ATTGGCAGGAACCTTTATGTCAGGGT
gi|8 : gcaTTACAGAGTGCGATAGCAAACAT-TACTCAAGTG---ACTGTAGCGGTATATGTGGACACTGT-AAAA-ATGGAGAACGTTGT--CACAACATTACAGGGCATTGTGCTA--ATGGGTGTCAGCTCA--ACTGGCAGGAACCTTTATGTCAAGGTa
gi|9 : CAGAGTGCGATAGCAAACAT-TACTCAAGTG---ACTGTAGCGGTATATGTGGACACTGT-AAAA-ATGGAAAACGATGC--CATAATATCACAGGACATTGTATTG--ATGGATGTCAAACCA--ACTGGTTGGGACCTTTATGTCAAGGT
Alignments
lowQualScore : 1 2 444 44 2 2 33 33 0 0 1
lowQualScore : . . ... .. . . .. .. . . .
lowQualScore : 0 7 777 11 5 5 44 77 6 1 3
consensus : NNTTACAGAATGCGATAACAANCAT-TACTCGAGTG---ACTGTAGCGGGNTATGTGGACACTGT-AAGA-ATGGAGAACGATGT--CACAACATCACAGGACATTGTGTTA--ATGGATGTCAGCCCAACTGGCAGGAACCTTTATGTCAAGGT
Reference ( family-1037 ) : NNTTACAGAATGCGATAACAANCAT-TACTCGAGTG---ACTGTAGCGGGNTATGTGGACACTGT-AAGA-ATGGAGAACGATGT--CACAACATCACAGGACATTGTGTTA--ATGGATGTCAGCCCAACTGGCAGGAACCTTTATGTCAAGGT
gi|1 : AGAATGTGACAACAAGCAT-TACTCAGTTG---ACTGTACTGAGGTATGTGGACACTGC-AAGA-ATGAAGAACGGTGC--CATAACATCACTAGACATTGTTTTA--ATGAATGTCAGCCCAACTTGAAGGAACCCTTATGTCAAGAT
gi|10 : tcaacattGTGATAACAAACAC-TACTTGATCG---AATGTAGCGGTATATGTGGATACTTT-AAAA-ATGGAGAACGGTGT--CAATACATCACAGGACATTGTAGAA--ATGGATGTCGGCCTAACTGGCAGGAACCTTTGTGTCTAGG
gi|11 : aaAGTGCGTTAGCAAACAT-TACTCAAGTG---ACTGTAGCGGTATATGTGGACACTGT-AAAA-ATGGAGAACGATGT--CACAACATCACAGGACATTGTGCTG--ATGGATGTCAGCTCAATTGGAAGGAACCTTTGTGTCAAGGTcaaa
gi|12 : TGACAATCAT-TACTCGAGTG---ACTGTAGCGAGGTATGTGGACACTGT-AAGG-ATGGAGAACGATGT--CACAACATCACAGGACATTGTGTTA--ATGGATGTCAACCATACTGGCAGGAACCTTTGTGTCAAGa
gi|13 : atGTGACAACAAGCAT-TACTCGAGTG---ACTGCACTGGGTTATGTGGACACTGT-AAGA-ATGGGTCACGATAT--CATAACATCACAGGACAGTGTAACA--AAGTATGTCGGCCTACCTGGAAAGAt
gi|14 : cATCATGTATT-GAATGGAAACTGTATCAA---ATGTGGAAACTGT-AAAG-ATGGCATATCATGTAACAGAACA--ACTGGACGGTGTGATA--ATGGCTG-CAGC
gi|15 : ccGTGGATATTGTGAACACATGGA--ACGCTGC--CATAACGTCACTGGGCA--GTGTAAGCATGGATGTGAACCCACCTGGCAGGAACCTTATTGTAAAGGaatcactgg
gi|16 : CAGTGTGTTATAACAACCAA-TACTCGAGTG---ACTGTAGTAGATTATGTGGACACTGT-AGGA-ATAGAGAAAGATGT--CACAACATAACAGGGAATT
gi|2 : TTACAGAATGTGATAGCAGTCAT-TACTCGAGTG---ACTGTAGTGGGTTATGTGGAAACTGC-AAGA-ATGGAGAACAATGT--CACACTGACACAGGGCATTGTATTC--ACGGTTGTCAACCAAACTTGCAGGAACCTTTCTGTCAAGGT
gi|3 : atTTGCAGAATGCGATAACAACCAT-TACTCGGGTG---ACTGTAGCGGGGTATGTGGACACTGT-AAGA-ATGGAGAACGATGT--CACAACATCACAGGAGATTGTGTTA--ATGGATGTCAACCATACTGGCAGGAACCTTTGTGTCAAGGT
gi|4 : aaTTATAGAATGTGATAGCAAACAT-TACTCGAGTG---ACTGTAGCGGGGTATGTGGACACTGT-AAGA-ATGGAGAACGGTGT--CACAACATCACAGGACATTGCGTTG--ATGGATGTCAATTCAGCTGGCAGGGAACTTTATGTCAAGGT
gi|5 : tACAGAATGTGACAACAAACAT-TACTGGAGTG---ATTGTAGCGGGTTATGTGGACACTGT-AAGA-ATGAAGAACGATGC--CGCAACATCACAGGGCATTGTGTTA--ATGGATGTCGGCCAAATTGGGAGGAACTTTTATGTCTAGGT
gi|6 : TCACAGAATGCGATGAAAACCAT-TACTCGAGTG---ACTGTAGCGGGGTATGTGGACATTGT-AAGA-ATGCGTCACGATGT--CACAACATCACAGGACACTGTAAAC--ATGGATGTCAACTCAACTGGAAGGAACCTTTCTGTCAAGGTgaa
gi|7 : tAGAATGTGTTGACAAGCAT-TACTCGAGTG---ACTGTAGCAAATTATGTGGACACTGT-AAGA-ATGGAGAGGGATGT--AACGACATCACAGGACACTGTGTTT--ATGGATGTCAACCTAATTGGCAGGAACCTTTATGTCAGGGT
gi|8 : gcaTTACAGAGTGCGATAGCAAACAT-TACTCAAGTG---ACTGTAGCGGTATATGTGGACACTGT-AAAA-ATGGAGAACGTTGT--CACAACATTACAGGGCATTGTGCTA--ATGGGTGTCAGCTCAACTGGCAGGAACCTTTATGTCAAGGTa
gi|9 : CAGAGTGCGATAGCAAACAT-TACTCAAGTG---ACTGTAGCGGTATATGTGGACACTGT-AAAA-ATGGAAAACGATGC--CATAATATCACAGGACATTGTATTG--ATGGATGTCAAACCAACTGGTTGGGACCTTTATGTCAAGGT
Alignments
lowQualScore : 1 2 444 44 2 2 33 33 0 0 1
lowQualScore : . . ... .. . . .. .. . . .
lowQualScore : 0 7 777 11 5 5 44 77 6 1 3
consensus : NNTTACAGAATGCGATAACAANCAT-TACTCGAGTG---ACTGTAGCGGGNTATGTGGACACTGT-AAGA-ATGGAGAACGATGT--CACAACATCACAGGACATTGTGTTA--ATGGATGTCAGCCCAACTGGCAGGAACCTTTATGTCAAGGT
Reference ( family-1037 ) : NNTTACAGAATGCGATAACAANCAT-TACTCGAGTG---ACTGTAGCGGGNTATGTGGACACTGT-AAGA-ATGGAGAACGATGT--CACAACATCACAGGACATTGTGTTA--ATGGATGTCAGCCCAACTGGCAGGAACCTTTATGTCAAGGT
gi|1 : AGAATGTGACAACAAGCAT-TACTCAGTTG---ACTGTACTGAGGTATGTGGACACTGC-AAGA-ATGAAGAACGGTGC--CATAACATCACTAGACATTGTTTTA--ATGAATGTCAGCCCAACTTGAAGGAACCCTTATGTCAAGAT
gi|10 : tcaacattGTGATAACAAACAC-TACTTGATCG---AATGTAGCGGTATATGTGGATACTTT-AAAA-ATGGAGAACGGTGT--CAATACATCACAGGACATTGTAGAA--ATGGATGTCGGCCTAACTGGCAGGAACCTTTGTGTCTAGG
gi|11 : aaAGTGCGTTAGCAAACAT-TACTCAAGTG---ACTGTAGCGGTATATGTGGACACTGT-AAAA-ATGGAGAACGATGT--CACAACATCACAGGACATTGTGCTG--ATGGATGTCAGCTCAATTGGAAGGAACCTTTGTGTCAAGGTcaaa
gi|12 : TGACAATCAT-TACTCGAGTG---ACTGTAGCGAGGTATGTGGACACTGT-AAGG-ATGGAGAACGATGT--CACAACATCACAGGACATTGTGTTA--ATGGATGTCAACCATACTGGCAGGAACCTTTGTGTCAAGa
gi|13 : atGTGACAACAAGCAT-TACTCGAGTG---ACTGCACTGGGTTATGTGGACACTGT-AAGA-ATGGGTCACGATAT--CATAACATCACAGGACAGTGTAACA--AAGTATGTCGGCCTACCTGGAAAGAt
gi|14 : cATCATGTATT-GAATGGAAACTGTATCAA---ATGTGGAAACTGT-AAAG-ATGGCATATCATGTAACAGAACA--ACTGGACGGTGTGATA--ATGGCTG-CAGC
gi|15 : ccGTGGATATTGTGAACACATGGA--ACGCTGC--CATAACGTCACTGGGCA--GTGTAAGCATGGATGTGAACCCACCTGGCAGGAACCTTATTGTAAAGGaatcactgg
gi|16 : CAGTGTGTTATAACAACCAA-TACTCGAGTG---ACTGTAGTAGATTATGTGGACACTGT-AGGA-ATAGAGAAAGATGT--CACAACATAACAGGGAATT
gi|2 : TTACAGAATGTGATAGCAGTCAT-TACTCGAGTG---ACTGTAGTGGGTTATGTGGAAACTGC-AAGA-ATGGAGAACAATGT--CACACTGACACAGGGCATTGTATTC--ACGGTTGTCAACCAAACTTGCAGGAACCTTTCTGTCAAGGT
gi|3 : atTTGCAGAATGCGATAACAACCAT-TACTCGGGTG---ACTGTAGCGGGGTATGTGGACACTGT-AAGA-ATGGAGAACGATGT--CACAACATCACAGGAGATTGTGTTA--ATGGATGTCAACCATACTGGCAGGAACCTTTGTGTCAAGGT
gi|4 : aaTTATAGAATGTGATAGCAAACAT-TACTCGAGTG---ACTGTAGCGGGGTATGTGGACACTGT-AAGA-ATGGAGAACGGTGT--CACAACATCACAGGACATTGCGTTG--ATGGATGTCAATTCAGCTGGCAGGGAACTTTATGTCAAGGT
gi|5 : tACAGAATGTGACAACAAACAT-TACTGGAGTG---ATTGTAGCGGGTTATGTGGACACTGT-AAGA-ATGAAGAACGATGC--CGCAACATCACAGGGCATTGTGTTA--ATGGATGTCGGCCAAATTGGGAGGAACTTTTATGTCTAGGT
gi|6 : TCACAGAATGCGATGAAAACCAT-TACTCGAGTG---ACTGTAGCGGGGTATGTGGACATTGT-AAGA-ATGCGTCACGATGT--CACAACATCACAGGACACTGTAAAC--ATGGATGTCAACTCAACTGGAAGGAACCTTTCTGTCAAGGTgaa
gi|7 : tAGAATGTGTTGACAAGCAT-TACTCGAGTG---ACTGTAGCAAATTATGTGGACACTGT-AAGA-ATGGAGAGGGATGT--AACGACATCACAGGACACTGTGTTT--ATGGATGTCAACCTAATTGGCAGGAACCTTTATGTCAGGGT
gi|8 : gcaTTACAGAGTGCGATAGCAAACAT-TACTCAAGTG---ACTGTAGCGGTATATGTGGACACTGT-AAAA-ATGGAGAACGTTGT--CACAACATTACAGGGCATTGTGCTA--ATGGGTGTCAGCTCAACTGGCAGGAACCTTTATGTCAAGGTa
gi|9 : CAGAGTGCGATAGCAAACAT-TACTCAAGTG---ACTGTAGCGGTATATGTGGACACTGT-AAAA-ATGGAAAACGATGC--CATAATATCACAGGACATTGTATTG--ATGGATGTCAAACCAACTGGTTGGGACCTTTATGTCAAGGT
blockSeqs : A G GAA TA G C AA GC G
blockSeqs : A . . TA . . . . G
blockSeqs : T . . GG . . . . G
blockSeqs : G . . GT . . . . T
blockSeqs : T . . AT . . . . C
blockSeqs : C . . GT . . . . G
blockSeqs : T . . GG . . . . A
blockSeqs : C . . GG . . . . A
blockSeqs : A . . GT . . . . C
blockSeqs : A . . GG . . . . A
blockSeqs : C . . AT . . . . A
blockSeqs : G . . TA . . . . A
blockSeqs : A . . TA . . . .
blockSeqs : A . . . . . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqCons :
originalCons : NNTTACAGAATGCGATAACAANCAT-TACTCGAGTG---ACTGTAGCGGGNTATGTGGACACTGT-AAGA-ATGGAGAACGATGT--CACAACATCACAGGACATTGTGTTA--ATGGATGTCAGCCCAACTGGCAGGAACCTTTATGTCAAGGT
finalCons : NNTTACAGAATGCGATAACAANCAT-TACTCGAGTG---ACTGTAGCGGGNTATGTGGACACTGT-AAGA-ATGGAGAACGATGT--CACAACATCACAGGACATTGTGTTA--ATGGATGTCAGCCCAACTGGCAGGAACCTTTATGTCAAGGT
Alignments
lowQualScore : 1 2 444 44 2 2 33 33 0 0 1
lowQualScore : . . ... .. . . .. .. . . .
lowQualScore : 0 7 777 11 5 5 44 77 6 1 3
consensus : NNTTACAGAATGCGATAACAANCAT-TACTCGAGTG---ACTGTAGCGGGNTATGTGGACACTGT-AAGA-ATGGAGAACGATGT--CACAACATCACAGGACATTGTGTTA--ATGGATGTCAGCCCAACTGGCAGGAACCTTTATGTCAAGGT
Reference ( family-1037 ) : NNTTACAGAATGCGATAACAANCAT-TACTCGAGTG---ACTGTAGCGGGNTATGTGGACACTGT-AAGA-ATGGAGAACGATGT--CACAACATCACAGGACATTGTGTTA--ATGGATGTCAGCCCAACTGGCAGGAACCTTTATGTCAAGGT
gi|1 : AGAATGTGACAACAAGCAT-TACTCAGTTG---ACTGTACTGAGGTATGTGGACACTGC-AAGA-ATGAAGAACGGTGC--CATAACATCACTAGACATTGTTTTA--ATGAATGTCAGCCCAACTTGAAGGAACCCTTATGTCAAGAT
gi|10 : tcaacattGTGATAACAAACAC-TACTTGATCG---AATGTAGCGGTATATGTGGATACTTT-AAAA-ATGGAGAACGGTGT--CAATACATCACAGGACATTGTAGAA--ATGGATGTCGGCCTAACTGGCAGGAACCTTTGTGTCTAGG
gi|11 : aaAGTGCGTTAGCAAACAT-TACTCAAGTG---ACTGTAGCGGTATATGTGGACACTGT-AAAA-ATGGAGAACGATGT--CACAACATCACAGGACATTGTGCTG--ATGGATGTCAGCTCAATTGGAAGGAACCTTTGTGTCAAGGTcaaa
gi|12 : TGACAATCAT-TACTCGAGTG---ACTGTAGCGAGGTATGTGGACACTGT-AAGG-ATGGAGAACGATGT--CACAACATCACAGGACATTGTGTTA--ATGGATGTCAACCATACTGGCAGGAACCTTTGTGTCAAGa
gi|13 : atGTGACAACAAGCAT-TACTCGAGTG---ACTGCACTGGGTTATGTGGACACTGT-AAGA-ATGGGTCACGATAT--CATAACATCACAGGACAGTGTAACA--AAGTATGTCGGCCTACCTGGAAAGAt
gi|14 : cATCATGTATT-GAATGGAAACTGTATCAA---ATGTGGAAACTGT-AAAG-ATGGCATATCATGTAACAGAACA--ACTGGACGGTGTGATA--ATGGCTG-CAGC
gi|15 : ccGTGGATATTGTGAACACATGGA--ACGCTGC--CATAACGTCACTGGGCA--GTGTAAGCATGGATGTGAACCCACCTGGCAGGAACCTTATTGTAAAGGaatcactgg
gi|16 : CAGTGTGTTATAACAACCAA-TACTCGAGTG---ACTGTAGTAGATTATGTGGACACTGT-AGGA-ATAGAGAAAGATGT--CACAACATAACAGGGAATT
gi|2 : TTACAGAATGTGATAGCAGTCAT-TACTCGAGTG---ACTGTAGTGGGTTATGTGGAAACTGC-AAGA-ATGGAGAACAATGT--CACACTGACACAGGGCATTGTATTC--ACGGTTGTCAACCAAACTTGCAGGAACCTTTCTGTCAAGGT
gi|3 : atTTGCAGAATGCGATAACAACCAT-TACTCGGGTG---ACTGTAGCGGGGTATGTGGACACTGT-AAGA-ATGGAGAACGATGT--CACAACATCACAGGAGATTGTGTTA--ATGGATGTCAACCATACTGGCAGGAACCTTTGTGTCAAGGT
gi|4 : aaTTATAGAATGTGATAGCAAACAT-TACTCGAGTG---ACTGTAGCGGGGTATGTGGACACTGT-AAGA-ATGGAGAACGGTGT--CACAACATCACAGGACATTGCGTTG--ATGGATGTCAATTCAGCTGGCAGGGAACTTTATGTCAAGGT
gi|5 : tACAGAATGTGACAACAAACAT-TACTGGAGTG---ATTGTAGCGGGTTATGTGGACACTGT-AAGA-ATGAAGAACGATGC--CGCAACATCACAGGGCATTGTGTTA--ATGGATGTCGGCCAAATTGGGAGGAACTTTTATGTCTAGGT
gi|6 : TCACAGAATGCGATGAAAACCAT-TACTCGAGTG---ACTGTAGCGGGGTATGTGGACATTGT-AAGA-ATGCGTCACGATGT--CACAACATCACAGGACACTGTAAAC--ATGGATGTCAACTCAACTGGAAGGAACCTTTCTGTCAAGGTgaa
gi|7 : tAGAATGTGTTGACAAGCAT-TACTCGAGTG---ACTGTAGCAAATTATGTGGACACTGT-AAGA-ATGGAGAGGGATGT--AACGACATCACAGGACACTGTGTTT--ATGGATGTCAACCTAATTGGCAGGAACCTTTATGTCAGGGT
gi|8 : gcaTTACAGAGTGCGATAGCAAACAT-TACTCAAGTG---ACTGTAGCGGTATATGTGGACACTGT-AAAA-ATGGAGAACGTTGT--CACAACATTACAGGGCATTGTGCTA--ATGGGTGTCAGCTCAACTGGCAGGAACCTTTATGTCAAGGTa
gi|9 : CAGAGTGCGATAGCAAACAT-TACTCAAGTG---ACTGTAGCGGTATATGTGGACACTGT-AAAA-ATGGAAAACGATGC--CATAATATCACAGGACATTGTATTG--ATGGATGTCAAACCAACTGGTTGGGACCTTTATGTCAAGGT