lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 66666 1 2 8888888888888888888888888888888 1 55555555555 444444444444444 1111 2222222 444 22 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 22222222222 333333333333333333333333 11111 111111 22 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 11 6666666666 33333 111 2222 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 111111 11111 11111111111 111111111111 33333333333333333 111111111111 1111111 1111111111 1111111 111 333333333333333333333 11111 1111111 11111111 1 111111 1111
lowQualScore : 88888 2 2 0 2 5 6 33 66 333 33 7777777777777777777777777777777 5 3 3 3 77777777777 555555555555555 77 3 77 2222 0 9999999 555 22 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 33 99 11111111111 7 666666666666666666666666 333 2 77 66666 8 2 2 8888 777777 22 1 0 7 22 2 22 2 22 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 77 2 33 6666666666 2 55555 999 444 0000 5 2 2 2 6666 33 2 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 66666 666666 2 55 00 2 44444 33 5 33 5 2 2 88 33 22222222222 2 33 777 333333333333 2 33333333333333333 2 0 5555 4444 666666666666 55 0000000 4444 33 7777 2 2 33 55 2 2 2 555 2 55 5555555555 2 6 2 7777777 33 6666 777 2 555555555555555555555 3 44 3 22222 0000000 6 3 3 44 3 3 33 555 3 3 3 11111111 2 0 666666 55555 2 2222 777 0 2 1 2 77 33 3 5 66 7 4 33 2 2 2 5 1 22 2 2
lowQualScore : ..... . . . . . . .. .. ... .. ............................... . . . . ........... ............... .. . .. .... . ....... ... .. .................................................................................................. .. .. ........... . ........................ ... . .. ..... . . . .... ...... .. . . . .. . .. . .. ...................................................................................... .. . .. .......... . ..... ... ... .... . . . . .... .. . ....................................................................................................................... ..... ...... . .. .. . ..... .. . .. . . . .. .. ........... . .. ... ............ . ................. . . .... .... ............ .. ....... .... .. .... . . .. .. . . . ... . .. .......... . . . ....... .. .... ... . ..................... . .. . ..... ....... . . . .. . . .. ... . . . ........ . . ...... ..... . .... ... . . . . .. .. . . .. . . .. . . . . . .. . .
lowQualScore : 44444 9 6 7 9 7 2 00 88 666 99 2222222222222222222222222222222 0 1 1 1 33333333333 999999999999999 33 3 11 1111 7 3333333 000 22 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 11 22 55555555555 9 888888888888888888888888 777 1 11 66666 4 2 1 7777 444444 99 3 4 7 88 1 99 5 99 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 55 7 77 2222222222 9 99999 000 888 7777 3 7 7 7 7777 77 7 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 77777 333333 7 33 99 7 11111 44 0 44 0 5 5 44 44 11111111111 4 22 777 999999999999 7 66666666666666666 7 2 7777 3333 777777777777 66 9999999 3333 22 6666 4 4 22 66 4 4 4 999 4 99 4444444444 7 2 7 3333333 77 8888 111 9 222222222222222222222 3 66 3 77777 0000000 2 1 1 22 1 1 99 444 1 1 1 88888888 9 4 555555 11111 9 1111 999 7 7 6 5 00 44 2 0 55 1 7 44 4 4 4 0 4 88 7 7
consensus : NACAGTTGCA--TC-GCGG-GGGAAAATGTC-AT-AATA-TTTT-A--T-CGTTA--TTTACT-AAC--G-TTAT----C-AAG--GTG-ACATTATGT-ATA-CG-TGAAACANTTTCCTTG--TCCTAT-AATA-A-CA--T--ATTCTTTC--CTTT-TAT-NC----CGCTCTCCATTACCAG-ATCACTCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCATAAA-TTCT---TACGAC-C-A-GC-----T---G--A-G--A---A---CTGTGT-A-AATTG-CAACG--ATAC--GC---A---GCAT-G--C---G----G--AT--GT--TGGAAGA--------TTATATAC-TTA-TT---T-A----C-GTA-T---TA-AA--T---G-ATANAGC-AG----AAA------G--TGATGGGAAGAAA-CTTC-T--GACGC--AA-GAGAGAAACC-CT-TTC-CCG-GTAT--AC-A-A-TAA----T--T--T---TG---C-A-T-AC-T------GT---C---G--AAAA-TTGAAA-A--GTA-----TG--CCGC-GTTGT--A-TGCA-TTTT--AAA-C-TATTTT-C-TTT-TA-TAC-G-AG--A-A--G--G---------TT--------TTTCC-C-----A--A---CA---TTTTCATG-----TAATGT---TTA--AA--TTAA--ACTT---T--T---TCTCCTTAA-----TAT--CAAA-----AGGG-T-CGG-CCTGT-ATTTAG-TCG---A--T-A--TC-G-T-TG--CA--A--T---T-T-GCA-A--TTAA-TACA------A-TN-ATT-TTTG-T---T--N---A---TT-CTAA----A-A--T-TA---CA-A-TAT--C-------A--C-G--TGA-T--A-G-T--C--A-C-G-TGAT-A-AT-AAAC--AN---CA-GT-C-TTGNTGA-A-------A--AT---GTA-C-GGA-ATCC--T-----TC--T----ACG-TA-TC--G-AT-AA--GA-------A-CGT-CG-A--TT-C-AC-TCTC---GG-A-T-A---T----T-TTTC-----TTTG---AA-TAGTAC-A-CATGT---ACA-AAACACTTAT-GAT-T--GTTT-TATG--TA-T-GCT-TTTTACGTTA-TT-T-CTGTATG-GGACGCCT-TA-A-TTCAGT
Reference ( gi|1 ) : GACAGTTGCAGATCAGCGG-GGGAAAATGTC-AT-AATAGTTTT-A--T-CGTTA--TTAACT-GAC-TGCTTAT----C-AAGC-GTGCACATTCTGT-ATA-CA-TGAAACACTTTCTTTGC-TCCTAT-AATA-AGCA--C--ATTCTTTC--CTTT-TAT-TC----CGCCCTCCCTTACCCGCATCACTCTCAGCAGCTGCCCACTCTCCATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCATAAA-TTCTATACACGAC-C-A-GC-----T---G--A-G--A---A---CTTTGC-A-AATTGGCAACGCGATAC-CGC---A---GCAT-G--C---GC--CGC-AT--GT--TGGACGA--------TTGTATACCTTA-TT---T-A----C-GT--T---TA-AA--T---G-ATATAGC-AG----AAA------G--TGATGGGAAGAAATCTTC-T--GACGC--AATGAGAAAAACCACTGTTC-CCGAGTAT-GAC-A-A-TAA----T--T--T---TG---T-A-T-A--T------GG---C---A--AAAC-TTGAAA-A--GT------T---CCGC-GTTGT--ACTGCA-CATT--AAAGC-TATTTT-C-TTT-TA-TAC-G-AG--A-A--G--G---------TTG-------TTTCC-C-----A--A---C----TTTTCATG----CTAATGT---TTA--AA--TTAA--ACTT---T--T---TCTCCTTAA-----TATG-CAAA-----AAAA-T-CGG-CCTGT-ATTTAG-TCC---A--T-A--TC-G-T-TG--CA--A--T---T-T-ACA-A--TTGA-TACA------A-TA-ATT-TTTA-T---T--C---A---TT-CTAA----A-A--T-TA---CA-A-CAT--C-------A--C-G--TGA-T--A-G-T--C--A-C-G-TGAT-A-AT-AAAC--AG---CA-GT-C-TTGTTGA-A-------A--AT---GTA-A-GGA-ATCC--T-----TC--T----ACG-TA-TC--G-AT-AA--GA-------A-CGT-CG-A--TT-C-AC-TCTC---GG-A-T-A---T----T-TCTC-----TTTG---AA-TAGTAC-A-CATGT---ACA-AAACACTTAT-GAT-T--GTTT-TATG--TA-T-GCT-TTTTACGTTA-TT-T-CTGTATG-GGACGCCT-TA-A-TTCAGT
gi|30 : ACAGTTGCA--TC-GCGG-G--AAAAT-TC-AT-GAT--TTTT-A--T-CGTTA--TTA-CC-AAC--G--TAT----C-A-GA-GTGACCATTATGT-ATA-CA-TAAAACATTTCCTT----TTCTAT-AATT-AGCA--T--ATTCCTTT--ATAC-AAA-TC----CACTCTCC
gi|31 : ttACAGTTGCAG--C-GCG-------AATGTC-AT-AATA--TTG-A--T-C--TA--TTTAC---AC---CTTAT----C-AAA--GTG-ACATTATGT-ATA-CA-TG-AATA--TTCCTTG---TCTAT-AAT----CA--T--ACACTTTC--CTTT-TAT-AC----C
gi|33 : ttACAGTTGCA--TCGGCGG-G---AAATGTC-AT-AATA--TTA-A--T-CG--A--TTTACT-AAC-----TAT----C-AA-----GTACATTATGT-ATA-CA---GAATA--TTC-CTG--TCC-AT-AAT----CA--T--ACACTTTC--CTTT-TAT-aaatcactctcca
gi|28 : tACAGTTGCA--TC-GCGG-GG--AAATGTC-AT-A-TATTTTA-A--T-CGTTA--TTTACT-AA---ACTTTT----T-A-GT-G-GCG-ATTATGG-A-A-CG-TGAAACATTTATCTTG--TCCTAT-ATTA------------TCTT-C--TTTC-TGT-TT----GGCA------TACCAG-ATCACTCTacaaatcactctcc
gi|6 : CAGTTGCA--TC-GCGG-GGAAA---GTC-AT-AATA--TTT-A--T---TTA--TTAACT-----TCGTTGTAGTGC-ACGCAGTGAACATTATGTTGTA-CA-TGAA-CAATT-----GCGTCCTAT-AATATGGC-------TTCTTCC--TTTT-GATATC----Ctc
gi|8 : CAGT-GCA--TCACCGCCGGGAAA--GTC-AT-AATA-TTTT-A--T--GTTA--TTG-CT-AGC--G-TTAT----CCAAG------ACATTAT-T-ATA-CA-TGAACCAATATC---G--TCCTAT---TA-ATTA--C--ATTCTTTC--CTTT-aaaccactctcatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncataaattctacgacactgaaaactttggaaattgcaacgcatacgtcaagcatggcgatgttggagattttacgtatttaattgaatataatgatatagcgaaaaagtgatggaaaatcttctgacgcaaagagagaacccatttccgtatacaataatttccttgccatactgtcaaaaattgaaaagttgccgcgttgtatgacaatatttaaactattttcttttatacgagaaagttttcccaaacactttcatgtaatgtaaaggttaacttttcttcttaacatatcaaaaggacggcctgtattagtccatatcgttgcaattttgcaattaatacaaaatttttgttagttcaaattacaaatccaacgtgataagcagtgataataaatagagtcttgttgaaaatgtaaggaatctactacgtatcgaaagaacgtcgatcaacctcggattattgtttctttgaatagtcacatgtcaaaacattatgatgtttatgtatgccttttacgttatttgctgtatgggacgccttaattcag
gi|13 : CAGTTGCA--TT-GCGG-GG-AAAACGTTTATGAATA-TTTT-AAAT-CATTA--CTTACT-AAC--G-TTAT----C-AAGT-G---ACATGATGT-ATA-AG-T-AAACAATTTATT-G--TCCTAT-AA-A-ATTA--TGTATTCTTTCG-TTTT-TAT-AC----Catacctaatactctcaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntataatcttacgacacctgacagaaactgtacaattcaaacatacgcaatgcatgcagtggagaatcatatatatctaattgataaagcaaaaagtgtggaaaatctctgacgcaagagagaaaccctgtcctaaactaatatttcttgcatactgccgaaaattgaaaagtatgccgcgttagcatttgcaaacaatttctgaatcggatttccccaacactttcaatgtaagtaaaattgttttttttctccaatatcaaaaggatcggcctgtatgttatgatctgttgcaatttgcaataatttttttgctaattctaaaataaaatcacgtgaagtcacgtgataataaacaacagcctgttgaaattaaggaatctaaggaatcctctacgtagcgatatgaacctcgagtcaactcggatattttcttgatagtaatatgtacaaaacactaagagttagtatcttgtacgtcatttcgttatggtaacctaattc
gi|11 : GTTGCA--TC-GCGG-GG-AAAATGTT-ATGGATATTTGT-A--T-CGTT---TT-ACT-AA---G--TAT----C-AAGT-G---ACATTATGT-ATAGCA-TGAAA-A-TTCCTTT---TCATAT-TAT--------C--ATTATTTCTTCTTT-TAT-ACAAATCACTCTCCATTaaatcactctccaatttctatgtattgaattatgaaattgataatcatattaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacagtgcatgacgatgctggaagtttatatatttattgacatattaaatgtgaggggagaaacttctgacacaatggaaaatcctttcccgtatacaataaattct
gi|5 : atTTGCA--TC-GCGG-GG-AAAATGTC-AT-A-TGATTTT-A--TTCGTTAATTCTACT-AAC-CG-TTA-----C-AAG---TGAACATTATGT-ATA-CA-TGAAACACTT--CTTG--TCCTATAAATG-A----------TCTTTC--CTTT-Ttctttgttagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttacatacttataagagccagctgagaaactgctgaattgcaacgatactcatgcatgtgtcgtgtttggaagatttatacttatttacgtttaaatttgaataacagaaagtaatggcacaaaacgtatgaccaagggaagaccttctcccgtattaacagataatttgcttgcatctgtcagcatatttaaaaagtatgccgcgttttttaatgcattttaaactatttttcttttatacgggaaaaataagttttttgttttctttttccccaaaaaacctttcatgatagtgtaaagttaatttcattcgtcttataaaaggacggctgttttagtcgtatttgcatttgcaattaaat
gi|3 : tG-GGTAAAAT-TC-AT-AAAAATTTTTAC-T-CGTTA--TT---T-AAC-T----AT----G-AAGT-AAATGAATGATGT-ATA-CG-CGAAACATTTTTCTTG--TCCTAT-AA-A-AACT--T--ATATTTCT--CTTttataccaaatcactctccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntacataattcttacgacccagctgaaagaaacttttgaaattgaaaccgatacgcatcaatggtgatgtggaagattgtatactattttaccgtattaaatgattaccagaaaagtgatgggaaaatcttctttgacgaaagagaaactctttcccgtattcaataaatttctttgcactacctgtcaaaaattgaaatagtatgggccgcgttgtatgaacatttaaactatttctttttaataggagaagttttttttttatgtaatggtaaagttaaactttctcttaatatcaaaaggatcggccggtatttagtccatatcgcaataaatggcaattaaatacatttttttgtttaattcttaaattacaaacaccagtgaatagtcccactgtgatacataaaccagcagtcgtgttgaaaatatacagaatccttctaagtatcgataaagaaccgtcgatttctcctcggatcatttttctttgatagtacaacatgtacaaaccacttatgatatgttttatgaatatgctttttacgtatttctgatgggatgccttaattcag
gi|38 : G-GGGAAAATGTC-AT-AATA----T-A--T-CGTTA--TCAAGT-GATATGCTcgcatgtacaccaaagcactttctaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaataattcttatcgaacagtctaaatgagaaatgtggtattgcaacgatagtacagtgcaatgacgatgttggaagtatatatattaatttgcgtattaaattcagaatatcgaaagcgtgaggggagaaacttcatgaaccaaagggacgatctttccgatacaataaattactttgcatactgtcaaaaaattgaaaagtattccgcgttgtttgcattttttataccatcttttatacgcggagaagtttttcccaacactttcattatgtaaaggttacactttataaatctctaatacaaaagggctcggctgtttttagttcggaatatcgttgcaggatatgcaattaataaaataacgtttatggttaaatctaaaattcgatatgtacagtgaatccacgtgatataactgaacaatcttggtggaaatatgtagcggagatcctaatggtattaaaagggatcgattattgaagcgccgaagttcactctcgggtaactttttcattaattgaaatactagtcatgtaactaaaaacttatgattattttatttattgctcttaacgttatttctgtatggacgcttaattca
gi|2 : aggttcttatatatcgc-GGGAAAA--TC-AT--ATATTTTA-A--T-C--TA--TTTACTAGAA-CGTTTAT----C-AA----TG-ACATGATGT-ATA-CGTTGGAACATTTTA-TTG--TCCTAT-AA-A-ATTATGT--ATTCTTTG--GTTTATAT-TC----
gi|9 : cttacatttccattgc-GGGAAA--GTC-AT-AATA-TTTT-A--T--GTTA--TTG-CT-AGC--G-TTAT----CCAAG------ACATTAT-T-ATA-CA-TGAACCAATATC---G--TCCTAT---TA-ATTA--C--ATTCTTTC--CTTT-aaagcatctccaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncataattcttacgaacagcaaataaaatgtggtattgcaacgatatacaagtgcatgacgattggttggaagttatataacttattacatataaattcatatatcagaaaagtgaggagaaaaacttctgacacaaaggggaaatcctttctcttatacaataagattcttgtcattatcgtctcgaaaattgaaaagtatgccgcagttgtttgcattttttaaatcctattttcttttatacggagacacgttttctcccaaccactttctcatatattctaaagtttaacttaagtttactcaattagtcaaaaggtcgggcttgttatttaggtcgagctatcgtctgcaattttgcaaattcaagacaatcatttgtgtttaattctaaagattatgatatcaaccgcttgatgtagtcacgtgattaataaacaacaatcttggtgagaaatgtacggaatcctcagttgatatggtatcgatgaatgaacatcgattctactctcgggtaattttcagttgtatagtagtacacatgtacaaaacacttattattaaatttatatgtactgcttttaacgttattgtctgtatgaggacgcctataattcag
gi|42 : gcc-GGGTAAATGTC-AT-AATATTTTA-A--T-CGTTA--TTTACatacctaatactctcaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntataatcttacgacacctgacagaaactgtacaattcaaacatacgcaatgcatgcagtggagaatcatatatatctaattgataaagcaaaaagtgtggaaaatctctgacgcaagagagaaaccctgtcctaaactaatatttcttgcatactgccgaaaattgaaaagtatgccgcgttagcatttgcaaacaatttctgaatcggatttccccaacactttcaatgtaagtaaaattgttttttttctccaatatcaaaaggatcggcctgtatgttatgatctgttgcaatttgcaataatttttttgctaattctaaaataaaatcacgtgaagtcacgtgataataaacaacagcctgttgaaattaaggaatctaaggaatcctctacgtagcgatatgaacctcgagtcaactcggatattttcttgatagtaatatgtacaaaacactaagagttagtatcttgtacgtcatttcgttatggtaacctaattc
gi|7 : attgcACAGTATGT-ACA-CA-TGAAACATTTTC-TTG--TCCTAT-AATT-A-TG--C--ATTATTTC--CTTT-T
gi|6 : gCATAAA-TTCTA----CGAC-----AC-----T---G--A-A--A---A---CTTTGG-A-AATTG-CAACGC-ATAC-GTC---AA--GCAT-G-----------GCGAT--GT--TGGA-GA--------TTTTA---CGTA-TT---T-A------AT--TGAATATAA--T---G-ATATAGCGAA----AAA------G--TGATGGAAA---ATCTTC-T--GACGC--AAAGAGAGAACCCATT--TC-C---GTAT--AC-A-A-TAA----T--T--TCCTTG---CCA-T-AC-T------GT---C---A--AAAA-TTGAAA-A--GT------TG--CCGC-GTTGT--ATGACAATATT--TAAAC-TATTTT-C-TTT-TA-TAC-G-AG--A-A--A--G---------T---------TTTCC-CA----A--A---CA---CTTTCATG-----TAATG-----TA--AAGGTTAA----CT---T--T---TCTTCTTAA-----CATATCAAA-----AGGA---CGG-CCTGT-A-TTAG-TCC---A--T-A--TC-G-T-TG--CA--AT-T---T-T-GCA-A--TTAA-TACA------A--A-ATT-TTTG-T---T--A---G---TT-C--A----A-A--T-TA---CA-A--AT--CCA-----A--C-G--TGA-T--A-A-G--C--A---G-TGAT-A-AT-AAAT--AG----A-GT-C-TTGTTGA-A-------A--AT---GTA-A-GGA-AT-C--T-----AC--T----ACG-TA-TC--G-A--AA--GA-------A-CGT-CG-A---T-C-AA-CCTC---GG-ATT-A---T----TGTTTC-----TTTG---AA-TAGT-C-A-CATGT----CA-AAACA-TTAT-GA--T--G-TT-TATG--TA-T-GCC-TTTTACGTTA-TT-TGCTGTATG-GGACGCCT-TA-A-TTCAGtataccaaaattactctccatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacgaccagctcatgaaactgaatttacaacaatacgcaatgcatgacgatgttggaagattatatacttatttacgtattaaattgataaagcaaaaaagtgatgagaaaaacttctaacgcaaagggaaaccctttcttgtatacagtaatgtattgcatactgtcgaaaattgaaaagtatgccgcgttgtatgcattttaaagcattttcttttatacggaaaagtttttcccaacacttttcatgtaatgtaaaatagattttatttctaaatatcaaaagggtcggtctgtctttagtcgatatcgttggcaatttgcgattaatcaatcattatttgttaattctaagcagagttaagacaaaatcgacgtaaatgtgaataagtcatgtgatactaaacatattcagtacttgtgaaaattttgtacggagttcattacttactcgtataagatattgaaacgtgcgttccactctcggtataaattttagcatttgaaatagacagcatgtacaatcacttatgattgttttatgtatgctttatattttatttctgtatgggacgccttaattca
gi|5 : cagttgcatcgcggggaaagtcataatatttatttattaacttcgttgtagtgcacgcagtgaacattatgttgtacatgaacaattgcgtcctataatatggcttcttccttttgatatccaaaccactctcatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCATAA--TTCT---TACGAC-CCA-GC-----T---G--A-A--AGAAA---CTTTTG-A-AATTGA-AAC-CGATAC--GC---A---TCA--A--T---GG--TG--AT--GT---GGAAGA--------TTGTATAC--TA-TT---TTA----CCGTA-T---TA-AA--T---G-AT-TACC-AG----AAAA-----G--TGATGGGAA--AATCTTC-TTTGACGA--AA-GAGAAA---CTCT-TTC-CCG--TAT-T-C-A-A-TAAATTTC--T--T---TG---C-ACT-ACCT------GT---C---A--AAAA-TTGAAATA--GTA-----TGGGCCGC-GTTGT--A-TGAA-CATT--TAAAC-TATTTC-T-TTT-TAATAG-G-AG--A-A--G------------TT--------TTT---------------------TTTTTATG-----TAATGG---TAA--AG--TTAA--ACTT---T--C---TCT---TAA-----TAT--CAAA-----AGGA-T-CGG-CCGGT-ATTTAG-TCC---A--T-A--TC-G-------CA--A--TAAAT-G-GCA-A--TTAAATACA------T-T---TT-TTTG-T---T--T---AA--TT-CTTA----A-A--T-TA---CA-AACAC--C-------A----G--TGAAT--A-G-T--CCCA-CTG-TGAT-ACAT-AAACC-AG---CA-GT-C-GTGTTGA-A-------A--AT---ATA-C-AGA-ATCC--T-----TC--T----AAG-TA-TC--G-ATAAA--GA-------ACCGT-CG-A--TT-T-CT-CCTC---GG-A-TCA---T----T-TTTC-----TTTG----A-TAGTACAA-CATGT---ACA-AACCACTTAT-GATAT--GTTT-TATGAATA-T-GCT-TTTTACG-TA-TT-T-CTG-ATG-GGATGCCT-TA-A-TTCAG
gi|4 : tttgcatcgcggggaaaatgtcatatgattttattcgttaattctactaaccgttacaagtgaacattatgtatacatgaaacacttcttgtcctataaatgatctttccttttttataccaaatcactctccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaCATAAAATTCCTTGCG-AAC-C-AAGC-----T---G--A-G--A---AGAACTGTG--A-AATT--CAAC---ATAC--GC---AATGGCATAG--C---G-------AT--GT--TGGAAGA--------T-ATATAC-TTA-TT---T-AACAGT-AT--T---TA-AAATT---G-ATA-AGC-AA----AAA------G--TGATGGGAAAAACTGTCT-T--GACGC--AA---GGGAAACC-CT-TTC-CCGTATAT---C-A-G-TAA----TGTC--T---TG---C-A-T-A--TACTGTCGG----------AAAT-TGGAAA-A--GTGATG--C---CCGC-GTTGT--GTGGCA-TCTT--TAAAC-TATTTT-T-TTCACA-TAC-GGAA--A-A--A--G---------TTT-------TTTCCGC-----A--A---CAC--TTTTCATG-----TAATGT---AGA--AG--TTAATTATTA---T--T---TCTCC---A-----TGT--CAAA-----AAAGGT-CGG-CCTGT-CTTTAG-TCG---A--T-A--TC-GGT-TGTTCA--GATT---T-T-GCA-A--TTAA-TACG------AGTC-ATT-TTTG-G---T--T---AAACTT-CTGA----A-AATT-TA---CAGA-CAT--C-------A--C-G--TGA-T--A-G-T--CC-A-C-G-TGAT-A-AT-AACG--AG----A-GT-CCTTGTTGA-A-------C--AT----TA-C-GGA-ATATAAT-----TAA-T----ACG-TA-TC--G-AT-AT--GA-------A-CGT-CG-A--TTTC-ACCTCTCCAGGA-A-T-A---TAACTT-TTTC-----TTTG---GT-CAGTAC-A-CATGT---ACA-AAACACTAAT-GAT-T--GTTT-TATG--TA-T-GAA-TTTCACGTTATTT-T-CTGTATGTGGACGCCT-TA-CTTTCAGT
gi|2 : atagaatttttcgttattttactaaattttatcgagtgcacatgtatgtcaacatgttacttgtccgataattattgccatttttcctttttataccaaatcgactcttaccatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCATAA--TTCT---TACGAA-C-A-GC-----A---A--ATA--A---A---ATGTG--G-TATTG-CAACGATATAC-AAG---T---GCAT-GA-C---G-------ATTGGT--TGGAAG---------TTATATAACTTA-TT-----A----C-AT--A---TA-AA--T---TCATATATC-AG----AAAA-----G--TGAGGAGAAAAA--CTTC-T--GACAC--AAAGGGGAAATCC--T-TTC-TCT--TAT--AC-A-A-TAAGAT-T--C--T---TG---TCA-TTA--T------CGTCTC---G--AAAA-TTGAAA-A--GTA-----TG--CCGCAGTTGT---TTGCA-TTTTTTAAATCCTATTTT-C-TTT-TA-TAC-GGAG--ACA--C--G---------TTT-------TCTCC-C-----A--A---CCACTTTCTCATATATTCTAAAGT---TTA--AC--TTAA--G--T---T--T---ACTC---AA-----TTAG-TCAA-----AAGG-T-CGGGCTTGTTATTTAGGTCG---AGCT-A--TC-G-TCTG--CA--A--T---T-TTGCA-AATTCAA-GACA------A-TC-ATT-TGTG-T---T--T---AA--TT-CTAA----AGA--T-TA---TG-A-TAT--C-------AACC-GCTTGA-TGTA-G-T--C--A-C-G-TGATTA-AT-AAAC--AA---CA-AT-C-TTGGTGAGA-------A--AT---GTA-C-GGA-ATCC--TCAG--TTGAT----ATGGTA-TC--G-AT-GAATGA-------A-CAT-CG-A--TT-CTAC-TCTC---GG-G-T-A---A----T-TTTCA----GTTGTATAG-TAGTAC-A-CATGT---ACA-AAACACTTAT-TAT-TAAATTTATATG--TACT-GCT-TTTAACGTTA-TTGT-CTGTATGAGGACGCCTATA-A-TTCAGt
gi|12 : cttacatttccattgcgggaaaatcatatattttaatctatttactagaacgtttatcaatgacatgatgtatacgttggaacattttattgtcctataaaattatgtattctttggtttatattcaaagcatctccaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCATAA--TTCT---TACGAC-C-A-GC-----C---G--A-A--A---A---AAATGT-A-AAATTGCAACGATATAC-AGT-------GCAT-GA-C---G-------AT--GT--TGGAAGT--------TTATATAC--TA-GT---T-A----C-GTA-T---TA-AAT-T---C-ATATATC-AGA---AAA------G--TGA-GGGAAAAAA--TTA-T--GACAC--AA--ACGGAAACC-CT-TTC-CC--GTAT--AC-A-A-TAA----T--TTCT---TG---C-A-T-AC-T------GT---C---G--AAAA-TTGAAA-A--GTA-----TG--CCGC-GTTAG--A-TGCA-TATT--AAA-C-CATTTT-CTTTT-TA-CAC-G--G--A-G--A--G---------T---------TTTCC-CTA---A--A---C----ATTTCATA----TTAAT-C---TTA--AA---GGA--ACTTATAT--T---TCTC---AA-----TAT--CAAA-----A-------GG-CTCAT-A--CAA-TCA---T--T-T--TT-G-T-T----A--A--T---TCT-AAA-A-----A-TACA------A-TA-
gi|3 : gtgaaccattttcttgtcctaagttatttgcattttttcttttttatacaaaagcactctccatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAA-TTCT-TAT-CGAA-C-A-GTCTAAAT---G--A-G--A---A---ATGTG--G-TATTG-CAACG--ATAG-TAC---A---G--T-G--CAATGA--CG--AT--GT--TGGAAG----------TATATATATTAATT---T-G----C-GTA-T---TA-AA--TTCAG-A-ATATC--G----AAA------GCGTGA-GGGGAGAAA-CTTCAT--GAACC--AAAGGGA-----CGATCTTT-CCGA-TAC-AAT-A-AATTA----C--T--T---TG---C-A-T-AC-T------GT---C---A--AAAAATTGAAA-A--GTAT----T---CCGC-GTTGT---TTGCA-TTTT--TTA---TACCAT-C-TTT-TA-TAC-G-CG--G-A--GAAG---------TT--------TTTCC-C-----A--A---CA---CTTTCAT---------TAT---GTA--AAGGTTAC--ACTT---TA-TAAATCTC--TAA-----TA---CAAA-----AGGGCT-CGG-C-TGT-TTTTAG-TTCGGAA--T-A--TC-G-T-TG--CAGGA--T---A-T-GCA-A--TTAA-TAAA------A-TA-ACG-TTTA-TGGTT--A---A---AT-CTAA----A-A--T-T----CG-A-TATG-T-------A--CAG--TGA----A-T-C--C--A-C-G-TGAT---AT--AACTGAA---CA-AT-C-TTGGTGG-A-------AATAT---GTA-GCGGAGATCC--TAATGGTA--TTAAAAGG-GA-TC--G-AT-TATTGA-------AGCGC-CG-AAGTT-C-AC-TCTC---GG-G-T-AAC-T----T-TTTCATTAATTGA---AA-TACTAG-T-CATGTA--ACT-AAAAACTTAT-GAT-T--ATTT-TATT--TATT-GCT-CTTAACGTTA-TT-T-CTGTAT--GGACG-CT-TA-A-TTCAccacgtgatagtcacgtgataacaaacaa
gi|16 : gggtaaaattcataaaaatttttactcgttatttaactatgaagtaaatgaatgatgtatacgcgaaacatttttcttgtcctataaaaacttatatttctcttcgcatgtacaccaaagcactttctaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaatTCTA---ACAAC-C-A-GA-----T---G--A-AGAA---A---CTGTA--A-AATTG-CAACG--ATACTCAA---A---ACAT-GA-C---G-------AT--AT--TGGAAGT--------TTATATAC-TTA-TT---T-A----C-GTA-T---TA-AA--TT--G-ATAAAGC-AG----AAAA-----G--TAATGGGAAAAA--CTTC-T--GACAC--AA--AGGAAAACC--TTTTC-CCG--TAT--AC-A-G-TTA----T--T--TCT-TG---C-A-T-AC-T------GT---C---G--AAAA-TTGAAA-ACTAT------G---CAGC-TTTGG--A-TGCA-TTTT--AAA-C-CATTTT-C-CTT-TA-TACAG-AG--A-A-----G---------TT--------TTTCC-C-----A--A---C----
gi|10 : CACGAAAC-A-GC-----T---A--A-G--A---AAA-TGTGGT-A-AAATTGCAAC-CGATAT--AC---A---ACGT-G--CAT-GA--CG--AT--GCGCTGGAGTA--------TTATATA------TT---T-A----------T---TG-AA--T-----AT-TA---AG----AT-------G--TGAGCGGGAGAA-CCTTC-T--GAAGTTAAATCGGAACAATC-CT--TC-CCG--TAT--AC-A-A-TAT----T--C--T---TG---C-A-T-AC-T------GT---CCGAA--AAAT-TTGAAA----GC------TATGCCGC-GTTGT---TTGCA-TTTT--AAACC-C--TTT-C-TTT-TA-TAC-G-AG--A-A-----G---------T---------TTTCC-CA----A--A---C----TTTCGAT-----TTATTG-----TA--AA--GTTA--ACTT---T--A---TTTCATTAA-----T-TA-TCAT-----AAGG-T-TGG-CTTGT-ATTTAG-GTC---G--T-ACCTC-G-T-TG--CA--AT-T---T-T-GCA-A--TTAA-TACA------A-TACATT-TTTG-TG--TAAC---A---TT-CTAA----A-G--TATG----G-A-TAT--C-------A--C-G--TG--T--A-GTT--C--ATC-GTTGAT-ACAT-Aact
gi|7 : ttactaagtttaatcaagtgacatggatgtataataaacaatttattgtccttctaaattatgtattccttgtttgttttaaccaaatcaactctccaatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgttaattttccccACGAC-C-A-GC-----TCATG--A----A---A---CT-----G-AATTTACAACA--ATAC--GC---AAT-GCAT-GA-C---G-------AT--GT--TGGAAGA--------TTATATAC-TTA-TT---T-A----C-GTA-T---TA-AA--TT--G-ATAAAGC-AA----AAAA-----G--TGATGAGAAAAA--CTTC-T--AACGC--AA--AGGGAAACC-CT-TTC-TTG--TAT--AC-A-G-TAA----TG-TA-T---TG---C-A-T-AC-T------GT---C---G--AAAA-TTGAAA-A--GTA-----TG--CCGC-GTTGT--A-TGCA-TTTT--AAAGC--ATTTT-C-TTT-TA-TAC-G-GA--A-A--A--G---------TT--------TTTCC-C-----A--A---CAC--TTTTCATG-----TAATGT-----A--AA--ATAG--ATTT---T--A---TTTC-TAAA-----TAT--CAAA-----AGGG-T-CGG-TCTGT-CTTTAG-TCG---A--T-A--TC-G-T-TGG-CA--A--T---T-T-GCG-A--TTAA-T-CA------A-TC-ATTATTTG-T---T--A---A---TT-CTAAGCAGA-G--T-TAAGACA-A-AAT--CGACGTAAA--T-G--TGAAT--AAG-T--C--A-T-G-TGAT-A-CT-AAAC--ATATTCA-GTAC-TTGT-GA-A-------A--ATTTTGTA-C-GGA-GTTC--A-----T---T----ACT-TACTC--GTAT-AA--GATATTGAAA-CGTGCG-T--TC-C-AC-TCTC---GGTA-T-AAATT----T-TAGCA----TTTG---AAATAG-AC-AGCATGT---ACA-AT-CACTTAT-GAT-T--GTTT-TATG--TA-T-GCT-TTATATTTTA-TT-T-CTGTATG-GGACGCCT-TA-A-TTCAtagttacaa
gi|17 : gacagtatgtacacatgaaacattttcttgtcctataattatgcattatttcctttttataccaaaattactctccatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnACGAC-C-A-GA-----T---G--A-G--A---A---ACTGGT-A-AAATTGCA--GCGATAC-T-CAAAA---ACAT-GAAC---G-------AT--AT--TGGAAG---------TTATATATCTT--TT---T-AG---C-ATACT---TA-AT--T---G-ATAAAGA-GA----AAA------G--TAATG----GAAAACTTC-T--GAC-C--AAAGGGA------ACTTTTCGCC--GTAT-TAC-A-G-TAA----T--TTCT---TGGGCT-A-C----T------GT---CG--A--AAA---TGAAA-A--TT------G---CCGC--TTGTG-GATGCA-TTTT--AAA-C-CATTTT-C--TT-TA-TACGG-AGACA-A--T--G---------TTT-------TTCCC-C-----A--A---CA---TTTT
gi|25 : ACGAC-A-A-GC-----T---G--AAG--AG--A---CTGTG--A-AATTG-CAACG--ATAC--GC---AT--GAAT-T--C---AT--GGCGAT--GT--TGGAAGG--------TTATAT-TCTTG-TT---T-A----C-GTA-T---TG-AAT-T---G-ATAAAAC-AGA---AAA------G--TGATAAGAAAAA--CTTC-T--GACAC--AA--AGAGAAACC-CT-TTC-CC
gi|14 : tcttCGAC-C-A-AT-----T---TC-A-G--A---A----TGTGT-A-AAATTGCAACGATATAT-AGT-------GCAT-G------GT--GGT-AT------TCAAAGT--------CTACATAT-TTA-TA---T-G----C-CTG-T---TA-CA--TT--G-ATATATC-GGGGGAAAA------A--C--TGGAAAGCAA-CGTC-T--GACAC--AAAAAGAA----------TC-CTACATCT-GAT-A-A-T------T--TC-T---TC---C-A-T-A--T------T----CTT-A--AAAA-TTGAAA-A--GTACACCGTATGCAGC-CTTG---ACCGCA-TTTT--AAA-T-TACCTTGC-TTT-TA-TCG-G-AG--A-A-----A---------TCG-------CT--C-T-----A--AGCGC----TTTTCA-G----TTAATG-----TA--AA--GTAA--ATAT---T--G---TTTTTCTAA-----TAT----AA-----AAAG-C-CGG-TCTTT-ATTTTG-TTC---A--A-A--TC-C-A-TG--TA--A--T---T-T-TGAGA--TTAC-TGTA------A-TG-ATT-TTTT-T---T--TTTGG---TT-CT-A----A-A--T-T-----------T--T-------A-------TAA-T----G-T--C--A-C-A-TGAT-G-AT-AAA---AC---TT-GC-T-TTGATGG-A-------A--AT---GTA-T-GGA-A
gi|11 : cttgC-C-A-GC-----T---G--A-G--A---AA--CT--GCTG-AATTG-CAACG--ATAC-T-C---AT--GCAT-G--T---GT--CGT-GT---T--TGGAAGA--------TT-TATAC-TTA-TT---T-A----C-GT--T---TA-AA--TTT-G-A-ATAAC-AG----AAA------G--TAATGGCACAAAA-CGTA-T--GAC-C--AA--GGGAAGACC--TTCTC-CCG--TATTAAC-AGA-TAA----T--T--TGCTTG---C-A-T-C--T------GT---C---AGCATAT-TTAAAA-A--GTA-----TG--CCGC-GTTTTTTAATGCA-TTTT--AAA-C-TATTTTTC-TTT-TA-TAC-G-GG--A-A--A--AATAAGTTTTTTGTTTTCTTTTTCC-CCAAAAA--A---C----CTTTCATG----ATAGTG-----TA--AAG-TTAA----TT---TCAT---TCGTCTTA-----------TAAA-----AGGA---CGG--CTGT--TTTAG-T-C---G--T-A--T----T-TG--C---A--T---T-T-GCA-A--TTAA-gc
gi|23 : atgttgcatcgcggggaaaatgttatggatatttgtatcgttttactaagtatcaagtgacattatgtatagcatgaaaattccttttcatattatcattatttcttcttttatacaaatcactctccatttctttgttagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttacatacttataagagC-T-A-GT-----T---GCAA-A--A---A---CT--GT-ATAATTGTCA---TGATAT--AC---A---G--T-G--T---AC--CG--GT--GG--TGGACAAAATCATATTTCTATTCCT-A-TTACAT-A----C-TA--T---TA-GA--T---A-TTA-AG---A----AAA------G--TGTTGGGAGCAA--CTTC-T--AACAC--AA--AATGAAACCAC--TTC-CCGat
gi|32 : gcttttgcagATTG-CAACA--ATAC--GC---A-----AT-G--C---AT--GGCGAT--GT--AGGAAGA--------TTATATAC-TTG-TA---T-A----C-GTA-T---TA-AA--TT--G-GTAAAGC-AA----AAAAAAAAAG--TGATG---AGAAAACTTC-T--GACGC--AAAGGGAca
gi|9 : ---A---ACAT-A--C---GCAATGC-AT--GCAGTGGAGAA--------TCATATA-----------T-A-------T--C---TA-AT--T---G-ATAAAGC-AA----AAA------G--TG-TGGAAA---ATCT-C-T--GACGC--AA-GAGAGAAACC-CTGT-C-CTAA------ACTA-A-TAT----T--TC-T---TG---C-A-T-AC-T------GC---C---G--AAAA-TTGAAA-A--GTA-----TG--CCGC-GTTA------GCA-TTTG--CAAAC-AATTT--C-T-------------G--A-ATCG--G---------AT--------TTCCC-C-----A--A---CA---CTTTCA---------ATGTAAGTAA--AA--TTGT--TTTT---T--T---TCTCC--AA-----TAT--CAAA-----AGGA-T-CGG-CCTGT-AT---G-TT----A--TGA--TCTG-T-TG--CA--A--T---T-T-GCA-A--T-------A------A-TT--TT-TTTG-C---T--A---A---TT-CTAA----A-A--T-------A-A-AAT--C-------A--C-G--TGA----A-G-T--C--A-C-G-TGAT-A-AT-AAAC--AA---CA-G--C-CTGTTGA-AATTAAGGA--AT---CTA-A-GGA-ATCC--------TC--T----ACG-TA-GC--G-AT-AT--GA-------A-CCT-CG-A--GT-C-AA--CTC---GG-A-T-A---T----T-T-TC-----TT-----GA-TAGTA--A-TATGT---ACA-AAACAC-TAA-GA-----G--T-TA-G--TA-T---C-TTGTACGTCA-TT-T-CGTTATG-GTA-ACC--TA-A-TTCcatcctttctcgt
gi|8 : gccgggaaagtcataatattttatgttattgctagcgttatccaagacattattatacatgaaccaatatcgtcctattaattacattctttcctttatacctaatactctcaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntataatcttacgacacctgacagaaactgtacaattca---A---ACAT-A--C---GCAATGC-AT--GCAGTGGAGAA--------TCATATA-----------T-A-------T--C---TA-AT--T---G-ATAAAGC-AA----AAA------G--TG-TGGAAA---ATCT-C-T--GACGC--AA-GAGAGAAACC-CTGT-C-CTAA------ACTA-A-TAT----T--TC-T---TG---C-A-T-AC-T------GC---C---G--AAAA-TTGAAA-A--GTA-----TG--CCGC-GTTA------GCA-TTTG--CAAAC-AATTT--C-T-------------G--A-ATCG--G---------AT--------TTCCC-C-----A--A---CA---CTTTCA---------ATGTAAGTAA--AA--TTGT--TTTT---T--T---TCTCC--AA-----TAT--CAAA-----AGGA-T-CGG-CCTGT-AT---G-TT----A--TGA--TCTG-T-TG--CA--A--T---T-T-GCA-A--T-------A------A-TT--TT-TTTG-C---T--A---A---TT-CTAA----A-A--T-------A-A-AAT--C-------A--C-G--TGA----A-G-T--C--A-C-G-TGAT-A-AT-AAAC--AA---CA-G--C-CTGTTGA-AATTAAGGA--AT---CTA-A-GGA-ATCC--------TC--T----ACG-TA-GC--G-AT-AT--GA-------A-CCT-CG-A--GT-C-AA--CTC---GG-A-T-A---T----T-T-TC-----TT-----GA-TAGTA--A-TATGT---ACA-AAACAC-TAA-GA-----G--T-TA-G--TA-T---C-TTGTACGTCA-TT-T-CGTTATG-GTA-ACC--TA-A-TTC
gi|13 : cagtgcatcaccgccgggaaagtcataatattttatgttattgctagcgttatccaagacattattatacatgaaccaatatcgtcctattaattacattctttcctttatacctaatactctcaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntataatcttacgacacctgacagaaactgtacaattca---GCAT-GA-C---G-------AT--GC--TGGAAGT--------TTATATAT-TTA-TT---G-A----C-ATA-T---TA-AA--T---G---------------------------TGA-GGGGAGAAA-CTTC-T--GACAC--AATG-GAAAATC--CT-TTC-CC--GTAT--AC-A-A-TAA----A--T--T---
gi|29 : cagttgcattgcggggaaaacgtttatgaatattttaaatcattacttactaacgttatcaagtgacatgatgtataagtaaacaatttattgtcctataaaattatgtattctttcgtttttataccaaatcactctccaatttctatgtattgaattatgaaattgataatcatattaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacagtGA--------TTATATAT-TTA-TT---T-A----C-GTA-T---TA-AA--T---TCATAAAGC-AA----AAAAA----G--TGATG---AGAAAACTTT-T--GACGC--AA--AGGGACACC-CTAT----CTAGTAT--AC-A-G-TAATG--T--T--T---TG---C-A-T-AC-T------GT---C---A--ACAA-TTGAAA-A--GT------ct
gi|16 : a--AAAG---GTTTT-C-CTT-TG-TGT-C-AG--A-A--G------------TT--------TTTCC-C-----ATTA---C----TTTTC-TG----C-----T---TTATCAA--TTTA--A---------------TACGTAAATAAGTATA-TAAACTTCCAATA-T-CGT-CATGT-TTTGAG----------T-A--TC-G-T-TG--CA--AT-T---T-T-ACA-G--TTatgccgc
gi|15 : tctaacaaccagatgaagaA--ACTA---TA-T---TGTCCTCAA-----TATC-TAAA-----AGGG-TGCGG-CCAGT-ATT-AG-TTG---A--T-G--TC-G-T-TGG-CA--A--T---T-T--TA-----TAA-TACA--------TC-ATT-TTTGGT---T--T---AAA-TT-CTAA----A-A--T-TAGG-CA-A-CAT--C-------A--T----TGA-T--A-G-TGTC--A-C-A-TGATTA-ATGAAAC--AA---CA-AT-C-TTCATGA-A-------A--AT---GTT---GGA-ATC-----------------------------G-CT-AA--CT-------A-TGT-CT-A--TT-C-AC-TCTC---GG-G-T-A---T----T-TTTC------TTG---AA-TAGTA--A-CATGC---A----------TGT-GAC-T--G-TT-TATG--TA-TGGCA-TTTTACGTTC-TT-T-CTGTAT--GGACGCCT-TA-A-TTCAGtcccgtatacagttatttcttgcatactgtcgaaaattgaaaactatgcagctttggatgcattttaaaccattttcctttatacagagaagtttttcccaacact
gi|21 : atagttAA-----TA----AAA-----GGAG-T-CGG-TCTGT-TTATAG-TCG---A--T-A--TT-G-T-TG--CA--A--T---CAT-GCG-A--TTGT-TACATGTTCAA-TA-ATT-TTT------C--C---G---GTGCTAA----A-C--T-TA---TA-A-TGT--C-------A--C-G--TGA-T--A-A-T--A--A-C-G-CGAT-A-AT-ACAC--TC---CT-AC-A-TTGATGA-A-------A--AT---GTA-ct
gi|18 : tagtttatgtaaagtaagcgttaataaatcatgtacaa---A--T-A--TT-G-T-TG--TA--A--A---T-------A--TTG----CG------G-T---TT-TTTA-A---C--CG--A---TG-TTCA----A-T--T-TA---AA-T-TAT--C-------T--T-G--TGA-T--A-G-T--C--A-C-G-TGAT-A-AT-GAAC--AC---CT-GC-C-TCTATGA-A-------A--AC---GTA-T-GGA-AGCA--T-----AC--C----GGG-TA-TG--G-TT-----GA-------A-CGT-TGTT--TT-C-GT-TTTC---GG-A-T-A---T----T-TCTC-----ATTG---AA-TGTTTT-C-CATATAAGACAGAAACA--TAT---------TTT-TATGGATA-TAGTTGTTTTGCTTTA--T-T-CTGTATA-GGATGC---TATA-TTCAAT
gi|35 : -A--TTAA-TACA------A-TC-AAT-TTTG-T---T--A---A---TT-CTAA----A-C--T-TA---CG-ATCATACC-------A--C-A--TGA-T--A-G-T--C--A-C-G-TGAT-A-AT-ACAC--AA---AC-GT-C-TTAGTGA-A-------A--AT---ATA-T-GGA-ATCC--T-----a
gi|12 : A-TACA------A-TC-ATT-TTTG-T---T--A---A---TT-CTAA----A-A--A-TA---CA-A-TAC--C-------A--C-G--TGA-T--A-G-T--C--A-C-G-TGAT-A-AC-AAAC--A
gi|19 : gtgaaccattttcttgtcctaagttatttgcattttttcttttttatacaaaagcactctccatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncataattcttacgaccagccgaaaaaaatgtaaaattgcaacgatatacagtgcatgacgatgttggaagtttatatactagttacgtattaaattcatatatcagaaaagtgagggaaaaaattatgacacaaacggaaaccctttcccgtatacaataatttcttgcatactgtcgaaaattgaaaagtatgccgcgttagatgcatattaaaccattttctttttacacggagagttttccctaaacatttcatattaatcttaaaggaacttatatttctcaatatcaaaaggctcA-A-TGT--C-------A--C-A--TTA-T--A-G-T--C--A-T-T-TAAT-G-AT-AAAC--A----CGTGC-C-CCCATGA-A-------A--AT---GTA-C-GGG-AGCC--T-----AT--T-----CGATA-TT--G-GC-AT--GA-------A-TGT-TG-A--TT-C-TT-TCTC---AG-A-T-A---T----T-TTTC-----ATCG---AA-TCATTC---CA--T---AGA-AAATACGAAC-AAT-T--GTCTGTATG--TA-T-ATG-TT-----TTA-TT-C-TTGAATG-GGGGACCT-TA-A-TTCAGTa
gi|20 : ttgcttccaatatgatcattacaatcatatttgccggtgttgattttt--C-------A--C-G--TGA-T--A-G-C--C--A-C-A-TGAT-G-AT-GAAC--AC---CT-GG-T-TGGATGA-A-------A--AT----TATT-TGA-ATCA--T-----AT--T----ATG-TA-TCAGA-AT-AA--AA-------A---T-TG-A--TT-C-GC-TTTC---GG-A-T-A---TTG--T-TTTC-----ATCG---AA-TAGTAT-T-CATGT-----A-AAGCACTCATAGAT-T--GTTT-TATT--TA-T-GTG-TTTTACTGTA-TT-T-CTGTACA-GGGCGTCC-TA-A-TTCt
gi|34 : A-------A-CGT-TG-A--CT-C-AC-TCTC---GG-A-T-A---T----A-TTTT-----TTT-----A-TATGAC-A-CATGT---ACA-AAACACTTGT-GAC-T--ATTT-TATG--TA-T-GCT-TTTTACGTTG-TT-T-CTGTGTG-GGGCGCC
gi|26 : ---T----T-TTTC-----ATTG---AA-TATTAC-C-CATGT---A---AAACACTTAA-AGT-T--GTTT-TATC--TAAT-GTA-TTTTACTCTA-TT-T-CTGTATA-GAACGTTT-TA-A-TTCAAT
gi|41 : gagggctacattattgcagctagaagccttacaaggctatcggtatgaatgttag-AAACACTTAT-GGC-T--GTTT-TATG--TA-T-GCT-TTTTACGTTA-TT-T-CTt
gi|37 : TTAT-GAT-T--GTTT-TATG--TA-T-GCT-TTTTACGTCA-TT-T-CTGTATG-GTAAGCCT-TA-A-TTCAG
gi|40 : G--TA-T-GCT-TTAAACGTTA-TT-T-ATATATG-TGACGCCT-TA-A-TTCA
6 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|22 ): TATGTAAACATTAAAACATTTTCTTGTCCTATCAAATCACTCTCCATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCATG
Unaligned ( gi|24 ): ANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGACATAATTTCATACGACAGGCGGAAACTGTGAAATTGCAA
Unaligned ( gi|27 ): TTCTTTTAGATGAATCGCGGGGAAATATATTTTGTCATTATTTACAACCGTTATCAAGTGATATGCTTAAACGAAAACGTTTACTTATCAAACAAATGTTCATTTCTTTCTTTTTCATATCAAATAACTCATTATTCTTTATATGA
Unaligned ( gi|36 ): TTTTACGACCAGCTGTAAAAAGTGCAATATTGCAACGATATACGGTGTATGCTAGGAATTTTCAGTCTGTATCTTTATATTCTTATTACA
Unaligned ( gi|39 ): AGTAGTATCATGGGGAAAATTTATTTGTTGAAATTATTACCATTATCAAGTG
Unaligned ( gi|43 ): ATTTTTCCAAGCCAAAAAAGGTCAGCCTTCTATAC
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 22 11 1111 33333 1 33333333333333333 5555555555555555555 1 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 222 111111 11 111 3333333333333333333333333333 11111111 111111111111 11 2 11 2222 222222222222222 111111 11 111111111111 1111111111111 111 111111 222 11 1111 111111 111 111111 111111111111111 111111 11111111111111 1111111111 1111111 33333333333333333333 1111111111111 1111111 111111 1111
lowQualScore : 33 2 2 33 00 2 2 4 55 2 2 00 2 33 2 33 2 999 2 1111 00000 7 2 5 2 55 2 555 0 0 99 2 5 66 2 44444444444444444 333 66 2222222222222222222 3 3 3 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 000 444 2 666 33 2 55555 333 55 777777 555 99999 44 222 2 8888 2 2 22 6666666666666666666666666666 2 22 22 2 22 3 22 555 44444 666 555 22 33333333 4 0 222222222222 22 22 0 0 2 2 2 44 1 55 333 22 2 2 8888 77 2 4 7777 666666666666666 5555 2 2 5 33 2 33 2 33 55 2 2 8888888 22 33 2 2 555555 99 00 5 5 66 3 2 2 2 2 8 33 33 555555555555 2 2 7777777777777 2 33 2 666 9 666666 2 777 11 3333 222222 555 33 2 33 2 2 44 77777 2 2 0 5 888 55 33 333 2 2 55 33 555555 2 66 2 111111111111111 2 2 55555 000000 2 444 55 5555 22222222222222 2 6666 2 55 33 2 33 2 2 0000000000 2 66 2 2 2 2 2 2 4 2 2 33 5555 0 44 2 3 2 6666666 33 444 1 77 2 00000000000000000000 3 3 44 3 2222222222222 5 2 2 33 2 2 33 555 2 2 6666666 2 33 444444 1 777 0000 777 2 1 2 66 33 2 4 66 6 4 22 2 2 2 4 0 2 2 2
lowQualScore : .. . . .. .. . . . .. . . .. . .. . .. . ... . .... ..... . . . . .. . ... . . .. . . .. . ................. ... .. ................... . . . ............................................................................................................................................. ... ... . ... .. . ..... ... .. ...... ... ..... .. ... . .... . . .. ............................ . .. .. . .. . .. ... ..... ... ... .. ........ . . ............ .. .. . . . . . .. . .. ... .. . . .... .. . . .... ............... .... . . . .. . .. . .. .. . . ....... .. .. . . ...... .. .. . . .. . . . . . . .. .. ............ . . ............. . .. . ... . ...... . ... .. .... ...... ... .. . .. . . .. ..... . . . . ... .. .. ... . . .. .. ...... . .. . ............... . . ..... ...... . ... .. .... .............. . .... . .. .. . .. . . .......... . .. . . . . . . . . . .. .... . .. . . . ....... .. ... . .. . .................... . . .. . ............. . . . .. . . .. ... . . ....... . .. ...... . ... .... ... . . . .. .. . . .. . . .. . . . . . . . .
lowQualScore : 99 9 9 44 11 5 4 7 66 4 4 33 4 22 5 77 7 777 7 0000 99999 5 5 0 5 99 5 888 5 8 66 5 0 99 5 00000000000000000 111 33 5555555555555555555 1 2 3 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 666 444 2 111 55 1 33333 777 00 333333 888 22222 66 111 0 8888 1 1 99 5555555555555555555555555555 0 88 88 0 66 8 66 444 88888 000 222 66 11111111 4 4 222222222222 88 88 8 4 0 0 0 88 9 99 555 00 0 0 9999 99 4 7 4444 999999999999999 3333 5 5 0 44 5 44 5 44 99 5 5 1111111 77 44 5 5 555555 00 00 3 3 33 5 7 7 7 7 0 77 77 000000000000 7 7 3333333333333 7 77 7 333 2 666666 4 777 55 9999 000000 666 99 9 99 9 7 88 33333 7 7 9 3 000 99 44 111 4 4 66 22 444444 4 11 2 444444444444444 4 4 99999 777777 4 222 66 0000 33333333333333 4 1111 2 33 11 2 11 2 2 8888888888 2 11 2 2 2 2 2 2 4 2 4 22 1111 6 99 5 4 5 2222222 44 444 4 00 7 66666666666666666666 1 1 22 1 7777777777777 7 9 9 99 9 9 00 000 9 9 9999999 7 77 888888 1 333 1111 333 5 0 4 11 22 5 7 11 7 4 77 2 2 2 7 7 5 5 5
consensus : NACAGTTGCA--TC-G-CGG--GG-AAAATGTC-AT-AATA--TTT-T-A--T-CGTTA--TTT-ACTA--A-C-G-TT-AT----CAAG---GTG-A-C-AT-TATG--TATA-CGT-GAAACANTTTCCTTG-TCCTA-T--AA-TA--A-----CG-T----ATTCTTTC-C-TTT--TAT----AC-----C------AC-TCTCCATTACCAG-ATCACTCTCAGCAGCTGCCCACTCTCCATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCATAAA--TTCT---TA-CGA---CC-A-GC-----T---G--A---G--A---A---C-TGTG-TAA-A-TTG-CAAC-G--ATA-C-GC--A---G----C---A-T-G--N---C----G-AT--GT--T-GGA--AGATTATA--TA-C-TTATT-----TA-C-GTA---TT--AAA--T---G-ATANAGC------AG----AAA--G--TGATGGGAA-AAA-CT-TC-T--GACGCAA-GA---GAGAAACC-CT-TTCCCG-GTAT--A-C-A----ATAA----T--T---T---T----G-C-A-TA--C-TG--TC-G--AAAA--TTG-AAA-A-------GT-ATG--CC-GC-GTTGT---A-TG--CA--T-TT-TAAA--CCA-TTTT-CTTT-TA-TAC-G--AG--A-----A--G--GTT-TT-T-------------CC-C--AA-CA---CTTTC-ATG-----TAATG-TTAAA--TTAA--ACTTT--T---TCTCCTTA--A-T--AT-C-AAAAG-G-G-T-C-GGCCTG-TAT-TTA-G-TCG--A--TATCG-T-T-G--CA--A--T---T-TGCAA--TT-AATACA------A-T-CA---T-T-TT-----T---G--T-T--AA--TTCTAA----A-A--TT---A--C-A-AT---AT-C--A--C-G--T-G-A--T-------AG-T--C-A-C-G-TGA-T-A-AT-AAA-C--A---NCAGT-C-TTGNTGA-A-------A--A---TGTA-CGGA-ATCC--T-----TC--T----AC-G-TA-TC--G-AT-AA--G-------AA-CGT-CG-A--TT-C-AC-TCTC---GGA-T-A--T----T-TTT--C-----TTTG---AATAGTAC-A-CATGT---ACA-AAACACTTAT-GAT-T--GTTT-TATG--TA-T-GCT-TTTTACGTTA-TT-T-CTGTATG-GGACGCCT-TA-A-TTCAGT
Reference ( family-948 ) : NACAGTTGCA--TC-G-CGG--GGGAAAATGTC-AT-AATA--TTT-T-A--T-CGTTA--TTT-ACTA--A-C-G-TT-AT----CAAG---GTG-A-C-AT-TATG--TATA-CGT-GAAACANTTTCCTTG-TCCTA-T--AA-TA--A-----CA-T----ATTCTTTC-C-TTT--TAT----NC-----C------GC-TCTCCATTACCAG-ATCACTCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCATAAA--TTCT---TA-CGA---CC-A-GC-----T---G--A---G--A---A---C-TGTG-TAA-A-TTG-CAAC-G--ATA-C-GC--A---G----C---A-T-G--C---G----G-AT--GT--T-GGA--AGATTATA--TA-C-TTATT-----TA-C-GTA---TT--AAA--T---G-ATANAGC------AG----AAA--G--TGATGGGAAGAAA-CT-TC-T--GACGCAA-GA---GAGAAACC-CT-TTCCCG-GTAT--A-C-A----ATAA----T--T---T---T----G-C-A-TA--C-TG--TC-G--AAAA--TTG-AAA-A-------GT-ATG--CC-GC-GTTGT---A-TG--CA--T-TT-TAAA--CTA-TTTT-CTTT-TA-TAC-G--AG--A-----A--G--GTT-TT-T-------------CC-C--AA-CA---TTTTC-ATG-----TAATGTTTAAA--TTAA--ACTTT--T---TCTCCTTA--A-T--AT-C-AAAAG-G-G-T-C-GGCCTG-TAT-TTA-G-TCG--A--TATCG-T-T-G--CA--A--T---T-TGCAA--TT-AATACA------A-T-NA---T-T-TT-----T---G--T-T--NA--TTCTAA----A-A--TT---A--C-A-AT---AT-C--A--C-G--T-G-A--T-------AG-T--C-A-C-G-TGA-T-A-AT-AAA-C--A---NCAGT-C-TTGNTGA-A-------A--A---TGTA-CGGA-ATCC--T-----TC--T----AC-G-TA-TC--G-AT-AA--G-------AA-CGT-CG-A--TT-C-AC-TCTC---GGA-T-A--T----T-TTT--C-----TTTG---AATAGTAC-A-CATGT---ACA-AAACACTTAT-GAT-T--GTTT-TATG--TA-T-GCT-TTTTACGTTA-TT-T-CTGTATG-GGACGCCT-TA-A-TTCAGT
gi|1 : ACAGTTGCAGATCAG-CGG--GGGAAAATGTC-AT-AATAG-TTT-T-A--T-CGTTA--TTA-ACTG--A-CTGCTT-AT----CAAGC--GTGCA-C-AT-TCTG--TATA-CAT-GAAACACTTTCTTTGCTCCTA-T--AA-TA--AG----CA-C----ATTCTTTC-C-TTT--TAT----TC-----C------GC-CCTCCCTTACCCGCATCACTCTCAGCAGCTGCCCACTCTCCATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCATAAA--TTCTATACA-CGA---CC-A-GC-----T---G--A---G--A---A---C-TTTG-CAA-A-TTGGCAAC-GCGATA-CCGC--A---G----C---A-T-G--C---GCC--GCAT--GT--T-GGA--CGATTGTA--TA-CCTTATT-----TA-C-GT----TT--AAA--T---G-ATATAGC------AG----AAA--G--TGATGGGAAGAAATCT-TC-T--GACGCAATGA---GAAAAACCACTGTTCCCGAGTATG-A-C-A----ATAA----T--T---T---T----G-T-A-TA----TG--GC-A--AAAC--TTG-AAA-A-------GT--T---CC-GC-GTTGT---ACTG--CA--C-AT-TAAAG-CTA-TTTT-CTTT-TA-TAC-G--AG--A-----A--G--GTTGTT-T-------------CC-C--AA-C----TTTTC-ATGC----TAATGTTTAAA--TTAA--ACTTT--T---TCTCCTTA--A-T--ATGC-AAAAA-A-A-T-C-GGCCTG-TAT-TTA-G-TCC--A--TATCG-T-T-G--CA--A--T---T-TACAA--TT-GATACA------A-T-AA---T-T-TT-----T---A--T-T--CA--TTCTAA----A-A--TT---A--C-A-AC---AT-C--A--C-G--T-G-A--T-------AG-T--C-A-C-G-TGA-T-A-AT-AAA-C--A---GCAGT-C-TTGTTGA-A-------A--A---TGTA-AGGA-ATCC--T-----TC--T----AC-G-TA-TC--G-AT-AA--G-------AA-CGT-CG-A--TT-C-AC-TCTC---GGA-T-A--T----T-TCT--C-----TTTG---AATAGTAC-A-CATGT---ACA-AAACACTTAT-GAT-T--GTTT-TATG--TA-T-GCT-TTTTACGTTA-TT-T-CTGTATG-GGACGCCT-TA-A-TTCAGT
gi|10 : gC-A-GC-----T---A--A---G--A---A---AATGTGGTAA-AATTG-CAACCG--ATA-T-AC--A---A----C---G-T-G--C---ATGACG-AT--GCGCT-GGA--GTATTATA--TA-T-TTATT-----GA---ATA---TT--AA-------G-AT----------------------G--TGAGCGGGAGAAC-CT-TC-T--GAAGTTA-AATCGGAACAATC-CT-TCCC---GTAT--A-C-A----ATAT----T--C---T---T----G-C-A-TA--C-TG--TCCG--AAAAATTTG-AAA-G-------CT-ATG--CC-GC-GTTGT---T-TG--CA--T-TT-TAAA--CC--CTTT-CTTT-TA-TAC-G--AG--A-----A--G----T-TT-T-------------CC-C--AA--A---CTTTCGATT-----TATTG--TAAA--GTTA--ACTTT--A---TTTCATTA--ATT--AT-C-ATAA--G-G-T-T-GGCTTG-TAT-TTAGG-TCGT-A--CCTCG-T-T-G--CA--AT-T---T-TGCAA--TT-AATACA------A-TACA---T-T-TT-----T---G--TGTAACA--TTCTAA----A-G---T---A--TGG-AT---AT-C--A--C-G--T-G----T-------AGTT--C-ATC-GTTGA-T-ACAT-A
gi|11 : ttactaagtttaatcaagtgacatggatgtataataaacaatttattgtccttctaaattatgtattccttgtttgttttaaccaaatcaactctccaatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgttaattttcccccacgaaaGTTGCA--TC-G-C-G--GGGAAAATGTT-ATGGATA--TTTGT-A--T-CGT----TTT-ACTA--A---G--T-AT----CAA----GTG-A-C-AT-TATG--TATAGCAT-GAAA-A--TTCCTTT-TCATA-T-----TA--T-----CATT----ATT-TCTT-C-TTT--TAT----ACAAAT-C------AC-TCTCCATTtagttacaa
gi|11 : atTACA--TACT---TA-TAAGAGCC-A-GC-----T---G--A---G--A---AA--C-TGC--TGA-A-TTG-CAAC-G--ATA-C-TC--AT--G----C---A-T-G--T---GTC--G--T--GT--TTGGA--AGATT-TA--TA-C-TTATT-----TA-C-GT----TT--AAATTT---G-A-ATAAC------AG----AAA--G--TAATGGCACAAAA-CG-TA-T--GAC-CAA-GG---GA-AGACC-TT-CTCCC--GTATTAA-C-AG---ATAA----T--TTGCT---T----G-C-A-T---C-TG--TC-AGCATAT--TTA-AAA-A-------GT-ATG--CC-GC-GTTTTTTAA-TG--CA--T-TT-TAAA--CTATTTTT-CTTT-TA-TAC-G--GG--AAAAATA--A--GTT-TT-TTGTTTTCTTTTTCCC-C--AA-AAAACCTTTC-ATGA----TAGTG--TAAAG-TTAA----TTTCAT---TCGTCTTA----------T-AAAAG-G-A---C-GG-CTG-T-T-TTA-G-TCG-----TAT---T-T-G--C---A--T---T-TGCAA--TT-AAtctttgttagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttacatacttataagagccagctgagaaactgctgaattgcaacgatactcatgcatgtgtcgtgtttggaagatttatacttatttacgtttaaatttgaataacagaaagtaatggcacaaaacgtatgaccaagggaagaccttctcccgtattaacagataatttgcttgcatctgtcagcatatttaaaaagtatgccgcgttttttaatgcattttaaactatttttcttttatacgggaaaaataagttttttgttttctttttccccaaaaaacctttcatgatagtgtaaagttaatttcattcgtcttataaaaggacggctgttttagtcgtatttgcatttgcaattaaat
gi|12 : atgttgcatcgcggggaaaatgttatggatatttgtatcgttttactaagtatcaagtgacattatgtatagcatgaaaattccttttcatattatcattatttcttcttttatacaaatcactctccatttctttgttagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntCATAA---TTCT---TA-CGA---CC-A-GC-----C---G--A---A--A---A---A-AATG-TAA-AATTG-CAAC-G--ATA-T-AC--A---GTG--C---A-T-G--A---C----G-AT--GT--T-GGA--AGTTTATA--TA-C-T-AGT-----TA-C-GTA---TT--AAA--T---TCATATATC------AG----AAAA-G--TGA-GGGAAAAAA--T-TA-T--GACACAA-AC---G-GAAACC-CT-TTCCCG--TAT--A-C-A----ATAA----T--T---TCT-T----G-C-A-TA--C-TG--TC-G--AAAA--TTG-AAA-A-------GT-ATG--CC-GC-GTTAG---A-TG--CA--T-AT-TAAA--CCA-TTTT-CTTT-T--TAC-A--CG--G-----A--G--AGT-TT-T-------------CC-CTAAA-CA---TTT-C-AT----------------A--TTAA--TCTT----------------------------AAAG-G-A------ACTTA-TAT-TTC---TCA--A--TATC----------A--A-----------AAGGCT-CATACA------A-T-CA---T-T-TT-----T---G--T-T--AA--TTCTAA----A-A--AT---A--C-A-AT---AC-C--A--C-G--T-G-A--T-------AG-T--C-A-C-G-TGA-T-A-AC-AAA-C--A---at
gi|13 : gtgaaccattttcttgtcctaagttatttgcattttttcttttttatacaaaagcactctccatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCAGTTGCA--TT-G-CGG--GG-AAAACGTTTATGAATA--TTT-T-AAAT-CATTA--CTT-ACTA--A-C-G-TT-AT----CAA----GTG-A-C-AT-GATG--TATA-AGT--AAACAATTT-ATTG-TCCTA-TAAAA-TT--A-----TG-T----ATTCTTTCGT-TTT--TAT----ACCAAATC------AC-TCTCCAa
gi|13 : ---G----C---A-T-G--A---C----G-AT--GC--T-GGA--AGTTTATA--TA-T-TTATT-----GA-C-ATA---TT--AAA--T---G----------------------------TGA-GGGGAGAAA-CT-TC-T--GACACAA-TG---GA-AAATC-CT-TTCCC--GTAT--A-C-A----ATAA----A--T---T---atttctatgtattgaattatgaaattgataatcatattaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacagtgcatgacgatgctggaagtttatatatttattgacatattaaatgtgaggggagaaacttctgacacaatggaaaatcctttcccgtatacaataaattct
gi|14 : cagttgcattgcggggaaaacgtttatgaatattttaaatcattacttactaacgttatcaagtgacatgatgtataagtaaacaatttattgtcctataaaattatgtattctttcgtttttataccaaatcactctccaatttctatgtattgaattatgaaattgataatcatattaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacagtCT---TG-CGA---CC-A-AT-----T---TC-A---G--A---A-----TGTG-TAA-AATTG-CAAC-G--ATA-T-AT--A---GTG--C---A-T-G--G---T----G-GT--AT--T-CAA--AGTCTACA--TA-T-TTATA-----TG-C-CTG---TT--ACA--TT--G-ATATATC------GGGGGAAAA--A--C--TGGAAAGCAA-CG-TC-T--GACACAA-AA----AGAA--------TCC------T--A-C-ATCTGATAA----T--T---TCT-T----C-C-A-TA--T-TC--TT-A--AAAA--TTG-AAA-AGTACACCGT-ATG--CA-GC-CTTGA---C-CG--CA--T-TT-TAAA--TTA-CCTTGCTTT-TA-TCG-G--AG--A-----A-----ATC-GC-T-------------CT-A--AG-CGC--TTTTC-AGT-----TAATG--TAAA--GTAA--ATATT--G---TTTTTCTA--A-T--AT-A-AAAA----G-C-C-GGTCTT-TAT-TTT-G-TTC--A--AATCC-A-T-G--TA--AT-T---T-TGAGA--TT-ACTGTA------A-T-GATTTT-T-TT-----T---T--T-T--GG--TTCTAA----ATT--TT---A--T-A-AT---------------------------------G-T--C-A-C-A-TGA-T-G-AT-AAA----A---CTTGC-T-TTGATGG-A-------A--A---TGTA-TGGA-Act
gi|15 : A--ACTATA-T---TGTCCTCA--A-T--AT-CTAAAAG-G-G-TGC-GGCCAG-TAT-T-A-G-TTG--A--TGTCG-T-T-GG-CA--A--T---T-T-TA----T-AATACA--------T-CA---T-T-TT-----T---GGTT-T--AAA-TTCTAA----A-A--TT---AGGC-A-AC---AT-C--A--T----T-G-A--T-------AG-TGTC-A-C-A-TGA-TTA-ATGAAA-C--A---ACAAT-C-TTCATGA-A-------A--A---TGT--TGGA----------------------------A-TC--G-CT-AA--C-------TA-TGT-CT-A--TT-C-AC-TCTC---GGG-T-A--T----T-TTT--C------TTG---AATAGTA--A-CATGC---A----------TGT-GAC-T--G-TT-TATG--TA-TGGCA-TTTTACGTTC-TT-T-CTGTAT--GGACGCCT-TA-A-TTCAGgc
gi|16 : atagttTCT---AA-CAA---CC-A-GA-----T---G--A---AGAA---A---C-TGTA--AA-A-TTG-CAAC-G--ATA-C-TC--A---AAA--C---A-T-G--A---C----G-AT--AT--T-GGA--AGTTTATA--TA-C-TTATT-----TA-C-GTA---TT--AAA--TT--G-ATAAAGC------AG----AAAA-G--TAATGGGAA-AAA-CT-TC-T--GACACAA-AG---GA-AAACC-TT-TTCCCG--TAT--A-C-A----GTTA----T--T---TCT-T----G-C-A-TA--C-TG--TC-G--AAAA--TTG-AAA-A-------CT-ATG--CA-GC-TTTGG---A-TG--CA--T-TT-TAAA--CCA-TTTT-CCTT-TA-TACAG--AG--A-----A-----GTT-TT-T-------------CC-C--AA-CA---CTct
gi|17 : A-CGA---CC-A-GA-----T---G--A---G--A---AA--C-TG-G-TAA-AATTG-CAGC-G--ATA-C-TC--A---AAAA-C---A-T-GAAC---G------AT--AT--T-GGA--AG-TTATA--TA-T-CTTTT-----TAGC-ATAC--TT--AAT--T---G-ATAAAGA------GA----AAA--G--TAATGGAAA---A-CT-TC-T--GAC-CAA--A---GGGAA--C-TT-TTCGCC-GTATT-A-C-A----GTAA----T--T---T---CTTGGG-C---TA--C-TG--TC-G--AAAA--T-G-AAA-A--------T--TG--CC-GC--TTGTGG-A-TG--CA--T-TT-TAAA--CCA-TTTT-C-TT-TA-TACGG--AGACA-----A--T--GTT-TT-TC------------CC-C--AA-CA---TTTT
gi|18 : --A--TATTG-T-T-G--TA--AA-TA--T-TGCGG--TT----------------------T-T-TT-----A---A--C-C--GA--TGTTCA----A-T--TT---A--A-A-TT---AT-C--T--T-G--T-G-A--T-------AG-T--C-A-C-G-TGA-T-A-AT-GAA-C--A---CCTGC-C-TCTATGA-A-------A--A---CGTA-TGGA-AGCA--T-----AC--C----GG-G-TA-TG--G-TT-----G-------AA-CGT-TGTT--TT-C-GT-TTTC---GGA-T-A--T----T-TCT--C-----ATTG---AATGTTTT-C-CATATAAGACAGAAACA--TAT---------TTT-TATGGATA-TAGTTGTTTTGCTTTA--T-T-CTGTATA-GGATGC---TATA-TTCAAT
gi|19 : -T-T-C--CA--A--T---A-TG--A--TC-ATTACA------A-T-CA---TAT-TTGCCGGT---G--T-T--GA--TTTT-------------------T-A-AT---GT-C--A--C-A--T-T-A--T-------AG-T--C-A-T-T-TAA-T-G-AT-AAA-C--A---CGTGC-C-CCCATGA-A-------A--A---TGTA-CGGG-AGCC--T-----AT--T-----C-GATA-TT--G-GC-AT--G-------AA-TGT-TG-A--TT-C-TT-TCTC---AGA-T-A--T----T-TTT--C-----ATCG---AATCATTC---CA--T---AGA-AAATACGAAC-AAT-T--GTCTGTATG--TA-T-ATG-TT-----TTA-TT-C-TTGAATG-GGGGACCT-TA-A-TTCAGTa
gi|2 : ttgcACATTTCCA--TT-G-CGG--G--AAAAT--C-AT-A-TA--TTT-T-AA-T-C--TA--TTT-ACTAGAA-C-G-TTTAT----CAA-----TG-A-C-AT-GATG--TATA-CGTTGGAACATTTTA-TTG-TCCTA-TAAAA-TT--A-----TG-T----ATTCTTTG-G-TTTA-TAT----TCAA---A------GCATCTCCAt
gi|2 : cttCATAA---TTCT---TA-CGA---AC-A-GC-----A---A--AT--A--A---A---A-TGTGGTA----TTG-CAAC-G--ATA-T-AC--AAGTG----C---A-T-G--A---C----G-ATTGGT--T-GGA--AG-TTATA--TAAC-TTATT------A-C-ATA---TA--AAT--T---C-ATATATC------AG----AAAA-G--TGAGGAGAA-AAA-CT-TC-T--GACACAA-AG---GGGAAATC-CT-TTCTC--TTAT--A-C-A----ATAAGAT-T--C---T---T----GTC-ATTA--T-CGTCTC-G--AAAA--TTG-AAA-A-------GT-ATG--CC-GCAGTTGT---T-TG--CATTT-TT-TAAATCCTA-TTTT-CTTT-TA-TACGG--AG--AC----A--C--GTT-TTCT-------------CC-C--AACCACT-TTCTC-ATATATTCTAAAGTTTAAC--TTAA--G--TT--T---ACTC---A--A-TTAGT-C-AAAA--G-G-T-CGGGCTTGTTAT-TTAGG-TCG--AGCTATCG-TCT-G--CA--AT-T---T-TGCAAATTC-AAGACA------A-T-CA---T-T-TG-----T---GT-T-T--AA--TTCTAA----AGA--TT---A--T-G-AT---AT-C--AACC-GCTT-G-ATGT-------AG-T--C-A-C-G-TGATT-A-AT-AAA-C--A---ACAAT-C-TTGGTGAGA-------A--A---TGTA-CGGA-ATCC--TCAG--TTGAT----ATGG-TA-TC--G-AT-GAATG-------AA-CAT-CG-A--TT-CTAC-TCTC---GGG-T-A--A----T-TTT--CA----GTTGTATAGTAGTAC-A-CATGT---ACA-AAACACTTAT-TAT-TAAATTTATATG--TACT-GCT-TTTAACGTTA-TTGT-CTGTATGAGGACGCCTATA-A-TTCAGannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncataattcttacgaacagcaaataaaatgtggtattgcaacgatatacaagtgcatgacgattggttggaagttatataacttattacatataaattcatatatcagaaaagtgaggagaaaaacttctgacacaaaggggaaatcctttctcttatacaataagattcttgtcattatcgtctcgaaaattgaaaagtatgccgcagttgtttgcattttttaaatcctattttcttttatacggagacacgttttctcccaaccactttctcatatattctaaagtttaacttaagtttactcaattagtcaaaaggtcgggcttgttatttaggtcgagctatcgtctgcaattttgcaaattcaagacaatcatttgtgtttaattctaaagattatgatatcaaccgcttgatgtagtcacgtgattaataaacaacaatcttggtgagaaatgtacggaatcctcagttgatatggtatcgatgaatgaacatcgattctactctcgggtaattttcagttgtatagtagtacacatgtacaaaacacttattattaaatttatatgtactgcttttaacgttattgtctgtatgaggacgcctataattcag
gi|20 : cttacatttccattgcgggaaaatcatatattttaatctatttactagaacgtttatcaatgacatgatgtatacgttggaacattttattgtcctataaaattatgtattctttggtttatattcaaagcatctccaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-C--A--C-G--T-G-A--T-------AG-C--C-A-C-A-TGA-T-G-AT-GAA-C--A---CCTGG-T-TGGATGA-A-------A--A---T-TATTTGA-ATCA--T-----AT--T----AT-G-TA-TCAGA-AT-AA--A-------AA---T-TG-A--TT-C-GC-TTTC---GGA-T-A--TTG--T-TTT--C-----ATCG---AATAGTAT-T-CATGT-----A-AAGCACTCATAGAT-T--GTTT-TATT--TA-T-GTG-TTTTACTGTA-TT-T-CTGTACA-GGGCGTCC-TA-A-TTC
gi|21 : -AAAAG-GAG-T-C-GGTCTG-TTT-ATA-G-TCG--A--TATTG-T-T-G--CA--A--T---CATGCGA--TT-GTTACATGTTCAA-T-AA---T-T-TT-----T------C-C--GG--TGCTAA----A-C--TT---A--T-A-AT---GT-C--A--C-G--T-G-A--T-------AA-T--A-A-C-G-CGA-T-A-AT-ACA-C--T---CCTAC-A-TTGATGA-A-------A--A---TGTA-
gi|23 : tagtttatgtaaagtaagcgttaataaatcatgtacaaaatTTT---TG-CAG---CT-A-GT-----T---GCAA---A--A---A---C-TGTA-TAA---TTG-TCAT-G--ATA-T-AC--A---G----T---G-T-A--C---C----G-GT--GG--T-GGACAAAATCATA--TT-T-CTATTCCTATTA-C-ATACTATT--AGA--T-----ATTAAG--------A----AAA--G--TGTTGGGA-GCAA-CT-TC-T--AACACAA-AA---T-GAAACC-AC-TTCCCG-
gi|24 : gcCATAAT--TTCA---TA-CGA---CA-G-GC-----G---G--A------A---A---C-TGTG--AA-A-TTG-CAAca
gi|25 : annnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaTCT---TA-CGA---CA-A-GC-----T---G--AA--G--AG--A---C-TGTG--AA-A-TTG-CAAC-G--ATA-C-GC--AT--GAATTC---A-T-G--G---C----G-AT--GT--T-GGA--AGGTTATA--TT-C-TTGTT-----TA-C-GTA---TT--GAAT-T---G-ATAAAAC------AGA---AAA--G--TGATAAGAA-AAA-CT-TC-T--GACACAA--A---GAGAAACC-CT-TTCCC
gi|26 : --T----T-TTT--C-----ATTG---AATATTAC-C-CATGT---A---AAACACTTAA-AGT-T--GTTT-TATC--TAAT-GTA-TTTTACTCTA-TT-T-CTGTATA-GAACGTTT-TA-A-TTCAAT
gi|27 : gagggctacattattgcagctagaagccttacaaggctatcggtatgaatgttagAGATGAA--TC-G-CGG--GG--AAAT--------ATA--TTT-T-G--T-CATTA--TTT-ACAA--C-C-G-TT-AT----CAA----GTG-A------TATGCTTAAA-CG--AAAAC-GTTTACTTA-TC--A----AA-CA--AATGTTCA-T-----TTCTTTC-T-TTT--Tt
gi|28 : ttcttttACAGTTGCA--TC-G-CGG--GG--AAATGTC-AT-A-TA--TTT-T-AA-T-CGTTA--TTT-ACTA--A-A-C-TT-TT----TA-----GTG-G-CGAT-TATG--GA-A-CGT-GAAACATTTATCTTG-TCCTA-T--AT-TA-----------T----CTTCTTTC-T-GTT--TG-------------------GC------AT-ACCAG-ATCACTCTcatatcaaataactcattattctttatatga
gi|29 : --AGATTATA--TA-T-TTATT-----TA-C-GTA---TT--AAA--T---TCATAAAGC------AA----AAAAAG--TGATGAGAA--AA-CT-TT-T--GACGCAA--A---GGGACACC-CT-ATCT-A-GTAT--A-C-A----GTAA----TGTT---T---T----G-C-A-TA--C-TG--TC-A--ACAA--TTG-AAA-A-------GT-ATG--CC-GC-tc
gi|3 : G--GGTAAAAT-TC-AT-AAAAATTTT-T-AC-T-CGTTA--TTT-A-----A-C----T-AT----GAAGTAAATG-A---AT-GATG--TATA-CGC-GAAACATTTTTCTTG-TCCTA-T--AA-AA--A-----CT-T----ATATTTCT-C-TT
gi|3 : AA--TTCT---TATCGA---AC-A-GTCTAAAT---G--A---G--A---A---A-TGTGGTA----TTG-CAAC-G--ATAGT-AC--A---G----TGCAA-T-G--A---C----G-AT--GT--T-GGA--AGTATATA--TA-T-TAATT-----TG-C-GTA---TT--AAA--TTCAG-A-ATATC-------G----AAA--GCGTGA-GGGGAGAAA-CT-TCAT--GAACCAA--A---GGGACGAT-CT-TTCC---G-AT--A-C-A----ATAAATTAC--T---T---T----G-C-A-TA--C-TG--TC-A--AAAAA-TTG-AAA-A-------GT-ATT--CC-GC-GTTGT---T-TG--CATTT-TT-TATA--CCA----T-CTTT-TA-TAC-G--CG--G-----A--GAAGTT-TT-T-------------CC-C--AA-CA---CTTTC-AT---------TATGTAAAGGTTAC--ACTTTA-TAAATCTC--TA--A-T--A--C-AAAAG-G-GCT-C-GG-CTG-TTT-TTA-GTTCGGAA--TATCG-T-T-G--CAGGA--T---A-TGCAA--TT-AATAAA------A-T-AA---C-G-TT-----TATGG--T-T--AA--ATCTAA----A-A--TT------C-G-AT---ATGT--A--CAG--T-G-A----------AT-C--C-A-C-G-TGA-T---AT--AA-CTGA---ACAAT-C-TTGGTGG-A-------AATA---TGTAGCGGAGATCC--TAATGGTA--TTAAAAG-G-GA-TC--G-AT-TATTG-------AAGCGC-CG-AAGTT-C-AC-TCTC---GGG-T-AACT----T-TTT--CATTAATTGA---AATACTAG-T-CATGTA--ACT-AAAAACTTAT-GAT-T--ATTT-TATT--TATT-GCT-CTTAACGTTA-TT-T-CTGTAT--GGACG-CT-TA-A-TTCAcgcatgtacaccaaagcactttctaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaataattcttatcgaacagtctaaatgagaaatgtggtattgcaacgatagtacagtgcaatgacgatgttggaagtatatatattaatttgcgtattaaattcagaatatcgaaagcgtgaggggagaaacttcatgaaccaaagggacgatctttccgatacaataaattactttgcatactgtcaaaaaattgaaaagtattccgcgttgtttgcattttttataccatcttttatacgcggagaagtttttcccaacactttcattatgtaaaggttacactttataaatctctaatacaaaagggctcggctgtttttagttcggaatatcgttgcaggatatgcaattaataaaataacgtttatggttaaatctaaaattcgatatgtacagtgaatccacgtgatataactgaacaatcttggtggaaatatgtagcggagatcctaatggtattaaaagggatcgattattgaagcgccgaagttcactctcgggtaactttttcattaattgaaatactagtcatgtaactaaaaacttatgattattttatttattgctcttaacgttatttctgtatggacgcttaattca
gi|30 : gggtaaaattcataaaaatttttactcgttatttaactatgaagtaaatgaatgatgtatacgcgaaacatttttcttgtcctataaaaacttatatttctcttcgcatgtacaccaaagcactttctaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaatACAGTTGCA--TC-G-CGG--G--AAAAT-TC-AT-GAT---TTT-T-A--T-CGTTA--TT--ACCA--A-C-G-T--AT----CAGA---GTG-A-CCAT-TATG--TATA-CAT-AAAACA-TTTCCTT--TTCTA-T--AATTA--G-----CA-T----ATTCCTTT-A-TAC--AAA----TC-----C------AC-TCTCC
gi|31 : ttACAGTTGCA--GC-G-CG--------AATGTC-AT-AATA--TTG---A--T-C--TA--TTT-AC----A-C-C-TT-AT----CAAA---GTG-A-C-AT-TATG--TATA-CAT-G-AATA--TTCCTTG-T-CTA-T--AA-T---------CA-T----ACACTTTC-C-TTT--TAT----ACCAAATC------AC-TCTCCA
gi|32 : tt-A-TTG-CAAC-A--ATA-C-GC--AAT-G----C---A-T-G--G---C----G-AT--GT--A-GGA--AGATTATA--TA-C-TTGTA-----TA-C-GTA---TT--AAAT-T---G-GTAAAGCAAAAAAAA----AAA--G--TGATGAGA--AAA-CT-TC-T--GACGCAA--A---GGGACATC-CT-TTCTCG-
gi|33 : ACAGTTGCA--TC-GGCGG--G---AAATGTC-AT-AATA---TT-A-A--T-CG--A--TTT-ACTA--A-C----T-AT----CAA----GT--A-C-AT-TATG--TATA-C---AGAATA--TTCC-TG-TCC-A-T--AA-T---------CA-T----ACACTTTC-C-TTT--TAT----ACAAAT-C------AC-TCTCCt
gi|34 : t-------AA-CGT-TG-A--CT-C-AC-TCTC---GGA-T-A--T----A-TTT--T-----TTT-----ATATGAC-A-CATGT---ACA-AAACACTTGT-GAC-T--ATTT-TATG--TA-T-GCT-TTTTACGTTG-TT-T-CTGTGTG-GGGCGCC
gi|35 : A--TT-AATACA------A-T-CA---A-T-TT-----T---G--T-T--AA--TTCTAA----A-C--TT---A--C-G-ATCATAC-C--A--C-A--T-G-A--T-------AG-T--C-A-C-G-TGA-T-A-AT-ACA-C--A---AACGT-C-TTAGTGA-A-------A--A---TATA-TGGA-ATCC--T-----
gi|36 : TTT---TA-CGA---CC-A-GC-----T---G--T---A--A---A---A-AGTG-CAATA-TTG-CAAC-G--ATA-T-AC--GGT-G----T---A-T-G--CTAGG----A-AT--TT--T---C--AGTCTGTA--TC-T-TTATA-----TT-C-TTA---TT--A
gi|37 : TTAT-GAT-T--GTTT-TATG--TA-T-GCT-TTTTACGTCA-TT-T-CTGTATG-GTAAGCCT-TA-A-TTCAGca
gi|38 : A--TC-G-CGG--GG-AAAATGTC-AT-AATA------T-A--T-CGTTA--T
gi|4 : aggttcttatat-AT-AGAA--TTT-T----T-CGTTA--TTTTACTA--AAT-T-TT-AT----CGAG----TGCA-C-ATGTATG--T----C-----AACATGTTACTTG-TCCGA-T--AA-T---------TA-TTGCCATTTTTCC-T-TTT--TAT----AC-----C------caagtgatatgct
gi|4 : CATAAAATTCCT---TG-CGAA--CC-AAGC-----T---G--A---G--A---AGAAC-TGTG--AA-A-TT--CAAC----ATA-C-GC--AATGG----C---A-TAG--C---G------AT--GT--T-GGA--AGAT-ATA--TA-C-TTATT-----TAACAGTA---TTTAAAA--TT--G-ATA-AGC------AA----AAA--G--TGATGGGAA-AAA-CTGTC-TT-GACGCAA-GG---GA--AACC-CT-TTCCCG--TAT--ATC-A----GTAA----TGTC---T---T----G-C-A-TATAC-TG--TC-G--GAAA--TTGGAAA-A-------GTGATG--CCCGC-GTTGT---G-TGG-CA--TCTT-TAAA--CTA-TTTT-TTTCACA-TAC-GGAAA--A-----A--G--TTT-TT-T-------------CCGC--AA-CAC--TTTTC-ATG-----TAATGTAGAAG--TTAATTATTAT--T---TCTCC-----A-T--GT-C-AAAAAAG-G-T-C-GGCCTG-TCT-TTA-G-TCG--A--TATCGGT-T-GTTCA--GATT---T-TGCAA--TT-AATACG------AGT-CA---T-T-TT-----T---GG-T-T--AAACTTCTGA----A-AATTT---A--C-AGAC---AT-C--A--C-G--T-G-A--T-------AG-T--CCA-C-G-TGA-T-A-AT-AA--C--G---AGAGT-CCTTGTTGA-A-------C--A---T-TA-CGGA-ATATAAT-----TAA-T----AC-G-TA-TC--G-AT-AT--G-------AA-CGT-CG-A--TTTC-ACCTCTCCAGGAA-T-A--TAACTT-TTT--C-----TTTG---GTCAGTAC-A-CATGT---ACA-AAACACTAAT-GAT-T--GTTT-TATG--TA-T-GAA-TTTCACGTTATTT-T-CTGTATGTGGACGCCT-TA-CTTTCAGTaaatcgactcttaccatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncataaaattccttgcgaaccaagctgagaagaactgtgaaattcaacatacgcaatggcatagcgatgttggaagatatatacttatttaacagtatttaaaattgataagcaaaaagtgatgggaaaaactgtcttgacgcaagggaaaccctttcccgtatatcagtaatgtcttgcatatactgtcggaaattggaaaagtgatgcccgcgttgtgtggcatctttaaactatttttttcacatacggaaaaagttttttccgcaacacttttcatgtaatgtagaagttaattattatttctccatgtcaaaaaaggtcggcctgtctttagtcgatatcggttgttcagattttgcaattaatacgagtcatttttggttaaacttctgaaaatttacagacatcacgtgatagtccacgtgataataacgagagtccttgttgaacattacggaatataattaatacgtatcgatatgaacgtcgatttcacctctccaggaatataactttttctttggtcagtacacatgtacaaaacactaatgattgttttatgtatgaatttcacgttattttctgtatgtggacgccttactttcagtt
gi|40 : atagaatttttcgttattttactaaattttatcgagtgcacatgtatgtcaacatgttacttgtccgataattattgccatttttcctttttataccaaatcgactcttaccatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnG--TA-T-GCT-TTAAACGTTA-TT-T-ATATATG-TGACGCCT-TA-A-TTCAt
gi|41 : -AAACACTTAT-GGC-T--GTTT-TATG--TA-T-GCT-TTTTACGTTA-TT-T-CTcgtt
gi|42 : A--TT-G-CGG--GT--AAATGTC-AT-AATA--TTT-TAA--T-CGTTA--TTT-AC
gi|5 : TTGCA--TC-G-CGG--GG-AAAATGTC-AT-ATGA--TTT-T-A--TTCGTTAATTCT-ACTA--A-CCG-TT-A-----CAAG----TG-AAC-AT-TATG--TATA-CAT-GAAACACTT--CTTG-TCCTA-T--AA------------A-T----GATCTTTC-C-TTT--TTT----A-----------------------TACCAA-ATCACTCT
gi|5 : tCATAA---TTCT---TA-CGA---CCCA-GC-----T---G--A---A--AGAAA---C-TTTT-GAA-A-TTG-AAACCG--ATA-C-GC--A---T----C---AAT-G--G---T----G-AT--GT----GGA--AGATTGTA--TA-C-TATTT-----TA-CCGTA---TT--AAA--T---G-AT-TACC------AG----AAAA-G--TGATGGGAA-AAT-CT-TC-TTTGACG--A-AA---GAGAAACT-CT-TTCCCG--TAT--T-C-A----ATAAATTTC--T---T---T----G-C-ACTA--CCTG--TC-A--AAAA--TTG-AAATA-------GT-ATGGGCC-GC-GTTGT---A-TGAACA--T-TT--AAA--CTA-TTTC-TTTT-TAATAG-G--AG--A-----A--G---TT-TT-T---------------------------TTTTT-ATG-----TAATGGTAAAG--TTAA--ACTTT--C---TCT---TA--A-T--AT-C-AAAAG-G-A-T-C-GGCCGG-TAT-TTA-G-TCC--A--TATC------G--CA--A--TAAAT-GGCAA--TTAAATACA------T-T------T-T-TT-----T---GT-T-T--AA--TTCTTA----A-A--TT---A--CAA-AC---AC-C--A----G--T-GAA--T-------AG-TCCC-A-CTG-TGA-T-ACAT-AAACC--A---GCAGT-C-GTGTTGA-A-------A--A---TATA-CAGA-ATCC--T-----TC--T----AA-G-TA-TC--G-ATAAA--G-------AACCGT-CG-A--TT-T-CT-CCTC---GGA-TCA--T----T-TTT--C-----TTTG----ATAGTACAA-CATGT---ACA-AACCACTTAT-GATAT--GTTT-TATGAATA-T-GCT-TTTTACG-TA-TT-T-CTG-ATG-GGATGCCT-TA-A-TTCAGccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntacataattcttacgacccagctgaaagaaacttttgaaattgaaaccgatacgcatcaatggtgatgtggaagattgtatactattttaccgtattaaatgattaccagaaaagtgatgggaaaatcttctttgacgaaagagaaactctttcccgtattcaataaatttctttgcactacctgtcaaaaattgaaatagtatgggccgcgttgtatgaacatttaaactatttctttttaataggagaagttttttttttatgtaatggtaaagttaaactttctcttaatatcaaaaggatcggccggtatttagtccatatcgcaataaatggcaattaaatacatttttttgtttaattcttaaattacaaacaccagtgaatagtcccactgtgatacataaaccagcagtcgtgttgaaaatatacagaatccttctaagtatcgataaagaaccgtcgatttctcctcggatcatttttctttgatagtacaacatgtacaaaccacttatgatatgttttatgaatatgctttttacgtatttctgatgggatgccttaattcag
gi|6 : tttgcatcgcggggaaaatgtcatatgattttattcgttaattctactaaccgttacaagtgaacattatgtatacatgaaacacttcttgtcctataaatgatctttccttttttataccaaatcactctccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaCAGTTGCA--TC-G-CGG--GGAAA---GTC-AT-AATA---TT-T-A--T---TTA--TTA-ACT---T-C-G-TT-GTAGTGCACGCA-GTGAA-C-AT-TATGT-TGTA-CAT-G-AACAATTGC---G-TCCTA-T--AA-TATGG-----C--------TTCTTCC-T-TTTGATATCCAAAC-----C------AC-TCTC
gi|6 : CATAAA--TTCT----A-CGA---C----AC-----T---G--A---A--A---A---C-TTTG-GAA-A-TTG-CAAC-GC-ATA-C-GTCAA---G----C---A-T-G--G---C----G-AT--GT--T-GGA---GATTTTACGTA-T-TTAAT-----TG-A-ATA---T----AA--T---G-ATATAGCG-----AA----AAA--G--TGATGGAAA--AT-CT-TC-T--GACGCAAAGA---GAGAACCC-AT-TTCC---GTAT--A-C-A----ATAA----T--T---TCCTT----G-CCA-TA--C-TG--TC-A--AAAA--TTG-AAA-A-------GT--TG--CC-GC-GTTGT---A-TGA-CAA-TATT-TAAA--CTA-TTTT-CTTT-TA-TAC-G--AG--A-----A--A--GTT-TT-C-------------CC-A--AA-CA---CTTTC-ATG-----TAATG--TAAAGGTTAA----CTT--T---TCTTCTTAACA-T--AT-C-AAAAG-G-A---C-GGCCTG-TA--TTA-G-TCC--A--TATCG-T-T-G--CA--AT-T---T-TGCAA--TT-AATACA------A---AA---T-T-TT-----T---G--T-T--AG--TTC--A----A-A--TT---A--C-A-A----AT-CCAA--C-G--T-G-A--T-------AA-G--C-A---G-TGA-T-A-AT-AAA-T--A---G-AGT-C-TTGTTGA-A-------A--A---TGTA-AGGA-AT-C--T-----AC--T----AC-G-TA-TC--G-A--AA--G-------AA-CGT-CG-A---T-C-AA-CCTC---GGATT-A--T----TGTTT--C-----TTTG---AATAGT-C-A-CATGT----CA-AAACA-TTAT-GA--T--G-TT-TATG--TA-T-GCC-TTTTACGTTA-TT-TGCTGTATG-GGACGCCT-TA-A-TTCAGatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncataaattctacgacactgaaaactttggaaattgcaacgcatacgtcaagcatggcgatgttggagattttacgtatttaattgaatataatgatatagcgaaaaagtgatggaaaatcttctgacgcaaagagagaacccatttccgtatacaataatttccttgccatactgtcaaaaattgaaaagttgccgcgttgtatgacaatatttaaactattttcttttatacgagaaagttttcccaaacactttcatgtaatgtaaaggttaacttttcttcttaacatatcaaaaggacggcctgtattagtccatatcgttgcaattttgcaattaatacaaaatttttgttagttcaaattacaaatccaacgtgataagcagtgataataaatagagtcttgttgaaaatgtaaggaatctactacgtatcgaaagaacgtcgatcaacctcggattattgtttctttgaatagtcacatgtcaaaacattatgatgtttatgtatgccttttacgttatttgctgtatgggacgccttaattcag
gi|7 : cagttgcatcgcggggaaagtcataatatttatttattaacttcgttgtagtgcacgcagtgaacattatgttgtacatgaacaattgcgtcctataatatggcttcttccttttgatatccaaaccactctcatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnG-A-C-AG-TATG--TACA-CAT-GAAACATTTTC-TTG-TCCTA-T--AA-TT--A-----TG-C----ATTATTTC-CTTTT--TAT----AC-----CAAAATTAC-TCTCCAT
gi|7 : A-CGA---CC-A-GC-----TCATG--A------A---A---C-TG----AA-T-TTA-CAAC-A--ATA-C-GC--AAT-G----C---A-T-G--A---C----G-AT--GT--T-GGA--AGATTATA--TA-C-TTATT-----TA-C-GTA---TT--AAA--TT--G-ATAAAGC------AA----AAAA-G--TGATGAGAA-AAA-CT-TC-T--AACGCAA--A---GGGAAACC-CT-TTCTTG--TAT--A-C-A----GTAA----TG-TA--T---T----G-C-A-TA--C-TG--TC-G--AAAA--TTG-AAA-A-------GT-ATG--CC-GC-GTTGT---A-TG--CA--T-TT-TAAA--GCA-TTTT-CTTT-TA-TAC-G--GA--A-----A--A--GTT-TT-T-------------CC-C--AA-CAC--TTTTC-ATG-----TAATG--TAAA--ATAG--A-TTT--T---ATTTCTAA--A-T--AT-C-AAAAG-G-G-T-C-GGTCTG-TCT-TTA-G-TCG--A--TATCG-T-TGG--CA--A--T---T-TGCGA--TT-AAT-CA------A-T-CA---T-TATT-----T---G--T-T--AA--TTCTAAGCAGA-G--TTAAGA--C-A-AA---AT-CG-A--C-G--TAA-A--TGTGAATAAG-T--C-A-T-G-TGA-T-A-CT-AAA-C--ATATTCAGTAC-TTG-TGA-A-------A--ATTTTGTA-CGGA-GTTC--A-----T---T----AC-T-TACTC--GTAT-AA--GATATTGAAA-CGTGCG-T--TC-C-AC-TCTC---GG--T-A--TAAA-T-TTTAGCA----TTTGA--AATAG-AC-AGCATGT---AC--AATCACTTAT-GAT-T--GTTT-TATG--TA-T-GCT-TTATATTTTA-TT-T-CTGTATG-GGACGCCT-TA-A-TTCAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacgaccagctcatgaaactgaatttacaacaatacgcaatgcatgacgatgttggaagattatatacttatttacgtattaaattgataaagcaaaaaagtgatgagaaaaacttctaacgcaaagggaaaccctttcttgtatacagtaatgtattgcatactgtcgaaaattgaaaagtatgccgcgttgtatgcattttaaagcattttcttttatacggaaaagtttttcccaacacttttcatgtaatgtaaaatagattttatttctaaatatcaaaagggtcggtctgtctttagtcgatatcgttggcaatttgcgattaatcaatcattatttgttaattctaagcagagttaagacaaaatcgacgtaaatgtgaataagtcatgtgatactaaacatattcagtacttgtgaaaattttgtacggagttcattacttactcgtataagatattgaaacgtgcgttccactctcggtataaattttagcatttgaaatagacagcatgtacaatcacttatgattgttttatgtatgctttatattttatttctgtatgggacgccttaattca
gi|8 : gacagtatgtacacatgaaacattttcttgtcctataattatgcattatttcctttttataccaaaattactctccatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCAGT-GCA--TC-A-CCGCCGGGAAA--GTC-AT-AATA--TTT-T-A--T--GTTA---TT-GCTA--G-C-G-TT-ATC---CAA------G-A-C-AT-TAT---TATA-CAT-GAACCAATATC---G-TCCTATT--AA-TT--A-----C-------ATTCTTTC-C--TT--TAT----AC-----CTAAT--AC-TCTC
gi|8 : ATAA----TCT---TA-CGA---C--A-CC-----T---G--ACAGA--A---A---C-TGTA-CAA---TTC-AAAC----ATA-C-GC--AAT-G----C---A-T-G--C---A----G---------T-GGA--GAATCATA--TA----TATC-----TA-----A---TT-----------G-ATAAAGC------AA----AAA--G--TG-TGGAAA---A-TC-TC-T--GACGCAA-GA---GAGAAACC-CT-GTCC----TAA--A-CTA----ATAT----T--TC--T---T----G-C-A-TA--C-TG--CC-G--AAAA--TTG-AAA-A-------GT-ATG--CC-GC-GTTA-------G--CA--T-TTGCAAA--C-A-ATTT-CT--------------G--A-----ATCG--GAT-TT-C-------------CC-C--AA-CA---CTTTCAATG-----TAA-G-TAAAA--TTGT--TTTTT--T---TCTCC--A--A-T--AT-C-AAAAG-G-A-T-C-GGCCTG-TATGTTA----TG--A--TCT-G-T-T-G--CA--A--T---T-TGCAA--T-------A------A-T-T----T-T-TT-----T---G--C-T--AA--TTCTAA----A-A--T---------A-AA---AT-C--A--C-G--T-G-A----------AG-T--C-A-C-G-TGA-T-A-AT-AAA-C--A---ACAG--C-CTGTTGA-AATTAAGGA--A---TCTA-AGGA-ATCC--------TC--T----AC-G-TA-GC--G-AT-AT--G-------AA-CCT-CG-A--GT-C-AA--CTC---GGA-T-A-------T-TTT--C-----TT-----GATAGTA--A-TATGT---ACA-AAACAC-TAA-GA-----G--T-TA-G--TA-T---C-TTGTACGTCA-TT-T-CGTTATG-GTA-ACC--TA-A-TTCaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntataatcttacgacacctgacagaaactgtacaattcaaacatacgcaatgcatgcagtggagaatcatatatatctaattgataaagcaaaaagtgtggaaaatctctgacgcaagagagaaaccctgtcctaaactaatatttcttgcatactgccgaaaattgaaaagtatgccgcgttagcatttgcaaacaatttctgaatcggatttccccaacactttcaatgtaagtaaaattgttttttttctccaatatcaaaaggatcggcctgtatgttatgatctgttgcaatttgcaataatttttttgctaattctaaaataaaatcacgtgaagtcacgtgataataaacaacagcctgttgaaattaaggaatctaaggaatcctctacgtagcgatatgaacctcgagtcaactcggatattttcttgatagtaatatgtacaaaacactaagagttagtatcttgtacgtcatttcgttatggtaacctaattc
gi|9 : cagtgcatcaccgccgggaaagtcataatattttatgttattgctagcgttatccaagacattattatacatgaaccaatatcgtcctattaattacattctttcctttatacctaatactctcaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnt--GGGAAA--GTC-AT-AATA--TTT-T-A--T--GTTA---TT-GCTA--G-C-G-TT-ATC---CAA------G-A-C-AT-TAT---TATA-CAT-GAACCAATATC---G-TCCTATT--AA-TT--A-----C-------ATTCTTTC-C--TT--TAT----AC-----CTAAT--AC-TCTC
gi|9 : gccATAA----TCT---TA-CGA---C--A-CC-----T---G--ACAGA--A---A---C-TGTA-CAA---TTC-AAAC----ATA-C-GC--AAT-G----C---A-T-G--C---A----G---------T-GGA--GAATCATA--TA----TATC-----TA-----A---TT-----------G-ATAAAGC------AA----AAA--G--TG-TGGAAA---A-TC-TC-T--GACGCAA-GA---GAGAAACC-CT-GTCC----TAA--A-CTA----ATAT----T--TC--T---T----G-C-A-TA--C-TG--CC-G--AAAA--TTG-AAA-A-------GT-ATG--CC-GC-GTTA-------G--CA--T-TTGCAAA--C-A-ATTT-CT--------------G--A-----ATCG--GAT-TT-C-------------CC-C--AA-CA---CTTTCAATG-----TAA-G-TAAAA--TTGT--TTTTT--T---TCTCC--A--A-T--AT-C-AAAAG-G-A-T-C-GGCCTG-TATGTTA----TG--A--TCT-G-T-T-G--CA--A--T---T-TGCAA--T-------A------A-T-T----T-T-TT-----T---G--C-T--AA--TTCTAA----A-A--T---------A-AA---AT-C--A--C-G--T-G-A----------AG-T--C-A-C-G-TGA-T-A-AT-AAA-C--A---ACAG--C-CTGTTGA-AATTAAGGA--A---TCTA-AGGA-ATCC--------TC--T----AC-G-TA-GC--G-AT-AT--G-------AA-CCT-CG-A--GT-C-AA--CTC---GGA-T-A-------T-TTT--C-----TT-----GATAGTA--A-TATGT---ACA-AAACAC-TAA-GA-----G--T-TA-G--TA-T---C-TTGTACGTCA-TT-T-CGTTATG-GTA-ACC--TA-A-TTCaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntataatcttacgacacctgacagaaactgtacaattcaaacatacgcaatgcatgcagtggagaatcatatatatctaattgataaagcaaaaagtgtggaaaatctctgacgcaagagagaaaccctgtcctaaactaatatttcttgcatactgccgaaaattgaaaagtatgccgcgttagcatttgcaaacaatttctgaatcggatttccccaacactttcaatgtaagtaaaattgttttttttctccaatatcaaaaggatcggcctgtatgttatgatctgttgcaatttgcaataatttttttgctaattctaaaataaaatcacgtgaagtcacgtgataataaacaacagcctgttgaaattaaggaatctaaggaatcctctacgtagcgatatgaacctcgagtcaactcggatattttcttgatagtaatatgtacaaaacactaagagttagtatcttgtacgtcatttcgttatggtaacctaattc
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|22 ): TATGTAAACATTAAAACATTTTCTTGTCCTATCAAATCACTCTCCATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCATG
Unaligned ( gi|39 ): AGTAGTATCATGGGGAAAATTTATTTGTTGAAATTATTACCATTATCAAGTG
Unaligned ( gi|43 ): ATTTTTCCAAGCCAAAAAAGGTCAGCCTTCTATAC
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 11 1111 33333 11 111 3333333333 44444444444444444444444 1 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 222 111111 11 111 333333333 11111111 11111111111 11 11 2222 22222222222222222222 111111 11 11111111111 1111111111111 1111 11111111111111 11 1111111 11 11111111111111 1111111111 1111111 33333333333333333333 1111111111111 1111111 111111 1111
lowQualScore : 33 777 2 2 2 2 4 2 55 2 2 00 2 333 2 33 999999 55 0000 00000 7 4 2 4 55 2 4 2 9 33 2 4 000 4 0000000000 2 333 444 55 2 88888888888888888888888 3 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 000 444 2 666 33 2 55555 333 55 777777 555 99999 44 222 2 8888 2 2 22 555555555 333 2 888 2 22 22 4 22 3 22 555 55555 666 555 22 33333333 4 0 11111111111 55 2 1 2 22 22 2 2 44 1 77 333 1 2 2 7777 77 2 4 7777 22222222222222222222 5555 2 2 5 33 2 33 5555 33 2 2 8888888 22 33 2 2 555555 99 00 5 66 2 2 2 2 8 33 33 44444444444 2 2 7777777777777 2 33 2 77777 33 2 9 88 0 8888 77 1 444 555 66666666666666 33 2 33 2 2 44 77777 2 2 0 5 888 66 33 333 2 2 55 33 33 444 2 66 2 777777 2 1111111 2 2 2 66666 00 2 33 55 5555 22222222222222 2 6666 2 55 33 2 33 2 2 0000000000 2 66 2 2 2 2 2 2 4 2 2 33 5555 0 44 2 3 2 6666666 33 444 1 77 2 00000000000000000000 3 3 44 3 2222222222222 5 2 2 33 2 2 33 555 2 2 6666666 2 33 444444 1 777 0000 777 2 1 2 66 33 2 4 66 6 4 22 2 2 2 4 0 2 2 2
lowQualScore : .. ... . . . . . . .. . . .. . ... . .. ...... .. .... ..... . . . . .. . . . . .. . . ... . .......... . ... ... .. . ....................... . ........................................................................................................................ ... ... . ... .. . ..... ... .. ...... ... ..... .. ... . .... . . .. ......... ... . ... . .. .. . .. . .. ... ..... ... ... .. ........ . . ........... .. . . . .. .. . . .. . .. ... . . . .... .. . . .... .................... .... . . . .. . .. .... .. . . ....... .. .. . . ...... .. .. . .. . . . . . .. .. ........... . . ............. . .. . ..... .. . . .. . .... .. . ... ... .............. .. . .. . . .. ..... . . . . ... .. .. ... . . .. .. .. ... . .. . ...... . ....... . . . ..... .. . .. .. .... .............. . .... . .. .. . .. . . .......... . .. . . . . . . . . . .. .... . .. . . . ....... .. ... . .. . .................... . . .. . ............. . . . .. . . .. ... . . ....... . .. ...... . ... .... ... . . . .. .. . . .. . . .. . . . . . . . .
lowQualScore : 99 333 7 5 4 4 7 1 66 4 4 33 4 888 4 44 999999 99 3333 88888 1 7 4 7 66 4 4 2 7 22 2 4 000 4 8888888888 2 999 888 66 4 88888888888888888888888 3 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 666 444 2 111 55 1 33333 777 00 333333 888 22222 66 000 0 8888 1 1 99 111111111 555 0 555 0 88 88 0 66 1 88 444 00000 888 555 88 11111111 4 4 55555555555 55 0 2 0 88 88 0 0 88 9 55 555 1 0 0 8888 99 4 7 4444 55555555555555555555 3333 5 5 0 44 5 44 4444 44 5 5 1111111 77 44 5 5 555555 00 00 3 33 7 7 7 7 0 77 77 55555555555 7 7 3333333333333 7 77 7 11111 99 9 2 99 4 8888 33 1 000 000 44444444444444 99 9 99 9 7 88 33333 7 7 9 3 000 33 77 666 5 5 99 44 44 444 5 55 4 222222 5 2222222 5 5 5 22222 99 5 44 99 0000 33333333333333 4 1111 2 33 11 2 11 2 2 8888888888 2 11 2 2 2 2 2 2 4 2 4 22 1111 6 99 5 4 5 2222222 44 444 4 00 7 66666666666666666666 1 1 22 1 7777777777777 7 9 9 99 9 9 00 000 9 9 9999999 7 77 888888 1 333 1111 333 5 0 4 11 22 5 7 11 7 4 77 2 2 2 7 7 5 5 5
consensus : NACAGTTGCA--TC---G-CGGGG-AAAATGTC-AT-AATA--TTT-T-A--T-CGTTA--TTT-ACTA--A-C-G-TT--AT----CAAG---GTG-A-C-AT-TATG--TATA-CGT-GAAACANTTTCCTTG-TCCTA-T---AA-TNA--C-GT--A-TTCT---TTC-C-TTT--T-AT----A-----C-----C------ACTCTCCATTACCAG-ATCACTCTCAGCAGCTGCCCACTCTCCATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCATAAA--TTCT---TA-CGA---CC-A-GC-----T---G--A---G--A---A---C-TGTG-TAA-A-TTG-CAAC-G--ATA-C-GC--A----G----C---A-TGN--CG-AT--GT--T-GGA--AGATTATA--TA-C-TTATT-----TA-C-GTA---TT--AAA--T---G-ATANAGC------AG---AAA--GTGA-TGGGA-AA--AA--CT-TC-T--GACGCAA-GA---GAGAAACC-CT-TTCCCG-GTAT--A-C-A----ATA----A----T--T---T---T----G-C-A-TA--C-TG--TC-G--AAAA--TTG-AAA-A-------GT-ATG--CC-GC-GTTGT---A-TG--CA--T-TTTAAA--CCA-TTTT-CTTT-TA-TAC-G--AG--A-----A--G--GTT-TT-T-------------CC-C--AA-CA---C-TT--T-C-ATG-TAATGT-N-AAA--TTAA--ACTT---T--T---T-CTCCTTA--A-T--AT-C-AAAAG-G-G-T-C-GGCCTG-TAT-TTA-G-TCG--A--TATCG-T-T-G--CA--A--T---T-TGCAA--TT-AATACA------A-T--CA---T-T-T-T-----TG--T-TA--A--TTCTAA----A-A--TT---A--C-A-AT---AT-C--A--C-G--T-G-A--T-------AG-T--C-A-C-G-TGA-T-A-AT-AAA-C--A---NCAGT-C-TTGNTGA-A-------A--A---TGTA-CGGA-ATCC--T-----TC--T----AC-G-TA-TC--G-AT-AA--G-------AA-CGT-CG-A--TT-C-AC-TCTC---GGA-T-A--T----T-TTT--C-----TTTG---AATAGTAC-A-CATGT---ACA-AAACACTTAT-GAT-T--GTTT-TATG--TA-T-GCT-TTTTACGTTA-TT-T-CTGTATG-GGACGCCT-TA-A-TTCAGT
Reference ( family-948 ) : NACAGTTGCA--TC---G-CGGGG-AAAATGTC-AT-AATA--TTT-T-A--T-CGTTA--TTT-ACTA--A-C-G-TT--AT----CAAG---GTG-A-C-AT-TATG--TATA-CGT-GAAACANTTTCCTTG-TCCTA-T---AA-TAA--C-GT--A-TTCT---TTC-C-TTT--T-AT----A-----C-----C------ACTCTCCATTACCAG-ATCACTCTCAGCAGCTGCCCACTCTCCATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCATAAA--TTCT---TA-CGA---CC-A-GC-----T---G--A---G--A---A---C-TGTG-TAA-A-TTG-CAAC-G--ATA-C-GC--A----G----C---A-TGN--CG-AT--GT--T-GGA--AGATTATA--TA-C-TTATT-----TA-C-GTA---TT--AAA--T---G-ATANAGC------AG---AAA--GTGA-TGGGA-AA--AA--CT-TC-T--GACGCAA-GA---GAGAAACC-CT-TTCCCG-GTAT--A-C-A----ATA----A----T--T---T---T----G-C-A-TA--C-TG--TC-G--AAAA--TTG-AAA-A-------GT-ATG--CC-GC-GTTGT---A-TG--CA--T-TTTAAA--CCA-TTTT-CTTT-TA-TAC-G--AG--A-----A--G--GTT-TT-T-------------CC-C--AA-CA---C-TT--T-C-ATG-TAATGT-T-AAA--TTAA--ACTT---T--T---T-CTCCTTA--A-T--AT-C-AAAAG-G-G-T-C-GGCCTG-TAT-TTA-G-TCG--A--TATCG-T-T-G--CA--A--T---T-TGCAA--TT-AATACA------A-T--CA---T-T-T-T-----TG--T-TA--A--TTCTAA----A-A--TT---A--C-A-AT---AT-C--A--C-G--T-G-A--T-------AG-T--C-A-C-G-TGA-T-A-AT-AAA-C--A---NCAGT-C-TTGNTGA-A-------A--A---TGTA-CGGA-ATCC--T-----TC--T----AC-G-TA-TC--G-AT-AA--G-------AA-CGT-CG-A--TT-C-AC-TCTC---GGA-T-A--T----T-TTT--C-----TTTG---AATAGTAC-A-CATGT---ACA-AAACACTTAT-GAT-T--GTTT-TATG--TA-T-GCT-TTTTACGTTA-TT-T-CTGTATG-GGACGCCT-TA-A-TTCAGT
gi|1 : ACAGTTGCAGATCA--G-CGGGGGAAAATGTC-AT-AATAG-TTT-T-A--T-CGTTA--TTA-ACTG--A-CTGCTT--AT----CAAGC--GTGCA-C-AT-TCTG--TATA-CAT-GAAACACTTTCTTTGCTCCTA-T---AA-TAAG-C-AC--A-TTCT---TTC-C-TTT--T-AT----T-----C-----C------GCCCTCCCTTACCCGCATCACTCTCAGCAGCTGCCCACTCTCCATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCATAAA--TTCTATACA-CGA---CC-A-GC-----T---G--A---G--A---A---C-TTTG-CAA-A-TTGGCAAC-GCGATA-CCGC--A----G----C---A-TGCGCCGCAT--GT--T-GGA--CGATTGTA--TA-CCTTATT-----TA-C-GT----TT--AAA--T---G-ATATAGC------AG---AAA--GTGA-TGGGA-AG--AAATCT-TC-T--GACGCAATGA---GAAAAACCACTGTTCCCGAGTATG-A-C-A----ATA----A----T--T---T---T----G-T-A-TA----TG--GC-A--AAAC--TTG-AAA-A-------GT--T---CC-GC-GTTGT---ACTG--CA--C-ATTAAAG-CTA-TTTT-CTTT-TA-TAC-G--AG--A-----A--G--GTTGTT-T-------------CC-C--AA-C----T-TT--T-C-ATGCTAATGT-TTAAA--TTAA--ACTT---T--T---T-CTCCTTA--A-T--ATGC-AAAAA-A-A-T-C-GGCCTG-TAT-TTA-G-TCC--A--TATCG-T-T-G--CA--A--T---T-TACAA--TT-GATACA------A-T--AA---T-T-T-T-----TA--T-TC--A--TTCTAA----A-A--TT---A--C-A-AC---AT-C--A--C-G--T-G-A--T-------AG-T--C-A-C-G-TGA-T-A-AT-AAA-C--A---GCAGT-C-TTGTTGA-A-------A--A---TGTA-AGGA-ATCC--T-----TC--T----AC-G-TA-TC--G-AT-AA--G-------AA-CGT-CG-A--TT-C-AC-TCTC---GGA-T-A--T----T-TCT--C-----TTTG---AATAGTAC-A-CATGT---ACA-AAACACTTAT-GAT-T--GTTT-TATG--TA-T-GCT-TTTTACGTTA-TT-T-CTGTATG-GGACGCCT-TA-A-TTCAGT
gi|10 : gTT-ACTA--A---G-TTTAAT----CAA----GTG-A-C-ATGGATG--TATA--AT--AAACAATTT-ATTG-TCCT--TCTAAA-TTA--T-GT--A-TTCCTTGTTT-G-TTT--T-A-----A-----C-----CAAATCAACTCTCCA
gi|10 : C-A-GC-----T---A--A---G--A---A---AATGTGGTAA-AATTG-CAACCG--ATA-T-AC--AACGTG----C---A-TGA--CG-AT--GCGCT-GGA--GTATTATA--TA-T-TTATT-----GA---ATA---TT--AA-------G-AT---------------------GTGAGCGGGA-GA--AC--CT-TC-T--GAAGTTA-AATCGGAACAATC-CT-TCCC---GTAT--A-C-A----ATA----T----T--C---T---T----G-C-A-TA--C-TG--TCCG--AAAAATTTG-AAA-G-------CT-ATG--CC-GC-GTTGT---T-TG--CA--T-TTTAAA--CC--CTTT-CTTT-TA-TAC-G--AG--A-----A--G----T-TT-T-------------CC-C--AA--A---C-TT--T-CGATT-TATTGT-A-AAG--TT-A--ACTT---T--A---T-TTCATTA--ATT--AT-C-ATAA--G-G-T-T-GGCTTG-TAT-TTAGG-TCGT-A--CCTCG-T-T-G--CA--AT-T---T-TGCAA--TT-AATACA------A-TA-CA---T-T-T-T-----TG--TGTAACA--TTCTAA----A-G---T---A--TGG-AT---AT-C--A--C-G--T-G----T-------AGTT--C-ATC-GTTGA-T-ACAT-Aatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgttaattttcccccacgaaacagctaagaaaatgtggtaaaattgcaaccgatatacaacgtgcatgacgatgcgctggagtattatatatttattgaatattaagatgtgagcgggagaaccttctgaagttaaatcggaacaatccttcccgtatacaatattcttgcatactgtccgaaaaatttgaaagctatgccgcgttgtttgcattttaaaccctttcttttatacgagaagttttcccaaactttcgatttattgtaaagttaactttatttcattaattatcataaggttggcttgtatttaggtcgtacctcgttgcaattttgcaattaatacaatacatttttgtgtaacattctaaagtatggatatcacgtgtagttcatcgttgatacatatagttacaa
gi|11 : ttactaagtttaatcaagtgacatggatgtataataaacaatttattgtccttctaaattatgtattccttgtttgttttaaccaaatcaactctccaatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgttaattttcccccacgaaaGTTGCA--TC---G-CGGGG-AAAATGTT-ATGGATA--TTTGT-A--T-CGT----TTT-ACTA--A---G--T--AT----CAA----GTG-A-C-AT-TATG--TATAGCAT-GAAA-A--TTCCTTT-TCATA-T---TA-TCA--T--T--A-TT-T---CTT-C-TTT--T-AT----A-----CAAAT-C------ACTCTCCATTtagttacaa
gi|11 : atTACA--TACT---TA-TAAGAGCC-A-GC-----T---G--A---G--A---AA--C-TGC--TGA-A-TTG-CAAC-G--ATA-C-TC--AT---G----C---A-TGTGTCG--T--GT--TTGGA--AGATT-TA--TA-C-TTATT-----TA-C-GT----TT--AAATTT---G-A-ATAAC------AG---AAA--GTAA-TGGCACAA--AA--CG-TA-T--GAC-CAA-GG---GA-AGACC-TT-CTCCC--GTATTAA-C-AG---ATA----A----T--TTGCT---T----G-C-A-T---C-TG--TC-AGCATAT--TTA-AAA-A-------GT-ATG--CC-GC-GTTTTTTAA-TG--CA--T-TTTAAA--CTATTTTT-CTTT-TA-TAC-G--GG--AAAAATA--A--GTT-TT-TTGTTTTCTTTTTCCC-C--AA-AAAACC-TT--T-C-ATGATAGTGT-A-AAG--TTAA----TT---TCAT---T-CGTCTTA----------T-AAAAG-G-A---C-GG-CTG-T-T-TTA-G-TCG-----TAT---T-T-G--C---A--T---T-TGCAA--TT-AAtctttgttagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttacatacttataagagccagctgagaaactgctgaattgcaacgatactcatgcatgtgtcgtgtttggaagatttatacttatttacgtttaaatttgaataacagaaagtaatggcacaaaacgtatgaccaagggaagaccttctcccgtattaacagataatttgcttgcatctgtcagcatatttaaaaagtatgccgcgttttttaatgcattttaaactatttttcttttatacgggaaaaataagttttttgttttctttttccccaaaaaacctttcatgatagtgtaaagttaatttcattcgtcttataaaaggacggctgttttagtcgtatttgcatttgcaattaaat
gi|12 : atgttgcatcgcggggaaaatgttatggatatttgtatcgttttactaagtatcaagtgacattatgtatagcatgaaaattccttttcatattatcattatttcttcttttatacaaatcactctccatttctttgttagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntGT-GAACCATTTTC-TTG-TCCTA-----AG-TTATTT-GC--A-TTTT---TTCTT-TTT--T-AT----A-----CAAAAGC------ACTCTCCATat
gi|12 : CATAA---TTCT---TA-CGA---CC-A-GC-----C---G--A---A--A---A---A-AATG-TAA-AATTG-CAAC-G--ATA-T-AC--A----GTG--C---A-TGA--CG-AT--GT--T-GGA--AGTTTATA--TA-C-T-AGT-----TA-C-GTA---TT--AAA--T---TCATATATC------AG---AAAA-GTGA--GGGA-AA--AA--AT-TA-T--GACACAA-AC---G-GAAACC-CT-TTCCCG--TAT--A-C-A----ATA----A----T--T---TCT-T----G-C-A-TA--C-TG--TC-G--AAAA--TTG-AAA-A-------GT-ATG--CC-GC-GTTAG---A-TG--CA--T-ATTAAA--CCA-TTTT-CTTT-T--TAC-A--CG--G-----A--G--AGT-TT-T-------------CC-CTAAA-CA-----TT--T-C-AT-------------A--TTAA--TCTT--------------------------------AAAG-G-A------ACTTA-TAT-TTC---TCA--A--TATC----------A--A-----------AAGGCT-CATACA------A-T--CA---T-T-T-T-----TG--T-TA--A--TTCTAA----A-A--AT---A--C-A-AT---AC-C--A--C-G--T-G-A--T-------AG-T--C-A-C-G-TGA-T-A-AC-AAA-C--A---nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncataattcttacgaccagccgaaaaaaatgtaaaattgcaacgatatacagtgcatgacgatgttggaagtttatatactagttacgtattaaattcatatatcagaaaagtgagggaaaaaattatgacacaaacggaaaccctttcccgtatacaataatttcttgcatactgtcgaaaattgaaaagtatgccgcgttagatgcatattaaaccattttctttttacacggagagttttccctaaacatttcatattaatcttaaaggaacttatatttctcaatatcaaaaggctcatacaatcatttttgttaattctaaaaatacaataccacgtgatagtcacgtgataacaaacaa
gi|13 : gtgaaccattttcttgtcctaagttatttgcattttttcttttttatacaaaagcactctccatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCAGTTGCA--TT---G-CGGGG-AAAACGTTTATGAATA--TTT-T-AAAT-CATTA--CTT-ACTA--A-C-G-TT--AT----CAA----GTG-A-C-AT-GATG--TATA-AGT--AAACAATTT-ATTG-TCCTA-TAA-AA-TTA--T-GT--A-TTCT---TTCGT-TTT--T-AT----A-----CCAAATC------ACTCTCCAa
gi|13 : ----G----C---A-TGA--CG-AT--GC--T-GGA--AGTTTATA--TA-T-TTATT-----GA-C-ATA---TT--AAA--T---G-------------------------TGA-GGGGA-GA--AA--CT-TC-T--GACACAA-TG---GA-AAATC-CT-TTCCC--GTAT--A-C-A----ATA----A----A--T---T---atttctatgtattgaattatgaaattgataatcatattaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacagtgcatgacgatgctggaagtttatatatttattgacatattaaatgtgaggggagaaacttctgacacaatggaaaatcctttcccgtatacaataaattct
gi|14 : cagttgcattgcggggaaaacgtttatgaatattttaaatcattacttactaacgttatcaagtgacatgatgtataagtaaacaatttattgtcctataaaattatgtattctttcgtttttataccaaatcactctccaatttctatgtattgaattatgaaattgataatcatattaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacagtCT---TG-CGA---CC-A-AT-----T---TC-A---G--A---A-----TGTG-TAA-AATTG-CAAC-G--ATA-T-AT--A----GTG--C---A-TGG--TG-GT--AT--T-CAA--AGTCTACA--TA-T-TTATA-----TG-C-CTG---TT--ACA--TT--G-ATATATC------GGGGGAAA--A--A-CTGGA-AAGCAA--CG-TC-T--GACACAA-AA----AGAA--------TCC------T--A-C-ATCTGATA----A----T--T---TCT-T----C-C-A-TA--T-TC--TT-A--AAAA--TTG-AAA-AGTACACCGT-ATG--CA-GC-CTTGA---C-CG--CA--T-TTTAAA--TTA-CCTTGCTTT-TA-TCG-G--AG--A-----A-----ATC-GC-T-------------CT-A--AG-CG---CTTT--T-C-AGT-TAATG--T-AAA--GTAA--ATAT---T--G---T-TTTTCTA--A-T--AT-A-AAAA----G-C-C-GGTCTT-TAT-TTT-G-TTC--A--AATCC-A-T-G--TA--AT-T---T-TGAGA--TT-ACTGTA------A-T--GATTTT-T-T-T-----TT--T-TG--G--TTCTAA----ATT--TT---A--T-A-AT---------------------------------G-T--C-A-C-A-TGA-T-G-AT-AAA----A---CTTGC-T-TTGATGG-A-------A--A---TGTA-TGGA-Act
gi|15 : A--ACTA---TA-T---T-GTCCTCA--A-T--AT-CTAAAAG-G-G-TGC-GGCCAG-TAT-T-A-G-TTG--A--TGTCG-T-T-GG-CA--A--T---T-T-TA----T-AATACA--------T--CA---T-T-T-T-----TGGTT-TA--AA-TTCTAA----A-A--TT---AGGC-A-AC---AT-C--A--T----T-G-A--T-------AG-TGTC-A-C-A-TGA-TTA-ATGAAA-C--A---ACAAT-C-TTCATGA-A-------A--A---TGT--TGGA----------------------------A-TC--G-CT-AA--C-------TA-TGT-CT-A--TT-C-AC-TCTC---GGG-T-A--T----T-TTT--C------TTG---AATAGTA--A-CATGC---A----------TGT-GAC-T--G-TT-TATG--TA-TGGCA-TTTTACGTTC-TT-T-CTGTAT--GGACGCCT-TA-A-TTCAGgc
gi|16 : atagttTCT---AA-CAA---CC-A-GA-----T---G--A---AGAA---A---C-TGTA--AA-A-TTG-CAAC-G--ATA-C-TC--A----AAA--C---A-TGA--CG-AT--AT--T-GGA--AGTTTATA--TA-C-TTATT-----TA-C-GTA---TT--AAA--TT--G-ATAAAGC------AG---AAAA-GTAA-TGGGA-AA--AA--CT-TC-T--GACACAA--A---GGAAAACC-TT-TTCCC--GTAT--A-C-A----GTT----A----T--TTC-T---T----G-C-A-TA--C-TG--TC-G--AAAA--TTG-AAA-A-------CT-ATG--CA-GC-TTTGG---A-TG--CA--T-TTTAAA--CCA-TTTT-CCTT-TA-TACAG--AG--A-----A-----GTT-TT-T-------------CC-C--AA-CA---C-Tct
gi|17 : A-CGA---CC-A-GA-----T---G--A---G--A---AA--C-TG-G-TAA-AATTG-CAGC-G--ATA-C-TC--A----AAAA-C---A-TGAA-CG-AT--AT--T-GGA--AG-TTATA--TA-T-CTTTT-----TAGC-ATAC--TT--AAT--T---G-ATAAAGA------GA---AAA--GTAA-TGG---AA--AA--CT-TC-T--GAC-CAA--A---GGGAA--C-TT-TTCGCC-GTATT-A-C-A----GTA----A----T--T---T---CTTGGG-C---TA--C-TG--TC-G--AAAA--T-G-AAA-A--------T--TG--CC-GC--TTGTGG-A-TG--CA--T-TTTAAA--CCA-TTTT-C-TT-TA-TACGG--AGACA-----A--T--GTT-TT-TC------------CC-C--AA-CA---T-TT--T-
gi|18 : A----A-T--TT---A--A-A-TT---AT-C--T--T-G--T-G-A--T-------AG-T--C-A-C-G-TGA-T-A-AT-GAA-C--A---CCTGC-C-TCTATGA-A-------A--A---CGTA-TGGA-AGCA--T-----AC--C----GG-G-TA-TG--G-TT-----G-------AA-CGT-TGTT--TT-C-GT-TTTC---GGA-T-A--T----T-TCT--C-----ATTG---AATGTTTT-C-CATATAAGACAGAAACA--TAT---------TTT-TATGGATA-TAGTTGTTTTGCTTTA--T-T-CTGTATA-GGATGC---TATA-TTCAAT
gi|19 : atattgttgtaaatattgcggttttttaaccgatgttc-T-T-C--CA--A--T---A-TG--A--TC-ATTACA------A-T--CA---TAT-T-TGCCGGTG--T-TG--A--TTTT-------------------T-A-AT---GT-C--A--C-A--T-T-A--T-------AG-T--C-A-T-T-TAA-T-G-AT-AAA-C--A---CGTGC-C-CCCATGA-A-------A--A---TGTA-CGGG-AGCC--T-----AT--T-----C-GATA-TT--G-GC-AT--G-------AA-TGT-TG-A--TT-C-TT-TCTC---AGA-T-A--T----T-TTT--C-----ATCG---AATCATTC---CA--T---AGA-AAATACGAAC-AAT-T--GTCTGTATG--TA-T-ATG-TT-----TTA-TT-C-TTGAATG-GGGGACCT-TA-A-TTCAGTa
gi|2 : ttgcACATTTCCA--TT---G-CGGGA-AAA---TC-AT-A-TA--TTT-T-AA-T-C--TA--TTT-ACTAGAA-C-G-TTT-AT----CAA-----TG-A-C-AT-GATG--TATA-CGTTGGAACATTTTA-TTG-TCCTA-TAA-AA-TTA--T-GT--A-TTCT---TTG-G-TTTA-T-ATTCAAA-----G-----C------A-TCTCCAt
gi|2 : cttCATAA---TTCT---TA-CGA---AC-A-GC-----A---A--AT--A--A---A---A-TGTGGTA----TTG-CAAC-G--ATA-T-AC--AAGT-G----C---A-TGA--CG-ATTGGT--T-GGA--AG-TTATA--TAAC-TTATT------A-C-ATA---TA--AAT--T---C-ATATATC------AG---AAAA-GTGA-GGAGA-AA--AA--CT-TC-T--GACACAA-AG---GGGAAATC-CT-TTCTC--TTAT--A-C-A----ATA----AGAT-T--C---T---T----GTC-ATTA--T-CGTCTC-G--AAAA--TTG-AAA-A-------GT-ATG--CC-GCAGTTGT---T-TG--CATTT-TTTAAATCCTA-TTTT-CTTT-TA-TACGG--AG--AC----A--C--GTT-TTCT-------------CC-C--AACCA---C-TTTCT-C-ATA-TATTCT-A-AAG--TTTA--ACTTAAGT--T---TACTC---A--A-TTAGT-C-AAAA--G-G-T-CGGGCTTGTTAT-TTAGG-TCG--AGCTATCG-TCT-G--CA--AT-T---T-TGCAAATTC-AAGACA------A-T--CA---T-T-T-G-----TGT-T-TA--A--TTCTAA----AGA--TT---A--T-G-AT---AT-C--AACC-GCTT-G-ATGT-------AG-T--C-A-C-G-TGATT-A-AT-AAA-C--A---ACAAT-C-TTGGTGAGA-------A--A---TGTA-CGGA-ATCC--TCAG--TTGAT----ATGG-TA-TC--G-AT-GAATG-------AA-CAT-CG-A--TT-CTAC-TCTC---GGG-T-A--A----T-TTT--CA----GTTGTATAGTAGTAC-A-CATGT---ACA-AAACACTTAT-TAT-TAAATTTATATG--TACT-GCT-TTTAACGTTA-TTGT-CTGTATGAGGACGCCTATA-A-TTCAGannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncataattcttacgaacagcaaataaaatgtggtattgcaacgatatacaagtgcatgacgattggttggaagttatataacttattacatataaattcatatatcagaaaagtgaggagaaaaacttctgacacaaaggggaaatcctttctcttatacaataagattcttgtcattatcgtctcgaaaattgaaaagtatgccgcagttgtttgcattttttaaatcctattttcttttatacggagacacgttttctcccaaccactttctcatatattctaaagtttaacttaagtttactcaattagtcaaaaggtcgggcttgttatttaggtcgagctatcgtctgcaattttgcaaattcaagacaatcatttgtgtttaattctaaagattatgatatcaaccgcttgatgtagtcacgtgattaataaacaacaatcttggtgagaaatgtacggaatcctcagttgatatggtatcgatgaatgaacatcgattctactctcgggtaattttcagttgtatagtagtacacatgtacaaaacacttattattaaatttatatgtactgcttttaacgttattgtctgtatgaggacgcctataattcag
gi|20 : cttacatttccattgcgggaaaatcatatattttaatctatttactagaacgtttatcaatgacatgatgtatacgttggaacattttattgtcctataaaattatgtattctttggtttatattcaaagcatctccaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-C--A--C-G--T-G-A--T-------AG-C--C-A-C-A-TGA-T-G-AT-GAA-C--A---CCTGG-T-TGGATGA-A-------A--A---T-TATTTGA-ATCA--T-----AT--T----AT-G-TA-TCAGA-AT-AA--A-------AA---T-TG-A--TT-C-GC-TTTC---GGA-T-A--TTG--T-TTT--C-----ATCG---AATAGTAT-T-CATGT-----A-AAGCACTCATAGAT-T--GTTT-TATT--TA-T-GTG-TTTTACTGTA-TT-T-CTGTACA-GGGCGTCC-TA-A-TTC
gi|21 : -AAAAG-GAG-T-C-GGTCTG-TTT-ATA-G-TCG--A--TATTG-T-T-G--CA--A--T---CATGCGA--TT-GTTACATGTTCAA-T--AA---T-T-T-T-----T---C-CG--G--TGCTAA----A-C--TT---A--T-A-AT---GT-C--A--C-G--T-G-A--T-------AA-T--A-A-C-G-CGA-T-A-AT-ACA-C--T---CCTAC-A-TTGATGA-A-------A--A---TGTA-
gi|23 : tagtttatgtaaagtaagcgttaataaatcatgtacaaaatTTT---TG-CAG---CT-A-GT-----T---GCAA---A--A---A---C-TGTA-TAA---TTG-TCAT-G--ATA-T-AC--A----G----T---G-TAC--CG-GT--GG--T-GGACAAAATCATA--TT-T-CTATTCCTATTA-C-ATACTATT--AGA--T-----ATTAAG--------A---AAA--GTGT-TGGGA-GC--AA--CT-TC-T--AACACAA-AA---T-GAAACC-AC-TTCCCG-
gi|24 : gcCATAAT--TTCA---TA-CGA---CA-G-GC-----G---G--A------A---A---C-TGTG--AA-A-TTG-CAAca
gi|25 : annnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaTCT---TA-CGA---CA-A-GC-----T---G--AA--G--AG--A---C-TGTG--AA-A-TTG-CAAC-G--ATA-C-GC--AT---GAATTC---A-TGG--CG-AT--GT--T-GGA--AGGTTATA--TT-C-TTGTT-----TA-C-GTA---TT--GAAT-T---G-ATAAAAC------AGA--AAA--GTGA-TAAGA-AA--AA--CT-TC-T--GACACAA--A---GAGAAACC-CT-TTCCC
gi|26 : --T----T-TTT--C-----ATTG---AATATTAC-C-CATGT---A---AAACACTTAA-AGT-T--GTTT-TATC--TAAT-GTA-TTTTACTCTA-TT-T-CTGTATA-GAACGTTT-TA-A-TTCAAT
gi|27 : gagggctacattattgcagctagaagccttacaaggctatcggtatgaatgttagAGATGAA--TC---G-CGGGG-AAA-------T-A-TA--TTT-T-G--T-CATTA--TTT-ACAA--C-C-G-TT--AT----CAA----GTG-A------TATGCTTAAA-CG--AAAAC-GTTTACTTA-TCAAA-C---A---AA--T-GTTCATTTCT---TTC-T-TTT--TCAT----A-----T-----C------At
gi|28 : ttcttttACAGTTGCA--TC---G-CGGGG-AAA-TGTC-AT-A-TA--TTT-T-AA-T-CGTTA--TTT-ACTA--A-A-C-TT--TT----TA-----GTG-G-CGAT-TATG--GA-A-CGT-GAAACATTTATCTTG-TCCTA-T---AT-TA------T--C-TTCT---TTC-T-GTT-----T----G-----G-----C------A--------TACCAG-ATCACTCTaataactcattattctttatatga
gi|29 : --AGATTATA--TA-T-TTATT-----TA-C-GTA---TT--AAA--T---TCATAAAGC------AA---AAAAAGTGA-TGAGA-AA--A---CT-TT-T--GACGCAA--A---GGGACACC-CT-ATCT-A-GTAT--A-C-A----GTA----A----TGTT---T---T----G-C-A-TA--C-TG--TC-A--ACAA--TTG-AAA-A-------GT-ATG--CC-GC-tc
gi|3 : GGGT-AAAAT-TC-AT-AAAAATTTT-T-AC-T-CGTTA--TTT-A-----A-C----T--AT----GAAGTAAATG-A---AT-GATG--TATA-CGC-GAAACATTTTTCTTG-TCCTA-T---AA-AAA--C-TT--A-TATT---TCT-C-TT
gi|3 : AA--TTCT---TATCGA---AC-A-GTCTAAAT---G--A---G--A---A---A-TGTGGTA----TTG-CAAC-G--ATAGT-AC--A----G----TGCAA-TGA--CG-AT--GT--T-GGA--AGTATATA--TA-T-TAATT-----TG-C-GTA---TT--AAA--TTCAG-A-ATATC-------G---AAAGCGTGA-GGGGA-GA--AA--CT-TCAT--GAACCAA--A---GGGACGAT-CT-TT-CCG---AT--A-C-A----ATAAATTA----C--T---T---T----G-C-A-TA--C-TG--TCAA--AAAA--TTG-AAA-A-------GT-ATT--CC-GC-GTTGT---T-TG--CATTT-TTTATA--CCA----T-CTTT-TA-TAC-G--CG--G-----A--GAAGTT-TT-T-------------CC-C--AA-CA---C-TT--T-C-AT--T-ATG--T-AAAGGTTAC--ACTT---TA-TAAAT-CTC--TA--A-T--A--C-AAAAG-G-GCT-C-GG-CTG-TTT-TTA-GTTCGGAA--TATCG-T-T-G--CAGGA--T---A-TGCAA--TT-AATAAA------A-TAACG---T-T-TAT-----GG--T-TA--A--ATCTAA----A-A--TT------C-G-AT---ATGT--A--CAG--T-G-A----------AT-C--C-A-C-G-TGA-T---AT--AA-CTGA---ACAAT-C-TTGGTGG-A-------AATA---TGTAGCGGAGATCC--TAATGGTA--TTAAAAG-G-GA-TC--G-AT-TATTG-------AAGCGC-CG-AAGTT-C-AC-TCTC---GGG-T-AACT----T-TTT--CATTAATTGA---AATACTAG-T-CATGTA--ACT-AAAAACTTAT-GAT-T--ATTT-TATT--TATT-GCT-CTTAACGTTA-TT-T-CTGTAT--GGACG-CT-TA-A-TTCAcgcatgtacaccaaagcactttctaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaataattcttatcgaacagtctaaatgagaaatgtggtattgcaacgatagtacagtgcaatgacgatgttggaagtatatatattaatttgcgtattaaattcagaatatcgaaagcgtgaggggagaaacttcatgaaccaaagggacgatctttccgatacaataaattactttgcatactgtcaaaaaattgaaaagtattccgcgttgtttgcattttttataccatcttttatacgcggagaagtttttcccaacactttcattatgtaaaggttacactttataaatctctaatacaaaagggctcggctgtttttagttcggaatatcgttgcaggatatgcaattaataaaataacgtttatggttaaatctaaaattcgatatgtacagtgaatccacgtgatataactgaacaatcttggtggaaatatgtagcggagatcctaatggtattaaaagggatcgattattgaagcgccgaagttcactctcgggtaactttttcattaattgaaatactagtcatgtaactaaaaacttatgattattttatttattgctcttaacgttatttctgtatggacgcttaattca
gi|30 : gggtaaaattcataaaaatttttactcgttatttaactatgaagtaaatgaatgatgtatacgcgaaacatttttcttgtcctataaaaacttatatttctcttcgcatgtacaccaaagcactttctaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaatACAGTTGCA--TC---G-C-GGG-AAAAT-TC-AT-GAT---TTT-T-A--T-CGTTA---TT-ACCA--A-C-G--T--AT----CAGA---GTG-ACC-AT-TATG--TATA-CAT-AAAACA-TTTCCTT--TTCTA-T---AATTAG--C-AT--A-TT---------C-CTT--T-AT----ACAAATC-----C------ACTCTCC
gi|31 : ttACAGTTGCA--GC---G-CG------AATGTC-AT-AATA--TTG---A--T-C--TA--TTT-AC----A-C-C-TT--AT----CAAA---GTG-A-C-AT-TATG--TATA-CAT-G-AATA--TTCCTTG-T-CTA-T---AA-T----C-AT--A-CACT---TTC-C-TTT--T-AT----A-----CCAAATC------ACTCTCCA
gi|32 : tt-A-TTG-CAAC-A--ATA-C-GC--AAT--G----C---A-TGG--CG-AT--GT--A-GGA--AGATTATA--TA-C-TTGTA-----TA-C-GTA---TT--AAAT-T---G-GTAAAGCAAAAAAAA---AAA--GTGA-TGAG--AA--AA--CT-TC-T--GACGCAA--A---GGGACATC-CT-TTCTCG-
gi|33 : ACAGTTGCA--TC---GGCGGG---AAATGTC-AT-AATA---TT-A-A--T-CG--A--TTT-ACTA--A-C----T--AT----CAA----GT--A-C-AT-TATG--TATA-C---AGAATA--TTCC-TG-TCC-A-T---AA-T----C-AT--A-CACT---TTC-C-TTT--T-AT----A-----CAAAT-C------ACTCTCCt
gi|34 : t-------AA-CGT-TG-A--CT-C-AC-TCTC---GGA-T-A--T----A-TTT--T-----TTT-----ATATGAC-A-CATGT---ACA-AAACACTTGT-GAC-T--ATTT-TATG--TA-T-GCT-TTTTACGTTG-TT-T-CTGTGTG-GGGCGCC
gi|35 : A--TT-AATACA------A-T--CA---A-T-T-T-----TG--T-TA--A--TTCTAA----A-C--TT---A--C-G-ATCATAC-C--A--C-A--T-G-A--T-------AG-T--C-A-C-G-TGA-T-A-AT-ACA-C--A---AACGT-C-TTAGTGA-A-------A--A---TATA-TGGA-ATCC--T-----
gi|36 : TTT---TA-CGA---CC-A-GC-----T---G--T---A--A---A---A-AGTG-CAATA-TTG-CAAC-G--ATA-T-AC--G----G----------TGT-----AT--GC--TAGGA--A
gi|37 : TTAT-GAT-T--GTTT-TATG--TA-T-GCT-TTTTACGTCA-TT-T-CTGTATG-GTAAGCCT-TA-A-TTCAGttttcagtctgtatctttatattcttattaca
gi|38 : A--TC---G-CGGGG-AAAATGTC-AT-AATA------T-A--T-CGTTA--T
gi|4 : aggttcttatat-AT-AGAA--TTT-T----T-CGTTA--TTTTACTA--AAT-T-TT--AT----CGAG----TGCA-C-ATGTATG--T----C-----AACATGTTACTTG-TCCGA-T---AA-TTA--TTGCC-A-TTTT---TCC-T-TTT--T-AT----A-----C-----C------Acaagtgatatgct
gi|4 : CATAAAATTCCT---TG-CGAA--CC-AAGC-----T---G--A---G--A---AGAAC-TGTG--AA-A-TT--CAAC----ATA-C-GC--AATG-G----C---A-TAG--CG-AT--GT--T-GGA--AGAT-ATA--TA-C-TTATT-----TAACAGTA---TTTAAAA--TT--G-ATA-AGC------AA---AAA--GTGA-TGGGA-AA--AA--CTGTC-TT-GACGCAA-GG---GA--AACC-CT-TTCCCG--TAT--ATC-A----GTA----A----TGTC---T---T----G-C-A-TATAC-TG--TC-G--GAAA--TTGGAAA-A-------GTGATG--CCCGC-GTTGT---G-TGG-CA--TCTTTAAA--CTA-TTTT-TTTCACA-TAC-GGAAA--A-----A--G--TTT-TT-T-------------CCGC--AA-CA---C-TT--TTC-ATG-TAATGTAG-AAG--TTAATTATTA---T--T---T-CTCC-----A-T--GT-C-AAAAAAG-G-T-C-GGCCTG-TCT-TTA-G-TCG--A--TATCGGT-T-GTTCA--GATT---T-TGCAA--TT-AATACG------AGT--CA---T-T-T-T-----TGG-T-TA--AACTTCTGA----A-AATTT---A--C-AGAC---AT-C--A--C-G--T-G-A--T-------AG-T--CCA-C-G-TGA-T-A-AT-AA--C--G---AGAGT-CCTTGTTGA-A-------C--A---T-TA-CGGA-ATATAAT-----TAA-T----AC-G-TA-TC--G-AT-AT--G-------AA-CGT-CG-A--TTTC-ACCTCTCCAGGAA-T-A--TAACTT-TTT--C-----TTTG---GTCAGTAC-A-CATGT---ACA-AAACACTAAT-GAT-T--GTTT-TATG--TA-T-GAA-TTTCACGTTATTT-T-CTGTATGTGGACGCCT-TA-CTTTCAGTaatcgactcttaccatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncataaaattccttgcgaaccaagctgagaagaactgtgaaattcaacatacgcaatggcatagcgatgttggaagatatatacttatttaacagtatttaaaattgataagcaaaaagtgatgggaaaaactgtcttgacgcaagggaaaccctttcccgtatatcagtaatgtcttgcatatactgtcggaaattggaaaagtgatgcccgcgttgtgtggcatctttaaactatttttttcacatacggaaaaagttttttccgcaacacttttcatgtaatgtagaagttaattattatttctccatgtcaaaaaaggtcggcctgtctttagtcgatatcggttgttcagattttgcaattaatacgagtcatttttggttaaacttctgaaaatttacagacatcacgtgatagtccacgtgataataacgagagtccttgttgaacattacggaatataattaatacgtatcgatatgaacgtcgatttcacctctccaggaatataactttttctttggtcagtacacatgtacaaaacactaatgattgttttatgtatgaatttcacgttattttctgtatgtggacgccttactttcagtt
gi|40 : atagaatttttcgttattttactaaattttatcgagtgcacatgtatgtcaacatgttacttgtccgataattattgccatttttcctttttataccaaatcgactcttaccatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnG--TA-T-GCT-TTAAACGTTA-TT-T-ATATATG-TGACGCCT-TA-A-TTCAt
gi|41 : -AAACACTTAT-GGC-T--GTTT-TATG--TA-T-GCT-TTTTACGTTA-TT-T-CTcgtt
gi|42 : A--TT---G-CGGGT-AAA-TGTC-AT-AATA--TTT-TAA--T-CGTTA--TTT-AC
gi|5 : TTGCA--TC---G-CGGGG-AAAATGTC-AT-ATGA--TTT-T-A--TTCGTTAATTCT-ACTA--A-CCG-TT--A-----CAAG----TG-AAC-AT-TATG--TATA-CAT-GAAACACTT--CTTG-TCCTA-T---AAATGA-----------TCT---TTC-C-TTT--T-TT----A---------------------------TACCAA-ATCACTCTC
gi|5 : tCATAA---TTCT---TA-CGA---CCCA-GC-----T---G--A---A--AGAAA---C-TTTT-GAA-A-TTG-AAACCG--ATA-C-GC--A----T----C---AATGG--TG-AT--GT----GGA--AGATTGTA--TA-C-TATTT-----TA-CCGTA---TT--AAA--T---G-AT-TACC------AG---AAAA-GTGA-TGGGA-AA--AT--CT-TC-TTTGACG--A-AA---GAGAAACT-CT-TTCCCG--TAT--T-C-A----ATA----AATTTC--T---T---T----G-C-ACTA--CCTG--TC-A--AAAA--TTG-AAATA-------GT-ATGGGCC-GC-GTTGT---A-TGAACA--T-TT-AAA--CTA-TTTC-TTTT-TAATAG-G--AG--A-----A--G--TTT-TT-T-----------------------------TT--T-T-ATG-TAATGG-T-AAAG-TTAA--ACTT---T--C---T-CT---TA--A-T--AT-C-AAAAG-G-A-T-C-GGCCGG-TAT-TTA-G-TCC--A--TATC------G--CA--A--TAAAT-GGCAA--TTAAATACA------T-T-------T-T-T-T-----TGT-T-TA--A--TTCTTA----A-A--TT---A--CAA-AC---AC-C--A----G--T-GAA--T-------AG-TCCC-A-CTG-TGA-T-ACAT-AAACC--A---GCAGT-C-GTGTTGA-A-------A--A---TATA-CAGA-ATCC--T-----TC--T----AA-G-TA-TC--G-ATAAA--G-------AACCGT-CG-A--TT-T-CT-CCTC---GGA-TCA--T----T-TTT--C-----TTTG----ATAGTACAA-CATGT---ACA-AACCACTTAT-GATAT--GTTT-TATGAATA-T-GCT-TTTTACG-TA-TT-T-CTG-ATG-GGATGCCT-TA-A-TTCAGcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntacataattcttacgacccagctgaaagaaacttttgaaattgaaaccgatacgcatcaatggtgatgtggaagattgtatactattttaccgtattaaatgattaccagaaaagtgatgggaaaatcttctttgacgaaagagaaactctttcccgtattcaataaatttctttgcactacctgtcaaaaattgaaatagtatgggccgcgttgtatgaacatttaaactatttctttttaataggagaagttttttttttatgtaatggtaaagttaaactttctcttaatatcaaaaggatcggccggtatttagtccatatcgcaataaatggcaattaaatacatttttttgtttaattcttaaattacaaacaccagtgaatagtcccactgtgatacataaaccagcagtcgtgttgaaaatatacagaatccttctaagtatcgataaagaaccgtcgatttctcctcggatcatttttctttgatagtacaacatgtacaaaccacttatgatatgttttatgaatatgctttttacgtatttctgatgggatgccttaattcag
gi|6 : tttgcatcgcggggaaaatgtcatatgattttattcgttaattctactaaccgttacaagtgaacattatgtatacatgaaacacttcttgtcctataaatgatctttccttttttataccaaatcactctccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaCAGTTGCA--TC---G-CGGGG-AAA--GTC-AT-AATA---TT-T-A--T---TTA--TTA-ACT---T-C-G-TT--GTAGTGCACGCA-GTGAA-C-AT-TATGT-TGTA-CAT-G-AACAATTGC---G-TCCTA-T---AA-T-A--T-GG--C-TTCT---TCC-T-TTTGAT-ATCCAAA-----C-----C------ACTCTC
gi|6 : CATAAA--TTCT----A-CGA---C----AC-----T---G--A---A--A---A---C-TTTG-GAA-A-TTG-CAAC-GC-ATA-C-GTCAA----G----C---A-TGG--CG-AT--GT--T-GGA---GATTTTACGTA-T-TTAAT-----TG-A-ATA---T----AA--T---G-ATATAGCG-----AA---AAA--GTGA-TGG-A-AA--AT--CT-TC-T--GACGCAAAGA---GAGAACCC-AT-TTCC---GTAT--A-C-A----ATA----A----T--T---TCCTT----G-CCA-TA--C-TG--TC-A--AAAA--TTG-AAA-A-------GT--TG--CC-GC-GTTGT---A-TGA-CAA-TATTTAAA--CTA-TTTT-CTTT-TA-TAC-G--AG--A-----A--A--GTT-TT-C-------------CC-A--AA-CA---C-TT--T-C-ATG-TAATGT-A-AAG--GTTA--AC-T---T--T---T-CTTCTTAACA-T--AT-C-AAAAG-G-A---C-GGCCTG-TA--TTA-G-TCC--A--TATCG-T-T-G--CA--AT-T---T-TGCAA--TT-AATACA------A----AA---T-T-T-T-----TG--T-TA--G--TTC--A----A-A--TT---A--C-A-A----AT-CCAA--C-G--T-G-A--T-------AA-G--C-A---G-TGA-T-A-AT-AAA-T--A---G-AGT-C-TTGTTGA-A-------A--A---TGTA-AGGA-AT-C--T-----AC--T----AC-G-TA-TC--G-A--AA--G-------AA-CGT-CG-A---T-C-AA-CCTC---GGATT-A--T----TGTTT--C-----TTTG---AATAGT-C-A-CATGT----CA-AAACA-TTAT-GA--T--G-TT-TATG--TA-T-GCC-TTTTACGTTA-TT-TGCTGTATG-GGACGCCT-TA-A-TTCAGatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncataaattctacgacactgaaaactttggaaattgcaacgcatacgtcaagcatggcgatgttggagattttacgtatttaattgaatataatgatatagcgaaaaagtgatggaaaatcttctgacgcaaagagagaacccatttccgtatacaataatttccttgccatactgtcaaaaattgaaaagttgccgcgttgtatgacaatatttaaactattttcttttatacgagaaagttttcccaaacactttcatgtaatgtaaaggttaacttttcttcttaacatatcaaaaggacggcctgtattagtccatatcgttgcaattttgcaattaatacaaaatttttgttagttcaaattacaaatccaacgtgataagcagtgataataaatagagtcttgttgaaaatgtaaggaatctactacgtatcgaaagaacgtcgatcaacctcggattattgtttctttgaatagtcacatgtcaaaacattatgatgtttatgtatgccttttacgttatttgctgtatgggacgccttaattcag
gi|7 : cagttgcatcgcggggaaagtcataatatttatttattaacttcgttgtagtgcacgcagtgaacattatgttgtacatgaacaattgcgtcctataatatggcttcttccttttgatatccaaaccactctcatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnG-A-C-AG-TATG--TACA-CAT-GAAACATTTTC-TTG-TCCTA-T---AA-TTA--T-GC--A-TTAT---TTC-CTTTT--T-AT----A-----C-----CAAAATTACTCTCCAT
gi|7 : A-CGA---CC-A-GC-----TCATG--A------A---A---C-TG----AA-T-TTA-CAAC-A--ATA-C-GC--AAT--G----C---A-TGA--CG-AT--GT--T-GGA--AGATTATA--TA-C-TTATT-----TA-C-GTA---TT--AAA--TT--G-ATAAAGC------AA---AAAA-GTGA-TGAGA-AA--AA--CT-TC-T--AACGCAA--A---GGGAAACC-CT-TTCTTG--TAT--A-C-A----GTA----A----TG-TA--T---T----G-C-A-TA--C-TG--TC-G--AAAA--TTG-AAA-A-------GT-ATG--CC-GC-GTTGT---A-TG--CA--T-TTTAAA--GCA-TTTT-CTTT-TA-TAC-G--GA--A-----A--A--GTT-TT-T-------------CC-C--AA-CA---CTTT--T-C-ATG-TAATG--T-AAA--ATAG--A-TT---T--T---A-TTTCTAA--A-T--AT-C-AAAAG-G-G-T-C-GGTCTG-TCT-TTA-G-TCG--A--TATCG-T-TGG--CA--A--T---T-TGCGA--TT-AAT-CA------A-T--CA---T-TAT-T-----TG--T-TA--A--TTCTAAGCAGA-G--TTAAGA--C-A-AA---AT-CG-A--C-G--TAA-A--TGTGAATAAG-T--C-A-T-G-TGA-T-A-CT-AAA-C--ATATTCAGTAC-TTG-TGA-A-------A--ATTTTGTA-CGGA-GTTC--A-----T---T----AC-T-TACTC--GTAT-AA--GATATTGAAA-CGTGCG-T--TC-C-AC-TCTC---GG--T-A--TAAA-T-TTTAGCA----TTTGA--AATAG-AC-AGCATGT---AC--AATCACTTAT-GAT-T--GTTT-TATG--TA-T-GCT-TTATATTTTA-TT-T-CTGTATG-GGACGCCT-TA-A-TTCAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacgaccagctcatgaaactgaatttacaacaatacgcaatgcatgacgatgttggaagattatatacttatttacgtattaaattgataaagcaaaaaagtgatgagaaaaacttctaacgcaaagggaaaccctttcttgtatacagtaatgtattgcatactgtcgaaaattgaaaagtatgccgcgttgtatgcattttaaagcattttcttttatacggaaaagtttttcccaacacttttcatgtaatgtaaaatagattttatttctaaatatcaaaagggtcggtctgtctttagtcgatatcgttggcaatttgcgattaatcaatcattatttgttaattctaagcagagttaagacaaaatcgacgtaaatgtgaataagtcatgtgatactaaacatattcagtacttgtgaaaattttgtacggagttcattacttactcgtataagatattgaaacgtgcgttccactctcggtataaattttagcatttgaaatagacagcatgtacaatcacttatgattgttttatgtatgctttatattttatttctgtatgggacgccttaattca
gi|8 : gacagtatgtacacatgaaacattttcttgtcctataattatgcattatttcctttttataccaaaattactctccatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCAGT-GCA--TCACCG-CCGGG-AAA--GTC-AT-AATA--TTT-T-A--T--GTTA---TT-GCTA--G-C-G-TT--ATC---CAA------G-A-C-AT-TAT---TATA-CAT-GAACCAATATC---G-TCCTATT---AA-TTA--C-----A-TTCT---TTC-C--TT--T-AT----A-----C-----CTAAT--ACTCTC
gi|8 : ATAA----TCT---TA-CGA---C--A-CC-----T---G--ACAGA--A---A---C-TGTA-CAA---TTC-AAAC----ATA-C-GC--AAT--G----C---A-TGC--AG---------T-GGA--GAATCATA--TA----TATC-----TA-----A---TT-----------G-ATAAAGC------AA---AAA--GTG--TGG---AA--AA--TC-TC-T--GACGCAA-GA---GAGAAACC-CT-GTCC----TAA--A-CTA----ATA----T----T--TC--T---T----G-C-A-TA--C-TG--CC-G--AAAA--TTG-AAA-A-------GT-ATG--CC-GC-GTTA-------G--CA--T-TTGCAA--ACA-ATTT-CT--------------G--A-----ATCG--GAT-TT-C-------------CC-C--AA-CA---C-TT--T-CAATG-TAA-GT-A-AAA--TTGT--TTTT---T--T---T-CTCC--A--A-T--AT-C-AAAAG-G-A-T-C-GGCCTG-TATGTTA----TG--A--TCT-G-T-T-G--CA--A--T---T-TGCAA--T-------A------A-T--T----T-T-T-T-----TG--C-TA--A--TTCTAA----A-A--T---------A-AA---AT-C--A--C-G--T-G-A----------AG-T--C-A-C-G-TGA-T-A-AT-AAA-C--A---ACAG--C-CTGTTGA-AATTAAGGA--A---TCTA-AGGA-ATCC--------TC--T----AC-G-TA-GC--G-AT-AT--G-------AA-CCT-CG-A--GT-C-AA--CTC---GGA-T-A-------T-TTT--C-----TT-----GATAGTA--A-TATGT---ACA-AAACAC-TAA-GA-----G--T-TA-G--TA-T---C-TTGTACGTCA-TT-T-CGTTATG-GTA-ACC--TA-A-TTCaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntataatcttacgacacctgacagaaactgtacaattcaaacatacgcaatgcatgcagtggagaatcatatatatctaattgataaagcaaaaagtgtggaaaatctctgacgcaagagagaaaccctgtcctaaactaatatttcttgcatactgccgaaaattgaaaagtatgccgcgttagcatttgcaaacaatttctgaatcggatttccccaacactttcaatgtaagtaaaattgttttttttctccaatatcaaaaggatcggcctgtatgttatgatctgttgcaatttgcaataatttttttgctaattctaaaataaaatcacgtgaagtcacgtgataataaacaacagcctgttgaaattaaggaatctaaggaatcctctacgtagcgatatgaacctcgagtcaactcggatattttcttgatagtaatatgtacaaaacactaagagttagtatcttgtacgtcatttcgttatggtaacctaattc
gi|9 : cagtgcatcaccgccgggaaagtcataatattttatgttattgctagcgttatccaagacattattatacatgaaccaatatcgtcctattaattacattctttcctttatacctaatactctcaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnt---G-CCGGG-AAA--GTC-AT-AATA--TTT-T-A--T--GTTA---TT-GCTA--G-C-G-TT--ATC---CAA------G-A-C-AT-TAT---TATA-CAT-GAACCAATATC---G-TCCTATT---AA-TTA--C-----A-TTCT---TTC-C--TT--T-AT----A-----C-----CTAAT--ACTCTC
gi|9 : ATAA----TCT---TA-CGA---C--A-CC-----T---G--ACAGA--A---A---C-TGTA-CAA---TTC-AAAC----ATA-C-GC--AAT--G----C---A-TGC--AG---------T-GGA--GAATCATA--TA----TATC-----TA-----A---TT-----------G-ATAAAGC------AA---AAA--GTG--TGG---AA--AA--TC-TC-T--GACGCAA-GA---GAGAAACC-CT-GTCC----TAA--A-CTA----ATA----T----T--TC--T---T----G-C-A-TA--C-TG--CC-G--AAAA--TTG-AAA-A-------GT-ATG--CC-GC-GTTA-------G--CA--T-TTGCAA--ACA-ATTT-CT--------------G--A-----ATCG--GAT-TT-C-------------CC-C--AA-CA---C-TT--T-CAATG-TAA-GT-A-AAA--TTGT--TTTT---T--T---T-CTCC--A--A-T--AT-C-AAAAG-G-A-T-C-GGCCTG-TATGTTA----TG--A--TCT-G-T-T-G--CA--A--T---T-TGCAA--T-------A------A-T--T----T-T-T-T-----TG--C-TA--A--TTCTAA----A-A--T---------A-AA---AT-C--A--C-G--T-G-A----------AG-T--C-A-C-G-TGA-T-A-AT-AAA-C--A---ACAG--C-CTGTTGA-AATTAAGGA--A---TCTA-AGGA-ATCC--------TC--T----AC-G-TA-GC--G-AT-AT--G-------AA-CCT-CG-A--GT-C-AA--CTC---GGA-T-A-------T-TTT--C-----TT-----GATAGTA--A-TATGT---ACA-AAACAC-TAA-GA-----G--T-TA-G--TA-T---C-TTGTACGTCA-TT-T-CGTTATG-GTA-ACC--TA-A-TTCaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntataatcttacgacacctgacagaaactgtacaattcaaacatacgcaatgcatgcagtggagaatcatatatatctaattgataaagcaaaaagtgtggaaaatctctgacgcaagagagaaaccctgtcctaaactaatatttcttgcatactgccgaaaattgaaaagtatgccgcgttagcatttgcaaacaatttctgaatcggatttccccaacactttcaatgtaagtaaaattgttttttttctccaatatcaaaaggatcggcctgtatgttatgatctgttgcaatttgcaataatttttttgctaattctaaaataaaatcacgtgaagtcacgtgataataaacaacagcctgttgaaattaaggaatctaaggaatcctctacgtagcgatatgaacctcgagtcaactcggatattttcttgatagtaatatgtacaaaacactaagagttagtatcttgtacgtcatttcgttatggtaacctaattc
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|22 ): TATGTAAACATTAAAACATTTTCTTGTCCTATCAAATCACTCTCCATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCATG
Unaligned ( gi|39 ): AGTAGTATCATGGGGAAAATTTATTTGTTGAAATTATTACCATTATCAAGTG
Unaligned ( gi|43 ): ATTTTTCCAAGCCAAAAAAGGTCAGCCTTCTATAC
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 11 1111 33333 11 111 33333333 44444444444444444444444 1 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 222 111111 11 111 333333333 11111111 11111111111 11 11 2222 222222222222222 111111 11 11111111111 1111111111111 111111 111 11 1111111 11 11111111111111 1111111111 1111111 33333333333333333333 1111111111111 1111111 111111 1111
lowQualScore : 33 777 2 2 2 2 4 2 55 2 2 00 2 333 2 33 999999 55 0000 00000 7 4 2 4 55 2 4 2 9 33 2 4 000 2 3 00000000 2 333 444 55 2 88888888888888888888888 3 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 000 444 2 666 33 2 55555 333 55 777777 555 99999 44 222 2 8888 2 2 22 555555555 333 2 888 2 22 22 4 22 3 22 555 55555 666 555 22 33333333 4 0 11111111111 22 22 2 1 2 22 22 2 2 44 1 77 333 1 2 2 8888 77 2 4 7777 666666666666666 5555 2 2 5 33 2 33 2 33 55 2 2 8888888 22 33 2 2 555555 99 00 5 66 2 2 2 2 8 33 33 44444444444 2 2 7777777777777 2 33 2 77777 33 2 9 88 0 3 55 555 1 666 555 000000 2 888 33 2 33 2 2 44 77777 2 2 0 5 888 66 33 333 2 2 55 33 33 444 2 66 2 777777 2 1111111 2 2 2 66666 00 2 33 55 5555 22222222222222 2 6666 2 55 33 2 33 2 2 0000000000 2 66 2 2 2 2 2 2 4 2 2 33 5555 0 44 2 3 2 6666666 33 444 1 77 2 00000000000000000000 3 3 44 3 2222222222222 5 2 2 33 2 2 33 555 2 2 6666666 2 33 444444 1 777 0000 777 2 1 2 66 33 2 4 66 6 4 22 2 2 2 4 0 2 2 2
lowQualScore : .. ... . . . . . . .. . . .. . ... . .. ...... .. .... ..... . . . . .. . . . . .. . . ... . . ........ . ... ... .. . ....................... . ........................................................................................................................ ... ... . ... .. . ..... ... .. ...... ... ..... .. ... . .... . . .. ......... ... . ... . .. .. . .. . .. ... ..... ... ... .. ........ . . ........... .. .. . . . .. .. . . .. . .. ... . . . .... .. . . .... ............... .... . . . .. . .. . .. .. . . ....... .. .. . . ...... .. .. . .. . . . . . .. .. ........... . . ............. . .. . ..... .. . . .. . . .. ... . ... ... ...... . ... .. . .. . . .. ..... . . . . ... .. .. ... . . .. .. .. ... . .. . ...... . ....... . . . ..... .. . .. .. .... .............. . .... . .. .. . .. . . .......... . .. . . . . . . . . . .. .... . .. . . . ....... .. ... . .. . .................... . . .. . ............. . . . .. . . .. ... . . ....... . .. ...... . ... .... ... . . . .. .. . . .. . . .. . . . . . . . .
lowQualScore : 99 333 7 5 4 4 7 1 66 4 4 33 4 888 4 44 999999 99 3333 88888 1 7 4 7 66 4 4 2 7 22 2 4 000 2 9 88888888 2 999 888 66 4 88888888888888888888888 3 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 666 444 2 111 55 1 33333 777 00 333333 888 22222 66 000 0 8888 1 1 99 111111111 555 0 555 0 88 88 0 66 1 88 444 00000 888 555 88 11111111 4 4 55555555555 88 88 0 2 0 88 88 0 0 88 9 55 555 1 0 0 6666 99 4 7 4444 999999999999999 3333 5 5 0 44 5 44 5 44 99 5 5 1111111 77 44 5 5 555555 00 00 3 33 7 7 7 7 0 77 77 55555555555 7 7 3333333333333 7 77 7 11111 99 9 2 99 4 1 22 222 1 999 000 333333 9 666 99 9 99 9 7 88 33333 7 7 9 3 000 33 77 666 5 5 99 44 44 444 5 55 4 222222 5 2222222 5 5 5 22222 99 5 44 99 0000 33333333333333 4 1111 2 33 11 2 11 2 2 8888888888 2 11 2 2 2 2 2 2 4 2 4 22 1111 6 99 5 4 5 2222222 44 444 4 00 7 66666666666666666666 1 1 22 1 7777777777777 7 9 9 99 9 9 00 000 9 9 9999999 7 77 888888 1 333 1111 333 5 0 4 11 22 5 7 11 7 4 77 2 2 2 7 7 5 5 5
consensus : NACAGTTGCA--TC---G-CGGGG-AAAATGTC-AT-AATA--TTT-T-A--T-CGTTA--TTT-ACTA--A-C-G-TT--AT----CAAG---GTG-A-C-AT-TATG--TATA-CGT-GAAACANTTTCCTTG-TCCTA-T---AA-TTA--C-GT--A-TTCT---TTC-C-TTT--T-AT----A-----C-----C------ACTCTCCATTACCAG-ATCACTCTCAGCAGCTGCCCACTCTCCATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCATAAA--TTCT---TA-CGA---CC-A-GC-----T---G--A---G--A---A---C-TGTG-TAA-A-TTG-CAAC-G--ATA-C-GC--A----G----C---A-TGN--CG-AT--GT--T-GGA--AGATTATA--TA-C-TTATT-----TA-C-GTA---TT--AAA--T---G-ATANAGC------AG---AAA--G--TGA-TGGGA-AA--AA--CT-TC-T--GACGCAA-GA---GAGAAACC-CT-TTCCCG-GTAT--A-C-A----ATAA----T--T---T---T----G-C-A-TA--C-TG--TC-G--AAAA--TTG-AAA-A-------GT-ATG--CC-GC-GTTGT---A-TG--CA--T-TTTAAA--CCA-TTTT-CTTT-TA-TAC-G--AG--A-----A--G--GTT-TT-T-------------CC-C--AA-CA---C-TT--T-C-ATG-TAATG-TA-AA-G-TTAA--ACTT---T--T---T-CTCCTTA--A-T--AT-C-AAAAG-G-G-T-C-GGCCTG-TAT-TTA-G-TCG--A--TATCG-T-T-G--CA--A--T---T-TGCAA--TT-AATACA------A-T--CA---T-T-T-T-----TG--T-TA--A--TTCTAA----A-A--TT---A--C-A-AT---AT-C--A--C-G--T-G-A--T-------AG-T--C-A-C-G-TGA-T-A-AT-AAA-C--A---NCAGT-C-TTGNTGA-A-------A--A---TGTA-CGGA-ATCC--T-----TC--T----AC-G-TA-TC--G-AT-AA--G-------AA-CGT-CG-A--TT-C-AC-TCTC---GGA-T-A--T----T-TTT--C-----TTTG---AATAGTAC-A-CATGT---ACA-AAACACTTAT-GAT-T--GTTT-TATG--TA-T-GCT-TTTTACGTTA-TT-T-CTGTATG-GGACGCCT-TA-A-TTCAGT
Reference ( family-948 ) : NACAGTTGCA--TC---G-CGGGG-AAAATGTC-AT-AATA--TTT-T-A--T-CGTTA--TTT-ACTA--A-C-G-TT--AT----CAAG---GTG-A-C-AT-TATG--TATA-CGT-GAAACANTTTCCTTG-TCCTA-T---AA-TNA--C-GT--A-TTCT---TTC-C-TTT--T-AT----A-----C-----C------ACTCTCCATTACCAG-ATCACTCTCAGCAGCTGCCCACTCTCCATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCATAAA--TTCT---TA-CGA---CC-A-GC-----T---G--A---G--A---A---C-TGTG-TAA-A-TTG-CAAC-G--ATA-C-GC--A----G----C---A-TGN--CG-AT--GT--T-GGA--AGATTATA--TA-C-TTATT-----TA-C-GTA---TT--AAA--T---G-ATANAGC------AG---AAA--G--TGA-TGGGA-AA--AA--CT-TC-T--GACGCAA-GA---GAGAAACC-CT-TTCCCG-GTAT--A-C-A----ATAA----T--T---T---T----G-C-A-TA--C-TG--TC-G--AAAA--TTG-AAA-A-------GT-ATG--CC-GC-GTTGT---A-TG--CA--T-TTTAAA--CCA-TTTT-CTTT-TA-TAC-G--AG--A-----A--G--GTT-TT-T-------------CC-C--AA-CA---C-TT--T-C-ATG-TAATG-TN-AA-A-TTAA--ACTT---T--T---T-CTCCTTA--A-T--AT-C-AAAAG-G-G-T-C-GGCCTG-TAT-TTA-G-TCG--A--TATCG-T-T-G--CA--A--T---T-TGCAA--TT-AATACA------A-T--CA---T-T-T-T-----TG--T-TA--A--TTCTAA----A-A--TT---A--C-A-AT---AT-C--A--C-G--T-G-A--T-------AG-T--C-A-C-G-TGA-T-A-AT-AAA-C--A---NCAGT-C-TTGNTGA-A-------A--A---TGTA-CGGA-ATCC--T-----TC--T----AC-G-TA-TC--G-AT-AA--G-------AA-CGT-CG-A--TT-C-AC-TCTC---GGA-T-A--T----T-TTT--C-----TTTG---AATAGTAC-A-CATGT---ACA-AAACACTTAT-GAT-T--GTTT-TATG--TA-T-GCT-TTTTACGTTA-TT-T-CTGTATG-GGACGCCT-TA-A-TTCAGT
gi|1 : ACAGTTGCAGATCA--G-CGGGGGAAAATGTC-AT-AATAG-TTT-T-A--T-CGTTA--TTA-ACTG--A-CTGCTT--AT----CAAGC--GTGCA-C-AT-TCTG--TATA-CAT-GAAACACTTTCTTTGCTCCTA-T---AA-TAAG-C-AC--A-TTCT---TTC-C-TTT--T-AT----T-----C-----C------GCCCTCCCTTACCCGCATCACTCTCAGCAGCTGCCCACTCTCCATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCATAAA--TTCTATACA-CGA---CC-A-GC-----T---G--A---G--A---A---C-TTTG-CAA-A-TTGGCAAC-GCGATA-CCGC--A----G----C---A-TGCGCCGCAT--GT--T-GGA--CGATTGTA--TA-CCTTATT-----TA-C-GT----TT--AAA--T---G-ATATAGC------AG---AAA--G--TGA-TGGGA-AG--AAATCT-TC-T--GACGCAATGA---GAAAAACCACTGTTCCCGAGTATG-A-C-A----ATAA----T--T---T---T----G-T-A-TA----TG--GC-A--AAAC--TTG-AAA-A-------GT--T---CC-GC-GTTGT---ACTG--CA--C-ATTAAAG-CTA-TTTT-CTTT-TA-TAC-G--AG--A-----A--G--GTTGTT-T-------------CC-C--AA-C----T-TT--T-C-ATGCTAATG-TTTAA-A-TTAA--ACTT---T--T---T-CTCCTTA--A-T--ATGC-AAAAA-A-A-T-C-GGCCTG-TAT-TTA-G-TCC--A--TATCG-T-T-G--CA--A--T---T-TACAA--TT-GATACA------A-T--AA---T-T-T-T-----TA--T-TC--A--TTCTAA----A-A--TT---A--C-A-AC---AT-C--A--C-G--T-G-A--T-------AG-T--C-A-C-G-TGA-T-A-AT-AAA-C--A---GCAGT-C-TTGTTGA-A-------A--A---TGTA-AGGA-ATCC--T-----TC--T----AC-G-TA-TC--G-AT-AA--G-------AA-CGT-CG-A--TT-C-AC-TCTC---GGA-T-A--T----T-TCT--C-----TTTG---AATAGTAC-A-CATGT---ACA-AAACACTTAT-GAT-T--GTTT-TATG--TA-T-GCT-TTTTACGTTA-TT-T-CTGTATG-GGACGCCT-TA-A-TTCAGT
gi|10 : gTT-ACTA--A---G-TTTAAT----CAA----GTG-A-C-ATGGATG--TATA--AT--AAACAATTT-ATTG-TCCT--TCTAAA-TTA--T-GT--A-TTCCTTGTTT-G-TTT--T-A-----A-----C-----CAAATCAACTCTCCA
gi|10 : C-A-GC-----T---A--A---G--A---A---AATGTGGTAA-AATTG-CAACCG--ATA-T-AC--AACGTG----C---A-TGA--CG-AT--GCGCT-GGA--GTATTATA--TA-T-TTATT-----GA---ATA---TT--AA-------G-AT---------------------G--TGAGCGGGA-GA--AC--CT-TC-T--GAAGTTA-AATCGGAACAATC-CT-TCCC---GTAT--A-C-A----ATAT----T--C---T---T----G-C-A-TA--C-TG--TCCG--AAAAATTTG-AAA-G-------CT-ATG--CC-GC-GTTGT---T-TG--CA--T-TTTAAA--CC--CTTT-CTTT-TA-TAC-G--AG--A-----A--G----T-TT-T-------------CC-C--AA--A---C-TT--T-CGATT-TATTG-TA-AA-G-TT-A--ACTT---T--A---T-TTCATTA--ATT--AT-C-ATAA--G-G-T-T-GGCTTG-TAT-TTAGG-TCGT-A--CCTCG-T-T-G--CA--AT-T---T-TGCAA--TT-AATACA------A-TA-CA---T-T-T-T-----TG--TGTAACA--TTCTAA----A-G---T---A--TGG-AT---AT-C--A--C-G--T-G----T-------AGTT--C-ATC-GTTGA-T-ACAT-Aatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgttaattttcccccacgaaacagctaagaaaatgtggtaaaattgcaaccgatatacaacgtgcatgacgatgcgctggagtattatatatttattgaatattaagatgtgagcgggagaaccttctgaagttaaatcggaacaatccttcccgtatacaatattcttgcatactgtccgaaaaatttgaaagctatgccgcgttgtttgcattttaaaccctttcttttatacgagaagttttcccaaactttcgatttattgtaaagttaactttatttcattaattatcataaggttggcttgtatttaggtcgtacctcgttgcaattttgcaattaatacaatacatttttgtgtaacattctaaagtatggatatcacgtgtagttcatcgttgatacatatagttacaa
gi|11 : ttactaagtttaatcaagtgacatggatgtataataaacaatttattgtccttctaaattatgtattccttgtttgttttaaccaaatcaactctccaatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgttaattttcccccacgaaaGTTGCA--TC---G-CGGGG-AAAATGTT-ATGGATA--TTTGT-A--T-CGT----TTT-ACTA--A---G--T--AT----CAA----GTG-A-C-AT-TATG--TATAGCAT-GAAA-A--TTCCTTT-TCATA-T---TA-TCA--T--T--A-TT-T---CTT-C-TTT--T-AT----A-----CAAAT-C------ACTCTCCATTtagttacaa
gi|11 : atTACA--TACT---TA-TAAGAGCC-A-GC-----T---G--A---G--A---AA--C-TGC--TGA-A-TTG-CAAC-G--ATA-C-TC--AT---G----C---A-TGTGTCG--T--GT--TTGGA--AGATT-TA--TA-C-TTATT-----TA-C-GT----TT--AAATTT---G-A-ATAAC------AG---AAA--G--TAA-TGGCACAA--AA--CG-TA-T--GAC-CAA-GG---GA-AGACC-TT-CTCCC--GTATTAA-C-AG---ATAA----T--TTGCT---T----G-C-A-T---C-TG--TC-AGCATAT--TTA-AAA-A-------GT-ATG--CC-GC-GTTTTTTAA-TG--CA--T-TTTAAA--CTATTTTT-CTTT-TA-TAC-G--GG--AAAAATA--A--GTT-TT-TTGTTTTCTTTTTCCC-C--AA-AAAACC-TT--T-C-ATGATAGTG-TA-AA-G-TTAA----TT---TCAT---T-CGTCTTA----------T-AAAAG-G-A---C-GG-CTG-T-T-TTA-G-TCG-----TAT---T-T-G--C---A--T---T-TGCAA--TT-AAtctttgttagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttacatacttataagagccagctgagaaactgctgaattgcaacgatactcatgcatgtgtcgtgtttggaagatttatacttatttacgtttaaatttgaataacagaaagtaatggcacaaaacgtatgaccaagggaagaccttctcccgtattaacagataatttgcttgcatctgtcagcatatttaaaaagtatgccgcgttttttaatgcattttaaactatttttcttttatacgggaaaaataagttttttgttttctttttccccaaaaaacctttcatgatagtgtaaagttaatttcattcgtcttataaaaggacggctgttttagtcgtatttgcatttgcaattaaat
gi|12 : atgttgcatcgcggggaaaatgttatggatatttgtatcgttttactaagtatcaagtgacattatgtatagcatgaaaattccttttcatattatcattatttcttcttttatacaaatcactctccatttctttgttagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntGT-GAACCATTTTC-TTG-TCCTA-----AG-TTATTT-GC--A-TTTT---TTCTT-TTT--T-AT----A-----CAAAAGC------ACTCTCCATat
gi|12 : CATAA---TTCT---TA-CGA---CC-A-GC-----C---G--A---A--A---A---A-AATG-TAA-AATTG-CAAC-G--ATA-T-AC--A----GTG--C---A-TGA--CG-AT--GT--T-GGA--AGTTTATA--TA-C-T-AGT-----TA-C-GTA---TT--AAA--T---TCATATATC------AG---AAAA-G--TGA--GGGA-AA--AA--AT-TA-T--GACACAA-AC---G-GAAACC-CT-TTCCCG--TAT--A-C-A----ATAA----T--T---TCT-T----G-C-A-TA--C-TG--TC-G--AAAA--TTG-AAA-A-------GT-ATG--CC-GC-GTTAG---A-TG--CA--T-ATTAAA--CCA-TTTT-CTTT-T--TAC-A--CG--G-----A--G--AGT-TT-T-------------CC-CTAAA-CA-----TT--T-C-AT--------------A-TTAA--TCTT--------------------------------AAAG-G-A------ACTTA-TAT-TTC---TCA--A--TATC----------A--A-----------AAGGCT-CATACA------A-T--CA---T-T-T-T-----TG--T-TA--A--TTCTAA----A-A--AT---A--C-A-AT---AC-C--A--C-G--T-G-A--T-------AG-T--C-A-C-G-TGA-T-A-AC-AAA-C--A---nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncataattcttacgaccagccgaaaaaaatgtaaaattgcaacgatatacagtgcatgacgatgttggaagtttatatactagttacgtattaaattcatatatcagaaaagtgagggaaaaaattatgacacaaacggaaaccctttcccgtatacaataatttcttgcatactgtcgaaaattgaaaagtatgccgcgttagatgcatattaaaccattttctttttacacggagagttttccctaaacatttcatattaatcttaaaggaacttatatttctcaatatcaaaaggctcatacaatcatttttgttaattctaaaaatacaataccacgtgatagtcacgtgataacaaacaa
gi|13 : gtgaaccattttcttgtcctaagttatttgcattttttcttttttatacaaaagcactctccatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCAGTTGCA--TT---G-CGGGG-AAAACGTTTATGAATA--TTT-T-AAAT-CATTA--CTT-ACTA--A-C-G-TT--AT----CAA----GTG-A-C-AT-GATG--TATA-AGT--AAACAATTT-ATTG-TCCTA-TAA-AA-TTA--T-GT--A-TTCT---TTCGT-TTT--T-AT----A-----CCAAATC------ACTCTCCAa
gi|13 : ----G----C---A-TGA--CG-AT--GC--T-GGA--AGTTTATA--TA-T-TTATT-----GA-C-ATA---TT--AAA--T---G---------------------------TGA-GGGGA-GA--AA--CT-TC-T--GACACAA-TG---GA-AAATC-CT-TTCCC--GTAT--A-C-A----ATAA----A--T---T---atttctatgtattgaattatgaaattgataatcatattaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacagtgcatgacgatgctggaagtttatatatttattgacatattaaatgtgaggggagaaacttctgacacaatggaaaatcctttcccgtatacaataaattct
gi|14 : cagttgcattgcggggaaaacgtttatgaatattttaaatcattacttactaacgttatcaagtgacatgatgtataagtaaacaatttattgtcctataaaattatgtattctttcgtttttataccaaatcactctccaatttctatgtattgaattatgaaattgataatcatattaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacagtCT---TG-CGA---CC-A-AT-----T---TC-A---G--A---A-----TGTG-TAA-AATTG-CAAC-G--ATA-T-AT--A----GTG--C---A-TGG--TG-GT--AT--T-CAA--AGTCTACA--TA-T-TTATA-----TG-C-CTG---TT--ACA--TT--G-ATATATC------GGGGGAAA--A----A-CTGGA-AAGCAA--CG-TC-T--GACACAA-AA----AGAA--------TCC------T--A-C-ATCTGATAA----T--T---TCT-T----C-C-A-TA--T-TC--TT-A--AAAA--TTG-AAA-AGTACACCGT-ATG--CA-GC-CTTGA---C-CG--CA--T-TTTAAA--TTA-CCTTGCTTT-TA-TCG-G--AG--A-----A-----ATC-GC-T-------------CT-A--AG-CG---CTTT--T-C-AGT-TAATG-TA-AA-G-TAAAT-ATTG---T--T---T-TTC--TA--A-T--AT-A-AAAA----G-C-C-GGTCTT-TAT-TTT-G-TTC--A--AATCC-A-T-G--TA--AT-T---T-TGAGA--TT-ACTGTA------A-T--GATTTT-T-T-T-----TT--T-TG--G--TTCTAA----ATT--TT---A--T-A-AT---------------------------------G-T--C-A-C-A-TGA-T-G-AT-AAA----A---CTTGC-T-TTGATGG-A-------A--A---TGTA-TGGA-Act
gi|15 : A--ACTA---TA-T---T-GTCCTCA--A-T--AT-CTAAAAG-G-G-TGC-GGCCAG-TAT-T-A-G-TTG--A--TGTCG-T-T-GG-CA--A--T---T-T-TA----T-AATACA--------T--CA---T-T-T-T-----TGGTT-TA--AA-TTCTAA----A-A--TT---AGGC-A-AC---AT-C--A--T----T-G-A--T-------AG-TGTC-A-C-A-TGA-TTA-ATGAAA-C--A---ACAAT-C-TTCATGA-A-------A--A---TGT--TGGA----------------------------A-TC--G-CT-AA--C-------TA-TGT-CT-A--TT-C-AC-TCTC---GGG-T-A--T----T-TTT--C------TTG---AATAGTA--A-CATGC---A----------TGT-GAC-T--G-TT-TATG--TA-TGGCA-TTTTACGTTC-TT-T-CTGTAT--GGACGCCT-TA-A-TTCAGgc
gi|16 : atagttTCT---AA-CAA---CC-A-GA-----T---G--A---AGAA---A---C-TGTA--AA-A-TTG-CAAC-G--ATA-C-TC--A----AAA--C---A-TGA--CG-AT--AT--T-GGA--AGTTTATA--TA-C-TTATT-----TA-C-GTA---TT--AAA--TT--G-ATAAAGC------AG---AAAA-G--TAA-TGGGA-AA--AA--CT-TC-T--GACACAA--A---GGAAAACC-TT-TTCCC--GTAT--A-C-A----GTTA----T--TTC-T---T----G-C-A-TA--C-TG--TC-G--AAAA--TTG-AAA-A-------CT-ATG--CA-GC-TTTGG---A-TG--CA--T-TTTAAA--CCA-TTTT-CCTT-TA-TACAG--AG--A-----A-----GTT-TT-T-------------CC-C--AA-CA---C-Tct
gi|17 : A-CGA---CC-A-GA-----T---G--A---G--A---AA--C-TG-G-TAA-AATTG-CAGC-G--ATA-C-TC--A----AAAA-C---A-TGAA-CG-AT--AT--T-GGA--AG-TTATA--TA-T-CTTTT-----TAGC-ATAC--TT--AAT--T---G-ATAAAGA------GA---AAA--G--TAA-TGG---AA--AA--CT-TC-T--GAC-CAA--A---GGGAA--C-TT-TTCGCC-GTATT-A-C-A----GTAA----T--T---T---CTTGGG-C---TA--C-TG--TC-G--AAAA--T-G-AAA-A--------T--TG--CC-GC--TTGTGG-A-TG--CA--T-TTTAAA--CCA-TTTT-C-TT-TA-TACGG--AGACA-----A--T--GTT-TT-TC------------CC-C--AA-CA---T-TT--T-
gi|18 : A----A-T--TT---A--A-A-TT---AT-C--T--T-G--T-G-A--T-------AG-T--C-A-C-G-TGA-T-A-AT-GAA-C--A---CCTGC-C-TCTATGA-A-------A--A---CGTA-TGGA-AGCA--T-----AC--C----GG-G-TA-TG--G-TT-----G-------AA-CGT-TGTT--TT-C-GT-TTTC---GGA-T-A--T----T-TCT--C-----ATTG---AATGTTTT-C-CATATAAGACAGAAACA--TAT---------TTT-TATGGATA-TAGTTGTTTTGCTTTA--T-T-CTGTATA-GGATGC---TATA-TTCAAT
gi|19 : atattgttgtaaatattgcggttttttaaccgatgttc-T-T-C--CA--A--T---A-TG--A--TC-ATTACA------A-T--CA---TAT-T-TGCCGGTG--T-TG--A--TTTT-------------------T-A-AT---GT-C--A--C-A--T-T-A--T-------AG-T--C-A-T-T-TAA-T-G-AT-AAA-C--A---CGTGC-C-CCCATGA-A-------A--A---TGTA-CGGG-AGCC--T-----AT--T-----C-GATA-TT--G-GC-AT--G-------AA-TGT-TG-A--TT-C-TT-TCTC---AGA-T-A--T----T-TTT--C-----ATCG---AATCATTC---CAT-----AGA-AAATACGAAC-AAT-T--GTCTGTATG--TA-T-ATG-TTTTA------TT-C-TTGAATG-GGGGACCT-TA-A-TTCAGTa
gi|2 : ttgcACATTTCCA--TT---G-CGGGA-AAA---TC-AT-A-TA--TTT-T-AA-T-C--TA--TTT-ACTAGAA-C-G-TTT-AT----CAA-----TG-A-C-AT-GATG--TATA-CGTTGGAACATTTTA-TTG-TCCTA-TAA-AA-TTA--T-GT--A-TTCT---TTG-G-TTTA-T-ATTCAAA-----G-----C------A-TCTCCAt
gi|2 : cttCATAA---TTCT---TA-CGA---AC-A-GC-----A---A--AT--A--A---A---A-TGTGGTA----TTG-CAAC-G--ATA-T-AC--AAGT-G----C---A-TGA--CG-ATTGGT--T-GGA--AG-TTATA--TAAC-TTATT------A-C-ATA---TA--AAT--T---C-ATATATC------AG---AAAA-G--TGA-GGAGA-AA--AA--CT-TC-T--GACACAA-AG---GGGAAATC-CT-TTCTC--TTAT--A-C-A----ATAAGAT-T--C---T---T----GTC-ATTA--T-CGTCTC-G--AAAA--TTG-AAA-A-------GT-ATG--CC-GCAGTTGT---T-TG--CATTT-TTTAAATCCTA-TTTT-CTTT-TA-TACGG--AG--AC----A--C--GTT-TTCT-------------CC-C--AACCA---C-TTTCT-C-ATA-TATTC-TA-AA-G-TTTA--ACTTAAGT--T---TACTC---A--A-TTAGT-C-AAAA--G-G-T-CGGGCTTGTTAT-TTAGG-TCG--AGCTATCG-TCT-G--CA--AT-T---T-TGCAAATTC-AAGACA------A-T--CA---T-T-T-G-----TGT-T-TA--A--TTCTAA----AGA--TT---A--T-G-AT---AT-C--AACC-GCTT-G-ATGT-------AG-T--C-A-C-G-TGATT-A-AT-AAA-C--A---ACAAT-C-TTGGTGAGA-------A--A---TGTA-CGGA-ATCC--TCAG--TTGAT----ATGG-TA-TC--G-AT-GAATG-------AA-CAT-CG-A--TT-CTAC-TCTC---GGG-T-A--A----T-TTT--CA----GTTGTATAGTAGTAC-A-CATGT---ACA-AAACACTTAT-TAT-TAAATTTATATG--TACT-GCT-TTTAACGTTA-TTGT-CTGTATGAGGACGCCTATA-A-TTCAGannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncataattcttacgaacagcaaataaaatgtggtattgcaacgatatacaagtgcatgacgattggttggaagttatataacttattacatataaattcatatatcagaaaagtgaggagaaaaacttctgacacaaaggggaaatcctttctcttatacaataagattcttgtcattatcgtctcgaaaattgaaaagtatgccgcagttgtttgcattttttaaatcctattttcttttatacggagacacgttttctcccaaccactttctcatatattctaaagtttaacttaagtttactcaattagtcaaaaggtcgggcttgttatttaggtcgagctatcgtctgcaattttgcaaattcaagacaatcatttgtgtttaattctaaagattatgatatcaaccgcttgatgtagtcacgtgattaataaacaacaatcttggtgagaaatgtacggaatcctcagttgatatggtatcgatgaatgaacatcgattctactctcgggtaattttcagttgtatagtagtacacatgtacaaaacacttattattaaatttatatgtactgcttttaacgttattgtctgtatgaggacgcctataattcag
gi|20 : cttacatttccattgcgggaaaatcatatattttaatctatttactagaacgtttatcaatgacatgatgtatacgttggaacattttattgtcctataaaattatgtattctttggtttatattcaaagcatctccaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-C--A--C-G--T-G-A--T-------AG-C--C-A-C-A-TGA-T-G-AT-GAA-C--A---CCTGG-T-TGGATGA-A-------A--A---T-TATTTGA-ATCA--T-----AT--T----AT-G-TA-TCAGA-AT-AA--A-------AA---T-TG-A--TT-C-GC-TTTC---GGA-T-A--TTG--T-TTT--C-----ATCG---AATAGTAT-T-CATGT-----A-AAGCACTCATAGAT-T--GTTT-TATT--TA-T-GTG-TTTTACTGTA-TT-T-CTGTACA-GGGCGTCC-TA-A-TTC
gi|21 : -AAAAG-GAG-T-C-GGTCTG-TTT-ATA-G-TCG--A--TATTG-T-T-G--CA--A--T---CATGCGA--TT-GTTACATGTTCAA-T--AA---T-T-T-T-----T---C-CG--G--TGCTAA----A-C--TT---A--T-A-AT---GT-C--A--C-G--T-G-A--T-------AA-T--A-A-C-G-CGA-T-A-AT-ACA-C--T---CCTAC-A-TTGATGA-A-------A--A---TGTA-
gi|23 : tagtttatgtaaagtaagcgttaataaatcatgtacaaaatTTT---TG-CAG---CT-A-GT-----T---GCAA---A--A---A---C-TGTA-TAA---TTG-TCAT-G--ATA-T-AC--A----G----T---G-TAC--CG-GT--GG--T-GGACAAAATCATA--TT-T-CTATTCCTATTA-C-ATACTATT--AGA--T-----ATTAAG--------A---AAA--G--TGT-TGGGA-GC--AA--CT-TC-T--AACACAA-AA---T-GAAACC-AC-TTCCCG-
gi|24 : gcCATAAT--TTCA---TA-CGA---CA-G-GC-----G---G--A------A---A---C-TGTG--AA-A-TTG-CAAca
gi|25 : annnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaTCT---TA-CGA---CA-A-GC-----T---G--AA--G--AG--A---C-TGTG--AA-A-TTG-CAAC-G--ATA-C-GC--AT---GAATTC---A-TGG--CG-AT--GT--T-GGA--AGGTTATA--TT-C-TTGTT-----TA-C-GTA---TT--GAAT-T---G-ATAAAAC------AGA--AAA--G--TGA-TAAGA-AA--AA--CT-TC-T--GACACAA--A---GAGAAACC-CT-TTCCC
gi|26 : --T----T-TTT--C-----ATTG---AATATTAC-C-CATGT---A---AAACACTTAA-AGT-T--GTTT-TATC--TAAT-GTA-TTTTACTCTA-TT-T-CTGTATA-GAACGTTT-TA-A-TTCAAT
gi|27 : gagggctacattattgcagctagaagccttacaaggctatcggtatgaatgttagAGATGAA--TC---G-CGGGG-AAA-------T-A-TA--TTT-T-G--T-CATTA--TTT-ACAA--C-C-G-TT--AT----CAA----GTG-A------TATGCTTAAA-CG--AAAAC-GTTTACTTA-TCAAA-C---AA---A--T-GTTCATTTCT---TTC-T-TTT--TCAT----A-----T-----C------At
gi|28 : ttcttttACAGTTGCA--TC---G-CGGGG-AAA-TGTC-AT-A-TA--TTT-T-AA-T-CGTTA--TTT-ACTA--A-A-C-TT--TT----TA-----GTG-G-CGAT-TATG--GA-A-CGT-GAAACATTTATCTTG-TCCTA-T----A-TTA-----T--C-TTCT---TTC-T-GTT-----T----G-----G-----C------A--------TACCAG-ATCACTCTaataactcattattctttatatga
gi|29 : --AGATTATA--TA-T-TTATT-----TA-C-GTA---TT--AAA--T---TCATAAAGC------AA---AAAAAG--TGA-TGAGA-AA--A---CT-TT-T--GACGCAA--A---GGGACACC-CT-ATCT-A-GTAT--A-C-A----GTAA----TGTT---T---T----G-C-A-TA--C-TG--TC-A--ACAA--TTG-AAA-A-------GT-ATG--CC-GC-tc
gi|3 : GGGT-AAAAT-TC-AT-AAAAATTTT-T-AC-T-CGTTA--TTT-A-----A-C----T--AT----GAAGTAAATG-A---AT-GATG--TATA-CGC-GAAACATTTTTCTTG-TCCTA-T---AA-AAA--C-TT--A-TATT---TCT-C-TT
gi|3 : AA--TTCT---TATCGA---AC-A-GTCTAAAT---G--A---G--A---A---A-TGTGGTA----TTG-CAAC-G--ATAGT-AC--A----G----TGCAA-TGA--CG-AT--GT--T-GGA--AGTATATA--TA-T-TAATT-----TG-C-GTA---TT--AAA--TTCAG-A-ATATC-------G---AAA--GCGTGA-GGGGA-GA--AA--CT-TCAT--GAACCAA--A---GGGACGAT-CT-TTCC---G-AT--A-C-A----ATAAATTAC--T---T---T----G-C-A-TA--C-TG--TC-A--AAAAA-TTG-AAA-A-------GT-ATT--CC-GC-GTTGT---T-TG--CATTT-TTTATA--CCA----T-CTTT-TA-TAC-G--CG--G-----A--GAAGTT-TT-T-------------CC-C--AA-CA---C-TT--T-C-AT--T-ATG-TA-AAGG-TTAC--ACTT---TA-TAAAT-CTC--TA--A-T--A--C-AAAAG-G-GCT-C-GG-CTG-TTT-TTA-GTTCGGAA--TATCG-T-T-G--CAGGA--T---A-TGCAA--TT-AATAAA------A-TAACG---T-T-TAT-----GG--T-TA--A--ATCTAA----A-A--TT------C-G-AT---ATGT--A--CAG--T-G-A----------AT-C--C-A-C-G-TGA-T---AT--AA-CTGA---ACAAT-C-TTGGTGG-A-------AATA---TGTAGCGGAGATCC--TAATGGTA--TTAAAAG-G-GA-TC--G-AT-TATTG-------AAGCGC-CG-AAGTT-C-AC-TCTC---GGG-T-AACT----T-TTT--CATTAATTGA---AATACTAG-T-CATGTA--ACT-AAAAACTTAT-GAT-T--ATTT-TATT--TATT-GCT-CTTAACGTTA-TT-T-CTGTAT--GGACG-CT-TA-A-TTCAcgcatgtacaccaaagcactttctaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaataattcttatcgaacagtctaaatgagaaatgtggtattgcaacgatagtacagtgcaatgacgatgttggaagtatatatattaatttgcgtattaaattcagaatatcgaaagcgtgaggggagaaacttcatgaaccaaagggacgatctttccgatacaataaattactttgcatactgtcaaaaaattgaaaagtattccgcgttgtttgcattttttataccatcttttatacgcggagaagtttttcccaacactttcattatgtaaaggttacactttataaatctctaatacaaaagggctcggctgtttttagttcggaatatcgttgcaggatatgcaattaataaaataacgtttatggttaaatctaaaattcgatatgtacagtgaatccacgtgatataactgaacaatcttggtggaaatatgtagcggagatcctaatggtattaaaagggatcgattattgaagcgccgaagttcactctcgggtaactttttcattaattgaaatactagtcatgtaactaaaaacttatgattattttatttattgctcttaacgttatttctgtatggacgcttaattca
gi|30 : gggtaaaattcataaaaatttttactcgttatttaactatgaagtaaatgaatgatgtatacgcgaaacatttttcttgtcctataaaaacttatatttctcttcgcatgtacaccaaagcactttctaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaatACAGTTGCA--TC---G-C-GGG-AAAAT-TC-AT-GAT---TTT-T-A--T-CGTTA---TT-ACCA--A-C-G--T--AT----CAGA---GTG-ACC-AT-TATG--TATA-CAT-AAAACA-TTTCCTT--TTCTA-T---AA-TTAG-C-AT--A-TT---------C-CTT--T-AT----ACAAATC-----C------ACTCTCC
gi|31 : ttACAGTTGCA--GC---G-CG------AATGTC-AT-AATA--TTG---A--T-C--TA--TTT-AC----A-C-C-TT--AT----CAAA---GTG-A-C-AT-TATG--TATA-CAT-G-AATA--TTCCTTG-T-CTA-T---AA-TCA-----T--A-CACT---TTC-C-TTT--T-AT----A-----CCAAATC------ACTCTCCA
gi|32 : tt-A-TTG-CAAC-A--ATA-C-GC--AAT--G----C---A-TGG--CG-AT--GT--A-GGA--AGATTATA--TA-C-TTGTA-----TA-C-GTA---TT--AAAT-T---G-GTAAAGCAAAAAAAA---AAA--G--TGA-TGAG--AA--AA--CT-TC-T--GACGCAA--A---GGGACATC-CT-TTCTCG-
gi|33 : ACAGTTGCA--TC---GGCGGG---AAATGTC-AT-AATA---TT-A-A--T-CG--A--TTT-ACTA--A-C----T--AT----CAA----GT--A-C-AT-TATG--TATA-C---AGAATA--TTCC-TG-TCC-A-T---AA-TCA-----T--A-CACT---TTC-C-TTT--T-AT----A-----CAAAT-C------ACTCTCCt
gi|34 : t-------AA-CGT-TG-A--CT-C-AC-TCTC---GGA-T-A--T----A-TTT--T-----TTT-----ATATGAC-A-CATGT---ACA-AAACACTTGT-GAC-T--ATTT-TATG--TA-T-GCT-TTTTACGTTG-TT-T-CTGTGTG-GGGCGCC
gi|35 : A--TT-AATACA------A-T--CA---A-T-T-T-----TG--T-TA--A--TTCTAA----A-C--TT---A--C-G-ATCATAC-C--A--C-A--T-G-A--T-------AG-T--C-A-C-G-TGA-T-A-AT-ACA-C--A---AACGT-C-TTAGTGA-A-------A--A---TATA-TGGA-ATCC--T-----
gi|36 : TTT---TA-CGA---CC-A-GC-----T---G--T---A--A---A---A-AGTG-CAATA-TTG-CAAC-G--ATA-T-AC--G----G----------TGT-----AT--GC--TAGGA--A
gi|37 : TTAT-GAT-T--GTTT-TATG--TA-T-GCT-TTTTACGTCA-TT-T-CTGTATG-GTAAGCCT-TA-A-TTCAGttttcagtctgtatctttatattcttattaca
gi|38 : A--TC---G-CGGGG-AAAATGTC-AT-AATA------T-A--T-CGTTA--T
gi|4 : aggttcttatat-AT-AGAA--TTT-T----T-CGTTA--TTTTACTA--AAT-T-TT--AT----CGAG----TGCA-C-ATGTATG--T----C-----AACATGTTACTTG-TCCGA-T---AA-TTA--TTGCC-A-TTTT---TCC-T-TTT--T-AT----A-----C-----C------Acaagtgatatgct
gi|4 : CATAAAATTCCT---TG-CGAA--CC-AAGC-----T---G--A---G--A---AGAAC-TGTG--AA-A-TT--CAAC----ATA-C-GC--AATG-G----C---A-TAG--CG-AT--GT--T-GGA--AGAT-ATA--TA-C-TTATT-----TAACAGTA---TTTAAAA--TT--G-ATA-AGC------AA---AAA--G--TGA-TGGGA-AA--AA--CTGTC-TT-GACGCAA-GG---GA--AACC-CT-TTCCCG--TAT--ATC-A----GTAA----TGTC---T---T----G-C-A-TATAC-TG--TC-G--GAAA--TTGGAAA-A-------GTGATG--CCCGC-GTTGT---G-TGG-CA--TCTTTAAA--CTA-TTTT-TTTCACA-TAC-GGAAA--A-----A--G--TTT-TT-T-------------CCGC--AA-CA---C-TT--TTC-ATG-TAATG-TA-GA-AGTTAATTATTA---T--T---T-CTCC-----A-T--GT-C-AAAAAAG-G-T-C-GGCCTG-TCT-TTA-G-TCG--A--TATCGGT-T-GTTCA--GATT---T-TGCAA--TT-AATACG------AGT--CA---T-T-T-T-----TGG-T-TA--AACTTCTGA----A-AATTT---A--C-AGAC---AT-C--A--C-G--T-G-A--T-------AG-T--CCA-C-G-TGA-T-A-AT-AA--C--G---AGAGT-CCTTGTTGA-A-------C--A---T-TA-CGGA-ATATAAT-----TAA-T----AC-G-TA-TC--G-AT-AT--G-------AA-CGT-CG-A--TTTC-ACCTCTCCAGGAA-T-A--TAACTT-TTT--C-----TTTG---GTCAGTAC-A-CATGT---ACA-AAACACTAAT-GAT-T--GTTT-TATG--TA-T-GAA-TTTCACGTTATTT-T-CTGTATGTGGACGCCT-TA-CTTTCAGTaatcgactcttaccatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncataaaattccttgcgaaccaagctgagaagaactgtgaaattcaacatacgcaatggcatagcgatgttggaagatatatacttatttaacagtatttaaaattgataagcaaaaagtgatgggaaaaactgtcttgacgcaagggaaaccctttcccgtatatcagtaatgtcttgcatatactgtcggaaattggaaaagtgatgcccgcgttgtgtggcatctttaaactatttttttcacatacggaaaaagttttttccgcaacacttttcatgtaatgtagaagttaattattatttctccatgtcaaaaaaggtcggcctgtctttagtcgatatcggttgttcagattttgcaattaatacgagtcatttttggttaaacttctgaaaatttacagacatcacgtgatagtccacgtgataataacgagagtccttgttgaacattacggaatataattaatacgtatcgatatgaacgtcgatttcacctctccaggaatataactttttctttggtcagtacacatgtacaaaacactaatgattgttttatgtatgaatttcacgttattttctgtatgtggacgccttactttcagtt
gi|40 : atagaatttttcgttattttactaaattttatcgagtgcacatgtatgtcaacatgttacttgtccgataattattgccatttttcctttttataccaaatcgactcttaccatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnG--TA-T-GCT-TTAAACGTTA-TT-T-ATATATG-TGACGCCT-TA-A-TTCAt
gi|41 : -AAACACTTAT-GGC-T--GTTT-TATG--TA-T-GCT-TTTTACGTTA-TT-T-CTcgtt
gi|42 : A--TT---G-CGGGT-AAA-TGTC-AT-AATA--TTT-TAA--T-CGTTA--TTT-AC
gi|5 : TTGCA--TC---G-CGGGG-AAAATGTC-AT-ATGA--TTT-T-A--TTCGTTAATTCT-ACTA--A-CCG-TT--A-----CAAG----TG-AAC-AT-TATG--TATA-CAT-GAAACACTT--CTTG-TCCTA-T---AAATGA-----------TCT---TTC-C-TTT--T-TT----A---------------------------TACCAA-ATCACTCTC
gi|5 : tCATAA---TTCT---TA-CGA---CCCA-GC-----T---G--A---A--AGAAA---C-TTTT-GAA-A-TTG-AAACCG--ATA-C-GC--A----T----C---AATGG--TG-AT--GT----GGA--AGATTGTA--TA-C-TATTT-----TA-CCGTA---TT--AAA--T---G-AT-TACC------AG---AAAA-G--TGA-TGGGA-AA--AT--CT-TC-TTTGACG--A-AA---GAGAAACT-CT-TTCCCG--TAT--T-C-A----ATAAATTTC--T---T---T----G-C-ACTA--CCTG--TC-A--AAAA--TTG-AAATA-------GT-ATGGGCC-GC-GTTGT---A-TGAACA--T-TT-AAA--CTA-TTTC-TTTT-TAATAG-G--AG--A-----A--G--TTT-TT-T-----------------------------TT--T-T-ATG-TAATGGTA-AA-G-TTAA--ACTT---T--C---T-CT---TA--A-T--AT-C-AAAAG-G-A-T-C-GGCCGG-TAT-TTA-G-TCC--A--TATC------G--CA--A--TAAAT-GGCAA--TTAAATACA------T-T-------T-T-T-T-----TGT-T-TA--A--TTCTTA----A-A--TT---A--CAA-AC---AC-C--A----G--T-GAA--T-------AG-TCCC-A-CTG-TGA-T-ACAT-AAACC--A---GCAGT-C-GTGTTGA-A-------A--A---TATA-CAGA-ATCC--T-----TC--T----AA-G-TA-TC--G-ATAAA--G-------AACCGT-CG-A--TT-T-CT-CCTC---GGA-TCA--T----T-TTT--C-----TTTG----ATAGTACAA-CATGT---ACA-AACCACTTAT-GATAT--GTTT-TATGAATA-T-GCT-TTTTACG-TA-TT-T-CTG-ATG-GGATGCCT-TA-A-TTCAGcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntacataattcttacgacccagctgaaagaaacttttgaaattgaaaccgatacgcatcaatggtgatgtggaagattgtatactattttaccgtattaaatgattaccagaaaagtgatgggaaaatcttctttgacgaaagagaaactctttcccgtattcaataaatttctttgcactacctgtcaaaaattgaaatagtatgggccgcgttgtatgaacatttaaactatttctttttaataggagaagttttttttttatgtaatggtaaagttaaactttctcttaatatcaaaaggatcggccggtatttagtccatatcgcaataaatggcaattaaatacatttttttgtttaattcttaaattacaaacaccagtgaatagtcccactgtgatacataaaccagcagtcgtgttgaaaatatacagaatccttctaagtatcgataaagaaccgtcgatttctcctcggatcatttttctttgatagtacaacatgtacaaaccacttatgatatgttttatgaatatgctttttacgtatttctgatgggatgccttaattcag
gi|6 : tttgcatcgcggggaaaatgtcatatgattttattcgttaattctactaaccgttacaagtgaacattatgtatacatgaaacacttcttgtcctataaatgatctttccttttttataccaaatcactctccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaCAGTTGCA--TC---G-CGGGG-AAA--GTC-AT-AATA---TT-T-A--T---TTA--TTA-ACT---T-C-G-TT--GTAGTGCACGCA-GTGAA-C-AT-TATGT-TGTA-CAT-G-AACAATTGC---G-TCCTA-T---AA-T-A--T-GG--C-TTCT---TCC-T-TTTGAT-ATCCAAA-----C-----C------ACTCTC
gi|6 : CATAAA--TTCT----A-CGA---C----AC-----T---G--A---A--A---A---C-TTTG-GAA-A-TTG-CAAC-GC-ATA-C-GTCAA----G----C---A-TGG--CG-AT--GT--T-GGA---GATTTTACGTA-T-TTAAT-----TG-A-ATA---T----AA--T---G-ATATAGCG-----AA---AAA--G--TGA-TGG-A-AA--AT--CT-TC-T--GACGCAAAGA---GAGAACCC-AT-TTCC---GTAT--A-C-A----ATAA----T--T---TCCTT----G-CCA-TA--C-TG--TC-A--AAAA--TTG-AAA-A-------GT--TG--CC-GC-GTTGT---A-TGA-CAA-TATTTAAA--CTA-TTTT-CTTT-TA-TAC-G--AG--A-----A--A--GTT-TT-C-------------CC-A--AA-CA---C-TT--T-C-ATG-TAATG-TA-AA-G-GTTA--AC-T---T--T---T-CTTCTTAACA-T--AT-C-AAAAG-G-A---C-GGCCTG-TA--TTA-G-TCC--A--TATCG-T-T-G--CA--AT-T---T-TGCAA--TT-AATACA------A----AA---T-T-T-T-----TG--T-TA--G--TTC--A----A-A--TT---A--C-A-A----AT-CCAA--C-G--T-G-A--T-------AA-G--C-A---G-TGA-T-A-AT-AAA-T--A---G-AGT-C-TTGTTGA-A-------A--A---TGTA-AGGA-AT-C--T-----AC--T----AC-G-TA-TC--G-A--AA--G-------AA-CGT-CG-A---T-C-AA-CCTC---GGATT-A--T----TGTTT--C-----TTTG---AATAGT-C-A-CATGT----CA-AAACA-TTAT-GA--T--G-TT-TATG--TA-T-GCC-TTTTACGTTA-TT-TGCTGTATG-GGACGCCT-TA-A-TTCAGatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncataaattctacgacactgaaaactttggaaattgcaacgcatacgtcaagcatggcgatgttggagattttacgtatttaattgaatataatgatatagcgaaaaagtgatggaaaatcttctgacgcaaagagagaacccatttccgtatacaataatttccttgccatactgtcaaaaattgaaaagttgccgcgttgtatgacaatatttaaactattttcttttatacgagaaagttttcccaaacactttcatgtaatgtaaaggttaacttttcttcttaacatatcaaaaggacggcctgtattagtccatatcgttgcaattttgcaattaatacaaaatttttgttagttcaaattacaaatccaacgtgataagcagtgataataaatagagtcttgttgaaaatgtaaggaatctactacgtatcgaaagaacgtcgatcaacctcggattattgtttctttgaatagtcacatgtcaaaacattatgatgtttatgtatgccttttacgttatttgctgtatgggacgccttaattcag
gi|7 : cagttgcatcgcggggaaagtcataatatttatttattaacttcgttgtagtgcacgcagtgaacattatgttgtacatgaacaattgcgtcctataatatggcttcttccttttgatatccaaaccactctcatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnG-A-C-AG-TATG--TACA-CAT-GAAACATTTTC-TTG-TCCTA-T---AA-TTA--T-GC--A-TTAT---TTC-CTTTT--T-AT----A-----C-----CAAAATTACTCTCCAT
gi|7 : A-CGA---CC-A-GC-----TCATG--A------A---A---C-TG----AA-T-TTA-CAAC-A--ATA-C-GC--AAT--G----C---A-TGA--CG-AT--GT--T-GGA--AGATTATA--TA-C-TTATT-----TA-C-GTA---TT--AAA--TT--G-ATAAAGC------AA---AAAA-G--TGA-TGAGA-AA--AA--CT-TC-T--AACGCAA--A---GGGAAACC-CT-TTCTTG--TAT--A-C-A----GTAA----TG-TA--T---T----G-C-A-TA--C-TG--TC-G--AAAA--TTG-AAA-A-------GT-ATG--CC-GC-GTTGT---A-TG--CA--T-TTTAAA--GCA-TTTT-CTTT-TA-TAC-G--GA--A-----A--A--GTT-TT-T-------------CC-C--AA-CA---CTTT--T-C-ATG-TAATG-TA-AA-A--TAG--A-TT---T--T---A-TTTCTAA--A-T--AT-C-AAAAG-G-G-T-C-GGTCTG-TCT-TTA-G-TCG--A--TATCG-T-TGG--CA--A--T---T-TGCGA--TT-AAT-CA------A-T--CA---T-TAT-T-----TG--T-TA--A--TTCTAAGCAGA-G--TTAAGA--C-A-AA---AT-CG-A--C-G--TAA-A--TGTGAATAAG-T--C-A-T-G-TGA-T-A-CT-AAA-C--ATATTCAGTAC-TTG-TGA-A-------A--ATTTTGTA-CGGA-GTTC--A-----T---T----AC-T-TACTC--GTAT-AA--GATATTGAAA-CGTGCG-T--TC-C-AC-TCTC---GG--T-A--TAAA-T-TTTAGCA----TTTGA--AATAG-AC-AGCATGT---AC--AATCACTTAT-GAT-T--GTTT-TATG--TA-T-GCT-TTATATTTTA-TT-T-CTGTATG-GGACGCCT-TA-A-TTCAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacgaccagctcatgaaactgaatttacaacaatacgcaatgcatgacgatgttggaagattatatacttatttacgtattaaattgataaagcaaaaaagtgatgagaaaaacttctaacgcaaagggaaaccctttcttgtatacagtaatgtattgcatactgtcgaaaattgaaaagtatgccgcgttgtatgcattttaaagcattttcttttatacggaaaagtttttcccaacacttttcatgtaatgtaaaatagattttatttctaaatatcaaaagggtcggtctgtctttagtcgatatcgttggcaatttgcgattaatcaatcattatttgttaattctaagcagagttaagacaaaatcgacgtaaatgtgaataagtcatgtgatactaaacatattcagtacttgtgaaaattttgtacggagttcattacttactcgtataagatattgaaacgtgcgttccactctcggtataaattttagcatttgaaatagacagcatgtacaatcacttatgattgttttatgtatgctttatattttatttctgtatgggacgccttaattca
gi|8 : gacagtatgtacacatgaaacattttcttgtcctataattatgcattatttcctttttataccaaaattactctccatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCAGT-GCA--TCACCG-CCGGG-AAA--GTC-AT-AATA--TTT-T-A--T--GTTA---TT-GCTA--G-C-G-TT--ATC---CAA------G-A-C-AT-TAT---TATA-CAT-GAACCAATATC---G-TCCTATT---AA-TTA--C-----A-TTCT---TTC-C--TT--T-AT----A-----C-----CTAAT--ACTCTC
gi|8 : ATAA----TCT---TA-CGA---C--A-CC-----T---G--ACAGA--A---A---C-TGTA-CAA---TTC-AAAC----ATA-C-GC--AAT--G----C---A-TGC--AG---------T-GGA--GAATCATA--TA----TATC-----TA-----A---TT-----------G-ATAAAGC------AA---AAA--G--TG--TGG---AA--AA--TC-TC-T--GACGCAA-GA---GAGAAACC-CT-GTCC----TAA--A-CTA----ATAT----T--TC--T---T----G-C-A-TA--C-TG--CC-G--AAAA--TTG-AAA-A-------GT-ATG--CC-GC-GTTA-------G--CA--T-TTGCAA--ACA-ATTT-CT--------------G--A-----ATCG--GAT-TT-C-------------CC-C--AA-CA---C-TT--T-CAATG-TAA-G-TA-AA-A-TTGT--TTTT---T--T---T-CTCC--A--A-T--AT-C-AAAAG-G-A-T-C-GGCCTG-TATGTTA----TG--A--TCT-G-T-T-G--CA--A--T---T-TGCAA--T-------A------A-T--T----T-T-T-T-----TG--C-TA--A--TTCTAA----A-A--T---------A-AA---AT-C--A--C-G--T-G-A----------AG-T--C-A-C-G-TGA-T-A-AT-AAA-C--A---ACAG--C-CTGTTGA-AATTAAGGA--A---TCTA-AGGA-ATCC--------TC--T----AC-G-TA-GC--G-AT-AT--G-------AA-CCT-CG-A--GT-C-AA--CTC---GGA-T-A-------T-TTT--C-----TT-----GATAGTA--A-TATGT---ACA-AAACAC-TAA-GA-----G--T-TA-G--TA-T---C-TTGTACGTCA-TT-T-CGTTATG-GTA-ACC--TA-A-TTCaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntataatcttacgacacctgacagaaactgtacaattcaaacatacgcaatgcatgcagtggagaatcatatatatctaattgataaagcaaaaagtgtggaaaatctctgacgcaagagagaaaccctgtcctaaactaatatttcttgcatactgccgaaaattgaaaagtatgccgcgttagcatttgcaaacaatttctgaatcggatttccccaacactttcaatgtaagtaaaattgttttttttctccaatatcaaaaggatcggcctgtatgttatgatctgttgcaatttgcaataatttttttgctaattctaaaataaaatcacgtgaagtcacgtgataataaacaacagcctgttgaaattaaggaatctaaggaatcctctacgtagcgatatgaacctcgagtcaactcggatattttcttgatagtaatatgtacaaaacactaagagttagtatcttgtacgtcatttcgttatggtaacctaattc
gi|9 : cagtgcatcaccgccgggaaagtcataatattttatgttattgctagcgttatccaagacattattatacatgaaccaatatcgtcctattaattacattctttcctttatacctaatactctcaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnt---G-CCGGG-AAA--GTC-AT-AATA--TTT-T-A--T--GTTA---TT-GCTA--G-C-G-TT--ATC---CAA------G-A-C-AT-TAT---TATA-CAT-GAACCAATATC---G-TCCTATT---AA-TTA--C-----A-TTCT---TTC-C--TT--T-AT----A-----C-----CTAAT--ACTCTC
gi|9 : ATAA----TCT---TA-CGA---C--A-CC-----T---G--ACAGA--A---A---C-TGTA-CAA---TTC-AAAC----ATA-C-GC--AAT--G----C---A-TGC--AG---------T-GGA--GAATCATA--TA----TATC-----TA-----A---TT-----------G-ATAAAGC------AA---AAA--G--TG--TGG---AA--AA--TC-TC-T--GACGCAA-GA---GAGAAACC-CT-GTCC----TAA--A-CTA----ATAT----T--TC--T---T----G-C-A-TA--C-TG--CC-G--AAAA--TTG-AAA-A-------GT-ATG--CC-GC-GTTA-------G--CA--T-TTGCAA--ACA-ATTT-CT--------------G--A-----ATCG--GAT-TT-C-------------CC-C--AA-CA---C-TT--T-CAATG-TAA-G-TA-AA-A-TTGT--TTTT---T--T---T-CTCC--A--A-T--AT-C-AAAAG-G-A-T-C-GGCCTG-TATGTTA----TG--A--TCT-G-T-T-G--CA--A--T---T-TGCAA--T-------A------A-T--T----T-T-T-T-----TG--C-TA--A--TTCTAA----A-A--T---------A-AA---AT-C--A--C-G--T-G-A----------AG-T--C-A-C-G-TGA-T-A-AT-AAA-C--A---ACAG--C-CTGTTGA-AATTAAGGA--A---TCTA-AGGA-ATCC--------TC--T----AC-G-TA-GC--G-AT-AT--G-------AA-CCT-CG-A--GT-C-AA--CTC---GGA-T-A-------T-TTT--C-----TT-----GATAGTA--A-TATGT---ACA-AAACAC-TAA-GA-----G--T-TA-G--TA-T---C-TTGTACGTCA-TT-T-CGTTATG-GTA-ACC--TA-A-TTCaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntataatcttacgacacctgacagaaactgtacaattcaaacatacgcaatgcatgcagtggagaatcatatatatctaattgataaagcaaaaagtgtggaaaatctctgacgcaagagagaaaccctgtcctaaactaatatttcttgcatactgccgaaaattgaaaagtatgccgcgttagcatttgcaaacaatttctgaatcggatttccccaacactttcaatgtaagtaaaattgttttttttctccaatatcaaaaggatcggcctgtatgttatgatctgttgcaatttgcaataatttttttgctaattctaaaataaaatcacgtgaagtcacgtgataataaacaacagcctgttgaaattaaggaatctaaggaatcctctacgtagcgatatgaacctcgagtcaactcggatattttcttgatagtaatatgtacaaaacactaagagttagtatcttgtacgtcatttcgttatggtaacctaattc
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|22 ): TATGTAAACATTAAAACATTTTCTTGTCCTATCAAATCACTCTCCATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCATG
Unaligned ( gi|39 ): AGTAGTATCATGGGGAAAATTTATTTGTTGAAATTATTACCATTATCAAGTG
Unaligned ( gi|43 ): ATTTTTCCAAGCCAAAAAAGGTCAGCCTTCTATAC
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 11 1111 33333 11 222222222222222 44444444444444444444444 1 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 222 111111 11 111 333333333 11111111 11111111111 11 11 2222 22222222222222222222 111111 11 11111111111 1111111111111 222222222222222222222222 11 1111111 11 11111111111111 1111111111 1111111 33333333333333333333 1111111111111 1111111 111111 1111
lowQualScore : 33 777 2 2 2 2 4 2 55 2 2 00 2 333 2 33 999999 55 0000 00000 7 4 2 4 55 2 4 2 9 33 2 4 666 444444444444444 2 666 7777 55 2 44444444444444444444444 3 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 000 444 2 666 33 2 55555 333 55 777777 555 99999 44 222 2 8888 2 2 22 555555555 333 2 888 2 22 22 4 22 3 22 555 55555 666 555 22 33333333 4 0 11111111111 55 2 1 2 22 22 2 2 44 1 77 333 1 2 2 7777 77 2 4 7777 22222222222222222222 5555 2 2 5 33 2 33 5555 33 2 2 8888888 22 33 2 2 555555 99 00 5 66 2 2 2 2 8 33 33 44444444444 2 2 7777777777777 2 33 2 77777 33 2 8 55 1 2 33 2 5 555555555555555555555555 33 2 33 2 2 44 777 2 2 0 5 888 66 33 333 2 2 55 33 33 444 2 66 2 777777 2 1111111 2 2 2 66666 00 2 33 55 5555 22222222222222 2 6666 2 55 33 2 33 2 2 0000000000 2 66 2 2 2 2 2 2 4 2 2 33 5555 0 44 2 3 2 6666666 33 444 1 77 2 00000000000000000000 3 3 44 3 2222222222222 5 2 2 33 2 2 33 555 2 2 6666666 2 33 444444 1 777 0000 777 2 1 2 66 33 2 4 66 6 4 22 2 2 2 4 0 2 2 2
lowQualScore : .. ... . . . . . . .. . . .. . ... . .. ...... .. .... ..... . . . . .. . . . . .. . . ... ............... . ... .... .. . ....................... . ........................................................................................................................ ... ... . ... .. . ..... ... .. ...... ... ..... .. ... . .... . . .. ......... ... . ... . .. .. . .. . .. ... ..... ... ... .. ........ . . ........... .. . . . .. .. . . .. . .. ... . . . .... .. . . .... .................... .... . . . .. . .. .... .. . . ....... .. .. . . ...... .. .. . .. . . . . . .. .. ........... . . ............. . .. . ..... .. . . .. . . .. . . ........................ .. . .. . . .. ... . . . . ... .. .. ... . . .. .. .. ... . .. . ...... . ....... . . . ..... .. . .. .. .... .............. . .... . .. .. . .. . . .......... . .. . . . . . . . . . .. .... . .. . . . ....... .. ... . .. . .................... . . .. . ............. . . . .. . . .. ... . . ....... . .. ...... . ... .... ... . . . .. .. . . .. . . .. . . . . . . . .
lowQualScore : 99 333 7 5 4 4 7 1 66 4 4 33 4 888 4 44 999999 99 3333 88888 1 7 4 7 66 4 4 2 7 22 2 4 999 888888888888888 2 111 1111 33 2 44444444444444444444444 3 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 666 444 2 111 55 1 33333 777 00 333333 888 22222 66 000 0 8888 1 1 99 111111111 555 0 555 0 88 88 0 66 1 88 444 00000 888 555 88 11111111 4 4 55555555555 55 0 2 0 88 88 0 0 88 9 55 555 1 0 0 8888 99 4 7 4444 55555555555555555555 3333 5 5 0 44 5 44 4444 44 5 5 1111111 77 44 5 5 555555 00 00 3 33 7 7 7 7 0 77 77 55555555555 7 7 3333333333333 7 77 7 11111 77 7 6 88 6 9 99 9 3 111111111111111111111111 77 7 77 7 7 88 111 7 7 9 3 000 33 77 666 5 5 99 44 44 444 5 55 4 222222 5 2222222 5 5 5 22222 99 5 44 99 0000 33333333333333 4 1111 2 33 11 2 11 2 2 8888888888 2 11 2 2 2 2 2 2 4 2 4 22 1111 6 99 5 4 5 2222222 44 444 4 00 7 66666666666666666666 1 1 22 1 7777777777777 7 9 9 99 9 9 00 000 9 9 9999999 7 77 888888 1 333 1111 333 5 0 4 11 22 5 7 11 7 4 77 2 2 2 7 7 5 5 5
consensus : NACAGTTGCA--TC---G-CGGGG-AAAATGTC-AT-AATA--TTT-T-A--T-CGTTA--TTT-ACTA--A-C-G-TT--AT----CAAG---GTG-A-C-AT-TATG--TATA-CGT-GAAACANTTTCCTTG-TCCTA-T---AA----TTA--CG-T--A-TTCT---TTC-C-TTT--T-AT----A-----C-----C------ACTCTCCATTACCAG-ATCACTCTCAGCAGCTGCCCACTCTCCATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCATAAA--TTCT---TA-CGA---CC-A-GC-----T---G--A---G--A---A---C-TGTG-TAA-A-TTG-CAAC-G--ATA-C-GC--A----G----C---A-TGN--CG-AT--GT--T-GGA--AGATTATA--TA-C-TTATT-----TA-C-GTA---TT--AAA--T---G-ATANAGC------AG---AAA--GTGA-TGGGA-AA--AA--CT-TC-T--GACGCAA-GA---GAGAAACC-CT-TTCCCG-GTAT--A-C-A----ATA----A----T--T---T---T----G-C-A-TA--C-TG--TC-G--AAAA--TTG-AAA-A-------GT-ATG--CC-GC-GTTGT---A-TG--CA--T-TTTAAA--CCA-TTTT-CTTT-TA-TAC-G--AG--A-----A--G--GTT-TT-T-------------CC-C--AA-CA---C-TT--T-C-ATG-TAATG-T--A-AA-GTTAA--ACTT---T--T---T-CTCCTTA--A-T--AT-C-AAAAG-GG-T-C-GGCCTG-TAT-TTA-G-TCG--A--TATCG-T-T-G--CA--A--T---T-TGCAA--TT-AATACA------A-T--CA---T-T-T-T-----TG--T-TA--A--TTCTAA----A-A--TT---A--C-A-AT---AT-C--A--C-G--T-G-A--T-------AG-T--C-A-C-G-TGA-T-A-AT-AAA-C--A---NCAGT-C-TTGNTGA-A-------A--A---TGTA-CGGA-ATCC--T-----TC--T----AC-G-TA-TC--G-AT-AA--G-------AA-CGT-CG-A--TT-C-AC-TCTC---GGA-T-A--T----T-TTT--C-----TTTG---AATAGTAC-A-CATGT---ACA-AAACACTTAT-GAT-T--GTTT-TATG--TA-T-GCT-TTTTACGTTA-TT-T-CTGTATG-GGACGCCT-TA-A-TTCAGT
Reference ( family-948 ) : NACAGTTGCA--TC---G-CGGGG-AAAATGTC-AT-AATA--TTT-T-A--T-CGTTA--TTT-ACTA--A-C-G-TT--AT----CAAG---GTG-A-C-AT-TATG--TATA-CGT-GAAACANTTTCCTTG-TCCTA-T---AA----TTA--CG-T--A-TTCT---TTC-C-TTT--T-AT----A-----C-----C------ACTCTCCATTACCAG-ATCACTCTCAGCAGCTGCCCACTCTCCATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCATAAA--TTCT---TA-CGA---CC-A-GC-----T---G--A---G--A---A---C-TGTG-TAA-A-TTG-CAAC-G--ATA-C-GC--A----G----C---A-TGN--CG-AT--GT--T-GGA--AGATTATA--TA-C-TTATT-----TA-C-GTA---TT--AAA--T---G-ATANAGC------AG---AAA--GTGA-TGGGA-AA--AA--CT-TC-T--GACGCAA-GA---GAGAAACC-CT-TTCCCG-GTAT--A-C-A----ATA----A----T--T---T---T----G-C-A-TA--C-TG--TC-G--AAAA--TTG-AAA-A-------GT-ATG--CC-GC-GTTGT---A-TG--CA--T-TTTAAA--CCA-TTTT-CTTT-TA-TAC-G--AG--A-----A--G--GTT-TT-T-------------CC-C--AA-CA---C-TT--T-C-ATG-TAATG-T--A-AA-GTTAA--ACTT---T--T---T-CTCCTTA--A-T--AT-C-AAAAG-GG-T-C-GGCCTG-TAT-TTA-G-TCG--A--TATCG-T-T-G--CA--A--T---T-TGCAA--TT-AATACA------A-T--CA---T-T-T-T-----TG--T-TA--A--TTCTAA----A-A--TT---A--C-A-AT---AT-C--A--C-G--T-G-A--T-------AG-T--C-A-C-G-TGA-T-A-AT-AAA-C--A---NCAGT-C-TTGNTGA-A-------A--A---TGTA-CGGA-ATCC--T-----TC--T----AC-G-TA-TC--G-AT-AA--G-------AA-CGT-CG-A--TT-C-AC-TCTC---GGA-T-A--T----T-TTT--C-----TTTG---AATAGTAC-A-CATGT---ACA-AAACACTTAT-GAT-T--GTTT-TATG--TA-T-GCT-TTTTACGTTA-TT-T-CTGTATG-GGACGCCT-TA-A-TTCAGT
gi|1 : ACAGTTGCAGATCA--G-CGGGGGAAAATGTC-AT-AATAG-TTT-T-A--T-CGTTA--TTA-ACTG--A-CTGCTT--AT----CAAGC--GTGCA-C-AT-TCTG--TATA-CAT-GAAACACTTTCTTTGCTCCTA-T---AA----TAAG-CA-C--A-TTCT---TTC-C-TTT--T-AT----T-----C-----C------GCCCTCCCTTACCCGCATCACTCTCAGCAGCTGCCCACTCTCCATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCATAAA--TTCTATACA-CGA---CC-A-GC-----T---G--A---G--A---A---C-TTTG-CAA-A-TTGGCAAC-GCGATA-CCGC--A----G----C---A-TGCGCCGCAT--GT--T-GGA--CGATTGTA--TA-CCTTATT-----TA-C-GT----TT--AAA--T---G-ATATAGC------AG---AAA--GTGA-TGGGA-AG--AAATCT-TC-T--GACGCAATGA---GAAAAACCACTGTTCCCGAGTATG-A-C-A----ATA----A----T--T---T---T----G-T-A-TA----TG--GC-A--AAAC--TTG-AAA-A-------GT--T---CC-GC-GTTGT---ACTG--CA--C-ATTAAAG-CTA-TTTT-CTTT-TA-TAC-G--AG--A-----A--G--GTTGTT-T-------------CC-C--AA-C----T-TT--T-C-ATGCTAATG-TTTA-AA--TTAA--ACTT---T--T---T-CTCCTTA--A-T--ATGC-AAAAA-AA-T-C-GGCCTG-TAT-TTA-G-TCC--A--TATCG-T-T-G--CA--A--T---T-TACAA--TT-GATACA------A-T--AA---T-T-T-T-----TA--T-TC--A--TTCTAA----A-A--TT---A--C-A-AC---AT-C--A--C-G--T-G-A--T-------AG-T--C-A-C-G-TGA-T-A-AT-AAA-C--A---GCAGT-C-TTGTTGA-A-------A--A---TGTA-AGGA-ATCC--T-----TC--T----AC-G-TA-TC--G-AT-AA--G-------AA-CGT-CG-A--TT-C-AC-TCTC---GGA-T-A--T----T-TCT--C-----TTTG---AATAGTAC-A-CATGT---ACA-AAACACTTAT-GAT-T--GTTT-TATG--TA-T-GCT-TTTTACGTTA-TT-T-CTGTATG-GGACGCCT-TA-A-TTCAGT
gi|10 : gTT-ACTA--A---G-TTTAAT----CAA----GTG-A-C-ATGGATG--TATA--AT--AAACAATTT-ATTG-TCCT--TCTAAA----TTA--TG-T--A-TTCCTTGTTT-G-TTT--T-A-----A-----C-----CAAATCAACTCTCCA
gi|10 : C-A-GC-----T---A--A---G--A---A---AATGTGGTAA-AATTG-CAACCG--ATA-T-AC--AACGTG----C---A-TGA--CG-AT--GCGCT-GGA--GTATTATA--TA-T-TTATT-----GA---ATA---TT--AA-------G-AT---------------------GTGAGCGGGA-GA--AC--CT-TC-T--GAAGTTA-AATCGGAACAATC-CT-TCCC---GTAT--A-C-A----ATA----T----T--C---T---T----G-C-A-TA--C-TG--TCCG--AAAAATTTG-AAA-G-------CT-ATG--CC-GC-GTTGT---T-TG--CA--T-TTTAAA--CC--CTTT-CTTT-TA-TAC-G--AG--A-----A--G----T-TT-T-------------CC-C--AA--A---C-TT--T-CGATT-TATTG-T--A-AA-GTT-A--ACTT---T--A---T-TTCATTA--ATT--AT-C-ATAA--GG-T-T-GGCTTG-TAT-TTAGG-TCGT-A--CCTCG-T-T-G--CA--AT-T---T-TGCAA--TT-AATACA------A-TA-CA---T-T-T-T-----TG--TGTAACA--TTCTAA----A-G---T---A--TGG-AT---AT-C--A--C-G--T-G----T-------AGTT--C-ATC-GTTGA-T-ACAT-Aatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgttaattttcccccacgaaacagctaagaaaatgtggtaaaattgcaaccgatatacaacgtgcatgacgatgcgctggagtattatatatttattgaatattaagatgtgagcgggagaaccttctgaagttaaatcggaacaatccttcccgtatacaatattcttgcatactgtccgaaaaatttgaaagctatgccgcgttgtttgcattttaaaccctttcttttatacgagaagttttcccaaactttcgatttattgtaaagttaactttatttcattaattatcataaggttggcttgtatttaggtcgtacctcgttgcaattttgcaattaatacaatacatttttgtgtaacattctaaagtatggatatcacgtgtagttcatcgttgatacatatagttacaa
gi|11 : ttactaagtttaatcaagtgacatggatgtataataaacaatttattgtccttctaaattatgtattccttgtttgttttaaccaaatcaactctccaatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgttaattttcccccacgaaaGTTGCA--TC---G-CGGGG-AAAATGTT-ATGGATA--TTTGT-A--T-CGT----TTT-ACTA--A---G--T--AT----CAA----GTG-A-C-AT-TATG--TATAGCAT-GAAA-A--TTCCTTT-TCATA-T---TA----TCA--T--T--A-TT-T---CTT-C-TTT--T-AT----A-----CAAAT-C------ACTCTCCATTtagttacaa
gi|11 : atTACA--TACT---TA-TAAGAGCC-A-GC-----T---G--A---G--A---AA--C-TGC--TGA-A-TTG-CAAC-G--ATA-C-TC--AT---G----C---A-TGTGTCG--T--GT--TTGGA--AGATT-TA--TA-C-TTATT-----TA-C-GT----TT--AAATTT---G-A-ATAAC------AG---AAA--GTAA-TGGCACAA--AA--CG-TA-T--GAC-CAA-GG---GA-AGACC-TT-CTCCC--GTATTAA-C-AG---ATA----A----T--TTGCT---T----G-C-A-T---C-TG--TC-AGCATAT--TTA-AAA-A-------GT-ATG--CC-GC-GTTTTTTAA-TG--CA--T-TTTAAA--CTATTTTT-CTTT-TA-TAC-G--GG--AAAAATA--A--GTT-TT-TTGTTTTCTTTTTCCC-C--AA-AAAACC-TT--T-C-ATGATAGTG-T--A-AA-GTTAA----TT---TCAT---T-CGTCTTA----------T-AAAAG-GA---C-GG-CTG-T-T-TTA-G-TCG-----TAT---T-T-G--C---A--T---T-TGCAA--TT-AAtctttgttagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttacatacttataagagccagctgagaaactgctgaattgcaacgatactcatgcatgtgtcgtgtttggaagatttatacttatttacgtttaaatttgaataacagaaagtaatggcacaaaacgtatgaccaagggaagaccttctcccgtattaacagataatttgcttgcatctgtcagcatatttaaaaagtatgccgcgttttttaatgcattttaaactatttttcttttatacgggaaaaataagttttttgttttctttttccccaaaaaacctttcatgatagtgtaaagttaatttcattcgtcttataaaaggacggctgttttagtcgtatttgcatttgcaattaaat
gi|12 : atgttgcatcgcggggaaaatgttatggatatttgtatcgttttactaagtatcaagtgacattatgtatagcatgaaaattccttttcatattatcattatttcttcttttatacaaatcactctccatttctttgttagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntGT-GAACCATTTTC-TTG-TCCTA-----AG----TTATTTG-C--A-TTTT---TTCTT-TTT--T-AT----A-----CAAAAGC------ACTCTCCATat
gi|12 : CATAA---TTCT---TA-CGA---CC-A-GC-----C---G--A---A--A---A---A-AATG-TAA-AATTG-CAAC-G--ATA-T-AC--A----GTG--C---A-TGA--CG-AT--GT--T-GGA--AGTTTATA--TA-C-T-AGT-----TA-C-GTA---TT--AAA--T---TCATATATC------AG---AAAA-GTGA--GGGA-AA--AA--AT-TA-T--GACACAA-AC---G-GAAACC-CT-TTCCCG--TAT--A-C-A----ATA----A----T--T---TCT-T----G-C-A-TA--C-TG--TC-G--AAAA--TTG-AAA-A-------GT-ATG--CC-GC-GTTAG---A-TG--CA--T-ATTAAA--CCA-TTTT-CTTT-T--TAC-A--CG--G-----A--G--AGT-TT-T-------------CC-CTAAA-CA-----TT--T-C-A---------T--A-----TTAA--TCTT--------------------------------AAAG-GA------ACTTA-TAT-TTC---TCA--A--TATC----------A--A-----------AAGGCT-CATACA------A-T--CA---T-T-T-T-----TG--T-TA--A--TTCTAA----A-A--AT---A--C-A-AT---AC-C--A--C-G--T-G-A--T-------AG-T--C-A-C-G-TGA-T-A-AC-AAA-C--A---nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncataattcttacgaccagccgaaaaaaatgtaaaattgcaacgatatacagtgcatgacgatgttggaagtttatatactagttacgtattaaattcatatatcagaaaagtgagggaaaaaattatgacacaaacggaaaccctttcccgtatacaataatttcttgcatactgtcgaaaattgaaaagtatgccgcgttagatgcatattaaaccattttctttttacacggagagttttccctaaacatttcatattaatcttaaaggaacttatatttctcaatatcaaaaggctcatacaatcatttttgttaattctaaaaatacaataccacgtgatagtcacgtgataacaaacaa
gi|13 : gtgaaccattttcttgtcctaagttatttgcattttttcttttttatacaaaagcactctccatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCAGTTGCA--TT---G-CGGGG-AAAACGTTTATGAATA--TTT-T-AAAT-CATTA--CTT-ACTA--A-C-G-TT--AT----CAAG----TG-A-C-AT-GATG--TATA-AGT--AAACAATTTA-TTG-TCCTA-T---AAAA--TTA--TG-T--A-TTCT---TTCGT-TTT--T-AT----A-----CCAAATC------ACTCTCCAa
gi|13 : ----G----C---A-TGA--CG-AT--GC--T-GGA--AGTTTATA--TA-T-TTATT-----GA-C-ATA---TT--AAA--T---G-------------------------TGA-GGGGA-GA--AA--CT-TC-T--GACACAA-TG---GA-AAATC-CT-TTCCC--GTAT--A-C-A----ATA----A----A--T---T---atttctatgtattgaattatgaaattgataatcatattaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacagtgcatgacgatgctggaagtttatatatttattgacatattaaatgtgaggggagaaacttctgacacaatggaaaatcctttcccgtatacaataaattct
gi|14 : cagttgcattgcggggaaaacgtttatgaatattttaaatcattacttactaacgttatcaagtgacatgatgtataagtaaacaatttattgtcctataaaattatgtattctttcgtttttataccaaatcactctccaatttctatgtattgaattatgaaattgataatcatattaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacagtCT---TG-CGA---CC-A-AT-----T---TC-A---G--A---A-----TGTG-TAA-AATTG-CAAC-G--ATA-T-AT--A----GTG--C---A-TGG--TG-GT--AT--T-CAA--AGTCTACA--TA-T-TTATA-----TG-C-CTG---TT--ACA--TT--G-ATATATC------GGGGGAAA--A--A-CTGGA-AAGCAA--CG-TC-T--GACACAA-AA----AGAA--------TCC------T--A-C-ATCTGATA----A----T--T---TCT-T----C-C-A-TA--T-TC--TT-A--AAAA--TTG-AAA-AGTACACCGT-ATG--CA-GC-CTTGA---C-CG--CA--T-TTTAAA--TTA-CCTTGCTTT-TA-TCG-G--AG--A-----A-----ATC-GC-T-------------CT-A--AG-CG---CTTT--T-C-AGT-TAATG-T--A-AA-GTAAAT-ATTG---T--T---T-TTC--TA--A-T--AT-A-AAAA---G-C-C-GGTCTT-TAT-TTT-G-TTC--A--AATCC-A-T-G--TA--AT-T---T-TGAGA--TT-ACTGTA------A-T--GATTTT-T-T-T-----TT--T-TG--G--TTCTAA----ATT--TT---A--T-A-AT---------------------------------G-T--C-A-C-A-TGA-T-G-AT-AAA----A---CTTGC-T-TTGATGG-A-------A--A---TGTA-TGGA-Act
gi|15 : A-GTTAA---CTA---TA-T---T-GTCCTCA--A-T--AT-CTAAAAG-GG-TGC-GGCCAG-TAT-T-A-G-TTG--A--TGTCG-T-T-GG-CA--A--T---T-T-TA----T-AATACA--------T--CA---T-T-T-T-----TGGTT-TA--AA-TTCTAA----A-A--TT---AGGC-A-AC---AT-C--A--T----T-G-A--T-------AG-TGTC-A-C-A-TGA-TTA-ATGAAA-C--A---ACAAT-C-TTCATGA-A-------A--A---TGT--TGGA----------------------------A-TC--G-CT-AA--C-------TA-TGT-CT-A--TT-C-AC-TCTC---GGG-T-A--T----T-TTT--C------TTG---AATAGTA--A-CATGC---A----------TGT-GAC-T--G-TT-TATG--TA-TGGCA-TTTTACGTTC-TT-T-CTGTAT--GGACGCCT-TA-A-TTCAGgc
gi|16 : atTCT---AA-CAA---CC-A-GA-----T---G--A---AGAA---A---C-TGTA--AA-A-TTG-CAAC-G--ATA-C-TC--A----AAA--C---A-TGA--CG-AT--AT--T-GGA--AGTTTATA--TA-C-TTATT-----TA-C-GTA---TT--AAA--TT--G-ATAAAGC------AG---AAAA-GTAA-TGGGA-AA--AA--CT-TC-T--GACACAA--A---GGAAAACC-TT-TTCCC--GTAT--A-C-A----GTT----A----T--TTC-T---T----G-C-A-TA--C-TG--TC-G--AAAA--TTG-AAA-A-------CT-ATG--CA-GC-TTTGG---A-TG--CA--T-TTTAAA--CCA-TTTT-CCTT-TA-TACAG--AG--A-----A-----GTT-TT-T-------------CC-C--AA-CA---C-Tct
gi|17 : A-CGA---CC-A-GA-----T---G--A---G--A---AA--C-TG-G-TAA-AATTG-CAGC-G--ATA-C-TC--A----AAAA-C---A-TGAA-CG-AT--AT--T-GGA--AG-TTATA--TA-T-CTTTT-----TAGC-ATAC--TT--AAT--T---G-ATAAAGA------GA---AAA--GTAA-TGG---AA--AA--CT-TC-T--GAC-CAA--A---GGGAA--C-TT-TTCGCC-GTATT-A-C-A----GTA----A----T--T---T---CTTGGG-C---TA--C-TG--TC-G--AAAA--T-G-AAA-A--------T--TG--CC-GC--TTGTGG-A-TG--CA--T-TTTAAA--CCA-TTTT-C-TT-TA-TACGG--AGACA-----A--T--GTT-TT-TC------------CC-C--AA-CA---T-TT--T-
gi|18 : A----A-T--TT---A--A-A-TT---AT-C--T--T-G--T-G-A--T-------AG-T--C-A-C-G-TGA-T-A-AT-GAA-C--A---CCTGC-C-TCTATGA-A-------A--A---CGTA-TGGA-AGCA--T-----AC--C----GG-G-TA-TG--G-TT-----G-------AA-CGT-TGTT--TT-C-GT-TTTC---GGA-T-A--T----T-TCT--C-----ATTG---AATGTTTT-C-CATATAAGACAGAAACA--TAT---------TTT-TATGGATA-TAGTTGTTTTGCTTTA--T-T-CTGTATA-GGATGC---TATA-TTCAAT
gi|19 : atattgttgtaaatattgcggttttttaaccgatgttc-T-T-C--CA--A--T---A-TG--A--TC-ATTACA------A-T--CA---TAT-T-TGCCGGTG--T-TG--A--TTTT-------------------T-A-AT---GT-C--A--C-A--T-T-A--T-------AG-T--C-A-T-T-TAA-T-G-AT-AAA-C--A---CGTGC-C-CCCATGA-A-------A--A---TGTA-CGGG-AGCC--T-----AT--T-----C-GATA-TT--G-GC-AT--G-------AA-TGT-TG-A--TT-C-TT-TCTC---AGA-T-A--T----T-TTT--C-----ATCG---AATCATTC---CA--T---AGA-AAATACGAAC-AAT-T--GTCTGTATG--TA-T-ATG-TT-----TTA-TT-C-TTGAATG-GGGGACCT-TA-A-TTCAGTa
gi|2 : ttgcACATTTCCA--TT---G-CGGGA-AAA---TC-AT-A-TA--TTT-T-AA-T-C--TA--TTT-ACTAGAA-C-G-TTT-AT----CAA-----TG-A-C-AT-GATG--TATA-CGTTGGAACATTTTA-TTG-TCCTA-TAA-AA----TTA--TG-T--A-TTCT---TTG-G-TTTA-T-ATTCAAA-----G-----C------A-TCTCCAt
gi|2 : cttCATAA---TTCT---TA-CGA---AC-A-GC-----A---A--AT--A--A---A---A-TGTGGTA----TTG-CAAC-G--ATA-T-AC--AAGT-G----C---A-TGA--CG-ATTGGT--T-GGA--AG-TTATA--TAAC-TTATT------A-C-ATA---TA--AAT--T---C-ATATATC------AG---AAAA-GTGA-GGAGA-AA--AA--CT-TC-T--GACACAA-AG---GGGAAATC-CT-TTCTC--TTAT--A-C-A----ATA----AGAT-T--C---T---T----GTC-ATTA--T-CGTCTC-G--AAAA--TTG-AAA-A-------GT-ATG--CC-GCAGTTGT---T-TG--CATTT-TTTAAATCCTA-TTTT-CTTT-TA-TACGG--AG--AC----A--C--GTT-TTCT-------------CC-C--AACCA---C-TTTCT-C-ATA-TATTC-T--A-AA-GTTTA--ACTTAAGT--T---TACTC---A--A-TTAGT-C-AAAA--GG-T-CGGGCTTGTTAT-TTAGG-TCG--AGCTATCG-TCT-G--CA--AT-T---T-TGCAAATTC-AAGACA------A-T--CA---T-T-T-G-----TGT-T-TA--A--TTCTAA----AGA--TT---A--T-G-AT---AT-C--AACC-GCTT-G-ATGT-------AG-T--C-A-C-G-TGATT-A-AT-AAA-C--A---ACAAT-C-TTGGTGAGA-------A--A---TGTA-CGGA-ATCC--TCAG--TTGAT----ATGG-TA-TC--G-AT-GAATG-------AA-CAT-CG-A--TT-CTAC-TCTC---GGG-T-A--A----T-TTT--CA----GTTGTATAGTAGTAC-A-CATGT---ACA-AAACACTTAT-TAT-TAAATTTATATG--TACT-GCT-TTTAACGTTA-TTGT-CTGTATGAGGACGCCTATA-A-TTCAGannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncataattcttacgaacagcaaataaaatgtggtattgcaacgatatacaagtgcatgacgattggttggaagttatataacttattacatataaattcatatatcagaaaagtgaggagaaaaacttctgacacaaaggggaaatcctttctcttatacaataagattcttgtcattatcgtctcgaaaattgaaaagtatgccgcagttgtttgcattttttaaatcctattttcttttatacggagacacgttttctcccaaccactttctcatatattctaaagtttaacttaagtttactcaattagtcaaaaggtcgggcttgttatttaggtcgagctatcgtctgcaattttgcaaattcaagacaatcatttgtgtttaattctaaagattatgatatcaaccgcttgatgtagtcacgtgattaataaacaacaatcttggtgagaaatgtacggaatcctcagttgatatggtatcgatgaatgaacatcgattctactctcgggtaattttcagttgtatagtagtacacatgtacaaaacacttattattaaatttatatgtactgcttttaacgttattgtctgtatgaggacgcctataattcag
gi|20 : cttacatttccattgcgggaaaatcatatattttaatctatttactagaacgtttatcaatgacatgatgtatacgttggaacattttattgtcctataaaattatgtattctttggtttatattcaaagcatctccaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-C--A--C-G--T-G-A--T-------AG-C--C-A-C-A-TGA-T-G-AT-GAA-C--A---CCTGG-T-TGGATGA-A-------A--A---T-TATTTGA-ATCA--T-----AT--T----AT-G-TA-TCAGA-AT-AA--A-------AA---T-TG-A--TT-C-GC-TTTC---GGA-T-A--TTG--T-TTT--C-----ATCG---AATAGTAT-T-CATGT-----A-AAGCACTCATAGAT-T--GTTT-TATT--TA-T-GTG-TTTTACTGTA-TT-T-CTGTACA-GGGCGTCC-TA-A-TTC
gi|21 : T--T-T-ATG-TAAAG-T--A-AGCGTTAAT-AAAT---C--A---T-GTAC--A--A-A--AT-A-AAAGG-AG-T-C-GGTCTG-TTT-ATA-G-TCG--A--TATTG-T-T-G--CA--A--T---CATGCGA--TT-GTTACATGTTCAA-T--AA---T-T-T-T-----T---C-CG--G--TGCTAA----A-C--TT---A--T-A-AT---GT-C--A--C-G--T-G-A--T-------AA-T--A-A-C-G-CGA-T-A-AT-ACA-C--T---CCTAC-A-TTGATGA-A-------A--A---TGTA-
gi|23 : tagTTT---TG-CAG---CT-A-GT-----T---GCAA---A--A---A---C-TGTA-TAA---TTG-TCAT-G--ATA-T-AC--A----G----T---G-TAC--CG-GT--GG--T-GGACAAAATCATA--TT-T-CTATTCCTATTA-C-ATACTATT--AGA--T-----ATTAAG--------A---AAA--GTGT-TGGGA-GC--AA--CT-TC-T--AACACAA-AA---T-GAAACC-AC-TTCCCG-
gi|24 : gcCATAAT--TTCA---TA-CGA---CA-G-GC-----G---G--A------A---A---C-TGTG--AA-A-TTG-CAAca
gi|25 : annnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaTCT---TA-CGA---CA-A-GC-----T---G--AA--G--AG--A---C-TGTG--AA-A-TTG-CAAC-G--ATA-C-GC--AT---GAATTC---A-TGG--CG-AT--GT--T-GGA--AGGTTATA--TT-C-TTGTT-----TA-C-GTA---TT--GAAT-T---G-ATAAAAC------AGA--AAA--GTGA-TAAGA-AA--AA--CT-TC-T--GACACAA--A---GAGAAACC-CT-TTCCC
gi|26 : --T----T-TTT--C-----ATTG---AATATTAC-C-CATGT---A---AAACACTTAA-AGT-T--GTTT-TATC--TAAT-GTA-TTTTACTCTA-TT-T-CTGTATA-GAACGTTT-TA-A-TTCAAT
gi|27 : gagggctacattattgcagctagaagccttacaaggctatcggtatgaatgttagAGATGAA--TC---G-CGGGG-AAA-------T-A-TA--TTT-T-G--T-CATTA--TTT-ACAA--C-C-G-TT--AT----CAA----GTG-A------TATGCTTAAA-CG--AAAAC-GTTTACTTA-TCAAA-C---AA------A--TG-TTCATTTCT---TTC-T-TTT--TCAT----A-----T-----C------At
gi|28 : ttcttttACAGTTGCA--TC---G-CGGGG-AAA-TGTC-AT-A-TA--TTT-T-AA-T-CGTTA--TTT-ACTA--A-A-C-TT--TT----TA-----GTG-G-CGAT-TATG--GA-A-CGT-GAAACATTTATCTTG-TCCTA-T----A----TTA-----T--C-TTCT---TTC-T-GTT-----T----G-----G-----C------A--------TACCAG-ATCACTCTaataactcattattctttatatga
gi|29 : --AGATTATA--TA-T-TTATT-----TA-C-GTA---TT--AAA--T---TCATAAAGC------AA---AAAAAGTGA-TGAGA-AA--A---CT-TT-T--GACGCAA--A---GGGACACC-CT-ATCT-A-GTAT--A-C-A----GTA----A----TGTT---T---T----G-C-A-TA--C-TG--TC-A--ACAA--TTG-AAA-A-------GT-ATG--CC-GC-tc
gi|3 : GGGT-AAAAT-TC-AT-AAAAATTTT-T-AC-T-CGTTA--TTT-A-----A-C----T--AT----GAAGTAAATG-A---AT-GATG--TATA-CGC-GAAACATTTTTCTTG-TCCTA-T---AAAAACTTA--TA-T----TTCTC--TTCGC-ATG--T-AC----A-----C-----C------A
gi|3 : AA--TTCT---TATCGA---AC-A-GTCTAAAT---G--A---G--A---A---A-TGTGGTA----TTG-CAAC-G--ATAGT-AC--A----G----TGCAA-TGA--CG-AT--GT--T-GGA--AGTATATA--TA-T-TAATT-----TG-C-GTA---TT--AAA--TTCAG-A-ATATC-------G---AAAGCGTGA-GGGGA-GA--AA--CT-TCAT--GAACCAA--A---GGGACGAT-CT-TT-CCG---AT--A-C-A----ATAAATTA----C--T---T---T----G-C-A-TA--C-TG--TCAA--AAAA--TTG-AAA-A-------GT-ATT--CC-GC-GTTGT---T-TG--CATTT-TTTATA--CCA----T-CTTT-TA-TAC-G--CG--G-----A--GAAGTT-TT-T-------------CC-C--AA-CA---C-TT--T-C-AT--T-ATG-T--A-AAGGTTAC--ACTT---TA-TAAAT-CTC--TA--A-T--A--C-AAAAG-GGCT-C-GG-CTG-TTT-TTA-GTTCGGAA--TATCG-T-T-G--CAGGA--T---A-TGCAA--TT-AATAAA------A-TAACG---T-T-TAT-----GG--T-TA--A--ATCTAA----A-A--TT------C-G-AT---ATGT--A--CAG--T-G-A----------AT-C--C-A-C-G-TGA-T---AT--AA-CTGA---ACAAT-C-TTGGTGG-A-------AATA---TGTAGCGGAGATCC--TAATGGTA--TTAAAAG-G-GA-TC--G-AT-TATTG-------AAGCGC-CG-AAGTT-C-AC-TCTC---GGG-T-AACT----T-TTT--CATTAATTGA---AATACTAG-T-CATGTA--ACT-AAAAACTTAT-GAT-T--ATTT-TATT--TATT-GCT-CTTAACGTTA-TT-T-CTGTAT--GGACG-CT-TA-A-TTCAaagcactttctaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaataattcttatcgaacagtctaaatgagaaatgtggtattgcaacgatagtacagtgcaatgacgatgttggaagtatatatattaatttgcgtattaaattcagaatatcgaaagcgtgaggggagaaacttcatgaaccaaagggacgatctttccgatacaataaattactttgcatactgtcaaaaaattgaaaagtattccgcgttgtttgcattttttataccatcttttatacgcggagaagtttttcccaacactttcattatgtaaaggttacactttataaatctctaatacaaaagggctcggctgtttttagttcggaatatcgttgcaggatatgcaattaataaaataacgtttatggttaaatctaaaattcgatatgtacagtgaatccacgtgatataactgaacaatcttggtggaaatatgtagcggagatcctaatggtattaaaagggatcgattattgaagcgccgaagttcactctcgggtaactttttcattaattgaaatactagtcatgtaactaaaaacttatgattattttatttattgctcttaacgttatttctgtatggacgcttaattca
gi|30 : gggtaaaattcataaaaatttttactcgttatttaactatgaagtaaatgaatgatgtatacgcgaaacatttttcttgtcctataaaaacttatatttctcttcgcatgtacaccaaagcactttctaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaatACAGTTGCA--TC---G-C-GGG-AAAAT-TC-AT-GAT---TTT-T-A--T-CGTTA---TT-ACCA--A-C-G--T--AT----CAGA---GTG-ACC-AT-TATG--TATA-CAT-AAAACA-TTTCCTT--TTCTA-T---AA----TTAG-CA-T--A-TT---------C-CTT--T-AT----ACAAATC-----C------ACTCTCC
gi|31 : ttACAGTTGCA--GC---G-CG------AATGTC-AT-AATA--TTG---A--T-C--TA--TTT-AC----A-C-C-TT--AT----CAAA---GTG-A-C-AT-TATG--TATA-CAT-G-AATA--TTCCTTG-T-CTA-T---AA----T----CA-T--A-CACT---TTC-C-TTT--T-AT----A-----CCAAATC------ACTCTCCA
gi|32 : tt-A-TTG-CAAC-A--ATA-C-GC--AAT--G----C---A-TGG--CG-AT--GT--A-GGA--AGATTATA--TA-C-TTGTA-----TA-C-GTA---TT--AAAT-T---G-GTAAAGCAAAAAAAA---AAA--GTGA-TGAG--AA--AA--CT-TC-T--GACGCAA--A---GGGACATC-CT-TTCTCG-
gi|33 : ACAGTTGCA--TC---GGCGGG---AAATGTC-AT-AATA---TT-A-A--T-CG--A--TTT-ACTA--A-C----T--AT----CAA----GT--A-C-AT-TATG--TATA-C---AGAATA--TTCC-TG-TCC-A-T---AA----T----CA-T--A-CACT---TTC-C-TTT--T-AT----A-----CAAAT-C------ACTCTCCt
gi|34 : t-------AA-CGT-TG-A--CT-C-AC-TCTC---GGA-T-A--T----A-TTT--T-----TTT-----ATATGAC-A-CATGT---ACA-AAACACTTGT-GAC-T--ATTT-TATG--TA-T-GCT-TTTTACGTTG-TT-T-CTGTGTG-GGGCGCC
gi|35 : A--TT-AATACA------A-T--CA---A-T-T-T-----TG--T-TA--A--TTCTAA----A-C--TT---A--C-G-ATCATAC-C--A--C-A--T-G-A--T-------AG-T--C-A-C-G-TGA-T-A-AT-ACA-C--A---AACGT-C-TTAGTGA-A-------A--A---TATA-TGGA-ATCC--T-----
gi|36 : TTT---TA-CGA---CC-A-GC-----T---G--T---A--A---A---A-AGTG-CAATA-TTG-CAAC-G--ATA-T-AC--G----G----------TGT-----AT--GC--TAGGA--A
gi|37 : TTAT-GAT-T--GTTT-TATG--TA-T-GCT-TTTTACGTCA-TT-T-CTGTATG-GTAAGCCT-TA-A-TTCAGttttcagtctgtatctttatattcttattaca
gi|38 : A--TC---G-CGGGG-AAAATGTC-AT-AATA------T-A--T-CGTTA--T
gi|4 : aggttcttatat-AT-AGAA--TTT-T----T-CGTTA--TTTTACTA--AAT-T-TT--AT----CGAG----TGCA-C-ATGTATG--T----C-----AACATGTTACTTG-TCCGA-T---AA----TTAT-TGCC--A-TTTT---TCC-T-TTT--T-AT----A-----C-----C------Acaagtgatatgct
gi|4 : CATAAAATTCCT---TG-CGAA--CC-AAGC-----T---G--A---G--A---AGAAC-TGTG--AA-A-TT--CAAC----ATA-C-GC--AATG-G----C---A-TAG--CG-AT--GT--T-GGA--AGAT-ATA--TA-C-TTATT-----TAACAGTA---TTTAAAA--TT--G-ATA-AGC------AA---AAA--GTGA-TGGGA-AA--AA--CTGTC-TT-GACGCAA-GG---GA--AACC-CT-TTCCCG--TAT--ATC-A----GTA----A----TGTC---T---T----G-C-A-TATAC-TG--TC-G--GAAA--TTGGAAA-A-------GTGATG--CCCGC-GTTGT---G-TGG-CA--TCTTTAAA--CTA-TTTT-TTTCACA-TAC-GGAAA--A-----A--G--TTT-TT-T-------------CCGC--AA-CA---C-TT--TTC-ATG-TAATG-T--AGAA-GTTAATTATTA---T--T---T-CTCC-----A-T--GT-C-AAAAAAGG-T-C-GGCCTG-TCT-TTA-G-TCG--A--TATCGGT-T-GTTCA--GATT---T-TGCAA--TT-AATACG------AGT--CA---T-T-T-T-----TGG-T-TA--AACTTCTGA----A-AATTT---A--C-AGAC---AT-C--A--C-G--T-G-A--T-------AG-T--CCA-C-G-TGA-T-A-AT-AA--C--G---AGAGT-CCTTGTTGA-A-------C--A---T-TA-CGGA-ATATAAT-----TAA-T----AC-G-TA-TC--G-AT-AT--G-------AA-CGT-CG-A--TTTC-ACCTCTCCAGGAA-T-A--TAACTT-TTT--C-----TTTG---GTCAGTAC-A-CATGT---ACA-AAACACTAAT-GAT-T--GTTT-TATG--TA-T-GAA-TTTCACGTTATTT-T-CTGTATGTGGACGCCT-TA-CTTTCAGTaatcgactcttaccatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncataaaattccttgcgaaccaagctgagaagaactgtgaaattcaacatacgcaatggcatagcgatgttggaagatatatacttatttaacagtatttaaaattgataagcaaaaagtgatgggaaaaactgtcttgacgcaagggaaaccctttcccgtatatcagtaatgtcttgcatatactgtcggaaattggaaaagtgatgcccgcgttgtgtggcatctttaaactatttttttcacatacggaaaaagttttttccgcaacacttttcatgtaatgtagaagttaattattatttctccatgtcaaaaaaggtcggcctgtctttagtcgatatcggttgttcagattttgcaattaatacgagtcatttttggttaaacttctgaaaatttacagacatcacgtgatagtccacgtgataataacgagagtccttgttgaacattacggaatataattaatacgtatcgatatgaacgtcgatttcacctctccaggaatataactttttctttggtcagtacacatgtacaaaacactaatgattgttttatgtatgaatttcacgttattttctgtatgtggacgccttactttcagtt
gi|40 : atagaatttttcgttattttactaaattttatcgagtgcacatgtatgtcaacatgttacttgtccgataattattgccatttttcctttttataccaaatcgactcttaccatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnG--TA-T-GCT-TTAAACGTTA-TT-T-ATATATG-TGACGCCT-TA-A-TTCAt
gi|41 : -AAACACTTAT-GGC-T--GTTT-TATG--TA-T-GCT-TTTTACGTTA-TT-T-CTcgtt
gi|42 : A--TT---G-CGGGT-AAA-TGTC-AT-AATA--TTT-TAA--T-CGTTA--TTT-AC
gi|5 : TTGCA--TC---G-CGGGG-AAAATGTC-AT-ATGA--TTT-T-A--TTCGTTAATTCT-ACTA--A-CCG-TT--A-----CAAG----TG-AAC-AT-TATG--TATA-CAT-GAAACACTT--CTTG-TCCTA-T---AA------A--TG----A-T-CT---TTC-C-TTT--T-TT----A---------------------------TACCAA-ATCACTCTC
gi|5 : tCATAA---TTCT---TA-CGA---CCCA-GC-----T---G--A---A--AGAAA---C-TTTT-GAA-A-TTG-AAACCG--ATA-C-GC--A----T----C---AATGG--TG-AT--GT----GGA--AGATTGTA--TA-C-TATTT-----TA-CCGTA---TT--AAA--T---G-AT-TACC------AG---AAAA-GTGA-TGGGA-AA--AT--CT-TC-TTTGACG--A-AA---GAGAAACT-CT-TTCCCG--TAT--T-C-A----ATA----AATTTC--T---T---T----G-C-ACTA--CCTG--TC-A--AAAA--TTG-AAATA-------GT-ATGGGCC-GC-GTTGT---A-TGAACA--T-TT-AAA--CTA-TTTC-TTTT-TAATAG-G--AG--A-----A--G--TTT-TT-T-----------------------------TT--T-T-ATG-TAATGGT--A-AA-GTTAA--ACTT---T--C---T-CT---TA--A-T--AT-C-AAAAG-GA-T-C-GGCCGG-TAT-TTA-G-TCC--A--TATC------G--CA--A--TAAAT-GGCAA--TTAAATACA------T-T-------T-T-T-T-----TGT-T-TA--A--TTCTTA----A-A--TT---A--CAA-AC---AC-C--A----G--T-GAA--T-------AG-TCCC-A-CTG-TGA-T-ACAT-AAACC--A---GCAGT-C-GTGTTGA-A-------A--A---TATA-CAGA-ATCC--T-----TC--T----AA-G-TA-TC--G-ATAAA--G-------AACCGT-CG-A--TT-T-CT-CCTC---GGA-TCA--T----T-TTT--C-----TTTG----ATAGTACAA-CATGT---ACA-AACCACTTAT-GATAT--GTTT-TATGAATA-T-GCT-TTTTACG-TA-TT-T-CTG-ATG-GGATGCCT-TA-A-TTCAGcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntacataattcttacgacccagctgaaagaaacttttgaaattgaaaccgatacgcatcaatggtgatgtggaagattgtatactattttaccgtattaaatgattaccagaaaagtgatgggaaaatcttctttgacgaaagagaaactctttcccgtattcaataaatttctttgcactacctgtcaaaaattgaaatagtatgggccgcgttgtatgaacatttaaactatttctttttaataggagaagttttttttttatgtaatggtaaagttaaactttctcttaatatcaaaaggatcggccggtatttagtccatatcgcaataaatggcaattaaatacatttttttgtttaattcttaaattacaaacaccagtgaatagtcccactgtgatacataaaccagcagtcgtgttgaaaatatacagaatccttctaagtatcgataaagaaccgtcgatttctcctcggatcatttttctttgatagtacaacatgtacaaaccacttatgatatgttttatgaatatgctttttacgtatttctgatgggatgccttaattcag
gi|6 : tttgcatcgcggggaaaatgtcatatgattttattcgttaattctactaaccgttacaagtgaacattatgtatacatgaaacacttcttgtcctataaatgatctttccttttttataccaaatcactctccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaCAGTTGCA--TC---G-CGGGG-AAA--GTC-AT-AATA---TT-T-A--T---TTA--TTA-ACT---T-C-G-TT--GTAGTGCACGCA-GTGAA-C-AT-TATGT-TGTA-CAT-G-AACAATTGC---G-TCCTA-T---AA-----TA--TG-G--C-TTCT---TCC-T-TTTGAT-ATCCAAA-----C-----C------ACTCTC
gi|6 : CATAAA--TTCT----A-CGA---C----AC-----T---G--A---A--A---A---C-TTTG-GAA-A-TTG-CAAC-GC-ATA-C-GTCAA----G----C---A-TGG--CG-AT--GT--T-GGA---GATTTTACGTA-T-TTAAT-----TG-A-ATA---T----AA--T---G-ATATAGCG-----AA---AAA--GTGA-TGG-A-AA--AT--CT-TC-T--GACGCAAAGA---GAGAACCC-AT-TTCC---GTAT--A-C-A----ATA----A----T--T---TCCTT----G-CCA-TA--C-TG--TC-A--AAAA--TTG-AAA-A-------GT--TG--CC-GC-GTTGT---A-TGA-CAA-TATTTAAA--CTA-TTTT-CTTT-TA-TAC-G--AG--A-----A--A--GTT-TT-C-------------CC-A--AA-CA---C-TT--T-C-ATG-TAATG-T--A-AA-GGTTA--AC-T---T--T---T-CTTCTTAACA-T--AT-C-AAAAG-GA---C-GGCCTG-TA--TTA-G-TCC--A--TATCG-T-T-G--CA--AT-T---T-TGCAA--TT-AATACA------A----AA---T-T-T-T-----TG--T-TA--G--TTC--A----A-A--TT---A--C-A-A----AT-CCAA--C-G--T-G-A--T-------AA-G--C-A---G-TGA-T-A-AT-AAA-T--A---G-AGT-C-TTGTTGA-A-------A--A---TGTA-AGGA-AT-C--T-----AC--T----AC-G-TA-TC--G-A--AA--G-------AA-CGT-CG-A---T-C-AA-CCTC---GGATT-A--T----TGTTT--C-----TTTG---AATAGT-C-A-CATGT----CA-AAACA-TTAT-GA--T--G-TT-TATG--TA-T-GCC-TTTTACGTTA-TT-TGCTGTATG-GGACGCCT-TA-A-TTCAGatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncataaattctacgacactgaaaactttggaaattgcaacgcatacgtcaagcatggcgatgttggagattttacgtatttaattgaatataatgatatagcgaaaaagtgatggaaaatcttctgacgcaaagagagaacccatttccgtatacaataatttccttgccatactgtcaaaaattgaaaagttgccgcgttgtatgacaatatttaaactattttcttttatacgagaaagttttcccaaacactttcatgtaatgtaaaggttaacttttcttcttaacatatcaaaaggacggcctgtattagtccatatcgttgcaattttgcaattaatacaaaatttttgttagttcaaattacaaatccaacgtgataagcagtgataataaatagagtcttgttgaaaatgtaaggaatctactacgtatcgaaagaacgtcgatcaacctcggattattgtttctttgaatagtcacatgtcaaaacattatgatgtttatgtatgccttttacgttatttgctgtatgggacgccttaattcag
gi|7 : cagttgcatcgcggggaaagtcataatatttatttattaacttcgttgtagtgcacgcagtgaacattatgttgtacatgaacaattgcgtcctataatatggcttcttccttttgatatccaaaccactctcatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnG-A-C-AG-TATG--TACA-CAT-GAAACATTTTC-TTG-TCCTA-T---AA----TTA--TG-C--A-TTAT---TTC-CTTTT--T-AT----A-----C-----CAAAATTACTCTCCAT
gi|7 : A-CGA---CC-A-GC-----TCATG--A------A---A---C-TG----AA-T-TTA-CAAC-A--ATA-C-GC--AAT--G----C---A-TGA--CG-AT--GT--T-GGA--AGATTATA--TA-C-TTATT-----TA-C-GTA---TT--AAA--TT--G-ATAAAGC------AA---AAAA-GTGA-TGAGA-AA--AA--CT-TC-T--AACGCAA--A---GGGAAACC-CT-TTCTTG--TAT--A-C-A----GTA----A----TG-TA--T---T----G-C-A-TA--C-TG--TC-G--AAAA--TTG-AAA-A-------GT-ATG--CC-GC-GTTGT---A-TG--CA--T-TTTAAA--GCA-TTTT-CTTT-TA-TAC-G--GA--A-----A--A--GTT-TT-T-------------CC-C--AA-CA---CTTT--T-C-ATG-TAATG-T--A-AA-A-TAG--A-TT---T--T---A-TTTCTAA--A-T--AT-C-AAAAG-GG-T-C-GGTCTG-TCT-TTA-G-TCG--A--TATCG-T-TGG--CA--A--T---T-TGCGA--TT-AAT-CA------A-T--CA---T-TAT-T-----TG--T-TA--A--TTCTAAGCAGA-G--TTAAGA--C-A-AA---AT-CG-A--C-G--TAA-A--TGTGAATAAG-T--C-A-T-G-TGA-T-A-CT-AAA-C--ATATTCAGTAC-TTG-TGA-A-------A--ATTTTGTA-CGGA-GTTC--A-----T---T----AC-T-TACTC--GTAT-AA--GATATTGAAA-CGTGCG-T--TC-C-AC-TCTC---GG--T-A--TAAA-T-TTTAGCA----TTTGA--AATAG-AC-AGCATGT---AC--AATCACTTAT-GAT-T--GTTT-TATG--TA-T-GCT-TTATATTTTA-TT-T-CTGTATG-GGACGCCT-TA-A-TTCAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacgaccagctcatgaaactgaatttacaacaatacgcaatgcatgacgatgttggaagattatatacttatttacgtattaaattgataaagcaaaaaagtgatgagaaaaacttctaacgcaaagggaaaccctttcttgtatacagtaatgtattgcatactgtcgaaaattgaaaagtatgccgcgttgtatgcattttaaagcattttcttttatacggaaaagtttttcccaacacttttcatgtaatgtaaaatagattttatttctaaatatcaaaagggtcggtctgtctttagtcgatatcgttggcaatttgcgattaatcaatcattatttgttaattctaagcagagttaagacaaaatcgacgtaaatgtgaataagtcatgtgatactaaacatattcagtacttgtgaaaattttgtacggagttcattacttactcgtataagatattgaaacgtgcgttccactctcggtataaattttagcatttgaaatagacagcatgtacaatcacttatgattgttttatgtatgctttatattttatttctgtatgggacgccttaattca
gi|8 : gacagtatgtacacatgaaacattttcttgtcctataattatgcattatttcctttttataccaaaattactctccatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCAGT-GCA--TCACCG-CCGGG-AAA--GTC-AT-AATA--TTT-T-A--T--GTTA---TT-GCTA--G-C-G-TT--ATC---CAA------G-A-C-AT-TAT---TATA-CAT-GAACCAATATC---G-TCCTATT---AA----TTA--C-----A-TTCT---TTC-C--TT--T-AT----A-----C-----CTAAT--ACTCTC
gi|8 : ATAA----TCT---TA-CGA---C--A-CC-----T---G--ACAGA--A---A---C-TGTA-CAA---TTC-AAAC----ATA-C-GC--AAT--G----C---A-TGC--AG---------T-GGA--GAATCATA--TA----TATC-----TA-----A---TT-----------G-ATAAAGC------AA---AAA--GTG--TGG---AA--AA--TC-TC-T--GACGCAA-GA---GAGAAACC-CT-GTCC----TAA--A-CTA----ATA----T----T--TC--T---T----G-C-A-TA--C-TG--CC-G--AAAA--TTG-AAA-A-------GT-ATG--CC-GC-GTTA-------G--CA--T-TTGCAA--ACA-ATTT-CT--------------G--A-----ATCG--GAT-TT-C-------------CC-C--AA-CA---C-TT--T-CAATG-TAA-G-T--A-AA-ATTGT--TTTT---T--T---T-CTCC--A--A-T--AT-C-AAAAG-GA-T-C-GGCCTG-TATGTTA----TG--A--TCT-G-T-T-G--CA--A--T---T-TGCAA--T-------A------A-T--T----T-T-T-T-----TG--C-TA--A--TTCTAA----A-A--T---------A-AA---AT-C--A--C-G--T-G-A----------AG-T--C-A-C-G-TGA-T-A-AT-AAA-C--A---ACAG--C-CTGTTGA-AATTAAGGA--A---TCTA-AGGA-ATCC--------TC--T----AC-G-TA-GC--G-AT-AT--G-------AA-CCT-CG-A--GT-C-AA--CTC---GGA-T-A-------T-TTT--C-----TT-----GATAGTA--A-TATGT---ACA-AAACAC-TAA-GA-----G--T-TA-G--TA-T---C-TTGTACGTCA-TT-T-CGTTATG-GTA-ACC--TA-A-TTCaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntataatcttacgacacctgacagaaactgtacaattcaaacatacgcaatgcatgcagtggagaatcatatatatctaattgataaagcaaaaagtgtggaaaatctctgacgcaagagagaaaccctgtcctaaactaatatttcttgcatactgccgaaaattgaaaagtatgccgcgttagcatttgcaaacaatttctgaatcggatttccccaacactttcaatgtaagtaaaattgttttttttctccaatatcaaaaggatcggcctgtatgttatgatctgttgcaatttgcaataatttttttgctaattctaaaataaaatcacgtgaagtcacgtgataataaacaacagcctgttgaaattaaggaatctaaggaatcctctacgtagcgatatgaacctcgagtcaactcggatattttcttgatagtaatatgtacaaaacactaagagttagtatcttgtacgtcatttcgttatggtaacctaattc
gi|9 : cagtgcatcaccgccgggaaagtcataatattttatgttattgctagcgttatccaagacattattatacatgaaccaatatcgtcctattaattacattctttcctttatacctaatactctcaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnt---G-CCGGG-AAA--GTC-AT-AATA--TTT-T-A--T--GTTA---TT-GCTA--G-C-G-TT--ATC---CAA------G-A-C-AT-TAT---TATA-CAT-GAACCAATATC---G-TCCTATT---AA----TTA--C-----A-TTCT---TTC-C--TT--T-AT----A-----C-----CTAAT--ACTCTC
gi|9 : ATAA----TCT---TA-CGA---C--A-CC-----T---G--ACAGA--A---A---C-TGTA-CAA---TTC-AAAC----ATA-C-GC--AAT--G----C---A-TGC--AG---------T-GGA--GAATCATA--TA----TATC-----TA-----A---TT-----------G-ATAAAGC------AA---AAA--GTG--TGG---AA--AA--TC-TC-T--GACGCAA-GA---GAGAAACC-CT-GTCC----TAA--A-CTA----ATA----T----T--TC--T---T----G-C-A-TA--C-TG--CC-G--AAAA--TTG-AAA-A-------GT-ATG--CC-GC-GTTA-------G--CA--T-TTGCAA--ACA-ATTT-CT--------------G--A-----ATCG--GAT-TT-C-------------CC-C--AA-CA---C-TT--T-CAATG-TAA-G-T--A-AA-ATTGT--TTTT---T--T---T-CTCC--A--A-T--AT-C-AAAAG-GA-T-C-GGCCTG-TATGTTA----TG--A--TCT-G-T-T-G--CA--A--T---T-TGCAA--T-------A------A-T--T----T-T-T-T-----TG--C-TA--A--TTCTAA----A-A--T---------A-AA---AT-C--A--C-G--T-G-A----------AG-T--C-A-C-G-TGA-T-A-AT-AAA-C--A---ACAG--C-CTGTTGA-AATTAAGGA--A---TCTA-AGGA-ATCC--------TC--T----AC-G-TA-GC--G-AT-AT--G-------AA-CCT-CG-A--GT-C-AA--CTC---GGA-T-A-------T-TTT--C-----TT-----GATAGTA--A-TATGT---ACA-AAACAC-TAA-GA-----G--T-TA-G--TA-T---C-TTGTACGTCA-TT-T-CGTTATG-GTA-ACC--TA-A-TTCaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntataatcttacgacacctgacagaaactgtacaattcaaacatacgcaatgcatgcagtggagaatcatatatatctaattgataaagcaaaaagtgtggaaaatctctgacgcaagagagaaaccctgtcctaaactaatatttcttgcatactgccgaaaattgaaaagtatgccgcgttagcatttgcaaacaatttctgaatcggatttccccaacactttcaatgtaagtaaaattgttttttttctccaatatcaaaaggatcggcctgtatgttatgatctgttgcaatttgcaataatttttttgctaattctaaaataaaatcacgtgaagtcacgtgataataaacaacagcctgttgaaattaaggaatctaaggaatcctctacgtagcgatatgaacctcgagtcaactcggatattttcttgatagtaatatgtacaaaacactaagagttagtatcttgtacgtcatttcgttatggtaacctaattc
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|22 ): TATGTAAACATTAAAACATTTTCTTGTCCTATCAAATCACTCTCCATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCATG
Unaligned ( gi|39 ): AGTAGTATCATGGGGAAAATTTATTTGTTGAAATTATTACCATTATCAAGTG
Unaligned ( gi|43 ): ATTTTTCCAAGCCAAAAAAGGTCAGCCTTCTATAC
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 11 1111 33333 11 222222222222222 44444444444444444444444 1 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 222 111111 11 111 333333333 11111111 11111111111 11 11 2222 22222222222222222222 111111 11 11111111111 1111111111111 222222222222222222222222 11 1111111 11 11111111111111 1111111111 1111111 33333333333333333333 1111111111111 1111111 111111 1111
lowQualScore : 33 777 2 2 2 2 4 2 55 2 2 00 2 333 2 33 999999 55 0000 00000 7 4 2 4 55 2 4 2 9 33 2 4 666 444444444444444 2 666 7777 55 2 44444444444444444444444 3 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 000 444 2 666 33 2 55555 333 55 777777 555 99999 44 222 2 8888 2 2 22 555555555 333 2 888 2 22 22 4 22 3 22 555 55555 666 555 22 33333333 4 0 11111111111 55 2 1 2 22 22 2 2 44 1 77 333 1 2 2 7777 77 2 4 7777 22222222222222222222 5555 2 2 5 33 2 33 5555 33 2 2 8888888 22 33 2 2 555555 99 00 5 66 2 2 2 2 8 33 33 44444444444 2 2 7777777777777 2 33 2 77777 33 2 8 55 1 2 33 2 5 555555555555555555555555 33 2 33 2 2 44 777 2 2 0 5 888 66 33 333 2 2 55 33 33 444 2 66 2 777777 2 1111111 2 2 2 66666 00 2 33 55 5555 22222222222222 2 6666 2 55 33 2 33 2 2 0000000000 2 66 2 2 2 2 2 2 4 2 2 33 5555 0 44 2 3 2 6666666 33 444 1 77 2 00000000000000000000 3 3 44 3 2222222222222 5 2 2 33 2 2 33 555 2 2 6666666 2 33 444444 1 777 0000 777 2 1 2 66 33 2 4 66 6 4 22 2 2 2 4 0 2 2 2
lowQualScore : .. ... . . . . . . .. . . .. . ... . .. ...... .. .... ..... . . . . .. . . . . .. . . ... ............... . ... .... .. . ....................... . ........................................................................................................................ ... ... . ... .. . ..... ... .. ...... ... ..... .. ... . .... . . .. ......... ... . ... . .. .. . .. . .. ... ..... ... ... .. ........ . . ........... .. . . . .. .. . . .. . .. ... . . . .... .. . . .... .................... .... . . . .. . .. .... .. . . ....... .. .. . . ...... .. .. . .. . . . . . .. .. ........... . . ............. . .. . ..... .. . . .. . . .. . . ........................ .. . .. . . .. ... . . . . ... .. .. ... . . .. .. .. ... . .. . ...... . ....... . . . ..... .. . .. .. .... .............. . .... . .. .. . .. . . .......... . .. . . . . . . . . . .. .... . .. . . . ....... .. ... . .. . .................... . . .. . ............. . . . .. . . .. ... . . ....... . .. ...... . ... .... ... . . . .. .. . . .. . . .. . . . . . . . .
lowQualScore : 99 333 7 5 4 4 7 1 66 4 4 33 4 888 4 44 999999 99 3333 88888 1 7 4 7 66 4 4 2 7 22 2 4 999 888888888888888 2 111 1111 33 2 44444444444444444444444 3 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 666 444 2 111 55 1 33333 777 00 333333 888 22222 66 000 0 8888 1 1 99 111111111 555 0 555 0 88 88 0 66 1 88 444 00000 888 555 88 11111111 4 4 55555555555 55 0 2 0 88 88 0 0 88 9 55 555 1 0 0 8888 99 4 7 4444 55555555555555555555 3333 5 5 0 44 5 44 4444 44 5 5 1111111 77 44 5 5 555555 00 00 3 33 7 7 7 7 0 77 77 55555555555 7 7 3333333333333 7 77 7 11111 77 7 6 88 6 9 99 9 3 111111111111111111111111 77 7 77 7 7 88 111 7 7 9 3 000 33 77 666 5 5 99 44 44 444 5 55 4 222222 5 2222222 5 5 5 22222 99 5 44 99 0000 33333333333333 4 1111 2 33 11 2 11 2 2 8888888888 2 11 2 2 2 2 2 2 4 2 4 22 1111 6 99 5 4 5 2222222 44 444 4 00 7 66666666666666666666 1 1 22 1 7777777777777 7 9 9 99 9 9 00 000 9 9 9999999 7 77 888888 1 333 1111 333 5 0 4 11 22 5 7 11 7 4 77 2 2 2 7 7 5 5 5
consensus : NACAGTTGCA--TC---G-CGGGG-AAAATGTC-AT-AATA--TTT-T-A--T-CGTTA--TTT-ACTA--A-C-G-TT--AT----CAAG---GTG-A-C-AT-TATG--TATA-CGT-GAAACANTTTCCTTG-TCCTA-T---AA----TTA--CG-T--A-TTCT---TTC-C-TTT--T-AT----A-----C-----C------ACTCTCCATTACCAG-ATCACTCTCAGCAGCTGCCCACTCTCCATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCATAAA--TTCT---TA-CGA---CC-A-GC-----T---G--A---G--A---A---C-TGTG-TAA-A-TTG-CAAC-G--ATA-C-GC--A----G----C---A-TGN--CG-AT--GT--T-GGA--AGATTATA--TA-C-TTATT-----TA-C-GTA---TT--AAA--T---G-ATANAGC------AG---AAA--GTGA-TGGGA-AA--AA--CT-TC-T--GACGCAA-GA---GAGAAACC-CT-TTCCCG-GTAT--A-C-A----ATA----A----T--T---T---T----G-C-A-TA--C-TG--TC-G--AAAA--TTG-AAA-A-------GT-ATG--CC-GC-GTTGT---A-TG--CA--T-TTTAAA--CCA-TTTT-CTTT-TA-TAC-G--AG--A-----A--G--GTT-TT-T-------------CC-C--AA-CA---C-TT--T-C-ATG-TAATG-T--A-AA-GTTAA--ACTT---T--T---T-CTCCTTA--A-T--AT-C-AAAAG-GG-T-C-GGCCTG-TAT-TTA-G-TCG--A--TATCG-T-T-G--CA--A--T---T-TGCAA--TT-AATACA------A-T--CA---T-T-T-T-----TG--T-TA--A--TTCTAA----A-A--TT---A--C-A-AT---AT-C--A--C-G--T-G-A--T-------AG-T--C-A-C-G-TGA-T-A-AT-AAA-C--A---NCAGT-C-TTGNTGA-A-------A--A---TGTA-CGGA-ATCC--T-----TC--T----AC-G-TA-TC--G-AT-AA--G-------AA-CGT-CG-A--TT-C-AC-TCTC---GGA-T-A--T----T-TTT--C-----TTTG---AATAGTAC-A-CATGT---ACA-AAACACTTAT-GAT-T--GTTT-TATG--TA-T-GCT-TTTTACGTTA-TT-T-CTGTATG-GGACGCCT-TA-A-TTCAGT
Reference ( family-948 ) : NACAGTTGCA--TC---G-CGGGG-AAAATGTC-AT-AATA--TTT-T-A--T-CGTTA--TTT-ACTA--A-C-G-TT--AT----CAAG---GTG-A-C-AT-TATG--TATA-CGT-GAAACANTTTCCTTG-TCCTA-T---AA----TTA--CG-T--A-TTCT---TTC-C-TTT--T-AT----A-----C-----C------ACTCTCCATTACCAG-ATCACTCTCAGCAGCTGCCCACTCTCCATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCATAAA--TTCT---TA-CGA---CC-A-GC-----T---G--A---G--A---A---C-TGTG-TAA-A-TTG-CAAC-G--ATA-C-GC--A----G----C---A-TGN--CG-AT--GT--T-GGA--AGATTATA--TA-C-TTATT-----TA-C-GTA---TT--AAA--T---G-ATANAGC------AG---AAA--GTGA-TGGGA-AA--AA--CT-TC-T--GACGCAA-GA---GAGAAACC-CT-TTCCCG-GTAT--A-C-A----ATA----A----T--T---T---T----G-C-A-TA--C-TG--TC-G--AAAA--TTG-AAA-A-------GT-ATG--CC-GC-GTTGT---A-TG--CA--T-TTTAAA--CCA-TTTT-CTTT-TA-TAC-G--AG--A-----A--G--GTT-TT-T-------------CC-C--AA-CA---C-TT--T-C-ATG-TAATG-T--A-AA-GTTAA--ACTT---T--T---T-CTCCTTA--A-T--AT-C-AAAAG-GG-T-C-GGCCTG-TAT-TTA-G-TCG--A--TATCG-T-T-G--CA--A--T---T-TGCAA--TT-AATACA------A-T--CA---T-T-T-T-----TG--T-TA--A--TTCTAA----A-A--TT---A--C-A-AT---AT-C--A--C-G--T-G-A--T-------AG-T--C-A-C-G-TGA-T-A-AT-AAA-C--A---NCAGT-C-TTGNTGA-A-------A--A---TGTA-CGGA-ATCC--T-----TC--T----AC-G-TA-TC--G-AT-AA--G-------AA-CGT-CG-A--TT-C-AC-TCTC---GGA-T-A--T----T-TTT--C-----TTTG---AATAGTAC-A-CATGT---ACA-AAACACTTAT-GAT-T--GTTT-TATG--TA-T-GCT-TTTTACGTTA-TT-T-CTGTATG-GGACGCCT-TA-A-TTCAGT
gi|1 : ACAGTTGCAGATCA--G-CGGGGGAAAATGTC-AT-AATAG-TTT-T-A--T-CGTTA--TTA-ACTG--A-CTGCTT--AT----CAAGC--GTGCA-C-AT-TCTG--TATA-CAT-GAAACACTTTCTTTGCTCCTA-T---AA----TAAG-CA-C--A-TTCT---TTC-C-TTT--T-AT----T-----C-----C------GCCCTCCCTTACCCGCATCACTCTCAGCAGCTGCCCACTCTCCATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCATAAA--TTCTATACA-CGA---CC-A-GC-----T---G--A---G--A---A---C-TTTG-CAA-A-TTGGCAAC-GCGATA-CCGC--A----G----C---A-TGCGCCGCAT--GT--T-GGA--CGATTGTA--TA-CCTTATT-----TA-C-GT----TT--AAA--T---G-ATATAGC------AG---AAA--GTGA-TGGGA-AG--AAATCT-TC-T--GACGCAATGA---GAAAAACCACTGTTCCCGAGTATG-A-C-A----ATA----A----T--T---T---T----G-T-A-TA----TG--GC-A--AAAC--TTG-AAA-A-------GT--T---CC-GC-GTTGT---ACTG--CA--C-ATTAAAG-CTA-TTTT-CTTT-TA-TAC-G--AG--A-----A--G--GTTGTT-T-------------CC-C--AA-C----T-TT--T-C-ATGCTAATG-TTTA-AA--TTAA--ACTT---T--T---T-CTCCTTA--A-T--ATGC-AAAAA-AA-T-C-GGCCTG-TAT-TTA-G-TCC--A--TATCG-T-T-G--CA--A--T---T-TACAA--TT-GATACA------A-T--AA---T-T-T-T-----TA--T-TC--A--TTCTAA----A-A--TT---A--C-A-AC---AT-C--A--C-G--T-G-A--T-------AG-T--C-A-C-G-TGA-T-A-AT-AAA-C--A---GCAGT-C-TTGTTGA-A-------A--A---TGTA-AGGA-ATCC--T-----TC--T----AC-G-TA-TC--G-AT-AA--G-------AA-CGT-CG-A--TT-C-AC-TCTC---GGA-T-A--T----T-TCT--C-----TTTG---AATAGTAC-A-CATGT---ACA-AAACACTTAT-GAT-T--GTTT-TATG--TA-T-GCT-TTTTACGTTA-TT-T-CTGTATG-GGACGCCT-TA-A-TTCAGT
gi|10 : gTT-ACTA--A---G-TTTAAT----CAA----GTG-A-C-ATGGATG--TATA--AT--AAACAATTT-ATTG-TCCT--TCTAAA----TTA--TG-T--A-TTCCTTGTTT-G-TTT--T-A-----A-----C-----CAAATCAACTCTCCA
gi|10 : C-A-GC-----T---A--A---G--A---A---AATGTGGTAA-AATTG-CAACCG--ATA-T-AC--AACGTG----C---A-TGA--CG-AT--GCGCT-GGA--GTATTATA--TA-T-TTATT-----GA---ATA---TT--AA-------G-AT---------------------GTGAGCGGGA-GA--AC--CT-TC-T--GAAGTTA-AATCGGAACAATC-CT-TCCC---GTAT--A-C-A----ATA----T----T--C---T---T----G-C-A-TA--C-TG--TCCG--AAAAATTTG-AAA-G-------CT-ATG--CC-GC-GTTGT---T-TG--CA--T-TTTAAA--CC--CTTT-CTTT-TA-TAC-G--AG--A-----A--G----T-TT-T-------------CC-C--AA--A---C-TT--T-CGATT-TATTG-T--A-AA-GTT-A--ACTT---T--A---T-TTCATTA--ATT--AT-C-ATAA--GG-T-T-GGCTTG-TAT-TTAGG-TCGT-A--CCTCG-T-T-G--CA--AT-T---T-TGCAA--TT-AATACA------A-TA-CA---T-T-T-T-----TG--TGTAACA--TTCTAA----A-G---T---A--TGG-AT---AT-C--A--C-G--T-G----T-------AGTT--C-ATC-GTTGA-T-ACAT-Aatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgttaattttcccccacgaaacagctaagaaaatgtggtaaaattgcaaccgatatacaacgtgcatgacgatgcgctggagtattatatatttattgaatattaagatgtgagcgggagaaccttctgaagttaaatcggaacaatccttcccgtatacaatattcttgcatactgtccgaaaaatttgaaagctatgccgcgttgtttgcattttaaaccctttcttttatacgagaagttttcccaaactttcgatttattgtaaagttaactttatttcattaattatcataaggttggcttgtatttaggtcgtacctcgttgcaattttgcaattaatacaatacatttttgtgtaacattctaaagtatggatatcacgtgtagttcatcgttgatacatatagttacaa
gi|11 : ttactaagtttaatcaagtgacatggatgtataataaacaatttattgtccttctaaattatgtattccttgtttgttttaaccaaatcaactctccaatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgttaattttcccccacgaaaGTTGCA--TC---G-CGGGG-AAAATGTT-ATGGATA--TTTGT-A--T-CGT----TTT-ACTA--A---G--T--AT----CAA----GTG-A-C-AT-TATG--TATAGCAT-GAAA-A--TTCCTTT-TCATA-T---TA----TCA--T--T--A-TT-T---CTT-C-TTT--T-AT----A-----CAAAT-C------ACTCTCCATTtagttacaa
gi|11 : atTACA--TACT---TA-TAAGAGCC-A-GC-----T---G--A---G--A---AA--C-TGC--TGA-A-TTG-CAAC-G--ATA-C-TC--AT---G----C---A-TGTGTCG--T--GT--TTGGA--AGATT-TA--TA-C-TTATT-----TA-C-GT----TT--AAATTT---G-A-ATAAC------AG---AAA--GTAA-TGGCACAA--AA--CG-TA-T--GAC-CAA-GG---GA-AGACC-TT-CTCCC--GTATTAA-C-AG---ATA----A----T--TTGCT---T----G-C-A-T---C-TG--TC-AGCATAT--TTA-AAA-A-------GT-ATG--CC-GC-GTTTTTTAA-TG--CA--T-TTTAAA--CTATTTTT-CTTT-TA-TAC-G--GG--AAAAATA--A--GTT-TT-TTGTTTTCTTTTTCCC-C--AA-AAAACC-TT--T-C-ATGATAGTG-T--A-AA-GTTAA----TT---TCAT---T-CGTCTTA----------T-AAAAG-GA---C-GG-CTG-T-T-TTA-G-TCG-----TAT---T-T-G--C---A--T---T-TGCAA--TT-AAtctttgttagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttacatacttataagagccagctgagaaactgctgaattgcaacgatactcatgcatgtgtcgtgtttggaagatttatacttatttacgtttaaatttgaataacagaaagtaatggcacaaaacgtatgaccaagggaagaccttctcccgtattaacagataatttgcttgcatctgtcagcatatttaaaaagtatgccgcgttttttaatgcattttaaactatttttcttttatacgggaaaaataagttttttgttttctttttccccaaaaaacctttcatgatagtgtaaagttaatttcattcgtcttataaaaggacggctgttttagtcgtatttgcatttgcaattaaat
gi|12 : atgttgcatcgcggggaaaatgttatggatatttgtatcgttttactaagtatcaagtgacattatgtatagcatgaaaattccttttcatattatcattatttcttcttttatacaaatcactctccatttctttgttagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntGT-GAACCATTTTC-TTG-TCCTA-----AG----TTATTTG-C--A-TTTT---TTCTT-TTT--T-AT----A-----CAAAAGC------ACTCTCCATat
gi|12 : CATAA---TTCT---TA-CGA---CC-A-GC-----C---G--A---A--A---A---A-AATG-TAA-AATTG-CAAC-G--ATA-T-AC--A----GTG--C---A-TGA--CG-AT--GT--T-GGA--AGTTTATA--TA-C-T-AGT-----TA-C-GTA---TT--AAA--T---TCATATATC------AG---AAAA-GTGA--GGGA-AA--AA--AT-TA-T--GACACAA-AC---G-GAAACC-CT-TTCCCG--TAT--A-C-A----ATA----A----T--T---TCT-T----G-C-A-TA--C-TG--TC-G--AAAA--TTG-AAA-A-------GT-ATG--CC-GC-GTTAG---A-TG--CA--T-ATTAAA--CCA-TTTT-CTTT-T--TAC-A--CG--G-----A--G--AGT-TT-T-------------CC-CTAAA-CA-----TT--T-C-A---------T--A-----TTAA--TCTT--------------------------------AAAG-GA------ACTTA-TAT-TTC---TCA--A--TATC----------A--A-----------AAGGCT-CATACA------A-T--CA---T-T-T-T-----TG--T-TA--A--TTCTAA----A-A--AT---A--C-A-AT---AC-C--A--C-G--T-G-A--T-------AG-T--C-A-C-G-TGA-T-A-AC-AAA-C--A---nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncataattcttacgaccagccgaaaaaaatgtaaaattgcaacgatatacagtgcatgacgatgttggaagtttatatactagttacgtattaaattcatatatcagaaaagtgagggaaaaaattatgacacaaacggaaaccctttcccgtatacaataatttcttgcatactgtcgaaaattgaaaagtatgccgcgttagatgcatattaaaccattttctttttacacggagagttttccctaaacatttcatattaatcttaaaggaacttatatttctcaatatcaaaaggctcatacaatcatttttgttaattctaaaaatacaataccacgtgatagtcacgtgataacaaacaa
gi|13 : gtgaaccattttcttgtcctaagttatttgcattttttcttttttatacaaaagcactctccatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCAGTTGCA--TT---G-CGGGG-AAAACGTTTATGAATA--TTT-T-AAAT-CATTA--CTT-ACTA--A-C-G-TT--AT----CAAG----TG-A-C-AT-GATG--TATA-AGT--AAACAATTTA-TTG-TCCTA-T---AAAA--TTA--TG-T--A-TTCT---TTCGT-TTT--T-AT----A-----CCAAATC------ACTCTCCAa
gi|13 : ----G----C---A-TGA--CG-AT--GC--T-GGA--AGTTTATA--TA-T-TTATT-----GA-C-ATA---TT--AAA--T---G-------------------------TGA-GGGGA-GA--AA--CT-TC-T--GACACAA-TG---GA-AAATC-CT-TTCCC--GTAT--A-C-A----ATA----A----A--T---T---atttctatgtattgaattatgaaattgataatcatattaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacagtgcatgacgatgctggaagtttatatatttattgacatattaaatgtgaggggagaaacttctgacacaatggaaaatcctttcccgtatacaataaattct
gi|14 : cagttgcattgcggggaaaacgtttatgaatattttaaatcattacttactaacgttatcaagtgacatgatgtataagtaaacaatttattgtcctataaaattatgtattctttcgtttttataccaaatcactctccaatttctatgtattgaattatgaaattgataatcatattaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacagtCT---TG-CGA---CC-A-AT-----T---TC-A---G--A---A-----TGTG-TAA-AATTG-CAAC-G--ATA-T-AT--A----GTG--C---A-TGG--TG-GT--AT--T-CAA--AGTCTACA--TA-T-TTATA-----TG-C-CTG---TT--ACA--TT--G-ATATATC------GGGGGAAA--A--A-CTGGA-AAGCAA--CG-TC-T--GACACAA-AA----AGAA--------TCC------T--A-C-ATCTGATA----A----T--T---TCT-T----C-C-A-TA--T-TC--TT-A--AAAA--TTG-AAA-AGTACACCGT-ATG--CA-GC-CTTGA---C-CG--CA--T-TTTAAA--TTA-CCTTGCTTT-TA-TCG-G--AG--A-----A-----ATC-GC-T-------------CT-A--AG-CG---CTTT--T-C-AGT-TAATG-T--A-AA-GTAAAT-ATTG---T--T---T-TTC--TA--A-T--AT-A-AAAA---G-C-C-GGTCTT-TAT-TTT-G-TTC--A--AATCC-A-T-G--TA--AT-T---T-TGAGA--TT-ACTGTA------A-T--GATTTT-T-T-T-----TT--T-TG--G--TTCTAA----ATT--TT---A--T-A-AT---------------------------------G-T--C-A-C-A-TGA-T-G-AT-AAA----A---CTTGC-T-TTGATGG-A-------A--A---TGTA-TGGA-Act
gi|15 : A-GTTAA---CTA---TA-T---T-GTCCTCA--A-T--AT-CTAAAAG-GG-TGC-GGCCAG-TAT-T-A-G-TTG--A--TGTCG-T-T-GG-CA--A--T---T-T-TA----T-AATACA--------T--CA---T-T-T-T-----TGGTT-TA--AA-TTCTAA----A-A--TT---AGGC-A-AC---AT-C--A--T----T-G-A--T-------AG-TGTC-A-C-A-TGA-TTA-ATGAAA-C--A---ACAAT-C-TTCATGA-A-------A--A---TGT--TGGA----------------------------A-TC--G-CT-AA--C-------TA-TGT-CT-A--TT-C-AC-TCTC---GGG-T-A--T----T-TTT--C------TTG---AATAGTA--A-CATGC---A----------TGT-GAC-T--G-TT-TATG--TA-TGGCA-TTTTACGTTC-TT-T-CTGTAT--GGACGCCT-TA-A-TTCAGgc
gi|16 : atTCT---AA-CAA---CC-A-GA-----T---G--A---AGAA---A---C-TGTA--AA-A-TTG-CAAC-G--ATA-C-TC--A----AAA--C---A-TGA--CG-AT--AT--T-GGA--AGTTTATA--TA-C-TTATT-----TA-C-GTA---TT--AAA--TT--G-ATAAAGC------AG---AAAA-GTAA-TGGGA-AA--AA--CT-TC-T--GACACAA--A---GGAAAACC-TT-TTCCC--GTAT--A-C-A----GTT----A----T--TTC-T---T----G-C-A-TA--C-TG--TC-G--AAAA--TTG-AAA-A-------CT-ATG--CA-GC-TTTGG---A-TG--CA--T-TTTAAA--CCA-TTTT-CCTT-TA-TACAG--AG--A-----A-----GTT-TT-T-------------CC-C--AA-CA---C-Tct
gi|17 : A-CGA---CC-A-GA-----T---G--A---G--A---AA--C-TG-G-TAA-AATTG-CAGC-G--ATA-C-TC--A----AAAA-C---A-TGAA-CG-AT--AT--T-GGA--AG-TTATA--TA-T-CTTTT-----TAGC-ATAC--TT--AAT--T---G-ATAAAGA------GA---AAA--GTAA-TGG---AA--AA--CT-TC-T--GAC-CAA--A---GGGAA--C-TT-TTCGCC-GTATT-A-C-A----GTA----A----T--T---T---CTTGGG-C---TA--C-TG--TC-G--AAAA--T-G-AAA-A--------T--TG--CC-GC--TTGTGG-A-TG--CA--T-TTTAAA--CCA-TTTT-C-TT-TA-TACGG--AGACA-----A--T--GTT-TT-TC------------CC-C--AA-CA---T-TT--T-
gi|18 : A----A-T--TT---A--A-A-TT---AT-C--T--T-G--T-G-A--T-------AG-T--C-A-C-G-TGA-T-A-AT-GAA-C--A---CCTGC-C-TCTATGA-A-------A--A---CGTA-TGGA-AGCA--T-----AC--C----GG-G-TA-TG--G-TT-----G-------AA-CGT-TGTT--TT-C-GT-TTTC---GGA-T-A--T----T-TCT--C-----ATTG---AATGTTTT-C-CATATAAGACAGAAACA--TAT---------TTT-TATGGATA-TAGTTGTTTTGCTTTA--T-T-CTGTATA-GGATGC---TATA-TTCAAT
gi|19 : atattgttgtaaatattgcggttttttaaccgatgttc-T-T-C--CA--A--T---A-TG--A--TC-ATTACA------A-T--CA---TAT-T-TGCCGGTG--T-TG--A--TTTT-------------------T-A-AT---GT-C--A--C-A--T-T-A--T-------AG-T--C-A-T-T-TAA-T-G-AT-AAA-C--A---CGTGC-C-CCCATGA-A-------A--A---TGTA-CGGG-AGCC--T-----AT--T-----C-GATA-TT--G-GC-AT--G-------AA-TGT-TG-A--TT-C-TT-TCTC---AGA-T-A--T----T-TTT--C-----ATCG---AATCATTC---CA--T---AGA-AAATACGAAC-AAT-T--GTCTGTATG--TA-T-ATG-TT-----TTA-TT-C-TTGAATG-GGGGACCT-TA-A-TTCAGTa
gi|2 : ttgcACATTTCCA--TT---G-CGGGA-AAA---TC-AT-A-TA--TTT-T-AA-T-C--TA--TTT-ACTAGAA-C-G-TTT-AT----CAA-----TG-A-C-AT-GATG--TATA-CGTTGGAACATTTTA-TTG-TCCTA-TAA-AA----TTA--TG-T--A-TTCT---TTG-G-TTTA-T-ATTCAAA-----G-----C------A-TCTCCAt
gi|2 : cttCATAA---TTCT---TA-CGA---AC-A-GC-----A---A--AT--A--A---A---A-TGTGGTA----TTG-CAAC-G--ATA-T-AC--AAGT-G----C---A-TGA--CG-ATTGGT--T-GGA--AG-TTATA--TAAC-TTATT------A-C-ATA---TA--AAT--T---C-ATATATC------AG---AAAA-GTGA-GGAGA-AA--AA--CT-TC-T--GACACAA-AG---GGGAAATC-CT-TTCTC--TTAT--A-C-A----ATA----AGAT-T--C---T---T----GTC-ATTA--T-CGTCTC-G--AAAA--TTG-AAA-A-------GT-ATG--CC-GCAGTTGT---T-TG--CATTT-TTTAAATCCTA-TTTT-CTTT-TA-TACGG--AG--AC----A--C--GTT-TTCT-------------CC-C--AACCA---C-TTTCT-C-ATA-TATTC-T--A-AA-GTTTA--ACTTAAGT--T---TACTC---A--A-TTAGT-C-AAAA--GG-T-CGGGCTTGTTAT-TTAGG-TCG--AGCTATCG-TCT-G--CA--AT-T---T-TGCAAATTC-AAGACA------A-T--CA---T-T-T-G-----TGT-T-TA--A--TTCTAA----AGA--TT---A--T-G-AT---AT-C--AACC-GCTT-G-ATGT-------AG-T--C-A-C-G-TGATT-A-AT-AAA-C--A---ACAAT-C-TTGGTGAGA-------A--A---TGTA-CGGA-ATCC--TCAG--TTGAT----ATGG-TA-TC--G-AT-GAATG-------AA-CAT-CG-A--TT-CTAC-TCTC---GGG-T-A--A----T-TTT--CA----GTTGTATAGTAGTAC-A-CATGT---ACA-AAACACTTAT-TAT-TAAATTTATATG--TACT-GCT-TTTAACGTTA-TTGT-CTGTATGAGGACGCCTATA-A-TTCAGannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncataattcttacgaacagcaaataaaatgtggtattgcaacgatatacaagtgcatgacgattggttggaagttatataacttattacatataaattcatatatcagaaaagtgaggagaaaaacttctgacacaaaggggaaatcctttctcttatacaataagattcttgtcattatcgtctcgaaaattgaaaagtatgccgcagttgtttgcattttttaaatcctattttcttttatacggagacacgttttctcccaaccactttctcatatattctaaagtttaacttaagtttactcaattagtcaaaaggtcgggcttgttatttaggtcgagctatcgtctgcaattttgcaaattcaagacaatcatttgtgtttaattctaaagattatgatatcaaccgcttgatgtagtcacgtgattaataaacaacaatcttggtgagaaatgtacggaatcctcagttgatatggtatcgatgaatgaacatcgattctactctcgggtaattttcagttgtatagtagtacacatgtacaaaacacttattattaaatttatatgtactgcttttaacgttattgtctgtatgaggacgcctataattcag
gi|20 : cttacatttccattgcgggaaaatcatatattttaatctatttactagaacgtttatcaatgacatgatgtatacgttggaacattttattgtcctataaaattatgtattctttggtttatattcaaagcatctccaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-C--A--C-G--T-G-A--T-------AG-C--C-A-C-A-TGA-T-G-AT-GAA-C--A---CCTGG-T-TGGATGA-A-------A--A---T-TATTTGA-ATCA--T-----AT--T----AT-G-TA-TCAGA-AT-AA--A-------AA---T-TG-A--TT-C-GC-TTTC---GGA-T-A--TTG--T-TTT--C-----ATCG---AATAGTAT-T-CATGT-----A-AAGCACTCATAGAT-T--GTTT-TATT--TA-T-GTG-TTTTACTGTA-TT-T-CTGTACA-GGGCGTCC-TA-A-TTC
gi|21 : T--T-T-ATG-TAAAG-T--A-AGCGTTAAT-AAAT---C--A---T-GTAC--A--A-A--AT-A-AAAGG-AG-T-C-GGTCTG-TTT-ATA-G-TCG--A--TATTG-T-T-G--CA--A--T---CATGCGA--TT-GTTACATGTTCAA-T--AA---T-T-T-T-----T---C-CG--G--TGCTAA----A-C--TT---A--T-A-AT---GT-C--A--C-G--T-G-A--T-------AA-T--A-A-C-G-CGA-T-A-AT-ACA-C--T---CCTAC-A-TTGATGA-A-------A--A---TGTA-
gi|23 : tagTTT---TG-CAG---CT-A-GT-----T---GCAA---A--A---A---C-TGTA-TAA---TTG-TCAT-G--ATA-T-AC--A----G----T---G-TAC--CG-GT--GG--T-GGACAAAATCATA--TT-T-CTATTCCTATTA-C-ATACTATT--AGA--T-----ATTAAG--------A---AAA--GTGT-TGGGA-GC--AA--CT-TC-T--AACACAA-AA---T-GAAACC-AC-TTCCCG-
gi|24 : gcCATAAT--TTCA---TA-CGA---CA-G-GC-----G---G--A------A---A---C-TGTG--AA-A-TTG-CAAca
gi|25 : annnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaTCT---TA-CGA---CA-A-GC-----T---G--AA--G--AG--A---C-TGTG--AA-A-TTG-CAAC-G--ATA-C-GC--AT---GAATTC---A-TGG--CG-AT--GT--T-GGA--AGGTTATA--TT-C-TTGTT-----TA-C-GTA---TT--GAAT-T---G-ATAAAAC------AGA--AAA--GTGA-TAAGA-AA--AA--CT-TC-T--GACACAA--A---GAGAAACC-CT-TTCCC
gi|26 : --T----T-TTT--C-----ATTG---AATATTAC-C-CATGT---A---AAACACTTAA-AGT-T--GTTT-TATC--TAAT-GTA-TTTTACTCTA-TT-T-CTGTATA-GAACGTTT-TA-A-TTCAAT
gi|27 : gagggctacattattgcagctagaagccttacaaggctatcggtatgaatgttagAGATGAA--TC---G-CGGGG-AAA-------T-A-TA--TTT-T-G--T-CATTA--TTT-ACAA--C-C-G-TT--AT----CAA----GTG-A------TATGCTTAAA-CG--AAAAC-GTTTACTTA-TCAAA-C---AA------A--TG-TTCATTTCT---TTC-T-TTT--TCAT----A-----T-----C------At
gi|28 : ttcttttACAGTTGCA--TC---G-CGGGG-AAA-TGTC-AT-A-TA--TTT-T-AA-T-CGTTA--TTT-ACTA--A-A-C-TT--TT----TA-----GTG-G-CGAT-TATG--GA-A-CGT-GAAACATTTATCTTG-TCCTA-T----A----TTA-----T--C-TTCT---TTC-T-GTT-----T----G-----G-----C------A--------TACCAG-ATCACTCTaataactcattattctttatatga
gi|29 : --AGATTATA--TA-T-TTATT-----TA-C-GTA---TT--AAA--T---TCATAAAGC------AA---AAAAAGTGA-TGAGA-AA--A---CT-TT-T--GACGCAA--A---GGGACACC-CT-ATCT-A-GTAT--A-C-A----GTA----A----TGTT---T---T----G-C-A-TA--C-TG--TC-A--ACAA--TTG-AAA-A-------GT-ATG--CC-GC-tc
gi|3 : GGGT-AAAAT-TC-AT-AAAAATTTT-T-AC-T-CGTTA--TTT-A-----A-C----T--AT----GAAGTAAATG-A---AT-GATG--TATA-CGC-GAAACATTTTTCTTG-TCCTA-T---AAAAACTTA--TA-T----TTCTC--TTCGC-ATG--T-AC----A-----C-----C------A
gi|3 : AA--TTCT---TATCGA---AC-A-GTCTAAAT---G--A---G--A---A---A-TGTGGTA----TTG-CAAC-G--ATAGT-AC--A----G----TGCAA-TGA--CG-AT--GT--T-GGA--AGTATATA--TA-T-TAATT-----TG-C-GTA---TT--AAA--TTCAG-A-ATATC-------G---AAAGCGTGA-GGGGA-GA--AA--CT-TCAT--GAACCAA--A---GGGACGAT-CT-TT-CCG---AT--A-C-A----ATAAATTA----C--T---T---T----G-C-A-TA--C-TG--TCAA--AAAA--TTG-AAA-A-------GT-ATT--CC-GC-GTTGT---T-TG--CATTT-TTTATA--CCA----T-CTTT-TA-TAC-G--CG--G-----A--GAAGTT-TT-T-------------CC-C--AA-CA---C-TT--T-C-AT--T-ATG-T--A-AAGGTTAC--ACTT---TA-TAAAT-CTC--TA--A-T--A--C-AAAAG-GGCT-C-GG-CTG-TTT-TTA-GTTCGGAA--TATCG-T-T-G--CAGGA--T---A-TGCAA--TT-AATAAA------A-TAACG---T-T-TAT-----GG--T-TA--A--ATCTAA----A-A--TT------C-G-AT---ATGT--A--CAG--T-G-A----------AT-C--C-A-C-G-TGA-T---AT--AA-CTGA---ACAAT-C-TTGGTGG-A-------AATA---TGTAGCGGAGATCC--TAATGGTA--TTAAAAG-G-GA-TC--G-AT-TATTG-------AAGCGC-CG-AAGTT-C-AC-TCTC---GGG-T-AACT----T-TTT--CATTAATTGA---AATACTAG-T-CATGTA--ACT-AAAAACTTAT-GAT-T--ATTT-TATT--TATT-GCT-CTTAACGTTA-TT-T-CTGTAT--GGACG-CT-TA-A-TTCAaagcactttctaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaataattcttatcgaacagtctaaatgagaaatgtggtattgcaacgatagtacagtgcaatgacgatgttggaagtatatatattaatttgcgtattaaattcagaatatcgaaagcgtgaggggagaaacttcatgaaccaaagggacgatctttccgatacaataaattactttgcatactgtcaaaaaattgaaaagtattccgcgttgtttgcattttttataccatcttttatacgcggagaagtttttcccaacactttcattatgtaaaggttacactttataaatctctaatacaaaagggctcggctgtttttagttcggaatatcgttgcaggatatgcaattaataaaataacgtttatggttaaatctaaaattcgatatgtacagtgaatccacgtgatataactgaacaatcttggtggaaatatgtagcggagatcctaatggtattaaaagggatcgattattgaagcgccgaagttcactctcgggtaactttttcattaattgaaatactagtcatgtaactaaaaacttatgattattttatttattgctcttaacgttatttctgtatggacgcttaattca
gi|30 : gggtaaaattcataaaaatttttactcgttatttaactatgaagtaaatgaatgatgtatacgcgaaacatttttcttgtcctataaaaacttatatttctcttcgcatgtacaccaaagcactttctaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaatACAGTTGCA--TC---G-C-GGG-AAAAT-TC-AT-GAT---TTT-T-A--T-CGTTA---TT-ACCA--A-C-G--T--AT----CAGA---GTG-ACC-AT-TATG--TATA-CAT-AAAACA-TTTCCTT--TTCTA-T---AA----TTAG-CA-T--A-TT---------C-CTT--T-AT----ACAAATC-----C------ACTCTCC
gi|31 : ttACAGTTGCA--GC---G-CG------AATGTC-AT-AATA--TTG---A--T-C--TA--TTT-AC----A-C-C-TT--AT----CAAA---GTG-A-C-AT-TATG--TATA-CAT-G-AATA--TTCCTTG-T-CTA-T---AA----T----CA-T--A-CACT---TTC-C-TTT--T-AT----A-----CCAAATC------ACTCTCCA
gi|32 : tt-A-TTG-CAAC-A--ATA-C-GC--AAT--G----C---A-TGG--CG-AT--GT--A-GGA--AGATTATA--TA-C-TTGTA-----TA-C-GTA---TT--AAAT-T---G-GTAAAGCAAAAAAAA---AAA--GTGA-TGAG--AA--AA--CT-TC-T--GACGCAA--A---GGGACATC-CT-TTCTCG-
gi|33 : ACAGTTGCA--TC---GGCGGG---AAATGTC-AT-AATA---TT-A-A--T-CG--A--TTT-ACTA--A-C----T--AT----CAA----GT--A-C-AT-TATG--TATA-C---AGAATA--TTCC-TG-TCC-A-T---AA----T----CA-T--A-CACT---TTC-C-TTT--T-AT----A-----CAAAT-C------ACTCTCCt
gi|34 : t-------AA-CGT-TG-A--CT-C-AC-TCTC---GGA-T-A--T----A-TTT--T-----TTT-----ATATGAC-A-CATGT---ACA-AAACACTTGT-GAC-T--ATTT-TATG--TA-T-GCT-TTTTACGTTG-TT-T-CTGTGTG-GGGCGCC
gi|35 : A--TT-AATACA------A-T--CA---A-T-T-T-----TG--T-TA--A--TTCTAA----A-C--TT---A--C-G-ATCATAC-C--A--C-A--T-G-A--T-------AG-T--C-A-C-G-TGA-T-A-AT-ACA-C--A---AACGT-C-TTAGTGA-A-------A--A---TATA-TGGA-ATCC--T-----
gi|36 : TTT---TA-CGA---CC-A-GC-----T---G--T---A--A---A---A-AGTG-CAATA-TTG-CAAC-G--ATA-T-AC--G----G----------TGT-----AT--GC--TAGGA--A
gi|37 : TTAT-GAT-T--GTTT-TATG--TA-T-GCT-TTTTACGTCA-TT-T-CTGTATG-GTAAGCCT-TA-A-TTCAGttttcagtctgtatctttatattcttattaca
gi|38 : A--TC---G-CGGGG-AAAATGTC-AT-AATA------T-A--T-CGTTA--T
gi|4 : aggttcttatat-AT-AGAA--TTT-T----T-CGTTA--TTTTACTA--AAT-T-TT--AT----CGAG----TGCA-C-ATGTATG--T----C-----AACATGTTACTTG-TCCGA-T---AA----TTAT-TGCC--A-TTTT---TCC-T-TTT--T-AT----A-----C-----C------Acaagtgatatgct
gi|4 : CATAAAATTCCT---TG-CGAA--CC-AAGC-----T---G--A---G--A---AGAAC-TGTG--AA-A-TT--CAAC----ATA-C-GC--AATG-G----C---A-TAG--CG-AT--GT--T-GGA--AGAT-ATA--TA-C-TTATT-----TAACAGTA---TTTAAAA--TT--G-ATA-AGC------AA---AAA--GTGA-TGGGA-AA--AA--CTGTC-TT-GACGCAA-GG---GA--AACC-CT-TTCCCG--TAT--ATC-A----GTA----A----TGTC---T---T----G-C-A-TATAC-TG--TC-G--GAAA--TTGGAAA-A-------GTGATG--CCCGC-GTTGT---G-TGG-CA--TCTTTAAA--CTA-TTTT-TTTCACA-TAC-GGAAA--A-----A--G--TTT-TT-T-------------CCGC--AA-CA---C-TT--TTC-ATG-TAATG-T--AGAA-GTTAATTATTA---T--T---T-CTCC-----A-T--GT-C-AAAAAAGG-T-C-GGCCTG-TCT-TTA-G-TCG--A--TATCGGT-T-GTTCA--GATT---T-TGCAA--TT-AATACG------AGT--CA---T-T-T-T-----TGG-T-TA--AACTTCTGA----A-AATTT---A--C-AGAC---AT-C--A--C-G--T-G-A--T-------AG-T--CCA-C-G-TGA-T-A-AT-AA--C--G---AGAGT-CCTTGTTGA-A-------C--A---T-TA-CGGA-ATATAAT-----TAA-T----AC-G-TA-TC--G-AT-AT--G-------AA-CGT-CG-A--TTTC-ACCTCTCCAGGAA-T-A--TAACTT-TTT--C-----TTTG---GTCAGTAC-A-CATGT---ACA-AAACACTAAT-GAT-T--GTTT-TATG--TA-T-GAA-TTTCACGTTATTT-T-CTGTATGTGGACGCCT-TA-CTTTCAGTaatcgactcttaccatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncataaaattccttgcgaaccaagctgagaagaactgtgaaattcaacatacgcaatggcatagcgatgttggaagatatatacttatttaacagtatttaaaattgataagcaaaaagtgatgggaaaaactgtcttgacgcaagggaaaccctttcccgtatatcagtaatgtcttgcatatactgtcggaaattggaaaagtgatgcccgcgttgtgtggcatctttaaactatttttttcacatacggaaaaagttttttccgcaacacttttcatgtaatgtagaagttaattattatttctccatgtcaaaaaaggtcggcctgtctttagtcgatatcggttgttcagattttgcaattaatacgagtcatttttggttaaacttctgaaaatttacagacatcacgtgatagtccacgtgataataacgagagtccttgttgaacattacggaatataattaatacgtatcgatatgaacgtcgatttcacctctccaggaatataactttttctttggtcagtacacatgtacaaaacactaatgattgttttatgtatgaatttcacgttattttctgtatgtggacgccttactttcagtt
gi|40 : atagaatttttcgttattttactaaattttatcgagtgcacatgtatgtcaacatgttacttgtccgataattattgccatttttcctttttataccaaatcgactcttaccatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnG--TA-T-GCT-TTAAACGTTA-TT-T-ATATATG-TGACGCCT-TA-A-TTCAt
gi|41 : -AAACACTTAT-GGC-T--GTTT-TATG--TA-T-GCT-TTTTACGTTA-TT-T-CTcgtt
gi|42 : A--TT---G-CGGGT-AAA-TGTC-AT-AATA--TTT-TAA--T-CGTTA--TTT-AC
gi|5 : TTGCA--TC---G-CGGGG-AAAATGTC-AT-ATGA--TTT-T-A--TTCGTTAATTCT-ACTA--A-CCG-TT--A-----CAAG----TG-AAC-AT-TATG--TATA-CAT-GAAACACTT--CTTG-TCCTA-T---AA------A--TG----A-T-CT---TTC-C-TTT--T-TT----A---------------------------TACCAA-ATCACTCTC
gi|5 : tCATAA---TTCT---TA-CGA---CCCA-GC-----T---G--A---A--AGAAA---C-TTTT-GAA-A-TTG-AAACCG--ATA-C-GC--A----T----C---AATGG--TG-AT--GT----GGA--AGATTGTA--TA-C-TATTT-----TA-CCGTA---TT--AAA--T---G-AT-TACC------AG---AAAA-GTGA-TGGGA-AA--AT--CT-TC-TTTGACG--A-AA---GAGAAACT-CT-TTCCCG--TAT--T-C-A----ATA----AATTTC--T---T---T----G-C-ACTA--CCTG--TC-A--AAAA--TTG-AAATA-------GT-ATGGGCC-GC-GTTGT---A-TGAACA--T-TT-AAA--CTA-TTTC-TTTT-TAATAG-G--AG--A-----A--G--TTT-TT-T-----------------------------TT--T-T-ATG-TAATGGT--A-AA-GTTAA--ACTT---T--C---T-CT---TA--A-T--AT-C-AAAAG-GA-T-C-GGCCGG-TAT-TTA-G-TCC--A--TATC------G--CA--A--TAAAT-GGCAA--TTAAATACA------T-T-------T-T-T-T-----TGT-T-TA--A--TTCTTA----A-A--TT---A--CAA-AC---AC-C--A----G--T-GAA--T-------AG-TCCC-A-CTG-TGA-T-ACAT-AAACC--A---GCAGT-C-GTGTTGA-A-------A--A---TATA-CAGA-ATCC--T-----TC--T----AA-G-TA-TC--G-ATAAA--G-------AACCGT-CG-A--TT-T-CT-CCTC---GGA-TCA--T----T-TTT--C-----TTTG----ATAGTACAA-CATGT---ACA-AACCACTTAT-GATAT--GTTT-TATGAATA-T-GCT-TTTTACG-TA-TT-T-CTG-ATG-GGATGCCT-TA-A-TTCAGcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntacataattcttacgacccagctgaaagaaacttttgaaattgaaaccgatacgcatcaatggtgatgtggaagattgtatactattttaccgtattaaatgattaccagaaaagtgatgggaaaatcttctttgacgaaagagaaactctttcccgtattcaataaatttctttgcactacctgtcaaaaattgaaatagtatgggccgcgttgtatgaacatttaaactatttctttttaataggagaagttttttttttatgtaatggtaaagttaaactttctcttaatatcaaaaggatcggccggtatttagtccatatcgcaataaatggcaattaaatacatttttttgtttaattcttaaattacaaacaccagtgaatagtcccactgtgatacataaaccagcagtcgtgttgaaaatatacagaatccttctaagtatcgataaagaaccgtcgatttctcctcggatcatttttctttgatagtacaacatgtacaaaccacttatgatatgttttatgaatatgctttttacgtatttctgatgggatgccttaattcag
gi|6 : tttgcatcgcggggaaaatgtcatatgattttattcgttaattctactaaccgttacaagtgaacattatgtatacatgaaacacttcttgtcctataaatgatctttccttttttataccaaatcactctccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaCAGTTGCA--TC---G-CGGGG-AAA--GTC-AT-AATA---TT-T-A--T---TTA--TTA-ACT---T-C-G-TT--GTAGTGCACGCA-GTGAA-C-AT-TATGT-TGTA-CAT-G-AACAATTGC---G-TCCTA-T---AA-----TA--TG-G--C-TTCT---TCC-T-TTTGAT-ATCCAAA-----C-----C------ACTCTC
gi|6 : CATAAA--TTCT----A-CGA---C----AC-----T---G--A---A--A---A---C-TTTG-GAA-A-TTG-CAAC-GC-ATA-C-GTCAA----G----C---A-TGG--CG-AT--GT--T-GGA---GATTTTACGTA-T-TTAAT-----TG-A-ATA---T----AA--T---G-ATATAGCG-----AA---AAA--GTGA-TGG-A-AA--AT--CT-TC-T--GACGCAAAGA---GAGAACCC-AT-TTCC---GTAT--A-C-A----ATA----A----T--T---TCCTT----G-CCA-TA--C-TG--TC-A--AAAA--TTG-AAA-A-------GT--TG--CC-GC-GTTGT---A-TGA-CAA-TATTTAAA--CTA-TTTT-CTTT-TA-TAC-G--AG--A-----A--A--GTT-TT-C-------------CC-A--AA-CA---C-TT--T-C-ATG-TAATG-T--A-AA-GGTTA--AC-T---T--T---T-CTTCTTAACA-T--AT-C-AAAAG-GA---C-GGCCTG-TA--TTA-G-TCC--A--TATCG-T-T-G--CA--AT-T---T-TGCAA--TT-AATACA------A----AA---T-T-T-T-----TG--T-TA--G--TTC--A----A-A--TT---A--C-A-A----AT-CCAA--C-G--T-G-A--T-------AA-G--C-A---G-TGA-T-A-AT-AAA-T--A---G-AGT-C-TTGTTGA-A-------A--A---TGTA-AGGA-AT-C--T-----AC--T----AC-G-TA-TC--G-A--AA--G-------AA-CGT-CG-A---T-C-AA-CCTC---GGATT-A--T----TGTTT--C-----TTTG---AATAGT-C-A-CATGT----CA-AAACA-TTAT-GA--T--G-TT-TATG--TA-T-GCC-TTTTACGTTA-TT-TGCTGTATG-GGACGCCT-TA-A-TTCAGatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncataaattctacgacactgaaaactttggaaattgcaacgcatacgtcaagcatggcgatgttggagattttacgtatttaattgaatataatgatatagcgaaaaagtgatggaaaatcttctgacgcaaagagagaacccatttccgtatacaataatttccttgccatactgtcaaaaattgaaaagttgccgcgttgtatgacaatatttaaactattttcttttatacgagaaagttttcccaaacactttcatgtaatgtaaaggttaacttttcttcttaacatatcaaaaggacggcctgtattagtccatatcgttgcaattttgcaattaatacaaaatttttgttagttcaaattacaaatccaacgtgataagcagtgataataaatagagtcttgttgaaaatgtaaggaatctactacgtatcgaaagaacgtcgatcaacctcggattattgtttctttgaatagtcacatgtcaaaacattatgatgtttatgtatgccttttacgttatttgctgtatgggacgccttaattcag
gi|7 : cagttgcatcgcggggaaagtcataatatttatttattaacttcgttgtagtgcacgcagtgaacattatgttgtacatgaacaattgcgtcctataatatggcttcttccttttgatatccaaaccactctcatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnG-A-C-AG-TATG--TACA-CAT-GAAACATTTTC-TTG-TCCTA-T---AA----TTA--TG-C--A-TTAT---TTC-CTTTT--T-AT----A-----C-----CAAAATTACTCTCCAT
gi|7 : A-CGA---CC-A-GC-----TCATG--A------A---A---C-TG----AA-T-TTA-CAAC-A--ATA-C-GC--AAT--G----C---A-TGA--CG-AT--GT--T-GGA--AGATTATA--TA-C-TTATT-----TA-C-GTA---TT--AAA--TT--G-ATAAAGC------AA---AAAA-GTGA-TGAGA-AA--AA--CT-TC-T--AACGCAA--A---GGGAAACC-CT-TTCTTG--TAT--A-C-A----GTA----A----TG-TA--T---T----G-C-A-TA--C-TG--TC-G--AAAA--TTG-AAA-A-------GT-ATG--CC-GC-GTTGT---A-TG--CA--T-TTTAAA--GCA-TTTT-CTTT-TA-TAC-G--GA--A-----A--A--GTT-TT-T-------------CC-C--AA-CA---CTTT--T-C-ATG-TAATG-T--A-AA-A-TAG--A-TT---T--T---A-TTTCTAA--A-T--AT-C-AAAAG-GG-T-C-GGTCTG-TCT-TTA-G-TCG--A--TATCG-T-TGG--CA--A--T---T-TGCGA--TT-AAT-CA------A-T--CA---T-TAT-T-----TG--T-TA--A--TTCTAAGCAGA-G--TTAAGA--C-A-AA---AT-CG-A--C-G--TAA-A--TGTGAATAAG-T--C-A-T-G-TGA-T-A-CT-AAA-C--ATATTCAGTAC-TTG-TGA-A-------A--ATTTTGTA-CGGA-GTTC--A-----T---T----AC-T-TACTC--GTAT-AA--GATATTGAAA-CGTGCG-T--TC-C-AC-TCTC---GG--T-A--TAAA-T-TTTAGCA----TTTGA--AATAG-AC-AGCATGT---AC--AATCACTTAT-GAT-T--GTTT-TATG--TA-T-GCT-TTATATTTTA-TT-T-CTGTATG-GGACGCCT-TA-A-TTCAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacgaccagctcatgaaactgaatttacaacaatacgcaatgcatgacgatgttggaagattatatacttatttacgtattaaattgataaagcaaaaaagtgatgagaaaaacttctaacgcaaagggaaaccctttcttgtatacagtaatgtattgcatactgtcgaaaattgaaaagtatgccgcgttgtatgcattttaaagcattttcttttatacggaaaagtttttcccaacacttttcatgtaatgtaaaatagattttatttctaaatatcaaaagggtcggtctgtctttagtcgatatcgttggcaatttgcgattaatcaatcattatttgttaattctaagcagagttaagacaaaatcgacgtaaatgtgaataagtcatgtgatactaaacatattcagtacttgtgaaaattttgtacggagttcattacttactcgtataagatattgaaacgtgcgttccactctcggtataaattttagcatttgaaatagacagcatgtacaatcacttatgattgttttatgtatgctttatattttatttctgtatgggacgccttaattca
gi|8 : gacagtatgtacacatgaaacattttcttgtcctataattatgcattatttcctttttataccaaaattactctccatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCAGT-GCA--TCACCG-CCGGG-AAA--GTC-AT-AATA--TTT-T-A--T--GTTA---TT-GCTA--G-C-G-TT--ATC---CAA------G-A-C-AT-TAT---TATA-CAT-GAACCAATATC---G-TCCTATT---AA----TTA--C-----A-TTCT---TTC-C--TT--T-AT----A-----C-----CTAAT--ACTCTC
gi|8 : ATAA----TCT---TA-CGA---C--A-CC-----T---G--ACAGA--A---A---C-TGTA-CAA---TTC-AAAC----ATA-C-GC--AAT--G----C---A-TGC--AG---------T-GGA--GAATCATA--TA----TATC-----TA-----A---TT-----------G-ATAAAGC------AA---AAA--GTG--TGG---AA--AA--TC-TC-T--GACGCAA-GA---GAGAAACC-CT-GTCC----TAA--A-CTA----ATA----T----T--TC--T---T----G-C-A-TA--C-TG--CC-G--AAAA--TTG-AAA-A-------GT-ATG--CC-GC-GTTA-------G--CA--T-TTGCAA--ACA-ATTT-CT--------------G--A-----ATCG--GAT-TT-C-------------CC-C--AA-CA---C-TT--T-CAATG-TAA-G-T--A-AA-ATTGT--TTTT---T--T---T-CTCC--A--A-T--AT-C-AAAAG-GA-T-C-GGCCTG-TATGTTA----TG--A--TCT-G-T-T-G--CA--A--T---T-TGCAA--T-------A------A-T--T----T-T-T-T-----TG--C-TA--A--TTCTAA----A-A--T---------A-AA---AT-C--A--C-G--T-G-A----------AG-T--C-A-C-G-TGA-T-A-AT-AAA-C--A---ACAG--C-CTGTTGA-AATTAAGGA--A---TCTA-AGGA-ATCC--------TC--T----AC-G-TA-GC--G-AT-AT--G-------AA-CCT-CG-A--GT-C-AA--CTC---GGA-T-A-------T-TTT--C-----TT-----GATAGTA--A-TATGT---ACA-AAACAC-TAA-GA-----G--T-TA-G--TA-T---C-TTGTACGTCA-TT-T-CGTTATG-GTA-ACC--TA-A-TTCaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntataatcttacgacacctgacagaaactgtacaattcaaacatacgcaatgcatgcagtggagaatcatatatatctaattgataaagcaaaaagtgtggaaaatctctgacgcaagagagaaaccctgtcctaaactaatatttcttgcatactgccgaaaattgaaaagtatgccgcgttagcatttgcaaacaatttctgaatcggatttccccaacactttcaatgtaagtaaaattgttttttttctccaatatcaaaaggatcggcctgtatgttatgatctgttgcaatttgcaataatttttttgctaattctaaaataaaatcacgtgaagtcacgtgataataaacaacagcctgttgaaattaaggaatctaaggaatcctctacgtagcgatatgaacctcgagtcaactcggatattttcttgatagtaatatgtacaaaacactaagagttagtatcttgtacgtcatttcgttatggtaacctaattc
gi|9 : cagtgcatcaccgccgggaaagtcataatattttatgttattgctagcgttatccaagacattattatacatgaaccaatatcgtcctattaattacattctttcctttatacctaatactctcaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnt---G-CCGGG-AAA--GTC-AT-AATA--TTT-T-A--T--GTTA---TT-GCTA--G-C-G-TT--ATC---CAA------G-A-C-AT-TAT---TATA-CAT-GAACCAATATC---G-TCCTATT---AA----TTA--C-----A-TTCT---TTC-C--TT--T-AT----A-----C-----CTAAT--ACTCTC
gi|9 : ATAA----TCT---TA-CGA---C--A-CC-----T---G--ACAGA--A---A---C-TGTA-CAA---TTC-AAAC----ATA-C-GC--AAT--G----C---A-TGC--AG---------T-GGA--GAATCATA--TA----TATC-----TA-----A---TT-----------G-ATAAAGC------AA---AAA--GTG--TGG---AA--AA--TC-TC-T--GACGCAA-GA---GAGAAACC-CT-GTCC----TAA--A-CTA----ATA----T----T--TC--T---T----G-C-A-TA--C-TG--CC-G--AAAA--TTG-AAA-A-------GT-ATG--CC-GC-GTTA-------G--CA--T-TTGCAA--ACA-ATTT-CT--------------G--A-----ATCG--GAT-TT-C-------------CC-C--AA-CA---C-TT--T-CAATG-TAA-G-T--A-AA-ATTGT--TTTT---T--T---T-CTCC--A--A-T--AT-C-AAAAG-GA-T-C-GGCCTG-TATGTTA----TG--A--TCT-G-T-T-G--CA--A--T---T-TGCAA--T-------A------A-T--T----T-T-T-T-----TG--C-TA--A--TTCTAA----A-A--T---------A-AA---AT-C--A--C-G--T-G-A----------AG-T--C-A-C-G-TGA-T-A-AT-AAA-C--A---ACAG--C-CTGTTGA-AATTAAGGA--A---TCTA-AGGA-ATCC--------TC--T----AC-G-TA-GC--G-AT-AT--G-------AA-CCT-CG-A--GT-C-AA--CTC---GGA-T-A-------T-TTT--C-----TT-----GATAGTA--A-TATGT---ACA-AAACAC-TAA-GA-----G--T-TA-G--TA-T---C-TTGTACGTCA-TT-T-CGTTATG-GTA-ACC--TA-A-TTCaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntataatcttacgacacctgacagaaactgtacaattcaaacatacgcaatgcatgcagtggagaatcatatatatctaattgataaagcaaaaagtgtggaaaatctctgacgcaagagagaaaccctgtcctaaactaatatttcttgcatactgccgaaaattgaaaagtatgccgcgttagcatttgcaaacaatttctgaatcggatttccccaacactttcaatgtaagtaaaattgttttttttctccaatatcaaaaggatcggcctgtatgttatgatctgttgcaatttgcaataatttttttgctaattctaaaataaaatcacgtgaagtcacgtgataataaacaacagcctgttgaaattaaggaatctaaggaatcctctacgtagcgatatgaacctcgagtcaactcggatattttcttgatagtaatatgtacaaaacactaagagttagtatcttgtacgtcatttcgttatggtaacctaattc
blockSeqs : . ACC G . A T G A AT G A AA T ATT T GA ATTT TA AGTG GTAAA C C G G CT G A T A CC . T CTA AAACTTATAT T TTG TTT GA C ACCAAATCA . AAT . T GAG CC A CTAAA CAT CA CAGA GAA GAAC GT AA . CG G . CA TGAATT GCA A TGT . TG GC T CA A CG AC CCTAT ACA CTA TA TTCAG T AAAAAAAA AA G G C GC . G A TT G AG TCG A . . CCG TA T T TCTG AATTACTT TTGG T C T TA C TC AGC AT G T GTACACC GA GG C A TTTAA AA TT C TC T G A A A GA AC AAAATAA . C TGTTTTCTTTTTC G TA C AACC TC T G GA T G . G C ACTTTATAAATCTCT AC T TA . T AA TG G T G GG GA GC CGG C G TT GG AT AAA A GG A TGTTCA G GATTT A A A GCCGG GT G AC AC GCAG GTTAAGAC G TCAT G CA AC A CT A A TGTGAATA T GT C T T T T T C G C TG TATT TA C A G ATTAAGG AT TTT G TT G TAATGGTATTAAAAG A C AG T AAGATATTGA G G T AG T T CT CAG T C TAACT G AG ATTAAT T TAT CAA AAG G G A TA AA T G GA C G TG T G G A A T T
blockSeqs : . . . . A . G A . . . A . T . . CCGT T C GCAG A A . G T . A . T AC . T AA TTATTTGC . C GTT A . ACCAAAATT . A . . A C . . . C CAGA G AA GT AA . CG . . . ACGTG . . AA . . . A . A . T . GC C . TTTG T GGGGG GC . C . . . . . T A A . A . . CG T . T G AATTTCTT . . . C . . . CG . . . . A . . . TGGA G TT A . . . . . G . . AGAA . . C . . . CT . . A T T . . . G ACTTAAGTTTACTC . . . . . G CT . . G GG T . CG . . G . T . . AT . . . AACG . . . . T . . A . ATTAGGC . T . G . . . . . TGT . CC . . . . . . C . . . C C . A . ATTAAGG . . G GC . TCAGTTGATATG . . . . GAATG C . . . . . T . . . TAAA . . AG T A CAG A . T . C . T A AA A A A . . . T . . .
blockSeqs : . . . . A . . A . . . A . C . . CGT . C AG . . . . . . G . A TC . . . AATTATGT . . GCA . . ACAAAAGC T . . . C . . . . AGA . AC GT AA . GC . . . AAAA . . A . . . . . T . C . CC . . TTC T AGA A . G . . . . . . A G . A . . CG . . . . ATTTGCT . . . . . . . AA . . . . A . . . TT A A . . . . . . G . . ATCG . . . . . . CT . . A T T . . . . ACTTTATTTCATT . . . . . G T . . . GT . . CC . . . . T . . . . . . ACA . . . . G . . . . AATTTAC . T . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . A T . A . . . . G T . AATTAATAC . . . . TATTG . . . . . . T . . . TTG . . AT C . TC . . T . T . T . . T . G . . . . . . .
blockSeqs : . . . . A . . A . . . C . T . . CGT . . AG . . . . . . G . T TC . . . TTATTGCC . . CTT . . ACCAAATC A . . . C . . . . TA . AC T AA . G . . . AGTG . . A . . . . . T . C . C . . TTG A GAA A . G . . . . . . A A . A . . CG . . . . AGATTCT . . . . . . . G . . . . A . . . GA . . . . . . . . . . . ATCG . . . . . . C . . . A T . . . . TTTCATTCGTCTT . . . . . G C . . . G . . CG . . . . T . . . . . . CA . . . . T . . . . TTTTAT . T . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . C C . A . . . . G T . TACCGG . . . . AAAG . . . . . . T . . . ACT . . A T . CA . . T . T . T . . . . T . . . . . . .
blockSeqs : . . . . A . . A . . . . . T . . CGT . . G . . . . . . G . G CC . . . TTAGCAT . . GT . . ACAAATCC A . . . C . . . . AG . A T TA . G . . . ATGG . . A . . . . . T . T . C . . TTG A AG A . G . . . . . . A T . G . . CG . . . . ATTTCCT . . . . . . . A . . . . A . . . AC . . . . . . . . . . . CAC . . . . . . C . . . G A . . . . CTATATTGTCCTC . . . . . G T . . . G . . CG . . . . T . . . . . . CA . . . . . . . . . GATTAT . C . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . C C . G . . . . G T . TATTAT . . . . AAC . . . . . . T . . . T . . A C . TT . . T . T . T . . . . G . . . . . . .
blockSeqs : . . . . A . . A . . . . . T . . ACT . . G . . . . . . G . T CC . . . TTATGT . . CT . . ACCAAATC . . . . C . . . . G . C T A . G . . . GTG . . G . . . . . T . T . C . . TTG T AG A . G . . . . . . A A . G . . CT . . . . ATTTCT . . . . . . . G . . . . A . . . GA . . . . . . . . . . . AG . . . . . . T . . . G T . . . . TTATTATTTCTCC . . . . . G T . . . G . . TG . . . . . . . . . . . CA . . . . . . . . . ATTACA . T . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . A T . A . . . . G C . TTCTAA . . . . ATG . . . . . . T . . . T . . A T . CC . . T . T . T . . . . A . . . . . . .
blockSeqs : . . . . A . . A . . . . . T . . CCT . . G . . . . . . G . T CC . . . TTATGT . . GT . . ACAAATC . . . . C . . . . G . A T A . G . . . GTG . . A . . . . . A . C . C . . TTC A AG A . G . . . . . . A A . G . . AG . . . . ATTTCT . . . . . . . G . . . . A . . . TT . . . . . . . . . . . AG . . . . . . C . . . G T . . . . TATTGTTTTTCT . . . . . G T . . . G . . CG . . . . . . . . . . . CA . . . . . . . . . GTATG . T . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . C G . A . . . . G C . TACTAC . . . . AAA . . . . . . T . . . T . . A G . GT . . T . T . T . . . . T . . . . . . .
blockSeqs : . . . . A . . G . . . . . T . . CGT . . G . . . . . . G . T AC . . . ATGTTC . . TT . . TCAAAGC . . . . C . . . . A . C T A . G . . . AAA . . A . . . . . G . T . C . . TTG A GA . . G . . . . . . A A . A . . CG . . . . ATTTCT . . . . . . . G . . . . A . . . TT . . . . . . . . . . . AT . . . . . . C . . . G T . . . . TAAATCATGTAC . . . . . G T . . . G . . CG . . . . . . . . . . . AA . . . . . . . . . AATAC . T . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . C C . G . . . . A T . TATTC . . . . ATG . . . . . . T . . . A . . T T . CA . . T . C . T . . . . T . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . A . . . . . T . . CGT . . G . . . . . . A . C A . . . TTATGC . . TG . . ACAAATC . . . . T . . . . G . C C A . G . . . ATG . . C . . . . . A . T . C . . TTG A AG . . G . . . . . . G G . G . . CG . . . . ATGTTT . . . . . . . A . . . . A . . . TG . . . . . . . . . . . AG . . . . . . C . . . G T . . . . ACTTTTCTTCTT . . . . . G T . . . G . . CG . . . . . . . . . . . CA . . . . . . . . . TTTAA . T . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . A T . G . . . . A C . ATTAC . . . . AAG . . . . . . C . . . T . . T T . CA . . T . T . T . . . . T . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . T . . . . . T . . CGT . . G . . . . . . A . A C . . . TCATT . . CC . . CCAAACC . . . . A . . . . G . C G A . G . . . ATG . . G . . . . . T . C . C . . TTG T AA . . G . . . . . . C A . G . . CG . . . . ATGTCT . . . . . . . G . . . . A . . . TA . . . . . . . . . . . AG . . . . . . C . . . G T . . . . ATTTTATTTCTA . . . . . G T . . . G . . C . . . . . . . . . . . CA . . . . . . . . . CTTAT . T . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . A T . T . . . . G C . TCTAC . . . . ATG . . . . . . C . . . T . . T T . CA . . T . T . T . . . . A . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . A . . . . . T . . GT . . G . . . . . . A . T A . . . TATGG . . CT . . ACCTAAT . . . A . . . . A . A G A . G . . . ATG . . A . . . . . A . T . C . . TG A AA . . G . . . . . . G G . G . . TG . . . . ATGTAT . . . . . . . A . . . . A . . . TA . . . . . . . . . . . AA . . . . . . C . . . G . . . . . TTTTTTTCTCC . . . . . G T . . . G . . C . . . . . . . . . . . AA . . . . . . . . . CTTAC . C . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . A T . T . . . . G A . TCTAC . . . . ATG . . . . . . T . . . T . . T T . A . . T . C . T . . . . T . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . A . . . . . T . . CG . . G . . . . . . A . A A . . . TTAT . . CT . . ACCTAAT . . . C . . . . G . A C A . G . . . ATG . . G . . . . . A . T . C . . TG T AG . . G . . . . . . G G . A . . G . . . . TTTCT . . . . . . . A . . . . A . . . TA . . . . . . . . . . . AA . . . . . . C . . . . . . . . . TTTTTTTCTCC . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . CA . . . . . . . . . ATTAC . C . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . G T . T . . . . C C . . . . . . G . . . . . . . . . . T . . T T . C . . T . T . T . . . . T . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . A . . . . . T . . G . . . . . . . . . A . A C . . . TCAT . . TT . . ATC . . . C . . . . A . C C A . A . . . TG . . T . . . . . A . C . C . . TC T AA . . G . . . . . . G . . A . . G . . . . TTTCT . . . . . . . G . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . ACTTTCTCTT . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . ATTC . A . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . G T . T . . . . C A . . . . . . . . . . . . . . T . . A . . . . . . . . . . . T . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . A . . C . . . TCAT . . CT . . GGC . . . C . . . . G . C . T . G . . . G . . G . . . . . A . C . C . . TG A AA . . G . . . . . . G . . A . . . . . . . TTCT . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . TCTT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . AT . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . T . . . . . A . . . . . . . A . . . . . . . . . . . C . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . A . . C . . . TTAC . . TT . . ACC . . . C . . . . A . C . . . A . . . G . . G . . . . . A . C . A . . TG A AA . . G . . . . . . G . . G . . . . . . . AATT . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AT . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . TTAC . . C . . ACC . . . . . . . A . C . . . . . . . G . . G . . . . . A . T . C . . G A A . . . . . . . . . G . . A . . . . . . . ATTT . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . .
blockSeqs : . . . C . . . ATG . . C . . A . . . . . . . . . C . . . . . . . G . . A . . . . . A . C . . . . T . G . . . . . . . . . G . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . T . . C . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . G . . C . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : .
blockSeqCons : ** *** ** CGT*** G**** C* TTATGC********* ACCAAATC*************** A** *** G*** ATG****** G** C** TTG***** ** A* CG** ** ATTTCT************** A* TN**** ** G* ** TACTAC**************
originalCons : NACAGTTGCA--TC---G-CGGGG-AAAATGTC-AT-AATA--TTT-T-A--T-CGTTA--TTT-ACTA--A-C-G-TT--AT----CAAG---GTG-A-C-AT-TATG--TATA-CGT-GAAACANTTTCCTTG-TCCTA-T---AA----TTA--CG-T--A-TTCT---TTC-C-TTT--T-AT----A-----C-----C------ACTCTCCATTACCAG-ATCACTCTCAGCAGCTGCCCACTCTCCATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCATAAA--TTCT---TA-CGA---CC-A-GC-----T---G--A---G--A---A---C-TGTG-TAA-A-TTG-CAAC-G--ATA-C-GC--A----G----C---A-TGN--CG-AT--GT--T-GGA--AGATTATA--TA-C-TTATT-----TA-C-GTA---TT--AAA--T---G-ATANAGC------AG---AAA--GTGA-TGGGA-AA--AA--CT-TC-T--GACGCAA-GA---GAGAAACC-CT-TTCCCG-GTAT--A-C-A----ATA----A----T--T---T---T----G-C-A-TA--C-TG--TC-G--AAAA--TTG-AAA-A-------GT-ATG--CC-GC-GTTGT---A-TG--CA--T-TTTAAA--CCA-TTTT-CTTT-TA-TAC-G--AG--A-----A--G--GTT-TT-T-------------CC-C--AA-CA---C-TT--T-C-ATG-TAATG-T--A-AA-GTTAA--ACTT---T--T---T-CTCCTTA--A-T--AT-C-AAAAG-GG-T-C-GGCCTG-TAT-TTA-G-TCG--A--TATCG-T-T-G--CA--A--T---T-TGCAA--TT-AATACA------A-T--CA---T-T-T-T-----TG--T-TA--A--TTCTAA----A-A--TT---A--C-A-AT---AT-C--A--C-G--T-G-A--T-------AG-T--C-A-C-G-TGA-T-A-AT-AAA-C--A---NCAGT-C-TTGNTGA-A-------A--A---TGTA-CGGA-ATCC--T-----TC--T----AC-G-TA-TC--G-AT-AA--G-------AA-CGT-CG-A--TT-C-AC-TCTC---GGA-T-A--T----T-TTT--C-----TTTG---AATAGTAC-A-CATGT---ACA-AAACACTTAT-GAT-T--GTTT-TATG--TA-T-GCT-TTTTACGTTA-TT-T-CTGTATG-GGACGCCT-TA-A-TTCAGT
finalCons : NACAGTTGCA--TC---G-CGGGG-AAAATGTC-AT-AATA--TTT-T-A--T-CGTTA--TTT-ACTA--ACGT---T--AT----CAAG----TG-A-C-AT-TATG--TATA-CGT-GAAACANTTTC-TTG-TCCTA-T---AATTATGC---------A-TTCT---TTC-C-TTT--T-ATACCAAATC---------------ACTCTCCATTACCAG-ATCACTCTCAGCAGCTGCCCACTCTCCATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCATAAA--TTCT---TA-CGA---CC-A-GC-----T---G--A---G--A---A---C-TGTG-TAA-A-TTG-CAACG---ATA-C-GC--AATG------C---A-TGG--CG-AT--GT--T-GGA--AGATTATA--TAC--TTATT-----TA-C-GTA---TT--AAATTG-----ATANAGC------AG---AAA--GTGA-TGGGA-AA--AA--CT-TC-T--GACGCAAA-A---GAGAAACC-CT-TTCCCG--TAT--A-C-A----ATAATTTCT--------------T----G-C-A-TA--C-TG--TC-G--AAAA--TTG-AAA-A-------GTA-TG--CC-GC-GTTGTN----TG--CA--T-TTTAAA--CCA-TTTT-CTTT-TA-TAC-G--AG--A-----A--G--GTT-TT-T-------------CC-C--AA-CA---C-TT--T-C-ATG-TAATG-T--A-AA-GTTAA--ACTT---T--T---T-CTCCTTA--A-T--AT-C-AAAAG-GG-T-C-GGCCTG-TAT-TTA-G-TCG--A--TATCG-T-T-G--CA--A--T---T-TGCAA--TT-AATACA------A-T--CA---T-T-T-T-----TG--T-TA--A--TTCTAA----A-A--TT---A--C-A-AT---AT-C--A--C-G--T-G-A--T-------AG-T--C-A-C-G-TGA-T-A-AT-AAA-C--A---NCAGT-C-TTGNTGA-A-------A--A---TGTA-CGGA-ATCCTACTAC--------------G-TA-TC--G-AT-AA--G-------AA-CGT-CG-A--TT-C-AC-TCTC---GGA-T-A--T----T-TTT--C-----TTTG---AATAGTAC-A-CATGT---ACA-AAACACTTAT-GAT-T--GTTT-TATG--TA-T-GCT-TTTTACGTTA-TT-T-CTGTATG-GGACGCCT-TA-A-TTCAGT
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|22 ): TATGTAAACATTAAAACATTTTCTTGTCCTATCAAATCACTCTCCATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCATG
Unaligned ( gi|39 ): AGTAGTATCATGGGGAAAATTTATTTGTTGAAATTATTACCATTATCAAGTG
Unaligned ( gi|43 ): ATTTTTCCAAGCCAAAAAAGGTCAGCCTTCTATAC
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 11 1111 111 111 11111 111111 444 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 222 111111 11 111 111111111111111111 1111111 11 11111111111 1111111111111 222222222222222222222222 11 1111111 11 11111111111111 1111111111 1111111 222222222222222222 1111111111111 1111111 111111 1111
lowQualScore : 33 777 2 2 2 2 4 2 55 2 2 22 333 2 2 2 99999999 55 0000 666 22 111 2 2 4 55 2 2 2 1 88 2 2 2 4 000 4444 00000 2 2 666 444444 888 44 2 555 33 555 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 000 444 2 666 33 2 55555 333 55 999999 555 77777 44 222 2 8888 2 333 999999 4 2 444 22 2 22 22 3 444 55555 888 22 2 8888888 555555555555555555 6 22 2 222 22 22 2 2 44 1 4 2 2 4 22 2 2 2 0 22 77 2 4 2 2 2 55 2 2 55 2 5 33 2 33 2 33 55 2 2 8888888 22 33 2 2 6666666 99 00 5 66 2 2 2 2 8 33 33 44444444444 2 2 7777777777777 2 33 2 77777 33 2 8 55 1 2 33 2 5 555555555555555555555555 33 2 33 2 2 44 777 2 2 0 5 888 66 33 333 2 2 55 33 33 444 2 66 2 777777 2 1111111 2 2 2 66666 00 2 33 55 5555 22222222222222 2 6666 2 55 33 2 33 2 2 0000000000 2 66 2 2 2 2 2 2 4 2 2 33 5555 0 44 2 3 2 6666666 33 444 1 77 2 2 555 222222222222222222 3 3 3 44 3 6666666666666 5 2 2 33 2 2 33 555 2 2 6666666 2 33 444444 1 777 0000 777 2 1 2 66 33 2 4 66 6 4 22 2 2 2 4 0 2 2 2
lowQualScore : .. ... . . . . . . .. . . .. ... . . . ........ .. .... ... .. ... . . . .. . . . . .. . . . . ... .... ..... . . ... ...... ... .. . ... .. ... ........................................................................................................................ ... ... . ... .. . ..... ... .. ...... ... ..... .. ... . .... . ... ...... . . ... .. . .. .. . ... ..... ... .. . ....... .................. . .. . ... .. .. . . .. . . . . . .. . . . . .. .. . . . . . .. . . .. . . .. . .. . .. .. . . ....... .. .. . . ....... .. .. . .. . . . . . .. .. ........... . . ............. . .. . ..... .. . . .. . . .. . . ........................ .. . .. . . .. ... . . . . ... .. .. ... . . .. .. .. ... . .. . ...... . ....... . . . ..... .. . .. .. .... .............. . .... . .. .. . .. . . .......... . .. . . . . . . . . . .. .... . .. . . . ....... .. ... . .. . . ... .................. . . . .. . ............. . . . .. . . .. ... . . ....... . .. ...... . ... .... ... . . . .. .. . . .. . . .. . . . . . . . .
lowQualScore : 99 333 7 5 4 4 7 1 66 4 4 66 888 4 4 5 55555555 99 3333 999 99 222 4 4 7 66 4 6 2 8 33 2 2 2 4 000 7777 88888 2 2 111 222222 333 66 2 999 11 000 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 666 444 2 111 55 1 33333 777 00 444444 888 11111 66 000 0 8888 1 999 000000 0 0 888 99 1 99 88 1 666 00000 000 88 0 5555555 444444444444444444 0 88 0 888 88 88 0 0 88 4 5 0 0 0 88 0 0 0 3 99 99 4 7 4 4 4 66 4 5 99 5 0 44 5 44 5 44 99 5 5 1111111 77 44 5 5 3333333 00 00 3 33 7 7 7 7 0 77 77 55555555555 7 7 3333333333333 7 77 7 11111 77 7 6 88 6 9 99 9 3 111111111111111111111111 77 7 77 7 7 88 111 7 7 9 3 000 33 77 666 5 5 99 44 44 444 5 55 4 222222 5 2222222 5 5 5 22222 99 5 44 99 0000 33333333333333 4 1111 2 33 11 2 11 2 2 8888888888 2 11 2 2 2 2 2 2 4 2 4 22 1111 6 99 5 4 5 2222222 44 444 4 00 7 9 000 888888888888888888 1 1 1 22 1 4444444444444 7 9 9 99 9 9 00 000 9 9 9999999 7 77 888888 1 333 1111 333 5 0 4 11 22 5 7 11 7 4 77 2 2 2 7 7 5 5 5
consensus : NACAGTTGCA--TC---G-CGGGG-AAAATGTC-AT-AATA--TTT-T-A--TCGTTA--TTT-A-CT-A--A-C-G-TT--AT----CA---A-GTG---A-C-AT-TATG--TATA-CGT-GAAACA-NTT-TCTT-G-TCCTA-T---AA----TTA-T--GC-A-TTCT---TTC--C--TTTT---ATA-CC-AAAT-C-ACTCT--CCATTACCCGCATCACTCTCAGCAGCTGCCCACTCTCCATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCATAAA--TTCT---TA-CGA---CC-A-GC-----T---G--A---G--A---A---C-TGTG-TAA-A-TTG-CAAC-G--ATA-C-G-CA---A--TG-CA-TG-G-CGAT--G-T--TGGA--AGATTATATA-C-TTATT-----TA-C-GTATT--AAA-T----T--GATAN--A---GC------AG-AAA-G--TGA-TGGGA-AA--AA--CT-TC-T--GACGCAA-A-AGAGAAAC--C-CT-TTC-CCG--TAT--A-C-A-ATAA-T-TT--C-TT-G--C-A-TA--C-TG--TC-G--AAAA--TTG-AAA-A-------GT-ATG--CC-GC-GTTGT---A--TG--CA--T-TTTAAA--CCA-TTTT-CTTT-TA-TAC-G--AG--A-----A--G--GTT-TT-T-------------CC-C--AA-CA---C-TT--T-C-ATG-TAATG-T--A-AA-GTTAA--ACTT---T--T---T-CTCCTTA--A-T--AT-C-AAAAG-GG-T-C-GGCCTG-TAT-TTA-G-TCG--A--TATCG-T-T-G--CA--A--T---T-TGCAA--TT-AATACA------A-T--CA---T-T-T-T-----TG--T-TA--A--TTCTAA----A-A--TT---A--C-A-AT---AT-C--A--C-G--T-G-A--T-------AG-T--C-A-C-G-TGA-T-A-AT-AAA-C--A---NCAGT-C-TTGNTGA-A-------A--A---TGTA-CGGA-ATC-C---TAC------T---------AC-G-TA-TC--G-AT-AA--G-------AA-CGT-CG-A--TT-C-AC-TCTC---GGA-T-A--T----T-TTT--C-----TTTG---AATAGTAC-A-CATGT---ACA-AAACACTTAT-GAT-T--GTTT-TATG--TA-T-GCT-TTTTACGTTA-TT-T-CTGTATG-GGACGCCT-TA-A-TTCAGT
Reference ( family-948 ) : NACAGTTGCA--TC---G-CGGGG-AAAATGTC-AT-AATA--TTT-T-A--TCGTTA--TTT-A-CT-A--A-C-G-TT--AT----CA---A-GTG---A-C-AT-TATG--TATA-CGT-GAAACA-NTT-TCTT-G-TCCTA-T---AA----TTA-T--GC-A-TTCT---TTC--C--TTTT---ATA-CC-AAAT-C-ACTCT--CCATTACCAG-ATCACTCTCAGCAGCTGCCCACTCTCCATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCATAAA--TTCT---TA-CGA---CC-A-GC-----T---G--A---G--A---A---C-TGTG-TAA-A-TTG-CAAC-G--ATA-C-G-CA---A--TG-CA-TG-G-CGAT--G-T--TGGA--AGATTATATA-C-TTATT-----TA-C-GTATT--AAA-T----T--GATAN--A---GC------AG-AAA-G--TGA-TGGGA-AA--AA--CT-TC-T--GACGCAA-A-AGAGAAAC--C-CT-TTC-CCG--TAT--A-C-A-ATAA-T-TT--C-TT-G--C-A-TA--C-TG--TC-G--AAAA--TTG-AAA-A-------GT-ATG--CC-GC-GTTGT---N--TG--CA--T-TTTAAA--CCA-TTTT-CTTT-TA-TAC-G--AG--A-----A--G--GTT-TT-T-------------CC-C--AA-CA---C-TT--T-C-ATG-TAATG-T--A-AA-GTTAA--ACTT---T--T---T-CTCCTTA--A-T--AT-C-AAAAG-GG-T-C-GGCCTG-TAT-TTA-G-TCG--A--TATCG-T-T-G--CA--A--T---T-TGCAA--TT-AATACA------A-T--CA---T-T-T-T-----TG--T-TA--A--TTCTAA----A-A--TT---A--C-A-AT---AT-C--A--C-G--T-G-A--T-------AG-T--C-A-C-G-TGA-T-A-AT-AAA-C--A---NCAGT-C-TTGNTGA-A-------A--A---TGTA-CGGA-ATC-C---TAC------T---------AC-G-TA-TC--G-AT-AA--G-------AA-CGT-CG-A--TT-C-AC-TCTC---GGA-T-A--T----T-TTT--C-----TTTG---AATAGTAC-A-CATGT---ACA-AAACACTTAT-GAT-T--GTTT-TATG--TA-T-GCT-TTTTACGTTA-TT-T-CTGTATG-GGACGCCT-TA-A-TTCAGT
gi|1 : ACAGTTGCAGATCA--G-CGGGGGAAAATGTC-AT-AATAG-TTT-T-A--TCGTTA--TTA-A-CT-G--A-CTGCTT--AT----CA---A-GCGTGCA-C-AT-TCTG--TATA-CAT-GAAACA-CTT-TCTTTGCTCCTA-T---AA----TAAGC--AC-A-TTCT---TTC--C--TTTT---ATT-CC-G-------CCCT--CCCTTACCCGCATCACTCTCAGCAGCTGCCCACTCTCCATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCATAAA--TTCTATACA-CGA---CC-A-GC-----T---G--A---G--A---A---C-TTTG-CAA-A-TTGGCAAC-GCGATA-CCG-CAGC-A--TG-CG-CC-G-C-AT--G-T--TGGA--CGATTGTATA-CCTTATT-----TA-C-GT-TT--AAA-T-------GATAT--A---GC------AG-AAA-G--TGA-TGGGA-AG--AAATCT-TC-T--GACGCAATG-AGAAAAAC--CACTGTTC-CCGAGTATG-A-C-A-ATAA-T-TT-----T-G--T-A-TA----TG--GC-A--AAAC--TTG-AAA-A-------GT--T---CC-GC-GTTGT---AC-TG--CA--C-ATTAAAG-CTA-TTTT-CTTT-TA-TAC-G--AG--A-----A--G--GTTGTT-T-------------CC-C--AA-C----T-TT--T-C-ATGCTAATG-TTTA-AA--TTAA--ACTT---T--T---T-CTCCTTA--A-T--ATGC-AAAAA-AA-T-C-GGCCTG-TAT-TTA-G-TCC--A--TATCG-T-T-G--CA--A--T---T-TACAA--TT-GATACA------A-T--AA---T-T-T-T-----TA--T-TC--A--TTCTAA----A-A--TT---A--C-A-AC---AT-C--A--C-G--T-G-A--T-------AG-T--C-A-C-G-TGA-T-A-AT-AAA-C--A---GCAGT-C-TTGTTGA-A-------A--A---TGTA-AGGA-ATC-C---TTC------T---------AC-G-TA-TC--G-AT-AA--G-------AA-CGT-CG-A--TT-C-AC-TCTC---GGA-T-A--T----T-TCT--C-----TTTG---AATAGTAC-A-CATGT---ACA-AAACACTTAT-GAT-T--GTTT-TATG--TA-T-GCT-TTTTACGTTA-TT-T-CTGTATG-GGACGCCT-TA-A-TTCAGT
gi|10 : gTT-A-CT-A--A---G-TTTAAT----CA---A-GTG---A-C-ATGGATG--TATA--AT--AAACA-ATT-TATT-G-TCCT--TCTAAA----TTA-T--GT-A-TTCCTTGTTT--G--TTTT---A-A-CC-AAAT-CAACTCT--CCA
gi|10 : C-A-GC-----T---A--A---G--A---A---AATGTGGTAA-AATTG-CAACCG--ATA-T-A-CA---ACGTG-CA-TG-A-CGAT--G-CGCTGGA--GTATTATATA-T-TTATT-----GA---ATATT--AA----------GAT-----------------------G--TGAGCGGGA-GA--AC--CT-TC-T--GAAGTTA-A-ATCGGAACAAT-CC-TTC-CCG--TAT--A-C-A-ATA----TT--C-TT-G--C-A-TA--C-TG--TCCG--AAAAATTTG-AAA-G-------CT-ATG--CC-GC-GTTGT---T--TG--CA--T-TTTAAA--CC--CTTT-CTTT-TA-TAC-G--AG--A-----A--G----T-TT-T-------------CC-C--AA--A---C-TT--T-CGATT-TATTG-T--A-AA-GTT-A--ACTT---T--A---T-TTCATTA--ATT--AT-C-ATAA--GG-T-T-GGCTTG-TAT-TTAGG-TCGT-A--CCTCG-T-T-G--CA--AT-T---T-TGCAA--TT-AATACA------A-TA-CA---T-T-T-T-----TG--TGTAACA--TTCTAA----A-G---T---A--TGG-AT---AT-C--A--C-G--T-G----T-------AGTT--C-ATC-GTTGA-T-ACAT-Aatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgttaattttcccccacgaaacagctaagaaaatgtggtaaaattgcaaccgatatacaacgtgcatgacgatgcgctggagtattatatatttattgaatattaagatgtgagcgggagaaccttctgaagttaaatcggaacaatccttcccgtatacaatattcttgcatactgtccgaaaaatttgaaagctatgccgcgttgtttgcattttaaaccctttcttttatacgagaagttttcccaaactttcgatttattgtaaagttaactttatttcattaattatcataaggttggcttgtatttaggtcgtacctcgttgcaattttgcaattaatacaatacatttttgtgtaacattctaaagtatggatatcacgtgtagttcatcgttgatacatatagttacaa
gi|11 : ttactaagtttaatcaagtgacatggatgtataataaacaatttattgtccttctaaattatgtattccttgtttgttttaaccaaatcaactctccaatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgttaattttcccccacgaaaGTTGCA--TC---G-CGGGG-AAAATGTT-ATGGATA--TTTGT-A--TCGT----TTT-A-CT-A--A---G--T--AT----CA---A-GTG---A-C-AT-TATG--TATAGCAT-GAA--A-ATT-CCTT-T-TC--A-T----A----TTA-T---C-A-TTAT---TTCTTC--TTTT---ATA--C-AAAT-C-ACTCT--CCATTtagttacaa
gi|11 : atTACA--TACT---TA-TAAGAGCC-A-GC-----T---G--A---GA-A---A---C-TGC--TGA-A-TTG-CAAC-G--ATA-C-T-C----A--TG-CA-TGTG-TCGT--GTT--TGGA--AGATT-TATA-C-TTATT-----TA-C-GT-TT--AAATT----T--GA-AT--A---AC------AG-AAA-G--TAA-TGGCACAA--AA--CG-TA-T--GAC-CAA-G-GGA-AGAC--C-TT-CTC-CCG--TATTAA-C-AGATAA-T-TTG-C-TT-G--C-A-T---C-TG--TC-AGCATAT--TTA-AAA-A-------GT-ATG--CC-GC-GTTTTTTAA--TG--CA--T-TTTAAA--CTATTTTT-CTTT-TA-TAC-G--GG--AAAAATA--A--GTT-TT-TTGTTTTCTTTTTCCC-C--AA-AAAACC-TT--T-C-ATGATAGTG-T--A-AA-GTTAA----TT---TCAT---T-CGTCTTA----------T-AAAAG-GA---C-GG-CTG-T-T-TTA-G-TCG-----TAT---T-T-G--C---A--T---T-TGCAA--TT-AAtctttgttagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttacatacttataagagccagctgagaaactgctgaattgcaacgatactcatgcatgtgtcgtgtttggaagatttatacttatttacgtttaaatttgaataacagaaagtaatggcacaaaacgtatgaccaagggaagaccttctcccgtattaacagataatttgcttgcatctgtcagcatatttaaaaagtatgccgcgttttttaatgcattttaaactatttttcttttatacgggaaaaataagttttttgttttctttttccccaaaaaacctttcatgatagtgtaaagttaatttcattcgtcttataaaaggacggctgttttagtcgtatttgcatttgcaattaaat
gi|12 : atgttgcatcgcggggaaaatgttatggatatttgtatcgttttactaagtatcaagtgacattatgtatagcatgaaaattccttttcatattatcattatttcttcttttatacaaatcactctccatttctttgttagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntGT-GAACCA-TTT-TCTT-G-TCCTA-----AG----TTA-TTTGC-A-TTTT---TTC--T--TTTTT--ATA-CA-AAAG-C-ACTCT--CCATat
gi|12 : CATAA---TTCT---TA-CGA---CC-A-GC-----C---G--A---A--A---A---A-AATG-TAA-AATTG-CAAC-G--ATA-T-A-CA---G--TG-CA-TG-A-CGAT--G-T--TGGA--AGTTTATATA-C-T-AGT-----TA-C-GTATT--AAA-T----T--CATAT--A---TC------AG-AAAAG--TGA--GGGA-AA--AA--AT-TA-T--GACACAA-A-CG-GAAAC--C-CT-TTC-CCG--TAT--A-C-A-ATAA-T-TT--C-TT-G--C-A-TA--C-TG--TC-G--AAAA--TTG-AAA-A-------GT-ATG--CC-GC-GTTAG---A--TG--CA--T-ATTAAA--CCA-TTTT-CTTT-T--TAC-A--CG--G-----A--G--AGT-TT-T-------------CC-CTAAA-CA-----TT--T-C-A---------T--A-----TTAA--TCTT--------------------------------AAAG-GA------ACTTA-TAT-TTC---TCA--A--TATC----------A--A-----------AAGGCT-CATACA------A-T--CA---T-T-T-T-----TG--T-TA--A--TTCTAA----A-A--AT---A--C-A-AT---AC-C--A--C-G--T-G-A--T-------AG-T--C-A-C-G-TGA-T-A-AC-AAA-C--A---nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncataattcttacgaccagccgaaaaaaatgtaaaattgcaacgatatacagtgcatgacgatgttggaagtttatatactagttacgtattaaattcatatatcagaaaagtgagggaaaaaattatgacacaaacggaaaccctttcccgtatacaataatttcttgcatactgtcgaaaattgaaaagtatgccgcgttagatgcatattaaaccattttctttttacacggagagttttccctaaacatttcatattaatcttaaaggaacttatatttctcaatatcaaaaggctcatacaatcatttttgttaattctaaaaatacaataccacgtgatagtcacgtgataacaaacaa
gi|13 : gtgaaccattttcttgtcctaagttatttgcattttttcttttttatacaaaagcactctccatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCAGTTGCA--TT---G-CGGGG-AAAACGTTTATGAATA--TTT-T-AAATCATTA--CTT-A-CT-A--A-C-G-TT--AT----CA---A-GTG---A-C-AT-GATG--TATA-AGT--AAACA-ATT-TATT-G-TCCTA-TAA-AA----TTA-T--GT-A-TTCT---TTCG-T--TTTT---ATA-CC-AAAT-C-ACTCT--CCAa
gi|13 : -CA---G--TG-CA-TG-A-CGAT--G-C--TGGA--AGTTTATATA-T-TTATT-----GA-C-ATATT--AAA-T---------------------------------G--TGA-GGGGA-GA--AA--CT-TC-T--GACACAA-T-GGA-AAAT--C-CT-TTC-CCG--TAT--A-C-A-ATAA-A-TT--C-Tatttctatgtattgaattatgaaattgataatcatattaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacagtgcatgacgatgctggaagtttatatatttattgacatattaaatgtgaggggagaaacttctgacacaatggaaaatcctttcccgtatacaataaattct
gi|14 : cagttgcattgcggggaaaacgtttatgaatattttaaatcattacttactaacgttatcaagtgacatgatgtataagtaaacaatttattgtcctataaaattatgtattctttcgtttttataccaaatcactctccaatttctatgtattgaattatgaaattgataatcatattaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaCT---TG-CGA---CC-A-AT-----T---TC-A---G--A---A-----TGTG-TAA-AATTG-CAAC-G--ATA-T-A-TA---G--TG-CA-TG-G-TGGT--A-T--TCAA--AGTCTACATA-T-TTATA-----TG-C-CTGTT--ACA-T----T--GATAT--ATCGGG------GG-AAA-----AA-CTGGA-AAGCAA--CG-TC-T--GACACAA-A-A-AGAA----------TC-CTA--CAT--C-T-G-ATAA-T-TT--C-TT-C--C-A-TA--T-TC--TT-A--AAAA--TTG-AAA-AGTACACCGT-ATG--CA-GC-CTTGA---C--CG--CA--T-TTTAAA--TTA-CCTTGCTTT-TA-TCG-G--AG--A-----A-----ATC-GC-T-------------CT-A--AG-CG---CTTT--T-C-AGT-TAATG-T--A-AA-GTAAAT-ATTG---T--T---T-TTC--TA--A-T--AT-A-AAAA---G-C-C-GGTCTT-TAT-TTT-G-TTC--A--AATCC-A-T-G--TA--AT-T---T-TGAGA--TT-ACTGTA------A-T--GATTTT-T-T-T-----TT--T-TG--G--TTCTAA----ATT--TT---A--T-A-AT---------------------------------G-T--C-A-C-A-TGA-T-G-AT-AAA----A---CTTGC-T-TTGATGG-A-------A--A---TGTA-TGGA-A
gi|15 : A-GTTAA---CTA---TA-T---T-GTCCTCA--A-T--AT-CTAAAAG-GG-TGC-GGCCAG-TAT-T-A-G-TTG--A--TGTCG-T-T-GG-CA--A--T---T-T-TA----T-AATACA--------T--CA---T-T-T-T-----TGGTT-TA--AA-TTCTAA----A-A--TT---AGGC-A-AC---AT-C--A--T----T-G-A--T-------AG-TGTC-A-C-A-TGA-TTA-ATGAAA-C--A---ACAAT-C-TTCATGA-A-------A--A---TGT--TGGA-ATCGC---TA-----------------AC---TA-T------------------------GT-CT-A--TT-C-AC-TCTC---GGG-T-A--T----T-TTT--C------TTG---AATAGTA--A-CATGC---A----------TGT-GAC-T--G-TT-TATG--TA-TGGCA-TTTTACGTTC-TT-T-CTGTAT--GGACGCCT-TA-A-TTCAGgc
gi|16 : atTCT---AA-CAA---CC-A-GA-----T---G--A---AGAA---A---C-TGTA--AA-A-TTG-CAAC-G--ATA-C-T-CA---A--AA-CA-TG-A-CGAT--A-T--TGGA--AGTTTATATA-C-TTATT-----TA-C-GTATT--AAA-T----T--GATAA--A---GC------AGAAAA-G--TAA-TGGGA-AA--AA--CT-TC-T--GACACAA-A-GGA-AAAC--C-TT-TTC-CCG--TAT--A-C-A-GTTA-T-TT--C-TT-G--C-A-TA--C-TG--TC-G--AAAA--TTG-AAA-A-------CT-ATG--CA-GC-TTTGG---A--TG--CA--T-TTTAAA--CCA-TTTT-CCTT-TA-TACAG--AG--A-----A-----GTT-TT-T-------------CC-C--AA-CA---C-Tct
gi|17 : A-CGA---CC-A-GA-----T---G--A---G--A---AA--C-TG-G-TAA-AATTG-CAGC-G--ATA-C-T-CA---A--AAACA-TG-AACGAT--A-T--TGGA--AG-TTATATA-T-CTTTT-----TAGC-ATACT--TAA-T----T--GATAA--A---GA------GA-AAA-G--TAA-TGG---AA--AA--CT-TC-T--GAC-CAA-A-GG-GAA----C-TT-TTCGCCG--TATT-A-C-A-GTAA-T-TT--C-TT-GGGC---TA--C-TG--TC-G--AAAA--T-G-AAA-A--------T--TG--CC-GC--TTGT---GGATG--CA--T-TTTAAA--CCA-TTTT-C-TT-TA-TACGG--AGACA-----A--T--GTT-TT-TC------------CC-C--AA-CA---T-TT--T-
gi|18 : A----A-T--TT---A--A-A-TT---AT-C--T--T-G--T-G-A--T-------AG-T--C-A-C-G-TGA-T-A-AT-GAA-C--A---CCTGC-C-TCTATGA-A-------A--A---CGTA-TGGA-AGC-A---TAC------C---------GG-G-TA-TG--G-TT-----G-------AA-CGT-TGTT--TT-C-GT-TTTC---GGA-T-A--T----T-TCT--C-----ATTG---AATGTTTT-C-CATATAAGACAGAAACA--TAT---------TTT-TATGGATA-TAGTTGTTTTGCTTTA--T-T-CTGTATA-GGATGC---TATA-TTCAAT
gi|19 : atattgttgtaaatattgcggttttttaaccgatgttc-T-T-C--CA--A--T---A-TG--A--TC-ATTACA------A-T--CA---TAT-T-TGCCGGTG--T-TG--A--TTTT-------------------T-A-AT---GT-C--A--C-A--T-T-A--T-------AG-T--C-A-T-T-TAA-T-G-AT-AAA-C--A---CGTGC-C-CCCATGA-A-------A--A---TGTA-CGGG-AGC-C---TAT------T----------C-GATA-TT--G-GC-AT--G-------AA-TGT-TG-A--TT-C-TT-TCTC---AGA-T-A--T----T-TTT--C-----ATCG---AATCATTC---CA--T---AGA-AAATACGAAC-AAT-T--GTCTGTATG--TA-T-ATG-TT-----TTA-TT-C-TTGAATG-GGGGACCT-TA-A-TTCAGTa
gi|2 : ttgcACATTTCCA--TT---G-CGGGA-AAA---TC-AT-A-TA--TTT-T-AA-TC--TA--TTT-A-CT-AGAA-C-G-TTT-AT----CA---A--TG---A-C-AT-GATG--TATA-CGTTGGAACA-TTT-TATT-G-TCCTA-TAA-AA----TTA-T--GT-A-TTCT---TT---G--GTTT---ATATTC-AAAG-C-A-TCT--CCAt
gi|2 : cttCATAA---TTCT---TA-CGA---AC-A-GC-----A---A--AT--A--A---A---A-TGTGGTA----TTG-CAAC-G--ATA-T-A-CA---AG-TG-CA-TG-A-CGATTGG-T--TGGA--AG-TTATATAAC-TTATT------A-C-ATAT---AAA-T----T--CATAT--A---TC------AG-AAAAG--TGA-GGAGA-AA--AA--CT-TC-T--GACACAA-A-GGGGAAAT--C-CT-TTC-TCT--TAT--A-C-A-ATAA-GATT--C-TT-GT-C-ATTA--T-CGTCTC-G--AAAA--TTG-AAA-A-------GT-ATG--CC-GCAGTTGT---T--TG--CATTT-TTTAAATCCTA-TTTT-CTTT-TA-TACGG--AG--AC----A--C--GTT-TTCT-------------CC-C--AACCA---C-TTTCT-C-ATA-TATTC-T--A-AA-GTTTA--ACTTAAGT--T---TACTC---A--A-TTAGT-C-AAAA--GG-T-CGGGCTTGTTAT-TTAGG-TCG--AGCTATCG-TCT-G--CA--AT-T---T-TGCAAATTC-AAGACA------A-T--CA---T-T-T-G-----TGT-T-TA--A--TTCTAA----AGA--TT---A--T-G-AT---AT-C--AACC-GCTT-G-ATGT-------AG-T--C-A-C-G-TGATT-A-AT-AAA-C--A---ACAAT-C-TTGGTGAGA-------A--A---TGTA-CGGA-ATC-C---T-CAGTTGAT---------ATGG-TA-TC--G-AT-GAATG-------AA-CAT-CG-A--TT-CTAC-TCTC---GGG-T-A--A----T-TTT--CA----GTTGTATAGTAGTAC-A-CATGT---ACA-AAACACTTAT-TAT-TAAATTTATATG--TACT-GCT-TTTAACGTTA-TTGT-CTGTATGAGGACGCCTATA-A-TTCAGannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncataattcttacgaacagcaaataaaatgtggtattgcaacgatatacaagtgcatgacgattggttggaagttatataacttattacatataaattcatatatcagaaaagtgaggagaaaaacttctgacacaaaggggaaatcctttctcttatacaataagattcttgtcattatcgtctcgaaaattgaaaagtatgccgcagttgtttgcattttttaaatcctattttcttttatacggagacacgttttctcccaaccactttctcatatattctaaagtttaacttaagtttactcaattagtcaaaaggtcgggcttgttatttaggtcgagctatcgtctgcaattttgcaaattcaagacaatcatttgtgtttaattctaaagattatgatatcaaccgcttgatgtagtcacgtgattaataaacaacaatcttggtgagaaatgtacggaatcctcagttgatatggtatcgatgaatgaacatcgattctactctcgggtaattttcagttgtatagtagtacacatgtacaaaacacttattattaaatttatatgtactgcttttaacgttattgtctgtatgaggacgcctataattcag
gi|20 : cttacatttccattgcgggaaaatcatatattttaatctatttactagaacgtttatcaatgacatgatgtatacgttggaacattttattgtcctataaaattatgtattctttggtttatattcaaagcatctccaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-C--A--C-G--T-G-A--T-------AG-C--C-A-C-A-TGA-T-G-AT-GAA-C--A---CCTGG-T-TGGATGA-A-------A--A---T-TATTTGA-ATC-A---TAT------T---------AT-G-TA-TCAGA-AT-AA--A-------AA---T-TG-A--TT-C-GC-TTTC---GGA-T-A--TTG--T-TTT--C-----ATCG---AATAGTAT-T-CATGT-----A-AAGCACTCATAGAT-T--GTTT-TATT--TA-T-GTG-TTTTACTGTA-TT-T-CTGTACA-GGGCGTCC-TA-A-TTC
gi|21 : T--T-T-ATG-TAAAG-T--A-AGCGTTAAT-AAAT---C--A---T-GTAC--A--A-A--AT-A-AAAGG-AG-T-C-GGTCTG-TTT-ATA-G-TCG--A--TATTG-T-T-G--CA--A--T---CATGCGA--TT-GTTACATGTTCAA-T--AA---T-T-T-T-----T---C-CG--G--TGCTAA----A-C--TT---A--T-A-AT---GT-C--A--C-G--T-G-A--T-------AA-T--A-A-C-G-CGA-T-A-AT-ACA-C--T---CCTAC-A-TTGATGA-A-------A--A---TGTA-
gi|23 : tagTTT---TG-CAG---CT-A-GT-----T---GCAA---A--A---A---C-TGTA-TAA---TTG-TCAT-G--ATA-T-A-CA---G--TG-TA-C----CGGT--G-G--TGGACAAAATCATATT-T-CTATTCCTATTA-C-ATACT--A---T----TA-GATATTAA---G--------A-AAA-G--TGT-TGGGA-GC--AA--CT-TC-T--AACACAA-A-AT-GAAAC--C-AC-TTC-CCG--CA
gi|24 : gcCATAAT--TTCA---TA-CGA---CA-G-GC-----G---G--A------A---A---C-TGTG--AA-A-TTG-CAA
gi|25 : annnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaTCT---TA-CGA---CA-A-GC-----T---G--AA--G--AG--A---C-TGTG--AA-A-TTG-CAAC-G--ATA-C-G-CATGAA--TT-CA-TG-G-CGAT--G-T--TGGA--AGGTTATATT-C-TTGTT-----TA-C-GTATT--GAA-T----T--GATAA--A---AC------AGAAAA-G--TGA-TAAGA-AA--AA--CT-TC-T--GACAC-A-A-AGAGAAAC--C-CT-TTC-CC
gi|26 : --T----T-TTT--C-----ATTG---AATATTAC-C-CATGT---A---AAACACTTAA-AGT-T--GTTT-TATC--TAAT-GTA-TTTTACTCTA-TT-T-CTGTATA-GAACGTTT-TA-A-TTCAAT
gi|27 : gagggctacattattgcagctagaagccttacaaggctatcggtatgaatgttagAGATGAA--TC---G-CGGGG-AAA-------T-A-TA--TTT-T-G--TCATTA--TTT-A-CA-A--C-C-G-TT--AT----CA---A-GTG---A------TATGCTTAAA-CG--AAAACG-TTT-ACTT-A-TCAAA-C---AA----ATG-T--TC-ATTTCT---TTC--T--TTTTC--ATA-TC-AAAT-A-ACT-----CATTAt
gi|28 : ttcttttACAGTTGCA--TC---G-CGGGG-AAA-TGTC-AT-A-TA--TTT-T-AA-TCGTTA--TTT-A-CTAA--A-C-T-TT--TT---------A-GTG---G-CGAT-TATG--GA-A-CGT-GAAACA-TTTATCTT-G-TCCTA-T----A----TTA-T---C---TTCT---TTC--T--GTTTGGCATA-CC-AGAT-C-ACTCT--TCttctttatatga
gi|29 : --AGATTATATA-T-TTATT-----TA-C-GTATT--AAA-T----T--CATAA--A---GCAA----AA-AAA-G--TGA-TGAG--AA--AA--CT-TT-T--GACGC-A-A-AGGGACAC--C-CT-ATC-TAG--TAT--A-C-A-GTAA-T-GT--T-TT-G--C-A-TA--C-TG--TC-A--ACAA--TTG-AAA-A-------GT-ATG--CC-GC-
gi|3 : GGGT-AAAAT-TC-AT-AAAAATTTT-T-AC-TCGTTA--TTT-AACT-ATGA-A-G-T----------A---A-ATG---A---AT-GATG--TATA-CGC-GAAACATTTT-TCTT-G-TCCTA-T---AAAAACTTA-T--AT---TTCTC--TTCG-C--ATGT---ACA-CC-AAAG-C-ACTTT--CTA
gi|3 : AA--TTCT---TATCGA---AC-A-GTCTAAAT---G--A---G--A---A---A-TGTGGTA----TTG-CAAC-G--ATAGT-A-CA---G--TG-CAATG-A-CGAT--G-T--TGGA--AGTATATATA-T-TAATT-----TG-C-GTATT--AAA-T----TCAGA-AT--A---TC-------G-AAA-GCGTGA-GGGGA-GA--AA--CT-TCAT--GA-ACCA-A-AGGGACGA--T-CT-TTC-C-G---AT--A-C-A-ATAA-A-TTACT-TT-G--C-A-TA--C-TG--TC-A--AAAAA-TTG-AAA-A-------GT-ATT--CC-GC-GTTGT---T--TG--CATTT-TTTATA--CCA----T-CTTT-TA-TAC-G--CG--G-----A--GAAGTT-TT-T-------------CC-C--AA-CA---C-TT--T-C-AT--T-ATG-T--A-AAGGTTAC--ACTT---TA-TAAAT-CTC--TA--A-T--A--C-AAAAG-GGCT-C-GG-CTG-TTT-TTA-GTTCGGAA--TATCG-T-T-G--CAGGA--T---A-TGCAA--TT-AATAAA------A-TAACG---T-T-TAT-----GG--T-TA--A--ATCTAA----A-A--TT------C-G-AT---ATGT--A--CAG--T-G-A----------AT-C--C-A-C-G-TGA-T---AT--AA-CTGA---ACAAT-C-TTGGTGG-A-------AATA---TGTAGCGGAGATC-C---TAA------TGGTATTAAAAG-G-GA-TC--G-AT-TATTG-------AAGCGC-CG-AAGTT-C-AC-TCTC---GGG-T-AACT----T-TTT--CATTAATTGA---AATACTAG-T-CATGTA--ACT-AAAAACTTAT-GAT-T--ATTT-TATT--TATT-GCT-CTTAACGTTA-TT-T-CTGTAT--GGACG-CT-TA-A-TTCAannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaataattcttatcgaacagtctaaatgagaaatgtggtattgcaacgatagtacagtgcaatgacgatgttggaagtatatatattaatttgcgtattaaattcagaatatcgaaagcgtgaggggagaaacttcatgaaccaaagggacgatctttccgatacaataaattactttgcatactgtcaaaaaattgaaaagtattccgcgttgtttgcattttttataccatcttttatacgcggagaagtttttcccaacactttcattatgtaaaggttacactttataaatctctaatacaaaagggctcggctgtttttagttcggaatatcgttgcaggatatgcaattaataaaataacgtttatggttaaatctaaaattcgatatgtacagtgaatccacgtgatataactgaacaatcttggtggaaatatgtagcggagatcctaatggtattaaaagggatcgattattgaagcgccgaagttcactctcgggtaactttttcattaattgaaatactagtcatgtaactaaaaacttatgattattttatttattgctcttaacgttatttctgtatggacgcttaattca
gi|30 : gggtaaaattcataaaaatttttactcgttatttaactatgaagtaaatgaatgatgtatacgcgaaacatttttcttgtcctataaaaacttatatttctcttcgcatgtacaccaaagcactttctaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaatACAGTTGCA--TC---G-C-GGG-AAAAT-TC-AT-GAT---TTT-T-A--TCGTTA---TT-A-CC-A--A-C-G--T--AT----CAG--A-GTG---ACC-AT-TATG--TATA-CAT-AAAACA-TTT-CCTT---TTCTA-T---AA----TTA----GC-A-T--A---TTC--C---TTT---ATA--C-AAATCC-ACTCT--CC
gi|31 : ttACAGTTGCA--GC---G-CG------AATGTC-AT-AATA--TTG---A--TC--TA--TTT-A-C-----A-C-C-TT--AT----CA---AAGTG---A-C-AT-TATG--TATA-CAT-GAA-TA--TT-CCTT-G-TC-TA-T---AA----TCA-T--AC-A---CT---TTC--C--TTTT---ATA-CC-AAAT-C-ACTCT--CCA
gi|32 : tt-A-TTG-CAAC-A--ATA-C-G-CA---A--TG-CA-TG-G-CGAT--G-T--AGGA--AGATTATATA-C-TTGTA-----TA-C-GTATT--AAA-T----T--GGTAA--A---GCAAAAAAAA-AAA-G--TGA-TGAG--AA--AA--CT-TC-T--GACGC-A-A-AGGGACAT--C-CT-TTC-TCG--T
gi|33 : ACAGTTGCA--TC---GGCGGG---AAATGTC-AT-AATA---TT-A-A--TCG--A--TTT-A-CT-A--A-C----T--AT----CA---A-GT----A-C-AT-TATG--TATA-C---AGAATA---T-TCCT-G-TCC-A-T---AA----TCA-T--AC-A---CT---TTC--C--TTTT---ATA--C-AAAT-C-ACTCT--CC
gi|34 : t-------AA-CGT-TG-A--CT-C-AC-TCTC---GGA-T-A--T----A-TTT--T-----TTT-----ATATGAC-A-CATGT---ACA-AAACACTTGT-GAC-T--ATTT-TATG--TA-T-GCT-TTTTACGTTG-TT-T-CTGTGTG-GGGCGCC
gi|35 : A--TT-AATACA------A-T--CA---A-T-T-T-----TG--T-TA--A--TTCTAA----A-C--TT---A--C-G-ATCATAC-C--A--C-A--T-G-A--T-------AG-T--C-A-C-G-TGA-T-A-AT-ACA-C--A---AACGT-C-TTAGTGA-A-------A--A---TATA-TGGA-ATC-C---T
gi|36 : TTT---TA-CGA---CC-A-GC-----T---G--T---A--A---A---A-AGTG-CAATA-TTG-CAAC-G--ATA-T-A-CG---G--TG-TA-TG-
gi|37 : TTAT-GAT-T--GTTT-TATG--TA-T-GCT-TTTTACGTCA-TT-T-CTGTATG-GTAAGCCT-TA-A-TTCAGctaggaattttcagtctgtatctttatattcttattaca
gi|38 : A--TC---G-CGGGG-AAAATGTC-AT-AATA------T-A--TCGTTA--T
gi|4 : aggttcttatat-AT-AGAA--TTT-T----TCGTTA--TTTTA-CT-A--AAT-T-TT--AT----CG---A-GTGC--A-C-ATGTATG--TCAA-CAT-G-------TT-ACTT-G-TCCGA-T---AA----TTA-TT-GCCA-TTTT---TCC--T--TTTT---ATA-CC-AAAT-CGACTCTTACCATcaagtgatatgct
gi|4 : CATAAAATTCCT---TG-CGAA--CC-AAGC-----T---G--A---G--A---AGAAC-TGTG--AA-A-TT--CAAC----ATA-C-G-CA---A--TGGCA-TA-G-CGAT--G-T--TGGA--AGAT-ATATA-C-TTATT-----TAACAGTATTTAAAA-T----T--GATA---A---GC------AA-AAA-G--TGA-TGGGA-AA--AA--CTGTC-TT-GACGCAA----GGGAAAC--C-CT-TTC-CCG--TAT--ATC-A-GTAA-T-GT--C-TT-G--C-A-TATAC-TG--TC-G--GAAA--TTGGAAA-A-------GTGATG--CCCGC-GTTGT---G--TGG-CA--TCTTTAAA--CTA-TTTT-TTTCACA-TAC-GGAAA--A-----A--G--TTT-TT-T-------------CCGC--AA-CA---C-TT--TTC-ATG-TAATG-T--AGAA-GTTAATTATTA---T--T---T-CTCC-----A-T--GT-C-AAAAAAGG-T-C-GGCCTG-TCT-TTA-G-TCG--A--TATCGGT-T-GTTCA--GATT---T-TGCAA--TT-AATACG------AGT--CA---T-T-T-T-----TGG-T-TA--AACTTCTGA----A-AATTT---A--C-AGAC---AT-C--A--C-G--T-G-A--T-------AG-T--CCA-C-G-TGA-T-A-AT-AA--C--G---AGAGT-CCTTGTTGA-A-------C--A---T-TA-CGGA-ATA-TAATTAA------T---------AC-G-TA-TC--G-AT-AT--G-------AA-CGT-CG-A--TTTC-ACCTCTCCAGGAA-T-A--TAACTT-TTT--C-----TTTG---GTCAGTAC-A-CATGT---ACA-AAACACTAAT-GAT-T--GTTT-TATG--TA-T-GAA-TTTCACGTTATTT-T-CTGTATGTGGACGCCT-TA-CTTTCAGTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncataaaattccttgcgaaccaagctgagaagaactgtgaaattcaacatacgcaatggcatagcgatgttggaagatatatacttatttaacagtatttaaaattgataagcaaaaagtgatgggaaaaactgtcttgacgcaagggaaaccctttcccgtatatcagtaatgtcttgcatatactgtcggaaattggaaaagtgatgcccgcgttgtgtggcatctttaaactatttttttcacatacggaaaaagttttttccgcaacacttttcatgtaatgtagaagttaattattatttctccatgtcaaaaaaggtcggcctgtctttagtcgatatcggttgttcagattttgcaattaatacgagtcatttttggttaaacttctgaaaatttacagacatcacgtgatagtccacgtgataataacgagagtccttgttgaacattacggaatataattaatacgtatcgatatgaacgtcgatttcacctctccaggaatataactttttctttggtcagtacacatgtacaaaacactaatgattgttttatgtatgaatttcacgttattttctgtatgtggacgccttactttcagtt
gi|40 : atagaatttttcgttattttactaaattttatcgagtgcacatgtatgtcaacatgttacttgtccgataattattgccatttttcctttttataccaaatcgactcttaccatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnG--TA-T-GCT-TTAAACGTTA-TT-T-ATATATG-TGACGCCT-TA-A-TTCAt
gi|41 : -AAACACTTAT-GGC-T--GTTT-TATG--TA-T-GCT-TTTTACGTTA-TT-T-CTcgtt
gi|42 : A--TT---G-CGGGT-AAA-TGTC-AT-AATA--TTT-TAA--TCGTTA--TTT-A-C
gi|5 : TTGCA--TC---G-CGGGG-AAAATGTC-AT-ATGA--TTT-T-AT-TCGTTAATTCT-A-CT-A--ACC-G-TT--A-----CA---A-GTGA--A-C-AT-TATG--TATA-CAT-GAAACA-C-T-TCTT-G-TCCTA-T---AA------A-T--G--A--TCT---TTC--CTTTTTT---ATA-CC-AAAT-C-ACTCT--CCA
gi|5 : tCATAA---TTCT---TA-CGA---CCCA-GC-----T---G--A---A--AGAAA---C-TTTT-GAA-A-TTG-AAACCG--ATA-C-G-CA------TC-AA-TG-G-TGAT--G-T---GGA--AGATTGTATA-C-TATTT-----TA-CCGTATT--AAA-T-------GAT-T--A---CC------AG-AAAAG--TGA-TGGGA-AA--AT--CT-TC-TTTGACG--A-A-AGAGAAAC--T-CT-TTC-CCG--TAT--T-C-A-ATAAAT-TT--C-TTTG--C-ACTA--CCTG--TC-A--AAAA--TTG-AAATA-------GT-ATGGGCC-GC-GTTGT---A--TGAACA--T-TT-AAA--CTA-TTTC-TTTT-TAATAG-G--AG--A-----A--G--TTT-TT-T-----------------------------TT--T-T-ATG-TAATGGT--A-AA-GTTAA--ACTT---T--C---T-CT---TA--A-T--AT-C-AAAAG-GA-T-C-GGCCGG-TAT-TTA-G-TCC--A--TATC------G--CA--A--TAAAT-GGCAA--TTAAATACA------T-T-------T-T-T-T-----TGT-T-TA--A--TTCTTA----A-A--TT---A--CAA-AC---AC-C--A----G--T-GAA--T-------AG-TCCC-A-CTG-TGA-T-ACAT-AAACC--A---GCAGT-C-GTGTTGA-A-------A--A---TATA-CAGA-ATC-C---TTC------T---------AA-G-TA-TC--G-ATAAA--G-------AACCGT-CG-A--TT-T-CT-CCTC---GGA-TCA--T----T-TTT--C-----TTTG----ATAGTACAA-CATGT---ACA-AACCACTTAT-GATAT--GTTT-TATGAATA-T-GCT-TTTTACG-TA-TT-T-CTG-ATG-GGATGCCT-TA-A-TTCAGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntacataattcttacgacccagctgaaagaaacttttgaaattgaaaccgatacgcatcaatggtgatgtggaagattgtatactattttaccgtattaaatgattaccagaaaagtgatgggaaaatcttctttgacgaaagagaaactctttcccgtattcaataaatttctttgcactacctgtcaaaaattgaaatagtatgggccgcgttgtatgaacatttaaactatttctttttaataggagaagttttttttttatgtaatggtaaagttaaactttctcttaatatcaaaaggatcggccggtatttagtccatatcgcaataaatggcaattaaatacatttttttgtttaattcttaaattacaaacaccagtgaatagtcccactgtgatacataaaccagcagtcgtgttgaaaatatacagaatccttctaagtatcgataaagaaccgtcgatttctcctcggatcatttttctttgatagtacaacatgtacaaaccacttatgatatgttttatgaatatgctttttacgtatttctgatgggatgccttaattcag
gi|6 : tttgcatcgcggggaaaatgtcatatgattttattcgttaattctactaaccgttacaagtgaacattatgtatacatgaaacacttcttgtcctataaatgatctttccttttttataccaaatcactctccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaCAGTTGCA--TC---G-CGGGG-AAA--GTC-AT-AATA---TT-T-A--T--TTA--TTA-A-CT----T-C-G-TT--GTAGTGCACGCA-GTGA--A-C-AT-TATGT-TGTA-CAT-G-AACA-ATT-GC---G-TCCTA-T---AA-----TA-T--GG-C-TTCT---TCC--T--TTTG---ATATCC-AAAC-C-ACTCT--C
gi|6 : CATAAA--TTCT----A-CGA---C----AC-----T---G--A---A--A---A---C-TTTG-GAA-A-TTG-CAAC-GC-ATA-C-GTCA---A---G-CA-TG-G-CGAT--G-T--TGGA---GATT-T-TA-C-GTATT-----TA-----ATT--GAA-TATAAT--GATAT--A---GCG-----AA-AAA-G--TGA-TGG-A-AA--AT--CT-TC-T--GACGCAA-AGAGAGAA-C--C-CA-TTT-CCG--TAT--A-C-A-ATAA-T-TT--CCTT-G--CCA-TA--C-TG--TC-A--AAAA--TTG-AAA-A-------GT--TG--CC-GC-GTTGT---A--TGA-CAA-TATTTAAA--CTA-TTTT-CTTT-TA-TAC-G--AG--A-----A--A--GTT-TT-C-------------CC-A--AA-CA---C-TT--T-C-ATG-TAATG-T--A-AA-GGTTA--AC-T---T--T---T-CTTCTTAACA-T--AT-C-AAAAG-GA---C-GGCCTG-TA--TTA-G-TCC--A--TATCG-T-T-G--CA--AT-T---T-TGCAA--TT-AATACA------A----AA---T-T-T-T-----TG--T-TA--G--TTC--A----A-A--TT---A--C-A-A----AT-CCAA--C-G--T-G-A--T-------AA-G--C-A---G-TGA-T-A-AT-AAA-T--A---G-AGT-C-TTGTTGA-A-------A--A---TGTA-AGGA-AT--C---TAC------T---------AC-G-TA-TC--G-A--AA--G-------AA-CGT-CG-A---T-C-AA-CCTC---GGATT-A--T----TGTTT--C-----TTTG---AATAGT-C-A-CATGT----CA-AAACA-TTAT-GA--T--G-TT-TATG--TA-T-GCC-TTTTACGTTA-TT-TGCTGTATG-GGACGCCT-TA-A-TTCAGatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncataaattctacgacactgaaaactttggaaattgcaacgcatacgtcaagcatggcgatgttggagattttacgtatttaattgaatataatgatatagcgaaaaagtgatggaaaatcttctgacgcaaagagagaacccatttccgtatacaataatttccttgccatactgtcaaaaattgaaaagttgccgcgttgtatgacaatatttaaactattttcttttatacgagaaagttttcccaaacactttcatgtaatgtaaaggttaacttttcttcttaacatatcaaaaggacggcctgtattagtccatatcgttgcaattttgcaattaatacaaaatttttgttagttcaaattacaaatccaacgtgataagcagtgataataaatagagtcttgttgaaaatgtaaggaatctactacgtatcgaaagaacgtcgatcaacctcggattattgtttctttgaatagtcacatgtcaaaacattatgatgtttatgtatgccttttacgttatttgctgtatgggacgccttaattcag
gi|7 : cagttgcatcgcggggaaagtcataatatttatttattaacttcgttgtagtgcacgcagtgaacattatgttgtacatgaacaattgcgtcctataatatggcttcttccttttgatatccaaaccactctcatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnG---A-C-AG-TATG--TACA-CAT-GAAACA-TTT-TCTT-G-TCCTA-T---AA----TTA-T--GC-A-TTAT---TTC--CT-TTTT---ATA-CCAAAAT-T-ACTCT--CCAT
gi|7 : A-CGA---CC-A-GC-----TCATG--A------A---A---C-TG----AA-T-TTA-CAAC-A--ATA-C-G-CA---A--TG-CA-TG-A-CGAT--G-T--TGGA--AGATTATATA-C-TTATT-----TA-C-GTATT--AAA-T----T--GATAA--A---GCA-----AA-AAA-G--TGA-TGAGA-AA--AA--CT-TC-T--AACGC-A-A-AGGGAAAC--C-CT-TTC-TTG--TAT--A-C-A-GTAA-T-GT--A-TT-G--C-A-TA--C-TG--TC-G--AAAA--TTG-AAA-A-------GT-ATG--CC-GC-GTTGT---A--TG--CA--T-TTTAAA--GCA-TTTT-CTTT-TA-TAC-G--GA--A-----A--A--GTT-TT-T-------------CC-C--AA-CA---CTTT--T-C-ATG-TAATG-T--A-AA-A-TAG--A-TT---T--T---A-TTTCTAA--A-T--AT-C-AAAAG-GG-T-C-GGTCTG-TCT-TTA-G-TCG--A--TATCG-T-TGG--CA--A--T---T-TGCGA--TT-AAT-CA------A-T--CA---T-TAT-T-----TG--T-TA--A--TTCTAAGCAGA-G--TTAAGA--C-A-AA---AT-CG-A--C-G--TAA-A--TGTGAATAAG-T--C-A-T-G-TGA-T-A-CT-AAA-C--ATATTCAGTAC-TTG-TGA-A-------A--ATTTTGTA-CGGA-GTT-C----AT------T---------AC-T-TACTC--GTAT-AA--GATATTGAAA-CGTGCG-T--TC-C-AC-TCTC---GG--T-A--TAAA-T-TTTAGCA----TTTGA--AATAG-AC-AGCATGT---AC--AATCACTTAT-GAT-T--GTTT-TATG--TA-T-GCT-TTATATTTTA-TT-T-CTGTATG-GGACGCCT-TA-A-TTCAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacgaccagctcatgaaactgaatttacaacaatacgcaatgcatgacgatgttggaagattatatacttatttacgtattaaattgataaagcaaaaaagtgatgagaaaaacttctaacgcaaagggaaaccctttcttgtatacagtaatgtattgcatactgtcgaaaattgaaaagtatgccgcgttgtatgcattttaaagcattttcttttatacggaaaagtttttcccaacacttttcatgtaatgtaaaatagattttatttctaaatatcaaaagggtcggtctgtctttagtcgatatcgttggcaatttgcgattaatcaatcattatttgttaattctaagcagagttaagacaaaatcgacgtaaatgtgaataagtcatgtgatactaaacatattcagtacttgtgaaaattttgtacggagttcattacttactcgtataagatattgaaacgtgcgttccactctcggtataaattttagcatttgaaatagacagcatgtacaatcacttatgattgttttatgtatgctttatattttatttctgtatgggacgccttaattca
gi|8 : gacagtatgtacacatgaaacattttcttgtcctataattatgcattatttcctttttataccaaaattactctccatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCAGT-GCA--TCACCG-CCGGG-AAA--GTC-AT-AATA--TTT-T-A--T-GTTA---TT-G-CT-A--G-C-G-TT--ATC---CA---A---G---A-C-AT-TAT---TATA-CAT-GAACCA-ATA-TC---G-TCCTATT---AA----TTA-----C-A-TTCT---TTC--C---TTT---ATA-CC-TAAT---ACTCT--C
gi|8 : ATAA----TCT---TA-CGA---C--A-CC-----T---G--ACAGA--A---A---C-TGTA-CAA---TTC-AAAC----ATA-C-G-CA---A--TG-CA-TG-C-AG---------TGGA--GAATCATATA----TATC-----TA------------A-T----T--GATAA--A---GC------AA-AAA-G--TG--TGG---AA--AA--TC-TC-T--GACGCAA-G-AGAGAAAC--C-CT-GTC-C----TAA--A-CTA-ATA--T-TT--C-TT-G--C-A-TA--C-TG--CC-G--AAAA--TTG-AAA-A-------GT-ATG--CC-GC-GTTA--------G--CA--T-TTGCAA--ACA-ATTT-CT--------------G--A-----ATCG--GAT-TT-C-------------CC-C--AA-CA---C-TT--T-CAATG-TAA-G-T--A-AA-ATTGT--TTTT---T--T---T-CTCC--A--A-T--AT-C-AAAAG-GA-T-C-GGCCTG-TATGTTA----TG--A--TCT-G-T-T-G--CA--A--T---T-TGCAA--T-------A------A-T--T----T-T-T-T-----TG--C-TA--A--TTCTAA----A-A--T---------A-AA---AT-C--A--C-G--T-G-A----------AG-T--C-A-C-G-TGA-T-A-AT-AAA-C--A---ACAG--C-CTGTTGA-AATTAAGGA--A---TCTA-AGGA-ATC-C---T-C------T---------AC-G-TA-GC--G-AT-AT--G-------AA-CCT-CG-A--GT-C-AA--CTC---GGA-T-A-------T-TTT--C-----TT-----GATAGTA--A-TATGT---ACA-AAACAC-TAA-GA-----G--T-TA-G--TA-T---C-TTGTACGTCA-TT-T-CGTTATG-GTA-ACC--TA-A-TTCaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntataatcttacgacacctgacagaaactgtacaattcaaacatacgcaatgcatgcagtggagaatcatatatatctaattgataaagcaaaaagtgtggaaaatctctgacgcaagagagaaaccctgtcctaaactaatatttcttgcatactgccgaaaattgaaaagtatgccgcgttagcatttgcaaacaatttctgaatcggatttccccaacactttcaatgtaagtaaaattgttttttttctccaatatcaaaaggatcggcctgtatgttatgatctgttgcaatttgcaataatttttttgctaattctaaaataaaatcacgtgaagtcacgtgataataaacaacagcctgttgaaattaaggaatctaaggaatcctctacgtagcgatatgaacctcgagtcaactcggatattttcttgatagtaatatgtacaaaacactaagagttagtatcttgtacgtcatttcgttatggtaacctaattc
gi|9 : cagtgcatcaccgccgggaaagtcataatattttatgttattgctagcgttatccaagacattattatacatgaaccaatatcgtcctattaattacattctttcctttatacctaatactctcaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnt---G-CCGGG-AAA--GTC-AT-AATA--TTT-T-A--T-GTTA---TT-G-CT-A--G-C-G-TT--ATC---CA---A---G---A-C-AT-TAT---TATA-CAT-GAACCA-ATA-TC---G-TCCTATT---AA----TTA-----C-A-TTCT---TTC--C---TTT---ATA-CC-TAAT---ACTCT--C
gi|9 : ATAA----TCT---TA-CGA---C--A-CC-----T---G--ACAGA--A---A---C-TGTA-CAA---TTC-AAAC----ATA-C-G-CA---A--TG-CA-TG-C-AG---------TGGA--GAATCATATA----TATC-----TA------------A-T----T--GATAA--A---GC------AA-AAA-G--TG--TGG---AA--AA--TC-TC-T--GACGCAA-G-AGAGAAAC--C-CT-GTC-C----TAA--A-CTA-ATA--T-TT--C-TT-G--C-A-TA--C-TG--CC-G--AAAA--TTG-AAA-A-------GT-ATG--CC-GC-GTTA--------G--CA--T-TTGCAA--ACA-ATTT-CT--------------G--A-----ATCG--GAT-TT-C-------------CC-C--AA-CA---C-TT--T-CAATG-TAA-G-T--A-AA-ATTGT--TTTT---T--T---T-CTCC--A--A-T--AT-C-AAAAG-GA-T-C-GGCCTG-TATGTTA----TG--A--TCT-G-T-T-G--CA--A--T---T-TGCAA--T-------A------A-T--T----T-T-T-T-----TG--C-TA--A--TTCTAA----A-A--T---------A-AA---AT-C--A--C-G--T-G-A----------AG-T--C-A-C-G-TGA-T-A-AT-AAA-C--A---ACAG--C-CTGTTGA-AATTAAGGA--A---TCTA-AGGA-ATC-C---T-C------T---------AC-G-TA-GC--G-AT-AT--G-------AA-CCT-CG-A--GT-C-AA--CTC---GGA-T-A-------T-TTT--C-----TT-----GATAGTA--A-TATGT---ACA-AAACAC-TAA-GA-----G--T-TA-G--TA-T---C-TTGTACGTCA-TT-T-CGTTATG-GTA-ACC--TA-A-TTCaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntataatcttacgacacctgacagaaactgtacaattcaaacatacgcaatgcatgcagtggagaatcatatatatctaattgataaagcaaaaagtgtggaaaatctctgacgcaagagagaaaccctgtcctaaactaatatttcttgcatactgccgaaaattgaaaagtatgccgcgttagcatttgcaaacaatttctgaatcggatttccccaacactttcaatgtaagtaaaattgttttttttctccaatatcaaaaggatcggcctgtatgttatgatctgttgcaatttgcaataatttttttgctaattctaaaataaaatcacgtgaagtcacgtgataataaacaacagcctgttgaaattaaggaatctaaggaatcctctacgtagcgatatgaacctcgagtcaactcggatattttcttgatagtaatatgtacaaaacactaagagttagtatcttgtacgtcatttcgttatggtaacctaattc
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|22 ): TATGTAAACATTAAAACATTTTCTTGTCCTATCAAATCACTCTCCATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCATG
Unaligned ( gi|39 ): AGTAGTATCATGGGGAAAATTTATTTGTTGAAATTATTACCATTATCAAGTG
Unaligned ( gi|43 ): ATTTTTCCAAGCCAAAAAAGGTCAGCCTTCTATAC