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lowQualScore                  :     6   4         55        3 3   22222   333333333  3 3   4  555     7777  0 4444444444444   1111  9999 44        2222222222222222222222    99  888 66    2222   77777 2 33  9       33     3333333               444   2        111111   33 4    2  2      2     99999             6      5555555          33  2  77               3  3  00000000    555          44   5    2   3 0    4              7  1      
lowQualScore                  :     .   .         ..        . .   .....   .........  . .   .  ...     ....  . .............   ....  .... ..        ......................    ..  ... ..    ....   ..... . ..  .       ..     .......               ...   .        ......   .. .    .  .      .     .....             .      .......          ..  .  ..               .  .  ........    ...          ..   .    .   . .    .              .  .      
lowQualScore                  :     0   1         00        6 6   88888   333333333  3 3   1  888     1111  3 8888888888888   9999  4444 22        2222222222222222222222    77  999 88    5555   11111 9 99  1       77     7777777               777   7        111111   77 6    5  5      9     66666             1      4444444          99  7  77               1  1  44444444    444          66   0    5   3 2    0              0  4      
consensus                     :  TACGTTCCTCATTTTTA--TATAATTT-T-CCTC----GAA---------AT-T-TTGTAT---AATAC----ATACA-AT---TA---CTTGC---AT--C-A--AAACATGTT---------------------TATGCNAA---A--AAAAT--TAGG-----C-C--ATATTACCAG--GACACTTTT-T-GAGTTTGAATATTTT---GCA-TTGTACCT-G----TTA--CGGCAT-GC-AAAAAC-CATGT-A---AATGCTCAAAAATAAAATAT-----CGAATATATATT--TT-CC-CTTTGAAATACATTTA-TC-AGA-ATA-T-AGGA---GTAGCTTAAA--AATAAAATATAA-TTTTTG-GAAGCAATGTTTCCAGGCCATTGA
Reference ( gi|2 )            :  TACATTCTTCATTTTTA--TATAATTT-T-CCTA----GAA---------AT-T-TTGCAT---AATAC----ATACA-AT--GTA---CTTGT---AT--C-A--AAACATGTT------AAAA---CT-----TTATGCCAA---A--AAAAT--TAGG-----C-C--ATGTTACCAG--GACACTTTC-T-GAGTTTGAATATTTT---GCA-TTGTACCT-T----TTA--CAGCAT-GC-AAAAAC-CATGT-ATTGAATGCTCAAAAATGAAATAT-----TGAATATATATT--TT-CC-TTTTGAAATACATTTA-TC-AGA-ATA-A-AGGA---GTAGCTTAAA--AATCAAATATAA-TATTTG-GAAGCAATGTTTCCTGGCCATTGA
gi|5                          :  TACGTTCCTCATTTTTA--TATAATTT-T-CCTC----GAA---------AT-G-TTGTAT---TATAC----ATAC-------------TTGC---AT--G-A--AAACATGTT---------------------TATGCCAA---A--AAAAT--TAGG-----C-T--ATATTACCTG--GACACTTTT-T-GAGTTTGAATGTTTT---GAA-TTGTACCT-G----TTA--CGACAT-GC-AGAAGC-CATGT-A---AATGCTCAAAAATAAAAAAT-----GGA--AGGCATT--TT-CC-CTTTGAAATACATTTA-TC-AG---TA-AGAGGA---GAAGCTTAAA--GATGAAATCTAA-T-TTT
gi|28                         : aTACGTCCCTCATTTTTA--TACTGTTT-T-CCTC----GAA---------AT-T-TTGTAT---AATA-----ATA
gi|8                          :   ACGTTCCTCATTTTTA--TATGATTT-T-CCTC----GAC---------AA-T-TTGTAC---AATAC----ATAC-------------TTGC---AT--TTA--AAACATGTT---------------------TACGCAAA---AT-AAAAT--TAGG-----C-C--ATATTAACAG--GACACTTTT-T-GAGTTTGAACATTTT---GCA-TTGTTCCT-GAACATTG--CGGCAT-GC-AAAAAC-CATG----TCAATGCTCAAAAATGAAATATATATATATATATATATT--TT-CC-
gi|25                         :    CGTTCCTCATTTTTA--TGTAATTT-T-TCTC----GAA---------AT-T-TAGTAT---AATGC----ACACA-aaaaagaatatggtttggtacagaaata
gi|14                         :     cTTCCCCATCTTTA--TATAATTT-T-CCT--------------------T-TT--AT---AACGC----AT-C------------CTTGC---AT--C-A--AAACACGTT---------------------TAT---AA---A--AAAAA--AAGG-----C-C--CTATTTCCACCTGACACT----------------ATTAT---GCA-TTGTACCT-G----TCA--CGGTTT-GC-AAAAACTTATGT-A---AATGCTCAAAAATAAAATAT-----CGtgcat
gi|6                          : gtattTTCCTCATTTTCA--TATGATTT-T-CTTC----GAATTTAAATACATAT-TTGCATCAAAACACGTTTATGCA-ACCAATA---AATAA---AT--A-A--ATATAAATTGAGAAAAAAA---AT-----GTAGGCCAA---A--TAAA-----GC-----C-C--AAATTACCAT--GACTTTTTT-T-TAGTTTGGATATTTT---GCA-CTGTACCT-G----TTA--CGGCAT-GA-AAAAA
gi|20                         :     gTTCCTCATTTGTA--TTTGATTT-T-CCTC----GAA---------AT-TCTTCCAT-------------TAAA-AT--ATG---TTTAA---ATGCC-A--AAAAA----------AAAA------------A-GAAAA---A--AAAA----AGGGGGGGT-C--ATATTACCAG--GACACGTTC-T-GAGTaaaggtttccaggccattgaaatataaatttattacatagtaggattaatgtcgttt
gi|9                          :        gTTTATTTTTA--TATAATTT-T-CCTC----GAA---------AT-T-TTGTAT---AATAC----ATACATGT--GTA---CTAGC---AT--C-A--AAACATATG---------------------TATGCGAA---A--CAAAA--AAAG-----T-C--ATTTTA-------------------AGTTTGA-----------TA-TTGTACCT-G----TTA--CGGGGT-GC-AAAAAC-CATGT-A---AATGCTCAAAAATAAAATAT-----CGAATATATATT--TT-CC-CTCTGAAATACATTTA-TC-AG--ATA-T-AGGA---TGAGCTTAAA--AAT-AAAT-TAG-GATTT
gi|1                          :      tcctTCACTTCTA--TATAACTT-TGTTTC----GAA---------AT-T-TTGTAT---AATAC----ATAC-------------TTGC---AT--C-A--AAACGTATT------GA---------------TG--AA---A--AAAAT--TAAA-----C-C--ATATTAACAG--GACACT---------------TATTTT---GCATTTGTACTT-G----TTA--CGAAAT-GTAAAAAAC-CATGT-A---AATGATCAAAAATAAAATAT-----T-AATATATATTAGTT-TC-CTTTGCAATACATTAA-TC-AG--ATA-T-AGGA---GTACTTTAAA--AGTAAATTATAA-TTTTTG-GAAGCAATGTTTCCAGATCATTAAtt
gi|7                          :          TCATTTTTACATATAATTT-T-CT------GAT---------AT-T-TTGTAT---ACTTC----ATCCT-AT--TTAGCTCTTGCTCCAT--C-ATCGAACATGTT---------------------TATGCAAACA-A--AAAAT--TAGG-----C-C--ATATTACCAG--GACACATTCTT-GACTTTAAATA-GTT---GCA-ATGTACCT-G----ATA--CGGCAT-GC-AAAAAC-CATGTAAATGCATGCTT-AAAATAAAATAT-----C-AATATATAAT--TT-TC-CTTTGAAATACAaatataaatgaataaaaggattaatgtcggaaacgtatcgtctgcccttc
gi|27                         :       tatttcacTCTA--TATAATTTCT-TCGAAATCGAA---------AT-T-TTGTAT---AATAC----ATACgagtgcttaaaa
gi|24                         :                                         AA---------AT-T-TTGTAT---AATAC----A----------TA---CTTGC---AT--C-A--AGACTTGT---------------T-----TTATGCAAA---A--Attgcatc
gi|10                         :                                                       aacttaatttcaactatcatgttgt-AT--ATA---CTTGC---AT--C-A--AAACATGTT------TATATCGCTGTTCGTTAT--C------------T--TTGT-----C-TTTACATTACCAT--GATACTTTT-T-GAATTTGAATATTTT---GCA-TTTTACCT-G----TTA--CGTCAT-GC-AATAAC-TATGT-A---AATGCTCAAAAATAAAATAT-----CGAATATAT----------------------ATTTA-TC-AG--ATA-T-AGGT---GTAGTTTGAA--AATAAAATATAT-TTTTTGAGAAGCAATGTTTCC
gi|3                          :                                                                                      aagtatTTGC---AC--T-A--AAACATGTT---------------------TATGCCAA---A--AAAAAAATAGG-----C-C--ATATTACGAG--GACACGTTG-A-GAGTTTGAATATTTTTTTGCA-TTGTACCT-G----TTA--CGGCAT-GC-AAATAC-CATGT----GAATGCTCAAGAATATAATGT-----CGAATATATATT--TT-CCTTTTTGAAATCAAATTA-TC-AGATATA-C-AGGA---GTAACTTAA-----------------ATTTG-GAAGC-ATGTTTCCAGACTATTGAaat
gi|15                         :                                                                                            TTGC---AT--A-A--AAACATGTT---------------------TATG--AA---A--AAAA----AAA-----CTC--ATATCACCAA--GGCACTTTT-T-GAGTTTGAATGTCTT---GCA-TTTTACAT-G----TTA------ATGGC-AAACAC-CAT----TCAAATGCTCAAACATAAACAAT-----CGAATATGTATT--TT-CC-aatacaaataaataataagattaatgttggaaacgaactgtctgtcctt
gi|22                         :                                                                                            TTGT---AT----A--ATACAT------------A---CT-----T---GTCGATGGA--AAAA----AGG-----C-C--TTATTACCAG--AACAC---------ATTT-AATATTTT---GCA-TTGTACCA-G----TTA--CGACAT-GC-Ac
gi|4                          :                                                                                                                          cttgaaagtT-----TTATGCAAA---ATAAAAAT----GG-----C-C--ATATTACCAT--GATACTCCT-T-GAGTTTGAATATTTT---TCA-TTGTACCT-C----TAA--CAGCAT-GC-AAACAC-AAT----TTAAATGCTCAAAAATAAAATAC-----CGAATGTATGTT--TT-CC-CTTTGAAATACATTTA-TC-A-A-AGA-T-AGGA---GTAGC-TAAAGCAATC-AATATAATTTTTTG-GAAGCAATGTTTACAGGACATTGA
gi|11                         :                                                                                                                                                            gtatgGG-----C-C--AT---ACCAG--GACACTTTT-TTGTGTTTGAATATTTT---GCA-TTGTATCT-G----TTA--CAGCAT-GC-AAAAAC-CATGT-A---AATAGTCATAAATAAAATAT-----CGAGAATAT-TT--TC-CC-CTTTGAAATACATTTA-TC-AG--ATA-T-AGGA---GCAaatatagataaataatatgattagtgtcggaaacgtaccatctgaactta
gi|12                         :                                                                                                                                                                                 TACCAG--GACACTTT--T-GAGTTGGAATATTTT---GCA-TTGTACTT-G----TTA--CGGCAT-GC-AAAAAC-C--------------------ATG------------GAATATATATT--TT-CC-CTTTGAAATACATTTA-TC-AG--ATA-T-AGGA---GTAGCTTAAA--AATAGAATATAA-TA-TTG-GAAGCAAAATATCCAGG-CATTGAatgtttccaggccattgaaataggattaatgtcggaaacgtaccggctgtccttaac
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                ac-T-GAGTTTGAATATTTT---GCA-TTGTACCTGT----GTAATTGTCAT-GC-AAAAAC-CACGT-A---AATGCTCAAAAACAGAATAT-----GGAACATATAT-----------------TATGTTTA-TC-AG--ATA-T-AGGA---ATAGCTTAAA--AATaatatgaataaacaataggattaatgtcggaa
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                  AT-GG-AAAAAC-CATGT-A---AATGCTCAAA--T---ATAT--------ACATGTATT--TTGCC-TTTT-AAATATATTTA-TC-AAATATAGA-AGTACATGTAGCTTACA--AA--AAATATAA-TTTTTG-GAAGCAACGTTTTCAGGCCATTGA
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                             T--TG-CC-CTTTGAAATACA------CGAGA-AT---------------CTTAAA--AATAAAATTGAA-TTTTTG-GAAGTAATGTTTCCAGCCCACTAAaatataaataaacaatagtattaatgtcggaaacgcaccgcctgtccttaat
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 T-CC-CATTGAAATGCATTTT-CC-AGA--TA-T-AGGA---GTAGCCTAAA--ATTAAAATATAA-TATTTA-GAGGCAATGattataaatatataacaggattagtgtcgtaaaagtactctctgtccttagaa
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gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          cAAATATAT-TTTTTG-GAAGCAATGTTTCCAGGCCTTTaatgtaattagataataggattaatgtcgggaacatactgtctggccttga

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Reference ( family-1024 )     :                                                                                                                                                                                      TACGTTC-CTCATTTTTA--TATAATTT-T-CC----TCGAA---------AT-TTTGTAT---AATAC----ATACA-AT-T-A---CT---TGC---ATC-A--AAACATG-TT-------T--AT---GCNAA--A--AAAAT--TA-----------------G--------GCC---A--TA---------TTACCAG--GACAC-TTTTT-GAGTTTGAATAT--TTT---GCA-TTGTACC-TG----T-TA--CGGCAT-GC-----AAAAAC----C-A-TGTA---A----ATGCTC---AAAAATAAAATATCGA-----ATAT----ATATT--TT-CCCTTT-GAAATACATTTA-TC-AGA-ATATAGGAGTA------GCTTAAAAATAA--AATATAA-TTTTTG-GAAGCAATGTTTCCAGGCCATTGA
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gi|14                         :                                                                                                                                                                                          TTC-CCCATCTTTA--TATAATTT-T-CC----T-----------------TT-TAT---AACGC----AT-C-----------CT---TGC---ATC-A--AAACACG-TT-------T--AT---A-AAA--A--AAAA----A-----------------G--------GCC---C--TA---------TTTCCACCTGACAC-T---------------AT--TAT---GCA-TTGTACC-TG----T-CA--CGGTTT-GC-----AAAAAC----TTA-TGTA---A----ATGCTC---AAAAATAAAATATCGaatataaataaacaatagtattaatgtcggaaacgcaccgcctgtccttaat
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                          gtattT---TGC---ATA-A--AAACATG-TT-------T--AT---G-AAA--A--AAAA----A-----------------A--------CTC---A--TA---------TCACCAA--GGCAC-TTTTT-GAGTTTGAATGT--CTT---GCA-TTTTACA-TG----T-TA------ATGGC-----AAACAC----C-A-TTCA---A----ATGCTC---AAACATAAACAATCGA-----ATAT----GTATT--TT-CCC
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TGACTATCGTTG---GCA-CTGTACCCTG----T-TA--CTGGAC-GCTACAAAAGAACGCAGC-ACTGTA---A----AAAATCGACAAAAAGTAAATACGAA-----ACATTGCAATGTT--TTTCCCGTT-GAAATTCACTTAATC-ACA--TATAGGA
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    cCTTT-GAAATACATGCATTC-AG--ATATAGGAGAA------GCTTAGAAATAA--AATGTAA-TTTTTG-GAAGCGATGTTTTCAGGCCATTGA
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             T--TG-CCCTTT-GAAATACA------CGAGA-AT----------------CTTAAAAATAA--AATTGAA-TTTTTG-GAAGTAATGTTTCCAGCCCACTAAaatgtaattagataataggattaatgtcgggaacatactgtctggccttga
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             T-GAGTTTGAATAT--TTT---GCA-TTGTACC-TG----TGTAATTGTCAT-GC-----AAAAAC----C-A-CGTA---A----ATGCTC---AAAAACAGAATATGGA-----ACAT----ATAT-----------------TATGTTTA-TC-AG--ATATAGGAATA------GCTTAAAAATattataaatatataacaggattagtgtcgtaaaagtactctctgtccttagaa
gi|2                          :                                                                                                                                                                                      TACATTC-TTCATTTTTA--TATAATTT-T-CC----TAGAA---------AT-TTTGCAT---AATAC----ATACA-ATGT-A---CT---TGT---ATC-A--AAACATG-TTAAAACTTT--AT---GCCAA--A--AAAAT--TA-----------------G--------GCC---A--TG---------TTACCAG--GACAC-TTTCT-GAGTTTGAATAT--TTT---GCA-TTGTACC-TT----T-TA--CAGCAT-GC-----AAAAAC----C-A-TGTATTGA----ATGCTC---AAAAATGAAATATTGA-----ATAT----ATATT--TT-CCTTTT-GAAATACATTTA-TC-AGA-ATAAAGGAGTA------GCTTAAAAATCA--AATATAA-TATTTG-GAAGCAATGTTTCCTGGCCATTGA
gi|20                         :                                                                                                                                                                                         GTTC-CTCATTTGTA--TTTGATTT-T-CC----TCGAA---------AT-T---------------------------------CT---TCC---ATT-A--AAATATG-TT-------TAAAT---GCCAA--A--AAAAA--AAAGAAAAAAAAAAGGGGGG--------GTC---A--TA---------TTACCAG--GACAC-GTTCT-GAGT
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 T-CCCATT-GAAATGCATTTT-CC-AGA--TATAGGAGTA------GCCTAAAATTAA--AATATAA-TATTTA-GAGGCAATG
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                      C----TTGAA---------AG-TTTGTAT---AATAC----ATAC------------T---TG-----TC-G--A--------------------T---G-GAA--A--AAA-----------------------G--------GCC---T--TA---------TTACCAG--AACAC-ATTT---------AATAT--TTT---GCA-TTGTACC-AG----T-TA--CGACAT-GC-----Aaaatataaataaacaatgggatccatgt
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          A--AATATAT-TTTTTG-GAAGCAATGTTTCCAGGCCTTT
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                           aggAA---------AT-TTTGTAT---AATAC----A--------T-A---CT---TGC---ATC-A--AGACTTGTTT-------T--AT---GCAAA--A--Acaaatatgagtaaatattttaagactgatgtcggaaacgtgccttttttcaatg
gi|25                         :                                                                                                                                                               aacttaatttcaactatcatgttgtCGTTC-CTCATTTTTA--TGTAATTT-T-TC----TCGAA---------AT-TTAGTAT---AATGC----ACACA-
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                   cTCTA--TATAATTTCT-TCGAAATCGAA---------AT-TTTGTAT---AATAC----A--------T-A---CT---TGC---ATC-tgcat
gi|28                         :                                                                                                                                                                                      TACGTCC-CTCATTTTTA--TACTGTTT-T-CC----TCGAA---------AT-TTTGTAT---AATA-----ATA
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                               T---TGC---ACT-A--AAACATG-TT-------T--AT---GCCAA--A--AAAAAAATA-----------------G--------GCC---A--TA---------TTACGAG--GACAC-GTTGA-GAGTTTGAATAT--TTTTTTGCA-TTGTACC-TG----T-TA--CGGCAT-GC-----AAATAC----C-A-TGTG---A----ATGCTC---AAGAATATAATGTCGA-----ATAT----ATATT--TT-CCTTTTTGAAATCAAATTA-TC-AGATATACAGGAGTA------ACTTAAA-----------------TTTG-GAAGCA-TGTTTCCAGACTATTGA
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ATG-TT-------T--AT---GCAAA--ATAAAAAT---------------------G--------GCC---A--TA---------TTACCAT--GATAC-TCCTT-GAGTTTGAATAT--TTT---TCA-TTGTACC-TC----T-AA--CAGCAT-GC-----AAACAC----A-A-TTTA---A----ATGCTC---AAAAATAAAATACCGA-----ATGT----ATGTT--TT-CCCTTT-GAAATACATTTA-TC-A-A-AGATAGGAGTA------GCT--AAAGCAATCAATATAATTTTTTG-GAAGCAATGTTTACAGGACATTGAaatacaaataaataataagattaatgttggaaacgaactgtctgtcctt
gi|5                          :                                                                                                                                                                                    gtTACGTTC-CTCATTTTTA--TATAATTT-T-CC----TCGAA---------AT-GTTGTAT---TATAC----ATAC------------T---TGC---ATG-A--AAACATG-TT-------T--AT---GCCAA--A--AAAAT--TA-----------------G--------GCT---A--TA---------TTACCTG--GACAC-TTTTT-GAGTTTGAATGT--TTT---GAA-TTGTACC-TG----T-TA--CGACAT-GC-----AGAAGC----C-A-TGTA---A----ATGCTC---AAAAATAAAAAATGGA-------AG----GCATT--TT-CCCTTT-GAAATACATTTA-TC-AGT-A-AGAGGAGAA------GCTTAAAGATGA--AATCTAA-TTTTaatatagataaataatatgattagtgtcggaaacgtaccatctgaactta
gi|6                          :                                                                                                                                                                                        aGTTC-CTCATTTTCA--TATGATTT-T-CT----TCGAATTTAAATACATATTTGCATCAAAACACGTTTATGCA-AC-C-A---ATAAATAA---ATA-A--ATATAAA-TT-------G--A----G-AAA--A--AAAATG-TA-----------------G--------GCC---AAATAAAGCCCAAATTACCAT--GACTT-TTTTT-TAGTTTGGATAT--TTT---GCA-CTGTACC-TG----T-TA--CGGCAT-GA-----AAAAA
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 AAGGTTTCCAGGCCATTGAaaaggtttccaggccattgaaatataaatttattacatagtaggattaatgtcgttt
gi|7                          : gttcctcattttcatatgattttcttcgaatttaaatacatatttgcatcaaaacacgtttatgcaaccaataaataaataaatataaattgagaaaaaaaatgtaggccaaataaagcccaaattaccatgacttttttttagtttggatattttgcactgtacctgttacggcatgaaaaaaaTTCACTCATTTTTACATATAATTT-T-CT------GAT---------AT-TTTGTAT---ACTTC----ATCCT-AT-TTAGCTCT---TGCTCCATC-ATCGAACATG-TT-------T--AT---GCAAACAA--AAAAT--TA-----------------G--------GCC---A--TA---------TTACCAG--GACACATTCTT-GACTTTAAATA---GTT---GCA-ATGTACC-TG----A-TA--CGGCAT-GC-----AAAAAC----C-A-TGTA---AATGCATGCTT----AAAATAAAATATC-A-----ATAT----ATAAT--TT-TCCTTT-GAAATACAaatataaatttattacatagtaggattaatgtcgttt
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Unaligned ( gi|26 ): ATTGAGATATATGAACAAATAGGATTAATGTCGGAAATGTGCCGTCCGTCCTTCA

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gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   AGCAATGTTTCCAGGCCATTGAatgtttccaggccattgaaataggattaatgtcggaaacgtaccggctgtccttaac
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                               ggccataccaggacacttttttgtgtttgaatattttgcattgtatctgttacagcatgcaaaaaccatgtaaatagtcataaataaaatatcgagaatattttcccctttgaaatacatttatcagatataggA---------CTACCAG--GACAC-TTTT--GAGTTGGAATAT--TTT---GCA-TTGTACT-TG----T-TA--CGGCAT-GC-----AAAAAC----C-A-TG---------------------------------GA-----ATAT----ATATT--TT-CCCTTT-GAAATACATTTA-TC-AG--ATATAGGAGTA------GCTTAAAAATAG--AATATAA--TATTG-GAAGCAAAATATCCAGG-CATTGAaataggattaatgtcggaaacgtaccggctgtccttaac
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    AT-GG-----AAAAAC----C-A-TGTA---A----ATGCTC---AAA--TA---TAT--------ACAT----GTATT--TT-GCCTTT-TAAATATATTTA-TC-A-A-ATATAGAAGTACATGTAGCTTACAAA--A--AATATAA-TTTTTG-GAAGCAACGTTTTCAGGCCATTGAaatatgaataaacaataggattaatgtcggaa
gi|14                         :                                                                                                                                                                                          TTC-CCCATCTTTA--TATAATTT-T-CC----T-----------------TT-TAT---AACGC----AT-C--------------CT--TGC---ATC-A--AAACACG-T---T-------T--AT---A-AAA--A--AAAA----A-----------------G--------GCC---C--TA---------TTTCCACCTGACAC-T---------------AT--TAT---GCA-TTGTACC-TG----T-CA--CGGTTT-GC-----AAAAAC----TTA-TGTA---A----ATGCTC---AAAAATAAAATATCGaatataaataaacaatagtattaatgtcggaaacgcaccgcctgtccttaat
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                             gtattT--TGC---ATA-A--AAACATG-T---T-------T--AT---G-AAA--A--AAAA----A-----------------A--------CTC---A--TA---------TCACCAA--GGCAC-TTTTT-GAGTTTGAATGT--CTT---GCA-TTTTACA-TG----T-TA------ATGGC-----AAACAC----C-A-TTCA---A----ATGCTC---AAACATAAACAATCGA-----ATAT----GTATT--TT-CCC
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TGACTATCGTTG---GCA-CTGTACCCTG----T-TA--CTGGAC-GCTACAAAAGAACGCAGC-ACTGTA---A----AAAATCGACAAAAAGTAAATACGAA-----ACATTGCAATGTT--TTTCCCGTT-GAAATTCACTTAATC-ACA--TATAGGA
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         cCTTT-GAAATACATGCATTC-AG--ATATAGGAGAA------GCTTAGAAATAA--AATGTAA-TTTTTG-GAAGCGATGTTTTCAGGCCATTGA
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  T--TG-CCCTTT-GAAATACA------CGAGA-AT----------------CTTAAAAATAA--AATTGAA-TTTTTG-GAAGTAATGTTTCCAGCCCACTAAaatgtaattagataataggattaatgtcgggaacatactgtctggccttga
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  T-GAGTTTGAATAT--TTT---GCA-TTGTACC-TG----TGTAATTGTCAT-GC-----AAAAAC----C-A-CGTA---A----ATGCTC---AAAAACAGAATATGGA-----ACAT----ATAT-----------------TATGTTTA-TC-AG--ATATAGGAATA------GCTTAAAAATattataaatatataacaggattagtgtcgtaaaagtactctctgtccttagaa
gi|2                          :                                                                                                                                                                                      TACATTC-TTCATTTTTA--TATAATTT-T-CC----TAGAA---------AT-TTTGCAT---AATAC----ATACAATG-TA-------CT--TGT---ATC-A--AAACATG-T---TAAAACTTT--AT---GCCAA--A--AAAAT--TA-----------------G--------GCC---A--TG---------TTACCAG--GACAC-TTTCT-GAGTTTGAATAT--TTT---GCA-TTGTACC-TT----T-TA--CAGCAT-GC-----AAAAAC----C-A-TGTATTGA----ATGCTC---AAAAATGAAATATTGA-----ATAT----ATATT--TT-CCTTTT-GAAATACATTTA-TC-AGA-ATAAAGGAGTA------GCTTAAAAATCA--AATATAA-TATTTG-GAAGCAATGTTTCCTGGCCATTGA
gi|20                         :                                                                                                                                                                                         GTTC-CTCATTTGTA--TTTGATTT-T-CC----TCGAA---------AT-T------------------------------------CT--TCC---ATT-A--AAATATG-T---T-------TAAAT---GCCAA--A--AAAAA--AAAGAAAAAAAAAAGGGGGG--------GTC---A--TA---------TTACCAG--GACAC-GTTCT-GAGT
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      T-CCCATT-GAAATGCATTTT-CC-AGA--TATAGGAGTA------GCCTAAAATTAA--AATATAA-TATTTA-GAGGCAATG
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                      C----TTGAA---------AG-TTTGTAT---AATAC----ATAC-----T------------------------------TG-T---C-------G--AT---G-GAA--A--AAA-----------------------G--------GCC---T--TA---------TTACCAG--AACAC-ATTT---------AATAT--TTT---GCA-TTGTACC-AG----T-TA--CGACAT-GC-----Aaaatataaataaacaatgggatccatgt
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               A--AATATAT-TTTTTG-GAAGCAATGTTTCCAGGCCTTT
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                           aggAA---------AT-TTTGTAT---AATAC----A--------TA-------CT--TGC---ATC-A--AGACTTGTT---T-------T--AT---GCAAA--A--Acaaatatgagtaaatattttaagactgatgtcggaaacgtgccttttttcaatg
gi|25                         :                                                                                                                                                               aacttaatttcaactatcatgttgtCGTTC-CTCATTTTTA--TGTAATTT-T-TC----TCGAA---------AT-TTAGTAT---AATGC----ACAC------A-----------TGC---AT
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                   cTCTA--TATAATTTCT-TCGAAATCGAA---------AT-TTTGTAT---AATAC----A--------TA-------CT--TGC---ATC-
gi|28                         :                                                                                                                                                                                      TACGTCC-CTCATTTTTA--TACTGTTT-T-CC----TCGAA---------AT-TTTGTAT---AATA-----ATA
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                  T--TGC---ACT-A--AAACATG-T---T-------T--AT---GCCAA--A--AAAAAAATA-----------------G--------GCC---A--TA---------TTACGAG--GACAC-GTTGA-GAGTTTGAATAT--TTTTTTGCA-TTGTACC-TG----T-TA--CGGCAT-GC-----AAATAC----C-A-TGTG---A----ATGCTC---AAGAATATAATGTCGA-----ATAT----ATATT--TT-CCTTTTTGAAATCAAATTA-TC-AGATATACAGGAGTA------ACTTAAA-----------------TTTG-GAAGCA-TGTTTCCAGACTATTGA
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ATG-T---T-------T--AT---GCAAA--ATAAAAAT---------------------G--------GCC---A--TA---------TTACCAT--GATAC-TCCTT-GAGTTTGAATAT--TTT---TCA-TTGTACC-TC----T-AA--CAGCAT-GC-----AAACAC----A-A-TTTA---A----ATGCTC---AAAAATAAAATACCGA-----ATGT----ATGTT--TT-CCCTTT-GAAATACATTTA-TC-A-A-AGATAGGAGTA------GCT--AAAGCAATCAATATAATTTTTTG-GAAGCAATGTTTACAGGACATTGAaatacaaataaataataagattaatgttggaaacgaactgtctgtcctt
gi|5                          :                                                                                                                                                                                    gtTACGTTC-CTCATTTTTA--TATAATTT-T-CC----TCGAA---------AT-GTTGTAT---TATAC----ATAC-----T------------TGC---ATG-A--AAACATG-T---T-------T--AT---GCCAA--A--AAAAT--TA-----------------G--------GCT---A--TA---------TTACCTG--GACAC-TTTTT-GAGTTTGAATGT--TTT---GAA-TTGTACC-TG----T-TA--CGACAT-GC-----AGAAGC----C-A-TGTA---A----ATGCTC---AAAAATAAAAAATGGA-------AG----GCATT--TT-CCCTTT-GAAATACATTTA-TC-AGT-A-AGAGGAGAA------GCTTAAAGATGA--AATCTAA-TTTTaatatagataaataatatgattagtgtcggaaacgtaccatctgaactta
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gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      AAGGTTTCCAGGCCATTGAaaaggtttccaggccattgaaatataaatttattacatagtaggattaatgtcgttt
gi|7                          : gttcctcattttcatatgattttcttcgaatttaaatacatatttgcatcaaaacacgtttatgcaaccaataaataaataaatataaattgagaaaaaaaatgtaggccaaataaagcccaaattaccatgacttttttttagtttggatattttgcactgtacctgttacggcatgaaaaaaaTTCACTCATTTTTACATATAATTT-T-CT------GAT---------AT-TTTGTAT---ACTTC----ATCC-----TATTTAGCTCT--TGCTCCATC-ATCGAACATG-T---T-------T--AT---GCAAACAA--AAAAT--TA-----------------G--------GCC---A--TA---------TTACCAG--GACACATTCTT-GACTTTAAATA---GTT---GCA-ATGTACC-TG----A-TA--CGGCAT-GC-----AAAAAC----C-A-TGTA---AATGCATGCTT----AAAATAAAATATC-A-----ATAT----ATAAT--TT-TCCTTT-GAAATACAaatataaatttattacatagtaggattaatgtcgttt
gi|8                          :                                                                                                                                                                                    tatACGTTC-CTCATTTTTA--TATGATTT-T-CC----TCGAC---------AA-TTTGTAC---AATAC----ATAC-----T------------TGC---ATTTA--AAACATG-T---T-------T--AC---GCAAA--AT-AAAAT--TA-----------------G--------GCC---A--TA---------TTAACAG--GACAC-TTTTT-GAGTTTGAACAT--TTT---GCA-TTGTTCC-TGAACAT-TG--CGGCAT-GC-----AAAAAC----C-A-TGTC---A----ATGCTC---AAAAATGAAATATATATATATATAT----ATATT--TT-CCgagtgcttaaaa
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Unaligned ( gi|26 ): ATTGAGATATATGAACAAATAGGATTAATGTCGGAAATGTGCCGTCCGTCCTTCA

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Reference ( family-1024 )     :                                                                                                                                                                                      TACGTTC-CTCATTTTTA--TATAATTT-T-CC----TCGAA---------AT-TTTGTAT---AATAC----ATAC-----TA-------CT--TGC---ATC-A--AAACATG-T---T-------T--AT---GCNAA--A--AAAAT--TA-----------------G--------GCC---A--TA---------TTACCAG--GACAC-TTTTT-GAGTTTGAATAT--TTT---GCA-TTGTACC-TG----T-TA--CGGCAT-GC-----AAAAAC----C-A-TGTA---A----ATGCTC---AAAAATAAAATATCGA-----ATAT----ATATT--TT-CCCTTT-GAAATACATTTA-TC-AGA-ATATAGGAGTA------GCTTAAAAATAA--AATATAA-TTTTTG-GAAGCAATGTTTCCAGGCCATTGA
gi|1                          :                                                                                                                                                                                               TCACTTCTA--TATAACTT-TGTT----TCGAA---------AT-TTTGTAT---AATAC----ATAC-----T------------TGC---ATC-A--AAACGTA-T---T-------G--AT---G--AA--A--AAAAT--TA-----------------A--------ACC---A--TA---------TTAACAG--GACAC-T--------------TAT--TTT---GCATTTGTACT-TG----T-TA--CGAAAT-GTA----AAAAAC----C-A-TGTA---A----ATGATC---AAAAATAAAATATT-A-----ATAT----ATATTAGTT-TCCTTT-GCAATACATTAA-TC-AG--ATATAGGAGTA------CTTTAAAAGTAA--ATTATAA-TTTTTG-GAAGCAATGTTTCCAGATCATTAA
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                   ---AGTAT----ATA------TA-------CT--TGC---ATC-A--AAACATG-T---T-------T--ATATCGCTG----------T--TC-----------------GTTATCTTTGTCTTTA--CA---------TTACCAT--GATAC-TTTTT-GAATTTGAATAT--TTT---GCA-TTTTACC-TG----T-TA--CGTCAT-GC-----AATAAC----T-A-TGTA---A----ATGCTC---AAAAATAAAATATCGA-----ATAT----AT----------------------ATTTA-TC-AG--ATATAGGTGTA------GTTTGAAAATAA--AATATAT-TTTTTGAGAAGCAATGTTTCCAaatataaatgaataaaaggattaatgtcggaaacgtatcgtctgcccttc
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                a-----------------G--------GCC---A--TA------------CCAG--GACAC-TTTTTTGTGTTTGAATAT--TTT---GCA-TTGTATC-TG----T-TA--CAGCAT-GC-----AAAAAC----C-A-TGTA---A----ATAGTC---ATAAATAAAATATCGA-----GAAT----AT-TT--TC-CCCTTT-GAAATACATTTA-TC-AG--ATATAGGAGCA------at
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   AGCAATGTTTCCAGGCCATTGAatgtttccaggccattgaaataggattaatgtcggaaacgtaccggctgtccttaac
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                               ggccataccaggacacttttttgtgtttgaatattttgcattgtatctgttacagcatgcaaaaaccatgtaaatagtcataaataaaatatcgagaatattttcccctttgaaatacatttatcagatataggA---------CTACCAG--GACAC-TTTT--GAGTTGGAATAT--TTT---GCA-TTGTACT-TG----T-TA--CGGCAT-GC-----AAAAAC----C-A-TG---------------------------------GA-----ATAT----ATATT--TT-CCCTTT-GAAATACATTTA-TC-AG--ATATAGGAGTA------GCTTAAAAATAG--AATATAA--TATTG-GAAGCAAAATATCCAGG-CATTGAaataggattaatgtcggaaacgtaccggctgtccttaac
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    AT-GG-----AAAAAC----C-A-TGTA---A----ATGCTC---AAA--TA---TAT--------ACAT----GTATT--TT-GCCTTT-TAAATATATTTA-TC-A-A-ATATAGAAGTACATGTAGCTTACAAA--A--AATATAA-TTTTTG-GAAGCAACGTTTTCAGGCCATTGAaatatgaataaacaataggattaatgtcggaa
gi|14                         :                                                                                                                                                                                          TTC-CCCATCTTTA--TATAATTT-T-CC----T-----------------TT-TAT---AACGC----AT-C--------------CT--TGC---ATC-A--AAACACG-T---T-------T--AT---A-AAA--A--AAAA----A-----------------G--------GCC---C--TA---------TTTCCACCTGACAC-T---------------AT--TAT---GCA-TTGTACC-TG----T-CA--CGGTTT-GC-----AAAAAC----TTA-TGTA---A----ATGCTC---AAAAATAAAATATCGaatataaataaacaatagtattaatgtcggaaacgcaccgcctgtccttaat
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                             gtattT--TGC---ATA-A--AAACATG-T---T-------T--AT---G-AAA--A--AAAA----A-----------------A--------CTC---A--TA---------TCACCAA--GGCAC-TTTTT-GAGTTTGAATGT--CTT---GCA-TTTTACA-TG----T-TA------ATGGC-----AAACAC----C-A-TTCA---A----ATGCTC---AAACATAAACAATCGA-----ATAT----GTATT--TT-CCC
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TGACTATCGTTG---GCA-CTGTACCCTG----T-TA--CTGGAC-GCTACAAAAGAACGCAGC-ACTGTA---A----AAAATCGACAAAAAGTAAATACGAA-----ACATTGCAATGTT--TTTCCCGTT-GAAATTCACTTAATC-ACA--TATAGGA
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         cCTTT-GAAATACATGCATTC-AG--ATATAGGAGAA------GCTTAGAAATAA--AATGTAA-TTTTTG-GAAGCGATGTTTTCAGGCCATTGA
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  T--TG-CCCTTT-GAAATACA------CGAGA-AT----------------CTTAAAAATAA--AATTGAA-TTTTTG-GAAGTAATGTTTCCAGCCCACTAAaatgtaattagataataggattaatgtcgggaacatactgtctggccttga
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  T-GAGTTTGAATAT--TTT---GCA-TTGTACC-TG----TGTAATTGTCAT-GC-----AAAAAC----C-A-CGTA---A----ATGCTC---AAAAACAGAATATGGA-----ACAT----ATAT-----------------TATGTTTA-TC-AG--ATATAGGAATA------GCTTAAAAATattataaatatataacaggattagtgtcgtaaaagtactctctgtccttagaa
gi|2                          :                                                                                                                                                                                      TACATTC-TTCATTTTTA--TATAATTT-T-CC----TAGAA---------AT-TTTGCAT---AATAC----ATACAATG-TA-------CT--TGT---ATC-A--AAACATG-T---TAAAACTTT--AT---GCCAA--A--AAAAT--TA-----------------G--------GCC---A--TG---------TTACCAG--GACAC-TTTCT-GAGTTTGAATAT--TTT---GCA-TTGTACC-TT----T-TA--CAGCAT-GC-----AAAAAC----C-A-TGTATTGA----ATGCTC---AAAAATGAAATATTGA-----ATAT----ATATT--TT-CCTTTT-GAAATACATTTA-TC-AGA-ATAAAGGAGTA------GCTTAAAAATCA--AATATAA-TATTTG-GAAGCAATGTTTCCTGGCCATTGA
gi|20                         :                                                                                                                                                                                         GTTC-CTCATTTGTA--TTTGATTT-T-CC----TCGAA---------AT-T------------------------------------CT--TCC---ATT-A--AAATATG-T---T-------TAAAT---GCCAA--A--AAAAA--AAAGAAAAAAAAAAGGGGGG--------GTC---A--TA---------TTACCAG--GACAC-GTTCT-GAGT
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      T-CCCATT-GAAATGCATTTT-CC-AGA--TATAGGAGTA------GCCTAAAATTAA--AATATAA-TATTTA-GAGGCAATG
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                      C----TTGAA---------AG-TTTGTAT---AATAC----ATAC-----T------------------------------TG-T---C-------G--AT---G-GAA--A--AAA-----------------------G--------GCC---T--TA---------TTACCAG--AACAC-ATTT---------AATAT--TTT---GCA-TTGTACC-AG----T-TA--CGACAT-GC-----Aaaatataaataaacaatgggatccatgt
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               A--AATATAT-TTTTTG-GAAGCAATGTTTCCAGGCCTTT
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                           aggAA---------AT-TTTGTAT---AATAC----A--------TA-------CT--TGC---ATC-A--AGACTTGTT---T-------T--AT---GCAAA--A--Acaaatatgagtaaatattttaagactgatgtcggaaacgtgccttttttcaatg
gi|25                         :                                                                                                                                                               aacttaatttcaactatcatgttgtCGTTC-CTCATTTTTA--TGTAATTT-T-TC----TCGAA---------AT-TTAGTAT---AATGC----ACAC------A-----------TGC---AT
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                   cTCTA--TATAATTTCT-TCGAAATCGAA---------AT-TTTGTAT---AATAC----A--------TA-------CT--TGC---ATC-
gi|28                         :                                                                                                                                                                                      TACGTCC-CTCATTTTTA--TACTGTTT-T-CC----TCGAA---------AT-TTTGTAT---AATA-----ATA
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                  T--TGC---ACT-A--AAACATG-T---T-------T--AT---GCCAA--A--AAAAAAATA-----------------G--------GCC---A--TA---------TTACGAG--GACAC-GTTGA-GAGTTTGAATAT--TTTTTTGCA-TTGTACC-TG----T-TA--CGGCAT-GC-----AAATAC----C-A-TGTG---A----ATGCTC---AAGAATATAATGTCGA-----ATAT----ATATT--TT-CCTTTTTGAAATCAAATTA-TC-AGATATACAGGAGTA------ACTTAAA-----------------TTTG-GAAGCA-TGTTTCCAGACTATTGA
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ATG-T---T-------T--AT---GCAAA--ATAAAAAT---------------------G--------GCC---A--TA---------TTACCAT--GATAC-TCCTT-GAGTTTGAATAT--TTT---TCA-TTGTACC-TC----T-AA--CAGCAT-GC-----AAACAC----A-A-TTTA---A----ATGCTC---AAAAATAAAATACCGA-----ATGT----ATGTT--TT-CCCTTT-GAAATACATTTA-TC-A-A-AGATAGGAGTA------GCT--AAAGCAATCAATATAATTTTTTG-GAAGCAATGTTTACAGGACATTGAaatacaaataaataataagattaatgttggaaacgaactgtctgtcctt
gi|5                          :                                                                                                                                                                                    gtTACGTTC-CTCATTTTTA--TATAATTT-T-CC----TCGAA---------AT-GTTGTAT---TATAC----ATAC-----T------------TGC---ATG-A--AAACATG-T---T-------T--AT---GCCAA--A--AAAAT--TA-----------------G--------GCT---A--TA---------TTACCTG--GACAC-TTTTT-GAGTTTGAATGT--TTT---GAA-TTGTACC-TG----T-TA--CGACAT-GC-----AGAAGC----C-A-TGTA---A----ATGCTC---AAAAATAAAAAATGGA-------AG----GCATT--TT-CCCTTT-GAAATACATTTA-TC-AGT-A-AGAGGAGAA------GCTTAAAGATGA--AATCTAA-TTTTaatatagataaataatatgattagtgtcggaaacgtaccatctgaactta
gi|6                          :                                                                                                                                                                                        aGTTC-CTCATTTTCA--TATGATTT-T-CT----TCGAATTTAAATACATATTTGCATCAAAACACGTTTATGC-----AA-------CCAATAA---ATA-A--ATAAATA-TAAAT-------T--GA---G-AAA--A--AAAATG-TA-----------------G--------GCC---AAATAAAGCCCAAATTACCAT--GACTT-TTTTT-TAGTTTGGATAT--TTT---GCA-CTGTACC-TG----T-TA--CGGCAT-GA-----AAAAA
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      AAGGTTTCCAGGCCATTGAaaaggtttccaggccattgaaatataaatttattacatagtaggattaatgtcgttt
gi|7                          : gttcctcattttcatatgattttcttcgaatttaaatacatatttgcatcaaaacacgtttatgcaaccaataaataaataaatataaattgagaaaaaaaatgtaggccaaataaagcccaaattaccatgacttttttttagtttggatattttgcactgtacctgttacggcatgaaaaaaaTTCACTCATTTTTACATATAATTT-T-CT------GAT---------AT-TTTGTAT---ACTTC----ATCC-----TATTTAGCTCT--TGCTCCATC-ATCGAACATG-T---T-------T--AT---GCAAACAA--AAAAT--TA-----------------G--------GCC---A--TA---------TTACCAG--GACACATTCTT-GACTTTAAATA---GTT---GCA-ATGTACC-TG----A-TA--CGGCAT-GC-----AAAAAC----C-A-TGTA---AATGCATGCTT----AAAATAAAATATC-A-----ATAT----ATAAT--TT-TCCTTT-GAAATACAaatataaatttattacatagtaggattaatgtcgttt
gi|8                          :                                                                                                                                                                                    tatACGTTC-CTCATTTTTA--TATGATTT-T-CC----TCGAC---------AA-TTTGTAC---AATAC----ATAC-----T------------TGC---ATTTA--AAACATG-T---T-------T--AC---GCAAA--AT-AAAAT--TA-----------------G--------GCC---A--TA---------TTAACAG--GACAC-TTTTT-GAGTTTGAACAT--TTT---GCA-TTGTTCC-TGAACAT-TG--CGGCAT-GC-----AAAAAC----C-A-TGTC---A----ATGCTC---AAAAATGAAATATATATATATATAT----ATATT--TT-CCgagtgcttaaaa
gi|9                          :                                                                                                                                                                                               TTATTTTTA--TATAATTT-T-CC----TCGAA---------AT-TTTGTAT---AATAC----ATACATGTGTA-------CT--AGC---ATC-A--AAACATA-T---G-------T--AT---GCGAA--A--CAAAA--AA-----------------A--------GTC---A--T---------------------------TTT-AAGTTTGA-------------TA-TTGTACC-TG----T-TA--CGGGGT-GC-----AAAAAC----C-A-TGTA---A----ATGCTC---AAAAATAAAATATCGA-----ATAT----ATATT--TT-CCCTCT-GAAATACATTTA-TC-AG--ATATAGGATGA------GCTTAAAAATAA--ATTAGGA-TTTTTaaaaagaatatggtttggtacagaaata


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blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                             .          .         . .  .        .          .       .       .    TACAATGTACT             .     . .        . .   .       .   .   CC  .  .     AAATAG                            .   .   .               .      .    T             .    .     .       .  .    .  .       .  .          .    . .    .   .         .               CG .        .        .   .      .            .  .  A            .                 .        .      .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                             .          .         . .  .        .          .       .       .    TGCAACCAA               .     . .        . .   .       .   .   CA  .  .     TGTAG                             .   .   .               .      .    T             .    .     .       .  .    .  .       .  .          .    . .    .   .         .               CG .        .        .   .      .            .  .  A            .                 .        .      .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                             .          .         . .  .        .          .       .       .    TATACT                  .     . .        . .   .       .   .   CC  .  .     TTAG                              .   .   .               .      .    T             .    .     .       .  .    .  .       .  .          .    . .    .   .         .               GA .        .        .   .      .            .  .  A            .                 .        .      .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                             .          .         . .  .        .          .       .       .    TCCT                    .     . .        . .   .       .   .   CA  .  .     TTAG                              .   .   .               .      .    T             .    .     .       .  .    .  .       .  .          .    . .    .   .         .               GG .        .        .   .      .            .  .  A            .                 .        .      .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                             .          .         . .  .        .          .       .       .    TACT                    .     . .        . .   .       .   .   CC  .  .     TTAG                              .   .   .               .      .    A             .    .     .       .  .    .  .       .  .          .    . .    .   .         .               TG .        .        .   .      .            .  .  A            .                 .        .      .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                             .          .         . .  .        .          .       .       .    TACT                    .     . .        . .   .       .   .   CA  .  .     TTAG                              .   .   .               .      .    T             .    .     .       .  .    .  .       .  .          .    . .    .   .         .               CG .        .        .   .      .            .  .  T            .                 .        .      .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                        .         . .  .        .          .       .       .    CACA                    .     . .        . .   .       .   .   CA  .  .     AAAA                              .   .   .               .      .    T             .    .     .       .  .    .  .       .  .          .    . .    .   .         .               CG .        .        .   .      .            .  .  .            .                 .        .      .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                        .         . .  .        .          .       .       .    TACT                    .     . .        . .   .       .   .   CG  .  .     AG                                .   .   .               .      .    T             .    .     .       .  .    .  .       .  .          .    . .    .   .         .               GG .        .        .   .      .            .  .  .            .                 .        .      .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                        .         . .  .        .          .       .       .    TACT                    .     . .        . .   .       .   .   A   .  .     AA                                .   .   .               .      .    T             .    .     .       .  .    .  .       .  .          .    . .    .   .         .               AT .        .        .   .      .            .  .  .            .                 .        .       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                       .        .          .       .       .    TACT                    .     . .        . .   .       .   .   A   .  .     TG                                .   .   .               .      .    T             .    .     .       .  .    .  .       .  .          .    . .    .   .         .               CG .        .        .   .      .            .  .  .            .                 .        .       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                .          .       .       .    CT                      .     . .        . .   .       .   .   G   .  .     G                                 .   .   .               .      .    T             .    .     .       .  .    .  .       .  .          .    . .    .   .         .               G  .        .        .   .      .            .  .  .            .                                  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                   .       .                            .     .          . .   .       .   .   A   .  .                                       .   .   .               .      .    .             .    .     .       .  .    .  .       .  .          .    . .    .   .         .               C  .        .        .   .      .            .  .  .                                               
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gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   AGCAATGTTTCCAGGCCATTGAatgtttccaggccattgaaataggattaatgtcggaaacgtaccggctgtccttaac
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                               ggccataccaggacacttttttgtgtttgaatattttgcattgtatctgttacagcatgcaaaaaccatgtaaatagtcataaataaaatatcgagaatattttcccctttgaaatacatttatcagatataggA---------CTACCAG--GACAC-TTTT--GAGTTGGAATAT--TTT---GCA-TTGTACT-TG----T-TA--CGGCAT-GC-----AAAAAC----C-A-TG---------------------------------GA-----ATAT----ATATT--TT-CCCTTT-GAAATACATTTA-TC-AG--ATATAGGAGTA------GCTTAAAAATAG--AATATAA--TATTG-GAAGCAAAATATCCAGG-CATTGAaataggattaatgtcggaaacgtaccggctgtccttaac
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    AT-GG-----AAAAAC----C-A-TGTA---A----ATGCTC---AAA--TA---TAT--------ACAT----GTATT--TT-GCCTTT-TAAATATATTTA-TC-A-A-ATATAGAAGTACATGTAGCTTACAAA--A--AATATAA-TTTTTG-GAAGCAACGTTTTCAGGCCATTGAaatatgaataaacaataggattaatgtcggaa
gi|14                         :                                                                                                                                                                                          TTC-CCCATCTTTA--TATAATTT-T-CC----T-----------------TT-TAT---AACGC----AT-C--------------CT--TGC---ATC-A--AAACACG-T---T-------T--AT---A-AAA--A--AAAA----A-----------------G--------GCC---C--TA---------TTTCCACCTGACAC-T---------------AT--TAT---GCA-TTGTACC-TG----T-CA--CGGTTT-GC-----AAAAAC----TTA-TGTA---A----ATGCTC---AAAAATAAAATATCGaatataaataaacaatagtattaatgtcggaaacgcaccgcctgtccttaat
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                             gtattT--TGC---ATA-A--AAACATG-T---T-------T--AT---G-AAA--A--AAAA----A-----------------A--------CTC---A--TA---------TCACCAA--GGCAC-TTTTT-GAGTTTGAATGT--CTT---GCA-TTTTACA-TG----T-TA------ATGGC-----AAACAC----C-A-TTCA---A----ATGCTC---AAACATAAACAATCGA-----ATAT----GTATT--TT-CCC
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TGACTATCGTTG---GCA-CTGTACCCTG----T-TA--CTGGAC-GCTACAAAAGAACGCAGC-ACTGTA---A----AAAATCGACAAAAAGTAAATACGAA-----ACATTGCAATGTT--TTTCCCGTT-GAAATTCACTTAATC-ACA--TATAGGA
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         cCTTT-GAAATACATGCATTC-AG--ATATAGGAGAA------GCTTAGAAATAA--AATGTAA-TTTTTG-GAAGCGATGTTTTCAGGCCATTGA
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  T--TG-CCCTTT-GAAATACA------CGAGA-AT----------------CTTAAAAATAA--AATTGAA-TTTTTG-GAAGTAATGTTTCCAGCCCACTAAaatgtaattagataataggattaatgtcgggaacatactgtctggccttga
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  T-GAGTTTGAATAT--TTT---GCA-TTGTACC-TG----TGTAATTGTCAT-GC-----AAAAAC----C-A-CGTA---A----ATGCTC---AAAAACAGAATATGGA-----ACAT----ATAT-----------------TATGTTTA-TC-AG--ATATAGGAATA------GCTTAAAAATattataaatatataacaggattagtgtcgtaaaagtactctctgtccttagaa
gi|2                          :                                                                                                                                                                                      TACATTC-TTCATTTTTA--TATAATTT-T-CC----TAGAA---------AT-TTTGCAT---AATAC----ATACAATG-TA-------CT--TGT---ATC-A--AAACATG-T---TAAAACTTT--AT---GCCAA--A--AAAAT--TA-----------------G--------GCC---A--TG---------TTACCAG--GACAC-TTTCT-GAGTTTGAATAT--TTT---GCA-TTGTACC-TT----T-TA--CAGCAT-GC-----AAAAAC----C-A-TGTATTGA----ATGCTC---AAAAATGAAATATTGA-----ATAT----ATATT--TT-CCTTTT-GAAATACATTTA-TC-AGA-ATAAAGGAGTA------GCTTAAAAATCA--AATATAA-TATTTG-GAAGCAATGTTTCCTGGCCATTGA
gi|20                         :                                                                                                                                                                                         GTTC-CTCATTTGTA--TTTGATTT-T-CC----TCGAA---------AT-T------------------------------------CT--TCC---ATT-A--AAATATG-T---T-------TAAAT---GCCAA--A--AAAAA--AAAGAAAAAAAAAAGGGGGG--------GTC---A--TA---------TTACCAG--GACAC-GTTCT-GAGT
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      T-CCCATT-GAAATGCATTTT-CC-AGA--TATAGGAGTA------GCCTAAAATTAA--AATATAA-TATTTA-GAGGCAATG
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                      C----TTGAA---------AG-TTTGTAT---AATAC----ATAC-----T------------------------------TG-T---C-------G--AT---G-GAA--A--AAA-----------------------G--------GCC---T--TA---------TTACCAG--AACAC-ATTT---------AATAT--TTT---GCA-TTGTACC-AG----T-TA--CGACAT-GC-----Aaaatataaataaacaatgggatccatgt
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               A--AATATAT-TTTTTG-GAAGCAATGTTTCCAGGCCTTT
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                           aggAA---------AT-TTTGTAT---AATAC----A--------TA-------CT--TGC---ATC-A--AGACTTGTT---T-------T--AT---GCAAA--A--Acaaatatgagtaaatattttaagactgatgtcggaaacgtgccttttttcaatg
gi|25                         :                                                                                                                                                               aacttaatttcaactatcatgttgtCGTTC-CTCATTTTTA--TGTAATTT-T-TC----TCGAA---------AT-TTAGTAT---AATGC----ACAC------A-----------TGC---AT
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                   cTCTA--TATAATTTCT-TCGAAATCGAA---------AT-TTTGTAT---AATAC----A--------TA-------CT--TGC---ATC-
gi|28                         :                                                                                                                                                                                      TACGTCC-CTCATTTTTA--TACTGTTT-T-CC----TCGAA---------AT-TTTGTAT---AATA-----ATA
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                  T--TGC---ACT-A--AAACATG-T---T-------T--AT---GCCAA--A--AAAAAAATA-----------------G--------GCC---A--TA---------TTACGAG--GACAC-GTTGA-GAGTTTGAATAT--TTTTTTGCA-TTGTACC-TG----T-TA--CGGCAT-GC-----AAATAC----C-A-TGTG---A----ATGCTC---AAGAATATAATGTCGA-----ATAT----ATATT--TT-CCTTTTTGAAATCAAATTA-TC-AGATATACAGGAGTA------ACTTAAA-----------------TTTG-GAAGCA-TGTTTCCAGACTATTGA
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ATG-T---T-------T--AT---GCAAA--ATAAAAAT---------------------G--------GCC---A--TA---------TTACCAT--GATAC-TCCTT-GAGTTTGAATAT--TTT---TCA-TTGTACC-TC----T-AA--CAGCAT-GC-----AAACAC----A-A-TTTA---A----ATGCTC---AAAAATAAAATACCGA-----ATGT----ATGTT--TT-CCCTTT-GAAATACATTTA-TC-A-A-AGATAGGAGTA------GCT--AAAGCAATCAATATAATTTTTTG-GAAGCAATGTTTACAGGACATTGAaatacaaataaataataagattaatgttggaaacgaactgtctgtcctt
gi|5                          :                                                                                                                                                                                    gtTACGTTC-CTCATTTTTA--TATAATTT-T-CC----TCGAA---------AT-GTTGTAT---TATAC----ATAC-----T------------TGC---ATG-A--AAACATG-T---T-------T--AT---GCCAA--A--AAAAT--TA-----------------G--------GCT---A--TA---------TTACCTG--GACAC-TTTTT-GAGTTTGAATGT--TTT---GAA-TTGTACC-TG----T-TA--CGACAT-GC-----AGAAGC----C-A-TGTA---A----ATGCTC---AAAAATAAAAAATGGA-------AG----GCATT--TT-CCCTTT-GAAATACATTTA-TC-AGT-A-AGAGGAGAA------GCTTAAAGATGA--AATCTAA-TTTTaatatagataaataatatgattagtgtcggaaacgtaccatctgaactta
gi|6                          :                                                                                                                                                                                        aGTTC-CTCATTTTCA--TATGATTT-T-CT----TCGAATTTAAATACATATTTGCATCAAAACACGTTTATGC-----AA-------CCAATAA---ATA-A--ATAAATA-TAAAT-------T--GA---G-AAA--A--AAAATG-TA-----------------G--------GCC---AAATAAAGCCCAAATTACCAT--GACTT-TTTTT-TAGTTTGGATAT--TTT---GCA-CTGTACC-TG----T-TA--CGGCAT-GA-----AAAAA
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      AAGGTTTCCAGGCCATTGAaaaggtttccaggccattgaaatataaatttattacatagtaggattaatgtcgttt
gi|7                          : gttcctcattttcatatgattttcttcgaatttaaatacatatttgcatcaaaacacgtttatgcaaccaataaataaataaatataaattgagaaaaaaaatgtaggccaaataaagcccaaattaccatgacttttttttagtttggatattttgcactgtacctgttacggcatgaaaaaaaTTCACTCATTTTTACATATAATTT-T-CT------GAT---------AT-TTTGTAT---ACTTC----ATCC-----TATTTAGCTCT--TGCTCCATC-ATCGAACATG-T---T-------T--AT---GCAAACAA--AAAAT--TA-----------------G--------GCC---A--TA---------TTACCAG--GACACATTCTT-GACTTTAAATA---GTT---GCA-ATGTACC-TG----A-TA--CGGCAT-GC-----AAAAAC----C-A-TGTA---AATGCATGCTT----AAAATAAAATATC-A-----ATAT----ATAAT--TT-TCCTTT-GAAATACAaatataaatttattacatagtaggattaatgtcgttt
gi|8                          :                                                                                                                                                                                    tatACGTTC-CTCATTTTTA--TATGATTT-T-CC----TCGAC---------AA-TTTGTAC---AATAC----ATAC-----T------------TGC---ATTTA--AAACATG-T---T-------T--AC---GCAAA--AT-AAAAT--TA-----------------G--------GCC---A--TA---------TTAACAG--GACAC-TTTTT-GAGTTTGAACAT--TTT---GCA-TTGTTCC-TGAACAT-TG--CGGCAT-GC-----AAAAAC----C-A-TGTC---A----ATGCTC---AAAAATGAAATATATATATATATAT----ATATT--TT-CCgagtgcttaaaa
gi|9                          :                                                                                                                                                                                               TTATTTTTA--TATAATTT-T-CC----TCGAA---------AT-TTTGTAT---AATAC----ATACATGTGTA-------CT--AGC---ATC-A--AAACATA-T---G-------T--AT---GCGAA--A--CAAAA--AA-----------------A--------GTC---A--T---------------------------TTT-AAGTTTGA-------------TA-TTGTACC-TG----T-TA--CGGGGT-GC-----AAAAAC----C-A-TGTA---A----ATGCTC---AAAAATAAAATATCGA-----ATAT----ATATT--TT-CCCTCT-GAAATACATTTA-TC-AG--ATATAGGATGA------GCTTAAAAATAA--ATTAGGA-TTTTTaaaaagaatatggtttggtacagaaata

Unaligned ( gi|26 ): ATTGAGATATATGAACAAATAGGATTAATGTCGGAAATGTGCCGTCCGTCCTTCA